JPH01155242A - クロマトスキャナのデータ処理方法 - Google Patents

Abstract

(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。

Description

【発明の詳細な説明】 （産業上の利用分野） 本発明は薄層クロマト（Ｔ　Ｌ　Ｃ）プレートや電気泳
動ゲルなどのサンプルプレートに展開されたパターンを
光学的に走査して解析するクロマトスキャナにおいて、
８Ｉ！ｌ定データを処理する方法に関するものである。

特に本発明は、１枚のＴＬＣプレートなどに同時に展開
された複数レーンのクロマトグラムをデータ解析するの
に好都合な方法に関するものである。

（従来の技術） １枚のサンプルプレートには複数のサンプルが同時に展
開され、複数のレーンが存在している。

特定のスポットを定量する場合には検量線が必要であり
、また、ＳＤＳ電気泳動や等電点電気泳動においては、
スポットの位置と分子量やＰＩ（等電点）との対応関係
を示す分子量カーブやＰＩカーブが必要である。

同一のサンプルプレートに展開されたパターン対しては
、−度に連続して測定を行なうのが通常であり、オート
レーンスキャンが行なわれている。

オートレーンスキャンで得られる測定データには、第６
図に示されるように、レーンごとに連続した番号がつけ
られ、記憶装置に記憶されていく。第６図で、１は装置
に固有のルートディレクトリ。

ファイル１，２はシングルレーンスキャンで得られたデ
ータのファイル、レーン１〜レーンｎ１は一サンプルプ
レートをオートレーンスキャンして得られたデータのフ
ァイル、レーン１〜レーンｎ２は他のサンプルプレート
をオートレーンスキャンして得られたデータのファイル
である。

測定データに検量線１分子量カーブ、ＰＩカーブなどを
適用してデータ処理を行なうときは、測定データをル−
ンずつ呼び出し、それらに検量線などを適用して処理を
行なっている。

（発明が解決しようとする問題点） サンプルプレートのクロマトグラムを検量線やその他の
データ処理にかける場合、ル−ンだけにデータ処理を実
行するのは稀であり、一つのレーンのクロマトグラムに
必要な処理は同時に他のレーンのクロマトグラムに対し
ても施す必要があるのが殆んどである。すなわち、複数
のサンプルを同時泳動させるのはデータ処理した後の結
果をレーン間で比較検討するのが目的である場合が多い
からである。

従来は、１枚のサンプルプレートに展開された複数レー
ンのデータに対してレーンごとにデータ処理を施してい
るので、その作業が煩しいという問題がある。

本発明は同一のサンプルプレート上で測定されたデータ
に対して一様にデータ処理を施すようにしてデータ処理
の煩わしさを除き、また、ファイルの管理も容易にする
ことのできるデータ処理方法を提供することを目的とす
るものである。

（問題点を解決するための手段） 本発明の方法では、測定データを処理するコンピュータ
システムとしてディレクトリによるファイル管理能力を
もつものを使用し、同一サンプルプレートの複数レーン
の走査による測定データには同一ディレクトリを作成し
て記憶し、データ処理時には同一ディレクトリをもつ測
定データに対して同一処理を施す。

（作用） 第１図に本発明により記憶装置に記憶されたデータのデ
ィレクトリ構造を示す。

ｌは特定のクロマトスキャナ装置に固有のディレクトリ
（ルートディレクトリ）であり、サブディレクトリ２，
３はＴＬＣプレートや電気泳動ゲルなどのサンプルプレ
ートごとのディレクトリである。ファイルｌオファイル
２と示されているのはシングルレーンスキャンで得られ
たデータのファイルである。サブディレクトリ２にはオ
ートレーンスキャンで測定されたーサンプルプレートの
レーン１からレーンｎ１までのデータが記憶されている
。サブディレクトリ３にはオートレーンスキャンで測定
された他のサンプルプレートのレーン１からレーンｎ２
までのデータが記憶されている。

このように記憶されたデータに対し、例えばサブディレ
クトリ２に族するレーンｌからレーンｎ１までの全ての
データに例えば検量線処理を施す場合は、ディレクトリ
名を指定することによってそのディレクトリ２内の全て
のレーン１〜レーンｎ１のデータに対して同じデータ処
理を施すことができる。

ディレクトリとオートレーンスキャンが１対１に対応し
ているので、ディレクトリを指定することで１回のオー
トレーンスキャンで作成された全てのクロマトグラムを
識別することができる。このように、オートレーンスキ
ャンで得られるクロマトグラムをディレクトリで管理す
ると好都合である。

（実施例） 第２図は本発明が適用されるクロマトスキャナの一例を
表わす。

４はＴＬＣプレートや電気泳動ゲルなどのサンプルプレ
ートであり、ＸＹステージ（図示略）に載せられている
。ＸＹステージはＸモータ５とＹモータ６によってＸ方
向とＹ方向に移動させられる。７は光源であり、光源７
からの光はサンプルプレート４を透過（又は反射）して
受光部８により検出される。９は受光部８が検出した信
号から吸光度などを算出する信号処理部である。

Ｘモータ５、Ｙモータ６を制御し、信号処理部９からの
測定データを入力してデータ処理を行なうためにマイク
ロコンピュータシステム１０が設けられている、マイク
ロコンピュータシステム１０にはＲＯＭ１２に記憶され
たプログラムと設定されたパラメータに従がってモータ
５，６を制御するとともに、信号処理部９からのデータ
処理を行なう制御部１１と、データ処理の演算を行なう
演算部１３と、オートレーンスキャンのパラメータを記
憶したり、信号処理部９から取り込んだデータを一時記
憶するＲＡＭ１４が設けられている。

マイクロコンピュータシステム１０にはデータ処理され
た後のデータを保存するための外部記憶装置１５（例え
ばプロッピーディスク装置など）、オートレーンスキャ
ンのパラメータを入力したり、対話形式でデータ処理を
行なうためのキーボード１６、表示を行なうＣＲＴ１７
が接続されている。

第３図にオートレーンスキャンのパラメータを示す。

サンプルプレート４上にはレーンＬｔ”Ｌｎに沿ってス
ポット４ａが展開されている。レーンの数はｎである。

パラメータとしてはオートレーンスキャンを開始するス
タート位置のＸｏ、Ｙｏ、Ｙ方向の終了点Ｙｅ、レーン
数ｎ及びレーン間距離ｄである。

オートレーンスキャンはスタート位［（Ｘｏ。

Ｙｏ）からレーンＬ＋に沿ってＹ方向にＹｅまで走査し
、次のレーンＬ２の開始点（Ｘ　ｌ、　Ｙ　ｏ）に移動
して次のレーンＬ２の走査を行なう。レーンＬ１からレ
ーンＬｎまで順番に測定し、ファイルを作る。

次に、オートレーンスキャンのディレクトリによる管理
を第４図により説明する。

まず、オートレーンスキャンのパラータＸｏ。

Ｙｏ、Ｙａ、ｎ、ｄを読み取り（ステップＳｌ）、ディ
レクトリ名が入力されるとそのディレクトリが既に存在
するかどうかをチエツクする（ステップＳ２．Ｓ３）。

もし既に存在してる場合はエラーメツセージを出力して
終了する（ステップｓ５）。

そのディレクトリが既に存在するものでない盛合、入力
されたディレクトリ名に基づいてディレクトリを作成す
る（ステップＳ６）。

レーン番号Ｎを１とし、ファイル名を作成する（ステッ
プ８７〜Ｓ９）。

ファイル名は、例えば ＊＊＊＊＊＊＊＊￥ＬＡＮＥ＊＊・ＣＨＴのように作成
される。ここで ＊＊＊＊＊＊＊＊はディレクトリ名であり、次の￥ＬＡ
ＮＥ＊＊はレーン番号であり１次の・ＣＨＴはファイル
の種類を表わしている。

次に、オートレーンスキャンを開始するためにＸＹステ
ージのＸ位置を次の式 ％式％） で表わされる位置、Ｙ位置をＹＯへ移動し、Ｙ方向の終
了点Ｙｅまで走査を行なってデータを取り込む（ステッ
プ８１０〜５１２）。取り込んだデータを外部記憶装置
１５に記憶する（ステップＳユ３）。その後、レーン番
号Ｎに１を加算して順次次のレーンの走査を行なってい
く（ステップ５１４）。全てのレーンの走査が行なわれ
ると終了する。

次に、データ処理の例を第５図に基づいて説明する。

データ処理は例えば検量線の適用、マーカ処理、拡大縮
小、エクスパンド、平行移動などであり。

いずれの処理の場合も同様である。

データ処理を行なうことが指定され（ステップ５２０）
、ディレクトリ名が指定される（ステップ５２１）と、
指定されたディレクトリ内でクロマトのエクステンショ
ンをもつもののリストを作る（ステップ５２２）、上記
の例ではファイル名に・ＣＲＴをもつもののリストが作
られる。

データ処理後のファイルを新たにディレクトリ名を作成
して記憶するのか１元のディレクトリに重ね書きするの
かが入力されるのを待つ（ステップ５２３）。

重ね書きが指定された場合は、データ処理後のファイル
を記憶するストア・ディレクトリ名を初めに指定したも
のとする（ステップ５２４）。

その後、ファイルリストから順次ファイルを呼び出して
ＲＡＭにロードし、データ処理を実行する（ステップ８
２５〜８２８）。データ処理後のファイルを同じファイ
ル名でストア・ディレクトリに記憶する（ステップ５２
９）、リストアツブされたファイルが終了するまでこの
データ処理を実行する。

一方、重ね書きしないことが指定された場合は新たにデ
ィレクトリ名が入力されるのを待って（ステップＳ２３
，５３０）、その入力されたディレクトリ名が既に存在
するかどうかをチエツクする（ステップ５３１）、存在
すればエラーメツセージを出力して終了する（ステップ
５３３）。

存在しなければそのディレクトリ名に基づいて新たにデ
ィレクトリを作成し、新たに作成したディレクトリをス
トア・ディレクトリとする（ステップＳ３２，８３４，
５３５）。

その後、リストアツブされたファイルについて順次デー
タ処理を実行していく（ステップ５２５〜５２９）。

（発明の効果） 本発明では測定データを処理するコンピュータシステム
としてディレクトリによるファイル管理能力をもつもの
を使用し、同一サンプルプレートの複数レーンの走査に
よる測定データには同一ディレクトリを作成して記憶し
、データ処理時には同一ディレクトリをもつ測定データ
に対して同一処理を施すようにしたので、オートレーン
スキャンされたデータのファイルの管理と識別が容易に
なる。

同一サンプルプレートに展開された複数レーンのクロマ
トグラムに対して一様に適用することを必要とするデー
タ処理に対しては、ファイルを１つ１つ指定する必要が
ないので、データ処理が容易になる。

【図面の簡単な説明】

第１図は本発明により記憶されるファイルのディレクト
リ構造を示す図、第２図は本発明が適用されるクロマト
スキャナの一例を示す構成図、第３図はオートレーンス
キャンのパラメータを示す図、第４図は本発明における
オートレーンスキャンのディレクトリによる管理を示す
ブロー図、第５図は本発明によるデータ処理の手順を示
すフロー図、第６図は従来のデータ処理方法におけるフ
ァイルの記憶様式を示す図である。 ４・・・・・・サンプルプレート・ ５．６・・・・・・モータ、 ８・・・・・・受光部、 ９・・・・・・信号処理部、 １０・・・・・・マイクロコンピュータシステム、１５
・・・・・・外部記憶装置。 特許出願人　株式会社島津製作所

Claims (1)

【特許請求の範囲】
1. 測光部、測光信号から吸光度を算出する信号処理部、測
   定データを記憶する記憶部、及びＸＹステージを制御す
   るとともに、測定データを処理するコンピュータシステ
   ムを備えたクロマトスキャナにおいて、コンピュータシ
   ステムとしてディレクトリによるファイル管理能力をも
   つものを使用し、同一サンプルプレートの複数レーンの
   走査による測定データには同一ディレクトリを作成して
   記憶し、データ処理時には同一ディレクトリをもつ測定
   データに対して同一処理を施すことを特徴とするデータ
   処理方法。