JP2001520041A - 新規な改変核酸配列並びに細胞システムにおいてmRNAレベル及び蛋白質発現を増大させる方法 - Google Patents
新規な改変核酸配列並びに細胞システムにおいてmRNAレベル及び蛋白質発現を増大させる方法Info
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Abstract
Description
生物又は寄生性生物の遺伝子の一層高等な真核生物細胞システムにおける発現に
関係する。
イン・ビボ組換え生成システムにおいて、しばしば、困難である。例えば、多く
の研究者が、細菌、寄生虫及びウイルスに由来する蛋白質を、その蛋白質が最初
に得られた細胞と異なる細胞培養システム特に哺乳動物細胞培養システムにおい
て発現させることが困難であることを見出した。哺乳動物細胞により生成するこ
とが困難であった治療上重要な蛋白質の一例は、マラリア娘虫表面蛋白質(MS P−1)である。
る耐性は、急速に広がりつつあり、ワクチンが緊急に必要とされている。P.falc
iparumの生活環において発現される多数の抗原の内で、MSP−1が、最も広範
囲に研究されており、予防接種のための最も上首尾の候補である見込みがある。
P.falciparumにさらされた個人は、MSP−1に対する抗体を発生し、研究は、
MSP−1に対する自然に得られた免疫応答と減じたマラリア罹患率との間に相
関があることを示した。多数の研究の内で、精製した天然のMSP−1又はこの
蛋白質の組換え断片での免疫化は、少なくともこの寄生虫に対する部分的防護を
誘導した(Diggs等(1993)Parasitol.Today9:300-302)。従って、MSP−1は、P
.falciparumに対するワクチンの開発に関して重要な標的である。
ワクチンとしての利用のための組換え生成の焦点であった。しかしながら、ワク
チンとしてのMSP−1の開発における主要な問題は、細菌又は酵母発現システ
ムにおいて、免疫学的効力においてアフィニティー精製した天然の蛋白質と同等
である組換え蛋白質を得ること(Chang等(1992)J.Immunol.148:548-555)及びワク
チン生産を可能にするのに十分な量で該組換え蛋白質を得ることの困難さである
。
性生物体に由来する蛋白質の十分な量の発現を促進する改良された手順は、好都
合であろう。特に、十分な量でMSP−1を発現することのできる組換えシステ
ムは、特に好都合であろう。
乳動物細胞培養システム又はトランスジェニック哺乳動物において発現させるの
が困難であった異種細胞(好ましくは、細菌、ウイルス及び寄生虫等の下等生物)
由来のmRNAレベル及び蛋白質発現を増大させる手順を提供する。この発明に
よる発現システムにおける発現のための好適な蛋白質の候補は、この組換え発現
システムと比べて全体的に高いAT含量若しくはATリッチな領域及び/又はm
RNA不安定性モチーフ及び/又は希なコドンを含むDNAコード配列を有する
蛋白質である。
知の核酸(好ましくは、細菌、ウイルス又は寄生虫に由来する遺伝子)を特徴とし
、ここに、改変は、未改変配列と比べて減じたAT含量を含み、随意、天然の遺
伝子中に存在する少なくとも一つのmRNA不安定性モチーフの除去を更に含む
。ある好適具体例において、この改変は、更に、天然の遺伝子の少なくとも一つ
のコドンのこの細胞システムの好適コドンでの置換を含む。
T含量を低下させるステップ及び/又は少なくとも一つのmRNA不安定性モチ
ーフを除去するステップ及び/又は少なくとも一つのコドンを選択した細胞シス
テムの好適コドンで置換するステップ{すべて、天然の遺伝子中の少なくとも一 つのコドンを、選択した細胞システムに認識可能な(好ましくは、選択した細胞 システムに好まれる)コドンで置換し且つ置換されたコドンと同じアミノ酸をコ ードするコドンで置換することによる}を含むこの発明の改変された核酸を調製 する方法を提供する。この発明のこの面は、更に、この発明の方法により調製さ
れた改変された核酸を含む。
物中で活性なプロモーターを含むベクター、並びにこの発明の核酸でトランスフ
ォームされた宿主細胞をも提供する。
乳動物の作成ためのトランスジェニック発現ベクター及び生殖細胞系がこの発明
の核酸を含むトランスジェニック非ヒト泌乳動物を提供する。
れたその核酸によりコードされる蛋白質の乳腺でのトランスジェニック動物の乳
汁中への発現を指示するプロモーターを含むトランスジェニック泌乳動物種の作
成のためのトランスジェニック発現ベクターを提供する。
ワクチンを提供する。この発明のこの面の好適具体例には、この発明による改変
されたMSP−1遺伝子の断片が含まれる。
る。本明細書中で引用されている発行された米国特許、許可された出願、公開さ
れた外国出願及び参考文献は、本明細書中に参考として援用する。これらの参考
文献と本願の開示との間の如何なる矛盾も、本願の開示に賛成して解決されよう
。
レベルを及び細胞培養システム、哺乳動物細胞培養システムにおいて又はトラン
スジェニック動物において発現させることが困難であることが知られている(又 は、ありそうな)蛋白質の発現を増大させる方法を提供する。この発明の組換え 技術を用いる発現のための好適な「困難な」蛋白質の候補は、異種細胞好ましく
は寄生虫、細菌及びウイルス等の下等生物から導かれた、用いられるべき組換え
発現システムと比較して全体的に高いAT含量即ちATリッチの領域及び/又は
mRNA不安定性モチーフ及び/又は希なコドンを含む配列をコードするDNA
を有する蛋白質である。
る改変された公知の核酸好ましくは細菌、ウイルス又は寄生虫に由来する遺伝子
を特徴とし、ここに、この改変は、減じたAT含量(未改変配列と比べて)を含み
、適宜、天然の遺伝子中に存在する少なくとも一つのmRNA不安定性モチーフ
の除去を更に含む。「細胞システム」は、細胞培養システム、組織培養システム
、器官培養システム及び生きている動物の組織を包含する。ある好適具体例にお
いては、この改変は、更に、天然遺伝子の少なくとも一つのコドンのこの細胞シ
ステムの好適コドンでの置換を含む。これらの特徴の各々は、天然遺伝子の少な
くとも一つのコドンを、置換されたコドンと同じアミノ酸をコードするこの細胞
システムに認識可能な(好ましくは、好まれる)コドンで置換することにより達成
される。この発明により、かかる「サイレント」ヌクレオチド及びコドン置換は
、mRNAを生成して所望の蛋白質を発現する細胞システムの能力を維持しつつ
(好ましくは、改良しつつ)、ゴールのAT含量の低下及び/又はmRNA不安定
性モチーフの除去及び/又は希なコドンの数を減らすことを達せするのに十分で
あるべきである。
、この発明に含まれる(これらの改変された核酸が由来した公知の核酸は、特異 的に排除する)。一の配列は、その配列の正確な相補鎖と特異的にハイブリダイ ズするのに十分に相同であるならば、他の配列と「特異的に相同」である。一の
配列は、もしそれが、体内で、又はイオン強度に関して生理的条件に近い条件下
(例えば、140mM NaCl、5mM MgCl2)でハイブリダイズしてワ トソン−クリック又はフーグスティーン塩基対を形成するならば、他の配列と「
特異的にハイブリダイズする」。好ましくは、かかる特異的ハイブリダイゼーシ
ョンは、緊縮条件下(例えば、68℃で、0.2×SSC)に維持する。
ランスジェニック動物において、天然遺伝子によりイン・ビトロ細胞培養システ
ム又はトランスジェニック動物において同じ条件下(即ち、同じ細胞型、同じ培 養条件、同じ発現ベクター)で発現される蛋白質の少なくとも25%(好ましくは
50%)の、更に一層好ましくは少なくとも100%以上のレベルで蛋白質を発 現することができる。
する。発現は、関心ある蛋白質に特異的な抗体の利用を含む当分野で公知の多く
の技術によって測定することができる。「天然の遺伝子」又は「自然のままの遺
伝子」とは、野生型の蛋白質をコードし且つ改変された核酸が由来する遺伝子配
列又はその断片(天然の対立遺伝子変異体を含む)を意味する。「好適なコドン」
は、選択した細胞システムにより一層優勢に用いられるコドンを意味する。コド
ン置換が、少なくとも細胞システムにより認識されるコドンでありさえすれば、
ここに記載のすべてのコドンの変化が、好適コドンへの変化ではない。用語「減
じたAT含量」は、ここで用いる場合、A(アデニン)又はT(チミン)を含むヌク
レオチド位置の置換のために或はA及び/又はT含有コドンの選択した細胞シス
テムにより認識されるヌクレオチド又はコドンでの置換(該置換は、標的蛋白質 のアミノ酸配列を変化させない)のために、A又はT塩基を有するヌクレオチド の全体的に一層低いパーセンテージ(天然の遺伝子と比べて)を有することを意味
する。「異種」は、ここでは、遺伝物質を導入した種と異なる種に起源を発する
その遺伝物質又はかかる遺伝物質から生成された蛋白質を示すために用いられて
いる。
OS細胞及びCHO細胞並びにトランスジェニック動物特にトランスジェニック
動物の乳組織が含まれる。しかしながら、この発明は又、細菌、酵母、大腸菌及
びバキュロウイルス等のウイルス性発現システム及び植物のシステムさえも企図
している。
T含量を減じ、及び/又は少なくとも一つのmRNA不安定性モチーフを除去し
、及び/又は少なくとも一つのコドンを選択した細胞システムの好適コドンで置
換するステップ(すべて、天然の遺伝子中の少なくとも一つのコドンを選択した 細胞システムにより好まれるコドンで置換することにより、且つ該置換後のコド
ンは、置換されたコドンと同じアミノ酸をコードする)を含むこの発明の改変さ れた核酸の製造方法を提供する。組換えDNA技術の原理を記載している標準的
な参考文献には、Watson,J.D.等、Molecular Biology of the Gene,第I及びI I巻 the Benjamin/Cummings Publishing Company,Inc.publisher,Menlo Park,カ
リフォルニア (1987)Darnell,J.E.等、Molecular Cell Biology,Scientific American Books,Inc.,Publisher,New York,ニューヨーク(1986); Old,R.W.,等、Principles of G ene Manipulation: An Introduction to Genetic Engineering,第二版、Univers
ity of California Press,publisher,Berkeleyカリフォルニア(1981); Maniatis,T.,等 、Molecular Cloning: A Laboratory Manual,第二版、Cold Spring Harbor Labo
ratory,publisher,Cold Spring Harbor,ニューヨーク(1989)及びCurrent Protocols in Molecular Biology,Ausubel等、Wiley Press,New York,ニューヨーク(1992)が含まれ る。この発明のこの面は、この発明の方法により調製された改変された核酸をも
包含する。
NAの3’非翻訳領域からの保存されたAU配列(AUUUA)が選択的mRNA
分解を媒介することを示した(Shaw,G.及びKamen,R.Cell46:659-667)。この過去 における焦点は、遺伝子の非翻訳領域内のこれらの不安定性モチーフの存在の上
にあった。本発明は、遺伝子のコード領域内の不安定性配列の除去の利点を認識
する最初のものである。
物中で活性なプロモーターを含むベクター、及びこの発明の核酸でトランスフォ
ームされた宿主細胞をも提供する。好適なベクターは、複製起点を含み、従って
、少なくとも一の細胞型において複製可能である。ある好適なベクターは、発現
ベクターであり、少なくとも一つのプロモーター及び受動的ターミネーターを更
に含み、それにより、組換え発現エレメントの細菌、カビ、植物、昆虫又は哺乳
動物細胞における転写を可能にしている。
乳動物の作成のためのトランスジェニック発現ベクター並びに、生殖細胞系列が
この発明の核酸を含むトランスジェニック非ヒト泌乳動物を提供する。かかるト
ランスジェニック発現ベクターは、宿主トランスジェニック動物のゲノムの部分
として発現することのできるプロモーターを含む。トランスジェニック動物作成
のための一般的原理は、当分野で公知である。例えば、Hogan等,Manipulating t
he Mouse Embryo: A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Laboratory,(1986
);Simons等,Bio/Technology6:179-183,(1988);Wall等,Biol.Reprod.32:645-65
1,(1985);Buhler等,Bio/Technology,8:140-143(1990);Ebert等,Bio/Technolog
y9:835-838(1991);Krimenfort等,Bio/Technology9:844-847(1991);Wall等,J.C
ell.Biochem.49:113-120(1992)を参照されたい。外来DNA配列を哺乳動物及び
それらの生殖細胞に導入する技術は、最初、マウスにおいて開発された。例えば
、Gordon等,Proc.Natl.Acad.Sci.USA77:7380-7384,(1980);Gordon及びRuddle,S
cience214:1244-1246(1981);Palmiter及びBrinster,Cell41:343-345,1985;Bri
nster等,Proc.Natl.Acad.Sci.USA82:4438-4442(1985)及びHogan等(前出)を参照 されたい。これらの技術は、その後、ウシ及びヤギを含むもっと大きい動物用に
改変された。ごく最近まで、トランスジェニックマウス又は家畜の作成のための
最も広く用いられた手順においては、トランスジェニック発現構築物の形態の関
心あるDNAの数百の線状分子が、受精卵の前核の一つに注入される。接合体の
細胞質中へのDNAの注入も又、広く用いられている。最も最近において、未受
精卵に注入することのできる完全なトランスジェニック細胞系統のクローン化が
、達成された(KHS Campbell等,Nature380 64-66(1996))。
れ、その核酸によりコードされる蛋白質の乳腺での発現(トランスジェニック動 物の乳汁中への)を指示するプロモーターを含むトランスジェニック泌乳動物種 の作成のためのトランスジェニック発現ベクターを提供する。この乳腺発現シス
テムは、高発現レベル、低コスト、正確なプロセッシング及び利用しやすさの利
点を有している。公知の蛋白質例えばウシ及びヒトのアルファ−ラクトアルブミ
ンが、何人かの研究者により、泌乳トランスジェニック動物において生成されて
おり、(Wright等,Bio/Technology9:830-834(1991);Vilotte等,Eur.J.Biochem.,
186:43-48(1989);Hochi等,Mol Reprod.And Devel.33:160-164(1992);Soulier 等,FEBS Letters297(1,2):13-18(1992))且つこのシステムは、高レベルの蛋白質
を生成することが示されている。
る遺伝子例えば乳組織において見出される遺伝子において特異的に活性な即ち乳
汁が合成される生理的条件下で乳組織において他の組織におけるよりも一層活性
であるプロモーターは、特に有用である。最も好適なのは、乳組織に特異的で且
つ該組織で効率的であるプロモーターである。かかるプロモーターの内で、カゼ
イン、ラクトアルブミン及びラクトグロブリンのプロモーターが好適である(ア ルファ、べータ及びガンマカゼインプロモーター及びアルファラクトアルブミン
及びべータ−ラクトグロブリンプロモーターが含まれるが、これらに限られない
)。これらのプロモーターの内で、ゲッ歯類、ヤギ及びウシ由来のものが好適で ある。他のプロモーターには、乳清酸性蛋白質(WAP)遺伝子を調節するものが
含まれる。
細胞培養システム、哺乳動物細胞培養システムにおいて又はトランスジェニック
動物の乳汁中で発現し得るその断片を提供する。天然のMSP−1遺伝子をコー
ドする核酸配列を、この発明により改変する。第一に、全体的AT含量を、天然
遺伝子のコドンを選択した細胞システムに認識可能なコドン(好ましくは、該細 胞システムに好まれるコドン)で置換することにより減じる(該置換後のコドンは
、同じアミノ酸をコードするが、改変された核酸のAT含量を天然のままのMS
P−1遺伝子又は遺伝子断片と比べて低下させるのに十分である)。第2に、天 然の遺伝子又は遺伝子断片中のmRNA不安定性モチーフ(AUUUA、Shaw及 びKamen,前出)を、天然遺伝子のコドンを、選択した細胞システムにより認識さ れ得る(好ましくは、好まれる)コドンで置換することにより、この遺伝子のコー
ド配列から除去する(該置換後のコドンは、同じアミノ酸をコードするが、mR NA不安定性モチーフを除去するには十分なものである)。適宜、天然遺伝子の 任意の他のコドンを、記載したように、選択した発現システムの優先的コドンで
置換することができる。
ワクチンを提供する。ある好適な具体例において、このDNAワクチンは、この
発明によるベクターを含む。この発明によるDNAワクチンは、「裸の」形態で
あってもこの発明による精製された改変された核酸の形態であってもよい(プロ モーターと機能的に結合していてもいなくてもよい)。核酸は、その核酸配列が 発現可能となるような仕方でプロモーターと結合されているならば、プロモータ
ーと機能的に結合されている。かかるDNAワクチンは、カプセル封入しないで
送達することができ、又はリポソーム若しくはウイルスゲノムの部分として送達
することができる。一般に、かかるワクチンは、この核酸の発現を可能にして、
このワクチンを受けたヒトを含む動物中に抗体応答を誘出するのに十分な量で送
達される。最初の送達から少なくとも一週間後の第二次の送達を用いて、抗体応
答を増大させることができる。好適な送達経路には、粘膜経由の導入並びに非経
口投与が含まれる。
伝子の断片が含まれる。かかる断片は、好ましくは、遺伝子配列全体の約5〜1
00%を含み且つ少なくとも一のこの発明による改変を含む。
P−1の自然のままの遺伝子並びにこの発明の改変されたMSP−1遺伝子につ
いてのコドン利用頻度を示しており、又、大腸菌の該遺伝子におけるコドン利用
頻度とヒトのそれとの比較もしている。コドン利用頻度表は、容易に利用するこ
とができ、多くの他の発現システム(例えば、酵母、バキュロウイルス及び哺乳 動物のシステム)について当業者に公知である。
いて同様の結果を得ることができるので、この発明の範囲を制限することを意味
するものではない。
酸を提供する。この発明の哺乳動物細胞中で発現することのできるMSP−1の
42kDのC末端部分(MSP−142)をコードするのこの発明の新規な改変され
た核酸を図1に示す。天然のMSP−142遺伝子(図2)は、哺乳動物細胞培養中
で又はトランスジェニックマウスにおいて発現することができなかった。天然の
MSP−142遺伝子の分析は、それを哺乳動物の遺伝子と区別する幾つかの特徴
を示唆した。第一に、それは、全体的に非常に高い76%のAT含量を有してい
る。第二に、mRNA不安定性モチーフAUUUAが、この1100bpのDN
Aセグメント中に10回現れた(図2)。これらの差異を扱うために、新たなMS
P−142遺伝子をデザインした。サイレントヌクレオチド置換を天然のMSP−
142遺伝子の306の位置に導入して全体的AT含量を49.7%に減少させた
。その上、天然遺伝子中の10のAUUUAmRNA不安定性モチーフの各々を
、コドン使用量の変更により除去した。コドン使用量を変えるために、乳組織特
異的コドン使用表(図3a)を、幾つかのマウス及びヤギの乳特異的蛋白質を用い
て作成した。この表を用いて、上記のように改変したMSP−142遺伝子につい
てのコドン使用量の選択を導いた。例えば、表(図3a中)に示したように、天然
遺伝子において、Leuの65%(25/38)が、TTA(乳腺においては希な コドン)によりコードされていた。改変されたMSP−142遺伝子においては、 100%のLeuがCTG(乳腺におけるLeuの好適なコドン)によりコードさ
れた。
カゼインの最初の26アミノ酸をこの改変されたMSP−142遺伝子のN末端に
融合することにより作成し、この融合遺伝子を有するSalI−XhoI断片を
発現ベクターpCDNA3のXhoI部位にサブクローン化した。この遺伝子産
物をアフィニティー精製可能にするためにこのMSP−142遺伝子の3’末端に
His6タグを融合させた。これは、プラスミドGTC627(図4c)を生じた
。
比較するために、天然のMSP−142遺伝子についても発現ベクターを作成して
、その遺伝子を哺乳動物細胞培養に加え、下記のようにマウスに注入してトラン
スジェニックマウスを生成した:
するために、MSP−1の42KDのC末端部分(MSP−142)をコードする野
生型遺伝子をヤギのべータ−カゼインの最初の15又は25アミノ酸をコードす
るDNAに融合した。これは、第一に、MSP−1プラスミド(NIHのDavid K
aslow博士から得た)をプライマーMSP1及びMSP2(図6)を用いて増幅する
PCRにより達成され、次いで、そのPCR生成物をTAベクター(Invitrogen)
中にクローン化する。PCR生成物のBglII−XhoI断片を、オリゴOT
1及びOT2(図6)を用いて発現ベクターpCDNA3中に連結した。この生成
されたプラスミドGTC564(図4b)は、15アミノ酸のべータ−カゼインシ
グナルペプチド及び成熟ヤギべータ−カゼインの最初の11アミノ酸をコードし
、その次に天然のMSP−142遺伝子が続く。オリゴMSP−8及びMSP−2
(図6)を用いて、MSP−1プラスミドをPCRにより増幅し、次いで、その生
成物をTAベクター中にクローン化した。XhoI断片を切り出して、発現ベク
ターpCDNA3のXhoI部位にクローン化して、プラスミドGTC479( 図4a)を生成した(これは、野生型MSP−142遺伝子に融合された15アミノ
酸のヤギべータ−カゼインシグナルペプチドをコードした)。His6タグを、 GTC564及びGTC479中のMSP−142遺伝子の3’末端に加えた。
クションアッセイによりアッセイした。GTC479及びGTC564プラスミ
ドDNAを、リポフェクタミン(Gibco-BRL)により、製造業者のプロトコールに 従ってCOS−7細胞に導入した。全細胞RNAを、COS細胞から、トランス
フェクションの二日後に単離した。これらの新たに合成された蛋白質を、35Sメ
チオニンを加える(トランスフェクションの二日後に培養培地に加える)ことによ
り10時間にわたって代謝的に標識した。
を、GTC479に由来する32P標識したDNA断片をプローブとして調べた。
MSPRNAは、GTC479又はGTC564トランスフェクタントにおいて
検出されなかった(データは、示してない)。もっと長い露出は、分解されたMS
PmRNAの残留レベルを示した。35S標識した培養上清及び細胞溶解物は、M
SPに対して高められたポリクローナル抗体で免疫沈降された。免疫沈降実験は
、これらのGTC479又はGTC564でトランスフェクトされた細胞の溶解
物又は上清の何れからも、発現を示さなかった(データは、示してない)。これら
の結果は、天然のMSP−1遺伝子がCOS細胞において発現されないことを示
した。
れない GTC479のSalI−XhoI断片(15アミノ酸のヤギべータ−カゼイ ンシグナルペプチド、ヤギべータ−カゼインの最初の11アミノ酸及び天然のM
SP−142遺伝子をコードする)を、ベクターBC350中で発現されるべータ −カゼインのXhoI部位にクローン化した。これは、プラスミドBC574( 図7)を生成した。BC574のSalI−NotI断片を、マウス胚中に注入 して、トランスジェニックマウスを生成した。15系統のトランスジェニックマ
ウスを樹立した。雌の創出マウスからの乳汁を集めて、MSPに対するポリクロ
ーナル抗体を用いるウエスタンブロット分析にかけた。分析した7匹のマウスの
何れも、それらの乳汁中にMSP−142蛋白質を発現することが見出されなかっ
た。MSP−142のmRNAが乳腺で発現されるかどうかを更に測定するために
、全RNAを、11日間泌乳しているトランスジェニックマウスから抽出して、
ノーザンブロッティングにより分析した。MSP−142mRNAは、分析したB
C574系統の何れによっても検出されなかった。それ故、MSP−142トラン
スジーンは、トランスジェニックマウスの乳腺において発現されなかった。まと
めると、これらの実験は、天然の寄生虫のMSP−142遺伝子が哺乳動物細胞に
おいて発現され得なかったこと及びこのブロックがmRNAの豊富さのレベルに
あることを示唆している。
改変されたMSP−142遺伝子の発現を評価した。GTC627及びGTC47
9DNAをCOS−7細胞に導入した。全RNAを、トランスフェクションの4
8時間後にノーザン分析用に単離した。固定化したRNAをGTC627の32P
標識したSalI−XhoI断片をプローブとして調べた。劇的な差異が、GT
C479とGTC627の間で認められた。GTC479でトランスフェクトさ
れた細胞においては前に示したようにMSP−142mRNAが検出されなかった
が、豊富なMSP−142mRNAがGTC627により発現された(図5、パネ ルA)。GTC469を負の対照として用いたが、これは、市販のクローニング ベクターのPU19中にクローン化したGTC564のインサートを含む。35S
メチオニンを用いる代謝的標識実験とそれに続くMSPに対するポリクローナル
抗体(NIAID、NIHのD.Kaslow提供)を用いる免疫沈降は、MSP−142蛋
白質がトランスフェクトされたCOS細胞により合成されるを示した(図5、パ ネルB)。更に、MSP−142は、トランスフェクトされたCOSの上清中で検 出されたが、これは、MSP−142蛋白質が分泌もされることを示している。更
に、Ni−NTAカラムを用いて、MSP−142を、GTC627トランスフェ
クトされたCOS上清からアフィニティー精製した。
SPmRNAの発現へと導くことを示した。従って、MSP−142産物は、哺乳
動物細胞により合成されて分泌された。
製することができる(Antibodies: A Laboratory Manual,Ed Harlow及びDavid La
ne編、Cold Spring Harbor Laboratory,publishers(1988))。MSP血清抗体の 生成も又、Chang等,Infection and Immunity(1996)64:253-261及びChang等,(199
2)Proc.Natl.Acad.Sci.USA86:6343-6347に記載されている。
(全く発現されなかった)と比べて非常に高レベルで発現されることを示している
。これらの結果は、遺伝子中のAT%を減じることが異種システムにおけるMS
P遺伝子の発現に導くという第一の実験的証拠を示しており、MSPコード領域
からのAUUUAmRNA不安定性モチーフの除去がCOS細胞におけるMSP
蛋白質の発現を導くという第一の証拠もを示している。
存在及び又は選択した細胞システムに認識不能な希なコドンの使用の故に細胞培
養又はトランスジェニックシステムにおいて発現させるのが困難であろうある種
の異種蛋白質を、任意所定のシステムにおいて発現できるように、そのシステム
についてのコドン利用表の助けによって、作り直すことができることを示唆して
いる。本発明は、低RNAレベル又はRNAが全くないということを生じる分解
の原因となると思われる配列を除去する目的をもってDNA配列が改変された第
一のものに相当する。図5、パネルAのノーザンに示した結果(即ち、天然の遺 伝子ではRNAは検出されず、この発明による改変されたDNA配列では、妥当
なレベルのRNAが検出された)は、蛋白質生成の増加をもっともらしく説明す る。
白質としての(且つグリコシル化されてない)MSP1−42の発現を説明する。
ために、15アミノ酸のカゼインシグナル及びClaI部位で終わるMSP1−
42の最初の5アミノ酸をコードするオリゴMSP203及びMSP204の対
(MSP203:ggccgctcgacgccaccatgaaggtcctcataattgcctgtctggtggctctggcca
ttgcagccgtcactccctccgtcat、MSP204:cgatgacggagggagtgacggctgcaatggc
cagagccaccagacaggcaattatgaggaccttcatggtggcgtcgagc)を、MSP1−42遺伝
子の残りをコードするBC620(図8)のClaI−XhoI断片と共に、発現
ベクターpCDNA3のXhoI部位に連結した。このプラスミド(GTC66 9)のXhoI断片を、次いで、乳特異的発現ベクターBC350のXhoI部 位にクローン化して、B670(図9)を生成した。
クロインジェクションしてトランスジェニックマウスを生成した。トランスジェ
ニックマウスを、マウスのDNAを尾のバイオプシーから抽出した後にオリゴG
TC17及びMSP101を用いるPCR分析により同定した(オリゴGTC1 7の配列:GATTGACAAGTAATACGCTGTTTCCTC、オリゴMSP101、GGATTCAATAGAT
ACGG)。雌の創出トランスジェニックマウスの乳汁を、泌乳の7日目及び9日目 に集め、ポリクローナル抗MSP抗体及びモノクローナル抗MSP抗体5.2( NIH、David Kaslow博士)を用いるウエスタン分析にかけて、MSP−1−4 2の発現レベルを測定した。結果は、トランスジェニックマウスの乳汁中のMS
P−1−42の発現レベルが1〜2mg/mlであることを示した(図10)。
白質がNグリコシル化されることを示した。MSP1−42遺伝子中のNグリコ
シル化部位を除去するために、181位及び262位のAsn(N)をGln(Q)
で置換した。これらの置換を、MSP1の対応領域にアニールし且つAACから
CAGへの突然変異を担うDNAオリゴをデザインすることにより導入した。こ
れらのオリゴを、次いで、PCRプライマーとして用いて、NからQへの置換を
コードするDNA断片を生成した。
GGAATGCTGCAGATCAGC)及びMSP42−2(AATTCTCGAGTTAGTGGTGGTGGTGGTGGTGATC
GCAGAAAATACCATG、図11)の対を用いて、合成のMSP1−42遺伝子を含むプ
ラスミドGTC627をPCR増幅した。このPCR生成物を、pCR2.1ベ
クター(Invitrogen)中にクローン化した。これは、プラスミドGTC716を生
成した。
TGTTCAGGAACTTGTAGGG)及びMSPGLCO−2(GTCCTGCAGTACACATATGAG、図4) を用いて、プラスミドGTC627を増幅した。このPCR生成物を、pCR2
.1中にクローン化した。これは、プラスミドGTC700を生成した。
BC670のXhoI−BsmI断片とGTC716のBsmI−XhoI断片
をベクターpCR2.1のXhoI部位に連結する。これは、N262−Q突然
変異を有するMSP−1−42遺伝子を含むプラスミドを生じた。次いで、この
プラスミドのEcoNI−NdeI断片をプラスミドGTC716からのEco
NI−NdeI断片により置換して第二の突然変異N181−Qを導入した。こ
のプラスミドのXhoI断片を、最後に、BC350中にクローン化してBC7
18(図12)を生成した。
カゼインプロモーターの制御下に、それがトランスジェニック動物の乳腺におい
て泌乳中発現され得るように有している。更に、それは、N末端に何らの更なる
アミノ酸も有しないMSP1−42が乳汁中に分泌され得るように、MSP1−
42に直接融合された15アミノ酸のβ−カゼインリーダー配列をコードする。
最後に、N−Q置換のために、この構築物によりトランスジェニック動物の乳汁
中に生成されたMSPは、N末端グリコシル化されない。まとめると、BC71
8により乳汁中に生成されたトランスジェニックMSPは、寄生虫のMSPと同
じである。
クロインジェクションしてトランスジェニックマウスを生成した。トランスジェ
ニック動物を、前に記載されたように同定した。雌の創出動物の乳汁を集めて、
抗体5.2を用いるウエスタンブロッティングにより分析した。図13に示した
結果は、非グリコシル化MSP1の濃度0.5〜1mg/mlでの発現を示して
いる。
えられること及びそれらが請求の範囲によりカバーされることを認識し、又は確
認することができるであろう。
じ蛋白質アミノ酸配列を維持しつつmRNA不安定性モチーフが排除されている
)を描いた図である。大文字は、ヌクレオチド置換を示している。
ヌクレオチド配列を描いた図である。
P−142遺伝子(表中で「編集されたMSP」で示した)及び幾つかの乳蛋白質遺
伝子(ヤギ及びマウス由来のカゼイン遺伝子)についてのコドン利用表である。各
欄内の数値は、特定のコドンが列記した各遺伝子において現れる実際の回数を示
している。この新たなMSP−142合成遺伝子は、乳特異的なコドン利用量から
、所定のアミノ酸のGCリッチなコドンを第一に選択する(乳蛋白質において最 も頻繁に利用されているアミノ酸を選択することと組み合わせる)ことにより導 かれた。
変したMSP−142遺伝子(表中で「編集されたMSP」で示した)の両者におい
て現れる回数を含むコドン利用表である(図3aにも示してある)。図3bの表は
、各コドンが、野生型MSP−142及び新たな改変したMSP−142遺伝子にお
いて現れる頻度を、各コドンの大腸菌遺伝子及びヒトの遺伝子の両者における出
現頻度と比較している。従って、もしこの発現システムが大腸菌細胞であったな
らば、この表を用いてどのコドンが大腸菌により認識され又は好まれるかを決定
することができる。
含み、GTC479が自然のままのMSP−142遺伝子を含む構築物であり且つ
構築物GTC469が負の対照用DNAであるノーザン分析である。 パネルB アフィニティー精製後の溶出画分のウエスタン分析である。数字は、採取した
画分である。これらの結果は、GTC679(改変されたMSP−142合成遺伝 子構築物)からの画分がMSP−1に対するポリクローナル抗体と反応したが、 負の対照のGTC479は反応しなかったことを示している。
[SEQ ID NO:5]MSP−2[SEQ ID NO:6]及びMSP1[SEQ ID NO:7]の核酸配
列を描いた図である。
表示である。
Claims (26)
- 【請求項1】 哺乳動物細胞中で発現することのできる寄生虫の改変された
公知の核酸であって、改変が、遺伝子中の少なくとも一のAT含有コドンの、置
換されたコドンと同じアミノ酸をコードする好適コドンでの置換による遺伝子の
AT含量の減少を含む当該改変された核酸。 - 【請求項2】 哺乳動物細胞中で発現することのできる寄生虫蛋白質の改変
された公知の核酸であって、遺伝子のコード鎖中に存在する少なくとも一のmR
NA不安定性モチーフが、該mRNA不安定性モチーフを置換されたコドンと同
じアミノ酸をコードする好適コドンで置換することによって除去されている当該
改変された核酸。 - 【請求項3】 公知の遺伝子の少なくとも一のコドンが、置換されたコドン
と同じアミノ酸をコードする好適な乳蛋白質特異的なコドンで置換されている、
請求項1又は2に記載の改変された核酸。 - 【請求項4】 哺乳動物細胞で発現することのできる寄生虫の改変された公
知の核酸であって、この公知の遺伝子コーディングの全体的AT含量が乳蛋白質
特異的コドンでの置換により低下されており且つこの遺伝子中に存在する少なく
とも一のmRNA不安定性モチーフが乳蛋白質特異コドンでの置換により除去さ
れ且つ天然遺伝子の少なくとも一のコドンが好適な乳蛋白質特異的コドンにより
置換されている当該改変された核酸。 - 【請求項5】 前記の改変された核酸が前記の蛋白質を、イン・ビトロ又は
イン・ビボ哺乳動物細胞システム中で前記の天然遺伝子により発現されるレベル
の少なくとも100%のレベルで発現することのできる、請求項4に記載の改変
された核酸。 - 【請求項6】 哺乳動物細胞中での発現のための寄生虫の改変された公知の
核酸の製造方法であって、天然遺伝子のAT含量を、その天然遺伝子の少なくと
も一のAT含有コドンを、置換されたコドンと同じアミノ酸をコードする好適な
乳特異的コドンで置換することにより低下させることを含む当該製造方法。 - 【請求項7】 哺乳動物細胞中での発現のための寄生虫蛋白質の改変された
公知の核酸の製造方法であって、遺伝子コード配列中に存在する少なくとも一の
mRNA不安定性モチーフをその遺伝子中の少なくとも一のmRNA不安定性モ
チーフを、置換されたコドンと同じアミノ酸をコードする乳特異的コドンで置換
することにより除去することを含む当該製造方法。 - 【請求項8】 前記の蛋白質をコードする天然遺伝子中の少なくとも一のコ
ドンを、置換されたコドンと同じアミノ酸をコードする好適な乳特異的コドンで
置換することを更に含む、請求項5又は6に記載の方法。 - 【請求項9】 請求項5又は6に記載の方法により製造された改変された核
酸配列。 - 【請求項10】 哺乳動物細胞における発現のための寄生虫の改変された公
知の核酸の製造方法であって、下記のステップを含む当該方法: a)前記の蛋白質をコードする天然遺伝子中に存在する少なくとも一のmRNA
不安定性モチーフを、その遺伝子中の少なくとも一のmRNA不安定性モチーフ
を、置換されたコドンと同じアミノ酸をコードする好適な乳蛋白質特異的コドン
で置換することにより除去し; b)前記の蛋白質をコードする天然遺伝子のATリッチな含量を、その遺伝子の
少なくとも一のAT含有コドンを、置換されたコドンと同じアミノ酸をコードす
る乳蛋白質特異的コドンで置換することにより低下させ;そして c)前記の蛋白質をコードする天然遺伝子中の少なくとも一のコドンを、置換さ
れたコドンと同じアミノ酸をコードする好適な乳特異的コドンで置換する。 - 【請求項11】 請求項10に記載の方法により製造された改変された核酸
。 - 【請求項12】 前記の寄生虫がマラリアであり、且つ前記の核酸が、SEQ
ID NO:1若しくはSEQ ID NO:9の断片又はそれらと特異的に相同な配列である、
請求項1に記載の改変された核酸。 - 【請求項13】 前記の寄生虫がマラリアであり、且つ前記の核酸が、SEQ
ID NO:9若しくはその断片又はそれらと特異的に相同な配列である、請求項1に
記載の改変された核酸。 - 【請求項14】 細胞システムで発現することのできるSEQ ID NO:1の断片
又はそれに特異的に相同な配列である改変された核酸であって、その天然遺伝子
のAT含量が、少なくとも一のコドンの前記の細胞培養システムにより認識し得
るコドンでの置換により低下されており、置換後のコドンは置換されたコドンと
同じアミノ酸をコードするが該置換はこの天然遺伝子の全体的AT含量を効果的
に低下させる、当該改変された核酸。 - 【請求項15】 細胞システムで発現することのできるSEQ ID NO:1の断片
又はそれに特異的に相同な配列である改変された核酸であって、その天然遺伝子
のコード配列中に存在する少なくとも一のmRNA不安定性モチーフが、該不安
定性モチーフを含む少なくとも一のコドンを該細胞システムにより認識し得るコ
ドンで置換することにより除去されており、該置換は該不安定性モチーフを効果
的に除去し且つ置換されたコドンと同じアミノ酸をコードする、当該改変された
核酸。 - 【請求項16】 天然遺伝子の少なくとも一のコドンが前記の細胞システム
の好適コドンで置換されている、請求項14又は15に記載の改変された核酸。 - 【請求項17】 請求項12に記載の改変された核酸を含むベクター。
- 【請求項18】 請求項17のベクターでトランスフェクトされ又はトラン
スフォームされた宿主細胞。 - 【請求項19】 請求項12に記載の改変された核酸を含むトランスジェニ
ック発現構築物。 - 【請求項20】 生殖細胞系統が請求項12に記載の改変された核酸を含む
トランスジェニック非ヒト動物。 - 【請求項21】 トランスジェニック動物の作成のためのトランスジェニッ
ク発現ベクターであって、請求項12に記載の改変された核酸と機能的に結合さ
れたプロモーターを含み、該プロモーターが該改変された核酸によりコードされ
る蛋白質の乳腺でのその動物の乳汁中への発現を指示する、当該トランスジェニ
ック発現ベクター。 - 【請求項22】 細胞システムにおいて発現することのできる細菌、ウイル
ス又は寄生虫の改変された公知の核酸であって、その遺伝子のAT含量が少なく
とも一のコドンの該細胞システムにより認識し得るコドンでの置換により低下さ
れており、該置換後のコドンが置換されたコドンと同じアミノ酸をコードするが
該置換が天然遺伝子の全体的ATリッチな含量を効果的に低下させる、当該改変
された公知の核酸。 - 【請求項23】 細胞システムにおいて発現することのできる細菌、ウイル
ス又は寄生虫の改変された核酸であって、その遺伝子コード配列中に存在する少
なくとも一のmRNA不安定性モチーフが、該不安定性モチーフを含む少なくと
も一のコドンを該細胞システムにより認識され得るコドンで置換することにより
除去されており、該置換が該不安定性モチーフを効果的に排除し且つ置換された
コドンと同じアミノ酸をコードする、当該改変された核酸。 - 【請求項24】 天然遺伝子の少なくとも一のコドンが前記の細胞システム
の好適コドンで置換されている、請求項22又は23に記載の改変された核酸。 - 【請求項25】 請求項24に記載の改変された核酸を含むDNAワクチン
。 - 【請求項26】 請求項17に記載のベクターを含むDNAワクチン。
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