JP2003502012A - 特定遺伝子の発現を抑制するための方法および薬剤 - Google Patents

特定遺伝子の発現を抑制するための方法および薬剤

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Abstract

(57)【要約】 本発明は、標的遺伝子の発現を抑制するように設計された少なくとも1の二本さオリゴリボヌクレオチド(二本鎖RNA)を含む薬剤に関する。本発明によれば、その二本鎖RNAの1の鎖は、少なくとも一部が標的遺伝子に相補的である。標的遺伝子は下記の群から選択することができる:ガン遺伝子、サイトカイン遺伝子、Id蛋白質遺伝子、発生遺伝子、プリオン遺伝子。標的遺伝子は、病原性生物(特に、プラスモディウム)において発現し得る。標的遺伝子はまた、好ましくはヒトに対して病原性であるウイルスまたはウイロイドの一部であり得る。

Description

【発明の詳細な説明】
【0001】 本発明は、請求項1および2のプリアンブルに記載される方法に関する。本発
明はさらに、二本鎖オリゴリボヌクレオチドの薬剤およびその使用に関し、そし
て二本鎖オリゴリボヌクレオチドをコードするベクターに関する。
【0002】 そのような方法は、本発明の優先権日に公開されていない国際特許出願公開W
O99/32619により知られている。この知られている方法は、無脊椎動物
の細胞における遺伝子の発現を抑制することを目的としている。この目的のため
に、二本鎖のオリゴリボヌクレオチドは、標的遺伝子と同一である配列で、少な
くとも50塩基の長さを有する配列を示さなければならない。効率的な抑制を達
成するために、同一の配列は、長さが300塩基対〜1000塩基対でなければ
ならない。そのようなオリゴリボヌクレオチドは、調製することが複雑である。
【0003】 ドイツ国特許DE19631919C2には、特異的な二次構造を有するアン
チセンスRNAであって、それをコードするベクターの形態で存在するアンチセ
ンスRNAが記載されている。このアンチセンスRNAは、mRNAの領域に対
して相補的であるRNA分子の形態を取っている。遺伝子発現の抑制が、これら
の領域に結合することによって引き起こされる。この抑制は、特に、疾患(例え
ば、腫瘍疾患またはウイルス感染症)の診断および/または治療のために用いる
ことができる。しかし、その欠点は、アンチセンスRNAを少なくともmRNA
の量と同じくらい多くの量で細胞に導入しなければならないということである。
この知られているアンチセンス方法は特に効果的ではない。
【0004】 米国特許第5,712,257号には、ミスマッチの二本鎖RNA(dsRN
A)およびdsRNAの生物活性なミスマッチのフラグメントを界面活性剤との
三成分複合体の形態で含む薬剤が開示されている。この目的に使用されるdsR
NAは、規定された塩基配列を有しない合成された核酸の一本鎖からなる。この
一本鎖は、「非ワトソン・クリック」塩基対形成としても知られる変則的な塩基
対形成を生じさせ、これによりミスマッチした二本鎖が生じる。この知られてい
るdsRNAは、HIVなどのレトロウイルスの増幅を抑制するために使用され
る。ウイルスの増幅は、配列非特異的なdsRNAが細胞内に導入されたときに
抑制され得る。これにより、ウイルスの増幅を抑制することを目的とするインタ
ーフェロンの誘導がもたらされる。この方法の抑制効果または活性は良くない。
【0005】 抑制すべき線虫遺伝子に対して一方の鎖が部分的に相補的であるdsRNAに
よってこの遺伝子の発現が非常に効率よく抑制されることが、Fire,A.他、NATUR
E、第391巻、806頁により知られている。使用されたdsRNAの線虫細
胞におけるこの特定の活性は、アンチセンス原理のためではなく、おそらくはd
sRNAの触媒作用的な性質、またはそれによって誘導された酵素に基づいてい
ると考えられる。しかし、この論文には、特に哺乳動物細胞およびヒト細胞にお
ける遺伝子発現を抑制することに関する特異的なdsRNAの活性については何
ら言及されていない。
【0006】 本発明の目的は、先行技術の欠点を解決することである。特に、本発明は、特
定の標的遺伝子の発現の特に効果的な抑制をもたらし得るできる限り効果的な方
法、薬剤、または薬剤を調製するための使用を提供することを目的とする。
【0007】 この目的は、請求項1、2、37、38ならびに74および75の特徴によっ
て達成される。好都合な実施形態は、請求項3〜36、39〜73および76〜
112から理解することができる。
【0008】 方法に関する発明に従い、標的遺伝子に対して相補的である領域Iが49以下
の連続したヌクレオチド対を示すことがそれぞれの場合に提供される。
【0009】 本発明により、オリゴリボヌクレオチドまたはオリゴリボヌクレオチドをコー
ドするベクターが提供される。少なくともこのオリゴリボヌクレオチドの一部は
、規定されたヌクレオチド配列を示す。規定されたセグメントは、相補的な領域
Iに限定されていてもよい。しかし、二本鎖オリゴリボヌクレオチドのすべてが
規定されたヌクレオチド配列を示すことも可能である。
【0010】 驚くべきことに、相補的な領域Iが49塩基対以下の長さである場合でさえ、
標的遺伝子の発現の効果的な抑制が達成され得ることが明らかにされた。そのよ
うなオリゴリボヌクレオチドを提供する手順はあまり複雑ではない。
【0011】 特に、長さが50ヌクレオチド対を越えるdsRNAは、哺乳動物細胞および
ヒト細胞における特定の細胞機構、例えば、dsRNA依存性蛋白質キナーゼま
たは2−5Aシステムを誘導する。これにより、規定された配列を示すdsRN
Aによって媒介される干渉作用の消失がもたらされる。その結果、細胞における
蛋白質生合成が阻止される。本発明は、特にこの欠点を克服する。
【0012】 さらに、鎖長が短いdsRNAの細胞内または核内への取込みが、より長い鎖
のdsRNAよりも著しく促進される。
【0013】 dsRNAまたはベクターが、ミセル構造に、特にリポソームにパッケージさ
れて存在することは好都合であることが明らかにされた。dsRNAまたはベク
ターは、同様に、ウイルスの天然のキャプシドに、あるいは化学的または酵素的
に作製された人工的なキャプシドまたはそれに由来する構造体に封入させること
ができる。上記の特徴により、dsRNAまたはベクターを特定の標的細胞に導
入することが可能になる。
【0014】 さらなる側面において、dsRNAは、10塩基対〜1000塩基対、好まし
くは15塩基対〜49塩基対を有する。従って、dsRNAは、標的遺伝子に対
して相補的である領域Iよりも長くすることができる。相補的な領域Iは、末端
部に位置させることができ、あるいはdsRNA内に挿入することができる。相
補的な領域Iをコードするために提供されるそのようなdsRNAまたはベクタ
ーは、従来的な方法で合成的または酵素的に作製することができる。
【0015】 抑制される遺伝子は、真核生物細胞において都合良く発現される。標的遺伝子
は下記の群から選択することができる:ガン遺伝子、サイトカイン(cytokin)
遺伝子、Id蛋白質遺伝子、発生遺伝子、プリオン遺伝子。標的遺伝子は、病原
性生物(特に、プラスモディウム)において発現し得る。標的遺伝子はまた、好
ましくはヒトに対して病原性であるウイルスまたはウイロイドの一部であり得る
。提案された方法は、遺伝子的に決定された疾患(例えば、ガン、ウイルス疾患
またはアルツハイマー病)の治療に対する組成物を製造することを可能にする。
【0016】 ウイルスまたはウイロイドはまた、動物に対して病原性であるか、または植物
病原体であるウイルスまたはウイロイドであり得る。この場合、本発明による方
法はまた、動物または植物の病気を処置するための組成物の提供を可能にする。
【0017】 さらなる側面において、dsRNAの一部は二本鎖として設計される。二本鎖
構造において相補的である領域IIは、2つの異なるRNA一本鎖によって形成
されるか、または環状形態であることが好ましい位相幾何学的に閉環したRNA
一本鎖の自己相補的な領域によって形成される。
【0018】 dsRNAの両端は、細胞内での分解または一本鎖への解離が妨げられるよう
に改変することができる。解離は、低濃度または短い鎖長が使用されたときに特
に生じる。特に効果的な様式で解離を抑制するために、ヌクレオチド対によりも
たらされる相補的な領域IIの密着性(結合)を、少なくとも1つ(好ましくは
、2つ)のさらなる化学結合によって増大させることができる。解離を低下させ
た本発明によるdsRNAは、細胞または生物における酵素的および化学的な分
解に対するより大きな安定性を示す。
【0019】 相補的な領域IIは、特に、本発明によるベクターが使用された場合、RNA
ヘアピンループの自己相補的な領域によって形成され得る。分解からの保護を得
るために、ヌクレオチドを二本鎖構造間のループ領域において化学的に修飾する
ことが好都合である。
【0020】 化学的な結合は、共有結合またはイオン結合、水素結合、疎水性相互作用、好
ましくはファンデルワールス相互作用またはスタッキング(重なり)相互作用に
よって、あるいは金属イオンの配位によって都合良く形成される。特に好都合な
側面において、化学的な結合を、相補的な領域IIの少なくとも一方の末端に、
好ましくは両端に形成させることができる。
【0021】 さらに、化学的な結合を1つまたは2つ以上の結合基によって形成させること
は好都合であることが明らかにされた。この場合、結合基は、好ましくはポリ(
オキシホスフィニコオキシ−1,3−プロパンジオール)鎖および/またはポリ
エチレングリコール鎖である。化学的な結合はまた、相補的な領域IIにおいて
プリンの代わりに使用されるプリンアナログ(類縁体)によって形成させること
ができる。化学的な結合を、相補的な領域IIに導入されたアザベンゼン単位に
よって形成させることもまた好都合である。その上、化学的な結合は、相補的な
領域IIにおいてヌクレオチドの代わりに使用される分枝状ヌクレオチドアナロ
グによって形成させることができる。
【0022】 化学的な結合を生成させるために下記の基の少なくとも1つを使用することが
好都合であることが明らかにされた:メチレンブルー;二官能性基、好ましくは
、ビス(2−クロロエチル)アミン;N−アシル−N’−(p−グリオキシルベ
ンゾイル)シスタミン;4−チオウラシル;ソラレン。化学的な結合は、さらに
、二本鎖領域の両端に提供されたチオホスホリル基によって形成させることがで
きる。二本鎖領域の両端における化学的な結合は、好ましくは三重らせんの結合
によって形成される。
【0023】 化学的な結合は、好都合なことに、紫外光により誘導させることができる。
【0024】 dsRNAのヌクレオチドは改変することができる。これにより、二本鎖RN
Aに依存する蛋白質キナーゼ(PKR)の細胞内での活性化が妨げられる。有益
には、相補的な領域IIにおけるdsRNAのヌクレオチドの少なくとも1つの
2’−ヒドロキシル基は、好ましくは2’−アミノ基または2’−メチル基の化
学基によって置換される。相補的な領域IIの少なくとも一方の鎖における少な
くとも1つのヌクレオチドもまた、好ましくは2’−O、4’−Cメチレン架橋
により化学的に修飾された糖の環により固定された(ロックされた)ヌクレオチ
ドであり得る。好都合なことに、数ヌクレオチドが、固定されたヌクレオチドで
ある。
【0025】 さらに特に好都合な実施形態は、dsRNAまたはベクターが、ウイルス起源
であるか、またはウイルスに由来するか、または合成的に調製された少なくとも
1つのウイルス外殻蛋白質に結合するか、会合するか、または囲まれているもの
を提供する。外殻蛋白質は、ポリオーマウイルスに由来し得る。外殻蛋白質は、
ポリオーマウイルスのウイルス蛋白質1(VP1)および/またはウイルス蛋白
質2(VP2)を含有することができる。そのような外殻蛋白質の使用は、例え
ば、ドイツ国特許DE19618797A1(この開示は本明細書中に組み込ま
れる)により知られている。上記の特徴は、細胞内へのdsRNAまたはベクタ
ーの導入をかなり容易にする。
【0026】 キャプシド構造またはキャプシドタイプの構造が外殻蛋白質から形成される場
合、一の側面は、好ましくはキャプシド構造またはキャプシドタイプの構造の内
部と向き合う。形成された構造は特に安定である。
【0027】 dsRNAは、標的遺伝子の一次RNA転写物またはプロセシングされたRN
A転写物に対して相補的であり得る。細胞は、脊椎動物細胞またはヒト細胞であ
り得る。
【0028】 互いに異なる少なくとも2つのdsRNA、またはそれらをコードする少なく
とも1つのベクターを細胞内に導入することができる。この場合、少なくともそ
れぞれのdsRNAの一方の鎖の一部は、それぞれの場合、少なくとも2つの異
なる標的遺伝子の1つに対して相補的である。これにより、少なくとも2つの異
なる標的遺伝子の発現を同時に抑制することが可能になる。二本鎖RNAに依存
する蛋白質キナーゼ(PKR)の発現を細胞内で抑制するために、標的遺伝子の
1つは、好都合にはPKR遺伝子である。これにより、細胞内におけるPKR活
性の効果的な抑制が可能になる。
【0029】 本発明はさらに、特定の標的遺伝子の発現を抑制するための、二本鎖構造を有
するオリゴリボヌクレオチド(dsRNA)の少なくとも1つを有する薬剤を提
供する。この場合、dsRNAの一方の鎖は、少なくとも一部が標的遺伝子に対
して相補的である領域Iを有する。驚くべきことに、そのようなdsRNAは、
哺乳動物細胞における特定の遺伝子の発現を抑制するための薬剤として好適であ
ることが明らかにされた。一本鎖オリゴリボヌクレオチドの使用との比較におい
て、抑制が、少なくとも1桁低い濃度で既に生じている。本発明による薬剤は非
常に効果的である。副作用はほとんど予想され得ない。
【0030】 本発明はさらに、特定の標的遺伝子の発現を抑制するための、二本鎖構造を有
するオリゴリボヌクレオチド(dsRNA)の少なくとも1つをコードするため
の少なくとも1つのベクターを有する薬剤を提供する。この場合、dsRNAの
一方の鎖は、少なくとも一部が標的遺伝子に対して相補的である領域Iを有する
。提案された薬剤は上記の利点を示す。ベクターを使用することによって、特に
製造コストを減少させることができる。
【0031】 特に好都合な実施形態において、相補的な領域Iは、49以下の連続したヌク
レオチド対を有する。驚くべきことに、相補的な領域Iが49塩基対以下の長さ
である場合でさえ、標的遺伝子の発現の効果的な抑制が達成され得ることが明ら
かにされた。そのようなオリゴリボヌクレオチドを提供する手順はあまり複雑で
はない。
【0032】 本発明はさらに、特定の標的遺伝子の発現を抑制するための薬剤を調製するた
めの、二本鎖構造を有するオリゴリボヌクレオチド(dsRNA)の使用を提供
する。この場合、dsRNAの一方の鎖は、少なくとも一部が標的遺伝子に対し
て相補的である領域Iを有する。驚くべきことに、そのようなdsRNAは、特
定の遺伝子の発現を抑制するための薬剤を調製するために適している。一本鎖オ
リゴリボヌクレオチドの使用との比較において、抑制が、dsRNAを使用した
ときには少なくとも1桁低い濃度で既に生じている。従って、本発明による使用
により、特に効果的な薬剤の調製が可能になる。
【0033】 本発明はさらに、特定の標的遺伝子の発現を抑制するための薬剤を調製するた
めの、二本鎖構造を有するオリゴリボヌクレオチド(dsRNA)の少なくとも
1つをコードするためのベクターの使用を提供する。この場合、dsRNAの一
方の鎖は、少なくとも複数のセグメントがこの標的遺伝子に対して相補的である
領域Iを有する。ベクターの使用により、特に効果的な遺伝子治療が可能になる
【0034】 薬剤および使用の好都合な実施形態に関して、上記の特徴の説明が参照される
【0035】 本発明の使用例を、図を参照して下記にさらに詳しく例示する。
【0036】 使用例1: 転写抑制を、ヒトHeLa細胞からの核抽出物を用いたインビトロ転写システ
ムにおける配列相同的なdsRNAによって検出した。この実験に対するDNA
テンプレートは、BamHIで線状化されたプラスミドpCMV1200であっ
た。
【0037】 テンプレートプラスミドの作製: 図1に示されるプラスミドを、dsRNAの酵素的合成において使用するため
に構築した。この目的のために、Promega(Madison、米国)によるHelaScribe(
登録商標)核抽出物インビトロ転写キットの「陽性コントロールDNA」をDN
Aテンプレートとして用いたポリメラーゼ連鎖反(PCR)を最初に行った。使
用したプライマーの1つには、配列番号1に示されているように、EcoRI切
断部位およびT7RNAポリメラーゼプロモーターの配列が含まれた。もう一方
のプライマーには、配列番号2に示されているように、BamHI切断部位およ
びSP6RNAポリメラーゼプロモーターの配列が含まれた。さらに、この2つ
のプライマーは、3’末端に、DNAテンプレートと同一である領域、またはD
NAテンプレートに対して相補的である領域を有した。PCRを、Qiagen(Hild
en、ドイツ)による「Taq PCR Coreキット」で製造者の説明書に従って行った。
1.5mMのMgCl2、200μMの各dNTP、0.5μMの各プライマー
、2.5UのTaqDNAポリメラーゼ、およびテンプレートとしての約100
ngの「陽性コントロールDNA」を、100μlの容量のPCR緩衝液におい
て用いた。94℃で5分間加熱することによってテンプレートDNAを最初に変
性した後、増幅を、それぞれの場合において、94℃で60秒間の変性、プライ
マーの計算された融解温度よりも5℃低い温度で60秒間のアニーリング、およ
び72℃で1.5分間〜2分間の重合の30サイクルで行った。72℃で5分間
の最後の重合を行った後、反応液の5μlをアガロースゲル電気泳動により分析
した。このように増幅されたDNAフラグメントの長さは400塩基対であった
。340塩基対は「陽性コントロールDNA」に対応した。PCR産物を精製し
、EcoRIおよびBamHIで加水分解し、そして再び精製した後、EcoR
IおよびBamHIで同様に加水分解されたpUC18ベクターとの連結におい
て用いた。その後、大腸菌XL1−blueを形質転換した。得られたプラスミ
ド(pCMV5)は、5’末端にはT7プロモーターが隣接し、3’末端にはS
P6プロモーターが隣接するDNAフラグメントを有する。プラスミドをBam
HIで線状化することによって、プラスミドは、長さが340ヌクレオチドであ
り、配列番号3に示される一本鎖RNAのラン・オフ転写のためにT7RNAポ
リメラーゼとともにインビトロで用いることができる。プラスミドをEcoRI
で線状化すれば、プラスミドは、SP6RNAポリメラーゼを用いたラン・オフ
転写のために用いることができ、これにより相補鎖が得られる。本明細書中上記
に概略された方法により、長さが23ヌクレオチドのRNAもまた合成された。
この目的に対して、配列番号4に示されるDNAを、EcoRIおよびBamH
Iの切断部位を介してpUC18ベクターに連結した。
【0038】 プラスミドpCMV1200を、HeLa核抽出物を用いたインビトロ転写の
ためのDNAテンプレートとして構築した。この目的のために、HeLaScribe(登
録商標)核抽出物インビトロ転写キットに含まれる陽性コントロールDNAの1
191bpのEcoRI/BamHIフラグメントをPCRにより増幅した。増
幅フラグメントは、828bpの「極初期」CMVプロモーターと363bpの
転写可能なDNAフラグメントとを含む。PCR産物を「T突出」連結によりベ
クターpGEM−Tに連結した。BamHI切断部位がフラグメントの5’末端
に存在する。プラスミドを、BamHIでの加水分解により線状化して、ラン・
オフ転写におけるテンプレートとして使用した。
【0039】 相補的な一本鎖のインビトロ転写: pCMV5プラスミドDNAをEcoRIまたはBamHIで線状化した。こ
れを、SP6RNAポリメラーゼおよびT7RNAポリメラーゼをそれぞれ用い
た相補的なRNA一本鎖のインビトロ転写のためのDNAテンプレートとして使
用した。Promega(Madison、米国)による「Riboprobeインビトロ転写」システ
ムをこの目的のために用いた。製造者の説明書に従い、2μgの線状化プラスミ
ドDNAを100μlの転写緩衝液において40UのT7RNAポリメラーゼま
たはSP6RNAポリメラーゼと37℃で5時間〜6時間インキュベーションし
た。続いて、DNAテンプレートを、2.5μlのRNase非含有DNase
RQ1を加え、37℃で30分間インキュベーションすることによって分解し
た。転写反応液をH2Oで300μlにしてフェノール抽出により精製した。R
NAを、150μlの7M酢酸アンモニウム[sic]および1125μlのエ
タノールを加えることによって沈殿させて、ハイブリダイゼーションに使用され
るまで−65℃で保存した。
【0040】 RNA二本鎖の作製: ハイブリダイゼーションのために、エタノール中に保存され、沈殿させた50
0μlの一本鎖RNAを遠心分離した。得られたペレットを乾燥し、80%ホル
アミド、400mMのNaClおよび1mMのEDTAの存在下、30μlのP
IPES緩衝液(pH6.4)に溶解した。それぞれの場合において、15μl
の相補的な一本鎖を一緒にして、85℃で10分間加熱した。続いて、反応液を
50℃で一晩インキュベーションして、室温に冷却した。
【0041】 ほぼ等モル量の2つの一本鎖のみをハイブリダイゼーションにおいて用いた。
これは、一本鎖RNA(ssRNA)が混入物としてdsRNA調製物に含まれ
たためである。これらのssRNA混入物を除くために、反応液を、ハイブリダ
イゼーション後、一本鎖に特異的なリボヌクレアーゼのウシ膵臓RNaseAお
よびAspergillus oryzae RNaseT1で処理した。RN
aseAは、ピリミジンに特異的なエンドリボヌクレアーゼである。RNase
T1は、グアノシンの3’側を優先的に切断するエンドリボヌクレアーゼである
。dsRNAは、これらのリボヌクレアーゼの基質ではない。RNase処理の
ために、Tris(pH7.4)、300mMのNaClおよび5mMのEDT
Aからなる300μlにおける反応液を、濃度が10mg/mlのRNaseA
の1.2μlと、濃度が290μg/mlのRNaseT1の2μlとで処理し
た。反応液を30℃で1.5時間インキュベーションした。その後すぐ、これら
のRNaseを、濃度が20mg/mlのプロテイナーゼKの5μlと、20%
のSDSの10μlとを加えて、37℃で30分間インキュベーションすること
によって変性させた。dsRNAをフェノール抽出により精製し、エタノールで
沈殿させた。RNase消化の完全性を確認するために、2つのコントロール反
応液を、ハイブリダイゼーション反応液と同様にssRNAを用いて処理した。
【0042】 乾燥ペレットを15μlのTE緩衝液(pH6.5)に溶解し、8%ゲルでの
未変性ポリアクリルアミドゲル電気泳動に付した。続いて、アクリルアミドゲル
を臭化エチジウム溶液で染色し、水浴で洗浄した。図2には、UVトランスイル
ミネーターにおいて可視化されたRNAが示されている。レーン1に加えられた
センスRNA、およびレーン2に加えられたアンチセンスRNAは、レーン3に
加えられたハイブリダイゼーション反応液のdsRNAとは異なる移動挙動を、
選ばれた条件下で示した。レーン4およびレーン5にそれぞれ加えられたRNa
se処理されたセンスRNAおよびアンチセンスRNAは、視認されるバンドを
もたらさなかった。このことは、一本鎖RNAが完全に分解されたことを示して
いる。レーン6に加えられたハイブリダイゼーション反応液のRNase処理d
sRNAは、RNase処理に対して耐性である。レーン3に加えられたdsR
NAと比較して、未変性ゲルにおいてより早く移動するバンドは、ssRNAを
含まないdsRNAに由来する。優勢な主バンドに加えて、より早く移動するよ
り弱いバンドが、RNase処理の後に認められる。
【0043】 ヒト核抽出物を用いたインビトロ転写試験: Promega(Madison、米国)によるHeLaScribe(登録商標)核抽出物インビトロ
転写キットを使用して、プラスミドpCMV1200に存在し、かつその「陽性
コントロールDNA」に対して相同的である上記DNAフラグメントの転写効率
を、配列相同性を有するdsRNA(dsRNA−CMV5)の存在下で測定し
た。また、配列相同性を有さず、黄色蛍光蛋白質(YFP)遺伝子に対応するd
sRNA(dsRNA−YFP)の影響も調べた。このdsRNAは、配列相同
性を有するdsRNAと同様に作製された。このdsRNAの鎖の配列は配列番
号5に見出され得る。プラスミドpCMV1200をラン・オフ転写のテンプレ
ートとして使用した。このプラスミドは、真核生物RNAポリメラーゼIIによ
って認識される「極初期」サイトメガロウイルスプロモーターと、転写可能なD
NAフラグメントとを有する。転写を、転写に必要な蛋白質をすべて含有するH
eLa核抽出物によって行った。[・−32P]rGTPを転写反応液に加えるこ
とによって、放射能標識された転写物が得られた。使用した[・−32P]rGT
Pは、比活性が400Ci/mmol(10mCi/ml)であった。転写緩衝
液において、3mMのMgCl2、それぞれが400μMのrATP、rCTP
、rUTP、16μMのrGTP、0.4μMの[・−32P]rGTP、ならび
に実験に依存して、1fmolの線状化プラスミドDNA、および様々な量のd
sRNAを反応毎に用いた。各バッチを8.5μlの容量にH2Oで作製した。
反応液を注意深く混合した。転写を開始させるために、4UのHeLa核抽出物
を4μlの容量で加え、30℃で60分間インキュベーションした。反応を、3
0℃に暖められた87.5μlの停止混合液を加えることによって停止させた。
蛋白質を除くために、反応液を、TE緩衝液(pH5.0)を飽和させた100
μlのフェノール/クロロホルム/イソアミルアルコール(25:24:1 v
/v/v)で処理した。反応液を1分間激しく混合した。相分離のために、反応
液を12000rpmで約1分間遠心分離して、上部相を新しい反応容器に移し
た。それぞれの反応液を250μlのエタノールで処理した。反応液を十分に混
合し、ドライアイス/メタノールにおいて少なくとも15分間インキュベーショ
ンした。RNAを沈殿させるために、反応液を40℃において12000rpm
で20分間遠心分離した。上清を捨てた。ペレットを真空下で15分間乾燥して
、10μlのH2Oに再懸濁した。それぞれの反応液を10μlの変性ローディ
ング緩衝液で処理した。遊離GTPを、7M尿素を含む8%ゲルでの変性ポリア
クリルアミドゲル電気泳動によって、形成された転写物から分離した。HeLa
核抽出物を用いて転写させたときに形成されたRNA転写物を、変性ローディン
グ緩衝液中で90℃で10分間加熱して、10μl部分を、新しく洗浄したポケ
ットに直ちに加えた。電気泳動を40mAで行った。転写時に形成された放射活
性なssRNAの量を、電気泳動後、Instant Imagerの助けによって分析した。
【0044】 図3には、Instant Imagerによって示された、代表的な試験から得られた放射
活性なRNAが示されている。下記の転写反応液から得られたサンプルを加えた
: レーン1:テンプレートDNAなし、dsRNAなし; レーン1:50ngのテンプレートDNA、dsRNAなし; レーン3:50ngのテンプレートDNA、0.5μgのdsRNA YFP; レーン4:50ngのテンプレートDNA、1.5μgのdsRNA YFP; レーン5:50ngのテンプレートDNA、3μgのdsRNA YFP; レーン6:50ngのテンプレートDNA、5μgのdsRNA YFP; レーン7:テンプレートDNAなし、1.5μgのdsRNA YFP; レーン8:50ngのテンプレートDNA、dsRNAなし; レーン9:50ngのテンプレートDNA、0.5μgのdsRNA CMV5
: レーン10:50ngのテンプレートDNA、1.5μgのdsRNA CMV
5: レーン11:50ngのテンプレートDNA、3μgのdsRNA CMV5: レーン12:50ngのテンプレートDNA、5μgのdsRNA CMV5:
【0045】 転写物の量は、dsRNAを含まないコントロール反応液、および配列相同性
を有しないdsRNA YFPを用いた反応液と比較して、配列相同性を有する
dsRNAの存在下で著しく減少することが明らかにされた。レーン2における
陽性コントロールは、放射活性な転写物が、HeLa核抽出物を用いたインビト
ロ転写で形成されたことを示している。この反応液は、dsRNAの存在下でイ
ンキュベーションされた転写反応液と比較するために使用される。レーン3〜6
は、配列非特異的なdsRNA YFPの添加は形成された転写物の量に何ら影
響しなかったことを示している。レーン9〜12は、1.5μg〜3μgの間の
量の配列特異的なdsRNA CMV5の添加は形成された転写物の量を減少さ
せていることを示している。認められた影響が、dsRNAではなく、dsRN
Aの調製時に偶発に持ち込まれたと考えられる何らかの混入物に基づいていると
いうことを除外するために、さらなる対照実験を行った。一本鎖RNAを上記の
ように転写し、続いてRNase処理に付した。ssRNAが完全に分解された
ことが、未変性ポリアクリルアミドゲル電気泳動によって明らかにされた。この
反応液を、ハイブリダイゼーション反応液のように、フェノール抽出およびエタ
ノール沈殿に付し、続いてPE緩衝液に溶解した。これにより、RNAを含有し
ないが、dsRNAと同じ酵素および緩衝液で処理されたサンプルが得られた。
レーン8は、このサンプルの添加は転写に対する影響を何ら有していないことを
示している。従って、配列特異的なdsRNAを添加したときの転写物の減少は
、明らかにdsRNA自体の結果であり得る。ヒトの転写システムにおけるds
RNAの存在下での遺伝子転写量の減少は、問題とした遺伝子の発現が抑制され
たことを示している。この作用は、dsRNAによってもたらされる新規な機構
によるものであり得る。
【0046】 使用例2: これらのインビボ実験に使用される試験システムはマウスの繊維芽細胞株NI
H3T3(ATCC CRL−1658)であった。YFP遺伝子をマイクロイ
ンジェクションによって核内に導入した。YFPの発現を、配列相同性を有する
同時にコトランスフェクションされたdsRNAの影響のもとで調べた。このd
sRNA YFPは、315bpの長さにわたってYFP遺伝子の5’領域との
相同性を示す。dsRNA YFPの鎖のヌクレオチド配列は配列番号5に示さ
れる。蛍光顕微鏡による評価を、形成されたYFPの緑黄色蛍光に関して、イン
ジェクションの3時間後に行った。
【0047】 テンプレートプラスミドの構築、およびdsRNAの調製: プラスミドを、T7およびSP6のインビトロ転写によってYFP dsRN
Aを産生するためのテンプレートとして作用するように、使用例1に記載される
のと同じ原理に従って構築した。配列番号6に示されるプライマーEco_T7
_YFPおよび配列番号7に示されるプライマーBam_SP6_YFPを使用
して、所望する遺伝子フラグメントをPCRにより増幅し、上記記載と同様に使
用して、dsRNAを調製した。得られたdsRNA YFPは、配列非特異的
なコントロールとして使用例1で使用されたdsRNAと同一である。
【0048】 配列番号8に示されているRNAの3’末端において、C18リンカー基を介
して相補的なRNAの5’末端に化学的に連結されたdsRNAを調製した(L
−dsRNA)。この目的のために、ジスルフィド架橋で修飾されたシントンを
使用した。3’末端シントンは、ジスルフィド架橋を介して脂肪族リンカー基に
より3’炭素を介して固体支持体に結合される。1つのオリゴリボヌクレオチド
3’末端シントンに対して相補的である相補的なオリゴリボヌクレオチドの5’
末端シントンにおいては、5’−トリチル保護基がさらなる脂肪族リンカーおよ
びジスルフィド架橋を介して結合される。2つの一本鎖の合成、保護基の除去お
よび相補的なオリゴリボヌクレオチドのハイブリダイゼーションを行った後、形
成されたチオール基を空間的に接近させる。一本鎖は、その脂肪族リンカーおよ
びジスルフィド架橋を介して酸化によって互いに結合される。この後、HPLC
の助けによって精製が行われる。
【0049】 細胞培養物の調製: 細胞を、7.5%CO2雰囲気のもと、37℃で、培養皿において、4.5g
/lのグルコース、10%のウシ胎児血清を補充したDMEMでインキュベーシ
ョンし、コンフルエンスに達する前に継代した。細胞をトリプシン/EDTAに
よって剥がした。マイクロインジェクション用に調製するために、細胞をペトリ
皿に移し、微小コロニーが形成されるまでさらにインキュベーションした。
【0050】 マイクロインジェクション: マイクロインジェクションのために、培養皿をインキュベーターから約10分
間取り出した。約50個の核を、Carl Zeiss(Gottingen、ドイツ)から得られ
るAISマイクロインジェクションシステムを使用して、印を付けられた領域内
に反応あたり1個づつ注入した。続いて、細胞をさらに3時間インキュベーショ
ンした。マイクロインジェクションのために、先端の直径が0.5μm未満であ
るHilgenberg GmbH(Malsfeld、ドイツ)から得られるホウケイ酸塩ガラスキャ
ピラリーを準備した。マイクロインジェクションを、ナリシゲ科学機械(東京、
日本)から得られるマイクロマニピュレーターを使用して行った。注入時間は0
.8秒であり、圧力は約100hPaであった。トランスフェクションを、ベク
ターpcDNA3内にYFP遺伝子とともに約800bpのBamHI/Eco
RIフラグメントを含有するプラスミドpCDNA−YFPを使用して行った。
核に注入されたサンプルには、0.01μg/μlのpCDNA−YFPと、デ
キストラン−7000に結合させたテキサスレッドとが、14mMのNaCl、
3mMのKCl、10mMのKPO4[sic](pH7.5)に含まれた。約
100plのRNAを、1μMの濃度で、あるいはL−dsRNAの場合には3
75μMの濃度でさらに加えた。
【0051】 細胞を、568nmのテキサスレッドの励起波長または488nmのYFPの
励起波長の光で励起される蛍光顕微鏡で調べた。個々の細胞をデジタルカメラに
より記録した。図4a〜4eにはNIH3T3細胞の結果が示されている。図4
aに示される細胞にはセンス−YFP−ssRNAが注入され、図4bではアン
チセンス−YFP−ssRNAが注入され、図4cではdsRNA−YFPが注
入され、図4dではRNAは注入されず、図4eではL−dsRNAが注入され
た。
【0052】 左側の視野には、それぞれの場合、568nmでの励起による細胞の蛍光が示
されている。488nmの励起における同じ細胞の蛍光が右側に示されている。
示された細胞のすべてのテキサスレッドの蛍光は、注入液が核内に問題なく加え
られたこと、および注入が成功した細胞は3時間後も依然として生存していたこ
とを明らかにしている。死細胞はテキサスレッドの蛍光をもはや示さなかった。
【0053】 図4aおよび図4bのそれぞれの右側視野は、一本鎖RNAが核内に注入され
たとき、YFPの発現が認められるほど抑制されなかったことを示している。図
4cの右側視野は、dsRNA−YFPを注入した後、YFPの蛍光がもはや検
出できなかった細胞を示している。図4dは、コントロールとして、RNAが注
入されなかった細胞を示している。図4eに示される細胞は、YFP遺伝子に対
して配列相同性を有する領域を示すL−dsRNAが注入されたためにもはや検
出できないYFPの蛍光を示している。この結果は、より短いdsRNAでさえ
、一本鎖を化学的に結合することによって二本鎖が安定化された場合、哺乳動物
における遺伝子発現を特異的に抑制するために使用できることを明らかにしてい
る。
【0054】
【参考文献】
【配列表】
【図面の簡単な説明】
【図1】 図1は、T7ポリメラーゼおよびSP6ポリメラーゼを用いたイ
ンビトロ転写のためのプラスミドの概略図を示す。
【図2】 図2は、8%ポリアクリルアミドゲルでの電気泳動および臭化エ
チジウムで染色した後のRNAを示す。
【図3】 図3は、Instant Imagerによる、7M尿素を含む8%ポリアクリ
ルアミドゲルでの電気泳動後の放射活性なRNA転写物の一例を示す。
【図4】 図4a〜eは、マウス繊維芽細胞におけるテキサスレッドおよび
YFPの蛍光を示す。
【手続補正書】特許協力条約第34条補正の翻訳文提出書
【提出日】平成13年4月4日(2001.4.4)
【手続補正1】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考) A61K 48/00 A61P 25/28 A61P 25/28 31/12 31/12 35/00 35/00 C12N 15/00 ZNAA (81)指定国 EP(AT,BE,CH,CY, DE,DK,ES,FI,FR,GB,GR,IE,I T,LU,MC,NL,PT,SE),OA(BF,BJ ,CF,CG,CI,CM,GA,GN,GW,ML, MR,NE,SN,TD,TG),AP(GH,GM,K E,LS,MW,SD,SL,SZ,TZ,UG,ZW ),EA(AM,AZ,BY,KG,KZ,MD,RU, TJ,TM),AE,AL,AM,AT,AU,AZ, BA,BB,BG,BR,BY,CA,CH,CN,C R,CU,CZ,DE,DK,DM,EE,ES,FI ,GB,GD,GE,GH,GM,HR,HU,ID, IL,IN,IS,JP,KE,KG,KP,KR,K Z,LC,LK,LR,LS,LT,LU,LV,MA ,MD,MG,MK,MN,MW,MX,NO,NZ, PL,PT,RO,RU,SD,SE,SG,SI,S K,SL,TJ,TM,TR,TT,TZ,UA,UG ,US,UZ,VN,YU,ZA,ZW Fターム(参考) 4B024 AA01 BA80 CA11 DA02 DA03 EA04 FA02 FA20 GA13 4C076 AA19 AA95 CC01 CC27 CC35 CC41 FF02 FF65 4C084 AA13 NA03 NA13 NA14 ZA15 ZA16 ZB26 ZB33 4C086 AA01 AA02 EA16 MA01 MA04 NA03 NA13 NA14 ZA15 ZA16 ZA26 ZB33 4C087 AA01 AA02 BC83 CA12 NA03 NA13 NA14 ZA15 ZA16 ZB26 ZB27

Claims (112)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】 細胞中の一定の標的遺伝子の発現を抑制する方法であって、
    二本鎖構造のオリゴリボヌクレオチド(二本鎖RNA)が当該細胞へ導入され、当
    該二本鎖RNAの一方の鎖は、少なくともその一部が当該標的遺伝子に相補的な領
    域 Iを有している方法であり、 当該標的遺伝子に相補的な当該領域I が、49以下の連続するヌクレオチド対を
    有することを特徴とする方法。
  2. 【請求項2】 細胞中の一定の標的遺伝子の発現を抑制する方法であって、
    二本鎖構造の少なくとも一のオリゴリボヌクレオチド(二本鎖RNA)をコードす
    るベクターが当該細胞内へ導入され、当該二本鎖RNAの一の鎖は、少なくとも
    その一部が当該標的遺伝子に相補的な領域Iを有している方法であり、 当該標的遺伝子に相補的な当該領域Iは、49以下の連続するヌクレオチド対を
    有することを特徴とする方法。
  3. 【請求項3】 前記の二本鎖RNA又は前記のベクターが、ミセル構造、好
    ましくはリポソームにより封入されていることを特徴とする請求項1又は2に記
    載の方法。
  4. 【請求項4】 前記の二本鎖RNA又は前記のベクターが、天然のウイルス
    キャプシド、又は化学的若しくは酵素学的に産生された人工のキャプシド、又は
    それに由来する構造により封入されていることを特徴とする請求項1乃至3の何
    れか一項に記載の方法。
  5. 【請求項5】 前記の二本鎖RNAが10乃至1000、好ましくは15乃
    至49の塩基対を有することを特徴とする請求項1乃至4の何れか一項に記載の
    方法。
  6. 【請求項6】 前記の標的遺伝子が、真核細胞内で発現されることを特徴と
    する請求項1乃至5の何れか一項に記載の方法。
  7. 【請求項7】 前記の標的遺伝子が、以下の群: 癌遺伝子、サイトカイン遺伝子、Id-蛋白質遺伝子、 発生遺伝子、プリオン遺伝
    子 から選択されることを特徴とする請求項1乃至6の何れか一項に記載の方法。
  8. 【請求項8】 前記の標的遺伝子が、病原性の生物、好ましくはプラスモデ
    ィウムにおいて発現されることを特徴とする請求項1乃至7の何れか一項に記載
    の方法。
  9. 【請求項9】 前記の標的遺伝子が、ウイルス又はウイロイドの一部である
    ことを特徴とする請求項1乃至8の何れか一項に記載の方法。
  10. 【請求項10】 前記のウイルスが、ヒトに対して病原性であるウイルス
    又はウイロイドであることを特徴とする請求項9に記載の方法。
  11. 【請求項11】 前記のウイルス又はウイロイドが、動物に対して病原性で
    あるか又は植物病原体であるウイルス又はウイロイドであることを特徴とする請
    求項9に記載の方法。
  12. 【請求項12】 前記の二本鎖RNAの一部が、二本鎖の形態をとることを
    特徴とする請求項1乃至11の何れか一項に記載の方法。
  13. 【請求項13】 前記の二本鎖構造内部において相補的な領域IIが、二つの
    分離したRNA一本鎖によるか、又は位相的に閉じたRNA一本鎖、好ましくは
    環状の形態のものの自己相補的領域により形成されることを特徴とする請求項1
    乃至12の何れか一項に記載の方法。
  14. 【請求項14】 前記の相補的領域IIが、RNAヘアピンループの自己相補
    的領域により形成されることを特徴とする請求項1乃至13の何れか一項に記載
    の方法。
  15. 【請求項15】 前記のヌクレオチドが、前記の二本鎖構造の間のループ領
    域において化学的に修飾されていて、分解から保護されるようになっていること
    を特徴とする請求項1乃至14の何れか一項に記載の方法。
  16. 【請求項16】 前記の二本鎖RNAの末端が修飾されて、細胞内での分解
    又は一本鎖への分離が生じないようになっていることを特徴とする請求項1乃至
    15の何れか一項に記載の方法。
  17. 【請求項17】 ヌクレオチド対により形成される、前記の相補的領域IIの
    結合が、少なくとも1の、好ましくは2の更なる化学結合により増大しているこ
    とを特徴とする請求項1乃至16の何れか一項に記載の方法。
  18. 【請求項18】 前記の化学結合が、共有若しくはイオン結合、水素結合、
    疎水性相互作用、好ましくはファンデルワールス若しくはスタッキング相互作
    用、又は金属イオン配位により形成されることを特徴とする請求項1乃至17の
    何れか一項に記載の方法。
  19. 【請求項19】 前記の化学結合が、前記の相補的領域IIの少なくとも一方
    、好ましくは両方の末端において生じていることを特徴とする請求項1乃至18
    の何れか一項に記載の方法。
  20. 【請求項20】 前記の化学結合が、一以上の化合物群、好ましくは: ポリ (オキシホスフィニコオキシ-1,3-プロパンジオール)鎖及び/又はポリエ
    チレングリコール鎖により形成されることを特徴とする請求項1乃至19の何れ
    か一項に記載の方法。
  21. 【請求項21】 前記の化学結合が、プリンの代わりに、前記の相補的領域
    IIにおいて使用されるプリン類縁体により形成されることを特徴とする請求項1
    乃至20の何れか一項に記載の方法。
  22. 【請求項22】 前記の化学結合が、前記の相補的領域IIに導入されたアザ
    ベンゼン単位により形成されることを特徴とする請求項1乃至21の何れか一項
    に記載の方法。
  23. 【請求項23】 前記の化学結合が、ヌクレオチドの代わりに、前記の相補
    的領域IIにおいて使用される分枝したヌクレオチド類縁体により形成されること
    を特徴とする請求項1乃至22の何れか一項に記載の方法。
  24. 【請求項24】 以下の群: メチレンブルー;二官能性基、好ましくはビス(2-クロロエチル)アミン;N-アセ
    チル-N’-(p-グリオキシル-ベンゾイル) シスタミン;4-チオウラシル;ソラレ
    ン の少なくとも1を使用して前記の化学結合を生成することを特徴とする請求項1
    乃至23の何れか一項に記載の方法。
  25. 【請求項25】 前記の化学結合が、前記の二本鎖領域の末端にあるチオホ
    スホリル基により形成されることを特徴とする請求項1乃至24の何れか一項に
    記載の方法。
  26. 【請求項26】 前記の二本鎖領域の末端にある前記の化学結合が、三重ら
    せん結合により形成されることを特徴とする請求項1乃至25の何れか一項に記
    載の方法。
  27. 【請求項27】 前記の相補的領域II内の前記の二本鎖RNAのヌクレオチ
    ドの2’-ヒドロキシル基の少なくとも1つが、化学基、好ましくは2’-アミノ基
    又は2’-メチル基により置換されていることを特徴とする請求項1乃至26の何
    れか一項に記載の方法。
  28. 【請求項28】 前記の相補的領域IIの少なくとも1の鎖中の少なくとも
    1のヌクレオチドが、好ましくは2’-O、4’-C-メチレン架橋により化学的に修
    飾された糖環を有する、ロックされたヌクレオチドであることを特徴とする請求
    項1乃至27の何れか一項に記載の方法。
  29. 【請求項29】 前記の二本鎖RNA又は前記のベクターが、少なくとも1
    のウイルス外殻蛋白質であって、ウイルス起源のもの、それに由来するもの、又
    は合成されたものに、結合しているか、会合しているか、又は囲まれていること
    を特徴とする請求項1乃至28の何れか一項に記載の方法。
  30. 【請求項30】 前記の外殻蛋白質が、ポリオーマウイルス由来であること
    を特徴とする請求項1乃至29の何れか一項に記載の方法。
  31. 【請求項31】 前記の外殻蛋白質が、ポリオーマウイルスのウイルス蛋白
    質1(VP1)及び/又はウイルス蛋白質2(VP2)を含むことを特徴とする
    請求項1乃至30の何れか一項に記載の方法。
  32. 【請求項32】 キャプシド又はキャプシドタイプの構造が、外殻蛋白質よ
    り形成される場合に、1の側面が当該キャプシド又はキャプシドタイプの構造の
    内部に面していることを特徴とする請求項1乃至31の何れか一項に記載の方法
  33. 【請求項33】 前記の二本鎖RNAが、前記の標的遺伝子の第一次RNA
    転写産物又はプロセッシングされたRNA転写産物に相補的であることを特徴と
    する請求項1乃至32の何れか一項に記載の方法。
  34. 【請求項34】 前記の細胞が、脊椎動物の細胞、又はヒトの細胞であるこ
    とを特徴とする請求項1乃至33の何れか一項に記載の方法。
  35. 【請求項35】 互いに異なる少なくとも2つの二本鎖RNA又はそれらを
    コードする少なくとも1のベクターを、前記の細胞内に導入し、それぞれの二本
    鎖RNAの1の鎖の少なくとも一部が、それぞれの場合に、少なくとも2つの異
    なる標的遺伝子のうちの一つに相補的であることを特徴とする請求項1乃至34
    の何れか一項に記載の方法。
  36. 【請求項36】 前記の標的遺伝子の1つが、PKR遺伝子であることを特
    徴とする請求項1乃至35の何れか一項に記載の方法。
  37. 【請求項37】 二本鎖構造(二本鎖RNA)を有する少なくとも1のオリゴ
    リボヌクレオチドを有し、一定の標的遺伝子の発現を阻害するための薬剤であっ
    て、当該二本鎖RNAの1の鎖は、一部が少なくとも当該標的遺伝子に相補的な
    領域Iを有することを特徴とする薬剤。
  38. 【請求項38】 二本鎖構造(二本鎖RNA)を有する少なくとも1のオリ
    ゴリボヌクレオチドをコードする少なくとも1のベクターを有し、一定の標的遺
    伝子の発現を阻害するための薬剤であって、当該二本鎖RNAの1の鎖は、一部
    が少なくとも当該標的遺伝子に相補的な領域Iを有することを特徴とする薬剤。
  39. 【請求項39】 前記のベクター上の前記の二本鎖RNAが、ミセル構造、
    好ましくはリポソームにより封入されていることを特徴とする請求項37又は3
    8に記載の薬剤。
  40. 【請求項40】 前記の二本鎖RNA又は前記のベクターが、天然のウイル
    スキャプシド、又は化学的若しくは酵素学的に産生された人工のキャプシド、又
    はこれらに由来する構造によって封入されていることを特徴とする請求項37又
    は38に記載の薬剤。
  41. 【請求項41】 二本鎖RNAが、10乃至1000、好ましくは15乃至
    49の塩基対を有することを特徴とする請求項37乃至40の何れか一項に記載
    の薬剤。
  42. 【請求項42】 前記の標的遺伝子が、真核細胞内で発現することができる
    ことを特徴とする請求項37乃至41の何れ一項に記載の薬剤。
  43. 【請求項43】 前記の標的遺伝子が、下記の群: 癌遺伝子、サイトカイン遺伝子、Id-蛋白質遺伝子、発生遺伝子、プリオン遺伝
    子 から選択されることを特徴とする請求項37乃至42の何れか一項に記載の薬剤
  44. 【請求項44】 前記の標的遺伝子が、病原性の生物、好ましくはプラスモ
    ディウムにおいて発現することができることを特徴とする請求項37乃至43の
    何れか一項に記載の薬剤。
  45. 【請求項45】 前記の標的遺伝子が、ウイルス又はウイロイドの一部であ
    ることを特徴とする請求項37乃至44の何れか一項に記載の薬剤。
  46. 【請求項46】 前記のウイルスが、ヒトに病原性であるウイルス又はウイ
    ロイドであることを特徴とする請求項45に記載の薬剤。
  47. 【請求項47】 前記のウイルス又はウイロイドが、動物に対して病原性で
    あるか又は植物病原体であるウイルス又はウイロイドであることを特徴とする請
    求項45に記載の薬剤。
  48. 【請求項48】 前記の二本鎖RNAの一部が、二本鎖の形態をとることを
    特徴とする請求項37乃至47の何れか一項に記載の薬剤。
  49. 【請求項49】 前記の相補的領域Iが、49以下の連続するヌクレオチド
    を有することを特徴とする請求項37乃至48の何れか一項に記載の薬剤。
  50. 【請求項50】 前記の二本鎖構造内で相補的な領域IIが、二つの分離した
    RNA一本鎖によるか、又は位相的に閉じたRNA一本鎖、好ましくは環状の形
    態にあるものの自己相補的領域により形成されることを特徴とする請求項37乃
    至49の何れか一項に記載の薬剤。
  51. 【請求項51】 前記の相補的領域IIが、RNAヘアピンループの自己相補
    的領域により形成されることを特徴とする請求項37乃至50の何れか一項に記
    載の薬剤。
  52. 【請求項52】 前記のヌクレオチドが、前記の二本鎖構造の間のループ領
    域内において化学的に修飾されていて、分解から保護されるようになっているこ
    とを特徴とする請求項37乃至51の何れか一項に記載の薬剤。
  53. 【請求項53】 前記の二本鎖RNAの末端が修飾されて、細胞内での分解
    又は一本鎖への分離が生じないようになっていることを特徴とする請求項37乃
    至52の何れ一項に記載の薬剤。
  54. 【請求項54】 相補的ヌクレオチド対により引き起こされる、前記の相補
    的領域IIの結合が、少なくとも1の、好ましくは2の更なる化学結合により増大
    していることを特徴とする請求項37乃至53の何れか一項に記載の薬剤。
  55. 【請求項55】 前記の化学結合が、共有若しくはイオン結合、水素結合、
    疎水性相互作用、好ましくはファンデルワールス若しくはスタッキング相互作用
    、又は金属-イオン配位により形成されることを特徴とする請求項37乃至54
    の何れか一項に記載の薬剤。
  56. 【請求項56】 前記の化学結合が、前記の相補的領域IIの少なくとも一方
    の、好ましくは両方の末端において生じていることを特徴とする請求項37乃至
    55の何れか一項に記載の薬剤。
  57. 【請求項57】 前記の化学結合が、1以上の化合物群、好ましくは: ポリ(オキシホスフィニコオキシ-1,3-プロパンジオール)鎖及び/又はポリエチ
    レングリコール鎖により形成されていることを特徴とする請求項37乃至56の
    何れか一項に記載の薬剤。
  58. 【請求項58】 前記の化学結合が、プリンの代わりに、相補的領域IIにお
    いて使用されるプリン類縁体によって形成されていることを特徴とする請求項3
    7乃至57の何れか一項に記載の薬剤。
  59. 【請求項59】 前記の化学結合が、前記の相補的領域II内に導入されたア
    ザベンゼン単位により形成されていることを特徴とする請求項37乃至58の何
    れか一項に記載の薬剤。
  60. 【請求項60】 前記の化学結合が、ヌクレオチドの代わりに、前記の相補
    的領域IIにおいて使用される分枝ヌクレオチド類縁体により形成されることを特
    徴とする請求項37乃至59の何れか一項に記載の薬剤。
  61. 【請求項61】 下記の基: メチレンブルー;二官能性基、好ましくはビス(2-クロロエチル)アミン;N-アセ
    チル-N’-(p-グリオキシルベンゾイル)-シスタミン;4-チオウラシル; ソラレ
    ン の少なくとも1を使用して前記の化学結合が形成されていることを特徴とする請
    求項37乃至60の何れか一項に記載の薬剤。
  62. 【請求項62】 前記の化学結合が、前記の二本鎖領域の末端にあるチオホ
    スホリル基により形成されていることを特徴とする請求項37乃至61の何れか
    一項に記載の薬剤。
  63. 【請求項63】 前記の化学結合が、前記の二本鎖構造の末端にある三重ら
    せん結合であることを特徴とする請求項37乃至62の何れか一項に記載の薬剤
  64. 【請求項64】 前記の相補的領域II内の前記の二本鎖RNAのヌクレオチ
    ドの2’-ヒドロキシル基の少なくとも1つが、化学基、好ましくは2’-アミノ
    基又は2’-メチル基により置換されていることを特徴とする請求項37乃至6
    3の何れか一項に記載の薬剤。
  65. 【請求項65】 前記の相補的領域IIの少なくとも1の鎖中の少なくとも1
    のヌクレオチドが、好ましくは2’-O、4’-Cメチレン架橋により化学的に修
    飾された糖環を有する、ロックされたヌクレオチドであることを特徴とする請求
    項37乃至64の何れか一項に記載の薬剤。
  66. 【請求項66】 前記の二本鎖RNA又は前記のベクターが、少なくとも1
    のウイルス外殻蛋白質であって、ウイルス起源のもの、それに由来するもの、又
    は合成されたものに、結合しているか、会合しているか、又は囲まれていること
    を特徴とする請求項37乃至65の何れか一項に記載の薬剤。
  67. 【請求項67】 前記の外殻蛋白質が、ポリオーマウイルス由来であること
    を特徴とする請求項37乃至66の何れか一項に記載の薬剤。
  68. 【請求項68】 前記の外殻蛋白質が、ポリオーマウイルスのウイルス蛋白
    質1(VP1)及び/又はウイルス蛋白質2(VP2)を含むことを特徴とする
    請求項37乃至67の何れか一項に記載の薬剤。
  69. 【請求項69】 キャプシド又はキャプシドタイプの構造が、外殻蛋白質よ
    り形成される場合に、1の側面が当該キャプシド又はキャプシドタイプの構造の
    内部に面していることを特徴とする請求項37乃至68の何れか一項に記載の薬
    剤。
  70. 【請求項70】 前記の二本鎖RNAが、前記の標的遺伝子の第一次RNA
    転写産物又はプロセッシングされたRNA転写産物に相補的であることを特徴と
    する請求項37乃至69の何れか一項に記載の薬剤。
  71. 【請求項71】 前記の細胞が、脊椎動物の細胞、又はヒトの細胞であるこ
    とを特徴とする請求項37乃至70の何れか一項に記載の薬剤。
  72. 【請求項72】 互いに異なる少なくとも2つの二本鎖RNA又はそれらを
    コードする少なくとも1のベクターを、前記の薬剤内に含ませ、それぞれの二本
    鎖RNAの1の鎖の少なくとも一部が、それぞれの場合に、少なくとも2つの異
    なる標的遺伝子の一つに相補的であることを特徴とする請求項37乃至71の何
    れか一項に記載の薬剤。
  73. 【請求項73】 前記の標的遺伝子の1つが、PKR遺伝子であることを特
    徴とする請求項72に記載の薬剤。
  74. 【請求項74】 一定の標的遺伝子の発現を抑制するための薬剤を調製する
    ための、二本鎖構造(二本鎖RNA)を有するオリゴリボヌクレオチドの使用で
    あって、当該二本鎖RNAの1の鎖は領域Iを有し、その少なくとも一部が当該
    標的遺伝子に相補的であることを特徴とする使用。
  75. 【請求項75】 一定の標的遺伝子の発現を抑制するための薬剤を調製する
    ための、二本鎖構造(二本鎖RNA)を有する少なくとも1のオリゴリボヌクレ
    オチドをコードするベクターの使用であって、当該二本鎖RNAの1の鎖は領域
    Iを有し、その少なくとも一部が当該標的遺伝子に相補的であることを特徴とす
    る使用。
  76. 【請求項76】 前記の二本鎖RNA又は前記のベクターが、ミセル構造、
    好ましくはリポソームにより封入されていることを特徴とする請求項74又は7
    5に記載の使用。
  77. 【請求項77】 前記の二本鎖RNA又は前記のベクターが、天然のウイル
    スキャプシド、又は化学的若しくは酵素学的に産生された人工のキャプシド、又
    はそれに由来する構造により封入されていることを特徴とする請求項74又は7
    5に記載の使用。
  78. 【請求項78】 二本鎖RNAが、10乃至1000、好ましくは15乃至
    49の塩基対を有することを特徴とする請求項74乃至77の何れか一項に記載
    の使用。
  79. 【請求項79】 前記の標的遺伝子が、真核細胞内で発現できることを特徴
    とする請求項74乃至78の何れか一項に記載の使用。
  80. 【請求項80】 前記の標的遺伝子が、以下の群: 癌遺伝子、サイトカイン遺伝子、Id-蛋白質遺伝子、発生遺伝子、プリオン遺伝
    子 から選択されることを特徴とする請求項74乃至79の何れか一項に記載の使用
  81. 【請求項81】 前記の標的遺伝子が、病原性の生物、好ましくはプラスモ
    ディウムにおいて発現できることを特徴とする請求項74乃至80の何れか一項
    に記載の使用。
  82. 【請求項82】 前記の標的遺伝子が、ウイルス又はウイロイドの一部であ
    ることを特徴とする請求項74乃至81の何れか一項に記載の使用。
  83. 【請求項83】 前記のウイルスが、ヒトに病原性であるウイルス又はウイ
    ロイドであることを特徴とする請求項82に記載の使用。
  84. 【請求項84】 前記のウイルス又はウイロイドが、動物に対して病原性で
    あるか又は植物病原体であるウイルス又はウイロイドであることを特徴とする請
    求項82に記載の使用。
  85. 【請求項85】 前記の二本鎖RNAの一部が、二本鎖の形態をとることを
    特徴とする請求項74乃至84の何れか一項に記載の使用。
  86. 【請求項86】 前記の二本鎖構造内部において相補的な領域IIが、二つの
    分離したRNAの一本鎖によるか、又は位相的に閉じたRNA一本鎖、好ましく
    は環状の形態のものの自己相補的な領域により形成されることを特徴とする請求
    項74乃至85に記載の使用。
  87. 【請求項87】 前記の相補的領域IIが、RNAヘアピンループの自己相補
    的領域により形成されることを特徴とする請求項74乃至86の何れか一項に記
    載の使用。
  88. 【請求項88】 前記のヌクレオチドが、前記の二本鎖構造の間のループ領
    域において化学的に修飾されていて、分解から保護されるようになっていること
    を特徴とする請求項74乃至87の何れか一項に記載の使用。
  89. 【請求項89】 前記の二本鎖RNAの末端が修飾されて、細胞内での分解
    又は一本鎖への分離が生じないようになっていることを特徴とする請求項74乃
    至88の何れか一項に記載の使用。
  90. 【請求項90】 相補的ヌクレオチド対により形成される、前記の相補的領
    域IIの結合が、少なくとも1の、好ましくは2の更なる化学結合により増大して
    いることを特徴とする請求項74乃至89の何れか一項に記載の使用。
  91. 【請求項91】 前記の化学結合が、共有若しくはイオン結合、水素結合、
    疎水性相互作用、好ましくはファンデルワールス若しくはスタッキング相互作
    用、又は金属イオン配位により形成されることを特徴とする請求項74乃至90
    の何れか一項に記載の使用。
  92. 【請求項92】 前記の化学結合が、前記の相補的領域IIの少なくとも一方
    、好ましくは両方の末端において生じていることを特徴とする請求項74乃至9
    1の何れか一項に記載の使用。
  93. 【請求項93】 前記の化学結合が、一以上の化合物群、好ましくは: ポリ (オキシホスフィニコオキシ-1,3-プロパンジオール)鎖及び/又はポリエ
    チレングリコール鎖により形成されることを特徴とする請求項74乃至92の何
    れか一項に記載の使用。
  94. 【請求項94】 前記の化学結合が、プリンの代わりに、前記の相補的領域
    IIにおいて使用されるプリン類似体により形成されることを特徴とする請求項7
    4乃至93の何れか一項に記載の使用。
  95. 【請求項95】 前記の化学結合が、前記の相補的領域IIに導入されたアザ
    ベンゼン単位により形成されることを特徴とする請求項74乃至94の何れか一
    項に記載の使用。
  96. 【請求項96】 前記の化学結合が、ヌクレオチドの代わりに、前記の相補
    的領域IIにおいて使用される分枝したヌクレオチド類縁体により形成されること
    を特徴とする請求項74乃至95の何れか一項に記載の使用。
  97. 【請求項97】 以下の群: メチレンブルー;二官能性基、好ましくはビス(2-クロロエチル)アミン;N-アセ
    チル-N’-(p-グリオキシル-ベンゾイル) シスタミン;4-チオウラシル;ソラレ
    ン の少なくとも1を使用して前記の化学結合を生成することを特徴とする請求項7
    4乃至96の何れか一項に記載の使用。
  98. 【請求項98】 前記の化学結合が、前記の二本鎖領域の末端にあるチオホ
    スホリル基により形成されることを特徴とする請求項74乃至97の何れか一項
    に記載の使用。
  99. 【請求項99】 前記の二本鎖領域の末端にある前記の化学結合が、三重ら
    せん結合により形成されることを特徴とする請求項74乃至98の何れか一項に
    記載の使用。
  100. 【請求項100】 前記の相補的領域II内の前記の二本鎖RNAのヌクレオ
    チドの2’-ヒドロキシル基の少なくとも 1つが、化学基、好ましくは2’-アミ
    ノ基又は2’-メチル基により置換されていることを特徴とする請求項74乃至9
    9の何れか一項に記載の使用。
  101. 【請求項101】 前記の相補的領域IIの少なくとも1の鎖中の少なくとも
    1のヌクレオチドが、好ましくは2’-O、4’C-メチレン架橋により化学的に修
    飾された糖環を有する、ロックされたヌクレオチドであることを特徴とする請求
    項74乃至100の何れか一項に記載の使用。
  102. 【請求項102】 前記の二本鎖RNA又は前記のベクターが、少なくとも
    1のウイルス外殻蛋白質であって、ウイルス起源のもの、それに由来するもの、
    又は合成されたものに、結合しているか、会合しているか、又は囲まれているこ
    とを特徴とする請求項74乃至101の何れか一項に記載の使用。
  103. 【請求項103】 前記の外殻蛋白質が、ポリオーマウイルス由来であるこ
    とを特徴とする請求項74乃至102の何れか一項に記載の使用。
  104. 【請求項104】 前記の外殻蛋白質が、ポリオーマウイルスのウイルス蛋
    白質1(VP1)及び/又はウイルス蛋白質2(VP2)を含むことを特徴とす
    る請求項74乃至103の何れか一項に記載の使用。
  105. 【請求項105】 キャプシド又はキャプシドタイプの構造が、外殻蛋白質
    より形成される場合に、1の側面が当該キャプシド又はキャプシドタイプの構造
    の内部に面していることを特徴とする請求項74乃至104の何れか一項に記載
    の使用。
  106. 【請求項106】 前記の二本鎖RNAが、前記の標的遺伝子の第一次RN
    A転写産物又はプロセッシングされたRNA転写産物に相補的であることを特徴
    とする請求項74乃至105の何れか一項に記載の使用。
  107. 【請求項107】 前記の細胞が、脊椎動物の細胞、又はヒトの細胞である
    ことを特徴とする請求項74乃至106の何れか一項に記載の使用。
  108. 【請求項108】 互いに異なる少なくとも2つの二本鎖RNA又はそれら
    をコードする少なくとも1のベクターを使用し、それぞれの二本鎖RNAの1の
    鎖の少なくとも一部が、それぞれの場合に、少なくとも2つの異なる標的遺伝子
    の一つに相補的であることを特徴とする請求項74乃至107の何れか一項に記
    載の使用。
  109. 【請求項109】 前記の標的遺伝子の1つが、PKR遺伝子であることを
    特徴とする請求項108に記載の使用。
  110. 【請求項110】 前記の薬剤を、生物の間質内又は血流内に注射して治療
    を行うことを特徴とする請求項74乃至109の何れか一項に記載の使用。
  111. 【請求項111】 前記の二本鎖RNA又はそれをコードする前記のベクタ
    ーが、細菌又は微生物内へ取り込まれることを特徴とする請求項74乃至110
    の何れか一項に記載の使用。
  112. 【請求項112】 前記の相補的領域Iが、49以下の連続するヌクレオチ
    ド対を有することを特徴とする請求項74乃至111の何れか一項に記載の使用
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