CN114761006A

CN114761006A - 对激酶抑制剂产生耐药性的癌症的治疗方法

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Publication number: CN114761006A
Application number: CN202080077981.3A
Authority: CN
Inventors: O·卡尔瓦亚克; G·法夫尔; S·费加罗
Original assignee: Institut National de la Sante et de la Recherche Medicale INSERM; INSTITUT CLAUDIUS REGAUD; Universite Toulouse III Paul Sabatier
Current assignee: Institut National de la Sante et de la Recherche Medicale INSERM; INSTITUT CLAUDIUS REGAUD; Universite Toulouse III Paul Sabatier
Priority date: 2019-11-08
Filing date: 2020-11-06
Publication date: 2022-07-15
Also published as: US20220401436A1; WO2021089791A1; AU2020378630A1; KR20220098759A; EP4054579A1; JP2023500906A; CA3159348A1

Abstract

对激酶抑制剂的耐药性是对癌症患者有效治疗的最大障碍。最近的研究表明，上述耐药性的出现可能不仅是像人们通常认为，由现已存在的耐药亚克隆的药物选择来解释，也可能是因为产生了少量耐药细胞(DTC)，通过细胞进入缓慢循环状态，一开始就对治疗起到了抵抗作用。因此，针对这些DTC应该采用一种有前景的新方法，以阻止对激酶抑制剂出现继发性的耐药性。目前发明人已经证明，抑制法尼基转移酶(但不是香叶酰香叶酰转移酶)可以防止在不同致癌环境中出现上述耐药性。特别是，发明人在体外测定了法尼基转移酶抑制剂(即替匹法尼)与厄洛替尼联合使用在几个EGFR突变细胞系中的疗效。它们表明，该组合可以有效地消除了所有耐药细胞，并完全阻止了耐药克隆的出现。有趣的是，在其他致癌模型中也观察到类似的结果，如ALK易位的肺癌细胞或BRAF突变的黑色素瘤细胞。因此，本发明涉及法尼基转移酶抑制剂在治疗耐激酶抑制剂型癌症中的用途。

Description

对激酶抑制剂产生耐药性的癌症的治疗方法

技术领域

本发明涉及医学领域，特别是肿瘤学。

背景技术

肺癌是全球癌症死亡的主要原因¹。转移性非小细胞肺癌(NSCLC)最近受益于两个连续的突破：癌基因驱动因素的识别，如EGFR突变，导致了靶向治疗的发展，以及对癌症免疫周期的理解，导致了免疫检查点抑制剂的发展。

第一代EGFR-酪氨酸激酶抑制剂(EGFR-TKI)如厄洛替尼或吉非替尼是治疗带有EGFR激活突变的NSCLC的有效疗法²。然而，尽管有70％的有效率，但由于耐药性的发展，患者通常会在中位时间12个月内复发。获得性耐药的机制包括EGFR^T790M突变、包括MET³或HER2⁴在内的旁路途径的激活、上皮-间质转化(EMT)⁵和转化为小细胞肺癌⁶等⁷。这些抗性也可以通过重新激活EGFR下游的增殖/存活途径来介导，主要是PI3K/AKT、MEK/ERK或STAT^8，9。最初，人们认为针对复发时在肿瘤中发现的附加基因变异可以解决耐药性的问题。然而，肿瘤间和肿瘤内的突变异质性使这一策略失效。事实上，使用有效靶向T790M看门基因突变的第三代EGFR-TKI奥希美替尼(Osimertinib)治疗的患者也会由于新的耐药机制(例如EGFR-C797S/G突变)的出现而复发¹⁰。

最近的体外研究表明，EGFR-TKI耐药性的出现可能不仅是像人们普遍认为的那样，因为现已存在的耐药性亚克隆的药物选择来解释，而且也可能是由少量耐药细胞(DTC)从头开始，通过进入缓慢循环状态来抵抗治疗¹¹。随着时间的推移，其中一些细胞可以重新进入细胞周期，并最终获得基因改变，使其能够完全恢复增殖能力^12，13。DTCs基本上在EGFR突变的PC9肺细胞系中得到了描述，其在体外再现了患者中显示的主要阶段：i)在用1μMEGFR-TKI(剂量为该细胞系IC50的50-100倍，并且相当于患者的血液浓度)治疗的前5天产生强烈的初始反应，导致绝大多数细胞死亡；ii)随后观察到数天/周的潜伏期，这与剩余的DTCs的存在相对应。这些细胞被描述为低增殖细胞，表达癌症干细胞标记，如CD133或CD24，并经历了没有基因型改变的表观遗传的重编程^11，14；iii)经过几周的治疗后，其中一些细胞可以获得新的基因修饰，如EGFR^T790M耐药突变(在第一代EGFR-TKI治疗的情况下)或其他基因改变^12，13。

其他研究表明存在一种类似的细胞状态，也称为微小残留病(Minimal ResidualDisease)(MRD)，在应NSCLC和其他癌症，如转移性黑色素瘤¹⁵、胶质母细胞瘤¹⁶或急性髓细胞白血病门中对几种抗癌疗法产生反应。尽管如此，这种特殊状态仍然没有得到描述，我们仍然不知道肿瘤细胞是通过哪种分子机制演变为DTC状态，这些DTC如何产生耐药性突变，以及这些细胞可以在何种程度上促进患者的耐药性。因此，靶向这些DTC应该是一种新的有希望的方法，以阻止对EGFR-TKI的继发耐药性的出现。然而，我们仍然缺乏这种特定状态的准确体内表型和分子表征，这是开发新疗法的先决条件。

发明内容

根据权利要求的定义，本发明涉及用于治疗对激酶抑制剂已获得耐药性的癌症的方法、药物组合物和试剂盒。

本发明详细说明：

本发明的第一个目的涉及一种治疗有需要的受试者癌症的方法，包括向受试者施用含有激酶抑制剂和法尼基转移酶抑制剂的治疗有效组合物。

本发明的另一个目的涉及一种延迟和/或预防受试者对耐激酶抑制剂产生耐药性的癌症发展的方法，包括向受试者施用治疗有效量的激酶抑制剂与法尼基转移酶抑制剂的组合物。

如本文所用术语“对激酶抑制剂的耐药性”在其最广义的背景下，指至少一种激酶抑制剂抑制细胞生长、杀死细胞或抑制一种或多种细胞功能的效力降低，以及指细胞在暴露于旨在抑制细胞生长、杀死细胞或抑制一种或多种细胞功能的试剂后存活的能力。细胞表现出的耐药性可以例如通过事先暴露于试剂而获得，或者可以是固有的或先天的。细胞表现出的耐药性可能是完全的，因为药剂对细胞完全无效，也可能是部分的，因为药剂的有效性降低。因此，术语“耐药性”是指癌症的反复爆发，或癌症的进展，而与疾病在所述爆发或进展之前疾病是否被治愈无关。

本发明的另一个目的涉及一种在需要的受试者中治疗耐激酶抑制剂型癌症的方法，包括向受试者施用治疗有效量的法尼基转移酶抑制剂。

本发明的另一个目的涉及一种预防癌症受试者对施用的激酶抑制剂产生耐药性的方法，包括向受试者施用治疗有效量的法尼基转移酶抑制剂。

本发明的另一目的涉及一种用于增强作为治疗方案的一部分给予癌症受试者的激酶抑制剂效力的方法，该方法包括向受试者施用药学上有效量的法尼基转移酶抑制剂与激酶抑制剂的组合物。

本发明的另一个目的涉及使用法尼基转移酶抑制剂抑制或预防癌症持续细胞(cancer persister cell)的增殖或癌症持续细胞群的形成，从而预防或延迟癌症复发和/或对激酶抑制剂疗法的获得性耐药性的出现。此外，这种对癌症持续细胞的作用可能会导致癌症治疗达到完全反应。事实上，法尼基转移酶抑制剂将能够消除癌症持续细胞。它还涉及一种用于消除或减少癌症持续细胞群和/或预防或延迟癌症复发和/或对癌症治疗产生获得性耐药性的方法，包括施用治疗有效量的法尼基转移酶抑制剂，从而消除或减少癌症持续细胞群。法尼基转移酶抑制剂将有利于靶向存活的“持久性”肿瘤细胞，因此可以防止耐药性克隆的出现，特别是在与激酶抑制剂联合治疗的情况下。

如本文所用，术语“持续细胞”、“癌症持续细胞”、“耐药持久性”和“DTP”指在抗癌靶向治疗，特别是用激酶抑制剂治疗下保持活力的一小部分癌细胞亚群。更具体地，它指的是对高浓度的激酶抑制剂治疗具有耐受性的癌细胞，当其以比IC50高100倍的浓度使用时。这些细胞生长缓慢，几乎处于静止状态。因此，本发明的法尼基转移酶抑制剂特别适用于根除耐药性扩增的持久性菌。本文所使用的术语“耐药性扩增的持久性”或“耐药性细胞”是指在持续的高浓度癌症药物治疗下，特别是激酶抑制剂治疗下，能够增殖的癌细胞。

如本文所用，术语“复发”是指在初始响应周期(例如，完全响应或部分响应)之后，癌症再次出现。初始响应周期可能涉及癌细胞水平下降到某个阈值以下，例如，低于20％、15％、10％、5％、4％、3％、2％或1％。再次出现可能涉及癌细胞水平上升到某个阈值以上，例如，高于20％、15％、10％、5％、4％、3％、2％或1％。更一般地，响应(例如，完全响应或部分响应)可以涉及不能检测到的MRD(微小残留疾病(minimal residual disease))。在一些实施方案中，初始响应周期至少持续1、2、3、4、6、8、10或12个月；或至少1、2、3、4或5年。

如本文所用，术语“激酶抑制剂”是指本领域目前已知的或未来将被识别的任何化合物，并且在施用于受试者时导致抑制受试者癌细胞中的激酶途径的任何化学实体。在一些实施方案中，激酶抑制剂是有机小分子。激酶抑制剂包括但不限于低分子量的抑制剂、抗体或抗体片段、反义构建体、小的抑制性RNA(即dsRNA的RNA干扰；RNAi)和核酶。激酶抑制剂通常是一种有机小分子。该术语不包括生物大分子(例如：蛋白质、核酸等)。优选的有机小分子的大小范围不超过2000Da，最优选不超过约1000Da。

根据本发明，激酶抑制剂是一种用于治疗癌症的激酶抑制剂。特别地，该激酶可以是酪氨酸激酶、丝氨酸/苏氨酸激酶或具有双重特异性的激酶。在一个特定方面，已知激酶抑制剂与癌症治疗期间的获得性耐药性有关。在一个非常具体的方面，在用这种激酶抑制剂治疗癌症期间，该激酶抑制剂与癌症持续细胞的发生有关。

在一些实施方案中，激酶抑制剂可以靶向以下激酶中的任何一种：EGFR家族、ALK、B-Raf、MEK、FGFR1、FGFR2、FGFR3、FGFR4、FLT3、IGF1R、c-Met、JAK家族、PDGFRα和β、RET、AXL、c-KIT、TrkA、TrkB、TrkC、ROS1、BTK和Syk。

在一些实施方案中，激酶抑制剂是靶向受体酪氨酸激酶抑制剂，特别是选自EGFR家族、ALK、FGFR1、FGFR2、FGFR3、FGFR4、c-Met、RET、IGF1R、PDGFRα和β、c-KIT、FLT3、AXL、TrkA、TrkB、TrkC和ROS1组成的组。

在一些实施方案中，以酪氨酸激酶为靶的激酶抑制剂选自EGFR、ALK、B-Raf、MEK、c-Met、JAK、PDGFRα和β、RET和BTK组成的组。例如，一组在进化和结构上与ALK相关的酪氨酸激酶是RET、ROS1、AXL和Trk家族激酶。

EGFR激酶抑制剂是众所周知的。例如，发表的期刊公布了这种EGFR激酶抑制剂(Expert Opinion on Therapeutic Patents Dec 2002，Vol.12，No.12，Pages 1903-1907；Kane，Expert Opinion on Therapeutic Patents Feb 2006，Vol.16，No.2，Pages 147-164；Traxler，Expert Opinion on Therapeutic Patents Dec1998，Vol.8，No.12，Pages1599-1625；Singh et al，Mini Rev Med Chem.2016；16(14)：1134-66；Cheng et al，CurrMed Chem.2016；23(29)：3343-3359；Milik et al，Eur J Med Chem.2017Dec 15；142：131-151.；Murtuza et al，Cancer Res.2019Feb 15；79(4)：689-698；Tan et al，Onco TargetsTher.2019Jan18；12：635-645；Roskoski，Pharmacol Res.2019Jan；139：395-411；Mountzios，Ann Transl Med.2018Apr；6(8)：140；Tan et al，Mol Cancer.2018Feb19；17(1)：29)，其中公开内容这里做为参考引入。专利申请也公开了EGFR激酶抑制剂，例如，且非穷尽地：WO19010295、WO19034075、WO18129645、WO18108064、WO18050052、WO18121758、WO18218963、WO17114383、WO17049992、WO17008761、WO17015363、WO17016463、WO17117680、WO17205459、WO16112847、WO16054987、WO16070816、WO16079763、WO16125186、WO16123706、WO16050165、WO15081822、WO12167415、WO13138495、WO10129053、WO10076764、WO09143389、WO05065687、WO05018677、WO05027972、WO04011461、WO0134574，其公开内容这里做为参考引入。下表公开了EGFR激酶抑制剂的具体实例。

ALK激酶抑制剂是众所周知的。例如，发表的期刊披露了这种ALK激酶抑制剂(Beardslee et al，J Adv Pract Oncol.2018Jan-Feb；9(1)：94-101；Pacenta et al，DrugDes Devel Ther.2018Oct 23；12：3549-3561；Spagnuolo et al，Expert Opin EmergDrugs.2018Sep；23(3)：231-241；Peters et al，Curr Treat Options Oncol.2018May 28；19(7)：37；Goldings et al，Mol Cancer.2018Feb 19；17(1)：52；Karachaliou et al，Expert Opin Investig Drugs.2017Jun；26(6)：713-722；Liu et al，Curr MedChem.2017；24(6)：590-613；Crescenzo et al，Curr Opin Pharmacol.2015Aug；23：39-44；Sgambato et al，Expert Rev Anticancer Ther.2018Jan；18(1)：71-80；Michellys etal，Bioorg Med Chem Lett.2016Feb1；26(3)：1090-1096；Straughan et al，Curr DrugTargets.2016；17(6)：739-45)，其中的披露内容这里做为参考引入。专利申请也公开了ALK激酶抑制剂，例如，且非穷尽地：WO04080980、WO05016894、WO05009389、WO09117097、WO09143389、WO09132202、WO10085597、WO10143664、WO11138751、WO12037155、WO12017239、WO12023597、WO13013308、WO14193932、WO15031666、WO15127629、WO15180685、WO15194764、WO17076355、WO18001251、WO18044767、WO18094134、WO18127184，该公开内容这里做为参考引入。下表公开了ALK激酶抑制剂的具体实例。

B-Raf激酶抑制剂是众所周知的。例如，发表的期刊公布了这种B-Raf激酶抑制剂(Tsai et al，PNAS February 26，2008105(8)3041-3046，Garnett et Marais，2004Cancercell，Vblume 6，Issue 4，Pages 313-319；Wilmott et al 2012，Cancer Therapy：Clinical，Volume 18，Issue 5；Fujimura et al，Expert Opin Investig Drugs.2019Feb；28(2)：143-148，Trojaniello et al，Expert Rev Clin Pharmacol.2019Mar；12(3)：259-266；Kakadia et al，Onco Targets Ther.2018Oct17；11：7095-7107；Roskoski，PharmacolRes.2018Sep；135：239-258；Eroglu et al，Ther Adv Med Oncol.2016Jan；8(1)：48-56)，该公开内容这里做为参考引入。专利申请也公开了B-Raf激酶抑制剂，例如，且非穷尽地：WO14164648、WO14164648、WO14206343、WO13040515、WO11147764、WO11047238、WO11025968、WO11025951、WO11025938、WO11025965、WO11090738、WO09143389、WO09111280、WO09111279、WO09111278、WO09111277、WO08068507、WO08020203、WO07119055、WO07113558、WO07071963、WO07113557、WO06079791、WO06067446、WO06040568、WO06024836、WO06024834、WO06003378、WO05123696，该公开内容这里做为参考引入。下表公开了B-Raf激酶抑制剂的具体实例。

激酶抑制剂可以靶向MEK(丝裂素活化蛋白激酶激酶(Mitogen-activatedprotein kinase kinase)，也称为MAP2K、MP2K、MAPKK、MAPK/ERK激酶、JNK活化激酶、c-JunN-末端激酶激酶(JNKK)、应激活化蛋白激酶激酶(SAPKK))；UniprotKB-Q02750(MP2K1)、P36507(MP2K2)、P46734(MP2K3)、P45985(MP2K4)、Q13163(MP2K5)、P52564(MP2K6)、O14733(MP2K7))。优选地，激酶抑制剂靶向MEK-1(也称为MAP2K1、MP2K1、MAPKK1或MKK1)和/或MEK-2(也称为MAP2K2、MP2K2、MAPKK2或MKK2)。MEK-1和MEK-2在MAPK/ERK级联中都具有特异性的功能。MEK激酶抑制剂是众所周知的。例如，发表的期刊公布了这种MEK激酶抑制剂(Kakadiaet al，Onco Targets Ther.2018Oct 17；11：7095-7107；Steeb et al，Eur J Cancer.2018Nov；103：41-51；Sarkisian and Davar，Drug Des Devel Ther.2018Aug 20；12：2553-2565；Roskoski，Pharmacol Res.2018Sep；135：239-258；Eroglu et al，Ther Adv MedOncol.2016Jan；8(1)：48-56)，该公开内容这里做为参考引入。专利申请也公开了MEK激酶抑制剂，例如，且非穷尽地：WO15022662、WO15058589、WO14009319、WO14204263、WO13107283、WO13136249、WO13136254、WO12095505、WO12059041、WO11047238、WO11047055、WO11054828、WO10017051、WO10108652、WO10121646、WO10145197、WO09129246、WO09018238、WO09153554、WO09018233、WO09013462、WO09093008、WO08089459、WO07014011、WO07044515、WO07071951、WO07022529、WO07044084、WO07088345、WO07121481、WO07123936、WO06011466、WO06011466、WO06056427、WO06058752、WO06133417、WO05023251、WO05028426、WO05051906、WO05051300、WO05051301、WO05051302、WO05023759、WO04005284、WO03077855、WO03077914、WO02069960、WO0168619、WO0176570、WO0041994、WO0042022、WO0042003、WO0042002、WO0056706、WO0068201、WO9901426，该公开内容这里做为参考引入。下表公开了MEK激酶抑制剂的具体实例。

激酶抑制剂可以靶向FGFR(纤维细胞生长因子受体；UniprotKB-P11362(FGFR1)、P21802(FGFR2)、P22607(FGFR3)、P22455(FGFR4))。FGFR激酶抑制剂是众所周知的。例如，发表的期刊公布了这种FGFR激酶抑制剂(Katoh，Int J Mol Med.2016Jul；38(1)：3-15；Rizviet Borad，J Gastrointest Oncol.2016 Oct；7(5)：789-796；Tan et al，Onco TargetsTher.2019Jan 18；12：635-645，Shen et al，J Hematol Oncol.2018 Sep19；11(1)：120；Porta et al，Crit Rev Oncol Hematol.2017May；113：256-267；Cheng et al，Eur J MedChem.2017Jan 27；126：476-490)，该公开内容这里做为参考引入。专利申请也公开了FGFR激酶抑制剂，例如，且非穷尽地：WO19034075、WO19034076、WO19001419、WO18028438、WO18049781、WO18121650、WO18153373、WO18010514、WO17028816、WO17070708、WO16091849、WO16134320、WO16054483、WO15059668、WO14007951、WO14026125、WO14129477、WO14162039、WO14172644、WO13108809、WO13129369、WO13144339、WO13179033、WO13053983、WO12008563、WO12008564、WO12047699、WO09153592、WO08078091、WO08075068、WO06112479、WO04056822，该公开内容这里做为参考引入。下表公开了FGFR激酶抑制剂的具体实例。FGFR激酶抑制剂可以是选择性的一个或几个FGFR家族成员，特别是选自FGFR1、FGFR2、FGFR3和FGFR4。

激酶抑制剂可能靶向FLT3(受体型酪氨酸蛋白激酶FLT3，也称为FL细胞因子受体、胎肝激酶-2(FLK-2)、Fms样酪氨酸激酶3(FLT-3)、干细胞酪氨酸激酶1(STK-1)或CD抗原：CD135；UniprotKB-P36888)。FLT3激酶抑制剂是众所周知的。例如，发表的期刊公布了这种FLT3激酶抑制剂(Stone，Best Pract Res Clin Haematol.2018Dec；31(4)：401-404；Wu etal，J Hematol Oncol.2018Dec 4；11(1)：133；Short et al，Ther AdvHematol.2019Feb15；10：2040620719827310；Elshouryet al，Expert Rev AnticancerTher.2019Mar；19(3)：273-286；Zhi et al，Eur J Med Chem.2018Jul15；155：303-315；Tiong IS，Wei AH，Genes Chromosomes Cancer.2019Mar 12，Gallogly et Lazarus，JBlood Med.2016Apr 19；7：73-83；Pitoia et Jerkovich，Drug Des Devel Ther.2016Mar11；10：1119-31)，该公开内容这里做为参考引入。专利申请也公开了XX激酶抑制剂，例如，且非穷尽地：WO19034538、WO17148440、WO15056683、WO13170671、WO13124869、WO13142382、WO13157540、WO11086085、WO09095399、WO09143389、WO08111441、WO08046802、WO06020145、WO06106437、WO06135719，该公开内容这里做为参考引入。下表公开了FLT3激酶抑制剂的具体实例。

激酶抑制剂可以靶向IGF1R(***1受体，也称为***I受体(IGF-I受体)或CD抗原：CD221；UniprotKB-P08069或C9J5X1)。IGF1R激酶抑制剂是众所周知的。例如，发表的期刊公布了这种IGF1R激酶抑制剂(Qu et al，Oncotarget.2017Apr25；8(17)：29501-29518；Chen et al，Curr Top Med Chem.2017Nov 20；17(28)：3099-3130)，该公开内容这里做为参考引入。专利申请也公开了IGF1R激酶抑制剂，例如，且非穷尽地：WO16082713、WO08076415、WO08000922、WO08076143、WO07121279、WO07083017、WO07075554、WO06080450、WO05095399、WO05097800、WO05037836、WO02092599，该公开内容这里做为参考引入。下表公开了IGF1R激酶抑制剂的具体实例。

激酶抑制剂可以靶向c-Met(肝细胞生长因子受体，也称为HGF/SF受体、原癌基因c-Met、散射因子受体或酪氨酸蛋白激酶Met；UniprotKB-P08581)。c-Met激酶抑制剂是众所周知的。例如，发表的期刊公布了这种c-Met激酶抑制剂(Zhang et a1，Expert Opin TherPat.2019Jan；29(1)：25-41；

-Spychalska et al，Curr Treat OptionsOncol.2014Dec；15(4)：670-82；Bahrami et al，J Cell Physiol.2017Oct；232(10)：2657-2673；Zhang et al，Eur J Med Chem.2016Jan 27；108：495-504；Qi et al，World JGastroenterol.2015May 14；21(18)：5445-53)，该公开内容这里做为参考引入。专利申请也公开了c-Met激酶抑制剂，例如，且非穷尽地：WO18153293、WO18187355、WO14000713、WO14032498、WO14067417、WO14180182、WO1307089、WO13107285、WO13149581、WO12006960、WO12015677、WO12034055、WO12048258、WO12075683、WO11039527、WO11079142、WO11121223、WO11143646、WO11149878、WO10007317、WO10007316、WO10007318、WO10019899、WO10059668、WO10089508、WO10089509、WO09143389、WO09143211、WO09056692、WO09093049、WO09068955、WO13013308、WO08023698、WO08008310、WO08102870、WO07036630、WO07066185、WO07023768、WO07002254、WO07002258、WO07111904、WO06104161、WO05082854、WO05082855、WO0160814，该公开内容这里做为参考引入。下表公开了c-Met激酶抑制剂的具体实例。

激酶抑制剂可以靶向JAK(酪氨酸蛋白激酶JAK2，也称为Janus激酶2；UniprotKB-O60674)。JAK激酶抑制剂是众所周知的。例如，发表的期刊公布了这种JAK激酶抑制剂(Heet al，Expert Opin Ther Pat.2019Feb；29(2)：137-149；Hobbs et al，Hematol OncolClin North Am.2017Aug；31(4)：613-626；Senkevitch et Durum，Cytokine.2017Oct；98：33-41；Leroy et Constantinescu，Leukemia.2017May；31(5)：1023-1038；Jin et al，Pathol Oncol Res.2019Jan 31)，该公开内容这里做为参考引入。专利申请也公开了JAK激酶抑制剂，例如，且非穷尽地：WO19034153、WO18215389、WO18215390、WO18204238、WO17006968、WO17079205、WO17091544、WO17097224、WO17129116、WO17140254、WO17215630、WO16027195、WO16032209、WO16116025、WO16173484、WO16191524、WO16192563、WO15174376、WO15039612、WO14111037、WO14123167、WO14146492、WO14186706、WO13091539、WO13188184、WO11076419、WO10085597、WO10051549、WO10083283、WO10135621、WO10142752、WO10149769、WO11003065、WO09132202、WO09143389、WO09062258、WO09114512、WO09145856、WO09155565、WO09155551、WO08047831、WO08109943、WO08116139、WO08157207、WO07070514、WO07084557、WO07117494、WO07007919、WO06034116、WO06056399、WO06069080、WO05095400、WO04058753、WO04041789、WO04041814、WO04041810、WO03101989、WO0152892，该公开内容这里做为参考引入。下表公开了JAK激酶抑制剂的具体实例。

激酶抑制剂可以靶向PDGFR(血小板衍生生长因子受体，也称为血小板衍生生长因子受体，CD140抗原样家族成员；UniprotKB-P16234(PGFRA)P09619(PGFRB))。PDGFR激酶抑制剂是众所周知的。例如，发表的期刊公布了这种PDGFR激酶抑制剂(Roskoski，PharmacolRes.2018Mar；129：65-83；Andrick et Gandhi，Ann Pharmacother.2017Dec；51(12)：1090-1098；Khalique et Banerjee，Expert Opin Investig Drugs.2017Sep；26(9)：1073-1081；Miyamoto et al，Jpn J Clin Oncol.2018Jun1；48(6)：503-513；Gallogly et Lazarus，JBlood Med.2016Apr 19；7：73-83；Pitoia et Jerkovich，Drug Des Devel Ther.2016Mar11；10：1119-31；Chen et Chen，Drug Des Devel Ther.2015Feb 9；9：773-9)，该公开内容这里做为参考引入。专利申请也公开了PDGFR激酶抑制剂，例如，且非穷尽地：WO11119894、WO08016192、WO07004749、WO03077892、WO03077892、WO0164200、WO0125238、WO0172711、WO0172758、WO9957117和WO9928304，该公开内容这里做为参考引入。下表公开了PDGFR激酶抑制剂的具体实例。

激酶抑制剂可以靶向RET(原癌基因酪氨酸蛋白激酶受体Ret，也称为钙粘着蛋白家族成员12或原癌基因c-Ret；UniprotKB-P07949)。RET激酶抑制剂是众所周知的。例如，发表的期刊公布了这种RET激酶抑制剂(Roskoski et Sadeghi-Nejad，PharmacolRes.2018Feb；128：1-17；

et Grüllich；Recent Results Cancer Res.2018；211：187-198；Grüllich，Recent Results Cancer Res.2018；211：67-75；Pitoia etJerkovich，Drug Des Devel Ther.2016Mar 11；10：1119-31)，该公开内容这里做为参考引入。专利申请也公开了RET激酶抑制剂，例如，且非穷尽地：WO18071454、WO18136663、WO18136661、WO18071447、WO18060714、WO18022761、WO18017983、WO17146116、WO17161269、WO17146116、WO17043550、WO17011776、WO17026718、WO14050781、WO07136103、WO06130673，该公开内容这里做为参考引入。下表公开了RET激酶抑制剂的具体实例。

激酶抑制剂可以靶向AXL(酪氨酸蛋白激酶受体UFO，也称为AXL癌基因；UniprotKB-P30530)。AXL激酶抑制剂是众所周知的。例如，发表的期刊公布了这种AXL激酶抑制剂(Myers et al，J Med Chem.2016Apr28；59(8)：3593-608；Grüllich，RecentResults Cancer Res.2018；211：67-75)，该公开内容这里做为参考引入。专利申请也公开了AXL激酶抑制剂，例如，且非穷尽地：WO18121228、WO17059280、WO17028797、WO16166250、WO16104617、WO16097918、WO16006706、WO15143692、WO15119122、WO15100117、WO15068767、WO15017607、WO15012298、WO13115280、WO13074633、WO12135800、WO12028332、WO10090764、WO10083465、WO10005876、WO10005879、WO09127417、WO09054864、WO08128072、WO08098139、WO08083353、WO08083357、WO08083354、WO08083356、WO08083367、WO08080134、WO08045978、WO07030680，该公开内容这里做为参考引入。下表公开了AXL激酶抑制剂的具体实例。

激酶抑制剂可以靶向c-KIT(肥大/干细胞生长因子受体试剂盒，也称为Piebald特征蛋白(PBT)、原癌基因c-Kit、酪氨酸蛋白激酶试剂盒或p145c-kit；UniprotKB-P10721)。c-KIT激酶抑制剂是众所周知的。例如，发表的期刊公布了这种c-KIT激酶抑制剂(Abbaspour Babaei et al，Drug Des Devel Ther.2016 Aug 1；10：2443-59，

et Grüllich；Recent Results Cancer Res.2018；211：187-198；Miyamoto et al，Jpn JClin Oncol.2018 Jun 1；48(6)：503-513；Chen et al，Curr Top Med Chem.2017 Nov 20；17(28)：3099-3130；Gallogly et Lazarus，J Blood Med.2016 Apr 19；7：73-83；Pitoiaet Jerkovich，Drug Des Devel Ther.2016 Mar 11；10：1119-31，Chen et Chen，Drug DesDevel Ther.2015 Feb 9；9：773-9)，该公开内容这里做为参考引入。专利申请也公开了c-kit激酶抑制剂，例如，且非穷尽地：WO19034128、WO18112136、WO18112140、WO17167182、WO17121444、WO14202763、WO13033116、WO13033203、WO13033167、WO13033070、WO13014170、WO09105712、WO08011080、WO08005877、WO07124369、WO07092403、WO07038669、WO07026251、WO06106437、WO06135719、WO060603R1、WO05073225、WO05021531、WO0302153/、WO03021344、WO04080462、WO04014903、WO03033049、WO03002114、WO03003006、WO03004006，该公开内容这里做为参考引入。下表公开了c-KTT激酶抑制剂的具体实例。

激酶抑制剂可以靶向Trk(原肌球蛋白受体激酶(Tropomyosin receptorkinase)，也称为高亲和神经生长因子受体、神经营养酪氨酸激酶受体或TRK转化酪氨酸激酶蛋白；UniprotKB-P04629(Trk1)、Q16620(Trk2)、Q16288(Trk3))。Trk激酶抑制剂是众所周知的。例如，发表的期刊公布了这种Trk激酶抑制剂(Bhangoo et Sigal，Curr OncolRep.2019Feb 4；21(2)：14，Pacenta et Macy，Drug Des Devel Ther.2018Oct 23；12：3549-3561；Cocco et al，Nat Rev Clin Oncol.2018Dec；15(12)：731-747；Lange et Lo，Cancers(Basel).2018Apr4；10(4)；Rolfo et al，Expert Opin Investig Drugs.2015；24(11)：1493-500)，该公开内容这里做为参考引入。专利申请也公开了Trk激酶抑制剂，例如，且非穷尽地：WO18199166、WO18079759、WO17135399、WO17087778、WO17006953、WO16164286、WO16161572、WO16116900、WO16036796、WO16021629、WO15200341、WO15175788、WO15143653、WO15148350、WO15148344、WO15143654、WO15148373、WO15148354、WO15143652、WO15089139、WO15039334、WO15042085、WO15039333、WO15017533、WO14129431、WO14105958、WO14078417、WO14078408、WO14078378、WO14078372、WO14078331、WO14078328、WO14078325、WO14078322、WO14078323、WO13183578、WO13176970、WO13161919、WO13088257、WO13088256、WO13009582、WO12158413、WO12137089、WO12116217、WO12034091、WO12037155、WO11006074、WO10048314、WO10033941、WO09054468、WO08135785、WO07123269、WO06135719、WO06123113、WO06087538、WO06087530、WO06082392、WO05049033、WO03027111，该公开内容这里做为参考引入。下表公开了Trk激酶抑制剂的具体实例。

激酶抑制剂可以靶向ROS1(原癌基因酪氨酸蛋白激酶ROS，也称为原癌基因c-Ros、原癌基因c-Ros-1、受体酪氨酸激酶c-ros癌基因1和c-Ros受体酪氨酸激酶；UniprotKB-P08922)。ROS1激酶抑制剂是众所周知的。例如，发表的期刊公布了这种ROS1激酶抑制剂(Lin et Shaw，J Thorac Oncol.2017 Nov；12(11)：1611-1625；Facchinetti et al，Cancer Treat Rev.2017 Apr；55：83-95；Rolfo et al，Expert Opin InvestigDrugs.2015；24(11)：1493-500，Yang et Gong，Expert Rev Clin Pharmacol.2019 Mar；12(3)：173-178，Liu et al，Ther Clin Risk Manag.2018 Jul 20；14：1247-1252；Sgambatoet al.Expert Rev Anticancer Ther.2018 Jan；18(1)：71-80)，该公开内容这里做为参考引入。专利申请也公开了ROS1激酶抑制剂，例如，且非穷尽地，国际专利：WO13183578、WO13180183、WO13158859、WO12037155、WO12005299、WO14141129、WO15144801、WO15144799、WO18170381，该公开内容这里做为参考引入。下表公开了ROS1激酶抑制剂的具体实例。

激酶抑制剂可以靶向BTK(酪氨酸蛋白激酶BTK，也称为无丙种球蛋白血症酪氨酸激酶(Agammaglobulinemia tyrosine kinase)(ATK)、B细胞祖激酶(BPK)和布鲁顿酪氨酸激酶(Bruton tyrosine kinase)；UniprotKB-Q06187)。BTK激酶抑制剂是众所周知的。例如，发表的期刊公布了这种BTK激酶抑制剂(Kim HO，Arch Pharm Res.2019 Feb；42(2)：171-181；Lianget al，Eur J Med Chem.2018 May 10；151：315-326，Aw et Brown，DrugsAging.2017 Jul；34(7)：509-527；Wu et al，Oncotarget.2017 Jan 24；8(4)：7201-7207，Wu et al，J Hematol Oncol.2016Sep 2；9(1)：80)，该公开内容这里做为参考引入。专利申请也公开了BTK激酶抑制剂，例如，且非穷尽地：WO18002958、WO18001331、WO18009017、WO18035080、WO18088780、WO18090792、WO18095398、WO18133151、WO18145525、A1WO18154131、WO18175512、A1WO18192536、WO18192532、WO18196757、WO18208132、WO18233655、WO19034009、WO17007987、WO17046604、WO17066014、WO17077507、WO17123695、WO17127371、WO17128917、WO17190048、WO17106429、WO16019233、WO16057500、WO16065222、WO16066726、WO16106628、WO16106626、WO16106629、WO16109215、WO16106627、WO16106623、WO16106624、WO16106652、WO16112637、WO16161571、WO16161570、WO16196776、WO16196840、WO16192074、WO16210165、WO16109220、WO15017502、WO15002894、WO15022926、WO15048689、WO15048662、WO15061247、WO15084998、WO15095102、WO15095099、WO15116485、WO15169233、WO15165279、WO15132799、WO15039612、WO14104757、WO14113932、WO14114185、WO14113942、WO14116504、WO14130693、WO14164558、WO14151620、WO14152114、WO14161799、WO14187319、WO14210255、WO14005217、WO14025976、WO14039899、WO14055928、WO14055934、WO14068527、WO14078578、WO14082598、WO14082598、WO13067264、WO13081016、WO13102059、WO13116382、WO13148603、WO13152135、WO13185084、WO13067277、WO13067274、WO13059738、WO13010869、WO13010380、WO13010868、WO12170976、WO12135801、WO12021444、WO11153514、WO11152351、WO11029043、WO11029046、WO10126960、WO10056875、WO10009342、WO09156284、WO09098144、WO09053269、WO08121742、WO08039218、WO9954286，该公开内容这里做为参考引入。下表公开了BTK激酶抑制剂的具体实例。

激酶抑制剂可以靶向Syk(酪氨酸蛋白激酶SYK，也称为脾酪氨酸激酶，p72-Syk；UniprotKB-P43405)。Syk激酶抑制剂是众所周知的。例如，发表的期刊公布了这种Syk激酶抑制剂(Bartaula-Brevik et al，Expert Opin Investig Drugs.2018 Apr；27(4)：377-387；Liu et Mamorska-Dyga，J Hematol Oncol.2017；10：145，Geahlen，Trends PharmacolSci.2014 Aug；35(8)：414-22；Norman Expert Opin Ther Pat.2014May；24(5)：573-95)，该公开内容这里做为参考引入。专利申请也公开了Syk激酶抑制剂，例如，且非穷尽地：WO19034153、WO18053189、WO18053190、WO18108083、WO18228475、WO17046302、WO16010809、WO15138273、WO15140051、WO15140054、WO15140055、WO15144614、WO15017610、WO15061369、WO15094997、WO15095444、WO15095445、WO15100217、WO14051654、WO14048065、WO14060371、WO14064134、WO14074422、WO14086032、WO14093191、WO14100314、WO14176210、WO14176216、WO14023385、WO14027300、WO14031438、WO14029732、WO14045029、WO13192125、WO13192128、WO13192098、WO13192088、WO13047813、WO13052391、WO13052394、WO13052393、WO13064445、WO13099041、WO13104573、WO13104575、WO13109882、WO13124026、WO13126132、WO13124025、WO12002577WO12025187WO12025186、WO12061418、WO12123311、WO12123312、WO12130780、WO12151137、WO12154519、WO12154520、WO12154518、WO12167423、WO12167733、WO11086085、WO11014795、WO11014515、WO11075515、WO11075560、WO11079051、WO11092128、WO11112995、WO11117160、WO11134971、WO11144584、WO11144585、WO10068257、WO10068258、WO10097248、WO10147898、WO09131687、WO09136995、WO09145856、WO09031011、WO08033798、WO07129226、WO07042298、WO07042299、WO07028445、WO07009681、WO07009681、WO07085540、WO06093247、WO05033316、WO05026158、WO03063794、WO03057695、WO0183485、WO0147922、WO0109134、WO0075113，该公开内容这里做为参考引入。下表公开了Syk激酶抑制剂的具体实例。

在一个非常具体的方面，激酶抑制剂可以在下表中选择：

在一些实施例中，激酶抑制剂是EGFR抑制剂。例如，它可以选自吉非替尼(gefitinib)、厄洛替尼(erlotinib)、拉帕替尼(lapatinib)、凡德他尼(vandetanib)、阿法替尼(afatinib)、奥希替尼(osimertinib)、来那替尼(neratinib)、达可替尼(dacomitinib)、布加替尼(brigatinib)、卡纳替尼(canertinib)、纳夸替尼(naquotinib)、纳扎替尼(nazartinib)、培利替尼(pelitinib)、诺司替尼(rociletinib)和埃克替尼(icotinib)。

在一些实施方案中，受试者患有显示MAPK途径激活增加的癌症(即“与MAPK途径激活相关的癌症”)。如本文所用，作为一种表达水平或活动水平的增加的表达或活性相对于参考表达水平或参考活性水平而言至少10％、至少20％、至少30％、至少40％、至少50％、至少100％、至少200％、至少300％或更多。用于确定MAPK途径的特定成分的表达水平是否增加的方法是本领域众所周知的，并且包括基于确定相应组分的mRNA水平的方法(例如，Northern印迹、RT-PCR等)和基于测定相应组分的蛋白质水平的方法(例如，ELISA、Western印迹等)。用于确定MAPK途径的一种或多种组分的活性是否增加的方法是基于对不同组分的活性的测定并且为本领域技术人员所熟知。用于确定MAPK途径活性的合适方法包括，例如，检测磷酸化ERK(phosphorylated ERK)(MAPK)蛋白以及磷酸化ERK(phosphoERK)与ERK的比率。

在一些实施方案中，受试者患有以MAPK途径中涉及的蛋白质中存在至少一个突变为特征的癌症。通常，癌症的特征在于酪氨酸激酶受体(例如FGFR1、FGFR2、FGFR3、EGFR、HER2、IGF-1R cMET……)、BRAF、RAS、CRAF、CCND1、CDK4、MAP2K1、MAP2K2、NRAS、KRAS HRAS、PTEN、PIK3CA和P16中的至少一个突变。

在一些实施方案中，受试者患有EGFR突变的癌症。如本文所用，术语“EGFR”在本领域具有其普遍含义并且是指表皮生长因子受体。EGFR是一种众所周知的跨膜蛋白，它是表皮生长因子家族(EGF家族)的细胞外蛋白配体成员的受体。表皮生长因子受体是ErbB受体家族的成员，是由四种密切相关的受体酪氨酸激酶组成的亚家族：EGFR(ErbB-1)、HER2/neu(ErbB-2)、Her 3(ErbB-3)和Her 4(ErbB-4)。如本文所用，“EGFR突变的癌症”的表述是指其中癌细胞包含EGFR中的激活突变的癌症。EGFR中的许多突变是已知的，通常包括L858R、T790M和C797S。

在一些实施方案中，受试者患有ALK突变的癌症。如本文所用，术语“ALK”在本领域具有其普遍含义并且指参与细胞生长的间变性淋巴瘤激酶(anaplastic lymphomakinase)(ALK)。在某些类型的癌症中发现了突变(改变)形式的ALK基因和蛋白质，包括神经母细胞瘤、非小细胞肺癌和间变性大细胞淋巴瘤。这些变化可能会增加癌细胞的生长。如本文所用，“ALK突变的癌症”的表述是指其中癌细胞包含ALK中的激活突变的癌症。ALK中的许多突变是已知的。ALK突变是众所周知的，存在三种类型的ALK突变：重排(ALK-R)、扩增(ALK-A)和点突变。已鉴定出几种赋予耐药性的点突变，包括：C1156Y、L1196M、G1269A、F1174L、1151Tins、L1152R、S1206Y、I1171T、G1202、D1203N和V1180L。

在一些实施方案中，受试者患有RAS突变的癌症。此处所用术语“RAS”代表RAS家族蛋白的任何成员或其突变体。Ras家族蛋白包括但不限于HRAS、KRAS和NRAS，以及该亚家族的其他成员：DIRAS1、DIRAS2、DIRAS3、ERAS、GEM、MRAS、NKIRAS1、NKIRAS2、NRAS、RALA、RALB、RAP1A、RAP1B、RAP2A、RAP2B、RAP2C、RASD1、RASD2、RASL10A、RASL10B、RASL11A、RASL11B、RASL12、REM1、REM2、RERG、RERGL、RRAD、RRAS、RRAS2(Wennerberg等人，The Rassuperfamily at a glance，J.Cell.Sci.，2005，118(Pt 5)，843-846)。因此，“突变-RAS癌症”的表述是指其中癌细胞包含Ras蛋白中的激活突变的癌症。特别是，受试者患有NRAS突变的癌症。NRAS中的许多突变是已知的，通常包括Q61R、Q61K、Q61H、Q61L、Q61N、Q61E、Q61P、A146T、A146P或A146V。

在一些实施例中，受试者患有RAF突变的癌症。此处所用术语“RAF”代表Raf家族蛋白的任何成员或其突变体。RAF家族蛋白包括但不限于A-RAF、B-RAF和C-RAF。因此，“突变的RAF癌症”的表述是指其中癌细胞包含Raf蛋白中的激活突变的癌症。特别是，受试者患有BRAF突变的癌症。BRAF的一些突变是已知的。特别是V600E突变很突出。已发现的其他突变是R461I、I462S、G463E、G463V、G465A、G465E、G465V、G468A、G468E、N580S、E585K、D593V、F594L、G595R、L596V、T598I、V599D、V599E、V599K、V579VR、V600E、A727V，而这些突变中的大多数都聚集到两个区域：N叶富含甘氨酸的P环和激活段及侧翼区域。正如本领域已知的，已知几种基于PCR和/或测序的方法可用于检测MAPK途径中的突变，并且在一些期刊文章和美国专利中有所提到，包括但不限于Brose等人，Cancer Research 62：6997-7000(2002)，Solit等人，Cancer Research 70(14)：5901-5911(1010)，Xu等人，Cancer research 63：4561-4567(2003)，以及美国专利第7,745，128号和几种市售试剂盒(参见Dxs DiagnosticInnovations、Applied Biosystems和Quest diagnostics)。

各种癌症也包括在本发明的范围内，包括但不限于以下：膀胱癌(包括加速和转移性膀胱癌)、乳腺癌、结肠癌(包括结肠直肠癌)、肾癌、肝癌、肺癌(包括小细胞和非小细胞肺癌和肺腺癌)、卵巢癌、***癌、睾丸癌、泌尿生殖道癌、淋巴***癌、直肠癌、喉癌、胰腺癌(包括外分泌胰腺癌)、食道癌、胃癌、胆囊癌、子***、甲状腺癌和皮肤癌(包括鳞状细胞癌)；淋巴系的造血肿瘤，包括白血病、急性淋巴细胞白血病、急性淋巴细胞性白血病、B细胞淋巴瘤、T细胞淋巴瘤(包括皮肤或外周T细胞淋巴瘤)、霍奇金淋巴瘤、非霍奇金淋巴瘤、毛细胞淋巴瘤、组织细胞淋巴瘤和伯克茨淋巴瘤；髓系造血肿瘤，包括急性和慢性髓性白血病、骨髓增生异常综合征、髓性白血病和早幼粒细胞白血病；中枢和外周神经***肿瘤，包括星形细胞瘤、神经母细胞瘤、神经胶质瘤和神经鞘瘤；间叶来源的肿瘤，包括纤维肉瘤、横纹肌肉瘤和骨肉瘤；其他肿瘤包括黑色素瘤、色素异皮病瘤、角化棘皮瘤、***瘤、甲状腺滤泡瘤和畸胎瘤；黑色素瘤、不可切除的III期或IV期恶性黑色素瘤、鳞状细胞瘤、小细胞肺瘤、非小细胞肺瘤、神经胶质瘤、胃肠道瘤、肾瘤、卵巢瘤、肝瘤、结直肠瘤、子宫内膜瘤、肾瘤、***瘤、甲状腺瘤、神经母细胞瘤、胰腺瘤、多形性胶质母细胞瘤、宫颈瘤、胃瘤、膀胱瘤、肝瘤、乳腺瘤、结肠癌和头颈瘤、视网膜母细胞瘤、胃瘤、生殖细胞肿瘤、骨瘤、骨肿瘤，成人骨恶性纤维组织细胞瘤；儿童骨恶性纤维组织细胞瘤、肉瘤、小儿肉瘤；骨髓增生异常综合征；神经母细胞瘤；睾丸生殖细胞肿瘤、眼内黑色素瘤、骨髓增生异常综合征；骨髓增生异常/骨髓增生性疾病，滑膜肉瘤。

在一些实施方案中，癌症是实体瘤。例如，癌症可以是肉瘤和骨肉瘤，例如卡波西肉瘤、艾滋病相关的卡波西肉瘤、黑色素瘤，特别是葡萄膜黑色素瘤，以及头颈癌、肾癌、卵巢癌、胰腺癌、***癌、甲状腺癌、肺癌、食道癌、乳腺癌，特别是三阴性乳腺癌(TNBC)、膀胱癌、结肠直肠癌、肝癌和胆道癌、子宫癌、阑尾癌和***、睾丸癌、胃肠道癌和子宫内膜癌和腹膜癌。优选地，癌症可以是肉瘤、黑色素瘤，特别是葡萄膜黑色素瘤，以及头颈癌、肾癌、卵巢癌、胰腺癌、***癌、甲状腺癌、肺癌、食道癌、乳腺癌特别是(TNBC)、膀胱癌、结肠直肠癌、肝癌、***、子宫内膜癌和腹膜癌。

在一些实施方案中，癌症可以选自白血病、淋巴瘤、肉瘤、黑色素瘤以及头颈癌、肾癌、卵巢癌、胰腺癌、***癌、甲状腺癌、肺癌、食道癌、乳腺癌、膀胱癌、脑癌、结直肠癌、肝癌和***组成的组。

在一些实施方案中，癌症可以选自肺癌，特别是非小细胞肺癌，白血病，特别是急性髓性白血病，慢性淋巴细胞白血病，淋巴瘤，特别是外周T细胞淋巴瘤，慢性髓细胞性白血病、头颈部鳞状细胞癌、具有BRAF突变的晚期黑色素瘤、结肠直肠癌、胃肠道间质瘤、乳腺癌，尤其是HER²⁺乳腺癌、甲状腺癌，尤其是晚期甲状腺髓样癌、肾癌，尤其是肾细胞癌、***癌、神经胶质瘤、胰腺癌，特别是胰腺神经内分泌癌、多发性骨髓瘤和肝癌，特别是肝细胞癌组成的组。

特别是，受试者患有肺癌。如本文所用，术语“肺癌”在本领域具有其普遍含义，是指肺组织中涉及不受控制的细胞生长的疾病，在某些情况下会导致转移。大多数原发性肺癌是源自上皮细胞的肺癌。肺癌的主要类型是小细胞肺癌(SCLC)和非小细胞肺癌(NSCLC)。在一个具体实施方案中，受试者患有非小细胞肺癌。此处所用术语“非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer)”，也称为非小细胞肺癌(non-small cell lung carcinoma，NSCLC)，是指除小细胞肺癌(SCLC)之外的上皮性肺癌。主要有三种亚型：腺癌、肺鳞状细胞癌和大细胞肺癌。其他不太常见的非小细胞肺癌类型包括多形性、类癌、唾液腺癌和未分类癌。腺癌约占肺癌的40％，是在不吸烟人群中最常见的肺癌类型。鳞状细胞癌约占肺癌的25％。肺鳞状细胞癌在男性中比在女性中更常见，与其他类型的肺癌相比，它与吸烟史的相关性甚至更高。肺鳞状细胞癌至少有四种类型(***状、小细胞、透明细胞和基底样)。大细胞肺癌是一种起源于肺上皮细胞转化的异质性恶性肿瘤。大细胞肺癌是在光镜下缺乏小细胞癌、鳞状细胞癌或腺癌特征的癌。NSCLC可以使用肿瘤-***-转移(TNM)分期***进行分类。参考文献Spira J&Ettinger，D.S.Multiprofiling management oflung cancer，NEngl J Med，350：382-(2004)(以下简称Spira)；Greene F L、Page D L、Fleming I D、Fritz A G、Balch C M、Haller D G等人(编).AJCC Cancer Staging Manual(第6版)。纽约：Springer-Verlag，2002年：167-77(以下简称Greene)；Sobin L H，Wittekind C H(编辑).国际抗癌联盟.恶性肿瘤的TNM分类(第6版)。纽约：Wiley-Liss(2002)(以下简称Sobin)。因此，在一些实施方案中，肺癌可被分层为前述任何阶段(例如，潜隐性、0期、IA期、IB期、IIA期、IIB期、IIIA期、IIIB期或IV期)。更具体地，受试者患有如上所述的EGFR突变的NSCLC或ALK突变的NSLC。

特别地，受试者患有黑色素瘤，特别是转移性黑色素瘤。如本文所用，“黑色素瘤”是指一种以皮肤和其他器官的黑素细胞***产生的肿瘤生长为特征的病症。大多数黑色素细胞存在于皮肤中，但也存在于脑膜、消化道、***和眼睛中。当黑色素瘤出现在皮肤时，它被称为皮肤黑色素瘤。黑色素瘤也可能出现在眼睛，称为眼部或眼内黑色素瘤。黑色素瘤很少发生在脑膜、消化道、***或其他发现黑色素细胞的区域。40-60％的黑色素瘤携带一种激活突变BRAF。

在一些实施方案中，如果激酶抑制剂是EGFR抑制剂，则癌症优选选自肺癌，特别是非小细胞肺癌、胰腺癌、乳腺癌，特别是早期乳腺癌、甲状腺癌、特别是甲状腺髓样癌、结直肠癌，特别是转移性或晚期结直肠癌、头颈部鳞状细胞癌和神经胶质瘤组成的组。如果激酶抑制剂是ALK抑制剂，则癌症优选为非小细胞肺癌。如果激酶抑制剂是B-Raf抑制剂，则癌症优选选自黑色素瘤、肺癌、结肠直肠癌和胃肠道间质癌。如果激酶抑制剂是MEK抑制剂，则癌症优选为黑色素瘤或肺癌。如果激酶抑制剂是FGFR抑制剂，则癌症优选选自甲状腺癌、结肠直肠癌和胃肠道间质癌。如果激酶抑制剂是FLT3抑制剂，则癌症优选选自肾癌、胰腺癌，尤其是胰腺神经内分泌肿瘤、胃肠道间质癌、多发性骨髓瘤、***癌、白血病如急性髓性白血病和慢性淋巴细胞白血病和淋巴瘤组成的组。如果激酶抑制剂是JAK抑制剂，则癌症优选选自淋巴瘤，尤其是外周T细胞淋巴瘤、骨髓增生性肿瘤、多发性骨髓瘤、胰腺癌和***癌组成的组。如果激酶抑制剂是PDGFR抑制剂，癌症优选选自白血病，例如费城染色体阳性慢性髓细胞白血病、胃肠道间质癌、骨髓增生异常和骨髓增生综合征、结肠直肠癌、肾癌、胰腺癌、特别是胰腺神经内分泌肿瘤、肝癌、乳腺癌和甲状腺癌组成的组。如果激酶抑制剂是RET抑制剂，则癌症优选是肾癌或甲状腺癌，例如甲状腺髓样癌。如果激酶抑制剂是AXL抑制剂，则癌症优选选自白血病，特别是急性白血病例如急性髓细胞白血病或费城染色体阳性慢性髓细胞白血病、肾癌和肺癌例如NSCLC组成的组。如果激酶抑制剂是Trk抑制剂，则癌症优选是转移性实体癌。如果激酶抑制剂是ROS1抑制剂，则癌症优选选自肺癌如NSCLC和肾癌组成的组。如果激酶抑制剂是BTK抑制剂，则癌症优选选自B细胞癌，例如慢性淋巴细胞白血病(CLL)和非霍奇金淋巴瘤组成的组。如果激酶抑制剂是Syk抑制剂，则癌症优选是淋巴瘤，尤其是外周T细胞淋巴瘤。

如本文所用，术语“法尼基转移酶抑制剂(famesyltransferase inhibitor)”可以在最广义上理解为防止法尼基残基酶催化转移至底物的分子。在此，被法尼基化的底物通常是长度至少为四个氨基酸的多肽。酶催化法尼基化的多肽优选包括CAAX-序列基序，其中C代表半胱氨酸部分，A代表脂肪族氨基酸部分，X代表由催化法尼基化的酶鉴定的另一个氨基酸部分。如本文所用，法尼基残基酶催化转移描述了一种生化反应，其中法尼基残基转移至底物，优选是多肽。催化法尼基残基向底物转移的酶称为法尼基转移酶。在这种情况下，通常会转移活化的法尼基。活化的法尼基优选为法尼基二磷磷酸(farnesylpyrophosphate，FPP)。通常，代表底物的多肽被法尼基化为半胱氨酸部分。因此产生了硫醇酯(thiolester)。术语“硫醇酯”和“硫代酯”是可互换的，并且描述了R1-CO-S-R2基团，其中硫醇酯还可以包含酯R1-COH＝S-R2的同分异构体形式。优选地，可以被法尼基化的半胱氨酸部分定位在蛋白质的C末端附近。特别优选地，CAAX-序列基元的半胱氨酸部分被法尼基化，其中C代表半胱氨酸部分，A代表脂肪族氨基酸部分，X代表由催化法尼基化的酶鉴定的另一个氨基酸部分。

催化法尼基化的酶优选是法尼基转移酶(FTase)，其代表酶分类号为EC 2.5.1.X，更优选为EC 2.5.1.29、EC 2.5.1.58或EC 2.5.1.59，甚至更优选为EC 2.5.1.29或EC2.5.1.58的异戊二烯转移酶(prenyltransferase)。该酶通常结合一个或几个锌离子(Zn² ⁺)。根据本发明，香叶酰香叶酰转移酶(Geranylgeranyltransferase)也可以有效作为法尼基转移酶，因为这种酶也能够使特定的多肽法尼基化。

能够减慢或防止催化法尼基化的每种物质或每种分子组合物都可以是法尼基转移酶抑制剂。优选地，法尼基化率的减慢可以理解为与不添加法尼基转移酶抑制剂的类似反应环境相比，通过在作用位点添加合适浓度的法尼基转移酶抑制剂，减慢大于10％，更优选大于25％，甚至更优选大于50％，甚至更优选大于75％，甚至优先大于80％，甚至更优选大于90％，最优选大于95％。

更重要的是，法尼基转移酶抑制剂抑制RhoB的法尼基化。如本文所用，术语“RhoB”具有其在本领域中的普遍含义，是指ras同源基因家族，成员B是一种在人类中由RHOB基因编码的蛋白质。

在一些实施方案中，法尼基转移酶抑制剂可以是一种抗代谢物，例如，示例性的法尼醇(analogue of farnesole)、法尼基磷酸盐(farnesylphosphate)、法尼基二磷酸盐(farnesyldiphosphate)或底物肽的类似物。法尼基转移酶抑制剂也可以是具有不同结构的分子，其可以结合到肽底物或法尼基二磷酸盐的结合袋中。另外，法尼基转移酶抑制剂可以是变构抑制剂。

在一些实施方案中，法尼基转移酶抑制剂可以具有任何分子结构。例如，它可以是肽试剂、仿肽剂或非肽小分子试剂。肽试剂主要由肽组成。然而，肽可以与其他分子结构共轭，例如，示例性地与有机的、生物相容的聚合物(例如，聚乙二醇(PEG)、聚乙烯亚胺(PEI)、羟丙基甲基丙烯酰胺(HPMA))，共轭，与脂质、烷基部分或其他多肽共轭。仿肽剂是一种分子结构模仿肽的药剂。仿肽剂可包含例如β-氨基酸(1氨基酸)、γ-氨基酸(γ-氨基酸)或D-氨基酸，或它可以由这些或由其中几种的组合制成。仿肽剂也可以与其他分子结构共轭，例如有机生物相容性聚合物。仿肽剂也可以是逆反肽。小分子试剂是分子量小于1500Da、优选小于1000Da、甚至更优选小于500Da的分子。小分子试剂也可以与其他分子结构共轭，例如，示例性地与有机生物相容性聚合物共轭。

在一些实施方案中，法尼基转移酶抑制剂选自R11577(Zamestra，替匹法尼)、SCH66336(Lonafamib)、FTI-277、GGTI-298、BMS-214664、L-778和L-123组成的组。

在一些实施方案中，本发明的法尼基转移酶抑制剂是替匹法尼(Tipifamib)。如本文所用，术语“替匹法尼(Tipifamib)”，还以商标名称

(J&JPRD)闻名，是指FTase抑制剂(R)-6-[氨基(4-氯苯基)(1-甲基-1H-咪唑-5)-基)甲基]-4-(3-氯苯基)-1-甲基-2(1H)-喹啉酮(FTase inhibitor(R)-6-[amino(4-chlorophenyl)(1-methyl-1H-imidazol-5-yl)methyl]-4-(3-chloroph enyl)-l-methyl-2(1H)-quinolinone)(也称为R1 15777)，其结构如下所示：

如本文所用，术语“联合用药(combination)”旨在指提供第一种药物和另一种(第二种、第三种......)药物的所有给药形式。这些药物可以同时、单独或相继给药，也可以按任何顺序给药。联合给药的药物在给药的对象中具有生物活性。在本发明的范围内，这样一种联合用药包括至少两种不同的药物，并且其中一种药物至少是激酶抑制剂，而另一种药物是法尼基转移酶抑制剂。在一些情况下，本发明的联合用药导致癌细胞的合成致死率，特别是DTC。

“治疗有效量”指的是必要的剂量和时间段内的有效量，以达到预期的治疗效果。治疗有效量的药物可能根据不同的因素而变化，如疾病状态、年龄、性别和个体的重量，以及药物在个体中引起预期反应的能力。治疗有效量也是其中抗体或抗体部分的任何毒性或有害作用被治疗上的有益作用所抵消。药物的有效剂量和给药方案取决于要治疗的疾病或病症，可由本领域技术人员确定。具有本领域普通技术的医生可以很容易地确定并开出所需的药物组合物的有效量。例如，医生可以开始在药物组合中使用的药物剂量低于为达到预期治疗效果所需要的剂量，然后逐渐增加剂量，直到达到预期效果。一般而言，本发明组合物的合适剂量是指根据特定的给药方案产生有效治疗效果的最低有效剂量的化合物的量。这种有效剂量通常取决于上述因素。例如，用于治疗用途的治疗有效量可以通过其稳定疾病进展的能力来衡量。治疗有效量的治疗化合物可以减小受试者的肿瘤大小，或以其他方式改善受试者的症状。本领域的普通技术人员将能够基于如受试者的体型、受试者症状的严重性和所选择的特定组合物或给药途径等因素来确定这种量。药物的治疗有效量的一个示例性、非限制性范围是约0.1-100mg/kg、例如约0.1-50mg/kg、例如约0.1-20mg/kg、例如约0.1-10mg/kg、例如约0.5、例如约0.3、约1、约3mg/kg、约5mg/kg或约8mg/kg。本发明抗体的治疗有效量的一个示例性、非限制性范围是0.02-100mg/kg、例如约0.02-30mg/kg、例如约0.05-10mg/kg或0.1-3mg/kg、，例如约0.5-2mg/kg。给药方式可以是静脉注射、肌肉注射、腹腔注射或皮下注射，并例如在靶位点附近给药。调整上述治疗方法和使用中的剂量方案以提供最佳的预期反应(例如治疗反应)。例如，可以施用单一的栓剂，可以在一段时间内施用几个分次的剂量，也可以根据治疗情况的紧急情况，按比例减少或增加剂量。在一些实施方案中，在治疗期间，例如在预定的时间点，监测治疗的疗效。作为非限制性实例，根据本发明的治疗可以作为本发明药剂的每日剂量提供，其量约为0.1-100mg/kg，例如0.2、0.5、0.9、1.0、1.1、1.5、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、40、45、50、60、70、80、90或100mg/kg，每天，在第1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39或40天中的至少一天，或者在治疗开始后1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20周中的至少一周，或其任何组合，每24、12、8、6、4或2小时使用一次或分次剂量，或其任何组合。

通常，本发明的药物以包含药学上可接受的载体的药物组合物的形式施用于受试者。可用于这些组合物的药学上可接受的载体包括但不限于离子交换剂、氧化铝、硬脂酸铝、卵磷脂、血清蛋白如人血清白蛋白、缓冲物质如磷酸盐、甘氨酸、山梨酸、山梨酸钾、饱和植物脂肪酸的部分甘油酯混合物、水、盐或电解质，例如鱼精蛋白硫酸盐(protaminesulfate)、磷酸氢二钠、磷酸氢钾、氯化钠、锌盐、胶体二氧化硅、三硅酸镁、聚乙烯吡咯烷酮、纤维素基物质、聚乙二醇、羧甲基纤维素钠、聚丙烯酸酯、蜡、聚乙烯-聚氧丙烯-嵌段聚合物、聚乙二醇和羊毛脂肪。为了用于给药于受试者，该组合物将配制用于给受试者施用。本发明的组合物可以口服、肠外、通过吸入喷雾、局部、直肠、鼻腔、口腔、***或通过植入储物器给药。本发明使用包括皮下、静脉内、肌肉内、关节内、滑膜内、胸骨内、鞘内、肝内、病灶内和颅内注射或输注技术。本发明组合物的无菌可注射形式可以是水性或油质悬浮液。这些悬浮液可以根据本领域已知的技术使用合适的分散剂或润湿剂和悬浮剂来配制。无菌可注射制剂也可以是在无毒的肠胃外可接受的稀释剂或溶剂中的无菌可注射溶液或悬浮液，例如作为在1，3-丁二醇中的溶液。可以使用的可接受的载体和溶剂包括水、林格式溶液(Ringer′s solution)和等渗氯化钠溶液。此外，无菌的不挥发油通常用作溶剂或悬浮介质。为此目的，可以使用任何温和的不挥发油，包括合成的甘油单酯或甘油二酯。脂肪酸，例如油酸及其甘油酯衍生物可用于制备注射剂，天然药学上可接受的油，例如橄榄油或蓖麻油，尤其是它们的聚氧乙基化形式。这些油溶液或悬浮液还可以含有长链醇类稀释剂或分散剂，例如羧甲基纤维素或类似的分散剂，它们通常用于药学上可接受的剂型包括乳剂和悬浮剂的制剂中。其他常用的表面活性剂，例如Tweens、Spans和其他乳化剂或生物利用度增强剂，它们通常用于制备药学上可接受的固体、液体或其他剂型，也可用于制剂的目的。本发明的组合物可以任何口服可接受的剂型口服给药，包括但不限于胶囊、片剂、水性悬液或溶液。在口服片剂的情况下，常用的载体包括乳糖和玉米淀粉。通常还添加润滑剂，例如硬脂酸镁。对于胶囊形式的口服给药，有用的稀释剂包括例如乳糖。当需要口服水性悬液时，活性成分与乳化剂和助悬剂组合。如果需要，也可以添加某些甜味剂、调味剂或着色剂。另外，本发明的组合物可以以直肠给药的栓剂的形式给药。这些可以通过将药剂与合适的非刺激性赋形剂混合来制备，该赋形剂在室温下为固体，但在直肠温度下为液体，因此会在直肠中融化以释放药物。此类材料包括可可脂、蜂蜡和聚乙二醇。本发明的组合物也可以局部给药，特别是当治疗目标包括容易通过局部给药接触到的区域或器官时，包括眼睛、皮肤或下肠道疾病。很容易为这些区域或器官中的每一个制备合适的局部制剂。对于局部应用，可以将组合物配制成合适的软膏剂，其中含有悬浮或溶解在一种或多种载体中的活性成分。用于本发明化合物的局部给药的载体包括但不限于矿物油、液体凡士林、白凡士林、丙二醇、聚氧乙烯、聚氧丙烯化合物、乳化蜡和水。另外，可以将组合物配制成合适的洗剂或乳膏剂，其中含有悬浮或溶解在一种或多种药学上可接受的载体中的活性成分。合适的载体包括但不限于矿物油、山梨醇酐单硬脂酸酯、聚山梨酯60、十六烷基酯蜡、鲸蜡硬脂醇(cetearyl alcohol)、2-辛基十二烷醇、苯甲醇和水。下肠道的局部应用可以在直肠栓剂制剂(见上文)或合适的灌肠剂制剂中实现。也可以使用药贴。本发明的组合物也可以通过鼻喷雾或吸入给药。此类组合物根据制药工艺领域中众所周知的技术制备并且可以制备成盐溶液，使用苯甲醇或其他合适的防腐剂、吸收促进剂以提高生物利用度、碳氟化合物和/或其他常规增溶剂或分散剂。例如，本发明的药物组合物中存在的抗体可以以10mg/mL的浓度提供在100mg(10mL)或500mg(50mL)的一次性小瓶中。该产品配制成用于静脉给药的9.0mg/mL氯化钠、7.35mg/mL二水柠檬酸钠、0.7mg/mL聚山梨醇酯80和无菌注射用水。将pH调节至6.5。本发明药物组合物中抗体的示例性合适剂量范围可以在约1mg/m²和500mg/m²之间。然而，应当理解，这些方案是示例性的，并且考虑到必须在临床试验中确定的药物组合中特定抗体的亲和力和耐受性，可以调整最佳时间表和方案。本发明的注射用药组合物(例如，肌肉内注射，静脉注射)可以制备成含有无菌缓冲水(例如，1ml用于肌肉内)，本发明抑制剂在约1ng至约100mg之间，例如约50ng至约30mg或更优选约5mg至约25mg。

本发明的另一个目的涉及包含法尼基转移酶抑制剂和激酶抑制剂的药物组合物或试剂盒(kit)(分试剂盒(kit-of-parts))，特别是用于治疗癌症。

此处所用术语“试剂盒”、“产品”或“组合制剂”，特别定义“分试剂盒”，意思是如上定义的组合搭配可以独立给药或通过使用不同的固定组合给药显著数量，即同时或在不同时间点。然后可以例如同时或按时间交错施用分试剂盒的各部分，即在不同的时间点，并且对于分试剂盒的任何部分具有相等或不同的时间间隔。在组合制剂中给药的组合搭配的总量的比例可以变化。组合搭配可以通过相同的途径或不同的途径给药。

本发明将通过以下附图和实施例进一步说明。然而，这些实施例和附图不应以任何方式解释为限制本发明的范围。

附图说明

图1.FTi而不是GGTi可防止几种TKI敏感模型的复发。用1μM厄洛替尼(Erlotinib)加或不加FTi(替匹法尼(Tipifaruib)，1μM)、GGTi(GGTi-298，1μM)或TatC3(2μg/ml)(A-C)或替匹法尼0.1μM(D-F)处理GFP转导的EGFR突变细胞系，并通过荧光检测跟踪反应以及复发情况。(G-H)。GFP转导的H3122(ALK易位NSCLC细胞系)或A375(BRAF突变的黑色素瘤细胞系)分别用替匹法尼0.1μM与艾乐替尼(Alectinib)(2μM)或威罗菲尼(Vemurafenib)(5μM)联合治疗，并通过荧光检测跟踪反应以及复发情况。

图2.(A)肿瘤体积在治疗中的变化。(B)最佳反应(45天)时肿瘤大小与基线的变化。(C)Kaplan-Meier无进展生存图。(D)Kaplan-Meier总体生存图。(E)治疗期间小鼠体型的变化。

具体实施方式

体外：

我们最近报道了RAS相关的GTP酶RHOB在用EGFR-TKI处理的EGFR突变的肺癌细胞中通过AKT途径预防细胞死亡方面具有关键作用¹⁸。我们发现，高RHOB肿瘤水平预示着接受EGFR-TKI治疗的携带EGFR激活突变的NSCLC患者的早期复发。在用BRAF抑制剂威罗替尼(vemurafenib)治疗的BRAF突变黑色素瘤中也是如此¹⁹，这表明RHOB途径可能是一种对受体酪氨酸激酶(RTK)-ERK途径抑制的常见适应性机制，可能诱导获得DTC状态。我们还在EGFR-TKI治疗后确定了一种与体外药物耐受性相关的新表型，该表型与已知的治疗诱导衰老(TIS)²⁰过程有一些共同的特征，但也显示出一些特定特征(数据未显示)。因此，我们将这种表型称为“类似衰老”。这些观察结果来自于一组EGFR突变肺细胞系(这些细胞系之前被克隆以避免在群体中存在潜在的耐药亚克隆)中DTC状态的广泛表型表征，包括充分描述的PC9和HCC827、HCC4006、H3255和HCC2935，它们都显示出对EGFR-TKI的初始敏感性，但尚未表征它们响应EGFR-TKI产生DTC的能力。令人惊讶的是，尽管所有这些细胞系都能够在EGFR-TKI治疗(1μM厄洛替尼或奥希替尼)几天后产生DTC，但我们观察到细胞系内和细胞系间的几个关键参数，如细胞***率/细胞停滞或增殖克隆发生动力学等，存在高变异性。例如，PC9、HCC827和HCC4006在厄洛替尼治疗后能够产生增殖抗性克隆，但我们从未在HCC2935和H3255细胞系中观察到厄洛替尼处理后的抗性克隆(数据未显示)。

尽管存在这些差异，我们还观察到，在治疗过程中，各细胞系中DTC状态的一个共同特征是细胞形状重组，主要是扁平和扩大的形态，与TIS过程一致(数据未显示)。我们进一步研究了这些形态学变化，并观察到TKI治疗开始几天后肌动蛋白应力纤维产生明显增加(数据未显示)。肌动蛋白聚合是一个受到GTP酶协调的紧密调节过程。鉴于我们对RHOB在靶向治疗耐药中的作用的了解，我们评估了这种GTP酶是否可能负责产生应激纤维以响应EGFR-TKI。我们首先观察到，在所有细胞系的DTC中，RHOB蛋白表达和活性都高度增加，而RHOA和RHOC被强烈抑制(数据未显示)。我们还发现siRNA对RHOB的特异性抑制以及使用C3外酶(tatC3)对RHO-GTP酶的药理学抑制不仅强烈降低肌动蛋白应力纤维的产生，而且还强烈降低DTC存活率，这表明肌动蛋白重塑和药物之间存在联系-公差(数据未显示)。

RHOB没有临床相容的特异性抑制剂，但其活性取决于其异戊烯化状态(法尼基化或香叶酰香叶酰化(geranylgeranylated))，因此可以被法尼基转移酶抑制剂(FTi)或香叶酰香叶酰转移酶抑制剂(GGTi)靶向^21-23。因此，我们决定在体外确定FTi或GGTi联合厄洛替尼在几种EGFR突变细胞系(PC9、HCC827和HCC4006)中的疗效。与1μM的GGTI 298组合并不能阻止耐药增殖克隆的出现(图1A-C)，而与FTi替匹法尼的合用1μM(图1A-C)和0.1μM(图1D-F)均能有效地消除所有耐药细胞，完全阻止耐药克隆的出现。有趣的是，在其他致癌模型中也观察到了类似的结果，例如用艾乐替尼处理的ALK易位肺癌细胞(例如H3122)(图1G)或用威罗菲尼处理的BRAF突变的黑色素瘤细胞(A375)(图1H)，这表明与替匹法尼联合治疗可能会干扰其他靶向(RTK)-ERK途径的靶向治疗。

单独使用0.1μM的替匹法尼对PC9和HCC827细胞生长几乎没有影响(数据未显示)，但对HCC4006(数据未显示)、A375和H3122显示了一些细胞抑制作用，替匹法尼使用1μM时这种作用加剧(数据未显示)。重要的是，替匹法尼(0.1μm)和厄洛替尼(1μm)的组合导致完全细胞死亡，在治疗几天后没有剩余的DTC(数据未显示)。有趣的是，第三代EGFR-TKI奥希替尼也观察到了相同的结果，该药物现在将用作携带EGFR突变的NSCLC患者的标准一线治疗(数据未显示)。

总之，我们的体外数据强烈表明，抑制法尼基转移酶(而不是香叶酰香叶酰转移酶)可以防止在不同的致癌背景下酪氨酸激酶抑制剂耐药性的出现。令人兴奋的是，最近发表的一项I期临床试验报告称，厄洛替尼和替匹法尼联合使用对患者具有良好的耐受性²⁴，但联合使用的有效性并不具有指示性，因为该研究没有在EGFR突变的NSCLC患者中进行。

体内

将先前描述的EGFRL858R/T790M肺患者衍生异种移植模型(TP103，Pax Ares实验室，CNIO Madrid)皮下植入6-8周大的NSG小鼠(Charles River)并允许肿瘤建立，大小(平均300-350mm3)进行匹配，然后将小鼠随机分配到以下组：媒介物(n＝3)、替匹法尼(n＝3)、奥希替尼(n＝6)和奥希替尼+替匹法尼(n＝6)。替匹法尼以80mg/Kg每天2次，5天/周通过口服管饲法给药，奥希替尼以5mg/Kg每天一次，5天/周通过口服管饲法给药。肿瘤大小通过卡尺测量肿瘤长度和宽度来确定，肿瘤体积计算为＝0.5236×长度×宽度2(mm)，并小鼠每周称重一次。GraphPad Prism(GraphPad软件)进行未配对的双尾t检验或Mantel-Cox进行PFS和OS图(图2A至2E)。

参考文献：

在整个本申请中，各种参考文献描述了本发明所涉及的现有技术。这些参考文献的公开内容在此通过引用并入本公开。

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Claims

1.一种治疗有需要的受试者癌症的方法，该方法包括向受试者施用治疗有效的组合物，所述组合物含有激酶抑制剂和法尼基转移酶抑制剂。

2.一种延缓和/或预防受试者对激酶抑制剂耐药的癌症的发展的方法，该方法包括向受试者施用治疗有效量的激酶抑制剂与法尼基转移酶抑制剂的组合物。

3.一种治疗有需要的受试者对激酶抑制剂耐药的癌症的方法，该方法包括向受试者施用治疗有效量的法尼基转移酶抑制剂。

4.一种预防癌症受试者对施用的激酶抑制剂产生耐药性的方法，该方法包括向受试者施用治疗有效量的法尼基转移酶抑制剂。

5.法尼基转移酶抑制剂抑制或预防癌症宿主细胞的增殖的用途，从而预防或延迟癌症复发和/或对激酶抑制剂疗法的获得性耐药性的出现。

6.根据前述任意一项权利要求所述的方法，其中，所述激酶抑制剂是靶向选自EGFR家族、ALK、B-Raf、MEK、FGFR1、FGFR2、FGFR3、FGFR4、FLT3、IGF1R、c-Met、JAK家族、PDGFRα和β、RET、AXL、c-KIT、TrkA、TrkB、TrkC、ROS1、BTK和Syk组成的列表中选择的一个或多个靶的抑制剂。

7.根据权利要求6所述的方法，其中，所述激酶抑制剂选自由吉非替尼、厄洛替尼、拉帕替尼、凡德他尼、阿法替尼、奥希替尼、来那替尼、达可替尼、布加替尼、卡纳替尼、纳夸替尼、纳扎替尼、培利替尼、诺司替尼、埃克替尼、AZD3759、AZ5104(CAS No 1421373-98-9)、波齐替尼、WZ4002、克唑替尼、恩曲替尼、色瑞替尼、艾乐替尼、劳拉替尼、TSR-011、CEP-37440、恩沙替尼、威罗菲尼、达拉非尼、瑞戈非尼、PLX4720、考比替尼、曲美替尼、比美替尼、司美替尼、PD-325901、CI-1040、PD035901、U0126、TAK-733、乐伐替尼、Debio-1347、多韦替尼、BLU9931、索拉非尼、舒尼替尼、来他替尼、坦度替尼、奎扎替尼、克莱拉尼、吉瑞替尼、普纳替尼、依鲁替尼、林西替尼、NVP-AEW541、BMS-536924、AG-1024、GSK1838705A、BMS-754807、PQ401、ZD3463、NT157、鬼臼苦素(PPP)、Tivantinib、JNJ-38877605、PF-04217903、弗雷替尼(GSK 1363089)、梅沙替尼、鲁索替尼、托法替尼、奥拉替尼、巴瑞克替尼、非戈替尼、赛度替尼、甘多替尼、莫洛替尼、帕克替尼、PF-04965842、乌帕替尼、吡西替尼、菲达替尼、伊马替尼、帕唑帕尼、特拉替尼、博舒替尼、尼洛替尼、卡博替尼、贝美替尼、安姆伐替尼、吉瑞替尼(ASP2215)、glesatinib(MGCD 265)、SGI-7079、拉罗替尼、RXDX-102、altiratinib、LOXO-195、司曲替尼、TPX-0005、DS-6051b、福坦替尼、恩托普替尼和TAK-659组成的组。

8.根据权利要求6所述的方法，其中，所述激酶抑制剂选自由EGFR、ALK和B-Raf的组，特别是选自包括吉非替尼、厄洛替尼、拉帕替尼、凡德他尼、阿法替尼、奥希替尼、来那替尼、达可替尼、布加替尼、卡纳替尼、纳夸替尼、纳扎替尼、培利替尼、诺司替尼、埃克替尼、AZD3759、AZ5104(CAS No 1421373-98-9)、波齐替尼、WZ4002、克唑替尼、恩曲替尼、色瑞替尼、艾乐替尼、劳拉替尼、TSR-011、CEP-37440、恩沙替尼、威罗菲尼、达拉非尼、瑞戈非尼和PLX4720组成的组。

9.根据权利要求6所述的方法，其中，所述激酶抑制剂是EGFR抑制剂，特别是选自包括吉非替尼、厄洛替尼、拉帕替尼、凡德他尼、阿法替尼、奥希替尼、来那替尼、达可替尼、布加替尼、卡纳替尼、纳夸替尼、纳扎替尼、培利替尼、诺司替尼、埃克替尼、AZD3759、AZ5104(CASNo 1421373-98-9)、波齐替尼和WZ4002组成的组。

10.根据前述任意一项权利要求所述的方法，其中，所述受试者患有EGFR突变型癌症、ALK突变型癌症、RAS突变型癌症或RAF突变型癌症。

11.根据权利要求10所述的方法，其中，所述癌症选自由白血病、淋巴瘤、肉瘤、黑色素瘤以及头颈癌、肾癌、卵巢癌、胰腺癌、***癌、甲状腺癌、肺癌、食道癌、乳腺癌、膀胱癌、脑癌、结直肠癌、肝癌和***组成的组。

12.根据权利要求10所述的方法，其中，所述受试者患有非小细胞肺癌。

13.根据权利要求10所述的方法，其中，如果所述激酶抑制剂是EGFR抑制剂，则所述癌症优选选自由肺癌特别是非小细胞肺癌、胰腺癌、乳腺癌特别是早期乳腺癌、甲状腺癌特别是甲状腺髓样癌、结直肠癌特别是转移性或晚期结直肠癌、头颈部鳞状细胞癌和胶质瘤组成的组。

14.根据权利要求10所述的方法，其中，如果所述激酶抑制剂是ALK抑制剂，则所述癌症优选为非小细胞肺癌。

15.根据权利要求10所述的方法，其中，如果所述激酶抑制剂是B-Raf抑制剂，则所述癌症优选地选自包括黑色素瘤、肺癌、结直肠癌和胃肠间质癌的组。

16.根据前述任意一项权利要求所述的方法，其中，所述法尼基转移酶抑制剂为替匹法尼。

17.一种药物组合物或试剂盒(分试剂盒)，所述药物组合物或试剂盒(分试剂盒)含有法尼基转移酶抑制剂和激酶抑制剂，所述药物组合物或所述试剂盒(分试剂盒)特别用于治疗癌症。