JP6526767B2 - Pkm2調節因子およびそれらの使用方法 - Google Patents
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Description
発明の分野
本発明は、一般的に、新規のPKM2調節因子および種々のがんの処置のためのそれらの使用に関する。
がん細胞の増殖には、細胞内で核酸、タンパク質および脂質の各々を複製するために生合成による充分な構築ブロック(すなわち、バイオマス)の蓄積が必要とされる。腫瘍が大きくなるにつれて、栄養分と酸素の必要量は、新生が不充分な血管の供給能を超えるようになり得る。このような課題に直面するため、がん細胞によって代謝経路が調整されることになり得るはずである。
簡単には、本発明は、PKM2調節因子としての活性を有する化合物(その立体異性体、互変異性体 薬学的に許容され得る塩およびプロドラッグを含む)、ならびに種々のがんの処置のためのかかる化合物の使用に関する。特定の実施形態において、該化合物はPKM2の活性化因子である。
を有する化合物またはその立体異性体、薬学的に許容され得る塩、互変異性体もしくはプロドラッグを提供する。
本発明の実施形態において、例えば以下の項目が提供される。
(項目1)
下記の構造(I)
を有する化合物またはその立体異性体、薬学的に許容され得る塩、互変異性体もしくはプロドラッグであって、ここで、
R1はシクロアルキル、ハロアルキル、ハロ、ニトリルまたはアミノであり、
R2はHまたはハロであり、
R3はアルキル、アルコキシアルキル、シクロアルコキシアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクリル、ヘテロシクリルアルキル、ヘテロアリール、ヘテロアリールアルキルまたはアラルキルであり、
R4はアリールまたはヘテロアリールであり、
R5およびR6は各々独立して、Hまたはアルキルである、
化合物またはその立体異性体、薬学的に許容され得る塩、互変異性体もしくはプロドラッグ。
(項目2)
R4がアリールである、項目1に記載の化合物。
(項目3)
R4がヘテロアリールである、項目1に記載の化合物。
(項目4)
R4が、下記の構造(A)、(B)または(C)
のうちの一つを有し、ここで、
Hは5員または6員の複素環式の環を表し;
XはO、N、N+−O−またはSであり、
YはCHまたはNであり、
R7およびR8は各々独立して、H、アルキル、アルコキシ、ハロ、ヒドロキシル、ヒドロキシルアルキル、アミノ、アミノアルキル、アルキルアミノアルキル、ニトリル、ニトロ、−O(CH2)mP(=O)(OH)2、アミノ酸エステルであり、
mおよびnは各々独立して、0または1であり、
ここで、すべての結合価が満たされている、
前記項目のいずれかに記載の化合物。
(項目5)
R4が構造(A)を有する、項目4に記載の化合物。
(項目6)
R7およびR8が各々独立して、H、ハロまたはアミノである、項目5に記載の化合物。
(項目7)
R4が下記の構造
を有する、前記項目のいずれかに記載の化合物。
(項目8)
R7がHまたはアミノである、項目7に記載の化合物。
(項目9)
R8がクロロまたはフルオロである、項目7または8に記載の化合物。
(項目10)
R4が、下記の構造
(項目11)
R4が構造(B)を有する、項目4に記載の化合物。
(項目12)
R4が、下記の構造
のうちの一つを有する、項目11に記載の化合物。
(項目13)
R7およびR8が各々、Hである、項目12に記載の化合物。
(項目14)
R7またはR8はハロまたはアルキルアミノアルキルである、項目12に記載の化合物。
(項目15)
R4が、下記の構造
のうちの一つを有する、項目1に記載の化合物。
(項目16)
R4が構造(C)を有する、項目4に記載の化合物。
(項目17)
R4が、下記の構造
のうちの一つを有する、項目16に記載の化合物。
(項目18)
R7およびR8が各々、Hである、項目17に記載の化合物。
(項目19)
R7またはR8はハロ、アミノまたはヒドロキシルアルキルである、項目17に記載の化合物。
(項目20)
R4が、下記の構造
のうちの一つを有する、項目1に記載の化合物。
(項目21)
R3が、下記の構造(D)、(E)または(F)
のうちの一つを有し、ここで、
QはCH2、O、NR13、CF2、またはS(O)wであり、
BはCH2、O、NR14、C(=O)または
であり、
R9、R11およびR13は各々独立して、Hまたはアルキルであり、
R10はH、ヒドロキシル、ハロ、アルコキシまたはアルキルであり、
R12はH、アミノまたはアルコキシであり、
R14はH、アルキルまたはアルキルスルホンであり、
q、vおよびwは各々独立して、0、1または2であり、
rおよびsは各々独立して、1または2であり、
tは1、2または3であり、
uは0、1、2または3である、
前記項目のいずれかに記載の化合物。
(項目22)
R3が構造(D)を有する、項目21に記載の化合物。
(項目23)
sが1である、項目22に記載の化合物。
(項目24)
sが2である、項目22に記載の化合物。
(項目25)
rが1である、項目23または24のいずれかに記載の化合物。
(項目26)
rが2である、項目23または24のいずれかに記載の化合物。
(項目27)
qが0である、項目23〜26のいずれかに記載の化合物。
(項目28)
qが1である、項目23〜26のいずれかに記載の化合物。
(項目29)
qが2である、項目23〜26のいずれかに記載の化合物。
(項目30)
R3が、下記の構造
のうちの一つを有する、項目1に記載の化合物。
(項目31)
R3が構造(E)を有する、項目21に記載の化合物。
(項目32)
QがCH2である、項目31に記載の化合物。
(項目33)
QがSO2である、項目31に記載の化合物。
(項目34)
QがOである、項目31に記載の化合物。
(項目35)
QがCHF2である、項目31に記載の化合物。
(項目36)
QがNR13である、項目31に記載の化合物。
(項目37)
R13がメチルまたはエチルである、項目35に記載の化合物。
(項目38)
R10およびR11が各々、Hである、項目31〜37のいずれかに記載の化合物。
(項目39)
R10がメチル、フルオロ、ヒドロキシルまたはメトキシである、項目31〜37のいずれかに記載の化合物。
(項目40)
R3が、下記の構造
のうちの一つを有する、項目1に記載の化合物。
(項目41)
R3が構造(F)を有する、項目21に記載の化合物。
(項目42)
BがCH2である、項目41に記載の化合物。
(項目43)
R12がHである、項目41または42のいずれかに記載の化合物。
(項目44)
R12がアルコキシである、項目41または42のいずれかに記載の化合物。
(項目45)
R12がメトキシ、エトキシまたはイソプロポキシである、項目41または42のいずれかに記載の化合物。
(項目46)
R3が、下記の構造
のうちの一つを有する、項目1に記載の化合物。
(項目47)
R3がアルコキシアルキルである、項目1に記載の化合物。
(項目48)
R3がアルキルである、項目1に記載の化合物。
(項目49)
前記アルキルが、ヒドロキシル、ハロ、アミノ、アルキルアミノ、アルコキシおよびアルキルスルホンから選択される一つまたは複数の置換基で置換されている、項目1に記載の化合物。
(項目50)
R3がヘテロアリールである、項目1に記載の化合物。
(項目51)
R3がシクロアルコキシアルキルである、項目1に記載の化合物。
(項目52)
R3がアラルキルである、項目1に記載の化合物。
(項目53)
R5およびR6が各々、Hである、前記項目のいずれかに記載の化合物。
(項目54)
R2がHである、前記項目のいずれかに記載の化合物。
(項目55)
R2がFである、項目1〜53のいずれかに記載の化合物。
(項目56)
R1がCF3である、前記項目のいずれかに記載の化合物。
(項目57)
R1がClである、項目1〜55のいずれかに記載の化合物。
(項目58)
R1がBrである、項目1〜55のいずれかに記載の化合物。
(項目59)
R1がシクロプロピルである、項目1〜55のいずれかに記載の化合物。
(項目60)
R1がニトリルである、項目1〜55のいずれかに記載の化合物。
(項目61)
R1がアミノである、項目1〜55のいずれかに記載の化合物。
(項目62)
前記化合物が下記の構造(Ia)
を有し、ここで、
R15はハロであり、
R16はHまたはNH2であり、
wは1または2である、
項目1に記載の化合物またはその立体異性体、薬学的に許容され得る塩、互変異性体もしくはプロドラッグ。
(項目63)
R15がクロロである、項目62に記載の化合物。
(項目64)
R15がフルオロである、項目62に記載の化合物。
(項目65)
R16がHである、項目62〜64のいずれか一項に記載の化合物。
(項目66)
R16がNH2である、項目62〜64のいずれか一項に記載の化合物。
(項目67)
wが1である、項目62〜66のいずれか一項に記載の化合物。
(項目68)
wが2である、項目62〜64のいずれか一項に記載の化合物。
(項目69)
前記化合物が下記の構造(Ib)
を有し、ここで、
R17はハロであり、
R18はHまたはNH2であり、
ZはCH2、O、NH、NR19、CHR20またはCF2であり、
R19はアルキルであり、
R20はアルコキシ、ヒドロキシルまたはハロであり、
xは0、1、2または3である、
項目1に記載の化合物またはその立体異性体、薬学的に許容され得る塩、互変異性体もしくはプロドラッグ。
(項目70)
R17がクロロである、項目69に記載の化合物。
(項目71)
R18がNH2である、項目69または70に記載の化合物。
(項目72)
ZがCHOHである、項目69〜71のいずれか一項に記載の化合物。
(項目73)
ZがCHOCH3である、項目69〜71のいずれか一項に記載の化合物。
(項目74)
ZがCHFである、項目69〜71のいずれか一項に記載の化合物。
(項目75)
ZがOである、項目69〜71のいずれか一項に記載の化合物。
(項目76)
xが1である、項目69〜75のいずれか一項に記載の化合物。
(項目77)
xが2である、項目69〜75のいずれか一項に記載の化合物。
(項目78)
前記化合物が下記の構造(Ic)
R21およびR22は各々独立して、Hまたはハロであり、
R23はHまたはアルキルであり、
yは1または2である、
項目1に記載の化合物またはその立体異性体、薬学的に許容され得る塩、互変異性体もしくはプロドラッグ。
(項目79)
R21がクロロである、項目78に記載の化合物。
(項目80)
R21がFである、項目78に記載の化合物。
(項目81)
R22がHである、項目78〜80のいずれか一項に記載の化合物。
(項目82)
R23がメチル、エチルまたはイソプロピルである、項目78〜81のいずれか一項に記載の化合物。
(項目83)
yが1である、項目78〜82のいずれか一項に記載の化合物。
(項目84)
yが2である、項目78〜82のいずれか一項に記載の化合物。
(項目85)
表1中の化合物から選択される、項目1に記載の化合物。
(項目86)
項目1〜85のいずれか一項に記載の化合物またはその立体異性体、薬学的に許容され得る塩もしくはプロドラッグおよび薬学的に許容され得る担体、希釈剤または賦形剤を含む、医薬組成物。
(項目87)
PKM2の活性化を、それを必要とする哺乳動物において行う方法であって、前記哺乳動物に有効量の項目1〜85のいずれか一項に記載の化合物または項目86に記載の組成物を投与することを含む、方法。
(項目88)
前記PKM2の活性化ががんを処置するためのものである、項目87に記載の方法。
(項目89)
がんの処置を、それを必要とする哺乳動物において行う方法であって、前記哺乳動物に有効量の項目1〜85のいずれか一項に記載の化合物または項目86に記載の組成物を投与することを含む、方法。
(項目90)
前記がんが肺がんである、項目88または89に記載の方法。
以下の説明において、本発明の種々の実施形態の充分な理解をもたらすために特定の具体的かつ詳細な説明を示す。しかしながら、当業者には、本発明がこれらの詳細な説明を伴わずに実施され得ることが理解されよう。
(i)哺乳動物において、該疾患または状態が発生するのを予防すること(特に、このような哺乳動物が該状態に罹りやすいが、該状態を有するとは未だ診断されていない場合);
(ii)該疾患または状態を抑制すること、すなわち、その発症を止めること;
(iii)該疾患または状態を軽減すること、すなわち、該疾患または状態の後退をもたらすこと;あるいは
(iv)該疾患または状態に起因する症状を軽減すること、すなわち、根源的な疾患または状態に取り組まずに痛みを軽減することを含む。本明細書において使用される場合、用語「疾患」および「状態」は互換的に使用され得るか、あるいは、具体的な疾病または状態が既知の原因因子を有していなくともよく(その結果、病因がまだ解明されていない)、したがって、それはまだ疾患と認識されていないが単に望ましくない状態または症候群とだけ認識されており、臨床医によって多かれ少なかれ具体的な1セットの症状が確認されているという点で異なり得る。
上記のように、本発明の一実施形態において、PKM2調節因子(例えば、活性化因子)としての活性を有する化合物であって、下記の構造(I)
R1はシクロアルキル、ハロアルキル、ハロ、ニトリルまたはアミノであり、
R2はHまたはハロであり、
R3はアルキル、アルコキシアルキル、シクロアルコキシアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクリル、ヘテロシクリルアルキル、ヘテロアリール、ヘテロアリールアルキルまたはアラルキルであり、
R4はアリールまたはヘテロアリールであり、
R5およびR6は各々独立して、Hまたはアルキルである)
を有する化合物またはその立体異性体、薬学的に許容され得る塩、互変異性体もしくはプロドラッグを提供する。
Hは5員または6員の複素環式の環を表し、
XはO、N、N+−O−またはSであり、
YはCHまたはNであり、
R7およびR8は各々独立して、H、アルキル、アルコキシ、ハロ、ヒドロキシル、ヒドロキシルアルキル、アミノ、アミノアルキル、アルキルアミノアルキル、ニトリル、ニトロ、−O(CH2)mP(=O)(OH)2、アミノ酸エステルであり、
mおよびnは各々独立して、0または1であり、
ここで、すべての結合価が満たされている)
のうちの一つを有する。
QはCH2、O、NR13、CF2、またはS(O)wであり、
BはCH2、O、NR14、C(=O)または
R9、R11およびR13は各々独立して、Hまたはアルキルであり、
R10はH、ヒドロキシル、ハロ、アルコキシまたはアルキルであり、
R12はH、アミノまたはアルコキシであり、
R14はH、アルキルまたはアルキルスルホンであり、
q、vおよびwは各々独立して、0、1または2であり、
rおよびsは各々独立して、1または2であり、
tは1、2または3であり、
uは0、1、2または3である)
のうちの一つを有する。
R7およびR8は各々独立して、H、アルキル、アルコキシ、ハロ、ヒドロキシル、ヒドロキシルアルキル、アミノ、アミノアルキル、アルキルアミノアルキル、ニトリル、ニトロ、−O(CH2)mP(=O)(OH)2、アミノ酸エステルであり、
wは1または2である)
を有するものまたはその立体異性体、薬学的に許容され得る塩、互変異性体もしくはプロドラッグである。
R15はハロであり、
R16はHまたはNH2であり、
wは1または2である)
を有するものまたはその立体異性体、薬学的に許容され得る塩、互変異性体もしくはプロドラッグである。
QはCH2、O、NR13、CF2、またはS(O)wであり、
R7およびR8は各々独立して、H、アルキル、アルコキシ、ハロ、ヒドロキシル、ヒドロキシルアルキル、アミノ、アミノアルキル、アルキルアミノアルキル、ニトリル、ニトロ、−O(CH2)mP(=O)(OH)2、アミノ酸エステルであり、
R9、R11およびR13は各々独立して、Hまたはアルキルであり、
R10はH、ヒドロキシル、ハロ、アルコキシまたはアルキルであり、
wは0、1または2であり、
tは1、2または3である)
を有するものまたはその立体異性体、薬学的に許容され得る塩、互変異性体もしくはプロドラッグである。
R17はハロであり、
R18はHまたはNH2であり、
ZはCH2、O、NH、NR19、CHR20またはCF2であり、
R19はアルキルであり、
R20はアルコキシ、ヒドロキシルまたはハロであり、
xは0、1、2または3である)
を有するものまたはその立体異性体、薬学的に許容され得る塩、互変異性体もしくはプロドラッグである。
BはCH2、O、NR14、C(=O)または
R7およびR8は各々独立して、H、アルキル、アルコキシ、ハロ、ヒドロキシル、ヒドロキシルアルキル、アミノ、アミノアルキル、アルキルアミノアルキル、ニトリル、ニトロ、−O(CH2)mP(=O)(OH)2、アミノ酸エステルであり、
R12はH、アミノまたはアルコキシであり、
vは0、1または2であり、
uは0、1、2または3である)
を有するものまたはその立体異性体、薬学的に許容され得る塩、互変異性体もしくはプロドラッグである。
R21およびR22は各々独立して、Hまたはハロであり、
R23はHまたはアルキルであり、
yは1または2である)
を有するものまたはその立体異性体、薬学的に許容され得る塩、互変異性体もしくはプロドラッグである。
†は、適用可能な場合は塩形態を示す。TFA=トリフルオロ酢酸
他の実施形態において、本発明は、本明細書に記載の化合物のいずれかまたはその立体異性体、薬学的に許容され得る塩もしくはプロドラッグおよび薬学的に許容され得る担体、希釈剤または賦形剤を含む医薬組成物に関する。
種々の他の実施形態において、本発明は、上記の構造(I)の化合物のいずれかを、がんの処置を必要とする患者(例えば、哺乳動物)に投与することによるがんの処置方法に関する。他の実施形態において、本開示により、哺乳動物に有効量の上記の構造(I)の化合物のいずれかまたは該化合物を含む医薬を投与することを含む、PKM2の活性化を、それを必要とする哺乳動物において行う方法を提供する。例えば、PKM2の活性化は、肺がんなどのがんを処置するためのものであり得る。また、本発明は、後述する種々の他のがんの処置に対して提供される。
実施例1
N−(シクロブチルメチル)−N−(2−フルオロ−4−ヒドロキシベンジル)−3−(トリフルオロメチル)−1H−ピラゾール−5−カルボキサミドの合成
3−シアノ−N−(シクロブチルメチル)−N−(2−フルオロ−4−ヒドロキシベンジル)−1H−ピラゾール−5−カルボキサミドの合成
3−アミノ−N−(シクロブチルメチル)−N−(2−フルオロ−4−ヒドロキシベンジル)−1H−ピラゾール−5−カルボキサミドの合成
3−ブロモ−N−(シクロブチルメチル)−N−(1−フェニルエチル)−1H−ピラゾール−5−カルボキサミドの合成
3−トリフルオロメチル−N−(シクロブチルメチル)−N−(1−フェニルエチル)−1H−ピラゾール−5−カルボキサミドの合成
N−((1H−インドール−4−イル)メチル)−N−(シクロブチルメチル)−3−(トリフルオロメチル)−1H−ピラゾール−5−カルボキサミドの合成
3−トリフルオロメチル−N−(シクロブチルメチル)−N−((2−オキソ−2,3−ジヒドロベンゾ[d]チアゾール−7−イル)メチル)−1H−ピラゾール−5−カルボキサミドの合成
3−シアノ−N−(シクロブチルメチル)−N−((2−オキソ−2,3−ジヒドロベンゾ[d]チアゾール−7−イル)メチル)−1H−ピラゾール−5−カルボキサミドの合成
3−クロロ−N−(シクロブチルメチル)−N−((2−オキソ−2,3−ジヒドロベンゾ[d]チアゾール−7−イル)メチル)−1H−ピラゾール−5−カルボキサミドの合成
3−ブロモ−N−(シクロブチルメチル)−N−((2−オキソ−2,3−ジヒドロベンゾ[d]チアゾール−7−イル)メチル)−1H−ピラゾール−5−カルボキサミドの合成
N−(アゼチジン−3−イルメチル)−3−ブロモ−N−(2−フルオロ−4−ヒドロキシベンジル)−1H−ピラゾール−5−カルボキサミドの合成
4−((N−(シクロブチルメチル)−3−(トリフルオロメチル)−1H−ピラゾール−5−カルボキサミド)メチル)インドリン−1−カルボン酸tert−ブチルの合成
N−(2−フルオロベンジル)−N−(トランス−4−メトキシシクロヘキシル)−3−(トリフルオロメチル)−1H−ピラゾール−5−カルボキサミドの合成
(3−((N−(トランス−4−メトキシシクロヘキシル)−3−(トリフルオロメチル)−1H−ピラゾール−5−カルボキサミド)メチル)フェニル)カルバミン酸tert−ブチルの合成
N−(2−(1,4−ジオキサスピロ[4.5]デカン−8−イル)エチル)−N−(2−フルオロベンジル)−3−(トリフルオロメチル)−1H−ピラゾール−5−カルボキサミドの合成
N−(2−(1,4−ジオキサスピロ[4.5]デカン−8−イル)エチル)−N−(2−フルオロベンジル)−3−(トリフルオロメチル)−1H−ピラゾール−5−カルボキサミドの合成
N−(2−クロロベンジル)−N−(2−(1,1−ジオキシドテトラヒドロチオフェン−3−イル)エチル)−3−(トリフルオロメチル)−1H−ピラゾール−5−カルボキサミドの合成
N−(2−クロロベンジル)−N−(2−(1,1−ジオキシドテトラヒドロチオフェン−3−イル)エチル)−3−(トリフルオロメチル)−1H−ピラゾール−5−カルボキサミドの合成
N−(2−クロロベンジル)−N−(2−(1−オキシドテトラヒドロ−2H−チオピラン−4−イル)エチル)−3−(トリフルオロメチル)−1H−ピラゾール−5−カルボキサミドの合成
N−(2−クロロベンジル)−N−(2−(1,1−ジオキシドテトラヒドロ−2H−チオピラン−4−イル)エチル)−3−(トリフルオロメチル)−1H−ピラゾール−5−カルボキサミドの合成
N−(2−アミノ−6−フルオロベンジル)−N−(2−(1,1−ジオキシドテトラヒドロ−2H−チオピラン−4−イル)エチル)−3−(トリフルオロメチル)−1H−ピラゾール−5−カルボキサミドの合成
N−(2−クロロ−3−ニトロベンジル)−N−(2−(1,1−ジオキシドテトラヒドロチオフェン−3−イル)エチル)−3−(トリフルオロメチル)−1H−ピラゾール−5−カルボキサミドの合成
N−(3−アミノ−2−クロロベンジル)−N−(2−(1,1−ジオキシドテトラヒドロチオフェン−3−イル)エチル)−3−(トリフルオロメチル)−1H−ピラゾール−5−カルボキサミドの合成
リン酸二水素4−((3−クロロ−N−(シクロブチルメチル)−1H−ピラゾール−5−カルボキサミド)メチル)−3−フルオロフェニルの合成
リン酸二水素(4−((3−クロロ−N−(シクロブチルメチル)−1H−ピラゾール−5−カルボキサミド)メチル)−3−フルオロフェノキシ)メチル
(S)−2−アミノ−2−メチルブタン酸4−((3−クロロ−N−(シクロブチルメチル)−1H−ピラゾール−5−カルボキサミド)メチル)−3−フルオロフェニル
還元的アミノ化およびアミドの形成は、実施例1に記載の方法と同様の方法を用いて行った。
実施例170,N−(2−クロロ−4−フルオロベンジル)−N−(2−(ジエチルアミノ)エチル)−3−(トリフルオロメチル)−1H−ピラゾール−5−カルボキサミド。
3−クロロ−N−(シクロブチルメチル)−N−((3−フルオロピリジン−N−オキシド−4−イル)メチル)−1H−ピラゾール−5−カルボキサミド
3−クロロ−N−(シクロブチルメチル)−N−((3−((ジメチルアミノ)メチル)−1H−インドール−4−イル)メチル)−1H−ピラゾール−5−カルボキサミド。
N−((1H−インドール−4−イル)メチル)−N’−シクロブチル−3−(トリフルオロメチル)−1H−ピラゾール−5−カルボヒドラジド。
N−(2−クロロベンジル)−3−クロロ−N−(2−(ジエチルアミノ)エチル)−4−フルオロ−1H−ピラゾール−5−カルボキサミド。
ニトロ基を実施例96に示したように還元した。
boc−保護類似体を各実施例で使用した。脱保護は実施例11に記載のようにして行った。
Boc−保護類似体を各実施例で使用した。脱保護は実施例91に記載のようにして行った。
結晶学およびアッセイ
完全長のヒトPKM2酵素をPromab(Richmond,CA)から入手した。試薬はすべて、特に記載のない限り、Sigma(St.Louis,MO)から入手した。細胞系はATCC(Manassas,VA)から入手した。培地はInvitrogen(Grand Island,NY)から入手した。
化合物を2nM PKM2とともに反応バッファー(50mM Tris−HCl,pH8.0,200mM KCl,30mM MgCl2,2mM DTT,5%DMSO)中で、周囲温度にて30分間プレインキュベートした。次いで、ADPおよびPEPを、それぞれ75μMおよび15μMの終濃度まで添加した。30分後、ATPの形成をKinase Glo(Promega,Madison,WI)によって測定し、AC50値をPrism(GraphPad Software,Inc.,La Jolla,CA)を用いて測定した。
††%FBPは、FBP(100%に標準化)と比較したときの最大活性化の程度を示す。
公衆に利用可能なヒトPKM2(hPKM2)発現構築物をStructural Genomics Consortium(SGC)から入手した。His6−hPKM2を、NiNTA親和性捕捉およびHiload Superdex 16/60 S75サイズ排除クロマトグラフィーを用いて精製した。hPKM2を、ハンギングドロップ蒸気拡散を用いて結晶化させた。タンパク質溶液(20mg/ml,25mM Tris/HCl pH7.5,0.1M KCL,5mM MgCl2,10%(v/v)グリセロール)を1:1の比で、0.1M KCl、0.1M酒石酸アンモニウム、25%(w/v)PEG3350を含む貯留液と混合した。結晶を一晩、2mMの実施例244を含む溶液中に浸漬させ、凍結防止し、液体N2中でフラッシュ凍結させた。X線回折データは単一の結晶から100Kで、Beamline−ID29(ESRF)にて収集した。回折データを、XDS AutoPROC(Global Phasing製)およびSCALA(CCP4)(32)を用いて処理した。分子置換をCSEARCHのモデル3H6O(SGC)を用いて行い(33)、最大尤度の精密化は自動精密化プロトコル(34)および手作業精密化プロトコル(Refmac(CCP4)を使用)を混ぜたものを用いて行った。リガンドフィッティングは、Autosolve(33)および手作業再構築を用いて行った。非対称単位の四量体を構成する四つのPKM2単量体および四つの活性化因子リガンドの各々を独立した存在体として精密化した。
A549またはNCI−H1299肺がん細胞を20,000細胞/ウェル(96ウェルプレート)で、さらなるグルタミンもピルベートも無しでMEM培地+10%FBS中にプレーティングした。一晩のインキュベーション後、細胞をPBSで洗浄した後、MEM培地中で4時間のインキュベーションを行った。この細胞に化合物をDMSO中1%終濃度で添加した。30分後、細胞を溶解させ、溶解物のピルビン酸キナーゼ活性をPyruvate Kinase Activity Assay(BioVision,Milpitas,CA)によって測定した。最大速度の値を速度論データから計算し、Prism GraphPad Software(La Jolla,CA)を用いてAC50値を求めた。化合物の洗い流し実験は上記のとおりであったが、実施例244(469nM)との30分間のインキュベーション後、細胞をPBSで洗浄した後、MEM培地を表示した期間、添加し、溶解させ、ピルビン酸キナーゼ活性を測定した。結果を表3の表にまとめ、図6Aおよび6Bにグラフで示す。
HEK−293細胞をFLAG−PKM2(Origene,Rockville,MD)で安定的にトランスフェクトし、RPMI 1640培地中で増殖させた。細胞が6ウェルプレート内で80%コンフルエントになったら、細胞をPBSで洗浄し、その後、ピルベートを含まない最少必須培地(MEM)中で3時間のインキュベーションを行った。化合物をDMSO中1%終濃度で添加した。化合物との3時間のインキュベーション後、細胞を洗浄し、1%Triton X−100バッファー中で溶解させ、FLAG−M2−アガロースビーズ(Sigma,St.Louis,MO)を用いて免疫沈降させた。免疫沈降による溶離タンパク質をSDSゲル電気泳動によって分離した後、抗FLAG M2抗体(Sigma,St.Louis,MO)を用いてウエスタンブロッティングを行った。FLAG−PKM2と共免疫沈降した内在性PKM2の増加は四量体の形成を示す。図3Bおよび7参照。
細胞を5000細胞/ウェル(96ウェルプレート内)で、非必須アミノ酸なしのBME培地+5%透析血清中に播種した。18時間後、DMSOまたはDMSO中0.1%終濃度の化合物を添加した。72時間後、細胞のバイアビリティをATPliteアッセイによって測定し、Prism GraphPad Software(La Jolla,CA)を用いてEC50値を求めた(図4A)。
雌の胸腺欠損Nu/Nuマウスに、107個のA549−luc−C8細胞を1:1容積でMatrigelとともに右の後部脇腹に1日目に移植した後、生物発光測定および各群への無作為化を行った(図5Aの異種移植片研究ではn=15;図5Bの異種移植片試験ではn=18)。マウスにビヒクル(5%エタノール/7.5%DMSO/25%PEG400/12.5%Cremophor EL/50%D5水)またはビヒクル+化合物のいずれかを50mg/kgの用量で、1日1回、5日連続、2日あけて5週間、腹腔内投与した(1日目に開始)。腫瘍体積をカリパスでの測定によって決定した(移植後、7日目に開始)。31日目における統計学的有意性をスチューデントのt−検定によって決定した。上記実験の体重データを図9に示す。
Claims (32)
- 式E
[式中、
R1はシクロアルキル、ハロアルキル、ハロ、ニトリルまたはアミノであり、
R2はHまたはハロであり、
R3はアルキル、アルコキシアルキル、シクロアルコキシアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクリル、ヘテロシクリルアルキル、ヘテロアリール、ヘテロアリールアルキルまたはアラルキルであり、
R4はアリールまたはヘテロアリールであり、
R5は、Hまたはアルキルである]で表される化合物またはその立体異性体、薬学的に許容され得る塩、もしくは互変異性体であって、ここにおいて、
5−シクロプロピル−2H−ピラゾール−3−カルボン酸(3−エチル−3−アザ−ビシクロ[3.1.0]ヘキス−6−イルメチル)−(3−トリフルオロメトキシ−ベンジル)−アミド、およびその薬学的に許容される塩、ならびに
を除く、化合物またはその立体異性体、薬学的に許容され得る塩、もしくは互変異性体を製造する方法であって、下記工程(b)を含む製造方法:
(b)式C
の化合物またはその立体異性体、薬学的に許容され得る塩、もしくは互変異性体[式中、R3、R4、及びR5は、上で定義したとおりである]を、カップリング条件下で、
式D
の化合物またはその立体異性体、薬学的に許容され得る塩、もしくは互変異性体[式中、R1及びR2は、上で定義したとおりである]と反応させる工程。 - 前記工程(b)の前に、下記工程(a)をさらに含む、請求項1に記載の製造方法:
(a)式A
の化合物またはその立体異性体、薬学的に許容され得る塩、もしくは互変異性体[式中、R4、及びR5は、請求項1で定義したとおりである]を、還元的アミノ化条件で、
式B
- R4がアリールである、請求項1または2のいずれか一項に記載の製造方法。
- R4が、下記の構造(A)、(B)または(C)
のうちの一つを有し、ここで、
Hは5員または6員の複素環式の環を表し;
XはO、N、N+−O−またはSであり、
YはCHまたはNであり、
R7およびR8は各々独立して、H、アルキル、アルコキシ、ハロ、ヒドロキシル、ヒドロキシルアルキル、アミノ、アミノアルキル、アルキルアミノアルキル、ニトリル、ニトロ、−O(CH2)mP(=O)(OH)2、アミノ酸エステルであり、
mおよびnは各々独立して、0または1であり、
ここで、すべての結合価が満たされている、
請求項1〜3のいずれか一項に記載の製造方法。 - R4が前記構造(A)を有する、請求項4に記載の製造方法。
- R7およびR8が各々独立して、H、ハロまたはアミノである、請求項5に記載の製造方法。
- R4が下記の構造
を有する、請求項1〜6のいずれか一項に記載の製造方法。 - R7がHまたはアミノである、請求項7に記載の製造方法。
- R8がクロロまたはフルオロである、請求項7または8のいずれか一項に記載の製造方法。
- R4が、下記の構造
- R3が、下記の構造(D)、(E)または(F)
のうちの一つを有し、ここで、
QはCH2、O、NR13、CF2、またはS(O)wであり、
BはCH2、O、NR14、C(=O)または
であり、
R9、R11およびR13は各々独立して、Hまたはアルキルであり、
R10はH、ヒドロキシル、ハロ、アルコキシまたはアルキルであり、
R12はH、アミノまたはアルコキシであり、
R14はH、アルキルまたはアルキルスルホンであり、
q、vおよびwは各々独立して、0、1または2であり、
rおよびsは各々独立して、1または2であり、
tは1、2または3であり、
uは0、1、2または3である、
請求項1〜10のいずれか一項に記載の製造方法。 - R3が前記構造(D)を有する、請求項11に記載の製造方法。
- sが2である、請求項11または12のいずれか一項に記載の製造方法。
- rが2である、請求項11〜13のいずれか一項に記載の製造方法。
- qが2である、請求項11〜14のいずれか一項に記載の製造方法。
- R3が、下記の構造
のうちの一つを有する、請求項11に記載の製造方法。 - R5が、Hである、請求項1〜16のいずれか一項に記載の製造方法。
- R2がHである、請求項1〜17のいずれか一項に記載の製造方法。
- R1がCF3である、請求項1〜18のいずれか一項に記載の製造方法。
- 前記式Eが下記の構造(Ia)
を有し、ここで、
R15はハロであり、
R16はHまたはNH2であり、
wは1または2である、
請求項1に記載の製造方法。 - R15がフルオロである、請求項20に記載の製造方法。
- R16がNH2である、請求項20または21のいずれか一項に記載の製造方法。
- wが2である、請求項20〜22のいずれか一項に記載の製造方法。
- 前記式Eが、下記の化合物から選択される、請求項1に記載の製造方法
。 - 前記式Eが、N−(2−アミノ−6−フルオロベンジル)−N−(2−(1,1−ジオキシドテトラヒドロ−2H−チオピラン−4−イル)エチル)−3−(トリフルオロメチル)−1H−ピラゾール−5−カルボキサミドまたはその薬学的に許容され得る塩、もしくは互変異性体である、請求項1に記載の製造方法。
- 前記式Cが、(3−フルオロ−2−(((2−(テトラヒドロ−2H−チオピラン−4−イル)エチル)アミノ)メチル)フェニル)カルバミン酸tert−ブチルまたはその薬学的に許容され得る塩であり、
前記式Dが、3−トリフルオロ−1H−ピラゾール−5−カルボン酸またはその薬学的に許容され得る塩であり、
前記工程(b)において、(3−フルオロ−2−((N−(2−(テトラヒドロ−2H−チオピラン−4−イル)エチル)−3−(トリフルオロメチル)−1H−ピラゾール−5−カルボキサミド)メチル)フェニル)カルバミン酸tert−ブチルまたはその薬学的に許容され得る塩、を得ることを特徴とする、請求項25に記載の製造方法。 - 前記工程(b)の後に、下記工程(c)をさらに含む、請求項25または26のいずれか一項に記載の製造方法:
(c)前記工程(b)で得た、(3−フルオロ−2−((N−(2−(テトラヒドロ−2H−チオピラン−4−イル)エチル)−3−(トリフルオロメチル)−1H−ピラゾール−5−カルボキサミド)メチル)フェニル)カルバミン酸tert−ブチルまたはその薬学的に許容され得る塩を酸化して、(2−((N−(2−(1,1−ジオキシドテトラヒドロ−2H−チオピラン−4−イル)エチル)−3−(トリフルオロメチル)−1H−ピラゾール−5−カルボキサミド)メチル)−3−フルオロフェニル)カルバミン酸tert−ブチルまたはその薬学的に許容され得る塩を得る工程。 - 前記工程(c)の後に、下記工程(d)をさらに含む、請求項27に記載の製造方法:
(d)(2−((N−(2−(1,1−ジオキシドテトラヒドロ−2H−チオピラン−4−イル)エチル)−3−(トリフルオロメチル)−1H−ピラゾール−5−カルボキサミド)メチル)−3−フルオロフェニル)カルバミン酸tert−ブチルまたはその薬学的に許容され得る塩の保護基を除去し、N−(2−アミノ−6−フルオロベンジル)−N−(2−(1,1−ジオキシドテトラヒドロ−2H−チオピラン−4−イル)エチル)−3−(トリフルオロメチル)−1H−ピラゾール−5−カルボキサミドまたはその薬学的に許容され得る塩を得る工程。 - 前記工程(b)の前に、下記工程(a)をさらに含む、請求項25〜28のいずれか一項に記載の製造方法:
(a)(3−フルオロ−2−ホルミルフェニル)カルバミン酸tert−ブチルまたはその薬学的に許容され得る塩を、カップリング条件下で、
2−(テトラヒドロ−2H−チオピラン−4−イル)エタンアミンまたはその薬学的に許容され得る塩と反応させることにより、
(3−フルオロ−2−(((2−(テトラヒドロ−2H−チオピラン−4−イル)エチル)アミノ)メチル)フェニル)カルバミン酸tert−ブチルまたはその薬学的に許容され得る塩を得る工程。 - 前記工程(b)における前記カップリング条件が、EDCI及びHOAt、又はプロピルホスホン酸無水物を使用するカップリング条件であり、ここで、EDCIは1−(3−ジメチルアミノプロピル)−3−エチルカルボジイミドを指し、HOAtは1−ヒドロキシ−7−アザベンゾトリアゾールを指す、請求項1〜29のいずれか一項に記載の製造方法。
- 前記工程(a)における前記還元的アミノ化条件が、NaBH4を使用する還元的アミノ化条件である、請求項2〜30のいずれか一項に記載の製造方法。
- 前記工程(c)における前記酸化が、H2O2及びモリブデン酸アンモニウムを使用する酸化である、請求項27〜31のいずれか一項に記載の製造方法。
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