JPH05504552A - 2’位が改変されたオリゴヌクレオチド - Google Patents

2’位が改変されたオリゴヌクレオチド

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JPH05504552A JP2515636A JP51563690A JPH05504552A JP H05504552 A JPH05504552 A JP H05504552A JP 2515636 A JP2515636 A JP 2515636A JP 51563690 A JP51563690 A JP 51563690A JP H05504552 A JPH05504552 A JP H05504552A
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Abstract

(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるため要約のデータは記録されません。

Description

【発明の詳細な説明】 2′1が改′ されたオリゴヌクレオチド1人立互 本発明は、薬剤送達用あるいは核酸活性を直接阻害するためのオリゴマー配列の 相補性あるいは特異性に基づく技術に有用な、改変されたオリゴヌクレオチドに 関する。さらに詳細には、本発明は、ヌクレアーゼ活性に対して安定な、2°位 で改変されたオリゴマーに関する。
1人!見 近年、診断用あるいは治療用の手段としての核酸の設計に関するかなりの活動が ある。この設計の一面は、疾患あるいは腫瘍を媒介する核酸物質に対するある種 のオリゴマー配列のインビボでの特異的な親和力に基づく。この一般的なアプロ ーチはしばしば「アンチセンス」テクノロジーと称されている。簡略化されすぎ ている一般的な前提は、感染性生物の繁殖あるいは悪性腫瘍のような細胞の状態 に関連し、そして重要であるDNAあるいはRNAに対して、投与されるオリゴ マーが相補性であることである。この前提は、その相補性がオリゴマーを標的の 核酸に結合させ、従ってその正規の機能がなんであろうと、これを不活性化する ことである。
簡単な例は、感染の進行に必要なタンパク質をコードするmRNAに相補的なり NAオリゴマーの投与である。この投与されるDNAは、mRNAの翻訳を不活 性化し、従って、タンパク質の形成を阻害する。多分、このDNAは、直接投与 され得るか、あるいはインサイチュでの標的のmRNAに相補的なmRNAを生 成するために使用され得る。現在、この一般的なアプローチに関する文献が大量 にあり、標的のRNAあるいはDNA配列に相補的なこのタイプのオリコマ−を 用いる方法は明らかになっている。
例えば、van der Krol、A、R,ら、Biotechni ues  (1988) i:958−976; 5tein、C,A、ら、Cance r Re5earch (198g) 48:2659−2668; 1zan t、 J、G、ら、5cience (1985) 229:345−352; およびZon、 G、、 Pharmaceutical Re5earch  (198g) 5:539−549゜これら全ては参考として本明細書に援用さ れている。さらに、アンチセンスオリゴヌクレオチドに関する文献の目録は、D r。
Leo Leeにより、Frederick Cancer Re5earch  Facility in Frederick、 MDに作成されている。
インビトロでの核酸の機能性を阻害するために相補性を用いる一般的な構想に2 つの概念的な追加がある。これらのうちの最初の1つは、古典的な塩基対センス の厳密な相補性が、ある種のオリゴヌクレオチド配列が二重螺旋のDNA中の配 列を認識しそして結合する特異的な能力、およびこの複合体の大溝(+ajor  groove)にそれ自身を挿入する特異的な能力により補足され得ることで ある。最近の最も確実な報告書では、このような特異性に対する新しい法則が説 明されている。これらの文献は、最も初期の研究、例えば、二重鎖po 1y− dT/p。
l y−dA /po 1y−d Tとしての結合の一般的な原理を示している Arnott、 s、ら、J Mol Biol (1974)■、509−5 21による研究;および、poly−dCを含有する対応のアナログ三重鎖につ いてまとめられているMo5er、 H,E、ら、5cience (1987 ) 238:645−650を考慮に入れる。さらに最近の研究では、先の法則 (ホモピリミジンンオリゴマーによって、二重螺旋中にあるホモプリン/ホモピ リミジンに対する認識は達成され得る)は、混合配列がさらに認識され得るパタ ーンに拡張され得た(Grjffin、 L、C0ら、5cience (19 89) 245:907−971)。さらに、これらの現象のまとめは、例えば 、Maher III、 L、J、ら、5cience (1989) 245 ニア25−730の概説にある。さらに三重螺旋形成関連の開示は、Coone y、M、ら、5cience (1988) 24ユニ456−459; Fr ancois、 J、−C,、Nucleic Ac1ds Res (198 8) 16:11431−11440;および5trobel、S、A、ら、J  Ai+ Chew Soc (1988> 110ニア927−7929にあ る。この内容に関して、正確な配列の特異性の研究を提供するためにさらに詳細 な説明が必要とされるが、二重螺旋の大溝に特異的にはめこむこのセンスの「相 補性」に対する法則が早く浮かびあがることは明確である。
第2の局面は、天然のオリゴヌクレオチドでの塩基対の相補性の単純な概念から 逸脱したアンチセンステクノロジーは、オリゴヌクレオチド、特にRNAが生物 学的な系中でのヌクレアーゼ開裂を高度に受け易いという初期の認識から得られ る。
これらの物質に活性薬剤を残存させるために、投与されるオリゴヌクレオチドを この分解に対して安定にする必要がある。
これまで用いられてきたアプローチは、これらの酵素による攻撃に対して耐性に なるようにホスホジエステル結合を改変することであった。特に、このホスホノ エステエル結合は、ホスホルアミデート結合、メチルホスホネート結合、および ホスホロチオエート結合で置換されていた。これらのアプローチは、完全には満 足されないが、立体異性および標的配列へのハイブリダイゼーションに対する関 連の影響に関わるある程度の結果を宵する。他のアプローチは、2−0−メチル リボースあるいは従来のヌクレオシド残基のαアノマーを用いてヌクレオシドを 改変することである。さらに、2°アミノ基を有するオリゴマーは、それらのト リホスフェートアナログにより調製され、そしてHobbs、 J、ら、Bio chemis工rl(1973) 12:513g−5145による酵素触媒に より重合される。これらのアプローチは、前述の章に掲載されているZonの概 説にまとめられている。
本発明は、さらに、この技術において有用なオリゴマーに包含されるための、2 °位が置換されたペントース部分を提供する。これは、ヌクレアーゼ活性に対し て耐性であり、そして、さらに必要に応じて上述したさらなる改変と組み合わせ られ得る。
全日の−な2日 本発明は、下記式のヌクレオシドおよびヌクレオチドに向ここで、 Bがプリンあるいはピリミジン残基、あるいはそれらのアナログであり; WlがHS mが1から3の整数である(PO3)l−2、保護基、あるいは結 合水酸基に反応する基であり;W2がH,POa−2、保護基、あるいは結合水 酸基に反応する基であり; XがO,S、 それぞれのRが独立してHあるいはアルキル(1−6C)である NRあるいはCR2であり;Yがリンカ一部分、必要に応じてリンカ一部分を介 して結合された薬剤残基、必要に応じてリンカ一部分を介して結合されたラベル 、あるいは必要に応じてリンカ一部分を介して結合された特性に影響する残基で あって、ここで、該X−Y置換基が、該(1)式のヌクレオシドあるいはヌクレ オチドを含有するオリゴマーを、2位に−H2あるいは−HOHを有する対応の ヌクレオチドを取り込んだ該オリゴマーよりもヌクレアーゼ処理に対してより安 定にする。
これらの物質は、本発明のオリゴマーの合成における中間生成物として有用であ り、これは下記の式のオリゴマーである。
(以下余白) それぞれのBが、独立して、プリンあるいはピリミジン残基、あるいはそれらの アナログであり;W3およびW4が、それぞれ独立してH,PO3−2、保護基 、あるいは結合水酸基に反応する基であり;nが1から200の整数であり; それぞれの2が、独立して、その続きのヌクレオチド残基の水酸基に共有結合す るヌクレオチド結合残基であり;それぞれのAが、独立して、H,OH,あるい は保護基に誘導化したOH1およびx−Yからなる群から選択され、ここに、 XがOSS、 NR,あるいはRが独立してHあるいはアルキル(1−6C)で あるCR2であり;およびYが、リンカ一部分、必要に応じてリンカ一部分を介 して結合された薬剤残基、必要に応じてリンカ一部分を介して結合されたラベル 、あるいは必要に応じてリンカ一部分を介して結合された、特性に影響する残基 であって:ここで、少なくとも1つのAがX−Yであり;そして、ここで、該オ リゴマーが、すべてのAがHあるいはOHであるこれに対応するオリゴマーより も、ヌクレアーゼに対して安定である。
式(2)のオリゴマー物質は、病状に関連する特定のDIJAおよび/またはl 1NAを標的することによって、感染症あるいは悪性腫瘍に対して向けられたプ ロトコール、並びに診断の応用における、治療剤あるいは予防剤として有用であ る。
日を するための≦態 A、1爽 本発明のオリゴマーは、少な(とも1つの式(1)のヌクレオチドの残基を含む 。この式において、およびオリゴマーにおいて、Bは、アテ゛ニン(A)、チア ミン(T)、シトシン(C)、グアニン(G)、またはウランル(U)、または これらの保護形態などの、従来のプリン塩基またはピリミジン塩基を表す。適切 な保護基としては、アフル、イソブチリル、ベンゾイルなどが含まれる。しかし 、Bはまた、これらの従来生じている塩基の、改変されたまたは保護された形態 、もしくは関連する誘導体、すなわち「類似化合物」をも表わし得る。広範囲に わたるこれら類似複素環塩基が当該分野で既知である。例えば、このような類似 化合物の中で通常みられるものには以下のものが含まれる。5−フルオロウラシ ル、5〜ブロモウラシル、5−クロロウラシル、5−イオドゥラ/ル、ヒポキサ ンチン、キサニ/チン、4−アセチル/ドシン、5−(カルポキンヒドロキシル メチル)ウランル、5−カルボキシメチルアミンメチル−2−チオリ7ン、5− カルボキンメチルアミンメチルウラシル、ジヒドロウラシル、ヘーターD−ガラ クトシルキューオシン、イノノン、R6−イソペンテニルアデニン、1−メチル アデニン、■−メチルプソイドウラシル、1−メチルグアニン、1−メチルイノ ンン、2,2−ジメチルグアニン、2−メチルアデニン、2−メチルグアニン、 3−メチルシト7ン、5−メチルシトシン、R6−メチルアデニン、7−メチル グアニン、5−メチルアミノメチルウラシル、5−メトキシアミノメチル−2− チオウラシル、ベーターD−マンノンル牛ユーオシン、5−メトキシカルボニル メチルウラシル、5−メトキシウラシル、2−メチルチオ−R6−イソベンテニ ルアデニン、ウラシル−5−オキシ酢酸メチルエステル、ウラシル−5−オキシ 酢酸(v)、ワイブトキソシン、プソイドウラシル、キューオンン、2−チオシ トシン、5−メチル−2−チオウラシル、2−チオウラノル、4−チオウラシル 、5−メチルウラノル、ウランルー5−オキ/酢酸メチルエステル、ウランルー 5−オキシ酢酸(V)、ワイブトキソ7ン、プソイドウラシル、キ二−オンン、 2−チオシトシン、5−メチル−2−チオウラシル、2−チオウラシル、3−( 3−アミノ−3−N−2−カルボキシプロピル)ウラシル、(aep3顧 およ び2.6−ジアミツプリン。
これら塩基の改変は、得られるオリコマ−の安定性および配列のハイブリッド形 成能力の両方に影響を与えるため、多くの場合、特定のオリゴマーにおいてこの ような置換は限られた数だけ行うことが望ましい。しがし、1つのオリゴマー全 体が、類似化合物を含むヌクレオチド残基よりなり得るような場合がある。例え ば、ウリジンのDNAポリマーおよび5−ブロモウリジンのオリゴマー、ならび に5−メチルンチジンは、治療および診断において有用であることが示されてい る。
当該分野の従事者には明らかなように、従来のまたは改変された塩基形態のいず れがを含有するオリゴマーの設計は、得られるモノマーの特性が所望の範囲内と なるように実際的なアプローチにより行わねばならない。従って、ある場合には 、式(2)の配列のrBJとして示される塩基のうち類似化合物塩基により置換 されるのは、10%以下、好ましくは5%以下、さらに好ましくは1%以下であ り、また最も好ましいのは全く置換されないことである。しがし、他の場合には 、類似化合物により完全に置換されるのが望ましい。
同じことが、アルキルまたはアリル非複素環などの非官能置換基の塩基への置換 にも適用される。しがし、このような置換の許容範囲は、例えば、オリゴマーの 官能性を実際に破壊せずに、塩基約20に対して1つの残基など、非常に限定さ れ得る。このような置換を行うことに特別の利点があるようにはみえない。また この置換は、単に、置換しても分子の残りの官能性により圧倒され得るがゆえに 許容される。
’+V+ WaT’示される置換基ハH,PO3−2、(PO3)、−2、保護 基、または結合水酸基に反応する基であり得る。
Wの前後関係における「保護基」は、化学反応、典型的には連続した結合ヌクレ オチドへの反応において結合する一〇Hの反応性を妨げ、また反応が完了すると 除去され得る置換基である。本発明の化合物の典型的な保護基としては、4.4 ゛−ジメトキシトリチル(DMT) 、4−モノメトキシトリチル、およびトリ チルが含まれる。
「結合ヒドロキシルに反応する基」は5°および3°ヒドロキシルの間のインタ ーヌクレオチド結合の形成における中間的な残基である。従って、該基が隣接し たヌクレオチドの適切な−OHと反応すると、ヌクレオチド結合残基Zが得られ る。
Zにより表される結合残基は、典型的には自然に生じるオリゴヌクレオチドにお けるP(0)O−であるが、またP(0)S、 P(0)NR2、P(0)L  またはP (0) OR’であり得、もしくはCOまたはCN[12であり得る 。ここで、RはHまたはアルキル(1−6C)、およびRoはアルキル(1−6 C)であり、または−CX2−であり得る。ここで各Xは個別に電子吸引置換基 である。これは本出願と同日に提出され同譲受人に譲渡された同時継続出願、代 理人参照番号第4610−0005号にて述べられており、該出願は本明細書に おいて参考として援用されている。一般に、Zはヌクレオチド残基と共役してオ リゴヌクレオチドを形成するために従来使用されるヌクレオチド結合部分であり 得る。
Y(追加置換基に共有結合されるときはY’)により表されるリンカ一部分は、 所望する置換基をモノマーまたはオリゴマーに接着させるために使用される二価 架橋残基である。1ノンカーは単に結合メチレン基、すなわち−(CH2)n− であり得、またはへテロ原子および官能基、例えば−CH20C1(2CH20 −1または−CH2O−CH2CH2NH−1または−COOCH2CH20− であり得る。lノンカー残基はまた、Pierce Chemical Co、 、 Rockford、lL、!こより市販されているヘテロおよびホモ三官能 性リンカ−などの市販の二官能性リンカ−由来の残基でもあり得る。
Yにより表される「薬剤残基」は、DNA−DNAまた(′!DNA−RNA2 重らせんの小溝へのインターカレーシコンすなわち挿入が可能な、またはオリゴ ヌクレオチド開裂を行い得る薬剤などの、オリゴマーとの共役にお(Xで有用な 薬剤の接着部位である。このような薬剤の例は以下(こ示される。
「ラベル残基」とは、放射性同位体、蛍光体、発色団、酵素などを含有する部分 などのラベルの接着部位である。このようなラベルは、このオリゴマーを診断に て使用する場合(こは望ましいものであり得る。
「特性に影響を与える」残基とは、その存在により第1ノゴマーの特性が変化す る残基である。このような特性の変イヒ(こは、細胞浸透特性の向上、オリゴマ ーがオリコ′ヌクレオチド配列ヘハイブリダイゼー/:Iン化、さもな(ifこ れに結合する能力の向上、およびヌクレアーゼへの安定性の向上刃ぐ含まれるが 、これらに限定されない。
pl+が中性のとき負に帯電する基を含有する本発明の化合物はその塩として調 製され得る。塩は、NaOH,KOHlまたはCa(OH)2などの無機塩基、 またはカフェイン、様々なアルキルアミン、TEA、およびDBUなどの有機塩 基から形成される。
pHが中性のとき正に蓄電する基を含有する本発明の化合物はHCI、H2SO 4、またH3SOaなどの無機酸から、または酢酸、琥珀酸、くえん酸などの有 機酸から形成される酸添加の塩として調製され得る。
従って、ヌクレオチドおよびこれに対応するオリゴヌクレオチドは、これらが存 在するときのpHまたは調製されるときのp)Iにより塩として存在し得る。こ れらの分子に関連するホスフェートおよびホスホジエステル部分においては、ナ トリウムイオン、カリウムイオン、アンモニウムイオンなどの無機イオンである が、特にカルシウムイオンおよびマグネシウムイオンなどの2価イオンから形成 されるものなどの塩基性塩の形成が可能である。これらの物質の塩を、有機アミ ンまたは複素環などの有機塩基と共に形成することは可能であるが一般的ではな い。
本発明の化合物が従来の化合物と異なる点は、2°部位において、いずれかのキ ラリティーで、ヌクレアーゼに安定性を与え、必要に応じて、薬剤、例えば、小 溝において2本鎖DNAと相互作用するのに効果的である試薬を送達する能力を 提供し、ラベルを提供し、またはいくらかの付加特性を提供する置換基を持つこ とである。式(2)の分子の残りは便宜上、元のオリゴヌクレオチドの特徴を持 つものとして示されることがあり、実際、これが最も好適な実施態様であること が多い一方で、本発明の2°延長部分と置換基を含有するが、またホスホジエス テル結合の1つまたはそれ以上が、例えばホスホロチオエートまたはメチルホス ホネート結合、およびモルホリゾートなどの有機アミ/置換基を含有するものを 含むホスホールアミデート結合に置換すること、すべてのベータアノマーがアル ファーアノマーにより置換されること、および5°および3°末端で保護基また はホスフェート残基の有無などの付加的な改変をも包含する分子もまた本発明の 範囲内に含まれる。
本発明は、2°部位におけるいくつかの一般的なカテゴリーの置換基を開示する 。これらの置換基は、0、S、R1およびCR2から選択される置換基を通して 2°炭素へ結合するタイプが共通である。ここで各Rは個別に選択される。すべ ての実施態様において、X−Yはヌクレアーゼによりオリゴマー中に含まれる置 換基であり、この存在により、該オリゴマーの開裂を阻害し得る置換基を表す。
本発明のオリゴマー中スべてはヌクレアーゼに対して比較的安定している。
ヌクレアーゼに対するオリゴマーの安定性の測定には、便利ないかなるアッセイ 検定法をも使用し得るが、以下に示すヘビ毒検定法を使用して評価すると便利で ある。このアッセイ検定法は次のように行われる。アッセイバッファーは110 0u/MgC1zを含有するpH8,0,0,5MのTris )IcIである 。Croatalus durissusから単離される市販のホスホジェステ ラーゼは、比活性が約1.2U/+gでpH6のグリセロール中の50%(v/ v)溶液としてBoehringer Mannheimから入手される。ホス ホジェステラーゼ含有溶液Lulを100 ulバ・ノファーに添加して、オリ ゴマー0.150Dを上述のように調製された100 ulのバッファー/ヘビ 毒溶液内で元に戻すことによりオリゴマーの試験を行う。HPLCにおけるその 特性保持時間でのオリゴマーの260 nm吸収が消滅するのを観察し、また分 解生成物の出現を測定することにより分解が監視される。
2°置換基を含有する少なくとも1つのヌクレオチド残基を含有する本発明のオ リゴマーは、本発明の化合物の置換部位の代わりに、非置換の2°位置を含有す る対応するオリゴマーより、前述のアッセイ検定法による判定によれば、ヌクレ アーゼに対してより安定している。ヘビ毒アッセイ検定法における本発明の化合 物との加水分解の速度を、2°部位において誘導体化されない対応するオリゴマ ーの速度と比較することにより、2゛置換基の存在がヌクレアーゼによる開裂に 対してオリゴマーを安定化したかどうかが評価され得る。
Yの典型的な実施態様は、その唯一の機能がオリゴマーの特性を変えることであ るとき、−0H1−〇、カルボキシル基、ハロ基、アミ7基などのような非干渉 置換基により置換され得、またはされ得ないアルキルまたはアルケニル(2−2 0C)、好ましくは2−6C,アリルまたは置換アリル(6−20C)、式5i R3(各Rは2−6Cのアルキル)の様々なアルキルノリル誘導体、およびヘテ ロ原子を同様に含有する類似の置換基を含有する。Yがリンカ一部分を含有する 場合は、Y (Y’)のこの部分は付加物質に共役するための官能基を提供する 。例えば、1−20CのYoの実施態様は、水酸基、アミ7基、メルカプチル基 、カルボキン基、ケト基、または池の官能基またはこれらのいくつかの組合せを 含有する。典型的な例としては、−CH2COOH,−CH2CONH2、−C HzCOOEt、−CH2CONHCH2CH2NH2などが含まれる。
リンカ一部分はヌクレオシド、ヌクレオチド、またはオリゴマー内の残基を、2 本鎖DNAまたはDNA/RNAの小溝と相互作用するものとして知られる薬剤 などの試薬または薬剤に結合させるために利用され得る。これらの試薬および物 質は幅広い種類が知られており、インビボにおける機能は一般には、これら試薬 が相互作用するDNA2本鎖を不活性にすることである。このような試薬の典型 的な例としては、ネトロブンンおよびその誘導体、アントラマイシン、牛ノクサ リン抗生物質、アントラマイシン、ピロロ(1−4)ベンゾジアゼピン誘導体お よびインターカレーティング剤が含まれる。
小溝を捜す薬剤以外の池の薬剤もまた使用され得る。インターカレーター、ト牛 シン、分解誘導物質などもまた使用され得る。さらに、薬剤はリンカ一部分を通 して結合される必要はなく、特定の薬剤の化学的性質により置換基Xに直接結合 され得る。
Yの別の実施態様はラベルを表す。これは、必要に応じてリンカ一部分を通して Xに結合されるが、これもまた特定の場合には同様に化学的性質により直接接着 され得る。適切なラヘルトシては、放射性同位体、フルオロセイン(fluor oscein)およびダンノル(dansyl)などの蛍光標識、発色団、酵素 などが含まれる。幅広い種類のラベルが知られており、本発明のオリゴマーがプ ローブとして、または他の特定の結合診断アッセイ検定法において使用されると き、探知可能性を提供するために使用され得る。
最後に、Yは、オリゴマーの特性を変更させる置換基であり得る。薬剤およびラ ベルを含む置換基のすべてがヌクレアーゼの安定性を高めることはすでに述べた 。しかし、付加特性もまた影響を受け得る。例えば、結合したヌクレオチド鎖を 開裂する媒介物が接着され得る。置換基により細胞浸透が増大し得る。または、 Yはオリゴマーの相補オリゴヌクレオチドへのまたはDNA/DNAまたはD  N A/RN Aらせんへのハイブリダイゼーション化を高め得る。前述のYの 実施態様すべてにおけるように、活性または特性を変える置換基はXに直接結合 され得、またはリンカ一部分を通して共役され得る。
B−fL!1ij−1惣1」1毀 ヌクレオシドまたはヌクレオチドである本発明の化合物のいくつかは、2゛部位 にOHを持つ対応するヌクレオチドまたはヌクレオシドを、適切な試薬と反応さ せて置換された形帖に変換させることにより調製される。ある場合には、2°置 換基はヌクレオシドまたはヌクレオチドの環状形態に由来し得る。オリゴマーに 封入するためヌクレオチドまたはヌクレオシドを活性化するには、以下に示すよ うに、さらに変換を必要とし得る。これら変換の技法は、当該分野では一般に、 オリゴマーの連続合成の技法として理解されている。
特に、ヌクレアーゼの活性に及ぼす2゛置換基の効果を評価するために、ダイマ ーが合成され得る。ダイマーの形成において、5°部位で保護され、3′部位で 結合水酸基に反応する基を含有する本発明の変換ヌクレオシドまたはヌクレオチ ドは、例えば、3′部位で固形支持体に結合したチミジンまたはシチジンと反応 し、得られるダイマーは支持体から開裂され非保護状態となる。
前述のすべての場合において、2゛置換基の官能性および特質を変える変換は、 モノマーまたはオリゴマーのレベルのいずれかで行われ得る。従って、X−Yの 式0CH2COOEtを持つ2゛置換基は、エステルが単一のヌクレオノドまた はヌクレオチドの、ダイマーの、またはオリゴマー鎖に含まれる置換基のいずれ かであるとき、置換基は遊離酸またはアミドである実施態様に変換され得る。
オリゴマーである本発明の化合物は、誘導体化ヌクレオチドまたはヌクレオシド を、標準固相オリゴヌクレオチド合成技法を使用してオリゴマーに封入すること により得られるOこのような技法は、標準ホスホジエステル結合、および上述の 従来め置換結合の両方の形成に対して商業用に利用可能である。
C9塾月」1」dえ昼 本発明の化合物はヌクレアーゼ阻害の、特異的に相補または結合するオリゴマー に対して、当該分野で既知の方法で利用される。上述のように、これらの化合物 を利用する一般的な方法は既知であり、特定の病気または状態への適用は、適切 な結合特異性を突きとめることに依存する。この結合特異性の決定は、本発明の 改変化合物の調製または適用の方法に影響を与えない。
従って、本発明の改変オリゴマーは治療、診断および研究の関係において有用で ある。治療への適用においては、オリゴマーは一般に、アンチセンス治療に対し て適切な方法で利用される。上述のように、本明細書にて使用されるアンチセン ス治療とは、相補を通じて、または例えばDNA2重らせんの大溝の配列特異的 な配向などの他の特異的な結合手段、または他の特異的な結合モードを通じて特 定のDNAまたはRNA配列をターゲットとすることを含む。このような治療の 場合は、本発明のオリゴマーは、全身投与および部分的すなわち局部投与を含む 様々な投与モードに対して処方され得る。技法および処方については一般に、R em1n ton’s Pharmaceutical 5ciences、  Mack Publishing Co、、Easton、 PA最新版にて見 いだされ得る。
全身投与の場合、筋肉、静脈、1夏腔、および皮下を含む注射が好適である。注 射の場合、本発明のオリゴマーは溶液で、好ましくは、ハング氏液(Hank’ s 5olution)またはリンガ−氏族などの生理的に適合性のあるバッフ ァーで処方される。
さらに、オリゴマーは固体の影響で処方され得、使用直前に再溶解またはり濁さ れ得る。凍結乾燥形態もまた含まれる。
全身投与はまた経粘膜または経皮手段によっても行われ得る。または化合物は経 口投与され得る。経粘膜または経皮投与の場合は、浸透すべきバリヤーに適した 浸透剤が処方に使用される。このような浸透剤は一般に当該分野において既知で あり、例えば、経粘膜投与の場合は胆汁酸塩およびフシジン酸誘導体を含む。さ らに、浸透を容易にするために、洗浄剤を使用し得る。経粘膜投与は、例えば鼻 からのスプレーを通して、または座薬を使用して行われ得る。経口投与の場合は 、オリゴマーは、カプセル、錠剤、および強壮剤などの従来の経口投与の形態へ と処方される。
局部投与の場合は、本発明のオリゴマーは、一般に当該分野において既知の、軟 膏、膏薬、ゲル、またはクリームに処方される。
治療用途に加えて、本発明のオリゴマーは、特異的に結合する夕・−ゲットDN AまたはRNA配列の有無を検出する診断試薬として使用され得る。このような 診断試験は、次に従来の手段により検出される塩基十目補性または3重らせん形 成を介するハイブリタイゼーションにより行われる。例えば、オリゴマーは放射 線、蛍光または色素ラベルを使用してラベル化され、固体支持体に結合したラベ ルの存在が検出され得る。もしくは、2重または3重らせんの存在は、これらの 形態を特異的に認識する抗体により検出され得る。このようなオリゴマーをプロ ーブとして使用してアッセイ検定法を行う手段は一般的に既知である。
上述の用途に加えて、遺伝子発現を阻害するオリゴマーの能力は、組替えシステ ムにおける発現レベルを測定することにより、インビトロのシステムにおいて立 証され得る。
本発明の特異的に結合するオリゴマーがターゲラ)RNAまたはDNAの活性と 干渉しまたはこれを阻害するメカニズムはいつでも確立されるわけではなく、ま た本発明の一部ではない。例えば、オリゴマーがターゲットmRNAを捜す場合 は、翻訳は阻害され得る。さらに、ターゲットを結合することにより、mRNA メツセージの分解が高まる。またはRNAの次のプロセッシングが阻害され得る 。3重らせんの形成により、対象DNAの転写または複製が阻害され得、さらに 、感染性RNAの逆転写または感染DNAの複製が干渉される。また、免疫機能 が、例えば「アムプリゲン(aa+pligen)」システムにより例証される ような2本鎖RNAにより誘導されるものに類似した、または全身性紅斑性狼癒 を抑制するために使用されるものに類似した生理的メカニズムを通して調節され 得ると考えられる。本発明のオリゴマーの特徴は、ターゲットするメカニズムま たはその効果のメカニズムに関係なく、特定のオリゴヌクレオチド配列をターゲ ットする能力である。
最後に、オリゴヌクレオチドは、インターカレーター、キレート化剤、脂肪親和 基、ラベル、または基幹のオリゴマー的特質を改変はするが著しく破壊すること はない他の置換基を含む様々な部分に改変され得る。
以下の実施例は本発明を説明するものであって、これを制限するためのものでは ない。すべての合成反応において、乾燥アルゴン雰囲気が使用された。
(以下余白) 実施例1 ヌクレオチドおよびオリゴマーの調製 (A=NHAc) 以下のように、2°−N−アセトアミノウリジンを5−位において保護し、オリ ゴマー中の残基を共役させるポスポジエステルリンケージを形成するために、3 −位を反応性とした。
1’−N−7>tlt7 i / ’7 ’J ’;ヱ、251のMeOH中ノ 152mgノ2−N−アシルアミノ−3°、5−o−ジアシルウリジン(Ver heydens J、P、Hら、Org Chew (1971) 35:25 0−254)(0,411mmol)に、KCNをその触媒作用が得られる量だ け加えた。15時間後に、1、 OOgのシリカゲルを加えて、反応物を濃縮し た。CHs CN905%(7)H2Oで平衡状態とした2ha+のシリカゲル のカラムノ上端に、この粉末を加えた。標準フラッシュクロマトグラフィー条件 (Still、 W、C,ら、L虹り堕競(197g) 43:2923−29 25)を用いて、カラムをCH3CN中の5%のH20で溶出した。
この生成物を単離し、濃縮することによって、59.5+sg(収量50.8% )の生成物を得た。
2−N−アシルアミ7−5−o−44−ジメトキントリチルーウリジン、2.5 mlの乾燥ピリジン(乾燥ピリジンがら最初に濃縮)中の59.5o+g(7) 2−N−7シルア ミ/ ウ’)シフ (0,208mm。
1)ニ、77、6+sg (0,229gmol、1.10当量)の4.4−ジ メトキシトリチルクロライドを加えた。反応物を室温で15時間攪拌した後に、 3.0mlのH2Oで希釈した。この混合物をH2OおよびEt20に分配し、 振り混ぜて、分離した。水性層をEt20で抽出し、混合有機物を1%の水性N aHCOaで洗浄し、乾燥(Na2SOa)L、濾過し、そして濃縮した。残留 物を20mmのカラム上でフラッシュクロマトグラフイーにより精製した。
その際には、最初に1カラム量のCH2Cl2を、次に8%MeOHジクロロメ タン(CH2C12)溶液を溶離剤として使用した。単離および濃縮を行うこと によって、70.7mgの生成物(収量56.6%)を無色泡沫として得た。
2−N−アシルアミノ−5゛−〇−(4,4−ジメトキシトリチル−ウリジン− 3−イルーヒドロゲンホスホネートトリエチルアンモニウム塩、2.40m1の 乾燥CH2Cl2中に溶解した132II+gの1、2.4−1−リアゾール( 1,91mmol)と0.476m1の無水4−メチルモルホリン(4,33+ gmol)との混合物に、0.236m1の2.0MのPct3ジクooメタン (CH2C12)溶液(0,472mmol)を加えた。
次いでこの混合物を氷−水浴上で30分間冷却した。この混合物に、0.523 a+1の乾燥ピリジン中に70.7mgの2゛−N−アシルアミノ−5−0−( 4,4−ジメトキシトリチル)−ウリジン(0,188+amol、乾燥ピリジ ノから予め濃縮)を溶解した溶液を、数分間に渡って適加した。この反応物を2 0分間攪拌した後に、16.8mlのIMの低温水性トリエチルアンモニウムバ イカーボネート(TEAB、pH=9.0)上に流し込んだ。この混合物を15 分間急速に撹拌した後に、2 x 17 mlのCH2Cl2で抽出した。この 混合有機物を11.7mlのIMの水性TEABで洗浄し、乾燥しくNa25O 4)、濾過し、そして濃縮した。残留物を20mmのカラム上でフラノンニクロ マトグラフイーによって精特表平5−504552 (9) 製した。その際には、1カラム量の1%TEAジクロロメタン(CH2C12) 溶液、1カラム量の1%T E Aおよび2.5%MeOHジクooj9ン(C H2C12)溶液、並びに1%TEAおよび10%MeOHジクロロメタン(C H2C12)溶液を、順に使用した。生成物を単離し、濃縮した。残留物をCH 2Cl 2およびIMの水性TEABに分配し、振り混ぜて、分離した。
有機物層を乾燥しくN a 2S Oa)、濾過し、そして濃縮した。
生成物を乾燥CHaCNから濃縮して、41.9mg(収量43.6%)の生成 物をやや黄色を帯びた泡沫として得た。
得られた表題の化合物を、Proeh ler、 B、 C,らのNuclei c Aeids Res (1986) 14.5399−5407に記載の方 法を用いてオリゴマー中に連結させた。
夾l五主 2.2゛−アンハイドロ−(1−B−D−アラビノフラノシル)シトシン−HC I(環式ヌクレオシド)から、チオフェノールを用いて適切な処理をすることに よって、2’−3−フェニルシチジンを調製した。以下のように、シトシンの− NH2および5′−ヒドロキシを保護し、3−OHを活性化した。
2°−8−フェニルチオシチジン、5oIIllの乾燥DMFおよび1゜86+ alの乾燥T E A (13,3mmol)中に500mg (1,91mm ol)の2.2°−アンハイドロ−(1−B−D−アラビノフラノシル)−シト シン塩酸塩(Sigmaより購入)を溶解した溶液に、0.980m1 (9, 54111+ao1.5.0当量)のチオフェノール(thipheno l) を加えた。反応物を5時間攪拌した後に、濃縮した。残留物をMeOHから2. OQgのシリカゲル上に濃縮した。粉末を、CH2Cl2で平衡状態にした30 mmのシリカゲルのカラムの上端に加えた。次いで、1カラム量のCH2Cl2 .1カラム量の6.25%M e OHジクooメタ7(CH2C12)溶液、 1カラム量の12.5%Me○Hジクooメタン(CH2C12)溶液、および 25%M e OHジクロロメタン(CH2CI2)溶液を順に用いてカラムを 溶出した。生成物画分を濃縮することによって、529mg (収量82.5% )の生成物を無色に近いオイルとして得た。
N4−ベンゾイル−2−S−フェニルチオシチジン helthlO勉」オ且y D−,過渡保護の方法(Ti、 G、S、ら、J Am Chew 5oc(1 982) 104:1315−1319)を用いて、表題の化合物を調製した。
121m1の乾燥ピリジン中の429mg (1,23mmol)の2−3−フ ェニルチオシチジン(乾燥ピリジンから最初に濃縮)を氷−水浴上で冷却してお いて、これに0.832m1 (6,56mmol)のりooトリメチル/う7  (chlorotimethylsilane)を加えた。反応物を15分間 撹拌し、次いで0.767m1 (6,61mmol)の塩化ベンゾイルを加え た。水浴を除去して、撹拌を25時間続けた。反応物を再び水−水浴上で冷却し 、2.56m1のI20を加えた。反応物を5分間撹拌し、次いで2.56m1 の濃縮した水性N Ha OHを加えた。攪拌を30分間続けた後に、混合物を E tOAcおよびI20に分配し、振り混ぜて、分離した。水性層をEtOA cで抽出して、混合有機物をI20で洗浄し、乾燥しくNa2S04)、濾過し 、そして濃縮した。残留物を30+amのカラム上でフラッシュクロマトグラフ ィーによって精製した。その際には、1カラム量のCH2Cl2を、次に5%M eOHジクロロメタン(CH2C12)溶液を溶離剤として使用した。生成物画 分を濃縮することによって138mg (収量32.2%)の生成物をオシチジ ン、2.00m1の乾燥ピリジン中の138mg (0,314mmol)のN 4−ベンゾイル−2−S−フェニルチオシチジン(乾燥ピリジンから最初に濃縮 )に、128mg(0,377mmol、1.2当量)の4,4°−ジメトキシ トリチルクロライドを加えた。反応物を室温で18時間攪拌し、その後に2.  (lomlのI20で希釈した。混合物をEt2oおよびI20に分配し、振り 混ぜて分離した。水性層をEt2oで抽出し、混合有機物を1%の水性N a  HCO3で洗浄し、乾燥しくNa2S○4)、濾過し、そして濃縮した。粗生成 物を30mo+のカラム上でフラッシュクロマトグラフィーによって精製した。
その際には、1カラム量のCH2Cl2.2.5%MeOHジクooメタン(C H2C12)溶液、および5%MeOHジクロロメタン(CH2CI2)溶液を 、溶離剤として順に使用した。生成物画分を濃縮することによって、206II 1g(収量88.4%)の生成物を得た。
5°−〇−44−ジメトキシトリチル Dimejh OX trit 1−2 ’−3−フェニルチオ/チジンー3−イルーヒドロゲンホスホ不−トトリエチル アンモニウム塩、このヒドロゲンホスホ不一トの1M製は、20fl+sg(0 ,278+*+mol)の5−0− (4,4°−ジメトキシトリチル)−2− S−フェニルチオシチジンを使用したこと、および各試薬を0.278m1ol を基準に調整したこと以外は、上記と同じ方法で行った。TEABを用いた処理 の後に、有機物を1Mの水性TEABで洗浄し、乾燥しくNa2S○4)、濾過 し、そして濃縮した。残留物を30wmのカラム上で精製した。
その際には、1カラム量の2%T E Aジクロロメタン(CH2C12)溶液 、2%TEAおよび5%MeOHジクooメタン(CH2C12)溶液、並びに 2%TEAおよび10%MeOHジクooメタン(CH2C12)溶液を、溶離 剤として順に使用した。生成物画分を濃縮して泡沫とし、この泡沫をCH2Cl 2およびIMの水性TEABに分配し、振り混ぜて、分離した。有機物層を乾燥 しくNa25Oi)、濾過し、そして濃縮した。生成物を乾燥CH3CNから濃 縮して、165*g (収ji65.5%)の生成物を泡沫として得た。
ids Res (1986) +4:5399−5407に記載の方法を用い てオリゴマー中に連結した。
K立五立 ヌクレオチドおよびオリゴマーの−1 A、Aノ二−9工」ムゴ]と立Etと 2−誘導化されたヌクレオチドを、N4−ベンゾイル−3°、5−0−(テトラ イソプロピルジシロキサン−1,3−’;イル)−シチジンから、エチルヨード アセテートとの反応並びに2°および5゜ヒドロキシルの脱保護によって調製し た。5゛位を保護し、3゜位を結合水酸基に対して反応性を有する基に転換した 。
NJ−ベンゾイル−2’−0−(エトキンカルボニルメチル et胚■」二二■ U止ユとニー辷匹ヨユヱユjヱ工ユ○L肛乞Zヱ旦牛サン−13−ジイル −シ チジン、この化合物の調製では、2゜−OMe (Inoue、Hら、Nucl eic Aci s Res (1987) 15:6131−6149)の調 製に用いられる反応と類似の反応を使用した。250mgのN4−ベンゾイル− 3°、5’−0−(テトライソプロピルジシロキサン−1,3−ジイル)−シチ ジン(MarkieviczSW、J、、ム江em Res (1979) 1 81−196) (0,424a+ll1ol;ベンゼンから最初に濃縮)に、 1.OO+1 (8,45mmol、 19.g当1りのエチルヨードアセテー トを加え、次いで294mgのAg20(1,27mmoL 2.9g当量)を 加えた。混合物を急速に攪拌し、42℃で32時間加熱し、次いでこれを濾過し 、濃縮した。残留物をCH2Cl2中に溶解し、H2Sで処理し、そして濃縮し た。暗色の残留物を25mmのカラム上でフラッシュクロマトグラフィーによっ て精製した。その際には、1カラム量のCH2Cl2.1カラム量の2゜5%M  e OHジクooメタン(CH2C12)溶液、およびS%MeOHジクロロ メタン(CH2CI2)溶液を、順に溶離剤として使用した。生成物画分を濃縮 することにより、270mg (収量94.4%)の生成物を泡沫として得た。
N4−ベンゾイル−2°−〇−エトキシカルボニルメチル −シチジン、1.7 (1mlのT)(F中の170mgのN4−ベンゾイル−2゛−○−(エトキシ カルボニルメチル) −3゛、s−o −(テトライソプロt”ルシシo++ン ー1.3−ジイル)−シチジ7 (0,252mmol)に、0、126m1の 、テトラブチルアンモニウムフルオライドの1.OMのT HF (0,126 mmol、0.50当量)溶液を加えた。反応物を室温で70分間攪拌した。次 いで、ピリジン/ E t OH/ H20を3 / 1 / 1 (v /  v / v )の割合で混合した3、 4mlの溶液を加えて、5分間攪拌を続 けた。その後に、約101111のアン/ (−リストA−21(Amberl yst A−21)イオン交換樹脂(ピリジニウム形)を加え、5分間攪拌を続 けた。混合物を濾過し、樹脂をEtOHで洗浄した。混合濾液を濃縮した。次い で残留物をEtOHから1.00gのンリカゲル上に濃縮した。この粉末を、C H2Cl2と平衡状態にした251IIlのシリカゲルのカラム上に載置した。
1カラム量のCH2Cl2.1カラム量の2.5%MeOHジクロロメタン(C H2C12)溶液、および5%MeOHジクロロメタン(CH2C12)溶液を 順に使用してカラムを溶出した。生成物画分を濃縮することによって、40.1 rrrg (収量376%)の生成物をオイルとして得た。
N′−ベンゾイル−5°−○−44°−ジメトキシトリチル −2−0−(エト キンカルボニルメチル)−シチジン、1.00m1の乾燥ピリジン中の40.7 BのN4−ベンゾイル−2−0−(エトキシカルボニルメチル)−シチジン(0 ,0939■ol、乾燥ピリジンから最初に濃縮)に、38.3mgの4.4゛ −ジメトキシトリチルクロライド(0,113+imol、1.2当量)を加え た。反応物を室温で20時間攪拌し、次いで0.50+xlの820で希釈した 。混合物をEt20およびH2Oに分配し、振り混ぜて、分離した。水性層をE t2○で抽出した。混合有機物を1%の水性NaHCO3で洗浄し、乾燥しくN a2S○4)、濾過し、そして濃縮した。残留物を20II1mのカラム上でフ ラッシュクロマトグラフィーによって精製した。その際には、1カラム貢のCH 2Cl2.2.5%MeOHジクcoメタ7(CH2CI2)溶液、および5, 0%M e OHジクロロメタン(CH2CI2)溶液を順に溶離剤として使用 した。生成物画分を濃縮することにより、55.2mg(収j179.9%)の 生成物を得た。
N′−ベンゾイル−5−0−(5,5’−ジメトキシトリチル −2゛−0−エ トキンカルボニルメチル −フチジン−3°−イルーヒドロゲンホスホネートト リエチルアンモニウム 、この化合物の調製は、55.2mg (0,0750 mmol)のN4−ベンゾイル−5°−0−(4,4−ジメトキシトリチル)− 2’−0−(エトキシカルボニルメチル)−シチジンを使用したこと、および各 試薬を0.0750mmolを基準に調整したこと以外は、上記のヒドロゲンホ スホネートの調製と同じ方法で行った。TEABを用いた処理の後に、有機物層 をIMの水性TEABで洗浄し、乾燥しくNa25O4)、濾過し、そして濃縮 した。残留物を25℃1mlのカラム上でフラッシュクロマトグラフィーによっ て精製した。その際には、1カラム量の1zTEAアセトニトリル(CH3CN )溶液、1カラム量の1%TEAおよび5%H20アセトニトリル(CH3CN )溶液、並びに1%TEAおよび10%H20アセトニトリル(CH3CN)溶 液を順に使用した。生成物画分を濃縮することによって泡沫を得た。泡沫をCH 2Cl2および1Mの水性TEABに分配し、振り混ぜて、分離した。有機物を 乾燥しくNa2S○4)、濾過し、そして濃縮した。生成物を乾燥CH3CNか ら濃縮することによって、23.8+ag(収135.2%)の生成物を得た。
上記で得られた誘導化された化合物を、上述のようにオリゴマー中に含有させた 。
B、工人二立旦工L Na−ベンゾイル−2゛−〇−エチルー3°5゛−○−テトライソプロピルジシ ロキサン−1,3−ジイル)−シチジンを、エチルヨードアセテートの代わりに ヨードエタンを使用したこと以外はNa−ベンゾイル−2−〇−(エトキシカル ボニルメチル) −3’、5°−〇−(テトライソプロピルジシロキサン(te traisoproyldisiloxane)−1,3−ジイル)−シチジン の場合と同様にして調製した。
次に、表題の化合物をNa−ベンゾイル−5−0−(4,4’−ジメトキシトリ チル)−2−0−エチル−/チジンー3−イルーヒドロゲンホスホネートトリエ チルアンモニウム塩に転換した。転換の際ニは、2−0−(エトキシカルボニル メチル)−化合物の場合と同じ工程順序を用いた。さらにこれを上記のようにオ リゴマー中に含有させた。
C,A=OCHCHCHCH N4−ベンゾイル−2−0−ブチル−3°、5−0−(テトライソプロピルジシ ロキサン−13−ジイル −シチジンを、エチルヨードアセテートの代わりにヨ ードブタンを使用したこと以外はNa−ベンゾイル−2−0−(エトキシカルボ ニルメチル)−3°、5°−0−(テトライソプロピルジシロキサン−1,3− ジイル)−シチジンの場合と同様にして調製した。次いで表題の化合物をNa− ベンゾイル−5−0−(4,4−ジメトキシトリチル)−2°−0−ブチル−シ チジン−3−イルーヒドロゲンホスホ不−トトリエチルアンモニウム塩に転換し た。転換の際には、2−0−(エトキシカルボニルメチル)−化合物の場合と同 じ工程順序を用いた。
さらにこれを上記のようにオリゴマー中に含有させた。
チルシリルウリジン−3−イルーヒドロゲンホスホネートDBU塩、この化合物 は、文献に記載のものとは異なる方法で調製した。この化合物の調製は、400 +ag (0,606mmol)の5−0−(4,4−ジメトキシトリチル)− 2°−0−1−ブチルジメチルシリルウリジン(Peninsula Labs より購入)を使用したこと、および他の条件を0.606nmolを基準に調整 したこと以外は上記化合物の場合と同じ方法で行った。TEABを用いた処理の 後に、有機物層を乾燥しくNa25O4)、濾過し、そして濃縮した。
残留物を35n++sのカラム上でフラッシュクロマトグラフィーによって精製 した。その際には、1カラム量の1%TEAジクロo)97 (CH2CI2) 溶液、1カラム量(7)1%TEAおよび4%MeOHジクooメタン(CH2 CI2)溶液、並びに1%TEAおよび8%M e OHジクロoメタ7(CH 2C12)溶液を、順に溶離剤として使用した。生成物を単離し、濃縮した。泡 沫をCH2Cl2およびIMの水性1.8−ジアザビンクロ[5,4,0]ウン デク−7−ニンバイカーボネート(DBUバイカーボネート、pH=9.0)に 分配し、振り混ぜて、分離した。再び有機物層をSOmLのIMの水性DBUバ イカーボネートで洗浄し、乾燥しくNa25O4)、濾過し、そして濃縮した。
生成物を乾燥CH3CNから濃縮することによって、435mg (収fi81 .9%)の生成物をオイルとして得た。得られた誘導体を、標準的方法で合成し たオリゴマー中に含有させた。
K亘五土 オリゴマー の2° 基の転 A=OCH2COOE t −0CH2COOH= 0CH2CONH2 →OCH2C0NHCH2CH2NH2N4−ベンゾイル−5−0−(4,4− ジメトキシトリチル)−2−0−(エトキンカルボニルメチル)−シチジン−3 ゛−イルーヒドロゲンホスホネートトリエチルアンモニウム塩を、ヒドロゲンホ スホ不−ト法を用いてオリゴヌクレオチド中に連結した。
2−OCH2C02Hを生成するために、オリゴを脱保護し、担体から開裂し、 O,1M水性NaOHを用いて45℃で45時間に渡って2−○CH2C○2E tを加水分解することにより2−OCH2CO2Hを形成した。
2−OCH2CON H2を生成すルタメニ、2°−0CH2CO2Etを含有 する上記オリゴを脱保護し、担体から開裂し、NH3のMeOH溶液を用いて4 5°Cで29時間かけて2−OCH2C02E tを2−OCH2CON H2 に転換した。式−0CH2CONHCH2CH2NH2の対応するアミドを同様 にして調整した。
K1旦l 木全日の化合物のヌクレアーゼ活性に・する、性実施例1で合成した化合物の2 量体の、ヌクレアーゼ活性に抵抗する能力を測定した。図示した式1の化合物を 、改変されていない付加のチミジンに、標準的な処理手順を用いて連結すること によって、次式の化合物を得た。
H 得られた2ffi体化合物の、ヘビの毒液からのヌクレアーゼに対する安定性を 上記のように調べた。その結果を表1に示す。
(以下余白) L 二1夜 −X−Y−Z S 後の2 体く%)100% 解に した −−OCH2CO 2H40% 46分 −0CH2CONH251% 〉42分−○TBS >99% >>140分 (140分後に77%の2量体) −OCH2CONHCH2CH2NH2100% >>140分(140分後に 〉99%の2量体) 表1に示すように、2−位に置換基を添加すると、得られる2量体のヌクレアー ゼ開裂に対する安定性が大幅に向上する。
国際調査報告

Claims (49)

    【特許請求の範囲】
  1. 1.下記の式のモノマーであって; ▲数式、化学式、表等があります▼(1)ここで、 Bがプリンあるいはピリミジン残基、あるいはそれらのアナログであり; W1がH、mが1から3の整数である(PO3)m−2、保護基、あるいは結合 水酸基に反応する基であり;W2がH、PO3−2、保護基、あるいは結合水酸 基に反応する基であり; XがO、S、それぞれのRが独立してHあるいはアルキル(1−6C)であるN RあるいはCR2であり;Yがリンカー部分、必要に応じてリンカー部分を介し て結合された薬剤残基、必要に応じてリンカー部分を介して結合されたラベル、 あるいは必要に応じてリンカー部分を介して結合された、特性に影響する残基で あって、ここで、該X−Y置換基が、該(I)式のモノマーを含有するオリゴマ ーを2位に−H2あるいは−HOHを有する対応のヌクレオチドを取り込んだ該 オリゴマーよりもヌクレアーゼ処理に対してより安定にする、モノマー。
  2. 2.XがOあるいはSである、請求項1に記載のモノマー。
  3. 3.XがNRである、請求項1に記載のモノマー。
  4. 4.XがCR2である、請求項1に記載のモノマー。
  5. 5.Yが、置換されたあるいは置換されていないアルキル(2−6C)、および 置換されたあるいは置換されていないアリル(6−20C)からなる群から選択 される、ヌクレアーゼを阻害する置換基である、請求項1に記載のモノマー。
  6. 6.Yが、置換されたあるいは置換されていないアルキル(2−6C)、および 置換されたあるいは置換されていないアリル(6−20C)からなる群から選択 される、ヌクレアーゼを阻害する置換基である、請求項2に記載のモノマー。
  7. 7.Yが、置換されたあるいは置換されていないアルキル(2−6C)、および 置換されたあるいは置換されていないアリル(6−20C)からなる群から選択 される、ヌクレアーゼを阻害する置換基である、請求項3に記載のモノマー。
  8. 8.Yが、置換されたあるいは置換されていないアルキル(2−6C)、および 置換されたあるいは置換されていないアリル(5−20C)からなる群から選択 される、ヌクレアーゼを阻害する置換基である、請求項4に記載のモノマー。
  9. 9.Yが、−CH2COOEt;−CH2COOH;−CH2CONH2;およ び−CH2CONHCH2CH2NH2からなる群から選択される、請求項1に 記載のモノマー。
  10. 10.Yが、必要に応じてリンカー部分を介して結合された薬剤残基である、請 求項1に記載のモノマー。
  11. 11.Yが、必要に応じてリンカー部分を介して結合された、ネトロプシンおよ びその誘導体、アントラマイシン、キノキサリン抗生物質、アクチノマイシン、 およびピルロロ(1−4)ベンゾジアゼピン誘導体からなる群から選択される、 請求項10に記載のモノマー。
  12. 12.Yが、必要に応じてリンカー部分を介して結合されたラベルである、請求 項1に記載のモノマー。
  13. 13.Yが、必要に応じてリンカー部分を介して結合された、特性に影響する残 基である、請求項1に記載のモノマー。
  14. 14.Bが、A、T、G、C、およびUおよびその保護された形態からなる群か ら選択される、請求項1に記載のモノマー。
  15. 15.W2がホスホネート残基である、請求項1に記載のモノマー。
  16. 16.W1が保護基である、請求項1に記載のモノマー。
  17. 17.N4−ベンゾイル−5′−O−(4.4−ジメトキシトリチル)−2′− O−(エトキシカルボニルメチル)−シチジン−3′−イル−ヒドロゲンホスホ ネートの塩である、請求項1に記載のモノマー。
  18. 18.5′−O−(4.4′−ジメトキシトリチル)−2′−O−(エトキシカ ルボニルメチル)−ウリジン−3′−イル−ヒドロゲンホスホネートの塩である 、請求項1に記載のモノマー。
  19. 19.N6−ベンゾイル−5′−O−(4.4′−ジメトキシトリチル)−2′ −O−(エトキシカルボニルメチル)−アデニン−3′−イル−ヒドロゲンホス ホネートの塩である、請求項1に記載のモノマー。
  20. 20.N2−イソブチリル−5′−O−(4.4′−ジメトキシトリチル)−2 ′−O−(エトキシカルボニルメチル)−グアノシン−3′−イル−ヒドロゲン ホスホネートの塩である、請求項1に記載のモノマー。
  21. 21.5−メチル−5′−O−(4.4′−ジメトキシトリチル)−2′−O− (エトキシカルボニルメチル)−ウリジン−3′−イル−ヒドロゲンホスホネー トの塩である、請求項1に記載のモノマー。
  22. 22.5−ブロモ−5′−O−(4.4′−ジメトキシトリチル)−2′−O− (エトキシカルボニルメチル)−ウリジン−3′−イル−ヒドロゲンホスホネー トの塩である、請求項1に記載のモノマー。
  23. 23.5−メチル−N4−ベンゾイル−5′−O−(4.4′−ジメトキシトリ チル)−2′−O−(エトキシカルボニルメチル)−シチジン−3′−イル−ヒ ドロゲンホスホネートの塩である、請求項1に記載のモノマー。
  24. 24.2′−N−アシルアミノ−5′−O−(4.4′−ジメトキシトリチル) −ウリジン−3′−イル−ヒドロゲンホスホネートの塩である、請求項1に記載 のモノマー。
  25. 25.トリエチルアンモニウム塩である、請求項17から24に記載のモノマー 。
  26. 26.下記の式のオリゴマーであって;▲数式、化学式、表等があります▼(2 )ここで、 それぞれのBが、独立して、プリンあるいはピリミジン残基、あるいはそれらの アナログであり;W3およびW4が、それぞれ独立してH、PO3−2、保護基 、あるいは結合水酸基に反応する基であり;nが1から200の整数であり; それぞれのZが、独立して、その続きのヌクレオチド残基の水酸基に共有結合す るヌクレオチド結合残基であり;それぞれのAが、独立して、H、OH、あるい は保護基に誘導体化したOH、およびX−Yからなる群から選択され、ここに、 XがO、S、NR、あるいはそれぞれのRが独立してHあるいはアルキル(1− 6C)であるCR2であり;およびYが、リンカー部分、必要に応じてリンカー 部分を介して結合された薬剤残基、必要に応じてリンカー部分を介して結合され たラベル、あるいは必要に応じてリンカー部分を介して結合された、特性に影響 する残基であって;ここで、少なくとも1つのAがX−Yであり;そして、ここ で、該オリゴマーが、すべてのAがHあるいはOHであるこれに対応するオリゴ マーよりも、ヌクレアーゼに対して安定である、オリゴマー。
  27. 27.ダイマーあるいはトリマーである、請求項2に記載のオリゴマー。
  28. 28.Zが、P(O)O、P(O)S、P(O)NR2、P(O)R、CO、C NR2からなる群から選択され、ここで、RがHあるいはアルキル(1−6)、 P(O)OR′であり、ここでR′がアルキル(1−6C)およびCX2′であ り、ここで、それぞれのX′が、独立して電子求引性置換基である、請求項26 に記載のオリゴマー。
  29. 29.全てのAが前記の式X−Yである、請求項26に記載のオリゴマー。
  30. 30.少なくとも1つのAが、前記の式X−Yを有し、そして残りの全てのAが HあるいはOH、あるいはそれらのリン酸化された形態である、請求項26に記 載のオリゴマー。
  31. 31.XがOあるいはSである、請求項26に記載のオリゴマー。
  32. 32.XがNRである、請求項26に記載のオリゴマー。
  33. 33.XがCR2である、請求項26に記載のオリゴマー。
  34. 34.Yが、置換されたあるいは置換されていないアルキル(2−6C)および 置換されたあるいは置換されていないアリル(6−20C)からなる群から選択 される、ヌクレアーゼを阻害する置換基である、請求項26に記載のオリゴマー 。
  35. 35.Yが、置換されたあるいは置換されていないアルキル(2−6C)および 置換されたあるいは置換されていないアリル(6−20C)からなる群から選択 される、ヌクレアーゼを阻害する置換基である、請求項31に記載のオリゴマー 。
  36. 36.Yが、置換されたあるいは置換されていないアルキル(2−6C)および 置換されたあるいは置換されていないアリル(6−20C)からなる群から選択 される、ヌクレアーゼを阻害する置換基である、請求項32に記載のオリゴマー 。
  37. 37.Yが、置換されたあるいは置換されていないアルキル(2−6C)および 置換されたあるいは置換されていないアリル(6−20C)からなる群から選択 される、ヌクレアーゼを阻害する置換基である、請求項33に記載のオリゴマー 。
  38. 38.Yが、必要に応じてリンカー部分を介して結合された薬剤残基である、請 求項26に記載のオリゴマー。
  39. 39.Yが、必要に応してリンカー部分を介して結合された、ネトロプシンおよ びその誘導体、アントラマイシン、キノザリン抗生物質、アクチノマイシン、お よびピルロロ(1−4)ベンゾジアゼピン誘導体からなる群から選択される、請 求項38に記載のオリゴマー。
  40. 40.Yが、必要に応じてリンカー部分を介して結合されたラベルである、請求 項26に記載のオリゴマー。
  41. 41.Yが、必要に応じてリンカー部分を介して結合された、特性に影響する残 基である、請求項26に記載のオリゴマー。
  42. 42.それぞれのBが独立して、A、T、G、CおよびU、およびそれらの保護 された形態からなる群から選択される、請求項26に記載のオリゴマー。
  43. 43.2′−S−フェニルチオシチジルイル−(3′→5′)−チミジンである 、請求項26に記載のオリゴマー。
  44. 44.2′−O−(エトキシカルボニルメチル)−シチジルイル−(3′→5′ )−チミジンである、請求項26に記載のオリゴマー。
  45. 45.2′−O−アミノカルボニルメチル−(3′→5′)−チミジンである、 請求項26に記載のオリゴマー。
  46. 46.2′−O−(ヒドロキシカルボニルメチル)−シチジルイル−(3′→5 ′)−チミジンである、請求項26に記載のオリゴマー。
  47. 47.2′−O−[(2−アミノエチル)−アミノカルボニルメチル]−シチジ ルイル−(3′→5′)−チミジンである、請求項26に記載のオリゴマー。
  48. 48.2′−N−アシルアミノ−2′−デオキシウリジルイル−(3′→5′) −チミジンである、請求項26に記載のオリゴマー。
  49. 49.ヌクレオチド配列の存在に媒介される疾患を治療する方法であって、該ヌ クレオチド配列を不活性化するのに有効な量の、該ヌクレオチド配列に特異的に 結合し得る、請求項26に記載の改変されたオリゴマーを、このような治療を必 要とする被験体に投与することを包含する、方法。
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