TW201702218A - 關於治療癌症、自體免疫疾病及神經退化性疾病之組合物及方法 - Google Patents

關於治療癌症、自體免疫疾病及神經退化性疾病之組合物及方法 Download PDF

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Abstract

本文描述關於治療例如癌症、自體免疫疾病、免疫缺乏症及/或神經退化性疾病的方法及組合物。在一些實施例中，治療方法係關於投與如本文所述的化合物。在一些實施例中，根據本文所述方法治療的個體為經確定具有升高之DNA損傷程度的個體。

Description

關於治療癌症、自體免疫疾病及神經退化性疾病之組合物及方法 相關申請案之交叉參考
本申請案依據35 U.S.C.§ 119(e)主張2014年12月12日所申請之美國臨時申請案第62/091,026號的權益，該案之全部內容以引用的方式併入本文中。
政府支持
本發明依據國家癌症研究所(National Cancer Institute)授與的授權號R41CA183197獲得政府支持。美國政府享有本發明的某些權利。
本文所述之技術係關於藉由抑制DNA修復機制來治療例如癌症、自身免疫病症及/或神經退化性疾病。
2010年，僅在美國，估計存在137,000個患有白血病、淋巴瘤及多發性骨髓瘤之新病例，且死於此等癌症的病例超過54,000個。白血病/淋巴瘤治療之當前標準照護療法往往包括密集、長期的化學療法，此於對患者而言繁重費力。習知化學療法之常見副作用包括免疫系統破壞、骨髓抑制、骨髓毀壞、噁心、疲乏、肝中毒、體重降低、脫髮、長期認知障礙及療法相關繼發性腫瘤。標準化學療法的一個主 要問題為以其他方式對癌症患者之健康細胞及組織造成的損傷。當前療法往往不能達成長期的緩解，且存活的患者通常經歷持久的化學療法相關健康問題，始終妨礙其真正地好轉。特定針對癌細胞之選擇性靶向療法可改善此等破壞性副作用中的大部分。令人遺憾的是，除少數外，選擇性靶向在技術上為困難或不可能的。因此非常需要選擇性靶向癌細胞、同時最小化脫靶副作用的其他或替代性方法。
本文描述抑制DNA修復機制(例如雙股斷裂修復)的化合物，及使用此等化合物的方法，例如治療癌症、自身免疫疾病及/或神經退化性疾病的方法對DNA修復的此抑制作用使得此等化合物僅對經歷DNA損傷程度升高(造成及/或引起此類疾病之病理學的細胞特徵)之細胞有毒。相應地，本文提供關於選擇性抑制及/或殺死DNA損傷程度升高及/或DNA編輯酶之含量及/或活性升高之細胞的化合物及方法，例如用於治療癌症。
本文所述之方法及化合物係關於殺死DNA損傷程度升高之細胞，包括DNA編輯酶之含量及/或活性升高之細胞、代謝異常之細胞及/或經DNA損傷劑(例如輻射或化學療法)處理之細胞。
在一個態樣中，本文描述式I化合物：
其中RA及RB為SO2N(R22)2，或RA及RB中之一者為SO3R23且另一者為氫或SO3R23，或RA及RB中之一者為SO3 -Y+且另一者為氫，或RA及 RB中之一者為CO2 -Y+且另一者為氫或CO2 -Y+，或RA及RB中之一者為PO3 -(Y+)2且另一者為氫或PO3 -(Y+)2；R2、R3、R4、R5、R6、R7、R8及R9獨立地為氫、鹵素、CF3、CN、C(O)R21、CO2R21、CO2 -Y+、C(O)N(R22)2、OH、OR21、N(R12)2、N=C=S、NHC(O)R21、NHC(O)OR21、NHC(S)R21、NHC(S)N(R22)2、NHSO2R21、NHSO2N(R22)2、NO2、N2-R22、SOR21、SO2R21、SO3R21、SO3 -Y+、OP(O)(OH)2、視情況經取代之直鏈或分支鏈C1-C10烷基、視情況經取代之直鏈或分支鏈C2-C10烯基、視情況經取代之直鏈或分支鏈C2-C10炔基、視情況經取代之環基、視情況經取代之雜環基、視情況經取代之芳基，或視情況經取代之雜芳基，其限制條件為R3與R8不相同；R21在每次出現時獨立地為氫、視情況經取代之直鏈或分支鏈C1-C10烷基、視情況經取代之直鏈或分支鏈C2-C10烯基、視情況經取代之直鏈或分支鏈C2-C10炔基、視情況經取代之環基、視情況經取代之雜環基、視情況經取代之芳基，或視情況經取代之雜芳基；R22在每次出現時獨立地為氫、視情況經取代之直鏈或分支鏈C1-C10烷基、視情況經取代之直鏈或分支鏈C2-C10烯基、視情況經取代之直鏈或分支鏈C2-C10炔基、視情況經取代之環基、視情況經取代之雜環基、視情況經取代之芳基，或視情況經取代之雜芳基；R23在每次出現時獨立地為視情況經取代之直鏈或分支鏈C1-C10烷基；Y+在每次出現時為陽離子；及其醫藥學上可接受之鹽。
在一些實施例中，R3及R8獨立地選自由以下組成之群：氫、雜環基、OR21、NO2、N(R22)2、N=C=S、NHC(O)R21、NHSO2R21、N(R22)2、NHC(O)N(R22)2、NHC(S)N(R22)2及NHSO2N(R22)2，其中R21為H或C1-C4烷基且R22可為H或C1-C10烷基。
在一些實施例中，R3及R8獨立地選自由以下組成之群：氫、OH、OCH3、N=C=S、NH2、NHCH3、NO2、NH-十八烷、 NHC(O)CH3、NHC(O)CH(CH3)2、NHC(O)CH2OCH3、NHSO2CH3、NHSO2-環丙烷、NHSO2CH(CH3)2、NHSO2N(CH3)2、NHC(S)NHCH3、NHC(S)NHCH(CH3)2、NHC(S)NH-環丙烷、NHC(O)NHCH3、NHC(O)NHCH(CH3)2、苯并噁唑基，及NHC(O)NH-環丙烷。
在一些實施例中，R3及R8中之一者為NHC(O)CH3且另一者為NHC(O)CH3或NHC(S)NHCH(CH3)2。在一些實施例中，R3與R8不同。在一些實施例中，R2、R4、R5、R6、R7及R9中的至少一者為氫。在一些實施例中，R2、R4、R5、R6、R7及R9皆為氫。
在一些實施例中，R22在每次出現時獨立地選自由以下組成之群：氫、甲基、乙基、丙基、異丙基、丁基、異丁基、戊基、第三丁基及環丙基；或兩個R22與其所連接之氮一起形成視情況經取代之3-8員雜環基。在一些實施例中，R23在每次出現時獨立地為甲基、乙基、丙基、異丙基、丁基、異丁基、戊基、第三丁基或環丙基。在一些實施例中，Y+在每次出現時獨立地選自由以下組成之群：鈉、鉀、鋁、鈣、鋰、鎂、鋇、鋅、銨、銨自由基(aminium)及其任何組合。
在一些實施例中，RA為SO3R23；RB為氫或SO3R23；且各R23獨立地為異丙基或第三丁基。在一些實施例中，RA為SO3R23；RB為氫或SO3R23；且R2、R4、R5、R6、R7及R9為氫。在一些實施例中，RA為SO3R23；RB為氫或SO3R23；各R23獨立地為異丙基或第三丁基；且R2、R4、R5、R6、R7及R9為氫。在一些實施例中，RA及RB中之一者為SO3 -Y+且另一者為氫；且R3及R8中之一者為NHC(O)CH3且另一者為NHC(S)NHCH(CH3)2。在一些實施例中，RA及RB中之一者為SO3 -Y+且另一者為氫；且R2、R4、R5、R6、R7及R9為氫。在一些實施例中，RA及RB中之一者為SO3 -Y+且另一者為氫；R3及R8中之一者為NHC(O)CH3且另一者為NHC(S)NHCH(CH3)2；且R2、R4、R5、R6、R7及R9為氫。 在一些實施例中，RA及RB中之一者為CO2 -Y+且另一者為氫或CO2 -Y+；且R3及R8中之一者為NHC(O)CH3且另一者為NHC(S)NHCH(CH3)2。在一些實施例中，RA及RB中之一者為CO2 -Y+且另一者為氫或CO2 -Y+；且R2、R4、R5、R6、R7及R9為氫。在一些實施例中，RA及RB中之一者為CO2 -Y+且另一者為氫或CO2 -Y+；R3及R8中之一者為NHC(O)CH3且另一者為NHC(S)NHCH(CH3)2；且R2、R4、R5、R6、R7及R9為氫。在一些實施例中，RA及RB中之一者為PO3 -Y+且另一者為氫或PO3 -Y+；且R3及R8中之一者為NHC(O)CH3且另一者為NHC(S)NHCH(CH3)2。在一些實施例中，RA及RB中之一者為PO3 -Y+且另一者為氫或PO3 -Y+；且R2、R4、R5、R6、R7及R9為氫。在一些實施例中，RA及RB中之一者為PO3 -Y+且另一者為氫或PO3 -Y+；R3及R8中之一者為NHC(O)CH3且另一者為NHC(S)NHCH(CH3)2；且R2、R4、R5、R6、R7及R9為氫。
在一些實施例中，化合物係選自由以下組成之群：
在一個態樣中，本文描述一種治療癌症、自體免疫疾病、免疫缺乏症或神經退化性疾病的方法，該方法包含向需要治療癌症、自體免疫疾病、免疫缺乏症或神經退化性疾病的個體投與治療有效劑量的如本文所述組合物。
在一些實施例中，相對於參考水準，個體經確定在一或多個細胞類型中存在升高的DNA損傷程度。在一些實施例中，個體經確定在選自由以下組成之群的細胞中存在升高的DNA損傷程度：癌細胞；免疫細胞；自體免疫細胞；或神經系統細胞。在一些實施例中，DNA損傷係選自由以下組成之群：單股DNA斷裂、雙股DNA斷裂及DNA突變。
在一些實施例中，若個體的DNA損傷過程或DNA編輯酶之含量及/或活性經測定升高，則確定個體的DNA損傷程度升高。在一些實施例中，DNA編輯酶係選自由以下組成之群：活化誘導性胞苷脫胺酶(AID或AICDA)、APOBEC2、APOBEC3A、APOBEC3C、 APOBEC3D、APOBEC3F、APOBEC3G、APOBEC3H、APOBEC4、1型拓撲異構酶、2型拓撲異構酶、重組活化基因1(RAG1)，及重組活化基因2(RAG2)。
在一些實施例中，若個體已暴露於選自由以下組成之群的DNA損傷劑，則確定個體具有升高的DNA損傷程度：DNA整合病毒的病毒感染；暴露於DNA損傷化學品；暴露於化學治療劑；及暴露於離子化或紫外輻射。
在一些實施例中，DNA損傷為雙股斷裂。在一些實施例中，DNA損傷酶為活化誘導性胞苷脫胺酶(AID)。在一些實施例中，升高的AID含量為可偵測的AID含量。在一些實施例中，升高的AID含量為AID含量在統計學上顯著高於未活化B細胞或來自健康個體之正常非免疫細胞中所表現之AID的含量。在一些實施例中，AID含量為血細胞或B細胞中的含量。
在一些實施例中，癌症係選自由以下組成之群：淋巴瘤、白血病及漿細胞贅瘤。在一些實施例中，淋巴瘤係選自由以下組成之群：非霍奇金氏淋巴瘤(Non-Hodgkin's lymphoma)；伯基特氏淋巴瘤(Burkitt's lymphoma)、小淋巴細胞性淋巴瘤；淋巴漿細胞淋巴瘤；MALT淋巴瘤；濾泡性淋巴瘤；瀰漫性大B細胞淋巴瘤；及T細胞淋巴瘤。在一些實施例中，白血病係選自由以下組成之群：：急性淋巴母細胞白血病(ALL)、伯基特氏白血病；B細胞白血病；B細胞急性淋巴母細胞白血病；優性淋巴細胞性白血病(CLL)；急性骨髓性白血病(AML)；慢性骨髓性白血病(CML)；及T細胞急性淋巴母細胞白血病(T-ALL)。在一些實施例中，漿細胞贅瘤係選自由以下組成之群：多發性骨髓瘤；漿細胞骨髓瘤；漿細胞白血病；及漿細胞瘤。在一些實施例中，個體患有選自由以下組成之群的癌症：上皮細胞癌；結腸癌、肝癌、胃癌；腸癌；食道癌；乳癌；卵巢癌；頭頸癌；肺癌；及 甲狀腺癌。
在一些實施例中，自體免疫疾病係選自由以下組成之群：紅斑狼瘡；韋斯考特-奧德里奇症候群(Wiskott-Aldrich syndrome)；自體免疫淋巴增生症候群；重症肌無力；類風濕性關節炎(RA)；狼瘡腎炎；多發性硬化症；全身性紅斑狼瘡、盤狀狼瘡、亞急性皮膚紅斑狼瘡、皮膚紅斑狼瘡(包括凍瘡紅斑狼瘡)、慢性關節炎、休格連氏症候群(Sjogren's syndrome)、發炎性慢性鼻竇炎、結腸炎、乳糜瀉、發炎性腸病、巴雷特氏食道(Barrett's esophagus)、發炎性胃炎、自體免疫腎炎、自體免疫血管炎、自體免疫肝炎、自體免疫糖尿病、自體免疫糖尿病腎炎及自體免疫介導性血液疾病。
圖1描述本文所述之某些化合物的示意圖。
圖2描述本文所述之某些化合物的結構及特徵。
圖3描述C-1523-1A在靜脈內及經口遞送時的生物可用性。
圖4-6描繪所指示化合物經由多種投藥途徑之研究中的生物可用性資料。
圖7描述c-1523-1a在以各種劑量靜脈內投與時的生物可用性(血漿濃度)曲線圖。
圖8描繪回應於C-1523-1a之投與之細胞活力的曲線圖。
圖9描繪來自CLL患者之血液塗片之顯微鏡影像，該等影像顯示存在惡性B細胞；及展現回應於依魯替尼及C-1523-1a之投與之細胞活力的曲線圖。
圖10描繪回應於指示劑量之C-1523及C-1523-1a之MEC2細胞活力的曲線圖。
圖11描繪來自靜脈內投與C-1523-1a之研究的生物可用性資料。
圖12A-12D展現根據強抑制劑同源重組篩選的DIDS文庫，其鑑 別C-1523作為第二代候選物。圖12A描繪對母化合物DIDS進行之官能基修飾以便產生用於篩選之衍生物文庫的示意性概述。圖12B描繪差異圖，其顯示各種化合物在10μM下針對AID+/+相對於AID-/-(活化誘導性胞苷脫胺酶)初級小鼠B細胞所測試的化合物篩選資料。經由MultiTox Fluor分析評估活力且活力係以如藉由讀盤器分析所量測的相對螢光單位(RFU)表示。對RFU與AID-/-(y軸)相對於AID+/+(x軸)作圖，其中每個資料點代表個別衍生物。視為強候選物的化合物使得AID-/-細胞保持高活力，而使得AID+/+細胞的活力極低。代表C-1523(篩選中所鑑別之最強候選分子之一)的點用箭頭指示。圖12C描繪C-1523之結構。圖12D描繪條形圖，其表示用10μM之選自文庫之各種化合物處理之後的B細胞相對活力(AID+/AID-)，如圖12B中所示。指示代表C-1523的資料點。
圖13A至13B表明C-1523使細胞對IR敏感且抑制RAD51病灶形成。圖13A描繪0或2.5 Gy IR之後的24小時，對經C-1523處理之CH12-F3細胞的活力分析。資料相對於僅接受DMSO媒劑之各種IR劑量之細胞分 率標準化；誤差條表示三次獨立實驗之SEM。圖13B描繪0或2.5 Gy IR且用C-1523(100nM)或媒劑處理之後的24小時，藉由免疫螢光偵測初級小鼠B細胞中的RAD51。RAD51染色呈紅色，核DNA(DAPI染色)呈藍色。比例條：10μM。圖13C描繪利用得自圖13B之核RAD51(RAD51+)對細胞的量化。誤差條表示三次獨立實驗之SEM。圖13D描繪對核及細胞質溶離份中之RAD51表現的量化，如藉由西方墨點法所測定。值表示三次獨立實驗之平均值且誤差條為SEM。圖13E描繪對初級鼠類B細胞中之NF-κB局域化進行的免疫螢光偵測。NF-κB染色呈綠色，核DNA呈藍色(頂圖)。圖13F描繪對得自圖13E之核NF-κB染色的量化。誤差條表示三次獨立實驗之SEM。
圖14A-14E表明C-1523抑制姊妹染色單體交換。圖14A-14B描繪 經DMSO媒劑(圖14A)或100nM C-1523(圖14B)處理之HEK293T細胞的代表性中期影像。圖14A中之插圖為單一染色體之放大倍數，如虛線所指示，以便更清晰地展現差異性染色單體標記及SCE事件。個別SCE事件用箭頭指示。在各種處理中，對得自三次個別實驗中的二十個中期進行評分。圖14C描繪對來自如圖14A及14B中所評分之中期之每個染色體之中值SCE的量化。誤差條表示三次個別實驗之SEM。根據不成對史都登氏t檢驗法(unpaired Student's t test)得到P值(用於顯著性)。圖14D-14E描繪小鼠ES細胞(圖14D)及人類U2OS細胞(圖14E)的DR-GFP分析。誤差條表示三次個別實驗之SEM。根據不成對史都登氏t檢驗法得到P值(用於顯著性)。
圖15A-15F表明初級小鼠細胞及人類白血病細胞株之活力在C-1523處理之後降低。圖15A描繪在活化條件(αCD40及IL-4，第0及2天)下且經指示劑量之C-1523處理4天之初級WT(AID+/+，封閉標記)及AID-/-(空心標記)鼠類B細胞增殖的分析。細胞增殖之量測係藉由錐蟲藍(Trypan Blue)染色及經由血球計對活的、非染色細胞計數來確定。資料係以各種條件下的平均細胞計數表示。圖15B描繪得自實驗的資料，其中得自A的初級B細胞在第4天用PI染色且經由流式細胞術分析非活的、PI陽性(PI+)之細胞的百分比。圖15C描繪對經培養人類細胞株中之AID表現進行的RT-PCR分析。水(H2O)及得自HEK293T細胞的RNA分別用作模板及AID表現之陰性對照，且人類活化B淋巴細胞RNA(Stim B)用作陽性對照。包括GAPDH表現作為內參考物。圖15D描繪CCRF-SB、MEC-1及MEC-2細胞與指示濃度之C-1523、150μM DIDS或DMSO媒劑一起培養6天之後的活力分析。藉由錐蟲藍染色及血球計計數來測定活力。圖15E描繪得自AID-/-(左)或AID+/+(WT，右)小鼠之初級鼠類脾B細胞之磷酸化γH2AX(綠色)及核(DAPI，藍色)的代表性免疫螢光影像。細胞用αCD40及IL-4活化且用 100nM C-1523處理3天。比例條，10μM。圖15F描繪對圖15E中所示之AID-/-及WT細胞中所觀測之病灶的量化。資料以如下類別分類：DNA損傷量較低(每個核1-2個病灶)、中等(每個核3-10個病灶)或較高(每個核>10個病灶)。誤差條表示三次獨立實驗之SEM。
圖16A-16C表明，C-1523在表現AID之B細胞中所誘導的細胞活力降低具有p53依賴性。圖16A描繪在活化條件(αCD40及IL-4，在第0及2天)下且經DMSO(實心標記)或100nM C-1523(空心標記)處理之初級WT(AID+/+，圓形標記)、AID-/-(方形標記)及p53-/-(三角形標記)B細胞之活力的量測。細胞活力之量測係藉由錐蟲藍染色及經由血球計對活的、非染色細胞計數來確定。資料係以各種條件下的平均細胞計數表示。圖16B描繪如圖16A中之經處理之細胞在第4天之細胞死亡的分析。藉由錐蟲藍染色及經由血球計對藍色的死細胞計數來量測細胞死亡。圖16C描繪經由免疫螢光分析對初級B細胞中之活性卡斯蛋白酶-3(AC3)的量化。左圖：用於AC3誘導的陽性(WT，10 Gy IR)及陰性(0 Gy，及p53-/- 10 Gy)對照。右圖：活化(αCD40及IL-4)及用DMSO或100nM C-1523處理之後3天，經由免疫螢光量測WT、AID-/-及p53-/- B細胞中的AC3。誤差條表示三次獨立實驗之SEM。
圖17A-17D表明，對經C-1523處理之細胞進行的基因表現分析未涉及活力降低的漸進式細胞死亡路徑。圖17A描繪對得自所指示處理組之RNASeq資料進行的變化倍數(FC)分析示意圖。活化(αCD40及IL-4)且用DMSO或100nM C-1523處理之後的60小時，自細胞製備RNA。藉由生物反應路徑分析(Ingenuity Pathway Analysis，IPA)進行路徑分析。圖17B-17D描繪FC1(圖17B)及FC2(圖17C)分析所獨有的前10種路徑及FC1>FC2(向下)及F2>FC1(向上)分析(圖17D)中的所有路徑。在每個條形圖內(白色)，為得自IPA所牽涉之路徑之基因之比率。虛線表示顯著路徑(穿過其之長條)相對於非顯著路徑之0.05顯著性臨限 值。細胞死亡機制為非細胞凋亡且經由有絲***災變來進行。
圖18A-18C表明AID誘導經C-1523處理之細胞出現有絲***災變。圖18A描繪用於微核(MN)評分的代表性影像。頂圖：MN陰性細胞及MN陽性細胞之實例。活化WT B細胞用DMSO(中間圖)或環磷醯胺(下圖)處理三天，接著就微核形成而言進行成像。微核藉由箭頭指示。圖18B描繪如圖18A中所評分之WT(深灰色條)、AID-/-(淺灰色條)及p53-/-(黑色條)細胞的量化。細胞用環磷醯胺(5μg/mL，陽性對照)，DMSO或100nM C-1523處理三天。圖18C描繪MN分析對MEC-1細胞之量化。細胞如圖18B中加以處理。對每個樣品中的500個核評分，且資料以各樣品中之微核平均分率表示。資料條表示三次個別實驗之SEM。
圖19A描繪劑量反應資料曲線圖，其顯示暴露於C-1523之表現AID之B細胞、而非AID陰性B細胞的B細胞活力發生劑量依賴性降低。細胞在培養中用媒劑(DMSO)或50、100、150、200或250nM C-1523處理3天且藉由錐蟲藍排除法及人工血細胞計數法對活力進行評分。圖19B描繪經100nM C-1523處理指定天數之表現AID(實心)及AID陰性(空心)B細胞的生長曲線圖。錐蟲藍染色之後測定活力。
圖20描繪結構模型化，其顯示C-1523結合至RAD51之表面囊穴。預測的胺基酸接點或受影響的胺基酸包括MET80、GLU84 THR177、GLU271及ARG273。
圖21描繪細胞週期分析，其顯示經媒劑處理之B細胞相對於經C-1523處理之B細胞的最小差異。AID+/+或AID-/- B細胞用100nM培養且每隔至多96小時、藉由碘化丙錠染色及流式細胞術測定細胞週期概況。非活化(CD40)細胞用作陰性對照；經微管毒素秋水仙醯胺(colcemid)(ACT+秋水仙醯胺)處理的活化細胞用作陽性對照。
圖22描繪經100nM C-1523處理之表現AID之初級B細胞的活細胞 成像。組蛋白H2B-EGFP轉殖基因小鼠用作B細胞源以促進染色質成像。頂圖描繪460分鐘期間每隔20分鐘成像的個別細胞。影像顯示染色體片段化始於120分鐘。底圖資料描繪活細胞成像之量化，描繪在各個時間點開始片段化之細胞分率(底部左圖)及片段化核之累積分率(底部右圖)。
圖23描繪經C-1523處理之人類癌細胞株之活力分析曲線圖。急性淋巴母細胞白血病(ALL)株系CCRF-SB及慢性淋巴細胞性白血病株系MEC1及MEC2用媒劑(DMSO)或100nM C-1523處理，且藉由錐蟲藍排除法量測活力。所有三種株系均表現AID且對C-1523療法敏感。
圖24描繪MEC1細胞之分率曲線圖，該等MEC1細胞在經環磷醯胺(陽性對照)、媒劑(DMSO)或C-1523(100nM)處理之後顯示微核，作為有絲***災變之證據。
圖25描繪MEC1相對於AID基因表現經阻斷之同基因型細胞株AKD的比較性活力曲線圖，該細胞株AKD經媒劑(DMSO)或100nM C-1523處理。MEC1細胞，而非AKD細胞對C-1523敏感。
圖26描繪MEC1相對於AID基因剔除之同基因型細胞株AKO 14-1及AKO 14-3之比較性活力曲線圖，該等細胞株經媒劑(DMSO)或100nM C-1523處理。MEC1細胞，而非AKD細胞對C-1523敏感。
圖27描繪經C-1523-1AD4(100nM)相對於媒劑(DMSO)處理之表現AID之初級B細胞之細胞存活分析曲線圖。
如本文所述，內源性DNA修復機制之抑制為治療多種疾病(例如癌症)的治療方法。本文描述DNA修復抑制劑且用此類抑制劑治療癌症、自體免疫疾病、免疫缺乏症或神經退化性疾病的方法。
在一個態樣中，本文描述包含式I化合物之組合物：
在式I化合物中，RA及RB中的至少一者不為氫。
RA可為氫或SO2R1、CO2 -Y+、PO3 -(Y+)m，其中m為2。
RB可為氫或SO2R10、CO2 -Y+、PO3 -(Y+)m，其中m為2。
R1可為N(R22)2或OR23。在一些實施例中，R1為N(R22)2且R22獨立地為H或C1-C4烷基、C(O)(CH2)nCH3，其中n=0、1、2、3、4、5或6，或R22與其所連接之氮一起形成視情況經取代之3-8員雜環基。在一些實施例中，R1為NH2、NHCH3、NHCH(CH3)、N(CH3)2、吡咯啶基、C(O)(CH2)2CH3、C(O)(CH)n(CH)3，其中n=1、2、3；或氮雜環丁烷基。在一些實施例中，R1為OR23，其中R23為C1-C4烷基。在一些實施例中，R23為甲基、乙基、丙基、異丙基、丁基、異丁基、戊基、第三丁基、環丙基。在一個較佳實施例中，R23為異丙基。
R2可選自由以下組成之群：氫、鹵素、CF3、CN、C(O)R21、CO2R21、CO2 -Y+、C(O)N(R22)2、OH、OR21、N(R22)2、N=C=S、NHC(O)R21、NHC(O)OR21、NHC(S)R21、NHC(S)N(R22)2、NHSO2R21、NHSO2N(R22)2、NO2、N2-R22、SOR21、SO2R21、SO3R21、SO3 -Y+、OP(O)(OH)2、視情況經取代之直鏈或分支鏈C1-C10烷基、視情況經取代之直鏈或分支鏈C2-C10烯基、視情況經取代之直鏈或分支鏈C2-C10炔基、視情況經取代之環基、視情況經取代之雜環基、視情況經取代之芳基及視情況經取代之雜芳基。較佳地，R2為氫、OR21、NO2、N(R22)2、OP(O)(OH)2或SO3R21，其中R21及R22獨立 地為H或C1-C4烷基。在一些實施例中，R2為氫、OH、OCH3、NO2、NH2、OP(O)(OH)2。在一些實施例中，R2為C1-C4烷基。在一些實施例中，R2為甲基、乙基、正丙基、異丙基、正丁基、異丁基或第三丁基。在一些實施例中，R2為SO3H或SO3 -Y+，其中Y可為鈉、鉀、鋁、鈣、鋰、鎂、鋇或鋅。在一些實施例中，R2為CO2H或CO2 -Y+，其中Y可為鈉、鉀、鋁、鈣、鋰、鎂、鋇或鋅。在一些實施例中，R2為視情況經取代之芳基。在一些實施例中，芳基為環戊二烯或苯基。在一些實施例中，R2為視情況經取代之雜芳基。在一些實施例中，雜芳基為呋喃基、吡啶基、噻吩基、吡咯基、噁唑基、咪唑基、噻唑基、吡唑基、嘌呤基、喹啉基、異喹啉基、菲基、噠嗪基、啉基、酞嗪基、吡嗪基、嘧啶基、喹唑啉基或三嗪基。
R3可選自由以下組成之群：氫、鹵素、CF3、CN、C(O)R21、CO2R21、CO2 -Y+、C(O)N(R22)2、OH、OR21、N(R22)2、N=C=S、NHC(O)R21、NHC(O)OR21、NHC(S)R21、NHC(S)N(R22)2、NHSO2R21、NHSO2N(R22)2、NO2、N2-R22、SOR21、SO2R21、SO3R21、SO3 -Y+、OP(O)(OH)2、視情況經取代之直鏈或分支鏈C1-C10烷基、視情況經取代之直鏈或分支鏈C2-C10烯基、視情況經取代之直鏈或分支鏈C2-C10炔基、視情況經取代之環基、視情況經取代之雜環基、視情況經取代之芳基及視情況經取代之雜芳基。較佳地，R3為氫、雜環基、OR21、NO2、N(R22)2、N=C=S、NHC(O)R21、NHSO2R21、N(R22)2、NHC(O)N(R22)2、NHC(S)N(R22)2或NHSO2N(R22)2，其中R21及R22獨立地為H或C1-C4烷基。在一些實施例中，R3為氫、OH、OCH3、N=C=S、NH2、NHCH3、NO2、NH-十八烷、NHC(O)CH3、NHC(O)CH(CH3)2、NHC(O)CH2OCH3、NHSO2CH3、NHSO2-環丙烷、NHSO2CH(CH3)2、NHSO2N(CH3)2、NHC(S)NHCH3、NHC(S)NHCH(CH3)2、NHC(S)NH-環丙烷、NHC(O)NHCH3、NHC(O)NHCH(CH3)2、苯并噁唑基或 NHC(O)NH-環丙烷。在一些實施例中，R3為C1-C4烷基。在一些實施例中，R3為甲基、乙基、正丙基、異丙基、正丁基、異丁基或第三丁基。在一些實施例中，R3為SO3H或SO3 -Y+，其中Y可為鈉、鉀、鋁、鈣、鋰、鎂、鋇或鋅。在一些實施例中，R3為CO2H或CO2 -Y+，其中Y可為鈉、鉀、鋁、鈣、鋰、鎂、鋇或鋅。在一些實施例中，R3為視情況經取代之芳基。在一些實施例中，芳基為環戊二烯或苯基。在一些實施例中，R3為視情況經取代之雜芳基。在一些實施例中，雜芳基為呋喃基、吡啶基、噻吩基、吡咯基、噁唑基、咪唑基、噻唑基、吡唑基、嘌呤基、喹啉基、異喹啉基、菲基、噠嗪基、啉基、酞嗪基、吡嗪基、嘧啶基、喹唑啉基或三嗪基。
R4可選自由以下組成之群：氫、鹵素、CF3、CN、C(O)R21、CO2R21、CO2 -Y+、C(O)N(R22)2、OH、OR21、N(R22)2、N=C=S、NHC(O)R21、NHC(O)OR21、NHC(S)R21、NHC(S)N(R22)2、NHSO2R21、NHSO2N(R22)2、NO2、N2-R22、SOR21、SO2R21、SO3R21、SO3 -Y+、OP(O)(OH)2、視情況經取代之直鏈或分支鏈C1-C10烷基、視情況經取代之直鏈或分支鏈C2-C10烯基、視情況經取代之直鏈或分支鏈C2-C10炔基、視情況經取代之環基、視情況經取代之雜環基、視情況經取代之芳基及視情況經取代之雜芳基。較佳地，R4為氫、OR21、NO2、N(R22)2、OP(O)(OH)2或SO3R21，其中R21及R22獨立地為H或C1-C4烷基。在一些實施例中，R4為氫、OH、OCH3、NO2、NH2、OP(O)(OH)2。在一些實施例中，R4為C1-C4烷基。在一些實施例中，R4為甲基、乙基、正丙基、異丙基、正丁基、異丁基或第三丁基。在一些實施例中，R4為SO3H或SO3 -Y+，其中Y可為鈉、鉀、鋁、鈣、鋰、鎂、鋇或鋅。在一些實施例中，R4為CO2H或CO2 -Y+，其中Y可為鈉、鉀、鋁、鈣、鋰、鎂、鋇或鋅。在一些實施例中，R4為視情況經取代之芳基。在一些實施例中，芳基為環戊二烯或苯基。在一些實施例中，R4 為視情況經取代之雜芳基。在一些實施例中，雜芳基為呋喃基、吡啶基、噻吩基、吡咯基、噁唑基、咪唑基、噻唑基、吡唑基、嘌呤基、喹啉基、異喹啉基、菲基、噠嗪基、啉基、酞嗪基、吡嗪基、嘧啶基、喹唑啉基或三嗪基。
R5可選自由以下組成之群：氫、鹵素、CF3、CN、C(O)R21、CO2R21、CO2 -Y+、C(O)N(R22)2、OH、OR21、N(R22)2、N=C=S、NHC(O)R21、NHC(O)OR21、NHC(S)R21、NHC(S)N(R22)2、NHSO2R21、NHSO2N(R22)2、NO2、N2-R22、SOR21、SO2R21、SO3R21、SO3 -Y+、OP(O)(OH)2、視情況經取代之直鏈或分支鏈C1-C10烷基、視情況經取代之直鏈或分支鏈C2-C10烯基、視情況經取代之直鏈或分支鏈C2-C10炔基、視情況經取代之環基、視情況經取代之雜環基、視情況經取代之芳基及視情況經取代之雜芳基。較佳地，R5為氫、OR21、NO2、N(R22)2、OP(O)(OH)2或SO3R21，其中R21及R22獨立地為H或C1-C4烷基。在一些實施例中，R5為氫、OH、OCH3、NO2、NH2、OP(O)(OH)2。在一些實施例中，R5為C1-C4烷基。在一些實施例中，R5為甲基、乙基、正丙基、異丙基、正丁基、異丁基或第三丁基。在一些實施例中，R5為SO3H或SO3 -Y+，其中Y可為鈉、鉀、鋁、鈣、鋰、鎂、鋇或鋅。在一些實施例中，R5為CO2H或CO2 -Y+，其中Y可為鈉、鉀、鋁、鈣、鋰、鎂、鋇或鋅。在一些實施例中，R5為視情況經取代之芳基。在一些實施例中，芳基為環戊二烯或苯基。在一些實施例中，R5為視情況經取代之雜芳基。在一些實施例中，雜芳基為呋喃基、吡啶基、噻吩基、吡咯基、噁唑基、咪唑基、噻唑基、吡唑基、嘌呤基、喹啉基、異喹啉基、菲基、噠嗪基、啉基、酞嗪基、吡嗪基、嘧啶基、喹唑啉基或三嗪基。
R6可選自由以下組成之群：氫、鹵素、CF3、CN、C(O)R21、CO2R21、CO2 -Y+、C(O)N(R22)2、OH、OR21、N(R22)2、N=C=S、 NHC(O)R21、NHC(O)OR21、NHC(S)R21、NHC(S)N(R22)2、NHSO2R21、NHSO2N(R22)2、NO2、N2-R22、SOR21、SO2R21、SO3R21、SO3 -Y+、OP(O)(OH)2、視情況經取代之直鏈或分支鏈C1-C10烷基、視情況經取代之直鏈或分支鏈C2-C10烯基、視情況經取代之直鏈或分支鏈C2-C10炔基、視情況經取代之環基、視情況經取代之雜環基、視情況經取代之芳基及視情況經取代之雜芳基。較佳地，R6為氫、OR21、NO2、N(R22)2、OP(O)(OH)2或SO3R21，其中R21及R22獨立地為H或C1-C4烷基。在一些實施例中，R6為氫、OH、OCH3、NO2、NH2、OP(O)(OH)2。在一些實施例中，R6為C1-C4烷基。在一些實施例中，R6為甲基、乙基、正丙基、異丙基、正丁基、異丁基或第三丁基。在一些實施例中，R6為SO3H或SO3 -Y+，其中Y可為鈉、鉀、鋁、鈣、鋰、鎂、鋇或鋅。在一些實施例中，R6為CO2H或CO2 -Y+，其中Y可為鈉、鉀、鋁、鈣、鋰、鎂、鋇或鋅。在一些實施例中，R6為視情況經取代之芳基。在一些實施例中，芳基為環戊二烯或苯基。在一些實施例中，R6為視情況經取代之雜芳基。在一些實施例中，雜芳基為呋喃基、吡啶基、噻吩基、吡咯基、噁唑基、咪唑基、噻唑基、吡唑基、嘌呤基、喹啉基、異喹啉基、菲基、噠嗪基、啉基、酞嗪基、吡嗪基、嘧啶基、喹唑啉基或三嗪基。
R7可選自由以下組成之群：氫、鹵素、CF3、CN、C(O)R21、CO2R21、CO2 -Y+、C(O)N(R22)2、OH、OR21、N(R22)2、N=C=S、NHC(O)R21、NHC(O)OR21、NHC(S)R21、NHC(S)N(R22)2、NHSO2R21、NHSO2N(R22)2、NO2、N2-R22、SOR21、SO2R21、SO3R21、SO3 -Y+、OP(O)(OH)2、視情況經取代之直鏈或分支鏈C1-C10烷基、視情況經取代之直鏈或分支鏈C2-C10烯基、視情況經取代之直鏈或分支鏈C2-C10炔基、視情況經取代之環基、視情況經取代之雜環基、視情況經取代之芳基及視情況經取代之雜芳基。較佳地，R7為 氫、OR21、NO2、N(R22)2、OP(O)(OH)2或SO3R21，其中R21及R22獨立地為H或C1-C4烷基。在一些實施例中，R7為氫、OH、OCH3、NO2、NH2、OP(O)(OH)2。在一些實施例中，R7為C1-C4烷基。在一些實施例中，R7為甲基、乙基、正丙基、異丙基、正丁基、異丁基或第三丁基。在一些實施例中，R7為SO3H或SO3 -Y+，其中Y可為鈉、鉀、鋁、鈣、鋰、鎂、鋇或鋅。在一些實施例中，R7為CO2H或CO2 -Y+，其中Y可為鈉、鉀、鋁、鈣、鋰、鎂、鋇或鋅。在一些實施例中，R7為視情況經取代之芳基。在一些實施例中，芳基為環戊二烯或苯基。在一些實施例中，R7為視情況經取代之雜芳基。在一些實施例中，雜芳基為呋喃基、吡啶基、噻吩基、吡咯基、噁唑基、咪唑基、噻唑基、吡唑基、嘌呤基、喹啉基、異喹啉基、菲基、噠嗪基、啉基、酞嗪基、吡嗪基、嘧啶基、喹唑啉基或三嗪基。
R8可選自由以下組成之群：氫、鹵素、CF3、CN、C(O)R21、CO2R21、CO2 -Y+、C(O)N(R22)2、OH、OR21、N(R22)2、N=C=S、NHC(O)R21、NHC(O)OR21、NHC(S)R21、NHC(S)N(R22)2、NHSO2R21、NHSO2N(R22)2、NO2、N2-R22、SOR21、SO2R21、SO3R21、SO3 -Y+、OP(O)(OH)2、視情況經取代之直鏈或分支鏈C1-C10烷基、視情況經取代之直鏈或分支鏈C2-C10烯基、視情況經取代之直鏈或分支鏈C2-C10炔基、視情況經取代之環基、視情況經取代之雜環基、視情況經取代之芳基及視情況經取代之雜芳基。較佳地，R8為氫、雜環基、OR21、NO2、N(R22)2、N=C=S、NHC(O)R21、NHSO2R21、N(R22)2、NHC(O)N(R22)2、NHC(S)N(R22)2，或NHSO2N(R22)2，其中R21及R22獨立地為H或C1-C4烷基。在一些實施例中，R8為氫、OH、OCH3、N=C=S、NH2、NHCH3、NO2、NH-十八烷、NHC(O)CH3、NHC(O)CH(CH3)2、NHC(O)CH2OCH3、NHSO2CH3、NHSO2-環丙烷、NHSO2CH(CH3)2、NHSO2N(CH3)2、 NHC(S)NHCH3、NHC(S)NHCH(CH3)2、NHC(S)NH-環丙烷、NHC(O)NHCH3、NHC(O)NHCH(CH3)2、苯并噁唑基或NHC(O)NH-環丙烷。在一些實施例中，R8為C1-C4烷基。在一些實施例中，R8為甲基、乙基、正丙基、異丙基、正丁基、異丁基或第三丁基。在一些實施例中，R1為SO3H或SO3 -Y+，其中Y可為鈉、鉀、鋁、鈣、鋰、鎂、鋇或鋅。在一些實施例中，R8為CO2H或CO2 -Y+，其中Y可為鈉、鉀、鋁、鈣、鋰、鎂、鋇或鋅。在一些實施例中，R8為視情況經取代之芳基。在一些實施例中，芳基為環戊二烯或苯基。在一些實施例中，R8為視情況經取代之雜芳基。在一些實施例中，雜芳基為呋喃基、吡啶基、噻吩基、吡咯基、噁唑基、咪唑基、噻唑基、吡唑基、嘌呤基、喹啉基、異喹啉基、菲基、噠嗪基、啉基、酞嗪基、吡嗪基、嘧啶基、喹唑啉基或三嗪基。
R9可選自由以下組成之群：氫、鹵素、CF3、CN、C(O)R21、CO2R21、CO2 -Y+、C(O)N(R22)2、OH、OR21、N(R22)2、N=C=S、NHC(O)R21、NHC(O)OR21、NHC(S)R21、NHC(S)N(R22)2、NHSO2R21、NHSO2N(R22)2、NO2、N2-R22、SOR21、SO2R21、SO3R21、SO3 -Y+、OP(O)(OH)2、視情況經取代之直鏈或分支鏈C1-C10烷基、視情況經取代之直鏈或分支鏈C2-C10烯基、視情況經取代之直鏈或分支鏈C2-C10炔基、視情況經取代之環基、視情況經取代之雜環基、視情況經取代之芳基及視情況經取代之雜芳基。較佳地，R9為氫、OR21、NO2、N(R22)2、OP(O)(OH)2或SO3R21，其中R21及R22獨立地為H或C1-C4烷基。在一些實施例中，R9為氫、OH、OCH3、NO2、NH2、OP(O)(OH)2。在一些實施例中，R9為C1-C4烷基。在一些實施例中，R9為甲基、乙基、正丙基、異丙基、正丁基、異丁基或第三丁基。在一些實施例中，R1為SO3H或SO3 -Y+，其中Y可為鈉、鉀、鋁、鈣、鋰、鎂、鋇或鋅。在一些實施例中，R9為CO2H或CO2 -Y+，其中Y 可為鈉、鉀、鋁、鈣、鋰、鎂、鋇或鋅。在一些實施例中，R9為視情況經取代之芳基。在一些實施例中，芳基為環戊二烯或苯基。在一些實施例中，R9為視情況經取代之雜芳基。在一些實施例中，雜芳基為呋喃基、吡啶基、噻吩基、吡咯基、噁唑基、咪唑基、噻唑基、吡唑基、嘌呤基、喹啉基、異喹啉基、菲基、噠嗪基、啉基、酞嗪基、吡嗪基、嘧啶基、喹唑啉基或三嗪基。
R10可為N(R22)2或OR23。在一些實施例中，R10為N(R22)2且R22獨立地為H或C1-C4烷基、C(O)CH2)nCH3，其中n=0、1、2、3、4、5、6，或R22與其所連接之氮一起形成視情況經取代之3-8員雜環基。在一些實施例中，R10為NH2、NHCH3、NHCH(CH3)2、N(CH3)2、吡咯啶基、C(O)(CH2)2CH3、C(O)(CH)n(CH)3，其中n=1、2、3；或氮雜環丁烷基。在一些實施例中，R10為OR23，其中R23為C1-C4烷基。在一些實施例中，R23為甲基、乙基、丙基、異丙基、丁基、異丁基、戊基、第三丁基、環丙基。在一個較佳實施例中，R23為異丙基。
各R21可獨立地選自由以下組成之群：氫、視情況經取代之直鏈或分支鏈C1-C10烷基、視情況經取代之直鏈或分支鏈C2-C10烯基、視情況經取代之直鏈或分支鏈C2-C10炔基、視情況經取代之環基、視情況經取代之雜環基、視情況經取代之芳基、視情況經取代之雜芳基，及其任何組合。較佳地，R21為氫或直鏈或分支鏈C1-C10烷基。在一些實施例中，R21可為甲基、乙基、丙基、異丙基、丁基、異丁基、戊基、第三丁基、環丙基或CH2OCH3。
各R22可獨立地選自由以下組成之群：氫、視情況經取代之直鏈或分支鏈C1-C10烷基、視情況經取代之直鏈或分支鏈C2-C10烯基、視情況經取代之直鏈或分支鏈C2-C10炔基、視情況經取代之環基、視情況經取代之雜環基、視情況經取代之芳基、視情況經取代之雜芳基，及其任何組合。較佳地，R22為氫或直鏈或分支鏈C1-C10烷基。在一些 實施例中，R22可為氫、甲基、乙基、丙基、異丙基、丁基、異丁基、戊基、第三丁基或環丙基。在一些實施例中，兩個R22與其所連接之氮一起形成視情況經取代之3-8員雜環基。
各R23可獨立地選自由氫、C1-C6烷基組成之群。在一些實施例中，R23為甲基、乙基、丙基、異丙基、丁基、異丁基、戊基、第三丁基、環丙基。在一個較佳實施例中，R23為異丙基。在另一個實施例中，R23為第三丁基。
各Y+獨立地為陽離子，例如單價陽離子。例示性陽離子包括(但不限於)鈉、鉀、鋁、鈣、鋰、鎂、鋇、鋅、銨及銨自由基。
R3與R8可相同或不同。在一些實施例中，R3及R8中的至少一者不為氫。在一些實施例中，R3與R8均不為氫。在一些實施例中，R3及R8獨立地選自由以下組成之群：氫、雜環基、OR21、NO2、N(R22)2、N=C=S、NHC(O)R21、NHSO2R21、N(R22)2、NHC(O)N(R22)2、NHC(S)N(R22)2及NHSO2N(R22)2，其中R21為H或C1-C4烷基且R22可為H或C1-C10烷基。舉例而言，R3及R8可獨立地選自由以下組成之群：氫、OH、OCH3、N=C=S、NH2、NHCH3、NO2、NH-十八烷、NHC(O)CH3、NHC(O)CH(CH3)2、NHC(O)CH2OCH3、NHSO2CH3、NHSO2-環丙烷、NHSO2CH(CH3)2、NHSO2N(CH3)2、NHC(S)NHCH3、NHC(S)NHCH(CH3)2、NHC(S)NH-環丙烷、NHC(O)NHCH3、NHC(O)NHCH(CH3)2、苯并噁唑基，或NHC(O)NH-環丙烷。
在一些實施例中，R3及R8獨立地選自由以下組成之群：氫、OH、OCH3、N=C=S、NH2、NHCH3、NO2、NH-十八烷、NHC(O)CH3、NHC(O)CH(CH3)2、NHC(O)CH2OCH3、NHSO2CH3、NHSO2-環丙烷、NHSO2CH(CH3)2、NHSO2N(CH3)2、NHC(S)NHCH3、NHC(S)NHCH(CH3)2、NHC(S)NH-環丙烷、 NHC(O)NHCH3、NHC(O)NHCH(CH3)2、苯并噁唑基，或NHC(O)NH-環丙烷。舉例而言，R3及R8之一可為H且另一者可為NH2，R3及R8中之一者可為H且另一者可為NHCH3，R3及R8中之一者可為H且另一者可為N(CH3)2，R3及R8中之一者可為H且另一者可為NHC(O)CH3，R3及R8中之一者可為H且另一者可為NHC(O)CH(CH3)2，R3及R8中之一者可為H且另一者可為NHC(O)CH2OCH3，R3及R8中之一者可為H且另一者可為NHSO2-CH3，R3及R8中之一者可為H且另一者可為NHSO2-CH(CH3)2，R3及R8中之一者可為H且另一者可為NHSO2-環丙烷，R3及R8中之一者可為H且另一者可為NHSO2-NHCH3，R3及R8中之一者可為H且另一者可為NHSO2-N(CH3)2，R3及R8中之一者可為H且另一者可為NHSO2-NHCH(CH3)2，R3及R8中之一者可為H且另一者可為NHSO2-NH-環丙烷，R3及R8中之一者可為H且另一者可為NHC(S)NH-CH3，R3及R8中之一者可為H且另一者可為NHC(S)NH-CH(CH3)2，R3及R8中之一者可為H且另一者可為NHC(S)NH-環丙烷，R3及R8中之一者可為H且另一者可為NHC(O)NH-CH3，R3及R8中之一者可為H且另一者可為NHC(O)NH-CH(CH3)2，R3及R8中之一者可為H且另一者可為NHC(O)NH-環丙烷，R3及R8中之一者可為NH2且另一者可為NHCH3，R3及R8中之一者可為NH2且另一者可為N(CH3)2，R3及R8中之一者可為NH2且另一者可為NHC(O)CH3，R3及R8中之一者可為NH2且另一者可為NHC(O)CH(CH3)2，R3及R8中之一者可為NH2且另一者可為NHC(O)CH2OCH3，R3及R8中之一者可為NH2且另一者可為NHSO2-CH3，R3及R8中之一者可為NH2且另一者可為NHSO2-CH(CH3)2，R3及R8中之一者可為NH2且另一者可為NHSO2-環丙烷，R3及R8中之一者可為NH2且另一者可為NHSO2-NHCH3，R3及R8中之一者可為NH2且另一者可為NHSO2-N(CH3)2，R3及R8中之一者可為NH2且另一者可為NHSO2-NHCH(CH3)2，R3及R8中之一者可為NH2且另一者可為NHSO2- NH-環丙烷，R3及R8中之一者可為NH2且另一者可為NHC(S)NH-CH3，R3及R8中之一者可為NH2且另一者可為NHC(S)NH-CH(CH3)2，R3及R8中之一者可為NH2且另一者可為NHC(S)NH-環丙烷，R3及R8中之一者可為NH2且另一者可為NHC(O)NH-CH3，R3及R8中之一者可為NH2且另一者可為NHC(O)NH-CH(CH3)2，R3及R8中之一者可為NH2且另一者可為NHC(O)NH-環丙烷，R3及R8中之一者可為NHCH3且另一者可為N(CH3)2，R3及R8中之一者可為NHCH3且另一者可為NHC(O)CH3，R3及R8中之一者可為NHCH3且另一者可為NHC(O)CH(CH3)2，R3及R8中之一者可為NHCH3且另一者可為NHC(O)CH2OCH3，R3及R8中之一者可為NHCH3且另一者可為NHSO2-CH3，R3及R8中之一者可為NHCH3且另一者可為NHSO2-CH(CH3)2，R3及R8中之一者可為NHCH3且另一者可為NHSO2-環丙烷，R3及R8中之一者可為NHCH3且另一者可為NHSO2-NHCH3，R3及R8中之一者可為NHCH3且另一者可為NHSO2-N(CH3)2，R3及R8中之一者可為NHCH3且另一者可為NHSO2-NHCH(CH3)2，R3及R8中之一者可為NHCH3且另一者可為NHSO2-NH-環丙烷，R3及R8中之一者可為NHCH3且另一者可為NHC(S)NH-CH3，R3及R8中之一者可為NHCH3且另一者可為NHC(S)NH-CH(CH3)2，R3及R8中之一者可為NHCH3且另一者可為NHC(S)NH-環丙烷，R3及R8中之一者可為NHCH3且另一者可為NHCO)NH-CH3，R3及R8中之一者可為NHCH3且另一者可為NHC(O)NH-CH(CH3)2，R3及R8中之一者可為NHCH3且另一者可為NHC(O)NH-環丙烷，R3及R8中之一者可為N(CH3)2且另一者可為NHC(O)CH3，R3及R8中之一者可為N(CH3)2且另一者可為NHC(O)CH(CH3)2，R3及R8中之一者可為N(CH3)2且另一者可為NHC(O)CH2OCH3，R3及R8中之一者可為N(CH3)2且另一者可為NHSO2-CH3，R3及R8中之一者可為N(CH3)2且另一者可為NHSO2- CH(CH3)2，R3及R8中之一者可為N(CH3)2且另一者可為NHSO2-環丙烷，R3及R8中之一者可為N(CH3)2且另一者可為NHSO2-NHCH3，R3及R8中之一者可為N(CH3)2且另一者可為NHSO2-N(CH3)2，R3及R8中之一者可為N(CH3)2且另一者可為NHSO2-NHCH(CH3)2，R3及R8中之一者可為N(CH3)2且另一者可為NHSO2-NH-環丙烷，R3及R8中之一者可為N(CH3)2且另一者可為NHC(S)NH-CH3，R3及R8中之一者可為N(CH3)2且另一者可為NHC(S)NH-CH(CH3)2，R3及R8中之一者可為N(CH3)2且另一者可為NHC(S)NH-環丙烷，R3及R8中之一者可為N(CH3)2且另一者可為NHC(O)NH-CH3，R3及R8中之一者可為N(CH3)2且另一者可為NHC(O)NH-CH(CH3)2，R3及R8中之一者可為N(CH3)2且另一者可為NHC(O)NH-環丙烷，R3及R8中之一者可為NHC(O)CH3且另一者可為NHC(O)CH(CH3)2，R3及R8中之一者可為NHC(O)CH3且另一者可為NHC(O)CH2OCH3，R3及R8中之一者可為NHC(O)CH3且另一者可為NHSO2-CH3，R3及R8中之一者可為NHC(O)CH3且另一者可為NHSO2-CH(CH3)2，R3及R8中之一者可為NHC(O)CH3且另一者可為NHSO2-環丙烷，R3及R8中之一者可為NHC(O)CH3且另一者可為NHSO2-NHCH3，R3及R8中之一者可為NHC(O)CH3且另一者可為NHSO2-N(CH3)2，R3及R8中之一者可為NHC(O)CH3且另一者可為NHSO2-NHCH(CH3)2，R3及R8中之一者可為NHC(O)CH3且另一者可為NHSO2-NH-環丙烷，R3及R8中之一者可為NHC(O)CH3且另一者可為NHC(S)NH-CH3，R3及R8中之一者可為NHC(O)CH3且另一者可為NHC(S)NH-CH(CH3)2，R3及R8中之一者可為NHC(O)CH3且另一者可為NHC(S)NH-環丙烷，R3及R8中之一者可為NHC(O)CH3且另一者可為NHC(O)NH-CH3，R3及R8中之一者可為NHC(O)CH3且另一者可為NHC(O)NH-CH(CH3)2，R3及R8中之一者可為NHC(O)CH3且另一者可為NHC(O)NH-環丙烷，R3及R8中之一者可為NHC(O)CH(CH3)2且另一 者可為NHC(O)CH2OCH3，R3及R8中之一者可為NHC(O)CH(CH3)2且另一者可為NHSO2-CH3，R3及R8中之一者可為NHC(O)CH(CH3)2且另一者可為NHSO2-CH(CH3)2，R3及R8中之一者可為NHC(O)CH(CH3)2且另一者可為NHSO2-環丙烷，R3及R8中之一者可為NHC(O)CH(CH3)2且另一者可為NHSO2-NHCH3，R3及R8中之一者可為NHC(O)CH(CH3)2且另一者可為NHSO2-N(CH3)2，R3及R8中之一者可為NHC(O)CH(CH3)2且另一者可為NHSO2-NHCH(CH3)2，R3及R8中之一者可為NHC(O)CH(CH3)2且另一者可為NHSO2-NH-環丙烷，R3及R8中之一者可為NHC(O)CH(CH3)2且另一者可為NHC(S)NH-CH3，R3及R8中之一者可為NHC(O)CH(CH3)2且另一者可為NHC(S)NH-CH(CH3)2，R3及R8中之一者可為NHC(O)CH(CH3)2且另一者可為NHC(S)NH-環丙烷，R3及R8中之一者可為NHC(O)CH(CH3)2且另一者可為NHC(O)NH-CH3，R3及R8中之一者可為NHC(O)CH(CH3)2且另一者可為NHC(O)NH-CH(CH3)2，R3及R8中之一者可為NHC(O)CH(CH3)2且另一者可為NHC(O)NH-環丙烷，R3及R8中之一者可為NHC(O)CH2OCH3且另一者可為NHSO2-CH3，R3及R8中之一者可為NHC(O)CH2OCH3且另一者可為NHSO2-CH(CH3)2，R3及R8中之一者可為NHC(O)CH2OCH3且另一者可為NHSO2-環丙烷，R3及R8中之一者可為NHC(O)CH2OCH3且另一者可為NHSO2-NHCH3，R3及R8中之一者可為NHC(O)CH2OCH3且另一者可為NHSO2-N(CH3)2，R3及R8中之一者可為NHC(O)CH2OCH3且另一者可為NHSO2-NHCH(CH3)2，R3及R8中之一者可為NHC(O)CH2OCH3且另一者可為NHSO2-NH-環丙烷，R3及R8中之一者可為NHC(O)CH2OCH3且另一者可為NHC(S)NH-CH3，R3及R8中之一者可為NHC(O)CH2OCH3且另一者可為NHC(S)NH-CH(CH3)2，R3及R8中之一者可為NHC(O)CH2OCH3且另一者可為NHC(S)NH-環丙烷，R3及R8中之一者可為NHC(O)CH2OCH3且另一者可為NHC(O)NH-CH3，R3及 R8中之一者可為NHC(O)CH2OCH3且另一者可為NHC(O)NH-CH(CH3)2，R3及R8中之一者可為NHC(O)CH2OCH3且另一者可為NHC(O)NH-環丙烷，R3及R8中之一者可為NHSO2-CH3且另一者可為NHSO2-CH(CH3)2，R3及R8中之一者可為NHSO2-CH3且另一者可為NHSO2-環丙烷，R3及R8中之一者可為NHSO2-CH3且另一者可為NHSO2-NHCH3，R3及R8中之一者可為NHSO2-CH3且另一者可為NHSO2-N(CH3)2，R3及R8中之一者可為NHSO2-CH3且另一者可為NHSO2-NHCH(CH3)2，R3及R8中之一者可為NHSO2-CH3且另一者可為NHSO2-NH-環丙烷，R3及R8中之一者可為NHSO2-CH3且另一者可為NHC(S)NH-CH3，R3及R8中之一者可為NHSO2-CH3且另一者可為NHC(S)NH-CH(CH3)2，R3及R8中之一者可為NHSO2-CH3且另一者可為NHC(S)NH-環丙烷，R3及R8中之一者可為NHSO2-CH3且另一者可為NHC(O)NH-CH3，R3及R8中之一者可為NHSO2-CH3且另一者可為NHC(O)NH-CH(CH3)2，R3及R8中之一者可為NHSO2-CH3且另一者可為NHC(O)NH-環丙烷，R3及R8中之一者可為NHSO2-CH(CH3)2且另一者可為NHSO2-環丙烷，R3及R8中之一者可為NHSO2-CH(CH3)2且另一者可為NHSO2-NHCH3，R3及R8中之一者可為NHSO2-CH(CH3)2且另一者可為NHSO2-N(CH3)2，R3及R8中之一者可為NHSO2-CH(CH3)2且另一者可為NHSO2-NHCH(CH3)2，R3及R8中之一者可為NHSO2-CH(CH3)2且另一者可為NHSO2-NH-環丙烷，R3及R8中之一者可為NHSO2-CH(CH3)2且另一者可為NHC(S)NH-CH3，R3及R8中之一者可為NHSO2-CH(CH3)2且另一者可為NHC(S)NH-CH(CH3)2，R3及R8中之一者可為NHSO2-CH(CH3)2且另一者可為NHC(S)NH-環丙烷，R3及R8中之一者可為NHSO2-CH(CH3)2且另一者可為NHC(O)NH-CH3，R3及R8中之一者可為NHSO2-CH(CH3)2且另一者可為NHC(O)NH-CH(CH3)2，R3及R8中之一者可為NHSO2-CH(CH3)2且另一者可為NHC(O)NH-環丙 烷，R3及R8中之一者可為NHSO2-環丙烷且另一者可為NHSO2-NHCH3，R3及R8中之一者可為NHSO2-環丙烷且另一者可為NHSO2-N(CH3)2，R3及R8中之一者可為NHSO2-環丙烷且另一者可為NHSO2-NHCH(CH3)2，R3及R8中之一者可為NHSO2-環丙烷且另一者可為NHSO2-NH-環丙烷，R3及R8中之一者可為NHSO2-環丙烷且另一者可為NHC(S)NH-CH3，R3及R8中之一者可為NHSO2-環丙烷且另一者可為NHC(S)NH-CH(CH3)2，R3及R8中之一者可為NHSO2-環丙烷且另一者可為NHC(S)NH-環丙烷，R3及R8中之一者可為NHSO2-環丙烷且另一者可為NHC(O)NH-CH3，R3及R8中之一者可為NHSO2-環丙烷且另一者可為NHC(O)NH-CH(CH3)2，R3及R8中之一者可為NHSO2-環丙烷且另一者可為NHC(O)NH-環丙烷，R3及R8中之一者可為NHSO2-NHCH3且另一者可為NHSO2-N(CH3)2，R3及R8中之一者可為NHSO2-NHCH3且另一者可為NHSO2-NHCH(CH3)2，R3及R8中之一者可為NHSO2-NHCH3且另一者可為NHSO2-NH-環丙烷，R3及R8中之一者可為NHSO2-NHCH3且另一者可為NHC(S)NH-CH3，R3及R8中之一者可為NHSO2-NHCH3且另一者可為NHC(S)NH-CH(CH3)2，R3及R8中之一者可為NHSO2-NHCH3且另一者可為NHC(S)NH-環丙烷，R3及R8中之一者可為NHSO2-NHCH3且另一者可為NHC(O)NH-CH3，R3及R8中之一者可為NHSO2-NHCH3且另一者可為NHC(O)NH-CH(CH3)2，R3及R8中之一者可為NHSO2-NHCH3且另一者可為NHC(O)NH-環丙烷，R3及R8中之一者可為NHSO2-N(CH3)2且另一者可為NHSO2-NHCH(CH3)2，R3及R8中之一者可為NHSO2-N(CH3)2且另一者可為NHSO2-NH-環丙烷，R3及R8中之一者可為NHSO2-N(CH3)2且另一者可為NHC(S)NH-CH3，R3及R8中之一者可為NHSO2-N(CH3)2且另一者可為NHC(S)NH-CH(CH3)2，R3及R8中之一者可為NHSO2-N(CH3)2且另一者可為NHC(S)NH-環丙烷，R3及R8中之一者可為NHSO2-N(CH3)2且另一者可 為NHC(O)NH-CH3，R3及R8中之一者可為NHSO2-N(CH3)2且另一者可為NHC(O)NH-CH(CH3)2，R3及R8中之一者可為NHSO2-N(CH3)2且另一者可為NHC(O)NH-環丙烷，R3及R8中之一者可為NHSO2-NHCH(CH3)2且另一者可為NHSO2-NH-環丙烷，R3及R8中之一者可為NHSO2-NHCH(CH3)2且另一者可為NHC(S)NH-CH3，R3及R8中之一者可為NHSO2-NHCH(CH3)2且另一者可為NHC(S)NH-CH(CH3)2，R3及R8中之一者可為NHSO2-NHCH(CH3)2且另一者可為NHC(S)NH-環丙烷，R3及R8中之一者可為NHSO2-NHCH(CH3)2且另一者可為NHC(O)NH-CH3，R3及R8中之一者可為NHSO2-NHCH(CH3)2且另一者可為NHC(O)NH-CH(CH3)2，R3及R8中之一者可為NHSO2-NHCH(CH3)2且另一者可為NHC(O)NH-環丙烷，R3及R8中之一者可為NHSO2-NH-環丙烷且另一者可為NHC(S)NH-CH3，R3及R8中之一者可為NHSO2-NH-環丙烷且另一者可為NHC(S)NH-CH(CH3)2，R3及R8中之一者可為NHSO2-NH-環丙烷且另一者可為NHC(S)NH-環丙烷，R3及R8中之一者可為NHSO2-NH-環丙烷且另一者可為NHC(O)NH-CH3，R3及R8中之一者可為NHSO2-NH-環丙烷且另一者可為NHC(O)NH-CH(CH3)2，R3及R8中之一者可為NHSO2-NH-環丙烷且另一者可為NHC(O)NH-環丙烷，R3及R8中之一者可為NHC(S)NHCH3且另一者可為NHC(S)NH-CH(CH3)2，R3及R8中之一者可為NHC(S)NHCH3且另一者可為NHC(S)NH-環丙烷，R3及R8中之一者可為NHC(S)NHCH3且另一者可為NHC(O)NH-CH3，R3及R8中之一者可為NHC(S)NHCH3且另一者可為NHC(O)NH-CH(CH3)2，R3及R8中之一者可為NHC(S)NHCH3且另一者可為NHC(O)NH-環丙烷，R3及R8中之一者可為NHC(S)NH-CH(CH3)2且另一者可為NHC(S)NH-環丙烷，R3及R8中之一者可為NHC(S)NH-CH(CH3)2且另一者可為NHC(O)NH-CH3，R3及R8中之一者可為NHC(S)NH-CH(CH3)2且另一者可為NHC(O)NH-CH(CH3)2，R3及R8中 之一者可為NHC(S)NH-CH(CH3)2且另一者可為NHC(O)NH-環丙烷，R3及R8中之一者可為NHC(O)NH-CH3且另一者可為NHC(O)NH-CH(CH3)2，R3及R8中之一者可為NHC(O)NH-CH3且另一者可為NHC(O)NH-環丙烷，或R3及R8中之一者可為NHC(O)NH-CH(CH3)2且另一者可為NHC(O)NH-CH(CH3)2。
在一些實施例中，RA為SO2R1且RB為氫或SO2R10。在一些實施例中，RA為SO2R1且RB為SO2R10。
在一些實施例中，RA為SO2R1，RB為氫或SO2R10，且R1及R10中的至少一者(例如一者或兩者)為N(R22)2。在一些實施例中，R1及R10中的至少一者(例如一者或兩者)可為N(R22)2且R3及R8獨立地選自由以下組成之群：氫、雜環基、OR21、NO2、N(R22)2、N=C=S、NHC(O)R21、NHSO2R21、N(R22)2、NHC(O)N(R22)2、NHC(S)N(R22)2及NHSO2N(R22)2，其中R21及R22獨立地為H或C1-C4烷基。舉例而言，R1及R10中的至少一者(例如一者或兩者)可為N(R22)2且R3及R8可獨立地選自由以下組成之群：氫、OH、OCH3、N=C=S、NH2、NHCH3、NO2、NH-十八烷、NHC(O)CH3、NHC(O)CH(CH3)2、NHC(O)CH2OCH3、NHSO2CH3、NHSO2-環丙烷、NHSO2CH(CH3)2、NHSO2N(CH3)2、NHC(S)NHCH3、NHC(S)NHCH(CH3)2、NHC(S)NH-環丙烷、NHC(O)NHCH3、NHC(O)NHCH(CH3)2、苯并噁唑基或NHC(O)NH-環丙烷。
在一些實施例中，RA為SO2R1，RB為氫或SO2R10，且R1及R10中的至少一者(例如一者或兩者)可為N(R22)2，且R3及R8獨立地選自由以下組成之群：氫、N=C=S、NHC(O)R21、NHSO2R21、N(R22)2、NHC(O)N(R22)2、NHC(S)N(R22)2及NHSO2N(R22)2。舉例而言，R1及R10中的至少一者(例如一者或兩者)可為N(R22)2，且R3與R8相同且可選自由以下組成之群：氫、N=C=S、NH2、NHC(O)CH3、 NHC(O)CH(CH3)2、NHC(O)CH2OCH3、NHSO2CH3、NHSO2-環丙烷、NHSO2CH(CH3)2、NHSO2N(CH3)2、NHC(S)NHCH3、NHC(S)NHCH(CH3)2、NHC(S)NH-環丙烷、NHC(O)NHCH3、NHC(O)NHCH(CH3)2及NHC(O)NH-環丙烷。在另一個非限制性實例中，R1及R10中之至少一者(例如一者或兩者)可為N(R22)且R3與R8為不同的且可選自由以下組成之群：氫、N=C=S、NH2、NHC(O)CH3、NHC(O)CH(CH3)2、NHC(O)CH2OCH3、NHSO2CH3、NHSO2-環丙烷、NHSO2CH(CH3)2、NHSO2N(CH3)2、NHC(S)NHCH3、NHC(S)NHCH(CH3)2、NHC(S)NH-環丙烷、NHC(O)NHCH3、NHC(O)NHCH(CH3)2及NHC(O)NH-環丙烷。
在一些實施例中，RA為SO2R1，RB為氫或SO2R10，R1及R10中的至少一者為N(R22)2，且R3及R8獨立地選自由以下組成之群：氫、N=C=S、NHC(O)R21、NHSO2R21、N(R22)2、NHC(O)N(R22)2、NHC(S)N(R22)2及NHSO2N(R22)2。舉例而言，R1及R10中之至少一者(例如一者或兩者)可為N(R22)2，且R3與R8相同且可選自由以下組成之群：氫、N=C=S、NH2、NHC(O)CH3、NHC(O)CH(CH3)2、NHC(O)CH2OCH3、NHSO2CH3、NHSO2-環丙烷、NHSO2CH(CH3)2、NHSO2N(CH3)2、NHC(S)NHCH3、NHC(S)NHCH(CH3)2、NHC(S)NH-環丙烷、NHC(O)NHCH3、NHC(O)NHCH(CH3)2及NHC(O)NH-環丙烷。在另一非限制性實例中，R1及R10中的至少一者(例如一者或兩者)可為N(R22)2，且R3與R8為不同的且可選自由以下組成之群：氫、N=C=S、NH2、NHC(O)CH3、NHC(O)CH(CH3)2、NHC(O)CH2OCH3、NHSO2CH3、NHSO2-環丙烷、NHSO2CH(CH3)2、NHSO2N(CH3)2、NHC(S)NHCH3、NHC(S)NHCH(CH3)2、NHC(S)NH-環丙烷、NHC(O)NHCH3、NHC(O)NHCH(CH3)2及NHC(O)NH-環丙烷。
在一些實施例中，RA為SO2R1，RB為SO2R10，且R1及R10中的至 少一者(例如一者或兩者)為N(R22)2。在一些實施例中，R1及R10中的至少一者(例如一者或兩者)可為N(R22)2且R3及R8獨立地選自由以下組成之群：氫、雜環基、OR21、NO2、N(R22)2、N=C=S、NHC(O)R21、NHSO2R21、N(R22)2、NHC(O)N(R22)2、NHC(S)N(R22)2及NHSO2N(R22)2，其中R21及R22獨立地為H或C1-C4烷基。舉例而言，R1及R10中的至少一者(例如一者或兩者)可為N(R22)2且R3及R8可獨立地選自由以下組成之群：氫、OH、OCH3、N=C=S、NH2、NHCH3、NO2、NH-十八烷、NHC(O)CH3、NHC(O)CH(CH3)2、NHC(O)CH2OCH3、NHSO2CH3、NHSO2-環丙烷、NHSO2CH(CH3)2、NHSO2N(CH3)2、NHC(S)NHCH3、NHC(S)NHCH(CH3)2、NHC(S)NH-環丙烷、NHC(O)NHCH3、NHC(O)NHCH(CH3)2、苯并噁唑基或NHC(O)NH-環丙烷。
在一些實施例中，RA為SO2R1，RB為SO2R10，且R1及R10中的至少一者(例如一者或兩者)可為N(R22)2，且R3及R8獨立地選自由以下組成之群：氫、N=C=S、NHC(O)R21、NHSO2R21、N(R22)2、NHC(O)N(R22)2、NHC(S)N(R22)2及NHSO2N(R22)2。舉例而言，R1及R10中之至少一者(例如一者或兩者)可為N(R22)2，且R3與R8相同且可選自由以下組成之群：氫、N=C=S、NH2、NHC(O)CH3、NHC(O)CH(CH3)2、NHC(O)CH2OCH3、NHSO2CH3、NHSO2-環丙烷、NHSO2CH(CH3)2、NHSO2N(CH3)2、NHC(S)NHCH3、NHC(S)NHCH(CH3)2、NHC(S)NH-環丙烷、NHC(O)NHCH3、NHC(O)NHCH(CH3)2及NHC(O)NH-環丙烷。在另一非限制性實例中，R1及R10中的至少一者(例如一者或兩者)可為SO2R21且R3與R8為不同的且可選自由以下組成之群：氫、N=C=S、NH2、NHC(O)CH3、NHC(O)CH(CH3)2、NHC(O)CH2OCH3、NHSO2CH3、NHSO2-環丙烷、NHSO2CH(CH3)2、NHSO2N(CH3)2、NHC(S)NHCH3、 NHC(S)NHCH(CH3)2、NHC(S)NH-環丙烷、NHC(O)NHCH3、NHC(O)NHCH(CH3)2及NHC(O)NH-環丙烷。
在一些實施例中，RA為SO2R1，RB為氫或SO2R10，R1及R10中的至少一者為N(R22)2，且R3及R8獨立地選自由以下組成之群：氫、N=C=S、NHC(O)R21、NHSO2R21、N(R22)2、NHC(O)N(R22)2、NHC(S)N(R22)2及NHSO2N(R22)2。舉例而言，R1及R10中之至少一者(例如一者或兩者)可為N(R22)2，且R3與R8相同且可選自由以下組成之群：氫、N=C=S、NH2、NHC(O)CH3、NHC(O)CH(CH3)2、NHC(O)CH2OCH3、NHSO2CH3、NHSO2-環丙烷、NHSO2CH(CH3)2、NHSO2N(CH3)2、NHC(S)NHCH3、NHC(S)NHCH(CH3)2、NHC(S)NH-環丙烷、NHC(O)NHCH3、NHC(O)NHCH(CH3)2及NHC(O)NH-環丙烷。在另一非限制性實例中，R1及R10中的至少一者(例如一者或兩者)可為N(R22)2，且R3與R8為不同的且可選自由以下組成之群：氫、N=C=S、NH2、NHC(O)CH3、NHC(O)CH(CH3)2、NHC(O)CH2OCH3、NHSO2CH3、NHSO2-環丙烷、NHSO2CH(CH3)2、NHSO2N(CH3)2、NHC(S)NHCH3、NHC(S)NHCH(CH3)2、NHC(S)NH-環丙烷、NHC(O)NHCH3、NHC(O)NHCH(CH3)2及NHC(O)NH-環丙烷。
在一些實施例中，RA為SO2R1，RB為SO2R10，且R1及R10中的至少一者(例如一者或兩者)為OR23。在一些實施例中，R1及R10中的至少一者(例如一者或兩者)可為OR23且R3及R8獨立地選自由以下組成之群：氫、雜環基、OR21、NO2、N(R22)2、N=C=S、NHC(O)R21、NHSO2R21、N(R22)2、NHC(O)N(R22)2、NHC(S)N(R22)2及NHSO2N(R22)2，其中R21及R22獨立地為H或C1-C4烷基。舉例而言，R1及R10中的至少一者(例如一者或兩者)可為OR23且R3及R8可獨立地選自由以下組成之群：氫、OH、OCH3、N=C=S、NH2、NHCH3、NO2、NH-十八烷、NHC(O)CH3、NHC(O)CH(CH3)2、NHC(O)CH2OCH3、 NHSO2CH3、NHSO2-環丙烷、NHSO2CH(CH3)2、NHSO2N(CH3)2、NHC(S)NHCH3、NHC(S)NHCH(CH3)2、NHC(S)NH-環丙烷、NHC(O)NHCH3、NHC(O)NHCH(CH3)2、苯并噁唑基或NHC(O)NH-環丙烷。
在一些實施例中，RA為SO2R1，RB為SO2R10，且R1及R10中的至少一者(例如一者或兩者)可為OR23，且R3及R8獨立地選自由以下組成之群：氫、N=C=S、NHC(O)R21、NHSO2R21、N(R22)2、NHC(O)N(R22)2、NHC(S)N(R22)2及NHSO2N(R22)2。舉例而言，R1及R10中的至少一者(例如一者或兩者)可為OR23，且R3與R8相同且可選自由以下組成之群：氫、N=C=S、NH2、NHC(O)CH3、NHC(O)CH(CH3)2、NHC(O)CH2OCH3、NHSO2CH3、NHSO2-環丙烷、NHSO2CH(CH3)2、NHSO2N(CH3)2、NHC(S)NHCH3、NHC(S)NHCH(CH3)2、NHC(S)NH-環丙烷、NHC(O)NHCH3、NHC(O)NHCH(CH3)2及NHC(O)NH-環丙烷。在另一個非限制性實例中，R1及R10中的至少一者(例如一者或兩者)可為OR23且R3與R8為不同的且可選自由以下組成之群：氫、N=C=S、NH2、NHC(O)CH3、NHC(O)CH(CH3)2、NHC(O)CH2OCH3、NHSO2CH3、NHSO2-環丙烷、NHSO2CH(CH3)2、NHSO2N(CH3)2、NHC(S)NHCH3、NHC(S)NHCH(CH3)2、NHC(S)NH-環丙烷、NHC(O)NHCH3、NHC(O)NHCH(CH3)2及NHC(O)NH-環丙烷。
在一些實施例中，RA為SO2R1，RB為SO2R10，R1及R10中的至少一者為OR23，且R3及R8獨立地選自由以下組成之群：氫、N=C=S、NHC(O)R21、NHSO2R21、N(R22)2、NHC(O)N(R22)2、NHC(S)N(R22)2及NHSO2N(R22)2。舉例而言，R1及R10中的至少一者(例如一者或兩者)可為OR23，且R3與R8相同且可選自由以下組成之群：氫、N=C=S、NH2、NHC(O)CH3、NHC(O)CH(CH3)2、NHC(O)CH2OCH3、 NHSO2CH3、NHSO2-環丙烷、NHSO2CH(CH3)2、NHSO2N(CH3)2、NHC(S)NHCH3、NHC(S)NHCH(CH3)2、NHC(S)NH-環丙烷、NHC(O)NHCH3、NHC(O)NHCH(CH3)2及NHC(O)NH-環丙烷。在另一個非限制性實例中，R1及R10中的至少一者(例如一者或兩者)可為OR23，且R3與R8為不同的且可選自由以下組成之群：氫、N=C=S、NH2、NHC(O)CH3、NHC(O)CH(CH3)2、NHC(O)CH2OCH3、NHSO2CH3、NHSO2-環丙烷、NHSO2CH(CH3)2、NHSO2N(CH3)2、NHC(S)NHCH3、NHC(S)NHCH(CH3)2、NHC(S)NH-環丙烷、NHC(O)NHCH3、NHC(O)NHCH(CH3)2及NHC(O)NH-環丙烷。
在一些實施例中，RA為SO2R1，RB為氫或SO2R10，R1及R10為OR23，且R23為異丙基或第三丁基。
在一些實施例中，RA及RB中之一者為SO3 -Y+且另一者為氫或SO3 -Y+。在一些實施例中，RA及RB中之一者為SO3 -Y+且另一者為氫。在一些實施例中，RA及RB中之一者為SO3 -Y+且另一者為氫或SO3 -Y+，且Y+為Na+。在一些實施例中，RA及RB中之一者為SO3 -Y+且另一者為氫或SO3 -Y+，且R3與R8為不同的。
在一些實施例中，RA或RB中之一者為SO3 -Y+且另一者為氫或SO3 -Y+，且R3及R8可獨立地選自由以下組成之群：氫、N=C=S、NHC(O)R21、NHSO2R21、N(R22)2、NHC(O)N(R22)2、NHC(S)N(R22)2及NHSO2N(R22)2。在一些實施例中，RA或RB中之一者為SO3 -Y+且另一者為氫或SO3 -Y+，且R3及R8可獨立地選自由以下組成之群：氫、N=C=S、NH2、NHC(O)CH3、NHC(O)CH(CH3)2、NHC(O)CH2OCH3、NHSO2CH3、NHSO2-環丙烷、NHSO2CH(CH3)2、NHSO2N(CH3)2、NHC(S)NHCH3、NHC(S)NHCH(CH3)2、NHC(S)NH-環丙烷、NHC(O)NHCH3、NHC(O)NHCH(CH3)2及NHC(O)NH-環丙烷。
在一個實施例中，RA及RB中之一者為SO3 -Y+且另一者為氫，R3 為NHC(O)CH3且R8為NHC(S)NHCH(CH3)2。
在一些實施例中，RA及RB中之一者為CO2 -Y+且另一者為氫或CO2 -Y+。
在一些實施例中，RA及RB為CO2 -Y+。在一些實施例中，RA及RB中之一者為CO2Y+且另一者為氫或CO2 -Y+，且Y+為Na+。在一些實施例中，RA及RB中之一者為CO2 -Y+且另一者為氫或CO2 -Y+，且R3與R8為不同的。
在一些實施例中，RA或RB中之一者為CO2 -Y+且另一者為氫或CO2 -Y+，且R3及R8可獨立地選自由以下組成之群：氫、N=C=S、NHC(O)R21、NHSO2R21、N(R22)2、NHC(O)N(R22)2、NHC(S)N(R22)2及NHSO2N(R22)2。在一些實施例中，RA或RB中之一者為CO2 -Y+且另一者為氫或CO2 -Y+，且R3及R8可獨立地選自由以下組成之群：氫、N=C=S、NH2、NHC(O)CH3、NHC(O)CH(CH3)2、NHC(O)CH2OCH3、NHSO2CH3、NHSO2-環丙烷、NHSO2CH(CH3)2、NHSO2N(CH3)2、NHC(S)NHCH3、NHC(S)NHCH(CH3)2、NHC(S)NH-環丙烷、NHC(O)NHCH3、NHC(O)NHCH(CH3)2及NHC(O)NH-環丙烷。
在一個實施例中，RA及RB為CO2 -Y+，R3為NHC(O)CH3且R8為NHC(S)NHCH(CH3)2。
在一些實施例中，RA及RB中之一者為PO2 -(Y+)2且另一者為氫或PO2 -(Y+)2。在一些實施例中，RA及RB為PO2 -(Y+)2。在一些實施例中，RA及RB中之一者為PO2 -(Y+)2且另一者為氫或PO2 -(Y+)2，且Y+為Na+。在一些實施例中，RA及RB中之一者為PO2 -(Y+)2且另一者為氫或PO2 -(Y+)2，且R3與R8為不同的。
在一些實施例中，RA或RB中之一者為PO2 -(Y+)2且另一者為氫或PO2-(Y+)2，且R3及R8可獨立地選自由以下組成之群：氫、N=C=S、NHC(O)R21、NHSO2R21、N(R22)2、NHC(O)N(R22)2、NHC(S)N(R22)2及 NHSO2N(R22)2。在一些實施例中，RA或RB中之一者為PO2 -(Y+)2且另一者為氫或PO2 -(Y+)2，且R3及R8可獨立地選自由以下組成之群：氫、N=C=S、NH2、NHC(O)CH3、NHC(O)CH(CH3)2、NHC(O)CH2OCH3、NHSO2CH3、NHSO2-環丙烷、NHSO2CH(CH3)2、NHSO2N(CH3)2、NHC(S)NHCH3、NHC(S)NHCH(CH3)2、NHC(S)NH-環丙烷、NHC(O)NHCH3、NHC(O)NHCH(CH3)2及NHC(O)NH-環丙烷。
在一個實施例中，RA及RB為PO2 -(Y+)2，R3為NHC(O)CH3且R8為NHC(S)NHCH(CH3)2。
在一些實施例中，R2-R9皆為不同的。在一些其他實施例中，R2-R9中之至少兩者(例如兩、三、四、五、六或七者)相同。
在一些實施例中，R2、R4、R5、R6、R7、R8及R6中的至少一者與R3或R4相同。在一些實施例中，R2與R9，或R4與R7，或R5與R6相同。在一些實施例中，R2、R4及R5中之至少兩者相同。在一些實施例中，R6、R7及R9中之至少兩者相同。
在一些實施例中，R2、R4、R5、R6、R7、R8及R6皆為不同的。
在一些實施例中，R2-R9中的至少一者(例如1、2、3、4、5、6或7者)為氫、羥基或甲氧基。在一些實施例中，R2、R4、R5、R6、R7及R9皆為氫。
式(I)化合物包括其醫藥學上可接受之鹽、立體異構體混合物及對映異構體。本文所述技術之化合物亦可包括式(I)化合物之生理學上可接受之鹽。式(I)化合物可以外消旋混合物或以實質上純的立體異構體或對映異構體形式存在。
一些例示性式(I)化合物包括(但不限於)表1中所示的彼等物。
製備芪之方法在此項技術中已熟知且描述於例如美國專利第7,321,050號；第6,022,998號；第6,177,220號；第5,068,300號；第3,387,050號；第5,563,298號；第7,820,848號；第8,101,804號；第6,218,108號及第7,714,161號；美國專利公開案2007/0276172及2004/0143023；Likhtenstein,Gertz I.「Stilbenes Synthesis and Applications」於Kirk-Othmer Encyclopedia of Chemical Technology.2000,John Wiley & Sons,Inc.；Likhtenshtein,G.「Stilbenes Preparation and Analysis」於「Applications in Chemistry,Life Sciences and Materials Science」2010,Wiley-VCH；該等文獻以全文引用的方式併入本文中。芪合成及芪衍生物亦可以商業服務形式獲得(例如 Mercachem,Nijmegen,Netherlands；Proteros,Martinsried,Germany；AMRI,Albany,NY；WuXi Apptec,Shanghai,China；and Richman Chemical Inc.,Gwynedd,PA)。在一些實施例中，芪可進一步官能化而得到醯胺及磺醯胺衍生物。
在一些實施例中，相對於DIDS而言，化合物可包含位於4位置及4'位置的連接雙鍵、磺酸酯及不對稱取代基。在一些實施例中，相對於DIDS而言，化合物不包含質子，而是包含一或多種磺酸酯。在一些實施例中，相對於DIDS而言，化合物在4位置及4'位置不包含對稱取代之基團。
在一個態樣中，本文描述一種治療癌症、自體免疫疾病、免疫缺乏症或神經退化性疾病的方法，該方法包含向需要治療癌症、自體免疫疾病、免疫缺乏症或神經退化性疾病之個體投與治療有效劑量之如本文所述組合物，例如包含具有式I之結構之化合物的組合物。
在一些實施例中，個體可為經確定在一或多種細胞類型中發生之DNA損傷程度相對於參考水準增加的個體。如本文所用，「DNA損傷」係指存在於細胞中之DNA斷裂、缺口及突變。在一些實施例中，DNA損傷可包含單股斷裂(例如「缺口」)、雙股斷裂(DSBs)及突變中之一或多者。在一些實施例中，DNA損傷可為一或多個DSBs。如本文所用，「突變」係指相較於參考野生型細胞，細胞之遺傳物質中之變化或差異，例如缺失、***、SNP、基因重排，及/或外源基因或序列之引入。
在一些實施例中，若個體經測定DNA損傷過程或DNA編輯酶之含量及/或活性增加，則可確定該個體具有增加的DNA損傷程度。如本文所用，「DNA損傷過程」係指細胞中引起一或多種DNA損傷類型發生的任何活性或過程。
在一些實施例中，增加的DNA損傷程度可為增加的突變程度， 例如藉由測定細胞基因組之全部或一部分中的總體突變狀態。總體突變狀態比參考細胞中之總體突變狀態大至少2%(例如大或超過2%、大或超過3%、大或超過5%、大或超過10%，或大或超過20%)可指示DNA編輯酶活性程度增加、升高及/或顯著。在一些實施例中，可測定超突變程度。在一些實施例中，全基因組或其一部分中的總體突變狀態可使用FISH、全基因組測序、高通量測序、外顯子組(exome)測序、雜交及/或PCR測定。在一些實施例中，DNA編輯酶之活性可藉由測定特定標靶基因(包括(但不限於)IGH、BCL6、MYC、BCL 11A、CD93、PIM1及/或PAX5)之超突變程度來量測。在某些實施例中，DNA編輯酶為AID。在一些實施例中，特定標靶基因(包括IGH、BCL6、MYC、BCL11A、CD93、PIM1及/或PAX5)之突變程度比參考細胞中之IGH、BCL6、MYC、BCL11A、CD93、PIM1及/或PAX5之突變程度大至少2%，例如大或超過2%、大或超過3%、大或超過5%、大或超過10%，或大或超過20%可指示AID活性程度增加、升高及/或顯著。
在一些實施例中，增加的DNA損傷程度可為增加的雙股斷裂(DSBs)程度。舉非限制性實例而言，DSBs程度可藉由核型分析(karyotyping)、藉由γ-H2AX病灶形成及/或藉由使用偵測DNA雙股斷裂的FISH分析(例如DNA斷裂偵測FISH(DBD-FISH))(Volpi及Bridger,BioTechniques，第45卷，第4期，2008年10月，第385-409頁)測定。
在一些實施例中，增加的DNA損傷程度可為增加的單股斷裂程度。舉非限制性實例而言，DNA中的單股斷裂程度可藉由COMET分析、FISH或使用單股斷裂特異性探針來測定。DNA斷裂(單股與雙股斷裂)之偵測在此項技術中已知且進一步描述於例如Kumari等人，EXCLI Journal 2009 7：44-62及Motalleb等人，Research Journal of Applied Sciences,Engineering and Technology.2012 4：1888-1894；該 等文獻各以全文引用的方式併入本文中。
在一些實施例中，DNA損傷過程之程度或活性增加可包含DNA編輯酶之含量及/或活性增加。在一些實施例中，本文所述技術係關於用具有式I結構之化合物處理具有活性DNA編輯酶的細胞。在一些實施例中，本文所述技術係關於用具有式I結構之化合物處理DNA編輯酶之含量及/或活性增加的細胞。如本文所用，「DNA編輯酶」係指正常催化DNA區段之突變、交換或切割的酶，尤其是可產生或促進點突變、DNA單股斷裂、DNA雙股斷裂或蛋白質-DNA加合物產生的酶。如本文所提及的DNA編輯酶在其作用上不一定具有位點特異性。類似地，其不一定具有細胞特異性。在一些實施例，細胞為表現可偵測量之此類酶的B細胞。
DNA編輯酶之非限制性實例包括(但不限於)重組活化基因1(RAG1；NCBI基因ID：5896)、重組活化基因1(RAG2；NCBI基因ID：5897)、孢子形成特異性蛋白質11(SPO11；NCBI基因ID：23626)、APOBEC家族成員1型拓撲異構酶；2型拓撲異構酶；及/或AID。在一些實施例中，DNA編輯酶可為AID。
在一些實施例中，DNA編輯酶可為APOBEC(脫脂蛋白B mRNA編輯酶，催化性多肽樣)家族成員。如本文所用，「APOBEC家族」係指胞苷脫胺酶家族，其具有N末端鋅依賴性胞苷脫胺酶催化域(包含)及C末端假催化性域。APOBEC家族成員之非限制性實例包括AID、APOBEC1(例如NCBI基因ID：339)、APOBEC2(例如NCBI基因ID：10930)、APOBEC3A(例如NCBI基因ID：200315)、APOBEC3C(例如NCBI基因ID：27350)、APOBEC3E(例如NCBI基因ID：140564)、APOBEC3F(例如NCBI基因ID：200316)、APOBEC3G(例如NCBI基因ID：60489)、APOBEC3H(例如NCBI基因ID：164668)，及APOBEC4(例如NCBI基因ID：403314)。
在一些實施例中，DNA編輯酶可為1型拓撲異構酶。在一些實施例中，DNA編輯酶可為2型拓撲異構酶。拓撲異構酶的DNA產生斷裂，有助於使股展開或鬆馳。II型拓撲異構酶使ATP水解而產生DSB切口，而I型拓撲異構酶產生單股斷裂。II型拓撲異構酶之非限制性實例可包括拓撲異構酶II(例如NCBI基因ID：7153及7155)。I型拓撲異構酶之非限制性實例可包括拓撲異構酶I(例如NCBI基因ID：7150)。
本文所述技術之實施例係基於發現本文所述化合物可抑制DNA修復機制，例如同源修復。活化誘導性胞苷脫胺酶(AID，或AICDA，亦稱ARP2、CDA2或HIGM2)，作為催化性多肽樣脫脂蛋白B mRNA編輯酶(APOBEC)之成員的DNA編輯酶，引起同源重組能力減弱之細胞(例如DNA雙股斷裂修復能力降低的細胞)發生廣泛的基因組斷裂及細胞死亡。因此，本文提供一種引起細胞死亡的方法，該方法包含偵測細胞中之DNA編輯酶(例如AID)表現增強及隨後使該細胞與具有式I結構之化合物接觸；從而引起細胞死亡。因此，本文提供一種引起細胞死亡的方法，該方法包含使細胞中之DNA編輯酶(例如AID)表現增強及隨後使該細胞與具有式I結構之化合物接觸；從而引起細胞死亡。因此，本文提供一種引起細胞死亡的方法，該方法包含將治療有效量之DNA編輯酶(例如AID)投與細胞及隨後使該細胞與具有式I結構之化合物接觸；從而引起細胞死亡。
由AICDA基因(NCBI基因ID：57379)編碼的AID為適當B細胞功能所必需的且最顯著地表現於中心母細胞B細胞中。該蛋白質涉及體細胞超突變、基因轉換，及免疫球蛋白基因之類別轉換重組。AID在正常情況下幾乎完全表現於抗原活化生髮中心B細胞中，其中其起始免疫球蛋白同型類別轉換(Manis等人，2002,Trends Immunol,23,31-39；Chaudhuri及Alt,Nat Rev Immunol,2004,4,541-552；Longerich等人，Curr Opin Immunol,2006,18,164-174；Chaudhuri等人，Adv Immunol 2007,94,157-214)。AID為體細胞超突變及活化B細胞之免疫球蛋白類別轉換所必需的。AID表現藉由CD40配位體、B細胞受體、IL4R或鐘樣受體刺激來調節(Crouch等人，J Exp Med 2007 204：1145-1156；Muramatsu等人，J Biol Chem 1999 274：18470-6)。活化之後，AID受到短暫上調，以序列非特異性方式誘導免疫球蛋白基因內部發生點突變或DNA雙股斷裂，接著受到下調(Longerich等人，Curr Opin Immunol,2006,18,164-176；Chaudhuri等人，Adv Immunol 2007,94,157-214)。總體而言，AID僅在很小的正常細胞(抗原活化B細胞)群中、在任何指定時間具有活性。由AID控制的基因組重排及突變引起抗原識別多樣性、受體編輯及淋巴效應子功能之發展，此為功能適應性免疫所必需的(Mills等人，Immunol Rev 2003 194：77-95)。最近，已報導AID具有脫靶點突變活性(Liu,M.等人，Nature 2008,451,841-845；Liu及Schatz,Trends Immunol.2009,30,173-181；Pérez-Durán等人，Carcinogenesis.2007,28(12)：2427-33)。Robbiani等人已報導AID在B細胞中之脫靶活性，尤其c-myc/IgH移位(Robbiani等人，Mol Cell 2009,36(4)：631-41)。AID表現促進Bcl6轉殖基因老鼠中之腫瘤發展速率(Pasqualucci等人，2008,Nat.Genet.40,108-112)。然而，調節異常的AID不一定單獨引起B細胞之惡性腫瘤或移位相關癌症(Muto等人，2006,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 103,2752-2757；Okazaki等人，2003,J.Exp.Med.197,1173-1181；Shen等人，2008,Mol.Immunol.45,1883-1892)。另外，AID儘管在c-myc/IgH移位上起強制作用，但並非漿細胞增多症或漿細胞瘤在IL-6轉殖基因老鼠或經降植烷(pristane)處理之老鼠中分別發展所必需的(Kovalchuk等人，2007,J.Exp.Med.204,2989-3001；Ramiro等人，2004,J.Exp.Med.200,1103-1110)。然而，大部分人類B細胞淋巴瘤相關移位不涉及c-myc，且多者不涉及Ig基因(Kuppers,2005,Oncogene 20,5580-5594)。
已報導AID過度表現於慢性淋巴細胞性白血病(CLL)中(Hancer等人，Leuk Lymphoma.2011 Jan；52(1)：79-84；Heintel等人，Leukemia.2004 Apr；18(4)：756-62)。此外，AID表現已表明與急變期B譜系白血病及骨髓性白血病治療抗性相關且與慢性B淋巴細胞性白血病之普遍不良預後有關(Mao等人，Br J Dermatol 2001,145：117-122；Chaudhuri等人，Nature 2004,430：992-8)。已報導AID在各種癌症之腫瘤細胞中的進一步表現，該等癌症包括(但不限於)肺癌、乳癌、胃癌、結腸癌、腸癌、肝癌及膽管癌(Greeve等人，Blood 2003,1010,3574-3580；Feldhahn等人，J Exp Med 2007,204,1157-1166；Kotani等人，PNAS USA 2007,104,1616-1620；Engels等人，2008,Appl Immunohistochem Mol Morphol 16,521-529；Klemm等人，2009,Cancer Cell 6,232-245；Palacios等人，2010,Blood 115(22),4488-4496；Leuenberger等人，2009,Mod Pathol 32,177-186；Gruber等人，2010,Cancer Res 70,7411-7420)、發炎性癌症(Marusawa 2008,Int J Biochem Cell Biol.40,399-402)；濾泡性淋巴瘤(Hardianti等人，2004,Leukemia 18,826-831；Shikata等人，2012,Cancer Sci.103(3)：415-21)；甲狀腺癌(Qiu等人，2012,Mod Pathol 25(1),36-45)；乳癌(Borchert等人，2011,BMC Cancer 11：347)；Marusawa等人，2011,Adv Immunol 111：109-41；Zhang等人，2012,Hum Pathol 43(3)：423-34；Komori等人，2008,Hepatology 47(3)：888-896；Hockley 2010,Leukemia 24(5)：1084-6、成人T細胞白血病(Nakamura等人，2011,Br J Dermatol.165(2)：437-9)。前一段中之所有參考文獻均以全文引用的方式併入本文中。
已報導AID在關節炎(Xu等人，Scand.J.Immunol.2009,296,2033-6)中及在MRL/Fas(lpr/lpr)老鼠狼瘡模型(White等人，2011,Autoimmunity 44(8),585-98)中的含量升高。前一段中之所有參考文獻均以全文引用的方式併入本文中。
抑制DSB修復時，AID所產生之DSB的程度比先前懷疑的程度高得多且基因組損傷程度如此嚴重以致引起細胞死亡。因此，在本文所述技術之一個實施例中，提供一種治療方法，包含：(a)選擇具有表現升高量之活化誘導性胞苷脫胺酶(AID)之細胞的個體；及(b)向該個體投與治療有效量之雙股斷裂修復抑制劑(例如具有式I結構之化合物)；其中升高的AID含量為比來自健康個體之同類型細胞中之AID含量高的AID含量。在一些實施例中，表現升高量之AID的細胞為B細胞。在一些實施例中，表現升高量之AID的B細胞為癌變B細胞或與自體免疫疾病有關的B細胞。在一些實施例中，個體可為人類個體。
本文提供的方法藉由抑制DNA雙股斷裂修復來治療癌症及/或自體免疫病症。此抑制證明可殺死表現AID之細胞，原因為AID產生廣泛的基因組斷裂，且用雙股斷裂修復抑制劑治療可防止細胞本身正產生之此等病變修復。此引起個體之細胞死亡，對表現AID之細胞具有特異性，例如癌變B細胞及/或自體免疫細胞。因此，如本文所述，在一個實施例中，提供治療範例，其選擇性地誘導某些病變細胞自毀，同時減少對健康組織之意外副作用。
在一些實施例中，DNA編輯酶之含量及/或活性增加可為DNA編輯酶mRNA之含量增加。mRNA含量可使用例如生物化學及分子生物學技術評估，例如北方墨點法或其他雜交分析、核酸酶保護分析、逆轉錄(定量RT-PCR)技術、RNA-Seq、高處理量測序及其類似技術。此類分析已為熟習此項技術者所熟知。在一個實施例中，使用核「運作」(或「關閉」)轉錄分析(參見例如Methods in Molecular Biology,第49卷，1995年9月27日，頁碼範圍：229-238)。亦可使用陣列；陣列及使用此類陣列分析mRNA的方法先前已描述於例如EP0834575、EP0834576、WO96/31622、美國專利第5,837,832號或WO98/30883中。WO97/10365提供使用高密度寡核苷酸陣列監測許多基因之表現 量的方法。
在一個實施例中，自待測試的個體獲得一或多個細胞且自細胞分離RNA。獲得細胞時，較佳為獲得主要含有所要類型之細胞的樣品，例如其中至少約50%、較佳至少約60%、甚至更佳至少約70%、80%且甚至更佳至少約90%之細胞為所要類型的細胞樣品。組織樣品可根據此項技術中已知的方法獲得。
亦可自個體獲得細胞樣品，接著富集所要細胞類型。舉例而言，細胞可使用各種技術與其他細胞分離，例如使用結合至所要細胞類型之細胞表面上之抗原決定基的抗體進行分離。在所要細胞存在於實體組織中的情況下，可解剖分離出特定細胞，例如藉由顯微解剖或雷射捕捉顯微解剖(LCM)。
自個體組織樣品或細胞分離RNA時，在自個體移除組織或細胞之後，防止基因表現的任何其他變化可為重要的。已知表現量的變化可在擾動(例如熱衝擊或經脂多糖LPS)或其他試劑活化)之後快速地變化。另外，組織及細胞中的RNA可迅速地降解。因此，在一個較佳實施例中，將獲自個體的組織或細胞快速冷凍或隨後儘快地用RNA處理。
可藉由各種方法自組織樣品中萃取RNA，例如硫氰酸胍溶解，隨後進行CsCl離心(Chirgwin等人，1979,Biochemistry 18：5294-5299)。來自單一細胞的RNA可如自單一細胞製備cDNA文庫的方法中所述獲得，例如Dulac,C.(1998)Curr.Top.Dev.Biol.36,245及Jena等人，(1996)J.Immunol.Methods 190：199中所述之方法。必須小心以免RNA降解，例如藉由包含RNAsin。
接著可依特定物種、對RNA樣品進行富集。在一個實施例中，自RNA樣品中分離聚(A)+RNA。一般而言，此類純化係利用mRNA上的聚-A尾。詳言之且如上所述，聚-T寡核苷酸可固定於固體載體內部 以作為mRNA的親和性配位體。用於此目的之套組可市購，例如QuickExtract®套組(Epicentre Biotechnologies,Madison,WI；Oligotex Direct mRNA套組，Qiagen,Valencia,CA)。
本文所述方法中可使用的探針類型包括cDNA、核糖探針、合成寡核苷酸及基因組探針。所用探針類型通常根據特定情形決定，例如用於原位雜交的核糖探針，及例如用於北方墨點法的cDNA。在一個實施例中，探針指向RNA獨有的核苷酸區域。探針可短如所要求的那樣，以差異性地識別可調節蛋白質之mRNA轉錄物，且可短為例如15個鹼基；然而，可使用至少17、18、19或20或超過20個鹼基之探針。在一個實施例中，引子及探針特定地在嚴格條件下與DNA片段雜交，該DNA片段具有對應於編碼所分析之蛋白質之基因的核苷酸序列。如本文所用，術語「嚴格條件」意謂雜交僅在核苷酸序列存在至少95%一致性時才發生。在另一個實施例中，當序列之間存在至少97%一致性時，發生「嚴格條件」下的雜交。
在一些實施例中，DNA編輯酶之含量及/或活性增加可為DNA編輯酶多肽之含量增加。自基因所表現之蛋白質的含量可藉由例如西方墨點法、藉由免疫學偵測蛋白質、ELISA(酶聯免疫吸附分析)、放射免疫分析(RIA)或其他免疫分析及螢光活化細胞分析(FACS)、質譜法或偵測蛋白質的蛋白質測序法來評估。
在一些實施例中，若個體已暴露於已知引起此類DNA損傷之媒介物，則可確定個體之一或多種細胞類型中發生之DNA損傷程度相對於參考水準而言增加。此類媒介物之非限制性實例可包括DNA整合病毒(例如腺病毒相關病毒、逆轉錄病毒、人類嗜T淋巴細胞病毒、HIV-1、致癌病毒、肝炎病毒、B型肝炎病毒)之病毒感染；DNA損傷化學品(例如乙縮醛、多環芳族烴、苯、亞硝基胺、菸草煙霧、黃麴黴素(alflatoxin)及其類似物)；DNA損傷化學治療劑(例如博萊黴素 (bleomycin)、絲裂黴素(mitomycin)、氮芥類(例如二氯甲二乙胺(mechlorethamine)、環磷醯胺(cyclophosphamide)、美法侖(melphalan)、苯丁酸氮芥(chlorambucil)、異環磷醯胺(ifosfamide)及白消安(busulfan))、亞硝基脲(例如N-亞硝基-N-甲基脲(MNU)、卡氮芥(carmustine)(BCNU)、洛莫司汀(lomustine)(CCNU)及司莫司汀(semustine)(MeCCNU)、福莫司汀(fotemustine)及鏈脲菌素(streptozotocin))、四嗪(例如達卡巴嗪(dacarbazine)、米托唑胺(mitozolomide)及替莫唑胺(temozolomide))、氮雜環丙烷(例如噻替派(thiotepa)、絲裂黴素(mytomycin)及地吖醌(diaziquone)(AZQ))、順鉑類(cisplatins)(例如順鉑、卡鉑(carboplatin)及奧沙利鉑(oxaliplatin))、丙卡巴肼(procarbazine)及六甲密胺(hexamethylmelamine))；及電離或紫外線。暴露於此類媒介物可為事故、感染及/或環境暴露的結果或此類媒介物之治療性投與的結果。
在一些實施例中，DNA損傷程度增加可發生於受癌症、自體免疫疾病及/或神經退化性疾病影響之細胞類型中。在一些實施例中，個體經確定在選自由以下組成之群之細胞中發生之DNA損傷程度程度增加：癌細胞；免疫系統細胞；或神經系統細胞。
在一些實施例中，DNA編輯酶可為AID。在一些實施例中，AID含量可為血球中之AID含量。在一些實施例中，AID含量可為B細胞中之AID含量。
在一些實施例中，AID含量增加可為可偵測的AID含量，例如如下文所述。
在一些實施例中，AID含量增加為AID含量在統計上顯著地高於未活化B細胞(例如得自同一個體或健康個體之未活化B細胞)中所表現之AID含量。在一些實施例中，AID含量增加為AID含量在統計上顯著地高於得自同一個體之正常非免疫細胞中所表現之AID含量。在一 些實施例中，AID含量增加為AID含量在統計上顯著地高於得自健康個體之正常非免疫細胞中所表現之AID含量。
在一些實施例中，表現升高量之DNA編輯酶之細胞中的DNA編輯酶含量顯著地高於得自健康個體之正常細胞。在一些實施例中，表現升高量之DNA編輯酶之細胞中的DNA編輯酶含量顯著地高於得自健康個體之未活化B細胞中所表現之DNA編輯酶的含量。在一些實施例中，表現升高量之DNA編輯酶之B細胞中的DNA編輯酶含量顯著地高於得自健康個體之未活化B細胞中所表現之AID的含量。
在一些實施例中，個體可為人類個體。
本文提供的方法藉由抑制DNA雙股斷裂修復來治療癌症及/或自體免疫病症。此抑制證明可殺死表現AID之細胞，原因為AID產生廣泛的基因組斷裂，且用雙股斷裂修復抑制劑治療可防止細胞本身正產生之此等病變修復。此引起個體之細胞死亡，從而對表現AID之細胞具有特異性，例如癌變B細胞及/或自體免疫細胞。因此，如本文所述，在一個實施例中，提供治療範例，其選擇性地誘導某些病變細胞自毀，同時減少對健康組織之意外副作用。
在一些實施例中，DNA編輯酶之含量及/或活性增加可為DNA編輯酶mRNA之含量增加。mRNA含量可使用例如生物化學及分子生物學技術評估，例如北方墨點法或其他雜交分析、核酸酶保護分析、逆轉錄(定量RT-PCR)技術、RNA-Seq、高處理量測序及其類似技術。此類分析已為熟習此項技術者所熟知。在一個實施例中，使用核「運作」(或「關閉」)轉錄分析(參見例如Methods in Molecular Biology,第49卷，1995年9月27日，頁碼範圍：229-238)。亦可使用陣列；使用此類陣列分析mRNA的方法先前已描述於例如EP0834575、EP0834576、WO96/31622、美國專利第5,837,832號或WO98/30883中。WO97/10365提供使用高密度寡核苷酸陣列監視許多基因之表現 量的方法。
在一個實施例中，自待測試的個體獲得一或多個細胞且自細胞分離RNA。獲得細胞時，較佳為獲得主要含有所要類型之細胞的樣品，例如其中至少約50%、較佳至少約60%、甚至更佳至少約70%、80%且甚至更佳至少約90%之細胞為所要類型的細胞樣品。組織樣品可根據此項技術中已知的方法獲得。
亦可自個體獲得細胞樣品，接著富集所要細胞類型。舉例而言，細胞可使用各種技術與其他細胞分離，例如使用結合至所要細胞類型之細胞表面上之抗原決定基的抗體進行分離。在所要細胞存在於實體組織中的情況下，可解剖分離出特定細胞，例如藉由顯微解剖或雷射捕捉顯微解剖(LCM)。
自個體組織樣品或細胞分離RNA時，在自個體移除組織或細胞之後，防止基因表現的任何其他變化可為重要的。已知表現量的變化可在擾動(例如熱衝擊或經脂多糖LPS)或其他試劑活化)之後快速地變化。另外，組織及細胞中的RNA可迅速地降解。因此，在一個較佳實施例中，將獲自個體的組織或細胞快速冷凍或隨後儘快地用RNA處理。
可藉由各種方法自組織樣品中萃取RNA，例如硫氰酸胍溶解，隨後進行CsCl離心(Chirgwin等人，1979,Biochemistry 18：5294-5299)。來自單一細胞的RNA可如自單一細胞製備cDNA文庫的方法中所述獲得，例如Dulac,C.(1998)Curr.Top.Dev.Biol.36,245及Jena等人，(1996)J.Immunol.Methods 190：199中所述之方法。必須小心以免RNA降解，例如藉由包含RNAsin。
接著可依特定物種、對RNA樣品進行富集。在一個實施例中，自RNA樣品中分離聚(A)+RNA。一般而言，此類純化係利用mRNA上的聚-A尾。詳言之且如上所述，聚-T寡核苷酸可固定於固體載體內部 以作為mRNA的親和性配位體。用於此目的之套組可市購，例如QuickExtract®套組(Epicentre Biotechnologies,Madison,WI；Oligotex Direct mRNA套組，Qiagen,Valencia,CA)。
本文所述方法中可使用的探針類型包括cDNA、核糖探針、合成寡核苷酸及基因組探針。所用探針類型通常根據特定情形決定，例如用於原位雜交的核糖探針，及例如用於北方墨點法的cDNA。在一個實施例中，探針指向RNA獨有的核苷酸區域。探針可短如所要求的那樣，以差異性地識別可調節蛋白質之mRNA轉錄物，且可短為例如15個鹼基；然而，可使用至少17、18、19或20或超過20個鹼基之探針。在一個實施例中，引子及探針特定地在嚴格條件下與DNA片段雜交，該DNA片段具有對應於編碼所分析之蛋白質之基因的核苷酸序列。如本文所用，術語「嚴格條件」意謂雜交僅在核苷酸序列存在至少95%一致性時才發生。在另一個實施例中，當序列之間存在至少97%一致性時，發生「嚴格條件」下的雜交。
本文亦提供用於確定個體之病狀(例如癌症、神經退化性疾病或自體免疫疾病)對具有式I結構之化合物之治療是否有反應的方法，其藉由測定個體細胞中之DNA編輯酶(例如AID)蛋白質、mRNA之含量及/或活性來達成。個體細胞(試樣)中存在高含量的DNA編輯酶可指示個體對具有式I結構之化合物之治療有反應。DNA編輯酶含量可藉由評估獲自個體之生物樣品中之含量且對所觀測含量與對照參考樣品中所發現之DNA編輯酶含量進行比較來測定。在一些實施例中，DNA編輯酶可為AID。
在一個實施例中，熟習此項技術者已知待治療的病狀(例如癌症或自體免疫疾病)具有高含量的DNA編輯酶，且用DSB修復抑制劑如此治療表明無需量測獲自患者之生物樣品中之DNA編輯酶蛋白質、mRNA之含量及/或表現。在某些實施例中，DNA編輯酶為AID。
如本文所用，「生物樣品」係指獲自患者、較佳人類患者之生物材料樣品，包括組織樣品(例如組織活檢，諸如穿刺活檢、刷試活檢、表面活檢、針吸活檢、鑽孔活檢、切除活檢、開放活檢、切開活檢或內窺鏡活檢)或細胞樣品(例如上皮細胞或淋巴細胞。生物樣品亦可為生物流體樣品，例如***、尿、血液、血清、唾液、腦脊髓液，及細胞溶解物上清液，例如淋巴細胞部分。本文所述技術之一些實施例亦涵蓋生物樣品分離物在本文所述方法中的用途。
在一些實施例中，對照及/或參考水準可為健康個體或個體群之水準。在一些實施例中，對照及/或參考水準可為健康細胞或同類型健康細胞群之水準。在一些實施例中，對照及/或參考水準可為對照及/或參考樣品之水準。對照及/或參考樣品可為獲自健康個體(亦即未患癌症或自體免疫疾病之個體)的生物樣品(同類型)。對照參考樣品亦可為標準樣品，其所含DNA編輯酶的濃度與類型相同且獲自健康個體之生物樣品中通常所發現的濃度相同。舉例而言，對於生物樣品(諸如特定細胞部分(例如淋巴細胞)、***、尿、血液、腦脊髓液或組織)中通常所發現之DNA編輯酶的量而言，可存在標準參考對照樣品。在一個實施例中，對照參考樣品為標準參考樣品，其含有平均或中值濃度之DNA編輯酶mRNA或DNA編輯酶蛋白質，此平均或中值濃度發現於未患癌症或自體免疫疾病之健康個體群的細胞中。在一個實施例中，例如當細胞為B細胞時，參考水準為得自健康個體之未活化B淋巴細胞群中所發現之DNA編輯酶蛋白質或mRNA的含量。在一個實施例中，對照參考樣品為患者之健康細胞或組織之患者生物樣品，例如患者患有淋巴瘤，則可使用頰拭子或皮膚活檢作為參考樣品。在一些實施例中，經歷類別轉換之B細胞群中所發現之DNA編輯酶mRNA、蛋白質的含量及/或活性並非適當的對照參考樣品。
若個體細胞(例如包含癌變或自體免疫細胞之生物樣品)中所偵測 之DNA編輯酶蛋白質、DNA編輯酶mRNA之含量及/或DNA編輯酶活性比代表獲自健康個體之同類型細胞中之DNA編輯酶含量的參考對照樣品中所發現之DNA編輯酶蛋白質、mRNA含量及/或活性高出統計顯著量，則獲自個體的細胞具有DNA編輯酶蛋白質及/或mRNA之含量增加或升高的特徵。DNA編輯酶含量可用任意單位表示，例如獲自密度計、光度計或ELISA讀盤器等之單位。
如本文所用，術語「高含量」、「升高之含量」及/或「增加之含量」的DNA編輯酶蛋白質、mRNA及/或活性可互換地使用且係指DNA編輯酶蛋白質、mRNA及/或活性之量顯著大於代表得自健康個體之同類型細胞中之DNA編輯酶含量的對照參考樣品中所存在之DNA編輯酶蛋白質、mRNA及/或活性之量。
在一些實施例中，對照參考樣品可包含類型與待測定DNA編輯酶含量之細胞相同的健康細胞。在一些實施例中，對照參考樣品之細胞可具有與待測定DNA編輯酶表現量之細胞相似的年齡、發育狀態、性別及/或細胞類型。在一些實施例中，對照參考樣品可獲自年齡、發育狀態及/或性別與待測定DNA編輯酶表現量之個體生物體相似的健康生物體。在一些實施例中，測試樣品與對照參考樣品的類型相同，亦即，獲自相同生物來源，且包含相同組成，例如細胞數目及類型相同。
在一些實施例中，對照參考樣品可包含健康、未活化及/或未轉換的B細胞。在一些實施例，升高的DNA編輯酶含量為顯著大於健康、未活化及/或未轉型B細胞中之含量的含量。在一些實施例，經歷類別轉換的B細胞不視為有用的參考樣品。在某一實施例中，DNA編輯酶為AID。
在大部分正常細胞中，AID蛋白質/mRNA為不可偵測的，因此在一些實施例中，相較於健康個體細胞中之不可偵測的含量，僅僅偵測 到AID視為含量增加。在一些實施例中，AID含量升高可為使用RT-PCR分析可偵測到之AID的含量。
在一些實施例中，可偵測的AID含量可為每1mL血液1pg AID或超過1pg AID，例如10pg/mL、100pg/mL、1ng/mL、10ng/mL或超過10ng/mL。在一些實施例中，可偵測的AID含量可為每1mL血液10pg或超過10pg AID mRNA。在一些實施例中，可偵測的AID含量可為每1mL血液100pg或超過100pg AID mRNA。在一些實施例中，可偵測的AID含量可為每1mL血液1ng或超過1ng AID mRNA。在一些實施例中，可偵測的AID含量可為每1mL血液10ng或超過10ng AID mRNA。在一些實施例中，可偵測的AID含量可為每1mL血液100ng或超過100ng AID mRNA。
在一些實施例中，可偵測的AID含量可為每個細胞5個或超過5個AID mRNA複本(例如轉錄物)，例如每個細胞10個複本、100個複本、1,000個複本或超過1,000個複本。
在一些實施例中，可偵測的AID含量可為每20平方微米組織切片中1個或超過1個AID多肽，例如每20平方微米組織切片中1個多肽、10個多肽、100個多肽、1,000個多肽或超過1,000個多肽。
在一些實施例中，可偵測的AID含量可為每毫升血液或血清0.1pg或超過0.1pg AID多肽，例如每毫升血液0.1pg、1pg、10pg、100pg、1ng、10ng或超過10ng。在一些實施例中，可偵測的AID含量可為每毫升血液或血清0.1pg或超過0.1pg AID多肽。在一些實施例中，可偵測的AID含量可為每毫升血液10pg或超過10pg AID多肽。在一些實施例中，可偵測的AID含量可為每毫升血液100pg或超過100pg AID多肽。在一些實施例中，可偵測的AID含量可為每毫升血液1ng或超過1ng AID多肽。在一些實施例中，可偵測的AID含量可為每毫升血液10ng或超過10ng AID多肽。在一些實施例中，可偵測的AID 含量可為每毫升血液100ng或超過100ng AID多肽。
在一些實施例中，包含血清的樣品首先可耗乏血清白蛋白以提高敏感性。在一些實施例中，偵測DNA編輯酶含量之前，包含血液的樣品可根據B細胞或癌變細胞富集。在一些實施例中，數值表達值可使用軟體(例如Microsoft EXCEL®試算表及Affymetrix GENECHIP®軟體)量化及分析。
在一些實施例中，若個體細胞中之DNA編輯酶含量顯著地大於對照參考樣品中所存在之DNA編輯酶的含量，則該個體為根據本文所述方法治療的候選者。在一些實施例中，若個體細胞中之DNA編輯酶含量為對照參考樣品中所存在之DNA編輯酶含量的至少1.5倍、2倍、5倍、10倍，例如1.5倍或大於1.5倍、2倍或大於2倍、3倍或大於3倍、4倍或大於4倍、5倍或大於5倍、或6倍或大於6倍，則該個體為根據本文所述方法治療的候選者。
在一些實施例中，健康個體及/或無需根據本文所述方法治療的個體可為其細胞不表現可偵測量之DNA編輯酶的個體。在一些實施例中，DNA編輯酶可為AID。
本文所述技術可關於至少一種具有式I結構之化合物及包含至少一種具有式I結構之化合物的組合物用於治療DNA損傷程度增加及/或DNA編輯酶之含量及/或活性增加(例如AID蛋白質或mRNA增加)之癌症的用途。舉例而言，含有具有式I結構之化合物的組合物用於減少腫瘤尺寸、腫瘤生長、癌細胞計數、癌細胞擴增或癌症轉移。舉例而言，含有具有式I結構之化合物的組合物用於減少與下列(僅為了舉例而提供)之一有關之症狀的嚴重程度、持續時間或數目：B細胞癌症、白血病、淋巴瘤、結腸癌、肝癌、胃癌、腸癌、乳癌、肺癌、甲狀腺癌、腦癌、腎癌、黑色素瘤、***癌或膽管癌。本文所述技術亦可關於至少一種具有式I結構之化合物用於延長經化合物治療之患者之 期望壽命或延長其緩解時間(相較於未經化合物治療的患者)的用途。
如上文所述，本發明之一些實施例係關於治療方法，其包含(a)選擇具有DNA損傷增加及/或DNA編輯酶(例如活化誘導性胞苷脫胺酶(AID))之含量及/或活性增加之細胞的個體；及(b)向該個體投與治療有效量之具有式I結構之化合物。本發明之一些實施例係關於治療方法，其包含(a)選擇具有表現升高含量之DNA編輯酶(例如活化誘導性胞苷脫胺酶(AID))的個體；及(b)向該個體投與治療有效量之具有式I結構之化合物，其中升高的DNA編輯酶含量為DNA編輯酶含量高於得自健康個體之同類型細胞中的DNA編輯酶含量。
在一些實施例中，治療方法包含(a)選擇具有表現DNA編輯酶之B細胞的個體；及(b)向該個體投與治療有效量之具有式I結構之化合物。在一些實施例中，治療方法包含(a)選擇具有表現升高含量之DNA編輯酶之B細胞的個體；及(b)向該個體投與治療有效量之具有式I結構之化合物，其中升高的DNA編輯酶含量為DNA編輯酶含量高於得自健康個體之B細胞中的DNA編輯酶含量。在一些實施例中，表現DNA編輯酶的細胞為癌變細胞。在一些實施例中，表現DNA編輯酶的B細胞為癌變細胞。在一些實施例中，DNA編輯酶可為AID。如本文所用，術語「癌變細胞」係指以失調方式增殖的細胞。在一些實施例中，具有表現升高含量之DNA編輯酶之癌變B細胞的個體可為患有或經診斷患有B細胞癌症例如B細胞淋巴瘤或白血病)的個體，如下文所述。在一些實施例中，在血液、血清或活檢樣品中偵測到高含量的DNA編輯酶。
在某些實施例中，本文所述方法藉由利用重組及DNA修復系統誘導腫瘤細胞自毀來選擇性地治療B細胞贅生物、淋巴瘤及白血病。此方法係利用以下發現：DNA編輯酶誘導同源重組能力減弱之初級B細胞發生廣泛的基因組斷裂及細胞死亡。如本文所述，本發明人已確 定，在以DNA損傷增加及/或DNA編輯酶之含量及/或活性增加(例如AID表現增加)為特徵之細胞群經如本文所述之化合物處理的情況下，引起細胞死亡。因此，本文提供用如本文所述之化合物治療患有癌症之患者(例如患有其中DNA損傷程度增加及/或DNA編輯酶之含量及/或活性增加之癌症的患者)的方法。
在某些實施例中，所治療的癌症為DNA編輯酶表現較高的類型。在某些實施例中，所治療的癌症為B細胞贅生物。在某些實施例中，所治療的癌症為淋巴瘤。
在某些實施例中，所治療的癌症為伯基特氏淋巴瘤(Burkitt's lymphoma)、濾泡性淋巴瘤、MALT淋巴瘤、多發性骨髓瘤、小淋巴細胞性淋巴瘤、淋巴漿細胞性淋巴瘤、漿細胞骨髓瘤、大B細胞淋巴瘤及/或T細胞淋巴瘤。淋巴瘤為免疫系統之淋巴細胞(例如B細胞、T細胞或天然殺手(NK)細胞)中的惡性腫瘤。淋巴瘤往往起源於淋巴結且以實體腫瘤呈現。其可轉移至其他器官，諸如腦、骨或皮膚。結外位點往往位於腹部。淋巴瘤與淋巴細胞性白血病緊密相關且在一些情況下，特定的癌症形式歸類為淋巴瘤與白血病。
淋巴瘤存在若干分類系統，其中2001年開發的世界衛生組織(World Health Organization)分級為最新的且在2008年更新(Jaffe,E.S.等人，(編)World Health Organization Classification of Tumors,Pathology and Genetics of tumors of hematopoietic and lymphoid tissues IARC Press：Lyon,France 2001)。WHO系統將淋巴瘤分成三種主要類別；成熟B細胞淋巴瘤、成熟T細胞淋巴瘤及成熟NK細胞淋巴瘤。各別類別中包括霍奇金氏淋巴瘤(包含異常B細胞)及許多其他不常見的淋巴瘤。
淋巴瘤可藉由活檢診斷。對獲自活檢的組織進行組織學檢查，以確定惡性細胞之存在、類型及排列。亦測試細胞以確定其是否為淋 巴細胞且若是，則確定淋巴細胞為何種類型。確定淋巴瘤範圍及其位於體內何處的其他測試可包括其他活檢、核醫學、X射線、CT掃描或MRI(參見美國專利公開案US2003/0129665)。除疾病特有的其他異常細胞模式之外，亦可根據里-斯二氏細胞(Reed-Sternberg cells)之存在來診斷霍奇金氏淋巴瘤。區分各種淋巴瘤類型之標記及組織學標誌已為熟習此項技術者所知(Jaffe,E.S.等人，(編)World Health Organization Classification of Tumors,Pathology and Genetics of tumors of hematopoietic and lymphoid tissues IARC Press：Lyon,France 2001)。
在某些實施例中，所治療的癌症為白血病。白血病為造血組織惡性贅生物。白血病分類為兩種主要形式：慢性及急性。急性白血病的特徵為不成熟血細胞快速增加，其減弱骨髓產生健康血細胞之能力。慢性白血病的特徵為相對成熟、然而異常之白血球的積聚。異常細胞產生的速率比正常細胞大得多且引起異常白血球在血液中之積累。儘管有此等分類，然而正常造血作用之病理性障礙為所有白血病之標誌。
此外，白血病根據所影響的血細胞來細分。舉例而言，白血病可分為淋巴母細胞性或淋巴細胞性白血病及骨髓樣或骨髓性白血病。在淋巴母細胞性或淋巴細胞性白血病中，前淋巴細胞細胞典型地受到影響，其減弱來源於淋巴細胞之細胞的抗感染特性。大部分淋巴細胞性白血病涉及B細胞，特定的淋巴細胞亞型。在骨髓樣或骨髓性白血病中，白血球前驅物往往受到影響，一些其他類型之紅血球及血小板亦受到影響。因此，白血病大體上可細分為四類：急性淋巴母細胞白血病(ALL)、慢性淋巴細胞性白血病(CLL)及慢性骨髓性白血病(CML)。各亞型之特定顯現可涉及B細胞。在一些實施例中，術語白血病包括伯基特氏白血病；慢性淋巴細胞性白血病(CLL)、急性骨髓 性白血病(AML)；B細胞急性淋巴細胞性白血病(B-ALL)及T細胞急性淋巴母細胞白血病(T-ALL)。在一個實施例中，如本文所述的術語白血病亦涵蓋毛細胞白血病，其往往視為上述分類方案之外。
白血病可藉由此項技術中已知之任何方法診斷。典型地，首先進行全血球計數(CBC)測試。CBC係對血液樣品中之白血球、紅血球及血小板的數目進行計數。白血球數目較高且紅血球或血小板含量較低的血液樣品可指示白血病，且異常肝及腎功能測試將指示白血病是否已影響彼等器官。亦可使用流式細胞術進行更準確的診斷，例如藉由使用成熟骨髓標記(諸如CD11b及Gr-1)測定細胞類型、細胞數目及/或細胞形態。區分各類型癌症之標記及組織學標誌已為熟習此項技術者所知(Jaffe,E.S.等人，(編)World Health Organization Classification of Tumors,Pathology and Genetics of tumors of hematopoietic and lymphoid tissues IARC Press：Lyon,France 2001)。對於AML而言，紅血球、血小板及正常白血球會下降。此等症狀包括疲乏、呼吸短促、容易瘀傷及出血，及感染風險升高。此等症狀起因於正常骨髓被白血病細胞置換，白血病細胞主要為不成熟的異常白血球，其積聚於骨髓中且干擾正常血細胞之產生。
在某些實施例中，所治療之癌症為B細胞贅瘤、B細胞白血病、B細胞急性淋巴母細胞白血病、慢性淋巴細胞性白血病、慢性骨髓性白血病、伯基特氏白血病、急性骨髓性白血病及/或T-ALL。當外來抗原已中和時，B細胞之成熟最典型地發生中止或實質上減少。然而，特定B細胞之增殖偶爾將連續減弱；此類增殖可導致癌症，稱為「B細胞淋巴瘤」或「B細胞白血病」。在某些實施例中，所治療之癌症為慢性淋巴細胞性白血病(CLL)或慢性骨髓性白血病(CML)。
在一個實施例中，利用骨髓活檢有助於診斷白血病。骨髓活檢樣品可包括骨髓組織或骨髓與骨之混合物。在另一個實施例中，利用 細胞遺傳學檢查個別細胞中的染色體。細胞遺傳學測試係使用抽血或骨髓或淋巴結活檢之樣品。用顯微鏡檢查樣品染色體中的異常，此等異常指示對細胞DNA造成的損傷，且支持白血病之診斷。在另一個實施例中，脊椎穿剌可用於診斷白血病。典型地，自下背(腰區域)獲得腦脊髓液樣品。接著檢查體液樣品中的白血病細胞及其他異常。MRIs(磁共振成像)、CT(電腦化軸向斷層攝影術)掃描及X射線為可用於支持白血病診斷的成像技術。
在某些實施例中，所治療之癌症為漿細胞贅瘤。漿細胞贅瘤實例包括多發性骨髓瘤；漿細胞骨髓瘤；漿細胞白血病及漿細胞瘤。
特徵為DNA損傷程度較高及/或DNA編輯酶表現量較高的任何癌症可用如本文所述的化合物治療，例如具有式I結構之化合物。舉例而言，肉瘤、上皮細胞癌(癌瘤)、結腸癌、胃癌、腸癌、肝癌、肝細胞癌、乳癌、甲狀腺癌、食道癌、肺癌、腦癌、頭頸癌、黑色素瘤、腎癌、***癌、血管瘤、橫紋肌肉瘤、軟骨肉瘤、骨肉瘤、纖維肉瘤及膽管癌可以較高的DNA編輯酶表現量(例如AID)為特徵。在某些實施例中，所治療之癌症為結腸癌、肝癌、胃癌、腸癌、乳癌、肺癌、甲狀腺癌及/或膽管癌。此等癌症中的任一者可藉由此項技術中已知之任何方法診斷。活檢、結腸鏡檢查、大便樣品、成像或此項技術中已知的其他方式可用於偵測腫瘤及/或息肉之存在。對藉由此等方法獲得的組織進行組織學檢查，以確定惡性細胞之存在、類型及排列。區分各種淋巴瘤類型之標記及組織學標誌已為熟習此項技術者所知(Diagnostic Histopathology of Tumors,Fletcher,C.D.M.(編)，第3版，Churchill Livingstone Elsevier,China(2007)；Methods of Cancer Diagnosis,Therapy and Prognosis.Hayat,M.A.(編),(第3卷),Springer(2009))。確定癌症範圍及其位於體內何處的其他測試可包括其他活檢、核醫學、X射線、CT掃描或MRI。
在某些實施例中，相較於化合物治療之前的指標、標記、症狀、嚴重程度、轉移、復發及/或腫瘤尺寸或相較於未接受化合物治療的患者，用具有式I結構之化合物治療DNA編輯酶含量及/或活性較高(例如AID表現較高)之癌症患者使得癌症之指標、標記、症狀、嚴重程度、轉移、復發及/或腫瘤尺寸減少至少10%，例如至少20%、至少30%、至少50%、至少75%、至少100%、至少200%或超過200%。
在某些實施例中，具有式I結構之化合物包含於組合物中，該組合物包含具有式I結構之化合物及醫藥學上可接受之載劑。在其他實施例中，具有式I結構之化合物可包含於組合物中，該組合物包含醫藥學上可接受之載劑及另一種醫藥學上有效化合物。
本文所述技術之醫藥組合物可單獨或與以下組合投與：包括(但不限於)免疫療法或免疫治療劑之其他療法，或可有益於癌症患者之其他療法，或其組合。預期本文所述技術之治療劑可與有效針對本文所述癌症之一的任何其他療法一起投與。當兩種或超過兩種治療劑一起投與時，其可同時投與或其投與之間延遲一些時間投與(亦即根據最佳化遞送時程)。在其他實施例中，本文所述技術之醫藥組合物可包含至少一種DSB修復抑制劑及至少一種其他醫藥劑。
如本文所用，術語「免疫療法」係指個體用抗體或基於抗體之療法治療。如本文所用，免疫療法可為被動或主動的。如本文所定義的被動免疫療法為抗體被動轉移至個體(患者)。主動免疫為誘導個體(患者)發生抗體及/或T細胞反應。例示性免疫治療劑包括貝伐單抗(bevacizumab)(Avastin®)、阿侖單抗(Alemtuzumab)(Campath®)、西妥昔單抗(cetuximab)(艾必妥(Erbitux))、異貝莫單抗泰澤坦(Ibritumomab tiuxetan)(澤娃靈(Zevalin))、帕尼單抗(Panitumumab)(維克替比(Vectibix))、利妥昔單抗(rituximab)(Rituxan®)，及托西莫單抗(tositumomab)+131I(Bexxar®,Corixia Corp.)。利妥昔單抗藉由選擇 性地耗乏CD20+ B細胞來起作用。利妥昔單抗之治療有效性描述於Collins-Burow等人，Rituximab and its Role as Maintenance Therapy in non-Hodgkin Lymphoma,Expert Rev Anticancer Ther 7(3)：257-73(2007)；Marcus等人，The Therapeutic Use of Rituximab in non-Hodgkin's Lymphoma,Eur J Haemotal Suppl(67)：5-14(2007)；Plosker等人，Rituximab：A Review of its Use in non-Hodgkin's Lymphoma and Chronic Lymphocytic Leukaemia,Drugs(2003)，該等文獻以全文引用之方式併入本文中。貝伐單抗(Avastin®,Genentech/Roche)阻斷血管生成且用於治療各種癌症，西妥昔單抗(IMC-C225；Erbitux®)為針對表皮生長因子受體(EGFR)抑制因子的嵌合(小鼠/人類)單株抗體，其藉由靜脈內輸注給與，用於治療轉移性結腸直腸癌及頭頸部鱗狀細胞癌。異貝莫單抗泰澤坦(澤娃靈)為針對一些形式之B細胞非霍奇金氏淋巴瘤的單株抗體放射免疫治療療法且結合至CD20抗原。帕尼單抗為特異性針對表皮生長因子受體(亦稱為EGF受體、EGFR、ErbB-1及HER1)的完全人類單株抗體，用於治療結腸直腸癌。
本文所述之一些癌症的其他治療形式為幹細胞移植。
在一些實施例中，本文所述技術之醫藥組合物可在其他療法之後或之前投與，包括(但不限於)免疫治療劑、化學治療劑、輻射治療或可有益於癌症患者的其他療法，或其組合。
在一些實施例中，向個體投與一個治療循環，包含投與含有具有如本文所述式I結構之化合物的組合物。接著向個體投與一個治療循環，包含投與另一種化學療法、免疫療法、輻射或可有益於癌症患者的其他療法，或其組合。每個治療循環可包含投與組合物或療法1次或超過1次，亦即1次投藥、2次投藥、3次投藥、5次投藥、10次投藥、20次投藥或超過20次投藥。各治療循環可持續至少1天，亦即至少1天、至少2天、至少1週、至少2週、至少3週、至少4週、至少6週 或超過6週。在一些實施例中，各輪治療循環之間存在間斷或中斷，此間斷或中斷可持續至少1天，亦即至少1天、至少2天、至少1週、至少2週、至少3週、至少4週、至少6週或超過6週。治療過程包含用具有如本文所述式I結構之化合物治療之循環，視情況中斷，及用另一種化學療法、免疫療法、輻射或可有益於癌症患者之其他療法或其組合治療之循環，及視情況可部分地或完全地重複進行第二次中斷。在一些實施例中，用具有式I結構之化合物治療之循環為第二循環且另一種抗癌療法係用於第一循環。在一些實施例中，可有益於癌症患者之另一種化學療法、免疫療法、輻射或其他療法或其組合包含對個體DNA引起損傷的療法。在一些實施例中，可有益於癌症患者之另一種化學療法、免疫療法、輻射或其他療法或其組合包含小紅莓(doxorubicin)。在一些實施例中，可有益於癌症患者之另一種化學療法、免疫療法、輻射或其他療法或其組合包含氟達拉賓(fludarabine)。
其他療法包括(但不限於)可在本文所述方法之前、期間或之後進行的化學療法。在一個實施例中，化學療法係在如本文所述之組合物或方法治療之前或之後，而非在其期間投與。化學療法之非限制性實例包括輻射或化學治療劑治療，諸如放線菌素(actinomycin)、安吖啶(amsacrine)(Amsidine®)、蒽環黴素(anthracyclines)、博萊黴素(bleomycin)(Blenoxane®)、白消安(busulfan)、喜樹鹼(camptothecin)、卡鉑(carboplatin)(Paraplatin®)、苯丁酸氮芥(chlorambucil)(Leukeran®)、順鉑(cisplatin)、環磷醯胺(Cytoxan®)、克拉屈濱(cladribine)、阿糖胞苷(cytarabine)(Cytosar-U®)、賽特杉(cytoxan)、達卡巴嗪(dacarbazine)(DTIC-Dome®)、放線菌素d(dactinomycin)、道諾黴素(daunorubicin)、***(dexamethasone)(Decadron®)、多西他賽(docetaxel)、小紅莓 (doxorubicin)(Adriamycin®)、表柔比星(epirubicin)、依託泊苷(etoposide)(Etopophos®)、氟達拉賓(fludarabine)(Fludara®)、六甲密胺奧沙利鉑(hexamethylmelamineoxaliplatin)、異環磷醯胺(ifosfamide)(Ifex®)、異環磷醯胺(iphosphamide)、美法侖(melphalan)、二氯甲二乙胺(merchlorethamine)、甲胺喋呤(methotrexate)、絲裂黴素(mitomycin)、米托蒽醌(mitoxantrone)、亞硝基脲、太平洋紫杉醇、普卡黴素(plicamycin)、潑尼松(prednisone)、丙卡巴肼(procarbazine)、替尼泊苷(teniposide)、三伸乙基硫代磷醯胺(triethylenethiophosphoramide)、依託泊苷(etoposide)(VPI6)、長春新鹼(vincristine)(Oncovin®)、長春鹼(vinblastine)、苯達莫司汀(bendamustine)(利鉑莫司汀(Ribomustin)及特瑞達(Treanda))、CHOP療法、c-myc基因之單株抗體及抑制劑、DNA甲基轉移酶、蛋白酶體及週期素依賴性激酶。
化學治療劑可包括誘導DNA損傷的藥劑。此類藥劑之非限制性實例可包括烷基化劑、亞硝基脲、抗代謝物、植物鹼、植物萃取物或放射性同位素。
亦包括治療過程，包括(但不限於)1)CODOX-M/IVAC療程(Magrath方案)-CODOX-M(環磷醯胺、長春新鹼、小紅莓及高劑量甲胺喋呤)與IVAC(異環磷醯胺、依託泊苷及高劑量阿糖胞苷)之兩個循環，2)三個CODOX-M循環。亦包括此類組合療法之修改形式，諸如United Kingdom Lymphoma Group及Dana-Farber Cancer Institute之調適性Magrath方案。
如上文所述，本發明之一些實施例係關於治療方法，包含向需要治療自體免疫疾病之個體投與治療有效量之本文所述化合物，例如具有式I結構之化合物。如本文所用，術語「自體免疫疾病」或「自體免疫病症」係指由於攻擊自身組織而受免疫介導(諸如當個體自身 抗體與宿主組織反應時)，但亦可涉及針對微生物之免疫反應的病狀。在一些實施例中，個體可經確定具有升高的DNA損傷程度及/或升高的DNA編輯酶(例如AID)含量及/或活性。在一些實施例中，方法可進一步包含選擇DNA損傷程度升高及/或DNA編輯酶(例如AID)之含量及/或活性升高的個體。
如上文所述，本發明之一些實施例係關於治療方法，包含向需要治療免疫缺乏症之個體投與治療有效量之本文所述化合物，例如具有式I結構之化合物。如本文所用，術語「免疫缺乏症」係指其中構成免疫系統之細胞組分之一部分或一些部分缺乏或出現功能障礙，以致正常免疫機制受到損傷的病狀。換言之，「免疫缺乏症」意謂先天性免疫及/或後天性免疫受到抑止及/或降低的病狀。在一些實施例中，免疫缺乏症個體為免疫功能不全個體。免疫缺乏症之非限制性實例可包括AIDS、低γ球蛋白血症、無γ球蛋白血症、粒細胞缺乏症、慢性肉芽腫性疾病、無脾症、SCID、補體缺乏症及/或鐮狀細胞貧血。
在一些實施例中，個體可經確定具有升高的DNA損傷程度及/或升高的DNA編輯酶(例如AID)含量及/或活性。在一些實施例中，方法可進一步包含選擇DNA損傷程度升高及/或DNA編輯酶(例如AID)之含量及/或活性升高的個體。
在一些實施例中，升高的DNA編輯酶含量及/或活性可為酶含量高於得自健康個體之同類型細胞中之酶含量。在一些實施例中，表現升高含量之DNA編輯酶的細胞可為自體免疫細胞。如本文所用，「自體免疫細胞」或「自體反應性細胞」係指對細胞所來源之生物體之細胞或生物組分具有活性及/或識別其的免疫細胞。可為自體免疫細胞之細胞之實例包括(但不限於)成人脾細胞、T細胞及B細胞。如本文所用，術語「免疫細胞」係指作為先天及/或適應性免疫系統之一部分 的細胞。免疫細胞可具有造血來源且作為非限制性實例，包括淋巴細胞、B細胞、T細胞、NK細胞、骨髓細胞、單核細胞、巨噬細胞、嗜伊紅血球、肥大細胞、嗜鹼性血球、粒細胞、樹突狀細胞、吞噬細胞及嗜中性球。
在一些實施例中，治療方法包含(a)選擇具有表現升高含量之活化誘導性胞苷脫胺酶(AID)之B細胞的個體；及(b)向個體投與治療有效量之本文所述化合物(例如具有式I結構之化合物)；其中升高的AID含量為AID含量高於得自健康個體之B細胞中的AID含量。在一些實施例中，表現升高含量之AID的B細胞為與自體免疫疾病相關的B細胞。如本文所用，術語「與自體免疫疾病相關的B細胞」係指特定自體免疫疾病中具有異常功能、行為及/或增殖的B細胞。在一些實施例中，與自體免疫疾病相關之B細胞可為由於其異常功能、行為及/或增殖而引起疾病的B細胞。在一些實施例中，與自體免疫疾病相關的B細胞可為由於其異常功能、行為及/或增殖而引起自體免疫疾病之一或多種症狀之B細胞。在一些實施例中，具有與自體免疫疾病相關之B細胞的個體可為患有或經診斷而患有自體免疫疾病的個體，該自體免疫疾病特徵為或起因於具有異常功能、行為及/或增殖的B細胞。作為非限制性實例，在全身性紅斑狼瘡中，個體B細胞異常地產生對自體抗原及類風濕性關節炎具有特異性之抗體，個體B細胞與個體T細胞發生異常相互作用。
在某些實施例中，本文所述方法藉由利用淋巴重組系統誘導病變B細胞自毀、同時不傷害正常細胞來選擇性地治療自體免疫疾病。此方法係利用以下發現：B細胞重組酶AID誘導同源重組能力減弱之初級B細胞發生廣泛的基因組斷裂及細胞死亡。如本文所述，已確定在以DNA編輯酶(例如AID)表現增加為特徵之細胞群用如本文所述之化合物(例如具有式I結構之化合物)處理的情況下，引起細胞死亡。相 應地，本文提供治療患有自體免疫疾病(例如以異常B細胞增殖、類別轉換或活化為特徵的自體免疫疾病)的方法。在一些實施例中，自體免疫疾病可以增強的B細胞增殖、類別轉換或活化為特徵。在一些實施例中，自體免疫疾病可以具有DNA編輯酶(例如AID)含量及/或活性增加之B細胞為特徵。在一些實施例中，方法係關於用DSB修復抑制劑治療患有自體免疫疾病且具有高DNA編輯酶表現之細胞的個體。已知以異常B細胞增殖、類別轉換及/或活化為特徵的自體免疫疾病包括(但不限於)紅斑狼瘡；韋斯考特-奧德里奇症候群；自體免疫淋巴增生症候群；重症肌無力；類風濕性關節炎(RA)；狼瘡腎炎；多發性硬化症；全身性紅斑狼瘡；盤狀狼瘡；亞急性皮膚紅斑狼瘡；皮膚紅斑狼瘡，包括凍瘡紅斑狼瘡；慢性關節炎；休格連氏症候群；自體免疫腎炎；自體免疫糖尿病腎炎；自體免疫血管炎；自體免疫肝炎；自體免疫心臟炎；自體免疫腦炎；及自體免疫介導性血液疾病。在某些實施例中，自體免疫疾病的特徵為DNA編輯酶之表現異常。在某些實施例中，所治療之自體免疫疾病為克羅恩氏病、潰瘍性結腸炎、血管炎；僵直性脊椎炎；白塞氏疾病(Behçet's disease)；副腫瘤自體免疫或皮肌炎。在一些實施例中，根據本文所述方法治療之自體免疫疾病為以異常B細胞增殖為特徵的自體免疫疾病。在一些實施例中，自體免疫疾病可為例如發炎性慢性鼻竇炎、乳糜瀉、發炎性腸病、巴雷特氏食道(Barrett's esophagus)、發炎性胃炎、自體免疫腎炎或自體免疫糖尿病。
狼瘡或紅斑狼瘡或全身性紅斑狼瘡(SLE)為可引起身體之不同部分、尤其皮膚、關節、血液及腎臟發生慢性炎症的自體免疫病症。身體免疫系統通常產生稱為抗體的蛋白質，其保護身體抵抗病毒、細菌及其他外來物質(亦即抗原)。在諸如狼瘡或紅斑狼瘡或SLE之自體免疫病症中，免疫系統喪失可在抗原與其自身細胞及組織之間作出辨別 的能力且因此可產生針對其自身細胞及組織以形成免疫複合物的抗體。此等免疫複合物可在組織中積聚且引起炎症、組織損傷及/或疼痛。三種最常見的狼瘡類型包括全身性紅斑狼瘡(SLE)、皮膚紅斑狼瘡(CLE)及藥物誘導性狼瘡。自身免疫病症之其他類型包括(但不限於)亞急性皮膚紅斑狼瘡、皮膚紅斑狼瘡(包括凍瘡紅斑狼瘡)、類風濕性關節炎、慢性關節炎、休格連氏症候群、自體免疫腎炎、自體免疫血管炎、自體免疫肝炎、自體免疫心臟炎、自體免疫腦炎及自體免疫介導性血液疾病。狼瘡或紅斑狼瘡之更詳細描述可發現於Wallace,2000,The Lupus Book：A Guide for Patients and Their Families,Oxford University Press，修訂及擴增版；Kuhn等人，2004,Cutaneous Lupus Erythematosus,Springer，第1版；及Lahita,1999,Systemic Lupus Erythematosus,Academic Press，第3版，該等文獻以全文引用的方式併入本文中。
紅斑狼瘡診斷方法在此項技術中已熟知。針對狼瘡存在之實驗室測試包括LE細胞測試、抗核抗體測試及抗DNA抗體測試。然而，狼瘡往往根據特定臨床表現來識別，包括：(i)關節炎(發生於患有全身性狼瘡之90-95%人中)；(ii)皮膚變化，諸如橫越鼻樑、橫越面頰及/或眼下方的光敏誘導性「蝶形」皮疹，及/或體表任何處之紅色、突起及鱗片狀斑點，稱為盤狀狼瘡(發生於患有狼瘡之75-80%人中)；(iii)血液異常，諸如貧血、白血球減少症及血小板減少症(發生於患有狼瘡之約50%人中)；(iv)腎臟損傷(發生於患有狼瘡之約50%人中)；(v)心臟或肺疾病，諸如心臟或肺襯壁之刺激導致心包炎或肋膜炎(發生於患有狼瘡之約30%人中)，及(vi)神經精神變化(發生於患有狼瘡之約10%至20%人中)。作為非限制性實例，相對於經診斷未患全身性紅斑性狼瘡之個體中的自體抗體含量，可根據至少一種自體抗體之含量升高而診斷個體患有全身性紅斑狼瘡。用於診斷全身性紅斑狼瘡之例 示性自體抗體包括(但不限於)抗核抗體(ANA)、抗雙股DNA抗體(抗dsDNA)、抗Sm核抗原抗體(抗Sm)、抗磷脂抗體及其任何組合。相較於經診斷未患全身性紅斑狼瘡的個體，此含量升高可為至少5%、至少10%、至少15%、至少20%、至少25%、至少30%、至少40%、至少50%、至少60%、至少70%、至少80%、至少90%、至少1倍、至少2倍、至少3倍、至少4倍、至少5倍或至少10倍或高於10倍。或者，相對於經診斷未患全身性紅斑狼瘡之個體中的含量，可根據干擾素-β及或干擾素-β基因表現之量升高來診斷個體患有全身性紅斑狼瘡。相較於經診斷未患全身性紅斑狼瘡的個體，此含量升高可為至少5%、至少10%、至少15%、至少20%、至少25%、至少30%、至少40%、至少50%、至少60%、至少70%、至少80%、至少90%、至少1倍、至少2倍、至少3倍、至少4倍、至少5倍或至少10倍或高於10倍。
在某些實施例中，相較於治療之前的指標、標記、症狀及/或嚴重程度，或相較於未接受如本文所述化合物之治療的患者，用如本文所述之化合物(例如具有式I結構之化合物)治療患有自體免疫疾病或自體免疫病症之患者使自體免疫疾病的指標、標記、症狀及/或嚴重程度減少至少10%，例如至少20%、至少30%、至少50%、至少75%、至少80%、至少90%、至少95%或超過95%。
本文所述之技術可係關於至少一種具有式I結構之化合物及包含至少一種此類化合物之組合物的用途，係用於治療具有DNA編輯酶(例如AID蛋白質或mRNA)之含量升高之B細胞的自體免疫疾病或自體免疫病症。舉例而言，包含式I化合物的組合物用於降低與以下(為了舉例而提供)中之一者相關之症狀的嚴重程度、持續時間或數目：紅斑狼瘡；全身性紅斑狼瘡(SLE)；皮膚紅斑狼瘡(CLE)；藥物誘導性狼瘡；亞急性皮膚紅斑狼瘡；皮膚紅斑狼瘡，包括凍瘡紅斑狼瘡；類風濕性關節炎；休格連氏症候群；自體免疫腎炎；自體免疫血管炎；自 體免疫肝炎；自體免疫心臟炎；自體免疫腦炎；及自體免疫介導性血液疾病。在本上下文中，「降低」意謂此含量的統計顯著性減少。減少可為例如至少10%、至少20%、至少50%、至少90%或超過90%。
本文所述技術之醫藥組合物可單獨或與其他療法組合投與，包括(但不限於)消炎療法，或可有益於自體免疫疾病患者的其他療法或其組合。預期本文所述技術之治療劑可與有效針對本文所述自體免疫疾病中之一者的任何其他療法一起投與。當兩種或超過兩種治療劑一起投與時，其可同時投與或其投與之間延遲一些時間投與(亦即根據最佳化遞送時程)。在其他實施例中，本文所述技術之醫藥組合物可包含至少一種具有式I結構之化合物及至少一種其他醫藥劑。
作為非限制性實例，用於治療紅斑狼瘡的藥劑包括(但不限於)非類固醇消炎藥(NSAIDs)、皮質類固醇、抗瘧疾藥(例如氯奎寧(chloroquinine)；羥氯喹(hydroxychloroquine)；及奎納克林(quinacrine))、免疫抑制劑(例如硫唑嘌呤(azathioprine)、環孢靈A(cyclosporine A)、烷基化劑、氮芥(nitrogen mustards)、苯丁酸氮芥(chlorambucil)或環磷醯胺)、肝素(heparin)、阿司匹林(aspirin)、達那唑(danazol)(達諾克林(Danocrine))、脫氫表雄酮(dehydroepiandrosterone)(DHEA)、長春新鹼(安可平(Oncovin))、華法林(warfarin)、甲基潑尼龍(methylprednisolone)脈動療法、達普松(dapsone)、沙立度胺(thalidomide)(昔諾韋(Synovir))；甲基潑尼龍丁二酸鈉(methylprednisolone sodium succinate)(A-Methapred，Solu-Medrol)、甲胺喋呤(赫瑪瑞斯(Rheumatrex))、羥氯喹(普拉昆(Plaquenil))、曲安西龍(triamcinolone)(阿力妥盤(Aristospan))、類視黃素(例如異維A酸(istretinoin)及依曲替酯(etretinate))。消炎藥(NSAIDs)之非限制性實例包括諸如阿司匹林(aspirin)、水楊酸酯(salisylates)、布洛芬(ibuprofen)、萘普生(naproxen)、克林瑞爾 (clinoril)、奧沙普嗪(oxaprozin)及托美丁(tolmetin)。
在一些實施例中，本文所述技術之醫藥組合物可在其他療法之後或之前投與，包括(但不限於)消炎藥或免疫抑制劑或可有益於自體免疫疾病患者的其他療法，或其組合。
如上文所述，本發明之一些實施例係關於治療方法，包含向需要治療神經退化性疾病之個體投與治療有效量之本文所述化合物，例如具有式I結構之化合物。在一些實施例中，個體可經確定具有升高的DNA損傷程度及/或升高的DNA編輯酶(例如AID)含量及/或活性。在一些實施例中，方法可進一步包含選擇DNA損傷程度升高及/或DNA編輯酶(例如AID)之含量及/或活性升高的個體。
在一些實施例中，升高的DNA編輯酶含量及/或活性可為酶含量高於得自健康個體之同類型細胞中之酶含量。在一些實施例中，表現升高含量之DNA編輯酶的細胞可為神經細胞及/或神經系統細胞。如本文所用，「神經系統細胞」係指中樞及/或周邊神經系統之細胞，包括(但不限於)神經、神經元及神經膠質細胞。在一些實施例中，神經系統細胞可為神經元。
在一些實施例中，治療方法包含(a)選擇神經系統細胞表現升高含量之DNA編輯酶(例如活化誘導性胞苷脫胺酶(AID))的個體；及(b)向該個體投與治療有效量之本文所述化合物(例如具有式I結構之化合物)；其中升高的酶含量為酶含量高於得自健康個體之神經系統細胞中的酶含量。在一些實施例中，表現升高含量之DNA編輯酶的細胞為與神經退化性疾病相關的細胞。如本文所用，術語「與神經退化性疾病相關的神經系統細胞」係指特定神經退化性疾病中具有異常功能、行為及/或增殖的細胞。在一些實施例中，與神經退化性疾病相關之細胞可為由於其異常功能、行為及/或增殖而引起疾病的細胞。在一些實施例中，與神經退化性疾病相關之細胞可為由於其異常功能、行 為及/或增殖而引起神經退化性疾病之一或多種症狀的細胞。在一些實施例中，具有與神經退化性疾病相關之細胞的個體可為患有或經診斷而患有特徵為或起因於具有異常功能、行為及/或增殖之神經系統細胞之神經退化性疾病的個體。
可根據本文所述方法治療之神經退化性疾病之非限制性實例可包括阿茲海默氏病(Alzheimer's disease)、齒狀核紅核蒼白球丘腦下部萎縮(Dentatorubropallidoluysian atrophy，DRPLA)、亨廷頓氏病(Huntington's Disease，HD)、1型脊髓小腦共濟失調(SCA1)、2型脊髓小腦共濟失調(SCA2)、3型脊髓小腦共濟失調(SCA3)、6型脊髓小腦共濟失調(SCA6)、7型脊髓小腦共濟失調(SCA7)、8型脊髓小腦共濟失調(SCA8)、12型脊髓小腦共濟失調(SCA12)、17型脊髓小腦共濟失調(SCA17)、脊髓延髓肌肉共濟失調/甘乃迪病(Spinobulbar Muscular Ataxia/Kennedy Disease，SBMA)、X脆折症候群(FRAXA)、XE脆折智力遲鈍(FRAXE)，及肌緊張性營養不良(DM)。
在某些實施例中，相較於治療之前的指標、標記、症狀及/或嚴重程度，或相較於未接受如本文所述化合物治療的患者，用如本文所述之化合物(例如具有式I結構之化合物)治療患有神經退化性疾病或神經系統細胞具有高DNA編輯酶含量或活性(例如AID含量或活性)之神經退化性病症的患者使自體免疫疾病之指標、標記、症狀及/或嚴重程度減少至少10%，例如至少20%、至少30%、至少50%、至少75%、至少80%、至少90%、至少95%或超過95%。
本文所述之技術可關於至少一種具有式I結構之化合物及包含至少一種此類化合物之組合物的用途，係用於治療神經退化性疾病或神經系統細胞具有升高之DNA編輯酶(例如AID蛋白質或mRNA)含量的神經退化性病症。舉例而言，包含式I化合物的組合物用於降低與以下(為了舉例而提供)中之一者相關之症狀的嚴重程度、持續時間或數 目；阿茲海默氏病、齒狀核紅核蒼白球丘腦下部萎縮(DRPLA)、亨廷頓氏病(HD)、1型脊髓小腦共濟失調(SCA1)、2型脊髓小腦共濟失調(SCA2)、3型脊髓小腦共濟失調(SCA3)、6型脊髓小腦共濟失調(SCA6)、7型脊髓小腦共濟失調(SCA7)、8型脊髓小腦共濟失調(SCA8)、12型脊髓小腦共濟失調(SCA12)、17型脊髓小腦共濟失調(SCA17)、脊髓延髓肌肉共濟失調/甘乃迪病(SBMA)、X脆折症候群(FRAXA)、XE脆折智力遲鈍(FRAXE)，及肌緊張性營養不良(DM)。在本上下文中，「降低」意謂此含量的統計顯著性減少。減少可為例如至少10%、至少20%、至少50%、至少90%或超過90%。
本文所述技術之醫藥組合物可單獨或與其他療法組合投與，包括(但不限於)可有益於神經退化性疾病患者之治療或療法，或其組合。預期本文所述技術之治療劑可與有效針對本文所述神經退化性疾病中之一者的任何其他療法一起投與。當兩種或超過兩種治療劑一起投與時，其可同時投與或其投與之間延遲一些時間.投與(亦即根據最佳化遞送時程)。在其他實施例中，本文所述技術之醫藥組合物可包含至少一種具有式I結構之化合物及至少一種其他醫藥劑。
在一些實施例中，本文所述技術之醫藥組合物可在其他療法之後或之前投與，包括(但不限於)可有益於神經退化性疾病患者之治療或療法，或其組合。作為非限制性實例，亨廷頓氏病之治療或療法可選自由以下組成之群：有規律的身體鍛煉；有規律的精神鍛煉；膳食改善；或投與單水合肌酸、輔酶Q10、苯丁酸鈉。
在一些實施例中，本文提供一種使細胞對死亡敏感及/或誘導或引起細胞死亡的方法。在一些實施例中，本文提供一種引起細胞死亡的方法，包含：向細胞投與有效量之DNA編輯酶；及隨後使細胞與具有式I結構之化合物接觸；從而引起細胞死亡。在一些實施例中，本文提供一種使細胞對細胞死亡敏感的方法，包含：向個體投與治療有 效量之DNA編輯酶；及隨後向該個體投與具有式I結構之化合物；從而使該個體之細胞對細胞死亡敏感。在一些實施例中，DNA編輯酶可為APOBEC家族成員，或AID、Rag1或Rag2或SPO11。在一些實施例中，DNA編輯酶可為APOBEC家族成員。APOBEC家族成員之非限制性實例包括APOBEC1；APOBEC2、APOBEC3A；APOBEC3C；APOBEC3E；APOBEC3F；APOBEC3G；APOBEC3H；及APOBEC4。
在一些實施例中，DNA編輯酶可以下列形式投與：多肽、編碼DNA編輯酶之核酸，或包含編碼DNA編輯酶之核酸的載體。在一些實施例中，DNA編輯酶可為AID。在一些實施例中，投與細胞的DNA編輯酶為包含AID序列的多肽或其變異體、功能片段或同源物。在一些實施例中，投與細胞的DNA編輯酶為編碼AID多肽的核酸，使得AID或其變異體、功能片段或同源物在核酸所投與的細胞中表現。
亦涵蓋聯合本文所述方法使用的基因療法組合物及方法。此類方法允許臨床醫師將編碼所關注之多肽或RNA分子的DNA直接引入患者中(活體內基因療法)或引入自患者或供者分離的細胞中(離體基因療法)。相較於直接投與的蛋白質，基因療法之後由經轉導細胞產生的治療蛋白可在例如個體之癌細胞(例如腫瘤)中維持相對恆定的含量。治療劑(諸如AID及/或具有式I結構之化合物)之此持續性產生特別適於治療慢性疾病，諸如癌症。
此外，已開發出使用小分子誘導劑的可調節基因構築體，其可包括於載體中以用於本文所述之一些本發明實施例中。(Rivera等人，(1996)Nat.Med.2：1028-32；No等人，(1996)Proc.Natl.Acad.Sci.USA,93：3346-51；Gossen及Bujard(1992)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 89：5547-51；GeneSwitch®系統(Valentis,Inc.,Burlingame,Calif.))。此等系統係基於使用經工程改造之轉錄因子，其活性藉由小分子藥物控 制；及轉殖基因，其表現藉由經調節之轉錄因子驅動(Rivera等人，(1996)Nat.Med.2：1028-32；Pollock等人，(2000)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 97：13221-26；美國專利第6,043,082號及第6,649,595號；Rivera等人，(1999)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 96：8657-62)。
適用於本文所述方法中的載體可包括(但不限於)質體、逆轉錄病毒載體、腺病毒載體、腺相關病毒載體、疱疹病毒及痘病毒載體。
如本文所用，術語「轉導」係指使用病毒顆粒或病毒將外源性核酸引入細胞中。如本文所用，術語「轉染」係指將外源性核酸(諸如編碼增強如本文所述AID之活性及/或含量之藥劑的核酸序列)引入細胞中的方法，諸如化學方法。如本文所用，術語轉染不涵蓋將外源性核酸引入細胞中之基於病毒之方法。轉染方法包括物理處理(電穿孔、奈米顆粒、磁轉染)，及基於化學之轉染方法。基於化學之轉染方法包括(但不限於)使用環糊精、聚合物、脂質體、奈米顆粒、陽離子脂質或其混合物(例如DOPA、脂染胺(Lipofectamine)及阿普菲汀(UptiFectin))，及陽離子聚合物，諸如DEAE-聚葡萄糖或聚伸乙基亞胺的彼等方法。
在一些實施例中，細胞可為活體外細胞、細胞培養物中之細胞，或獲自個體之樣品中的細胞。在一些實施例中，DNA編輯酶及/或具有式I結構之化合物可例如添加至維持細胞的細胞培養基中。在一些實施例中，DNA編輯酶及/或具有式I結構之化合物可例如包含於介導或增強其進入細胞中之組合物中。下文中描述適用於活體內或活體外將藥劑遞送至細胞中的組合物，例如脂質體。
在一些實施例中，細胞可為活體內細胞，例如個體中之細胞。
在一些實施例中，需要靶向所關注的特定細胞或組織(靶向細胞或組織)，例如以增強載體有效性、最小化有效劑量，及/或最小化副作用或脫靶效應。使藥劑靶向特定細胞類型的方法在此項技術中已熟 知。欲回顧，參見Peng等人，「Viral Vector Targeting」,Curr.Opin.Biotechnol.10：454-457,1999；Gunzburg等人，「Retroviral Vector Targeting for Gene Therapy」,Cytokines Mol.Ther.2：177-184,1996.；Wickham,「Targeting Adenovirus」,Gene Ther.7：110-114,2000；Dachs等人,「Targeting Gene Therapy to Cancer：A Review」,Oncol.Res.9：313-325,1997；Curiel,「Strategies to Adapt Adenoviral Vectors for Targeted Delivery」,Ann NY Acad.Sci.886：158171,1999；Findeis等人，「Targeted Delivery of DNA for Gene Therapy via Receptors」,Trends Biotechnol.11：202205,1993；該等文獻以全文引用的方式併入本文中。
一些靶向策略係完全或部分地利用細胞受體及其天然配位體。參見例如Cristiano等人，「Strategies to Accomplish Gene Delivery Via the Receptor-Mediated Endocytosis Pathway」,Cancer Gene Ther.，第3卷，第1期，第49-57頁，1996年1月至2月；S.C.Philips,「Receptor-Mediated DNA Delivery Approaches to Human Gene Therapy」,Biologicals，第23卷，第1期，第13-6頁，1995年3月；Michael等人，「Strategies to Achieve Targeted Gene Delivery Via the Receptor-Mediated Endocytosis Pathway」,Gene Ther.，第1卷，第4期，第223-32頁，1994年7月；Lin等人，「Antiangiogenic Gene Therapy Targeting The Endothelium-Specific Receptor Tyrosine Kinase Tie2」,Proc.Natl.Acad.Sci.,USA，第95卷，第8829-8834頁，1998.Sudimack等人，「Targeted Drug Delivery Via the Folate Receptor」,Adv.Drug Deliv.,第147-62頁，2000年3月；Fan等人，「Therapeutic Application of Anti-Growth Factor Receptor Antibodies」,Curr.Opin.Oncol.，第10卷，第1期，第67-73頁，1998年1月；Wadhwa等人，「Receptor Mediated Glycotargeting」,J.Drug Target，第3期，第2期，第111-27頁，1995； Perales等人，「An Evaluation of Receptor-Mediated Gene Transfer Using Synthetic DNA-Ligand Complexes」,Eur.J.Biochem，第1卷，第2期，第226、255-66頁，1994年12月；Smith等人，「Hepatocyte Directed Gene Delivery by Receptor-Mediated Endocytosis」,Semin Liver Dis.，第19卷，第1期，第83-92頁，1999；該等文獻皆以全文引用的方式併入本文中。
針對特定細胞類型所特有之表面抗原的抗體(尤其單鏈抗體)亦可用作靶向元件。參見例如Kuroki等人，「Specific Targeting Strategies of Cancer Gene Therapy Using a Single-Chain Variable Fragment(scFv)with a High Affinity for CEA」,Anticancer Res.，第4067-71頁，2000；頒予Dornburg之美國專利第6,146,885號，名稱「Cell-Type Specific Gene Transfer Using Retroviral Vectors Containing Antibody-Envelope Fusion Proteins」；Jiang等人，「In Vivo Cell Type-Specific Gene Delivery With Retroviral Vectors That Display Single Chain Antibodies」,Gene Ther.1999,6：1982-7；Engelstadter等人，「Targeting Human T Cells By Retroviral Vectors Displaying Antibody Domains Selected From A Phage Display Library」,Hum.Gene Ther.2000,11：293-303；Jiang等人，「Cell-Type-Specific Gene Transfer Into Human Cells With Retroviral Vectors That Display Single-Chain Antibodies」,J.Virol 1998,72：10148-56；Chu等人，「Toward Highly Efficient Cell-Type-Specific Gene Transfer With Retroviral Vectors Displaying Single-Chain Antibodies」,J.Virol 1997,71：720-5；Chu等人，Retroviral Vector Particles Displaying The Antigen-Binding Site Of An Antibody Enable Cell-Type-Specific Gene Transfer,J.Virol 1995,69：2659-63；及Chu等人，「Cell Targeting With Retroviral Vector Particles Containing Antibody-Envelope Fusion Proteins」,Gene Ther. 1994,1：292-9；該等文獻皆以全文引用的方式併入本文中。
本文所述之組合物及方法可投與患有或經診斷患有例如癌症(自體免疫疾病及/或神經退化性疾病)之個體。在一些實施例中，本文所述方法包含向個體投與有效量之本文所述組合物，例如具有式I結構之化合物，以便緩解疾病或病狀之症狀。如本文所用，「緩解症狀」為改善與該疾病或病狀相關之任何病狀或症狀。與等效的未處理對照組相比，此類減少為至少5%、10%、20%、40%、50%、60%、80%、90%、95%、99%或超過99%，如藉由任何標準技術所量測。用於將本文所述組合物投與個體的多種方式已為熟習此項技術者所知。此類方法可包括(但不限於)經口、非經腸、靜脈內、肌肉內、皮下、經皮、呼吸道(氣溶膠)、肺、皮膚、局部、注射或瘤內投藥。投藥可為局部或全身性投藥。
如本文所用，術語「有效量」係指為緩解疾病或病症之至少一或多種症狀所需的化合物之量，且係關於足以提供所要作用的藥理學組合物之量。術語「治療有效量」因此係指當投與典型個體時足以提供特定作用的化合物之量。在不同背景中，如本文所用之有效量亦包括足以延遲疾病症狀之發展、改變症狀疾病(例如(但不限於)減緩疾病症狀之進展)之過程或逆轉疾病症狀的量。因此，指明確切的「有效量」通常為不切實際的。然而，在任何指定情況中，適當「有效量」可由一般技術者使用常規實驗確定。
有效量、毒性及治療功效可藉由標準醫藥程序、在細胞培養物或實驗動物中確定，例如用於確定LD50(50%群體致死劑量)及ED50(50%群體治療有效劑量)。劑量可依據所用劑型及所用投藥途徑而變化。毒性與治療作用之間的劑量比率為治療指數且其可以比率LD50/ED50表示。展現大治療指數之組合物及方法為較佳的。治療有效劑量可首先利用細胞培養分析來估計。又，可利用動物模型調配劑 量以達成循環血漿濃度範圍，包括IC50(亦即達成症狀之半最大抑制之活性成分(例如具有式I結構之化合物)的濃度)，如在細胞培養中或在適當動物模型中所測定。血漿中之含量可例如藉由高效液相層析法量測。任何特定劑量的效應尤其可藉由適合生物分析(例如用於腫瘤生長的分析)來監測。劑量可由醫師確定且根據需要調整以適合所觀測之治療作用。
在一些實施例中，本文所述之技術係關於醫藥組合物，其包含具有如本文所述之式I結構之化合物及視情況存在之醫藥學上可接受之載劑。醫藥學上可接受之載劑及稀釋劑包括生理鹽水、水性緩衝溶液、溶劑及/或分散介質。此類載劑及稀釋劑之用途在此項技術中已熟知。可充當醫藥學上可接受之載劑之材料的一些非限制性實例包括：(1)糖，諸如乳糖、葡萄糖及蔗糖；(2)澱粉，諸如玉米澱粉及馬鈴薯澱粉；(3)纖維素及其衍生物，諸如羧甲基纖維素鈉、甲基纖維素、乙基纖維素、微晶纖維素及纖維素乙酸酯；(4)粉末狀黃蓍；(5)麥芽；(6)明膠；(7)潤滑劑，諸如硬脂酸鎂、月桂基硫酸鈉及滑石；(8)賦形劑，諸如可可脂及栓劑蠟；(9)油，諸如花生油、棉籽油、紅花油、芝麻油、橄欖油、玉米油及大豆油；(10)二醇，諸如丙二醇；(11)多元醇，諸如甘油、山梨糖醇、甘露糖醇及聚乙二醇(PEG)；(12)酯，諸如油酸乙酯及月桂酸乙酯；(13)瓊脂；(14)緩衝劑，諸如氫氧化鎂及氫氧化鋁；(15)海藻酸；(16)無熱原質水；(17)等張生理鹽水；(18)林格氏溶液(Ringer's solution)；(19)乙醇；(20)pH緩衝溶液；(21)聚酯、聚碳酸酯及/或聚酸酐；(22)增積劑，諸如多肽及胺基酸；(23)血清組分。諸如血清白蛋白、HDL及LDL；(22)C2-C12醇，諸如乙醇；及(23)醫藥調配物中所用之其他無毒相容性物質。濕潤劑、著色劑、脫模劑、包覆劑、甜味劑、調味劑、芳香劑、防腐劑及抗氧化劑亦可存在於調配物中。諸如「賦形劑」、「載劑」、「醫藥學上 可接受之載劑」或其類似物之術語在本文中可互換使用。在一些實施例中，載劑抑制活性劑降解。
在某些實施例中，具有式I結構之化合物包含於組合物中，該組合物包含具有式I結構之化合物及醫藥學上可接受之載劑。在其他實施例中，具有式I結構之化合物可包含於組合物中，該組合物包含醫藥學上可接受之載劑及另一種醫藥學上有效化合物。
投與個體時，化合物可於醫藥學上可接受之組合物中提供。此等醫藥學上可接受之組合物包含治療有效量之至少一種具有如上文所述式I結構之化合物，其與一或多種醫藥學上可接受之載劑(添加劑)及/或稀釋劑一起調配。如下文詳細所述，本文所述技術之醫藥組合物可專門調配成固體或液體形式投與，包括根據以下調適之彼等形式：(1)經口投藥，例如灌藥(水性或非水性溶液或懸浮液)、***錠、糖衣藥丸、膠囊、丸劑、錠劑(例如靶向頰內、舌下及全身性吸收之彼等物)、大丸劑、散劑、顆粒、施用於舌之糊狀物；(2)非經腸投藥，例如，以例如無菌溶液或懸浮液或持續釋放調配物形式進行皮下、肌肉內、靜脈內或硬膜外注射；(3)局部施用，例如以乳膏、洗劑、凝膠、軟膏或控制釋放貼片或噴霧劑形式施用於皮膚；(4)***內或直腸內，例如子宮托、乳膏、栓劑或發泡體形式；(5)舌下；(6)眼部；(7)經皮；(8)經黏膜；或(9)鼻部。另外，化合物可使用藥物遞送系統植入或注入患者中。經包覆之遞送裝置亦可為適用的。參見例如Urquhart等人，Ann.Rev.Pharmacol.Toxicol.24：199-236(1984)；Lewis編，「Controlled Release of Pesticides and Pharmaceuticals」(Plenum Press,New York,1981)；美國專利第3,773,919號；美國專利第6,747,014號；及美國專利第353,270,960號。
許多組織化界面活性劑結構已研究且用於調配藥物。此等物包括單層、微胞、雙層及微脂粒。就藥物遞送之觀點而言，微脂粒(諸 如脂質體)因為其特異性及其提供之持續作用時間而已吸引較大的關注。脂質體為單層或多層微脂粒，其具有由親脂性材料形成之膜及水性內部。水性部分含有待遞送之組合物。脂質體可為陽離子型(Wang等人，Biochem.Biophys.Res.Commun.,1987,147,980-985)、陰離子型(Zhou等人，Journal of Controlled Release,1992,19,269-274)或非離子型(Hu等人，S.T.P.Pharma.Sci.,1994,4,6,466)。脂質體可包含多種不同的磷脂、脂質、醣脂及/或聚合物，其可賦予適用於某些應用中的專門特性且已描述於此項技術中(Allen等人，FEBS Letters,1987,223,42；Wu等人，Cancer Research,1993,53,3765；Papahadjopoulos等人，Ann.N.Y.Acad.Sci.,1987,507,64；Gabizon等人，PNAS,1988,85,6949；Klibanov等人，FEBS Lett.,1990,268,235；Sunamoto等人，Bull.Chem.Soc.Jpn.,1980,53,2778；Illum等人，FEBS Lett.,1984,167,79；Blume等人，Biochimica et Biophysica Acta,1990,1029,91；Hughes等人，Methods Mol Biol.2010；605：445-59；美國專利第4,837,028號、第5,543,152號、第4,426,330號、第4,534,899號、第5,013,556號、第5,356,633號、第5,213,804號、第5,225,212號、第5,540,935號、第5,556,948號、第5,264,221號、第5,665,710號；歐洲專利EP 0 445 131 B1；EP 0 496 813 B1；及歐洲專利公開案WO 88/04924、WO 97/13499、WO 90/04384、WO 91/05545、WO 94/20073、WO 96/10391、WO 96/40062、WO 97/0478)。
本文所述技術之組合物可製備及調配為乳液或微乳液。乳液典型地為一種液體分散於另一者中之呈直徑超過0.1μm之液滴形式的非均相系統，且已描述於此項技術中。微乳液可定義為水、油及兩親分子之系統，其為具有單一光學各向同性及熱力學穩定性的液體溶液且可包含界面活性劑及共界面活性劑。此等藥物遞送方式均已描述於此項技術中(參見例如Ansel's Pharmaceutical Dosage Forms and Drug Delivery Systems,Allen,LV.,Popovich NG.，及Ansel HC.,2004,Lippincott Williams & Wilkins(第8版),New York,NY；Idson，於Pharmaceutical Dosage Forms,Lieberman,Rieger及Banker(編),1988,Marcel Dekker,Inc.,New York,N.Y.，第1卷，第199頁；Rosoff，於Pharmaceutical Dosage Forms,Lieberman,Rieger及Banker(編),1988,Marcel Dekker,Inc.,New York,N.Y.，第1卷，第245頁；Block於Pharmaceutical Dosage Forms,Lieberman,Rieger及Banker(編),1988,Marcel Dekker,Inc.,New York,N.Y.，第2卷，第199、245及335頁；Higuchi等人，於Remington's Pharmaceutical Sciences,Mack Publishing Co.,Easton,Pa.,1985，第301頁；Leung及Shah，於：Controlled Release of Drugs：Polymers and Aggregate Systems,Rosoff,M.，編，1989,VCH Publishers,New York，第185-215頁；Schott，於Remington's Pharmaceutical Sciences,Mack Publishing Co.,Easton,Pa.,1985，第271頁；Constantinides等人，Pharmaceutical Research,1994,11,1385-1390；Ritschel,Meth.Find.Exp.Clin.Pharmacol.,1993,13,205；Ho等人，J.Pharm.Sci.,1996,85,138-143；Lee等人，Critical Reviews in Therapeutic Drug Carrier Systems,1991，第92頁；美國專利第6,191,105號、第7,063,860號、第7,070,802號、第7,157,099號)。
在一個實施例中，脂質體或乳液調配物包含界面活性劑。界面活性劑廣泛應用於諸如乳液(包括微乳液)及脂質體之調配物中。親水性基團(亦稱為「頭部」)之性質提供最適用於將調配物中所用之不同界面活性劑分類的方式(Rieger，於Pharmaceutical Dosage Forms,Marcel Dekker,Inc.,New York,N.Y.,1988，第285頁)。適合界面活性劑包括脂肪酸及/或其酯或鹽、膽酸及/或其鹽。在一些實施例中，界面活性劑可為陰離子型、陽離子型或非離子型。界面活性劑在藥品、調配物及乳液中的用途已有評述(Rieger，於Pharmaceutical Dosage Forms,Marcel Dekker,Inc.,New York,N.Y.,1988，第285頁)。
在一個實施例中，本文所述之技術係使用不同穿透增強劑來影響具有式I結構之化合物跨越細胞膜的有效遞送。穿透增強劑可歸類屬於五種廣泛類別之一，亦即界面活性劑、脂肪酸、膽汁鹽、螯合劑及非螯合非界面活性劑，其皆已描述於別處(參見例如Malmsten,M.Surfactants and polymers in drug delivery,Informa Health Care,New York,NY,2002；Lee等人，Critical Reviews in Therapeutic Drug Carrier Systems,1991，第92頁；Takahashi等人，J.Pharm.Pharmacol.,1988,40,252；Touitou,E.等人，Enhancement in Drug Delivery,CRC Press,Danvers,MA,2006；Muranishi,Critical Reviews in Therapeutic Drug Carrier Systems,1990,7,1-33；El Hariri等人，J.Pharm.Pharmacol.,1992,44,651-654；Brunton，第38章，於：Goodman & Gilman's The Pharmacological Basis of Therapeutics，第9版，Hardman等人編，McGraw-Hill,New York,1996，第934-935頁；Swinyard，第39章，於：Remington's Pharmaceutical Sciences，第18版，Gennaro編，Mack Publishing Co.,Easton,Pa.,1990，第782-783頁；Yamamoto等人，J.Pharm.Exp.Ther.,1992,263,25；Yamashita等人，J.Pharm.Sci.,1990,79,579-583；Jarrett,J.Chromatogr.,1993,618,315-339；Katdare,A.等人，Excipient development for pharmaceutical,biotechnology,and drug delivery,CRC Press,Danvers,MA,2006；Buur等人，J.Control Rel.,1990,14,43-51)。
經口調配物及其製備詳細描述於美國專利6,887,906、美國公開案第20030027780號及美國專利第6,747,014號，其各自以引用的方式併入本文中。用於非經腸、實質內、鞘內、室內或肝內投與之組合物及調配物可包括無菌水溶液，其亦可含有緩衝劑、稀釋劑及其他適合的添加劑，諸如(但不限於)穿透增強劑、載劑化合物及其他醫藥學上 可接受之載劑或賦形劑。水性懸浮液可進一步含有提高懸浮液黏度之物質，包括例如羧甲基纖維素鈉、山梨糖醇及/或聚葡萄糖。懸浮液亦可含有穩定劑。
在一些實施例中，包含具有如本文所述式I結構之化合物的醫藥組合物可呈非經腸劑量形式。由於非經腸劑型之投與典型地繞過患者針對污染物的天然防禦，因此非經腸劑型較佳為無菌的或能夠在投與患者之前滅菌。非經腸劑型的實例包括(但不限於)即用型注射溶液、待溶解或懸浮於醫藥學上可接受之媒劑中的即用型乾燥產物、即用型注射懸浮液，及乳液。另外，可製備控制釋放型非經腸劑型投與患者，包括(但不限於)DUROS®型劑型及劑量突釋。
可用於提供具有如本文中所揭示之式I結構之化合物之非經腸劑型的適合媒劑已為熟習此項技術者所熟知。實例包括(但不限於)：無菌水；注射用水USP；生理鹽水溶液；水性媒劑，諸如(但不限於)氯化鈉注射劑、林格氏注射劑(Ringer's injection)、右旋糖注射劑、右旋糖及氯化鈉注射劑，及乳酸化林格氏注射劑；水可混溶性媒劑，諸如(但不限於)乙醇、聚乙二醇及丙二醇；及非水性媒劑，諸如(但不限於)玉米油、棉籽油、花生油、芝麻油、油酸乙酯、肉豆蔻酸異丙酯及苯甲酸苯甲酯。改變或調節具有如本文所揭示之式I結構之化合物之醫藥學上可接受之鹽之溶解性的化合物亦可併入本發明之非經腸劑型中，包括習知及控制釋放的非經腸劑型。
習知劑型通常提供藥物自調配物的快速或即刻釋放。根據藥物之藥理學及藥物動力學，習知劑型之使用可引起患者血液及其他組織中的藥物濃度發生較寬的波動。此等波動可影響多個參數，諸如給藥頻率、起始作用時間、功效持續時間、治療劑血液含量之維持、毒性、副作用及其類似參數。有利地，控制釋放型調配物可用於控制藥物起始作用時間、持續作用時間、治療窗內之血漿含量，及峰值血液 含量。詳言之，控制或延長釋放型劑型或調配物可用於確保藥物達成最大有效性的同時最小化潛在副作用及安全問題，在藥物劑量不足(亦即低於最小治療劑含量)以及超過藥物毒性含量的情況下，副作用及安全問題均會發生。在一些實施例中，具有式I結構之化合物可於持續釋放型調配物中投與。
控制釋放型醫藥產品的共同目標為改良藥物療法優於由其非控制釋放型對應物所達成者。理想的是，在醫學治療中使用最佳設計之控制釋放型製劑的特徵為使用最少的原料藥、以最小的時間量治癒或控制病狀。控制釋放型調配物之優點包括：1)延長藥物活性；2)降低給藥頻率；3)增強患者順應性；4)降低總藥物用量；5)減少局部或全身性副作用；6)最小化藥物積累；7)減少血液含量波動；8)改良治療功效；9)降低藥物活性之增強或損失；及10)改良疾病或病狀之控制速度。Kim,Cherng-ju,Controlled Release Dosage Form Design,2(Technomic Publishing,Lancaster,Pa.：2000)。
大部分控制釋放型調配物設計成首先釋放迅速產生所需治療作用之量之藥物(活性成分)，且逐漸及持續地釋放其餘量之藥物以在延長的時間段期間維持此水準之治療或預防作用。為了維持體內恆定的藥物含量，藥物必須以置換自身體代謝及分泌之藥物量的速率自劑型中釋放。活性成分之控制釋放可利用不同條件來刺激，包括(但不限於)pH、離子強度、滲透壓、溫度、酶、水及其他生理學條件或化合物。
多種已知的控制或延長釋放型劑型、調配物及裝置可經調適以用於本發明之鹽及組合物。實例包括(但不限於)美國專利第3,845,770號、第3,916,899號、第3,536,809號、第3,598,123號、第4,008,719號、第5674,533號、第5,059,595號、第5,591,767號、第5,120,548號、第5,073,543號、第5,639,476號、第5,354,556號、第5,733,566號及第 6,365,185 B1號，該等專利各自以引用的方式併入本文中。此等劑型可使用例如羥丙基甲基纖維素、其他聚合物受質、凝膠、滲透膜、滲透系統(諸如OROS®(Alza Corporation,Mountain View,Calif.USA))或其組合而用於提供一或多種活性成分的緩慢或控制釋放，從而得到不同比例的所要釋放曲線。
本文所述技術之組合物可另外含有醫藥組合物中習知發現之在其技術領域中已確立之使用量的其他佐劑組分。因此，舉例而言，組合物可含有其他相容的醫藥學上活性物質，諸如止癢劑、收斂劑、局部麻醉劑或消炎劑，或可含有適用於在物理上調配本文所述技術之組合物之多種劑型的其他物質，諸如染料、調味劑、防腐劑、抗氧化劑、遮光劑、增稠劑及穩定劑。然而，此類物質在添加時不應不當地干擾本文所述技術之組合物之組分的生物活性。調配物可加以滅菌且必要時與助劑混合，例如潤滑劑、防腐劑、穩定劑、濕潤劑、乳化劑、影響滲透壓之鹽、緩衝劑、著色劑、調味劑及/或芳族物質及其類似物，其與調配物中之具有式I結構之化合物不發生有害的相互作用。
適合乳化劑包括合成非離子型乳化劑，諸如乙氧基化醚、乙氧基化酯、聚氧丙烯-聚氧乙烯嵌段共聚物及磷脂。亦可使用天然存在之磷脂，諸如卵或大豆磷脂，及經修飾或經人工操縱之磷脂或其混合物。在一些實施例中，乳化劑為卵磷脂及大豆磷脂。卵黃磷脂包括膽鹼磷脂、卵磷脂及磷脂醯乙醇胺。
本文所述技術之組合物亦可包括穩定劑。陰離子型穩定劑包括例如與聚乙二醇結合之磷脂醯乙醇胺(PEG-PE)及磷脂醯甘油，其特定實例為肉豆蔻醯磷脂醯甘油(DMPG)。其他穩定劑包括(但不限於)油酸及其鈉鹽、膽酸及去氧膽酸及其相應鹽；陽離子脂質，諸如硬脂胺及油胺；及3|3-[N-(N',N'-二甲基胺基乙烷)胺甲醯基]膽固醇(DC- Chol)。
本文所述技術之組合物可藉由合併適合的張力調節劑而產生與血液的等張性。最常使用甘油作為張力調節劑。替代性張力調節劑包括木糖醇、甘露醇及山梨糖醇。醫藥組合物典型地在生理學中性pH(典型地在6.0-8.5範圍內)下調配。藉由添加鹼(例如NaOH或NaHCO3)或在一些情況下添加酸(諸如HCl)來調節pH。
該技術之組合物可用醫藥學上安全的水包油乳液調配，該等水包油乳液包含植物油、磷脂乳化劑(典型地為蛋卵磷脂或大豆卵磷脂)，及張力調節劑，諸如Liposyn® II及Liposyn® III(Abbott Laboratories,North Chicago,Ill.)及Intralipid®(Fresenius Kabi AB,Uppsala,Sweden)，或其他類似的水包油乳液。
本發明化合物可以前藥形式存在。如本文所用，「前藥」意欲包括當此類前藥投與個體時釋放活性母藥物或化合物的任何載劑，該活性母藥物或化合物活體內代謝為活性藥物或活體內代謝為本發明之方法中所用的其他化合物。由於前藥已知可增強藥物之諸多所要品質(例如溶解性、生物可用性、製造等)，但本發明之一些方法中所用的化合物必要時可以前藥形式遞送。因此，本發明涵蓋本發明化合物之前藥以及遞送前藥之方法。本發明所用之化合物之前藥可藉由修飾化合物中存在的官能基來製備，其方式為使得修飾在常規操縱中或活體內裂解為母化合物。相應地，前藥包括例如其中羥基、胺基或羧基鍵結至任何基團的本文所述化合物，當前藥投與個體時，其裂解而分別形成游離羥基、游離胺基或羧酸。其他實例包括(但不限於)醇及胺官能基之乙酸酯、甲酸酯及苯甲酸酯衍生物；及烷基、碳環、芳基及烷基芳基酯，諸如甲基、乙基、丙基、異丙基、丁基、異丁基、第二丁基、第三丁基、環丙基、苯基、苯甲基及苯乙基酯，及其類似物。
如本文所用，術語「醫藥學上可接受之鹽」係指治療劑或化合 物或前藥之無機及有機鹽、習知無毒鹽或四級銨鹽，例如源自無毒有機或無機酸。此等鹽可用投藥媒劑或劑型製造方法當場製備，或藉由使呈游離鹼或酸形式之治療劑分別與適合有機或無機酸或鹼反應且在後續純化期間分離如此形成之鹽來製備。習知無毒鹽包括衍生自無機酸之彼等鹽，該等無機酸諸如硫酸、胺磺酸、磷酸、硝酸及其類似物；及自有機酸製備之鹽，該等有機酸諸如乙酸、丙酸、丁二酸、乙醇酸、硬脂酸、乳酸、蘋果酸、酒石酸、檸檬酸、抗壞血酸、棕櫚酸、順丁烯二酸、羥基順丁烯二酸、苯乙酸、麩胺酸、苯甲酸、水楊酸、對胺基苯磺酸、2-乙醯氧基苯甲酸、反丁烯二酸、甲苯磺酸、甲烷磺酸、乙烷二磺酸、草酸、羥乙磺酸、己二酸、天冬胺酸、碳酸、葡萄糖酸、葡糖醛酸、丙二酸、油酸、雙羥萘酸及其類似物。參見例如Berge等人，「Pharmaceutical Salts」,J.Pharm.Sci.66：1-19(1977)或P.H.Stahl及C.G.Wermuth，編者，Handbook of Pharmaceutical Salts：Properties,Selection and Use,Weinheim/Zürich：Wiley-VCH/VHCA,2002，該文獻之內容以全文引用的方式併入本文中。術語「鹽(salt)」或「鹽(salts)」可與「醫藥學上可接受之鹽」互換使用。
在本文所述態樣之一些實施例中，代表性鹽包括氫溴酸鹽、鹽酸鹽、硫酸鹽、硫酸氫鹽、磷酸鹽、硝酸鹽、乙酸鹽、丁二酸鹽、戊酸鹽、油酸鹽、棕櫚酸鹽、硬脂酸鹽、月桂酸鹽、苯甲酸鹽、乳酸鹽、甲苯磺酸鹽、檸檬酸鹽、順丁烯二酸鹽、反丁烯二酸鹽、丁二酸鹽、酒石酸鹽、萘甲酸鹽、甲磺酸鹽、單氫磷酸鹽、葡庚糖酸鹽、乳糖酸鹽、月桂基磺酸鹽、焦磷酸鹽、焦硫酸鹽及鈉鹽及其類似物。
預期本文所述技術之治療劑可與有效針對本文所述之癌症、神經退化病症或自身免疫病症中之一者的任何其他療法一起投與。當兩種或超過兩種治療劑一起投與時，其可同時投與或其投與之間延遲一 些時間投與(亦即根據最佳化遞送時程)。在其他實施例中，本文所述技術之醫藥組合物可包含至少一種具有式I結構之化合物及至少一種其他醫藥劑。
在一些實施例中，本文所述技術之醫藥組合物可包含至少一種具有式I結構之化合物及至少一種布魯頓氏酪胺酸激酶(BTK)抑制劑。BTK已顯示為B譜系淋巴細胞中Fas/APO-1(CD-95)死亡誘發信號傳導複合物(DISC)之抑制劑(Vassilev等人，J.Biol.Chem.1998,274,1646-1656)。BTK抑制劑使得淋巴結腫瘤負荷減少，但提高循環腫瘤負荷。基因化學療法有效治療循環腫瘤細胞，且因此可與BTK抑制劑組合來亦有效控制淋巴結與循環疾病。亦已發現，BTK抑制劑適用作化學敏感劑，且因此與基因化學療法組合使用。例示性BTK抑制劑包括依魯替尼(PCI-32765；1-[(3R)-3-[4-胺基-3-(4-苯氧基苯基)吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基]哌啶-1-基]丙-2-烯-1-酮)；AVL-291；AVL-292；PCI-45292；6-苯基-咪唑并(1,2-a)吡啶；6-苯基-咪唑并(1,2-b)噠嗪衍生物，如US8,324,211中所述；吡啶酮及噠嗪酮衍生物，如US8,318,719中所述；3-胺基-5-苯基-1H-吡啶-2-酮衍生物，如US8,299,077中所述；1H-吡唑并(3,4-d)嘧啶-4-基胺替代物，如US8,232,280中所述；3-苯基-1H-吡唑并-嘧啶-4-基胺替代物，如US8,236,812中所述；如以下文獻中所述的化合物：US7,393,848、US7,405,295、US7,514,444、US7,625,880、US7,683,064、US7,732,454、US7,741,330、US7,825,118、US7,902,194、US7,906,509、US7,943,618、US7,960,396、US8,008,309、US8,067,395、US8,088,781、US8,124,604、US20130018032、US20130018060及US20130035334，其揭示內容以引用的方式併入本文中。
在一些實施例中，本文所述技術之醫藥組合物可包含至少一種具有式I結構之化合物及至少一種Bcl-2抑制劑。Bcl-2抑制劑具有促細 胞凋亡性且當與DSB修復抑制劑組合投與時，可進一步增強癌症細胞凋亡效應。例示性Bcl-2抑制劑包括ABT-199(GDC-0199)、納維克拉斯(navitoclax)(ABT-263；(R)-4-(4-((4'-氯-4,4-二甲基-3,4,5,6-四氫-[1,1'-聯苯]-2-基)甲基)哌嗪-1-基)-N-((4-((4-嗎啉基-1-(苯硫基)丁-2-基)胺基)-3-((三氟甲基)磺醯基)苯基)磺醯基)苯甲醯胺)、ABT-737(4-[4-[(4'-氯[1,1'-聯苯]-2-基)甲基]-1-哌嗪基]-N-[[4-[[(1R)-3-(二甲基胺基)-1-[(苯硫基)甲基]丙基]胺基]-3-硝基苯基]磺醯基]-苯甲醯胺)、奧巴拉西(obatoclax)(GX15-070；2-(2-((3,5-二甲基-1H-吡咯-2-基)亞甲基)-3-甲氧基-2H-吡咯-5-基)-1H-吲哚)，及TW-37(5-(2-異丙基苯甲基)-N-(4-(2-第三丁基苯基磺醯基)苯基)-2,3,4-三羥基苯甲醯胺)。
在一些實施例中，本文所述技術之醫藥組合物可包含至少一種具有式I結構之化合物及至少一種Chk1抑制劑。Chk1為ATP依賴性絲胺酸-蘇胺酸激酶且為雙股斷裂(DSB)所活化之DNA複製監測檢查點系統中的主要組分。Chk1有助於當前所定義之所有細胞週期檢查點，包括G1/S、內-S-期、G2/M，及有絲***紡錘體檢查點。如本文所用，Chk1抑制劑為能夠至少部分地消除Chk1蛋白質之至少一種細胞週期檢查點活性的化合物。DNA修復抑制劑與Chk1抑制劑組合處理可引起協同性細胞停滯或殺死。例示性Chk1抑制劑包括AZD7762(1-(2-((S)-哌啶-3-基胺甲醯基)-5-(3-氟苯基)噻吩-3-基)脲)、LY2603618(IC-83；(S)-1-(5-溴-4-甲基-2-(嗎啉-2-基甲氧基)苯基)-3-(5-甲基吡嗪-2-基)脲)、CHIR-124((S)-3-(1H-苯并[d]咪唑-2-基)-6-氯-4-(啶-3-基胺基)喹啉-2(1H)-酮)、SCH900776(6-溴-3-(1-甲基-1H-吡唑-4-基)-5-((R)-哌啶-3-基)吡唑并[1,5-a]嘧啶-7-胺)，及PF 477736(α-胺基-N-[5,6-二氫-2-(1-甲基-1H-吡唑-4-基)-6-側氧基-1H-吡咯并[4,3,2-ef][2,3]苯并二氮呯-8-基]-環己烷乙醯胺，(αR)-)、UCN-01(KW-24101；7-羥基星孢菌素(7-Hydroxystaurosporine)；得自Kyowa Hakko Kogyo Co., Ltd.,Tokyo,Japan及Keryx Biopharmaceuticals,Inc.,New York,N.Y.)、Lilly/ICOS IC83/LY2603618(得自Eli Lilly,Indianapolis,Ind.)、XL-844(EXEL-9844，得自Exelixis)、PF-394691(得自Pfizer)、PF-473336(得自Pfizer)及如以下文獻中所述的化合物：US8,093,244、US7,560,462、US7,550,477、US7,501,435、US7,485,649、US 2007/0083044、US 2007/0082900、US 2007/0105864及US 2007/0117804，其揭示內容以全文引用的方式併入本文中。
在一些實施例中，本文所述技術之醫藥組合物可包含至少一種具有式I結構之化合物及至少一種MDM2抑制劑。如本文所用，術語「MDM2抑制劑」係關於靶向、減少或抑制MDM2與p53腫瘤抑制劑之相互作用的化合物。MDM2抑制劑之實例包括(但不限於)反-4-碘，4'-硼烷基-查耳酮(chalcone)；努特林-3(Nutlin-3)(4-(4,5-雙(4-氯苯基)-2-(2-異丙氧基-4-甲氧基苯基)-4,5-二氫-1H-咪唑-1-羰基)哌嗪-2-酮)；NSC-207895(XI-006；4-(4-甲基-1-哌嗪基)-7-硝基-2,1,3-苯并噁二唑3-氧化物)；RG7112(努特林-3a)；順-咪唑啉類似物，稱為努特林(努特林-1、努特林-2、努特林-3)及如US7,737,174、US8288377、US8222288、US7834016、US20110319378及WO2012121662中所述的化合物，其揭示內容以引用的方式併入本文中。
在一些實施例中，本文所述技術之醫藥組合物可包含至少一種具有式I結構之化合物及至少一種WEE1抑制劑。Wee1激酶為參與細胞週期之G2檢查點的酪胺酸激酶。Wee1使參與細胞週期中G2期進展至M期之Cdc2(Cdk1)酪胺酸15磷酸化，從而使Cdc2不活化且使細胞週期暫時停止在G2期(McGowan及Russell 1993 The EMBO Journal,12,75-85)。已報導，RNA干擾引起的Wee1表現減少或化合物引起的Wee1抑制可增強癌細胞對阿黴素(adriamycin)、X射線及γ射線的敏感性(Wang等人，2004,Cancer Biology & Therapy,3,305-313；Wang等 人，2001,Cancer Research,61,8211-8217)。DNA修復抑制劑與Chk1抑制劑組合治療可增強癌細胞對治療的敏感性。吾人認為，Wee1抑制劑可抑制p53耗乏性癌細胞之G2檢查點功能，從而增強細胞對DSB修復抑制劑的敏感性。例示性WEE1抑制劑包括MK-1775(2-烯丙基-1-(6-(2-羥基丙-2-基)吡啶-2-基)-6-(4-(4-甲基哌嗪-1-基)苯基胺基)-1,2-二氫吡唑并[3,4-d]嘧啶-3-酮)；PD0166285(6-(2,6-二氯苯基)-2-[[4-[2-(二乙基胺基)乙氧基]苯基]胺基]-8-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮二鹽酸鹽)，及如美國申請案2005/0250836、WO2003/091255中所述之化合物，該等文獻各自以全文引用的方式併入本文中。
在一些實施例中，本文所述技術之醫藥組合物可包含至少一種具有式I結構之化合物及至少一種聚ADP核糖聚合酶(PARP)抑制劑。聚(ADP-核糖)聚合酶(PARP)或聚(ADP-核糖)合成酶(PARS)具有促進DNA修復、控制RNA轉錄、介導細胞死亡及調節免疫反應的基本作用。PARP抑制劑有效地靶向同源重組修復能力降低之細胞，諸如BRCA1或BRCA2缺乏性乳癌或卵巢癌。用DSB修復抑制劑處理可使得具有完整同源重組的細胞對PARP抑制劑敏感，可增強PARP抑制劑對同源重組缺乏性癌症的功效，且可避開針對PARP抑制劑之獲得性抗性的情況。PARP抑制劑之實例包括(但不限於)依尼帕瑞(Iniparib)(BSI 201；4-碘-3-硝基苯甲醯胺)、奧拉帕尼(Olaparib)(AZD-2281；KU-59436；4-[(3-[(4-環丙基羰基)哌嗪-4-基]羰基)-4-氟苯基]甲基(2H)酞嗪-1-酮)、如卡帕瑞(Rucaparib)(AG014699，PF-01367338；2-{4-[(甲基胺基)甲基]苯基}-1,3,4,5-四氫-6H-氮呯并[5,4,3-cd]吲哚-6-酮)、維利帕尼(Veliparib)(ABT-888；2-((R)-2-甲基吡咯啶-2-基)-1H-苯并咪唑-4-甲醯胺)；CEP-8983；CEP-9722；MK-4827(尼拉帕尼(Niraparib)；2-{4-[(3S)-哌啶-3-基]苯基}-2H-吲唑-7-甲醯胺)；BMN-673(LT-673；(8S,9R)-5-氟-8-(4-氟苯基)-9-(1-甲基-1H-1,2,4-***-5- 基)-8,9-二氫-2H-吡啶并[4,3,2-de]酞嗪-3(7H)-酮)；LT-674；LT-628；3-胺基苯甲醯胺(INO-1001；3-AB)；PD128763(3,4-二氫-5-甲基-1(2H)-異喹啉酮)；NU1025(8-羥基-2-甲基-4(3H)-喹唑啉酮)；DR 2313(1,5,7,8-四氫-2-甲基-4H-硫哌喃并[4,3-d]嘧啶-4-酮)；UPF 1069(5-(2-側氧基-2-苯基乙氧基)-3,4-二氫異喹啉-1(2H)-酮)；EB 47(5'-去氧-5'-[4-[2-[(2,3-二氫-1-側氧基-1H-異吲哚-4-基)胺基]-2-側氧基乙基]-1-哌嗪基]-5'-側氧基腺苷二鹽酸鹽)；E7016(苯并哌喃并[4,3,2-de]酞嗪-3(2H)-酮，10-[(4-羥基-1-哌啶基)甲基]-)；4-HQN(4-(1H)-喹唑啉酮)；ABT-767及如以下文獻中所述的化合物：Griffin等人，1998,J.Med.Chem.41,5247；Skalitzky等人，2003,J.Med.Chem.46：210-213；Zaremba等人，2007,Anti-Cancer Agents in Medicinal Chemistry 7,515；Lewis等人，2007,Curr Opin.Investigational Drugs 8,1061；Guha 2011,Nature Biotechnology 29,373-374；Rouleau等人，2010,Nature Reviews Cancer 10,293-301；Miknyoczki等人，2007 Mol Cancer Ther,6(8),2290-2302；Pellicciari等人，2008,Chem.Med.Chem 3,91；Jones等人，2009,J Med Chem,52(22),7170-7185；Mason等人，2008,Invest New Drugs,26(1),1-5；Ferraris等人，2010,J.Med.Chem.53 4561；美國專利申請案：US2006/0229289、US20070259937、US20120309717、US20130011365；美國專利：US8372987、US8362030、US8236802、US8217070、US8183250、US8088760；國際專利申請案：WO 01/85686、WO 00/42040、WO 00/39070、WO 00/39104、WO 99/11623、WO 99/11628、WO 99/11622、WO 99/59975、WO 99/11644、WO 99/11945、WO 99/11649及WO 99/59973，該等文獻各自以全文引用的方式併入本文中。
預期本文所述技術之治療劑可與有效針對本文所述自體免疫病 症中之一者的任何其他療法一起投與。預期本文所述技術之治療劑可與有效針對本文所述自身免疫病症中之一者的任何其他療法一起投與。當兩種或超過兩種治療劑一起投與時，其可同時投與或其投與之間延遲一些時間投與(亦即根據最佳化遞送時程)。在其他實施例中，本文所述技術之醫藥組合物可包含至少一種具有式I結構之化合物及至少一種其他醫藥劑。
在一些實施例中，本文所述技術之醫藥組合物可包含至少一種具有式I結構之化合物及至少一種介白素-1受體相關激酶4(IRAK-4)抑制劑。IRAK-4抑制劑之實例包括(但不限於)Nd-346、ND-2110及ND-2158(Nimbus Discovery)，及如以下文獻中所述的化合物：Kim等人，J.Exp.Med.2007 204(5),1025-1036；Lebakken等人，J.Biomol.Screen.2007,12(6),828-841；Maschera等人，Biochem.J.1999,339,227-231；Song等人，Mol.Immunol.2009,46,1458-1466；美國申請案US20120283238、US8,293,923，該等文獻各自以全文引用的方式併入本文中。
劑量可由醫師確定且根據需要調整以適合所觀測之治療作用。一般而言，組合物經投與，使得具有式I結構之化合物以如下劑量給與：1μg/kg至150mg/kg，1μg/kg至100mg/kg，1μg/kg至50mg/kg，1μg/kg至20mg/kg，1μg/kg至10mg/kg，1μg/kg至1mg/kg，100μg/kg至100mg/kg，100μg/kg至50mg/kg，100μg/kg至20mg/kg，100μg/kg至10mg/kg，100μg/kg至1mg/kg，1mg/kg至100mg/kg，1mg/kg至50mg/kg，1mg/kg至20mg/kg，1mg/kg至10mg/kg，10mg/kg至100mg/kg，10mg/kg至50mg/kg，或10mg/kg至20mg/kg。應瞭解，本文中指定的範圍包括所有中間範圍，例如範圍1mg/kg至10mg/kg包括1mg/kg至2mg/kg、1mg/kg至3mg/kg、1mg/kg至4mg/kg、1mg/kg至5mg/kg、1mg/kg至6mg/kg、1mg/kg至7mg/kg、1 mg/kg至8mg/kg、1mg/kg至9mg/kg、2mg/kg至10mg/kg、3mg/kg至10mg/kg、4mg/kg至10mg/kg、5mg/kg至10mg/kg、6mg/kg至10mg/kg、7mg/kg至10mg/kg、8mg/kg至10mg/kg、9mg/kg至10mg/kg等。進一步瞭解，中間值至上述指定值之範圍亦屬於本文所述之此技術之範圍內，例如在1mg/kg至10mg/kg範圍內，諸如2mg/kg至8mg/kg、3mg/kg至7mg/kg、4mg/kg至6mg/kg之劑量範圍等。
就治療之持續時間及頻率而言，典型的是熟練的臨床醫師監測個體以便確定治療提供治療益處的時間，及確定是否增加或減少劑量、增加或減少投藥頻率、中斷治療、恢復治療或對治療方案作出其他變更。給藥時程可為一週一次至每天一次而不等，此視多種臨床因素而定，諸如個體對具有式I結構之化合物的敏感性。所要劑量可一次性或分成子劑量(例如2-4次子劑量)投與，且在一段時間內投與，例如依適當的時間間隔(整天)或其他適當時程投與。此類子劑量可以單位劑型投與。在一些實施例中，投藥為長期的，例如每天一或多次劑量，歷時數週或數月。給藥時程之實例為每天投藥一次，每天兩次，每天三次，或每天四次或超過四次，歷時1週、2週、3週、4週、1個月、2個月、3個月、4個月、5個月或6個月或超過6個月。所要劑量可利用連續輸注或遞送、經由控制釋放型調配物投與。在彼情況下，各子劑量中所含之具有式I結構之化合物相應地必須較小以便達成總日劑量。劑量單元亦可經混配以遞送數日，例如使用習知的持續釋放型調配物，其使具有式I結構之化合物在數日期間內持續釋放。持續釋放型調配物在此項技術中已熟知且尤其適用於遞送藥劑於特定位點，諸如可聯合本文所述技術之藥劑使用。在此實施例中，劑量單元含有相應多個日劑量。
全劑量之具有式I結構之化合物投與之前，可向患者投與較小劑量，諸如5%輸注量，且監測副作用，諸如過敏反應。具有式I結構之 化合物或由其製備的醫藥組合物由於對癌症、神經退化或自體免疫的作用而可增強生活品質。
如本文所述之組合物的劑量可由醫師確定且根據需要調整以適合所觀測之治療作用。就治療之持續時間及頻率而言，典型的是熟練的臨床醫師監測個體以便確定治療提供治療益處的時間，及確定是否增加或減少劑量、增加或減少投藥頻率、中斷治療、恢復治療或對治療方案作出其他變更。給藥時程可為一週一次至每天一次而不等，此視多個臨床因素而定，諸如個體對化合物之敏感性。所要劑量或量的活化劑可一次性或分成子劑量(例如2-4次子劑量)投與，且在一段時間內投與，例如依適當的時間間隔(整日)或其他適當時程投與。在一些實施例中，投藥可為長期的，例如每天一或多次劑量及/或治療，歷時數週或數月。給藥及/或治療時程之實例為每天投藥一次，每天兩次，每天三次，或每天四次或超過四次，歷時1週、2週、3週、4週、1個月、2個月、3個月、4個月、5個月或6個月或超過6個月。組合物可在一段時間內投與，諸如在5分鐘、10分鐘、15分鐘、20分鐘或25分鐘時段內。
在一些實施例中，醫藥組合物可包括(a)一或多種具有式I結構之化合物及(b)一或多種如本文所述之醫藥學有效化合物。
根據本文所述方法投與具有式I結構之化合物的劑量範圍視以下而定：例如具有式I結構之化合物之形式、其效力，及本文所述病狀之症狀、標記或指標意欲降低的程度，例如症狀之意欲降低百分比。劑量不應如此大以致引起有害副作用，諸如脫靶細胞死亡。一般而言，劑量將因患者之年齡、病狀及性別而異且可由熟習此項技術者確定。在任何併發症之情況下，亦可由個別醫師調整劑量。
具有式I結構之化合物的功效(例如治療本文所述之病狀，或誘導如本文所述之反應)可由熟練的臨床醫師測定。然而，根據本文所述 方法治療之後，若本文所述病狀之病徵或症狀中之一或多者以有益方式發生變化，臨床上所接受的其他症狀改善，或甚至緩解，或誘導所要反應，例如至少10%，則治療視為如本文所用之術語「有效治療」。可評估功效，例如藉由量測根據本文所述方法治療之病狀之標記、指標、症狀及/或發病率或任何其他適當的可量測參數，例如存活期。功效亦可根據個體未發生惡化(如住院所評估)或醫學干預之需要(亦即疾病停止進展)來量測。量測此等指標之方法已為熟習此項技術者所知及/或描述於本文中。治療包括個體或動物(一些非限制性實例包括人類或動物)疾病之任何治療且包括：(1)抑制疾病，例如防止症狀(例如疼痛或發炎)惡化；或(2)減輕疾病之嚴重程度，例如促使症狀消退。治療疾病之有效量意謂當投與有需要之個體時足以對該疾病產生有效治療(該術語如本文所定義)的量。藥劑之功效可藉由評估病狀之身體指標或所要反應來確定。熟習此項技術者完全有能力藉由量測此類參數中之任一者或任何參數組合來監測投藥及/或治療功效。可利用本文所述病狀之動物模型評估功效，例如治療癌症的功效。使用實驗動物模型時，當觀測到標記發生統計顯著性變化時，證明治療有功效。
本文提供允許對化合物之指定劑量進行評估的活體外及動物模型分析。可評估指定劑量組合在動物模型(例如異種移植鼠類癌症模型)中的功效。可將腫瘤細胞植入及/或注入小鼠且隨後投與一定劑量之具有式I結構的化合物。可根據例如腫瘤生長、腫瘤尺寸及/或存活期來評估功效。
毒性及治療功效可藉由標準醫藥程序、在細胞培養物或實驗動物中測定，例如測定LD50(50%群體致死劑量)及ED50(50%群體治療有效劑量)。毒性作用與治療作用之間的劑量比為治療指數且其可以比率LD50/ED50表示。展現大治療指數之組合物較佳。鼠類遺傳學已 產生多種小鼠模型用於研究化合物，諸如本文所述之彼等物。此類模型可用於活體內測試本發明所述化合物，以及用於確定治療有效劑量。適合小鼠模型為例如本文所述之AICDA-/-小鼠或使用來源於患者之組織異種移植物(PDX)開發的模型。在適用於研究DSB修復抑制劑之此技術的某些實施例中，免疫功能不全小鼠品系，諸如Nod-錫特(Nod-scid)、NSG(NOD-錫特Il2ry-空；NOD.Cg-Prkdc-錫特<Il2rg>/Wjl/SzJ)或NRG(NOD-RagIl2ry-空；NOD-Rag1<空>IL2rg<空>/Wjl/SzJ)移植有初級人類癌細胞，諸如白血病。
自細胞培養物分析及動物研究獲得之資料可用於調配用於人類的劑量範圍。此類化合物之劑量較佳處於循環濃度之範圍內，包括毒性很小或無毒性之ED50。劑量可在此範圍內變化，此視所用劑型及所用投藥途徑而定。
治療有效劑量可首先利用細胞培養物分析來估計。可利用動物模型調配劑量以獲得循環血漿濃度範圍，包括IC50(亦即達成症狀之半最大抑制的治療劑濃度)，如在細胞培養中所測定。化合物在血漿中之含量可藉由例如高效液相層析來量測。任何特定劑量之作用可藉由適合生物分析來監測。
可與載劑物質合併以製造單一劑型的化合物之量通常為產生治療作用之化合物的量。一般而言，以百分之一百計，此量將在約0.1%至99%化合物、較佳約5%至約70%、最佳10%至約30%之範圍內。
熟習此項技術者將瞭解，某些因素可能影響有效治療個體所需要之劑量及時機，包括(但不限於)疾病或病症之嚴重程度、先前治療、個體之一般健康狀況及/或年齡及存在之其他疾病。此外，用治療有效量之組合物治療個體可包括單次治療或一系列治療。本文所述化合物之有效劑量及活體內半衰期可使用習知方法或基於使用適當動物模型的活體內測試加以估計，如本文中別處所述。
為方便起見，下文提供本說明書、實例及隨附申請專利範圍中所用之一些術語及片語之含義。除非另外說明或上下文暗示，否則以下術語及片語包括下文所提供之含義。提供該等定義以有助於描述特定實施例，且不希望限制所主張之本發明，因為本發明之範疇僅由申請專利範圍限定。除非另外定義，否則本文中所用的所有技術及科學術語均具有與本發明所屬領域的技術人員通常所理解相同的含義。在此項技術中術語之用法與本文提供之其定義之間存在明顯不一致時，應以本說明書內提供之定義為準。
術語「減少(decrease)」、「降低(reduced)」、「降低(reduction)」或「抑制」在本文中皆用於意謂發生統計學顯著量之減少。在一些實施例中，「降低(reduce)」、「降低(reduction)」、「減少(decrease)」或「抑制(inhibit)」典型地意謂相較於參考水準(例如指定療法不存在的情況)減少至少10%，且可包括例如減少至少約10%、至少約20%、至少約25%、至少約30%、至少約35%、至少約40%、至少約45%、至少約50%、至少約55%、至少約60%、至少約65%、至少約70%、至少約75%、至少約80%、至少約85%、至少約90%、至少約95%、至少約98%、至少約99%或超過99%。如本文所用，「降低」或「抑制」不涵蓋相較於參考水準的完全抑制或降低。「完全抑制」為相較於參考水準的100%抑制。減少較佳可低至對於無指定病症之個體而言已接受為正常範圍內之水準。
術語「增加(increased)」、「增加(increase)」、「增強(enhance)」或「活化(activate)」在本文中皆用於意謂發生統計學顯著量之增加。在一些實施例中，術語「增加(increased)」、「增加(increase)」、「增強(enhance)」或「活化(activate)」可意謂相較於參考水準增加至少10%，例如相較於參考水準增加至少約20%，或至少約30%，或至少約40%，或至少約50%，或至少約60%，或至少約70%，或至少約 80%，或至少約90%，或至多且包括100%增加，或10-100%之間的任何增加，或相較於參考含量至少約2倍，或至少約3倍，或至少約4倍，或至少約5倍或至少約10倍增加，或2倍與10倍或大於10倍之間的任何增加。在標記或症狀之上下文中，「增加(increase)」為此水準之統計學顯著增加。
如本文所用，「個體」意謂人類或動物。動物為脊椎動物，諸如靈長類動物、嚙齒動物、馴養動物或比賽動物。靈長類動物包括黑猩猩、食蟹猴、蜘蛛猴及獼猴，例如恆河猴。嚙齒動物包括小鼠、大鼠、土撥鼠、雪貂、兔及倉鼠。馴養動物及比賽動物包括牛、馬、豬、鹿、野牛、水牛、貓種(例如馴養貓)、犬種(例如犬、狐狸、狼)、鳥種(例如雞、鴯鶓、鴕鳥)，及魚(例如鱒魚、鯰魚及鮭魚)。在一些實施例中，個體為哺乳動物，例如靈長類動物，例如人類。術語「個體(individual)」、「患者(patient)」及「個體(subject)」在本文中可互換使用。
個體較佳為哺乳動物。哺乳動物可為人類、非人類靈長類動物、小鼠、大鼠、犬、貓、馬或牛，但不限於此等實例。除人類之外的哺乳動物可有利地用作代表動物模型(例如癌症、自體免疫疾病及/或神經退化性疾病之動物模型)之個體。個體可為雄性或雌性。
個體可為先前已診斷患有或經鑑別罹患或患有需要治療之病狀或與此類病狀相關的一或多種併發症且視情況已針對該病狀或與該病狀相關的一或多種併發症經受治療的個體。或者，個體亦可為先前尚未診斷患有該病狀或與該病狀相關之一或多種併發症的個體。舉例而言，個體可為展現該病狀或與該病狀相關之一或多種併發症之一或多個風險因素的個體或未展現風險因素的個體。
「需要治療特定病狀之個體」可為患有該病狀、經診斷患有該病狀或處於發展該病狀之風險中的個體。
如本文所用，術語「蛋白質」及「多肽」在本文中可互換使用以表示一連串胺基酸殘基，其彼此間藉由相鄰殘基之α胺基與羧基之間的肽鍵連接。術語「蛋白質」及「多肽」係指胺基酸(包括經修飾之胺基酸(例如磷酸化、糖化、糖基化等)及胺基酸類似物)之聚合物，不論其尺寸或功能。「蛋白質」及「多肽」往往在提及相對較大的多肽時使用，而術語「肽」往往在提及較小的多肽時使用，但此等術語在此項技術中之用法重疊。當提及基因產物及其片段時，術語「蛋白質」及「多肽」在本文中可互換使用。因此，例示性多肽或蛋白質包括基因產物、天然存在之蛋白質、同源物、直系同源物、旁系同源物、片段及前述者之其他等效物、變異體、片段及類似物。
如本文所用，術語「核酸」或「核酸序列」係指併有核糖核酸、去氧核糖核酸或其類似物之單元的任何分子，較佳為聚合物分子。核酸可為單股或雙股核酸。單股核酸可為變性雙股DNA中之一個核酸股。或者，其可為非來源於任何雙股DNA之單股核酸。在一個態樣中，核酸可為DNA。在另一態樣中，核酸可為RNA。適合之核酸分子為DNA，包括基因組DNA或cDNA。其他適合之核酸分子為RNA，包括mRNA。
術語「表現」係指涉及產生RNA及蛋白質及適當時分泌蛋白質的細胞過程，適用時，包括(但不限於)例如轉錄、轉譯、摺疊、修飾及加工。術語「表現產物(expression product)」或「表現產物(expression products)」包括自基因轉錄的RNA，及藉由轉譯自基因轉錄之mRNA所得的多肽。在一些實施例中，表現產物係由不編碼多肽之序列(諸如微RNA或RNAi)轉錄。
如本文所用，術語「B細胞」係指在免疫反應中起作用且作為適應性免疫系統之組分的淋巴細胞。在本申請案中，表述「B細胞」及「B淋巴細胞」係指相同細胞。
不成熟B細胞係在大部分哺乳動物之骨髓中產生。在骨髓中達到IgM+不成熟期之後，此等不成熟B細胞遷移至淋巴器官中，其中其被稱為過渡期B細胞，其中一些隨後分化成成熟B淋巴細胞。B細胞發育存在若干個期，各期藉由抗體基因座之基因組含量的變化表徵。
每個B細胞在其表面上具有能夠結合至獨特抗原的獨特受體蛋白質(稱為B細胞受體(BCR))。BCR為膜結合免疫球蛋白，且此分子允許將B細胞與其他類型之淋巴細胞區分開來且在活體內B細胞活化中起主要作用。B細胞遇到其同源抗原且接收來自T輔助細胞之其他信號後，其可進一步分化成兩種B細胞類型(血漿B細胞及記憶B細胞)中之一者。B細胞可直接變成此等細胞類型中之一者或其可經歷中間分化步驟(生發中心反應)，在此期間B細胞使其免疫球蛋白基因之可變區發生超突變(「體細胞超突變」)且可能經歷類別轉換。
血漿B細胞(亦稱為漿細胞)為大B細胞，其已暴露於抗原且正產生及分泌大量抗體。此等細胞為短命細胞且通常在誘導免疫反應之藥劑清除時經歷細胞凋亡。記憶B細胞係由對在初始免疫反應期間所遇到之抗原具有特異性的活化B細胞形成。此等細胞能夠長期存活，且可在第二次暴露於相同抗原之後快速反應。
如本文所用，術語「血細胞」係指血液中所發現的細胞，例如紅血球、白血球、血小板、嗜中性球、嗜伊紅血球、嗜鹼性血球、淋巴細胞及/或單核細胞。
如本文所用，術語「治療(treat)」、「治療(treatment)」、「治療(treating)」或「改善(amelioration)」係指治療性治療，其中目標為逆轉、緩解、改善、抑制、減緩或中止與疾病或病症(例如癌症)相關之病狀的進展或嚴重程度。術語「治療」包括減少或緩解病狀、與病狀相關之疾病或病症之至少一種不良作用或症狀。若一或多種症狀或臨床標記減少，則治療通常為「有效的」。或者，若疾病之進展降低或 停止，則治療為「有效的」。亦即，「治療」不僅包括症狀或指標之改善，而且包括症狀之進展或惡化相較於缺乏治療之情況下的預期而言停止或至少減緩。有益或所要的臨床結果包括(但不限於)一或多種症狀的緩解、疾病程度的減輕、疾病狀態的穩定(亦即不惡化)、疾病進展的延遲或減緩、疾病病況的改善或緩和、緩解(不論部分或全部)，及/或死亡率降低，不論可偵測或不可偵測。術語疾病之「治療」亦包括使得疾病之症狀或副作用緩解(包括緩解性治療)。
如本文所用，術語「醫藥組合物」係指活性劑與醫藥學上可接受之載劑(例如醫藥工業中常用之載劑)的組合。片語「醫藥學上可接受」在本文中用於指在合理醫學判斷範疇內，適用於與人類及動物之組織接觸而無過度毒性、刺激、過敏反應或其他問題或併發症、與合理益處/風險比相稱的化合物、物質、組合物及/或劑型。
如本文所用，術語「投藥」係指藉由可將藥劑至少部分地遞送於所要位點處之方法或途徑將如本文所揭示之化合物置放於個體中。包含本文揭示之化合物的醫藥組合物可藉由對個體產生有效治療之任何適當途徑來投與。
術語「統計學顯著的」或「顯著的」係指統計學顯著性且通常意謂兩個標準差(2SD)或大於兩個標準差的差異。
除操作實例中或其中另有說明之外，本文中所使用之表示成分之量或反應條件的所有數字應瞭解在所有情況下由術語「約」修飾。術語「約」當結合百分比使用時可意謂±1%。
如本文所用，術語「包含(comprising)」或「包含(comprises)」係在提及組合物、方法及其相應組分時使用，該等相應組分對於該方法或組合物而言為必需的，而對於未指定的要素納入而言為開放的，不論其必需與否。
術語「組成為」係指如本文所述之組合物、方法及其相應組 分，其排除實施例之該描述中未列舉的任何要素。
如本文所用，術語「基本上組成為」係指指定實施例所需的彼等要素。術語允許實質上不影響實施例之基本及新穎或功能特徵之要素的存在。
除非上下文另外明確指示，否則單數術語「一(a)」、「一(an)」及「該(the)」包括複數個指示物。類似地，除非上下文另外明確指示，否則「或」一詞意欲包括「及」。儘管類似或等效於本文所述者之方法及材料可用於本發明的實施或測試，但下文描述適合之方法及材料。縮寫「例如(e.g.)」係衍生自拉丁語例如(exempli gratia)，且在本文中用以指示非限制性實例。因此，縮寫「例如(e.g.)」與術語「例如(for example)」同義。
如本文所用，術語「烷基」意謂具有碳原子鏈的直鏈或分支鏈飽和脂族基團。術語「烷基」包括環烷基或環狀烷基。典型地，使用Cx烷基及Cx-Cy烷基，其中X及Y指示鏈中之碳原子數目。舉例而言，C1-C6烷基包括具有1至6個碳之鏈的烷基(例如甲基、乙基、丙基、異丙基、丁基、第二丁基、異丁基、第三丁基、戊基、新戊基、己基及其類似烷基)。連同另一基團所示的烷基(例如芳基烷基)意謂具有指定數目個原子的直鏈或分支鏈飽和烷基二價基團，或當未指定原子時意謂一鍵，例如(C6-C10)芳基(C0-C3)烷基包括苯基、苯甲基、苯乙基、1-苯基乙基3-苯丙基，及其類似物。烷基主鏈視情況可插有一或多個雜原子，諸如N、O或S。烷基之實例包括(但不限於)甲基、乙基、丙基、異丙基、正丁基、第三丁基、新戊基、正己基及正辛基。
在較佳實施例中，直鏈或分支鏈烷基在其主鏈中具有30個或少於30個碳原子(例如直鏈為C1-C30，分支鏈為C3-C30)，且更佳為20或少於20個。同樣，較佳環烷基在其環結構中具有3-10個碳原子，且更佳地在環結構中具有5、6或7個碳。如整個說明書、實例及申請專利 範圍中所用之術語「烷基」(或「低碳烷基」)意欲包括「未經取代之烷基」與「經取代之烷基」，後者係指烴主鏈之一或多個碳上的一或多個氫經取代基置換的烷基部分。
除非碳數另有說明，否則如本文中所用的「低碳烷基」意謂如上文所定義、但在其主鏈結構中具有一至十個碳，更佳一至六個碳原子的烷基。同樣，「低碳烯基」及「低碳炔基」具有類似的鏈長度。在通篇申請案中，較佳烷基為低碳烷基。在較佳實施例中，本文中指定為烷基的取代基為低碳烷基。
經取代之烷基取代基可包括鹵素、羥基、硝基、硫醇、胺基、疊氮基、亞胺基、醯胺基、磷醯基(包括膦酸酯及亞膦酸酯)、磺醯基(包括硫酸酯、磺醯胺基、胺磺醯基及磺酸酯)，及矽烷基，以及醚、烷基硫基、羧基(包括酮、醛、羧酸酯及酯)、-CF3、-CN及其類似基團。
如本文所用，術語「烯基」係指具有至少一個碳-碳雙鍵的不飽和直鏈、分支鏈或環烴基團。典型地使用Cx烯基及Cx-Cy烯基，其中X及Y指示鏈中之碳原子數目。舉例而言，C2-C6烯基包括具有1個至6個碳之鏈及至少一個雙鍵的烯基，例如乙烯基、烯丙基、丙烯基、異丙烯基、1-丁烯基、2-丁烯基、3-丁烯基、2-甲基烯丙基、1-己烯基、2-己烯基、3-己烯基及其類似物)。與另一基團一起所示的烯基(例如芳基烯基)意謂具有指定原子數目的直鏈或分支鏈烯基二價基團。烯基主鏈可視情況插有一或多個雜原子，諸如N、O或S。
如本文所用，術語「炔基」係指具有至少一個碳-碳參鍵的不飽和烴基團。典型地使用Cx炔基及Cx-Cy炔基，其中X及Y指示鏈中之碳原子數目。舉例而言，C2-C6炔基包括具有1至6個碳之鏈及至少一個參鍵的炔基，例如乙炔基、1-丙炔基、2-丙炔基、1-丁炔基、異戊炔基、1,3-己二炔基、正己炔基、3-戊炔基、1-己-3-炔基及其類似基 團。與另一基團一起所示的炔基(例如芳基炔基)意謂具有指定原子數的直鏈或分支鏈炔基二價基團。炔基主鏈可視情況插有一或多個雜原子，諸如N、O或S。
如本文所用，術語「鹵素」或「鹵基」係指選自氟、氯、溴及碘之原子。術語「鹵素放射性同位素」或「鹵基同位素」係指選自氟、氯、溴及碘之原子的放射性核素。「經鹵素取代之部分」或「經鹵基取代之部分」，作為分離之基團或較大基團之一部分，意謂如本文所述之脂族、脂環族或芳族部分，其經一或多個「鹵基」原子取代，此術語如本申請案中所定義。舉例而言，經鹵基取代之烷基包括鹵烷基、二鹵烷基、三鹵烷基、全鹵烷基及其類似物(例如經鹵基取代之(C1-C3)烷基包括氯甲基、二氯甲基、二氟甲基、三氟甲基(-CF3)、2,2,2-三氟乙基、全氟乙基、2,2,2-三氟-1,1-二氯乙基及其類似物)。
術語「環基」或「環烷基」係指具有3至12個碳的飽和及部分不飽和環烴基團，例如3至8碳及例如3至6個碳。典型地使用Cx環烷基及Cx-Cy環烷基，其中X及Y指示環系統中之碳原子數目。環烷基另外可視情況經例如1、2、3或4個取代基取代。環基之實例包括(但不限於)環丙基、環丁基、環戊基、環戊烯基、環己基、環己烯基、2,5-環己二烯基、環庚基、環辛基、雙環[2.2.2]辛基、金剛烷-1-基、十氫萘基、側氧基環己基、二側氧基己基、硫基環己基、2-側氧基雙環[2.2.1]庚-1-基及其類似物。
術語「雜環基」係指具有1-3個雜原子(若為單環)、1-6個雜原子(若為雙環)或1-9個雜原子(若為三環)的非芳族5-8員單環、8-12員雙環或11-14員三環環系統，該等雜原子選自O、N或S(例如碳原子及1-3、1-6或1-9個N、O或S雜原子(若分別為單環、雙環或三環))。典型地使用Cx雜環基及Cx-Cy雜環基，其中X及Y指示環系統中之碳原子數 目。在一些實施例中，各環中之1、2或3個氫原子可經取代基取代。例示性雜環基包括(但不限於)哌嗪基、吡咯啶基、二噁烷基、嗎啉基、四氫呋喃基、哌啶基、4-嗎啉基、4-哌嗪基、吡咯啶基、全氫吡咯嗪基、1,4-二氮全氫化呯基、1,3-二噁烷基、1,4-二噁烷基及類似物。
術語「雙環」及「三環」係指藉由單鍵多環組合稠合、橋連或連接。如本文所用，術語「稠合環」係指一個環與另一個環鍵結而形成具有雙環結構的化合物，此時兩個環共有的環原子彼此直接結合。常見稠合環之非排他性實例包括十氫萘、萘、蒽、菲、吲哚、呋喃、苯并呋喃、喹啉及其類似物。具有稠合之環系統的化合物可為飽和、部分飽和的環基、雜環基、芳族烴、雜芳族烴及其類似物。
術語「芳基」係指單環、雙環或三環稠合芳族環系統。典型地使用Cx芳基及Cx-Cy芳基，其中X及Y指示環系統中之碳原子數目。例示性芳基包括(但不限於)吡啶基、嘧啶基、呋喃基、噻吩基、咪唑基、噻唑基、吡唑基、噠嗪基、吡嗪基、三嗪基、四唑基、吲哚基、苯甲基、苯基、萘基、蒽基、薁基、茀基、二氫茚基、茚基、萘基、苯基、四氫萘基、苯并咪唑基、苯并呋喃基、苯并硫呋喃基、苯并噻吩基、苯并噁唑基、苯并噁唑啉基、苯并噻唑基、苯并***基、苯并四唑基、苯并異噁唑基、苯并異噻唑基、苯并咪唑啉基、咔唑基、4aH咔唑基、咔啉基、烷基、烯基、啉基、十氫喹啉基、2H、6H-1,5,2-二噻嗪基、二氫呋喃并[2,3b]四氫呋喃、呋喃基、呋呫基、咪唑啶基、咪唑啉基、咪唑基、1H-吲唑基、吲哚烯基、吲哚啉基、吲哚嗪基、吲哚基、3H-吲哚基、靛紅醯基、異苯并呋喃基、異烷基、異吲唑基、異吲哚啉基、異吲哚基、異喹啉基、異噻唑基、異噁唑基、亞甲基二氧基苯基、嗎啉基、啶基、八氫異喹啉基、噁二唑基、1,2,3-噁二唑基、1,2,4-噁二唑基、1,2,5-噁二唑基、1,3,4-噁二唑 基、噁唑啶基、噁唑基、羥吲哚基、嘧啶基、啡啶基、啡啉基、啡嗪基、啡噻嗪基、啡噁噻基、啡噁嗪基、酞嗪基、哌嗪基、哌啶基、哌啶酮基、4-哌啶酮基、向日葵基、喋啶基、嘌呤基、哌喃基、吡嗪基、吡唑啶基、吡唑啉基、吡唑基、噠嗪基、吡啶并噁唑基、吡啶并咪唑基、吡啶并噻唑基、吡啶基(pyridinyl)、吡啶基(pyridyl)、嘧啶基、吡咯啶基、吡咯啉基、2H-吡咯基、吡咯基、喹唑啉基、喹啉基、4H-喹嗪基、喹喏啉基、啶基、四氫呋喃基、四氫異喹啉基、四氫喹啉基、四唑基、6H-1,2,5-噻二嗪基、1,2,3-噻二唑基、1,2,4-噻二唑基、1,2,5-噻二唑基、1,3,4-噻二唑基、噻嗯基、噻唑基、噻吩基、噻吩并噻唑基、噻吩并噁唑基、噻吩并咪唑基、噻吩基及二苯并哌喃基，及其類似基團。在一些實施例中，各環中之1、2、3或4個氫原子可經取代基取代。
術語「雜芳基」係指芳族5-8員單環、8-12員稠合雙環或11-14員稠合三環環系統，其具有1-3個雜原子(若為單環)、1-6個雜原子(若為雙環)或1-9個雜原子(若為三環)，該等雜原子選自O、N或S(例如碳原子及1-3個、1-6個或1-9個N、O或S雜原子(若分別為單環、雙環或三環))。典型地使用Cx雜芳基及Cx-Cy雜芳基，其中X及Y指示環系統中之碳原子數目。雜芳基包括(但不限於)衍生自以下之彼等物：苯并[b]呋喃、苯并[b]噻吩、苯并咪唑、咪唑并[4,5-c]吡啶、喹唑啉、噻吩并[2,3-c]吡啶、噻吩并[3,2-b]吡啶、噻吩并[2,3-b]吡啶、吲哚嗪、咪唑并[1,2a]吡啶、喹啉、異喹啉、酞嗪、喹喏啉、啶、喹嗪、吲哚、異吲哚、吲唑、吲哚啉、苯并噁唑、苯并吡唑、苯并噻唑、咪唑并[1,5-a]吡啶、吡唑并[1,5-a]吡啶、咪唑并[1,2-a]嘧啶、咪唑并[1,2-c]嘧啶、咪唑并[1,5-a]嘧啶、咪唑并[1,5-c]嘧啶、吡咯并[2,3-b]吡啶、吡咯并[2,3c]吡啶、吡咯并[3,2-c]吡啶、吡咯并[3,2-b]吡啶、吡咯并[2,3-d]嘧啶、吡咯并[3,2-d]嘧啶、吡咯并[2,3-b]吡嗪、吡唑并[1,5-a] 吡啶、吡咯并[1,2-b]噠嗪、吡咯并[1,2-c]嘧啶、吡咯并[1,2-a]嘧啶、吡咯并[1,2-a]吡嗪、疊氮基[1,5-a]吡啶、喋啶、嘌呤、咔唑、吖啶、啡嗪、啡噻嗪、啡噁嗪、1,2-二氫吡咯并[3,2,1-hi]吲哚、吲哚嗪、吡啶并[1,2-a]吲哚、2(1H)-吡啶酮、苯并咪唑基、苯并呋喃基、苯并硫呋喃基、苯并噻吩基、苯并噁唑基、苯并噁唑啉基、苯并噻唑基、苯并***基、苯并四唑基、苯并異噁唑基、苯并異噻唑基、苯并咪唑啉基、咔唑基、4aH-咔唑基、咔啉基、烷基、烯基、啉基、十氫喹啉基、2H,6H-1,5,2-二噻嗪基、二氫呋喃并[2,3-b]四氫呋喃、呋喃基、呋呫基、咪唑啶基、咪唑啉基、咪唑基、1H-吲唑基、吲哚烯基、吲哚啉基、吲哚嗪基、吲哚基、3H-吲哚基、靛紅醯基、異苯并呋喃基、異烷基、異吲唑基、異吲哚啉基、異吲哚基、異喹啉基、異噻唑基、異噁唑基、亞甲基二氧基苯基、嗎啉基、啶基、八氫異喹啉基、噁二唑基、1,2,3-噁二唑基、1,2,4-噁二唑基、1,2,5-噁二唑基、1,3,4-噁二唑基、噁唑啶基、噁唑基、氧雜環庚基、氧雜環丁基、羥吲哚基、嘧啶基、啡啶基、啡啉基、啡嗪基、啡噻嗪基、啡噁噻基、啡噁嗪基、酞嗪基、哌嗪基、哌啶基、哌啶酮基、4-哌啶酮基、向日葵基、喋啶基、嘌呤基、哌喃基、吡嗪基、吡唑啶基、吡唑啉基、吡唑基、噠嗪基、吡啶并噁唑基、吡啶并咪唑基、吡啶并噻唑基、吡啶基、吡啶基、嘧啶基、吡咯啶基、吡咯啉基、2H-吡咯基、吡咯基、喹唑啉基、喹啉基、4H-喹嗪基、喹喏啉基、啶基、四氫呋喃基、四氫異喹啉基、四氫哌喃基、四氫喹啉基、四唑基6H-1,2,5-噻二嗪基、1,2,3-噻二唑基、1,2,4-噻二唑基、1,2,5-噻二唑基、1,3,4-噻二唑基、噻嗯基、噻唑基、噻吩基、噻吩并噻唑基、噻吩并噁唑基、噻吩并咪唑基、噻吩基及二苯并哌喃基。一些例示性雜芳基包括(但不限於)吡啶基、呋喃基(furyl)或呋喃基(furanyl)、咪唑基、苯并咪唑基、嘧啶基、噻吩基(thiophenyl)或噻吩基(thienyl)、噠嗪基、吡嗪 基、喹啉基、吲哚基、噻唑基、啶基、2-胺基-4-側氧基-3,4-二氫喋啶-6-基、四氫異喹啉基及其類似基團。在一些實施例中，各環中之1、2、3或4個氫原子可經取代基取代。
如本文所用，術語「經取代」係指經取代之部分上之一或多個氫原子獨立地經取代基置換，該等取代基獨立地選自(但不限於)烷基、烯基、雜環烷基、烷氧基、芳氧基、羥基、胺基、醯胺基、烷基胺基、芳基胺基、氰基、鹵基、巰基、硝基、羰基、醯基、芳基及雜芳基。
如本文所用，術語「經取代」係指經取代之部分上的一或多個(典型地為1、2、3、4或5個)氫原子獨立地經獨立地選自下文在「取代基」之定義中所列之取代基群組之取代基置換，或以其他方式特定說明。一般而言，非氫取代基可為可與經特定說明經取代之指定部分之原子結合的任何取代基。取代基之實例包括(但不限於)醯基、醯胺基、醯氧基、醛、脂環、脂族、烷磺醯胺基、烷磺醯基、烷芳基、烯基、烷氧基、烷氧基羰基烷基、烷基胺基、烷基羰基、伸烷基、亞烷基、烷基硫基、炔基、醯胺、醯胺基、胺基、胺基、胺基烷基、芳烷基、芳烷基磺醯胺基、芳磺醯胺基、芳磺醯基、芳族、芳基、芳基胺基、芳基羰基、芳氧基、疊氮基、胺甲醯基、羰基、羧基(包括酮、羧基、羧酸酯、CF3、氰基(CN)、環烷基、伸環烷基、酯、醚、鹵烷基、鹵素、雜芳基、雜環基、羥基、羥基、羥基烷基、亞胺基、亞胺基酮、酮、巰基、硝基、氧雜烷基、側氧基、側氧基烷基、磷醯基(包括膦酸酯及亞膦酸酯)、矽烷基、磺醯胺基、磺醯基(包括硫酸酯、胺磺醯基及磺酸酯)、硫醇及脲基部分，其中之每一者亦可視情況經取代或未經取代。在一些情況下，兩個取代基與其所連接之碳一起可形成環。
芳基及雜芳基可視情況在一或多個位置經一或多個取代基取 代，例如鹵素、烷基、芳烷基、烯基、炔基、環烷基、羥基、胺基、硝基、硫氫基、亞胺基、醯胺基、磷酸酯、膦酸酯、亞膦酸酯、羰基、羧基、矽烷基、醚、烷硫基、磺醯基、酮、醛、酯、雜環基芳族或雜芳族部分、-CF3、-CN，或其類似基團。
如本文所用，術語「烷氧基」或「烷氧基」係指與氧基連接之如上文所定義之烷基。代表性烷氧基包括甲氧基、乙氧基、丙氧基、第三丁氧基、正丙氧基、異丙氧基、正丁氧基、異丁氧基及其類似基團。「醚」為兩種烴經氧共價連接。因此，使得烷基成為醚之烷基取代基為或類似於烷氧基，諸如可由-O-烷基、-O-烯基及-O-炔基中之一者所示者。芳氧基可由-O-芳基或O-雜芳基表示，其中芳基及雜芳基如下文所定義。烷氧基及芳氧基可如上文針對烷基所述經取代。
如本文所用，術語「芳烷基」係指經芳基(例如芳族或雜芳族基團)取代之烷基。
術語「烷硫基」係指與硫基連接之如上文所定義之烷基。在較佳實施例中，「烷硫基」部分係由-S-烷基、-S-烯基及-S-炔基中之一者表示。代表性烷硫基包括甲硫基、乙硫基及其類似基團。術語「烷硫基」亦涵蓋環烷基、烯烴及環烯基團，及炔烴基團。「芳硫基」係指芳基或雜芳基。
術語「亞碸基」意謂基團-SO-。應注意亞碸基可進一步經多種取代基取代以形成不同亞碸基，包括亞磺酸、亞磺醯胺、亞碸基酯、亞碸及其類似物。
術語「磺醯基」意謂基團-SO2-。應注意磺醯基可進一步經多種取代基取代以形成不同磺醯基，包括磺酸(-SO3H)、磺醯胺、磺酸酯、碸及其類似物。
術語「硫羰基」意謂基團-C(S)-。應注意，硫羰基可進一步經多種取代基取代以形成不同硫羰基，包括硫代酸、硫代醯胺、硫酯、硫 酮及其類似物。
如本文所用，術語「胺基」意謂-NH2。術語「烷基胺基」意謂具有至少一個直鏈或分支鏈不飽和脂族、環基或雜環基連接至氮的含氮部分。舉例而言，代表性胺基包括-NH2、-NHCH3、-N(CH3)2、-NH(C1-C10烷基)、-N(C1-C10烷基)2及其類似物。術語「烷基胺基」包括「烯基胺基」、「炔基胺基」、「環基胺基」及「雜環基胺基」。術語「芳基胺基」意謂具有至少一個芳基連接至氮的含氮部分。舉例而言，-NH芳基及-N(芳基)2。術語「雜芳基胺基」意謂具有至少一個雜芳基連接至氮的含氮部分。舉例而言，-NH雜芳基及-N(雜芳基)2。視情況而定，兩個取代基亦可與氮一起形成環。除非另外指明，否則含有胺基部分的本文所述化合物可包括其經保護的衍生物。適用於胺基部分之保護基團包括乙醯基、第三丁氧基羰基、苯甲氧羰基及其類似基團。
術語「胺基烷基」意謂如上文所定義之烷基、烯基及炔基，但其中一或多個經取代或未經取代之氮原子(-N-)安置於烷基、烯基或炔基之碳原子之間。舉例而言，(C2-C6)胺基烷基係指包含2至6個碳及一或多個安置於碳原子之間之氮原子的鏈。
術語「烷氧基烷氧基」意謂-O-(烷基)-O-(烷基)，諸如-OCH2CH2OCH3，及其類似基團。術語「烷氧基羰基」意謂-C(O)O-(烷基)，諸如-C(=O)OCH3、-C(=O)OCH2CH3，及其類似基團。術語「烷氧基烷基」意謂-(烷基)-O-(烷基)，諸如--CH2OCH3、-CH2OCH2CH3，及其類似基團。術語「芳氧基」意謂-O-(芳基)，諸如-O-苯基、-O-吡啶基，及其類似基團。術語「芳基烷基」意謂-(烷基)-(芳基)，諸如苯甲基(亦即-CH2苯基)、-CH2-吡啶基，及其類似基團。術語「芳基烷氧基」意謂-O-(烷基)-(芳基)，諸如-O-苯甲基、-O-CH2-吡啶基，及其類似基團。術語「環烷基氧基」意謂-O-(環烷 基)，諸如-O-環己基，及其類似基團。術語「環烷基烷氧基」意謂-O-(烷基)-(環烷基，諸如-OCH2環己基，及其類似基團。術語「胺基烷氧基」意謂-O-(烷基)-NH2，諸如-OCH2NH2、-OCH2CH2NH2，及其類似基團。術語「單-或二-烷基胺基」分別意謂-NH(烷基)或-N(烷基)(烷基)，諸如-NHCH3、-N(CH3)2及其類似基團。術語「單-或二-烷基胺基烷氧基」分別意謂-O-(烷基)-NH(烷基)或-O-(烷基)-N(烷基)(烷基)，諸如-OCH2NHCH3、-OCH2CH2N(CH3)2及其類似基團。術語「芳基胺基」意謂-NH(芳基)，諸如-NH-苯基、-NH-吡啶基及其類似基團。術語「芳基烷基胺基」意謂-NH-(烷基)-(芳基)，諸如-NH-苯甲基、-NHCH2-吡啶基及其類似物。術語「烷基胺基」意謂-NH(烷基)，諸如-NHCH3、-NHCH2CH3及其類似基團。術語「環烷胺基」意謂-NH-(環烷基)，諸如-NH-環己基及其類似物。術語「環烷基烷基胺基」-NH-(烷基)-(環烷基)，諸如-NHCH2-環己基及其類似基團。
就本文所提供之所有定義而言，應注意，在可包括超出說明之其他取代基的意義上，該等定義應解釋為開放端的。因此，C1烷基指示存在一個碳原子，但未指示碳原子上之取代基為何取代基。因此，C1烷基包含甲基(亦即-CH3)以及-CRaRbRc，其中Ra、Rb及Rc可各自獨立地為氫或任何其他取代基，其中碳上的α原子為雜原子或氰基。因此，CF3、CH2OH及CH2CN皆為C1烷基。
除非另有說明，否則本文所描繪的結構意欲包括不同之處僅為存在一或多個同位素增濃原子的化合物。舉例而言，除氫原子經氘或氚置換或碳原子經13C增濃或14C增濃碳置換之外，具有本發明結構的化合物均在本發明範疇內。
如本文所用，術語「異構體」係指具有相同分子式、但不同結構的化合物。僅組態及/或構形不同的異構體稱為「立體異構體」。術語「異構體」亦用於指對映異構體。
術語「對映異構體」用於描述彼此互為鏡像且不可重疊的分子異構體對中之一者。用於表示或關於對映異構體的其他術語包括「立體異構體」(因為圍繞對掌性中心的排列或立體化學結構不同；雖然所有對映異構體均為立體異構體，並非所有立體異構體均為對映異構體)或「光學異構體」(因為純對映異構體存在光學活性，其為不同純對映異構體使平面偏振光向不同方向旋轉的能力)。對映異構體通常具有相同的物理特性，諸如熔點及沸點，且亦具有相同的光譜學特性。對映異構體就其與平面偏振光的相互作用而言且就生物活性而言，彼此可為不同的。
術語「外消旋混合物」、「外消旋化合物」或「外消旋物」係指一種化合物之兩種對映異構體之混合物。理想的外消旋混合物為其中化合物之兩種對映異構體50：50混合的混合物，使得(+)對映異構體之旋光度抵消(-)對映異構體之旋光度。
術語「解析(resolving)」或「解析(resolution)」當在提及外消旋混合物使用時，係指外消旋物分離成其兩種非對映異構形式(亦即(+)及(-)；或(R)及(S)形式)。術語亦可指外消旋物中之一種異構體相對於產物的對映選擇性轉化。
術語「對映異構體過量」或「ee」係指反應產物，其中一種對映異構體的產生超過另一者，且針對(+)-對映異構體與(-)-對映異構體之混合物定義，其中組成係以莫耳或重量或體積分率F(+)及F(-)形式指定(其中F(+)與F(-)之總和=1)。對映異構體過量定義為*F(+)-F(-) *且對映異構體過量百分比為100x* F(+)-F(-) *。對映異構體之「純度」係利用其ee或ee百分比值(%ee)描述。
不論以「純化之對映異構體」或「純對映異構體」或「解析之對映異構體」或「對映異構體過量之化合物」表示，術語均意指一種對映異構體之量超過另一者之量。因此，當提及對映異構體製劑時， 主要對映異構體之百分比(例如以莫耳計或以重量計或以體積計)及(或)主要對映異構體之對映異構體過量百分比之兩者(或任一者)均可用於確定該製劑是否代表純化對映異構體製劑。
術語異構體之「對映異構純度」或「對映異構體純度」係指純化對映異構體之定性或定量度量；典型地，量測結果係基於ee或對映異構體過量來表示。
術語「實質上純化之對映異構體」、「實質上解析之對映異構體」、「實質上純化之對映異構體製劑」意指一種製劑(例如衍生自非光學活性起始物質、受質，或中間物)，其中一種對映異構體相對於另一者而言已增濃，且更佳地，其中另一種對映異構體在對映異構體或對映異構體製劑中佔小於20%、更佳小於10%且更佳小於5%，且再更佳地，小於2%。
術語「純化對映異構體」、「解析對映異構體」及「純化對映異構體製劑」意指一種製劑(例如衍生自非光學活性起始物質、受質或中間物)，其中一種對映異構體(例如R-對映異構體)相對於另一者而言增濃，且更佳地，其中另一種對映異構體(例如S-對映異構體)在製劑中佔小於30%，較佳小於20%，更佳小於10%(例如在此特定情況中，R-對映異構體實質上不含S-對映異構體)，且更佳小於5%且再更佳小於2%。純化對映異構體經合成可實質上不含另一種對映異構體，或純化對映異構體可以立體較佳化程序合成，隨後進行分離步驟，或純化對映異構體可衍生自外消旋混合物。
術語「對映選擇性」，亦稱為對映異構體比率(由符號「E」表示)，係指酶利用外消旋受質產生一種對映異構體(相對於產物外消旋混合物中的另一者)的選擇性能力；換言之，其為酶區分對映異構體之能力的度量。非選擇性反應的E為1，而E高於20的解析度通常視為適用於合成或解析。對映選擇性存在於所述對映異構體之間轉化率的 差異。獲得對映異構體中之一者增濃的反應產物；反之，剩餘受質中的另一種對映異構體增濃。為了實施目的，通常需要對映異構體中之一者以較大過量獲得。此藉由在特定轉化率時終止轉化過程來達成。
細胞生物學及分子生物學中常見術語之定義可見於「The Merck Manual of Diagnosis and Therapy」，第19版，Merck Research Laboratories出版，2006(ISBN 0-911910-19-0)；Robert S.Porter等人(編),The Encyclopedia of Molecular Biology,published by Blackwell Science Ltd.,1994(ISBN 0-632-02182-9)；Benjamin Lewin,Genes X,Jones & Bartlett Publishing出版，2009(ISBN-10：0763766321)；Kendrew等人(編),Molecular Biology and Biotechnology：a Comprehensive Desk Reference,VCH Publishers,Inc.出版，1995(ISBN 1-56081-569-8)及Current Protocols in Protein Sciences 2009,Wiley Intersciences,Coligan等人編。
除非另有說明，否則本發明係使用標準程序進行，如例如以下文獻中所述：Sambrook等人，Molecular Cloning：A Laboratory Manual(第4版),Cold Spring Harbor Laboratory Press,Cold Spring Harbor,N.Y.,USA(2012)；Davis等人，Basic Methods in Molecular Biology,Elsevier Science Publishing,Inc.,New York,USA(1995)；或Methods in Enzymology：Guide to Molecular Cloning Techniques第152卷，S.L.Berger及A.R.Kimmel編，Academic Press Inc.,San Diego,USA(1987)；Current Protocols in Protein Science(CPPS)(John E.Coligan等人編，John Wiley and Sons,Inc.),Current Protocols in Cell Biology(CPCB)(Juan S.Bonifacino等人編，John Wiley and Sons,Inc.)，及Culture of Animal Cells：A Manual of Basic Technique by R.Ian Freshney，出版商：Wiley-Liss；第5版(2005),Animal Cell Culture Methods(Methods in Cell Biology，第57卷，Jennie P.Mather及David Barnes編者，Academic Press，第1版，1998)，該等文獻皆以全文引用的方式併入本文中。
其他術語在本文中定義於本發明之各種態樣的描述中。
本申請案通篇所引述的所有專利及其他公開案，包括參考文獻、所頒予之專利、公開專利申請案及同在申請中之專利申請案，均以引用的方式明確併入本文中，目的在於描述及揭示例如此類公開案中所述之可聯合本文所述技術使用之方法。在本申請案之提申日期之前，此等公開案僅為了其揭示而提供。就此而言，不應理解為承認本發明人因先前發明或任何其他原因而無權先於此揭示案。關於日期之所有陳述或關於此等文獻之內容的表述係基於可供申請人使用的的資訊且不構成關於此等文獻之日期或內容之正確性的任何承認。
本發明之實施例描述不希望為詳盡的或將本發明限制於所揭示之確切形式。雖然本發明之特定實施例及實例在本文中為了說明性目的而描述，但熟習此項技術者將認識到，在本發明之範疇內可進行各種等效潤飾。舉例而言，雖然方法步驟或功能係以指定次序呈現，但替代實施例可以不同次序執行功能，或可實質上同時執行功能。本文所提供之本發明教示內容可在適當時應用於其他程序或方法。本文所述之各種實施例可加以組合以提供其他實施例。本發明之態樣在需要時可經潤飾以採用上述參考文獻及申請案之組合物、功能及構思，從而提供本發明之其他實施例。此外，由於生物學功能等效性考慮因素，因此可對蛋白質結構進行一些變化而不影響生物學或化學作用的種類或量。可根據實施方式來對本發明進行此等及其他變化。所有此類修飾均希望包括在隨附申請專利範圍之範疇內。
上述實施例中任一者的特定要素可加以組合或取代成其他實施例中之要素。另外，雖然與本發明之某些實施例相關之優點已在此等實施例之上下文中描述，但其他實施例亦可展現此類優點，且並非所 有實施例必定需要展現屬於本發明範疇內的此類優勢。
本文所述之技術藉由以下實例進一步說明，該等實例決不應理解為進一步限制。
本文所述技術之一些實施例可根據以下編號段落中的任一者來定義：
1.一種式I化合物，
其中：RA及RB為SO2N(R22)2，或RA及RB中之一者為SO3R23且另一者為氫或SO3R23，或RA及RB中之一者為SO3 -Y+且另一者為氫，或RA及RB中之一者為CO2 -Y+且另一者為氫或CO2 -Y+，或RA及RB中之一者為PO3 -(Y+)2且另一者為氫或PO3 -(Y+)2；R2、R3、R4、R5、R6、R7、R8及R9獨立地為氫、鹵素、CF3、CN、C(O)R21、CO2R21、CO2 -Y+、C(O)N(R22)2、OH、OR21、N(R12)2、N=C=S、NHC(O)R21、NHC(O)OR21、NHC(S)R21、NHC(S)N(R22)2、NHSO2R21、NHSO2N(R22)2、NO2、N2-R22、SOR21、SO2R21、SO3R21、SO3 -Y+、OP(O)(OH)2、視情況經取代之直鏈或分支鏈C1-C10烷基、視情況經取代之直鏈或分支鏈C2-C10烯基、視情況經取代之直鏈或分支鏈C2-C10炔基、視情況經取代之環基、視情況經取代之雜環基、視情況經取代之芳基或視情況經取代之雜芳基，其限制條件為R3與R8不相同； R21在每次出現時獨立地為氫、視情況經取代之直鏈或分支鏈C1-C10烷基、視情況經取代之直鏈或分支鏈C2-C10烯基、視情況經取代之直鏈或分支鏈C2-C10炔基、視情況經取代之環基、視情況經取代之雜環基、視情況經取代之芳基或視情況經取代之雜芳基；R22在每次出現時獨立地為氫、視情況經取代之直鏈或分支鏈C1-C10烷基、視情況經取代之直鏈或分支鏈C2-C10烯基、視情況經取代之直鏈或分支鏈C2-C10炔基、視情況經取代之環基、視情況經取代之雜環基、視情況經取代之芳基、視情況經取代之雜芳基或C(O)(CH2)nCH3，其中n=0、1、2、3、4、5或6；R23在每次出現時獨立地為視情況經取代之直鏈或分支鏈C1-C10烷基；Y+在每次出現時為陽離子；及其醫藥學上可接受之鹽。
2.如段落1之化合物，其中R3及R8獨立地選自由以下組成之群：氫、雜環基、OR21、NO2、N(R22)2、N=C=S、NHC(O)R21、NHSO2R21、N(R22)2、NHC(O)N(R22)2、NHC(S)N(R22)2及NHSO2N(R22)2，其中R21為H或C1-C4烷基且R22可為H或C1-C10烷基。
3.如段落1或2之化合物，其中R3及R8獨立地選自由以下組成之群：氫、OH、OCH3、N=C=S、NH2、NHCH3、NO2、NH-十八烷、NHC(O)CH3、NHC(O)CH(CH3)2、NHC(O)CH2OCH3、NHSO2CH3、NHSO2-環丙烷、NHSO2CH(CH3)2、NHSO2N(CH3)2、NHC(S)NHCH3、NHC(S)NHCH(CH3)2、NHC(S)NH-環丙烷、NHC(O)NHCH3、NHC(O)NHCH(CH3)2、苯并噁唑基，及NHC(O)NH-環丙烷。
4.如段落1至3中任一段之化合物，其中R3及R8中之一者為NHC(O)CH3且另一者為NHC(O)CH3或NHC(S)NHCH(CH3)2。
5.如段落1至4中任一段之化合物，其中R3與R8不同。
6.如段落1至5中任一段之化合物，其中R2、R4、R5、R6、R7及R9中的至少一者為氫。
7.如段落1至6中任一段之化合物，其中R2、R4、R5、R6、R7及R9均為氫。
8.如段落1至7中任一段之化合物，其中R22在每次出現時獨立地選自由以下組成之群：氫、甲基、乙基、丙基、異丙基、丁基、異丁基、戊基、第三丁基及環丙基；或兩個R22與其所連接之氮一起形成視情況經取代之3-8員雜環基。
9.如段落1至8中任一段之化合物，其中R23在每次出現時獨立地為甲基、乙基、丙基、異丙基、丁基、異丁基、戊基、第三丁基或環丙基。
10.如段落1至9中任一段之化合物，其中Y+在每次出現時獨立地選自由以下組成之群：鈉、鉀、鋁、鈣、鋰、鎂、鋇、鋅、銨、銨自由基及其任何組合。
11.如段落1至10中任一段之化合物，其中RA為SO3R23；RB為氫或SO3R23；且各R23獨立地為異丙基或第三丁基。
12.如段落1至11中任一段之化合物，其中RA為SO3R23；RB為氫或SO3R23；且R2、R4、R5、R6、R7及R9為氫。
13.如段落1至12中任一段之化合物，其中RA為SO3R23；RB為氫或SO3R23；各R23獨立地為異丙基或第三丁基；且R2、R4、R5、R6、R7及R9為氫。
14.如段落1至13中任一段之化合物，其中RA及RB中之一者為SO3 -Y+且另一者為氫；且R3及R8中之一者為NHC(O)CH3且另一者為NHC(S)NHCH(CH3)2。
15.如段落1至14中任一段之化合物，其中RA及RB中之一者為 SO3 -Y+且另一者為氫；且R2、R4、R5、R6、R7及R9為氫。
16.如段落1至15中任一段之化合物，其中RA及RB中之一者為SO3 -Y+且另一者為氫；R3及R8中之一者為NHC(O)CH3且另一者為NHC(S)NHCH(CH3)2；且R2、R4、R5、R6、R7及R9為氫。
17.如段落1至16中任一段之化合物，其中RA及RB中之一者為CO2 -Y+且另一者為氫或CO2 -Y+；且R3及R8中之一者為NHC(O)CH3且另一者為NHC(S)NHCH(CH3)2。
18.如段落1至17中任一段之化合物，其中RA及RB中之一者為CO2 -Y+且另一者為氫或CO2 -Y+；且R2、R4、R5、R6、R7及R9為氫。
19.如段落1至18中任一段之化合物，其中RA及RB中之一者為CO2 -Y+且另一者為氫或CO2 -Y+；R3及R8中之一者為NHC(O)CH3且另一者為NHC(S)NHCH(CH3)2；且R2、R4、R5、R6、R7及R9為氫。
20.如段落1至19中任一段之化合物，其中RA及RB中之一者為PO3 -Y+且另一者為氫或PO3 -Y+；且R3及R8中之一者為NHC(O)CH3且另一者為NHC(S)NHCH(CH3)2。
21.如段落1至20中任一段之化合物，其中RA及RB中之一者為PO3 -Y+且另一者為氫或PO3 -Y+；且R5、R4、R5、R6、R7及R9為氫。
22.如段落1至21中任一段之化合物，其中RA及RB中之一者為PO3 -Y+且另一者為氫或PO3 -Y+；R3及R8中之一者為NHC(O)CH3且另一者為NHC(S)NHCH(CH3)2；且R2、R4、R5、R6、R7及R9為氫。
23.如段落1至22中任一段之化合物，其中該化合物係選自由以下組成之群：
24.一種治療癌症、自體免疫疾病、免疫缺乏症或神經退化性疾病的方法，該方法包含向需要治療癌症、自體免疫疾病、免疫缺乏症或神經退化性疾病的個體投與治療有效劑量之如段落1至23中任一段之組合物。
25.如段落24之方法，其中相對於參考水準，個體經確定在一或多個細胞類型中發生的DNA損傷程度增加。
26.如段落24至25中任一段之方法，其中該個體經確定在選自由以下組成之群的細胞中發生的DNA損傷程度增加：癌細胞；免疫細胞；自體免疫細胞或神經系統細胞。
27.如段落24至26中任一段之方法，其中該DNA損傷係選自由以下組成之群：單股DNA斷裂、雙股DNA斷裂及DNA突變。
28.如段落24至27中任一段之方法，其中若個體經測定具有增加之DNA損傷過程或DNA編輯酶含量及/或活性，則確定該個體具有增加的DNA損傷程度。
29.如段落28之方法，其中該DNA編輯酶係選自由以下組成之群：活化誘導性胞苷脫胺酶(AID或AICDA)、APOBEC2、 APOBEC3A、APOBEC3C、APOBEC3D、APOBEC3F、APOBEC3G、APOBEC3H、APOBEC4、1型拓撲異構酶、2型拓撲異構酶、重組活化基因1(RAG1)，及重組活化基因2(RAG2)。
30.如段落24至29中任一段之方法，其中若個體已暴露於選自由以下組成之群的DNA損傷劑，則該個體經確定具有增加的DNA損傷程度：DNA整合病毒之病毒感染；暴露於DNA損傷化學品；暴露於化學治療劑；及暴露於離子化或紫外輻射。
31.如段落24至30中任一段之方法，其中該DNA損傷為雙股斷裂。
32.如段落24至31中任一段之方法，其中該DNA損傷酶為活化誘導性胞苷脫胺酶(AID)。
33.如段落24至32之方法，其中增加的AID含量為可偵測的AID含量。
34.如段落24至33中任一段之方法，其中增加的AID含量為AID含量在統計學上顯著高於未活化B細胞或來自健康個體之正常非免疫細胞中所表現之AID的含量。
35.如段落24至34中任一段之方法，其中該AID含量為血細胞或B細胞中的含量。
36.如段落24至35中任一段之方法，其中該癌症係選自由以下組成之群：淋巴瘤、白血病及漿細胞贅瘤。
37.如段落36之方法，其中該淋巴瘤係選自由以下組成之群：非霍奇金氏淋巴瘤；伯基特氏淋巴瘤、小淋巴細胞性淋巴瘤；淋巴漿細胞淋巴瘤；MALT淋巴瘤；濾泡性淋巴瘤；瀰漫性大B細胞淋巴瘤；及T細胞淋巴瘤。
38.如段落36之方法，其中該白血病係選自由以下組成之群：急性淋巴母細胞白血病(ALL)、伯基特氏白血病；B細胞白血病；B細胞急性淋巴母細胞白血病；慢性淋巴細胞性白血病(CLL)；急性骨髓性白血病(AML)；慢性骨髓性白血病(CML)；及T細胞急性淋巴母細胞白血病(T-ALL)。
39.如段落36之方法，其中該漿細胞贅瘤係選自由以下組成之群：多發性骨髓瘤；漿細胞骨髓瘤；漿細胞白血病；及漿細胞瘤。
40.如段落24至35中任一段之方法，其中該個體患有選自由以下組成之群的癌症：上皮細胞癌；結腸癌、肝癌、胃癌；腸癌；食道癌；乳癌；卵巢癌；頭頸癌；肺癌；及甲狀腺癌。
41.如段落24至35中任一段之方法，其中該自體免疫疾病係選自由以下組成之群：紅斑狼瘡；韋斯考特-奧德里奇症候群(Wiskott-Aldrich syndrome)；自體免疫淋巴增生症候群；重症肌無力；類風濕性關節炎(RA)；狼瘡腎炎；多發性硬化症；全身性紅斑狼瘡、盤狀狼瘡、亞急性皮膚紅斑狼瘡、包括凍瘡紅斑狼瘡之皮膚紅斑狼瘡、慢性關節炎、休格連氏症候群(Sjogren's syndrome)、發炎性慢性鼻竇炎、結腸炎、乳糜瀉、發炎性腸病、巴雷特氏食道、發炎性胃炎、自體免疫腎炎、自體免疫血管炎、自體免疫肝炎、自體免疫心臟炎、自體免疫腦炎、自體免疫糖尿病、自體免疫糖尿病腎炎及自體免疫介導性血液疾病。
42.如段落1至23中任一段之組合物，其用於治療個體之癌症、自體免疫疾病、免疫缺乏症或神經退化性疾病。
43.如段落42之組合物，其中相對於參考水準，個體經確定在 一或多個細胞類型中發生的DNA損傷程度增加。
44.如段落42至43中任一段之方法，其中該個體經確定在選自由以下組成之群的細胞中發生的DNA損傷程度增加：癌細胞；免疫細胞；自體免疫細胞或神經系統細胞。
45.如段落42至44中任一段之組合物，其中該DNA損傷係選自由以下組成之群：：單股DNA斷裂、雙股DNA斷裂及DNA突變。
46.如段落42至45中任一段之組合物，其中若個體經測定具有增加之DNA損傷過程或DNA編輯酶含量及/或活性，則確定該個體具有增加的DNA損傷程度。
47.如段落46之組合物，其中該DNA編輯酶係選自由以下組成之群：活化誘導性胞苷脫胺酶(AID或AICDA)、APOBEC2、APOBEC3A、APOBEC3C、APOBEC3D、APOBEC3F、APOBEC3G、APOBEC3H、APOBEC4、1型拓撲異構酶、2型拓撲異構酶、重組活化基因1(RAG1)，及重組活化基因2(RAG2)。
48.如段落42至47中任一段之組合物，其中若個體已暴露於選自由以下組成之群的DNA損傷劑，則該個體經確定具有增加的DNA損傷程度：DNA整合病毒之病毒感染；暴露於DNA損傷化學品；暴露於化學治療劑；及暴露於離子化或紫外輻射。
49.如段落42至48中任一段之組合物，其中該DNA損傷為雙股斷裂。
50.如段落42至49中任一段之組合物，其中該DNA損傷酶為活化誘導性胞苷脫胺酶(AID)。
51.如段落42至50中任一段之組合物，其中增加的AID含量為 可偵測的AID含量。
52.如段落42至41中任一段之組合物，其中增加的AID含量為AID含量在統計學上顯著高於未活化B細胞或來自健康個體之正常非免疫細胞中所表現之AID的含量。
53.如段落42至52中任一段之組合物，其中該AID含量為血細胞或B細胞中的含量。
54.如段落42至53中任一段之組合物，其中該癌症係選自由以下組成之群：淋巴瘤、白血病及漿細胞贅瘤。
55.如段落42至54中任一段之組合物，其中該淋巴瘤係選自由以下組成之群：非霍奇金氏淋巴瘤；伯基特氏淋巴瘤、小淋巴細胞性淋巴瘤；淋巴漿細胞淋巴瘤；MALT淋巴瘤；濾泡性淋巴瘤；瀰漫性大B細胞淋巴瘤；及T細胞淋巴瘤。
56.如段落42至54中任一段之組合物，其中該白血病係選自由以下組成之群：急性淋巴母細胞白血病(ALL)、伯基特氏白血病；B細胞白血病；B細胞急性淋巴母細胞白血病；慢性淋巴細胞性白血病(CLL)；急性骨髓性白血病(AML)；慢性骨髓性白血病(CML)；及T細胞急性淋巴母細胞白血病(T-ALL)。
57.如段落42至54中任一段之組合物，其中該漿細胞贅瘤係選自由以下組成之群：多發性骨髓瘤；漿細胞骨髓瘤；漿細胞白血病；及漿細胞瘤。
58.如段落42至54中任一段之組合物，其中該個體患有選自由以下組成之群的癌症：上皮細胞癌；結腸癌、肝癌、胃癌；腸癌；食道癌；乳癌；卵 巢癌；頭頸癌；肺癌；及甲狀腺癌。
59.如段落42至53中任一段之組合物，其中該自體免疫疾病係選自由以下組成之群：紅斑狼瘡；韋斯考特-奧德里奇症候群；自體免疫淋巴增生症候群；重症肌無力；類風濕性關節炎(RA)；狼瘡腎炎；多發性硬化症；全身性紅斑狼瘡、盤狀狼瘡、亞急性皮膚紅斑狼瘡、包括凍瘡紅斑狼瘡之皮膚紅斑狼瘡、慢性關節炎、休格連氏症候群、發炎性慢性鼻竇炎、結腸炎、乳糜瀉、發炎性腸病、巴雷特氏食道、發炎性胃炎、自體免疫腎炎、自體免疫血管炎、自體免疫肝炎、自體免疫心臟炎、自體免疫腦炎、自體免疫糖尿病、自體免疫糖尿病腎炎及自體免疫介導性血液疾病。
實例
實例1
合成C-1523之衍生物(C-1523-1(a、b、b-1、c、c-1、d、e、f、f-1_、C-1523-2、C-1523-3、C-1523-4、C-1523-5)(圖1)。DIDS((E)-4,9-二硫氰酸基-2,8-芪二磺酸)之異硫氰酸酯基團經修飾以產生C-1523((E)-5-乙醯胺基-2-(4-(3-異丙基硫脲基)-2-磺酸基苯乙烯基)苯磺酸酯。C-1523((E)-5-乙醯胺基-2-(4-(3-異丙基硫脲基)-2-磺酸基苯乙烯基)苯磺酸酯之磺酸基經衍生而產生C-1523-1A((E)-5-乙醯胺基-2-(4-(3-異丙基硫脲基)-2-)磺酸基苯乙烯基)苯磺醯胺(圖2)。
C-1523-1A在具有5%DMSO之PBS中調配且經由單次靜脈內注射(1毫克/公斤)或藉由經口管飼(2毫克/公斤)給予史泊格多利大鼠(Sprague Dawley rats)。對於靜脈內注射組而言，在t=15min、t=30min、t=1hr、t=2hr、t=4hr及t=8hr，且在t=1hr、t=2hr、t=3hr、t=4hr、t=5hr、t=6hr，藉由質譜量測血漿濃度。靜脈內注射之後的血漿半衰期為1.5hr；AUC=971hr*ng/ml；Vss=0.29L/kg，及Ct=17.7 ml/min/kg。經口可利用性為2-3%(圖3)。
DIDS、C-1523及C-1523-1a經口及靜脈內投與史泊格多利大鼠之後進行藥物動力學量測(圖4-6)且在以2、10或20毫克/公斤投與史泊格多利大鼠之後的t=15min、t=30min、t=1hr、t=2hr、t=8hr及t=24hr，測定C-1523-1a的血漿濃度(圖7)。
使表現AID之初級B細胞暴露於濃度為100飛莫耳濃度、1皮莫耳濃度、10皮莫耳濃度、100皮莫耳濃度、1奈莫耳濃度、100奈莫耳濃度、1微莫耳濃度及10微莫耳濃度(分別為10^-4、10^-3、10^-2、10^-1、10^0、10^1、10^2、10^3、10^4奈莫耳濃度)之C-1523-1a歷時4天且測定細胞活力(圖8)。在培養液中暴露於媒劑(PBS/5%DMSO)、100皮莫耳濃度或10奈莫耳濃度C-1523-1a歷時20天之後，亦測定人類CLL細胞株MEC1(處理前)及MEC2(復發)的細胞活力(圖8，右圖)。
使得自表現AID之小鼠的初級脾B細胞暴露於C-1523-1a及BTK抑制劑依魯替尼且與AID陰性小鼠的初級脾B細胞比較細胞活力(圖9)。C-1523-1a對於此細胞類型中的AID+細胞具有驚人的強效及選擇性。
測定C-1523(藍色)及C-1523-1a(紅色)對初級B細胞(AID+)的劑量反應(圖10)。C-1523高於100nM時顯示倒逆的劑量反應，而C-1523-1a低於10nM時顯示一致反應。
單次靜脈內投與1毫克/公斤至史泊格多利大鼠之後，亦測定C-1523-1a的尿分泌(圖11)。
實例2：RAD51防止表現AID之細胞中發生DNA損傷過載及有絲***災變
靶向的選擇性治療劑在最近的二十年中顯著改善癌症治療。腫瘤細胞選擇性療法係利用惡性細胞獨有而非惡性細胞不存在的生物學特徵。在本上下文中，活化誘導性胞苷脫胺酶(AID)(一種通常侷限於刺激性B淋巴細胞的DNA變位酶)異常表現於許多腫瘤類型中，包括一 系列B淋巴細胞性癌症。AID誤表現促進廣泛的DNA損傷、基因組不穩定性、腫瘤進展及治療抗性。用4,4'-二異硫氰基芪-2,2'-二磺酸(DIDS)抑制同源重組因子RAD51可減少AID誘導性基因組損傷之修復且可誘導B細胞死亡。本文中已證明C-1523(強效DIDS類似物)干擾RAD51之正常核質分佈且抑制姊妹染色單體交換。C-1523減弱重組修復可抑制AID起始性DNA斷裂之修復，導致惡性B淋巴細胞發生細胞致死性DNA損傷過載。出乎意料地，C-1523與AID之組合作用藉由p53依賴性有絲***災變而非典型的細胞凋亡來引起細胞死亡。因此，本文描述合成的致死療法，其中RAD51減弱與AID表現之組合效應可誘導腫瘤細胞發生選擇性自毀。此方法為表現AID之癌症的腫瘤細胞選擇性治療範例。
前言
治療誘導性副作用代表臨床腫瘤學中的重要挑戰。習知化學療法往往與一系列脫靶毒性相關，此等脫靶毒性可限制給藥及治療持續時間，漸漸損害患者順應性，且造成有害的長期效應，包括繼發性腫瘤發生(Cheson等人，1999；Molica,2005；Robak及Robak,2007)。分子靶向或腫瘤選擇性治療劑有望成為有效療法，同時減輕副作用及脫靶毒性。在最近的二十年中，分子遺傳學及基因組測序技術的進展已引起分子靶向小分子藥物(例如伊馬替尼)以及標靶特異性生物製劑(例如利妥昔單抗)之發展發生指數級的增強。本文描述利用惡性細胞中固有之誘導腫瘤細胞自毀之DNA損傷基因程式開發靶向腫瘤細胞的新穎方法。
活化誘導性脫胺酶(AICDA或AID)為DNA變位酶/重組酶，其通常僅表現於抗原刺激性生發中心B淋巴細胞中(Chaudhuri等人，2003；McBride等人，2006；Muramatsu等人，2000)。AID使免疫球蛋白基因座中之靶點處的去氧胞苷發生脫胺基，產生U：：G鹼基對錯配 (Chaudhuri等人，2003)。此等錯配鹼基可經校正以恢復原始C：：G鹼基對；可經誤修復，導致C>T轉換；或可最終裂解而產生DNA單股或雙股斷裂(分別為SSB及DSB)(Zan及Casali,2008)。AID起始性點突變驅動正常的B細胞體細胞超突變，而AID起始性DSB誘導免疫球蛋白類別轉換重組(Chaudhuri等人，2003；McBride等人，2006；Muramatsu等人，2000)。雖然免疫球蛋白基因為其已知的生理標靶，但AID亦可在整個基因組中的許多非Ig位置產生點突變及DSB(Hasham等人，2010；McBride等人，2006；Robbiani等人，2009；Staszewski等人，2011)。通常，此等「脫靶」點突變及DSB分別藉由錯配修復(MMR)及同源重組(HR)修復而得到有效修復(Chahwan等人，2012；Hasham等人，2012；Hasham等人，2010)。
雖然AID表現通常侷限於生發中心B細胞，但許多研究已顯示AID過度表現於淋巴細胞源與非淋巴細胞源之多種腫瘤中(Heintel等人，2004；Klemm等人，2009；Kou等人，2007；Palacios等人，2010；Pasqualucci等人，2008；Shinmura等人，2011)。AID組成性表現於大於40%的人類初級慢性淋巴細胞性白血病(CLL)個案中(Lamont等人，2013)。在淋巴細胞性急變CML中，AID表現導致基因組不穩定性、DNA修復基因高突變，及由於BCR-ABL點突變而獲得伊馬替尼抗性(Klemm等人，2009；Liu等人，2011)。在初級CLL中，AID過度表現與診斷時的較早年齡及需要治療的可能性增加相關(Palacios等人，2010)。雖然AID在惡性細胞中之過度表現的確切功能後果在大多數情況下未瞭解，但AID突變活性似乎被所轉型細胞吸收，導致突變率及基因組不穩定性增加(Klemm等人，2009；Kou等人，2007；Okazaki等人，2003；Palacios等人，2010；Shimizu等人，2012)。
DSB修復之同源重組(HR)路徑對於表現AID之B淋巴細胞的存活率而言為關鍵的(Caddle等人，2008；Hasham等人，2012；Hasham等人， 2010)。HR通常視為高保真度DSB修復機制，促進之DNA斷裂依照未受損姊妹染色單體模板修復且在DNA複製叉塌陷、阻塞或退化之後介導DNA複製叉再起始。RAD51蛋白質為核心HR因子，其為經由核蛋白纖絲形成、同源性搜尋及DNA股交換來起始HR反應所必需的(Daboussi等人，2002；Shinohara等人，1992；Sung及Robberson,1995)。RAD51與RAD51蛋白質亞群及多種其他輔助因子一起參與多種蛋白質亞複合物。已知存在五(5)種RAD51旁系同源物：RAD51B、RAD51C、RAD51D、XRCC2及XRCC3(Kawabata等人，2005；Suwaki等人，2011；Thacker,2005)。藉由阻斷XRCC2之shRNA基因表現來部分地減弱HR足以使初級B淋巴細胞與經轉型之B淋巴細胞對AID介導性DNA損傷過載敏感(Hasham等人，2010)。使用小分子RAD51抑制劑4,4'-二異硫氰基芪-2,2'-二磺酸(DIDS)獲得類似結果(Lamont等人，2013)。
本文描述開發DIDS之強效且高度選擇性類似物(E)-5-乙醯胺基-2-(4-(3-異丙基硫脲基)-2磺酸基苯乙烯基)苯磺酸酯(C-1523)。C-1523藉由在誘導DNA損傷之後改變RAD51之核質分佈來抑制HR。C-1523暴露使AID誘導性DNA雙股斷裂之修復減少，從而對正常B淋巴細胞與惡性B淋巴細胞均產生AID依賴性細胞毒性。出乎意料地，本文中已證明，C-1523與AID活性之組合所誘導的細胞死亡為p53依賴性有絲***災變，而非典型的細胞凋亡。此等結果表明，在遺傳程式化DNA損傷(諸如AID活性引起的並行基因組損傷)程度較高之細胞中，DNA修復抑制誘導之協同細胞毒性為腫瘤細胞選擇性治療的新穎方法。
結果
C-1523，RAD51介導性HR之一種新穎強效抑制劑。暴露於RAD51抑制劑DIDS藉由減少AID起始性DSB之HR修復來誘導初級B淋 巴細胞發生細胞死亡，導致DSB積累及DNA損傷過載(Ishida等人，2009；Lamont等人，2013)。此表示RAD51為可行的治療標靶，至少在過度表現AID之腫瘤中。為了更直接地測試RAD51之藥理學抑制是否可代表可能的治療方法，開發出C-1523(DIDS之更強效類似物)。產生105 DIDS衍生物之文庫，其聚焦於(1)2-及2'-磺酸酯及4-及4'-異硫氰酸酯基團之官能基取代；(2)使連接苯環之中心雙鍵還原；及(3)改變分子之對稱性，同時保留核心雙苯環結構(圖12A)。
使用96孔比色活力分析(MultiTox-Fluor多工細胞毒性分析)測試67/105 DIDS類似物對表現AID之小鼠B淋巴細胞相對於AID基因剔除小鼠B淋巴細胞之增殖及活力的影響(圖12B)。所有化合物在10μM下測試，且對表現AID之B細胞、而非對AID缺乏性B細胞具有選擇性細胞毒性的彼等物評價為成功(圖12B，圖12D)。保留連接雙鍵及磺酸酯、但在4位置及4'位置含有不對稱取代基的化合物對表現AID之B細胞具有強細胞毒性，同時在相同條件下對AID-/- B細胞顯示的影響最小(圖12B、圖12D)。相比之下，其中磺酸酯經質子置換且在4及4'位置經基團對稱地取代之化合物產生相反效應，優先誘導AID-/-細胞死亡，或促進AID+/+細胞增殖。
建立生物活性分析，其量測AID陽性細胞相對於AID陰性細胞在化合物處理之後的活力比率。所有經篩選之化合物接著根據其AID+：AID-活性分數評級。根據此分析，化合物(E)-5-乙醯胺基-2-(4-(3-異丙基硫脲基)-2-磺酸基苯乙烯基)苯磺酸酯(C-1523，圖12C)對AID+細胞顯示的作用相應的AID細胞大約6倍，指示對表現AID之細胞具有強選擇性(圖12B，圖12D)。劑量反應資料顯示C-1523比DIDS強效至少1500倍，在100nM下誘發AID特異性細胞毒性(相對於DIDS之150μM)(圖12B)。C-1523為所測試之最強效DIDS，且基於此等結果，進行進一步評價及機理性測試。
C-1523干擾RAD51核質分佈及損傷誘導性再局域化。為了評估C-1523之DNA修復抑制活性，量測在C-1523存在或不存在的情況下對小鼠白血病細胞株CH12-F3的輻射敏感性。在媒劑、50nM、100nM或150nM C-1523存在下培養細胞，且給予0或2.5 Gy離子化輻照。在C-1523(或媒劑對照物)存在下回收培養物中的細胞且定量活細胞。C-1523處理在所測試的每種濃度下對離子化輻照產生敏感性，支持C-1523之DNA修復抑制活性(圖13A)。
接著測試C-1523是否會影響RAD51局域化或DNA損傷誘導性焦點形成。用100nM C-1523(或媒劑對照物)處理初級小鼠B細胞且給予0或2.5 Gy離子化輻照。在細胞培養物中回收之後，固定細胞且染色用於免疫螢光成像以量測RAD51之亞細胞局域化。此分析顯示C-1523處理完全阻斷IR誘導性RAD51再局域化及焦點形成(圖13B，圖13C)。經處理之細胞展現IR誘導性RAD51焦點形成減少>6倍，顯示含量與未處理、未輻照之細胞不可區分(圖13C)。為了證實C-1523對RAD51亞細胞局域化的影響，C-1523處理之後，藉由細胞分級分離及西方墨點法獨立地量測核質分佈(圖13D；增圖2)。輻照之後，C-1523處理使得局域化至核之RAD51的分率發生較小、但可量測的降低。對於亞細胞局域化的此影響為RAD51所特有的，因為在細胞刺激之後經歷核易位及歸巢至基因組靶點之NF-kB之局域化不受C-1523暴露的影響(圖13E-圖13F)。
C-1523抑制姊妹染色單體交換。資料表明C-1523藉由減少RAD51再局域化來抑制HR介導性DSB修復。為了直接量測C-1523對RAD51介導性同源重組的影響，吾人量測姊妹染色單體交換及核酸內切酶所產生之DSB之HR修復。姊妹染色單體交換(SCE)為複製性細胞或後複製性細胞中之所複製姊妹染色分體之間的RAD51介導性同源重組事件，且反映複製相關性DNA損傷之修復。藉由BrdU合併進行差 異性染色單體標記(Latt及Schreck,1980)之後，可量測SCE。已知SCE在HEK293T細胞中以高速率發生，其中每個染色體自發地發生約0.25個交換事件(圖14A、圖14C)(Londono-Vallejo等人，2004)。用100nM C-1523處理之後，每個染色體中之中值SCE事件數目相對於僅經DMSO媒劑處理之細胞而言顯著地降低(圖14B、圖14C)。
為了評估C-1523抑制RAD51介導非複製DNA斷裂修復的能力，使用DR-GFP報導子分析量測核酸內切酶所產生之DSB在小鼠與人類細胞中之HR修復(Moynahan等人，2001；Nakanishi等人，2005)。相較於經DMSO處理之細胞，在經100nM C-1523處理之mES細胞中，GFP陽性細胞的百分比降低約40%(圖14D)。然而，在100nM或1μM C-1523存在下，在經C-1523處理之人類U2OS細胞中，觀測到GFP陽性細胞未發生顯著變化(圖14E)。此等結果表明C-1523部分地減弱、但未完全消除核酸內切酶所誘導之直接DSB之HR介導性修復。
C-1523誘導AID依賴性細胞毒性。基於DIDS結果，預計C-1523對HR的抑制會引起AID介導性細胞毒性(Lamont等人，2013)。為了對此進行測試，自WT或AID-/-小鼠獲得初級脾B細胞且利用或不利用αCD40+IL-4活化、在媒劑或C-1523存在下、在50-250nM範圍內之濃度下培養四天。在所測試的所有濃度下，C-1523在表現AID之WT培養物中選擇性地抑制細胞擴增(圖15A)。相比之下，在C-1523暴露存在或不存在的情況下，αCD40+IL-4活化的AID-/- B細胞，相同地擴增至經媒劑處理之對照組。為了確定AID與C-1523組合所誘發的細胞培養物生長抑制是否與細胞生長抑制或細胞毒性相關，藉由對經碘化丙錠(PI)染色之培養物進行流式細胞學分析來量測細胞活力。在表現AID之WT細胞培養物中，而非在相應AID-/-培養物中，C-1523使得PI+細胞顯著增加(圖15B)。此等發現獨立地藉由經活體染料染色之後的人工細胞計數(資料未顯示)來確認。總體而言，此等資料證明 RAD51介導性HR之抑制使B細胞對AID誘導性細胞毒性顯著地敏感。
進一步測試C-1523對表現AID之人類B細胞腫瘤細胞株之活力的影響(圖15C)。CCRF-SB為衍生自白血球層製劑的急性淋巴母細胞白血病細胞株(Foley等人，1968)。MEC-1及MEC-2為在兩個不同時間點(在氟達拉賓(fludarabine)及利妥昔單抗(rituximab)治療之前及之後)來源於慢性淋巴細胞性白血病患者的細胞株(Stacchini等人，1999)。在對數增量之1至1000nM之劑量範圍內，針對此等細胞株測試C-1523，且與150μM DIDS相比較。CCRF-SB及MEC-1細胞證明C-1523在所測試之範圍內存在劑量依賴性活力反應，而MEC-2細胞在所有測試劑量下均具敏感性(圖15D)。CCRF-SB及MEC-1細胞在100nM C-1523存在下的活力降幅最大，此類似於在經DIDS處理之細胞中所觀測之活力降幅。有趣的是，在所測試之C-1523的最高劑量(1000nM)下，CCRF-SB及MEC-1細胞的活力降幅小於在100nM處理之後所觀測者(圖15D)。在此相同劑量範圍內，亦觀測到小鼠初級B細胞存在此兩階段反應(增圖3)。小分子之兩階段或興奮效應反應可反映多種生物化學/生物學機制(Calabrese,2013)。
為了確定C-1523對表現AID之細胞的細胞毒性作用是否與DNA損傷過載相關，藉由H2AX免疫染色量測未修復AID起始之DSB在活化的小鼠B淋巴細胞中的積累(圖15E、圖15F)。分離出初級WT或AID-/-小鼠脾B細胞，用媒劑或100nM C-1523培養，且用αCD40及IL-4活化。C-1523處理引起H2AX病灶在表現AID之WT細胞中、而非在相應AID-/-細胞中積累(圖15E、圖15F)。在正常的未處理條件下，AID活性使得每個細胞中之H2AX病灶數目較低(1-2個)，但額外的H2AX病灶(>2)為罕見的(Hasham等人，2010；Lamont等人，2013)。用100nM C-1523處理之後，僅在表現AID之活化B細胞中觀測到具有額外病灶(每個細胞中3-10個)之細胞分率顯著增加(圖15F)。總體而言，此等資 料證明C-1523為RAD51介導性DSB修復之強效抑制劑，其抑制IR-誘導性DSB與生理學相關AID起始性DSB之解析。
C-1523介導的細胞死亡具有p53依賴性。假設C-1523誘導的AID依賴性細胞毒性與p53介導性細胞凋亡有關。為了測試p53(針對DNA損傷之細胞反應的中心調節因子)之重要性，暴露於C-1523之後，量測得自Trp53+/+相對於Trp53-/-小鼠之小鼠初級B細胞的活力。如所預計，C-1523誘導的細胞死亡均具AID與Trp53依賴性。用100nM C-1523處理之後，Trp53-/-小鼠的B細胞培養物在4天活化過程中未顯示活力降低或細胞增加(圖16A、圖16B)。量測經C-1523處理之B細胞中的卡斯蛋白酶3活化(細胞凋亡性細胞死亡之標記)。B細胞用識別經裂解、活化之卡斯蛋白酶-3(AC3)的抗體染色且經由免疫螢光顯微鏡量測AC3陽性細胞的數目。10 Gy離子化輻照之後，Trp53+/+(WT)、而非Trp53-/-培養物顯示AC3+細胞百分比增加>30倍，證實此等細胞在DNA損傷之後發生Trp53依賴性細胞凋亡。相比之下，C-1523處理未顯著誘導WT、AID-/-或Trp53-/- B細胞發生卡斯蛋白酶3活化(圖16C)。為了更完全地排除細胞凋亡作為B細胞在C-1523處理之後的細胞死亡模式，經由西方墨點法檢查細胞凋亡誘導之其他常見標記的表現。用αCD40及IL-4活化及用媒劑或C-1523處理之後的第2天，未觀測到PARP-1或卡斯蛋白酶-9發生裂解(資料未顯示)。第3天，所裂解之PARP-1及卡斯蛋白酶-9的含量明顯降低，然而其存在於所有基因型及所有處理中，表明此歸因於細胞凋亡誘導之背景水準，而非特定地歸因於C-1523處理(資料未顯示)。此等資料與圖17C中之卡斯蛋白酶-3資料組合證明，表現AID之細胞回應於C-1523處理的細胞死亡並非經由細胞凋亡機制發生。此等意外結果表明，AID誘導之針對經C-1523處理之B細胞的細胞毒性與典型的p53依賴性細胞凋亡並非強烈相關。
C-1523經由非細胞凋亡性有絲***災變來誘導非細胞凋亡性細胞死亡。C-1523誘導之細胞凋亡性細胞死亡的意外缺乏有利於吾人評價基因表現標記以鑑別其他潛在的細胞死亡路徑。為了量測基因表現概況，對活化的初級WT相對於經細胞激素、經100nM C-1523或媒劑處理之AID-/-細胞進行RNASeq分析(圖17A-圖17D)。最顯著變化路徑中的獨創性路徑分析(Ingenuity Pathways Analysis，IPA)不能鑑別任何先前註釋的細胞死亡路徑。五種最不相同之表現路徑中的四種(經C-1523處理之細胞相對於經媒劑處理之細胞)涉及細胞代謝(麩胱甘肽氧化還原，TCA週期)及洛奇信號傳導(圖17B-17E)，總體而言，此為與有絲***災變引起之細胞死亡有關之路徑(Curry等人，2007；Hung等人，2013)。
結合細胞凋亡路徑之缺乏，此觀測結果引起對有絲***災變的研究，一種細胞死亡機制，已愈來愈認識到其為與DNA損傷過載相關的細胞凋亡非依賴性替代細胞死亡路徑(Roninson等人，2001a；Roninson等人，2001b)。異常、無效或失敗的有絲***往往產生微核(較小的殘餘核材料)，其由於著絲點所致的染色體收縮失敗或細胞***失敗而與核主體分離(Roninson等人，2001a)。(Curry等人，2007；Hung等人，2013)。經環磷醯胺(氮芥DNA烷基化劑)處理之所有測試基因型的小鼠初級B細胞(WT、AID-/-，及p53-/-)在3天之後展現約9%微核(圖18A、圖18B)。在經100nM C-1523處理之WT細胞中，相較於DMSO，觀測到微核增加9倍，而AID-/-或p53-/-細胞中之微核分率經觀測未增加(圖7B)。用100nM C-1523處理3天之後，亦觀測到MEC-1細胞中之微核誘導(圖7C)，其中經處理之細胞中的微核比接受媒劑之細胞中的微核多約3.5倍。MEC-1細胞中之此微核含量低於小鼠初級細胞可能反映種間差異，或初級細胞與永生化細胞株之間的差異，因為即使在環磷醯胺處理之後，MEC-1細胞仍具有與初級細胞同樣多之 微核的約一半。
論述
本文中已證明，同源重組(HR)之抑制為使表現AID之細胞對DNA損傷過載敏感的有效方式。此外，已證明AID誘導性DNA損傷引起AID活化性B淋巴細胞發生p53依賴性細胞死亡。出人意料的是，AID誘導B細胞發生的細胞毒性為非細胞凋亡，且經由有絲***災變發生，此可能歸因於與DNA損傷之重組修復減弱相關的複製壓力。
RAD51依賴性同源重組為大部分哺乳動物細胞之增殖、DNA雙股斷裂修復及細胞存活所必需的基本路徑。在增殖性組織中，需要RAD51重組活性以再起始已停止或塌陷的DNA複製叉。除其複製相關作用之外，RAD51依賴性重組對於複製或複製後細胞中之DNA雙股斷裂(DSB)之同源性介導、高保真度修復具有重要作用。遺傳毒性損傷程度在生理學上正常的細胞具有分佈於核與細胞質之間的RAD51蛋白質，而DNA損傷或複製壓力程度高的細胞使細胞質RAD51再局域化至核中，在核中其聚集於作用位點。在本上下文中，靶向RAD51再局域化(抑制其輔助活性，而非其基線活性)為針對與過度遺傳毒性壓力相關之癌症之腫瘤細胞選擇性療法的誘人方法。本文中已證明C-1523干擾正常的RAD51核質分佈，抑制DNA損傷誘導性再局域化，且使細胞對AID活性顯著敏感。藉由C-1523減弱RAD51介導性HR特異地且選擇性地引起表現AID之細胞(包括過度表現AID之活化B淋巴細胞及惡性B細胞)中發生DNA損傷過載。因此，本文中描述一種可選擇性地使表現AID之腫瘤細胞敏感、同時不傷害大部分正常組織的治療方法。有趣的是，C-1523對表現AID之細胞誘導的細胞毒性係由於有絲***災變，而非細胞凋亡，表明此治療方法可適用於細胞凋亡功能降低的一些癌症。
DNA損傷治療劑所誘導的DNA損傷過載已成為數十年癌症療法 的主要且通用原則(Harper及Elledge,2007)。習知的抗贅生性療法(核苷類似物、抗複製藥劑及細胞毒性藥物)可高度有效地摧毀腫瘤細胞，但對於惡性細胞的選擇性不良。因此，抗贅生藥與一系列劑量限制毒性相關且可引起顯著的長期副作用，包括誘導性繼發腫瘤，其對生活品質產生不利影響，即使對於長期緩解中之患者亦如此。因此，腫瘤藥物開發的一個重要目標為鑑別對於腫瘤具有選擇性、減少有害副作用的治療策略。基於抑制BRCA1或BRCA22種突變型癌症中之聚ADP-核糖聚合酶(PARP)的合成致死性療法例示了利用轉型細胞中固有之基因弱點的選擇性治療方法(Boss等人，2010)。BRCA1或BRCA2中之突變降低了DNA DSB修復效率，導致細胞存活對SSB斷裂修復產生急切的依賴性。PARP抑制劑(諸如奧拉帕尼(olaparib))治療可抑制單股斷裂(SSB)之修復，導致DSB修復功能減弱之細胞的增殖能力及細胞毒性發生特異性的降低。缺乏BRCA1或BRCA2突變的非轉型組織由於完整的DSB修復而對PARP抑制具有明顯更強的抗性。合成致死性可視為「雙叉」機制，其基於DNA損傷修復路徑之單獨臂之廢除，導致DNA損傷過載及腫瘤選擇性細胞死亡之告終。
本文所述之結果係關於一種類似方法，其稱為協同毒性，藉此將單一DNA損傷修復路徑(在此情況下為HR)之抑制與遺傳漸進式過量的DNA損傷相關聯。此方法導致DNA損傷與修復之間產生不能忍受的不平衡，產生DNA損傷過載且同樣起始腫瘤選擇性細胞死亡。儘管基於PARP抑制的合成致死性使兩個臂的DNA損傷修復同時降低，導致容易自發地發生DNA損傷，合成致死性依賴於單一路徑抑制且利用存在於一些腫瘤類型中的升高之DNA損傷活性。如同合成致死性，協同毒性由於遺傳漸進式DNA損傷侷限於惡性細胞而具有最小化脫靶副作用的潛力。
腫瘤演變代表了現代臨床腫瘤學中的重大挑戰，其導致腫瘤進 展及獲得治療抗性。腫瘤演變定義為暴露於各種選擇性壓力(包括輻射療法或化學療法)之後，具有獨特基因變化之新腫瘤細胞純系之適應性過度生長。基因組不穩定性加快腫瘤演變，體現為增加突變速率，且因此增加具有關鍵選擇性優勢之新腫瘤細胞變異體的出現。根除具有基因組不穩定性之細胞的干預可潛在地減緩腫瘤演變。靶向構成腫瘤演變之機制可以單一療法形式或與其他療法組合進行，從而可增強習知療法之功效或持久性。HR抑制與AID誘導性基因組損傷聯合可視為靶向腫瘤演變的療法，因為AID已顯示可產生允許突變且驅動腫瘤進展的容許性基因組修飾(Nagaoka等人，2010；Okazaki等人，2003)。
總之，本文中證明HR抑制為使得表現AID之細胞對DNA損傷過載敏感的有效方式。所誘導的細胞死亡係依賴於p53，但經由非細胞凋亡的有絲***災變機制來進展。具有長期持久抗贅生性作用、無有害副作用的靶向療法為腫瘤學界當前指定療法，且本文所述之協同毒性策略例示了該目標。
材料及方法
依活力篩選DIDS修飾之化學文庫。根據製造商說明書(Promega,Madison,WI)進行MultiTox-Fluor多工細胞毒性分析。
小鼠。Aicda-/-(AID-/-)及C57BL6/J(WT；AID+/+)小鼠在加壓、個別經通風之籠中維持且餵養標準實驗室膳食；如別處所述進行群落維持(Muramatsu等人，2000)。AID-/-品系如Muramatsu等人(Muramatsu等人，2000)所報導衍生且與C57BL6/J回交>20代。
細胞株及細胞培養物。獲得CH12-F3且如別處所述培養(Lamont等人，2013)。CCRF SB(ATCC® CCL-120TM)及HEK293T細胞購自美國菌種保藏中心(American Type Culture Collection)。MEC-1及MEC-2細胞購自Leibniz Institute，DSMZ德國微生物及細胞培養物保藏中心 (DSMZ,Germany)。所有細胞株均根據製造商建議培養。如先前所述進行小鼠初級脾B細胞之分離、培養及誘導類別轉換(Hasham等人，2010；Lamont等人，2013)。經由0.2%錐蟲藍(Lonza)染色及經由血球計對排除染料(活)及吸收染料(死)之細胞進行計數來測定細胞活力。免疫螢光。使細胞附著至經聚-L-賴胺酸塗覆之蓋玻片，接著用3%NBF、2%蔗糖PBS溶液固定且在0.1%TritonX-100中滲透。一次抗體：(1：400，Bethyl Laboratories,Inc.)、活性卡斯蛋白酶-3(1：100，Abcam)、Rad51(1：100，Abcam)及NF-(1：400，Cell Signaling，#D14E12)。二次抗體為山羊抗兔IgG-TRITC(1：1000，Jackson ImmunoResearch Laboratories,Inc.)或山羊抗兔IgG-AlexaFluor 488(1：500，Life Technologies)。蓋玻片使用VectaShield plus DAPI(Vector Laboratories,Inc.)固著於載片上，且如先前所述成像(Caddle等人，2008)。
碘化丙錠及流式細胞術。如別處所述進行PI染色(Caddle等人，2008；Hasham等人，2012)。在使用CellQuest ProTM擷取軟體(BD Biosciences)的FACSCaliburTM上收集所有流式細胞術資料且經由FlowJoTM(v.9.5.2,Troestar,Inc.)分析。中期製備及姊妹染色單體交換分析。HEK293T細胞與DMSO或100nM C-1523一起培養三天。在收集之前的44小時，將10μM BrdU(BD Biosciences)給予培養中的細胞，使得合併可在兩個細胞週期發生以有差異地標記唯一染色單體。KaryoMaxTM，一種秋水仙醯胺溶液(Invitrogen)，以1：200之稀釋度添加至培養物中，30分鐘至1小時之後固定以促進***細胞之中期停滯。接著快速轉移細胞至溫熱(37℃)的低張力KCl溶液(75mM)中且在37℃培育20分鐘以使細胞脹大。藉由兩次更換冷3：1甲醇：乙酸來完成快速固定。將中期細胞滴落至載片上，暴露於UV，且根據方案，用Giemsa染色(Stults等人，2014)。藉由明視場顯微鏡目測中期，且每個 樣品評估20個中期。
DR-GFP分析。如先前所述進行(Lamont等人，2013)。微核分析。分離鼠類脾初級B細胞且安設於培養物中用於活力分析，用αCD40及IL-4活化且用100nM C-1523或DMSO媒劑處理3天。作為微核形成之陽性對照，一些細胞用5μg/mL環磷醯胺(Sigma)處理3天(Krishna等人，1995)。MEC-1細胞與100nM C-1523或DMSO一起培養4天。處理之後，將細胞轉移至經聚-L-賴胺酸塗覆之蓋玻片上，給其時間附著，接著固定，滲透，且固著至載片上用於免疫螢光分析。對隨機視野中的各樣品細胞進行成像且計數500個細胞。
RT-PCR分析。總蛋白質製備、引子、循環參數均如先前所述進行(Lamont等人，2013)
RNASeq分析。使用NGSQCToolkitTM(v2.3，IlluQC_PRLL.pl及TrimmingReads.pl)過濾原始測序資料。經過濾且微調的讀數接著使用tophat(v2.0.7)與mm10比對。接著傳遞經比對之bam檔案通過Cufflinks(v2.0.2)且使用htseq-count.edgeR對每種基因的讀數進行計數。使用R/edgeR套裝程式(Robinson等人，2010)進行四種RNA Seq差異基因表現比較，亦即FC1、FC2、FC3及FC4。FC1測試WT-媒劑與WT-C-1523之差異，FC2測試AID-/--媒劑與AID-/--C1523之差異，FC3測試WT-C-1523與AID-/--C1523之差異，且FC4測試WT-媒劑與AID-/--媒劑之差異。藉由每次比較時微調M值之方式(TMM)來進行標準化。多次測試調整之FDR<0.05用於確定表現有顯著差異的基因。
生物反應路徑分析。使用生物反應路徑分析軟體(IPA；Ingenuity Systems，www.ingenuity.com，2014年3月發佈)，跨越表現有差異之不同基因進行網路產生。此等資料集來源於處理組之差異基因表現分析，如圖17A中所概述。特定言之，使用表現有差異且FC1獨有的基因、表現有顯著差異且FC2獨有的基因、FC1相較於FC2之變化倍數較 大、但FDR>0.05且<0.10的基因，及FC2相較於FC1之變化倍數較大、但FDR>0.05且<0.10的基因產生四個集合。此等資料集中之每一者上傳至IPA且使用IPA知識庫，與小鼠Entrez基因符號對應。將此等對象覆加於利用IPA知識庫(2014年3月發佈)所含之資訊開發的典型路徑上。
參考文獻
Boss, D.S., J.H. Beijnen, and J.H.M. Schellens. 2010. Inducing Synthetic Lethality using PARP Inhibitors. Curr Clin Pharmacol. 5:192-195.
Caddle, L.B., M.G. Hasham, W.H. Schott, B.-J. Shirley, and K.D. Mills. 2008. Homologous Recombination Is Necessary for Normal Lymphocyte Development. Mol. Cell. Biol. 28:2295-2303.
Calabrese, E.J. 2013. Hormetic mechanisms. Critical Reviews in Toxicology. 43:580-606.
Chahwan, R., W. Edelmann, M.D. Scharff, and S. Roa. 2012. AIDing antibody diversity by error-prone mismatch repair. Seminars in Immunology. 24:293-300.
Chaudhuri, J., M. Tian, C. Khuong, K. Chua, E. Pinaud, and F.W. Alt. 2003. Transcription-targeted DNA deamination by the AID antibody diversification enzyme. Nature. 422:726-730.
Cheson, B.D., D.A. Vena, J. Barrett, and B. Freidlin. 1999. Second Malignancies as a Consequence of Nucleoside Analog Therapy for Chronic Lymphoid Leukemias. Journal of Clinical Oncology. 17:2454.
Curry, C.L., L.L. Reed, E. Broude, T.E. Golde, L. Miele, and K.E. Foreman. 2007. Notch inhib ition in Kaposi's sarcoma tumor cells leads to mitotic catastrophe through nuclear factor- signaling. Molecular Cancer Therapeutics. 6:1983-1992.
Daboussi, F., A. Dumay, F. Delacoe, and B.S. Lopez. 2002. DNA double-strand break repair signalling: The casse of RAD51 post-translational regulation. Cellular Signalling. 14:969-975.
Foley, G.E., H. Lazarus, S. Farber, B.G. Uzman, and R.A. Adams. 1968. Studies on Human Leukemic Cels in Vitro. In The Proliferation and Spread of Neoplastic Cels. The Wiliams & Wilkins Co, Baltimore. 65-97.
Harper, J.W., and S.J. Elledge. 2007. The DNA Damage Response: Ten Years After. Molecular Cell. 28:739-745.
Hasham, M., K. Snow, N. Donghia, J. Branca, M. Lessard, J. Stavnezer, L. Shopland, and K. Mills. 2012. Activation-Induced cytidine deaminase-initiated off-target DNA breaks are detected and resolved during S phase. J Immunol. 189:2374-2382.
Hasham, M.G., N.M. Donghia, E. Coffey, J. Maynard, K.J. Snow, J. Ames, R.Y. Wilpan, Y. He, B.L. King, and K.D. Mills. 2010. Widespread genomic breaks generated by activation-induced cytidine deaminase are prevented by homologous recombination. Nat Immunol. 11:820-826.
Heintel, D., E. Kroemer, D. Kienle, I. Schwarzinger, A. Gleib, J. Schwarzmeier, R. Marculescu, T. Le, C. Mannhalter, A. Gaiger, S. Stilgenbauer, H. Dohner, C. Fonatsch, and U. Jager. 2004. High expression of activation-induced cytidine deaminase (AID) mRNA is associated with unmutated IGVH gene status and unfavourable cytogenetic aberrations in patients with chronic lymphocytic leukaemia. Leukemia. 18:756-762.
Hung, J.-Y., C.-W. Wen, Y.-L. Hsu, E.-S. Lin, M.-S. Huang, C.-Y. Chen, and P.-L. Kuo. 2013. Subamolide A Induces Mitotic Catastrophe Accompanied by Apoptosis in Human Lung Cancer Cells. Evidence-Based Complementary and Alternative Medicine. 2013:15.
Ishida, T., Y. Takizawa, T. Kainuma, J. Inoue, T. Mikawa, T. Shibata, H. Suzuki, S. Tashiro, and H. Kurumizaka. 2009. DIDS, a chemical compound that inhibits RAD51-mediated homologous pairing and strand exchange. Nucleic Acids Research. 37:3367-3376.
Kawabata, M., T. Kawabata, and M. Nishibori. 2005. Role of recA/RAD51 Family Proteins in Mammals. Acta Med Okayama. 59:1-9.
Klemm, L., C. Duy, I. Iacobucci, S. Kuchen, G. von Levetzow, N. Feldhahn, N. Henke, Z. Li, T.K. Hoffmann, Y.-m. Kim, W.-K. Hofmann, H. Jumaa, J. Groffen, N. Heisterkamp, G. Martinelli, M.R. Lieber, R. Casellas, and M. Muschen. 2009. The B Cell Mutator AID Promotes B Lymphoid Blast Crisis and Drug Resistance in Chronic Myeloid Leukemia. Cancer Cell. 16:232-245.
Kou, T., H. Marusawa, K. Kinoshita, Y. Endo, I.-m. Okazaki, Y. Ueda, Y. Kodama, H. Haga, I. Ikai, and T. Chiba. 2007. Expression of activation-induced cytidine deaminase in human hepatocytes during hepatocarcinogenesis. International Journal of Cancer. 120:469-476.
Krishna, G., J. Petrere, J. Anderson, and J. Theiss. 1995. Use of cyclophosphamide as a positive control in dominant lethal and micronucleus assays. Mutation Research/Environmental Mutagenesis and Related Subjects. 335:331-337.
Lamont, K.R., M.G. Hasham, N.M. Donghia, J. Branca, M. Chavaree, B. Chase, A. Breggia, J. Hedlund, I. Emery, F. Cavallo, M. Jasin, J. Rase, A. Breggia, J. Hedlund, I. Emery, F. Cavallo, M. Jasin, J. R°ter, and K.D. Mills. 2013. Attenuating homologous recombination stimulates an AID-induced antileukemic effect. The Journal of Experimental Medicine. 210:1021-1033.
Latt, S., and R. Schreck. 1980. Sister Chromatid Exchange Analysis. Am J Hum Genet. 32:297-313.
Liu, Z., X. Wu, Y. Duan, Y. wang, B. Shan, J. Kong, X. Ma, and Y. Bao. 2011. AID expression is correlated with Bcr-Abl expression in CML-LBC and can be down-regulated by As2O3 and/or imatinib. Leukemia Research. 35:1355-1359.
Londono-Vallejo, J.A., H. Der-Sarkissian, L. Cazes, S. Bacchetti, and R.R. Reddel. 2004. Alternative Lengthening of Telomeres Is Characterized by High Rates of Telomeric Exchange. Cancer Research. 64:2324-2327.
McBride, K.M., A. Gazumyan, E.M. Woo, V.M. Barreto, D.F. Robbiani, B.T. Chait, and M.C. Nussenzweig. 2006. Regulation of hypermutation by activation-induced cytidine deaminase phosphorylation. Proceedings of the National Academy of Sciences. 103:8798-8803.
Molica, S. 2005. Second neoplasms in chronic lymphocytic leukemia: incidence and pathogenesis with emphasis on the role of different therapies. Leukemia & Lymphoma. 46:49-54.
Moynahan, M., A. Pierce, and M. Jasin. 2001. BRCA2 is required for homology-directed repair of chromosomal breaks. Molecular Cell. 7:263-272.
Muramatsu, M., K. Kinoshita, S. Fagarasan, S. Yamada, Y. Shinkai, and T. Honjo. 2000. Class Switch Recombination and Hypermutation Require Activation-Induced Cytidine Deaminase (AID), a Potential RNA Editing Enzyme. Cell. 102:553-563.
Nagaoka, H., T.H. Tran, M. Kobayashi, M. Aida, and T. Honjo. 2010. Preventing AID, a physiological mutator, from deleterious activation: regulation of the genomic instability that is associated with antibody diversity. International Immunology. 22:227-235.
Nakanishi, K., Y. Yang, A. Pierce, T. Taniguchi , M. Digweed, A. D'Andrea, Z. Wang, and M. Jasin. 2005. Human Fanconi anemia monoubiquitination pathway promotes homologous DNA repair. Proceedings of the National Academy of Sciences. 102:1110-1115.
Okazaki, I.-m., H. Hiai, N. Kakazu, S. Yamada, M. Muramatsu, K. Kinoshita, and T. Honjo. 2003. Constitutive Expression of AID Leads to Tumorigenesis. The Journal of Experimental Medicine. 197:1173-1181.
Palacios, F., P. Moreno, P. Morande, C. Abreu, A.n. Correa, V. Porro, A.I.
Landoni, R. Gabus, M. Giordano, G. Dighiero, O. Pritsch, and P. Oppezzo. 2010. High expression of AID and active class switch recombination might account for a more aggressive disease in unmutated CLL patients: link with an activated microenvironment in CLL disease. Blood. 115:4488-4496.
Pasqualucci, L., G. Bhagat, M. Jankovic, M. Compagno, P. Smith, M. Muramatsu, T. Honjo, H.C. Morse, M.C. Nussenzweig, and R. Dalla-Favera. 2008. AID is required for germinal center-derived lymphomagenesis. Nat Genet. 40:108-112.
Robak, E., and T. Robak. 2007. Skin lesions in chronic lymphocytic leukemia. Leukemia & Lymphoma. 48:855-865.
Robbiani, D.F., S. Bunting, N. Feldhahn, A. Bothmer, J. Camps, S. Deroubaix, K.M. McBride, I.A. Klein, G. Stone, T.R. Eisenreich, T. Ried, A. Nussenzweig, and M.C. Nussenzweig. 2009. AID Produces DNA Double-Strand Breaks in Non-Ig Genes and Mature B Cell Lymphomas with Reciprocal Chromosome Translocations. Molecular Cell. 36:631-641.
Robinson, M.D., D.J. McCarthy, and G.K. Smyth. 2010. edgeR: a Bioconductor package for differential expression analysis of digital gene expression data. Bioinformatics. 26:139-140.
Roninson, I.B., E.V. Broude, and B.-D. Chang. 2001a. If not apoptosis, then what？ Treatment-induced senescence and mitotic catastrophe in tumor cells. Drug Resistance Updates. 4:303-313.
Roninson, I.B., B.-D. Chang, and E.V. Broude. 2001b. Non-Apoptotic Responses to Anticancer Agents: Mitotic Catastrophe, Senescence, and the Role of p53 and p21. In Cell Cycle Ceckpoints and Cancer. M.v. Blagosklonny, editor. Landes Bioscience, Georgetown, TX.
Shimizu, T., H. Marusawa, Y. Endo, and T. Chiba. 2012. Inflammation-mediated genomic instability: roles of activation-induced cytidine deaminase in carcinogenesis. Cancer Science. 103:1201-1206.
Shinmura, K., H. Igarashi, M. Goto, H. Tao, H. Yamada, S. Matsuura, M. Tajima, T. Matsuda, A. Yamane, and K.e.a. Funai. 2011. Aberrant expression and mutation-inducing activity of AID in human lung cancer. Annals of Surgical Oncology. 18:2084-2092.
Shinohara, A., H. Ogawa, and T. Ogawa. 1992. Rad51 protein involved in repair and recombination in S. cerevisiae is a RecA-like protein. Cell. 69:457-470.
Stacchini, A., M. Aragno, A. Vallario, A. Alfarano, P. Circosta, D. Gottardi, A. Faldella, G. Rege-Cambrin, U. Thunberg, K. Nilsson, and F. Caligaris-Cappio. 1999. MEC1 and MEC2: two new cell lines derived from B-chronic lymphocytic leukaemia in prolymphocytoid transformation. Leukemia Research. 23:127-136.
Staszewski, O., R.E. Baker, A.J. Ucher, R. Martier, J. Stavnezer, and J.E.J. Guikema. 2011. Activation-Induced Cytidine Deaminase lnduces Reproducible DNA Breaks at Many Non-Ig Loci in Activated B Cells. Molecular Cell. 41:232-242.
Stults, D., M. Killen, and A. Pierce. 2014. The Sister Chromatid Exchange (SCE) Assay. In Molecular Toxicology Protocols. Vol. 1105. P. Keohavong and S.G. Grant, editors. Humana Press. 439-455.
Sung, P., and D.L. Robberson. 1995. DNA strand exchange mediated by a RAD51-ssDNA nucleoprotein filament with polarity opposite to that of RecA. Cell. 82:453-461.
Suwaki, N., K. Klare, and M. Tarsounas. 2011. RAD51 paralogs: Roles in DNA damage signalling, recombinational repair and tumorigenesis. Seminars in Cell & Developmental Biology. 22:898-905.
Thacker, J. 2005. The RAD51 gene family, genetic instability and cancer. Cancer Letters. 219:125-135.
Zan, H., and P. Casali. 2008. AID- and Ung-dependent generation of staggered double-strand DNA breaks in immunoglobulin class switch DNA recombination: A post-cleavage role for AID. Molecular Immunology. 46:45-61.
實例3
基因化學療法係利用免疫系統之天然基因程式設計作為癌症之 「阿喀琉斯之踵(Achilles heel)」，其誘導DNA損傷相對於修復之間不可抗拒的不平衡。此不平衡殺死癌細胞，但保護健康細胞，從而使傳統化學療法所引起之副作用類型明顯缺失。
本文中描述基因化學療法化合物C-1523，其有效性為DIDS的1000倍且急性副作用不增加；及C-1523-1a，其更強效且更有效且具有改良之藥物動力學特性。另外，本文中證明基因化學療法可適用於範圍甚至更寬的癌症，除白血病及淋巴瘤外，亦包括乳癌、卵巢癌及肺癌。
已活體外測試C-1523對經培養之癌細胞及活體內對人類細胞樣品的作用。進行臨床前藥物動力學分析以確定化合物在其投與時的結局。此等研究顯示C-1523-1a在靶向表現AID之細胞(擔負基因化學療法之細胞)時明顯的強且非常有效。此外，C-1523-1a顯示顯著改良之藥物動力學特性(例如在20mg/kg劑量下，血漿半衰期為約6小時)且成功地使非霍奇金氏淋巴瘤模型中的腫瘤減小。
C-1523與C-1523-1a均幾乎未產生急性毒性，表明此等藥物高度有效地針對一些癌症類型，且亦具有優於大部分現有化學療法的安全概況。對小鼠及大鼠(較佳為臨床前嚙齒動物種)的單次與多次劑量毒性研究證明對延長之藥物暴露具有優良耐受性，其中一些B細胞減少為唯一(及經預測)的副作用。此表明如本文所述之基因化學療法具有極小副作用至無副作用，而且在促使多種癌症類型之患者癌症自毀方面非常有效。
C-1523-1a在本文中經證明容易以可注射療法投與。
實例4
在暴露於C-1523之表現AID之B細胞中，而非在AID陰性B細胞中，B細胞活力存在劑量依賴性降低(圖19A)。細胞在培養中用媒劑(DMSO)或50、100、150、200或250nM C-1523處理3天且藉由錐蟲藍 排除法及人工血細胞計數法對活力進行評分。用錐蟲藍染色之後測定活力(圖19B)。
C-1523結合至RAD51之表面凹穴且預計可接觸或影響胺基酸，包括MET80、GLU84 THR177、GLU271及ARG273(圖20)。
C-1523對細胞週期的作用最小(圖21)。AID+/+或AID-/- B細胞用100nM培養且每隔至多96小時、藉由碘化丙錠染色及流式細胞術測定細胞週期概況。非活化(CD40)細胞用作陰性對照；經微管毒素秋水仙醯胺(ACT+秋水仙醯胺)處理的活化細胞用作陽性對照。對經100nM C-1523處理之表現AID之初級B細胞進行核斷裂分析(圖22)。
急性淋巴母細胞白血病(ALL)株系CCRF-SB及慢性淋巴細胞性白血病株系MEC1 MEC2 MEC2對C-1523治療敏感(圖23)。C-1523處理之後，分析MEC1細胞中的微核含量(圖24)。
MEC1細胞(而非同基因型AID基因表現阻斷細胞株AKD)對C-1523敏感(圖25)。MEC1(而非同基因型AID基因剔除細胞株AKO 14-1及AKO 14-3)對C-1523敏感(圖26)。
表現AID之初級B細胞對C-1523-1AD4敏感(圖27)。

Claims (41)

  1. 一種式I化合物， 其中：RA及RB為SO2N(R22)2，或RA及RB中之一者為SO3R23且另一者為氫或SO3R23，或RA及RB中之一者為SO3 -Y+且另一者為氫，或RA及RB中之一者為CO2 -Y+且另一者為氫或CO2 -Y+，或RA及RB中之一者為PO3 -(Y+)2且另一者為氫或PO3 -(Y+)2；R2、R3、R4、R5、R6、R7、R8及R9獨立地為氫、鹵素、CF3、CN、C(O)R21、CO2R21、CO2 -Y+、C(O)N(R22)2、OH、OR21、N(R12)2、N=C=S、NHC(O)R21、NHC(O)OR21、NHC(S)R21、NHC(S)N(R22)2、NHSO2R21、NHSO2N(R22)2、NO2、N2-R22、SOR21、SO2R21、SO3R21、SO3 -Y+、OP(O)(OH)2、視情況經取代之直鏈或分支鏈C1-C10烷基、視情況經取代之直鏈或分支鏈C2-C10烯基、視情況經取代之直鏈或分支鏈C2-C10炔基、視情況經取代之環基、視情況經取代之雜環基、視情況經取代之芳基或視情況經取代之雜芳基，限制條件為R3與R8不相同；R21在每次出現時獨立地為氫、視情況經取代之直鏈或分支鏈C1-C10烷基、視情況經取代之直鏈或分支鏈C2-C10烯基、視 情況經取代之直鏈或分支鏈C2-C10炔基、視情況經取代之環基、視情況經取代之雜環基、視情況經取代之芳基或視情況經取代之雜芳基；R22在每次出現時獨立地為氫、視情況經取代之直鏈或分支鏈C1-C10烷基、視情況經取代之直鏈或分支鏈C2-C10烯基、視情況經取代之直鏈或分支鏈C2-C10炔基、視情況經取代之環基、視情況經取代之雜環基、視情況經取代之芳基、視情況經取代之雜芳基或C(O)(CH2)nCH3，其中n=0、1、2、3、4、5或6；R23在每次出現時獨立地為視情況經取代之直鏈或分支鏈C1-C10烷基；Y+在每次出現時為陽離子；及其醫藥學上可接受之鹽。
  2. 如請求項1之化合物，其中R3及R8獨立地選自由以下組成之群：氫、雜環基、OR21、NO2、N(R22)2、N=C=S、NHC(O)R21、NHSO2R21、N(R22)2、NHC(O)N(R22)2、NHC(S)N(R22)2及NHSO2N(R22)2，其中R21為H或C1-C4烷基且R22可為H或C1-C10烷基。
  3. 如請求項1或2之化合物，其中R3及R8獨立地選自由以下組成之群：氫、OH、OCH3、N=C=S、NH2、NHCH3、NO2、NH-十八烷、NHC(O)CH3、NHC(O)CH(CH3)2、NHC(O)CH2OCH3、NHSO2CH3、NHSO2-環丙烷、NHSO2CH(CH3)2、NHSO2N(CH3)2、NHC(S)NHCH3、NHC(S)NHCH(CH3)2、NHC(S)NH-環丙烷、NHC(O)NHCH3、NHC(O)NHCH(CH3)2、苯并噁唑基，及NHC(O)NH-環丙烷。
  4. 如請求項1或2之化合物，其中R3及R8中之一者為NHC(O)CH3且 另一者為NHC(O)CH3或NHC(S)NHCH(CH3)2。
  5. 如請求項1或2之化合物，其中R3與R8不同。
  6. 如請求項1或2之化合物，其中R2、R4、R5、R6、R7及R9中的至少一者為氫。
  7. 如請求項1或2之化合物，其中R2、R4、R5、R6、R7及R9皆為氫。
  8. 如請求項1或2之化合物，其中R22在每次出現時獨立地選自由以下組成之群：氫、甲基、乙基、丙基、異丙基、丁基、異丁基、戊基、第三丁基及環丙基；或該兩個R22與其所連接的氮一起形成視情況經取代之3-8員雜環基。
  9. 如請求項1或2之化合物，其中R23在每次出現時獨立地為甲基、乙基、丙基、異丙基、丁基、異丁基、戊基、第三丁基或環丙基。
  10. 如請求項1或2之化合物，其中Y+在每次出現時獨立地選自由以下組成之群：鈉、鉀、鋁、鈣、鋰、鎂、鋇、鋅、銨、銨自由基(aminium)及其任何組合。
  11. 如請求項1或2之化合物，其中RA為SO3R23；RB為氫或SO3R23；且各R23獨立地為異丙基或第三丁基。
  12. 如請求項1或2之化合物，其中RA為SO3R23；RB為氫或SO3R23；且R2、R4、R5、R6、R7及R9為氫。
  13. 如請求項1或2之化合物，其中RA為SO3R23；RB為氫或SO3R23；各R23獨立地為異丙基或第三丁基；且R2、R4、R5、R6、R7及R9為氫。
  14. 如請求項1或2之化合物，其中RA及RB中之一者為SO3 -Y+且另一者為氫；且R3及R8中之一者為NHC(O)CH3且另一者為NHC(S)NHCH(CH3)2。
  15. 如請求項1或2之化合物，其中RA及RB中之一者為SO3 -Y+且另一 者為氫；且R2、R4、R5、R6、R7及R9為氫。
  16. 如請求項1或2之化合物，其中RA及RB中之一者為SO3 -Y+且另一者為氫；R3及R8中之一者為NHC(O)CH3且另一者為NHC(S)NHCH(CH3)2；且R2、R4、R5、R6、R7及R9為氫。
  17. 如請求項1或2之化合物，其中RA及RB中之一者為CO2 -Y+且另一者為氫或CO2 -Y+；且R3及R8中之一者為NHC(O)CH3且另一者為NHC(S)NHCH(CH3)2。
  18. 如請求項1或2之化合物，其中RA及RB中之一者為CO2 -Y+且另一者為氫或CO2 -Y+；且R2、R4、R5、R6、R7及R9為氫。
  19. 如請求項1或2之化合物，其中RA及RB中之一者為CO2 -Y+且另一者為氫或CO2 -Y+；R3及R8中之一者為NHC(O)CH3且另一者為NHC(S)NHCH(CH3)2；且R2、R4、R5、R6、R7及R9為氫。
  20. 如請求項1或2之化合物，其中RA及RB中之一者為PO3 -Y+且另一者為氫或PO3 -Y+；且R3及R8中之一者為NHC(O)CH3且另一者為NHC(S)NHCH(CH3)2。
  21. 如請求項1或2之化合物，其中RA及RB中之一者為PO3 -Y+且另一者為氫或PO3 -Y+；且R2、R4、R5、R6、R7及R9為氫。
  22. 如請求項1或2之化合物，其中RA及RB中之一者為PO3 -Y+且另一者為氫或PO3 -Y+；R3及R8中之一者為NHC(O)CH3且另一者為NHC(S)NHCH(CH3)2；且R2、R4、R5、R6、R7及R9為氫。
  23. 如請求項1或2之化合物，其中該化合物選自由以下組成之群：
  24. 一種如請求項1至23中任一項之化合物的用途，其係用於製造供治療個體之癌症、自體免疫疾病、免疫缺乏症或神經退化性疾病的藥物。
  25. 如請求項24之用途，其中相對於參考水準，個體經確定在一或多個細胞類型中發生的DNA損傷程度增加。
  26. 如請求項24至25中任一項之用途，其中該個體經確定在選自由以下組成之群的細胞中發生的DNA損傷程度增加：癌細胞；免疫細胞；自體免疫細胞或神經系統細胞。
  27. 如請求項25之用途，其中該DNA損傷係選自由以下組成之群：單股DNA斷裂、雙股DNA斷裂及DNA突變。
  28. 如請求項24、25及27中任一項之用途，其中若個體經測定具有增加之DNA損傷過程或DNA編輯酶(editing enzyme)含量及/或活性，則確定該個體具有增加的DNA損傷程度。
  29. 如請求項28之用途，其中該DNA編輯酶係選自由以下組成之群：活化誘導性胞苷脫胺酶(AID或AICDA)、APOBEC2、APOBEC 3A、APOBEC3C、APOBEC3D、APOBEC3F、APOBEC3G、APOBEC3H、APOBEC4、1型拓撲異構酶、2型拓撲異構酶、重 組活化基因1(RAG1)，及重組活化基因2(RAG2)。
  30. 如請求項24、25及27中任一項之用途，其中若個體已暴露於選自由以下組成之群的DNA損傷劑，則該個體經確定具有增加的DNA損傷程度：DNA整合病毒之病毒感染；暴露於DNA損傷化學品；暴露於化學治療劑；及暴露於離子化或紫外輻射。
  31. 如請求項25或27之用途，其中該DNA損傷為雙股斷裂。
  32. 如請求項29之用途，其中該DNA編輯酶為活化誘導性胞苷脫胺酶(AID)。
  33. 如請求項32之用途，其中增加的AID含量為可偵測的AID含量。
  34. 如請求項33之用途，其中增加的AID含量為AID含量在統計學上顯著高於未活化B細胞或健康個體之正常非免疫細胞中所表現之AID含量。
  35. 如請求項33之用途，其中該AID含量為血細胞或B細胞中的含量。
  36. 如請求項24、25及27中任一項之用途，其中該癌症係選自由以下組成之群：淋巴瘤、白血病及漿細胞贅瘤。
  37. 如請求項36之用途，其中該淋巴瘤係選自由以下組成之群：非霍奇金氏淋巴瘤(Non-Hodgkin's lymphoma)；伯基特氏淋巴瘤(Burkitt's lymphoma)、小淋巴細胞性淋巴瘤；淋巴漿細胞淋巴瘤；MALT淋巴瘤；濾泡性淋巴瘤；瀰漫性大B細胞淋巴瘤；及T細胞淋巴瘤。
  38. 如請求項36之用途，其中該白血病係選自由以下組成之群：急性淋巴母細胞白血病(ALL)、伯基特氏白血病；B細胞白血病；B細胞急性淋巴母細胞白血病；慢性淋巴細胞性白血病 (CLL)；急性骨髓性白血病(AML)；慢性骨髓性白血病(CML)；及T細胞急性淋巴母細胞白血病(T-ALL)。
  39. 如請求項36之用途，其中該漿細胞贅瘤係選自由以下組成之群：多發性骨髓瘤；漿細胞骨髓瘤；漿細胞白血病；及漿細胞瘤。
  40. 如請求項24、25及27中任一項之用途，其中該個體患有選自由以下組成之群的癌症：上皮細胞癌；結腸癌、肝癌、胃癌；腸癌；食道癌；乳癌；卵巢癌；頭頸癌；肺癌；及甲狀腺癌。
  41. 如請求項24、25及27中任一項之用途，其中該自體免疫疾病係選自由以下組成之群：紅斑狼瘡；韋斯考特-奧德里奇症候群(Wiskott-Aldrich syndrome)；自體免疫淋巴增生症候群；重症肌無力；類風濕性關節炎(RA)；狼瘡腎炎；多發性硬化症；全身性紅斑狼瘡、盤狀狼瘡、亞急性皮膚紅斑狼瘡、包括凍瘡紅斑狼瘡之皮膚紅斑狼瘡、慢性關節炎、休格連氏症候群(Sjogren's syndrome)、發炎性慢性鼻竇炎、結腸炎、乳糜瀉、發炎性腸病、巴雷特氏(Barrett’s)食道、發炎性胃炎、自體免疫腎炎、自體免疫血管炎、自體免疫肝炎、自體免疫心臟炎、自體免疫腦炎、自體免疫糖尿病、自體免疫糖尿病腎炎及自體免疫介導性血液疾病。
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Families Citing this family (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
PL3681884T3 (pl) 2017-09-11 2022-11-14 Cyteir Therapeutics, Inc. Inhibitory RAD51
US11046731B2 (en) * 2018-01-18 2021-06-29 Hong Kong Baptist University Zinc-binder based EBNA1-specific compounds
TW202104198A (zh) 2019-03-12 2021-02-01 美商賽堤爾醫療公司 Ｒａｄ５１抑制劑
AU2020244809A1 (en) 2019-03-25 2021-10-07 Cyteir Therapeutics, Inc. Combinations of RAD51 and PARP inhibitors
JP2022537372A (ja) 2019-06-21 2022-08-25 サイティアー セラピューティクス，インコーポレイティド 膵臓がんの治療にｒａｄ５１阻害剤を利用する方法
JP2023517884A (ja) 2020-03-03 2023-04-27 サイティアー セラピューティクス，インコーポレイティド 癌を治療するための特定の投薬量でのｒａｄ５１阻害剤化合物６７ａ（２３０１０８５－０６－１）
CN113045461B (zh) * 2021-05-31 2021-09-21 天津瑞普生物技术股份有限公司 一种二苯乙烯型化合物及其合成方法与应用

Family Cites Families (133)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
NL188856B (nl) * 1953-07-01 Koa Oil Co Ltd Inrichting voor het bereiden van mesofase koolstof.
US3270960A (en) 1964-09-11 1966-09-06 Sperry Rand Corp Fluid sensor
US3387050A (en) 1965-10-22 1968-06-04 Phillips Petroleum Co Production of stilbene and bibenzyl
US3536809A (en) 1969-02-17 1970-10-27 Alza Corp Medication method
US3598123A (en) 1969-04-01 1971-08-10 Alza Corp Bandage for administering drugs
US3828060A (en) * 1969-07-31 1974-08-06 Procter & Gamble Heterocyclic nitrogen-and sulfur-containing optical brightener compounds
US3773919A (en) 1969-10-23 1973-11-20 Du Pont Polylactide-drug mixtures
US3845770A (en) 1972-06-05 1974-11-05 Alza Corp Osmatic dispensing device for releasing beneficial agent
US3916899A (en) 1973-04-25 1975-11-04 Alza Corp Osmotic dispensing device with maximum and minimum sizes for the passageway
US4008719A (en) 1976-02-02 1977-02-22 Alza Corporation Osmotic system having laminar arrangement for programming delivery of active agent
US4534899A (en) 1981-07-20 1985-08-13 Lipid Specialties, Inc. Synthetic phospholipid compounds
US4426330A (en) 1981-07-20 1984-01-17 Lipid Specialties, Inc. Synthetic phospholipid compounds
IE58110B1 (en) 1984-10-30 1993-07-14 Elan Corp Plc Controlled release powder and process for its preparation
US4837028A (en) 1986-12-24 1989-06-06 Liposome Technology, Inc. Liposomes with enhanced circulation time
US4920016A (en) 1986-12-24 1990-04-24 Linear Technology, Inc. Liposomes with enhanced circulation time
CA1338645C (en) 1987-01-06 1996-10-15 George R. Pettit Isolation, structural elucidation and synthesis of novel antineoplastic substances denominated "combretastatins"
CA1340955C (en) 1988-02-24 2000-04-11 Michael Klaus Stilbene derivatives
US5073543A (en) 1988-07-21 1991-12-17 G. D. Searle & Co. Controlled release formulations of trophic factors in ganglioside-lipsome vehicle
GB8824593D0 (en) 1988-10-20 1988-11-23 Royal Free Hosp School Med Liposomes
IT1229203B (it) 1989-03-22 1991-07-25 Bioresearch Spa Impiego di acido 5 metiltetraidrofolico, di acido 5 formiltetraidrofolico e dei loro sali farmaceuticamente accettabili per la preparazione di composizioni farmaceutiche in forma a rilascio controllato attive nella terapia dei disturbi mentali organici e composizioni farmaceutiche relative.
DE3911221A1 (de) 1989-04-07 1990-10-11 Bayer Ag Verfahren zur herstellung von bifunktionellen, mindestens eine z-konfigurierte stilbengruppierung enthaltenden stilbenverbindungen, neue bifunktionelle, mindestens eine z-konfigurierte stilbengruppierung enthaltende stilbenverbindungen sowie die verwendung der stilbenverbindungen zur herstellung von polymeren
US6040138A (en) 1995-09-15 2000-03-21 Affymetrix, Inc. Expression monitoring by hybridization to high density oligonucleotide arrays
US5013556A (en) 1989-10-20 1991-05-07 Liposome Technology, Inc. Liposomes with enhanced circulation time
US5356633A (en) 1989-10-20 1994-10-18 Liposome Technology, Inc. Method of treatment of inflamed tissues
US5225212A (en) 1989-10-20 1993-07-06 Liposome Technology, Inc. Microreservoir liposome composition and method
US5120548A (en) 1989-11-07 1992-06-09 Merck & Co., Inc. Swelling modulated polymeric drug delivery device
US5665710A (en) 1990-04-30 1997-09-09 Georgetown University Method of making liposomal oligodeoxynucleotide compositions
US5733566A (en) 1990-05-15 1998-03-31 Alkermes Controlled Therapeutics Inc. Ii Controlled release of antiparasitic agents in animals
EP0562047A4 (en) 1990-12-06 1995-11-02 Affymax Tech Nv Sequencing by hybridization of a target nucleic acid to a matrix of defined oligonucleotides
JP3220180B2 (ja) 1991-05-23 2001-10-22 三菱化学株式会社 薬剤含有タンパク質結合リポソーム
US5580578A (en) 1992-01-27 1996-12-03 Euro-Celtique, S.A. Controlled release formulations coated with aqueous dispersions of acrylic polymers
ATE165345T1 (de) * 1992-02-20 1998-05-15 Merrell Pharma Inc Sulfonsaeurederivate zur behandlung von viruserkrankungen
EP0672129A4 (en) 1992-11-20 1997-06-11 Univ New Jersey Med CELL TYPE SPECIFIC GENE TRANSFER USING RETROVIRAL VECTORS CONTAINING WRAP PROTEIN-ANTIBODY PROTEINS.
JP3351476B2 (ja) 1993-01-22 2002-11-25 三菱化学株式会社 リン脂質誘導体及びそれを含有するリポソーム
US5591767A (en) 1993-01-25 1997-01-07 Pharmetrix Corporation Liquid reservoir transdermal patch for the administration of ketorolac
US5869337A (en) 1993-02-12 1999-02-09 President And Fellows Of Harvard College Regulated transcription of targeted genes and other biological events
US5395619A (en) 1993-03-03 1995-03-07 Liposome Technology, Inc. Lipid-polymer conjugates and liposomes
US6191105B1 (en) 1993-05-10 2001-02-20 Protein Delivery, Inc. Hydrophilic and lipophilic balanced microemulsion formulations of free-form and/or conjugation-stabilized therapeutic agents such as insulin
US5837832A (en) 1993-06-25 1998-11-17 Affymetrix, Inc. Arrays of nucleic acid probes on biological chips
US6309823B1 (en) 1993-10-26 2001-10-30 Affymetrix, Inc. Arrays of nucleic acid probes for analyzing biotransformation genes and methods of using the same
US5540935A (en) 1993-12-06 1996-07-30 Nof Corporation Reactive vesicle and functional substance-fixed vesicle
KR0165729B1 (ko) 1994-02-18 1999-03-20 로베르트 뢰머 스틸벤 기재물질, 그 제조방법 및 그 사용
US6048903A (en) 1994-05-03 2000-04-11 Robert Toppo Treatment for blood cholesterol with trans-resveratrol
US5543152A (en) 1994-06-20 1996-08-06 Inex Pharmaceuticals Corporation Sphingosomes for enhanced drug delivery
IT1270594B (it) 1994-07-07 1997-05-07 Recordati Chem Pharm Composizione farmaceutica a rilascio controllato di moguisteina in sospensione liquida
US5820873A (en) 1994-09-30 1998-10-13 The University Of British Columbia Polyethylene glycol modified ceramide lipids and liposome uses thereof
GB9507238D0 (en) 1995-04-07 1995-05-31 Isis Innovation Detecting dna sequence variations
US5756122A (en) 1995-06-07 1998-05-26 Georgetown University Liposomally encapsulated nucleic acids having high entrapment efficiencies, method of manufacturer and use thereof for transfection of targeted cells
US6187757B1 (en) 1995-06-07 2001-02-13 Ariad Pharmaceuticals, Inc. Regulation of biological events using novel compounds
EP0854721B1 (en) 1995-08-02 2001-10-24 Smithkline Beecham Corporation Endothelin receptor antagonists
US5858397A (en) 1995-10-11 1999-01-12 University Of British Columbia Liposomal formulations of mitoxantrone
US5858401A (en) 1996-01-22 1999-01-12 Sidmak Laboratories, Inc. Pharmaceutical composition for cyclosporines
US6218108B1 (en) 1997-05-16 2001-04-17 Research Corporation Technologies, Inc. Nucleoside analogs with polycyclic aromatic groups attached, methods of synthesis and uses therefor
CA2294988C (en) 1997-07-01 2015-11-24 Isis Pharmaceuticals Inc. Compositions and methods for the delivery of oligonucleotides via the alimentary canal
US6022998A (en) 1997-07-24 2000-02-08 Mita Industrial Co., Ltd. Stilbene derivative and method for producing the same
US5950784A (en) 1997-09-03 1999-09-14 Yang; Shu-Chiung C. Hub structural improvement
US6197785B1 (en) 1997-09-03 2001-03-06 Guilford Pharmaceuticals Inc. Alkoxy-substituted compounds, methods, and compositions for inhibiting PARP activity
AU9298098A (en) 1997-09-03 1999-03-22 Guilford Pharmaceuticals Inc. Amino-substituted compounds, methods, and compositions for inhibiting parp activity
US6635642B1 (en) 1997-09-03 2003-10-21 Guilford Pharmaceuticals Inc. PARP inhibitors, pharmaceutical compositions comprising same, and methods of using same
AU9298198A (en) 1997-09-03 1999-03-22 Guilford Pharmaceuticals Inc. Di-n-heterocyclic compounds, methods, and compositions for inhibiting parp activity
US20020028813A1 (en) 1997-09-03 2002-03-07 Paul F. Jackson Thioalkyl compounds, methods, and compositions for inhibiting parp activity
US6365185B1 (en) 1998-03-26 2002-04-02 University Of Cincinnati Self-destructing, controlled release peroral drug delivery system
WO1999059973A1 (en) 1998-05-15 1999-11-25 Guilford Pharmaceuticals Inc. Carboxamide compounds, compositions, and methods for inhibiting parp activity
AU9298798A (en) 1998-05-15 1999-12-06 Guilford Pharmaceuticals Inc. Fused tricyclic compounds which inhibit parp activity
JP3646012B2 (ja) 1998-10-29 2005-05-11 京セラミタ株式会社 電子写真感光体
US6361815B1 (en) 1998-12-21 2002-03-26 Pure World Botanicals, Inc. Products comprising trihydroxystilbenes and derivatives thereof and methods for their manufacture and use
US6201020B1 (en) 1998-12-31 2001-03-13 Guilford Pharmaceuticals, Inc. Ortho-diphenol compounds, methods and pharmaceutical compositions for inhibiting parp
US6387902B1 (en) 1998-12-31 2002-05-14 Guilford Pharmaceuticals, Inc. Phenazine compounds, methods and pharmaceutical compositions for inhibiting PARP
NZ512731A (en) 1999-01-11 2004-01-30 Agouron Pharma Tricyclic inhibitors of poly(ADP-ribose) polymerases
EP1156812A4 (en) 1999-02-23 2004-09-29 Isis Pharmaceuticals Inc MULTIPARTICULAR FORMULATION
US7321050B2 (en) 1999-12-06 2008-01-22 Welichem Biotech Inc. Anti-inflammatory and psoriasis treatment and protein kinase inhibition by hydroxy stilbenes and novel stilbene derivatives and analogues
US7122679B2 (en) 2000-05-09 2006-10-17 Cephalon, Inc. Multicyclic compounds and the use thereof
IT1318539B1 (it) 2000-05-26 2003-08-27 Italfarmaco Spa Composizioni farmaceutiche a rilascio prolungato per lasomministrazione parenterale di sostanze idrofile biologicamente
US20020058708A1 (en) * 2000-08-16 2002-05-16 Inman Wayne D. Compositions containing hypotriglyceridemically active stilbenoids
GB0031263D0 (en) 2000-12-21 2001-01-31 Paterson Inst For Cancer Res Materials and methods for synthesizing stilbenes
US7220784B2 (en) 2000-12-21 2007-05-22 John Anthony Hadfield Substituted stilbenes and their reactions
AU2002323151A1 (en) 2001-08-13 2003-03-03 University Of Pittsburgh Application of lipid vehicles and use for drug delivery
US20030129665A1 (en) 2001-08-30 2003-07-10 Selvan Gowri Pyapali Methods for qualitative and quantitative analysis of cells and related optical bio-disc systems
EP2289499A3 (en) 2001-11-02 2012-05-16 The Regents of the University of California Methods and compositions for prevention and treatment of inflammatory disease, autoimmune disease, and transplant rejection
MXPA04010617A (es) 2002-04-26 2004-12-13 Warner Lambert Co Inhibidores de quinasa de puntos de control (wee1 y chk1).
WO2003094833A2 (en) 2002-05-10 2003-11-20 Orchid Chemicals & Pharmaceuticals Limited A new stereoselective route to produce tris-o-substituted-(e)-( 3,5-dihydroxyphenyl)-2-(4- hydroxyphenyl)ethene
WO2004009539A2 (en) 2002-07-19 2004-01-29 Orchid Chemicals And Pharmaceuticals Limited Method for the conversion of a z-isomer into e-isomer
EP1536794A2 (en) 2002-09-06 2005-06-08 Merck & Co., Inc. Treatment of rheumatoid arthritis by inhibition of pde4
EP1418164A1 (en) 2002-11-07 2004-05-12 Institut National De La Sante Et De La Recherche Medicale (Inserm) New stilbene derivatives and their use as aryl hydrocarbon receptor ligand antagonists
AU2004242947B2 (en) 2003-05-28 2010-04-29 Eisai Inc. Compounds, methods and pharmaceutical compositions for inhibiting PARP
WO2005014599A1 (en) 2003-06-04 2005-02-17 Cellular Genomics, Inc. Imidazo[1,2-a]pyrazin-8-ylamines and method of inhibition of bruton’s tyrosine kinase by such compounds
US7393848B2 (en) 2003-06-30 2008-07-01 Cgi Pharmaceuticals, Inc. Certain heterocyclic substituted imidazo[1,2-A]pyrazin-8-ylamines and methods of inhibition of Bruton's tyrosine kinase by such compounds
CN100348564C (zh) 2003-09-05 2007-11-14 帝斯曼知识产权资产管理有限公司 二苯乙烯衍生物的制备方法
EP1753708B1 (en) 2004-01-20 2018-02-21 Brigham Young University Novel sirtuin activating compounds and methods for making the same
US20050250836A1 (en) 2004-05-03 2005-11-10 Pfizer Inc Inhibitors of checkpoint kinases (Wee1 and Chk1)
MX2007000265A (es) 2004-07-02 2007-07-20 Icos Corp Compuestos utiles para inhibir chk1.
BRPI0515594B8 (pt) 2004-09-22 2021-05-25 Janssen Pharmaceutica Nv compostos inibidores da interação entre mdm2 e p53,composição farmacêutica, processo para a preparação desta composição farmacêutica, usos dos compostos, suas combinações e processo para a preparação destes compostos
AU2006204072C1 (en) 2005-01-06 2010-07-29 Merck Sharp & Dohme Corp. Inhibitors of checkpoint kinases
WO2006105262A1 (en) 2005-03-29 2006-10-05 Icos Corporation HETEROARYL UREA DERIVATIVES USEFUL FOR INHIBITING CHKl
US7728026B2 (en) 2005-04-11 2010-06-01 Abbott Laboratories, Inc. 2-substituted-1 h-benzimidazile-4-carboxamides are PARP inhibitors
TWI375673B (en) 2005-04-11 2012-11-01 Abbott Lab 1h-benzimidazole-4-carboxamides substituted with a quaternary carbon at the 2-position are potent parp inhibitors
JP2008540549A (ja) * 2005-05-09 2008-11-20 ハイドラ バイオサイエンシズ インコーポレイテッド Ｔｒｐｖ３機能調節用化合物
EP1931676B1 (en) 2005-10-06 2011-11-16 Schering Corporation Pyrazolopyrimidines as protein kinase inhibitors
CA2627623C (en) 2005-10-06 2014-04-22 Schering Corporation Methods for inhibiting protein kinases
EP1945216A1 (en) 2005-11-10 2008-07-23 Schering Corporation Methods for inhibiting protein kinases
CA2628455A1 (en) 2005-11-10 2007-05-24 Schering Corporation Imidazopyrazines as protein kinase inhibitors
JP2009522359A (ja) 2006-01-04 2009-06-11 メルク エンド カムパニー インコーポレーテッド チェックポイントキナーゼの阻害剤
WO2007084857A2 (en) 2006-01-13 2007-07-26 President And Fellows Of Harvard College Methods and compositions for treating cell proliferative disorders
JP2009523724A (ja) 2006-01-13 2009-06-25 ファーマサイクリクス，インコーポレイテッド チロシンキナーゼ阻害剤およびその使用方法
US20070276172A1 (en) 2006-03-28 2007-11-29 Sinha Arun K Single step microwave induced process for the preparation of substituted stilbenes and its analogs
TW200806670A (en) 2006-04-25 2008-02-01 Merck & Co Inc Inhibitors of checkpoint kinases
ES2385849T3 (es) 2006-05-02 2012-08-01 Abbott Laboratories Las 1H-bencimidazol-4-carboxamidas substituidas son potentes inhibidores de la PARP
JP5284955B2 (ja) 2006-06-20 2013-09-11 アボット・ラボラトリーズ Ｐａｒｐ阻害剤としてのピラゾロキナゾリノン
FR2904311B1 (fr) 2006-07-28 2013-01-11 Clariant Specialty Fine Chem F Nouveau procede de synthese de derives (e) stilbeniques perm permettant d'obtenir le resveratrol et le piceatannol
US8222288B2 (en) 2006-08-30 2012-07-17 The Regents Of The University Of Michigan Small molecule inhibitors of MDM2 and the uses thereof
US7737174B2 (en) 2006-08-30 2010-06-15 The Regents Of The University Of Michigan Indole inhibitors of MDM2 and the uses thereof
RU2459821C2 (ru) 2006-09-07 2012-08-27 Байоджен Айдек Ма Инк. Модуляторы киназы, ассоциированной с рецептором интерлейкина-1
SI2530083T1 (sl) 2006-09-22 2016-09-30 Pharmacyclics Llc Inhibitorji Bruton tirozin kinaze
US8809273B2 (en) 2007-03-28 2014-08-19 Pharmacyclics, Inc. Inhibitors of Bruton's tyrosine kinase
WO2009037343A1 (en) 2007-09-21 2009-03-26 Janssen Pharmaceutica Nv Inhibitors of the interaction between mdm2 and p53
SG185272A1 (en) 2007-10-03 2012-11-29 Eisai Inc Parp inhibitor compounds, compositions and methods of use
SG185297A1 (en) 2007-10-12 2012-11-29 Abbott Lab 2-((r)-2-methylpyrrolidin-2-yl)-1h-benzimidazole-4-carboxamide crystalline form 1
EP2426109B1 (en) 2007-10-23 2013-12-18 F. Hoffmann-La Roche AG Novel kinase inhibitors
US7683064B2 (en) 2008-02-05 2010-03-23 Roche Palo Alto Llc Inhibitors of Bruton's tyrosine kinase
CN101998959B (zh) 2008-02-06 2013-08-28 生物马林药物股份有限公司 聚(adp-核糖)聚合酶(parp)的苯并噁唑甲酰胺抑制剂
GB0804755D0 (en) 2008-03-14 2008-04-16 Angeletti P Ist Richerche Bio Therapeutic compounds
CN102066366B (zh) 2008-06-24 2014-04-16 霍夫曼-拉罗奇有限公司 新型取代的吡啶-2-酮和哒嗪-3-酮
ES2552681T3 (es) 2008-07-15 2015-12-01 F. Hoffmann-La Roche Ag Nuevas fenil-imidazopiridinas y piridazinas
US8299077B2 (en) 2009-03-02 2012-10-30 Roche Palo Alto Llc Inhibitors of Bruton's tyrosine kinase
ES2513915T3 (es) 2009-04-24 2014-10-27 F. Hoffmann-La Roche Ag Inhibidores de la tirosina quinasa de Bruton
US7741330B1 (en) 2009-10-12 2010-06-22 Pharmacyclics, Inc. Pyrazolo-pyrimidine inhibitors of Bruton's tyrosine kinase
JO2998B1 (ar) 2010-06-04 2016-09-05 Amgen Inc مشتقات بيبيريدينون كمثبطات mdm2 لعلاج السرطان
EP2663312B1 (en) 2011-01-10 2017-10-11 Nimbus Iris, Inc. Irak inhibitors and uses thereof
WO2012121662A1 (en) 2011-03-04 2012-09-13 Agency For Science, Technology And Research Novel pharmaceutical combinations and methods for treating cancer
AU2012275841A1 (en) * 2011-06-27 2014-01-16 The Jackson Laboratory Methods and compositions for treatment of cancer and autoimmune disease
KR20140048968A (ko) 2011-07-13 2014-04-24 파마시클릭스, 인코포레이티드 브루톤형 티로신 키나제의 억제제
CN102786414B (zh) * 2012-08-15 2014-07-16 四川大学 一类用于治疗和/或预防神经退行性相关疾病的化合物
WO2014177593A1 (en) * 2013-04-29 2014-11-06 MAX-PLANCK-Gesellschaft zur Förderung der Wissenschaften e.V. Amorfrutin analogs as ppargamma-modulators

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