KR20150023889A - 2 개 이상의 상이한 결합 단위를 함유하는 맞춤-제작된 고도로 선별적이고 다중-특이적인 표적화 단위의 선별 및 제조 방법 및 이의 용도 - Google Patents
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Abstract
본원에는 하기 (i) 내지 (iii) 을 인큐베이션하는 단계를 포함하는 2-특이적 항체의 제조 방법이 보고된다:
(i) 20 개의 C-말단 아미노산 잔기 내에 아미노산 서열 LPX1TG (SEQ ID NO: 01) 을 포함하는 항체 Fab 단편 또는 scFv 항체,
(ii) 전장 항체 중쇄, 전장 항체 경쇄, 및 Fc-중쇄를 포함하는 외-분지 (one-armed) 항체,
전장 항체 중쇄 및 전장 항체 경쇄는 항원 결합 부위를 형성하는 동족 항체 사슬이고,
전장 항체 중쇄 및 Fc-중쇄는 항체 힌지 영역을 형성하는 하나 이상의 디설파이드 결합을 통해 서로 공유 연결되고,
Fc-중쇄는 그의 N-말단에 올리고글라이신 아미노산 서열을 가짐,
및
(iii) 소르타제 A 효소.
(i) 20 개의 C-말단 아미노산 잔기 내에 아미노산 서열 LPX1TG (SEQ ID NO: 01) 을 포함하는 항체 Fab 단편 또는 scFv 항체,
(ii) 전장 항체 중쇄, 전장 항체 경쇄, 및 Fc-중쇄를 포함하는 외-분지 (one-armed) 항체,
전장 항체 중쇄 및 전장 항체 경쇄는 항원 결합 부위를 형성하는 동족 항체 사슬이고,
전장 항체 중쇄 및 Fc-중쇄는 항체 힌지 영역을 형성하는 하나 이상의 디설파이드 결합을 통해 서로 공유 연결되고,
Fc-중쇄는 그의 N-말단에 올리고글라이신 아미노산 서열을 가짐,
및
(iii) 소르타제 A 효소.
Description
본원에는 트랜스펩티다제, 에컨대, 소르타제 A (Sortase A) 를 사용함으로써 다중특이적 단위를 선별 및 제조하기 위한 방법 (상기 특이성은 서로 독립적으로 선택될 수 있음) 및 신규한 맞춤-제작 다중특이적 항체의 생성을 위해 상기 방법의 용도가 보고된다.
모노클로날 항체는 큰 치료 잠재성을 갖고, 오늘날의 의료 포트폴리오에서 중요한 역할을 수행한다. 지난 10 년간, 제약 산업의 중요한 트렌드는 종양학, 만성 염증 질환, 이식, 감염 질환, 심혈관 의약 또는 안과 질환을 포함하는 다양한 임상 설정에 걸치는 치료제로서의 모노클로날 항체 (mAb) 및 항체 Fc-융합 폴리펩티드 (결정성 분절-융합 폴리펩티드) 의 개발이었다 (Carter, J.P., Nature Reviews Immunology 6 (2006) 343-357; Chan, A.C. 및 Carter, J.P., Nature Reviews Immunology 10 (2010) 301-316).
치료 항체의 임상 효율은 주로 하기 2 개의 기능에 의존한다: i) Fv-도메인에 의해 매개되는 표적-특이적 결합, 및 ii) 항체 Fc-영역에 의해 매개되는 면역-매개되는 효과기 기능 예컨대 ADCC (항체-의존적 세포-매개되는 세포독성), CDC (보체-의존적 세포독성), 및 ADCP (항체-의존적 세포성 식세포작용). IgG 클래스의 면역글로불린의 Fc-영역은 힌지 영역 및 2 개의 불변 도메인 (CH2 및 CH3) 을 포함한다. Fc 영역은 또한 신생아 FcRn 수용체와 상호작용하고, 그에 의해 생체내에서의 항체 반감기를 결정한다. 힌지 영역은 이 지점에서 항체 분자의 분지가 Y-유사 구조를 형성하여 분자 내에서 유연성을 부여하는 영역이다. IgG 서브클래스/서브클래스들은 디설파이드 결합의 개수 및 힌지 영역의 길이에서 상이하다.
항체의 Fc-영역과 연관되는 효과기 기능은 항체의 클래스 및 서브클래스에 따라 다르고, 예를 들어, 세포 상의 특정 Fc 수용체 (FcR) 에 대한 그것의 Fc-영역을 통한 항체의 결합으로 다양한 생물학적 응답을 유발하는 것을 포함한다 (예를 들어, Jiang, X.-R., et al., Nature Reviews Drug Discovery 10 (2011) 101-110; Presta, L.G., Current Opinion in Immunology 20 (2008) 460-470 참고).
항체 또는 Fc-영역 포함 융합 폴리펩티드 또는 접합체의 힌지 영역은 항체 기능의 적어도 일부 예컨대 항원 결합 및 Fc-영역-매개되는 항체 효과기 기능에 관여한다. 항원 결합 (특히 2 가 아비드 (avid) 항체 결합) 은 특정/선천 힌지 영역의 유연성, 길이 및 공간 배향에 의존하지만, Fc-영역-매개되는 효과기 기능은 항체의 클래스 및 서브클래스에 의존적이다. 다른 IgG 항체에 대한 2 가와 비교하여 일부 인간 IgG4 항체에 대해 관찰되는 기능적 1 가는 항원 결합 특성에서 Fc-영역의 관여를 보여주는 또다른 예이다 (Salfeld, J.G., Nature Biotechnology 12 (2007) 1369-1372; Presta, L.G., Current Opinion in Immunology 20 (2008) 460-470).
문헌 [Levary, D.A., et al.] 에는 소르타제 A 에 의해 촉매되는 단백질-단백질 융합이 보고된다 (PLOS ONE 6 (2011)). 단일 사슬 형태로의 항-표피 성장 인자 수용체 항체의 조작 및 소르타아제 A-매개 단백질 라이게이션에 의한 라벨링이 Madej, M.P., et al. (Biotechnol. Bioeng. 109 (2012) 1461-1470) 에 의해 보고되어 있다. 문헌 [Ta, H.T., et al.] 에는 심혈관 질환에서 표적된 분자 이미지화 및 세포 회귀 (homing) 에 대한 범 접근법으로서 효소적 단쇄 항체 태그화가 보고되어 있다 (Cir. Res. 109 (2011) 365-373). 문헌 [Popp, M., et al.] 에는 펩티드 결합의 제조 및 파괴 - 소르타제를 사용하는 단백질 조작법이 보고되어 있다 (Angew. Chem. Int. Ed. Eng. 50 (2011) 5024-5032). WO 2010/087994 에서는 라이게이션 방법 및 이의 용도가 보고되어 있다.
본원에는 치료를 필요로 하는 환자에서 질환, 예컨대 암의 치료를 위한 맞춤-제작된, 고도로 특이적인 치료 분자를 제공하기 위한 방법이 보고되어 있고, 치료 분자는 환자의 질환 특성 및/또는 환자의 유전자형/표현형에 맞게 조정된다.
이러한 조정은 환자의 질환 잠복/영향 세포의 유전자형/표현형을 고려하는 맞춤-제작 분자의 제작에 의해 달성된다.
첫번째 단계에서, 치료 분자로 표적화되는 것이 의도되는 세포의 유전자형/표현형 (예를 들어, 질환-특이적 세포 표면 항원의 존재 및 수/양) 이 결정된다. 이것은 예를 들어, 형광 표지된 1-특이적 (치료 또는 진단) 항체를 사용하여, 예를 들어, 혈액 및/또는 생검 물질로부터 유래된 환자의 세포의 면역조직화학 염색 (IHC, 면역조직화학) 과 같은 세포 이미지화 기법에 의해 달성될 수 있다. 대안적으로 세포의 유전자형/표현형은 FACS-기반 방법을 사용하는 표지된 치료 또는 진단 항체를 사용하는 염색 후 분석될 수 있다. 광학 이미지화, 분자 이미지화, 형광 이미지화, 생체발광 이미지화, MRI, PET, SPECT, CT, 및 인트라바이탈 (intravital) 현미경을 비롯한 생체 내 이미지화 기법이 또한 환자의 질환-관련 세포의 유전자형/표현형의 결정에 대해 사용될 수 있다. 환자의 질환-관련 세포의 결정된 유전자형/표현형에 따라, 표적/결합 단위의 맞춤-제작 조합이 선택될 수 있고, 치료 분자에서 조합된다. 이러한 치료 분자는 예를 들어, 2-특이적 항체일 수 있다.
이러한 맞춤-제작 치료 분자는 i) 고도로 특이적일 것이고, ii) 양호한 효능을 가질 것이고, iii) 통상적으로 선택된 치료제와 비교해 부작용을 덜 유도할 것이다. 이들은 예를 들어, 치료 적재량의 이의 의도되는 작용 부위로의 개선된 표적화 및/또는 개선된 맞춤-제작 전달 특성을 치료 분자에 부여함으로써 달성될 수 있다.
치료 분자의 이의 작용 부위, 예컨대 예를 들어, 암 세포로의 개선된 전달은, 통상적으로 선택된 치료 분자와 비교하여 표적화된 치료 분자의 높은/증가된 선택성 및/또는 특이성에 의해 달성될 수 있다. 치료 분자는 상이한 항원 (예를 들어, 2 개의 상이한 표면 마커) 또는 동일한 항원 상의 상이한 에피토프 (예를 들어, 동일한 표면 마커 상의 2 개의 상이한 에피토프) 에 특이적으로 결합하는 2 개 이상의 단위를 포함한다.
맞춤-제작된 치료 분자의 증가된 선택성 및/또는 특이성은 이들의 각각의 표적/에피토프에 대해 두 표적 단위의 동시 결합에 의해 달성될 수 있다, 즉, 이들은 결합능 (avidity) 영향에 의해 달성된다. 특히 적합한 것은 이들의 각각의 표적/에피토프에 대해 낮은 내지 중간 친화성을 갖는 2 개의 결합 단위의 조합이다. 부가적으로는, 표적을 벗어난 (off-target) 결합이 크게 감소하거나 심지어 완전히 제거될 수 있다.
맞춤-제작된 2-특이적 표적 및 결합 분자가 효소 소르타제 A 를 사용하여, 첫번째 결합 단위, 예컨대 다르핀 도메인 기반 결합 단위, 안티칼린 도메인 기반 결합 단위, T-세포 수용체 단편 예컨대 scTCR 도메인 기반 결합 단위, 카멜 VH 도메인 기반 결합 단위, 열번째 (tenth) 피브로넥틴 3 도메인 기반 결합 단위, 테나신 도메인 기반 결합 단위, 캐드헤린 도메인 기반 결합 단위, ICAM 도메인 기반 결합 단위, 티틴 도메인 기반 결합 단위, GCSF-R 도메인 기반 결합 단위, 사이토카인 수용체 도메인 기반 결합 단위, 글리코시다제 억제제 도메인 기반 결합 단위, 슈퍼옥사이드 디스무타제 도메인 기반 결합 단위, 또는 항체 단편 (Fab 또는 scFv 단편) (그의 C-말단 아미노산 서열 영역 내에 아미노산 서열 LPX1TG (SEQ ID NO: 01, 식 중 X1 은 임의의 아미노산 잔기일 수 있음) 를 포함함) 과 외-분지 항체 단편 (OA-Fc) (이것은 이의 N 말단에 올리고글라이신 Gm (m = 2, 또는 3, 또는 4, 또는 5) 이 있는 항체 중쇄 Fc 영역 폴리펩티드 및 동족 전장 경쇄와 쌍을 이룬 전장 항체 중쇄를 포함한다
사이의 효소적 접합 반응을 사용하여 제공될 수 있다는 것이 밝혀졌다.
본원에 보고된 방법으로 세포, 예컨대 암 세포의 표면 상에서 발견되는 2 개의 표면 마커에 특이적으로 지정되는, 예를 들어 2-특이적 항체를 맞춤-제작하는 것이 가능하다는 것이 밝혀졌다. 결합 특이성이 출발 성분에 의해 개별적으로 제공되므로, 세포 상에, 예를 들어, 암 세포 상에 존재하는 표면 마커를 결정하고, 효소 절차에 의해 상기 표면 마커 또는 이들의 각각의 리간드에 특이적으로 결합하는 각각의 항체 단편을 접합시킴으로써 간단히 다중특이적 표적 및 결합 분자를 맞춤-제작하는 것이 가능하다. 효소적 접합이 효소 소르타제 A 에 의해 수행되므로, 산출되는 2-특이적 항체는 아미노산 서열 LPX1TG ((SEQ ID NO: 01, 식 중 X1 은 임의의 아미노산 잔기일 수 있음) 의 존재를 특징으로 한다.
본원에 보고되는 하나의 양상은 하기 단계를 포함하는 2-특이적 항체의 제조 방법이다:
하기 (i) 내지 (iii) 을 인큐베이션하는 단계:
(i) 20 개의 C-말단 아미노산 잔기 내에 아미노산 서열 LPX1TG (SEQ ID NO: 01, 식 중 X1 은 임의의 아미노산 잔기일 수 있음) 을 포함하는 첫번째 결합 단위,
(ii) 전장 항체 중쇄, 전장 항체 경쇄, 및 항체 중쇄 Fc 영역 폴리펩티드를 포함하는 항체 단편,
전장 항체 중쇄 및 전장 항체 경쇄는 동족 항체 사슬이고 이의 가변 도메인 (VH 및 VL) 의 쌍은 항원 결합 부위를 형성하고,
전장 항체 중쇄 및 항체 중쇄 Fc 영역 폴리펩티드는 항체 힌지 영역을 형성하는 하나 이상의 디설파이드 결합을 통해 서로 공유 연결되고,
항체 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드는 그의 N-말단에 올리고글라이신 Gm (m = 2, 또는 3, 또는 4, 또는 5) 아미노산 서열을 가짐,
및
(iii) 소르타제 A 효소,
및 이에 의해 다중특이적 결합 분자를 제조하는 단계.
본원에 보고되는 하나의 양상은 하기 단계를 포함하는 다중특이적 결합 분자의 제조 방법이다:
(i) 세포 함유 샘플에 존재하는 세포 표면 마커를 결정하는 단계 및 i) 첫번째 세포 표면 마커 및 두번째 세포 표면 마커를 적어도 선별하는 단계, 또는 ii) 다중특이적 결합 분자의 결합 특이성의 수에 상응하는 다수의 세포 표면 마커를 선별하는 단계,
(ii) (a) 첫번째 세포 표면 마커 또는 이의 리간드에 특이적으로 결합하고, 20 개의 C-말단 아미노산 잔기 내에 아미노산 서열 LPX1TG (SEQ ID NO: 01, 식 중 X1 은 임의의 아미노산 잔기일 수 있음) 를 포함하는 첫번째 결합 단위, (b) 전장 항체 중쇄, 전장 항체 경쇄, 및 항체 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드를 포함하는 항체 단편, 전장 항체 중쇄 및 전장 항체 경쇄는 동족 항체 사슬이고 이의 가변 도메인 (VH 및 VL) 의 쌍은 두번째 세포 표면 마커 또는 이의 리간드에 특이적으로 결합하는 항원 결합 부위를 형성하고, 전장 항체 중쇄 및 항체 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드는 항체 힌지 영역을 형성하는 하나 이상의 디설파이드 결합에 의해 서로 공유 연결되고, 항체 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드는 그의 N-말단에 올리고글라이신 Gm (m = 2, 또는 3, 또는 4, 또는 5) 아미노산 서열을 가짐, 및 (c) 소르타제 A 효소를 인큐베이션하는 단계
및 이에 의해 다중특이적 결합 분자를 제조하는 단계.
본원에 보고되는 하나의 양상은 치료제로서 사용하기 위해, 하기 (a) 내지 (c) 를 인큐베이션함으로써 단일 다중특이적 결합 분자 내에 어셈블된 결합 단위의 수집/라이브러리로부터 2 개 이상의 결합 단위의 선별을 위한 방법이다: (a) 첫번째 에피토프 또는 항원에 특이적으로 결합하고, 20 개의 C-말단 아미노산 잔기 내에 아미노산 서열 LPX1TG (SEQ ID NO: 01, 식 중 X1 은 임의의 아미노산 잔기일 수 있음) 을 포함하는 첫번째 결합 단위, (b) 전장 항체 중쇄, 전장 항체 경쇄 및 항체 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드를 포함하는 항체 단편, 전장 항체 중쇄 및 전장 항체 경쇄는 동족 항체 사슬이고 이의 가변 도메인 (VH 및 VL) 의 쌍은 두번째 에피토프 또는 항원에 특이적으로 결합하는 항원 결합 부위를 형성하고, 전장 항체 중쇄 및 항체 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드는 항체 힌지 영역을 형성하는 하나 이상의 디설파이드 결합에 의해 서로 공유 연결되고, 항체 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드는 그의 N-말단에 올리고글라이신 Gm (m = 2, 또는 3, 또는 4, 또는 5) 아미노산 서열을 가짐, 및 (c) 소르타제 A 효소. 이러한 작용제는 개선된 표적/전달 특성을 갖는다.
본원에 보고되는 하나의 양상은 하기 단계를 포함하는 2-특이적 항체의 제조 방법이다:
하기 (i) 내지 (iii) 을 인큐베이션하여:
(i) 20 개의 C-말단 아미노산 잔기 내에 아미노산 서열 LPX1TG (SEQ ID NO: 01, 식 중 X1 은 임의의 아미노산 잔기일 수 있음) 을 포함하는 항체 Fab 단편 또는 scFv 항체,
(ii) 전장 항체 중쇄, 전장 항체 경쇄, 및 항체 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드를 포함하는 외-분지 (one-armed) 항체 단편,
전장 항체 중쇄 및 전장 항체 경쇄는 서로 상보적인 동족 항체 사슬이고 이의 가변 도메인 (VH 및 VL) 의 쌍은 항원 결합 부위를 형성하고,
전장 항체 중쇄 및 항체 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드는 항체 힌지 영역을 형성하는 하나 이상의 디설파이드 결합을 통해 서로 공유 연결되고,
항체 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드는 그의 N-말단에 올리고글라이신 Gm (m = 2, 또는 3, 또는 4, 또는 5) 아미노산 서열을 가짐,
및
(iii) 소르타제 A 효소,
2-특이적 항체를 제조하는 단계.
본원에 보고되는 하나의 양상은 하기 단계를 포함하는 2-특이적 항체의 제조 방법이다:
(i) 세포 함유 샘플에 존재하는 세포 표면 마커를 결정하고 적어도 첫번째 세포 표면 마커 및 두번째 세포 표면 마커를 선별하는 단계,
(ii) (a) 20 개의 C-말단 아미노산 잔기 내에 아미노산 서열 LPX1TG (SEQ ID NO: 01, 식 중 X1 은 임의의 아미노산 잔기일 수 있음) 를 포함하는 항체 Fab 단편 또는 scFv 항체, 상기 Fab 단편 또는 scFv 항체는 첫번째 세포 표면 마커 또는 이의 리간드에 특이적으로 결합함, (b) 전장 항체 중쇄, 전장 항체 경쇄, 및 항체 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드를 포함하는 외-분지 항체 단편, 상기 전장 항체 중쇄 및 전장 항체 경쇄는 서로 상보적인 동족 항체 사슬이고 이의 가변 도메인 (VH 및 VL) 의 쌍은 두번째 세포 표면 마커 또는 이의 리간드에 특이적으로 결합하는 항원 결합 부위를 형성하고, 전장 항체 중쇄 및 항체 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드는 항체 힌지 영역을 형성하는 하나 이상의 디설파이드 결합에 의해 서로 공유 연결되고, 항체 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드는 그의 N-말단에 올리고글라이신 Gm (m = 2, 또는 3, 또는 4, 또는 5) 아미노산 서열을 가짐, 및 (c) 소르타제 A 효소를 인큐베이션하는 단계
및 이에 의해 2-특이적 항체를 제조하는 단계.
본원에 보고되는 하나의 양상은 하기 단계를 포함하는 다중특이적 결합 분자에 대한 결합 단위의 조합의 결정 방법이다:
(i) 다수의 다중특이적 결합 분자의 결합 특이성 및/또는 선택성 및/또는 친화성 및/또는 효과기 기능 및/또는 생체 내 반감기를 측정하는 단계, 다수의 다중특이적 결합 분자에는 결합 단위의 각각의 (가능한) 조합이 포함됨,
및
(ii) 적합한 결합 특이성 및/또는 선택성 및/또는 친화성 및/또는 효과기 기능 및/또는 생체 내 반감기를 가진 다중특이적 결합 분자를 선택하여, 항원 결합 부위의 조합을 결정하는 단계.
본원에 보고되는 하나의 양상은 하기 단계를 포함하는 항원 결합 부위의 조합의 결정 방법이다:
(i) (a) 첫번째 다수의 항체 Fab 단편 또는 scFv 항체 단편의 각각의 멤버 (각각의 멤버는 20 개의 C-말단 아미노산 잔기 내에 아미노산 서열 LPX1TG (SEQ ID NO: 01, 식 중 X1 은 임의의 아미노산 잔기일 수 있음) 를 포함하고, Fab 단편 또는 scFv 항체는 첫번째 에피토프 또는 항원에 특이적으로 결합함) 와, (b) 전장 항체 중쇄, 전장 항체 경쇄, 및 항체 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드를 포함하는 다수의 외-분지 항체 단편의 각각의 멤버를 조합함으로써 제조된 다수의 2-특이적 항체의 결합 특이성 및/또는 선택성 및/또는 친화성 및/또는 효과기 기능 및/또는 생체 내 반감기를 결정하는 단계, 전장 항체 중쇄 및 전장 항체 경쇄는 서로 상보적인 동족 항체 사슬이고 이의 가변 도메인 (VH 및 VL) 의 쌍은 두번째 에피토프 또는 항원에 특이적으로 결합하는 항원 결합 부위를 형성하고, 전장 항체 중쇄 및 항체 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드는 항체 힌지 영역을 형성하는 하나 이상의 디설파이드 결합에 의해 서로 공유 연결되고, 항체 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드는 그의 N-말단에 올리고글라이신 Gm (m = 2, 또는 3, 또는 4, 또는 5) 아미노산 서열을 가짐, 및 (c) a 소르타제 A 효소
및
(ii) 적합한 결합 특이성 및/또는 선택성 및/또는 친화성 및/또는 효과기 기능 및/또는 생체 내 반감기를 갖는 2-특이적 항체를 선택하여 항원 결합 부위의 조합을 결정하는 단계.
하나의 구현예에서, 결합 단위는 서로 독립적으로 다르핀 도메인 기반 결합 단위, 안티칼린 도메인 기반 결합 단위, T-세포 수용체 단편 예컨대 scTCR 도메인 기반 결합 단위, 카멜 VH 도메인 기반 결합 단위, 열번째 (tenth) 피브로넥틴 3 도메인 기반 결합 단위, 테나신 도메인 기반 결합 단위, 캐드헤린 도메인 기반 결합 단위, ICAM 도메인 기반 결합 단위, 티틴 도메인 기반 결합 단위, GCSF-R 도메인 기반 결합 단위, 사이토카인 수용체 도메인 기반 결합 단위, 글리코시다제 억제제 도메인 기반 결합 단위, 슈퍼옥사이드 디스무타제 도메인 기반 결합 단위, 또는 항체 단편, 예컨대 Fab 또는 scFv 단편으로부터 선택된다.
모든 양상의 하나의 구현예에서 다중특이적 결합 분자는 2-특이적 항체이고, 및/또는 첫번째 결합 단위는 항체 Fab 단편 또는 scFv 항체이다.
하나의 구현예에서, 조합은 항체 Fab 단편 또는 scFv 항체 단편 및 전장 항체 중쇄, 전장 항체 경쇄, 및 항체 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드를 포함하는 항체 단편을, 소르타제 A 효소와 인큐베이션하는 것을 특징으로 한다.
하나의 구현예에서, Fab 단편 또는 scFv 항체 단편은 20 개의 C-말단 아미노산 잔기 내에 아미노산 서열 LPX1TG (SEQ ID NO: 01, 식 중 X1 은 임의의 아미노산 잔기일 수 있음) 를 포함한다.
하나의 구현예에서, 외-분지 항체 단편의 전장 항체 중쇄 및 전장 항체 경쇄는 동족 항체 사슬이고 이의 가변 도메인 (VH 및 VL) 의 쌍은 두번째 표면 마커에 특이적으로 결합하는 항원 결합 부위를 형성하고, 전장 항체 중쇄 및 항체 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드는 항체 힌지 영역을 형성하는 하나 이상의 디설파이드 결합을 통해 서로 공유 연결되고, 항체 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드는 그의 N-말단에 올리고글라이신 Gm (m = 2, 또는 3, 또는 4, 또는 5) 아미노산 서열을 갖는다.
모든 양상의 하나의 구현예에서, 항체 Fab 단편 또는 scFv 항체는 20 개의 C-말단 아미노산 잔기 내에 아미노산 서열 GnSLPX1TG (SEQ ID NO: 02, 식 중 X1 은 임의의 아미노산 잔기일 수 있고, n = 1, 2 또는 3 임) 을 포함한다.
모든 양상의 하나의 구현예에서, 항체 Fab 단편 또는 scFv 항체는 20 개의 C-말단 아미노산 잔기 내에 아미노산 서열 GSLPX1TGGSGS (SEQ ID NO: 03, 식 중 X1 은 임의의 아미노산 잔기일 수 있음) 을 포함한다.
모든 양상의 하나의 구현예에서, 항체 Fab 단편 또는 scFv 항체는 20 개의 C-말단 아미노산 잔기 내에 아미노산 서열 GGGSLPX1TGGSGS (SEQ ID NO: 04, 식 중 X1 은 임의의 아미노산 잔기일 수 있음) 을 포함한다.
모든 양상의 하나의 구현예에서, 항체 Fab 단편 또는 scFv 항체는 아미노산 서열 X2GSLPX1TGGSGS (SEQ ID NO: 05, 식 중 X1 은 임의의 아미노산 잔기일 수 있음) 을 20 개의 C-말단 아미노산 잔기 내에 포함하고, 이 때 X2 는 G 를 제외한 임의의 아미노산 잔기일 수 있다.
모든 양상의 하나의 구현예에서, 항체 Fab 단편 또는 scFv 항체는 아미노산 서열 GnSLPX1TGGSGSX3 (SEQ ID NO: 06, 식 중 X1 은 임의의 아미노산 잔기일 수 있고, n=1, 2 또는 3 임) 을 20 개의 C 말단 아미노산 잔기 내에 포함하고, 이 때 X3 은 아미노산 서열 태그이다.
모든 양상의 하나의 구현예에서, 항체 Fab 단편 또는 scFv 항체는 아미노산 서열 X2GSLPX1TGGSGSX3 (SEQ ID NO: 07, 식 중 X1 은 임의의 아미노산 잔기일 수 있음) 을 20 개의 C-말단 아미노산 잔기 내에 포함하고, 이 때 X2 는 G 를 제외한 임의의 아미노산 잔기일 수 있고, X3 은 아미노산 서열 태그이다.
모든 양상의 하나의 구현예에서, 항체 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드는 그의 N-말단에서 2 개의 글라이신 잔기를 포함한다.
모든 양상의 하나의 구현예에서, 외-분지 항체 단편은 아미노산 서열 GGCPX4C (SEQ ID NO: 08) 를 그의 중쇄의 N-말단에 포함하고, 이 때 X4 는 S 또는 P 이다.
모든 양상의 하나의 구현예에서 X1 은 E 이다.
본원에 보고되는 하나의 양상은 본원에 보고된 방법에 의해 수득된 다중특이적 결합 분자이다.
하나의 양상은 그의 중쇄 중 하나에 아미노산 서열 LPX1TG (SEQ ID NO: 01, 식 중 X1 은 임의의 아미노산 잔기일 수 있음) 를 포함하는 다중특이적 결합 분자이다.
하나의 구현예에서, 다중특이적 결합 분자는 그의 중쇄 중 하나에 아미노산 서열 GnSLPX1TG (SEQ ID NO: 02, 식 중 X1 은 임의의 아미노산 잔기일 수 있고, n = 1, 2 또는 3 임) 를 포함한다.
하나의 구현예에서, 다중특이적 결합 분자는 그의 중쇄 중 하나에 아미노산 서열 GnSLPX1TGGCPX4C (SEQ ID NO: 09, 식 중 X1 은 임의의 아미노산 잔기일 수 있고, X4 는 S 또는 P 일 수 있고, n = 1, 2 또는 3 임) 를 포함한다.
하나의 구현예에서, 다중특이적 결합 분자는 그의 중쇄 중 하나에 아미노산 서열 X2GSLPX1TGGCPX4C (SEQ ID NO: 10, 식 중 X1 은 임의의 아미노산 잔기일 수 있고, X4 는 S 또는 P 일 수 있음) 를 포함하고, 이 때 X2 는 G 를 제외한 임의의 아미노산 잔기일 수 있다.
본원에 보고되는 하나의 양상은 본원에 보고된 방법에 의해 수득된 2-특이적 항체이다.
하나의 양상은 그의 중쇄 중 하나에 아미노산 서열 LPX1TG (SEQ ID NO: 01, 식 중 X1 은 임의의 아미노산 잔기일 수 있음) 를 포함하는 2-특이적 항체이다.
하나의 구현예에서, 2-특이적 항체는 그의 중쇄 중 하나에 아미노산 서열 GnSLPX1TG (SEQ ID NO: 02, 식 중 X1 은 임의의 아미노산 잔기일 수 있고, n=1, 2 또는 3 임) 를 포함한다.
하나의 구현예에서, 2-특이적 항체는 그의 중쇄 중 하나에 아미노산 서열 GnSLPX1TGGCPX4C (SEQ ID NO: 09, 식 중 X1 은 임의의 아미노산 잔기일 수 있고, X4 는 S 또는 P 일 수 있고, n = 1, 2 또는 3 임) 를 포함한다.
하나의 구현예에서, 2-특이적 항체는 그의 중쇄 중 하나에 아미노산 서열 X2GSLPX1TGGCPX4C (SEQ ID NO: 10, 식 중 X1 은 임의의 아미노산 잔기일 수 있고, X4 는 S 또는 P 일 수 있음) 를 포함하고, 이 때 X2 는 G 를 제외한 임의의 아미노산 잔기일 수 있다.
본원에 보고되는 하나의 양상은 본원에 보고된 다중특이적 결합 분자를 포함하는 약학 조성물이다.
본원에 보고되는 하나의 양상은 의약의 제조에서의 본원에 보고된 다중특이적 결합 분자의 용도이다.
하나의 구현예에서, 의약은 암의 치료를 위한 것이다.
본원에 보고되는 하나의 양상은 본원에 보고된 다중특이적 결합 분자의 유효량을 개체에게 투여하는 것을 포함하는, 암을 가지고 있는 개체의 치료 방법이다.
본원에 보고되는 하나의 양상은 본원에 보고된 다중특이적 결합 분자의 유효량을 개체에게 투여하는 것을 포함하는, 개체에서 암 세포를 파괴하기 위한 방법이다.
본원에 보고되는 하나의 양상은 본원에 보고된 2-특이적 항체를 포함하는 약학 조성물이다.
본원에 보고되는 하나의 양상은 의약의 제조에서의 본원에 보고된 2-특이적 항체의 용도이다.
하나의 구현예에서, 의약은 암의 치료를 위한 것이다.
본원에 보고되는 하나의 양상은 본원에 보고된 2-특이적 항체의 유효량을 개체에게 투여하는 것을 포함하는, 암을 가진 개체의 치료 방법이다.
본원에 보고되는 하나의 양상은 본원에 보고된 2-특이적 항체의 유효량을 개체에게 투여하는 것을 포함하는, 개체에서 암 세포를 파괴하기 위한 방법이다. 본원에 보고된 모든 양상의 하나의 구현예에서 Fc-영역은 인간 Fc-영역 또는 이의 변이체이다.
하나의 구현예에서, 인간 항체 Fc-영역은 인간 IgG1 서브클래스, 또는 인간 IgG2 서브클래스, 또는 인간 IgG3 서브클래스, 또는 인간 IgG4 서브클래스의 것이다.
하나의 구현예에서, 항체 Fc-영역은 인간 IgG1 서브클래스, 또는 인간 IgG4 서브클래스의 인간 항체 Fc-영역이다.
하나의 구현예에서, 인간 항체 Fc-영역은 하기 아미노산 위치 228, 233, 234, 235, 236, 237, 297, 318, 320, 322, 329, 및/또는 331 중 하나 이상에서 상이한 잔기로의 자연 발생적 아미노산 잔기의 돌연변이를 포함하고, 항체 Fc-영역 내의 잔기는 Kabat 의 EU 인덱스에 따라 번호지정된다.
하나의 구현예에서, 인간 항체 Fc-영역은 위치 329 에서 자연 발생적 아미노산 잔기의 돌연변이 및 위치 228, 233, 234, 235, 236, 237, 297, 318, 320, 322 및 331 에서 아미노산 잔기를 포함하는 군으로부터 선택되는 하나 이상의 아미노산 잔기의 상이한 잔기로의 하나 이상의 추가의 돌연변이를 포함하고, Fc-영역 내의 잔기는 Kabat 의 EU 인덱스에 따라 번호지정된다. 상기 특정 아미노산 잔기의 변화는 비-개질된 (야생형) Fc-영역과 비교해 Fc-영역의 효과기 기능을 변화시키는 결과를 낳는다.
하나의 구현예에서, 인간 항체 Fc-영역은 상응하는 야생형 IgG Fc-영역을 포함하는 접합체와 비교해 인간 FcγRIIIA, 및/또는 FcγRIIA, 및/또는 FcγRI 에 대한 감소된 친화성을 갖는다.
하나의 구현예에서, 인간 항체 Fc-영역 내 위치 329 에서 아미노산 잔기는 글라이신, 또는 아르기닌, 또는 Fc 영역 내에 프롤린 샌드위치를 파괴할 정도로 충분히 큰 아미노산 잔기로 치환된다.
하나의 구현예에서, 자연 발생적 아미노산 잔기의 인간 항체 Fc-영역 내 돌연변이는 S228P, E233P, L234A, L235A, L235E, N297A, N297D, P329G, 및/또는 P331S 중 하나 이상이다.
하나의 구현예에서, 돌연변이는 항체 Fc-영역이 인간 IgG1 서브클래스의 것인 경우 L234A 및 L235A 이거나, 또는 항체 Fc-영역이 인간 IgG4 서브클래스의 것인 경우 S228P 및 L235E 이다.
하나의 구현예에서, 항체 Fc-영역은 돌연변이 P329G 를 포함한다.
하나의 구현예에서, 항체 Fc-영역은 제 1 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드 내에 돌연변이 T366W 를, 제 2 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드 내에 돌연변이 T366S, L368A 및 Y407V 를 포함하고, 번호지정은 Kabat 의 EU 인덱스에 따른다.
하나의 구현예에서, 항체 Fc-영역은 제 1 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드 내에 돌연변이 S354C 를, 제 2 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드 내에 돌연변이 Y349C 를 포함한다.
I. 정의
본 명세서 및 청구항에서 면역글로불린 중쇄 Fc-영역 내의 잔기의 번호지정은 Kabat 의 EU 인덱스에 따른다 (Kabat, E.A., et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th ed., Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD (1991), NIH Publication 91 3242, 본원에 참조로 명백히 포함됨).
용어 "변경" 은 변이체 항체 또는 융합 폴리펩티드를 수득하는, 예를 들어, 항체 또는 적어도 Fc-영역의 FcRn 결합 부분을 포함하는 융합 폴리펩티드의, 부모 아미노산 서열 내의 하나 이상의 아미노산 잔기의 돌연변이, 부가, 또는 결실을 의미한다.
용어 "아미노산 돌연변이" 는 부모 아미노산 서열의 아미노산 서열 내의 수식을 의미한다. 예시적 수식은 아미노산 치환, 삽입, 및/또는 결실을 포함한다. 하나의 구현예에서 아미노산 돌연변이는 치환이다. 용어 "위치에서의 아미노산 돌연변이" 는 명시된 잔기의 치환 또는 결실, 또는 명시된 잔기에 인접한 하나 이상의 아미노산 잔기의 삽입을 의미한다. 용어 "명시된 잔기에 인접한 삽입" 은 그의 1 개 내지 2 개의 잔기 내의 삽입을 의미한다. 삽입은 명시된 잔기의 N-말단 또는 C-말단에 있을 수 있다.
용어 "아미노산 치환" 은 소정의 부모 아미노산 서열 내의 하나 이상의 아미노산 잔기의 상이한 "대체" 아미노산 잔기로의 대체를 의미한다. 대체 잔기 또는 잔기들은 "자연 발생적 아미노산 잔기" (즉, 유전 부호에 의해 인코딩됨) 일 수 있고, 하기로 이루어지는 군으로부터 선택될 수 있다: 알라닌 (Ala); 아르기닌 (Arg); 아스파라긴 (Asn); 아스파르트산 (Asp); 시스테인 (Cys); 글루타민 (Gln); 글루탐산 (Glu); 글라이신 (Gly); 히스티딘 (His); 이소류신 (Ile): 류신 (Leu); 라이신 (Lys); 메티오닌 (Met); 페닐알라닌 (Phe); 프롤린 (Pro); 세린 (Ser); 트레오닌 (Thr); 트립토판 (Trp); 티로신 (Tyr); 및 발린 (Val). 하나의 구현예에서 대체 잔기는 시스테인이 아니다. 하나 이상의 비-자연 발생적 아미노산 잔기에 의한 치환이 또한 본원에서 아미노산 치환의 정의에 포함된다. "비-자연 발생적 아미노산 잔기" 는 폴리펩티드 사슬 내의 인접한 아미노산 잔기(들)에 공유 결합할 수 있는, 위에 열거된 자연 발생적 아미노산 잔기 이외의, 잔기를 의미한다. 비-자연 발생적 아미노산 잔기의 예는 노르류신, 오르니틴, 노르발린, 호모세린, 아이브 (aib) 및 기타 아미노산 잔기 유사체 예컨대 Ellman, et al., Meth. Enzym. 202 (1991) 301-336 에 기재된 것을 포함한다. 그러한 비-자연 발생적 아미노산 잔기를 생성하기 위해, Noren, et al. (Science 244 (1989) 182) 및/또는 Ellman, et al. (상기) 의 절차가 사용될 수 있다. 간략히, 이들 절차는 비-자연 발생적 아미노산 잔기에 의한 억제 tRNA 의 화학적 활성화 이후, RNA 의 시험관내 전사 및 번역을 수반한다. 비-자연 발생적 아미노산은 또한 화학적 펩티드 합성 및 이들 펩티드와 재조합적으로 생산된 폴리펩티드, 예컨대 항체 또는 항체 분절의 후속 융합을 통해 펩티드 내로 통합될 수 있다.
용어 "아미노산 삽입" 은 소정의 부모 아미노산 서열 내로의 하나 이상의 부가적 아미노산 잔기의 통합을 의미한다. 삽입은 통상적으로 1 개 또는 2 개의 아미노산 잔기의 삽입으로 이루어질 것이지만, 본 출원은 더 큰 "펩티드 삽입", 예를 들어, 약 3 개 내지 약 5 개 또는 심지어는 약 10 개 이하의 아미노산 잔기의 삽입을 고려한다. 삽입된 잔기(들)은 위에 정의된 바와 같이 자연 발생적 또는 비-자연 발생적일 수 있다.
용어 "아미노산 결실" 은 아미노산 서열 내의 소정의 위치에서의 하나 이상의 아미노산 잔기의 제거를 의미한다.
이 출원에서 아미노산 변경이 언급될 때마다, 그것은 의도적 아미노산 변경이지, 무작위 아미노산 수식이 아니다.
용어 "아미노산 서열 태그" 는 특이적 결합 특성을 갖는 펩티드 결합을 통해 서로 연결된 아미노산 잔기의 서열을 의미한다. 하나의 구현예에서 아미노산 서열 태그는 친화도 또는 정제 태그이다. 하나의 구현예에서 아미노산 서열 태그는 Arg-태그, His-태그, Flag-태그, 3xFlag-태그, Strep-태그, Nano-태그, SBP-태그, c-myc-태그, S-태그, 칼모듈린-결합-펩티드, 셀룰로오스-결합-도메인, 키틴-결합-도메인, GST-태그, 또는 MBP-태그로부터 선택된다. 하나의 구현예에서 아미노산 서열 태그는 SEQ ID NO: 11 (RRRRR), 또는 SEQ ID NO: 12 (RRRRRR), 또는 SEQ ID NO: 13 (HHHHHH), 또는 SEQ ID NO: 14 (KDHLIHNVHKEFHAHAHNK), 또는 SEQ ID NO: 15 (DYKDDDDK), 또는 SEQ ID NO: 16 (DYKDHDGDYKDHDIDYKDDDDK), 또는 SEQ ID NO: 17 (AWRHPQFGG), 또는 SEQ ID NO: 18 (WSHPQFEK), 또는 SEQ ID NO: 19 (MDVEAWLGAR), 또는 SEQ ID NO: 20 (MDVEAWLGARVPLVET), 또는 SEQ ID NO: 21 (MDEKTTGWRGGHVVEGLAGELEQLRARLEHHPQGQREP), 또는 SEQ ID NO: 22 (EQKLISEEDL), 또는 SEQ ID NO: 23 (KETAAAKFERQHMDS), 또는 SEQ ID NO: 24 (KRRWKKNFIAVSAANRFKKISSSGAL), 또는 SEQ ID NO: 25 (셀룰로오스 결합 도메인), 또는 SEQ ID NO: 26 (셀룰로오스 결합 도메인), 또는 SEQ ID NO: 27 (TNPGVSAWQVNTAYTAGQLVTYNGKTYKCLQPHTSLAGWEP SNVPALWQLQ), 또는 SEQ ID NO: 28 (GST-태그), 또는 SEQ ID NO: 29 (MBP-태그) 로부터 선택된다.
용어 "항체 분절" 은 온전한 항체가 결합하는 항원에 결합하는 온전한 항체의 부분을 포함하는 온전한 항체 이외의 분자를 의미한다. 항체 분절의 예는 Fv, Fab, Fab', Fab'-SH, F(ab')2; 다이아바디; 선형 항체; 단일-사슬 항체 분자 (예를 들어, scFv); 및 항체 분절로부터 형성된 다중특이적 항체를 포함하나 그에 제한되지 않는다.
항체 단편에는 Fab, Fab', Fab'-SH, F(ab')2, Fv, 및 scFv 단편, 및 하기 기재된 기타 단편이 포함되나 이에 제한되지 않는다. 특정 항체 단편의 리뷰를 위해, Hudson, P.J., et al., Nat. Med. 9 (2003) 129-134 를 참조한다. scFv 단편의 리뷰를 위해, 예를 들어, Plueckthun, A., In: The Pharmacology of Monoclonal Antibodies, vol. 113, Rosenburg and Moore (eds.), Springer-Verlag, New York (1994), pp. 269-315 를 참조하고; 또한 WO 93/16185; US 5,571,894 및 US 5,587,458 을 참조한다. 구조 (salvage) 수용체 결합 에피토프 잔기를 포함하고 증가된 생체 내 반감기를 갖는 Fab 및 F(ab')2 단편의 논의에 대해서는, US 5,869,046 을 참조한다.
다이아바디는 2-원자가 또는 2-특이적일 수 있는 2 개의 항원-결합 부위를 가진 항체 단편이다. 예를 들어, EP 0 404 097; WO 1993/01161; Hudson, P.J., et al., Nat. Med. 9 (2003) 129-134; 및 Holliger, P., et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90 (1993) 6444-6448 을 참조한다. 트리아바디 및 테트라바디가 또한 Hudson, P.J., et al., Nat. Med. 9 (2003) 129-134) 에 기재된다.
단일-도메인 항체는 중쇄 가변 도메인의 모두 또는 일부 또는 항체의 경쇄 가변 도메인의 모두 또는 일부를 포함하는 항체 단편이다. 특정 구현예에서, 단일-도메인 항체는 인간 단일-도메인 항체이다 (Domantis, Inc., Waltham, MA; 예를 들어, 미국 특허 번호 6,248,516 B1 을 참조한다).
항체 단편은 온전한 항체의 단백질가수분해 소화 뿐 아니라 본원에 기재된 바와 같은 재조합 숙주 세포 (예를 들어, 대장균 (E. coli) 또는 파지) 에 의한 생성을 포함하나 이에 제한되지 않는 다양한 기법에 의해 제조될 수 있다.
용어 "2-특이적 항체" 는 첫번째 항원 또는 에피토프 및 두번째 항원 또는 에피토프에 특이적으로 결합할 수 있는 항원 결합 분자를 의미하며, 이 때 첫번째 항원 또는 에피토프는 두번째 항원 또는 에피토프와 상이하다.
2-특이적 항체 형태는 예를 들어, WO 2009/080251, WO 2009/080252, WO 2009/080253, WO 2009/080254, WO 2010/112193, WO 2010/115589, WO 2010/136172, WO 2010/145792, 및 WO 2010/145793 에 기재되어 있다.
용어 "항체-의존적 세포-매개되는 세포독성", 약어 "ADCC" 는 FcR 을 발현하는 비-항원 특이적 세포독성 세포 (예를 들어, 자연 살해 세포 (NK 세포), 호중구, 및 대식세포) 가 면역글로불린 Fc-영역에 결합함으로써 표적 세포를 인지하고, 후속적으로 표적 세포의 용해를 야기하는 세포-매개되는 반응이다. ADCC 을 매개하는 1 차 세포인, NK 세포는 오직 FcγRIII 만을 발현하지만, 단핵구는 FcγRI, FcγRII 및 FcγRIII 을 발현한다. 조혈 세포 상의 FcR 발현이 Ravetch and Kinet, Annu. Rev. Immunol. 9 (1991) 457-492 의 464 페이지의 표 3 에 요약되어 있다.
용어 "항체-의존적 세포성 식세포작용", 약어 "ADCP" 는 면역글로불린 Fc-영역에 결합하는 식균 면역 세포 (예를 들어, 마크로파지, 호중구, 또는 수지상 세포) 에 의해 항체-코팅된 세포가, 전체적으로 또는 부분적으로, 내부화되는 과정을 의미한다.
용어 "Fc 수용체에 결합하는" 은, 예를 들어, BIAcore(R) 검정 (Pharmacia Biosensor AB, Uppsala, Sweden) 에서, Fc 수용체에 대한 Fc-영역의 결합을 의미한다.
BIAcore(R) 검정에서 Fc 수용체는 표면에 결합되어 있고, 분석물, 예를 들어, 융합 폴리펩티드를 포함하는 Fc-영역 또는 항체의 결합은 표면 플라스몬 공명 (SPR) 에 의해 측정된다. 결합의 친화도는 용어 ka (연합 상수: Fc-영역/Fc 수용체 복합체를 형성하는 Fc-영역 융합 폴리펩티드 또는 접합체의 연합에 대한 속도 상수), kd (해리 상수; Fc-영역/Fc 수용체 복합체로부터의 Fc-영역 융합 폴리펩티드 또는 접합체의 해리에 대한 속도 상수), 및 KD (kd/ka) 에 의해 정의된다. 대안적으로, SPR 센서그램의 결합 신호는, 공명 신호 높이 및 해리 거동에 관하여, 레퍼런스의 응답 신호와 직접 비교될 수 있다.
용어 "C1q" 는 면역글로불린의 Fc-영역에 대한 결합 자리를 포함하는 폴리펩티드를 의미한다. C1q 는 2 개의 세린 프로테아제, C1r 및 C1s 와 함께, 보체 의존적 세포독성 (CDC) 경로의 제 1 성분인, 복합체 C1 을 형성한다. 인간 C1q 는, 예를 들어, Quidel, San Diego, Calif 로부터 구입할 수 있다.
용어 "CH2 도메인" 은 대략적으로 EU 위치 231 에서부터 EU 위치 340 (Kabat 에 따른 EU 번호지정 시스템) 까지 이르는 항체 중쇄 폴리펩티드의 부분을 의미한다. 하나의 구현예에서 CH2 도메인은:
APELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVWDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQESTYRWSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAK (SEQ ID NO: 30) 의 아미노산 서열을 갖는다. CH2 도메인은 또다른 도메인과 가까이에서 짝을 이루고 있지 않다는 점에서 독특하다. 대신에, 2 개의 N-연결된 분지형 탄화수소 사슬이 온전한 선천 Fc-영역의 2 개의 CH2 도메인 사이에 끼어 들어가 있다. 상기 탄수화물은 도메인-도메인 짝짓기를 대체하고 CH2 도메인 안정화를 도울 수 있다고 추측되어 왔다 (Burton, Mol. Immunol. 22 (1985) 161-206).
용어 "CH3 도메인" 은 대략적으로 EU 위치 341 에서부터 EU 위치 446 까지 이르는 항체 중쇄 폴리펩티드의 부분을 의미한다. 하나의 구현예에서 CH3 도메인은:
GQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG (SEQ ID NO: 31) 의 아미노산 서열을 갖는다.
용어 항체의 "클래스" 는 그것의 중쇄에 의해 보유되는 불변 도메인 또는 불변 영역의 유형을 의미한다. 인간에서는 항체의 5 가지 주요 클래스: IgA, IgD, IgE, IgG, 및 IgM 가 존재하고, 이들 중 여럿은 서브클래스 (동형), 예를 들어, IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1, 및 IgA2 로 추가로 분류될 수 있다. 상이한 클래스의 면역글로불린에 상응하는 중쇄 불변 도메인은 각각 α, δ, ε, γ, 및 μ 로 호칭된다.
용어 "보체-의존적 세포독성", 약어 "CDC" 는 표적-결합된 Fc-영역 융합 폴리펩티드 또는 접합체의 Fc-영역이 표적 세포 막 내에 구멍을 형성하는 것으로 끝이 나는 일련의 효소 반응을 활성화시키는 세포 사망을 유도하는 메카니즘을 의미한다. 전형적으로, 항원-항체 복합체 예컨대 항체-코팅된 표적 세포 상의 항원-항체 복합체는 보체 성분 C1q 에 결합하여 활성화시키고, 이는 결국 보체 캐스케이드를 활성화시켜 표적 세포 사망을 초래한다. 보체의 활성화는 또한 표적 세포 표면에 보체 성분의 침전을 초래하여, 백혈구 상의 보체 수용체 (예를 들어, CR3) 에 결합함으로써 ADCC 또는 ADCP 를 촉진할 수 있다.
용어 "효과기 기능" 은 항체의 Fc-영역에 기인하는 생물학적 활성이며, 항체 서브클래스에 따라 다르다. 항체 효과기 기능의 예는 하기를 포함한다: C1q 결합 및 보체 의존적 세포독성 (CDC); Fc 수용체 결합; 항체-의존적 세포-매개되는 세포독성 (ADCC); 식세포작용 (ADCP); 세포 표면 수용체 (예를 들어, B-세포 수용체) 의 하향조절; 및 B-세포 활성화. 그러한 기능은, 예를 들어, 식균 또는 용균 활성을 갖는 면역 세포 상의 Fc 수용체에 대한 Fc-영역의 결합에 의해, 또는 보체계의 성분들에 대한 Fc-영역의 결합에 의해 달성될 수 있다.
작용제, 예를 들어, 약학 조성물의 "유효량" 은 원하는 치료 또는 예방 결과를 달성하기 위한, 필요한 용량 및 시간 기간 동안의 유효량을 말한다.
용어 "감소된 효과기 기능" 은 대조군 분자 (예를 들어 야생형 Fc-영역을 갖는 폴리펩티드) 와 비교하여, 분자와 연관되는 특정 효과기 기능, 예컨대 예를 들어 ADCC 또는 CDC 의 20 % 이상의 감소를 의미한다. 용어 "크게 감소된 효과기 기능" 은 대조군 분자와 비교하여, 분자와 연관되는 특정 효과기 기능, 예컨대 예를 들어 ADCC 또는 CDC 의 50 % 이상의 감소를 의미한다.
용어 "Fc-영역" 은 면역글로불린의 C-말단 영역을 의미한다. Fc-영역은 2 개의 디설파이드-연결된 항체 중쇄 단편 (중쇄 Fc-영역 폴리펩티드 사슬) 을 포함하는 이합체 분자이다. Fc-영역은 온전한 (전장) 항체의 파파인 소화, 또는 IdeS 소화, 또는 트립신 소화에 의해 생성될 수 있거나 재조합적으로 생산될 수 있다.
전장 항체 또는 면역글로불린으로부터 수득가능한 Fc-영역은 적어도 전장 중쇄의 잔기 226 (Cys) 에서 C-말단까지를 포함하고, 따라서, 힌지 영역의 일부 및 2 개 또는 3 개의 불변 도메인, 즉, CH2 도메인, CH3 도메인, 및 IgE 및 IgM 클래스 항체 상의 부가적/추가의 CH4 도메인을 포함한다. US 5,648,260 및 US 5,624,821 로부터 Fc-영역 내의 정의된 아미노산 잔기의 수식은 표현형 효과를 초래하는 것이 알려져 있다.
2 개의 동일한 또는 동일하지 않은 항체 중쇄 단편을 포함하는 이합체 Fc-영역의 형성은 포함된 CH3 도메인의 비-공유적 이합체화에 의해 매개된다 (관여하는 아미노산 잔기에 대해 예를 들어, Dall'Acqua, Biochem. 37 (1998) 9266-9273 참고). Fc-영역은 힌지 영역 내의 디설파이드 결합의 형성에 의해 공유적으로 안정화된다 (예를 들어, Huber, et al., Nature 264 (1976) 415-420; Thies, et al., J. Mol. Biol. 293 (1999) 67-79 참고). CH3-CH3 도메인 상호작용의 이합체화를 파괴하기 위한 CH3 도메인 내의 아미노산 잔기 변화의 도입은 신생아 Fc 수용체 (FcRn) 결합에 악영향을 미치지 않는데, 그 이유는 CH3-CH3-도메인 이합체화 관여 잔기는 CH3 도메인의 내부 경계면에 위치하지만, Fc-영역-FcRn 상호작용에 관여하는 잔기는 CH2-CH3 도메인의 외부에 위치하기 때문이다.
Fc-영역의 효과기 기능과 연관되는 잔기는 힌지 영역, CH2, 및/또는 CH3 도메인 내에 위치하며, 이는 전장 항체 분자에 대해 확인되었다. Fc-영역 연관되는/매개되는 기능은 다음과 같다:
(i) 항체-의존적 세포성 세포독성 (ADCC),
(ii) 보체 (C1q) 결합, 활성화 및 보체-의존적 세포독성 (CDC),
(iii) 항원-항체 복합체의 식세포작용/제거,
(iv) 경우에 따라 사이토카인 방출, 및
(v) 항체 및 항원-항체 복합체의 반감기/제거 속도.
Fc-영역 연관되는 효과기 기능은 Fc-영역과 효과기 기능 특이적 분자 또는 수용체의 상호작용에 의해 개시된다. 주로 IgG1 서브클래스의 항체는 수용체 활성화를 달성할 수 있지만, IgG2 및 IgG4 서브클래스의 항체는 효과기 기능을 갖지 않거나 제한된 효과기 기능을 갖는다.
효과기 기능 유발 수용체는 Fc 수용체 유형 (및 하위-유형) FcγRI, FcγRII 및 FcγRIII 이다. IgG1 서브클래스와 연관되는 효과기 기능은 FcγR 및 C1q 결합에 관여하는, 하부 힌지 영역, 예컨대 L234A 및/또는 L235A 에 특정 아미노산 변화를 도입함으로써 감소될 수 있다. 또한, 특히 CH2 및/또는 CH3 도메인 내에 위치하는, 특정 아미노산 잔기는 혈류 내의 항체 분자 또는 Fc-영역 융합 폴리펩티드의 순환 반감기와 연관된다. 순환 반감기는 신생아 Fc 수용체 (FcRn) 에 대한 Fc-영역의 결합에 의해 결정된다.
Fc-영역 당구조 (glycostructure) 상에 존재하는 시알릴 잔기는 Fc-영역의 항-염증 매개되는 활성에 관여한다 (예를 들어, Anthony, R.M., et al. Science 320 (2008) 373-376 참고).
항체의 불변 영역 내의 아미노산 잔기의 번호지정은 Kabat 의 EU 인덱스에 따른다 (Kabat, E.A., et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th ed., Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD (1991), NIH Publication 91 3242).
용어 "인간 Fc-영역" 은 적어도 힌지 영역의 일부, CH2 도메인 및 CH3 도메인을 함유하는 인간 기원의 면역글로불린 중쇄의 C-말단 영역을 의미한다. 하나의 구현예에서, 인간 IgG 항체 중쇄 Fc-영역은 약 Glu216, 또는 약 Cys226, 또는 약 Pro230 에서부터, 중쇄의 카르복실-말단까지 이른다. 그러나, 항체 Fc-영역의 C-말단 라이신 (Lys447) 은 존재하거나 존재하지 않을 수 있다.
용어 "변이체 Fc-영역" 은 하나 이상의 "아미노산 변경/돌연변이" 에 의해 "선천" 또는 "야생형" Fc-영역 아미노산 서열과 상이한 아미노산 서열을 의미한다. 하나의 구현예에서 변이체 Fc-영역은 선천 Fc-영역 또는 부모 폴리펩티드의 Fc-영역과 비교하여 하나 이상의 아미노산 돌연변이, 예를 들어, 약 1 개 내지 약 10 개의 아미노산 돌연변이를 갖고, 하나의 구현예에서 선천 Fc-영역 또는 부모 폴리펩티드의 Fc-영역 내에 약 1 개 내지 약 5 개의 아미노산 돌연변이를 갖는다. 하나의 구현예에서 (변이체) Fc-영역은 야생형 Fc-영역 및/또는 부모 폴리펩티드의 Fc-영역과 약 80 % 이상의 상동성을 갖고, 하나의 구현예에서 변이체 Fc-영역은 약 90 % 상동성의 상동성을 갖고, 하나의 구현예에서 변이체 Fc-영역은 약 95 % 이상의 상동성을 갖는다.
본원에서 보고되는 변이체 Fc-영역은 함유되어 있는 아미노산 변경에 의해 정의된다. 따라서, 예를 들어, 용어 P329G 는 부모 (야생형) Fc-영역과 비교하여 아미노산 위치 329 에서 프롤린이 글라이신으로 돌연변이된 변이체 Fc-영역을 의미한다. 야생형 아미노산의 실체는 불특정 상태일 수 있고, 그러한 경우에 앞서 언급된 변이체는 329G 로 언급된다. 본 발명에서 논의되는 모든 위치에 대해, 번호지정은 EU 인덱스에 따른다. EU 인덱스 또는 Kabat 또는 EU 번호지정 규약에서와 같은 EU 인덱스는 EU 항체의 번호지정을 언급한다 (Edelman, et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 63 (1969) 78-85, 전문이 본원에 참조로 포함됨). 변경은 부가, 결실, 또는 돌연변이일 수 있다. 용어 "돌연변이" 는 자연 발생적 아미노산에 대한 변화 뿐만 아니라 비-자연 발생적 아미노산에 대한 변화를 의미하며, 예를 들어, US 6,586,207, WO 98/48032, WO 03/073238, US 2004/0214988, WO 2005/35727, WO 2005/74524, Chin, J.W., et al., J. Am. Chem. Soc. 124 (2002) 9026-9027; Chin, J.W. and Schultz, P.G., ChemBioChem 11 (2002) 1135-1137; Chin, J.W., et al., PICAS United States of America 99 (2002) 11020-11024; 및, Wang, L. and Schultz, P.G., Chem. (2002) 1-10 (모두 전문이 본원에 참조로 포함됨) 을 참고한다.
IgG1 서브클래스의 야생형 인간 Fc-영역의 폴리펩티드 사슬은 하기 아미노산 서열을 갖는다:
CPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK (SEQ ID NO: 32).
돌연변이 L234A, L235A 를 갖는 IgG1 서브클래스의 변이체 인간 Fc-영역의 폴리펩티드 사슬은 하기 아미노산 서열을 갖는다:
CPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK (SEQ ID NO: 33).
T366S, L368A 및 Y407V 돌연변이를 갖는 IgG1 서브클래스의 변이체 인간 Fc-영역의 폴리펩티드 사슬은 하기 아미노산 서열을 갖는다:
CPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVCTLPPSRDELTKNQVSLSCAVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLVSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK (SEQ ID NO: 34).
T366W 돌연변이를 갖는 IgG1 서브클래스의 변이체 인간 Fc-영역의 폴리펩티드 사슬은 하기 아미노산 서열을 갖는다:
CPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPCRDELTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK (SEQ ID NO: 35).
L234A, L235A 및 T366S, L368A 및 Y407V 돌연변이를 갖는 IgG1 서브클래스의 변이체 인간 Fc-영역의 폴리펩티드 사슬은 하기 아미노산 서열을 갖는다:
CPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVCTLPPSRDELTKNQVSLSCAVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLVSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK (SEQ ID NO: 36).
L234A, L235A 및 T366W 돌연변이를 갖는 IgG1 서브클래스의 변이체 인간 Fc-영역의 폴리펩티드 사슬은 하기 아미노산 서열을 갖는다:
CPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPCRDELTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK (SEQ ID NO: 37).
P329G 돌연변이를 갖는 IgG1 서브클래스의 변이체 인간 Fc-영역의 폴리펩티드 사슬은 하기 아미노산 서열을 갖는다:
CPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK (SEQ ID NO: 38).
L234A, L235A 및 P329G 돌연변이를 갖는 IgG1 서브클래스의 변이체 인간 Fc-영역의 폴리펩티드 사슬은 하기 아미노산 서열을 갖는다:
CPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK (SEQ ID NO: 39).
P239G 및 T366S, L368A 및 Y407V 돌연변이를 갖는 IgG1 서브클래스의 변이체 인간 Fc-영역의 폴리펩티드 사슬은 하기 아미노산 서열을 갖는다:
CPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVCTLPPSRDELTKNQVSLSCAVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLVSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK (SEQ ID NO: 40).
P329G 및 T366W 돌연변이를 갖는 IgG1 서브클래스의 변이체 인간 Fc-영역의 폴리펩티드 사슬은 하기 아미노산 서열을 갖는다:
CPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPCRDELTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK (SEQ ID NO: 41).
L234A, L235A, P329G 및 T366S, L368A 및 Y407V 돌연변이를 갖는 IgG1 서브클래스의 변이체 인간 Fc-영역의 폴리펩티드 사슬은 하기 아미노산 서열을 갖는다:
CPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVCTLPPSRDELTKNQVSLSCAVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLVSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK (SEQ ID NO: 42).
L234A, L235A, P329G 및 T366W 돌연변이를 갖는 IgG1 서브클래스의 변이체 인간 Fc-영역의 폴리펩티드 사슬은 하기 아미노산 서열을 갖는다:
CPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPCRDELTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK (SEQ ID NO: 43).
IgG4 서브클래스의 야생형 인간 Fc-영역의 폴리펩티드 사슬은 하기 아미노산 서열을 갖는다:
CPSCPAPEFLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLGK (SEQ ID NO: 44).
S228P 및 L235E 돌연변이를 갖는 IgG4 서브클래스의 변이체 인간 Fc-영역의 폴리펩티드 사슬은 하기 아미노산 서열을 갖는다:
CPPCPAPEFEGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLGK (SEQ ID NO: 45).
S228P, L235E 및 P329G 돌연변이를 갖는 IgG4 서브클래스의 변이체 인간 Fc-영역의 폴리펩티드 사슬은 하기 아미노산 서열을 갖는다:
CPPCPAPEFEGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLGSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLGK (SEQ ID NO: 46).
용어 "Fc 수용체", 약어 "FcR" 은 Fc-영역에 결합하는 수용체를 의미한다. 하나의 구현예에서 FcR 은 선천 서열 인간 FcR 이다. 더욱이, 하나의 구현예에서 FcR 은 IgG 항체에 결합하는 FcR (Fc 감마 수용체) 이고, FcγRI, FcγRII, 및 FcγRIII 서브클래스의 수용체를, 대립유전자 변이체 및 대안적으로 그의 스플라이싱된 형태 (spliced form) 를 포함하여, 포함한다. FcγRII 수용체는 FcγRIIA ("활성화 수용체") 및 FcγRIIB ("저해 수용체") 를 포함하고, 이들은 주로 그의 세포질 도메인에서 상이한 유사한 아미노산 서열을 갖는다. 활성화 수용체 FcγRIIA 는 그것의 세포질 도메인 내에 면역수용체 티로신-기반 활성화 모티프 (ITAM) 를 함유한다. 저해 수용체 FcγRIIB 는 그것의 세포질 도메인 내에 면역수용체 티로신-기반 저해 모티프 (ITIM) 를 함유한다 (예를 들어, Daeron, M., Annu. Rev. Immunol. 15 (1997) 203-234 참조). FcR 은 Ravetch and Kinet, Annu. Rev. Immunol. 9 (1991) 457-492, Capel, et al., Immunomethods 4 (1994) 25-34, de Haas, et al., J. Lab. Clin. Med. 126 (1995) 330-341 에서 리뷰되어 있다. 그 밖의 FcR 은, 장래에 식별될 것들을 포함하여, 본원에서의 용어 "FcR" 에 포괄된다. 상기 용어는 또한 신생아 수용체, FcRn 을 포함하며, 이는 어머니 IgG 의 태아로의 전달을 책임진다 (예를 들어, Guyer, et al., J. Immunol. 117 (1976) 587; Kim, et al., J. Immunol. 24 (1994) 249 참고).
용어 "Fc 감마 수용체", 약어 "FcγR" 은 IgG 항체 Fc-영역에 결합하는 단백질의 패밀리의 임의의 일원을 의미하고, FcγR 유전자에 의해 인코딩된다. 인간에서 이러한 패밀리는 FcγRI (CD64) [동형 (isoform) FcγRIA, FcγRIB, 및 FcγRIC 를 포함함], FcγRII (CD32) [동형 FcγRIIA (동종이인자형 H131 및 R131 을 포함함), FcγRIIB (FcγRIIB-1 및 FcγRIIB-2 를 포함함), 및 FcγRIIC 를 포함함], 및 FcγRIII (CD16) [동형 FcγRIIIA (동종이인자형 V158 및 F158 을 포함함) 및 FcγRIIIB (동종이인자형 FcγRIIB-NA1 및 FcγRIIB-NA2 를 포함함) 를 포함함] (예를 들어, Jefferis, et al., Immunol. Lett. 82 (2002) 57-65 참고, 전문이 참조로 포함됨), 뿐만 아니라 임의의 발견되지 않은 인간 FcγR 또는 FcγR 동형 또는 동종이인자형을 포함하나 그에 제한되지 않는다. FcγR 은, 인간, 마우스, 랫트, 토끼, 및 원숭이를 포함하나 그에 제한되지 않는, 임의의 유기체에서 기원할 수 있다. 마우스 FcγR 은 FcγRI (CD64), FcγRII (CD32), FcγRIII (CD16), 및 FcγRIII-2 (CD16-2), 뿐만 아니라 임의의 발견되지 않은 마우스 FcγR 또는 FcγR 동형 또는 동종이인자형을 포함하나 그에 제한되지 않는다. Fc-영역-FcγR 상호작용에 관여하는 아미노산 잔기는 234-239 (하부 힌지 영역), 265-269 (B/C 루프), 297-299 (D/E 루프), 및 327-332 (F/G) 루프이다 (Sondermann, et al., Nature 406 (2000) 267-273). FcγRI, FcγRIIA, FcγRIIB, 및/또는 FcγRIIIA 에 대한 감소된 결합/친화도를 초래하는 아미노산 돌연변이는 N297A (부수적으로 감소된 면역원성 및 연장된 반감기 결합/친화도와 함께) (Routledge, et al., Transplantation 60 (1995) 847; Friend, et al., Transplantation 68 (1999) 1632; Shields, et al., J. Biol. Chem. 276 (2001) 6591-6604), 잔기 233-236 (Ward and Ghetie, Ther. Immunol. 2 (1995) 77; Armour, et al., Eur. J. Immunol. 29 (1999) 2613-2624) 를 포함한다. 일부 예시적 아미노산 치환이 US 7,355,008 및 US 7,381,408 에 기재되어 있다.
용어 "신생아 Fc 수용체", 약어 "FcRn" 은 IgG 항체 Fc-영역에 결합하는 단백질을 의미하고, 적어도 부분적으로 FcRn 유전자에 의해 인코딩된다. FcRn 은 인간, 마우스, 랫트, 토끼, 및 원숭이를 포함하나 그에 제한되지 않는 임의의 유기체에서 기원할 수 있다. 기술분야에서 알려져 있는 바와 같이, 기능적 FcRn 단백질은, 흔히 중쇄 및 경쇄로 언급되는, 2 개의 폴리펩티드를 포함한다. 경쇄는 베타-2-마이크로글로불린이고, 중쇄는 FcRn 유전자에 의해 인코딩된다. 본원에서 다르게 언급되지 않으면, FcRn 또는 FcRn 단백질은 FcRn 중쇄와 베타-2-마이크로글로불린의 복합체를 언급한다. Fc-영역과 FcRn 의 상호작용 아미노산 잔기는 CH2 및 CH3 도메인의 연결지점 (junction) 근처에 있다. Fc-영역-FcRn 접촉 잔기는 모두 단일 IgG 중쇄 내에 있다. 관여하는 아미노산 잔기는 248, 250-257, 272, 285, 288, 290-291, 308-311, 및 314 (모두 CH2 도메인 내) 및 아미노산 잔기 385-387, 428, 및 433-436 (모두 CH3 도메인 내) 이다. FcRn 에 대한 증가된 결합/친화도를 초래하는 아미노산 돌연변이는 T256A, T307A, E380A, 및 N434A 를 포함한다 (Shields, et al., J. Biol. Chem. 276 (2001) 6591-6604).
용어 "전장 항체" 는 선천 항체 구조와 실질적으로 동일한 구조 및 아미노산 서열을 갖는 항체 뿐만 아니라 본원에서 보고되는 Fc-영역을 포함하는 폴리펩티드를 의미한다.
용어 "전장 항체 중쇄" 는 N- 에서 C-말단 방향으로 항체 가변 도메인, 제 1 불변 도메인, 항체 중쇄 힌지 영역, 제 2 불변 도메인, 및 제 3 불변 도메인을 포함하는 폴리펩티드를 의미한다.
용어 "항체 중쇄 Fc-영역" 은 항체 중쇄 힌지 영역, 제 1 불변 도메인, 및 제 2 불변 도메인을 포함하는 폴리펩티드를 의미한다.
용어 "전장 항체 경쇄" 는 N- 에서 C-말단 방향으로 항체 가변 도메인 및 불변 도메인을 포함하는 폴리펩티드를 의미한다.
용어 "힌지 영역" 은 야생형 항체 중쇄 내에서 CH1 도메인 및 CH2 도메인을 연결하는 항체 중쇄 폴리펩티드의 부분, 예를 들어 Kabat 의 EU 번호 시스템에 따른 위치 216 근처에서부터 위치 230 근처까지, 또는 Kabat 의 EU 번호 시스템에 따른 위치 226 근처에서부터 위치 230 근처까지를 의미한다. 그 밖의 IgG 서브클래스의 힌지 영역은 IgG1 서브클래스 서열의 힌지-영역 시스테인 잔기와 나란히 정렬시킴으로써 확인될 수 있다.
힌지 영역은 보통 동일한 아미노산 서열을 갖는 2 개의 폴리펩티드로 이루어지는 이합체 분자이다. 힌지 영역은 일반적으로 약 25 아미노산 잔기를 포함하고, 유연하여 항원 결합 영역이 독립적으로 움직이는 것을 허용한다. 힌지 영역은 3 개의 도메인으로 하위분류될 수 있다: 상부, 중간, 및 하부 힌지 도메인 (예를 들어, Roux, et al., J. Immunol. 161 (1998) 4083 참고).
용어 Fc-영역의 "하부 힌지 영역" 은 힌지 영역의 바로 C-말단에 있는 아미노산 잔기의 스트레치 (stretch), 즉, Kabat 의 EU 번호지정에 따른 Fc-영역의 잔기 233 내지 239 를 의미한다.
용어 "야생형 Fc-영역" 은 자연에서 발견되는 Fc-영역의 아미노산 서열과 동일한 아미노산 서열을 의미한다. 야생형 인간 Fc-영역은 선천 인간 IgG1 Fc-영역 (비-A 및 A 동종이인자형), 선천 인간 IgG2 Fc-영역, 선천 인간 IgG3 Fc-영역, 및 선천 인간 IgG4 Fc-영역 뿐만 아니라 그의 자연 발생적 변이체를 포함한다.
용어 "개체" 또는 "대상" 은 포유류를 의미한다. 포유류에는 가축 (예를 들어, 소, 양, 고양이, 개 및 말), 영장류 (예를 들어, 인간 및 비-인간 영장류, 예컨대 원숭이), 토끼 및 설치류 (예를 들어, 마우스 및 랫트) 가 포함되나 이에 제한되는 것은 아니다. 특정 구현예에서, 개체 또는 대상은 인간이다.
기준 폴리펩티드 서열에 대한 "퍼센트 (%) 아미노산 서열 동일성" 은 서열을 정렬하고, 갭을 도입하여 (필요한 경우) 최대 퍼센트 서열 동일성을 획득하고, 임의의 보존적 치환을 서열 동일성의 일부로서 간주하지 않은 후의 기준 폴리펩티드 서열 내의 아미노산 잔기와 동일한 후보 서열 내의 아미노산 잔기의 백분율로서 정의된다. 퍼센트 아미노산 서열 동일성을 결정하기 위한 목적의 정렬은 당해 기술분야의 통상의 기술에 속하는 다양한 방식으로, 예를 들어, 공개적으로 입수가능한 컴퓨터 소프트웨어 예컨대 BLAST, BLAST-2, ALIGN 또는 Megalign (DNASTAR) 소프트웨어를 사용하여 달성될 수 있다. 당해 기술분야의 통상의 기술자는 비교되는 서열의 전체 길이에 걸쳐 최대 정렬을 획득하는데 필요한 임의의 알고리즘을 포함하여, 서열 정렬에 적당한 파라미터를 결정할 수 있다. 본원에서의 목적을 위해, 그러나, % 아미노산 서열 동일성 값은 서열 비교 컴퓨터 프로그램 ALIGN-2 를 사용하여 생성된다. ALIGN-2 서열 비교 컴퓨터 프로그램은 저작자가 Genentech, Inc. 이고, 소스 코드는 사용자 문서와 함께 미국 저작권청 (U.S. Copyright Office, Washington D.C., 20559) 에 제출되었고, 미국 저작권 등록 번호 TXU510087 로 등록되어 있다. ALIGN-2 프로그램은 Genentech, Inc., South San Francisco, California 로부터 공개적으로 입수가능하고, 또는 소스 코드로부터 컴파일될 수 있다. ALIGN-2 프로그램은 디지탈 UNIX V4.0D 를 포함하는, UNIX 운영 체제에서 사용하기 위해 컴파일되어야 한다. 모든 서열 비교 파라미터는 ALIGN-2 프로그램에 의해 설정되고, 다르지 않다.
ALIGN-2 가 아미노산 서열 비교에 이용되는 상황에서, 주어진 아미노산 서열 B 와의, 또는 그에 대한 주어진 아미노산 서열 A 의 % 아미노산 서열 동일성 (이는 대안적으로 주어진 아미노산 서열 B 와의, 또는 그에 대한 특정 % 아미노산 서열 동일성을 갖는 또는 포함하는 주어진 아미노산 서열 A 로서 표현될 수 있음) 은 다음과 같이 계산된다:
100 곱하기 분수 X/Y
여기서, X 는 서열 정렬 프로그램 ALIGN-2 에 의해 그 프로그램의 A 및 B 의 정렬에서 동일한 매치 (match) 로서 채점된 아미노산 잔기의 개수이고, Y 는 B 내의 아미노산 잔기의 총수임. 아미노산 서열 A 의 길이가 아미노산 서열 B 의 길이와 동일하지 않은 경우에, B 에 대한 A 의 % 아미노산 서열 동일성은 A 에 대한 B 의 % 아미노산 서열 동일성과 동일하지 않다고 이해될 것이다. 구체적으로 다르게 언급되지 않으면, 본원에서 사용되는 모든 % 아미노산 서열 동일성 값은 바로 직전 단락에서 기재된 바와 같이 ALIGN-2 컴퓨터 프로그램을 사용하여 수득된다.
용어 "약학 조성물" 은 그안에 함유된 활성 성분의 생물학적 활성이 효과적이도록 허용하는 형태이고, 제형이 투여될 대상에게 수용불가능할 정도로 독성인 부가적 성분을 함유하지 않는 제제를 의미한다.
"약학적으로 허용가능한 담체" 는 대상에게 비독성인, 활성 성분 이외의, 약학 조성물 내의 성분을 의미한다. 약학적으로 허용가능한 담체는 완충액, 부형제, 안정화제, 또는 보존제를 포함하나, 그에 제한되지 않는다.
용어 "환자의 표현형" 은 환자로부터의 세포 종류 내의 세포 표면 수용체의 조성을 의미한다. 조성은 정량적 뿐 아니라 정성적 조성일 수 있다. 유전자형이 결정되는/제시되는 세포는 단일 세포 또는 다중 세포를 포함하는 샘플일 수 있다.
용어 "위치" 는 폴리펩티드의 아미노산 서열 내의 아미노산 잔기의 위치를 의미한다. 위치는 순차적으로, 또는 확립된 형식, 예를 들어 항체 번호지정에 관한 Kabat 의 EU 인덱스에 따라 번호지정될 수 있다.
용어 "변경된" FcR 결합 친화도 또는 ADCC 활성은 부모 폴리펩티드 (예를 들어, 야생형 Fc-영역을 포함하는 폴리펩티드) 와 비교하여 증강된 또는 감소된 FcR 결합 활성 및/또는 ADCC 활성을 갖는 폴리펩티드를 의미한다. FcR 에 대한 "증가된 결합도를 갖는" 변이체 폴리펩티드는 하나 이상의 FcR 에 부모 또는 야생형 폴리펩티드보다 더 낮은 해리 상수 (즉, 더 나은/더 높은 친화도) 로 결합한다. FcR 에 대한 "감소된 결합도를 갖는" 폴리펩티드 변이체는 하나 이상의 FcR 에 부모 또는 야생형 폴리펩티드보다 더 높은 해리 상수 (즉, 더 나쁜/더 낮은 친화도) 로 결합한다. FcR 에 대한 감소된 결합도를 나타내는 그러한 변이체는 야생형 또는 부모 IgG Fc-영역과 비교하여 FcR 에 대한 적은 또는 눈에 띄지 않는 결합도, 예를 들어, 0 - 20 % 를 보유할 수 있다.
FcR 에 부모 또는 야생형 폴리펩티드와 비교하여 "감소된 친화도" 로 결합하는 폴리펩티드는, 결합 검정에서 폴리펩티드 변이체 및 부모 폴리펩티드의 양이 (본질적으로) 대략 동일할 때, 위에 식별된 FcR 중 임의의 하나 이상에 부모 폴리펩티드에 비해 (실질적으로) 감소된 결합 친화도로 결합하는 폴리펩티드이다. 예를 들어, 감소된 FcR 결합 친화도를 갖는 폴리펩티드 변이체는 FcR 결합 친화도가 결정되는 부모 폴리펩티드와 비교하여 FcR 결합 친화도에서 약 1.15 배 내지 약 100 배, 예를 들어, 약 1.2 배 내지 약 50 배 감소를 나타낼 수 있다.
부모 폴리펩티드보다 "덜 효과적으로 인간 효과기 세포의 존재 하에 항체-의존적 세포-매개되는 세포독성 (ADCC) 을 매개하는" 변이체 Fc-영역을 포함하는 폴리펩티드는 시험관내에서 또는 생체내에서 검정에서 사용되는 변이체 폴리펩티드 및 부모 폴리펩티드의 양이 (본질적으로) 대략 동일할 때 ADCC 의 매개에서 (실질적으로) 덜 효과적인 것이다. 일반적으로, 그러한 변이체는 본원에 개시된 시험관내 ADCC 검정을 사용하여 식별될 것이나, 예를 들어, 동물 모델 등에서, ADCC 활성을 확인하는 기타 검정 또는 방법이 고려된다. 하나의 구현예에서 변이체는, 예를 들어, 본원에 개시된 시험관내 검정에서 부모보다 ADCC 의 매개에서 약 1.5 배 내지 약 100 배, 예를 들어, 약 2 개의 배 내지 약 50 배 덜 효과적이다.
용어 "수용체" 는 하나 이상의 리간드에 결합할 수 있는 폴리펩티드를 의미한다. 하나의 구현예에서 수용체는 세포외 리간드-결합 도메인 및, 임의로, 기타 도메인 (예를 들어, 막관통 도메인, 세포내 도메인 및/또는 막 앵커 (anchor)) 을 갖는 세포-표면 수용체이다. 본원에 기재된 검정에서 평가되는 수용체는 온전한 수용체 또는 그의 단편 또는 유도체 (예를 들어, 하나 이상의 이종 폴리펩티드에 융합된 수용체의 결합 도메인을 포함하는 융합 단백질) 일 수 있다. 더욱이, 그것의 결합 특성에 대해 평가되는 수용체는 세포 내에 존재하거나 단리되고 임의로 검정 플레이트 또는 일부 기타 고상에 코팅될 수 있다.
본원에 사용되는 바와 같은, "치료" (및 이의 문법적 변형, 예컨대 "치료하다" 또는 "치료하기") 는 치료하고자 하는 개체의 자연적 경과를 변형하기 위한 시도의 임상적 개입을 말하고, 예방을 위해 또는 임상 병리학 과정 동안 수행될 수 있다. 원하는 치료 효과에는 질환의 발생 또는 재발 방지, 증상의 경감, 질환의 임의의 직접적 또는 간접적 병리학적 결과의 소실, 전이 방지, 질환 진행 속도의 감소, 질환 상태의 개선 또는 완화, 및 차도 또는 개선된 예후가 포함되나 이에 제한되는 것은 아니다. 일부 구현예에서, 본 발명의 항체는 질환의 발달을 지연시키거나 질환의 진행을 저하시키기 위해 사용된다.
II. 맞춤-제조된 다중특이적 결합 분자
대부분의 세포 기반 질환에서, 수용체 분자의 항체 기반 결합을 통한 질환-관련 세포의 표적화는 하나의 유망한 접근법이다. 그러나, 임상적으로 관련된 표면 수용체 (=표적) 의 발현 수준은 환자마다 상이하며, 표준화된 항체 기반 약물의 효능이 따라서 상이하다. 이것은 그 작용 방식이 2 개의 상이한 에피토프/수용체를 동시에 표적하는 것인 2-특이적 및 다중특이적 결합 분자에 특이적으로 적용된다.
하나의 유망한 접근법은 각각의 환자의 특정한/개별 상황에 대해 특이적으로 약물 (본원에서, 2-특이적 또는 다중특이적 결합 분자) 을 디자인하는 것이다.
개체로부터의 각각의 세포는 발현된 세포 표면 분자, 예컨대 수용체의 관점에서 수 및 종류가 상이하다. 이것은 특히 암 세포 및 비-암 세포에 대해 사실이다. 따라서, 세포는 제시된 세포 표면 분자를 특징으로 할 수 있다.
환자의 질환-관련 세포 상의 임상적으로 관련된 표면 수용체의 발현 프로파일 데이터에 근거해, 일련의 결합 단위 (예를 들어, Fab 단편) 는 라이브러리로부터 특이적으로 선택되고, 환자 특이적 약물로서 다중특이적 결합 분자와 조합된다. 상기 선별된 결합 분자는 예를 들어, 표면 수용체의 발현 수준, 및 따라서 개별 환자의 필요 및 표현형에 근거하여, 각각의 질환-관련 세포, 예컨대 종양 세포에 대해 특이적으로 선택된다.
이러한 특성은 시험관 내 및 생체 내 기반 세포 이미지화 기법에 의해 영향을 받을 수 있다. 생체 내 이미지화 기법에는 예를 들어, 광학 이미지화, 분자 이미지화, 형광 이미지화, 생체발광 이미지화, MRI, PET, SPECT, CT, 및 인트라바이탈 현미경이 포함된다. 시험관 내 이미지화 기법에는 예를 들어, 특이적 세포 표면 마커를 인지하는 예를 들어 형광 표지된 항체로 환자 세포를 면역조직화학 염색하고 현미경에 의해 형광 신호를 분석하는 것이 포함된다. 대안적으로 세포의 유전자형/표현형은 FACS-기반 방법을 사용하여 표지된 치료 또는 진단 항체로 염색 후 분석할 수 있다.
하나의 구현예에서, 환자-유래 세포의 유전자형/표현형은 FACS-기반 방법에 의해 결정된다. 하나의 구현예에서, 세포 표면 마커는 형광 표지된 진단 또는 치료 항체를 사용함으로써 결정된다. 하나의 구현예에서, 형광 표지된 치료 항체가 사용된다.
특정 질환은 특이적 세포 표면 분자의 수의 변화 또는 신규한 세포 표면 분자의 발생과 연관될 수 있다.
이러한 질환에 의해 영향을 받은 개체는 특정 범위 내에서 질환 및/또는 개체-특이적 세포 표면 마커 패턴을 나타낼 것이다.
이것은 이러한 개체에게 맞춤-제작된, 표적화된 치료법을 제공하기 위해 고려해야만 한다.
세포 표면 분자 및 이들의 리간드에 대한 다수의 치료 항체는 맞춤-제작된 다중-특이적 표적화 단위의 선별 및 구축을 위해 사용될 수 있는 것, 예컨대 리툭산 (Rituxan)/MabThera/리툭시맙 (Rituximab), 2H7/오크렐리주맙 (Ocrelizumab), 제발린 (Zevalin)/이브리주모맙 (Ibrizumomab), Arzerra/오파투무맙 (Ofatumumab) (CD20), HLL2/에프라투주맙 (Epratuzumab), 이노투조맙 (Inotuzomab) (CD22), Zenapax/다실리주맙 (Daclizumab), Simulect/바실리시맙 (Basiliximab) (CD25), 허셉틴 (Herceptin)/트라스투주맙 (Trastuzumab), 페르투주맙(Pertuzumab) (Her2/ERBB2), Mylotarg/젬투주맙 (Gemtuzumab) (CD33), Raptiva/에팔리주맙 (Efalizumab) (Cd11a), Erbitux/세툭시맙 (Cetuximab) (EGFR, 표피 성장 인자 수용체), IMC-1121B (VEGF 수용체 2), Tysabri/나탈리주맙 (Natalizumab) (α4ß1 및 α4ß7 인테그린의 α4-서브유닛), ReoPro/압식시맙 (Abciximab) (gpIIb-gpIIa 및 αvß3-인테그린), Orthoclone OKT3/무로모납 (Muromonab)-CD3 (CD3), Benlysta/벨리무맙 (Belimumab) (BAFF), Tolerx/오텔리시맙 (Oteliximab) (CD3), Soliris/에쿨리주맙 (Eculizumab) (C5 보체 단백질), Actemra/토실리주맙 (Tocilizumab) (IL-6R), Panorex/에드레콜로맙 (Edrecolomab) (EpCAM, 상피 세포 부착 분자), CEA-CAM5/라베투주맙 (Labetuzumab) (CD66/CEA, 암-배아 항원), CT-11 (PD-1, 프로그램된 사멸-1 T-세포 억제 수용체, CD-d279), H224G11 (c-Met 수용체), SAR3419 (CD19), IMC-A12/시숙투무맙 (Cixutumumab) (IGF-1R, 인슐린-유사 성장 인자 1 수용체), MEDI-575 (PDGF-R, 혈소판-유래 성장 인자 수용체), CP-675, 206/트레멜리무맙 (Tremelimumab) (세포독성 T 림프구 항원 4), RO5323441 (태반 성장 인자 또는 PGF), HGS1012/마파투무맙 (Mapatumumab) (TRAIL-R1), SGN-70 (CD70), Vedotin(SGN-35)/브렌투시맙 (Brentuximab) (CD30), 및 ARH460-16-2 (CD44) 로 공지된다.
예를 들어, 환자의 샘플에 존재하는 세포 표면 마커의 결정을 위해서, 상이한 방법이 알려져 있다. 하나의 예시적인 방법은 형광 활성화된 세포 분류 (FACS), 특히, 특이적으로 염색되고 분류된 세포 집단의 분석에 기반한 것이다. 본 방법에서, 샘플 (세포 집단) 의 표현형화는 세포 집단 내 표면 마커의 통계적 분포를 임의로 포함하여, 상기 마커에 대해 형광 표지된 항체를 사용하는 제시된 세포 표면 마커에 대해 개별 세포를 분석함으로써 달성된다. 상기 맞춤-제작된 다중특이적 결합 분자가 진단 항체와 동일한 에피토프에 결합할 것이라는 것이 확실하므로, 상기 목적을 위해 형광 표지로 표지된 치료 항체를 사용하는 것이 특히 적합하다. 본원에 보고된 다중특이적 결합 분자/2-특이적 항체는 예를 들어, 종양 질환, 심혈관 질환, 감염성 질환, 염증성 질환, 자가면역 질환, 대사성 (예를 들어, 내분비성) 질환, 또는 신경학적 (예를 들어, 신경병성) 질환의 치료를 위한 의약의 제조에서 사용될 수 있다. 상기 질환의 예시적인 비-제한적인 예는 알쯔하이머 질환, 비-호지킨 림프종, B-세포 급성 및 만성 림프구성 백혈병, 버킷 림프종, 호지킨 림프종, 모발 세포 백혈병, 급성 및 만성 골수성 백혈병, T-세포 림프종 및 백혈병, 다발성 골수종, 신경교종, 발덴스트롬 마크로글로불린혈증, 상피성 암종 (예컨대 구강, 위장관, 결장, 위, 폐의 관, 폐, 유방, 난소, 전립선, 자궁, 자궁내막, 자궁경부, 방광, 췌장, 뼈, 간, 담낭, 신장, 피부, 및 고환의 암종), 흑색종, 육종, 신경교종, 및 피부 암, 급성 특발 혈소판감소 자색반증, 만성 특발 혈소판감소 자색반증, 피부근염, 시드남 무도병, 중증 근무력증, 전신 홍반성 루프스, 홍반성 신염, 류마티스성 열, 다선성 증후군, 수포성 유천포창, 진성 당뇨병, 헤노흐-쇤라인 자반병, 연쇄상 구균감염후 사구체 신염, 결절성 홍반, 타카야수 동맥염, 에디슨 질환, 류머티스성 관절염, 다발성 경화증, 유육종증, 궤양성 대장염, 다형홍반, IgA 신증, 결절성 다발성 동맥염, 강직성 척추염, 굿파스처 증후군, 폐쇄성 혈전혈관염, 쇼그렌 증후군, 원발성 담즙성 간경변, 하시모토 갑상선염, 갑상샘항진증, 공피증, 만성 활성 간염, 다발근육염/피부근염, 다발연골염, 심상성 천포창, 베게너 육아종증, 막성 콩팥병, 근위축성 측삭 경화증, 척수매독, 거세포 동맥염/다발근육통증, 악성 빈혈, 급속 진행 사구체신염, 건선, 또는 섬유성 폐렴이다.
다수의 세포 표면 마커 및 이들의 리간드가 알려져 있다. 예를 들어, 암 세포는 하기를 포함하나 이에 제한되지 않는 하기 세포 표면 마커 및 또는 리간드 중 하나를 발현하는 것으로 보고되어 있다: 탄산 탈수효소 IX, 알파 태아단백질, 알파-액티닌-4, A3 (A33 항체에 특이적인 항원), ART-4, B7, Ba-733, BAGE, BrE3-항원, CA125, CAMEL, CAP-1, CASP-8/m, CCCL19, CCCL21, CD1, CD1a, CD2, CD3, CD4, CDS, CD8, CD1-1A, CD14, CD15, CD16, CD18, CD19, CD20, CD21, CD22, CD23, CD25, CD29, CD30, CD32b, CD33, CD37, CD38, CD40, CD40L, CD45, CD46, CD54, CD55, CD59, CD64, CD66a-e, CD67, CD70, CD74, CD79a, CD80, CD83, CD95, CD126, CD133, CD138, CD147, CD154, CDC27, CDK-4/m, CDKN2A, CXCR4, CXCR7, CXCL12, HIF-1-알파, 결장-특이적 항원-p (CSAp), CEA (CEACAM5), CEACAM6, c-met, DAM, EGFR, EGFRvIII, EGP-1, EGP-2, ELF2-M, Ep-CAM, Flt-1, Flt-3, 엽산 수용체, G250 항원, GAGE, GROB, HLA-DR, HM1.24, 인간 융모막 성 생식선 자극 호르몬 (HCG) 및 이의 서브유닛, HER2/neu, HMGB-1, 저산소증 유도 인자 (HIF-1), HSP70-2M, HST-2or la, IGF-1R, IFN-감마, IFN-알파, IFN-베타, IL-2, IL-4R, IL-6R, IL-13R, IL-15R, IL-17R, IL-18R, IL-6, IL-8, IL-12, IL-15, IL-17, IL-18, IL- 25, 인슐린-유사 성장 인자-1 (IGF-1), KC4-항원, KS-1-항원, KS1-4, Le-Y, LDR/FUT, 대식세포 이동 억제 인자 (MIF), MAGE, MAGE-3, MART-1, MART-2, NY-ESO-1, TRAG-3, mCRP, MCP-1, MIP-1A, MIP-1B, MIF, MUC1, MUC2, MUC3, MUC4, MUC5, MUM-1/2, MUM-3, NCA66, NCA95, NCA90, 췌장암 뮤신, 태반 성장 인자, p53, PLAGL2, 프로스타트산 (prostatic acid) 포스파타아제, PSA, PRAME, PSMA, P1GF, ILGF, ILGF-1R, IL-6, IL-25, RS5, RANTES, T101, SAGE, S100, 서바이빈, 서바이빈-2B, TAC, TAG-72, 테나신, TRAIL 수용체, TNF-알파, Tn-항원, Thomson-Friedenreich 항원, 종양 괴사 항원, VEGFR, ED-B 피브로넥틴, WT-1, 17-1A-항원, 보체 인자 C3, C3a, C3b, C5a, C5, 혈관형성 마커, bcl-2, bcl-6, Kras, cMET, 종양 마커 및 종양 생성물 (예를 들어, Sensi, et al., Clin. Cancer Res. 12 (2006) 5023-5032; Parmiani, et al, J. Immunol. 178 (2007) 1975-1979; Novellino, et al., Cancer Immunol. Immunother. 54 (2005) 187-207 참조).
따라서, 리간드를 비롯한 특이적 세포 표면 수용체를 인지하는 항원은 질환과 연관된 다수의 세포 표면 마커에 특이적이고 선택적으로 표적화하고 결합하는데 사용될 수 있다. 세포 표면 마커는 예를 들어, 신호 사건 또는 리간드 결합과 관련된 세포 (예를 들어, 질환-관련 세포) 의 표면에 위치한 폴리펩티드이다.
하나의 구현예에서, 암/종양의 치료를 위해 종양-연관 항원을 표적하는 다중특이적 결합 분자/2-특이적 항체, 예컨대 문헌 Herberman, "Immunodiagnosis of Cancer", in Fleisher (ed.), "The Clinical Biochemistry of Cancer", 페이지 347 (American Association of Clinical Chemists (1979)) 및 US 4,150,149; US 4,361,544; 및 US 4,444,744 에 보고된 것이 사용된다.
종양 연관 항원 (TAA) 에 대한 보고서에는 Mizukami, et al., (Nature Med. 11 (2005) 992-997); Hatfield, et al., (Curr. Cancer Drug Targets 5 (2005) 229-248); Vallbohmer, et al., (J Clin. Oncol. 23 (2005) 3536-3544); 및 Ren, et al., (Ann. Surg. 242 (2005) 55-63) 이 포함되고, 각각은 확인된 TAA 와 관련하여 참조로서 본원에 인용된다.
질환이 림프종, 백혈병 또는 자가면역 질환과 연관되는 경우, 표적된 항원은 CD4, CD5, CD8, CD14, CD15, CD19, CD20, CD21, CD22, CD23, CD25, CD33, CD37, CD38, CD40, CD40L, CD46, CD54, CD67, CD74, CD79a, CD80, CD126, CD138, CD154, CXCR4, B7, MUC1 또는 la, HM1.24, HLA-DR, 테나신, VEGF, P1GF, ED-B 피브로넥틴, 종양유전자, 종양유전자 생성물 (예를 들어, c-met 또는 PLAGL2), CD66a-d, 괴사 항원, IL-2, T101, TAG, IL-6, MIF, TRAIL-R1 (DR4) 및 TRAIL-R2 (DR5) 로 이루어지는 군으로부터 선택될 수 있다.
다수의 2-특이적 항체는 2 개의 상이한 표적, 예컨대 BCMA/CD3, 조합으로의 HER 계열의 상이한 항원 (EGFR, HER2, HER3), CD19/CD3, IL17RA/IL7R, IL-6/IL-23, IL-1-베타/IL-8, IL-6 또는 IL 6R/ IL-21 또는 IL-21R 에 대항하는 것으로 알려져 있고, 첫번째 특이성은 Lewis x-, Lewis b- 및 Lewis y-구조, Globo H-구조, KH1, Tn-항원, TF-항원 및 뮤신 (Mucin) 의 탄화수소 구조, CD44, 당지질 및 당스핑고지질, 예컨대 Gg3, Gb3, GD3, GD2, Gb5, Gm1, Gm2, 시알릴테트라오실세라마이드로 이루어지는 군으로부터 선택되는 항원의 당에피토프 (glycoepitope) 에 대한 것이고, 두번째 특이성은 EGFR, HER2, HER3 및 HER4 로 이루어지는 군으로부터 선택되는 ErbB 수용체 티로신 키나아제에 대한 것이고, 두번째 항원 결합 부위와 조합으로의 GD2 는 T 림프구 NK 세포, B-림프구, 수지상 세포, 단핵구, 대식세포, 호중구, 간엽 줄기 세포, 신경 줄기 세포, ANG2/VEGF, VEGF/PDGFR-베타, 혈관 내피 성장 인자 (VEGF) 허용체 2/CD3, PSMA/CD3, EPCAM/CD3 으로 이루어지는 군으로부터 선택되는 면역학적 세포와 연관되고, 항원의 조합은 VEGFR-1, VEGFR-2, VEGFR-3, FLT3, c FMS/CSF1R, RET, c-Met, EGFR, Her2/neu, HER3, HER4, IGFR, PDGFR, c-KIT, BCR, 인테그린 및 MMP 로 이루어지는 군으로부터 선택되고, 수용성 리간드는 VEGF, EGF, PIGF, PDGF, HGF, 및 안지오포이에틴, ERBB-3/C-MET, ERBB-2/C-MET, EGF 수용체 1/CD3, EGFR/HER3, PSCA/CD3, C-MET/CD3, ENDOSIALIN/CD3, EPCAM/CD3, IGF-1R/CD3, FAPALPHA/CD3, EGFR/IGF-1R, IL 17A/F, EGF 수용체 1/CD3, 및 CD19/CD16 으로 이루어지는 군으로부터 선택된다.
따라서, 본원에 보고된 모듈화 접근법을 사용함으로써 맞춤-제작된 2-특이성 치료 항체가 제공될 수 있다는 것이 밝혀졌다. 상기 항체는 그러한 세포 표면 분자와 상호작용하는 리간드에 대해 또는 치료를 필요로 하는 개체의 세포 상에 실제로 존재하는 세포 표면 분자에 대해 맞춤-제작된다. 개체의 세포 표면 분자 상태를 결정함으로써 치료 표적의 맞춤-제작 조합을 선택할 수 있다.
2 개의 상이한 에피토프에 대한 동시 표적 및 결합을 위해 2 개의 단일 치료 분자의 조합에 의한 2-특이적 치료제의 상기 맞춤-제작 생성으로, 단일 치료 분자와 비교하여 첨가/시너지 효과가 예상될 수 있다.
이미 이용가능한 1-특이적 치료 결합 단위, 예컨대 치료 항체로부터 유래되는 것을 사용함으로써, 필요한 다중특이적 결합 분자의 빠르고 손쉬운 생성이 달성될 수 있다.
상기 결합능 (avidity) 조작된 결합 분자/항체는 단일 세포 상에 존재하는 2 개 이상의 세포 표면 마커에 결합될 수 있다. 상기 결합은 모든/양쪽 결합 단위가 세포에 동시에 결합하는 경우에만 결합 (avid) 된다. 상기 목적을 위해 중간 내지 낮은 친화성의 항체가 특히 적합하다. 이것은 또한 한편으로는 스크리닝 과정 동안 결합 특이성의 덜 특이적인 조합을 배제하는 것을 가능하게 한다.
선택된 환자 특이적 다중특이적 결합 분자는 관련 범주에 대해 다양한 세포 시험관 내 검정/세포 샘플에서 시험될 수 있다 (예를 들어, 최적 결합/결합 파트너, 최적 연결자 길이 등):
- 포스포 티로신 키나아제의 인산화 상태의 측정
- c-Jun N-말단 키나아제 (JNK) 억제의 측정
- 분자 유도된 세포자멸사의 측정
- 1-특이적 대 다중특이적 결합 분자로 실시한 결합 검정
- 증식 억제의 측정
이러한 접근법으로 맞춤-제작의 발생 및, 따라서, 고도로 효과적인 치료 분자가 가능하다. 상기 분자는 개선된 표적/전달 (예를 들어, 종양 세포에 대한 적재량) 에 의해 감소된 부작용을 보일 것이고, 표적 세포에 대한 개선된 표적화는 표적 성분의 높은 선택성 및 특이성 (2 개 이상의 결합 분자를 포함하는) 을 기반으로 한다.
다중특이적 결합 분자의 더 높은 선택성 및 특이성은 2 개의 "저 친화성" 결합제의 조합에 의한 동시 결합 (결합능) 때문이고, 이것은 가능한 "표적을 벗어난" 결합을 감소시킨다.
본원에 보고되는 방법
본원에 보고되는 하나의 양상은 하기 단계를 포함하는 2-특이적 항체의 제조 방법이다:
하기 (i) 내지 (iii) 을 인큐베이션하여:
(i) 20 개의 C-말단 아미노산 잔기 내에 아미노산 서열 LPX1TG (SEQ ID NO: 01, 식 중 X1 은 임의의 아미노산 잔기일 수 있음) 을 포함하는 항체 Fab 단편 또는 scFv 항체,
(ii) 전장 항체 중쇄, 전장 항체 경쇄, 및 항체 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드를 포함하는 항체 단편,
전장 항체 중쇄 및 전장 항체 경쇄는 동족 항체 사슬이고 이의 가변 도메인 (VH 및 VL) 의 쌍은 항원 결합 부위를 형성하고,
전장 항체 중쇄 및 항체 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드는 항체 힌지 영역을 형성하는 하나 이상의 디설파이드 결합을 통해 서로 공유 연결되고,
항체 중쇄 Fc-영역은 그의 N-말단에 올리고글라이신 아미노산 서열을 가짐,
및
(iii) 소르타제 A 효소,
2-특이적 항체를 제조하는 단계.
본원에 보고되는 하나의 양상은 하기 단계를 포함하는 2-특이적 항체의 제조 방법이다:
(i) 샘플 내의 세포의 표면 상에 존재하는 표면 마커를 결정하고 첫번째 표면 마커 및 두번째 표면 마커를 선별하는 단계,
(ii) (a) 20 개의 C-말단 아미노산 잔기 내에 아미노산 서열 LPX1TG (SEQ ID NO: 01, 식 중 X1 은 임의의 아미노산 잔기일 수 있음) 를 포함하는 항체 Fab 단편 또는 scFv 항체 단편, Fab 단편 또는 scFv 는 첫번째 표면 마커에 특이적으로 결합함, (b) 전장 항체 중쇄, 전장 항체 경쇄, 및 항체 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드를 포함하는 항체 단편, 전장 항체 중쇄 및 전장 항체 경쇄는 동족 항체 사슬이고 이의 가변 도메인 (VH 및 VL) 의 쌍은 두번째 표면 마커에 특이적으로 결합하는 항원 결합 부위를 형성하고, 전장 항체 중쇄 및 항체 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드는 항체 힌지 영역을 형성하는 하나 이상의 디설파이드 결합에 의해 서로 공유 연결되고, 항체 중쇄 Fc-영역은 그의 N-말단에 올리고글라이신 아미노산 서열을 가짐, 및 (c) 소르타제 A 효소를 인큐베이션하는 단계
및 이에 의해 2-특이적 항체를 제조하는 단계.
본원에 보고되는 하나의 양상은 하기 단계를 포함하는 항원 결합 부위의 조합의 결정 방법이다:
(i) 첫번째 다수의 항체 Fab 단편 또는 scFv 항체 단편의 각각의 일원과, 전장 항체 중쇄, 전장 항체 경쇄, 및 항체 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드를 포함하는 두번째 다수의 항체 단편의 각각의 일원을 조합함으로써 제조되는, 다수의 2-특이적 항체의 결합 특이성 및/또는 친화성 및/또는 효과기 기능 및/또는 생체 내 반감기를 결정하는 단계,
첫번째 다수는 첫번째 세포 표면 분자에 특이적으로 결합하고, 두번째 다수는 두번째 세포 표면 분자에 특이적으로 결합함,
및
(ii) 적합한 결합 특이성 및/또는 친화성 및/또는 효과기 기능 및/또는 생체 내 반감기를 가진 2-특이적 항체를 선택하여, 항원 결합 부위의 조합을 결정하는 단계.
하나의 구현예에서, 조합은 항체 Fab 단편 또는 scFv 항체 단편 및 전장 항체 중쇄, 전장 항체 경쇄, 및 항체 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드를 포함하는 항체 단편을, 소르타제 A 효소와 인큐베이션하는 것을 특징으로 한다.
하나의 구현예에서, Fab 단편 또는 scFv 항체 단편은 20 개의 C-말단 아미노산 잔기 내에 아미노산 서열 LPX1TG (SEQ ID NO: 01, 식 중 X1 은 임의의 아미노산 잔기일 수 있음) 를 포함한다.
하나의 구현예에서, 외-분지 항체 단편의 전장 항체 중쇄 및 전장 항체 경쇄는 동족 항체 사슬이고 이의 가변 도메인 (VH 및 VL) 의 쌍은 두번째 표면 마커에 특이적으로 결합하는 항원 결합 부위를 형성하고, 전장 항체 중쇄 및 항체 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드는 항체 힌지 영역을 형성하는 하나 이상의 디설파이드 결합을 통해 서로 공유 연결되고, 항체 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드는 그의 N-말단에 올리고글라이신 아미노산 서열을 갖는다.
모든 양상의 하나의 구현예에서, 항체 Fab 단편 또는 scFv 항체는 20 개의 C-말단 아미노산 잔기 내에 아미노산 서열 GnSLPX1TG (SEQ ID NO:02, 식 중 X1 은 임의의 아미노산 잔기일 수 있고, n=1, 2 또는 3 임) 을 포함한다.
모든 양상의 하나의 구현예에서, 항체 Fab 단편 또는 scFv 항체는 20 개의 C-말단 아미노산 잔기 내에 아미노산 서열 GSLPX1TGGSGS (SEQ ID NO: 03, 식 중 X1 은 임의의 아미노산 잔기일 수 있음) 을 포함한다.
모든 양상의 하나의 구현예에서, 항체 Fab 단편 또는 scFv 항체는 아미노산 서열 X2GSLPX1TGGSGS (SEQ ID NO: 05, 식 중 X1 은 임의의 아미노산 잔기일 수 있고, X2 는 G 를 제외한 임의의 아미노산 잔기일 수 있음) 를 포함한다.
모든 양상의 하나의 구현예에서, 항체 Fab 단편 또는 scFv 항체는 아미노산 서열 GnSLPX1TGGSGSX3 (SEQ ID NO: 06, 식 중 X1 은 임의의 아미노산 잔기일 수 있고, n=1, 2 또는 3 임) 을 20 개의 C 말단 아미노산 잔기 내에 포함하고, 이 때 X3 은 아미노산 서열 태그이다.
모든 양상의 하나의 구현예에서, 항체 Fab 단편 또는 scFv 항체는 아미노산 서열 X2GSLPX1TGGSGSX3 (SEQ ID NO: 07, 식 중 X1 은 임의의 아미노산 잔기일 수 있음) 을 20 개의 C-말단 아미노산 잔기 내에 포함하고, 이 때 X2 는 G 를 제외한 임의의 아미노산 잔기일 수 있고, X3 은 아미노산 서열 태그이다.
모든 양상의 하나의 구현예에서, 항체 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드는 그의 N-말단에서 2 개의 글라이신 잔기를 포함한다.
모든 양상의 하나의 구현예에서 외-분지 항체 Fc-영역은 아미노산 서열 GGCPX4C (SEQ ID NO: 08) 를 그의 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드의 N-말단에 포함하고, 이 때 X4 는 S 또는 P 이다.
모든 양상의 하나의 구현예에서 X1 은 E 이다.
본원에 보고되는 하나의 양상은 본원에서 보고되는 방법에 의해 수득된 다중특이적 결합 분자/2-특이적 항체이다.
하나의 양상은 그의 중쇄 중 하나에 아미노산 서열 LPX1TG (SEQ ID NO: 01, 식 중 X1 은 임의의 아미노산 잔기일 수 있음) 를 포함하는 다중특이적 결합 분자/2-특이적 항체이다.
하나의 구현예에서, 다중특이적 결합 분자/2-특이적 항체는 그의 중쇄 중 하나에 아미노산 서열 GnSLPX1TG (SEQ ID NO: 02, 식 중 X1 은 임의의 아미노산 잔기일 수 있고, n=1, 2 또는 3 임) 를 포함한다.
하나의 구현예에서, 다중특이적 결합 분자/2-특이적 항체는 그의 중쇄 중 하나에 아미노산 서열 GnSLPX1TGGCPX4C (SEQ ID NO: 09, 식 중 X1 은 임의의 아미노산 잔기일 수 있고, X4 는 S 또는 P 일 수 있고, n=1, 2 또는 3 임) 를 포함한다.
하나의 구현예에서, 다중특이적 결합 분자/2-특이적 항체는 그의 중쇄 중 하나에 아미노산 서열 X2GSLPX1TGGCPX4C (SEQ ID NO: 10, 식 중 X1 은 임의의 아미노산 잔기일 수 있고, X4 는 S 또는 P 일 수 있음) 를 포함하고, 이 때 X2 는 G 를 제외한 임의의 아미노산 잔기일 수 있다.
하나의 구현예에서, X1 은 E 이다.
본원에 보고되는 하나의 양상은 본원에 보고된 항체/다중특이적 결합 분자를 포함하는 약학 조성물이다.
본원에 보고되는 하나의 양상은 의약의 제조에서의 본원에 보고된 2-특이적 항체/다중특이적 결합 분자의 용도이다.
하나의 구현예에서, 의약은 암의 치료를 위한 것이다.
본원에 보고되는 하나의 양상은 본원에 보고된 2-특이적 항체/다중특이적 결합 분자의 유효량을 개체에게 투여하는 것을 포함하는, 암을 가지고 있는 개체의 치료 방법이다.
본원에 보고되는 하나의 양상은 본원에 보고된 2-특이적 항체/다중특이적 결합 분자의 유효량을 개체에게 투여하는 것을 포함하는, 개체에서 암 세포를 파괴하기 위한 방법이다.
본원에 보고되는 모든 양상의 하나의 구현예에서 Fc-영역은 인간 Fc 영역, 또는 이의 변이체이다.
하나의 구현예에서, 인간 Fc-영역은 인간 IgG1 서브클래스, 또는 인간 IgG2 서브클래스, 또는 인간 IgG3 서브클래스, 또는 인간 IgG4 서브클래스의 것이다. 하나의 구현예에서, Fc-영역은 인간 IgG1 서브클래스 또는 인간 IgG4 서브클래스의 인간 Fc-영역이다.
하나의 구현예에서, 인간 Fc-영역은 하기 아미노산 위치 228, 233, 234, 235, 236, 237, 297, 318, 320, 322, 329, 및/또는 331 중 하나 이상에서 상이한 잔기로의 자연 발생적 아미노산 잔기의 돌연변이를 포함하고, Fc-영역 내의 잔기는 Kabat 의 EU 인덱스에 따라 번호지정된다.
하나의 구현예에서, 인간 Fc-영역은 위치 329 에서 자연 발생적 아미노산 잔기의 돌연변이 및 위치 228, 233, 234, 235, 236, 237, 297, 318, 320, 322 및 331 에서 아미노산 잔기를 포함하는 군으로부터 선택되는 하나 이상의 아미노산 잔기의 상이한 잔기로의 하나 이상의 추가의 돌연변이를 포함하고, Fc-영역 내의 잔기는 Kabat 의 EU 인덱스에 따라 번호지정된다. 상기 특정 아미노산 잔기의 변화는 비-개질된 (야생형) Fc-영역과 비교해 Fc-영역의 효과기 기능을 변화시키는 결과를 낳는다.
하나의 구현예에서, 인간 Fc-영역은 상응하는 야생형 IgG Fc-영역을 포함하는 접합체와 비교해 인간 FcγRIIIA, 및/또는 FcγRIIA, 및/또는 FcγRI 에 대한 감소된 친화성을 갖는다.
하나의 구현예에서, 인간 항체 Fc-영역 내 위치 329 에서 아미노산 잔기는 글라이신, 또는 아르기닌, 또는 Fc 영역 내에 프롤린 샌드위치를 파괴할 정도로 충분히 큰 아미노산 잔기로 치환된다.
하나의 구현예에서, 자연 발생적 아미노산 잔기의 돌연변이는 S228P, E233P, L234A, L235A, L235E, N297A, N297D, P329G, 및/또는 P331S 이다. 하나의 구현예에서, 돌연변이는 Fc-영역이 인간 IgG1 서브클래스의 것인 경우 L234A 및 L235A 이거나, 또는 Fc-영역이 인간 IgG4 서브클래스의 것인 경우 S228P 및 L235E 이다. 하나의 구현예에서, Fc-영역은 돌연변이 P329G 를 포함한다.
Fc-영역 내의 규정된 위치에서의 2 개의 돌연변이의 조합에 의해 Fc-영역 연관된 효과기 기능의 완전한 감소가 달성될 수 있다.
효과기 기능 유발 Fc-영역의 선택은 다중특이적 결합 분자/2-특이적 항체의 의도되는 용도에 의존적이다.
의도되는 용도가 가용성 표적의 기능적 중화인 경우에 비-효과기 기능 유발 서브클래스 또는 변이체가 선택되어야 한다.
의도되는 용도가 표적의 제거인 경우에 효과기 기능 유발 서브클래스 또는 변이체가 선택되어야 한다.
의도되는 용도가 세포-결합된 표적의 길항작용인 경우에 비-효과기 기능 유발 서브클래스 또는 변이체가 선택되어야 한다.
의도되는 용도가 표적 제시 세포의 제거인 경우에 효과기 기능 유발 서브클래스 또는 변이체가 선택되어야 한다.
항체 또는 항체 Fc-영역 접합체의 순환 반감기는 Fc-영역-FcRn 상호작용을 조정함으로써 영향을 받을 수 있다.
항체-의존적 세포-매개되는 세포독성 (ADCC) 및 보체-의존적 세포독성 (CDC) 의 최소화 또는 심지어는 제거는 소위 힌지-영역 아미노산 변화/치환에 의해 달성될 수 있다.
고전적 보체 캐스케이드의 활성화의 최소화 또는 심지어는 제거는 소위 힌지-영역 아미노산 변화/치환에 의해 달성될 수 있다.
항체 또는 항체 Fc-영역 접합체의 순환 반감기의 증가는 신생아 Fc 수용체에 대한 증가된 결합도에 의해 달성될 수 있고, 개선된 효능, 감소된 투여량 또는 투여 빈도, 또는 표적에 대한 개선된 전달을 초래한다. 항체 또는 항체 Fc-영역 접합체의 순환 반감기의 감소는 신생아 Fc 수용체에 대한 감소된 결합도에 의해 달성될 수 있고, 감소된 전신 노출 또는 개선된 표적-대-비-표적 결합 비율을 초래한다.
일반적으로, 본원에서 보고되는 방법은 야생형 Fc-영역 또는 변경된/변이체 Fc-영역을 포함하는 항체 Fc-영역 접합체의 생산에 적용가능하다.
하나의 구현예에서, Fc-영역은 인간 Fc-영역이다.
하나의 구현예에서, Fc-영역은 "개념적" 이고, 그것이 물리적으로 존재하지 않지만, 항체 기술자는 변이체 Fc-영역을 사용할 것을 결정할 수 있다.
하나의 구현예에서, 항체 Fc-영역 접합체의 Fc-영역 부분을 인코딩하는 핵산은 변경되어 항체 Fc-영역 접합체의 변이체 Fc-영역 부분을 인코딩하는 변이체 핵산 서열을 생성한다.
항체 Fc-영역 접합체의 Fc-영역 부분의 아미노산 서열을 인코딩하는 핵산은 당 기술분야에 알려진 여러 가지 방법에 의해 제조될 수 있다. 이들 방법은 항체 Fc-영역 접합체의 폴리펩티드를 인코딩하는 이전에 제조된 DNA 의 자리 지정 (또는 올리고뉴클레오티드-매개되는) 돌연변이유발, PCR 돌연변이유발, 및 카세트 돌연변이유발을 포함하나, 그에 제한되지 않는다.
Fc-영역은 Fc 수용체 (예를 들어, FcγRI, FcγRIIA, FcγRIIIA), 보체 단백질 C1q, 및 기타 분자 예컨대 단백질 A 및 G 를 포함하나 그에 제한되지 않는 다수의 수용체 또는 리간드와 상호작용한다. 이들 상호작용은 항체 의존적 세포-매개되는 세포독성 (ADCC), 항체 의존적 세포성 식세포작용 (ADCP) 및 보체 의존적 세포독성 (CDC) 을 포함하나, 그에 제한되지 않는 여러 가지 효과기 기능 및 하류 신호전달 사건에 필수적이다.
하나의 구현예에서, 항체 Fc-영역 접합체 (본원에서 보고되는 방법으로 생성됨) 는 하나 이상의 하기 특성을 갖는다: 감소된 또는 제거된 효과기 기능 (ADCC 및/또는 CDC 및/또는 ADCP), Fc 수용체에 대한 감소된 또는 제거된 결합도, C1q 에 대한 감소된 또는 제거된 결합도, 또는 감소된 또는 제거된 독성.
하나의 구현예에서, 항체 Fc-영역 접합체 (본원에서 보고되는 방법으로 생성됨) 는 적어도 2 개의 아미노산 돌연변이, 부가, 또는 결실을 갖는 야생형 Fc-영역을 포함한다.
하나의 구현예에서, 항체 Fc-영역 접합체 (본원에서 보고되는 방법으로 생성됨) 는 야생형 인간 Fc-영역을 포함하는 항체 또는 항체 Fc-영역 접합체에 비해 인간 Fc 수용체 (FcγR) 및/또는 인간 보체 수용체에 대한 감소된 친화도를 갖는다.
하나의 구현예에서, 항체 Fc-영역 접합체 (본원에서 보고되는 방법으로 생성됨) 는 야생형 인간 Fc-영역을 포함하는 항체 또는 항체 Fc-영역 접합체에 비해 인간 Fc 수용체 (FcγR) 및/또는 인간 보체 수용체에 대한 감소된 친화도를 갖는 Fc-영역을 포함한다.
하나의 구현예에서, 항체 Fc-영역 접합체 (본원에서 보고되는 방법으로 생성됨) 는 FcγRI, FcγRII, 및/또는 FcγRIIIA 중 하나 이상에 대해 감소된 친화도를 갖는다. 하나의 구현예에서 FcγRI 및 FcγRIIIA 에 대한 친화도가 감소된다. 하나의 구현예에서 FcγRI, FcγRII 및 FcγRIIIA 에 대한 친화도가 감소된다.
하나의 구현예에서, FcγRI, FcγRIIIA 및 C1q 에 대한 친화도가 감소된다.
하나의 구현예에서, FcγRI, FcγRII, FcγRIIIA 및 C1q 에 대한 친화도가 감소된다.
하나의 구현예에서, 항체 Fc-영역 접합체 (본원에서 보고되는 방법으로 생성됨) 는 야생형 Fc-영역을 포함하는 항체 또는 항체 Fc 접합체에 비해 감소된 ADCC 를 갖는다. 하나의 구현예에서 ADCC 는 야생형 Fc-영역을 포함하는 Fc-영역 융합 폴리펩티드 또는 접합체에 유도되는 ADCC 에 비해 적어도 20 % 감소된다.
하나의 구현예에서, 항체 Fc-영역 접합체 (본원에서 보고되는 방법으로 생성됨) 는 야생형 Fc-영역을 포함하는 항체 Fc-영역 접합체에 비해 감소된 또는 제거된 Fc-영역에 의해 유도되는 ADCC 및 CDC 를 갖는다.
하나의 구현예에서, 항체 Fc-영역 접합체 (본원에서 보고되는 방법으로 생성됨) 는 야생형 Fc-영역을 포함하는 OA-Fc-영역 접합체에 비해 감소된 ADCC, CDC, 및 ADCP 를 갖는다.
하나의 구현예에서, 항체 Fc-영역 접합체는 S228P, E233P, L234A, L235A, L235E, N297A, N297D, P329G, 및 P331S 를 포함하는 군으로부터 선택되는 Fc-영역 내의 하나 이상의 아미노산 치환을 포함한다.
하나의 구현예에서, 야생형 Fc-영역은 인간 IgG1 Fc-영역 또는 인간 IgG4 Fc-영역이다.
하나의 구현예에서, 항체 Fc-영역은 위치 329 에서의 아미노산 잔기 프롤린의 돌연변이 외에도 항체 Fc-영역 접합체의 증가된 안정성과 상관관계가 있는 Fc-영역 내의 아미노산 잔기의 하나 이상의 추가의 부가, 돌연변이, 또는 결실을 포함한다.
하나의 구현예에서, Fc-영역 내의 아미노산 잔기의 추가의 부가, 돌연변이, 또는 결실은 Fc-영역이 IgG4 서브클래스인 경우에 Fc-영역의 위치 228 및/또는 235 에 있다. 하나의 구현예에서, 위치 228 에서의 아미노산 잔기 세린 및/또는 위치 235 에서의 아미노산 잔기 류신은 또다른 아미노산에 의해 치환되어 있다. 하나의 구현예에서, 항체 Fc-영역 접합체는 위치 228 에서 프롤린 잔기를 포함한다 (세린 잔기의 프롤린 잔기로의 돌연변이). 하나의 구현예에서, 항체 Fc-영역 접합체는 위치 235 에서 글루탐산 잔기를 포함한다 (류신 잔기의 글루탐산 잔기로의 돌연변이).
하나의 구현예에서, Fc-영역은 3 개의 아미노산 돌연변이를 포함한다. 하나의 구현예에서, 3 개의 아미노산 돌연변이는 P329G, S228P 및 L235E 돌연변이 (P329G / SPLE) 이다.
하나의 구현예에서, Fc-영역 내의 아미노산 잔기의 추가의 부가, 돌연변이, 또는 결실은 Fc-영역이 IgG1 서브클래스인 경우에 Fc-영역의 위치 234 및/또는 235 에 있다. 하나의 구현예에서, 위치 234 에서의 아미노산 잔기 류신 및/또는 위치 235 에서의 아미노산 잔기 류신은 또다른 아미노산으로 돌연변이되어 있다.
하나의 구현예에서, Fc-영역은 위치 234 에서 아미노산 돌연변이를 포함하고, 여기서 류신 아미노산 잔기는 알라닌 아미노산 잔기로 돌연변이되어 있다.
하나의 구현예에서, Fc-영역은 235 에서 아미노산 돌연변이를 포함하고, 여기서 류신 아미노산 잔기는 알라닌 아미노산 잔기로 돌연변이되어 있다.
하나의 구현예에서, Fc-영역은 위치 329 에서 아미노산 돌연변이를 포함하고, 여기서 프롤린 아미노산 잔기는 글라이신 아미노산 잔기로 돌연변이되어 있고, 위치 234 에서 아미노산 돌연변이를 포함하고, 여기서 류신 아미노산 잔기는 알라닌 아미노산 잔기로 돌연변이되어 있고, 및 위치 235 에서 아미노산 돌연변이를 포함하고, 여기서 류신 아미노산 잔기는 알라닌 아미노산 잔기로 돌연변이되어 있다.
FcRn 에 대한 증가된 친화도를 갖는 Fc-영역 변이체는 더 긴 혈청 반감기를 갖고, 그러한 분자는 투여되는 항체 Fc-영역 접합체의 긴 전신 반감기가 요망되는 포유류의 치료 방법에서, 예를 들어, 만성 질환 또는 장애의 치료에서 유용한 적용을 갖는다.
감소된 FcRn 결합 친화도를 갖는 항체 Fc-영역 접합체는 더 짧은 혈청 반감기를 갖고, 그러한 분자는 투여되는 항체 Fc-영역 접합체의 더 짧은 전신 반감기가 요망되는 포유류의 치료 방법에서, 예를 들어, 독성 부작용의 회피 또는 생체내 진단 영상화 응용물에서 유용한 적용을 갖는다. 감소된 FcRn 결합 친화도를 갖는 Fc-영역 융합 폴리펩티드 또는 접합체는 태반을 통과할 가능성이 더 낮고, 따라서 임신한 여성의 질환 또는 장애의 치료에서 이용될 수 있다.
FcRn 에 대한 변경된 결합 친화도를 갖는 Fc-영역은 하나의 구현예에서 아미노산 위치 238, 252, 253, 254, 255, 256, 265, 272, 286, 288, 303, 305, 307, 309, 311, 312, 317, 340, 356, 360, 362, 376, 378, 380, 382, 386, 388, 400, 413, 415, 424, 433, 434, 435, 436, 439, 및/또는 447 중 하나 이상에서 아미노산 변경을 갖는 Fc-영역이다.
Fc-영역은 하나의 구현예에서 아미노산 위치 252, 253, 254, 255, 288, 309, 386, 388, 400, 415, 433, 435, 436, 439, 및/또는 447 에서 하나 이상의 아미노산 변경을 갖는 Fc-영역이다.
FcRn 에 대한 증가된 결합도를 나타내는 Fc-영역은 하나의 구현예에서 아미노산 위치 238, 256, 265, 272, 286, 303, 305, 307, 311, 312, 317, 340, 356, 360, 362, 376, 378, 380, 382, 413, 424, 및/또는 434 에서 하나 이상의 아미노산 변경을 포함한다.
하나의 구현예에서, Fc-영역은 IgG1 서브클래스의 Fc-영역이고, 아미노산 돌연변이 P329G, 및/또는 L234A 및 L235A 를 포함한다.
하나의 구현예에서, Fc-영역은 IgG4 서브클래스의 Fc-영역이고, 아미노산 돌연변이 P329G, 및/또는 S228P 및 L235E 를 포함한다.
하나의 구현예에서, 항체 Fc-영역은 제 1 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드 내에 돌연변이 T366W 및 제 2 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드 내에 돌연변이 T366S, L368A 및 Y407V 를 포함하고, 여기서 번호지정은 Kabat 의 EU 인덱스에 따른다.
하나의 구현예에서, 항체 Fc-영역은 제 1 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드 내에 돌연변이 S354C 및 제 2 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드 내에 돌연변이 Y349C 를 포함한다.
소르타제 A 를 사용하는 효소적 접합
외-분지 항체 (OA-Fc) 및 하나 이상의 항원 결합 도메인을 포함하는 2-특이적 항체는 효소 소르타제 A 를 사용하여 수득될 수 있다.
많은 그람-양성 박테리아는 소르타제를 사용하여 균력 인자를 포함하는 여러 가지 표면 단백질을 그들의 세포벽에 공유적으로 고정한다 (펩티도글리칸). 소르타제는 세포외 막 연합된 효소이다. 야생형 황색포도상구균 소르타제 A (SrtA) 는 N-말단 막 관통 영역을 갖는 206 개의 아미노산의 폴리펩티드이다. 제 1 단계에서, 소르타제 A 는 LPX1TG 아미노산 서열 모티프를 함유하는 기질 단백질을 인지하고, Thr 과 Gly 사이의 아미드 결합을 활성-부위 Cys 에 의해 절단한다. 이러한 펩티드 절단 반응은 소르타제 A 티오에스테르 중간체를 초래한다. 제 2 단계에서 티오에스테르 아실-효소 중간체는 올리고글라이신 함유 제 2 기질 폴리펩티드 (황색포도상구균 내의 펩티도글리칸의 펜타글라이신 단위체에 상응함) 의 아미노 기의 친핵성 공격에 의해 분해되어, 공유적으로 연결된 세포벽 단백질 및 소르타제 A 의 재생을 초래한다. 올리고글라이신 친핵체의 부재시에, 아실-효소 중간체는 물 분자에 의해 가수분해된다.
소르타제-매개되는 라이게이션/접합은 여러 가지 단백질 조작 및 생물접합 목적을 위해 적용되기 시작했다. 이러한 새로운 기술은 LPX1TG-태그된 재조합 또는 화학적으로 합성된 폴리펩티드 내로 자연적 및 비자연적 기능의 도입을 가능하게 해준다. 예는 올리고글라이신 유도된 중합체 (예를 들어, PEG), 형광단, 비타민 (예를 들어, 비오틴 및 폴레이트) 지질, 탄수화물, 핵산, 합성 펩티드 및 단백질 (예를 들어, GFP) 의 공유적 부착을 포함한다 (Tsukiji, S. and Nagamune, T., ChemBioChem 10 (2009) 787-798; Popp, M.W.-L. 및 Ploegh, H.L., Angew. Chem. Int. Ed. 50 (2011) 5024-5032).
아미노 성분의 트리글라이신 및 심지어는 디글라이신 모티프가 SrtA-매개되는 라이게이션 단계에 충분하다고 밝혀졌다 (Clancy, K.W., et al., Peptide Science 94 (2010) 385-396).
효소적 접합을 위해 막 관통 영역을 결여하는 가용성 절두된 (truncated) 소르타제 A (SrtA; 황색포도상구균 SrtA 의 아미노산 잔기 60-206) 가 사용될 수 있다 (Ton-That, H., et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 96 (1999) 12424-12429; Ilangovan, H., et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 98 (2001) 6056-6061). 절두된 가용성 소르타제 A 변이체는 대장균 (E.coli) 에서 생산될 수 있다.
적어도 하나의 N-말단에서 올리고글라이신 (Gm, m=2, 또는 3, 또는 4, 또는 5) 을 포함하는 항체 Fc-영역은 진핵 세포 (예를 들어, HEK293 세포, CHO 세포) 의 상청액으로부터 별현 및 정제될 수 있다.
하나의 폴리펩티드 사슬의 C-말단에서 SrtA 인지 모티프를 포함하는 결합 단위 (예를 들어, 단일 사슬 항원 결합 폴리펩티드 예컨대 scFv, scFab, 또는 다르핀, 또는 다중 사슬 항원 결합 폴리펩티드 예컨대 dsFv 또는 Fab) 은 진핵 세포 (예를 들어, HEK293 세포, CHO 세포) 의 상청액으로부터 별현 및 정제될 수 있다.
본원에서 보고되는 하나의 양상은 효소 소르타제 A 를 사용하여 항원 결합 폴리펩티드/도메인 (예를 들어, scFv 또는 Fab) 을 외-분지 항체 변이체 (OA-Fc) 에 접합시킴으로써 수득되는 2-특이적 항체이며, 여기서 소르타제 인지 서열은 단일 사슬 항원 결합 폴리펩티드 (예를 들어, scFv, scFab 또는 다르핀) 의 C-말단 또는 다중 사슬 항원 결합 복합체 (예를 들어, dsFv 또는 Fab) 의 하나의 폴리펩티드 사슬의 C-말단에 위치하고, 이중 또는 삼중 글라이신 모티프는 외-분지 항체 변이체의 Fc 사슬의 N-말단 (OA-Fc-Gm; m=2 또는 3) 에 위치한다. 항체 Fab 단편 (OA-Fc~Fab) 또는 scFv 항체 단편 (OA-Fc~scFv) 및 외-분지 항체 (OA-Fc) 를 포함하는 외-분지 항체 Fab 또는 scFv 접합체는 (i) 이의 C-말단 영역 내에 아미노산 서열 GnSLPX1TG (SEQ ID NO:02, 식 중 X1 은 임의의 아미노산 잔기일 수 있고, n=1, 2 또는 3 임) 를 포함하는 폴리펩티드, (ii) 이의 N-말단에 올리고글라이신을 포함하는 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드, 및 (iii) 효소 소르타제 A 를 사용함으로써 효소적 접합으로 고 수율로 수득될 수 있다.
시약의 상기 조합으로, 증가된 반응 시간에서 정상적으로 일어나는
i) 기질로서 생성 접합체 내의 LPX1TG 아미노산 서열을 인지하는 역 반응, 및/또는
ii) 막다른 가수분해 폴리펩티드 단편 (Gm-항체 Fc-영역 친핵체에 의한 것 대신 물에 의한 티오아실-결합 단위 소르타제 A 중간체의 분할을 통해 생성된 분할된 LPX1TG 인지 서열이 있는 또는 없는 폴리펩티드) 의 생성
이 감소되거나 심지어 제거될 수 있다.
C-말단 및 N-말단 아미노산 서열 조합의 상이한 조합이 시험되었다.
더욱 상세하게는, 예시적 결합 단위로서 항체 Fab 단편이 사용되었고, 예시적 항체 Fc-영역으로서 외-분지 항체 Fc-영역 (OA-Fc-영역 = 전장 항체 중쇄 및 이의 동족 경쇄 및 중쇄 항체 Fc-영역 폴리펩티드의 쌍) 이 사용되었다. 항체 Fab 단편 VH-CH1 중쇄의 C-말단에서의 및 OA-Fc-영역의 N-말단에서의 3 개의 상이한 서열은 각각 예시적 트랜스펩티다아제 소르타제 A 를 사용하여 접합되었다. 9 개의 상이한 접합체가 수득되었다. 커플링 반응의 과정/효율은 상이한 시점에서 측정하였다. 이를 위해, 펩티드전이 반응의 분취물을 SDS-PAGE 에 의해 분석하였다. 라이게이션 효율은 젤로부터 농도계에 의해 추정되었다. 결과는 하기 표 1 에 제시된다.
표 1
하나의 구현예에서, Fab 항체 단편 또는 scFv 항체 단편은 20 개의 C-말단 아미노산 잔기 내에 아미노산 서열 GSLPX1TGGSGS (SEQ ID NO: 03, 식 중 X1 은 임의의 아미노산 잔기일 수 있음) 을 포함한다.
하나의 구현예에서, Fab 항체 단편 또는 scFv 항체 단편은 아미노산 서열 X2GSLPX1TGGSGS (SEQ ID NO: 05, 식 중 X1 은 임의의 아미노산 잔기일 수 있고, X2 는 G 를 제외한 임의의 아미노산 잔기일 수 있음) 를 포함한다.
하나의 구현예에서, Fab 항체 단편 또는 scFv 항체 단편은 아미노산 서열 GnSLPX1TGGSGSX3 (SEQ ID NO: 06, 식 중 X1 은 임의의 아미노산 잔기일 수 있고, n=1, 2 또는 3 임) 을 20 개의 C 말단 아미노산 잔기 내에 포함하고, 이 때 X3 은 아미노산 서열 태그이다.
하나의 구현예에서, Fab 항체 단편 또는 scFv 항체 단편은 아미노산 서열 X2GSLPX1TGGSGSX3 (SEQ ID NO: 07, 식 중 X1 은 임의의 아미노산 잔기일 수 있고, n=1, 2 또는 3 임) 을 20 개의 C 말단 아미노산 잔기 내에 포함하고, 이 때 X2 는 G 를 제외한 임의의 아미노산 잔기일 수 있고, X3 은 아미노산 서열 태그이다.
"콤비매트릭스 (Combimatrix)" 접근법
첫번째 결합 단위, 예컨대 항체 Fab 단편을, 또다른 특이적 결합 단위, 예컨대 두번째 항체 Fab 단편 또는 전장 중쇄 및 이의 동족 경쇄 및 디술파이드 연결된 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드를 포함하는 외-분지 항체 단편과 조합시키는 것이 바람직하다. 또한, 첫번째 결합 단위가 다수의 상이한 기타 결합 단위에 연결될 때 이것이 더 양호한 특성을 갖는지를 스크리닝하는 것이 가능하다. 소위 콤비매트릭스 접근법이라고 불리는 것을 사용해서, 결합 단위의 다수의 조합이 용이한 방식으로 다뤄질 수 있다. 두번째 결합 단위가 상이한 표적/에피토프/항원에 결합할 수 있거나, 동일한 항원이지만 상이한 에피토프에 결합할 수 있거나, 동일한 에피토프이지만 단일 결합 부분의 상이한 변이체 (예를 들어, 인간화 후보자) 에 결합할 수 있다는 것이 지적되어야만 한다.
본 시나리오에서, 자동화된 플랫폼은 결합 단위 및 이들의 반응 또는 유도체를 파이펫팅하고, 정제 및 결합시키는 임무를 수행할 수 있다. 예를 들어, 96-웰 플레이트 또는 기타 고 출력 포맷을 사용하는 임의의 플랫폼 (예컨대 Eppendorf epMotion 5075vac 파이펫팅 로봇) 이 적합하다.
먼저, 결합 단위를 인코딩하는 구축물의 클로닝을 수행한다. 결합 단위를 인코딩하는 핵산을 가진 플라스미드는, 하나의 인코딩된 결합 단위의 C-말단 영역은 소르타제-모티브 (motive) 및 His-태그를 함유하고, 각각의 기타 결합 단위의 하나의 N-말단 영역이 올리고글라이신 모티프 상에 포함되는 통상 유전자 합성에 의해, 또는 B-세포 PCR 및 서열- 및 라이게이션-독립적 클로닝 (SLIC) 을 통한 가변 도메인의 불변 영역과 같은 필수적인 요소, 소르타제 모티브 및 His-태그를 각각 함유하는 적합한 벡터 내로의 클로닝에 의해 수득된다. 플라스미드는 다중-웰 플레이트의 개별 웰 내로 개별적으로 옮겨진다 (전체 플레이트가 로딩될 수 있음). 이후, 플라스미드를 결합 단위-코딩 영역을 절단해내는 제한 효소 믹스로 소화시킨다. 오직 하나의 제한 효소 믹스가 모든 플라스미드에 대해 필요한 방식으로 모든 유전자 합성을 디자인하는 것이 바람직하다. 이후, 임의의 세정 단계는 정제된 DNA 단편을 산출한다. 상기 단편은 상기 언급된 바와 같은 동일한 제한 믹스로 허용체 벡터를 절단해 낸 플라스미드 백본 내로 라이게이션된다. 대안적으로는, 클로닝 절차는 SLIC-매개 클로닝 단계에 의해 수행될 수 있다 (예를 들어, PCT/EP2012/076155 참조). 라이게이션 후, 자동화된 플랫폼이 모든 라이게이션 믹스를 적격 대장균 (E. coli) 세포 (예를 들어, Top10 Multi Shot, Invitrogen) 가 있는 추가의 다중-웰 플레이트 내로 옮기고, 형질전환 반응을 수행한다. 세포를 원하는 밀도로 배양한다. 배양 혼합물의 분취액으로부터 글리세롤 저장액을 수득할 수 있다. 배양물로부터 플라스미드를 (예를 들어, 플라스미드 단리 미니 키트 (예를 들어, NucleoSpin 96 Plasmid, Macherey& Nagel) 를 사용하여) 단리한다. 플라스미드 정체는 적합한 제한 믹스 및 폴리아크릴아미드 겔 전기영동 (예를 들어, E-Gel 48, Invitrogen) 으로 분취액을 소화시킴으로써 확인된다. 이후, 신규 플레이트에, 대조 서열분석 반응을 수행하기 위해 플라스미드의 분취액을 적재할 수 있다.
다음 단계에서, 결합 단위가 발현된다. 따라서, HEK 세포를 다중-웰 플레이트 (예를 들어, 48-웰-플레이트) 또는 소형 진탕 플라스크 상에 시딩하고, 단리된 플라스미드 (적합한 백본 벡터 내에 결합 단위-코딩 영역을 함유하는) 로 트랜스펙션하였다. 트랜스펙션된 HEK 세포를 수 일 동안 배양하고, 수확하였다 (예를 들어, 진공 스테이션 (station) 을 사용함으로써 1.2 μm 및 0.22 μm 필터 플레이트를 통한 여과에 의해). 예를 들어, ELISA 를 수행함으로써 적정농도를 모니터링 할 수 있다.
결합 단위는 sortase-매개 펩티드전이 반응을 사용하여 서로 연결될 수 있다. 첫번째 결합 단위, 두번째 결합 단위, 및 sortase 반응 믹스가 다중-웰 포맷에서 결합될 수 있다. 37℃ 에서 4-72 시간 (예를 들어, 16 시간) 동안 인큐베이션 후, 접합체는 음성 His-태그 선별 절차 (혼합물을 예를 들어, His MultiTrap HP 플레이트 (GE Healthcare) 상에 적용함) 를 사용하여 수확하고, 여과할 수 있는데, His-태그를 여전히 가지고 있는 모든 분자는 크로마토그래피 컬럼 상에 결합되는 반면, 접합체는 여과액에서 발견되며; 여과액으로는 완충액 교환이 예를 들어, 접합체를 초여과 막 상에 적용함으로서, 또는 결합 단위 중 하나에 특이적인 친화성 매질을 함유하는 플레이트를 사용함으로써 이뤄져야만 한다.
다중특이적 결합 분자는 콤비매트릭스 (Combimatrix) 접근법을 사용하여 제조될 수 있다 (하기 표 참조).
다중-웰 플레이트의 첫번째 행에 동등한 몰 농도의 C 말단 Sortase 모티프를 포함하는 상이한 첫번째 결합 단위를 각각의 웰 (첫번째 행의 첫번째 웰을 제외하고) 내에 파이펫팅하고, 아라비아 숫자 (예를 들어, 1 내지 11) 로 지정하였다. 동일한 플레이트의 첫번째 컬럼에서, 동등한 몰 농도의 N-말단 영역 내에 올리고글라이신을 포함하는 상이한 두번째 결합 단위를 각각의 웰 (첫번째 열의 첫번째 웰을 제외하고) 내에 파이펫팅하고, 글자 (예를 들어, A 내지 G) 로 지정하였다. 이후 첫번째 행의 모든 첫번째 결합 단위를 첫번째 열의 모든 두번째 결합 단위와 조합시키고 (예를 들어, 96-웰 플레이트 중 77 개의 조합을 산출함), 숫자 및 글자의 조합 (예를 들어, 1A 내지 11G) 으로 지정하였다. 모든 조합에, 적합한 완충액 중의 Sortase 를 첨가한다. 효소적 접합을 수행한 후, 임의의 정제 단계가 수행될 수 있다. 다중특이적 결합 분자를 이후 세포-기반 검정에서 평가할 준비를 하였다.
III. 재조합 방법
OA-Fc-영역 접합체의 라이게이션 성분, 특히, 외-분지 항체 변이체 (OA-Fc-Gm) 및 단일 사슬 항원 결합 폴리펩티드 (예를 들어, scFv, scFab 또는 다르핀) 또는 다중 사슬 항원 결합 복합체 (예를 들어, dsFv 또는 Fab) 는 재조합 방법 및 조성물을 사용하여 생산될 수 있으며, 예를 들어, US 4,816,567 을 참고한다.
하나의 양상에서 OA-Fc~폴리펩티드 접합체의 제조 방법이 제공되고, 여기서 상기 방법은 (i) 접합체의 외-분지 항체 변이체 (OA-Fc-Gm) 부분을 인코딩하는 핵산을 포함하는 제 1 숙주 세포를 외-분지 항체 변이체 (OA-Fc-Gm) 의 발현/분비에 적합한 조건 하에 배양하고, 임의로 OA-Fc-Gm 부분을 숙주 세포 (또는 숙주 세포 배양 배지) 로부터 회수하는 단계, 및 (ii) 접합체의 폴리펩티드 부분을 인코딩하는 핵산을 포함하는 제 2 숙주 세포를 폴리펩티드의 발현/분비에 적합한 조건 하에 배양하고, 임의로 폴리펩티드 부분을 숙주 세포 (또는 숙주 세포 배양 배지) 로부터 회수하는 단계, 및 (iii) OA-Fc~폴리펩티드 접합체의 재조합적으로 생산된 부분들을 소르타제 A 매개 펩티드전이를 사용하여 효소적으로 접합시키는 단계를 포함한다.
OA-Fc~폴리펩티드 접합체의 OA-Fc-Gm 부분 및 폴리펩티드 부분의 재조합 생산을 위해, 예를 들어, 위에 기재된 바와 같은, OA-Fc~폴리펩티드 접합체의 OA-Fc-Gm 부분 및 폴리펩티드 부분을 인코딩하는 핵산을 단리하고, 후속적인 숙주 세포에서의 클로닝 및/또는 발현/분비를 위해 하나 이상의 벡터 내로 삽입된다. 그러한 핵산은 종래의 절차를 사용하여 용이하게 단리 및/또는 생산될 수 있다.
폴리펩티드-인코딩 벡터의 클로닝 또는 발현/분비에 적합한 숙주 세포는 본원에 기재된 원핵 또는 진핵 세포를 포함한다. 예를 들어, 특히 글리코실화 및 Fc 효과기 기능가 필요하지 않을 때, 폴리펩티드는 박테리아에서 생산될 수 있다 (예를 들어, US 5,648,237, US 5,789,199, 및 US 5,840,523, Charlton, Methods in Molecular Biology 248 (2003) 245-254 (B.K.C. Lo, (ed.), Humana Press, Totowa, NJ) (대장균에서의 항체 분절의 발현을 기재함) 참고). 발현 후에, 폴리펩티드는 박테리아 세포 페이스트로부터 가용성 분획 중에 단리될 수 있거나, 또는 가용화되어 생체활성 형태로 되접힐 수 있는 불용성 분획 소위 봉입체로부터 단리될 수 있다. 이후 폴리펩티드는 추가로 정제될 수 있다.
원핵생물에 더하여, 진핵 미생물 예컨대 사상 진균 또는 효모가 폴리펩티드-인코딩 벡터에 적합한 클로닝 또는 발현 숙주이며, 글리코실화 경로가 "인간화" 되어, 일부 또는 전부 인간 글리코실화 패턴을 갖는 폴리펩티드의 생성을 초래하는 진균 및 효모 균주를 포함한다 (예를 들어, Gerngross, Nat. Biotech. 22 (2004) 1409-1414, 및 Li, et al., Nat. Biotech. 24 (2006) 210-215 참고).
글리코실화된 폴리펩티드의 발현에 적합한 숙주 세포는 또한 다세포성 유기체 (무척추동물 및 척추동물) 에서 유래한다. 무척추동물 세포의 예는 식물 및 곤충 세포를 포함한다. 특히 스포도프테라 프루기페르다 (Spodoptera frugiperda) 세포의 트랜스펙션을 위해, 곤충 세포와 함께 사용될 수 있는 수많은 배큘로바이러스 균주가 식별되었다.
식물 세포 배양물이 또한 숙주로서 이용될 수 있다 (예를 들어, US 5,959,177, US 6,040,498, US 6,420,548, US 7,125,978, 및 US 6,417,429 (트랜스제닉 식물에서 항체의 생산을 위한 PLANTIBODIES™ 기술을 기재함) 참고).
척추동물 세포가 또한 숙주로서 사용될 수 있다. 예를 들어, 현탁액 중에서 성장하도록 적응된 포유류 세포주가 유용할 수 있다. 유용한 포유류 숙주 세포주의 다른 예는 COS-7 세포주 (SV40 에 의해 형질전환된 원숭이 신장 CV1 세포; HEK293 세포주 (인간 배아 신장) BHK 세포주 (아기 햄스터 신장); TM4 마우스 세르톨리 세포주 (TM4 세포, 예를 들어, Mather, Biol. Reprod. 23 (1980) 243-251 에 기재됨); CV1 세포주 (원숭이 신장 세포); VERO-76 세포주 (아프리카 녹색 원숭이 신장 세포); HELA 세포주 (인간 자궁경부암 세포); MDCK 세포주 (개 신장 세포); BRL-3A 세포주 (버팔로 랫트 간 세포); W138 세포주 (인간 폐 세포); HepG2 세포주 (인간 간 세포); MMT 060562 세포주 (마우스 유방암 세포); TRI 세포주 (예를 들어, Mather, et al., Annals N.Y. Acad. Sci. 383 (1982) 44-68 에 기재됨); MRC5 세포주; 및 FS4 세포주이다. 다른 유용한 포유류 숙주 세포주는 CHO 세포주 (중국 햄스터 난소 세포), 예를 들어 DHFR 음성 CHO 세포주 (Urlaub, et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 77 (1980) 4216), 및 골수종 세포주 예컨대 Y0, NS0 및 Sp2/0 세포주를 포함한다. 폴리펩티드 생산에 적합한 특정 포유류 숙주 세포주의 리뷰에 대해, 예를 들어, Yazaki, and Wu, Methods in Molecular Biology, Antibody Engineering 248 (2004) 255-268 (B.K.C. Lo, (ed.), Humana Press, Totowa, NJ) 을 참고한다.
IV. 진단 및 검출을 위한 방법 및 조성물
특정 구현예에서, 본원에 제공된 2-특이적 항체 중 임의의 것이 생물학적 샘플 내에 하나 또는 두 항원의 존재를 검출하는데 유용하다. 본원에 사용되는 용어 "검출하기" 는 정량 또는 정성 검출을 포함한다. 특정 구현예에서, 생물학적 샘플은 세포 또는 조직, 예컨대 암 세포의 생검을 포함한다.
하나의 구현예에서, 진단 또는 검출 방법에서 사용하기 위한 2-특이적 항체가 제공된다. 추가의 양상에서, 생물학적 샘플 내의 암 세포의 존재의 검출 방법이 제공된다. 특정 구현예에서, 방법은 생물학적 샘플을 본원에 기재된 2-특이적 항체와 2-특이적 항체의 이의 항원 또는 항원들과의 결합을 허용하는 조건 하에서 접촉시키고, 복합체가 2-특이적 항체와 이의 항원 또는 항원들 사이에 형성되는지를 측정하는 것을 포함한다. 이러한 방법은 시험관 내 또는 생체 내 방법일 수 있다.
본 발명의 항체를 사용하여 진단될 수 있는 예시적 질환에는 암이 포함된다.
특정 구현예에서, 표지된 2-특이적 항체가 제공된다. 표지에는 직접적으로 검출되는 표지 또는 부분 (예컨대 형광, 발색단, 전자-밀도, 화학발광 및 방사능 표지) 뿐 아니라, 예를 들어, 효소 반응 또는 분자 상호작용을 통해 간접적으로 검출되는 부분, 예컨대 효소 또는 표지가 포함되나 이에 제한되는 것은 아니다. 예시적인 표지에는 방사능동위원소 32P, 14C, 125I, 3H, 및 131I, 형광단, 예컨대 희토류 킬레이트 또는 플루오레세인 및 이의 유도체, 로다민 및 이의 유도체, 단실, 움벨리페론, 루시페라아제, 예를 들어, 반딧불 루시페라아제 및 박테리아 루시페라아제 (US 4,737,456), 루시페린, 2,3-디히드로프탈라진디온, 호스래디시 퍼옥시다아제 (HRP), 알칼리 포스파타아제, β-갈락토시다아제, 글루코아밀라아제, 라이소자임, 당류 옥시다아제, 예를 들어, 글루코오스 옥시다아제, 갈락토오스 옥시다아제, 및 글루코오스-6-포스페이트 데히드로게나아제, 헤테로시클릭 옥시다아제, 예컨대 헤테로시클릭 옥시다아제, 예컨대 유리카아제 및 잔틴 옥시다아제 (염료 전구체를 산화시키기 위해 과산화수소를 사용하는 효소와 커플링됨), 예컨대 HRP, 락토퍼록시다아제, 또는 마이크로퍼옥시다아제, 비오틴/아비딘, 스핀 라벨, 박테리오파지 표지, 안정한 자유 라디칼 등이 포함되나 이에 제한되는 것은 아니다.
V. 약학 조성물
본원에 기재된 2-특이적 항체의 약학 조성물은 원하는 순도를 갖는 이러한 항체를 하나 이상의 임의의 약학적으로 허용가능한 담체 (Remington's Pharmaceutical Sciences, 16th edition, Osol, A. (ed.), (1980)) 와 혼합함으로써, 동결건조된 제형 또는 수용액의 형태로 제조된다. 약학적으로 허용가능한 담체는 일반적으로 사용되는 투여량 및 농도에서 수여자에게 무독성이고, 완충액, 예컨대 포스페이트, 시트레이트 및 기타 유기 산; 아스코르브산 및 메티오닌을 비롯한 항산화제; 보존제 (예컨대, 옥타데실 디메틸벤질 염화암모늄; 염화헥사메토늄; 염화벤즈알코늄; 염화벤제토늄; 페놀, 부틸 또는 벤질 알코올; 알킬 파라벤, 예컨대 메틸 또는 프로필 파라벤; 카테콜; 레소르시놀; 시클로헥사놀; 3-펜타놀; 및 m-크레솔); 저 분자량 (약 10 개 잔기 미만) 폴리펩티드; 단백질, 예컨대 혈청 알부민, 젤라틴, 또는 면역글로불린; 친수성 중합체, 예컨대 폴리 (비닐피롤리돈); 아미노산, 예컨대 글라이신, 글루타민, 아스파라긴, 히스티딘, 아르기닌 또는 라이신; 단당류, 이당류 및 글루코오스, 만노오스 또는 덱스트린을 비롯한 기타 탄수화물; 킬레이트제, 예컨대 EDTA; 당, 예컨대 수크로오스, 만니톨, 트레할로스 또는 소르비톨; 염-형성 반대-이온, 예컨대 나트륨; 금속 착물 (예를 들어, Zn-단백질 착물); 및/또는 비-이온성 계면활성제, 예컨대 폴리에틸렌 글리콜 (PEG) 이 포함되나 이에 제한되는 것은 아니다. 본원의 예시적인 약학적으로 허용가능한 담체에는 추가로 사이질 약물 분산액 제제, 예컨대 가용성 중성-활성 히알루로니다아제 당단백질 (sHASEGP), 예를 들어, 인간 가용성 PH-20 히알루로니다아제 당단백질, 예컨대 rhuPH20 (HYLENEX®, Baxter International, Inc.) 이 포함된다. rhuPH20 을 비롯한, 특정의 예시적인 sHASEGP 및 사용 방법은 US 2005/0260186 및 US 2006/0104968 에 기재되어 있다. 하나의 양상에서, sHASEGP 는 하나 이상의 부가적인 글리코사미노글리카나아제, 예컨대 콘드로이티나아제와 조합된다.
예시적인 동결건조된 항체 제형은 US 6,267,958 에 기재되어 있다. 수성 항체 제형에는 US 6,171,586 및 WO 2006/044908 에 기재된 것들이 포함되고, 상기 제형은 히스티딘-아세테이트 완충액을 포함한다.
본원의 제형은 또한 치료되는 특정 증상에 필요한 것인 1 개 초과의 유효 성분, 바람직하게는 서로에게 악영향을 주지 않는 상보적 활성을 가진 것들을 함유할 수 있다. 이러한 유효 성분은 의도되는 목적에 유효한 양으로 조합하여 적합하게 존재한다.
유효 성분은 예를 들어, 코아세르베이션 (coacervation) 기법에 의해 또는 계면 중합에 의해 제조된 마이크로캡슐, 예를 들어, 각각 콜로이드성 약물 전달 시스템 (예를 들어, 리포좀, 알부민 마이크로스피어, 마이크로에멀젼, 나노-입자 및 나노캡슐) 내에 또는 마크로에멀젼 내에 히드록시메틸셀룰로오스 또는 젤라틴-마이크로캡슐 및 폴리-(메틸 메타크릴레이트) 마이크로캡슐 내에 포획될 수 있다. 이러한 기법은 문헌 Remington's Pharmaceutical Sciences, 16th edition, Osol, A. (ed.) (1980) 에 기재되어 있다.
서방성 제제가 제조될 수 있다. 서방성 제제의 적합한 예에는 항체를 함유하는 고체 소수성 중합체의 반-투과성 매트릭스가 포함되며, 상기 매트릭스는 성형품의 형태, 예를 들어, 필름, 또는 마이크로캡슐이다.
생체 내 투여에 사용하고자 하는 제형은 일반적으로 멸균된다. 멸균은, 예를 들어, 멸균 여과 막을 통한 여과에 의해 쉽게 달성될 수 있다.
VI. 치료 방법 및 조성물
본원에 제공된 2-특이적 항체 중 임의의 것이 치료 방법에서 사용될 수 있다.
하나의 양상에서, 의약으로서 사용하기 위한 2-특이적 항체가 제공된다. 추가의 양상에서, 암을 치료하는데 사용하기 위한 2-특이적 항체가 제공된다. 특정 구현예에서, 치료 방법에서 사용하기 위한 2-특이적 항체가 제공된다. 특정 구현예에서, 본 발명은 개체에게 2-특이적 항체의 유효량을 투여하는 것을 포함하는 암을 가진 개체의 치료 방법에 사용하기 위한 2-특이적 항체를 제공한다. 하나의 이러한 구현예에서, 방법은 개체에게 예를 들어 하기에 기재되는 바와 같은 하나 이상의 부가적인 치료제의 유효량을 투여하는 것을 추가로 포함한다. 추가의 구현예에서, 본 발명은 암 세포를 제거/살해/용리시키기는데 사용하기 위한 2-특이적 항체를 제공한다. 특정 구현예에서, 본 발명은 개체에게 암 세포를 제거/살해/용리시키기 위해 2-특이적 항체의 유효량을 투여하는 것을 포함하는, 개체에서 암 세포를 제거/살해/용리시키는 방법에서 사용하기 위한 2-특이적 항체를 제공한다. 상기 구현예 중 임의의 것에 따른 "개체" 는 인간일 수 있다.
추가의 양상에서, 본 발명은 의약의 제조 또는 제제에서의 2-특이적 항체의 용도를 위해 제공된다. 하나의 구현예에서, 의약은 암의 치료를 위한 것이다. 추가의 구현예에서, 의약은 암을 가진 개체에게 유효량의 의약을 투여하는 것을 포함하는 암 치료 방법에서 사용하기 위한 것이다. 하나의 이러한 구현예에서, 방법은 개체에게 예를 들어 하기에 기재되는 바와 같은 하나 이상의 부가적인 치료제의 유효량을 투여하는 것을 추가로 포함한다. 추가의 구현예에서, 의약은 암 세포를 제거/살해/용리시키기 위한 것이다. 추가의 구현예에서, 의약은 개체에게 암 세포를 제거/살해/용리시키기 위한 유효량의 의약을 투여하는 것을 포함하는, 개체에서의 암 세포를 제거/살해/용리시키는 방법에서 사용하기 위한 것이다. 상기 구현예 중 임의의 것에 따른 "개체" 는 인간일 수 있다.
추가의 양상에서, 본 발명은 암 치료 방법을 제공한다. 하나의 구현예에서, 방법은 암을 가진 개체에게 유효량의 2-특이적 항체를 투여하는 것을 포함한다. 하나의 이러한 구현예에서, 본 방법은 개체에게 하기 기재된 바와 같은 하나 이상의 부가적인 치료제의 유효량을 투여하는 것을 추가로 포함한다. 상기 구현예 중 임의의 것에 따른 "개체" 는 인간일 수 있다.
추가의 양상에서, 본 발명은 개체에서 암 세포를 제거/살해/용리시키기 위한 방법을 제공한다. 하나의 구현예에서, 방법은 개체에게 암 세포를 제거/살해/용리시키기 위해 유효량의 2-특이적 항체를 투여하는 것을 포함한다. 하나의 구현예에서, "개체" 는 인간이다.
추가의 양상에서, 본 발명은 예를 들어, 상기 치료 방법 중 임의의 것에서 사용하기 위한, 본원에 제공된 2-특이적 항체 중 임의의 것을 포함하는 약학 제형을 제공한다. 하나의 구현예에서, 약학 제형은 본원에 제공된 2-특이적 항체 중 임의의 것 및 약학적으로 허용가능한 담체를 포함한다. 또다른 구현예에서, 약학 제형은 본원에 제공된 2-특이적 항체 중 임의의 것 및 예를 들어 하기에 기재되는 바와 같은 하나 이상의 부가적인 치료제를 포함한다.
본 발명의 항체는 요법에서 단독으로 또는 다른 제제와 조합으로 사용될 수 있다. 예를 들어, 본 발명의 항체는 하나 이상의 부가적인 치료제와 동시에 투여될 수 있다. 특정 구현예에서, 부가적인 치료제는 세포독성제 또는 화학치료제이다.
상기 명시된 이러한 조합 요법은 조합 투여 (2 가지 이상의 치료제가 동일한 또는 별도의 제형 내에 포함됨), 및 개별 투여를 포함하는데, 이 경우 본 발명의 항체의 투여는 부가적인 치료제 및/또는 면역보강제의 투여 전에, 이와 동시에 및/또는 이후에 일어날 수 있다. 본 발명의 항체는 또한 방사선 요법과 조합으로 사용될 수 있다.
본 발명의 항체 (및 임의의 부가적인 치료제) 는 비경구, 폐내, 및 비강내, 및, 국소 치료가 요망되는 경우, 병반내 투여를 비롯한 임의의 적합한 방식에 의해 투여될 수 있다. 비경구 주입에는 근육내, 정맥내, 동맥내, 복강내, 또는 피하 투여가 포함된다. 투여는 임의의 적합한 경로에 의해, 예를 들어 주사, 예컨대 부분적으로는 투여가 간단한지 또는 만성적인지에 따라, 정맥내 또는 피하 주사에 의해 실시될 수 있다. 다양한 시점에 걸친 단일 또는 다중 투여, 일시 투여 및 펄스 주입을 포함하나 이에 제한되지 않는 다양한 투여 스케줄이 본원에서 고려된다.
본 발명의 항체는 양호한 의료적 실시와 일치하는 방식으로 제형화되고, 투약되고, 투여될 것이다. 본 문맥에서 고려되는 인자에는, 치료할 특정 질환, 치료할 특전 포유류, 개별 환자의 임상적 상태, 질환의 원인, 제제의 전달 부위, 투여 방법, 투여 스케쥴, 및 의사에게 공지된 기타 인자가 포함된다. 항체는 반드시 그런 것은 아니지만, 논의되는 질환을 예방하거나 치료하기 위해 현재 사용되는 하나 이상의 작용제와 함께 임의로 제형화될 필요도 있다. 이러한 기타 제제의 유효량은 제형 내에 존재하는 항체의 양, 질환 또는 치료의 유형, 및 상기 논의된 기타 인자에 따라 다르다. 이들은 일반적으로 본원에 기재된 것과 동일한 투여량과 투여 경로로, 또는 본원에 기재된 투여량의 약 1 내지 99% 로, 또는 경함적으로/임상적으로 적합한 것으로 결정되는 임의의 투여량 및 임의의 경로로 사용된다.
질환의 예방 또는 치료를 위해, 본 발명의 항체 (단독으로 또는 하나 이상의 기타 부가적인 치료제와 조합으로 사용되는 경우) 의 적합한 투여량은 치료하고자 할 질환의 유형, 항체의 유형, 질환의 경중도 및 경과, 항체가 예방적 또는 치료적 목적을 위해 투여되는지의 여부, 이전 요법, 환자의 임상적 이력 및 항체에 대한 반응, 및 주치의의 재량에 따라 다를 것이다. 항체는 환자에게 1 회에 또는 일련의 치료에 걸쳐 적합하게 투여된다. 질환의 유형 및 경중도에 따라, 약 1 μg/kg 내지 15 mg/kg (예를 들어, 0.5 mg/kg - 10 mg/kg) 의 항체는, 예를 들어, 1 회 이상의 개별 투여에 의한, 또는 연속 주입에 의한 것이든지 환자에 대한 투여를 위한 초기 후보 투여량일 수 있다. 하나의 전형적인 일일 투여량은 상기 언급되는 인자에 따라, 약 1 μg/kg 내지 100 mg/kg 이상의 범위일 것이다. 상태에 따라, 수 일 또는 그 이상의 기간에 걸친 반복된 투여를 위해서는, 치료는 일반적으로 질환 증상의 원하는 억제가 일어날때까지 지속될 것이다. 항체의 하나의 예시적인 투여량은 약 0.05 mg/kg 내지 약 10 mg/kg 의 범위일 것이다. 따라서, 약 0.5 mg/kg, 2.0 mg/kg, 4.0 mg/kg 또는 10 mg/kg (또는 이의 임의의 조합) 의 1 회 이상의 투여량이 환자에게 투여될 수 있다. 이러한 투여량은 간헐적으로, 예를 들어, 매주 또는 매 3 주 (예를 들어, 환자가 약 2 내지 약 20, 또는 예를 들어, 약 6 투여량의 항체를 수여받는 식) 투여될 수 있다. 초기의 높은 적재 투여량, 후 1 회 이상의 적은 투여량이 투여될 수 있다. 예시적 투여 섭생은 [[예시적 투여 섭생을 첨가하기, 알려져 있다면, 예를 들어, "약 4 mg/kg 의 초기 적재 투여량 후, 약 2 mg/kg 의 항체의 주당 유지 투여량"]] 을 투여하는 것을 포함한다. 그러나, 기타 투여량 섭생이 유용할 수 있다. 상기 요법의 진행은 통상의 기법 및 검정에 의해 쉽게 모니터링된다.
상기 임의의 제형 또는 치료 방법은 2-특이적 항체 대신에 또는 이에 더해 본 발명의 면역접합체를 사용하여 실시될 수 있다는 것으로 이해된다.
VII. 제조품
본 발명의 또다른 양상에서, 상기 기재된 질환의 치료, 예방 및/또는 진단에 유용한 물질을 함유하는 제조품이 제공된다. 제조품은 용기 및 용기 상의 또는 용기와 연관된 라벨 또는 패키지 삽입물을 포함한다. 적합한 용기에는, 예를 들어, 병, 바이알, 주사기, IV 용액 백 등이 포함된다. 상기 용기는 유리 또는 플라스틱과 같은 다양한 물질로 형성될 수 있다. 용기는 조성물 그 자체 또는 상태의 치료, 예방 및/또는 진단에 효과적인 또다른 조성물과 조합된 조성물을 담고 있으며, 멸균 접근 포트 (예를 들어, 용기는 피하 (hypodermic) 주사 바늘에 의해 관통가능한 마개를 가진 정맥내 용액 백 또는 바이알일 수 있음) 를 가질 수 있다. 조성물 내 하나 이상의 활성제는 본 발명의 항체이다. 라벨 또는 패키지 삽입물은 조성물이 선택되는 상태를 치료하기 위해 사용되는 것을 표시한다. 게다가, 제조품은 하기 요소를 포함할 수 있다: (a) 내부에 함유된 조성물이 있는 제 1 용기, 상기 조성물은 본 발명의 항체를 포함함; 및 (b) 내부에 함유된 조성물이 있는 제 2 용기, 상기 조성물은 추가의 세포독성제 또는 그렇지 않으면 치료제를 포함함. 본 발명의 상기 구현예에서 제조품은 조성물이 특정 상태를 치료하기 위해 사용될 수 있다는 것을 나타내는 패키지 삽입물을 추가로 포함할 수 있다. 대안적으로, 또는 부가적으로는, 제조품은 약학적으로-허용가능한 완충액, 예컨대 세균발육저지 주사용수 (BWFI), 인산염-완충 식염수, 링거 (Ringer) 용액 및 덱스트로오스 용액을 포함하는 제 2 (또는 제 3) 용기를 추가로 포함할 수 있다. 이것은 기타 완충액, 희석제, 필터, 바늘, 및 주사기를 비롯해서, 판매자 및 사용자 관점으로부터 바람직한 기타 물질을 추가로 포함할 수 있다.
임의의 상기 제조품에 2-특이적 항체 대신에 또는 이 외에도 본 발명의 면역접합체가 포함될 수 있는 것으로 이해된다.
서열 목록의 설명:
SEQ ID NO: 01 내지 07 및 66 내지 67 Sortase 모티프
SEQ ID NO: 08 Fc-영역 친핵체
SEQ ID NO: 09 내지 10 접합체 내 Sortase 모티프 나머지
SEQ ID NO: 11 내지 29 아미노산 서열 태그
SEQ ID NO: 30 인간 CH2 도메인
SEQ ID NO: 31 인간 CH3 도메인
SEQ ID NO: 32 내지 46 예시적 야생형 및 변이체 항체 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드
SEQ ID NO: 47 내지 65 실시예에서 사용되는 서열.
실시예
하기 실시예는 본 발명의 방법 및 조성물의 예이다. 상기 제시된 일반적인 설명을 제시하면서 다양한 기타 구현예가 실시될 수 있다고 이해된다.
상기 발명이 이해의 명확성을 목적으로 설명과 예시에 의해 더욱 상세히 기술되고는 있지만, 설명과 예시가 본 발명의 범주를 제한하는 것으로 해석되어서는 안된다.
재료 및 방법
재조합 DNA 기법
문헌 [Sambrook, J., et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual; Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, New York (1989)] 에 기재된 바와 같이 DNA 를 조작하기 위해 표준 방법이 사용되었다. 분자 생물학 시약은 제조자의 지침에 따라 사용되었다.
유전자 합성
원하는 유전자 분절을 Geneart GmbH (Regensburg, Germany) 에서 화학적 합성에 의해 제조했다. 합성된 유전자 단편을 증식/증폭을 위해 대장균 플라스미드 내로 클로닝했다. 서브클로닝된 유전자 단편의 DNA 서열을 DNA 서열분석에 의해 확인했다.
단백질 측정
정제된 폴리펩티드의 단백질 농도를 폴리펩티드의 아미노산 서열에 기초하여 계산된 몰 흡광 계수를 사용하여 280 ㎚ 에서 광학 밀도 (OD) 를 측정함으로써 확인했다.
실시예 1
발현 플라스미드의 생성
기본/표준 포유류 발현 플라스미드의 설명
원하는 단백질을 인간 배아 신장 세포 (HEK 293) 의 일시적 트랜스펙션에 의해 발현시켰다. 원하는 유전자/단백질 (예를 들어, 전장 항체 중쇄, 전장 항체 경쇄, 또는 그의 N-말단에 올리고글라이신을 함유하는 Fc-사슬) 의 발현을 위해 하기 기능적 요소들을 포함하는 전사 단위를 사용했다:
- 인트론 A 를 포함하는 인간 사이토메갈로바이러스 (P-CMV) 로부터의 조기 발현 인핸서 및 프로모터,
- 인간 중쇄 면역글로불린 5'-미번역 영역 (5'UTR),
- 쥐 면역글로불린 중쇄 신호 서열 (SS),
- 발현될 유전자/단백질 (예를 들어, 전장 항체 중쇄), 및
- 소 성장 호르몬 폴리아데닐화 서열 (BGH pA).
발현될 원하는 유전자를 포함하는 발현 단위/카세트 외에 기본/표준 포유류 발현 플라스미드는 하기를 함유한다:
- 대장균에서 이러한 플라스미드의 복제를 허용하는 벡터 pUC18 로부터의 복제 기원, 및
- 대장균에서 암피실린 저항성을 부여하는 베타-락타마제 유전자.
하기 폴리펩티드/단백질에 대해 코딩하는 발현 플라스미드를 구축했다:
- T366W 돌연변이를 함유하는 서브클래스 IgG1 의 인간 중쇄 불변 영역과 조합된 페르투주맙 중쇄 가변 도메인:
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFTDYTMDWVRQAPGKGLEWVADVNPNSGGSIYNQRFKGRFTLSVDRSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARNLGPSFYFDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPCRDELTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK (SEQ ID NO: 47).
- 인간 카파 경쇄 불변 영역과 조합된 페르투주맙 경쇄 가변 도메인:
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKASQDVSIGVAWYQQKPGKAPKLLIYSASYRYTGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQYYIYPYTFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC (SEQ ID NO: 48).
- T366S, L368A, 및 Y407V 돌연변이를 함유하는 서브클래스 IgG1 의 인간 중쇄 불변 영역과 조합된 트라스투주맙 중쇄 가변 도메인:
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFNIKDTYIHWVRQAPGKGLEWVARIYPTNGYTRYADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCSRWGGDGFYAMDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVCTLPPSRDELTKNQVSLSCAVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLVSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK (SEQ ID NO: 49).
- 인간 카파 경쇄 불변 영역과 조합된 트라스투주맙 경쇄 가변 도메인:
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDVNTAVAWYQQKPGKAPKLLIYSASFLYSGVPSRFSGSRSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQHYTTPPTFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC (SEQ ID NO: 50).
- C-말단 GGGSLPETGGSGSHHHHHH 아미노산 서열을 함유하는 서브클래스 IgG1 의 인간 중쇄 불변 영역 1 (CH1) 및 페르투주맙 중쇄 가변 도메인을 포함하는 항체 Fab 단편:
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFTDYTMDWVRQAPGKGLEWVADVNPNSGGSIYNQRFKGRFTLSVDRSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARNLGPSFYFDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCGGGSLPETGGSGSHHHHHH (SEQ ID NO: 51).
- C-말단 GSLPETGGSGSHHHHHH 서열을 함유하는 서브클래스 IgG1 의 인간 중쇄 불변 영역 1 (CH1) 및 페르투주맙 중쇄 가변 도메인을 포함하는 항체 Fab 단편:
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFTDYTMDWVRQAPGKGLEWVADVNPNSGGSIYNQRFKGRFTLSVDRSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARNLGPSFYFDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCGSLPETGGSGSHHHHHH (SEQ ID NO: 52).
- C-말단 LPETGGSGSHHHHHH 서열을 함유하는 서브클래스 IgG1 의 인간 중쇄 불변 영역 1 (CH1) 및 페르투주맙 중쇄 가변 도메인을 포함하는 항체 Fab 단편:
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFTDYTMDWVRQAPGKGLEWVADVNPNSGGSIYNQRFKGRFTLSVDRSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARNLGPSFYFDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCLPETGGSGSHHHHHH (SEQ ID NO: 53).
- C-말단 GGGSLPETGGSGSHHHHHH 서열을 함유하는 서브클래스 IgG1 의 인간 중쇄 불변 영역 1 (CH1) 및 트라스투주맙 중쇄 가변 도메인을 포함하는 항체 Fab 단편:
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFNIKDTYIHWVRQAPGKGLEWVARIYPTNGYTRYADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCSRWGGDGFYAMDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCGGGSLPETGGSGSHHHHHH (SEQ ID NO: 54).
- C-말단 GSLPETGGSGSHHHHHH 서열을 함유하는 서브클래스 IgG1 의 인간 중쇄 불변 영역 1 (CH1) 및 트라스투주맙 중쇄 가변 도메인을 포함하는 항체 Fab 단편:
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFNIKDTYIHWVRQAPGKGLEWVARIYPTNGYTRYADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCSRWGGDGFYAMDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCGSLPETGGSGSHHHHHH (SEQ ID NO: 55).
- C-말단 LPETGGSGSHHHHHH 서열을 함유하는 서브클래스 IgG1 의 인간 중쇄 불변 영역 1 (CH1) 및 트라스투주맙 중쇄 가변 도메인을 포함하는 항체 Fab 단편:
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFNIKDTYIHWVRQAPGKGLEWVARIYPTNGYTRYADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCSRWGGDGFYAMDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCLPETGGSGSHHHHHH (SEQ ID NO: 56).
- N-말단 GGGDKTHTCPPC 서열을 함유하는 T366S, L368A, 및 Y407V 돌연변이를 갖는 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드 (인간 IgG1(CH2-CH3)):
GGGDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVCTLPPSRDELTKNQVSLSCAVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLVSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK (SEQ ID NO: 57).
- N-말단 GGHTCPPC 서열을 함유하는 T366S, L368A, 및 Y407V 돌연변이를 갖는 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드 (인간 IgG1(CH2-CH3)):
GGHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVCTLPPSRDELTKNQVSLSCAVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLVSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK (SEQ ID NO: 58).
- N-말단 GGCPPC 서열을 함유하는 T366S, L368A, 및 Y407V 돌연변이를 갖는 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드 (인간 IgG1(CH2-CH3)):
GGCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVCTLPPSRDELTKNQVSLSCAVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLVSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK (SEQ ID NO: 59).
- N-말단 GGGDKTHTCPPC 서열을 함유하는 T366W 돌연변이를 갖는 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드 (인간 IgG1(CH2-CH3)):
GGGDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPCRDELTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK (SEQ ID NO: 60).
- N-말단 GGHTCPPC 서열을 함유하는 T366W 돌연변이를 갖는 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드 (인간 IgG1(CH2-CH3)):
GGHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPCRDELTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK (SEQ ID NO: 61).
- N-말단 GGCPPC 서열을 함유하는 T366W 돌연변이를 갖는 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드 (인간 IgG1(CH2-CH3)):
GGCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPCRDELTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK (SEQ ID NO: 62).
실시예 2
일시적 발현, 정제 및 분석적 특징화
F17 배지 (Invitrogen Corp.) 에서 배양된 HEK293 세포 (인간 배아 신장 세포주 293-유래됨) 의 일시적 트랜스펙션에 의해 항체 사슬을 생성했다. 트랜스펙션을 위해 "293-Fectin" 트랜스펙션 시약 (Invitrogen) 을 사용했다. 전장 중쇄 (페르투주맙-놉 (knob), 또는 트라스투주맙-홀 (hole)), 상응하는 전장 경쇄, 및 N-말단 올리고글라이신 서열 중 하나를 함유하는 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드 (놉, 또는 홀 변이체로서) 에 대해 코딩하는, 3 개의 상이한 플라스미드로부터 항체 사슬을 발현시켰다. 3 가지 플라스미드를 트랜스펙션시 등몰 플라스미드 비율로 사용했다. 트랜스펙션을 제조사의 지침에 명시된 바와 같이 수행했다. 항체 Fc-영역-함유 세포 배양물 상청액을 트랜스펙션 후 7 일째에 수집했다. 상청액을 정제 전까지 동결 상태로 저장했다.
항체 Fc-영역-함유 배양물 상청액을 2 개의 크로마토그래피 단계에 의해 여과 및 정제했다. 항체 Fc-영역을 PBS (1 mM KH2PO4, 10 mM Na2HPO4, 137 mM NaCl, 2.7 mM KCl), pH 7.4 로 평형시킨 HiTrap MabSelectSuRe (GE Healthcare) 를 사용하여 친화도 크로마토그래피에 의해 포획했다. 미결합 단백질을 평형 완충액으로 세정하여 제거하고, 항체 Fc-영역을 0.1 M 시트레이트 완충액, pH 3.0 으로 회수했다. 용리 직후 용액을 1 M Tris-염기, pH 9.0 로 pH 6.0 으로 중화시켰다. Superdex 200™ (GE Healthcare) 에서의 크기 배제 크로마토그래피를 제 2 정제 단계로서 사용했다. 크기 배제 크로마토그래피를 40 mM Tris-HCl 완충액, 0.15 M NaCl, pH 7.5 중에서 수행했다. 용리된 항체 Fc-영역을 Biomax-SK 멤브레인 (Millipore, Billerica, MA) 이 구비된 Ultrafree-CL 원심분리 필터 유닛으로 농축시키고, -80 ℃ 에서 저장했다.
아미노산 서열에 기초하여 계산된 몰 흡광 계수를 사용하여 280 ㎚ 에서 광학 밀도 (OD) 를 측정함으로써 항체 Fc-영역의 단백질 농도를 확인했다. SDS-PAGE 에 의해 환원제 (5 mM 1.4-디티오트레이톨) 의 존재 및 부재 하에 및 쿠마시 브릴리언트 블루로 염색하여 순도 및 적절한 항체 Fc-영역 형성을 분석했다.
실시예 3
C-말단 LPX1TG 모티프를 함유하는 항체 Fab 단편의 일시적 발현, 정제 및 분석적 특징화
F17 배지 (Invitrogen Corp.) 에서 배양된 HEK293 세포 (인간 배아 신장 세포주 293-유래됨) 의 일시적 트랜스펙션에 의해 항체 Fab 단편을 생성했다. 트랜스펙션을 위해 "293-Fectin" 트랜스펙션 시약 (Invitrogen) 을 사용했다. 전장 경쇄 (페르투주맙, 또는 트라스투주맙) 및 C-말단 LPX1TG 서열 중 하나를 함유하는 상응하는 절두된 중쇄에 대해 코딩하는, 2 개의 상이한 플라스미드로부터 항체 Fab 단편을 발현시켰다. 2 가지 플라스미드를 트랜스펙션시 등몰 플라스미드 비율로 사용했다. 트랜스펙션을 제조사의 지침에 명시된 바와 같이 수행했다. Fab 분절-함유 세포 배양물 상청액을 트랜스펙션 후 7 일째에 수집했다. 상청액을 정제 전까지 동결 상태로 저장했다.
Fab 단편 함유 배양물 상청액을 2 개의 크로마토그래피 단계에 의해 여과 및 정제했다. Fab 단편을 PBS 및 20mM 이미다졸 (1 mM KH2PO4, 10 mM Na2HPO4, 137 mM NaCl, 2.7 mM KCl, 20mM 이미다졸), pH 7.4 로 평형시킨 HisTrap HP Ni-NTA 칼럼 (GE Healthcare) 을 사용하여 친화도 크로마토그래피에 의해 포획했다. 미결합 단백질을 평형 완충액으로 세정하여 제거했다. 히스티딘-태그된 단백질을 10 칼럼 부피로 PBS (1 mM KH2PO4, 10 mM Na2HPO4, 137 mM NaCl, 2.7 mM KCl, 400 mM 이미다졸) 중 20 mM 내지 400 mM 선형 이미다졸 구배로 용리했다. Superdex 200™ (GE Healthcare) 에서의 크기 배제 크로마토그래피를 제 2 정제 단계로서 사용했다. 크기 배제 크로마토그래피를 40 mM Tris-HCl 완충액, 0.15 M NaCl, pH 7.5 중에서 수행했다. Fab 단편을 Biomax-SK 멤브레인 (Millipore, Billerica, MA) 이 구비된 Ultrafree-CL 원심분리 필터 유닛으로 농축시키고, -80 ℃ 에서 저장했다.
아미노산 서열에 기초하여 계산된 몰 흡광 계수를 사용하여 280 ㎚ 에서 광학 밀도 (OD) 를 측정함으로써 Fab 분절의 단백질 농도를 확인했다. SDS-PAGE 에 의해 환원제 (5 mM 1.4-디티오트레이톨) 의 존재 및 부재 하에 및 쿠마시 브릴리언트 블루로 염색하여 순도 및 적절한 항체 Fab 형성을 분석했다.
실시예 4
항체 Fc-영역 및 결합 단위 (Fab 분절) 의 소르타제 A 매개되는 라이게이션
소르타제-매개되는 펩티드전이 반응을 위해, N-말단 절두된 황색포도상구균 소르타제 A 를 사용했다 (Δ1-59). 50 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, pH 7.5 를 함유하는 완충액 (소르타제-완충액) 중에서 반응을 수행했다. 반응에서, VH-CH1 중쇄의 C-말단 (...KSC) 과 소르타제 모티프의 N-말단 (LPETGGSGSHHHHHH, SEQ ID NO: 63, GSLPETGGSGSHHHHHH, SEQ ID NO: 64, 및 GGGSLPETGGSGSHHHHHH, SEQ ID NO: 65) 사이에 2 가지 상이한 연결성 짧은 아미노산 서열을 포함하거나 포함하지 않는 VH-CH1-중쇄의 C-말단에서 소르타제 모티프 (LPETG) 를 보유하는 Fab 단편 및 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드의 N-말단에서 올리고글라이신 모티프 및 3 개의 상이한 힌지 서열 (GGCPPC, SEQ ID NO: 8, 식 중 X4 = P, GGHTCPPC, SEQ ID NO: 66, 및 GGGDKTHTCPPC, SEQ ID NO: 67, 각각) 을 보유하는 외-분지 항체를 연결시켜, 항체 Fc-영역 접합체를 초래했다. 반응을 수행하기 위해, 모든 시약을 소르타제 완충액 중 용액으로 만들었다. 제 1 단계에서, 항체 Fc-영역 및 항체 Fab 단편을 혼합하고, 후속적으로 소르타제 A 및 5 mM CaCl2 를 첨가하여 반응을 시작했다. 성분들을 피펫팅에 의해 혼합하고, 37 ℃ 에서 72h 동안 인큐베이션했다. 후속적으로, 반응 혼합물을 동결시켜 반응을 중단시키고, 분석 전까지 -20℃ 에서 저장했다.
몰비 Fab:외-분지 항체:소르타제 = 20:4:1
결과
각각 Fab 의 C-말단에서 및 항체의 N-말단에서 3 가지 상이한 서열을 소르타제 A 에 의해 접합시켜 항체 Fc-영역 접합체의 9 가지 상이한 조합을 수득했다. 커플링 반응의 효율을 상이한 시점에 평가했다. 이를 위해 펩티드전이 반응의 분취물을 SDS-PAGE 에 의해 분석했다. 라이게이션의 효율을 SDS PAGE 겔로부터 농도계측으로 추정했다. 72h 의 반응 후의 결과가 표 2 에 각각의 서열에 대해 나타나 있다.
표 2:
Fab 분절과 외-분지 항체의 접합
<110> F. Hoffmann-La Roche AG
<120> Method for selection and production of tailor-made highly
selective and multi-specific targeting entities containing at
least two different binding entities and uses thereof
<130> 31069 WO
<150> EP12173875.1
<151> 2012-06-27
<160> 67
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 5
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> sortase amino acid sequence tag
<220>
<221> SITE
<222> (3)
<223> X can be any amino acid residue
<400> 1
Leu Pro Xaa Thr Gly
1 5
<210> 2
<211> 7
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
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<223> sortase amino acid sequence tag 2
<220>
<221> SITE
<222> (1)
<223> X = G or GG or GGG
<220>
<221> SITE
<222> (5)
<223> X = any amino acid residue
<400> 2
Xaa Ser Leu Pro Xaa Thr Gly
1 5
<210> 3
<211> 11
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
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<223> sortase amino acid sequence tag 3
<220>
<221> SITE
<222> (5)
<223> X = any amino acid residue
<400> 3
Gly Ser Leu Pro Xaa Thr Gly Gly Ser Gly Ser
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<210> 4
<211> 13
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
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<223> sortase amino acid sequence tag 3a
<220>
<221> SITE
<222> (7)
<223> X = any amino acid residue
<400> 4
Gly Gly Gly Ser Leu Pro Xaa Thr Gly Gly Ser Gly Ser
1 5 10
<210> 5
<211> 12
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
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<223> sortase amino acid sequence tag 5
<220>
<221> SITE
<222> (1)
<223> X = any amino acid residue except G
<220>
<221> SITE
<222> (6)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> SITE
<222> (7)
<223> X = any amino acid residue
<400> 5
Xaa Gly Ser Leu Pro Xaa Thr Gly Gly Ser Gly Ser
1 5 10
<210> 6
<211> 12
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
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<223> sortase amino acid sequence tag 5
<220>
<221> SITE
<222> (1)
<223> X = G or GG or GGG
<220>
<221> SITE
<222> (5)
<223> X = any amino acid residue
<220>
<221> SITE
<222> (12)
<223> X = amino acid sequence tag
<400> 6
Xaa Ser Leu Pro Xaa Thr Gly Gly Ser Gly Ser Xaa
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<213> Artificial Sequence
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<223> sortase amino acid sequence tag 6
<220>
<221> SITE
<222> (1)
<223> X = any amino acid residue except G
<220>
<221> SITE
<222> (6)
<223> X = any amino acid residue
<220>
<221> SITE
<222> (13)
<223> X = amino acid sequence tag
<400> 7
Xaa Gly Ser Leu Pro Xaa Thr Gly Gly Ser Gly Ser Xaa
1 5 10
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<211> 6
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> hinge nucleophile
<220>
<221> SITE
<222> (5)
<223> X = S or P
<400> 8
Gly Gly Cys Pro Xaa Cys
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<213> Artificial Sequence
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<223> sortase product characteristic amino acid sequence
<220>
<221> SITE
<222> (1)
<223> X = G or GG or GGG
<220>
<221> SITE
<222> (5)
<223> X = any amino acid residue
<220>
<221> SITE
<222> (11)
<223> X = S or P
<400> 9
Xaa Ser Leu Pro Xaa Thr Gly Gly Cys Pro Xaa Cys
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<211> 13
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> sortase product characteristic amino acid sequence 2
<220>
<221> SITE
<222> (1)
<223> X = any amino acid residue except G
<220>
<221> SITE
<222> (6)
<223> X = any amino acid residue
<220>
<221> SITE
<222> (12)
<223> X = S or P
<400> 10
Xaa Gly Ser Leu Pro Xaa Thr Gly Gly Cys Pro Xaa Cys
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Arg Arg Arg Arg Arg
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Arg Arg Arg Arg Arg Arg
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<213> Artificial Sequence
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His His His His His His
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Lys Asp His Leu Ile His Asn Val His Lys Glu Phe His Ala His Ala
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His Asn Lys
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Asp Tyr Lys Asp Asp Asp Asp Lys
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<211> 22
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> amino acid tag
<400> 16
Asp Tyr Lys Asp His Asp Gly Asp Tyr Lys Asp His Asp Ile Asp Tyr
1 5 10 15
Lys Asp Asp Asp Asp Lys
20
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<213> Artificial Sequence
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Ala Trp Arg His Pro Gln Phe Gly Gly
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Trp Ser His Pro Gln Phe Glu Lys
1 5
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Met Asp Val Glu Ala Trp Leu Gly Ala Arg
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<213> Artificial Sequence
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Met Asp Val Glu Ala Trp Leu Gly Ala Arg Val Pro Leu Val Glu Thr
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<213> Artificial Sequence
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<223> amino acid tag
<400> 21
Met Asp Glu Lys Thr Thr Gly Trp Arg Gly Gly His Val Val Glu Gly
1 5 10 15
Leu Ala Gly Glu Leu Glu Gln Leu Arg Ala Arg Leu Glu His His Pro
20 25 30
Gln Gly Gln Arg Glu Pro
35
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<211> 10
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<213> Artificial Sequence
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<400> 22
Glu Gln Lys Leu Ile Ser Glu Glu Asp Leu
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<211> 15
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<213> Artificial Sequence
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<223> amino acid tag
<400> 23
Lys Glu Thr Ala Ala Ala Lys Phe Glu Arg Gln His Met Asp Ser
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 24
Lys Arg Arg Trp Lys Lys Asn Phe Ile Ala Val Ser Ala Ala Asn Arg
1 5 10 15
Phe Lys Lys Ile Ser Ser Ser Gly Ala Leu
20 25
<210> 25
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> amino acid tag
<400> 25
Pro Ala Thr Thr Thr Gly Ser Ser Pro Gly Pro Thr Gln Ser His Tyr
1 5 10 15
Gly Gln Cys Gly Gly Ile Gly Tyr Ser Gly Pro Thr Val Cys Ala Ser
20 25 30
Gly Thr Thr Cys Gln Val Leu Asn Pro Tyr Tyr Ser Gln Cys Leu
35 40 45
<210> 26
<211> 32
<212> PRT
<213> Butyrivibrio fibrisolvens
<400> 26
Met Asp Trp Asn Ala Asn Ile Ala Pro Gly Asn Ser Val Glu Phe Gly
1 5 10 15
Ile Gln Gly Ala Gly Ser Val Gly Asn Val Ile Asp Ile Thr Val Glu
20 25 30
<210> 27
<211> 51
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> chitin-binding-domain
<400> 27
Thr Asn Pro Gly Val Ser Ala Trp Gln Val Asn Thr Ala Tyr Thr Ala
1 5 10 15
Gly Gln Leu Val Thr Tyr Asn Gly Lys Thr Tyr Lys Cys Leu Gln Pro
20 25 30
His Thr Ser Leu Ala Gly Trp Glu Pro Ser Asn Val Pro Ala Leu Trp
35 40 45
Gln Leu Gln
50
<210> 28
<211> 209
<212> PRT
<213> Chondrus crispus
<400> 28
Met Pro Glu Ile Lys Leu Thr Tyr Phe Asp Met Arg Gly Arg Ala Glu
1 5 10 15
Ala Ser Arg Leu Ala Leu Val Val Gly Glu Ile Pro Phe Glu Asp Glu
20 25 30
Arg Val Val Phe Asp His Trp Lys Glu Ala Lys Pro Lys Thr Pro Tyr
35 40 45
Ala Ala Leu Pro Met Leu Thr Val Asp Gly Met Gln Val Ala Gln Ser
50 55 60
Asp Ala Ile Leu Arg Tyr Cys Gly Lys Leu Ala Gly Leu Tyr Pro Ser
65 70 75 80
Asp Pro Leu Glu Ala Ala Lys Val Asp Glu Val Gly Gly Val Ile Asp
85 90 95
Asp Val Thr His Ala Met Tyr Arg Tyr Arg Gly Asp Asp Lys Asp Lys
100 105 110
Leu Arg Glu Glu Arg Asp Lys Phe Ser Lys Val Asp Val Pro Arg Tyr
115 120 125
Val Gly Ala Leu Glu Lys Arg Leu Glu Ala Phe Gly Asp Gly Pro Trp
130 135 140
Ala Val Gly Gly Asn Met Thr Ile Ala Asp Leu His Ile Cys His Leu
145 150 155 160
Val Thr Asn Ile Arg Cys Gly Met Leu Asp Phe Val Asp Lys Asp Leu
165 170 175
Leu Glu Gly Tyr Val Arg Ile Val Lys Ser Tyr Ser Ala Val Met Glu
180 185 190
His Pro Lys Val Thr Glu Trp Tyr Glu Lys Lys Pro Val Lys Met Phe
195 200 205
Ser
<210> 29
<211> 396
<212> PRT
<213> Escherichia coli
<400> 29
Met Lys Ile Lys Thr Gly Ala Arg Ile Leu Ala Leu Ser Ala Leu Thr
1 5 10 15
Thr Met Met Phe Ser Ala Ser Ala Leu Ala Lys Ile Glu Glu Gly Lys
20 25 30
Leu Val Ile Trp Ile Asn Gly Asp Lys Gly Tyr Asn Gly Leu Ala Glu
35 40 45
Val Gly Lys Lys Phe Glu Lys Asp Thr Gly Ile Lys Val Thr Val Glu
50 55 60
His Pro Asp Lys Leu Glu Glu Lys Phe Pro Gln Val Ala Ala Thr Gly
65 70 75 80
Asp Gly Pro Asp Ile Ile Phe Trp Ala His Asp Arg Phe Gly Gly Tyr
85 90 95
Ala Gln Ser Gly Leu Leu Ala Glu Ile Thr Pro Asp Lys Ala Phe Gln
100 105 110
Asp Lys Leu Tyr Pro Phe Thr Trp Asp Ala Val Arg Tyr Asn Gly Lys
115 120 125
Leu Ile Ala Tyr Pro Ile Ala Val Glu Ala Leu Ser Leu Ile Tyr Asn
130 135 140
Lys Asp Leu Leu Pro Asn Pro Pro Lys Thr Trp Glu Glu Ile Pro Ala
145 150 155 160
Leu Asp Lys Glu Leu Lys Ala Lys Gly Lys Ser Ala Leu Met Phe Asn
165 170 175
Leu Gln Glu Pro Tyr Phe Thr Trp Pro Leu Ile Ala Ala Asp Gly Gly
180 185 190
Tyr Ala Phe Lys Tyr Glu Asn Gly Lys Tyr Asp Ile Lys Asp Val Gly
195 200 205
Val Asp Asn Ala Gly Ala Lys Ala Gly Leu Thr Phe Leu Val Asp Leu
210 215 220
Ile Lys Asn Lys His Met Asn Ala Asp Thr Asp Tyr Ser Ile Ala Glu
225 230 235 240
Ala Ala Phe Asn Lys Gly Glu Thr Ala Met Thr Ile Asn Gly Pro Trp
245 250 255
Ala Trp Ser Asn Ile Asp Thr Ser Lys Val Asn Tyr Gly Val Thr Val
260 265 270
Leu Pro Thr Phe Lys Gly Gln Pro Ser Lys Pro Phe Val Gly Val Leu
275 280 285
Ser Ala Gly Ile Asn Ala Ala Ser Pro Asn Lys Glu Leu Ala Lys Glu
290 295 300
Phe Leu Glu Asn Tyr Leu Leu Thr Asp Glu Gly Leu Glu Ala Val Asn
305 310 315 320
Lys Asp Lys Pro Leu Gly Ala Val Ala Leu Lys Ser Tyr Glu Glu Glu
325 330 335
Leu Ala Lys Asp Pro Arg Ile Ala Ala Thr Met Glu Asn Ala Gln Lys
340 345 350
Gly Glu Ile Met Pro Asn Ile Pro Gln Met Ser Ala Phe Trp Tyr Ala
355 360 365
Val Arg Thr Ala Val Ile Asn Ala Ala Ser Gly Arg Gln Thr Val Asp
370 375 380
Glu Ala Leu Lys Asp Ala Gln Thr Arg Ile Thr Lys
385 390 395
<210> 30
<211> 107
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 30
Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys
1 5 10 15
Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val
20 25 30
Trp Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val
35 40 45
Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln
50 55 60
Glu Ser Thr Tyr Arg Trp Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp
65 70 75 80
Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro
85 90 95
Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys
100 105
<210> 31
<211> 106
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 31
Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Asp
1 5 10 15
Glu Leu Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe
20 25 30
Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu
35 40 45
Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe
50 55 60
Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly
65 70 75 80
Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr
85 90 95
Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly
100 105
<210> 32
<211> 222
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 32
Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe
1 5 10 15
Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro
20 25 30
Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val
35 40 45
Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr
50 55 60
Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val
65 70 75 80
Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys
85 90 95
Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser
100 105 110
Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro
115 120 125
Ser Arg Asp Glu Leu Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val
130 135 140
Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly
145 150 155 160
Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp
165 170 175
Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp
180 185 190
Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His
195 200 205
Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
210 215 220
<210> 33
<211> 222
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> variant human Fc-region of the IgG1 isotype with the mutations
L234A, L235A
<400> 33
Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Ala Ala Gly Gly Pro Ser Val Phe
1 5 10 15
Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro
20 25 30
Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val
35 40 45
Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr
50 55 60
Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val
65 70 75 80
Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys
85 90 95
Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser
100 105 110
Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro
115 120 125
Ser Arg Asp Glu Leu Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val
130 135 140
Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly
145 150 155 160
Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp
165 170 175
Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp
180 185 190
Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His
195 200 205
Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
210 215 220
<210> 34
<211> 222
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> variant human Fc-region of the IgG1 isotype with a hole mutation
<400> 34
Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe
1 5 10 15
Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro
20 25 30
Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val
35 40 45
Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr
50 55 60
Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val
65 70 75 80
Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys
85 90 95
Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser
100 105 110
Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Cys Thr Leu Pro Pro
115 120 125
Ser Arg Asp Glu Leu Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Ser Cys Ala Val
130 135 140
Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly
145 150 155 160
Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp
165 170 175
Gly Ser Phe Phe Leu Val Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp
180 185 190
Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His
195 200 205
Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
210 215 220
<210> 35
<211> 222
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> variant human Fc-region of the IgG1 isotype with a knob mutation
<400> 35
Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe
1 5 10 15
Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro
20 25 30
Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val
35 40 45
Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr
50 55 60
Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val
65 70 75 80
Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys
85 90 95
Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser
100 105 110
Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro
115 120 125
Cys Arg Asp Glu Leu Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Trp Cys Leu Val
130 135 140
Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly
145 150 155 160
Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp
165 170 175
Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp
180 185 190
Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His
195 200 205
Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
210 215 220
<210> 36
<211> 222
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> variant human Fc-region of the IgG1 isotype with a L234A, L235A
and hole mutation
<400> 36
Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Ala Ala Gly Gly Pro Ser Val Phe
1 5 10 15
Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro
20 25 30
Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val
35 40 45
Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr
50 55 60
Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val
65 70 75 80
Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys
85 90 95
Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser
100 105 110
Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Cys Thr Leu Pro Pro
115 120 125
Ser Arg Asp Glu Leu Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Ser Cys Ala Val
130 135 140
Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly
145 150 155 160
Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp
165 170 175
Gly Ser Phe Phe Leu Val Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp
180 185 190
Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His
195 200 205
Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
210 215 220
<210> 37
<211> 222
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> variant human Fc-region of the IgG1 isotype with a L234A, L235A
and knob mutation
<400> 37
Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Ala Ala Gly Gly Pro Ser Val Phe
1 5 10 15
Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro
20 25 30
Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val
35 40 45
Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr
50 55 60
Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val
65 70 75 80
Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys
85 90 95
Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser
100 105 110
Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro
115 120 125
Cys Arg Asp Glu Leu Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Trp Cys Leu Val
130 135 140
Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly
145 150 155 160
Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp
165 170 175
Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp
180 185 190
Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His
195 200 205
Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
210 215 220
<210> 38
<211> 222
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> variant human Fc-region of the IgG1 isotype with a P329G mutation
<400> 38
Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe
1 5 10 15
Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro
20 25 30
Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val
35 40 45
Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr
50 55 60
Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val
65 70 75 80
Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys
85 90 95
Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Gly Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser
100 105 110
Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro
115 120 125
Ser Arg Asp Glu Leu Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val
130 135 140
Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly
145 150 155 160
Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp
165 170 175
Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp
180 185 190
Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His
195 200 205
Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
210 215 220
<210> 39
<211> 222
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> variant human Fc-region of the IgG1 isotype with a L234A, L235A
and P329G mutation
<400> 39
Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Ala Ala Gly Gly Pro Ser Val Phe
1 5 10 15
Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro
20 25 30
Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val
35 40 45
Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr
50 55 60
Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val
65 70 75 80
Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys
85 90 95
Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Gly Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser
100 105 110
Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro
115 120 125
Ser Arg Asp Glu Leu Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val
130 135 140
Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly
145 150 155 160
Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp
165 170 175
Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp
180 185 190
Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His
195 200 205
Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
210 215 220
<210> 40
<211> 222
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> variant human Fc-region of the IgG1 isotype with a P239G and hole
mutation
<400> 40
Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe
1 5 10 15
Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro
20 25 30
Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val
35 40 45
Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr
50 55 60
Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val
65 70 75 80
Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys
85 90 95
Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Gly Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser
100 105 110
Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Cys Thr Leu Pro Pro
115 120 125
Ser Arg Asp Glu Leu Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Ser Cys Ala Val
130 135 140
Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly
145 150 155 160
Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp
165 170 175
Gly Ser Phe Phe Leu Val Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp
180 185 190
Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His
195 200 205
Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
210 215 220
<210> 41
<211> 222
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> variant human Fc-region of the IgG1 isotype with a P329G and knob
mutation
<400> 41
Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe
1 5 10 15
Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro
20 25 30
Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val
35 40 45
Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr
50 55 60
Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val
65 70 75 80
Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys
85 90 95
Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Gly Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser
100 105 110
Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro
115 120 125
Cys Arg Asp Glu Leu Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Trp Cys Leu Val
130 135 140
Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly
145 150 155 160
Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp
165 170 175
Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp
180 185 190
Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His
195 200 205
Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
210 215 220
<210> 42
<211> 222
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> variant human Fc-region of the IgG1 isotype with a L234A, L235A,
P329G and hole mutation
<400> 42
Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Ala Ala Gly Gly Pro Ser Val Phe
1 5 10 15
Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro
20 25 30
Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val
35 40 45
Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr
50 55 60
Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val
65 70 75 80
Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys
85 90 95
Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Gly Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser
100 105 110
Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Cys Thr Leu Pro Pro
115 120 125
Ser Arg Asp Glu Leu Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Ser Cys Ala Val
130 135 140
Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly
145 150 155 160
Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp
165 170 175
Gly Ser Phe Phe Leu Val Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp
180 185 190
Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His
195 200 205
Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
210 215 220
<210> 43
<211> 222
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> variant human Fc-region of the IgG1 isotype with a L234A, L235A,
P329G and knob mutation
<400> 43
Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Ala Ala Gly Gly Pro Ser Val Phe
1 5 10 15
Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro
20 25 30
Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val
35 40 45
Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr
50 55 60
Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val
65 70 75 80
Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys
85 90 95
Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Gly Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser
100 105 110
Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro
115 120 125
Cys Arg Asp Glu Leu Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Trp Cys Leu Val
130 135 140
Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly
145 150 155 160
Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp
165 170 175
Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp
180 185 190
Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His
195 200 205
Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
210 215 220
<210> 44
<211> 222
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 44
Cys Pro Ser Cys Pro Ala Pro Glu Phe Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe
1 5 10 15
Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro
20 25 30
Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser Gln Glu Asp Pro Glu Val
35 40 45
Gln Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr
50 55 60
Lys Pro Arg Glu Glu Gln Phe Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val
65 70 75 80
Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys
85 90 95
Lys Val Ser Asn Lys Gly Leu Pro Ser Ser Ile Glu Lys Thr Ile Ser
100 105 110
Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro
115 120 125
Ser Gln Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val
130 135 140
Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly
145 150 155 160
Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp
165 170 175
Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Arg Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp
180 185 190
Gln Glu Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His
195 200 205
Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Leu Gly Lys
210 215 220
<210> 45
<211> 222
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> variant human Fc-region of the IgG4 isotype with a S228P and
L235E mutation
<400> 45
Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Phe Glu Gly Gly Pro Ser Val Phe
1 5 10 15
Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro
20 25 30
Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser Gln Glu Asp Pro Glu Val
35 40 45
Gln Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr
50 55 60
Lys Pro Arg Glu Glu Gln Phe Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val
65 70 75 80
Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys
85 90 95
Lys Val Ser Asn Lys Gly Leu Pro Ser Ser Ile Glu Lys Thr Ile Ser
100 105 110
Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro
115 120 125
Ser Gln Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val
130 135 140
Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly
145 150 155 160
Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp
165 170 175
Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Arg Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp
180 185 190
Gln Glu Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His
195 200 205
Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Leu Gly Lys
210 215 220
<210> 46
<211> 222
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> variant human Fc-region of the IgG4 isotype with a S228P, L235E
and P329G mutation
<400> 46
Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Phe Glu Gly Gly Pro Ser Val Phe
1 5 10 15
Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro
20 25 30
Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser Gln Glu Asp Pro Glu Val
35 40 45
Gln Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr
50 55 60
Lys Pro Arg Glu Glu Gln Phe Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val
65 70 75 80
Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys
85 90 95
Lys Val Ser Asn Lys Gly Leu Gly Ser Ser Ile Glu Lys Thr Ile Ser
100 105 110
Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro
115 120 125
Ser Gln Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val
130 135 140
Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly
145 150 155 160
Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp
165 170 175
Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Arg Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp
180 185 190
Gln Glu Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His
195 200 205
Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Leu Gly Lys
210 215 220
<210> 47
<211> 449
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Pertuzumab heavy chain variable domain combined with a human
heavy chain constant region of the subclass IgG1 containing a
T366W mutation
<400> 47
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Thr Asp Tyr
20 25 30
Thr Met Asp Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Asp Val Asn Pro Asn Ser Gly Gly Ser Ile Tyr Asn Gln Arg Phe
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Leu Ser Val Asp Arg Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Asn Leu Gly Pro Ser Phe Tyr Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe
115 120 125
Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu
130 135 140
Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp
145 150 155 160
Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu
165 170 175
Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser
180 185 190
Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro
195 200 205
Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Lys Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys
210 215 220
Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro
225 230 235 240
Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser
245 250 255
Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp
260 265 270
Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn
275 280 285
Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val
290 295 300
Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu
305 310 315 320
Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys
325 330 335
Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr
340 345 350
Leu Pro Pro Cys Arg Asp Glu Leu Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Trp
355 360 365
Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu
370 375 380
Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu
385 390 395 400
Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys
405 410 415
Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu
420 425 430
Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly
435 440 445
Lys
<210> 48
<211> 214
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Pertuzumab light chain variable domain combined with a human
kappa light chain constant region
<400> 48
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ala Ser Gln Asp Val Ser Ile Gly
20 25 30
Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Ser Ala Ser Tyr Arg Tyr Thr Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Tyr Ile Tyr Pro Tyr
85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Arg Thr Val Ala Ala
100 105 110
Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gln Leu Lys Ser Gly
115 120 125
Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Arg Glu Ala
130 135 140
Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly Asn Ser Gln
145 150 155 160
Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser Leu Ser
165 170 175
Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His Lys Val Tyr
180 185 190
Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser Pro Val Thr Lys Ser
195 200 205
Phe Asn Arg Gly Glu Cys
210
<210> 49
<211> 450
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Trastuzumab heavy chain variable domain combined with a human
heavy chain constant region of the subclass IgG1 containing a
T366S, L368A, and Y407V mutation
<400> 49
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Asn Ile Lys Asp Thr
20 25 30
Tyr Ile His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Arg Ile Tyr Pro Thr Asn Gly Tyr Thr Arg Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Ala Asp Thr Ser Lys Asn Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ser Arg Trp Gly Gly Asp Gly Phe Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val
115 120 125
Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala
130 135 140
Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser
145 150 155 160
Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val
165 170 175
Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro
180 185 190
Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys
195 200 205
Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Lys Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp
210 215 220
Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly
225 230 235 240
Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile
245 250 255
Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His Glu
260 265 270
Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His
275 280 285
Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg
290 295 300
Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys
305 310 315 320
Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu
325 330 335
Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Cys
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355 360 365
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Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val
385 390 395 400
Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Val Ser Lys Leu Thr Val Asp
405 410 415
Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His
420 425 430
Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro
435 440 445
Gly Lys
450
<210> 50
<211> 214
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Trastuzumab light chain variable domain combined with a human
kappa light chain constant region
<400> 50
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Asp Val Asn Thr Ala
20 25 30
Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Ser Ala Ser Phe Leu Tyr Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Arg Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln His Tyr Thr Thr Pro Pro
85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Arg Thr Val Ala Ala
100 105 110
Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gln Leu Lys Ser Gly
115 120 125
Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Arg Glu Ala
130 135 140
Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly Asn Ser Gln
145 150 155 160
Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser Leu Ser
165 170 175
Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His Lys Val Tyr
180 185 190
Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser Pro Val Thr Lys Ser
195 200 205
Phe Asn Arg Gly Glu Cys
210
<210> 51
<211> 241
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> antibody Fab fragment comprising a Pertuzumab heavy chain
variable domain and a human heavy chain constant region 1 (CH1)
of the subclass IgG1 containing a C-terminal GGGSLPETGGSGSHHHHHH
amino acid sequence
<400> 51
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Thr Asp Tyr
20 25 30
Thr Met Asp Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Asp Val Asn Pro Asn Ser Gly Gly Ser Ile Tyr Asn Gln Arg Phe
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Leu Ser Val Asp Arg Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Asn Leu Gly Pro Ser Phe Tyr Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe
115 120 125
Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu
130 135 140
Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp
145 150 155 160
Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu
165 170 175
Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser
180 185 190
Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro
195 200 205
Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Lys Val Glu Pro Lys Ser Cys Gly Gly
210 215 220
Gly Ser Leu Pro Glu Thr Gly Gly Ser Gly Ser His His His His His
225 230 235 240
His
<210> 52
<211> 239
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> antibody Fab fragment comprising a Pertuzumab heavy chain
variable domain and a human heavy chain constant region 1 (CH1)
of the subclass IgG1 containing a C-terminal GSLPETGGSGSHHHHHH
sequence
<400> 52
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Thr Asp Tyr
20 25 30
Thr Met Asp Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Asp Val Asn Pro Asn Ser Gly Gly Ser Ile Tyr Asn Gln Arg Phe
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Leu Ser Val Asp Arg Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Asn Leu Gly Pro Ser Phe Tyr Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe
115 120 125
Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu
130 135 140
Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp
145 150 155 160
Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu
165 170 175
Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser
180 185 190
Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro
195 200 205
Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Lys Val Glu Pro Lys Ser Cys Gly Ser
210 215 220
Leu Pro Glu Thr Gly Gly Ser Gly Ser His His His His His His
225 230 235
<210> 53
<211> 237
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> antibody Fab fragment comprising a Pertuzumab heavy chain
variable domain and a human heavy chain constant region 1 (CH1)
of the subclass IgG1 containing a C-terminal LPETGGSGSHHHHHH
sequence
<400> 53
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Thr Asp Tyr
20 25 30
Thr Met Asp Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Asp Val Asn Pro Asn Ser Gly Gly Ser Ile Tyr Asn Gln Arg Phe
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Leu Ser Val Asp Arg Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Asn Leu Gly Pro Ser Phe Tyr Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe
115 120 125
Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu
130 135 140
Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp
145 150 155 160
Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu
165 170 175
Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser
180 185 190
Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro
195 200 205
Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Lys Val Glu Pro Lys Ser Cys Leu Pro
210 215 220
Glu Thr Gly Gly Ser Gly Ser His His His His His His
225 230 235
<210> 54
<211> 242
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> antibody Fab fragment comprising a Trastuzumab heavy chain
variable domain and a human heavy chain constant region 1 (CH1)
of the subclass IgG1 containing a C-terminal GGGSLPETGGSGSHHHHHH
sequence
<400> 54
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Asn Ile Lys Asp Thr
20 25 30
Tyr Ile His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Arg Ile Tyr Pro Thr Asn Gly Tyr Thr Arg Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Ala Asp Thr Ser Lys Asn Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ser Arg Trp Gly Gly Asp Gly Phe Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val
115 120 125
Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala
130 135 140
Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser
145 150 155 160
Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val
165 170 175
Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro
180 185 190
Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys
195 200 205
Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Lys Val Glu Pro Lys Ser Cys Gly
210 215 220
Gly Gly Ser Leu Pro Glu Thr Gly Gly Ser Gly Ser His His His His
225 230 235 240
His His
<210> 55
<211> 240
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> antibody Fab fragment comprising a Trastuzumab heavy chain
variable domain and a human heavy chain constant region 1 (CH1)
of the subclass IgG1 containing a C-terminal GSLPETGGSGSHHHHHH
sequence
<400> 55
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Asn Ile Lys Asp Thr
20 25 30
Tyr Ile His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Arg Ile Tyr Pro Thr Asn Gly Tyr Thr Arg Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Ala Asp Thr Ser Lys Asn Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ser Arg Trp Gly Gly Asp Gly Phe Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val
115 120 125
Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala
130 135 140
Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser
145 150 155 160
Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val
165 170 175
Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro
180 185 190
Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys
195 200 205
Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Lys Val Glu Pro Lys Ser Cys Gly
210 215 220
Ser Leu Pro Glu Thr Gly Gly Ser Gly Ser His His His His His His
225 230 235 240
<210> 56
<211> 238
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> antibody Fab fragment comprising a Trastuzumab heavy chain
variable domain and a human heavy chain constant region 1 (CH1)
of the subclass IgG1 containing a C-terminal LPETGGSGSHHHHHH
sequence
<400> 56
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Asn Ile Lys Asp Thr
20 25 30
Tyr Ile His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Arg Ile Tyr Pro Thr Asn Gly Tyr Thr Arg Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Ala Asp Thr Ser Lys Asn Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ser Arg Trp Gly Gly Asp Gly Phe Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val
115 120 125
Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala
130 135 140
Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser
145 150 155 160
Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val
165 170 175
Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro
180 185 190
Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys
195 200 205
Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Lys Val Glu Pro Lys Ser Cys Leu
210 215 220
Pro Glu Thr Gly Gly Ser Gly Ser His His His His His His
225 230 235
<210> 57
<211> 230
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> heavy chain Fc-region polypeptide (human IgG1(CH2-CH3)) with
T366S, L368A and Y407V mutation containing a N-terminal
gggdkthtcppc sequence
<400> 57
Gly Gly Gly Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu
1 5 10 15
Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp
20 25 30
Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp
35 40 45
Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly
50 55 60
Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn
65 70 75 80
Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp
85 90 95
Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro
100 105 110
Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu
115 120 125
Pro Gln Val Cys Thr Leu Pro Pro Ser Arg Asp Glu Leu Thr Lys Asn
130 135 140
Gln Val Ser Leu Ser Cys Ala Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile
145 150 155 160
Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr
165 170 175
Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Val Ser Lys
180 185 190
Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys
195 200 205
Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu
210 215 220
Ser Leu Ser Pro Gly Lys
225 230
<210> 58
<211> 226
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> heavy chain Fc-region polypeptide (human IgG1(CH2-CH3)) with
T366S, L368A and Y407V mutation containing a N-terminal gghtcppc
sequence
<400> 58
Gly Gly His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly
1 5 10 15
Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile
20 25 30
Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His Glu
35 40 45
Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His
50 55 60
Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg
65 70 75 80
Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys
85 90 95
Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu
100 105 110
Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Cys
115 120 125
Thr Leu Pro Pro Ser Arg Asp Glu Leu Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu
130 135 140
Ser Cys Ala Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp
145 150 155 160
Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val
165 170 175
Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Val Ser Lys Leu Thr Val Asp
180 185 190
Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His
195 200 205
Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro
210 215 220
Gly Lys
225
<210> 59
<211> 224
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> heavy chain Fc-region polypeptide (human IgG1(CH2-CH3)) with
T366S, L368A and Y407V mutation containing a N-terminal ggcppc
sequence
<400> 59
Gly Gly Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser
1 5 10 15
Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg
20 25 30
Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro
35 40 45
Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala
50 55 60
Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val
65 70 75 80
Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr
85 90 95
Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr
100 105 110
Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Cys Thr Leu
115 120 125
Pro Pro Ser Arg Asp Glu Leu Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Ser Cys
130 135 140
Ala Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser
145 150 155 160
Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp
165 170 175
Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Val Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser
180 185 190
Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala
195 200 205
Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
210 215 220
<210> 60
<211> 230
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> heavy chain Fc-region polypeptide (human IgG1(CH2-CH3)) with
T366W mutation containing a N-terminal gggdkthtcppc sequence
<400> 60
Gly Gly Gly Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu
1 5 10 15
Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp
20 25 30
Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp
35 40 45
Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly
50 55 60
Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn
65 70 75 80
Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp
85 90 95
Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro
100 105 110
Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu
115 120 125
Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Cys Arg Asp Glu Leu Thr Lys Asn
130 135 140
Gln Val Ser Leu Trp Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile
145 150 155 160
Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr
165 170 175
Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys
180 185 190
Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys
195 200 205
Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu
210 215 220
Ser Leu Ser Pro Gly Lys
225 230
<210> 61
<211> 226
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> heavy chain Fc-region polypeptide (human IgG1(CH2-CH3)) with
T366W mutations containing a N-terminal gghtcppc sequence
<400> 61
Gly Gly His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly
1 5 10 15
Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile
20 25 30
Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His Glu
35 40 45
Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His
50 55 60
Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg
65 70 75 80
Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys
85 90 95
Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu
100 105 110
Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr
115 120 125
Thr Leu Pro Pro Cys Arg Asp Glu Leu Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu
130 135 140
Trp Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp
145 150 155 160
Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val
165 170 175
Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp
180 185 190
Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His
195 200 205
Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro
210 215 220
Gly Lys
225
<210> 62
<211> 224
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> heavy chain Fc-region polypeptide (human IgG1(CH2-CH3)) with
T366W mutation containing a N-terminal ggcppc sequence
<400> 62
Gly Gly Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser
1 5 10 15
Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg
20 25 30
Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro
35 40 45
Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala
50 55 60
Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val
65 70 75 80
Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr
85 90 95
Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr
100 105 110
Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu
115 120 125
Pro Pro Cys Arg Asp Glu Leu Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Trp Cys
130 135 140
Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser
145 150 155 160
Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp
165 170 175
Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser
180 185 190
Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala
195 200 205
Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
210 215 220
<210> 63
<211> 15
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Fab fragment C-terminus
<400> 63
Leu Pro Glu Thr Gly Gly Ser Gly Ser His His His His His His
1 5 10 15
<210> 64
<211> 17
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Fab fragment C-terminus 2
<400> 64
Gly Ser Leu Pro Glu Thr Gly Gly Ser Gly Ser His His His His His
1 5 10 15
His
<210> 65
<211> 19
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Fab fragment C-terminus 3
<400> 65
Gly Gly Gly Ser Leu Pro Glu Thr Gly Gly Ser Gly Ser His His His
1 5 10 15
His His His
<210> 66
<211> 8
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> sortase tag 7
<400> 66
Gly Gly His Thr Cys Pro Pro Cys
1 5
<210> 67
<211> 12
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> sortase tag 8
<400> 67
Gly Gly Gly Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys
1 5 10
Claims (8)
- 하기 단계를 포함하는 2-특이적 항체의 제조 방법:
하기 (i) 내지 (iii) 을 인큐베이션하는 단계:
(i) 20 개의 C-말단 아미노산 잔기 내에 아미노산 서열 LPX1TG (SEQ ID NO: 01, 식 중 X1 은 임의의 아미노산 잔기일 수 있음) 을 포함하는 항체 Fab 단편 또는 scFv 항체,
(ii) 전장 항체 중쇄, 전장 항체 경쇄, 및 항체 중쇄 Fc 영역 폴리펩티드를 포함하는 외-분지 (one-armed) 항체 단편,
전장 항체 중쇄 및 전장 항체 경쇄는 서로 상보적인 동족 항체 사슬이고 이의 가변 도메인 (VH 및 VL) 의 쌍은 항원 결합 부위를 형성하고,
전장 항체 중쇄 및 항체 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드는 항체 힌지 영역을 형성하는 하나 이상의 디설파이드 결합을 통해 서로 공유 연결되고,
항체 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드는 그의 N-말단에 올리고글라이신 Gm (m = 2, 또는 3, 또는 4, 또는 5) 아미노산 서열을 가짐,
및
(iii) 소르타제 A 효소,
및 이에 의해 2-특이적 항체를 제조하는 단계. - 하기 단계를 포함하는 2-특이적 항체의 제조 방법:
(i) 세포 함유 샘플에 존재하는 세포 표면 마커를 결정하고 적어도 첫번째 세포 표면 마커 및 두번째 세포 표면 마커를 선별하는 단계,
(ii) (a) 20 개의 C-말단 아미노산 잔기 내에 아미노산 서열 LPX1TG (SEQ ID NO: 01, 식 중 X1 은 임의의 아미노산 잔기일 수 있음) 를 포함하는 항체 Fab 단편 또는 scFv 항체, 상기 Fab 단편 또는 scFv 항체는 첫번째 세포 표면 마커 또는 이의 리간드에 특이적으로 결합함, (b) 전장 항체 중쇄, 전장 항체 경쇄, 및 항체 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드를 포함하는 외-분지 항체 단편, 상기 전장 항체 중쇄 및 전장 항체 경쇄는 서로 상보적인 동족 항체 사슬이고 이의 가변 도메인 (VH 및 VL) 의 쌍은 두번째 세포 표면 마커 또는 이의 리간드에 특이적으로 결합하는 항원 결합 부위를 형성하고, 전장 항체 중쇄 및 항체 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드는 항체 힌지 영역을 형성하는 하나 이상의 디설파이드 결합에 의해 서로 공유 연결되고, 항체 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드는 그의 N-말단에 올리고글라이신 Gm (m = 2, 또는 3, 또는 4, 또는 5) 아미노산 서열을 가짐, 및 (c) 소르타제 A 효소를 인큐베이션하는 단계
및 이에 의해 2-특이적 항체를 제조하는 단계. - 하기 단계를 포함하는 항원 결합 부위의 조합의 결정 방법:
(i) 하기 (a), (b) 및 (c) 를 조합함으로써 제조되는 다수의 2-특이적 항체의 결합 특이성 및/또는 선택성 및/또는 친화성 및/또는 효과기 기능 및/또는 생체 내 반감기를 측정하는 단계: (a) 첫번째 다수의 항체 Fab 단편 또는 scFv 항체 단편의 각각의 일원, 상기 각각의 일원은 20 개의 C-말단 아미노산 잔기 내에 아미노산 서열 LPX1TG (SEQ ID NO: 01, 식 중 X1 은 임의의 아미노산 잔기일 수 있음) 를 포함하고, Fab 단편 또는 scFv 항체는 첫번째 에피토프 또는 항원에 특이적으로 결합함, (b) 전장 항체 중쇄, 전장 항체 경쇄, 및 항체 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드를 포함하는 다수의 외-분지 항체 단편의 각각의 일원, 상기 전장 항체 중쇄 및 전장 항체 경쇄는 서로 상보적인 동족 항체 사슬이고, 이의 가변 도메인 (VH 및 VL) 의 쌍은 두번째 에피토프 또는 항원에 특이적으로 결합하는 항원 결합 부위를 형성하고, 전장 항체 중쇄 및 항체 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드는 항체 힌지 영역을 형성하는 하나 이상의 디설파이드 결합을 통해 서로 공유 연결되고, 항체 중쇄 Fc-영역 폴리펩티드는 그의 N-말단에 올리고글라이신 Gm (m = 2, 또는 3, 또는 4, 또는 5) 아미노산 서열을 가짐, 및 (c) 소르타제 A 효소
및
(ii) 적합한 결합 특이성 및/또는 선택성 및/또는 친화성 및/또는 효과기 기능 및/또는 생체 내 반감기를 가진 2-특이적 항체를 선택하고, 항원 결합 부위의 조합을 결정하는 단계. - 제 1 항 또는 제 2 항에 따른 방법에 의해 수득되는 2-특이적 항체.
- 중쇄 중 하나에 아미노산 서열 LPX1TG (SEQ ID NO: 01, 식 중 X1 은 임의의 아미노산 잔기일 수 있음) 를 포함하는 2-특이적 항체.
- 제 1 항 내지 제 3 항, 또는 제 4 항 또는 제 5 항 중 어느 한 항에 있어서, Fc-영역이 위치 329 에서의 자연 발생적 아미노산 잔기의 돌연변이 및 위치 228, 233, 234, 235, 236, 237, 297, 318, 320, 322 및 331 에서의 아미노산 잔기를 포함하는 군으로부터 선택되는 하나 이상의 아미노산 잔기의 상이한 잔기로의 하나 이상의 추가의 돌연변이를 포함하고, Fc-영역 내의 잔기는 Kabat 의 EU 인덱스에 따라 넘버링되고, 상기 특이적 아미노산 잔기의 변화가 비-개질된 (야생형) Fc-영역과 비교하여 Fc-영역의 효과기 기능의 변경을 야기하는 것을 특징으로 하는 방법 또는 항체.
- 제 4 항 또는 제 5 항에 따른 2-특이적 항체를 포함하는 약학 제형.
- 의약의 제조에서의 제 4 항 또는 제 5 항에 따른 2-특이적 항체의 용도.
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