KR20150016941A - 다중 면역 스크리닝 분석 - Google Patents

다중 면역 스크리닝 분석 Download PDF

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Abstract

본 발명은 병원체의 조기 검출, 병인체의 정확한 확인 및 개선된 질병 감시를 위한 키트 및 분석 방법을 제공한다. 더욱 구체적으로, 본 발명은 감염된 환자의 생물학적 유체 중의 다양한 감염성 병원체에 대한 항체의 신속하고 동시적인 검출을 이끄는 면역분석을 기술한다. 이러한 면역분석은 AGT 효소의 기질로 미리 코팅된 식별가능한 고체 지지체(예: 형광 마이크로구) 상에 AGT 효소 및 바이러스 항원을 포함하는 융합 단백질을 공유적이고 지향적으로 커플링시키는 것을 포함한다. 이러한 커플링은 AGT 효소의 기질에 대한 AGT 효소의 비가역적 반응에 의해 중재된다. 이렇게 수득된 항원-커플링된 마이크로구는, 표준 아민 커플링 공정에 따라 생성된 항원-커플링된 마이크로구에 비해, 특이적 항체의 포획을 증진시킨다. 본 발명의 방법은 다중 능력을 갖고, 생물학적 샘플의 양을 최소화하며, 종래의 ELISA 또는 방사선-면역침전 분석에 비해 표적 항체에 대한 민감도 및 특이성을 개선한다.

Description

다중 면역 스크리닝 분석 {MULTIPLEX IMMUNO SCREENING ASSAY}
세균, 바이러스(예: 바이러스 출혈열(VHFs)) 및 기생충 등의 병원성 작용물질에 의해 유발된 감염성 질환은 질병의 중증도, 높은 치사율, 특정 매개물의 인간간 전염성 및 이들 대부분에 대한 효과적인 치료의 결여 때문에 중요한 공중 건강 문제를 갖는다.
전염병의 구제는, 시기적절하게 적합한 규정을 확정하고 실행하기 위해, 매개물의 신속한 검출 및 정확한 확인에 결정적으로 의존한다. 이러한 맥락에서, 발생의 조기 검출, 병인체의 정확한 확인 및 개선된 질병 감시를 위한 수단을 생산하고 유효화 하는 것이 필수적이다.
이러한 점에서, 체액 중의 항체의 검출은 바이러스 유발된 질환, 감염성 생물에 의해 유발된 기타 질환 및 자가면역 질환의 진단 및 암의 검출에 중요한 부분을 구성한다. 사실, 특정의 항체는, 이들의 존재가 병원체의 발생과 관련이 있는 것으로 알려져 있으므로, 진단시 마커로서 사용할 수 있고 예후 및 치료를 가능하게 한다. 이는 특히 바이러스 항원을 전적으로 표적화하는 항체에 해당한다.
항체의 존재를 검출하는 최근의 방법은 면역형광 현미경법, 화학발광 분석, 웨스턴 블롯팅, 방사성 면역-침전 분석(RIP) 및 ELISA와 같은 다양한 기술을 포함한다. 수개의 항체를 동시에 병행 검출하는 것은, 캘리브레이터 및 항체가 동일 조건 하에서 분석되기 때문에, 각각의 분석들, 예를 들어, ELISA 간에 존재하는 매트릭스 효과를 최소화하는데 특히 유용하다; 따라서, 이는 동일 샘플 내에 존재하는 다수의 항체를 측정하기 위한 비교 결과를 제공할 것이다. 한 가지 이러한 분석은 비드에 결합된 항원을 사용하는 루미넥스 다중 분석이다(Pickering et al., Clinical and Diagnostic Laboratory Immunology 9: 872-876(2002)).
그러나, 병원체와 관련된 항체의 직접적 확인을 복잡하게 하는 것은, 일반적인 혈청은 다량의 천연 항체를 포함하고 이들 항체는 복잡한 염색 패턴으로 그들 자신을 나타낸다는 것이다(Avrameas S. Immunol. Today 1991). 이들 천연 항체의 존재는 "자가-면역 노이즈", 즉 천연 발생 자가항체의 복잡한 배경으로부터 질병-관련 항체의 구별을 복잡하게 할 수 있다. 문헌(Anderson et al., Methods Mol. Biol. 723:227-238(2011))에서 서술한 바와 같이, 교차(cross-talk) 및 간섭은 다중 분석과의 관련성이 있다.
다중 분석에서 비드에 직접 인간 항체의 결합은 또한 문제로서 보고되어 있다(Tainsky et al., Biomarker Insights 2:261-267(2007); Waterboer et al., J. Immunol Methods 309:200-204(2006)).
더욱이, 포지티브 샘플과 대조군 샘플 사이의 낮은 차이는 다중 분석의 유용성을 제한할 수 있다(Burbelo et al., Exp. Rev Vaccines, 9:567-578(2010)).
또 다른 문제는 ELISA 및 다중 분석이 동일한 결과를 제공할 필요가 없다는 것이다. 예를 들면, 픽커링 등(Pickering et al., 2002)은, 다양한 바이러스 및 세균 항원에 대한 보호 항체를 측정할 경우, 2개 분석 사이의 다수의 모순을 지적했다. 이는 항원이 기질에 부착하는 방법과 관련한 항원성의 변화를 반영할 수 있다. 문헌(Ambrosino et al., Malaria Journal 9:317(2010). Similarly, Cham et al., Malaria Journal 7:108(2008))은 일부 샘플이 ELISA 및 비드-기반 분석 측정치 사이에 현저한 차이를 나타냈음을 보고했고, 이중 일부는 보다 높은 ELISA 측정치를 가졌다. 이는, 단백질이 표면 또는 구에 결합되는 경우, 재조합 단백질의 상이한 부분이 항체에 의해 접근가능하다는 사실에 기인할 수 있다(Id.)
상업적 적용(즉, 키트)을 위한 충분한 양의 항원의 제조가 또한 필요할 수 있다(Burbelo et al., Exp. Rev Vaccines, 9:567-578(2010)).
앞서 살펴본 바와 같이, 항체-발생 질병의 분자적 진단을 위한 대용량처리, 비용-효과 및 정확성에 추가의 개선을 제공할 수 있는 취급가능한 시스템 및 방법이 필요하다. 본 발명은 이러한 요구 및 기타 요구를 충족시킨다.
본 발명은 항원에 대한 지향 항원 커플링 공정을 사용하여 보다 높은 민감도 및 특이성을 갖는 생물학적 샘플에서 다중 항원을 동시 스크리닝하는 것을 가능하게 한다. 본 발명자들은 생물학적 유체에서 다양한 질병, 특히 아르보바이러스 질환 및 VHFs에 의해 생성되는 수개의 항체를 신속하고 동시에 검출하는 면역분석을 개발하고 입증하였다.
도 1은 키메라 AGT-항원 단백질의 기질-코팅된 마이크로구에 대한 지향적(oriented) 커플링을 나타낸다. 커플링의 제1 단계는 AGT 기질 BG-PEG-NH2를 아민 커플링에 의해 활성화된 마이크로구에 커플링시키는 것으로 이루어진다. 제2 단계는 기질-코팅된 마이크로구를 AGT(예를 들어, SNAP 돌연변이체)를 포함하는 융합 단백질과 접촉시키는 것으로 이루어지며, 상기 효소를 이의 BG-PEG-NH2 기질, 즉 마이크로구에 공유적으로 부착시키기 위한 것이다.
도 2는 항-SNAP 항체에 의한 키메라 SNAP-바이러스 항원 단백질(SNAP-DV1.EDIII, SNAP-DV2.EDIII, SNAP.DV3.EDIII, SNAP.DV4.EDIII, SNAP-WNV.EDIII, SNAP-YF.EDIII, SNAP-JE.EDIII, SNAP-ZIKA.EDIII)의 커플링 효율을 도시한다.
도 3은 hAGT 단백질의 기질을 통해(본 발명의 커플링) 또는 표준 아민 커플링 공정, 예를 들어, Bio-Plex 아민 커플링 키트(BIORAD)를 통해 커플링된 마이크로구에 접합된 키메라 SNAP-DV2.EDIII 단백질에 대한 정제된 모노클로날 항-DV2 항체의 검출을 위한 면역분석 실험의 민감도를 비교한다.
도 4는 마이크로구에 접합된 키메라 SNAP-DV1.EDIII 단백질에 대한 정제된 모노클로날 항-DV1 항체의 검출을 위해 일중(singleplex) 포맷으로 수행되거나 마이크로구에 커플링된 다른 키메라 SNAP-바이러스 Ags 단백질(SNAP-DV2.EDIII, SNAP.DV3.EDIII, SNAP.DV4.EDIII, SNAP-WNV.EDIII, SNAP-YF.EDIII, SNAP-JE.EDIII, SNAP-TBE.EDIII)과 함께 다중 포맷으로 수행된 면역분석 실험의 민감도를 비교한다.
도 5는 마이크로구에 커플링된 키메라 SNAP-바이러스 Ags 단백질(SNAP-DV1.EDIII, SNAP-DV2.EDIII, SNAP.DV3.EDIII, SNAP.DV4.EDIII, SNAP-WNV.EDIII, SNAP-YF.EDIII, SNAP-JE.EDIII, SNAP-TBE.EDIII)에 대한 정제된 모노클로날 항-WNV 항체 희석물의 검출을 위한 다중 면역분석 실험의 반응성 및 특이성을 도시한다.
도 6은, 마이크로구에 커플링된 키메라 SNAP-바이러스 Ags 단백질(SNAP-DV1.EDIII, SNAP-DV2.EDIII, SNAP.DV3.EDIII, SNAP.DV4.EDIII, SNAP-WNV.EDIII, SNAP-YF.EDIII, SNAP-JE.EDIII, SNAP-WSL.EDIII, SNAP-ROCIO.EDIII, SNAP-MVE.EDIII, SNAP-SLE.EDIII, SNAP-ZIKA.EDIII)에 대한 다중 면역분석으로, DV3에 대한 마우스 폴리클로날 혈청에서 항-DV3 IgG 검출의 반응성 및 특이성(A) 및 YF에 대한 마우스 폴리클로날 혈청에서 항-YF IgG 검출의 반응성 및 특이성(B)을 도시한다.
도 7은, 마이크로구에 커플링된 키메라 SNAP-바이러스 Ags 단백질(SNAP-DV1.EDIII, SNAP-DV2.EDIII, SNAP.DV3.EDIII, SNAP.DV4.EDIII, SNAP-WNV.EDIII, SNAP-YF.EDIII, SNAP-JE.EDIII, SNAP-WSL.EDIII, SNAP-ROCIO.EDIII, SNAP-MVE.EDIII, SNAP-SLE.EDIII, SNAP-ZIKA.EDIII, SNAP-TBE.EDIII)에 대한 다중 면역분석으로, 인간 환자의 DV1-감염된 혈청에서 항-DV1 IgM 검출의 반응성 및 특이성(A) 및 항-DV1 IgG 검출의 반응성 및 특이성(B)을 도시한다.
도 8은 pDeSNAPuniv 카세트의 구조를 도시한다.
도 9는 pDeSNAPuniv/SBV.N 카세트의 구조를 도시한다.
도 10A는 Cd2+로 10일 동안 유도되거나 (+) 비유도된 (-) S2/SNAP-SBV.N 세포의 상등액에 대해 수행된 면역블롯 분석을 도시한다. 분비되는 키메라 단백질 SNAP-SBV.N(이론적 MW 50 kDa)을 항-Histag 항체를 사용하여 소정량의 고도로 정제된 키메라 단백질 SNAP-TOS.N(이론적 MW 49 kDa)과 비교하여 검출하였다. 도 10B는 10일 동안 유도된 S2/SNAP+SBV.N 세포로부터 분비되는 SNAP+SBV.N 단백질의 최종 정제 단계에 상응하는 크기-배제 크로마토그래피 컬럼의 각 분획물에 대한 단백질의 직접 가시화(PAGE-SDS의 코마시 블루 염색)을 도시한다.
도 11은 본 발명의 항원-코팅된 마이크로구를 포함하는 디바이스의 일예를 도시한다.
도 12A 내지 12F는 SARS 바이러스 N 유전자를 함유하는 SNAP 작제물의 코딩 뉴클레오타이드(서열번호 154) 및 아미노산 서열(서열번호 155)를 나타낸다.
도 13A 내지 13D는 SARS 바이러스 S 유전자 수용체 결합 도메인을 함유하는 SNAP 작제물의 코딩 뉴클레오타이드(서열번호 156) 및 아미노산 서열(서열번호 157)을 나타낸다.
도 14A 내지 14D는 인간 코로나바이러스 N 유전자를 함유하는 SNAP 작제물의 코딩 뉴클레오타이드(서열번호 158) 및 아미노산 서열(서열번호 159)을 나타낸다.
도 15A 내지 15G는 인간 코로나바이러스 S1 유전자를 함유하는 SNAP 작제물의 코딩 뉴클레오타이드(서열번호 160) 및 아미노산 서열(서열번호 161)을 나타낸다.
도 16A 내지 16D는 인간 코로나바이러스 S1 유전자 수용체 결합 도메인(RBD)를 함유하는 SNAP 작제물의 코딩 뉴클레오타이드(서열번호 162) 및 아미노산 서열(서열번호 163)을 나타낸다.
도 17A 내지 17D는 렙토스피라증의 LruA 유전자를 함유하는 SNAP 작제물의 코딩 뉴클레오티드(서열번호 164) 및 아미노산 서열(서열번호 165)을 나타낸다.
도 18A 내지 18D는 렙토스피라증의 LruB 유전자를 함유하는 SNAP 작제물의 코딩 뉴클레오타이드(서열번호 166) 및 아미노산 서열(서열번호 167)을 나타낸다.
도 19A 내지 19D는 렙토스피라증의 LipL32 유전자를 함유하는 SNAP 작제물의 코딩 뉴클레오타이드(서열번호 168) 및 아미노산 서열(서열번호 169)을 나타낸다.
도 20A 내지 20F는 E형 간염의 C 유전자를 함유하는 SNAP 작제물의 코딩 뉴클레오타이드(서열번호 170) 및 아미노산 서열(서열번호 171)을 나타낸다.
도 21A 내지 21E는 E형 간염의 C 유전자의 코어 서열을 함유하는 SNAP 작제물의 코딩 뉴클레오타이드(서열번호 172) 및 아미노산 서열(서열번호 173)을 나타낸다.
도 22A 내지 22C는 C형 간염의 C 유전자를 함유하는 SNAP 작제물의 코딩 뉴클레오타이드(서열번호 174) 및 아미노산 서열(서열번호 175)을 나타낸다.
도 23A 내지 23D는 C형 간염의 C 유전자의 코어 서열을 함유하는 SNAP 작제물의 코딩 뉴클레오타이드(서열번호 176) 및 아미노산 서열(서열번호 177)을 나타낸다.
도 24A 내지 24C는 쉬말렌베르그 바이러스로부터 NS 단백질을 인코딩하는 서열을 함유하는 SNAP 작제물의 코딩 뉴클레오타이드(서열번호 178) 및 아미노산 서열(서열번호 179)을 나타낸다.
도 25A 및 25B는 본 발명의 키트에 포함되는 항원-커플링된 마이크로구의 유리한 조합을 나타낸다.
최소 항원을 사용하여 소량의 항체를 검출하기 위한 최적 민감도 및 특이성를 달성하기 위해, 지향적 항원 커플링 공정이 개발되었다. 이러한 지향적 항원 커플링 공정은 AGT 효소와 효소의 활성 부위 시스테인에 벤질 그룹을 전달함으로써 AGT 효소와 비가역적으로 반용하는 이의 기질인 O6-벤질구아닌 유도체 간의 공유적 상호작용에 기초한다. 따라서, 다수의 표적 항원이 AGT 효소 부분에 융합될 수 있으며, 그 결과 생물학적 샘플 중에 존재하는 항체에 대한 포획 시약으로 사용될 수 있는 상이한 키메라 융합 단백질(이하 [AGT- 항원] 융합 단백질이라 칭함)을 생성한다. 본 발명자들은 이들 융합 단백질을 특이적 AGT-기질 상호작용에 의해 고체 지지체에 결합시키는 경우 이러한 항체 포획이 예상치 않게 증진된다는 것을 밝혔다.
실시예에서 기술되는 바와 같이, 본 발명자들은 지향적 항원 커플링 공정으로 다수의 상이한 항원-코팅된 형광 마이크로구를 생성하였다. 16개의 정제된 키메라 [AGT-항원] 융합 단백질과 커플링시킨 16개의 상이한 마이크로구 세트를 뎅기 혈청형 1 내지 4, 웨스트 나일, 황열, 일본 뇌염, 진드기-매개 뇌염, 세이트-루이스 뇌염, 머레이 계곡 뇌염, 베셀스브론, 지카, 리시오(Ricio), 우수투(Usutu), 리프트 계곡 열 및 치쿤구니아(chikungunya) 바이러스의 상이한 단백질에 대해 특이적인 16개의 혈청 항체의 적정에 사용하였다. 예상치 않게, 이들 16개의 상이한 마이크로구 세트를 검출의 민감도 및 특이성에 영향을 끼치지 않으면서 단일 샘플에서 혼합하였다(참조: 도 5). 이러한 시스템의 생성은, 한 세트의 항원-커플링된 마이크로구(약 1.25 x 106개 마이크로구)(이러한 세트는 1000개의 개별 분석을 수행하는데 충분하다)를 생성하는데 단지 매우 소량의 재조합 항원(< 50 ㎍)이 필요하므로, 매우 시간-효과적이고 비용-효과적이다.
결과적으로, 본 발명은, 키메라 융합 단백질, 즉 AGT-항원에 커플링되는 AGT 기질에 대한 고체 지지체, 바람직하게는 표지된 마이크로입자 (microparticle)의 지향적 항원 커플링에 기반한 다중 분석을 수행하는 방법 및 키트를 포함한다. 이러한 지향적 커플링은 생물학적 샘플에서 항원과 항체의 증가된 상호작용을 가능하게 한다. AGT-기질로 코팅된 고체 지지체는 이들 면역분석에서 AGT 효소의 효소적 활성을 통해 AGT-항원과 커플링될 수 있다.
6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT, 또는 ATase 또는 MGMT로서 공지되어 있고, 이하 "AGT"로서 지칭됨)는 IUBMB 효소 명명법에서 EC 2.1.1.63으로 번호가 부여되어 있다. 이는 세포에서의 기능이 알킬화된 DNA를 수복하는 것인 207개 아미노산 잔기의 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 DNA 수복 효소이다. 보다 정확하게는, AGT는 SN2 반응 중의 메틸 그룹을 반응성 시스테인 잔기(Cys 145)로 비가역적으로 전이시킴으로써 DNA에서 O6-메틸화된 구아닌에 작용한다. 최근, 다수의 O6-벤질구아닌 유도체는 이들의 벤질 그룹을 AGT 효소의 활성 부위 시스테인으로 전이시킴으로써 상기 효소와 비가역적으로 반응하는 것으로 밝혀졌다(참조: Damoiseaux et al., ChemBiochem., 2001, WO 2004/031404 및 WO 2005/085470). 따라서, AGT-항원은 이러한 효소적 반응을 통해 AGT 기질에 커플링될 수 있다.
AGT-항원에 커플링된 고체 지지체는 면역글로불린을 함유하는 생물학적 샘플과 함께 항온처리할 수 있다. 면역글로불린이 고체 지지체에 결합된 후, 면역글로불린에 효과적으로 결합한 고체 지지체의 검출이 달성될 수 있다. 면역글로불린-코팅된 고체 지지체(들)의 동정은 환자를 감염시키는 병원체의 진단을 가능하게 한다(각각의 고체 지지체는 정의된 병원성 항원과 일치하기 때문임). 이러한 검출 단계는 임의의 통상의 수단에 의해, 예를 들면, 표지된 검출 항체를 사용함으로써 및 고체 지지체의 성질을 동정함으로써 수행된다.
유리하게는, 본 발명의 방법은 발병된 환자에서 항체의 존재의 검출만을 포함하지만, 이들 항체의 동일성에 대한 지식이 요구되지 않는다.
다중 표적 항체를 검출하는 방법
본 발명은 생물학적 샘플에서 적어도 2개의 표적 항체를 검출하는 방법에 관한 것이다. 본 발명은 적어도 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 20, 25, 30, 40, 50, 100개 등의 상이한 표적 항체의 존재 또는 부재를 검출하는 것을 포함한다. 따라서, 본 발명은 적어도 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 20, 25, 30, 40, 50, 100개 등의 고체 지지체를 포함하는 방법, 및 적어도 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 20, 25, 30, 40, 50, 100개 등의 상이한 에피토프를 포함하는 방법을 포함한다. 상기 방법은, 생물학적 샘플의 첨가 전에 함께 혼합된, 적어도 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 20, 25, 30, 40, 50, 100개 등의 고체 지지체를 포함할 수 있다. 에피토프는 표적 항체에 의해 인지될 수 있다.
한 가지 실시형태에서, 상기 방법은
(a) 적어도 2개의 고체 지지체의 혼합물을 생물학적 샘플과 접촉시키는 단계로서, 여기서 상기 고체 지지체 중의 적어도 하나는 AGT 기질에 공유 커플링된 제1 AGT-항원 융합 단백질을 포함하고, 상기 고체 지지체 중의 적어도 하나는 AGT 기질에 공유 결합된 제2-AGT-항원 융합 단백질을 포함하는 단계,
(b) 제1 AGT-항원에 대한 항체의 결합의 존재 또는 부재를 검출하는 단계; 및
(c) 제2 AGT-항원에 대한 항체의 결합의 존재 또는 부재를 검출하는 단계를 포함한다.
한 가지 실시형태에서, 상기 방법은
(a) 적어도 10개의 고체 지지체의 혼합물을 생물학적 샘플과 접촉시키는 단계로서,
제1 고체 지지체는 AGT 기질과 공유적으로 커플링 (covalently coupling)된 제1 AGT-항원 융합 단백질을 포함하고,
제2 고체 지지체는 AGT 기질과 공유적으로 커플링된 제2 AGT-항원 융합 단백질을 포함하고,
제3 고체 지지체는 AGT 기질과 공유적으로 커플링된 제3 AGT-항원 융합 단백질을 포함하고,
제4 고체 지지체는 AGT 기질과 공유적으로 커플링된 제4 AGT-항원 융합 단백질을 포함하고,
제5 고체 지지체는 AGT 기질과 공유적으로 커플링된 제5 AGT-항원 융합 단백질을 포함하고,
제6 고체 지지체는 AGT 기질과 공유적으로 커플링된 제6 AGT-항원 융합 단백질을 포함하고,
제7 고체 지지체는 AGT 기질과 공유적으로 커플링된 제7 AGT-항원 융합 단백질을 포함하고,
제8 고체 지지체는 AGT 기질과 공유적으로 커플링된 제8 AGT-항원 융합 단백질을 포함하고,
제9 고체 지지체는 AGT 기질과 공유적으로 커플링된 제9 AGT-항원 융합 단백질을 포함하고,
제10 고체 지지체는 AGT 기질과 공유적으로 커플링된 제10 AGT-항원 융합 단백질을 포함하는 단계, 및
(b) 각각의 AGT-항원에 대한 항체의 결합의 존재 또는 부재를 검출하는 단계를 포함한다.
한 가지 실시형태에서, 상기 방법은
(a) O6-알킬구아닌-DNA 알킬트랜스퍼라제 활성을 갖는 AGT 폴리펩타이드 및 제1 표적 항체에 의해 인지되는 제1 에피토프를 포함하는 제1 융합 단백질에 공유적으로 커플링된 AGT 기질을 포함하는 제1 고체 지지체를 생물학적 샘플과 접촉시키는 단계,
(b) O6-알킬구아닌-DNA 알킬트랜스퍼라제 활성을 갖는 AGT 폴리펩타이드 및 제2 표적 항체에 의해서는 인지되나 상기 제1 표적 항체에 의해서는 인지되지 않는 제2 에피토프를 포함하는 제2 융합 단백질에 공유적으로 커플링된 AGT 기질을 포함하는 제2 고체 지지체를 생물학적 샘플과 접촉시키는 단계, 및
(c) 2개의 표적 항체의 존재 또는 부재를 검출하는 단계를 포함한다.
바람직하게는, 제1 및 제2 등의 고체 지지체는 마이크로구이다. 가장 바람직하게는, 마이크로구는 표지되어 있다. 바람직하게는, 제1 및 제2 고체 지지체는 상이한 표지로 표지되어 있다.
본 발명은 피험자로부터의 생물학적 샘플에 존재하는 적어도 2개의 상이한 표적 항체를 검출하기 위한 시험관내 분석 방법에 관한 것으로서, 상기 방법은
(a) 하기를 포함하는 제1 융합 단백질을 제공하는 단계:
- 제1 표적 항체에 의해 인지되는 제1 에피토프를 포함하는 폴리펩타이드 및
- O6-알킬구아닌-DNA 알킬트랜스퍼라제 활성을 갖는 AGT 폴리펩타이드,
(b) 상기 제1 융합 단백질을 상기 AGT 폴리펩타이드의 기질과 공유적으로 커플링된 제1 고체 지지체와 접촉시키는 단계,
(c) 제1 표적 항체에 의해 인지되는 제1 에피토프와 공유적으로 커플링된 제1 고체 지지체를 수득하는 단계,
(d) 하기를 포함하는 제2 융합 단백질을 제공하는 단계:
- 제2 표적 항체에 의해서는 인지되나 상기 제1 표적 항체에 의해서는 인지되지 않는 제2 에피토프를 포함하는 폴리펩타이드 및
- O6-알킬구아닌-DNA 알킬트랜스퍼라제 활성을 갖는 AGT 폴리펩타이드,
(e) 상기 제2 융합 단백질을 상기 AGT 폴리펩타이드 기질과 공유적으로 커플링된 제2 고체 지지체와 접촉시키는 단계,
(f) 제2 표적 항체에 의해서는 인지되나 상기 제1 표적 항체에 의해서는 인지되지 않는 제2 에피토프와 공유적으로 커플링된 제2 고체 지지체를 수득하는 단계,
(g) 상기 생물학적 샘플을 단계(c) 및 (f)에서 수득된 제1 및 제2 고체 지지체와 접촉시키는 단계, 및
(h) 상기 적어도 2개의 표적 항체의 존재를 검출하는 단계를 포함한다.
하기에서 사용되는 용어 "항체", "융합 단백질", "에피토프", "항원", "AGT 폴리펩타이드", "고체 지지체" 등은 분명히 당해 기술 분야에서 통상적으로는, 즉, 광의적으로 이해되어야 한다. 특히, 이들 용어는 특정한 단일 분자뿐만 아니라 다수의 상기 분자들을 포함한다. 예를 들어, 용어 "고체 지지체"는 다수의 동일한 고체 지지체의 서브세트를 포함하고, 용어 "마이크로입자"는 다수의 동일한 마이크로입자의 서브세트를 포함하고, 용어 "융합 단백질"은 다수의 동일한 단일 단백질 분자를 포함한다. 본 발명과 관련하여, 고체 지지체는 다수의 동일한 융합 단백질(융합 단백질은 AGT 폴리펩타이드와는 별개로 동일한 항원을 포함한다) 및 따라서 동일한 에피토프를 가지므로, 고체 지지체 상에서 검출될 항체가 명확히 식별될 수 있다는 것이 주목할 만하다.
본원에서 사용되는 용어 "융합 단백질"은 단백질을 함유하는 폴리펩타이드 또는 적어도 2개의 폴리펩타이드의 인위적 연결을 통해 형성되는 폴리펩타이드를 의미한다(참조: http://en.wikipedia.org/wiki/peptide). 본 발명의 면역분석에서, 융합 단백질은 AGT 폴리펩타이드 및 하나 이상의 에피토프를 포함하는 항원을 포함한다. 융합 단백질은 융합 유전자의 유전자 조작(http://en.wikipedia.org/wiki/Genetic_engineering)을 통해 수득될 수 있다. 이는 전형적으로 제1 단백질을 인코딩하는 cDNA 서열(참조: http://en.wikipedia.org/wiki/CDNA)로부터 정지 코돈(참조: http://en.wikipedia.org/wiki/Codon)을 제거한 후 결합(참조: http://en.wikipedia.org/wiki/Ligase) 또는 오버랩 연장 PCR(참조: http://en.wikipedia.org/wiki/PCR)을 통해 프레임(참조: http://en.wikipedia.org/wiki/Reading_frame) 내에 제2 단백질의 cDNA 서열을 추가하는 것을 포함한다. 따라서, 이러한 DNA 서열은 단일 단백질로서 세포(참조: http://en.wikipedia.org/wiki/Cell_(biology))에 의해 발현될 것이다(참조: http://en.wikipedia.org/wiki/Protein_expression). 단백질은 최초 단백질 둘다의 전체 서열 또는 단지 일부를 포함하도록 조작될 수 있다. 2개의 실체가 단백질인 경우, 링커(또는 "스페이서") 펩타이드가 추가될 수 있으며, 이것이 단백질이 독립적으로 폴딩하고 예상하는 바와 같이 거동하도록 할 것 같다. 특히, 본 발명의 융합 단백질은 AGT DNA 서열의 N-말단 또는 C-말단 측에 부착되는 에피토프 또는 항원 인코딩 서열과 함께 프레임 내에 AGT 인코딩 서열을 포함하는 벡터를 제공함으로써 수득될 수 있다. 이들 벡터는 유박테리아를 포함하는 원핵생물 숙주, 예를 들어, 이. 콜라이 세균, 또는 진핵생물 숙주, 예를 들어, 효로, 곤충 세포 또는 포유동물 세포에 도입될 수 있으며, 재조합 융합 단백질은 적합한 조건 하에서 생성될 수 있다. 대표적인 작제는 본원의 실시예에서 기술된다.
본원에서 사용되는 용어 "항체"는 모노클로날 항체, 폴리클로날 항체 및 키메라 항체를 포함하고자 한다. 바람직하게는, 본 발명의 면역분석으로 검출될 항체는 질병에 걸린 환자의 생물학적 샘플에 존재하고 상이한 B 세포 공급원으로부터 생성된 폴리클로날 항체이다. 이에, 이들은 병원성 항원에 의해 제시되는 상이한 에피토프를 인지한다(달리, 모노클로날 항체는 단일 세포주로부터 유도되며 동일한 에피토프를 인지한다).
항체(또는 "면역글로불린")은 디설파이드 결합에 의해 서로 연결된 적어도 2개의 중쇄(H) 및 2개의 경쇄(L)를 포함하는 당단백질이다. 각각의 중쇄는 중쇄 가변 영역(또는 도메인)(HCVR 또는 VH로 약칭함) 및 중쇄 불변 영역을 포함한다. 중쇄 불변 영역은 3개의 도메인인 CH1, CH2 및 CH3를 포함한다. 각각의 경쇄는 경쇄 가변 영역(LCVR 또는 VL로 약칭됨) 및 경쇄 불변 영역을 포함한다. 경쇄 불변 영역은 하나의 도메인인 CL을 포함한다. VH 및 VL 영역은, 항원의 에피토프 결합에 주로 관여하며 프레임 영역(FR)이라 불리는 보다 보존된 영역으로 사이에 간격을 둔, "상보성 결정 영역"(CDR)" 또는 "과가변 영역"이라 불리는 과가변성 영역으로 더욱 세분될 수 있다. 각각의 VH 및 VL은 3개의 CDR 및 4개의 FR로 구성되고, 이들은 아미노-말단부터 카복시-말단으로 FR1, CDR1, FR2, CDR2, FR3, CDR3, FR4의 순으로 배열된다. 중쇄 및 경쇄의 가변 영역은 항원과 상호작용하는 결합 도메인을 포함한다. 항체의 불변 영역은 면역계의 다양한 세포(예: 이펙터 세포) 및 전형적 보체계의 제1 성분(Clq)을 포함하는 숙주 조직 또는 인자들에 대한 면역글로불린의 결합을 중개할 수 있다.
항체는 상이한 이소형(즉, IgA, IgD, IgE, IgG 또는 IgM)일 수 있다. IgG 및 IgM 유형 항체 모두 본 발명의 방법으로 검출될 수 있다. 주목할 만한 것으로서, 이들 이소형은 디설파이드 결합으로 연결되는 2개의 동일한 중쇄 및 2개의 동일한 경쇄로 구성된다. 중요하게도, IgM 항체는 다수의 면역글로불린이 주로 펜타머 및 헥사머와 같이 디설파이드 결합으로 함께 공유적으로 연결된 중합체를 형성하므로, 이들은 (이들의 펜타머 형태에서) 약 900 kDa의 분자 매쓰를 갖는다. 각각의 모노머가 2개의 항원 결합 부위를 갖기 때문에, 펜타머 IgM은 10개의 결합 부위를 갖는다. 그러나, 통상적으로, IgM 항체는, 대부분의 항원의 큰 크기가 가까운 부위에 결합하는 것을 방해하기 때문에, 동시에 10개의 항원을 결합할 수 없다. IgM은 중합체성 특성 때문에, 높은 친화력을 갖는다. 상이한 이소형의 항체(예: IgG 또는 IgM)은, 항체 반응이 항원/감염에 대한 초기 또는 후기 반응인지와 같이 항체 반응의 일시적 식별을 가능하게 하는, 동일한 항원으로 검출할 수 있다. 이는 감염 또는 항원에 대한 노출의 타이밍에 관한 정보를 제공할 수 있다.
항체 단편도 또한 본 발명의 방법으로 검출될 수 있다. 이 용어는 Fab, Fab', F(ab')2, scFv, dsFv, ds-scFv, 다이머, 미니바디, 디아바디 및 이의 멀티머 및 이특이적 항체 단편을 포함하고자 한다.
모노클로날 항체가, 예를 들어, 고체 지지체에 결합된 면역글로불린을 검출하기 위해 본 발명의 면역분석에 사용될 수 있다. 본원에서 사용되는 "모노클로날 항체"는 균질한 항체군으로부터 생성되는 항체를 정의한다. 보다 특히, 일 항체군의 개별 항체는 최소한으로 발견될 수 있는 소수의 가능한 천연-발생 돌연변이를 제외하고는 동일하다. 달리, 모노클로날 항체는 단일 세포 클론(예를 들어, 하이브리도마, 균질 항체를 인코딩하는 DNA 분자로 형질감염된 진핵생물 숙주 세포, 균질 항체를 인코딩하는 DNA 분자로 형질감염된 원핵생물 숙주 세포 등)의 성장으로부터 생성되는 균질 항체로 이루어지고, 일반적으로 단지 하나의 부류 및 아부류의 중쇄 및 단지 하나의 유형의 경쇄로 특징지어진다. 모노클로날 항체는 고도로 특이적이며, 단일 항원에 대해 지시된다. 또한, 통상적으로 다양한 결정자에 대해 지시되는 다양한 항체를 포함하는 폴리클로날 항체의 제조와는 반대로, 각각의 모노클로날 항체는 항원의 단일 에피토프에 대해 지시된다.
본원에서 용어 "항원"은 면역계가 이 물질에 대해 항체를 생성하도록 하는 물질을 의미한다. "면역원성" 항원은 단독으로 주사시 적응 면역 반응을 자극할 수 있는 특정 유형의 항원이다. 분자적 수준에서, 항원은 항체의 항원-결합 부위에 "결합"하는 능력으로 특징지어진다.
본 발명과 관련하여, 항체는, 이러한 항체가 항원(또는 에피토프)에 대해 105 M-1 초과, 바람직하게는 106 M-1 초과, 더욱 바람직하게는 107 M-1 초과의 친화성 상수 Ka(이는 역 해리 상수, 즉, 1/Kd이다)를 갖는 경우, 정의된 항원(또는 에피토프)에 "결합"하거나 상기 항원(또는 에피토프)을 "인식"한다고 말한다. 이러한 친화성은, 예를 들어, 평형 투석에 의하거나 형광 퀀칭에 의해 측정될 수 있으며, 이 두 기술은 모두 당해 기술 분야에서 통상적으로 이용된다.
본 발명의 방법은, 예를 들면, 알레르기 항원(allergen)의 검출에서 단백질, 핵산, 항체, 면역 반응, 폴리사카라이드 등의 검출을 위해 기타 기술과 결합할 수 있다.
다중 면역분석에 사용하기 위한 항원
본 발명과 관련하여, 항원 또는 에피토프는 단백질, 지단백질, 폴리사카라이드 및 당단백질을 포함한다. 상기 단백질은 바이러스, 세균, 기생충, 동물 및 진균 단백질, 예를 들어, 알부민, 파상풍 변성독소, 디프테리아 변성독소, 백일해 변성독소, 세균 외막 단백질(수막구균 외막 단백질 포함), RSV-F 단백질, 말라리아 유도된 펩타이드, B-락토글로불린 B, 아프로티니, 오브알부민, 리소자임, 선형 펩타이드, 올리고펩타이드 등을 포함한다. 항원 및 에피토프는 암, 사이토킨, 알레르기 항원 및 에피토프를 포함한다. 항원은 자가면역 질환에 관여하는 항원일 수 있다.
항원은 종양 관련 항원, 예를 들면, 알파페토단백질(AFP, http://en.wikipedia.org/wiki/Alphafetoprotein), 암배 항원(CEA), CA 15-3, CA27-29, CA 125, CA 19-9, 칼레피닌, 전립선 특이적 항원(PSA), MUC-1(http://en.wikipedia.org/wiki/MUC1), 상피 막 단백질(EMA), 상피 종양 항원(ETA), 티로시나제(http://en.wikipedia.org/wiki/Tyrosinase), 흑색종-관련 항원(MAGE), TAA 복합체, SSX2 또는 NERCMSL, ras(http://en.wikipedia.org/wiki/Ras_subfamily), P53, CD34, CD99, CD117, 크로모그라닌, 사이토케라틴, 데스민, 인자 VIII(http://en.wikipedia.org/wiki/Factor_VIII), CD31(http://en.wikipedia.org/wiki/CD31), FL1(http://en.wikipedia.org/wiki/FL1), GFAP, GCDFP-15, HMB-45, hCG, 인히빈, 케라틴, PTPRC(CD45), MART-1, MyoD1, MSA, NSE, PLAP, S100 단백질, SMA, 시냅토피신, 티로글로불린, 갑상선 전사 인자-1, 종양 M2-PK 및 비멘틴일 수 있다.
항원은 암 바이오마커, 예를 들면, 안지오포이에틴-2, sCD40L, EGF, 엔도글린, sFASL, HB-EGF, IGFBP-1, IL-6, IL-8, IL-18, PAI-1, PLGF, TGF-α, TNF-α, uPA, VEGF-A, VEGF-C, VEGF-D, sEGFR, FGF-기본, 폴리스타틴, G-CSF, HGF, sHER-2/neu, sIL-6Rα, 렙틴, 오스테오폰틴, PECAM-1, PDGF-AB/BB, 프로락틴, SCF, sTIE-2, sVEGFR-1 및 sVEGFR-2일 수 있다.
항원은 신장 독성 마커, 예를 들면, 칼빈딘, 클루스테린, GST-π, IL-18, KIM-1, MCP-1, 알부민, B2M, 시스타틴 C, NGAL, 오스테오폰틴 및 TFF3일 수 있다.
항원은 사이토킨, 케모킨 및 성장 인자, 예를 들면, TGF-β1, TGF-β2, TGF-β3, IL-1β IL-1ra, IL-2, IL-4, IL-5, IL-6, IL-7, IL-8, IL-9, IL-10, IL-12(p70), IL-13, IL-15, IL-17, 염기성 FGF, 에오탁신, G-CSF, GM-CSF, IFN-γ, IP-10, MCP-1(MCAF), MIP-1α, MIP-1β, PDGF-BB, RANTES, TNF-α, VEGF, IL-1α, IL-2Rα, IL-3, IL-12(p40), IL-16, IL-18, CTACK, GRO-α, HGF, IFN-α2, LIF, MCP-3, M-CSF, MIF, MIG, β-NGF, SCF, SCGF-β, SDF-1α, TNF-β 및 TRAIL일 수 있다.
상기 항원은 또한 합텐 및 저분자량 분자를 포함하는 다른 부분, 예를 들어, 사카라이드, 올리고사카라이드, 폴리사카라이드, 펩타이드, 뮤신, 독소 및 알레르기 항원(꽃가루, 달걀 흰자)일 수 있다.
상기 항원은 알레르기 항원, 예를 들어, 식품, 풀, 나무, 잡초, 곤충, 곰팡이, 표피 또는 먼지 진드기 알레르기 항원일 수 있다. 항원은 동물, 갑각류, 밀크(참조: http://en.wikipedia.org/wiki/Milk), 대두(참조: http://en.wikipedia.org/wiki/Soy), 난(참조: http://en.wikipedia.org/wiki/Egg_(food)), 밀(참조: http://en.wikipedia.org/wiki/Wheat), 땅콩(참조: http://en.wikipedia.org/wiki/Peanuts), 나무 견과류(참조: http://en.wikipedia.org/wiki/Tree_nuts), 어류(참조: http://en.wikipedia.org/wiki/Fish) 또는 종자 알레르기 항원일 수 있다.
항원은 자가면역 질환에 관여할 수 있고, 바람직하게는 인간 항원이다. 바람직한 항원은 티로글로불린, 갑상선 퍼옥시다제, 류마토이드 인자(IgA, IgG, IgM), 시트룰린화 펩타이드, 히스티딜-tRNA 합성효소(Jo-1), PM-Scl, 보체, 보체 성분 C4c 및 C3c; 전체 보체(CH50), Sm/RNP, SS-A 및 -B(Sjogren a 및 b), Scl-70, 토포이소머라제, 리보솜 P 단백질, 액틴, 조직 트랜스글루타미나제, 미엘로퍼옥시다제, 프로테이나제-3, M-형 포스포리파제 A, 간 신장 마이크로좀 항원 타입-1(항-LKM1), 항-간 시토졸 타입 1(항-LC1), SMA, 피루베이트 데하이드로게나제 복합체 E2 아단위, 핵 모공 gp210, 핵 바디 sp100, 고이동성 그룹 박스 1, 콜라겐, 콜라겐 타입 II, 콜라겐 타입 IV, 콜라겐 VII, hLAMP-2, 전위 의존성 칼륨 채널(VGKC), N-메틸-D-아스파르트산 수용체(NMDAR), Hu, Yo, Ri, Ma 1/2, CRMP-5, 암피피신, 열 충격 단백질(HSPs), HSP60, 응고 인자 VIII, 증식 세포 핵 항원(PCNA), DNA 폴리머라제, 레코베린, α-에놀라제, 트랜스두신-α, 미엘린 염기성 단백질(MBP), 인자 VIII(FVIII), 인자 IX(FIX), 아밀로이드 β 펩타이드(Aβ), 미엘린 올리고덴드로사이트 글리코단백질(MOG; see www.discoverymedicine.com/category/species-and-cell-types/human/brain/oligodendrocyte/), 미멜린 염기성 단백질(MBP), 과립구 마크로파지-콜로니 자극 인자(GM-CSF), 인터페론(IFN)-γ, 인터류킨-(IL)-6, IL-17A, IL-17F, IL-22, 히스톤 H1,사이토크롬 P450, 미엘린, 아쿠아포린-4(AQP-4), Ro, La, 근육-특이적 키나제(MuSK), 액티닌-α4, α-에놀라제, 신장 인자 2, 글루타메이트 수용체(NR2), 라미닌, 미오신, smD1, PM-Scl, 피브릴라린, RNA 폴리머라제 I, NOR), Scl-70, 사이클린 I 및 II, 간-특이적 단백질, 포르미미노트랜스퍼라제-사이클로데아미나제(LC-1), 가용성 간 항원/간-췌장 항원(SLA/LP), 데스모글레인 1 또는 3, 엔보플라킨, BP180 단백질, BP230 단백질, 미엘린-관련 글리코단백질, 글루탐산 데카복실라제(GAD), 티로신 포스파타제(IA2), 인슐린, H+/K+-ATPase, 엘라스타제, 카텝신 G, 칵토페린, BPI, rPAg1(CUZD1) 및 rPAg2(GP2), 포스포리파제 A2 수용체, 글리아딘-유사 융합 펩타이드, 글루탐산 데카복실라제(GAD65), 및 티로트로핀 수용체 항원일 수 있다.
상기 항원은 독소, 예를 들어, 보툴리늄 신경독소, 클로스트리듐 퍼프린겐스 엡실론 독소, 리신, 삭시톡소, 쉬가톡소, 테트로도독소, 스타필로코쿠스 엔테로독소 등을 인용할 수 있다. 무신도 또한 당해 기술 분야에 널리 알려져 있다. MUC5AC, MUC5B 및 MUC2가 그의 예이다. 특히, 이들은 천연-발생 폴리사카라이드, 예를 들어, 그룹 B 스트렙토코쿠스 및 뉴모코쿠스 캡슐 폴리사카라이드(III형 포함), 슈도모나스 아에루기노사(Pseudomonas aeruginosa) 뮤코엑소폴리사카라이드, 및 캡슐 폴리사카라이드(피셔 I형 포함), 및 해모필루스 인플루엔재(Haemophilus influenzae) 폴리사카리이드일 수 있다.
바람직한 실시형태에서, 상기 항원 또는 에피토프는 하기로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 바이러스에 의해 발현된다: 인플루엔자 바이러스, A형 간염 바이러스, B형 간염 바이러스, C형 간염 바이러스, E형 간염 바이러스, G형 간염 바이러스, HIV 바이러스, 황열 바이러스, 뎅기 바이러스, 일본 뇌염 바이러스, 진드기-매개 뇌염 바이러스, 누수투 또는 웨스트 나일 바이러스, 리프트 계곡 열 또는 토스카나 바이러스, 치쿤구니아 바이러스, 옴스크 출혈열 바이러스, 알크후마 출혈열 바이러스, 키아사누르 삼림병 바이러스, 베네주엘라 말 뇌염 바이러스, 동부 말 뇌염 바이러스, 서부 말 뇌염 바이러스, 로스 리버 바이러스, 마야로 바이러스, 호흡기 합포체 바이러스, 로시오 바이러스, 홍역 바이러스, 머레이 계곡 뇌염 바이러스, 베셀스브론 바이러스, 지카 바이러스, 림프구 무도수막염(lymphocytic choreomeningitis) 바이러스, 에볼라 바이러스, 마르부르그 바이러스, 크리미아-콩고 출혈 열 바이러스, 리사 바이러스, 주닌(Junin) 바이러스, 마추포(Machupo) 바이러스(http://en.wikipedia.org/wiki/Machupo_virus), 사비아(Sabia) 바이러스, 구아나리토(Guanarito) 바이러스, 유행성 이하선염 바이러스, 광견병 바이러스, 루벨라(rubella) 바이러스, 수두 대상 포진 바이러스, 단순 포진 1형 및 2형 바이러스, 더욱 일반적으로 알파바이러스, 아데노바이러스, 한타바이러스, 에코바이러스, 로타바이러스, 플라비바이러스, 리노바이러스, 오쏘부냐바이러스(orthobunyavirus), 폴리오바이러스, 폭스바이러스(예를 들어, 천연두(http://en.wikipedia.org/wiki/Smallpox), 원두, 블랙폭스 또는 카나리아 두창), 오쏘믹소바이러스(예를 들어, 인플루엔자바이러스 A, 인플루엔자바이러스 B, 인플루엔자바이러스 C, http://en.wikipedia.org/wiki/Influenza_A_virus; http://en.wikipedia.org/wiki/Influenzavirus_B; http://en.wikipedia.org/wiki/Influenzavirus_C), 피코나바이러스(예를 들어, 구제역 바이러스, FMDV, http://en.wikipedia.org/wiki/Picornavirus), 인간 파보바이러스, 엔테로바이러스, 코로나바이러스(예를 들어, SARS 또는 인간 베타코로나바이러스), 인간 파필로마바이러스, 헤르페스 바이러스, 인간 시토메갈로바이러스, 엡스테인-바르 바이러스, 파라믹소바이러스(http://en.wikipedia.org/wiki/Paramyxovirus), 예를 들어, 1, 2 및 3형의 파라인플루엔재 바이러스, 또는 임의의 확인된 바이러스.
바람직한 실시형태에서, 상기 항원 또는 에피토프는 하기로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 과에 속하는 바이러스에 의해 발현된다: 플라비비리대(뎅기 바이러스, 황열 바이러스, 웨스트 나일 바이러스, 일본 뇌염 바이러스, 진드기-매개 뇌염 바이러스, C형 간염 바이러스), 토가비리대(치쿤구니아 바이러스, 로스 강 바이러스, 마야로 바이러스, 서부 말 뇌염 바이러스, 동부 말 뇌염 바이러스, 베네주엘라 말 뇌염 바이러스), 부냐비리대(크리미아-콩고 출혈 열 바이러스, 리프트 계곡 열 바이러스, 쉬말렌베르그 바이러스), 칼리시비리대(E형 간염 바이러스), 아레나비리대(라사 바이러스) 및 필로비리대(에볼라 바이러스, 마르부르그 바이러스).
또 다른 바람직한 실시형태에서, 상기 항원 또는 에피토프는 기생 원생동물, 예를 들어, 레이슈마니아(Leishmania) 속으로부터의 것, 또는 톡소플라스마 곤디( Toxoplasma Gondii), 엔타모에바 히스톨리티카(Entamoeba histolytica), 플라스 모듐 팔시파룸(Plasmodium falciparum)(예를 들어, MSP1(19)+ AMA-1(III) 항원, 별개로 또는 동시-발현됨), 뉴모시스티스 카리니(Pneumocystis carinii), 크립토스포리디움(Kryptosporidium), 나에글레리아 포우레리(Naegleria fowleri)(http://en.wikipedia.org/wiki/Naegleria_fowleri), 또는 기아르 디아 람블리아)(Giardia lamblia), 벌레(예: 트리파노소마 크루지(Trypanosoma cryzi), 선충, 촌충 또는 흡충), 또는 절지동물(예: 갑각류, 곤충, 거미류)에 의해 발현된다.
또 다른 바람직한 실시형태에서, 상기 항원 또는 에피토프는, 예를 들어, 살모넬라(Salmonella), 쉬겔라(Shigella), 스트렙토코쿠스(Streptococcus), 스타필로코쿠스(Staphylococcus), 미코플라스마(Mycoplasma), 디프테리애(Diphteriae), 렙토스피로사(Leptospirosa), 리케챠(Rickettsia) 또는 에쉐리키아(Escherichia)의 속의 감염성 세균에 의해 발현된다. 추가의 바람직한 실시형태에서, 상기 세균은 트레포네마 팔리둠(Treponema pallidum )(http://en.wikipedia.org/wiki/Treponema_pallidum), 헬리코박터 필로리(Helicobacter pylori), 캄필로박터 제주니(Campylobacter jejuni), 보렐리아 부르그도르페리(Borrelia burgdorferi), 레기오넬라 뉴모필라(Legionella pneumophila), 예르시니아 페스티스(Yersinia pestis), 예르시니아 엔테로콜리티카(Yersinia enterocolitica), 브루셀라 아보르투스(Brucella abortus), 부르크홀데리아 말레이(Burkholderia mallei)(http://en.wikipedia.org/wiki/Burkholderia_mallei), 브르크홀데리아 슈도말레이(Burkholderia pseudomallei)(http://en.wikipedia.org/wiki/Burkholderia_pseudomallei), 클라미디아 뉴모니아(Chlamydia pneumonia), 프란시셀라 투라렌시스(Francisella tularensis), 마이코플라스마 뉴모니아(Mycoplasma pneumonia), 에이치. 인플루엔자에(H. influenzae), 에스. 뉴모니아에(S. pneumoniae), 클레브시엘라 뉴모니아에(Klebsiella pneumoniae), 에스. 아우레우스(S. aureus), 바실루스 안트라시스(Bacillus anthracis), 클로스트리디움 보툴리눔(Clostridium botulinum)(http://en.wikipedia.org/wiki/Clostridium_botulinum), 클로스트리디움 퍼프린겐스(Clostridium perfringens)(http://en.wikipedia.org/wiki/Clostridium_perfringens), 리스테리아 모노사이토게네스(Listeria monocytogenes), 보르데텔라 퍼투시스(Bordetella pertussis), 클로스트리디움 테타니(Clostridium tetani), 네이세리아 메닝기티디스(Neisseria meningitidis)(http://en.wikipedia.org/wiki/Neisseria_meningitidis), 에스. 에피더미디스(S. epidermidis), 엔. 메닌기디티스(N. meningiditis), 슈도모나스 아에루기노사(Pseudomonas aeruginosa), 클라미디아 트라초마티스(Chlamydia trachomatis), 미코박테리움 투버쿨로시스(Mycobacterium tuberculosis), 콕시엘라 부르네티(Coxiella burnetii), 릭케트시아 프로바제키(Rickettsia prowazekii)(http://en.wikipedia.org/wiki/Rickettsia_prowazekii), 클라미디아 시타시(Chlamydia psittaci)(http://en.wikipedia.org/wiki/Chlamydia_psittaci), 렙토스피로사 인테로간스(Leptospirosa interrogans) 및 이. 콜라이(E.coli)(예를 들어, 이. 콜라이 O157:H7(http://en.wikipedia.org/wiki/Escherichia_coli_O157:H7)) 중에서 선택되는 종에 속한다.
또 다른 바람직한 실시형태에서, 상기 항원 또는 에피토프는 진균 또는 효모에 의해, 예를 들어, 칸디다( Candida), 아스퍼질루스(Aspergillus), 크립토코쿠스( Cryptococcus), 히스토플라스마(Histoplasma), 뉴모시스티스(Pneumocystis) 또는 스타치보트리스(Stachybotrys)의 종으로부터 발현된다.
항원 또는 에피토프는 프리온 단백질(PrPc)로부터 유래할 수 있다.
에피토프는 특이적 면역글로불린, 예를 들어, IgD, IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA, IgM, IgE, 또는 IgG 등으로부터 유래할 수 있다.
항원은 통상적으로 특이적 항체에 대해 상호작용의 관점에서 작용할 수 있는 수개의 표면 특징을 나타낸다. 이러한 구별되는 분자적 특징이 에피토프를 구성한다. 따라서, 본원에서 사용되는 용어 "에피토프"는 항원의 특정한 분자 표면 특징, 예를 들어, 하나 이상의 항체에 의해 결합될 수 있는 항원의 단편을 나타낸다. 따라서, 분자적 수준에서, 에피토프는 특이적 항체에 의해 인지되고 결합되는 항원의 특정 분자적 표면 특징(예를 들어, 항원의 단편)에 상응한다. 본 발명과 관련하여, "융합 단백질"은 표적 항체에 의해 인지되는 하나 이상의 에피토프를 포함한다. 바람직하게는, 상기 융합 단백질은 수개의 에피토프(http://en.wikipedia.org/wiki/Epitope)를 포함하는 전체 항원을 포함한다. 이들 에피토프는 선형 또는 입체형태적(conformational) 에피토프일 수 있다. 본원에서 사용되는 바와 같이, 선형(또는 순차적) 에피토프는 항체(http://en.wikipedia.org/wiki/Antibody), 아미노산(http://en.wikipedia.org/wiki/Amino_acid)의 선형 서열 또는 일차 구조(http://en.wikipedia.org/wiki/Primary_structure)에 의해 인지되는 에피토프이다. 이와는 반대로, 입체형태적 에피토프(http://en.wikipedia.org/wiki/Conformational_epitope)는 이의 특이적 3차원 모양에 의해 인지된다. 바람직하게는, 본 발명의 융합 단백질은 대부분의 폴리클로날 항체가 인지하는 바와 같이 입체형태적 에피토프를 포함한다.
그러나, 이러한 항원이 교차-반응성 에피토프, 즉, 에피토프에 결합될 비-특이적 항체에 의해 인지되는 에피토프를 나타내지는 않는다는 것이 중요하다. 만약 이러한 경우, 본 발명의 특이성이 감소될 것이다.
바람직한 실시형태에서, 상기 에피토프는 바이러스 단백질, 바람직하게는 EDIII 단백질 상에 존재하고, 이는 뎅기 바이러스 1, 뎅기 바이러스 2, 뎅기 바이러스 3, 뎅기 바이러스 4, 웨스 나일 바이러스, 황열 바이러스, 일본 뇌염 바이러스, 지카 바이러스, 베셀스브론 바이러스, 로시오 바이러스, 머레이 뇌염 바이러스, 세인트-루이스 뇌염 바이러스, 유전형 1의 일본 뇌염 바이러스, 유전형 2의 일본 뇌염 바이러스, 유전형 4의 일본 뇌염 바이러스, 유전형 5의 일본 뇌염 바이러스 및 라벤스버그 바이러스로 이루어진 그룹으로부터 선택된다.
더욱 바람직한 실시형태에서, 상기 에피토프는 하기로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 바이러스 단백질 상에 존재한다: 서열번호 3의 뎅기 바이러스 1의 EDIII 단백질, 서열번호 4의 뎅기 바이러스 2의 EDIII 단백질, 서열번호 5의 뎅기 바이러스 3의 EDIII 단백질, 서열번호 6의 뎅기 바이러스 4의 EDIII 단백질, 서열번호 7의 웨스트 나일 바이러스의 EDIII 단백질, 서열번호 8의 황열 바이러스의 EDIII 단백질, 서열번호 9의 일본 뇌염 바이러스의 EDIII 단백질, 서열번호 10의 지카 바이러스의 EDIII 단백질, 서열번호 11의 베셀스브론 바이러스의 EDIII 단백질, 서열번호 12의 로시오 바이러스의 EDIII 단백질, 서열번호 13의 머레이 뇌염 바이러스의 EDIII 단백질, 서열번호 14의 세인트-루이스 뇌염 바이러스의 EDIII 단백질, 서열번호 54에 의해 인코딩되는 유전형 1의 일본 뇌염 바이러스의 EDIII 단백질, 서열번호 55에 의해 인코딩되는 유전형 2의 일본 뇌염 바이러스의 EDIII 단백질, 서열번호 56에 의해 인코딩되는 유전형 4의 일본 뇌염 바이러스의 EDIII 단백질, 서열번호 57에 의해 인코딩되는 유전형 5의 일본 뇌염 바이러스의 EDIII 단백질, 서열번호 58에 의해 인코딩되는 라벤스버그 바이러스의 EDIII 단백질, 및 HIV1, HIV2, B형 간염 바이러스, C형 간염 바이러스, E형 간염 바이러스, 웨스트-나일 바이러스 및 HPV 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59, 66 및 68와 같은 종양 HPV 스트레인의 바이러스 단백질.
바람직한 실시형태에서, 본 발명의 방법에서 사용되는 융합 단백질에서 hAGT 효소와 융합되는 제1 및 제2 에피토프(또는 항원)는 동일한 분류 수준에 속한다. 즉, 이들은 동일한 과(예: 플라비비리대 과, 부냐비리대 과, 아레나비리대 과 또는 필로비리대 과) 또는 속 또는 종에 속하나 상이한 혈청형을 갖는다. 달리, 상기 제1 및 제2 에피토프는 긴밀히 관련된, 예를 들어, 동일한 과, 속 또는 종에 속하나 뎅기 바이러스 1, 2, 3, 또는 4와 같이 상이한 혈청형을 갖는, 바이러스에 의해 발현될 수 있다.
달리, 또 다른 바람직한 실시형태에서, 상기 제1 및 제2 에피토프(또는 항원)는 비관련된 생물학적 과, 속 또는 종에 속한다.
에피토프는 바이러스 에피토프일 수 있다. 바람직하게는, 적어도 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 또는 16개의 에피토프가 바이러스 에피토프로부터 선택된다. 바람직하게는, 적어도 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 또는 16개의 에피토프가 뎅기 바이러스(혈청형 1, 2, 3 또는 4), 웨스트 나일 바이러스, 황열 바이러스, 일본 뇌염 바이러스, 진드기-매개 뇌염 바이러스, 세인트-루이스 뇌염 바이러스, 머레이 계곡 뇌염 바이러스, 베셀스브론 바이러스, 지카 바이러스, 로시오 바이러스, 우수투 바이러스, 리프트 계곡 열 바이러스 및 치쿤구니아 바이러스 에피토프로부터 선택된다. 보다 바람직하게는, 적어도 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 또는 16개의 에피토프가 뎅기 바이러스(혈청형 1, 2, 3 또는 4), 웨스트 나일 바이러스, 황열 바이러스, 일본 뇌염 바이러스, 진드기-매개 뇌염 바이러스, 세인트-루이스 뇌염 바이러스, 머레이 계곡 뇌염 바이러스, 베셀스브론 바이러스, 지카 바이러스, 로시오 바이러스, 우수투 바이러스, 리프트 계곡 열 바이러스, 치쿤구니아 바이러스, SARS 코로나바이러스, 인간 코로나바이러스, C형 간염 바이러스(HCV), E형 간염 바이러스(HEV) 또는 쉬말렌베르그 바이러스 에피토프로부터 선택된다.
바람직하게는, 적어도 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 또는 16개의 에피토프는 뎅기 바이러스(혈청형 1, 2, 3 또는 4), 웨스트 나일 바이러스, 황열 바이러스, 일본 뇌염 바이러스, 진드기-매개 뇌염 바이러스, 세인트-루이스 뇌염 바이러스, 머레이 계곡 뇌염 바이러스, 베셀스브론 바이러스, 지카 바이러스, 로시오 바이러스, 우수투 바이러스, 리프트 계곡 열 바이러스, 치쿤구니아 바이러스, SARS 코로나바이러스, 인간 코로나바이러스, C형 간염 바이러스(HCV), E형 간염 바이러스(HEV), 쉬말렌베르그 바이러스, HIV1, HIV2, B형 간염 바이러스 및 HPV 에피토프로부터 선택된다. 적어도 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 또는 16개의 에피토프는 달리는 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 또는 16개의 상술된 바이러스의 임의의 그룹으로부터 선택될 수 있다.
바람직하게는, 적어도 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 또는 16개의 에피토프는 플라비리대 ( Flaviviridae) 에피토프로부터 선택된다. 바람직하게는, 적어도 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 또는 16개의 에피토프는 토가비리대 ( Togaviridae) 에피토프로부터 선택된다. 바람직하게는, 적어도 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 또는 16개의 에피토프는 분야비리대( Bunyaviridae) 에피토프로부터 선택된다. 바람직하게는, 적어도 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 또는 16개의 에피토프는 칼리시비리대( Caliciviridae) 에피토프로부터 선택된다. 바람직하게는, 적어도 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 또는 16개의 에피토프는 아레나비리대( Arenaviridae) 에피토프로부터 선택된다. 바람직하게는, 적어도 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 또는 16개의 에피토프는 필로비리대( Filoviridae) 에피토프로부터 선택된다. 바람직하게는, 적어도 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 또는 16개의 에피토프는 폭스비리대( Poxviridae) 에피토프로부터 선택된다.
에피토프는 세균 에피토프일 수 있다. 바람직하게는, 적어도 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 또는 16개의 에피토프는 세균 에피토프로부터 선택된다. 바람직하게는, 적어도 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 또는 16개의 에피토프는 트레포네마 팔리둠(Treponema pallidum)(http://en.wikipedia.org/wiki/Treponema_pallidum), 헬리코박터 필로리(Helicobacter pylori), 캄필로박터 제주니(Campylobacter jejuni), 보렐리아 부르그도르페리(Borrelia burgdorferi), 레지오넬라 뉴모필라(Legionella pneumophila), 예르시니아 페스티스(Yersinia pestis)(http://en.wikipedia.org/wiki/Yersinia_pestis), 예르시니아 엔테로콜리티카(Yersinia enterocolitica), 브루셀라 아보르투스(Brucella abortus), 부르크홀데리아 말레이(Burkholderia mallei), 부르크홀데리아 슈도말레이(Burkholderia pseudomallei), 클라미디아 뉴모니아(Chlamydia pneumonia), 프란시셀라 툴라렌시스(Francisella tularensis), 마이코플라스마 뉴모니아(Mycoplasma pneumonia), 에이치. 인플루엔자(H. influenzae), 에스. 뉴모니아에(S. pneumoniae), 클레브시엘라 뉴모니아에(Klebsiella pneumoniae), 에스. 아우레우스(S. aureus), 바실루스 안트라시스(Bacillus anthracis), 클로스트리디움 보툴리눔(Clostridium botulinum), 클로스트리디움 퍼프린겐스(Clostridium perfringens), 리스테리아 모노시토게네스(Listeria monocytogenes), 보르데텔라 퍼투시스(Bordetella pertussis), 클로스트리디움 테타니(Clostridium tetani), 네이세리아 메닝기티디스(Neisseria meningitidis), 에스. 에피데르미디스(S. epidermidis), 엔. 메닝기디티스(N. meningiditis), 슈도모나스 에루기노사(Pseudomonas aeruginosa), 클라미디아 트라코마티스(Chlamydia trachomatis), 마이코박테리움 투베르쿨로시스(Mycobacterium tuberculosis), 콕시엘라 부르네티(Coxiella burnetii), 릭켓시아 프로와제키(Rickettsia prowazekii), 클라미디아 시타시(Chlamydia psittaci), 렙토스피로사 인테로간스(Leptospirosa interrogans) 및 이. 콜라이(E.coli)(예를 들어, 이. 콜라이, O157:H7) 에피토프로부터 선택된다. 적어도 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 또는 16개의 에피토프는 달리는 적어도 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 또는 16개의 상술된 세균의 임의의 그룹으로부터 선택될 수 있다.
바람직하게는, 적어도 1, 2, 3 또는 4개의 에피토프는 렙토스피라 에피토프, 가장 바람직하게는 LruA, LruB, HbpA 또는 LipL32 에피토프로부터 선택된다.
일부 실시형태에서, 제1 또는 제2 융합 단백질은 서열번호 3 내지 14 및 54 내지 58 중의 어느 하나에 의해 인코딩된 적어도 하나의 아미노산 서열, 또는 이의 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 40, 50, 60, 100, 200 또는 300개의 연속 아미노산을 포함한다.
일부 실시형태에서, 제1 또는 제2 융합 단백질은 서열번호 155, 157, 159, 161, 163, 165, 167, 171, 173, 175, 177 및 179 중의 어느 하나에 의해 인코딩된 하나 이상의 아미노산 서열, 또는 이의 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 40, 50, 60, 100, 200 또는 300개의 연속 아미노산을 포함한다.
일부 실시형태에서, 제1 또는 제2 융합 단백질은 서열번호 3 내지 14 및 54 내지 58 중의 어느 하나에 의해 인코딩된 하나 이상의 아미노산 서열을 포함하고/하거나 서열번호 155, 157, 159, 161, 163, 165, 167, 171, 173, 175, 177 및 179로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열, 또는 이의 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 40, 50, 60, 100, 200 또는 300개의 연속 아미노산을 포함한다.
일부 실시형태에서, 제1 또는 제2 융합 단백질은 SARS 코로나바이러스의 돌연변이된 N 단백질, SARS 코로나바이러스의 S 단백질의 RBD, 인간 베타코로나바이러스의 N 단백질, 인간 베타코로나바이러스의 S1 단백질, 인간 베타코로나바이러스의 S 단백질의 RBD, C형 간염(HCV) 바이러스의 돌연변이된 C 단백질, HEV 코어 항원, HCV 코어 항원, HCV 코어 항원의 짧은 형태, 쉬말렌베르그 바이러스의 NS 단백질로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시형태에서, 제1 또는 제2 융합 단백질은 도 12 내지 16 및 21 내지 24에 도시된 바이러스 아미노산 서열의 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 40, 50, 60, 100, 200 또는 300개의 연속 아미노산을 포함한다.
일부 실시형태에서, 제1 또는 제2 융합 단백질은 LruA, LruB 또는 LipL32 단백질로부터 선택된 적어도 하나의 아미노산 서열을 포함한다. 바람직하게는, 제1 또는 제2 융합 단백질은 도 17, 18 또는 19에 도시된 LruA, LruB 또는 LipL32 아미노산 서열의 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 40, 50, 60, 100, 200 또는 300개의 연속 아미노산을 포함한다.
일부 실시형태에서, 상기 에피토프는 도 17, 18 또는 19에 도시된 서열의 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 40, 50, 60, 100, 200 또는 300개의 보존적 LruA, LruB 또는 LipL32 아미노산을 포함한다.
본 발명의 면역분석은 공지 또는 미지인 다수의 항체를 동시에 검출할 수 있다. 본원에서 "다수"란 적어도 5개, 바람직하게는 적어도 15개, 더욱 바람직하게는 적어도 50개, 더욱더 바람직하게는 적어도 100개의 항체이다. 따라서, 바람직한 실시형태에서, 본 발명의 분석 방법은 피험자로부터의 생물학적 샘플 중의 적어도 5개, 바람직하게는 적어도 15개, 더욱 바람직하게는 적어도 50개, 더욱더 바람직하게는 적어도 100개의 표적 항체를 검출하는데 이용된다. 절차가 항체의 특성에 의거하지 않고 항체의 존재를 검출하는 것에 의거하기 때문에, 특정의 항체가 적절히 특징화 되는지 여부는 본 발명의 방법과 관련이 없다.
본 발명의 바람직한 실시형태에서, 상기 제1 및 제2 고체 지지체와 커플링되는 제1 및 제2 융합 단백질은 하기로 이루어진 그룹으로부터 선택된다:
- 서열번호 21(융합 단백질 [SNAP-DEN1.EDIII]에 상응)
- 서열번호 42(융합 단백질 [SNAP-SBV.N]에 상응)
- 서열번호 49(융합 단백질 [SNAP-EV71.VP1]에 상응)
- 서열번호 51(융합 단백질 [JE.sE-SNAP]에 상응)
- 서열번호 53(융합 단백질 [SNAP-JE-1.EDIII]에 상응)
- 서열번호 60(융합 단백질 [SNAP- JE-2.EDIII]에 상응)
- 서열번호 62(융합 단백질 [SNAP- JE-4.EDIII]에 상응)
- 서열번호 64(융합 단백질 [SNAP- JE-5.EDIII]에 상응)
- 서열번호 66(융합 단백질 [SNAP- RabV.EDIII]에 상응)
- 서열번호 68(융합 단백질 [SNAP- 플라비바이러스.EDIII]에 상응)
- 서열번호 70(융합 단백질 [RR.sE2-SNAP]에 상응)
- 서열번호 72(융합 단백질 [MAY.sE2-SNAP]에 상응)
- 서열번호 74(융합 단백질 [WEE.sE2-SNAP]에 상응)
- 서열번호 76(융합 단백질 [EEE.sE2-SNAP]에 상응)
- 서열번호 78(융합 단백질 [VEE.sE2-SNAP]에 상응)
- 서열번호 80(융합 단백질 [SNAP- AKA.N]에 상응)
- 서열번호 82(융합 단백질 [SNAP- AIN.N]에 상응)
- 서열번호 84(융합 단백질 [SNAP- SHA.N]에 상응)
- 서열번호 86(융합 단백질 [SNAP- huCOV.N]에 상응)
- 서열번호 88(융합 단백질 [SNAP- huCOV.S]에 상응)
- 서열번호 90(융합 단백질 [SNAP- HCV.C]에 상응)
- 서열번호 92(융합 단백질 [SNAP- MSP+AMA]에 상응)
- 서열번호 94(융합 단백질 [SNAP- HbpA1]에 상응)
- 서열번호 96(융합 단백질 [SNAP- MUB40]에 상응)
- 서열번호 98(융합 단백질 [SNAP- moCLEC5A]에 상응)
- 서열번호 100(융합 단백질 [SNAP- huCLEC5A]에 상응)
- 서열번호 102(융합 단백질 [SNAP- cxVAGO]에 상응)
- 서열번호 104(융합 단백질 [SNAP- aaVAGO]에 상응)
- 서열번호 109(융합 단백질 [SNAP- CCHF.N]에 상응)
- 서열번호 111(융합 단백질 [SNAP- EBO.N]에 상응)
- 서열번호 113(융합 단백질 [SNAP- MAR.N]에 상응)
- 서열번호 115(융합 단백질 [SNAP- LAS.N]에 상응)
- 서열번호 117(융합 단백질 [SNAP- JUN.N]에 상응)
- 서열번호 119(융합 단백질 [SNAP- MAC.N]에 상응)
- 서열번호 121(융합 단백질 [SNAP- GUA.N]에 상응)
- 서열번호 123(융합 단백질 [SNAP- SAB.N]에 상응)
- 서열번호 125(융합 단백질 [SNAP- OMSK.EDIII]에 상응)
- 서열번호 127(융합 단백질 [SNAP- KYA.EDIII]에 상응)
- 서열번호 129(융합 단백질 [SNAP- ALK.EDIII]에 상응)
- 서열번호 131(융합 단백질 [LAS.ectoGP1-SNAP]에 상응)
- 서열번호 133(융합 단백질 [JUN.ectoGP1-SNAP]에 상응)
- 서열번호 135(융합 단백질 [MAC.ectoGP1-SNAP]에 상응)
- 서열번호 137(융합 단백질 [GUA.ectoGP1-SNAP]에 상응)
- 서열번호 139(융합 단백질 [SAB.ectoGP1-SNAP]에 상응)
- 서열번호 141(융합 단백질 [LAS.ectoGP2-SNAP]에 상응)
- 서열번호 143(융합 단백질 [JUN.ectoGP2-SNAP]에 상응)
- 서열번호 145(융합 단백질 [MAC.ectoGP2-SNAP]에 상응)
- 서열번호 147(융합 단백질 [GUA.ectoGP2-SNAP]에 상응)
- 서열번호 149(융합 단백질 [SAB.ectoGP2-SNAP]에 상응), 및
- 서열번호 151((융합 단백질 [SNAP- HEV.C]에 상응).
따라서, 본 발명의 시험관내 방법으로 바이러스, 세균, 효모 또는 진균-매개된 감염인 표적 질환(들)을 검출할 수 있다. 바람직하게는, 상기 바이러스 감염은 파필로마바이러스 또는 플라비비리대(뎅기 바이러스, 황열 바이러스, 웨스트 나일 바이러스, 일본 뇌염 바이러스, 진드기-매개 뇌염 바이러스, C형 간염 바이러스), 토가비리대(치쿤구니아 바이러스, 로스 강 바이러스, 마야로 바이러스, 서부 말 뇌염 바이러스, 동부 말 뇌염 바이러스, 베네주엘라 말 뇌염 바이러스), 부냐비리대(크리미아-콩고 출혈 열 바이러스, 리프트 계곡 열 바이러스, 쉬말렌베르그 바이러스), 칼리시비리대(E형 간염 바이러스), 아레나비리대(라사 http://en.wikipedia.org/wiki/Lassa_virus) 및 필로비리대(에볼라 http://en.wikipedia.org/wiki/Ebola_virus, 마르부르그 http://en.wikipedia.org/wiki/Marburg_virus)의 과로부터의 RNA 바이러스에 의해 유발된다. 바람직하게는, 상기 세균 감염은 렙토스피로사 인테로간스에 의해 유발된다. 바람직하게는, 상기 감염은 플라스모듐 팔시파룸에 의해 유발된다.
본원에서 사용되는 용어 "생물학적 샘플"은 환자로부터 수득되고 항체를 포함할 수 있는 임의의 샘플을 말한다. 바람직하게는, 상기 생물학적 샘플은 생물학적 유체, 예를 들어 비여과 생물학적 유체, 예를 들어 소변, 뇌척수액, 늑막액, 윤활액, 복막액, 양수, 위액, 혈액, 혈청, 혈장, 림프액, 간질액, 타액, 생리학적 분비물, 눈물, 점액, 땀, 젖, 정액(semen, seminal fluid), 질 분비물, 궤양 및 다른 표면 발진으로부터의 유체, 수포 및 농양이다. 또한, 생물학적 샘플은 또한 항체를 포함할 수 있는 정상적, 악성 및 의심되는 조직 또는 임의의 다른 신체 구성물의 생검을 포함한 조직의 추출물을 말한다. 상기 생물학적 샘플은 사용 전에, 예를 들어, 혈액으로부터 혈장을 준비하고 점성 유체를 희석시키는 등과 같이 전처리될 수 있으며; 처리 방법은 여과, 증류, 농축, 간섭 화합물의 불활성화, 및 시약 첨가를 포함할 수 있다. 바람직한 실시형태에서, 상기 생물학적 샘플은 전혈, 혈청, 혈장, 소변, 정액, 뇌척수액 및 타액으로부터 선택된다.
AGT 폴리펩타이드
O6-알킬구아닌-DNA 알킬트랜스퍼라제 활성을 갖는 임의의 폴리펩타이드를 본 발명의 방법에 사용할 수 있다. 본 발명의 목적 상, 이들 폴리펩타이드는 "AGT 폴리펩타이드"로 지칭될 것이다.
AGT는 이의 기질인 O6-알킬구아닌-DNA로부터의 알킬 그룹을 이의 시스테인 부분에 비가역적으로 전달한다. AGT와 신속히 반응하는 기질 동족체는 O6-벤질-구아닌이고, 이차 속도 상수는 약 103 sec-1 M-1이다.
본 발명과 관련하여, 폴리펩타이드가 O6-알킬구아닌-포함 분자로부터의 알킬 그룹을 그 자신의 시스테인 부분에 비가역적으로 전달할 수 있는 경우, 이 폴리펩타이드를 "O6-알킬구아닌-DNA 알킬트랜스퍼라제 활성"(또는 "AGT 활성")을 갖는다고 한다. 상기 폴리펩타이드의 "O6-알킬구아닌-DNA 알킬트랜스퍼라제 활성"은, 예를 들어, 공지된 표지된 O6-벤질-구아닌 유도체를 접촉시키고, 상기 표지가 시험되는 폴리펩타이드에 전달되는 것을 모니터링함으로써 측정될 수 있다. 분석이 세포에서(in cellulo) 또는 세포 추출물에서 수행되는 경우, 숙주 세포의 내인성 AGT의 반응이 조절되어야 하며, 이렇게 함으로써 내인성 AGT가 상기 폴리펩타이드를 방해하지 않는다. 따라서, 공지된 AGT-결핍 세포주가 바람직하게 사용된다. AGT 활성을 확인하는 분석은 널리 알려져 있다. 수개의 O6-벤질-구아닌 유도체가 시판된다(O6-벤질-구아닌은, 예를 들어, Santa Cruz biotechnology에 의해 공급되며, 형광-표지된 O6-벤질-구아닌 유도체는 New England Biolabs NEB에 의해 입수될 수 있다). 이들 분석 중 일부가 WO 2005/085470 및 WO 2004/031405에 기술되어 있다.
본 발명과 관련하여, AGT 폴리펩타이드의 "촉매 도메인"은 효소의 활성 부위, 또는, 달리, 이의 기질인 O6-알킬구아닌-DNA로부터의 알킬 그룹을 반응성 시스테인 부분으로 전달하는 효소의 부분에 상응한다. 활성 부위에서 O6-벤질구아닌과 결합하는 hAGT의 구조에서, 4개의 아미노산이 벤질 환에 가까이 있거나(Pro140, Ser159, Gly160), 핵염기의 N9와 접촉될 수 있다(Asn157). 위치 Pro140 및 Gly160에서의 돌연변이는 hAGT와 O6-벤질구아닌와의 반응에 영향을 끼치는 것으로 이전에 밝혀졌으며(Xu-Welliver et al., Biochemical Pharmacology 1999), 위치 140에서의 프롤린은 벤질 환과의 상호작용에 필수적인 것으로 믿어지며, 돌연변이 Gly160Trp은 O6-벤질구아닌에 대한 hAGT의 반응성을 증가시키는 것으로 알려져 있다.
바람직한 실시형태에서, O6-알킬구아닌-DNA 알킬트랜스퍼라제 활성을 갖는 AGT 폴리펩타이드는 서열번호 1의 인간 AGT 폴리펩타이드(NP_002403.2), NP_032624.1(서열번호 18)로 확인되는 마우스 AGT, NP_036993.1(서열번호 19)로 확인되는 래트 MGMT 또는 O6-알킬구아닌-DNA 알킬트랜스퍼라제 활성을 갖는 이의 상동성 서열이다.
본원에서 사용되는 용어 "상동성"은 서열 유사성을 갖는 서열을 말한다. 용어 "서열 유사성"은 이의 모든 문법적 형태에서 핵산 또는 아미노산 서열 간의 동일성 또는 상응 정도를 말한다. 본 발명과 관련하여, 2개의 아미노산 서열은 적어도 약 80%, 달리 적어도 약 81%, 달리 적어도 약 82%, 달리 적어도 약 83%, 달리 적어도 약 84%, 달리 적어도 약 85%, 달리 적어도 약 86%, 달리 적어도 약 87%, 달리 적어도 약 88%, 달리 적어도 약 89%, 달리 적어도 약 90%, 달리 적어도 약 91%, 달리 적어도 약 92 %, 달리 적어도 약 93%, 달리 적어도 약 94%, 달리 적어도 약 95%, 달리 적어도 약 96%, 달리 적어도 약 97%, 달리 적어도 약 98%, 달리 적어도 약 99%의 아미노산이 유사한 경우 "상동성"이다. 바람직하게는, 유사하거나 상동성인 폴리펩타이드 서열은 Needleman 및 Wunsch의 알고리즘을 이용하여 확인된다.
바람직하게는, AGT 효소에 대한 상동성 서열은 서열번호 1과 적어도 64% 아미노산 서열 동일성, 바람직하게는 적어도 약 65% 아미노산 서열 동일성, 달리 적어도 약 66% 아미노산 서열 동일성, 달리 적어도 약 67% 아미노산 서열 동일성, 달리 적어도 약 68% 아미노산 서열 동일성, 달리 적어도 약 69% 아미노산 서열 동일성, 달리 적어도 약 70% 아미노산 서열 동일성, 달리 적어도 약 71% 아미노산 서열 동일성, 달리 적어도 약 72% 아미노산 서열 동일성, 달리 적어도 약 73% 아미노산 서열 동일성, 달리 적어도 약 74% 아미노산 서열 동일성, 달리 적어도 약 75% 아미노산 서열 동일성, 달리 적어도 약 76% 아미노산 서열 동일성, 달리 적어도 약 77% 아미노산 서열 동일성, 달리 적어도 약 78% 아미노산 서열 동일성, 달리 적어도 약 79% 아미노산 서열 동일성, 달리 적어도 80% 아미노산 동일성, 달리 적어도 약 81 % 아미노산 서열 동일성, 달리 적어도 약 82% 아미노산 서열 동일성, 달리 적어도 약 83% 아미노산 서열 동일성, 달리 적어도 약 84% 아미노산 서열 동일성, 달리 적어도 약 85% 아미노산 서열 동일성, 달리 적어도 약 86% 아미노산 서열 동일성, 달리 적어도 약 87% 아미노산 서열 동일성, 달리 적어도 약 88% 아미노산 서열 동일성, 달리 적어도 약 89% 아미노산 서열 동일성, 달리 적어도 약 90% 아미노산 서열 동일성, 달리 적어도 약 91% 아미노산 서열 동일성, 달리 적어도 약 92% 아미노산 서열 동일성, 달리 적어도 약 93% 아미노산 서열 동일성, 달리 적어도 약 94% 아미노산 서열 동일성, 달리 적어도 약 95% 아미노산 서열 동일성, 달리 적어도 약 96% 아미노산 서열 동일성, 달리 적어도 약 97% 아미노산 서열 동일성, 달리 적어도 약 98% 아미노산 서열 동일성 및 달리 적어도 약 99 % 아미노산 서열 동일성을 갖는다. 바람직한 실시형태에서, 서열번호 1의 상동성 서열은 서열번호 1에 대해 적어도 64%, 바람직하게는 70%, 더욱 바람직하게는 80% 동일하다.
바람직한 실시형태에서, 상기 상동성 폴리펩타이드는 서열번호 1의 hAGT 폴리펩타이드의 단편 또는 돌연변이체로서 O6-알킬구아닌-DNA 알킬트랜스퍼라제 활성을 갖는다.
상기 단편은 적어도 50개, 바람직하게는 100개, 더욱 바람직하게는 150개 아미노산의 크기를 가질 수 있으며, 적어도, AGT 효소의 O6-알킬구아닌-DNA 알킬트랜스퍼라제 활성에 중요한, 상기 정의된 바와 같은 AGT 폴리펩타이드의 "촉매 도메인"을 포함한다. 이들 단편은 당업자에 의해 알려진 일반적 기술을 이용하여 수득될 수 있다.
천연 AGT로부터 유도되는 상이한 돌연변이체 효소가 문헌(Lim A. et al, 1996; Daniels D.S. et al, 2000; Juillerat A. et al, 2003, WO 2005/085470, WO 2004/031405)에 기재되어 있다. 특히, 아미노산 182에서 절두된 돌연변이 Cys62Ala, Lys125Ala, Ala127Thr, Arg128Ala, Gly131Lys, Gly132Thr, Met134Leu, Arg135Ser, Cys150Ser, Asn157Gly, Ser159Glu를 포함하는 20 kDa의 돌연변이체 단백질이 수득되었다(WO 2005/085470에서 이른바 "AGT26" 돌연변이체라 불리고, 또한 WO 2006/114409에서는 "SNAP 26"이라 불림). 이러한 특정 돌연변이체 "SNAP26"은 증강된 표지 활성을 갖는 것으로 밝혀졌다.
본 발명과 관련하여, 더욱 바람직한 AGT 폴리펩타이드의 서열은 WO 2005/085470에 기술된 돌연변이를 포함하며, 돌연변이 위치는 서열번호 1을 고려하여 쉽게 이동될 수 있으며, SNAP26의 출발 메티오닌 부분은 서열번호 1의 위치 32에 있는 메티오닌 부분에 상응한다(따라서, 서열번호 1에 상응하는 것을 얻기 위해서는 WO 2005/085470에 기술된 위치에 31개의 아미노산이 추가되어야 한다).
바람직한 실시형태에서, 본 발명에 유용한 AGT 상동성 서열은, 1 내지 30개, 바람직하게는 6 내지 25개, 특히 14개, 15개, 16개, 17개, 18개, 19개, 20개, 21개, 22개 또는 23개 아미노산이 다른 아미노산으로 치환되고/되거나 1 내지 40개, 바람직하게는 1 내지 20개, 특히 10 내지 20개의 아미노산, 더욱 바람직하게는 15개 아미노산이 C-말단에서 결실된, 서열번호 1의 천연 AGT 서열에 상응한다.
더욱 바람직한 실시형태에서, AGT 상동성 서열은 서열번호 1과 비교하여 하기의 돌연변이를 포함한다:
(A) Lys31이 Arg로 대체, 또는 Met32이 Ser로 대체, 또는 Cys93이 Ala로 대체, 또는 Lys156이 Ala로 대체, 또는 Ala158이 Thr로 대체, 또는 Arg159이 Ala로 대체, 또는 Gly162이 Lys로 대체, 또는 Gly163이 Thr로 대체, 또는 Met165이 Leu로 대체, 또는 Arg166이 Ser로 대체, 또는 Cys181이 Ser로 대체, 또는 Asn188이 Gly로 대체, 또는 Ser190이 Glu로 대체, 또는 Gly214이 Pro로 대체, 또는 Ser215이 Ala로 대체, 또는 Ser216이 Gly로 대체, 또는 Gly217이 Ile로 대체, 또는 Leu218이 Gly로 대체, 또는 Gly220이 Pro로 대체, 또는 Ala221이 Gly로 대체, 또는 Trp222이 Ser로 대체, 또는
(B) Lys31-Met32이 Arg-Ser로 대체, 또는 Ala158-Arg159이 Thr-Ala로 대체, 또는 Gly162-Gly163이 Lys-Thr로 대체, 또는 Met165-Arg166이 Leu-Ser로 대체, 또는 Gly162-Gly163/Met165-Arg166이 Lys-Thr/Leu-Ser로 대체, 또는 Asn188/Ser190이 Gly/Glu로 대체, 또는 Gly214-Ser215-Ser216-Gly217-Leu218이 Pro-Ala-Gly-Ile-Gly로 대체, 또는 Gly220-Ala221-Trp222이 Pro-Gly-Ser로 대체(바람직하게는, 상기(A)에서 인용되는 임의의 다른 아미노산 대체와 조합됨), 또는
(C) Leu223 이후 절두됨(아미노산 224-238이 결실됨)(바람직하게는, 상기 (A) 또는 (B)에서 인용되는 임의의 다른 아미노산 대체와 조합됨).
바람직한 AGT 상동성 서열은 Leu223 이후 절두되는 것들이다.
바람직한 AGT 상동성 서열은 변형(B) 중 2개가 존재하고, 임의로, Leu223 이후 절두되는 것들이다.
바람직한 AGT 상동성 서열은 변형(B) 중 3개가 존재하고, 임의로, Leu223 이후 절두되는 것들이다.
바람직한 AGT 상동성 서열은 변형(B) 중 4개가 존재하고, 임의로, Leu223 이후 절두되는 것들이다.
바람직한 AGT 상동성 서열은 변형(B) 중 5개가 존재하고, 임의로, Leu223 이후 절두되는 것들이다.
바람직한 AGT 상동성 서열은 변형(B) 중 6개가 존재하고, 임으로, Leu223 이후 절두되는 것들이다.
다른 바람직한 AGT 상동성 서열은 (A)에 기술되는 변형 중에서 선택되는 2개, 3개, 4개, 5개, 6개, 7개, 8개, 9개, 10개, 11개, 12개, 13개, 14개, 15개, 16개, 17개, 18개, 19개 또는 20개 돌연변이의 조합을 포함하고, 임의로, Leu223 이후 절두되는 것들이다.
더욱더 바람직한 실시형태에서, 본 발명의 AGT 폴리펩타이드는, hAGT 효소에 상동성이고 서열번호 1과 비교하여 돌연변이 Lys31Arg, Met32Ser, Cys93Ala, Lys156Ala, Ala158Thr, Arg159Ala, Gly162Lys, Gly163Thr, Met165Leu, Arg166Ser, Cys181Ser, Asn188Gly, Ser190Glu, Gly214Pro, Ser215Ala, Ser216Gly, Gly217Ile, Leu218Gly, Gly220Pro, Ala221Gly, Trp222Ser를 포함하고 Leu223 후 절두된, 서열번호 2의 SNAP 돌연변이체이다. 서열번호 2의 SNAP 돌연변이체는 인간 6-메틸구아닌-DNA-메틸트랜스라제(NP_002403.2, 서열번호 1)의 아미노산 서열과 77% 상동성 및 마우스 6-메틸구아닌-DNA-메틸트랜스라제(NP_032624.1, 서열번호 18)의 아미노산 서열과 70% 상동성을 갖는다.
더욱더 바람직한 실시형태에서, AGT 효소는, O6-알킬구아닌-DNA 알킬트랜스퍼라제 활성을 갖는, 서열번호 2의 SNAP 돌연변이체 단백질 또는 이의 상동체이다. 바람직하게는, SNAP 돌연변이체 단백질에 대한 상기 상동성 서열은, 적어도, 서열번호 2의 SNAP 돌연변이체 단백질에 대해 80% 초과, 바람직하게는 81% 초과, 더욱 바람직하게는 82% 초과, 더욱 바람직하게는 83% 초과, 더욱 바람직하게는 84% 초과, 더욱 바람직하게는 85% 초과, 바람직하게는 86% 초과, 더욱 바람직하게는 87% 초과, 더욱 바람직하게는 88% 초과, 더욱 바람직하게는 89% 초과, 더욱 바람직하게는 90% 초과, 더욱 바람직하게는 91% 초과, 더욱 바람직하게는 92% 초과, 더욱 바람직하게는 93% 초과, 더욱 바람직하게는 94% 초과, 더욱 바람직하게는 95% 초과, 더욱 바람직하게는 96% 초과, 더욱더 바람직하게는 97% 초과로 동일하고, 상술된 바와 같은 O6-알킬구아닌-DNA 알킬트랜스퍼라제 활성을 갖는다.
O6-알킬구아닌-DNA 알킬트랜스퍼라제 활성을 갖는 상기 상동성 폴리펩타이드는 당업자에게 알려진 단백질 조작 기술 및/또는 새로운 O6-알킬구아닌-DNA 알킬트랜스퍼라제를 생성하고 선택하기 위한 분자적 발전을 이용하여 생성될 수있다. 이러한 기술은, 예를 들어, 서열 내에의 임의의 위치에 변이를 도입하기 위한 표적된 돌연변이유발, 파아지 디스플레이 방법, 포화 돌연변이유발, 에러 유발 PCR, 포화 돌연변이유발 및/또는 에러 유발 PCR 후 이용되는 DNA 셔플링, 또는 수개의 종으로부터의 유전자를 이용하는 패밀리 셔플링이다.
가장 바람직한 실시형태에서, 본 발명의 방법에서 사용되는 AGT 폴리펩타이드는 서열번호 2의 SNAP 돌연변이체이다.
AGT 기질
AGT 효소는 이의 기질인 O6-알킬구아닌-DNA로부터 알킬 그룹을 이의 시스테인 부분 중 하나에 비가역적으로 전달한다. 그러나, 벤질 환의 C4에서 O6-벤질구아닌의 치환은 O6-벤질구아닌 유도체에 대한 AGT의 반응성에 유의하게 영향을 끼치지 않는다. 이러한 특성은 벤질 환의 C4에 부착된 표지를 AGT에 전달하는데 이용되었다(참조: WO 2004/031404 및 WO 2005/085470).
벤질 그룹을 AGT 효소의 활성 부위 시스테인에 전달함으로써 AGT 효소와 반응하는 다수의 O6-벤질구아닌 유도체가 알려져 있다(참조: Damoiseaux et al., ChemBiochem., 2001, WO 2004/031404 및 WO 2005/085470).
바람직한 실시형태에서, 본 발명의 방법에 사용되는 AGT 기질은 하기 화학식 I의 O6 벤질 구아닌 유도체이다:
[화학식 I]
R1-X-CH2-R3-R4-Y
상기 식 중,
- R1은 AGT 폴리펩타이드에 의해 기질로서 인지되는 그룹, 예를 들어, 1 내지 5개의 질소 원자를 포함하는 헤테로방향족 그룹, 바람직하게는 하기 화학식의 푸린 라디칼이고:
Figure pct00001
(상기 식 중, R5는 수소, 할로겐, 예를 들어, 클로로 또는 브로모, 트리플루오로메틸 또는 하이드록시이고, R6는 수소, 하이드록시 또는 비치환 또는 치환된 아미노이고, R2는 수소, 1 내지 10개의 탄소 원자를 갖는 알킬 또는 사카라이드 부분이다),
- X는 산소 또는 황 원자, 바람직하게는 산소 원자이고,
- R3은 방향족 또는 헤테로방향족 그룹, 또는 CH2에 연결된 이중 결합을 갖는, 임의로 치환된 불포화된 알킬, 사이클로알킬 또는 헤테로사이클릴 그룹, 바람직하게는 페닐, 예를 들어, 파라 또는 메타 위치에서 R4에 의해 치환된 페닐이고,
- R4는 링커 부분이고,
- Y는 반응 그룹,바람직하게는 아미노 그룹이다.
바람직한 실시형태에서, 상기 링커 부분 R4는 가요성 링커(flexible linker)이다. 링커 단위는 가상적인 적용과 관련하여, 즉, AGT를 포함하는 융합 단백질에 기질을 전달하는데 선택된다. 링커는 AGT와의 반응을 방해하지 않으며, 표적 항체의 반응도 방해하지 않는다.
예를 들어, 이는
(a) 하나 이상의 탄소 원자가 산소에 의해 대체되고, 특히, 모든 세번째 탄소 원자가 산소, 예를 들어 1 내지 5개의 에틸렌옥시 단위를 갖는 폴리에틸렌옥시 그룹에 의해 대체되고;
(b) 하나 이상의 탄소 원자가 수소 원자를 수반하는 질소로 대체되고, 인접 탄소 원자가 옥소에 의해 대체되며(아미드 작용기 -NH-CO-로 대표됨);
(c) 하나 이상의 탄소 원자가 산소에 대체되고, 인접 탄소 원자가 옥소로 치환되며(에스테르 작용기 -O-CO-로 대표됨);
(d) 2개의 인접 탄소 원자 사이의 결합이 이중 또는 삼중 결합이고(작용기 -CH=CH- 또는 -C≡C-로 대표됨);
(e) 하나 이상의 탄소 원자가 페닐렌, 포화 또는 불포화된 사이클로알킬렌, 포화 또는 불포화된 비사이클로알킬렌, 가교된 헤테로방향족 또는 가교된 포화 또는 불포화 헤테로사이클릴 그룹으로 대체되고;
(f) 2개의 인접한 탄소 원자가 디설파이드 결합 -S-S-에 의해 대체되는, 1 내지 20개의 탄소 원자, 바람직하게는 5개 내지 15개의 탄소 원자를 갖는 직쇄 또는 측쇄 알킬렌 그룹이거나, 임으로 치환체를 포함하는, 상기 (a) 내지 (f)에서 정의되는 바와 같은, 적어도 2개, 특히, 2개 또는 3개의 알킬렌 및/또는 변형된 알킬렌 그룹의 조합일 수 있다.
고려되는 치환체는, 예를 들어, 알킬, 예를 들어, 메틸, 저급 알콕시, 예를 들어, 메톡시, 저급 아실옥시, 예를 들어, 아세톡시 또는 할로겐, 예를 들어, 클로로이다.
바람직한 실시형태에서, R4는 1 내지 8개의 에틸렌옥시 단위를 갖고, 인접 탄소 원자가 옥소로 치환되는 수소 원자를 수반하는 1 내지 4개의 질소 원자를 추가로 포함하는(아미드 작용기 -NH-CO-로 대표됨), 폴리에틸렌옥시 그룹이다.
더욱 바람직한 실시형태에서, R4는 -CH2-NH-CO-NH-[C2H4-O]n-이고, n은 1 내지 8, 바람직하게는 2 내지 6, 가장 바람직하게는 3이다.
바람직한 실시형태에서, 상기 반응성 그룹은 고체 지지체에 기질의 부착 및 결합을 용이하게 하는 작용 그룹이다. 이러한 작용 그룹은 당해 기술 분야에 널리 알려져 있다. 이들은 아민, 활성화된 에스테르, 아크릴아미드, 아실 아지드, 아실 할라이드, 아실 니트릴, 알데하이드, 케톤, 알킬 할라이드, 무수물, 아릴 할라이드, 아지리딘, 보로네이트, 활성화된 카복실산, 카보디이미드, 디아조알칸, 에폭사이드, 할로아세타미드, 할로플라티네이트, 할로트리아진, 이미도 에스테르, 이소시아네이트, 이소티오시아네이트, 말레이미드, 포스포르아미다이트, 솔릴 할라이드, 설포네이트 에스테르 및 설포닐 할라이드를 포함한다. 바람직하게는, 아민 그룹 -NH2이다.
반대측에서, 고체 지지체는 이러한 반응성 그룹에 상응하는 상보적 그룹으로 작용화되어야 한다. 이들 반응성 그룹 각각에 상응하는 상보적 그룹은 당해 기술 분야에 널리 알려져 있다. 이들은, 예를 들어, WO 2010/107433의 표 1에 나타나 있다.
바람직한 실시형태에서, 본 발명에 사용되는 AGT 기질은 하기 화합물이다:
Figure pct00002
또 다른 바람직한 실시형태에서, 본 발명의 방법에 사용되는 AGT 기질은 하기 화학식을 갖는 "SNAP-cell®505"로 표시되는 형광 링커이다:
Figure pct00003

이러한 벤질구아닌 유도체는 SNAP 도메인과의 특이적 상호작용을 위한 벤질 푸린 그룹(구아닌)뿐만 아니라 마이크로구 표현에의 공유적 커플링을 위한 하나의 유리 아민 그룹을 갖는다. 이는 New England BioLabs에 의해 시판되고 있으며, 본 발명의 마이크로입자의 표면에 성공적으로 커플링되었다.
본 발명의 기질은 일반적으로 당해 기술 분야에 공지된 표준 방법으로 제조된다. 특정한 방법은, 예를 들어, 특허원 WO 2005/085470에 기재되어 있다.
고체 지지체에 대한 AGT 기질의 커플링
본 발명은 고체 지지체에 공유적으로 커플링시킨 AGT 기질을 포함한다. 본 발명과 관련하여, AGT 기질은 상기 고체 지지체에 영구적으로 부착되는 경우 고체 지지체에 "공유적으로 커플링"되며, 시간이 경과에 따라 탁착되거나 이탈되지 않을 것이다. 본 발명에 따라, AGT 기질은 장기간 저장, 예를 들어, 통상적으로 6개월 이하의 저장 동안 부착되어 있는 상태로 남아 있는 경우 상기 고체 지지체에 영구적으로 부착된다. 지금까지 다수의 커플링 공정이 기술되어 왔다. AGT 기질이 고체 지지체에 영구적으로 부착되는 한, 이들 커플링 공정 중 임의의 공정을 본 발명의 면역분석에 사용할 수 있다.
고체 지지체에 대한 AGT-항원 융합 단백질의 커플링
본 발명은 추가로 하기 2개 단계를 포함하는 고체 지지체에 항원을 커플링시키는 방법을 포함한다: i) 고체 표면을 AGT 기질(예를 들어, BG-PEG-아미노)로 코팅 및 ii) 앵커로서 AGT를 사용하여 키메라 [AGT-항원] 융합 단배질의 고정화(참조: 도 1). 상기 AGT 기질로 코팅하기 전에, 고체 표면은 AGT 기질이 고체 표면에 공유적으로 부착되도록 바람직하게는 최적화된 2단계 카보디이미드 공정(Kufer SK, Eur. Biophys.J. 2005)을 사용하여 유리하게 작용화시킬 수 있다. 이들 단계가 수행되면, 고체 표면은 키메라 [AGT-항원] 융합 단백질에 비가역적으로 결합되는 AGT 기질을 포함한다. 이 반응의 높은 특이성 때문에, 융합 단백질은 AGT 효소의 시스테인-함유 도메인을 통해 배타적으로 커플링되고, 이에 의해 항원과의 상호작용을 위해 접근가능한 항원을 잔류시킨다.
이러한 커플링 공정은 고체 지지체 상에 지향적 방식으로 항원의 결합을 가능하게 하기 때문에 매우 유리하다. 또한, 이 항원 커플링 공정은, 면역글로불린 G 및 잠재적으로 면역글로불린 M의 포획 효율을 증가시키도록, 고체 표면 상에서 다량체성 항원 조직화를 유리하게 수득할 수 있게 한다. 결과적으로, 본원의 실시예 부분에서 개발된 항원 커플링된 마이크로구는, 표준 비지향적 아민 커플링 공정에 의해 생성된 항원-커플링된 마이크로구와 비교하여, 특이적 항체의 향상된 포획을 나타냈다(참조: 하기 실험 부분 및 도 3). 마지막으로, 이러한 항원 커플링 공정은 항원-접합된 마이크로구의 고도 커플링 효율 및 장기간 안정성(4℃에서 6개월 이상)을 수득할 수 있게 한다.
본 발명의 면역분석에서, 공유적 커플링은, 바람직하게는, (이는 상술된 바와 같은 반응성 그룹 Y를 포함한다.) AGT 기질을 WO 2010/107433(이의 기술이 본원에 참조로 포함됨)의 표 1에 기술되는 것들과 같은 상보적 그룹으로 미리 작용화된 고체 지지체와 접촉시킴으로써 수행된다.
따라서, 바람직한 실시형태에서, 본 발명의 방법은, AGT 기질과 접촉 전, AGT 기질의 반응성 그룹에 대해 상보적인 그룹으로 작용화된 고체 지지체를 사용한다.
AGT 기질을 고체 지지체의 표면에 공유적으로 커플링시키기 위한 바람직한 통상의 공정은 카보디이미드 반응에 기초하고, 수용성 카보디이미드를 사용한다. 이러한 공정에 따라, 고체 지지체는 반응성 아민- 또는 설프하이드릴-포함 AGT 기질의 부착에 이용가능한 표면 카복실 그룹을 갖는다. 따라서, 이러한 바람직한 실시형태에서, 본 발명의 방법은 AGT 기질과 접촉 전 표면 카복실 그룹으로 작용화된 고체 지지체를 사용한다.
이러한 경우, 본 발명의 방법의 제1 단계는 고체 지지체를 코팅하는 카복실 그룹을 활성화시키는 것이다. 이러한 활성화는 통상적으로 소위 "활성화 완충액", 예를 들어, 50 mg/mL EDAC 용액 또는 50 mg/mL S-NHS 용액을 가함으로써 수행된다. 이들 용액은 시판된다. 고체 지지체의 활성화는 통상적으로 제조자의 지시에 따라 수분(예: 5분 내지 30분) 동안 실온에서 상기 지지체를 활성화 완충액과 함께 인큐베이션함으로써 수행된다.
중요하게도, AGT 기질의 고체 지지체에의 공유적 커플링은 AGT 기질 용해도 및 비드의 통합성(내부 형광색소)이 보존되도록 특정 조건 하에 수행되어야 한다. 본 발명자들은 AGT 기질이 0 내지 20%의 디메틸설폭사이드(DMSO)를 포함하는 "공유적 커플링" 완충액에 현탁되어야 한다는 것을 관측하였다. 특히, 본 발명자들은 20%를 초과하는 DMSO 농도가 본 발명의 방법의 검출 단계에 영향을 끼칠 수 있다는 것을 관측하였다. 바람직하게는, 상기 완충액은 0 내지 20%의 DMSO, 더욱 바람직하게는 10% 내지 20%의 DMSO를 포함하는 PBS 완충액이다.
유리하게는, AGT 기질에 공유적으로 부착되지 않은 고체 지지체 상의 비특정 부위는 임의의 통상적인 수단, 예를 들어, 1%의 소혈청 알부민(BSA) 또는 임의의 포화 단백질(예: 카제인)을 포함하는 차단 완충액을 사용하여 추가로 차단될 수 있다.
일단 본 발명의 고체 지지체가 (바람직하게는 카보디이미드 공유 결합을 통해) AGT 기질과 공유적으로 커플링되면, 고체 지지체는 표적 항체에 의해 특이적으로 인지되는 에피토프를 상기 지지체에 커플링시키도록 본 발명의 융합 단백질과 접촉된다.
이러한 커플링 단계는 특정 조건 하에서 다시 수행되어야 한다. 실제로, AGT 효소의 촉매 부위 및 융합 단백질에 의해 수반되는 항원/에피토프의 입체형태적 구조는 커플링 공정 동안 보존되어야 한다. 본 발명자들은 융합 단백질이 커플링에 효과적이도록 디티오트레이톨(DTT)-포함 완충액, 바람직하게는 PBS/DTT 완충액 중에 현탁되어야 한다는 것을 확인하였다. 유리하게는, 상기 커플링 완충액은 tween 20을 포함한다. 실제로, 본 발명자들은 커플링 매질에 tween 20을 첨가하는 것이 비드 응집을 피하는 것을 돕는다는 것을 관측하였다. 바람직하게는, 커플링 완충액은 0,02% tween 20을 포함한다. 더욱 바람직하게는, 본 발명의 공유적 커플링 완충액은 0,02% tween 20 및 1 mM DTT를 포함하는 pH 7.4의 PBS 완충액이다.
다른 커플링 조건은 통상적인 것이다. 바람직하게는, AGT 기질의 공유적 커플링 및 융합 단백질의 고체 지지체에 대한 커플링은 실온에서 수행된다. 고체 지지체가 형광 표지되는 경우, 상기 공정은 더욱 바람직하게는 암흑 속에서 수행된다.
본 발명은 O6-알킬구아닌-DNA 알킬트랜스퍼라제 활성을 갖는 AGT 폴리펩타이드를 작용화된 고체 지지체 상에 공유적으로 커플링시키는 방법을 포함하고, 상기 방법은
a) 상기 작용화된 고체 지지체를 활성화시키는 단계,
b) 0 내지 20%의 DMSO를 포함하는 완충액 중에 현탁된, AGT 폴리펩타이드의 기질을 상기 기질이 상기 지지체에 공유적으로 부착되기에 적합한 조건에서 첨가하는 단계, 및
c) 상기 AGT 폴리펩타이드를 PBS/DTT 완충액 중의 단계 b)의 기질-코팅된 지지체와 접촉시키는 단계를 포함하고,
비결합된 분자는 단계 b) 및 c) 이후 세척 제거된다.
세척은 임의의 종류의 적합한 세척 완충액을 사용하여 수행될 수 있다. 이러한 완충액은 통상적으로 당업자에 의해 사용되며, 본원에서 추가로 상세히 기술할 필요가 없다. 바람직하게는, PBS 완충액이 사용된다.
본원에서 사용되는 "적합한 조건"은 통상의 것이다. 바람직하게는, AGT 기질의 공유적 커플링은 실온에서, 고체 지지체가 형광 표지되는 경우, 암흑 속에서 수행된다.
고체 지지체의 작용화는 (상술된 바와 같은) 임의의 통상의 수단에 의해 수행될 수 있다. 상기 작용화된 고체 지지체의 활성화도 상응하게 수행된다. 바람직한 실시형태에서, 상기 고체 지지체는 표면 카복실 그룹으로 작용화되고, 통상의 활성화 완충액, 예를 들어, 50 mg/mL EDAC 용액 또는 50 mg/mL S-NHS 용액으로 더욱 활성화된다.
바람직한 실시형태에서, DTT는 PBS/DTT 완충액 중 1 mM의 농도이다.
본 발명은 또한 상기 방법에 의해 수득되는 고체 지지체 및 본 발명의 면역분석에서의 고체 지지체의 용도에 관한 것이다.
이때, 상기 고체 지지체는, 예를 들어, 0.5 g/L 아지드화나트륨, 0.1% BSA, 0.02% tween 20 및/또는 1 mM DTT를 포함하는, 통상의 저장 완충액 중에 저장될 수 있다.
이들 모든 커플링 단계들은 바람직하게는 살아있는 세포가 없는 완충액 중에서 시험관내에서 수행되므로 내인성 AGT 효소와의 반응을 고려할 필요가 없으며, 따라서 (외인성) AGT 융합 단백질의 반응은 고도로 특이적이다.
고체 지지체
본 발명의 방법에 사용될 수 있는 고체 지지체는, 서로 특이적으로 식별될 수 있는 한, 임의의 종류의 것, 예를 들어, 시험관, 미세역가 웰 (microtiter well), 시트, 비드, 칩 및/또는 마이크로입자일 수 있다. 이러한 식별은, 예를 들어, 고체 지지체가 공간 상 떨어져 있거나 (예: 미세역가판 (microtiter plate)에서의 웰 또는 칩 상의 상이한 위치) 상이하게 표지되는 경우, 가능하다. 따라서, "고체 지지체"는 광의로, 즉, (플레이트 또는 바이오칩의 경우) 전체 고체 지지체의 구분된 작은 부분 또는 공통의 검출가능한 특성을 공유하는 다수의 동일한 마이크로입자(본원에서 마이크로입자 "서브세트"라 칭함)를 나타내는 것으로 이해되어야 한다.
바람직한 실시형태에서, 본 발명의 면역분석에 사용된 고체 지지체는, 고체 지지체에 의해 포함된 항원을 정확하게 결정할 수 있도록, 본질적으로 식별가능해야 한다. 이어서, 항원-커플링된 및 식별가능한 고체 지지체는 특이적 인간 면역글로불린을 위한 포착 시약으로서 사용되고, 따라서 환자의 생물학적 샘플과 접촉된다.
바람직한 실시형태에서, 본 발명에 사용되는 고체 지지체는 이들의 특정한 위치, 크기, 직경, 중량, 입도측정 및/또는 표지화에 의해 특이적으로 식별될 수 있다. 이러한 표지는, 예를 들어, 형광색소, 형광단, 발색단, 방사성동위원소, 질량 태그(mass tag) 또는 당해 기술 분야에 알려진 임의의 종류의 검출가능한 택이다.
본 발명에 사용되는 고체 지지체는 임의의 물질, 예를 들어, 폴리스티렌, 셀룰로즈, 니트로셀룰로즈, 유리, 세라믹, 수지, 고무, 플라스틱, 실리카, 실리콘, 금속 및/또는 중합체로 제조될 수 있다. 중합체성 물질은 브롬화된 폴리스티렌, 폴리아크릴산, 폴리아크릴로니트릴, 폴리아미드, 폴리아크릴아미드, 폴리아크롤레인, 폴리부타디엔, 폴리카프롤락톤, 폴리카보네이트, 폴리에스테르, 폴리에틸렌, 폴리에틸렌 테레프탈레이트, 폴리디메틸실록산, 폴리이소프렌, 폴리우레탄, 폴리비닐아세테이트, 폴리비닐클로라이드, 폴리비닐피리딘, 폴리비닐벤질클로라이드, 폴리비닐톨루엔, 폴리비닐리덴 클로라이드, 폴리디비닐벤젠, 폴리메틸메타크릴레이트, 폴리락타이드, 폴리글리콜라이드, 폴리(락타이드-코-글리콜라이드), 폴리안하이드라이드, 폴리오르토에스테르, 폴리포스파젠, 폴리포소파제, 폴리설폰, 또는 허용가능한 이의 조합을 포함한다. 이들 지지체 대부분은 시판된다. 예를 들어, 폴리스티렌, 폴리아크릴아미드, 폴리아크릴레이트 또는 라텍스와 같은 합성 중합체로부터의 비드는 Bio-Rad Laboratories(Richmond, Calif.) 및 LKB Produkter(Stockholm, Sweden)와 같은 다수의 공급원으로부터 시판된다. 아가로즈, 가교-결합된 아가로즈, 글로불린, 데옥시리보즈 핵산 및 리포좀과 같은 천연 고분자 및 입자로부터 형성된 비드가 Bio-Rad Laboratories, Pharmacia(Piscataway, NJ) 및 IBF(France)와 같은 공급원으로부터 시판된다. 폴리아크릴아미드 및 아가로즈의 공중합체로부터 형성되는 비드가 IBF 및 Pharmacia와 같은 공급원으로부터 시판된다.
중합체성 지지체가 사용되는 경우, 카복실 그룹을 포함하는 모노머를 중합체에 포함시킴으로써 카복실 그룹이 고체 지지체의 표면에 추가될 수 있다(예: 아크릴산, 메타크릴산, 이타콘산 등). 달리, 상술된 바와 같이, 카복실 그룹으로 전환될 수 있는 다른 전구체 반응성 그룹을 갖는 중합체에 대한 추가의 화학적 반응에 의해 (예를 들어, 말산 무수물과 같은 무수물의 가수분해에 의해, 또는 표면 메틸롤 또는 알데하이드 말단 그룹의 산화에 의해) 카복실 그룹이 상기 지지체에 추가될 수 있다.
바람직한 실시형태에서, 본 발명에 사용되는 고체 지지체는 마이크로입자이다. 상기 마이크로입자는 바람직하게는 1 mm 미만의 직경, 바람직하게는 약 0.1 내지 약 1,000 ㎛의 직경을 갖는다. 마이크로입자가 임의의 크기를 가질 수 있지만, 바람직한 크기는 1 내지 100 ㎛이고, 더욱 바람직하게는 2 내지 50 ㎛, 더욱 바람직하게는 3 내지 25 ㎛, 및 더욱더 바람직하게는 약 6 내지 12 ㎛ 이다. 마이크로입자는 임의의 규칙적인 모양을 갖는 물질로 제조된다. 바람직한 모양은 구형이다. 그러나, 임의의 다른 모양의 입자도 이러한 변수가 본 발명의 특성에 중요하지 않으므로 본 발명에 사용될 수 있다. 입자의 모양은, 예를 들어, 고분해 슬릿-스캐닝 방법으로, 유동 세포측정에 의해 식별되는 추가의 차별 변수로서 사용될 수 있다.
본원에서 용어 "마이크로입자", "마이크로구" 또는 "마이크로비드"는 이들이 본질적으로 마이크로미터 범위에 속하는 전체 직경을 갖는 작은 입자를 말하기 때문에 상호교환적으로 사용되고 동등한 의미를 갖는다. 용어 "나노구", "나노입자" 또는 "나노비드"는 본질적으로 나노미터 범위에 속하는 전체 크기를 갖는 작은 입자를 말한다. 본원에서 사용되는 일반 용어인 입자, 구 또는 비드는 본 발명의 방법에서 고체 지지체로서 효과적으로 사용될 수 있는 마이크로입자 및 나노입자 모두를 말한다.
본 발명과 관련하여, 마이크로입자의 일 "서브세트"는 동일한 특성을 갖고 동일한 에피토프로 코팅된 다수의 동일한 마이크로입자에 상응한다. 중요하게도, 마이크로입자 서브세트 각각은 하나 이상의 특성 (예: 위치, 크기, 직경, 중량, 입도측정 및/또는 표지화)에 의해 마이크로입자군의 다른 서브세트로부터 구별되어야 한다.
바람직한 실시형태에서, 상이한 마이크로입자 서브세트는 이들이 (예를 들어, 형광색소, 형광단, 발색단, 방사성동위원소, 질량 태그 또는 당해 기술 분야에 공지된 임의의 종류의 검출가능한 택으로) 상이하게 표지되기 때문에 구별될 수 있다.
더욱 바람직한 실시형태에서, 상이한 마이크로입자 서브세트는, US 5,736,330, US 5,981,180, US 6,057,107, US 6,268,222, US 6,449,562, US 6,514,295, US 6,524,793 및 US 6,528,165에서 제시되는 바와 같이, 이들이 상이하게 형광 표지되기 때문에 구별될 수 있다. 더욱 정확히, 이들 상이한 서브세트는 상이한 형광 염료 및/또는 상이한 농도의 하나 이상의 형광 염료로 염색될 수 있다. 따라서, 상이한 서브세트는 각각의 마이크로입자가 속하는 서브세트를 결정하기 위해 (즉, 서브세트에 따라 마이크로입자를 분류하기 위해) 측정되고 측정 시스템으로서 사용될 수 있는 상이한 형광 특징(예: 상이한 형광 파장(들), 상이한 형광 강도 등)을 가질 수 있다.
바람직한 실시형태에서, 본 발명에 사용되는 마이크로입자는, 본원에서 참조로서 도입되는 EP 1 204 869에 기재되는 바와 같이, 형광 염료로 내부적으로 표지된다.
이들 마이크로입자는 또한 자석 또는 초상자성, 상자성 및 강자성 금속 산화물로 이루어진 그룹 중에서 선택되는 자기적으로 반응하는 금속 산화물을 포함할 수 있다. 자성 비드는, 예를 들어, Dynal Inc.(Great Neck, NY)와 같은 공급원으로부터 시판되거나, 예를 들어, U.S. 4,358,388; US 4,654,267; US 4,774,265; US 5,320,944; 및 US 5,356,713에 기술되는 바와 같은 당해 기술 분야의 공지된 방법으로 제조될 수 있다. 바람직한 실시형태에서, 본 발명에 사용되는 고체 지지체는 자성을 띤다.
더욱 바람직한 실시형태에서, 본 발명에 사용되는 고체 지지체는, 상표명 MagPlex으로 Luminex Corp에 의해 시판되는 것과 같이, 리간드의 공유적 커플링을 위해 표면 카복실 그룹을 포함하는 작용성 중합체 외부 코트에 캡슐화된(encapsulated) 자철광(magnetite)을 갖는 형광 염료로 내부적으로 표지된 마이크로입자이다.
또한, 스펙트럼으로 구분되는 영역으로 칼라 코드화된 카복실화된 폴리스티렌 마이크로입자인 MicroPlex 마이크로구(Luminex 시판)를 사용할 수도 있다. 이들 영역은 하나의 단일 샘플 용적으로부터 동시에 100개 이하의 상이한 분석물에 대한 조사를 가능하게 하는 xMAP 기구에 의해 신속하게 구별될 수 있다.
또한, 혈청 분석시 비-특이적 결합이 감소되도록 최적화된 MicroPlex 마이크로구의 특정 제형인 SeroMAP 마이크로구(Luminex 시판)를 사용할 수도 있다.
결합된 항체의 검출
본 발명은 에피토프 및 따라서 검출가능한 고체 지지체에 결합된 항체의 존재를 검출하는 것을 포함한다. 마이크로입자의 어떤 서브세트에 항체가 결합되었는가를 분석함으로써, 어떤 항체가 생물학적 샘플에 존재하고 이로써 시험된 피험자가 어떤 병원체에 의해 감염되었는가를 쉽게 추론할 수 있다.
임의의 공지된 기술을 이용하여 고체 지지체에 결합된 항체의 존재를 검출할 수 있다. 예를 들어, 하기 실시예에 기재되는 바와 같이, 피험자 면역글로불린의 불변부를 특이적으로 인지하는 표지된 제2 항체가 사용될 수 있다. 항체에 커플링된 고체 지지체와 커플링되지 않은 고체 지지체를 구분하도록 검출-항체의 표지화는 고체 지지체의 표지화과 달라야 한다는 것을 주목하는 것이 중요하다.
달리, 감염된 동물 또는 인간으로부터의 혈청에 존재하는 면역글로불린은 1-단계 항체 표지화 프로토콜을 이용하여 (Lightning-LinkTM R-피코에리트린 접합 키트 - Innova Biosciences) R-피코에리트린 (R-PE)에 직접적으로 접합될 수 있다. 전체 공정을 위한 실제 시간은 통상적으로 20 내지 30초이고, 100%의 회수율로 소량의 면역글로불린 표지화를 가능하게 한다. 이러한 공정은 다중-면역분석 실험에서 접합된 항-종 항체 및 스트렙트아비딘-R-피코에리트린과 같은 제2 시약을 필요로 하지 않는다.
형광 염료로 내부적으로 표지된 마이크로입자가 사용되는 경우, 형광 검출 기구에는 마이크로구의 유형을 검출하기 위한 제1 레이저 및 특정 검출 항체에 접합된 형광단을 여기시킴으로써 포획된 IgM 또는 IgG 의 정량화를 가능하게 하는 제2 레이저가 구비되어야 한다.
이러한 접근은, 이의 광범위한 다중화 능력 및 낮은 검출 한계로 인해, 종래의 ELISA 측정에 비해 실질적인 비용 및 샘플 절약을 제공한다. 또한, 선택된 마이크로구 세트는 MagPix(Luminex Corporation)와 같은 저렴하고 소형이며 강력한 형광 검출 시스템에 적용가능하다.
이러한 실시형태에서, 본 발명의 방법은 유동 분석 수단을 사용함으로써 웰 당 100개 유형 이하의 커플링된 마이크로구를 동시에 분석할 수 있으며, 현재 사용되는 시스템 및 방법의 민감도 보다 약 수 개의 자릿수가 클 것으로 예상되는 대단히 증강된 민감도를 제공한다.
흥미롭게도, 본 발명의 방법은 인간 또는 동물 개체에서 다수의 감염을 진단하도록 대용량처리 혈청 스크리닝을 수행하는 것을 가능하게 한다.
다중 면역분석 키트
본 발명은 다중 항원에 대한 항체의 검출에 사용하기에 적합한 키트를 포함한다. 본원에 기재된 항원 또는 에피토프 중의 어느 하나를 키트에 도입할 수 있다.
본 발명은 바이러스, 세균, 기생충, 동물, 프리온, 효모 및 진균 단백질을 검출하기 위한 키트를 포함한다.
상기 키트는 적어도 2개의 고체 지지체를 포함한다. 본 바명은 적어도 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 20, 25, 30, 40, 50, 100개 등의 고체 지지체를 포함하는 키트, 및 적어도 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 20, 25, 30, 40, 50, 100개 등의 상이한 에피토프를 포함하는 키트를 포함한다. 키트는 함께 혼합된 적어도 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 20, 25, 30, 40, 50, 100개 등의 고체 지지체를 포함한다. 에피토프는 표적 항체에 의해 인지될 수 있다.
한 가지 실시형태에서, 키트는 본 발명의 방법의 단계(c)에서 수득된 제1 고체 지지체(여기서, 상기 지지체는 AGT 기질에 공유적으로 커플링된 제1 AGT-항원 융합 단백질을 포함한다.) 및 AGT 기질에 공유적으로 커플링된 제2 AGT-항원 융합 단백질을 포함하는 제2 고체 지지체를 포함한다.
한 가지 실시형태에서, 키트는
AGT 기질에 공유적으로 커플링된 제1 AGT-항원 융합 단백질을 포함하는 제1 고체 지지체,
AGT 기질에 공유적으로 커플링된 제2 AGT-항원 융합 단백질을 포함하는 제2 고체 지지체,
AGT 기질에 공유적으로 커플링된 제3 AGT-항원 융합 단백질을 포함하는 제3 고체 지지체,
AGT 기질에 공유적으로 커플링된 제4 AGT-항원 융합 단백질을 포함하는 제4 고체 지지체,
AGT 기질에 공유적으로 커플링된 제5 AGT-항원 융합 단백질을 포함하는 제5 고체 지지체,
AGT 기질에 공유적으로 커플링된 제6 AGT-항원 융합 단백질을 포함하는 제6 고체 지지체,
AGT 기질에 공유적으로 커플링된 제7 AGT-항원 융합 단백질을 포함하는 제7 고체 지지체,
AGT 기질에 공유적으로 커플링된 제8 AGT-항원 융합 단백질을 포함하는 제8 고체 지지체,
AGT 기질에 공유적으로 커플링된 제9 AGT-항원 융합 단백질을 포함하는 제9 고체 지지체 및
AGT 기질에 공유적으로 커플링된 제10 AGT-항원 융합 단백질을 포함하는 제10 고체 지지체를 포함한다.
다른 실시형태에서, 키트는 AGT 기질에 공유적으로 커플링된 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 20, 25, 30, 40, 50 또는 100개 AGT-항원 융합 단백질을 포함하는 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 20, 25, 30, 40, 50 또는 100개 고체 지지체를 포함할 수 있다.
- 한 가지 실시형태에서, 키트는 제1 표적 항체에 의해 인지되는 제1 에피토프와 공유적으로 커플링되는 제1 고체 지지체,
제2 표적 항체에 의해서는 인지되나 상기 제1 표적 항체에 의해서는 인지되지 않는 제2 에피토프와 공유적으로 커플링되는 제2 고체 지지체를 포함하고,
상기 적어도 2개의 고체 지지체는 서로로부터 특이적으로 식별될 수 있으며 2개의 상이한 표적 항체의 검출을 가능하게 한다.
바람직한 실시형태에서, 본 발명은 생물학적 샘플 중의 적어도 2개의 표적 항체의 검출을 위한 키트를 포함하고, 상기 키트는
(a) O6-알킬구아닌-DNA 알킬트랜스퍼라제 활성을 갖는 AGT 폴리펩타이드 및 제1 표적 항체에 의해서는 인지되는 제1 에피토프를 포함하는 제1 융합 단백질에 공유적으로 커플링되는 AGT 기질을 포함하는 제1 고체 지지체, 및
b) O6-알킬구아닌-DNA 알킬트랜스퍼라제 활성을 갖는 AGT 폴리펩타이드 및 제2 표적 항체에 의해서는 인지되나 상기 제1 표적 항체에 의해서는 인지되지 않는 제2 에피토프를 포함하는 제2 융합 단백질에 공유적으로 커플링되는 AGT 기질을 포함하는 제2 고체 지지체를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 키트는 적어도 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 20, 25, 30, 40, 50, 100개 등의 상이한 바이러스 에피토프를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 키트는 적어도 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 20, 25, 30, 40, 50, 100개 등의 상이한 베균 에피토프를 포함한다.
키트는 바이러스, 세균 및/또는 기생충에 특이적일 수 있다.
키트는 바이러스 또는 세균 부류에 특이적일 수 있거나, 유사하게 관련된 임상 증상(즉, 소아기 질환, 호흡 또는 출혈성 증후군 등)에 기초할 수 있다.
키트는 면역글루불린에 특이적일 수 있고, 여기서 키트는 IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA, IgM, IgE 및 IgG 합계로부터 선택된 적어도 2, 3, 4 또는 5개 면역글로불린에 대한 항체를 검출한다.
키트는 바이오테러(bioterrorism) 병원체에 특이적일 수 있고, 여기서 키트는 프란시셀라 툴라렌시스(Francisella tularensis), 바실루스 안트라시스(Bacillus anthracis), 클로스트리디움 보툴리눔(Clostridium botulinum), 예르시니아 페스티스(Yersinia pestis), 천연두(Smallpox), 마르부르그 바이러스, 에볼라 바이러스, 라사 바이러스 및 마추포 바이러스 단백질로부터 선택된 적어도 2, 3, 4 또는 5개 단백질을 검출한다.
키트는 플루 바이러스에 특이적일 수 있고, 여기서 키트는 적어도 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 또는 16개의 상이한 인플루엔자 또는 SARS 단백질에 대한 항체를 검출한다.
키트는 폭스바이러스에 특이적일 수 있고, 여기서 키트는 적어도 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 또는 16개의 상이한 폭스바이러스에 대한 항체를 검출한다. 폭스바이러스는 오르소폭스(천연두 바이러스/바리올라, 백시니아 바이러스(http://en.wikipedia.org/wiki/Vaccinia), 우두 바이러스(http://en.wikipedia.org/wiki/Cowpox), 또는 원숭이 천연두 바이러스 http://en.wikipedia.org/wiki/Monkeypox), 파라폭스(orf 바이러스, 가성 우두, 소 구진성 내구염 바이러스), 야타폭스(타나폭스 바이러스(http://en.wikipedia.org/wiki/Tanapox), 야바 원숭이 종양 바이러스(http://en.wikipedia.org/wiki/Yaba_monkey_tumor_virus)) 또는 몰루시폭스(http://en.wikipedia.org/wiki/Molluscum_contagiosum)일 수 있다.
본 발명은 암 및 종양 항원, 신장 독성 마커, 사이토킨, 케모킨, 성장 인자, 자가면역 질환과 관여하는 항원 및 면역글로불린을 포함하는 인간 단백질에 대한 항체를 검출하기 위한 키트를 포함한다.
본 발명은 알레르기 항원에 대한 항체를 검출하기 위한 키트를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 적어도 하나의 에피토프는 바이러스 에피토프이다. 바람직한 실시형태에서, 상기 제1 및/또는 제2 에피토프는 하기로 이루어진 그룹 중에서 선택되는 바이러스 단백질 상에 존재한다: 서열번호 3의 뎅기 바이러스 1의 EDIII 단백질, 서열번호 4의 뎅기 바이러스 2의 EDIII 단백질, 서열번호 5의 뎅기 바이러스 3의 EDIII 단백질, 서열번호 6의 뎅기 바이러스 4의 EDIII 단백질, 서열번호 7의 웨스트 나일 바이러스의 EDIII 단백질, 서열번호 8의 황열 바이러스의 EDIII 단백질, 서열번호 9의 일본 뇌염 바이러스의 EDIII 단백질, 서열번호 10의 지카 바이러스의 EDIII 단백질, 서열번호 11의 베셀스브론 바이러스의 EDIII 단백질, 서열번호 12의 로시오 바이러스의 EDIII 단백질, 서열번호 13의 머레이 뇌염 바이러스의 EDIII 단백질, 서열번호 14의 세인트-루이스 뇌염 바이러스의 EDIII 단백질, 서열번호 54에 의해 인코딩되는 유전형 1의 일본 뇌염 바이러스의 EDIII 단백질, 서열번호 55에 의해 인코딩되는 유전형 2의 일본 뇌염 바이러스의 EDIII 단백질, 서열번호 56에 의해 인코딩되는 유전형 4의 일본 뇌염 바이러스의 EDIII 단백질, 서열번호 57에 의해 인코딩되는 유전형 5의 일본 뇌염 바이러스의 EDIII 단백질, 서열번호 58에 의해 인코딩되는 라벤스버그 바이러스의 EDIII 단백질, 및 HIV1, HIV2, B형 간염 바이러스, C형 간염 바이러스, E형 간염 바이러스, 웨스트-나일 바이러스 및 HPV 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59, 66 및 68와 같은 종양 HPV 스트레인의 바이러스 단백질.
바람직하게는, 이러한 키트는 또한 고체 지지체에 결합된 적어도 2개의 표적 항체를 검출하기 위한 수단을 포함한다. 상기 수단은 더욱 바람직하게는 표적 항체의 불변부를 인지하는 제2 항체이다. 상기 제2 항체는 표지될 수 있으며, 단 표지가 고체 지지체 상에 존재하는 것과 동일하지 않아야 한다. 그러나, 감염성 병원체(들)에 관한 정보가 항체에 결합된 고체 지지체의 확인에 의해서만 제공되기 때문에, 고체 지지체(들)에 결합된 항체를 검출하는데 사용되는 모든 제2 항체에 대해 동일한 표지를 이용할 수 있다.
본 발명의 키트는 세척 완충액, 필수 플라스틱웨어 등과 같이 표준 시약으로 인정되는 기타 성분들을 포함할 수 있다.
바람직한 실시형태에서, 본 발명의 키트는, 예를 들어, 상술된 바와 같은 마이크로입자의 서브세트인, 적어도 10개, 바람직하게는 적어도 50개, 더욱 바람직하게는 적어도 100개의 상이하게 커플링된 고체 지지체를 포함한다.
더욱 바람직한 실시형태에서, 상기 고체 지지체는 마이크로구, 예를 들어, 표면 카복실 그룹을 포함하는 작용성 중합체 외부 코트에 캡슐화된 자철광을 갖는 형광 염료로 내부적으로 표지된 마이크로구이다.
또 다른 바람직한 실시형태에서, 본 발명의 키트 중의 상기 고체 지지체는 하나 이상의 단일 구획(single compartment)에서 함께 혼합된다.
유리하게는, 본 발명의 키트는 통상의 지지체(들), 예를 들어, 상술된 바와 같은 상이한 항원-코팅된 마이크로입자 서브세트를 포함하는 미세역가판을 포함한다. 바람직한 실시형태에서, 상기 마이크로입자 서브세트는 하나 이상의 구획(예: 웰 또는 튜브)에서 함께 혼합된다. 이러한 디바이스가 도 11에 도시되어 있다.
본 발명의 키트는 또한 상기한 항원-코팅된 마이크로입자 서브세트를 포함하는 수용체(예: 튜브)를 포함할 수 있다.
본 발명은 또한 피험자의 생물학적 샘플로부터의 적어도 2개, 바람직하게는 적어도 10개, 더욱 바람직하게는 적어도 50개, 더욱더 바람직하게는 적어도 100개의 표적 항체를 검출하기 위한 본 발명의 키트의 용도에 관한 것이다.
바람직한 실시형태에서, 본 발명의 키트는 동일한 지역의 풍토병적 바이러스 또는 기생충에 의한 감염시 생성되는 적어도 2개, 바람직하게는 적어도 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 20, 25, 30, 40, 50 또는 100개의 표적 항체를 검출하는데 사용된다. 예를 들어, 본 발명의 키트는 아프리카 지역에서 특이적인 바이러스 또는 기생충의 항원, 예를 들어, 뎅기 바이러스 1형, 2형, 3형, 4형, 황열 바이러스, 웨스트-나일 바이러스, 우수투 바이러스, 지카 바이러스, 베셀스보론 바이러스, 샤몬다 바이러스, 리프트 계곡 열 바이러스, 치쿤구니아 바이러스, 크리미아-콩고 출혈 열 바이러스, 에볼라 바이러스, 마르부르그 바이러스, 리사 바이러스, C형 간염 바이러스, E형 간염 바이러스, 엔테로바이러스 71, 플라스모듐 팔시파룸 또는 렙토스피라 인테로간스(Leptospira interrogans)로 코팅된 마이크로입자를 포함할 수있다.
도 25는 의도되는 지역(아시아, 유럽, 아메리카, 오세아니아 또는 아프리카)에 따라 본 발명의 키트에 포함될 수 있는 항원-커플링된 마이크로구 조합에 대한 예를 기술한다.
달리, 본 발명의 키트는 특정 증상(플루-유사, 뇌염 또는 출혈 열)을 유발하거나 특정 동물을 감염시키는 바이러스 또는 기생충의 진단을 가능하게 하는 항원-커플링된 마이크로구를 포함하므로, 각각의 환자/동물에 따라 조정될 수 있다.
도 25는 환자 또는 동물의 증상에 따라 본 발명의 키트에 포함될 수 있는 항원-커플링된 마이크로구 조합의 예를 기술한다.
국립 보거 기관에 의해 제시되는 항원 조합을 포함하는 키트도 또한 분명히 본 발명에 포함된다.
특히, 본 발명의 키트는 하기로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 적어도 2개의 융합 단백질로 코팅된 적어도 2개의 고체 지지체를 포함한다: 서열번호 21, 서열번호 42, 서열번호 49, 서열번호 51, 서열번호 53, 서열번호 60, 서열번호 62, 서열번호 64, 서열번호 66, 서열번호 68, 서열번호 70, 서열번호 72, 서열번호 74, 서열번호 76, 서열번호 78, 서열번호 80, 서열번호 82, 서열번호 84, 서열번호 86, 서열번호 88, 서열번호 90, 서열번호 92, 서열번호 94, 서열번호 96, 서열번호 98, 서열번호 100, 서열번호 102, 서열번호 104, 서열번호 109, 서열번호 111, 서열번호 113, 서열번호 115, 서열번호 117, 서열번호 119, 서열번호 121, 서열번호 123, 서열번호 125, 서열번호 127, 서열번호 129, 서열번호 131, 서열번호 133, 서열번호 135, 서열번호 137, 서열번호 139, 서열번호 141, 서열번호 143, 서열번호 145, 서열번호 147, 서열번호 149 및 서열번호 151.
바람직한 실시형태에서, 본 발명의 키트는 상기 융합 단백질로 코팅된 적어도 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 20, 25, 30, 40, 50 또는 100개의 고체 지지체의 조합을 포함한다.
더욱 바람직한 실시형태에서, 본 발명의 키트는 식품의약청에 의해 권장되는 바와 같은 항원, 즉, HBV, HCV, HIV1, HIV2 및 웨스트 나일 바이러스로부터의 항원을 포함하는 적어도 5개의 상이한 융합 단백질로 코팅된 적어도 5개의 고체 지지체의 조합(예: 마이크로구 서브세트)을 포함한다.
한 가지 실시형태에서, 본 발명은 키트를 제조하는 방법을 포함하고, 상기 방법은
(a) 제1 표적 항체에 의해 인지되는 제1 AGT-항원 융합 단백질을 제공하는 단계,
(b) 상기 제1 AGT-항원 융합 단백질을 상기 AGT-항원 융합 단백질의 기질과 공유적으로 커플링된 제1 고체 지지체와 접촉시키는 단계,
(c) 제1 AGT-항원 융합 단백질과 공유적으로 커플링된 제1 상기 지지체를 수득하는 단계,
(d) 제2 표적 항체에 의해 인지되나 상기 제1 표적 항체에 의해 인지되지 않는 제2 AGT-항원 융합 단백질을 제공하는 단계,
(e) 상기 제2 AGT-항원 융합 단백질을 상기 AGT-항원 융합 단백질과 공유적으로 커플링된 제2 고체 지지체와 접촉시키는 단계, 및
(f) 제2 AGT-항원 융합 단백질과 공유적으로 커플링된 제2 고체 지지체를 수득하는 단계를 포함하고,
상기 제1 및 제2 고체 지지체는 서로로부터 특이적으로 식별할 수 있다.
한 가지 실시형태에서, AGT-항원 융합 단백질과 공유적으로 커플링된 고체 지지체는 함께 혼합되어 있다.
상기 단계 (a) 내지 (c)는, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 20, 25, 30, 40, 50 또는 100개의 상이한 AGT-항원 융합 단백질과 공유적으로 커플링된 적어도 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 20, 25, 30, 40, 50 또는 100개의 고체 지지체를 생성하기 위해, 적어도 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 20, 25, 30, 40, 50 또는 100개의 상이한 AGT-항원 융합 단백질로 반복할 수 있다.
또 다른 양상에서, 본 발명은, 적어도 제1 및 제2 고체 지지체를 포함하는 상기 정의되는 바와 같은 본 발명의 키트를 제조하는 방법에 관한 것으로서, 상기 방법은
(a) 하기를 포함하는 하나 이상의 제1 융합 단백질을 제공하는 단계:
- 제1 표적 항체에 의해 인지되는 제1 에피토프를 포함하는 폴리펩타이드 및
- O6-알킬구아닌-DNA 알킬트랜스퍼라제 활성을 갖는 AGT 폴리펩타이드,
(b) 상기 제1 융합 단백질을 상기 AGT 폴리펩타이드의 기질과 공유적으로 커플링된 제1 고체 지지체와 접촉시키는 단계,
(c) 제1 표적 항체에 의해 인지되는 제1 에피토프와 공유적으로 커플링된 제1 고체 지지체를 수득하는 단계,
(d) 하기를 포함하는 하나 이상의 제2 융합 단백질을 제공하는 단계:
- 제2 표적 항체에 의해서는 인지되나 상기 제1 표적 항체에 의해서는 인지되지 않는 제2 에피토프를 포함하는 폴리펩타이드 및
- O6-알킬구아닌-DNA 알킬트랜스퍼라제 활성을 갖는 AGT 폴리펩타이드,
(e) 상기 제2 융합 단백질을 상기 AGT 폴리펩타이드 기질과 공유적으로 커플링된 제2 고체 지지체와 접촉시키는 단계, 및
(f) 제2 표적 항체에 의해서는 인지되나 상기 제1 표적 항체에 의해서는 인지되지 않는 제2 에피토프와 공유적으로 커플링된 제2 고체 지지체를 수득하는 단계를 포함하고,
상기 적어도 제1 및 제2 고체 지지체는 서로 특이적으로 식별될 수 있으며,본 발명의 상기 키트는 적어도 상기 제1 및 제2 고체 지지체를 포함한다.
또 다른 양상에서, 본 발명은, 각각의 고체 지지체가 여기 후 상이하고 식별가능한 파장을 방출하는, 상기 정의된 바와 같은, 적어도 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 35, 40, 45, 50, 60, 70, 80, 90 또는 96개의 고체 지지체를 포함하는, 다중 면역 스크리닝 분석에 관한 것이다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 다중 면역 스크리닝 분석 방법에 관한 것으로서, 상기 방법은
a) 하나 또는 수개의 생물학적 샘플(들)을, 각각의 고체 지지체가 여기 후 상이하고 식별가능한 파장을 방출하는, 상기 정의된 바와 같은, 적어도 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 35, 40, 45, 50, 60, 70, 80, 90 또는 96개의 고체 지지체와 접촉시키는 단계, 및
b) 표적 항체의 존재 또는 부재를 검출하는 단계를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 상기 표적 항체는 WHO 또는 FDA 지침에 따라 혈액 뱅크에서 검출되는 바이러스, 예를 들어, HBV, HCV, HIV1, HIV2 및 WNV 중에서 선택되는 바이러스로부터의 항원에 특이적이다.
또 다른 바람직한 실시형태에서, 상기 표적 항체는 HPV 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59, 66 및 68과 같은 종양 HPV 스트레인에 대해 특이적이다.
또 다른 바람직한 실시형태에서, 상기 표적 항체 각각은 검출 표지로 표지된다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 상기 정의된 바와 같은 본 발명의 키트를 제작하는 방법을 수행하기 위한 장치에 관한 것으로서, 상기 장치는 고체 지지체로부터 방출되는 광원 및 표적 항체 또는 표적 항체에 결합된 표지된 항체로부터 방출되는 광원을 검출하기 위한 전문적 디바이스 및 고체 지지체와 표적 항체와의 결합을 확인하여 분석 샘플 중 항원, 세균, 바이러스 또는 기생충의 존재 또는 부재를 나타내기 위한 계산 또는 컴퓨터 디바이스를 포함한다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 피험자에서 하나 이상의 표적 항체의 합성을 유도하는 것으로 알려진 하나 이상의 표적 질환을 진단하기 위한 시험관내 진단 방법에 관한 것으로서, 상기 방법은 본 발명의 면역분석 방법을 수행하는 것을 포함하며, 하나 이상의 표적 항체의 양이 대조값 보다 높은 경우 상기 피험자가 하나 이상의 표적 질환을 앓는 것으로 진단된다.
이러한 진단 방법은 바람직하게는 진단이 필요한 피험자에서 2개, 바람직하게는 3개, 더욱 바람직하게는 4개의 표적 질환의 진단을 가능하게 한다. 그러나, 이러한 수는 제한적인 것이 아니어서, 본 발명의 검출 방법으로 100개의 상이한 항체를 검출할 수 있는 한 실제로 100개 이하의 표적 질환을 진단할 수 있다.
바람직한 실시형태에서, 상기한 하나 이상의 표적 질환은 바이러스, 세균, 효모 또는 진균-매개된 감염, 바람직하게는 파필로마바이러스 또는 플라비비리대(뎅기 바이러스, 황열 바이러스, 웨스트 나일 바이러스, 일본 뇌염 바이러스, 진드기-매개 뇌염, 바이러스, C형 간염 바이러스), 토가비리대(치쿤구니아 바이러스, 로스 강 바이러스, 마야로 바이러스, 서부 말 뇌염 바이러스, 동부 말 뇌염 바이러스, 베네주엘라 말 뇌염 바이러스), 부냐비리대(크리미아-콩고 출혈 열 바이러스, 리프트 계곡 열 바이러스, 쉬말렌베르그 바이러스), 칼리시비리대(E형 간염 바이러스), 아레나비리대(라사 바이러스) 및 필로비리대(에볼라 바이러스, 마르부르그 바이러스)의 과로부터의 RNA 바이러스에 의해 유발되는 바이러스 감염, 렙토스피로사 인테로간스에 의해 유발되는 세균 감염, 또는 플라스모듐 팔시파룸에 의해 유발되는 감염이다.
바람직한 실시형태에서, 상기 시험관내 방법은 상기 피험자에서 적어도 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13 또는 15개, 더욱 바람직하게는 적어도 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 30, 35, 40 또는 45개, 더욱 바람직하게는 적어도 50, 60, 70, 80 또는 90개, 및 더욱더 바람직하게는 적어도 100개의 바이러스 및/또는 세균 및/또는 기생충 감염을 진단하는데 사용된다.
바람직한 실시형태에서, 상기 방법에 사용되는 대조값은 표적 질환을 앓지 않는 피험자, 바람직하게는 건강한 피험자로부터의 샘플에서의 상기 표적 항체의 양을 나타낸다.
본 발명의 방법은 동물에서 감염을 진단하는데 사용될 수 있다.
특히, 이들은 동물 질환을 진단하는데 사용될 수 있으며, 또한 천연적으로 감염된 동물을 백신접종된 동물과 구별하기 위한 DIVA(Differentiating Infected from Vaccinated Animals: 백신접종된 동물로부터 감염된 동물의 구별) 접근에 이용될 수 있다. 새로운 백신을 보완하는 DIVA 전략은 통상의 전략(시험, 도살 조사 및 식육 검사)과 나란히 표적화된 제어 전략으로서 백신접종의 이행을 가능하게 한다. 또한, 증가된 시험 민감도는 불필요하게 도살될 수 있는 그룻-양성 동물의 수를 감소시킴으로써 주요한 경제적 이득을 가질 것이다. 마지막으로, 개선된 민감도는, 특히 새로운 진단 분석이 이용되는 경우, 심지어 백신접종의 부재하에서도 질병 구제에 대한 경제적 부담감을 감소시키는데 추가의 이점을 가질 것이다.
바람직한 실시형태에서, 본 발명의 방법은 인간 개체에 적용된다.
본 발명은 피험자에서 적어도 2개의 표적 질환을 진단하기 위한 본 발명의 키트의 용도에 관한 것으로서, 상기 표적 질환은 파필로마바이러스 또는 플라비비리대(뎅기 바이러스, 황열 바이러스, 웨스트 나일 바이러스, 일본 뇌염 바이러스, 진드기-매개 뇌염 바이러스, C형 간염 바이러스), 토가비리대(치쿤구니아 바이러스, 로스 강 바이러스, 마야로 바이러스, 서부 말 뇌염 바이러스, 동부 말 뇌염 바이러스, 베네주엘라 말 뇌염 바이러스), 부냐비리대(크리미아-콩고 출혈 열 바이러스, 리프트 계곡 열 바이러스, 쉬말렌베르그 바이러스), 칼리시비리대(E형 간염 바이러스), 아레나비리대(라사 바이러스) 및 필로비리대(에볼라 바이러스, 마르부르그 바이러스)의 과로부터의 RNA 바이러스에 의해 유발되는 바이러스 감염, 렙토스피로사 인테로간스에 의해 유발되는 세균 감염, 또는 플라스모듐 팔시파룸에 의해 유발되는 감염이다.
새로이 부각되고 있는 아르보바이러스가 최근에 서열분석되었으며, 독일, 베네룩스 및 프랑스에서 소에 영향을 끼친다. 이러한 바이러스는 쉬말렌베르그 바이러스(SBV)라 불리며, 부냐비리대 과의 오쏘부냐 바이러스 속의 심부(Simbu) 혈청그룹에 속하는 아카반 바이러스에 관련된다. 쉬말렌베르그 바이러스의 바이러스 게놈은 S, L 및 M으로 알려진 3개의 단일-가닥 RNA 절편을 포함한다. S 절편은 N 핵단백질 및 NS 비-구조 단백질을 인코딩한다. N 핵단백질은 상이한 부냐바이러스와 항원 결정자를 공유한다. 쉬말렌베르그 바이러스의 BH80/11-4 스트레인의 3개의 RNA 바이러스 서열이 번호 HE649913.1, HE649914.1 및 HE649912.1로 입수가능하다.
AGT 융합 단백질의 생산을 증가시키기 위한 AGT의 사용
본 발명자들은 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT)와 SBV N 단백질과의 키메라 단백질로서의 융합이, 특히 S2 세포와 같은 무척추동물 세포에서 재조합 N 단백질의 생성을 크게 개선한다는 것을 관측하였다.
본 발명자들은 처음으로 숙주 세포, 특히 비-척추동물 세포에서 SBV로부터의 N 핵단백질의 생성을 증강시키기 위한 AGT 효소(EC 2.1.1.63) 또는 이의 돌연변이체, 이의 촉매 도메인 또는 이의 아단편의 이용을 제안한다. 증강 효과는 숙주 세포가 적어도 i) 상기 숙주 세포에서 기능성인 분비 시그널 펩타이드, ii) AGT 효소 또는 이의 돌연변이체, 촉매 도메인 또는 아단편, 및 iii) SBV의 N 핵단백질을 포함하는 융합 폴리펩타이드를 발현하는 경우 관측된다. 증강 효과를 위해, AGT 효소는 직접적으로나 간접적으로 (스페이서 및 다른 아미노산이 도입될 수 있다) 관심 단백질에 물리적으로 연결되어야 한다. 특정 이론에 구애됨이 없이, AGT 효소가, 예를 들어, 숙주 세포로부터 분비를 용이하게 하고 합성된 융합 단백질을 숙주 세포의 상등액에서 안정화시키거나 이의 합성 및 숙주 세포로부터의 분비 동안 및 후 대사되는 것을 방지함으로써 샤페론 단백질로 작용한다고 생각된다. 또한, AGT는 AGT의 스캐폴딩 역활과 양립할 수 있는 α 나선(Wibley J.E.A. et al, 2000)을 포함하는 3D 구형 구조를 갖는 것으로 관측되었다.
본 발명과 관련하여, "숙주" 세포는 재조합 단백질을 생성하는데 사용될 수 있는 임의의 세포, 예를 들어, "비-척추동물"(또는 무척추동물) 세포, 척추동물 세포, 식물 세포, 효모 세포 또는 원핵생물 세포이다. 이들은, 바람직하게는, 비-척추동물 및 척추동물 세포이다.
비-척추동물(무척추동물로도 알려짐)은 상이한 문을 포함하며, 가장 유명한 것은 곤충(Insect), 거미(Arachnida), 연체동물(Mollusca), 환형동물(Annelida), 만각류 동물(Cirripedia), 방사대칭동물(Radiata), 강장동물(Coelenterata) 및 적충류(Infusoria)이다. 이들은 현재 바다수세미 및 편형동물과 같은 단순 유기체로부터 절지동물 및 연체동물과 같은 복잡한 동물까지 30개 이하의 문으로 분류된다. 본 발명과 관련하여, 비-척추동물 세포는 바람직하게는 곤충 세포, 예를 들어, 초파리(Drosophila) 또는 모기(Mosquito) 세포, 더욱 바람직하게는 초파리 S2 세포이다.
숙주 세포주로서 유용한 척추동물 유기체로부터 유도되는 세포의 예는 비-인간 배아 줄기 세포 또는 이의 유도체, 예를 들어, 조류 EBX 세포; SV40 서열로 형질전환된 원숭이 신장 CVI 세포주(COS-7, ATCC CRL 1651); 인간 배아 신장 세포주(293); 베이비 햄스터 신장 세포(BHK, ATCC CCL 10); 차이니즈 햄스터 난소 세포(CHO); 마우스 세르톨리 세포 [TM4]; 원숭이 신장 세포(CVI, ATCC CCL 70); 아프리카 녹색 원숭이 신장 세포(VERO-76, ATCC CRL-1587); 인간 경부 암 세포(HeLa, ATCC CCL 2); 개 신장 세포(MDCK, ATCC CCL 34); 버팔로 래트 간 세포(BRL 3A, ATCC CRL 1442); 인간 폐 세포(W138, ATCC CCL 75 ); 인간 간 세포(Hep G2, HB 8065); 마우스 유방 암 세포(MMT 060562, ATCC CCL51); 래트 간암 세포 [HTC, Ml.5]; YB2/O(ATCC n℃RL1662); NIH3T3; HEK 및 TRI 세포를 포함한다. 본 발명과 관련하여, 척추동물 세포는 바람직하게는 EBX, CHO, YB2/O, COS, HEK, NIH3T3 세포 또는 이의 유도체이다.
본 발명과 관련하여 사용될 수 있는 식물 세포는 토바코 컬티바스(tobacco cultivars) 브라이트 엘로우 2(BY2) 및 니코티아나 타바쿰(Nicotiana tabaccum) 1(NT-1)이다.
본 발명과 관련하여 사용될 수 있는 효모 세포는 사카로마이세스 세레비지애( Saccharomyces cerevisiae), 쉬조사카로마이세스 폼베( Schizosaccharomyces pombe) 및 한세눌라 폴리모파( Hansenula polymorpha), 및 피치아 파스토리스( Pichia pastoris) 및 피치아 메타놀리카( Pichia methanolica)와 같은 메틸로트로픽(methylotropic) 효모이다.
본 발명과 관련하여 사용될 수 있는 원핵생물 세포는 이. 콜라이 세균 또는 바실루스 서브틸리스(Bacillus subtilis) 세균이다.
또 다른 양상에서, 본 발명은, a) 숙주 세포에서 기능성인 분비 시그널 펩타이드, b) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT) 또는 이의 돌연변이체, 단편 또는 촉매 도메인, 및 c) 서열번호 16의 SBV의 N 핵단백질을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는, 숙주 세포에서 SBV로부터의 N 핵단백질(SBV.N)를 발현시키기 위한 벡터에 관한 것이다.
SBV로부터의 N 핵단백질은 하기에서 "이종 단백질", "관심 단백질","키메라 단백질" 또는 "재조합 단백질"로 불릴것이다.
용어 "벡터"는 외래 유전자의 DNA 또는 RNA 서열이 숙주 세포에 도입되어 이를 형질전환시키고 도입된 서열의 발현을 증진시킬 수 있는 비히클을 의미한다. 본원에서 이해되는 바와 같이, 벡터는 핵산 분자, 예를 들어, 플라스미드, 파아지 및 바이러스이다. 이들은 하기에서 상세히 기술된다. 플라스미드, 코스미드, YAC 또는 바이러스 벡터의 어떠한 유형도 관심 단백질의 발현이 요구되는 숙주 세포로 도입될 수 있는 재조합 핵산 작제물을 제조하는데 사용될 수 있다. 특정 유형의 숙주 세포에서의 관심 단백질의 발현이 요구되는 경우, 목적하는 세포 유형 또는 조직 유형을 선택적으로 감염시키는 바이러스 벡터가 사용될 수 있다. 또한, 유전자 요법(즉, 숙주 유기체로 핵산 분자를 전달할 수 있는 유전자 요법)에 사용하기 위한 벡터가 본 발명에 중요하다.
예를 들어, 바이러스 벡터는 렌티바이러스, 레트로바이러스, 헤르페스 바이러스, 아데노바이러스, 아데노-관련 바이러스, 백시니아 바이러스, 배큘로바이러스 및 바람직한 세포 굴성을 갖는 다른 재조합 바이러스 벡터를 포함한다. 바이러스 벡터를 작제하고 사용하는 방법은 당해 기술 분야에 알려져 있다(참조:, Miller and Rosman, BioTechniques, 7:980-990, 1992).
본 발명에 실제로 바람직한 바이러스 벡터는 척추동물 및 비-척추동물 세포에 사용하기에 매우 적합한 것들이다.
비-척추동물 세포에 대해, 바람직한 벡터는 아르보바이러스 벡터이고, 웨스트 나일 바이러스 벡터가 특히 바람직하며, 이들은 절지동물 벡터이다. 비-척추동물 세포에서 효과적으로 발현되는 것으로 알려진 다른 벡터는 배큘로바이러스이다.
척추동물 세포에 대해, 렌티바이러스, AAV, 배큘로바이러스 및 아데노바이러스 벡터가 바람직하다. 포유동물 숙주 세포에서의 발현에 적합한 벡터는 또한 비-바이러스(예: 플라스미드 DNA) 기원의 것일 수 있다. 적합한 플라스미드 벡터는 pREP4, pCEP4(Invitrogen), pCI(Promega), pCDM8 및 pMT2PC, pVAX 및 pgWiz를 포함하고 이로 제한되지 않는다.
원핵생물 세포에 대해, 플라스미드, 박테리오파아지 및 코스미드 벡터가 바람직하다. 원핵생물 시스템에 사용하기에 적합한 벡터는 pBR322(Gibco BRL), pUC(Gibco BRL), pBluescript(Stratagene), p Poly, pTrc; pET 11d; pIN; 및 pGEX 벡터를 포함하고 이로 제한되지 않는다.
식물 세포에 대해, 플라스미드 발현 벡터, 예를 들어, Ti 플라스미드 및 바이러스 발현 벡터, 예를 들어, 콜리플라워 모자이크 바이러스(CaMV) 및 담배 모자이크 바이러스 TMV가 바람직하다.
3가지 유형의 벡터: 인테그레이션(integration) 벡터(YIp), 에피솜 플라스미드(YEp) 및 센트로메릭(centromeric) 플라스미드(YCp)를 사용하는 효모 세포에서의 재조합 단백질의 발현이 수행될 수 있다: 효모(예: 에스. 세레비지애)에서의 발현을 위한 적합한 벡터는 pYepSec1, pMFa, pJRY88, pYES2(Invitrogen Corporation, San Diego, Calif.) 및 pTEF-MF(Dualsystems Biotech Product code: P03303)을 포함하고 이로 제한되지 않는다.
유전자 요법에 사용될 수 있는 벡터는 당해 기술 분야에 널리 알려져 있다. 이들은, 예를 들어, 렌티바이러스, 레트로바이러스, 아데노바이러스, 폭스바이러스, 헤르페스 바이러스, 홍역 바이러스, 포미(foamy) 바이러스 또는 아데노-관련 바이러스(AAV)이다. 바이러스 벡터는 복제-적격 벡터이거나 복제-결함 또는 복제-손상되도록 유전적으로 장애를 가질 수 있다. 바람직한 유전자 요법 벡터는 WO 99/055892, US 6,682,507 및 WO 01/27300에 기술되어 있는 바와 같은 DNA Flap 벡터이다.
발현 생성물, 예를 들어, RNA, 폴리펩타이드, 단백질 또는 효소를 "인코딩"하는 서열은, 발현시, 상기 RNA, 폴리펩타이드, 단백질 또는 효소를 생성하는 뉴클레오타이드 서열이다: 즉, 상기 뉴클레오타이드 서열은 상기 RNA를 "인코딩"하거나 상기 폴리펩타이드, 단백질 또는 효소에 대한 아미노산 서열을 인코딩한다.
본 발명의 벡터는 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT) 또는 이의 돌연변이체, 단편 또는 촉매 도메인을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함한다. 이들 폴리펩타이드는 상기에 정의되었다. 바람직하게는, 상기 AGT 돌연변이체는 서열번호 2의 SNAP 효소이고, 예를 들어, 서열번호 15 또는 서열번호 31에 의해 인코딩되며, 후자는 51%의 G/C 함량을 갖는다.
바람직하게는, 본 발명의 뉴클레오타이드 발현 벡터는 관심 단백질을 인코딩하는 이종 DNA 서열의 인-프레임 삽입을 가능하게 하는 클로닝 부위를 추가로 포함한다.
본 발명에서 용어 "분비 시그널 펩타이드"는 N 핵단백질의 숙주 세포 외부로의 수송을 지시하는 짧은 (3 내지 60개 아미노산 길이) 펩타이드를 나타낸다.
본 발명에 적합한 분비 시그널의 예는 교배 인자 (MF) 알파(US 5,879,926); 인버타제(WO 84/01153); PHO5(DK 3614/83); YAP3(효모 아스파틱 프로테아제 3; WO 95/02059); 및 BAR1(WO 87/02670)의 시그널 펩타이드 서열을 포함하고 이로 제한되지 않는다.
본 발명과 관련하여, 이러한 분비 시그널 펩타이드는 바람직하게는 비-척추동물 세포 또는 척추동물 세포 또는 이둘 모두에서 기능성이다.
곤충 세포에서 기능성인 분비 시그널 펩타이드의 예는 곤충 ssBiP(서열번호 37)(예를 들어, 서열번호 22의 DNA 서열에 의해 인코딩됨), 서열번호 24의 BiP-유사 펩타이드 시그널(예를 들어, 서열번호 23의 DNA 서열에 의해 인코딩됨), 서열번호 153의 BiP-유사 펩타이드 시그널(예를 들어, 서열번호 152의 DNA 서열에 의해 암호됨) 및 아르보바이러스, 예를 들어, 웨스트-나일 바이러스의 외피 E 단백질(서열번호 38)에 존재하는 임의의 펩타이드 시그널이다.
흥미롭게도, 서열번호 24의 상기 BiP-유사 펩타이드 시그널은 비-척추동물 및 척추동물 세포 모두에서 기능성이다. 이러한 BiP-유사 시그널은, 마지막 글리신 아미노산이 뎅기 바이러스의 E 단백질의 개열 부위에 상응하는 아미노산 서열 Pro Thr Ala Leu Ala(서열번호 39)으로 대체된 서열번호 37의 BiP 펩타이드 시그널에 상응한다. 따라서, BiP-유사 시그널은 일단 단백질이 해독되고 숙주 세포의 상등액에 분비되면 유리하게 개열될 것이다.
다양한 분비 시그널이 또한 효모 숙주 세포, 예를 들어 에스. 세레비지애에서의 발현에 이용가능하다. 이들은 프리프로-알파 인자, HSp150, PHO1, SUC2, KILM1(킬러 독소 1형) 및 GGP1을 포함한다.
클로닝 부위는 관심 단백질을 인코딩하는 유전자를 발현 시스템으로 클로닝 하는 것을 용이하게 하는 서열이다. 이는 제한 부위, 또는 제한 인지 부위, 즉, 제한 효소에 인지되는 뉴클레오타이드의 특정 서열을 포함하는 DNA 분자 상의 위치를 포함한다(예를 들어, 도면 참조). (제한 효소가 통상적으로 호모이량체로서 결합하기 때문에) 이들은 일반적으로 팔린드롬(palindromic) 서열이며, 특정 제한 효소는 이의 인지 부위 내 또는 근방의 2개의 뉴클레오타이드 사이의 서열을 개열할 수 있다. 클로닝 부위는 당업자에게 널리 알려져 있다.
본 발명의 바람직한 실시형태에서, 상기 AGT 효소를 인코딩하는 DNA 서열은 관심의 이종 단백질을 인코딩하는 DNA 서열의 5' 또는 3', 바람직하게는 5'에 위치된다. 따라서, AGT 효소는 관심의 이종 단백질/폴리펩타이드에 직접적으로나 간접적으로 연결되며, 바람직하게는 관심의 이종 단백질/폴리펩타이드의 N-말단에 위치된다. 펩타이드 시그널, AGT 효소 또는 이의 돌연변이체 또는 촉매 도메인 및 관심의 재조합 단백질을 포함하는 융합 폴리펩타이드를 인코딩하는 DNA 서열은 펩타이드 시그널이 기능성인 것과 동일한 숙주 세포에서 기능성인 유도성 프로모터과 작동적으로 연결될 수 있다.
더욱 바람직하게는, 본 발명의 벡터에서, 상기 개방 판독 프레임은 펩타이드 시그널이 기능성인 것과 동일한 숙주 세포에서 기능성인 유도성 프로모터와 작동적으로 연결된다.
인코딩 서열은, RNA 폴리머라제가 인코딩 서열을 RNA로 전사시킨 후, (RNA가 인트론을 포함하는 경우) 트랜스-RNA 스플라이싱되고, 인코딩 서열이 단백질을 인코딩하는 경우, 단백질로 해독되는 경우, 세포 내의 발현 조절 서열(즉, 전사 및 해독 조절 서열)과 "작동적으로 연결"된다.
"프로모터"는, 이로부터 하부에 (즉, 이중-가닥 DNA의 센스 가닥에 대해 3' 방향으로) 작동적으로 연결된 DNA의 전사가 개시될 수 있는 뉴클레오타이드의 서열이다. (편리하게는, 예를 들어, 뉴클레아제 S1을 사용한 매핑에 의해 발견되는) 전사 개시 부위 및 RNA 폴리머라제의 결합에 중요한 단백질 결합 도메인(컨센서스 서열)이 프로모터 서열 내에서 발견될 것이다.
본 발명과 관련하여 유전자 발현을 조절하는데 사용될 수 있는 프로모터는, 예를 들어, 비-척추동물 세포 또는 척추동물 세포에서 기능성인 것이다. 예를 들어, 비-척추동물 세포에 대해, 메탈로티오네인 유전자의 조절 서열이 사용될 수 있다(Brinster et al., Nature , 296:39-42, 1982).
바람직하게는, 본 발명의 벡터에 존재하는 유도성 프로모터는 곤충 세포, 더욱 바람직하게는 초파리 세포에서 프로모터 활성을 갖는다. 예를 들어, CuSO4와 같은 금속의 존재 하에서 유전자의 고수준 전사를 지시하는, 드로소필라 메탈로티오네인(Drosophila metallothionein) 프로모터 pMT(Lastowski-Perry et al, J. Biol . Chem. 260:1527(1985))이다. 달리, 구성적 프로모터로서 금속 첨가를 필요로 하지 않는 초파리 액틴 5C 유전자 프로모터가 사용될 수 있다(B.J.Bond et al, Mol . 세포. Biol. 6:2080(1986)). 다른 공지된 초파리 프로모터는, 예를 들어, 유도성 열쇽(Hsp70) 및 COPIA LTR 프로모터를 포함한다. SV40 조기 프로모터는 초파리 메틸로티오네인 프로모터 보다 낮은 발현 수준을 제공한다.
바람직하게는, 본 발명의 벡터에 존재하는 유도성 프로모터는 드로소필라 라노가스터( Drosophila melanogaster) 세포, 바람직하게는 초파리 S2 세포에서 프로모터 활성을 갖는다. 예를 들어, 문헌(Lastowski-Perry et al, J. Biol . Chem. 260: 1527 (1985))에 상세히 기술된 메탈로티오네인 프로모터이다.
포유동물 세포에서의 구성적 발현에 적합한 프로모터는 시토메갈로바이러스(CMV) 전 초기(immediate early) 프로모터, 아데노바이러스 주요 후기(major late) 프로모터, 포스포글리세로 키나제(PGK) 프로모터 및 단순 포진 바이러스(HSV)-1의 티미딘 키나제(TK) 프로모터를 포함한다. 외부에서 공급되는 화합물에 의해 조절되는 유도성 진핵생물 프로모터는 아연-유도성 메탈로티오네인(MT) 프로모터, 덱사메타손(Dex)-유도성 마우스 유방암 바이러스(MMTV) 프로모터, T7 폴리머라제 프로모터 시스템(WO 98/10088), 엑디손 곤충 프로모터, 테트라사이클린-억제성 프로모터, 테트라사이클린-유도성 프로모터, RU486-유도성 프로모터 및 라파마이신-유도성 프로모터를 포함하며 이로 제한되지 않는다.
바람직하게는, 본 발명의 벡터에 존재하는 프로모터는 포유동물 세포, 바람직하게는 HeLa 세포에서 프로모터 활성을 갖는다. 예를 들어, SV 40 프로모터이다.
다양한 효모 프로모터가 효모 숙주 세포에서의 단백질 발현에 이용가능하다. ADH2, SUC2와 같은 일부 프로모터는 발현시 유도성이고, GAPDH와 같은 다른 프로모터는 발현시 구성적이다. 효모에서의 발현에 적합한 다른 프로모터는 TEF, PGK, MF alpha, CYC-1, GAL-1, GAL4, GAL10, PHO5, 글리세르알데하이드-3-포스페이트 디하이드로게나제(GAP 또는 GAPDH) 및 알콜 디하이드로게나제(ADH) 프로모터를 포함하고 이에 제한되지 않는다.
식물 세포에 사용하기 위해, 가장 일반적으로 사용되는 프로모터는 콜리플라워 모자이크 바이러스(CaMV) 35S 프로모터 또는 이의 증강된 버젼이나, 다수의 대체적 프로모터, 예를 들어, 하이브리드(ocs)3mas 프로모터 또는 옥수수 및 아라비도스프시스 탈리아나( Arabidospsis thaliana)로부터의 유비퀴틴 프로모터가 사용될 수 있다. 이러한 구성적 프로모터와는 반대로, 라이스 α-아밀라제 RAmy3D 프로모터는 슈가 결핍에 의해 유도된다(Hellwig S et al., Nat. Biotechnol.2004; 22(11):1415-22).
이. 콜라이 숙주 세포에서의 발현에 적합한 프로모터는 박테리오파아지 람다 pL 프로모터, lac, TRP 및 IPTG-유도성 pTAC 프로모터를 포함하고 이로 제한되지 않는다.
분비 시그널 펩타이드 및 유도성 프로모터는 동일한 숙주 세포에서 기능성이다.
더욱 바람직하게는, 분비 시그널 펩타이드 및 유도성 프로모터는 초파리 S2 세포 및 척추동물 세포 모두에서 기능성이다.
프로모터에 적용되는 용어 "유도성"은 당업자에 의해 널리 이해된다. 본질적으로, 유도성 프로모터 조절 하에서의 발현은 적용된 자극에 반응하여 "발동(switched on)"되거나 증가된다. 자극의 특성은 프로모터 간에 다양하다. 일부 유도성 프로모터는 적합한 자극의 부재 하에서 적거나 검출 불가능한 수준의 발현을 야기한다(또는 발현을 야기하지 않는다). 다른 유도성 프로모터는 자극의 부재 하에서 검출가능한 구성적 발현을 야기한다. 발현이 자극의 부재 하에서 어떠한 수준이든, 임의의 유도성 프로모터로부터의 발현은 정확한 자극의 존재시 증가된다.
일단 적합한 벡터가 작제되고 선택된 숙주 세포, 바람직하게는, 초파리 세포주로 형질감염되면, 이종 단백질의 발현은 유도성 프로모터에 대한 적합한 유도제의 첨가에 의해 유도된다. 예를 들어, 카드뮴 또는 구리가 Hsp70 프로모터에 대한 유도제이다. 구성적 프로모터, 예를 들어, 액틴 5C 프로모터에 대해서는, 발현에 어떠한 유도제도 필요하지 않다.
본 발명의 또 다른 실시형태에서, 뉴클레오타이드 발현 벡터는, 바람직하게는 AGT 효소 또는 이의 촉매 도메인과 목적 재조합 단백질 사이에 위치되는, 하나 이상의 펩타이드 개열 부위를 인코딩한다.
펩타이드 개열 부위는 하나 이상의 프로테아제 효소(예를 들어, 특히 세린 프로테아제, 시스테인 프로테아제)에 의해 인지되는 아미노산 서열이다. 펩타이드 개열 부위의 예는 서열번호 40(AspAspAspAspLys/Asp)의 엔테로키나제 개열 부위이다. 엔테로키나제는 불활성 트립시노겐을 이 서열의 C-말단에서의 개열으로 활성 트립신으로 전환시키는 것으로 알려진 세린 프로테아제 효소(EC 3.4.21.9)이다: Val--(Asp)4--Lys--Ile--Val~ (트립시노겐) -> Val--(Asp)4--Lys (헥사펩타이드) + Ile--Val~ (트립신). 엔테로키나제는 Lys 앞에 4개의 Asp가 선행되고 프롤린 부분이 뛰따르지 않는 경우 리신 이후를 개열한다.
또 다른 유용한 펩타이드 개열 부위는 이른바 "TEV 프로테아제"의 개열 부위로서, 서열번호 32의 아미노산 서열(pro-TEV1) 또는 서열번호 33의 아미노산 서열(pro-TEV2)을 갖는다(각각 Glu Asn Leu Tyr Phe Gln Ser 또는 Gly). 이러한 개열 부위는, 예를 들어, 서열번호 29 및 30에 의해 인코딩될 수 있다. TEV 프로테아제는 담배 에치 바이러스(tobacco etch virus)에 의해 인코딩되는 핵 포함 단백질의 27 kDa 촉매 도메인에 대한 일반명이다. 이는 시판된다(Invitrogen).
뎅기 바이러스 혈청형 1의 막 전구체 prM으로부터의 개열 부위(서열번호 39)도 또한 본 발명의 벡터에 사용될 수 있다.
또 다른 실시형태에서, 본 발명이 뉴클레오타이드 발현 벡터는, 바람직하게는 (펩타이드 시그널, AGT 단백질 또는 이의 상동체 및 재조합 단백질을 포함하는) 본 발명의 융합 폴리펩타이드에서 재조합 단백질의 C-말단에 위치되는, 표지를 추가로 인코딩한다. 본 발명과 관련하여, "표지"는 숙주 세포의 조 용해물로부터 폴리펩타이드의 회수를 용이하게 하기 위한 것으로서, 바람직하게는 형광 단백질, 폴리-히스티딘(poly-his) 또는 폴리-히스티딘-글리신(poly-his-gly) 택; flu HA 택; c-myc tag 단순 포진 바이러스 당단백질 D(gD) 택, Flag-펩타이드, 알파-투불린 에피토프, 또는 T7 유전자 10 단백질 펩타이드 택을 포함하는 그룹 중에서 선택된다. 그러나, 임의의 다른 표지도 사용될 수 있다. 본 발명의 바람직한 실시형태에서, 벡터는 서열번호 27을 갖는 헥사-히스티딘 택을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA을 포함한다.
또 다른 실시형태에서, 본 발명의 뉴클레오타이드 발현 벡터는, 바람직하게는 AGT 효소(또는 이의 촉매 도메인)와 관심 재조합 단백질 사이 및/또는 관심 재조합 단백질과 표지 사이에 위치되는, 스페이서 서열(들)을 추가로 인코딩한다. 본 발명과 관련하여, 스페이서 서열은 2개의 연결된 폴리펩타이드가 공간적으로 떨어지게 하는 (이로써 이들 폴리펩타이드는 간접적으로 연결된다) 적어도 3개의 아미노산을 포함하는 아미노산 서열이다. 이러한 스페이서는, 예를 들어, 아미노산 서열 글리신-글리신-글리신-세린(GGGS, 서열번호 25)일 수 있고, 이를 인코딩하는 DNA 스페이서 서열은 서열번호 26일 수 있다. 본 발명과 관련하여, 이러한 DNA 서열은 이하에서 "DNA 스페이서 서열"이라 지칭되며, AGT 또는 이의 촉매 도메인과, 바람직하게는 펩타이드 개열 부위를 인코딩하는 DNA서열로부터 상부에 있는, 재조합 DNA 서열 사이에 위치된다.
SNAP 카세트 및 항원 발현
본원에서 사용되는 용어 "pDeSNAPUniv"는 단일 개방 판독 프레임에 5'로부터 3'로 하기를 인코딩하는 DNA 카세트를 지칭한다:
a) 분비 시그널 펩타이드,
b) 서열번호 1의 AGT 단백질 또는 이의 돌연변이체, 단편 또는 촉매 도메인, 특히 서열번호 2의 SNAP 돌연변이체,
c) 하나 이상의 펩타이드 개열 부위,
d) 하나 이상의 표지, 및
e) 하나 이상의 스페이서 서열.
이러한 pDeSNAPUniv DNA 카세트는, 유리하게는 서열번호 24의 BiP-유사 펩타이드 시그널 또는 서열번호 37의 ssBiP 펩타이드 시그널인 분비 시그널, 서열번호 2의 SNAP 돌연변이체, 유리하게는 서열번호 27의 His-택인 표지, 유리하게는 서열번호 32의 pro-TEV 또는 서열번호 33의 pro-TEV인 펩타이드 개열 부위, 및/또는 유리하게는 서열번호 25의 아미노산 서열을 갖는 스페이서를 인코딩한다.
더욱 바람직하게는, pDeSNAPUniv DNA 카세트는 5'로부터 3'로 BiP-유사 분비 시그널을 인코딩하는 서열번호 23의 서열, SNAP 돌연변이체를 인코딩하는 서열번호 15 또는 31, 서열번호 26의 스페이서 서열, 서열번호 29의 펩타이드 개열 부위 pro-TEV, 서열번호 30의 펩타이드 개열 부위 pro-TEV, 서열번호 26의 스페이서 서열 및 His-택 표지를 인코딩하는 서열번호 28의 서열을 포함한다(pDeSNAPUniv 카세트의 구조를 도시하는 도 8 참조). 이러한 pDeSNAPUniv DNA 카세트는, 예를 들어, 서열번호 34이다.
이러한 "pDeSNAPUniv" 카세트는 이종 단백질을 생성하기 위해 숙주 세포를 형질감염하는데 사용되는 모든 종류의 벡터, 즉 척추동물 벡터(예: pcDNA3 또는 pCI-neo 벡터) 및 비-척추동물 벡터(예: Invitrogen으로부터의 DES 시스템에 유용한 pMT/BiP/V5-HisA)에 삽입될 수 있으므로, "보편적"인 것으로 여겨진다. 이러한 보편적 서열을 포함하는 플라스미드의 예는 서열번호 43(pDeSNAP Univ 카세트를 포함하는 Invitrogen으로부터의 pMT/BiP/V5-HisA), 서열번호 44(pDeSNAP Univ 카세트를 포함하는 Invitrogen으로부터의 pUC57) 또는 서열번호 45(pDeSNAP Univ 카세트를 포함하는 Invitrogen으로부터의 pcDNA3)이다.
상기 보편적 서열을 포함하는 또 다른 플라스미드의 예는 5'로부터 3'로 오르기아 슈도쓰가타(Orgyia pseudotsugata) 멀티캡시드 핵단백질 바이러스-전 초기 2 프로모터(OpIE2SP)의 구성적 프로모터, 서열번호 152의 BiP-유사 시그널 펩타이드, 서열번호 31의 SNAP-유사 서열, 서열번호 26의 스페이서 서열, 서열번호 29의 pro-TEV1, 및 서열번호 106의 C-말단 펩타이드 택을 포함하는 pUC57 플라스미드인 서열번호 105이다.
일단 SBV.N과 같은 관심 단백질의 이종 서열이 이러한 벡터에 클로닝되면, 벡터는 유리하게는 관심 단백질을 다량으로 생성하도록 척추동물 또는 비-척추동물에 형질감염될 수 있다.
바람직한 실시형태에서, 본 발명의 벡터는 이른바 "pDeSNAP Univ/SBV.N 카세트", 즉, SBV의 N 핵단백질의 서열이 삽입된 pDeSNAPUniv DNA 카세트를 포함하고, 상기 pDeSNAP Univ/SBV.N 카세트는 단일 개방 판독 프레임에 5'로부터 3'로 하기를 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함한다:
a) 분비 시그널 펩타이드,
b) 서열번호 1의 AGT 단백질 또는 이의 돌연변이체, 단편 또는 촉매 도메인, 특히 서열번호 2의 SNAP 돌연변이체,
c) 하나 이상의 펩타이드 개열 부위,
d) 서열번호 16의 SBV의 N 핵단백질,
e) 하나 이상의 표지, 및
f) 하나 이상의 스페이서 서열.
이러한 pDeSNAP Univ/SBV.N DNA 카세트는 유리하게는 서열번호 24의 BiP-유사 펩타이드 시그널 또는 서열번호 37의 ssBiP 펩타이드 시그널인 분비 시그널 펩타이드, 서열번호 2의 SNAP 돌연변이체, 서열번호 16의 SBV의 N 핵단백질, 유리하게는 서열번호 27의 His-택인 표지, 유리하게는 서열번호 32의 pro-TEV 또는 서열번호 33의 pro-TEV인 펩타이드 개열 부위, 및/또는 유리하게는 서열번호 25의 아미노산 서열을 갖는 스페이서 서열을 인코딩한다.
더욱 바람직하게는, pDeSNAP Univ/SBV.N DNA 카세트는 5'로부터 3'로 BiP-유사 분비 시그널을 인코딩하는 서열번호 23의 서열 또는 ssBiP 분비 시그널을 인코딩하는 서열번호 22, SNAP 돌연변이체를 인코딩하는 서열번호 15 또는 31, 서열번호 26의 스페이서 서열, 서열번호 29의 펩타이드 개열 부위 pro-TEV1, SBV의 N 핵단백질을 인코딩하는 서열번호 17의 서열, 서열번호 30의 펩타이드 개열 부위 pro-TEV2, 서열번호 26의 스페이서 서열 및 His-택 표지를 인코딩하는 서열번호 28의 서열을 포함한다.
더욱더 바람직하게는, pDeSNAP Univ/SBV.N DNA 카세트는 5'로부터 3'로 BiP 시그널을 인코딩하는 서열번호 22의 서열, SNAP 돌연변이체를 인코딩하는 서열번호 31, 서열번호 26의 스페이서 서열, 서열번호 29의 펩타이드 개열 부위 pro-TEV1, SBV의 N 핵단백질을 인코딩하는 서열번호 17의 서열, 서열번호 30의 펩타이드 개열 부위 pro-TEV2, 서열번호 26의 스페이서 서열 및 His-택 표지를 인코딩하는 서열번호 28의 서열을 포함한다. 이러한 pDeSNAP Univ/SBV.N 카세트는, 예를 들어, 서열번호 35이다.
달리, pDeSNAP Univ/SBV.N DNA 카세트는 5'로부터 3'로 BiP-유사 분비 시그널을 인코딩하는 서열번호 23의 서열, SNAP 돌연변이체를 인코딩하는 서열번호 31, 서열번호 26의 스페이서 서열, 서열번호 29의 펩타이드 개열 부위 pro-TEV1, SBV의 N 핵단백질을 인코딩하는 서열번호 17의 서열, 서열번호 30의 펩타이드 개열 부위 pro-TEV2, 서열번호 26의 스페이서 서열 및 His-택 표지를 인코딩하는 서열번호 28의 서열을 포함할 수 있다. 이러한 pDeSNAP Univ/SBV.N 카세트는, 예를 들어, 서열번호 36이다(이의 구조가 도 9에 도시되어 있다).
따라서, 바람직한 실시형태에서, 본 발명의 벡터는 서열번호 35의 뉴클레오타이드 서열 또는 서열번호 36의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 pDeSNAP Univ/SBV.N 카세트를 포함한다.
더욱 정확히, 서열번호 35의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 pDeSNAP Univ/SBV.N 카세트는 하기를 포함한다:
- 서열번호 22의 곤충 BiP 서열,
- 서열번호 31의 SNAP-유사 서열,
- 스페이서 서열 GGGS(서열번호 25)을 인코딩하는 서열번호 26의 제1 DNA 서열,
- 서열 ENLYFQS(서열번호 32)의 pro-TEV1 개열 부위를 인코딩하는 서열번호 29의 DNA 서열,
- 서열번호 17의 SBV.N DNA 서열(내부 EcoRV 부위가 결실되고 2개의 EcoRVXmaI 부위가 맨 끝에 첨가된, 천연 SBV.N 서열에 상응),
- 서열 ENLYFQG(서열번호 33)의 pro-TEV2 개열 부위를 인코딩하는 서열번호 30의 DNA 서열,
- HisTag 서열을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA 서열.
서열번호 36의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 pDeSNAP Univ/SBV.N 카세트는 하기를 포함한다(도 9 참조):
- 서열번호 23의 곤충 BiP-유사 서열,
- 서열번호 31의 SNAP-유사 서열,
- 스페이서 서열 GGGS(서열번호 25)을 인코딩하는 서열번호 26의 제1 DNA 서열,
- 서열 ENLYFQS(서열번호 32)의 pro-TEV1 개열 부위를 인코딩하는 서열번호 29의 DNA 서열,
- 서열번호 17의 SBV.N DNA 서열(내부 EcoRV 부위가 결실되고 2개의 EcoRVXmaI 부위가 맨 끝에 첨가된, 천연 SBV.N 서열에 상응),
- 서열 ENLYFQG(서열번호 33)의 pro-TEV2 개열 부위를 인코딩하는 서열번호 30의 DNA 서열,
- HisTag 서열을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA 서열.
흥미롭게도, 서열번호 36의 pDeSNAP Univ/SBV.N 카세트 뉴클레오타이드 서열은 또한 AGT의 상부에 NheI 부위, BiP-유사 서열과 SNAP-유사 서열 사이에 BglII 부위, 및 정지 코돈 하부에 위치된 AgeI 부위 및 HindIII 부위를 포함한다.
본 발명의 벡터는, 예를 들어, 서열번호 17의 SBV.N DNA 서열이 삽입된 서열번호 43(pDeSNAP Univ 카세트를 포함하는 Invitrogen으로부터의 pMT/BiP/V5-HisA 플라스미드), 서열번호 17의 SBV.N DNA 서열이 삽입된 서열번호 44(pDeSNAP Univ 카세트를 포함하는 Invitrogen으로부터의 pUC57 플라스미드) 또는 서열번호 17의 SBV.N DNA 서열이 삽입된 서열번호 45(pDeSNAP Univ 카세트를 포함하는 Invitrogen으로부터의 pcDNA3 플라스미드)이다.
본 발명의 벡터는 또한 파스퇴르 인스티튜트 국립 미생물 배양센터 [the Centre National de Culture et de Microorganismes(CNCM), Institut Pasteur(25 rue du Docteur Roux, 75724 Paris cedex 15, France)]에 2012년 4월 24일자로 기탁 번호 CNCM I-4616으로 기탁된 S2에 제공된다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 본 발명의 벡터, 바람직하게는 서열번호 35 또는 서열번호 36의 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 벡터로 안정하게 형질감염되는 재조합 세포에 관한 것이다.
바람직하게는, 본 발명의 이러한 양상에서, 상기 재조합 세포는 비-척추동물 세포, 바람직하게는 곤충 세포, 더욱 바람직하게는 S2 세포이다.
비-척추동물 세포는 곤충(Insect), 거미(Arachnida), 갑각류 동물(Crustacea), 연체동물(Mollusca), 환형동물(Annelida), 만각류 동물(Cirripedia), 방사대칭동물(Radiata), 강장동물(Coelenterata) 및 적충류(Infusoria) 중의 임의의 동물일 수 있다. 본 발명과 관려하여, 비-척추동물은 바람직하게는 곤충 세포, 예를 들어, 초파리 또는 모기 세포이다. 이들은 더욱 바람직하게는 초파리 S2 세포이다. 이러한 경우, 본 발명의 발현 벡터는, 예를 들어, 서열번호 35를 포함한다.
초파리 S2 세포는 널리 알려져 있다. 이들은 실온(24±1℃)에서 현탁 배양으로 유지될 수 있기 때문에 고수율 단백질 생산에 특히 적합하다. 배양 배지는 5 내지 10%(v/v)의 열-불활성화된 우태혈청 혈청(FBS)으로 보충된 M3이다. 본 발명의 바람직한 실시형태에서, 배양 배지는 5% FBS를 포함한다. 세포는 유도 후 혈청-비함유 배지에서 배양된다. S2 세포는 이러한 배지에서 현탁 배양으로, 예를 들어, 250 mL 내지 2000 mL 스피너 플라스크에서 50 내지 60 rpm의 교반과 함께 성장될 수 있다. 세포 밀도는 통상적으로 106 내지 107개/mL로 유지된다.
바람직한 실시형태에서, 본 발명의 재조합 세포는 파스퇴르 인스티튜트 국립 미생물 배양센터 [the Centre National de Culture et de Microorganismes(CNCM), Institut Pasteur(25 rue du Docteur Roux, 75724 Paris cedex 15, France)]에 2012년 4월 24일자로 기탁 번호 CNCM I-4616으로 기탁된 S2 세포이다.
또 다른 바람직한 실시형태에서, 상기 재조합 세포는 척추동물 세포이다.
바람직하게는, 상기 척추동물 재조합 세포는 포유동물 세포, 바람직하게는 CHO, YB2/O, COS, HEK, NIH3T3, HeLa 세포 또는 이의 유도체이다. 더욱 바람직하게는, 본 발명의 발현 벡터는 서열번호 36을 포함한다.
본 발명의 또 다른 양상에서, 상기 재조합 세포는 본 발명의 발현 벡터, 바람직하게는 서열번호 35 또는 36을 포함하는 발현 벡터를 증폭 및 정제하는데 사용된다.
이러한 목적 상, 본 발명의 뉴클레오타이드 발현 벡터는 선별 마커를 인코딩하는 유전자 및/또는 터미네이터 서열을 포함한다. 작제물에 포함될 수 있는 선별 마커 유전자는 통상적으로 항생제(예: 블라스티시딘, 암피실린, 카나마이신, 하이그로마이신, 푸로마이신, 클로람페니콜)에 대한 내성과 같은 선별가능한 표현형을 제공하는 것들이다.
발현 벡터를 제조하는 방법은 당해 기술 분야에 널리 알려져 있다.
또 다른 양상에서, 본 발명의 재조합 세포는 쉬말렌베르그 바이러스의 N 핵단백질을 다량으로 생성하도록 사용된다.
따라서, 특정 실시형태에서, 본 발명은 또한 쉬말렌베르그 바이러스의 N 핵단백질을 제조하는 방법에 관한 것으로서, 상기 방법은 하기 단계를 포함한다:
(a) 예를 들어, 서열번호 35 또는 36의 DNA 서열을 포함하는 본 발명의 벡터를 수득하는 단계,
(b) 단계 (a)에서 수득된 폴리뉴클레오타이드를 사용하여 숙주 세포(바람직하게는, 곤충 세포 또는 포유동물 세포)를 형질감염하는 단계,
(c) 단계 (b)에서 수득된 상기 폴리뉴클레오타이드를 발현시켜 쉬말렌베르그 바이러스의 N 핵단백질을 생성하는 단계,
(d) 임의로, AGT 폴리펩타이드를 개열하는 단계,
(e) 쉬말렌베르그 바이러스의 N 핵단백질을 회수하는 단계,
(f) 임의로, 쉬말렌베르그 바이러스의 N 핵단백질을 정제하는 단계.
본 발명의 방법의 상이한 단계들을 수행하기 위해서, 당해 기술 분야의 통상의 분자 생물학, 미생물학 및 재조합 DNA 기술을 이용할 수 있다. 이러한 기술은 문헌에 충분히 설명되어 있다. 예를 들어, 하기 문헌을 참조한다: Sambrook, Fitsch & Maniatis, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 제2 Edition (1989) Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y. (본원에서 "Sambrook et al., 1989"로 언급됨); DNA Cloning: A Practical Approach, Volumes I 및 II (D. N. Glover ed. 1985); Oligonucleotide Synthesis (M. J. Gait ed. 1984); Nucleic Acid Hybridization(B. D. Hames & S. J. Higgins, eds. 1984); Animal Cell Culture (R. I. Freshney, ed. 1986); Immobilized Cells and Enzymes (IRL Press, 1986); B. E. Perbal, A Practical Guide to Molecular Cloning (1984); F. M. Ausubel et al. (eds.), Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, Inc. (1994).
용어 "형질감염"은, 숙주 세포가 도입된 유전자 또는 서열을 발현시켜 쉬말렌베르그 바이러스의 N 핵단백질을 생성하도록, 외래 핵산을 진핵생물 숙주 세포로 도입하는 것을 의미한다. 도입된 DNA 또는 RNA를 수용하고 발현시키는 숙주 세포는 "형질감염되며", 이러한 숙주 세포가 "트랜스펙턴트" 또는 "클론"이다. 숙주 세포에 도입된 DNA 또는 RNA는 숙주 세포와 동일한 속 또는 종의 세포 또는 상이한 속 또는 종의 세포를 포함하는 임의의 공급원으로부터의 것일 수 있다.
본 발명과 관련하여, 폴리뉴클레오타이드를 사용한 숙주 세포의 형질감염은 당해 기술 분야의 고전적인 방법, 예를 들어, 형질감염, 감염 또는 전기천공으로 수행될 수 있다. 또 다른 실시형태에서, 본 발명의 벡터는 (네이키드 (naked) DNA로서) 리포펙션에 의해 또는 다른 형질감염 촉진제(펩타이드, 중합체 등)를 사용하여 생체내에서 도입될 수 있다. 합성 양이온 지질을 사용하여 마커를 인코딩하는 유전자의 생체내 형질감염을 위한 리포좀을 제조할 수 있다(Felgner et al., Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 84:7413-7417, 1987). 핵산 전달에 유용한 지질 화합물과 조성물이 WO 95/18863, WO 96/17823 및 U.S. 5,459,127에 기술되어 있다. 지질은 표적화를 위한 다른 분자에 화학적으로 커플링될 수 있다(참조:, Mackey et al., Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 85:8027-8031, 1988). 표적 펩타이드, 예를 들어, 호르몬 또는 신경전달자 및 단백질, 예를 들어, 항체, 또는 비-펩타이드 분자를 화학적으로 리포좀에 커플링시킬 수 있었다. 또한, 다른 분자, 예를 들어, 양이온성 올리고펩타이드(참조: WO 95/21931), DNA 결합 단백질로부터 유도되는 펩타이드(참조: WO 96/25508), 또는 양이온성 중합체(참조: WO 95/21931)도 핵산의 생체내 형질감염을 용이하게 하는데 유용하다. 또한, 벡터를 생체내에서 네이키드 DNA 플라스미드로서 도입할 수 있다. 유전자 요법을 위한 네이키드 DNA 벡터는 당해 기술 분야의 공지된 방법, 예를 들어, 전기천공, 마이크로주입, 세포 융합, DEAE 덱스트란, 인산칼슘 침전, 유전자총 사용, DNA 벡터 이동자 사용에 의해 목적하는 숙주 세포로 도입될 수 있다(참조:, Wu et al., J. Biol. Chem., 267:963-967, 1992; Wu and Wu, J. Biol. Chem., 263:14621-14624, 1988; Williams et al., Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 88:2726-2730, 1991).
본원에서 폴리뉴클레오타이드의 "발현을 가능하게 하는"이란 표현은 벡터에 존재하는 조절 서열의 자극(예: 유도성 프로모터를 활성화시키는 자극) 및 모든 필요한 성분이 폴리뉴클레오타이드의 해독이 일어나기에 충분한 양으로 존재한다는 것을 의미한다.
필요한 경우, AGT/SNAP 폴리펩타이드는, 재조합 세포의 상등액에 또는 재조합 세포내로 정의된 개열 부위를 갖는 프로테아제를 부가함으로써 생성된 융합 단백질로부터 개열될 수 있다. 예를 들어, 서열번호 35 또는 36의 pDeSNAP Univ 카세트를 포함하는 벡터를 사용하는 경우, 재조합 세포의 상등액에 TEV 프로테아제를 부가함으로써 pro-TEV 개열 부위 ENLKYFQ/G(S)가 개열된다. 달리, AGT/SNAP 폴리펩타이드는 SBV로부터의 N 핵단백질의 수명을 증진시키도록 유지될 수 있다.
또한, 당업자는 발현되거나 분비되는 단백질 또는 폴리펩타이드가 당해 숙주 세포를 유지시키거나 성장시키기 위해 사용된 배양 배지에서 검출될 수 있다는 것을 알 수 있을 것이다. 배양 배지는 공지된 공정, 예를 들어, 원심분리 또는 여과에 의해 숙주 세포로부터 분리될 수 있다. 이어서, 단백질 또는 폴리펩타이드는 이에 대해 공지된 특성을 이용하여 세포-비함유 배양 배지에서 검출될 수 있다. 이러한 특성은 단백질 또는 폴리펩타이드의 상이한 면역학적, 효소적 또는 물리적 특성을 포함할 수 있다. 예를 들어, 단백질 또는 폴리펩타이드가 독특한 효소 활성을 갖는 경우, 숙주 세포에 의해 사용된 배양 배지 상에서 효소 활성 분석이 수행될 수 있다. 또한, 소정의 단백질 또는 폴리펩타이드에 대해 반응적인 항체가 이용가능한 경우, 이러한 항체를 사용하여 (예를 들어, 문헌(Harlowe, et al., 1988, Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press)에서와 같이) 임의의 공지된 면역학적 분석으로 단백질 또는 폴리펩타이드를 검출할 수 있다
SBV로부터의 핵단백질 N 의 회수는, 제조용(preparative) 디스크-겔 전기영동, 등전점 포커싱, HPLC, 역상 HPLC, 겔 여과, 이온 교환 및 분배 크로마토그래피, 침전 및 염석 크로마토그래피, 추출, 향류 분배 등을 포함하고 이로 제한되지 않는 당해 기술 분야의 널리 공지된 방법으로 수행된다. 표지는 적합한 고체상 매트릭스 상에서의 크로마토그래피로 숙주 세포의 조 용해물로부터 폴리펩타이드의 회수를 용이하게 할 것이므로, 표지와 연결된 본 발명의 재조합 시스템으로 관심 단백질을 생성하는 것이 바람직하다. 달리, 단백질 또는 이로부터 유도된 펩타이드에 대해 생성된 항체를 회수 시약으로 사용할 수 있다.
본 발명자들은 본 발명의 방법으로 생성되는 융합 단백질이 일반적으로 추가로 정제될 필요가 없다는 것을 발견하였다. 그러나, 필요한 경우, 추가의 정제 단계 (g)가 수행될 수 있다.
정제된 물질은 처음에 관련된 세포성 성분을 약 50% 미만, 바람직하게는 약 75% 미만, 가장 바람직하게는 약 90% 미만으로 포함할 수 있다. 용어 "실질적으로 순수한"은 당해 기술 분야에 공지된 통상의 정제 기술을 이용하여 달성될 수 있는 최고의 순도를 나타낸다.
본 발명의 일 실시형태에서, 본 발명의 방법은 회수된 세포 배양 상등액 중의 적어도 40 mg/L, 바람직하게는 적어도 50 mg/L, 더욱 바람직하게는 적어도 60 mg/L의 실질적으로 순수한 쉬말렌베르그 바이러스(SBV)의 N 핵단백질을 수득하는 것을 가능하게 한다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 a) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT)(EC 2.1.1.63) 또는 이의 돌연변이체 또는 촉매 도메인 및 b) 서열번호 16의 쉬말렌베르그 바이러스의 N 핵단백질을 포함하는 융합 폴리펩타이드에 관한 것이다.
이러한 융합 폴리펩타이드에서, AGT 효소는 바람직하게는 서열번호 2의 단백질 또는 (상기 정의된 바와 같은) 이의 상동체이다.
이러한 융합 폴리펩타이드 바람직하게는 상기 정의된 바와 같은 표지를 추가로 포함한다. 이러한 표지는 바람직하게는 폴리-히스티딘 표지이며, 바람직하게는 쉬말렌베리그 바이러스의 N 핵단백질의 C 말단에 위치된다.
본 발명의 융합 폴리펩타이드의 예는 서열번호 41(BiPlike/SNAP/SBV.N/Histag 융합 단백질에 상응) 또는 서열번호 46(ssBiP/SNAP/SBV.N/Histag 융합 단백질에 상응) 또는 서열번호 42(SNAP/SBV.N 융합 단백질에 상응)의 아미노산 서열이다.
본 발명은, 서열번호 178의 뉴클레오타이드 서열을 갖고/갖거나 서열번호 179의 아미노산 서열을 인코딩하는 DeSNAPuniv-쉬말렌베르그 NS 단백질 카세트를 포함하는 벡터를 포함한다. 상기 벡터는 SNAP의 시그널 펩타이드, SNAP 서열, pro-TEV 부위, 또는 도 24에 도시된 수말렌베르그 바이러스의 NS 단백질을 인코딩하는 DNA 서열, 또는 이의 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 40, 50, 60, 100, 200 또는 300개의 연속 아미노산을 단독으로 또는 조합하여 포함한다.
마지막으로, 키메라 단백질 SNAP-SBV. N는 생물학적 유체, 예를 들어, 혈액, 혈청, 타액 등에서 쉬말렌베르그 바이러스에 의한 감염의 검출 또는 상기 바이러스에 특이적인 항체의 검출을 위한 진단제로서 유용할 수 있다.
따라서, 또 다른 양상에서, 본 발명은 또한, 예를 들어, 본 발명의 면역분석으로 생물학적 샘플 중의 병원성 또는 비-병원성 미생물의 존재를 확인하기 위한 본 발명의 임의의 방법에 의해 수득되는 융합 단백질 [SNAP- SBV. N]의 용도에 관한 것이다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 또한 관심 항원, 예를 들어, 관심의 바이러스 또는 세균 항원, 미생물 펩타이드 및/또는 폴리펩타이드와 프레임 내에 융합된 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT) 또는 이의 돌연변이체, 단편 또는 촉매 도메인을 포함하는 특정 관심의 융합 단백질을 발현하는 벡터에 관한 것이다. 이들 벡터가 하기에서 상세히 기술된다.
에코바이러스 항원
또 다른 양상에서, 본 발명은 숙주 세포에서 에코바이러스 항원, 예를 들어, 엔테로바이러스 71(피코나비리대)의 VP1 단백질을 발현시키기 위한 벡터에 관한 것이다. 특히, 본 발명은 a) 상기 숙주 세포에서 기능성인 분비 시그널 펩타이드, 및 b) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT) 또는 이의 돌연변이체, 단편 또는 촉매 도메인, 및 c) 엔테로바이러스 71(EV71, 예를 들어, 문헌(Kolpe A.B. et al, Virus Research 2012) 참조)의 VP1 단백질을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 벡터에 관한 것이다.
바람직한 실시형태에서, 이 벡터는 이른바 "pDeSNAP Univ/EV71.VP1 카세트", 즉, EV71 바이러스 스트레인 JL-AFP-EV71-07-03(Genebank#JQ715713)으로부터의 VP1 단백질을 인코딩하는 서열번호 47의 서열이 삽입된 상기 정의된 바와 같은 pDeSNAPUniv DNA 카세트를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이 벡터는 하기를 포함하는 서열번호 48의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 pDeSNAP Univ/EV71.VP1 카세트를 포함한다:
- 서열번호 22의 곤충 BiP 서열,
- 서열번호 31의 SNAP-유사 서열,
- 스페이서 서열 GGGS(서열번호 25)을 인코딩하는 서열번호 26의 제1 DNA 서열,
- 서열 ENLYFQS(서열번호 32)의 pro-TEV1 개열 부위를 인코딩하는 서열번호 29의 DNA 서열,
- EV71 바이러스 스트레인 JL-AFP-EV71-07-03(Genebank#JQ715713)로부터의 VP1 단백질을 인코딩하는 서열번호 47의 DNA 서열,
- 서열 ENLYFQG(서열번호 33)의 pro-TEV2 개열 부위를 인코딩하는 서열번호 30의 DNA 서열,
- 스페이서 서열 GGGS(서열번호 25)을 인코딩하는 서열번호 26의 제2 DNA 서열,
- HisTag 서열을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA 서열.
또 다른 양상에서, 본 발명은 상기 벡터로 안정하게 형질감염된 재조합 세포에 관한 것이다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 a) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT)(EC 2.1.1.63) 또는 이의 돌연변이체 또는 촉매 도메인 및 b) EV71 바이러스로부터의 VP1 단백질을 포함하는 융합 폴리펩타이드에 관한 것이다. 이러한 융합 폴리펩타이드에서, 상기 AGT 효소는 서열번호 2의 단백질 또는 (상기 정의된 바와 같은) 이의 상동체이다. 이러한 융합 폴리펩타이드는, 예를 들어, 서열번호 49의 아미노산 서열(SNAP-유사/proTEV1/EV71.VP1/proTEV2/Histag 융합 단백질에 상응)이다. 고도(30mg/l)의 이러한 단백질은 S2의 유도 후에 생성되었다.
따라서, 또 다른 양상에서, 본 발명은, 예를 들어, 본 발명의 면역분석에서,생물학적 샘플 중의 엔테로바이러스 71의 존재를 확인하기 위한 이러한 융합 단백질 [SNAP- EV71.VP1]의 용도에 관한 것이다.
플라비바이러스 항원
또 다른 양상에서, 본 발명은 숙주 세포에서 특정 플라비바이러스 항원을 발현시키기 위한 벡터에 관한 것이다.
바람직한 실시형태에서, 상기 플라비바이러스 항원은 일본 뇌염으로부터의 가용성 E 단백질(sE)(JEV.sE)이다. 보다 특히, 본 발명은 a) 상기 숙주 세포에서 기능성인 분비 시그널 펩타이드, 및 b) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT) 또는 이의 돌연변이체, 단편 또는 촉매 도메인, 및 c) 일본 뇌염 바이러스로부터의 sE 단백질을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 벡터에 관한 것이다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 이른바 "pDeSNAP Univ/JEV.sE 카세트, 즉 일본 뇌염 바이러스(JEV)로부터의 가용성 E 단백질(sE)을 인코딩하는 서열이 삽입된 상기 정의된 바와 같은 pDeSNAPUniv DNA 카세트를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 5'로부터 3'까지 하기를 포함하는 서열번호 50의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 pDeSNAP Univ/JEV.sE 카세트를 포함한다:
- 서열번호 22의 곤충 BiP 서열,
- JEV 스트레인 SA-14(Genbank#M55506)으로부터의 prM/M 서열을 인코딩하는 DNA 서열,
- JEV 스트레인 SA-14(Genbank#M55506)으로부터의 E[1-395] 서열을 인코딩하는 DNA 서열,
- 스페이서 서열 GGGS(서열번호 25)을 인코딩하는 서열번호 26의 DNA 서열,
- 서열번호 31의 SNAP-유사 서열,
- HisTag 서열을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA 서열.
또 다른 양상에서, 본 발명은 상기 벡터로 안정하게 형질감염된 재조합 세포에 관한 것이다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 a) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT)(EC 2.1.1.63) 또는 이의 돌연변이체 또는 촉매 도메인 및 b) 일본 뇌염 바이러스로부터의 가용성 E 단백질(sE)(JEV.sE)을 포함하는 융합 폴리펩타이드에 관한 것이다. 이러한 융합 폴리펩타이드에서, 상기 AGT 효소는 서열번호 2의 단백질 또는 (상기 정의된 바와 같은) 이의 상동체이다. 이러한 융합 폴리펩타이드는, 예를 들어, 서열번호 51의 아미노산 서열(JEV.sE/SNAP-유사/Histag 융합 단백질에 상응)이다.
따라서, 또 다른 양상에서, 본 발명은, 예를 들어, 본 발명의 면역분석으로 생물학적 샘플 중의 일본 뇌염 바이러스(JEV)의 존재를 확인하기 위한 이러한 융합 단백질 [SNAP-JEV.sE]의 용도에 관한 것이다.
바람직한 실시형태에서, 상기 플라비바이러스 항원은 일본 뇌염 바이러스 유전형 1(JE-1.EDIII), 유전형 2(JE-2.EDIII), 유전형 4(JE-4.EDIII), 또는 유전형 5(JE-5.EDIII)로부터의 외피 E 단백질의 도메인 III(EDIII 단백질)이다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 따라서 a) 상기 숙주 세포에서 기능성인 분비 시그널 펩타이드, 및 b) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT) 또는 이의 돌연변이체, 단편 또는 촉매 도메인, 및 c) 일본 뇌염 바이러스 유전형 1(JE-1.EDIII), 유전형 2(JE-3.EDIII), 유전형 4(JE-4.EDIII), 또는 유전형 5(JE-5.EDIII)로부터의 EDIII 단백질을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는, 숙주 세포에서 일본 뇌염 바이러스 유전형 1(JE-1.EDIII), 유전형 2(JE-2.EDIII), 유전형 4(JE-4.EDIII), 또는 유전형 5(JE-5.EDIII)로부터의 외피 E 단백질의 도메인 III(EDIII 단백질)을 발현시키기위한 벡터에 관한 것이다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 이른바 "pDeSNAP Univ/JE-I.EDIII 카세트", 즉, 일본 뇌염 바이러스 유전형 1로부터의 외피 E 단백질의 도메인 III(EDIII 단백질)(JE-1.EDIII)를 인코딩하는 서열이 삽입된 상기 정의된 바와 같은 pDeSNAPUniv DNA 카세트를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 하기를 포함하는 서열번호 52이 뉴클레오타이드 서열을 갖는 pDeSNAP Univ/ JE-1.EDIII 카세트를 포함한다:
- 서열번호 23의 곤충 BiP-유사 서열,
- 서열번호 31의 SNAP-유사 서열,
- 일본 뇌염 바이러스 유전형 1(Genebank#AY377577)로부터의 외피 E 단백질의 도메인 III(EDIII 단백질)를 인코딩하는 서열번호 54의 DNA서열,
- HisTag 서열을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA 서열.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 이른바 "pDeSNAP Univ/JE-2.EDIII 카세트", 즉, 일본 뇌염 바이러스 유전형 2로부터의 외피 E 단백질의 도메인 III(EDIII 단백질)(JE-2.EDIII)의 서열이 삽입된 상기 정의된 바와 같은 pDeSNAPUniv DNA 카세트를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 하기를 포함하는 서열번호 59의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 pDeSNAP Univ/ JE-2.EDIII 카세트를 포함한다:
- 서열번호 23의 곤충 BiP-유사 서열,
- 서열번호 31의 SNAP-유사 서열,
- 일본 뇌염 바이러스 유전형 2(Genebank#L-43566)로부터의 외피 E 단백질의 도메인 III(EDIII 단백질)를 인코딩하는 서열번호 55의 DNA서열,
- HisTag 서열을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA 서열.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 이른바 "pDeSNAP Univ/JE-4.EDIII 카세트", 즉, 일본 뇌염 바이러스 유전형 4로부터의 외피 E 단백질의 도메인 III(EDIII 단백질)(JE-4.EDIII)의 서열이 삽입된 상기 정의된 바와 같은 pDeSNAPUniv DNA 카세트를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 하기를 포함하는 서열번호 61의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 pDeSNAP Univ/ JE-4.EDIII 카세트를 포함한다:
- 서열번호 23의 곤충 BiP-유사 서열,
- 서열번호 31의 SNAP-유사 서열,
- 일본 뇌염 바이러스 유전형 4(Genebank#U70408)로부터의 외피 E 단백질의 도메인 III(EDIII 단백질)를 인코딩하는 서열번호 56의 DNA 서열,
- HisTag 서열을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA 서열.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 이른바 "pDeSNAP Univ/JE-5.EDIII 카세트", 즉, 일본 뇌염 바이러스 유전형 5로부터의 외피 E 단백질의 도메인 III(EDIII 단백질)(JE-5.EDIII)를 인코딩하는 서열이 삽입된 상기 정의된 바와 같은 pDeSNAPUniv DNA 카세트를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 하기를 포함하는 서열번호 63의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 pDeSNAP Univ/ JE-5.EDIII 카세트를 포함한다:
- 서열번호 23의 곤충 BiP-유사 서열,
- 서열번호 31의 SNAP-유사 서열,
- 일본 뇌염 바이러스 유전형 5(Genebank#JN587258)로부터의 외피 E 단백질의 도메인 III(EDIII 단백질)을 인코딩하는 서열번호 57의 DNA서열,
- HisTag 서열을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA 서열.
또 다른 양상에서, 본 발명은 상기 벡터로 안정하게 형질감염된 재조합 세포에 관한 것이다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 a) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT)(EC 2.1.1.63) 또는 이의 돌연변이체 또는 촉매 도메인 및 b) JE-1, JE-2, JE-4, 또는 JE-5 바이러스로부터의 EDIII 단백질을 포함하는 융합 폴리펩타이드에 관한 것이다. 이러한 융합 폴리펩타이드에서, 상기 AGT 효소는 서열번호 2의 단백질 또는 (상기 정의된 바와 같은) 이의 상동체이다. 이러한 융합 폴리펩타이드는, 예를 들어, 서열번호 53의 아미노산 서열(SNAP-유사/JE-1.EDIII/Histag 융합 단백질에 상응), 서열번호 60의 아미노산 서열(SNAP-유사/JE-2.EDIII/Histag 융합 단백질에 상응) 서열번호 62의 아미노산 서열(SNAP-유사/JE-4.EDIII/Histag 융합 단백질에 상응) 또는 서열번호 64(SNAP-유사/JE-5.EDIII/Histag 융합 단백질에 상응)이다.
따라서, 또 다른 양상에서, 본 발명은, 예를 들어, 본 발명의 면역분석으로 생물학적 샘플 중의 유전형 1, 2, 4 또는 5의 일본 뇌염 바이러스의 존재를 확인하기 위한 이러한 융합 단백질 [SNAP- JE-1.EDIII], [SNAP- JE-2.EDIII], [SNAP- JE-4.EDIII] 또는 [SNAP- JE-5.EDIII]의 용도에 관한 것이다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 숙주 세포에서 라벤스버그 바이러스(RabV)로부터의 외피 E 단백질의 도메인 III(EDIII 단백질)을 발현시키기 위한 벡터에 관한 것으로, a) 상기 숙주 세포에서 기능성인 분비 시그널 펩타이드, 및 b) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT) 또는 이의 돌연변이체, 단편 또는 촉매 도메인, 및 c) 라벤스버그 바이러스(RabV)로부터의 외피 E 단백질의 도메인 III(EDIII 단백질)를 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 이른바 "pDeSNAP Univ/RabV.EDIII 카세트", 즉, 라벤스버그 바이러스로부터의 EDIII 단백질의 서열이 삽입된 상기 정의된 바와 같은 pDeSNAPUniv DNA 카세트를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 하기를 포함하는 서열번호 65의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 pDeSNAP Univ/ RabV.EDIII 카세트를 포함한다:
- 서열번호 23의 곤충 BiP-유사 서열,
- 서열번호 31의 SNAP-유사 서열,
- 라벤스버그 바이러스(Genebank#AY65264)로부터의 외피 E 단백질의 도메인 III(EDIII 단백질)을 인코딩하는 서열번호 58의 DNA 서열,
- HisTag 서열을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA 서열.
또 다른 양상에서, 본 발명은 상기 벡터로 안정하게 형질감염된 재조합 세포에 관한 것이다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 a) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT)(EC 2.1.1.63) 또는 이의 돌연변이체 또는 촉매 도메인 및 b) 라벤스버그 바이러스로부터의 EDIII 단백질을 포함하는 융합 폴리펩타이드에 관한 것이다. 이러한 융합 폴리펩타이드에서, 상기 AGT 효소는 서열번호 2의 단백질 또는 (상기 정의된 바와 같은) 이의 상동체이다. 이러한 융합 폴리펩타이드는, 예를 들어, 서열번호 66의 아미노산 서열 (SNAP-유사/RabV.EDIII/Histag 융합 단백질에 상응)이다.
따라서, 또 다른 양상에서, 본 발명은, 예를 들어, 본 발명의 면역분석으로 생물학적 샘플 중의 라벤스버그 바이러스의 존재를 확인하기 위한 이러한 융합 단백질 [SNAP- RabV.EDIII]의 용도에 관한 것이다.
알파바이러스 항원
또 다른 양상에서, 본 발명은 숙주 세포에서 특정 알파바이러스 항원, 예를 들어, 로스 강 바이러스로부터의 가용성 E2 단백질(RR.sE2) 또는 마야로 바이러스로부터의 가용성 E2 단백질(MAY.sE2)를 발현시키기 위한 벡터에 관한 것이다.
특히, 본 발명은 a) 상기 숙주 세포에서 기능성인 분비 시그널 펩타이드, 및 b) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT) 또는 이의 돌연변이체, 단편 또는 촉매 도메인, 및 c) 로스 강 바이러스로부터의 sE2 단백질을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 벡터에 관한 것이다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 이른바 "pDeSNAP Univ/RR.sE2 카세트", 즉, 로스 강 바이러스로부터의 sE2 유전자의 서열이 삽입된 상기 정의된 바와 같은 pDeSNAPUniv DNA 카세트를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 하기를 포함하는 서열번호 69의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 pDeSNAP Univ/ RR.sE2 카세트를 포함한다:
- 서열번호 22의 곤충 BiP 서열,
- 로스 강 바이러스 스트레인 QML1(Genbank#GQ433354)의 sE2 단백질을 인코딩하는 DNA 서열,
- 서열번호 31의 SNAP-유사 서열,
- HisTag 서열을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA 서열.
또 다른 양상에서, 본 발명은 상기 벡터로 안정하게 형질감염된 재조합 세포에 관한 것이다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 a) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT)(EC 2.1.1.63) 또는 이의 돌연변이체 또는 촉매 도메인 및 b) 로스 강 바이러스로부터의 sE2 단백질을 포함하는 융합 폴리펩타이드에 관한 것이다. 이러한 융합 폴리펩타이드에서, 상기 AGT 효소는 서열번호 2의 단백질 또는 (상기 정의된 바와 같은) 이의 상동체이다. 이러한 융합 폴리펩타이드는, 예를 들어, 서열번호 70의 아미노산 서열(RR.sE2/SNAP-유사/Histag 융합 단백질에 상응)이다.
따라서, 또 다른 양상에서, 본 발명은, 예를 들어, 본 발명의 면역분석으로 생물학적 샘플 중의 로스 강 바이러스의 존재를 확인하기 위한 이러한 융합 단백질 [SNAP- RR.sE2]의 용도에 관한 것이다.
본 발명은 또한 숙주 세포에서 마야로 바이러스로부터의 가용성 E2 단백질(MAY.sE2)을 발현시키기 위한 벡터에 관한 것으로, a) 상기 숙주 세포에서 기능성인 분비 시그널 펩타이드, 및 b) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT) 또는 이의 돌연변이체, 단편 또는 촉매 도메인, 및 c) 마야로 바이러스로부터의 sE2 단백질을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 이른바 "pDeSNAP Univ/MAY.sE2 카세트", 즉, 마야로 바이러스로부터의 sE2 유전자의 서열이 삽입된 상기 정의된 바와 같은 pDeSNAPUniv DNA 카세트를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 하기를 포함하는 서열번호 71의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 pDeSNAP Univ/MAY.sE2 카세트를 포함한다:
- 서열번호 22의 곤충 BiP 서열,
- 마야로 바이러스 스트레인 IQD2668(Genbank#DQ487429.1)의 수정된 sE2 단백질(E2-S203C)을 인코딩하는 DNA 서열,
- 서열번호 31의 SNAP-유사 서열,
- HisTag 서열을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA 서열.
또 다른 양상에서, 본 발명은 상기 벡터로 안정하게 형질감염된 재조합 세포에 관한 것이다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 a) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT)(EC 2.1.1.63) 또는 이의 돌연변이체 또는 촉매 도메인 및 b) 마야로 바이러스로부터의 sE2 단백질(MAY.sE2)을 포함하는 융합 단백질에 관한 것이다. 이러한 융합 폴리펩타이드에서, 상기 AGT 효소는 서열번호 2의 단백질 또는 (상기 정의된 바와 같은) 이의 상동체이다. 이러한 융합 폴리펩타이드는, 예를 들어, 서열번호 72의 아미노산 서열(MAY.sE2/SNAP-유사/Histag 융합 단백질에 상응)이다.
따라서, 또 다른 양상에서, 본 발명은, 예를 들어, 본 발명의 면역분석으로 생물학적 샘플 중의 마야로 바이러스의 존재를 확인하기 위한 이러한 융합 단백질 [SNAP- MAY.sE2]의 용도에 관한 것이다.
말 뇌염 바이러스 항원
또 다른 양상에서, 본 발명은 숙주 세포에서 특정 말 뇌염 바이러스 항원, 예를 들어, 서부 말 뇌염 바이러스로부터의 가용성 E2 단백질(WEE.sE2), 동부 말 뇌염 바이러스로부터의 가용성 E2 단백질(EEE.sE2) 또는 베네주엘라 말 뇌염 바이러스로부터의 가용성 E2 단백질(VEE.sE2)을 발현시키 위한 벡터에 관한 것이다.
특히, 본 발명은 a) 상기 숙주 세포에서 기능성인 분비 시그널 펩타이드, 및 b) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT) 또는 이의 돌연변이체, 단편 또는 촉매 도메인, 및 c) 서부 말 뇌염 바이러스로부터의 가용성 E2 단백질을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 벡터에 관한 것이다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 이른바 "pDeSNAP Univ/ WEE.sE2 카세트", 즉, 서부 말 뇌염으로부터의 sE2 유전자의 서열이 삽입된 상기 정의된 바와 같은 pDeSNAPUniv DNA 카세트를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 하기를 포함하는 서열번호 73의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 pDeSNAP Univ/ WEE.sE2 카세트를 포함한다:
- 서열번호 22의 곤충 BiP 서열,
- 서부 말 뇌염 바이러스 스트레인(Genbank#NC00390808)으로부터의 sE2 단백질을 인코딩하는 DNA 서열,
- 서열번호 31의 SNAP-유사 서열,
- HisTag 서열을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA 서열.
또 다른 양상에서, 본 발명은 상기 벡터로 안정하게 형질감염된 재조합 세포에 관한 것이다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 a) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT)(EC 2.1.1.63) 또는 이의 돌연변이체 또는 촉매 도메인 및 b) WEE 바이러스의 sE2 단백질을 포함하는 융합 폴리펩타이드에 관한 것이다. 이러한 융합 폴리펩타이드에서, 상기 AGT 효소는 서열번호 2의 단백질 또는 (상기 정의된 바와 같은) 이의 상동체이다. 이러한 융합 폴리펩타이드는, 예를 들어, 서열번호 74의 아미노산 서열(WEE.sE2/SNAP-유사/Histag 융합 단백질에 상응)이다.
따라서, 또 다른 양상에서, 본 발명은, 예를 들어, 본 발명의 면역분석으로 생물학적 샘플 중의 서부 말 뇌염 바이러스의 존재를 확인하기 위한 이러한 융합 단백질 [SNAP- WEE.sE2]의 용도에 관한 것이다.
또 다른 실시형태에서, 본 발명은 숙주 세포에서 동부 말 뇌염 바이러스로부터의 가용성 E2 단백질(EEE.sE2)을 발현시키기 위한 벡터에 관한 것으로서, a) 상기 숙주 세포에서 기능성인 분비 시그널 펩타이드, 및 b) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT) 또는 이의 돌연변이체, 단편 또는 촉매 도메인, 및 c) 동부 말 뇌염 바이러스로부터의 가용성 E2 단백질을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 이른바 "pDeSNAP Univ/ EEE.sE2 카세트", 즉, 동부 말 뇌염 바이러스로부터의 sE2 유전자의 서열이 삽입된 상기 정의된 바와 같은 pDeSNAPUniv DNA 카세트를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 하기를 포함하는 서열번호 75의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 pDeSNAP Univ/ EEE.sE2 카세트를 포함한다:
- 서열번호 22의 곤충 BiP 서열,
- 동부 말 뇌염 바이러스 스트레인(Genbank#EF151502)으로부터의 sE2 단백질을 인코딩하는 DNA 서열,
- 서열번호 31의 SNAP-유사 서열,
- HisTag 서열을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA 서열.
또 다른 양상에서, 본 발명은 상기 벡터로 안정하게 형질감염된 재조합 세포에 관한 것이다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 a) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT)(EC 2.1.1.63) 또는 이의 돌연변이체 또는 촉매 도메인 및 b) EEE 바이러스로부터의 sE2 단백질을 포함하는 융합 폴리펩타이드에 관한 것이다. 이러한 융합 폴리펩타이드에서, 상기 AGT 효소는 서열번호 2의 단백질 또는 (상기 정의된 바와 같은) 이의 상동체이다. 이러한 융합 폴리펩타이드는, 예를 들어, 서열번호 76의 아미노산 서열(EEE.sE2/SNAP-유사/Histag 융합 단백질에 상응)이다.
따라서, 또 다른 양상에서, 본 발명은, 예를 들어, 본 발명의 면역분석으로 생물학적 샘플 중의 동부 말 뇌염 바이러스의 존재를 확인하기 위한 이러한 융합 단백질 [SNAP- EEE.sE2]의 용도에 관한 것이다.
또 다른 실시형태에서, 본 발명은 숙주 세포에서 베네주엘라 말 뇌염 바이러스로부터의 가용성 E2 단백질(VEE.sE2)을 발현시키기 위한 벡터에 관한 것으로서, a) 상기 숙주 세포에서 기능성인 분비 시그널 펩타이드, 및 b) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT) 또는 이의 돌연변이체, 단편 또는 촉매 도메인, 및 c) 베네주엘라 말 뇌염 바이러스로부터의 가용성 E2 단백질을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 이른바 "pDeSNAP Univ/ VEE.sE2 카세트", 즉, 베네주엘라 말 뇌염 바이러스로부터의 sE2 서열이 삽입된 상기 정의된 바와 같은 pDeSNAPUniv DNA 카세트를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 하기를 포함하는 서열번호 77의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 pDeSNAP Univ/ VEE.sE2 카세트를 포함한다:
- 서열번호 22의 곤충 BiP 서열,
- 베네주엘라 말 뇌염 바이러스 스트레인(Genbank#AY973944)으로부터의 sE2 단백질을 인코딩하는 DNA 서열,
- 서열번호 31의 SNAP-유사 서열,
- HisTag 서열을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA 서열.
또 다른 양상에서, 본 발명은 상기 벡터로 안정하게 형질감염된 재조합 세포에 관한 것이다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 a) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT)(EC 2.1.1.63) 또는 이의 돌연변이체 또는 촉매 도메인 및 b) VEE 바이러스로부터의 sE2 단백질을 포함하는 융합 폴리펩타이드에 관한 것이다. 이러한 융합 폴리펩타이드에서, 상기 AGT 효소는 서열번호 2의 단백질 또는 (상기 정의된 바와 같은) 이의 상동체이다. 이러한 융합 폴리펩타이드는, 예를 들어, 서열번호 78의 아미노산 서열(VEE.sE2/SNAP-유사/Histag 융합 단백질에 상응)이다.
따라서, 또 다른 양상에서, 본 발명은, 예를 들어, 본 발명의 면역분석으로 생물학적 샘플 중의 베네주엘라 말 뇌염 바이러스의 존재를 확인하기 위한 이러한 융합 단백질 [SNAP- VEE.sE2]의 용도에 관한 것이다.
오쏘부냐바이러스 항원
또 다른 양상에서, 본 발명은 숙주 세포에서 특정 오쏘부냐바이러스 항원, 특히 아카반 바이러스로부터의 핵단백질 N(AKA.N), 아이노 바이러스의 핵단백질 N(AIN.N) 또는 샤몬다 바이러스의 핵단백질 N(SHA.N)을 발현시키기 위한 벡터에 관한 것이다.
특히, 본 발명은 a) 상기 숙주 세포에서 기능성인 분비 시그널 펩타이드, 및 b) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT) 또는 이의 돌연변이체, 단편 또는 촉매 도메인, 및 c) 아카반 바이러스로부터의 핵단백질 N을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 벡터에 관한 것이다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 이른바 "pDeSNAP Univ/AKA.N 카세트", 즉, 아카반 바이러스로부터의 핵 단백질 N을 인코딩하는 서열이 삽입된 상기 정의된 바와 같은 pDeSNAPUniv DNA 카세트를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 하기를 포함하는 서열번호 79의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 pDeSNAP Univ/ AKA.N 카세트를 포함한다:
- 서열번호 22의 곤충 BiP 서열,
- 서열번호 31의 SNAP-유사 서열,
- 스페이서 서열 GGGS(서열번호 25)을 인코딩하는 서열번호 26의 제1 DNA 서열,
- 서열 ENLYFQS(서열번호 32)의 pro-TEV1 개열 부위를 인코딩하는 서열번호 29의 DNA 서열,
- 아카반 바이러스의 천연 N 핵단백질을 인코딩하는 DNA 서열,
- 서열 ENLYFQG(서열번호 33)의 pro-TEV2 개열 부위를 인코딩하는 서열번호 30의 DNA 서열,
- 스페이서 서열 GGGS(서열번호 25)을 인코딩하는 서열번호 26의 제2 DNA 서열,
- HisTag 서열을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA 서열.
또 다른 양상에서, 본 발명은 상기 벡터로 안정하게 형질감염된 재조합 세포에 관한 것이다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 a) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT)(EC 2.1.1.63) 또는 이의 돌연변이체 또는 촉매 도메인 및 b) 아카반 바이러스로부터의 N 핵단백질을 포함하는 융합 폴리펩타이드에 관한 것이다. 이러한 융합 폴리펩타이드에서, 상기 AGT 효소는 서열번호 2의 단백질 또는 (상기 정의된 바와 같은) 이의 상동체이다. 이러한 융합 폴리펩타이드는, 예를 들어, 서열번호 80의 아미노산 서열(SNAP-유사/proTEV1/AKA.N/pro-TEV2/Histag 융합 단백질에 상응)이다.
따라서, 또 다른 양상에서, 본 발명은, 예를 들어, 본 발명의 면역분석으로 생물학적 샘플 중의 아카반 바이러스의 존재를 확인하기 위한 이러한 융합 단백질 [SNAP- AKA.N]의 용도에 관한 것이다.
또 다른 실시형태에서, 본 발명은 숙주 세포에서 아이노 바이러스로부터의 핵단백질 N(AIN.N)을 발현시키기 위한 벡터에 관한 것으로서, a) 상기 숙주 세포에서 기능성인 분비 시그널 펩타이드, 및 b) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT) 또는 이의 돌연변이체, 단편 또는 촉매 도메인, 및 c) 아이노 바이러스로부터의 핵단백질 N을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 이른바 "pDeSNAP Univ/AIN.N 카세트", 즉, 아이노 바이러스로부터의 핵단백질 N을 암호호하는 유전자의 서열이 삽입된 상기 정의된 바와 같은 pDeSNAPUniv DNA 카세트를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 하기를 포함하는 서열번호 81의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 pDeSNAP Univ/AIN.N 카세트를 포함한다:
- 서열번호 22의 곤충 BiP 서열,
- 서열번호 31의 SNAP-유사 서열,
- 스페이서 서열 GGGS(서열번호 25)을 인코딩하는 서열번호 26의 제1 DNA 서열,
- 서열 ENLYFQS(서열번호 32)의 pro-TEV1 개열 부위를 인코딩하는 서열번호 29의 DNA 서열,
- 아이노 바이러스로부터의 천연 N 핵단백질을 인코딩하는 DNA 서열,
- 서열 ENLYFQG(서열번호 33)의 pro-TEV2 개열 부위를 인코딩하는 서열번호 30의 DNA 서열,
- 스페이서 서열 GGGS(서열번호 25)을 인코딩하는 서열번호 26의 제2 DNA 서열,
- HisTag 서열을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA 서열.
또 다른 양상에서, 본 발명은 상기 벡터로 안정하게 형질감염된 재조합 세포에 관한 것이다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 a) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT)(EC 2.1.1.63) 또는 이의 돌연변이체 또는 촉매 도메인 및 b) 아이노 바이러스로부터의 N 핵단백질을 포함하는 융합 폴리펩타이드에 관한 것이다. 이러한 융합 폴리펩타이드에서, 상기 AGT 효소는 서열번호 2의 단백질 또는 (상기 정의된 바와 같은) 이의 상동체이다. 이러한 융합 폴리펩타이드는, 예를 들어, 서열번호 82의 아미노산 서열(SNAP-유사/proTEV1/AIN.N/pro-TEV2/Histag 융합 단백질에 상응)이다.
따라서, 또 다른 양상에서, 본 발명은, 예를 들어, 본 발명의 면역분석으로 생물학적 샘플 중의 아이노 바이러스의 존재를 확인하기 위한 이러한 융합 단백질 [SNAP- AIN.N]의 용도에 관한 것이다.
또 다른 실시형태에서, 본 발명은 숙주 세포에서 샤몬다 바이러스로부터의 핵단백질 N(SHA.N)을 발현시키기 위한 벡터에 관한 것으로서, a) 상기 숙주 세포에서 기능성인 분비 시그널 펩타이드, 및 b) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT) 또는 이의 돌연변이체, 단편 또는 촉매 도메인, 및 c) 샤몬다 바이러스로부터의 핵단백질 N을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 이른바 "pDeSNAP Univ/SHA.N 카세트", 즉, 샤몬다 바이러스로부터의 핵단백질 N을 인코딩하는 유전자의 서열이 삽입된 상기 정의된 바와 같은 pDeSNAPUniv DNA 카세트를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 하기를 포함하는 서열번호 83의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 pDeSNAP Univ/SHA.N 카세트를 포함한다:
- 서열번호 22의 곤충 BiP 서열,
- 서열번호 31의 SNAP-유사 서열,
- 스페이서 서열 GGGS(서열번호 25)을 인코딩하는 서열번호 26의 제1 DNA 서열,
- 서열 ENLYFQS(서열번호 32)의 pro-TEV1 개열 부위를 인코딩하는 서열번호 29의 DNA 서열,
- 샤몬다 바이러스로부터의 천연 N 핵단백질을 인코딩하는 DNA 서열,
- 서열 ENLYFQG(서열번호 33)의 pro-TEV2 개열 부위를 인코딩하는 서열번호 30의 DNA 서열,
- 스페이서 서열 GGGS(서열번호 25)을 인코딩하는 서열번호 26의 제2 DNA 서열,
- HisTag 서열을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA 서열.
또 다른 양상에서, 본 발명은 상기 벡터로 안정하게 형질감염된 재조합 세포에 관한 것이다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 a) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT)(EC 2.1.1.63) 또는 이의 돌연변이체 또는 촉매 도메인 및 b) 샤몬다 바이러스로부터의 N 핵단백질을 포함하는 융합 폴리펩타이드에 관한 것이다. 이러한 융합 폴리펩타이드에서, 상기 AGT 효소는 서열번호 2의 단백질 또는 (상기 정의된 바와 같은) 이의 상동체이다. 이러한 융합 폴리펩타이드는, 예를 들어, 서열번호 84의 아미노산 서열(SNAP-유사/proTEV1/SHA.N/pro-TEV2/Histag 융합 단백질에 상응)이다.
따라서, 또 다른 양상에서, 본 발명은, 예를 들어, 본 발명의 면역분석으로 생물학적 샘플 중의 샤몬다 바이러스의 존재를 확인하기 위한 이러한 융합 단백질 [SNAP- SHA.N]의 용도에 관한 것이다.
베타코로나바이러스 항원
또 다른 양상에서, 본 발명은 숙주 세포에서 특정 베타코로나바이러스 항원, 예를 들어, 인간 베타코로나바이러스로부터의 핵단백질 N(huCOV.N) 또는 인간 베타코로나바이러스로부터의 단백질 S(huCOV.S)를 발현시키기위한 벡터에 관한 것이다.
특히, 본 발명은 a) 상기 숙주 세포에서 기능성인 분비 시그널 펩타이드, 및 b) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT) 또는 이의 돌연변이체, 단편 또는 촉매 도메인, 및 c) 인간 베타코로나바이러스로부터의 핵단백질 N을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 벡터에 관한 것이다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 이른바 "pDeSNAP Univ/huCOV.N 카세트", 즉, 인간 베타코로나 바이러스로부터의 핵단백질 N을 인코딩하는 유전자의 서열이 삽입된 상기 정의된 바와 같은 pDeSNAPUniv DNA 카세트를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 하기를 포함하는 서열번호 85의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 pDeSNAP Univ/huCOV.N 카세트를 포함한다:
- 서열번호 22의 곤충 BiP 서열,
- 서열번호 31의 SNAP-유사 서열,
- 서열 ENLYFQS(서열번호 32)의 pro-TEV1 개열 부위를 인코딩하는 서열번호 29의 DNA 서열,
- 인간 베타코로나바이러스 2cEMC/2012(Genbank#JX869059)로부터의 유전자 N을 인코딩하는 DNA 서열,
- 서열 ENLYFQG(서열번호 33)의 pro-TEV2 개열 부위를 인코딩하는 서열번호 30의 DNA 서열,
- HisTag 서열을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA 서열.
또 다른 양상에서, 본 발명은 상기 벡터로 안정하게 형질감염된 재조합 세포에 관한 것이다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 a) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT)(EC 2.1.1.63) 또는 이의 돌연변이체 또는 촉매 도메인 및 b) 인간 베타코로나바이러스로부터의 핵단백질 N을 포함하는 융합 폴리펩타이드에 관한 것이다. 이러한 융합 폴리펩타이드에서, 상기 AGT 효소는 서열번호 2의 단백질 또는 (상기 정의된 바와 같은) 이의 상동체이다. 이러한 융합 폴리펩타이드는, 예를 들어, 서열번호 86의 아미노산 서열 (SNAP-유사/proTEV1/huCOV.N/proTEV2/Histag 융합 단백질에 상응)이다.
따라서, 또 다른 양상에서, 본 발명은, 예를 들어, 본 발명의 면역분석으로 생물학적 샘플 중의 인간 베타코로나 바이러스의 존재를 확인하기 위한 이러한 융합 단백질 [SNAP- huCOV.N]의 용도에 관한 것이다.
또 다른 실시형태에서, 본 발명은 숙주 세포에서 인간 베타코로나바이러스로부터의 스파이크 S 단백질의 가용성 형태(huCOV.S)를 발현시키기 위한 벡터에 관한 것으로서, a) 상기 숙주 세포에서 기능성인 분비 시그널 펩타이드, 및 b) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT) 또는 이의 돌연변이체, 단편 또는 촉매 도메인, 및 c) 인간 베타코로나바이러스로부터의 스파이크 S 단백질의 가용성 형태를 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 이른바 "pDeSNAP Univ/huCOV.S 카세트", 즉, 인간 베타코로나 바이러스로부터의 유전자 S의 서열이 삽입된 상기 정의된 바와 같은 pDeSNAPUniv DNA 카세트를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 하기를 포함하는 서열번호 87의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 pDeSNAP Univ/huCOV.S 카세트를 포함한다:
- 서열번호 22의 곤충 BiP 서열,
- 인간 베타코로나바이러스 2cEMC/2012(Genbank#JX869059)로부터의 유전자 S를 인코딩하는 DNA 서열,
- 스페이서 서열 GGGS(서열번호 25)을 인코딩하는 서열번호 26의 DNA 서열,
- 서열번호 31의 SNAP-유사 서열,
- HisTag 서열을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA 서열.
또 다른 실시형태에서, 벡터는 서열번호 154의 뉴클레오타이드 서열을 갖고/갖거나 서열번호 155의 아미노산 서열을 인코딩하는 DeSNAPuniv-SARS 바이러스 N 단백질 카세트를 포함한다. 벡터는 SNAP의 시그널 펩타이드, SNAP 서열, pro-TEV 부위, 또는 도 12에 도시된 SARS 코로나바이러스의 돌연변이된 단백질을 인코딩하는 DNA 서열, 또는 이의 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 40, 50, 60, 100, 200 또는 300개의 연속 아미노산을 단독으로 또는 조합하여 포함한다.
또 다른 실시형태에서, 벡터는 서열번호 156의 뉴클레오타이드 서열을 갖고/갖거나 서열번호 157의 아미노산 서열을 인코딩하는 DeSNAP+SARS S-RDB 카세트를 포함한다. 벡터는 SNAP의 시그널 펩타이드, SNAP 서열, pro-TEV 부위, 또는 도 13에 도시된 SARS 바이러스의 S 단백질의 수용체 결합 도메인을 인코딩하는 DNA 서열, 또는 이의 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 40, 50, 60, 100, 200 또는 300개의 연속 아미노산을 단독으로 또는 조합하여 포함한다.
또 다른 실시형태에서, 또 다른 실시형태에서, 벡터는 서열번호 158의 뉴클레오타이드 서열을 갖고/갖거나 서열번호 159의 아미노산 서열을 인코딩하는 DeSNAPuniv-huCOV.N(인간 코로나바이러스) 카세트를 포함한다. 벡터는 SNAP의 시그널 펩타이드, SNAP 서열, pro-TEV 부위, 또는 도 14에 도시된 인간 베타코로나바이러스의 유전자 N을 인코딩하는 DNA 서열, 또는 이의 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 40, 50, 60, 100, 200 또는 300개의 연속 아미노산을 단독으로 또는 조합하여 포함한다.
또 다른 실시형태에서, 벡터는 서열번호 160의 뉴클레오타이드 서열을 갖고/갖거나 서열번호 161의 아미노산 서열을 인코딩하는 -huCOV.S1+DeSNAP(인간 코로나바이러스) 카세트를 포함한다. 벡터는 키메라 단백질의 시그널 펩타이드, SNAP 서열, 또는 도 15에 도시된 인간 베타코로나바이러스의 유전자 S1을 인코딩하는 DNA 서열, 또는 이의 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 40, 50, 60, 100, 200 또는 300개의 연속 아미노산을 단독으로 또는 조합하여 포함한다.
또 다른 실시형태에서, 벡터는 서열번호 162의 뉴클레오타이드 서열을 갖고/갖거나 서열번호 163의 아미노산 서열을 인코딩하는 DeSNAPuniv-huCoV.S-RDB 카세트를 포함한다. 벡터는 키메라 단백질의 시그널 펩타이드, SNAP 서열, pro-TEV 부위, 또는 도 16에 도시된 인간 베타코로나바이러스의 S 단백질의 RBD를 인코딩하는 DNA 서열, 또는 이의 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 40, 50, 60, 100, 200 또는 300개의 연속 아미노산을 단독으로 또는 조합하여 포함한다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 상기 벡터로 안정하게 형질감염된 재조합 세포에 관한 것이다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 a) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT)(EC 2.1.1.63) 또는 이의 돌연변이체 또는 촉매 도메인 및 b) 인간 베타코로나바이러스로부터의 스파이크 S 단백질의 가용성 형태를 포함하는 융합 폴리펩타이드에 관한 것이다. 이러한 융합 폴리펩타이드에서, 상기 AGT 효소는 서열번호 2의 단백질 또는 (상기 정의된 바와 같은) 이의 상동체이다. 이러한 융합 폴리펩타이드는, 예를 들어, 서열번호 88의 아미노산 서열(huCOV.S/SNAP-유사/Histag 융합 단백질에 상응)이다.
따라서, 또 다른 양상에서, 본 발명은, 예를 들어, 본 발명의 면역분석으로 생물학적 샘플 중의 인간 베타코로나 바이러스의 존재를 확인하기 위한 이러한 융합 단백질 [SNAP- huCOV.S]의 용도에 관한 것이다.
헤파시바이러스 항원
또 다른 양상에서, 본 발명은 숙주 세포에서 특정 헤파시바이러스 항원, 예를 들어, C형 간염 바이러스로부터의 단백질 C(HCV.C) 또는 E형 간염 바이러스로부터의 단백질 C(HEV.C)를 발현시키기 위한 벡터에 관한 것이다.
하나의 실시형태에서, 본 발명은 a) 상기 숙주 세포에서 기능성인 분비 시그널 펩타이드, 및 b) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT) 또는 이의 돌연변이체, 단편 또는 촉매 도메인, 및 c) C형 간염 바이러스로부터의 단백질 C를 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 벡터에 관한 것이다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 이른바 "pDeSNAP Univ/HCV.C 카세트", 즉, C형 간염 바이러스로부터의 단백질 C의 유전자의 서열이 삽입된 상기 정의된 바와 같은 pDeSNAPUniv DNA 카세트를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 하기를 포함하는 서열번호 89의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 pDeSNAP Univ/HCV.C 카세트를 포함한다:
- 서열번호 22의 곤충 BiP 서열,
- 서열번호 31의 SNAP-유사 서열,
- 스페이서 서열 GGGS(서열번호 25)을 인코딩하는 서열번호 26의 제1 DNA 서열,
- 서열 ENLYFQS(서열번호 32)의 pro-TEV1 개열 부위를 인코딩하는 서열번호 29의 DNA 서열,
- C형 간염 바이러스 유전형 1b(스트레인 TCHM-R2/03)로부터의 C 단백질을 인코딩하는 DNA 서열 ,
- 서열 ENLYFQG(서열번호 33)의 pro-TEV2 개열 부위를 인코딩하는 서열번호 30의 DNA 서열,
- HisTag 서열을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA 서열.
또 다른 실시형태에서, 벡터는 서열번호 170의 뉴클레오타이드 서열을 갖고/갖거나 서열번호 171의 아미노산 서열을 인코딩하는 DeSNAPuniv-HEV.C 카세트를 포함한다. 벡터는 SNAP의 시그널 펩타이드, SNAP 서열, pro-TEV 부위, 또는 도 20에 도시된 E형 간염 바이러스의 돌연변이된 C 단백질을 인코딩하는 DNA 서열, 또는 이의 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 40, 50, 60, 100, 200 또는 300개의 연속 아미노산을 단독으로 또는 조합하여 포함한다.
또 다른 실시형태에서, 벡터는 서열번호 172의 뉴클레오타이드 서열을 갖고/갖거나 서열번호 173의 아미노산 서열을 인코딩하는 DeSNAPuniv-HEV.C 단백질 중심 도메인 카세트를 포함한다. 벡터는 SNAP의 시그널 펩타이드, SNAP 서열, pro-TEV 부위, 또는 도 21에 도시된 HEV 코어 항원을 인코딩하는 DNA 서열, 또는 이의 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 40, 50, 60, 100, 200 또는 300개의 연속 아미노산을 단독으로 또는 조합하여 포함한다.
또 다른 실시형태에서, 또 다른 실시형태에서, 벡터는 서열번호 174의 뉴클레오타이드 서열을 갖고/갖거나 서열번호 175의 아미노산 서열을 인코딩하는 DeSNAPuniv-HCV 코어 항원 카세트를 포함한다. 벡터는 SNAP의 시그널 펩타이드, SNAP 서열, pro-TEV 부위, 또는 도 22에 도시된 HCV 코어 항원을 인코딩하는 DNA 서열, 또는 이의 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 40, 50, 60, 100, 200 또는 300개의 연속 아미노산을 단독으로 또는 조합하여 포함한다.
또 다른 실시형태에서, 벡터는 서열번호 176의 뉴클레오타이드 서열을 갖고/갖거나 서열번호 177의 아미노산 서열을 인코딩하는 DeSNAPuniv-짧은 HCV 코어(C) 카세트를 포함한다. 벡터는 SNAP의 시그널 펩타이드, SNAP 서열, pro-TEV 부위, 또는 도 23에 도시된 HCV 코어 단백질의 짧은 형태를 인코딩하는 DNA 서열, 또는 이의 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 40, 50, 60, 100, 200 또는 300개의 연속 아미노산을 단독으로 또는 조합하여 포함한다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 상기 벡터로 안정하게 형질감염된 재조합 세포에 관한 것이다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 a) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT)(EC 2.1.1.63) 또는 이의 돌연변이체 또는 촉매 도메인 및 b) C형 간염 바이러스로부터의 단백질 C(HCV.C)를 포함하는 융합 폴리펩타이드에 관한 것이다. 이러한 융합 폴리펩타이드에서, 상기 AGT 효소는 서열번호 2의 단백질 또는(상기 정의된 바와 같은) 이의 상동체이다. 이러한 융합 폴리펩타이드는, 예를 들어, 서열번호 90의 아미노산 서열(SNAP-유사/proTEV1/HCV.C/proTEV2/Histag 융합 단백질에 상응)이다.
따라서, 또 다른 양상에서, 본 발명은, 예를 들어, 본 발명의 면역분석으로 생물학적 샘플 중의 C형 간염 바이러스의 존재를 확인하기 위한 이러한 융합 단백질 [SNAP- HCV.C]의 용도에 관한 것이다.
또 다른 실시형태에서, 본 발명은 a) 상기 숙주 세포에서 기능성인 분비 시그널 펩타이드, 및 b) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT) 또는 이의 돌연변이체, 단편 또는 촉매 도메인, 및 c) E형 간염 바이러스의 단백질 C(HEV.C)를 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 벡터에 관한 것이다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 이른바 "pDeSNAP Univ/HEV.C 카세트", 즉, E형 간염 바이러스로부터의 단백질 C의 유전자의 서열이 삽입된 상기 정의된 바와 같은 pDeSNAPUniv DNA 카세트를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 하기를 포함하는 서열번호 150의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 pDeSNAP Univ/HEV.C 카세트를 포함한다:
- 서열번호 23의 곤충 BiP-유사 서열,
- 서열번호 31의 SNAP-유사 서열,
- 스페이서 서열 GGGS(서열번호 25)을 인코딩하는 서열번호 26의 제1 DNA 서열,
- 서열 ENLYFQS(서열번호 32)의 pro-TEV1 개열 부위를 인코딩하는 서열번호 29의 DNA 서열,
- E형 간염 바이러스(Genbank#AB29196)로부터의 C 단백질을 인코딩하는 DNA 서열,
- 서열 ENLYFQG(서열번호 33)의 pro-TEV2 개열 부위를 인코딩하는 서열번호 30의 DNA 서열,
- HisTag 서열을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA 서열.
또 다른 양상에서, 본 발명은 상기 벡터로 안정하게 형질감염된 재조합 세포에 관한 것이다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 a) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT)(EC 2.1.1.63) 또는 이의 돌연변이체 또는 촉매 도메인 및 b) E형 간염 바이러스로부터의 단백질 C(HEV.C)를 포함하는 융합 폴리펩타이드에 관한 것이다. 이러한 융합 폴리펩타이드에서, 상기 AGT 효소는 서열번호 2의 단백질 또는 (상기 정의된 바와 같은) 이의 상동체이다. 이러한 융합 폴리펩타이드는, 예를 들어, 서열번호 151의 아미노산 서열(SNAP-유사/proTEV1/HEV.C/proTEV2/Histag 융합 단백질에 상응)이다.
따라서, 또 다른 양상에서, 본 발명은, 예를 들어, 본 발명의 면역분석으로 생물학적 샘플 중의 E형 간염 바이러스의 존재를 확인하기 위한 이러한 융합 단백질 [SNAP- HEV.C]의 용도에 관한 것이다.
말라리아 항원
또 다른 양상에서, 본 발명은 숙주 세포에서 특정 말라리아 항원, 예를 들어, 플라스모듐 팔시파룸으로부터의 MSP-1 및 AMA-1 단백질(MSP-1+AMA-1)(참조: Pan W. et al, The Journal of Immunology, 2004)을 발현시키기 위한 벡터에 관한 것이다.
특히, 본 발명은 a) 상기 숙주 세포에서 기능성인 분비 시그널 펩타이드, 및 b) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT) 또는 이의 돌연변이체, 단편 또는 촉매 도메인, 및 c) 기생충 플라스모듐 팔시파룸으로부터의 MSP-1 및 AMA-1 단백질을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 벡터에 관한 것이다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 이른바 "pDeSNAP Univ/MSP-1+AMA-1카세트", 즉, 기생충 플라스모듐 팔시파룸으로부터의 MSP-1 및 AMA-1 단백질을 인코딩하는 서열이 삽입된 상기 정의된 바와 같은 pDeSNAPUniv DNA 카세트를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 하기를 포함하는 서열번호 91의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 pDeSNAP Univ/MSP-1+AMA-1카세트를 포함한다:
- 서열번호 22의 곤충 BiP 서열,
- 서열번호 31의 SNAP-유사 서열,
- 스페이서 서열 GGGS(서열번호 25)을 인코딩하는 서열번호 26의 제1 DNA 서열,
- 플라스모듐 팔시파룸으로부터의 MSP-1(19) 서열(50% G+C)을 인코딩하는 DNA 서열,
- 서열 ENLYFQG(서열번호 33)의 pro-TEV2 개열 부위를 인코딩하는 서열번호 30의 DNA 서열,
- 플라스모듐 팔시파룸으로부터의 AMA-1(III) 서열(50% G+C)을 인코딩하는 DNA 서열,
- 스페이서 서열 GGGS(서열번호 25)을 인코딩하는 서열번호 26의 제2 DNA 서열,
- HisTag 서열을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA 서열.
또 다른 양상에서, 본 발명은 상기 벡터로 안정하게 형질감염된 재조합 세포에 관한 것이다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 a) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT)(EC 2.1.1.63) 또는 이의 돌연변이체 또는 촉매 도메인 및 b) 플라스모듐 팔시파룸으로부터의 MSP-1+AMA-1 단백질을 포함하는 융합 폴리펩타이드에 관한 것이다. 이러한 융합 폴리펩타이드에서, 상기 AGT 효소는 서열번호 2의 단백질 또는 (상기 정의된 바와 같은) 이의 상동체이다. 이러한 융합 폴리펩타이드는, 예를 들어, 서열번호 92의 아미노산 서열(SNAP-유사/MSP-1/proTEV2/AMA-1/Histag 융합 단백질에 상응)이다.
따라서, 또 다른 양상에서, 본 발명은, 예를 들어, 본 발명의 면역분석으로 생물학적 샘플 중의 기생충 플라스모듐 팔시파룸의 존재를 확인하기 위한 이러한 융합 단백질 [SNAP- MSP-1+AMA-1]의 용도에 관한 것이다.
렙토스피로시스 항원
또 다른 양상에서, 본 발명은 숙주 세포에서 특정 렙토스피로시스 항원, 예를 들어, 렙토스피라 세균의 HbpA, LruA, LruB 또는 LipL32 단백질(참조: Sivakolundu S. et al, Journal of Medical Microbiology, 2012)을 발현시키기 위한 벡터에 관한 것이다. 바람직한 벡터는 SNAP-Lru A 및 SNAP-Lru B이다. 특히 바람직한 것은 이들 벡터를 함유하는 S2 세포주이다. S2/SNAP-Lru A 및 S2/SNAP-Lru B 세포주는 2013년 5월 2일자로 콜렉션 네션날레 드 컬쳐 드 마이크로오르가니즘 [the Collection Nationale de Cultures de Microorganismes(CNCM)), 25, Rue du Docteur Roux, 75724 Paris Cedex 15, France]에 각각 기탁번호 CNCM I-4745 및 CNCM I-4746으로 기탁되었다.
특히, 본 발명은 a) 상기 숙주 세포에서 기능성인 분비 시그널 펩타이드, 및 b) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT) 또는 이의 돌연변이체, 단편 또는 촉매 도메인, 및 c) 렙토스피라 인테로간스 세균으로부터의 HbpA 단백질을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 벡터에 관한 것이다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 이른바 "pDeSNAP Univ/HbpA 카세트", 즉, 렙토스피라 세균으로부터의 HbpA 단백질을 인코딩하는 서열이 삽입된 상기 정의된 바와 같은 pDeSNAPUniv DNA 카세트를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 하기를 포함하는 서열번호 93의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 pDeSNAP Univ/HbpA 카세트를 포함한다:
- 서열번호 22의 곤충 BiP 서열,
- 서열번호 31의 SNAP-유사 서열,
- 스페이서 서열 GGGS(서열번호 25)을 인코딩하는 서열번호 26의 제1 DNA 서열,
- 서열 ENLYFQS(서열번호 32)의 pro-TEV1 개열 부위를 인코딩하는 서열번호 29의 DNA 서열,
- 렙토스피라 인테로간스 혈청형 Lai str.56601(Genbank#AA51750.1)로부터의 HbpA(TonB-의존적 외막 수용체 또는 LB191)의 변형된 단축 형태를 인코딩하는 DNA 서열,
- 서열 ENLYFQG(서열번호 33)의 pro-TEV2 개열 부위를 인코딩하는 서열번호 30의 DNA 서열,
- 스페이서 서열 GGGS(서열번호 25)을 인코딩하는 서열번호 26의 제2 DNA 서열,
- HisTag 서열을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA 서열.
또 다른 실시형태에서, 벡터는 서열번호 164의 뉴클레오타이드 서열을 갖고/갖거나 서열번호 165의 아미노산 서열을 인코딩하는 DeSNAPuniv-짧은 LruA(렙토스피라증) 카세트를 포함한다. 벡터는 SNAP의 시그널 펩타이드, SNAP 서열, pro-TEV 부위, 또는 도 17에 도시된 LruA의 변형된 짧은 형태를 인코딩하는 DNA 서열, 또는 이의 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 40, 50, 60, 100, 200 또는 300개의 연속 아미노산을 단독으로 또는 조합하여 포함한다.
또 다른 실시형태에서, 벡터는 서열번호 166의 뉴클레오타이드 서열을 갖고/갖거나 서열번호 167의 아미노산 서열을 인코딩하는 DeSNAPuniv-짧은 LruB(렙토스피라증) 카세트를 포함한다. 벡터는 SNAP의 시그널 펩타이드, SNAP 서열, pro-TEV 부위, 또는 도 18에 도시된 LruB의 변형된 짧은 형태를 인코딩하는 DNA 서열, 또는 이의 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 40, 50, 60, 100, 200 또는 300개의 연속 아미노산을 단독으로 또는 조합하여 포함한다.
또 다른 실시형태에서, 또 다른 실시형태에서, 벡터는 서열번호 168의 뉴클레오타이드 서열을 갖고/갖거나 서열번호 169의 아미노산 서열을 인코딩하는 DeSNAPuniv-LipL2(렙토스피라증) 카세트를 포함한다. 벡터는 SNAP의 시그널 펩타이드, SNAP 서열, pro-TEV 부위, 또는 도 19에 도시된 LipL32의 변형된 짧은 형태를 인코딩하는 DNA 서열, 또는 이의 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 40, 50, 60, 100, 200 또는 300개의 연속 아미노산을 단독으로 또는 조합하여 포함한다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 상기 벡터로 안정하게 형질감염된 재조합 세포에 관한 것이다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 a) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT)(EC 2.1.1.63) 또는 이의 돌연변이체 또는 촉매 도메인 및 b) 렙토스피라 인테로간스 세균으로부터의 HbpA 단백질을 포함하는 융합 폴리펩타이드에 관한 것이다. 이러한 융합 폴리펩타이드에서, 상기 AGT 효소는 서열번호 2의 단백질 또는 (상기 정의된 바와 같은) 이의 상동체이다. 이러한 융합 폴리펩타이드는, 예를 들어, 서열번호 94의 아미노산 서열(SNAP-유사/proTEV1/HbpA/proTEV2/Histag 융합 단백질에 상응)이다.
따라서, 또 다른 양상에서, 본 발명은, 예를 들어, 본 발명의 면역분석으로 생물학적 샘플 중의 렙토스피라 세균의 존재를 확인하기 위한 이러한 융합 단백질 [SNAP-HbpA]의 용도에 관한 것이다.
미생물성 펩타이드
또 다른 양상에서, 본 발명은 숙주 세포에서 미생물성 펩타이드, 예를 들어, 미생물성 펩타이드 MUB-40를 발현시키기 위한 벡터에 관한 것이다.
특히, 본 발명은 a) 상기 숙주 세포에서 기능성인 분비 시그널 펩타이드, 및 b) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT) 또는 이의 돌연변이체, 단편 또는 촉매 도메인, 및 c) MUB-40 펩타이드를 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 벡터에 관한 것이다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 이른바 "pDeSNAP Univ/MUB40 카세트", 즉, MUB40 펩타이드를 인코딩하는 서열이 삽입된 상기 정의된 바와 같은 pDeSNAPUniv DNA 카세트를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 하기를 포함하는 서열번호 95의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 pDeSNAP Univ/MUB40 카세트를 포함한다:
- 서열번호 22의 곤충 BiP 서열,
- 서열번호 31의 SNAP-유사 서열,
- 스페이서 서열 GGGS(서열번호 25)을 인코딩하는 서열번호 26의 제1 DNA 서열,
- 서열 ENLYFQS(서열번호 32)의 pro-TEV1 개열 부위를 인코딩하는 서열번호 29의 DNA 서열,
- MUB-40 펩타이드를 인코딩하는 DNA 서열,
- 서열 ENLYFQG(서열번호 33)의 pro-TEV2 개열 부위를 인코딩하는 서열번호 30의 DNA 서열, 및
- HisTag 서열을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA 서열.
또 다른 양상에서, 본 발명은 상기 벡터로 안정하게 형질감염된 재조합 세포에 관한 것이다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 a) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT)(EC 2.1.1.63) 또는 이의 돌연변이체 또는 촉매 도메인 및 b) MUB 40 펩타이드를 포함하는 융합 폴레펩타이드에 관한 것이다. 이러한 융합 폴리펩타이드에서, 상기 AGT 효소는 서열번호 2의 단백질 또는 (상기 정의된 바와 같은) 이의 상동체이다. 이러한 융합 폴리펩타이드는, 예를 들어, 서열번호 96의 아미노산 서열(SNAP-유사/proTEV1/MUB40/proTEV2/Histag 융합 단백질에 상응)이다.
따라서, 또 다른 양상에서, 본 발명은, 예를 들어, 본 발명의 면역분석으로 생물학적 샘플 중의 리간드의 존재를 확인하기 위한 이러한 융합 단백질 [SNAP-MUB40]의 용도에 관한 것이다.
플라비바이러스 발병에 관여되는 렉틴
또 다른 양상에서, 본 발명은 숙주 세포에서 플라비바이러스 발병에 관여되는 특정 렉틴, 예를 들어, C형 유사 렉틴의 마우스 또는 인간 가용성 형태(CLEC5A)를 발현시키기 위한 벡터에 관한 것이다.
특히, 본 발명은 a) 상기 숙주 세포에서 기능성인 분비 시그널 펩타이드, 및 b) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT) 또는 이의 돌연변이체, 단편 또는 촉매 도메인, 및 c) 마우스 CLEC5A(mo-CLEC5A) 또는 인간 CLEC5A(hu-CLEC5A)를 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 벡터에 관한 것이다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 이른바 "pDeSNAP Univ/mo-CLEC5A 카세트", 즉, C형 유사 렉틱의 마우스 가용성 형태를 인코딩하는 서열이 삽입된 상기 정의된 바와 같은 pDeSNAPUniv DNA 카세트를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 하기를 포함하는 서열번호 97의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 pDeSNAP Univ/mo-CLEC5A 카세트를 포함한다:
- 서열번호 22의 곤충 BiP 서열,
- 서열번호 31의 SNAP-유사 서열,
- 스페이서 서열 GGGS(서열번호 25)을 인코딩하는 서열번호 26의 제1 DNA 서열,
- 서열 ENLYFQS(서열번호 32)의 pro-TEV1 개열 부위를 인코딩하는 서열번호 29의 DNA 서열,
- C형 유사 렉틴의 마우스 가용성 형태(CLEC5A)를 인코딩하는 DNA 서열,
- 서열 ENLYFQG(서열번호 33)의 pro-TEV2 개열 부위를 인코딩하는 서열번호 30의 DNA 서열,
- 스페이서 서열 GGGS(서열번호 25)을 인코딩하는 서열번호 26의 제2 DNA 서열, 및
- HisTag 서열을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA 서열.
또 다른 양상에서, 본 발명은 상기 벡터로 안정하게 형질감염된 재조합 세포에 관한 것이다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 이른바 "pDeSNAP Univ/hu-CLEC5A 카세트", 즉, C형 유사 렉틴의 인간 가용성 형태를 인코딩하는 서열이 삽입된 상기 정의된 바와 같은 pDeSNAPUniv DNA 카세트를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 하기를 포함하는 서열번호 99의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 pDeSNAP Univ/hu-CLEC5A 카세트를 포함한다:
- 서열번호 22의 곤충 BiP 서열,
- 서열번호 31의 SNAP-유사 서열,
- 스페이서 서열 GGGS(서열번호 25)을 인코딩하는 서열번호 26의 제1 DNA 서열,
- 서열 ENLYFQS(서열번호 32)의 pro-TEV1 개열 부위를 인코딩하는 서열번호 29의 DNA 서열,
- C형 유사 렉틴의 인간 가용성 형태(CLEC5A)를 인코딩하는 DNA 서열,
- 서열 ENLYFQG(서열번호 33)의 pro-TEV2 개열 부위를 인코딩하는 서열번호 30의 DNA 서열,
- 스페이서 서열 GGGS(서열번호 25)을 인코딩하는 서열번호 26의 제2 DNA 서열, 및
- HisTag 서열을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA 서열.
또 다른 양상에서, 본 발명은 상기 벡터로 안정하게 형질감염된 재조합 세포에 관한 것이다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 a) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT)(EC 2.1.1.63) 또는 이의 돌연변이체 또는 촉매 도메인 및 b) C형 유사 렉틴의 마우스 또는 인간 가용성 형태(CLEC5A)를 포함하는 융합 폴리펩타이드에 관한 것이다. 이러한 융합 폴리펩타이드에서, 상기 AGT 효소는 서열번호 2의 단백질 또는(상기 정의된 바와 같은) 이의 상동체이다. 이러한 융합 폴리펩타이드는, 예를 들어, 서열번호 98의 아미노산 서열(SNAP-유사/proTEV1/mo-CLEC5A/proTEV2/Histag 융합 단백질에 상응) 또는 서열번호 100(SNAP-유사/proTEV1/hu-CLEC5A/proTEV2/Histag 융합 단백질에 상응)이다.
따라서, 또 다른 양상에서, 본 발명은, 예를 들어, 본 발명의 면역분석으로 생물학적 샘플 중의 플라비 바이러스의 존재를 확인하기 위한 이러한 융합 단백질 [SNAP-mo-CLEC5A] 또는 [SNAP-hu-CLEC5A]의 용도에 관한 것이다.
항-플라비바이러스 모기 단백질
또 다른 양상에서, 본 발명은 숙주 세포에서 특정 항바이러스 모기 단백질, 예를 들어, 쿨렉스(Culex) 종으로부터의 VAGO 단백질(cxVAGO) 또는 아에데스(Aedes) 종으로부터의 VAGO 단백질(aaVAGO)을 발현시키기 위한 벡터에 관한 것이다.
특히, 본 발명은 a) 상기 숙주 세포에서 기능성인 분비 시그널 펩타이드, 및 b) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT) 또는 이의 돌연변이체, 단편 또는 촉매 도메인, 및 c) 아에데스 알보픽투스(Aedes albopictus) 모기로부터의 VAGO 단백질을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 벡터에 관한 것이다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 이른바 "pDeSNAP Univ/aaVAGO 카세트", 즉, 아에데스 알보픽투스 모기로부터의 VAGO 단백질을 인코딩하는 서열이 삽입된 상기 정의된 바와 같은 pDeSNAPUniv DNA 카세트를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 하기를 포함하는 서열번호 103의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 pDeSNAP Univ/aaVAGO 카세트를 포함한다:
- 서열번호 152의 곤충 BiP-유사 서열,
- 서열번호 31의 SNAP-유사 서열,
- 스페이서 서열 GGGS(서열번호 25)을 인코딩하는 서열번호 26의 DNA 서열,
- 아에데스 알보픽투스 모기로부터의 VAGO 단백질을 인코딩하는 DNA 서열, 및
- HisTag 서열을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA 서열.
또 다른 양상에서, 본 발명은 상기 벡터로 안정하게 형질감염된 재조합 세포에 관한 것이다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 a) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT)(EC 2.1.1.63) 또는 이의 돌연변이체 또는 촉매 도메인 및 b) 아에데스 알보픽투스 모기로부터의 VAGO 단백질을 포함하는 융합 폴리펩타이드에 관한 것이다. 이러한 융합 폴리펩타이드에서, 상기 AGT 효소는 서열번호 2의 단백질 또는 (상기 정의된 바와 같은) 이의 상동체이다. 이러한 융합 폴리펩타이드는, 예를 들어, 서열번호 104의 아미노산 서열(SNAP-유사/aaVAGO/Histag 융합 단백질에 상응)이다.
따라서, 또 다른 양상에서, 본 발명은, 예를 들어, 본 발명의 면역분석으로 생물학적 샘플 중의 리간드의 존재를 확인하기 위한 이러한 융합 단백질 [SNAP-aaVAGO]의 용도에 관한 것이다.
또 다른 실시형태에서, 본 발명은 a) 상기 숙주 세포에서 기능성인 분비 시그널 펩타이드, 및 b) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT) 또는 이의 돌연변이체, 단편 또는 촉매 도메인, 및 c) 쿨렉스 퀸퀘파시아투스(Culex quinquefasciatus) 모기로부터의 VAGO 단백질을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 벡터에 관한 것이다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 이른바 "pDeSNAP Univ/cxVAGO 카세트", 즉, 쿨렉스 퀸퀘파시아투스 모기로부터의 VAGO 단백질을 인코딩하는 서열이 삽입된 상기 정의된 바와 같은 pDeSNAPUniv DNA 카세트를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 하기를 포함하는 서열번호 101의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 pDeSNAP Univ/cxVAGO 카세트를 포함한다:
- 서열번호 152의 곤충 BiP-유사 서열,
- 서열번호 31의 SNAP-유사 서열,
- 스페이서 서열 GGGS(서열번호 25)을 인코딩하는 서열번호 26의 DNA 서열,
- 쿨렉스 퀸퀘파시아투스 모기로부터의 VAGO 단백질을 인코딩하는 DNA 서열, 및
- HisTag 서열을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA 서열.
또 다른 양상에서, 본 발명은 상기 벡터로 안정하게 형질감염된 재조합 세포에 관한 것이다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 a) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT)(EC 2.1.1.63) 또는 이의 돌연변이체 또는 촉매 도메인 및 b) 쿨렉스 퀸퀘파시아투스 모기로부터의 VAGO 단백질을 포함하는 융합 폴리펩타이드에 관한 것이다. 이러한 융합 폴리펩타이드에서, 상기 AGT 효소는 서열번호 2의 단백질 또는 (상기 정의된 바와 같은) 이의 상동체이다. 이러한 융합 폴리펩타이드는, 예를 들어, 서열번호 102의 아미노산 서열(SNAP-유사/cxVAGO/Histag 융합 단백질에 상응)이다.
따라서, 또 다른 양상에서, 본 발명은, 예를 들어, 본 발명의 면역분석으로 생물학적 샘플 중의 리간드의 존재를 확인하기 위한 이러한 융합 단백질 [SNAP-cxVAGO]의 용도에 관한 것이다.
바이러스 출혈 열 항원
또 다른 양상에서, 본 발명은 하기와 같은 특정 바이러스 출혈 열 항원을 발현시키기 위한 벡터에 관한 것이다:
- 크리미아-콩고 바이러스로부터의 핵단백질 N(CCHF.N), 에볼라 바이러스로부터의 핵단백질 N(EBO.N), 마르부르그 바이러스로부터의 핵단백질 N(MAR.N), 라사 바이러스로부터의 핵단백질 N(LAS.N), 주닌 바이러스로부터의 핵단백질 N(JUN.N), 마추포 바이러스로부터의 핵단백질 N(MAC.N), 사비아 바이러스로부터의 핵단백질 N(SAB.N), 또는 구아나리토 바이러스로부터의 핵단백질 N(GUA.N),
- 라사 바이러스로부터의 GP1의 엑토도메인(LAS.ectoGP1), 주닌 바이러스로부터의 GP1의 엑토도메인(JUN.ectoGP1), 마추포 바이러스로부터의 GP1의 엑토도메인(MAC.ectoGP1), 사비아 바이러스로부터의 GP1의 엑토도메인(SAB.ectoGP1), 또는 구아나리토 바이러스로부터의 GP1의 엑토도메인(GUA.ectoGP1),
- 라사 바이러스로부터의 GP2의 엑토도메인(LAS.ectoGP2), 주닌 바이러스로부터의 GP2의 엑토도메인(JUN.ectoGP2), 마추포 바이러스로부터의 GP2의 엑토도메인(MAC.ectoGP2), 사비아 바이러스로부터의 GP2의 엑토도메인(SAB.ectoGP2), 또는 구아나리토 바이러스로부터의 GP2의 엑토도메인(GUA.ectoGP2),
- 옴스크 바이러스로부터의 외피 단백질의 도메인 III(OMSK.EDIII), 카샤누르(Kasyanur) 바이러스로부터의 외피 단백질의 도메인 III(KAS.EDIII), 또는 알쿠르마(Alkhurma) 바이러스로부터의 외피 단백질의 도메인 III(ALK.EDIII).
특히, 본 발명은 a) 상기 숙주 세포에서 기능성인 분비 시그널 펩타이드, 및 b) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT) 또는 이의 돌연변이체, 단편 또는 촉매 도메인, 및 c) 크리미아-콩고 바이러스로부터의 핵단백질 N(CCHF.N)을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 벡터에 관한 것이다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 이른바 "pDeSNAP Univ/CCHF.N 카세트", 즉, 크리미아-콩고 바이러스로부터의 핵단백질 N을 인코딩하는 서열이 삽입된 상기 정의된 바와 같은 pDeSNAPUniv DNA 카세트를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 하기를 포함하는 서열번호 108의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 pDeSNAP Univ/CCHF.N 카세트를 포함한다:
- 서열번호 22의 곤충 BiP 서열,
- 서열번호 31의 SNAP-유사 서열,
- 스페이서 서열 GGGS(서열번호 25)을 인코딩하는 서열번호 26의 제1 DNA 서열,
- 서열 ENLYFQS(서열번호 32)의 pro-TEV1 개열 부위를 인코딩하는 서열번호 29의 DNA 서열,
- 크리미아-콩고 바이러스로부터의 핵단백질 N을 인코딩하는 DNA 서열,
- 서열 ENLYFQG(서열번호 33)의 pro-TEV2 개열 부위를 인코딩하는 서열번호 30의 DNA 서열,
- 스페이서 서열 GGGS(서열번호 25)을 인코딩하는 서열번호 26의 제2 DNA 서열,
- HisTag 서열을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA 서열.
또 다른 양상에서, 본 발명은 상기 벡터로 안정하게 형질감염된 재조합 세포에 관한 것이다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 a) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT)(EC 2.1.1.63) 또는 이의 돌연변이체 또는 촉매 도메인 및 b) 크리미아-콩고 바이러스로부터의 핵단백질 N을 포함하는 융합 폴리펩타이드에 관한 것이다. 이러한 융합 폴리펩타이드에서, 상기 AGT 효소는 서열번호 2의 단백질 또는 (상기 정의된 바와 같은) 이의 상동체이다. 이러한 융합 폴리펩타이드는, 예를 들어, 서열번호 109의 아미노산 서열 (SNAP-유사/proTEV1/CCHF.N/proTEV2/Histag 융합 단백질에 상응)이다.
따라서, 또 다른 양상에서, 본 발명은, 예를 들어, 본 발명의 면역분석으로 생물학적 샘플 중의 크리미아-콩고 바이러스의 존재를 확인하기 위한 이러한 융합 단백질 [SNAP- CCHF.N]의 용도에 관한 것이다.
또 다른 실시형태에서, 본 발명은 상기 숙주 세포에서 기능성인 분비 시그널 펩타이드, 및 b) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT) 또는 이의 돌연변이체, 단편 또는 촉매 도메인, 및 c) 에볼라 바이러스로부터의 핵단백질 N(EBO.N)을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 벡터에 관한 것이다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 이른바 "pDeSNAP Univ/EBO.N 카세트", 즉, 에볼라 바이러스로부터의 핵단백질 N을 인코딩하는 서열이 삽입된 상기 정의된 바와 같은 pDeSNAPUniv DNA 카세트를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 하기를 포함하는 서열번호 110의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 pDeSNAP Univ/EBO.N 카세트를 포함한다:
- 서열번호 22의 곤충 BiP 서열,
- 서열번호 31의 SNAP-유사 서열,
- 스페이서 서열 GGGS(서열번호 25)을 인코딩하는 서열번호 26의 제1 DNA 서열,
- 서열 ENLYFQS(서열번호 32)의 pro-TEV1 개열 부위를 인코딩하는 서열번호 29의 DNA 서열,
- 에볼라 바이러스(Genbank#NC_002549)로부터의 핵단백질 N,
- 서열 ENLYFQG(서열번호 33)의 pro-TEV2 개열 부위를 인코딩하는 서열번호 30의 DNA 서열,
- 스페이서 서열 GGGS(서열번호 25)을 인코딩하는 서열번호 26의 제2 DNA 서열,
- HisTag 서열을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA 서열.
또 다른 양상에서, 본 발명은 상기 벡터로 안정하게 형질감염된 재조합 세포에 관한 것이다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 a) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT)(EC 2.1.1.63) 또는 이의 돌연변이체 또는 촉매 도메인 및 b) 에볼라 바이러스로부터의 핵단백질 N을 포함하는 융합 폴리펩타이드에 관한 것이다. 이러한 융합 폴리펩타이드에서, 상기 AGT 효소는 서열번호 2의 단백질 또는 (상기 정의된 바와 같은) 이의 상동체이다. 이러한 융합 폴리펩타이드는, 예를 들어, 서열번호 111의 아미노산 서열(SNAP-유사/proTEV1/EBO.N/proTEV2/Histag 융합 단백질에 상응)이다.
따라서, 또 다른 양상에서, 본 발명은, 예를 들어, 본 발명의 면역분석으로 생물학적 샘플 중의 에볼라 바이러스의 존재를 확인하기 위한 이러한 융합 단백질 [SNAP- EBO.N]의 용도에 관한 것이다.
또 다른 실시형태에서, 본 발명은 a) 상기 숙주 세포에서 기능성인 분비 시그널 펩타이드, 및 b) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT) 또는 이의 돌연변이체, 단편 또는 촉매 도메인, 및 c) 마르부르그 바이러스의 핵단백질 N(MAR.N)을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 벡터에 관한 것이다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 이른바 "pDeSNAP Univ/MAR.N 카세트", 즉, 마르부르그 바이러스로부터의 핵단백질 N을 인코딩하는 서열이 삽입된 상기 정의된 바와 같은 pDeSNAPUniv DNA 카세트를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 하기를 포함하는 서열번호 112의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 pDeSNAP Univ/MAR.N 카세트를 포함한다:
- 서열번호 22의 곤충 BiP 서열,
- 서열번호 31의 SNAP-유사 서열,
- 스페이서 서열 GGGS(서열번호 25)을 인코딩하는 서열번호 26의 제1 DNA 서열,
- 서열 ENLYFQS(서열번호 32)의 pro-TEV1 개열 부위를 인코딩하는 서열번호 29의 DNA 서열,
- 마르부르그 바이러스(Genbank#NC_001608)의 핵단백질 N을 인코딩하는 DNA 서열,
- 서열 ENLYFQG(서열번호 33)의 pro-TEV2 개열 부위를 인코딩하는 서열번호 30의 DNA 서열,
- 스페이서 서열 GGGS(서열번호 25)을 인코딩하는 서열번호 26의 제2 DNA 서열,
- HisTag 서열을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA 서열.
또 다른 양상에서, 본 발명은 상기 벡터로 안정하게 형질감염된 재조합 세포에 관한 것이다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 a) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT)(EC 2.1.1.63) 또는 이의 돌연변이체 또는 촉매 도메인 및 b) 마르부르그 바이러스의 핵단백질 N을 포함하는 융합 폴리펩타이드에 관한 것이다. 이러한 융합 폴리펩타이드에서, 상기 AGT 효소는 서열번호 2의 단백질 또는 (상기 정의된 바와 같은) 이의 상동체이다. 이러한 융합 폴리펩타이드는, 예를 들어, 서열번호 113의 아미노산 서열(SNAP-유사/proTEV1/MAR.N /proTEV2/Histag 융합 단백질에 상응)이다.
따라서, 또 다른 양상에서, 본 발명은, 예를 들어, 본 발명의 면역분석으로 생물학적 샘플 중의 마르부르그 바이러스의 존재를 확인하기 위한 이러한 융합 단백질 [SNAP-MAR.N]의 용도에 관한 것이다.
또 다른 실시형태에서, 본 발명은 a) 상기 숙주 세포에서 기능성인 분비 시그널 펩타이드, 및 b) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT) 또는 이의 돌연변이체, 단편 또는 촉매 도메인, 및 c) 라사 바이러스의 핵단백질 N(LAS.N)을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 벡터에 관한 것이다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 이른바 "pDeSNAP Univ/LAS.N 카세트", 즉, 리사 바이러스로부터의 핵단백질 N을 인코딩하는 서열이 삽입된 상기 정의된 바와 같은 pDeSNAPUniv DNA 카세트를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 하기를 포함하는 서열번호 114의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 pDeSNAP Univ/LAS.N 카세트를 포함한다:
- 서열번호 22의 곤충 BiP 서열,
- 서열번호 31의 SNAP-유사 서열,
- 스페이서 서열 GGGS(서열번호 25)을 인코딩하는 서열번호 26의 제1 DNA 서열,
- 서열 ENLYFQS(서열번호 32)의 pro-TEV1 개열 부위를 인코딩하는 서열번호 29의 DNA 서열,
- 라사 바이러스(Genbank#NC_004296)의 핵단백질 N,
- 서열 ENLYFQG(서열번호 33)의 pro-TEV2 개열 부위를 인코딩하는 서열번호 30의 DNA 서열,
- 스페이서 서열 GGGS(서열번호 25)을 인코딩하는 서열번호 26의 제2 DNA 서열,
- HisTag 서열을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA 서열.
또 다른 양상에서, 본 발명은 상기 벡터로 안정하게 형질감염된 재조합 세포에 관한 것이다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 a) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT)(EC 2.1.1.63) 또는 이의 돌연변이체 또는 촉매 도메인 및 b) 라사 바이러스의 핵단백질 N을 포함하는 융합 폴리펩타이드에 관한 것이다. 이러한 융합 폴리펩타이드에서, 상기 AGT 효소는 서열번호 2의 단백질 또는 (상기 정의된 바와 같은) 이의 상동체이다. 이러한 융합 폴리펩타이드는, 예를 들어, 서열번호 115의 아미노산 서열(SNAP-유사/proTEV1/LAS.N/proTEV2/Histag 융합 단백질에 상응)이다.
따라서, 또 다른 양상에서, 본 발명은, 예를 들어, 본 발명의 면역분석으로 생물학적 샘플 중의 라사 바이러스의 존재를 확인하기 위한 이러한 융합 단백질 [SNAP-LAS.N]의 용도에 관한 것이다.
또 다른 실시형태에서, 본 발명은 a) 상기 숙주 세포에서 기능성인 분비 시그널 펩타이드, 및 b) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT) 또는 이의 돌연변이체, 단편 또는 촉매 도메인, 및 c) 주닌 바이러스로부터의 핵단백질 N(JUN.N)을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 벡터에 관한 것이다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 이른바 "pDeSNAP Univ/JUN.N 카세트", 즉, 주닌 바이러스로부터의 핵단백질 N을 인코딩하는 서열이 삽입된 상기 정의된 바와 같은 pDeSNAPUniv DNA 카세트를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 하기를 포함하는 서열번호 116의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 pDeSNAP Univ/JUN.N 카세트를 포함한다:
- 서열번호 22의 곤충 BiP 서열,
- 서열번호 31의 SNAP-유사 서열,
- 스페이서 서열 GGGS(서열번호 25)을 인코딩하는 서열번호 26의 제1 DNA 서열,
- 서열 ENLYFQS(서열번호 32)의 pro-TEV1 개열 부위를 인코딩하는 서열번호 29의 DNA 서열,
- 주닌 바이러스로(Genbank#NC_005081)부터의 핵단백질 N을 인코딩하는 DNA 서열,
- 서열 ENLYFQG(서열번호 33)의 pro-TEV2 개열 부위를 인코딩하는 서열번호 30의 DNA 서열,
- 스페이서 서열 GGGS(서열번호 25)을 인코딩하는 서열번호 26의 제2 DNA 서열,
- HisTag 서열을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA 서열.
또 다른 양상에서, 본 발명은 상기 벡터로 안정하게 형질감염된 재조합 세포에 관한 것이다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 a) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT)(EC 2.1.1.63) 또는 이의 돌연변이체 또는 촉매 도메인 및 b) 주닌 바이러스로부터의 핵단백질 N을 포함하는 융합 폴리펩타이드에 관한 것이다. 이러한 융합 폴리펩타이드에서, 상기 AGT 효소는 서열번호 2의 단백질 또는 (상기 정의된 바와 같은) 이의 상동체이다. 이러한 융합 폴리펩타이드는, 예를 들어, 서열번호 117의 아미노산 서열 (SNAP-유사/proTEV1/JUN.N/proTEV2/Histag 융합 단백질에 상응)이다.
따라서, 또 다른 양상에서, 본 발명은, 예를 들어, 본 발명의 면역분석으로 생물학적 샘플 중의 주닌 바이러스의 존재를 확인하기 위한 이러한 융합 단백질 [SNAP-JUN.N]의 용도에 관한 것이다.
또 다른 실시형태에서, 본 발명은 a) 상기 숙주 세포에서 기능성인 분비 시그널 펩타이드, 및 b) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT) 또는 이의 돌연변이체, 단편 또는 촉매 도메인, 및 c) 마추포 바이러스로부터의 핵단백질 N(MAC.N)을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 벡터에 관한 것이다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 이른바 "pDeSNAP Univ/MAC.N 카세트", 즉, 마추포 바이러스로부터의 핵단백질 N을 인코딩하는 서열이 삽입된 상기 정의된 바와 같은 pDeSNAPUniv DNA 카세트를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 하기를 포함하는 서열번호 118의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 pDeSNAP Univ/MAC.N 카세트를 포함한다:
- 서열번호 22의 곤충 BiP 서열,
- 서열번호 31의 SNAP-유사 서열,
- 스페이서 서열 GGGS(서열번호 25)을 인코딩하는 서열번호 26의 제1 DNA 서열,
- 서열 ENLYFQS(서열번호 32)의 pro-TEV1 개열 부위를 인코딩하는 서열번호 29의 DNA 서열,
- 마추포 바이러스(Genbank#NC_005078)로부터의 핵단백질 N을 인코딩하는 DNA 서열,
- 서열 ENLYFQG(서열번호 33)의 pro-TEV2 개열 부위를 인코딩하는 서열번호 30의 DNA 서열,
- 스페이서 서열 GGGS(서열번호 25)을 인코딩하는 서열번호 26의 제2 DNA 서열,
- HisTag 서열을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA 서열.
또 다른 양상에서, 본 발명은 상기 벡터로 안정하게 형질감염된 재조합 세포에 관한 것이다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 a) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT)(EC 2.1.1.63) 또는 이의 돌연변이체 또는 촉매 도메인 및 b) 마추포 바이러스로부터의 핵단백질 N를 포함하는 융합 폴리펩타이드에 관한 것이다. 이러한 융합 폴리펩타이드에서, 상기 AGT 효소는 서열번호 2의 단백질 또는 (상기 정의된 바와 같은) 이의 상동체이다. 이러한 융합 폴리펩타이드는, 예를 들어, 서열번호 119의 아미노산 서열(SNAP-유사/proTEV1/MAC.N/proTEV2/Histag 융합 단백질에 상응)이다.
따라서, 또 다른 양상에서, 본 발명은, 예를 들어, 본 발명의 면역분석으로 생물학적 샘플 중의 마추포 바이러스의 존재를 확인하기 위한 이러한 융합 단백질 [SNAP-MAC.N]의 용도에 관한 것이다.
또 다른 실시형태에서, 본 발명은 a) 상기 숙주 세포에서 기능성인 분비 시그널 펩타이드, 및 b) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT) 또는 이의 돌연변이체, 단편 또는 촉매 도메인, 및 c) 구아나리토 바이러스로부터는 핵단백질 N(GUA.N)를 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 벡터에 관한 것이다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 이른바 "pDeSNAP Univ/GUA.N 카세트", 즉, 구아나리코 바이러스로부터의 핵단백질 N을 인코딩하는 서열이 삽입된 상기 정의된 바와 같은 pDeSNAPUniv DNA 카세트를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 하기를 포함하는 서열번호 120의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 pDeSNAP Univ/GUA.N 카세트를 포함한다:
- 서열번호 22의 곤충 BiP 서열,
- 서열번호 31의 SNAP-유사 서열,
- 스페이서 서열 GGGS(서열번호 25)을 인코딩하는 서열번호 26의 제1 DNA 서열,
- 서열 ENLYFQS(서열번호 32)의 pro-TEV1 개열 부위를 인코딩하는 서열번호 29의 DNA 서열,
- 구아나리토 바이러스(Genbank#NC_005077)로부터의 핵단백질 N을 인코딩하는 DNA 서열,
- 서열 ENLYFQG(서열번호 33)의 pro-TEV2 개열 부위를 인코딩하는 서열번호 30의 DNA 서열,
- 스페이서 서열 GGGS(서열번호 25)을 인코딩하는 서열번호 26의 제2 DNA 서열,
- HisTag 서열을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA 서열.
또 다른 양상에서, 본 발명은 상기 벡터로 안정하게 형질감염된 재조합 세포에 관한 것이다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 a) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT)(EC 2.1.1.63) 또는 이의 돌연변이체 또는 촉매 도메인 및 b) 구아나리토 바이러스로부터의 핵단백질 N을 포함하는 융합 폴리펩타이드에 관한 것이다. 이러한 융합 폴리펩타이드에서, 상기 AGT 효소는 서열번호 2의 단백질 또는 (상기 정의된 바와 같은) 이의 상동체이다. 이러한 융합 폴리펩타이드는, 예를 들어, 서열번호 121의 아미노산 서열(SNAP-유사/proTEV1/GUA.N/proTEV2/Histag 융합 단백질에 상응)이다.
따라서, 또 다른 양상에서, 본 발명은, 예를 들어, 본 발명의 면역분석으로 생물학적 샘플 중의 구아나리토 바이러스의 존재를 확인하기 위한 이러한 융합 단백질 [SNAP-GUA.N]의 용도에 관한 것이다.
또 다른 실시형태에서, 본 발명은 a) 상기 숙주 세포에서 기능성인 분비 시그널 펩타이드, 및 b) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT) 또는 이의 돌연변이체, 단편 또는 촉매 도메인, 및 c) 사비아 바이러스로부터의 핵단백질 N(SAB.N)을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 벡터에 관한 것이다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 이른바 "pDeSNAP Univ/SAB.N 카세트", 즉, 사비아 바이러스로부터의 핵단백질 N을 인코딩하는 서열이 삽입된 상기 정의된 바와 같은 pDeSNAPUniv DNA 카세트를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 하기를 포함하는 서열번호 122의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 pDeSNAP Univ/SAB.N 카세트를 포함한다:
- 서열번호 22의 곤충 BiP 서열,
- 서열번호 31의 SNAP-유사 서열,
- 스페이서 서열 GGGS(서열번호 25)을 인코딩하는 서열번호 26의 제1 DNA 서열,
- 서열 ENLYFQS(서열번호 32)의 pro-TEV1 개열 부위를 인코딩하는 서열번호 29의 DNA 서열,
- 사비아 바이러스(Genbank#NC_006317)로부터의 핵단백질 N을 인코딩하는 DNA 서열,
- 서열 ENLYFQG(서열번호 33)의 pro-TEV2 개열 부위를 인코딩하는 서열번호 30의 DNA 서열,
- 스페이서 서열 GGGS(서열번호 25)을 인코딩하는 서열번호 26의 제2 DNA 서열,
- HisTag 서열을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA 서열.
또 다른 양상에서, 본 발명은 상기 벡터로 안정하게 형질감염된 재조합 세포에 관한 것이다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 a) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT)(EC 2.1.1.63) 또는 이의 돌연변이체 또는 촉매 도메인 및 b) 사비아 바이러스로부터의 핵단백질 N을 포함하는 융합 폴리펩타이드에 관한 것이다. 이러한 융합 폴리펩타이드에서, 상기 AGT 효소는 서열번호 2의 단백질 또는 (상기 정의된 바와 같은) 이의 상동체이다. 이러한 융합 폴리펩타이드는, 예를 들어, 서열번호 123의 아미노산 서열(SNAP-유사/proTEV1/SAB.N/proTEV2/Histag 융합 단백질에 상응)이다.
따라서, 또 다른 양상에서, 본 발명은, 예를 들어, 본 발명의 면역분석으로 생물학적 샘플 중의 사비아 바이러스의 존재를 확인하기 위한 이러한 융합 단백질 [SNAP-SAB.N]의 용도에 관한 것이다.
또 다른 실시형태에서, 본 발명은 a) 상기 숙주 세포에서 기능성인 분비 시그널 펩타이드, 및 b) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT) 또는 이의 돌연변이체, 단편 또는 촉매 도메인, 및 c) 옴스크 바이러스로부터의 외피 단백질 E의 도메인 III(OMSK.EDIII)를 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 벡터에 관한 것이다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 이른바 "pDeSNAP Univ/OMSK.EDIII 카세트", 즉, 옴스크 바이러스로부터의 EDIII 단백질을 인코딩하는 서열이 삽입된 상기 정의된 바와 같은 pDeSNAPUniv DNA 카세트를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 하기를 포함하는 서열번호 124의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 pDeSNAP Univ/OMSK.EDIII 카세트를 포함한다:
- 서열번호 152의 곤충 BiP-유사 서열,
- 서열번호 31의 SNAP-유사 서열,
- 옴스크 바이러스(Genbank#NC_005062)로부터의 EDIII 단백질을 인코딩하는 DNA 서열,
- HisTag 서열을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA 서열.
또 다른 양상에서, 본 발명은 상기 벡터로 안정하게 형질감염된 재조합 세포에 관한 것이다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 a) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT)(EC 2.1.1.63) 또는 이의 돌연변이체 또는 촉매 도메인 및 b) 옴스크 바이러스로부터의 EDIII 단백질을 포함하는 융합 폴리펩타이드에 관한 것이다. 이러한 융합 폴리펩타이드에서, 상기 AGT 효소는 서열번호 2의 단백질 또는(상기 정의된 바와 같은) 이의 상동체이다. 이러한 융합 폴리펩타이드는, 예를 들어, 서열번호 125의 아미노산 서열(SNAP-유사/OMSK.EDIII/Histag 융합 단백질에 상응)이다.
따라서, 또 다른 양상에서, 본 발명은, 예를 들어, 본 발명의 면역분석으로 생물학적 샘플 중의 옴스크 바이러스의 존재를 확인하기 위한 이러한 융합 단백질 [SNAP-OMSK.EDIII]의 용도에 관한 것이다.
또 다른 실시형태에서, 본 발명은 a) 상기 숙주 세포에서 기능성인 분비 시그널 펩타이드, 및 b) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT) 또는 이의 돌연변이체, 단편 또는 촉매 도메인, 및 c) 카샤누르 숲 질환 바이러스로부터의 외피 단백질 E의 도메인 III(KYA.EDIII)를 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 벡터에 관한 것이다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 이른바 "pDeSNAP Univ/KYA.EDIII 카세트", 즉, 캬사누르 숲 질환 바이러스로부터의 EDIII 단백질을 인코딩하는 서열이 삽입된 상기 정의된 바와 같은 pDeSNAPUniv DNA 카세트를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 하기를 포함하는 서열번호 126의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 pDeSNAP Univ/KYA.EDIII 카세트를 포함한다:
- 서열번호 152의 곤충 BiP-유사 서열,
- 서열번호 31의 SNAP-유사 서열,
- 카샤누르 숲 질환 바이러스(Genbank#JF416958)로부터의 EDIII 단백질을 인코딩하는 DNA 서열,
- HisTag 서열을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA 서열.
또 다른 양상에서, 본 발명은 상기 벡터로 안정하게 형질감염된 재조합 세포에 관한 것이다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 a) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT)(EC 2.1.1.63) 또는 이의 돌연변이체 또는 촉매 도메인 및 b) 카샤누르 숲 질환 바이러스로부터의 EDIII 단백질을 포함하는 융합 폴리펩타이드에 관한 것이다. 이러한 융합 폴리펩타이드에서, 상기 AGT 효소는 서열번호 2의 단백질 또는 (상기 정의된 바와 같은) 이의 상동체이다. 이러한 융합 폴리펩타이드는, 예를 들어, 서열번호 127의 아미노산 서열(SNAP-유사/KYA.EDIII/Histag 융합 단백질에 상응)이다.
따라서, 또 다른 양상에서, 본 발명은, 예를 들어, 본 발명의 면역분석으로 생물학적 샘플 중의 캬사누르 숲 질환 바이러스의 존재를 확인하기 위한 이러한 융합 단백질 [SNAP-KYA.EDIII]의 용도에 관한 것이다.
또 다른 실시형태에서, 본 발명은 a) 상기 숙주 세포에서 기능성인 분비 시그널 펩타이드, 및 b) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT) 또는 이의 돌연변이체, 단편 또는 촉매 도메인, 및 c) 알쿠르마 바이러스로부터의 외피 단백질 E의 도메인 III(ALK.EDIII)를 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 벡터에 관한 것이다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 이른바 "pDeSNAP Univ/ALK.EDIII 카세트", 즉, 알쿠르마 바이러스로부터의 EDIII 단백질을 인코딩하는 서열이 삽입된 상기 정의된 바와 같은 pDeSNAPUniv DNA 카세트를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 하기를 포함하는 서열번호 128의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 pDeSNAP Univ/ALK.EDIII 카세트를 포함한다:
- 서열번호 152의 곤충 BiP-유사 서열,
- 서열번호 31의 SNAP-유사 서열,
- 알쿠르마 바이러스(Genbank#NC_004355)로부터의 EDIII 단백질을 인코딩하는 DNA 서열,
- HisTag 서열을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA 서열.
또 다른 양상에서, 본 발명은 상기 벡터로 안정하게 형질감염된 재조합 세포에 관한 것이다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 a) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT)(EC 2.1.1.63) 또는 이의 돌연변이체 또는 촉매 도메인 및 b) 알쿠르마 바이러스로부터의 EDIII 단백질을 포함하는 융합 폴리펩타이드에 관한 것이다. 이러한 융합 폴리펩타이드에서, 상기 AGT 효소는 서열번호 2의 단백질 또는 (상기 정의된 바와 같은) 이의 상동체이다. 이러한 융합 폴리펩타이드는, 예를 들어, 서열번호 129의 아미노산 서열(SNAP-유사/ALK.EDIII/Histag 융합 단백질에 상응)이다.
따라서, 또 다른 양상에서, 본 발명은, 예를 들어, 본 발명의 면역분석으로 생물학적 샘플 중의 알쿠르마 바이러스의 존재를 확인하기 위한 이러한 융합 단백질 [SNAP-ALK.EDIII]의 용도에 관한 것이다.
또 다른 실시형태에서, 본 발명은 a) 상기 숙주 세포에서 기능성인 분비 시그널 펩타이드, 및 b) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT) 또는 이의 돌연변이체, 단편 또는 촉매 도메인, 및 c) 리사 바이러스로부터의 당단백질 GP1 엑토도메인(LAS.ectoGP1)을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 벡터에 관한 것이다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 이른바 "pDeSNAP Univ/LAS.ectoGP1 카세트", 즉, 라사 바이러스로부터의 당단백질 GP1 엑토도메인을 인코딩하는 서열이 삽입된 상기 정의된 바와 같은 pDeSNAPUniv DNA 카세트를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 하기를 포함하는 서열번호 130의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 pDeSNAP Univ/LAS.ectoGP1 카세트를 포함한다:
- 서열번호 22의 곤충 BiP 서열,
- 리사 바이러스(Genbank#NC_004296)로부터의 당단백질 GP1 엑토도메인을 인코딩하는 DNA 서열,
- 서열번호 31의 SNAP-유사 서열, 및
- HisTag 서열을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA 서열.
또 다른 양상에서, 본 발명은 상기 벡터로 안정하게 형질감염된 재조합 세포에 관한 것이다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 a) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT)(EC 2.1.1.63) 또는 이의 돌연변이체 또는 촉매 도메인 및 b) 리사 바이러스로부터의 당단백질 GP1 엑토도메인을 포함하는 융합 폴리펩타이드에 관한 것이다. 이러한 융합 폴리펩타이드에서, 상기 AGT 효소는 서열번호 2의 단백질 또는 (상기 정의된 바와 같은) 이의 상동체이다. 이러한 융합 폴리펩타이드는, 예를 들어, 서열번호 131의 아미노산 서열(SNAP-유사/ LAS.ectoGP1/Histag 융합 단백질에 상응)이다.
따라서, 또 다른 양상에서, 본 발명은, 예를 들어, 본 발명의 면역분석으로 생물학적 샘플 중의 라사 바이러스의 존재를 확인하기 위한 이러한 융합 단백질 [SNAP- LAS.ectoGP1]의 용도에 관한 것이다.
또 다른 실시형태에서, 본 발명은 a) 상기 숙주 세포에서 기능성인 분비 시그널 펩타이드, 및 b) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT) 또는 이의 돌연변이체, 단편 또는 촉매 도메인, 및 c) 주닌 바이러스로부터의 당단백질 GP1 엑토도메인(JUN.ectoGP1)을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 벡터에 관한 것다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 이른바 "pDeSNAP Univ/JUN.ectoGP1 카세트", 즉, 주닌 바이러스로부터의 당단백질 GP1 엑토 도메인을 인코딩하는 서열이 삽입된 상기 정의된 바와 같은 pDeSNAPUniv DNA 카세트를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 하기를 포함하는 서열번호 132의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 pDeSNAP Univ/JUN.ectoGP1 카세트를 포함한다:
- 서열번호 22의 곤충 BiP 서열,
- 주닌 바이러스(Genbank#NC_005081)로부터의 당단백질 GP1 엑토도메인을 인코딩하는 DNA 서열,
- 서열번호 31의 SNAP-유사 서열, 및
- HisTag 서열을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA 서열.
또 다른 양상에서, 본 발명은 상기 벡터로 안정하게 형질감염된 재조합 세포에 관한 것이다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 a) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT)(EC 2.1.1.63) 또는 이의 돌연변이체 또는 촉매 도메인 및 b) 주닌 바이러스로부터의 당단백질 GP1 엑토도메인을 포함하는 융합 폴리펩타이드에 관한 것이다. 이러한 융합 폴리펩타이드에서, 상기 AGT 효소는 서열번호 2의 단백질 또는 (상기 정의된 바와 같은) 이의 상동체이다. 이러한 융합 폴리펩타이드는, 예를 들어, 서열번호 133의 아미노산 서열(SNAP-유사/ JUN.ectoGP1/Histag 융합 단백질에 상응)이다.
따라서, 또 다른 양상에서, 본 발명은, 예를 들어, 본 발명의 면역분석으로 생물학적 샘플 중의 주닌의 존재를 확인하기 위한 이러한 융합 단백질 [SNAP- JUN.ectoGP1]의 용도에 관한 것이다.
또 다른 실시형태에서, 본 발명은 a) 상기 숙주 세포에서 기능성인 분비 시그널 펩타이드, 및 b) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT) 또는 이의 돌연변이체, 단편 또는 촉매 도메인, 및 c) 마추포 바이러스로부터의 당단백질 GP1 엑토도메인(MAC.ectoGP1)을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 벡터에 관한 것이다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 이른바 "pDeSNAP Univ/MAC.ectoGP1 카세트", 즉, 마추포 바이러스로부터의 당단백질 GP1 엑토 도메인을 인코딩하는 서열이 삽입된 상기 정의된 바와 같은 pDeSNAPUniv DNA 카세트를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 하기를 포함하는 서열번호 134의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 pDeSNAP Univ/MAC.ectoGP1 카세트를 포함한다:
- 서열번호 22의 곤충 BiP 서열,
- 마추포 바이러스(Genbank#NC_005078)로부터의 당단백질 GP1 엑토도메인을 인코딩하는 DNA 서열,
- 서열번호 31의 SNAP-유사 서열, 및
- HisTag 서열을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA 서열.
또 다른 양상에서, 본 발명은 상기 벡터로 안정하게 형질감염된 재조합 세포에 관한 것이다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 a) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT)(EC 2.1.1.63) 또는 이의 돌연변이체 또는 촉매 도메인 및 b) 마추포 바이러스로부터의 당단백질 GP1 엑토도메인을 포함하는 융합 폴리펩타이드에 관한 것이다. 이러한 융합 폴리펩타이드에서, 상기 AGT 효소는 서열번호 2의 단백질 또는 (상기 정의된 바와 같은) 이의 상동체이다. 이러한 융합 폴리펩타이드는, 예를 들어, 서열번호 135의 아미노산 서열(SNAP-유사/ MAC.ectoGP1/Histag 융합 단백질에 상응)이다.
따라서, 또 다른 양상에서, 본 발명은, 예를 들어, 본 발명의 면역분석으로 생물학적 샘플 중의 마추포 바이러스의 존재를 확인하기 위한 이러한 융합 단백질 [SNAP-MAC.ectoGP1]의 용도에 관한 것이다.
또 다른 실시형태에서, 본 발명은 a) 상기 숙주 세포에서 기능성인 분비 시그널 펩타이드, 및 b) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT) 또는 이의 돌연변이체, 단편 또는 촉매 도메인, 및 c) 구아나리토 바이러스로부터의 당단백질 GP1 엑토도메인(GUA.ectoGP1)을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 벡터에 관한 것이다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 이른바 "pDeSNAP Univ/GUA.ectoGP1 카세트", 즉, 구아나리토 바이러스로부터의 당단백질 GP1 엑토도메인을 인코딩하는 서열이 삽입된 상기 정의된 바와 같은 pDeSNAPUniv DNA 카세트를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 하기를 포함하는 서열번호 136의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 pDeSNAP Univ/GUA.ectoGP1 카세트를 포함한다:
- 서열번호 22의 곤충 BiP 서열,
- 구아나리토 바이러스(Genbank#NC_005077)로부터의 당단백질 GP1 엑토도메인을 인코딩하는 DNA 서열,
- 서열번호 31의 SNAP-유사 서열, 및
- HisTag 서열을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA 서열.
또 다른 양상에서, 본 발명은 상기 벡터로 안정하게 형질감염된 재조합 세포에 관한 것이다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 a) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT)(EC 2.1.1.63) 또는 이의 돌연변이체 또는 촉매 도메인 및 b) 구아나리토 바이러스로부터의 당단백질 GP1 엑토도메인을 포함하는 융합 폴리펩타이드에 관한 것이다. 이러한 융합 폴리펩타이드에서, 상기 AGT 효소는 서열번호 2의 단백질 또는 (상기 정의된 바와 같은) 이의 상동체이다. 이러한 융합 폴리펩타이드는, 예를 들어, 서열번호 137의 아미노산 서열(SNAP-유사/ GUA.ectoGP1/Histag 융합 단백질에 상응)이다.
따라서, 또 다른 양상에서, 본 발명은, 예를 들어, 본 발명의 면역분석으로 생물학적 샘플 중의 구아나리토 바이러스의 존재를 확인하기 위한 이러한 융합 단백질 [SNAP-GUA.ectoGP1]의 용도에 관한 것이다.
또 다른 실시형태에서, 본 발명은 a) 상기 숙주 세포에서 기능성인 분비 시그널 펩타이드, 및 b) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT) 또는 이의 돌연변이체, 단편 또는 촉매 도메인, 및 c) 사비아 바이러스로부터의 당단백질 GP1 엑토도메인(SAB.ectoGP1)을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 벡터에 관한 것이다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 이른바 "pDeSNAP Univ/SAB.ectoGP1 카세트", 즉, 사비아 바이러스로부터의 당단백질 GP1 엑토도메인을 인코딩하는 서열이 삽입된 상기 정의된 바와 같은 pDeSNAPUniv DNA 카세트를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 하기를 포함하는 서열번호 138의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 pDeSNAP Univ/SAB.ectoGP1 카세트를 포함한다:
- 서열번호 22의 곤충 BiP 서열,
- 사비아 바이러스(Genbank#NC_006317)로부터의 당단백질 GP1 엑토도메인을 인코딩하는 DNA 서열,
- 서열번호 31의 SNAP-유사 서열, 및
- HisTag 서열을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA 서열.
또 다른 양상에서, 본 발명은 상기 벡터로 안정하게 형질감염된 재조합 세포에 관한 것이다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 a) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT)(EC 2.1.1.63) 또는 이의 돌연변이체 또는 촉매 도메인 및 b) 사비아 바이러스로부터의 당단백질 GP1 엑토도메인을 포함하는 융합 폴리펩타이드에 관한 것이다. 이러한 융합 폴리펩타이드에서, 상기 AGT 효소는 서열번호 2의 단백질 또는 (상기 정의된 바와 같은) 이의 상동체이다. 이러한 융합 폴리펩타이드는, 예를 들어, 서열번호 139의 아미노산 서열(SNAP-유사/ SAB.ectoGP1/Histag 융합 단백질에 상응)이다.
따라서, 또 다른 양상에서, 본 발명은, 예를 들어, 본 발명의 면역분석으로 생물학적 샘플 중의 사비아 바이러스의 존재를 확인하기 위한 이러한 융합 단백질 [SNAP-SAB.ectoGP1]의 용도에 관한 것이다.
또 다른 실시형태에서, 본 발명은 a) 상기 숙주 세포에서 기능성인 분비 시그널 펩타이드, 및 b) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT) 또는 이의 돌연변이체, 단편 또는 촉매 도메인, 및 c) 라사 바이러스로부터의 당단백질 GP2 엑토도메인(LAS.ectoGP2)을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 벡터에 관한 것이다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 이른바 "pDeSNAP Univ/LAS.ectoGP2 카세트", 즉, 라사 바이러스로부터의 당단백질 GP2 엑토도메인을 인코딩하는 서열이 삽입된 상기 정의된 바와 같은 pDeSNAPUniv DNA 카세트를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 하기를 포함하는 서열번호 140의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 pDeSNAP Univ/LAS.ectoGP2 카세트를 포함한다:
- 서열번호 22의 곤충 BiP 서열,
- 라사 바이러스로부터의 당단백질 GP2 엑토도메인을 인코딩하는 DNA 서열(Genbank#NC_004296),
- 서열번호 31의 SNAP-유사 서열, 및
- HisTag 서열을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA 서열.
또 다른 양상에서, 본 발명은 상기 벡터로 안정하게 형질감염된 재조합 세포에 관한 것이다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 a) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT)(EC 2.1.1.63) 또는 이의 돌연변이체 또는 촉매 도메인 및 b) 라사 바이러스로부터의 당단백질 GP2 엑토도메인을 포함하는 융합 폴리펩타이드에 관한 것이다. 이러한 융합 폴리펩타이드에서, 상기 AGT 효소는 서열번호 2의 단백질 또는 (상기 정의된 바와 같은) 이의 상동체이다. 이러한 융합 폴리펩타이드는, 예를 들어, 서열번호 141의 아미노산 서열(SNAP-유사/ LAS.ectoGP2/Histag 융합 단백질에 상응)이다.
따라서, 또 다른 양상에서, 본 발명은, 예를 들어, 본 발명의 면역분석으로 생물학적 샘플 중의 라사 바이러스의 존재를 확인하기 위한 이러한 융합 단백질 [SNAP-LAS.ectoGP2]의 용도에 관한 것이다.
또 다른 실시형태에서, 본 발명은 a) 상기 숙주 세포에서 기능성인 분비 시그널 펩타이드, 및 b) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT) 또는 이의 돌연변이체, 단편 또는 촉매 도메인, 및 c) 주닌 바이러스로부터의 당단백질 GP2 엑토도메인(JUN.ectoGP2)을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 벡터에 관한 것이다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 이른바 "pDeSNAP Univ/JUN.ectoGP2 카세트", 즉, 주닌 바이러스로부터의 당단백질 GP2 엑토도메인을 인코딩하는 서열이 삽입된 상기 정의된 바와 같은 pDeSNAPUniv DNA 카세트를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 하기를 포함하는 서열번호 142의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 pDeSNAP Univ/JUN.ectoGP2 카세트를 포함한다:
- 서열번호 22의 곤충 BiP 서열,
- 주닌 바이러스(Genbank#NC_005081)로부터의 당단백질 GP2 엑토도메인을 인코딩하는 DNA 서열,
- 서열번호 31의 SNAP-유사 서열, 및
- HisTag 서열을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA 서열.
또 다른 양상에서, 본 발명은 상기 벡터로 안정하게 형질감염된 재조합 세포에 관한 것이다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 a) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT)(EC 2.1.1.63) 또는 이의 돌연변이체 또는 촉매 도메인 및 b) 주닌 바이러스로부터의 당단백질 GP2 엑토도메인을 포함하는 융합 폴리펩타이드에 관한 것이다. 이러한 융합 폴리펩타이드에서, 상기 AGT 효소는 서열번호 2의 단백질 또는 (상기 정의된 바와 같은) 이의 상동체이다. 이러한 융합 폴리펩타이드는, 예를 들어, 서열번호 143의 아미노산 서열(SNAP-유사/ JUN.ectoGP2/Histag 융합 단백질에 상응)이다.
따라서, 또 다른 양상에서, 본 발명은, 예를 들어, 본 발명의 면역분석으로 생물학적 샘플 중의 주닌의 존재를 확인하기 위한 이러한 융합 단백질 [SNAP-JUN.ectoGP2]의 용도에 관한 것이다.
또 다른 실시형태에서, 본 발명은 a) 상기 숙주 세포에서 기능성인 분비 시그널 펩타이드, 및 b) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT) 또는 이의 돌연변이체, 단편 또는 촉매 도메인, 및 c) 마추포 바이러스로부터의 당단백질 GP2 엑토도메인(MAC.ectoGP2)을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 벡터에 관한 것이다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 이른바 "pDeSNAP Univ/MAC.ectoGP2 카세트", 즉, 마추포 바이러스로부터의 당단백질 GP2 엑토도메인을 인코딩하는 서열이 삽입된 상기 정의된 바와 같은 pDeSNAPUniv DNA 카세트를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 하기를 포함하는 서열번호 144의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 pDeSNAP Univ/MAC.ectoGP2 카세트를 포함한다:
- 서열번호 22의 곤충 BiP 서열,
- 마추포 바이러스 (Genbank#NC_005078)로부터의 당단백질 GP2 엑토도메인을 인코딩하는 DNA 서열,
- 서열번호 31의 SNAP-유사 서열, 및
- HisTag 서열을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA 서열.
또 다른 양상에서, 본 발명은 상기 벡터로 안정하게 형질감염된 재조합 세포에 관한 것이다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 a) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT)(EC 2.1.1.63) 또는 이의 돌연변이체 또는 촉매 도메인 및 b) 마추포 바이러스로부터의 당단백질 GP2 엑토도메인을 포함하는 융합 폴리펩타이드에 관한 것이다. 이러한 융합 폴리펩타이드에서, 상기 AGT 효소는 서열번호 2의 단백질 또는 (상기 정의된 바와 같은) 이의 상동체이다. 이러한 융합 폴리펩타이드는, 예를 들어, 서열번호 145의 아미노산 서열(SNAP-유사/ MAC.ectoGP2/Histag 융합 단백질에 상응)이다.
따라서, 또 다른 양상에서, 본 발명은, 예를 들어, 본 발명의 면역분석으로 생물학적 샘플 중의 마추포 바이러스의 존재를 확인하기 위한 이러한 융합 단백질 [SNAP-MAC.ectoGP2]의 용도에 관한 것이다.
또 다른 실시형태에서, 본 발명은 a) 상기 숙주 세포에서 기능성인 분비 시그널 펩타이드, 및 b) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT) 또는 이의 돌연변이체, 단편 또는 촉매 도메인, 및 c) 구아나리토 바이러스로부터의 당단백질 GP2 엑토도메인(GUA.ectoGP2)을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 벡터에 관한 것이다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 이른바 "pDeSNAP Univ/GUA.ectoGP2 카세트", 즉, 구아나리토 바이러스로부터의 당단백질 GP2 엑토도메인을 인코딩하는 서열이 삽입된 상기 정의된 바와 같은 pDeSNAPUniv DNA 카세트를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 하기를 포함하는 서열번호 146의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 pDeSNAP Univ/GUA.ectoGP2 카세트를 포함한다:
- 서열번호 22의 곤충 BiP 서열,
- 구아나리토 바이러스(Genbank#NC_005077)로부터의 당단백질 GP2 엑토도메인을 인코딩하는 DNA 서열,
- 서열번호 31의 SNAP-유사 서열, 및
- HisTag 서열을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA 서열.
또 다른 양상에서, 본 발명은 상기 벡터로 안정하게 형질감염된 재조합 세포에 관한 것이다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 a) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT)(EC 2.1.1.63) 또는 이의 돌연변이체 또는 촉매 도메인 및 b) 구아나리토 바이러스로부터의 당단백질 GP2 엑토도메인을 포함하는 융합 폴리펩타이드에 관한 것이다. 이러한 융합 폴리펩타이드에서, 상기 AGT 효소는 서열번호 2의 단백질 또는 (상기 정의된 바와 같은) 이의 상동체이다. 이러한 융합 폴리펩타이드는, 예를 들어, 서열번호 147의 아미노산 서열(SNAP-유사/ GUA.ectoGP2/Histag 융합 단백질에 상응)이다.
따라서, 또 다른 양상에서, 본 발명은, 예를 들어, 본 발명의 면역분석으로 생물학적 샘플 중의 구아나리토 바이러스의 존재를 확인하기 위한 이러한 융합 단백질 [SNAP-GUA.ectoGP2]의 용도에 관한 것이다.
또 다른 실시형태에서, 본 발명은 a) 상기 숙주 세포에서 기능성인 분비 시그널 펩타이드, 및 b) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT) 또는 이의 돌연변이체, 단편 또는 촉매 도메인, 및 c) 사비아 바이러스로부터의 당단백질 GP2 엑토도메인(SAB.ectoGP2)을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 벡터에 관한 것이다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 이른바 "pDeSNAP Univ/SAB.ectoGP2 카세트", 즉, 사비아 바이러스로부터의 당단백질 GP2 엑토도메인을 인코딩하는 서열이 삽입된 상기 정의된 바와 같은 pDeSNAPUniv DNA 카세트를 포함한다.
바람직한 실시형태에서, 이러한 벡터는 하기를 포함하는 서열번호 148의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 pDeSNAP Univ/MAC.ectoGP2 카세트를 포함한다:
- 서열번호 22의 곤충 BiP 서열,
- 사비아 바이러스(Genbank#NC_006317)로부터의 당단백질 GP2 엑토도메인을 인코딩하는 DNA 서열,
- 서열번호 31의 SNAP-유사 서열, 및
- HisTag 서열을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA 서열.
또 다른 양상에서, 본 발명은 상기 벡터로 안정하게 형질감염된 재조합 세포에 관한 것이다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 a) 6-알킬구아닌-DNA-알킬트랜스퍼라제 효소(AGT)(EC 2.1.1.63) 또는 이의 돌연변이체 또는 촉매 도메인 및 b) 사비아 바이러스로부터의 당단백질 GP2 엑토도메인을 포함하는 융합 폴리펩타이드에 관한 것이다. 이러한 융합 폴리펩타이드에서, 상기 AGT 효소는 서열번호 2의 단백질 또는 (상기 정의된 바와 같은) 이의 상동체이다. 이러한 융합 폴리펩타이드는, 예를 들어, 서열번호 149의 아미노산 서열(SNAP-유사/ SAB.ectoGP2/Histag 융합 단백질에 상응)이다.
따라서, 또 다른 양상에서, 본 발명은, 예를 들어, 본 발명의 면역분석으로 생물학적 샘플 중의 사비아 바이러스의 존재를 확인하기 위한 이러한 융합 단백질 [SNAP-SAB.ectoGP2]의 용도에 관한 것이다.
실시예
본 발명과 관련하여, 생물학적 유체 중의 아르보바이러스에 대한 항체의 신속하고 동시적인 검출을 위해 다중 비드-기반 면역분석법을 개발하였다.
이 시스템은 xMAP 기술(Luminex corporation)에 기초하고 특이적 인간 면역글로불린에 대한 포획 시약으로서 항원-코팅된 마이크로구의 혼합물을 사용한다. 상이한 세트의 마이크로구(Magplex, Luminex corporation)를 정제된 AGT 융합 단백질, 즉, SNAP-택을 갖는 바이러스 재조합 단백질: sSNAP-DV1.EDIII, sSNAP-DV2.EDIII, sSNAP-DV3.EDIII, sSNAP-DV4.EDIII, sSNAP-WN.EDIII, sSNAP-JE.EDIII, sSNAP-USU.EDIII, sSNAP-TBE.EDIII, sSNAP-YF.EDIII, sSNAP-MVE.EDIII, sSNAP-Rocio.EDIII, sSNAP-WSL.EDIII, sSNAP-ZIKA.EDIII, SNAP-DV1ectoM, sSNAP-N.RVF, sSNAP-N.TOS, 및 CHIK.sE2-SNAP와 커플링시켰다. 재조합 항원을 링커로서 AGT 단백질의 기질((BG-PEG-NH2, New England Biolabs)을 사용하여 카복실 마이크로구 표면에 공유적으로 커플링시킴으로써, 표준 아민 커플링 공정과 비교하여, 항체 포획 효율을 증진시켰다.
항-SNAP-택 항체 및 특이적 마우스 모노클로날 항체를 사용하는 기술적 확인으로 커플링 효율을 입증하고 장기간 항원 안정성(6개월 이하)을 입증하였다. 이러한 적용은 임의의 펩타이드 또는 폴리펩타이드가 비드 코팅 및 후속적 항체 포획에 사용될 수 있기 때문에 바이러스 항원에 대해서만 제한되는 것은 아니다.
I. 재료 및 방법
1. 하기 완충액 및 용액을 사용하였다:
a) PBS 완충액: 100 mL의 10X PBS, pH 7.4, 1 L 멸균 H2O 중,
b) SNAP 커플링 완충액(PBS-DTT) : 100 mL의 10 X PBS, pH 7.4, 0.5 mL 10% 트윈 20, 1 mL의 1.0 M DTT, 1 L 멸균 H2O 중,
c) 차단 / 분석 완충액(PBS-B): PBS, 1% BSA, pH 7.4, 1 L 멸균 H2O 중,
d) 저장 완충액(PBS-TBN): 100 mL의 10X PBS, 1 g의 BSA, 2 mL의 10% 트윈 20, 500 mg의 아지드화나트륨, 1 mL의 1.0M DTT, 1 L 멸균 H2O 중,
e) 기질 용액(4 mg/mL): 2 mg의 BG-PEG-NH2, DMSO 200 μL,
f) 활성화 용액(EDAC /SNHS): 50 mg/mL의 EDAC 용액 또는 50 mg/mL의 SNSHS, 증류수 중.
2. 하기 물질을 사용하였다:
2.1. MagPlex Luminex 마이크로구: MC 100XX-ID(여기서, XX는 형광 영역이다), XX는, 도 7B에서 도시되는 바와 같이, 예를 들어, 26, 27, 28, 29, 34, 35, 36, 37, 45, 52, 53, 63, 64일 수 있다.
2.2. hAGT 기질: PEG-BG-NH2(NEB S9150S)
Figure pct00004
2.3. 융합 단백질 SNAP-바이러스 EDIII :
AGT 및 바이러스 EDIII 부분을 포함하는 융합 단백질의 생성은 당업자에게 널리 알려져 있다. AGT 효소가 융합 단백질에서 활성인 한, 모든 공지된 합성법이 이러한 목적에 이용될 수 있다.
본 실시예에서는 서열번호 2의 AGT 돌연변이체 SNAP가 사용되었으며, SNAP-바이러스 EDIII 융합 단백질이 생성되었다.
초파리 S2 유도성 발현 시스템(DES, Invitrogen)이 비-척추동물에서 플라비바이러스로부터의 각각의 EDIII를 다량 생성하기 위해 선택되었으며, 플라스미드 pMT/BiP/V5-HisA(Invitrogen)가 사용되었다.
이 플라스미드 하기를 포함한다:
- 메탈로티오네인 프로모터 pMT,
- 서열번호 22의 곤충 ssBiP 서열,
- Bgl IIAge I 제한 부위,
- AgeI 제한 부위의 하부에 위치되는 His6택을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA, 및
- AgeI 제한 부위와 His6택을 인코딩하는 DNA 사이에 위치되는 서열번호 26의 DNA 스페이서 서열.
플라비바이러스 WN, USU, JE, TBE, DEN-1 내지 DEN-4, YF, Rocio, MVE, Zika, SLE, 및 WSL로부터의 E 단백질의 전장 도메인 III를 인코딩하는 합성 유전자가 서열번호 3 내지 서열번호 14에 열거되어 있다. EDIII 아미노산 서열을 SNAP 단백질의 C-말단에 프레임 내에 융합시켰으며, 양쪽 부분은 링커 GGGS(서열번호 25)에 의해 분리되었다. SNAP-EDIII를 플라스미드 pMT/BiP/V5-Histag(Invitrogen)에 삽입하여 플라스미드 pMT/BiP/SNAP/EDIII/Histag을 생성하였다.
분비되는 SNAP-EDIII-His6 융합 단백질의 발현을 유도할 수 있는 생성된 플라스미드 pMT/BiP/SNAP-EDIII-Histag을 선별 마커 pCo-Blast와 함께 S2 세포에 공동-형질감염시켜 블라스티시딘에 대해 내성을 나타내는 안정한 S2/sSNAP-ED III- Histag 세포주를 생성하였다.
스피너(1000 ml)에서 성장된 안정한 S2 세포주를 중금속 카드뮴(Cd2+)으로 10일 동안 자극하고, 세포외 배지로부터의 단백질을 농축하고 정제하였다.
중금속 카드뮴으로 10일 동안 유도한 후 분비되는 SNAP-태깅된 EDIII 단백질의 축적이 안정한 S2/sSNAP-EDIII-Histag 세포의 상등액에서 관측되었다.
서열번호 21의 SNAP-DEN1.EDIII, 서열번호 X의 SNAP-DEN2.EDIII, 서열번호 X의 SNAP-DEN3.EDIII, 서열번호 X의 SNAP-DEN4.EDIII, 서열번호 X의 SNAP-WN.EDIII, 서열번호 X의 SNAP-JE.EDIII, 서열번호 X의 SNAP-YF.EDIII, 서열번호 X의 SNAP-MVE.EDIII, 서열번호 X의 SNAP-Rocio.EDIII, 서열번호 X의 SNAP-WSL.EDIII, 서열번호 X의 SNAP-ZIKA.EDIII, 서열번호 X의 SNAP-SLE.EDIII 단백질이 생성되었다.
3.항원-커플링된 비드의 제조
항원-커플링된 비드의 생성은 하기 2단계를 포함하였다: 마이크로구 표면을 O6-벤질구아닌 유도체(BG-PEG-아미노)로 작용화시키는 단계 및 키메라 SNAP-바이러스 Ag 단백질을 앵커로서 BG-PEG-아미노를 사용하여 공유적 고정화시키는 단계(도 1). 카복실 마이크로구 표면을 최적화된 2-단계 카보디이미드 공정을 이용하여 BG-PEG-아미노 기질로 공유적으로 코팅하였다(Wong et al Journal of Clinical Microbiology 42(1): 65-72, 2004). 이어서, 벤질 그룹을 SNAP 단백질의 시스테인의 활성 부위 시스테인에 전달시킴으로써 커플링된 BG-PEG-아미노 화합물을 키메라 SNAP-바이러스 Ag 단백질에 비가역적으로 연결시켰다. 이러한 반응의 높은 특이성 때문에, 융합 단백질은 전적으로 SNAP 도메인을 통해 커플링되며, 바이러스 항원은 항체와의 상호작용에 사용가능하게 된다.
3.1. 먼저, 시판 비드를 제조자의 지침에 따라(EDAC 및 SNHS 활성화 용액을 사용하여) 활성화시키고, PBS 완충액에서 세척하였다. 모든 단계는 제조자의 지침에 따라 형광 퀀칭을 막도록 암흑 속에서 수행하였다.
약 1.25 x 106개의 비드가 각각의 커플링 공정에 사용되었다.
3.2. 이어서, DMSO 용액 중의 AGT 기질 PEG-BG-NH2을 실온에서 밤새 활성화된 비드 상에 부가한 후, PBS 완충액으로 세척하였다.
3.3. 이어서, 결합되지 않은 카복실 부위를 실온에서 30분 동안 차단 완충액으로 차단한 후, 비드를 SNAP 커플링 완충액으로 세척하였다.
3.4. SNAP 커플링 완충액(100 ㎛/mL)에 현탁된 SNAP-EDIII 단백질을 실온에서 2시간 동안 상기에서 수득된 비드와 함께 인큐베이션한 후, SNAP 커플링 완충액으로 1회 및 저장 완충액(PBS-TBN)으로 3회 세척하였다.
4. 마이크로구 형광 면역분석
상이한 SNAP-바이러스 Ag와 접합된 비드 세트를 볼텍스로 혼합하여 비드를 완전히 분산시켰다. 비드 밀도를 100개 비드/μL로 조절한 후, 25 μL의 비드 세트 각각 (2500개 마이크로구 포함)을 96-웰 미세역가판(Bio-Plex Pro 평저 플레이트, BioRad)으로 일중 분석을 위해 개별 웰에 옮기거나 다중 분석을 위해 동일한 웰에서 혼합하였다. 마이크로구를 자성 비드(BioPlex Pro Wash Station, BioRad)를 위한 마이크로플레이트 세척 스테이션을 이용하여 100 μL 세척 완충액(BioPlex 세척 완충액, BioRad)으로 2회 세척하였다. 샘플(항체 또는 혈청)을 분석 완충액(PBS-BSA)에 희석시키고, 50 μL의 생성 용액을 접합된 비드를 포함하는 시험 웰에 가하였다. 30분 동안 판상 쉐이커 상에서 암흑 속에서 인큐베이션한 후, 플레이트를 이전과 같이 세척하였다. 이어서, 형광색소-표지된 제2 항체를 분석 완충액(PBS-BSA)에 2 μg/mL로 희석시키고, 50 μL의 생성 용액을 접합된 비드를 포함하는 시험 웰에 가하였다. 30분 동안 판상 쉐이커 상에서 암흑 속에서 인큐베이션한 후, 플레이트를 3회 세척하였다. 마지막으로, 스트렙트아비딘-피코에리트린(SAPE, Invitrogen Molecular Probes)을 분석 완충액(PBS-BSA)에 2 μg/ml로 희석시킨 후, 50 μL의 생성 용액을 마이크로플레이트 웰에 가하였다. 웰 내용물을 125 μL 분석 완충액에 재현탁시키기 전, 플레이트를 10분 동안 플레이트 쉐이커 상에서 암흑 속에서 인큐베이션하고 이전과 같이 세척하였다. 각각의 마이크로구에 결합된 검출 항체의 중간 형광 강도(MFI)를 이중-레이저 유동 분석기(BioPlex 200 기구, BioRad)를 사용하여 웰 당 50개 마이크로구의 유동 분석으로 평가하였다. 형광 검출 기구는 비드의 유형을 검출하기 위한 제1 레이저 및 특정 검출 항체에 접합된 형광단(레드-피코에리트린)을 여기시킴으로써 포획된 IgM 또는 IgG를 정량하기 위한 제2 레이저가 구비된다.
4.1. 항원 커플링의 확인
항원 커플링은 항원-커플링된 마이크로구를 토끼 항-SNAP-택 폴리클로날 항체(GenScript)의 희석물로 시험함으로써 확인되었다. 형광 면역분석은 상술된 바와 같이 일중 포맷으로 수행되었다. 4000 ng/mL로 개시하여 3.9 ng/mL로 종결되는 항-SNAP 항체의 2배 희석 시리즈를 PBS-BSA에서 수행하고, 각각의 희석물을 비드를 포함하는 시험 웰에 가하였다. 바이오틴-접합된 염소 항-토끼 IgG(2 ㎍/mL, 50 μL PBS-BSA 중)를 결합된 항-SNAP 항체를 검출하기 위한 제2 항체로서 사용하였다.
도 2는 키메라 SNAP-바이러스 항원 단백질(SNAP-DV1.EDIII, SNAP-DV2.EDIII, SNAP.DV3.EDIII, SNAP.DV4.EDIII, SNAP-WNV.EDIII, SNAP-YF.EDIII, SNAP-JE.EDIII, SNAP-TBE.EDIII)에 커플링된 8개의 상이한 세트의 마이크로구 상에서의 항-SNAP 항체 검출에 대해 관측된 형광 결과를 도시한다.
4.2. 특이적 항체의 검출
정제된 모노클로날 마우스 항체(항-WNV, 항-DV1 및 항-DV2) 및 폴리클로날 마우스 혈청(항-DV3, 항-DV4, 항-YF 및 항-JE) 또는 인간 혈청(항-DV1)을 사용하여 항원-접합된 마이크로구에 의한 특이적 항체의 포획 및 검출을 평가하였다. 형광 면역분석을 상술된 바와 같이 일중 및 다중 포맷으로 수행하였다. 400 ng/mL로 개시하여 0.1 ng/mL로 종결되는 마우스 모노클로날 항체의 4배 희석 시리즈 및 1:25로 개시하여 1:102400으로 종결되는 마우스 및 인간 혈청의 4배 희석 시리즈를 PBS-BSA에서 수행하고, 각각의 희석물을 비드를 포함하는 시험 웰에 가하였다. 바이오틴-접합된 염소 항-마우스 IgG(2 ㎍/mL, 50 μL PBS-BSA 중)를 결합된 모노클로날 및 폴리클로날 마우스 항체를 검출하기 위한 제2 항체로 사용하였다. 바이오틴-접합된 염소 항-인간 IgM(2 ㎍/mL, 50 μL PBS-BSA 중) 또는 바이오틴-접합된 염소 항-인간 IgG(2 ㎍/mL, 50 μL PBS-BSA 중)를 사용하여 각각 인간 혈청 중의 결합된 IgM 또는 IgG 항체를 검출하였다.
도 3은 hAGT 단백질의 기질을 통해 (본 발명의 커플링) 또는 Bio-Plex 아민 커플링 키트(BIORAD)를 통해 커플링된 마이크로구에 접합된 키메라 SNAP-DV2.EDIII 단백질에 대한 정제된 모노클로날 항-DV2 항체의 검출을 위한 면역분석 실험의 민감도를 비교한다.
도 4는 마이크로구에 접합된 키메라 SNAP-DV1.EDIII 단백질에 대한 정제된 모노클로날 항-DV1 항체의 검출을 위해 일중 포맷으로 수행되거나 마이크로구에 커플링된 다른 키메라 SNAP-바이러스 Ag 단백질(SNAP-DV2.EDIII, SNAP.DV3.EDIII, SNAP.DV4.EDIII, SNAP-WNV, SNAP-YF, SNAP-JE, SNAP-TBE)과 함께 다중 포맷으로 수행된 면역분석 실험의 민감도를 비교한다.
도 5는 마이크로구에 커플링된 키메라 SNAP-바이러스 Ag 단백질(SNAP-DV1.EDIII, SNAP-DV2.EDIII, SNAP.DV3.EDIII, SNAP.DV4.EDIII, SNAP-WNV, SNAP-YF, SNAP-JE, SNAP-TBE)에 대한 정제된 모노클로날 항-WNV 항체 희석물의 검출을 위한 다중 면역분석 실험의 반응성 및 특이성을 도시한다.
도 6은, 마이크로구에 커플링된 키메라 SNAP-바이러스 Ag 단백질(SNAP-DV1.EDIII, SNAP-DV2.EDIII, SNAP.DV3.EDIII, SNAP.DV4.EDIII, SNAP-WNV, SNAP-YF, SNAP-JE, SNAP-WSL, SNAP-ROCIO, SNAP-MVE, SNAP-SLE, SNAP-ZIKA)에 대한 다중 면역분석으로, DV3에 대한 마우스 폴리클로날 혈청에서 항-DV3 IgG 검출의 반응성 및 특이성(A) 및 YF에 대한 마우스 폴리클로날 혈청에서 항-YF IgG 검출의 반응성 및 특이성(B)을 도시한다.
도 7은, 마이크로구에 커플링된 키메라 SNAP-바이러스 Ag 단백질(SNAP-DV1.EDIII, SNAP-DV2.EDIII, SNAP.DV3.EDIII, SNAP.DV4.EDIII, SNAP-WNV, SNAP-YF, SNAP-JE, SNAP-WSL, SNAP-ROCIO, SNAP-MVE, SNAP-SLE, SNAP-ZIKA, SNAP-TBE)에 대한 다중 면역분석으로, 인간 환자의 DV1-감염된 혈청에서 항-DV1 IgM 검출의 반응성 및 특이성(A) 및 항-DV1 IgG 검출의 반응성 및 특이성(B)을 도시한다.
II. 결과
본 발명의 시스템은 특이적 인간 면역글로불린에 대한 포획 시약으로서 항원-코팅된 Magplex 마이크로구(Luminex Corporation)의 혼합물을 사용한다. 내부적으로 칼라-코드화된 마이크로구의 각각의 세트를 특정 재조합 항원에 커플링시키고, 소량의 샘플 용적으로 다른 유형의 마이크로구들과 함께 혼합하였다. 이러한 시스템의 능력은 사실상 유동 분석 기구를 사용하여 웰당 100개 유형 이하의 커플링된 마이크로구를 동시에 분석할 수 있다는 것이다. 형광 검출 기구는 비드의 유형을 검출하기 위한 제1 레이저 및 특정 검출 항체에 접합된 형광단(레드-피코에리트린)을 여기시킴으로써 포획된 IgM 또는 IgG를 정량하기 위한 제2 레이저가 구비된다. 이러한 접근은 광범위한 다중화 능력 및 낮은 검출 한도를 갖기 때문에 종래의 ELISA 측정에 비해 비용 및 샘플이 상당히 절감된다.
본 실시예에서는, 16개의 상이한 마이크로구 세트가 정제된 키메라 SNAP-바이러스 Ag 단백질에 커플링되었으며, 뎅기 혈청형 1 내지 4, 웨스트 나일, 황열, 일본 뇌염, 진드기-매개 뇌염, 세인트-루이스 뇌염, 머레이 계곡 뇌염, 베셀스브론, 지카, 로시오, 우수투, 리프트 계곡 열 및 치쿤구니아 바이러스에 특이적인 혈청 항체를 적정하였다. 1000개의 개별 분석을 수행하기에 충분한 한 세트의 항원-커플링된 마이크로구(약 1.25 x 106개 마이크로구)를 생성하는데 단지 매우 소량의 재조합 항원(< 50㎍)이 필요하므로 이 시스템의 제조는 시간 및 비용에 있어 매우 효과적이다. 또한, 선택된 세트의 마이크로구는 MagPix(Luminex Corporation)와 같이 저렴하고 소형이며 강력한 형광 검출 시스템에 적합하다.
항-SNAP 항체를 사용한 항원 커플링의 평가(도 2)는 커플링 효율을 입증하였으며, 결합된 항원의 상대적 양이 상이한 커플링된 마이크로구 세트 간에 유사하다는 것을 증명하였다. 정제된 마우스 항체를 사용한 항체 포획 및 검출 평가는, 표준 아민 커플링 공정으로 수득된 항원-커플링된 마이크로구와 비교하여, 생성된 항원-커플링된 마이크로구에 의한 특이적 항체의 증진된 포획을 입증하였다(도 3). 또한, 이는 상기 방법의 낮은 검출 한계를 입증하였으며, 다중화가 항체 검출에 영향을 끼치지 않는다는 것을 증명하였다(도 4). 또한, 항원-접합된 마이크로구는, 4℃(> 6개월)에서 저장하는 경우, 장기간 안정성을 나타내었다. 마지막으로, 다중 면역분석에서 커플링된 마이크로구 세트 각각의 특이성이 정제된 모노클로날 항체(도 5), 폴리클로날 마우스 혈청 중의 IgG 항체(도 6A-B) 및 감염된 인간으로부터의 폴리클로날 혈청 중의 IgM 및 IgG 항체 모두 (도 7)에 대해 입증되었다.
이러한 접근은 광범위한 다중화 능력 (웰당 100개 유형 이하의 커플링된 마이크로구) 및 낮은 검출 한도를 갖기 때문에 종래의 ELISA 측정에 비해 비용 및 샘플이 상당히 절감된다.
III. SNAP와 쉬말렌베르그 바이러스의 N 핵단백질을 포함하는 융합 단백질의 생성
1.융합 단백질 SNAP-SBV.N을 인코딩하는 벡터의 작제
SNAP와 쉬말렌베르그 바이러스의 N 핵단백질을 포함하는 키메라 융합 단백질을 하기와 같이 수득하였다:
제1 단계에서, BH80/11-4 스트레인의 N 핵단백질 및 NSs 단백질을 인코딩하는 S 절편의 개방 판독 프레임의 서열을 이의 5' 말단에 EcoRV 제한 부위 및 3' 말단에 XmaI 제한 부위를 삽입함으로써 돌연변이시켰다. 또한, 294T 뉴클레오타이드를 294A로 돌연변이시킴으로써 내부 EcoRV 제한 부위를 제거시켰다. 이러한 돌연변이된 서열이 서열번호 17에 나타나있다.
이어서, 이러한 돌연변이된 서열을 서열번호 34의 pDeSNAP Univ 카세트의 EcoRVXmaI 제한 부위에 삽입하여 서열번호 36의 "pDeSNAP Univ/SBV.N" DNA 카세트를 생성하였다.
이른바 "pDeSNAP Univ/SBV.N" DNA 카세트는 하기를 포함한다(참조: 도 9 및 서열번호 36):
- 서열번호 23의 곤충 BiP-유사 서열,
- 서열번호 31의 SNAP-유사 서열,
- 스페이서 서열 GGGS(서열번호 25)을 인코딩하는 서열번호 26의 제1 DNA 서열,
- 서열 ENLYFQS(서열번호 32)의 pro-TEV1 개열 부위를 인코딩하는 서열번호 29의 DNA 서열,
- 서열번호 17의 SBV.N DNA 서열(내부 EcoRV 부위가 결실되고 2개의 EcoRVXmaI 부위가 맨 끝에 첨가된, 천연 SBV.N 서열에 상응),
- 서열 ENLYFQG(서열번호 33)의 pro-TEV2 개열 부위를 인코딩하는 서열번호 30의 DNA 서열,
- HisTag 서열을 인코딩하는 서열번호 28의 DNA 서열.
이러한 카세트는 또한 ATG의 상부에 NheI 부위, BiP-유사 서열과 SNAP-유사 서열 사이에 BglII 부위, 및 AgeI 부위 및 HindIII 부위(이들 모두 정지 코돈 하부에 위치된다)를 포함한다.
pDeSNAPUniv/SBV.N 카세트(참조: 도 9)의 BglIIAgeI 제한 부위 사이에 포함된 서열을 효소적 분해로 개열한 후, pMT/BiP/V5-A 플라스미드(Invitrogen)에 클로닝하여 pMT/BiP/SNAP-SBV.N 벡터를 생성하였다. 이러한 벡터를 사용하여 SNAP-SBV.N 융합 단백질을 분비하는 안정한 S2 세포를 생성하였다.
이어서, pDeSNAPUniv/SBV.N 카세트의 NheINotI 제한 부위 사이에 포함된 서열을 pcDNA3 플라스미드(Invitrogen)에 클로닝하여 pcDNA3/SNAP-SBV.N 벡터를 생성하였다. 이어서, 이 벡터를 사용하여 SNAP-SBV.N 융합 단백질을 분비하는 안정한 포유동물 세포를 생성하였다.
2. 융합 단백질 SNAP-SBV.N의 생성
분비되는 융합 단백질로서 SNAP-태깅된 SBV.N 단백질을 생성하는 생성 플라스미드 pMT/BiP/SNAP-SBV.N를 선별 마커 pCo-Blast와 함께 S2 세포로 공동-형질감염하여 블라스티시딘에 대해 내성을 나타내는 안정한 S2/SNAP-SBV.N 세포주를 생성하였다.
이 세포주는 파스퇴르 인스티튜트 국립 미생물 배양센터 [the Collection Nationale de Cultures de Microorganismes(CNCM) of the Institut Pasteur (25 rue du Docteur Roux, 75724 PARIS CEDEX 15, France)]에 기탁 번호 CNCM I-4616으로 기탁되었다.
스피너(1000 ml)에서 성장된 안정한 S2 세포주를 중금속 카드뮴(Cd2+)으로 10일 동안 자극하였다.
중금속 카드뮴으로 10일 동안 유도한 후 분비되는 SNAP-SBV.N 단백질의 축적이 S2/SNAP-SBV.N 세포의 상등액에서 관측되었다.
Cd2 +으로 10일 동안 유도된 S2/SNAP-SBV.N 세포의 상등액 4 mL로부터의 0.01 mL를 항-Histag 항체(희석율 1:1,000)를 사용하여 면역블롯 분석으로 시험하였다(참조: 도 10).
키메라 단백질 SNAP-SBV.N을 SNAP-TOS.N 키메라 단백질(SNAP와 플레보바이러스인 토스카나 바이러스로부터의 N 핵단백질을 포함하는 융합 단백질)의 정의된 양과 비교하였다.
10일 동안 유도된 S2/SNAP+SBV.N 세포로부터의 정제된 SNAP-SBV.N의 생성은 세포 배양물 L 당 18 mg이었다(도 10B).
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꼴렉시용 나시오날레 드 꿀뚜레드 미끄로오르가니스메 (CNDM) CNCMI-4745 20130502 꼴렉시용 나시오날레 드 꿀뚜레드 미끄로오르가니스메 (CNDM) CNCMI-4746 20130502
SEQUENCE LISTING <110> INSTITUT PASTEUR <120> MULTIPLEX IMMUNO SCREENING ASSAY <130> IPA141114-FR <150> US 61/642,924 <151> 2012-05-04 <150> PCT/EP2012/074986 <151> 2012-12-10 <160> 179 <170> KopatentIn 2.0 <210> 1 <211> 238 <212> PRT <213> homo sapiens <400> 1 Met Leu Gly Gln Pro Ala Pro Leu Glu Arg Phe Ala Ser Arg Arg Pro 1 5 10 15 Gln Val Leu Ala Val Arg Thr Val Cys Asp Leu Val Leu Gly Lys Met 20 25 30 Asp Lys Asp Cys Glu Met Lys Arg Thr Thr Leu Asp Ser Pro Leu Gly 35 40 45 Lys Leu Glu Leu Ser Gly Cys Glu Gln Gly Leu His Glu Ile Lys Leu 50 55 60 Leu Gly Lys Gly Thr Ser Ala Ala Asp Ala Val Glu Val Pro Ala Pro 65 70 75 80 Ala Ala Val Leu Gly Gly Pro Glu Pro Leu Met Gln Cys Thr Ala Trp 85 90 95 Leu Asn Ala Tyr Phe His Gln Pro Glu Ala Ile Glu Glu Phe Pro Val 100 105 110 Pro Ala Leu His His Pro Val Phe Gln Gln Glu Ser Phe Thr Arg Gln 115 120 125 Val Leu Trp Lys Leu Leu Lys Val Val Lys Phe Gly Glu Val Ile Ser 130 135 140 Tyr Gln Gln Leu Ala Ala Leu Ala Gly Asn Pro Lys Ala Ala Arg Ala 145 150 155 160 Val Gly Gly Ala Met Arg Gly Asn Pro Val Pro Ile Leu Ile Pro Cys 165 170 175 His Arg Val Val Cys Ser Ser Gly Ala Val Gly Asn Tyr Ser Gly Gly 180 185 190 Leu Ala Val Lys Glu Trp Leu Leu Ala His Glu Gly His Arg Leu Gly 195 200 205 Lys Pro Gly Leu Gly Gly Ser Ser Gly Leu Ala Gly Ala Trp Leu Lys 210 215 220 Gly Ala Gly Ala Thr Ser Gly Ser Pro Pro Ala Gly Arg Asn 225 230 235 <210> 2 <211> 193 <212> PRT <213> artificial <220> <223> Amino acid sequence of SNAP <400> 2 Arg Ser Asp Lys Asp Cys Glu Met Lys Arg Thr Thr Leu Asp Ser Pro 1 5 10 15 Leu Gly Lys Leu Glu Leu Ser Gly Cys Glu Gln Gly Leu His Glu Ile 20 25 30 Lys Leu Leu Gly Lys Gly Thr Ser Ala Ala Asp Ala Val Glu Val Pro 35 40 45 Ala Pro Ala Ala Val Leu Gly Gly Pro Glu Pro Leu Met Gln Ala Thr 50 55 60 Ala Trp Leu Asn Ala Tyr Phe His Gln Pro Glu Ala Ile Glu Glu Phe 65 70 75 80 Pro Val Pro Ala Leu His His Pro Val Phe Gln Gln Glu Ser Phe Thr 85 90 95 Arg Gln Val Leu Trp Lys Leu Leu Lys Val Val Lys Phe Gly Glu Val 100 105 110 Ile Ser Tyr Gln Gln Leu Ala Ala Leu Ala Gly Asn Pro Ala Ala Thr 115 120 125 Ala Ala Val Lys Thr Ala Leu Ser Gly Asn Pro Val Pro Ile Leu Ile 130 135 140 Pro Cys His Arg Val Val Ser Ser Ser Gly Ala Val Gly Gly Tyr Glu 145 150 155 160 Gly Gly Leu Ala Val Lys Glu Trp Leu Leu Ala His Glu Gly His Arg 165 170 175 Leu Gly Lys Pro Gly Leu Gly Pro Ala Gly Ile Gly Ala Pro Gly Ser 180 185 190 Leu <210> 3 <211> 404 <212> DNA <213> Dengue virus 1 <400> 3 taggcgcgcc agggtccctg gagggaggtg gcgggtctct gactttaaaa gggatgtcat 60 atgtgatgtg cacaggctca tttaagctag agaaggaagt ggctgagacc cagcatggaa 120 ctgtcctagt gcaggttaaa tacgaaggaa cagatgcgcc atgcaagatc cccttttcga 180 cccaagatga gaaaggagtg acccagaatg ggagattgat aacagccaat cccatagtta 240 ctgacaaaga aaaaccaatc aacattgaga cagaaccacc ttttggtgag agctacatca 300 tagtaggggc aggtgaaaaa gctttgaaac taagctggtt caagaaagga agcagcatag 360 ggaaaggagg tggccatcac catcaccatc actgatgacc ggtt 404 <210> 4 <211> 404 <212> DNA <213> Dengue virus 2 <400> 4 taggcgcgcc agggtccctg gagggaggtg gcgggtctct acagctcaaa ggaatgtcat 60 attctatgtg tacaggaaag tttaaagttg tgaaggaaat agcagaaaca caacatggaa 120 caatagttct cagagtacaa tatgaagggg acggttctcc gtgcaagatc ccttttgaaa 180 taatggattt ggaaaaaaga catgtcttag gtcgcttgat cacagtcaac ccaattgtta 240 cagaaataga cagcccagtc aacatagaag cagaacctcc attcggagac agctacatca 300 ttataggagt agaaccggga caactgaagc tcagctggtt taagaaagga agttccattg 360 gccaaggagg tggccatcac catcaccatc actgatgacc ggtt 404 <210> 5 <211> 401 <212> DNA <213> Dengue virus 3 <400> 5 taggcgcgcc agggtccctg gagggaggtg gcgggtctga actcaagggg atgagctatg 60 caatgtgctt gaataccttt gtgttgaaga aagaagtctc cgaaacgcag catgggacaa 120 tactcattaa ggttgagtac aaaggggaag atgcaccttg caagattcct ttctccacag 180 aggatggaca agggaaagcc cacaatggta gactgatcac agccaaccca gtggttacta 240 agaaggagga gcctgtcaac attgaggctg aacctccttt tggggaaagc aacatagtga 300 ttggagttgg agacaaagcc ttgaaaatta actggtacaa gaagggaagc tcgattggga 360 agggaggtgg ccatcaccat caccatcact gatgaccggt t 401 <210> 6 <211> 401 <212> DNA <213> Dengue virus 4 <400> 6 taggcgcgcc agggtccctg gagggaggtg gcgggtctag aatcaaggga atgtcataca 60 cgatgtgctc aggaaagttc tcaattgaca aagagatggc agaaacacag catgggacaa 120 cagtggtgaa agtcaagtat gaaggtgctg gagctccgtg taaagtcccc atagagatac 180 gagatgtaaa taaggaaaaa gtggttgggc gtgtcatctc atccacccct ctagctgaga 240 ataccaacag tgtgaccaac atagaactgg aacccccctt tggggacagt tacatagtca 300 taggtgttgg gaacagtgca ttgacactcc attggttcag gaaaggaagt tctattggca 360 agggaggtgg ccatcaccat caccatcact gatgaccggt t 401 <210> 7 <211> 398 <212> DNA <213> West Nile Virus <400> 7 taggcgcgcc aggaggtggc gggtctcagt tgaagggaac aacctatggc gtctgttcaa 60 aggctttcaa gtttcttggg actcccgcag acacaggtca cggcactgtg gtgttggaat 120 tgcagtacac tggcacggat ggaccttgca aagttcctat ctcgtcagtg gcttcattga 180 acgacctaac gccagtgggc agattggtca ctgtcaaccc ttttgtttca gtggccacgg 240 ccaacgctaa ggtcctgatt gaattggaac caccctttgg agactcatac atagtggtgg 300 gcagaggaga acaacagatc aatcaccatt ggcacaagtc tggaagcagc attggcaaag 360 gaggtggcca tcaccatcac catcactgat gaccggtt 398 <210> 8 <211> 410 <212> DNA <213> Yellow fever virus <400> 8 taggcgcgcc agggtccctg gagggaggtg gcgggtcttc agctttgaca ctcaagggga 60 catcctacaa aatgtgcact gacaaaatgt cttttgtcaa gaacccaact gacactggcc 120 atggcactgt tgtgatgcag gtgaaagtgc caaaaggagc cccctgcaag attccagtga 180 tagtagctga tgatcttaca gcggcaatca ataaaggcat tttggttaca gttaacccca 240 tcgcctcaac caatgatgat gaagtgctga ttgaggtgaa cccacctttt ggagacagct 300 acattatcgt tgggacagga gattcacgtc tcacttacca gtggcacaaa gagggaagct 360 caataggaaa gggaggtggc catcaccatc accatcactg atgaccggtt 410 <210> 9 <211> 410 <212> DNA <213> Japanese encephalitis virus <400> 9 taggcgcgcc agggtccctg gagggaggtg gcgggtctgc tctgaaaggc acaacctatg 60 gcatgtgtac agaaaaattc tcgttcgcga aaaatccggc ggacactggt cacggaacag 120 ttgtcattga actctcctac tctgggagtg atggcccctg caaaattccg attgtctccg 180 tcgcgagcct caatgacatg actcctgttg ggcggctggt gacagtgaac ccctttgtcg 240 cggcttccag tgccaactca aaggtgctgg tcgagatgga accccccttc ggagactcct 300 atatcgtggt tggaagggga gacaagcaga tcaaccacca ttggcacaga gctggaagca 360 cgctgggcaa gggaggtggc catcaccatc accatcactg atgaccggtt 410 <210> 10 <211> 397 <212> DNA <213> Zika virus <400> 10 gcgcgccagg aggtggcggg tctcttagat tgaagggcgt gtcatactcc ttgtgtaccg 60 cagcgttcac attcaccaag atcccggctg aaacactgca cgggacagtc acagtggagg 120 tacagtacgc agggacagat ggaccctgca aggttccagc tcagatggcg gtggacatgc 180 aaactctgac cccagttggg aggctgataa ccgctaaccc tgtaatcact gaaagcactg 240 agaactctaa gatgatgctg gaacttgatc caccatttgg ggactcttac attgtcatag 300 gagtcgggga gaagaagatc acccatcact ggcacaggag tggcagcacc attggaaaag 360 gaggtggcca tcaccatcac catcactgat gaccggt 397 <210> 11 <211> 385 <212> DNA <213> Wesselbron virus <400> 11 gcgcgccagg aggtggcggg ctcatcctga aaggttcaac ctactcaatg tgcaaaagag 60 ggatgtcctt tgctaagcaa ccagttgaga cagaccatgg aacagcagtg atgcagataa 120 aagttacaac tggagctccg tgcagaattc cagtgattgc agcagattcc atggcgggaa 180 cagaaaaccg tggaagcgtc atcacaacca atcctattgc tgcgtcaaac aatgatgaag 240 tgttggtgga gatcagtcca ccatttggag agagttacat catcgttggt aatggagatg 300 ataaacttac ataccactgg caaagatcag gaagcaccat cgggaatgga ggtggccatc 360 accatcacca tcactgatga ccggt 385 <210> 12 <211> 397 <212> DNA <213> Rocio virus <400> 12 gcgcgccagg aggtggcggg tctctcaaaa tcaaagggtc aacatacctg atgtgcaagg 60 acaaatttgc ttttgccaag aacccagttg acacaggaca cggcacaatc gtgacggagg 120 tacagtacgc tggttctgat gggccatgca ggattccaat caccatgacc gagaacctac 180 atgatctcac tcccatcgga cgattggtga cggtcaatcc atttgttccc tcatccgaga 240 cggcacaaaa aattttgatt gaactcgagc ccccctttgg gacatccttc atactggtgg 300 gtacaggtcc caaccaggtg aaataccagt ggcataagtc tggtagtgtg atcggaaaag 360 gaggtggcca tcaccatcac catcactgat gaccggt 397 <210> 13 <211> 397 <212> DNA <213> Murray encephalitis virus <400> 13 gcgcgccagg aggtggcggg tctttgaaac tgaaaggaac cacttatggg atgtgcacag 60 aaaaatttac tttctcaaag aatccagccg acaccggaca tggcacggta gtactagaac 120 tgcagtacac cgggagtgat ggaccatgca aaattccaat atcctctgta gcaagtctca 180 atgacatgac gcctgtcgga agaatggtga cagctaatcc atatgtagct tcatcaactg 240 ccaatgctaa agttctggtg gagattgaac cacccttcgg agactcatac attgtggtag 300 gcaggggaga caagcagatc aatcaccact ggcataagga gggtagttca attggcaaag 360 gaggtggcca tcaccatcac catcactgat gaccggt 397 <210> 14 <211> 397 <212> DNA <213> Saint-Louis encephalitis virus <400> 14 gcgcgccagg aggtggcggg tctgttaaaa tcaaggggac gacatatggt atgtgtgact 60 ctgctttcac cttcagcaag aaccctgctg acacagggca tgggacagtg atcgtggaac 120 tgcagtacac tggaagcaac ggaccatgcc gggttcccat ttctgtgact gcaaacctca 180 tggacttgac accagttgga agactggtca cggtcaatcc ctttattagc acagggggag 240 cgaacaacaa ggtcatgatc gaagttgaac caccctttgg cgactcttac atcgtcgtcg 300 gaagaggcac cacccagatc aactaccact ggcacaaaga gggaagcagc attgggaagg 360 gaggtggcca tcaccatcac catcactgat gaccggt 397 <210> 15 <211> 579 <212> DNA <213> artificial <220> <223> DNA encoding original SNAP (normal G/C content) <400> 15 agatctgaca aagactgcga aatgaagcgc accaccctgg atagccctct gggcaagctg 60 gaactgtctg ggtgcgaaca gggcctgcac gagatcaagc tgctgggcaa aggaacatct 120 gccgccgacg ccgtggaagt gcctgcccca gccgccgtgc tgggcggacc agagccactg 180 atgcaggcca ccgcctggct caacgcctac tttcaccagc ctgaggccat cgaggagttc 240 cctgtgccag ccctgcacca cccagtgttc cagcaggaga gctttacccg ccaggtgctg 300 tggaaactgc tgaaagtggt gaagttcgga gaggtcatca gctaccagca gctggccgcc 360 ctggccggca atcccgccgc caccgccgcc gtgaaaaccg ccctgagcgg aaatcccgtg 420 cccattctga tcccctgcca ccgggtggtg tctagctctg gcgccgtggg gggctacgag 480 ggcgggctcg ccgtgaaaga gtggctgctg gcccacgagg gccacagact gggcaagcct 540 gggctgggtc ctgcaggtat aggcgcgcca gggtcccta 579 <210> 16 <211> 235 <212> PRT <213> artificial <220> <223> mutated N protein of schmallenberg virus <400> 16 Asp Ile Ser Ser Gln Phe Ile Phe Glu Asp Val Pro Gln Arg Asn Ala 1 5 10 15 Ala Thr Phe Asn Pro Glu Val Gly Tyr Val Ala Phe Ile Gly Lys Tyr 20 25 30 Gly Gln Gln Leu Asn Phe Gly Val Ala Arg Val Phe Phe Leu Asn Gln 35 40 45 Lys Lys Ala Lys Met Val Leu His Lys Thr Ala Gln Pro Ser Val Asp 50 55 60 Leu Thr Phe Gly Gly Val Lys Phe Thr Val Val Asn Asn His Phe Pro 65 70 75 80 Gln Tyr Val Ser Asn Pro Val Pro Asp Asn Ala Ile Thr Leu His Arg 85 90 95 Met Ser Gly Tyr Leu Ala Arg Trp Ile Ala Asp Thr Cys Lys Ala Ser 100 105 110 Val Leu Lys Leu Ala Glu Ala Ser Ala Gln Ile Val Met Pro Leu Ala 115 120 125 Glu Val Lys Gly Cys Thr Trp Ala Asp Gly Tyr Thr Met Tyr Leu Gly 130 135 140 Phe Ala Pro Gly Ala Glu Met Phe Leu Asp Ala Phe Asp Phe Tyr Pro 145 150 155 160 Leu Val Ile Glu Met His Arg Val Leu Lys Asp Asn Met Asp Val Asn 165 170 175 Phe Met Lys Lys Val Leu Arg Gln Arg Tyr Gly Thr Met Thr Ala Glu 180 185 190 Glu Trp Met Thr Gln Lys Ile Thr Glu Ile Lys Ala Ala Phe Asn Ser 195 200 205 Val Gly Gln Leu Ala Trp Ala Lys Ser Gly Phe Ser Pro Ala Ala Arg 210 215 220 Thr Phe Leu Gln Gln Phe Gly Ile Asn Ile Pro 225 230 235 <210> 17 <211> 707 <212> DNA <213> artificial <220> <223> Mutated DNA sequence encoding the N protein of schmallenberg virus <400> 17 gatatctcaa gccaattcat ttttgaagat gtaccacaac ggaatgcagc tacatttaac 60 ccggaggtcg ggtatgtggc atttattggt aagtatgggc aacaactcaa cttcggtgtt 120 gctagagtct tcttcctcaa ccagaagaag gccaagatgg tcctacataa gacggcacaa 180 ccaagtgtcg atcttacttt tggtggggtc aaatttacag tggttaataa ccattttccc 240 caatatgtct caaatcctgt gccagacaat gccattacac ttcacaggat gtcaggttat 300 ctagcacgtt ggattgctga tacatgcaag gctagtgtcc tcaaactagc tgaagctagt 360 gctcagattg tcatgcccct tgctgaggtt aagggatgca cctgggccga tggttataca 420 atgtatcttg gatttgcacc tggggccgaa atgttccttg atgcttttga cttctatcca 480 ctagttattg aaatgcatag ggtcctcaag gacaatatgg atgtaaattt tatgaaaaaa 540 gtcctccgcc aacgctatgg aacaatgact gctgaagaat ggatgactca gaaaataaca 600 gaaataaaag ctgcttttaa ttctgttgga cagcttgcct gggccaaatc tggattctct 660 cctgctgcta gaaccttctt gcagcaattc ggtatcaaca tcccggg 707 <210> 18 <211> 211 <212> PRT <213> mus musculus <400> 18 Met Ala Glu Thr Cys Lys Met Lys Tyr Ser Val Leu Asp Ser Pro Leu 1 5 10 15 Gly Lys Met Glu Leu Ser Gly Cys Glu Arg Gly Leu His Gly Ile Arg 20 25 30 Leu Leu Ser Gly Lys Thr Pro Asn Thr Asp Pro Thr Glu Ala Pro Ala 35 40 45 Thr Pro Glu Val Leu Gly Gly Pro Glu Gly Val Pro Glu Pro Leu Val 50 55 60 Gln Cys Thr Ala Trp Leu Glu Ala Tyr Phe Arg Glu Pro Ala Ala Thr 65 70 75 80 Glu Gly Leu Pro Leu Pro Ala Leu His His Pro Val Phe Gln Gln Asp 85 90 95 Ser Phe Thr Arg Gln Val Leu Trp Lys Leu Leu Lys Val Val Lys Phe 100 105 110 Gly Glu Thr Val Ser Tyr Gln Gln Leu Ala Ala Leu Ala Gly Asn Pro 115 120 125 Lys Ala Ala Arg Ala Val Gly Gly Ala Met Arg Ser Asn Pro Val Pro 130 135 140 Ile Leu Ile Pro Cys His Arg Val Val Arg Ser Asp Gly Ala Ile Gly 145 150 155 160 His Tyr Ser Gly Gly Gly Gln Ala Val Lys Glu Trp Leu Leu Ala His 165 170 175 Glu Gly Ile Pro Thr Gly Gln Pro Ala Ser Lys Gly Leu Gly Leu Thr 180 185 190 Gly Thr Trp Leu Lys Ser Ser Phe Glu Ser Thr Ser Ser Glu Pro Ser 195 200 205 Gly Arg Asn 210 <210> 19 <211> 209 <212> PRT <213> Rattus norvegicus <400> 19 Met Ala Glu Ile Cys Lys Met Lys Tyr Thr Val Leu Asp Ser Pro Leu 1 5 10 15 Gly Lys Ile Glu Leu Ser Gly Cys Glu Arg Gly Leu His Gly Ile Arg 20 25 30 Phe Leu Ser Gly Lys Thr Pro Asn Thr Asp Pro Thr Glu Ala Pro Ala 35 40 45 Cys Pro Glu Val Leu Gly Gly Pro Glu Gly Val Pro Glu Pro Leu Val 50 55 60 Gln Cys Thr Ala Trp Leu Glu Ala Tyr Phe His Glu Pro Ala Ala Thr 65 70 75 80 Glu Gly Leu Pro Leu Pro Ala Leu His His Pro Val Phe Gln Gln Asp 85 90 95 Ser Phe Thr Arg Gln Val Leu Trp Lys Leu Leu Lys Val Val Lys Phe 100 105 110 Gly Glu Met Val Ser Tyr Gln Gln Leu Ala Ala Leu Ala Gly Asn Pro 115 120 125 Lys Ala Ala Arg Ala Val Gly Gly Ala Met Arg Ser Asn Pro Val Pro 130 135 140 Ile Leu Ile Pro Cys His Arg Val Ile Arg Ser Asp Gly Ala Ile Gly 145 150 155 160 Asn Tyr Ser Gly Gly Gly Gln Thr Val Lys Glu Trp Leu Leu Ala His 165 170 175 Glu Gly Ile Pro Thr Gly Gln Pro Ala Ser Lys Gly Leu Gly Leu Ile 180 185 190 Gly Ser Trp Leu Lys Pro Ser Phe Glu Ser Ser Ser Pro Lys Pro Ser 195 200 205 Gly <210> 20 <211> 963 <212> DNA <213> artificial <220> <223> DNA sequence coding for SNAP - linker - DEN1 EDIII - linker- Histag <400> 20 agatctgaca aagactgcga aatgaagcgc accaccctgg atagccctct gggcaagctg 60 gaactgtctg ggtgcgaaca gggcctgcac gagatcaagc tgctgggcaa aggaacatct 120 gccgccgacg ccgtggaagt gcctgcccca gccgccgtgc tgggcggacc agagccactg 180 atgcaggcca ccgcctggct caacgcctac tttcaccagc ctgaggccat cgaggagttc 240 cctgtgccag ccctgcacca cccagtgttc cagcaggaga gctttacccg ccaggtgctg 300 tggaaactgc tgaaagtggt gaagttcgga gaggtcatca gctaccagca gctggccgcc 360 ctggccggca atcccgccgc caccgccgcc gtgaaaaccg ccctgagcgg aaatcccgtg 420 cccattctga tcccctgcca ccgggtggtg tctagctctg gcgccgtggg gggctacgag 480 ggcgggctcg ccgtgaaaga gtggctgctg gcccacgagg gccacagact gggcaagcct 540 gggctgggtc ctgcaggtat aggcgcgcca gggtccctgg agggaggtgg cgggtctctg 600 actttaaaag ggatgtcata tgtgatgtgc acaggctcat ttaagctaga gaaggaagtg 660 gctgagaccc agcatggaac tgtcctagtg caggttaaat acgaaggaac agatgcgcca 720 tgcaagatcc ccttttcgac ccaagatgag aaaggagtga cccagaatgg gagattgata 780 acagccaatc ccatagttac tgacaaagaa aaaccaatca acattgagac agaaccacct 840 tttggtgaga gctacatcat agtaggggca ggtgaaaaag ctttgaaact aagctggttc 900 aagaaaggaa gcagcatagg gaaaggaggt ggccatcacc atcaccatca ctgatgaccg 960 gtt 963 <210> 21 <211> 316 <212> PRT <213> artificial <220> <223> SNAP - linker - DEN1 EDIII - linker- Histag <400> 21 Arg Ser Asp Lys Asp Cys Glu Met Lys Arg Thr Thr Leu Asp Ser Pro 1 5 10 15 Leu Gly Lys Leu Glu Leu Ser Gly Cys Glu Gln Gly Leu His Glu Ile 20 25 30 Lys Leu Gly Lys Gly Thr Ser Ala Ala Asp Ala Val Glu Val Pro Ala 35 40 45 Pro Ala Ala Val Leu Gly Gly Pro Glu Pro Leu Met Gln Ala Thr Ala 50 55 60 Trp Leu Asn Ala Tyr Phe His Gln Pro Glu Ala Ile Glu Glu Phe Pro 65 70 75 80 Val Pro Ala Leu His His Pro Val Phe Gln Gln Glu Ser Phe Thr Arg 85 90 95 Gln Val Leu Trp Lys Leu Leu Lys Val Val Lys Phe Gly Glu Val Ile 100 105 110 Ser Tyr Gln Gln Leu Ala Ala Leu Ala Gly Asn Pro Ala Ala Thr Ala 115 120 125 Ala Val Lys Thr Ala Leu Ser Gly Asn Pro Val Pro Ile Leu Ile Pro 130 135 140 Cys His Arg Val Val Ser Ser Ser Gly Ala Val Gly Gly Tyr Glu Gly 145 150 155 160 Gly Leu Ala Val Lys Glu Trp Leu Leu Ala His Glu Gly His Arg Leu 165 170 175 Gly Lys Pro Gly Leu Gly Pro Ala Gly Ile Gly Ala Pro Gly Ser Leu 180 185 190 Glu Gly Gly Gly Gly Ser Leu Thr Leu Lys Gly Met Ser Tyr Val Met 195 200 205 Cys Thr Gly Ser Phe Lys Leu Glu Lys Glu Val Ala Glu Thr Gln His 210 215 220 Gly Thr Val Leu Val Gln Val Lys Tyr Glu Gly Thr Asp Ala Pro Cys 225 230 235 240 Lys Ile Pro Phe Ser Thr Gln Asp Glu Lys Gly Val Thr Gln Asn Gly 245 250 255 Arg Leu Ile Thr Ala Asn Pro Ile Val Thr Asp Lys Glu Lys Pro Ile 260 265 270 Asn Ile Glu Thr Glu Pro Pro Phe Gly Glu Ser Tyr Ile Ile Val Gly 275 280 285 Ala Gly Glu Lys Ala Leu Lys Leu Ser Trp Phe Lys Lys Gly Ser Ser 290 295 300 Ile Gly Lys Gly Gly Gly His His His His His His 305 310 315 <210> 22 <211> 54 <212> DNA <213> artificial <220> <223> DNA sequence encoding the ssBiP sequence <400> 22 atgaagttat gcatattact ggccgtcgtg gcctttgttg gcctctcgct cggg 54 <210> 23 <211> 66 <212> DNA <213> artificial <220> <223> DNA artificial encoding BiP-like signal = insect ssBiP signal peptide + cleavage site DEN1prM signal sequence <400> 23 atgaaactat gtattctact tgcagttgtt gcgttcgtag gattgtcctt acctacagct 60 ctggca 66 <210> 24 <211> 22 <212> PRT <213> artificial <220> <223> BiP-like signal = insect ssBiP signal peptide + cleavage site DEN1prM signal sequence <400> 24 Met Lys Leu Cys Ile Leu Leu Ala Val Val Ala Phe Val Gly Leu Ser 1 5 10 15 Leu Pro Thr Ala Leu Ala 20 <210> 25 <211> 4 <212> PRT <213> artificial <220> <223> Amino acid sequence of the spacer <400> 25 Gly Gly Gly Ser 1 <210> 26 <211> 12 <212> DNA <213> artificial <220> <223> DNA sequence of the spacer <400> 26 ggtggcggat ct 12 <210> 27 <211> 6 <212> PRT <213> artificial <220> <223> Amino acid sequence of HIS TAG <400> 27 His His His His His His 1 5 <210> 28 <211> 18 <212> DNA <213> artificial <220> <223> DNA sequence encoding His Tag <400> 28 catcatcatc atcatcat 18 <210> 29 <211> 21 <212> DNA <213> artificial <220> <223> DNA encoding pro-TEV cleavage site 1 <400> 29 gaaaacctgt acttccagag c 21 <210> 30 <211> 21 <212> DNA <213> artificial <220> <223> DNA encoding pro-TEV cleavage site 2 <400> 30 gagaatctat attttcaagg g 21 <210> 31 <211> 530 <212> DNA <213> artificial <220> <223> SNAP-like sequence G/C low content <400> 31 gacaaagact gcgaaatgaa aagaactaca ttggattcac cacttgggaa gttggaactg 60 agtggatgcg agcaaggatt gcatgaaatt aagctactgg gaaaaggaac ttctgctgct 120 gatgcagttg aagttccagc accagcagct gttcttggag gtcctgagcc cctcatgcaa 180 gccacagcct ggcttaacgc atatttccac cagcctgagg ccattgagga atttccagtc 240 cccgcccttc accatcctgt gtttcagcag gagagcttca cccgccaggt cctgtggaaa 300 ttgctgaagg tggtcaagtt tggtgaagtg atttcatatc agcaacttgc tgcattggcc 360 ggtaaccccg cagctacagc tgccgtgaaa actgctctca gcggaaatcc tgtgcccatc 420 ctgatccctt gtcacagagt cgtttcatct tccggagctg taggtggcta tgaaggagga 480 ctggcagtta aggagtggct gctggctcat gaaggtcata gacttggaaa 530 <210> 32 <211> 7 <212> PRT <213> artificial <220> <223> Pro-TEV cleavage site 1 <400> 32 Glu Asn Leu Tyr Phe Gln Ser 1 5 <210> 33 <211> 7 <212> PRT <213> artificial <220> <223> Pro-TEV cleavage site 2 <400> 33 Glu Asn Leu Tyr Phe Gln Gly 1 5 <210> 34 <211> 798 <212> DNA <213> artificial <220> <223> Cassette DNA pDeSNAP Univ (BIPlike - SNAPlike- proTEV/Histag) <400> 34 gatcgcgagc tagcaccatg aaactatgta ttctacttgc agttgttgcg ttcgtaggat 60 tgtccttacc tacagctctg gcaagatctg acaaagactg cgaaatgaaa agaactacat 120 tggattcacc acttgggaag ttggaactga gtggatgcga gcaaggattg catgaaatta 180 agctactggg aaaaggaact tctgctgctg atgcagttga agttccagca ccagcagctg 240 ttcttggagg tcctgagccc ctcatgcaag ccacagcctg gcttaacgca tatttccacc 300 agcctgaggc cattgaggaa tttccagtcc ccgcccttca ccatcctgtg tttcagcagg 360 agagcttcac ccgccaggtc ctgtggaaat tgctgaaggt ggtcaagttt ggtgaagtga 420 tttcatatca gcaacttgct gcattggccg gtaaccccgc agctacagct gccgtgaaaa 480 ctgctctcag cggaaatcct gtgcccatcc tgatcccttg tcacagagtc gtttcatctt 540 ccggagctgt aggtggctat gaaggaggac tggcagttaa ggagtggctg ctggctcatg 600 aaggtcatag acttggaaag cctgggctgg gtcctgctgg tataggcgcg ccagggtccc 660 taggtggcgg atccgaaaac ctgtacttcc agagcgatat cggaggtgga ggcccgggag 720 agaatctata ttttcaaggg cccggcggag gtagtcacca tcatcaccat cactaatgac 780 cggtgcggcc gcaagctt 798 <210> 35 <211> 1439 <212> DNA <213> artificial <220> <223> Cassette DNA pDeSNAP Univ +SBV.N (ssBIP - SNAPlike- SBV.N- proTEV/Histag) <400> 35 atgaagttat gcatattact ggccgtcgtg gcctttgttg gcctctcgct cgggagatct 60 gacaaagact gcgaaatgaa aagaactaca ttggattcac cacttgggaa gttggaactg 120 agtggatgcg agcaaggatt gcatgaaatt aagctactgg gaaaaggaac ttctgctgct 180 gatgcagttg aagttccagc accagcagct gttcttggag gtcctgagcc cctcatgcaa 240 gccacagcct ggcttaacgc atatttccac cagcctgagg ccattgagga atttccagtc 300 cccgcccttc accatcctgt gtttcagcag gagagcttca cccgccaggt cctgtggaaa 360 ttgctgaagg tggtcaagtt tggtgaagtg atttcatatc agcaacttgc tgcattggcc 420 ggtaaccccg cagctacagc tgccgtgaaa actgctctca gcggaaatcc tgtgcccatc 480 ctgatccctt gtcacagagt cgtttcatct tccggagctg taggtggcta tgaaggagga 540 ctggcagtta aggagtggct gctggctcat gaaggtcata gacttggaaa gcctgggctg 600 ggtcctgctg gtataggcgc gccagggtcc ctaggtggcg gatccgaaaa cctgtacttc 660 cagagcgata tctcaagcca attcattttt gaagatgtac cacaacggaa tgcagctaca 720 tttaacccgg aggtcgggta tgtggcattt attggtaagt atgggcaaca actcaacttc 780 ggtgttgcta gagtcttctt cctcaaccag aagaaggcca agatggtcct acataagacg 840 gcacaaccaa gtgtcgatct tacttttggt ggggtcaaat ttacagtggt taataaccat 900 tttccccaat atgtctcaaa tcctgtgcca gacaatgcca ttacacttca caggatgtca 960 ggttatctag cacgttggat tgctgataca tgcaaggcta gtgtcctcaa actagctgaa 1020 gctagtgctc agattgtcat gccccttgct gaggttaagg gatgcacctg ggccgatggt 1080 tatacaatgt atcttggatt tgcacctggg gccgaaatgt tccttgatgc ttttgacttc 1140 tatccactag ttattgaaat gcatagggtc ctcaaggaca atatggatgt aaattttatg 1200 aaaaaagtcc tccgccaacg ctatggaaca atgactgctg aagaatggat gactcagaaa 1260 ataacagaaa taaaagctgc ttttaattct gttggacagc ttgcctgggc caaatctgga 1320 ttctctcctg ctgctagaac cttcttgcag caattcggta tcaacatccc gggagagaat 1380 ctatattttc aagggcccgg cggaggtagt caccatcatc accatcacta atgaccggt 1439 <210> 36 <211> 1480 <212> DNA <213> artificial <220> <223> Cassette DNA pDeSNAP Univ +SBV.N (BIPlike - SNAPlike-SBV.N -proTEV/Histag) <400> 36 tcgcgagcta gcaccatgaa actatgtatt ctacttgcag ttgttgcgtt cgtaggattg 60 tccttaccta cagctctggc aagatctgac aaagactgcg aaatgaaaag aactacattg 120 gattcaccac ttgggaagtt ggaactgagt ggatgcgagc aaggattgca tgaaattaag 180 ctactgggaa aaggaacttc tgctgctgat gcagttgaag ttccagcacc agcagctgtt 240 cttggaggtc ctgagcccct catgcaagcc acagcctggc ttaacgcata tttccaccag 300 cctgaggcca ttgaggaatt tccagtcccc gcccttcacc atcctgtgtt tcagcaggag 360 agcttcaccc gccaggtcct gtggaaattg ctgaaggtgg tcaagtttgg tgaagtgatt 420 tcatatcagc aacttgctgc attggccggt aaccccgcag ctacagctgc cgtgaaaact 480 gctctcagcg gaaatcctgt gcccatcctg atcccttgtc acagagtcgt ttcatcttcc 540 ggagctgtag gtggctatga aggaggactg gcagttaagg agtggctgct ggctcatgaa 600 ggtcatagac ttggaaagcc tgggctgggt cctgctggta taggcgcgcc agggtcccta 660 ggtggcggat ccgaaaacct gtacttccag agcgatatct caagccaatt catttttgaa 720 gatgtaccac aacggaatgc agctacattt aacccggagg tcgggtatgt ggcatttatt 780 ggtaagtatg ggcaacaact caacttcggt gttgctagag tcttcttcct caaccagaag 840 aaggccaaga tggtcctaca taagacggca caaccaagtg tcgatcttac ttttggtggg 900 gtcaaattta cagtggttaa taaccatttt ccccaatatg tctcaaatcc tgtgccagac 960 aatgccatta cacttcacag gatgtcaggt tatctagcac gttggattgc tgatacatgc 1020 aaggctagtg tcctcaaact agctgaagct agtgctcaga ttgtcatgcc ccttgctgag 1080 gttaagggat gcacctgggc cgatggttat acaatgtatc ttggatttgc acctggggcc 1140 gaaatgttcc ttgatgcttt tgacttctat ccactagtta ttgaaatgca tagggtcctc 1200 aaggacaata tggatgtaaa ttttatgaaa aaagtcctcc gccaacgcta tggaacaatg 1260 actgctgaag aatggatgac tcagaaaata acagaaataa aagctgcttt taattctgtt 1320 ggacagcttg cctgggccaa atctggattc tctcctgctg ctagaacctt cttgcagcaa 1380 ttcggtatca acatcccggg agagaatcta tattttcaag ggcccggcgg aggtagtcac 1440 catcatcacc atcactaatg accggtgcgg ccgcaagctt 1480 <210> 37 <211> 18 <212> PRT <213> artificial <220> <223> Amino acid sequence of the ssBiP sequence <400> 37 Met Lys Leu Cys Ile Leu Leu Ala Val Val Ala Phe Val Gly Leu Ser 1 5 10 15 Leu Gly <210> 38 <211> 17 <212> PRT <213> West Nile virus strain IS-98-ST1 <400> 38 Met Val Val Phe Val Val Leu Leu Leu Leu Val Ala Pro Ala Tyr Ser 1 5 10 15 Leu <210> 39 <211> 5 <212> PRT <213> Dengue virus <400> 39 Pro Thr Ala Leu Ala 1 5 <210> 40 <211> 6 <212> PRT <213> artificial <220> <223> Cleavage site of enterokinase <400> 40 Asp Asp Asp Asp Lys Asp 1 5 <210> 41 <211> 480 <212> PRT <213> artificial <220> <223> Amino acid sequence of BiPlike+SNAPlike+proTEV+SBV.N+proTEV+Histag <400> 41 Met Lys Leu Cys Ile Leu Leu Ala Val Val Ala Phe Val Gly Leu Ser 1 5 10 15 Leu Pro Thr Ala Leu Ala Arg Ser Asp Lys Asp Cys Glu Met Lys Arg 20 25 30 Thr Thr Leu Asp Ser Pro Leu Gly Lys Leu Glu Leu Ser Gly Cys Glu 35 40 45 Gln Gly Leu His Glu Ile Lys Leu Leu Gly Lys Gly Thr Ser Ala Ala 50 55 60 Asp Ala Val Glu Val Pro Ala Pro Ala Ala Val Leu Gly Gly Pro Glu 65 70 75 80 Pro Leu Met Gln Ala Thr Ala Trp Leu Asn Ala Tyr Phe His Gln Pro 85 90 95 Glu Ala Ile Glu Glu Phe Pro Val Pro Ala Leu His His Pro Val Phe 100 105 110 Gln Gln Glu Ser Phe Thr Arg Gln Val Leu Trp Lys Leu Leu Lys Val 115 120 125 Val Lys Phe Gly Glu Val Ile Ser Tyr Gln Gln Leu Ala Ala Leu Ala 130 135 140 Gly Asn Pro Ala Ala Thr Ala Ala Val Lys Thr Ala Leu Ser Gly Asn 145 150 155 160 Pro Val Pro Ile Leu Ile Pro Cys His Arg Val Val Ser Ser Ser Gly 165 170 175 Ala Val Gly Gly Tyr Glu Gly Gly Leu Ala Val Lys Glu Trp Leu Leu 180 185 190 Ala His Glu Gly His Arg Leu Gly Lys Pro Gly Leu Gly Pro Ala Gly 195 200 205 Ile Gly Ala Pro Gly Ser Leu Gly Gly Gly Ser Glu Asn Leu Tyr Phe 210 215 220 Gln Ser Asp Ile Ser Ser Gln Phe Ile Phe Glu Asp Val Pro Gln Arg 225 230 235 240 Asn Ala Ala Thr Phe Asn Pro Glu Val Gly Tyr Val Ala Phe Ile Gly 245 250 255 Lys Tyr Gly Gln Gln Leu Asn Phe Gly Val Ala Arg Val Phe Phe Leu 260 265 270 Asn Gln Lys Lys Ala Lys Met Val Leu His Lys Thr Ala Gln Pro Ser 275 280 285 Val Asp Leu Thr Phe Gly Gly Val Lys Phe Thr Val Val Asn Asn His 290 295 300 Phe Pro Gln Tyr Val Ser Asn Pro Val Pro Asp Asn Ala Ile Thr Leu 305 310 315 320 His Arg Met Ser Gly Tyr Leu Ala Arg Trp Ile Ala Asp Thr Cys Lys 325 330 335 Ala Ser Val Leu Lys Leu Ala Glu Ala Ser Ala Gln Ile Val Met Pro 340 345 350 Leu Ala Glu Val Lys Gly Cys Thr Trp Ala Asp Gly Tyr Thr Met Tyr 355 360 365 Leu Gly Phe Ala Pro Gly Ala Glu Met Phe Leu Asp Ala Phe Asp Phe 370 375 380 Tyr Pro Leu Val Ile Glu Met His Arg Val Leu Lys Asp Asn Met Asp 385 390 395 400 Val Asn Phe Met Lys Lys Val Leu Arg Gln Arg Tyr Gly Thr Met Thr 405 410 415 Ala Glu Glu Trp Met Thr Gln Lys Ile Thr Glu Ile Lys Ala Ala Phe 420 425 430 Asn Ser Val Gly Gln Leu Ala Trp Ala Lys Ser Gly Phe Ser Pro Ala 435 440 445 Ala Arg Thr Phe Leu Gln Gln Phe Gly Ile Asn Ile Pro Gly Glu Asn 450 455 460 Leu Tyr Phe Gln Gly Pro Gly Gly Gly Ser His His His His His His 465 470 475 480 <210> 42 <211> 438 <212> PRT <213> artificial <220> <223> Amino acid sequence of the fusion protein SNAP+SCHM.N (without BiPlike + HisTag <400> 42 Arg Ser Asp Lys Asp Cys Glu Met Lys Arg Thr Thr Leu Asp Ser Pro 1 5 10 15 Leu Gly Lys Leu Glu Leu Ser Gly Cys Glu Gln Gly Leu His Glu Ile 20 25 30 Lys Leu Leu Gly Lys Gly Thr Ser Ala Ala Asp Ala Val Glu Val Pro 35 40 45 Ala Pro Ala Ala Val Leu Gly Gly Pro Glu Pro Leu Met Gln Ala Thr 50 55 60 Ala Trp Leu Asn Ala Tyr Phe His Gln Pro Glu Ala Ile Glu Glu Phe 65 70 75 80 Pro Val Pro Ala Leu His His Pro Val Phe Gln Gln Glu Ser Phe Thr 85 90 95 Arg Gln Val Leu Trp Lys Leu Leu Lys Val Val Lys Phe Gly Glu Val 100 105 110 Ile Ser Tyr Gln Gln Leu Ala Ala Leu Ala Gly Asn Pro Ala Ala Thr 115 120 125 Ala Ala Val Lys Thr Ala Leu Ser Gly Asn Pro Val Pro Ile Leu Ile 130 135 140 Pro Cys His Arg Val Val Ser Ser Ser Gly Ala Val Gly Gly Tyr Glu 145 150 155 160 Gly Gly Leu Ala Val Lys Glu Trp Leu Leu Ala His Glu Gly His Arg 165 170 175 Leu Gly Lys Pro Gly Leu Gly Pro Ala Gly Ile Gly Ala Pro Gly Ser 180 185 190 Leu Gly Gly Gly Ser Glu Asn Leu Tyr Phe Gln Ser Asp Ile Ser Ser 195 200 205 Gln Phe Ile Phe Glu Asp Val Pro Gln Arg Asn Ala Ala Thr Phe Asn 210 215 220 Pro Glu Val Gly Tyr Val Ala Phe Ile Gly Lys Tyr Gly Gln Gln Leu 225 230 235 240 Asn Phe Gly Val Ala Arg Val Phe Phe Leu Asn Gln Lys Lys Ala Lys 245 250 255 Met Val Leu His Lys Thr Ala Gln Pro Ser Val Asp Leu Thr Phe Gly 260 265 270 Gly Val Lys Phe Thr Val Val Asn Asn His Phe Pro Gln Tyr Val Ser 275 280 285 Asn Pro Val Pro Asp Asn Ala Ile Thr Leu His Arg Met Ser Gly Tyr 290 295 300 Leu Ala Arg Trp Ile Ala Asp Thr Cys Lys Ala Ser Val Leu Lys Leu 305 310 315 320 Ala Glu Ala Ser Ala Gln Ile Val Met Pro Leu Ala Glu Val Lys Gly 325 330 335 Cys Thr Trp Ala Asp Gly Tyr Thr Met Tyr Leu Gly Phe Ala Pro Gly 340 345 350 Ala Glu Met Phe Leu Asp Ala Phe Asp Phe Tyr Pro Leu Val Ile Glu 355 360 365 Met His Arg Val Leu Lys Asp Asn Met Asp Val Asn Phe Met Lys Lys 370 375 380 Val Leu Arg Gln Arg Tyr Gly Thr Met Thr Ala Glu Glu Trp Met Thr 385 390 395 400 Gln Lys Ile Thr Glu Ile Lys Ala Ala Phe Asn Ser Val Gly Gln Leu 405 410 415 Ala Trp Ala Lys Ser Gly Phe Ser Pro Ala Ala Arg Thr Phe Leu Gln 420 425 430 Gln Phe Gly Ile Asn Ile 435 <210> 43 <211> 4194 <212> DNA <213> artificial <220> <223> pMT/BiP/SNAP-Histag avec cassette DeSNAP Univ <400> 43 tcgcgcgttt cggtgatgac ggtgaaaacc tctgacacat gcagctcccg gagacggtca 60 cagcttgtct gtaagcggat gccgggagca gacaagcccg tcagggcgcg tcagcgggtg 120 ttggcgggtg tcggggctgg cttaactatg cggcatcaga gcagattgta ctgagagtgc 180 accatatgcg gtgtgaaata ccgcacagat gcgtaaggag aaaataccgc atcaggcgcc 240 attcgccatt caggctgcgc aactgttggg aagggcgatc ggtgcgggcc tcttcgctat 300 tacgccagct ggcgaaaggg ggatgtgctg caaggcgatt aagttgggta acgccagggt 360 tttcccagtc acgacgttgt aaaacgacgg ccagtgccag tgaattttaa cgttgcagga 420 caggatgtgg tgcccgatgt gactagctct ttgctgcagg ccgtcctatc ctctggttcc 480 gataagagac ccagaactcc ggccccccac cgcccaccgc cacccccata catatgtggt 540 acgcaagtaa gagtgcctgc gcatgcccca tgtgccccac caagagtttt gcatcccata 600 caagtcccca aagtggagaa ccgaaccaat tcttcgcggg cagaacaaaa gcttctgcac 660 acgtctccac tcgaatttgg agccggccgg cgtgtgcaaa agaggtgaat cgaacgaaag 720 acccgtgtgt aaagccgcgt ttccaaaatg tataaaaccg agagcatctg gccaatgtgc 780 atcagttgtg gtcagcagca aaatcaagtg aatcatctca gtgcaactaa aggggggatc 840 cgatctcaat atgaagttat gcatattact ggccgtcgtg gcctttgttg gcctctcgct 900 cgggagatct gacaaagact gcgaaatgaa aagaactaca ttggattcac cacttgggaa 960 gttggaactg agtggatgcg agcaaggatt gcatgaaatt aagctactgg gaaaaggaac 1020 ttctgctgct gatgcagttg aagttccagc accagcagct gttcttggag gtcctgagcc 1080 cctcatgcaa gccacagcct ggcttaacgc atatttccac cagcctgagg ccattgagga 1140 atttccagtc cccgcccttc accatcctgt gtttcagcag gagagcttca cccgccaggt 1200 cctgtggaaa ttgctgaagg tggtcaagtt tggtgaagtg atttcatatc agcaacttgc 1260 tgcattggcc ggtaaccccg cagctacagc tgccgtgaaa actgctctca gcggaaatcc 1320 tgtgcccatc ctgatccctt gtcacagagt cgtttcatct tccggagctg taggtggcta 1380 tgaaggagga ctggcagtta aggagtggct gctggctcat gaaggtcata gacttggaaa 1440 gcctgggctg ggtcctgctg gtataggcgc gccagggtcc ctaggtggcg gatccgaaaa 1500 cctgtacttc cagagcgata tcggaggtgg aggcccggga gagaatctat attttcaagg 1560 gcccggcgga ggtagtcacc atcatcacca tcactaatga ccggtcatca tcaccatcac 1620 cattgagttt aaacccgctg atcagcctcg actgtgcctt ctaaggcctg agctcgctga 1680 tcagcctcga tcgaggatcc agacatgata agatacattg atgagtttgg acaaaccaca 1740 actagaatgc agtgaaaaaa atgctttatt tgtgaaattt gtgatgctat tgctttattt 1800 gtaaccatta taagctgcaa taaacaagtt aacaacaaca attgcattca ttttatgttt 1860 caggttcagg gggaggtgtg ggaggttttt taaagcaagt aaaacctcta caaatgtggt 1920 atggctgatt atgatcagtc gacctgcagg catgcaagct tggcgtaatc atggtcatag 1980 ctgtttcctg tgtgaaattg ttatccgctc acaattccac acaacatacg agccggaagc 2040 ataaagtgta aagcctgggg tgcctaatga gtgagctaac tcacattaat tgcgttgcgc 2100 tcactgcccg ctttccagtc gggaaacctg tcgtgccagc tgcattaatg aatcggccaa 2160 cgcgcgggga gaggcggttt gcgtattggg cgctcttccg cttcctcgct cactgactcg 2220 ctgcgctcgg tcgttcggct gcggcgagcg gtatcagctc actcaaaggc ggtaatacgg 2280 ttatccacag aatcagggga taacgcagga aagaacatgt gagcaaaagg ccagcaaaag 2340 gccaggaacc gtaaaaaggc cgcgttgctg gcgtttttcc ataggctccg cccccctgac 2400 gagcatcaca aaaatcgacg ctcaagtcag aggtggcgaa acccgacagg actataaaga 2460 taccaggcgt ttccccctgg aagctccctc gtgcgctctc ctgttccgac cctgccgctt 2520 accggatacc tgtccgcctt tctcccttcg ggaagcgtgg cgctttctca tagctcacgc 2580 tgtaggtatc tcagttcggt gtaggtcgtt cgctccaagc tgggctgtgt gcacgaaccc 2640 cccgttcagc ccgaccgctg cgccttatcc ggtaactatc gtcttgagtc caacccggta 2700 agacacgact tatcgccact ggcagcagcc actggtaaca ggattagcag agcgaggtat 2760 gtaggcggtg ctacagagtt cttgaagtgg tggcctaact acggctacac tagaaggaca 2820 gtatttggta tctgcgctct gctgaagcca gttaccttcg gaaaaagagt tggtagctct 2880 tgatccggca aacaaaccac cgctggtagc ggtggttttt ttgtttgcaa gcagcagatt 2940 acgcgcagaa aaaaaggatc tcaagaagat cctttgatct tttctacggg gtctgacgct 3000 cagtggaacg aaaactcacg ttaagggatt ttggtcatga gattatcaaa aaggatcttc 3060 acctagatcc ttttaaatta aaaatgaagt tttaaatcaa tctaaagtat atatgagtaa 3120 acttggtctg acagttacca atgcttaatc agtgaggcac ctatctcagc gatctgtcta 3180 tttcgttcat ccatagttgc ctgactcccc gtcgtgtaga taactacgat acgggagggc 3240 ttaccatctg gccccagtgc tgcaatgata ccgcgagacc cacgctcacc ggctccagat 3300 ttatcagcaa taaaccagcc agccggaagg gccgagcgca gaagtggtcc tgcaacttta 3360 tccgcctcca tccagtctat taattgttgc cgggaagcta gagtaagtag ttcgccagtt 3420 aatagtttgc gcaacgttgt tgccattgct acaggcatcg tggtgtcacg ctcgtcgttt 3480 ggtatggctt cattcagctc cggttcccaa cgatcaaggc gagttacatg atcccccatg 3540 ttgtgcaaaa aagcggttag ctccttcggt cctccgatcg ttgtcagaag taagttggcc 3600 gcagtgttat cactcatggt tatggcagca ctgcataatt ctcttactgt catgccatcc 3660 gtaagatgct tttctgtgac tggtgagtac tcaaccaagt cattctgaga atagtgtatg 3720 cggcgaccga gttgctcttg cccggcgtca atacgggata ataccgcgcc acatagcaga 3780 actttaaaag tgctcatcat tggaaaacgt tcttcggggc gaaaactctc aaggatctta 3840 ccgctgttga gatccagttc gatgtaaccc actcgtgcac ccaactgatc ttcagcatct 3900 tttactttca ccagcgtttc tgggtgagca aaaacaggaa ggcaaaatgc cgcaaaaaag 3960 ggaataaggg cgacacggaa atgttgaata ctcatactct tcctttttca atattattga 4020 agcatttatc agggttattg tctcatgagc ggatacatat ttgaatgtat ttagaaaaat 4080 aaacaaatag gggttccgcg cacatttccc cgaaaagtgc cacctgacgt ctaagaaacc 4140 attattatca tgacattaac ctataaaaat aggcgtatca cgaggccctt tcgt 4194 <210> 44 <211> 3458 <212> DNA <213> artificial <220> <223> pUC57 with DeSNAP Univ cassette <400> 44 tcgcgcgttt cggtgatgac ggtgaaaacc tctgacacat gcagctcccg gagacggtca 60 cagcttgtct gtaagcggat gccgggagca gacaagcccg tcagggcgcg tcagcgggtg 120 ttggcgggtg tcggggctgg cttaactatg cggcatcaga gcagattgta ctgagagtgc 180 accatatgcg gtgtgaaata ccgcacagat gcgtaaggag aaaataccgc atcaggcgcc 240 attcgccatt caggctgcgc aactgttggg aagggcgatc ggtgcgggcc tcttcgctat 300 tacgccagct ggcgaaaggg ggatgtgctg caaggcgatt aagttgggta acgccagggt 360 tttcccagtc acgacgttgt aaaacgacgg ccagtgaatt cgagctcggt acctcgcgaa 420 tgcatctaga tcgagctagc accatgaaac tatgtattct acttgcagtt gttgcgttcg 480 taggattgtc cttacctaca gctctggcaa gatctgacaa agactgcgaa atgaaaagaa 540 ctacattgga ttcaccactt gggaagttgg aactgagtgg atgcgagcaa ggattgcatg 600 aaattaagct actgggaaaa ggaacttctg ctgctgatgc agttgaagtt ccagcaccag 660 cagctgttct tggaggtcct gagcccctca tgcaagccac agcctggctt aacgcatatt 720 tccaccagcc tgaggccatt gaggaatttc cagtccccgc ccttcaccat cctgtgtttc 780 agcaggagag cttcacccgc caggtcctgt ggaaattgct gaaggtggtc aagtttggtg 840 aagtgatttc atatcagcaa cttgctgcat tggccggtaa ccccgcagct acagctgccg 900 tgaaaactgc tctcagcgga aatcctgtgc ccatcctgat cccttgtcac agagtcgttt 960 catcttccgg agctgtaggt ggctatgaag gaggactggc agttaaggag tggctgctgg 1020 ctcatgaagg tcatagactt ggaaagcctg ggctgggtcc tgctggtata ggcgcgccag 1080 ggtccctagg tggcggatcc gaaaacctgt acttccagag cgatatcgga ggtggaggcc 1140 cgggagagaa tctatatttt caagggcccg gcggaggtag tcaccatcat caccatcact 1200 aatgaccggt gcggccgcaa gcttggcgta atcatggtca tagctgtttc ctgtgtgaaa 1260 ttgttatccg ctcacaattc cacacaacat acgagccgga agcataaagt gtaaagcctg 1320 gggtgcctaa tgagtgagct aactcacatt aattgcgttg cgctcactgc ccgctttcca 1380 gtcgggaaac ctgtcgtgcc agctgcatta atgaatcggc caacgcgcgg ggagaggcgg 1440 tttgcgtatt gggcgctctt ccgcttcctc gctcactgac tcgctgcgct cggtcgttcg 1500 gctgcggcga gcggtatcag ctcactcaaa ggcggtaata cggttatcca cagaatcagg 1560 ggataacgca ggaaagaaca tgtgagcaaa aggccagcaa aaggccagga accgtaaaaa 1620 ggccgcgttg ctggcgtttt tccataggct ccgcccccct gacgagcatc acaaaaatcg 1680 acgctcaagt cagaggtggc gaaacccgac aggactataa agataccagg cgtttccccc 1740 tggaagctcc ctcgtgcgct ctcctgttcc gaccctgccg cttaccggat acctgtccgc 1800 ctttctccct tcgggaagcg tggcgctttc tcatagctca cgctgtaggt atctcagttc 1860 ggtgtaggtc gttcgctcca agctgggctg tgtgcacgaa ccccccgttc agcccgaccg 1920 ctgcgcctta tccggtaact atcgtcttga gtccaacccg gtaagacacg acttatcgcc 1980 actggcagca gccactggta acaggattag cagagcgagg tatgtaggcg gtgctacaga 2040 gttcttgaag tggtggccta actacggcta cactagaaga acagtatttg gtatctgcgc 2100 tctgctgaag ccagttacct tcggaaaaag agttggtagc tcttgatccg gcaaacaaac 2160 caccgctggt agcggtggtt tttttgtttg caagcagcag attacgcgca gaaaaaaagg 2220 atctcaagaa gatcctttga tcttttctac ggggtctgac gctcagtgga acgaaaactc 2280 acgttaaggg attttggtca tgagattatc aaaaaggatc ttcacctaga tccttttaaa 2340 ttaaaaatga agttttaaat caatctaaag tatatatgag taaacttggt ctgacagtta 2400 ccaatgctta atcagtgagg cacctatctc agcgatctgt ctatttcgtt catccatagt 2460 tgcctgactc cccgtcgtgt agataactac gatacgggag ggcttaccat ctggccccag 2520 tgctgcaatg ataccgcgag acccacgctc accggctcca gatttatcag caataaacca 2580 gccagccgga agggccgagc gcagaagtgg tcctgcaact ttatccgcct ccatccagtc 2640 tattaattgt tgccgggaag ctagagtaag tagttcgcca gttaatagtt tgcgcaacgt 2700 tgttgccatt gctacaggca tcgtggtgtc acgctcgtcg tttggtatgg cttcattcag 2760 ctccggttcc caacgatcaa ggcgagttac atgatccccc atgttgtgca aaaaagcggt 2820 tagctccttc ggtcctccga tcgttgtcag aagtaagttg gccgcagtgt tatcactcat 2880 ggttatggca gcactgcata attctcttac tgtcatgcca tccgtaagat gcttttctgt 2940 gactggtgag tactcaacca agtcattctg agaatagtgt atgcggcgac cgagttgctc 3000 ttgcccggcg tcaatacggg ataataccgc gccacatagc agaactttaa aagtgctcat 3060 cattggaaaa cgttcttcgg ggcgaaaact ctcaaggatc ttaccgctgt tgagatccag 3120 ttcgatgtaa cccactcgtg cacccaactg atcttcagca tcttttactt tcaccagcgt 3180 ttctgggtga gcaaaaacag gaaggcaaaa tgccgcaaaa aagggaataa gggcgacacg 3240 gaaatgttga atactcatac tcttcctttt tcaatattat tgaagcattt atcagggtta 3300 ttgtctcatg agcggataca tatttgaatg tatttagaaa aataaacaaa taggggttcc 3360 gcgcacattt ccccgaaaag tgccacctga cgtctaagaa accattatta tcatgacatt 3420 aacctataaa aataggcgta tcacgaggcc ctttcgtc 3458 <210> 45 <211> 6365 <212> DNA <213> artificial <220> <223> pcDNA3 with DeSNAP Univ cassette <400> 45 gacggatcgg gagatctccc gatcccctat ggtgcactct cagtacaatc tgctctgatg 60 ccgcatagtt aagccagtat ctgctccctg cttgtgtgtt ggaggtcgct gagtagtgcg 120 cgagcaaaat ttaagctaca acaaggcaag gcttgaccga caattgcatg aagaatctgc 180 ttagggttag gcgttttgcg ctgcttcgcg atgtacgggc cagatatacg cgttgacatt 240 gattattgac tagttattaa tagtaatcaa ttacggggtc attagttcat agcccatata 300 tggagttccg cgttacataa cttacggtaa atggcccgcc tggctgaccg cccaacgacc 360 cccgcccatt gacgtcaata atgacgtatg ttcccatagt aacgccaata gggactttcc 420 attgacgtca atgggtggag tatttacggt aaactgccca cttggcagta catcaagtgt 480 atcatatgcc aagtacgccc cctattgacg tcaatgacgg taaatggccc gcctggcatt 540 atgcccagta catgacctta tgggactttc ctacttggca gtacatctac gtattagtca 600 tcgctattac catggtgatg cggttttggc agtacatcaa tgggcgtgga tagcggtttg 660 actcacgggg atttccaagt ctccacccca ttgacgtcaa tgggagtttg ttttggcacc 720 aaaatcaacg ggactttcca aaatgtcgta acaactccgc cccattgacg caaatgggcg 780 gtaggcgtgt acggtgggag gtctatataa gcagagctct ctggctaact agagaaccca 840 ctgcttactg gcttatcgaa attaatacga ctcactatag ggagacccaa gctggctagc 900 accatgaaac tatgtattct acttgcagtt gttgcgttcg taggattgtc cttacctaca 960 gctctggcaa gatctgacaa agactgcgaa atgaaaagaa ctacattgga ttcaccactt 1020 gggaagttgg aactgagtgg atgcgagcaa ggattgcatg aaattaagct actgggaaaa 1080 ggaacttctg ctgctgatgc agttgaagtt ccagcaccag cagctgttct tggaggtcct 1140 gagcccctca tgcaagccac agcctggctt aacgcatatt tccaccagcc tgaggccatt 1200 gaggaatttc cagtccccgc ccttcaccat cctgtgtttc agcaggagag cttcacccgc 1260 caggtcctgt ggaaattgct gaaggtggtc aagtttggtg aagtgatttc atatcagcaa 1320 cttgctgcat tggccggtaa ccccgcagct acagctgccg tgaaaactgc tctcagcgga 1380 aatcctgtgc ccatcctgat cccttgtcac agagtcgttt catcttccgg agctgtaggt 1440 ggctatgaag gaggactggc agttaaggag tggctgctgg ctcatgaagg tcatagactt 1500 ggaaagcctg ggctgggtcc tgctggtata ggcgcgccag ggtccctagg tggcggatcc 1560 gaaaacctgt acttccagag cgatatcgga ggtggaggcc cgggagagaa tctatatttt 1620 caagggcccg gcggaggtag tcaccatcat caccatcact aatgaccggt gcggccgcaa 1680 gcttggtacc gagctcggat ccactagtcc agtgtggtgg aattctgcag atatccagca 1740 cagtggcggc cgctcgagtc tagagggccc gtttaaaccc gctgatcagc ctcgactgtg 1800 ccttctagtt gccagccatc tgttgtttgc ccctcccccg tgccttcctt gaccctggaa 1860 ggtgccactc ccactgtcct ttcctaataa aatgaggaaa ttgcatcgca ttgtctgagt 1920 aggtgtcatt ctattctggg gggtggggtg gggcaggaca gcaaggggga ggattgggaa 1980 gacaatagca ggcatgctgg ggatgcggtg ggctctatgg cttctgaggc ggaaagaacc 2040 agctggggct ctagggggta tccccacgcg ccctgtagcg gcgcattaag cgcggcgggt 2100 gtggtggtta cgcgcagcgt gaccgctaca cttgccagcg ccctagcgcc cgctcctttc 2160 gctttcttcc cttcctttct cgccacgttc gccggctttc cccgtcaagc tctaaatcgg 2220 gggctccctt tagggttccg atttagtgct ttacggcacc tcgaccccaa aaaacttgat 2280 tagggtgatg gttcacgtag tgggccatcg ccctgataga cggtttttcg ccctttgacg 2340 ttggagtcca cgttctttaa tagtggactc ttgttccaaa ctggaacaac actcaaccct 2400 atctcggtct attcttttga tttataaggg attttgccga tttcggccta ttggttaaaa 2460 aatgagctga tttaacaaaa atttaacgcg aattaattct gtggaatgtg tgtcagttag 2520 ggtgtggaaa gtccccaggc tccccagcag gcagaagtat gcaaagcatg catctcaatt 2580 agtcagcaac caggtgtgga aagtccccag gctccccagc aggcagaagt atgcaaagca 2640 tgcatctcaa ttagtcagca accatagtcc cgcccctaac tccgcccatc ccgcccctaa 2700 ctccgcccag ttccgcccat tctccgcccc atggctgact aatttttttt atttatgcag 2760 aggccgaggc cgcctctgcc tctgagctat tccagaagta gtgaggaggc ttttttggag 2820 gcctaggctt ttgcaaaaag ctcccgggag cttgtatatc cattttcgga tctgatcagc 2880 acgtgatgaa aaagcctgaa ctcaccgcga cgtctgtcga gaagtttctg atcgaaaagt 2940 tcgacagcgt ctccgacctg atgcagctct cggagggcga agaatctcgt gctttcagct 3000 tcgatgtagg agggcgtgga tatgtcctgc gggtaaatag ctgcgccgat ggtttctaca 3060 aagatcgtta tgtttatcgg cactttgcat cggccgcgct cccgattccg gaagtgcttg 3120 acattgggga attcagcgag agcctgacct attgcatctc ccgccgtgca cagggtgtca 3180 cgttgcaaga cctgcctgaa accgaactgc ccgctgttct gcagccggtc gcggaggcca 3240 tggatgcgat cgctgcggcc gatcttagcc agacgagcgg gttcggccca ttcggaccgc 3300 aaggaatcgg tcaatacact acatggcgtg atttcatatg cgcgattgct gatccccatg 3360 tgtatcactg gcaaactgtg atggacgaca ccgtcagtgc gtccgtcgcg caggctctcg 3420 atgagctgat gctttgggcc gaggactgcc ccgaagtccg gcacctcgtg cacgcggatt 3480 tcggctccaa caatgtcctg acggacaatg gccgcataac agcggtcatt gactggagcg 3540 aggcgatgtt cggggattcc caatacgagg tcgccaacat cttcttctgg aggccgtggt 3600 tggcttgtat ggagcagcag acgcgctact tcgagcggag gcatccggag cttgcaggat 3660 cgccgcggct ccgggcgtat atgctccgca ttggtcttga ccaactctat cagagcttgg 3720 ttgacggcaa tttcgatgat gcagcttggg cgcagggtcg atgcgacgca atcgtccgat 3780 ccggagccgg gactgtcggg cgtacacaaa tcgcccgcag aagcgcggcc gtctggaccg 3840 atggctgtgt agaagtactc gccgatagtg gaaaccgacg ccccagcact cgtccgaggg 3900 caaaggaata gcacgtgcta cgagatttcg attccaccgc cgccttctat gaaaggttgg 3960 gcttcggaat cgttttccgg gacgccggct ggatgatcct ccagcgcggg gatctcatgc 4020 tggagttctt cgcccacccc aacttgttta ttgcagctta taatggttac aaataaagca 4080 atagcatcac aaatttcaca aataaagcat ttttttcact gcattctagt tgtggtttgt 4140 ccaaactcat caatgtatct tatcatgtct gtataccgtc gacctctagc tagagcttgg 4200 cgtaatcatg gtcatagctg tttcctgtgt gaaattgtta tccgctcaca attccacaca 4260 acatacgagc cggaagcata aagtgtaaag cctggggtgc ctaatgagtg agctaactca 4320 cattaattgc gttgcgctca ctgcccgctt tccagtcggg aaacctgtcg tgccagctgc 4380 attaatgaat cggccaacgc gcggggagag gcggtttgcg tattgggcgc tcttccgctt 4440 cctcgctcac tgactcgctg cgctcggtcg ttcggctgcg gcgagcggta tcagctcact 4500 caaaggcggt aatacggtta tccacagaat caggggataa cgcaggaaag aacatgtgag 4560 caaaaggcca gcaaaaggcc aggaaccgta aaaaggccgc gttgctggcg tttttccata 4620 ggctccgccc ccctgacgag catcacaaaa atcgacgctc aagtcagagg tggcgaaacc 4680 cgacaggact ataaagatac caggcgtttc cccctggaag ctccctcgtg cgctctcctg 4740 ttccgaccct gccgcttacc ggatacctgt ccgcctttct cccttcggga agcgtggcgc 4800 tttctcatag ctcacgctgt aggtatctca gttcggtgta ggtcgttcgc tccaagctgg 4860 gctgtgtgca cgaacccccc gttcagcccg accgctgcgc cttatccggt aactatcgtc 4920 ttgagtccaa cccggtaaga cacgacttat cgccactggc agcagccact ggtaacagga 4980 ttagcagagc gaggtatgta ggcggtgcta cagagttctt gaagtggtgg cctaactacg 5040 gctacactag aagaacagta tttggtatct gcgctctgct gaagccagtt accttcggaa 5100 aaagagttgg tagctcttga tccggcaaac aaaccaccgc tggtagcggt ttttttgttt 5160 gcaagcagca gattacgcgc agaaaaaaag gatctcaaga agatcctttg atcttttcta 5220 cggggtctga cgctcagtgg aacgaaaact cacgttaagg gattttggtc atgagattat 5280 caaaaaggat cttcacctag atccttttaa attaaaaatg aagttttaaa tcaatctaaa 5340 gtatatatga gtaaacttgg tctgacagtt accaatgctt aatcagtgag gcacctatct 5400 cagcgatctg tctatttcgt tcatccatag ttgcctgact ccccgtcgtg tagataacta 5460 cgatacggga gggcttacca tctggcccca gtgctgcaat gataccgcga gacccacgct 5520 caccggctcc agatttatca gcaataaacc agccagccgg aagggccgag cgcagaagtg 5580 gtcctgcaac tttatccgcc tccatccagt ctattaattg ttgccgggaa gctagagtaa 5640 gtagttcgcc agttaatagt ttgcgcaacg ttgttgccat tgctacaggc atcgtggtgt 5700 cacgctcgtc gtttggtatg gcttcattca gctccggttc ccaacgatca aggcgagtta 5760 catgatcccc catgttgtgc aaaaaagcgg ttagctcctt cggtcctccg atcgttgtca 5820 gaagtaagtt ggccgcagtg ttatcactca tggttatggc agcactgcat aattctctta 5880 ctgtcatgcc atccgtaaga tgcttttctg tgactggtga gtactcaacc aagtcattct 5940 gagaatagtg tatgcggcga ccgagttgct cttgcccggc gtcaatacgg gataataccg 6000 cgccacatag cagaacttta aaagtgctca tcattggaaa acgttcttcg gggcgaaaac 6060 tctcaaggat cttaccgctg ttgagatcca gttcgatgta acccactcgt gcacccaact 6120 gatcttcagc atcttttact ttcaccagcg tttctgggtg agcaaaaaca ggaaggcaaa 6180 atgccgcaaa aaagggaata agggcgacac ggaaatgttg aatactcata ctcttccttt 6240 ttcaatatta ttgaagcatt tatcagggtt attgtctcat gagcggatac atatttgaat 6300 gtatttagaa aaataaacaa ataggggttc cgcgcacatt tccccgaaaa gtgccacctg 6360 acgtc 6365 <210> 46 <211> 476 <212> PRT <213> artificial <220> <223> Amino acid sequence of ssBiP+SNAPlike+proTEV+SBV.N+proTEV+Histag (encoded by SEQ ID NO:35) <400> 46 Met Lys Leu Cys Ile Leu Leu Ala Val Val Ala Phe Val Gly Leu Ser 1 5 10 15 Leu Gly Arg Ser Asp Lys Asp Cys Glu Met Lys Arg Thr Thr Leu Asp 20 25 30 Ser Pro Leu Gly Lys Leu Glu Leu Ser Gly Cys Glu Gln Gly Leu His 35 40 45 Glu Ile Lys Leu Leu Gly Lys Gly Thr Ser Ala Ala Asp Ala Val Glu 50 55 60 Val Pro Ala Pro Ala Ala Val Leu Gly Gly Pro Glu Pro Leu Met Gln 65 70 75 80 Ala Thr Ala Trp Leu Asn Ala Tyr Phe His Gln Pro Glu Ala Ile Glu 85 90 95 Glu Phe Pro Val Pro Ala Leu His His Pro Val Phe Gln Gln Glu Ser 100 105 110 Phe Thr Arg Gln Val Leu Trp Lys Leu Leu Lys Val Val Lys Phe Gly 115 120 125 Glu Val Ile Ser Tyr Gln Gln Leu Ala Ala Leu Ala Gly Asn Pro Ala 130 135 140 Ala Thr Ala Ala Val Lys Thr Ala Leu Ser Gly Asn Pro Val Pro Ile 145 150 155 160 Leu Ile Pro Cys His Arg Val Val Ser Ser Ser Gly Ala Val Gly Gly 165 170 175 Tyr Glu Gly Gly Leu Ala Val Lys Glu Trp Leu Leu Ala His Glu Gly 180 185 190 His Arg Leu Gly Lys Pro Gly Leu Gly Pro Ala Gly Ile Gly Ala Pro 195 200 205 Gly Ser Leu Gly Gly Gly Ser Glu Asn Leu Tyr Phe Gln Ser Asp Ile 210 215 220 Ser Ser Gln Phe Ile Phe Glu Asp Val Pro Gln Arg Asn Ala Ala Thr 225 230 235 240 Phe Asn Pro Glu Val Gly Tyr Val Ala Phe Ile Gly Lys Tyr Gly Gln 245 250 255 Gln Leu Asn Phe Gly Val Ala Arg Val Phe Phe Leu Asn Gln Lys Lys 260 265 270 Ala Lys Met Val Leu His Lys Thr Ala Gln Pro Ser Val Asp Leu Thr 275 280 285 Phe Gly Gly Val Lys Phe Thr Val Val Asn Asn His Phe Pro Gln Tyr 290 295 300 Val Ser Asn Pro Val Pro Asp Asn Ala Ile Thr Leu His Arg Met Ser 305 310 315 320 Gly Tyr Leu Ala Arg Trp Ile Ala Asp Thr Cys Lys Ala Ser Val Leu 325 330 335 Lys Leu Ala Glu Ala Ser Ala Gln Ile Val Met Pro Leu Ala Glu Val 340 345 350 Lys Gly Cys Thr Trp Ala Asp Gly Tyr Thr Met Tyr Leu Gly Phe Ala 355 360 365 Pro Gly Ala Glu Met Phe Leu Asp Ala Phe Asp Phe Tyr Pro Leu Val 370 375 380 Ile Glu Met His Arg Val Leu Lys Asp Asn Met Asp Val Asn Phe Met 385 390 395 400 Lys Lys Val Leu Arg Gln Arg Tyr Gly Thr Met Thr Ala Glu Glu Trp 405 410 415 Met Thr Gln Lys Ile Thr Glu Ile Lys Ala Ala Phe Asn Ser Val Gly 420 425 430 Gln Leu Ala Trp Ala Lys Ser Gly Phe Ser Pro Ala Ala Arg Thr Phe 435 440 445 Leu Gln Gln Phe Gly Ile Asn Ile Pro Gly Glu Asn Leu Tyr Phe Gln 450 455 460 Gly Pro Gly Gly Gly Ser His His His His His His 465 470 475 <210> 47 <211> 891 <212> DNA <213> artificial <220> <223> Modified DNA sequence encoding enterovirus 71 VP1 (strain JL-AFP-EV71-07-03) <400> 47 ggagataggg tggcagacgt gattgaaagt tccaaaggaa atagtgtgag cagagccctc 60 actcaagctc taccagcacc cacaggtcag aacacacagg tgagcagtca tcgactggat 120 acaggcaagg ttccagcact ccaagctgct gaaattggag catcatcaaa tgctagtgat 180 gagagcatga tcgagacacg ctgtgttctt aactcgcata gcacagctga gaccactctt 240 gatagtttct tcagcagagc ggggttagtt ggagagattg atctccctct tgaaggcaca 300 actaacccaa atggttatgc caactgggac atagatataa caggttacgc gcaaatgcgt 360 agaaaggtgg agctattcac ctacatgcgc tttgatgcag agttcacttt tgttgcgtgc 420 acacccaccg gggaagttgt cccacaattg ctccaataca tgtttgtgcc acctggagcc 480 cctaagccag attccaggga atccctcgca tggcaaactg ccaccaaccc ctcagttttt 540 gtcaagctgt cagaccctcc agcacaagtt tcagtaccat tcatgtcacc tgcgagtgct 600 taccaatggt tttatgacgg ttatcccaca ttcggagaac acaaacagga gaaggatctc 660 gaatatgggg catgtcctaa caacatgatg ggcacgttct cagtgcggac tgtagggacc 720 tccaagtcca agtacccttt agtggttagg atttacatga gaatgaagca cgtcagggcg 780 tggatacctc gcccgatgcg caaccaaaac tacctattca aagccaaccc aaattatgct 840 ggcaactcca ttaagccaac tggtaccagt cgcacagcga tcactactct c 891 <210> 48 <211> 1643 <212> DNA <213> artificial <220> <223> DNA Sequence of chimeric DeSNAPuniv-EV71.VP1 (ssBiP-SNAPlike- proTEVcleavage site - modified EV71-VP1-proTEVcleavage site -Histag) for expression in S2 cells <400> 48 atgaagttat gcatattact ggccgtcgtg gtggcctttg ttggcctctc gctcgggaga 60 tctagatctg acaaagactg cgaaatgaaa agaactacat tggattcacc acttgggaag 120 ttggaactga gtggatgcga gcaaggattg catgaaatta agctactggg aaaaggaact 180 tctgctgctg atgcagttga agttccagca ccagcagctg ttcttggagg tcctgagccc 240 ctcatgcaag ccacagcctg gcttaacgca tatttccacc agcctgaggc cattgaggaa 300 tttccagtcc ccgcccttca ccatcctgtg tttcagcagg agagcttcac ccgccaggtc 360 ctgtggaaat tgctgaaggt ggtcaagttt ggtgaagtga tttcatatca gcaacttgct 420 gcattggccg gtaaccccgc agctacagct gccgtgaaaa ctgctctcag cggaaatcct 480 gtgcccatcc tgatcccttg tcacagagtc gtttcatctt ccggagctgt aggtggctat 540 gaaggaggac tggcagttaa ggagtggctg ctggctcatg aaggtcatag acttggaaag 600 cctgggctgg gtcctgctgg tataggcgcg ccagggtccc taggtggcgg atccgaaaac 660 ctgtacttcc agagcgatat cggagatagg gtggcagacg tgattgaaag ttccaaagga 720 aatagtgtga gcagagccct cactcaagct ctaccagcac ccacaggtca gaacacacag 780 gtgagcagtc atcgactgga tacaggcaag gttccagcac tccaagctgc tgaaattgga 840 gcatcatcaa atgctagtga tgagagcatg atcgagacac gctgtgttct taactcgcat 900 agcacagctg agaccactct tgatagtttc ttcagcagag cggggttagt tggagagatt 960 gatctccctc ttgaaggcac aactaaccca aatggttatg ccaactggga catagatata 1020 acaggttacg cgcaaatgcg tagaaaggtg gagctattca cctacatgcg ctttgatgca 1080 gagttcactt ttgttgcgtg cacacccacc ggggaagttg tcccacaatt gctccaatac 1140 atgtttgtgc cacctggagc ccctaagcca gattccaggg aatccctcgc atggcaaact 1200 gccaccaacc cctcagtttt tgtcaagctg tcagaccctc cagcacaagt ttcagtacca 1260 ttcatgtcac ctgcgagtgc ttaccaatgg ttttatgacg gttatcccac attcggagaa 1320 cacaaacagg agaaggatct cgaatatggg gcatgtccta acaacatgat gggcacgttc 1380 tcagtgcgga ctgtagggac ctccaagtcc aagtaccctt tagtggttag gatttacatg 1440 agaatgaagc acgtcagggc gtggatacct cgcccgatgc gcaaccaaaa ctacctattc 1500 aaagccaacc caaattatgc tggcaactcc attaagccaa ctggtaccag tcgcacagcg 1560 atcactactc tcccgggaga gaatctatat tttcaagggc ccggcggagg tagtcaccat 1620 catcaccatc actaatgacc ggt 1643 <210> 49 <211> 523 <212> PRT <213> artificial <220> <223> Amino acid sequence of fusion protein [SNAPlike - proTEV - VP1 EV71 - proTEV- Histag] <400> 49 Arg Ser Asp Lys Asp Cys Glu Met Lys Arg Thr Thr Leu Asp Ser Pro 1 5 10 15 Leu Gly Lys Leu Glu Leu Ser Gly Cys Glu Gln Gly Leu His Glu Ile 20 25 30 Lys Leu Leu Gly Lys Gly Thr Ser Ala Ala Asp Ala Val Glu Val Pro 35 40 45 Ala Pro Ala Ala Val Leu Gly Gly Pro Glu Pro Leu Met Gln Ala Thr 50 55 60 Ala Trp Leu Asn Ala Tyr Phe His Gln Pro Glu Ala Ile Glu Glu Phe 65 70 75 80 Pro Val Pro Ala Leu His His Pro Val Phe Gln Gln Glu Ser Phe Thr 85 90 95 Arg Gln Val Leu Trp Lys Leu Leu Lys Val Val Lys Phe Gly Glu Val 100 105 110 Ile Ser Tyr Gln Gln Leu Ala Ala Leu Ala Gly Asn Pro Ala Ala Thr 115 120 125 Ala Ala Val Lys Thr Ala Leu Ser Gly Asn Pro Val Pro Ile Leu Ile 130 135 140 Pro Cys His Arg Val Val Ser Ser Ser Gly Ala Val Gly Gly Tyr Glu 145 150 155 160 Gly Gly Leu Ala Val Lys Glu Trp Leu Leu Ala His Glu Gly His Arg 165 170 175 Leu Gly Lys Pro Gly Leu Gly Pro Ala Gly Ile Gly Ala Pro Gly Ser 180 185 190 Leu Gly Gly Gly Ser Glu Asn Leu Tyr Phe Gln Ser Asp Ile Gly Asp 195 200 205 Arg Val Ala Asp Val Ile Glu Ser Ser Lys Gly Asn Ser Val Ser Arg 210 215 220 Ala Leu Thr Gln Ala Leu Pro Ala Pro Thr Gly Gln Asn Thr Gln Val 225 230 235 240 Ser Ser His Arg Leu Asp Thr Gly Lys Val Pro Ala Leu Gln Ala Ala 245 250 255 Glu Ile Gly Ala Ser Ser Asn Ala Ser Asp Glu Ser Met Ile Glu Thr 260 265 270 Arg Cys Val Leu Asn Ser His Ser Thr Ala Glu Thr Thr Leu Asp Ser 275 280 285 Phe Phe Ser Arg Ala Gly Leu Val Gly Glu Ile Asp Leu Pro Leu Glu 290 295 300 Gly Thr Thr Asn Pro Asn Gly Tyr Ala Asn Trp Asp Ile Asp Ile Thr 305 310 315 320 Gly Tyr Ala Gln Met Arg Arg Lys Val Glu Leu Phe Thr Tyr Met Arg 325 330 335 Phe Asp Ala Glu Phe Thr Phe Val Ala Cys Thr Pro Thr Gly Glu Val 340 345 350 Val Pro Gln Leu Leu Gln Tyr Met Phe Val Pro Pro Gly Ala Pro Lys 355 360 365 Pro Asp Ser Arg Glu Ser Leu Ala Trp Gln Thr Ala Thr Asn Pro Ser 370 375 380 Val Phe Val Lys Leu Ser Asp Pro Pro Ala Gln Val Ser Val Pro Phe 385 390 395 400 Met Ser Pro Ala Ser Ala Tyr Gln Trp Phe Tyr Asp Gly Tyr Pro Thr 405 410 415 Phe Gly Glu His Lys Gln Glu Lys Asp Leu Glu Tyr Gly Ala Cys Pro 420 425 430 Asn Asn Met Met Gly Thr Phe Ser Val Arg Thr Val Gly Thr Ser Lys 435 440 445 Ser Lys Tyr Pro Leu Val Val Arg Ile Tyr Met Arg Met Lys His Val 450 455 460 Arg Ala Trp Ile Pro Arg Pro Met Arg Asn Gln Asn Tyr Leu Phe Lys 465 470 475 480 Ala Asn Pro Asn Tyr Ala Gly Asn Ser Ile Lys Pro Thr Gly Thr Ser 485 490 495 Arg Thr Ala Ile Thr Thr Leu Pro Gly Glu Asn Leu Tyr Phe Gln Gly 500 505 510 Pro Gly Gly Gly Ser His His His His His His 515 520 <210> 50 <211> 2386 <212> DNA <213> artificial <220> <223> DNA Sequence encoding chimeric DeSNAPuniv-JE. -sE (ssBiP- sE from JEV strain SA-14 -SNAPlike) for expression in S2 cells <400> 50 atgaagttat gcatattact ggccgtcgtg gcctttgttg gcctctcgct cgggagatct 60 atgaagttgt cgaatttcca ggggaagctt ttgatgacca tcaacaacac ggacattgca 120 gacgttatcg tgattcccac ctcaaaagga gagaacagat gctgggtccg ggcaatcgac 180 gtcggctaca tgtgtgagga cactatcacg tacgaatgtc ctaagcttac catgggcaat 240 gatccagagg atgtggattg ctggtgtgac aaccaagaag tctacgtcca atatggacgg 300 tgcacgcgga ccaggcattc caagcgaagc aggagatccg tgtcggtcca aacacatggg 360 gagagttcac tagtgaataa aaaagaggct tggctggatt caacgaaagc cacacgatat 420 ctcatgaaaa ctgagaactg gatcataagg aatcctggct atgctttcct ggcggcggta 480 cttggctgga tgcttggcag taacaacggt caacgcgtgg tatttaccat cctcctgctg 540 ttggtcgctc cggcttacag ttttaattgt ctgggaatgg gcaatcgtga cttcatagaa 600 ggagccagtg gagccacttg ggtggacttg gtgctagaag gagatagctg cttgacaatc 660 atggcaaacg acaaaccaac attggacgtc cgcatgatta acatcgaagc tagccaactt 720 gctgaggtca gaagttactg ctatcatgct tcagtcactg acatctcgac ggtggctcgg 780 tgccccacga ctggagaagc tcacaacgag aagcgagctg atagtagcta tgtgtgcaaa 840 caaggcttca ctgaccgtgg gtggggcaac ggatgtggac ttttcgggaa gggaagcatt 900 gacacatgtg caaaattctc ctgcaccagt aaagcgattg ggagaacaat ccagccagaa 960 aacatcaaat acgaagttgg catttttgtg catggaacca ccacttcgga aaaccatggg 1020 aattattcag cgcaagttgg ggcgtcccag gcggcaaagt ttacagtaac acccaatgct 1080 ccttcgataa ccctcaaact tggtgactac ggagaagtca cactggactg tgagccaagg 1140 agtggactga acactgaagc gttttacgtc atgaccgtgg ggtcaaagtc atttctggtc 1200 catagggagt ggtttcatga cctcgctctc ccctggacgt ccccttcgag cacagcgtgg 1260 agaaacagag aactcctcat ggaatttgaa ggggcgcacg ccacaaaaca gtccgttgtt 1320 gctcttgggt cacaggaagg aggcctccat caggcgttgg caggagccat cgtggtggag 1380 tactcaagct cagtgaagtt aacatcaggc cacctgaaat gtaggctgaa aatggacaaa 1440 ctggctctga aaggcacaac ctatggcatg tgtacagaaa aattctcgtt cgcgaaaaat 1500 ccggcggaca ctggtcacgg aacagttgtc attgaactct cctactctgg gagtgatggc 1560 tcctgcaaaa ttccgattgt ttccgttgcg agcctcaatg acatgacccc cgttgggcgg 1620 ctggtgacag tgaacccctt cgtcgcgact tccagtgcca actcaaaggt gctggtcgag 1680 atggaacccc ccttcggaga ctcctacatc gtagttggaa ggggagacaa gcagatcaac 1740 caccattggc acaaagctgg gcggccgcac ggcggaggta gcaaagactg cgaaatgaag 1800 cgcaccaccc tggatagccc tctgggcaag ctggaactgt ctgggtgcga acagggcctg 1860 cacgagatca agctgctggg caaaggaaca tctgccgccg acgccgtgga agtgcctgcc 1920 ccagccgccg tgctgggcgg accagagcca ctgatgcagg ccaccgcctg gctcaacgcc 1980 tactttcacc agcctgaggc catcgaggag ttccctgtgc cagccctgca ccacccagtg 2040 ttccagcagg agagctttac ccgccaggtg ctgtggaaac tgctgaaagt ggtgaagttc 2100 ggagaggtca tcagctacca gcagctggcc gccctggccg gcaatcccgc cgccaccgcc 2160 gccgtgaaaa ccgccctgag cggaaatccc gtgcccattc tgatcccctg ccaccgggtg 2220 gtgtctagct ctggcgccgt ggggggctac gagggcgggc tcgccgtgaa agagtggctg 2280 ctggcccacg agggccacag actgggcaag cctgggctgg gtcctgcagg tataggcgcg 2340 ccagggtccc tggagcatca tcatcatcat cattgatgac gggccc 2386 <210> 51 <211> 773 <212> PRT <213> artificial <220> <223> Amino acid Sequence of fusion protein [sE from JEV strain SA-14 - SNAPlike - Histag] <400> 51 Arg Ser Met Lys Leu Ser Asn Phe Gln Gly Lys Leu Leu Met Thr Ile 1 5 10 15 Asn Asn Thr Asp Ile Ala Asp Val Ile Val Ile Pro Thr Ser Lys Gly 20 25 30 Glu Asn Arg Cys Trp Val Arg Ala Ile Asp Val Gly Tyr Met Cys Glu 35 40 45 Asp Thr Ile Thr Tyr Glu Cys Pro Lys Leu Thr Met Gly Asn Asp Pro 50 55 60 Glu Asp Val Asp Cys Trp Cys Asp Asn Gln Glu Val Tyr Val Gln Tyr 65 70 75 80 Gly Arg Cys Thr Arg Thr Arg His Ser Lys Arg Ser Arg 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705 710 715 720 Arg Val Val Ser Ser Ser Gly Ala Val Gly Gly Tyr Glu Gly Gly Leu 725 730 735 Ala Val Lys Glu Trp Leu Leu Ala His Glu Gly His Arg Leu Gly Lys 740 745 750 Pro Gly Leu Gly Pro Ala Gly Ile Gly Ala Pro Gly Ser Leu Glu His 755 760 765 His His His His His 770 <210> 52 <211> 1020 <212> DNA <213> artificial <220> <223> DNA Sequence encoding the fusion protein BiPlike-SNAPlike-EDIII from Japanese encephalitis virus genotype I cloned into pMT/BiP/SNAP for expression in S2 cells <400> 52 atgaaactat gtattctact tgcagttgtt gcgttcgtag gattgtcctt aagatctgac 60 aaagactgcg aaatgaaaag aactacattg gattcaccac ttgggaagtt ggaactgagt 120 ggatgcgagc aaggattgca tgaaattaag ctactgggaa aaggaacttc tgctgctgat 180 gcagttgaag ttccagcacc agcagctgtt cttggaggtc ctgagcccct catgcaagcc 240 acagcctggc ttaacgcata tttccaccag cctgaggcca ttgaggaatt tccagtcccc 300 gcccttcacc atcctgtgtt tcagcaggag agcttcaccc gccaggtcct gtggaaattg 360 ctgaaggtgg tcaagtttgg tgaagtgatt tcatatcagc aacttgctgc attggccggt 420 aaccccgcag ctacagctgc cgtgaaaact gctctcagcg gaaatcctgt gcccatcctg 480 atcccttgtc acagagtcgt ttcatcttcc ggagctgtag gtggctatga aggaggactg 540 gcagttaagg agtggctgct ggctcatgaa ggtcatagac ttggaaagcc tgggctgggt 600 cctgctggta taggcgcgcc agggtccctg gagggaggtg gcgggtctgc tctgaagggc 660 acgacttacg gcatgtgtac agaaaaattc tcgttcgcga aaaatccagc ggacacaggc 720 catggaacag ttgtcattga gctcacatac tctggaagcg atggtccctg taaaattccg 780 attgtctcag tcgcgagttt aaacgacatg acccctgtgg ggaggctggt aacagtaaac 840 cccttcgtcg cgacatctag ctccaactca aaggtgctgg ttgagatgga acctcccttc 900 ggagactctt acatcgtggt tggaagaggg gataagcaga ttaaccatca ctggcacaaa 960 gctggaagca cgctgggtaa aggaggtggc catcaccatc accatcactg atgaccggtt 1020 <210> 53 <211> 319 <212> PRT <213> artificial <220> <223> Amino acid Sequence of the fusion protein SNAPlike-EDIII from Japanese encephalitis virus genotype I - Histag <400> 53 Arg Ser Asp Lys Asp Cys Glu Met Lys Arg Thr Thr Leu Asp Ser Pro 1 5 10 15 Leu Gly Lys Leu Glu Leu Ser Gly Cys Glu Gln Gly Leu His Glu 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caccatcacc atcactgatg accggt 406 <210> 55 <211> 406 <212> DNA <213> artificial <220> <223> DNA sequence encoding Domain III of envelope E protein from Japanese encephalitis virus of genotype 2 (JE-2.EDIII) <400> 55 gcgcgccagg gtccctggag ggaggtggcg ggtctgctct gaaaggcaca acctatggta 60 tgtgcacaga aaactcctcg ttccgaaaaa atccagcgga cacaggccat ggaacagttg 120 tcattgagct cacatactct gggagtgatg gtccctgtaa gattccaaat gtctccgttg 180 cgagcctgaa tgacatgacc cctgtaggga ggctggtaac agtaaacccc tttgtcgcga 240 catccagcgc caactcaaaa gtgctggttg aaatggaacc cccttttgga gattcttaca 300 tcgtggtcgg aagaggtgac aagcagatca atcatcactg gcacaaagct ggaagcacgc 360 tgggcaaagg aggtggccat caccatcacc atcactgatg accggt 406 <210> 56 <211> 406 <212> DNA <213> artificial <220> <223> DNA sequence encoding Domain III of envelope E protein from Japanese encephalitis virus of genotype 4 (JE-4.EDIII) <400> 56 gcgcgccagg gtccctggag ggaggtggcg ggtctgctct gaaaggcaca acctatggaa 60 tgtgcacaga aaagttctcg tttgcaaaga atccagcaga cactggtcat ggaacagttg 120 tcattgaact cctgtattct ggaagtgacg gcccctgtaa catcccaatt gtctcagtgg 180 tcagtctaaa cgacatgact ccagttggaa ggttggtgac agtgaacccc ttcgttgcca 240 catccagttc caattcaaag gtcttagttg agatggaacc tccttttgga gactcctaca 300 ttgtggtcgg gagaggagaa aaacaaatca accaccactg gcacaaacct ggaagcacat 360 tgggcaaagg aggtggccat caccatcacc atcactgatg accggt 406 <210> 57 <211> 406 <212> DNA <213> artificial <220> <223> DNA sequence encoding Domain III of envelope E protein from Japanese encephalitis virus of genotype 5 (JE-5.EDIII) <400> 57 gcgcgccagg gtccctggag ggaggtggcg ggtctgcgtt gaaagggacc acctatggta 60 tgtgcacaga gaagttctct ttttccaaga atccagctga cactggtcat ggtacggttg 120 tcatagaatt gcagtacacc ggcactgacg gaccttgcaa gatacccatc tcttcggtgg 180 ccagtctgaa tgatttaact ccagttggta gattggtgac agtcaatcct tttgttgcca 240 catccaccgc caattcgaag gttttggtag aattggaacc accatttgga gattcattca 300 ttgttgtcgg aagaggagat aagcagatca atcaccattg gcacaaggct ggcagttcac 360 tgggaaaggg aggtggccat caccatcacc atcactgatg accggt 406 <210> 58 <211> 394 <212> DNA <213> artificial <220> <223> DNA sequence of Domain III encoding envelope E protein from Rabensburg virus (RabV.EDIII) <400> 58 gcgcgccagg aggtggcggg tctcagctca aaggaacgac ctatggagta tgcgcaaaag 60 ccttcaagtt ttctgggaat ccagctgaca cagggcatgg caccgtggtc ttagagttgc 120 aatacaccgg aaccgatggt ccttgtaagg tgcctgtctc ttccgtggct tcactcaacg 180 acctaactcc cgttgggaga ctggtgacag tgaatccctt tgttgctgca gctactgcta 240 attcaaaggt tctgatagaa ctggaacctc cattcggtga ctcatacatt gtggtaggta 300 gaggagaaca ccagataaac caccattggc acaagtctgg aagcagtatt ggaaagggag 360 gtggccatca ccatcaccat cactgatgac cggt 394 <210> 59 <211> 1020 <212> DNA <213> artificial <220> <223> DNA Sequence encoding the fusion protein BiPlike -SNAPlike-EDIII from Japanese encephalitis virus genotype 2 cloned into pMT/BiP/SNAP for expression in S2 cells <400> 59 atgaaactat gtattctact tgcagttgtt gcgttcgtag gattgtcctt aagatctgac 60 aaagactgcg aaatgaaaag aactacattg gattcaccac ttgggaagtt ggaactgagt 120 ggatgcgagc aaggattgca tgaaattaag ctactgggaa aaggaacttc tgctgctgat 180 gcagttgaag ttccagcacc agcagctgtt cttggaggtc ctgagcccct catgcaagcc 240 acagcctggc ttaacgcata tttccaccag cctgaggcca ttgaggaatt tccagtcccc 300 gcccttcacc atcctgtgtt tcagcaggag agcttcaccc gccaggtcct gtggaaattg 360 ctgaaggtgg tcaagtttgg tgaagtgatt tcatatcagc aacttgctgc attggccggt 420 aaccccgcag ctacagctgc cgtgaaaact gctctcagcg gaaatcctgt gcccatcctg 480 atcccttgtc acagagtcgt ttcatcttcc ggagctgtag gtggctatga aggaggactg 540 gcagttaagg agtggctgct ggctcatgaa ggtcatagac ttggaaagcc tgggctgggt 600 cctgctggta taggcgcgcc agggtccctg gagggaggtg gcgggtctgc tctgaaaggc 660 acaacctatg gtatgtgcac agaaaactcc tcgttccgaa aaaatccagc ggacacaggc 720 catggaacag ttgtcattga gctcacatac tctgggagtg atggtccctg taagattcca 780 aatgtctccg ttgcgagcct gaatgacatg acccctgtag ggaggctggt aacagtaaac 840 ccctttgtcg cgacatccag cgccaactca aaagtgctgg ttgaaatgga accccctttt 900 ggagattctt acatcgtggt cggaagaggt gacaagcaga tcaatcatca ctggcacaaa 960 gctggaagca cgctgggcaa aggaggtggc catcaccatc accatcactg atgaccggtt 1020 <210> 60 <211> 319 <212> PRT <213> artificial <220> <223> Amino acid Sequence of the fusion protein SNAPlike-EDIII from Japanese encephalitis virus genotype 2 - Histag <400> 60 Arg Ser Asp Lys Asp Cys Glu Met Lys Arg Thr Thr Leu Asp Ser Pro 1 5 10 15 Leu Gly Lys Leu Glu Leu Ser Gly Cys Glu Gln Gly Leu His Glu Ile 20 25 30 Lys Leu Leu Gly Lys Gly Thr Ser Ala Ala Asp Ala Val Glu Val Pro 35 40 45 Ala Pro Ala Ala Val Leu Gly Gly Pro Glu Pro Leu Met Gln Ala Thr 50 55 60 Ala Trp Leu Asn Ala Tyr Phe His Gln Pro Glu Ala Ile Glu Glu Phe 65 70 75 80 Pro Val Pro Ala Leu His His Pro Val Phe Gln Gln Glu Ser Phe Thr 85 90 95 Arg Gln Val Leu Trp Lys Leu Leu Lys Val Val Lys Phe Gly Glu Val 100 105 110 Ile Ser Tyr Gln Gln Leu Ala Ala Leu Ala Gly Asn Pro Ala Ala Thr 115 120 125 Ala Ala Val Lys Thr Ala Leu Ser Gly Asn Pro Val Pro Ile Leu Ile 130 135 140 Pro Cys His Arg Val Val Ser Ser Ser Gly Ala Val Gly Gly Tyr Glu 145 150 155 160 Gly Gly Leu 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tgcagttgtt gcgttcgtag gattgtcctt aagatctgac 60 aaagactgcg aaatgaaaag aactacattg gattcaccac ttgggaagtt ggaactgagt 120 ggatgcgagc aaggattgca tgaaattaag ctactgggaa aaggaacttc tgctgctgat 180 gcagttgaag ttccagcacc agcagctgtt cttggaggtc ctgagcccct catgcaagcc 240 acagcctggc ttaacgcata tttccaccag cctgaggcca ttgaggaatt tccagtcccc 300 gcccttcacc atcctgtgtt tcagcaggag agcttcaccc gccaggtcct gtggaaattg 360 ctgaaggtgg tcaagtttgg tgaagtgatt tcatatcagc aacttgctgc attggccggt 420 aaccccgcag ctacagctgc cgtgaaaact gctctcagcg gaaatcctgt gcccatcctg 480 atcccttgtc acagagtcgt ttcatcttcc ggagctgtag gtggctatga aggaggactg 540 gcagttaagg agtggctgct ggctcatgaa ggtcatagac ttggaaagcc tgggctgggt 600 cctgctggta taggcgcgcc agggtccctg gagggaggtg gcgggtctgc tctgaaaggc 660 acaacctatg gaatgtgcac agaaaagttc tcgtttgcaa agaatccagc agacactggt 720 catggaacag ttgtcattga actcctgtat tctggaagtg acggcccctg taacatccca 780 attgtctcag tggtcagtct aaacgacatg actccagttg gaaggttggt gacagtgaac 840 cccttcgttg ccacatccag ttccaattca aaggtcttag 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encephalitis virus genotype 5 cloned into pMT/BiP/SNAP for expression in S2 cells <400> 63 atgaaactat gtattctact tgcagttgtt gcgttcgtag gattgtcctt aagatctgac 60 aaagactgcg aaatgaaaag aactacattg gattcaccac ttgggaagtt ggaactgagt 120 ggatgcgagc aaggattgca tgaaattaag ctactgggaa aaggaacttc tgctgctgat 180 gcagttgaag ttccagcacc agcagctgtt cttggaggtc ctgagcccct catgcaagcc 240 acagcctggc ttaacgcata tttccaccag cctgaggcca ttgaggaatt tccagtcccc 300 gcccttcacc atcctgtgtt tcagcaggag agcttcaccc gccaggtcct gtggaaattg 360 ctgaaggtgg tcaagtttgg tgaagtgatt tcatatcagc aacttgctgc attggccggt 420 aaccccgcag ctacagctgc cgtgaaaact gctctcagcg gaaatcctgt gcccatcctg 480 atcccttgtc acagagtcgt ttcatcttcc ggagctgtag gtggctatga aggaggactg 540 gcagttaagg agtggctgct ggctcatgaa ggtcatagac ttggaaagcc tgggctgggt 600 cctgctggta taggcgcgcc agggtccctg gagggaggtg gcgggtctgc gttgaaaggg 660 accacctatg gtatgtgcac agagaagttc tctttttcca agaatccagc tgacactggt 720 catggtacgg ttgtcataga attgcagtac accggcactg acggaccttg caagataccc 780 atctcttcgg tggccagtct gaatgattta actccagttg gtagattggt gacagtcaat 840 ccttttgttg ccacatccac cgccaattcg aaggttttgg tagaattgga accaccattt 900 ggagattcat tcattgttgt cggaagagga gataagcaga tcaatcacca ttggcacaag 960 gctggcagtt cactgggaaa gggaggtggc catcaccatc accatcactg atgaccggtt 1020 <210> 64 <211> 319 <212> PRT <213> artificial <220> <223> Amino acid Sequence of the fusion protein SNAPlike-EDIII from Japanese encephalitis virus genotype 5 - Histag <400> 64 Arg Ser Asp Lys Asp Cys Glu Met Lys Arg Thr Thr Leu Asp Ser Pro 1 5 10 15 Leu Gly Lys Leu Glu Leu Ser Gly Cys Glu Gln Gly Leu His Glu Ile 20 25 30 Lys Leu Leu Gly Lys Gly Thr Ser Ala Ala Asp Ala Val Glu Val Pro 35 40 45 Ala Pro Ala Ala Val Leu Gly Gly Pro Glu Pro Leu Met Gln Ala Thr 50 55 60 Ala Trp Leu Asn Ala Tyr Phe His Gln Pro Glu Ala Ile Glu Glu Phe 65 70 75 80 Pro Val Pro Ala Leu His His Pro Val Phe Gln Gln Glu Ser Phe Thr 85 90 95 Arg Gln Val Leu Trp Lys Leu Leu Lys Val Val Lys Phe Gly Glu Val 100 105 110 Ile Ser Tyr Gln Gln Leu 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<213> artificial <220> <223> DNA Sequence encoding the fusion protein BiPlike -SNAPlike-EDIII from Rabensburg virus cloned into pMT/BiP/SNAP for expression in S2 cells <400> 65 atgaaactat gtattctact tgcagttgtt gcgttcgtag gattgtcctt aagatctgac 60 aaagactgcg aaatgaaaag aactacattg gattcaccac ttgggaagtt ggaactgagt 120 ggatgcgagc aaggattgca tgaaattaag ctactgggaa aaggaacttc tgctgctgat 180 gcagttgaag ttccagcacc agcagctgtt cttggaggtc ctgagcccct catgcaagcc 240 acagcctggc ttaacgcata tttccaccag cctgaggcca ttgaggaatt tccagtcccc 300 gcccttcacc atcctgtgtt tcagcaggag agcttcaccc gccaggtcct gtggaaattg 360 ctgaaggtgg tcaagtttgg tgaagtgatt tcatatcagc aacttgctgc attggccggt 420 aaccccgcag ctacagctgc cgtgaaaact gctctcagcg gaaatcctgt gcccatcctg 480 atcccttgtc acagagtcgt ttcatcttcc ggagctgtag gtggctatga aggaggactg 540 gcagttaagg agtggctgct ggctcatgaa ggtcatagac ttggaaagcc tgggctgggt 600 cctgctggta taggcgcgcc aggaggtggc gggtctcagc tcaaaggaac gacctatgga 660 gtatgcgcaa aagccttcaa gttttctggg aatccagctg acacagggca 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tcgaaggaat agcggagata acactaaaag aggcccaaaa gagcatttgt 720 tcactacctt tgtcttgtgt gggctgtagc ttgttgtctt ccaaggtcgt tttccttgag 780 acaacaacga aagctgccgt ccacgttgga tgtgggaatg gaacttctgt tctaacagtt 840 ggaactactc ctgtgagtat cgactgtgta gtaacgcccc tgtcgcaggt gtggaggctc 900 gtgtcgcacg tcaccggaag atacaccaaa cttgggtttg gaggtggcca tcaccatcac 960 catcactgat gaccggt 977 <210> 68 <211> 305 <212> PRT <213> artificial <220> <223> Amino acid Sequence of the fusion protein SNAPlike-EDIII from a insect flavivirus - Histag <400> 68 Arg Ser Asp Lys Asp Cys Glu Met Lys Arg Thr Thr Leu Asp Ser Pro 1 5 10 15 Leu Gly Lys Leu Glu Leu Ser Gly Cys Glu Gln Gly Leu His Glu Ile 20 25 30 Lys Leu Leu Gly Lys Gly Thr Ser Ala Ala Asp Ala Val Glu Val Pro 35 40 45 Ala Pro Ala Ala Val Leu Gly Gly Pro Glu Pro Leu Met Gln Ala Thr 50 55 60 Ala Trp Leu Asn Ala Tyr Phe His Gln Pro Glu Ala Ile Glu Glu Phe 65 70 75 80 Pro Val Pro Ala Leu His His Pro Val Phe Gln Gln Glu Ser Phe Thr 85 90 95 Arg Gln Val Leu Trp Lys Leu Leu Lys 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aatgccatgc tgccgtcacc agccatgaca aatggcaatt tacctctcca 780 tttgttccca gggctgatca gacagctagg aaaggcaagg tacacgttcc gttccctctg 840 actaacgtca cctgccgagt gccgttggct cgagcgccgg atgtcaccta tggtaagaag 900 gaggtgaccc tgagattaca cccagatcat ccgacactct tctcctatag gagtttagga 960 gccgaaccgc acccgtacga ggaatgggtt gacaagttct ctgagcgcat catcccagtg 1020 acggaagaag ggattgaata ccagtggggc aacaacccgc cggtccgcct gtgggcgcaa 1080 ctgacgaccg agggcaaacc ccatggatgg ccacatgaaa tcattcagta ctattatgga 1140 ctataccccg ccgccacgcg gccgcacggc ggaggtagca aagactgcga aatgaagcgc 1200 accaccctgg atagccctct gggcaagctg gaactgtctg ggtgcgaaca gggcctgcac 1260 gagatcaagc tgctgggcaa aggaacatct gccgccgacg ccgtggaagt gcctgcccca 1320 gccgccgtgc tgggcggacc agagccactg atgcaggcca ccgcctggct caacgcctac 1380 tttcaccagc ctgaggccat cgaggagttc cctgtgccag ccctgcacca cccagtgttc 1440 cagcaggaga gctttacccg ccaggtgctg tggaaactgc tgaaagtggt gaagttcgga 1500 gaggtcatca gctaccagca gctggccgcc ctggccggca atcccgccgc caccgccgcc 1560 gtgaaaaccg ccctgagcgg 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1460 <210> 89 <211> 1325 <212> DNA <213> artificial <220> <223> DNA sequence encoding ssBiP - SNAPlike -proTEV- C protein from hepatitis C virus strain TCHM-R2/03 of genotype 1b - -proTEV - Histag for expression in S2 cells <400> 89 atgaagttat gcatattact ggccgtcgtg gtggcctttg ttggcctctc gctcgggaga 60 tctagatctg acaaagactg cgaaatgaaa agaactacat tggattcacc acttgggaag 120 ttggaactga gtggatgcga gcaaggattg catgaaatta agctactggg aaaaggaact 180 tctgctgctg atgcagttga agttccagca ccagcagctg ttcttggagg tcctgagccc 240 ctcatgcaag ccacagcctg gcttaacgca tatttccacc agcctgaggc cattgaggaa 300 tttccagtcc ccgcccttca ccatcctgtg tttcagcagg agagcttcac ccgccaggtc 360 ctgtggaaat tgctgaaggt ggtcaagttt ggtgaagtga tttcatatca gcaacttgct 420 gcattggccg gtaaccccgc agctacagct gccgtgaaaa ctgctctcag cggaaatcct 480 gtgcccatcc tgatcccttg tcacagagtc gtttcatctt ccggagctgt aggtggctat 540 gaaggaggac tggcagttaa ggagtggctg ctggctcatg aaggtcatag acttggaaag 600 cctgggctgg gtcctgctgg tataggcgcg ccagggtccc taggtggcgg atccgaaaac 660 ctgtacttcc agagcgatat cagtacaaat cctaaacctc aaagaaaaac taaacgaaat 720 actaatcgtc gtccacaaga tgttaagttt ccgggaggag gacaaattgt tggtggagtt 780 tacctattgc cgcgaagagg tcctcgttta ggtgttcgag caactagaaa aacttctgaa 840 cgatcacaac ctcgtggaag acgacaacct attcctaagg ctcgtcagcc tgaaggtaga 900 gcttgggctc agcctggtta tccttggcct ctatatggta atgaaggaat gggttgggca 960 ggatggctac tatcacctcg tggttctcga cctagttggg gtgcaaatga ccctcgacga 1020 agatcacgta atttaggtaa ggtaattgat acacttacat gtggttttgc tgatcttatg 1080 ggatatattc cactagtagg tgctccacta ggtggagctg caagagttct tgcacatggt 1140 gtacgagttc ttgaagatgg agtgaactat gcaacaggta atcttcctgg atgttcattt 1200 tctatttttc tattagcttt gctatcatgt ctgactattc cagcttcagc tggcccggga 1260 gagaatctat attttcaagg gcccggcgga ggtagtcacc atcatcacca tcactaatga 1320 ccggt 1325 <210> 90 <211> 417 <212> PRT <213> artificial <220> <223> Amino acid sequence of fusion protein [SNAPlike-proTEV-C protein of HCV-proTEV-Histag] <400> 90 Arg Ser Asp Lys Asp Cys Glu Met Lys Arg Thr Thr Leu Asp 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encoding ssBiP- SNAPlike - MSP1(19) antigen from Plasmodium falciparum - proTEV - AMA-1(III) antigen from Plasmodium falciparum - Histag for expression in S2 cells <400> 91 atgaagttat gcatattact ggccgtcgtg gtggcctttg ttggcctctc gctcgggaga 60 tctagatctg acaaagactg cgaaatgaaa agaactacat tggattcacc acttgggaag 120 ttggaactga gtggatgcga gcaaggattg catgaaatta agctactggg aaaaggaact 180 tctgctgctg atgcagttga agttccagca ccagcagctg ttcttggagg tcctgagccc 240 ctcatgcaag ccacagcctg gcttaacgca tatttccacc agcctgaggc cattgaggaa 300 tttccagtcc ccgcccttca ccatcctgtg tttcagcagg agagcttcac ccgccaggtc 360 ctgtggaaat tgctgaaggt ggtcaagttt ggtgaagtga tttcatatca gcaacttgct 420 gcattggccg gtaaccccgc agctacagct gccgtgaaaa ctgctctcag cggaaatcct 480 gtgcccatcc tgatcccttg tcacagagtc gtttcatctt ccggagctgt aggtggctat 540 gaaggaggac tggcagttaa ggagtggctg ctggctcatg aaggtcatag acttggaaag 600 cctgggctgg gtcctgctgg tataggcgcg ccagggtccc taggtggcgg atccgaaaac 660 ctgtacttcc agagcgatat caaacaatgt ccacaaaatt ctggatgttt cagacattta 720 gatgaaagag aagaatgtaa atgtttatta aattacaaac aagaaggtga taaatgtgtt 780 gaaaatccaa atcttacttg taacgaaaat aatggtggat gtgatgcaga tgccaaatgt 840 accgaagaag attcaggcag caacggaaag aaaatcacat gtgaatgtac taaacctgat 900 tcttatccac ttttcgatgg tattttcgga ggtggctctg agaatctata ttttcaaggg 960 cccggtggag gcgaagttga aaacaatttt ccatgttcat tatataaaga tgaaataatg 1020 aaagaaatcg aaagagaatc aaaacgaatt aaattaaatg ataatgatga tgaagggaat 1080 aaaaaaatta tagctccaag aatttttatt tcagatgata aagacagttt aaaatgccca 1140 tgtgaccctg aaatggtaag taatagtaca tgtcgtttct ttgtatgtaa atgtgtagaa 1200 agaagggcag aagtaacatc aaataatgaa gttgtagtta aagaagaata taaagatgaa 1260 tatgcagata ttcctgaaca taaaccaact tatgataaaa tgctcccggg agagaatcta 1320 tattttcaag ggcccggcgg aggtagtcac catcatcacc atcactaatg accggt 1376 <210> 92 <211> 434 <212> PRT <213> artificial <220> <223> Amino acid sequence of fusion protein [SNAPlike-MSP1-proTEV-AMA1-Histag] <400> 92 Arg Ser Asp Lys Asp Cys Glu Met Lys Arg Thr Thr Leu Asp Ser Pro 1 5 10 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<211> 2195 <212> DNA <213> artificial <220> <223> DNA sequence encoding ssBiP- SNAPlike -proTEV- modified short form of HbpA from Leptospira interrogans serovar Lai str.56601 - proTEV- Histag for expression in S2 cells <400> 93 atgaagttat gcatattact ggccgtcgtg gtggcctttg ttggcctctc gctcgggaga 60 tctagatctg acaaagactg cgaaatgaaa agaactacat tggattcacc acttgggaag 120 ttggaactga gtggatgcga gcaaggattg catgaaatta agctactggg aaaaggaact 180 tctgctgctg atgcagttga agttccagca ccagcagctg ttcttggagg tcctgagccc 240 ctcatgcaag ccacagcctg gcttaacgca tatttccacc agcctgaggc cattgaggaa 300 tttccagtcc ccgcccttca ccatcctgtg tttcagcagg agagcttcac ccgccaggtc 360 ctgtggaaat tgctgaaggt ggtcaagttt ggtgaagtga tttcatatca gcaacttgct 420 gcattggccg gtaaccccgc agctacagct gccgtgaaaa ctgctctcag cggaaatcct 480 gtgcccatcc tgatcccttg tcacagagtc gtttcatctt ccggagctgt aggtggctat 540 gaaggaggac tggcagttaa ggagtggctg ctggctcatg aaggtcatag acttggaaag 600 cctgggctgg gtcctgctgg tataggcgcg ccagggtccc taggtggcgg atccgaaaac 660 ctgtacttcc agagcgatat cttcaacacc acggccaaca tgggcttcag gaacgagtac 720 gtgagcggcg cggtgtccgc aggttacaat aagaaccccg gctacaggtt ggtcccaaac 780 tctcaggcga ctactgggaa cgcctatcag gacttgaaca cgggcatcaa cctgaccttc 840 aacccggacg gcaagttcaa ggggaagacg aggattctct accagcacag ggaccagaac 900 ggggtggacg tgacccagtc caaggccgtc ttcgaccgga acaacaagac gcacgacttc 960 ttggcgacgg ggtcgttgga gtacgggtta gggaagagga acttgatctc cttcaggggg 1020 aacatctcca agtgggagaa caagtactac aacaaccaga gggggtcgga cgagttggac 1080 gtgaagcagt tgaactcgga gttgacgtcg caggggaccg tgcagttgga catggaggcc 1140 tctgagaagc acttcatcac tgtaggtgcg gagtccttcg cgaacgagtt ggagtcggac 1200 cgcttgcaga gcaggtacgt gtacaggacg aggaaggcgg tgttcttcca ggacgagtgg 1260 accgtgtccc ggtcgccgag gattcgggtg gtgccaggag tgaggtacga cgacgactcg 1320 cagttcggga accagacgac gccgaagctg gcggcccggt acgacatatt gcagaacttg 1380 gtgtggaggg cgagctacgg gaggggatta cggccgccga gcttgcagga gttgtacctg 1440 cggttcgaga acccggccgt gggttacgtg gtggagggta acccgaactt gaagccggag 1500 cggtcgatca cgatcaactc ggacttggag tacagcccgt tcagcttctt gacgttctcc 1560 ttgagcgtgt accggaacga catcatcaac ctgatccagt acaagttcga ctcgaacaag 1620 gggagggagt tcgcggagtt ccagctgcag aacatcgcga aggcgtacac gagaggagga 1680 gagttcggcg tgcagtacag gttcttgaag tacttcacgc tggagttggg gtacaaccac 1740 acggacacga gggacctgag ctcggacagg ccgttggagg gcagggcgct gcaccaggcg 1800 tcggcgaact tcatctacaa ctcgcccgga ggattccaat tcaacctgag gggcaagcac 1860 ttggacaaga ggccgttcta cagctcgacc aacaacctgt cggcggccgg acaggactac 1920 atccccagcg aggtgaagtt gaacgagaac ccgcccgtga tctacgggaa gccgttcacg 1980 atcttgaacg tgaggatcga gcagaagttc ttcaacaagc acttcgcgct gttcttgggc 2040 gtggacaact tgctcaacca gtacgagctg gcgtacaacc ccacgcggcc gaggttctac 2100 tacggcggct tctcggccca gttcccggga gagaatctat attttcaagg gcccggcgga 2160 ggtagtcacc atcatcacca tcactaatga ccggt 2195 <210> 94 <211> 707 <212> PRT <213> artificial <220> <223> Amino acid sequence of fusion protein [SNAPlike-proTEV-HbPA1-proTEV-Histag] <400> 94 Arg Ser Asp Lys Asp Cys Glu Met Lys Arg Thr 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cccgccaggt cctgtggaaa ttgctgaagg tggtcaagtt tggtgaagtg 480 atttcatatc agcaacttgc tgcattggcc ggtaaccccg cagctacagc tgccgtgaaa 540 actgctctca gcggaaatcc tgtgcccatc ctgatccctt gtcacagagt cgtttcatct 600 tccggagctg taggtggcta tgaaggagga ctggcagtta aggagtggct gctggctcat 660 gaaggtcata gacttggaaa gcctgggctg ggtcctgctg gtataggcgc gccagggtcc 720 ctaggtggcg gatccgaaaa cctgtacttc cagagcgata tcacggctga aggcatcaag 780 aagtttgaag gcgacggtta tgaactgttc aaggacaact tcccagctgg tgagaagttc 840 gataacgatg acaccaacga tcaattctac acggtaatct tcaagcacca tcgtggcccg 900 ggagagaatc tatattttca agggcccggc ggaggtagtc accatcatca ccatcactaa 960 tgaccggt 968 <210> 96 <211> 298 <212> PRT <213> artificial <220> <223> Amino acid sequence of fusion protein [SNAPlike-proTEV-MUB40-proTEV-Histag] <400> 96 Ser Arg Ala Ser Thr Met Lys Leu Cys Ile Leu Leu Ala Val Val Ala 1 5 10 15 Phe Val Gly Leu Ser Leu Pro Thr Ala Leu Ala Arg Ser Asp Lys Asp 20 25 30 Cys Glu Met Lys Arg Thr Thr Leu Asp Ser Pro Leu Gly Lys Leu Glu 35 40 45 Leu 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Asp Asn Asp Asp Thr Asn Asp Gln Phe Tyr Thr Val Ile 260 265 270 Phe Lys His His Arg Gly Pro Gly Glu Asn Leu Tyr Phe Gln Gly Pro 275 280 285 Gly Gly Gly Ser His His His His His His 290 295 <210> 97 <211> 1238 <212> DNA <213> artificial <220> <223> DNA sequence encoding ssBiP- SNAPlike -proTEV- soluble form of mouse C-type like lectin (CLEC5A) - proTEV- Histag for expression in S2 cells <400> 97 atgaagttat gcatattact ggccgtcgtg gtggcctttg ttggcctctc gctcgggaga 60 tctagatctg acaaagactg cgaaatgaaa agaactacat tggattcacc acttgggaag 120 ttggaactga gtggatgcga gcaaggattg catgaaatta agctactggg aaaaggaact 180 tctgctgctg atgcagttga agttccagca ccagcagctg ttcttggagg tcctgagccc 240 ctcatgcaag ccacagcctg gcttaacgca tatttccacc agcctgaggc cattgaggaa 300 tttccagtcc ccgcccttca ccatcctgtg tttcagcagg agagcttcac ccgccaggtc 360 ctgtggaaat tgctgaaggt ggtcaagttt ggtgaagtga tttcatatca gcaacttgct 420 gcattggccg gtaaccccgc agctacagct gccgtgaaaa ctgctctcag cggaaatcct 480 gtgcccatcc tgatcccttg tcacagagtc gtttcatctt ccggagctgt aggtggctat 540 gaaggaggac tggcagttaa ggagtggctg ctggctcatg aaggtcatag acttggaaag 600 cctgggctgg gtcctgctgg tataggcgcg ccagggtccc taggtggcgg atccgaaaac 660 ctgtacttcc agagcgatat cgtttttggc aaaagtaatg atggcttcgt ccccacggag 720 agctacggaa ccactagtgt gcagaatgtc tcacaaatct ttgggagaaa tgacgaaagt 780 accatgccta caaggagcta tggaacagtc tgtcccagaa actgggattt tcaccaagga 840 aaatgctttt tcttctcctt ctccgaatca ccttggaaag acagcatgga ttattgtgca 900 acacaagggt ccacactggc aattgtcaac actccagaga aactgaagta tcttcaggac 960 atagctggta ttgagaatta ctttattggt ttggtacgtc agcctggaga gaaaaagtgg 1020 cgctggatca acaactctgt gttcaatggc aatgttacca atcaggacca gaacttcgac 1080 tgtgtcacta taggtctgac gaagacatat gatgctgcat catgtgaagt cagctatcgc 1140 tggatctgcg aaatgaatgc caaaggcccg ggagagaatc tatattttca agggcccggc 1200 ggaggtagtc accatcatca ccatcactaa tgaccggt 1238 <210> 98 <211> 388 <212> PRT <213> artificial <220> <223> Amino acid sequence of fusion protein [SNAPlike-proTEV-moCLEC5A-proTEV-Histag] <400> 98 Arg Ser 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proTEV- Histag for expression in S2 cells <400> 99 atgaagttat gcatattact ggccgtcgtg gtggcctttg ttggcctctc gctcgggaga 60 tctagatctg acaaagactg cgaaatgaaa agaactacat tggattcacc acttgggaag 120 ttggaactga gtggatgcga gcaaggattg catgaaatta agctactggg aaaaggaact 180 tctgctgctg atgcagttga agttccagca ccagcagctg ttcttggagg tcctgagccc 240 ctcatgcaag ccacagcctg gcttaacgca tatttccacc agcctgaggc cattgaggaa 300 tttccagtcc ccgcccttca ccatcctgtg tttcagcagg agagcttcac ccgccaggtc 360 ctgtggaaat tgctgaaggt ggtcaagttt ggtgaagtga tttcatatca gcaacttgct 420 gcattggccg gtaaccccgc agctacagct gccgtgaaaa ctgctctcag cggaaatcct 480 gtgcccatcc tgatcccttg tcacagagtc gtttcatctt ccggagctgt aggtggctat 540 gaaggaggac tggcagttaa ggagtggctg ctggctcatg aaggtcatag acttggaaag 600 cctgggctgg gtcctgctgg tataggcgcg ccagggtccc taggtggcgg atccgaaaac 660 ctgtacttcc agagcgatat ctttaacaaa agtaacgatg gtttcaccac caccaggagc 720 tatggaacag tctcacagat ttttgggagc agttccccaa gtcccaacgg cttcattacc 780 acaaggagct atggaacagt ctgccccaaa 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ggtggtcaag tttggtgaag tgatttcata tcagcaactt 1380 gctgcattgg ccggtaaccc cgcagctaca gctgccgtga aaactgctct cagcggaaat 1440 cctgtgccca tcctgatccc ttgtcacaga gtcgtttcat cttccggagc tgtaggtggc 1500 tatgaaggag gactggcagt taaggagtgg ctgctggctc atgaaggtca tagacttgga 1560 aagcctgggc tgggtcctgc tggtataggc gcgccagggt ccctaggtgg cggatccgaa 1620 aacctgtact tccagagcga tatcggaggt ggaggcccgg gaggtggcgg aagtgactat 1680 aaagatgacg acgataagtg ataagcggcc gcaaaaccgg ttgagtttat ctgactaaat 1740 cttagtttgt attgtcatgt tttaatacaa tatgttatgt ttaaatatgt ttttaataaa 1800 ttttataaaa taatttcaac ttttattgta acaacattgt ccatttacac actcctttca 1860 agcgcgtgaa gcttggcgta atcatggtca tagctgtttc ctgtgtgaaa ttgttatccg 1920 ctcacaattc cacacaacat acgagccgga agcataaagt gtaaagcctg gggtgcctaa 1980 tgagtgagct aactcacatt aattgcgttg cgctcactgc ccgctttcca gtcgggaaac 2040 ctgtcgtgcc agctgcatta atgaatcggc caacgcgcgg ggagaggcgg tttgcgtatt 2100 gggcgctctt ccgcttcctc gctcactgac tcgctgcgct cggtcgttcg gctgcggcga 2160 gcggtatcag ctcactcaaa 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tatatatgag taaacttggt ctgacagtta ccaatgctta 3060 atcagtgagg cacctatctc agcgatctgt ctatttcgtt catccatagt tgcctgactc 3120 cccgtcgtgt agataactac gatacgggag ggcttaccat ctggccccag tgctgcaatg 3180 ataccgcgag acccacgctc accggctcca gatttatcag caataaacca gccagccgga 3240 agggccgagc gcagaagtgg tcctgcaact ttatccgcct ccatccagtc tattaattgt 3300 tgccgggaag ctagagtaag tagttcgcca gttaatagtt tgcgcaacgt tgttgccatt 3360 gctacaggca tcgtggtgtc acgctcgtcg tttggtatgg cttcattcag ctccggttcc 3420 caacgatcaa ggcgagttac atgatccccc atgttgtgca aaaaagcggt tagctccttc 3480 ggtcctccga tcgttgtcag aagtaagttg gccgcagtgt tatcactcat ggttatggca 3540 gcactgcata attctcttac tgtcatgcca tccgtaagat gcttttctgt gactggtgag 3600 tactcaacca agtcattctg agaatagtgt atgcggcgac cgagttgctc ttgcccggcg 3660 tcaatacggg ataataccgc gccacatagc agaactttaa aagtgctcat cattggaaaa 3720 cgttcttcgg ggcgaaaact ctcaaggatc ttaccgctgt tgagatccag ttcgatgtaa 3780 cccactcgtg cacccaactg atcttcagca tcttttactt tcaccagcgt ttctgggtga 3840 gcaaaaacag gaaggcaaaa 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ctgagctaaa ggtcgacgtc 1020 ccgaaaatag agcagcttac gggttaccaa caagctgcct tgaagtggag aaaagacata 1080 ggtttccgtg tcaatgccaa cacagcagct ctgagcaaca aagtcctcgc agaatacaaa 1140 gtccctggtg agattgtgat gtctgtcaaa gagatgctgt cagacatgat taggagaagg 1200 aacctgattc taaacagggg tggtgatgag aacccacgtg gcccagtgag ccatgagcat 1260 gtagactggt gcagggagtt tgtcaaaggc aaatacatca tggccttcaa cccaccatgg 1320 ggggacatca acaagtcagg ccgttcagga atagcacttg ttgcaacagg ccttgctaag 1380 cttgcagaga ctgaaggaaa gggaatattt gatgaagcca aaaagactgt ggaggccctc 1440 aacgggtatc tggacaagca taaggacgaa gttgatagag caagcgccga cagcatgata 1500 acaaaccttc ttaagcatat tgccaaggca caggagctct ataaaaattc atctgcactt 1560 cgtgcacaaa gcgcacagat tgacactgct ttcagctcat actattggct ttacaaggct 1620 ggcgtgactc ctgaaacctt cccgacggtg tcacagttcc tctttgagct agggaaacag 1680 ccaagaggta ccaagaaaat gaagaaggct cttctgagca ccccaatgaa gtgggggaag 1740 aagctttatg agctctttgc cgatgattct ttccagcaga acaggattta catgcatcct 1800 gccgtgctta cagctggtag aatcagtgaa atgggagtct gctttgggac aatccctgtg 1860 gccaatcctg atgatgctgc ccaaggatct ggacacacta agtctattct caacctccgt 1920 accaacactg agaccaataa tccgtgtgcc aaaaccatcg tcaagctatt tgaagttcaa 1980 aaaacagggt tcaacattca ggacatggac atagtggcct ctgagcactt gctacaccaa 2040 tcccttgttg gcaagcaatc cccattccag aacgcctaca acgtcaaggg caatgccacc 2100 agtgctaaca tcatcccggg agagaatcta tattttcaag ggcccggcgg aggtagtcac 2160 catcatcacc atcactaatg accggtgcgg ccgcaagctt 2200 <210> 109 <211> 707 <212> PRT <213> artificial <220> <223> Amino acid sequence of fusion protein [SNAPlike-proTEV1-CCHF.N-proTEV2-Histag] <400> 109 Arg Ser Asp Lys Asp Cys Glu Met Lys Arg Thr Thr Leu Asp Ser Pro 1 5 10 15 Leu Gly Lys Leu Glu Leu Ser Gly Cys Glu Gln Gly Leu His Glu Ile 20 25 30 Lys Leu Leu Gly Lys Gly Thr Ser Ala Ala Asp Ala Val Glu Val Pro 35 40 45 Ala Pro Ala Ala Val Leu Gly Gly Pro Glu Pro Leu Met Gln Ala Thr 50 55 60 Ala Trp Leu Asn Ala Tyr Phe His Gln Pro Glu Ala Ile Glu Glu Phe 65 70 75 80 Pro Val Pro Ala Leu His His Pro Val Phe Gln Gln Glu 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agtaaataat cttgagcatg gtcttttccc tcaactatcg 1620 gcaattgcac tcggagtcgc cacagcacac gggagtaccc tcgcaggagt aaatgttgga 1680 gaacagtatc aacaactcag agaggctgcc actgaggctg agaagcaact ccaacaatat 1740 gcagagtctc gcgaacttga ccatcttgga cttgatgatc aggaaaagaa aattcttatg 1800 aacttccatc agaaaaagaa cgaaatcagc ttccagcaaa caaacgctat ggtaactcta 1860 agaaaagagc gcctggccaa gctgacagaa gctatcactg ctgcgtcact gcccaaaaca 1920 agtggacatt acgatgatga tgacgacatt ccctttccag gacccatcaa tgatgacgac 1980 aatcctggcc atcaagatga tgatccgact gactcacagg atacgaccat tcccgatgtg 2040 gtggttgatc ccgatgatgg aagctacggc gaataccaga gttactcgga aaacggcatg 2100 aatgcaccag atgacttggt cctattcgat ctggacgagg acgacgagga cactaagcca 2160 gtgcctaata gatcgaccaa gggtggacaa cagaagaaca gtcaaaaggg ccagcatata 2220 gagggcagac agacacaatc caggccaatt caaaatgtcc caggccctca cagaacaatc 2280 caccacgcca gtgcgccact cacggacaat gacagaagaa atgaaccctc cggctcaacc 2340 agccctcgca tgctgacacc aattaacgaa gaggcagacc cactggacga tgccgacgac 2400 gagacgtcta gccttccgcc 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ttgtcccagt cacaacttgc taaaagatca 1080 gagatattga gaacactggg atttcaacag caagggactg ggggaaatgg tgtggtgagg 1140 atatgggatg ttaaagaccc ttcaaagcta aacaatcagt ttggctctgt tcctgcattg 1200 acaattgcat gcatgactgt tcaaggaggt gagacaatga acagtgtcat acaggcttta 1260 acctcacttg ggcttctata cactgtgaag tatccaaact taagtgacct tgacagactg 1320 actcaggaac atgactgcct tcagattgtg actaaagatg aaagctccat caatatttct 1380 ggttacaact tcagtctttc agctgcagta aaggctggag catctattct tgatggtgga 1440 aacatgttgg aaacaatcag agtcacccca gaaaacttct cttccctcat aaaatcaacc 1500 attcaggtta aacgaagaga aggcatgttt attgatgaga aaccaggcaa tagaaatcct 1560 tatgaaaacc ttttgtacaa actttgtctt tctggcgatg gttggcctta tattggttca 1620 agatcacaaa tcacaggcag gtcatgggac aacacaagta ttgatctgac aaggaaacca 1680 gttgctggtc ctagacagcc ggaaaaaaac ggtcagaatt tgagattggc taacttgaca 1740 gagatacaag aagctgtcat cagagaggca gtggggaaac tcgaccccac caacaccctt 1800 tggctcgaca ttgaaggacc agccactgac cctgttgaga tggcattatt ccaacctgca 1860 ggtaagcagt acattcactg cttcagaaaa ccacatgatg agaaagggtt taaaaatggt 1920 agcagacact ctcacggcat cttaatgaag gacatagaag atgcaatgcc aggagttctt 1980 agttacgtga tcggcttgct gcctccagac atggttgtga ctactcaagg ttccgatgac 2040 atcaggaagt tgtttgacct ccatggaaga agggatctta aactggttga tgttaagctc 2100 acatctgaac aagccaggca gtttgatcaa caggtctggg agaaatatgg tcacttatgc 2160 aaatatcaca atggagtggt tgtcaataag aaaaagaggg aaaaggatac tcccttcaag 2220 ttggcctcca gtgaaccaca ctgtgctctg ctagactgca taatgtttca gtcagtgcta 2280 gatgggaagc tctatgagga ggaacctaca cctctattac caccgagctt gctgttcctc 2340 ccgaaggcag cctatgcact cccgggagag aatctatatt ttcaagggcc cggcggaggt 2400 agtcaccatc atcaccatca ctaatgaccg gtgcggccgc aagctt 2446 <210> 117 <211> 789 <212> PRT <213> artificial <220> <223> Aa sequence of fusion protein [SNAPlike-proTEV1-JUN.N-proTEV2-Histag] <400> 117 Arg Ser Asp Lys Asp Cys Glu Met Lys Arg Thr Thr Leu Asp Ser Pro 1 5 10 15 Leu Gly Lys Leu Glu Leu Ser Gly Cys Glu Gln Gly Leu His Glu Ile 20 25 30 Lys Leu Leu Gly Lys Gly Thr Ser Ala Ala Asp Ala Val 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ccacatgatg agaagggctt caaaaatggc 1920 agcagacatt cacatggcat cttgatgcaa gacatcgagg atgcaatgcc aggagtatta 1980 agttatgtaa taggtttact accacaagat atggtgatta caactcaagg ttctgacgac 2040 ataaggaaac ttttagacat tcatggacgg aaggatttaa agctggtaga tgtgaaactc 2100 acatctgatc aagcaagact ctatgatcag caaatttggg agaagtttgg acatctttgc 2160 aaacatcata atggagttgt tgtcaacaag aaaaagagag aaaaagactc tccattcaaa 2220 ttgagttctg gtgaacctca ctgtgctctg ttggattgta tcatgtatca atcagtgatg 2280 gatggcaaaa tggtagatga agaaccagtg gcacttttac ctctcagcct tctatttcta 2340 cccaaggcag cctttgcact cccgggagag aatctatatt ttcaagggcc cggcggaggt 2400 agtcaccatc atcaccatca ctaatgaccg gtgcggccgc aagctt 2446 <210> 119 <211> 789 <212> PRT <213> artificial <220> <223> Amino acid sequence of fusion protein [SNAPlike-proTEV1-MAC.N-proTEV2-Histag] <400> 119 Arg Ser Asp Lys Asp Cys Glu Met Lys Arg Thr Thr Leu Asp Ser Pro 1 5 10 15 Leu Gly Lys Leu Glu Leu Ser Gly Cys Glu Gln Gly Leu His Glu Ile 20 25 30 Lys Leu Leu Gly Lys Gly Thr Ser Ala Ala Asp 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catgggaaac ttgacgcagt cacaattgga aaaaagagca 1080 gggattctta gaaccctggg attccaacaa caaagggggg ctgcaggtgg ggttgtcagg 1140 ttgtgggatg tatctgatcc ctccaaactg aataaccaat ttggttcaat gccagctctt 1200 accattgcct gcatgacagt tcagggagga gaaacaatga acaatgttgt gcaggcacta 1260 acatcacttg gtcttctcta cactgtcaaa tatcccaatc ttgatgacct ggaaaaacta 1320 actttagaac acgactgcct acagattata acaaaggatg agagtgcact caacatatct 1380 ggttataact tcagtctttc agctgctgta aaagctggtg catcacttat agatggtggc 1440 aacatgctgg agacaataaa agtcacaccc aacaacttct cttctattgt caaggccgca 1500 ttgaacgtca aaagaagaga aggcatgttc atagatgaga gaccgggcaa tagaaaccct 1560 tatgagaacc ttctctacaa gctgtgtttg tctggggagg gttggccata tattggatca 1620 aggtcacaaa tactcgggag gtcttgggac aacacaagtg tcgatttaaa tgcaagacct 1680 gtaacaggtc cccgagctcc tgaaaagaat ggacaaaata tcagactatc aaatctttct 1740 gaaatgcaag aagcgatcgt aaaggaagca atgaggaaat tagattcatc agacacaatc 1800 tggatggaca ttgaaggccc gccaactgat cctgtggagt tggcagtttt ccaaccttct 1860 tcaggaaact atgtacactg 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gttcttggag gtcctgagcc cctcatgcaa 240 gccacagcct ggcttaacgc atatttccac cagcctgagg ccattgagga atttccagtc 300 cccgcccttc accatcctgt gtttcagcag gagagcttca cccgccaggt cctgtggaaa 360 ttgctgaagg tggtcaagtt tggtgaagtg atttcatatc agcaacttgc tgcattggcc 420 ggtaaccccg cagctacagc tgccgtgaaa actgctctca gcggaaatcc tgtgcccatc 480 ctgatccctt gtcacagagt cgtttcatct tccggagctg taggtggcta tgaaggagga 540 ctggcagtta aggagtggct gctggctcat gaaggtcata gacttggaaa gcctgggctg 600 ggtcctgctg gtataggcgc gccagggtcc ctaggtggcg gatccgaaaa cctgtacttc 660 cagagcgata tcagcaactc aaaggaaatc cccagcttca gatggactca atccctgaga 720 agagggctca gtgagttcac aacacccgtg aagaccgatg ttctgaggga tgccaaaatg 780 atacttgatg gtcttgattt caatcaagtc tctcttgttc aaagaatcct tagaaagtct 840 aaaaggaatg atggtgatct tgataaactg agagacctaa ataaagaagt ggacaacctg 900 atgagcatga agagttccca aagagacaca atcttaaaac ttggtgatct caacaaatct 960 gaactgatgg atcttgcatc agacctggag aaactgaaaa gaaaagttgg acaaacagaa 1020 agatcagcct caggaggtgt gtacctggga aacctttccc aatcacagct caccaaaagg 1080 tctgatcttt taaggaaact tggttttcaa cagcagcaag tgaggtctcc aggggttgta 1140 aggatttggg acgtagctga tccgaacagg ctgaataatc aatttggatc tgtccctgca 1200 ctgacaatcg cttgtatgac taaacaaagt gacaatacca tgggggatgt tgttcaggca 1260 ctaacatctt tgggacttct ttatacagtt aagttcccca acctgattga cctagaaaaa 1320 cttacagcag aacatgactg tcttcaaata gtgactaaag atgagagcgg cttgaacatc 1380 tcaggatata actatagtct ttctgcagct gttaaagctg gtgcaacgct tctggatggt 1440 ggtaacatgc tggaaaccat aaggatcact cctgacaact tttctcagat cataaagaca 1500 accctatcca taaagaaaaa ggaaggcatg tttgtagatg agaaacctgg aaatagaaac 1560 ccttatgaaa accttctgta caaaatctgc ctttcaggag aaggttggcc ttacattggc 1620 tccagatccc agatcaaggg taggtcatgg gaaaacacca ctgttgattt aagcacaaag 1680 ccccaacaag ggccgagaac accagaaaag gcaggtcaga acattagact ctcccacttg 1740 actgagttgc aagagtcagt tgtgagagag gcaatgggta agattgaccc aactctgaca 1800 acatggattg acattgaggg taccagtaat gatccggttg aattagcatt gtaccaacca 1860 gacacaggta attatatcct ctgttatagg aaaccacatg atgagaaggg gttcaaaaat 1920 ggtagcaggc attcacatgg gatgttgcta aaggacctag aatctgcaca gccaggcttg 1980 ctcagctatg ttatagggct ccttcctcaa aacatggtcc tcaccaccca aggttcagat 2040 gatataaggc gcttagtaga tacacacggt cgcaaagact taaagattgt cgacattaaa 2100 ttggcatctg aacaggcgag aaagtttgag gagccaatct ggtcagattt tggtcacctc 2160 tgtaagaaac acaatggagt tattgtgcca aagaaaaaga aagacaaaga catcccacag 2220 tcctcagagc cacactgtgc cctacttgat tgtctaatgt ttcagtcagc catagcaggc 2280 caaccacctc aaaccaaact ggaaggttta ttgcctgatg cattgctctt cacactggag 2340 gcagcattca ccatcccggg agagaatcta tattttcaag ggcccggcgg aggtagtcac 2400 catcatcacc atcactaatg accggtgcgg ccgcaagctt 2440 <210> 123 <211> 787 <212> PRT <213> artificial <220> <223> Amino acid sequence of fusion protein [SNAPlike-proTEV1-SAB.N-proTEV2-Histag] <400> 123 Arg Ser Asp Lys Asp Cys Glu Met Lys Arg Thr Thr Leu Asp Ser Pro 1 5 10 15 Leu Gly Lys Leu Glu Leu Ser Gly Cys Glu Gln Gly Leu His Glu Ile 20 25 30 Lys Leu Leu Gly Lys Gly Thr Ser Ala Ala Asp Ala Val Glu Val 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catgcaagcc 240 acagcctggc ttaacgcata tttccaccag cctgaggcca ttgaggaatt tccagtcccc 300 gcccttcacc atcctgtgtt tcagcaggag agcttcaccc gccaggtcct gtggaaattg 360 ctgaaggtgg tcaagtttgg tgaagtgatt tcatatcagc aacttgctgc attggccggt 420 aaccccgcag ctacagctgc cgtgaaaact gctctcagcg gaaatcctgt gcccatcctg 480 atcccttgtc acagagtcgt ttcatcttcc ggagctgtag gtggctatga aggaggactg 540 gcagttaagg agtggctgct ggctcatgaa ggtcatagac ttggaaagcc tgggctgggt 600 cctgctggta taggcgcgcc aggaggtggc gggctggaaa aactcaagat gaagggtctt 660 acctatacaa tgtgcgacaa ggcaaagttc acgtggaaaa gagctcccac agacagtggg 720 cacgacacag ttgtcatgga agtcgctttc tctggaacaa agccttgcag aatacccgtc 780 agggctgtgg cacatggttc cccagatgtg gatgtggcca tgctcataac gccaaatcca 840 acaatcgaaa acaatggagg tggctttata gagatgcagc tccccccagg agacaacatc 900 atctatgttg gggaactaaa acaccagtgg ttccagaagg ggagtagcat tggcggaggt 960 ggccatcacc atcaccatca ctgatgaccg gt 992 <210> 125 <211> 310 <212> PRT <213> artificial <220> <223> Amino acid sequence of fusion protein [SNAPlike-OMSK.EDIII-Histag] <400> 125 Arg Ser Asp Lys Asp Cys Glu Met Lys Arg Thr Thr Leu Asp Ser Pro 1 5 10 15 Leu Gly Lys Leu Glu Leu Ser Gly Cys Glu Gln Gly Leu His Glu Ile 20 25 30 Lys Leu Leu Gly Lys Gly Thr Ser Ala Ala Asp Ala Val Glu Val Pro 35 40 45 Ala Pro Ala Ala Val Leu Gly Gly Pro Glu Pro Leu Met Gln Ala Thr 50 55 60 Ala Trp Leu Asn Ala Tyr Phe His Gln Pro Glu Ala Ile Glu Glu Phe 65 70 75 80 Pro Val Pro Ala Leu His His Pro Val Phe Gln Gln Glu Ser Phe Thr 85 90 95 Arg Gln Val Leu Trp Lys Leu Leu Lys Val Val Lys Phe Gly Glu Val 100 105 110 Ile Ser Tyr Gln Gln Leu Ala Ala Leu Ala Gly Asn Pro Ala Ala Thr 115 120 125 Ala Ala Val Lys Thr Ala Leu Ser Gly Asn Pro Val Pro Ile Leu Ile 130 135 140 Pro Cys His Arg Val Val Ser Ser Ser Gly Ala Val Gly Gly Tyr Glu 145 150 155 160 Gly Gly Leu Ala Val Lys Glu Trp Leu Leu Ala His Glu Gly His Arg 165 170 175 Leu Gly Lys Pro Gly Leu Gly Pro Ala Gly Ile Gly Ala Pro Gly Gly 180 185 190 Gly Gly Leu Glu Lys Leu Lys Met Lys Gly Leu Thr Tyr Thr Met 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ttaacgcata tttccaccag cctgaggcca ttgaggaatt tccagtcccc 300 gcccttcacc atcctgtgtt tcagcaggag agcttcaccc gccaggtcct gtggaaattg 360 ctgaaggtgg tcaagtttgg tgaagtgatt tcatatcagc aacttgctgc attggccggt 420 aaccccgcag ctacagctgc cgtgaaaact gctctcagcg gaaatcctgt gcccatcctg 480 atcccttgtc acagagtcgt ttcatcttcc ggagctgtag gtggctatga aggaggactg 540 gcagttaagg agtggctgct ggctcatgaa ggtcatagac ttggaaagcc tgggctgggt 600 cctgctggta taggcgcgcc aggaggtggc gggcttgaaa aacttaagat gaaagggatg 660 acatacacgg tttgtgaggg atcaaaattt gcttggaaaa ggccgccaac cgacagtgga 720 catgataccg tagtcatgga ggtgacttac accgggagca agccatgcag aataccagtg 780 agagccgtgg cccatggaga acccaatgtt aacgtggcaa gtctaataac cccaaaccca 840 tccatggaaa caactggagg agggttcgtt gagctacagc taccaccagg agacaacatc 900 atctatgttg gtgagctgag ccaccagtgg tttcagaagg gcagcacaat tggcggaggt 960 ggccatcacc atcaccatca ctgatgaccg gt 992 <210> 127 <211> 310 <212> PRT <213> artificial <220> <223> Amino acid sequence of fusion protein [SNAPlike-KYA.EDIII-Histag] <400> 127 Arg Ser Asp Lys Asp Cys Glu Met Lys Arg Thr Thr Leu Asp Ser Pro 1 5 10 15 Leu Gly Lys Leu Glu Leu Ser Gly Cys Glu Gln Gly Leu His Glu Ile 20 25 30 Lys Leu Leu Gly Lys Gly Thr Ser Ala Ala Asp Ala Val Glu Val Pro 35 40 45 Ala Pro Ala Ala Val Leu Gly Gly Pro Glu Pro Leu Met Gln Ala Thr 50 55 60 Ala Trp Leu Asn Ala Tyr Phe His Gln Pro Glu Ala Ile Glu Glu Phe 65 70 75 80 Pro Val Pro Ala Leu His His Pro Val Phe Gln Gln Glu Ser Phe Thr 85 90 95 Arg Gln Val Leu Trp Lys Leu Leu Lys Val Val Lys Phe Gly Glu Val 100 105 110 Ile Ser Tyr Gln Gln Leu Ala Ala Leu Ala Gly Asn Pro Ala Ala Thr 115 120 125 Ala Ala Val Lys Thr Ala Leu Ser Gly Asn Pro Val Pro Ile Leu Ile 130 135 140 Pro Cys His Arg Val Val Ser Ser Ser Gly Ala Val Gly Gly Tyr Glu 145 150 155 160 Gly Gly Leu Ala Val Lys Glu Trp Leu Leu Ala His Glu Gly His Arg 165 170 175 Leu Gly Lys Pro Gly Leu Gly Pro Ala Gly Ile Gly Ala Pro Gly Gly 180 185 190 Gly Gly Leu Glu Lys Leu Lys Met Lys Gly Met Thr Tyr Thr Val Cys 195 200 205 Glu Gly Ser Lys 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300 gcccttcacc atcctgtgtt tcagcaggag agcttcaccc gccaggtcct gtggaaattg 360 ctgaaggtgg tcaagtttgg tgaagtgatt tcatatcagc aacttgctgc attggccggt 420 aaccccgcag ctacagctgc cgtgaaaact gctctcagcg gaaatcctgt gcccatcctg 480 atcccttgtc acagagtcgt ttcatcttcc ggagctgtag gtggctatga aggaggactg 540 gcagttaagg agtggctgct ggctcatgaa ggtcatagac ttggaaagcc tgggctgggt 600 cctgctggta taggcgcgcc aggaggtggc gggcttgaaa aactcaagat gaaaggaatg 660 acatacacgg tctgtgaggg atcaaagttt gcttggaaga ggccgccaac cgacagtggg 720 catgacactg tggtcatgga agtgacttac actgggagca agccatgcag aataccagtg 780 agagccgtgg cccatggaga acctaatgtc aatgtagcta gcctgataac tccaaatcca 840 tccatggaga caactggagg aggtttcgtt gaactgcagc tgccaccagg agacaacatc 900 atctatgttg gtgagctgag tcaccagtgg tttcagaagg gtagtacaat aggcggaggt 960 ggccatcacc atcaccatca ctgatgaccg gt 992 <210> 129 <211> 310 <212> PRT <213> artificial <220> <223> Amino acid sequence of fusion protein [SNAPlike-ALK.EDIII-Histag] <400> 129 Arg Ser Asp Lys Asp Cys Glu Met Lys Arg Thr Thr Leu Asp Ser Pro 1 5 10 15 Leu Gly Lys Leu Glu Leu Ser Gly Cys Glu Gln Gly Leu His Glu Ile 20 25 30 Lys Leu Leu Gly Lys Gly Thr Ser Ala Ala Asp Ala Val Glu Val Pro 35 40 45 Ala Pro Ala Ala Val Leu Gly Gly Pro Glu Pro Leu Met Gln Ala Thr 50 55 60 Ala Trp Leu Asn Ala Tyr Phe His Gln Pro Glu Ala Ile Glu Glu Phe 65 70 75 80 Pro Val Pro Ala Leu His His Pro Val Phe Gln Gln Glu Ser Phe Thr 85 90 95 Arg Gln Val Leu Trp Lys Leu Leu Lys Val Val Lys Phe Gly Glu Val 100 105 110 Ile Ser Tyr Gln Gln Leu Ala Ala Leu Ala Gly Asn Pro Ala Ala Thr 115 120 125 Ala Ala Val Lys Thr Ala Leu Ser Gly Asn Pro Val Pro Ile Leu Ile 130 135 140 Pro Cys His Arg Val Val Ser Ser Ser Gly Ala Val Gly Gly Tyr Glu 145 150 155 160 Gly Gly Leu Ala Val Lys Glu Trp Leu Leu Ala His Glu Gly His Arg 165 170 175 Leu Gly Lys Pro Gly Leu Gly Pro Ala Gly Ile Gly Ala Pro Gly Gly 180 185 190 Gly Gly Leu Glu Lys Leu Lys Met Lys Gly Met Thr Tyr Thr Val Cys 195 200 205 Glu Gly Ser Lys Phe Ala Trp Lys Arg Pro Pro Thr Asp Ser Gly His 210 215 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cgatttcaat 360 gggggcaaga tcagtgtgca gtacaacctg agtcacagct acgctgggga tgcagccaac 420 cattgtggca ctgtggcaaa cggtgtgttg cagactttca tgaggatggc ttggggcggg 480 agctacatcg ctcttgactc aggccgtggc aactgggact gtatcatgac tagttaccaa 540 tacctgataa tccagaacac aacctgggaa gatcactgcc aattctccag accatctccc 600 atcggctacc tcgggctcct ctcacaaagg actagagata tttacatcag tagaagattg 660 ctgcggccgc acggcggagg tagcaaagac tgcgaaatga agcgcaccac cctggatagc 720 cctctgggca agctggaact gtctgggtgc gaacagggcc tgcacgagat caagctgctg 780 ggcaaaggaa catctgccgc cgacgccgtg gaagtgcctg ccccagccgc cgtgctgggc 840 ggaccagagc cactgatgca ggccaccgcc tggctcaacg cctactttca ccagcctgag 900 gccatcgagg agttccctgt gccagccctg caccacccag tgttccagca ggagagcttt 960 acccgccagg tgctgtggaa actgctgaaa gtggtgaagt tcggagaggt catcagctac 1020 cagcagctgg ccgccctggc cggcaatccc gccgccaccg ccgccgtgaa aaccgccctg 1080 agcggaaatc ccgtgcccat tctgatcccc tgccaccggg tggtgtctag ctctggcgcc 1140 gtggggggct acgagggcgg gctcgccgtg aaagagtggc tgctggccca cgagggccac 1200 agactgggca agcctgggct gggtcctgca ggtataggcg cgccagggtc cctggagcat 1260 catcatcatc atcattgatg acgggccc 1288 <210> 131 <211> 407 <212> PRT <213> artificial <220> <223> Amino acid sequence of fusion protein [LAS.ectoGP1- SNAPlike-Histag] <400> 131 Arg Ser Thr Ser Leu Tyr Lys Gly Val Tyr Glu Leu Gln Thr Leu Glu 1 5 10 15 Leu Asn Met Glu Thr Leu Asn Met Thr Met Pro Leu Ser Cys Thr Lys 20 25 30 Asn Asn Ser His His Tyr Ile Met Val Gly Asn Glu Thr Gly Leu Glu 35 40 45 Leu Thr Leu Thr Asn Thr Ser Ile Ile Asn His Lys Phe Cys Asn Leu 50 55 60 Ser Asp Ala His Lys Lys Asn Leu Tyr Asp His Ala Leu Met Ser Ile 65 70 75 80 Ile Ser Thr Phe His Leu Ser Ile Pro Asn Phe Asn Gln Tyr Glu Ala 85 90 95 Met Ser Cys Asp Phe Asn Gly Gly Lys Ile Ser Val Gln Tyr Asn Leu 100 105 110 Ser His Ser Tyr Ala Gly Asp Ala Ala Asn His Cys Gly Thr Val Ala 115 120 125 Asn Gly Val Leu Gln Thr Phe Met Arg Met Ala Trp Gly Gly Ser Tyr 130 135 140 Ile Ala Leu Asp Ser Gly Arg Gly Asn Trp Asp Cys Ile Met Thr Ser 145 150 155 160 Tyr 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ggcctctcca atgtccactc gaccacgtca acacattaca cttccttaca 600 agaggcaaga acattcagct tccaaggagg tccttgaagc ggccgcacgg cggaggtagc 660 aaagactgcg aaatgaagcg caccaccctg gatagccctc tgggcaagct ggaactgtct 720 gggtgcgaac agggcctgca cgagatcaag ctgctgggca aaggaacatc tgccgccgac 780 gccgtggaag tgcctgcccc agccgccgtg ctgggcggac cagagccact gatgcaggcc 840 accgcctggc tcaacgccta ctttcaccag cctgaggcca tcgaggagtt ccctgtgcca 900 gccctgcacc acccagtgtt ccagcaggag agctttaccc gccaggtgct gtggaaactg 960 ctgaaagtgg tgaagttcgg agaggtcatc agctaccagc agctggccgc cctggccggc 1020 aatcccgccg ccaccgccgc cgtgaaaacc gccctgagcg gaaatcccgt gcccattctg 1080 atcccctgcc accgggtggt gtctagctct ggcgccgtgg ggggctacga gggcgggctc 1140 gccgtgaaag agtggctgct ggcccacgag ggccacagac tgggcaagcc tgggctgggt 1200 cctgcaggta taggcgcgcc agggtccctg gagcatcatc atcatcatca ttgatgacgg 1260 gccc 1264 <210> 133 <211> 399 <212> PRT <213> artificial <220> <223> Amino acid sequence of fusion protein [JUN.ectoGP1- SNAPlike-Histag] <400> 133 Arg Ser Glu Glu 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virus- SNAPlike-Histag for expression in S2 cells <400> 134 atgaagttat gcatattact ggccgtcgtg gcctttgttg gcctctcgct cgggagatct 60 gacggcacat tcaagatcgg cctgcacacg gagttccagt cagtcaccct caccatgcag 120 agacttttgg ctaaccattc aaacgagctc ccgtctctct gcatgctgaa caacagtttc 180 tattatatga ggggaggtgt gaacaccttc ctgatccgtg tttctgatat ttcagtcctc 240 atgaaggagt acgatgtatc aatctacgag ccagaggacc tcggaaactg tctgaacaag 300 tctgactcaa gctgggctat ccattggttc tcaaacgctt tgggacatga ctggctgatg 360 gaccctccaa tgctctgtag aaacaagaca aagaaggagg gatctaacat ccaattcaac 420 atcagcaagg ctgatgatgc cagagtgtat ggaaagaaga tcagaaacgg tatgaggcat 480 ctcttcaggg gcttccatga cccgtgtgag gaagggaagg tgtgctacct gaccatcaac 540 cagtgtggtg accccagttc cttcgactac tgtggcgtga accatctgtc caagtgtcag 600 ttcgaccatg tgaacaccct gcatttcctg gtgagaagta agacacatct caacttcgag 660 aggtctttga agcggccgca cggcggaggt agcaaagact gcgaaatgaa gcgcaccacc 720 ctggatagcc ctctgggcaa gctggaactg tctgggtgcg aacagggcct gcacgagatc 780 aagctgctgg gcaaaggaac atctgccgcc gacgccgtgg aagtgcctgc cccagccgcc 840 gtgctgggcg gaccagagcc actgatgcag gccaccgcct ggctcaacgc ctactttcac 900 cagcctgagg ccatcgagga gttccctgtg ccagccctgc accacccagt gttccagcag 960 gagagcttta cccgccaggt gctgtggaaa ctgctgaaag tggtgaagtt cggagaggtc 1020 atcagctacc agcagctggc cgccctggcc ggcaatcccg ccgccaccgc cgccgtgaaa 1080 accgccctga gcggaaatcc cgtgcccatt ctgatcccct gccaccgggt ggtgtctagc 1140 tctggcgccg tggggggcta cgagggcggg ctcgccgtga aagagtggct gctggcccac 1200 gagggccaca gactgggcaa gcctgggctg ggtcctgcag gtataggcgc gccagggtcc 1260 ctggagcatc atcatcatca tcattgatga cgggccc 1297 <210> 135 <211> 410 <212> PRT <213> artificial <220> <223> Amino acid sequence of fusion protein [MAC.ectoGP1- SNAPlike-Histag] <400> 135 Arg Ser Asp Gly Thr Phe Lys Ile Gly Leu His Thr Glu Phe Gln Ser 1 5 10 15 Val Thr Leu Thr Met Gln Arg Leu Leu Ala Asn His Ser Asn Glu Leu 20 25 30 Pro Ser Leu Cys Met Leu Asn Asn Ser Phe Tyr Tyr Met Arg Gly Gly 35 40 45 Val Asn Thr Phe Leu Ile Arg Val Ser Asp Ile Ser Val 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catgaattgc cttcgctgtg tagggtcaac aactcctaca gtctgatcag gctctcccat 180 aacagtaacc aggcattgtc ggttgagtac gtggatgtgc accctgtcct ctgttcgtcc 240 agtccaacca tcctcgacaa ctacacgcaa tgtatcaagg gctcgccaga gttcgattgg 300 attctcgggt ggacgatcaa gggattggga catgacttct tgagagatcc aagaatctgc 360 tgtgagccta agaagacgac taacgctgag ttcacgttcc aattgaactt gacggatagt 420 cctgagaccc atcactacag gagcaagatt gaggtaggca tccgacactt gttcgggaac 480 tacatcacca acgatagcta ctcgaagatg tccgtggtta tgaggaacac cacctgggaa 540 ggtcaatgct cgaacagtca tgtgaacacg ctgagattcc tcgttaagaa cgcaggttac 600 ctcgttggaa ggaagccact gcggccgcac ggcggaggta gcaaagactg cgaaatgaag 660 cgcaccaccc tggatagccc tctgggcaag ctggaactgt ctgggtgcga acagggcctg 720 cacgagatca agctgctggg caaaggaaca tctgccgccg acgccgtgga agtgcctgcc 780 ccagccgccg tgctgggcgg accagagcca ctgatgcagg ccaccgcctg gctcaacgcc 840 tactttcacc agcctgaggc catcgaggag ttccctgtgc cagccctgca ccacccagtg 900 ttccagcagg agagctttac ccgccaggtg ctgtggaaac tgctgaaagt ggtgaagttc 960 ggagaggtca tcagctacca gcagctggcc gccctggccg gcaatcccgc cgccaccgcc 1020 gccgtgaaaa ccgccctgag cggaaatccc gtgcccattc tgatcccctg ccaccgggtg 1080 gtgtctagct ctggcgccgt ggggggctac gagggcgggc tcgccgtgaa agagtggctg 1140 ctggcccacg agggccacag actgggcaag cctgggctgg gtcctgcagg tataggcgcg 1200 ccagggtccc tggagcatca tcatcatcat cattgatgac gggccc 1246 <210> 137 <211> 393 <212> PRT <213> artificial <220> <223> Amino acid sequence of fusion protein [GUA.ectoGP1- SNAPlike-Histag] <400> 137 Arg Ser Phe Lys Val Gly His His Thr Asn Phe Glu Ser Phe Thr Val 1 5 10 15 Lys Leu Gly Gly Val Phe His Glu Leu Pro Ser Leu Cys Arg Val Asn 20 25 30 Asn Ser Tyr Ser Leu Ile Arg Leu Ser His Asn Ser Asn Gln Ala Leu 35 40 45 Ser Val Glu Tyr Val Asp Val His Pro Val Leu Cys Ser Ser Ser Pro 50 55 60 Thr Ile Leu Asp Asn Tyr Thr Gln Cys Ile Lys Gly Ser Pro Glu Phe 65 70 75 80 Asp Trp Ile Leu Gly Trp Thr Ile Lys Gly Leu Gly His Asp Phe Leu 85 90 95 Arg Asp Pro Arg Ile Cys Cys Glu Pro Lys Lys Thr Thr Asn Ala Glu 100 105 110 Phe Thr Phe Gln 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atcactgagg ggttcgggtc ccacgggttc gaagatacca tcctccagag actcggggtt 480 ctgttcggtt cgagaattgc attctcgaac atccaggact tgggtaagaa gaggttcttg 540 ttgatcagga actcgacttg gaagaaccaa tgcgagatga accatgtgaa ctccatgcac 600 ttgatgttgg cgaacgctgg tcgctcgtcc ggttcgagaa gaccactgcg gccgcacggc 660 ggaggtagca aagactgcga aatgaagcgc accaccctgg atagccctct gggcaagctg 720 gaactgtctg ggtgcgaaca gggcctgcac gagatcaagc tgctgggcaa aggaacatct 780 gccgccgacg ccgtggaagt gcctgcccca gccgccgtgc tgggcggacc agagccactg 840 atgcaggcca ccgcctggct caacgcctac tttcaccagc ctgaggccat cgaggagttc 900 cctgtgccag ccctgcacca cccagtgttc cagcaggaga gctttacccg ccaggtgctg 960 tggaaactgc tgaaagtggt gaagttcgga gaggtcatca gctaccagca gctggccgcc 1020 ctggccggca atcccgccgc caccgccgcc gtgaaaaccg ccctgagcgg aaatcccgtg 1080 cccattctga tcccctgcca ccgggtggtg tctagctctg gcgccgtggg gggctacgag 1140 ggcgggctcg ccgtgaaaga gtggctgctg gcccacgagg gccacagact gggcaagcct 1200 gggctgggtc ctgcaggtat aggcgcgcca gggtccctgg agcatcatca tcatcatcat 1260 tgatgacggg ccc 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gggcaaagga acatctgccg ccgacgccgt ggaagtgcct 720 gccccagccg ccgtgctggg cggaccagag ccactgatgc aggccaccgc ctggctcaac 780 gcctactttc accagcctga ggccatcgag gagttccctg tgccagccct gcaccaccca 840 gtgttccagc aggagagctt tacccgccag gtgctgtgga aactgctgaa agtggtgaag 900 ttcggagagg tcatcagcta ccagcagctg gccgccctgg ccggcaatcc cgccgccacc 960 gccgccgtga aaaccgccct gagcggaaat cccgtgccca ttctgatccc ctgccaccgg 1020 gtggtgtcta gctctggcgc cgtggggggc tacgagggcg ggctcgccgt gaaagagtgg 1080 ctgctggccc acgagggcca cagactgggc aagcctgggc tgggtcctgc aggtataggc 1140 gcgccagggt ccctggagca tcatcatcat catcattgat gacgggccc 1189 <210> 141 <211> 374 <212> PRT <213> artificial <220> <223> Amino acid sequence of fusion protein [LAS.ectoGP2- SNAPlike-Histag] <400> 141 Arg Ser Gly Thr Phe Thr Trp Thr Leu Ser Asp Ser Glu Gly Lys Asp 1 5 10 15 Thr Pro Gly Gly Tyr Cys Leu Thr Arg Trp Met Leu Ile Glu Ala Glu 20 25 30 Leu Lys Cys Phe Gly Asn Thr Ala Val Ala Lys Cys Asn Glu Lys His 35 40 45 Asp Glu Glu Phe Cys Asp Met Leu Arg Leu 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gaacgatgag actaagaagc aagtgaacct gatggggcag 300 acaatcaacg ccctgatctc ggacaacttg ttgatgaaga acaagatcag ggaactgatg 360 agtgtccctt actgcaacta cacgaagttc tggtacgtca accacacact ctccggacaa 420 cactcgttgc caaggtgctg gttgatcaag aacaacagct acttgaacat ctccgacttc 480 cgtaacgact ggatcttgga gagtgacttc ttgatctccg agatgctgag caaggagtac 540 tcggacaggc agggtaagac tccgcggccg cacggcggag gtagcaaaga ctgcgaaatg 600 aagcgcacca ccctggatag ccctctgggc aagctggaac tgtctgggtg cgaacagggc 660 ctgcacgaga tcaagctgct gggcaaagga acatctgccg ccgacgccgt ggaagtgcct 720 gccccagccg ccgtgctggg cggaccagag ccactgatgc aggccaccgc ctggctcaac 780 gcctactttc accagcctga ggccatcgag gagttccctg tgccagccct gcaccaccca 840 gtgttccagc aggagagctt tacccgccag gtgctgtgga aactgctgaa agtggtgaag 900 ttcggagagg tcatcagcta ccagcagctg gccgccctgg ccggcaatcc cgccgccacc 960 gccgccgtga aaaccgccct gagcggaaat cccgtgccca ttctgatccc ctgccaccgg 1020 gtggtgtcta gctctggcgc cgtggggggc tacgagggcg ggctcgccgt gaaagagtgg 1080 ctgctggccc acgagggcca cagactgggc 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ctgtcaacat gttgactcac 300 tcgatcaaca gtctgatctc cgataacttg ttgatgagga acaagctgaa ggagattttg 360 aaggtcccat actgcaacta cacaagattc tggtacatca accacacgaa gtccggcgag 420 cactcgctgc ctcggtgttg gctggtcagt aacggttcct acttgaacga gagtgacttc 480 aggaacgagt ggatcttgga gagtgatcac ctgatcgcag agatgttgag caaggaatac 540 caagataggc aggggaagac tccgcggccg cacggcggag gtagcaaaga ctgcgaaatg 600 aagcgcacca ccctggatag ccctctgggc aagctggaac tgtctgggtg cgaacagggc 660 ctgcacgaga tcaagctgct gggcaaagga acatctgccg ccgacgccgt ggaagtgcct 720 gccccagccg ccgtgctggg cggaccagag ccactgatgc aggccaccgc ctggctcaac 780 gcctactttc accagcctga ggccatcgag gagttccctg tgccagccct gcaccaccca 840 gtgttccagc aggagagctt tacccgccag gtgctgtgga aactgctgaa agtggtgaag 900 ttcggagagg tcatcagcta ccagcagctg gccgccctgg ccggcaatcc cgccgccacc 960 gccgccgtga aaaccgccct gagcggaaat cccgtgccca ttctgatccc ctgccaccgg 1020 gtggtgtcta gctctggcgc cgtggggggc tacgagggcg ggctcgccgt gaaagagtgg 1080 ctgctggccc acgagggcca cagactgggc aagcctgggc tgggtcctgc 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<211> 1189 <212> DNA <213> artificial <220> <223> DNA sequence encoding ssBiP-Glycoprotein GP2 from Sabia virus- SNAPlike-Histag for expression in S2 cells <400> 148 atgaagttat gcatattact ggccgtcgtg gcctttgttg gcctctcgct cgggagatct 60 ggcatcttct cctggacgat cacggatgca gtgggcaacg acatgcctgg tggttactgt 120 ctggagagat ggatgctggt gacgtcggat cttaagtgct tcggcaacac ggcactggcg 180 aagtgtaacc tcgaccacga ttcggagttc tgtgacatgt tgaagttgtt cgagttcaac 240 aagaaggcga tcgagacatt gaacgacaac acgaagaaca aggtgaactt gctgacccac 300 tcgatcaacg cattgatctc cgacaacttg ctgatgaaga accgactcaa ggaattgttg 360 aacacgcctt actgtaacta caccaagttc tggtatgtca accacacggc atccggggag 420 cactcattgc cacggtgctg gctggttagg aacaatagct acttgaacga gagtgagttc 480 aggaatgatt ggatcatcga gagtgatcac ttgttgtccg agatgctcaa caaggaatac 540 atcgatagac agggcaagac gccgcggccg cacggcggag gtagcaaaga ctgcgaaatg 600 aagcgcacca ccctggatag ccctctgggc aagctggaac tgtctgggtg cgaacagggc 660 ctgcacgaga tcaagctgct gggcaaagga acatctgccg ccgacgccgt ggaagtgcct 720 gccccagccg ccgtgctggg cggaccagag ccactgatgc aggccaccgc ctggctcaac 780 gcctactttc accagcctga ggccatcgag gagttccctg tgccagccct gcaccaccca 840 gtgttccagc aggagagctt tacccgccag gtgctgtgga aactgctgaa agtggtgaag 900 ttcggagagg tcatcagcta ccagcagctg gccgccctgg ccggcaatcc cgccgccacc 960 gccgccgtga aaaccgccct gagcggaaat cccgtgccca ttctgatccc ctgccaccgg 1020 gtggtgtcta gctctggcgc cgtggggggc tacgagggcg ggctcgccgt gaaagagtgg 1080 ctgctggccc acgagggcca cagactgggc aagcctgggc tgggtcctgc aggtataggc 1140 gcgccagggt ccctggagca tcatcatcat catcattgat gacgggccc 1189 <210> 149 <211> 374 <212> PRT <213> artificial <220> <223> Amino acid sequence of fusion protein [SAB.ectoGP2- SNAPlike-Histag] <400> 149 Arg Ser Gly Ile Phe Ser Trp Thr Ile Thr Asp Ala Val Gly Asn Asp 1 5 10 15 Met Pro Gly Gly Tyr Cys Leu Glu Arg Trp Met Leu Val Thr Ser Asp 20 25 30 Leu Lys Cys Phe Gly Asn Thr Ala Leu Ala Lys Cys Asn Leu Asp His 35 40 45 Asp Ser Glu Phe Cys Asp Met Leu Lys Leu Phe Glu Phe Asn Lys Lys 50 55 60 Ala Ile Glu Thr Leu Asn Asp Asn Thr Lys Asn Lys Val Asn Leu Leu 65 70 75 80 Thr His Ser Ile Asn Ala Leu Ile Ser Asp Asn Leu Leu Met Lys Asn 85 90 95 Arg Leu Lys Glu Leu Leu Asn Thr Pro Tyr Cys Asn Tyr Thr Lys Phe 100 105 110 Trp Tyr Val Asn His Thr Ala Ser Gly Glu His Ser Leu Pro Arg Cys 115 120 125 Trp Leu Val Arg Asn Asn Ser Tyr Leu Asn Glu Ser Glu Phe Arg Asn 130 135 140 Asp Trp Ile Ile Glu Ser Asp His Leu Leu Ser Glu Met Leu Asn Lys 145 150 155 160 Glu Tyr Ile Asp Arg Gln Gly Lys Thr Pro Arg Pro His Gly Gly Gly 165 170 175 Ser Lys Asp Cys Glu Met Lys Arg Thr Thr Leu Asp Ser Pro Leu Gly 180 185 190 Lys Leu Glu Leu Ser Gly Cys Glu Gln Gly Leu His Glu Ile Lys Leu 195 200 205 Leu Gly Lys Gly Thr Ser Ala Ala Asp Ala Val Glu Val Pro Ala Pro 210 215 220 Ala Ala Val Leu Gly Gly Pro Glu Pro Leu Met Gln Ala Thr Ala Trp 225 230 235 240 Leu Asn Ala Tyr Phe His Gln Pro Glu Ala Ile Glu Glu Phe Pro Val 245 250 255 Pro Ala Leu His His Pro Val Phe Gln Gln Glu Ser Phe Thr Arg Gln 260 265 270 Val Leu Trp Lys Leu Leu Lys Val Val Lys Phe Gly Glu Val Ile Ser 275 280 285 Tyr Gln Gln Leu Ala Ala Leu Ala Gly Asn Pro Ala Ala Thr Ala Ala 290 295 300 Val Lys Thr Ala Leu Ser Gly Asn Pro Val Pro Ile Leu Ile Pro Cys 305 310 315 320 His Arg Val Val Ser Ser Ser Gly Ala Val Gly Gly Tyr Glu Gly Gly 325 330 335 Leu Ala Val Lys Glu Trp Leu Leu Ala His Glu Gly His Arg Leu Gly 340 345 350 Lys Pro Gly Leu Gly Pro Ala Gly Ile Gly Ala Pro Gly Ser Leu Glu 355 360 365 His His His His His His 370 <210> 150 <211> 2774 <212> DNA <213> artificial <220> <223> DNA sequence encoding BiPlike- SNAPlike-proTEV1-C protein of Hepatitis E virus- proTEV2-Histag for expression in S2 cells <400> 150 atgaaactat gtattctact tgcagttgtt gcgttcgtag gattgtcctt acctacagct 60 ctggcaagat ctgacaaaga ctgcgaaatg aaaagaacta cattggattc accacttggg 120 aagttggaac tgagtggatg cgagcaagga ttgcatgaaa ttaagctact gggaaaagga 180 acttctgctg ctgatgcagt tgaagttcca gcaccagcag ctgttcttgg aggtcctgag 240 cccctcatgc aagccacagc ctggcttaac gcatatttcc accagcctga ggccattgag 300 gaatttccag tccccgccct tcaccatcct gtgtttcagc aggagagctt cacccgccag 360 gtcctgtgga aattgctgaa ggtggtcaag tttggtgaag tgatttcata tcagcaactt 420 gctgcattgg ccggtaaccc cgcagctaca gctgccgtga aaactgctct cagcggaaat 480 cctgtgccca tcctgatccc ttgtcacaga gtcgtttcat cttccggagc tgtaggtggc 540 tatgaaggag gactggcagt taaggagtgg ctgctggctc atgaaggtca tagacttgga 600 aagcctgggc tgggtcctgc tggtataggc gcgccagggt ccctaggtgg cggatccgaa 660 aacctgtact tccagagcga tatcaataac atgttctttt gctctgtgca tggagatgcc 720 accatgcgct ctcgggcttt tctgtttttg ttcctcgtgt ttctgcctat gctgcccgcg 780 ccaccggccg gtcagccgtc tggccgccgc cgcgggcggc gcagcggcgg tgccggcggt 840 ggtttctggg gtgaccggat tgattctcag cccttcgccc tcccctatat tcatccaacc 900 aaccccttcg cacctgacat tccagccgca gccggggctg gagctcgccc tcggcagcca 960 gcccgcccac tcggctccgc ttggcgtgac caatcccagc gccccgccac ttccgcccgt 1020 cgtcgatctg ccccagctgg ggcttcgccg ctgactgctg tggccccggc ccccgatact 1080 gttcctgttc ccgatgtcga ttctcgcggc gctatattac gccgccagta taatttatca 1140 acatccccgc taacatctac tattgccact ggtactaacc ttgttctata tgctgctccg 1200 ctgagccctt tgcttccgct ccaagatgga actaacactc acattatggc cactgaagca 1260 tcaaattatg cccagtaccg tgttgtccgc gctaccatcc ggtaccgtcc gcttgtgccg 1320 aacgctgtcg gcggatacgc tatatctatc tctttctggc ctcagacaac tactaccccg 1380 acatctgtgg acatgaactc tatcacctcc acggatgtcc gaatccttgt ccagcctggt 1440 attgcttcag aacttgtgat ccccagtgag cgcctgcatt atcgtaacca aggctggcgc 1500 tctgttgaga cctctggtgt tgcggaggag gaggcgacct ccggccttgt catgctttgc 1560 atccacggat cacctgtaaa ttcttacacc aatacgcctt atactggtgc ccttggcttg 1620 cttgatttcg cactcgagct cgagttccgc aatttgacac ctggtaacac gaacacacgt 1680 gtttcccgct actcgagtag tgcgcgccac aagctacgcc gagggcctga tggcactgct 1740 gagttaacta cgactgctgc tacacgcttt atgaaggacc ttcattttac agggactaat 1800 ggagttggtg aagtcggtcg tggtatagcg ctaactctgt tcaaccttgc tgatacgctt 1860 ctcggcgggc tcccgacaga attgatttcg tcggctggtg gtcagctatt ttattctcgc 1920 cccgtcgtct cagccaatgg cgagccgacg gtgaagctct acacttcagt cgagaacgct 1980 cagcaggata agggtatagc tatcccacat gatattgatc ttggtgagtc ccgtgttgtc 2040 attcaggatt atgataacca acatgagcag gatcgtccca ccccttctcc tgctccctct 2100 cggccttttt ctgtccttcg tgctaatgat gtgctatggc tttcacttac agcagctgag 2160 tatgatcaga ctacctatgg ctcctctact aatcccatgt atgtctctga taccgtgaca 2220 tttgtcaatg ttgctactgg tgcccagggg gtatctcgct ctctggactg gtctaaagtc 2280 acccttgatg ggcgcccact tatgactatc cagcagtatt ctaagacttt ctttgttctg 2340 cccctccgtg gcaagctctc cttctgggag gccggtacca ctaaggccgg ctacccttat 2400 aattataata ctactgccag tgaccagatt ttaattgaga atgcagctgg tcaccgtgta 2460 tgcatctcaa cctacactac taatcttgga tctggccctg tttctatttc tgctgtcggt 2520 gtcctcgcac ctcactctgc gttggccgct ttagaggaca ctgttgacta tcctgctcgt 2580 gctcacactt ttgatgattt ctgccctgag tgccgtacac tcggccttca gggttgtgct 2640 ttccaatcaa ctgttgctga gctacagcgt cttaaaatga aggtgggtaa aactcgggag 2700 tacccgggag agaatctata ttttcaaggg cccggcggag gtagtcacca tcatcaccat 2760 cactaatgac cggt 2774 <210> 151 <211> 899 <212> PRT <213> artificial <220> <223> Aa sequence of fusion protein [SNAPlike-proTEV1-HEV.C-proTEV2-Histag] <400> 151 Arg Ser Asp Lys Asp Cys Glu Met Lys Arg Thr Thr Leu Asp Ser Pro 1 5 10 15 Leu Gly Lys Leu Glu Leu Ser Gly Cys Glu Gln Gly Leu His Glu Ile 20 25 30 Lys Leu Leu Gly Lys Gly Thr Ser Ala Ala Asp Ala Val Glu Val Pro 35 40 45 Ala Pro Ala Ala Val Leu Gly Gly Pro Glu Pro Leu Met Gln Ala Thr 50 55 60 Ala Trp Leu Asn Ala Tyr Phe His Gln Pro Glu Ala Ile Glu Glu Phe 65 70 75 80 Pro Val Pro Ala Leu His His Pro Val Phe Gln Gln Glu Ser Phe Thr 85 90 95 Arg Gln Val Leu Trp Lys Leu Leu Lys Val Val Lys Phe Gly Glu Val 100 105 110 Ile Ser Tyr Gln Gln Leu Ala Ala Leu Ala Gly Asn Pro Ala Ala Thr 115 120 125 Ala Ala Val Lys Thr Ala Leu Ser Gly Asn Pro Val Pro Ile Leu Ile 130 135 140 Pro Cys His Arg Val Val Ser Ser Ser Gly Ala Val Gly Gly Tyr Glu 145 150 155 160 Gly Gly Leu Ala Val Lys Glu Trp Leu Leu Ala His Glu Gly His Arg 165 170 175 Leu Gly Lys Pro Gly Leu Gly Pro Ala Gly Ile Gly Ala Pro Gly Ser 180 185 190 Leu Gly Gly Gly Ser Glu Asn Leu Tyr Phe Gln Ser Asp Ile Asn Asn 195 200 205 Met Phe Phe Cys Ser Val His Gly Asp Ala Thr Met Arg Ser Arg Ala 210 215 220 Phe Leu Phe Leu Phe Leu Val Phe Leu Pro Met Leu Pro Ala Pro Pro 225 230 235 240 Ala Gly Gln Pro Ser Gly Arg Arg Arg Gly Arg Arg Ser Gly Gly Ala 245 250 255 Gly Gly Gly Phe Trp Gly Asp Arg Ile Asp Ser Gln Pro Phe Ala Leu 260 265 270 Pro Tyr Ile His Pro Thr Asn Pro Phe Ala Pro Asp Ile Pro Ala Ala 275 280 285 Ala Gly Ala Gly Ala Arg Pro Arg Gln Pro Ala Arg Pro Leu Gly Ser 290 295 300 Ala Trp Arg Asp Gln Ser Gln Arg Pro Ala Thr Ser Ala Arg Arg Arg 305 310 315 320 Ser Ala Pro Ala Gly Ala Ser Pro Leu Thr Ala Val Ala Pro Ala Pro 325 330 335 Asp Thr Val Pro Val Pro Asp Val Asp Ser Arg Gly Ala Ile Leu Arg 340 345 350 Arg Gln Tyr Asn Leu Ser Thr Ser Pro Leu Thr Ser Thr Ile Ala Thr 355 360 365 Gly Thr Asn Leu Val Leu Tyr Ala Ala Pro Leu Ser Pro Leu Leu Pro 370 375 380 Leu Gln Asp Gly Thr Asn Thr His Ile Met Ala Thr Glu Ala Ser Asn 385 390 395 400 Tyr Ala Gln Tyr Arg Val Val Arg Ala Thr Ile Arg Tyr Arg Pro Leu 405 410 415 Val Pro Asn Ala Val Gly Gly Tyr Ala Ile Ser Ile Ser Phe Trp Pro 420 425 430 Gln Thr Thr Thr Thr Pro Thr Ser Val Asp Met Asn Ser Ile Thr Ser 435 440 445 Thr Asp Val Arg Ile Leu Val Gln Pro Gly Ile Ala Ser Glu Leu Val 450 455 460 Ile Pro Ser Glu Arg Leu His Tyr Arg Asn Gln Gly Trp Arg Ser Val 465 470 475 480 Glu Thr Ser Gly Val Ala Glu Glu Glu Ala Thr Ser Gly Leu Val Met 485 490 495 Leu Cys Ile His Gly Ser Pro Val Asn Ser Tyr Thr Asn Thr Pro Tyr 500 505 510 Thr Gly Ala Leu Gly Leu Leu Asp Phe Ala Leu Glu Leu Glu Phe Arg 515 520 525 Asn Leu Thr Pro Gly Asn Thr Asn Thr Arg Val Ser Arg Tyr Ser Ser 530 535 540 Ser Ala Arg His Lys Leu Arg Arg Gly Pro Asp Gly Thr Ala Glu Leu 545 550 555 560 Thr Thr Thr Ala Ala Thr Arg Phe Met Lys Asp Leu His Phe Thr Gly 565 570 575 Thr Asn Gly Val Gly Glu Val Gly Arg Gly Ile Ala Leu Thr Leu Phe 580 585 590 Asn Leu Ala Asp Thr Leu Leu Gly Gly Leu Pro Thr Glu Leu Ile Ser 595 600 605 Ser Ala Gly Gly Gln Leu Phe Tyr Ser Arg Pro Val Val Ser Ala Asn 610 615 620 Gly Glu Pro Thr Val Lys Leu Tyr Thr Ser Val Glu Asn Ala Gln Gln 625 630 635 640 Asp Lys Gly Ile Ala Ile Pro His Asp Ile Asp Leu Gly Glu Ser Arg 645 650 655 Val Val Ile Gln Asp Tyr Asp Asn Gln His Glu Gln Asp Arg Pro Thr 660 665 670 Pro Ser Pro Ala Pro Ser Arg Pro Phe Ser Val Leu Arg Ala Asn Asp 675 680 685 Val Leu Trp Leu Ser Leu Thr Ala Ala Glu Tyr Asp Gln Thr Thr Tyr 690 695 700 Gly Ser Ser Thr Asn Pro Met Tyr Val Ser Asp Thr Val Thr Phe Val 705 710 715 720 Asn Val Ala Thr Gly Ala Gln Gly Val Ser Arg Ser Leu Asp Trp Ser 725 730 735 Lys Val Thr Leu Asp Gly Arg Pro Leu Met Thr Ile Gln Gln Tyr Ser 740 745 750 Lys Thr Phe Phe Val Leu Pro Leu Arg Gly Lys Leu Ser Phe Trp Glu 755 760 765 Ala Gly Thr Thr Lys Ala Gly Tyr Pro Tyr Asn Tyr Asn Thr Thr Ala 770 775 780 Ser Asp Gln Ile Leu Ile Glu Asn Ala Ala Gly His Arg Val Cys Ile 785 790 795 800 Ser Thr Tyr Thr Thr Asn Leu Gly Ser Gly Pro Val Ser Ile Ser Ala 805 810 815 Val Gly Val Leu Ala Pro His Ser Ala Leu Ala Ala Leu Glu Asp Thr 820 825 830 Val Asp Tyr Pro Ala Arg Ala His Thr Phe Asp Asp Phe Cys Pro Glu 835 840 845 Cys Arg Thr Leu Gly Leu Gln Gly Cys Ala Phe Gln Ser Thr Val Ala 850 855 860 Glu Leu Gln Arg Leu Lys Met Lys Val Gly Lys Thr Arg Glu Tyr Pro 865 870 875 880 Gly Glu Asn Leu Tyr Phe Gln Gly Pro Gly Gly Gly Ser His His His 885 890 895 His His His <210> 152 <211> 51 <212> DNA <213> artificial <220> <223> DNA encoding biPlike sequence <400> 152 atgaaactat gtattctact tgcagttgtt gcgttcgtag gattgtcctt a 51 <210> 153 <211> 17 <212> PRT <213> artificial <220> <223> Amino acid of BIPlike sequence <400> 153 Met Lys Leu Cys Ile Leu Leu Ala Val Val Ala Phe Val Gly Leu Ser 1 5 10 15 Leu <210> 154 <211> 2047 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> nucleotide sequence of a SNAP construct containing the SARS virus N gene <400> 154 tcgcgagcta gcaccatgaa actatgtatt ctacttgcag ttgttgcgtt cgtaggattg 60 tccttaccta cagctctggc aagatctgac aaagactgcg aaatgaaaag aactacattg 120 gattcaccac ttgggaagtt ggaactgagt ggatgcgagc aaggattgca tgaaattaag 180 ctactgggaa aaggaacttc tgctgctgat gcagttgaag ttccagcacc agcagctgtt 240 cttggaggtc ctgagcccct catgcaagcc acagcctggc ttaacgcata tttccaccag 300 cctgaggcca ttgaggaatt tccagtcccc gcccttcacc atcctgtgtt tcagcaggag 360 agcttcaccc gccaggtcct gtggaaattg ctgaaggtgg tcaagtttgg tgaagtgatt 420 tcatatcagc aacttgctgc attggccggt aaccccgcag ctacagctgc cgtgaaaact 480 gctctcagcg gaaatcctgt gcccatcctg atcccttgtc acagagtcgt ttcatcttcc 540 ggagctgtag gtggctatga aggaggactg gcagttaagg agtggctgct ggctcatgaa 600 ggtcatagac ttggaaagcc tgggctgggt cctgctggta taggcgcgcc agggtcccta 660 ggtggcggat ccgaaaacct gtacttccag agcgatatct ctgataatgg accccaatca 720 aaccaacgta gtgcccctcg cattacattt ggtggaccta cagattcaac tgacaataac 780 cagaatggag gtcgcaatgg tgcaaggcca aagcagcgcc gacctcaagg tttacctaat 840 aatactgcgt cttggttcac agctctcact cagcatggca aggaggaact tagattccct 900 cgaggccagg gcgttccaat caacaccaat agtggtccag atgaccaaat tggctactac 960 cgaagagcta cccgacgagt tcgtggtggt gacggcaaaa tgaaggagct cagccctaga 1020 tggtacttct attacctagg aactggccca gaagcctcac ttccttacgg cgctaacaag 1080 gaaggcatcg tatgggttgc aactgaggga gccttgaata cacctaagga ccacattggc 1140 acccgcaatc ctaataacaa tgctgccacc gtgctacaac ttcctcaagg aacaacattg 1200 cctaagggct tctacgcaga gggaagcaga ggcggcagtc aagcctcttc tcgctcctca 1260 tcacgtagtc gcggtaattc aagaaattca actcctggca gcagtagggg aaattctcct 1320 gctcgaatgg ccagcggagg tggtgaaact gccctcgcgc tattgctgct agacagattg 1380 aaccagcttg agagcaaagt ttctggtaag ggccagcaac agcagggcca aactgtcact 1440 aagaagtctg ctgctgaggc atctaagaag cctcgccaaa agcgtactgc cacaaagcag 1500 tacaacgtca ctcaagcatt cggcagacgt ggtccagaac agacccaggg aaatttcggt 1560 gaccaagacc taatcagaca gggaactgat tacaagcatt ggccgcagat tgcacagttc 1620 gctccaagtg cctctgcatt cttcggaatg tcacgcattg gcatggaagt cacaccttcg 1680 ggaacatggc tgacttatca tggagccatt aagttggatg acaaggaccc acagttcaag 1740 gacaacgtca tactgctgaa caagcacatt gacgcataca aaacattccc accaacagag 1800 cctaagaagg acaagaagaa gaagactgat gaagctcagc ctttgccgca gagacaaaag 1860 aagcagccca ctgtgactct tcttcctgcg gctgacatgg atgatttctc cagacaactt 1920 cagaattcca tgagtggagc ttctgctgat tcaactcagg ccccgggaga gaatctatat 1980 tttcaagggc ccggcggagg tagtcaccat catcaccatc actaatgacc ggtgcggccg 2040 caagctt 2047 <210> 155 <211> 674 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Amino acid sequence of a SNAP construct containing the SARS virus N gene <400> 155 Ser Arg Ala Ser Thr Met Lys Leu Cys Ile Leu Leu Ala Val Val Ala 1 5 10 15 Phe Val Gly Leu Ser Leu Pro Thr Ala Leu Ala Arg Ser Asp Lys Asp 20 25 30 Cys Glu Met Lys Arg Thr Thr Leu Asp Ser Pro Leu Gly Lys Leu Glu 35 40 45 Leu Ser Gly Cys Glu Gln Gly Leu His Glu Ile Lys Leu Leu Gly Lys 50 55 60 Gly Thr Ser Ala Ala Asp Ala Val Glu Val Pro Ala Pro Ala Ala Val 65 70 75 80 Leu Gly Gly Pro Glu Pro Leu Met Gln Ala Thr Ala Trp Leu Asn Ala 85 90 95 Tyr Phe His Gln Pro Glu Ala Ile Glu Glu Phe Pro Val Pro Ala Leu 100 105 110 His His Pro Val Phe Gln Gln Glu Ser Phe Thr Arg Gln Val Leu Trp 115 120 125 Lys Leu Leu Lys Val Val Lys Phe Gly Glu Val Ile Ser Tyr Gln Gln 130 135 140 Leu Ala Ala Leu Ala Gly Asn Pro Ala Ala Thr Ala Ala Val Lys Thr 145 150 155 160 Ala Leu Ser Gly Asn Pro Val Pro Ile Leu Ile Pro Cys His Arg Val 165 170 175 Val Ser Ser Ser Gly Ala Val Gly Gly Tyr Glu Gly Gly Leu Ala Val 180 185 190 Lys Glu Trp Leu Leu Ala His Glu Gly His Arg Leu Gly Lys Pro Gly 195 200 205 Leu Gly Pro Ala Gly Ile Gly Ala Pro Gly Ser Leu Gly Gly Gly Ser 210 215 220 Glu Asn Leu Tyr Phe Gln Ser Asp Ile Ser Asp Asn Gly Pro Gln Ser 225 230 235 240 Asn Gln Arg Ser Ala Pro Arg Ile Thr Phe Gly Gly Pro Thr Asp Ser 245 250 255 Thr Asp Asn Asn Gln Asn Gly Gly Arg Asn Gly Ala Arg Pro Lys Gln 260 265 270 Arg Arg Pro Gln Gly Leu Pro Asn Asn Thr Ala Ser Trp Phe Thr Ala 275 280 285 Leu Thr Gln His Gly Lys Glu Glu Leu Arg Phe Pro Arg Gly Gln Gly 290 295 300 Val Pro Ile Asn Thr Asn Ser Gly Pro Asp Asp Gln Ile Gly Tyr Tyr 305 310 315 320 Arg Arg Ala Thr Arg Arg Val Arg Gly Gly Asp Gly Lys Met Lys Glu 325 330 335 Leu Ser Pro Arg Trp Tyr Phe Tyr Tyr Leu Gly Thr Gly Pro Glu Ala 340 345 350 Ser Leu Pro Tyr Gly Ala Asn Lys Glu Gly Ile Val Trp Val Ala Thr 355 360 365 Glu Gly Ala Leu Asn Thr Pro Lys Asp His Ile Gly Thr Arg Asn Pro 370 375 380 Asn Asn Asn Ala Ala Thr Val Leu Gln Leu Pro Gln Gly Thr Thr Leu 385 390 395 400 Pro Lys Gly Phe Tyr Ala Glu Gly Ser Arg Gly Gly Ser Gln Ala Ser 405 410 415 Ser Arg Ser Ser Ser Arg Ser Arg Gly Asn Ser Arg Asn Ser Thr Pro 420 425 430 Gly Ser Ser Arg Gly Asn Ser Pro Ala Arg Met Ala Ser Gly Gly Gly 435 440 445 Glu Thr Ala Leu Ala Leu Leu Leu Leu Asp Arg Leu Asn Gln Leu Glu 450 455 460 Ser Lys Val Ser Gly Lys Gly Gln Gln Gln Gln Gly Gln Thr Val Thr 465 470 475 480 Lys Lys Ser Ala Ala Glu Ala Ser Lys Lys Pro Arg Gln Lys Arg Thr 485 490 495 Ala Thr Lys Gln Tyr Asn Val Thr Gln Ala Phe Gly Arg Arg Gly Pro 500 505 510 Glu Gln Thr Gln Gly Asn Phe Gly Asp Gln Asp Leu Ile Arg Gln Gly 515 520 525 Thr Asp Tyr Lys His Trp Pro Gln Ile 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ggaactgagt ggatgcgagc aaggattgca tgaaattaag 180 ctactgggaa aaggaacttc tgctgctgat gcagttgaag ttccagcacc agcagctgtt 240 cttggaggtc ctgagcccct catgcaagcc acagcctggc ttaacgcata tttccaccag 300 cctgaggcca ttgaggaatt tccagtcccc gcccttcacc atcctgtgtt tcagcaggag 360 agcttcaccc gccaggtcct gtggaaattg ctgaaggtgg tcaagtttgg tgaagtgatt 420 tcatatcagc aacttgctgc attggccggt aaccccgcag ctacagctgc cgtgaaaact 480 gctctcagcg gaaatcctgt gcccatcctg atcccttgtc acagagtcgt ttcatcttcc 540 ggagctgtag gtggctatga aggaggactg gcagttaagg agtggctgct ggctcatgaa 600 ggtcatagac ttggaaagcc tgggctgggt cctgctggta taggcgcgcc agggtcccta 660 ggtggcggat ccgaaaacct gtacttccag agcgatatca ccaacctctg tcctttcggt 720 gaagtgttta acgccactaa gttccccagc gtttacgctt gggagcgtaa gaaaatctca 780 aattgcgtgg ccgactactc tgtgctctac aacagcactt tcttttccac cttcaagtgt 840 tacggagttt ccgctacaaa gctgaacgac ctgtgcttca gcaacgtgta cgctgatagc 900 tttgtggtca agggagacga tgttcgccag attgcccctg gacagaccgg cgttatcgct 960 gactacaact ataaactgcc agacgatttc 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attctaacat aactatcact tatcaaggtc tttttcccta tcagggagac 240 catggtgata tgtatgttta ctctgcagga catgctacag gcacaactcc acaaaagttg 300 tttgtagcta actattctca ggacgtcaaa cagtttgcta atgggtttgt cgtccgtata 360 ggagcagctg ccaattccac tggcactgtt attattagcc catctaccag cgctactata 420 cgaaaaattt accctgcttt tatgctgggt tcttcagttg gtaatttctc agatggtaaa 480 atgggccgct tcttcaatca tactctagtt cttttgcccg atggatgtgg cactttactt 540 agagcttttt attgtattct agagcctcgc tctggaaatc attgtcctgc tggcaattcc 600 tatacttctt ttgccactta tcacactcct gcaacagatt gttctgatgg caattacaat 660 cgtaatgcca gtctgaactc ttttaaggag tattttaatt tacgtaactg cacctttatg 720 tacacttata acattaccga agatgagatt ttagagtggt ttggcattac acaaactgct 780 caaggtgttc acctcttctc atctcggtat gttgatttgt acggcggcaa tatgtttcaa 840 tttgccacct tgcctgttta tgatactatt aagtattatt ctatcattcc tcacagtatt 900 cgttctatcc aaagtgatag aaaggcttgg gctgccttct acgtatataa acttcaaccg 960 ttaactttcc tgttggattt ttctgttgat ggttatatac gcagagctat agactgtggt 1020 tttaatgatt tgtcacaact 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catgcaagcc acagcctggc ttaacgcata tttccaccag 300 cctgaggcca ttgaggaatt tccagtcccc gcccttcacc atcctgtgtt tcagcaggag 360 agcttcaccc gccaggtcct gtggaaattg ctgaaggtgg tcaagtttgg tgaagtgatt 420 tcatatcagc aacttgctgc attggccggt aaccccgcag ctacagctgc cgtgaaaact 480 gctctcagcg gaaatcctgt gcccatcctg atcccttgtc acagagtcgt ttcatcttcc 540 ggagctgtag gtggctatga aggaggactg gcagttaagg agtggctgct ggctcatgaa 600 ggtcatagac ttggaaagcc tgggctgggt cctgctggta taggcgcgcc agggtcccta 660 ggtggcggat ccgaaaacct gtacttccag agcgatatcg gagctgagct tcctattgag 720 gagttaagtg atgcaaagaa ctcgatcaca agagctaagt ctgcaggtgc tgaaaagtat 780 gctccttcag agttagagga ggcccgtaag aacttactca cagctcatca gaaggcttcg 840 gaggagaatc ttacagagac taagaagtcc gcgttgtatg caagagcaaa ggctttagac 900 gcttccgaga agtccttccc ttcttctgtt gatgatgcac gtaaggagtc cagctcttca 960 atcgagtctg cagaggaggc ctatgcttct cagcttgctt ctgagcctta taatacttct 1020 gtacagcttc gcaaggaggg tgattctcta cgcgagactg ctgaccgcac tttagagtcg 1080 tatccgaagg agtccggaga tgacgcaaag 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taccccagaa 1020 gaaaaatcaa tgccacattg gtttgatact tggattcgtg tagaaagaat gtcggcgatt 1080 atgcctgacc aaatcgccaa agctgcgaaa gcaaaaccag ttcaaaaatt ggacgatgat 1140 gatgatggtg acgatactta taaagaagag agacacaaca agtacaactc tcttactaga 1200 atcaagatcc ctaatcctcc aaaatctttt gacgatctga aaaacatcga cactaaaaaa 1260 cttttagtaa gaggtcttta cagaatttct ttcactacct acaaaccagg tgaagtgaaa 1320 ggatctttcg ttgcatctgt tggtctgctt ttcccaccag gtattccagg tgtgagcccg 1380 ctgatccact caaatcctga agaattgcaa aaacaagcta tcgctgcccc gggagagaat 1440 ctatattttc aagggcccgg cggaggtagt caccatcatc accatcacta atgaccggtg 1500 cggccgcaag ctt 1513 <210> 169 <211> 496 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Amino acid sequence of a SNAP construct containing the LipL32 gene of Leptospirosis. <400> 169 Ser Arg Ala Ser Thr Met Lys Leu Cys Ile Leu Leu Ala Val Val Ala 1 5 10 15 Phe Val Gly Leu Ser Leu Pro Thr Ala Leu Ala Arg Ser Asp Lys Asp 20 25 30 Cys Glu Met Lys Arg Thr Thr Leu Asp Ser Pro Leu Gly Lys Leu Glu 35 40 45 Leu Ser Gly 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ttcagaactt gtgatcccca gtgagcgcct gcattatcgt 1500 aaccaaggct ggcgctctgt tgagacctct ggtgttgcgg aggaggaggc gacctccggc 1560 cttgtcatgc tttgcatcca cggatcacct gtaaattctt acaccaatac gccttatact 1620 ggtgcccttg gcttgcttga tttcgcactc gagctcgagt tccgcaattt gacacctggt 1680 aacacgaaca cacgtgtttc ccgctactcg agtagtgcac gacacaagct acgccgagga 1740 cctgatggca ctgctgagtt aactacgact gctgctacac gctttatgaa ggaccttcat 1800 tttacaggga ctaatggagt tggtgaagtc ggtcgtggta tagcgctaac tctgttcaac 1860 cttgctgata cgcttctcgg tggactcccg acagaattga tttcgtcggc tggtggtcag 1920 ctattctatt ctcgccccgt cgtctcagcc aatggcgagc caacggtgaa gctctacact 1980 tcagtcgaga acgctcagca ggataagggt atagctatcc cacatgatat tgatcttggt 2040 gagtcccgtg ttgtcattca ggattatgat aaccaacatg agcaggatcg tccaactcct 2100 tctcctgctc catctcgacc tttatctgtc cttcgtgcta atgatgtgct atggctttca 2160 cttacagcag ctgagtatga tcagactacc tatggctcct ctactaatcc aatgtatgtc 2220 tctgataccg tgacatttgt caatgttgct actggtgccc agggtgtatc tcgctctctg 2280 gactggtcta aagtcaccct 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actcgagctc gagttccgca atttgacacc tggtaacacg 1440 aacacacgtg tttcccgcta ctcgagtagt gcacgacaca agctacgccg aggacctgat 1500 ggcactgctg agttaactac gactgctgct acacgcttta tgaaggacct tcattttaca 1560 gggactaatg gagttggtga agtcggtcgt ggtatagcgc taactctgtt caaccttgct 1620 gatacgcttc tcggtggact cccgacagaa ttgatttcgt cggctggtgg tcagctattc 1680 tattctcgcc ccgtcgtctc agccaatggc gagccaacgg tgaagctcta cacttcagtc 1740 gagaacgctc agcaggataa gggtatagct atcccacatg atattgatct tggtgagtcc 1800 cgtgttgtca ttcaggatta tgataaccaa catgagcagg atcgtccaac tccttctcct 1860 gctccatctc gacctttatc tgtccttcgt gctaatgatg tgctatggct ttcacttaca 1920 gcagctgagt atgatcagac tacctatggc tcctctacta atccaatgta tgtctctgat 1980 accgtgacat ttgtcaatgt tgctactggt gcccagggtg tatctcgctc tctggactgg 2040 tctaaagtca cccttgatgg acgaccactt atgactatcc agcagtattc taagactttc 2100 tttgttctgc cactacgtgg caagctctcc ttctgggagg ccggtaccac taaggccggc 2160 tacccttata attataatac tactgccagt gaccagattt taattgagaa tgcagctggt 2220 caccgtgtat gcatctcaac 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Gly Gln Leu Phe 545 550 555 560 Tyr Ser Arg Pro Val Val Ser Ala Asn Gly Glu Pro Thr Val Lys Leu 565 570 575 Tyr Thr Ser Val Glu Asn Ala Gln Gln Asp Lys Gly Ile Ala Ile Pro 580 585 590 His Asp Ile Asp Leu Gly Glu Ser Arg Val Val Ile Gln Asp Tyr Asp 595 600 605 Asn Gln His Glu Gln Asp Arg Pro Thr Pro Ser Pro Ala Pro Ser Arg 610 615 620 Pro Leu Ser Val Leu Arg Ala Asn Asp Val Leu Trp Leu Ser Leu Thr 625 630 635 640 Ala Ala Glu Tyr Asp Gln Thr Thr Tyr Gly Ser Ser Thr Asn Pro Met 645 650 655 Tyr Val Ser Asp Thr Val Thr Phe Val Asn Val Ala Thr Gly Ala Gln 660 665 670 Gly Val Ser Arg Ser Leu Asp Trp Ser Lys Val Thr Leu Asp Gly Arg 675 680 685 Pro Leu Met Thr Ile Gln Gln Tyr Ser Lys Thr Phe Phe Val Leu Pro 690 695 700 Leu Arg Gly Lys Leu Ser Phe Trp Glu Ala Gly Thr Thr Lys Ala Gly 705 710 715 720 Tyr Pro Tyr Asn Tyr Asn Thr Thr Ala Ser Asp Gln Ile Leu Ile Glu 725 730 735 Asn Ala Ala Gly His Arg Val Cys Ile Ser Thr Tyr Thr Thr Asn Leu 740 745 750 Gly Ser Gly Pro Val Ser Ile Ser Ala Val Gly Val Leu Ala Pro His 755 760 765 Ser Ala Pro Gly Glu Asn Leu Tyr Phe Gln Gly Pro Gly Gly Gly Ser 770 775 780 His His His His His His 785 790 <210> 174 <211> 1195 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Nucleotide sequence of a SNAP construct containing the C gene of Hepatitis C <400> 174 tcgcgagcta gcaccatgaa actatgtatt ctacttgcag ttgttgcgtt cgtaggattg 60 tccttaccta cagctctggc aagatctgac aaagactgcg aaatgaaaag aactacattg 120 gattcaccac ttgggaagtt ggaactgagt ggatgcgagc aaggattgca tgaaattaag 180 ctactgggaa aaggaacttc tgctgctgat gcagttgaag ttccagcacc agcagctgtt 240 cttggaggtc ctgagcccct catgcaagcc acagcctggc ttaacgcata tttccaccag 300 cctgaggcca ttgaggaatt tccagtcccc gcccttcacc atcctgtgtt tcagcaggag 360 agcttcaccc gccaggtcct gtggaaattg ctgaaggtgg tcaagtttgg tgaagtgatt 420 tcatatcagc aacttgctgc attggccggt aaccccgcag ctacagctgc cgtgaaaact 480 gctctcagcg gaaatcctgt gcccatcctg atcccttgtc acagagtcgt ttcatcttcc 540 ggagctgtag gtggctatga aggaggactg gcagttaagg agtggctgct ggctcatgaa 600 ggtcatagac ttggaaagcc tgggctgggt cctgctggta taggcgcgcc agggtcccta 660 ggtggcggat ccgaaaacct gtacttccag agcgatatcg gagtttacct attgccgcga 720 agaggtcctc gtttaggtgt tcgagcaact agaaagactt ctgaacgatc acaacctcgt 780 ggaagacgac aacctatttt taaggctcgt cgtcctgaag gtagaactat ggctcagcct 840 ggttatccta tgcctctata tggtaatgaa ggatgcggta atgcaggaat gctactatca 900 cctcgtggtt ctcgacctag ttggggtcct actgaccctc gacgaagatc acgtaattta 960 ggtagagtaa ttgatacact tacatgtggt tttgctgatc ttatgggata tattccacta 1020 gtaggtgctc cactaggtgg agctgcaaga gctcttgcac atggtgtacg agttcttgaa 1080 gatggagtga actatgcaac aggtaatctc ccgggagaga atctatattt tcaagggccc 1140 ggcggaggta gtcaccatca tcaccatcac taatgaccgg tgcggccgca agctt 1195 <210> 175 <211> 390 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Amino acid sequence of a SNAP construct containing the C gene of Hepatitis C. <400> 175 Ser Arg Ala Ser Thr Met Lys Leu Cys Ile Leu Leu Ala Val Val Ala 1 5 10 15 Phe Val Gly Leu Ser Leu Pro Thr Ala Leu Ala Arg Ser Asp Lys Asp 20 25 30 Cys Glu Met Lys Arg Thr Thr Leu Asp Ser Pro Leu Gly Lys Leu Glu 35 40 45 Leu Ser Gly Cys Glu Gln Gly Leu His Glu Ile Lys Leu Leu Gly Lys 50 55 60 Gly Thr Ser Ala Ala Asp Ala Val Glu Val Pro Ala Pro Ala Ala Val 65 70 75 80 Leu Gly Gly Pro Glu Pro Leu Met Gln Ala Thr Ala Trp Leu Asn Ala 85 90 95 Tyr Phe His Gln Pro Glu Ala Ile Glu Glu Phe Pro Val Pro Ala Leu 100 105 110 His His Pro Val Phe Gln Gln Glu Ser Phe Thr Arg Gln Val Leu Trp 115 120 125 Lys Leu Leu Lys Val Val Lys Phe Gly Glu Val Ile Ser Tyr Gln Gln 130 135 140 Leu Ala Ala Leu Ala Gly Asn Pro Ala Ala Thr Ala Ala Val Lys Thr 145 150 155 160 Ala Leu Ser Gly Asn Pro Val Pro Ile Leu Ile Pro Cys His Arg Val 165 170 175 Val Ser Ser Ser Gly Ala Val Gly Gly Tyr Glu Gly Gly Leu Ala Val 180 185 190 Lys Glu Trp Leu Leu Ala His Glu Gly His Arg Leu Gly Lys Pro Gly 195 200 205 Leu Gly Pro Ala Gly Ile Gly Ala Pro Gly Ser Leu Gly Gly Gly Ser 210 215 220 Glu Asn Leu Tyr Phe Gln Ser Asp Ile Gly Val Tyr Leu Leu Pro Arg 225 230 235 240 Arg Gly Pro Arg Leu Gly Val Arg Ala Thr Arg Lys Thr Ser Glu Arg 245 250 255 Ser Gln Pro Arg Gly Arg Arg Gln Pro Ile Phe Lys Ala Arg Arg Pro 260 265 270 Glu Gly Arg Thr Met Ala Gln Pro Gly Tyr Pro Met Pro Leu Tyr Gly 275 280 285 Asn Glu Gly Cys Gly Asn Ala Gly Met Leu Leu Ser Pro Arg Gly Ser 290 295 300 Arg Pro Ser Trp Gly Pro Thr Asp Pro Arg Arg Arg Ser Arg Asn Leu 305 310 315 320 Gly Arg Val Ile Asp Thr Leu Thr Cys Gly Phe Ala Asp Leu Met Gly 325 330 335 Tyr Ile Pro Leu Val Gly Ala Pro Leu Gly Gly Ala Ala Arg Ala Leu 340 345 350 Ala His Gly Val Arg Val Leu Glu Asp Gly Val Asn Tyr Ala Thr Gly 355 360 365 Asn Leu Pro Gly Glu Asn Leu Tyr Phe Gln Gly Pro Gly Gly Gly Ser 370 375 380 His His His His His His 385 390 <210> 176 <211> 1288 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Nucleotide sequence of a SNAP construct containing the core sequence of the C gene of Hepatitis C <400> 176 tcgcgagcta gcaccatgaa actatgtatt ctacttgcag ttgttgcgtt cgtaggattg 60 tccttaccta cagctctggc aagatctgac aaagactgcg aaatgaaaag aactacattg 120 gattcaccac ttgggaagtt ggaactgagt ggatgcgagc aaggattgca tgaaattaag 180 ctactgggaa aaggaacttc tgctgctgat gcagttgaag ttccagcacc agcagctgtt 240 cttggaggtc ctgagcccct catgcaagcc acagcctggc ttaacgcata tttccaccag 300 cctgaggcca ttgaggaatt tccagtcccc gcccttcacc atcctgtgtt tcagcaggag 360 agcttcaccc gccaggtcct gtggaaattg ctgaaggtgg tcaagtttgg tgaagtgatt 420 tcatatcagc aacttgctgc attggccggt aaccccgcag ctacagctgc cgtgaaaact 480 gctctcagcg gaaatcctgt gcccatcctg atcccttgtc acagagtcgt ttcatcttcc 540 ggagctgtag gtggctatga aggaggactg gcagttaagg agtggctgct ggctcatgaa 600 ggtcatagac ttggaaagcc tgggctgggt cctgctggta taggcgcgcc agggtcccta 660 ggtggcggat ccgaaaacct gtacttccag agcgatatca gtacgaatcc taagcctcaa 720 cgtaagacta agcgcaatac taatcgtcgt ccacaagatg ttaagtttcc gggtggcggt 780 caaattgttg gtggagttta cctattgccg cgaagaggtc ctcgtttagg tgttcgagca 840 actagaaaga cttctgaacg atcacaacct cgtggaagac gacaacctat ttttaaggct 900 cgtcgtcctg aaggtagaac tatggctcag cctggttatc ctatgcctct atatggtaat 960 gaaggatgcg gtaatgcagg aatgctacta tcacctcgtg gttctcgacc tagttggggt 1020 cctactgacc ctcgacgaag atcacgtaat ttaggtagag taattgatac acttacatgt 1080 ggttttgctg atcttatggg atatattcca ctagtaggtg ctccactagg tggagctgca 1140 agagctcttg cacatggtgt acgagttctt gaagatggag tgaactatgc aacaggtaat 1200 ctcccgggag agaatctata ttttcaaggg cccggcggag gtagtcacca tcatcaccat 1260 cactaatgac cggtgcggcc gcaagctt 1288 <210> 177 <211> 421 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Amino acid sequence of a SNAP construct containing the core sequence of the C gene of Hepatitis C <400> 177 Ser Arg Ala Ser Thr Met Lys Leu Cys Ile Leu Leu Ala Val Val Ala 1 5 10 15 Phe Val Gly Leu Ser Leu Pro Thr Ala Leu Ala Arg Ser Asp Lys Asp 20 25 30 Cys Glu Met Lys Arg Thr Thr Leu Asp Ser Pro Leu Gly Lys Leu Glu 35 40 45 Leu Ser Gly Cys Glu Gln Gly Leu His Glu Ile Lys Leu Leu Gly Lys 50 55 60 Gly Thr Ser Ala Ala Asp Ala Val Glu Val Pro Ala Pro Ala Ala Val 65 70 75 80 Leu Gly Gly Pro Glu Pro Leu Met Gln Ala Thr Ala Trp Leu Asn Ala 85 90 95 Tyr Phe His Gln Pro Glu Ala Ile Glu Glu Phe Pro Val Pro Ala Leu 100 105 110 His His Pro Val Phe Gln Gln Glu Ser Phe Thr Arg Gln Val Leu Trp 115 120 125 Lys Leu Leu Lys Val Val Lys Phe Gly Glu Val Ile Ser Tyr Gln Gln 130 135 140 Leu Ala Ala Leu Ala Gly Asn Pro Ala Ala Thr Ala Ala Val Lys Thr 145 150 155 160 Ala Leu Ser Gly Asn Pro Val Pro Ile Leu Ile Pro Cys His Arg Val 165 170 175 Val Ser Ser Ser Gly Ala Val Gly Gly Tyr Glu Gly Gly Leu Ala Val 180 185 190 Lys Glu Trp Leu Leu Ala His Glu Gly His Arg Leu Gly Lys Pro Gly 195 200 205 Leu Gly Pro Ala Gly Ile Gly Ala Pro Gly Ser Leu Gly Gly Gly Ser 210 215 220 Glu Asn Leu Tyr Phe Gln Ser Asp Ile Ser Thr Asn Pro Lys Pro Gln 225 230 235 240 Arg Lys Thr Lys Arg Asn Thr Asn Arg Arg Pro Gln Asp Val Lys Phe 245 250 255 Pro Gly Gly Gly Gln Ile Val Gly Gly Val Tyr Leu Leu Pro Arg Arg 260 265 270 Gly Pro Arg Leu Gly Val Arg Ala Thr Arg Lys Thr Ser Glu Arg Ser 275 280 285 Gln Pro Arg Gly Arg Arg Gln Pro Ile Phe Lys Ala Arg Arg Pro Glu 290 295 300 Gly Arg Thr Met Ala Gln Pro Gly Tyr Pro Met Pro Leu Tyr Gly Asn 305 310 315 320 Glu Gly Cys Gly Asn Ala Gly Met Leu Leu Ser Pro Arg Gly Ser Arg 325 330 335 Pro Ser Trp Gly Pro Thr Asp Pro Arg Arg Arg Ser Arg Asn Leu Gly 340 345 350 Arg Val Ile Asp Thr Leu Thr Cys Gly Phe Ala Asp Leu Met Gly Tyr 355 360 365 Ile Pro Leu Val Gly Ala Pro Leu Gly Gly Ala Ala Arg Ala Leu Ala 370 375 380 His Gly Val Arg Val Leu Glu Asp Gly Val Asn Tyr Ala Thr Gly Asn 385 390 395 400 Leu Pro Gly Glu Asn Leu Tyr Phe Gln Gly Pro Gly Gly Gly Ser His 405 410 415 His His His His His 420 <210> 178 <211> 1054 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Nucleotide sequence of a SNAP construct containing sequences encoding the NSs protein from Schmallenberg virus <400> 178 tcgcgagcta gcaccatgaa actatgtatt ctacttgcag ttgttgcgtt cgtaggattg 60 tccttaccta cagctctggc aagatctgac aaagactgcg aaatgaaaag aactacattg 120 gattcaccac ttgggaagtt ggaactgagt ggatgcgagc aaggattgca tgaaattaag 180 ctactgggaa aaggaacttc tgctgctgat gcagttgaag ttccagcacc agcagctgtt 240 cttggaggtc ctgagcccct catgcaagcc acagcctggc ttaacgcata tttccaccag 300 cctgaggcca ttgaggaatt tccagtcccc gcccttcacc atcctgtgtt tcagcaggag 360 agcttcaccc gccaggtcct gtggaaattg ctgaaggtgg tcaagtttgg tgaagtgatt 420 tcatatcagc aacttgctgc attggccggt aaccccgcag ctacagctgc cgtgaaaact 480 gctctcagcg gaaatcctgt gcccatcctg atcccttgtc acagagtcgt ttcatcttcc 540 ggagctgtag gtggctatga aggaggactg gcagttaagg agtggctgct ggctcatgaa 600 ggtcatagac ttggaaagcc tgggctgggt cctgctggta taggcgcgcc agggtcccta 660 ggtggcggat ccgaaaacct gtacttccag agcgatatct accacaacgg aatgcagcta 720 catttaaccc ggaggtcggg tatgtggcat ttattggtaa gtatgggcaa caactcaact 780 tcggtgttgc tagagtcttc ttcctcaacc agaagaaggc caagatggtc ctacataaga 840 cggcacaacc aagtgtcgat cttacttttg gtggggtcaa atttacagtg gttaataacc 900 attttcccca atatgtctca aatcctgtgc cagacaatgc cattacactt cacaggatgt 960 caggttatcc cgggagagaa tctatatttt caagggcccg gcggaggtag tcaccatcat 1020 caccatcact aatgaccggt gcggccgcaa gctt 1054 <210> 179 <211> 343 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Amino acid sequence of a SNAP construct containing sequences encoding the NSs protein from Schmallenberg virus <400> 179 Ser Arg Ala Ser Thr Met Lys Leu Cys Ile Leu Leu Ala Val Val Ala 1 5 10 15 Phe Val Gly Leu Ser Leu Pro Thr Ala Leu Ala Arg Ser Asp Lys Asp 20 25 30 Cys Glu Met Lys Arg Thr Thr Leu Asp Ser Pro Leu Gly Lys Leu Glu 35 40 45 Leu Ser Gly Cys Glu Gln Gly Leu His Glu Ile Lys Leu Leu Gly Lys 50 55 60 Gly Thr Ser Ala Ala Asp Ala Val Glu Val Pro Ala Pro Ala Ala Val 65 70 75 80 Leu Gly Gly Pro Glu Pro Leu Met Gln Ala Thr Ala Trp Leu Asn Ala 85 90 95 Tyr Phe His Gln Pro Glu Ala Ile Glu Glu Phe Pro Val Pro Ala Leu 100 105 110 His His Pro Val Phe Gln Gln Glu Ser Phe Thr Arg Gln Val Leu Trp 115 120 125 Lys Leu Leu Lys Val Val Lys Phe Gly Glu Val Ile Ser Tyr Gln Gln 130 135 140 Leu Ala Ala Leu Ala Gly Asn Pro Ala Ala Thr Ala Ala Val Lys Thr 145 150 155 160 Ala Leu Ser Gly Asn Pro Val Pro Ile Leu Ile Pro Cys His Arg Val 165 170 175 Val Ser Ser Ser Gly Ala Val Gly Gly Tyr Glu Gly Gly Leu Ala Val 180 185 190 Lys Glu Trp Leu Leu Ala His Glu Gly His Arg Leu Gly Lys Pro Gly 195 200 205 Leu Gly Pro Ala Gly Ile Gly Ala Pro Gly Ser Leu Gly Gly Gly Ser 210 215 220 Glu Asn Leu Tyr Phe Gln Ser Asp Ile Tyr His Asn Gly Met Gln Leu 225 230 235 240 His Leu Thr Arg Arg Ser Gly Met Trp His Leu Leu Val Ser Met Gly 245 250 255 Asn Asn Ser Thr Ser Val Leu Leu Glu Ser Ser Ser Ser Thr Arg Arg 260 265 270 Arg Pro Arg Trp Ser Tyr Ile Arg Arg His Asn Gln Val Ser Ile Leu 275 280 285 Leu Leu Val Gly Ser Asn Leu Gln Trp Leu Ile Thr Ile Phe Pro Asn 290 295 300 Met Ser Gln Ile Leu Cys Gln Thr Met Pro Leu His Phe Thr Gly Cys 305 310 315 320 Gln Val Ile Pro Gly Glu Asn Leu Tyr Phe Gln Gly Pro Gly Gly Gly 325 330 335 Ser His His His His His His 340

Claims (38)

  1. 피험자로부터의 생물학적 샘플에 존재하는 적어도 2개의 상이한 표적 항체를 검출하기 위한 시험관내 분석 방법으로서, 상기 방법은
    (a) 적어도 2개의 고체 지지체의 혼합물을 생물학적 샘플과 접촉시키는 단계로서, 상기 고체 지지체 중의 적어도 하나는 AGT 기질에 공유적으로 커플링 (covalently coupling)된 제1 AGT-항원 융합 단백질을 포함하고, 상기 고체 지지체 중의 적어도 하나는 AGT 기질에 공유적으로 커플링된 제2 AGT-항원 융합 단백질을 포함하는 단계,
    (b) 제1 AGT-항원에 대한 항체의 결합의 존재 또는 부재를 검출하는 단계; 및
    (c) 제2 AGT-항원에 대한 항체의 결합의 존재 또는 부재를 검출하는 단계를 포함하는, 시험관내 분석 방법.
  2. 제1항에 있어서, 적어도 5개의 고체 지지체의 혼합물을 피험자로부터의 생물학적 샘플과 접촉시키는 것을 포함하는, 분석 방법.
  3. 제1항에 있어서, 적어도 10개의 고체 지지체를 피험자로부터의 생물학적 샘플과 접촉시키는 것을 포함하는, 분석 방법.
  4. 제1항에 있어서, 적어도 15개의 고체 지지체의 혼합물을 피험자로부터의 생물학적 샘플과 접촉시키는 것을 포함하는, 분석 방법.
  5. 제1항 내지 제4항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 AGT-항원 융합 단백질 둘 다가 서열번호 2의 SNAP 돌연변이체를 포함하는, 분석 방법.
  6. 제1항 내지 제5항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 고체 지지체가 이들의 특정 위치, 크기, 직경, 중량, 입도측정 또는 표지화에 의해 특이적으로 식별될 수 있는, 분석 방법.
  7. 제1항 내지 제6항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 고체 지지체가 형광색소, 발색단, 방사성동위원소 및/또는 질량 태그(mass tag)에 의해 표지되는, 분석 방법.
  8. 제1항 내지 제7항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 고체 지지체가 마이크로입자 (microparticle)로 제조되는, 분석 방법.
  9. 제1항 내지 제8항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 고체 지지체가 자석인, 분석 방법.
  10. 제1항 내지 제9항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 고체 지지체가 형광 염료로 내부 표지된 마이크로입자인, 분석 방법.
  11. 제1항 내지 제10항 중 어느 한 항에 있어서, 각각의 상기 고체 지지체가 여기 후에 상이하고 식별가능한 파장을 방사하는, 분석 방법.
  12. 제1항 내지 제11항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 제1 또는 제2 AGT-항원 융합 단백질이 서열번호 3의 뎅기 바이러스 1의 EDIII 단백질, 서열번호 4의 뎅기 바이러스 2의 EDIII 단백질, 서열번호 5의 뎅기 바이러스 3의 EDIII 단백질, 서열번호 6의 뎅기 바이러스 4의 EDIII 단백질, 서열번호 7의 웨스트 나일 바이러스의 EDIII 단백질, 서열번호 8의 황열 바이러스의 EDIII 단백질, 서열번호 9의 일본 뇌염 바이러스의 EDIII 단백질, 서열번호 10의 지카 바이러스의 EDIII 단백질, 서열번호 11의 베셀스브론 바이러스의 EDIII 단백질, 서열번호 12의 로시오 바이러스의 EDIII 단백질, 서열번호 13의 머레이 뇌염 바이러스의 EDIII 단백질, 서열번호 14의 세인트-루이스 뇌염 바이러스의 EDIII 단백질, 서열번호 54에 의해 인코딩되는 유전형 1의 일본 뇌염 바이러스의 EDIII 단백질, 서열번호 55에 의해 인코딩되는 유전형 2의 일본 뇌염 바이러스의 EDIII 단백질, 서열번호 56에 의해 인코딩되는 유전형 4의 일본 뇌염 바이러스의 EDIII 단백질, 서열번호 57에 의해 인코딩되는 유전형 5의 일본 뇌염 바이러스의 EDIII 단백질, 서열번호 58에 의해 인코딩되는 라벤스버그 바이러스의 EDIII 단백질의 적어도 30개의 연속적 아미노산을 포함하는, 분석 방법.
  13. 제1항 내지 제12항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 제1 또는 제2 AGT-항원 융합 단백질이 HIV1, HIV2, B형 간염 바이러스, C형 간염 바이러스, E형 간염 바이러스, 웨스트-나일 바이러스 및 종양 HPV 스트레인, HPV 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59, 66 및 68의 바이러스 단백질의 적어도 20개의 연속적 아미노산을 포함하는, 분석 방법.
  14. 제1항 내지 제13항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 제1 또는 제2 AGT-항원 융합 단백질이 서열번호 21, 서열번호 42, 서열번호 49, 서열번호 51, 서열번호 53, 서열번호 60, 서열번호 62, 서열번호 64, 서열번호 66, 서열번호 68, 서열번호 70, 서열번호 72, 서열번호 74, 서열번호 76, 서열번호 78, 서열번호 80, 서열번호 82, 서열번호 84, 서열번호 86, 서열번호 88, 서열번호 90, 서열번호 92, 서열번호 94, 서열번호 96, 서열번호 98, 서열번호 100, 서열번호 102, 서열번호 104, 서열번호 109, 서열번호 111, 서열번호 113, 서열번호 115, 서열번호 117, 서열번호 119, 서열번호 121, 서열번호 123, 서열번호 125, 서열번호 127, 서열번호 129, 서열번호 131, 서열번호 133, 서열번호 135, 서열번호 137, 서열번호 139, 서열번호 141, 서열번호 143, 서열번호 145, 서열번호 147, 서열번호 149 및 서열번호 151로 이루어진 그룹으로부터 선택된 아미노산 서열을 포함하는, 분석 방법.
  15. 제1항 내지 제14항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 제1 또는 제2 AGT-항원 융합 단백질이 서열번호 155, 157, 159, 161, 163, 165, 167, 171, 173, 175, 177 및 179의 적어도 30개의 연속적 아미노산을 포함하는, 분석 방법.
  16. 제1항 내지 제15항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 제1 또는 제2 AGT-항원 융합 단백질이 서열번호 155, 157, 159, 161, 163, 165, 167, 171, 173, 175, 177 및 179의 아미노산 서열을 포함하는, 분석 방법.
  17. 제1항 내지 제16항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 생물학적 샘플이 혈청 또는 혈장인, 분석 방법.
  18. 피험자로부터의 생물학적 샘플에 존재하는 적어도 2개의 상이한 표적 항체를 검출하기 위한 키트로서,
    (a) AGT 기질에 공유적으로 커플링된 제1 AGT-항원 융합 단백질을 포함하는 제1 고체 지지체 및
    (b) AGT 기질에 공유적으로 커플링된 제2 AGT-항원 융합 단백질을 포함하는 제2 고체 지지체를 포함하는, 키트.
  19. 제18항에 있어서, AGT 기질에 공유적으로 커플링된 상이한 AGT-항원 융합 단백질에 각각 커플링된 적어도 5개의 고체 지지체를 포함하는, 키트.
  20. 제19항에 있어서, AGT 기질에 공유적으로 커플링된 상이한 AGT-항원 융합 단백질에 각각 커플링된 적어도 10개의 고체 지지체를 포함하는, 키트.
  21. 제20항에 있어서, AGT 기질에 공유적으로 커플링된 상이한 AGT-항원 융합 단백질에 각각 커플링된 적어도 15개의 고체 지지체를 포함하는, 키트.
  22. 제18항 내지 제21항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 고체 지지체가 마이크로입자인, 키트.
  23. 제18항 내지 제22항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 고체 지지체가 적어도 하나의 단일 구획에서 함께 혼합되는, 키트.
  24. 제18항 내지 제23항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 고체 지지체가 미세역가판 (microtiter plate)의 적어도 하나의 웰 또는 적어도 하나의 튜브에서 함께 혼합되는 마이크로입자인, 키트.
  25. 제18항 내지 제24항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 고체 지지체에 결합되는 적어도 2개의 표적 항체를 검출하기 위한 표지된 제2 항체를 추가로 포함하는, 키트.
  26. 제18항 내지 제25항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 제1 또는 제2 AGT-항원 융합 단백질이 서열번호 3의 뎅기 바이러스 1의 EDIII 단백질, 서열번호 4의 뎅기 바이러스 2의 EDIII 단백질, 서열번호 5의 뎅기 바이러스 3의 EDIII 단백질, 서열번호 6의 뎅기 바이러스 4의 EDIII 단백질, 서열번호 7의 웨스트 나일 바이러스의 EDIII 단백질, 서열번호 8의 황열 바이러스의 EDIII 단백질, 서열번호 9의 일본 뇌염 바이러스의 EDIII 단백질, 서열번호 10의 지카 바이러스의 EDIII 단백질, 서열번호 11의 베셀스브론 바이러스의 EDIII 단백질, 서열번호 12의 로시오 바이러스의 EDIII 단백질, 서열번호 13의 머레이 뇌염 바이러스의 EDIII 단백질, 서열번호 14의 세인트-루이스 뇌염 바이러스의 EDIII 단백질, 서열번호 54에 의해 인코딩되는 유전형 1의 일본 뇌염 바이러스의 EDIII 단백질, 서열번호 55에 의해 인코딩되는 유전형 2의 일본 뇌염 바이러스의 EDIII 단백질, 서열번호 56에 의해 인코딩되는 유전형 4의 일본 뇌염 바이러스의 EDIII 단백질, 서열번호 57에 의해 인코딩되는 유전형 5의 일본 뇌염 바이러스의 EDIII 단백질, 서열번호 58에 의해 인코딩되는 라벤스버그 바이러스의 EDIII 단백질의 적어도 30개의 연속적 아미노산을 포함하는, 키트.
  27. 제18항 내지 제26항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 제1 또는 제2 AGT-항원 융합 단백질이 HIV1, HIV2, B형 간염 바이러스, C형 간염 바이러스, E형 간염 바이러스, 웨스트-나일 바이러스 및 종양 HPV 스트레인, HPV 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59, 66 및 68의 바이러스 단백질의 적어도 20개 연속적 아미노산을 포함하는, 키트.
  28. 제18항 내지 제27항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 제1 또는 제2 AGT-항원 융합 단백질이 서열번호 21, 서열번호 42, 서열번호 49, 서열번호 51, 서열번호 53, 서열번호 60, 서열번호 62, 서열번호 64, 서열번호 66, 서열번호 68, 서열번호 70, 서열번호 72, 서열번호 74, 서열번호 76, 서열번호 78, 서열번호 80, 서열번호 82, 서열번호 84, 서열번호 86, 서열번호 88, 서열번호 90, 서열번호 92, 서열번호 94, 서열번호 96, 서열번호 98, 서열번호 100, 서열번호 102, 서열번호 104, 서열번호 109, 서열번호 111, 서열번호 113, 서열번호 115, 서열번호 117, 서열번호 119, 서열번호 121, 서열번호 123, 서열번호 125, 서열번호 127, 서열번호 129, 서열번호 131, 서열번호 133, 서열번호 135, 서열번호 137, 서열번호 139, 서열번호 141, 서열번호 143, 서열번호 145, 서열번호 147, 서열번호 149 및 서열번호 151로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 아미노산 서열을 포함하는, 키트.
  29. 제18항 내지 제28항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 제1 또는 제2 AGT-항원 융합 단백질이 서열번호 155, 157, 159, 161, 163, 165, 167, 171, 173, 175, 177 및 179의 적어도 30개의 연속적 아미노산을 포함하는, 키트.
  30. 제18항 내지 제29항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 제1 또는 제2 AGT-항원 융합 단백질이 서열번호 155, 157, 159, 161, 163, 165, 167, 171, 173, 175, 177 및 179의 아미노산 서열을 포함하는, 키트.
  31. 피험자로부터의 생물학적 샘플에서 적어도 2개의 표적 항체를 검출하기 위한, 제18항 내지 제30항 중 어느 한 항에 따른 키트의 용도.
  32. 피험자에서 파필로마바이러스 또는 뎅기 바이러스, 황열 바이러스, 웨스트 나일 바이러스, 일본 뇌염 바이러스, 진드기-매개 뇌염 바이러스, C형 간염 바이러스, 치쿤구니아 바이러스, 로스 강 바이러스, 마야로 바이러스, 서부 말 뇌염 바이러스, 동부 말 뇌염 바이러스, 베네주엘라 말 뇌염 바이러스, 크리미아-콩고 출혈 열 바이러스, 리프트 계곡 열 바이러스, 쉬말렌베르그 바이러스, E형 간염 바이러스, 라사 바이러스, 에볼라 바이러스, 마르부르그 바이러스에 의해 유발되는 바이러스 감염; 렙토스피로사 인테로간스에 의해 유발되는 세균 감염; 또는 플라스모듐 팔시파룸에 의해 유발되는 감염인 적어도 2개의 표적 질환을 진단하기 위한, 제18항 내지 제31항 중 어느 한 항에 따른 키트의 용도.
  33. 피험자에서 적어도 하나의 표적 항체의 합성을 유도하는 것으로 알려진 하나 이상의 표적 질환을 진단하기 위한 시험관내 진단 방법으로서, 상기 방법은 제1항 내지 제17항 중 어느 한 항에 따른 분석 방법을 수행하는 것을 포함하고, 하나 이상의 표적 항체의 양이 대조치 보다 높은 경우 상기 피험자가 적어도 하나의 표적 질환을 앓는 것으로 진단되는, 시험관내 진단 방법.
  34. 키트를 제조하는 방법으로서, 상기 방법은
    (a) 제1 표적 항체에 의해 인지되는 제1 AGT-항원 융합 단백질을 제공하는 단계,
    (b) 상기 제1 AGT-항원 융합 단백질을, 상기 AGT-항원 융합 단백질의 기질과 공유적으로 커플링된 제1 고체 지지체와 접촉시키는 단계,
    (c) 제1 AGT-항원 융합 단백질과 공유적으로 커플링된 제1 고체 지지체를 수득하는 단계,
    (d) 제2 표적 항체에 의해서는 인지되나 상기 제1 표적 항체에 의해서는 인지되지 않는 제2 AGT-항원 융합 단백질을 제공하는 단계,
    (e) 상기 제2 AGT-항원 융합 단백질을, 상기 AGT-항원 융합 단백질의 기질과 공유적으로 커플링된 제2 고체 지지체와 접촉시키는 단계, 및
    (f) 제2 AGT-항원 융합 단백질과 공유적으로 커플링된 제2 고체 지지체를 수득하는 단계를 포함하고,
    상기 제1 및 제2 고체 지지체는 서로 특이적으로 식별될 수 있는, 방법.
  35. 제34항에 있어서, AGT-항원 융합 단백질과 공유적으로 커플링된 고체 지지체를 함께 혼합하는 것을 추가로 포함하는, 방법.
  36. 제34항 또는 제35항에 있어서, 5개의 상이한 AGT-항원 융합 단백질과 공유적으로 커플링된 적어도 5개의 고체 지지체를 생성하기 위해 적어도 5개의 AGT-항원 융합 단백질로 단계 (a) 내지 (c)를 수행하는 것을 추가로 포함하는, 방법.
  37. 제34항 또는 제35항에 있어서, 10개의 상이한 AGT-항원 융합 단백질과 공유적으로 커플링된 적어도 10개의 고체 지지체를 생성하기 위해 적어도 10개의 AGT-항원 융합 단백질로 단계 (a) 내지 (c)를 수행하는 것을 추가로 포함하는, 방법.
  38. 제34항 또는 제35항에 있어서, 15개의 상이한 AGT-항원 융합 단백질과 공유적으로 커플링된 적어도 15개의 고체 지지체를 생성하기 위해 적어도 15개의 AGT-항원 융합 단백질로 단계 (a) 내지 (c)를 수행하는 것을 추가로 포함하는, 방법.
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