CN107108648A - 作为ERK抑制剂的噻吩并[2,3‑c]吡咯‑4‑酮衍生物 - Google Patents

作为ERK抑制剂的噻吩并[2,3‑c]吡咯‑4‑酮衍生物 Download PDF

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Abstract

本发明提供抑制细胞外信号调节激酶（ERK）的活性并可用于治疗癌症的噻吩并[2,3‑c]吡咯‑4‑酮化合物。

Description

作为ERK抑制剂的噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮衍生物
本发明涉及抑制细胞外信号调节激酶（ERK）的活性并可用于治疗癌症的噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮化合物或其可药用盐和包含该化合物的药物组合物。
ERK/MAPK通路对细胞增殖重要并常观察到在许多肿瘤中被激活。在ERK1/2上游的RAS基因在若干癌症，包括结直肠癌、黑素瘤、非小细胞肺癌以及乳腺和胰腺肿瘤中突变。在许多人类肿瘤中，高RAS活性伴随着升高的ERK活性。研究还显示，ERK是RAS信号传导的关键组分。这些观察结果支持ERK1/2信号传导通路在广谱人类肿瘤中的抗癌疗法开发中的吸引力。
ERK抑制剂是本领域中已知的；参见例如WO2013130976。另外，其它氨基嘧啶化合物是本领域中已知的；参见例如WO 2010/022121。仍然需要提供备选ERK抑制剂，更特别用于治疗癌症。相应地，本发明提供可用于治疗癌症的ERK1/2抑制剂。
本发明提供下式的化合物或其可药用盐：
其中：
R1是
R2和R3独立地是甲基或R2和R3可以一起形成环丙基；
R4是氢、甲基、氯、氟或三氟甲基；且
R5是
。
本发明还提供下式的化合物或其可药用盐：
其中：
R1是
R2和R3独立地是甲基或R2和R3可以一起形成环丙基；
R4是氢、甲基、氯、氟或三氟甲基；且
R5是
。
本发明还提供式I的化合物的一个实施方案，其中R2和R3是甲基。
本发明还提供式I的化合物的另一实施方案，其中R4是氢。
本发明还提供式I的化合物的再一实施方案，其中R1是。
本发明还提供式I的化合物的又一实施方案，其中R5是。
本发明优选提供一种化合物，其是6,6-二甲基-2-{2-[(1-甲基-1H-吡唑-5-基)氨基]嘧啶-4-基}-5-[2-(吗啉-4-基)乙基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮或其可药用盐。
作为一个特定实施方案，本发明提供化合物，其为6,6-二甲基-2-{2-[(1-甲基-1H-吡唑-5-基)氨基]嘧啶-4-基}-5-[2-(吗啉-4-基)乙基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮。
本发明提供一种药物组合物，其包含6,6-二甲基-2-{2-[(1-甲基-1H-吡唑-5-基)氨基]嘧啶-4-基}-5-[2-(吗啉-4-基)乙基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮或其可药用盐，和可药用载体、稀释剂或赋形剂。本发明提供一种药物组合物，其包含6,6-二甲基-2-{2-[(1-甲基-1H-吡唑-5-基)氨基]嘧啶-4-基}-5-[2-(吗啉-4-基)乙基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮和可药用载体、稀释剂或赋形剂。
本发明提供一种治疗癌症的方法，其包括给予需要治疗的患者有效量的6,6-二甲基-2-{2-[(1-甲基-1H-吡唑-5-基)氨基]嘧啶-4-基}-5-[2-(吗啉-4-基)乙基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮或其可药用盐。本发明提供一种治疗癌症的方法，其包括给予需要治疗的患者有效量的6,6-二甲基-2-{2-[(1-甲基-1H-吡唑-5-基)氨基]嘧啶-4-基}-5-[2-(吗啉-4-基)乙基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮。
本发明提供用于治疗的6,6-二甲基-2-{2-[(1-甲基-1H-吡唑-5-基)氨基]嘧啶-4-基}-5-[2-(吗啉-4-基)乙基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮或其可药用盐。本发明提供用于治疗癌症的6,6-二甲基-2-{2-[(1-甲基-1H-吡唑-5-基)氨基]嘧啶-4-基}-5-[2-(吗啉-4-基)乙基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮或其可药用盐。本发明提供一种用于治疗癌症的药物组合物，所述药物组合物包含6,6-二甲基-2-{2-[(1-甲基-1H-吡唑-5-基)氨基]嘧啶-4-基}-5-[2-(吗啉-4-基)乙基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮或其可药用盐。
本发明还提供用于治疗的6,6-二甲基-2-{2-[(1-甲基-1H-吡唑-5-基)氨基]嘧啶-4-基}-5-[2-(吗啉-4-基)乙基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮。本发明提供用于治疗癌症的6,6-二甲基-2-{2-[(1-甲基-1H-吡唑-5-基)氨基]嘧啶-4-基}-5-[2-(吗啉-4-基)乙基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮。本发明提供一种用于治疗癌症的药物组合物，所述药物组合物包含6,6-二甲基-2-{2-[(1-甲基-1H-吡唑-5-基)氨基]嘧啶-4-基}-5-[2-(吗啉-4-基)乙基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮。
本发明提供6,6-二甲基-2-{2-[(1-甲基-1H-吡唑-5-基)氨基]嘧啶-4-基}-5-[2-(吗啉-4-基)乙基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮或其可药用盐在制备治疗癌症的药物中的用途。本发明还提供6,6-二甲基-2-{2-[(1-甲基-1H-吡唑-5-基)氨基]嘧啶-4-基}-5-[2-(吗啉-4-基)乙基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮在制备治疗癌症的药物中的用途。
本发明提供结晶形式的6,6-二甲基-2-{2-[(1-甲基-1H-吡唑-5-基)氨基]嘧啶-4-基}-5-[2-(吗啉-4-基)乙基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮。本发明还提供结晶形式的6,6-二甲基-2-{2-[(1-甲基-1H-吡唑-5-基)氨基]嘧啶-4-基}-5-[2-(吗啉-4-基)乙基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮，其特征在于X-射线粉末衍射图具有以2θ ± 0.2°计出现在19.3°的特征峰以及一个或多个选自15.5°、17.1°、18.0°、20.2°、21.5°和22.1°的峰。
此外，本发明提供如本文所述的方法和用途的优选实施方案，其中癌症选自黑素瘤、结直肠癌、胰腺癌和非小细胞肺癌。优选癌症是结直肠癌、胰腺癌和非小细胞肺癌。
本发明还提供用于与一种或多种化疗剂组合同时、分开或相继给药以治疗癌症的6,6-二甲基-2-{2-[(1-甲基-1H-吡唑-5-基)氨基]嘧啶-4-基}-5-[2-(吗啉-4-基)乙基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮或其可药用盐。用于这种组合的优选化疗剂是pan-RAF抑制剂化合物，更特别是1-(3,3-二甲基丁基)-3-(2-氟-4-甲基-5-(7-甲基-2-(甲基氨基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-6-基)苯基)脲），CDK4/6抑制剂化合物，更特别是帕布昔利布（palbociclib）、ribociclib或[5-(4-乙基-哌嗪-1-基甲基)-吡啶-2-基]-[5-氟-4-(7-氟-3-异丙基-2-甲基-3H-苯并咪唑-5-基)-嘧啶-2-基]-胺或其可药用盐，或抗-VEGFR2抗体，更特别是雷莫芦单抗（ramucirumab）。用于这种组合的附加优选化疗剂是TGF-β受体激酶抑制剂化合物，更特别是galunisertib（参见WO 2004/048382），ALK-5激酶抑制剂，更特别是EW-7197，MEK抑制剂化合物，更特别是cobimetinib或曲美替尼，或Notch抑制剂化合物，更特别是4,4,4-三氟-N-[(1S)-2-[[(7S)-5-(2-羟乙基)-6-氧代-7H-吡啶并[2,3-d][3]苯并氮杂䓬-7-基]氨基]-1-甲基-2-氧代-乙基]丁酰胺（参见WO 2013/016081）。用于这种组合的其它附加优选化疗剂是PD-L1（程序性死亡配体1）抑制剂或PD-1（程序性死亡1）抑制剂。
本发明优选含有具有下列取代基的式I的化合物：
a) R1是；
b) R2是甲基；
c) R3是甲基；
d) R4是氢；或
e) R5是。
更优选地，本发明含有具有下列取代基组合的式I的化合物：
a) R2和R3是甲基；
b) R2是甲基，R3是甲基，且R4是氢；
c) R1是且R5是；
d) R2是甲基，R3是甲基，R4是氢，且R1是；
e) R2是甲基，R3是甲基，R4是氢，且R5是；或
f) R2是甲基，R3是甲基，R4是氢，且R1是，且R5是。
如上文所用并且在本发明的说明书各处，除非另行指明，下列术语应被理解为具有下列含义：
“可药用载体、稀释剂或赋形剂”是本领域中公认用于向哺乳动物，例如人类递送生物活性剂的介质。
“可药用盐”或“一种可药用盐”是指本发明化合物的相对无毒、无机和有机盐。
“有效量”是指引发研究者、兽医、医师或其它临床医生追求的生物或医疗响应或对组织、***、动物、哺乳动物或人类的所需疗效的本发明的化合物或其可药用盐或含有本发明的化合物或其可药用盐的药物组合物的量。
术语“治疗”等意在包括减慢或逆转障碍的进展。这些术语还包括缓解、改善、减弱、消除或减轻障碍或病症的一种或多种症状，即使没有实际消除该障碍或病症并且即使该障碍或病症的进程本身没有减慢或逆转。
技术人员会理解，本发明的化合物能够形成盐。本发明的化合物含有碱性杂环并相应地与许多无机和有机酸的任一种反应以形成可药用酸加成盐。这样的可药用酸加成盐和它们的常用制备方法是本领域中公知的。参见例如P. Stahl等人, HANDBOOK OFPHARMACEUTICAL SALTS: PROPERTIES, SELECTION AND USE, (VCHA/Wiley-VCH, 2008)；S.M. Berge等人, “Pharmaceutical Salts”, Journal of Pharmaceutical Sciences,Vol 66, No. 1, 1977年1月。
本发明的化合物优选配制成通过各种途径给药的药物组合物。此类组合物优选用于口服给药。此类药物组合物及其制备方法是本领域中公知的。参见例如REMINGTON:THESCIENCE AND PRACTICE OF PHARMACY（A. Gennaro等人, 21st ed., Mack PublishingCo., 2005）。
本发明的化合物通常在宽剂量范围内有效。例如，每日剂量通常在大约1至2000毫克的日剂量范围内。此类剂量优选在50至1000毫克的日剂量范围内。此类剂量更优选在125至400毫克的日剂量范围内。在一些情况下，低于上述范围的下限的剂量水平可能绰绰有余，而在另一些情况下，可能使用更大剂量，因此上述剂量范围无意以任何方式限制本发明的范围。要理解的是，由医师根据相关情况，包括要治疗的病症、所选给药途径、给予的实际化合物、个体患者的年龄、体重和响应以及患者症状的严重程度确定实际给予的化合物量。
技术人员会认识到，本发明的某些化合物含有至少一个手性中心。本发明考虑到所有独立的对映异构体或非对映异构体，以及所述化合物的对映异构体和非对映异构体的混合物，包括外消旋物。含有至少一个手性中心的本发明的化合物优选作为单一对映异构体或非对映异构体存在。单一对映异构体或非对映异构体可以用手性试剂开始制备或通过立体选择性或立体定向合成技术制备。或者，可以通过标准手性色谱或结晶技术从混合物中分离单一对映异构体或非对映异构体。
化合物名称中的“异构体1”的指定代表本发明的相应中间体或化合物是在通过手性色谱法分离一对对映异构体的混合物时的两种洗脱对映异构体的第一种。化合物名称中的“异构体2”的指定代表本发明的相应中间体或化合物是在通过手性色谱法分离一对对映异构体的混合物时的两种洗脱对映异构体的第二种。
本发明的化合物可根据本领域中公知和了解的合成方法制备。用于这些反应的步骤的合适反应条件是本领域中公知的并且溶剂和共试剂的适当替换在本领域技术范围内。同样地，本领域技术人员会认识到，可以按需要或预期通过各种公知技术分离和/或提纯合成中间体，并且通常可以在几乎或完全不提纯的情况下在后续合成步骤中直接使用各种中间体。此外，技术人员会认识到，在一些情况中，各部分的引入顺序不重要。如熟练化学家充分了解，制备本发明的化合物所需的步骤的特定顺序取决于合成的特定化合物、起始化合物和被取代的部分的相对不稳定性（liability）。除非另行指明，所有取代基如上定义，且所有试剂是本领域中公知的和了解的。
本文所用的下列术语具有所示含义：“ACN”是指乙腈；“DCM”是指二氯甲烷；“DMF”代表N,N-二甲基甲酰胺；“DMSO”是指二甲亚砜；“DTT”是指二硫苏糖醇；“EDTA”是指乙二胺四乙酸；“EGTA”是指乙二醇四乙酸；“ELISA”是指酶联免疫吸附测定法；“EtOAc”是指乙酸乙酯；“EtOH”是指乙醇；“FBS”是指胎牛血清；“HBSS”是指Hank氏平衡盐溶液；“IC50”是指半数最大抑制浓度；“IVTI”是指体内靶向抑制；“MS”是指质谱法；“MeOH”是指甲醇；“NMR”是指核磁共振；“PBST”是指含Tween-20的磷酸盐缓冲盐水；“THF”是指四氢呋喃；“UVW”是指紫外线波长，且“XRD”是指X-射线衍射。
除非作出相反的指示，本文例举的化合物使用ACDLABS或Accelrys Draw 4.1命名和编号。
本发明的化合物可以如下列方案中所示合成，其中R1、R2、R3、R4和R5如上定义。
方案1: 式I的化合物的合成。
方案1显示式I的化合物的一般合成。使化合物1与适当取代的化合物2在公知的芳族取代或偶联反应条件下反应以提供式I的化合物。更具体地，使化合物1与化合物2在升高的温度下在合适的碱，如氢化钠、异丙基氯化镁、碳酸铯、碳酸钾或叔丁醇钾存在下反应。任选地，在适当的溶剂如1,4-二氧杂环己烷或叔丁醇中引入合适的配体剂，如4,5-双(二苯基膦基)-9,9-二甲基呫吨或2-(二-叔丁基膦基)-2',4',6'-三异丙基-3,6-二甲氧基-1,1'-联苯和合适的催化剂，如乙酸钯(II)、三(二亚苄基丙酮)二钯(0)或氯[2-(二-叔丁基膦基)-2',4',6'-三异丙基-1,1'-联苯基][2-(2-氨基乙基)苯基]钯(II)也可提供式I的化合物。
方案2: 当R5是3-甲氧基-1H-吡唑-4-基或3-环丙基-1H-吡唑-4-基时式I的化合物的合成。
方案2显示当R5是3-甲氧基-1H-吡唑-4-基或3-环丙基-1H-吡唑-4-基时式I的化合物的合成。使化合物1与化合物3（其是用合适的氮保护基如叔丁氧基羰基适当取代的吡唑胺）在如上所述的公知偶联反应条件下反应以提供化合物4。使化合物4进一步与合适的氮脱保护剂如氯化氢或三氟乙酸在合适的溶剂，如1,4-二氧杂环己烷或MeOH中反应以提供当R5是3-甲氧基-1H-吡唑-4-基或3-环丙基-1H-吡唑-4-基时的式I的化合物。
方案3: 式I的化合物的另一合成。
方案3显示式I的化合物的另一合成。使化合物5与(2-溴乙氧基)-叔丁基二甲基甲硅烷在合适的溶剂如DMF中在合适的碱如氢化钠存在下反应以提供化合物6。然后使化合物6与适当取代的化合物2（R5-NH2）在如上所述的公知偶联反应条件下反应以提供化合物7。使化合物7与合适的脱保护剂如乙酸在合适的溶剂，如THF和水的混合物中反应以提供化合物8。化合物8在合适的溶剂如DMF中在合适的碱如三乙胺存在下与甲磺酰氯进一步反应以提供化合物9。使化合物9与合适的胺在合适的溶剂如ACN中反应以提供式I的化合物。
方案4: 化合物1的合成。
方案4显示化合物1的合成方法。使化合物10与合适的溴化剂如N-溴琥珀酰亚胺在合适的溶剂如ACN中反应以提供化合物11。使化合物11与合适的碱如氢化钠或氢氧化钠和合适的N-烷基化剂如4-(2-氯乙基)吗啉反应以提供化合物12。使化合物12与双(频哪醇合)二硼、合适的碱如乙酸钾和合适的催化剂如(1,1'-双(二苯基膦基)二茂铁)氯化钯(II)在合适的溶剂如1,4-二氧杂环己烷中在升高的温度下反应以提供化合物13。使化合物13与适当取代的嘧啶化合物如2,4-二氯-5-甲基嘧啶、合适的碱如碳酸钾、合适的催化剂如四(三苯膦)钯在合适的溶剂如1,4-二氧杂环己烷和水的混合物中在升高的温度下反应以提供化合物1。
方案5: 化合物1的另一合成。
方案5显示用于合成化合物1的另一方法。使化合物11与合适的氮保护剂如二碳酸二叔丁酯在合适的溶剂如ACN中在合适的碱如N,N-二异丙基乙胺存在下反应以提供化合物14。使化合物14与双(频哪醇合)二硼在如上所述的公知偶联反应条件下反应以提供化合物15。使化合物15与适当取代的嘧啶化合物在如上所述的公知偶联反应条件下反应以提供化合物16。化合物16在合适的溶剂如DCM或1,4-二氧杂环己烷中用合适的脱保护剂如三氟乙酸或氯化氢脱保护以提供化合物17。使化合物17与合适的烷基化剂如4-(2-溴乙基)吗啉在合适的溶剂如N-甲基吡咯烷酮中在合适的碱如氢化钠存在下反应以提供化合物1。
制备1
6,6-二甲基噻吩并[2,3-c]呋喃-4-酮
在20升三颈烧瓶中将3-噻吩甲酸（250克，1.95摩尔）在THF（9750毫升）中的溶液冷却至-70℃。在使温度保持低于-55℃的同时向这种溶液中缓慢加入正丁基锂（2.5 M在己烷中，1872毫升，4.68摩尔）。将反应混合物在-70℃下搅拌1小时。在-70℃下缓慢加入丙酮（187毫升，2.55摩尔）。使反应混合物升温至0℃并在0℃下搅拌3小时。在0℃下向所得溶液中加入4 M HCl（1500毫升）并使反应混合物升温至室温。将所得混合物搅拌整夜。经硅藻土垫过滤反应混合物并用甲苯（3 x 500毫升）洗涤该垫。在减压下浓缩滤液。将所得粗制残留物溶解在甲苯（3750毫升）和水（250毫升）中并在室温下加入对甲苯磺酸（100.1克，0.526摩尔）。将反应混合物在100℃下回流16小时。将该反应冷却至室温并在50℃下在减压下浓缩。将所得残留物溶解在水中并用EtOAc（2 x 10 L）萃取。用饱和碳酸氢钠水溶液和水洗涤有机层。经无水硫酸钠干燥有机层，过滤并在50℃下在减压下浓缩滤液以提供棕色粘稠液体形式的标题化合物200 g（61%）。MS (m/z): 169 (M+1)。
制备2
6,6-二甲基-5H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮
在5升高压釜中装载6,6-二甲基噻吩并[2,3-c]呋喃-4-酮（150克，0.891摩尔）在氢氧化铵（1000毫升）中的溶液。在封闭环境中，小心地使反应混合物达到200℃的温度并在200℃下搅拌4小时。在4小时后，将反应混合物冷却至室温并释放氨气。用DCM（3 x 750毫升）萃取该反应混合物。用水（1 x 750毫升）洗涤有机层，经无水硫酸钠干燥，过滤并在50℃下在减压下浓缩滤液以产生标题化合物100 g（67%）。MS (m/z): 168 (M+1)。
制备3
2-溴噻吩-3-甲酸甲酯
用硫酸（2.5毫升，45毫摩尔）处理2-溴-3-噻吩甲酸（10.1克，49毫摩尔）在MeOH（100毫升）中的溶液。将该反应加热至回流整夜。在减压下浓缩该混合物以除去有机溶剂并将所得混合物倒入冰冷水中。用EtOAc萃取该***液。用水、接着饱和碳酸氢钠水溶液洗涤合并的有机萃取物。经无水硫酸钠干燥该有机溶液，过滤并在减压下浓缩滤液以产生标题化合物10.77 g（100%）。
制备4
2-氰基噻吩-3-甲酸甲酯
将2-溴噻吩-3-甲酸甲酯（28克，128毫摩尔）和氰化铜（15克，167毫摩尔）在N-甲基吡咯烷酮（130毫升）中的混合物加热至120℃整夜。将该反应冷却至室温并用EtOAc稀释。用饱和NaCl洗涤该有机溶液，经无水硫酸钠干燥，过滤并在减压下浓缩滤液。通过用25% EtOAc/己烷洗脱的硅胶柱色谱法提纯该残留物以产生标题化合物15.2 g（71%）。
制备5
螺[5H-噻吩并[2,3-c]吡咯-6,1'-环丙烷]-4-酮
用乙基溴化镁的溶液（3 M在***中，58毫升，175毫摩尔）处理2-氰基噻吩-3-甲酸甲酯（13.7克，79毫摩尔）和四(异丙醇)钛（24.8克，87.4毫摩尔）在***（330毫升）中的-70℃溶液。将反应混合物搅拌60分钟。移除冷却浴并使该混合物经1小时缓慢升温至室温。加入三氟化硼***合物（22.6毫升，159毫摩尔）并将该混合物搅拌另外1小时。用1 N盐酸（240毫升）淬灭该反应并搅拌整夜。分离有机层并用另外的***反萃水层。合并有机萃取物并用饱和碳酸氢钠水溶液和饱和NaCl洗涤。经无水硫酸钠干燥该有机溶液，过滤并在减压下浓缩滤液。在C18柱（柱: 275 g；流动相: A）0.10%甲酸/水，B）0.10%甲酸/ACN；梯度：5-35% B；流速：80 mL/min）上通过HPLC提纯该残留物以产生标题化合物1.02 g（35%）。
制备6
2-溴-6,6-二甲基-5H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮
向含有6,6-二甲基-5H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮（835克，4.99摩尔）的20升烧瓶中加入ACN（10000毫升）并将该溶液冷却至10℃。将N-溴琥珀酰亚胺（444.4克，2.49摩尔）分四等份添加到反应混合物中并在25℃下搅拌6小时。在减压下浓缩该反应混合物并将所得化合物在水中制浆并用EtOAc（3 x 4.1升）萃取。用水（3 x 4.1升）和饱和NaCl（4.1升）洗涤合并的有机萃取物，经无水硫酸钠干燥并过滤。储存该有机溶液以与另外的批次合并。
使用上述相同方法，分别由650克和835克6,6-二甲基-5H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮开始制备另外两个批次。合并来自所有三个批次的有机溶液并在50℃下在减压下浓缩以产生棕色粘性物质形式的2-溴-6,6-二甲基-5H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮。将所得产物在***/己烷（2:1 v/v）中制浆并过滤以产生标题化合物1542 g（45%）。MS (m/z): 246/248(M+1/M+3)。
基本通过制备6的方法制备下列化合物。
制备No. 化合物名称 结构 MS (m/z):
7 2-溴螺[5H-噻吩并[2,3-c]吡咯-6,1'-环丙烷]-4-酮 244/246 (M+1/M+3)
制备8
4-(2-溴乙基)吗啉氢溴酸盐
在使反应温度保持低于25℃的同时用4-吗啉乙醇（32克，244毫摩尔）在DCM（60毫升）中的溶液经1小时逐滴处理三苯膦二溴化物（124克，293毫摩尔）在DCM（2.44升）中的溶液。将该混合物在室温下搅拌整夜。由4-吗啉乙醇（10克，76毫摩尔）开始进行另一如上反应，适当按比例增减试剂。合并反应混合物并通过真空过滤收集固体以产生标题化合物76.7 g（84%）。
制备9
2-溴-6,6-二甲基-4-氧代-噻吩并[2,3-c]吡咯-5-甲酸叔丁酯
合成方法1:
用二碳酸二叔丁酯（35克，162毫摩尔）处理2-溴-6,6-二甲基-5H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮（25克，102毫摩尔）、4-二甲基氨基吡啶（1.25克，10毫摩尔）和N,N-二异丙基乙胺（24毫升，138毫摩尔）在ACN（481毫升）中的溶液。将该混合物在室温下搅拌整夜。在减压下浓缩该混合物。用己烷稀释该混合物，经硅胶垫过滤该混合物并用己烷、接着20% DCM/己烷洗脱该垫。将滤液浓缩至干以产生橙色油形式的标题化合物36.5 g（93%）。
合成方法2:
用N,N-二异丙基乙胺（213毫升，1219毫摩尔）逐滴处理2-溴-6,6-二甲基-5H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮（200克，813毫摩尔）、N,N-二甲基吡啶-4-胺（9.93克，81毫摩尔）和二碳酸二叔丁酯（266克，1219毫摩尔）在ACN（2升）中的溶液。将该混合物在室温下搅拌4小时。将该反应加热至30℃ 2小时。将该混合物冷却至室温并搅拌整夜。在减压下浓缩该混合物。用EtOAc稀释该混合物并用水（300毫升）、接着饱和NaCl（300毫升）洗涤所得有机溶液两次。经无水硫酸钠干燥该有机溶液，过滤并在减压下浓缩滤液。在用0-20% EtOAc/己烷梯度洗脱的硅胶垫上提纯该残留物以产生标题化合物253 g（90%）。MS (m/z): 290/292 (M-异丁烯+1/M-异丁烯+3)。
制备10
6,6-二甲基-4-氧代-2-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)噻吩并[2,3-c]吡咯-5-甲酸叔丁酯
2-溴-6,6-二甲基-4-氧代-噻吩并[2,3-c]吡咯-5-甲酸叔丁酯（114克，329毫摩尔）、双(频哪醇合)二硼（125克，494毫摩尔）和乙酸钾（97克，988毫摩尔）在1,4-二氧杂环己烷（1.6升）中的混合物用氮气脱气10分钟。加入(1,1'-双(二苯基膦基)二茂铁)氯化钯(II)（5.38克，6.6毫摩尔）并将该混合物在90℃下加热4小时。将该反应冷却至室温并经CELITE®垫过滤。浓缩滤液，然后用10% EtOAc/己烷处理该残留物。通过真空过滤收集沉淀物以产生标题化合物65.8 g（40%）。MS (m/z): 338 (M-异丁烯+1)。
制备11
2-(2-氯嘧啶-4-基)-6,6-二甲基-4-氧代-噻吩并[2,3-c]吡咯-5-甲酸叔丁酯
合成方法1:
2-溴-6,6-二甲基-4-氧代-噻吩并[2,3-c]吡咯-5-甲酸叔丁酯（36克，104毫摩尔）、双(频哪醇合)二硼（59.8克，235毫摩尔）和乙酸钾（33.2克，338毫摩尔）在1,4-二氧杂环己烷（520毫升）中的混合物用氮气脱气10分钟。加入(1,1'-双(二苯基膦基)二茂铁)氯化钯(II)（4.45克，5.5毫摩尔）并将该混合物加热至90℃。将该混合物在90℃下加热2小时。将该反应冷却至室温并搅拌3小时。加入2,4-二氯嘧啶（22克，145毫摩尔），接着碳酸钾（20.4克，147毫摩尔）在水（83毫升）中的溶液。所得混合物用氮气脱气10分钟。加入四(三苯膦)钯（1.59克，1.38毫摩尔）并将该混合物加热至90℃ 2小时。将该混合物冷却至室温并经CELITE®垫过滤。用三份水和一份饱和NaCl洗涤该滤液。在减压下浓缩该有机物。通过用0-25% EtOAc/DCM梯度洗脱的硅胶柱色谱法提纯该残留物以产生标题化合物11 g（59%）。MS (m/z): 324(M-异丁烯+1)。
合成方法2:
6,6-二甲基-4-氧代-2-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)噻吩并[2,3-c]吡咯-5-甲酸叔丁酯（11.7克，30毫摩尔）、2,4-二氯嘧啶（13克，89毫摩尔）、碳酸钾（20.4克，147毫摩尔）和水（50毫升）在1,4-二氧杂环己烷（100毫升）中的混合物用氮气脱气10分钟。加入四(三苯膦)钯（2.58克，2.2毫摩尔）并将该混合物加热至87℃ 1.5小时。将该混合物冷却至室温。用EtOAc（1升）稀释该混合物并用水和饱和NaCl洗涤所得溶液。经无水硫酸钠干燥该有机溶液，过滤并在减压下浓缩滤液。用30% EtOAc/己烷（200毫升）处理该残留物并通过真空过滤收集所得沉淀物以产生标题化合物7.6 g（67%）。MS (m/z): 324 (M-异丁烯+1)。
制备12
2-(2-氯嘧啶-4-基)-6,6-二甲基-5H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮
将2-(2-氯嘧啶-4-基)-6,6-二甲基-4-氧代-噻吩并[2,3-c]吡咯-5-甲酸叔丁酯（6.36克，16.7毫摩尔）和三氟乙酸（25毫升）在DCM（25毫升）中的混合物在室温下搅拌2小时。在减压下浓缩该混合物并用DCM稀释该残留物。该混合物用饱和碳酸氢钠水溶液分配并从双相乳状液中收集固体。用***洗涤固体并在真空下在50℃下干燥整夜以产生标题化合物4.65g（99%）。MS (m/z): 280 (M+1)。
制备13
2-(2-氯嘧啶-4-基)-6,6-二甲基-5H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮盐酸盐
将2-(2-氯嘧啶-4-基)-6,6-二甲基-4-氧代-噻吩并[2,3-c]吡咯-5-甲酸叔丁酯（66.7克，176毫摩尔）和氯化氢（4 M在1,4-二氧杂环己烷中，263毫升，1054毫摩尔）在1,4-二氧杂环己烷（585毫升）中的溶液在30℃下加热5小时。移除加热元件并将该混合物在室温下搅拌整夜。将己烷（800毫升）缓慢添加到反应混合物中。将所得浆料搅拌10分钟并通过真空过滤收集固体。在真空下干燥该固体以产生标题化合物56 g（100%）。MS (m/z): 280 (M+1)。
制备14
2-溴-6,6-二甲基-5-(2-吗啉子基乙基)噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮
将氢氧化钠（160克，4摩尔）添加到水（250毫升）中并搅拌该混合物直至产生清澈溶液。加入1,4-二氧杂环己烷（2升），接着2-溴-6,6-二甲基-5H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮（215克，874毫摩尔）、 四丁基碘化铵（300克，812毫摩尔）和4-(2-氯乙基)吗啉盐酸盐（300克，1564毫摩尔）。将该混合物在80℃下加热1小时。将反应混合物冷却至室温。用水（2升）稀释该反应并用EtOAc（3 x 2升）萃取该混合物。合并的有机萃取物经无水硫酸钠干燥，过滤并在减压下浓缩滤液。加入DCM（2升）和己烷（2升）并用饱和NaCl（2 x 1升）洗涤所得有机溶液。该有机溶液在减压下浓缩至最小体积。滤出固体以产生标题化合物180 g（57%）。MS (m/z): 359/361 (M+1/M+3)。
制备15
2-溴-5-[2-[叔丁基(二甲基)甲硅烷基]氧基乙基]-6,6-二甲基-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮
在0℃下用2-溴-6,6-二甲基-5H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮（20克，81.3毫摩尔）、接着(2-溴乙氧基)-叔丁基二甲基甲硅烷（23.3克，97.5毫摩尔）处理氢化钠（60重量%在矿物油中，3.9克，97.5毫摩尔）在DMF（203毫升）中的悬浮液。将该反应在0℃下搅拌1小时。移除冰浴并将反应混合物搅拌整夜。用饱和氯化铵水溶液淬灭该反应混合物并用EtOAc萃取。用饱和NaCl洗涤该有机溶液。经无水硫酸钠干燥该有机溶液，过滤并在减压下浓缩滤液。通过用20% EtOAc/己烷洗脱的硅胶柱色谱法提纯该残留物以产生标题化合物26 g（79%）。MS (m/z): 404/406 (M+1/M+3)。
基本通过制备15的方法制备下列化合物。
制备 No. 化合物名称 结构 MS (m/z):
16 2'-溴-5'-(2-吗啉子基乙基)螺[环丙烷-1,6'-噻吩并[2,3-c]吡咯]-4'-酮 357/359 (M+1/M+3)
制备17
2-(2-氯-5-甲基-嘧啶-4-基)-6,6-二甲基-5-(2-吗啉子基乙基)噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮
2-溴-6,6-二甲基-5-(2-吗啉子基乙基)噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮（5.76克，16毫摩尔）、双(频哪醇合)二硼（4.88克，19.2毫摩尔）和乙酸钾（4.86克，48毫摩尔）在1,4-二氧杂环己烷（80毫升）中的混合物用氮气脱气20分钟。加入(1,1'-双(二苯基膦基)二茂铁)氯化钯(II)（668毫克，0.80毫摩尔）并将该混合物在90℃下加热整夜。将该反应冷却至室温，浓缩滤液，然后用EtOAc处理该残留物。通过真空过滤收集沉淀物。向该固体（3.7克）中加入2,4-二氯-5-甲基嘧啶（1.5克，9.1毫摩尔）、1,4-二氧杂环己烷（50毫升）、碳酸钾（3.8克，27毫摩尔）和水（33毫升）。所得混合物用氮气脱气20分钟。加入四(三苯膦)钯（790毫克，0.68毫摩尔）并将该混合物加热至90℃2小时。将该混合物冷却至室温并用EtOAc稀释。用饱和NaCl洗涤该有机溶液。经无水硫酸钠干燥该有机溶液，过滤并在减压下浓缩滤液。通过用0-10%MeOH/EtOAc梯度洗脱的硅胶柱色谱法提纯该残留物以产生标题化合物1.82 g（19%）。MS(m/z): 407 (M+1)。
基本通过制备17的方法制备下列化合物。
制备No. 化合物名称 结构 MS (m/z):
18 2-(2,5-二氯嘧啶-4-基)-6,6-二甲基-5-(2-吗啉子基乙基)噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮 427 (M+1)
19 2-(2-氯-5-氟-嘧啶-4-基)-6,6-二甲基-5-(2-吗啉子基乙基)噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮 411 (M+1)
20 2-[2-氯-5-(三氟甲基)嘧啶-4-基]-6,6-二甲基-5-(2-吗啉子基乙基)噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮 461 (M+1)
21 5-[2-[叔丁基(二甲基)甲硅烷基]氧基乙基]-2-(2-氯嘧啶-4-基)-6,6-二甲基-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮 438 (M+1)
22 2-(2-氯嘧啶-4-基)-6,6-二甲基-5-[2-(5-氧杂-8-氮杂螺[2.6]壬-8-基)乙基]噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮 433 (M+1)
23 2'-(2-氯嘧啶-4-基)-5'-(2-吗啉子基乙基)螺[环丙烷-1,6'-噻吩并[2,3-c]吡咯]-4'-酮 391 (M+1)
制备24
2-(2-氯嘧啶-4-基)-6,6-二甲基-5-(2-吗啉子基乙基)噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮
合成方法1:
2-溴-6,6-二甲基-5-(2-吗啉子基乙基)噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮（200克，557毫摩尔）、双(频哪醇合)二硼（200克，788毫摩尔）和乙酸钾（200克，2038毫摩尔）在1,4-二氧杂环己烷（1升）中的混合物用氮气脱气15分钟。加入(1,1'-双(二苯基膦基)二茂铁)氯化钯(II)（20克，27毫摩尔）并将该混合物加热至90℃。将该混合物在90℃下加热1小时。将该反应冷却至50℃并加入碳酸钾（250克，1809毫摩尔）、2,4-二氯嘧啶（230克，1543毫摩尔）和水（300毫升）。将该混合物在90℃下加热1小时。将该混合物冷却至35℃并加入水（700毫升）。用DCM（2升）萃取该反应混合物。该水溶液用DCM（500毫升）反萃取。合并的有机溶液经无水硫酸镁干燥，过滤并在减压下浓缩滤液。用10% EtOAc/己烷（2升）稀释该残留物并搅拌1小时。滗析母液并用己烷（500毫升）冲洗固体。将该固体溶解在DCM（300毫升）中并缓慢加入己烷（2升）。通过真空过滤收集所得固体并干燥以产生标题化合物150 g（65%）。MS (m/z): 393 (M+1)。
合成方法2:
使用冰水浴将2-(2-氯嘧啶-4-基)-6,6-二甲基-5H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮盐酸盐（10克，32毫摩尔）和四丁基碘化铵（1.17克，3.16毫摩尔）在N-甲基吡咯烷酮（211毫升）中的混合物冷却至0℃。分份加入氢化钠（60重量%在矿物油中，5.06克，126.5毫摩尔）。将该混合物在0℃下搅拌10分钟，然后加入4-(2-溴乙基)吗啉氢溴酸盐（13.9克，50.6毫摩尔）。移除冰浴并将该混合物搅拌4小时。用饱和氯化铵水溶液淬灭该反应混合物并用水（1升）稀释该混合物。用乙酸异丙酯（4 x 700毫升）萃取该混合物。合并的有机萃取物经无水硫酸钠干燥，过滤并在减压下浓缩滤液。加入20% EtOAc/己烷并将该混合物搅拌1小时。通过真空过滤收集固体并干燥以产生标题化合物8.6 g（69%）。MS (m/z): 393 (M+1)。
合成方法3:
用氢化钠（60重量%在矿物油中，129毫克，3.2毫摩尔）处理2-(2-氯嘧啶-4-基)-6,6-二甲基-5H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮（500毫克，1.4毫摩尔）在DMF（14毫升）中的溶液。将该混合物搅拌10分钟，然后加入4-(2-溴乙基)吗啉盐酸盐（412毫克，1.8毫摩尔）。将反应混合物在室温下搅拌整夜。将该混合物冷却至0℃并加入4-(2-溴乙基)吗啉盐酸盐（165毫克，0.7毫摩尔）、接着氢化钠（60重量%在矿物油中，14毫克，0.4毫摩尔）。移除冰浴并将该混合物在室温下搅拌整夜。加入氢化钠（60重量%在矿物油中，14毫克，0.4毫摩尔）并将所得混合物在室温下搅拌5小时。用水稀释该混合物并用EtOAc萃取。用5%氯化锂水溶液洗涤该有机萃取物。在减压下浓缩该有机溶液。通过用0-10% MeOH/DCM梯度洗脱的硅胶柱色谱法提纯该残留物以产生标题化合物524 mg（93%）。MS (m/z): 393 (M+1)。
制备25
5-[2-[叔丁基(二甲基)甲硅烷基]氧基乙基]-6,6-二甲基-2-[2-[(2-甲基吡唑-3-基)氨基]嘧啶-4-基]噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮
5-[2-[叔丁基(二甲基)甲硅烷基]氧基乙基]-2-(2-氯嘧啶-4-基)-6,6-二甲基-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮（6克，13.7毫摩尔）、2-甲基吡唑-3-胺（1.60克，16.4毫摩尔）、碳酸铯（8.92克，27.4毫摩尔）、4,5-双(二苯基膦基)-9,9-二甲基呫吨（790毫克，1.37毫摩尔）和1,4-二氧杂环己烷（150毫升）的混合物用氮气脱气10分钟。加入乙酸钯(II)（610毫克，2.74毫摩尔）并将该混合物在90℃下加热2.5小时。将该混合物冷却至室温并将该混合物在室温下搅拌整夜。用10% MeOH/DCM稀释该反应混合物并将该混合物搅拌15分钟。经CELITE®过滤该混合物并用10% MeOH/DCM洗涤固体。在减压下浓缩滤液。通过用60-100% EtOAc/DCM梯度洗脱的硅胶柱色谱法提纯该残留物以产生标题化合物5.73 g（84%）。MS (m/z): 499 (M+1)。
制备26
2-溴-5-(2-羟乙基)-6,6-二甲基-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮
用乙酸（120毫升）和水（40毫升）处理在THF（40毫升）中的2-溴-5-[2-[叔丁基(二甲基)甲硅烷基]氧基乙基]-6,6-二甲基-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮（26克，64毫摩尔）。将该混合物在室温下搅拌整夜。在减压下浓缩该反应混合物。用EtOAc稀释该残留物并用饱和碳酸氢钠水溶液、接着饱和NaCl洗涤所得溶液。经无水硫酸钠干燥该有机溶液，过滤并浓缩滤液以产生标题化合物18.97 g（100%）。MS (m/z): 290/292 (M+1/M+3)。
基本通过制备26的方法制备下列化合物。
制备No. 化合物名称 结构 注释 MS (m/z):
27 5-(2-羟乙基)-6,6-二甲基-2-[2-[(2-甲基吡唑-3-基)氨基]嘧啶-4-基]噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮 使用4N HCl二氧杂环己烷 385 (M+1)
制备28
甲磺酸2-(2-溴-6,6-二甲基-4-氧代-噻吩并[2,3-c]吡咯-5-基)乙酯
将2-溴-5-(2-羟乙基)-6,6-二甲基-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮（18.97克，65.4毫摩尔）在DCM（300毫升）中的溶液冷却至0℃。用三乙胺（13.7毫升，98.1毫摩尔）和甲磺酰氯（8.24克，71.9毫摩尔）处理该混合物。将该混合物在0℃下搅拌2小时。用水和饱和NaCl洗涤该溶液。经无水硫酸钠干燥该有机溶液，过滤并在减压下浓缩滤液。通过用EtOAc洗脱的硅胶柱色谱法提纯该残留物以产生标题化合物23.8 g（99%）。MS (m/z): 368/370 (M+1/M+3)。
基本通过制备28的方法制备下列化合物。
制备No. 化合物名称 结构 MS (m/z):
29 甲磺酸2-[6,6-二甲基-2-[2-[(2-甲基吡唑-3-基)氨基]嘧啶-4-基]-4-氧代-噻吩并[2,3-c]吡咯-5-基]乙酯 463 (M+1)
制备30
3-乙基-4-硝基-1H-吡唑
将3-乙基-1H-吡唑（1克，10.4毫摩尔）溶解在硫酸（5毫升）中并将该混合物冷却至-5℃。然后将硝酸钾（1.16克，11.4毫摩尔）分份添加到该混合物中。在使其缓慢升温至室温的同时将该混合物搅拌整夜。将该混合物冷却至0℃并用氢氧化铵缓慢淬灭直至pH为大约10。通过真空过滤收集所得固体并用少量水洗涤。将滤液冷却至0℃，然后通过真空过滤从滤液中收集固体并用少量水洗涤。合并固体并溶解在DCM中。经无水硫酸钠干燥该有机溶液，过滤并在减压下浓缩滤液。与***共蒸发一次以产生标题化合物1.34 g（91%）。MS (m/z):140 (M-1)。
制备31
3-甲氧基-4-硝基-吡唑-1-甲酸叔丁酯
用三乙胺（5.85毫升，42毫摩尔）处理5-甲氧基-4-硝基-1H-吡唑（3克，21毫摩尔）、二碳酸二叔丁酯（6.9克，31.6毫摩尔）和4-二甲基氨基吡啶（1.28克，10.5毫摩尔）在DCM（300毫升）中的悬浮液并将该混合物在室温下搅拌整夜。在减压下浓缩该反应混合物。通过用1-10% EtOAc/己烷梯度洗脱的硅胶柱色谱法提纯该残留物以产生标题化合物3.48 g（68%）。
制备32
3-乙基-1H-吡唑-4-胺
用3-乙基-4-硝基-1H-吡唑（300毫克，2.13毫摩尔）处理钯（5重量%在碳上，450毫克，0.21毫摩尔）在EtOH（21毫升）中的悬浮液。将所得混合物在氢气气氛下搅拌6.5小时。经CELITE®过滤该反应混合物并用另外的EtOH冲洗固体。在减压下浓缩滤液以产生标题化合物240 g（99%）。
基本通过制备32的方法制备下列化合物。
制备No. 化合物名称 结构 MS (m/z):
33 4-氨基-3-甲氧基-吡唑-1-甲酸叔丁酯 214 (M+1)
制备34
N-(2-环丙基吡唑-3-基)氨基甲酸叔丁酯
将2-环丙基吡唑-3-甲酸（4克，26毫摩尔）在THF（35毫升）中的溶液冷却至0℃，然后加入三乙胺（5.5毫升，39毫摩尔）、接着叠氮磷酸二苯酯（diphenylphosphonic azide）（8.5毫升，39毫摩尔）。在将反应温度缓慢升至室温的同时将该混合物搅拌4小时。加入叔丁醇（4.99毫升）并将该混合物在70℃下加热18小时。在减压下浓缩该反应混合物。通过用0-20%MeOH/DCM梯度洗脱的硅胶柱色谱法提纯该残留物以产生标题化合物5.39 g（92%）。MS (m/z): 224 (M+1)。
制备35
2-环丙基吡唑-3-胺
用三氟乙酸（16毫升，213毫摩尔）处理N-(2-环丙基吡唑-3-基)氨基甲酸叔丁酯（5.39克，24毫摩尔）在DCM（12毫升）中的溶液。将该溶液在室温下搅拌1小时。在减压下浓缩该反应混合物。将残留物溶解在DCM中并用饱和碳酸氢钠水溶液处理直至水相的pH保持>7。分离各相并经无水硫酸钠干燥有机相。过滤该混合物并在减压下浓缩滤液。在减压下浓缩水相。合并来自有机相和水相的残留物并通过反相柱色谱法（柱: 130 g C18；流动相: A）水，B）ACN；梯度: 0-20% B）提纯。浓缩级分并将残留物溶解在25% MeOH/DCM中。过滤该混合物并在减压下浓缩滤液。将残留物溶解在EtOAc中并加入水。分离各层并用EtOAc（8 x 100毫升）反萃取水层。合并的有机萃取物在减压下浓缩以产生标题化合物2.27 g（76%）。
制备36
2-(二苄基氨基)乙醇
用碳酸钾（1.83克，13.2毫摩尔）、接着苄基溴（1.18毫升，9.89毫摩尔）处理2-(苄基氨基)乙醇（0.95毫升，6.6毫摩尔）在ACN（35毫升）中的混合物。将反应混合物在80℃下加热1.5小时。将该反应冷却至室温并过滤该混合物。在减压下浓缩滤液并通过用0-30% EtOAc/己烷梯度洗脱的硅胶柱色谱法提纯该残留物以产生标题化合物1.7 g（100%）。MS (m/z):242 (M+1)。
制备37
2-[2-(二苄基氨基)乙氧基]-2,2-二氟-乙酸
在0℃下用氢化钠（60重量%在矿物油中，500毫克，12.5毫摩尔）处理2-(二苄基氨基)乙醇（1.5克，6.2毫摩尔）和氯-2,2-二氟-乙酸钠（950毫克，6.19毫摩尔）在THF（12毫升）中的溶液。将反应混合物加热至回流整夜。将另外的氢化钠（60重量%在矿物油中，120毫克，3毫摩尔）添加到反应混合物中并继续加热另外1小时。将该反应冷却至室温并用水稀释。用***萃取该混合物。分离各层并用6 N盐酸将水层调节至pH 6。用EtOAc萃取该水溶液。合并所有有机溶液并经无水硫酸钠干燥。过滤该混合物并在减压下浓缩滤液以产生标题化合物1.03 g（49%）。MS (m/z): 336 (M+1)。
制备38
2-[2-(二苄基氨基)乙氧基]-2,2-二氟乙酸甲酯
用(三甲基甲硅烷基)重氮甲烷（2 M在己烷中，0.16毫升，0.32毫摩尔）逐滴处理2-[2-(二苄基氨基)乙氧基]-2,2-二氟-乙酸（100毫克，0.298毫摩尔）在甲苯（9毫升）和MeOH（2毫升）中的溶液。将该混合物在室温下搅拌15分钟。用乙酸（0.1毫升）淬灭该反应并在减压下浓缩该反应混合物以产生标题化合物102 mg（98%）。MS (m/z): 350 (M+1)。
制备39
4-苄基-2,2-二氟-吗啉-3-酮
用在EtOH（15毫升）中的2-[2-(二苄基氨基)乙氧基]-2,2-二氟-乙酸甲酯（485毫克，1.39毫摩尔）处理钯（10%在碳上，50毫克，0.141毫摩尔）在EtOH（15毫升）中的悬浮液。该反应混合物在氢气气氛（气球）下在室温下搅拌整夜。经CELITE®过滤该反应混合物并在减压下浓缩滤液以产生标题化合物294 mg（93%）。MS (m/z): 228 (M+1)。
制备40
4-苄基-2,2-二氟-吗啉
用硼二甲硫醚络合物（2 M在THF中，3.06毫升，6.12毫摩尔）处理4-苄基-2,2-二氟-吗啉-3-酮（290毫克，1.28毫摩尔）在THF（13毫升）中的溶液。将反应混合物在55℃下加热3.5小时，然后移除热并继续搅拌整夜。将反应混合物加热至55℃另外2小时。将反应混合物冷却至室温并通过逐滴加入盐酸（6 N, 3.06毫升，18.4毫摩尔）淬灭。将反应混合物在100℃下加热1小时。将该混合物冷却至室温并在减压下浓缩。用水稀释该混合物并用2 N氢氧化钠将pH调节至12。用EtOAc萃取该混合物。有机萃取物经无水硫酸钠干燥，过滤并在减压下浓缩滤液以产生标题化合物120 mg（44%）。MS (m/z): 214 (M+1)。
制备41
2-溴-6,6-二甲基-5-[2-(5-氧杂-8-氮杂螺[2.6]壬-8-基)乙基]噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮
将甲磺酸2-(2-溴-6,6-二甲基-4-氧代-噻吩并[2,3-c]吡咯-5-基)乙酯（2.76克，6.9毫摩尔）和5-氧杂-8-氮杂螺[2.6]壬烷（2.18, 16.3毫摩尔）在DMF（33毫升）中的混合物在80℃下加热整夜。将该混合物冷却至室温并用EtOAc稀释。用饱和NaCl（3 x 30毫升）洗涤该有机溶液。经无水硫酸钠干燥该有机溶液，过滤并在减压下浓缩滤液。通过反相柱色谱法（柱: 100g Gold C18；流动相: A）0.1%甲酸/水，B）0.1%甲酸/ACN；梯度: 5% B 5分钟，经20分钟5%-50% B；流速: 53毫升/分钟）提纯该残留物以产生标题化合物3.6 g（85%）。MS (m/z): 399/401 (M+1/M+3)。
制备42
4-[[4-[6,6-二甲基-5-(2-吗啉子基乙基)-4-氧代-噻吩并[2,3-c]吡咯-2-基]-5-甲基-嘧啶-2-基]氨基]-3-甲氧基-吡唑-1-甲酸叔丁酯
2-(2-氯-5-甲基-嘧啶-4-基)-6,6-二甲基-5-(2-吗啉子基乙基)噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮（250毫克，0.61毫摩尔）、4-氨基-3-甲氧基-吡唑-1-甲酸叔丁酯（157毫克，0.74毫摩尔）、碳酸铯（300毫克，0.92毫摩尔）、4,5-双(二苯基膦基)-9,9-二甲基呫吨（71毫克，0.12毫摩尔）和1,4-二氧杂环己烷（6.4毫升）的混合物用氮气脱气15分钟。加入乙酸钯(II)（14毫克，0.0614毫摩尔）并将该混合物在110℃下加热整夜。将该混合物冷却至室温并用EtOAc稀释。用饱和NaCl洗涤该有机溶液。经无水硫酸钠干燥该有机溶液，过滤并在减压下浓缩滤液。通过在C18柱（柱: 150 g；流动相: A）0.10%甲酸/水，B）0.10%甲酸/ACN；梯度: 10-50%B；流速: 60 mL/min）上的HPLC提纯该残留物以产生标题化合物101 mg（28%）。MS (m/z):584 (M+1)。
基本通过制备42的方法制备下列化合物。
制备No. 化合物名称 结构 注释 MS (m/z):
43 4-[[4-[6,6-二甲基-5-(2-吗啉子基乙基)-4-氧代-噻吩并[2,3-c]吡咯-2-基]嘧啶-2-基]氨基]-3-甲氧基-吡唑-1-甲酸叔丁酯 催化剂: 三(二亚苄基丙酮)二钯(0) 570 (M+1)
44 4-[[4-[6,6-二甲基-5-(2-吗啉子基乙基)-4-氧代-噻吩并[2,3-c]吡咯-2-基]-5-氟-嘧啶-2-基]氨基]-3-甲氧基-吡唑-1-甲酸叔丁酯 588 (M+1)
45 5-环丙基-4-[[4-[6,6-二甲基-5-(2-吗啉子基乙基)-4-氧代-噻吩并[2,3-c]吡咯-2-基]嘧啶-2-基]氨基]吡唑-1-甲酸叔丁酯 580 (M+1)
实施例1
6,6-二甲基-2-{2-[(1-甲基-1H-吡唑-5-基)氨基]嘧啶-4-基}-5-[2-(吗啉-4-基)乙基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮
合成方法1:
将2-甲基吡唑-3-胺（75克，772毫摩尔）缓慢添加到氢化钠（60重量%在矿物油中，30克，750毫摩尔） 在N-甲基吡咯烷酮（500毫升）中的悬浮液中。将所得混合物搅拌90分钟。加入2-(2-氯嘧啶-4-基)-6,6-二甲基-5-(2-吗啉子基乙基)噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮（145克，369毫摩尔）在N-甲基吡咯烷酮（200毫升）中的溶液。将该放热反应冷却至室温并将该反应倒入水（3升）中。用浓盐酸（200毫升）将pH调节至~3。用DCM（4 x 2升）萃取该混合物。使用5M氢氧化钠中和水层。用DCM（2 x 2升）萃取这一水溶液。合并这些有机萃取物并用水（2升）洗涤。该有机物经无水硫酸钠干燥，过滤并在减压下浓缩滤液。在相继用DCM（2升）、2.5%EtOH/DCM（2升）、5% EtOH/DCM（2升）、7.5% EtOH/DCM（2升）和最后10% EtOH/DCM（10升）洗脱的硅胶塞（2千克）上提纯该残留物。在减压下浓缩适当的级分。加入EtOAc（1升）并在减压下浓缩。加入EtOAc（1升）并在减压下浓缩。加入EtOAc（500毫升）和己烷（500毫升）。通过真空过滤收集固体并用己烷（500毫升）洗涤该固体。在真空下在50℃下干燥该固体以产生标题化合物65.7 g（39%）。MS (m/z): 454 (M+1)。
合成方法2:
2-(2-氯嘧啶-4-基)-6,6-二甲基-5-(2-吗啉子基乙基)噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮（20.8克，52.9毫摩尔）、2-甲基吡唑-3-胺（5.7克，58.2毫摩尔）、碳酸铯（37.9克，116.5毫摩尔）、4,5-双(二苯基膦基)-9,9-二甲基呫吨（2.6克，4.5毫摩尔）和1,4-二氧杂环己烷（529毫升）的混合物用氮气脱气10分钟。加入三(二亚苄基丙酮)​二钯(0)（2.4克，2.6毫摩尔）并将该混合物加热至85℃ 4小时。将该混合物冷却至室温并经滤纸过滤该混合物。在减压下浓缩滤液。由8克2-(2-氯嘧啶-4-基)-6,6-二甲基-5-(2-吗啉子基乙基)噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮开始重复该反应并合并这两种残留物。通过用5-25% MeOH/(10% EtOAc在DCM中)梯度洗脱的硅胶柱色谱法（330 g）提纯该残留物。汇集级分并在减压下浓缩。通过用5-25%MeOH/10% EtOAc-DCM梯度洗脱的硅胶柱色谱法（330 g）再提纯该残留物。汇集级分并在减压下浓缩。将残留物溶解在DCM（400毫升）中，然后加入丙酮（1升）。该混合物在减压下缓慢浓缩至大约700毫升。通过真空过滤收集固体以产生标题化合物14.8 g（48%）。MS (m/z):454 (M+1)。
合成方法3:
2-(2-氯嘧啶-4-基)-6,6-二甲基-5-(2-吗啉子基乙基)噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮（250毫克，0.64毫摩尔）、2-甲基吡唑-3-胺（124毫克，1.3毫摩尔）、碳酸铯（622毫克，1.9毫摩尔）、4,5-双(二苯基膦基)-9,9-二甲基呫吨（55毫克，0.095毫摩尔）和1,4-二氧杂环己烷（6.4毫升）的混合物用氮气脱气15分钟。加入乙酸钯(II)（14.3毫克，0.0636毫摩尔）并将该混合物在90℃下加热整夜。将该混合物冷却至室温并经滤纸过滤该混合物。用10% MeOH/DCM洗涤该固体。在减压下浓缩滤液。重复该反应并合并这两种残留物。在用9-28% ACN/10mM碳酸铵水溶液（pH 10）以85毫升/分钟梯度洗脱的C18柱（30 x 75 mm, 5 um, xbridgeODB）上通过HPLC提纯该残留物。汇集级分并在减压下浓缩以除去ACN。冻干该水溶液以产生标题化合物100 mg（18%）。MS (m/z): 454 (M+1)。
基本通过实施例1的合成方法3制备下列化合物。
实施例No. 化学名称 结构 物理数据MS (m/z):
2 6,6-二甲基-2-{5-甲基-2-[(1-甲基-1H-吡唑-5-基)氨基]嘧啶-4-基}-5-[2-(吗啉-4-基)乙基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮 468 (M+1)
3 4-[(4-{6,6-二甲基-5-[2-(吗啉-4-基)乙基]-4-氧代-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-2-基}嘧啶-2-基)氨基]-1-甲基-1H-吡唑-3-甲腈 479 (M+1)
4 6,6-二甲基-2-{2-[(1-甲基-1H-吡唑-5-基)氨基]嘧啶-4-基}-5-[2-(5-氧杂-8-氮杂螺[2.6]壬-8-基)乙基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮 494 (M+1)
5 2'-{2-[(1-甲基-1H-吡唑-5-基)氨基]嘧啶-4-基}-5'-[2-(吗啉-4-基)乙基]螺[环丙烷-1,6'-噻吩并[2,3-c]吡咯]-4'(5'H)-酮 452 (M+1)
6 6,6-二甲基-2-{2-[(1-甲基-1H-吡唑-5-基)氨基]-5-(三氟甲基)嘧啶-4-基}-5-[2-(吗啉-4-基)乙基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮 522 (M+1)
7 2-{2-[(3-甲氧基-1-甲基-1H-吡唑-4-基)氨基]-5-甲基嘧啶-4-基}-6,6-二甲基-5-[2-(吗啉-4-基)乙基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮 498 (M+1)
8 2-{2-[(2,3-二甲基吡啶-4-基)氨基]嘧啶-4-基}-6,6-二甲基-5-[2-(吗啉-4-基)乙基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮 479 (M+1)
9 6,6-二甲基-2-{2-[(1-甲基-1H-吡唑-4-基)氨基]嘧啶-4-基}-5-[2-(吗啉-4-基)乙基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮 454 (M+1)
10 2-{2-[(4-氟-2-甲基苯基)氨基]-5-甲基嘧啶-4-基}-6,6-二甲基-5-[2-(吗啉-4-基)乙基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮 496 (M+1)
11 6,6-二甲基-2-[5-甲基-2-(嘧啶-4-基氨基)嘧啶-4-基]-5-[2-(吗啉-4-基)乙基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮 466 (M+1)
12 2-{2-[(2,3-二甲基吡啶-4-基)氨基]-5-甲基嘧啶-4-基}-6,6-二甲基-5-[2-(吗啉-4-基)乙基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮 493 (M+1)
13 4-[(4-{6,6-二甲基-5-[2-(吗啉-4-基)乙基]-4-氧代-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-2-基}嘧啶-2-基)氨基]吡啶-3-甲腈 476 (M+1)
14 2-{5-氯-2-[(1-甲基-1H-吡唑-5-基)氨基]嘧啶-4-基}-6,6-二甲基-5-[2-(吗啉-4-基)乙基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮 488 (M+1)
15 2-{5-氟-2-[(1-甲基-1H-吡唑-5-基)氨基]嘧啶-4-基}-6,6-二甲基-5-[2-(吗啉-4-基)乙基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮 472 (M+1)
16 4-[(4-{6,6-二甲基-5-[2-(吗啉-4-基)乙基]-4-氧代-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-2-基}-5-氟嘧啶-2-基)氨基]-1-甲基-1H-吡唑-3-甲腈 497 (M+1)
17* 2-{2-[(1,3-二甲基-1H-吡唑-5-基)氨基]嘧啶-4-基}-6,6-二甲基-5-[2-(吗啉-4-基)乙基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮 468 (M+1)
18 2-{2-[(2,4-二氟苯基)氨基]-5-甲基嘧啶-4-基}-6,6-二甲基-5-[2-(吗啉-4-基)乙基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮 500 (M+1)
19 2-{2-[(2,4-二氟苯基)氨基]嘧啶-4-基}-6,6-二甲基-5-[2-(吗啉-4-基)乙基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮 486 (M+1)
*: 使用甲磺酸[(4,5-双(二苯基膦基)-9,9-二甲基呫吨)-2-(2'-氨基-1,1'-联苯基)]钯(II)作为配体。
实施例20
4-[(4-{6,6-二甲基-5-[2-(吗啉-4-基)乙基]-4-氧代-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-2-基}嘧啶-2-基)氨基]-1H-吡唑-5-甲腈
将2-(2-氯嘧啶-4-基)-6,6-二甲基-5-(2-吗啉子基乙基)噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮（350毫克，0.89毫摩尔）、4-氨基-1H-吡唑-5-甲腈（116毫克，1.07毫摩尔）、碳酸钾（320毫克，2.32毫摩尔）, 2-(二-叔丁基膦基)-2',4',6'-三异丙基-3,6-二甲氧基-1,1'-联苯（87毫克，0.18毫摩尔）、叔丁醇（2.3毫升）和乙酸（一滴）的溶液在90℃下加热2小时。将该混合物冷却至室温。用10% MeOH/DCM稀释该混合物并经在顶部具有少量硅胶的CELITE®柱过滤该溶液。用10% MeOH/DCM洗涤该柱并在减压下浓缩滤液。通过反相柱色谱法（柱: C18,275g Gold；流动相: A）10 mM碳酸氢铵/含5% MeOH的水，B）ACN；梯度：10% B 5分钟，经25分钟梯度至40% B；流速: 125mL/min）提纯该残留物以产生标题化合物240 mg（58%）。MS (m/z): 465 (M+1)。
基本通过实施例20的方法制备下列化合物。
实施例No. 化学名称 结构 物理数据MS (m/z):
21 6,6-二甲基-5-[2-(吗啉-4-基)乙基]-2-[2-(1H-1,2,3-***-5-基氨基)嘧啶-4-基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮 441 (M+1)
实施例22
6,6-二甲基-2-{2-[(5-甲基-1H-吡唑-4-基)氨基]嘧啶-4-基}-5-[2-(吗啉-4-基)乙基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮
2-(2-氯嘧啶-4-基)-6,6-二甲基-5-(2-吗啉子基乙基)噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮（230毫克，0.59毫摩尔）、3-甲基-1H-吡唑-4-胺（142毫克，0.73毫摩尔）、氯[2-(二-叔丁基膦基)-2',4',6'-三异丙基-1,1'-联苯基][2-(2-氨基乙基)苯基]]钯(II)（8毫克，0.012毫摩尔）, 2-二-叔丁基膦基-2',4',6'-三异丙基联苯（5毫克，0.012毫摩尔）和叔丁醇钠（118毫克，1.2毫摩尔）的混合物用氮气吹扫三次。加入叔丁醇（2毫升），密封该反应并将该混合物在室温下搅拌1.5小时。用EtOAc处理该反应混合物并将该混合物搅拌整夜。在减压下浓缩。将残留物溶解在EtOAc中并用饱和氯化铵水溶液洗涤该有机溶液。用EtOAc反萃取水层两次。合并的有机萃取物经无水硫酸钠干燥，过滤并在减压下浓缩滤液。通过用0-10% MeOH/DCM梯度洗脱的硅胶柱色谱法提纯该残留物以产生标题化合物164 mg（62%）。MS (m/z):454 (M+1)。
基本通过实施例22的方法制备下列化合物。
实施例 No. 化学名称 结构 物理数据MS (m/z):
23 2-{2-[(1-环丙基-1H-吡唑-5-基)氨基]嘧啶-4-基}-6,6-二甲基-5-[2-(吗啉-4-基)乙基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮 480 (M+1)
24 2-{2-[(5-乙基-1H-吡唑-4-基)氨基]嘧啶-4-基}-6,6-二甲基-5-[2-(吗啉-4-基)乙基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮 468 (M+1)
实施例25
6,6-二甲基-2-{2-[(1-甲基-1H-吡唑-5-基)氨基]嘧啶-4-基}-5-[2-(硫代吗啉-4-基)乙基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮
将甲磺酸2-[6,6-二甲基-2-[2-[(2-甲基吡唑-3-基)氨基]嘧啶-4-基]-4-氧代-噻吩并[2,3-c]吡咯-5-基]乙酯（260毫克，0.56毫摩尔）、硫代吗啉（116毫克，1.12毫摩尔）和三乙胺（0.18毫升，0.38毫摩尔）在ACN（2毫升）中的混合物在60℃下加热整夜。将该混合物冷却至室温并经CELITE®过滤该溶液。用10% MeOH/DCM洗涤固体并在减压下浓缩滤液。通过反相柱色谱法（柱: C18, 275 g Gold；流动相: A）10 mM氨/5% MeOH水溶液，B）ACN；梯度:10% B 5分钟，经25分钟梯度至10-65% B；流速: 200 mL/min）提纯该残留物以产生标题化合物170 mg（64%）。MS (m/z): 470 (M+1)。
基本通过实施例25的方法制备下列化合物。
实施例No. 化学名称 结构 物理数据MS (m/z):
26 6,6-二甲基-2-{2-[(1-甲基-1H-吡唑-5-基)氨基]嘧啶-4-基}-5-[2-(2,2,6,6-四氟吗啉-4-基)乙基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮 526 (M+1)
27 6,6-二甲基-2-{2-[(1-甲基-1H-吡唑-5-基)氨基]嘧啶-4-基}-5-[2-(1,4-氧杂氮杂环庚-4-基)乙基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮 468 (M+1)
28 6,6-二甲基-2-{2-[(1-甲基-1H-吡唑-5-基)氨基]嘧啶-4-基}-5-[2-(8-氧杂-3-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)乙基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮 480 (M+1)
29 5-[2-(3,3-二氟吡咯烷-1-基)乙基]-6,6-二甲基-2-{2-[(1-甲基-1H-吡唑-5-基)氨基]嘧啶-4-基}-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮 474 (M+1)
30 6,6-二甲基-2-{2-[(1-甲基-1H-吡唑-5-基)氨基]嘧啶-4-基}-5-[2-(2-氧杂-5-氮杂双环[4.1.0]庚-5-基)乙基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮 466 (M+1)
31 6,6-二甲基-5-{2-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]乙基}-2-{2-[(1-甲基-1H-吡唑-5-基)氨基]嘧啶-4-基}-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮 468 (M+1)
实施例32
5-[2-(2,2-二氟吗啉-4-基)乙基]-6,6-二甲基-2-{2-[(1-甲基-1H-吡唑-5-基)氨基]嘧啶-4-基}-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮
用在EtOAc（5毫升）中的4-苄基-2,2-二氟-吗啉（95毫克，0.45毫摩尔）处理氢氧化钯（20%在碳上，63毫克，0.09毫摩尔）在EtOAc（5毫升）中的悬浮液。该反应混合物在氢气气氛（气球）下在室温下搅拌5小时。经CELITE®过滤该反应混合物并分离滤液。向滤液中加入三乙胺（0.11毫升，0.79毫摩尔）和甲磺酸2-[6,6-二甲基-2-[2-[(2-甲基吡唑-3-基)氨基]嘧啶-4-基]-4-氧代-噻吩并[2,3-c]吡咯-5-基]乙酯（306毫克，0.66毫摩尔）。将该混合物在80℃下加热1小时。加入ACN（15毫升）并将该混合物在80℃下加热2天。将反应混合物冷却至室温并在减压下浓缩。通过用0-10% MeOH/EtOAc梯度洗脱的硅胶柱色谱法提纯该残留物。在减压下浓缩级分。通过用50-100% EtOAc/己烷的梯度、接着0-10% MeOH/EtOAc的第二梯度洗脱的硅胶柱色谱法再提纯该残留物以产生标题化合物47 mg（30%）。MS (m/z): 490 (M+1)。
实施例33
5-[2-(6,6-二氟-1,4-氧杂氮杂环庚-4-基)乙基]-6,6-二甲基-2-{2-[(1-甲基-1H-吡唑-5-基)氨基]嘧啶-4-基}-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮
用在DCM（5毫升）中的碳酸盐树脂（3摩尔当量）处理6,6-二氟-1,4-氧杂氮杂环庚烷盐酸盐（200毫克，0.15毫摩尔）。将该树脂悬浮液旋转1小时。通过过滤除去固体并用对甲苯磺酸（250毫克，1.45毫摩尔）处理滤液。将所得混合物搅拌2小时，然后在减压下浓缩该混合物。加入ACN（2毫升）和甲磺酸2-[6,6-二甲基-2-[2-[(2-甲基吡唑-3-基)氨基]嘧啶-4-基]-4-氧代-噻吩并[2,3-c]吡咯-5-基]乙酯（200毫克，0.43毫摩尔）。用三乙胺（0.15毫升，1.08毫摩尔）处理所得溶液。密封反应容器并将该混合物在80℃下加热3小时。冷却至室温并浓缩该反应混合物。通过反相柱色谱法（柱: 50 g C-18；流动相: A）0.1%TFA/水，B）0.1%TFA/ACN；梯度10-80% B）提纯该残留物。浓缩含产物的级分。将残留物溶解在DCM中并用饱和碳酸氢钠水溶液洗涤。经无水硫酸钠干燥该有机溶液，过滤并在减压下浓缩滤液。通过反相柱色谱法（柱: 15 g Gold C-18；流动相: A）10 mM碳酸铵/含10% MeOH的水，B）ACN；梯度10-80% B）提纯该残留物以产生标题化合物16 mg（7%）。MS (m/z): 504 (M+1)。
实施例34
5-{2-[环丙基(甲基)氨基]乙基}-6,6-二甲基-2-{2-[(1-甲基-1H-吡唑-5-基)氨基]嘧啶-4-基}-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮
将甲磺酸2-[6,6-二甲基-2-[2-[(2-甲基吡唑-3-基)氨基]嘧啶-4-基]-4-氧代-噻吩并[2,3-c]吡咯-5-基]乙酯（70毫克，0.16毫摩尔）和N-甲基环丙胺（77毫克，1.08毫摩尔）在DMF（1.7毫升）中的溶液在90℃下加热整夜。将该混合物冷却至室温。通过反相柱色谱法（柱: 100 g Gold C-18；流动相: A）0.1%甲酸/水，B）0.1%甲酸ACN；梯度: 5% B 5分钟，经25分钟梯度至65% B；流速: 60 mL/min）提纯该溶液以产生标题化合物70 mg（37%）。MS (m/z): 438 (M+1)。
基本通过实施例34的方法制备下列化合物。
实施例No. 化学名称 结构 物理数据MS (m/z):
35 6,6-二甲基-2-{2-[(1-甲基-1H-吡唑-5-基)氨基]嘧啶-4-基}-5-[2-(7-氧杂-4-氮杂螺[2.5]辛-4-基)乙基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮 480 (M+1)
实施例36
2-{2-[(3-甲氧基-1H-吡唑-4-基)氨基]-5-甲基嘧啶-4-基}-6,6-二甲基-5-[2-(吗啉-4-基)乙基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮盐酸盐
将4-[[4-[6,6-二甲基-5-(2-吗啉子基乙基)-4-氧代-噻吩并[2,3-c]吡咯-2-基]-5-甲基-嘧啶-2-基]氨基]-3-甲氧基-吡唑-1-甲酸叔丁酯（101毫克，0.173毫摩尔）和氯化氢（4.0 M在1,4-二氧杂环己烷中，2毫升，8毫摩尔）在MeOH（20毫升）中的溶液在室温下搅拌12小时。将该混合物浓缩至干以产生标题化合物80 mg（89%）。MS (m/z): 484 (M+1)。
基本通过实施例36的方法制备下列化合物。
实施例No. 化学名称 结构 物理数据MS (m/z):
37* 2-{2-[(3-甲氧基-1H-吡唑-4-基)氨基]嘧啶-4-基}-6,6-二甲基-5-[2-(吗啉-4-基)乙基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮 470 (M+1)
38 2-{2-[(5-环丙基-1H-吡唑-4-基)氨基]嘧啶-4-基}-6,6-二甲基-5-[2-(吗啉-4-基)乙基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮盐酸盐 480 (M+1)
39 2-{5-氟-2-[(3-甲氧基-1H-吡唑-4-基)氨基]嘧啶-4-基}-6,6-二甲基-5-[2-(吗啉-4-基)乙基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮盐酸盐 488 (M+1)
*:反应后制成的游离碱。
实施例40
6,6-二甲基-2-{2-[(1-甲基-1H-吡唑-5-基)氨基]嘧啶-4-基}-5-{2-[2-氧杂-5-氮杂双环[4.1.0]庚-5-基]乙基}-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮，异构体2
通过手性柱色谱法（柱: Lux Cellulose-4 21.2 x 250 mm；流动相: 40%异丙醇（0.2%异丙胺）/CO2）；洗脱时间: 11分钟)提纯6,6-二甲基-2-{2-[(1-甲基-1H-吡唑-5-基)氨基]嘧啶-4-基}-5-[2-(2-氧杂-5-氮杂双环[4.1.0]庚-5-基)乙基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮（实施例30）以产生标题化合物24 mg（34%）。MS (m/z): 466 (M+1)。
X-射线粉末衍射
在配备CuKa源（λ = 1.54060 Å）和Vantec检测器、在35 kV和50 mA下运行的Bruker D4Endeavor X-射线粉末衍射仪上获得结晶固体的XRD图样。在4和40°2θ之间以0.009°2θ的步长和0.5秒/步的扫描速率和以0.6 mm发散狭缝、5.28固定防散射狭缝和9.5 mm检测器狭缝扫描样品。将干燥粉末填充在石英样品支架上并使用载玻片获得平滑表面。在环境温度和相对湿度下收集晶形衍射图。结晶学领域中众所周知，对于任何给定晶形，衍射峰的相对强度可由于由晶体形态和晶体习性之类的因素造成的择优取向而变。如果存在择优取向效应，峰强度改变但多晶型物的特征峰位置不变。此外，结晶学领域中也众所周知，对于任何给定晶形，角峰位置可能轻微改变。例如，峰位置可由于分析样品时的温度或湿度、样品位移或内标的存在与否而移动。在本发明情况下，2θ的± 0.2的峰位置变异性考虑到这些潜在变化，而不阻碍所示晶型的明确识别。可基于特征峰（以°2θ为单位），通常更突出峰的任何独特组合确认晶形。基于在8.853和26.774°2θ的NIST 675标准峰调节在环境温度和相对湿度下收集的晶形衍射图。
实施例1晶形1的X-射线粉末衍射
6,6-二甲基-2-{2-[(1-甲基-1H-吡唑-5-基)氨基]嘧啶-4-基}-5-[2-(吗啉-4-基)乙基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮（晶形1）
将6,6-二甲基-2-{2-[(1-甲基-1H-吡唑-5-基)氨基]嘧啶-4-基}-5-[2-(吗啉-4-基)乙基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮（103毫克）添加到ACN（1毫升）和水（1毫升）的溶液中并将该混合物在70℃下加热10分钟。过滤并使该溶液冷却至室温整夜。将水（2毫升）经5小时缓慢添加到该溶液中。通过真空过滤收集固体并用水洗涤。风干该固体以产生标题化合物94 mg（92%）。
制成的实施例1晶形1的样品通过使用CuKa辐射的XPD图样表征为具有如下表1中所述的衍射峰（2θ值），特别是具有在19.3°的峰以及选自15.5、17.1、18.0、20.2、21.5和22.1°的一个或多个峰；衍射角公差为0.2°。
表1: 实施例1晶形1的X-射线粉末衍射峰
。
若干证据表明癌细胞中的一种或多种信号传导通路的活化介导肿瘤启动、生长和进展中涉及的过程。丝裂原活化蛋白激酶（MAPK）通路是细胞增殖和存活的关键调节因子。ERK是这一通路的下游成员并在传递来自活化的受体酪氨酸激酶（RTKs）如EGFR、FGFR、PDGFR、VEGFR等的细胞外信号中起到核心作用。这一通路是由RAF、MEK和ERK（细胞外信号调节激酶）激酶构成的三层（three tiered）激酶级联，且这一通路的活化以RAS（一种小GTPase）的活化开始。RAS的活化造成RAF（一种丝氨酸/苏氨酸激酶）的募集及其活化。活化的RAF随后将MEK1/2磷酸化和活化，其又将ERK1/2磷酸化和活化。当活化时，ERK1/2将参与细胞增殖、生长、存活和EMT（上皮细胞向***转化）的若干下游细胞质和核靶磷酸化。
RAS/MAPK通路是对细胞增殖而言最重要的通路之一并且相信这一通路在所有人类癌症的~30%中常被激活。组成性的MAPK通路激活可源自激活RAS、BRAF、MEK1中的突变、肿瘤抑制因子NF1的损失或通过RTKs的突变、扩增或配体介导激活介导的上游激活。所有三种RAS家族基因（KRAS、NRAS和HRAS）已表明在若干癌症，包括结直肠癌、黑素瘤、肺癌和胰腺癌中体细胞突变，最常由于在密码子12、13和61处的单点突变。这些突变造成RAS的组成性激活，这伴随着提高的ERK1/2活性和生长信号传导。在KRAS的密码子12、13和61中的突变产生对抑制EGFR的化合物和单克隆抗体的耐受性。在30%的肺癌、90%的胰腺癌、10%的胃癌和50%的结直肠癌中发现KRAS突变。在大约10-25%的黑素瘤中检测到NRAS突变。此外，已在~55-60%的甲状腺癌中识别出RAS突变（HRAS、KRAS和NRAS）。BRAF中的体细胞点突变出现在大约8%的人类肿瘤中，最常出现在黑素瘤（60%）、结直肠癌（10%）和甲状腺癌（50%）中。在黑素瘤中，所有BRAF突变看起来都在激酶结构域内并且单取代（T-> A, V600E）占突变的80%。在具有RAS突变的互斥模式（mutually exclusive pattern）中发现BRAF突变，只有极少例外，表明这些基因改变激活共同的下游效应子。
生物检测
下列检测证实本发明的实施例化合物是ERK1和ERK2激酶活性的抑制剂。下列检测的结果还证实本发明的实施例化合物抑制癌细胞中的ERK信号传导。另外，实施例1的化合物在癌症的某些异种移植肿瘤模型中表现出ERK通路靶向抑制。此外，实施例1的化合物在癌症的某些异种移植肿瘤模型中抑制肿瘤生长。
ERK1激酶检测
这一检测的目的是测量化合物抑制ERK1激酶活性的能力。使用TR-FRET检测体外进行ERK1激酶检测。通过在384孔PROXIPLATETM（Perkin Elmer, #GRN6260）中加入5微升ERK1酶（Invitrogen, #PR5254B, 最终浓度100 ng/mL）+ 底物GFP-ATF2（Invitrogen, # PV4445,最终浓度0.2 µM）、5微升在激酶缓冲液（50 mM Hepes pH 7.4, 5 mM MgCl2, 0.1 mMEGTA, 0.01% Triton X-100, 1 mM DTT）中制备的ATP溶液（Invitrogen, # PV3227, 最终浓度10 µM）和2.5微升在DMSO溶液中的受试化合物（最终4%, v/v），开始反应（12.5微升）。将反应混合物在室温下温育60分钟。通过加入12.5微升在TR-FRET稀释缓冲液（Invitrogen, # PV3574）中的终止缓冲液（10 mM EDTA, 2 nM Tb-抗-pATF2 (pThr71)抗体, Invitrogen, #PV4448），终止该反应。将板在室温下温育另外60分钟并在ENVISION®（PerkinElmer）读板仪上在激发波长340 nm下读数。通过将GFP受体发射信号（在520纳米）除以Tb供体发射信号（在495纳米），计算TR-FRET比。相对于板上Max（DMSO对照）和Min（不添加酶）对照孔TR-FRET比数据，使用化合物处理孔计算抑制百分比{%抑制 = 100-[(受试化合物– Min中值)/(Max中值 - Min中值) X 100]}。使用1:3稀释方案在10个浓度（20 µM至0.001 µM）下测试所有化合物。通过使用ACTIVITYBASE® 7.3（ID Business SolutionsLimited）将抑制百分比和10点浓度数据拟合到四参数非线性逻辑方程中（方程205），推导Abs_IC50值。
在这一检测中基本如上所述测试本发明范围内的实施例化合物。这一检测的结果证实所有实施例化合物以小于0.15 µM的IC50值抑制ERK1激酶活性。例如，实施例1的化合物具有4.86 nM (±0.20, n=7)的IC50值。
ERK2激酶检测
这一检测的目的是测量化合物抑制ERK2激酶活性的能力。使用TR-FRET检测体外进行ERK2激酶检测。通过在384孔PROXIPLATETM（Perkin Elmer, #GRN6260）中加入5微升ERK2酶（Invitrogen, #PV3595B, 最终浓度50 ng/mL）+ 底物GFP-ATF2（Invitrogen, # PV4445,最终浓度0.2 µM）、5微升在激酶缓冲液（50 mM Hepes pH 7.4, 5 mM MgCl2, 0.1 mMEGTA, 0.01% Triton X-100, 1 mM DTT）中制备的ATP溶液（Invitrogen, # PV3227, 最终浓度10 µM）和2.5微升在DMSO溶液中的受试化合物（最终4%, v/v），开始所有反应（12.5微升）。将反应在室温下温育60分钟。通过加入12.5微升在TR-FRET稀释缓冲液（Invitrogen,# PV3574）中的终止缓冲液（10 mM EDTA, 2 nM Tb-抗-pATF2 (pThr71)抗体,Invitrogen, #PV4448），终止反应。将板在室温下温育另外60分钟并在ENVISION®（PerkinElmer）读板仪上在激发波长340 nm下读数。通过将GFP受体发射信号（在520纳米）除以Tb供体发射信号（在495纳米），计算TR-FRET比。相对于板上Max（DMSO对照）和Min（不添加酶）对照孔TR-FRET比数据，使用化合物孔计算抑制百分比{%抑制 = 100-[(受试化合物–Min中值)/(Max中值 - Min中值) X 100]}。使用1:3稀释方案在10个浓度（20 µM至0.001 µM）下测试所有化合物。通过使用ACTIVITYBASE 7.3（ID Business Solutions Limited）将抑制百分比和10点浓度数据拟合到四参数非线性逻辑方程中（方程205），推导Abs_IC50值。
在这一检测中基本如上所述测试本发明范围内的实施例化合物。这一检测的结果证实所有实施例化合物以小于0.15 µM的IC50值抑制ERK2激酶活性。例如，实施例1的化合物具有5.24 nM (±0.24, n=7)的IC50值。
ERK1/2细胞机理检测（pRSK1 Alphascreen检测）
这一检测的目的是体外测量化合物抑制癌细胞中的ERK信号传导的能力。使用HCT116结直肠癌细胞系（ATCC, # CCL-247）进行pRSK1 Alphascreen检测。在T-150烧瓶中在含有5% 胎牛血清（FBS）（Gibco, #16000-044）的Dulbecco氏改良 Eagle培养基（DMEM）（Hyclone, #SH30022）生长培养基中常规培养HCT116细胞并在5% CO2温育器中在37℃下温育。在细胞融合时收取细胞并在冻存培养基中以1x10e7细胞/mL作为“检测预备冷冻细胞（assay ready frozen cell）”冻结并储存在液氮中。为了运行该检测，在96孔组织培养板中接种40,000 HCT116细胞/孔并在5% CO2温育器中在37℃下温育整夜。在10个浓度下测试化合物，从20 µM最高浓度开始，采用1:3稀释方案（20 µM至0.001 µM），最终DMSO浓度为0.5% (v/v)。在20微升无血清生长培养基中加入化合物并在37℃下温育2小时。除去生长培养基并将含有1x holt蛋白酶和磷酸抑制剂混合物 [Thermo, #78441]的50微升1x裂解缓冲液 [Cell Signaling Technology, #9803]添加到各孔中并在摇振器上在室温下温育10分钟。将4微升来自各孔的细胞裂解产物转移到384孔检测板[Perkin Elmer, #6006280]的各孔中并加入5微升反应混合物 [2000份1x检测缓冲液（Perkin Elmer, #A1000）、1份生物素-RSK1抗体（Santa Cruz, #sc-231-B-G）、4份pRSK1抗体（Abcam, #ab32413）、35份受体珠（Perkin Elmer, #6760617R）]。用箔板密封剂（Beckman Coulter, # 538619）密封板并在室温下温育2小时。将2微升供体珠[20份1x 检测缓冲液, 1份供体珠]添加到各孔中并用透明板密封剂（Applied Biosystems, #4311971）密封板并在室温下在暗处温育2小时。通过在ENVISION®（PerkinElmer）读板仪中读板，测量各孔中的荧光强度。通过使用ACTIVITYBASE® 7.3（ID Business Solutions Limited）将pRSK1抑制百分比 [%抑制 =100-[(受试化合物– Min中值)/ (Max中值-Min中值) X 100]和10点浓度数据拟合到四参数非线性逻辑方程中（Abase方程205），推导Rel IC50值。
在这一检测中基本如上所述测试本发明范围内的实施例化合物。这一检测的结果证实所有实施例化合物以小于3 µM的IC50值抑制肿瘤细胞中的ERK底物（RSK）磷酸化。例如，实施例1的化合物具有0.429 µM (± 0.173, n=8)的IC50值。
体内靶向抑制(IVTI)检测（pRSK1 ELISA检测）
这一检测的目的是测量受试化合物在动物模型中抑制ERK1/2底物磷酸化的能力。在来自Harlan Laboratories的雌性无胸腺裸小鼠（22-25 g）的右侧腹区皮下植入在200微升1:1 Hank氏平衡盐溶液（HBSS）+ Matrigel溶液中的5x10e6 HCT116结直肠癌细胞（ATCC, #CCL-247）。在植入后第7天开始每周两次测量肿瘤生长和体重。当肿瘤尺寸达到300-500mm3时，将动物随机分成由五个动物构成的组。口服给予动物适当剂量的在化合物特异性媒介物中的化合物或仅媒介物（媒介物：1% HEC/0.25% Tween 80/0.05% Antifoam）并在给药后以所需时间间隔收集肿瘤和血液。使用异氟烷麻醉+颈椎脱位处死动物。快速冻结肿瘤并储存在-80℃直至处理以通过ELISA检测测定pRSK1水平。将血液收集在EDTA管中并离心提取血浆（spin down for plasma）并在96孔板中在-80℃下冻结。使用标准方法测定化合物暴露。
在液氮中粉碎肿瘤并在冷室（4℃）中在FastPrep-24TM 细胞粉碎机（MPBiomedical）中在含有1x halt蛋白酶 & 磷酸酶抑制剂混合物（Thermo Scientific, #0861281）、1 mM苯基甲磺酰氟（PMSF）（Sigma, # 93482-50ML-F）和1 µM偏钒酸钠（Sigma, #590088）的1x裂解缓冲液（MSD, #R60TX-3）中使用Matrix D珠（MP Biomedical, #6913-500）裂解。在4℃下以14000 rpm旋转20分钟后将肿瘤裂解物转移到新管中。使用PierceBCA蛋白检测试剂盒（cat# 23225, Thermo Scientific）测定肿瘤或细胞裂解物的蛋白质浓度。这一试剂盒含有三种主要组分 – (1) BCA试剂A，在0.1 M氢氧化钠中含有碳酸钠、碳酸氢钠、二喹啉甲酸和酒石酸钠，(2) BCA试剂B，含有4%硫酸铜，和(3) 白蛋白标准安瓿，在0.9%盐水和0.05%叠氮化钠中含有2 mg/mL。在96孔板中，在成对孔（duplicate wells）中以25微升加入20-2000 ug/mL浓度范围的牛血清白蛋白标准品以生成标准曲线。将在25微升1x PBS中稀释的细胞或肿瘤裂解物添加到成对试验孔（duplicate test wells）中。通过将2%试剂B添加到试剂A中（2毫升B + 98毫升A），制备工作BCA试剂，充分混合并将200微升添加到各样品或标准品中。充分混合，覆盖该板并在37℃下温育30分钟。将板冷却至室温并在读板仪（来自Perkin Elmer的Envision读板仪）上在562纳米或附近测量吸光度。从所有其它独立标准和未知（细胞或肿瘤裂解物）复制样品的562纳米测量结果中减去空白标准复制品的平均562纳米吸光度测量结果。通过绘制各牛血清白蛋白标准的平均空白校正562纳米测量结果 vs 其以µg/mL计的浓度，制备标准曲线。使用该标准曲线在Microsoft Excel中使用曲线拟合对数测定各未知样品的蛋白质浓度。剩余肿瘤裂解物在-80℃下冻结。使用一次冻融肿瘤裂解物通过夹心ELISA测量pRSK1表达。
用40纳克RSK1山羊抗体（Santa Cruz, # sc-231-G）在4℃下涂布96孔板（Thermo,#15042）整夜并在室温下温育1小时，然后在4℃下温育整夜。用300微升PBST（含有0.05%Tween-20的1x磷酸盐缓冲盐水（PBS））洗涤板三次，用每孔100微升封闭缓冲液（ThermoScientific, #37532）封闭并在室温下温育2小时。用300微升PBST洗涤板三次并将20微克肿瘤裂解物转移到各孔并在4℃下温育整夜。用300微升PBST洗涤板三次并用100微升pRSK1（T359/S363）兔抗体（在封闭缓冲液中1:1000稀释）在室温下温育4小时。用300微升PBST洗涤板三次并用100微升抗兔HRP-缀和二抗（GE Healthcare UK, #NA934V；在封闭缓冲液中1:10000稀释）温育。在室温下温育1小时。用300微升PBST洗涤板三次，加入100微升SUPERSIGNAL® ELISA Femto最大灵敏度底物（Thermo, #37075）并在摇振器上温育1分钟。使用ENVISION®读板仪测定发光信号。通过将获自仅用媒介物处理的动物的肿瘤裂解物视为100%，测定各肿瘤裂解物中的pRSK1水平。一式两份分析各样品并使用平均数进行计算。使用Excel和XL Fit计算TED50。
在这一检测中基本如上所述测试本发明范围内的化合物。这一检测的结果证实实施例1的化合物抑制肿瘤异种移植模型中的RSK1磷酸化。例如，实施例1的化合物具有16mg/kg的TED50值。
异种移植肿瘤模型
这一检测的目的是测量响应受试化合物给药的肿瘤体积减小。在培养中扩大人结直肠癌细胞HCT116（ATCC, # CCL-247），收获并在雌性无胸腺裸小鼠（22-25 g，HarlanLaboratories）的右后侧腹上皮下注射在200微升1:1 HBSS+matrigel溶液中的5x10e6 细胞。在培养中扩大人胰腺癌细胞MIA PACA-2（ATCC, # CRL-1420）或人非小细胞肺癌细胞CALU-6（ATCC, # HTB-56）或人结直肠癌细胞COLO-205（ATCC, # CCL-222），收获并在雌性无胸腺裸小鼠（22-25 g，Harlan Laboratories）的右后侧腹上皮下注射在200微升1:1HBSS+matrigel溶液中的5x10e6 细胞。在植入后第7天开始每周两次测量肿瘤生长和体重。当肿瘤尺寸达到200-400mm3时，将动物随机分成由8至10只动物构成的组。在适当的媒介物（媒介物：1% HEC/0.25% Tween 80/0.05% Antifoam）中制备受试化合物并通过口服灌胃给药14至21天。通过在治疗过程中每周两次进行的肿瘤体积测量测定肿瘤响应。作为毒性的一般量度获得体重。
在基本如上运行的这一检测中测试本发明范围内的化合物。发现实施例1的化合物具有如下表2中提供的ΔT/C%值。这些结果表明实施例1的化合物在若干人癌症异种移植模型，包括HCT116、MIA PACA-2、CALU-6和COLO-205中表现出显著抗肿瘤活性。
表2: 实施例1在异种移植模型中的效力
肿瘤体积的分析基于Log 10和SpatialPower协方差结构
*:显著性(p<0.05)
NA: 不适用
当治疗组中的终点肿瘤体积等于或高于基线肿瘤体积时，计算ΔT/C%。公式是100*(T-T0)/(C-C0)，其中T和C分别是治疗组或对照组中的平均终点肿瘤体积。T0和C0是这些组中的平均基线肿瘤体积；
在终点体积低于基线时计算消退%。公式是100*(T-T0)/T0，其中T0是治疗组的平均基线肿瘤体积；
对于HCT116、MIA PACA-2和CALU-6模型，分别使用在第10天、第20天和第15天自基线（随机化）的所有组的总平均值计算T/C的%变化。
体内组合研究
由于肿瘤异质性，组合疗法在某些类型的癌症治疗中对有效治疗或克服获得性耐药性是至关重要的。假设靶向疗法的组合具有更有效减慢或甚至中止癌症的潜力。在本文中，实施例1的化合物与pan-RAF抑制剂化合物（参见WO 2013/134243，1-(3,3-二甲基丁基)-3-(2-氟-4-甲基-5-(7-甲基-2-(甲基氨基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-6-基)苯基)脲，下文称作“pan-RAF抑制剂化合物”）、CDK4/6抑制剂化合物（参见WO 2010/075074，[5-(4-乙基-哌嗪-1-基甲基)-吡啶-2-基]-[5-氟-4-(7-氟-3-异丙基-2-甲基-3H-苯并咪唑-5-基)-嘧啶-2-基]-胺或其可药用盐，下文称作“CDK4/6抑制剂化合物”）或DC101（参见例如Witte L.等人Cancer Metastasis Rev., 17, 155-161, 1998，针对鼠VEGFR2的大鼠单克隆抗体，其可在实验中用作小鼠中的抗-VEGFR2 Ab，优选雷莫芦单抗（参见WO 2003/075840，也称作Cyramza®, IMC-1121b, CAS登记号947687-13-0）的替代物）组合测试肿瘤生长抑制。更具体地，在HCT116（一种KRAS突变结直肠癌异种移植模型）中与pan-RAF抑制剂化合物或CDK4/6抑制剂化合物组合测试实施例1的化合物。也在NCI-H441、A549和NCI-H2122（KRAS突变非小细胞肺癌（NSCLC）异种移植模型）中与CDK4/6抑制剂化合物或DC101组合测试实施例1的化合物。
在无胸腺裸大鼠中进行HCT116组合效力研究。在培养中扩大人结直肠癌细胞HCT116（ATCC, # CCL-247），收获并在雌性NIH裸大鼠（120-145 gm, Taconic Farms）的右后侧腹上皮下注射在200微升1:1 HBSS+matrigel溶液中的5x10e6 细胞。在植入后第7天开始每周两次测量肿瘤生长和体重。当平均肿瘤尺寸达到200-300mm3时，将动物随机分成由5至7只动物构成的组。在适当的媒介物（见下文）中制备受试化合物并通过口服灌胃给药21至28天。通过在治疗过程中每周两次进行的肿瘤体积测量测定肿瘤响应。这一研究中所用的媒介物是1% HEC（羟乙基纤维素）/0.25% Tween® 80/0.05% Antifoam。实施例1的化合物和pan-RAF抑制剂化合物在1% HEC /0.25% Tween® 80/0.05% Antifoam中配制。CDK4/6抑制剂化合物在1% HEC/25 mM磷酸钠缓冲液，pH 2中配制。实施例1的化合物以10 mpk和20mpk QD给药分别带来52%和64%肿瘤生长抑制的单剂活性（表3）。相反，pan-RAF抑制剂化合物以10 mpk和20 mpk BID给药分别带来29%和68%的单剂活性。除在10 mpk BID下的pan-RAF抑制剂化合物外，所有治疗与媒介物对照物相比统计显著（p<0.05）。在10 mpk, QD下的实施例1的化合物与在10 mpk, BID下的pan-RAF抑制剂化合物的组合给药带来94%肿瘤生长抑制（p<0.001）且组合结果如通过Bliss Independence方法计算为“协同”（表3）。看起来耐受这种组合，因为没有显著体重损失。在10 mpk, QD下的实施例1的化合物与在20 mpk,BID下的pan-RAF抑制剂化合物的组合给药也已带来显著（p<0.05）肿瘤生长抑制（95%）且组合结果如通过Bliss Independence方法计算为“相加”（表3）。看起来耐受这种组合，因为没有显著体重损失。在同一研究中，在10 mpk, QD下的实施例1的化合物与在20 mpk, QD下的CDK4/6抑制剂化合物一起给药带来98%肿瘤生长抑制，而实施例1的化合物和CDK4/6抑制剂化合物的单剂效力分别是52%和76%肿瘤生长抑制。这两种试剂的组合表现出如通过BlissIndependence方法计算出的统计显著的“相加”结果（表3）。看起来耐受这种组合，因为没有显著体重损失。这些结果表明实施例1的化合物与pan-RAF抑制剂化合物或CDK4/6抑制剂化合物的组合可为KRAS突变结直肠癌患者提供更大益处。
表3: 实施例1的化合物与pan-RAF抑制剂化合物或CDK4/6抑制剂化合物在HCT116KRAS突变结直肠癌异种移植模型中的组合研究
肿瘤体积的分析基于Log 10和SpatialPower协方差结构.
*: 显著性(p<0.05)
**通过Bliss Independence方法测定两种试剂的组合的统计效应：首先，将重复测量模型拟合至log肿瘤体积 vs. 组、时间和时间分组（group-by-time）。然后使用contrast语句测试各时间点的相互作用效应。在肿瘤体积标度上计算该组合的预期相加响应（EAR），EAR体积 = V1 * V2 / V0，其中V0、V1和V2分别是媒介物对照物、单独治疗1和单独治疗2的估算平均肿瘤体积。如果该相互作用试验显著（p < 0.05），在受试剂量和方案下，如果观察到的组合体积小于EAR体积，组合效应据称为协同，如果观察到的组合体积大于EAR体积，据称为拮抗，否则为相加。
NA: 不适用
当治疗组中的终点肿瘤体积等于或高于基线肿瘤体积时，计算ΔT/C%。公式是100*(T-T0)/(C-C0)，其中T和C分别是治疗组或对照组中的平均终点肿瘤体积。T0和C0是这些组中的平均基线肿瘤体积。
在所有研究中给药28天
使用在第11天自基线（随机化）的所有组的总平均值计算T/C的%变化。
也在三个KRAS突变NSCLC异种移植模型，包括SCID小鼠中的A549 (KRAS_G12S)以及无胸腺裸小鼠中的NCI-H441 (KRAS_G12V)和NCI-H2122 (KRAS_G12C)中测试组合效力。在培养中扩大人非小细胞肺癌细胞NCI-H441（ATCC, # CRL-5807）和NCI-H2122（ATCC, #CRL-5985），收获并在雌性无胸腺裸小鼠（20-22 gm, Harlan Laboratories）的右后侧腹上皮下注射在200微升1:1 HBSS+matrigel溶液中的5x10e6 细胞。在培养中扩大人非小细胞肺癌细胞A549（ATCC, # CCl-185），收获并在雌性CB-17 SCID小鼠（18-20 gm, TaconicFarms）的右后侧腹上皮下注射在200微升1:1 HBSS+matrigel溶液中的5x10e6 细胞。对于所有细胞系，在植入后第7天开始每周两次测量肿瘤生长和体重。当平均肿瘤尺寸达到200-300mm3时，将动物随机分成由5至7只动物构成的组。在适当的媒介物（见下文）中制备受试化合物并通过口服灌胃（实施例1的化合物和CDK4/6抑制剂化合物）或腹膜内（DC101）给药21至28天。通过在治疗过程中每周两次进行的肿瘤体积测量测定肿瘤响应。这些研究中所用的媒介物是1% HEC/0.25% Tween® 80/0.05% Antifoam。实施例1的化合物在1% HEC/0.25% Tween® 80/0.05% Antifoam中配制，且CDK4/6抑制剂化合物在1% HEC/25 mM磷酸钠缓冲液，pH 2中配制。实施例1的化合物以50 mpk单剂给药在NCI-H2122和A549肿瘤中分别带来41%和91%肿瘤生长抑制；并在NCI-H441肿瘤中带来101%肿瘤生长抑制（即1%肿瘤消退）。CDK4/6抑制剂化合物以50 mpk单剂给药在NCI-H2122、A549和NCI-H441模型中分别带来53%、51%和81%肿瘤生长抑制。实施例1的化合物（50 mpk）与CDK4/6抑制剂化合物（50mpk）的组合在A549和NCI-H441肿瘤中分别带来151%（即51%消退）和147%（即47%消退）肿瘤生长抑制；和在NCI-H2122肿瘤中82%肿瘤生长抑制。在所有三个肿瘤模型中的组合结果如通过Bliss Independence方法计算为“相加”（表4）。通常，如没有显著体重损失所示，看起来在这些研究中耐受所有治疗。在相同的NCI-H441异种移植模型中，在磷酸盐缓冲液中的DC101也作为单剂或与实施例1的化合物，50 mpk, QD组合地每周两次（BIW）腹膜内给药28天。在20 mpk BIW下的 DC101给药带来102%肿瘤生长抑制（即2%消退）的单剂活性。在50mpk, QD下的实施例1的化合物与在20 mpk, BIW下的 DC101的组合带来146%肿瘤生长抑制（即46%消退）。这一组合结果如通过Bliss Independence方法计算为“相加”（表4）。看起来耐受这种组合，因为没有显著体重损失。这些结果表明实施例1的化合物与CDK4/6抑制剂化合物或抗VEGFR2抗体的组合可为具有KRAS突变的非小细胞肺癌患者提供更大益处。
表4: 实施例1的化合物与CDK4/6抑制剂化合物或DC101在KRAS突变非小细胞肺癌异种移植模型中的组合研究
肿瘤体积的分析基于Log 10转换和具有特定检验力协方差结构的重复测量ANOVA
*:显著性(p <0.05)
**通过Bliss Independence方法测定两种试剂的组合的统计效应：首先，将重复测量模型拟合至log肿瘤体积 vs. 组、时间和时间分组（group-by-time）。然后使用contrast语句测试各时间点的相互作用效应。在肿瘤体积标度上计算该组合的预期相加响应（EAR），EAR体积 = V1 * V2 / V0，其中V0、V1和V2分别是媒介物对照物、单独治疗1和单独治疗2的估算平均肿瘤体积。如果该相互作用试验显著（p < 0.05），在受试剂量和方案下，如果观察到的组合体积小于EAR体积，组合效应据称为协同，如果观察到的组合体积大于EAR体积，据称为拮抗，否则为相加。
NA: 不适用
当治疗组中的终点肿瘤体积等于或高于基线肿瘤体积时，计算ΔT/C%。公式是100*(T-T0)/(C-C0)，其中T和C分别是治疗组或对照组中的平均终点肿瘤体积。T0和C0是这些组中的平均基线肿瘤体积。
使用第11天（HCT116）、第25天（NCI-H441）、第22天（A549）、第18天（NCI-H2122）的基线（随机化）计算T/C的%变化。
在所有研究中给药28天。

Claims (19)

1.下式的化合物或其可药用盐：
其中：
R1是
R2和R3是甲基或R2和R3可以一起形成环丙基；
R4是氢、甲基、氯、氟或三氟甲基；且
R5是
。
2.根据权利要求1的化合物或盐，其中R2和R3独立地为甲基。
3.根据权利要求2的化合物或盐，其中R4是氢。
4.根据权利要求3的化合物或盐，其中R1是。
5.根据权利要求3的化合物或盐，其中R5是。
6.根据权利要求4的化合物或盐，其是6,6-二甲基-2-{2-[(1-甲基-1H-吡唑-5-基)氨基]嘧啶-4-基}-5-[2-(吗啉-4-基)乙基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮。
7.根据权利要求6的化合物，其是6,6-二甲基-2-{2-[(1-甲基-1H-吡唑-5-基)氨基]嘧啶-4-基}-5-[2-(吗啉-4-基)乙基]-5,6-二氢-4H-噻吩并[2,3-c]吡咯-4-酮。
8.药物组合物，其包含根据权利要求1-7任一项的化合物或盐和可药用载体、稀释剂或赋形剂。
9.治疗癌症的方法，其包括给予需要治疗的患者有效量的根据权利要求1-7任一项的化合物或盐。
10.根据权利要求9的方法，其中所述癌症选自黑素瘤、结直肠癌、胰腺癌和非小细胞肺癌。
11.根据权利要求10的方法，其中所述癌症是结直肠癌。
12.根据权利要求10的方法，其中所述癌症是胰腺癌。
13.根据权利要求10的方法，其中所述癌症是非小细胞肺癌。
14.根据权利要求1-7任一项的化合物或盐，其用于治疗。
15.根据权利要求1-7任一项的化合物或盐，其用于治疗癌症。
16.根据权利要求15使用的化合物或盐，其中所述癌症选自黑素瘤、结直肠癌、胰腺癌和非小细胞肺癌。
17.根据权利要求16使用的化合物或盐，其中所述癌症是结直肠癌。
18.根据权利要求16使用的化合物或盐，其中所述癌症是胰腺癌。
19.根据权利要求16使用的化合物或盐，其中所述癌症是非小细胞肺癌。
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