JP5160636B2 - c−kitおよびPDGFRキナーゼ阻害剤としてのピリミジン誘導体および組成物 - Google Patents
c−kitおよびPDGFRキナーゼ阻害剤としてのピリミジン誘導体および組成物 Download PDFInfo
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Description
本出願は、2007年5月4日に出願した米国仮特許出願番号第60/916,035号に対する優先権の利益を主張する。この出願の開示は全て、参照することにより、その全体が、全ての目的のために、本明細書中に組み込まれる。
発明の属する技術分野
本発明は、新規化合物群、そのような化合物を含む医薬組成物、またそのような化合物を、異常なまたは調節解除されたキナーゼ活性と関連のある疾患または障害、特にc−kit、PDGFRαおよびPDGFRβキナーゼの異常活性化を含む疾患または障害を処置するまたは予防するために使用する方法を提供する。
タンパク質キナーゼは、広範囲にわたる様々な細胞過程の調節において中心的役割を果たし、そして細胞機能に対する制御を維持する、タンパク質の大きなファミリーを表す。これらのキナーゼの一部の非限定的なリストには、血小板由来増殖因子受容体キナーゼ(PDGF−R)、神経成長因子受容体、trkB、および線維芽細胞増殖因子受容体であるFGFR3、B−RAFのような受容体チロシンキナーゼ;Ablおよび融合キナーゼであるBCR−Abl、Lck、Bmxおよびc−srcのような非受容体チロシンキナーゼ;ならびにc−RAF、sgk、MAPキナーゼ(例えば、MKK4、MKK6等)およびSAPK2αおよびSAPK2βのようなセリン/スレオニンキナーゼが含まれる。良性および悪性の増殖性障害、ならびに免疫および神経系の不適切な活性化から生ずる疾患を含む、多くの疾患状態において、異常なキナーゼ活性が観察されている。
一態様において、本発明は、式I:
Lは、
R1、R2aおよびR2bは、水素、C3−8ヘテロシクロアルキル、C1−4アルキル、C1−4アルコキシ、ハロ置換されたC1−4アルコキシ、ハロ置換されたC1−4アルキル、−NR10R11、−OX1R8(ここで、X1は、結合およびC1−4アルキレンから選択され;R8は、C3−12シクロアルキルである。)から各々独立して選択されるか;またはR1とR2aまたはR1とR2bは、R1およびR2aまたはR2bが結合している炭素原子と一体となってフェニルを形成し(すなわち、マーカッシュ構造のピリジル環がR1/R2aまたはR1/R2bから形成されたフェニル環に縮合し、それによって、キノリニルまたはイソキノリニル環系を作り出す。);R10およびR11は、水素、C1−4アルキル、C1−4アルコキシ、ハロ置換されたC1−4アルコキシ、ハロ置換されたC1−4アルキル、C3−8ヘテロシクロアルキル、C1−10ヘテロアリールから独立して選択されるか;またはR10とR11は、R10およびR11が両方結合している窒素と一体となってC3−8ヘテロシクロアルキルまたはC1−10ヘテロアリールを形成し;
R3は、C6−10アリール、C1−10ヘテロアリール、C3−12シクロアルキルおよびC3−8ヘテロシクロアルキルから選択され;ここで、R3の該アリール、ヘテロアリール、シクロアルキルまたはヘテロシクロアルキルは、水素、ハロ、シアノ、C1−6アルキル、C1−6アルコキシ、ハロ置換されたC1−6アルキル、ハロ置換されたC1−6アルコキシ、C6−10アリール−C0−4アルキル、ヘテロアリール、ヘテロシクリル、−X2NR5aR5b、−X2NR5aOR5b、−X2C(O)R5a、−X2S(O)0−2R5a、−X2OX3R5a、−X2R5a、−X2C(O)OR5a、−X2OR5aおよび−X2OX3OR5aから独立して選択される1〜3個のラジカルで置換されており;ここで、X2およびX3は、結合およびC1−4アルキレンから独立して選択され;そしてR5aおよびR5bは、水素、C1−6アルキル、C6−10アリール、C3−12シクロアルキル、C1−10ヘテロアリールおよびC3−12ヘテロシクロアルキルから各々独立して選択され;
ここで、R3の該アリール、シクロアルキル、ヘテロアリールまたはヘテロシクロアルキル置換基は、所望により、ハロ、ヒドロキシ、シアノ、C1−6アルキル、C1−6アルコキシ、ハロ置換されたC1−6アルキル、ハロ置換されたC1−6アルコキシ、−X4OR6、−X4C(O)OR6、−X4C(O)NR6R6および−X4R6から独立して選択される1〜3個のラジカルでさらに置換され得て;ここで、X4は、結合およびC1−4アルキレンから選択され;そしてR6は、水素、C1−6アルキルおよびC3−12ヘテロシクロアルキルから選択される。]
の化合物:ならびにN−オキシド誘導体、プロドラッグ誘導体、保護誘導体、個々の異性体およびその異性体の混合物;ならびにそのような化合物の薬学的に許容される塩および溶媒和物(例えば、水和物)を提供する。
定義
1つの基としての、また他の基、例えば、ハロ置換されたアルキルおよびアルコキシの構造要素としての“アルキル”は、直鎖状または分岐鎖状のいずれかであり得る。C1−4アルコキシには、メトキシ、エトキシ等が含まれる。ハロ置換されたアルキルには、トリフルオロメチル、ペンタフルオロエチル等が含まれる。
c−kit遺伝子は、受容体チロシンキナーゼをコードし、c−kit受容体に対するリガンドは幹細胞因子(SCF)と呼ばれ、これは、肥満細胞生存に関する主要増殖因子である。c−kit受容体タンパク質チロシンキナーゼの活性は、正常細胞において調節され、c−kit遺伝子産物の正常な機能活性は、正常な造血、メラニン形成、配偶子形成(genetogenesis)、および肥満細胞の増殖および分化の維持に必須である。SCF結合の非存在下でc−kitキナーゼ活性の構成的活性化を引き起こす変異は、肥満細胞症からヒト悪性癌まで幅広い種々の疾患に関与する。
R1、R2aおよびR2bは、水素、C3−8ヘテロシクロアルキル、C1−4アルキル、C1−4アルコキシ、ハロ置換されたC1−4アルコキシ、ハロ置換されたC1−4アルキル、−NR10R11、−OX1R8(ここで、X1は、結合およびC1−4アルキレンから選択され;R8は、C3−12シクロアルキルである。)から独立して選択されるか;またはR1とR2aまたはR1とR2bは、R1およびR2aまたはR1およびR2bが結合している炭素原子と一体となってフェニルを形成し;R10およびR11は、水素、C1−4アルキル、C1−4アルコキシ、ハロ置換されたC1−4アルコキシ、ハロ置換されたC1−4アルキル、C3−8ヘテロシクロアルキル、C1−10ヘテロアリールから独立して選択されるか;またはR10とR11は、R10およびR11が両方結合している窒素と一体となってC3−8ヘテロシクロアルキルまたはC1−10ヘテロアリールを形成し;
R3は、C6−10アリールおよびC1−10ヘテロアリールから選択され;ここで、該アリールまたはヘテロアリールは、ハロ、シアノ、C1−6アルキル、C1−6アルコキシ、ハロ置換されたC1−6アルキル、ハロ置換されたC1−6アルコキシ、C6−10アリール−C0−4アルキル、ヘテロアリール、ヘテロシクリル、−X2NR5aR5b、−X2NR5aOR5b、−X2C(O)R5a、−X2S(O)0−2R5a、−X2OX3R5a、−X2R5a、−X2C(O)OR5a、−X2OR5aおよび−X2OX3OR5aから独立して選択される1〜3個のラジカルで置換されており;ここで、X2およびX3は、結合およびC1−4アルキレンから独立して選択され;そしてR5aおよびR5bは、水素、C1−6アルキル、C3−12シクロアルキル、C1−10ヘテロアリールおよびC3−12ヘテロシクロアルキルから各々独立して選択され;
ここで、R3の該アリール、シクロアルキル、ヘテロアリールまたはヘテロシクロアルキル置換基は、所望により、ハロ、ヒドロキシ、シアノ、C1−6アルキル、C1−6アルコキシ、ハロ置換されたC1−6アルキル、ハロ置換されたC1−6アルコキシ、−X4OR6、−X4C(O)OR6、−X4C(O)NR6R6および−X4R6から独立して選択される1〜3個のラジカルでさらに置換され得て;ここで、X4は、結合およびC1−4アルキレンから選択され;そしてR6は、水素、C1−6アルキルおよびC3−12ヘテロシクロアルキルから選択される。
本発明の化合物は、キナーゼの活性を調節し、またそのことから、キナーゼが疾患の病状および/または症状の一因となる疾患または障害を処置するのに有用である。本明細書中に記載する化合物および組成物により阻害され、また本明細書中に記載する方法が有用であるキナーゼの例には、限定されるものではないが、c−kit、PDGFRα、PDGFRβ、Lyn、MAPK14(p38δ)、ARG、BCR−Abl、BRK、EphB、Fms、Fyn、KDR、LCK、b−Raf、c−Raf、SAPK2、Src、Tie2およびTrkBキナーゼが含まれる。
CSKは、癌細胞、特に結腸癌の転移能に影響を与える。
一般に、本発明の化合物は、単独で、または1種以上の治療剤と組み合わせて、当業界で知られている通常かつ許容され得る方法のいずれかによって、治療上有効な量で投与される。治療上有効な量は、疾患の重症度、対象の年齢および相対的健康状態、使用する化合物の効力、ならびに他の因子によって大幅に異なり得る。一般に、満足のいく結果は、約0.03〜2.5mg/kg(体重)の1日投薬量で全身に得られることが示される。大型哺乳類、例えば、ヒトにおいて指示された1日投薬量は、約0.5mg〜約100mgの範囲内であり、例えば、1日4回までの分割用量で、または遅延型で便利に投与される。経口投与に適当な単位投薬形態は、約1〜50mgの活性成分を含む。
本発明にはまた、本発明の化合物の製造方法も含まれる。記載する反応において、反応性官能基、例えば、ヒドロキシ、アミノ、イミノ、チオまたはカルボキシ基を、これらは、最終製品において望ましいとき、保護して、その反応におけるそれらの不要な参加を回避することが必要であり得る。標準的な技法に従って、従来の保護基が使用され得る。例えば、T. W. GreeneおよびP. G. M. Wuts、“Protective Groups in Organic Chemistry”において、John Wiley and Sons、1991年を参照。
本発明の化合物は、遊離塩基型の化合物を薬学的に許容される無機または有機酸と反応させることにより、薬学的に許容される酸付加塩として製造され得る。あるいはまた、本発明の化合物の薬学的に許容される塩基付加塩は、遊離酸型の化合物を薬学的に許容される無機または有機塩基と反応させることにより製造され得る。あるいはまた、本発明の化合物の塩の形態は、出発物質または中間体の塩を使用して製造され得る。
(a)反応スキームIの方法;および
(b)所望により、本発明の化合物の薬学的に許容される塩への変換;
(c)所望により、本発明の化合物の塩の形態の塩ではない形態への変換;
(d)所望により、本発明の化合物の未酸化型の薬学的に許容されるN−オキシドへの変換;
(e)所望により、本発明の化合物のN−オキシド型のその未酸化型への変換;
(f)所望により、本発明の化合物の個々の異性体の異性体の混合物からの分割;
(g)所望により、本発明の非誘導体化化合物の薬学的に許容されるプロドラッグ誘導体への変換;ならびに
(h)所望により、本発明の化合物のプロドラッグ誘導体の非誘導体化型への変換;
を含む方法により製造され得る。
限定されるものではないが、本発明による式Iの化合物の製造を説明する以下の実施例により、本発明をさらに実証する。
本発明の化合物をアッセイして、野生型Ba/F3細胞ならびにTel c−kitキナーゼおよびTel PDGFR融合チロシンキナーゼで形質転換されたBa/F3細胞の増殖を選択的に阻害するそれらの能力を測定する。加えて、本発明の化合物は、Mo7e細胞におけるSCF依存性増殖を選択的に阻害する。さらに、化合物をアッセイして、Abl、ARG、BCR−Abl、BRK、EphB、Fms、Fyn、KDR、c−kit、LCK、PDGF−R、b−Raf、c−Raf、SAPK2、Src、Tie2およびTrkBキナーゼを阻害するそれらの能力を測定する。
化合物を、wt Ba/F3細胞およびTel融合チロシンキナーゼで形質転換されたBa/F3細胞の増殖を阻害するそれらの能力に関して試験する。非形質転換Ba/F3細胞を、組み換えIL3を含む培地で維持する。細胞を1ウェルあたり50ulの培地に5,000細胞で384ウェルのTCプレートへと播種して、試験化合物を0.06nM〜10μMで加える。次いで、その細胞を、37℃、5% CO2で48時間インキュベートする。その細胞をインキュベートした後、製造業者の説明書に従って、ブライト・グロ(BRIGHT GLO)(商標)(プロメガ(Promega)社)25μLを各々のウェルに加えて、アナリスト(Analyst) GT−発光モード−RLUで50000積分時間を使用して、そのプレートを読み取る。50% 阻害に必要な化合物の濃度であるIC50値を用量反応曲線から決定する。
96ウェルのフォーマットにおいてc−kitを内因的に発現するMo7e細胞を使用して、本明細書中に記載する化合物をSCF依存性増殖の阻害に関して試験する。簡単に言えば、連続的に2倍希釈した試験化合物(Cmax=10μM)を、ヒト組み換えSCFで刺激したMo7e細胞のそれらの抗増殖活性に関して評価する。37℃で48時間インキュベーションした後、プロメガ社製のMTT比色アッセイを使用することにより、細胞生存率を測定する。
キナーゼ緩衝液(20mM トリス pH 7.5、10mM MgCl2、0.01% BSA、0.1% Brij35、1mM DTT、5% グリセロール、0.05mM Na3VO4)中、25ngのc−kit(5ng/μL)および2μMのビオチン−EEEPQYEEIPIYLELLP−NH2ペプチドである、2倍濃度のc−kit酵素ミックスの一定量(5μL)を384のプロキシプレート(proxiplate)(パッカード(Packard)社)の各々のウェルに加える。そのプロキシプレートの最終列の各々のウェルは、バックグラウンドレベルを確かめるために、c−kit無しでc−kit酵素ミックス5μLを有する。本発明の化合物を各々のウェルに加えて、そのプレートを室温で30分間インキュベートする。キナーゼ緩衝液(5μL)中の2倍のATP(40μM)を各々のウェルに加えて、そのプレートを室温で3時間インキュベートする。検出ミックス(50% KF、40% キナーゼ緩衝液、10% EDTA、1:100に希釈したMab PT66−K(カタログ番号61T66KLB)および1:100に希釈したストレプトアビジン−XL(カタログ番号611SAXLB))(10μL)を各々のウェルに加えて、そのプレートを室温でさらに1〜2時間インキュベートする。次いで、HTRFシグナルを検出器で読み取る。
ヒトTG−HA−VSMC細胞(ATCC)を、10% FBSを補充したDMEMにおいて80−90%の集密度まで増殖させた後、1% FBSおよび30ng/mL 組み換えヒトPDGF−BBを補充したDMEMに6e4細胞/mLの割合で再懸濁させる。次いで、細胞を50uL/ウェルの割合で384ウェルのプレートへとアリコートし、37℃で20時間インキュベートした後、100倍の化合物0.5uLで37℃にて48時間処理する。処理した後、25uLのセルタイター−グロ(CellTiter−Glo)を各々のウェルに15分間加えた後、そのプレートをCLIPR(モレキュラー・デバイシズ(Molecular Devices)社)で読み取る。
2倍濃度のPDGERβペプチドおよびATPミックス(4μM ビオチン−βA−βA−βA−AEEEEYVFIEAKKKペプチド、アッセイ緩衝液(20mM ヘペス(Hepes)、54mM MgCl2、0.01% BSA、0.05% ツイーン(Tween)−20、1mM DTT、10% グリセロール、50μM Na3VO4)中の20μM ATP)のアリコート(2.5μL)を384のプロキシプレート(パッカード社)の各々のウェルに加える。そのプレートを遠心分離して、本発明の化合物(50nL)をピンツール(pintool)ディスペンサーによって各々のウェルに加える。各々のウェルに、2倍濃度の酵素ミックス(アッセイ緩衝液中、4.5ng/μLでのPDGFRα(カタログ番号PV4117)または1.5ng/μLでのPDGFRβ(カタログ番号PV3591))またはPDGFRα/β酵素無しのアッセイ緩衝液単独(2.5μL)を加える。そのプレートを室温で1.5時間インキュベートする。検出ミックス(5μL;50% 1M KF、40% キナーゼ緩衝液、10% EDTA、1:100に希釈したMab PT66−K(カタログ番号61T66KLB)および1:100に希釈したストレプトアビジン−XL(カタログ番号611SAXLB))を各々のウェルに加えて、そのプロキシプレートを室温で1時間インキュベートした後、HTRFシグナルを検出器で読み取る。
使用するマウス細胞株は、全長FLT3構築物を過剰発現するBa/F3 マウスプロ−B細胞株である。これらの細胞を、マウス組み換えIL3を加えて、ペニシリン 50μg/mL、ストレプトマイシン 50μg/mLおよびL−グルタミン 200mMを補充したRPMI 1640/10% ウシ胎仔血清(RPMI/FBS)中で維持する。Ba/F3 全長FLT3細胞は、IL3飢餓に16時間付された後、1ウェルあたり25uLの培地に5,000細胞の割合で384ウェルのTCプレートへと播種して、試験化合物を0.06nM〜10μMで加える。その化合物を加えた後、細胞毒性制御のためのFLT3リガンドまたはIL3を1ウェルあたり25uLの培地に適当な濃度で加える。次いで、その細胞を、37℃、5% CO2で48時間インキュベートする。その細胞をインキュベートした後、製造業者の説明書に従って、ブライト・グロ(商標)(プロメガ社)25μLを各々のウェルに加えて、アナリスト GT−発光モード−RLUで50000積分時間を使用して、そのプレートを読み取る。
使用するマウス細胞株は、BCR−Abl cDNAで形質転換された32D造血前駆細胞株(32D−p210)である。これらの細胞を、ペニシリン 50μg/mL、ストレプトマイシン 50μg/mLおよびL−グルタミン 200mMを補充したRPMI/10% ウシ胎仔血清(RPMI/FCS)中で維持する。非形質転換32D細胞を、15%のWEHI馴化培地をIL3源として加えて、同様に維持する。
32D−p210細胞を96ウェルのTCプレートに1ウェルあたり15,000細胞の密度で播種する。2倍連続希釈の試験化合物50μL(Cmaxは、40μMである。)を各々のウェル(STI571が陽性対照として含まれる。)に加える。その細胞を、37℃、5% CO2で48時間インキュベートした後、MTT(プロメガ社)15μLを各々のウェルに加えて、その細胞をさらに5時間インキュベートする。570nmでの光学密度を分光光度法で定量化して、50% 阻害に必要な化合物の濃度であるIC50値を用量反応曲線から決定する。
32Dおよび32D−p210細胞を5mLの培地に1ウェルあたり2.5×106細胞の割合で6ウェルのTCプレートへと播種して、試験化合物を1または10μMで加える(STI571が対照として含まれる。)。次いで、その細胞を、37℃、5% CO2で24または48時間インキュベートする。細胞懸濁液2mLをPBSで洗浄し、70% EtOHに1時間固定して、PBS/EDTA/RNアーゼ Aで30分間処理する。ヨウ化プロピジウム(Cf=10μg/ml)を加えて、蛍光強度をFACSカリバー(FACScalibur)(商標)システム(BDバイオサイエンス(BD Biosciences)社)でのフローサイトメトリーにより定量化する。本発明の試験化合物は、32D−p210細胞に対するアポトーシス効果を実証するが、32D親細胞ではアポトーシスを誘発しない。
BCR−Abl自己リン酸化を、c−abl特異的捕捉抗体および抗ホスホチロシン抗体を使用して、捕捉イライザ(Elisa)で定量化する。32D−p210細胞を50μLの培地において1ウェルあたり2×105細胞で96ウェルのTCプレートに播種する。2倍連続希釈の試験化合物50μL(Cmaxは、10μMである。)を各々のウェル(STI571が陽性対照として含まれる。)に加える。その細胞を、37℃、5% CO2で90分間インキュベートする。次いで、その細胞を、プロテアーゼおよびホスファターゼ阻害剤を含む溶解緩衝液(50mM トリス−HCl、pH 7.4、150mM NaCl、5mM EDTA、1mM EGTAおよび1% NP−40)150μLを用いて、氷上で1時間処理する。細胞溶解物50μLを抗abl特異的抗体で予め被覆された96ウェルのオプティプレート(optiplates)に加えて、ブロックする。そのプレートを4℃で4時間インキュベートする。TBS−ツイーン20緩衝液で洗浄した後、アルカリホスファターゼが結合した抗ホスホチロシン抗体50μLを加えて、そのプレートを4℃でさらに一晩インキュベートする。TBS−ツイーン20緩衝液で洗浄した後、発光基質90μLを加えて、アクキュエスト(商標)システム(モレキュラー・デバイス社)を使用して、発光を定量化する。BCR−Abl発現細胞の増殖を阻害する本発明の試験化合物は、細胞のBCR−Abl自己リン酸化を用量依存的方法で阻害する。
本発明の化合物を、STI571に抵抗性または感受性の減少を与えるBCR−Ablの野生型または変異型(G250E、E255V、T315I、F317L、M351T)のいずれかを発現するBa/F3細胞に対するそれらの抗増殖効果に関して試験する。変異体−BCR−Abl発現細胞に対する、また非形質転換細胞に対する、これらの化合物の抗増殖効果を、先に記載した通り(IL3を欠く培地において)、10、3.3、1.1および0.37μMで試験した。非形質転換細胞に対する毒性を欠く化合物のIC50値を、先に記載したようにして得られた用量反応曲線から決定した。
精製FGFR3(アップステート(Upstate)社)を用いてのキナーゼ活性アッセイを、キナーゼ緩衝液(30mM トリス−HCl pH 7.5、15mM MgCl2、4.5mM MnCl2、15μM Na3VO4および50μg/mL BSA)中、0.25μg/mLの酵素、および基質(5μg/mL ビオチン−ポリ−EY(Glu、Tyr)(CIS−US社)および3μM ATP)を含む、最終容量10μLにおいて行う。2つの溶液を作成する:最初に、キナーゼ緩衝液中にFGFR3酵素を含む1つ目の溶液5μLを384フォーマットのプロキシプレート(ProxiPlate)(商標)(パーキン−エルマー(Perkin−Elmer))へと分注した後、DMSOに溶解した化合物50nLを加え、次いで、キナーゼ緩衝液中に基質(ポリ−EY)およびATPを含む2つ目の溶液5μLを各々のウェルに加えた。その反応物を室温で1時間インキュベートし、HTRF検出混合物10μLを加えることにより停止させ、これは、30mM トリス−HCl pH 7.5、0.5M KF、50mM EDTA、0.2mg/mL BSA、15μg/mL ストレプトアビジン−XL665(CIS−US社)および150ng/mL クリプテートが結合した抗ホスホチロシン抗体(CIS−US社)を含む。ストレプトアビジン−ビオチン相互作用を可能とするために、室温で1時間インキュベーションした後、時間分解蛍光(florescent)シグナルをアナリスト GT(モレキュラー・デバイス社)で読み取る。IC50値を、12の濃度(50μMから0.28nMまでの1:3希釈)での各々の化合物のパーセント阻害の線形回帰分析により計算する。このアッセイにおいて、本発明の化合物は、10nM〜2μMの範囲内にIC50を有する。
本発明の化合物を、形質転換Ba/F3−TEL−FGFR3細胞増殖を阻害するそれらの能力に関して試験し、これは、FGFR3細胞キナーゼ活性に依存する。懸濁液中、培養培地として10% ウシ胎仔血清を補充したRPMI 1640と共に、Ba/F3−TEL−FGFR3を800,000細胞/mLまで培養する。細胞を50μLの培養培地に5000細胞/ウェルの割合で384ウェルフォーマットのプレートへと分注する。本発明の化合物をジメチルスルホキシド(dimethylsufoxide)(DMSO)に溶解して希釈する。12ポイントの1:3連続希釈をDMSOへと作成して、典型的には、10mMから0.05μMまでの範囲にわたる濃度勾配を作り出す。細胞を希釈化合物50nLと共に加えて、細胞培養インキュベーター中で48時間インキュベートする。増殖細胞により作り出される還元環境をモニターするために使用され得るアラマー・ブルー(Alamar Blue)(商標)(トレック・ダイアグノスティック・システムズ(TREK Diagnostic Systems))を最終濃度10%で細胞に加える。37℃の細胞培養インキュベーター中でさらに4時間インキュベーションした後、還元されたアラマー・ブルー(商標)からの蛍光シグナル(530nmで励起、580nmで発光)をアナリスト GT(モレキュラー・デバイス社)で定量化する。IC50値を、12の濃度での各々の化合物のパーセント阻害の線形回帰分析により計算する。
本発明の化合物を、b−Rafの活性を阻害するそれらの能力に関して試験する。そのアッセイは、壁が黒で底が透明な384ウェルのマキシソープ(MaxiSorp)プレート(NUNC社)で行う。基質であるIκBαをDPBSに希釈して(1:750)、15μLを各々のウェルに加える。そのプレートを4℃で一晩インキュベートして、EMBLAプレート洗浄機を使用して、TBST(25mM トリス pH 8.0、150mM NaClおよび0.05% ツイーン−20)で3回洗浄する。プレートをスーパーブロック(Superblock)(15μL/ウェル)により室温で3時間ブロックし、TBSTで3回洗浄して、パットを乾燥させる。20μM ATP(10μL)を含むアッセイ緩衝液を各々のウェルに加えた後、化合物100nLまたは500nLを加える。B−Rafをアッセイ緩衝液に(1μLを25μLへと)希釈して、希釈したb−Raf10μLを各々のウェルに加える(0.4μg/ウェル)。そのプレートを室温で2.5時間インキュベートする。そのプレートをTBSTで6回洗浄することにより、キナーゼ反応を停止させる。ホスホ(Phosph)−IκBα(Ser32/36)抗体をスーパーブロックに希釈して(1:10,000)、15μLを各々のウェルに加える。そのプレートを4℃で一晩インキュベートして、TBSTで6回洗浄する。APが結合したヤギ抗マウスIgGをスーパーブロックに希釈して(1:1,500)、15μLを各々のウェルに加える。プレートを室温で1時間インキュベートして、TBSTで6回洗浄する。蛍光アトフォス(Attophos)AP基質(プロメガ社)15μLを各々のウェルに加えて、プレートを室温で15分間インキュベートする。蛍光強度プログラム(励起455nm、発光580nm)を使用して、プレートをアクキュエストまたはアナリスト GTで読み取る。
本発明の化合物を、MEKのリン酸化を阻害するそれらの能力に関してA375細胞で試験する。A375細胞株(ATCC)は、ヒト黒色腫患者から誘導されて、それは、B−Raf遺伝子でのV599E変異を有する。B−Rafの変異のために、リン酸化MEKのレベルを評価する。サブコンフルエント乃至コンフルエントなA375細胞を化合物と共に無血清培地において37℃で2時間インキュベートする。次いで、細胞を冷PBSで1回洗浄して、1% トリトン(Triton)X100を含む溶解緩衝液で溶解する。遠心分離した後、上澄みをSDS−PAGEにかけて、次いで、ニトロセルロース膜に移す。次いで、その膜を抗−ホスホ−MEK抗体(ser217/221)(セル・シグナリング(Cell Signaling)社)と共にウエスタンブロットにかける。リン酸化MEKの量をニトロセルロース膜上のホスホ−MEKバンドの密度によりモニターする。
本発明の化合物を、キナーゼパネルの個々メンバーを阻害するそれらの能力に関して評価する。この一般的プロトコルに従って、その化合物を最終濃度10μMで二重に試験する。キナーゼ緩衝液組成物および基質は、“アップステート社のキナーゼプロフィルター(商標)”パネルに含まれる様々なキナーゼによって異なることに注意すべきである。キナーゼ緩衝液(2.5μL、10倍−必要な場合には、MnCl2を含む。)、活性キナーゼ(0.001−0.01単位;2.5μL)、キナーゼ緩衝液中の特異的またはポリ(Glu4−Tyr)ペプチド(5−500μMまたは.01mg/ml)およびキナーゼ緩衝液(50μM;5μL)を氷上のエッペンドルフ中で混合する。Mg/ATPミックス(10μL;67.5(または33.75)mM MgCl2、450(または225)μM ATPおよび1μCi/μl[γ−32P]−ATP(3000Ci/mmol))を加えて、その反応を約30℃で約10分間インキュベートする。その反応混合物を2cm×2cmのP81(ホスホセルロース、正電荷を持つペプチド基質用)またはワットマン(Whatman) No.1(ポリ(Glu4−Tyr)ペプチド基質用)正方紙上にスポットする(20μL)。そのアッセイ正方紙を0.75% リン酸で各々5分間4回洗浄して、アセトンで5分間1回洗浄する。そのアッセイ正方紙をシンチレーションバイアルに移し、シンチレーションカクテル5mlを加えて、ペプチド基質への32P取り込み(cpm)をベックマン(Beckman)社のシンチレーションカウンターで定量化する。各々の反応に関して阻害パーセントを計算する。
Claims (5)
- 式I:
Lは、
R1、R2aおよびR2bは、水素、C3−8ヘテロシクロアルキル、C1−4アルキル、C1−4アルコキシ、ハロ置換されたC1−4アルコキシ、ハロ置換されたC1−4アルキル、−NR10R11、−OX1R8(ここで、X1は、結合およびC1−4アルキレンから選択され;R8は、C3−12シクロアルキルである。)から各々独立して選択されるか;またはR1とR2aまたはR1とR2bは、R1およびR2aまたはR2bが結合している炭素原子と一体となってフェニルを形成し;R10およびR11は、水素、C1−4アルキル、C1−4アルコキシ、ハロ置換されたC1−4アルコキシ、ハロ置換されたC1−4アルキル、C3−8ヘテロシクロアルキル、C1−10ヘテロアリールから独立して選択されるか;またはR10とR11は、R10およびR11が両方結合している窒素と一体となってC3−8ヘテロシクロアルキルもしくはC1−10ヘテロアリールを形成し;
R3は、C6−10アリール、C1−10ヘテロアリール、C3−12シクロアルキルおよびC3−8ヘテロシクロアルキルから選択され;ここで、R3の該アリール、ヘテロアリール、シクロアルキルまたはヘテロシクロアルキルは、水素、ハロ、シアノ、C1−6アルキル、C1−6アルコキシ、ハロ置換されたC1−6アルキル、ハロ置換されたC1−6アルコキシ、C6−10アリール−C0−4アルキル、ヘテロアリール、ヘテロシクリル、−X2NR5aR5b、−X2NR5aOR 5b 、−X2C(O)R5a、−X2S(O)0−2R5a、−X2OX3R5a、−X2R5a、−X2C(O)OR5a、−X2OR5aおよび−X2OX3OR5aから独立して選択される1〜3個のラジカルで置換されており;ここで、X2およびX3は、結合およびC1−4アルキレンから独立して選択され;そしてR5aおよびR5bは、水素、C1−6アルキル、C6−10アリール、C3−12シクロアルキル、C1−10ヘテロアリールおよびC3−12ヘテロシクロアルキルから各々独立して選択され;
ここで、R3の該アリール、シクロアルキル、ヘテロアリールまたはヘテロシクロアルキル置換基は、所望により、ハロ、ヒドロキシ、シアノ、C1−6アルキル、C1−6アルコキシ、ハロ置換されたC1−6アルキル、ハロ置換されたC1−6アルコキシ、−X4OR6、−X4C(O)OR6、−X4C(O)NR6R6および−X4R6から独立して選択される1〜3個のラジカルでさらに置換され得て;ここで、X4は、結合およびC1−4アルキレンから選択され;そしてR6は、水素、C1−6アルキルおよびC3−12ヘテロシクロアルキルから選択される。]
の化合物:またはその薬学的に許容される塩。 - Lが、
R1、R2aおよびR2bが、水素、C3−8ヘテロシクロアルキル、C1−4アルキル、C1−4アルコキシ、ハロ置換されたC1−4アルコキシ、ハロ置換されたC1−4アルキル、−NR10R11、−OX1R8(ここで、X1は、結合およびC1−4アルキレンから選択され;R8は、C3−12シクロアルキルである。)から独立して選択されるか;またはR1とR2aが、R1およびR2aが結合している炭素原子と一体となってフェニルを形成し;R10およびR11は、水素、C1−4アルキル、C1−4アルコキシ、ハロ置換されたC1−4アルコキシ、ハロ置換されたC1−4アルキル、C3−8ヘテロシクロアルキル、C1−10ヘテロアリールから独立して選択されるか;またはR10とR11は、R10およびR11が両方結合している窒素と一体となってC3−8ヘテロシクロアルキルまたはC1−10ヘテロアリールを形成し;
R3が、C6−10アリールおよびC1−10ヘテロアリールから選択され;ここで、該アリールまたはヘテロアリールは、ハロ、シアノ、C1−6アルキル、C1−6アルコキシ、ハロ置換されたC1−6アルキル、ハロ置換されたC1−6アルコキシ、C6−10アリール−C0−4アルキル、ヘテロアリール、ヘテロシクリル、−X2NR5aR5b、−X2NR5aOR5b、−X2C(O)R5a、−X2S(O)0−2R5a、−X2OX3R5a、−X2R5a、−X2C(O)OR5a、−X2OR5aおよび−X2OX3OR5aから独立して選択される1〜3個のラジカルで置換されており;ここで、X2およびX3は、結合およびC1−4アルキレンから独立して選択され;そしてR5aおよびR5bは、水素、C1−6アルキル、C3−12シクロアルキル、C1−10ヘテロアリールおよびC3−12ヘテロシクロアルキルから各々独立して選択され;
ここで、R3の該アリールまたはヘテロアリール置換基は、所望により、ハロ、ヒドロキシ、シアノ、C1−6アルキル、C1−6アルコキシ、ハロ置換されたC1−6アルキル、ハロ置換されたC1−6アルコキシ、−X4OR6、−X4C(O)OR6、−X4C(O)NR6R6および−X4R6から独立して選択される1〜3個のラジカルでさらに置換され得て;ここで、X4は、結合およびC1−4アルキレンから選択され;そしてR6は、水素、C1−6アルキルおよびC3−12ヘテロシクロアルキルから選択される;
請求項1に記載の化合物。 - R1が、水素、ピロリジニル、モルホリノ、メトキシ、2−フルオロ−エトキシおよびメチルから選択され;R2aおよびR2bが水素であるか;またはR1とR2aが、R1およびR2aが結合している炭素原子と一体となってフェニルを形成する、請求項2に記載の化合物。
- R3が、ジフルオロメトキシ、ヒドロキシ−メチル、トリフルオロメトキシ、メチル−スルホニル、メトキシおよびエトキシから選択される基で置換されたフェニル;ならびに2,3−ジヒドロベンゾフラン−5−イルから選択される、請求項3に記載の化合物。
- {5−[5−(3−ジフルオロメトキシ−フェニル)−2H−[1,2,4]トリアゾール−3−イル]−2−メチル−フェニル}−(4−ピリジン−3−イル−ピリミジン−2−イル)−アミン;N−(2−メチル−5−(5−(3−(トリフルオロメトキシ)フェニル)−1H−1,2,4−トリアゾール−3−イル)フェニル)−4−(ピリジン−3−イル)ピリミジン−2−アミン;N−(2−メチル−5−(5−(3−(メチルスルホニル)フェニル)−1H−1,2,4−トリアゾール−3−イル)フェニル)−4−(ピリジン−3−イル)ピリミジン−2−アミン;N−(5−(5−(3−メトキシフェニル)−1H−1,2,4−トリアゾール−3−イル)−2−メチルフェニル)−4−(ピリジン−3−イル)ピリミジン−2−アミン;N−(5−(5−(3−エトキシフェニル)−1H−1,2,4−トリアゾール−3−イル)−2−メチルフェニル)−4−(ピリジン−3−イル)ピリミジン−2−アミン;N−(5−(5−(2,3−ジヒドロベンゾフラン−5−イル)−1H−1,2,4−トリアゾール−3−イル)−2−メチルフェニル)−4−(ピリジン−3−イル)ピリミジン−2−アミン;N−(5−(5−(4−(ジフルオロメトキシ)フェニル)−1H−1,2,4−トリアゾール−3−イル)−2−メチルフェニル)−4−(ピリジン−3−イル)ピリミジン−2−アミン;および(3−(3−(4−メチル−3−(4−(ピリジン−3−イル)ピリミジン−2−イルアミノ)フェニル)−1H−1,2,4−トリアゾール−5−イル)フェニル)メタノールから選択される、請求項1に記載の化合物。
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