JP6174782B2 - 抗c5抗体および使用方法 - Google Patents
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Description
[1]C5に結合する単離された抗体であって、酸性pHにおいてよりも中性pHにおいて高いアフィニティでC5のβ鎖内のエピトープに結合する抗体。
[2] (a) 前記抗体が、C5 (配列番号:39)のアミノ酸D51およびK109に接触する;
(b) C5 (配列番号:39)に対する該抗体のアフィニティが、配列番号:39のE48A置換からなるC5変異体に対する該抗体のアフィニティよりも大きい;および
(c) 該抗体が、配列番号:39のアミノ酸配列からなるC5タンパク質にはpH7.4で結合するが、H72Y置換を有する配列番号:39のアミノ酸配列からなるC5タンパク質にはpH7.4で結合しない
からなる群より選択される特性を有する、[1]の抗体。
[3]C5への結合に関して、
(a) 配列番号:1のVHおよび配列番号:11のVL;
(b) 配列番号:5のVHおよび配列番号:15のVL;
(c) 配列番号:4のVHおよび配列番号:14のVL;
(d) 配列番号:6のVHおよび配列番号:16のVL;
(e) 配列番号:2のVHおよび配列番号:12のVL;
(f) 配列番号:3のVHおよび配列番号:13のVL;
(g) 配列番号:9のVHおよび配列番号:19のVL;
(h) 配列番号:7のVHおよび配列番号:17のVL;
(i) 配列番号:8のVHおよび配列番号:18のVL;
(j) 配列番号:10のVHおよび配列番号:20のVL
から選択されるVHとVLの対を含む抗体と競合する、[1]の抗体。
[4]C5のβ鎖のMG1-MG2ドメイン内のエピトープに結合する、[1]〜[3]のいずれかの抗体。
[5]C5のβ鎖(配列番号:40)のアミノ酸33-124からなる断片内のエピトープに結合する、[1]〜[4]のいずれかの抗体。
[6]アミノ酸47-57、70-76、および107-110からなる群より選択される少なくとも1つの断片を含む、C5のβ鎖(配列番号:40)内のエピトープに結合する、[1]〜[5]のいずれかの抗体。
[7]Glu48、Asp51、His70、His72、Lys109、およびHis110からなる群より選択される少なくとも1つのアミノ酸を含む、C5のβ鎖(配列番号:40)の断片内のエピトープに結合する、[1]〜[6]のいずれかの抗体。
[8]表2、7または8に記載される抗体と同じエピトープに結合する、[1]〜[7]のいずれかの抗体。
[9]C5の活性化を阻害する、[1]〜[8]のいずれかの抗体。
[10]C5変異体R885Hの活性化を阻害する、[1]〜[9]のいずれかの抗体。
[11]モノクローナル抗体である、[1]〜[10]のいずれかの抗体。
[12]ヒト抗体、ヒト化抗体、またはキメラ抗体である、[1]〜[11]のいずれかの抗体。
[13]C5に結合する抗体断片である、[1]〜[12]のいずれかの抗体。
[14] (a)アミノ酸配列DX1GYX2X3PTHAMX4X5(ここでX1はGまたはA、X2はV、QまたはD、X3はTまたはY、X4はYまたはH、X5はLまたはYである)(配列番号:128)を含むHVR-H3と、(b)アミノ酸配列QX1TX2VGSSYGNX3(ここでX1はS、C、NまたはT、X2はFまたはK、X3はA、TまたはHである)(配列番号:131)を含むHVR-L3と、(c)アミノ酸配列X1IX2TGSGAX3YX4AX5WX6KG(ここでX1はC、AまたはG、X2はYまたはF、X3はT、DまたはE、X4はY、KまたはQ、X5はS、DまたはE、X6はAまたはVである)(配列番号:127)を含むHVR-H2とを含む、[1]〜[13]のいずれかの抗体。
[15] (a)アミノ酸配列SSYYX1X2(ここでX1はMまたはV、X2はCまたはAである)(配列番号:126)を含むHVR-H1と、(b)アミノ酸配列X1IX2TGSGAX3YX4AX5WX6KG(ここでX1はC、AまたはG、X2はYまたはF、X3はT、DまたはE、X4はY、KまたはQ、X5はS、DまたはE、X6はAまたはVである)(配列番号:127)を含むHVR-H2と、(c)アミノ酸配列DX1GYX2X3PTHAMX4X5(ここでX1はGまたはA、X2はV、QまたはD、X3はTまたはY、X4はYまたはH、X5はLまたはYである)(配列番号:128)を含むHVR-H3とを含む、[1]〜[13]のいずれかの抗体。
[16] (a)アミノ酸配列X1ASQX2IX3SX4LA(ここでX1はQまたはR、X2はN、QまたはG、X3はGまたはS、X4はD、KまたはSである)(配列番号:129)を含むHVR-L1と;(b)アミノ酸配列GASX1X2X3S(ここでX1はK、EまたはT、X2はLまたはT、X3はA、H、EまたはQである)(配列番号:130)を含むHVR-L2と;(c)アミノ酸配列QX1TX2VGSSYGNX3(ここでX1はS、C、NまたはT、X2はFまたはK、X3はA、TまたはHである)(配列番号:131)を含むHVR-L3とをさらに含む、[15]の抗体。
[17] (a)アミノ酸配列X1ASQX2IX3SX4LA(ここでX1はQまたはR、X2はN、QまたはG、X3はGまたはS、X4はD、KまたはSである)(配列番号:129)を含むHVR-L1と;(b)アミノ酸配列GASX1X2X3S(ここでX1はK、EまたはT、X2はLまたはT、X3はA、H、EまたはQである)(配列番号:130)を含むHVR-L2と;(c)アミノ酸配列QX1TX2VGSSYGNX3(ここでX1はS、C、NまたはT、X2はFまたはK、X3はA、TまたはHである)(配列番号:131)を含むHVR-L3とを含む、[1]〜[13]のいずれかの抗体。
[18]配列番号:132〜134のいずれか1つのアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインフレームワークFR1と;配列番号:135〜136のいずれか1つのアミノ酸配列を含むFR2と;配列番号:137〜139のいずれか1つのアミノ酸配列を含むFR3と;配列番号:140〜141のいずれか1つのアミノ酸配列を含むFR4とをさらに含む、[15]の抗体。
[19]配列番号:142〜143のいずれか1つのアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインフレームワークFR1と;配列番号:144〜145のいずれか1つのアミノ酸配列を含むFR2と;配列番号:146〜147のいずれか1つのアミノ酸配列を含むFR3と;配列番号:148のアミノ酸配列を含むFR4とをさらに含む、[17]の抗体。
[20] (a) 配列番号:10、106〜110のいずれか1つのアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するVH配列;(b) 配列番号:20、111〜113のいずれか1つのアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を有するVL配列;または(c) (a)のVH配列および(b)のVL配列を含む、[1]〜[13]のいずれかの抗体。
[21]配列番号:10、106〜110のいずれか1つのVH配列を含む、[20]の抗体。
[22]配列番号:20、111〜113のいずれか1つのVL配列を含む、[20]の抗体。
[23]配列番号:10、106〜110のいずれか1つのVH配列および配列番号:20、111〜113のいずれか1つのVL配列を含む、抗体。
[24]全長IgG1抗体または全長IgG4抗体である、[1]〜[23]のいずれかの抗体。
[25][1]〜[24]のいずれかの抗体をコードする、単離された核酸。
[26][25]の核酸を含む、宿主細胞。
[27]抗体を製造する方法であって、抗体が製造されるように[26]の宿主細胞を培養する工程を含む、方法。
[28]抗C5抗体を製造する方法であって、C5のβ鎖のMG1-MG2ドメイン(配列番号:43)を含むポリペプチドに対して動物を免疫化する工程を含む、方法。
[29]抗C5抗体を製造する方法であって、C5のβ鎖(配列番号:40)の位置33-124のアミノ酸に対応する領域を含むポリペプチドに対して動物を免疫化する工程を含む、方法。
[30]抗C5抗体を製造する方法であって、C5のβ鎖(配列番号:40)のアミノ酸47-57、70-76、および107-110から選択される少なくとも1つの断片を含むポリペプチドに対して動物を免疫化する工程を含む、方法。
[31]抗C5抗体を製造する方法であって、Glu48、Asp51、His70、His72、Lys109、およびHis110から選択される少なくとも1つのアミノ酸を含む、C5のβ鎖(配列番号:40)の断片を含むポリペプチドに対して動物を免疫化する工程を含む、方法。
[32][1]〜[24]のいずれかの抗体および薬学的に許容される担体を含有する薬学的製剤。
本明細書に記載または引用される手法および手順は、概して充分に理解されており、例えば、Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual 3d edition (2001) Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y.;Current Protocols in Molecular Biology (F.M. Ausubel, et al. eds., (2003));the series Methods in Enzymology (Academic Press, Inc.): PCR 2: A Practical Approach (M.J. MacPherson, B.D. Hames and G.R. Taylor eds. (1995)), Harlow and Lane, eds. (1988) Antibodies, A Laboratory Manual, and Animal Cell Culture (R.I. Freshney, ed. (1987));Oligonucleotide Synthesis (M.J. Gait, ed., 1984);Methods in Molecular Biology, Humana Press; Cell Biology: A Laboratory Notebook (J.E. Cellis, ed., 1998) Academic Press; Animal Cell Culture (R.I. Freshney), ed., 1987);Introduction to Cell and Tissue Culture (J. P. Mather and P.E. Roberts, 1998) Plenum Press; Cell and Tissue Culture: Laboratory Procedures (A. Doyle, J.B. Griffiths, and D.G. Newell, eds., 1993-8) J. Wiley and Sons; Handbook of Experimental Immunology (D.M. Weir and C.C. Blackwell, eds.);Gene Transfer Vectors for Mammalian Cells (J.M. Miller and M.P. Calos, eds., 1987);PCR: The Polymerase Chain Reaction, (Mullis et al., eds., 1994);Current Protocols in Immunology (J.E. Coligan et al., eds., 1991);Short Protocols in Molecular Biology (Wiley and Sons, 1999);Immunobiology (C.A. Janeway and P. Travers, 1997);Antibodies (P. Finch, 1997);Antibodies: A Practical Approach (D. Catty., ed., IRL Press, 1988-1989);Monoclonal Antibodies: A Practical Approach (P. Shepherd and C. Dean, eds., Oxford University Press, 2000);Using Antibodies: A Laboratory Manual (E. Harlow and D. Lane (Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1999);The Antibodies (M. Zanetti and J. D. Capra, eds., Harwood Academic Publishers, 1995);およびCancer: Principles and Practice of Oncology (V.T. DeVita et al., eds., J.B. Lippincott Company, 1993)に記載された広範に利用されている技法などの従来の技法を用いて、当業者により一般的に使用される。
別途定義しない限り、本明細書で使用される技術用語および科学用語は、本発明が属する技術分野の当業者によって一般的に理解されるのと同じ意味を有する。Singleton et al., Dictionary of Microbiology and Molecular Biology 2nd ed., J. Wiley & Sons (New York, N.Y. 1994)、およびMarch, Advanced Organic Chemistry Reactions, Mechanisms and Structure 4th ed., John Wiley & Sons (New York, N.Y. 1992)は、本出願において使用される用語の多くに対する一般的指針を当業者に提供する。特許出願および刊行物を含む、本明細書に引用される全ての参考文献は、その全体が参照により本明細書に組み入れられる。
本明細書で用いられる用語「超可変領域」または「HVR」は、配列において超可変であり(「相補性決定領域」または「CDR」(complementarity determining region))、および/または構造的に定まったループ(「超可変ループ」)を形成し、および/または抗原接触残基(「抗原接触」)を含む、抗体の可変ドメインの各領域のことをいう。通常、抗体は6つのHVRを含む:VHに3つ(H1、H2、H3)、およびVLに3つ(L1、L2、L3)である。本明細書での例示的なHVRは、以下のものを含む:
(a) アミノ酸残基26-32 (L1)、50-52 (L2)、91-96 (L3)、26-32 (H1)、53-55 (H2)、および96-101 (H3)のところで生じる超可変ループ (Chothia, J. Mol. Biol. 196:901-917 (1987));
(b) アミノ酸残基24-34 (L1)、50-56 (L2)、89-97 (L3)、31-35b (H1)、50-65 (H2)、 および95-102 (H3)のところで生じるCDR (Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, NIH, Bethesda, MD (1991));
(c) アミノ酸残基27c-36 (L1)、46-55 (L2)、89-96 (L3)、30-35b (H1)、47-58 (H2)、および93-101 (H3) のところで生じる抗原接触 (MacCallum et al. J. Mol. Biol. 262:732-745 (1996));ならびに、
(d) HVRアミノ酸残基46-56 (L2)、47-56 (L2)、48-56 (L2)、49-56 (L2)、26-35 (H1)、26-35b (H1)、49-65 (H2)、93-102 (H3)、および94-102 (H3)を含む、(a)、(b)、および/または(c)の組合せ。
一局面において、本発明は、抗C5抗体およびその使用に一部基づくものである。特定の態様において、C5に結合する抗体が提供される。本発明の抗体は、例えば、疾患の診断または治療のために、有用である。
一局面において、本発明は、C5に結合する単離された抗体を提供する。特定の態様において、本発明の抗C5抗体は、C5のβ鎖内のエピトープに結合する。特定の態様において、抗C5抗体は、C5のβ鎖のMG1-MG2ドメイン内のエピトープに結合する。特定の態様において、抗C5抗体は、C5のβ鎖のアミノ酸19-180からなる断片内のエピトープに結合する。特定の態様において、抗C5抗体は、C5のβ鎖のMG1ドメイン(配列番号:40のアミノ酸20-124(配列番号:41))内のエピトープに結合する。特定の態様において、抗C5抗体は、C5のβ鎖(配列番号:40)のアミノ酸33-124からなる断片内のエピトープに結合する。別の態様において、該抗体は、C5のβ鎖のアミノ酸33-124からなる断片より短い断片、例えば、C5のβ鎖(配列番号:40)のアミノ酸45-124、52-124、33-111、33-108、または45-111からなる断片には、結合しない。
特定の態様において、本明細書で提供される抗体は、≦1μM、≦100nM、≦10nM、≦1nM、≦0.1nM、≦0.01nMまたは≦0.001nM(例えば、10-8M以下、例えば10-8M〜10-13M、例えば10-9M〜10-13M)の解離定数 (Kd) を有する。
特定の態様において、本明細書で提供される抗体は、抗体断片である。抗体断片は、これらに限定されるものではないが、Fab、Fab'、Fab'-SH、F(ab')2、Fv、および scFv断片、ならびに、後述する他の断片を含む。特定の抗体断片についての総説として、Hudson et al., Nat. Med. 9:129-134 (2003) を参照のこと。scFv断片の総説として、例えば、Pluckthun, in The Pharmacology of Monoclonal Antibodies, vol. 113, Rosenburg and Moore eds., (Springer-Verlag, New York), pp.269-315 (1994);加えて、WO93/16185;ならびに米国特許第5,571,894号および第5,587,458号を参照のこと。サルベージ受容体結合エピトープ残基を含みインビボ (in vivo) における半減期の長くなったFabおよびF(ab')2断片についての論説として、米国特許第5,869,046号を参照のこと。
特定の態様において、本明細書で提供される抗体は、キメラ抗体である。特定のキメラ抗体が、例えば、米国特許第4,816,567号;および、Morrison et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81:6851-6855 (1984) に記載されている。一例では、キメラ抗体は、非ヒト可変領域(例えば、マウス、ラット、ハムスター、ウサギ、またはサルなどの非ヒト霊長類に由来する可変領域)およびヒト定常領域を含む。さらなる例において、キメラ抗体は、親抗体のものからクラスまたはサブクラスが変更された「クラススイッチ」抗体である。キメラ抗体は、その抗原結合断片も含む。
特定の態様において、本明細書で提供される抗体は、ヒト抗体である。ヒト抗体は、当該技術分野において知られる種々の手法によって製造され得る。ヒト抗体は、van Dijk and van de Winkel, Curr. Opin. Pharma. 5:368-74 (2001) および Lonberg, Curr. Opin. Immunol. 20:450-459 (2008) に、概説されている。
本発明の抗体は、所望の1つまたは複数の活性を伴う抗体についてコンビナトリアルライブラリをスクリーニングすることによって単離してもよい。例えば、ファージディスプレイライブラリの生成や、所望の結合特性を備える抗体についてそのようなライブラリをスクリーニングするための、様々な方法が当該技術分野において知られている。そのような方法は、Hoogenboom et al., Methods in Molecular Biology 178:1-37 (O'Brien et al., ed., Human Press, Totowa, NJ, 2001) において総説されており、さらに例えば、McCafferty et al., Nature 348:552-554;Clackson et al., Nature 352:624-628 (1991); Marks et al., J. Mol. Biol. 222:581-597 (1992); Marks, Meth. Mol. Biol. 248:161-175 (Lo, ed., Human Press, Totowa, NJ, 2003); Sidhu et al., J. Mol. Biol. 338(2):299-310 (2004); Lee et al., J. Mol. Biol. 340(5):1073-1093 (2004); Fellouse, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 101(34):12467-12472 (2004); Lee et al., J. Immunol. Methods 284(1-2):119-132(2004) に記載されている。
特定の態様において、本明細書で提供される抗体は、多重特異性抗体(例えば、二重特異性抗体)である。多重特異性抗体は、少なくとも2つの異なる部位に結合特異性を有する、モノクローナル抗体である。特定の態様において、結合特異性の1つは、C5に対するものであり、もう1つは他の任意の抗原へのものである。特定の態様において、二重特異性抗体は、C5の異なった2つのエピトープに結合してもよい。二重特異性抗体は、C5を発現する細胞に細胞傷害剤を局在化するために使用されてもよい。二重特異性抗体は、全長抗体としてまたは抗体断片として調製され得る。
特定の態様において、本明細書で提供される抗体のアミノ酸配列変異体も、考慮の内である。例えば、抗体の結合アフィニティおよび/または他の生物学的特性を改善することが、望ましいこともある。抗体のアミノ酸配列変異体は、抗体をコードするヌクレオチド配列に適切な修飾を導入すること、または、ペプチド合成によって、調製されてもよい。そのような修飾は、例えば、抗体のアミノ酸配列からの欠失、および/または抗体のアミノ酸配列中への挿入、および/または抗体のアミノ酸配列中の残基の置換を含む。最終構築物が所望の特徴(例えば、抗原結合性)を備えることを前提に、欠失、挿入、および置換の任意の組合せが、最終構築物に至るために行われ得る。
特定の態様において、1つまたは複数のアミノ酸置換を有する抗体変異体が提供される。置換的変異導入の目的部位は、HVRおよびFRを含む。保存的置換を、表1の「好ましい置換」の見出しの下に示す。より実質的な変更を、表1の「例示的な置換」の見出しの下に提供するとともに、アミノ酸側鎖のクラスに言及しつつ下で詳述する。アミノ酸置換は目的の抗体に導入されてもよく、産物は、例えば、保持/改善された抗原結合性、減少した免疫原性、または改善したADCCまたはCDCなどの、所望の活性についてスクリーニングされてもよい。
(1) 疎水性:ノルロイシン、メチオニン (Met)、アラニン (Ala)、バリン (Val)、ロイシン (Leu)、イソロイシン (Ile);
(2) 中性の親水性:システイン (Cys)、セリン (Ser)、トレオニン (Thr)、アスパラギン (Asn)、グルタミン (Gln);
(3) 酸性:アスパラギン酸 (Asp)、グルタミン酸 (Glu);
(4) 塩基性:ヒスチジン (His)、リジン (Lys)、アルギニン (Arg);
(5) 鎖配向に影響する残基:グリシン (Gly)、プロリン (Pro);および、
(6) 芳香族性:トリプトファン (Trp)、チロシン (Tyr)、フェニルアラニン (Phe)。
特定の態様において、本明細書で提供される抗体は、抗体がグリコシル化される程度を増加させるまたは減少させるように改変されている。抗体へのグリコシル化部位の追加または削除は、1つまたは複数のグリコシル化部位を作り出すまたは取り除くようにアミノ酸配列を改変することにより、簡便に達成可能である。
特定の態様において、本明細書で提供される抗体のFc領域に1つまたは複数のアミノ酸修飾を導入して、それによりFc領域変異体を生成してもよい。Fc領域変異体は、1つまたは複数のアミノ酸ポジションのところでアミノ酸修飾(例えば、置換)を含む、ヒトFc領域配列(例えば、ヒトIgG1、IgG2、IgG3、またはIgG4のFc領域)を含んでもよい。
特定の態様において、抗体の1つまたは複数の残基がシステイン残基で置換された、システイン改変抗体(例えば、「thioMAb」)を作り出すことが望ましいだろう。特定の態様において、置換を受ける残基は、抗体の、アクセス可能な部位に生じる。それらの残基をシステインで置換することによって、反応性のチオール基が抗体のアクセス可能な部位に配置され、当該反応性のチオール基は、当該抗体を他の部分(薬剤部分またはリンカー‐薬剤部分など)にコンジュゲートして本明細書でさらに詳述するようにイムノコンジュゲートを作り出すのに使用されてもよい。特定の態様において、以下の残基の任意の1つまたは複数が、システインに置換されてよい:軽鎖のV205(Kabatナンバリング);重鎖のA118(EUナンバリング);および重鎖Fc領域のS400(EUナンバリング)。システイン改変抗体は、例えば、米国特許第7,521,541号に記載されるようにして生成されてもよい。
特定の態様において、本明細書で提供される抗体は、当該技術分野において知られておりかつ容易に入手可能な追加の非タンパク質部分を含むように、さらに修飾されてもよい。抗体の誘導体化に好適な部分は、これに限定されるものではないが、水溶性ポリマーを含む。水溶性ポリマーの非限定的な例は、これらに限定されるものではないが、ポリエチレングリコール (PEG)、エチレングリコール/プロピレングリコールのコポリマー、カルボキシメチルセルロース、デキストラン、ポリビニルアルコール、ポリビニルピロリドン、ポリ1,3ジオキソラン、ポリ1,3,6,トリオキサン、エチレン/無水マレイン酸コポリマー、ポリアミノ酸(ホモポリマーまたはランダムコポリマーのいずれでも)、および、デキストランまたはポリ(n-ビニルピロリドン)ポリエチレングリコール、ポリプロピレングリコールホモポリマー、ポリプロピレンオキシド/エチレンオキシドコポリマー、ポリオキシエチル化ポリオール類(例えばグリセロール)、ポリビニルアルコール、および、これらの混合物を含む。ポリエチレングリコールプロピオンアルデヒドは、その水に対する安定性のために、製造において有利であるだろう。ポリマーは、いかなる分子量でもよく、枝分かれしていてもしていなくてもよい。抗体に付加されるポリマーの数には幅があってよく、1つ以上のポリマーが付加されるならそれらは同じ分子であってもよいし、異なる分子であってもよい。一般的に、誘導体化に使用されるポリマーの数および/またはタイプは、これらに限定されるものではないが、改善されるべき抗体の特定の特性または機能、抗体誘導体が規定の条件下での療法に使用されるか否か、などへの考慮に基づいて、決定することができる。
例えば、米国特許第4,816,567号に記載されるとおり、抗体は組み換えの方法や構成を用いて製造することができる。一態様において、本明細書に記載の抗C5抗体をコードする、単離された核酸が提供される。そのような核酸は、抗体のVLを含むアミノ酸配列および/またはVHを含むアミノ酸配列(例えば、抗体の軽鎖および/または重鎖)をコードしてもよい。さらなる態様において、このような核酸を含む1つまたは複数のベクター(例えば、発現ベクター)が提供される。さらなる態様において、このような核酸を含む宿主細胞が提供される。このような態様の1つでは、宿主細胞は、(1)抗体のVLを含むアミノ酸配列および抗体のVHを含むアミノ酸配列をコードする核酸を含むベクター、または、(2)抗体のVLを含むアミノ酸配列をコードする核酸を含む第一のベクターと抗体のVHを含むアミノ酸配列をコードする核酸を含む第二のベクターを含む(例えば、形質転換されている)。一態様において、宿主細胞は、真核性である(例えば、チャイニーズハムスター卵巣 (CHO) 細胞)またはリンパ系の細胞(例えば、Y0、NS0、SP20細胞))。一態様において、抗C5抗体の発現に好適な条件下で、上述のとおり当該抗体をコードする核酸を含む宿主細胞を培養すること、および任意で、当該抗体を宿主細胞(または宿主細胞培養培地)から回収することを含む、抗C5抗体を作製する方法が提供される。
本明細書で提供される抗C5抗体は、当該技術分野において知られている種々の測定法によって、同定され、スクリーニングされ、または物理的/化学的特性および/または生物学的活性について明らかにされてもよい。
一局面において、本発明の抗体は、例えばELISA、ウエスタンブロット、BIACORE(登録商標)等の公知の方法によって、その抗原結合活性に関して試験される。
一局面において、生物学的活性を有する抗C5抗体のそれを同定するための測定法が提供される。生物学的活性は、例えば、C5の活性化を阻害すること、C5aおよびC5bを形成するためのC5の切断を防止すること、C5上の切断部位へのC5転換酵素の接近を阻止すること、C5の活性化によって引き起こされる溶血活性を阻止することなどを含んでよい。また、このような生物学的活性をインビボおよび/またはインビトロで有する抗体が、提供される。
本発明はまた、1つまたは複数の細胞傷害剤(例えば化学療法剤または化学療法薬、増殖阻害剤、毒素(例えば細菌、真菌、植物もしくは動物起源のタンパク質毒素、酵素的に活性な毒素、もしくはそれらの断片)または放射性同位体)にコンジュゲートされた本明細書の抗C5抗体を含むイムノコンジュゲートを提供する。
特定の態様において、本明細書で提供される抗C5抗体のいずれも、生物学的サンプルにおけるC5の存在を検出するのに有用である。本明細書で用いられる用語「検出」は、定量的または定性的な検出を包含する。特定の態様において、生物学的サンプルは、細胞または組織、例えば、血清、全血、血漿、生検サンプル、組織サンプル、細胞懸濁物、唾液、痰、口腔液、脳脊髄液、羊水、腹水、母乳、初乳、乳腺分泌物、リンパ液、尿、汗、涙液、胃液、滑液、腹水、眼用レンズ液、および粘液を含む。
本明細書に記載の抗C5抗体の薬学的製剤は、所望の純度を有する抗体を、1つまたは複数の任意の薬学的に許容される担体 (Remington's Pharmaceutical Sciences 16th edition, Osol, A. Ed. (1980)) と混合することによって、凍結乾燥製剤または水溶液の形態で、調製される。薬学的に許容される担体は、概して、用いられる際の用量および濃度ではレシピエントに対して非毒性であり、これらに限定されるものではないが、以下のものを含む:リン酸塩、クエン酸塩、および他の有機酸などの緩衝液;アスコルビン酸およびメチオニンを含む、抗酸化剤;保存料(オクタデシルジメチルベンジル塩化アンモニウム;塩化ヘキサメトニウム;塩化ベンザルコニウム;塩化ベンゼトニウム;フェノール、ブチル、またはベンジルアルコール;メチルまたはプロピルパラベンなどのアルキルパラベン;カテコール;レソルシノール;シクロヘキサノール;3-ペンタノール;およびm-クレゾールなど);低分子(約10残基未満)ポリペプチド;血清アルブミン、ゼラチン、または免疫グロブリンなどのタンパク質;ポリビニルピロリドンなどの親水性ポリマー;グリシン、グルタミン、アスパラギン、ヒスチジン、アルギニン、またはリジンなどのアミノ酸;グルコース、マンノース、またはデキストリンを含む、単糖、二糖、および他の炭水化物;EDTAなどのキレート剤;スクロース、マンニトール、トレハロース、ソルビトールなどの、砂糖類;ナトリウムなどの塩形成対イオン類;金属錯体(例えば、Zn-タンパク質錯体);および/またはポリエチレングリコール (PEG) などの非イオン系表面活性剤。本明細書の例示的な薬学的に許容される担体は、さらに、可溶性中性活性型ヒアルロニダーゼ糖タンパク質 (sHASEGP)(例えば、rHuPH20 (HYLENEX(登録商標)、Baxter International, Inc.) などのヒト可溶性PH-20ヒアルロニダーゼ糖タンパク質)などの間質性薬剤分散剤を含む。特定の例示的sHASEGPおよびその使用方法は(rHuPH20を含む)、米国特許出願公開第2005/0260186号および第2006/0104968号に記載されている。一局面において、sHASEGPは、コンドロイチナーゼなどの1つまたは複数の追加的なグリコサミノグリカナーゼと組み合わせられる。
本明細書で提供される抗C5抗体のいずれも、治療的な方法において使用されてよい。
本発明の別の局面において、上述の障害の治療、予防、および/または診断に有用な器材を含んだ製品が、提供される。製品は、容器、および当該容器上にまたは当該容器に付属するラベルまたは添付文書を含む。好ましい容器としては、例えば、ボトル、バイアル、シリンジ、IV溶液バッグなどが含まれる。容器類は、ガラスやプラスチックなどの、様々な材料から形成されていてよい。容器は組成物を単体で保持してもよいし、症状の治療、予防、および/または診断のために有効な別の組成物と組み合わせて保持してもよく、また、無菌的なアクセスポートを有していてもよい(例えば、容器は、皮下注射針によって突き通すことのできるストッパーを有する静脈内投与用溶液バッグまたはバイアルであってよい)。組成物中の少なくとも1つの有効な剤は、本発明の抗体である。ラベルまたは添付文書は、組成物が選ばれた症状を治療するために使用されるものであることを示す。さらに製品は、(a)第一の容器であって、その中に収められた本発明の抗体を含む組成物を伴う、第一の容器;および、(b)第二の容器であって、その中に収められたさらなる細胞傷害剤またはそれ以外で治療的な剤を含む組成物を伴う、第二の容器を含んでもよい。本発明のこの態様における製品は、さらに、組成物が特定の症状を治療するために使用され得ることを示す、添付文書を含んでもよい。あるいはまたは加えて、製品はさらに、注射用制菌水 (BWFI)、リン酸緩衝生理食塩水、リンガー溶液、およびデキストロース溶液などの、薬学的に許容される緩衝液を含む、第二の(または第三の)容器を含んでもよい。他の緩衝液、希釈剤、フィルター、針、およびシリンジなどの、他の商業的観点またはユーザの立場から望ましい器材をさらに含んでもよい。
C5の調製
1.1.組み換えヒトおよびカニクイザルC5の発現および精製
組み換えヒトC5 (NCBI GenBankアクセッション番号: NP_001726.2、配列番号:39)を、FreeStyle293-F細胞株(Thermo Fisher, Carlsbad, CA, USA)を用いて一過性に発現させた。ヒトC5を発現する馴化培地を等量のmilliQ水で希釈し、次にQセファロースFFまたはQセファロースHPアニオン交換カラム(GE healthcare, Uppsala, スウェーデン)にアプライし、続いてNaCl勾配で溶出させた。ヒトC5を含む画分をプールし、その後塩濃度とpHをそれぞれ80mM NaClおよびpH6.4に調整した。得られたサンプルをSPセファロースHPカチオン交換カラム(GE healthcare, Uppsala, スウェーデン)にアプライして、NaCl勾配で溶出させた。ヒトC5を含む画分をプールし、CHTセラミックハイドロキシアパタイトカラム(Bio-Rad Laboratories, Hercules, CA, USA)に供した。その後、ヒトC5溶出物をSuperdex 200ゲル濾過カラム(GE healthcare, Uppsala, スウェーデン)にアプライした。ヒトC5を含む画分をプールして、-150℃で保存した。
カニクイザルからの血漿サンプルをSSL7-アガロース(Invivogen, San Diego, CA, USA)にアプライし、続いて100mM酢酸Na、pH3.5で溶出させた。cynoC5を含む画分を直ちに中和し、ペプチドMアガロース(Invivogen, San Diego, CA, USA)とタンデムに連結されたプロテインA HPカラム(GE healthcare, Uppsala, スウェーデン)に供した。その後、フロースルー画分をSuperdex 200ゲル濾過カラム(GE healthcare, Uppsala, スウェーデン)にアプライした。cynoC5を含む画分をプールして、-80℃で保存した。
抗C5抗体の作製
2.1.抗体スクリーニング
抗C5抗体を次のように調製し、選択し、アッセイした。
高いアフィニティ、pH依存性または中和活性を有する抗C5抗体を、さらなる解析のために選択した。選択された抗体を、サンドイッチELISA測定法を用いて、C5タンパク質の同一のエピトープまたは重複するエピトープに結合する様々なエピトープビンに分類した。未標識の捕捉抗体をPBS(-)で1μg/mlに希釈し、384ウェルMAXISorpプレート(Nunc、カタログ番号164688)に添加した。プレートを室温で1時間インキュベートして、5倍希釈したBlocking One (Nacalai Tesque、カタログ番号03953-95)でブロッキングした。プレートを1時間インキュベートし、洗浄し、2nMのヒトC5を添加して1時間インキュベートした。インキュベーション後、プレートを洗浄し、標識した検出抗体(1μg/mL、NHS-PEG4-ビオチンでビオチン化した)を添加した。1時間のインキュベーション後、ビオチン化抗体の結合を、ストレプトアビジン-西洋ワサビペルオキシダーゼコンジュゲート(Thermo Scientific、カタログ番号21132)に続いてABTS (KPL、カタログ番号50-66-06)を添加することにより検出した。
いくつかの抗C5抗体の可変領域のヒト化を、該抗体の潜在的免疫原性を低下させるために実施した。抗C5ウサギ抗体の相補性決定領域(CDR)を、従来のCDRグラフティング手法(Nature 321:522-525 (1986))を用いて、相同なヒト抗体フレームワーク(FR)にグラフティングした。ヒト化VHおよびVLをコードする遺伝子を合成し、それぞれ、改変ヒトIgG4 CH(SG402、配列番号:35)およびヒトCL(SK1、配列番号:38)と結合させ、結合した配列の各々を発現ベクターにクローニングした。
抗C5抗体の結合特徴決定
3.1.組み換え抗体の発現および精製
組み換え抗体を、FreeStyle293-F細胞株(Thermo Fisher, Carlsbad, CA, USA)を用いて一過性に発現させた。抗体を発現する馴化培地からの精製を、プロテインAを用いた従来の方法により行った。必要に応じて、ゲル濾過をさらに実施した。
組み換えヒトC5に対する抗C5抗体の反応速度パラメータを、BIACORE(登録商標)T200機器(GE Healthcare)を用いて、37℃でpH7.4およびpH5.8にて評価した。アミンカップリングキット(GE Healthcare)をGE Healthcareにより推奨された設定にしたがって用いて、ProA/G (Pierce) をCM4センサーチップ上に固定化した。抗体と分析物を、それぞれのランニング緩衝液であるACES pH7.4およびpH5.8 (20mM ACES、150mM NaCl、1.2mM CaCl2、0.05%Tween 20、0.005%NaN3)中に希釈した。各抗体をProA/Gによりセンサー表面上に捕捉した。抗体の捕捉レベルは、概して60〜90共鳴単位(RU)であった。次に、組み換えヒトC5を10および20nMまたは20および40nMの濃度で注入し、続いて解離させた。表面は25mM NaOHを用いて再生させた。両方のpH条件での反応速度パラメータを、BIACORE(登録商標)T200 Evaluationソフトウェア、バージョン2.0 (GE Healthcare)を用いて、1:1結合モデルでセンサーグラムをフィッティングすることによって決定した。全ての抗体のセンサーグラムは、図2Aおよび2Bに示される。抗体の結合速度(ka)、解離速度(kd)、および結合アフィニティ(KD)は、表3に示される。CFA0330(VH、配列番号:21およびVL、配列番号:25)とCFA0341(VH、配列番号:22およびVL、配列番号:26)を除く全ての抗体は、pH7.4よりもpH5.8で比較的速い解離速度を示した。
ヒトC5(hC5)とカニクイザルC5(cynoC5)に対する抗C5抗体の交差反応性を観察するために、BIACORE(登録商標)反応速度解析を行った。アッセイ設定は実施例3.2に記載したのと同じであった。組み換えcynoC5を2、10、および50nMの濃度で注入した。反応速度パラメータを、実施例3.2に記載したのと同じデータフィッティングにより決定した。pH7.4での結合反応速度およびアフィニティは、表4に示される。表4に示したhC5に対する反応速度パラメータは、実施例3.2の結果である。CFA0672を除く全ての抗C5抗体は、hC5とcynoC5に対して同程度のKDを示した。CFA0672のcynoC5に対するKDは、hC5に対するKDよりも8倍弱かった。
抗C5抗体のエピトープマッピング
4.1.C5β鎖由来ペプチドへの抗C5 MAbの結合
抗C5モノクローナル抗体(MAb) を、ウエスタンブロット分析においてC5β鎖由来ペプチドへの結合について試験した。GSTタグ(pGEX-4T-1、GE Healthcare Life Sciences、28-9545-49)に融合させたC5ペプチド:19-180、161-340、321-500、および481-660を、大腸菌(E. coli)(DH5α、TOYOBO、DNA-903)において発現させた。1mMのイソプロピルβ-D-1-チオガラクトピラノシド(IPTG)との37℃で5時間のインキュベーション後に大腸菌サンプルを回収し、20000×gで1分間遠心分離してペレットを得た。このペレットをサンプル緩衝液(2ME+)(Wako、191-13272)で懸濁し、ウエスタンブロット分析に使用した。各ペプチドの発現を、抗GST抗体(Abcam、ab9085)を用いて確認した(図3)。矢印は、GST融合C5ペプチド(46〜49kDa)を示す。抗C5 MAb:CFA0305、CFA0307、CFA0366、CFA0501、CFA0538、CFA0599、CFA0666、CFA0672、およびCFA0675は、C5の19-180に結合した(図3)。
ヒトC5のβ鎖の組み換えMG1-MG2ドメイン(配列番号:43) を、FreeStyle293-F細胞株(Thermo Fisher, Carlsbad, CA, USA)を用いて一過性に発現させた。MG1-MG2ドメインを発現する馴化培地を1/2容量のmilliQ水で希釈し、続いてQセファロースFFアニオン交換カラム(GE healthcare, Uppsala, スウェーデン)にアプライした。アニオン交換カラムからのフロースルー画分をpH5.0に調整し、SPセファロースHPカチオン交換カラム(GE healthcare, Uppsala, スウェーデン)にアプライして、NaCl勾配で溶出させた。MG1-MG2ドメインを含む画分を溶出物から回収し、続いて1×PBSで平衡化したSuperdex 75ゲル濾過カラム(GE healthcare, Uppsala, スウェーデン)に供した。その後、MG1-MG2ドメインを含む画分をプールして、-80℃で保存した。
MG1-MG2ドメインに対する抗C5抗体の結合能力は、測定をpH7.4の条件下でしか行わなかったことを除いて、実施例3.2に記載したのと同じアッセイ設定を用いて測定した。MG1-MG2ドメインを20nMおよび40nMの濃度で注入した。図4に示すように、エクリズマブ-F760G4を除く全ての抗体が結合応答の増加を示し、このことは、これらの抗体がMG1-MG2結合剤であることを示している。公知のα鎖結合剤であるエクリズマブ-F760G4は、MG1-MG2ドメインへの結合を示さなかった。
抗C5 MAbを、ウエスタンブロット分析においてMG1-MG2ドメイン由来ペプチドへの結合について試験した。GSTタグに融合させたC5ペプチド:33-124、45-124、52-124、33-111、33-108、および45-111(配列番号:40)を大腸菌において発現させた。大腸菌サンプルを1mM IPTGとの37℃で5時間のインキュベーション後に回収し、20000×gで1分間遠心分離してペレットを得た。このペレットをサンプル緩衝液(2ME+)で懸濁し、ウエスタンブロット分析に使用した。C5由来ペプチドの発現を抗GST抗体により確認した(図5A)。CFA0305は33-124のペプチドのみに結合した(図5B)。CFA0305は組み換えヒトC5 (rhC5)のβ鎖(約70kDa)に結合し、これを対照として使用した。図5Cには、C5由来ペプチドに対する抗C5 MAbの反応をまとめる。
C5のβ鎖中の3つのアミノ酸残基:E48、D51、およびK109は、結晶構造解析によりC5と抗C5 MAbとの結合に関与することが予測されたので、抗C5 MAbを、ウエスタンブロット分析においてヒトC5点変異体への結合について試験した。E48、D51、およびK109のいずれか1つがアラニンで置換されたC5点変異体を、リポフェクションによりFS293細胞において発現させた。リポフェクションの5日後に培養培地を回収し、その後ウエスタンブロットのために使用した。SDS-PAGEを還元条件下で実施した。結果は図6に示される。エクリズマブが野生型(WT)C5のα鎖および3つのC5点変異体に結合したのに対して、CFA0305は、WT C5のβ鎖に強く、E48A C5変異体に弱く結合し、D51Aおよび K109A C5変異体のβ鎖には結合しなかった。このことは、これら3つのアミノ酸残基が抗体/抗原相互作用に関与していることを示す。表5は、抗C5 MAb (CFA0305、CFA0307、CFA0366、CFA0501、CFA0538、CFA0599、CFA0666、CFA0672、およびCFA0675)のウエスタンブロット分析の概要を示す。これらの抗C5 MAbは同じエピトープCに分類されているが、結合パターンは抗体間でわずかに異なり、このことは、これら抗C5 MAbへのC5の結合領域は互いに近接しているが同一ではないことを示唆している。
残基E48、G51、およびK109が抗体/抗原相互作用に実際に関与しているかどうかを試験するために、BIACORE(登録商標)結合解析を行った。3つのC5変異体:E48A、G51A、およびK109Aを、実施例4.5に記載したように調製した。FS293細胞において過剰発現させた変異型C5を含む培養上清サンプルを、40μg/mlの変異型C5に調製した。BIACORE(登録商標)結合解析のために、サンプルをBIACORE(登録商標)ランニング緩衝液(ACES pH7.4、10mg/ml BSA、1mg/mlカルボキシメチルデキストラン)で10倍に希釈して、4μg/mlの変異型C5という最終サンプル濃度にした。
結晶構造解析は、ヒトC5上の3個のヒスチジン残基が抗体/抗原界面に位置することを明らかにした。約6.0の典型的pKaを有するヒスチジン残基は、pH依存的なタンパク質-タンパク質相互作用に寄与することが知られている(Igawa et al., Biochim Biophys Acta 1844(11):1943-1950 (2014))。抗体/抗原界面上のどのHis残基が抗C5抗体とC5の間のpH依存的相互作用に寄与するのかを調べるために、BIACORE(登録商標)結合解析を行った。単一His変異を有する3つのヒトC5変異体(H70Y、H72Y、およびH110Y)と、二重His変異を有する1つの変異体(H70Y+H110Y)を次のように作製した:H70、H72、およびH110のいずれか1つがチロシンで置換された単一His変異体、ならびにH70とH110の両方がチロシンで置換された二重His変異体を、リポフェクションによりFS293細胞において発現させた。pH依存的な抗C5抗体である305LO5へのC5 His変異体の抗原結合特性を、実施例4.6に記載したように、改変BIACORE(登録商標)測定法によって測定した。簡単に述べると、pH7.4で形成された複合体由来の抗体と抗原の間のpH依存的解離を評価するために、BIACORE(登録商標)測定法に、pH5.8での追加の解離段階を、pH7.4での解離段階(dissociation phase)の直後に組み入れた。pH5.8での解離速度は、Scrubber 2.0(BioLogic Software)カーブフィッティングソフトウェアを用いてデータを処理し、フィッティングを行うことによって決定した。
C5活性化に対する抗C5抗体の阻害活性
5.1.抗C5 MAbによる補体活性化リポソーム溶解の阻害
抗C5 MAbを、リポソーム溶解測定法により補体活性の阻害について試験した。30μLの正常ヒト血清(6.7%)(Biopredic、SER018)を96ウェルプレートにおいて20μLの希釈MAbと混合し、25℃で30分間シェーカー上でインキュベートした。ジニトロフェニルに対する抗体で感作したリポソーム(Autokit CH50、Wako、995-40801)を各ウェルに移し、プレートを25℃で2分間シェーカー上に置いた。50μLの基質溶液(Autokit CH50)を各ウェルに添加し、25℃で2分間振とうすることにより混合した。最終混合物を37℃で40分間インキュベートし、その後、該混合物の340nmでのODを測定した。リポソーム溶解パーセントは、100×[(ODMAb - OD血清およびリポソームバックグラウンド)]/[(ODMAbなし - OD血清およびリポソームバックグラウンド)]と定義された。図9Aは、抗C5 MAb:CFA0305、CFA0307、CFA0366、CFA0501、CFA0538、CFA0599、CFA0666、CFA0672、およびCFA0675がリポソーム溶解を阻害したことを示す。2つのpH非依存的抗体:CFA0330およびCFA0341もまた、該溶解を阻害した(図9B)。
抗C5 MAbがC5aおよびC5bへのC5の切断を阻害することを確認するために、リポソーム溶解の際のC5a生成について抗C5 MAbを試験した。リポソーム溶解測定法由来の上清中のC5aレベルを、C5a ELISAキット(R&D systems、DY2037)を用いて定量した。全てのMAbが、上清中のC5a生成を用量依存的に阻害した(図10Aおよび10B)。
抗C5 MAbを、溶血測定法において古典的補体活性の阻害について試験した。ニワトリ赤血球細胞(cRBC)(Innovative research、IC05-0810)を、0.5mM MgCl2および0.15mM CaCl2を含有するゼラチン/ベロナール緩衝生理食塩水(GVB++)(Boston BioProducts、IBB-300X)で洗浄し、その後1μg/mlの抗ニワトリRBC抗体(Rockland 103-4139)を用いて4℃で15分間感作した。次いで、該細胞をGVB++で洗浄し、同じ緩衝液中に細胞5×107個/mlで懸濁した。別の丸底96ウェルマイクロテストプレートにおいて、50μlの正常ヒト血清(20%)(Biopredic、SER019)を50μlの希釈MAbと混合し、37℃で30分間シェーカー上にてインキュベートした。次に、60μlの感作cRBC懸濁液を、該血清を含むウェルに添加し、この抗体混合物を37℃で30分間インキュベートした。インキュベーション後、プレートを1000×g、4℃で2分間遠心分離した。630nmの参照波長を用いて415nmでODを測定するために、上清(100μl)を平底96ウェルマイクロテストプレートのウェルに移した。溶血パーセントは、100×[(ODMAb - OD血清およびcRBC)]/[(ODMAbなし - OD血清およびcRBCバックグラウンド)]と定義された。図11は、抗C5 MAb:CFA0305および305LO5がcRBCの溶血を阻害したことを示している。
副経路のための溶血測定法は、古典経路の溶血測定法と類似の方式で行った。ニュージーランド白ウサギ(InVivos)から採取した血液を同量のAlsever's溶液(Sigma、A3551)と混合し、混合物をウサギRBC(rRBC)として使用した。rRBCを、2mM MgCl2および10mM EGTAを補充したGVBで洗浄し、同じ緩衝液中に細胞7×108個/mlで懸濁した。丸底96ウェルマイクロテストプレートにおいて、40μlの正常ヒト血清(25%)(Biopredic、SER019)を40μlの希釈MAbと混合し、37℃で30分間シェーカー上でインキュベートした。次に、20μlのrRBC懸濁液を、該血清を含むウェルに添加し、この抗体混合物を37℃で60分間インキュベートした。インキュベーション後、プレートを1000×g、4℃で2分間遠心分離した。630nmの参照波長を用いて415nmでODを測定するために、上清(70μl)を平底96ウェルマイクロテストプレート上のウェルに移した。図12は、抗C5 MAb:CFA0305およびCFA0672がrRBCの溶血を阻害したことを示し、このことは、これらの抗体が副補体経路を阻害することを示す。
抗C5モノクローナル抗体(305変異体)の最適化
抗C5抗体305LO5の最適化された可変領域に、その特性をさらに改善するためにいくつかの変異を導入して、最適化された可変領域305LO15、305LO16、305LO18、305LO19、305LO20、305LO22、および305LO23を作製した。これら305変異体のVHおよびVLのアミノ酸配列は、それぞれ、表7および8に示される。ヒト化VHをコードする遺伝子を、改変ヒトIgG1 CH変異体SG115(配列番号:114)、および改変ヒトIgG4 CH変異体SG422(配列番号:115)またはSG429(配列番号:116)と組み合わせた。ヒト化VLをコードする遺伝子を、ヒトCL(SK1、配列番号:38)と組み合わせた。これとは別に、ヒト化抗C5抗体BNJ441をコードする重鎖および軽鎖遺伝子(BNJ441H、配列番号:149;BNJ441L、配列番号:150)を合成し、それぞれを発現ベクターにクローニングした。
抗C5抗体(305変異体)の結合特徴決定
組み換えヒトC5に対する抗C5抗体の反応速度パラメータを、BIACORE(登録商標)T200機器(GE Healthcare)を用いて、以下の3つの異なる条件で37℃にて評価した:(1)結合と解離の両方がpH7.4、(2)結合と解離の両方がpH5.8、および(3)結合がpH7.4、解離がpH5.8。アミンカップリングキット(GE Healthcare)をGE Healthcareにより推奨される設定にしたがって用いて、ProA/G(Pierce) をCM1センサーチップ上に固定化した。条件(1)および(3)の場合には抗体および分析物をACES pH7.4緩衝液(20mM ACES、150mM NaCl、1.2mM CaCl2、0.05%Tween 20、0.005%NaN3)中に希釈し、条件(2)の場合はそれらをACES pH5.8緩衝液(20mM ACES、150mM NaCl、1.2mM CaCl2、0.05%Tween 20、0.005%NaN3)中に希釈した。各抗体をProA/Gによりセンサー表面上に捕捉させた。抗体の捕捉レベルは、概して60〜90共鳴単位(RU)であった。次に、組み換えヒトC5を、3倍段階希釈により調製して3〜27nMまたは13.3〜120nMで注入し、続いて解離させた。該表面は25mM NaOHを用いて再生させた。BIACORE(登録商標)T200 Evaluationソフトウェア、バージョン2.0(GE Healthcare)を用いて、条件(1)および(2)での反応速度パラメータを、1:1結合モデルでセンサーグラムをフィッティングさせることによって決定し、条件(3)での解離速度を、1:1 MCKの解離モデルでセンサーグラムをフィッティングさせることによって測定した。全ての抗体のpH依存性は、条件(2)と(1)の解離速度の比として示した。
C5活性化に対する抗C5抗体(305変異体)の阻害活性
8.1.抗C5 MAbによる補体活性化リポソーム溶解の阻害
抗C5 MAbを、リポソーム溶解測定法により補体活性の阻害について試験した。30μLの正常ヒト血清(6.7%)(Biopredic、SER019)を96ウェルプレートにおいて20μLの希釈MAbと混合し、室温で30分間シェーカー上でインキュベートした。ジニトロフェニルに対する抗体で感作したリポソーム溶液(Autokit CH50、Wako、995-40801)を各ウェルに移し、37℃で2分間シェーカー上に置いた。50μLの基質溶液(Autokit CH50)を各ウェルに添加し、37℃で2分間振とうすることにより混合した。最終混合物を37℃で40分間インキュベートし、その後340nmでのODを測定した。リポソーム溶解パーセントは、100×[(ODMAb - OD血清およびリポソームバックグラウンド)]/[(ODMAbなし - OD血清およびリポソームバックグラウンド)]と定義された。図13は、抗C5 MAb:305LO15-SG422、305LO16-SG422、305LO18-SG422、305LO19-SG422、305LO20-SG422、および305LO20-SG115がリポソーム溶解を阻害したことを示している。Fc変異体を有する2つの抗体:305LO15-SG115および305LO23-SG429もまた、リポソーム溶解を阻害した(図14)。
抗C5 MAbがC5aおよびC5bへのC5の切断を阻害することを確認するために、抗C5 MAbを、リポソーム溶解中のC5aの生成について試験した。リポソーム溶解測定法からの上清中のC5aレベルを、C5a ELISAキット(R&D systems、DY2037)を用いて定量した。全てのMAbは、上清中のC5a生成を用量依存的に阻害した(図16および17)。
抗C5 MAbを、カニクイザル血漿中の補体活性の阻害について試験した。抗C5 MAbをサルに投与し(20mg/kg)、血漿サンプルを56日目まで定期的に採取した。ニワトリ赤血球細胞(cRBC)(Innovative research、IC05-0810)を、0.5mM MgCl2および0.15mM CaCl2を含有するゼラチン/ベロナール緩衝生理食塩水(GVB++)(Boston BioProducts、IBB-300X)で洗浄し、その後1μg/mlの抗ニワトリRBC抗体(Rockland 103-4139)を用いて4℃で15分間感作した。次いで、該細胞をGVB++で洗浄し、同じ緩衝液中に細胞1×108個/mlで懸濁した。別の丸底96ウェルマイクロテストプレートにおいて、サル血漿を感作cRBCと37℃で20分間インキュベートした。インキュベーション後、プレートを1000×g、4℃で2分間遠心分離した。630nmの参照波長を用いて415nmでODを測定するために、上清を平底96ウェルマイクロテストプレート上のウェルに移した。溶血パーセントは、100×[(OD 投与後 - OD血漿およびcRBCバックグラウンド)]/[(OD 投与前 - OD血漿およびcRBCバックグラウンド)]と定義された。図18は、抗C5 MAb:305LO15-SG422、305LO15-SG115、305LO16-SG422、305LO18-SG422、305LO19-SG422、305LO20-SG422、305LO20-SG115、および305LO23-SG115が血漿中の補体活性を阻害したことを示している。
抗C5 MAbを、組み換えヒトC5変異体:V145I、R449G、V802I、R885H、R928Q、D966Y、S1310N、およびE1437Dの阻害について試験した。C5にR885H変異を有するPNH患者はエクリズマブへの応答不良を示すことが、報告されている(例えば、Nishimura et al., New Engl. J. Med. 370:632-639 (2014)を参照されたい)。ヒトC5変異体の各々をFS293細胞において発現させ、上清を以下の研究に使用した。10μLのC5欠損ヒト血清(Sigma、C1163)を96ウェルプレートにおいて20μLの希釈MAbおよび20μLの組み換えC5変異体(2〜3μg/mL)含有細胞培養培地と混合し、37℃で0.5時間シェーカー上でインキュベートした。リポソーム(Autokit CH50)を各ウェルに移し、37℃で2分間シェーカー上に置いた。50μLの基質溶液(Autokit CH50)を各ウェルに添加し、37℃で2分間振とうすることにより混合した。最終混合物を37℃で90分間インキュベートし、その後340nmでのODを測定した。リポソーム溶解パーセントは、上記のように定義された。図19は、抗C5 MAb(エクリズマブ)がR885H C5変異体を阻害しなかったが、試験した他の変異体を阻害したことを示している。図20は、抗C5 MAb(305変異体)が試験した全てのC5変異体を阻害したことを示している。
抗C5 MAbを、リポソーム溶解測定法により補体活性の阻害について試験した。30μLの正常ヒト血清(6.7%)(Biopredic、SER019)を96ウェルプレートにおいて20μLの希釈MAbと混合し、室温で30分間シェーカー上でインキュベートした。ジニトロフェニルに対する抗体で感作したリポソーム溶液(Autokit CH50、Wako、995-40801)を各ウェルに移し、25℃で2分間シェーカー上に置いた。50μLの基質溶液(Autokit CH50)を各ウェルに添加し、25℃で2分間振とうすることにより混合した。最終混合物を37℃で45分間インキュベートし、その後340nmでのODを測定した。リポソーム溶解の阻害パーセントは、100×[(ODMAb - OD血清およびリポソームバックグラウンド)]/[(ODMAbなし - OD血清およびリポソームバックグラウンド)]と定義された。図21は、抗C5 MAbであるBNJ441および305変異体がリポソーム溶解を阻害したこと、および305変異体がBNJ441よりも強い阻害活性を有することを、示している。
305変異体FabとヒトC5-MG1ドメインとの複合体のX線結晶構造解析
9.1.ヒトC5のMG1ドメイン(20-124)の発現および精製
トロンビン切断可能リンカーを介してGSTタグに融合させたMG1ドメイン(配列番号:39のアミノ酸残基20-124)(GST-MG1)を、pGEX-4T-1ベクター(GE healthcare)を用いて、大腸菌BL21 DE3 pLysS株(Promega)において発現させた。タンパク質発現は、0.1mMのイソプロピルβ-D-1-チオガラクトピラノシド(IPTG)を用いて25℃で5時間誘導した。細菌細胞ペレットを、リソナーゼ(lysonase)(Merck)およびコンプリートプロテアーゼインヒビターカクテル(Roche)を添加したBugbuster(Merck)により溶解させ、続いて、GSTrapカラム(GE healthcare)をメーカーの使用説明書にしたがって用いて、可溶性画分からGST-MG1を精製した。GSTタグをトロンビン(Sigma)で切断し、得られたMG1ドメインをSuperdex 75ゲル濾過カラム(GE healthcare)でさらに精製した。MG1ドメインを含む画分をプールして、-80℃で保存した。
305由来の最適化変異体のうち1つのFab断片を、パパイン(Roche Diagnostics、カタログ番号1047825)による制限消化、続いて、Fc断片を除去するためのプロテインAカラム(MabSlect SuRe、GE Healthcare)、カチオン交換カラム(HiTrap SP HP、GE Healthcare)、およびゲル濾過カラム(Superdex200 16/60、GE Healthcare)へローディングする、従来の方法により調製した。Fab断片を含む画分をプールして、-80℃で保存した。
精製した組み換えヒトC5-MG1ドメインを、精製した305変異体Fab断片と1:1のモル比で混合した。複合体を、25mM HEPES pH7.5、100mM NaClで平衡化したカラムを用いたゲル濾過クロマトグラフィー(Superdex200 10/300 increase、GE Healthcare)により精製した。
精製した複合体を約10mg/mLに濃縮し、シーディング法と組み合わせたシッティングドロップ蒸気拡散法により4℃で結晶化を行った。リザーバー溶液は、0.2Mギ酸マグネシウム無水物、15.0%w/vポリエチレングリコール3350から成るものであった。これにより、2〜3日で板状結晶を得ることに成功した。この結晶を、0.2Mギ酸マグネシウム無水物、25.0%w/vポリエチレングリコール3350、および20%グリセロールの溶液中に浸漬した。
X線回折データを、SPring-8のBL32XUで測定した。測定中、結晶を常に-178℃の窒素流下に置いて凍結状態を維持し、ビームラインに接続されたMX-225HS CCD検出器(RAYONIX)を用いて、結晶を1回に1.0°回転させながら、合計180のX線回折像を収集した。セルパラメータの決定、回折スポットのインデックス付け、および回折像から得られた回折データの処理を、Xia2プログラム(J. Appl. Cryst. 43:186-190 (2010))、XDSパッケージ(Acta. Cryst. D66:125-132 (2010))、およびScala (Acta. Cryst. D62:72-82 (2006))を用いて行い、最終的に分解能2.11Åまでの回折強度データを取得した。結晶学的データ統計値が表11に示される。
305由来の最適化変異体のFab断片(「305 Fab」)は、ヒトC5-MG1ドメイン(「MG1」)に1:1の比で結合し、この結晶構造の非対称単位は、図22Aに示すように、2つの複合体である分子1と分子2を含んでいた。分子1および2は、図22Bに示すように、全ての残基においてCα原子位置のRMSDが0.717Åで良好に重ね合わせることができる。以下で説明する図面は、分子1を用いて作成された。
実施例4.5および4.6に記載したように、305抗体シリーズを含む抗C5 MAbを、ウエスタンブロットおよびBIACORE(登録商標)結合解析によって、3つのヒトC5点変異体であるE48A、D51A、およびK109Aへの結合について試験した。305変異体はWT C5に強く結合したが、E48A C5変異体には弱くしか結合せず、D51AおよびK109A変異体には結合しなかった。305 FabとMG1の複合体の結晶構造は、図24Aに示すように、これら3つのアミノ酸E48、D51、およびK109が全て305 Fabから3.0Å以内の距離にあって、該Fabといくつかの水素結合を形成していることを明らかにした。より詳細に考察すると、MG1のK109残基は、Fabの重鎖の界面に形成された溝に埋もれており、H-CDR3_G97、H-CDR3_Y100、およびH-CDR3_T100bとの3つの水素結合によって、ならびにH-CDR3_D95との塩橋によって、Fabと強固に相互作用している(図24D)。D51は、MG1と305 Fabの重鎖との間に位置しており、H-CDR1_Ser32およびH-CDR2_Ser54と2つの水素結合を形成して空間を埋めている(図24C)。これらは、C5のK109とD51の両方が、305抗体シリーズの結合にとって極めて重要な残基であることを示している。一方、E48は、表面の比較的近くに位置し、Fabとの水素結合は1つしか形成しておらず、このことは、抗体結合へのその寄与がK109およびE51のそれを下回るであろうことを示唆している(図24B)。これらの関係は、ヒトC5変異体のウエスタンブロットおよびBIACORE(登録商標)結合解析の結果と一致している(実施例4.5および4.6)。補足事項:Fabのアミノ酸の残基番号付けは、Kabat番号付けスキームに基づく。(Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, Md., 1991)
結晶構造解析は、図23Aおよび図25Aに示すように、ヒトC5上の3つのヒスチジン残基、すなわちH70、H72、およびH110が、305変異体Fabのエピトープに含まれていることを明らかにした。ヒトC5と305変異体Fabの間のpH依存的タンパク質-タンパク質相互作用に対するこれらのヒスチジン残基の寄与を調べるために、ヒトC5変異体H70Y、H72Y、H110Y、およびH70Y+H110Yを用いて、BIACORE(登録商標)結合解析を行った(実施例4.7)。H72Yは、C5への305変異体Fabの結合の完全な消失をもたらした。C5のこの残基は、図25Cに示すように、305 Fabの重鎖のCDR2ループとMG1のループ(L73、S74、およびE76)によって形成されたポケット内に位置し、この空間をしっかりと埋めている。さらに、C5のH72残基はH-CDR2_Y58と水素結合を形成している。チロシンの比較的嵩高い側鎖を収容するのに充分な空間がないので、H72Y変異は許容されないと予想される。また、H-CDR2_Y58との水素結合を維持することもできない。H70およびH110のpH依存性への寄与に関しては、H70YおよびH110Y変異が、pH5.8でC5からの305変異体Fabの比較的遅い解離をもたらした。H70はMG1のT53と分子内水素結合を形成しているが、pH5.8でC5のH70がプロトン化されると、MG1の相互作用界面の対応部分で立体構造変化が起こり、この水素結合は破壊されると考えられる(図25B)。H110に関しては、このC5残基のプロトン化が305 Fabに対する電荷反発を引き起こすと予想され、これは隣接ヒスチジン残基H-CDR3_H100cのプロトン化によって増強されうる(図25D)。
Claims (8)
- C5に結合する単離されたモノクローナル抗体であって、pH5.8においてよりもpH7.4において高いアフィニティで、C5のβ鎖(配列番号:40)のアミノ酸33-124からなる断片内のエピトープに結合する抗体であり、かつ当該エピトープはアミノ酸47-57、70-76、および107-110からなる群より選択される少なくとも1つの断片を含む、抗体。
- Glu48、Asp51、His70、His72、Lys109、およびHis110からなる群より選択される少なくとも1つのアミノ酸を含む、C5のβ鎖(配列番号:40)の断片内のエピトープに結合する、請求項1に記載の抗体。
- C5の活性化を阻害する、請求項1〜2のいずれか一項に記載の抗体。
- C5変異体R885Hの活性化を阻害する、請求項1〜3のいずれか一項に記載の抗体。
- ヒト抗体、ヒト化抗体、またはキメラ抗体である、請求項1〜4のいずれか一項に記載の抗体。
- C5に結合する抗体断片である、請求項1〜5のいずれか一項に記載の抗体。
- 全長IgG1抗体または全長IgG4抗体である、請求項1〜5のいずれか一項に記載の抗体。
- 請求項1〜7のいずれか一項に記載の抗体および薬学的に許容される担体を含有する薬学的製剤。
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