相關申請案
本申請案主張2016年10月26日申請之美國臨時申請案第62/413,162號及2016年10月26日申請之美國臨時申請案第62/413,166號的優先權，該等申請案中之每一者之內容以引用之方式併入本文中。
1. 化合物之通用描述
在某些實施例中，本揭示內容提供式
I
化合物：
； 或其醫藥學上可接受之鹽，其中 n為1或2； m為1或2； o為0或1； q為1、2或3； R
1
為氫或(C
1
-C
6
)烷基； R
2
為氫或視情況經OH取代之(C
1
-C
6
)烷基或(C
1
-C
6
)烷氧基； 若存在，R
3
及R
4
各自獨立地選自氫、鹵基、OH及(C
1
-C
6
)烷基； R
5
選自NH
2
、-NH(SO
2
)(C
1
-C
6
)烷基、-NH(SO
2
)(C
1
-C
6
)烷基O(C
1
-C
6
)烷基、-NHC(O)(C
1
-C
6
)烷基、-NH(SO
2
)(C
3
-C
6
)環烷基、OH、-O(C
1
-C
6
)烷基、-SO
2
NH
2
、-C(O)NH
2
、-C(O)NH(C
1
-C
6
)烷基、-C(O)N[(C
1
-C
6
)烷基]
2
、-C(O)NH(SO
2
)(C
1
-C
6
)烷基、-C(O)NH(C
1
-C
6
)烷基(SO
2
)(C
1
-C
6
)烷基、-C(O)NH(SO
2
)(C
3
-C
6
)環烷基、-C(O)NH(C
1
-C
6
)烷基OH、-C(O)NH(C
1
-C
6
)烷基O(C
1
-C
6
)烷基及經OH取代之(C
1
-C
4
)烷基，以及 R
6
選自(C
1
-C
6
)烷基、鹵基(C
1
-C
6
)烷基、(C
1
-C
6
)烷氧基、鹵基(C
1
-C
6
)烷氧基、鹵基及氰基。 在某些實施例中，本揭示內容提供式
Ia '
化合物：
； 或其醫藥學上可接受之鹽，其中 n為1或2； m為1或2； o為0或1； q為0、1、2或3； R
1
為氫或(C
1
-C
6
)烷基； R
2
為氫或視情況經OH取代之(C
1
-C
6
)烷基或(C
1
-C
6
)烷氧基； 若存在，R
3
及R
4
各自獨立地選自氫、鹵基、OH及(C
1
-C
6
)烷基； R
5
選自NH
2
、-NH(SO
2
)(C
1
-C
6
)烷基、-NH(SO
2
)(C
1
-C
6
)烷基O(C
1
-C
6
)烷基、-NHC(O)(C
1
-C
6
)烷基、-NH(SO
2
)(C
3
-C
6
)環烷基、OH、-O(C
1
-C
6
)烷基、-SO
2
NH
2
、-C(O)NH
2
、-C(O)NH(C
1
-C
6
)烷基、-C(O)N[(C
1
-C
6
)烷基]
2
、-C(O)NH(SO
2
)(C
1
-C
6
)烷基、-C(O)NH(C
1
-C
6
)烷基(SO
2
)(C
1
-C
6
)烷基、-C(O)NH(SO
2
)(C
3
-C
6
)環烷基、-C(O)NH(C
1
-C
6
)烷基OH、-C(O)NH(C
1
-C
6
)烷基O(C
1
-C
6
)烷基及經OH取代之(C
1
-C
4
)烷基，以及 若存在，R
6
選自(C
1
-C
6
)烷基、鹵基(C
1
-C
6
)烷基、(C
1
-C
6
)烷氧基、鹵基(C
1
-C
6
)烷氧基、鹵基及氰基。
2. 化合物及定義
如本文中所使用，術語「鹵基」及「鹵素」係指選自氟(氟基，F)、氯(氯-，Cl)、溴(-溴基，Br)及碘(碘-，-I)之原子。 單獨或作為較大部分(諸如「烷氧基」或「鹵烷基」及其類似物)之一部分使用之術語「烷基」意謂飽和直鏈或分支鏈單價烴基。除非另外規定，否則烷基通常具有1至6個碳原子，亦即(C
1
-C
6
)烷基。如本文中所使用，「(C
1
-C
6
)烷基」意謂具有以直鏈或分支鏈排列之1至6個碳原子的基團。 術語「鹵烷基」包括單鹵烷基、聚鹵烷基及全鹵烷基，其中鹵素獨立地選自氟、氯、溴及碘。 「烷氧基」意謂經由氧連接原子連接、由-O-烷基表示之烷基。舉例而言，「(C
1
-C
4
)烷氧基」包括甲氧基、乙氧基、丙氧基及丁氧基。 當用於描述可具有多個連接點之化學基團時，連字符(-)指示該基團與所定義之變數的連接點。舉例而言，-NH(SO
2
)(C
3
-C
6
)環烷基意謂用於此基團之連接點在氮原子上。 所揭示之化合物以多種立體異構形式存在。立體異構體為僅在其原子之空間排列中不同之化合物。化合物中之不同空間排列可由例如以下造成：對掌性碳原子(亦即，對掌性中心)之四個不同取代基之定向、雙鍵之兩個或多於兩個取代基之定向或環烷基環上之兩個或多於兩個取代基之定向。 對映異構體為可由一或多個對掌性中心產生之立體異構體之一種類型。對映異構體為鏡像不可重疊之立體異構體對，最常見的原因係其含有充當對掌性中心之一或多個不對稱取代的碳原子。「R」及「S」表示一或多個對掌性碳原子之取代基之絕對組態，其中根據對掌性中心組態為右手側的(順時針旋轉)抑或左手側的(逆時針旋轉)而向各對掌性中心指配前綴「R」或「S」。若轉向為圍繞對掌性碳的順時針或右手側，則表示為針對右之「R」。若轉向為圍繞對掌性碳之逆時針或左手側，則表示為針對左之「S」。 對映異構體純度反映化合物之一個對映異構體主要存在於化合物之其他對映異構體的程度。其藉由用所存在之少量對映異構體之百分比組合物減去主量對映異構體之百分比組合物來確定的。舉例而言，外消旋混合物具有0%之對映異構體純度，而單一完整純對映異構體具有100%之對映異構體純度。具有70%之一種對映異構體及30%之其他的組合物具有40% (70%至30%)之對映異構體純度。 非對映異構體為與目標及鏡像無關的立體異構體且不為對映異構體。不同於為彼此之鏡像且不重疊之對映異構體，非對映異構體不為彼此之鏡像且不重疊。非對映異構體具有兩個或多於兩個對掌性中心。 歸因於雙鍵或環結構之存在，當雙鍵或環上之兩個或多於兩個取代基可具有相對於彼此之不同空間定向時，幾何異構體產生。當幾何異構體之取代基的定向在雙鍵之對置側上時，彼等取代基稱為彼此為「反式」或由字母「E」指示。當幾何異構體之取代基的定向在雙鍵之相同側上時，彼等取代基稱為彼此為「順式」或由字母「Z」指示。 當雙鍵之兩個或多於兩個取代基之組態由以下結構指示時：「E」或「Z」標示、「順式」或「反式」或前述之組合，應理解相對於雙鍵的所描繪之立體化學純度按重量計為至少85%、至少90%、至少95%、至少97%、至少98%或至少99%。相對於雙鍵按重量計之立體化學純度意謂具有雙鍵之經指示立體化學的組合物中之化合物的重量百分比。舉例而言，在具有式
I
或
Ia '
之化合物中，當雙鍵由以下表示時：
或
應理解，化合物按含有所表示反式(亦即，E)雙鍵之組合物中之化合物之重量計具有相對於雙鍵所描繪之反式(E)立體化學之立體化學純度，亦即至少85%、至少90%、至少95%、至少97%、至少98%或至少99%。 幾何異構體亦可基於環基之兩個或多於兩個取代基之定向產生。舉例而言，在式
I
或
Ia '
化合物中， 環丙基之
及
可產生兩個不同順式組態(如在
及
中)；及兩個不同反式組態(如在
及
中)。在未定義環丙基之立體化學的例項中，如在
中，結構包括不含其他順式立體異構體及反式立體異構體的順式異構體或反式異構體中之一者，或替代地順式立體異構體及反式立體異構體之任何混合物 當式
I
或
Ia '
化合物中之環丙基之立體化學僅由結構指示時，結構意欲描繪相對於其他對掌性中心處之立體化學的環丙基中之對掌性中心中之一者處的相對立體化學，且不為環丙基中之任一對掌性中心處的絕對立體化學。舉例而言，當環丙基之立體化學僅由為反式之結構描繪時，相對於環丙基所描繪之反式組態的化合物之立體化學純度按重量計為至少85%、至少90%、至少95%、至少97%、至少98%或至少99%，亦即具有環丙基處之反式立體化學的組合物中之化合物之重量百分比按重量計為至少85%、至少90%、至少95%、至少97%、至少98%或至少99%。舉例而言，由下式表示之化合物；
意謂按組合物中之化合物之重量計至少85%、至少90%、至少95%、至少97%、至少98%或至少99%具有環丙基所描繪之反式組態；按組合物中之化合物之重量計至少至少85%、至少90%、至少95%、至少97%、至少98%或至少99%含有如
之其他反式組態；或按組合物中之化合物之重量計至少85%、至少90%、至少95%、至少97%、至少98%或至少99%為兩個反式組態之混合物。 當化合物中之對掌性中心之絕對立體化學經結構上及由「R」或「S」標示指示時，應理解描繪意謂按重量計呈至少85%、至少90%、至少95%、至少97%、至少98%或至少99%之立體化學純度的經描繪之立體異構體，亦即組合物中之化合物之經指示立體異構體的重量百分比。舉例而言，由下式表示之式
I
或
Ia '
化合物：
意謂按組合物中之式
I
化合物之重量計至少85%、至少90%、至少95%、至少97%、至少98%或至少99%含有所描繪之立體異構體。當藉由結構及藉由「R」或「S」標示描繪之結構為單一對映異構體時，對映異構體純度為至少95% (例如，至少96%、至少97%、至少98%、至少99%、至少99.5%或至少99.9%)。 當在不指示對掌性中心處之立體化學的情況下結構上描繪化合物時，應理解結構包括對掌性中心處之任一組態，或替代地對掌性中心處之組態的任何混合物。 環丙基環之1位置及2位置表示以下：
。 本文所描述之化合物可以醫藥學上可接受之鹽的形式存在。對於用於藥品中，本發明之化合物之鹽係指對無毒的「醫藥學上可接受之鹽」。醫藥學上可接受之鹽形式包括醫藥學上可接受之酸/陰離子或鹼/陽離子鹽。本文中所描述化合物之適合的醫藥學上可接受之酸加成鹽包括例如無機酸(諸如氫氯酸、氫溴酸、磷酸、硝酸及硫酸)之鹽及有機酸(諸如乙酸、苯磺酸、苯甲酸、甲磺酸及對甲苯磺酸)之鹽。具有諸如羧酸之酸基的本教示內容之化合物可與醫藥學上可接受之鹼形成醫藥學上可接受之鹽。適合的醫藥學上可接受之鹼性鹽包括例如銨鹽、鹼金屬鹽(諸如鈉鹽及鉀鹽)及鹼土金屬鹽(諸如鎂鹽及鈣鹽)。具有四級銨基之化合物亦含有諸如氯離子、溴離子、碘離子、乙酸根、過氯酸根及其類似者之抗衡陰離子。此等鹽之其他實例包括鹽酸鹽、氫溴酸鹽、硫酸鹽、甲磺酸鹽、硝酸鹽、苯甲酸鹽及具有胺基酸(諸如麩胺酸)之鹽。 術語「個體」及「患者」可互換地使用，且意謂需要治療之哺乳動物，例如伴生動物(例如，狗、貓及其類似物)、農畜(例如，牛、豬、馬、綿羊、山羊及其類似物)及實驗室動物(例如，大鼠、小鼠、天竺鼠及其類似物)。通常，個體為需要治療之人類。
3. 例示性化合物之描述
在一第一實施例中，本揭示內容提供式
I
或
Ia '
化合物：
(
I
或
Ia '
)； 或其醫藥學上可接受之鹽，其中變量係如上文所描述。 在一第二實施例中，本揭示內容提供式
Ia
化合物：
； 或其醫藥學上可接受之鹽，其中變量係如上文所描述。 在一第三實施例中，式
I
、
Ia '
或
Ia
中之R
6
選自甲基、乙基、鹵甲基、鹵乙基、甲氧基、鹵甲氧基、鹵基及氰基，其中剩餘變量係如式
I
、
Ia '
或第二實施例中所描述。 在一第四實施例中，式
I
、
Ia '
或
Ia
化合物具有式
II
：
； 或其醫藥學上可接受之鹽，其中剩餘變量係如式
I
或
Ia '
中所描述。 在一第五實施例中，式
I
、
Ia '
、
Ia
或
II
化合物具有式
III
：
； 或其醫藥學上可接受之鹽，其中剩餘變量係如式
I
或
Ia '
中所描述。 在一第六實施例中，式
I
、
Ia '
、
Ia
或
II
化合物具有式
IV
：
； 或其醫藥學上可接受之鹽，其中剩餘變量係如式
I
或
Ia '
中所描述。 在一第七實施例中，式
I
、
Ia '
、
Ia
、
II
或
III
化合物具有式
V
：
； 或其醫藥學上可接受之鹽，其中剩餘變量係如式
I
或
Ia '
中所描述。 在一第八實施例中，式
I
、
Ia '
、
Ia
、
II
、
III
、
IV
或
V
化合物中之R
2
為氫、甲基或羥基(C
1
-C
4
)烷基，其中剩餘變量係如式
I
中或第三實施例中所描述。替代地，式
I
、
Ia '
、
Ia
、
II
、
III
、
IV
或
V
化合物中之R
2
為羥基(C
1
-C
4
)烷基，其中剩餘變量係如式
I
及第三實施例中所描述。在另一替代例中，式
I
、
Ia '
、
Ia
、
II
、
III
、
IV
或
V
化合物中之R
2
為羥基(C
1
-C
2
)烷基，其中剩餘變量係如式
I
及第三實施例中所描述。 在一第九實施例中，式
I
、
Ia '
、
Ia
、
II
或
III
化合物具有下式：
； 或其醫藥學上可接受之鹽，其中剩餘變量係如式
I
或
Ia '
中所描述。 在一第十實施例中，式
I
、
Ia '
、
Ia
、
II
或
III
化合物具有下式：
； 或其醫藥學上可接受之鹽，其中剩餘變量係如式
I
或
Ia '
中所描述。 在一第十一實施例中，式
I
、
Ia '
、
Ia
、
II
或
III
化合物具有下式：
； 或其醫藥學上可接受之鹽，其中剩餘變量係如式
I
或
Ia '
中所描述。 在一第十二實施例中，式
I
、
Ia '
、
Ia
、
II
或
IV
化合物具有下式：
； 或其醫藥學上可接受之鹽，其中剩餘變量係如式
I
或
Ia '
中所描述。 在一第十三實施例中，式
I
、
Ia '
、
Ia
、
II
、
IV
或
IX
化合物具有下式：
； 或其醫藥學上可接受之鹽，其中剩餘變量係如式
I
或
Ia '
中所描述。 在一第十四實施例中，式
I
、
Ia '
、
Ia
、
II
、
IV
或
IX
化合物具有下式：
； 或其醫藥學上可接受之鹽，其中剩餘變量係如式
I
或
Ia '
中所描述。 在一第十五實施例中，式
I
、
Ia '
、
Ia
、
II
、
IV
或
IX
化合物具有下式：
； 或其醫藥學上可接受之鹽，其中剩餘變量係如式
I
或
Ia '
中所描述。 在一第十六實施例中，式
I
、
Ia '
、
Ia
、
II
、
III
、
IV
、
V
、
VI
、
VII
、
VIII
、
IX
、
X
、
XI
或
XII
化合物中之任一者中之R
5
為NH
2
、-NH(SO
2
)(C
1
-C
4
)烷基、-NH(SO
2
)(C
1
-C
4
)烷基O(C
1
-C
4
)烷基、-NHC(O)(C
1
-C
4
)烷基、-NH(SO
2
)(C
3
-C
6
)環烷基、OH、-SO
2
NH
2
、-C(O)NH
2
、-C(O)NH(C
1
-C
4
)烷基、-C(O)NH(SO
2
)(C
1
-C
4
)烷基、-C(O)NH(C
1
-C
4
)烷基(SO
2
)(C
1
-C
4
)烷基、-C(O)NH(C
1
-C
4
)烷基OH或經OH取代之(C
1
-C
2
)烷基，其中剩餘變量係如針對式
I
或
Ia '
及第三實施例或第八實施例所描述。替代地，式
I
、
Ia '
、
Ia
、
II
、
III
、
IV
、
V
、
VI
、
VII
、
VIII
、
IX
、
X
、
XI
或
XII
化合物中之任一者中之R
5
為NH
2
、-NH(SO
2
)CH
3
、-NH(SO
2
)(CH
2
)
2
OCH
3
、-NH(SO
2
)CH(CH
3
)
2
、-NH(SO
2
)CH
2
CH
3
、-NHC(O)CH
3
、-NH(SO
2
)環丙基、OH、-SO
2
NH
2
、-C(O)NH
2
、-C(O)NH(SO
2
)CH
3
、-C(O)NH(CH
3
)
2
、-C(O)NHCH(CH
3
)
2
、-C(O)NHCH
2
CH
3
、-C(O)NH(CH
2
)
2
(SO
2
)CH
3
、-C(O)NH(CH
2
)
2
OH或-CH
2
OH，其中剩餘變量係如針對式
I
或
Ia '
及第三實施例或第八實施例所描述。在另一替代例中，式
I
、
Ia '
、
Ia
、
II
、
III
、
IV
、
V
、
VI
、
VII
、
VIII
、
IX
、
X
、
XI
或
XII
化合物中之任一者中之R
5
為-C(O)NH
2
、OH、-SO
2
NH
2
或-NH(SO
2
)CH
3
，其中剩餘變量係如針對式
I
或
Ia '
及第三實施例或第八實施例所描述。在又一替代例中，式
I
、
Ia '
、
Ia
、
II
、
III
、
IV
、
V
、
VI
、
VII
、
VIII
、
IX
、
X
、
XI
或
XII
化合物中之任一者中之R
5
為OH，其中剩餘變量係如針對式
I
或
Ia '
及第三實施例或第八實施例所描述。 在第十七實施例中，式
Ia '
化合物選自：
；及
； 或其醫藥學上可接受之鹽。 在一第十八實施例中，式
Ia '
化合物為：
； 或其醫藥學上可接受之鹽。 在一第十九實施例中，式
Ia '
化合物為：
； 或其醫藥學上可接受之鹽。 在一第二十實施例中，本文所描述之化合物(例如，式
I
、
Ia '
、
Ia
、
II
、
III
、
IV
、
V
、
VI
、
VII
、
VIII
、
IX
、
X
、
XI
或
XII
及第十七實施例至第十九實施例中之彼等)為具有至少95% (例如，至少96%、至少97%、至少98%、至少99%、至少99.5%或至少99.9%)之對映異構體純度的單一對映異構體。 在一第二十一實施例中，本文所描述之化合物(例如，式
I
、
Ia '
、
Ia
、
II
、
III
、
IV
、
V
、
VI
、
VII
、
VIII
、
IX
、
X
、
XI
或
XII
及第十七實施例至第十九實施例中之彼等)中之環丙基環之立體化學組態為1R,2S。 在一第二十二實施例中，本文所描述之化合物(例如，式
I
、
Ia '
、
Ia
、
II
、
III
、
IV
、
V
、
VI
、
VII
、
VIII
、
IX
、
X
、
XI
或
XII
及第十七實施例至第十九實施例中之彼等)中之環丙基環之立體化學組態為1R,2S且化合物為具有至少95% (例如，至少96%、至少97%、至少98%、至少99%、至少99.5%或至少99.9%)之對映異構體純度的單一對映異構體。 在一第二十三實施例中，本文所描述之化合物(例如，式
I
、
Ia '
、
Ia
、
II
、
III
、
IV
、
V
、
VI
、
VII
、
VIII
、
IX
、
X
、
XI
或
XII
及第十七實施例至第十九實施例中之彼等)中之環丙基環之立體化學組態為1S,2R。 在一第二十四實施例中，本文所描述之化合物(例如，式
I
、
Ia '
、
Ia
、
II
、
III
、
IV
、
V
、
VI
、
VII
、
VIII
、
IX
、
X
、
XI
或
XII
及第十七實施例至第十九實施例中之彼等)之環丙基環之立體化學組態為1S,2R且化合物為具有至少95% (例如，至少96%、至少97%、至少98%、至少99%、至少99.5%或至少99.9%)之對映異構體純度的單一對映異構體。 在一個態樣中，本文所描述之化合物不為
或
；或其鹽。 在一個態樣中，當q為0，m為1，n為1，o為0且R
1
及R
2
均為本文所描述之化合物中之氫時，則R
5
不為-CONH
2
。在另一態樣中，當q為0，m為2，n為2，o為0且R
1
及R
2
均為本文所描述之化合物中之氫時，則R
5
不為-CONH
2
。 化合物之特定實例提供於範例章節中且被包括為本文之第十四實施例之部分。亦包括醫藥學上可接受之鹽以及範例中之化合物之中性形式。
4. 調配物及投藥
在一個態樣中，本文提供包含本文所描述之化合物或其醫藥學上可接受之鹽的組合物。 在另一態樣中，組合物進一步包含醫藥學上可接受之載劑、佐劑或媒劑。組合物中之化合物之量為使得有效地可量測地調節生物樣品或患者中之LSD1或其突變體的量，亦即「有效量」或「治療有效量」。 在某些態樣中，調配本文所描述之組合物以向有需要之患者投予此組合物。在一些態樣中，調配本文所描述之組合物以經口投予患者。 術語「醫藥學上可接受之載劑、佐劑或媒劑」或「醫藥學上可接受之載劑」係指不破壞其調配化合物之藥理學活性的無毒載劑、佐劑或媒劑。可用於本文所描述組合物中之醫藥學上可接受之載劑、佐劑或媒劑包括(但不限於)離子交換劑、氧化鋁、硬脂酸鋁、卵磷脂、血清蛋白(諸如人類血清白蛋白)、緩衝物質(諸如磷酸鹽)、甘胺酸、山梨酸、山梨酸鉀、飽和植物脂肪酸之部分甘油酯混合物、水、鹽或電解質(諸如魚精蛋白硫酸鹽、磷酸氫二鈉、磷酸氫鉀、氯化鈉、鋅鹽)、膠態二氧化矽、三矽酸鎂、聚乙烯基吡咯啶酮、基於纖維素之物質、聚乙二醇、羧甲基纖維素鈉、聚丙烯酸酯、蠟、聚乙烯-聚氧丙烯-嵌段聚合物、聚乙二醇及羊毛脂。 本文所描述之醫藥學上可接受之組合物可以任何經口可接受之劑型經口投予，包括(但不限於)膠囊、錠劑、水性懸浮液或溶液。在用於經口使用之錠劑之情況下，常用載劑包括乳糖及玉米澱粉。亦典型地添加潤滑劑，諸如硬脂酸鎂。對於以膠囊形式經口投予，適用之稀釋劑包括乳糖及乾燥玉米澱粉。當需要水性懸浮液用於經口使用時，使活性成分與乳化劑及懸浮劑組合。若需要，亦可添加某些甜味劑、調味劑或著色劑。 本文所描述之醫藥學上可接受之組合物亦可製備呈可注射形式。可根據已知技術使用適合的分散劑或濕潤劑及懸浮劑來調配可注射製劑，例如無菌可注射水性或油性懸浮液。無菌可注射製劑亦可為於無毒性非經腸可接受之稀釋劑或溶劑中之無菌可注射溶液、懸浮液或乳液，例如於1,3-丁二醇中之溶液。在可接受之媒劑及溶劑中，可採用的為水、林格氏溶液(Ringer's solution)、U.S.P.及等張性氯化鈉溶液。此外，無菌不揮發性油習知地用作溶劑或懸浮介質。出於此目的，可採用任何溫和(bland)不揮發性油，包括合成之單甘油酯或二甘油酯。另外，脂肪酸(諸如油酸)用於製備可注射劑。 本文所描述之醫藥學上可接受之組合物亦可局部投予，尤其當治療目標包括藉由局部施用容易達到之區域或器官(包括眼睛、皮膚或低位腸道之疾病)時。容易製備用於此等區域或器官中之每一者的適合局部調配物。用於低位腸道之局部施用可以經直腸栓劑調配物(參見上文)形式或以適合的灌腸調配物形式實現。亦可使用局部經皮貼片。 可與載劑材料組合以產生呈單一劑型之組合物的本文所描述之化合物之量將視經治療之宿主及投予之特定模式而變化。在一些實施例中，所提供之組合物應經調配使得在抑制劑之0.01毫克/公斤體重/天與100毫克/公斤體重/天之間的劑量(諸如0.1毫克/公斤體重/天至100毫克/公斤體重/天)可投予至接收此等組合物之患者。 亦應瞭解，任何特定患者之特定劑量及治療方案將視多種因素而定，該等因素包括所採用之特定化合物之活性、年齡、體重、一般健康、性別、膳食、投予時間、***率、藥物組合及治療醫師之判斷及所治療之特定疾病之嚴重強度。本文所描述之化合物於組合物中之量亦視組合物中之特定化合物而定。
5. 化合物及醫藥學上可接受之組合物的用途
在一些實施例中，本文所描述之化合物及組合物適用於治療與LSD1之過度表現及/或LSD1之突變體形式(諸如更改LSD1底物活性之彼等突變體形式)之表現相關聯的疾病及/或病症。 在一些實施例中，本文所描述之化合物及組合物適用於治療與細胞增殖相關聯的疾病及/或病症。在一些實施例中，本文所描述之化合物及組合物適用於治療與細胞循環或DNA修復之誤調控相關聯的疾病及/或病症。在一些實施例中，本文所描述之化合物及組合物適用於治療癌症。例示性癌症類型包括乳癌、***癌、結腸癌、腎細胞癌、多形性神經膠質母細胞瘤癌、膀胱癌、黑色素瘤、支氣管癌、淋巴瘤及肝癌。 在一些實施例中，本揭示內容提供一種降低個體中之LSD1之活性的方法，該方法包含以下步驟：投予本文所描述之化合物或包含本文中之化合物中之任一者的組合物。在一些實施例中，本揭示內容提供一種降低個體中之野生型LSD1之活性的方法，該方法包含以下步驟：投予本文所描述之化合物或包含前述任一者之組合物。在一些實施例中，本揭示內容提供一種降低個體中之LSD1之突變體形式之活性的方法，該方法包含以下步驟：投予本文所描述之化合物或包含前述任一者之組合物。 在一些實施例中，本揭示內容提供一種治療與癌症相關之疾病或病況的方法，該癌症包括例如腫瘤，諸如皮膚瘤、***瘤、腦瘤、子宮頸癌、睪丸瘤等。在一個態樣中，可藉由本文所描述之組合物及方法治療之癌症包括(但不限於)腫瘤類型，諸如星形細胞瘤、***瘤、子宮頸癌、結腸直腸瘤、子宮內膜瘤、食道瘤、胃瘤、頭頸瘤、肝細胞瘤、喉瘤、肺瘤、口腔瘤、卵巢瘤、***瘤及甲狀腺癌及肉瘤。 在一些實施例中，本揭示內容提供一種治療選自以下中之一或多者之疾病或病況的方法：心肌：肉瘤(血管肉瘤、纖維肉瘤、橫紋肌肉瘤、脂肪肉瘤)、黏液瘤、橫紋肌瘤、纖維瘤、脂肪瘤及畸胎瘤；肺：支氣管癌(鱗狀細胞、未分化小細胞、未分化大細胞腺癌)、肺泡(細支氣管)癌、支氣管腺瘤、肉瘤、淋巴瘤、軟骨瘤錯構瘤、間皮瘤；腸胃：食道(鱗狀細胞癌、腺癌、平滑肌肉瘤、淋巴瘤)、胃(癌瘤、淋巴瘤、平滑肌肉瘤)、胰臟(乳腺管腺癌、胰島素瘤、升糖素瘤、胃泌素瘤、類癌、血管活性腸肽瘤)、小腸(腺癌、淋巴瘤、類癌、卡堡氏肉瘤(Kaposi's sarcoma)、平滑肌瘤、血管瘤、脂肪瘤、神經纖維瘤、纖維瘤)、大腸(腺癌、管狀腺瘤、纖毛狀腺瘤、錯構瘤、平滑肌瘤)；生殖泌尿道：腎(腺癌、威爾姆斯瘤(Wilm's tumor) (腎胚細胞瘤)、淋巴瘤、白血病)、膀胱及尿道(鱗狀細胞癌、轉移細胞癌、腺癌)、***(腺癌、肉瘤)、睾丸(精原細胞瘤、畸胎瘤、胚胎癌、畸胎上皮癌、絨膜癌、肉瘤、間質細胞癌、纖維瘤、纖維腺瘤、腺瘤樣瘤、脂瘤)；肝：肝癌(肝細胞癌)、膽管上皮癌、肝母細胞瘤、血管肉瘤、肝細胞腺瘤、血管瘤；骨骼：骨原性肉瘤(骨肉瘤)、纖維肉瘤、惡性纖維組織細胞瘤、軟骨肉瘤、尤文氏肉瘤(Ewing's sarcoma)、惡性淋巴瘤(網狀細胞肉瘤)、多發性骨髓瘤、惡性巨細胞瘤脊索瘤、骨軟骨瘤(骨軟骨外生骨疣)、良性軟骨瘤、軟骨母細胞瘤、軟骨黏液性纖維瘤、骨樣骨瘤及巨細胞腫瘤；神經系統：顱骨(骨瘤、血管瘤、肉芽腫瘤、黃瘤、畸形性骨炎)、腦膜(腦膜瘤、腦膜肉瘤、神經膠質過多)、腦(星形細胞瘤、神經管胚細胞瘤、神經膠質瘤、室管膜瘤、胚細胞瘤(松果體瘤)、多形性神經膠質母細胞瘤、寡樹突神經膠質瘤、神經鞘瘤、視網膜胚細胞瘤、先天性腫瘤)、脊髓(神經纖維瘤、腦膜瘤、神經膠質瘤、肉瘤)；婦科學：子宮(子宮內膜癌)、子宮頸(子宮頸癌、腫瘤前子宮頸發育不良)、卵巢(卵巢癌(漿液性囊腺癌、黏液性囊腺癌、類別不明癌)、粒層鞘細胞瘤、史脫力-雷迪格細胞瘤(Sertoli-Leydig cell tumors)、無性細胞瘤、惡性畸胎瘤)、外陰(鱗狀細胞癌、上皮內癌、腺癌、纖維肉瘤、黑色素瘤)、***(透明細胞癌、鱗狀細胞癌、葡萄樣肉瘤(胚胎性橫紋肌肉瘤))、輸卵管(癌)；血液科：血液(骨髓白血病(急性及慢性)、急性淋巴母細胞白血病、慢性淋巴球性白血病、骨髓增生疾病、多發性骨髓瘤、骨髓發育不良症候群)、霍奇金氏疾病(Hodgkin's disease)、非霍奇金氏淋巴瘤(non-Hodgkin's lymphoma) (惡性淋巴瘤)；皮膚：惡性黑色素瘤、基底細胞癌、鱗狀細胞癌、卡堡氏肉瘤(Kaposi's sarcoma)、角化棘皮瘤、痣(發育不良痣)、脂瘤、血管瘤、皮膚纖維瘤、瘢痕瘤、牛皮癬；及腎上腺：神經母細胞瘤。 在一個實施例中，本揭示內容提供一種治療選自以下之疾病或病況的方法：CML、T-ALL、神經母細胞瘤、乳癌、***癌、單純疱疹病毒再活化及HIV感染，該方法包含以下步驟：向需要其之個體投予本文所描述之化合物或其醫藥學上可接受之鹽。在一個替代例中，疾病或病況選自CML、T-ALL及神經母細胞瘤。
範例
以下代表性實例意欲幫助說明本揭示內容，且並不意欲亦不應解釋為限制所描述之範疇。除本文所展示及描述之彼等以外，修改及另外的實施例將對熟習此項技術者變得顯而易見。 將進一步理解，本揭示內容(包括範例)涵蓋本文所描述之化合物之個別化合物。在其中所例示之個別化合物以鹽之形式(例如，以三氟乙酸鹽之形式)經分離及/或表徵的情況下，本揭示內容涵蓋該鹽之游離鹼，以及該游離鹼之其他醫藥學上可接受之鹽。 除非另外說明，否則所有溶劑、化學品及試劑為商購所得且不經純化即使用。在D
2
O、CDCl
3
、
d6
-DMSO、CD
3
OD或
d6
-丙酮中於25℃下在OXFORD (Varian)上以400 MHz以相對於作為內標之TMS而報告的化學位移(
δ
，ppm)獲得
1
H NMR光譜。用Shimadzu LC-MS-2020系統獲得HPLC-MS層析圖及譜。用Yilite P270獲得對掌性分析及純化。
( 1R , 2S )- 2 -(( E )- 1 - 苯基丁 - 1 - 烯 - 2 - 基 ) 環丙 - 1 - 胺 ( S )- 2 - 羥基 - 2 - 苯乙酸酯 步驟 1 ： ( E )- 2 - 苯亞甲基丁醛
向苯甲醛(130.0 kg，1226.4 mol)於MeOH (1100.0 kg)中之溶液中添加NaOH (水溶液) (10%，500.0 kg)。接著在0℃下逐滴添加丁醛(92.7 kg，1287.5 mol)。在10℃下攪拌反應混合物10 h。移除溶劑且藉由HCl (水溶液，4 N)將殘餘物酸化至pH=5。用EtOAc (500 kg+200 kg)萃取混合物且用鹽水(100 kg×2)洗滌。在真空下濃縮有機層。在真空(85℃至95℃，2 mmhg至10 mmhg)下蒸餾粗產物以得到呈淡黃色油狀之(E)-2-苯亞甲基丁醛(130.0 kg，GC＞95%)。
步驟 2 ： ( E )- 4 -(( E )- 苯亞甲基 ) 己 - 2 - 烯酸乙酯
將2-(二乙氧基磷醯基)乙酸乙酯(182.0 kg，812.5 mol)溶解於THF (2200 kg)中並冷卻至0℃。一次性添加第三丁醇鉀(105.0 kg，937.5 mol)且在0℃下劇烈攪拌反應混合物15 min。將(E)-2-苯亞甲基丁醛(130.0 kg，812.5 mol，1.0當量)添加至反應混合物中且在25℃下攪拌反應混合物16 h。用H
2
O (320.0 kg)淬滅反應混合物且用EtOAc (360.0 kg)萃取。有機層經硫酸鈉乾燥且過濾。在減壓下蒸發溶劑以得到呈油狀物之粗產物。將油狀物溶解於石油醚(560.0 kg)中，經由矽膠墊(30.0 kg)過濾，且用石油醚洗滌濾餅。濃縮經合併之濾液，得到呈油狀物之(E)-4-((E)-苯亞甲基)己-2-烯酸乙酯(170.0 kg)。此物質不經進一步純化即用於下一步驟中。
步驟 3 ： ( 反 )- 2 -(( E )- 1 - 苯基丁 - 1 - 烯 - 2 - 基 ) 環丙烷 - 1 - 甲酸乙酯
在惰性氛圍下將第三丁醇鉀(103.5 kg，924.1 mol)溶解於DMSO (1900 kg)中。在添加三甲基氧化鋶碘(210.0 kg，959.0 mol)之前在25℃下攪拌混合物15 min。在添加(E)-4-((E)-苯亞甲基)己-2-烯酸乙酯(170.0 kg，738.0 mol)之前在25℃下攪拌此混合物45 min。使反應物升溫至50℃至55℃且攪拌16 h。用水(600 kg)淬滅反應物。用石油醚(800 kg)萃取混合物。在減壓下蒸發石油醚相，以得到呈棕色液體之(反)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙烷-1-甲酸乙酯(76.5 kg)。此物質不經進一步純化即用於下一步驟中。
步驟 4 ： ( 反 )- 2 -(( E )- 1 - 苯基丁 - 1 - 烯 - 2 - 基 ) 環丙烷 - 1 - 甲酸
將(反)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙烷-1-甲酸乙酯(76.5 kg，313.1 mol)溶解於水(320 kg)及甲醇(360 kg)中。向此溶液中添加氫氧化鈉(41.0 kg，1025 mol)且在50℃下攪拌溶液3 h。將混合物濃縮至約300 L且使用HCl (水溶液，4 N)酸化至pH=4。用EtOAc (520 kg)萃取此溶液且分離各層。有機層用鹽水洗滌，經硫酸鈉乾燥，過濾且濃縮，以得到(反)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙烷-1-甲酸(62.5 kg)。此材料不經進一步純化即用於下一步驟中。
步驟 5 ： ( 反 )- 2 -(( E )- 1 - 苯基丁 - 1 - 烯 - 2 - 基 ) 環丙 - 1 - 胺鹽酸鹽
在0℃向(反)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙烷-1-甲酸(26.0 kg，120.4 mol)於甲苯(270 kg)中之溶液中添加三乙胺(36.3 kg，359 mol)及疊氮磷酸二苯酯(38.0 g，138.1 mol)。在0℃至10℃攪拌反應混合物3 h。添加水(100 kg)且用EtOAc (80.0 kg)萃取混合物並在真空下濃縮有機層，得到粗油。將該粗油溶解於石油醚(50 kg)中。經由矽膠墊過濾懸浮液且用石油醚洗濾餅。濃縮合併之濾液，得到粗製醯基疊氮化物。將粗製醯基疊氮化物溶解於甲苯(100 kg)中且將溶液加熱至85℃ 2 h。使有機層濃縮至約60 L。在室溫將三甲基矽醇鉀(23.0 kg，177.9 mol)添加至甲苯混合物中且攪拌1.5 h。接著用HCl (2 N水溶液，120 kg)處理反應物且攪拌。分離各層。用HCl (2N水溶液，20 kg)萃取有機層兩次且合併水性萃取物。用MTBE (30kg)萃取水層一次，且接著用氫氧化鈉(47 kg，30%水溶液)鹼化至pH=10至11。接著用MTBE (150 kg)萃取水層。有機萃取物用鹽水洗，經硫酸鈉乾燥且過濾。向此MTBE溶液中添加HCl (23.5kg，12%於二***中)且自溶液沈澱白色固體。收集固體，得到(反)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙-1-胺鹽酸鹽(16.5 kg，73.8 mol)。
步驟 6 ： ( 1R , 2S )- 2 -(( E )- 1 - 苯基丁 - 1 - 烯 - 2 - 基 ) 環丙 - 1 - 胺 ( S )- 2 - 羥基 - 2 - 苯乙酸酯
將(反)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙-1-胺鹽酸鹽(16.5 kg，73.8 mol)饋入反應器中且添加K
3
PO
3
(46 L，37wt%)接著EtOAc (150 kg)。在0℃至10℃攪拌反應混合物3 h。分離有機層且濃縮至乾燥，得到油狀物。將
S
-杏仁酸(8.4 kg，55.35 mol)及95% EtOH (165 kg)添加至反應器中且在室溫攪拌反應物72 h (直至ee＞99%)。經由過濾收集固體，得到(1R,2S)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙-1-胺(S)-2-羥基-2-苯乙酸酯(5.8 kg，17.1 mol)。LCMS
m/z
188 [M+H]
+
。藉由X射線結晶學測定絕對立體化學。參見
圖 1
。
N -( 2 , 2 - 二甲氧基乙基 ) 甲磺醯胺
在0℃下向2,2-二甲氧基乙胺(518 µL，4.75 mmol)於二氯甲烷(4.75 mL)中之溶液中添加三乙胺(1.32 mL，9.50 mmol)，繼之以甲磺醯氯(550 µL，7.12 mmol)。在0℃下攪拌混合物30分鐘。用二氯甲烷稀釋反應物且用碳酸氫鈉飽和水溶液洗滌。用二氯甲烷萃取水層兩次。經合併之有機層經硫酸鈉乾燥，接著在減壓下濃縮，以得到1.18 g之呈淡黃色油狀物之粗化合物。接著將粗混合物稀釋於丙酮:水(1:1，4 mL)中且用amberlyst-15氫型(1.2 g)處理。在室溫下攪拌所得混合物2小時。經由矽藻土過濾懸浮液並且在減壓下濃縮，以得到呈黃色油狀物之粗製N-(2,2-二甲氧基乙基)甲磺醯胺(900 mg)。該產物不經進一步純化即使用。
1
H NMR (400 MHz, dmso) δ 7.13 (t, J = 6.0 Hz, 1H), 4.36 (t, J = 5.5 Hz, 1H), 3.28 (s, 6H), 3.02 (t, J = 5.7 Hz, 2H), 2.90 (s, 3H)。
N -( 2 - 側氧基乙基 ) 乙磺醯胺 步驟 1 ： N -( 2 , 2 - 二甲氧基乙基 ) 乙磺醯胺
在0℃下向2,2-二甲氧基乙胺(247 µL，2.28 mmol)於DCM (1.9 mL)中之溶液中添加三乙胺(634 µL，4.56 mmol)，繼之以乙磺醯氯(212 µL，2.28 mmol)。在0℃下攪拌混合物30 min。用DCM稀釋反應物且用飽和NaHCO
3
洗滌。用DCM反萃取水層兩次。經合併之有機層經Na
2
SO
4
乾燥且接著在減壓下濃縮，以得到呈棕色油狀物之粗製N-(2,2-二甲氧基乙基)乙磺醯胺。
步驟 2 ： N -( 2 - 側氧基乙基 ) 乙磺醯胺
向粗製N-(2,2-二甲氧基乙基)乙磺醯胺於丙酮:水(1:1，4 mL)中之溶液中添加Amberlyst-15氫型(1.0 g)。在室溫下歷經兩天攪拌所得混合物。經由矽藻土過濾懸浮液並且在減壓下濃縮，以得到呈黃色油狀物之粗製N-(2-側氧基乙基)乙磺醯胺(614 mg)。不經進一步純化即使用。1H NMR (400 MHz, CDCl
3
) δ 9.68 (s, J = 1.1 Hz, 1H), 4.15 (d, J = 5.2 Hz, 2H), 3.07 (q, J = 7.4 Hz, 2H), 1.40 (t, J = 7.4 Hz, 3H)。 使用合適起始材料及修飾，使用針對N-(2-側氧基乙基)乙磺醯胺所描述之合成程序合成
表 1
中之以下中間物。
表 1 2 , 2 - 二甲基 - 1 -( 甲磺醯基 ) 氮丙啶
在0℃下向2-胺基-2-甲基丙-1-醇(1.0 g，11.2 mmol)於DCM (22.4 mL)中之溶液中添加三乙胺(7.79 mL，56.0 mmol)，繼之以甲磺醯氯(2.16 mL，28.0 mmol)。在0℃下攪拌混合物30 min且接著使其升溫至室溫隔夜。用DCM稀釋反應物且用飽和NaHCO
3
洗滌。用DCM萃取水層一次。經合併之有機層經Na
2
SO
4
乾燥且接著在減壓下濃縮，以得到呈棕色油狀物之粗製2,2-二甲基-1-(甲磺醯基)氮丙啶(1.95 g)化合物。
2 , 2 , 2 - 三氟 - N -(( 1R , 2S )- 2 -(( E )- 1 - 苯基丁 - 1 - 烯 - 2 - 基 ) 環丙基 )- N -( 7 - 氮雜螺 [ 3 . 5 ] 壬 - 2 - 基 ) 乙醯胺鹽酸鹽 步驟 1 ： 2 -((( 1R , 2S )- 2 -(( E )- 1 - 苯基丁 - 1 - 烯 - 2 - 基 ) 環丙基 ) 胺基 )- 7 - 氮雜螺 [ 3 . 5 ] 壬烷 - 7 - 甲酸第三丁酯
在0℃下向(1R,2S)-2-((
E
)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙胺(
S
)-2-羥基-2-苯乙酸酯(3.5 g，10.3 mmol)於1,2-二氯乙烷(75 mL)中之懸浮液中添加2-側氧基-7-氮雜螺[3.5]壬烷-7-甲酸第三丁酯(2.58 g，10.8 mmol)，繼之以三乙醯氧基硼氫化鈉(4.78 g，22.6 mmol)。使反應混合物升溫至23℃且攪拌4小時。接著添加額外的2-側氧基-7-氮雜螺[3.5]壬烷-7-甲酸第三丁酯(123 mg，0.51 mmol)及三乙醯氧基硼氫化鈉(328 mg，1.55 mmol)且在23℃下攪拌反應混合物2小時。接著用K
2
CO
3
飽和水溶液(50 mL)稀釋反應混合物且用DCM (3×20 mL)萃取。經合併之有機層用鹽水(20 mL)洗滌，經Na
2
SO
4
乾燥，過濾且在減壓下濃縮。經由Biotage (梯度0%至100% EtOAc/己烷)純化粗殘餘物，以得到2-(((1R,2S)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙基)胺基)-7-氮雜螺[3.5]壬烷-7-甲酸第三丁酯(3.235 g)。LCMS (ESI)
m/z
411.3 [M+H]
+
。
步驟 2 ： 2 -( 2 , 2 , 2 - 三氟 - N -(( 1R , 2S )- 2 -(( E )- 1 - 苯基丁 - 1 - 烯 - 2 - 基 ) 環丙基 ) 乙醯胺基 )- 7 - 氮雜螺 [ 3 . 5 ] 壬烷 - 7 -
甲酸
第三丁酯
在0℃下向2-(((1R,2S)-2-((
E
)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙基)胺基)-7-氮雜螺[3.5]壬烷-7-甲酸第三丁酯(3.226g，7.84 mmol)於DCM (50 mL)中之溶液中添加
N , N -
二異丙基乙胺(2.03 mL，11.7 mmol)，繼之以三氟乙酸酐(1.40 mL，10.1 mmol)。使反應混合物升溫至23℃且攪拌4小時。接著用NaHCO
3
飽和水溶液(30 mL)稀釋反應混合物且分離兩個層。有機層用NH
4
Cl飽和水溶液(2×20 mL)洗滌，經Na
2
SO
4
乾燥，過濾且在減壓下濃縮。經由Biotage (梯度0%至50% EtOAc/己烷)純化粗殘餘物，以得到2-(2,2,2-三氟-N-((1R,2S)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙基)乙醯胺基)-7-氮雜螺[3.5]壬烷-7-甲酸第三丁酯(3.258 g)。LCMS (ESI)
m/z
: 529.2 [M+Na]
+
。
步驟 3 ： 2 , 2 , 2 - 三氟 - N -(( 1R , 2S )- 2 -(( E )- 1 - 苯基丁 - 1 - 烯 - 2 - 基 ) 環丙基 )- N -( 7 - 氮雜螺 [ 3 . 5 ] 壬 - 2 - 基 ) 乙醯胺鹽酸鹽
在23℃下向2-(2,2,2-三氟-
N
-((1R,2S)-2-((
E
)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙基)乙醯胺基)-7-氮雜螺[3.5]壬烷-7-甲酸第三丁酯(3.254 g，6.41 mmol)於二噁烷(32 mL)中之溶液中逐滴添加4.0 M之HCl於二噁烷(12.8 mL，51.2 mmol)中之溶液。在23℃下攪拌反應混合物2小時。接著添加額外的HCl (12.8 mL，51.2 mmol，4.0 M溶液於二噁烷中)且在23℃下攪拌反應混合物2小時。接著在減壓下濃縮反應混合物，以得到呈粗製黃色發泡體狀之2,2,2-三氟-N-((1R,2S)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙基)-N-(7-氮雜螺[3.5]壬-2-基)乙醯胺鹽酸鹽(3.185 g)。LCMS (ESI)
m/z
: 407.2 [M+H]
+
。
2 , 2 , 2 - 三氟 - N -(( 1R , 2S )- 2 -(( E )- 1 - 苯基丁 - 1 - 烯 - 2 - 基 ) 環丙基 )- N -( 2 - 氮雜螺 [ 3 . 3 ] 庚 - 6 - 基 ) 乙醯胺 2 , 2 , 2 - 三氟乙酸酯 步驟 1 ： 6 -((( 1R , 2S )- 2 -(( E )- 1 - 苯基丁 - 1 - 烯 - 2 - 基 ) 環丙基 ) 胺基 )- 2 - 氮雜螺 [ 3 . 3 ] 庚烷 - 2 - 甲酸第三丁酯
向含(1R,2S)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙胺(S)-2-羥基-2-苯乙酸酯(8.65 g，25.5 mmol)及6-側氧基-2-氮雜螺[3.3]庚烷-2-甲酸第三丁酯(5.15 g，24.3 mmol)之1,2-DCE (100 mL)中添加三乙醯氧基硼氫化鈉(10.8 g，51 mmol)。在30 min之後，用K
2
CO
3
(水溶液)淬滅反應物且用DCM (2×150 mL)萃取。濃縮有機相且經由管柱層析法(50 g管柱，5%至100% EtOAc:己烷)純化粗殘餘物，以得到6-(((1R,2S)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙基)胺基)-2-氮雜螺[3.3]庚烷-2-甲酸第三丁酯(4.61 g)。LCMS
m/z
: 383.7 [M+H]
+
。
步驟 2 ： 6 -( 2 , 2 , 2 - 三氟 - N -(( 1R , 2S )- 2 -(( E )- 1 - 苯基丁 - 1 - 烯 - 2 - 基 ) 環丙基 ) 乙醯胺基 )- 2 - 氮雜螺 [ 3 . 3 ] 庚烷 - 2 - 甲酸第三丁酯
向溶解於DCM中之6-(((1R,2S)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙基)胺基)-2-氮雜螺[3.3]庚烷-2-甲酸第三丁酯(4.61 g，12 mmol)添加二異丙基乙胺(2.81 mL，16.2 mmol)。在添加三氟乙酸酐(2.08 mL，15 mmol)之前將溶液冷卻至0℃。攪拌反應混合物2 h，同時升溫至室溫。減壓蒸發揮發物，以得到粗製6-(2,2,2-三氟-N-((1R,2S)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙基)乙醯胺基)-2-氮雜螺[3.3]庚烷-2-甲酸第三丁酯。LCMS
m/z
479 [M+H]
+
。
步驟 3 ： 2 , 2 , 2 - 三氟 - N -(( 1R , 2S )- 2 -(( E )- 1 - 苯基丁 - 1 - 烯 - 2 - 基 ) 環丙基 )- N -( 2 - 氮雜螺 [ 3 . 3 ] 庚 - 6 - 基 ) 乙醯胺 2 , 2 , 2 - 三氟乙酸酯
將6-(2,2,2-三氟-N-((1R,2S)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙基)乙醯胺基)-2-氮雜螺[3.3]庚烷-2-甲酸第三丁酯(5.74 g，12 mmol)溶解於DCM (80 mL)中且在添加三氟乙酸(20 mL，240 mmol)之前冷卻至10℃。隨後使溶液升溫至室溫且攪拌3 h。濃縮反應物，以得到粗製2,2,2-三氟-N-((1R,2S)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙基)-N-(2-氮雜螺[3.3]庚-6-基)乙醯胺2,2,2-三氟乙酸酯。LCMS
m/z
379.2 [M+H]
+
。
化合物 1 ： 2 -( 6 -((( 1R , 2S )- 2 -(( E )- 1 - 苯基丁 - 1 - 烯 - 2 - 基 ) 環丙基 ) 胺基 )- 2 - 氮雜螺 [ 3 . 3 ] 庚 - 2 - 基 ) 乙醇 步驟 1 ： 2 , 2 , 2 - 三氟 - N -( 2 -( 2 - 羥基乙基 )- 2 - 氮雜螺 [ 3 . 3 ] 庚 - 6 - 基 )- N -(( 1R , 2S )- 2 -(( E )- 1 - 苯基丁 - 1 - 烯 - 2 - 基 ) 環丙基 ) 乙醯胺
用乙酸(2.0 mL)及氰基硼氫化鈉(2.88 g，45.9 mmol)處理2,2,2-三氟-N-((1R,2S)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙基)-N-(2-氮雜螺[3.3]庚-6-基)乙醯胺2,2,2-三氟乙酸酯(7.57 g，15.3 mmol)及乙醇醛二聚體(5.51 g，45.9 mmol)於甲醇中之溶液。將反應物加熱至60℃且藉由LCMS監測。在1小時之後，用碳酸鉀10%水溶液淬滅反應物至pH為8。接著在真空下移除揮發物。用2-甲基四氫呋喃萃取粗混合物兩次。有機層接著經硫酸鈉乾燥，經過濾，且在真空下移除揮發物。所要產物2,2,2-三氟-
N
-(2-(2-羥基乙基)-2-氮雜螺[3.3]庚-6-基)-N-((1R,2S)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙基)乙醯胺不經進一步純化即使用。LCMS (ESI) m/z: 423.1 [M+H]
+
。
步驟 2 ： 2 -( 6 -((( 1R , 2S )- 2 -(( E )- 1 - 苯基丁 - 1 - 烯 - 2 - 基 ) 環丙基 ) 胺基 )- 2 - 氮雜螺 [ 3 . 3 ] 庚 - 2 - 基 ) 乙醇雙 ( 2 , 2 , 2 - 三氟乙酸酯 )
向圓底燒瓶中，將2,2,2-三氟-
N
-(2-(2-羥基乙基)-2-氮雜螺[3.3]庚-6-基)-
N
-((1R,2S)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙基)乙醯胺(6.46 g，15.3 mmol)溶解於甲醇(75 mL)中，使其冷卻至0℃且用10 mL之氫氧化鈉10%水溶液處理。在氮氣氛圍下攪拌反應物30分鐘且用2,2,2-三氟乙酸淬滅至pH為2.0。在真空下移除揮發物。使用10%至30% CH
3
CN/0.1% 2,2,2-三氟乙酸水溶液藉由反相管柱層析法純化所要產物。純溶離份經合併，冷凍及凍乾，以得到2-(6-(((1R,2S)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙基)胺基)-2-氮雜螺[3.3]庚-2-基)乙醇雙(2,2,2-三氟乙酸) (2.90 g)。LCMS (ESI) m/z: 327.3 [M+H]
+
。
1
H NMR (400 MHz, DMSO-d
6
)
δ
9.87 (br s, 1H), 9.21 (br s, 2H), 7.39 - 7.31 (m, 2H), 7.27 - 7.17 (m, 3H), 6.21 (s, 1H), 5.23 (br s, 1H), 4.25 - 4.11 (m, 2H), 4.11 - 4.06 (m, 1H), 3.98 (m, 1H), 3.85 - 3.69 (m, 1H), 3.55 (s, 2H), 3.25 - 3.11 (m, 2H), 2.80 - 2.72 (m, 1H), 2.72 - 2.65 (m, 1H), 2.65 - 2.53 (m, 1H), 2.48 - 2.35 (m, 2H), 2.30 - 21.8 (m, 2H), 2.02 - 1.90 (m, 1H), 1.22 - 1.14 (m, 2H), 1.12 (t,
J
= 7.6 Hz, 3H)。
化合物 2 ： 2 -( 6 -((( 1R , 2S )- 2 -(( E )- 1 - 苯基丁 - 1 - 烯 - 2 - 基 ) 環丙基 ) 胺基 )- 2 - 氮雜螺 [ 3 . 3 ] 庚 - 2 - 基 ) 丙烷 - 1 , 3 - 二醇 步驟 1 ： N -( 2 -( 1 , 3 - 二羥基丙 - 2 - 基 )- 2 - 氮雜螺 [ 3 . 3 ] 庚 - 6 - 基 )- 2 , 2 , 2 - 三氟 - N -(( 1R , 2S )- 2 -(( E )- 1 - 苯基丁 - 1 - 烯 - 2 - 基 ) 環丙基 ) 乙醯胺
向圓底燒瓶中，向溶解於甲醇(18.6 mL)中之2,2,2-三氟-N-((1R,2S)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙基)-N-(2-氮雜螺[3.3]庚-6-基)乙醯胺2,2,2-三氟乙酸酯(2.75 g，5.58 mmol)添加1,3-二羥基丙-2-酮(3.0 g，33.4 mmol)及乙酸(10滴)。接著用氰基硼氫化鈉(2.09 g，33.4 mmol)處理溶液且攪拌1 h。接著使用10%碳酸鉀水溶液將反應物淬滅至pH 8且在真空下移除揮發物。用2-甲基四氫呋喃萃取粗混合物兩次。經合併之有機層用鹽水洗滌一次，接著經硫酸鈉乾燥，過濾且濃縮，以得到粗製N-(2-(1,3-二羥基丙-2-基)-2-氮雜螺[3.3]庚-6-基)-2,2,2-三氟-N-((1R,2S)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙基)乙醯胺。粗產物不經進一步純化即使用。LCMS (ESI) m/z: 453.4 [M+H]
+
。
步驟 2 ： 2 -( 6 -((( 1R , 2S )- 2 -(( E )- 1 - 苯基丁 - 1 - 烯 - 2 - 基 ) 環丙基 ) 胺基 )- 2 - 氮雜螺 [ 3 . 3 ] 庚 - 2 - 基 ) 丙烷 - 1 , 3 - 二醇雙 ( 2 , 2 , 2 - 三氟乙酸酯 )
將N-(2-(1,3-二羥基丙-2-基)-2-氮雜螺[3.3]庚-6-基)-2,2,2-三氟-N-((1R,2S)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙基)乙醯胺(2.52 g，5.58 mmol)溶解於甲醇中，在冰浴中冷卻且用NaOH 10%水溶液處理並使其達至室溫。在30 min之後，使用TFA淬滅反應物至pH 2且在減壓下移除揮發物。使用10%至30% MeCN/0.1% TFA水溶液作為溶離劑藉由反相管柱層析法(60 g)純化粗混合物。溶離份經合併，冷凍及凍乾，以得到呈白色非晶形固體之2-(6-(((1R,2S)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙基)胺基)-2-氮雜螺[3.3]庚-2-基)丙烷-1,3-二醇雙(2,2,2-三氟乙酸酯) (740 mg)。LCMS (ESI) m/z: 357.4 [M+H]
+
。
1
H NMR (400 MHz, DMSO-d
6
) δ 10.00 (s br, 1H), 9.33 (s br, 2H), 7.42 - 7.31 (m, 2H), 7.28 - 7.16 (m, 3H), 6.20 (s, 1H), 5.28 (s br, 2H), 4.30 (t, J = 15.6 Hz, 2H), 4.14 (s, 1H), 3.99 (s, 1H), 3.86 - 3.68 (m, 1H), 3.58 (dd, J = 12.7, 9.6 Hz, 4H), 3.29 (s, 2H), 2.72 (s, 2H), 2.40 (d, J = 8.6 Hz, 1H), 2.31 - 2.15 (m, 2H), 1.97 (s, 1H), 1.15 (dt, J = 15.1, 5.9 Hz, 5H)。
2 -( 6 -((( 1R , 2S )- 2 -(( E )- 1 - 苯基丁 - 1 - 烯 - 2 - 基 ) 環丙基 ) 胺基 )- 2 - 氮雜螺 [ 3 . 3 ] 庚 - 2 - 基 ) 丙烷 - 1 , 3 - 二醇之檸檬酸單酯鹽之按比例增長及形成 步驟 1 ： 6 -((( 1R , 2S )- 2 -(( E )- 1 - 苯基丁 - 1 - 烯 - 2 - 基 ) 環丙基 ) 胺基 )- 2 - 氮雜螺 [ 3 . 3 ] 庚烷 - 2 - 甲酸第三丁酯
將(1R,2S)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙-1-胺(S)-2-羥基-2-苯乙酸酯(160 g，1.0當量)饋入至3 L燒瓶中且溶解於DCM (1000 mL)中。向此燒瓶中添加10% K
2
CO
3
(500 mL)與水(500 mL)之溶液。攪拌溶液10 min。分離各層且用DCM (2×，300 mL)萃取水層。經合併之有機層經Na
2
SO
4
(100 g)乾燥，過濾且濃縮，以得到呈淡黃色油狀之(1R,2S)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙-1-胺。將此材料溶解於2-MeTHF (500 mL)中且濃縮。接著將此材料溶解於2-MeTHF (1000 mL)中且轉移至10 L燒瓶。向10 L燒瓶中添加2-MeTHF (1000 mL)以完全溶解游離鹼且向此溶液中添加6-側氧基-2-氮雜螺[3.3]庚烷-2-甲酸第三丁酯(100 g)。在添加NaBH(OAc)
3
(200 g，2.0當量)之前攪拌反應物10 min。在室溫下攪拌反應物4 h。添加額外的NaBH(OAc)
3
(8 g，0.08當量)且在室溫下攪拌溶液2 h。經由添加10% K
2
CO
3
溶液(950 mL)將此溶液鹼化至pH=8且在室溫下攪拌反應物30 min。分離各層且用DCM (1×，500 mL)萃取水層。經合併之有機層經濃縮(浴溫＜45℃)以得到粗製6-(((1R,2S)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙基)胺基)-2-氮雜螺[3.3]庚烷-2-甲酸第三丁酯(220 g)。
步驟 2 ： 6 -( 2 , 2 , 2 - 三氟 - N -(( 1R , 2S )- 2 -(( E )- 1 - 苯基丁 - 1 - 烯 - 2 - 基 ) 環丙基 ) 乙醯胺基 )- 2 - 氮雜螺 [ 3 . 3 ] 庚烷 - 2 - 甲酸第三丁酯
向饋入有粗製6-(((1R,2S)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙基)胺基)-2-氮雜螺[3.3]庚烷-2-甲酸第三丁酯(200 g)之燒瓶中添加DCM (2000 mL)及惠寧氏鹼(Hunig's base) (100 mL)。在歷經30 min逐滴添加三氟乙酸酐(120 g)之前將反應物冷卻至0℃。在升溫至10℃至20℃之前在0℃下攪拌反應物且攪拌16 h。將水(2000 mL)添加至此反應物且分離各層。濃縮有機層以得到粗產物(264 g)。將粗油溶解於庚烷(500 mL)中且攪拌30分鐘以得到懸浮液。接著經由矽膠層析法(1.5 kg，100至200目矽膠；梯度：1:20乙酸乙酯:庚烷；1:10乙酸乙酯:庚烷；1:5乙酸乙酯:庚烷)純化此材料，以獲得6-(2,2,2-三氟-N-((1R,2S)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙基)乙醯胺基)-2-氮雜螺[3.3]庚烷-2-甲酸第三丁酯(溶離份A：114 g，96%純度；溶離份B：72 g，86%純度)。
步驟 3 ： 2 , 2 , 2 - 三氟 - N -(( 1R , 2S )- 2 -(( E )- 1 - 苯基丁 - 1 - 烯 - 2 - 基 ) 環丙基 )- N -( 2 - 氮雜螺 [ 3 . 3 ] 庚 - 6 - 基 ) 乙醯胺 2 , 2 , 2 - 三氟乙酸酯
向饋入有6-(2,2,2-三氟-N-((1R,2S)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙基)乙醯胺基)-2-氮雜螺[3.3]庚烷-2-甲酸第三丁酯(104 g)之燒瓶中添加DCM (1050 mL)且使溶液冷卻至0℃。向此溶液中添加TFA (240 g，10當量)且使溶液升溫至室溫。在添加額外的TFA (40 g，2.0當量)之前攪拌反應物2 h。在濃縮之前攪拌反應物1 h以得到棕色油狀物。將棕色油狀物溶解於MeOH (500 mL)中且濃縮。重複此步驟(3×)以得到粗製2,2,2-三氟-N-((1R,2S)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙基)-N-(2-氮雜螺[3.3]庚-6-基)乙醯胺2,2,2-三氟乙酸酯(365.7 g)。
步驟 4 ： N -( 2 -( 1 , 3 - 二羥基丙 - 2 - 基 )- 2 - 氮雜螺 [ 3 . 3 ] 庚 - 6 - 基 )- 2 , 2 , 2 - 三氟 - N -(( 1R , 2S )- 2 -(( E )- 1 - 苯基丁 - 1 - 烯 - 2 - 基 ) 環丙基 ) 乙醯胺
向饋入有粗製2,2,2-三氟-N-((1R,2S)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙基)-N-(2-氮雜螺[3.3]庚-6-基)乙醯胺2,2,2-三氟乙酸酯(365.7 g，1.0當量)之燒瓶中添加MeOH (1500 mL)。向此溶液中添加1,3-二羥基丙-2-酮(120 g，1.33當量)且在添加AcOH (20 mL，1.41當量)之前在室溫下攪拌溶液20 min。在添加NaBH
3
CN (84 g，6.01當量)之前攪拌反應物10 min。將反應物置放於冷浴中以保持溫度低於40℃。攪拌反應物1 h且在反應過程期間，混合物變成淡黃色。經由添加10% K
2
CO
3
溶液(400 mL)將此溶液鹼化至pH=8。濃縮混合物以移除MeOH (浴溫＜45℃)。將所得溶液溶解於DCM (500 mL)中且添加水(200 mL)。分離各層且用DCM (2×)萃取水層。經合併之有機層經Na
2
SO
4
乾燥，過濾且濃縮，以得到粗製N-(2-(1,3-二羥基丙-2-基)-2-氮雜螺[3.3]庚-6-基)-2,2,2-三氟-N-((1R,2S)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙基)乙醯胺(110.6 g)。
步驟 5 ： 2 -( 6 -((( 1R , 2S )- 2 -(( E )- 1 - 苯基丁 - 1 - 烯 - 2 - 基 ) 環丙基 ) 胺基 )- 2 - 氮雜螺 [ 3 . 3 ] 庚 - 2 - 基 ) 丙烷 - 1 , 3 - 二醇
向饋入有粗製N-(2-(1,3-二羥基丙-2-基)-2-氮雜螺[3.3]庚-6-基)-2,2,2-三氟-N-((1R,2S)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙基)乙醯胺(110.6 g)之燒瓶中添加2-MeTHF (1100 mL)。向此混合物中緩慢添加NaOH溶液(20 g NaOH溶解於500 mL水中)。在室溫下攪拌反應物1 h。分離各層且用2-MeTHF (2×)萃取水層。經合併之有機層用鹽水洗滌，經Na
2
SO
4
乾燥，過濾且濃縮，以得到黃色油狀物(190 g)。將黃色油狀物溶解於乙酸乙酯中且用鹽水洗滌。有機層經濃縮(浴溫＜45℃)以得到呈淡黃色固體狀之2-(6-(((1R,2S)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙基)胺基)-2-氮雜螺[3.3]庚-2-基)丙烷-1,3-二醇(76.4 g)。
步驟 6 ： 2 -( 6 -((( 1R , 2S )- 2 -(( E )- 1 - 苯基丁 - 1 - 烯 - 2 - 基 ) 環丙基 ) 胺基 )- 2 - 氮雜螺 [ 3 . 3 ] 庚 - 2 - 基 ) 丙烷 - 1 , 3 - 二醇 2 - 羥基丙 - 1 , 2 , 3 - 三甲酸酯
向饋入有2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙基)胺基)-2-氮雜螺[3.3]庚-2-基)丙烷-1,3-二醇(50 g，1.0當量)之燒瓶中添加DCM:MeOH (500 mL:40 mL)之混合物。在逐滴添加溶解於MeOH (90 mL)中之檸檬酸(40 g，1.43當量)之前在室溫下攪拌此溶液10 min。在經由過濾收集沈澱物之前在室溫下攪拌混合物1 h。用MeOH:DCM (3:20，200 mL)之混合物洗滌固體。在40℃下在真空下乾燥濾餅16 h，以得到呈結晶產物之2-(6-(((1R,2S)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙基)胺基)-2-氮雜螺[3.3]庚-2-基)丙烷-1,3-二醇2-羥基丙-1,2,3-三甲酸酯(77.4 g)。1H NMR (400 MHz, D
2
O) δ = 7.46 - 7.33 (m, 2 H), 7.31 - 7.25 (m, 3 H), 6.23 (s, 1 H), 4.40 (s, 2 H), 4.32 (br s, 2 H), 3.93 (quin,
J
= 8.1 Hz, 1 H), 3.84 - 3.71 (m, 4 H), 3.40 (quin,
J
= 4.6 Hz, 1 H), 2.90 - 2.52 (m, 9 H), 2.36 - 2.19 (m, 2 H), 2.09 - 2.00 (m, 1 H), 1.30 - 1.19 (m, 2 H), 1.11 (t,
J
= 7.8 Hz, 3 H)。藉由X射線結晶確認結構。參見
圖 2
。 使用合適起始材料及修飾，使用針對化合物1所描述之合成程序合成
表 2
中之以下化合物。僅展示於表中之1R,2S異構體致力於減少頁面長度。
表 2 化合物 12 ： 2 - 甲基 - 1 -( 6 -((( 1R , 2S )- 2 -(( E )- 1 - 苯基丁 - 1 - 烯 - 2 - 基 ) 環丙基 ) 胺基 )- 2 - 氮雜螺 [ 3 . 3 ] 庚 - 2 - 基 ) 丙 - 2 - 醇雙 ( 2 , 2 , 2 - 三氟乙酸酯 ) 步驟 1 ： 2 , 2 , 2 - 三氟 - N -( 2 -( 2 - 羥基 - 2 - 甲基丙基 )- 2 - 氮雜螺 [ 3 . 3 ] 庚 - 6 - 基 )- N -(( 1R , 2S )- 2 -(( E )- 1 - 苯基丁 - 1 - 烯 - 2 - 基 ) 環丙基 ) 乙醯胺
向密封管中添加2,2,2-三氟-N-((1R,2S)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙基)-N-(2-氮雜螺[3.3]庚-6-基)乙醯胺2,2,2-三氟乙酸酯(200 mg，406 µmol)、2,2-二甲基環氧乙烷(54.0 µL，609 µmol)、二異丙基乙胺(210 µL，1.21 mmol)及EtOH (4.1 mL)。在50℃下攪拌反應混合物18 h。混合物在減壓下經濃縮，用乙酸乙酯稀釋，接著用1 N HCl淬滅。分離各層且用乙酸乙酯萃取水溶液一次。經合併之有機層用鹽水洗滌一次，經硫酸鈉乾燥且在減壓下蒸發，以得到呈黃色油狀物之2,2,2-三氟-N-(2-(2-羥基-2-甲基丙基)-2-氮雜螺[3.3]庚-6-基)-N-((1R,2S)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙基)乙醯胺(296 mg)。LCMS
m/z
451.3 [M+H]
+
。
步驟 2 ： 2 - 甲基 - 1 -( 6 -((( 1R , 2S )- 2 -(( E )- 1 - 苯基丁 - 1 - 烯 - 2 - 基 ) 環丙基 ) 胺基 )- 2 - 氮雜螺 [ 3 . 3 ] 庚 - 2 - 基 ) 丙 - 2 - 醇雙 ( 2 , 2 , 2 - 三氟乙酸酯 )
在室溫下向2,2,2-三氟-N-(2-(2-羥基-2-甲基丙基)-2-氮雜螺[3.3]庚-6-基)-N-((1R,2S)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙基)乙醯胺(250 mg，554 µmol)於MeOH (2.8 mL)中之溶液中添加NaOH (1 M，2.77 mL，2.77 mmol)。使混合物在室溫下攪拌60 min。用TFA淬滅混合物，接著在減壓下濃縮。使用具有以下梯度(2CV 0%，20 CV 0%至30%，3 CV 30%)之MeCN/0.1% TFA H
2
O作為溶離劑在30 g C-18管柱上純化粗產物，以在凍乾之後得到2-甲基-1-(6-(((1R,2S)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙基)胺基)-2-氮雜螺[3.3]庚-2-基)丙-2-醇雙(2,2,2-三氟乙酸酯) (22.0 mg)。LCMS m/z 355.3 [M+H]+. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 9.59 (br s, 1H), 9.27 (br s, 2H), 7.35 (t, J = 7.6 Hz, 2H), 7.29 - 7.14 (m, 3H), 6.20 (s, 1H), 5.10 (br s, 1H), 4.37 - 4.25 (m, 1H), 4.25 - 4.07 (m, 3H), 3.83 - 3.64 (m, 1H), 3.18 - 3.09 (m, 2H), 2.79 - 2.65 (m, 2H), 2.65 - 2.52 (m, 1H), 2.47 - 2.33 (m, 1H), 2.30 - 2.13 (m, 2H), 2.03 - 1.89 (m, 1H), 1.23 - 1.15 (m, 2H), 1.13 (s, 6H), 1.11 (t, J = 7.6 Hz, 3H)。 使用合適起始材料及修飾，使用針對化合物12所描述之合成程序合成
表 3
中之以下實例。僅展示於表中之1R,2S異構體致力於減少頁面長度。
表 3 化合物 21 ： 2 -( 6 -((( 1R , 2S )- 2 -(( E )- 1 - 苯基丁 - 1 - 烯 - 2 - 基 ) 環丙基 ) 胺基 )- 2 - 氮雜螺 [ 3 . 3 ] 庚 - 2 - 基 ) 乙磺醯胺 步驟 1 ： 2 -( 6 -((( 1R , 2S )- 2 -(( E )- 1 - 苯基丁 - 1 - 烯 - 2 - 基 ) 環丙基 ) 胺基 )- 2 - 氮雜螺 [ 3 . 3 ] 庚 - 2 - 基 ) 乙磺醯胺
在室溫下向饋入有2,2,2-三氟-N-(2-(2-羥基-2-甲基丙基)-2-氮雜螺[3.3]庚-6-基)-N-((1R,2S)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙基)乙醯胺(0.1610 g，326 µmol)、N,N-二甲基甲醯胺及碳酸鈉(100 mg，943 µmol)之經密封小瓶中添加乙烯磺醯胺(80.1 mg，748 µmol)。接著密封小瓶且於油浴中加熱至60℃隔夜。將粗混合物分配於2-甲基四氫呋喃與水之間。有機相用水/鹽水(1:1 v/v)洗滌兩次，經硫酸鈉乾燥且在真空下蒸發，以得到粗製2-(6-(((1R,2S)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙基)胺基)-2-氮雜螺[3.3]庚-2-基)乙磺醯胺。粗產物不經進一步純化即使用。LCMS (ESI) m/z: 485.9 [M+H]
+
。
步驟 2 ： 化合物 32 ： 2 -( 6 -((( 1R , 2S )- 2 -(( E )- 1 - 苯基丁 - 1 - 烯 - 2 - 基 ) 環丙基 ) 胺基 )- 2 - 氮雜螺 [ 3 . 3 ] 庚 - 2 - 基 ) 乙磺醯胺雙 ( 2 , 2 , 2 - 三氟乙酸酯 )
將粗製2-(6-(((1R,2S)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙基)胺基)-2-氮雜螺[3.3]庚-2-基)乙磺醯胺溶解於甲醇(2.0 mL)中且在0℃下用10% NaOH水溶液(0.5 mL)處理30 min。藉由反相管柱層析法使用10%至30% MeCN/ 0.1% TFA水溶液作為溶離劑純化反應混合物。將純溶離份合併，冷凍且凍乾三天。獲得呈白色非晶形固體(49.6 mg)之所要產物2-(6-(((1R,2S)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙基)胺基)-2-氮雜螺[3.3]庚-2-基)乙磺醯胺雙(2,2,2三氟乙酸酯)。LCMS (ESI) m/z: 390.2 [M+H]
+
。
1
H NMR (500 MHz, MeOD) δ7.34 - 7.28 (m, 2H), 7.23 - 7.15 (m, 3H), 6.26 (s, 1H), 4.36 (s, 2H), 4.27 (s, 2H), 3.92 (p, J = 8.1 Hz, 1H), 3.67 (t, J = 6.7 Hz, 2H), 3.41 (t, J = 6.7 Hz, 2H), 2.88 - 2.79 (m, 2H), 2.79 - 2.72 (m, 1H), 2.67- 2.56 (m, 2H), 2.40 - 2.25 (m, 2H), 2.09 - 2.01 (m, 1H), 1.40 (s, 2H), 1.33 - 1.20 (m, 3H), 1.17 (t, J = 7.6 Hz, 3H)。 使用合適起始材料及修飾，使用針對化合物21所描述之合成程序合成
表 4
中之以下實例。僅展示於表中之1R,2S異構體致力於減少頁面長度。
表 4 化合物 25 ： N - 乙基 - 2 -( 6 -((( 1R , 2S )- 2 -(( E )- 1 - 苯基丁 - 1 - 烯 - 2 - 基 ) 環丙基 ) 胺基 )- 2 - 氮雜螺 [ 3 . 3 ] 庚 - 2 - 基 ) 乙醯胺雙 ( 2 , 2 , 2 - 三氟乙酸酯 ) 步驟 1 ： 2 -( 6 -( 2 , 2 , 2 - 三氟 - N -(( 1R , 2S )- 2 -(( E )- 1 - 苯基丁 - 1 - 烯 - 2 - 基 ) 環丙基 ) 乙醯胺基 )- 2 - 氮雜螺 [ 3 . 3 ] 庚 - 2 - 基 ) 乙酸
用氰基硼氫化鈉(305 mg，4.86 mmol)處理2,2,2-三氟-N-(2-(2-羥基-2-甲基丙基)-2-氮雜螺[3.3]庚-6-基)-N-((1R,2S)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙基)乙醯胺(800 mg，1.62 mmol)、2-氧代乙酸水合物(298 mg，3.24 mmol)及5滴AcOH於MeOH (16.2 mL)中之溶液。在室溫下攪拌反應混合物1 h。在1 h之後，添加額外的2-氧代乙酸水合物(298 mg，3.24 mmol)且在45℃下攪拌反應物1.5 h。使混合物冷卻至室溫且在減壓下濃縮。殘餘物用DCM稀釋，接著用飽和NaHCO
3
淬滅。分離各層且用DCM萃取水溶液一次。經合併之有機層用鹽水洗滌一次，經硫酸鈉乾燥且在減壓下蒸發，以得到粗製2-(6-(2,2,2-三氟-N-((1R,2S)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙基)乙醯胺基)-2-氮雜螺[3.3]庚-2-基)乙酸(522 mg)。LCMS
m/z
437.2 [M+H]
+
。
步驟 2 ： N -( 2 -( 2 -( 乙胺基 )- 2 - 側氧基乙基 )- 2 - 氮雜螺 [ 3 . 3 ] 庚 - 6 - 基 )- 2 , 2 , 2 - 三氟 - N -(( 1R , 2S )- 2 -(( E )- 1 - 苯基丁 - 1 - 烯 - 2 - 基 ) 環丙基 ) 乙醯胺
在0℃下向2-(6-(2,2,2-三氟-N-((1R,2S)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙基)乙醯胺基)-2-氮雜螺[3.3]庚-2-基)乙酸(175 mg，400 µmol)、氯化乙基銨(40.4 mg，496 µmol)及二異丙基乙胺(215 µL，1.24 mmol)於DMF (2.8 mL)中之溶液中添加HATU (236 mg，621 µmol)。使反應混合物升溫且在室溫下攪拌3 h。用水稀釋反應混合物，且用乙酸乙酯(2×15 mL)萃取。經合併之有機相用鹽水洗滌一次，經無水Na
2
SO
4
乾燥，接著濃縮，以得到具有殘餘DMF之呈黃色油狀物的粗製N-(2-(2-(乙胺基)-2-側氧基乙基)-2-氮雜螺[3.3]庚-6-基)-2,2,2-三氟-N-((1R,2S)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙基)乙醯胺(199 mg，430 µmol)。LCMS
m/z
464.2 [M+H]
+
。
步驟 3 ： N - 乙基 - 2 -( 6 -((( 1R , 2S )- 2 -(( E )- 1 - 苯基丁 - 1 - 烯 - 2 - 基 ) 環丙基 ) 胺基 )- 2 - 氮雜螺 [ 3 . 3 ] 庚 - 2 - 基 ) 乙醯胺雙 ( 2 , 2 , 2 - 三氟乙酸酯 )
在室溫下向N-(2-(2-(乙胺基)-2-側氧基乙基)-2-氮雜螺[3.3]庚-6-基)-2,2,2-三氟-N-((1R,2S)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙基)乙醯胺(190 mg，409 µmol)於MeOH (2.0 mL)中之溶液中添加NaOH (1 M，2.04 mL，2.04 mmol)。使混合物在室溫下攪拌30 min。在減壓下濃縮混合物且將粗產物溶解於TFA/水中並用以下梯度(2CV 0%，20 CV 0%至30%，5 CV 30%)使用MeCN/0.1% TFA H
2
O作為溶離劑在12 g C-18管柱上純化，以在凍乾之後得到呈白色固體狀之N-乙基-2-(6-(((1R,2S)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙基)胺基)-2-氮雜螺[3.3]庚-2-基)乙醯胺雙(2,2,2-三氟乙酸酯) (86.7 mg)。LCMS m/z 368.1 [M+H]+。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.23 (br s, 1H), 9.23 (br s, 2H), 8.45 - 8.33 (m, 1H), 7.35 (t, J = 7.5 Hz, 2H), 7.27 - 7.14 (m, 3H), 6.19 (s, 1H), 4.27 - 4.10 (m, 1H), 4.10 - 3.99 (m, 2H), 3.98 - 3.87 (m, 2H), 3.80 - 3.63 (m, 1H), 3.16 - 3.04 (m, 2H), 2.77 - 2.57 (m, 2H), 2.57 - 2.52 (m, 2H), 2.48 - 2.35 (m, 2H), 2.30 - 2.17 (m, 2H), 2.01 - 1.85 (m, 1H), 1.20 - 1.14 (m, 2H), 1.12 (t, J = 7.5 Hz, 3H), 1.03 (t, J = 7.2 Hz, 3H)。 使用合適起始材料及修飾，使用針對化合物25所描述之合成程序合成
表 5
中之以下實例。僅展示於表中之1R,2S異構體致力於減少頁面長度。
表 5
可使用上文所描述之程序及中間物(1S,2R)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙-1-胺(S)-2-羥基-2-苯乙酸酯而非(1R,2S)-2-((E)-1-苯基丁-1-烯-2-基)環丙-1-胺(S)-2-羥基-2-苯乙酸酯再生前述實例中之每一者以得到對置對映異構體(亦即，1S,2R)。此等對映異構體之結構呈現於下表中。
LSD1 TR - FRET 分析
LSD1去甲基酶反應在50 mM HEPES pH 7.4、100 mM NaCl、1 mM DTT、0.01% Tween-20及0.1 mg/mL BSA中進行。所有酶反應以10-µL體積在室溫下執行50分鐘。將五微升之8 µM生物素化H3K4me1胜肽溶液添加至黑色384孔之各孔，該黑色384孔為含有80 nL化合物之透明底分析盤(最終濃度為0.8% DMSO及4 µM底物)。藉由添加含有20 nM LSD1及80 nM FAD (5 µL)之混合物引發反應。LSD1及FAD最終濃度分別為10 nM及40 nM。藉由添加90 µL之由50 mM HEPES pH 7.4、500 mM NaCl、1 mM DTT、0.01% Tween-20及0.1 mg/mL BSA組成之高鹽緩衝液來終止酶活性。將十微升之經淬滅反應混合物轉移至黑色384孔ProxiPlate。將十微升檢測混合物添加至ProxiPlate，使用分別呈0.3 nM及200 nM之最終濃度的經銪標記之抗體及抗生蛋白鏈菌素APC (總分析體積為20 µL)。藉由抗H3K4me0抗體俘獲產物胜肽且在量測TR-FRET信號之前在室溫下使抗生蛋白鏈菌素APC繼續60 min。在Perkin Elmer EnVision上讀取盤。使用最大(無抑制劑)及最小(用終止緩衝液淬滅)對照及繪製以確定IC
50
值之抑制曲線來計算抑制百分比。
LSD1 LY96 Quantigene 分析
在96孔盤中每孔4×10
4
個細胞之密度下培養MV4-11細胞且用自10 μM開始至0.0005 μM之各種劑量抑制劑處理16 h。使用Quantigene 2.0系統(Affymetrix)定量LY-96 mRNA誘導。用含有蛋白酶K之裂解混合物裂解細胞。根據在Quantigene手冊中之「Capturing Target RNA from Cultured Cell or Blood Lysates」詳述之步驟製備中用於捕獲RNA之工作試劑。使用LY-96探針之後續雜化、信號放大及檢測步驟如手冊中所描述執行。使用Envision (PerkinElmer)讀取化學發光且Abase (IDBS軟體)用於繪製劑量反應曲線並計算IC
50
。
Kasumi - 1 GI50 分析
在含有呈10點劑量曲線排列之工具化合物(範圍介於4倍稀釋下之0 mM至10 mM)的96孔組織培養皿中以每孔5,000個細胞接種細胞，且以固定比率每四天***以針對經DMSO處理之對照重建5,000個細胞/孔密度。細胞處理進行總共12天。在每4天***下，使用EnVision®多標記盤讀取器(Perkin Elmer, Waltham, MA USA)使用細胞Titer-Glo發光細胞存活率分析(Promega, Madison, WI USA)測定活細胞數目。GraphPad Prism 6 (GraphPad Software, Inc., La Jolla, CA USA)用於曲線擬合及GI
50
值之測定。
表 6 *
IC
50
、EC
50
及GI
50
值經報導為遵循：「A」指示小於100 nM之IC
50
值；「B」指示100 nM至1 µM之IC
50
值；「C」指示對於各酶大於1 µM且小於10 µM之IC
50
值；「D」指示對於各酶大於10 µM之IC
50
值；「*(X µM)」指示未在所測試之化合物之最高濃度(亦即，X µM)下觀測到抑制；且「ND」為未經測定。