ES2246905T3 - Inhibicion de la expresion genica con arndc. - Google Patents
Inhibicion de la expresion genica con arndc.Info
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Abstract
ARN que comprende una estructura de doble cadena que tiene una secuencia de nucleótidos que es idéntica en al menos un 80% a al menos una parte del gen diana en una célula de mamífero o que puede hibridarse con una parte del transcrito del gen diana en las siguientes condiciones: hibridación en NaCl 400 mM, PIPES 40 mM pH 6, 4, EDTA 1 mM, a 50ºC o 70ºC durante 12-16 horas, seguido por lavado, y que se deriva de un molde endógeno, o un vector de expresión que codifica para tal ARN, para su uso como un medicamento.
Description
Inhibición de la expresión génica con ARNdc.
La presente invención se refiere a la inhibición
de la expresión génica. En particular, se refiere a la inhibición
de la expresión génica en mamíferos utilizando ARN de doble cadena
(ARNdc).
Los beneficios de poder inhibir la expresión de
un gen o grupo de genes específico en los mamíferos son obvios.
Muchas enfermedades (tales como el cáncer, trastornos endocrinos,
trastornos inmunitarios, etcétera) surgen de la expresión anómala un
gen o grupo de genes particular en un mamífero; por tanto, puede
utilizarse la inhibición del gen o grupo para tratar estos estados.
De manera similar, la enfermedad puede resultar a través de la
expresión de una forma mutante de una proteína, en cuyo caso sería
ventajoso eliminar la expresión del alelo mutante. Además, tal
inhibición específica de genes puede utilizarse para tratar
enfermedades virales que están producidas, por ejemplo, por
retrovirus, tales como VIH, en las que los genes virales se integran
en el genoma de su huésped y se expresan.
Además, puede utilizarse la eliminación o
inhibición de la expresión de un gen específico para estudiar y
manipular los acontecimientos de desarrollo tempranos en el embrión
no humano. La información más valiosa se obtendría si la función del
gen de interés pudiera alterarse en células específicas del embrión
en momentos definidos. En tal situación, en el modelo de ratón, no
pueden utilizarse las técnicas clásicas de "inactivación"
("knockout") génica, debido a que eliminan la función del gen
de manera universal en todo el embrión. Además, si se utiliza un
gen de manera repetida en el espacio y tiempo para dirigir procesos
de desarrollo, la eliminación de su papel mediante la
"inactivación" génica convencional puede negar la comprensión
de todo excepto el primer acontecimiento. Incluso cuando el interés
es estudiar el primer momento mismo en el desarrollo en el que
funciona un gen, la contribución de los transcritos maternos y sus
productos de traducción pueden enmascarar los efectos de la
inactivación del gen. La tecnología de "inactivación"
existente es extremadamente laboriosa. En primer lugar, necesita
preparar un segmento de gen alterado que se marque adecuadamente
para permitir la selección de acontecimientos de recombinación
homólogos en células madre embrionarias en cultivo. Tales células
deben entonces incorporarse a blastocistos y utilizarse los animales
híbridos resultantes para establecer líneas reproductoras puras
antes de que puedan obtenerse mutantes homocigóticos.
Se sabe que la expresión de genes puede inhibirse
específicamente mediante ARN de doble cadena en ciertos organismos.
La interferencia de ARN (ARNi) de doble cadena de la expresión
génica que se mostró por primera vez en Caenorhabditis
elegans (Fire et al. Nature 391,
806-811 (1998); documento WO99/32619), ha demostrado
recientemente ser eficaz en eucariotas inferiores, incluyendo
Drosophila melanogaster (Kennerdell. y Carthew, Cell
95, 1017-1026 (1998)), Trypanosoma
brucei (Ngo, et al. Proc Natl Acad Sci U S A 95,
14687-14692 (1998)) planarias (Sanchez Alvarado y
Newmark, Proc Natl Acad Sci U S A 96,
5049-5054 (1999)) y plantas (Waterhouse, et al.
Proc Natl Acad Sci U S A 95, 13959-13964
(1998)). La aplicación de este enfoque también se ha demostrado en
embriones de pez cebra, pero con éxito limitado (Wargelius, et
al. Biochem Biophys Res Commun 263,
156-61 (1999)).
Hasta la fecha, no se ha notificado que puede
utilizarse ARNi en mamíferos y además, existe la creencia en la
técnica, de que ARNi no funcionará en mamíferos. A este respecto,
se ha expresado la preocupación de que es poco probable que los
protocolos utilizados para sistemas invertebrados y de plantas sean
eficaces en mamíferos (revisado por Fire (Fire Trends Genet
15, 358-363 (1999)). Esto es debido a que la
acumulación de ARNdc en las células de mamífero puede dar como
resultado un bloqueo general de la síntesis de proteínas. La
acumulación de cantidades muy pequeñas de ARN de doble cadena
(ARNdc) en las células de mamífero tras una infección viral da como
resultado la respuesta del interferón (Marcus, Interferon
5, 115-180 (1983)), que conduce a un bloqueo
global de la traducción y el inicio de apoptosis (Lee y Esteban
Virology 199, 491- 496 (1994)). Parte de la respuesta
del interferón es la activación de una proteína cinasa que responde
a ARNdc (PKR) (Clemens, Int J Biochem Cell 29,
945-949 (1997)). Esta enzima fosforila e inactiva
el factor de traducción EIF2\alpha en respuesta al ARNdc. La
consecuencia es una supresión global de la traducción, que a su vez
desencadena la apoptosis. Wagner y Sun (Nature 391,
806-811 (1998)) sugieren que la ARNi no funcionará
en mamíferos porque no tiene efecto cuando se utiliza como control
en experimentos en ARN complementario.
Se ha probado el ARN complementario como medio de
reducir la expresión génica en los embriones de varias especies.
Aunque se ha tenido un éxito considerable en Drosophila, ha
sido desalentador en embriones de pez cebra, Xenopus y
ratón. En Xenopus, hubo algunas limitaciones en el uso de un
enfoque complementario. Se cree que es debido a una destacada
actividad de fundido del ARN (Bass y Weintraub, Cell
48, 607-613 (1987); Rebagliati y Melton,
Cell 48, 599-605 (1987)), ejercida por
la adenosina desaminasa específica para ARNdc (RADdc) y sugiere que
no es probable que la ARNi sea satisfactoria.
En el embrión de ratón, el ARN complementario ha
tenido un éxito desigual y limitado en la reducción de la expresión
génica, particularmente entre las fases celulares dos a cuatro
(Bevilacqua et al. Proc Natl Acad Sci U S A 85,
831-835 (1988)). Estos autores estaban interesados
en si la inhibición parcial de
\beta-glucuronidasa en sus experimentos
podría reflejar una actividad de fundido que actúa sobre los dúplex
codificante/complementario, y así examinaron la estabilidad de ARNdc
de \beta-glucuronidasa microinyectado en
blastómeros de ratón. No notificaron efectos sobre la estabilidad
del ARN, pero esto sólo se siguió durante un periodo de 5 horas. Por
tanto, no hay sugerencias en este artículo de que el ARNdc pueda
persistir en células de mamífero el tiempo suficiente para
interferir en la expresión génica. Además, no notificaron efectos
sobre la expresión de \beta-glucuronidasa
tras la inyección de ARNdc. Por tanto, este artículo no sugiere que
el ARNdc pueda inhibir la expresión génica en células de
mamífero.
El documento WO99/32619 sugiere que puede
utilizarse ARNdc para inhibir la expresión génica en mamíferos. Sin
embargo, las únicas pruebas experimentales en este documento
muestran que la ARNi funciona en C. elegans; no hay nada que
muestre que podría funcionar en mamíferos. De hecho, las
publicaciones posteriores de los inventores enumeradas para el
documento WO99/32619 (Fire Trends Genet 15,
358-363 (1999); Montgomery y Fire, Trends
Genet 14, 3255-258 (1998)) establecen que sólo
podría hacerse funcionar la ARNi en mamífero si pudiera
neutralizarse la respuesta de PKR o evitarse de alguna manera,
aunque no se proporcionan sugerencias en el documento WO99/32619
sobre cómo podría conseguirse esto. Estas publicaciones posteriores
indican que los inventores del documento WO99/32619 creen ellos
mismos que la ARNi no se ha hecho funcionar todavía (y que no se
puede) en mamíferos.
Por tanto, existe la percepción en la técnica de
que la ARNi no puede hacerse funcionar en mamíferos. En contra de
esta percepción, los inventores han demostrado ahora que es posible
interferir en la expresión génica específica en el ovocito y cigoto
de ratón tras la microinyección del ARNdc apropiado. Han demostrado
experimentalmente que la ARNi puede crear una fenocopia de los
efectos de perturbación de la expresión materna del gen
c-mos en el ovocito, para vencer la detención
de la meiosis en la metafase II, o la expresión cigótica de
E-cadherina para evitar el desarrollo del
blastocisto, tal como se observa en los correspondientes ratones
deficientes. Los inventores han demostrado que la inyección de un
ARNdc es específico para el gen correspondiente; no produce una
detención traduccional general, ya que el embrión continúa
desarrollándose y no pueden observarse signos de muerte celular.
Por tanto, han demostrado que la ARNi puede ser eficaz en células
de mamífero.
Según un primer aspecto de la presente invención,
se proporciona un ARN que comprende una estructura de doble cadena
que tiene una secuencia de nucleótidos que es idéntica en al menos
un 80% a al menos una parte del gen diana en una célula de mamífero
o que puede hibridarse con una parte del transcrito del gen diana en
las siguientes condiciones: hibridación en NaCl 400 mM, PIPES 40 mM
pH 6,4, EDTA 1 mM, a 50ºC o 70ºC durante 12-16
horas, seguido por lavado, y que se deriva de un molde endógeno, o
un vector de expresión que codifica para tal ARN, para su uso como
un medicamento.
Según un segundo aspecto de la presente invención
se proporciona un método in vitro para inhibir la expresión
de un gen diana en una célula de mamífero, comprendiendo el
método:
introducir en la célula un ARN que comprende una
estructura de doble cadena que tiene una secuencia de nucleótidos
que es idéntica en al menos un 80% a al menos una parte del gen
diana o que puede hibridarse con una parte del transcrito del gen
diana en las siguientes condiciones: hibridación en NaCl 400 mM,
PIPES 40 mM pH 6,4, EDTA 1 mM, a 50ºC o 70ºC durante
12-16 horas, seguido por lavado, y que se deriva de
un molde endógeno; y
verificar la inhibición de la expresión del gen
diana;
en el que la célula de mamífero es una célula
somática, un ovocito no humano o una célula de un embrión antes de
la implantación no humano.
El ARNdc útil según la invención se deriva de un
"molde endógeno". Tal molde puede ser toda o parte de una
secuencia de nucleótidos endógena al mamífero; puede ser una
secuencia génica de ADN o un ADNc producido a partir de un ARNm
aislado del mamífero, por ejemplo, mediante transcriptasa inversa.
Cuando el molde es toda o parte de una secuencia génica de ADN, se
prefiere que proceda de uno o más o todos los exones del gen.
Adicionalmente, todo o parte del gen viral puede formar un molde
endógeno, si se expresa en el mamífero de tal manera que no se
induzca la respuesta del interferón, por ejemplo, la expresión a
partir de un provirus integrado en el cromosoma de la célula
huésped. Por tanto, el ARNdc de la presente invención se distingue
del ARNdc viral y polyrIC sintético, que se ha observado que
inducen ambos PKR que conduce a apoptosis en las células de
mamífero.
Aunque el ARNdc se deriva de un molde endógeno,
no existe limitación sobre la manera en que se sintetiza. Por tanto,
pueden sintetizarse in vitro o in vivo, utilizando
procedimientos manuales y/o automatizados. La síntesis in
vitro puede ser química o enzimática, por ejemplo, utilizando
ARN polimerasa clonada (por ejemplo, T3, T7, SP6) para la
transcripción del molde de ADN endógeno (o ADNc), o una mezcla de
ambos.
In vivo, el ARNdc puede sintetizarse
utilizando técnicas recombinantes bien conocidas en la técnica
(véase por ejemplo, Sambrook, et al., MOLECULAR CLONING; A
LABORATORY MANUAL, SEGUNDA EDICIÓN (1989); DNA CLONING, VOLÚMENES I
Y II (D. N Glover ed. 1985); OLIGONUCLEOTIDE SYNTHESIS (M. J. Gait
ed, 1984); NUCLEIC ACID HYBRIDISATION (B. D. Hames y S. J. Higgins
eds. 1984); TRANSCRIPTION AND TRANSLATION (B. D. Hames y S. J.
Higgins eds. 1984), ANIMAL CELL CULTURE (R. I. Freshney ed. 1986);
IMMOBILISED CELLS AND ENZYMES (IRL Press, 1986); B. Perbal, A
PRACTICAL GUIDE TO MOLECULAR CLONING (1984); the series, METHODS IN
ENZYMOLOGY (Academic Press, Inc.); GENE TRANSFER VECTORS FOR
MAMMALIAN CELLS (J. H. Miller y M. P. Calos eds. 1987, Cold Spring
Harbor Laboratory), Methods in Enzymology Vol. 154 y Vol. 155 (Wu y
Grossman, y Wu, eds., respectivamente), Mayer y Walker, eds.
(1987), IMMUNOCHEMICAL METHODS IN CELL AND MOLECULAR BIOLOGY
(Academic Press, Londres), Scopes, (1987), PROTEIN PURIFICATION:
PRINCIPLES AND PRACTICE, segunda edición
(Springer-Verlag, N.Y.), y HANDBOOK OF EXPERIMENTAL
IMMUNOLOGY, VOLÚMENES I-IV (D. M. Weir y C C.
Blackwell eds 1986).
Por tanto, las células bacterianas pueden
transformarse con un vector de expresión Que comprende el molde de
ADN a partir del cual va a derivarse el ARNdc. Alternativamente, las
células del mamífero en las que se requiere la inhibición de la
expresión génica pueden transformarse con un vector de expresión o
por otros medios. La transcripción bidireccional de una o más
copias del molde puede estar por ARN polimerasa endógena de la
célula transformada o por una ARN polimerasa clonada (por ejemplo,
T3, T7, SP6) codificada por el vector de expresión o un vector de
expresión diferente. El uso y la producción de un constructo de
expresión se conocen en la técnica (véase el documento WO98/32016;
las patentes de los EE.UU. números 5.593.874, 5.698.425, 5.712.135,
5.789.214 y 5.804.693). La inhibición de la expresión génica puede
dirigirse mediante la transcripción específica en un órgano, tejido
o tipo celular; una condición ambiental (por ejemplo, infección,
tensión, temperatura, compuesto químico); y/o transcripción
mediante ingeniería genética en una fase o edad de desarrollo,
especialmente cuando el ARNdc se sintetiza in vivo en el
mamífero. El ARNdc también puede suministrarse a tejidos o tipos
celulares específicos utilizando sistemas de suministro de genes
conocidos. Los vectores eucariotas conocidos incluyen pWLNEO,
pSV2CAT, pOG44, pXT1 y pSG disponibles de Stratagene; y pSVK3, pBPV,
pMSG y pSVL disponibles de Pharmacia. Estos vectores se enumeran
solamente a modo de ilustración de los muchos vectores disponibles
comercialmente y bien conocidos de los que disponen los expertos en
la técnica.
Si se sintetizan fuera de la célula de mamífero,
el ARN puede purificarse antes de la introducción en la célula. La
purificación puede ser mediante extracción con un disolvente (tal
como fenol/cloroformo) o resina, precipitación (por ejemplo, en
etanol), electroforesis, cromatografía, o una combinación de los
mismos. Sin embargo, la purificación puede dar como resultado una
pérdida de ARNdc y, por tanto, puede ser mínima o no llevarse a
cabo en absoluto. El ARN puede secarse para su almacenamiento o
disolverse en una disolución acuosa, que puede contener tampones o
sales para promover la hibridación y/o la estabilización de las
hebras de ARN.
El ARNdc útil en la presente invención incluye
ARNdc que contiene una o más bases modificadas y ARNdc con un
esqueleto modificado para su estabilidad o por otros motivos. Por
ejemplo, pueden modificarse los enlaces fosfodiéster del ARN natural
para incluir al menos uno de un heteroátomo de nitrógeno o azufre.
Además, pueden utilizarse en la invención ARNdc que comprenden
bases no usuales, tales como inosina, o bases modificadas, tales
como bases tritiladas, solamente por nombrar dos ejemplos. Se
apreciará que puede realizarse una gran variedad de modificaciones
al ARN para que sirva para muchos fines útiles conocidos por los
expertos en la técnica. El término ARNdc tal como se emplea en el
presente documento engloba tales formas modificadas química,
enzimática o metabólicamente de ARNdc, siempre que se derive de un
molde endógeno.
La estructura de doble cadena puede formarse
mediante una única cadena de ARN autocomplementario o dos cadenas de
ARN complementario diferentes. La formación del dúplex de ARN puede
iniciarse o bien dentro o bien fuera de la célula de mamífero.
El ARNdc comprende una estructura de doble
cadena, cuya secuencia es idéntica en al menos un 80% a al menos una
parte del gen diana. "Identidad", tal como se conoce en la
técnica, es la relación entre dos o más secuencias polinucleotídicas
(o polipéptidícas), determinado comparando las secuencias. En la
técnica, identidad también significa el grado de relación entre las
secuencias polinucleotídicas, determinado por la coincidencia de
las cadenas de tales secuencias. La identidad puede calcularse
fácilmente (Computational Molecular Biology, Lesk, A.M.,
ed., Oxford University Press, Nueva York, 1988; Biocomputing:
Informatics and Genome Projects, Smith, D.W., ed., Academic
Press, Nueva York, 1993; Computer Analysis of Sequence Data,
Parte I, Griffin, A.M., y Griffin, H.G., eds., Humana Press, Nueva
Jersey, 1994; Sequence Analysis in Molecular Biology, von
Heinje, G., Academic Press, 1987; y Sequence Analysis Primer,
Gribskov, M. y Devereux, J., eds., M Stockton Press, Nueva York,
1991). Aunque existen varios métodos para medir la identidad entre
dos secuencias polinucleotídicas, el término lo conocen bien los
expertos en la técnica (Sequence Analysis in Molecular
Biology, von Heinje, G., Academic Press, 1987; Sequence
Analysis Primer, Gribskov, M. y Devereux, J., eds., M Stockton
Press, Nueva York, 1991; y Carillo, H., y Lipman, D., SIAM J.
Applied Math., 48: 1073 (1988). Los métodos empleados
comúnmente para determinar la identidad entre secuencias incluyen,
pero sin limitarse a los descritos en Carillo, H., y Lipman, D.,
SIAM J. Applied Math., 48:1073 (1988). Los métodos
preferidos para determinar la identidad se diseñan para dar la
mayor coincidencia entre las secuencias probadas. Los métodos para
determinar la identidad se codifican en programas informáticos. Los
métodos de programas informáticos para determinar la identidad
entre dos secuencias incluyen, pero sin limitarse a, el paquete
informático GCG (Devereux, J., et al., Nucleic Acids
Research 12 (1):387 (1984)), BLASTP, BLASTN, y FASTA
(Atschul, S.F. et al., J. Molec. Biol. 215:403
(1990)). Otro paquete informático bien conocido en la técnica para
llevar a cabo este procedimiento es el programa CLUSTAL. Compara la
secuencia de dos polinucleótidos y halla la alineación óptima
insertando espacios en cualquier secuencia, según sea apropiado. La
identidad para una alineación óptima puede calcularse utilizando un
paquete de software tal como BLASTx. Este programa alinea la región
más grande de secuencia similar y asigna un valor al ajuste. Para
cualquier comparación patrón, pueden encontrarse varias regiones de
similitud, que tienen, cada una, una puntuación diferente. Un
experto en la técnica apreciará que dos polinucleótidos de
longitudes diferentes pueden compararse a lo largo de la longitud
completa del fragmento más largo. Alternativamente, pueden
compararse regiones pequeñas. Normalmente, se comparan secuencias de
la misma longitud para que se haga una comparación útil.
Se prefiere que haya un 100% de identidad de
secuencia entre el ARN inhibidor y la parte del gen diana. Sin
embargo, puede utilizarse ARNdc que tiene un 80% o más del 90% o el
95% de identidad de secuencia en la presente invención, y por tanto,
pueden tolerarse las variaciones de la secuencia que podrían
esperarse debido a la mutación genética, polimorfismo de las cepas
o divergencia evolutiva.
La región de dúplex del ARN puede tener una
secuencia de nucleótidos que puede hibridarse con una parte del
transcrito del gen diana (por ejemplo, hibridación en NaCl 400 mM,
PIPES 40 mM, pH 6,4, EDTA 1 mM, a 50ºC o 70ºC durante
12-16 horas; seguido por lavado).
Aunque la longitud óptima del ARNdc puede variar
según el gen diana y las condiciones experimentales, la región de
dúplex del ARN puede ser de al menos 25, 50, 100, 200, 300, 400 o
más bases de largo.
Tal como se utiliza en el presente documento,
"gen diana" dignifica generalmente un polinucleótido que
comprende una región que codifica para un polipéptido, o una región
de polinucleótido que regula la replicación, transcripción o
traducción u otros procesos importantes para la expresión del
polipéptido, o un polinucleótido que comprende tanto una región que
codifica para un polipéptido como una región operativamente unida a
la misma que regula la expresión. Los genes diana pueden ser genes
celulares presentes en el genoma o genes virales o provirales que
no producen la respuesta del interferón, tales como genes
retrovirales. El gen diana puede ser un gen que codifica para una
proteína o un gen que codifica no para una proteína, tal como un
gen que codifica para ARN ribosómicos, ARN del empalmosoma, ARNt,
etc.
Se prefiere que el ARNdc sea sustancialmente
idéntico a la totalidad del gen diana, es decir, a la parte
codificante del gen. Sin embargo, el ARNdc puede ser al menos el
80% idéntico a una parte del gen diana. El tamaño de esta parte
depende del gen diana particular y puede determinarse por los
expertos en la técnica variando el tamaño del ARNdc y observando si
la expresión del gen se ha inhibido.
En la presente invención, puede utilizarse ARNdc
para inhibir un gen diana que produce o es probable que produzca una
enfermedad, es decir, puede utilizarse para el tratamiento o la
prevención de la enfermedad. En la prevención de la enfermedad, el
gen diana puede ser uno que se requiera para el inicio o
mantenimiento de la enfermedad, o que se ha identificado que está
asociado con un riesgo superior de contraer la enfermedad.
En el tratamiento de la enfermedad, el ARNdc
puede ponerse en contacto con las células o tejido que presentan la
enfermedad. Por ejemplo, ARNdc sustancialmente idéntico a todo o
parte de un gen mutado asociado con el cáncer, o uno que se exprese
a altos niveles en células tumorales, por ejemplo cinasa aurora,
puede ponerse en contacto con o introducirse en una célula
cancerosa o gen tumoral. Ejemplos de cánceres con los que puede
utilizarse la presente invención para prevenirlos o tratarlos
incluyen tumores sólidos y leucemias, incluyendo: apudoma,
coristoma, branquioma, síndrome carcinoide maligno, enfermedad
cardiaca carcinoide, carcinoma (por ejemplo, de Walker, de células
basales, basoescamoso, de Brown-Pearce, ductal,
tumor de Ehrlich, in situ, de Krebs 2, de células de Merkel,
mucinoso, de pulmón no microcítico, de células en grano de avena,
papilar, escirro, bronquiolar, broncogénico, epidermoide y de
células de transición), trastornos histiocíticos, leucemia (por
ejemplo, de células B, de células mixtas, de células nulas, de
células T, crónica de células T, asociada a HTLV-II,
linfocítica aguda, linfocítica crónica, de mastocitos y mieloide),
histiocitosis maligna, enfermedad de Hodgkin, linfoma no Hodgkin,
inmunoproliferativo de células pequeñas, plasmacitoma,
reticuloendoteliosis, melanoma, condroblastoma, condroma,
condrosarcoma, fibroma, fibrosarcoma, tumores de células gigantes,
histiocitoma, lipoma, liposarcoma, mesotelioma, mixoma,
mixosarcoma, osteoma, osteosarcoma, sarcoma de Ewing, sinovioma,
adenofibroma, adenolinfoma, carcinosarcoma, cordoma,
craneo-faringioma, disgerminoma, hamartoma,
mesenquimoma, mesonefroma, miosarcoma, ameloblastoma, cementoma,
odontoma, teratoma, timoma, tumor trofoblástico,
adeno-carcinoma, adenoma, colangioma, colesteatoma,
cilindroma, cistoadenocarcinoma, cistoadenoma, tumor de las células
de la granulosa, ginandroblastoma, hepatoma, hidradenoma, tumor de
las células del islote, tumor de las células de Leydig, papiloma,
tumor de las células de Sertoli, tumor de las células de la teca,
leiomioma, leiomiosarcoma, mioblastoma, mioma, miosarcoma,
rabdomioma, rabdomiosarcoma, ependimoma, ganglioneuroma, glioma,
meduloblastoma, meningioma, neurilemoma, neuroblastoma,
neuroepitelioma, neurofibroma, neuroma, paraganglioma,
quimiodectaoma, angioqueratoma, hiperplasia angiolinfoide con
eosinofilia, hemangioma esclerosante, angiomatosis, glomangioma,
hemangioendotelioma, hemangioma, hemangiopericitoma,
hemangiosarcoma, linfangioma, linfangiomioma, linfangiosarcoma,
pinealoma, carcinosarcoma, condrosarcoma, cistosarcoma, filoides,
fibrosarcoma, hemangiosarcoma, leimiosarcoma, leucosarcoma,
liposarcoma, linfangiosarcoma, miosarcoma, mixosarcoma, carcinoma
ovárico, rabdomiosarcoma, sarcoma (por ejemplo, de Ewing,
experimental, de Kaposi, y de mastocitos), neoplasias (por ejemplo,
óseas, de mama, del sistema digestivo, colorrectales, hepáticas,
pancreáticas, hipofisarias, testiculares, orbitales, de cabeza y
cuello, del sistema nervioso central, de oído, pélvicas, del aparato
respiratorio y genitourinario), neurofibromatosis y displasia del
cuello uterino, y otros estados en los que las células se han
inmortalizado o transformado. La invención podría utilizarse en
combinación con otros tratamientos, tales como quimioterapia,
crioterapia, hipertermia, radioterapia y similares.
La presente invención también puede utilizarse en
el tratamiento y la profilaxis de otras enfermedades, especialmente
aquellas asociadas con la expresión o sobreexpresión de un gen o
genes particulares. Por ejemplo, podría inhibirse la expresión de
genes asociados con la respuesta inmunitaria para tratar/prevenir
enfermedades autoinmunitarias tales como la artritis reumatoide,
enfermedad de injerto contra huésped, etc. En tal tratamiento, el
ARNdc puede utilizarse junto con fármacos inmunosupresores. Los
fármacos inmunosupresores utilizados más comúnmente incluyen
actualmente costicosteroides e inhibidores más potentes como, por
ejemplo, metotrexato, sulfasalazina, hidroxicloroquina,
6-MP/azatioprina y ciclosporina. Sin embargo, todos
estos tratamientos tienen graves efectos secundarios relacionados
con la toxicidad, y es urgente la necesidad de fármacos que
permitieran su eliminación o la reducción de su uso. Otros fármacos
inmunosupresores incluyen los tratamientos no esteroideos más
suaves, pero no menos potentes tales como aspirina e ibuprofeno, y
una nueva clase de reactivos que se basan en funciones moduladoras
inmunitarias más específicas. Esta última clase incluye
interleucinas, citocinas, moléculas de adhesión recombinantes y
anticuerpos monoclonales. El uso de ARNdc para inhibir un gen
asociado con la respuesta inmunitaria en un protocolo de tratamiento
inmunosupresor podría aumentar la eficacia de la inmunosupresión, y
particularmente, puede permitir que se disminuyan las cantidades
administradas de otros fármacos, que tienen efectos adversos
tóxicos u otros.
Las clases siguientes de posibles genes diana son
ejemplos de los genes con los que puede utilizarse la presente
invención para inhibirlos: genes de desarrollo (por ejemplo,
moléculas de adhesión, inhibidores de la cinasa dependiente de
ciclina, miembros de la familia Wnt, miembros de la familia Pax,
miembros de la familia Winged helix, miembros de la familia Hox,
citocinas/linfocinas y sus receptores, factores de
crecimiento/diferenciación y sus receptores, neurotransmisores y sus
receptores); oncogenes (por ejemplo, ABLI, BCL1, BCL2, BCL6, CBFA2,
CBL, CSFIR, ERBA, ERBB, EBRB2, ETS1, ETS1, ETV6, FGR, FOS, FYN, HCR,
HRAS, JUN, KRAS, LCK, LYN, MDM2, MLL, MYB, MYC, MYCL1, MYCN, NRAS,
PIM1, PML, RET, SRC, TAL1, TCL3 y YES); genes supresores de tumores
(por ejemplo, APC, BRCA1, BRCA2, MADH4, MCC, NF1, NF2, RB1, TP53 y
WT1); y enzimas (por ejemplo, ACP desaturasas e hidroxilasas,
ADP-glucosa piroforilasas, ATPasas, alcohol
deshidrogenasas, amilasas, amiloglucosidasas, catalasas, celulasas,
ciclooxigenasas, descarboxilasas, dextrinasas, ADN y ARN
polimerasas, galactosidasas, glucanasas, glucosa oxidasas, GTPasas,
helicasas, hemicelulasas, integrasas, invertasas, isomerasas,
cinasas, lactasas, lipasas, lipoxigenasas, lisozimas,
pectinesterasas, peroxidasas, fosfatasas, fosfolipasas,
fosforilasas, poligalacturonasas, proteinasas y peptidasas,
pulanasas, recombinasas, trascriptasas inversas, topoisomerasas
y
xilanasas).
xilanasas).
En una realización preferida del primer aspecto,
el ARNdc no se deriva de
\beta-glucuronidasa. En un aspecto
adicional, la presente invención proporciona un método in
vitro para inhibir la expresión de un gen diana en una célula de
mamífero, comprendiendo el método:
introducir en la célula un ARN que comprende una
estructura de doble cadena que tiene una secuencia de nucleótidos
que es idéntica en al menos un 80% a al menos una parte del gen
diana o que puede hibridarse con una parte del transcrito del gen
diana en las siguientes condiciones: hibridación en NaCl 400 mM,
PIPES 40 mM pH 6,4, EDTA 1 mM, a 50ºC o 70ºC durante
12-16 horas, seguido por lavado, y que se deriva de
un molde endógeno, en el que el ARNdc no se deriva de
\beta-glucuronidasa, en el que la célula
de mamífero es una célula somática, un ovocito no humano o una
célula de un embrión antes de la implantación no humano.
La inhibición de la expresión de un gen diana
puede verificarse observando o detectando la ausencia o una
disminución visible en el nivel de proteína codificada por un gen
diana (esto puede detectarse, por ejemplo, mediante un anticuerpo
específico u otras técnicas conocidas para la persona experta) y/o
el producto de ARNm de ese gen diana (esto puede detectarse, por
ejemplo, mediante estudios de hibridación) y/o el fenotipo asociado
con la expresión del gen. En el contexto de un tratamiento médico,
la verificación de la inhibición de la expresión de un gen diana
puede ser observando un cambio en el estado patológico de un
sujeto, tal como una reducción de los síntomas, remisión, un cambio
en el estado patológico, etcétera. Preferiblemente, la inhibición es
específica, es decir, la expresión del gen diana se inhibe sin
efectos evidentes sobre los demás genes de la célula.
La cantidad de ARNdc administrado a un mamífero
para la inhibición génica eficaz variará entre límites amplios según
una variedad de factores, incluyendo la vía de administración, la
edad, tamaño y estado del mamífero, el gen que va a inhibirse, la
enfermedad o trastorno que va a tratarse, etcétera. Los presentes
inventores han encontrado que, cuando se inyectan 10 pl en un
ovocito no humano o un embrión temprano no humano, son eficaces
disoluciones que tienen ARNdc a una concentración en el intervalo
de desde 0,01 a 40 mg/ml, preferiblemente de 0,1 a 4 mg/ml y lo más
preferido de 0,1 a 2 mg/ml. Por tanto, el ARNdc puede administrarse
para proporcionar de 0,1 a 400 pg, preferiblemente de 1 a 40 pg, y
lo más preferido de 1 a 20 pg a cada célula.
La célula que tiene el gen diana puede ser
somática, totipotente, Pluripotente, en división, que no está en
división, del epitelio, inmortalizada o transformada, procedente de
la línea germinal no humana o similar. La célula puede ser una
célula madre o una célula diferenciada. Los tipos celulares que se
diferencian incluyen adipocitos, fibroblastos, miocitos,
cardiomiocitos, endotelio, neuronas, glía, células sanguíneas,
megacariocitos, linfocitos, macrófagos, neutrófilos, eosinófilos,
basófilos, mastocitos, leucocitos, granulocitos, queratinocitos,
condrocitos, osteoblastos, osteoclastos, hepatocitos y células de
las glándulas endocrinas y exocrinas. La célula puede ser cualquier
célula individual del embrión temprano no humano, y puede ser un
blastocito no humano. Alternativamente, puede ser un ovocito no
humano.
Se sabe que las células de mamífero pueden
responder a ARNdc extracelular y, por tanto, pueden tener un
mecanismo de transporte para el ARNdc (Asher, et al, Nature
223 715-717 (1969)). Por tanto, el ARNdc
puede administrarse de manera extracelular en una cavidad, espacio
intersticial, en la circulación de un mamífero o introducirse por
vía oral. Los métodos para la introducción oral incluyen el mezclado
directo del ARN con los alimentos del mamífero, así como enfoques
de ingeniería genética en los que una especie que se utiliza como
alimento se modifica por ingeniería genética para expresar el ARN,
luego se alimenta al mamífero que va a afectarse. Por ejemplo,
pueden transformarse bacterias de los alimentos, tales como
Lactococcus lactis, para producir el ARNdc (véanse los
documentos WO93/17117, WO97/14806). La circulación vascular o
extravascular, los sistemas sanguíneo o linfático y el líquido
cefalorraquídeo son sitios en los que puede inyectarse el ARN.
El ARN puede introducirse en la célula de manera
intracelular. Los métodos físicos de introducción de ácidos
nucleicos también pueden utilizarse a este respecto. Los ARNdc
también pueden administrarse utilizando las técnicas de
microinyección descritas en Zernicka-Goetz,. et
al. Development 124, 1133-1137
(1997) y Wianny, et al. Chromosoma 107,
430-439 (1998).
Otros métodos físicos de introducción de ácidos
nucleicos de manera intracelular incluyen el bombardeo con
partículas recubiertas por el ARN, por ejemplo, la tecnología de la
pistola génica en la que se inmoviliza el ARNdc sobre partículas de
oro y se lanzan directamente en el sitio de la herida. Por tanto,
la invención proporciona el uso de un ARN que comprende una
estructura de doble cadena que tiene una secuencia de nucleótidos,
que es sustancialmente idéntica a al menos una parte de un gen diana
en una célula de mamífero y que se deriva de un molde endógeno, en
una pistola génica para inhibir la expresión del gen diana. Además,
se proporciona una composición adecuada para el tratamiento con
pistola génica que comprende: un ARN que comprende una estructura de
doble cadena que tiene una secuencia de nucleótidos, que es
sustancialmente idéntica a al menos una parte de un gen diana en
una célula de mamífero y que se deriva de un molde endógeno; y
partículas de oro. Un método físico alternativo incluye la
electroporación de membranas celulares en presencia del ARN. El
ARNdc puede introducirse en células embrionarias no humanas
mediante electroporación utilizando condiciones similares a las
aplicadas generalmente a células en cultivo. Las condiciones
precisas para la electroporación dependen del dispositivo utilizado
para producir el electrochoque y las dimensiones de la cámara
utilizada para contener los embriones. Este método permite la ARNi a
gran escala. Puede utilizarse cualquier terapia génica conocida
para administrar el ARN. Un constructo viral empaquetado en una
partícula viral conseguiría tanto la introducción eficaz de un
constructo de expresión en la célula como la transcripción del ARN
codificado por el constructo de expresión. Pueden utilizarse otros
métodos conocidos en la técnica para la introducción de ácidos
nucleicos en células, tales como el transporte de portadores mediado
por lípidos, el transporte mediado por compuestos químicos, tales
como el fosfato de calcio, y similares. Por tanto, el ARN puede
introducirse junto con componentes que realizan una o más de las
siguientes actividades: potenciar la captación de ARN por la célula,
promover la hibridación de las hebras del dúplex, estabilizar las
hebras hibridadas, o si no, aumentar la inhibición del gen diana.
Puede producirse un mamífero transgénico no humano que expresa ARN a
partir de un constructo recombinante introduciendo el constructo en
un cigoto, una célula madre embrionaria, u otra célula multipotente
derivada del mamífero adecuado.
En otro aspecto, la invención proporciona el uso
de un ARN, o un vector de expresión que codifica para tal ARN, según
se define en el primer aspecto, en la fabricación de un medicamento
para inhibir la expresión de un gen diana en una célula de
mamífero, en el que el gen diana produce o es probable que produzca
una enfermedad, y en el que la célula de mamífero es una célula
somática o una célula de un embrión antes de la implantación no
humano.
El medicamento se suministrará normalmente como
parte de una composición farmacéutica, estéril que incluirá
normalmente un vehículo farmacéuticamente aceptable. Por tanto, la
invención también proporciona una formulación farmacéutica que
comprende un ARN según se define en el primer aspecto, o un vector
de expresión que codifica para tal ARN, junto con un vehículo
farmacéuticamente aceptable.
La composición farmacéutica puede estar en
cualquier forma adecuada (dependiendo del método deseado para
administrársela al paciente). Puede proporcionarse en una forma
farmacéutica unitaria, generalmente se facilitará en un envase
sellado y puede proporcionarse como parte de un kit.
Tal kit normalmente incluiría (aunque no
necesariamente) instrucciones para su uso. Puede incluir una
pluralidad de dichas formas farmacéuticas unitarias.
La composición farmacéutica puede adaptarse para
la administración por cualquier vía apropiada, por ejemplo por la
vía oral (incluyendo bucal y sublingual), rectal, nasal, tópica
(incluyendo bucal, sublingual y transdérmica), vaginal o parenteral
(incluyendo subcutánea, intramuscular, intravenosa o intradérmica).
Tales composiciones pueden prepararse mediante cualquier método
conocido en la técnica de la farmacia, por ejemplo, mezclando el
principio activo con el (los) vehículo(s) o
excipiente(s) en condiciones estériles.
Las composiciones farmacéuticas adaptadas para la
administración oral pueden presentarse como unidades diferenciadas
tales como cápsulas o comprimidos; como polvos o gránulos; como
disoluciones, jarabes o suspensiones (en líquidos acuosos o no
acuosos; o como batidos o espumas comestibles; o como emulsiones).
Los excipientes adecuados para los comprimidos o cápsulas de
gelatina dura incluyen lactosa, almidón de maíz o derivados de los
mismos, ácido esteárico o sales del mismo. Los excipientes
adecuados para su uso con cápsulas de gelatina blanda incluyen, por
ejemplo, aceites vegetales, ceras, grasas, polioles semisólidos o
líquidos, etc.
Para la preparación de disoluciones y jarabes,
los excipientes que pueden utilizarse incluyen, por ejemplo, agua,
polioles y azúcares, para la preparación de suspensiones aceitosas
(por ejemplo, aceites vegetales) pueden utilizarse para proporcionar
suspensiones de aceite en agua o de agua en aceite.
Las composiciones farmacéuticas adaptadas para la
administración tópica pueden formularse como pomadas, cremas,
suspensiones, lociones, polvos, disoluciones, pastas, geles, spray,
aerosoles o aceites. Para infecciones oculares o de otros tejidos
externos, por ejemplo la boca y la piel, las composiciones se
aplican preferiblemente como una pomada o crema tópica. Cuando se
formulan en una pomada, el principio activo puede emplearse con una
base de pomada parafínica o miscible en agua. Alternativamente, el
principio activo puede formularse en una crema con una base de crema
de aceite en agua o una base de agua en aceite. Las composiciones
farmacéuticas adaptadas para la administración tópica ocular
incluyen colirios, en los que el principio activo se disuelve o
suspende en un vehículo adecuado, especialmente un disolvente
acuoso. Las composiciones farmacéuticas adaptadas para la
administración tópica bucal incluyen pastillas para chupar,
pastillas y enjuagues bucales.
Las composiciones farmacéuticas adaptadas para la
administración rectal pueden presentarse como supositorios o
enemas.
Las composiciones farmacéuticas adaptadas para la
administración nasal, en las que el vehículo es un sólido incluyen
un polvo grueso que tiene un tamaño de partícula, por ejemplo, en
el intervalo de 20 a 500 \mum, que se administran de la manera en
que se toma rapé, es decir, mediante inhalación rápida a través de
las fosas nasales desde un recipiente con el polvo sostenido cerca
de la nariz. Las composiciones adecuadas en las que el vehículo es
un líquido, para la administración como un aerosol nasal o como
gotas nasales, incluyen disoluciones acuosas o en aceite del
principio activo.
Las composiciones farmacéuticas adaptadas para la
administración mediante inhalación incluyen polvos o nieblas de
partículas finas que pueden generarse por medio de diversos tipos
de aerosoles, nebulizadores o insufladores presurizados de dosis
medidas.
Las composiciones farmacéuticas adaptadas para la
administración vaginal pueden presentarse como óvulos vaginales,
tampones, cremas, geles, pastas, espumas o formulaciones en
spray.
Las composiciones farmacéuticas adaptadas para la
administración parenteral incluyen una disolución para inyección,
estéril, acuosa o no acuosa, que puede contener antioxidantes,
tampones, bacterióstatos y solutos que hacen que la formulación sea
sustancialmente isotónica con la sangre del receptor pretendido; y
suspensiones estériles, acuosas y no acuosas, que pueden incluir
agentes de suspensión y agentes espesantes. Los excipientes que
pueden utilizarse para las disoluciones inyectables incluyen agua,
alcoholes, polioles, glicerina y aceites vegetales, por ejemplo. Las
composiciones pueden presentarse en envases de dosis unitaria o de
múltiples dosis, por ejemplo, ampollas y viales sellados, y pueden
almacenarse en un estado liofilizado (criodesecado) que solamente
requiere la adición del vehículo líquido estéril, por ejemplo, agua
para inyección, inmediatamente antes de su uso. Pueden prepararse
disoluciones y suspensiones para la inyección extemporánea a partir
de polvos, gránulos y comprimidos estériles.
Las composiciones farmacéuticas pueden contener
agentes conservantes, agentes de solubilización, agentes de
estabilización, agentes humectantes, emulsionantes, edulcorantes,
colorantes, odorizantes, sales (las propias sustancias de la
presente invención pueden proporcionarse en forma de una sal
farmacéuticamente aceptable), tampones, agentes de recubrimiento o
antioxidantes. Pueden contener también agentes terapéuticamente
aceptables además de la sustancia de la presente invención.
Las dosificaciones de la sustancia de la presente
invención pueden variar entre límites amplios, dependiendo de la
enfermedad o trastorno que va a tratarse, la edad y el estado del
individuo que va a tratarse, etc. y un médico determinará en última
instancia las dosificaciones apropiadas que van a utilizarse. Esta
dosificación puede repetirse tan a menudo como sea apropiado. Si se
desarrollan efectos secundarios, pueden reducirse la cantidad y/o
frecuencia de la dosificación, según la práctica clínica normal.
La presente invención puede utilizarse sola o
como componente de un kit que tiene al menos uno de los reactivos
necesarios para llevar a cabo la introducción in vitro o
in vivo de ARN en sujetos. Los componentes preferidos son el
ARNdc y un vehículo que promueva la introducción del ARNdc. Tal kit
puede incluir también instrucciones para permitir al usuario del
kit poner en práctica la invención.
Según un aspecto adicional de la presente
invención, se proporciona un kit para inhibir la expresión de un gen
diana en una célula de mamífero, comprendiendo el kit:
ARN que comprende una estructura de doble cadena
que tiene una secuencia de nucleótidos que es idéntica en al menos
un 80% a al menos una parte del gen diana en una célula de mamífero
o que puede hibridarse con una parte del transcrito del gen diana
en las siguientes condiciones: hibridación en NaCl 400 mM, PIPES 40
mM pH 6,4, EDTA 1 mM, a 50ºC o 70ºC durante 12-16
horas, seguido por lavado, y que se deriva de un molde endógeno, o
un vector de expresión que codifica para tal ARN; y
un vehículo que promueve la introducción del ARN
o vector en la célula de mamífero,
en el que el ARN no se deriva del gen que
codifica para la \beta- glucuronidasa y en el que la célula
de mamífero es una célula somática, un ovocito no humano o una
célula de un embrión antes de la implantación no humano.
La presente invención puede utilizarse para
manipular la expresión génica en el ovocito no humano para tratar la
infertilidad. También puede utilizarse para regular los procesos de
disyunción cromosómica en mamíferos no humanos. En los seres
humanos, hay un aumento de la incidencia de la no disyunción
cromosómica en madres mayores de 35 años de edad, que conduce a
hijos con síndrome de Down y abortos espontáneos. Ahora se sabe que
varias moléculas reguladoras del ciclo celular promueven varios
aspectos de la progresión del ciclo que incluyen cinasas
dependientes de ciclina, ciclinas, cinasa polo, cinasa aurora,
cinasa min A, proteín fosfatasas, compuestos del complejo que
promueve la anafase y sus moléculas reguladoras, compuestos del
proteosoma, el complejo SCF, compuestos del centrosoma, componentes
del cinetocoro, proteínas estructurales de los cromosomas, enzimas
de replicación del ADN, proteínas de recombinación del ADN y
proteínas de reparación del ADN. La invención puede utilizarse en
seres no humanos para modular la expresión de una o más de las
proteínas anteriores para garantizar la segregación correcta de los
cromosomas.
La invención también puede utilizarse para
manipular las fases del ciclo celular de cigotos enucleados
receptores y células donantes que proporcionan los núcleos para la
clonación de mamíferos no humanos (véase el documento WO97/07668).
La experiencia con la clonación de ovejas y ratones muestra una
necesidad de optimizar la fase del ciclo celular del cigoto
receptor antes de su enucleación, y de quitar los núcleos de las
células en una fase específica, frecuente pero no necesariamente,
células en G_{O}. La aplicación de la presente invención para
detener una o más moléculas del ciclo celular indicada anteriormente
puede utilizarse para este fin.
La presente invención puede utilizarse también
para dirigir patrones de expresión génica en células pluripotentes
con el fin de producir tipos celulares diferenciados específicos,
para su uso en el trasplante para sustituir tejido enfermo o de
otro modo no funcional. Un ejemplo de células pluripotentes son las
células madre embrionarias (ME) procedentes de embriones antes de
la implantación no humanos. Se conoce bien en la técnica que las
células ME de ratón pueden reintroducirse en el blastocisto, con lo
que quedan incorporadas en el embrión en desarrollo, desarrollarse y
diferenciarse en todos los tipos celulares y estructuras del
organismo. Las células ME también pueden inducirse para que se
diferencien in vitro en una amplia gama de tipos celulares
tras la eliminación de factores de crecimiento específicos del
medio de cultivo. Se espera que puedan establecerse líneas
celulares ME a partir de todos los mamíferos y, de hecho, ya se han
establecido métodos para establecer líneas celulares ME humanas. La
diferenciación de tipos celulares pluripotentes en tipos celulares
específicos requiere que ciertas rutas de la expresión génica se
desconecten y otras se conecten. La presente invención puede
aplicarse para eliminar proteínas clave en tales rutas reguladoras,
con el fin de dirigir células ME y otras embrionarias a que se
diferencien en tipos celulares específicos. Por tanto, la invención
puede utilizarse para interferir en la expresión de genes del
desarrollo (tales como los mencionados en el presente documento)
para dirigir la diferenciación celular a lo largo de rutas
preferidas. También se sabe que ciertos tipos celulares completan su
diferenciación con la salida del ciclo de división celular. Por
tanto, la invención puede utilizarse para inhibir moléculas
reguladoras del ciclo celular, tal como las enumeradas
anteriormente. Estos ARNdc pueden utilizarse directamente o
expresarse a partir de promotores que se pueden regular para llevar
a cabo las fases finales de la diferenciación celular.
La invención también proporciona una célula de
mamífero aislada que contiene un constructo de expresión,
codificando el constructo para un ARN que forma una estructura de
doble cadena que tiene una secuencia de nucleótidos que es idéntica
en al menos un 80% a al menos una parte del gen diana o que puede
hibridarse con una parte del transcrito del gen diana en las
siguientes condiciones: hibridación en NaCl 400 mM, PIPES 40 mM pH
6,4, EDTA 1 mM, a 50ºC o 70ºC durante 12-16 horas,
seguido por lavado, y que se deriva de un molde endógeno, en el que
la célula de mamífero es una célula somática, un ovocito no humano
o una célula de un embrión antes de la implantación no humano.
Cuando se utiliza en el presente documento,
"tratamiento/terapia" incluyen cualquier régimen que pueda
beneficiar a un ser humano o animal no humano, y "que
comprende/que tiene" cubre todo aquello que consista solamente en
un rasgo/característica específico, así como todo aquello con ese
rasgo/característica, pero que también tiene uno o más
rasgos/características adicionales.
Las características preferidas de cada aspecto de
la invención son, como para cada uno de los demás aspectos,
mutatis mutandi.
Ahora se describirá la presente invención
adicionalmente en los siguientes ejemplos. Se hace referencia a los
dibujos adjuntos:
Figura 1: El ARNdc de MmGFP suprime la
expresión de MmGPF en embriones transgénicos MmGFP
(a-c) Embriones representativos
de 131 embriones obtenidos a partir de once apareamientos
diferentes entre hembras F1 y machos transgénicos MmGFP. Embriones
transgénicos MmGFP en la fase de 4 -6 células (a), mórula (b),
blastocistos (c). Se obtuvo un patrón similar de expresión tras la
inyección de ARN de MmGFP complementario.
(d-f) Embriones representativos de 147 embriones
transgénicos MmGFP a los que se había inyectado ARNdc de
MmGFP en la fase de una célula. Embriones en la fase de
4-6 células (d), mórula (e), blastocisto (f).
(g-i) Embriones representativos de 18 embriones
transgénicos MmGFP a los que se había inyectado ARNdc de
c-mos en la fase de una célula, Embriones en
la fase de 6 células (g), mórula (h), blastocisto (i). Las barras de
escala representan 20 \mum. El sombreado indica fluorescencia
verde.
Figura 2: Interferencia en la expresión de ARNm
de MmGFP sintético inyectado.
(a), mórulas de tipo natural a las que se inyecta
ARNm de MmGFP solo; (b), junto con ARNdc de
E-cadherina; y (c), junto con ARNdc de
MmGFP, en la fase de una célula. Las barras de escala
representan 20 \mum. El sombreado indica fluorescencia verde.
Figura 3: La inyección de ARNdc de
E-cadherina al cigoto reduce la expresión de
E-cadherina y altera el desarrollo de los embriones
a los que se ha inyectado.
(a), Tinción inmunofluorescente de
E-cadherina en embriones a los que se les inyectó
en la fase de una célula ARNdc de MmGFP, y se cultivaron
durante cuatro días in vitro hasta la fase de blastocisto.
(b), Tinción inmunofluorescente de E-cadherina en
embriones a los que se les inyectó en la fase de una célula ARNdc
de E-cadherina, y se cultivaron durante
cuatro días in vitro. Obsérvese el desarrollo alterado de
estos embriones. Las barras de escala representan 20 \mum. (c),
Análisis por inmunotransferencia (Western blot) de la expresión de
E-cadherina en los cigotos, mórulas no inyectadas
(recogidas en la fase de una célula y cultivadas in vitro
tres días), mórulas a las que se les inyectó en la fase de una
célula 2 mg ml^{-1} de ARNdc de GFP y se cultivaron in
vitro durante tres días, mórulas a las que se les inyectó en la
fase de una célula 2 mg ml^{-1} de ARNdc de
E-cadherina y se cultivaron in vitro
durante tres días. En cada caso, se extrajeron las proteínas de 15
embriones. Este experimento se ha repetido tres veces con el mismo
resultado. La reducción de la señal tras la inyección de ARNdc de
E-cadherina fue de aproximadamente 6,5 veces.
Las barras de escala representan 20 \mum. El sombreado indica
quimioluminiscencia.
Figura 4: La inyección de ARNdc de
c-mos en ovocitos inmaduros inhibe la
expresión de c-mos y produce activación
partenogenética.
(a-d) Ejemplos de cigotos
activados partenogenéticamente obtenidos tras la inyección de ARNdc
de c-mos en ovocitos en la fase de vesícula
germinal. (a), Ovocito control detenido en la metafase II; (b),
embrión de una célula (la flecha blanca señala el pronúcleo); (c),
embrión de dos células; (d), embrión de cuatro células. Las barras
de escala representan 20 \mum. (e), Análisis por
inmunotransferencia de la expresión de c-mos en
ovocitos detenidos en la metafase II, ovocitos a los que se les
inyectó en la fase de vesícula germinal 2 mg ml^{-1} de ARNdc de
MmGFP y se cultivaron in vitro durante 12 horas,
ovocitos a los que se les inyectó en la fase de vesícula germinal 2
mg ml^{-1} de ARNdc de c-mos y se
cultivaron in vitro durante 12 horas. En cada caso, se
extrajeron las proteínas de 35 ovocitos. Este experimento se ha
repetido dos veces con el mismo resultado.
Figura 5: La inhibición de la expresión génica
tras la inyección de ARN de doble cadena se limita al linaje clonal
derivado de la célula inyectada.
La tinción inmunofluorescente de
E-cadherina en embriones a los que se les inyectó
en una célula, en la fase de dos células, ARNdc de
E-cadherina y ARNm de MmGFP sintético. Los
paneles de la izquierda muestran la fluorescencia (roja) de canal
único que revela E-cadherina. Obsérvese que la
tinción se reduce notablemente en la descendencia de la célula
inyectada. Estas células de descendencia se identifican en los
correspondientes canales segundos (verdes) como células que expresan
MmGFP.
Se recogieron ovocitos inmaduros detenidos en la
profase I de la meiosis de los ovarios de ratones F1 de
4-6 semanas (CBA x C57B1) en medio FHM (Speciality
media, Inc. Lavalette, N.J.) complementado con albúmina de suero
bovino (BSA) (4 mg ml^{-1}). Los ratones hembra F1 se sometieron
a superovulación mediante inyecciones intraperitoneales de
gonadotropina sérica de yegua preñada (PMSG, 5 u.i.) y
gonadotropina coriónica humana (GCh) separadas 48-52
horas. Se obtuvieron embriones de 1 célula fertilizados a partir de
hembras apareadas 20-24 horas después de la GCh.
Los moldes utilizados para la síntesis de ARN
fueron plásmidos linealizados. Se clonó ADNc de MmGFP de
longitud completa (714 pb) en el plásmido T7TS
(Zernicka-Goetz,. et al. Development
124, 1133-1137 (1997)). Se clonó un fragmento
KpnI/HindIII de ADNc de c-mos (550 pb)
(Colledge et al, Nature 370, 665-68
(1994)) en Bluescript pSK. Se clonó un ADNc correspondiente al exón
4-exón 8 de E-cadherina (580
pb) (Larue et al, Proc Nat Acad Sci USA 92,
55-859 (1995)) en Bluescript pSK. Los ARN se
sintetizaron utilizando las polimerasas T3 o T7, utilizando el kit
Megascripts (Ambion). Se eliminaron los moldes de ADN con
tratamiento con ADNasa. Los productos de ARN se extrajeron con
fenol/cloroformo y se precipitaron con etanol.
Para la hibridación, se mezclaron cantidades
equimolares de ARN codificante y complementario en el tampón de
hibridación (Tris 10 mM, pH 7,4, EDTA 0,1 mM) hasta una
concentración final de 2 \muM cada uno, se calentaron durante 10
minutos a 68ºC y se incubaron a 37ºC durante 3-4
horas. Para evitar la presencia de ARN de cadena sencilla
contaminante en las muestras de ARNdc, las preparaciones se
trataron con 2 \mug/ml de ARNasa T1 (Calbiochem) y
1 \mug/ml de ARNasa A (Sigma) durante 30 minutos a 37ºC. los ARNdc se trataron entonces con 140 \mug/ml de proteinasa K (Sigma), se extrajeron con fenol/cloroformo y se precipitaron con etanol. Se confirmó la formación de ARNdc mediante su migración sobre un gel de agarosa: para cada ARNdc, se desplazó la movilidad en el gel comparado con los ARNcs. Para la comparación de ARN complementarios y de doble cadena, se infectaron masas iguales de ARN.
1 \mug/ml de ARNasa A (Sigma) durante 30 minutos a 37ºC. los ARNdc se trataron entonces con 140 \mug/ml de proteinasa K (Sigma), se extrajeron con fenol/cloroformo y se precipitaron con etanol. Se confirmó la formación de ARNdc mediante su migración sobre un gel de agarosa: para cada ARNdc, se desplazó la movilidad en el gel comparado con los ARNcs. Para la comparación de ARN complementarios y de doble cadena, se infectaron masas iguales de ARN.
Los ARN se diluyeron en agua, hasta una
concentración final de 2 a 4 mg ml^{-1}. El intervalo de
concentraciones eficaces se ilustra mejor mediante el experimento
con c-mos (tabla 2) debido a la sensibilidad de
este fenotipo biológico. Se microinyectaron los ARNm en el
citoplasma de los ovocitos o embriones, utilizando un sistema de
flujo constante (Transjector, Eppendorf) tal como se ha descrito
(Zernicka-Goetz en Cell lineage and fate
determination (ed. Moody, S. A.) 521-527
(Academic Press, San Diego, CA, 1999)). Se inyectó a cada ovocito o
embrión aproximadamente 10 pl de ARNdc. Se consiguió una
penetrancia mejorada utilizando una capacitancia negativa. Tras la
microinyección, los ovocitos y embriones se cultivaron en medio KSOM
(Speciality media, Inc. Lavalette, N.J.) complementado con 4 mg
ml^{-1} de BSA, a 37ºC en una atmósfera de CO_{2} al 5%. Se
observaron los embriones transgénicos MmGFP mediante microscopía
confocal (cabezal de exploración Biorad 1024 en un microscopio
Nikon Eclipse 800).
Para el análisis de inmunotransferencia, las
muestras se sometieron a electroforesis en gel de
poliacrilamida-SDS y se transfirieron las proteínas
a una membrana de nitrocelulosa Hybond (Amersham). Las membranas se
preincubaron en tampón TBTS (Tris-HCl 20 mM, pH 8,2,
NaCl 150 mM, 0,1% de Tween-20) que contenía un 5%
(p/v) de leche desnatada en polvo durante la noche, para bloquear
la unión no específica de anticuerpos. Luego se incubaron con el
anticuerpo anti-E-cadherina
(DECMA-1) o el anticuerpo anti-mos
(SantaCruz Biotechnology), durante 1 hora, se lavaron con TBST, y
se incubaron con el anticuerpo secundario conjugado con peroxidasa
(SantaCruz Biotechnology), durante 1 hora y se lavaron de nuevo con
TBST. Los anticuerpos se diluyeron con TBST que contenía un 5%
(p/v) de leche desnatada en polvo. El anticuerpo secundario se
detectó mediante quimioluminiscencia intensificada (Amersham). Para
la inmunofluorescencia de la preparación microscópica completa con
el anticuerpo contra E-cadherina, se fijaron los
embriones en paraformaldehído al 2% durante 20 minutos a
temperatura ambiente, seguido por permeabilización con Triton
X-100 al 0,1% durante 10 minutos. Tras la
preincubación en BSA al 2% en PBS durante 30 minutos, se incubaron
los embriones con el anticuerpo
anti-E-cadherina durante 1 hora a
37ºC, y con un anticuerpo de cabra anti-rata
conjugado con rojo Texas (Jackson ImmunoResearch Laboratories, West
Grove, Pa., EE.UU.), durante 1 hora a 37ºC. Se observaron los
embriones utilizando el microscopio confocal de exploración láser
Biorad 1024.
Para determinar si podría utilizarse ARNdc para
evitar la expresión génica en el embrión de ratón, se desarrolló un
sistema de prueba experimental que utiliza una cepa transgénica de
ratones que expresa MmGFP bajo el control del promotor del factor de
elongación 1 \alpha (E1F\alpha)
(Zernicka-Goetz, M. en Cell lineage and fate
determination (ed. Moody, S. A.) 521-527
(Academic Press, san Diego, CA, 1999)). Esta línea ofreció la
ventaja de que la expresión de GFP puede visualizarse fácilmente en
embriones vivos y, dado que su función no es esencial, pudo
monitorizarse con efectos perjudiciales no específicos del ARNdc
sobre el desarrollo embrionario. Con el fin de evitar la
complicación de la perduración de los productos génicos maternos,
se utilizaron embriones heterocigóticos en los que el transgén se
derivó por vía paternal. El comienzo de la expresión de GFP en estos
embriones se observa mediante la aparición de células verdes tras
el inicio de la transcripción cigótica en la fase de dos
células.
Se pudo demostrar que la inyección de ARNdc de
MmGFP en el cigoto de una sola célula evitó el comienzo de
la aparición de fluorescencia verde en las fases de
2-4 células (figura 1). Tras la inyección, los
embriones se cultivaron in vitro durante 3-4
días hasta la fase de blastocisto. Aunque los embriones no
inyectados expresaron MmGFP de la manera esperada (figuras
1a-c), todos los embriones a los que se les inyectó
Mn-ARNdc mostraron una disminución drástica de la
fluorescencia verde en todo este periodo (figuras
1d-f), mostrando una proporción minoritaria (6,8%)
fluorescencia verde. Los embriones mostraron un desarrollo normal
antes y después de la implantación, demostrando que la inyección de
ARNdc no es tóxica.
La interferencia en la expresión génica es
específica porque, cuando se inyectó un ARNdc no relacionado
correspondiente a un segmento del transcrito de
c-mos en embriones transgénicos MnGFP, esto
no dio como resultado una disminución de la fluorescencia verde
(figura 1g-i). De manera similar, la inyección de
ARNdc correspondiente a un segmento del transcrito de
E-cadherina en cigotos transgénicos (59 embriones
observados) no dio como resultado una disminución de la
fluorescencia verde y no detuvo la síntesis de proteínas a través de
la cinasa dependiente de ARNdc, aunque el genotipo de tales
embriones fue anómalo (datos no mostrados, véase más adelante).
También se encontró que los cigotos transgénicos a los que se les
inyectó MnARN complementario mantuvieron la fluorescencia verde en
todas las fases previas a la implantación (37 embriones observados -
datos no mostrados).
También se intentó determinar si la expresión de
MmGFP a partir de ARNm de MmGFP de longitud total con
caperuza ("capped") podría eliminarse mediante la coinyección
de ARNdc de MmGFP.
Se encontró que la fluorescencia verde disminuía
enormemente o se suprimía en tales embriones inyectados (figura
2d). Esto fue a diferencia de los embriones a los que se les
inyectó ARN de MmGFP codificante o se les coinyectó tanto ARN de
MmGFP codificante como el ARNdc "irrelevante" para
E-cadherina (figuras 2a-b). Por
tanto, el ARNdc puede interferir tanto en la expresión de un gen
localizado en los cromosomas como de ARNm sintético introducido
mediante microinyección.
Se evaluaron las consecuencias específicas para
el desarrollo de inyectar ARNdc de E-cadherina. La
E-cadherina se expresa tanto por vía materna como
cigótica durante el desarrollo antes de la implantación. La
perturbación del gen E-cadherina, utilizando
recombinación homóloga para eliminar regiones de la molécula
esenciales para la función de adhesión, conduce a un grave defecto
antes de la implantación. Estos embriones pueden experimentar
inicialmente compactación, debido a la presencia de
E-cadherina expresada por vía materna. Sin embargo,
muestra un defecto en la cavitación y nunca forman blastocistos
normales (Larue, et al. Proc Natl Acad Sci U S A 91,
8263- 8267 (1994); Riethmacher, et al. Proc Natl Acad Sci U S
A, 92, 855-859 (1995)).
Se observó que tras la inyección de ARNdc de
E-cadherina, el fenotipo era idéntico al de
los embriones mutantes nulos. Por tanto, los embriones se
desarrollaron inicialmente de manera normal hasta la fase de
compactación de la mórula (datos no mostrados). Sin embargo,
solamente el 30% pudieron experimentar cavitación y formaron los
denominados "quistes", pero no formaron blastocistos normales
(Larue, et al. Proc Natl Acad Sci U S A 91,
8263-8267 (1994)) (tabla 1). Por el contrario, la
gran mayoría de los embriones no inyectados o los embriones control
a los que se les inyectó ARNdc de MmGFP experimentaron
cavitación y formaron blastocistos normales
(tabla 1).
(tabla 1).
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\vskip1.000000\baselineskip
El análisis de la expresión de
E-cadherina mediante inmunotinción e
inmunotransferencia muestra que la expresión de
E-cadherina disminuye drásticamente tras la
inyección de ARNdc de E-cadherina (figura
3b, c). Por el contrario, no se observó una disminución en la
expresión de E-cadherina en los embriones a
los que se les inyectó ARNdc de MmGFP, para los cuales el
nivel de expresión de E-cadherina fue
similar al de los embriones no inyectados control (figura 3c). El
nivel de E-cadherina en la fase de mórula en los
embriones a los que se les inyectó ARNdc de
E-cadherina, es inferior que en embriones
recién fertilizados antes de la inyección (figura 3c). Esta proteína
E-cadherina residual puede reflejar en gran
medida la persistencia de la proteína expresada por vía materna cuya
síntesis cesa durante la fase de 2 células (Sefton, et al,
Development 115, 313-318 (1992)). Esta
proteína materna residual está presente hasta la fase de
blastocisto tardía en embriones nulos homocigóticos (Larue, et
al. Proc Natl Acad Sci U S A 91,
8263-8267 (1994)).
Se concluye que la inyección de ARNdc de
E-cadherina conduce a una reducción
sorprendente de la proteína y, en consecuencia, un fenotipo similar
al de los embriones mutantes nulos.
Para determinar si podría utilizarse ARNdc para
interferir en los genes expresados por vía materna, se buscó un gen
modelo que tuviera un fenotipo deficiente característico.
C-mos es un componente esencial del factor
citostático, responsable de la detención del ovocito en maduración
en la metafase, en la segunda división meiótica. En ratones
c-mos -/-, entre el 60 y el 75% de los
ovocitos no mantiene esta detención en la metafase II e inicia un
desarrollo partenogenético (Colledge, et al, Nature
370, 65-68 (1994); Hashimoto, et al,
Nature 370, 68-71 (1994)). El ARNm de
c-mos está presente en ovocitos inmaduros de
crecimiento completo y su traducción se inicia a partir de moldes
maternos cuando la meiosis se reanuda tras la ruptura de la
vesícula germinal (Verlhac, et al. Development 122,
815-822 (1996)). Por tanto, la inyección de ARNdc
de c-mos permitiría que se probase si el
ARNdc podría interferir con la expresión de ARNm materno.
Cuando se inyecta ARNdc de
c-mos en ovocitos, aproximadamente el 63% no
mantiene la detención en la metafase II (tabla 2). De éstos, el 78%
inició desarrollo partenogenético y avanzó hasta embriones en la
fase de 2 a 4 células (figuras 4a, b, c). El resto experimentó
fragmentación. Ambos de estos acontecimientos se producen con
frecuencias similares en ovocitos mutantes nulos (Colledge, et
al, Nature 370, 65-68 (1994)). Por el
contrario, sólo el 1-2% de los ovocitos control, o
bien no inyectados o bien a los que se les inyectó ARNdc de
MmGFP, experimentó activación espontánea (tabla 2). Todavía
se pudo observar que el 42% de los ovocitos inyectados fracasó en
experimentar la detención de la metafase II, cuando se redujo la
concentración de ARNdc de c-mos 20 veces a
0,1 mg/ml (tabla 2). Ésta es una concentración significativamente
superior que la que se creía que era eficaz en C.elegans y
plantas, en las que se reivindica que se puede conseguir un efecto
con una cuantas moléculas de ARNdc por célula.
Se confirmó que el ARNdc de
c-mos interfiere en la expresión de
c-mos mediante un análisis de inmunotransferencia
llevado a cabo 12 horas después de la inyección de los ovocitos en
la fase de vesícula germinal, antes de que se hagan evidentes las
consecuencias fenotípicas de su pérdida de la expresión (figura
4e). Por tanto, la inyección de ARNdc de
c-mos en el ovocito interfiere
específicamente en la actividad de c-mos para
imitar la deleción dirigida de c-mos a través
de recombinación homóloga. Estos experimentos muestran que el ARNdc
puede bloquear la expresión de productos génicos proporcionados por
vía maternal.
Para evaluar si sería posible eliminar la
expresión de genes específicos en linajes definidos de células en
el embrión temprano de ratón, se microinyectó ARNdc para
E-cadherina en una célula de un embrión de
ratón en la fase de dos células, junto con ARNm sintético para
MmGFP, para marcar la célula inyectada. Los niveles de expresión de
E-cadherina y MmGFP se siguieron según se
desarrollaron estos embriones. La expresión de
E-cadherina se redujo específicamente en las células
derivadas del que se le inyectó ARNdc de
E-cadherina, marcándose el clon mediante la
expresión de MmGFP traducido a partir del ARNm inyectado en la
misma célula. Por tanto, en el embrión temprano de ratón, el efecto
del ARNdc no se transmite a las células vecinas. Por tanto, puede
utilizarse ARNdc en el embrión para regular los patrones de
expresión génica de manera diferencial entre linajes que tienen
diferentes destinos.
Se ha demostrado que el ARNdc puede utilizarse
como un inhibidor específico de la actividad génica en el ovocito
de ratón y el embrión antes de la implantación o temprano. Se
muestra que la especificidad del procedimiento inhibiendo
individualmente la expresión de 3 genes diferentes:
c-mos en el ovocito y
E-cadherina o un transgén de gfp en el
embrión temprano. En los casos de los dos genes de ratón endógenos,
esto da como resultado fenotipos comparables a los de los mutantes
nulos. Los experimentos para evitar la expresión del transgén de
gfp indican que la ARNi per se no afecta al
transcurso normal del desarrollo.
Dos de los experimentos apoyan la hipótesis de
que la ARNi actúa en el ratón induciendo la degradación de ARN
seleccionado como objetivo, o inhibiendo su traducción. En primer
lugar, se demuestra que la inyección de ARNdc de MmGFP inhibe
la expresión de ARNdc de MmGFP codificante coinyectado. En
segundo lugar, se inyectó ARNdc contra c-mos
en ovocitos antes de que se rompiera la vesícula germinal, la fase
en la que se ha acumulado ARNdc de c-mos pero
no se ha traducido todavía. C-mos se traduce cuando
se rompe la vesícula germinal, para detener los ovocitos en la
metafase II de la segunda división meiótica. Se encontró que el
ARNdc de c-mos evita su función; los
ovocitos avanzaron a través de la metafase II y experimentaron
activación partenogénetica. En cada caso, los efectos de la ARNi
persistieron durante suficiente tiempo para crear una fenocopia de
la pérdida de la función génica. Cuando se introduce ARNdc en
blastocistos tempranos, sigue siendo eficaz hasta las fases
tempranas después de la implantación. La herencia clonal del efecto
de ARNi indica que puede dirigirse hacia un patrón de actividad
génica en un linaje específico. Finalmente, como la ARNi funciona en
el desarrollo de peri-implantación, puede esperarse
que dé como resultado la eliminación de la expresión de los genes
diana en células madre embrionarias establecidas a partir de
embriones de ratón en esta fase del desarrollo, y esto puede
facilitar su diferenciación dirigida en tipos celulares
específicos.
Claims (35)
1. ARN que comprende una estructura de doble
cadena que tiene una secuencia de nucleótidos que es idéntica en al
menos un 80% a al menos una parte del gen diana en una célula de
mamífero o que puede hibridarse con una parte del transcrito del gen
diana en las siguientes condiciones: hibridación en NaCl 400 mM,
PIPES 40 mM pH 6,4, EDTA 1 mM, a 50ºC o 70ºC durante
12-16 horas, seguido por lavado, y que se deriva de
un molde endógeno, o un vector de expresión que codifica para tal
ARN, para su uso como un medicamento.
2. ARN, o vector de expresión que codifica para
tal ARN, según la reivindicación 1, en el que el gen diana es un
gen endógeno.
3. ARN, o vector de expresión que codifica para
tal ARN, según la reivindicación 1, en el que el gen diana es un
gen viral.
4. ARN, o vector de expresión que codifica para
tal ARN, según cualquier reivindicación anterior, en el que el
ARNdc no se deriva del gen que codifica para la
\beta-glucuronidasa.
5. ARN, o vector de expresión que codifica para
tal ARN, según cualquier reivindicación anterior, en el que el ARN
comprende una única cadena de ARN autocomplementario.
6. ARN, o vector de expresión que codifica para
tal ARN, según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4, en el
que el ARN comprende dos cadenas de ARN complementario
diferentes.
7. ARN, o vector de expresión que codifica para
tal ARN, según cualquier reivindicación anterior, en el que la
secuencia de nucleótidos es idéntica en al menos un 80% a la
totalidad del gen diana.
8. ARN, o vector de expresión que codifica para
tal ARN, según cualquier reivindicación anterior, en el que la
secuencia de nucleótidos tiene una identidad del 90%, 95% o 100%
con al menos una parte del gen diana.
9. Uso de un ARN, o vector de expresión que
codifica para tal ARN, según cualquier reivindicación anterior, en
la fabricación de un medicamento para inhibir la expresión de un
gen diana en una célula de mamífero, en el que el gen diana produce
o es probable que produzca una enfermedad y en el que la célula de
mamífero es una célula somática, un ovocito no humano o una célula
de un embrión antes de la implantación no humano.
10. Uso según la reivindicación 9, en el que el
gen es BCL2.
11. Uso según la reivindicación 9 o la
reivindicación 10, en el que el embrión antes de la implantación es
un blastocisto.
12. Uso según una cualquiera de las
reivindicaciones 9 a 11, en el que la célula del embrión antes de
la implantación es una célula madre embrionaria.
13. Formulación farmacéutica que comprende ARN
que comprende una estructura de doble cadena que tiene una
secuencia de nucleótidos que es idéntica en al menos un 80% a al
menos una parte del gen diana en una célula de mamífero o que puede
hibridarse con una parte del transcrito del gen diana en las
siguientes condiciones: hibridación en NaCl 400 mM, PIPES 40 mM pH
6,4, EDTA 1 mM, a 50ºC o 70ºC durante 12-16 horas,
seguido por lavado, y que se deriva de un molde endógeno, o un
vector de expresión que codifica para tal ARN, junto con un vehículo
farmacéuticamente aceptable, en la que el ARN no se deriva del gen
que codifica para \beta-glucuronidasa y en
la que la célula de mamífero es una célula somática, un ovocito no
humano o una célula de un embrión antes de la implantación no
humano.
14. Formulación farmacéutica según la
reivindicación 13, modificada por las características de una
cualquiera de las reivindicaciones 3 a 12.
15. Kit para inhibir la expresión de un gen diana
en una célula de mamífero, comprendiendo el kit:
ARN que comprende una estructura de doble cadena
que tiene una secuencia de nucleótidos que es idéntica en al menos
un 80% a al menos una parte del gen diana en una célula de mamífero
o que puede hibridarse con una parte del transcrito del gen diana en
las siguientes condiciones: hibridación en NaCl 400 mM, PIPES 40 mM
pH 6,4, EDTA 1 mM, a 50ºC o 70ºC durante 12-16
horas, seguido por lavado, y que se deriva de un molde endógeno, o
un vector de expresión que codifica para tal ARN; y
un vehículo que promueve la introducción del ARN
o vector en la célula de mamífero,
en el que el ARN no se deriva del gen que
codifica para la \beta-glucuronidasa y en
el que la célula de mamífero es una célula somática, un ovocito no
humano o una célula de un embrión antes de la implantación no
humano.
16. Kit según la reivindicación 15, modificado
por las características de una cualquiera de las reivindicaciones 3
a 12.
17. Célula de mamífero aislada que contiene un
constructo de expresión, codificando el constructo para un ARN que
forma una estructura de doble cadena que tiene una secuencia de
nucleótidos que es idéntica en al menos un 80% a al menos una parte
del gen diana en una célula de mamífero o que puede hibridarse con
una parte del transcrito del gen diana en las siguientes
condiciones: hibridación en NaCl 400 mM, PIPES 40 mM pH 6,4, EDTA 1
mM, a 50ºC o 70ºC durante 12-16 horas, seguido por
lavado, y que se deriva de un molde endógeno, en el que la célula de
mamífero es una célula somática, un ovocito no humano o una célula
de un embrión antes de la implantación no
humano.
humano.
18. Mamífero transgénico no humano que contiene
una célula según la reivindicación 17.
19. Método in vitro para inhibir la
expresión de un gen diana en una célula de mamífero, comprendiendo
el método:
introducir en la célula un ARN que comprende una
estructura de doble cadena que tiene una secuencia de nucleótidos
que es idéntica en al menos un 80% a al menos una parte del gen
diana o que puede hibridarse con una parte del transcrito del gen
diana en las siguientes condiciones: hibridación en NaCl 400 mM,
PIPES 40 mM pH 6,4, EDTA 1 mM, a 50ºC o 70ºC durante
12-16 horas, seguido por lavado, y que se deriva de
un molde endógeno; y
verificar la inhibición de la expresión del gen
diana,
en el que la célula de mamífero es una célula
somática, un ovocito no humano o una célula de un embrión antes de
la implantación no humano.
20. Método según la reivindicación 19, en el que
el gen diana es un gen endógeno.
21. Método según la reivindicación 19, en el que
el gen diana es un gen viral.
22. Método según la reivindicación 19, 20 ó 21,
en el que el ARN se produce fuera de la célula.
23. Método según la reivindicación 22, en el que
el ARN se inyecta en la célula.
24. Método según la reivindicación 19, 20 ó 21,
en el que el ARN se produce dentro de la célula.
25. Método según la reivindicación 22, 23 o 24,
en el que el ARN se produce de manera recombinante.
26. Método según la reivindicación 24 o 25, en el
que el ARN se produce mediante un vector de expresión en la
célula.
27. Método según una cualquiera de las
reivindicaciones 19 a 26, en el que el ARNdc no se deriva del gen
que codifica para la
\beta-glucuronidasa.
28. Método según una cualquiera de las
reivindicaciones 19 a 27, en el que el ARN comprende una única
cadena de ARN autocomplementario.
29. Método según una cualquiera de las
reivindicaciones 19 a 27, en el que el ARN comprende dos cadenas de
ARN complementario diferentes.
30. Método según una cualquiera de las
reivindicaciones 19 a 29, en el que la secuencia de nucleótidos es
idéntica en al menos un 80% a la totalidad del gen diana.
31. Método según una cualquiera de las
reivindicaciones 19 a 30, en el que la secuencia de nucleótidos
tiene una identidad del 90%, 95% o 100% con al menos una parte del
gen diana.
32. Método según una cualquiera de las
reivindicaciones 19 a 31, en el que el gen diana produce o es
probable que produzca una enfermedad.
33. Método según una cualquiera de las
reivindicaciones 19 a 32, en el que el embrión antes de la
implantación es un blastocisto.
34. Método según una cualquiera de las
reivindicaciones 19 a 33, en el que la célula del embrión antes de
la implantación es una célula madre embrionaria.
35. Método in vitro para inhibir la
expresión de un gen diana en una célula de mamífero, comprendiendo
el método:
introducir en la célula un ARN que comprende una
estructura de doble cadena que tiene una secuencia de nucleótidos
que es idéntica en al menos un 80% a al menos una parte del gen
diana o que puede hibridarse con una parte del transcrito del gen
diana en las siguientes condiciones: hibridación en NaCl 400 mM,
PIPES 40 mM pH 6,4, EDTA 1 mM, a 50ºC o 70ºC durante
12-16 horas, seguido por lavado, y que se deriva de
un molde endógeno, en el que el ARNdc no se deriva del gen que
codifica para la \beta-glucuronidasa, en el
que la célula de mamífero es una célula somática, un ovocito no
humano o una célula de un embrión antes de la implantación no
humano.
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