MX2012004036A - Analogos de aminoglicosidos antibacterianos. - Google Patents

Analogos de aminoglicosidos antibacterianos.

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    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07HSUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
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    • C07H15/20Carbocyclic rings
    • C07H15/22Cyclohexane rings, substituted by nitrogen atoms
    • C07H15/222Cyclohexane rings substituted by at least two nitrogen atoms
    • C07H15/226Cyclohexane rings substituted by at least two nitrogen atoms with at least two saccharide radicals directly attached to the cyclohexane rings
    • C07H15/228Cyclohexane rings substituted by at least two nitrogen atoms with at least two saccharide radicals directly attached to the cyclohexane rings attached to adjacent ring-carbon atoms of the cyclohexane rings
    • C07H15/232Cyclohexane rings substituted by at least two nitrogen atoms with at least two saccharide radicals directly attached to the cyclohexane rings attached to adjacent ring-carbon atoms of the cyclohexane rings with at least three saccharide radicals in the molecule, e.g. lividomycin, neomycin, paromomycin
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    • A61P31/00Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/04Antibacterial agents

Abstract

Se describen los compuestos que tienen actividad antibacteriana. Los compuestos tienen la siguiente estructura (I) que incluyen los estereoisómeros, las sales y los profármacos farmacéuticamente aceptables de los mismos, en donde Q1, Q2, Q5, R1, R2, R3, Z1 y Z2 son como se definen en la presente. Se describen también los métodos de asociados con la preparación y uso de tales compuestos, así como las composiciones farmacéuticas que comprenden tales compuestos.

Description

ANALOGOS DE AMINOGLÜCOSIDOS ANTIBACTERIANOS Campo de la Invención La presente invención está dirigida a los nuevos compuestos aminoglucósidos, y a los métodos para su preparación y uso como agentes terapéuticos y profilácticos.
Antecedentes de la Invención Un interés particular en el descubrimiento de fármacos modernos es el desarrollo de nuevos fármacos de bajo peso molecular que funcionen por el enlace al ARN. El ARN, el cual sirve como un mensajero entre el ADN y las protexnas, se pensaba que era una molécula completamente flexible sin complejidad estructural significativa. Estudios recientes han revelado un carácter intrincado sorprendente en la estructura del ARN. El ARN tiene una complejidad estructural que rivaliza con las proteínas, en vez de porciones simples como el ADN. El secuenciamiento del genoma revela las secuencias de las proteínas y los ARNm que codifican para ellas. Ya que las proteínas son sintetizadas utilizando una plantilla de ARN, tales proteínas pueden ser inhibidas al prevenir su producción en primer lugar por interferencia con la traducción con el ARNm. Ya que las proteínas y los ARN son sitios potenciales para dirigir los fármacos, el número de objetivos revelados a partir de los esfuerzos de secuenciamiento del genoma, es efectivamente duplicado.
Ref . : 229401 Estas observaciones develan un mundo nuevo de oportunidades para la industria farmacéutica hacia el ARN objetivo con moléculas pequeñas .
El descubrimiento clásico de fármacos se ha enfocado a las proteínas como objetivos para la intervención. Las proteínas pueden ser extremadamente difíciles de aislar y de purificar en la forma apropiada para el uso en ensayos para selección de fármacos. Muchas proteínas requieren modificaciones post-traduccionales que ocurren únicamente en tipos celulares específicos bajo condiciones específicas. Las proteínas se pliegan en dominios globulares con núcleos hidrofóbicos y grupos hidrofílicos y cargados sobre la superficie. Múltiples subunidades frecuentemente forman complejos, los cuales pueden ser requeridos para una selección válida de los fármacos. Las proteínas membranales usualmente necesitan ser incrustadas en una membrana para conservar su forma apropiada. La unidad práctica más pequeña de una proteína que puede sr utilizada en la selección de fármacos es un dominio globular. La noción de eliminar una hélice o vuelta alfa simple de una lámina beta, y utilizarla en una selección de f rmacos, no es práctica, ya que únicamente la proteína intacta puede tener la forma tridimensional apropiada para el enlace a los fármacos. La preparación de proteínas biológicamente activas para la selección es una limitación mayor en la selección clásica de alto rendimiento. Muy a menudo un reactivo limitante en los esfuerzos de selección de alto rendimiento es una forma biológicamente activa de una proteína que puede también ser muy costosa.
Para la selección para descubrir compuestos que se enlazan a los objetivos de ARN, los procedimientos clásicos que son utilizados para las proteínas pueden ser sustituidos con nuevos procedimientos. Todos los ARN son esencialmente equivalentes en su solubilidad, facilidad de síntesis o uso en ensayos. Las propiedades físicas de los ARN son independientes de la proteína que codifican. Éstos pueden ser fácilmente preparados en gran cantidad a través de síntesis química o enzimática y no son extensamente modificados in vivo. Con el ARN, la unidad práctica más pequeña para el enlace al fármaco es el subdominio funcional. Un subdominio funcional en el ARN es un fragmento que, cuando es eliminado del ARN más grande y estudiado en aislamiento, conserva su forma biológicamente relevante y las propiedades de proteína o de enlace al ARN. El tamaño y la composición de los subdominios funcionales de ARN los hacen accesibles por síntesis enzimática o química. La comunidad de biología estructural ha desarrollado experiencia significativa en la identificación de los subdominios de ARN funcionales con el fin de facilitar los estudios estructurales mediante técnicas tales como la espectroscopia de RMN. Por ejemplo, los análogos pequeños de la región de codificación del AR r 16S (el sitio A) han sido identificados como poseedores únicamente de la región esencial, y han mostrado que se enlazan a los antibióticos de la misma manera que el ribosoma intacto.
Los sitios de enlace sobre el ARN son hidrofílicos y relativamente abiertos en comparación a las proteínas. El potencial para el reconocimiento de molécula pequeña basada en la forma es mejorado por la capacidad de deformación del ARN. El enlace de las moléculas a los objetivos específicos de ARN puede ser determinado por la conformación global y la distribución de los grupos cargados, aromáticos, que se enlazan al hidrógeno a partir de un andamiaje relativamente rígido. Se cree que las cargas positivas adecuadamente colocadas son importantes, ya que las interacciones electrostáticas de amplio intervalo pueden ser utilizadas para dirigir las moléculas hacia una bolsa de enlace con la orientación apropiada. En las estructuras donde las nucleobases son expuestas, las interacciones de apilamiento con los grupos funcionales aromáticos pueden contribuir a la interacción de enlace. La hendidura mayor del ARN proporciona muchos sitios para el enlace específicos del hidrógeno con un ligando. Éstos incluyen los átomos de nitrógeno N7 aromáticos de la adenosina y la guanosina, los átomos de oxígeno 04 y 06 de la uridina y la guanosina, y las aminas de la adenosina y la citidina. La rica diversidad estructural y secuencial del ARN sugiere que los ligandos pueden ser creados con alta afinidad y especificidad para su objetivo .
Aunque nuestro entendimiento de la estructura y el plegamiento del ARN, así como los modos en los cuales el ARN es reconocido por otros ligados, está lejos de ser entendido, ha sido realizado un progreso significativo en la última década (ver, por ejemplo, C ow, C.S.; Bogdan, F.M., Chem. Rev. , 1997, 97, 1489 and Wallis, M.G.; Schroeder, R. , Prog. Biophys. Molec. Biol . 1997, 67, 141) . A pesar del papel central que el ARN juega en la replicación de las bacterias, los fármacos que se dirigen a estos sitios de ARN primordiales de estos patógenos, son escasos. El problema cada vez mayor de la resistencia bacteriana hacia los antibióticos hace a la investigación para nuevos enlazadores del ARN de crucial importancia.
Ciertas moléculas pequeñas pueden enlazarse y bloquear las funcionales esenciales del ARN. Los ejemplos de tales moléculas incluyen los antibióticos aminoglucósidos y fármacos que se enlazan al ARNr bacteriano y liberan el peptidil-tARN y el ARNm. Los antibióticos aminoglucósidos han sido conocidos por mucho tiempo por enlazarse al ARN. Éstos ejercen sus efectos antibacterianos por el enlace a los sitios objetivo específicos en el ribosoma bacteriano. Para los antibióticos estructuralmente relacionados neamina, ribostamicina, neoraicina B, y paromomicina, el sitio de enlace ha sido localizado hacia el sitio A del ARN de la región de descodificación ribosomal procariótica 16S (ver Moazed, D.; Noller, H.F., Nature, 1987, 327, 389). El enlace de los aminoglucósidos a este objetivo de ARN interfiere con la fidelidad de la traducción del ARNm y da como resultado una mala codificación y truncamiento, lo que conduce al final a muerte de las células bacterianas (ver Alper, P.B.; Hendrix, . ; Sears, P.; Wong, C, J Am. Chem. Soc, 1998, 120, 1965) .
Existe una necesidad en la técnica para nuevas entidades químicas que funcionen contra las bacterias con actividad de amplio espectro. Quizás el reto más grande en el descubrimiento de fármacos antibacterianos que se enlazan al ARN, es la identificación de estructuras vitales comunes para las bacterias, que pueden ser deshabilitadas por el fármaco de molécula pequeña que se enlaza. Un reto en dirigirse al ARN con moléculas pequeñas, es desarrollar una estrategia química que reconozca las formas específicas del ARN. Existen tres grupos de datos que proporcionan alusiones sobre cómo hacer esto. Las interacciones de proteínas naturales con el ARN, los antibióticos de productos naturales que se enlazan al ARN, y los ARN hechos por el hombre (aptámeros) que se enlazan a las proteínas y a otras moléculas. Cada grupo de datos, no obstante, proporciona diferentes introspectivas hacia el problema.
Varias clases de fármacos obtenidos a partir de fuentes naturales han mostrado que funcionan por el enlace al ARN o a los complejos de ARN/proteína . Éstas, incluyen tres diferentes clases estructurales de antibióticos: tiostreptona, la familia de aminoglucósidos y la familia de antibióticos macrólidos. Estos ejemplos proporcionan pistas poderosas respecto a cómo pueden ser seleccionadas las moléculas pequeñas y sus objetivos. La naturaleza ha seleccionado los objetivos de ARN en el ribosoma, uno de los objetivos más antiguos y conservados en las bacterias. Ya que se desea que los fármacos antibacterianos sean potentes y tengan actividad de amplio espectro, estos procesos antiguos fundamentales para toda la vida bacteriana representan objetivos atractivos. Entre más nos acercamos a las funciones conservadas antiguas, más probable es que encontremos las formas de ARN ampliamente conservadas. Es importante también considerar la forma de la estructura equivalente en los humanos, ya que es improbable que las bacterias hayan considerado el índice terapéutico de sus ARN mientras evolucionaban.
Existe un número grande de antibióticos naturales, éstos incluyen los aminoglucósidos, tales como, quirromicina, neomicina, paromomicina, tiostreptona, y muchos otros. Éstos son compuestos bactericidas muy potentes, que se enlazan al ARN de la subunidad ribosomal pequeña. La acción bactericida es mediada por el enlace al ARN bacteriano de una manera que conduce a la mala lectura del código genético. La mala lectura del código genético durante la traducción de las proteínas membranas integrales, se piensa que produce proteínas anormales que comprometen las propiedades de barrera de la membrana bacteriana.
Los antibióticos son sustancias químicas producidas por diversas especies de microorganismos (bacterias, hongos, actinomicetos ) que suprime el crecimiento de otros microorganismos y pueden eventualmente destruirlos. Sin embargo, el uso común a menudo extiende el término antibióticos para incluir los agentes antibacterianos sintéticos, tales como las sulfonamidas , y las quinolinas, que no son productos de los microbios . El número de antibióticos que han sido identificados ahora se extiende hasta cientos, y muchos de éstos han sido desarrollados hasta la etapa donde éstos son de valor en la terapia de enfermedades infecciosas. Los antibióticos difieren notablemente en propiedades físicas, químicas y farmacológicas, espectros antibacterianos, y mecanismos de acción. En años recientes, el conocimiento de los mecanismos moleculares de la replicación bacteriana, fúngica y viral ha facilitado en gran medida el desarrollo racional de los compuestos que pueden interferir con los ciclos de vida de estos microorganismos .
Al menos 30% de todos los pacientes hospitalizados ahora reciben uno o más cursos de terapia con antibióticos, y millones de las infecciones potencialmente fatales han sido curadas. Al mismo tiempo, estos agentes terapéuticos se han convertidos entre los más mal utilizados de aquellos disponibles para el médico practicante. Un resultado del uso muy difundido de los agentes antimicrobianos ha sido la aparición de patógenos resistentes de antibióticos, lo cual a su vez ha creado una necesidad cada vez mayor para nuevos fármacos . Muchos de estos agentes han contribuido también de manera significativa a la elevación de los costos del cuidado médico .
Cuando la actividad antimicrobiana de un nuevo agente es primeramente probada, es usualmente definido un patrón de sensibilidad y de resistencia. Desafortunadamente, este espectro de actividad puede cambiar subsecuentemente a un grado notable, debido a que los microorganismos han evolucionado el arreglo de alteraciones ingeniosas discutidas anteriormente, que les permiten sobrevivir en presencia de antibióticos. El mecanismo de resistencia a fármacos varía de microorganismo a microorganismo y de fármaco a fármaco.
El desarrollo de la resistencia hacia los antibióticos usualmente involucra un cambio genético estable, heredable de generación a generación. Cualquiera de los mecanismos que dan como resultado la alteración de la composición genética bacteriana pueden operar. Mientras que la mutación es frecuentemente la causa, la resistencia a los agentes antimicrobianos puede ser adquirida a través de la transferencia del material genético de una bacteria a otra mediante transducción, transformación o conjugación.
Por las razones anteriores, mientras que ha sido realizado el progreso en este campo, existe una necesidad para nuevas entidades químicas que posean actividad antibacteriana. Además, con el fin de acelerar el proceso de descubrimiento de fármacos, son necesarios nuevos métodos para sintetizar antibióticos aminoglucósidos para proporcionar una gama de compuestos que sean potencialmente nuevos fármacos para el tratamiento de infecciones bacterianas . La presente invención cumple estas necesidades y proporciona ventajas relacionadas adicionales.
Breve Descripción de la Invención En resumen, la presente invención está dirigida a nuevos compuestos aminoglucósidos, que tienen actividad antibacteriana, incluyendo los estereoisómeros , sales y profármacos farmacéuticamente aceptables de los mismos, y el uso de tales compuestos en el tratamiento de infecciones bacterianas .
En una modalidad, los compuestos que tienen la siguiente estructura (I) son proporcionados: (O o un estereoisómero, profármaco o sal farmacéuticamente aceptable del mismo, en donde : Qi es hidroxilo, un hidroxilo protegido, amino o un grupo amino protegido; Q2 es: Qs es hidroxilo, un hidroxilo protegido, amino o un grupo amino protegido; cada Rx y R2 es, independientemente, hidrógeno o un grupo protector de amino; cada R3 es, independientemente, hidrógeno o un grupo protector de hidroxilo; cada R4 y R5 es, independientemente, hidrógeno o alquilo de 1 a 6 átomos de carbono opcionalmente sustituido con uno o más grupos halógeno, hidroxilo o amino; cada R6 es, independientemente, hidrógeno, halógeno, hidroxilo, amino o alquilo de 1 a 6 átomos de carbono; o R4 y R5 junto con los átomos a los cuales están enlazados pueden formar un anillo heterocíclico que tiene de 4 a 6 átomos en el anillo, o Rs y un R6 conjuntamente con los átomos a los cuales están enlazados, pueden formar un anillo heterocíclico que tiene de 3 a 6 átomos en el anillo, o R4 y un R6 conjuntamente con los átomos a los cuales están enlazados, pueden formar un anillo carbocíclico que tiene de 3 a 6 átomos en el anillo; cada n es, independientemente, un número entero de 0 a 4; y cada Zx y Z2 es, independientemente, hidrógeno o - 0R3, en donde (i) al menos uno de Zi y Z2 es H, (ii) al menos uno de R4 y R5 es alquilo de 1 a 6 átomos de carbono sustituido o al menos uno de R6 es halógeno, hidroxilo o amino, y (iii) los dos grupos -CH- adyacentes a los cuales están enlazados Zi y Z2, pueden formar opcionalmente un doble enlace .
En otra modalidad más, son proporcionados los compuestos que tienen la siguiente estructura (I) : ( o un estereoisómero, profármaco o sal farmacéuticamente aceptable del mismo, en donde : Qi es hidroxilo, un hidroxilo protegido, amino o un grupo amino protegido; Q2 es alquilo opcionalmente sustituido con uno o más halógeno, hidroxilo, amino, cicloalquilo opcionalmente sustituido o heterociclilo opcionalmente sustituido, ?? o Q5 es hidroxilo, un hidroxilo protegido, amino o un grupo amino protegido; Cada Ri y R2 es, independientemente, hidrógeno o un grupo protector de amino ,· cada R3 es, independientemente, hidrógeno o un grupo protector de hidroxilo; cada R4 y R5 es, independientemente, hidrógeno o alquilo de 1 a 6 átomos de carbono opcionalmente sustituido con uno o más grupos halógeno, hidroxilo o amino; cada R6 es, independientemente, hidrógeno, halógeno, hidroxilo, amino o alquilo de 1 a 6 átomos de carbono; o R4 y R5 junto con los átomos a los cuales están enlazados pueden formar un anillo heterocíclico que tiene de 4 a 6 átomos en el anillo, o R5 y un R6 conjuntamente con los átomos a los cuales están enlazados, pueden formar un anillo heterocíclico que tiene de 3 a 6 átomos en el anillo, o R4 y un R6 conjuntamente con los átomos a los cuales están enlazados, pueden formar un anillo carbocíclico que tiene de 3 a 6 átomos en el anillo o R7 y R8 junto con el átomo al cual están enlazados, pueden formar un anillo heterocíclico que tiene de 3 a 6 átomos en el anillo; cada R9 es, independientemente, hidrógeno, hidroxilo, amino o alquilo de 1 a 6 átomos de carbono opcionalmente sustituido con uno o más de halógeno, hidroxilo o amino ; cada Rio es, independientemente, hidrógeno, halógeno, hidroxilo, amino o alquilo de 1 a 6 átomos de carbono ; cada Ru es, independientemente, hidrógeno, halógeno, amino o alquilo de 1 a 6 átomos de carbono; o R9 y un Ru junto con los átomos a los cuales están enlazados pueden formar un anillo heterocíclico que tiene de 3 a 6 átomos en el anillo, o R4 y un Ru junto con los átomos a los cuales están enlazados pueden formar un anillo carbocíclico que tiene de 3 a 6 átomos en el anillo; cada n es, independientemente, un número entero de 0 a 4; cada p es, independientemente, un número entero de 1 a 4; y cada Zx y Z2 es, independientemente, hidrógeno u - OR3, en donde (i) al menos uno de Zi y Z2 es hidrógeno, y (ii) los dos grupos -CH- adyacentes a los cuales están enlazados 1 y Z2 pueden formar opcionalmente un doble enlace.
En otra modalidad más, es proporcionada una composición' farmacéutica que comprende un compuesto que tiene la estructura (I) , o un estereoisómero, sal farmacéuticamente aceptable o profármaco del mismo, y un portador, diluyente o excipiente farmacéuticamente aceptables.
En otra modalidad más, se proporciona un método para utilizar un compuesto que tiene la estructura (I) en terapia. En particular, la presente invención proporciona un método de tratamiento de una infección bacteriana en un mamífero, que comprende administrarle a un mamífero en necesidad de la misma, una cantidad efectiva de un compuesto que tiene la estructura (I) , o un estereoisómero, sal farmacéuticamente aceptable o profármaco del mismo. Además, la presente invención proporciona un método para tratar una infección bacteriana en un mamífero, que comprende administrarle a un mamífero en necesidad de la misma, una cantidad efectiva de una composición farmacéutica que comprende un compuesto que tiene la estructura (I) , o un estereoisómero, sal farmacéuticamente aceptable o profármaco del mismo, y un portador, diluyente o excipiente farmacéuticamente aceptables .
Estos y otros aspectos de la invención serán aparentes con referencia a la siguiente descripción detallada.
Descripción Detallada de la Invención En la siguiente descripción, se describen ciertos detalles específicos con . el fin de proporcionar un entendimiento completo de las diversas modalidades de la invención. No obstante, una persona experta en la técnica entenderá que la invención puede ser practicada sin estos detalles .
A no ser que el contexto lo requiera de otro modo, a todo lo largo de la presente especificación, y las reivindicaciones, la palabra "comprender" y variantes de la misma, tales como, "comprendes" y "que comprende" deben ser consideradas en un sentido incluyente, abierto, es decir como que "incluye, pero no está limitado a".
La referencia a todo lo largo de esta especificación a "una modalidad" significa que una característica, rasgo o estructura particular descrita en conexión con la modalidad es incluida en al menos una modalidad de la presente invención. De este modo, las apariciones de la frase "en una modalidad" en diversos sitios a todo lo largo de esta especificación no son necesariamente todos referentes a la misma modalidad. Además, los rasgos, estructuras o características particulares pueden ser combinados de cualquier manera adecuada en una o más modalidades .
"Amino" se refiere al radical -NH2.
"Ciano" se refiere al radical -CN.
"Hidroxi" o "hidroxilo" se refiere al radical -OH.
"Imino" se refiere al sustituyente =NH.
"Nitro" se refiere al radical -N02.
"Oxo" se refiere al sustituyente =0.
"Tioxo" se refiere al sustituyente =S.
"Alquilo" se refiere a un radical hidrocarburo de cadena lineal o ramificada que consiste únicamente de átomos de carbono e hidrógeno, que está saturado o insaturado (por ejemplo, contiene uno o más dobles y/o triples enlaces) , que tiene de uno a doce átomos de carbono (alquilo de 1 a 12 átomos de carbono) , preferentemente de uno a ocho átomos de carbono (alquilo de 1 a 8 átomos de carbono) o de uno a seis átomos de carbono (alquilo de 1 a 6 átomos de carbono) , y que está enlazado al resto de la molécula por un enlace sencillo, por ejemplo, metilo, etilo, n-propilo, 1-metiletilo (iso-propilo) , n-butilo, n-pentilo, 1 , 1-dimetiletilo (t-butilo) , 3-metilhexilo, 2-metilhexilo, etenilo, prop- 1-enilo, but-1-enilo, pent-l-enilo, penta-1, 4-dienilo, etinilo, propinilo, butinilo, pentinilo, hexinilo, y similares. A no ser que se establezca de otro modo específicamente en la especificación, un grupo alquilo puede estar opcionalmente sustituido.
"Alquileno" o "cadena de alquileno" se refiere a una cadena de hidrocarburo divalente lineal o ramificada que enlaza al resto de la molécula a un grupo radical, que consiste únicamente de carbono e hidrógeno, que está saturada o instaurada (por ejemplo, que contiene uno o más dobles y/o triples enlaces) , y que tiene de uno a doce átomos de carbono, por ejemplo, metileno, etileno, propileno, n-butileno, etenileno, propenileno, n-butenileno, propinileno, r2-butinileno, y similares. La cadena de alquileno está enlazada al resto de la molécula a través de un enlace sencillo o doble y al grupo radical a través de un enlace sencillo o doble. Los puntos de enlace de la cadena de alquileno al resto de la molécula y al grupo de radicales pueden ser a través de un átomo de carbono o cualesquiera dos átomos de carbono dentro de la cadena. A no ser que se establezca de otro modo específicamente en la especificación, una cadena de alquileno puede estar opcionalmente sustituida.
"Alcoxi" se refiere a un radical de la fórmula -ORa donde Ra es un radical alquilo como se define anteriormente contiene uno a doce átomos de carbono. A no ser que se establezca de otro modo específicamente en la especificación, un grupo alcoxi puede estar opcionalmente sustituido.
"Alquilamino" se refiere a un radical de la fórmula -NHRa o -NRaRa donde cada Ra es, independientemente, un radical alquilo como se define anteriormente que contiene uno a doce átomos de carbono. A no ser que se establezca de otro modo, específicamente en la especificación, un grupo alquilamino puede estar opcionalmente sustituido.
"Tioalquilo" se refiere a un radical de la fórmula -SRa donde Ra es un radical alquilo como se define anteriormente que contiene uno a doce átomos de carbono . A no ser que se establezca de otro modo específicamente en la especificación, un grupo tioalquilo puede estar opcionalmente sustituido .
"Arilo" se refiere a un radical de sistema de anillo hidrocarburo que comprende hidrógeno, 6 a 18 átomos de carbono y al menos un anillo aromático. Para los propósitos de esta invención, el radical arilo puede ser un sistema de anillo monocíclico, bicíclico, tricíclico o tetracíclico, el cual puede incluir sistemas de anillos fusionados o unidos en puente. Los radicales arilo incluyen, pero no están limitados a, radicales arilo derivados de aceantrileno, acenaftileno , acefenantrileno, antraceno, azuleno, benceno, criseno, fluoranteno, fluoreno, as-indaceno, s-indaceno, indano, indeno, naftaleno, fenaleno, fenantreno, pleiadeno, pireno, y trifenileno. A no ser que se establezca de otro modo específicamente en la especificación, el término "arilo" o el prefijo "ar-" (tal como un "aralquilo") se entiende que incluye los radicales arilo que están opcionalmente sustituidos .
"Aralquilo" se refiere a un radical de la fórmula -R -Rc en donde Rb es una cadena de alquileno como se define anteriormente y Rc es uno o más radicales arilo como se definen anteriormente, por ejemplo, bencilo, difenilmetilo y similares. A no ser que se establezca de otro modo específicamente en la especificación, un grupo aralquilo puede estar opcionalmente sustituido.
"Cicloalquilo" o "anillo carbocíclico" se refiere a un radical hidrocarburo monocíclico o policíclico no aromático, estable que consiste únicamente de átomos de carbono y de hidrógeno, el cual puede incluir los sistemas de anillo fusionado o unidos en puente, que tienen de tres a quince átomos de carbono, preferentemente que tienen de tres a diez átomos de carbono, y que están saturados o insaturados y enlazados al resto de la molécula por un enlace simple. Los radicales monocíclicos incluyen, por ejemplo, ciclopropilo, ciclobutilo, ciclopentilo, ciclohexilo, cicloheptilo, y ciclooctilo. Los radicales policíclicos incluyen, por ejemplo, adamantilo, norbornilo, decalinilo, 7 , 7-dimetil-biciclo [2.2.1] heptanilo, y similares. A no ser que se establezca de otro modo específicamente en la especificación, un grupo cicloalquilo puede estar opcionalmente sustituido.
"Cicloalquilalquilo" se refiere a un radical de la fórmula - bRd donde Rd es una cadena de alquileno como se define anteriormente y Rg es un radical cicloalquilo como se define anteriormente. A no ser que se establezca de otro modo específicamente en la especificación, un grupo cicloalquilalquilo puede estar opcionalmente sustituido.
"Fusionado" se refiere a cualquier estructura de anillo descrita en la presente la cual está fusionada a una estructura de anillo existente en los compuestos de la invención. Cuando el anillo fusionado es un anillo heterociclilo o un anillo heteroarilo, cualquier átomo de carbono sobre la estructura de anillo existente puede volverse parte del anillo heterociclilo fusionado o del anillo heteroarilo fusionado puede ser reemplazado con un átomo de nitrógeno.
"Halo" o "halógeno" se refiere bromo, cloro, fluoro o yodo.
"Haloalquilo" se refiere a un radical alquilo, como se define anteriormente, que está sustituido con uno o más radicales halo, como se definieron anteriormente, por ejemplo, trifluorometilo, difluorometilo, triclorometilo, 2 , 2 , 2-trifluoroetilo, 1 , 2-difluoroetilo, 3-bromo-2-fluoropropilo, 1 , 2 -dibromoetilo, y similares. A no ser que se establezca de otro modo específicamente en la especificación, un grupo haloalquilo puede estar opcionalmente sustituido.
"Heterociclilo" o "anillo heterocíclico" se refiere a un radical de anillo no aromático estable de 3 a 18 miembros que consiste de dos a doce átomos de carbono y de uno a seis heteroátomos seleccionados del grupo que consiste de nitrógeno, oxígeno y azufre. A no ser que se establezca de otro modo específicamente en la especificación, el radical heterociclilo puede ser un sistema de anillo monocíclico, bicíclico, tricíclico o tetracíclico, el cual puede incluir los sistemas de anillo fusionados o unidos en puente; y los átomos de nitrógeno, carbono o azufre en el radical heterociclilo pueden estar opcionalmente oxidados; el átomo de nitrógeno puede estar opcionalmente cuaternizado; y el radical heterociclilo puede estar parcialmente o completamente saturado. Los ejemplos de tales radicales heterociclilo incluyen, pero no están limitados a, dioxolanilo, tienil [1 , 3] ditianilo, decahidroisoquinolilo, imidazolinilo, imidazolidinilo, isotiazolidinilo, isoxazolidinilo, morfolinilo, octahidroindolilo, octahidroisoindolilo, 2-oxopiperazinilo, 2-oxopiperidinilo, 2 -oxopirrolidinilo , oxazolidinilo, piperidinilo , piperazinilo, 4 -piperidonilo, pirrolidinilo, pirazolidinilo, quinuclidinilo, tiazolidinilo, tetrahidrofurilo, tritianilo, tetrahidropiranilo, tiomorfólinilo, tiamorfolinilo, 1-oxo-tiomorfolinilo, y 1, 1-dioxo-tiomorfolinilo . A no ser que se establezca de otro modo específicamente en la especificación, un grupo heterociclilo puede estar opcionalmente sustituido.
"N-heterociclilo" se refiere a un radical heterociclilo como se define anteriormente, que contiene al menos un nitrógeno y en donde el punto de enlace del radical heterociclilo al resto de la molécula es a través de un átomo de nitrógeno en el radical heterociclilo. A no ser que se establezca de otro modo específicamente en la especificación, un grupo N-heterociclilo puede estar opcionalmente sustituido.
"Heterociclilalquilo" se refiere a un radical de la fórmula -RbRe donde Rb es una cadena de alquileno como se define anteriormente y Re es un radical heterociclilo como se define anteriormente, y si el heterociclilo es un heterociclilo que contiene nitrógeno, el heterociclilo puede estar enlazado al radical alquilo en el átomo de nitrógeno. A no ser que se establezca de otro modo específicamente en la especificación, un grupo heterociclilalquilo puede estar opcionalmente sustituido.
"Heteroarilo" se refiere a un radical del sistema de anillo de 5 a 14 miembros que comprende átomos de hidrógeno, uno a trece átomos de carbono, uno a seis heteroátomos seleccionados del grupo que consiste de nitrógeno, oxígeno y azufre, y al menos un anillo aromático. Para los propósitos de esta invención, el radical heteroarilo puede ser un sistema de anillo monocíclico, bicíclico, tricíclico o tetracíclico, el cual puede incluir los sistemas de anillo fusionados o unidos en puente; y los átomos de nitrógeno, carbono o azufre en el radical heteroarilo pueden estar opcionalmente oxidados; el átomo de nitrógeno puede estar opcionalmente cuaternizado . Los ejemplos incluyen, pero no están limitados a, azepinilo, acridinilo, bencimidazolilo, benzotiazolilo, bencindolilo, benzodioxolilo, benzofuranilo, benzooxazolilo, benzotiazolilo, benzotiadiazolilo, benzo [b] [1 , 4] dioxepinilo, 1, 4-benzodioxanilo, benzonaftofuranilo, benzoxazolilo, benzodioxolilo, benzodioxinilo, benzopiranilo, benzopiranonilo, benzofuranilo, benzofuranonilo, benzotienilo (benzotiofenilo) , benzotriazolilo, benzo [4 , 6] imidazo [1 , 2-a] piridinilo, carbazolilo, cinolinilo, dibenzofuranilo, dibenzotiofenilo, furanilo, furanonilo, isotiazolilo, imidazolilo, indazolilo, indolilo, indazolilo, isoindolilo, indolinilo, isoindolinilo, isoquinolilo, indolizinilo, isoxazolilo, naftiridinilo, oxadiazolilo, 2-oxoazepinilo, oxazolilo, oxiranilo, 1-oxidopiridinilo, 1-oxidopirimidinilo, 1-oxidopirazinilo, 1-oxidopiridazinilo, 1-fenil-lH-pirrolilo, fenazinilo, fenotiazinilo, fenoxazinilo, ftalazinilo, pteridinilo, purinilo, pirrolilo, pirazolilo, piridinilo, pirazinilo, pirimidinilo, piridazinilo, quinazolinilo, quinoxalinilo, quinolinilo, quinuclidinilo, isoquinolinilo, tetrahidroquinolinilo, tiazolilo, tiadiazolilo, triazolilo, tetrazolilo, triazinilo, y tiofenilo (por ejemplo, tienilo) . A no ser que se establezca de otro modo específicamente en la especificación, un grupo heteroarilo puede estar opcionalmente sustituido.
"N-heteroarilo" se refiere a un radical heteroarilo como se define anteriormente que contiene al menos un nitrógeno y donde el punto de enlace del radical heteroarilo al resto de la molécula es a través de un átomo de nitrógeno en el radical heteroarilo. A no ser que se establezca de otro modo específicamente en la especificación, un grupo N-heteroarilo puede estar opcionalmente sustituido.
"Heteroarilalquilo" se refiere a un radical de la fórmula --¾>Rf en donde ¾, es una cadena de alquileno como se define anteriormente y Rf es un radical heteroarilo como se define anteriormente. A no ser que se establezca de otro modo específicamente en la especificación, un grupo heteroarilalquilo puede estar opcionalmente sustituido.
El término "sustituido" utilizado en la presente significa cualquiera de los grupos anteriores (por ejemplo, alquilo, alquileno, alcoxi, alquilamino, tioalquilo, arilo, aralquilo, cicloalquilo, cicloalquilalquilo, haloalquilo, heterociclilo, JV-heterociclilo, heterociclilalquilo, heteroarilo, ¿V-heteroarilo y/o heteroarilalquilo) en donde al menos un átomo de hidrógeno es reemplazado por un enlace a átomos no de hidrógeno tales como, pero no limitados a: un átomo de halógeno tal como flúor, cloro, bromo , y yodo; un átomo de oxígeno en grupos tales como los grupos hidroxilo, grupos alcoxi y grupos éster; un átomo de azufre en grupos tales como los grupos tiol, grupos tioalquilo, grupos sulfona, grupos sulfonilo, y grupos sulfóxido; un átomo de nitrógeno en grupos tales como aminas, amidas, alquilaminas , dialquilaminas , arilaminas, alquilarilaminas , diarilaminas, N-óxidos, imidas, y enaminas; un átomo de silicio en grupos tales como los grupos trialquilsililo, los grupos, dialquilarilsililo, los grupos alquildiarilsililo, y los grupos triarilsililo; y otros heteroátomos en otros diversos grupos. "Sustituido" también significa cualquiera de los grupos anteriores en los cuales uno o más átomos de hidrógeno son reemplazados por un enlace de orden superior (por ejemplo, un doble o triple enlace) a un heteroátomo tal como oxígeno en oxo, carbonilo, carboxilo, y los grupos éster; y nitrógeno en grupos tales como las iminas, oximas, hidrazonas, y nitrilos. Por ejemplo, "sustituido" incluye cualquiera de los grupos anteriores en los cuales uno o más de los átomos de hidrógeno son reemplazados con -NRgRh; -NRgC(=0)Rh, -NRgC(=0)NRgRh, -NRgC ( =0) 0Rh, -NRgC (=NRg) NRgRh, -NRgS02Rh, -OC(=0) NRgRh, -ORg, -SRg, -SORg, -S02Rg, -0S02Rg, -S02ORg, =NS02Rg, y -S02NRgRh. "Sustituido" también significa cualquiera de los grupos anteriores en los cuales uno o más átomos de hidrógeno son reemplazados con -C(=0)Rg, -C(=0)ORg, -C (=0) NRgRh, -CH2S02Rg, -CH2S02NRgRh . En lo anterior, Rg y Rh son los mismos o diferentes e independientemente son hidrógeno, alquilo, alcoxi, alquilamino, tioalquilo, arilo, aralquilo, cicloalquilo, cicloalquilalquilo, haloalquilo, heterociclilo, N-heterociclilo, heterociclilalquilo, heteroarilo, N-heteroarilo y/o heteroarilalquilo.
"Sustituido" significa además cualquiera de los grupos anteriores en los cuales uno o más átomos de hidrógeno son reemplazados con un enlace a un grupo amino, ciano, hidroxilo, imino, nitro, oxo, tioxo, halo, alquilo, alcoxi, alquilamino, tioalquilo, arilo, aralquilo, cicloalquilo, cicloalquilalquilo, haloalquilo, heterociclilo, N-heterociclilo, heterociclilalquilo, heteroarilo, N-heteroarilo y/o heteroarilalquilo. Además, cada uno de los sustituyentes anteriores puede también estar opcionalmente sustituido con uno o más de los sustituyentes anteriores.
El término "grupo protector", como se utiliza en la presente, se refiere a una porción química lábil la cual es conocida en la técnica por proteger grupos reactivos incluyendo sin limitación, los grupos hidroxilo y amino, contra las reacciones no deseadas durante los procedimientos sintéticos . Los grupos hidroxilo y amino que están protegidos con un grupo protector son denominados en la presente como "grupos hidroxilo protegidos" y "grupos amino protegidos", respectivamente. Los grupos protectores son típicamente utilizados de manera selectiva y/u ortogonalmente para proteger sitios durante las reacciones en otros sitios reactivos, y pueden ser luego eliminados para dejar el grupo no protegido tal cual o disponible para las reacciones futuras . Los grupos protectores como son conocidos en la técnica son descritos . en general en Greene y Wuts, Protective Groups in Organic Synthesis, 3a edición, John Wiley & Sons, New York (1999) . Los grupos pueden ser selectivamente incorporados dentro de los aminoglucósidos de la invención como precursores. Por ejemplo, un grupo amino puede ser colocado dentro de un compuesto de la invención como un grupo azido que puede ser químicamente convertido al grupo amino en un punto deseado en la síntesis. En general, los grupos son protegidos o están presentes como un precursor que será inerte para las reacciones que modifican otras áreas de la molécula progenitora para la conversión en sus grupos finales en un tiempo apropiado. Los grupos protectores o precursores representativos adicionales son discutidos en Agrawal, et al., Protocols for Oligonucleotide Conjugatas, Eds, Humana Press,· New Jersey, 1994; Vol. 26 pp. 1-72. Los ejemplos de "grupos protectores de hidroxilo" incluyen, pero no están limitados a, t-butilo, t-butoximetilo, metoximetilo, tetrahidropiranilo, 1-etoxietilo, 1- (2-cloroetoxi) etilo, 2-trimetilsililetilo, p-clorofenilo, 2 , 4 -dinitrofenilo, bencilo, 2 , 6-diclorobencilo, difenilmetilo, p-nitrobencilo, trifenilmetilo, trimetilsililo , trietilsililo, t-butildimetilsililo, t-butildifenilsililo (TBDPS) , trifenilsililo, benzoilformiato, acetato, cloroacetato, tricloroacetato, trifluoroacetato, pivaloato, benzoato, p-fenilbenzoato, carbonato de 9-fluorenilmetilo, mesilato y tosilato. Los ejemplos de "grupos protectores de amino" incluyen, pero no están limitados a, los grupos protectores de carbamato, tales como 2-trimetilsiletoxicarbonilo (Teoc) , 1-metil-l- (4 -bifenilil) etoxicarbonilo (Bpoc) , t-butoxicarbonilo (BOC) , aliloxicarbonilo (Alloc) , 9-fluorenilmetiloxicarbonilo (Fmoc) , y benciloxicarbonilo (Cbz) ; los grupos protectores de amida, tales como los grupos formilo, acetilo, trihaloacetilo, benzoilo, y nitrofenilacetilo; los grupos protectores de sulfonamida, tales como 2-nitrobencensulfonilo; y los grupos protectores de imina e imida cíclica, tales como ftalimido y ditiasuccinoilo .
Se entiende que "profármaco" indica un compuesto que puede ser convertido bajo condiciones fisiológicas, o mediante solvólisis, a un compuesto biológicamente activo de la invención. De este modo, el término "prof rmaco" se refiere a un precursor metabólico de un compuesto de la invención que es farmacéuticamente aceptable. Un profármaco puede estar inactivo cuando es administrado a un sujeto en necesidad del mismo, pero es convertido in vivo a un compuesto activo de la invención. Los profármacos son típicamente transformados de manera rápida in vivo para producir un compuesto progenitor de la invención, por ejemplo, mediante hidrólisis en la sangre. El compuesto profármaco a menudo ofrece ventajas de solubilidad, compatibilidad de tejido o liberación retardada en un organismo mamífero (ver, Bundgard, H., Design of Prodrugs (1985), pp. 7-9, 21-24 (Elsevier, Amsterdam) ) . Una discusión de los profármacos es proporcionada en Higuchi, T., et al, A.C.S. Symposium Serias, Vol . 14, y en Bioreversible Carriers en Drug Design, Ed. Edward B. Roche, American Pharmaceutical Association and Pergamon Press, 1987.
El término "profármaco" se entiende también que incluye cualesquiera portadores covalentemente enlazados, los cuales liberan el compuesto activo de la invención in vivo cuando tal profármaco es administrado a un sujeto mamífero. Los profármacos de un compuesto de la invención pueden ser preparados mediante la modificación de los grupos funcionales presentes en el compuesto de la invención, de una manera tal que las modificaciones son escindidas, ya sea en manipulación rutinaria o in vivo, al compuesto progenitor de la invención. Los profármacos incluyen los compuestos de la invención en donde un grupo hidroxilo, amino o mercapto está enlazado a cualquier grupo que, cuando el profármaco del compuesto de la invención es administrado a un sujeto mamífero, se rompe para formar un grupo hidroxilo libre, amino libre o mercapto libre, respectivamente. Los ejemplos de profármacos incluyen, pero no están limitados a, derivados de acetato, formiato y benzoato de los derivados de alcohol o amida de los grupos funcionales amina en los compuestos de la invención, y similares.
La invención descrita en la presente se entiende que también abarca todos los compuestos farmacéuticamente aceptables de la estructura (I) que son isotópicamente marcados por tener uno o más átomos reemplazados con un átomo que tiene una masa atómica diferente o un número de masa diferente. Los ejemplos de isótopos que pueden ser incorporados dentro de los compuestos incluyen los isótopos de hidrógeno, carbono, nitrógeno, oxígeno, fósforo, flúor, cloro, y yodo, tales como 2H, 3H, "C, 13C, 14C, 13N, 15N, 150, 170, 180, 31P, 32P, 35S, 18F, 36C1, 123I, y 125I, respectivamente. Estos compuestos radiomarcados podrían ser útiles para ayudar a determinar o a medir la efectividad de los compuestos, mediante caracterización, por ejemplo, del sitio o del modo de acción, o la afinidad de enlace al sitio de acción farmacológicamente importante. Ciertos compuestos isotópicamente marcados de la estructura (I) , por ejemplo, aquellos que incorporan un isótopo radioactivo, son útiles en los estudios de distribución tisular de fármacos y/o sustratos. Los isótopos radioactivos tritio, por ejemplo, 3H, y carbono 14, por ejemplo, 1C, son particularmente útiles para este propósito en vista de su facilidad de incorporación y medios de detección listos.
La sustitución con isótopos más pesados tales como deuterio, por ejemplo, 2H, puede proporcionar ciertas ventajas terapéuticas que resultan de mayor estabilidad metabólica, por ejemplo, vida media in vivo incrementada o requerimientos de dosificación reducida, y por lo tanto pueden ser preferidos en algunas circunstancias.
La sustitución con isótopos . emisores de positrones, tales como ^C, 18F, 150 y 13N, pueden ser útiles en los estudios de Topografía de Emisión de Positrones (PET, por sus siglas en inglés) para examinar la ocupación de receptores del sustrato. Los compuestos isotópicamente marcados de la estructura (I) pueden ser en general preparados mediante técnicas convencionales conocidas por aquellos expertos en la materia o mediante procesos análogos a aquellos descritos en las Preparaciones y Ejemplos como se detallan más adelante, utilizando un reactivo isotópicamente marcado apropiado, en lugar del reactivo no marcado, previamente empleado.
Se entiende que la invención descrita en la presente también abarca los productos metabólicos in vivo de los compuestos descritos. Tales productos pueden resultar de, por ejemplo, la oxidación, reducción, hidrólisis, amidación, esterificación, y similares del compuesto administrado, principalmente debido a los procesos enzimáticos. En consecuencia, la invención incluye los compuestos producidos mediante un proceso que incluye la administración de un compuesto de esta invención a un mamífero, por un periodo de tiempo suficiente para producir un producto metabólico del mismo. Tales productos son típicamente identificados al administrar un compuesto radiomarcado de la invención en una dosis detectable a un animal, tales como rata, ratón, cobayo, mono o a un humano, permitiendo que ocurra un tiempo suficiente para el metabolismo, y aislando sus productos de conversión a partir de la orina, la sangre u otras muestras biológicas.
"Compuesto estable" y "estructura estable" se entiende que indican un compuesto que es suficientemente robusto para sobrevivir al aislamiento a un grado útil de pureza a partir de una mezcla de reacción, y la formulación en un agente terapéutico eficaz.
"Mamífero" incluye los humanos y animales domésticos, tales como animales de laboratorio y mascotas domésticas (por ejemplo, gatos, perros, cerdos, reces, ovejas, cabras, caballos, conejos) , y animales no domésticos tales como de la vida silvestre y similares.
"Opcional" u "opcionalmente" significa que el evento de circunstancias subsecuentemente descrito, puede o no ocurrir, y que la descripción incluye los casos donde dicho evento o circunstancia ocurre, y los casos en los cuales no ocurre. Por ejemplo, "arilo opcionalmente sustituido" significa que el radical arilo puede o no estar sustituido y que la descripción incluye los radicales arilo sustituido y los radicales que no tienen sustitución.
"Portador, diluyente o excipiente farmacéuticamente aceptable" incluye sin limitación cualquier adyuvante, portador, excipiente, deslizante, agente endulzante, diluyente, conservante, pigmento/colorante, aumentador del sabor, tensioactivo, agente humectante, agente dispersante, agente suspensor, estabilizador, agente isotónico, solvente, o emulsificante que ha sido aprobado por la Administración de Alimentos y Fármacos de los Estados Unidos (FDA) como aceptable para el uso en humanos o en animales domésticos.
"Sal farmacéuticamente aceptable" incluye las sales por adición de ácido y base.
"Sal por adición de ácido farmacéuticamente aceptable" se refiere a aquellas sales que conservan la efectividad y las propiedades biológicas de las base libres, que no son biológicamente o de otro modo indeseables, y que son formadas con ácidos inorgánicos tales como, pero no son limitados a, ácido clorhídrico, ácido bromhídrico, ácido sulfúrico, ácido nítrico, ácido fosfórico, y similares, y ácidos orgánicos tales como, pero no limitados a, ácido acético, ácido 2 , 2-dicloroacético, ácido adípico, ácido algínico, ácido ascórbico, ácido aspártico, ácido bencensulfónico, ácido benzoico, ácido 4 -acetamidobenzoico, ácido canfórico, ácido canfor-10-sulfónico, ácido cáprico, ácido caproico, ácido caprílico, ácido carbónico, ácido cinámico, ácido cítrico, ácido ciclámico, ácido dodecilsulfúrico, ácido etan-1 , 2-disulfónico, ácido etansulfónico, ácido 2 -hidroxietansulfónico, ácido fórmico, ácido fumárico, ácido galactárico, ácido gentísico, ácido glucoheptónico, ácido glucónico, ácido glucurónico, ácido glutámico, ácido glutárico, ácido 2 -oxo-glutárico, ácido glicerofosfórico, ácido glicólico, ácido hipúrico, ácido isobutírico, ácido láctico, ácido lactobiónico, ácido láurico, ácido maleico, ácido málico, ácido malónico, ácido mandélico, ácido metansulfónico, ácido múcico, ácido naftalen-1, 5-disulfónico, ácido naftalen-2-sulfónico, ácido l-hidroxi-2-naftoico, ácido nicotínico, ácido oleico, ácido orótico, ácido oxálico, ácido palmítico, ácido pamoico, ácido propiónico, ácido piroglutámico, ácido pirúvico, ácido salicílico, ácido 4-aminosalicílico, ácido sebácico, ácido esteárilo, ácido succínico, ácido tartárico, ácido tiociánico, ácido p-toluensulfónico, ácido trifluoroacético, ácido undecilénico, y similares.
Las "sales por adición de base farmacéuticamente aceptables" se refieren a aquellas sales que conservan la efectividad y las propiedades biológicas de los ácidos libres, que no son biológicamente o de otro modo, indeseables . Estas sales son preparadas a partir de la adición de una base inorgánica o una base orgánica al ácido libre. Las sales derivadas de las bases inorgánicas incluyen, pero no están limitadas a, las sales de sodio, potasio, litio, amonio, calcio, magnesio, hierro, zinc, cobre, manganeso, aluminio y similares. Las sales inorgánicas preferidas son las sales de amonio, sodio, potasio, calcio y magnesio. Las sales derivadas de bases orgánicas incluyen, pero no están limitadas a, las sales de aminas primarias, secundarias, y terciarias, aminas sustituidas incluyendo aminas sustituidas de origen natural, aminas cíclicas y resinas de intercambio de iones básicos, tales como amonio, isopropilamina , trimetilamina, dietilamina, trietilamina, tripropilamina, dietanolamina, etanolamina, decanol , 2 - dimetilaminoetanol , 2-dietilaminoetanol , diciclohexilamina, lisina, arginina, histidina, cafeína, procaína, hidrabamina, colina, betaína, benetamina, benzatina, etilendiamina, glucosamina, metilglucamina, teobromina, trietanolamina, trometamina, purinas, piperazina, piperidina, N-etilpiperidina, resinas de poliamina y similares. Las bases orgánicas particularmente preferidas son la isopropilamina, dietilamina, etanolamina, trimetilamina, diciclohexilamina, colina y cafeína.
A menudo las cristalizaciones producen un solvato del compuesto de la invención. Como se utiliza en la presente, el término "solvato" se refiere a un agregado que comprende una o más moléculas de un compuesto de la invención con una o más moléculas de solvente. El solvente puede ser agua, en cuyo caso el solvente puede ser un hidrato. Alternativamente, el solvente puede ser un solvente orgánico. De este modo, los compuestos de la presente invención pueden existir como un hidrato, incluyendo un monohidrato, dihidrato, hemihidrato, sesquihidrato, trihidrato, tetrahidrato y similares, así como las formas solvatadas correspondientes. El compuesto de la invención pueden ser solvatos verdaderos, mientras que en otros casos, el compuesto de la invención puede retener meramente agua adventicia o ser una mezcla de agua más algún solvente adventicio.
Una "composición farmacéutica" se refiere a una formulación de un compuesto de la invención y un medio generalmente aceptado en la técnica para la distribución del compuesto biológicamente activo a mamíferos, por ejemplo, humanos. Tal medio incluye todos los portadores, diluyentes o excipientes farmacéuticamente aceptables para el mismo.
"Cantidad efectiva" o "cantidad terapéuticamente efectiva" se refiere a aquella cantidad de un compuesto de la invención la cual, cuando se administra a un mamífero, preferentemente un humano, es suficiente para efectuar el tratamiento, como se define más adelante, de una infección bacteriana en el mamífero, preferentemente un humano. La cantidad de un compuesto de la invención que constituye una "cantidad terapéuticamente efectiva" variará dependiendo del compuesto, la condición y su severidad, la manera de administración, y la edad del mamífero que se trate, pero puede ser determinada rutinariamente por una persona de experiencia ordinaria en la técnica tomando en consideración su propio conocido y esta descripción.
"Tratar" o "tratamiento" como se utiliza en la presente, cubre el tratamiento del trastorno o condición de interés en un mamífero, preferentemente un humano, que tiene el trastorno o la condición de interés e incluye: (i) prevenir que ocurre el trastorno o la condición en un mamífero, en particular, cuando tal mamífero está predispuesto a la condición pero no ha sido todavía diagnosticado como poseedor de la misma; (ii) inhibir el trastorno o la condición, por ejemplo, deteniendo su desarrollo; (iii) aliviar el trastorno o la condición, por ejemplo, provocando la regresión del trastorno o la condición; o (iv) aliviar los síntomas que resultan del trastorno o la condición, por ejemplo, aliviando el dolor sin dirigirse al trastorno o condición subyacente. Como se utilizan en la presente, los términos "trastorno", "enfermedad" y "condición" pueden ser utilizados intercambiablemente o pueden ser diferentes ya que la enfermedad o condición particular puede no tener un agente causal conocido (de modo que la etiología no ha sido todavía determinada) y es por lo tanto todavía no reconocida como una enfermedad sino únicamente como una condición o síndrome no deseable, en donde un grupo más o menos específico de síntomas han sido identificados por los clínicos.
Los compuestos de la invención, o sus sales farmacéuticamente aceptables pueden contener uno o más centros asimétricos, y pueden de este modo dar origen a enantiómeros , diastereoisómeros y otras formas estereoisoméricas que pueden ser definidas, en términos de la estereoquímica absoluta, como (R) - o (S)- o, como (D) -o (L) - para los aminoácidos. Se entiende que la presente invención incluye todos los posibles isómeros, así como sus formas racémicas y ópticamente puras. Los isómeros más ( + ) y (-), (R) - y (S)-, o (D) - y (L) - ópticamente activos, pueden ser preparados utilizando sintones quirales o reactivos quirales, o resueltos utilizando técnicas convencionales, por ejemplo, cromatografía y cristalización fraccional. Las técnicas convencionales para la preparación/aislamiento de los enantiómeros individuales incluyen la síntesis quiral a partir de un precursor adecuado ópticamente puro o la resolución del racemato (o el racemato de una sal o el derivado) utilizando, por ejemplo, cromatografía líquida de alta presión quiral (HPLC, por sus siglas en inglés) . Cuando los compuestos descritos en la presente contienen dobles enlaces olefínicos u otros centros de asimetría geométrica, y a no ser que .se especifique de otro modo, se pretende que los compuestos incluyan los isómeros geométricos E y Z . De igual modo, todas las formas tautoméricas están también destinadas a ser incluidas.
Un "estereoisomero" se refiere a un compuesto constituido de los mismos átomos enlazados por los mismos enlaces pero que tiene diferentes estructuras tridimensionales, las cuales no son intercambiables. La presente invención contempla diversos estereoisómeros y mezclas de los mismos e incluye los "enantiómeros" , lo cual se refiere a dos estereoisómeros cuyas moléculas son imágenes en el espejo no superponibles , una de la otra.
Un "tautómero" se refiere a un desplazamiento de protones de un átomo de una molécula a otro átomo de la misma molécula. La presente invención incluye los tautómeros de cualquiera de dichos compuestos .
Como se anotó anteriormente, en una modalidad de la presente invención, los compuestos que tienen actividad antibacteriana son proporcionados, teniendo los compuestos la siguiente estructura (I) : o un estereoisómero, profármaco o sal farmacéuticamente aceptable del mismo, en donde : Qx es hidroxilo, un grupo hidroxilo protegido, amino o amino protegido; Q2 es: ' Q5 es hidroxilo, un hidroxilo protegido, un grupo amino o un grupo amino protegido; cada Ri y R2 es, independientemente, hidrógeno o un grupo protector de amino; cada R3 es, independientemente, hidrógeno o un grupo protector de hidroxilo; cada R4 y R5 es, independientemente, hidrógeno o alquilo de 1 a 6 átomos de carbono opcionalmente sustituido con uno o más halógeno, hidroxilo o amino; cada R6 es, independientemente, hidrógeno, halógeno, hidroxilo, amino o alquilo de 1 a 6 átomos de carbono ; o R4 y R5 junto con los átomos a los cuales están enlazados, pueden formar un anillo heterocíclico que tiene de 4 a 6 átomos en el anillo, o R5 y un Re junto con los átomos a los cuales están enlazados, pueden formar un anillo heterocíclico que tiene de 3 a 6 átomos en el anillo, o R4 y un R6 junto con los átomos a los cuales están enlazados, pueden formar un anillo carbocíclico que tiene de 3 a 6 átomos en el anille- cada n es, independientemente, un número entero de 0 a ; y cada Zi y Z2 es, independientemente, hidrógeno o -0R3 en donde (i) al menos uno de ?? y Z2 es hidrógeno, (ii) al menos uno de R4 y R5 es alquilo de 1 a 6 átomos de carbono sustituido o al menos uno de R6 es halógeno, hidroxilo o amino, y (iii) los dos grupos -CH- adyacentes a los cuales están enlazados Zx y Z2, pueden formar opcionalmente un doble enlace.
En modalidades adicionales, cada Ri, R2 y 3 son hidrógeno .
En modalidades adicionales, Q5 es amino.
En otras modalidades adicionales, Q5 es hidroxilo .
En modalidades adicionales, Qx es amino.
En otras modalidades adicionales, Qi es hidroxilo .
En modalidades adicionales, ?? y Z2 son ambos hidrógeno .
En otras modalidades adicionales, Zx es hidroxilo y Z2 es hidrógeno.
En otras modalidades adicionales, Zx es hidrógeno y Z2 es hidroxilo.
En modalidades adicionales, Q2 es: en donde: R4 es hidrógeno; R5 es hidrógeno; al menos uno de R6 es halógeno; y n es un número entero de 1 a 4. Por ejemplo, en modalidades más específicas de lo anterior, Q2 en donde cada R6 es halógeno (tales como, por ejemplo, fluoro) .
En otras modalidades adicionales, Q2 es: en donde: R4 es hidrógeno; R5 es hidrógeno; al menos uno de R6 es hidroxilo; y n es un número entero de 1 a 4. Por ejemplo, en modalidades más específicas de lo anterior, Q2 es: En otras modalidades adicionales Q2 es en donde: R4 es hidrógeno; R5 y un R6 junto con los átomos a los cuales están enlazados forman un anillo heterocíclico que tiene de 3 a 6 átomos en el anillo; al menos uno de R6 es halógeno; y n es un número entero de 1 a 4.
En otras modalidades adicionales, Q2 es en donde: R4 y Rs junto con los átomos a los cuales están enlazados forman un anillo heterocíclico que tiene de 4 a 6 átomos en el anillo; al menos un R6 es halógeno; y n es un número entero de 1 a .
En otras modalidades adicionales, Q2 es: en donde: R5 es hidrógeno; R4 y un R6 junto con los átomos a los cuales están enlazados forman un anillo carbocíclico que tiene de 3 a 6 átomos en el anillo; al menos un R6 halógeno; y n es un número entero de 1 a 4.
En otras modalidades adicionales, Q2 es: En modalidades adicionales, los compuestos anteriores de la estructura (I) tienen la siguiente configuración : En modalidades adicionales, los dos átomos de carbono adyacentes a los cuales están enlazados Z1 y Z2, forman un doble enlace.
En otras modalidades adicionales, los dos átomos de carbono adyacentes a los cuales están enlazados, x y Z2, forman un enlace sencillo.
Como se anotó anteriormente, en otra modalidad más de la presente invención, son proporcionados los compuestos que tienen actividad antibacteriana, los compuestos que tienen la siguiente estructura (I) .· (I) o un estereoisómero, profármaco o sal farmacéuticamente aceptable del mismo, en donde : Qi es hidroxilo, un grupo hidroxilo protegido, amino o amino protegido; Q2 es alquilo opcionalmente sustituido con uno o más de halógeno, hidroxilo, amino, cicloalquilo opcionalmente sustituido o heterociclilo opcionalmente sustituido, 52 Qs es hidroxilo, un grupo hidroxilo protegido, amino o un amino protegido; cada Ri y R2 es, independientemente, hidrógeno o un grupo protector de amino; cada R3 es, independientemente, hidrógeno o un grupo protector de hidroxilo; cada R4 , R5, R7 y R8 es, independientemente, hidrógeno o alquilo de 1 a 6 átomos de carbono opcionalmente sustituido con uno o más de halógeno, hidroxilo o amino; cada R6 es, independientemente, hidrógeno, halógeno, hidroxilo, amino o alquilo de 1 a 6 átomos de carbono; o R4 y R5 junto con los átomos a los cuales están enlazados pueden formar un anillo heterocíclico que tiene de 4 a 6 átomos en el anillo, o R5 y un R6 junto con los átomos a los cuales están enlazados, pueden formar un anillo heterocíclico que tiene de 3 a 6 átomos en el anillo, o R4 y un R6 junto con los átomos a los cuales están enlazados, pueden formar un anillo carbocíclico que tiene de 3 a 6 átomos en el anillo, o R7 y R8 junto con el átomo al cual están enlazados, pueden formar un anillo heterocíclico que tiene de 3 a 6 átomos en el anillo; cada R9 es, independientemente, hidrógeno, hidroxilo, amino o alquilo de 1 a 6 átomos de carbono opcionalmente sustituido con uno o más de halógeno, hidroxilo o amino; cada Rio es, independientemente, hidrógeno, halógeno, hidroxilo, amino o alquilo de 1 a 6 átomos de carbono; cada Rn es, independientemente, hidrógeno, halógeno, amino o alquilo de 1 a 6 átomos de carbono; o R9 y un RX1 junto con los átomos a los cuales están enlazados, pueden formar un anillo heterocíclico que tiene de 3 a 6 átomos en el anillo, o R4 y un Rn junto con los átomos a los cuales están enlazados, pueden formar un anillo carbocíclico que tiene de 3 a 6 átomos en el anillo; cada n es, independientemente, un número entero de 0 a 4; cada p es, independientemente, un número entero de 1 a 4; y cada Zi y Z2 es, independientemente, hidrógeno o - 0R3, en donde (i) al menos uno de Zi y Z2 es hidrógeno, y (ii) los dos grupos -CH- adyacentes a los cuales están enlazados Zx y Z2 pueden formar opcionalmente un doble enlace.
En modalidades adicionales, cada R1# R2 y 3 son hidrógeno .
En modalidades adicionales, Q5 es a ino.
En otras modalidades adicionales, Q5 es hidroxilo. En modalidades adicionales, Qi es amino.
En otras modalidades adicionales, Qi es hidroxilo. En modalidades adicionales, Zi y Z2 son ambos hidrógeno .
En otras modalidades adicionales, Zx es hidroxilo y Z2 es hidrógeno.
En otras modalidades adicionales, Zi es hidrógeno y Z2 es hidroxilo.
En otras modalidades adicionales, Q2 es: en donde: R4 es hidrógeno; R7 es hidrógeno; R8 es hidrógeno; y n es un número entero de 1 a 4. En modalidades adicionales, cada R6 es hidrógeno. Por ejemplo, en modalidades más específicas de lo anterior, Q2 es: En otras modalidades adicionales, al menos un R es halógeno .
En otras modalidades adicionales, Q2 es: en donde: R4 y un R6 junto con los átomos a los cuales están enlazados forman un anillo carbocíclico que tiene de 3 a 6 átomos en el anillo; R7 es hidrógeno; R8 es hidrógeno; y n es un número entero de 1 a 4. Por ejemplo, en modalidades más específicas de lo anterior, Q2 es: En otras modalidades adicionales, al menos un R6 es halógeno.
En otras modalidades adicionales, Q2 es: en donde R5 es hidrógeno. En modalidades adicionales, cada R.6 es hidrógeno. Por ejemplo, en modalidades más específicas de lo anterior, Q2 es: En otras modalidades adicionales, al menos un R6 es halógeno .
En otras modalidades adicionales, Q2 es : en donde: R7 es hidrógeno; y R8 es hidrógeno. En modalidades adicionales, cada R6 es hidrógeno. Por ejemplo, en modalidades más específicas de lo anterior, Q2 es: En otras modalidades adicionales, al menos un Re es halógeno .
En otras modalidades adicionales, Q2 es: en donde R5 es hidrógeno. En modalidades adicionales, cada R6 es hidrógeno. En otras modalidades adicionales, al menos un R6 es halógeno.
En otras modalidades adicionales, Q2 es : en donde: R7 es hidrógeno; y R8 es hidrógeno, modalidades adicionales, cada R6 hidrógeno. En modalidades adicionales, al menos un R6 es halógeno.
En otras modalidades adicionales, Q2 es: en donde R5 es hidrógeno. En modalidades adicionales, cada R6 es hidrógeno. En otras modalidades adicionales, al menos un R6 es halógeno.
En otras modalidades adicionales Q2 es: en donde R9 es hidrógeno. En modalidades adicionales, cada Rn es hidrógeno. En otras modalidades adicionales, al menos un Rn es halógeno.
En otras modalidades adicionales, Q2 es: en donde: R7 es hidrógeno; y R8 es hidrógeno. En modalidades adicionales, cada R10 hidrógeno. En otras modalidades adicionales, al menos un Rio es halógeno.
En otras modalidades adicionales, Q2 es: en donde R4 es hidrógeno. En modalidades adicionales, cada Rn es hidrógeno. En otras modalidades adicionales, al menos un R es halógeno.
En otras modalidades adicionales, Q2 es : En otras modalidades adicionales, Q2 es alquilo opcionalmente sustituido con uno o más de halógeno, hidroxilo, amino, cicloalquilo opcionalmente sustituido o heterociclilo opcionalmente sustituido. Por ejemplo, en modalidades más específicas de lo anterior, Q2 es no sustituido o Q2 está sustituido con uno o más halógeno, hidroxilo o amino.
En modalidades adicionales, los compuestos anteriores de la estructura (I) tienen la siguiente configuración : En modalidades adicionales, los dos átomos de carbono adyacentes a los están enlazados Z1 y Z2 forman un doble enlace.
En otras modalidades adicionales, los dos átomos de carbono adyacentes a los cuales están enlazados Zi y Z2 forman un enlace sencillo.
Se entiende que cualquier modalidad de los compuestos de la estructura (I) , como se describe anteriormente, y cualquier sustituyente específico descrito en la presente para un grupo Qi, Q2, Qs, Ri R2/ R3» R-s/ R5/ R6, R7, R8, R9, Rio, Zx y Z2 en los compuestos de la estructura (I) , como se describió anteriormente, pueden ser independientemente combinados con otras modalidades y/o sustituyentes de compuestos de la estructura (I) para formar las modalidades de la invención no específicamente descritas anteriormente. Además, en el caso de que una lista de sustituyentes sea indicada para cualquier Q1# Q2, Q5; Ri, R2, R3 , R4, R5/ R6, R7/ R8, 9/ io» Zi y Z2 en particular, en una modalidad particular y/o reivindicación particular, se entiende que cada sustituyente individual puede ser suprimido de la modalidad y/o reivindicación particular y que la lista restante de sustituyentes serán considerados dentro del alcance de la invención.
Para fines de administración, los compuestos de la presente invención pueden ser administrados como un producto químico bruto o pueden ser formulados como composiciones farmacéuticas. Las composiciones farmacéuticas de la presente invención comprenden un compuesto de la estructura (I) y un portador, diluyente o excipiente farmacéuticamente aceptable. El compuesto de la estructura (I) está presente en la composición en una cantidad que es efectiva para tratar un trastorno o condición particular de interés - es decir, en una cantidad suficiente para tratar una infección bacteriana, y preferentemente con toxicidad aceptable para el paciente. La actividad antibacteriana de los compuestos de la estructura (I) puede ser determinada por una persona experta en la técnica, por ejemplo, como se describe en los Ejemplos siguientes. Las concentraciones y dosis apropiadas pueden ser fácilmente determinadas por una persona experta en la técnica .
Los compuestos de la presente invención poseen actividad antibacteriana contra un amplio espectro de bacterias gram positiva y gram negativas, así como enterobacterias y anaerobios . Los organismos susceptibles representativos incluyen en general aquellos gram positivos y gram negativos, organismos aeróbicos y anaeróbicos cuyo crecimiento puede ser inhibido por los compuestos de la invención tales como Staphylococcus, Lactobacillus, Streptococcus, Sarcina, Escherichia, Enterobacter, Klebsiella, Pseudomonas, Acinetobacter, Mycobacterium, Proteus, Campylobacter, Citrobacter, Nisseria, Baccillus, Bacteroidas, Peptococcus, Clostridiu , Salmonella, Shigella, Serratia, Haemophilus, Brucella, Francisella, Anthracis, Yersinia, Corynebacterium, Moraxella, Enterococcus, y otros organismos .
La administración de los compuestos de la invención, o sus sales farmacéuticamente aceptables, en forma pura o en una composición farmacéutica apropiada, puede ser llevada a cabo vía cualquiera de los modos de administración aceptados de los agentes para servir utilidades similares. Las composiciones farmacéuticas de la invención pueden ser preparadas mediante la combinación de un compuesto de la invención con un portador, diluyente o excipiente farmacéuticamente aceptable, apropiado, y pueden ser formulados en preparaciones en formas sólidas, semi-sólidas, líquidas o gaseosas, tales como tabletas, cápsulas, polvos, gránulos, ungüentos, soluciones, supositorios, inyecciones, inhalantes, geles, microesferas y aerosoles. Las vías típicas de administración de tales composiciones farmacéuticas incluyen, sin limitación, la vía oral, tópica, transdérmica, inhalación, parenteral, sublingual, bucal, rectal, vaginal, e intranasal. El término parenteral como se utiliza en la presente, incluye las inyecciones subcutánea, intravenosa, intramuscular, inyección intrasternal o técnicas de venoclisis. Las composiciones farmacéuticas de la invención son formuladas para permitir así que los ingredientes activos contenidos en éstas, estén biodisponibles después de la administración de la composición a un paciente. Las composiciones que serán administradas a un sujeto o paciente toman la forma de una o más unidades de dosis, donde por ejemplo, una tableta puede ser una unidad de dosis simple, y un recipiente de un compuesto de la invención en forma de aerosol puede mantener una pluralidad de unidades de dosis. Los métodos efectivos de preparar tales formas de dosis son conocidos, o serán aparentes para aquellas personas expertas en esta técnica; por ejemplo, ver Remington: The Science and Practice of Pharmacy, 20a Edición ( Philadelphia College of Pharmacy and Science, 2000) . La composición que va a ser administrada, en todo caso, contendrá una cantidad terapéuticamente efectiva de un compuesto de la invención, o un sal farmacéuticamente aceptable del mismo, para el tratamiento de un trastorno o condición de interés, de acuerdo con las enseñanzas de esta invención.
Una composición farmacéutica de la invención puede estar en la forma de un sólido o líquido. En un aspecto, el o los portadores son partículas, de modo que las composiciones están, por ejemplo, en forma de tableta o de polvo. El o los portadores pueden ser líquidos con las composiciones que son, por ejemplo, un jarabe oral, un líquido inyectable o un aerosol, el cual es útil en, por ejemplo, la administración por inhalación.
Cuando están destinadas para la administración oral, las composiciones farmacéuticas de la presente invención típicamente están ya sea en forma sólida o líquida, donde las formas semi-sólida, semi-líquida, suspensión o gel son incluidas dentro de las formas consideradas en la presente, como sólidas o bien como líquidas.
Como una composición sólida para la administración oral, las composiciones farmacéuticas pueden ser formuladas en un polvo, gránulo, tableta comprimida, pildora, cápsula, goma de mascar, oblea o forma similar. Tal composición sólida contendrá típicamente uno o más diluyentes inertes o portadores comestibles. Además, uno o más de los siguientes pueden estar presentes: aglutinantes tales como carboximetilcelulosa, etilcelulosa, celulosa microcristalina, goma de tragacanto o gelatina; excipientes tales como almidón, lactosa o dextrinas, agentes desintegradores tales como ácido algínico, alginato de sodio, Primogel, almidón de maíz y similares; lubricantes tales como estearato de magnesio o Sterotex; deslizantes tales como dióxido de silicio coloidal; agentes endulzantes tales como sucrosa o sacarina; un agente saborizante tal como saborizante de menta, salicilato de metilo o saborizante de naranja; y un agente colorante .
Cuando la composición farmacéutica está en la forma de una cápsula, por ejemplo, una cápsula de gelatina, ésta puede contener, además de los materiales del tipo anterior, un portador líquido tal como polietilenglicol o aceite.
Las composiciones farmacéuticas de la invención pueden estar en la forma de un líquido, por ejemplo, un elíxir, jarabe, solución emulsión o suspensión. El líquido puede ser para la administración oral o para la distribución por inyección, como dos ejemplos. Cuando están destinadas para la administración oral, las composiciones farmacéuticas de la invención contienen típicamente, además de los presentes compuestos, uno o más de un agente endulzante, conservantes, pigmentos/colorantes y mejoradores del sabor. En una composición destinada a ser administrada por inyección, pueden ser incluidos uno o más de un tensioactivo, conservante, agente humectante, agente dispersante, agente suspensor, amortiguador, estabilizador y un agente isotónico.
Las composiciones farmacéuticas líquidas de la invención, ya sea que éstas sean soluciones, suspensiones u otra forma similar, pueden incluir uno o más de los siguientes adyuvantes: diluyentes estériles tales como agua para inyección, solución salina, preferentemente solución salina fisiológica, solución de Ringer, cloruro de sodio isotónico, aceites fijos tales como mono- o diglicéridos sintéticos que pueden servir como el solvente o como el medio suspensor, polietilenglicoles , glicerina, propilenglicol u otros solventes; agentes antibacterianos tales como alcohol bencílico o metilparabeno ; antioxidantes tales como ácido ascórbico o bisulfito de sodio; agentes quelantes tales como ácido etilendiaminotetraacético; amortiguadores tales como acetatos, citratos o fosfatos y agentes para el ajuste de la tonicidad tales como cloruro de sodio o dextrosa. Las preparaciones parenterales pueden ser encerradas en ampolletas, jeringas desechables o viales de dosis múltiples elaborados de vidrio o de plástico. La solución salina fisiológica es un adyuvante preferido. Una composición farmacéutica inyectable es preferentemente estéril.
Una composición farmacéutica líquida de la invención, destinada ya sea para la administración parenteral u oral, debe contener una cantidad de un compuesto de la invención tal que será obtenida una dosis adecuada.
Las composiciones f rmacéuticas de la invención pueden estar destinadas para la administración tópica, en cuyo caso el portador puede comprender adecuadamente una solución, emulsión, ungüento o base de gel. La base, por ejemplo, puede comprender uno o más de los siguientes: petrolato, lanolina, polietilenglicoles , cera de abejas, aceite mineral, diluyentes tales como agua y alcohol, y emulsificantes y estabilizadores. Los agentes espesantes pueden estar presentes en una composición farmacéutica para la administración tópica. Si está destinada para la administración transdérmica, la composición puede incluir un parche transdérmico o un dispositivo de iontoforesis .
Las composiciones farmacéuticas de la invención pueden estar destinadas para la administración rectal, en la forma de, por ejemplo, un supositorio, el cual se fundirá en el recto liberará el fármaco. Las composiciones para la administración rectal pueden contener una base oleaginosa como un excipiente no irritante adecuado. Tales bases incluyen, sin limitación, lanolina, manteca de cacao y polietilenglicol .
Las composiciones farmacéuticas de la invención pueden incluir diversos materiales, los cuales modifican la forma física de una unidad de dosis sólida o liquida. Por ejemplo, la composición puede incluir materiales que forman una coraza de recubrimiento alrededor de los ingredientes activos. Los materiales que forman la coraza de recubrimiento son típicamente inertes, y pueden ser seleccionados de, por ejemplo, azúcar, goma laca y otros agentes de recubrimiento entéricos. Alternativamente, los ingredientes activos pueden ser encerrados en una cápsula de gelatina.
Las composiciones farmacéuticas de la invención en la forma sólida o líquida pueden incluir un agente que se enlaza al compuesto de la invención y con esto ayuda en la distribución del compuesto. Los agentes adecuados que pueden actuar en esta capacidad incluyen un anticuerpo monoclonal o policlonal, una proteína o un liposoma.
Las composiciones farmacéuticas de la invención pueden ser preparadas en unidades de dosis que pueden ser administradas como un aerosol. El término aerosol es utilizado para denotar una variedad de sistemas que van desde aquellos de naturaleza coloidal hasta sistemas que consisten de empaques presurizados . La distribución puede ser mediante un gas licuado o comprimido o por un sistema de bomba adecuada que surte los ingredientes activos. Los aerosoles de los compuestos de la invención pueden estar distribuidos en sistema de fase simple, bi-fásicos o trifásicos con el fin de distribuir el o los ingredientes activos. La distribución del aerosol incluye el recipiente, los activadores, las válvulas, los sub-recipientes, y similares, necesarios, los cuales conj ntamente pueden formar un kit. Una persona experta en la técnica, sin experimentación indebida puede determinar los aerosoles preferidos.
Las composiciones farmacéuticas de la invención pueden ser preparadas mediante la metodología bien conocida en la técnica, farmacéutica. Por ejemplo, una composición farmacéutica destinada a ser administrada por inyección puede ser preparada al combinar un compuesto de la invención con agua destilada estéril para formar así una solución. Puede ser agregado un tensioactivo para facilitar la formación de una solución o suspensión homogénea. Los tensioactivos son compuestos que interactúan no covalentemente con el compuesto de la invención, para facilitar así la disolución o la suspensión homogénea del compuesto en el sistema de distribución acuoso.
Los compuestos de la invención, o sus sales farmacéuticamente aceptables, son administrados en una cantidad terapéuticamente efectiva, la cual variará dependiendo de una variedad de factores que incluyen la actividad del compuesto específico empleado; la estabilidad metabólica y la longitud de acción del compuesto; la edad, el peso corporal, la salud general, el sexo y la dieta del paciente; el modo y la hora de administración; la velocidad de excreción; la combinación de fármaco; la severidad del trastorno condición particular; y el sujeto que sufre terapia.
Los compuestos de la invención, o los derivados farmacéuticamente aceptables de los mismos, pueden ser también administrados simultáneamente con, antes de, o después de la administración de uno o más de los otros agentes terapéuticos . Tal terapia en combinación incluye la administración de una formulación de dosis farmacéutica simple la cual contiene un compuesto de la invención y uno o más compuestos activos adicionales, así como la administración del compuesto de la invención y cada agente activo en su propia formulación de dosis farmacéutica separada. Por ejemplo, un compuesto de la invención y el otro agente activo pueden ser administrados al paciente conjuntamente en una composición de dosis oral simple tal como una tableta o cápsula, o cada agente es administrado en formulaciones de dosis oral separadas. Donde se utilizan formulaciones de dosis separadas, los compuestos de la invención y uno o más agentes' activos adicionales, pueden ser administrados esencialmente al mismo tiempo, por ejemplo, concurrentemente, o en horas separadamente escalonadas, por ejemplo, secuencialmente ; se entiende que la terapia en combinación incluye todos estos regímenes.
Se entiende que en la presente descripción, las combinaciones de los sustituyentes y/o variables de las fórmulas descritas, son permisibles únicamente si tales combinaciones dan como resultado compuestos estables.
Podrá ser apreciado por aquellos expertos en la técnica que en los procesos sintéticos descritos en la presente, los grupos funcionales de los compuestos intermediarios pueden necesitar ser protegidos por grupos protectores adecuados. Tales grupos funcionales incluyen hidroxilo, amino, mercapto y ácido carboxílico. Como se describió anteriormente, los grupos protectores adecuados para el hidroxilo incluyen trialquilsililo o diarilalquilsililo (por ejemplo, t-butildimetilsililo, t-butildifenilsililo o trimetilsililo) , tetrahidropiranilo, bencilo, y similares, y los grupos protectores adecuados para amino, amidino y guanidino incluyen t-butoxicarbonilo, benciloxicarbonilo, y similares. Los grupos protectores adecuados para mercapto incluyen -C(O)-R" (donde R" es alquilo, arilo o arilalquilo) , p-metoxibencilo, tritilo y similares. Los grupos protectores adecuados para el ácido carboxílico incluyen alquilo, arilo o ésteres de arilalquilo. Los grupos protectores pueden ser agregados o eliminados de acuerdo con las técnicas estándares, que son conocidas para una persona experta en la técnica y como se describe en la presente. El uso de grupos protectores es descrito en detalle en Green, T.W. y P.G.M. Wutz, Protective Grupos en Organic Synthesis (1999), 3rd Ed., Wiley. Como una persona experta en la técnica podría apreciar, el grupo protector puede ser también una resina polimérica tal como una resina de ang, resina de Rink o una resina de cloruro de 2 -clorotritilo .
Podrá ser apreciado también por aquellos expertos en la técnica, que aunque un derivado protegido de los compuestos de esta invención, pueda no poseer actividad farmacológica como tal, éstos pueden ser administrados a un mamífero y después de esto metabolizados en el cuerpo para formar compuestos de la invención que son farmacológicamente activos. Tales derivados pueden por lo tanto ser descritos como "profármacos" . Todos los profármacos de los compuestos de esta invención son incluidos dentro del alcance de la invención.
Además, los compuestos de la invención que existen en forma de base o ácido libre pueden ser convertidos a sus sales farmacéuticamente aceptables mediante tratamiento con la base o el ácido orgánico o inorgánico apropiado mediante métodos conocidos por una persona experta en la técnica. Las sales de los compuestos de la invención pueden ser convertidas a su forma de base o de ácido libre, mediante técnicas estándares .
Los siguientes ejemplos ilustran diversos métodos de elaboración de los compuestos de esta invención, por ejemplo, el compuesto de la estructura (I) : en donde Qi, Q2 , Q5 , Ri, R2 , 3 / Zx y Z2 son como se definieron anteriormente. Se entiende que la persona experta en la técnica puede ser capaz de elaborar estos compuestos mediante métodos similares o al combinar otros métodos conocidos para una persona experta en la técnica. Se entiende también que una persona experta en la técnica podría ser capaz de elaborar, de una manera similar como se describe más adelante, otros compuestos. de la estructura (I) no específicamente ilustrados más adelante, mediante el uso de los componentes iniciales apropiados y modificando los parámetros de la síntesis, como sea necesario. En general, los compuestos iniciales pueden ser obtenidos a partir de fuentes tales como Sigma Aldrich, Lancaster Synthesis, Inc., Maybridge, Matrix Scientific, TCI, y Fluorochem USA, etc. o sintetizados de acuerdo a fuentes conocidas por aquellos expertos en la técnica (ver, por ejemplo, Advanced Organic Chemistry: Reactions, Mechanisms, and Structure, 5a edición (Wiley, December 2000)) o preparados como se describe en la presente .
Como se ilustran en los siguientes ejemplos, los compuestos de la invención pueden ser elaborados de acuerdo a los métodos que utilizan un compuesto intermediario que tiene la siguiente estructura (INT-I): (INT-1) en donde : cada Ri es, independientemente, un grupo protector de amino; cada R3 es, independientemente, un grupo protector de hidroxilo; y cada A es , independientemente , fenilo, opcionalmente sustituido con uno o más halógeno, hidroxilo, amino o alquilo de 1 a 6 átomos de carbono opcionalmente sustituido con uno o más halógeno, hidroxilo o amino.
En modalidades más específicas de lo anterior, el compuesto intermediario es, por ejemplo: Se ha encontrado que los compuestos intermediarios de la estructura (INT-I) son útiles para la modificación selectiva de los derivados de neomicina en la posición 3 ' .
Los siguientes ejemplos son proporcionados para fines de ilustración, no de limitación.
EJEMPLOS ESQUEMAS SINTETICOS GENERALES Esquema de Reacción 1 Análogos de 31 , 41 -Didesoxi-Neomicina Sustituidos en N-l Esquema de Reacción 2 Análogos de 3 ' -Desoxi -Neomicina Sustituidos en N-1 Esquema de Reacción 3 Análogos de 4 ' -Desoxi-Neomicina Sustituidos en N-1 Ejemplo A Acilación de N-1 Método A: Ejemplo B Apertura del Epóxido de N-1 1 Ejemplo C Sulfonilación de N-1 Ejemplo D Aminación Reductiva de N-1 REACTIVOS DE ACOPLAMIENTO REPRESENTATIVOS Reactivos de Acoplamiento de N-1 Representativos PROCEDIMIENTOS GENERALES SINTETICOS Procedimiento 1: Aminación Reductiva Método A: A una solución agitada del derivado de aminoglucósido (0.06 mmol) en MeOH (2 mi) se agregó el aldehido (0.068 mmol), cianoborohidruro soportado .sobre sílice (0.1 g, 1.0 mmol/g) , y la mezcla de reacción se calentó mediante irradiación con microondas a 100°C (potencia de 100 vatios) por 15 minutos. La reacción fue verificada por MS para la terminación, y una vez completa todo el solvente fue eliminado mediante evaporación rotatoria. El residuo resultante fue disuelto en acetato de etilo (20 mi) , y lavado con NaHC03 al 5% (2 x 5 mi) , seguido por salmuera (5 mi) . La fase orgánica fue luego secada sobre sulfato de sodio, filtrada y el solvente fue eliminado mediante evaporación rotatoria.
Método B: A una solución del derivado de aminoglucósido (0.078 mmol) en DMF (1 mi) se agregaron tamices moleculares de 3Á (15-20) , seguido por el aldehido (0.15 mmol) y la reacción fue agitada por 2.5 horas. La reacción fue verificada mediante S para la terminación y, si era necesario, se agregó más aldehido (0.5 equivalentes). La mezcla de reacción fue luego agregada gota a gota a una solución de agitación de NaBH4 (0.78 mmol) en metanol (2 mi) a 0°C, y la reacción fue agitada por 1 hora. La reacción fue diluida con H20 (2 mi) y acetato de etilo (2 mi) . La capa orgánica fue separada y la capa acuosa fue extraída con acetato de etilo (3 x 3 m 1) . Las capas orgánicas combinadas se secaron sobre sulfato de sodio, se filtraron y se concentraron hasta sequedad Procedimiento 2 : Desprotección de Boc (el grupo protector de ter-butil-dimetil-sililo es eliminado bajo estas condiciones ) Importante : Antes de la desprotección de Boc una muestra debe ser bien secada por bombeo a alto vacío por 3 horas.
Método .A: A una solución agitada del aminoglucósido protegido con Boc (0.054 mmol) en DCM o metanol (1 mi) se agregaron tamices moleculares de 3 Á (4-6) , y el ácido trifluoroacético (0.6 mi). La reacción fue agitada a temperatura ambiente por 1 hora, y verificada para la terminación por MS . Después de la terminación, la mezcla de reacción fue diluida con éter (15 mi) para inducir la precipitación. El frasco fue centrifugado y el sobrenadante fue decantado. El precipitado se lavó con éter (2 x 15 mi), se decantó y se secó bajo vacío.
Procedimiento 3 : acoplamiento de PyBOP A una solución agitada del derivado de aminoglucósido (0.078 mmol) en DMF (1 mi) a -40°C se agregó el ácido (0.16 mmol), seguido por PyBOP (0.16 mmol) y DIPEA (0.31 mmol) y la reacción fue agitada. La mezcla de reacción fue diluida con acetato de etilo (3 mi) y agua (3 mi) , y la capa acuosa fue separada y fue extraída con acetato de etilo (3 x 3 mi) . Las capas orgánicas combinadas se secaron sobre sulfato de sodio, se filtraron y se concentraron hasta sequedad.
Procedimiento 4 : Apertura del Epóxido A una solución agitada del derivado de aminoglucósido (0.06 mmol) en metanol (2 mi) se agregó el epóxido (0.07 mmol), LiC104 (0.15 mmol), y la mezcla de reacción se calentó mediante irradiación con microondas a 100°C por 90 minutos. El progreso de la reacción fue monitorizado por MS. Después de la terminación, el solvente fue eliminado mediante evaporación rotatoria. El residuo resultante fue disuelto en acetato de etilo (20 mi) , lavado con agua (2 X 5 mi) y salmuera (5 mi) , secado sobre sulfato de sodio, filtrado y concentrado hasta sequedad.
Procedimiento 5 : Desprotección de Ftalimido A una solución agitada del aminoglucósido protegido con ftalimido (0.064 mmol) en etanol (3 mi) se agregó hidrazina (0.32 mmol), y la mezcla de reacción se calentó a reflujo por 2 horas. El progreso de la reacción fue monitorizado por MS . Después del enfriamiento a temperatura ambiente, el sub-producto cíclico precipitó y fue retirado mediante filtración. El filtrado fue concentrado hasta sequedad para producir un residuo, el cual fue disuelto en acetato de etilo (20 mi) , lavado con NaHC03 al 5% (2 x 5 mi) y salmuera (5 mi) , secado sobre sulfato de sodio, filtrado y concentrado hasta sequedad.
Procedimiento 6 : Sulfonilación A una solución agitada del aminoglucósido (0.067 mmol) en DCM (3 mi) se agregó DIPEA (0.128 mol) y el cloruro de sulfonilo (0.07 mmol). La mezcla de reacción fue agitada a temperatura ambiente y su progreso fue monitorizado por MS. Una vez terminado, el solvente fue eliminado mediante evaporación rotatoria y el residuo fue disuelto en acetato de etilo (20 mi) , lavado con NaHC03 al 5% (2 x 5 mi) y salmuera (5 mi) , se secó sobre sulfato de sodio, se filtró y se concentró hasta sequedad.
Procedimiento 7 : Protección con N-Boc A una solución agitada de la amina (4.64 mmol) en THF (10 mi) se agregó NaOH 1N (10 mi) , seguido por Boc-anhídrido (5.57 mmol) y el progreso de la reacción fue verificado por MS. Una vez terminada, el THF fue eliminado mediante evaporación rotatoria y se agregó agua (40 mi) . La fase acuosa se separó y se extrajo con éter dietílico (2 x 30 mi) . La fase acuosa se acidificó a pH 3 por la adición de H3PO4 diluido y luego se extrajo con acetato de etilo (2 x 60 mi) . Las capas orgánicas combinadas se lavaron con agua (2 x 30 mi) y salmuera (30 mi) , se secaron sobre sulfato de sodio; se filtraron y se concentraron hasta sequedad.
Procedimiento 8 : Síntesis de Epóxidos A una solución agitada del alqueno (5.16 mmol) en cloroformo (20 mi) a 0°C se agregó ácido m-cloroperbenzoico (8.0 mmol) y la mezcla de reacción fue agitada por 30 minutos a 0°C y luego se dejó calentar hasta temperatura ambiente. El progreso de la reacción fue monitorizado por MS y TLC, y se agregaron porciones adicionales de .m-CPBA como fuera necesario. Después de la terminación, la mezcla de reacción fue diluida con cloroformo (50 mi) y se lavó con Na2S03 acuoso al 10% (2 x 30 mi) , NaHC03 acuoso al 10% (2 x 50 mi) y salmuera (50 mi) . La capa orgánica se secó sobre sulfato de sodio, se filtró y se concentró para producir un producto crudo, el cual se purificó mediante cromatografía instantánea (gel de sílice/hexanos : acetato de etilo 0-25%) .
Procedimiento 9: Procedimiento General para la Síntesis de los ácidos a-hidroxicarboxílieos Paso # 1. cianohidrinas de O- (trimetilsililo) : Un matraz de 50 mi equipado con una barra . de agitación magnética y tubo de secado, se cargó con la cetona o el aldehido (0.010 mmol) , seguido por THF (50 mi), cianuro de trimetilsililo (1.39 g, 14 mmol), y yoduro de zinc (0.090 g, 0.28 mmol), y la mezcla de reacción se agitó a temperatura ambiente por 24 horas. La evaporación del solvente dio un residuo, el cual se disolvió en acetato de etilo (60 mi) , se lavó con NaHC03 acuoso al 5% (2 x 30 mi) , agua (30 mi), y salmuera (30 mi), se secó sobre sulfato de sodio, se filtró y se concentró hasta sequedad para producir un producto crudo, el cual fue llevado al siguiente paso sin purificación adicional.
Paso # 2. Hidrólisis acida al ácido a-hidroxicarboxílico : Se agregaron AcOH (25 mi) y HC1 concentrado (25 mi) al material no purificado del paso #1 y la mezcla de reacción se calentó a reflujo por 2-3 horas. La mezcla de reacción se concentró luego hasta sequedad para dar un sólido blanco, el cual se llevó al siguiente paso sin purificación adicional.
Paso # 3. Protección con Boc : A una solución agitada del sólido del paso #2 en NaOH 2 M (20 mi) e i-PrOH (20 mi) a 0°C se agregó Boc20 (6.6 g, 3 mmol) en pequeñas porciones, y la mezcla de reacción se dejó calentar hasta la temperatura ambiente en 4 horas. El i-PrOH fue luego evaporado, y se agregó agua (50 mi) , y la fase acuosa se separó y se extrajo con éter dietílico (2 x 30 mi) . La capa acuosa se acidificó a pH 3 por la adición de H3P04 diluido y se extrajo con acetato de etilo (2 x 60 mi) . Las capas orgánicas combinadas se lavaron con agua (2 x 30 mi) y salmuera (30 mi) , se secaron sobre sulfato de sodio, se filtraron y se concentraron para producir los ácidos N-Boc-cc-hidroxicarboxílieos deseados con un rendimiento del 56-72% .
Procedimiento 10: Protección de la Amina por el Grupo Fmoc A una solución agitada de la amina (0.049 mol) en DCM (100 mi), se agregó DIPEA (16 mi, 0.099 mol) y la mezcla de reacción se enfrió a 0°C. Se agregó luego en porciones Fmoc-Cl (12.8 g, 0.049 mol) en varios minutos, y la reacción se dejó calentar hasta la temperatura ambiente por 2 horas. La capa orgánica se lavó con agua (2 x 50 mi) y salmuera (50 mi) , se secó sobre sulfato de sodio, se filtró y se concentró hasta sequedad para producir la amina protegida con Fmoc (rendimiento de 90-95%) .
Procedimiento 11: Síntesis de los Aldehidos vía la Oxidación con TEMPO/Blanqueador A una solución vigorosamente agitada del alcohol (1.54 mmol) en DCM (4 mi) se agregó TEMPO (0.007 g, 0.045 mmol, 0.03 mol%) y una solución acuosa de KBr 2M (75 mi, 0.15 mmol, 10 mol%) y la mezcla de reacción se enfrió hasta -10°C. En un matraz separado se disolvió NaHC03 (0.5 g, 9.5 mmol) en blanqueador (25 mi, Clorox NaOCl al 6.0%) para producir una solución de NaOCl amortiguada 0.78 M. Esta solución de NaOCl 0.78 M recién preparada (2.3 mi, 1.8 mmol, 117 mol%) fue agregada a la mezcla de reacción en 5 minutos, y la reacción se agitó por 30 minutos adicionales a 0°C. La fase orgánica se separó y la capa acuosa se extrajo con diclorometano (2 x 4 mi) . Las capas orgánicas combinadas se lavaron con Na2S203 acuoso al 10% (4 mi) , NaHC03 acuoso saturado (2 x 4 mi) , salmuera (5 mi) , se secaron sobre sulfato de sodio y se concentraron hasta sequedad.
Procedimiento 12: Síntesis de los alcoholes vía la Reducción con Borano A una solución agitada del ácido (1.5 mmol) en THF (5 mi) a -10°C se agregó lentamente BH3-THF 1.0 M (2.98 mi, 2.98 mmol). La mezcla de reacción fue agitada vigorosamente por 3 minutos adicionales a -10°C, y luego se dejó calentar hasta temperatura ambiente toda la noche. La reacción se apagó por la adición gota a gota de una solución de HOAc/agua (1:1 v/v, 2.0 ral) . El THF fue eliminado mediante evaporación rotatoria y se agregó NaHC03 acuosa saturada (15 mi) . La capa acuosa fue extraída con DCM (3 x 5 mi) y las capas orgánicas combinadas fueron lavadas con NaHC03 acuoso saturado (2 x 5 mi) , salmuera (10 mi) , se secaron sobre sulfato de sodio, se filtraron y se concentraron hasta sequedad.
Procedimiento 13 : Ozonólis y oxidación de Pinnick La olefina sustrato (0.5 a 0.75 mmol) se disolvió en DCM (30 mi) y la reacción se enfrió a -78°C. Se burbujeó ozono a través de ésta hasta que persistió un color azul (3 a 5 minutos) , y la reacción se agitó por 1 hora. Se burbujeó luego Argón a través de la reacción para eliminar el ozono en exceso por 10 minutos. La reacción se apagó posteriormente por la adición de sulfuro de dimetilo (10 equivalentes) , y se agitó por 30 minutos con calentamiento a temperatura ambiente. El solvente se redujo bajo vacío para producir el aldehido crudo, el cual se secó bajo un alto vacío por 10 minutos, y se utilizó sin purificación adicional. A una solución agitada del aldehido en THF, tBuOH y agua (3:3:2, 10 mi) , se agregó NaH2P04 (4 equivalentes) seguido por 2-metil-2-buteno (10 equivalentes) y clorito de sodio (2 equivalentes) , y la reacción se agitó por 4 horas. La mezcla de reacción se agregó luego a NaCl acuoso saturado (10 mi) y se extrajo con DCM (3x) . Las capas orgánicas combinadas se secaron sobre sulfato de sodio; se filtraron y se redujeron bajo vacío para producir un material crudo, el cual se purificó mediante cromatografía instantánea (gel de sílice, 0 ? 0.5 ó 1% de metanol/DCM) .
Procedimiento 14 : Acoplamiento de PyBOP A una solución agitada del derivado de aminoglucósido (0.137 mmol) en DMF (2 mi) a 0°C se agregó el ácido (0.151 mmol, 1.1 eq) , seguido por PyBOP (0.164 mmol, 1.2 equivalentes) y DIPEA (0.411 mmol, 3 equivalentes) y la reacción se agitó (1-3 horas) con calentamiento a temperatura ambiente hasta la terminación (por LC-MS) . La mezcla de reacción se diluyó con AcOH (0.2 mi) y se cargó directamente sobre una columna de HPLC (Método #3) . Las fracciones se recolectaron, se neutralizaron con hidróxido de amonio 1 M y se concentraron. El residuo se extrajo con acetato de etilo (3 x 30 mi) . Las capas orgánicas combinadas se secaron sobre sulfato de sodio, se filtraron y se redujeron bajo vacío para producir el producto deseado.
Procedimiento 15: Acoplamiento de DCC A una solución agitada del ácido (0.15 mmol) y N-hidroxisuccinimida (0.15 mmol) en acetato de etilo (1.5 mi) se agregó N, N' -diciclohexilcarbodiimida (0.15 mmol) y la mezcla de reacción fue agitada por 1 hora. La suspensión blanca resultante se filtró a través de algodón, se lavó con acetato de etilo (3 x 5 mi) , y se evaporó hasta sequedad bajo vacío para producir el éster activado. A una solución agitada del éster activado en THF (1.5 mi) se agregó NaHC03 (1 mmol) seguido por el aminoglucósido (0.138 mmol) , y la reacción fue agitada por 24 horas. La mezcla de reacción se apagó con NaHC03 acuoso saturado y se extrajo con DCM (3 x 30 mi) . Las capas orgánicas combinadas se secaron sobre sulfato de sodio, se filtraron y se redujeron bajo vacío para producir un producto crudo, el cual se purificó mediante cromatografía en columna (gel de sílice, 0-100% Hexanos/acetato de etilo en 25 minutos a 18 ml/minuto) ; las fracciones que contenían el compuesto deseado fueron combinadas y concentradas in vacuo para producir el producto deseado .
Procedimiento 16: Hidrogenólisis en THF A una solución agitada del aminoglucósido (0.15 mmol) en THF (4 mi), se agregó AcOH (108 µL, 1.8 mmol), seguido por 20% de Pd(OH)2/C (140 mg) y la reacción fue agitada bajo una atmósfera de hidrógeno por 1 hora. Luego se agregó agua (2 mi) y la mezcla de reacción fue agitada por 1 hora. Se agregó agua adicional (2 2 mi) y .la reacción fue agitada bajo una atmósfera de hidrógeno toda la noche. La reacción se filtró a través de un filtro de PVDF de 0.45 pm, se diluyó con agua (50 mi) y se liofilizó para producir el producto como su sal de acetato.
Procedimiento 17: Hidrogenólisis en AcOH/H20 (4:1) A una solución agitada del arainoglucósido (0.2 mmol) en AcOH:agua (5 mi, 4:1 v/v) se agregó 20% de Pd(0H)2/C (400 mg) y la reacción fue agitada bajo una atmósfera de hidrógeno toda la noche. La reacción fue filtrada a través de un filtro de PVDF de 0.45 ym, fue diluida con agua (50 mi) y se liofilizó para producir el producto como su sal de acetato.
Procedimiento 18 : Intercambio de la sal de sulfato A una solución de la sal de aminoglucósido (0.074 mmol) en agua (1 mi) se agregó hidróxido de amonio 1 M (- 400 µ?,) para ajustar el pH a 7-8, seguido por (NH4)2S04 (0.22 mmol, 3 equivalentes) . La solución resultante se filtró a través de un filtro de PVDF de 0.45 ym, y el filtrado se sumergió en metanol (40 mi) con agitación vigorosa. Después de 20 minutos, el precipitado fue recolectado por centrifugación y secado por 1 hora bajo vacío. El sólido se disolvió en agua (1 mi) y se precipitó con metanol (40 mi) una segunda vez. El precipitado resultante se recolectó mediante centrifugación, se disolvió en agua (3 mi) y se liofilizó para producir el producto como su sal de sulfato.
PROCEDIMIENTOS PURIFICACION GENERAL Método #1: Purificación mediante Condición Básica Fases Móviles: A - Agua con NH4OH 10 mM B - Acetonitrilo con NH4OH 10 mM Columnas : A: Columna Waters-XBridge Prep Shield RP 18 19 x 250 mm, 5µp? Gradiente: 20 minutos a 0%, luego 0-20% en 200 minutos a un flujo de 20 ml/minutos B: Columna Waters-XBridge Prep Shield RP18 50 x 100 mm, 5 \xm Gradiente: 20 minutos a 0%, luego 0-20% en 200 minutos a un flujo de 20 ml/minutos Método #2: Purificación mediante Condición Acida Fases Móviles: A - Agua con TFA al 0.1% B - Acetonitrilo con TFA al 0.1% Columnas : A: Phenomenex Luna C18 21.4 x 250 mm, 10 µp\ Gradiente: 0-100%, flujo de 25 ml/minutos B: Phenomenex Luna C18 50 x 250 mm, 10 µp? Gradiente: 0-100%, flujo de 45 ml/minutos Método #3 : Purificación mediante Condición Acida Fases Móviles: A - Agua con TFA al 0.1% B - Acetonitrilo con TFA al 0.1% Columnas: Varían Dynamax 250 x 41.4 mm, Microsorb 100-8 C18 Gradiente: 30-100% de B en 70 minutos, flujo de 50 ml/minuto Detector de UV a 215 nm Método #4 : Purificación mediante Condición Básica Fases Móviles: A - Agua con NH4OH al 0.25 M B - Acetonitrilo con NH4OH al 0.25 M Columna: Phenomemex Gemini-NX 150 x 21.2 mm, 10 µp? 018 110A Gradiente: 0% de B en 20 minutos, 0-10% de B en 70 minutos, flujo de 15 ml/minuto Detector de UV 215 nm Las fracciones que contenían el compuesto deseado fueron combinadas y liof ilizadas . A una solución agitada del aminoglucósido (0.02-0.05 mmol) en agua (0.5-1 mi) se agregó ácido sulfúrico 1 M gota a gota hasta pH = 1-2. La solución se filtró a través de un filtro de PVDF de 0.45 \im y el filtrado se sumergió en metanol (25-30 mi) con agitación vigorosa. Se agregó éter dietílico (10-15 mi) si era necesario para mejorar la calidad del precipitado) . Después de 20 minutos, los sólidos se recolectaron mediante centrifugación y se lavaron con metanol - éter dietílico (1:1 v/v, 10 mi) , seguido por éter dietílico (10 mi) . El precipitado resultante se recolectó mediante centrifugación para producir el producto como su sal de sulfato .
INTERMEDIARIOS REPRESENTATIVOS Ácido N,N, -bis-Cbz-2 (S) -hidroxi-4-guanidino-butírico A una solución agitada del ácido 2 (S) -hidroxi- -amino-butírico (0.059 g, 0.50 mmol) en DMF (2 mi) se agregó N, N ' -bis (benciloxicarbonil ) -lH-pirazol-1-carboxamidina (0.26 g, 0.70 mmol) seguido por DIPEA (0.87 mi, 4.99 mmol) y la reacción se calentó a 80°C y se agitó toda la noche. La mezcla cruda se purificó sobre una columna de HPLC de fase inversa de 2 pulgadas (5 cm) (Método 2) para producir el ácido N, N' -bis-Cbz-2 (S) -hidroxi-4 -guanidino-butírico : MS : m/z (M+H) + calculado 430.15, encontrado 430.1.
Carbamato de bencil-2 - (benzoiloxiamino) etilo A una solución de la sal de cloruro del bencil-N- ¦aminoetil ) carbamato (1, 540 mg, 2.34 mmol) en NaHC03 acuoso saturado (45 mi) se agregó NaOH 1 M (15 mi) y la reacción se agitó vigorosamente. Se agregó DCM (30 mi) seguido por peróxido de benzoilo (1.13 g, 4.68 mmol) y la reacción se agitó toda la noche. La capa orgánica se separó y se lavó con salmuera, se secó sobre Sulfato de magnesio, se filtró y se concentró hasta obtener un producto crudo, el cual se purificó sobre una columna de HPLC de fase inversa de 1 pulgada (2.5 cm) (Método 2) para producir carbamato de bencil -2 - (benzoiloxiamino) etilo (2, 252 mg, 0.80 mmol, 34.2%): MS : m/z (M+H) + cale. 315.13, obs. 315.0.
Benzoiloxi (2 -Cbz -aminoetil ) carbamato de succinimidilo 3 A una solución agitada de carbonato de disuccinimidilo (525 mg, 2.05 mmol) en CH3CN (16 mi) se agregó carbamato de bencil-2- (benzoiloxiamino) etilo (2, 252 mg, 0.80 mmol) como una solución en CH3CN (12 mi) en 4 horas, y la reacción se agitó toda la noche. Se agregó carbonato de disuccinimidilo adicional (251 mg, 0.98 mmol) y la reacción 'se calentó a 60°C toda la noche. La eliminación del solvente dio material crudo, el cual se purificó sobre una columna de HPLC de fase inversa de (2 pulgadas) 5 cm (Método 2) para producir benzoiloxx (2-Cbz-aminoetil) carbaraato de succinimidilo (3, 81 mg, 0.18 mmol, rendimiento de 22.5%) .
N-Boc-3-amino-propanal A una solución agitada de 3 - (Boc-amino) - 1 -propanol (25 mi, 0.144 mol) en DCM saturado acuoso (1.0 litro) se agregó el reactivo de Dess-Martin (99.2 g, 233.9 mmol) y la mezcla de reacción se agitó por 1 hora. La reacción se diluyó luego con éter (1.0 litro), seguido por una solución de Na2S203 (250 g) en NaHC03 al 80% (450 g en 1.0 litro de agua) . La reacción se agitó vigorosamente por 30 minutos hasta que se formaron dos capas, la capa superior fue clara. La reacción se filtró para eliminar los sólidos precipitados y la capa acuosa se extrajo con éter (1.0 litro) . La capa orgánica se lavó con NaHC03 saturado (1.0 litro), agua (1.0 litro), y salmuera (l litro) , se secó sobre sulfato de sodio y se concentró hasta obtener un aceite claro. El aceite crudo se disolvió en acetato de etilo: hexanos (1:1 v/v, 1.0 litro) y se filtró a través de una columna' corta de gel de sílice para producir el N-Boc - 3 -amino-propanal deseado (21.7 g, 0.125 mol, rendimiento de 85.6%) : RMN 1H (400 MHz , CDC13) d 9.77 (S, 1H, CHO) , 4.85 (s amplio, 1H, H) , 3.36-3.42 (m, 2H, CH2) , 2.67 (t, 2H, CH2), 1.39 (s, 9H, (CH3)3).
N-Boc-l-oxa-6-azaespiro [2.5] octano La N-Boc-4 -metilen-piperidina (0.222 g, 1.12 mmol) fue sometida al Procedimiento 8 para formar el N-Boc - 1 -oxa- 6 -azaespiro [2.5] octano deseado (0.215 g, 1.01 mmol, rendimiento de 90.2%) : RMN ?? (250 MHz, DMS0-d6) d 3.29-3.61 (m, 6 H) , 1.56-1.70 (m, 2H) , 1.30-1.54 (m, 11H) . 2- (Pent-4-enil) -isoindolin-1, 3-diona A una solución agitada de 5 -bromo-penteno (6.0 g, 0.040 mol) en DMF (30 mi) se agregó K2C03 (4.7 g, 0.034 mol) y ftalimida de potasio (6.21 g, 0.033 mmol) y la mezcla de reacción se calentó a 100°C por 1 hora. La mezcla de reacción se enfrió a temperatura ambiente, y se agregó agua (50 mi) . La capa acuosa se extrajo luego con acetato de etilo (2 x 50 mi) , y las capas orgánicas combinadas se lavaron con NaHC03 acuoso al 5% (2 x 20 mi), salmuera (30 mi) y se secaron sobre sulfato de sodio. La filtración y la evaporación del solvente dieron un aceite, el cual se purificó mediante cromatografía instantánea (gel de sílice/hexanos : acetato de etilo 0-35%) para producir la 2- (pent-4 -enil) -isoindolin-1 , 3-diona deseada como un sólido (6.36 g, 0.029 mmol, rendimiento 72.5%): MS m/e [M+H] + calculado 216.1, encontrado 216.1; RMN (250 MHz , DMSO-d6) d 7.79-7.95 (m, 4H) , 5.70-5.91 (m, 1H) , 4.90-5.11 (m, 2H) , 3.58 (t, 2H) , 1.98-2.10 (m, 2H) , 1.59-1.78 (m, 2H) . 2- (3- (Oxiran-2 -il) -propil) -isoindolin-1, 3-diona La 2- (Pent-4-enil) -isoindolin-1, 3-diona (6.36 g, 0.029 mmol) se sometió al Procedimiento 8 para la formación del epóxido para producir 2 - ( 3 - (oxiran- 2 - il ) -propil-isoindolin-1, 3-diona (5.8 g, 0.025 mmol, rendimiento del 86.2%): MS m/e [M+H] + calculado 232.1, encontrado 232.1; RMN 1H (250 MHz, DMS0-d6) d 7.75-7.90 (m, 4 H, Ar), 3.52 (t, 2 H, CH2), 2.87-2.96 (m, 1 H, CH) , 2.70 (t, 1 H) , 2.30-2.45 (m, 1 H) , 1.36-1.80 (m, 4 H) .
N-Boc- 1 -amino-but- 3 -eno La 3 -buten- 1-amina (4.93 g, 0.069 mol) se sometió al Procedimiento 7 para la protección con Boc para producir un material crudo, el cual se purificó mediante cromatografía instantánea (gel de sílice/hexanos: acetato de etilo 0-30%) para producir del N-Boc-l-amino-but-3-eno (6.47 g, 0.038 mol, rendimiento 55.1%).
Carbamato de N-Boc-2 - (oxiran-2 -il) -etilo El N-Boc- l-amino-but-3 -eno (6.47 g, 0.038 mol) se sometió al Procedimiento 8 para la formación del epóxido para producir un material crudo, el cual se purificó mediante cromatografía instantánea (gel de sílice/hexanos: acetato de etilo 0-45%) para producir el carbamato de N-Boc-2- (oxiran- 2 - il ) -etilo (6.0 g, 0.032 mol, rendimiento de 84.2%): RMN XH (250 MHz, DMSO-de) d 2.98-3.09 (m, 2H) , 2.83-2.92 (m, 1H) , 2.65 (t, 1H) , 2.42 (dd, 1H) , 1.44-1.66 (m, 2H) , 1.36 (s, 9H, (CH3)3) . 3 -metilen-l-metilamino-ciclobutano una solución agitada de 3 -metilen-l-ciano ciclobutano (2.5 g, 0.026 mol) en THF (35 mi) a 0°C, se agregó lentamente LiAiH4 2M (22 mi, 0.044 mmol) y la reacción se dejó calentar hasta la temperatura ambiente. La reacción se apagó luego por la adición de cloruro de amonio acuoso saturado (10 mi) , y THF (10 mi) . La capa orgánica se separó y se concentró hasta sequedad para producir un residuo, el cual se disolvió en acetato de etilo (100 mi) . La capa orgánica se lavó con NaHC03 al 5% (2 x 20 mi) , salmuera (20 mi) , se secó sobre sulfato de sodio, se filtró y se concentró para producir el 3-metilen-l-metilamino-ciclobutano deseado como un aceite, el cual se llevó al siguiente paso sin purificación adicional. 3 -metilen- 1-N-Boc-metilamino- ciclobutano A una solución agitada del 3 -metilen-l-metilamino- lobutano (2.52 g, 0.026 mol) en NaOH 1N (15 mi) y THF (15 mi), se agregó Boc20 (6.7 g, 0.030 mol) y la mezcla de reacción se agitó toda la noche. El THF se evaporó y la capa acuosa se extrajo con acetato de etilo (2 x 40 mi) . Las capas orgánicas combinadas se lavaron con NaHC03 al 5% (2 x 20 mi) salmuera (20 mi) , se secaron sobre sulfato de sodio, se filtraron y se concentraron hasta sequedad para producir un material crudo, el cual se purificó mediante cromatografía instantánea (gel de sílice/hexanos : acetato de etilo 0%-60%) para producir el 3-metilen-l-N-Boc-metilamino-ciclobutano deseado (1.9 g, 0.0096 mol, rendimiento de 36.9%): R N XH (250 MHz , DMSO-d6) d 6.88 (s amplio, 1H) , 4.72 (s, 2H) , 2.95-3.05 (m, 2H) , 2.56-2.71 (m, 2H) , 2.21-2.40 (m, 3H) , 1.20 (s, 9H) .
N-Boc-l-oxaespiro [2.3] hexan-5-il-metanamina El 3 -metilen-l-N-Boc-metilamino-ciclobutano (1.9 g, 0.0096 mol) se sometió al Procedimiento 8 para la formación del epóxido para producir N-Boc-l-oxaespiro [2.3] hexan-5-il-metanamina (1.34 g, 6.27 mol, rendimiento de 65.3%): RMN XH (250 MHz, DMSO-d6) d 2.99-3.10 (m, 2H) , 2.60-2.66 (m, 2H) , 1.99-2.47 (m, 5H) , 1.40 (s, 9H) .
Dietilacetal del N-Fmoc- 4 -amino-butiraldehído El dietilacetal del 4 -amino-butiraldehído (8.0 g, 0.050 mol) fue protegido con Fmoc siguiendo el Procedimiento 10 para dar el dietilacetal del N-Fmoc-4 -amino-butiraldehído deseado (22.08 g, MS m/e [M+Na] + calculado 406.2, encontrado 406.1), el cual se llevó al siguiente paso sin purificación adicional .
N-Fmoc -4 -amino-butiraldehído A una solución agitada del dietilacetal del N-Fmoc -4 -amino-butiraldehído (0.050 mmol) en 1,4-dioxano (100 mi) se agregó HC1 acuoso (100 mi, 1:1 v/v, agua: HCl concentrado) y el progreso de la reacción fue monitorizado por MS . Después de la terminación, el solvente orgánico se eliminó mediante evaporación rotatoria, y la capa acuosa se extrajo con acetato de etilo (2 x 200 mi) . Las capas orgánicas combinadas se lavaron con NaHC03 5% (2 x 75 mi) , salmuera (75 mi) , se secaron sobre sulfato de sodio, se filtraron y se concentraron hasta sequedad para producir el N-Fmoc-4 -amino-butiraldehído deseado (15.35 g, 0.049 mol, rendimiento de 90.0%), el cual se llevó al siguiente paso sin purificación adicional: MS m/e [M+Na] + calculado 332.1, encontrado 332.0. Ácido 3 -metilen-ciclobutan-carboxílico A una solución agitada de KOH (70.0 g, 1.25 mol) en etanol/agua (500 mi, 1:1 v/v) se agregó 3 -metilenciclobutan-carbonitrilo (25.0 g, 0.26 mol) y la mezcla de reacción se calentó a reflujo por 6 horas. El progreso de la reacción fue monitorizado por TLC y, después de la terminación, la mezcla se enfrió y se acidificó a pH 3-4 con HCl . El etanol fue evaporado, y la capa acuosa restante se extrajo con éter dietílico (200 mi) . La capa orgánica se lavó con agua (2 x 20 mi) , con salmuera (30 mi) , se secó sobre sulfato de sodio, se filtró y se concentró hasta sequedad para producir el ácido 3 -metilen-ciclobutan-carboxílico, el cual se llevó al siguiente paso sin purificación adicional: RMN XH (250 MHz, CDC13) d 10.75 (s amplio, 1H) , 4.80 (s, 2H) , 2.85-3.26 (m, 5H) .
N-Boc- 3 -metilen-ciclobutanamina A una solución agitada del ácido 3-metilen-ciclobutan-carboxílico (1.0 g, 8.9 mmol) en THF (90 mi) se agregó NaN3 (2.0 g, 31.1 mmol), seguido por bromuro de tetrabutilamonio (0.48 g, 1.5 mmol) y Zn(OTf)2 (0.1 g, 0.3 mmol) , y la mezcla de reacción se calentó a 40°C. Se agregó luego de una sola vez Boc20 (2.1 g, 9.8 mmol) , y la reacción se calentó a 45°C toda la noche. La reacción se enfrió luego a 0°C se apagó con NaN02 acuoso al 10% (180 mi) . El THF se evaporó y la capa acuosa se extrajo con acetato de etilo (180 mi) . La capa orgánica se lavó con NaHC03 acuoso al 5% (2 x 20 mi) , salmuera (30 mi) , se secó sobre sulfato de sodio, se filtró y se concentró hasta sequedad para producir un material crudo, el cual se purificó mediante cromatografía instantánea (gel de sílice/hexanos : acetato de etilo: 0-90%) para producir la N-Boc-3-metilen-ciclobutanamina deseada (0.57 g, 3.1 mmol, rendimiento de 34.9%): RMN ?? (250 MHz , CDC13) d 4.83 (s, 2H) , 4.79 (s amplio, 1H) , 4.05-4.23 (m, 1H) , 2.92-3.1 1 (m, 2H) , 2.50-2.65 (m, 2H) , 1.44 (s, 9H) .
N-Boc- 1-oxaespiro [2.3] hexan-5 -amina La N-Boc-3-metilen-ciclobutanamina (1.65 g, 9.0 ramol) se sometió al Procedimiento 8 para la formación del epóxido para producir la N-Boc-l-oxaespiro [2.3] hexan-5-amina (1.46 g, 7.33 mmol, rendimiento del 81.5%): RMN ?? (250 MHz , CDC13) d 4.79 (s amplio, 1H) , 4.13-4.31 (m, 1H) , 2.66-2.83 (m, 4H) , 2.31-2.47 (m, 2H) , 1.45 (s, 9H) .
N-Boc-2, 2 -dimetil-3-amino-pro ionaldehído N-Boc-3 -amino-2 , 2 -dimetilpropanol (0.415 g, 2.04 mmol) se sometió al Procedimiento 11 para producir el N-Boc-2, 2-dimetil-3 -amino-propionaldehído (0.39 g, 1.94 mmol, rendimiento de 95.1%); RMN XH (250 MHz , CDC13) d 9.42 (s, 1H) , 4.80 (s amplio, 1H) , 3.11 (d, 2H) , 1.39 (s, 9H) , 1.06 (s, 6H) .
N-Boc- 3-amino- 3 -ciclopropil -propionaldehído El N-Boc- 3 -amino-3 -ciclopropil -propanol (0.130 g, 0.60 mmol) se sometió al Procedimiento 11 para la oxidación al N-Boc-3-amino-3-ciclopropil-propionaldehído correspondiente, el cual se llevó al siguiente paso sin purificación adicional. 4 (S) - er-butildimetilsililoxi-N-Boc-pirrolidin-2 (R) -carboxaldehído 4 (S) - ter-butildimetilsililoxi -N-Boc -pirrolidin-2 (R) -metanol (0.50 g, 1.50 mmol) se sometió al Procedimiento 11 para la oxidación al 4 (S) -ter-butildimetilsililoxi-N-Boc-pirrolidin-2 (R) -carboxaldehído correspondiente, el cual se llevó al siguiente paso sin purificación adicional. 3 - er-butildimetilsililoxi -propanal El 3 - ter-butildimetilsililoxi -propanol (0.50 g, 2.62 mmol) se sometió al Procedimiento 11 para la oxidación al 3- er-butildimetilsililoxi-propanal correspondiente, el cual se llevó al siguiente paso sin purificación adicional. 2 -metil-N-Boc-2 -amino -propanal 2-metil-N-Boc-2-amino-propanol (0.83 g, 4.38 mmol) se sometió al Procedimiento 11 para la oxidación al 2-metil-N-Boc-2-amino-propanal correspondiente (0.706 g, 3.77 mmol, rendimiento de 86.1%) : RMN XH (250 MHz, CDC13) d 9.40 (s, 1H) , 1.57 (s, 1H) , 1.41 (s, 9H) , 1.30 (s, 6H) . Ácido N-Boc-l-amino-ciclobutan-carboxílico El éster etílico del ácido 1-amino-ciclobutan-carboxílico (1.0 g, 6.28 mmol) se disolvió en HC1 1N (10 mi) y la reacción se calentó a reflujo por 2 horas. La mezcla de reacción se concentró luego hasta sequedad para producir un material crudo el cual se sometió al Procedimiento 7 para la protección con Boc para producir el ácido N-Boc-l-amino-ciclobutan-carboxílico deseado.
N-Boc-1-amino-ciclobutil-metanol El ácido N-Boc-l-amino-ciclobutan-carboxílico (6.28 mmol) se sometió al Procedimiento 12 para la reducción al N-Boc - 1 -amino-ciclobutil -metanol correspondiente .
N-Boc- l-amino-ciclobutan-carboxaldehído El N-Boc- 1 -amíno-ciclobutil -metanol (0.25 g, 1.24 mmol) se sometió al Procedimiento 11 para producir el N-Boc- 1-amino-ciclobutan-carboxaldehído correspondiente (0.24 g, 1.20 mmol, rendimiento de 96.8%) : RMN aH (250 MHz, CDC13) d 9.0 (s, 1H) , 4.91 (s amplio, 1H) , 3.74 (s amplio, 2H) , 1.71-2.20 (m, 4H) , 1.42 (s, 9H) .
N,N-diBoc-4 (S) -amino-2 (S) -metanol-pirrolidina El ácido N, -diBoc-4 (S) -amino-pirrolidin-2 (S) -carboxílico (1.03 g, 3.12 mmol) se sometió al Procedimiento 12 para producir la N,N-diBoc-4 (S) -amino-2 (S) -metanol-pirrolidina correspondiente (0.605 g, 1.91 mmol, rendimiento de 61.2%), el cual se llevó al siguiente paso sin purificación adicional.
N,N-diBoc-4 (S) -amino-pirrolidin-2 (S) -carbaldehído La N,N-diBoc- (S) -amino-2 (S) -metanol-pirrolidina (0.486 g, 1.53 ramol) se sometió al Procedimiento 11 para la oxidación al N, -diBoc- (S) -amino-pirrolidin-2 (S) -carbaldehído correspondiente, el cual se llevó al siguiente paso sin purificación adicional.
N-Boc-l-aminometil-ciclopropil-metanol El ácido N-Boc-l-aminometil-ciclopropan-carboxílico (1.0 g, 4.64 mmol) se sometió al Procedimiento 12 para producir el N-Boc-l-aminometil-ciclopropil-metanol correspondiente (0.99 g, MS /e [M+H] + calculado 202.1, encontrado 202.1), el cual se llevó al siguiente paso sin purificación adicional.
N-Boc- 1-aminometi1 -ciclopropan-carboxaldehído El N-Boc-l-aminometil-ciclopropil-metanol (0.87 g, 4.32 mmol) se sometió al Procedimiento 11 para la oxidación al N-Boc-l-aminometil-ciclopropan-carboxaldehído correspondiente, el cual se llevó al siguiente paso sin purificación adicional.
N-Boc-l-amino-ciclopropil-metanol El ácido N-Boc-l-amino-ciclopropan-carboxílico (0.25 g, 1.24 mmol) se sometió al Procedimiento 12 para producir el N-Boc - 1 -amino- ciclopropil -metanol correspondiente (0.051 g, 0.27 mmol, rendimiento de 21.8%), el cual se llevó al siguiente paso sin purificación adicional.
N-Boc- 1-amino-ciclopropan-carboxaldehído El N-Boc-l-amino-ciclopropil-metanol (0.051 g, 0.27 mmol) se sometió al Procedimiento 11 para la oxidación al N-Boc-l-amino-ciclopropan-carboxaldehído correspondiente, el cual se llevó al siguiente paso sin purificación adicional . Ácido N-Boc-1 (R) -amino-2 (S) -ter-butildimetilsililoxi-ciclopentan-4 (S) -carboxílico A una solución agitada del éster metílico del ácido N-Boc-1 (R) -amino-2 (S) -hidroxi-ciclopentan-4 (S) -carboxílico (0.622 g, 2.40 mmol) en DCM (1.9 mi) se agregó imidazol (0.164 g( 2.41 mmol), DMAP (0.047 g, 0.35 mmmol) y TBSC1 (0.363 g, 2.40 mmol) y la reacción se agitó a temperatura ambiente por 18 horas, seguido por calentamiento a 40°C por 1 hora. La mezcla de reacción se enfrió hasta la temperatura ambiente, y se apagó con agua (3 mi) . La capa orgánica se separó y se concentró hasta sequedad para producir un residuo, el cual se disolvió en isopropanol (6 mi) y NaOH 1M (2.9 mi), y la reacción se calentó a 60°C por 1 hora. La reacción se enfrió a 0°C y se acidificó lentamente a pH 3 con HC1 1M (3 mi) . Después de agregar cloroformo (18 mi) , la capa orgánica se separó, se secó sobre sulfato de sodio, y se concentró hasta sequedad para producir el ácido deseado (0.75 g, 2.09 ramol, rendimiento de 87.1%) .
N-Boc-1 (R) -amino-2 (S) -ter-butildimetilsililoxi - (S) -hidroximetil -ciclopentano El ácido N-Boc-1 (R) -amino-2 (S) - ter-butildimetilsililoxi-ciclopentan-4 (S) -carboxílico (0.53 g, 1.47 ramol) se sometió al Procedimiento 12 para la reducción al N-Boc-1 (R) -amino-2 (S) - ter-butildimetilsililoxi -4 (S) -hidroximetil-ciclopentano correspondiente (0.44 g, 1.27 mmol, rendimiento de 86.4%) : RMN XH (250 MHz , CDC13) d 4.69-4.79 (m, 1H) , 4.08-4.13 (m, 1H) , 3.88 (s amplio, 1H) , 3.52-3.61 (m, 2H) , 2.16-2.30 (m, 2H) , 1.96-2.14 (m, 2H) , 1.48-1.53 (m, 2H) , 1.47 (s, 9H) , 0.91 (s, 9H) , 0.09 (s, 6H) .
N-Boc-l(R) -amino-2 (S) - er-butildimetilsililoxi -ciclopentan- 4 (S) -carboxaldehido El N-Boc-1 (R) -amino-2 (S) -ter-bu ildimetilsililoxi -4 (S) -hidroximetil -ciclopentano (0.44 g, 1.27 mmol) se sometió al Procedimiento 11 para la oxidación al N-Boc-1 (R) -amino-2 (S) - ter-butildimetilsililoxi -ciclopentan- 4 (S) -carboxaldehído correspondiente (0.42 g, 1.22 mmol, rendimiento de 96.1%) . 2- (N-Boc-3-hidroxi-azetidin-3-il) acetato de ter-butilo A una solución agitada de N-Boc-3 -azetidinona (0.45 g, 2.64 mmol) en THF (5 mi) se agregó lentamente a una solución 0.5 M de cloruro de 2-ter-butoxi-2-oxoetil-zinc en éter dietílico (10 mi, 5.0 mmol), y la mezcla de reacción se agitó por 5 horas. La reacción se apagó luego con cloruro de amonio acuoso saturado (10 mi) , y la capa acuosa se separó y se extrajo con acetato de etilo (2 x 30 mi) . Las capas orgánicas combinadas se lavaron con NaHC03 acuoso al 5% (2 x 10 mi) , salmuera (15 mi) , se secaron sobre sulfato de sodio, se filtraron y se concentraron hasta sequedad para producir el 2 - (N-Boc- 3 -hidroxi -azetidin-3 -il) -acetato de ter-butilo (MS m/e [M+H] + calculado 288.2, encontrado 287.7) . Ácido 2- (N-Boc-3-hidroxi-azetidin-3-il) -acético A una solución agitada del 2 - (N-Boc- 3 -hidroxi-azetidin-3-il) -acetato de ter-butilo (0.86 g, 2.99 mmol) en dioxano (18 mi) se agregó HC1 3M (5 mi) , y la mezcla se calentó a 70°C por 1 hora. La mezcla de reacción se enfrió luego a 0°C y ésta se alcalinizó con NaOH 2 M (8 mi) , seguido por la adición de BOC20 (1.0 g, 4.6 mmol). La mezcla de reacción se dejó calentar hasta la temperatura ambiente por 2 horas, y luego se concentró hasta la mitad de su volumen total en el evaporador rotatorio. Se agregaron luego isopropanol (3 mi) y cloroformo (12 mi) y la mezcla se enfrió a 0°C y se acidificó lentamente a pH 3 con HC1 1M. La capa orgánica se separó luego, se secó sobre sulfato de sodio, y se concentró hasta sequedad para producir el ácido 2- (N-Boc-3-hidroxi-azetidin-3-il) -acético (0.65 g, 2.81 mmol, rendimiento de 94.0%).
N-Boc-3- (2-hidroxi-etil) -azetidin-3 -ol El ácido 2- (N-Boc-3-hidroxi-azetidin-3-il) -acético (0.44 g, 1.90 mmol) se sometió al Procedimiento 12 para la reducción para producir el N-Boc-3- (2-hidroxi-etil) -azetidin-3-ol correspondiente (0.29 g, 1.33 mmol, rendimiento de 70.0%) . 2- (N-Boc-3-hidroxi-azetidin-3-il) -acetaldehído El N-Boc-3- (2-hidroxi-etil) -azetidin-3 -ol (0.29 g, 1.33 mmol) se sometió al Procedimiento 11 para la oxidación al 2- (N-Boc-3-hidroxi-azetidin-3-il) -acetaldehído correspondiente, el cual se llevó al siguiente paso sin purificación adicional.
N-Boc- 3-hidroximetil -azetidina El ácido N-Boc-azetidin-3-carboxílico (1.94 g, 9.64 mmol) se sometió al Procedimiento 12 para la reducción al N-Boc-3 -hidroximetil-azetidina correspondiente, el cual se llevó al siguiente paso sin purificación adicional.
N-Boc-azetidin-3 -carboxaldehído La N-Boc-3 -hidroximetil-azetidina (9.64 mmol) se sometió al Procedimiento 11 para la oxidación al N-Boc-azetidin-3 -carboxaldehído deseado, el cual se llevó al siguiente paso sin purificación adicional.
Síntesis del ácido (2R, 3R) -4-azido-2 -benciloxi-3- fluorobutanoico (5) Se agregaron tamices moleculares (4 Á, 4 g) a un matraz de fondo redondo, y se activaron mediante calentamiento con un mechero de Bunsen bajo un alto vacío. Se agregó luego DCM (100 mi) y el matraz se enfrió a -35°C con un crioenfriador. Se agregaron tetraisopropóxido de titanio (1.75 mi, 5.95 mmol) y tartrato de (R,R)-(-)- diisopropilo (1.65 mi, 7.75 mmol) y la reacción se agitó por 30 minutos. Se agregaron luego penta-1, 4-dienol (5 g, 59.4 mmol) e hidróxido de eumeno en exceso (80%, 17.5 mi) en pequeñas porciones, y la agitación se continuó a -35 °C por 48 horas. La reacción se apagó por la adición de sulfato de sodio acuoso saturado (5 mi) inmediatamente seguido por éter dietílico (50 mi) y la reacción se agitó por 2 horas con calentamiento a temperatura ambiente. La mezcla de reacción se filtró a través de Celite, y se lavó con éter dietílico. La eliminación del solvente bajo vacío sin calentamiento dio como resultado aproximadamente 30 mi de la solución amarilla. El alcohol cuménico en exceso y el hidroperóxido fueron eliminados mediante cromatografía instantánea (gel de sílice, 40% éter dietílico/hexano) . Finalmente la eliminación del solvente bajo vacío sin calentamiento produjo una mezcla de (2S, 3R) -1, 2-epoxi-4-penten-3-ol (1) Rf = 0.47, 1:1 EtOAc/hex) y tartrato de diisopropilo (Rf= 0.6), que se utilizó en el siguiente paso sin purificación adicional.
A una solución agitada del epóxido (1) en THF (100 mi) bajo una atmósfera de argón se agregó yoduro de tetrabutilamonio (2.2 g, 5.96 mmol) , seguido por bromuro de bencilo (8.6 mi, 71.9 mmol) y la reacción se enfrió a -15°C. Se agregó hidruro de sodio (aceite mineral al 60%, 2.65 g, 66.1 mmol) en pequeñas porciones y la reacción se agitó toda la noche con calentamiento a temperatura ambiente. La reacción se apagó con metanol, se filtró a través de Celite, y se lavó con éter dietílico. La eliminación de solvente dio un residuo aceitoso que se purificó mediante cromatografía instantánea (gel de sílice, 5 ? 10% éter dietílico/hex) para producir el (2S, 3R) -1, 2-epoxi-3-benciloxi-4-penteno (2) como un líquido no volátil claro (5.3 g, rendimiento de 47.6%): Rf = 0.69 (1:4 EtOAc/hex) ; [a] D = -36.7° (c 1.52, CHC13); HRMS (ESI) (M+H)+ calculado para C12H1402 191.1067, obs . 191.1064; R N XH (CDCI3, 300 MHz) d 7.38-7.33 (m, 5H) , 5.92-5.78 (m, 1H) , 5.41-5.39 (m, 1H) , 5.37-5.33 (m, 1H) , 4.66 (d, J = 11.95 Hz, 1H) , 4.49 (d, J = 11.96 Hz , 1H) , 3.83 (dd, J = 7.34, 4.20 Hz, 1H) , 3.10 (dt, J = 4.07, 4.06, 2.70 Hz , 1H) , 2.79 (dd, J = 5.21, 4.00 Hz, 1H) , 2.70 (dd, J = 5.23, 2.64 Hz, 1H) . 13C RMN (CDCI3, 100 MHz) d 138.32, 134.67, 128.56 (2C) , 127. (2C) , 127.82, 119.73, 79.54, 70.83, 53.41, 45.00.
NaN3 (3.38 g, 52 mmol) y NH4C1 (2.78 g, 52 rammol) en agua (10 mi) se calentaron hasta que se obtuvo una solución clara. Esta solución fue luego agregada gota a gota a una solución de (2S, 3R) -1, 2-epoxi-3 -benciloxi-4 -penteno (2) (3.3 g, 17.4 mmol) en metanol (200 mi) y la mezcla de reacción .se agitó por 4 días. El solvente orgánico se eliminó bajo vacío, y la capa acuosa se extrajo con DCM (3 x) . Las capas orgánicas combinadas se secaron sobre sulfato de sodio, se filtraron y se redujeron bajo vacío para producir un material crudo, el cual se purificó mediante cromatografía instantánea (gel de sílice, 10 ? 20% éter dietílico/hex) para producir el (2S, 3R) -l-azido-3-benciloxi-4-penten-2-ol (3) (2.66 g, rendimiento de 66%) como un líquido claro no volátil: Rf = 4.8 (1:4 EtOAc/hex) ; HRMS (ESI) (M+Na) + calculado para C12HisN302 256.1056, obs . 256.1057; [<x] D = -46.3° (c 1.50, CHCI3) ; RMN XH (CDCI3, 300 MHz) d 7.42-7.28 (m, 5H) , 5.91-5.76 (m, 1H) , 5.46 (dd, J = 17.16, 1.42 Hz , 1H) , 5.42 (dd, J = 24.00, 1.37 Hz, 1H) , 4.65 (d, J = 1 1.67 Hz , 1H) , 4.39 (d, J = 1 1.67 Hz, 1H) , 3.88-3.80 (m, 2H) , 3.44-3.40 (m, 2H) , 2.22 (d, J = 3.60 Hz, 1H) ; 13C R N (CDC13, 100 MHz) d 137.88, 134.60, 128.66 (2C) , 128.08 (2C) , 128.05, 121.40, 81.39, 72.61, 70.70, 53.0; FTIR (NaCl) : 3435, 2870, 2102, 1642, 1454, 1070 cm"1.
A una solución agitada de DAST (900 yL, 6.87 mmol) en benceno (3.2 mi) y piridina (400 i~L) en un recipiente de plástico a -10°C se agregó (2S, 3R) -l-azido-3-benciloxi-4-penten-2-ol (3) (750 mg, 3.21 mmol) en pequeñas porciones, y la reacción se agitó a esta temperatura por 48 horas seguido por 6 horas a temperatura ambiente. La mezcla de reacción se agregó lentamente a NaHC03 acuoso saturado (20 mi) a 0°C, y se agitó por 10 minutos. La mezcla acuosa resultante se extrajo con DCM (3 x) y las capas orgánicas combinadas se lavaron con HCl 2 N, se secaron sobre sulfato de magnesio, se filtraron y se redujeron bajo vacío para producir un material crudo, el cual se purificó mediante cromatografía instantánea (gel de sílice, 1% de éter dietílico/hex) para producir el (3R, 4R) -5-azido-4-f luoro-3-benciloxi-pent-l-eno (4) (128 mg, rendimiento de 16.9%) como un líquido claro no volátil: Rf = 0.63 (1 :9 EtOAC/Hex) ; [a] D = -11.9° (c 1.50, CHC13 ) ; RMN XH (CDCI3, 400 MHz) d 7.44-7.29 (m, 5H) , 4.63 (dddd, J = 47.64, 7.07, 4.99, 3.32 Hz, 1H) , 5.49-5.42 (m, 2H) , 4.70 (d, J = 11.95 Hz, 1H) , 4.57 (ddd, J = 7.07, 4.99, 3.32 Hz , 1H) , 4.44 (d, J = 11.90 Hz, 1H) , 4.03 (ddd, J = 16.87, 7.57, 5.04 Hz, 1H) , 3.64-3.52 (m, 1H) , 3.45 (ddd, J = 27.45, 13.63, 3.27 Hz, 1H) . 19F RMN (CDC13, 282 MHz) -196.66 (dddd, J = 47.27, 27.08, 19.84, 16.89 Hz); 13C RMN (CDC13, 100 MHz) d 137.80, 133.09 (d, J = 5.30 Hz), 128.70 (2C) , 128.09 (3C), 121.04, 93.33 (d, J = 181.54 Hz) , 79.08 (d, J = 20.39 Hz), 70.92, 51.46 (d, J = 22.25 Hz) . FTIR (NaCl) : 2930, 2104, 1643, 1454, 1281, 1115, 1069 cra'1.
El (3R,4R) -5-azido-4-fluoro-3-benciloxi-pent-l-eno (4) (128 mg, 0.543 ramol) se sometió al Procedimiento 13, seguido por recristalización a partir de hexanos calientes (2 x) para producir el ácido (2R, 3R) -4-azido-2-benciloxi-3-fluorobutanoico (5) (120 mg, 90%): [a]D = -56.9° (c 0.68, CHCI3) ; HRMS (ESI modo negativo) (M-H) calculado para C11H12F 3O3 252.0790, obs. 252.0782; RMN XH (CDC13, 400 MHz), d 10.55 (s, 1H) , 7.46-7.34 (m, 5H) , 4.98 (dddd, J = 46.40, 7.57, 4.91, 2.92 Hz, 1H) , 4.94 (d, J = 11.47 Hz, 1H) , 4.55 (d, J = 11.51 Hz, 1H) , 4.17 (dd, J = 27.26, 2.86 Hz, 1H) , 3.77 (dt, J = 13.89, 13.66, 7.27 Hz, 1H) , 3.42 (ddd, J = 24.28, 13.20, 4.92 Hz, 1H) ; 19F RMN (CDCl3, 376 MHz) d-198.36 (dddd, J = 46.28, 27.22, 24.46, 14.15 Hz) ; 13C R N (CDC13, 100 ??) d 174.63 (d, J = 4.21 Hz) , 136.37, 129.15 (2C) , 129.07, 128.98 (2C) , 91.53 (d, J = 182.59 Hz) , 76.40 (d, J = 19.90 Hz), 73.96 (s) , 50.87 (d, J = 25.13 Hz) ; FTIR (NaCl) : 3151, 2098, 1753, 1407, 1283, 1112 cm"1.
Síntesis de ent-5 Comenzando a partir de penta-1 , 4-dienol (5 g, 59.4 mmol) y utilizando tartrato de (S, S) - (+) -diisopropilo bajo las mismas condiciones de reacción como se describieron anteriormente fue obtenido el enantiomero ent-2 (4.9 g, rendimiento de 43%): [a] D = +35.7° (c 1.76, CHC13) . El (2R, 3S) -1, 2-epoxi-3-benciloxi-4-penteno (ent-2, 3.9 g, 20.5 mmol) fue sometido a las mismas condiciones de reacción descritas anteriormente para producir el enantiomero (2R,3S)-l-azido-3-benciloxi-4-penten-2-ol (ent-3, 2.75 g, rendimiento de 57%): [a]D = +47.3° (c 1.30, CHC13). (2R, 3S) -l-azido-3-benciloxi- -penten-2-ol (ent-3) (500 mg, 2.14 mmol) se sometió a las mismas reacciones como se describió anteriormente para producir el enantiomero (3S, 4S) -5-azido-4-fluoro-3-benciloxi-pent-l-eno (ent-4, 75.5 mg, 0.32 mmol, rendimiento de 15%, [a]D = +10.7°,c 1.50, CHC13) , el cual se sometió a las mismas condiciones de reacción como se describieron anteriormente para producir el ent-5 (59 mg, rendimiento de 73%) : [a] D = +58.6° (c 0.73, CHC13) .
Síntesis del ácido (R) -4-azido-3, 3-difluoro-2-benciloxi-butanoico (3) 1 2 A una solución agitada de DMSO (690 pL, 9.65 mmol) en DCM (25 mi) a -78°C se agregó cloruro de oxalilo (3.21 mi de una solución 2.0 M en DCM, 6.43 mmol) y la reacción se agitó por 1 horas. Una solución de (2S, 3R) -l-azido-3-benciloxi- -penten-2-ol (1) (750 mg, 3.21 mmol) en DCM (1 mi) se agregó gota a gota y la mezcla de reacción fue agitada por 1 hora a -78°C. Se agregó gota a gota N-metil-morfolina (1.41 mi, 12.9 mmol) , y la reacción se agitó a -15°C por 2 horas. La reacción se apagó con amortiguador de fosfato (0.1 M, pH 6.0) y la capa acuosa se separó. La capa orgánica se lavó con el amortiguador de fosfato (3 x) , se secó sobre sulfato de sodio, se filtró y se redujo bajo vacío para dar un residuo café. El residuo fue disuelto en éter dietílico, secado sobre Sulfato de magnesio, filtrado a través de un tapón de algodón, y reducido bajo vacío para producir la cetona cruda, la cual fue disuelta en DCM (1 mi) y se agregó a una solución agitada de DAST (2 mi, 15.3 mmol) en DCM (3 mi) en un vial de plástico a -25°C. La reacción se dejó calentar lentamente hasta la temperatura ambiente y se agitó por 48 horas. La mezcla de reacción se vacío luego lentamente dentro de NaHC03 acuoso saturado (20 mi) con agitación, a 0°C, y se agitó por 10 minutos. La mezcla acuosa resultante se extrajo con DCM (3x) , y las capas orgánicas combinadas se secaron sobre sulfato de sodio, se filtraron y se redujeron bajo vacío para producir un material crudo, el cual se purificó mediante cromatografía instantánea (gel de sílice, 1% de éter dietí lico/hex) seguido por purificación por TLC preparativa (gel de sílice, 0.5 mm, 5% de éter dietílico/hex) para producir el ( R) - 5 - az ido- 4 , 4 -difluoro- 3 -benciloxi -pent - 1 -eno (2, 193 mg, 0.76 mmol, rendimiento de 24%) , como un líquido claro no volátil: Rf = 0.72 (1:4 EtOAc/hex) ; [a] D = -23.8° (c 1.52, CHC13) ; RMN XH ( CDC13 , 300 MHz) d 7.44-7.31 (m, 5H) , 5.89 (dddd, J = 16.88, 10.61 , 7.11, 0.62 Hz, 1H) , 5.59-5.56 (m, 1H) , 5.53 (d, J = 10.74 Hz, 1H) , 4.71 (d, J = 11.67 Hz, 1H) , 4.50 (d, J = 11.66 Hz, 1H) , 4.14 (td, J = 14.25, 7.13, 7.13 Hz, 1H) , 3.64 (tq, J = 13.67, 13.67, 13.67, 11.19, 11.19 Hz , 2H) ; 19F RMN (CDCl3/ 282 MHz) d -116.63 (dtd, J = 257.62, 13.91, 13.90, 8.72 Hz) , -111.27 (dtd, J = 257.59, 16.18, 16.16, 7.04 Hz); 13C RMN (CDC13, 75 MHz) d 137.14 , 130.33 (t, J - 3.06, 3.06 Hz), 128.71 (2C) , 128.27, 128.20 (2C), 122.78, 120.69 (dd, J = 249.89, 246.83 Hz), 78.87 (dd, J = 30.35, 25.35 Hz), 71.48 (d, J = 0.48 Hz), 51.47 (dd, J = 30.26, 25.92 Hz) ; FTIR (NaCl): 2928, 2108, 1455, 1292, 1091 cm'1.
El (R) -5-azido-4 , -difluoro-3-benciloxi-pent-l-eno (2, 193 mg, 0.76 mmol) se sometió al Procedimiento 13, seguido por lavado con hexanos fríos (3x) a -20°C para producir (3) (139 mg, rendimiento 67.6%) : [a] D = -32.4° (c 0.80, CHC13) ; HRMS (ESI modo negativo) (M-H) para CnHuFzNBÜa 270.0696, obs . 270.06924 ; RMN ?? (CDC13, 400 MHz) d 7.46-7.32 (m, 5H) , 6.48 (s, 1H) , 4.84 (d, J = 1 1.30 Hz, 1H) , 4.67 (d, J = 11.30 Hz , 1H) , 4.37 (dd, J = 12.23, 9.78 Hz, 1H) , 3.75 (dd, J = 14.67, 12.35 Hz, 2H) ; 19F RMN ( CDCI3 , 376 MHz) d -112.61 (qd, J = 260.95, 12.30, 12.29, 12.29 Hz), -109.68 (dtd, J = 260.79, 14.75, 14.68, 9.94 Hz) ; 13C RMN (CDC13, 100 MHz) d 170.84, 135.48, 129.01, 128.94 (2C), 128.78 (2C), 119.59 (t, J = 251.58, 251.58 Hz) , 76.56 (dd, J = 29.86, 27.24 Hz) , 74.34, 51.58 (dd, J = 28.94, 26.76 Hz) . FTIR (NaCl) : 3337, 2929, 2112, 1738, 1455, 1292, 1210, 11 19 cm"1.
Síntesis de ent-3 El (2R,3S) -l-azido-3-benciloxi-4-penten-2-ol (ent-1, 500 mg, 2.14 mmol) se sometió a las mismas condiciones de reacción descritas anteriormente para producir el (S )- 5 -azido-4 , 4 -difluoro- 3 -benciloxi -pent - 1 -eno (ent-2, 114 mg, rendimiento de 21%, [a] D = +27.9° (c 3.14, CHCl3 ) ) . Ent-2 (75.5 mg, 0.32 mmol) se sometió al Procedimiento 13 para producir el ácido (S) -4 -azido-2-benciloxi-3 , 3 -dif luorobutanoico (ent-3, 34.8 mg, rendimiento de 43%, [a]D = +36.4° (c 0.80, CHC13) .
Síntesis de ácido (2S , 3S) -4 -azido-2 , 3 -bis-benciloxibutanoico (3) A una solución agitada de (2S , 3R) -l-azido-3-benciloxi-4-penten-2-ol (1) (250 ?, 1.07 mmol) en THF (50 mi) bajo atmósfera de argón se agregó yoduro de tetrabutilamonio (42 mg, 0.11 mmol) seguido por bromuro de bencilo (155 iL, 1.27 mmol) y la reacción se enfrió a 0°C. Se agregó hidruro de sodio (60% en aceite mineral, 47 mg, 1.18 mmol) en pequeñas porciones y la reacción se agitó toda la noche con calentamiento a temperatura ambiente. La reacción se apagó con metanol, se filtró a través de Celite, y se lavó con éter dietílico. El solvente orgánico se eliminó bajo vacío para dar un residuo aceitoso, el cual se purificó mediante cromatografía instantánea (gel de sílice, 2% de éter diet ílico/hex) para producir el (3R, 4S) -5-azido-3 , 4 -bisbenciloxi -pent- 1-eno (2, 237 mg, rendimiento de 65%) como un líquido no volátil claro: Rf = 0.62 (1:4 EtOAc/hex) ; [a] D = -6.1 0 (c 1.50, CHC13) ; RMN XH (CDCI3, 300 MHz) d 7.35-7.24 (m, 10H) , 5.81 (ddd, J = 17.15, 10.58, 7.45 Hz, 1H) , 5.37 (ddd, J = 5.70, 1.65, 0.86 Hz, 1H), 5.33 (ddd, J = 12.07, 1.44, 0.81 Hz, 1H) , 4.63 (s, 2H) , 4.61 (d, J = 11.87 Hz , 1H) , 4.35 (d, J = 11.78 Hz, 1H) , 3.90 (tdd, J = 7.37, 5.65, 0.79, 0.79 Hz, 1H) , 3.60 (ddd, J = 6.39, 5.69, 3.64 Hz, 1H) , 3.43 (dd, J = 12.93, 6.42 Hz, 1H) , 3.35 (dd, J = 12.93, 3.60 Hz , 1H) ; 13C RMN (CDCI3, 75 MHz) d 138.25, 138.01, 135.43, 128.60 (4C) , 128.29 (2C) , 128.02, 127.99 (2C) , 127.87, 119.97, 80.76, 80.23, 73.33, 70.79, 51.69; FTIR (NaCl) : 2867, 2100, 1606, 1454, 1286, 1095, 1073.
El (3R, 4S) -5-azido-3, 4-bis-benciloxi-pent-l-eno (2, 237 mg, 0.69 mmol) se sometió al Procedimiento 13 para producir el ácido (2S , 3S) -4 -azido-2 , 3 -bis -benciloxibutanoico (3, 187.7 mg, rendimiento de 75%) : [a] D = -15.1° (c 1.05, CHC13) ; HRMS (ESI modo negativo) (M-H) calculado para Ci8H19N304 340.1303, obs . 340.1296; RMN XH (CDC13, 300 MHz) d 7.24 (s, 1H) , 7.38-7.33 (m, 10H) , 4.79 (d, J = 11.61 Hz, 1H) , 4.66 (S, 2H) , 4.56 (d, J = 11.61 Hz , 1H) , 4.20 (d, J = 4.24 Hz, 1H) , 3.98 (td, J = 6.56, 4.30, 4.30 Hz, 1H) , 3.58 (dd, J = 13.04, 6.62 Hz, 1H) , 3.42 (dd, J = 13.04, 4.31 Hz, 1H) ; 13C RMN (CDCI3 , 75 MHz) d 175.57, 137.92, 137.34, 129.44 (2C) , 129.36 (2C) , 129.15, 129.04 (2C) , 128.98 (2C) , 128.94, 79.71, 77.651, 74.04, 73.89, 51.65; FTIR (NaCl) : 3000, 2918, .2103, 1722, 1455, 1284, 1110 cm"1.
Síntesis de ent-3 ent-1 ent-2 "^V ent-3 El (2R, 3S) -l-azido-3-benciloxi-4-penten-2-ol (ent-1, 250 mg, 1.07 mmol) se sometió a las mismas condiciones de reacción como se describió anteriormente para producir el (3S, 4R) -5-azido-3 , 4-bis-benciloxi-pent-l-eno (ent-2, 322 mg, rendimiento de 59%): [a] D = +7.9° (c 1.50, CHC13) . El Ent-2 (178 mg, 0.55 mmol) se sometió al Procedimiento 13 para producir ent-3 (144 mg, rendimiento de 77%): [a] D = +15.2° (c 0.81, CHC13) .
Síntesis del Compuesto 6 Síntesis del Compuesto 2 Un matraz de fondo redondo de tres bocas, de 2 litros, equipado con un condensador a reflujo se cargó con el epóxido 1 (60 g, 315 mmol), ftalimida (69.6 g, 473 mmol), piridina (5.1 mi, 63.1 mmol, 20% mol) e IPA (600 mi) y la solución resultante se agitó a 80-82°C por 8 horas. La mezcla de reacción se enfrió luego a temperatura ambiente y se concentró en un evaporador rotatorio hasta sequedad. El residuo fue adsorbido sobre gel de sílice (100 g) , secado bajo alto vacío y purificado mediante cromatografía instantánea sobre gel de sílice (10-40% de MTBE/heptanos) para proporcionar el aminoalcohol 2 protegido con la ftalamida, deseado como un sólido blanco (73.5 g, 69%) : RMN 2H (CDC13, 500 MHz) d 7.83-7.82 (m, 2H) , 7.71-7.69 (m, 2H) , 7.32-7.31 (m, 4H) , 7.28-7.25 (m, 1H) , 5.91 (ddd, J = 17.4, 10.5, 7.6 Hz, 1H) , 5.46-5.40 (m, 2H) , 4.65 (d, J = 11.7 Hz, 1H) , 4.40 (d, J = 11.7 Hz, 1H) , 3.99-3.97 (m, 1H) , 3.95-3.90 (m, 2H) , 3.86 (dd, J = 14.0, 3.3 Hz, 1H) , 2.61 (d, J= 6.5 H , 1H) .
Síntesis del Compuesto 3 Un matraz de fondo redondo de tres bocas, de 2 litros, equipado con un embudo de adición, un agitador mecánico superior, y una entrada/salida de nitrógeno se cargó con una solución de alcohol 2 (70 g, 208 mmol) en tetrahidrofurano anhidro (840 mi) . La solución se enfrió a -10 hasta -15°C, luego se cargó BU4NI (7.66 g, 20.8 mmol, 10% mol) dentro del reactor, seguido por bromuro de bencilo (29.6 mi, 249 mmol) . La solución resultante se agitó por 20 minutos, luego se agregó hidruro de sodio (9.2 g, 228 mmol, 1.1 equivalente, dispersión en aceite mineral al 60%) al lote en porciones tal que la temperatura del lote fuera mantenida a -10 a -15°C. Una vez que se completó la adición del hidruro de sodio, la mezcla de reacción se agitó por 30 minutos adicionales y luego se llevó hasta la temperatura ambiente y se agitó adicionalmente por 18 horas. La reacción se apagó con NaHC0 acuoso (280 mi) al tiempo que se mantenía la mezcla de reacción a -5 a 0°C (baño de hielo). La mezcla de reacción se diluyó luego con MTBE (1.4 L mi) y las fases se separaron. La capa orgánica se lavó con agua (2 x 210 mi) , con salmuera (210 mi) , se secó (MgS04) , se filtró, y se concentró para obtener el producto crudo. El producto crudo fue purificado mediante cromatografía instantánea sobre gel de sílice (5-25% de MTBE/heptanos) para obtener el producto deseado 3 como un semi-sólido (75.7 g, 85%): RMN XH (CDC13, 300 MHz) 6 7.75-7.74 (m, 2H) , 7.67-7.66 (m, 2H) , 7.34-7.21 (m, 5H) , 7.15-7.13 (m, 2H) , 7.07-7.02 (m, 3H) , 5.98-5.91 (m, 1H) , 5.43 (s, 1H) , 5.39 (td, J = 5.9, 1 Hz , 1H) , 4.66 (dd, J = 12.0, 5.7 Hz, 2H) , 4.49 (d, J = 12.0 Hz , 1H) , 4.44 (d, J = 11.8 Hz, 1H) , 3.95-3.89 (m, 3H) , 3.77-3.72 (m, 1H) .
Síntesis del aldehido 4 y del ácido carboxílico 5 Una solución del alqueno 3 (30 g, 70.2 mol) en DCM (1.8 litros) se purgó con ozono a <-70 °C (hielo seco-acetona) por 1 minuto utilizando una fuente de oxígeno para generar el ozono. Una vez que la reacción fue considerada completa (TLC, 1:1 MTBE/heptanos), la solución se purgó con nitrógeno por 35 minutos para eliminar el ozono residual. La reacción se apagó con sulfuro de dimetilo (52 mi, 702 mmol) , mientras que se mantenía la mezcla de reacción a <-70°C (hielo seco-acetona) . El baño frío fue retirado y la mezcla se dejó calentar hasta la temperatura ambiente. La mezcla de reacción se concentró bajo presión reducida y se secó adicionalmente bajo un alto vacío para obtener el aldehido 4 crudo, como un aceite espeso (35.5 g, > 99%) . Rf" = 0.38 (1:1 MTBE/heptanos) . La reacción se repitió a una escala de 30 g del 3 para proporcionar el aldehido crudo 4 (33.4 g, > 99%) . Los dos lotes del aldehido crudo fueron combinados y sometidos a oxidación de Pinnick sin purificación adicional.
El aldehido 4 crudo (30.1 g) fue recogido en una mezcla de tetrahidrofurano, tBuOH, y agua (226 ral, 226 mi, 151 mi, 3:3:2) junto con NaH2P04 (33.7 g, 281 mmol) y 2-metil-2-buteno (149 mi, 1.4 mol). La solución fue enfriada (15 ± 5°C, baño de agua) . Se agregó clorito de sodio (12.7 g, 140 mmol) al lote y la solución resultante se agitó a temperatura ambiente por 4 horas . La terminación de la reacción fue confirmada por análisis de TLC (MTBE/heptanos 1:1 y 5% de metanol en DCM) . La reacción fue luego apagada con salmuera (602 mi) y el producto extraído en DCM (3 x 602 mi) . Las capas orgánicas se secaron sobre sulfato de magnesio, se concentraron bajo presión reducida para obtener el ácido crudo 5 como un aceite espeso (42.5 g, > 99%) . La síntesis fue repetida a una escala de 30.1 g del 4 para proporcionar el ácido 5 crudo (44.2 g, > 99%) . Ambos lotes de los ácidos crudos fueron combinados y purificados mediante cromatografía instantánea en columna sobre sílice (5-100% de MTBE/heptanos) . Las fracciones que contenían el ácido fueron combinadas y concentradas bajo presión reducida para proporcionar el ácido 5 como un sólido blanco (29.1 g, 47%) : Rf = 0.39 (5:95 metanol/DCM) ; RMN XH (CDC13, 500 MHz) d 7.76 (dd, J = 6.8, 3.7 Hz, 2H) , 7.68 (dd, J = 5.5, 3.0 Hz, 2H) , 7.35-7.34 (m, 2H) , 7.31-7.26 (m, 3H) , 7.18-7.16 (m, 2H) , 7.11-7.05 (m, 3H) , 4.75 (d, J = 11 Hz, 1H) , 4.65 (d, J = 12.8, 2H) , 4.59 (d, J = 11.9 Hz, 1H) , 4.22 (d, J= 3.65, 1H) , 4.17 (m, 1H) , 4.08 (dd, J = 14.3, 6.8 Hz, 1H) , 3.86 (dd, J = 14.3, 4.7 Hz, 1H) .
Síntesis del Compuesto 6 Un matraz de fondo redondo equipado con una barra de agitación magnética y sonda de termopar fue cargado con una solución del aminoácido 5 protegido con ftalimida (29.0 g, 65.1 mmol) en THF (350 mi) . A la solución amarillo claro se agregó agua desionizada (175 mi) y la mezcla resultante se enfrió a 5°C. Se agregó luego solución de metilamina en agua (58.0 mi, 40% p, 665 mmol) al lote, que se calentó a temperatura ambiente (21-23°C) y se agitó por 26 horas. El análisis de una alícuota proveniente de la mezcla de reacción por LCMS indicó que la reacción estaba completa. La mezcla de reacción fue luego concentrada in vacuo hasta obtener un residuo sólido amarillo, eliminando toda la metilamina en exceso. El residuo fue recogido en THF (700 mi) y agua (350 mi) , enfriado a 0-5°C, y a la solución del aminoácido crudo se agregó carbonato de potasio (45 g, 326 mmol) , seguido por cloroformiato de bencilo (17.2 mi, 114 mmol). El lote fue calentado a temperatura ambiente y la reacción se dejó proceder por 28 horas. El análisis de una alícuota en este punto en el tiempo por LCMS indicó una conversión completa del aminoácido al carbamato. La mezcla de reacción se concentró bajo presión reducida para eliminar la mayor parte del THF, el residuo acuoso fue diluido con agua (320 mi) y el pH ajustado con HCl 2N aproximadamente a pH 5 (tira de papel pH) . El producto crudo fue extraído con cloruro de metileno (3 x 500 mi) , los extractos lavados con agua (60 mi) , salmuera (60 mi) , secados sobre sulfato de magnesio, y concentrados in vacuo para obtener un aceite amarillo (40.34 g) el cual se purificó mediante cromatografía instantánea en columna sobre gel de sílice (400 g; elución con 0-5% de metanol en cloruro de metileno) para proporcionar el compuesto 6 como un aceite amarillo (27.5 g, rendimiento del 92% en dos pasos). RMN XH (DMS0-d5, 500 MHz) d 12.93 (s, 1H) , 7.36-7.23 (m, 16H) , 5.01 (s, 2H) , 4.63 (d, J= 11.8 Hz, 1H) , 4.56 (dd, J = 22.9, 11.7 Hz, 2H) , 4.45 (d, J= 11.7 Hz , 1H) , 4.14 (d, J= 4.0 Hz, 1H) , 3.81 (td, J = 7.3, 4.1 Hz, 1H) , 3.31-3.24 (m, 2H) . 13 Síntesis del Compuesto 9 4Nl Síntesis de Epoxi-Alcohol Ent-2 Un matraz de fondo redondo, de 5 litros, de 3 bocas equipado con un agitador mecánico superior, una sonda de termopar y una entrada/salida de nitrógeno, se cargó con tamices moleculares recién activados, en polvo (4 Á, 84 g, 0.8 p, equivalente), seguido por diclorometano anhidro (2.1 litros, 20 vol . ) . La suspensión resultante fue enfriada aproximadamente a -42 °C utilizando un baño de acetonitrilo/C02 , luego se cargó tetraisopropóxido de titanio (37 mi, 0.125 mol, 10% mol) dentro del lote, seguido por tartrato de (S, S) - (+) -diisopropilo (35 mi, 0.166 mol, 13.3% mol) . La mezcla de reacción se agitó luego por 30 minutos, luego se agregó alcohol divinílico 1 (105 g, 1.25 mol, 1.0 equivalente) en 3 minutos utilizando un embudo de adición (exoterma menor, 2°C) . El hidroperóxido de eumeno (370 mi, título de 80%, 1.99 mol, 1.59 equivalentes) fue luego agregado al lote en 5 minutos utilizando un embudo de adición (exoterma a 10 °C) . La reacción se dejó proceder por 18 horas, manteniendo la temperatura entre -45 y -30°C. Cuando fue determinada completa por análisis de TLC (Rf 0.42 para el alcohol divinílico, y 0.18 para el alcohol epóxico, 50% de MTBE en Heptanos) , la reacción fue apagada con solución acuosa saturada de sulfato de sodio (105 mi, 1 vol) , diluida con MTBE (1.05 litros, 10 vol) y el baño se dejó calentar hasta la temperatura ambiente, con agitación vigorosa. Al lote se agregó tierra de diatomea, Celite® (105 g, 1% p equivalente) , el cual fue luego filtrado a través de un lecho de Celite®. La torta de filtro prensa fue lavada con MTBE (0.5 litro) y el filtrado concentrado in vacuo en un evaporador rotatorio (con un baño de agua mantenido a 10-20°C) para proporcionar un aceite amarillo/café. Una porción del producto crudo [311 g] fue sometida a un lecho de sílice (1 kg de gel de sílice) utilizando MTBE/éter de petróleo 0-60%. Las fracciones que contenían el producto fueron recolectadas y concentradas para obtener un aceite incoloro (48.3 g) . Este material fue luego purificado vía la cromatografía en columna (300 g de gel de sílice, 5-30% de MTBE/éter de petróleo) para proporcionar ent-2 como un líquido claro [22.6 g, recuperación de masa general 36%] : Rf = 0.59 (MTBE/éter de petróleo 1:1); XH MR (CDC13, 500 MHz) d 5.85 (ddd, J = 17.0, 10.5, 6.2 Hz , 1H) , 5.40 (dt, J = 17.3, 1.3 Hz, 1H) , 5.27 (dt, J = 10.5, 1.3 Hz , 1H) , 4.36-4.33 (m, 1H) , 3.10 (ddd, J = 3.8, 3.8, 3.0 Hz, 1H) , 2.81 (dd, J = 2.9, 5.0 Hz, 1H) , 2.76 (dd, 4.1, 5.0 Hz , 1H) , 2.07 (d, J = 3.0 Hz, 1H) .
Síntesis del Compuesto 3 La reacción fue llevada a cabo a una escala de 20 g del alcohol siguiendo un procedimiento de la literatura (J Org. Chem. 2009, 74(15), 5758-5761). Un matraz de fondo redondo de 2 litros equipado con un agitador mecánico, una sonda de termopar, y un embudo de adición fue cargada con una solución del alcohol epóxico ent-2 [20 g, 200 mmol, 1 equivalente] en tetrahidrofurano (400 mi, 20 vol) junto con Ph3P (105 g, 400 mmol, 2 equivalentes), y ácido 4-nitrobenzoico (67 g, 400 mmol, 2 equivalentes) bajo una atmósfera de nitrógeno. Se agregó DIAD (81 g, 400 mmol, 2 equivalentes) a la mezcla de reacción utilizando un embudo de adición mientras que se mantenía la mezcla de reacción a 0°C (baño de hielo) . Una vez que se completó la adición del DIAD, el baño frío fue retirado y la mezcla de reacción se dejó alcanzar la temperatura ambiente (23°C) . La mezcla de reacción fue agitada por 1.5 horas (todo el material inicial se consumió) y luego se apagó con solución acuosa de NaHC03 (100 mi, 5 vol) seguido por la adición de MTBE (1000 mi, 50 vol) . La solución resultante fue transferida a un embudo de separación. Se agregó salmuera (100 mi, 5 vol) para obtener la separación de fases. La fase orgánica se lavó con salmuera (220 vol) , se secó sobre sulfato de magnesio, y se concentró bajo vacío para obtener un aceite (296 g) . El aceite se hizo pasar a través de un lecho de sílice (1 kg) utilizando 10-20% de MTBE/heptanos . El sólido crudo (46 g) fue luego disuelto en MTBE (20 vol) y lavado con NaHC03 (3 x 5 vol) , agua (22 vol) , salmuera (2 x 2 vol) , se secó sobre sulfato de magnesio, se concentró, y se secó adicionalmente para obtener el éster de benzoato como un sólido blanco [29 g, 59%: Rf = 0.56 (MTBE/heptanos 1:1)]; RMN XH (CDC13, 500 MHz) d 8.35(d, J = 10.8 Hz, 2H) , 8.25 (d, J = 10.8 Hz, 2H) , 5.97 (ddd, J = 17.2, 10.6, 6.2 Hz, 1H) , 5.48 (td, J = 17.3, 1.2 Hz, 1H) , 5.40 (td, J = 10.7, 1.1 Hz , 1H) , 5.34 (dd, J = 5.0, 1.3 Hz, 1H) , 3.31 (ddd, J = 6.5, 4.1, 2.6 Hz, 1H) , 2.93 (dd, J = 4.2, 4.2 Hz, 1H) , 2.76 (dd, J= 4.8, 2.6 Hz, 1H) .
La hidrólisis del éster de benzoato fue llevada a cabo siguiendo el procedimiento de la literatura (J. Org. Chem. 2009, 74(15), 5758-5761). De este modo, la solución del éster (22.7 g, 91 mmol, 1 equivalente) en metanol (340 mi, 15 vol) se trató con una solución acuosa de K2CO3 (13.8 g, 100 mmol, 1.1 equivalente, en 34 mi, 1.5 vol de agua) a 10-15 °C. La solución se volvió inmediatamente una suspensión espesa. La suspensión se agitó a temperatura ambiente (23°C) por 3 horas (el material inicial se consumió) . La mezcla de reacción se concentró en un evaporador rotatorio (a temperatura del baño de agua ambiente) hasta ~ 2 vol (45 mi) . La solución espesa fue luego resuspendida en DCM (454 mi, 20 vol) . La suspensión fue filtrada y los sólidos se lavaron con DCM (2 5 vol, 2 x 114 mi) . El filtro orgánico combinado se secó sobre sulfato de magnesio, se filtró, y se concentró para obtener un sólido (31 g) . El material crudo fue luego purificado mediante cromatografía en columna (gel de sílice, 10—30% de MTBE/éter de petróleo) para obtener el alcohol deseado 3 como un aceite claro [9.24 g, rendimiento cuantitativo, Rf = 0.31 (MTBE/heptanos 1:1)]; RMN ¾ (CDC13, 300 MHz) d 5.94 (ddd, J = 16.2, 10.6, 5.5, 1H) , 5.40 (d, J = 17.3 Hz, 1H) , 5.26 (d, J = 10.6 Hz, 1H) , 4.0 (t, J = 5.3 Hz, 1H) , 3.07 (m, 1H) , 2.84 (t, J = 4.8 Hz , 1H) , 2.77-2.74 (m, 1H) , 2.57 (s amplio, 1H) .
Síntesis del Compuesto 4 Un matraz de fondo redondo de tres bocas, de 1 litro, equipado con un embudo de adición, un agitador mecánico superior, una entrada/salida de nitrógeno, se cargó con el alcohol 3 [9.24 g, 92.3 mmol, 1 equivalente] en tetrahidrofurano anhidro (166 mi, 18 vol) . La solución se enfrió a -10 a -15°C. El catalizador Bu2NI (3.41 g, 9.23 mmol, 10% mol) se cargó dentro del reactor, seguido por bromuro de bencilo (19.1 g, 112 mmol, 1.2 equivalentes). La solución resultante se agitó por 20 minutos. Se agregó luego hidruro de sodio (4.1 g, 1.1 equivalentes, dispersión en aceite mineral al 60%) al lote en porciones, tal que la temperatura del baño fue mantenida a -10 a -15°C. Una vez que se completó la adición del hidruro de sodio, la mezcla de reacción fue agitada por 30 minutos adicionales y luego el baño frío se retiró y la mezcla de reacción se llevó hasta la temperatura ambiente y se agitó adicionalmente por 18 horas. La reacción se apagó con NaHC03 acuoso (37 mi, 4 vol) mientras que se mantenía la temperatura a -5 a 0°C (baño de hielo) . La solución resultante fue diluida con MTBE (185 mi, 20 vol), la capa orgánica se lavó con agua (218 mi, 2 3 vol), salmuera (118 mi, 1 x 3 vol), se secó sobre sulfato de magnesio, se filtró, y se concentró bajo presión reducida para obtener el producto crudo como un aceite. La síntesis fue repetida en una escala de 1.98 g del alcohol 3. El material crudo de ambas reacciones fue combinado y purificado vía la cromatografía en columna (columna de gel de sílice, 2.5-10% de MTBE/heptanos) para obtener el producto bencilado 4 deseado como un aceite [13.96 g, 65%: Rf = 0.61 (MTBE/heptanos 3:7)]; RMN XH (CDC13/ 500 MHz) d 7.36-7.32 (m, 4H) , 7.29-7.26 (m, 1H) , 5.83 (ddd, J = 17.3, 10.5, 6.7, 1H) , 5.36 (td, J = 17.3, 1.4 Hz , 1H) , 5.31 (td, J = 10.5, 1.2 Hz, 1H) , 4.63 (ABq, J = 12.0 Hz, 2H) , 3.62 (ddd, J = , 1H) , 3.11-3.08 (m, 1H) , 2.78 (t, J = 4.4 Hz, 1H) , 2.60 (dd, J = 5.0, 2.7 Hz , 1H) .
Síntesis del Compuesto 5 Un matraz de fondo redondo de 250 mi, equipado con un condensador a reflujo se cargó con el alcohol 4 [10 g, 52.5 mmol, 1 equivalente], ftalimida (11.6 g, 78.8 mmol, 1.5 equivalentes), piridina (0.85 mi, 10.5 mmol, 20% mol) e IPA (100 mi, 10 vol) y la solución resultante fue agitada a 80-82 °C por 8 horas. La mezcla de reacción fue luego enfriada a temperatura ambiente y concentrada en un evaporador rotatorio hasta sequedad. El residuo fue adsorbido sobre gel de sílice (20 g) , secado bajo un alto vacío y luego purificado mediante cromatografía instantánea en columna sobre gel de sílice (10-40% de MTBE/heptanos) para proporcionar el amino-alcohol 6 protegido con ftalimida, deseado como un sólido pegajoso blanco [15.85 g, 89%] : Rf = 0.34 (MTBE/heptanos 1:1); RMN *H (DMSO-d6, 500 MHz) d 7.84-7.82 (m, 4H) , 7.36-7.31 (m, 4H) , 7.28-7.25 (m, 1H) , 5.93 (ddd, J = 17.5, 10.5, 10.1 Hz, 1H) , 5.38-5.35 (m, 2H) , 5.12 (d, J = 5.5 Hz, 1H) , 4.53 (d, J = 11.9 Hz, 1H) , 4.40 (d, J = 11.9 Hz, 1H) , 3.98 (dddd, J = 9.0, 4.5, 4.5, 4.5 Hz 1H) , 3.86 (dd, J = 5.8, 4.6 Hz, 1H) , 3.67 (dd, J = 13.7, 8.9 Hz, 1H) , 3.59 (dd, J = 13.7, 4.4 Hz , 1H) .
Síntesis del Compuesto 6 Un matraz de fondo redondo de tres bocas, de 1 litro, equipado con un embudo de adición, un agitador mecánico superior, y una entrada/salida de nitrógeno se cargó con una solución del alcohol 5 [15 g, 44.5 mmol, 1 equivalente] en tetrahidrofurano anhidro (270 mi, 18 vol) . La solución se enfrió a -10 a -15°C, luego se cargó Bu4Ni (1.64 g, 4.45 mmol, 10% mol) dentro del reactor seguido por bromuro de bencilo (9.2 g, 53.8 mmol, 1.2 equivalentes) . La solución resultante se agitó por 20 minutos, luego se agregó hidruro de sodio (1.97 g, 1.1 equivalentes, dispersión en aceite mineral al 60%) al lote en porciones, tal que la temperatura del lote fue mantenida a -10 a -15°C. Una vez que se completó la adición del hidruro de sodio, la mezcla de reacción fue agitada por 30 minutos adicionales y se llevó luego a temperatura ambiente y se agitó adicionalmente por 18 horas. La reacción se apagó con NaHC03 acuoso (60 mi, 4 vol) mientras que se mantenía la mezcla de reacción a -5 a 0°C (baño de hielo) . La mezcla de reacción fue luego diluida con MTBE (300 mi, 20 vol) y las fases se separaron. La capa orgánica se lavó con agua (2 x 45 mi, 2 x 3 vol) , salmuera (1 x 45 mi, 1 x 3 vol) , se secó sobre sulfato de magnesio, se filtró, y se concentró para obtener el producto crudo como un aceite. La síntesis fue repetida a una escala de 1.75 g del alcohol 5. Los productos crudos combinados provenientes de ambas reacciones fueron purificados mediante cromatografía instantánea en columna sobre gel de sílice (5-25% de MTBE/heptanos ) para obtener el producto 6 deseado como un semi-sólido [15.1 g, 71%: R£ = 0.61 (MTBE/heptanos 1:1)] ; 1H N R ( CDCI3 , 300 MHz ) d 7.74-7.71 (m, 2H) , 7.67-7.64 (m, 2H) , 7.37-7.27 (m, 5H) , 7.10-7.07 (m, 2H) , 6.98-6.93 (m, 3H) , 5.97 (ddd, J = 17.5, 10.4, 10.0 Hz , 1H) , 5.42 (d, J = 4.38 Hz, 1H) , 5.38 (s, 1H) , 4.68 (dd, J = 12.3, 12.3 Hz, 2H) , 4.45 (d, J = 5.37 Hz , 1H) , 4.41 (d, J= 5.58 Hz, 1H) , 3.99-3.82 (m, 3H) , 3.65 (dd, J = 13.6, 3.2 Hz, 1H) .
Síntesis del Aldehido 7 y del Ácido Carboxílico 8 Una solución de alqueno, 6 [1 g, 2.34 mol] en DCM (60 mi, 60 vol) se purgó con ozono <-70°C (hielo seco-acetona) por 25 minutos utilizando una fuente doméstica de aire como oxígeno para generar el ozono. Una vez que la reacción fue considerada completa (TLC, MTBE/heptanos 1:1) , la solución fue purgada con nitrógeno por 20 minutos para eliminar el ozono residual. La reacción se apagó con sulfuro de dimetilo (1.7 mi, 23.4 mmol, 10 equivalentes) mientras que se mantenía la mezcla de reacción a <-70°C (hielo seco acetona) . El baño frío fue retirado y la mezcla se dejó calentar a temperatura ambiente. La mezcla de reacción se concentró bajo presión reducida y se secó adicionalmente bajo un alto vacío para obtener el aldehido crudo como un aceite espeso (1.12 g, > 99%, Rf = 0.36, MTBE/heptanos 1:1). La reacción fue repetida a escala de 13 g del 6. Los dos lotes del aldehido crudo fueron combinados y sometidos a la oxidación de Pinnick sin purificación adicional.
El aldehido crudo 7 [14.06 g] , se recogió en una mezcla de tetrahidrofurano, tBu0H, y agua (105 mi, 105 mi, 70 mi, 3:3:2, 20 vol) junto con NaH2P04 (15.6 g, 130 mmol, 4 equivalentes) y 2 -metil -2 -buteno (34.4 mi, 324 mmol, 10 equivalentes) . La solución se enfrió (15 + 5°C, baño de agua) . Se agregó clorito de sodio (3.9 g, 43 mmol, 1.33 equivalentes) al lote y la solución resultante fue agitada a temperatura ambiente por 4 horas . La terminación de la reacción fue confirmada por análisis de TLC (MTBE/heptanos 1:1 y 5% de metanol en DCM) . La reacción fue luego apagada con salmuera (280 mi, 20 vol) y el producto extraído en DCM (3 x 280 mi, 3 x 20 vol) . Las capas orgánicas se secaron sobre sulfato de magnesio, se concentraron bajo presión reducida para obtener el ácido crudo como un aceite espeso. El ácido crudo se purificó mediante cromatografía instantánea en columna sobre sílice (5-100% de MTBE/heptanos seguido por 5-20% de metanol/DCM) . Las fracciones que contenían el ácido fueron combinadas y concentradas bajo presión reducida para proporcionar el ácido 8 como un sólido blanco [2.64 g, 18%: Rf = 0.33, 5:95 metanol/DCM) ] ; RMN XH (CDC13, 500 Hz) d 7.78 (dd, J = 5.5, 3.0 Hz, 2H) , 7.70 (dd, J = 5.5, 3.0 Hz, 2H) , 7.43-7.40 (m, 2H) , 7.37-7.29 (m, 3H) , 7.20-7.19 (m, 2H) , 7.14-7.1 1 (m, 2H) , 7.09-7.05 (m, 1H) , 4.76 (d, J = 11 HZ, 1H) , 4.65 (dd, J = 10.9, 9.4 Hz, 2H) , 4.55 (d, J = 11.8 Hz, 1H) , 4.13 (ddd, J = 6.2, 6.2, 3.1 Hz, 1H) , 4.1 (d, J = 3.0 Hz, 1H) , 3.98 (dd, J = 14.2, 6.2 Hz, 1H) , 3.89 (dd, J = 14.2, 6.2 Hz, 1H) .
Síntesis del Compuesto 9 Un matraz de fondo redondo equipado con una barra de agitación magnética y una sonda de termopar, fue cargada con una solución del aminoácido 8 protegido con ftalamida [2.5 g, 5.61 mmol, 1.0 equivalentes] en THF (28 ral, 11 vol, grado solvente a granel) . A la solución amarilla clara se agregó agua desionizada (15 mi, 6 vol) y la mezcla resultante se enfrió a 5°C. Se agregó luego al lote solución de metilamina en agua (5.0 mi, 40% p, 56.1 mmol, 10 equivalentes) , que se calentó luego a temperatura ambiente (21-23°C) y se agitó por 22.5 horas. El análisis de una alícuota de la mezcla de reacción por LCMS indicó que la reacción estaba completa. La mezcla de reacción fue luego concentrada in vacuo hasta obtener un residuo sólido amarillo, eliminando toda la metilamina en exceso. El residuo fue recogido en THF (60 mi, 24 vol) y agua (30 mi, 12 vol) , enfriado a 0-5°C, y a la solución del aminoácido crudo se agregó carbonato de potasio (3.9 g, 28.26 mmol, 5.0 equivalentes), seguido por cloroformiato de bencilo (1.4 mi, 9.81 mmol, 1.75 equivalentes). El lote se calentó a temperatura ambiente y la reacción se dejó proceder por 25.5 horas. El análisis de una alícuota de este punto en el tiempo por LCMS indicó una conversión completa del aminoácido al carbamato. La mezcla de reacción fue concentrada bajo presión reducida para eliminar la mayor parte del THF, el residuo acuoso fue diluido con agua (30 mi, 12 vol) y el pH fue ajustado con HCl 2N aproximadamente a pH 5 (tira de papel pH) . El producto crudo fue extraído con cloroformo (3 x 60 mi), los extractos lavados con agua (1 x 60 mi) y con NaCl acuoso (1 x 60 mi) , se secaron sobre sulfato de magnesio y se concentraron in vacuo hasta obtener un aceite móvil amarillo (3.52 g) el cual se purificó mediante cromatografía instantánea en columna sobre gel de sílice (50% p equivalente; elución con 0-5% de metanol en CHC13) para proporcionar 9 como un aceite amarillo, el cual se solidificó parcialmente después del secado bajo un alto vacío [2.22 g, rendimiento de 88.1% en dos pasos] . RMN 1H (DMSO, 500 MHz) d 12.92 (s, 1H) , 7.43-7.23 (m, 15H) , 5.04 (s, 2H) , 4.67 (d, J = 11.10 Hz , 1H) , 4.58 (d, J = 11.10 Hz, 1H) , 4.48 (d, J = 11.05 Hz, 1H) , 4.42 (d, J = 11.05 Hz, 1H) , 4.09 (d, J = 2.95 Hz , 1H) , 3.96 (ddd, J 6.30, 3.15 Hz, 1H) , 3.29 (dd, J = 6.30, 6.30, 2H) .
Síntesis de los Ciclopropil -Aminoácidos 2 - (ter-butildimetilsililoxi) acrilato de etilo (2) Una solución de éster 1 (4.00 g, 34.4 mmol) y trietilamina (4.79 mi, 34.4 mmol) en diclorometano anhidro (170 mi) se enfrió a 0°C bajo atmósfera de nitrógeno y se agregó sulfonato de ter-butildimetilsililtrif luorometano (8.31 mi, 36.2 mmol) gota a gota. La solución resultante se agitó vigorosamente a reflujo por 4 horas. El solvente se evaporó luego cuidadosamente, el residuo se disolvió en éter dietílico (170 mi) , y la fase orgánica se lavó con agua (3 x 50 mi) . La fase orgánica se secó sobre sulfato de sodio, se filtró, y se concentró. El residuo se purificó mediante cromatografía sobre gel de sílice eluyendo con 0-20% de éter dietílico/hexanos para proporcionar 2 (4.89 g, 62%) como un aceite claro: RMN JH (500 MHz, CDC13) d 5.50 (d, J =1.0 Hz, 1H) , 4.85 (d, J = 1.0 Hz, 1H) , 4.21 (q, J = 7.0 Hz, 2H) , 1.31 (t, J = 7.0 Hz, 3H) , 0.95 (s, 9H) , 0.16 (s, 6H) . 1-etil-l- (ter-butildimetilsililoxi) ciclopropan-1, 2 -dicarboxilato 2-ter-butilo (3a y 3b) Una mezcla del 2- ( ter-butildimetilsililoxi) acrilato de etilo (2, 500 mg, 2.17 mmol) y Cu(acac)2 (0.011 g, 0.043 mmol) se calentó a 80°C. Se agregó luego a la mezcla de reacción en 2 horas un solución de diazoacetato de ter-butilo (463 mg, 3.25 mmol) en benceno (5 mi). Después de este tiempo, la mezcla de reacción se enfrió a temperatura ambiente y se concentró. El residuo se purificó mediante cromatografía sobre de sílice eluyendo con 0-10% de éter dietílico/hexanos para proporcionar ambos diaestereoisómeros 3a (0.119 g, 16%) y 3b (0.235 g, 31%) como aceites claros. 3a: RMN ? (500 MHz, CDC13) d 4.25?1.13 (m, 2H) , 2.28 (dd, J = 7.5, 2.0 Hz, 1H) , 1.73 (dd, J = 7.5, 2.0 Hz, 1H) , 1.59 (dd, J = 9.5, 4.0 Hz, 1H) , 1.46 (s, 9H) , 1.29 (t, J = 7.5 Hz, 3H) , 0.90 (s, 9H) , 0.18 (s, 3H) , 0.12 (s, 3H) ; ESI MS m/z 367 [M + Na]+; 3b: RMN XH (500 MHz, CDC13) d 4.23 (dq, J = 11.0, 7.0 Hz, 1H) , 4.13 (dq, J = 11.0, 7.0 Hz, 1H) , 2.11 (dd, J = 10.0, 1.5 Hz, 1H) , 1.85 (dd, J = 5.5, 2.5 Hz, 1H) , 1.43 (s, 9H) , 1.54 (dd, J = 10.0, 4.0 Hz, 1H) , 1.28 (t, J = 7.5 Hz, 3H) , 0.86 (s, 9H) , 0.19 (s, 3H) , 0.18 (s, 3H) ; ESI MS m/z 367 [M + Na] +. Ácido 2- (ter-butildimetilsililoxi) -2- (etoxicarbonil) ciclopropan-carboxílico (4a y 4b) Una mezcla del dicarboxilato 3a y 3b (0.385 g, 1.12 mmol, proporción 1:2 de 3a/3b) , ácido trif luoroacético (0.43 mi), y diclorometano (0.5 mi) se agitó toda la noche a temperatura ambiente. Los sólidos se filtraron, y el filtrado se concentró. El residuo se purificó mediante cromatografía sobre gel de sílice eluyendo con 0-100%) éter dietílico/hexanos para proporcionar ambos diaestereoisómeros 4a (0.050 g, 15%) y 4b (0.078 g, 24%) como sólidos blanquecinos. 4a: RMN XH (500 MHz, CDC13) d 4.25-4.17 (m, 2H) , 2.38 (dd, J = 7.5, 1.5 Hz, 1H) , 1.81-1.76 (m, 2H) , 1.30 (t, J = 7.0 Hz , 3H) , 0.90 (S, 9H) , 0.21 (S, 3H) , 0.13 (s, 3H) ; ESI MS m/z 289 [M + H]+; 4b: RMN 1H (500 MHz , CDC13) d 4.22 (q, J = 7.0 Hz, 1H) , 2.21 (dd, J = 10.0, 1.5 Hz , 1H) , 1.93 (dd, J = 8.0, 2.0 Hz, 1H) , 1.52 (dd, J = 6.0, 3.5 Hz , 1H) , 1.28 (t, J = 7.0 Hz, 3H) , 0.87 (s, 9H) , 0.19 (s, 3H) , 0.17 (s, 3H) ; ESI MS m/z 287 [M - H] " . 2- (benciloxicarbonilamino) -1- (ter-butildimetilsililoxi ) ciclopropancarboxilato de etilo (5b) Una mezcla del ácido 2-(ter-butildimetilsililoxi ) -2- (etoxicarbonil ) ciclopropan-carboxllico (4b, 0.335 g, 1.16 mmol) en tolueno (5 ml) bajo atmósfera de nitrógeno se trató con la base de Hünig (0.260 ml, 1.51 mmol) y la mezcla se enfrió a 0°C. Después de este tiempo, se agregó DPPA (0.324 ml, 1.51 mmol) y la mezcla se calentó a 90°C por 30 minutos, seguido por la adición de alcohol bencílico (0.155 ml, 1.51 mmol). Después de 15 horas, la mezcla se enfrió, se diluyó con acetato de etilo (75 ml) , y se lavó secuencialmente con ácido cítrico al 10% (2 x 50 ml) , agua (50 ml), y NaHC03 saturado (50 ml) . La fase orgánica se secó sobre sulfato de magnesio, se filtró, y se concentró. El residuo se purificó mediante cromatografía sobre gel de sílice eluyendo con 10% de acetato de etilo/hexanos hasta 100% de acetato de etilo para proporcionar el compuesto del título como un aceite claro (0.146 g, 30%): RMN XH (300 MHz, CDC13) d 7.34-7.30 (m, 5H) , 5.40-5.38 (m, 1H) , 5.21-5.00 (m, 2H) , 4.29-4.18 (m, 2H) , 4.16-4.09 (m, 1H) , 1.50-1.47 (m, 2H) , 1.30 (t, J = 7.2 Hz , 3H) , 0.88 (s, 9H) , 0.26-0.07 (ra, 6H) ; Multimodo (APCI + ESI) MS m/z 295 [M + H]\ 2- (benciloxicarbonilamino) - 1-hidroxiciclopropancarboxilato de etilo (6b) A una solución del 2 - (benciloxicarbonilamino) - 1-( ter-butildimetilsililoxi) ciclopropancarboxilato de etilo (1.45 g, 3.69 mmol) en THF (35 mi) bajo atmósfera de nitrógeno se agregó HF»piridina (1.0 mi, 38 mmol) . La mezcla de reacción se agitó por 5 horas. Después de este tiempo, se agregó HF*piridina adicional (1.0 mi, 38 mmol) y la agitación se continuó por 19 horas. La mezcla de reacción se enfrió luego a 0°C y se diluyó con éter dietllico (150 mi) . La mezcla se apagó cuidadosamente con NaHC03 acuoso saturado hasta que cesó la evolución del gas. A este tiempo, la capa orgánica se separó y la capa acuosa restante fue extraída con éter dietílico (300 mi) . Las capas orgánicas combinadas se lavaron con salmuera (200 mi) , se secaron sobre sulfato de sodio, se filtraron, y se concentraron in vacuo. La purificación mediante cromatografía sobre gel de sílice eluyendo con 20%-50% de acetato de etilo/hexanos proporcionó el compuesto del título (0.960 g, 93%) : RMN 2H (300 Hz , CDC13) d 7.34-7.30 (m, 5H) , 5.11-4.83 (m, 3H) , 4.21 (q, J = 7.2 Hz, 2H) , 3.37-3.25 (m, 2H) , 1.73-1.68 (m, 1H) , 1.27 (t, J = 7.2 Hz, 3H) , 1.14-1.06 (m, 1H) ; ESI MS m/z 280 [M + H] + . Ácido 2 - (benciloxicarbonilamino) - 1-hidroxiciclopropan-carboxílico (7b) A una solución de 0°C del 2- ( benci loxicarboni lamino) - 1 -hidroxiciclopropancarboxilato de etilo (6b, 12.5 g, 44.7 mmol) en THF (100 mi) se agregó K2C03 (24.7 g, 179.0 mmol) como una solución en agua (300 mi) . La reacción se dejó calentar hasta la temperatura ambiente y se agitó por 4 horas y luego se agregó agua adicional (200 mi) . Después de agitar 18 horas adicionales a temperatura ambiente, la reacción se concentró para eliminar la mayor parte del THF. La solución acuosa remanente fue lavada con éter dietílico (2 x 500 mi), acidificada con HC1 2 N a pH 2 , y luego se extrajo con acetato de etilo (5 x 200 mi) . Las capas combinadas de acetato de etilo fueron lavadas con salmuera (500 mi) , secadas sobre sulfato de sodio, filtradas y concentradas in vacuo para proporcionar los compuestos del título (7.75 g, 69%) como una mezcla de diaestereoisómeros . La mezcla fue triturada con éter dietílico para proporcionar un sólido blanco principalmente como los diaestereoisómeros principales. El sobrenadante fue concentrado y luego triturado con éter dietílico para proporcionar una mezcla limpia de ambos diaestereoisómeros. Diastereoisómero Mayor: RMN ?? (300 MHz, MeOD) d 7.50-7.14 (m, 5H) , 5.22-4.96 (m, 2H) , 3.23-3.10 (m, 1H) , 1.60 (dd, J = 8.9, 6.3 Hz , 1H) , 1.10 (t, J = 6.2 Hz, 1H) ; Multimodo (APCI + ESI) MS m/z 250 [M - H] " . Mezcla de Diaestereoisómeros: RMN 1H (300 MHz, MeOD) d 7.45-7.14 (m, 5H) , 5.24-5.01 (m, 2H) , 3.25-3.15 (m, 0.46H), 3.14-3.01 (m, 0.54H) , 1.71-1.53 (m, 1H) , 1.42 (dd, J = 9.1, 6.4 Hz, 0.54H), 1.12 (t, J = 6.2 Hz, 0.46H); Multimodo (APCI + ESI) MS m/z 250 [ - H] Síntesis del Compuesto 11 A una solución agitada de sulfato de paromomicina 1 (76 g, 84 mmol) en agua (209 mi) y THF (1084 mi) a 0°C se agregó una solución acuosa de carbonato de sodio (254 mi, 218 mmol, 0.86 M) , seguido por la adición gota a gota de cloroformiato de bencilo (120 mi, 840 mmol). Se agregó luego NaHC03 (70.6 g, 840 mmol) y la reacción fue agitada por 3 horas . La capa orgánica se separó y se concentró (hasta aproximadamente 800 mi) , se diluyó con acetato de etilo (400 mi) y se sumergió en hexano (9 litros) . El precipitado resultante se recolectó mediante filtración para producir 2 (69.85 g, 54.36 mmol, 65%): MS m/z calculado para C63H75 SO24 (M + Na+) 1308.48, encontrado 1308.6.
Se disolvió cloruro de zinc (59.2 g, 434 mmol) en benzaldehído (440 mi, 4344 mmol) para dar una solución amarilla, y la reacción se agitó por 5 minutos. Se agregó luego una solución de 2 (69.85 g, 54.3 mmol) en benzaldehído (440 mi) y la reacción se agitó por 7 horas. La mezcla de reacción se diluyó con acetato de etilo (2 litros) y se lavó sal disódica de EDTA 0.1M dihidratada (3 x 2 litros), agua (2 litros) , salmuera (2 litros) , se secó sobre sulfato de sodio, se concentró (hasta aproximadamente 900 mi) y se sumergió en éter dietílico : hexano (1:1, 4 litros). El precipitado resultante se recolectó mediante filtración y se secó bajo vacío para producir 3 (93.41 g, 63.94 mmol 118: MS m/z calculado para C77H83N5O24 (M + Na+) 1484.54, encontrado 1484.7.
A una suspensión agitada de hidruro de sodio (seco 95%, 9.64 g, 382 mmol) en DMA (501 mi) a -10°C se agregó una solución de 3 (93 g, 63.6 mmol) en DMA (500 mi) y la reacción se agitó por 4 horas. La reacción se apagó con ácido acético (100 mi) y se agitó por 30 minutos. La mezcla de reacción se diluyó luego con acetato de etilo (2 litros) , y se lavó con NaHC03 (2 x 2 litros) , agua (2 x 2 litros) , salmuera (2 litros) , se secó sobre sulfato de sodio, se filtró y se concentró hasta obtener un sólido café amarillento, el cual se purificó mediante cromatografía instantánea (gel de sílice, metanol/DCM) para producir 4 (30 g, 22.17 mmol, 35%) : MS m/z calculado para C7oH75 5023 (M+Na+) 1376.5, encontrado 1376.7.
A una solución agitada de 4 (30 g, 22.15 mmol) en piridina (201 mi) se agregó DMAP (2.71 g, 22.15 mmol), seguido por TBDPS-C1 (65.4 mi, 255 mmol) y la reacción se calentó a 80°C por 6 días. La mezcla de reacción se sumergió en éter dietílico : hexano (1:1, 9 litros) y el precipitado resultante se recolectó mediante filtración y se volvió a disolver en THF (130 mi) y metanol (40 mi) . Esta solución fue luego sumergida en éter dietílico : hexano (1:1, 9 litros) y el precipitado resultante se recolectó mediante filtración y se secó bajo vacío. El sólido blanco se disolvió en acetato de etilo (600 mi) , se lavó con ácido cítrico 1M (2 x 500 mi) , salmuera (500 mi) , NaHC03 (2 x 500 mi) , salmuera (500 mi) , se secó sobre sulfato de sodio, se filtró y se concentró para producir 5 (36.45 g, 19.93 mmol, 90%): MS m/z calculado para C102H111N5O23S Í2 (M+Na+) 1852.7, encontrado 1852.8.
A una solución agitada de 5 (5 g, 2.73 mmol) en DMA (49.6 mi) se agregó 1 ' -tiocarbonildiimidazol (4.53 g, 25.4 mmol) y la reacción se calentó a 40 °C por 18 horas. La reacción se diluyó con acetato de etilo (100 mi) , se lavó con ácido cítrico 1M (3 x 100 mi) , salmuera (3 x 100 mi) , se secó sobre sulfato de sodio, se filtró y se concentró hasta obtener una espuma anaranjada, la cual se purificó mediante cromatografía instantánea (gel de sílice/DCM/metanol) para producir el compuesto 6 (4.5 g, 2.32 mmol, 85%): MS m/z calculado para C106Hii3 7O23Si2 1962.7 (M+Na+) , encontrado 1962.8.
A una solución agitada de 6 (1.85 g, 0.953 mmol) en dioxano (68.1 mi) se agregó tris ( trimetilsilil) silano (0.882 mi, 2.86 mmol), seguido por AIBN (0.063 g, 0.381 mmol) y la reacción se calentó a 80°C por 2 horas. La reacción se diluyó con acetato de etilo (50 mi) , se lavó con NaHC03 acuoso saturado (50 mi) , salmuera (50 mi) , se secó sobre sulfato de sodio, se filtró y se concentró para producir el compuesto 7 (3 g, 0.953), el cual se llevó al siguiente paso sin purificación adicional. MS m/z calculado para Cio2Hiii 5022SÍ2 1836.7 (M+Na+) , encontrado 1837.0.
A una solución agitada de 7 (3.911 g, 2.155 mmol) en ácido acético (50 mi) se agregó lentamente una solución de TFA (0.385 mi, 5.00 mmol) en agua (6.94 mi) y la reacción se calentó a 50°C por 90 minutos. La reacción se enfrió a 0°C y se apagó con DIPEA (1.746 mi, 10.00 mmol). La mezcla de reacción se diluyó fue con acetato de etilo (100 mi), se lavó con agua (100 mi), salmuera (100 mi), con NaHC03 acuoso saturado (2 x 100 mi) , salmuera (100 mi) , se secó sobre sulfato de sodio, se filtró y se concentró hasta obtener un material crudo, el cual se purificó sobre una columna de HPLC de fase inversa de 2 pulgadas (5 cm) (Método 2) para producir el compuesto 8 (lg, 0.58 mmol, 27%): MS m/z calculado para C^H ^NsC^Sia 1748.7 (M+Na+) , encontrado 1748.8.
A una solución agitada de 8 (1 g, 0.58 mmol) en piridina (19.3 mi) se agregó cloruro de p-toluen- sulfonilo (0.883 g, 4.64 mmol) y la reacción se agitó por 7 horas. La mezcla de reacción se diluyó con acetato de etilo (50 mi) , se lavó con ácido cítrico 1M (2 x 50 mi) , agua (50 mi), salmuera (50 mi), NaHC03 acuoso saturado (2 x 50 mi), salmuera (50 mi), se secó sobre sulfato de sodio, se filtró y se concentró hasta obtener un material crudo, el cual se purificó sobre una columna de HPCL de fase inversa de 2 pulgadas (5 cm) (Método 2) para producir 9 (0.558 g, 0.297 mmol, 57%): MS m/z calculado para C102HH3 5O24 SS Í2 1902.7 (M+Na+) , encontrado 1902.8.
A una solución agitada de 9 (0.5 g, 0.266 mmol) en DMPU (8.8 mi) se agregó azida de sodio (0.172 g, 2.658 mmol) y la reacción se calentó a 70°C por 3 horas. La reacción se diluyó con acetato de etilo (50 mi), se lavó con salmuera : agua (1:1, 50 mi), agua (2 x 50 mi), salmuera (50 mi) , se secó sobre sulfato de sodio, se filtró y se concentró para producir compuesto 10 (0.480 g, 0.266 mmol) : MS m/z calculado para C95Hios 802iSÍ2 1773.7 (M + Na+) , encontrado 1773.7.
A una solución agitada de 10 (0.462 g, 0.264 mmol) en THF (2.64 mi) se agregó TBAF (2.64 mi, 2.64 mmol) y la reacción se agitó por 1 hora a temperatura ambiente, y a 40°C por 5 horas. La reacción se diluyó con acetato de etilo (50 mi), se lavó con NaHC03 acuoso saturado (50 mi), cloruro de amonio acuoso saturado (50 mi), salmuera (50 mi), se secó sobre sulfato de sodio, se filtró y se concentró hasta obtener una espuma blanca, la cual se trituró con hexano (3 x 30 mi) para producir el compuesto 11 (0.371 g, 0.264 mmol): MS m/z calculado para C62H72 802o 1271.5 (M+Na+) , encontrado 1271.5.
COMPUESTOS REPRESENTATIVOS Ejemplo 1 A una solución agitada de sulfato de neomicina (1, 120 g, 0.130 mol) en agua (430 mi) se agregó una solución de carbonato de potasio (63 g, 0.456 mol, 3.5 equivalentes) en agua (700 mi) seguido por THF (1.46 litros). A esta solución bifásica vigorosamente agitada se agregó gota a gota en 30 minutos, una solución del Cbz-succinimida (292 g, 1.174 mol) en THF (820 mi), y la mezcla de reacción se agitó por 18 horas. La reacción se apagó con la adición de 3 - (dimetilamino) -propilamina (148 mi, 1.174 mol), y se diluyó con acetato de etilo (1 litro) y agua (1 litro) . La mezcla de reacción se dividió entre acetato de etilo (1 litro) y ácido cítrico 1M (2 litros ) /salmuera (1 litro) . La capa acuosa se diluyó con salmuera (500 mi) y se extrajo con acetato de etilo (500 mi) . Las capas orgánicas combinadas se lavaron con ácido cítrico 1 M (1 litro) , salmuera (500 mi) . La capa orgánica se agitó luego con NaHC03 saturado (2 litros) y agua (600 mi) hasta que cesó el desprendimiento de gas. Las capas se dividieron, y la capa orgánica se lavó con NaHC03 hemi-saturado (1 litro) , salmuera (2 litros) se secó sobre sulfato de sodio, se concentró (hasta 660 mi) y se sumergió en éter dietílico (5.5 litros) con agitación vigorosa. El precipitado resultante se secó bajo un alto vacío por 72 horas a 30°C para producir 2 (172 g, 0.121 mmol, rendimiento de 93%) como un sólido blanco: MS m/z calculado para C7iH82Ns025 (M+H+) 1418.5, encontrado 1418.9.
A una solución agitada de per-Cbz-neomocina B (2, 50 g, 35.2 mmol) en benzaldehído (2000 mi, 19.7 mol) se agregó cloruro de aluminio (30.5 g, 229 mmol) y la mezcla de reacción se volvió de color amarillo a anaranjado oscuro con un incremento en la temperatura interna desde 22°C hasta 27°C. Después de 45 minutos, la mezcla de reacción se vació en hielo/cloruro de amonio saturado (1:1, 800 mi) con agitación vigorosa y la suspensión blanquecina se extrajo con acetato de etilo (800 mi) . La capa orgánica se lavó con cloruro de amonio acuoso saturado (800 mi), EDTA 0.1M (400 mi), salmuera (400 mi), NaHC03 acuoso saturado (800 mi), salmuera (400 mi), se secó sobre sulfato de magnesio, se filtró y se concentró (hasta aproximadamente 2 litros) . La solución resultante de benzaldehído se sumergió en hexanos/éter dietílico (2:1, 18 litros) y se agitó toda la noche. El precipitado blanco fino resultante se recolectó mediante filtración, se lavó con hexanos/éter dietílico (2:1, 1000 mi) y se secó bajo vacío para producir 3 (54.9 g, 32.6, rendimiento de 93%): MS m/z calculado para C7iH82N6025 (M + Na+) 1705.6, encontrado 1705.4.
A una suspensión agitada de hidruro de sodio (4.68 g, 195 mmol) en DMA (400 mi) a 0°C se agregó una solución fría de 3 (54.7 g, 32.5 mmol) en DMA (400 mi) y la reacción se agitó a 0°C por 4 horas. Se agregó AcOH (53.9 mi, 942 mmol) y la reacción se dejó calentar hasta la temperatura ambiente toda la noche. La mezcla de reacción se diluyó con acetato de etilo (1000 mi) , se lavó-con agua/salmuera (1:1, 1000 mi), NaHC03 acuoso saturado (2 x 800 mi), agua/salmuera (4:1, 2 x 1000 mi), salmuera (1 x 400 mi), se secó sobre sulfato de magnesio, se filtró y se concentró bajo vacío para producir 4 (52.1 g, 195 mmol, rendimiento de 100%): MS m/z calculado para 0?5?86?5024 (M+Na+) 1597.6, encontrado 1597.4.
A una solución agitada de 4 (51.2 g, 32.5 mmol) en dioxano (600 mi) se agregó una solución de TFA (16.02 mi, 208 mmol) en agua (200 mi) y la reacción se calentó a 50°C por 17 horas. La mezcla de reacción se diluyó con acetato de etilo (800 mi) y lavado con NaHC03 acuoso saturado (2 x 800 mi) , salmuera (400 mi) , se secó sobre sulfato de magnesio, se filtró y se concentró bajo vacío para producir 5 (49.9 g, 32.5 mmol, rendimiento de 100%): MS m/z calculado para C78H82 6024 (M + Na+) 1509.5, encontrado 1509.3.
A una solución agitada de 5 (48.3 g, 32.5 mmol) en piridina (350 mi) se agregó TBDPS-Cl (83 mi, 325 mmol) seguido por DMAP (3.97 g, 32.5 mmol) y la reacción se calentó a 85°C por 5 días. La reacción se dejó enfriar a temperatura ambiente y se sumergió lentamente en hexanos/éter dietilico (1:1, 11 litros). El precipitado resultante se recolectó mediante filtración y se lavó con hexanos/éter dietilico (1:1, 50 mi), seguido por purificación mediante cromatografía instantánea (gel de sílice/acetato de etilo/hexanos) para producir 6 (17.6 g, 8.05 mmol, rendimiento de 24.8%): MS m/z calculado para C110H11B 6O23SÍ12 (M+Na+) 1985.8, encontrado 1985.6.
A una solución agitada de 6 (275 g, 140 mmol) en tolueno (2000 mi) se agregó TCDI (59.9 g, 336 mmol) y la reacción fue agitada por 2 días. Se agregó agua (3.78 mi, 210 mmol) , seguido por DMAP (103 g, 840 mmol) y la reacción fue agitada por 6 horas. Se agregó agua adicional (1.26 mi, 0.5 eq) y la reacción fue agitada toda la noche. La mezcla de reacción se lavó con ácido cítrico 1 M: salmuera (4:1 v/v, 2 x 2000 mL) , salmuera (1000 mi) , se secó sobre sulfato de magnesio, se filtró y se concentró hasta sequedad para producir 7 (268 g) , el cual se llevó al siguiente paso sin purificación adicional: MS m/z calculado para C114H120N8O2 SS Í2 (M + Na+) 2095.8, encontrado 2096.4.
A una solución agitada de 7 (134.6 g, 64.9 mmol) en 1,4-dioxano (1300 mi) en un matraz de fondo redondo de dos bocas, de 2 litros, se agregó 1, 1, 1, 3, 3, 3-hexametil-2-( trimetilsilil) trisilano' (46 mi, 149 mmol) seguido por AIBN (1.07 g, 6.49 mmol), y la reacción se agitó por una hora a 100 °C. La reacción se dejó enfriar a temperatura ambiente y se agregó agua (90 mi), seguido por TFA (7.5 mi, 97 mmol) y la reacción se dejó en agitación toda la noche. La mezcla de reacción se alcalinizó por la adición lenta de hidróxido de amonio concentrado (10 mi) y luego se concentró bajo vacío hasta obtener un sólido pegajoso, el cual se disolvió en acetato de etilo (1300 mi) y se lavó con NaHC03 saturado (1300 mi) , NaHC03 al 5% (1300 mi) , salmuera (600 mi) , se secó sobre sulfato de magnesio (10 g) , se filtró y se concentró bajo vacío. Los sólidos resultantes se disolvieron en acetato de etilo (370 mi) y se sumergieron en una solución vigorosamente agitada de hexanos:MTBE (3:1 v/v, 7.4 litros). El precipitado resultante se filtró y se secó bajo un alto vacío por 3 días para proporcionar 8 (111.8 g) , el cual se llevó al siguiente paso sin purificación adicional. MS m/z calculado para Ci10H118 6O23Si2 (M + Na+) 1971.3, encontrado 1971.3.
A una solución agitada de 8 (54.5 g, 28 mmol) en DMF (295 mi) se agregó TBAF (103 mi, 75% en agua, 280 mmol) seguido por agua (7.6 mi, 420 mmol), y la reacción se calentó a 50°C y se agitó toda la noche. La mezcla de reacción se diluyó con acetato de etilo (1250. mi), se lavó con ácido cítrico 1M (1000 mi) , salmuera (1000 mi) , NaHC03 acuoso saturado (1000 mi) , salmuera (750 mi) , se secó sobre sulfato de sodio (10 g) , se concentró hasta sequedad para producir un material crudo, el cual se disolvió acetato de etilo (90 mi) y se sumergió en una solución vigorosamente agitada de MTBE : hexano (1:1 v/v, 1.8 litro). El precipitado resultante se filtró y se secó bajo un alto vacío para proporcionar un material crudo (35.9 g) , el cual se purificó mediante RP HPLC (Método 2) para producir 9 (15.5 g, 10.7 mmol, 38.2%): MS m/z calculado para C77H84 6O22 (M + H+) 1445.6, encontrado 1445.3.
El compuesto 9 (200 mg, 0.138 mmol) fue tratado con ácido (2S, 3R) -N-Cbz -2 , 3 -bisbenciloxi-4 -amino-butírico siguiendo el Procedimiento 14 para producir el compuesto 10 (180 rag, 0.096 mol, 69.6%) : MS m/z calculado para Ci03H1097O27 (M + H)+ 1878.0, encontrado 1878.0.
El compuesto 10 (180 mg, 0.096 mmol) se sometió a hidrogenólisis siguiendo el Procedimiento 16 para producir 11 como su sal de acetato, que se convirtió a su sal de sulfato de acuerdo al Procedimiento 18 (83 mg, 0.082 mmol, 85.4%) : MS m/z calculado para C27H53 7O15 (M+H)+ 716.7, encontrado 716.3; CLND 98.1%.
Ejemplo 2 El compuesto 1 (200 mg, 0.138 mmol) fue tratado con el ácido (2S, 3S) -N-Cbz-2, 3 -bisbenciloxi-4 -amino-butírico siguiendo el Procedimiento 14 para producir el compuesto 2 (148 mg, 0.079 mol, 57.2%) : MS m/z calculado para Ci03H109 7O27 (M+H) + 1878.0, encontrado 1878.7.
El compuesto 2 (148 mg, 0.079 mmol) fue sometido a hidrogenólisis siguiendo el Procedimiento 17 para producir 3 como su sal de acetato, que se convirtió a su sal de sulfato de acuerdo al Procedimiento 18 (27 mg, 0.027 mmol, 34.2%) : MS m/z calculado para C27H53 7015 (M+H)+ 716.7, encontrado 716.3; CLND 88.8%.
Ejemplo 3 El compuesto 1 (200 mg, 0.138 mmol) fue tratado con el ácido (2R, R) -2-benciloxi-3-fluoro-4 -az ida-butírico siguiendo el Procedimiento 15 para producir el compuesto 2 (157 mg, 0.093 mol, 67.4%) : MS m/z calculado para C88H94FN9024 (M+H)+ 1681.7, encontrado 1682.1.
El compuesto 2 (157 mg, 0.093 mmol) se sometió a hidrogenólisis siguiendo el Procedimiento 16 para producir 3 como su sal de acetato, la cual se purificó mediante RP HPLC (Método 4) y se convirtió a su sal de sulfato (35 mg, 0.035 mmol, 37.6%): MS m/z calculado para C27H52FN701 (M+H) + 718.7, encontrado 718.4; CLND 98.5%.
Ejemplo 4 17 El compuesto 1 (47 mg, 0.032 mmol) fue tratado con el ácido 2 (R) -benciloxi-3 , 3 -bisfluoro-4 -azida-butírico siguiendo el Procedimiento 15 para producir el compuesto 2 (40 mg, 0.024 mol, 75%): MS m/z calculado para C88H93F2 9024 (M+H)+ 1699.7, encontrado 1699.2.
El compuesto 2 (40 mg, 0.024 mmol) se sometió a hidrogenólisis siguiendo el Procedimiento 16 para producir 3 como su sal de acetato, el cual se convirtió a su sal de sulfato de acuerdo al Procedimiento 18 (20 mg, 0.019 mmol, 79.2%): MS m/z calculado para C27H5iF2 7014 (M+H) + 736.7, encontrado 736.3; CLND 97.6%.
Ejemplo 5 A una solución agitada de 1 (2 g, 1.092 mmol) en DMSO (10.92 mi) se agregó trióxido de azufre-piridina (1.825 g, 11.47 mmol), seguido por TEA (3.20 mi, 22.94 mmol) y la reacción fue agitada por 2 horas. La mezcla de reacción se diluyó con acetato de etilo (50 mi) , se lavó con NaHC03 (2 x 50 mi) , salmuera (50 mi) , se secó sobre sulfato de sodio, se filtró y se concentró bajo vacío para producir 2 (1.78 g, 0.974 mmol, 89%): MS: m/z calculado para C102H109N5O23 S Í2 (M+Na+) 1850.7, encontrado 1850.7.
A una solución agitada de 2 (1.78 g, 0.973 mmol) en DMF (18.71 mi) y metanol (18.71 mi) a 0°C se agregó NaBH (0.368 g, 9.73 mmol) y la reacción fue agitada por 1 hora. La mezcla de reacción se diluyó con acetato de etilo (75 mi) , se lavó con agua: salmuera (1:1, 75 mi), salmuera (3 x 75 mi) , se secó sobre sulfato de sodio, se filtró y se concentró hasta obtener un sólido blanco, el cual se purificó sobre una HPLC de fase inversa de 2 pulgadas (5 era) (Método 2) para producir el compuesto 3 (0.62 g, 0.339 mmol, 35%): MS m/z calculado para C102H111 5O23S Í2 (M+Na+) 1852.7, encontrado 1852.9.
A una solución agitada de 3 (14.3 g, 7.81 mmol) en piridina (46 mi) se agregó anhídrido acético (110 mi) y la reacción fue agitada por 2 días. Se agregó metanol (100 mi) (precaución reacción exotérmica), seguido por acetato de etilo (1 litro) . La capa orgánica se lavó con ácido cítrico 1 M (1 litro), NaHC03 al 5% (2 1 litro), salmuera : agua (1:1, 1 litro), salmuera (1 litro), se secó sobre sulfato de sodio, se filtró y se concentró hasta sequedad para producir el compuesto 4 (8.2 g), el cual se llevó al siguiente paso sin purificación adicional. MS m/z calculado para C106H115 5O25 S Í2 (M+Na+) 1936.7, encontrado 1936.4. 1 A una solución agitada de 4 (9.1 g, 4.76 mmol) en AcOH (19.8 ral) se agregó TFA (1.8 mi de una solución de TFA: agua 3:1), y la reacción se calentó a 40°C por 45 minutos. Se agregó TFA adicional (0.45 mi de una solución de TFA: agua 3:1) y la reacción se calentó por 1.5 horas . La reacción se enfrió luego a temperatura ambiente, se diluyó con acetato de etilo (200 mi) y se lavó con NaHC03 acuoso saturado (3 x 200 mi) y salmuera (200 mi) . La capa orgánica se secó sobre sulfato de sodio, se filtró y se concentró hasta sequedad para producir el compuesto 5 (8.7 g, 3.43 mmol), el cual se llevó al siguiente paso sin purificación adicional. MS m/z calculado para C99H111 5O25SÍ2 (M+Na+) 1848.7, encontrado 1848.3.
A una solución agitada de 5 (8.7 g, 4.76 mmol) en piridina (95 mi) se agregó cloruro de p-toluen-sulfonilo (5.45 g, 28.6 mmol) y la reacción se agitó por 2 horas. Se agregó cloruro de toluen-sulfonilo adicional (1.82 g, 9.52 mmol) y la reacción se agitó por otras 7 horas a temperatura ambiente. La reacción se diluyó con acetato de etilo (900 mi) y se lavó con ácido cítrico 0.5 M (2 1 litro), NaHC03 al 5% (1 litro) , salmuera (500 mi) , se secó sobre sulfato de sodio y se concentró bajo vacío hasta aproximadamente a 80 mi. Esta solución fue sumergida en una mezcla vigorosamente agitada de hexanos:éter dietílico 8:1 (900 mi). El precipitado se filtró y se lavó con hexanos (200 mi) y se secó bajo un alto vacío toda la noche para proporcionar un material crudo (8.6 g) , el cual se purificó mediante RP-HPLC (Método 2) para producir el compuesto 6 (4.5 g, 2.158 mmol, rendimiento de 64%) : MS m/z calculado para C117 5O27SSÍ2 (M+Na+) 2002.7, encontrado 2002.4.
A una solución agitada de 6 (7.7 g, 3.88 mmol) en tolueno (78 mi) a temperatura ambiente se agregó una solución de TCDI (5.4 g, 30.3 mmol) en tolueno (78 mi) y la reacción se agitó toda la noche. La reacción se diluyó con acetato de etilo y se lavó con ácido cítrico 1M (3 x 1 litros) , salmuera : agua (1:1 v,v, 3 x 250 mi), se secó sobre sulfato de sodio, y se concentró hasta sequedad para producir 7 (8.3 g), el cual se llevó al siguiente paso sin purificación adicional: S m/z calculado para C110H119 7O27S2Si2 (M+Na+) 2112.7, encontrado 2112.4.
A una solución agitada de 7 (8.1 g, 3.87 mmol) en 1,4-dioxano (100 mi) se agregó 2 , 21 -azobisisobutironitrilo (32 mg, 0.174 mmol), seguido por tris (trimetilsilil) silano (34.3 µ??, 7.67 mmol) y la reacción se calentó a una temperatura interna de 85 °C por una hora. La reacción se dejó enfriar a una temperatura ambiente, se diluyó con acetato de etilo (1 litro) se lavó con ácido cítrico 0.5M (2 x l litro) , NaHC03 acuoso saturado (l x l litro) , salmuera (500 mi) , se secó sobre sulfato de sodio y se concentró hasta sequedad para producir un material crudo, el cual se disolvió en acetato de etilo (80 mi) y se sumergió en una mezcla de hexanos vigorosamente agitada (1.125 litros) y éter dietílico (0.125 litros). La filtración del precipitado resultante proporcionó el compuesto 8 (6.6 g) , el cual se llevó al siguiente paso sin purificación adicional. MS m/z calculado para Ci06H117 5O26SSÍ2 (M+H+) 1964.7, encontrado 1964.5.
A una solución agitada de 8 (3.0 g, 1.53 mmol) en DMPU (52 mi) se agregó azida de sodio (0.794 g, 12.21 mmol) y la reacción se calentó a 70°C. Después de 2 horas, la reacción se enfrió a temperatura ambiente, se diluyó con acetato de etilo (500 mi) , se lavó con agua (2 x 800 mi) , salmuera : agua (1:1 v/v, 1 litro), salmuera (500 mi), se secó sobre sulfato de sodio y se concentró hasta sequedad para producir 9 (2.85 g), el cual se llevó al siguiente paso sin purificación adicional. MS m/z calculado para C99H110 8O23SÍ2 (M+Na+) 1857.7, encontrado 1857.6.
A una solución agitada de 9 (2.2 g, 1.20 mmol) en DMF (9 mi) se agregó agua (0.19 mi) seguido por TBAF (75% en agua, 3.14 mi, 8.58 mmol) y la reacción se calentó a 45°C toda la noche. Se agregó luego metilamina (40% en agua, 8.4 mi, 50 mmol) y la reacción se agitó por 4 horas. La reacción se diluyó con acetato de etilo (500 mi) , se lavó con ácido cítrico 1 M (1 litro), salmuera : agua (1:5 v/v, 600 mi), NaHC03 acuoso saturado (150 mi) , salmuera (300 mi) , se secó sobre sulfato de sodio y se concentró para proporcionar un material crudo, el cual se disolvió en acetato de etilo (30 mi) y se sumergió en una mezcla de MTBE vigorosamente agitado (250 mi) y hexanos (250 mi) . El precipitado resultante, se filtró, se lavó con hexanos (3 x 60 mi) y se secó bajo vacío para proporcionar un material crudo, el cual se purificó mediante RP-HPLC (Método 2) para producir 10 (0.582 g, 0.447 mmol, rendimiento de 52%): MS m/z calculado para CS2H72 802o (M+Na+) 1271.5, encontrado 1271.3.
El compuesto 10 (50 mg, 0.040 mmol) fue tratado con el ácido (2S, 3R) -N-Cbz-2, 3 -bisbenciloxi-4 -amino-butírico siguiendo el Procedimiento 14 para producir el compuesto 11 (59 mg, 0.035 mol, 87.5%): MS m/z calculado para C88H9 9O2S (M+H)+ 1681.8, encontrado 1682.0.
El compuesto 11 (59 mg, 0.035 mmol) se sometió a hidrogenólisis siguiendo el Procedimiento 17 para producir la sal de acetato cruda (33 mg) , la cual se purificó mediante RP HPLC (Método 4) para producir 12 como su sal de sulfato (9 mg, 0.009 mol, 25.7%): MS m/z calculado para C27H53 7O15 (M+H) + 716.7, encontrado 716.4; CLND 95.9%.
Ejemplo 6 El compuesto 1 (50 mg, 0.040 mmol) fue tratado con el ácido (2S,35) -N-Cbz-2 , 3 -bisbenciloxi-4 -amino-butírico siguiendo el Procedimiento 14 para producir el compuesto 2 (52 m 0.031 mol, 77%): MS m/z calculado para C88H97N9O25 (M+H) + 1681.8, encontrado 1682.0.
El compuesto 2 (52 mg, 0.031 mmol) se sometió a hidrogenólisis siguiendo el Procedimiento 17 para producir la sal de acetato cruda (38 mg) , la cual se purificó mediante RP HPLC (Método 4) para producir 3 como su sal de sulfato (9 mg, 0.009 mol, 29%): MS m/z calculado para C27H53 7015 (M+H) + 716.7, encontrado 716.4; CLND 99.4%.
Ejemplo 7 El compuesto 1 (50 mg, 0.040 mmol) fue tratado con el ácido (2R, 3R) -2-benciloxi-3-fluoro-4 -azida-butírico siguiendo el Procedimiento 15 para producir el compuesto 2 (47 mg, 0.032 mol, 80.0%) : MS m/z calculado para C73He2FNii022 (M+H)+ 1485.5, encontrado 1484.8.
El compuesto 2 (47 mg, 0.032 mmol) se sometió a hidrogenólisis siguiendo el Procedimiento 16 para producir la sal de acetato cruda (36 mg) , la cual se purificó mediante RP HPLC (Método 4) para producir 3 como su sal de sulfato (11 mg, 0.011 mol, 33.7%): MS m/z calculado para C27H52 FN7O14 (M+H) + 718.7, encontrado 718.4; CLND 96.7%.
Ejemplo 8 El compuesto 1 (81 mg, 0.065 mmol) fue tratado con el ácido 2 (R) -benciloxi-3 , 3 -bisfluoro-4 -azida-butírico siguiendo el Procedimiento 14 para producir el compuesto 2 (70 mg, 0.047 mol, 72.3%): MS m/z calculado para C 3H81F2 11O22 (M+H)+ 1503.5, encontrado 1503.0.
El compuesto 2 (70 mg, 0.047 mmol) se sometió a hidrogenólisis siguiendo el Procedimiento 16 para producir la sal de acetato cruda (76 mg) , el cual se purificó mediante RP HPLC (Método 4) para producir 3 (5 mg, 0.005 mol, 10.2%): MS m/z calculado para C27H5iF2 70i4 (M+H)+ 736.7, encontrado 736.3; CL D 99%.
Otros Compuestos Representativos Los siguientes compuestos representativos pueden ser preparados de acuerdo a los procedimientos anteriores. ?? 25 i93 i98 PROTOCOLO DE ENSAYO MIC Las concentraciones inhibitorias mínimas (MIC, por sus siglas en inglés) fueron determinadas por el Instituto de Estándares Clínicos y de Laboratorio de Referencia (CLSI, por sus siglas en inglés) mediante los métodos de microdilución en caldo de acuerdo a M7-A7
[2006] . Los intervalos de control de calidad que utilizan E. coli ATCC 25922, P. aeruginosa ATCC 27853 y S. aureus ATCC 29213, y los criterios interpretativos para agentes comparadores fueron como se publica en CLSI M100-S17
[2007] . En resumen, diluciones al cincuenta por ciento seriales de los compuestos de prueba fueron preparadas a una concentración 2X en Caldo Mueller Hinton. Las diluciones del compuesto fueron mezcladas en placas de ensayo de 96 pozos en una proporción 1:1 con el inoculo bacteriano. El inoculo fue preparado mediante la suspensión de una colonia proveniente de una placa de agar que fue preparada el día previo. Las bacterias fueron suspendidas en solución salina estéril y agregadas a cada placa de ensayo para obtener una concentración final de 5 x 1 UFC/ml . Las placas fueron incubadas a 35°C por 20 horas en aire ambiental . La MIC fue determinada como la concentración más baja del compuesto de prueba que dio como resultado ningún crecimiento bacteriano visible en comparación al control no tratado.
Tabla 1 * AECO001 es ATCC25922 y APAE001 es ATCC27853.
** Clave de MIC : MIC's de 1.0 g/ml o menores = A MIC's mayores de 1.0 pg/ml a 16.0 pg/ml = B MIC's mayores de 16.0 yg/ml, = C Todos las patentes de los Estados Unidos, publicaciones de solicitud de patente de los Estados Unidos, solicitudes de patente de los Estados Unidos, patentes extranjeras, solicitudes de patentes extranjeras, y publicaciones no de patente referidas en esta especificación, son incorporadas aquí por referencia en su totalidad al grado no inconsistente con la presente descripción.
A partir de lo anterior se apreciará que, aunque las modalidades específicas de la invención han sido descritas en la presente para fines de ilustración, pueden ser realizadas diversas modificaciones sin apartarse del espíritu y alcance de la invención. En consecuencia, la invención no está limitada excepto por las reivindicaciones anexas .
Se hace constar que con relación a esta fecha mejor método conocido por la solicitante para llevar a práctica la citada invención, es el que resulta claro de presente descripción de la invención.

Claims (79)

REIVINDICACIONES Habiéndose descrito la invención como antecede, se reclama como propiedad lo contenido en las siguientes reivindicaciones :
1. Un compuesto caracterizado porque tiene la siguiente estructura (I) : (I) o un estereoisómero, profármaco o sal farmacéuticamente aceptable del mismo, en donde : Qx es hidroxilo, un grupo hidroxilo protegido, amino o amino protegido; Q2 es: Q5 es hidroxilo, un hidroxilo protegido, un grupo amino o un grupo amino protegido; cada Ri y R2 es, independientemente, hidrógeno o un grupo protector de amino; cada R3 es, independientemente, hidrógeno o un grupo protector de hidroxilo; cada R4 y R5 es, independientemente, hidrógeno o alquilo de 1 a 6 átomos de carbono opcionalmente sustituido con uno o más halógeno, hidroxilo o amino; cada R6 es, independientemente, hidrógeno, halógeno, hidroxilo, amino o alquilo de 1 a 6 átomos de carbono; o R4 y R5 junto con los átomos a los cuales están enlazados, pueden formar un anillo heterocíclico que tiene de 4 a 6 átomos en el anillo, o R5 y un R6 junto con los átomos a los cuales están enlazados, pueden formar un anillo heterocíclico que tiene de 3 a 6 átomos en el anillo, o R y un R6 junto con los átomos a los cuales están enlazados, pueden formar un anillo carbocíclico que tiene de 3 a 6 átomos en el anillo; cada n es, independientemente, un número entero de 0 a 4; y cada Zx y Z2 es, independientemente, hidrógeno o -OR3 en donde (i) al menos uno de Zj. y Z2 es hidrógeno, (ii) al menos uno de R4 y R5 es alquilo de 1 a 6 átomos de carbono sustituido o al menos uno de Re es halógeno, hidroxilo o amino, y (iii) los dos grupos -CH- adyacentes a los cuales están enlazados Zx y Z2, pueden formar opcionalmente un doble enlace.
2. Un compuesto de conformidad con la reivindicación 1, caracterizado porque cada Ri, R2 y R3 son hidrógeno .
3. El compuesto de conformidad con la reivindicación 1 ó 2, caracterizado porque Q5 es amino.
4. El compuesto de conformidad con la reivindicación 1 ó 2, caracterizado porque Q5 es hidroxilo.
5. El compuesto de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4, caracterizado porque Qi es amino.
6. El compuesto de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4, caracterizado porque Qi es hidroxilo.
7. El compuesto de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 1 a 6, caracterizado porque ?? y Z2 ambos son hidrógeno.
8. El compuesto de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 1 a 6, caracterizado porque ?? es hidroxilo y Z2 es hidrógeno.
9. El compuesto de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 1 a 6, caracterizado porque ?? es hidrógeno y Z2 es hidroxilo.
10. El compuesto de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 1 a 9, caracterizado porque Q2 es: en donde: R4 es hidrógeno; Rs es hidrógeno; al menos uno de R6 es halógeno; y n es un número entero de 1 a 4.
11. El compuesto de conformidad con la reivindicación 10, caracterizado porque Q2 es: en donde cada R6 es halógeno.
12. El compuesto de conformidad con la reivindicación 11, caracterizado porque R6 es fluoro.
13. El compuesto de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 1 a 9, caracterizado porque Q2 es: en donde: R4 es hidrógeno; R5 es hidrógeno; al menos uno de R6 es hidroxilo; y n es un número entero de 1 a 4.
14. El compuesto de conformidad con la reivindicación 13, caracterizado porque Q2 es:
15. El compuesto de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 1 a 9, caracterizado porque Q2 es: en donde : R4 es hidrógeno; Rs Y R6 junto con los átomos a los cuales están enlazados forman un anillo heterociclico que tiene de 3 a 6 átomos en el anillo; al menos un R6 es halógeno; y n es un número entero de 1 a 4.
16. El compuesto de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 1 a 9, caracterizado porque Q2 es: en donde : R4 y Rs junto con los átomos a los cuales están enlazados forman un anillo heterociclico que tiene de 4 a 6 átomos en el anillo; al menos un R6 halógeno; y n es un número entero de l a 4.
17. El compuesto de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 1 a 9, caracterizado porque Q2 es: en donde : R5 es hidrógeno; R4 y un R6 junto con los átomos a los cuales están enlazados forman un anillo carbocíclico que tiene de 3 a 6 átomos en el anillo; al menos un R6 halógeno; y n es un número entero de 1 a 4.
18. El compuesto de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 1 a 9, caracterizado porque Q2 es:
19. El compuesto de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 1 a 18, caracterizado porque tiene la configuración :
20. El compuesto de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 1 a 14, caracterizado porque los dos átomos adyacentes a los cuales están unidos Zx y Z2 forman un doble enlace.
21. El compuesto de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 1 a 14, caracterizado porque los dos átomos adyacentes a los cuales están unidos Zx y Z2 forman un doble enlace .
22. El compuesto de conformidad con la reivindicación 1, caracterizado porque el compuesto es: ' o una sa armac u camente aceptable del mismo.
23. Una composición farmacéutica, caracterizada porque comprende un compuesto de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 1 a 22, o un estereoisómero farmacéuticamente aceptable, sal o profármaco del mismo, y un portador farmacéuticamente aceptable, diluyente o exicipiente.
24. Un método para tratar una infección bacteriana en un mamífero, caracterizado porque comprende administrarle al mamífero en necesidad del mismo una cantidad efectiva de un compuesto de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 1 a 22.
25. Un método para tratar una infección bacteriana en un mamífero, caracterizado porque comprende administrarle al mamífero en necesidad del mismo una cantidad efectiva de una composición farmacéutica de conformidad con la reivindicación 23.
26: Un compuesto caracterizado porque tiene la siguiente estructura (I) : ( o un estereoisómero, profármaco o sal farmacéuticamente aceptable del mismo, en donde: Qi es hidroxilo, un grupo hidroxilo protegido, amino o amino protegido; Q2 es alquilo opcionalmente sustituido con uno o más de halógeno, hidroxilo, amino, cicloalquilo opcionalmente sustituido o heterociclilo opcionalmente sustituido, 25 Qs es hidroxilo, un grupo hidroxilo protegido, amino o un amino protegido; cada Ri y R2 es, independientemente, hidrógeno o un grupo protector de amino; cada R3 es, independientemente, hidrógeno o un grupo protector de hidroxilo; cada R4, R5, R y R8 es, independientemente, hidrógeno o alquilo de 1 a 6 átomos de carbono opcionalmente sustituido con uno o más de halógeno, hidroxilo o amino; cada R6 es, independientemente, hidrógeno, halógeno, hidroxilo, amino o alquilo de 1 a 6 átomos de carbono; o R y R5 junto con los átomos a los cuales están enlazados pueden formar un anillo heterocíclico que tiene de 4 a 6 átomos en el anillo, o R5 y un R6 junto con los átomos a los cuales están enlazados, pueden formar un anillo heterocíclico que tiene de 3 a 6 átomos en el anillo, o R4 y un R6 junto con los átomos a los cuales están enlazados, pueden formar un anillo carbocíclico que tiene de 3 a 6 átomos en el anillo, o R7 y R8 junto con el átomo al cual están enlazados, pueden formar un anillo heterocíclico que tiene de 3 a 6 átomos en el anillo; cada R9 es, independientemente, hidrógeno, hidroxilo, amino o alquilo de 1 a 6 átomos de carbono opcionalmente sustituido con uno o más de halógeno, hidroxilo o amino; cada Rio es, independientemente, hidrógeno, halógeno, hidroxilo, amino o alquilo de 1 a 6 átomos de carbono; cada Ru es, independientemente, hidrógeno, halógeno, amino o alquilo de 1 a 6 átomos de carbono; o R9 y un Ru junto con los átomos a los cuales están enlazados, pueden formar un anillo heterocíclico que tiene de 3 a 6 átomos en el anillo, o R4 y un Rn junto con los átomos a los cuales están enlazados, pueden formar un anillo carbocíclico que tiene de 3 a 6 átomos en el anillo; cada n es, independientemente, un número entero de 0 a 4; cada p es, independientemente, un número entero de 1 a 4; y cada Zx y Z2 es, independientemente, hidrógeno o - OR3, en donde (i) al menos uno de ? y Z2 es hidrógeno, y (ii) los dos grupos -CH- adyacentes a los cuales están enlazados Zx y Z2 pueden formar opcionalmente un doble enlace.
27. El compuesto de conformidad con la reivindicación 26, caracterizado porque cada uno de Ri, R2 y R2 son hidrógeno.
28. El compuesto de conformidad con la reivindicación 26 ó 27, caracterizado porque Q5 es amino.
29. El compuesto de conformidad con la reivindicación 26 ó 27, caracterizado porque Q5 es hidroxilo.
30. El compuesto de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 26 a 29, caracterizado porque Qi es amino .
31. compuesto de conformidad con cualquiera las reivindicaciones 26 a 29, caracterizado porque Qx es hidroxilo .
32. El compuesto de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 26 a 31, caracterizado porque Zi y Z2 son ambos hidrógeno.
33. El compuesto de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 26 a 31, caracterizado porque Zx es hidroxilo y Z2 es hidrógeno.
34. El compuesto de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 26 a 31, caracterizado porque Zi es hidrógeno y Z2 es hidroxilo.
35. El compuesto de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 26 a 34, caracterizado porque Q2 es: en donde : R4 es hidrógeno R7 es hidrógeno R8 es hidrógeno; y n es un número entero de 1 a 4.
36. El compuesto de conformidad reivindicación 35, caracaterizado porque cada hidrógeno .
37. El compuesto de conformidad reivindicación 36, caracterizado porque Q2 es:
38. El compuesto de conformidad con la reivindicación 35, caracterizado porque al menos uno de R6 es halógeno .
39. El compuesto de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 26 a 34, caracterizado porque Q2 es: en donde : R4 y un R6 junto con los átomos a los cuales están enlazados forman un anillo carbocíclico que tiene de 3 átomos en el anillo; R7 es hidrógeno; R8 es hidrógeno; y n es un número entero de 1 a 4.
40. El compuesto de conformidad con reivindicación 39, caracterizado porque Q2 es:
41. El compuesto de conformidad con la reivindicación 39, caracterizado porque al menos uno de R6 es halógeno .
42. El compuesto de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 26 a 34, caracterizado porque Q2 es : en donde R5 es hidrógeno .
43. El compuesto de conformidad con la reivindicación 42, caracterizado porque cada Re es hidrógeno.
44. El compuesto de conformidad con la reivindicación 43, caracterizado porque Q2 es :
45. El compuesto de conformidad con la reivindicación 42, caracterizado porque al menos uno de R6 es halógeno.
46. El compuesto de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 26 a 34, caracterizado porque Q2 es : en donde: R7 es hidrógeno; y R8 es hidrógeno.
47. El compuesto de conformidad con la reivindicación 46, caracterizado porque cada R6 es hidrógeno.
48. El compuesto de conformidad con la reivindicación 47, caracterizado porque Q2 es:
49. El compuesto de conformidad con la reivindicación 46, caracterizado porque al menos uno de R6 es halógeno.
50. El compuesto de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 26 a 34, caracterizado porque Q2 es: en donde R5 es hidrógeno .
51. El compuesto de conformidad con la reivindicación 50, caracterizado porque cada R6 es hidrógeno.
52. El compuesto de conformidad con la reivindicación 50, caracterizado porque cada R6 es halógeno.
53. El compuesto de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 26 a 34, caracterizado porque Q2 es: en donde : R7 es hidrógeno; y R8 es hidrógeno.
54. El compuesto de conformidad con la reivindicación 53, caracterizado porque cada R6 es hidrógeno .
55. El compuesto de conformidad con la reivindicación 53, caracterizado porque al menos uno de R6 es halógeno.
56. El compuesto de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 26 a 34, caracterizado porque Q2 es : en donde R5 es hidrógeno.
57. El compuesto de conformidad con la reivindicación 56, caracterizado porque cada R6 es hidrógeno .
58. El compuesto de conformidad con la reivindicación 56, caracterizado porque al menos uno de R6 es halógeno.
59. El compuesto de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 26 a 34, caracterizado porque Q2 es : en donde R9 es hidrogeno.
60. El compuesto de conformidad con la reivindicación 59, caracterizado porque cada Ra es hidrógeno .
61. El compuesto de conformidad con la reivindicación 59, caracterizado porque cada Rn es halógeno .
62. El compuesto de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 26 a 34, caracterizado porque Q2 es : en donde : R es hidrógeno; y R8 es hidrógeno.
63. El compuesto de conformidad con la reivindicación 62, caracterizado porque cada Rio es hidrógeno.
64. El compuesto de conformidad con la reivindicación 62, caracterizado porque cada Rio es halógeno .
65. El compuesto de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 26 a 34, caracterizado porque Q2 es : en donde R4 es hidrógeno.
66. El compuesto de conformidad con reivindicación 65, caracterizado porque cada Rn hidrógeno .
67. El compuesto de conformidad con reivindicación 65, caracterizado porque cada uno Rn halógeno .
68. El compuesto de conformidad con cualquie de las reivindicaciones 26 a 34, caracterizado porque
69. El compuesto de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 26 a 34, caracterizado porque Q2 es alquilo opcionalmente sustituido con uno o más de halógeno, hidroxilo, amino, opcionalmente sustituidos cicloalquilo o heterociclil.o opcionalmente sustituidos.
70. El compuesto de conformidad con la reivindicación 69, caracterizado porque Q2 es no sustituido .
71. El compuesto de conformidad con la reivindicación 69, caracterizado porque Q2 es sustituido con uno o más de halógeno, hidroxilo o amino .
72. El compuesto de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 26 a 71, caracterizado porque tiene la configuración:
73. El compuesto de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 26 a 72, caracterizado porque los dos átomos adyacentes a los cuales Zi y Z2 están acoplados forman un doble enlace .
74. El compuesto de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 26 a 72, caracterizado porque los dos átomos adyacentes a los cuales Z y Z2 están acoplados forman un enlace simple .
75. Una composición farmacéutica, caracterizada porque comprende un compuesto de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 26 a 74, o un estereoisómero, sal o profármaco farmacéuticamente aceptable del mismo, y un portador farmacéuticamente aceptable, diluyente o exipiente.
76. Un método para tratar una infección bacteriana en un mamífero, caracterizado porque comprende administrarle al mamífero una cantidad efectiva en necesidad de la misma de un compuesto de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 26 a 74.
77. El método para tratar una infección bacteriana en un mamífero, caracterizado porque comprende administrarle al mamífero una cantidad efectiva en necesidad de la misma de un compuesto de conformidad con la reivindicación 75.
78. Un compuesto, caracterizado porque tiene la siguiente estructura (INT-I) : (INT-1) en donde : cada Rj. es, independientemente, un grupo protector de amino ; cada R3 es, independientemente, un grupo protector de hidroxilo; y cada A es, independientemente, fenilo, opcionalmente sustituido con uno o más halógeno, hidroxilo, amino o alquilo de 1 a 6 átomos de carbono opcionalmente sustituido con uno o más halógeno, hidroxilo o amino.
79. El compuesto de conformidad con la reivindicación 78, caracterizado porque es: CbzN^Ó
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