JP5836125B2 - 高分子量メラノーマ関連抗原に対する完全ヒト抗体およびその使用 - Google Patents

高分子量メラノーマ関連抗原に対する完全ヒト抗体およびその使用 Download PDF

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Description

優先権主張
これは、２００８年１０月１６日に出願された米国仮出願第６１／１０６，０５５号（これは、参考として本明細書に援用される）の利益を主張する。
政府の援助についての承認
この発明は、Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅｓ ｏｆ ＨｅａｌｔｈのＮａｔｉｏｎａｌ Ｃａｎｃｅｒ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅによって付与された契約番号第ＣＡ１６０５６号および同第ＣＡ１０５５００号の下で政府の援助を受けてなされた。政府は、本発明に一定の権利を有する。
分野
本開示は、完全ヒト（ｆｕｌｌｙ ｈｕｍａｎ）モノクローナル抗体、特に、高分子量メラノーマ関連抗原（ＨＭＷ−ＭＡＡ）に特異的に結合するヒトモノクローナル抗体、およびそれらの使用に関する。
背景
メラノーマは、メラノサイトまたはメラノサイト関連母斑細胞に由来する高悪性度でしばしば転移性の腫瘍である（非特許文献１）。メラノーマは、すべての皮膚癌の約３パーセントを占め、メラノーマの世界的な増加は、女性の肺癌を除く他のいずれの新生物によっても超えられない（非特許文献１；非特許文献２）。メラノーマが、明らかに皮膚に限局されるときでさえ、患者の最大３０％が全身転移を発症し、大部分が死亡する（非特許文献２）。メラノーマ処置の従来の様式としては、外科術、放射線照射および化学療法が挙げられる。過去１０年間において、メラノーマを処置するための新しい有望な方法として免疫療法および遺伝子治療が登場した。
癌に対する免疫応答がヒトに存在するという有力な証拠は、メラノーマ沈着物内にリンパ球が存在することによって提供される。これらのリンパ球は、単離されると、自己メラノーマ上および同種メラノーマ上の特異的な腫瘍抗原を主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）拘束性様式で認識することができる（非特許文献３；非特許文献４；非特許文献５；非特許文献６；非特許文献７；非特許文献８；非特許文献９；非特許文献１０）。転移性メラノーマを有する患者由来の腫瘍浸潤リンパ球（ＴＩＬ）は、メラノサイト−メラノーマ系統特異的組織抗原を含む共有抗原をインビトロにおいて認識する（Ｋａｗａｋａｍｉら（１９９３）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｔｈｅｒ．１４：８８−９３；Ａｎｉｃｈｉｎｉら（１９９３）Ｊ．Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．１７７：９８９−９９８）。抗メラノーマＴ細胞は、おそらく、インビボにおいて腫瘍部位でのクローン性増大および蓄積の結果としてＴＩＬ中に多く存在するとみられる（Ｓｅｎｓｉら（１９９３）Ｊ．Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．１７８：１２３１−１２４６）。多くのメラノーマ患者がこれらの腫瘍に対して細胞性応答および体液性応答を開始するという事実、ならびにメラノーマがＭＨＣ抗原と腫瘍関連抗原（ＴＡＡ）の両方を発現するという事実から、さらなるメラノーマ抗原の同定および特徴づけが、メラノーマを有する患者の免疫療法にとって重要であると示唆される。
Ａｂｂａｓ Ａ．Ｋ．，Ｌｅｃｈｔｍａｎ，Ａ．Ｈ．，Ｐｏｂｅｒ，Ｊ．Ｓ．（編）"Ｃｅｌｌｕｌａｒ ａｎｄ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ"；Ｗ．Ｂ．Ｓａｕｎｄｅｒｓ Ｃｏｍｐａｎｙ，Ｐｈｉｌａｄｅｌｐｈｉａ（１９９１）３４０〜３４１頁 Ｋｉｒｋｗｏｏｄ ａｎｄ Ａｇａｒｗａｌａ、Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ ａｎｄ Ｐｒａｃｔｉｃｅ ｏｆ Ｏｎｃｏｌｏｇｙ（１９９３）７：１〜１６ Ｉｔｏｈら、Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ．（１９８６）４６：３０１１〜３０１７ Ｍｕｕｌら、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．（１９８７）１３８：９８９〜９９５ Ｔｏｐａｌｉａｎら、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．（１９８９）１４２：３７１４〜３７２５ Ｄａｒｒｏｗら、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．（１９８９）１４２：３３２９〜３３３５ Ｈｏｍら、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｔｈｅｒ．（１９９１）１０：１５３〜１６４ Ｋａｗａｋａｍｉら、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．（１９９２）１４８：６３８〜６４３ Ｈｏｍら、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｔｈｅｒ．（１９９３）１３：１８〜３０ Ｏ’Ｎｅｉｌら、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．（１９９３）１５１：１４１０〜１４１８
ＣＳＰＧ４としても知られるヒトコンドロイチン硫酸プロテオグリカンＨＭＷ−ＭＡＡは、腫瘍細胞の増殖、遊走および浸潤の刺激に関わる初期の細胞表面メラノーマ進行マーカーである。ＨＭＷ−ＭＡＡ模倣物で免疫された、メラノーマを有する患者におけるＨＭＷ−ＭＡＡを標的化するワクチンが、ＨＭＷ−ＭＡＡ特異的抗体を生じた患者のサブセットだけに有意な延命効果をもたらし、その抗体を生じなかった患者には有意な延命効果をもたらさなかったので、臨床研究は、ＨＭＷ−ＭＡＡを妥当な治療的標的と示唆した。さらに、ＨＭＷ−ＭＡＡを標的化する生物学的意義は、細胞の成長および分化を制御する際の役割に関係し得る。しかしながら、この抗原を標的化する他の免疫療法ストラテジーが未だ必要とされている。
要約
ＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合する完全ヒトモノクローナル抗体が、本明細書中で提供される。完全ヒトモノクローナル抗体の機能性フラグメントもまた提供される。いくつかの実施形態において、このヒトモノクローナル抗体は、一本鎖可変フラグメント（ｓｃＦｖ）である。ＨＭＷ−ＭＡＡ特異的抗体およびその機能性フラグメントを含む組成物、これらの抗体をコードする核酸、その核酸を含む発現ベクター、ならびにその核酸を発現する単離された宿主細胞がさらに提供される。
ＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合するヒトモノクローナル抗体を含む免疫結合体もまた提供される。その免疫結合体を含む組成物も提供される。
本明細書中で提供される抗体および組成物は、種々の目的（例えば、被験体における癌の診断を確証すること）のために使用され得る。したがって、被験体における癌の診断を確証する方法が、本明細書中で提供され、その方法は、癌と診断された被験体由来のサンプルを、ＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合するヒトモノクローナル抗体と接触させる工程、およびそのサンプルへのその抗体の結合を検出する工程を包含する。コントロールサンプルへのその抗体の結合と比べてそのサンプルへのその抗体の結合の増加が、その癌診断を確証する。いくつかの実施形態において、その方法は、ＨＭＷ−ＭＡＡ特異的抗体を特異的に認識する２次抗体をサンプルと接触させる工程およびその２次抗体の結合を検出する工程をさらに包含する。
同様に、被験体における癌を検出する方法が本明細書中で提供され、その方法は、その被験体由来のサンプルを本明細書中に記載されるヒトモノクローナル抗体と接触させる工程およびそのサンプルへのその抗体の結合を検出する工程を包含する。コントロールサンプルと比べてそのサンプルへのその抗体の結合の増加が、被験体における癌を検出する。いくつかの実施形態において、その方法は、ＨＭＷ−ＭＡＡ特異的抗体を特異的に認識する２次抗体をサンプルと接触させる工程およびその２次抗体の結合を検出する工程をさらに包含する。
癌と診断された被験体を処置する方法がさらに提供され、その方法は、治療有効量のＨＭＷ−ＭＡＡ特異的モノクローナル抗体、その機能性フラグメントまたはその抗体もしくはその機能性フラグメントを含む免疫結合体をその被験体に投与する工程を包含する。いくつかの例において、癌は、メラノーマ、頭頸部癌または神経膠腫である。
ＨＭＷ−ＭＡＡペプチド模倣物もまた提供される。本明細書中に開示されるペプチド模倣物は、ＨＭＷ−ＭＡＡに特異的なヒトモノクローナル抗体に結合する。いくつかの実施形態において、そのペプチド模倣物は、コンセンサス配列ＰＸＸＹＸＰＸＸＤ（配列番号９）を含む。
本発明の好ましい実施形態では、例えば、以下が提供される：
（項目１）
単離されたヒトモノクローナル抗体またはその機能性フラグメントであって、ここで、該抗体の重鎖は、配列番号５のアミノ酸２７〜３８、配列番号５のアミノ酸５６〜６５、配列番号５のアミノ酸１０５〜１１５またはそれらの組み合わせを含み、該抗体は、ＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合する、単離されたヒトモノクローナル抗体またはその機能性フラグメント。
（項目２）
前記抗体の軽鎖が、配列番号６のアミノ酸２７〜３８、配列番号６のアミノ酸５６〜６５、配列番号６のアミノ酸１０５〜１１０またはそれらの組み合わせを含む、項目１に記載の単離されたヒトモノクローナル抗体またはその機能性フラグメント。
（項目３）
前記抗体の重鎖が、配列番号５のアミノ酸２７〜３８、配列番号５のアミノ酸５６〜６５および配列番号５のアミノ酸１０５〜１１５を含む、項目１または項目２に記載の単離されたヒトモノクローナル抗体またはその機能性フラグメント。
（項目４）
前記抗体の重鎖が、配列番号５を含む、項目１〜３のいずれか１項に記載の単離されたヒトモノクローナル抗体またはその機能性フラグメント。
（項目５）
前記抗体の軽鎖が、配列番号６のアミノ酸２７〜３８、配列番号６のアミノ酸５６〜６５、配列番号６のアミノ酸１０５〜１１０を含む、項目１〜４のいずれか１項に記載の単離されたヒトモノクローナル抗体またはその機能性フラグメント。
（項目６）
前記抗体の軽鎖が、配列番号６を含む、項目１〜５のいずれか１項に記載の単離されたヒトモノクローナル抗体またはその機能性フラグメント。
（項目７）
前記抗体の重鎖が、配列番号５を含み、該抗体の軽鎖が、配列番号６を含む、項目１〜６のいずれか１項に記載の単離されたヒトモノクローナル抗体またはその機能性フラグメント。
（項目８）
前記機能性フラグメントが、Ｆａｂフラグメント、Ｆａｂ’フラグメント、Ｆ（ａｂ）’ ２ フラグメント、一本鎖Ｆｖタンパク質（ｓｃＦｖ）またはジスルフィド安定化Ｆｖタンパク質（ｄｓＦｖ）である、項目１〜５のいずれかに記載の単離されたヒトモノクローナル抗体またはその機能性フラグメント。
（項目９）
前記抗体が、ｓｃＦｖである、項目８に記載のヒトモノクローナル抗体の単離された機能性フラグメント。
（項目１０）
前記抗体が、ＩｇＧである、項目１〜７のいずれかに記載の単離されたヒトモノクローナル抗体。
（項目１１）
前記抗体が、標識されている、項目１〜１０のいずれかに記載の単離されたヒトモノクローナル抗体またはその機能性フラグメント。
（項目１２）
前記標識が、蛍光標識、酵素標識または放射性標識である、項目１１に記載の単離されたヒトモノクローナル抗体またはその機能性フラグメント。
（項目１３）
項目１〜１２のいずれか１項に記載の抗体またはその機能性フラグメントおよび薬学的に許容可能なキャリアを含む、組成物。
（項目１４）
項目１〜１０のいずれかに記載のヒトモノクローナル抗体またはその機能性フラグメントを含む、単離された免疫結合体。
（項目１５）
Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ外毒素（ＰＥ）またはその改変体もしくはフラグメントを含む、項目１４に記載の単離された免疫結合体。
（項目１６）
項目１４または項目１５に記載の単離された免疫結合体および薬学的に許容可能なキャリアを含む、組成物。
（項目１７）
ＨＭＷ−ＭＡＡを発現する癌と診断された被験体を処置する方法であって、治療有効量の項目１１または項目１４に記載の組成物を該被験体に投与することによって、該被験体においてＨＭＷ−ＭＡＡを発現する癌を処置する工程を包含する、方法。
（項目１８）
前記癌が、メラノーマ、乳癌、頭頸部扁平上皮癌腫、前立腺癌、卵巣癌、結腸癌、神経膠腫、胃癌または膵癌である、項目１５に記載の方法。
（項目１９）
前記被験体の処置が、転移の数またはサイズの減少を含む、項目１７に記載の方法。
（項目２０）
被験体における癌を検出するかまたは癌の診断を確証する方法であって、該方法は：
該被験体由来のサンプルを、項目１〜１０のいずれかに記載の単離されたヒトモノクローナル抗体またはその機能性フラグメントと接触させる工程；および
該サンプルへの、該単離されたヒトモノクローナル抗体またはその機能性フラグメントの結合を検出する工程
を包含し、ここで、コントロールサンプルへの該単離されたヒトモノクローナル抗体またはその機能性フラグメントの結合と比較した際の該サンプルへの該単離されたヒトモノクローナル抗体またはその機能性フラグメントの結合の増加が、該被験体における癌を検出するか、または該被験体における癌の診断を確証する、方法。
（項目２１）
前記単離されたヒトモノクローナル抗体またはその機能性フラグメントが、直接標識されている、項目２０に記載の方法。
（項目２２）
前記単離されたヒトモノクローナル抗体またはその機能性フラグメントに特異的に結合する２次抗体を前記サンプルと接触させる工程、および
該２次抗体の結合を検出する工程
をさらに包含し、ここで、コントロールサンプルへの該２次抗体の結合と比較した際の該サンプルへの該２次抗体の結合の増加が、該被験体における癌を検出するかまたは該被験体における癌の診断を確証する、項目２０または２１に記載の方法。
（項目２３）
前記癌が、メラノーマ、乳癌、頭頸部扁平上皮癌腫、前立腺癌、卵巣癌、結腸癌、神経膠腫、胃癌または膵癌である、項目２０〜２２のいずれかに記載の方法。
（項目２４）
前記コントロールサンプルが、癌を有しない被験体由来のサンプルである、項目２０〜２３のいずれかに記載の方法。
（項目２５）
前記サンプルが、血液、尿、生検材料、血清、痰、血漿、脳髄液サンプルである、項目２０〜２４のいずれかに記載の方法。
（項目２６）
前記癌が、転移性である、項目２０〜２５のいずれか１項に記載の方法。
（項目２７）
項目１〜１０のいずれかに記載のヒトモノクローナル抗体またはその機能性フラグメントをコードする単離された核酸分子。
（項目２８）
前記ヒトモノクローナル抗体のＶ Ｈ ドメインが、配列番号１のヌクレオチド配列を含む、項目２７に記載の単離された核酸分子。
（項目２９）
前記ヒトモノクローナル抗体のＶ Ｌ ドメインが、配列番号３のヌクレオチド配列を含む、項目２７または項目２８に記載の単離された核酸分子。
（項目３０）
プロモーターに作動可能に連結された、項目２７〜２９のいずれか１項に記載の単離された核酸分子。
（項目３１）
項目２７〜３０のいずれか１項に記載の単離された核酸分子を含む、発現ベクター。
（項目３２）
項目２７〜３０のいずれか１項に記載の核酸分子または項目３１に記載の発現ベクターで形質転換された、単離された宿主細胞。
（項目３３）
項目１〜１０のいずれか１項に記載のヒトモノクローナル抗体に結合する単離されたペプチドであって、ここで、該ペプチドは、コンセンサスモチーフＰＸＸＹＸＰＸＸＤ（配列番号９）を含む、単離されたペプチド。
（項目３４）
項目３３に記載の単離されたペプチドであって、該ペプチドのアミノ酸配列は、配列番号７、配列番号１０、配列番号１３、または配列番号７、配列番号１０、配列番号１３の改変体を含み、ここで、該改変体は、３つ以下のアミノ酸の置換を含む、単離されたペプチド。
（項目３５）
項目３３に記載の単離されたペプチドであって、該ペプチドのアミノ酸配列は、配列番号７、配列番号１０または配列番号１３からなる、単離されたペプチド。
（項目３６）
被験体においてＨＭＷ−ＭＡＡ特異的免疫を誘導する方法であって、項目３３〜３５のいずれか１項に記載のペプチドを該被験体に投与することによって、該被験体においてＨＭＷ−ＭＡＡ特異的免疫を誘導する工程を包含する、方法。
本発明の前述および他の目的、特徴および利点は、添付の図面を参照しながら進める以下の詳細な説明からより明らかになるだろう。
ＥＬＩＳＡにおけるＨＭＷ−ＭＡＡ＋ヒト細胞株に対する可溶性ｓｃＦｖＣ２１の選択的反応性。培養ヒトメラノーマ細胞Ｃｏｌｏ３８、ＦＯ−１、ＳＫ−ＭＥＬ−２８およびＭｅｌｕｒ（これらのすべてがＨＭＷ−ＭＡＡを発現する）、ならびにヒト前立腺癌腫細胞ＰＣ３、ヒト膀胱癌腫細胞Ｔ２４、ヒト乳癌腫細胞Ｔ４７ＤならびにヒトＢリンパ系細胞ＪＹ、ＬＧ−２およびＬＫＴ１３（これらのすべてがＨＭＷ−ＭＡＡを発現しない）、ならびにラット神経芽細胞腫細胞Ｂ４９（ＨＭＷ−ＭＡＡホモログを発現する）を、５０μｌの
）およびビオチン化ｍＡｂ ９Ｅ１０（２．５μｇ／ｍｌの１％ＢＳＡ−ＰＢＳ）とともに４℃において２時間インキュベートした。ｓｃＦｖフラグメントの結合を、ＳＡ−ＨＲＰを用いて検出した。結果は、４９０ｎｍにおける吸光度として表される。
）を特異性コントロールとして使用した。
ｓｃＦｖＣ２１で染色されたＨＭＷ−ＭＡＡ＋Ｍ１４＃５／ＨＭＷ−ＭＡＡメラノーマ細胞のフローサイトメトリー解析。Ｍ１４＃５／ＨＭＷ−ＭＡＡトランスフェクタントおよび親のＨＭＷ−ＭＡＡ−Ｍ１４＃５細胞を、ＰＰｓｃＦｖＣ２１およびｍＡｂ ９Ｅ１０（白色ヒストグラム）ならびにコントロールＰＰｓｃＦｖ１１９およびｍＡｂ ９Ｅ１０（灰色ヒストグラム）（上段パネル）、ＨＭＷ−ＭＡＡ特異的マウスｍＡｂ７６３．７４（０．５μｇ）（白色ヒストグラム）およびコントロールｍＡｂ ＭＫ２−２３（灰色ヒストグラム）（中段パネル）、ならびにＨＬＡクラスＩ抗原特異的ｍＡｂ ＴＰ２５．９９（白色ヒストグラム）およびコントロールｍＡｂ ＭＫ２−２３（灰色ヒストグラム）（下段パネル）とともに氷上でインキュベートした。抗体の結合を、ヤギ抗マウスＩｇ抗体のＲＰＥ−標識Ｆ（ａｂ’）２フラグメントを用いて検出した。ＦＡＣＳｃａｎＴＭフローサイトメーターを用いて細胞を解析した。結果は、蛍光強度として表される。 ＨＭＷ−ＭＡＡ＋Ｃｏｌｏ３８細胞溶解産物における、ｓｃＦｖＣ２１およびＨＭＷ−ＭＡＡ特異的マウスｍＡｂ７６３．７４によって認識される分子間の構造的関係。１２５Ｉで標識されたＣｏｌｏ３８細胞の１％ＮＰ−４０抽出物を、ｍＡｂ７６３．７４を用いて免疫除去した。その免疫除去された細胞抽出物を不溶化ｍＡｂ７６３．７４およびｓｃＦｖＣ２１とともに免疫沈降した。抗原を溶出し、８％ポリアクリルアミドゲルにおけるＳＤＳ−ＰＡＧＥによって解析した。ゲルを固定し、乾燥し、−８０℃において最大１日間、オートラジオグラフィに供した。１００ｋＤ ＭＡＡ特異的マウスｍＡｂ３７６．９４で免疫除去された１２５Ｉで標識されたＣｏｌｏ３８細胞の１％ＮＰ−４０抽出物を、コントロールとして使用した。 ＨＭＷ−ＭＡＡ＋Ｃｏｌｏ３８細胞抽出物から単離されたＨＭＷ−ＭＡＡ上の、ｓｃＦｖＣ２１によって認識される抗原決定基の発現におけるＮ結合型グリコシル化の役割。ツニカマイシン（０、２および３μｇ／ｍｌ）の存在下における３５Ｓ−メチオニンで標識されたＣｏｌｏ３８細胞の１％ＮＰ−４０抽出物を、ｓｃＦｖＣ２１とともに免疫沈降した。抗原を免疫吸着物から溶出し、８％ポリアクリルアミドゲルにおけるＳＤＳ−ＰＡＧＥによって解析した。ゲルを固定し、乾燥し、−８０℃において最大３日間、フルオログラフィのためにＨｙｐｅｒｆｉｌｍ−ＥＣＬを用いて処理した。ＨＭＷ−ＭＡＡ特異的マウスｍＡｂ７６３．７４をコントロールとして使用した。 ＨＭＷ−ＭＡＡ＋メラノーマ細胞ＳＫ−ＭＥＬ−２８上における、ｓｃＦｖＣ２１によって定義される決定基とマウスｍＡｂ ＶＦ１−ＴＰ３４によって定義される決定基との空間的近接。様々な濃度の
をビオチン化ｓｃＦｖＣ２１（０．２５μｇ／ウェル）と混合した。次いで、その混合物をＨＭＷ−ＭＡＡ＋細胞が入ったウェルに移し、４℃において１時間インキュベートした。抗体の結合を、ＳＡ−ＨＲＰを用いて検出した。結果は、％阻害として表される。同様に、様々な量の
を、ビオチン化ｍＡｂ ＶＦ１−ＴＰ３４（４０ｎｇ／ウェル）と混合した。次いで、その混合物をＨＭＷ−ＭＡＡ＋細胞が入ったウェルに移し、４℃において１時間インキュベートした。無関係な
および無関係な
を特異性コントロールとして使用した。
外科的に取り出され凍結されたヒト母斑病変およびヒトメラノーマ病変のｓｃＦｖＣ２１による免疫組織化学的染色。ｓｃＦｖＣ２１は、凍結された母斑（パネルＡ）、凍結された原発性メラノーマ病変（パネルＢ）および凍結された転移性メラノーマ病変（パネルＣ）を染色する。母斑（パネルＤ）、原発性メラノーマ病変（パネルＥ）および転移性メラノーマ病変（パネルＦ）を無関係なｓｃＦｖ＃１１９で染色することによって、その染色の特異性をモニターした。 ＥＬＩＳＡにおける、ｓｃＦｖＣ２１を用いたファージディスプレイペプチドライブラリーＸ１５のパニングによって単離されたペプチドに由来する合成ペプチドに対するｓｃＦｖＣ２１の反応性。９６ウェルプレートを、０．２５％グルタルアルデヒド（ｇｌｕｔａｒａｄｅｈｙｄｅ）−ＰＢＳ中の
で３７℃において２時間コーティングした。ＰＢＳ−１％ＢＳＡでブロッキングした後、ウェルを５０μｌのＰＰｓｃＦｖＣ２１および５０μｌのビオチン化ｍＡｂ ９Ｅ１０（２．５μｇ／ｍｌの１％ＢＳＡ−ＰＢＳ）とともに室温において２時間インキュベートした。ペプチドへのｓｃＦｖ抗体の結合を、ＳＡ−ＨＲＰを加えることによって検出した。結果は、４９０μＭにおける吸光度として表される。無関係なＨＭＷ−ＭＡＡ決定基および無関係なペプチドＭＡＲＴ−１（ＡＡＧＩＧＩＬＴＶ）を認識するヒトｓｃＦｖ＃２８
を特異性コントロールとして使用した。
合成ペプチドＰ１Ｃ２１およびＰ３Ｃ２１ならびに改変ペプチドＰ３Ｃ２１による、ＨＭＷ−ＭＡＡ＋細胞Ｃｏｌｏ３８に対するｓｃＦｖＣ２１の反応性の阻害。様々な濃度の
を、５０μｌのＰＰｓｃＦｖ（１％ＢＳＡ−ＰＢＳにおける１：１６００希釈物）および５０μｌのビオチン化ｍＡｂ ９Ｅ１０（２．５μｇ／ｍｌの１％ＢＳＡ−ＰＢＳ）とともに４℃において２時間インキュベートした。次いで、その混合物をＣｏｌｏ３８細胞が入ったウェルに移した。ｓｃＦｖＣ２１の結合を、ＳＡ−ＨＲＰを用いて検出した（上パネル）。結果は、％阻害として表される。無関係な
および無関係なＨＭＷ−ＭＡＡ決定基を認識するｓｃＦｖ＃２８（下パネル）を特異性コントロールとして使用した。
ペプチドＰ１Ｃ２１で免疫され、Ｃｏｌｏ３８細胞でブーストされたＢＡＬＢ／ｃマウスにおける、ＨＭＷ−ＭＡＡ＋細胞Ｃｏｌｏ３８に対して選択的な反応性を有する抗体の作製。０、２１、４２、６３、８４および１０５日目に
（５０μｇ／注射）で、そして１３２日目にＨＭＷ−ＭＡＡ＋Ｃｏｌｏ３８メラノーマ細胞（５×１０５細胞／注射）で、マウスを免疫した。最初の免疫の１週間前および各免疫の１週間後に血清を回収した。血清の２倍希釈物（１００μｌ／ウェル）をＨＭＷ−ＭＡＡ＋Ｃｏｌｏ３８メラノーマ細胞（１×１０５／ウェル）とともにインキュベートした。ＨＲＰ結合体化ヤギ抗マウスＩｇＧ抗体とさらにインキュベートした後、その反応物を、ＴＭＢ基質を用いて発色させた。４５０ｎｍにおけるＯ．Ｄ．を測定した。結果は、ＨＭＷ−ＭＡＡ＋細胞への最大結合の５０％をもたらす最も高い希釈の血清の平均±ＳＤとして表される。ペプチドＭＢ１１９４−２０８で免疫されたマウス由来の血清をコントロールとして使用した。＊ｐ＜０．０５。
ＢＡＬＢ／ｃマウスにおいてペプチドＰ１Ｃ２１およびＨＭＷ−ＭＡＡ＋細胞Ｃｏｌｏ３８によって誘発された抗体で染色されたＨＭＷ−ＭＡＡ＋Ｍ１４＃５／ＨＭＷ−ＭＡＡメラノーマ細胞のフローサイトメトリー解析。Ｍ１４＃５／ＨＭＷ−ＭＡＡトランスフェクタントおよび親のＨＭＷ−ＭＡＡ−Ｍ１４＃５細胞を、ペプチドＰ１Ｃ２１で免疫されたマウス由来の１００μｌの血清（１：６０希釈物）（上段パネル）、およびペプチドＰ１Ｃ２１またはコントロールペプチドＭＢ１１９４−２０８で免疫され、ＨＭＷ−ＭＡＡ＋細胞Ｃｏｌｏ３８でブーストされたマウス由来の血清（中段パネル）とともに氷上でインキュベートした。洗浄後、細胞を、ヤギ抗マウスＩｇ抗体のＲＰＥ標識Ｆ（ａｂ’）２フラグメントとともに氷上でインキュベートした。次いで細胞を、ＦＡＣＳｃａｎＴＭフローサイトメトリーを用いて解析した。結果は、蛍光強度として表される（白色ヒストグラム）。コントロールとして、免疫前の血清（灰色ヒストグラム）、コントロールペプチドＭＢ１１９４−２０８で免疫されたマウス由来の血清（上段パネル）、ペプチドＭＢ１１９４−２０８で免疫され、ＨＭＷ−ＭＡＡ＋メラノーマ細胞Ｃｏｌｏ３８でブーストされたマウス由来の血清（中段パネル）、およびペプチドＰ１Ｃ２１またはペプチドＭＢ１１９４−２０８で免疫され、ＨＭＷ−ＭＡＡ−リンパ系細胞ＬＧ２でブーストされたマウス由来の血清（下段パネル）を使用した。 ペプチドＰ１Ｃ２１で免疫され、ＨＭＷ−ＭＡＡ＋細胞Ｃｏｌｏ３８でブーストされたマウス由来の血清のＨＭＷ−ＭＡＡ特異性の免疫化学的な特徴づけ。１２５Ｉで標識されたＣｏｌｏ３８メラノーマ細胞の１％ＴｒｉｔｏｎＸ−１００抽出物を、ペプチドＰ１Ｃ２１およびＨＭＷ−ＭＡＡ＋細胞Ｃｏｌｏ３８で連続的に免疫されたマウス由来の血清とともに免疫沈降した（レーンＢ）。抗原を免疫吸着物から溶出し、８％ポリアクリルアミドゲルにおけるＳＤＳ−ＰＡＧＥによって解析した。ゲルを固定し、乾燥し、−８０℃において２日間、オートラジオグラフィに供した。コントロールとして、ＨＭＷ−ＭＡＡ特異的マウスｍＡｂ７６３．７４（レーンＡ）、ペプチドＰ１Ｃ２１で免疫され、ＨＭＷ−ＭＡＡ−リンパ系細胞ＬＧ２でブーストされたマウス由来の血清（レーンＣ）およびコントロールペプチドＭＢ１１９４−２０８で免疫され、ＨＭＷ−ＭＡＡ＋Ｃｏｌｏ３８メラノーマ細胞でブーストされたマウス由来の血清のレーン（レーンＤ）を使用した。 ペプチドＰ１Ｃ２１で免疫されたＢＡＬＢ／ｃマウスにおけるＨＭＷ−ＭＡＡ＋メラノーマ細胞Ｃｏｌｏ３８に対するＤＴＨ反応。照射された（２０Ｋｒａｄｓ）ＨＭＷ−ＭＡＡ＋細胞Ｃｏｌｏ３８（５×１０５細胞／マウス）
およびＨＭＷ−ＭＡＡ−ＬＧ２細胞（５×１０５細胞／マウス）（□）を、それぞれＢＡＬＢ／ｃマウスの右および左足蹠に１３２日目に注射した（それらのマウスは、０、２１、４２、６３、８４および１０５日目にペプチドＰ１Ｃ２１で６回免疫されていた）。注射された細胞によって誘導された腫脹の量は、細胞を注射した２４時間後に測定された足蹠の厚さから、０時間において測定された足蹠の厚さを減算することによって、測定され、算出された。同じスケジュールを用いてコントロールペプチドＭＢ１１９４−２０８で免疫されたマウスに同じ時点においてＣｏｌｏ３８またはＬＧ２細胞を注射し、そのマウスをコントロールとして使用した。＊ｐ＜０．０５。
ｓｃＦｖＣ２１−Ｐ１Ｃ２１および−Ｐ３Ｃ２１ペプチド複合体の分子モデル。ｓｃＦｖＣ２１のＶＨおよびＶＬが示されている。非正規構造をとるＨＣＤＲ３およびＬＣＤＲ３もまた示されている。環状Ｐ１Ｃ２１ペプチドの結合が、左パネルに示されている。その結合エネルギーは、−９３．８Ｋｃａｌ／ｍｏｌである。残基７Ｐｒｏ、５Ｔｙｒおよび４Ｔｒｐが、特異性を定義する。ｓｃＦｖＣ２１への線状Ｐ３Ｃ２１の結合が、右パネルに示されている。その結合エネルギーは、−７．３Ｋｃａｌ／ｍｏｌである。Ｐ３Ｃ２１ペプチドは、その結合様式においてより伸びた構造をとる。重要な結合部分は、Ｈ１とＨ３との間で４Ａｒｇ、７Ｐｒｏおよび５Ｔｙｒにおよんで観察された。保存された残基のうちの１つ（１０Ａｓｐ）が、溶媒に露出されるが、疎水性ポケットに埋もれた近位のロイシンが、安定した複合体を促す。 ｓｃＦｖ−ＦｃＣ２１によるヒトメラノーマ細胞株の表面染色を示しているフロー解析。 ｓｃＦｖ−ＦｃＣ２１によるヒト神経膠腫細胞株ＬＮ４４４およびＡ１２０７の表面染色ならびにｓｃＦｖ−ＦｃＣ２１によるヒト頭頸部癌細胞株ＰＣＩ３０およびＰＣＩ１３の表面染色を示しているフロー解析。 ｓｃＦｖ−ＦｃＣ２１によるヒトメラノーマ細胞ＭＶ３の実験的肺転移の阻害を示しているデジタル画像およびグラフ。プロトコルは、以下のとおりだった：０日目：ＭＶ３細胞を１．４×１０６／マウスでｉ．ｖ．注射；３日目：ｍＡｂ治療を開始：１週間に２回、１００μｇ／マウス（ｍｏｕｓ），ｉ．ｖ．；２７日目：マウスを屠殺し、後の解析のために肺を回収し、ホルマリン固定し、パラフィン包埋し、Ｈ＆Ｅ染色：各切片のランダムに選択された５つの高倍率視野（×２００）の写真を撮影し、次いで、ＳＰＯＴソフトウェアを用いて腫瘍面積を測定。示されている値は、各群の平均腫瘍面積である。＊＊は、ｐ値＜０．０１を示す。 ｓｃＦｖ−ＦｃＣ２１がマウス内の転移性病変における腫瘍細胞の増殖を阻害することを示しているデジタル画像およびグラフ。プロトコルは、以下のとおりだった：０日目：ＭＶ３細胞を１．４×１０６／マウスでｉ．ｖ．注射；３日目：抗体療法を開始：１週間に２回、１００μｇ／マウス，ｉ．ｖ．；２７日目：マウスを屠殺し、肺を回収し、ホルマリン固定し、パラフィン包埋。 ｓｃＦｖ−ＦｃＣ２１による原発腫瘍の成長および局所的腫瘍再発の阻害。プロトコルは、以下のとおりだった：０日目：１．５×１０６／マウスでの腫瘍細胞ＭＶ３をＳ．Ｃ．接種；７日目：１週間に２回、ｓｃＦｖ−Ｆｃ（１００μｇ）をｉ．ｖ．投与；２８日目：腫瘍の外科的除去；３５日目：１週間に２回、ｓｃＦｖ−Ｆｃ（１００μｇ）をｉ．ｖ．投与；６１日目：再発した腫瘍のサイズがＩＡＣＵＣによって設定された限界に達したのでマウスを屠殺。 マウスにおけるｓｃＦｖ−ＦｃＣ２１による局所的腫瘍再発の阻害を示しているデジタル画像。 マウスにおけるｓｃＦｖ−ＦｃＣ２１による外科術後の自然肺転移の阻害。 外科的に取り出された原発性ＭＶ３腫瘍組織における、低レベルのＰＫＣ−αおよびｐ−Ｓｒｃを示しているデジタル画像およびグラフ。 ｓｃＦｖ−ＦｃＣ２１によるＭＤＡ−ＭＢ−２３１のインビトロ細胞遊走の阻害を示しているデジタル画像およびグラフ。遊走アッセイでは、ＭＤＡ−ＭＢ−２３１細胞を播種し、ｓｃＦｖ−ＦｃＣ２１、コントロールｓｃＦｖ−Ｆｃ１１９またはＰＢＳとともにインキュベートした。Ｚｅｉｓｓ Ｉｎｖｅｒｔｅｄ Ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｃｅ Ｍｉｃｒｏｓｃｏｐｅ（ＡｘｉｏＶｉｓｉｏｎ Ｓｏｆｔｗａｒｅ）下において、各ウェルの写真を撮影した（×２００）。結果は、抗体を含まないＰＢＳにおいて得られた値を参照として利用して、遊走の％阻害として表される。示される値は、３回の独立した実験の平均値である。＊＊＊は、ｐ＜０．００１を示す。 ｓｃＦｖ−Ｆｃ．Ｃ２１によるＭＤＡ−ＭＢ−２３１のインビトロ細胞成長の阻害のグラフ。ＭＤＡ−ＭＢ−２３１細胞を、３Ｄ（マトリゲル）設定において６日間、ｓｃＦｖ−ＦｃＣ２１またはコントロールｓｃＦｖ−Ｆｃ１１９で処置した。両方の抗体に対する溶媒として使用したＰＢＳを１００％細胞成長についての参照として使用した。次いで、各ウェル内の細胞を、Ｃｅｌｌ Ｒｅｃｏｖｅｒｙ Ｓｏｌｕｔｉｏｎ（ＢＤ Ｐｈａｒｍｉｎｇｅｎ）を用いてマトリゲルから回収し、トリパンブルーを用いて２人が計数した。結果は、ＰＢＳのみにおいて得られた値を参照として利用して、細胞成長の％阻害として表される。示される値は、２回の独立した実験の平均値である。＊＊＊は、ｐ＜０．００１を示す。 ウエスタンブロットのデジタル画像。ｐ−Ａｋｔ、ｐ−Ｅｒｋ１／２およびＥｒｋ１／２のレベルは、ｓｃＦｖ−ＦｃＣ２１による処理後に著しく低下している。 ウエスタンブロットのデジタル画像。β−カテニンは、ｓｃＦｖ０ＦｃＣ２１による処理後に減少している。β−カテニンは、悪性形質転換中に乱れる細胞間接着、細胞シグナル伝達および遺伝子転写に関与する。原発性メラノーマ細胞に対するＮｏｔｃｈ１の腫瘍形成作用は、Ｎｏｔｃｈ１活性化の後にアップレギュレートされるβ−カテニンによって媒介される。β−カテニンの発現を阻害することにより、Ｎｏｔｃｈ１によって増強される腫瘍の成長および転移が逆転した（Ｋｌａｒａ Ｂ．ら、Ｊ．Ｃｌｉｎ．Ｉｎｖｅｓｔ．１１５（１１）：３１６６−３１７６，２００５もまた参照のこと）。 ウエスタンブロットのデジタル画像。ｐ−ＰＴＥＮ（ｓｅｒ３８０／Ｔｈｒ３８２／３８３）、非ホスホＰＴＥＮ（ｓｅｒ３８０／Ｔｈｒ３８２／３８３）およびＰＴＥＮのレベルは、ｓｃＦｖ−ＦｃＣ２１による処理後に上昇している。ホスホイノシチド依存性タンパク質キナーゼ（ＰＤＫ１）のレベルは、ｓｃＦｖ−ＦｃＣ２１による処理後に低下している。ＰＫＣα、ｐ−ＦＡＫおよびＦＡＫのレベルは、低下している。
配列表
添付の配列表に列挙されている核酸配列およびアミノ酸配列を、３７Ｃ．Ｆ．Ｒ．１．８２２に規定されているように、ヌクレオチド塩基については標準的な文字省略形、およびアミノ酸については３文字コードを用いて示す。各核酸配列の一方の鎖だけを示すが、相補鎖は、表示される鎖の参照により含まれると理解される。添付の配列表において：
配列番号１は、ｓｃＦｖＣ２１のＶＨドメインのヌクレオチド配列である。
配列番号２は、ｓｃＦｖＣ２１リンカーのヌクレオチド配列である。
配列番号３は、ｓｃＦｖＣ２１のＶＬドメインのヌクレオチド配列である。
配列番号４は、ヒンジ、ＣＨ２およびＣＨ３ドメインを含む免疫グロブリン重鎖のヌクレオチド配列である。
配列番号５は、ｓｃＦｖＣ２１のＶＨドメインのアミノ酸配列である。
配列番号６は、ｓｃＦｖＣ２１のＶＬドメインのアミノ酸配列である。
配列番号７は、ペプチドＰ１Ｃ２１のアミノ酸配列である。
配列番号８は、ペプチドＰ２Ｃ２１のアミノ酸配列である。
配列番号９は、ｓｃＦｖＣ２１に結合するペプチドのアミノ酸コンセンサス配列である。
配列番号１０は、ペプチドＰ３Ｃ２１のアミノ酸配列である。
配列番号１１は、ペプチドＰ３Ａ５のアミノ酸配列である。
配列番号１２は、ペプチドＰ３Ｖ７のアミノ酸配列である。
配列番号１３は、ペプチドＰ３Ｓ１０のアミノ酸配列である。
配列番号１４は、ＨＭＷ−ＭＡＡのアミノ酸配列である。
配列番号１５は、ＨＭＷ−ＭＡＡをコードする例示的な核酸配列である。
詳細な説明
ヒトコンドロイチン硫酸プロテオグリカンＨＭＷ−ＭＡＡは、メラノーマを有する多くの割合の患者における病変内および病変間においてあまり不均一でなくメラノーマ細胞上で高発現し、正常組織における分布が限定的であるので（Ｆｅｒｒｏｎｅら、Ｒａｄｉｏｌａｂｅｌｅｄ Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ ｆｏｒ Ｉｍａｇｉｎｇ ａｎｄ Ｔｈｅｒａｐｙ １５２：５５，１９８８）、メラノーマの免疫療法を行うための魅力的な標的である（Ｓｐｉｔｌｅｒら、Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ ４７：１７１７−１７２３，１９８７；Ｍｉｔｔｅｌｍａｎら、Ｊ Ｃｌｉｎ Ｉｎｖｅｓｔ ８６：２１３６−２１４４，１９９０；Ｑｕａｎら、Ｊ Ｃｌｉｎ Ｏｎｃｏｌ １５：２１０３−２１１０，１９９７）。同定されているヒト腫瘍抗原の大部分と同様に、ＨＭＷ−ＭＡＡは、自己抗原である。結果として、ＨＭＷ−ＭＡＡは、メラノーマを有する患者において免疫原性が低い（Ｈａｍｂｙら、Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ ４７：５２８４−５２８９，１９９７）。メラノーマを有する患者では免疫原としてのＨＭＷ−ＭＡＡの適用が妨げられるというこの限界を克服するために、マウスｍＡｂによって定義されるＨＭＷ−ＭＡＡ決定基を模倣するマウス抗イディオタイプ（抗ｉｄ）モノクローナル抗体（ｍＡｂ）が、臨床試験において積極的な特異的免疫療法を行うために使用されている（Ｍｉｔｔｅｌｍａｎら、Ｊ Ｃｌｉｎ Ｉｎｖｅｓｔ ８６：２１３６−２１４４，１９９０；Ｑｕａｎら、Ｊ Ｃｌｉｎ Ｏｎｃｏｌ １５：２１０３−２１１０，１９９７；Ｍｉｔｔｅｌｍａｎら、Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ ８９：４６６−４７０，１９９２；Ｐｒｉｄｅら、Ｃｌｉｎ Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ ４：２３６３−２３７０，１９９８）。ＨＭＷ−ＭＡＡ模倣物は、免疫された患者の約６０％においてＨＭＷ−ＭＡＡ特異的な体液性免疫を誘導すると見出されている（Ｍｉｔｔｅｌｍａｎら、Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ ８９：４６６−４７０，１９９２）。この免疫と、少数の患者における転移の後退（Ｍｉｔｔｅｌｍａｎら、Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ ５４：４１５−４２１，１９９４）および統計学的に有意な生存時間の延長（Ｍｉｔｔｅｌｍａｎら、Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ ８９：４６６−４７０，１９９２）との関連は、ＨＭＷ−ＭＡＡ模倣物を用いた免疫ストラテジーの最適化への関心を刺激した。
これまで、ＨＭＷ−ＭＡＡの抗原性プロファイルの特徴づけおよび模倣物の開発は、マウスｍＡｂによって認識される決定基に限定されてきた。マウスｍＡｂの多くのパネルを使用することにより、６つの異なる空間的に遠位の抗原決定基が、ＨＭＷ−ＭＡＡ上で同定された（Ｃａｍｐｏｌｉら、Ｃｒｉｔ Ｒｅｖ Ｉｍｍｕｎｏｌ ２４：２６７−２９６，２００４）。さらに、マウスｍＡｂによって定義される抗原決定基の模倣物が、開発され、それらの免疫原性について特徴づけられた（Ｌｕｏら、Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ １７４：７１０４−７１１０，２００５）。対照的に、限られた数のＨＭＷ−ＭＡＡ特異的ヒトｓｃＦｖ抗体だけが、ファージディスプレイｓｃＦｖ抗体ライブラリーから単離されており、マウスｍＡｂによって認識される抗原決定基とは異なる抗原決定基を認識すると示された（Ｄｅｓａｉら、Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ ５８：２４１７−２４２５，１９９８；Ｎｏｒｏｎｈａら、Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ １６１：２９６８−２９７６，１９９８）。さらに、ＨＭＷ−ＭＡＡ特異的ヒト抗体によって同定される抗原決定基の模倣物は、未だ単離されていないし、免疫原性の特性について解析されていない。利用可能なＨＭＷ−ＭＡＡ特異的ヒトｓｃＦｖ抗体の低い結合定数を反映し得るものである情報の欠如（Ｄｅｓａｉら、Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ ５８：２４１７−２４２５，１９９８；Ｎｏｒｏｎｈａら、Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ １６１：２９６８−２９７６，１９９８）は、ＨＭＷ−ＭＡＡ模倣物を用いた免疫ストラテジーの最適化に対して負の影響を有する。
したがって、ヒト免疫レパートリーをより反映している、半合成ファージディスプレイｓｃＦｖ抗体ライブラリーから単離されたＨＭＷ−ＭＡＡ特異的ｓｃＦｖ（Ｃ２１）、および以前に報告されたものよりも高い親和性を有するｓｃＦｖ抗体の起源が、本明細書中に開示される。ＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合するこのヒトモノクローナル抗体由来の１つ以上のＣＤＲを含む抗体もまた開示される。さらに、ｓｃＦｖＣ２１の詳細な特異性が定義され、それを利用して、ファージディスプレイペプチドライブラリーからＨＭＷ−ＭＡＡペプチド模倣物が単離される。これらのペプチドは、ＨＭＷ−ＭＡＡに特異的なヒトモノクローナル抗体に結合する。いくつかの実施形態において、そのペプチド模倣物は、コンセンサス配列ＰＸＸＹＸＰＸＸＤ（配列番号９）を含む。
Ｉ．省略形
ＣＤＲ 相補性決定領域
ＣＴ コンピュータ断層撮影法
ＤＭＳＯ ジメチルスルホキシド
ＤＴＨ 遅延型過敏
ＥＤＣ Ｎ−エチル−Ｎ’−（ジメチルアミノプロピル）カルボジイミド
ＥＬＩＳＡ 酵素結合免疫吸着測定法
ＦＢＳ ウシ胎児血清
ＨＭＷ−ＭＡＡ 高分子量メラノーマ関連抗原
ＨＮＳＣＣ 頭頸部扁平上皮癌腫
ＨＰＬＣ 高圧液体クロマトグラフィ
ＩＰＴＧ イソプロピル−β−Ｄ−チオガラクトピラノシド
ＫＬＨ キーホールリンペットヘモシアニン
ｍＡｂ モノクローナル抗体
ＭＢＳ マレイミドベンゾイル−Ｎ−ヒドロキシスクシンイミド
ＭＲＩ 磁気共鳴画像法
ＮＨＳ Ｎ−ヒドロキシスクシンイミド
ＯＤ 光学濃度
ＰＡＧＥ ポリアクリルアミドゲル電気泳動
ＰＢＳ リン酸緩衝食塩水
ＰＥＴ ポジトロン放出断層撮影法
ＰＰ 細胞周辺調製物
ｓ．ｃ． 皮下
ｓｃＦｖ 一本鎖可変フラグメント
ＳＤＳ ドデシル硫酸ナトリウム
ＳＮＴ 上清
ＳＰＲ 表面プラズモン共鳴
ＩＩ．用語
別段述べられない限り、専門用語は、通常の使用法に従って用いられる。分子生物学における通常の用語の定義は、１９９４年にＯｘｆｏｒｄ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｐｒｅｓｓによって出版されたＢｅｎｊａｍｉｎ Ｌｅｗｉｎ，Ｇｅｎｅｓ Ｖ（ＩＳＢＮ０−１９−８５４２８７−９）；１９９４年にＢｌａｃｋｗｅｌｌ Ｓｃｉｅｎｃｅ Ｌｔｄ．によって出版されたＫｅｎｄｒｅｗら（ｅｄｓ．），Ｔｈｅ Ｅｎｃｙｃｌｏｐｅｄｉａ ｏｆ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ（ＩＳＢＮ０−６３２−０２１８２−９）；および１９９５年にＶＣＨ Ｐｕｂｌｉｓｈｅｒｓ，Ｉｎｃ．によって出版されたＲｏｂｅｒｔ Ａ．Ｍｅｙｅｒｓ（ｅｄ．），Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ ａｎｄ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ：ａ Ｃｏｍｐｒｅｈｅｎｓｉｖｅ Ｄｅｓｋ Ｒｅｆｅｒｅｎｃｅ（ＩＳＢＮ１−５６０８１−５６９−８）に見られ得る。
本開示の様々な実施形態の概説を容易にするために、以下の特定の用語の説明を提供する：
動物：生存している多細胞脊椎動物、例えば、哺乳動物および鳥類をはじめとしたカテゴリー。哺乳動物という用語には、ヒトと非ヒト哺乳動物の両方が含まれる。同様に、用語「被験体」は、ヒトと動物被験体の両方を包含する。
抗体：ＨＭＷ−ＭＡＡなどの抗原のエピトープまたはそのフラグメントを特異的に認識し、特異的に結合する、少なくとも軽鎖または重鎖免疫グロブリン可変領域を含むポリペプチドリガンド。抗体は、重鎖および軽鎖から構成され、それらの各々は、可変重鎖（ＶＨ）領域および可変軽鎖（ＶＬ）領域と呼ばれる可変領域を有する。ＶＨ領域およびＶＬ領域は一体となって、その抗体によって認識される抗原への結合に関与する。
抗体には、インタクトな免疫グロブリンならびに当該分野で周知の抗体の改変体および部分（例えば、Ｆａｂフラグメント、Ｆａｂ’フラグメント、Ｆ（ａｂ）’２フラグメント、一本鎖Ｆｖタンパク質（「ｓｃＦｖ」）およびジスルフィド安定化Ｆｖタンパク質（「ｄｓＦｖ」）が含まれる。ｓｃＦｖタンパク質は、免疫グロブリンの軽鎖可変領域と免疫グロブリンの重鎖可変領域とがリンカーによって結合されている融合タンパク質であり、ｄｓＦｖでは、それらの鎖は、それらの鎖の会合を安定化させるジスルフィド結合を導入するように変異導入されている。この用語は、キメラ抗体（例えば、ヒト化マウス抗体）、ヘテロ結合体抗体（例えば、二重特異性抗体）などの遺伝的に操作された形態も包含する。Ｐｉｅｒｃｅ Ｃａｔａｌｏｇ ａｎｄ Ｈａｎｄｂｏｏｋ，１９９４−１９９５（Ｐｉｅｒｃｅ Ｃｈｅｍｉｃａｌ Ｃｏ．，Ｒｏｃｋｆｏｒｄ，ＩＬ）；Ｋｕｂｙ，Ｊ．，Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，３ｒｄ Ｅｄ．，Ｗ．Ｈ．Ｆｒｅｅｍａｎ ＆ Ｃｏ．，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ，１９９７もまた参照のこと。
代表的には、天然に存在する免疫グロブリンは、ジスルフィド結合によって相互接続されている重（Ｈ）鎖および軽（Ｌ）鎖を有する。ラムダ（λ）およびカッパー（κ）という２タイプの軽鎖が存在する。抗体分子の機能活性を決定する５つの主要な重鎖のクラス（またはアイソタイプ）：ＩｇＭ、ＩｇＤ、ＩｇＧ、ＩｇＡおよびＩｇＥが存在する。
重鎖および軽鎖の各々は、定常領域および可変領域を含む（これらの領域は、「ドメイン」としても知られる）。重鎖および軽鎖の可変領域は、共同して抗原に特異的に結合する。軽鎖および重鎖の可変領域は、「相補性決定領域」または「ＣＤＲ」とも呼ばれる３つの超可変領域によって中断される「フレームワーク」領域を含む。フレームワーク領域およびＣＤＲの範囲は、定義されている（Ｋａｂａｔら、Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ Ｐｒｏｔｅｉｎｓ ｏｆ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ Ｉｎｔｅｒｅｓｔ，Ｕ．Ｓ．Ｄｅｐａｒｔｍｅｎｔ ｏｆ Ｈｅａｌｔｈ ａｎｄ Ｈｕｍａｎ Ｓｅｒｖｉｃｅｓ，１９９１（これは本明細書中で参考として援用される）を参照のこと）。Ｋａｂａｔデータベースは、現在、オンラインで維持されている。異なる軽鎖または重鎖のフレームワーク領域の配列は、ヒトなどの種内で比較的保存されている。構成要素である軽鎖および重鎖の組み合わされたフレームワーク領域である抗体のフレームワーク領域は、ＣＤＲを３次元空間に位置するためおよび整列させるために役立つ。
ＣＤＲは、主に抗原のエピトープへの結合に関与する。各鎖のＣＤＲは、代表的には、Ｎ末端から出発して順番に番号が付けられＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３と呼ばれ、代表的には、特定のＣＤＲが位置する鎖によっても特定される。したがって、ＶＨＣＤＲ３は、それが見られる抗体の重鎖の可変ドメインに位置する一方、ＶＬＣＤＲ１は、それが見られる抗体の軽鎖の可変ドメイン由来のＣＤＲ１である。ＨＭＷ−ＭＡＡに結合する抗体は、特異的なＶＨ領域配列およびＶＬ領域配列を有し、ゆえに、特異的なＣＤＲ配列を有する。異なる特異性（すなわち、異なる抗原に対する異なる結合部位）を有する抗体は、異なるＣＤＲを有する。ＣＤＲは、抗体ごとに異なるが、それらのＣＤＲ内の限られた数のアミノ酸位置だけが、抗原結合に直接関わる。そのＣＤＲ内のこれらの位置は、特異性決定残基（ＳＤＲｓ）と呼ばれる。
「ＶＨ」または「ＶＨ」という言及は、Ｆｖ、ｓｃＦｖ、ｄｓＦｖまたはＦａｂの可変領域を含む、免疫グロブリン重鎖の可変領域のことを指す。「ＶＬ」または「ＶＬ」という言及は、Ｆｖ、ｓｃＦｖ、ｄｓＦｖまたはＦａｂの可変領域を含む、免疫グロブリン軽鎖の可変領域のことを指す。
「モノクローナル抗体」は、Ｂリンパ球の単一クローンまたは単一の抗体の軽鎖遺伝子および重鎖遺伝子がトランスフェクトされた細胞によって産生される抗体である。モノクローナル抗体は、例えば、ミエローマ細胞と免疫脾臓細胞との融合によるハイブリッド抗体形成細胞を作製することなどの、当業者に公知の方法によって作製される。モノクローナル抗体には、ヒト化モノクローナル抗体が含まれる。
「キメラ抗体」は、ヒトなどの１つの種由来のフレームワーク残基およびＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合するマウス抗体などの別の種由来のＣＤＲ（一般に、抗原結合性を付与する）を有する。
「ヒト」抗体（「完全ヒト」抗体とも呼ばれる）は、ヒトフレームワーク領域およびヒト免疫グロブリン由来のすべてのＣＤＲを含む抗体である。１つの例において、フレームワークおよびＣＤＲは、同じ起源のヒト重鎖および／または軽鎖アミノ酸配列に由来する。しかしながら、１つのヒト抗体に由来するフレームワークは、異なるヒト抗体に由来するＣＤＲを含むように操作され得る。「ヒト化」免疫グロブリンは、ヒトフレームワーク領域および非ヒト（例えば、マウス、ラットまたは合成）免疫グロブリン由来の１つ以上のＣＤＲを含む免疫グロブリンである。ＣＤＲを提供する非ヒト免疫グロブリンは、「ドナー」と呼ばれ、フレームワークを提供するヒト免疫グロブリンは、「アクセプター」と呼ばれる。１つの実施形態において、すべてのＣＤＲが、ヒト化免疫グロブリンにおけるドナー免疫グロブリンに由来する。定常領域は、存在しなくてもよいが、存在する場合、それらは、ヒト免疫グロブリン定常領域と実質的に同一、すなわち、少なくとも約８５〜９０％、例えば、約９５％またはそれ以上同一でなければならない。それゆえ、おそらくＣＤＲを除くヒト化免疫グロブリンのすべての部分が、天然のヒト免疫グロブリン配列の対応する部分と実質的に同一である。「ヒト化抗体」は、ヒト化軽鎖およびヒト化重鎖免疫グロブリンを含む抗体である。ヒト化抗体は、ＣＤＲを提供するドナー抗体と同じ抗原に結合する。ヒト化免疫グロブリンまたはヒト化抗体のアクセプターフレームワークは、ドナーフレームワークに由来するアミノ酸による限られた数の置換を有し得る。ヒト化モノクローナル抗体または他のモノクローナル抗体は、抗原結合性または他の免疫グロブリン機能に対して実質的に影響を及ぼさないさらなる保存的アミノ酸置換を有し得る。ヒト化免疫グロブリンは、遺伝子操作を用いて構築され得る（例えば、米国特許第５，５８５，０８９号を参照のこと）。
結合親和性：抗原に対する抗体の親和性。１つの実施形態において、親和性は、Ｆｒａｎｋｅｌら、Ｍｏｌ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．，１６：１０１−１０６，１９７９によって報告されたＳｃａｔｃｈａｒｄ法の変法によって計算される。別の実施形態において、結合親和性は、抗原／抗体解離速度によって測定される。別の実施形態において、高い結合親和性は、競合ラジオイムノアッセイによって測定される。別の実施形態において、結合親和性は、ＥＬＩＳＡによって測定される。高親和性でＨＭＷ−ＭＡＡなどの抗原に「特異的に結合」する抗体は、他の無関係の抗原に著しく結合しない。
乳癌：良性または悪性であり得る***組織の新生物状態。最も一般的なタイプの乳癌は、乳管癌腫である。非浸潤性乳管癌腫は、乳管の非侵襲性新生物状態である。小葉癌腫は、侵襲性疾患ではなく、癌腫が発生し得る指標である。浸潤性（悪性）の乳癌腫は、ステージ（Ｉ、ＩＩＡ、ＩＩＢ、ＩＩＩＡ、ＩＩＩＢおよびＩＶ）に分けられ得る。
化学療法剤：異常な細胞成長を特徴とする疾患の処置において治療的に有用な任意の化学剤。そのような疾患としては、腫瘍、新生物および癌、ならびに乾癬などの肥厚成長を特徴とする疾患が挙げられる。１つの実施形態において、化学療法剤は、リンパ腫、白血病または別の腫瘍を処置する際に有用な薬剤である。１つの実施形態において、化学療法剤は、放射性化合物である。当業者は、有用な化学療法剤を容易に特定し得る（例えば、Ｈａｒｒｉｓｏｎ’ｓ Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ ｏｆ Ｉｎｔｅｒｎａｌ Ｍｅｄｉｃｉｎｅ，１４ｔｈ ｅｄｉｔｉｏｎ中のＣｈａｐｔｅｒ ８６のＳｌａｐａｋ ａｎｄ Ｋｕｆｅ，Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ ｏｆ Ｃａｎｃｅｒ Ｔｈｅｒａｐｙ；Ａｂｅｌｏｆｆ，Ｃｌｉｎｉｃａｌ Ｏｎｃｏｌｏｇｙ ２ｎｄ ｅｄ．，（著作権）２０００ Ｃｈｕｒｃｈｉｌｌ Ｌｉｖｉｎｇｓｔｏｎｅ，Ｉｎｃ中のＣｈ．１７のＰｅｒｒｙら、Ｃｈｅｍｏｔｈｅｒａｐｙ；Ｂａｌｔｚｅｒ，Ｌ．，Ｂｅｒｋｅｒｙ，Ｒ．（ｅｄｓ．）：Ｏｎｃｏｌｏｇｙ Ｐｏｃｋｅｔ Ｇｕｉｄｅ ｔｏ Ｃｈｅｍｏｔｈｅｒａｐｙ，２ｎｄ ｅｄ．Ｓｔ．Ｌｏｕｉｓ，Ｍｏｓｂｙ−Ｙｅａｒ Ｂｏｏｋ，１９９５；Ｆｉｓｃｈｅｒ，Ｄ．Ｓ．，Ｋｎｏｂｆ，Ｍ．Ｆ．，Ｄｕｒｉｖａｇｅ，Ｈ．Ｊ．（ｅｄｓ）：Ｔｈｅ Ｃａｎｃｅｒ Ｃｈｅｍｏｔｈｅｒａｐｙ Ｈａｎｄｂｏｏｋ，４ｔｈ ｅｄ．Ｓｔ．Ｌｏｕｉｓ，Ｍｏｓｂｙ−Ｙｅａｒ Ｂｏｏｋ，１９９３を参照のこと）。併用化学療法は、癌を処置する２つ以上の薬剤の投与である。１つの例は、放射性化合物または化学的化合物と組み合わせて使用される、ＨＭＷ−ＭＡＡに結合する抗体またはそのフラグメントの投与である。
キメラ抗体：代表的には異なる種の２つの異なる抗体に由来する配列を含む抗体。最も代表的には、キメラ抗体は、ヒトおよびマウスの抗体ドメイン、一般に、ヒト定常領域ならびにマウスの可変領域、マウスＣＤＲおよび／またはマウスＳＤＲを含む。
保存的改変体：「保存的」アミノ酸置換は、ＨＭＷ−ＭＡＡに対する抗体の親和性に実質的に影響を及ぼさないか、またはその親和性を低下させない置換である。例えば、ＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合するヒト抗体は、多くとも約１つ、多くとも約２つ、多くとも約５つ、多くとも（ａｎｄ ｍｏｓｔ）約１０個または多くとも約１５個の保存的置換を含み得、元のＨＭＷ−ＭＡＡポリペプチドに特異的に結合し得る。保存的バリエーションという用語は、抗体がＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合するという条件で、置換されていない親アミノ酸の代わりに置換されたアミノ酸の使用も含む。非保存的置換は、ＨＭＷ−ＭＡＡに対する活性または結合性を低下させる置換である。
機能的に類似するアミノ酸を提供する保存的アミノ酸置換の表は、当業者に周知である。以下の６つの群が、互いに保存的置換であると考えられるアミノ酸の例である：
１）アラニン（Ａ）、セリン（Ｓ）、トレオニン（Ｔ）；
２）アスパラギン酸（Ｄ）、グルタミン酸（Ｅ）；
３）アスパラギン（Ｎ）、グルタミン（Ｑ）；
４）アルギニン（Ｒ）、リシン（Ｋ）；
５）イソロイシン（Ｉ）、ロイシン（Ｌ）、メチオニン（Ｍ）、バリン（Ｖ）；および
６）フェニルアラニン（Ｆ）、チロシン（Ｙ）、トリプトファン（Ｗ）
相補性決定領域（ＣＤＲ）：天然のＩｇ結合部位の天然のＦｖ領域の結合親和性および特異性を一体となって定義するアミノ酸配列。Ｉｇの軽鎖および重鎖の各々は、それぞれＬ−ＣＤＲ１、Ｌ−ＣＤＲ２、Ｌ−ＣＤＲ３およびＨ−ＣＤＲ１、Ｈ−ＣＤＲ２、Ｈ−ＣＤＲ３と命名された３つのＣＤＲを有する。
接触：直接的な物理的会合の配置；固体と液体の形態の両方を含む。
細胞傷害性：生物の残りの細胞ではなく、標的化されることを意図された細胞に対する、免疫毒素などの分子の毒性。１つの実施形態では、対照的に、用語「毒性」とは、免疫毒素の標的化部分によって、標的化されることを意図された細胞以外の細胞に対する免疫毒素の毒性のことを指し、用語「動物毒性」とは、免疫毒素によって標的化されることを意図された細胞以外の細胞に対する免疫毒素の毒性による動物に対する免疫毒素の毒性のことを指す。
縮重改変体：遺伝暗号の結果として縮重である配列を含む、ＨＭＷ−ＭＡＡポリペプチドまたはＨＭＷ−ＭＡＡに結合する抗体をコードするポリヌクレオチド。２０種の天然のアミノ酸が存在し、それらのほとんどが、２つ以上のコドンによって特定される。それゆえ、そのヌクレオチド配列によってコードされるＨＭＷ−ＭＡＡポリペプチドまたはＨＭＷ−ＭＡＡに結合する抗体のアミノ酸配列が、変化しない限り、すべての縮重ヌクレオチド配列が含まれる。
診断：病的状態（例えば、メラノーマ、乳癌、神経膠腫、頭頸部癌または前立腺癌であるがこれらに限定されない）の存在または性質を同定すること。診断方法は、感度および特異性の点で異なる。診断アッセイの「感度」は、陽性と検査された罹患個体のパーセンテージ（真陽性のパーセント）である。診断アッセイの「特異性」は、１−偽陽性率であり、ここで、偽陽性率は、陽性と検査された、疾患を有していない者の割合と定義される。特定の診断方法は、ある状態の確証診断を提供しないかもしれないが、その方法が診断に役立つ陽性の指標を提供する場合、それで足りる。「予後」は、乳癌または転移などの病的状態の発生の確率（例えば、重症度）である。
エフェクター分子：キメラ分子が標的化する細胞に対して所望の効果を有するように意図されたキメラ分子の一部。エフェクター分子は、エフェクター部分（ＥＭ）、治療用薬剤もしくは診断用薬剤または類似の用語としても知られる。
治療用薬剤には、化合物（例えば、核酸、タンパク質、ペプチド、アミノ酸もしくは誘導体、糖タンパク質、放射性同位体、脂質、炭水化物または組換えウイルス）が含まれる。核酸治療部分および核酸診断部分としては、アンチセンス核酸、一本鎖または二重鎖ＤＮＡとの共有結合性架橋のための誘導体化オリゴヌクレオチド、および三重鎖形成オリゴヌクレオチドが挙げられる。あるいは、抗ＨＭＷ−ＭＡＡ抗体などの標的化部分に連結される分子は、例えば、治療用組成物（例えば、薬物、核酸（例えば、アンチセンス核酸）または循環器系に対する直接的な曝露から遮蔽され得る別の治療的部分）を含むリポソームまたはミセルなどの被包系であり得る。抗体に付着されるリポソームを調製する手段は、当業者に周知である（例えば、米国特許第４，９５７，７３５号；およびＣｏｎｎｏｒら、Ｐｈａｒｍ．Ｔｈｅｒ．２８：３４１−３６５，１９８５を参照のこと）。診断用薬剤または診断用部分は、放射性同位体および他の検出可能な標識を含む。そのような目的のために有用な検出可能な標識もまた、当該分野で周知であり、それらとしては、放射性同位体（例えば、３５Ｓ、１１Ｃ、１３Ｎ、１５Ｏ、１８Ｆ、１９Ｆ、９９ｍＴｃ、１３１Ｉ、３Ｈ、１４Ｃ、１５Ｎ、９０Ｙ、９９Ｔｃ、１１１Ｉｎおよび１２５Ｉ）、フルオロフォア、化学発光剤および酵素が挙げられる。
エピトープ：抗原決定基。これらは、抗原性である、すなわち、特異的免疫応答を誘発する、分子上の特定の化学基またはペプチド配列である。抗体は、ＨＭＷ−ＭＡＡなどのポリペプチド上の特定の抗原性エピトープに特異的に結合する。
発現：タンパク質への核酸の翻訳。タンパク質は、発現されて、細胞内に留まり得るか、細胞表面膜の構成要素になり得るか、または細胞外マトリックスもしくは細胞外の媒質に分泌され得る。
フレームワーク領域：ＣＤＲの間に挿入されたアミノ酸配列。フレームワーク領域には、可変軽鎖フレームワーク領域および可変重鎖フレームワーク領域が含まれる。フレームワーク領域は、抗原に結合するためにＣＤＲを適切な向きに保持するように働く。
神経膠腫：任意の発生状態における神経膠から構成される腫瘍。神経膠腫には、脳および脊髄のすべての内因性の新生物（例えば、星状細胞腫、上衣腫および乏突起膠腫）が含まれる。「低悪性度」神経膠腫は、十分に分化している（退形成でない）；これらは、良性であり、患者に対して良好な予後を予示する。「高悪性度」神経膠腫は、未分化または退形成である；これらは、悪性であり、不良な予後を有する。
ＨＡＭＡ（ヒト抗マウス抗体）応答：患者に投与されたマウス抗体の可変領域および定常領域に対するヒト被験体における免疫応答。抗体の反復投与は、患者の血清からの抗体のクリアランス速度を高め得、また、その患者においてアレルギー反応を誘発し得る。
宿主細胞：ベクターを増殖し得、そのＤＮＡを発現し得る、細胞。この細胞は、原核生物または真核生物の細胞であり得る。この用語は、対象宿主細胞の任意の子孫も含む。複製中に生じる変異が存在し得るので、すべての子孫が、親細胞と同一でないかもしれないことが理解される。しかしながら、用語「宿主細胞」が用いられるとき、そのような子孫が含まれる。
免疫応答：刺激に対するＢ細胞、Ｔ細胞または単球などの免疫系の細胞の応答。１つの実施形態において、その応答は、特定の抗原に対して特異的である（「抗原特異的応答」）。１つの実施形態において、免疫応答は、ＣＤ４＋応答またはＣＤ８＋応答などのＴ細胞応答である。別の実施形態において、その応答は、Ｂ細胞応答であり、それにより、特異的抗体の産生が生じる。
免疫結合体：抗体またはその機能性フラグメントに対するエフェクター分子の共有結合。そのエフェクター分子は、検出可能な標識または免疫毒素であり得る。トキシンの具体的で非限定的な例としては、アブリン、リシン、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ外毒素（ＰＥ、例えば、ＰＥ３５、ＰＥ３７、ＰＥ３８およびＰＥ４０）、ジフテリア毒素（ＤＴ）、ボツリヌス毒素もしくはそれらの改変トキシン、あるいは細胞の成長を直接もしくは間接的に阻害するかまたは細胞を殺滅する他の有毒な薬剤が挙げられるが、これらに限定されない。例えば、ＰＥおよびＤＴは、代表的には肝臓毒性によって死をもたらす非常に有毒な化合物である。しかしながら、ＰＥおよびＤＴは、そのトキシンの天然の標的化成分（例えば、ＰＥのドメインＩａおよびＤＴのＢ鎖）を除去すること、およびそれを抗体などの異なる標的化部分で置き換えることによって、免疫毒素として使用するための形態に改変され得る。「キメラ分子」は、エフェクター分子に結合体化（結合）されたリガンドまたは抗体などの標的化部分である。用語「結合体化された」または「連結された」とは、２つのポリペプチドを１つの連続したポリペプチド分子にすることを指す。１つの実施形態において、抗体は、エフェクター分子に接着される。別の実施形態において、エフェクター分子に接着された抗体は、体内での半減期を延長するために、タンパク質もしくはペプチドに対して脂質または他の分子にさらに接着される。その結合は、化学的手段または組換え手段によるものであり得る。１つの実施形態において、その結合は、化学的結合であり、ここで、抗体部分とエフェクター分子との反応は、それらの２分子間に共有結合を形成することにより、１つの分子を形成する。必要に応じて、ペプチドリンカー（短いペプチド配列）が、抗体とエフェクター分子との間に含められ得る。免疫結合体は、最初、別個の官能性を有する２分子（例えば、抗体およびエフェクター分子）から調製されたので、それらは、時折「キメラ分子」とも呼ばれる。ゆえに、用語「キメラ分子」は、本明細書中で使用される場合、エフェクター分子に結合体化（結合）された標的化部分（例えば、リガンドまたは抗体）のことを指す。
免疫原性ペプチド：ペプチドがＭＨＣ分子に結合して、細胞傷害性Ｔリンパ球（「ＣＴＬ」）応答、またはその免疫原性ペプチドが由来する抗原に対するＢ細胞応答（例えば、抗体産生）を誘導するような、対立遺伝子特異的モチーフまたは他の配列（例えば、Ｎ末端リピート）を含むペプチド。
１つの実施形態において、免疫原性ペプチドは、配列モチーフまたは当該分野で公知の他の方法（例えば、ニューラルネットまたは多項式判定（ｐｏｌｙｎｏｍｉａｌ ｄｅｔｅｒｍｉｎａｔｉｏｎ））を用いて同定される。代表的には、アルゴリズムを使用してペプチドの「結合閾値」が決定され、それによりある特定の親和性で結合する高確率をペプチドに付与するスコアを有し、かつ免疫原性であり得るペプチドが選択される。それらのアルゴリズムは、特定の位置における特定のアミノ酸のＭＨＣ結合性に対する影響、特定の位置における特定のアミノ酸の抗体結合性に対する影響、またはモチーフ含有ペプチドにおける特定の置換の結合性に対する影響に基づく。免疫原性ペプチドの文脈内において、「保存された残基」は、ペプチド内の特定の位置におけるランダム分布によって期待される頻度よりも著しく高い頻度で見られる残基である。１つの実施形態において、保存された残基は、ＭＨＣ構造が免疫原性ペプチドとの接触点を提供し得る残基である。１つの具体的で非限定的な例において、免疫原性ポリペプチドは、ＨＭＷ−ＭＡＡのある領域またはそのフラグメントを含み、ここで、そのポリペプチドは、完全長ＨＭＷ−ＭＡＡポリペプチドを発現する宿主細胞の細胞表面上で発現される。
免疫原性組成物：ＨＭＷ−ＭＡＡポリペプチドを発現する細胞に対して測定可能なＣＴＬ応答を誘導するか、またはＨＭＷ−ＭＡＡポリペプチドに対して測定可能なＢ細胞応答（例えば、抗体の産生）を誘導する、ＨＭＷ−ＭＡＡポリペプチドなどのポリペプチドを含む組成物。免疫原性組成物は、サイトカイン産生も誘導し得る。免疫原性組成物とは、さらに、ＨＭＷ−ＭＡＡポリペプチドを発現するために使用され得る（ゆえに、このポリペプチドに対する免疫応答を誘発するために使用され得る）ＨＭＷ−ＭＡＡポリペプチドをコードする単離された核酸のことを指す。インビトロで使用する場合、免疫原性組成物は、単離されたタンパク質またはペプチドエピトープからなり得る。インビボで使用する場合、免疫原性組成物は、代表的には、薬学的に許容可能なキャリア中のタンパク質もしくは免疫原性ペプチド、および／または他の薬剤を含む。ＨＭＷ−ＭＡＡポリペプチドなどの任意の特定のペプチドまたはそのポリペプチドをコードする核酸は、当該分野において認められているアッセイによって、ＣＴＬ応答またはＢ細胞応答を誘導する能力について容易に試験され得る。免疫原性組成物は、当業者に周知のアジュバントを含み得る。
免疫学的に反応性の条件：特定のエピトープに対して産生された抗体が、実質的にすべての他のエピトープに対する結合よりも検出可能に高い程度で、および／またはその結合を実質的に除外して、そのエピトープに結合することを可能にする条件に対する言及を含む。免疫学的に反応性の条件は、抗体結合反応の形式に依存し、代表的には、イムノアッセイプロトコルまたはインビボにおいて遭遇する条件において利用される条件である。イムノアッセイの形式および条件の説明については、Ｈａｒｌｏｗ ＆ Ｌａｎｅ，前出を参照のこと。それらの方法において使用される免疫学的に反応性の条件は、生存している哺乳動物内または哺乳動物細胞内において代表的な条件（例えば、温度、オスモル濃度およびｐＨ）に対する言及を含む「生理学的条件」である。一部の器官が極端な条件に供されることが認識されるが、生物内および細胞内の環境は、通常、およそｐＨ７（すなわち、ｐＨ６．０〜ｐＨ８．０、より代表的には、ｐＨ６．５〜７．５）になっており、主要な溶媒として水を含み、０℃より高く５０℃より低い温度にある。オスモル濃度は、細胞の生存能および増殖を支える範囲内である。
単離：「単離された」生物学的成分（例えば、核酸、タンパク質（抗体を含む）または細胞小器官）は、その成分が天然に存在する環境（例えば、細胞）内の他の生物学的成分、すなわち、他の染色体および染色体外のＤＮＡおよびＲＮＡ、タンパク質ならびに細胞小器官から実質的に分離されているか、または精製されている。「単離」されている核酸およびタンパク質には、標準的な精製法によって精製された核酸およびタンパク質が含まれる。この用語は、宿主細胞内での組換え発現によって調製された核酸およびタンパク質、ならびに化学的に合成された核酸も包含する。
標識：その分子の検出を容易にする別の分子（例えば、抗体またはタンパク質）に直接または間接的に結合体化される検出可能な化合物または組成物。標識の具体的で非限定的な例としては、蛍光タグ、酵素の結合および放射性同位体が挙げられる。１つの例において、「標識された抗体」とは、その抗体内における別の分子の組み込みのことを指す。例えば、その標識は、検出可能なマーカー（例えば、放射標識されたアミノ酸の組み込み、またはマークされたアビジン（例えば、光学的方法または比色法によって検出され得る蛍光マーカーまたは酵素活性を含むストレプトアビジン）によって検出され得るビオチニル部分のポリペプチドへの付着）である。ポリペプチドおよび糖タンパク質を標識する様々な方法が、当該分野で公知であり、それらが使用され得る。ポリペプチド用の標識の例としては、以下：放射性同位体または放射性ヌクレオチド（例えば、３５Ｓ、１１Ｃ、１３Ｎ、１５Ｏ、１８Ｆ、１９Ｆ、９９ｍＴｃ、１３１Ｉ、３Ｈ、１４Ｃ、１５Ｎ、９０Ｙ、９９Ｔｃ、１１１Ｉｎおよび１２５Ｉ）、蛍光標識（例えば、フルオレセインイソチオシアネート（ＦＩＴＣ）、ローダミン、ランタニドリン光体）、酵素標識（例えば、西洋ワサビペルオキシダーゼ、ベータ−ガラクトシダーゼ、ルシフェラーゼ、アルカリホスファターゼ）、化学発光マーカー、ビオチニル基、２次レポーターによって認識される所定のポリペプチドエピトープ（例えば、ロイシンジッパー対配列、２次抗体用の結合部位、金属結合ドメイン、エピトープタグ）、または磁性物質（例えば、ガドリニウムキレート）が挙げられるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態において、標識は、潜在的な立体障害を減少させるために様々な長さのスペーサーアームに付着される。
リンカー：いくつかの場合において、リンカーは、可変重鎖を可変軽鎖に間接的に結合するように働く抗体結合フラグメント（例えば、Ｆｖフラグメント）内のペプチドである。「リンカー」とは、抗体などの標的化部分を、細胞毒または検出可能な標識などのエフェクター分子に結合するように働くペプチドのことも指し得る。
用語「結合体化する」、「接着する」、「結合する」または「連結する」とは、２つのポリペプチドを１つの連続したポリペプチド分子にすること、または放射性核種もしくは他の分子をｓｃＦｖなどのポリペプチドに共有結合的に付着することを指す。特定の文脈において、これらの用語は、抗体部分などのリガンドをエフェクター分子に接着することについての言及を含む。その結合は、化学的手段または組換え手段によるものであり得る。「化学的手段」とは、抗体部分とエフェクター分子との間の反応（それにより、それらの２分子間に共有結合が形成され、１つの分子が形成される）のことを指す。
哺乳動物：この用語には、ヒトと非ヒト哺乳動物の両方が含まれる。同様に、用語「被験体」は、ヒトと動物被験体の両方を包含する。
主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）：ヒト白血球抗原（「ＨＬＡ」）を含む、様々な種において報告された組織適合性抗原系を包含することを意味する総称。用語「モチーフ」とは、特定のＭＨＣ対立遺伝子によって認識される規定の長さ（通常、約８〜約１１アミノ酸）のペプチドにおける残基のパターンのことを指す。そのペプチドモチーフは、代表的には、各ＭＨＣ対立遺伝子によって異なるものであり、高度に保存された残基および結合に関わらない残基のパターンが異なる。
メラノーマ：メラノサイト（メラニン色素を生成する細胞）に由来する癌の形態。メラノサイトは、主に皮膚に見られるが、腸および眼にも存在する。皮膚におけるメラノーマには、表在拡大型黒色腫、結節性黒色腫、末端部黒子様黒色腫および悪性黒子（メラノーマ）が含まれる。上記タイプのいずれもが、メラニンを生成し得るか、またはメラニン欠乏であり得る。同様に、任意のサブタイプが、高悪性度の挙動および局所的再発の傾向のマーカーである線維形成（神経向性を有する高密度線維反応）を示し得る。他のメラノーマとしては、明細胞肉腫、粘膜黒色腫（ｍｕｃｏｓａｌ ｍｅｌａｎｏｍａ）およびブドウ膜黒色腫が挙げられる。
予後に影響を及ぼす特徴は、腫瘍の厚さ（単位はミリメートル）（ブレスロー深度（Ｂｒｅｓｌｏｗ’ｓ ｄｅｐｔｈ））、皮膚構造に関連する深度（クラークレベル）、メラノーマのタイプ、潰瘍の存在、リンパ管浸潤／神経周囲浸潤の存在、腫瘍浸潤リンパ球の存在（存在する場合、予後は良好）、病変の位置、衛星病変の存在、および局所転移または遠隔転移の存在である。メラノーマがリンパ節に広がっているとき、最も重要な因子の１つは、悪性腫瘍を有する結節の数である。結節内の悪性腫瘍の範囲もまた重要である；悪性腫瘍が微視的にすぎない微小転移巣は、巨視的転移（ｍａｃｒｏｍｅｔａｓｔａｓｅｓ）よりも好ましい予後を有する。遠隔転移が存在するとき、５年生存率は、１０パーセント未満である；生存期間中央値は、６〜１２ヶ月である。皮膚および肺への転移は、より良好な予後を有する。脳、骨および肝臓への転移は、不良な予後に関連する。
メラノーマは、以下のとおりステージ分けされ得る：
ステージ０：上皮内黒色腫（クラークレベルＩ）、１００％生存。
ステージＩ／ＩＩ：侵襲性メラノーマ、８５〜９５％生存。
Ｔ１ａ：１．００ｍｍ未満の原発性、潰瘍なし、クラークレベルＩＩ〜ＩＩＩ。
Ｔ１ｂ：１．００ｍｍ未満の原発性、潰瘍ありまたはクラークレベルＩＶ〜Ｖ。
Ｔ２ａ：１．００〜２．００ｍｍの原発性、潰瘍なし。
ステージＩＩ：高リスクメラノーマ、４０〜８５％生存。
Ｔ２ｂ：１．００〜２．００ｍｍの原発性、潰瘍あり。
Ｔ３ａ：２．００〜４．００ｍｍの原発性、潰瘍なし。
Ｔ３ｂ：２．００〜４．００ｍｍの原発性、潰瘍あり。
Ｔ４ａ：４．００ｍｍ以上の原発性、潰瘍なし。
Ｔ４ｂ：４．００ｍｍ以上の原発性、潰瘍あり。
ステージＩＩＩ：局所性の転移、２５〜６０％生存。
Ｎ１：１つの陽性リンパ節。
Ｎ２：２〜３つの陽性リンパ節または局所性の皮膚／移動中転移巣（Ｉｎ Ｔｒａｎｓｉｔ Ｍｅｔａｓｔａｓｅｓ）。
Ｎ３：４つの陽性リンパ節またはリンパ節および局所性の皮膚／移動中転移巣。
ステージＩＶ：遠隔転移、９〜１５％生存。
Ｍ１ａ：遠位皮膚転移、正常な乳酸デヒドロゲナーゼ（ＬＤＨ）。
Ｍ１ｂ：肺転移、正常なＬＤＨ。
Ｍ１ｃ：他の遠隔転移または高ＬＤＨを有する任意の遠隔転移。
モノクローナル抗体：Ｂリンパ球の単一クローンまたは単一抗体の軽鎖遺伝子および重鎖遺伝子がトランスフェクトされた細胞によって産生される抗体。モノクローナル抗体は、当業者に公知の方法、例えば、ミエローマ細胞と免疫脾臓細胞との融合からハイブリッド抗体形成細胞を作製することによって生成される。モノクローナル抗体には、ヒト化モノクローナル抗体および完全ヒトモノクローナル抗体が含まれる。本明細書中で使用される場合、モノクローナル抗体には、抗体フラグメント（例えば、ｓｃＦｖ、Ｆｖ、ｄｓＲｖまたはＦａｂであるがこれらに限定されない）が含まれる。
新形成、悪性腫瘍、癌または腫瘍：細胞の異常な成長および制御されない成長の結果。新形成、悪性腫瘍、癌および腫瘍は、しばしば交換可能に使用される。個体における腫瘍の量は、腫瘍の数、体積または重量として測定され得る「全身腫瘍組織量（ｔｕｍｏｒ ｂｕｒｄｅｎ）」である。転移しない腫瘍は、「良性」と呼ばれる。周囲組織を浸潤する腫瘍および／または転移し得る腫瘍は、「悪性」と呼ばれる。血液学的腫瘍の例としては、急性白血病（例えば、１１ｑ２３陽性急性白血病、急性リンパ性白血病、急性骨髄球性白血病、急性骨髄性白血病、ならびに骨髄芽球性白血病、前骨髄球性白血病、骨髄単球性白血病、単球性白血病および赤白血病）、慢性白血病（例えば、慢性骨髄性（顆粒球性）白血病、慢性骨髄性白血病および慢性リンパ性白血病）、真性多血症、リンパ腫、ホジキン病、非ホジキンリンパ腫（低悪性度および高悪性度の形態）、多発性骨髄腫、ワルデンシュトレームマクログロブリン血症、重鎖病、骨髄異形成症候群、ヘアリーセル白血病および骨髄形成異常を含む白血病が挙げられる。
肉腫および癌腫などの固形腫瘍の例としては、線維肉腫、粘液肉腫、脂肪肉腫、軟骨肉腫、骨原性肉腫および他の肉腫、滑膜腫（ｓｙｎｏｖｉｏｍａ）、中皮腫、ユーイング腫瘍、平滑筋肉腫、横紋筋肉腫、結腸癌腫、リンパ系悪性腫瘍、膵癌、乳癌（基底細胞型（ｂａｓａｌ）乳癌腫、腺管癌腫および小葉性乳癌腫を含む）、肺癌、卵巣癌、前立腺癌、肝細胞癌腫、扁平上皮癌腫、基底細胞癌腫、腺癌腫、汗腺癌腫、甲状腺髄様癌腫、甲状腺乳頭癌腫、褐色細胞腫、脂腺癌腫、乳頭状癌腫、乳頭状腺癌腫、髄様癌腫、気管支原性癌腫、腎細胞癌腫、ヘパトーム、胆管癌腫、絨毛癌腫、ウィルムス腫瘍、子宮頸癌、精巣腫瘍、セミノーマ、膀胱癌腫およびＣＮＳ腫瘍（例えば、神経膠腫、星状細胞腫、髄芽腫、頭蓋咽頭腫（ｃｒａｎｉｏｐｈａｒｙｏｇｉｏｍａ）、上衣腫、松果体腫、血管芽腫、聴神経腫、乏突起膠腫、髄膜腫（ｍｅｎａｎｇｉｏｍａ）、メラノーマ、神経芽細胞腫および網膜芽細胞腫）が挙げられる。
いくつかの例において、腫瘍は、メラノーマ、乳癌、前立腺癌、神経膠腫または扁平上皮癌腫、例えば、頭頸部癌である。
核酸：ホスホジエステル結合を介して連結されるヌクレオチド単位（リボヌクレオチド、デオキシリボヌクレオチド、関連する天然に存在する構造上の改変体およびそれらの合成の天然に存在しないアナログ）、関連する天然に存在する構造上の改変体およびそれらの合成の天然に存在しないアナログから構成されるポリマー。したがって、この用語には、ヌクレオチドおよびそれらの間の結合が、天然に存在しない合成アナログ（例えば、ホスホロチオエート、ホスホルアミデート、メチルホスホネート、キラル−メチルホスホネート、２−Ｏ−メチルリボヌクレオチド、ペプチド核酸（ＰＮＡ）などであるが、これらに限定されない）を含む、ヌクレオチドポリマーが含まれる。そのようなポリヌクレオチドは、例えば、自動ＤＮＡ合成装置を用いて合成され得る。用語「オリゴヌクレオチド」とは、代表的には、一般に、約５０ヌクレオチドを超えない短いポリヌクレオチドのことを指す。ヌクレオチド配列が、ＤＮＡ配列（すなわち、Ａ、Ｔ、Ｇ、Ｃ）によって表されるとき、このヌクレオチド配列は、「Ｕ」が「Ｔ」に取って代わるＲＮＡ配列（すなわち、Ａ、Ｕ、Ｇ、Ｃ）も含むと理解される。
ヌクレオチド配列を記載するために、従来の表記法が本明細書中で使用される：一本鎖ヌクレオチド配列の左側の末端が、５’末端であり；二本鎖ヌクレオチド配列の左側の方向が、５’方向と呼ばれる。新生のＲＮＡ転写物に対するヌクレオチドの５’から３’への付加の方向が、転写方向と呼ばれる。ｍＲＮＡと同じ配列を有するＤＮＡ鎖が、「コーディング鎖」と呼ばれ；そのＤＮＡから転写されたｍＲＮＡと同じ配列を有するＤＮＡ鎖の配列であり、かつＲＮＡ転写物の５’末端に対して５’に位置する配列が、「上流配列」と呼ばれ；ＲＮＡと同じ配列を有するＤＮＡ鎖の配列であり、かつコードＲＮＡ転写物の３’末端に対して３’である配列が、「下流配列」と呼ばれる。
「ｃＤＮＡ」とは、ｍＲＮＡと相補的または同一である、一本鎖または二本鎖の形態のＤＮＡのことを指す。
「コードする」とは、規定の配列のヌクレオチド（すなわち、ｒＲＮＡ、ｔＲＮＡおよびｍＲＮＡ）または規定の配列のアミノ酸を有する、生物学的プロセスにおいて他のポリマーおよび高分子の合成するための鋳型として機能するポリヌクレオチド（例えば、遺伝子、ｃＤＮＡまたはｍＲＮＡ）としてのヌクレオチドの特異的配列の固有の特性、およびそれらからもたらされる生物学的特性のことを指す。したがって、ある遺伝子によって生成されるｍＲＮＡの転写および翻訳が、細胞または他の生体系においてタンパク質を生成する場合、その遺伝子は、タンパク質をコードする。コーディング鎖（そのヌクレオチド配列は、ｍＲＮＡ配列と同一であり、通常、配列表に提供されている）と非コーディング鎖（遺伝子またはｃＤＮＡの転写のために鋳型として使用されるもの）の両方が、タンパク質またはその遺伝子もしくはｃＤＮＡの他の産物をコードすると呼ばれ得る。別段明記されない限り、「アミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列」は、互いの縮重バージョンであって同じアミノ酸配列をコードする、すべてのヌクレオチド配列を含む。タンパク質およびＲＮＡをコードするヌクレオチド配列は、イントロンを含み得る。
「組換え核酸」とは、天然には共に連結されていないヌクレオチド配列を有する核酸のことを指す。これには、適当な宿主細胞を形質転換するために使用され得る増幅された核酸または組み立てられた核酸を含む核酸ベクターが含まれる。組換え核酸を含む宿主細胞は、「組換え宿主細胞」と呼ばれる。次いで、その組換え宿主細胞内で遺伝子が発現されることにより、「組換えポリペプチド」などが生成される。組換え核酸は、非コード機能も果たし得る（例えば、プロモーター、複製起点、リボソーム結合部位など）。
その配列が第１の配列であるポリヌクレオチドが、その配列が第２の配列であるポリヌクレオチドと特異的にハイブリダイズする場合、その第１の配列は、第２の配列に対して「アンチセンス」である。
２つ以上のヌクレオチド配列間またはアミノ酸配列間の配列の関係性を記載するために使用される用語としては、「参照配列」、「〜から選択される」、「比較ウィンドウ（ｃｏｍｐａｒｉｓｏｎ ｗｉｎｄｏｗ）」、「同一」、「配列同一性のパーセンテージ」、「実質的に同一」、「相補的」および「実質的に相補的」が挙げられる。
核酸配列の配列比較について、代表的には１つの配列が、試験配列と比較される参照配列となる。配列比較アルゴリズムを用いるとき、試験配列および参照配列を、コンピュータに入力し、必要であれば部分列座標（ｓｕｂｓｅｑｕｅｎｃｅ ｃｏｏｒｄｉｎａｔｅ）を指定し、配列アルゴリズムプログラムパラメータを指定する。デフォルトのプログラムパラメータが使用される。比較のための配列のアラインメント方法は、当該分野で周知である。比較のための配列の最適なアラインメントは、例えば、Ｓｍｉｔｈ ＆ Ｗａｔｅｒｍａｎ，Ａｄｖ．Ａｐｐｌ．Ｍａｔｈ．２：４８２，１９８１の局所相同性アルゴリズム、Ｎｅｅｄｌｅｍａｎ ＆ Ｗｕｎｓｃｈ，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．４８：４４３，１９７０の相同性アラインメントアルゴリズム、Ｐｅａｒｓｏｎ ＆ Ｌｉｐｍａｎ，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔ’ｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８５：２４４４，１９８８の類似度検索法、これらのアルゴリズム（Ｗｉｓｃｏｎｓｉｎ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ Ｓｏｆｔｗａｒｅ Ｐａｃｋａｇｅ，Ｇｅｎｅｔｉｃｓ Ｃｏｍｐｕｔｅｒ Ｇｒｏｕｐ，５７５ Ｓｃｉｅｎｃｅ Ｄｒ．，Ｍａｄｉｓｏｎ，ＷＩにおけるＧＡＰ、ＢＥＳＴＦＩＴ、ＦＡＳＴＡおよびＴＦＡＳＴＡ）のコンピュータ化された実行、または手動によるアラインメントおよび目視検査（例えば、Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ（Ａｕｓｕｂｅｌら、ｅｄｓ １９９５補遺）を参照のこと）によって行われ得る。
有用なアルゴリズムの１つの例は、ＰＩＬＥＵＰである。ＰＩＬＥＵＰは、Ｆｅｎｇ ＆ Ｄｏｏｌｉｔｔｌｅ，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｅｖｏｌ．３５：３５１−３６０，１９８７のプログレッシブ・アラインメント法の簡略法を用いる。使用される方法は、Ｈｉｇｇｉｎｓ ＆ Ｓｈａｒｐ，ＣＡＢＩＯＳ ５：１５１−１５３，１９８９によって記載された方法と類似している。ＰＩＬＥＵＰを用い、以下のパラメータ：デフォルトのギャップウェイト（ｇａｐ ｗｅｉｇｈｔ）（３．００）、デフォルトのギャップ長ウェイト（ｇａｐ ｌｅｎｇｔｈ ｗｅｉｇｈｔ）（０．１０）および重み付けエンドギャップ（ｗｅｉｇｈｔｅｄ ｅｎｄ ｇａｐｓ）を使用して、参照配列を他の試験配列と比較することにより、パーセント配列同一性関係が決定される。ＰＩＬＥＵＰは、バージョン７．０などのＧＣＧ配列解析ソフトウェアパッケージ（Ｄｅｖｅｒｅａｕｘら、Ｎｕｃ．Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．１２：３８７−３９５，１９８４から得ることができる。
パーセント配列同一性および配列類似性の決定に適したアルゴリズムの別の例は、ＢＬＡＳＴおよびＢＬＡＳＴ２．０アルゴリズムであり、これらは、Ａｌｔｓｃｈｕｌら、Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２１５：４０３−４１０，１９９０およびＡｌｔｓｃｈｕｌら、Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．２５：３３８９−３４０２，１９７７に説明されている。ＢＬＡＳＴ解析を行うためのソフトウェアは、Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｃｅｎｔｅｒ ｆｏｒ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｎｃｂｉ．ｎｌｍ．ｎｉｈ．ｇｏｖ／）を通じて公的に入手可能である。ＢＬＡＳＴＮプログラム（ヌクレオチド配列用）は、デフォルトとして、１１というワード長（Ｗ）、５０というアラインメント（Ｂ）、１０という期待値（Ｅ）、Ｍ＝５、Ｎ＝−４および両方の鎖の比較を用いる。ＢＬＡＳＴＰプログラム（アミノ酸配列用）は、デフォルトとして、３というワード長（Ｗ）および１０という期待値（Ｅ）ならびにＢＬＯＳＵＭ６２スコア行列を用いる（Ｈｅｎｉｋｏｆｆ ＆ Ｈｅｎｉｋｏｆｆ，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８９：１０９１５，１９８９を参照のこと）。
オリゴヌクレオチド：最大約１００ヌクレオチド塩基長の線状のポリヌクレオチド配列。
オープンリーディングフレーム（ＯＲＦ）：いずれの終止コドンも含まない、アミノ酸をコードする一続きのヌクレオチドトリプレット（コドン）。これらの配列は、通常、ペプチドに翻訳可能である。
作動可能に連結：第１の核酸配列が、第２の核酸配列と機能的な関係として配置されるとき、その第１の核酸配列は、第２の核酸配列に作動可能に連結される。例えば、ＣＭＶプロモーターなどのプロモーターが、コード配列の転写または発現に影響する場合、そのプロモーターは、コード配列に作動可能に連結される。一般に、同じ読み枠で２つのタンパク質コード領域を連結する必要がある場合、作動可能に連結されるＤＮＡ配列は、連続している。
医薬品：被験体または細胞に適切に投与されたときに所望の治療効果または予防効果を誘導することができる化学的化合物または化学的組成物。
薬学的に許容可能なキャリア：有用な薬学的に許容可能なキャリアは、従来のものである。Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，Ｅ．Ｗ．Ｍａｒｔｉｎ，Ｍａｃｋ Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ Ｃｏ．，Ｅａｓｔｏｎ，ＰＡ，１５ｔｈ Ｅｄｉｔｉｏｎ，１９７５には、本明細書中に開示される融合タンパク質の薬学的送達に適した組成物および製剤が記載されている。
一般に、キャリアの性質は、使用される特定の投与様式に依存する。例えば、非経口製剤は、通常、ビヒクルとして薬学的および生理的に許容可能な流体（例えば、水、生理食塩水、平衡塩類溶液、水溶性デキストロース、グリセロールなど）を含む注射可能な流体を含む。固体組成物（例えば、散剤、丸剤、錠剤またはカプセルの形態）については、従来の無毒性固体キャリアは、例えば、製薬グレードのマンニトール、ラクトース、デンプンまたはステアリン酸マグネシウムを含み得る。投与される薬学的組成物は、生物学的に中性のキャリアに加えて、少量の無毒性の補助剤物質（例えば、湿潤剤または乳化剤、保存剤およびｐＨ緩衝剤など、例えば、酢酸ナトリウムまたはソルビタンモノラウレート）を含み得る。
ポリヌクレオチド：ポリヌクレオチドまたは核酸配列という用語は、少なくとも１０塩基長のヌクレオチドの重合体型のことを指す。組換えポリヌクレオチドは、それが由来する生物の天然に存在するゲノムにおいて直接隣接する（一方は５’末端およびもう一方は３’末端に隣接する）両方のコード配列と直接隣接しないポリヌクレオチドを含む。それゆえ、この用語は、例えば、ベクター；自己複製プラスミドもしくは自己複製ウイルス；または原核生物もしくは真核生物のゲノムＤＮＡに組み込まれた組換えＤＮＡ、あるいは他の配列から独立した別個の分子（例えば、ｃＤＮＡ）として存在する組換えＤＮＡを含む。ヌクレオチドは、リボヌクレオチド、デオキシリボヌクレオチドまたはいずれかのヌクレオチドの改変型であり得る。この用語は、一本鎖および二本鎖の形態のＤＮＡを含む。
ポリペプチド：長さまたは翻訳後修飾（例えば、グリコシル化またはリン酸化）に関係なく、アミノ酸の任意の鎖。１つの実施形態において、ポリペプチドは、ＨＭＷ−ＭＡＡポリペプチドである。「残基」とは、アミド結合またはアミド結合模倣物によってポリペプチドに組み込まれているアミノ酸またはアミノ酸模倣物のことを指す。ポリペプチドは、アミノ末端（Ｎ末端）およびカルボキシ末端（Ｃ末端）を有する。
疾患を予防するか、処置するかまたは回復させる：疾患を「予防する」とは、疾患の完全な発生を阻害することを指す。「処置する」とは、疾患または病的状態が発症し始めた後にそれらの徴候または症状を回復させる治療的介入（例えば、全身腫瘍組織量の減少または転移のサイズの数の減少）のことを指す。「回復させる」とは、癌などの疾患の徴候または症状の数または重症度の減少のことを指す。
プローブおよびプライマー：プローブは、検出可能な標識またはレポーター分子に付着された、単離された核酸を含む。プライマーは、短い核酸、好ましくは、ＤＮＡオリゴヌクレオチド、１５ヌクレオチドまたはそれ以上の長さである。プライマーは、核酸ハイブリダイゼーションによって相補的な標的ＤＮＡ鎖にアニールされて、プライマーと標的ＤＮＡ鎖とのハイブリッドを形成し、次いで、ＤＮＡポリメラーゼ酵素によって標的ＤＮＡ鎖に沿って伸長し得る。プライマー対は、例えば、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）または当該分野で公知の他の核酸増幅方法による核酸配列の増幅のために使用され得る。当業者は、特定のプローブまたはプライマーの特異性が、その長さに伴って増加することを認識する。したがって、例えば、連続した２０ヌクレオチドを含むプライマーは、たった１５ヌクレオチドの対応するプライマーよりも高い特異性で標的にアニールする。ゆえに、より高い特異性を得るために、２０、２５、３０、３５、４０、５０またはそれ以上連続したヌクレオチドを含むプローブおよびプライマーが選択され得る。
プロモーター：プロモーターは、核酸の転写を指示する核酸調節配列の配列である。プロモーターは、転写開始部位付近の必須の核酸配列、例えば、ポリメラーゼＩＩ型プロモーターの場合はＴＡＴＡエレメントを含む。プロモーターは、転写開始部位から数千塩基対も離れて位置し得る遠位のエンハンサーまたはリプレッサーエレメントも必要に応じて含む。構成的プロモーターと誘導性プロモーターの両方が含まれる（例えば、Ｂｉｔｔｅｒら、Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ １５３：５１６−５４４，１９８７を参照のこと）。
プロモーターの具体的で非限定的な例としては、哺乳動物細胞のゲノムに由来するプロモーター（例えば、メタロチオネインプロモーター）が挙げられるか、または哺乳動物ウイルス（例えば、レトロウイルス末端反復配列；アデノウイルス後期プロモーター；ワクシニアウイルス７．５Ｋプロモーター）が使用され得る。組換えＤＮＡ法または合成手法によって生成されたプロモーターもまた、使用され得る。ポリヌクレオチドは、挿入される宿主の遺伝子配列の効率的な転写を促進するプロモーター配列を含む発現ベクターに挿入され得る。発現ベクターは、代表的には、複製起点、プロモーター、ならびに形質転換された細胞の表現型選択を可能にする特異的な核酸配列を含む。
前立腺癌：男性生殖系における腺である前立腺の組織に形成される癌のタイプ。前立腺癌は、腺癌腫、すなわち、正常な***分泌前立腺細胞が癌細胞に変異して始まる腺の癌として分類される。その腺癌腫が最も一般的である前立腺の領域は、辺縁部である。初期には、上皮内癌腫または前立腺上皮内新形成（ＰＩＮ）として知られる状態である、他の正常な前立腺に限局する癌細胞の小さい凝集塊が存在する。ＰＩＮが癌前駆体であるという証明は存在しないが、ＰＩＮは、癌に密接に関連する。やがてこれらの癌細胞は、増殖し始め、腫瘍を形成する周囲の前立腺組織（支質）に広がる。最終的には、その腫瘍は、近くの器官（例えば、精嚢または直腸）を浸潤するのに十分な大きさに成長し得るか、またはその腫瘍細胞は、血流およびリンパ系を遊走する能力を獲得し得る。前立腺癌は、身体の他の部分を浸潤し得る細胞塊であるので、悪性腫瘍と考えられる。前立腺癌は、通常、骨、リンパ節、直腸および膀胱に転移する。
前立腺癌は、以下のとおりステージ分けされ得る：
ステージ０：腫瘍のエビデンスなし。
ステージＩ：腫瘍が存在するが、臨床的にまたはイメージングで検出可能でない。
Ｔ１ａ：腫瘍は、切除された前立腺組織の５％未満で偶発的に見られた。
Ｔ１ｂ：腫瘍は、切除された前立腺組織の５％超で偶発的に見られた。
Ｔ１ｃ：腫瘍は、血清前立腺特異抗原（ＰＳＡ）が高いことを理由に実施された針生検において見られた。
ステージＩＩ：腫瘍は、検査時にさわって感じられ得る（触診され得る）が、前立腺の外に広がっていない。
Ｔ２ａ：腫瘍は、前立腺の２つの葉のうちの１つの半分または半分未満である。
Ｔ２ｂ：腫瘍は、両方ではなく一方の葉の半分より大きい。
Ｔ２ｃ：腫瘍は、両方の葉に存在する。
ステージＩＩＩ：腫瘍は、前立腺被膜を通って広がっている。
Ｔ３ａ：腫瘍は、片側または両側の被膜を通って広がっている。
Ｔ３ｂ：腫瘍は、片方または両方の精嚢を浸潤している。
ステージＩＶ：腫瘍は、他の近くの構造を浸潤している。
精製：精製という用語は、絶対的な純度を要求しない；むしろ、相対的な用語として意図される。したがって、例えば、精製されたペプチド調製物は、ペプチドまたはタンパク質が細胞内の天然の環境に存在するよりも多くそのペプチドまたはタンパク質が濃縮されている調製物である。１つの実施形態において、ある調製物は、そのタンパク質またはペプチドが、その調製物のペプチドまたはタンパク質含有量全体の少なくとも５０％であるように精製される。
本明細書中に開示されるＨＭＷ−ＭＡＡポリペプチドまたはＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合する抗体は、当該分野で公知の手段のいずれかによって精製され得る。例えば、Ｇｕｉｄｅ ｔｏ Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｐｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ，ｅｄ．Ｄｅｕｔｓｃｈｅｒ，Ｍｅｔｈ．Ｅｎｚｙｍｏｌ．１８５，Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ，Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ，１９９０；およびＳｃｏｐｅｓ，Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｐｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ：Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ ａｎｄ Ｐｒａｃｔｉｃｅ，Ｓｐｒｉｎｇｅｒ Ｖｅｒｌａｇ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ，１９８２を参照のこと。実質的な精製とは、他のタンパク質または細胞成分からの精製のことを表す。実質的に精製されたタンパク質は、少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、９５％または９８％純粋である。したがって、１つの具体的で非限定的な例において、実質的に精製されたタンパク質は、他のタンパク質または細胞成分を９０％含まない。
組換え：組換え核酸は、天然に存在しない配列を有するか、または２つの別の分離された配列セグメントの人工的な組み合わせによって作製された配列を有する、核酸である。この人工的な組み合わせは、しばしば、化学的合成、またはより一般的には、単離された核酸セグメントの人工的操作、例えば、遺伝子操作法によって、達成される。
組換えトキシン：細胞標的化部分がトキシンに融合されているキメラタンパク質（Ｐａｓｔａｎら、Ｓｃｉｅｎｃｅ，２５４：１１７３−１１７７，１９９１）。細胞標的化部分が、抗体のＦｖ部分である場合、その分子は、組換え免疫毒素と呼ばれる（Ｃｈａｕｄｈａｒｙら、Ｎａｔｕｒｅ，３３９：３９４−３９７，１９８９）。トキシン部分は、ほとんどの正常細胞上に存在するトキシンレセプターに結合することができないように遺伝的に変更される。組換え免疫毒素は、抗原結合ドメインによって認識される細胞を選択的に殺滅する。これらの組換えトキシンおよび免疫毒素は、癌、例えば、ＨＭＷ−ＭＡＡを発現する癌を処置するために使用され得る。
配列同一性：別では配列同一性と呼ばれるアミノ酸配列間の類似性は、配列間の類似性に関して表現される。配列同一性は、しばしばパーセンテージ同一性（または類似性または相同性）に関して測定される；そのパーセンテージが高いほど、２つの配列は、似ている。ポリペプチドのホモログまたは改変体は、標準的な方法を用いて整列されるとき、相対的に高い程度の配列同一性を有する。
比較するための配列のアラインメント方法は、当該分野で周知である。様々なプログラムおよびアラインメントアルゴリズムが：Ｓｍｉｔｈ ａｎｄ Ｗａｔｅｒｍａｎ，Ａｄｖ．Ａｐｐｌ．Ｍａｔｈ．２：４８２，１９８１；Ｎｅｅｄｌｅｍａｎ ａｎｄ Ｗｕｎｓｃｈ，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．４８：４４３，１９７０；Ｐｅａｒｓｏｎ ａｎｄ Ｌｉｐｍａｎ，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ．８５：２４４４，１９８８；Ｈｉｇｇｉｎｓ ａｎｄ Ｓｈａｒｐ，Ｇｅｎｅ ７３：２３７，１９８８；Ｈｉｇｇｉｎｓ ａｎｄ Ｓｈａｒｐ，ＣＡＢＩＯＳ ５：１５１，１９８９；Ｃｏｒｐｅｔら、Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈ １６：１０８８１，１９８８；およびＰｅａｒｓｏｎ ａｎｄ Ｌｉｐｍａｎ，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ．８５：２４４４，１９８８に記載されている。Ａｌｔｓｃｈｕｌら、Ｎａｔｕｒｅ Ｇｅｎｅｔ．６：１１９，１９９４には、配列アラインメント方法および相同性計算に関する詳細な考慮すべき点が示されている。
ＮＣＢＩ Ｂａｓｉｃ Ｌｏｃａｌ Ａｌｉｇｎｍｅｎｔ Ｓｅａｒｃｈ Ｔｏｏｌ（ＢＬＡＳＴ）（Ａｌｔｓｃｈｕｌら、Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２１５：４０３，１９９０）は、配列解析プログラムｂｌａｓｔｐ、ｂｌａｓｔｎ、ｂｌａｓｔｘ、ｔｂｌａｓｔｎおよびｔｂｌａｓｔｘと関連して使用するために、Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｃｅｎｔｅｒ ｆｏｒ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ（ＮＣＢＩ，Ｂｅｔｈｅｓｄａ，ＭＤ）をはじめとしたいくつかの供給源から、ならびにインターネット上で、入手可能である。このプログラムを用いて配列同一性を決定する方法の説明は、インターネットのＮＣＢＩウェブサイト上で入手可能である。
ＨＭＷ−ＭＡＡポリペプチドに特異的に結合する抗体のＶＬまたはＶＨのホモログおよび改変体は、代表的には、デフォルトパラメータに設定された、ギャップｂｌａｓｔｐであるＮＣＢＩ Ｂｌａｓｔ２．０を使用して、抗体のアミノ酸配列との完全長アラインメントに対して計算される、少なくとも約７５％、例えば、少なくとも約８０％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％または９９％の配列同一性を保持することを特徴とする。約３０を超えるアミノ酸のアミノ酸配列を比較する場合、デフォルトのパラメータ（１１というギャップ存在コスト（ｇａｐ ｅｘｉｓｔｅｎｃｅ ｃｏｓｔ）および１という残基あたりギャップコスト）に設定されたデフォルトのＢＬＯＳＵＭ６２行列を用いたＢｌａｓｔ２配列関数を使用する。短いペプチド（およそ３０アミノ酸未満）をアラインメントするとき、そのアラインメントは、デフォルトのパラメータ（オープンギャップ９ペナルティ、伸長ギャップ１ペナルティ）に設定されたＰＡＭ３０行列を用いたＢｌａｓｔ２配列関数を使用して行われるべきである。参照配列とより高い類似性を有するタンパク質は、この方法によって評価されるとき、高いパーセンテージ同一性（例えば、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％または少なくとも９９％の配列同一性）を示す。配列全体より短い配列が、配列同一性について比較されるとき、ホモログおよび改変体は、代表的には、１０〜２０アミノ酸という短い範囲にわたって少なくとも８０％の配列同一性を有し、参照配列に対する類似性に応じて、少なくとも８５％または少なくとも９０％または９５％という配列同一性を有し得る。そのような短い範囲にわたる配列同一性を決定するための方法は、インターネット上のＮＣＢＩウェブサイトにおいて入手可能である。当業者は、これらの配列同一性の範囲が、指針としてのみ提供されることを認識するだろう；提供される範囲に入らない非常に著しいホモログが得られ得ることは、全体的にあり得ることである。
特異的に結合する作用物質：実質的に、規定された標的にだけ結合する作用物質。したがって、ＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合する作用物質は、ＨＭＷ−ＭＡＡポリペプチドに実質的に結合する作用物質である。ＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合する作用物質は、他の無関係なタンパク質に実質的に結合しない。１つの実施形態において、特異的に結合する作用物質は、ＨＭＷ−ＭＡＡポリペプチドに特異的に結合するヒトモノクローナル抗体である。
用語「特異的に結合する」とは、ＨＭＷ−ＭＡＡなどの抗原に関して、抗体または他のリガンドと、その抗原を有する細胞または組織との全体的または部分的な優先的会合、ならびにその抗原を有しない細胞または組織に会合しないことを指す。ある程度の非特異的な相互作用が、分子と非標的細胞または非標的組織との間に生じ得ることが認識される。それにもかかわらず、特異的結合は、抗原の特異的認識によって媒介されるとき、区別され得る。選択的に反応性である抗体は、抗原に結合するが、それらは、低親和性で抗原に結合し得る。他方、特異的結合は、抗体（または他のリガンド）と抗原を有する細胞との間に、結合される抗体（または他のリガンド）とその抗原を有しない細胞との間の会合よりも強い会合をもたらす。特異的結合は、代表的には、ＨＭＷ−ＭＡＡポリペプチドを有しない細胞または組織と比べて、そのポリペプチドを有する細胞または組織に対して結合される抗体または他のリガンドの量（単位時間あたり）の２倍超、例えば、５倍超、１０倍超または１００倍超の増加をもたらす。そのような条件下でのタンパク質への特異的な結合は、特定のタンパク質に対する特異性について選択された抗体を必要とする。種々のイムノアッセイ形式が、特定のタンパク質と特異的に免疫反応性である抗体または他のリガンドを選択するために適切である。例えば、タンパク質と特異的に免疫反応性であるモノクローナル抗体を選択するために、固相ＥＬＩＳＡイムノアッセイが日常的に使用される。特異的免疫反応性を測定するために使用され得るイムノアッセイの形式および条件の説明については、Ｈａｒｌｏｗ ＆ Ｌａｎｅ，Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ，Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｐｕｂｌｉｃａｔｉｏｎｓ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ（１９８８）を参照のこと。
扁平上皮癌腫：皮膚、眼、様々な内部器官の表面、ならびに中空器官およびいくつかの腺管の裏打ちを形成する薄く平らな細胞である扁平上皮細胞に由来する癌のタイプ。扁平上皮癌腫は、類表皮癌腫とも呼ばれる。扁平上皮癌腫の１つのタイプは、頭頸部（ｈｅａｄ ａｎｄ ｎｅｃｋ ｈｅａｄ）扁平上皮癌腫（ＨＮＳＣＣ）である。頭頸部扁平上皮癌腫には、鼻腔、洞、***、口腔、唾液腺、のどおよび喉頭の癌が含まれる。ＨＮＳＣＣは、以下のとおりステージ分けされ得る：
ステージ０：腫瘍のエビデンスなし。
ステージＩ：腫瘍の最大径が、２ｃｍ以下である；限局的なリンパ節の関与または遠隔転移のエビデンスなし。
ステージＩＩ：腫瘍は、２ｃｍを超えるが、４ｃｍより大きくない；限局的なリンパ節の関与または遠隔転移のエビデンスなし。
ステージＩＩＩ：腫瘍は、４ｃｍより大きい；場合によっては、腫瘍はリンパ節に広がっている；遠隔転移のエビデンスなし。
ステージＩＶ：腫瘍は、リンパ節に広がっている；場合によっては、遠位への転移が存在する。
被験体：ヒトと動物の被験体（ヒトおよび非ヒト哺乳動物を含む）の両方を含むカテゴリーである、生存している多細胞脊椎動物。
治療有効量：処置される被験体において所望の効果を達成するのに十分な特異的物質の量。例えば、これは、腫瘍の成長を阻害するかまたは抑制するのに必要な量であり得る。１つの実施形態において、治療有効量は、腫瘍を除去するのに必要な量である。被験体に投与されるとき、所望のインビトロ効果を達成すると示された標的組織濃度（例えば、腫瘍における濃度）を達成する投薬量が、一般に使用される。
トキシン：細胞に対して細胞傷害性である分子。トキシンとしては、アブリン、リシン、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ外毒素（ＰＥ）、ジフテリア毒素（ＤＴ）、ボツリヌス毒素、サポリン、レストリクトシン（ｒｅｓｔｒｉｃｔｏｃｉｎ）もしくはゲロニン（ｇｅｌｏｎｉｎ）またはそれらの改変トキシンが挙げられる。例えば、ＰＥおよびＤＴは、代表的には肝臓毒性によって死をもたらす非常に有毒な化合物である。しかしながら、ＰＥおよびＤＴは、そのトキシンの天然の標的化成分（例えば、ＰＥのドメインＩａまたはＤＴのＢ鎖）を除去すること、およびそれを抗体などの異なる標的化部分で置き換えることによって、免疫毒素として使用するための形態に改変され得る。
形質導入：形質導入された細胞は、分子生物学手法によって核酸分子を導入された細胞である。本明細書中で使用される場合、形質導入という用語は、ウイルスベクターを用いたトランスフェクション、プラスミドベクターを用いた形質転換、ならびにエレクトロポレーション、リポフェクションおよびパーティクルガン法（ｐａｒｔｉｃｌｅ ｇｕｎ ａｃｃｅｌｅｒａｔｉｏｎ）による裸のＤＮＡの導入をはじめとした、核酸分子をそのような細胞に導入し得るすべての手法を包含する。
ベクター：宿主細胞に導入されることにより、形質転換された宿主細胞をもたらす核酸分子。ベクターは、複製起点などの宿主細胞内での複製を可能にする核酸配列を含み得る。ベクターは、１つ以上の選択可能マーカー遺伝子および当該分野で公知の他の遺伝的エレメントも含み得る。
別段説明されない限り、本明細書中で使用されるすべての専門用語および科学用語は、本開示が属する分野の当業者が通常理解する意味と同じ意味を有する。単数形の用語「ａ」、「ａｎ」および「ｔｈｅ」は、文脈が明らかに別のことを示していない限り、複数の指示対象を含む。同様に、単語「または」は、文脈が明らかに別のことを示していない限り、「および」を含むと意図される。それゆえ、「ＡまたはＢを含む」は、Ａ、またはＢ、またはＡおよびＢを含むを意味する。さらに、核酸またはポリペプチドに対して与えられるすべての塩基サイズまたはアミノ酸サイズおよびすべての分子量または分子質量の値は、近似であり、説明のために提供されるものであると理解される。本明細書中に提供されるものと類似または等価な方法および材料が、本開示の実施または試験において使用され得るが、適当な方法および材料が、以下に記載される。すべての刊行物、特許出願、特許、Ｇｅｎｂａｎｋ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ番号および本明細書中で述べられる他の参考文献は、その全体が参考として援用される。矛盾する場合は、用語の説明を含む本明細書が、支配する。さらに、材料、方法および実施例は、単なる例示であり、限定を意図しない。
ＩＩＩ．ＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合するヒトモノクローナル抗体
ＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合するヒトモノクローナル抗体およびその機能性フラグメントが、本明細書中に開示される。１つの例において、ＨＭＷ−ＭＡＡは、以下に示されるアミノ酸配列を有する：
本明細書中で参考として援用されるＧＥＮＢＡＮＫ（登録商標）Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ番号ＡＡＩ２８１１１も参照のこと。
ＨＭＷ−ＭＡＡは、メラノーマ細胞が内皮基底膜に広がる初期現象中に、細胞と下層との相互作用の安定化において役割を果たすヒトメラノーマ関連コンドロイチン硫酸プロテオグリカンである。ＣＳＰＧ４は、ヒト悪性メラノーマ細胞によって発現される内在性膜コンドロイチン硫酸プロテオグリカンを意味する。
ＨＭＷ−ＭＡＡは、ＣＳＰＧ４としても知られる。インビボにおいて、ＨＭＷ−ＭＡＡは、非共有結合的に会合された２つのグリコポリペプチドからなる分子として存在する。一方は、２８０Ｋという見かけの分子量を有し、他方は、４４０Ｋを超える見かけの分子量を有する。ＨＭＷ−ＭＡＡは、ヒトメラノーマ細胞によって合成され、発現される（Ｓｐｉｒｏ，Ｒ．Ｃ．ら、Ｆ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２６４：１７７９（１９８９）；Ｅｓｋｏ，Ｊ．Ｄ．，ら、Ｓｃｉｅｎｃｅ ２４１：１０９２，１９８８）。プロテオグリカンは、そのコアにおけるセリン残基に共有結合的に付着されたグリコサミノグリカン（ＧＡＧ）多糖鎖を有する糖タンパク質である。Ｍ＋ＨＭＷ−ＭＡＡコアタンパク質は、最初、高マンノースタイプのアスパラギンＮ結合型オリゴ糖を有する、分子質量が２４０Ｋの前駆体として翻訳される。
別の例において、ＨＭＷ−ＭＡＡは、以下に示される核酸配列によってコードされる：
本明細書中で参考として援用されるＧＥＮＢＡＮＫ（登録商標）Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ番号ＢＣ１２８１１０もまた参照のこと。当業者（Ｏｎｃｅ ｏｆ ｓｋｉｌｌ ｉｎ ｔｈｅ ａｒｔ）は、分子生物学における標準的な方法を用いて、ＨＭＷ−ＭＡＡなどのポリペプチドを生成する核酸配列を容易に使用し得る（例えば、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ，２ｎｄ ｅｄ．，ｖｏｌ．１−３，ｅｄ．Ｓａｍｂｒｏｏｋら、Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ，ＮＹ，１９８９を参照のこと）。
ヒトＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合する単離されたヒトモノクローナル抗体およびそのフラグメントが、本明細書中に記載される。いくつかの実施形態において、そのヒトモノクローナル抗体の機能性フラグメントは、ｓｃＦｖである。提供されるヒトモノクローナル抗体またはその機能性フラグメントおよび薬学的に許容可能なキャリアを含む組成物もまた記載される。これらの抗体をコードする核酸、これらの核酸を含む発現ベクター、およびそれらの核酸を発現する単離された宿主細胞もまた提供される。
ヒトＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合するヒトモノクローナル抗体またはその機能性フラグメントを含む免疫結合体もまた本明細書中に記載される。その免疫結合体は、任意の治療用薬剤、トキシンまたは他の部分を含み得る。１つの例において、トキシンは、ＰＥまたはその改変体もしくはフラグメントである。その免疫結合体を含む組成物もまた記載される。
ＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合するヒトモノクローナル抗体またはその機能性フラグメントを含む組成物は、スクリーニング、研究、検出および治療的な目的のために使用され得る。例えば、そのヒトモノクローナル抗体またはその機能性フラグメントは、競合的イムノアッセイなどにおいて、ＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合する他の抗体を同定するために使用され得る。
ＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合するヒトモノクローナル抗体またはその機能性フラグメントを含む組成物は、癌（例えば、正常細胞と比べてＨＭＷ−ＭＡＡの高発現を示す癌）と診断された被験体を処置するために使用され得る。例えば、その抗体は、メラノーマ、乳癌、前立腺癌、卵巣癌、結腸癌、胃癌、膵癌、神経膠腫、脊索腫、軟骨肉腫、神経膠腫または扁平上皮癌腫を処置するために使用され得る。メラノーマとしては、拡大型黒色腫、結節性黒色腫、末端部黒子様黒色腫および悪性黒子（メラノーマ）が挙げられる。扁平上皮細胞癌腫としては、頭頸部扁平上皮癌腫、ならびに皮膚、肺、前立腺、食道、膣および子宮頸部の扁平上皮細胞癌が挙げられるが、これらに限定されない。
ＨＭＷ−ＭＡＡ抗体を含む組成物は、転移を予防するため、または微小転移巣（例えば、領域リンパ節への微小転移巣）の数を減少させるためにも使用され得る。ＨＭＷ−ＭＡＡ抗体を含む免疫結合体は、癌と診断された患者を処置するためにも使用され得る。そのヒトモノクローナル抗体は、被験体における癌を診断するためにも使用され得る。例えば、そのヒトモノクローナル抗体を、その患者由来のサンプル（例えば、血清サンプル）と接触させることにより、高レベルのＨＭＷ−ＭＡＡが検出され得る。本明細書中に提供される抗体および組成物は、被験体内の癌を検出するためまたは患者内の癌の診断を確証するためにも使用され得る。
ヒトＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合する完全ヒトモノクローナル抗体およびその機能性フラグメントが、本明細書中に開示される。マウスモノクローナル抗体を臨床で使用することの主な限界は、その処置を受けた患者におけるヒト抗マウス抗体（ＨＡＭＡ）応答の発生である。ＨＡＭＡ応答は、アレルギー反応および投与された抗体の血清からのクリアランス速度の上昇を伴い得る。様々なタイプの改変モノクローナル抗体が、親モノクローナル抗体の抗原結合親和性を維持するように努めつつ、ＨＡＭＡ応答を最小にするように開発されている。１つのタイプの改変モノクローナル抗体は、マウスの抗原結合可変領域をヒト定常ドメインにつなげたヒト−マウスキメラである（Ｍｏｒｒｉｓｏｎ ａｎｄ Ｓｃｈｌｏｍ，Ｉｍｐｏｒｔａｎｔ Ａｄｖａｎｃｅｓ ｉｎ Ｏｎｃｏｌｏｇｙ，Ｒｏｓｅｎｂｅｒｇ，Ｓ．Ａ．（Ｅｄ．），１９８９）。第２のタイプの改変モノクローナル抗体は、相補性決定領域（ＣＤＲ）が移植された、すなわち、ヒト化されたモノクローナル抗体である（Ｗｉｎｔｅｒ ａｎｄ Ｈａｒｒｉｓ，Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｔｏｄａｙ １４：２４３−２４６，１９９３）。しかしながら、本明細書中に開示される抗体は、完全ヒト抗体であり；フレームワーク領域とＣＤＲの両方が、ヒト配列に由来する。したがって、これらの抗体がヒト被験体に投与されるとき、ＨＡＭＡは誘導されない。
いくつかの実施形態において、本ヒトモノクローナル抗体またはその機能性フラグメントは、配列番号５として示される重鎖アミノ酸配列の少なくとも一部を含み、ＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合する。いくつかの実施形態において、本ヒトモノクローナル抗体またはその機能性フラグメントは、配列番号６として示される軽鎖アミノ酸配列の少なくとも一部を含み、ＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合する。いくつかの例において、本抗体の重鎖は、配列番号５のアミノ酸２７〜３８（ＣＤＲ１）、配列番号５のアミノ酸５６〜６５（ＣＤＲ２）、配列番号５のアミノ酸１０５〜１１５（ＣＤＲ３）またはそれらの組み合わせを含む。いくつかの例において、本抗体の重鎖は、本抗体の重鎖は、配列番号５のアミノ酸２７〜３８（ＣＤＲ１）、配列番号５のアミノ酸５６〜６５（ＣＤＲ２）および配列番号５のアミノ酸１０５〜１１５（ＣＤＲ３）を含む含む。いくつかの例において、本抗体の軽鎖は、配列番号６のアミノ酸２７〜３８（ＣＤＲ１）、配列番号６のアミノ酸５６〜６５（ＣＤＲ２）、配列番号６のアミノ酸１０５〜１１０（ＣＤＲ３）またはそれらの組み合わせを含む。いくつかの例において、本抗体の軽鎖は、配列番号６のアミノ酸２７〜３８（ＣＤＲ１）、配列番号６のアミノ酸５６〜６５（ＣＤＲ２）および配列番号６のアミノ酸１０５〜１１０（ＣＤＲ３）を含む。いくつかの実施形態において、本ヒトモノクローナル抗体は、標識される。いくつかの例において、その標識は、蛍光標識、酵素標識または放射性標識である。
本モノクローナル抗体は、任意のアイソタイプであり得る。本モノクローナル抗体は、例えば、ＩｇＭまたはＩｇＧ抗体（例えば、ＩｇＧ１またはＩｇＧ２）であり得る。ＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合する抗体のクラスは、別のクラスにスイッチされ得る。１つの態様において、ＶＬまたはＶＨをコードする核酸分子は、それぞれ軽鎖または重鎖の定常領域をコードするいかなる核酸配列も含まないように当該分野で周知の方法を用いて単離される。次いで、ＶＬまたはＶＨをコードする核酸分子は、異なるクラスの免疫グロブリン分子由来のＣＬまたはＣＨをコードする核酸配列に作動可能に連結される。これは、当該分野で公知であるように、ＣＬまたはＣＨ鎖を含むベクターまたは核酸分子を用いて達成され得る。例えば、当初はＩｇＭだったＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合する抗体は、ＩｇＧにクラススイッチされ得る。クラススイッチは、１つのＩｇＧサブクラスを別のサブクラスに（例えば、ＩｇＧ１からＩｇＧ２に）変換するために用いられ得る。
完全ヒトモノクローナル抗体は、ヒトフレームワーク領域を含む。そのヒトフレームワーク領域は、配列番号５または配列番号６の一方または両方に開示されるフレームワーク領域を含み得る（これらの配列は、ＣＤＲ配列ならびにフレームワーク配列を含む）。しかしながら、そのフレームワーク領域は、別の起源に由来し得る。使用され得るフレームワーク配列のさらなる例としては、本明細書中で参考として援用されるＰＣＴ公開番号ＷＯ２００６／０７４０７１（例えば、配列番号１〜１６を参照のこと）に開示されている重鎖および軽鎖のアミノ酸フレームワーク配列が挙げられる。
抗体フラグメントは、本開示（例えば、重鎖可変領域および軽鎖可変領域を含む、Ｆａｂ、Ｆ（ａｂ’）２およびＦｖ）に包含され、ＨＭＷ−ＭＡＡ上のエピトープ決定基に結合することができるものである。これらの抗体フラグメントは、その抗原に特異的に結合する能力を保持する。これらのフラグメントとしては、以下が挙げられる：
（１）抗体分子の一価の抗原結合フラグメントを含むフラグメントであるＦａｂは、酵素パパインで抗体全体を消化することによって生成されることにより、インタクトな軽鎖および１つの重鎖の部分を生じ得る；
（２）抗体分子のフラグメントであるＦａｂ’は、抗体全体をペプシンで処理した後、還元することにより得られ、これによりインタクトな軽鎖および重鎖の一部がもたらされ得る；抗体１分子あたり２つのＦａｂ’フラグメントが得られる；
（３）抗体全体を酵素ペプシンで処理すること（その後の還元は行わない）によって得られ得る抗体のフラグメントである（Ｆａｂ’）２；Ｆ（ａｂ’）２は、２つのジスルフィド結合によってともに保持されている２つのＦａｂ’フラグメントの二量体である；
（４）２本の鎖として発現される軽鎖の可変領域および重鎖の可変領域を含む遺伝的に操作されたフラグメントであるＦｖ；および
（５）遺伝的に融合された一本鎖分子として、適当なポリペプチドリンカーによって連結された軽鎖の可変領域、重鎖の可変領域を含む遺伝的に操作された分子と定義される、一本鎖抗体（例えば、ｓｃＦｖ）
（６）ｓｃＦＶの二量体と定義される、一本鎖抗体の二量体（ｓｃＦＶ２）。これは、「ミニ抗体（ｍｉｎｉａｎｔｉｂｏｄｙ）」とも呼ばれている。
これらのフラグメントを生成する方法は、当該分野で公知である（例えば、Ｈａｒｌｏｗ ａｎｄ Ｌａｎｅ，Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ，１９８８を参照のこと）。いくつかの例において、本抗体に含められる可変領域は、Ｍ９１２の可変領域である。
さらなる群の実施形態において、本抗体は、代表的には約２５ｋＤａであり、各重鎖および各軽鎖あたり３つのＣＤＲを有する完全な抗原結合部位を含むＦｖ抗体である。これらの抗体を生成するために、ＶＨおよびＶＬを、宿主細胞内の２つの個別の核酸構築物から発現させ得る。そのＶＨおよびＶＬが、隣接せずに発現される場合、Ｆｖ抗体の鎖は、代表的には、非共有結合性相互作用によって共に保持される。しかしながら、これらの鎖は、希釈されると解離する傾向があるので、それらの鎖をグルタルアルデヒド、分子間ジスルフィドまたはペプチドリンカーによって架橋する方法が開発された。したがって、１つの例において、Ｆｖは、その重鎖可変領域および軽鎖可変領域がジスルフィド結合によって化学的に連結されている、ジスルフィド安定化Ｆｖ（ｄｓＦｖ）であり得る。
さらなる例において、Ｆｖフラグメントは、ペプチドリンカーによって接続されたＶＨ鎖およびＶＬ鎖を含む。これらの一本鎖抗原結合タンパク質（ｓｃＦｖ）は、オリゴヌクレオチドによって接続された、ＶＨおよびＶＬドメインをコードするＤＮＡ配列を含む構造遺伝子を構築することによって調製される。その構造遺伝子は、発現ベクターに挿入され、続いてそれは大腸菌などの宿主細胞に導入される。その組換え宿主細胞は、２つのＶドメインを架橋するリンカーペプチドを有する単一のポリペプチド鎖を合成する。ｓｃＦｖを生成するための方法は、当該分野で公知である（Ｗｈｉｔｌｏｗら、Ｍｅｔｈｏｄｓ：ａ Ｃｏｍｐａｎｉｏｎ ｔｏ Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ，Ｖｏｌ．２，９７頁，１９９１；Ｂｉｒｄら、Ｓｃｉｅｎｃｅ ２４２：４２３，１９８８；米国特許第４，９４６，７７８号；Ｐａｃｋら、Ｂｉｏ／Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ １１：１２７１，１９９３；およびＳａｎｄｈｕ，前出を参照のこと）。一本鎖抗体の二量体（ｓｃＦＶ２）もまた企図される。
抗体フラグメントは、抗体のタンパク分解性加水分解またはそのフラグメントをコードするＤＮＡの大腸菌における発現によって調製され得る。抗体フラグメントは、従来の方法による抗体全体のペプシンまたはパパイン消化によって得られ得る。例えば、抗体フラグメントは、ペプシンを用いた抗体の酵素的切断によって生成されることにより、Ｆ（ａｂ’）２と表示される５Ｓフラグメントがもたらされ得る。このフラグメントは、チオール還元剤、および必要に応じて、ジスルフィド結合の切断に起因するスルフヒドリル基に対する保護基を用いて、さらに切断されることにより、３．５Ｓ Ｆａｂ’一価フラグメントをもたらし得る。あるいは、ペプシンを用いた酵素的切断は、２つの一価Ｆａｂ’フラグメントおよびＦｃフラグメントを直接生成する（米国特許第４，０３６，９４５号および米国特許第４，３３１，６４７号、ならびにそれらに含まれる参考文献；Ｎｉｓｏｎｈｏｆｆら、Ａｒｃｈ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．８９：２３０，１９６０；Ｐｏｒｔｅｒ，Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｊ．７３：１１９，１９５９；Ｅｄｅｌｍａｎら、Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ，Ｖｏｌ．１，４２２頁，Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ，１９６７；およびＣｏｌｉｇａｎら、２．８．１−２．８．１０および２．１０．１−２．１０．４項を参照のこと）。
フラグメントが、インタクトな抗体によって認識される抗原に結合する限り、抗体を切断する他の方法（例えば、一価の軽鎖−重鎖フラグメントを形成する重鎖の分離、フラグメントのさらなる切断、または他の酵素的、化学的もしくは遺伝的手法）も使用してもよい。
当業者は、抗体の保存的改変体が生成され得ることを認識する。ｄｓＦｖフラグメントなどの抗体フラグメントまたはｓｃＦｖフラグメントとして使用されるそのような保存的改変体は、適切なフォールディングおよびＶＨ領域とＶＬ領域との間の安定化のために必要な重要なアミノ酸残基を保持し、その分子の低ｐＩおよび低毒性を保つためにそれらの残基の電荷特性を保持する。アミノ酸置換（例えば、多くとも１つ、多くとも２つ、多くとも３つ、多くとも４つまたは多くとも５つのアミノ酸置換）がＶＨ領域およびＶＬ領域において生成されることにより、収量が増加し得る。機能的に類似するアミノ酸を提供する保存的アミノ酸置換の表は、当業者に周知である。以下の６つの群が、互いに保存的置換であると考えられるアミノ酸の例である：
１）アラニン（Ａ）、セリン（Ｓ）、トレオニン（Ｔ）；
２）アスパラギン酸（Ｄ）、グルタミン酸（Ｅ）；
３）アスパラギン（Ｎ）、グルタミン（Ｑ）；
４）アルギニン（Ｒ）、リジン（Ｋ）；
５）イソロイシン（Ｉ）、ロイシン（Ｌ）、メチオニン（Ｍ）、バリン（Ｖ）；および
６）フェニルアラニン（Ｆ）、チロシン（Ｙ）、トリプトファン（Ｗ）。
ＩＶ．治療部分および診断部分として使用するための免疫結合体
ヒトＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合するヒトモノクローナル抗体またはその機能性フラグメントは、治療方法において使用され得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるヒトモノクローナル抗体またはその機能性フラグメントは、治療用薬剤に結合体化され得る。免疫結合体としては、治療用薬剤が抗体に共有結合されている分子が挙げられるが、これに限定されない。治療用薬剤は、特定の標的分子または標的分子を有する細胞に対して向けられている特定の生物学的活性を有する薬剤である。当業者は、治療用薬剤が、ビンブラスチン、ダウノマイシンなどの様々な薬物、天然のまたは改変されたＰｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ外毒素またはジフテリア毒素などの細胞毒、それ自体が薬理学的組成物を含む封入剤（例えば、リポソーム）、放射性物質（例えば、１２５Ｉ、３２Ｐ、１４Ｃ、３Ｈおよび３５Ｓ）ならびに他の標識、標的化部分およびリガンドを含み得ることを認識する。
特定の治療用薬剤の選択は、特定の標的分子または標的細胞および所望の生物学的作用に左右される。したがって、例えば、治療用薬剤は、特定の標的細胞の死をもたらすために使用される細胞毒であり得る。逆に、非致死性の生物学的応答の誘導が望まれる場合、治療用薬剤は、非致死性の薬理学的物質または非致死性の薬理学的物質を含むリポソームに結合体化され得る。
当業者は、本明細書中に記載される治療用薬剤および抗体を用いて、機能的に等価な核酸（例えば、配列は異なるが、同じＥＭまたは抗体配列をコードする核酸）を含む種々のクローンを容易に構築し得る。したがって、本発明は、抗体をコードする核酸、ならびにその結合体および融合タンパク質を提供する。
エフェクター分子は、当業者に公知の任意の数の手段を用いて目的の抗体に連結され得る。共有結合性と非共有結合性の結合手段の両方が、使用され得る。エフェクター分子を抗体に付着するための手順は、エフェクターの化学構造によって異なる。ポリペプチドは、代表的には、種々の官能基；例えば、カルボン酸（ＣＯＯＨ）、遊離アミン（−ＮＨ２）またはスルフヒドリル（−ＳＨ）基を含み、これらは、抗体上の適当な官能基との反応に利用可能であることにより、エフェクター分子の結合をもたらす。あるいは、抗体は、誘導体化されることにより、露出されるか、またはさらなる反応性官能基を付着される。誘導体化は、いくつかのリンカー分子（例えば、Ｐｉｅｒｃｅ Ｃｈｅｍｉｃａｌ Ｃｏｍｐａｎｙ，Ｒｏｃｋｆｏｒｄ，ＩＬから入手可能なもの）のいずれかの付着を含み得る。リンカーは、抗体をエフェクター分子に接着するために使用される任意の分子であり得る。リンカーは、抗体とエフェクター分子の両方に対して共有結合を形成することができる。適当なリンカーは、当業者に周知であり、それらとしては、直鎖または分枝鎖の炭素リンカー、複素環式炭素リンカーまたはペプチドリンカーが挙げられるが、これらに限定されない。抗体およびエフェクター分子が、ポリペプチドである場合、リンカーは、側基（例えば、システインに対するジスルフィド結合）または末端アミノ酸のアルファ炭素アミノ基およびアルファカルボキシル基を介して構成アミノ酸に接着され得る。
いくつかの状況において、免疫結合体がその標的部位に到達したときには、エフェクター分子を抗体から放すことが望ましい。ゆえに、これらの状況において、免疫結合体は、標的部位付近で切断可能な結合を含む。リンカーを切断することによりエフェクター分子を抗体から放出することは、標的細胞内または標的部位付近で免疫結合体が曝される酵素活性または酵素条件によって促され得る。
種々の放射性診断化合物、放射性治療化合物、標識（例えば、酵素または蛍光分子）薬物、トキシンおよび他の薬剤を抗体に付着するために報告されている多数の方法に鑑みて、当業者は、所与の薬剤を抗体または他のポリペプチドに付着するための適当な方法を判断することができる。
本明細書中に開示されるＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合する抗体または抗体フラグメントは、誘導体化され得るか、または別の分子（例えば、別のペプチドまたはタンパク質）に連結され得る。一般に、それらの抗体またはその一部は、ＨＭＷ−ＭＡＡへの結合が誘導体化または標識によって悪影響を受けないように誘導体化される。例えば、それらの抗体は、１つ以上の他の分子実体（例えば、別の抗体（例えば、二重特異性抗体またはダイアボディ）、検出剤、医薬品、および／またはその抗体もしくは抗体部分と別の分子（例えば、ストレプトアビジンコア領域またはポリヒスチジンタグ）との会合を媒介し得るタンパク質もしくはペプチド）に機能的に連結され得る（化学的結合、遺伝的融合、非共有結合性会合またはその他の方法によって）。
１つのタイプの誘導体化抗体は、２つ以上の抗体（二重特異性抗体を作製するなどのために、同じタイプまたは異なるタイプの抗体）を架橋することによって生成される。適当な架橋剤としては、適切なスペーサーによって分断された２つの明確に反応性の基を有するヘテロ二官能性である架橋剤（例えば、ｍ−マレイミドベンゾイル−Ｎ−ヒドロキシスクシンイミドエステル）またはホモ二官能性である架橋剤（例えば、ジスクシンイミジルスベレート）が挙げられる。そのようなリンカーは、Ｐｉｅｒｃｅ Ｃｈｅｍｉｃａｌ Ｃｏｍｐａｎｙ，Ｒｏｃｋｆｏｒｄ，Ｉｌｌから入手可能である。
ＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合するヒト抗体またはその機能性フラグメントは、検出可能な部分で標識され得る。有用な検出剤としては、フルオレセイン、フルオレセインイソチオシアネート、ローダミン、５−ジメチルアミン−１−ナフタレンスルホニル（ｎａｐｔｈａｌｅｎｅｓｕｌｆｏｎｙｌ）クロリド、フィコエリトリン、ランタニドリン光体などを含む蛍光化合物が挙げられる。生物発光マーカー（例えば、ルシフェラーゼ、緑色蛍光タンパク質（ＧＦＰ）、黄色蛍光タンパク質（ＹＦＰ））もまた有用である。抗体は、検出に有用な酵素（例えば、西洋ワサビペルオキシダーゼ、β−ガラクトシダーゼ、ルシフェラーゼ、アルカリホスファターゼ、グルコースオキシダーゼなど）でも標識され得る。抗体が、検出可能な酵素で標識されるとき、その抗体は、識別され得る反応産物を生成するためにその酵素が使用するさらなる試薬を加えることによって検出され得る。例えば、西洋ワサビペルオキシダーゼ薬剤が、存在するとき、過酸化水素およびジアミノベンジジンを加えることにより、視覚的に検出可能な着色された反応産物がもたらされる。抗体は、ビオチンでも標識され得、アビジンまたはストレプトアビジンの結合を間接的に測定することによって検出され得る。アビジン自体が、酵素または蛍光標識で標識され得ることに注意されるべきである。
抗体は、ガドリニウムなどの磁性物質で標識され得る。抗体は、ランタニド（例えば、ユウロピウムおよびジスプロシウム）およびマンガンでも標識され得る。超常磁性酸化鉄などの常磁性粒子もまた、標識として有用であり得る。抗体は、二次レポーター（例えば、ロイシンジッパー対配列、二次抗体に対する結合部位、金属結合ドメイン、エピトープタグ）によって認識される所定のポリペプチドエピトープでも標識され得る。いくつかの実施形態において、標識は、潜在的な立体障害を減少させるために様々な長さのスペーサーアームに付着される。
抗体は、放射標識されたアミノ酸でも標識され得る。その放射標識は、診断目的と治療目的の両方のために使用され得る。例えば、放射標識は、ｘ線、発光スペクトル、磁気共鳴画像法（ＭＲＩ）、コンピュータ（ｃｏｍｍｕｔｅｄ）断層撮影（ＣＴ）スキャン、ポジトロン放出断層撮影法（ＰＥＴ）または他の診断手法によってＨＭＷ−ＭＡＡを検出するために使用され得る。ポリペプチドに対する標識の例としては、以下の放射性同位体または放射性ヌクレオチド：３５Ｓ、１１Ｃ、１３Ｎ、１５Ｏ、１８Ｆ、１９Ｆ、９９ｍＴｃ、１３１Ｉ、３Ｈ、１４Ｃ、１５Ｎ、９０Ｙ、９９Ｔｃ、１１１Ｉｎおよび１２５Ｉが挙げられるが、これらに限定されない。
抗体はまた、化学基（例えば、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、メチル基もしくはエチル基または炭水化物基）を用いて誘導体化され得る。これらの基は、その抗体の生物学的特性を改善するため（例えば、血清半減期を延長するためまたは組織結合性を高めるため）に有用であり得る。
トキシンを、本明細書中に記載されるＨＭＷ−ＭＡＡ特異的ヒトモノクローナル抗体およびその機能性フラグメントとともに使用することにより、免疫毒素が生成され得る。例示的なトキシンとしては、リシン、アブリン、ジフテリア毒素およびそのサブユニットならびにボツリヌス毒素Ａ〜Ｆが挙げられる。これらのトキシンは、商業的供給源（例えば、Ｓｉｇｍａ Ｃｈｅｍｉｃａｌ Ｃｏｍｐａｎｙ，Ｓｔ．Ｌｏｕｉｓ，ＭＯ）から容易に入手可能である。企図されるトキシンは、本明細書中に記載されるトキシンの改変体も含む（例えば、米国特許第５，０７９，１６３号および同第４，６８９，４０１号を参照のこと）。１つの実施形態において、トキシンは、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ外毒素（ＰＥ）である（米国特許第５，６０２，０９５号）。本明細書中で使用される場合、「Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ外毒素」とは、完全長の天然（天然に存在する）ＰＥまたは改変されたＰＥのことを指す。そのような改変物としては、ドメインＩａの除去、ドメインＩｂ、ＩＩおよびＩＩＩにおける様々なアミノ酸欠失、単一アミノ酸置換、ならびにカルボキシル末端における１つ以上の配列の付加が挙げられ得るが、これらに限定されない（例えば、Ｓｉｅｇａｌｌら、Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２６４：１４２５６−１４２６１，１９８９を参照のこと）。１つの実施形態において、ＰＥの細胞傷害性フラグメントは、天然ＰＥの細胞傷害性の少なくとも５０％、少なくとも７５％、少なくとも９０％または少なくとも（ａｔ ｌｅｓｔ）９５％を保持する。いくつかの例において、その細胞傷害性フラグメントは、天然のＰＥよりも有毒である。
天然のＰｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ外毒素Ａ（ＰＥ）は、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ａｅｒｕｇｉｎｏｓａによって分泌される、真核細胞においてタンパク質合成を阻害する極度に活性な単量体タンパク質である（分子量６６ｋＤ）。ＰＥの作用方法は、伸長因子２（ＥＦ−２）のＡＤＰリボシル化の不活性化である。この外毒素は、協調することにより細胞傷害性を引き起こす３つの構造ドメインを含む。ドメインＩａは、細胞結合を媒介する。ドメインＩＩは、サイトゾルへの転位に関与し、ドメインＩＩＩは、伸長因子２のＡＤＰリボシル化を媒介する。ドメインＩｂの機能は、不明である。本明細書中に記載されるモノクローナル抗体とともに使用されるＰＥは、天然の配列、天然の配列の細胞傷害性フラグメントならびに天然のＰＥおよびその細胞傷害性フラグメントの保存的に改変された改変体を含み得る。ＰＥの細胞傷害性フラグメントは、標的細胞におけるその後のタンパク分解性プロセシングまたは他のプロセシングによってまたはよらずに細胞傷害性であるフラグメントを含む。ＰＥの細胞傷害性フラグメントとしては、ＰＥ４０、ＰＥ３８およびＰＥ３５が挙げられる。ＰＥおよびその改変体のさらなる説明については、例えば、米国特許第４，８９２，８２７号；同第５，５１２，６５８号；同第５，６０２，０９５号；同第５，６０８，０３９号；同第５，８２１，２３８号；および同第５，８５４，０４４号；ＰＣＴ公開番号ＷＯ９９／５１６４３；Ｐａｉら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８８：３３５８−３３６２，１９９１；Ｋｏｎｄｏら、Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２６３：９４７０−９４７５，１９８８；Ｐａｓｔａｎら、Ｂｉｏｃｈｉｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．Ａｃｔａ １３３３：Ｃ１−Ｃ６，１９９７（これらの各々は本明細書中で参考として援用される）を参照のこと。
本明細書中に記載される抗体およびその機能性フラグメントは、任意の数の様々な診断用化合物または治療用化合物を、その表面上でＨＭＷ−ＭＡＡを発現する細胞に対して標的化するためにも使用され得る。したがって、本開示の抗体は、直接またはリンカーを介して、細胞表面ＨＭＷ−ＭＡＡを発現する細胞に直接送達される薬物に付着され得る。治療用物質は、核酸、タンパク質、ペプチド、アミノ酸または誘導体、糖タンパク質、放射性同位体、脂質、炭水化物または組換えウイルスのような化合物を含む。核酸の治療部分および診断部分は、アンチセンス核酸、一本鎖または二重鎖ＤＮＡとの共有結合性架橋のための誘導体化オリゴヌクレオチド、および三重鎖形成オリゴヌクレオチドを含む。
あるいは、抗ＨＭＷ−ＭＡＡ抗体に連結される分子は、治療用組成物（例えば、薬物、核酸（例えば、アンチセンス核酸）または好ましくは循環器系に対する直接的な曝露から遮蔽される別の治療的部分）を含むリポソームまたはミセルなどの被包系であり得る。抗体に付着されたリポソームを調製する手段は、当業者に周知である（例えば、米国特許第４，９５７，７３５号；Ｃｏｎｎｏｒら、Ｐｈａｒｍ．Ｔｈｅｒ．２８：３４１−３６５，１９８５を参照のこと）。
本明細書中に記載される抗体はまた、検出可能な標識に、共有結合的にまたは非共有結合的に連結され得る。そのような用途に適した検出可能な標識としては、分光学的、光化学的、生化学的、免疫化学的、電気的、光学的または化学的な手段によって検出可能な任意の組成物が挙げられる。有用な標識としては、磁気ビーズ、蛍光色素（例えば、フルオレセインイソチオシアネート、テキサスレッド、ローダミン、緑色蛍光タンパク質など）、放射標識（例えば、３Ｈ、１２５Ｉ、３５Ｓ、１４Ｃ，または３２Ｐ）、酵素（例えば、西洋ワサビペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼおよびＥＬＩＳＡで通常使用されるその他のもの）および比色標識（例えば、コロイド金、または着色ガラスビーズもしくは着色プラスチックビーズ（例えば、ポリスチレン、ポリプロピレン、ラテックスなど））が挙げられる。これらの抗体は、蛍光励起細胞分取（ＦＡＣＳ）、免疫組織化学、放射免疫アッセイ（ＲＩＡｓ）および酵素結合免疫吸着測定法（ｅｎｚｙｍｅ−ｌｉｎｋｅｄ ｉｍｍｕｎｏｓｏｒｂａｎｔ ａｓｓａｙｓ）（ＥＬＩＳＡ）をはじめとした種々のイムノアッセイにおいて使用され得る。
そのような標識を検出する手段は、当業者に周知である。したがって、例えば、放射標識は、写真フィルムまたはシンチレーションカウンターを用いて検出され得、蛍光マーカーは、放射された照射を検出する光検出器を用いて検出され得る。酵素標識は、代表的には、その酵素に基質を提供し、その基質に対する酵素の作用によって生成された反応産物を検出することによって検出され、比色標識は、単に着色された標識を可視化することによって検出される。
Ｖ．ＨＭＷ−ＭＡＡ抗体ポリヌクレオチドおよびポリペプチド
本明細書中に提供されるポリペプチド（抗体、その機能性フラグメント、免疫結合体および融合タンパク質を含むがこれらに限定されない）をコードする核酸分子（ポリヌクレオチドとも呼ばれる）は、本明細書中に提供されるアミノ酸配列、当該分野において入手可能な配列および遺伝暗号を用いて、当業者によって容易に生成され得る。さらに、当業者は、機能的に等価な核酸（例えば、配列は異なるが、同じエフェクター分子配列または抗体配列をコードする核酸）を含む種々のクローンを容易に構築し得る。したがって、抗体、結合体および融合タンパク質をコードする核酸が、本明細書中に提供される。
いくつかの実施形態において、ＨＭＷ−ＭＡＡヒトモノクローナル抗体は、配列番号１を含むヌクレオチド配列によってコードされるＶＨドメインを有する。いくつかの実施形態において、ＨＭＷ−ＭＡＡヒトモノクローナル抗体は、配列番号３を含むヌクレオチド配列によってコードされるＶＬドメインを有する。いくつかの実施形態において、ＨＭＷ−ＭＡＡヒトモノクローナル抗体は、配列番号４のヌクレオチド配列を含む重鎖を有する。
ＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合するヒト抗体またはＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合するその機能性フラグメントをコードする核酸配列は、例えば、適切な配列のクローニングを含む任意の適当な方法、またはＮａｒａｎｇら、Ｍｅｔｈ．Ｅｎｚｙｍｏｌ．６８：９０−９９，１９７９のホスホトリエステル法；Ｂｒｏｗｎら、Ｍｅｔｈ．Ｅｎｚｙｍｏｌ．６８：１０９−１５１，１９７９のホスホジエステル法；Ｂｅａｕｃａｇｅら、Ｔｅｔｒａ．Ｌｅｔｔ．２２：１８５９−１８６２，１９８１のジエチルホスホルアミダイト法；例えば、Ｎｅｅｄｈａｍ−ＶａｎＤｅｖａｎｔｅｒら、Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．１２：６１５９−６１６８，１９８４に記載されているような例えば自動合成装置を用いる、Ｂｅａｕｃａｇｅ ＆ Ｃａｒｕｔｈｅｒｓ，Ｔｅｔｒａ．Ｌｅｔｔｓ．２２（２０）：１８５９−１８６２，１９８１によって記載されている固相ホスホルアミダイトトリエステル法；および米国特許第４，４５８，０６６号の固体支持体法などの方法による直接的な化学合成によって調製され得る。化学合成は、一本鎖オリゴヌクレオチドを生成する。これは、鋳型としてその一本鎖を用いる、相補的な配列とのハイブリダイゼーションまたはＤＮＡポリメラーゼによる重合によって、二本鎖ＤＮＡに変換され得る。当業者は、ＤＮＡの化学合成が、一般に、約１００塩基の配列に制限されるが、それよりも長い配列がより短い配列のライゲーションによって得られ得ることを認識するだろう。
ＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合するヒト抗体またはＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合するその機能性フラグメントをコードする例示的な核酸は、クローニング手法によって調製され得る。適切なクローニング手法および配列決定手法の例ならびに多くのクローニング演習を通じて当業者を指示するのに十分な指示書は、Ｓａｍｂｒｏｏｋら、前出、Ｂｅｒｇｅｒ ａｎｄ Ｋｉｍｍｅｌ（ｅｄｓ．），前出およびＡｕｓｕｂｅｌ，前出に見られる。生物学的試薬および実験機器の製造者からの製品情報も、有用な情報を提供する。そのような製造者としては、ＳＩＧＭＡ Ｃｈｅｍｉｃａｌ Ｃｏｍｐａｎｙ（Ｓａｉｎｔ Ｌｏｕｉｓ，ＭＯ）、Ｒ＆Ｄ Ｓｙｓｔｅｍｓ（Ｍｉｎｎｅａｐｏｌｉｓ，ＭＮ）、Ｐｈａｒｍａｃｉａ Ａｍｅｒｓｈａｍ（Ｐｉｓｃａｔａｗａｙ，ＮＪ）、ＣＬＯＮＴＥＣＨ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ，Ｉｎｃ．（Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ）、Ｃｈｅｍ Ｇｅｎｅｓ Ｃｏｒｐ．、Ａｌｄｒｉｃｈ Ｃｈｅｍｉｃａｌ Ｃｏｍｐａｎｙ（Ｍｉｌｗａｕｋｅｅ，ＷＩ）、Ｇｌｅｎ Ｒｅｓｅａｒｃｈ，Ｉｎｃ．、ＧＩＢＣＯ ＢＲＬ Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，Ｉｎｃ．（Ｇａｉｔｈｅｒｓｂｕｒｇ，ＭＤ）、Ｆｌｕｋａ Ｃｈｅｍｉｃａ−Ｂｉｏｃｈｅｍｉｋａ Ａｎａｌｙｔｉｋａ（Ｆｌｕｋａ Ｃｈｅｍｉｅ ＡＧ，Ｂｕｃｈｓ，Ｓｗｉｔｚｅｒｌａｎｄ）、Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ（Ｃａｒｌｓｂａｄ，ＣＡ）およびＡｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ（Ｆｏｓｔｅｒ Ｃｉｔｙ，ＣＡ）ならびに当業者に公知の他の多くの商業的供給源が挙げられる。
天然のエフェクター分子（ＥＭ）または抗ＨＭＷ−ＭＡＡ抗体をコードする核酸は、本開示のＥＭ、抗体または免疫結合体を形成するように改変され得る。部位特異的突然変異誘発による改変は、当該分野で周知である。核酸は、増幅方法によっても調製され得る。増幅方法としては、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）、リガーゼ連鎖反応（ＬＣＲ）、転写ベース増幅系（ＴＡＳ）、自己持続性配列複製系（ｓｅｌｆ−ｓｕｓｔａｉｎｅｄ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ｒｅｐｌｉｃａｔｉｏｎ ｓｙｓｔｅｍ）（３ＳＲ）が挙げられる。多種多様のクローニング方法、宿主細胞およびインビトロ増幅方法が、当業者に周知である。
１つの実施形態において、免疫結合体は、ヒトＨＭＷ−ＭＡＡ特異的モノクローナル抗体またはその機能性フラグメントをコードするｃＤＮＡを、ＥＭをコードするｃＤＮＡを含むベクターに挿入することによって調製される。この挿入は、その抗体とＥＭとが、機能的抗体領域および機能的ＥＭ領域を含む１つの連続したポリペプチドとしてインフレームで読まれるように、行われる。１つの実施形態において、ＥＭ、標識または酵素をコードするｃＤＮＡは、ＥＭ、標識または酵素がその抗体のカルボキシル末端に位置するように抗体にライゲーションされる。別の実施形態において、ＥＭ、標識または酵素は、抗体のアミノ末端に位置する。別の例において、ＥＭ、標識または酵素をコードするｃＤＮＡは、ＥＭ、標識または酵素が重鎖可変領域のカルボキシル末端に位置するように、抗体の重鎖可変領域にライゲーションされる。続いて、その重鎖可変領域は、ジスルフィド結合を用いてその抗体の軽鎖可変領域にライゲーションされ得る。なおも別の例において、ＥＭ、標識または酵素をコードするｃＤＮＡは、ＥＭ、標識または酵素が軽鎖可変領域のカルボキシル末端に位置するように、抗体の軽鎖可変領域にライゲーションされる。続いて、その軽鎖可変領域は、ジスルフィド結合を用いてその抗体の重鎖可変領域にライゲーションされ得る。
いったん、ＥＭ、抗ＨＭＷ−ＭＡＡ抗体、その機能性フラグメントまたは免疫結合体をコードする核酸が、単離されてクローニングされると、所望のタンパク質が、組換え的に操作された細胞（例えば、細菌、植物、酵母、昆虫および哺乳動物の細胞）において発現され得る。当業者は、大腸菌、他の細菌宿主、酵母および様々な高等真核細胞（例えば、ＣＯＳ、ＣＨＯ、ＨｅＬａおよびミエローマ細胞株）を含むタンパク質の発現に利用可能な多くの発現系に精通していると予想される。
本抗体またはそのフラグメントをコードする１つ以上のＤＮＡ配列は、ＤＮＡを適当な宿主細胞に移入することによってインビトロにおいて発現され得る。その細胞は、原核生物または真核生物の細胞であり得る。この用語は、対象宿主細胞の任意の子孫も含む。複製中に生じる変異が存在し得るので、すべての子孫が、親細胞と同一でないかもしれないことが理解される。外来ＤＮＡが宿主内に継続的に維持されることを意味する安定な移入の方法は、当該分野で公知である。目的の抗体を発現するハイブリドーマもまた、本開示によって包含される。
本明細書中に記載される単離された抗体および抗体フラグメントをコードする核酸の発現は、ＤＮＡまたはｃＤＮＡをプロモーター（構成的プロモーターまたは誘導性プロモーターのいずれか）に作動可能に連結した後、発現カセットに組み込むことによって達成され得る。そのカセットは、原核生物または真核生物のいずれかにおける複製および組み込みに適し得る。代表的な発現カセットは、タンパク質をコードするＤＮＡの発現の制御に有用な特異的配列を含む。例えば、発現カセットは、適切なプロモーター、エンハンサー、転写ターミネーターおよび翻訳ターミネーター、開始配列、タンパク質をコードする遺伝子の前に存在する開始コドン（すなわち、ＡＴＧ）、イントロンに対するスプライシングシグナル、すなわち、ｍＲＮＡの適切な翻訳を可能にするその遺伝子の適切な読み枠の維持のためのスプライシングシグナル、ならびに終止コドンを含み得る。
クローニングされた遺伝子の高レベルの発現を得るために、少なくとも、転写を指示する強力なプロモーター、翻訳開始のためのリボソーム結合部位および転写／翻訳ターミネーターを含む発現カセットを構築することが望ましい。大腸菌に対しては、これは、プロモーター（例えば、Ｔ７、ｔｒｐ、ｌａｃまたはラムダプロモーター）、リボソーム結合部位および好ましくは転写終結シグナルを含む。真核細胞に対しては、調節配列は、例えば、免疫グロブリン遺伝子、ＳＶ４０またはサイトメガロウイルスに由来するプロモーターおよび／またはエンハンサーならびにポリアデニル化配列を含み得、スプライスドナー配列およびスプライスアクセプター配列をさらに含み得る。そのカセットは、周知の方法（例えば、大腸菌に対しては形質転換またはエレクトロポレーション、および哺乳動物細胞に対してはリン酸カルシウム処理、エレクトロポレーションまたはリポフェクション）によって、選択された宿主細胞に移入され得る。カセットによって形質転換された細胞は、そのカセットに含まれる遺伝子（例えば、ａｍｐ、ｇｐｔ、ｎｅｏおよびｈｙｇ遺伝子）によって付与された抗生物質に対する耐性によって選択され得る。
宿主が真核生物であるとき、リン酸カルシウム共沈殿、従来の力学的手順（例えば、リポソームに包まれたプラスミドまたはウイルスベクターのマイクロインジェクション、エレクトロポレーション、挿入）のようなＤＮＡのトランスフェクション方法が、使用され得る。真核細胞はまた、抗体、標識された抗体またはそれらの機能性フラグメントをコードするポリヌクレオチド配列、および単純ヘルペスチミジンキナーゼ遺伝子などの選択可能な表現型をコードする第２の外来ＤＮＡ分子と同時形質転換され得る。別の方法は、真核生物ウイルスベクター（例えば、サルウイルス４０（ＳＶ４０）またはウシパピローマウイルス）を使用して、真核細胞を一過性に感染させるかまたは形質転換し、そのタンパク質を発現させることである（例えば、Ｅｕｋａｒｙｏｔｉｃ Ｖｉｒａｌ Ｖｅｃｔｏｒｓ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ，Ｇｌｕｚｍａｎ ｅｄ．，１９８２を参照のこと）。当業者は、高等真核細胞（例えば、ＣＯＳ、ＣＨＯ、ＨｅＬａおよびミエローマ細胞株）を含む細胞においてタンパク質を生成する際に有用なプラスミドおよびベクターなどの発現系を容易に使用し得る。
改変は、本明細書中に記載されるポリペプチド（すなわち、ヒトＨＭＷ−ＭＡＡ特異的モノクローナル抗体またはその抗体を含む免疫結合体）をコードする核酸に対して、その生物学的活性を低下させずに、行われ得る。いくつかの改変は、標的化分子のクローニング、発現または融合タンパク質への組み込みを容易にするために行われ得る。そのような改変物は、当業者に周知であり、それらは、例えば、終止コドン、開始部位を提供するためにアミノ末端に付加されたメチオニン、都合のよい位置に制限酵素認識部位を設けるためにいずれかの末端に位置する追加のアミノ酸、または精製工程に役立つ追加のアミノ酸（例えば、ポリＨｉｓ）を含む。組換え方法に加えて、本開示の免疫結合体、エフェクター部分および抗体はまた、当該分野で周知の標準的なペプチド合成を用いて、全体として、または部分的に構築され得る。
組換え免疫結合体、抗体および／またはエフェクター分子は、いったん発現されると、硫安塩析、アフィニティーカラム、カラムクロマトグラフィなどを含む当該分野の標準的な手順に従って精製され得る（一般には、Ｒ．Ｓｃｏｐｅｓ，ＰＲＯＴＥＩＮ ＰＵＲＩＦＩＣＡＴＩＯＮ，Ｓｐｒｉｎｇｅｒ−Ｖｅｒｌａｇ，Ｎ．Ｙ．，１９８２を参照のこと）。それらの抗体、免疫結合体およびエフェクター分子は、１００％純粋である必要はない。そのポリペプチドは、いったん精製されると、治療的に使用される場合は望まれるように部分的にまたは均質に、エンドトキシンを実質的に含まないべきである。
大腸菌などの細菌からの、一本鎖抗体の発現および／または一本鎖抗体を含む適切な活性型へのリフォールディングのための方法は、すでに報告されており、周知であり、本明細書中に開示される抗体に対して適用可能である。Ｂｕｃｈｎｅｒら、Ａｎａｌ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．２０５：２６３−２７０，１９９２；Ｐｌｕｃｋｔｈｕｎ，Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ ９：５４５，１９９１；Ｈｕｓｅら、Ｓｃｉｅｎｃｅ ２４６：１２７５，１９８９およびＷａｒｄら、Ｎａｔｕｒｅ ３４１：５４４，１９８９（すべてが本明細書中で参考として援用される）を参照のこと。
しばしば、大腸菌または他の細菌由来の機能的異種タンパク質が、封入体から単離され、それは、強力な変性剤を用いた可溶化およびその後のリフォールディングを必要とする。当該分野で周知であるように、ジスルフィド結合を分離するために、還元剤を可溶化工程中に含められなければならない。還元剤を含む例示的な緩衝液は：０．１Ｍ Ｔｒｉｓ ｐＨ８、６Ｍグアニジン、２ｍＭ ＥＤＴＡ、０．３Ｍ ＤＴＥ（ジチオエリトリトール）である。ジスルフィド結合の再酸化は、Ｓａｘｅｎａら、Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ ９：５０１５−５０２１，１９７０（本明細書中で参考として援用される）および特に、Ｂｕｃｈｎｅｒら、前出に記載されているように、還元型および酸化型の低分子量チオール試薬の存在下において生じ得る。
再生は、代表的には、変性されたタンパク質および還元されたタンパク質のリフォールディング緩衝液への希釈（例えば、１００倍）によって達成される。例示的な緩衝液は、０．１Ｍ Ｔｒｉｓ，ｐＨ８．０、０．５Ｍ Ｌ−アルギニン、８ｍＭ酸化型グルタチオン（ＧＳＳＧ）および２ｍＭ ＥＤＴＡである。
２本鎖抗体の精製プロトコルの変法として、重鎖領域および軽鎖領域を別々に可溶化し、還元し、次いで、リフォールディング溶液中で併せる。これらの２つのタンパク質を、一方のタンパク質が他方に対して５倍過剰なモル濃度を超えないようなモル比で混合すると、例示的な収量が得られる。酸化還元シャフリング（ｒｅｄｏｘ−ｓｈｕｆｆｌｉｎｇ）が完了した後、過剰な酸化型グルタチオンまたは他の低分子量酸化化合物が、リフォールディング溶液に加えられ得る。
組換え方法に加えて、本明細書中に開示される抗体、標識された抗体およびそれらの機能性フラグメントはまた、標準的なペプチド合成を用いて、全体として、または部分的に構築され得る。約５０アミノ酸長未満のポリペプチドの固相合成は、その配列のＣ末端アミノ酸を不溶性支持体に付着した後、その配列の残りのアミノ酸を順番に付加することによって達成され得る。固相合成についての手法は、Ｂａｒａｎｙ ＆ Ｍｅｒｒｉｆｉｅｌｄ，Ｔｈｅ Ｐｅｐｔｉｄｅｓ：Ａｎａｌｙｓｉｓ，Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ，Ｂｉｏｌｏｇｙ．Ｖｏｌ．２：Ｓｐｅｃｉａｌ Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｐｅｐｔｉｄｅ Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ，Ｐａｒｔ Ａ．ｐｐ．３−２８４；Ｍｅｒｒｉｆｉｅｌｄら、Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．８５：２１４９−２１５６，１９６３およびＳｔｅｗａｒｔら、Ｓｏｌｉｄ Ｐｈａｓｅ Ｐｅｐｔｉｄｅ Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ，２ｎｄ ｅｄ．，Ｐｉｅｒｃｅ Ｃｈｅｍ．Ｃｏ．，Ｒｏｃｋｆｏｒｄ，Ｉｌｌ．，１９８４に記載されている。より長いタンパク質は、より短いフラグメントのアミノ末端とカルボキシル末端との縮合によって合成され得る。カルボキシル末端の活性化によってペプチド結合を形成する方法（例えば、カップリング試薬Ｎ，Ｎ’−ジシクロヘキシルカルボジイミド（ｄｉｃｙｌｏｈｅｘｙｌｃａｒｂｏｄｉｍｉｄｅ）を使用することによる方法）は、当該分野で周知である。
ＶＩ．組成物および治療方法
キャリア、およびＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合する抗体またはＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合するその機能性フラグメントの１つ以上を含む組成物が、本明細書中に提供される。免疫結合体または免疫毒素を含む組成物もまた、提供される。その組成物は、被験体に投与するための単位剤形で調製され得る。所望の目的を達成するために、投与の量およびタイミングは、処置する医師の判断による。その抗体は、全身投与または局所（例えば、腫瘍内）投与のために製剤化され得る。１つの例において、ＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合する抗体は、静脈内投与などの非経口投与のために製剤化される。
投与用の組成物は、水溶性キャリアなどの薬学的に許容可能なキャリアに溶解された、ＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合する抗体（またはその機能性フラグメント）の溶液を含み得る。種々の水溶性キャリア、例えば、緩衝食塩水などが、使用され得る。これらの溶液は、滅菌され、一般に、望ましくない物質を含まない。これらの組成物は、従来の周知の滅菌法によって滅菌され得る。その組成物は、生理学的条件に近づけることが必要とされるとき、薬学的に許容可能な補助剤物質、例えば、ｐＨ調整剤およびｐＨ緩衝剤、毒性調整剤など、例えば、酢酸ナトリウム、塩化ナトリウム、塩化カリウム、塩化カルシウム、乳酸ナトリウムなどを含み得る。これらの製剤中の抗体の濃度は、広く変動し得、主に、選択される特定の投与様式および被験体のニーズに従って、液量、粘性、体重などに基づいて選択される。
静脈内投与用の代表的な薬学的組成物は、約０．１〜１０ｍｇの抗体／被験体／日を含む。特に、その薬剤が、隔離された部位に投与される場合および循環系またはリンパ系（例えば、体腔または器官の内腔）に投与されない場合、０．１〜約１００ｍｇ／被験体／日の投薬量が使用され得る。投与可能な組成物を調製するための実際の方法は、当業者に公知であるか、または当業者に明らかであり、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅ，１９ｔｈ ｅｄ．，Ｍａｃｋ Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ Ｃｏｍｐａｎｙ，Ｅａｓｔｏｎ，ＰＡ（１９９５）のような刊行物に詳細に記載されている。
抗体は、凍結乾燥された形態で提供され得、投与前に滅菌水で再水和され得るが、それらは、既知濃度の滅菌された溶液の形態でも提供される。次いで、その抗体溶液は、０．９％塩化ナトリウム，ＵＳＰを含む輸液バッグに加えられ、代表的には、０．５〜１５ｍｇ／ｋｇ体重の投薬量で投与される。１９９７年のＲＩＴＵＸＡＮ（登録商標）の承認以来、米国において販売されている抗体薬物の投与の分野における多数の経験内容が利用可能である。抗体は、静脈内プッシュまたはボーラスではなく緩徐な注入によって投与され得る。１つの例において、より多い負荷投与量が投与され、その後、維持用量が、より低レベルで投与される。例えば、４ｍｇ／ｋｇという最初の負荷投与量が、何回かの９０分間にわたって注入された後、その前の用量に良好な耐容性を示す場合、２ｍｇ／ｋｇの維持用量が、４〜８週間にわたって毎週、３０分間注入され得る。
ＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合する抗体（またはその機能性フラグメント）は、癌細胞などの細胞の成長を遅延させるかまたは阻害するために投与され得る。これらの適用において、治療有効量の抗体が、癌細胞の成長、複製もしくは転移を阻害するため、または癌の徴候もしくは症状を阻害するために十分な量で被験体に投与される。いくつかの実施形態において、本抗体は、転移の発生を阻害するためまたは予防するため、または微小転移巣などの転移（ｍｅｔａｓａｓｅｓ）、例えば、領域リンパ節への微小転移巣のサイズもしくは数を減少させるために、被験体に投与される（Ｇｏｔｏら、Ｃｌｉｎ．Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ．１４（１１）：３４０１−３４０７，２００８）。
適当な被験体は、ＨＭＷ−ＭＡＡを発現する癌（例えば、メラノーマ、前立腺癌、扁平上皮癌腫（例えば、頭頸部扁平上皮癌腫）、乳癌（基底細胞型乳癌腫、腺管癌腫および小葉性乳癌腫を含むがこれらに限定されない）、白血病（例えば、急性骨髄性白血病および１１ｑ２３陽性急性白血病）、神経堤腫瘍（例えば、星状細胞腫、神経膠腫または神経芽細胞腫）、卵巣癌、結腸癌、胃癌、膵癌、骨癌（例えば、脊索腫）、神経膠腫または肉腫（例えば、軟骨肉腫）であるがこれらに限定されない）と診断された被験体を含み得る。
ヒトＨＭＷ−ＭＡＡ特異的抗体の治療有効量は、疾患の重症度および患者の全般的な健康状態に依存する。その抗体の治療有効量は、症状の主観的な軽減、または臨床医もしくは他の適格な観察者によって述べられるような客観的に同定可能な改善を提供する量である。これらの組成物は、同時にまたは順次、別の化学療法剤とともに投与され得る。
現在、多くの化学療法剤が当該分野で公知である。１つの実施形態において、化学療法剤は、有糸***インヒビター、アルキル化剤、抗代謝産物、挿入抗生物質（ｉｎｔｅｒｃａｌａｔｉｎｇ ａｎｔｉｂｉｏｔｉｃｓ）、成長因子インヒビター、細胞周期インヒビター、酵素、トポイソメラーゼインヒビター、抗生存剤（ａｎｔｉ−ｓｕｒｖｉｖａｌ ａｇｅｎｔｓ）、生物学的応答改変因子（ｍｏｄｉｆｉｅｒｓ）、抗ホルモン、例えば、抗アンドロゲンおよび抗血管新生剤からなる群から選択される。
抗血管新生剤（例えば、ＭＭＰ−２（マトリックス−メタロプロテイナーゼ２）インヒビター、ＭＭＰ−９（マトリックス−メタロプロテイナーゼ９）インヒビターおよびＣＯＸ−ＩＩ（シクロオキシゲナーゼＩＩ）インヒビター）が、本発明の化合物とともに使用され得る。有用なＣＯＸ−ＩＩインヒビターの例としては、ＣＥＬＥＢＲＥＸＴＭ（セレコキシブ（ａｌｅｃｏｘｉｂ））、バルデコキシブおよびロフェコキシブが挙げられる。有用なマトリックスメタロプロテイナーゼインヒビターの例は、ＰＣＴ公開番号ＷＯ９６／３３１７２（１９９６年１０月２４日公開）、ＰＣＴ公開番号ＷＯ９６／２７５８３（１９９６年３月７日公開）、欧州特許出願番号９７３０４９７１．１（１９９７年７月８日出願）、欧州特許出願番号９９３０８６１７．２（１９９９年１０月２９日出願）、ＰＣＴ公開番号ＷＯ９８／０７６９７（１９９８年２月２６日公開）、ＰＣＴ公開番号ＷＯ９８／０３５１６（１９９８年１月２９日公開）、ＰＣＴ公開番号ＷＯ９８／３４９１８（１９９８年８月１３日公開）、ＰＣＴ公開番号ＷＯ９８／３４９１５（１９９８年８月１３日公開）、ＰＣＴ公開番号ＷＯ９８／３３７６８（１９９８年８月６日公開）、ＰＣＴ公開番号ＷＯ９８／３０５６６（１９９８年７月１６日公開）、欧州特許公開６０６，０４６（１９９４年７月１３日公開）、欧州特許公開９３１，７８８（１９９９年７月２８日公開）、ＰＣＴ公開番号ＷＯ９０／０５７１９（１９９０年５月３１日公開）、ＰＣＴ公開番号ＷＯ９９／５２９１０（１９９９年１０月２１日公開）、ＰＣＴ公開番号ＷＯ９９／５２８８９（１９９９年１０月２１日公開）、ＰＣＴ公開番号ＷＯ９９／２９６６７（１９９９年６月１７日公開）、ＰＣＴ国際出願番号ＰＣＴ／ＩＢ９８／０１１１３（１９９８年７月２１日出願）、欧州特許出願番号９９３０２２３２．１（１９９９年３月２５日出願）、米国特許第５，８６３，９４９号（１９９９年１月２６日発行）、米国特許第５，８６１，５１０号（１９９９年１月１９日発行）および欧州特許公開７８０，３８６（１９９７年６月２５日公開）に記載されている。１つの例において、ＭＭＰインヒビターは、投与されたときに関節痛を誘導しない。別の例において、ＭＭＰインヒビターは、他のマトリックス−メタロプロテイナーゼ（例えば、ＭＭＰ−１、ＭＭＰ−３、ＭＭＰ−４、ＭＭＰ−５、ＭＭＰ−６、ＭＭＰ−７、ＭＭＰ−８、ＭＭＰ−１０、ＭＭＰ−１１、ＭＭＰ−１２およびＭＭＰ−１３）と比べてＭＭＰ−２および／またはＭＭＰ−９を選択的に阻害する。有用なＭＭＰインヒビターのいくつかの具体的な例は、ＡＧ−３３４０、ＲＯ３２−３５５５、ＲＳ１３−０８３０、３−［［４−（４−フルオロ−フェノキシ）−ベンゼンスルホニル］−（１−ヒドロキシカルバモイル−シクロペンチル）−アミノ］−プロピオン酸；３−エキソ−３−［４−（４−フルオロ−フェノキシ）−ベンゼンスルホニルアミノ］−８−オキサ−ビシクロ［３．２．１］オクタン−３−カルボン酸ヒドロキシアミド；（２Ｒ，３Ｒ）１−［４−（２−クロロ−４−フルオロ−ベンジルオキシ）−ベンゼンスルホニル］−３−ヒドロキシ−３−メチル−ピペリジン−２−カルボン酸ヒドロキシアミド；４−［４−（４−フルオロ−フェノキシ）−ベンゼンスルホニルアミノ］−テトラヒドロ−ピラン−４−カルボン酸ヒドロキシアミド；３−［［４−（４−フルオロ−フェノキシ）−ベンゼンスルホニル］−（１−ヒドロキシカルバモイル−シクロブチル）−アミノ］−プロピオン酸；４−［４−（４−クロロ−フェノキシ）−ベンゼンスルホニルアミノ］−テトラヒドロ−ピラン−４−カルボン酸ヒドロキシアミド；（Ｒ）３−［４−（４−クロロ−フェノキシ）−ベンゼンスルホニルアミノ］−テトラヒドロ−ピラン−３−カルボン酸ヒドロキシアミド；（２Ｒ，３Ｒ）１−［４−（４−フルオロ−２−メチル−ベンジルオキシ）−ベンゼンスルホニル］−３−ヒドロキシ−３−メチル−ピペリジン−２−カルボン酸ヒドロキシアミド；３−［［４−（４−フルオロ−フェノキシ）−ベンゼンスルホニル］−（１−ヒドロキシカルバモイル−１−メチル−エチル）−アミノ］−プロピオン酸；３−［［４−（４−フルオロ−フェノキシ）−ベンゼンスルホニル］−（４−ヒドロキシカルバモイル−テトラヒドロ−ピラン−４−イル）−アミノ］−プロピオン酸；３−エキソ−３−［４−（４−クロロ−フェノキシ）−ベンゼンスルホニルアミノ］−８−オキサイシクロ［３．２．１］オクタン−３−カルボン酸ヒドロキシアミド；３−エンド−３−［４−（４−フルオロ−フェノキシ）−ベンゼンスルホニルアミノ］−８−オキサ−イシクロ［３．２．１］オクタン−３−カルボン酸ヒドロキシアミド；および（Ｒ）３−［４−（４−フルオロ−フェノキシ）−ベンゼンスルホニルアミノ］−テトラヒドロ−フラン−３−カルボン酸ヒドロキシアミド；ならびに前記化合物の薬学的に許容可能な塩および溶媒和化合物である。
ＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合する抗体はまた、シグナル伝達インヒビター（例えば、ＥＧＦ−Ｒ（上皮成長因子レセプター）応答を阻害し得る作用物質、例えば、ＥＧＦ−Ｒ抗体、ＥＧＦ抗体およびＥＧＦ−Ｒインヒビターである分子；ＶＥＧＦ（血管内皮成長因子）インヒビター（例えば、ＶＥＧＦレセプターおよびＶＥＧＦを阻害し得る分子）；およびｅｒｂＢ２レセプターインヒビター（例えば、ｅｒｂＢ２レセプターに結合する有機分子または抗体、例えば、ＨＥＲＣＥＰＴＩＮＴＭ（Ｇｅｎｅｎｔｅｃｈ，Ｉｎｃ．））とともに使用され得る。ＥＧＦ−Ｒインヒビターは、例えば、ＰＣＴ公開番号ＷＯ９５／１９９７０（１９９５年７月２７日公開）、ＷＯ９８／１４４５１（１９９８年４月９日公開）、ＷＯ９８／０２４３４（１９９８年１月２２日公開）および米国特許第５，７４７，４９８号（１９９８年５月５日発行）に記載されている。ＥＧＦＲ阻害剤としては、モノクローナル抗体Ｃ２２５および抗ＥＧＦＲ２２Ｍａｂ（ＩｍＣｌｏｎｅ Ｓｙｓｔｅｍｓ Ｉｎｃｏｒｐｏｒａｔｅｄ）、ＡＢＸ−ＥＧＦ（Ａｂｇｅｎｉｘ／Ｃｅｌｌ Ｇｅｎｅｓｙｓ）、ＥＭＤ−７２００（Ｍｅｒｃｋ ＫｇａＡ）、ＥＭＤ−５５９０（Ｍｅｒｃｋ ＫｇａＡ）、ＭＤＸ−４４７／Ｈ−４７７（Ｍｅｄａｒｅｘ Ｉｎｃ．およびＭｅｒｃｋ ＫｇａＡ）、ならびに化合物ＺＤ−１８３４、ＺＤ−１８３８およびＺＤ−１８３９（ＡｓｔｒａＺｅｎｅｃａ）、ＰＫＩ−１６６（Ｎｏｖａｒｔｉｓ）、ＰＫＩ−１６６／ＣＧＰ−７５１６６（Ｎｏｖａｒｔｉｓ）、ＰＴＫ７８７（Ｎｏｖａｒｔｉｓ）、ＣＰ７０１（Ｃｅｐｈａｌｏｎ）、レフルノミド（Ｐｈａｒｍａｃｉａ／Ｓｕｇｅｎ）、Ｃｌ−１０３３（Ｗａｒｎｅｒ Ｌａｍｂｅｒｔ Ｐａｒｋｅ Ｄａｖｉｓ）、Ｃｌ−１０３３／ＰＤ１８３，８０５（Ｗａｒｎｅｒ Ｌａｍｂｅｒｔ Ｐａｒｋｅ Ｄａｖｉｓ）、ＣＬ−３８７，７８５（Ｗｙｅｔｈ−Ａｙｅｒｓｔ）、ＢＢＲ−１６１１（Ｂｏｅｈｒｉｎｇｅｒ Ｍａｎｎｈｅｉｍ ＧｍｂＨ／Ｒｏｃｈｅ）、ナアミジン（Ｎａａｍｉｄｉｎｅ）Ａ（Ｂｒｉｓｔｏｌ Ｍｙｅｒｓ Ｓｑｕｉｂｂ）、ＲＣ−３９４０−ＩＩ（Ｐｈａｒｍａｃｉａ）、ＢＩＢＸ−１３８２（Ｂｏｅｈｒｉｎｇｅｒ Ｉｎｇｅｌｈｅｉｍ）、ＯＬＸ−１０３（Ｍｅｒｃｋ ＆ Ｃｏ．）、ＶＲＣＴＣ−３１０（Ｖｅｎｔｅｃｈ Ｒｅｓｅａｒｃｈ）、ＥＧＦ融合トキシン（Ｓｅｒａｇｅｎ Ｉｎｃ．）、ＤＡＢ−３８９（Ｓｅｒａｇｅｎ／Ｌｉｌｇａｎｄ）、ＺＭ−２５２８０８（Ｉｍｐｅｒｉａｌ Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｆｕｎｄ）、ＲＧ−５０８６４（ＩＮＳＥＲＭ）、ＬＦＭ−Ａ１２（Ｐａｒｋｅｒ Ｈｕｇｈｅｓ Ｃａｎｃｅｒ Ｃｅｎｔｅｒ）、ＷＨＩ−Ｐ９７（Ｐａｒｋｅｒ Ｈｕｇｈｅｓ Ｃａｎｃｅｒ Ｃｅｎｔｅｒ）、ＧＷ−２８２９７４（Ｇｌａｘｏ）、ＫＴ−８３９１（Ｋｙｏｗａ Ｈａｋｋｏ）およびＥＧＦ−Ｒワクチン（Ｙｏｒｋ Ｍｅｄｉｃａｌ／Ｃｅｎｔｒｏ ｄｅ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉａ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ（ＣＩＭ））も挙げられるが、これらに限定されない。
ＶＥＧＦインヒビター、例えば、ＳＵ−５４１６およびＳＵ−６６６８（Ｓｕｇｅｎ Ｉｎｃ．）、ＳＨ−２６８（Ｓｃｈｅｒｉｎｇ）およびＮＸ−１８３８（ＮｅＸｓｔａｒ）もまた、ＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合する抗体とともに使用され得る。ＶＥＧＦインヒビターは、例えば、ＰＣＴ公開番号ＷＯ９９／２４４４０（１９９９年５月２０日公開）、ＰＣＴ国際出願ＰＣＴ／ＩＢ９９／００７９７（１９９９年５月３日出願）、ＰＣＴ公開番号ＷＯ９５／２１６１３（１９９５年８月１７日公開）、ＰＣＴ公開番号ＷＯ９９／６１４２２（１９９９年１２月２日公開）、米国特許第５，８３４，５０４号（１９９８年１１月１０日発行）、ＰＣＴ公開番号ＷＯ９８／５０３５６（１９９８年１１月１２日公開）、米国特許第５，８８３，１１３号（１９９９年３月１６日発行）、米国特許第５，８８６，０２０号（１９９９年３月２３日発行）、米国特許第５，７９２，７８３号（１９９８年８月１１日発行）、ＰＣＴ公開番号ＷＯ９９／１０３４９（１９９９年３月４日公開）、ＰＣＴ公開番号ＷＯ９７／３２８５６（１９９７年９月１２日公開）、ＰＣＴ公開番号ＷＯ９７／２２５９６（１９９７年６月２６日公開）、ＰＣＴ公開番号ＷＯ９８／５４０９３（１９９８年１２月３日公開）、ＰＣＴ公開番号ＷＯ９８／０２４３８（１９９８年１月２２日公開）、ＷＯ９９／１６７５５（１９９９年４月８日公開）およびＰＣＴ公開番号ＷＯ９８／０２４３７（１９９８年１月２２日公開）に記載されている。いくつかの特異的ＶＥＧＦインヒビターの他の例は、ＩＭ８６２（Ｃｙｔｒａｎ Ｉｎｃ．）；Ｇｅｎｅｎｔｅｃｈ，Ｉｎｃ．の抗ＶＥＧＦモノクローナル抗体；ならびにＲｉｂｏｚｙｍｅおよびＣｈｉｒｏｎ製の合成リボザイムであるアンギオザイム（ａｎｇｉｏｚｙｍｅ）である。これらおよび他のＶＥＧＦインヒビターは、ＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合する抗体とともに使用され得る。
さらに、ＧＷ−２８２９７４（Ｇｌａｘｏ Ｗｅｌｌｃｏｍｅ ｐｉｃ）などのＥｒｂＢ２レセプターインヒビター、ならびにモノクローナル抗体ＡＲ−２０９（Ａｒｏｎｅｘ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ Ｉｎｃ．）および２Ｂ−１（Ｃｈｉｒｏｎ）、例えば、ＰＣＴ公開番号ＷＯ９８／０２４３４（１９９８年１月２２日公開）、ＰＣＴ公開番号ＷＯ９９／３５１４６（１９９９年７月１５日公開）、ＰＣＴ公開番号ＷＯ９９／３５１３２（１９９９年７月１５日公開）、ＰＣＴ公開番号ＷＯ９８／０２４３７（１９９８年１月２２日公開）、ＰＣＴ公開番号ＷＯ９７／１３７６０（１９９７年４月１７日公開）、ＰＣＴ公開番号ＷＯ９５／１９９７０（１９９５年７月２７日公開）、米国特許第５，５８７，４５８号（１９９６年１２月２４日発行）および米国特許第５，８７７，３０５号（１９９９年３月２日発行）に示されているものが、本発明の化合物と併用され得る。有用なＥｒｂＢ２レセプターインヒビターは、１９９９年１月２７日出願の米国仮出願番号６０／１１７，３４１および１９９９年１月２７日出願の米国仮出願番号６０／１１７，３４６にも記載されている。
メラノーマなどの癌を処置するために、本明細書中に開示される抗体は、外科的処置、またはダカルバジン（ＤＴＩＣとも呼ばれる）もしくはインターロイキン−２（ＩＬ−２）もしくはインターフェロン（ＩＦＮ）などのインターフェロンを含む別の治療薬とともに使用され得る。表在性黒色腫を処置するために、本抗体は、イミキモドとともに使用され得る。前立腺癌を処置するために、本抗体は、例えば、外科術、放射線治療、化学療法およびホルモン治療（例えば、抗アンドロゲンまたはＧｎＲＨアンタゴニスト）とともに使用され得る。ＨＮＳＣＣを処置するために、本明細書中に提供される抗体は、外科術、放射線治療、化学療法、他の抗体（例えば、セツキシマブおよびベバシズマブ）または小分子治療薬（例えば、エルロチニブ）とともに使用され得る。
本組成物の単回または複数回投与は、患者が必要とし、耐容するような投薬量および頻度に応じて投与される。任意の事象において、本組成物は、患者を効果的に処置するのに十分な量の、本明細書中に開示される抗体（またはその機能性フラグメント）の少なくとも１つを提供するべきである。投薬量は、１回投与され得るが、治療結果が達成されるまでまたは副作用によって治療の中断を余儀なくされるまで定期的に適用され得る。１つの例において、ある用量の抗体は、１日おきに３０分間にわたって注入される。この例では、約１〜約１０回、投与され得る（例えば、３または６回、１日おきに投与され得る）。さらなる例において、持続注入が、約５〜約１０日間にわたって投与される。被験体は、所望の治療結果が達成されるまで、毎月などの一定間隔で処置され得る。一般に、その用量は、許容できない毒性を患者にもたらさずに疾患の症状または徴候を処置するかまたは回復させるのに十分な量である。
非経口用徐放製剤は、埋没物、油性注射または粒子状の系として生成され得る。タンパク質送達系の広範な概要については、Ｂａｎｇａ，Ａ．Ｊ．，Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ Ｐｅｐｔｉｄｅｓ ａｎｄ Ｐｒｏｔｅｉｎｓ：Ｆｏｒｍｕｌａｔｉｏｎ，Ｐｒｏｃｅｓｓｉｎｇ，ａｎｄ Ｄｅｌｉｖｅｒｙ Ｓｙｓｔｅｍｓ，Ｔｅｃｈｎｏｍｉｃ Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ Ｃｏｍｐａｎｙ，Ｉｎｃ．，Ｌａｎｃａｓｔｅｒ，ＰＡ，（１９９５）（本明細書中で参考として援用される）を参照のこと。粒子状の系としては、ミクロスフェア、微小粒子、マイクロカプセル、ナノカプセル、ナノスフェアおよびナノ粒子が挙げられる。マイクロカプセルは、中核として細胞毒または薬物などの治療用タンパク質を含む。ミクロスフェアでは、治療薬は、粒子全体に分散される。約１μｍより小さい粒子、ミクロスフェアおよびマイクロカプセルは、通常、それぞれナノ粒子、ナノスフェアおよびナノカプセルと呼ばれる。毛細管は、約５μｍの直径を有し、ナノ粒子だけが静脈内投与される。微小粒子は、代表的には、およそ１００μｍの直径であり、皮下または筋肉内に投与される。例えば、Ｋｒｅｕｔｅｒ，Ｊ．，Ｃｏｌｌｏｉｄａｌ Ｄｒｕｇ Ｄｅｌｉｖｅｒｙ Ｓｙｓｔｅｍｓ，Ｊ．Ｋｒｅｕｔｅｒ，ｅｄ．，Ｍａｒｃｅｌ Ｄｅｋｋｅｒ，Ｉｎｃ．，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ，ＮＹ，ｐｐ．２１９−３４２（１９９４）；およびＴｉｃｅ ＆ Ｔａｂｉｂｉ，Ｔｒｅａｔｉｓｅ ｏｎ Ｃｏｎｔｒｏｌｌｅｄ Ｄｒｕｇ Ｄｅｌｉｖｅｒｙ，Ａ．Ｋｙｄｏｎｉｅｕｓ，ｅｄ．，Ｍａｒｃｅｌ Ｄｅｋｋｅｒ，Ｉｎｃ．Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ，ＮＹ，ｐｐ．３１５−３３９，（１９９２）（この両方が、本明細書中で参考として援用される）を参照のこと。
ポリマーは、本明細書中に開示される抗体組成物のイオン徐放のために使用され得る。制御された薬物送達において使用するための様々な分解性および非分解性のポリマーマトリックスは、当該分野で公知である（Ｌａｎｇｅｒ，Ａｃｃｏｕｎｔｓ Ｃｈｅｍ．Ｒｅｓ．２６：５３７−５４２，１９９３）。例えば、ブロック共重合体であるｐｏｌａｘａｍｅｒ４０７は、低温では粘稠性であるが移動性の液体として存在するが、体温では半固体ゲルを形成する。ｐｏｌａｘａｍｅｒ４０７は、組換えインターロイキン−２およびウレアーゼの製剤化および持続送達にとって有効なビヒクルであると示されている（Ｊｏｈｎｓｔｏｎら、Ｐｈａｒｍ．Ｒｅｓ．９：４２５−４３４，１９９２；およびＰｅｃら、Ｊ．Ｐａｒｅｎｔ．Ｓｃｉ．Ｔｅｃｈ．４４（２）：５８−６５，１９９０）。あるいは、ヒドロキシアパタイトが、タンパク質の徐放用のマイクロキャリアとして使用されている（Ｉｊｎｔｅｍａら、Ｉｎｔ．Ｊ．Ｐｈａｒｍ．１１２：２１５−２２４，１９９４）。なおも別の態様において、リポソームは、徐放、ならびに脂質でカプセル化された薬物の薬物標的化のために使用される（Ｂｅｔａｇｅｒｉら、Ｌｉｐｏｓｏｍｅ Ｄｒｕｇ Ｄｅｌｉｖｅｒｙ Ｓｙｓｔｅｍｓ，Ｔｅｃｈｎｏｍｉｃ Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ Ｃｏ．，Ｉｎｃ．，Ｌａｎｃａｓｔｅｒ，ＰＡ（１９９３））。治療用タンパク質の制御送達のための多くのさらなる系が知られている（米国特許第５，０５５，３０３号；米国特許第５，１８８，８３７号；米国特許第４，２３５，８７１号；米国特許第４，５０１，７２８号；米国特許第４，８３７，０２８号；米国特許第４，９５７，７３５号；米国特許第５，０１９，３６９号；米国特許第５，０５５，３０３号；米国特許第５，５１４，６７０号；米国特許第５，４１３，７９７号；米国特許第５，２６８，１６４号；米国特許第５，００４，６９７号；米国特許第４，９０２，５０５号；米国特許第５，５０６，２０６号；米国特許第５，２７１，９６１号；米国特許第５，２５４，３４２号および米国特許第５，５３４，４９６号を参照のこと）。
エフェクター分子に共有結合的に連結された、ＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合する完全ヒトモノクローナル抗体またはその機能性フラグメントは、放射免疫療法または放射免疫ガイド下手術をはじめとした種々の目的のために使用され得る。例えば、ＨＭＷ−ＭＡＡ抗体は、放射性同位体に連結されて、免疫療法において使用されることにより、ＨＭＷ−ＭＡＡを発現する腫瘍を処置し得る。放射性同位体に共有結合的に連結されたヒトＨＭＷ−ＭＡＡ抗体は、放射免疫ガイド下手術において腫瘍の位置を特定するために有用であり、その結果、腫瘍が外科的に除去され得る。１つの実施形態において、約１０ｍＣｉの放射標識されたヒトＨＭＷ−ＭＡＡモノクローナル抗体が、被験体に投与される。他の実施形態において、約１５ｍＣｉ、約２０ｍＣｉ、約５０ｍＣｉ、約７５ｍＣｉまたは約１００ｍＣｉの放射標識されたヒトＨＭＷ−ＭＡＡモノクローナル抗体が、被験体に投与される。他の実施形態において、約１００ｍＣｉ〜約１００ｍＣｉの放射標識されたヒトＨＭＷ−ＭＡＡモノクローナル抗体が、被験体に投与される。
被験体内の腫瘍を検出する方法は、放射性同位体などのエフェクター分子に複合体化された、ＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合するヒト抗体またはその機能性フラグメントの投与を包含する。投与された放射標識抗体を腫瘍に局在化させるのに十分な長さの時間が経過した後、腫瘍が検出される。１つの具体的で非限定的な例において、放射標識された免疫結合体は、手持ち式のガンマ検出プローブを用いて検出される。いくつかの実施形態において、腫瘍は、ＭＲＩ、ＣＴスキャンまたはＰＥＴスキャンによって検出される。ＨＭＷ−ＭＡＡを発現している原発腫瘍、転移した腫瘍または細胞が、検出され得る。例えば、放射性同位体などのエフェクター分子に複合体化されたヒトＨＭＷ−ＭＡＡモノクローナル抗体が、被験体に投与された後、外科術または処置が行われる。１つの具体的な実施形態において、外科術の前に検出工程が行われることにより、腫瘍の位置が特定される。別の実施形態において、検出工程は、例えば、腫瘍の位置を検出するために外科術中に行われ、その後、放射免疫ガイド下手術などにおいて、その腫瘍が除去される。放射性同位体などのエフェクター分子に複合体化されたヒトＨＭＷ−ＭＡＡモノクローナル抗体は、外科術後または処置後にも被験体に投与され得、それにより、その処置の有効性が判定される（例えば、腫瘍が完全に除去されたことが保証されるか、または腫瘍の再発が検出される）。このように、本抗体は、治療用薬剤（例えば、腫瘍に対する免疫療法用）として、または放射免疫ガイド下手術を行うために有用である。
ＶＩ．診断方法およびキット
ＨＭＷ−ＭＡＡの発現をインビトロまたはインビボにおいて検出するための方法が本明細書中で提供される。１つの例において、ＨＭＷ−ＭＡＡの発現は、生物学的サンプル中において検出される。そのサンプルは、任意のサンプル（生検、剖検および病理検体の組織を含むがこれらに限定されない）であり得る。生物学的サンプルには、組織の切片、例えば、組織学的な目的のために採取された凍結切片も含まれる。生物学的サンプルには、さらに体液（例えば、血液、血清、血漿、痰、髄液または尿）が含まれる。
いくつかの実施形態において、悪性腫瘍（例えば、メラノーマ、前立腺癌、扁平上皮癌腫（例えば、頭頸部扁平上皮癌腫）、乳癌（基底細胞型乳癌腫、腺管癌腫および小葉性乳癌腫を含むがこれらに限定されない）、白血病（例えば、急性骨髄性白血病および１１ｑ２３陽性急性白血病）、神経堤腫瘍（例えば、星状細胞腫、神経膠腫または神経芽細胞腫）、卵巣癌、結腸癌、胃癌、膵癌、骨癌（例えば、脊索腫）、神経膠腫または肉腫（例えば、軟骨肉腫））を検出するための方法が提供される。ＨＭＷ−ＭＡＡ陽性癌を有する患者由来の血清サンプルは、検出可能な量のＨＭＷ−ＭＡＡを含む（Ｖｅｒｇｉｌｉｓら、Ｊ．Ｉｎｖｅｓｔ．Ｄｅｒｍａｔｏｌ．１２５：５２６−５３１，２００５；Ｕｌｍｅｒら、Ｃｌｉｎ．Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ．１０：５３１−５３７，２００４）。したがって、ＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合する抗体またはその機能性フラグメントは、被験体由来の血清サンプル中のＨＭＷ−ＭＡＡを検出するため、被験体内の癌を検出するため、または被験体内の癌の診断を確証するために使用され得る。
本開示は、生物学的サンプル中のＨＭＷ−ＭＡＡを検出するための方法を提供し、ここで、その方法は、免疫結合体の形成をもたらす条件下において生物学的サンプルを、ＨＭＷ−ＭＡＡに結合するヒト抗体またはその機能性フラグメントと接触させる工程、およびその免疫結合体を検出することにより、その生物学的サンプル中のＨＭＷ−ＭＡＡを検出する工程を包含する。１つの例において、そのサンプル中のＨＭＷ−ＭＡＡの検出は、その被験体が悪性腫瘍を有することを示唆する。別の例において、そのサンプル中のＨＭＷ−ＭＡＡの検出は、被験体内の癌の診断を確証する。さらなる例において、ＨＭＷ−ＭＡＡの検出は、転移の存在を確証するかまたは検出する。
いくつかの実施形態において、ＨＭＡＷ−ＭＡＡに特異的に結合する完全ヒトモノクローナル抗体またはその機能性フラグメントは、被験体内の腫瘍の診断の確証などの被験体内の腫瘍の検出または診断のために使用される。他の実施形態において、ＨＭＡＷ−ＭＡＡに特異的に結合する完全ヒトモノクローナル抗体またはその機能性フラグメントは、治療の有効性を検出するために使用される。例えば、ＨＭＷ−ＭＡＡを発現する既知の悪性腫瘍を有する被験体に、治療用薬剤が投与される。その方法は、免疫結合体の形成をもたらす条件下において生物学的サンプルを、ＨＭＷ−ＭＡＡに結合するヒト抗体またはその機能性フラグメントと接触させる工程、およびその免疫結合体を検出することにより、その生物学的サンプル中のＨＭＷ−ＭＡＡを検出する工程を包含し得る。処置前の被験体由来のサンプルなどのコントロールまたは対照基準と比べたときのＨＭＷ−ＭＡＡの量の減少は、その治療用薬剤が、悪性腫瘍の処置に効果的であることを示唆する。いくつかの例において、コントロールと比べたときのＨＭＷ−ＭＡＡの量の増加は、その治療用薬剤がその悪性腫瘍の処置に効果的でないことを示唆する。
いくつかの実施形態において、検出は、インビボにおけるものであり得る。ＨＭＡＷ−ＭＡＡに特異的に結合するヒトモノクローナル抗体またはその機能性フラグメントは、放射性同位体に複合体化され得る。投与された放射標識抗体を腫瘍に局在化させるのに十分な長さの時間が経過した後、その腫瘍は、ＭＲＩ、ＣＴスキャンまたはＰＥＴスキャンなどによって検出される。
１つの実施形態において、ＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合するヒト抗体またはその機能性フラグメントは、検出可能な標識で直接標識される。別の実施形態において、ＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合するヒト抗体またはその機能性フラグメント（１次抗体）は、標識されず、ＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合するヒト抗体に結合し得る２次抗体または他の分子が、標識される。当業者に周知であるように、特定の種およびクラスの１次抗体に特異的に結合することができる２次抗体が、選択される。例えば、１次抗体がヒトＩｇＧである場合、２次抗体は、抗ヒトＩｇＧであり得る。抗体に結合し得る他の分子としては、プロテインＡおよびプロテインＧ（この両方は商業的に入手可能である）が挙げられるがこれらに限定されない。
本抗体または２次抗体に適した標識は、上に記載されたものであり、それらとしては、様々な酵素、補欠分子族、蛍光材料、発光材料、磁性物質および放射性材料が挙げられる。適当な酵素の非限定的な例としては、西洋ワサビペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼ、ベータ−ガラクトシダーゼまたはアセチルコリンエステラーゼが挙げられる。適当な補欠分子族複合体の非限定的な例としては、ストレプトアビジン／ビオチンおよびアビジン／ビオチンが挙げられる。適当な蛍光材料の非限定的な例としては、ウンベリフェロン、フルオレセイン、フルオレセインイソチオシアネート、ローダミン、ジクロロトリアジニルアミンフルオレセイン、塩化ダンシルまたはフィコエリトリンが挙げられる。非限定的で例示的な発光材料は、ルミノールであり；非限定的で例示的な磁性物質は、ガドリニウムであり、非限定的で例示的な放射性標識としては、３５Ｓ、１１Ｃ、１３Ｎ、１５Ｏ、１８Ｆ、１９Ｆ、９９ｍＴｃ、１３１Ｉ、３Ｈ、１４Ｃ、１５Ｎ、９０Ｙ、９９Ｔｃ、１１１Ｉｎおよび１２５Ｉが挙げられる。
代替の実施形態において、ＨＭＷ−ＭＡＡは、検出可能な物質で標識されたＨＭＷ−ＭＡＡ標準物質およびＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合する標識されていないヒト抗体を利用する競合イムノアッセイによって、生物学的サンプル中でアッセイされ得る。このアッセイでは、生物学的サンプル、標識されたＨＭＷ−ＭＡＡ標準物質およびＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合するヒト抗体またはその機能性フラグメントが混合され、標識されていない抗体に結合した標識ＨＭＷ−ＭＡＡ標準物質の量が測定される。生物学的サンプル中のＨＭＷ−ＭＡＡの量は、ＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合する抗体またはその機能性フラグメントに結合した標識ＨＭＷ−ＭＡＡ標準物質の量に反比例する。
本明細書中に開示されるイムノアッセイおよび方法は、いくつかの目的のために使用され得る。１つの実施形態において、ＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合するヒト抗体またはその機能性フラグメントは、細胞培養における細胞内のＨＭＷ−ＭＡＡの産生を検出するために使用され得る。別の実施形態において、その抗体は、生物学的サンプル中のＨＭＷ−ＭＡＡの量を検出するために使用され得る。ＨＭＷ−ＭＡＡの高発現は、いくつかのタイプの癌（メラノーマ、乳癌、前立腺癌、神経膠腫および扁平上皮癌腫を含むがこれらに限定されない）と関連する。１つの実施形態において、血清サンプルまたは組織サンプルなどの生物学的サンプル中のＨＭＷ−ＭＡＡを検出するためのキットが提供される。例えば、被験体内の癌の診断を確証するために、生検を行うことにより、組織学的検査用の組織サンプルが得られ得る。あるいは、ＨＭＷ−ＭＡＡタンパク質の存在を検出するために、血清サンプルが得られ得る。ポリペプチドを検出するためのキットは、代表的には、本明細書中に開示される抗体のいずれかなどのＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合するヒト抗体を備え得る。いくつかの実施形態において、抗体フラグメント（例えば、ＦｖフラグメントもしくはｓｃＦｖまたはＦａｂ）が、そのキット内に含まれる。さらなる実施形態において、その抗体は、標識される（例えば、蛍光標識、放射性標識または酵素標識で）。
１つの実施形態において、キットは、ＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合する抗体を使用する手段を開示している指示材料を備える。その指示材料は、電子的形態で記載されたものであり得るか（例えば、コンピュータディスケットまたはコンパクトディスク）または視覚的なものであり得る（例えば、ビデオファイル）。そのキットは、そのキットが予定している特定の適用を容易にするさらなる構成要素も備え得る。したがって、例えば、そのキットは、さらに、標識を検出する手段（例えば、酵素標識用の酵素基質、蛍光標識を検出するフィルターセット、２次抗体などの適切な２次標識など）を備え得る。そのキットは、さらに、特定の方法の実施するために日常的に使用される緩衝液および他の試薬を備え得る。そのようなキットおよび適切な内容物は、当業者に周知である。
１つの実施形態において、診断キットは、イムノアッセイを含む。イムノアッセイの詳細は、使用される特定の形式によって異なり得るが、生物学的サンプル中のＨＭＷ−ＭＡＡを検出する方法は、一般に、免疫学的に反応性の条件下において、ＨＭＷ−ＭＡＡポリペプチドと特異的に反応する抗体または抗体フラグメントと生物学的サンプルとを接触させる工程を包含する。その抗体は、免疫学的に反応性の条件下において、免疫結合体を形成するように特異的に結合することが可能であり、その免疫結合体（結合した抗体）の存在は、直接または間接的に検出される。
細胞表面マーカーが存在することまたは存在しないことを判定する方法は、当該分野で周知である。例えば、本抗体は、他の化合物（酵素、磁気ビーズ、コロイド状磁気ビーズ、ハプテン、蛍光色素、金属化合物、放射性化合物または薬物を含むがこれらに限定されない）に結合体化され得る。本抗体は、イムノアッセイ（例えば、ラジオイムノアッセイ（ＲＩＡ）、酵素結合免疫吸着測定法（ＥＬＩＳＡ）または免疫組織化学的アッセイであるがこれらに限定されない）においても利用され得る。本抗体は、蛍光顕微鏡検査または蛍光励起細胞分取（ＦＡＣＳ）にも使用され得る。ＦＡＣＳは、他の高性能の検出レベルの中でも、複数のカラーチャネル、低角度光散乱検出チャネルおよび鈍角光散乱検出チャネルならびにインピーダンスチャネルを使用することにより、細胞を分離するかまたは選別する（米国特許第５，０６１，６２０号を参照のこと）。本明細書中に開示されるようなＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合するヒト抗体のいずれかは、これらのアッセイにおいて使用され得る。したがって、本抗体は、従来のイムノアッセイ（ＥＬＩＳＡ、ＲＩＡ、ＦＡＣＳ、組織免疫組織化学、ウエスタンブロットまたは免疫沈降を含むがこれらに限定されない）において使用され得る。
ＶＩＩ．ペプチド模倣物
ＨＭＷ−ＭＡＡのペプチド模倣物もまた本明細書中に提供される。そのペプチド模倣物は、ＨＭＷ−ＭＡＡに特異的なヒトモノクローナル抗体に特異的に結合する。そのペプチド模倣物は、ＨＭＷ−ＭＡＡ特異的ヒトモノクローナル抗体ｓｃＦｖＣ２１を用いたペプチドライブラリーのパニングによって同定された。ＨＭＷ−ＭＡＡペプチド模倣物は、例えば、メラノーマなどのＨＭＷ−ＭＡＡ陽性癌と診断された被験体においてＨＭＷ−ＭＡＡ特異的免疫応答を誘発するために使用され得る。
ＨＭＷ−ＭＡＡに特異的なヒトモノクローナル抗体に結合する単離されたペプチドが、本明細書中に提供され、ここで、そのペプチドは、コンセンサスモチーフＰＸＸＹＸＰＸＸＤ（配列番号９）を含む。ペプチド模倣物は、一般に、約１０〜約２０アミノ酸長（例えば、約１３〜約１７または約１５アミノ酸長）である。いくつかの実施形態において、そのペプチドは、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０アミノ酸長である。いくつかの例において、そのペプチドのアミノ酸配列は、配列番号７、配列番号１０、配列番号１３、または配列番号７、配列番号１０もしくは配列番号１３の改変体を含み、ここで、その改変体は、３つ以下、２つ以下または１つ以下のアミノ酸の置換を含む。特定の例において、そのペプチドのアミノ酸配列は、配列番号７、配列番号１０または配列番号１３からなる。
被験体においてＨＭＷ−ＭＡＡ特異的免疫を誘導する方法もまた提供され、その方法は、その被験体に、コンセンサスモチーフＰＸＸＹＸＰＸＸＤ（配列番号９）を含むペプチドを投与する工程を包含する。
以下の実施例は、ある特定の特徴および／または実施形態を例証するために提供される。これらの実施例は、本開示を、記載される特定の特徴または実施形態に限定すると解釈されるべきでない。
実施例１：材料および方法
細胞株、細胞溶解産物および組織
ヒトメラノーマ細胞株Ｃｏｌｏ３８、ＦＯ−１およびＭｅｌｕｒならびにヒトＢリンパ系細胞株ＬＧ２を、１０％血清＋栄養補助剤（ＢｉｏＷｈｉｔｔａｋｅｒ，Ｗａｌｋｅｒｓｖｉｌｌｅ，ＭＤ）および２ｍＭ Ｌ−グルタミン（ＢｉｏＷｈｉｔｔａｋｅｒ）が補充されたＲＰＭＩ１６４０培地（Ｔｉｓｓｕｅ Ｃｕｌｔｕｒｅ Ｍｅｄｉａ Ｆａｃｉｌｉｔｙ，Ｒｏｓｗｅｌｌ Ｐａｒｋ Ｃａｎｃｅｒ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ（ＲＰＣＩ），Ｂｕｆｆａｌｏ，ＮＹ）中で維持した。ヒトメラノーマ細胞株Ｍ１４およびＳＫ−ＭＥＬ−２８、ヒト線維芽細胞ＦＦ２３７６、ヒト乳癌腫細胞株Ｔ４７Ｄ、ヒト膀胱癌腫細胞株Ｔ２４、ヒト前立腺癌腫細胞株ＰＣ３、ヒトＢリンパ系細胞株ＪＹおよびＬＫＴ１３、ならびにラット神経細胞株Ｂ４９を、１０％ウシ胎児血清（ＦＢＳ）（ＢｉｏＷｈｉｔｔａｋｅｒ）および２ｍＭ Ｌ−グルタミンが補充されたＲＰＭＩ１６４０培地中で維持した。ｐｃＤＮＡ３．１ＴＭ（＋）のプラスミドＤＮＡ／完全長のＨＭＷ−ＭＡＡ ＤＮＡ構築物を用いてＭ１４細胞をトランスフェクションした後にＨＭＷ−ＭＡＡを発現するＭ１４／ＨＭＷ−ＭＡＡ細胞（Ｙａｎｇら、Ｊ Ｃｅｌｌ Ｂｉｏｌ １６５：８８１−８９１，２００４）を、１０％ＦＢＳ、２ｍＭ Ｌ−グルタミンおよび０．４ｍｇ／ｍｌ Ｇ４１８（Ｐｒｏｍｅｇａ，Ｍａｄｉｓｏｎ，ＷＩ）が補充されたＲＰＭＩ１６４０培地中で生育した。３７℃、５％ＣＯ２雰囲気中で細胞を培養した。報告されているように（Ｄｅｓａｉら、Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ ５８：２４１７−２４２５，１９９８（本明細書中で参考として援用される））、細胞溶解産物を調製した。メラノサイト起源の病変は、Ｋｕｍａｍｏｔｏ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｓｃｈｏｏｌ ｏｆ Ｍｅｄｉｃｉｎｅ（Ｋｕｍａｍｏｔｏ，Ｊａｐａｎ）のＤｅｐａｒｔｍｅｎｔ ｏｆ Ｄｅｒｍａｔｏｌｏｇｙにおいて外科術を受けた患者から得た。メラノーマ病変の診断は、組織病理学的特徴に基づいた。以前に報告されているように（Ｄｅｓａｉら、Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ ５８：２４１７−２４２５，１９９８（本明細書中で参考として援用される））、凍結組織切片およびホルマリン固定組織切片を調製した。
動物
８週齢の雌ＢＡＬＢ／ｃマウスをＲＰＣＩの動物コア施設から入手した。
モノクローナル抗体およびポリクローナル抗体、ｓｃＦｖ抗体ならびに試薬
ＨＭＷ−ＭＡＡ特異的マウスｍＡｂ１４９．５３、２２５．２８、７６３．７４、ＴＰ６１．５ならびにＶＦ１−ＴＰ３４およびＶＦ１−ＴＰ４１．２を、他で報告されているように（Ｗｉｌｓｏｎら、Ｉｎｔ Ｊ Ｃａｎｃｅｒ，２８：２９３−３００，１９８１；Ｇｉａｃｏｍｉｎｉら、Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ ４３：３５８６−３５９０，１９８３；Ｃｈｅｎら、Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ ５１：４７９０−４７９７，１９９１；Ｔｅｍｐｏｎｉら、Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ ５２：２４９７−２５０３，１９９２）作製し、特徴づけた。この６種のｍＡｂは、ＨＭＷ−ＭＡＡ＋メラノーマ細胞への結合において互いを相互阻害（ｃｒｏｓｓ−ｉｎｈｉｂｉｔ）しないので、相互阻止（Ｃｒｏｓｓ−ｂｌｏｃｋｉｎｇ）実験から、これらが別々かつ空間的に遠い抗原決定基を認識すると示された（Ｃａｍｐｏｌｉら、Ｃｒｉｔ Ｒｅｖ Ｉｍｍｕｎｏｌ ２４：２６７−２９６，２００４）。１００ＫＤ特異的マウスｍＡｂ３７６．９６（Ｉｍａｉら、Ｊ Ｎａｔｌ Ｃａｎｃｅｒ Ｉｎｓｔ ６８：７６１−７６９，１９８２）、ＨＬＡクラスＩ抗原特異的マウスｍＡｂ ＴＰ２５．９９（Ｄｅｓａｉら、Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ １６５：３２７５−３２８３，２０００）、ｃ−ｍｙｃ腫瘍性タンパク質特異的マウスｍＡｂ ９Ｅ１０（Ｅｖａｎら、Ｍｏｌ Ｃｅｌｌ Ｂｉｏｌ ５：３６１０−３６１６，１９８５）およびマウス抗ｉｄ ｍＡｂ ＭＫ２−２３（Ｋｕｓａｍａら、Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ １４３：３８４４−３８５２，１９８９）が、以前に報告されている。ＨＭＷ−ＭＡＡ特異的ヒトｓｃＦｖ＃２８（Ｎｏｒｏｎｈａら、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ １６１：２９６８−２９７６，１９９８）、＃６１（Ｄｅｓａｉら、Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ ５８：２４１７−２４２５，１９９８）および＃７０（Ｎｏｒｏｎｈａら、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ １６１：２９６８−２９７６，１９９８）ならびに抗−抗ｉｄ ｓｃＦｖ＃１１９（Ｗａｎｇら、Ｉｄｉｏｔｙｐｅｓ ｉｎ Ｍｅｄｉｃｉｎｅ：Ａｕｔｏｉｍｍｕｎｉｔｙ，Ｉｎｆｅｃｔｉｏｎ ａｎｄ Ｃａｎｃｅｒ ｐ．５２３，１９９７）を、それぞれメラノーマ細胞Ｓ５、精製ＨＭＷ−ＭＡＡ、メラノーマ細胞ＳＫ−ＭＥＬ−２８および抗ｉｄ ｍＡｂ ＭＫ２−２３を用いたパニングによって、合成ｓｃＦｖライブラリー（＃１）（Ｎｉｓｓｉｍら、Ｅｍｂｏ Ｊ １３：６９２−６９８，１９９４）から単離した。ＭＡＡ特異的ヒトｓｃＦｖ Ｆ９８およびＷ３４は、それぞれメラノーマ細胞ＦＯ−１およびＷＭ１１５８を用いたパニングによって半合成ｓｃＦｖライブラリー（ｄｅ Ｋｒｕｉｆら、Ｊ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ ２４８：９７−１０５，１９９５）から単離した。
マウスｍＡｂは、連続的な硫安塩析およびカプリル酸沈殿によって腹水から精製した（Ｔｅｍｐｏｎｉら、Ｈｙｂｒｉｄｏｍａ ８：８５−９５，１９８９）。ｍＡｂ調製物の純度および活性を、それぞれＳＤＳ−ＰＡＧＥ、および結合アッセイにおける対応抗原を用いた試験によって評価した。モノクローナル抗体および精製ｓｃＦｖ抗体を、ＮＨＳ−ＬＣ−ビオチン（Ｐｉｅｒｃｅ，Ｒｏｃｋｆｏｒｄ，ＩＬ）を製造者の指示書に従って使用してビオチン化した。ｍＡｂ ９Ｅ１０を、製造者の指示書に従ってＨｉＴｒａｐ ＮＨＳ活性化セファロースカラム（Ａｍｅｒｓｈａｍ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ，Ｐｉｓｃａｔａｗａｙ，ＮＪ）上に固定化した。
ストレプトアビジン−西洋ワサビペルオキシダーゼ結合体（ＳＡ−ＨＲＰ）は、Ｐｉｅｒｃｅから購入した。ＨＲＰ−抗マウスＩｇＧ Ｆｃ抗体は、Ｊａｃｋｓｏｎ ＩｍｍｕｎｏＲｅｓｅａｒｃｈ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ，Ｉｎｃ．，Ｗｅｓｔ Ｇｒｏｖｅ，ＰＡから購入した。ヤギ抗マウスＩｇ抗体のＲ−フィコエリトリン（ＲＰＥ）標識Ｆ（ａｂ’）２フラグメントは、ＢＤ Ｐｈａｒｍｉｎｇｅｎ，Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ，ＣＡから購入した。
ファージディスプレイライブラリー
意図されたＣＤＲ３を含む大きな半合成ファージディスプレイｓｃＦｖ抗体ライブラリーを、報告されているように（ｄｅ Ｋｒｕｉｆら、Ｊ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ ２４８：９７−１０５，１９９５）構築した。１５アミノ酸のランダムな線状ペプチドをディスプレイするファージディスプレイペプチドライブラリーＸ１５、および１２アミノ酸のランダムなジスルフィド拘束ペプチドをディスプレイするＬＸ−８（ＸＣＸ８ＣＸ）を、報告されているように（Ｂｏｎｎｙｃａｓｔｌｅら、Ｊ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ ２５８：７４７−７６２，１９９６）構築した。
合成ペプチド
ペプチドは、ＲＰＣＩ Ｂｉｏｐｏｌｙｍｅｒ Ｃｏｒｅ Ｆａｃｉｌｉｔｙ（Ｂｕｆｆａｌｏ，ＮＹ）から購入した。システイン残基を含むペプチドＰ１Ｃ２１を、６ｍＭフェリシアン化カリウムを用いて環化し、逆相ＨＰＬＣで精製した。その組成物およびジスルフィド結合形成を質量分析によって確認した。ペプチドの純度は、ＨＰＬＣによって評価したとき、９５％超だった。ペプチドを水で５ｍＭの濃度に再構成し、分注し、−２０℃で保存した。水に不溶性であるペプチドＰ１Ｃ２１をジメチルスルホキシド（ＤＭＳＯ）で５ｍＭの濃度に再構成した。ペプチドを、報告されているように（Ｇｒａｎｔ，Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ ｐ．９．２．８，２００２）カップリング剤のマレイミドベンゾイル−Ｎ−ヒドロキシスクシンイミド（ＭＢＳ）（Ｐｉｅｒｃｅ）を用いてキーホールリンペットヘモシアニン（ＫＬＨ）（Ｐｉｅｒｃｅ）に結合体化した。
ファージディスプレイｓｃＦｖ抗体の選択
メラノーマ細胞に結合しているファージディスプレイｓｃＦｖ抗体を、報告されているように（Ｎｏｒｏｎｈａら、Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ １６１：２９６８−２９７６，１９９８（本明細書中で参考として援用される））パニング法を利用してファージディスプレイｓｃＦｖ抗体ライブラリーから単離した。
可溶性ｓｃＦｖ抗体の調製および精製
可溶性ｓｃＦｖ抗体は、報告されているように（Ｓｃｈｉｅｒら、Ｊ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ ２５５：２８−４３，１９９６（本明細書中で参考として援用される））イソプロピル−β−Ｄ−チオガラクトピラノシド（ＩＰＴＧ）（Ｒｏｃｈｅ Ａｐｐｌｉｅｄ Ｓｃｉｅｎｃｅ，Ｉｎｄｉａｎａｐｏｌｉｓ，ＩＮ）による誘導によって、個別のアンピシリン耐性大腸菌ＴＧ１感染コロニーから産生された。可溶性ｓｃＦｖ抗体を、個別の細菌コロニーの培養物の培養上清（ＳＮＴ）または細胞周辺腔（細胞周辺調製物，ＰＰ）から回収した。ＲＰＡＳ精製モジュール（Ａｍｅｒｓｈａｍ）について報告された方法に従って、ｓｃＦｖ抗体を、不溶化されたｍＡｂ ９Ｅ１０におけるアフィニティークロマトグラフィによってＳＮＴまたはＰＰから精製した。精製されたｓｃＦｖ抗体を、Ｃｅｎｔｒｉｃｏｎ１０（Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ，Ｂｅｄｆｏｒｄ，ＭＡ）を製造者の指示書に従って使用して、濃縮した。ｓｃＦｖ抗体調製物の純度および活性を、それぞれｐｈａｓｔＳｙｓｔｅｍＴＭ（Ａｍｅｒｓｈａｍ）を利用するＳＤＳ−ＰＡＧＥ、および酵素結合免疫吸着測定法（ＥＬＩＳＡ）を利用する対応抗原を用いた試験によって評価した。
結合アッセイ
合成ペプチドおよびメラノーマ細胞に対する可溶性ｓｃＦｖ抗体の反応性、ならびにメラノーマ細胞およびペプチドに対するマウス免疫血清の反応性を試験するＥＬＩＳＡを、報告されているように（Ｄｅｓａｉら、Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ ５８：２４１７−２４２５，１９９８；Ｄｅｓａｉら、Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ １６５：３２７５−３２８３，２０００；Ｍａｔｓｕｉら、Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ １３９：２０８８−２０９５，１９８７）行った。結果は、４５０ｎｍにおける光学濃度（Ｏ．Ｄ．）の吸光度として表される。ｓｃＦｖ Ｃ２１によって認識される抗原決定基をマッピングする競合アッセイは、ビオチン化ｓｃＦｖ Ｃ２１（０．２５μｇ／ウェル）をマウスｍＡｂもしくはｓｃＦｖＰＰの２倍希釈物と混合することによって、またはビオチン化ｍＡｂ（４５０ｎｍにおいて１．０と測定される吸光度をもたらす最適な量のもの）をｓｃＦｖＰＰの２倍希釈物と混合することによって、行われた。その混合物（１００μｌ／ウェル）を、９６ウェル組織培養プレート（Ｆａｌｃｏｎ ３０７２，Ｂｅｃｔｏｎ Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ，Ｆｒａｎｋｌｉｎ Ｌａｋｅｓ，ＮＪ）内においてＨＭＷ−ＭＡＡ＋細胞（２×１０５／５０μｌのＲＰＭＩ１６４０培地）とともに４℃で１時間インキュベートした。標的細胞へのビオチン化ｓｃＦｖ抗体およびビオチン化ｍＡｂの結合を、報告されているように（Ｎｏｒｏｎｈａら、Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ １６１：２９６８−２９７６，１９９８）ＳＡ−ＨＲＰおよび基質との連続的なインキュベートによって測定した。結果は、ＨＭＷ−ＭＡＡ＋細胞へのｓｃＦｖまたはｍＡｂの結合の、ｍＡｂ、ｓｃＦｖまたはペプチド（競合物質またはインヒビター）によるパーセント阻害として表される。パーセント阻害は、式：％阻害＝（（インヒビターの非存在下におけるＯＤ４５０−インヒビターの存在下におけるＯＤ４５０）／インヒビターの非存在下におけるＯＤ４５０）×１００を用いて計算した。
凍結組織切片およびホルマリン固定組織切片の間接的な免疫ペルオキシダーゼ染色を、以前に報告されているように（Ｄｅｓａｉら、Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ ５８：２４１７−２４２５，１９９８（本明細書中で参考として援用される））行った。
間接的な免疫沈降およびＳＤＳ−ＰＡＧＥ
ツニカマイシン（Ｓｉｇｍａ Ｃｈｅｍｉｃａｌ Ｃｏ．）の存在下における１２５ヨウ素（Ｎａ１２５Ｉ；Ａｍｅｒｓｈａｍ）または３５Ｓメチオニン（トランス−３５Ｓ−標識，ＩＣＮ Ｂｉｏｃｈｅｍｉｃａｌｓ，Ｃｏｓｔａ Ｍｅｓａ，ＣＡ）による細胞の標識を、報告されているように（Ｎｏｒｏｎｈａら、Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ １６１：２９６８−２９７６，１９９８；Ｄｅｓａｉら、Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ １６５：３２７５−３２８３，２０００）行った。標識された細胞の可溶化、免疫沈降、ＳＤＳ−ＰＡＧＥ、オートラジオグラフィおよびフルオログラフィを、ウサギ抗マウスＩｇＧ抗体でコーティングされたプロテインＡの代わりにＧａｍｍｏｎ Ｂｉｎｄ＋セファロース（Ａｍｅｒｓｈａｍ）を使用したことを除いて、報告されているように（Ｄｅｓａｉら、Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ ５８：２４１７−２４２５，１９９８）行った。
ビオチン化ｓｃＦｖ Ｃ２１を用いたペプチドライブラリーのパニング
ビオチン化ｓｃＦｖ Ｃ２１を用いたｐＶＩＩＩライブラリーＸ１５およびＬＸ−８のマイクロパニングを、本質的には報告されているように（Ｄｅｓａｉら、Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ １６５：３２７５−３２８３，２０００（本明細書中で参考として援用される））９６ウェルマイクロタイタープレート（Ｆａｌｃｏｎ ３０７６，Ｂｅｃｔｏｎ Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ）において行った。パニングの１回目は、ＴＢＳ５０中の１×１０１２ファージ粒子および１μｇ／ウェルの濃度のビオチン化ｓｃＦｖ Ｃ２１を用いて行った。その後の３回のパニングは、１×１０１０ファージ粒子のファージ投入および０．１μｇ／ウェルのビオチン化ｓｃＦｖ Ｃ２１を利用して行った。
ファージディスプレイペプチドライブラリーの免疫学的スクリーニング
ｓｃＦｖ Ｃ２１を用いた４回目のパニングの後のＸ１５およびＬＸ−８ライブラリーからのランダムファージクローンを、コロニーを含むプレートからのニトロセルロースフィルターリフトをプローブするために１０μｇ／ｍｌのｓｃＦｖ抗体および５μｇ／ｍｌのビオチン化ｍＡｂ ９Ｅ１０を使用することを除いて、報告されているように（Ｄｅｓａｉら、Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ １６５：３２７５−３２８３，２０００（本明細書中で参考として援用される））免疫学的スクリーニングによって解析した。
ファージディスプレイペプチドの配列解析
ファージクローンのペプチドインサートの配列を、報告されているように（Ｄｅｓａｉら、Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ １６５：３２７５−３２８３，２０００）ジデオキシヌクレオチドチェーンターミネーション法によって決定した。
マウスの免疫化
０日目はプライミングために等体積のフロイント完全アジュバント、ならびに２１、４２、６３、８４および１０５日目はブーストのために等体積のフロイント不完全アジュバントと混合されたＰ１Ｃ２１ペプチド−ＫＬＨ結合体（５０μｇ／注射）を用いて、ＢＡＬＢ／ｃマウス（各群８匹）の皮下に（ｓ．ｃ．）免疫した。プロテアソームサブユニットＭＢ１の配列に由来する関連性のないペプチドＭＢ１１９４−２０８で免疫されたマウスをコントロールとして用いた。１３２日目に、マウスを照射（２０Ｋ Ｒａｄｓ）細胞（５×１０５細胞／マウス）のｓ．ｃ．注射によってブーストした。最初の免疫化の１週間前および各免疫化の１週間後にマウスから採血した。
フローサイトメトリー解析
ｓｃＦｖ抗体または免疫血清中の抗体で染色されたメラノーマ細胞のフローサイトメトリー解析を、報告されているように（Ｗａｎｇら、Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ Ｍｅｔｈｏｄｓ ２９４：２３−３５，２００４（本明細書中で参考として援用される））行った。簡潔には、細胞（５×１０５）を、１２．５μｌのｓｃＦｖＰＰまたは０．５μｇのｍＡｂ ９Ｅ１０（両方とも、総体積１００μｌの２％ＢＳＡ−ＰＢＳ中に希釈されたもの）または１００μｌの免疫マウス血清とともに４℃で１時間インキュベートした。次いで、細胞を０．５％ＢＳＡ−ＰＢＳで２回洗浄し、最適量のヤギ抗マウスＩｇ抗体のＲＰＥ標識Ｆ（ａｂ’）２フラグメントとともに４℃において３０分間インキュベートした。２回洗浄した後、細胞を２％ホルムアルデヒド中で固定し、ＦＡＣＳｃａｎＴＭフローサイトメーター（ＢＤ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ，Ｓａｎ Ｊｏｓｅ，ＣＡ）を用いて解析した。各サンプルについての凝集物および残骸を排除するために前方散乱ゲートおよび側方散乱ゲートを用いて合計１０，０００細胞を数えた。結果は、相対的蛍光強度として表される。
遅延型過敏症（ＤＴＨ）反応
ペプチドＰ１Ｃ２１またはコントロールペプチドで６回免疫されたマウスの右および左の後足蹠に、それぞれ、照射されたＨＭＷ−ＭＡＡ＋細胞Ｃｏｌｏ３８（５×１０５細胞／注射／）およびＨＭＷ−ＭＡＡ−細胞ＬＧ２（５×１０５細胞／注射／）を１３２日目にｓ．ｃ．注射した。各足蹠の厚さを、以前に報告されているように（Ｌｕｏら、Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ １７４：７１０４−７１１０，２００５（本明細書中で参考として援用される））記載の時間において測定し、計算した。
統計解析
試験群において得られた結果間の差の統計的有意性を、スチューデントのｔ検定を用いて解析した。
ｓｃＦｖ Ｃ２１−ペプチド複合体の分子モデル
ｓｃＦｖ Ｃ２１の分子モデルを、ＡｂＭ（Ａｃｃｅｌｒｙｓ，Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ，ＣＡ）を用いて構築した。タンパク質データベース（Ｂｅｒｎｓｔｅｉｎら、Ｊ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ １１２：５３５−５４２，１９７７）からのインフルエンザウイルスノイラミニダーゼ（１ＮＭＣ）特異的ｓｃＦｖ抗体（Ｔｕｌｉｐら、Ｊ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ ２２７：１４９−１５９，１９９２）およびリゾチーム特異的ｓｃＦｖ抗体（Ａｙら、Ｊ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ ３０１：２３９−２４６，２０００）の結晶構造を用いてＶＬ−ＶＨ二量体を作製した。ＣＤＲを定義する分類およびナンバリングスキームは、Ｋａｂａｔら（Ｋａｂａｔら、Ｉｎ Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ Ｐｒｏｔｅｉｎｓ ｏｆ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ Ｉｎｔｅｒｅｓｔ ５：９１，１９９１）に従った。ＣＤＲループのＬ１、Ｈ１、Ｌ２およびＨ２は、標準的な正規立体配座（ｃａｎｏｎｉｃａｌ ｃｏｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ）をとる。Ｈ３およびＬ３は、タンパク質データベース（ＩＮＳＩＧＨＴＩＩ，Ａｃｃｅｌｒｙｓ）とＣＯＮＧＥＮ（Ｂｒｕｃｃｏｌｅｒｉら、Ｎａｔｕｒｅ ３３５：５６４−５６８，１９８８）のループ検索の両方を用いて構築された。ペプチドＰ１Ｃ２１およびＰ３Ｃ２１の出発立体配座は、ＩＮＳＩＧＨＴＩＩに構築されたループ検索方法を用いて決定された。ペプチドＰ１Ｃ２１およびＰ３Ｃ２１とｓｃＦｖ Ｃ２１との推定上の結合相互作用は、ソフトウェアＡＵＴＯＤＯＣＫ（Ｍｏｒｒｉｓら、Ｊ Ｃｏｍｐｕｔ Ａｉｄｅｄ Ｍｏｌ Ｄｅｓ １０：２９３−３０４，１９９６）とＩＮＳＩＧＨＴＩＩとＤＯＣＫ（ＤｅｓＪａｒｌａｉｓら、Ｊ Ｍｅｄ Ｃｈｅｍ ２９：２１４９−２１５３，１９８６）との組み合わせを用いて決定された。
動態結合（Ｋｉｎｅｔｉｃ ｂｉｎｄｉｎｇ）研究
結合実験を、表面プラズモン共鳴ベースのバイオセンサー装置ＢＩＡＣＯＲＥＴＭ３０００（Ｂｉａｃｏｒｅ ＡＢ，Ｕｐｐｓａｌａ，Ｓｗｅｄｅｎ）を２５℃において用いて行った。センサー表面におけるｓｃＦｖ Ｃ２１の固定化を、製造者の指示書に従い、標準的なアミンカップリング手順に従って行った。簡潔には、０．２Ｍ Ｎ−エチル−Ｎ’−（ジメチルアミノプロピル）カルボジイミド（ＥＤＣ）および０．０５Ｍ Ｎ−ヒドロキシスクシンイミド（ＮＨＳ）を含む３５μｌの溶液を、５μｌ／分の流速で注入することにより、センサーチップ表面上のカルボキシル基を活性化させた。ｓｃＦｖ Ｃ２１（４０ｎｇ／ｍｌの１０ｍＭ ＮａＯＡｃ緩衝液，ｐＨ５．０）を、所望の結合タンパク質レベルに達するまで、２０μｌ／分の流速でそのチップ表面の上に流した。未反応のｓｃＦｖ Ｃ２１を洗い流し、３５μｌの１Ｍエタノールアミンを５μｌ／分で注入することによって、未反応の活性化された基をブロッキングした。ｓｃＦｖ Ｃ２１の最終的な固定化応答は、３，０００ＲＵだった。参照表面を、同じ条件下であるがｓｃＦｖ Ｃ２１注入を行わずに同時に作製し、装置および緩衝液アーチファクトについて補正するためのブランクとして使用した。ペプチドを、２０〜１００μｌ／分の様々な流速において可変濃度で注射した。チップ上に固定化されたｓｃＦｖ Ｃ２１へのペプチドの結合をリアルタイムでモニターした。ＳＰＲから得られる結合定数がアナライトの再結合または大量注入（ｍａｓｓ ｔｒａｎｓｐｏｒｔ）効果に影響されないことを排除するために、様々な流速（２０〜１００μｌ／分）で研究を反復した。両方の流速において得られた速度定数は、変化しないままだった。
実施例２：ｓｃＦｖ Ｃ２１の単離および特徴づけ
ＨＭＷ−ＭＡＡ＋細胞Ｃｏｌｏ３８を用いた半合成ファージディスプレイｓｃＦｖ抗体ライブラリーのパニングによるｓｃＦｖ抗体の単離
Ｃｏｌｏ３８細胞を用いたパニングによって半合成ファージディスプレイｓｃＦｖ抗体ライブラリーから単離された４０種の可溶性ｓｃＦｖ抗体の、ＨＭＷ−ＭＡＡ＋細胞Ｃｏｌｏ３８およびＨＭＷ−ＭＡＡ−Ｂリンパ系細胞ＬＧ２を用いたＥＬＩＳＡにおけるスクリーニングによって、Ｃｏｌｏ３８細胞との選択的な反応性を有する２３個のクローンが同定された。その２３個のクローンを、Ｃｏｌｏ３８、ＦＦ２３７６線維芽細胞およびＴ２４膀胱癌腫細胞を用いて追加試験することにより、クローンＣ３、Ｃ２１、Ｃ２９およびＣ３０が単離された（これらのすべてが、Ｃｏｌｏ３８細胞との選択的な反応性を示した）。ｓｃＦｖ Ｃ２１が最大の反応性を示したので、さらなる解析のためにｓｃＦｖ Ｃ２１を選択した。その他のクローンは、失ったので、特徴づけられなかった。
ｓｃＦｖ Ｃ２１の特異性の解析
異なるＨＭＷ−ＭＡＡ発現を有するヒト細胞株のパネルおよびＨＭＷ−ＭＡＡホモログを発現するラット神経細胞株Ｂ４９を用いたＥＬＩＳＡにおいて試験したとき、ｓｃＦｖ Ｃ２１は、メラノーマ細胞株Ｃｏｌｏ３８、ＦＯ−１、ＭｅｌｕｒおよびＳＫ−ＭＥＬ−２８だけと反応した。それらのすべてが、ＨＭＷ−ＭＡＡを発現することから、ｓｃＦｖ Ｃ２１が、ＨＭＷ−ＭＡＡに特異的であることが示唆される（図１）。この可能性は、３つの系統の証拠によって立証された。第１に、フローサイトメトリー解析は、ｓｃＦｖ Ｃ２１が、完全長ＨＭＷ−ＭＡＡをコードするプラスミドＤＮＡによる安定なトランスフェクションの後にＨＭＷ−ＭＡＡを発現するＭ１４細胞を染色したが、ＨＭＷ−ＭＡＡを発現しない親のＭ１４細胞を染色しなかったことを示した（図２）。第２に、ｓｃＦｖ Ｃ２１は、１２５Ｉで標識されたＣｏｌｏ３８細胞のＨＭＷ−ＭＡＡ構成要素の特徴的な電気泳動（ｅｌｅｃｒｏｐｈｏｒｅｔｉｃ）プロファイルを有する２つの構成要素を免疫沈降させた。最後に、連続的な免疫沈降実験において、ｓｃＦｖ Ｃ２１は、ＨＭＷ−ＭＡＡ特異的マウスｍＡｂ７６３．７４を用いて免疫除去されていたＣｏｌｏ３８細胞溶解産物からのいかなる構成要素も免疫沈降させなかった。ｓｃＦｖ Ｃ２１が、１００ＫＤ ＭＡＡ特異的ｍＡｂ３７６．９６で免疫除去されたＣｏｌｏ３８細胞溶解産物のＨＭＷ−ＭＡＡ構成要素を免疫沈降させたので、この免疫除去は、特異的である（図３）。逆に、ｓｃＦｖ Ｃ２１によるＣｏｌｏ３８細胞溶解産物の免疫除去は、ほとんどを除去したが、すべての構成要素がｍＡｂ７６３．７４によって免疫沈降されたわけではない。これらの結果は、ｍＡｂ７６３．７４によって認識されるほとんどであるがすべてではないＨＭＷ−ＭＡＡ分子上のｓｃＦｖ Ｃ２１によって認識される決定基の発現および／またはｍＡｂ７６３．７４の会合定数よりも小さいｓｃＦｖ Ｃ２１の会合定数を反映している。
ｓｃＦｖ Ｃ２１によって定義される抗原決定基の特徴づけ
Ｎ−グリコシル化インヒビターのツニカマイシンの存在下において、３５Ｓ−メチオニンで固有に標識されたＣｏｌｏ３８細胞から免疫沈降されたＨＭＷ−ＭＡＡ構成要素の強度が著しく低下するので、炭水化物が、ｓｃＦｖ Ｃ２１によって定義される決定基の発現において役割を果たすと見られる。Ｎ−グリコシル化の阻害は、ｍＡｂ７６３．７４と反応する２２０ｋＤ前駆体の蓄積によって示唆される（図４）。競合実験では、ｓｃＦｖ Ｃ２１によって定義される決定基と、マウスｍＡｂのパネルによって定義される６つの決定基ならびにヒトｓｃＦｖ＃２８、＃６１および＃７０によって定義される決定基との空間的な関係を調べた。ｓｃＦｖ Ｃ２１およびｍＡｂ ＶＦ１−ＴＰ３４は、メラノーマ細胞ＳＫ−ＭＥＬ−２８への結合において互いを部分的に阻害した。この阻害は、用量依存的である（図５）。対照的に、マウスｍＡｂ１４９．５３、２２５．２８、７６３．７４、ＴＰ６１．５およびＶＦ１−ＴＰ４１．２ならびにｓｃＦｖ＃２８、＃６１および＃７０は、ＳＫ−ＭＥＬ−２８細胞へのｓｃＦｖ Ｃ２１の結合を阻害しなかった。これらの結果から、ｓｃＦｖＣ２１によって定義される決定基は、ｍＡｂ ＶＦ１−ＴＰ３４によって定義される決定基と異なるものであって、それと空間的に近位であり、残りのマウスｍＡｂならびにヒトｓｃＦｖ＃２８、＃６１および＃７０によって定義される決定基と異なるものであって、それらと空間的に遠位であることが示唆される。
ｓｃＦｖＣ２１によるメラノサイト病変の免疫組織化学的染色
ｓｃＦｖＣ２１は、免疫ペルオキシダーゼ反応において、凍結されたメラノサイト病変を染色したが、ホルマリン固定されたパラフィン包埋メラノサイト病変を染色しなかった。この染色は、膜と細胞質の両方におけるものだった（図６）。ｓｃＦｖＣ２１およびＨＭＷ−ＭＡＡ特異的マウスｍＡｂ７６３．７４による良性および悪性のメラノサイト病変の染色パターンの比較から、両方の抗体が、膜および細胞質のパターンで４つの色素性母斑を均一に染色することが示された。さらに、ｍＡｂ７６３．７４は、１５個中１４個の主要な病変を均一なパターンで染色し、ｓｃＦｖＣ２１は、９個を均一なパターンで染色し、２個を不均一なパターンで染色した。この染色は、１つの病変において膜におけるものであり、４つでは膜および細胞質におけるものであり、６つでは細胞質におけるものだった。最後に、ｍＡｂ７６３．７４は、６つの転移性病変を均一なパターンで染色し、ｓｃＦｖＣ２１は、３つを均一なパターンで、３つを不均一なパターンで染色した。この染色は、３つの病変において膜および細胞質におけるものであり、残りの３つでは細胞質におけるものだった。
実施例３：ｓｃＦｖＣ２１のヌクレオチド配列およびアミノ酸配列
ｓｃＦｖＣ２１のヌクレオチド配列およびアミノ酸配列を標準的な方法に従って決定した。ＶＨ、ＶＬおよびリンカーのヌクレオチド配列およびアミノ酸配列を以下に提供する。免疫グロブリン重鎖のヒンジ、ＣＨ２およびＣＨ３ドメインのヌクレオチド配列も提供する。
ＶＨ（配列番号５）とＶＬ（配列番号６）の両方について、フレームワーク領域（ＦＲ）およびＣＤＲの位置は、以下のとおりである：
ＦＲ１−アミノ酸１〜２６
ＣＤＲ１−アミノ酸２７〜３８
ＦＲ２−アミノ酸３９〜５５
ＣＤＲ２−アミノ酸５６〜６５
ＦＲ３−アミノ酸６６〜１０４
ＣＤＲ３−アミノ酸１０５〜１１５（ＶＨ）または１０５〜１１０（ＶＬ）
実施例４：ｓｃＦｖペプチド模倣物の同定および特徴づけ
ファージディスプレイペプチドライブラリーＬＸ−８およびＸ１５から単離されたｓｃＦｖＣ２１に結合するペプチドの配列
免疫学的スクリーニングから、ｓｃＦｖＣ２１が、ファージディスプレイペプチドＸ１５ライブラリーからのパニングによって単離されたクローンの２０％と強く反応するが、ＬＸ−８ライブラリーから単離されたクローンのいずれとも反応しないことが明らかになった。免疫スクリーニングから得られた陽性クローンのファージ上清は、ＥＬＩＳＡにおいてもｓｃＦｖＣ２１と反応した。これらのクローンが、無関係なＭＡＡを認識するｓｃＦｖ Ｆ９８およびＷ３４と反応しなかったので、この反応性は、特異的である。ｓｃＦｖＣ２１と反応するクローンのうちの１６のヌクレオチド配列解析から、解析された１６クローンの８８、６および６％においてそれぞれ配列ＳＰＳＷＹＣＰＤＣＤＫＲＰＬＶ（Ｐ１Ｃ２１）（配列番号７）、ＥＡＲＮＷＨＤＦＰＩＨＰＲＴＬ（Ｐ２Ｃ２１）（配列番号８）およびＲＰＹＲＹＤＰＬＧＤＬＫＳＲＨ（Ｐ３Ｃ２１）（配列番号１０）が同定された。ペプチドＰ１Ｃ２１およびＰ３Ｃ２１の配列は、コンセンサス
を共有するが、ペプチドＰ２Ｃ２１の配列は、完全に異なるものである。ｓｃＦｖＣ２１によって認識される決定基の炭水化物の性質と一致して、ファージディスプレイペプチドライブラリーから単離された３つのペプチドの配列と公開されているＨＭＷ−ＭＡＡコアタンパク質のアミノ酸配列（Ｐｌｕｓｃｈｋｅら、Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ ９３：９７１０−９７１５，１９９６）との間に相同性は、見出されなかった。
ｓｃＦｖＣ２１に対する合成ペプチドの反応性の解析
ｓｃＦｖＣ２１に対するファージディスプレイペプチドの反応性を確証するために、ペプチドＰ１Ｃ２１（環状）、Ｐ２Ｃ２１（線状）およびＰ３Ｃ２１（線状）を合成し、ＥＬＩＳＡにおいてｓｃＦｖＣ２１と反応する能力および阻害アッセイにおいてＨＭＷ−ＭＡＡ＋メラノーマ細胞Ｃｏｌｏ３８への結合を阻害する能力について試験した。０．２５％グルタルアルデヒドＰＢＳによってマイクロタイタープレート上に固定化された合成ペプチドＰ１Ｃ２１およびＰ２Ｃ２１は、ＥＬＩＳＡにおいてｓｃＦｖＣ２１と特異的に反応したが、固定化された合成ペプチドＰ３Ｃ２１は、反応しなかった（図７）。ペプチドが無関係なＨＭＷ−ＭＡＡ特異的ｓｃＦｖ＃２８と反応しなかったので、この結合は、特異的である。さらに、ペプチドＰ１Ｃ２１およびＰ３Ｃ２１は、用量依存的様式でＨＭＷ−ＭＡＡ＋細胞へのｓｃＦｖＣ２１の結合を阻害した（図８）。この両方のペプチドが、メラノーマ細胞Ｃｏｌｏ３８へのｓｃＦｖ＃２８の結合を阻害しなかったので、この阻害は、特異的である（図８）。対照的に、Ｐ２Ｃ２１は、メラノーマ細胞Ｃｏｌｏ３８へのｓｃＦｖＣ２１の結合を阻害しなかった。可溶性ペプチドＰ３Ｃ２１によってメラノーマ細胞へのｓｃＦｖＣ２１の結合が阻害されること、および固定化されたペプチドＰ３Ｃ２１とｓｃＦｖＣ２１との反応性がないことは、このペプチドとｓｃＦｖＣ２１との結合が、立体構造的に感受性であることを示唆する。
ＢＡＬＢ／ｃマウスにおけるペプチドＰ１Ｃ２１によるＨＭＷ−ＭＡＡ特異的な体液性免疫および細胞性免疫の誘導
ペプチドＰ１Ｃ２１によるＨＭＷ−ＭＡＡ模倣をさらに立証するために、ＢＡＬＢ／ｃマウスにおいてＨＭＷ−ＭＡＡ特異的な体液性免疫および細胞性免疫を誘発する能力を試験した。ＨＭＷ−ＭＡＡ＋メラノーマ細胞Ｃｏｌｏ３８と選択的に反応する抗体が、ペプチドＰ１Ｃ２１による３回目の免疫の１週間後にＢＡＬＢ／ｃマウスから回収された血清中で検出された。これらの抗体の平均力価は、低かったが、無関係なＭＢ１１９４−２０８ペプチドで免疫されたマウス由来の血清中のこれらの抗体の平均力価よりも有意に（ｐ＜０．０５）高かった。さらに、メラノーマ細胞と反応する抗体の力価は、３回のさらなる追加免疫の後も変化しなかった。しかしながら、ＨＭＷ−ＭＡＡ＋メラノーマ細胞と選択的に反応する抗体の力価は、ペプチドＰ１Ｃ２１で免疫されたマウスを、ＨＭＷ−ＭＡＡ＋メラノーマ細胞でブーストすることによって著しく増加した（図９）。
２つの系統の証拠が、誘発された抗体のＨＭＷ−ＭＡＡ特異性を立証した。第１に、この免疫血清は、完全長ＨＭＷ−ＭＡＡをコードするプラスミドＤＮＡによるトランスフェクション後にＨＭＷ−ＭＡＡを発現するＭ１４＃５／ＨＭＷ−ＭＡＡ細胞を染色したが、親のＭ１４＃５細胞を染色しなかった（図１０）。後者の細胞は、ＨＭＷ−ＭＡＡを発現しない。対照的に、ペプチドＭＢ１１９４−２０８で免疫されたマウス由来の血清は、Ｃｏｌｏ３８細胞との反応性を示さなかったが、それらは、その免疫ペプチドと高度に反応した。第２に、ＳＤＳ−ＰＡＧＥ解析から、ペプチドＰ１Ｃ２１およびＣｏｌｏ３８細胞で連続的に免疫されたマウス由来の血清が、Ｃｏｌｏ３８細胞溶解産物由来の特徴的なＨＭＷ−ＭＡＡ成分を免疫沈降させたことが示された。ペプチドＰ１Ｃ２１およびＨＭＷ−ＭＡＡ＋細胞Ｃｏｌｏ３８を用いたプライム・ブーストストラテジーによって誘発された免疫応答の特異性は、（ｉ）ペプチドＰ１Ｃ２１およびＨＭＷ−ＭＡＡ−リンパ系細胞ＬＧ２または（ｉｉ）ペプチドＭＢ１１９４−２０８およびＨＭＷ−ＭＡＡ＋細胞Ｃｏｌｏ３８で免疫されたＢＡＬＢ／ｃマウス由来の血清のＨＭＷ−ＭＡＡ＋細胞Ｃｏｌｏ３８との選択的な反応性の欠如によって示唆される（両方が、結合アッセイおよび免疫沈降実験において）（図１１）。
ＬＧ２細胞を注射した足蹠よりもＣｏｌｏ３８細胞を注射した足蹠が有意に（ｐ＜０．０５）強く腫脹したことによって示されるように、ペプチドＰ１Ｃ２１でＢＡＬＢ／ｃマウスを免疫することによってＨＭＷ−ＭＡＡ＋細胞Ｃｏｌｏ３８に対するＤＴＨ応答が誘発された。この腫脹は、４８時間持続した。無関係のＭＢ１１９４−２０８ペプチドで免疫され、Ｃｏｌｏ３８細胞を負荷されたマウスの足蹠では腫脹が認められなかったので、ペプチドＰ１Ｃ２１によって誘導されるＨＭＷ−ＭＡＡ＋メラノーマ細胞に対するＤＴＨ応答は、特異的である（図１２）。
ｓｃＦｖＣ２１へのペプチドＰ１Ｃ２１およびＰ３Ｃ２１の結合の構造的根拠
ｓｃＦｖＣ２１へのペプチドＰ１Ｃ２１およびＰ３Ｃ２１の結合に対する構造的根拠を定義するために、ｓｃＦｖＣ２１およびこれら２つのペプチドとの複合体の分子モデルを構築した。ＩＮＳＩＧＨＴＩＩにおける限られた立体配座検索アルゴリズムを用いて、ペプチドＰ１Ｃ２１およびＰ３Ｃ２１の最初のモデルを構築した。ｓｃＦｖＣ２１へのペプチド結合の最初の配向をＤＯＣＫ解析によって決定した。最善の配向を、接触スコアならびに結合エネルギーに基づいて選択し、次いで最適な結合および相互作用を解析するためにＩＮＳＩＧＨＴＩＩを用いて最小化した（表１）。その最小化中、最初の２０００サイクルについてはｓｃＦｖＣ２１を固定したままにした。続いて、ＣＤＲループおよびペプチドを動かした。
ペプチドＰ１Ｃ２１およびＰ３Ｃ２１の結合様式の立体配座の分子モデリングから、これらのペプチドが、ｓｃＦｖＣ２１の抗原結合部位内の様々な官能基と相互作用し得ることが示唆される。１０Ａｓｐから１０Ｓｅｒへの置換は、線状のペプチド型の結合を改善することを示唆する。太字で示されている残基は、１０Ａｓｐから１０Ｓｅｒへの変異に起因してさらに好ましい接触部分である。
ペプチドＰ１Ｃ２１およびＰ３Ｃ２１の１次配列は、５０％相同である。５Ｔｙｒ、７Ｐｒｏおよび１０Ａｓｐが、両方の配列の中心において保存されている。この分子モデリングにおいて、両方のペプチドが、保存された残基を介して２方向でｓｃＦｖＣ２１と相互作用する（表１および図１３）。ペプチドＰ１Ｃ２１は、折り畳まれた構造をとり、ｓｃＦｖＣ２１の重鎖および軽鎖ＣＤＲ３を横断して結合するが、ペプチドＰ３Ｃ２１は、伸びた立体配座で、すべてのＣＤＲループを横断して結合する。Ｐ１Ｃ２１は、環状ペプチドであり、その折り畳まれた構造によってｓｃＦｖＣ２１とのいくつかの好ましい相互作用がもたらされ、その構造は、重鎖ＣＤＲ２およびＣＤＲ３ならびに軽鎖ＣＤＲ２によって形成される疎水性ポケットにドッキングする４位のＴｒｐに起因して、より安定な複合体を形成する（表１）。他方、線状ペプチドのＰ３Ｃ２１は、Ｔｙｒとの接触部分がより少なく、Ｐｒｏによって媒介される主に疎水性の相互作用によって安定な複合体を形成する。保存された１０Ａｓｐは、いかなる接触部分にも関与しない。
ｓｃＦｖＣ２１に対するペプチドＰ３Ｃ２１の反応性に対するアミノ酸置換の影響
起きうる構造遷移および潜在的な接触残基と関連する影響をさらに特徴づけるために、分子モデリング研究に基づいてアミノ酸置換を線状ペプチドＰ３Ｃ２１に導入した。ペプチドＰ３Ｃ２１とｓｃＦｖＣ２１との反応性に対する選択された置換の影響を、Ｂｉａｃｏｒｅ（表２）および阻害解析（図８）によって実験的に試験した。
ｓｃＦｖＣ２１−Ｐ３Ｃ２１複合体において、５Ｔｙｒの（Ｈ２９に対する）相互作用が、７Ｐｒｏを疎水性ポケットに固着させるために重要であったことから、これらの２つの重要な位置における置換は、ｓｃＦｖＣ２１の結合を取り消しうることが示唆される。結合特性に対するそのペプチド配列に導入された改変の影響を試験するために、これらのペプチドと固定化されたｓｃＦｖＣ２１との相互作用のＢｉａｃｏｒｅ解析が行われた（表２）。実験データを計算された曲線にうまく当てはめられたことから、これらのペプチドとｓｃＦｖＣ２１との単純な擬一次（ｐｓｅｕｄｏ−ｆｉｒｓｔ ｏｒｄｅｒ）相互作用が示唆される。５Ｔｙｒ位および７Ｐｒｏ位における置換残基は、ｓｃＦｖＣ２１へのペプチド結合を実際に取り消した（表２）。
５Ｔｙｒ位および７Ｐｒｏ位とは対照的に、１０Ａｓｐは、ｓｃＦｖＣ２１とのいかなる接触部分にも含まれなかった。しかしながら、シミュレーション中、本発明者らは、ＬＧＤＬ配列域が非常に可動性であるのに対し、１０ＡｓｐがｓｃＦｖＣ２１結合部位と接触することが多い（Ｌ８９Ａｒｇ）が、この配向は、両方のＬｅｕ残基を露出させることに気づいた。疎水性残基が露出される配向は、エネルギー的に適当でないので、本発明者らは、さらなる最小化のために最も好ましい結合様式の１つとして露出された１０Ａｓｐ立体配座を選択したが、１０位にＳｅｒ残基を導入した。Ｓｅｒ置換ペプチドは、Ａｓｐとは対照的に、Ｌｅｕ配向を大きく変化させることなくｓｃＦｖＣ２１の４９ＬｅｕにおいてＴｙｒと接触する。分子間相互作用の解析により、このＳｅｒ置換ペプチドがｓｃＦｖＣ２１とより効率的に結合し得ることが示唆された（表１）。この可能性は、ｓｃＦｖＣ２１と置換ペプチドとの相互作用のＢｉａｃｏｒｅ解析によっても確証された（表２）。１０位におけるＳｅｒによるＡｓｐの置換（Ｐ３Ｓ１０）は、Ｐ３Ｃ２１がＣｏｌｏ３８細胞に対するｓｃＦｖＣ２１の反応性を阻害する能力に対してほんのわずかな影響しか有しなかった（図８）。この知見から、１０位において極性置換が許容されることが示唆される。阻害の低下は、ＨＷＭ−ＭＡＡ−ｓｃＦｖＣ２１−ペプチドの相互作用の複雑な性質に起因し得る。
実施例５：癌を処置するためのＨＭＷ−ＭＡＡ特異的モノクローナル抗体
この実施例では、ＨＭＷ−ＭＡＡの過剰発現を示す癌（本明細書中で「ＨＭＷ−ＭＡＡ陽性」癌とも呼ばれる）（メラノーマ、乳癌、前立腺癌および扁平上皮癌腫を含むがこれらに限定されない）を処置するためのＨＭＷ−ＭＡＡ特異的ヒトモノクローナル抗体の使用が説明される。ＨＭＷ−ＭＡＡ陽性癌と診断された患者は、当該分野において標準的な手順に従って処置され得る。一般に、処置の選択肢としては、外科術、放射線治療、化学療法、免疫療法またはインターフェロン療法が挙げられる。
この実施例では、ＨＭＷ−ＭＡＡ陽性メラノーマと診断された患者に、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ外毒素（ＰＥ）に連結されたＨＭＷ−ＭＡＡ特異的ヒトモノクローナル抗体を含む免疫結合体を投与する。ＰＥ免疫結合体の調製法は、報告されている（例えば、米国特許第７，０８１，５１８号および米国付与前公開（Ｕ．Ｓ．Ｐｒｅ−Ｇｒａｎｔ Ｐｕｂｌｉｃａｔｉｏｎ）番号２００５／０２１４３０４（これらは本明細書中で参考として援用される）を参照のこと）。一部の患者において、この免疫結合体は、静脈内ボーラス注射によって１日おきに合計３〜６回投与される。他の患者では、この免疫結合体は、１０日間にわたって連続的な静脈内点滴によって投与される。患者に投与される免疫結合体の用量は、患者の体重および性別、ならびに投与の様式および時間経過に応じて変化する。処置後、癌の進行（腫瘍の成長および転移を含む）および疾病の他の臨床的徴候について患者を評価する。患者は、この免疫結合体単独で、または１つ以上の標準的な癌処置法と併用して、処置され得る。例えば、メラノーマを除去する外科術を受けた患者が、その後、この免疫結合体で処置され得る。
実施例６：さらなる材料および方法
マウス：雌ＳＣＩＤ／ＢＡＬＢ／ｃマウス（Ｃ．Ｂ−Ｉｇｈ−１ｂＩｃｒＴａｃ−Ｐｒｋｄｃｓｃｉｄ，６〜８週齢）は、ＮＣＩまたはＴａｃｏｎｉｃ Ｆａｒｍｓ，Ｉｎｃから購入した。本研究のための実験は、Ｉｎｓｔｉｔｕｔｉｏｎａｌ Ａｎｉｍａｌ Ｃａｒｅ ａｎｄ Ｕｓｅ Ｃｏｍｍｉｔｔｅｅによって承認されたものである。
細胞株：ヒト腫瘍細胞株を、１０％ＦＣＳが補充されたＲＰＭＩ１６４０培地中で維持した。
抗体：ｓｃＦｖ−ＦｃＣ２１、およびアイソタイプコントロールとして使用されるｓｃＦｖ−Ｆｃ１１９を、マウス腹水から連続的な硫安塩析およびカプリル酸沈殿ならびにプロテインＡカラムによって精製した。ＰＥ−抗ヒトＩｇＧ抗体は、Ｊａｃｋｓｏｎ ＩｍｍｕｎｏＲｅｓｅａｒｃｈ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ、Ｉｎｃから購入した。シグナル伝達分子に対する特異的抗体：ＰＫＣα（Ｓｉｇｍａ）；ＦＡＫおよびリン酸化ＦＡＫ（Ｔｙｒ３９７）（ＢＤ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅ）；ＰＤＫおよびリン酸化ＰＤＫ１（ｓｅｒ２４１）、Ａｋｔおよびリン酸化Ａｋｔ（Ｓｅｒ４７３）、リン酸化Ｓｒｃ（Ｔｙｒ４１６）、Ｅｒｋ１／２およびリン酸化４４／４２Ｅｒｋ１／２（Ｔｈｒ２０２／Ｔｙｒ２０４）、抗β−カテニンならびにリン酸化ヒストンＨ３（Ｓｅｒ１０）（Ｃｅｌｌ ｓｉｇｎａｌｉｎｇ ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ）を商業的に購入した。
免疫組織化学，ホスホ−ヒストンＨ３（Ｓｅｒ１０）：製造者のプロトコルに従って、肺切片のＦＦＰＥを抗ｐ−ヒストン３抗体で染色した。
フローサイトメトリー解析：培養細胞株からの腫瘍細胞調製物を、ＣＳＰＧ４特異的ｓｃＦｖ−ＦｃＣ２１で３０分間染色し、ＰＢＳで２回洗浄し、そしてＰＥ標識抗ヒトＩｇＧ抗体とともに３０分間インキュベートした。３回洗浄した後、細胞をフローサイトメトリーで解析した。ｓｃＦｖ−Ｆｃ１１９をアイソタイプコントロールとして使用した。
ウエスタンブロッティング：シグナル伝達関連タンパク質に対するウエスタンブロットアッセイを、以下：ｉ）７２時間にわたって血清飢餓にされ、さらに４８時間にわたってｓｃＦｖ−ＦｃＣ２１（５０μｇ／ｍｌ）、アイソタイプマッチコントロール（５０μｇ／ｍｌ）またはＰＢＳとともにインキュベートされ、そして溶解緩衝液（１０ｍＭ Ｔｒｉｓ−ＨＣ、１％ＮＰ４０、１ｍＭ ＥＤＴＡ、０．１％ＢＳＡ、１５０ｍＭ ＮａＣｌ、１／５０のプロテアーゼインヒビターカクテル（Ｃａｌｂｉｏｃｈｅｍ）中で溶解された、培養ＭＶ３細胞（９６ウェルプレートにおいて２×１０４細胞／ウェル）；およびｉｉ）外科的に取り出され急凍され、１／５０のプロテアーゼインヒビターカクテル（Ｃａｌｂｉｏｃｈｅｍ）を含む氷冷ＲＩＰＡ緩衝液（Ｔｈｅｒｍｏ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ）を加える前後にホモジナイズされた異種移植片から調製された溶解産物に対して標準的な手法を用いて行った。６０秒間ボルテックスした後、サンプルを４５分間氷冷した。４℃、１３，０００ｒｐｍで３０分間、遠心分離することによって不溶性材料を組織溶解産物から除去した。タンパク質濃度をＢｒａｄｆｏｒｄ試薬（Ｂｉｏ−Ｒａｄ）によって測定した。等量の清澄化溶解産物タンパク質をドデシル硫酸ナトリウムポリアクリルアミドゲル電気泳動によって分離し、０．４５μｍ（ポアサイズ）ＰＶＤＦ（Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ）上に転写した。膜を、室温において２時間、５％脱脂粉乳＋２％ＢＳＡでブロッキングした後、抗ＰＫＣα、抗リン酸化ＦＡＫ、抗ＦＡＫ、抗ＰＤＫ、抗リン酸化ＰＤＫ１（ｓｅｒ２４１）、抗リン酸化Ａｋｔ、抗Ａｋｔ、抗リン酸化Ｓｒｃ（Ｔｙｒ４１６）、抗−抗Ｅｒｋ１／２、抗リン酸化Ｅｒｋ１／２（Ｔｈｒ２０２／Ｔｙｒ２０４）、抗β−カテニンおよびＨＬＡクラスＩ抗体ＨＣ−１０（０．２μｇ／ｍｌ）または抗（ａｎｔｏ）カルネキシンｍＡｂ Ｔｏ５（０．２μｇ／ｍｌ）を用いて４℃において一晩、次いで二次抗体を用いてプロービングした。バンドを、Ｅｎｈａｎｃｅｄ Ｃｈｅｍｉｌｕｍｉｎｅｓｃｅｎｃｅ Ｓｙｓｔｅｍ（ＧＥ Ｌｉｆｅ Ｓｃｉｅｎｃｅ）を用いて可視化し、バンドの密度をＦＯＴＯ／ＡＮＡＬＹＳＴ（登録商標）Ｉｎｖｅｓｔｉｇａｔｏｒ Ｅｃｌｉｐｓｅシステム（Ｆｏｔｏｄｙｎｅ Ｉｎｃｏｒｐｏｒａｔｅ）で読み出し、ＴＯＴＡＬＬＡＢＴＭＴＬ１００ソフトウェア（Ｎｏｎｌｉｎｅａｒ Ｄｙｎａｍｉｃｓ）を用いて定量化した。ＨＬＡクラスＩまたはカルネキシンを充填コントロールとして使用した。
細胞の成長および遊走：細胞成長アッセイについては、細胞（５×１０４／ウェル）を４８時間血清飢餓にし、次いで、無血清ＲＰＭＩ１６４０培地中に４倍希釈のＭＡＴＲＩＧＥＬＴＭ（低成長因子型（ｇｒｏｗｔｈ ｆａｃｔｏｒ−ｒｅｄｕｃｅｄ）ＭＡＴＲＩＧＥＬＴＭ−ＣＢ−４０２３０，ＢＤ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）およびｓｃＦｖ−ＦｃＣ２１（０．５ｍｇ／ｍｌ）、コントロールｓｃＦｖ−Ｆｃ１１９（０．５ｍｇ／ｍｌ）またはＰＢＳを含む９６ウェルプレート（総体積２００μｌ／ウェル）に播種し、３７℃、５％ＣＯ２雰囲気において６日間培養した。遊走アッセイについては、細胞（５×１０４／ウェル）を、４８時間血清飢餓にし、次いで、ｓｃＦｖ−ＦｃＣ２１（０．５ｍｇ／ｍｌ）、コントロールｓｃＦｖ−Ｆｃ１１９（０．５ｍｇ／ｍｌ）またはＰＢＳを含む２４トランスウェルプレート（２４ウェルインサート，ポアサイズ８μｍ；ＢＤ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）に播種した。細胞は、１０μｇ／ｍｌフィブロネクチンを含む無血清ＲＰＭＩ１６４０培地に向かって遊走した。４８時間後、遊走した細胞をＨＥＭＡ３染色セットで染色し、写真撮影し、Ｚｅｉｓｓ Ｉｎｖｅｒｔｅｄ Ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｃｅ Ｍｉｃｒｏｓｃｏｐｅ（ＡｘｉｏＶｉｓｉｏｎ Ｓｏｆｔｗａｒｅ）下で計数した。独立した６つの高倍率視野（２００×）の平均を棒グラフで示す。上記のすべての実験を３つ組で行った。
実験的肺転移および抗体投与：図１６に示されているように、ＳＣＩＤマウスにＭＶ３細胞を静脈内注射し、ｓｃＦｃ−ＦｃＣ２１で処置した。
自然肺転移および処置実験：ＭＶ３細胞をＳＣＩＤマウスの皮下に埋め込んだ。ケタミン（５ｍｇ／ｋｇ，腹腔内（ｉ．ｐ．））および連続的なイソフルラン吸入を用いて、そのマウスを完全に麻酔しながら、原発腫瘍を外科的に取り出した。外科術後、そのマウスに鎮痛薬のケトプロフェン（５ｍｇ／ｋｇ，皮下（ｓｕｂｃｕｎｔａｎｅｏｕｓ）（ｓ．ｃ．）投与）を３日間にわたって毎日投与した。図１８に示されているように、ｓｃＦｃ−ＦｃＣ２１を投与した。
実施例７：ヒト腫瘍細胞株のパネルに対するｓｃＦｖ−ＦｃＣ２１の反応性
フロー解析から、ｓｃＦｖ−ＦｃＣ２１が、メラノーマ細胞株ＭＤＡ−ＭＢ−４３５、ＭＶ３およびＷＭ１１５８；神経膠腫細胞株ＬＮ４４４およびＡ１２０７ならびに頭頸部癌細胞株ＰＣＩ３０およびＰＣＩ１３を含むヒト培養細胞株のパネルの細胞表面を特異的に染色したことが示されている。ＣＳＰＧ４−メラノーマ細胞株Ｍ１４をネガティブコントロールとして用い、Ｍ１４細胞株のＣＳＰＧ４トランスフェクタントであるＭ１４／ＣＳＰＧ４をポジティブコントロールとして用いた（図１４〜１５を参照のこと）。
実施例８：腫瘍細胞の成長および遊走のｓｃＦｖ−ＦｃＣ２１による阻害
ｓｃＦｖ−Ｆｃ２１は、腫瘍細胞の成長および遊走をインビトロにおいて阻害した（図２２〜２３）。この方法は、上記の実施例６に記載されている。
実施例９：腫瘍細胞の成長、生存および転移にとって重要な複数のシグナル伝達経路のインビトロにおける阻害
ｓｃＦｖ−ＦｃＣ２１で処理されたＭＶ３細胞は、低レベルのタンパク質キナーゼＣアルファ（ＰＫＣα）およびＦＡＫを有した。さらに、ｓｃＦｖ−ＦｃＣ２１処置により、ＦＡＫ、Ｅｒｋ１／２、ＰＤＫ１（Ａｋｔの上流）およびＡｋｔのリン酸化／活性化が阻害された。Ａｋｔ活性化の低下は、ＰＩ３Ｋ／Ａｋｔシグナル伝達経路の負の制御因子であるリン酸化／活性化ＰＴＥＮの増加を伴った（図２４〜２６を参照のこと）。
実施例１０：ヒトメラノーマの確立された実験的転移のｓｃＦｃ−ＦｃＣ２１によるインビボにおける阻害
ｓｃＦｃ−ＦｃＣ２１は、ＭＶ３細胞の実験的転移を有意に阻害した（図１６）。代用マーカーのｐ−ヒストンＨ３を用いて腫瘍細胞の増殖速度についても転移性病変を評価した。ｓｃＦｃ−ＦｃＣ２１の処置により、有糸***細胞の数が有意に減少した（図１７）。
実施例１１：外科術後のヒトメラノーマの再発および自然転移のｓｃＦｃ−ＦｃＣ２１によるインビボにおける阻害
ｓｃＦｃ−ＦｃＣ２１がＳＣＩＤマウスにおいてＭＶ３腫瘍の腫瘍再発および自然転移を阻害する能力を、原発腫瘍の外科的除去後に試験した。ｓｃＦｃ−ＦｃＣ２１で処置されたマウスは、コントロールｓｃＦｖ−Ｆｃを投与されたマウスよりも有意に遅い速度の腫瘍再発および低いレベルの自然肺転移を有した（図１８〜２０）。さらに、ｓｃＦｃ−ＦｃＣ２１で処置されたマウスから外科的に取り出された原発腫瘍を、メラノーマの成長および進行に関連する特異的シグナル伝達経路の活性化についても評価した。ＰＫＣ−αおよびＳｒｃシグナル伝達経路の活性化は、コントロールｓｃＦｖ−Ｆｃ１１９で処置されたマウスから取り出された原発腫瘍と比べて、ｓｃＦｖ−ＦｃＣ２１で処置されたマウスから取り出された原発腫瘍において著しく低下した（図２１）。
本開示は、ＨＭＷ−ＭＡＡに特異的な完全ヒト抗体を提供する。本開示は、さらに、ＨＭＷ−ＭＡＡの発現に関連する癌を処置するかまたは検出する方法およびこれらの抗体を用いて処置する方法を提供する。記載した方法の正確な詳細が、記載した開示の精神から逸脱することなく変更され得るかまたは改変され得ることは、明らかである。本発明者らは、以下の請求項の範囲および精神に含まれるそのようなすべての改変およびバリエーションを特許請求する。

Claims (27)

  1. 単離されたヒトモノクローナル抗体またはその一本鎖可変フラグメント（ｓｃＦｖ）であって、ここで、該ｓｃＦｖはＦｃドメインに融合されており、該抗体の重鎖は、配列番号５のアミノ酸２７〜３８、配列番号５のアミノ酸５６〜６５、および、配列番号５のアミノ酸１０５〜１１５を含み、該抗体の軽鎖は、配列番号６のアミノ酸２７〜３８、配列番号６のアミノ酸５６〜６５、および、配列番号６のアミノ酸１０５〜１１０を含み、該抗体またはそのｓｃＦｖは、ＨＭＷ−ＭＡＡに特異的に結合する、単離されたヒトモノクローナル抗体またはそのｓｃＦｖ。
  2. 前記抗体の重鎖が、配列番号５を含む、請求項１に記載の単離されたヒトモノクローナル抗体またはそのｓｃＦｖ。
  3. 前記抗体の軽鎖が、配列番号６を含む、請求項１〜２のいずれか１項に記載の単離されたヒトモノクローナル抗体またはそのｓｃＦｖ。
  4. 前記抗体の重鎖が、配列番号５を含み、該抗体の軽鎖が、配列番号６を含む、請求項１〜３のいずれか１項に記載の単離されたヒトモノクローナル抗体またはそのｓｃＦｖ。
  5. 前記抗体が、ＩｇＧである、請求項１〜４のいずれかに記載の単離されたヒトモノクローナル抗体。
  6. 前記抗体またはそのｓｃＦｖが、標識されている、請求項１〜５のいずれかに記載の単離されたヒトモノクローナル抗体またはそのｓｃＦｖ。
  7. 前記標識が、蛍光標識、酵素標識または放射性標識である、請求項６に記載の単離されたヒトモノクローナル抗体またはそのｓｃＦｖ。
  8. 請求項１〜７のいずれか１項に記載の単離されたヒトモノクローナル抗体またはそのｓｃＦｖおよび薬学的に許容可能なキャリアを含む、組成物。
  9. 請求項１〜５のいずれかに記載の単離されたヒトモノクローナル抗体またはそのｓｃＦｖを含む、単離された免疫結合体。
  10. Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ外毒素（ＰＥ）またはその改変体もしくはフラグメントを含む、請求項９に記載の単離された免疫結合体。
  11. 請求項９または請求項１０に記載の単離された免疫結合体および薬学的に許容可能なキャリアを含む、組成物。
  12. ＨＭＷ−ＭＡＡを発現する癌と診断された被験体を処置するための組成物であって、治療有効量の請求項６に記載の単離されたヒトモノクローナル抗体もしくはそのｓｃＦｖまたは請求項９に記載の免疫結合体を含む、組成物。
  13. 前記癌が、メラノーマ、乳癌、頭頸部扁平上皮癌腫、前立腺癌、卵巣癌、結腸癌、神経膠腫、胃癌または膵癌である、請求項１２に記載の組成物。
  14. 転移の数またはサイズが、前記組成物の投与によって前記被験体を処置することによって減少する、請求項１２に記載の組成物。
  15. 被験体における癌を検出するかまたは癌の診断を確証するための組成物であって、該組成物は、請求項１〜５のいずれかに記載の単離されたヒトモノクローナル抗体またはそのｓｃＦｖを含み、ここで該組成物は、該被験体由来のサンプルと接触され、そして該サンプルへの、該単離されたヒトモノクローナル抗体またはそのｓｃＦｖの結合が検出され、ここで、コントロールサンプルへの該単離されたヒトモノクローナル抗体またはそのｓｃＦｖの結合と比較した際の該サンプルへの該単離されたヒトモノクローナル抗体またはそのｓｃＦｖの結合の増加が、該被験体における癌を検出するか、または該被験体における癌の診断を確証する、組成物。
  16. 前記単離されたヒトモノクローナル抗体またはそのｓｃＦｖが、直接標識されている、請求項１５に記載の組成物。
  17. 前記単離されたヒトモノクローナル抗体またはそのｓｃＦｖに特異的に結合する２次抗体が前記組成物と組み合わせて使用され、そして前記サンプルと接触され、そして該２次抗体の結合が検出され、ここで、コントロールサンプルへの該２次抗体の結合と比較した際の該サンプルへの該２次抗体の結合の増加が、該被験体における癌を検出するかまたは該被験体における癌の診断を確証する、請求項１５または１６に記載の組成物。
  18. 前記癌が、メラノーマ、乳癌、頭頸部扁平上皮癌腫、前立腺癌、卵巣癌、結腸癌、神経膠腫、胃癌または膵癌である、請求項１５〜１７のいずれかに記載の組成物。
  19. 前記コントロールサンプルが、癌を有しない被験体由来のサンプルである、請求項１５〜１８のいずれかに記載の組成物。
  20. 前記サンプルが、血液、尿、生検材料、血清、痰、血漿、または脳髄液サンプルである、請求項１５〜１９のいずれかに記載の組成物。
  21. 前記癌が、転移性である、請求項１５〜２０のいずれか１項に記載の組成物。
  22. 請求項１〜５のいずれかに記載の単離されたヒトモノクローナル抗体またはそのｓｃＦｖをコードする単離された核酸分子。
  23. 前記ヒトモノクローナル抗体のＶＨドメインが、配列番号１のヌクレオチド配列を含む、請求項２２に記載の単離された核酸分子。
  24. 前記ヒトモノクローナル抗体のＶＬドメインが、配列番号３のヌクレオチド配列を含む、請求項２２または請求項２３に記載の単離された核酸分子。
  25. プロモーターに作動可能に連結された、請求項２２〜２４のいずれか１項に記載の単離された核酸分子。
  26. 請求項２２〜２５のいずれか１項に記載の単離された核酸分子を含む、発現ベクター。
  27. 請求項２２〜２５のいずれか１項に記載の単離された核酸分子または請求項２６に記載の発現ベクターで形質転換された、単離された宿主細胞。
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