CN106999537A - 新颖α4β7肽单体和二聚体拮抗剂 - Google Patents

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Abstract

本发明涉及肽二聚体化合物和肽单体化合物,其有效地体内抑制α4β7与粘膜地址素细胞粘附分子(MAdCAM)结合、对α4β1结合具有高选择性以及在胃肠条件下具有高稳定性。本申请是针对现有技术,尤其是针对当前可用的整合素拮抗剂还没有充分解决的本领域中的问题和需求而研发的。

Description

新颖α4β7肽单体和二聚体拮抗剂
相关申请案的交叉引用
本申请案要求2014年10月1日申请的美国临时申请案第62/058,506号;2014年10月1日申请的美国临时申请案第62/058,510号;2015年4月17日申请的美国临时申请案第62/149,257号;以及2015年7月15日申请的美国临时申请案第62/192,934号的优先权;其全部以全文引用的方式并入本文中。
技术领域
本发明涉及具有适用于治疗由整合素结合引起或加剧的病状的活性的新颖化合物、包含所述化合物的药学组合物、使用所述化合物治疗的方法以及阻断或破坏整合素结合的方法。
背景技术
整合素是从细胞粘附和迁移到基因调节范围内的许多细胞过程中涉及的非共价缔合的α/β杂二聚细胞表面受体(杜博瑞(Dubree)等人,选择性α4β7整合素拮抗剂和其作为消炎剂的可能性(Selectiveα4β7Integrin Antagonist and Their Potential as Anti-inflammatory Agents),药物化学杂志(J.Med.Chem.)2002,45,3451-3457)。整合素的差异表达可以调整细胞的粘附特性,允许不同白血球群体回应于不同发炎信号募集到特定器官。如果任其发展,那么整合素介导的粘附过程可能导致慢性发炎和自体免疫疾病。
α4整合素(α4β1和α4β7)在淋巴细胞于整个胃肠道中迁移时起基本作用。它们在大多数白血球(包括B淋巴细胞和T淋巴细胞)上表达,它们在这里通过分别结合到其各别主要配位体、血管细胞粘附分子(VCAM)和粘膜地址素细胞粘附分子(MAdCAM)来介导细胞粘附。蛋白质的结合特异性的差异在于VCAM既结合α4β1又以较低程度结合α4β7,而MAdCAM对α4β7具有高度特异性。除了与α4子单元配对之外,β7子单元还与αE子单元形成杂二聚络合物,从而形成αEβ7,它主要在肠、肺以及泌尿生殖道中的上皮内淋巴细胞(IEL)上表达。αEβ7还在肠道中的树突状细胞上表达。αEβ7杂二聚体结合于上皮细胞上的E-钙粘素。认为IEL细胞提供上皮细胞室内的免疫监督机制。因此,同时阻断αEβ7和α4β7可以是适用于治疗肠发炎病状的方法。
特定整合素-配位体相互作用的抑制剂已经显示是治疗多种自体免疫疾病的有效消炎剂。举例来说,对α4β7展现高结合亲和力的单克隆抗体已经对胃肠自身发炎/自体免疫疾病(例如克罗恩氏病和溃疡性结肠炎)展现治疗益处。然而,这些疗法中的一个干扰α4β1整合素-配位体相互作用,由此对患者产生危险副作用。利用双重特异性小分子拮抗剂的疗法已经在动物模型中显示类似副作用。
因此,所属领域中需要对α4β7整合素具有高亲和力并且对α4β1整合素具有高选择性的整合素拮抗剂分子,如用于多种胃肠自体免疫疾病的疗法。
本发明提供这类整合素拮抗剂分子和相关组合物和方法。
发明内容
已经响应于技术现状并且具体来说响应于当前可用的整合素拮抗剂尚未完全解决的所属领域中的问题和需要研发了本发明。因此,本发明提供α4β7拮抗剂单体和二聚体肽,例如用作消炎和/或免疫抑制剂。另外,本发明提供α4β7拮抗剂单体和二聚体肽,其用于治疗与α4β7对表达MAdCAM的组织的生物功能有关的病状。
本发明涉及展现整合素拮抗剂活性的新颖肽化合物。本发明进一步涉及对α4β7整合素展现高特异性并且增加口服稳定性的新颖肽化合物。在具体实施例中,本发明涉及具有适用于治疗由整合素结合引起或加剧的病状的活性的新颖化合物、包含所述化合物的药学组合物、使用所述化合物治疗的方法以及阻断或破坏整合素结合的方法。化合物是对α4β7整合素具有高亲和力的整合素拮抗剂分子,其可用作针对多种胃肠自体免疫疾病的疗法。
在某些实施例中,本发明的化合物是包含两个成对子单元的二聚体,所述子单元经连接部分由其C或N末端连接在一起。在某些实施例中,本发明的二聚体子单元肽中的一个或两个进一步包含两个天然或非天然氨基酸,它们能够桥接形成环状结构。因此,本发明的具体化合物包含二聚肽,二聚体的各子单元含有经二硫桥键、酰胺键或另一种或等效连接中的至少一个的环状结构。当作为治疗剂经口投予时,这一特征向化合物提供增加的稳定性。另外,这一特征进一步提供增加的特异性和效能。
所属领域的技术人员应了解,本文所披露的C和N末端连接子部分是适合连接子的非限制性实例,并且本发明可以包括任何适合连接子部分。因此,本发明的一些实施例包含由选自本文和附图和表格中所述的肽分子的两个单体子单元构成的均二聚体或杂二聚体分子,其中各别单体的C或N末端经任何适合连接子部分连接,提供具有优良整合素拮抗剂活性的二聚体分子。
另一方面,本发明提供用于治疗需要整合素拮抗剂疗法的个体的组合物,其包含式(I)的二聚体化合物,或本文或附图和表格中所述的任何其它化合物,以及药学上可接受的载剂。
另一方面,本发明提供一种用于观测和诊断疾病的诊断方法,其包含投予口服稳定的式(I)化合物,或本文或附图中所述的任何其它化合物,所述化合物经螯合基团和可检测标记中的至少一个进一步标记,用作用于无创诊断程序的体内显影剂。
在某些实施例中,本发明的化合物是单体。本发明的各单体肽进一步包含两个天然或非天然氨基酸,其能够桥接形成环状结构。因此,本发明的化合物包含单体肽,各自经二硫化物盐桥、酰胺键或等效连接中的至少一个形成环状结构。当作为治疗剂经口投予时,这一特征向化合物提供增加的稳定性。与非环状类似物相比,这一特征进一步提供增加的特异性和效能。
在一个实施例中,本发明包括肽二聚体化合物,其包含两个经连接的式(I)的单体子单元:
Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4-Xaa5-Xaa6-Xaa7-Xaa8-Xaa9-Xaa10-Xaa11-Xaa12-Xaa13-Xaa14
(式(I))
或其药学上可接受的盐,
其中:
Xaa1是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa2是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa3是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa4是能够与Xaa10形成键的任何氨基酸;
Xaa5选自由以下各项组成的群组:N-Me-Arg、Arg、N-Me-Lys、Phe(4-胍基胍基)、Phe(4-氨甲酰基)、Cit、Phe(4-NH2)、N-Me-homoArg、homoArg、Tyr、Dap、Dab、Arg-Me-sym、Arg-Me-asym、Cav以及His;
Xaa6是Ser、Gly、Thr或Ile;
Xaa7是Asp、Asp(OMe)或N-Me-Asp;
Xaa8选自由以下各项组成的群组:Thr、Val、Ile、Leu、homoLeu、Gln、Ser、Asp、Pro、Gly、His、Ala、Phe、Lys、Arg、Asn、Glu、Tyr、Trp、Met、Nle以及N-甲基氨基酸,包括N-Me-Thr;
Xaa9选自由以下各项组成的群组:Gln、Ser、Asp、Pro、Gly、Ala、Phe、Glu、Ile、Val、N-丁基Ala、N-戊基Ala、N-己基Ala、环丁基Ala、环戊基Ala、Leu、Nle、Cba、homoLeu、Cpa、Aoc以及N-Me-Leu;
Xaa10是能够与Xaa4形成键的任何氨基酸;
Xaa11不存在或选自由以下各项组成的群组:芳香族氨基酸、经取代的芳香族氨基酸以及Tic;
Xaa12不存在或选自由以下各项组成的群组:芳香族氨基酸、经取代的芳香族氨基酸、Glu、D-Glu、homoGlu、Asp、D-Asp、D-homoGlu、Gla、β-homoGlu、Tic、Aic、Gln、Cit、Glu(OMe)、Asn、D-His、Tic、Phe(3-COOH)、D-Arg、Bip、D-Trp、Phe、D-Phe、D-Val、D-Thr、D-Tyr、D-Lys、D-Ile、D-His、N-Me-Glu、N-Me-Asp、α-homoGlu、联苯基-Gly、联苯基-Ala、Homo-Phe、D-1-Nal、D-2-Nal、Thr以及Val,以及相应D-氨基酸和电子等排体;
Xaa13是不存在或Pro或任何氨基酸;以及
Xaa14选自由以下各项组成的群组:具有胺侧链的任何氨基酸、Lys、D-Lys、N-Me-Lys、D-N-Me-Lys、Orn、Dab、Dap、HomoLys、D-Dap、D-Dab、D-Orn、Cys、HomoCys、Pen、D-HomoCys、D-Cys、D-Pen、Asp、Glu、D-Asp、D-Glu以及HomoSer、HomoGlu、D-homoGlu、N-Me-Glu、N-Me-Asp、N-Me-D-Glu以及N-Me-D-Asp;
其中Xaa4和Xaa10都是Pen或Cys;
其中:
Xaa5选自由以下各项组成的群组:Cit、Phe(4-氨甲酰基氨基)以及N-Me-homoArg;Xaa8选自由以下各项组成的群组:Leu、homoLeu、Nle以及Val;Xaa9选自由以下各项组成的群组:Cba、homoLeu以及Cpa;Xaa11选自由以下各项组成的群组:Tic、Phe(2-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Phe(4-COOH)、Phe(4-OMe)以及Phe(4-tBu);Xaa12选自由以下各项组成的群组:Aic、Gln、Cit、Glu(OMe)、D-His、Tic、Phe(3-COOH)、D-Arg、Bip、D-Trp、Phe、D-Phe、D-Val、D-Thr、D-1-Nal、D-2-Nal、Thr、Val;或Xaa13是Pro;以及
其中所述肽二聚体化合物的一个或两个单体子单元在Xaa4和Xaa10之间包含一键。
在一个实施例中,Xaa4是Cys或Pen,Xaa10是Pen或Cys,并且Xaa4和Xaa10经二硫键连接。
在包含式(I)的化合物的具体实施例中,所述化合物进一步包含连接两个单体子单元的连接子部分,其中连接子部分任选地选自由以下各项组成的群组:DIG、PEG13、PEG25、PEG1K、PEG2K、PEG3.4K、PEG4K、PEG5K、IDA、IDA-Palm、IDA-Boc、IDA-异戊酸、三嗪、三嗪-Boc、间苯二甲酸、1,3-亚苯基二乙酸、1,4-亚苯基二乙酸、环丙基乙酸、4-氟苯甲酸、4-氟苯基乙酸、3-苯基丙酸、丁二酸、生物素、戊二酸、壬二酸、庚二酸、十二烷二酸、脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、杂芳香族化合物、分子量为约400Da到约40,000Da的聚乙二醇、双官能连接子、N-羟基丁二酰亚胺(NHS)活化的二酯以及双-顺丁烯二酰亚胺。
在包含式I的化合物的具体实施例中,各单体子单元的N末端经连接子部分连接以提供N末端二聚体化合物。
在具体实施例中,各单体子单元的C末端经连接子部分接合以提供C末端二聚体化合物。
在具体实施例中,Xaa5是N-Me-Arg;Xaa6是Ser,Xaa7是Asp,Xaa8是Thr,和/或Xaa9是Leu;Xaa11是Tic、Phe(2-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Phe(4-COOH)、Phe(4-OMe)或Phe(4-tBu)。在一个实施例中,Xaa5是N-甲基-Arg;Xaa6是Ser;Xaa7是Asp;Xaa8是Thr或Val;Xaa9是Leu;Xaa11选自由以下各项组成的群组:Trp、Phe、2-Nal、1-Nal、Tyr、His、Phe(4-F)、Phe(4-CF3)、Phe(4-CH3)、Phe(4-tBu)、Bip、Phe(4-COOH)、Gly、3,3-二苯基Gly、3,3二苯基Ala、Tic、β-homoTrp、D-1-Nal、D-2-Nal、Phe(2,4-二Cl)、Phe(3,4-二Cl)、Phe(4-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Tyr(Me)以及HomoPhe;Xaa12选自由以下各项组成的群组:任何芳香族氨基酸、Glu、D-Glu以及β-homoGlu;Xaa13不存在;以及Xaa14选自由以下各项组成的群组:D-Lys、N-Me-Lys以及D-N-Me-Lys。
在具体实施例中,Xaa14选自由以下各项组成的群组:具有胺侧链的任何氨基酸、Lys、D-Lys、N-Me-Lys、D-N-Me-Lys、Orn、Dab、Dap、HomoLys、D-Dap、D-Dab、D-Orn、Cys、HomoCys、Pen、D-HomoCys、D-Cys、D-Pen、Asp、Glu、D-Asp、D-Glu以及HomoSer、HomoGlu、D-homoGlu、N-Me-Glu、N-Me-Asp、N-Me-D-Glu以及N-Me-D-Asp。在具体实施例中,Xaa14还包括D-Cys和D-Pen。在某些实施例中,Xaa14选自由以下各项组成的群组:具有胺侧链的任何氨基酸、Lys、D-Lys、N-Me-Lys、D-N-Me-Lys、Orn、Dab、Dap、HomoLys、D-Dap、D-Dab、Cys、homoCys、Pen以及D-Orn。
在式(I)的某些实施例中,Xaa5选自由以下各项组成的群组:Cit、Phe(4-氨甲酰基氨基)以及N-Me-homoArg;Xaa8选自由以下各项组成的群组:Leu、homoLeu、Nle以及Val;Xaa9选自由以下各项组成的群组:Cba、homoLeu以及Cpa;Xaa11选自由以下各项组成的群组:Tic、Phe(2-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Phe(4-COOH)、Phe(4-OMe)以及Phe(4-tBu);Xaa12选自由以下各项组成的群组:Aic、Gln、Cit、Glu(OMe)、D-His、Tic、Phe(3-COOH)、D-Arg、Bip、D-Trp、Phe、D-Phe、D-Val、D-Thr、D-1-Nal、D-2-Nal、Thr、Val;或Xaa13是Pro。
在式(I)的某些实施例中,肽二聚体化合物的一个或两个单体子单元在Xaa4和Xaa10之间包含二硫键、内酰胺键、烯烃键、1,2,3-***环、硒醚键或二硒键。
在某些实施例中,式(I)代表二聚体分子的单体子单元,其中单体子单元连接形成根据本发明的二聚体分子。
在某些实施例中,Xaa4是Cys或Pen。在某些实施例中,Xaa10是Cys或Pen。在某些实施例中,Xaa4和Xaa10都是Cys或Pen。在某些实施例中,Xaa4和Xaa10都是Pen。在某些实施例中,直接处于Xaa10的C末端的氨基酸残基是芳香族氨基酸。
在化合物是肽二聚体的某些实施例中,Xaa14是具有胺侧链的任何氨基酸、Lys、D-Lys、N-Me-Lys、D-N-Me-Lys、Orn、Dab、Dap、HomoLys、D-Dap、D-Dab或D-Orn。在某些实施例中,Xaa14是Lys、D-Lys、N-Me-Lys、D-N-Me-Lys、Orn、Dab、Dap、HomoLys、D-Dap、D-Dab或D-Orn。在某些实施例中,Xaa14是Cys、HomoCys或Pen。
在某些实施例中,肽二聚体的一个或两个单体子单元在Xaa4和Xaa10之间包含分子内结合。在具体实施例中,分子内键是二硫键或内酰胺键。
在某些实施例中,肽单体的C末端氨基酸中的游离胺经例如乙酰基封端。
对于一些实施例,Xaa1-Xaa5、Xaa7-Xaa9和Xaa11-Xaa12中的任一个经N(α)甲基化。Xaa5可以进一步为Arg-Me-sym或Arg-Me-asym,并且Xaa11可以是O-Me-Tyr、N-Me-Lys(Ac)或4-Me-Phe。在一些情况下,Xaa1-Xaa4和Xaa11-Xaa14中的任一个经酰化。举例来说,在一些情况下,位置Xaa1-Xaa4和Xaa11-Xaa14处的一个或多个残基经选自由以下各项组成的群组的酰化有机化合物酰化:2-甲基-三氟丁基、三氟戊基、乙酰基、辛酰基、丁基、戊基、己基、棕榈基、月桂基、油酰基以及月桂基、三氟甲基丁酸、环戊烷甲酸、环丙基乙酸、4-氟苯甲酸、4-氟苯基乙酸、3-苯基丙酸、四氢-2H-吡喃-4甲酸、丁二酸以及戊二酸。在一些情况下,小PEG(例如PEG4-PEG13)用作酰化之前的间隔基团。在一些情况下,Glu、IsoGlu和/或Asp用作酰化的间隔基团。在一些情况下,Glu或Asp用作酰化的间隔基团。
在一些实施例中,肽二聚体的两个肽单体子单元的N末端或C末端氨基酸(例如Xaa1、Xaa2、Xaa3、Xaa12、Xaa13或Xaa14)用适合连接子部分修饰形成均二聚体或杂二聚体分子,其中式(I)包含由经适合C或N末端连接子接合的两个子单元形成的二聚体。
在式(I)的某些实施例中,两个子单元包含以下序列中的一个:
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe-(4-COOH)-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-(N-Me-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-Glu-(N-Me-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(D-Lys);或
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-(N-Me-D-Lys)。
在某些实施例中,两个子单元包含相同序列。在具体实施例中,子单元在其C末端经DIG连接。
在具体实施例中,肽二聚体化合物具有以下结构中的一个:
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(D-Lys)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe-(4-COOH)-(β-homoGlu)-(D-Lys)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-(N-Me-Lys)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-Glu-(N-Me-Lys)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-(D-Lys)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(D-Lys)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-(N-Me-D-Lys)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(D-Lys)-OH]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe-(4-COOH)-(β-homoGlu)-(D-Lys)-OH]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-(N-Me-Lys)-OH]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys)-OH]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys)-OH]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-Glu-(N-Me-Lys)-OH]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-(D-Lys)-OH]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)-OH]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)-OH]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)-OH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys)-OH]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)-OH]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(D-Lys)-OH]2-DIG;或
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-(N-Me-D-Lys)-OH]2-DIG,其中在单体子单元中的两个Pen残基之间存在二硫键。
在具体实施例中,肽二聚体化合物包含C末端OH。
在具体实施例中,肽二聚体化合物包含选自由Xaa3、Xaa5、Xaa7-Xaa9以及Xaa11-Xaa13组成的群组的一个或多个位置处的N(α)甲基化;或选自由Xaa1-Xaa3和Xaa11-Xaa14组成的群组的一个或多个位置处的酰化。在一个实施例中,Xaa1和Xaa2不存在,并且Xaa3是Ac。在一个实施例中,Xaa11、Xaa12和Xaa13中的一个或多个不存在。
在一个相关实施例中,本发明包括式(IV)的肽单体化合物:
Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4-Xaa5-Xaa6-Xaa7-Xaa8-Xaa9-Xaa10-Xaa11-Xaa12-Xaa13-Xaa14
(式(IV))
或其药学上可接受的盐,
其中:
Xaa1是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa2是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa3是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa4是能够与Xaa10结合的任何氨基酸;
Xaa5选自由以下各项组成的群组:N-Me-Arg、Arg、N-Me-Lys、Phe(4-胍基)、Phe(4-氨甲酰基氨基)、Cit、Phe(4-NH2)、N-Me-homoArg、homoArg、Tyr、Dap、Dab、Arg-Me-sym、Arg-Me-asym、Cav以及His;
Xaa6是Ser、Gly、Thr或Ile;
Xaa7是Asp、Asp(OMe)或N-Me-Asp;
Xaa8选自由以下各项组成的群组:Thr、Val、Ile、Leu、homoLeu、Gln、Ser、Asp、Pro、Gly、His、Ala、Phe、Lys、Arg、Asn、Glu、Tyr、Trp、Met、Nle以及N-甲基氨基酸,包括N-Me-Thr;
Xaa9选自由以下各项组成的群组:Gln、Ser、Asp、Pro、Gly、Ala、Phe、Glu、Ile、Val、N-丁基Ala、N-戊基Ala、N-己基Ala、环丁基Ala、环戊基Ala、Leu、Nle、Cpa、Cba、homoLeu、Aoc以及N-Me-Leu;
Xaa10是能够与Xaa4结合的任何氨基酸;
Xaa11不存在或选自由以下各项组成的群组:Trp、Phe、2-Nal、1-Nal、Tyr、His、Phe(4-F)、Phe(4-CF3)、Phe(4-CH3)、Phe(4-tBu)、Bip、Phe(4-COOH)、Gly、3,3-二苯基Gly、3,3-二苯基Ala、Tic、b-homoTrp、D-1-Nal、D-2-Nal、Phe(2,4-二Cl)、Phe(3,4-二Cl)、Phe(4-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Phe(2-氨甲酰基)、Tyr(Me)、homoPhe、N-Me-Phe、N-Me-Tyr、Ser、Sar、二氢Trp、Ile、Leu、Arg、Thr、芳香族氨基酸、经取代的芳香族氨基酸以及Tic;
Xaa12不存在或选自由以下各项组成的群组:芳香族氨基酸、经取代的芳香族氨基酸、Glu、D-Glu、homoGlu、Asp、D-Asp、D-homoGlu、Gla、β-homoGlu、Tic、Aic、Gln、Cit、Glu(OMe)、Asn、D-His、Tic、Phe(3-COOH)、D-Arg、Bip、D-Trp、Phe、D-Phe、D-Val、D-Thr、D-Tyr、D-Lys、D-Ile、D-His、N-Me-Glu、N-Me-Asp、α-homoGlu、联苯基-Gly、联苯基-Ala、Homo-Phe、D-1-Nal、D-2-Nal、Thr以及Val,以及相应D-氨基酸和电子等排体;
Xaa13是不存在或Pro或任何氨基酸;以及
Xaa14是任何氨基酸,
其中
Xaa5选自由以下各项组成的群组:Cit、Phe(4-氨甲酰基)以及N-Me-homoArg;
Xaa8选自由以下各项组成的群组:Leu、homoLeu、Nle以及Val;
Xaa9选自由以下各项组成的群组:Cba、homoLeu以及Cpa;
Xaa11选自由以下各项组成的群组:Tic、Phe(2-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Phe(4-COOH)、Phe(4-OMe)以及Phe(4-tBu);
Xaa12选自由以下各项组成的群组:Aic、Gln、Cit、Glu(OMe)、D-His、Tic、Phe(3-COOH)、D-Arg、Bip、D-Trp、Phe、D-Phe、D-Val、D-Thr、D-1-Nal、D-2-Nal、Thr、Val;或
Xaa13是Pro;
其中Xaa4和Xaa10经一键连接;以及
其中
Xaa5选自由以下各项组成的群组:Cit、Phe(4-氨甲酰基)以及N-Me-homoArg;
Xaa8选自由以下各项组成的群组:Leu、homoLeu、Nle以及Val;
Xaa9选自由以下各项组成的群组:Cba、homoLeu以及Cpa;
Xaa11选自由以下各项组成的群组:Tic、Phe(2-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Phe(4-COOH)、Phe(4-OMe)以及Phe(4-tBu);
Xaa12选自由以下各项组成的群组:Aic、Gln、Cit、Glu(OMe)、D-His、Tic、Phe(3-COOH)、D-Arg、Bip、D-Trp、Phe、D-Phe、D-Val、D-Thr、D-1-Nal、D-2-Nal、Thr、Val;或
Xaa13是Pro。
在具体实施例中,Xaa4是Cys或Pen,Xaa10是Cys或Pen,并且Xaa4和Xaa10经二硫键连接。
在具体实施例中,Xaa12不存在或选自由以下各项组成的群组:芳香族氨基酸、经取代的芳香族氨基酸、Glu、D-Glu、homoGlu、Asp、D-Asp、D-homoGlu、Gla、β-homoGlu、Tic以及相应D-氨基酸和适合电子等排体。
在具体实施例中,Xaa13是不存在或Pro。
在具体实施例中,Xaa5是N-Me-Arg。
在具体实施例中,Xaa1和Xaa2不存在,并且Xaa3是Ac,和/或其中Xaa11、Xaa12和Xaa13中的一个或多个不存在。
在式(IV)的具体实施例中,Xaa5选自由以下各项组成的群组:Cit、Phe(4-氨甲酰基)以及N-Me-homoArg;Xaa8选自由以下各项组成的群组:Leu、homoLeu、Nle以及Val;Xaa9选自由以下各项组成的群组:Cba、homoLeu以及Cpa;Xaa11选自由以下各项组成的群组:Tic、Phe(2-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Phe(4-COOH)、Phe(4-OMe)以及Phe(4-tBu);Xaa12选自由以下各项组成的群组:Aic、Gln、Cit、Glu(OMe)、D-His、Tic、Phe(3-COOH)、D-Arg、Bip、D-Trp、Phe、D-Phe、D-Val、D-Thr、D-1-Nal、D-2-Nal、Thr、Val;或Xaa13是Pro。
在具体实施例中,肽单体化合物在Xaa4和Xaa10之间包含二硫键、内酰胺键、烯烃键、1,2,3-***环、硒醚键或二硒键。
在某些实施例中,单体肽在Xaa4和Xaa10之间包含二硫键、内酰胺键、烯烃键、1,2,3-***环、硒醚键或二硒键。
在某些实施例中,Xaa4是Cys或Pen。在某些实施例中,Xaa10是Cys或Pen。在某些实施例中,Xaa4和Xaa10都是Cys或Pen。在某些实施例中,Xaa4和Xaa10都是Pen。
在某些实施例中,直接处于Xaa10的C末端的氨基酸残基是芳香族氨基酸。
在某些实施例中,Xaa14或C末端氨基酸不包含游离胺。
在某些实施例中,Xaa14是不存在或具有胺侧链的任何氨基酸、Lys、D-Lys、N-Me-Lys、D-N-Me-Lys、Orn、Dab、Dap、HomoLys、D-Dap、D-Dab或D-Orn。在某些实施例中,Xaa14是Lys、D-Lys、N-Me-Lys、D-N-Me-Lys、Orn、Dab、Dap、HomoLys、D-Dap、D-Dab或D-Orn。
在化合物是肽单体的某些实施例中,Xaa14或C末端包含NH2或OH。
在某些实施例中,肽单体的C末端氨基酸中的游离胺经例如乙酰基封端。
在某些实施例中,肽单体在Xaa4和Xaa10之间包含分子内结合。在具体实施例中,分子内键是二硫键或内酰胺键。
对于一些实施例,Xaa1-Xaa5、Xaa7-Xaa9和Xaa11-Xaa12中的任一个经N(α)甲基化。Xaa5可以进一步为Arg-Me-sym或Arg-Me-asym,并且Xaa11可以是O-Me-Tyr、N-Me-Lys(Ac)或4-Me-Phe。在一些情况下,Xaa1-Xaa4和Xaa11-Xaa14中的任一个经酰化。举例来说,在一些情况下,位置Xaa1-Xaa4和Xaa11-Xaa14处的一个或多个残基经选自由以下各项组成的群组的酰化有机化合物酰化:2-甲基-三氟丁基、三氟戊基、乙酰基、辛酰基、丁基、戊基、己基、棕榈基、月桂基、油酰基以及月桂基、三氟甲基丁酸、环戊烷甲酸、环丙基乙酸、4-氟苯甲酸、4-氟苯基乙酸、3-苯基丙酸、四氢-2H-吡喃-4甲酸、丁二酸以及戊二酸。在一些情况下,小PEG(例如PEG4-PEG13)用作酰化之前的间隔基团。在一些情况下,Glu、IsoGlu或Asp用作酰化的间隔基团。
本发明还包括式(V)的肽单体化合物:
Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4-Xaa5-Xaa6-Xaa7-Xaa8-Xaa9-Xaa10
(式(V))
或其药学上可接受的盐,
其中所述肽化合物包含二硫键Xaa1和Xaa7
其中式(V)的Xaa1-Xaa10对应于式(IV)的Xaa4-Xaa13,以及
其中
Xaa1是Pen或Cys;
Xaa2选自由以下各项组成的群组:Cit、Phe(4-氨甲酰基)以及N-Me-HomoArg;
Xaa3是Ser、Gly、Thr或Ile;
Xaa4是Asp、D-Asp、Asp(OMe)或N-Me-Asp;
Xaa5选自由以下各项组成的群组:Leu、HomoLeu、Nle以及Val;
Xaa6选自由以下各项组成的群组:Cba、HomoLeu以及Cpa;
Xaa7是Pen或Cys;
Xaa8选自由以下各项组成的群组:Tic、Phe(2-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Phe(4-COOH)、Phe(4-OMe)以及Phe(4-tBu);
Xaa9选自由以下各项组成的群组:Aic、Gln、Cit、Glu(OMe)、D-His、Tic、Phe(3-COOH)、D-Arg、Bip、D-Trp、Phe、D-Phe、D-Val、D-Thr、D-1-Nal、D-2-Nal、Thr、Val;以及
Xaa10是Pro。
在某些实施例中,肽单体化合物包含以下序列或结构中的一个:
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe(4-COOH))-(Glu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe(4-COOH))-(β-homo-Glu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe(4-tBu))-Glu-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe(4-tBu))-(β-homo-Glu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe(4-tBu))-Glu-(N-Me-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Bip-Glu-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Bip-(β-homo-Glu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe-(4-COOH)-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-(N-Me-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-Glu-(N-Me-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-(N-Me-D-Lys);
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(D-Lys)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe-(4-COOH)-(β-homoGlu)-(D-Lys)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-(N-Me-Lys)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-Glu-(N-Me-Lys)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-(D-Lys)-OH;Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(D-Lys)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-(N-Me-D-Lys)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(D-Lys)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe-(4-COOH)-(β-homoGlu)-(D-Lys)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-(N-Me-Lys)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-Glu-(N-Me-Lys)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-(D-Lys)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(D-Lys)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-(N-Me-D-Lys)-NH2;或
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe(4-COOH))-(Glu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe(4-COOH))-(β-homo-Glu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe(4-tBu))-Glu;
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe(4-tBu))-(β-homo-Glu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe(4-tBu))-Glu;
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Bip-Glu;
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Bip-(β-homo-Glu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe-(4-COOH)-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu;
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-Glu;
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe-(4-COOH)-(β-homoGlu)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-Glu-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe-(4-COOH)-(β-homoGlu)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-Glu-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-NH2;或
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-NH2
其中在某些实施例中,肽或肽单体化合物的两个Pen残基之间存在二硫键。
在某些实施例中,化合物中的任一个经可检测地标记。
本发明进一步包括药物组合物,其包含本发明化合物中的任一个。在一个实施例中,药物组合物包含肠溶包衣,其中所述肠溶包衣在个体的下胃肠***中保护和释放药物组合物。
本发明进一步包括一种用于治疗罹患与α4β7整合素的生物功能有关的病状的个体的方法,所述方法包含向人类投予有效量的本发明的化合物或组合物(compoid)。
在某些实施例中,病状选自由以下各项组成的群组:发炎性肠病(IBD)、溃疡性结肠炎、克罗恩氏病(Crohn's disease)、乳糜泻(非热带口炎性腹泻(nontropical Sprue))、与血清反应阴性的关节病有关的肠病、显微镜下结肠炎、胶原性结肠炎、嗜酸性球性胃肠炎、放射疗法、化学疗法、直肠结肠切除术和回肠肛管吻合术之后引起的结肠袋炎、胃肠癌、胰脏炎、胰岛素依赖性糖尿病、乳腺炎、胆囊炎、胆管炎、胆管周围炎、慢性支气管炎、慢性鼻窦炎、哮喘、原发性硬化性胆管炎、胃肠道中的人类免疫缺陷病毒(HIV)感染、嗜酸性球性哮喘、嗜酸性球性食道炎、胃炎、结肠炎、显微镜下结肠炎、移植物抗宿主疾病、与放射疗法或化学疗法有关的结肠炎、如白血球粘附缺乏症-1中的与先天免疫障碍有关的结肠炎、慢性肉芽肿性疾病、1b型糖原贮积病、赫曼斯基-普德拉克综合症(Hermansky-Pudlaksyndrome)、薛迪克-东氏综合症(Chediak-Higashi syndrome)以及韦斯考特-奥德里奇综合症(Wiskott-Aldrich Syndrome),或直肠结肠切除术和回肠肛管吻合术之后引起的结肠袋炎,和多种形式的胃肠癌、骨质疏松症、关节炎、多发性硬化症、慢性疼痛、体重增加以及抑郁症。在另一实施例中,所述病状是胰脏炎、胰岛素依赖性糖尿病、乳腺炎、胆囊炎、胆管炎、胆管周围炎、慢性支气管炎、慢性鼻窦炎、哮喘或移植物抗宿主疾病。在具体实施例中,病状是发炎性肠病,例如溃疡性结肠炎或克罗恩氏病。
在具体实施例中,本发明的肽二聚体化合物或肽单体化合物抑制α4β7与MAdCAM的结合,和/或选择性抑制α4β7与MAdCAM的结合。
在某些实施例中,个体是人类。
在某些实施例中,肽二聚体化合物或肽单体化合物通过选自由以下各项组成的群组的投予形式投予:经口、静脉内、腹膜、皮内、皮下、肌肉内、鞘内、吸入、气化、雾化、舌下、经颊、肠胃外、直肠、经***以及局部。
在具体实施例中,肽二聚体化合物或肽单体化合物以初始剂量,随后一个或多个后续剂量投予,并且任何两次剂量之间的最小间隔是小于1天的时间段,并且其中所述剂量中的每一个包含有效量的肽二聚体化合物。
在具体实施例中,肽二聚体化合物或肽单体化合物的有效量足以实现选自由以下各项组成的群组中的至少一个:a)α4β7整合素分子上MAdCAM结合位点的约50%或更高饱和度;b)细胞表面上约50%或更高的α4β7整合素表达抑制;以及c)α4β7分子上MAdCAM结合位点的约50%或更高饱和度和细胞表面上约50%或更高的α4β7整合素表达抑制,其中i)所述饱和度维持与不超过每天两次的给药频率相符的时间段;ii)所述抑制维持与不超过每天两次的给药频率相符的时间段;或iii)所述饱和度和所述抑制各自维持与不超过每天两次的给药频率相符的时间段。
在具体实施例中,化合物或药物组合物经口、肠胃外或局部投予。在具体实施例中,其以选自由以下各项组成的群组的间隔投予:一整天、每小时、每四小时、每天一次、每天两次、每天三次、每天四次、每隔一天、每周、每两周以及每个月。
附图说明
为了容易理解获得本发明的上文陈述和其它特征和优势的方式,在上文简单描述的本发明将参考其在附图中说明的特定实施例进行更具体描述。在理解这些图式仅描绘本发明的典型实施例并且因此不应认为其限制本发明的范围的情况下,将通过使用附图来以额外特异性和细节来描述并解释本发明。
图1是显示C和N末端二聚的示意图。
图2是显示一对整合素拮抗剂单体子单元的示意图,根据本发明的代表性实施例,其中子单元在其各别C末端处进行比对并且经DIG连接子连接。
图3提供示意图,其各自显示一对整合素拮抗剂单体子单元,其中子单元在其各别C末端(3A)或N末端(3B)处进行比对并且经连接子连接。在某些实施例中,连接子连接两个含有硫的氨基酸形成肽二聚体化合物。两个含有硫的氨基酸可以经连接子连接,所述连接子包含二卤化物、脂肪族链或PEG。举例来说,连接子可以通过在各单体子单元的C末端处连接含有硫的C末端氨基酸来连接两个单体子单元,或其可以通过在各单体子单元的N末端处连接含有硫的N末端氨基酸来连接两个单体子单元。在某些实施例中,连接子连接两个含有胺的氨基酸形成肽二聚体化合物。两个含有胺的氨基酸可以经连接子连接,所述连接子例如包含二卤化物、脂肪族链或PEG。举例来说,连接子可以通过在各单体子单元的C末端处连接含有胺的C末端氨基酸来连接两个单体子单元,或其可以通过在各单体子单元的N末端处连接含有胺的N末端氨基酸来连接两个单体子单元。
图4显示肽X的结构。
图5提供肽X产生的稳定性数据的概述,表明肽X对多种GI流体、代谢酶和肠道细菌稳定。
图6显示肽X的临床前动物研究的结果,显示结肠炎小鼠中的剂量成比例PK-PD功效相关性。
图7提供显示如FACS所测量肽X和维多珠单抗(vedolizumab)与人类全血中的多种细胞的结合特异性的曲线。对于各细胞类型,维多珠单抗结果显示于顶部曲线中,并且肽X结果显示于下部曲线中。
图8是显示用媒剂或肽X处理的DSS小鼠的平均内窥镜检查评分的曲线。
图9提供来自媒剂对照物或肽X处理的DSS小鼠的内窥镜检查图像。还显示来自不同研究的标准对照。白色圆圈指示结肠脆度。
图10A和10B是显示用媒剂或肽X处理之后血液(A)和脾脏(B)中的总α4β7+记忆细胞的曲线。α4β7+记忆T细胞定义成CD4+、CD45RB、CD44、α4β7+。数据以平均值+SEM的形式提供。n=每组10只小鼠。
图11A和11B是显示MLN(A)和派氏***(Peyer's Patche)(B)中α4β7记忆细胞相对于总细胞的百分比的曲线。α4β7+记忆T细胞定义为CD4+、CD45RB、CD44、α4β7+。数据以平均值±SEM的形式提供。N=1-每组的小鼠。
图12是展示经口投予之后肽X在血浆、近端结肠和远端结肠中的暴露的曲线。
图13A-13D提供显示小鼠DSS结肠炎模型中派氏***(A)、血液(B)、MLN(C)以及脾脏(D)中的α4β7+记忆T细胞的量的曲线。收集派氏***、MLN、脾脏和血液并且通过FACS分析α4β7+记忆T细胞的含量。以平均值和SD形式给出数据。N=每组10只小鼠。通过单因素ANOVA评定统计显著性:*:p<0.05;**:p<0.01。百分比值和统计显著性是相对于媒剂对照物的。
图14是显示食蟹猕猴中给药7天之后CD4记忆α4β7+T细胞被肽X占据的受体占有率百分比的曲线。对于各动物,第6天时的受体占有率百分比根据第0天的预先给药对照物标准化。
图15是各动物的受体占有率百分比对比肽X血浆浓度的曲线。
图16是显示食蟹猕猴中CD4记忆T细胞上α4β7的表达的曲线。所示为各动物的根据第0天预先给药的对照物标准化的第6天的平均荧光强度(MFI)。
图17是显示食蟹猕猴血液中根据总CD4细胞标准化的循环α4β7记忆T细胞的提高百分比的曲线。
图18A-18D提供显示鼠类15天慢性DSS模型中与抗体相当的肽XX降低结肠宏观组织病理学评分的曲线。*病理学家评估的总结肠评分(0=正常,1=红斑,2=红斑、轻微水肿和少量糜烂,3=两处或更多处出血溃疡、发炎以及中等粘连,4=严重溃烂、伴随扩张的狭窄以及严重粘连)。
图19显示15天慢性DSS结肠炎模型中肽XX减少的β7+细胞向末端结肠的固有层中的浸润。以平均值和SD形式给出数据。N=每组10只小鼠。通过单因素ANOVA评定相对于媒剂对照物的统计显著性:*:p<0.05;**:p<0.005;***:p<0.0001;ns:不显著。
图20是显示整合素拮抗剂肽的示意图,其中Xaa4和Xaa10经二硫键连接。
图21显示从用10mg/kg或90mg/kg与Alex 488结合的肽X处理,用抗Alex 488抗体染色的动物获得的PFA固定的小肠组织样品的免疫组织化学。
图22提供显示慢性DSS模型中用肽X处理导致α4β7+B细胞向固有层中的浸润降低的曲线。
具体实施方式
本发明大体上涉及已显示具有整合素拮抗剂活性的肽,包括肽单体化合物和肽二聚体化合物。如本文所展示,本发明的肽是当经口投予时具有最小全身暴露的α4β7整合素的选择性拮抗剂,并且在IBD鼠类模型中有效阻断T细胞复位和防止粘膜破坏。在鼠类结肠炎模型中,本发明的肽化合物阻断T细胞运输和减少组织病理学。
在具体实施例中,本发明涉及包含杂单体子单元或均单体子单元的多种肽单体化合物或肽二聚体化合物,其通过二硫键、内酰胺键、烯烃键、***键、硒醚键或二硒键形成环状结构。在某些实施例中,肽单体化合物或肽二聚体化合物的一个或两个单体子单元包含分子内键来形成环状肽单体化合物或环状单体子单元。肽单体化合物和肽二聚体化合物的单体子单元的环状结构已经显示效能和选择性提高,并且还提高经口传递的稳定性。肽单体子单元和肽二聚体化合物的环状结构的非限制性代表性图示显示于图2中。
定义
如本文所用,除非上下文另外明确规定,否则单数形式“一种(a/an)”和“所述”包括复数个参考物。
如本发明中所使用,以下术语具有指定含义:
如本文所用,术语“肽”广泛指经肽键接合在一起的两个或更多个氨基酸的序列。应理解,这一术语不包含特定长度的氨基酸聚合物,也不打算暗示或区分多肽是使用重组技术、化学或酶促合成产生还是天然存在的。
如本文所用的术语“DRP”指的是富含二硫键的肽。
如本文所用的术语“二聚体”广泛指包含两个或更多个子单元的肽,其中子单元是在C末端或N末端连接的肽(例如DRP)。二聚体还包括包含经一个或多个内部氨基酸残基或其衍生物连接的两个子单元的肽。子单元中的每一个可以经其N末端、C末端或内部氨基酸或其衍生物连接到另一个子单元,这对于两个子单元中的每一个来说都可以不同。本发明的二聚体可以包括均二聚体和杂二聚体并且用作整合素拮抗剂。肽二聚体化合物在本文中可以使用以下命名法描述:[Xn]2,这表明肽二聚体包含方括号中定义的两个单体子单元(例如Xn,其中X表示氨基酸并且n表示肽中氨基酸的数目)。连接两个肽子单元的连接子部分可以如下所示:[Xn]2--L或L-[Xn]2,其中L是连接子。其它化学部分(例如可检测标记)可使用与连接子类似的方式显示。
如本文所用的术语“L-氨基酸”指的是氨基酸的“L”异构形式,并且相对来说术语“D-氨基酸”指的是氨基酸的“D”异构形式。本文所述的氨基酸残基优选是“L”异构形式,然而,“D”异构形式的残基可以经任何L-氨基酸残基取代,只要肽保持所要功能。
如本文所用,术语“NH2”指的是多肽的氨基末端处存在的游离氨基。如本文所用,术语“OH”指的是肽的羧基末端处存在的游离羧基。另外,如本文所用,术语“Ac”指的是通过使多肽的C末端或N末端或肽中的任何氨基酸酰化进行的乙酰基保护。如本文所用的术语“NH2”在例如CONH2的情形中还指C末端酰胺基。
如本文所用,术语“羧基”指的是--CO2H。
如本文所用,术语“电子等排体”或“电子等排体置换”指的是生理化学和/或结构特性与规定氨基酸类似的任何氨基酸或其它类似物部分。在具体实施例中,氨基酸的“电子等排体”或“适合电子等排体”是同一类别的另一个氨基酸,其中氨基酸基于打算与极性溶剂(如水)接触的侧链的倾向属于以下类别:疏水性(与水接触的倾向低)、极性或带电(积极有利的与水接触)。说明性带电胺基酸残基包括赖氨酸(+)、精氨酸(+)、天冬氨酸(-)以及谷氨酸(-)。说明性极性氨基酸包括丝氨酸、苏氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、组氨酸以及酪氨酸。说明性疏水性氨基酸包括丙氨酸、缬氨酸、白氨酸、异白氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸、色氨酸、半胱氨酸以及甲硫氨酸。氨基酸甘氨酸不具有侧链并且难以分配到上述类别中的一个。然而,甘氨酸通常存在于蛋白质表面(通常在回路内),向这些区域提供高柔韧性,并且电子等排体可以具有类似特征。脯氨酸具有相反作用,通过对多肽链的区段强加特定扭转角度而向蛋白质结构提供刚度。在某些实施例中,电子等排体是氨基酸的衍生物,例如与参考氨基酸相比具有一个或多个经修饰的侧链的衍生物。
如本文所用,术语“环状”指的是多肽分子的一部分例如通过形成二硫桥键或其它类似键(例如内酰胺键)连接到多肽分子的另一部分形成闭环的反应。在具体实施例中,本文所述的肽单体化合物或肽二聚体化合物的单体子单元经肽单体或单体子单元中存在的两个氨基酸残基之间的分子内键环化。
如本文所用,术语“子单元”指的是在C末端或N末端处接合形成二聚体肽组合物的一对多肽单体中的一个。
如本文所用,术语“连接子”广泛指能够将多个肽单体子单元连接在一起形成二聚体的化学结构。
如本文所用,术语“受体”指的是细胞表面上或细胞内部中对特定化学基团或分子具有亲和力的分子的化学基团。二聚体肽和靶向的整合素之间的结合可以提供适用诊断工具。
如本文所用,术语“整合素相关疾病”指的是由于整合素结合而显现并且可以通过投予整合素拮抗剂来治疗的适应症。
如本文所用,术语“疾病”、“病症”和“病状”可互换使用。
如本文所用,“抑制”、“治疗(treatment、treating)”和“改善”可互换使用并且指的是例如在个体(例如哺乳动物)中停滞症状、延长存活期、部分或完全改善症状,以及部分或完全根除病状、疾病或病症。
如本文所用,“预防(prevent或prevention)”包括(i)预防或抑制个体(例如哺乳动物)中出现疾病、损伤或病状,具体来说当这类个体容易患所述病状但尚未诊断出患病时;或(ii)降低个体中将出现疾病、损伤或病状的可能性。
如本文所用,术语“药学上可接受的盐”代表本发明化合物的盐或两性离子形式,它们是水或油可溶解或可分散的,适于治疗疾病而无过度毒性、刺激和过敏反应;这与合理的效益/风险比相称,并且对其预定用途有效。可以在化合物的最终分离和纯化期间制备盐或独立地通过用适合酸处理氨基来制备盐。代表性酸加成盐包括乙酸盐、己二酸盐、海藻酸盐、柠檬酸盐、天冬氨酸盐、苯甲酸盐、苯磺酸盐、硫酸氢盐、丁酸盐、樟脑酸盐、樟脑磺酸盐、二葡糖酸盐、甘油磷酸盐、半硫酸盐、庚酸盐、己酸盐、甲酸盐、反丁烯二酸盐、盐酸盐、氢溴酸盐、氢碘酸盐、2-羟基乙烷磺酸盐(羟乙磺酸盐)、乳酸盐、顺丁烯二酸盐、均三甲苯磺酸盐、甲烷磺酸盐、萘磺酸盐、烟碱酸盐、2-萘磺酸盐、乙二酸盐、双羟萘酸盐、果胶酸盐、过硫酸盐、3-苯基丙酸盐、苦味酸盐、新戊酸盐、丙酸盐、丁二酸盐、酒石酸盐、三氯乙酸盐、三氟乙酸盐、磷酸盐、谷氨酸盐、碳酸氢盐、对甲苯磺酸盐以及十一烷酸盐。另外,本发明化合物中的氨基可以用甲基、乙基、丙基以及丁基氯化物、溴化物以及碘化物;硫酸二甲酯、硫酸二乙酯、硫酸二丁酯以及硫酸二戊酯;癸基、月桂基、肉豆蔻基以及固醇氯化物、溴化物以及碘化物;以及苯甲基溴化物和苯乙基溴化物季铵化。可用于形成治疗学上可接受的加成盐的酸的实例包括无机酸,例如氢氯酸、氢溴酸、硫酸以及磷酸;和有机酸,例如乙二酸、顺丁烯二酸、丁二酸以及柠檬酸。在某些实施例中,本文所述的肽单体化合物或肽二聚体化合物中的任一个可以是盐形式,例如乙酸盐。
如本文所用,术语“N(α)甲基化”描述氨基酸的α胺的甲基化,一般也称为N-甲基化。
如本文所用,术语“对称甲基化”或“Arg-Me-sym”描述精氨酸的胍基的两个氮的对称甲基化。另外,术语“不对称甲基化”或“Arg-Me-asym”描述精氨酸的胍基的单个氮的甲基化。
如本文所用,术语“酰化有机化合物”指的是具有羧酸官能基的多种化合物,例如其可用于在形成C末端二聚体之前使氨基酸子单元的N末端酰化。酰化有机化合物的非限制性实例包括环丙基乙酸、4-氟苯甲酸、4-氟苯乙酸、3-苯基丙酸、丁二酸、戊二酸、环戊烷甲酸、3,3,3-三氟丙烯酸、3-氟甲基丁酸、四氢-2H-吡喃-4-甲酸。
全部肽序列都是根据公认的规约书写,由此α-N-末端氨基酸残基在左边并且α-C末端在右边。如本文所用,术语“α-N-末端”指的是肽中的氨基酸的游离α-氨基,并且术语“α-C-末端”指的是肽中的氨基酸的游离α-羧酸末端。肽序列可以显示于表中,其可以另外披露额外部分,例如本发明化合物的某些实施例中存在的N末端或C末端化学修饰、连接子、结合物和/或标记。
应注意术语“包含”打算是开放式的并且允许但不要求纳入额外元件或步骤。当本文使用术语“包含”时,因此也涵盖和披露术语“由……组成”。
如本文所用,术语“氨基酸”或“任何氨基酸”指的是任何和全部氨基酸,包括天然存在的氨基酸(例如a-氨基酸)、非天然氨基酸、经修饰的氨基酸以及非天然氨基酸。包括D-氨基酸和L-氨基酸。天然氨基酸包括自然界中存在的那些氨基酸,例如组合成肽链以形成一大批蛋白质的构造块的23个氨基酸。这些主要是L立体异构体,但细菌包膜和一些抗生素中存在一些D-氨基酸。“非标准”天然氨基酸是吡咯赖氨酸(产甲烷生物体和其它真核生物中存在)、硒代半胱氨酸(许多非真核生物以及大部分真核生物中存在)以及N-甲酰基甲硫氨酸(细菌、线粒体和叶绿体中由初始密码子AUG编码)。“非天然(Unnatural或non-natural)”氨基酸是天然存在或化学合成的非蛋白型氨基酸(即并非天然编码或存在于遗传密码中的那些)。已知超过140种天然氨基酸并且可能有几千种或更多种组合。“非天然”氨基酸的实例包括β-氨基酸(β3和β2)、高氨基酸、脯氨酸和丙酮酸衍生物、3-取代的丙氨酸衍生物、甘氨酸衍生物、环取代的苯丙氨酸和酪氨酸衍生物、直链核心氨基酸、二氨基酸、D-氨基酸、α-甲基氨基酸以及N-甲基氨基酸。非天然或非天然氨基酸还包括经修饰的氨基酸。“经修饰的”氨基酸包括已经化学修饰以包括氨基酸上天然不存在的基团或化学部分的氨基酸(例如天然氨基酸)。
在很大程度上,本文所用的天然存在和非天然存在的氨基酰基残基的名称遵循IUPAC委员会关于有机化学方法命名法(Nomenclature of Organic Chemistry)和IUPAC-IUB委员会关于生物化学命名法(Biochemical Nomenclature)建议的命名规范,如“α-氨基酸命名法(Nomenclature ofα-Amino Acids)(推荐,1974)”生物化学(Biochemistry),14(2),(1975)中所述。在本说明书和所附权利要求书中所用的氨基酸和氨基酰基残基的名称和缩写与那些建议不同的情况下,将向读者明确。适用于描述本发明的一些缩写在下表1中定义。
表1.定义和缩写
本发明的各方面包括包含两个单体子单元的肽二聚体化合物,其中肽二聚体化合物是α4β7整合素的拮抗剂。本发明的相关方面包括肽拮抗剂的单体子单元。肽二聚体化合物中存在的单体子单元在其C末端或N末端处连接(例如图1中所示)或经内部氨基酸残基(例如经连接子部分)连接。在具体实施例中,两个单体子单元经其各别N末端连接,两个单体子单元经其各别C末端连接,或两个单体子单元经内部氨基酸残基连接。在其它实施例中,一个单体子单元经其N末端、C末端或内部氨基酸中的任一个连接到另一单体子单元(经其N末端、C末端或内部氨基酸中的任一个),并且键可以经肽二聚体化合物的两个单体子单元上的相同或不同氨基酸残基产生。在另一相关实施例中,本发明的肽二聚体化合物的单体子单元经其N末端和其C末端两个连接。在一个实施例中,连接单体子单元的两个N末端;在一个实施例中,连接单体子单元的两个C末端;以及在一个实施例中,肽二聚体化合物的第一单体子单元的N末端连接到第二单体子单元的C末端,以及肽二聚体化合物的第一单体子单元的C末端连接到第二单体子单元的N末端。
本发明的连接子部分可以包括与本文中的传授相容的任何结构、长度和/或尺寸。在某些实施例中,连接子部分选自由以下各项组成的非限制性群组:DIG、PEG13、PEG25、PEG1K、PEG2K、PEG3.4K、PEG4K、PEG5K、IDA、IDA-Palm、IDA-Boc、IDA-Ac、IDA-异戊酸、ADA三嗪、三嗪-Boc、间苯二甲酸、1,3-苯二乙酸、Glu、Asp、D-Glu、D-Asp、1,4-苯二乙酸、联苯二乙酸、环丙基乙酸、丁二酸、戊二酸、十二烷二酸、适合脂肪族二酸、适合芳香族二酸、杂芳香族化合物以及分子量为约400Da到约40,000Da的聚乙二醇。当连接子是IDA、ADA或具有游离胺的任何连接子时,其可以使用选自由以下各项组成的群组的酰化有机化合物酰化:2-甲基-三氟丁基、三氟戊基、乙酰基、辛酰基、丁基、戊基、己基、棕榈基、月桂基、油酰基、月桂基、三氟甲基丁酸、环戊烷甲酸、环丙基乙酸、4-氟苯甲酸、4-氟苯基乙酸、3-苯基丙酸、四氢-2H-吡喃-4甲酸、丁二酸以及戊二酸、具有10到20个碳单元的直链脂肪族酸、胆酸和其它胆汁酸。在一些情况下,小PEG(PEG4-PEG13)、Glu、IsoGlu或Asp用作酰化之前的间隔基团。
在某些实施例中,连接子通过连接两个含有硫的C末端或N末端氨基酸来连接两个单体子单元。在一些实施例中,两个含有硫的氨基酸经包含二卤化物、脂肪族链或PEG的连接子连接。在某些实施例中,连接子通过在各单体子单元的C末端处连接含有硫的C末端氨基酸来连接两个单体子单元。在某些实施例中,连接子通过在各单体子单元的N末端处连接含有硫的N末端氨基酸来连接两个单体子单元。在某些实施例中,连接子通过将一个单体子单元的含有硫的C末端氨基酸连接到另一个单体子单元的含有硫的N末端氨基酸来连接两个单体子单元。在一些实施例中,两个含有硫的氨基酸经包含以下的连接子连接:同型双官能顺丁烯二酰亚胺交联剂、二卤化物、1,2-双(溴单甲基)苯、1,2-双(氯单甲基)苯、1,3-双(溴单甲基)苯、1,3-双(氯单甲基)苯、1,4-双(溴单甲基)苯、1,4-双(氯单甲基)苯、3,3'-双-溴甲基-联苯或2,2'-双-溴甲基-联苯。具体卤乙酰基交联剂含有碘乙酰基或溴乙酰基。这些同双官能连接子可以含有包含PEG或脂肪族链的间隔基团。在具体实施例中,连接子是双官能连接子(例如二酸、二胺、二卤化物、N-羟基丁二酰亚胺(NHS)活化的二酯、双-顺丁烯二酰亚胺,其可能能够经胺、酯、硫醚、二硫基或醚键连接两个单体子单元。
在某些实施例中,连接子选自由以下各项组成的群组:DIG、PEG4、PEG4-生物素、PEG13、PEG25、PEG1K、PEG2K、PEG3.4K、PEG4K、PEG5K、IDA、ADA、Boc-IDA、戊二酸、间苯二甲酸、1,3-苯二乙酸、1,4-苯二乙酸、1,2-苯二乙酸、三嗪、Boc-三嗪、IDA-生物素、PEG4-生物素、AADA、脂肪族化合物、芳香族化合物、杂芳香族化合物以及分子量为约400Da到约40,000Da的聚乙二醇类连接子。在具体实施例中,连接子是双官能连接子(例如二酸、二胺、二卤化物、N-羟基丁二酰亚胺(NHS)活化的二酯、双-顺丁烯二酰亚胺,其可能能够经胺、酯、硫醚、二硫基或醚键连接两个单体子单元。适合连接子部分的非限制性实例提供于表2中。
在具体实施例中,本文所述的肽二聚体化合物(例如根据式(I)(包括I-A、I-B、I-C、I-D、I-E、I-F、I-G、I-H、I-I以及I-J中的任一个)、式(II)、式(III)、式(A)、式(B)、式(C)、式(D)、式(S)、式(X)或式(H)的肽二聚体化合物)中的任一个包含经本文所述的任何连接子连接的两个单体子单元;并且本文所述的肽单体化合物(例如根据式(IV)(包括IV-A、IV-B、IV-C、IV-D、IV-E、IV-F、IV-G、IV-H、IV-I以及IV-J中的任一个)、式(V)(包括V-A)、式(VI)、式(A)、式(B)、式(C)或式(D)的肽单体化合物)中的任一个包含本文所述的任何连接子。
表2.说明性连接子部分
当连接子是IDA、ADA或具有游离胺的任何连接子时,其可以例如使用选自由以下各项组成的群组的酰化有机化合物酰化:2-甲基-三氟丁基、三氟戊基、乙酰基、辛酰基、丁基、戊基、己基、棕榈基、月桂基、油酰基、月桂基、三氟甲基丁酸、环戊烷甲酸、环丙基乙酸、4-氟苯甲酸、4-氟苯基乙酸、3-苯基丙酸、四氢-2H-吡喃-4甲酸、丁二酸以及戊二酸、具有10到20个碳单元的直链脂肪族酸、胆酸和其它胆汁酸。在一些情况下,小PEG(PEG4-PEG13)、Glu、IsoGlu或Asp用作酰化之前的间隔基团。应理解结合到连接子或另一氨基酸之后,肽化合物的氨基酸残基可能发生结构改变,例如酸可能变成酰胺。提到具体氨基酸残基涵盖结合到连接子之后或与肽化合物的另一氨基酸形成分子内键之后任何改变的结构形式的氨基酸残基。
本发明的各方面涉及经二硫键、内酰胺键、烯烃键、***键、硒醚键或二硒键形成环状结构的多种肽单体化合物。各肽单体的环状结构已经显示提高分子的效能和选择性。
在具体实施例中,本发明的肽单体化合物和肽二聚体化合物(在本文中还统称为“肽化合物”)可以包含一个或多个末端修饰基团。在某些实施例中,肽化合物的末端经修饰以包含选自由以下各项组成的非限制性群组的末端修饰基团:DIG、PEG4、PEG13、PEG25、PEG1K、PEG2K、PEG4K、PEG5K、分子量为400Da到40,000Da的聚乙二醇、IDA、ADA、戊二酸、丁二酸、间苯二甲酸、1,3-苯二乙酸、1,4-苯二乙酸、1,2-苯二乙酸、AADA,以及脂肪族化合物、芳香族化合物和杂芳香族化合物。在某些实施例中,肽化合物的N末端或C末端连接到修饰基团。在某些实施例中,肽化合物的N末端经一到三个适合基团修饰,所述基团例如式(I)或(I-A)的Xaa1、Xaa2以及Xaa3所表示。N末端可以进一步经酰化。在一些情况下,N末端进一步包含连接子部分或其它修饰基团。类似地,在某些实施例中,肽的C末端经适合基团修饰。举例来说,C末端可以经酰化。在一些情况下,C末端进一步包含连接子部分,例如(但不限于)本文所披露的那些中的任一个。在某些实施例中,C末端包含NH2或OH。
本发明进一步包括肽已经被多种经修饰氨基酸取代的多种肽单体化合物和肽二聚体化合物。举例来说,一些肽包括Tic、Phe(2-氨基甲酰基)、Phe(3-氨基甲酰基)、Phe(4-COOH)、Phe(4-OMe)、Phe(4-tBu)、Homo-Phe、Aic、Cit、Glu(OMe)、Dab、Dap、Pen、Sar、Cit、Cav、homoLeu、2-Nal、D-1-Nal、D-2-Nal、Bip、O-Me-Tyr、β-homoTrp、β-homoPhe、β-homoGluPhe(4-CF3)、2-2-茚满、1-1-茚满,环丁基、Gla、Phe(4-NH2)、homoPhe、1-Nal、Nle、高氨基酸、D-氨基酸、3-3-二Phe、环丁基-Ala、HCha、Bip、β-Glu、Phe(4-胍基)、Phe(4-氨甲酰基)以及多种N-甲基化氨基酸。本发明涵盖的非天然氨基酸的额外非限制性实例显示于表1中。所属领域的技术人员应了解,可以进行额外取代来实现类似所要结果,并且这类取代在本发明的传授和精神内。
一方面,本发明提供包含两个经连接的式(I)的子单元的肽二聚体化合物:
Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4-Xaa5-Xaa6-Xaa7-Xaa8-Xaa9-Xaa10-Xaa11-Xaa12-Xaa13-Xaa14
(式(I))
或其药学上可接受的盐,
其中肽二聚体化合物的一个或两个子单元在Xaa4和Xaa10之间包含二硫键、内酰胺键、烯烃键、***键、硒醚键或二硒键,并且另外其中式(I)表示二聚体分子的单体子单元,单体子单元连接形式肽二聚体化合物,并且其中:
Xaa1是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa2是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa3是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa4是能够与Xaa10形成键的任何氨基酸;
Xaa5选自由以下各项组成的群组:N-Me-Arg、Arg、N-Me-Lys、Phe(4-胍基胍基)、Phe(4-氨甲酰基)、Cit、Phe(4-NH2)、N-Me-homoArg、homoArg、Tyr、Dap、Dab、Arg-Me-sym、Arg-Me-asym、Cav以及His;
Xaa6是Ser、Gly、Thr或Ile;
Xaa7是Asp、D-Asp、Asp(OMe)或N-Me-Asp;
Xaa8选自由以下各项组成的群组:Thr、Val、Ile、Leu、homoLeu、Gln、Ser、Asp、Pro、Gly、His、Ala、Phe、Lys、Arg、Asn、Glu、Tyr、Trp、Met、Nle以及N-甲基氨基酸,包括N-Me-Thr;
Xaa9选自由以下各项组成的群组:Gln、Ser、Asp、Pro、Gly、Ala、Phe、Glu、Ile、Val、N-丁基Ala、N-戊基Ala、N-己基Ala、环丁基Ala、环戊基Ala、Leu、Nle、Cba、homoLeu、Cpa、Aoc以及N-Me-Leu;
Xaa10是能够与Xaa4形成键的任何氨基酸;
Xaa11不存在或选自由以下各项组成的群组:芳香族氨基酸、经取代的芳香族氨基酸以及Tic;
Xaa12不存在或选自由以下各项组成的群组:芳香族氨基酸、经取代的芳香族氨基酸、Glu、D-Glu、homoGlu、Asp、D-Asp、D-homoGlu、Gla、β-homoGlu、Tic、Aic、Gln、Cit、Glu(OMe)、Asn、D-His、Tic、Phe(3-COOH)、D-Arg、Bip、D-Trp、Phe、D-Phe、D-Val、D-Thr、D-Tyr、D-Lys、D-Ile、D-His、N-Me-Glu、N-Me-Asp、α-homoGlu、联苯基-Gly、联苯基-Ala、Homo-Phe、D-1-Nal、D-2-Nal、Thr以及Val,以及相应D-氨基酸和电子等排体;
Xaa13是不存在或Pro或任何氨基酸;以及
Xaa14选自由以下各项组成的群组:具有胺侧链的任何氨基酸、Lys、D-Lys、N-Me-Lys、D-N-Me-Lys、Orn、Dab、Dap、HomoLys、D-Dap、D-Dab、D-Orn、Cys、HomoCys、Pen、D-HomoCys、D-Cys、D-Pen、Asp、Glu、D-Asp、D-Glu以及HomoSer、Asp、Glu、HomoGlu、D-Asp、D-Glu、D-homoGlu、N-Me-Glu、N-Me-Asp、N-Me-D-Glu以及N-Me-D-Asp。
在式(I)的某些实施例中,Xaa7是Asp、D-Asp或N-Me-Asp。在式(I)的某些实施例中,Xaa7是Asp、Asp(OMe)或N-Me-Asp。在某些实施例中,Xaa7是Asp或N-Me-Asp。在某些实施例中,Xaa7是Asp。
在式(I)的某些实施例中,Xaa11选自由以下各项组成的群组:Tic、Phe(2-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Phe(4-COOH)、Phe(4-OMe)、Phe(4-tBu)、Phe(4-CF3)、Phe(3-CF3)、Phe(CF3)、homo-Phe、D-Phe、Phe(2,3-二-Cl)、Phe(3,4-二-Cl)、N-Me-Tyr、N-Me-Phe、Phe(4-F)、Phe(3-F)、Phe(4-Me)、Phe(3-Me)、Phe(2-Me)、Phe(3,4--二-Me)、Phe(2,4-二-Phe)、β-甲基Phe以及联苯基-Ala。
在式(I)的具体实施例中,Xaa12选自由以下各项组成的群组:Aic、Gln、Cit、Glu(OMe)、Asn、D-His、Tic、Phe(3-COOH)、D-Arg、Bip、D-Trp、Phe、D-Phe、D-Val、D-Thr、D-Tyr、D-Lys、D-Ile、D-His、N-Me-Glu、N-Me-Asp、α-homoGlu、联苯基-Gly、联苯基-Ala、Homo-Phe、D-1-Nal、D-2-Nal、Thr以及Val。
在式(I)的具体实施例中,Xaa12选自由以下各项组成的群组:芳香族氨基酸、经取代的芳香族氨基酸、Glu、D-Glu、homoGlu、Asp、D-Asp、D-homoGlu、Gla、β-homoGlu、Tic以及相应D-氨基酸和电子等排体。
在式(I)的具体实施例中,Xaa14选自由以下各项组成的群组:具有胺侧链的任何氨基酸、Lys、D-Lys、N-Me-Lys、D-N-Me-Lys、Orn、Dab、Dap、homoLys、D-Dap、D-Dab、D-Orn、Cys、homoCys、Pen、D-homoCys、D-Cys以及D-Pen。
在式(I)的具体实施例中,Xaa14选自由以下各项组成的群组:具有胺侧链的任何氨基酸、Lys、D-Lys、N-Me-Lys、D-N-Me-Lys、Orn、Dab、Dap、homoLys、D-Dap、D-Dab、Cys、homoCys、Pen以及D-Orn。
在式(I)的一个实施例中,Xaa14选自由以下各项组成的群组:具有胺侧链的任何氨基酸、Lys、D-Lys、N-Me-Lys、D-N-Me-Lys、Orn、Dab、Dap、HomoLys、D-Dap、D-Dab、D-Orn、Cys、HomoCys、Pen、D-HomoCys、D-Cys、D-Pen、Asp、Glu、D-Asp、D-Glu以及HomoSer。
在式(I)的另一个实施例中,Xaa14选自由以下各项组成的群组:Asp、Glu、homoGlu、D-Asp、D-Glu、D-homoGlu、N-Me-Glu、N-Me-Asp、N-Me-D-Glu以及N-Me-D-Asp。
在式(I)的具体实施例中,肽二聚体化合物的各子单元的两个C末端氨基酸具有酸性官能基,并且它们经二胺连接子反转连接来连接。
在式(I)的具体实施例中,Xaa5选自由以下各项组成的群组:Cit、Phe(4-氨甲酰基)以及N-Me-homoArg;Xaa8选自由以下各项组成的群组:Leu、homoLeu、Nle以及Val;Xaa9选自由以下各项组成的群组:Cba、homoLeu以及Cpa;Xaa11选自由以下各项组成的群组:Tic、Phe(2-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Phe(4-COOH)、Phe(4-OMe)以及Phe(4-tBu);Xaa12选自由以下各项组成的群组:Aic、Gln、Cit、Glu(OMe)、D-His、Tic、Phe(3-COOH)、D-Arg、Bip、D-Trp、Phe、D-Phe、D-Val、D-Thr、D-1-Nal、D-2-Nal、Thr以及Val;或Xaa13是Pro。
在式(I)的具体实施例中,Xaa5选自由以下各项组成的群组:Cit、Phe(4-氨甲酰基)以及N-Me-homoArg。在式(I)的具体实施例中,Xaa8选自由以下各项组成的群组:Leu、homoLeu、Nle以及Val。在式(I)的具体实施例中,Xaa9选自由以下各项组成的群组:Cba、homoLeu以及Cpa。在式(I)的具体实施例中,Xaa11选自由以下各项组成的群组:Tic、Phe(2-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Phe(4-COOH)、Phe(4-OMe)以及Phe(4-tBu)。在式(I)的具体实施例中,Xaa12选自由以下各项组成的群组:Aic、Gln、Cit、Glu(OMe)、D-His、Tic、Phe(3-COOH)、D-Arg、Bip、D-Trp、Phe、D-Phe、D-Val、D-Thr、D-1-Nal、D-2-Nal、Thr以及Val。在式(I)的具体实施例中,Xaa13是Pro。
在式(I)的具体实施例中,Xaa11选自由以下各项组成的群组:Tic、Phe(2-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Phe(4-COOH)、Phe(4-OMe)、Phe(4-tBu)、Phe(4-CF3)、Phe(3-CF3)、Phe(CF3)、homo-Phe、D-Phe、Phe(2,3-二-Cl)、Phe(3,4-二-Cl)、N-Me-Tyr、N-Me-Phe、Phe(4-F)、Phe(3-F)、Phe(4-Me)、Phe(3-Me)、Phe(2-Me)、Phe(3,4--二-Me)、Phe(2,4-二-Phe)、β-甲基Phe或联苯基-Ala。
在式(I)的具体实施例中,Xaa12选自由以下各项组成的群组:Aic、Gln、Cit、Glu(OMe)、Asn、D-His、Tic、Phe(3-COOH)、D-Arg、Bip、D-Trp、Phe、D-Phe、D-Val、D-Thr、D-Tyr、D-Lys、D-Ile、D-His、N-Me-Glu、N-Me-Asp、α-homoGlu、联苯基-Gly、联苯基-Ala、Homo-Phe、D-1-Nal、D-2-Nal、Thr以及Val。
在式(I)的具体实施例中,Xaa7是Asp、D-Asp或N-Me-Asp;Xaa9选自由以下各项组成的群组:Gln、Ser、Asp、Pro、Gly、Ala、Phe、Glu、Ile、Val、N-丁基Ala、N-戊基Ala、N-己基Ala、环丁基Ala、Leu、Nle、Cba、homoLeu、Aoc以及N-Me-Leu;Xaa12不存在或选自由以下各项组成的群组:芳香族氨基酸、经取代的芳香族氨基酸、Glu、D-Glu、homoGlu、Asp、D-Asp、D-homoGlu、Gla、β-homoGlu、Tic以及相应D-氨基酸和电子等排体;Xaa13是不存在或Pro;以及Xaa14选自由以下各项组成的群组:具有胺侧链的任何氨基酸、Lys、D-Lys、N-Me-Lys、D-N-Me-Lys、Orn、Dab、Dap、HomoLys、D-Dap、D-Dab、D-Orn、Cys、HomoCys以及Pen。
在式(I)的具体实施例中,Xaa7是Asp、Asp(OMe)或N-Me-Asp。
在某些实施例中,直接处于Xaa10的C末端的氨基酸残基选自芳香族氨基酸、经取代的芳香族氨基酸以及Tic。在某些实施例中,直接处于Xaa10的C末端的氨基酸是芳香族氨基酸。在化合物是肽二聚体的某些实施例中,Xaa14是Lys、D-Lys、N-Me-Lys、D-N-Me-Lys、Orn、Dab、Dap、HomoLys、D-Dap、D-Dab或D-Orn。在某些实施例中,Xaa14是Cys、homoCys或Pen。在某些实施例中,Xaa14或C末端包含NH2或OH。
在某些实施例中,C末端氨基酸中的游离胺例如经乙酰基封端。
在本文所述的任何化学式的某些实施例中,当位于肽化合物的N末端时,例如结合于肽化合物的N末端氨基酸时,Xaa1、Xaa2或Xaa3可以仅为Ac。在本文所述的多种化学式中的任一个的任何化合物的具体实施例中,Xaa1是Ac,并且Xaa2和Xaa3都是不存在或任何氨基酸。
在某些实施例中,Xaa4和Xaa10是能够彼此结合的氨基酸残基。能够彼此结合的氨基酸是所属领域中已知的,并且本文描述彼此结合的特定氨基酸残基和所形成的键的多个实例。在具体实施例中,Xaa4和Xaa10能够经共价键彼此结合。在某些实施例中,通过Xaa4和Xaa10上的侧链基团产生共价键。在具体实施例中,键是二硫键。
在式(I)中的任一个(包括I-A、I-B、I-C、I-D、I-E、I-F、I-G、I-H以及I-I中的任一个)的某些实施例中,一个或两个肽二聚体子单元包含Xaa4和Xaa10之间的分子内键。在式(II)(包括II-A)、式(III)、式(A)、式(B)、式(C)或式(D)中的任一个的某些实施例中,一个或两个肽二聚体子单元在Xaa1与Xaa7之间包含分子内键。在某些实施例中,键是二硫键、内酰胺键、烯烃键、***、硒醚或二硒键。在某些实施例中,键直接存在于两个氨基酸残基之间。
在式(I)的某些实施例中,Xaa4选自由以下各项组成的群组:Cys、Pen、HomoCys、D-Cys、D-Pen、D-HomoCys、Asp、Glu、HomoGlu、β-Asp、β-Glu、Lys、HomoLys、Orn、Dap、Dap、2-烯丙基甘氨酸、2-(3'-丁烯基)甘氨酸、2-(4'-戊烯基)甘氨酸或2-(5'-己烯基)甘氨酸、相应D--氨基酸和适合电子等排体,并且Xaa10选自由以下各项组成的群组:Cys、Asp、Lys、Glu、Pen、HomoAsp、HomoGlu、HomoCys、D-Cys、D-Pen、HomoLys、Orn、β-Asp、β-Glu、Dap、Dab、D-HomoCys、2-烯丙基甘氨酸、2-(3'-丁烯基)甘氨酸、2-(4'-戊烯基)甘氨酸或2-(5'-己烯基)甘氨酸、相应D-氨基酸和适合电子等排体。
在式(I)的某些实施例中,肽子单元在Xaa4和Xaa10之间包含二硫键,并且Xaa4和Xaa10各自选自由Cys和Pen组成的群组。在某些实施例中,Xaa4和Xaa10都是Pen。
在式(I)的某些实施例中,Xaa10选自由以下各项组成的群组:Asp、homoAsp、Glu和homoGlu、homoLys,并且Xaa4选自由以下各项组成的群组:Lys、Dap、Dab、homoLys、Orn以及homoGlu。在某些实施例中,Xaa10选自由以下各项组成的群组:Lys、Dap、Dab、homoLys、Orn以及homoGlu,并且Xaa4选自由以下各项组成的群组:Asp、homoAsp、Glu、homoGlu以及homoLys。
在式(I)的某些实施例中,Xaa4选自由以下各项组成的群组:Asp、homoAsp、Glu、homoGlu以及homoLys,Xaa10选自由以下各项组成的群组:Lys、Dap、Dab、homoLys、Orn以及HGlu,并且Xaa4和Xaa10通过酰胺键环化。
在肽子单元在Xaa4和Xaa10之间包含烯烃键的式(I)的某些实施例中,Xaa4和Xaa10各自选自由以下各项组成的群组:2-烯丙基甘氨酸、2-(3'-丁烯基)甘氨酸、2-(4'-戊烯基)甘氨酸或2-(5'-己烯基)甘氨酸,并且肽经闭环岐化发生环化,获得相应烯烃/“订书钉肽”。
在式(I)的某些实施例中,Xaa4是Cys、Pen、homoCys、D-Pen、D-Cys或D-homoCys。在某些实施例中,Xaa10是Cys、Pen、homoCys、D-Pen、D-Cys或D-homoCys。
在式(I)的某些实施例中,Xaa4和Xaa10各自为β-叠氮基-Ala-OH或炔丙基甘氨酸,并且肽二聚体子单元经点击化学环化,产生***环。
在式(I)的具体实施例中,分子内键是二硫键或内酰胺键。
在一些实施例中,肽二聚体的两个肽单体子单元的N末端或C末端氨基酸(例如Xaa1、Xaa2、Xaa3、Xaa11、Xaa12、Xaa13或Xaa14)用适合连接子部分修饰形成均二聚体或杂二聚体分子,其中式(I)包含由经适合C或N末端连接子接合的两个子单元形成的二聚体。
一方面,本发明提供包含两个经连接的式(I')的子单元的肽二聚体化合物:
Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4-Xaa5-Xaa6-Xaa7-Xaa8-Xaa9-Xaa10-Xaa11-Xaa12-Xaa13-Xaa14(式(I'))
或其药学上可接受的盐,其中:
Xaa1是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa2是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa3是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa4是能够与Xaa10形成键的任何氨基酸;
Xaa5选自由以下各项组成的群组:N-Me-Arg、Arg、N-Me-Lys、Phe(4-胍基)、Phe(4-氨甲酰基)、Cit、Phe(4-NH2)、N-Me-homoArg、homoArg、Tyr、Dap、Dab、Arg-Me-sym、Arg-Me-asym、Phe(4-胍基)、Cav以及His;
Xaa6是Ser、Gly、Thr或Ile;
Xaa7是Asp或D-Asp、Asp(OMe)或N-Me-Asp;
Xaa8选自由以下各项组成的群组:Thr、Val、Ile、Leu、homoLeu、HomoLeu、Gln、Ser、Asp、Pro、Gly、His、Ala、Phe、Lys、Arg、Asn、Glu、Tyr、Trp、Met、Nle以及N-甲基氨基酸,包括N-Me-Thr;
Xaa9选自由以下各项组成的群组:Gln、Ser、Asp、Pro、Gly、Ala、Phe、Glu、Ile、Val、N-丁基Ala、N-戊基Ala、N-己基Ala、环丁基Ala、环戊基Ala、Leu、Nle、Cpa、Cba、homoLeu、Aoc以及N-Me-Leu;
Xaa10是能够与Xaa4形成键的任何氨基酸;
Xaa11不存在或选自由以下各项组成的群组:芳香族氨基酸、经取代的芳香族氨基酸以及Tic;
Xaa12不存在或选自由以下各项组成的群组:芳香族氨基酸、经取代的芳香族氨基酸、Glu、D-Glu、homoGlu、Asp、D-Asp、D-homoGlu、Gla、β-homoGlu、Tic以及相应D-氨基酸和适合电子等排体;
Xaa13是不存在或Pro;以及
Xaa14选自由以下各项组成的群组:具有胺侧链的任何氨基酸、Lys、D-Lys、N-Me-Lys、D-N-Me-Lys、Orn、Dab、Dap、homoLys、D-Dap、D-Dab、Cys、homoCys、Pen以及D-Orn。
在包含式(I')的肽单体子单元的肽二聚体化合物的具体实施例中,Xaa5和Xaa10经分子内键连接,所述键例如二硫键、内酰胺键、烯烃键、***键、硒醚键或二硒键。
在式(I')的某些实施例中,Xaa5选自由以下各项组成的群组:Cit、Phe(4-氨甲酰基)以及N-Me-homoArg;Xaa8选自由以下各项组成的群组:Leu、homoLeu、Nle以及Val;Xaa9选自由以下各项组成的群组:Cba、homoLeu以及Cpa;Xaa11选自由以下各项组成的群组:Tic、Phe(2-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Phe(4-COOH)、Phe(4-OMe)以及Phe(4-tBu);Xaa12选自由以下各项组成的群组:Aic、Gln、Cit、Glu(OMe)、D-His、Tic、Phe(3-COOH)、D-Arg、Bip、D-Trp、Phe、D-Phe、D-Val、D-Thr、D-1-Nal、D-2-Nal、Thr、Val;或Xaa13是Pro。
在多个实施例中,针对式(I)所述的其它限制中的任一个可以存在于式(I')中。式(I)的全部实施例的参考还适用于式(I)和式I的任何替代实施例。
一方面,本发明提供包含两个经连接的式(II)的子单元的肽二聚体化合物:
Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4-Xaa5-Xaa6-Xaa7-Xaa8-Xaa9-Xaa10
(式(II))
或其药学上可接受的盐,
其中肽二聚体化合物的一个或两个子单元在Xaa1和Xaa7之间包含二硫键、内酰胺键、烯烃键、***键、硒醚键或二硒键,并且另外其中式(II)表示二聚体分子的单体子单元,单体子单元连接形成根据本发明的二聚体分子,并且其中式(II)的Xaa1-Xaa10对应于式(I)的Xaa4-Xaa13
在式(II)的具体实施例中,Xaa1和Xaa7都是Cys或Pen;在具体实施例中,Xaa1和Xaa7都是Pen。
在式(II)的具体实施例中,Xaa10选自由以下各项组成的群组:具有胺侧链的任何氨基酸、Lys、D-Lys、N-Me-Lys、D-N-Me-Lys、Orn、Dab、Dap、HomoLys、D-Dap、D-Dab、D-Orn、Cys、HomoCys、Pen、D-HomoCys、D-Cys、D-Pen、Asp、Glu、D-Asp、D-Glu以及HomoSer。
在式(II)的具体实施例中,Xaa10选自由以下各项组成的群组:具有胺侧链的任何氨基酸、Lys、D-Lys、N-Me-Lys、D-N-Me-Lys、Orn、Dab、Dap、HomoLys、D-Dap、D-Dab、D-Orn、Cys、HomoCys、Pen、D-HomoCys、D-Cys以及D-Pen。
在式(II)的某些实施例中,Xaa2选自由以下各项组成的群组:Cit、Phe(4-氨甲酰基)以及N-Me-homoArg;Xaa5选自由以下各项组成的群组:Leu、HomoLeu、Nle以及Val;Xaa6选自由以下各项组成的群组:Cba、HomoLeu以及Cpa;Xaa8选自由以下各项组成的群组:Tic、Phe(2-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Phe(4-COOH)、Phe(4-OMe)以及Phe(4-tBu);Xaa9选自由以下各项组成的群组:Aic、Gln、Cit、Glu(OMe)、D-His、Tic、Phe(3-COOH)、D-Arg、Bip、D-Trp、Phe、D-Phe、D-Val、D-Thr、D-1-Nal、D-2-Nal、Thr、Val;或Xaa10是Pro。在式(II)的某些实施例中,Xaa2选自由以下各项组成的群组:Cit、Phe(4-氨甲酰基)以及N-Me-homoArg。在式(II)的某些实施例中,Xaa5选自由以下各项组成的群组:Leu、HomoLeu、Nle以及Val。在式(II)的某些实施例中,Xaa6选自由以下各项组成的群组:Cba、HomoLeu以及Cpa。在式(II)的某些实施例中,Xaa8选自由以下各项组成的群组:Tic、Phe(2-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Phe(4-COOH)、Phe(4-OMe)以及Phe(4-tBu)。在式(II)的某些实施例中,Xaa9选自由以下各项组成的群组:Aic、Gln、Cit、Glu(OMe)、D-His、Tic、Phe(3-COOH)、D-Arg、Bip、D-Trp、Phe、D-Phe、D-Val、D-Thr、D-1-Nal、D-2-Nal、Thr、Val。在式(II)的某些实施例中,Xaa10是Pro。
在具体实施例中,式(I)和式(II)的一个或两个子单元在式(I)的Xaa4和Xaa10之间或式(II)的Xaa1和Xaa7之间包含二硫键、内酰胺键、烯烃键、***键、硒醚键或二硒键。在具体实施例中,分子内键是二硫键或内酰胺键。在某些实施例中,肽二聚体包含一个或多个选自式(I)中的任一个(包括I-A、I-B、I-C、I-D、I-E、I-F、I-G、I-H、I-I以及I-J中的任一个)的单体子单元。
在式(I)的一个实施例(本文称为式(I-A))中,
Xaa1是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa2是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa3是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa4是Pen;
Xaa5选自由以下各项组成的群组:Arg、N-Me-Arg、Arg、N-Me-Lys、Phe(4-胍基)、Phe(4-氨甲酰基氨基)、Cit、Phe(4-NH2)、N-Me-HomoArg、HomoArg、Tyr以及His;
Xaa6是Ser、Ile、Gly或Thr;
Xaa7是Asp、D-Asp或N-Me-Asp;
Xaa8选自由以下各项组成的群组:Thr、Val、Ile、Leu、homoLeu、Nle以及Val;
Xaa9选自由以下各项组成的群组:Leu、Nle、Cpa、Cba、HomoLeu、Ile、环丁基Ala、环戊基Ala、Aoc以及N-Me-Leu;
Xaa10是Pen;
Xaa11不存在或选自由以下各项组成的群组:Trp、Phe、2-Nal、1-Nal、Tyr、His、Phe(4-F)、Phe(4-CF3)、Phe(4-CH3)、Phe(4-tBu)、Bip、Phe(4-COOH)、Gly、3,3-二苯基Gly、3,3-二苯基Ala、Tic、β-homoTrp、D-1-Nal、D-2-Nal、Phe(2,4-二Cl)、Phe(3,4-二Cl)、Phe(4-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Phe(2-氨甲酰基)、Tyr(Me)、homoPhe、N-Me-Phe、N-Me-Tyr、Ser、Sar、2,3-二氢Trp、Ile、Leu、Ser、Arg以及Thr;
Xaa12不存在或选自由以下各项组成的群组:Glu、D-Glu、homoGlu、Asp、D-Asp、D-homoGlu、D-Asp、Gla、β-homoGlu、相应D-氨基酸、任何芳香族氨基酸以及其电子等排体;
Xaa13是不存在或任何氨基酸;以及
Xaa14选自由以下各项组成的群组:侧链上具有游离氨基的任何氨基酸、Lys、D-Lys、N-Me-Lys、D-N-Me-Lys、Orn、Dab、Dap、HomoLys、D-Dap、D-Dab或D-Orn。
在式(I-A)的某些实施例中,Xaa4和Xaa10例如经二硫键连接。
在式(I-A)的某些实施例中,Xaa7是Asp或N-Me-Asp。
在式(I)的一个实施例(本文称为式(I-B))中,
Xaa1是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa2是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa3是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa4是Pen;
Xaa5是N-Me-Arg;
Xaa6是Ser;
Xaa7是Asp或D-Asp;
Xaa8选自由以下各项组成的群组:Thr、Val、Ile、Leu、homoLeu以及Nle;
Xaa9选自由以下各项组成的群组:Leu、Nle、Cpa、Cba、homoLeu、Aoc以及N-Me-Leu;
Xaa10是Pen;
Xaa11选自由以下各项组成的群组:Trp、Phe、2-Nal、1-Nal、Tyr、His、Phe(4-F)、Phe(4-CF3)、Phe(4-CH3)、Phe(4-tBu)、Bip、Phe(4-COOH)、Gly、3,3-二苯基Gly、3,3-二苯基Ala、Tic、β-homoTrp、D-1-Nal、D-2-Nal、Phe(2,4-二Cl)、Phe(3,4-二Cl)、Phe(4-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Tyr(Me)、homoPhe、N-Me-Phe、N-Me-Tyr、Ser、Sar、2,3-二氢Trp、Ile、Leu、Ser、Arg以及Thr;
Xaa12选自由以下各项组成的群组:任何芳香族氨基酸、Glu、D-Glu、homoGlu、Asp、D-Asp、D-homoGlu、Gla、β-homoGlu、相应D-氨基酸以及其电子等排体;
Xaa13是不存在或任何氨基酸;以及
Xaa14选自由以下各项组成的群组:Lys、D-Lys、N-Me-Lys、D-N-Me-Lys、Orn、Dab、Dap、HomoLys、D-Dap、D-Dab以及D-Orn。
在式(I-B)的某些实施例中,Xaa4和Xaa10例如经二硫键连接。
在式(I-B)的某些实施例中,Xaa7是Asp。
在式(I)的一个实施例(本文称为式(I-C))中,
Xaa1是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa2是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa3是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa4是Pen;
Xaa5是N-Me-Arg;
Xaa6是Ser;
Xaa7是Asp或D-Asp;
Xaa8选自由以下各项组成的群组:Thr、Val、Ile、Leu、homoLeu以及Nle;
Xaa9选自由以下各项组成的群组:Leu、Nle、Cpa、Cba、HomoLeu、Aoc以及N-Me-Leu;
Xaa10是Pen;
Xaa11选自由以下各项组成的群组:Trp、Phe、2-Nal、1-Nal、Tyr、His、Phe(4-F)、Phe(4-CF3)、Phe(4-CH3)、Phe(4-tBu)、Bip、Phe(4-COOH)、Gly、3,3-二苯基Gly、3,3-二苯基Ala、Tic、β-homoTrp、D-1-Nal、D-2-Nal、Phe(2,4-二Cl)、Phe(3,4-二Cl)、Phe(4-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Tyr(Me)、HomoPhe、N-Me-Phe、N-Me-Tyr、Ser、Sar、2,3-二氢Trp、Ile、Leu、Ser、Arg以及Thr;
Xaa12选自由以下各项组成的群组:Glu、D-Glu、homoGlu、Asp、D-Asp、D-homoGlu、Gla、β-homoGlu、相应D-氨基酸以及任何芳香族氨基酸和其相应电子等排体;
Xaa13是不存在或任何氨基酸;以及
Xaa14选自由以下各项组成的群组:Lys、D-Lys、N-Me-Lys、D-N-Me-Lys、Orn、Dab、Dap、HomoLys、D-Dap、D-Dab以及D-Orn。
在式(I-C)的某些实施例中,Xaa4和Xaa10例如经二硫键连接。
在式(I-C)的某些实施例中,Xaa7是Asp。
在式(I)的一个实施例(本文称为式(I-D))中,
Xaa1是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa2是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa3是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa4是Pen;
Xaa5是N-Me-Arg;
Xaa6是Ser;
Xaa7是Asp或D-Asp;
Xaa8是Thr或Val;
Xaa9选自由以下各项组成的群组:Leu、Nle、Cpa、Cba、homoLeu、Aoc以及N-Me-Leu;
Xaa10是Pen;
Xaa11选自由以下各项组成的群组:Trp、Phe、2-Nal、1-Nal、Tyr、His、Phe(4-F)、Phe(4-CF3)、Phe(4-CH3)、Phe(4-tBu)、Bip、Phe(4-COOH)、Gly、3,3-二苯基Gly、3,3-二苯基Ala、Tic、β-homoTrp、D-1-Nal、D-2-Nal、Phe(2,4-二Cl)、Phe(3,4-二Cl)、Phe(4-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Tyr(Me)、HomoPhe、N-Me-Phe、N-Me-Tyr、Ser、Sar、2,3-二氢Trp、Ile、Leu、Ser、Arg以及Thr;
Xaa12不存在或选自由以下各项组成的群组:任何芳香族氨基酸、Glu、D-Glu、homoGlu、Asp、D-Asp、D-homoGlu、Gla、β-homoGlu、相应D-氨基酸以及其电子等排体;
Xaa13不存在;以及
Xaa14选自由以下各项组成的群组:Lys、D-Lys、N-Me-Lys、D-N-Me-Lys、Orn、Dab、Dap、HomoLys、D-Dap、D-Dab以及D-Orn。
在式(I-D)的某些实施例中,Xaa4和Xaa10例如经二硫键连接。
在式(I-D)的某些实施例中,Xaa7是Asp。
在式(I)的一个实施例(本文称为式(I-E))中,
Xaa1是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa2是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa3是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa4是Pen;
Xaa5是N-Me-Arg;
Xaa6是Ser;
Xaa7是Asp或D-Asp;
Xaa8是Thr或Val;
Xaa9选自由以下各项组成的群组:Leu、Nle、Cpa、Cba、homoLeu、Aoc以及N-Me-Leu;
Xaa10是Pen;
Xaa11选自由以下各项组成的群组:Trp、Phe、2-Nal、1-Nal、Tyr、His、Phe(4-F)、Phe(4-CF3)、Phe(4-CH3)、Phe(4-tBu)、Bip、Phe(4-COOH)、Gly、3,3-二苯基Gly、3,3-二苯基Ala、Tic、β-homoTrp、D-1-Nal、D-2-Nal、Phe(2,4-二Cl)、Phe(3,4-二Cl)、Phe(4-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Tyr(Me)、homoPhe、N-Me-Phe、N-Me-Tyr、Ser、Sar、2,3-二氢Trp、Ile、Leu、Ser、Arg以及Thr;
Xaa12不存在或选自由以下各项组成的群组:任何芳香族氨基酸、Glu、D-Glu以及β-homoGlu;
Xaa13不存在;以及
Xaa14选自由以下各项组成的群组:Lys、D-Lys、N-Me-Lys、D-N-Me-Lys、Orn、Dab、Dap、HomoLys、D-Dap、D-Dab或D-Orn。
在某些实施例中,Xaa4和Xaa10例如经二硫键连接。
在式(I-E)的某些实施例中,Xaa7是Asp。
在式(I)的一个实施例(本文称为式(I-F))中,
Xaa1是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa2是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa3是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa4是Pen;
Xaa5是N-Me-Arg;
Xaa6是Ser;
Xaa7是Asp或D-Asp;
Xaa8是Thr或Val;
Xaa9是Leu;
Xaa10是Pen;
Xaa11选自由以下各项组成的群组:Trp、Phe、2-Nal、1-Nal、Tyr、His、Phe(4-F)、Phe(4-CF3)、Phe(4-CH3)、Phe(4-tBu)、Bip、Phe(4-COOH)、Gly、3,3-二苯基Gly、3,3二苯基Ala、Tic、b-homoTrp、D-1-Nal、D-2-Nal、Phe(2,4-二Cl)、Phe(3,4-二Cl)、Phe(4-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Tyr(Me)、HomoPhe、N-Me-Phe、N-Me-Tyr、Ser、Sar、二氢Trp、Ile、Leu、Ser、Arg以及Thr;
Xaa12选自由以下各项组成的群组:任何芳香族氨基酸、Glu、D-Glu、β-homoGlu、相应D-氨基酸以及其电子等排体;
Xaa13不存在;以及
Xaa14选自由以下各项组成的群组:Lys、D-Lys、N-Me-Lys、D-N-Me-Lys、Orn、Dab、Dap、HomoLys、D-Dap、D-Dab以及D-Orn。
在式(I-F)的某些实施例中,Xaa14选自由以下各项组成的群组:Lys、D-Lys、N-Me-Lys以及D-N-Me-Lys。
在式(I-F)的某些实施例中,Xaa4和Xaa10例如经二硫键或内酰胺键连接。
在式(I-F)的某些实施例中,Xaa7是Asp。
在式(I)的一个实施例(本文称为式(I-G))中,
Xaa1是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa2是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa3是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa4是Pen;
Xaa5是N-Me-Arg;
Xaa6是Ser;
Xaa7是Asp或D-Asp;
Xaa8是Thr或Val;
Xaa是Leu;
Xaa10是Pen;
Xaa11选自由以下各项组成的群组:Trp、Phe、2-Nal、1-Nal、Tyr、His、Phe(4-F)、Phe(4-CF3)、Phe(4-CH3)、Phe(4-tBu)、Bip、Phe(4-COOH)、Gly、3,3-二苯基Gly、3,3-二苯基Ala、Tic、β-homoTrp、D-1-Nal、D-2-Nal、Phe(2,4-二Cl)、Phe(3,4-二Cl)、Phe(4-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Tyr(Me)、homoPhe、N-Me-Phe、N-Me-Tyr、Ser、Sar、2,3-二氢Trp、Ile、Leu、Ser、Arg以及Thr
Xaa12选自由以下各项组成的群组:任何芳香族氨基酸、Glu、D-Glu以及β-homoGlu;
Xaa13不存在;以及
Xaa14选自由以下各项组成的群组:Lys、D-Lys、N-Me-Lys、D-N-Me-Lys、Orn、Dab、Dap、HomoLys、D-Dap、D-Dab或D-Orn。
在式(I-G)的某些实施例中,Xaa14选自由以下各项组成的群组:D-Lys、N-Me-Lys以及D-N-Me-Lys。
在式(I-G)的某些实施例中,Xaa4和Xaa10例如经二硫键连接。
在式(I-G)的某些实施例中,Xaa7是Asp。
在式(I)的一个实施例(本文称为式(I-H))中,
Xaa1是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa2是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa3是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa4是Pen;
Xaa5是N-Me-Arg;
Xaa6是Ser;
Xaa7是Asp;
Xaa8是Thr或Val;
Xaa9是Leu;
Xaa10是Pen;
Xaa11选自由以下各项组成的群组:Trp、Phe、2-Nal、1-Nal、Tyr、His、Phe(4-F)、Phe(4-CF3)、Phe(4-CH3)、Phe(4-tBu)、Bip、Phe(4-COOH)、Gly、3,3-二苯基Gly、3,3-二苯基Ala、Tic、b-homoTrp、D-1-Nal、D-2-Nal、Phe(2,4-二Cl)、Phe(3,4-二Cl)、Phe(4-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Tyr(Me)、HomoPhe、N-Me-Phe、N-Me-Tyr、Ser、Sar、2,3-二氢Trp、Ile、Leu、Ser、Arg以及Thr;
Xaa12选自由以下各项组成的群组:任何芳香族氨基酸、Glu、D-Glu以及β-homoGlu;
Xaa13不存在;以及
Xaa14选自由以下各项组成的群组:D-Lys、N-Me-Lys以及D-N-Me-Lys。
在式(I-H)的某些实施例中,Xaa4和Xaa10例如经二硫键连接。
在式(I)的一个实施例(本文称为式(I-I))中,
Xaa1是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa2是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa3是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa4是Pen;
Xaa5是N-Me-Arg;
Xaa6是Ser;
Xaa7是Asp或D-Asp;
Xaa8是Thr或Val;
Xaa9是Leu;
Xaa10是Pen;
Xaa11选自由以下各项组成的群组:Trp、Phe、2-Nal、1-Nal、Tyr、His、Phe(4-F)、Phe(4-CF3)、Phe(4-CH3)、Phe(4-tBu)、Bip、Phe(4-COOH)、Gly、3,3-二苯基Gly、3,3-二苯基Ala、Tic、β-homoTrp、D-1-Nal、D-2-Nal、Phe(2,4-二Cl)、Phe(3,4-二Cl)、Phe(4-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Tyr(Me)以及homoPhe;
Xaa12选自由以下各项组成的群组:任何芳香族氨基酸、Glu、D-Glu以及β-homoGlu;
Xaa13不存在;以及
Xaa14选自由以下各项组成的群组:D-Lys、N-Me-Lys以及D-N-Me-Lys。
在式(I-I)的某些实施例中,Xaa4和Xaa10例如经二硫键连接。
在式(I-I)的某些实施例中,Xaa7是Asp。
在式(I)的一个实施例(本文称为式(I-J))中,
Xaa1是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa2是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa3是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa4是Pen;
Xaa5是N-Me-Arg;
Xaa6是Ser;
Xaa7是Asp;
Xaa8是Thr;
Xaa9是Leu;
Xaa10是Pen;
Xaa11是Phe(4-tBu)
Xaa12是β-homoGlu;
Xaa13不存在;
并且Xaa14是D-Lys。
在式(I-J)的具体实施例中,Xaa4和Xaa10经二硫键连接,并且两个单体子单元经连接子连接。在具体实施例中,其经其各别C末端连接。在一个实施例中,连接子是DIG。
在式(I)、(I-A)、(I-B)、(I-C)、(I-D)、(I-E)、(I-F)、(I-G)、(I-H)、(I-I)或(I-J)中的任一个的某些实施例中,Xaa14选自由以下各项组成的群组:Lys、D-Lys、N-Me-Lys以及D-N-Me-Lys。
在式(II)、(III)、(A)、(B)或(C)中的任一个的某些实施例中,Xaa10选自由以下各项组成的群组:Lys、D-Lys、N-Me-Lys以及D-N-Me-Lys。
在式(I)、(I-A)、(I-B)、(I-C)、(I-D)、(I-E)、(I-F)、(I-G)、(I-H)、(I-I)或(I-J)中的任一个的某些实施例中,Xaa14选自由以下各项组成的群组:Lys、D-Lys、N-Me-Lys以及D-N-Me-Lys。
在式(I)、(I-A)、(I-B)、(I-C)、(I-D)、(I-E)、(I-F)、(I-G)、(I-H)、(I-I)或(I-J)中的任一个的替代实施例中,Xaa14选自由以下各项组成的群组:具有胺侧链的任何氨基酸、Lys、D-Lys、N-Me-Lys、D-N-Me-Lys、Orn、Dab、Dap、HomoLys、D-Dap、D-Dab、D-Orn、Cys、HomoCys、Pen、D-HomoCys、D-Cys、D-Pen、Asp、Glu、D-Asp、D-Glu以及HomoSer、Asp、Glu、homoGlu、D-Asp、D-Glu、D-homoGlu、N-Me-Glu、N-Me-Asp、N-Me-D-Glu以及N-Me-D-Asp。在其它替代实施例中,Xaa14选自由以下各项组成的群组:Asp、Glu、homoGlu、D-Asp、D-Glu、D-homoGlu、N-Me-Glu、N-Me-Asp、N-Me-D-Glu以及N-Me-D-Asp。在式(I)、(I-A)、(I-B)、(I-C)、(I-D)、(I-E)、(I-F)、(I-G)、(I-H)、(I-I)或(I-J)的这些替代的具体实施例中,肽二聚体化合物的各子单元的两个C末端氨基酸具有酸官能基,并且其经二胺连接子反转连接来连接。
在式(II)、(III)、(A)、(B)或(C)中的任一个的替代实施例中,Xaa10选自由以下各项组成的群组:具有胺侧链的任何氨基酸、Lys、D-Lys、N-Me-Lys、D-N-Me-Lys、Orn、Dab、Dap、HomoLys、D-Dap、D-Dab、D-Orn、Cys、HomoCys、Pen、D-HomoCys、D-Cys、D-Pen、Asp、Glu、D-Asp、D-Glu以及HomoSer、Asp、Glu、homoGlu、D-Asp、D-Glu、D-homoGlu、N-Me-Glu、N-Me-Asp、N-Me-D-Glu以及N-Me-D-Asp。在其它替代实施例中,Xaa10选自由以下各项组成的群组:Asp、Glu、homoGlu、D-Asp、D-Glu、D-homoGlu、N-Me-Glu、N-Me-Asp、N-Me-D-Glu以及N-Me-D-Asp。在式(II)、(III)、(A)、(B)或(C)中的这些替代的具体实施例中,肽二聚体化合物的各子单元的两个C末端氨基酸具有酸官能基,并且其经二胺连接子反转连接来连接。
在其它实施例中,本发明包括包含式(I-A)、(I-B)、(I-C)、(I-D)、(I-E)、(I-F)、(I-G)、(I-H)、(I-I)或(I-J)中的任一个的两个肽子单元的肽二聚体,但其中Xaa4和Xaa10处的Pen残基中的一个或两个经Cys取代。在具体实施例中,Xaa4和Xaa10处的两个Pen残基经Cys取代。在具体实施例中,一个或两个子单元在Xaa4和Xaa10之间包含二硫键。
在式(I)、(II)、(III)、(I-A)、(I-B)、(I-C)、(I-D)、(I-E)、(I-F)、(I-G)、(I-H)、(I-I)、(I-J)、(A)、(B)、(C)、(S)或相关肽中的任一个的具体实施例中,两个肽子单元经其各别C末端(例如经结合于各子单元的Xaa13或Xaa14的连接子)连接。
在式(I)、(II)、(III)、(I-A)、(I-B)、(I-C)、(I-D)、(I-E)、(I-F)、(I-G)、(I-H)、(I-I)或(I-J)、(A)、(B)、(C)、(S)或相关肽中的任一个的具体实施例中,两个肽子单元经其各别N末端(例如经结合于各子单元的Xaa1、Xaa2或Xaa3的连接子)连接。
在式(I)、(I-A)、(I-B)、(I-C)、(I-D)、(I-E)、(I-F)、(I-G)、(I-H)、(I-I)或(I-J)或相关肽中的任一个的具体实施例中,Xaa1是Ac,并且Xaa2和Xaa3是不存在或任何氨基酸。在某些实施例中,Xaa1和Xaa2不存在并且Xaa3是Ac。
在式(I)、(I-A)、(I-B)、(I-C)、(I-D)、(I-E)、(I-F)、(I-G)、(I-H)、(I-I)或(I-J)或相关肽中的任一个的具体实施例中,Xaa1、Xaa2或Xaa3中的任何一个或多个选自由以下各项组成的群组:具有胺侧链的任何氨基酸、Lys、D-Lys、N-Me-Lys、D-N-Me-Lys、Orn、Dab、Dap、HomoLys、D-Dap、D-Dab、Cys、homoCys、Pen以及D-Orn。在具体实施例中,当Xaa1、Xaa2或Xaa3不存在时,肽二聚体化合物的两个单体子单元与N末端氨基酸的α-胺连接。在具体实施例中,两个子单元与侧链胺、硫基或能够经Xaa1、Xaa2或Xaa3的氨基酸或α-胺的连接子连接的任何官能基连接。在具体实施例中,Xaa1、Xaa2或Xaa3是D-Lys、N-Me-Lys或D-N-Me-Lys。在具体实施例中,Xaa1、Xaa2或Xaa3是D-Lys、N-Me-Lys或D-N-Me-Lys,并且位于肽的N末端处。在具体实施例中,肽二聚体化合物的两个子单元包含选自这些残基中的一个的Xaa1、Xaa2或Xaa3,并且两个子单元经其各别N末端连接。
在式(I)、(I-A)、(I-B)、(I-C)、(I-D)、(I-E)、(I-F)、(I-G)、(I-H)、(I-I)或(I-J)或相关肽中的任一个的具体实施例中,Xaa1、Xaa2或Xaa3中的任何一个或多个选自由以下各项组成的群组:具有胺侧链的任何氨基酸、Lys、D-Lys、N-Me-Lys、D-N-Me-Lys、Orn、Dab、Dap、HomoLys、D-Dap、D-Dab、D-Orn、Cys、HomoCys、Pen、D-HomoCys、D-Cys、D-Pen、Asp、Glu、D-Asp、D-Glu以及HomoSer、Asp、Glu、homoGlu、D-Asp、D-Glu、D-homoGlu、N-Me-Glu、N-Me-Asp、N-Me-D-Glu以及N-Me-D-Asp。在具体实施例中,这一残基位于肽的N末端处。在某些实施例中,Xaa1、Xaa2或Xaa3选自由以下各项组成的群组:Asp、Glu、homoGlu、D-Asp、D-Glu、D-homoGlu、N-Me-Glu、N-Me-Asp、N-Me-D-Glu以及N-Me-D-Asp。在具体实施例中,这一残基位于肽的N末端处。在具体实施例中,肽二聚体化合物的各子单元的两个N末端氨基酸具有酸官能基,并且其经二胺连接子反转连接来连接。在具体实施例中,肽二聚体化合物的两个子单元包含选自这些残基中的一个的Xaa1、Xaa2或Xaa3,并且两个子单元经其各别N末端连接。
在式(I)、(I-A)、(I-B)、(I-C)、(I-D)、(I-E)、(I-F)、(I-G)、(I-H)、(I-I)或(I-J)或包括其单体子单元的相关肽中的任一个的具体实施例中,Xaa4和Xaa10是Pen,并且Xaa5是N-Me-Arg。在这些化学式或肽的任一个的其它实施例中,Xaa4和Xaa10是Pen,Xaa5是N-Me-Arg,并且Xaa11选自由以下各项组成的群组:Tic、Phe(2-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Phe(4-COOH)、Phe(4-OMe)以及Phe(4-tBu)。
在式(II)、(III)、(A)、(B)或(C)中的任一个的某些实施例中,Xaa10选自由以下各项组成的群组:Lys、D-Lys、N-Me-Lys以及D-N-Me-Lys。
在一个实施例中,本发明的肽二聚体化合物或肽单体化合物包含式(A)的一个或多个肽子单元:
Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4-Xaa5-Xaa6-Xaa7-Xaa8-Xaa9-Xaa10
(式(A))
或其药学上可接受的盐,
其中
Xaa1是Cys或Pen;
Xaa2是N-甲基-Arg;
Xaa3是Ser;
Xaa4是Asp;
Xaa5是Thr或Val;
Xaa6是Leu或Nle;
Xaa7是Cys或Pen;
Xaa8是Trp、Tic、Bip、1-Nal、2-Nal、Phe(4-tBu)、Phe、Tyr或Phe(4-COOH);
Xaa9是Glu、β-homoGlu或D-Glu,以及
Xaa10是任何氨基酸,
其中肽分子在Xaa1和Xaa7之间包含二硫键。
在式(A)的具体实施例中,Xaa10是D-Lys、N-Me-Lys或N-Me-D-Lys。在具体实施例中,Xaa1和/或Xaa7是Pen。在式(A)的某些实施例中,Xaa10选自由以下各项组成的群组:具有胺侧链的任何氨基酸、Lys、D-Lys、N-Me-Lys、D-N-Me-Lys、Orn、Dab、Dap、HomoLys、D-Dap、D-Dab、Cys、homoCys、Pen以及D-Orn。
在某些实施例中,肽的Xaa10或C末端包含NH2或OH。
实施例包括包含以下结构的肽二聚体化合物:
(Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4-Xaa5-Xaa6-Xaa7-Xaa8-Xaa9-Xaa10-Xaa11-Xaa12-Xaa13-Xaa14)2-L,
其中Xaa1--Xaa14如本文针对式(I)(包括(I-A)、(I-B)、(I-C)、(I-D)、(I-E)、(I-F)、(I-G)、(I-H)、(I-I)以及(I-J))中的任一个所示定义,并且其中L是连接两个单体子单元的C末端的任何连接子部分。在具体实施例中,L选自由以下各项组成的群组:DIG、双官能PEG13、双官能PEG25、双官能PEG1K、双官能PEG2K、双官能PEG3.4K、双官能PEG4K、双官能PEG5K、IDA、IDA-Palm、IDA-Boc、IDA-异戊酸、三嗪、三嗪-Boc、间苯二甲酸、1,3-苯二乙酸、1,4-苯二乙酸、戊二酸、壬二酸、庚二酸、十二烷二酸、适合脂肪族化合物、芳香族化合物、杂芳香族化合物以及分子量为约400Da到约40,000Da的聚乙二醇类连接子。当连接子是IDA、ADA或具有游离胺的任何连接子时,其可以使用选自由以下各项组成的群组的酰化有机化合物酰化:2-甲基-三氟丁基、三氟戊基、乙酰基、辛酰基、丁基、戊基、己基、棕榈基、月桂基、油酰基、月桂基、三氟甲基丁酸、环戊烷甲酸、环丙基乙酸、4-氟苯甲酸、4-氟苯基乙酸、3-苯基丙酸、四氢-2H-吡喃-4甲酸、丁二酸以及戊二酸、具有10到20个碳单元的直链脂肪族酸、胆酸和其它胆汁酸。在一些情况下,小PEG(PEG4-PEG13)、Glu、IsoGlu或Asp用作酰化之前的间隔基团。在具体实施例中,连接子是双官能连接子(例如二酸、二胺、二卤化物、N-羟基丁二酰亚胺(NHS)活化的二酯、双-顺丁烯二酰亚胺,其可能能够经胺、酯、硫醚、二硫基或醚键连接两个单体子单元。在具体实施例中,L选自由以下各项组成的群组:DIG、PEG13、PEG25、PEG1K、PEG2K、PEG3.4K、PEG4K、PEG5K、IDA、IDA-Palm、IDA-Boc、IDA-异戊酸、三嗪、三嗪-Boc、间苯二甲酸、1,3-苯二乙酸、1,4-苯二乙酸、环丙基乙酸、丁二酸、戊二酸、十二烷二酸、适合脂肪族化合物、适合芳香族化合物、杂芳香族化合物以及分子量为约400Da到约40,000Da的聚乙二醇。在一个实施例中,连接的是DIG。在其它实施例中,L是本文所述的连接子中的任一个。
其它实施例包括包含以下结构的肽二聚体化合物:
L-(Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4-Xaa5-Xaa6-Xaa7-Xaa8-Xaa9-Xaa10-Xaa11-Xaa12-Xaa13-Xaa14)2
其中Xaa1--Xaa14如本文针对式(I)(包括(I-A)、(I-B)、(I-C)、(I-D)、(I-E)、(I-F)、(I-G)、(I-H)、(I-I)以及(I-J))中的任一个所示定义,并且其中L选自由以下各项组成的群组:DIG、双官能PEG13、双官能PEG25、双官能PEG1K、双官能PEG2K、双官能PEG3.4K、双官能PEG4K、双官能PEG5K、IDA、IDA-Palm、IDA-Boc、IDA-异戊酸、三嗪、三嗪-Boc、间苯二甲酸、1,3-苯二乙酸、1,4-苯二乙酸、戊二酸、壬二酸、庚二酸、十二烷二酸、适合脂肪族化合物、芳香族化合物、杂芳香族化合物以及分子量为约400Da到约40,000Da的聚乙二醇类连接子。当连接子是IDA、ADA或具有游离胺的任何连接子时,其可以使用选自由以下各项组成的群组的酰化有机化合物酰化:2-甲基-三氟丁基、三氟戊基、乙酰基、辛酰基、丁基、戊基、己基、棕榈基、月桂基、油酰基、月桂基、三氟甲基丁酸、环戊烷甲酸、环丙基乙酸、4-氟苯甲酸、4-氟苯基乙酸、3-苯基丙酸、四氢-2H-吡喃-4甲酸、丁二酸以及戊二酸、具有10到20个碳单元的直链脂肪族酸、胆酸和其它胆汁酸。在一些情况下,小PEG(PEG4-PEG13)、Glu、IsoGlu或Asp用作酰化之前的间隔基团。在具体实施例中,连接子是双官能连接子(例如二酸、二胺、二卤化物、N-羟基丁二酰亚胺(NHS)活化的二酯、双-顺丁烯二酰亚胺,其可能能够经胺、酯、硫醚、二硫基或醚键连接两个单体子单元。在具体实施例中,L选自由以下各项组成的群组:DIG、PEG13、PEG25、PEG1K、PEG2K、PEG3.4K、PEG4K、PEG5K、IDA、IDA-Palm、IDA-Boc、IDA-异戊酸、三嗪、三嗪-Boc、间苯二甲酸、1,3-苯二乙酸、1,4-苯二乙酸、环丙基乙酸、丁二酸、戊二酸、十二烷二酸、适合脂肪族化合物、适合芳香族化合物、杂芳香族化合物以及分子量为约400Da到约40,000Da的聚乙二醇。在一个实施例中,连接的是DIG。
本发明的一些序列来源于式(I)(包括I-A、I-B、I-C、I-D、I-E、I-F、I-G、I-H、I-I、I-J中的任一个)、式(II)(包括II-A)、式(III)、式(A)、式(B)、式(C)、式(D)或式(S)中提供的通用序列。举例来说,由式(I)的Xaa4-Xaa13或式(II)的Xaa1-Xaa10表示的十肽的N末端可以经一个到三个如式(I)的Xaa1、Xaa2和Xaa3表示的适合基团修饰。N末端可以进一步经酰化。在具体实施例中,N末端可以用选自由以下各项组成的群组的酰化有机化合物酰化:2-甲基-4,4,4-三氟丁基、三氟戊基、乙酰基、辛酰基、丁基、戊基、己基、棕榈基、月桂基、油酰基、三氟甲基丁基、环戊烷甲酸、环丙基乙酸、4-氟苯甲酸、4-氟苯基乙酸、3-苯基丙酸、四氢-2H-吡喃-4甲酸、丁二酸以及戊二酸。在一些情况下,小PEG(例如PEG4-PEG13)用作酰化之前的间隔基团。在一些情况下,Glu、IsoGlu或Asp用作酰化的间隔基团。在一些情况下,N末端进一步包含适合连接子部分以便于将两个单体子单元连接在一起形成N末端二聚体分子。
在任何肽二聚体化合物的某些实施例(例如其中肽二聚体化合物经一个或两个单体子单元的N末端连接)中,N末端氨基酸是具有胺侧链的任何氨基酸、Lys、D-Lys、N-Me-Lys、D-N-Me-Lys、Orn、Dab、Dap、HomoLys、D-Dap、D-Dab、D-Orn、Cys、HomoCys、Pen、D-HomoCys、D-Cys、D-Pen、Asp、Glu、D-Asp、D-Glu以及HomoSer、Asp、Glu、homoGlu、D-Asp、D-Glu、D-homoGlu、N-Me-Glu、N-Me-Asp、N-Me-D-Glu以及N-Me-D-Asp。在某些实施例中,单体子单元的N末端氨基酸残基是具有胺侧链的氨基酸,或选自以下的氨基酸:Lys、D-Lys、N-Me-Lys、D-N-Me-Lys、Orn、Dab、Dap、HomoLys、D-Dap、D-Dab、Cys、homoCys、Pen以及D-Orn。在具体实施例中,它是D-Lys、N-Me-Lys或D-N-Me-Lys。
另外,如上文针对式(I)的多个实施例中的任一个所述,Xaa1、Xaa2和/或Xaa3可以是具有胺侧链的氨基酸,或选自以下的氨基酸:Lys、D-Lys、N-Me-Lys、D-N-Me-Lys、Orn、Dab、Dap、HomoLys、D-Dap、D-Dab、D-Orn、Cys、HomoCys、Pen、D-HomoCys、D-Cys、D-Pen、Asp、Glu、D-Asp、D-Glu以及HomoSer、Asp、Glu、homoGlu、D-Asp、D-Glu、D-homoGlu、N-Me-Glu、N-Me-Asp、N-Me-D-Glu以及N-Me-D-Asp。在某些实施例中,它是Lys、D-Lys、N-Me-Lys、D-N-Me-Lys、Orn、Dab、Dap、HomoLys、D-Dap、D-Dab、Cys、homoCys、Pen以及D-Orn,并且其可参与键联。参与键联的残基可以位于肽单体的N末端处,或它可以是内部氨基酸,即不是N末端或C末端氨基酸。
本发明进一步包括具有基于本文所述化学式(例如式(I)(包括I-A、I-B、I-C、I-D、I-E、I-F、I-G、I-H、I-I以及I-J中的任一个)、式(II)(包括II-A)、式(III)、式(A)、式(B)、式(C)、式(D)或式(S))中的任一个的子单元的肽二聚体化合物,其中子单元经一个或多个内部氨基酸残基连接。举例来说,一个或多个子单元的内部氨基酸残基可以经修饰以包括能够与连接子形成键的氨基酸或衍生物,例如具有胺侧链的氨基酸,或选自Lys、D-Lys、N-Me-Lys、D-N-Me-Lys、Orn、Dab、Dap、HomoLys、D-Dap、D-Dab、Cys、homoCys、Pen以及D-Orn的氨基酸。另外,单体子单元的内部氨基酸残基可以直接彼此连接(或连接到连接子)形成肽二聚体化合物。举例来说,各单体子单元中存在的内部赖氨酸残基可以彼此结合形成肽二聚体化合物。
在一些实施例中,式(I)(包括I-A、I-B、I-C、I-D、I-E、I-F、I-G、I-H、I-I以及I-J中的任一个)的Xaa1、Xaa2以及Xaa3不存在。在其它实施例中,Xaa1不存在,并且Xaa2和Xaa3表示用于修饰肽(例如式(I)的残基Xaa4-Xaa13和式(II)的残基Xaa1-Xaa10表示的十肽)的N末端的适合基团。另外,在一些实施例中,式(I)(包括I-A、I-B、I-C、I-D、I-E、I-F、I-G、I-H、I-I以及I-J中的任一个)的Xaa1和Xaa2不存在,并且式(I)(包括I-A、I-B、I-C、I-D、I-E、I-F、I-G、I-H、I-I以及I-J中的任一个)的Xaa3表示用于修饰十肽子单元的N末端的单个适合基团。在一些实施例中,式(I)(包括I-A、I-B、I-C、I-D、I-E、I-F、I-G、I-H、I-I以及I-J中的任一个)的Xaa1和Xaa2不存在,并且式(I)的Xaa3是Ac。在一些实施例中,式(I)(包括I-A、I-B、I-C、I-D、I-E、I-F、I-G、I-H、I-I以及I-J中的任一个)、式(II)(包括2-A)、式(III)、式(A)、式(B)、式(C)、式(D)或式(S)的肽二聚体的N末端氨基酸残基经酰化。在具体实施例中,N末端可以用选自由以下各项组成的群组的酰化有机化合物酰化:2-甲基-三氟丁基、三氟戊基、乙酰基、辛酰基、丁基、戊基、己基、棕榈基、月桂基、油酰基以及月桂基、三氟甲基丁酸、环戊烷甲酸、环丙基乙酸、4-氟苯甲酸、4-氟苯基乙酸、3-苯基丙酸、四氢-2H-吡喃-4甲酸、丁二酸以及戊二酸。在一些情况下,小PEG(例如PEG4-PEG13)用作酰化之前的间隔基团。在一些情况下,Glu、IsoGlu或Asp用作酰化的间隔基团。
类似地,肽(例如式(I)(包括I-A、I-B、I-C、I-D、I-E、I-F、I-G、I-H、I-I以及I-J中的任一个)、式(II)、式(III)、式(A)、式(B)、式(C)、式(D)或式(S)表示的十肽)的C末端可以经适合基团修饰。例如本文所述,例如在肽二聚体子单元经其N末端或肽单体化合物二聚的情形中,C末端可以进一步经酰化。在具体实施例中,例如在具有游离胺的氨基酸上,C末端可以用选自由以下各项组成的群组的酰化有机化合物酰化:2-甲基-三氟丁基、三氟戊基、乙酰基、辛酰基、丁基、戊基、己基、棕榈基、月桂基、油酰基以及月桂基、三氟甲基丁酸、环戊烷甲酸、环丙基乙酸、4-氟苯甲酸、4-氟苯基乙酸、3-苯基丙酸、四氢-2H-吡喃-4甲酸、丁二酸以及戊二酸。在一些情况下,小PEG(例如PEG4-PEG13)用作酰化之前的间隔基团。在一些情况下,Glu、IsoGlu或Asp用作酰化的间隔基团。在一些情况下,C末端进一步包含适合连接子部分以便于将两个单体子单元连接在一起形成C末端二聚体分子。
在式(I)(包括I-A、I-B、I-C、I-D、I-E、I-F、I-G、I-H、I-I以及I-J中的任一个)的肽的某些实施例中,Xaa11、Xaa12以及Xaa13不存在。在其它实施例中,Xaa12和Xaa13不存在。在其它实施例中,Xaa13不存在。在具体实施例中,Xaa14是肽二聚体的肽单体子单元的C末端氨基酸。在具体实施例中,Xaa14经修饰。在某些实施例中,Xaa14是赖氨酸、D-赖氨酸、N-甲基-赖氨酸、Dap或Dab。在具体实施例中,Xaa14是Dap或Dab。在某些实施例中,Xaa4包含NH2部分。
在一些实施例中,式(I)(包括I-A、I-B、I-C、I-D、I-E、I-F、I-G、I-H、I-I以及I-J中的任一个)、式(II)、式(III)、式(A)、式(B)、式(C)、式(D)或式(S)的N末端残基进一步包含连接子部分,例如选自由以下各项组成的群组的连接子部分:DIG、PEG13、PEG25、PEG1K、PEG2K、PEG3.4K、PEG4K、PEG5K、IDA、IDA-Palm、IDA-Boc、IDA-异戊酸、三嗪、三嗪-Boc、间苯二甲酸、1,3-苯二乙酸、1,4-苯二乙酸、环丙基乙酸、丁二酸、戊二酸、十二烷二酸、适合脂肪族化合物、适合芳香族化合物、杂芳香族化合物以及分子量为约400Da到约40,000Da的聚乙二醇。另外,在一些实施例中,Xaa1-Xaa4中的任何一个或多个经酰化。在具体实施例中,Xaa1-Xaa4中的任何一个或多个用选自由以下各项组成的群组的酰化有机化合物酰化:2-甲基-三氟丁基、三氟戊基、乙酰基、辛酰基、丁基、戊基、己基、棕榈基、月桂基、油酰基以及月桂基、三氟甲基丁酸、环戊烷甲酸、环丙基乙酸、4-氟苯甲酸、4-氟苯基乙酸、3-苯基丙酸、四氢-2H-吡喃-4甲酸、丁二酸以及戊二酸。在一些情况下,小PEG(例如PEG4-PEG13)用作酰化之前的间隔基团。在一些情况下,Glu、IsoGlu或Asp用作酰化的间隔基团。
在Xaa4和Xaa10都是Cys或Pen的某些实施例中,肽单体或肽二聚体的各子单元经Xaa4与Xaa10之间的二硫键环化。优选地,在一个实施例中,Xaa4是Cys。在另一实施例中,Xaa4优选是Pen。在具体实施例中,Xaa4是Pen;在其它实施例中,Xaa10是Pen;在其它实施例中,Xaa4和Xaa10都是Pen。
在本文所述的化学式(例如式(I)(包括I-A、I-B、I-C、I-D、I-E、I-F、I-G、I-H、I-I以及I-J中的任一个))中的任一个的某些实施例中,Xaa5是N-Me-Arg。在某些实施例中,Xaa6是Ser。在某些实施例中,Xaa7是Asp。在某些实施例中,Xaa8是Thr。在某些实施例中,Xaa9是Leu。在一个实施例中,Xaa10是Pen。在另一实施例中,Xaa10是Cys。在具体实施例中,Xaa11选自由以下各项组成的群组:Tic、Phe(2-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Phe(4-COOH)、Phe-(4-OMe)、Phe(4-tBu)、Phe(4-CN)、N-Me-Phe、N-Me-Tyr、b-homoTrp以及五氟-Phe。在某些实施例中,Xaa11是芳香族氨基酸。在具体实施例中,Xaa12是Aic。在具体实施例中,Xaa13是Pro,并且Xaa11和/或Xaa12存在。在具体实施例中,Xaa14是选自由以下各项组成的群组的氨基酰基残基:天然氨基酸、Dap、Dab、Orn、D-Orn、N-Me-Orn、N-Me-Dap、N-Me-Dab、N-Me Lys、D-Dap、D-Dab、D-Lys、N-Me-D-Lys、适合电子等排体替代物、相应D-氨基酸以及相应N-甲基氨基酸。在至少一个实施例中,Xaa14是C末端。当Xaa14是子单元的C末端时,Xaa14可以经修饰以包括根据本发明的连接子部分。另外,在一些实施例中,Xaa14经N(α)甲基化。对于一些实施例,Xaa1-Xaa5、Xaa7-Xaa9和Xaa11-Xaa12中的任一个经N(α)甲基化。Xaa5可以进一步为Arg-Me-sym或Arg-Me-asym,并且Xaa11可以是O-Me-Tyr、N-Me-Lys(Ac)或4-Me-Phe。在一些情况下,Xaa1-Xaa4和Xaa11-Xaa14中的任一个经酰化。举例来说,在一些情况下,位置Xaa1-Xaa4和Xaa11-Xaa14处的一个或多个残基经选自由以下各项组成的群组的酰化有机化合物酰化:2-甲基-三氟丁基、三氟戊基、乙酰基、辛酰基、丁基、戊基、己基、棕榈基、月桂基、油酰基以及月桂基、三氟甲基丁酸、环戊烷甲酸、环丙基乙酸、4-氟苯甲酸、4-氟苯基乙酸、3-苯基丙酸、四氢-2H-吡喃-4甲酸、丁二酸以及戊二酸。在一些情况下,小PEG(例如PEG4-PEG13)用作酰化之前的间隔基团。在一些情况下,Glu、IsoGlu或Asp用作酰化的间隔基团。
在式(I)(包括I-A、I-B、I-C、I-D、I-E、I-F、I-G、I-H、I-I以及I-J中的任一个)的肽的某些替代实施例中,Xaa14是Cys、HomoCys或Pen,而不是所列的氨基酸。
在本文所述的任何肽(包括(但不限于)式(I)(包括I-A、I-B、I-C、I-D、I-E、I-F、I-G、I-H、I-I以及I-J中的任一个)的那些或式(II)、(II-A)、(III)、(A)、(B)、(C)、(D)、(S)、(X)或(H)的相应残基)的具体实施例中,Xaa5选自由以下各项组成的群组:N-Me-Ar、Phe(4-胍基)、Phe(4-NH2)、N-Me-HomoArg、HomoArg、Tyr以及His;Xaa8选自由以下各项组成的群组:Leu、HomoLeu、Nle以及Val;Xaa9是CPA或Aoc;Xaa11选自由以下各项组成的群组:Tic、Phe(2-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Phe(4-氨甲酰基)、Phe(4-COOH)、Phe(4-OMe)以及Phe(4-tBu);Xaa12选自由以下各项组成的群组:Aic、Gln、Cit、Glu(OMe)、D-His、Tic、Phe(3-COOH)、D-Arg、Bip、D-Trp、Phe、D-Phe、D-Val、D-Thr、D-1-Nal、D-2-Nal、Thr、Val;或Xaa13是Pro。在本文所述的化合物和属中的任一个的具体实施例中,Xaa5选自由以下各项组成的群组:Cit、Phe(4-氨甲酰基)以及N-Me-HomoArg;Xaa8选自由以下各项组成的群组:Leu、HomoLeu、Nle以及Val;Xaa9选自由以下各项组成的群组:Cba、HomoLeu以及Cpa;Xaa11选自由以下各项组成的群组:Tic、Phe(2-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Phe(4-COOH)、Phe(4-OMe)以及Phe(4-tBu);Xaa12选自由以下各项组成的群组:Aic、Gln、Cit、Glu(OMe)、D-His、Tic、Phe(3-COOH)、D-Arg、Bip、D-Trp、Phe、D-Phe、D-Val、D-Thr、D-1-Nal、D-2-Nal、Thr、Val;或Xaa13是Pro。
在一些实施例中,本文所述的任何肽(例如式(I)(包括I-A、I-B、I-C、I-D、I-E、I-F、I-G、I-H、I-I以及I-J中的任一个)或式(II)(包括II-A)或式(III)、式(A)、式(B)或式(C)、式(D)或式(S))的N末端残基或C末端残基进一步包含结合部分,例如连接子部分,包括(但不限于)本文所述的那些中的任一个。在具体实施例中,连接子选自由以下各项组成的群组:DIG、双官能PEG13、双官能PEG25、双官能PEG1K、双官能PEG2K、双官能PEG3.4K、双官能PEG4K、双官能PEG5K、IDA、IDA-Palm、IDA-Boc、IDA-异戊酸、三嗪、三嗪-Boc、间苯二甲酸、1,3-苯二乙酸、1,4-苯二乙酸、戊二酸、壬二酸、庚二酸、十二烷二酸、适合脂肪族化合物、芳香族化合物、杂芳香族化合物以及分子量为约400Da到约40,000Da的聚乙二醇类连接子。当连接子是IDA、ADA或具有游离胺的任何连接子时,其可以使用选自由以下各项组成的群组的酰化有机化合物酰化:2-甲基-三氟丁基、三氟戊基、乙酰基、辛酰基、丁基、戊基、己基、棕榈基、月桂基、油酰基、月桂基、三氟甲基丁酸、环戊烷甲酸、环丙基乙酸、4-氟苯甲酸、4-氟苯基乙酸、3-苯基丙酸、四氢-2H-吡喃-4甲酸、丁二酸以及戊二酸、具有10到20个碳单元的直链脂肪族酸、胆酸和其它胆汁酸。在一些情况下,小PEG(PEG4-PEG13)、Glu、IsoGlu或Asp用作酰化之前的间隔基团。在具体实施例中,连接子是双官能连接子(例如二酸、二胺、二卤化物、N-羟基丁二酰亚胺(NHS)活化的二酯、双-顺丁烯二酰亚胺,其可能能够经胺、酯、硫醚、二硫基或醚键连接两个单体子单元。
本发明的一些实施例进一步包括肽均二聚体或杂二聚体分子,其中二聚体分子的各子单元包含由附图和表中所示的至少一个序列表示的氨基酸序列、基本上由所述氨基酸序列组成或由所述氨基酸序列组成。
本发明进一步包括本文(包括附图)所述的任何肽二聚体的单体子单元。
另外,本发明包括的化合物(包括肽二聚体化合物、肽单体化合物和单体子单元)包含本文(例如在任何化学式中)所述或随附表或图中的任一个所示的任何氨基酸序列中的一个或多个(例如两个),基本上由其组成或由其组成,而例如无需存在任何N末端修饰(例如Ac)或任何C末端修饰(例如NH2)。
本发明进一步包括本文所述的具有替代N末端或C末端基团的任何化合物。举例来说,还涵盖在N末端是氨基酸的未经改变的N末端或存在不同基团的情况下显示N末端Ac基团的那些化合物,并且还涵盖在C末端是氨基酸的未经改变的C末端或存在不同基团的情况下显示C末端NH2基团的那些化合物。
本发明的额外实施例包括的肽二聚体化合物、肽单体化合物和肽包含本文的化学式、表或图中的任一个中所示的任何氨基酸序列,并且可以包括一个或多个额外氨基酸残基。在具体实施例中,肽二聚体化合物的单体子单元、肽单体化合物和肽包含7到35个氨基酸残基、7到30个氨基酸残基、7到25个氨基酸残基、7到20个氨基酸残基、7到19个氨基酸残基、7到18个氨基酸残基、7到17个氨基酸残基、7到16个氨基酸残基、7到15个氨基酸残基、7到14个氨基酸残基、7到13个氨基酸残基或7到12个氨基酸残基。在具体实施例中,本发明包括的肽包含针对表3的SEQ ID No:1-193或表4的SEQ ID No:194-218所示的氨基酸残基,其中所述肽并非必须包括(但可以包括)N末端或C末端修饰、分子内键、连接子或其中所示的其它修饰中的任一个。在具体实施例中,肽在两个残基(例如两个Pen残基)之间包含分子内键(例如二硫键)。本发明进一步包括肽单体化合物、肽二聚体化合物以及包含具有本文所述的氨基酸序列的肽的其它化合物。
本发明进一步包括一种制造本发明的肽化合物的方法,其包含合成具有如本文所述的序列的肽,并且在肽的两个残基之间引入分子内键(或允许形成分子内键)。在具体实施例中,所述方法进一步包括对肽的C末端和N末端中的一个或两个进行修饰。在其它实施例中,所述方法包括使连接子结合到肽。在相关实施例中,本发明包括一种制备肽二聚体化合物的方法,其包含:(i)合成具有如本文所述的序列的肽,并且在肽的两个残基之间引入分子内键(或允许形成分子内键),并且使连接子结合到肽;(ii)合成具有如本文所述的序列(例如与步骤(i)相同的序列)的肽,并且在肽的两个残基之间引入分子内键(或允许形成分子内键);以及(iii)使步骤(i)的肽经附接到步骤(i)的肽的连接子结合到步骤(ii)的肽。
在具体实施例中,本发明包括编码本文所披露的任何肽序列的多核苷酸。在具体实施例中,多核苷酸是DNA、RNA、cDNA或mRNA,包括其单股、双股多核苷酸形式,以及其经修饰的形式。在某些实施例中,本发明包括载体,例如表达载体或基因疗法载体,其包含编码本文所述的任何肽的多核苷酸。载体可以进一步包括可操作地连接于编码本文所述的肽序列的序列的启动子和/或其它调节序列。本发明进一步包括细胞,其包含本文所述的外源性或引入的肽或多核苷酸。
在具体实施例中,本发明包括包含两个连接子单体子单元的肽二聚体化合物,其各自具有以下式(S)的结构:
Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4-Xaa5-Xaa6-Xaa7-Xaa8-Xaa9-Xaa10-Xaa11-Xaa12-Xaa13-Xaa14-Xaa15-Xaa16-Xaa17
式(S)
其中Xaa1--Xaa13对应于本文所述的化学式中的一个(例如式(I)、(IV)中的任一个)中的那些位置处所定义的残基并且其中Xaa13、Xaa14、Xaa15、Xaa16以及Xaa17是不存在或任何氨基酸,其限制条件为C末端氨基酸对应于已定义Xaa1-Xaa13的同一化学式中针对Xaa14所定义的残基。在具体实施例中,Xaa4和Xaa10经二硫键、内酰胺键、烯烃键、***键、硒醚键或二硒键连接。
在具体实施例中,本发明包括包含两个连接子单体子单元的肽二聚体化合物,其各自具有以下式(S')的结构:
Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4-Xaa5-Xaa6-Xaa7-Xaa8-Xaa9-Xaa10-Xaa11-Xaa12-Xaa13
式(S')
其中Xaa1--Xaa9对应于本文所述的化学式中的一个(例如式(II)、(III)、A、B、C或D中的任一个)中的那些位置处所定义的残基并且其中Xaa10、Xaa11、Xaa12以及Xaa13是不存在或任何氨基酸,其限制条件为C末端氨基酸对应于已定义Xaa1-Xaa10的同一化学式中针对Xaa10所定义的残基。在具体实施例中,Xaa1和Xaa7经二硫键、内酰胺键、烯烃键、***键、硒醚键或二硒键连接。
在某些实施例中,肽进一步包含一个或多个修饰基团和/或连接子。在某些实施例中,肽的N或C末端中的一个或两个经修饰。在具体实施例中,N末端经酰化;并且在具体实施例中,C末端包含游离胺,例如NH2。在具体实施例中,C末端包含--OH基团。在具体实施例中,肽在式(I)(包括I-A、I-B、I-C、I-D、I-E、I-F、I-G、I-H、I-I以及I-J中的任一个)的Xaa4和Xaa10之间(或式(II)、(III)、(A)、(B)、(C)或(D)的Xaa1和Xaa7之间)包含分子内键。本发明还包括具有本文所述的任何结构或如附图中的任一个所示的化合物。
另外,本发明的一些实施例包含肽均二聚体或杂二聚体分子,其中二聚体分子的各子单元经二硫键或内酰胺键环化,并且其中二聚体分子的各单体子单元包含附图和表中所示的至少一个序列所表示的氨基酸序列,基本上由所述氨基酸序列组成或由所述氨基酸序列组成。
在某些实施例中,本发明提供包含一个或两个式(III)的经连接的子单元的肽二聚体化合物:
Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4-Xaa5-Xaa6-Xaa7-Xaa8-Xaa9-Xaa10
(式(III))
或其药学上可接受的盐,
其中各子单元在Xaa1和Xaa7之间包含二硫键,并且另外其中式(III)表示二聚体分子的单体子单元,其中单体子单元连接形成根据本发明的二聚体分子,并且其中:
Xaa1是Pen;
Xaa2是N-Me-Arg;
Xaa3是Ser;
Xaa4是Asp;
Xaa5是Thr;
Xaa6是Leu;
Xaa7是Pen;
Xaa8是Trp;
Xaa9不存在或选自由以下各项组成的群组:Glu、D-Glu、β-homoGlu;以及
Xaa10选自由D-Lys和N-Me-Lys组成的群组。
在具体实施例中,Xaa9存在。在式(III)的具体实施例中,Xaa1经酰化。在式(III)的具体实施例中,Xaa10包含NH2或OH。在式(III)的二聚体的具体实施例中,两个单体子单元经其各别C末端经连接子部分(例如DIG)连接。在具体实施例中,肽二聚体化合物是均二聚体。
在一个实施例中,本发明的肽单体化合物或肽二聚体化合物包含式(B)的肽分子:
Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4-Xaa5-Xaa6-Xaa7-Xaa8-Xaa9-Xaa10
(式(B))
或其药学上可接受的盐,其中
Xaa1是Cys或Pen;
Xaa2是N-甲基-Arg;
Xaa3是Ser;
Xaa4是Asp;
Xaa5是Thr;
Xaa6是Leu或Nle;
Xaa7是Cys、Pen或D-Pen;
Xaa8是Trp、Tic、Bip、1-Nal、2-Nal、Phe(4-tBu)或Phe(4-COOH);
Xaa9是Glu、β-homoGlu、D-Glu或Glu(OMe);以及
Xaa10是任何氨基酸,
其中肽分子在Xaa1和Xaa7之间包含二硫键。
在式(B)的具体实施例中,Xaa1和Xaa7中的一个或两个是Pen。
在式(B)的具体实施例中,Xaa10是D-Lys或N-Me-Lys。
在具体实施例中,肽二聚体包含两个式(B)的单体子单元。在具体实施例中,二聚体的一个或两个子单元在Xaa1和Xaa7之间包含分子内键,例如二硫键。
本发明的说明性肽二聚体化合物显示于实例和附图中。肽二聚体化合物一般通过在圆括号中提供肽二聚体化合物的单体子单元的氨基酸序列,后面是小写体2来显示,这表示肽二聚体化合物包含两个具有所描述的氨基酸序列的子单元。连接子也可以显示在序列的C末端来指示两个单体子单元经其C末端连接,或显示于序列的N末端来指示两个单体子单元经其N末端连接。
本发明进一步包括具有本文所述的任何化学式的肽单体子单元。在某些实施例中,肽单体子单元结合于连接子。
本发明的肽二聚体和肽单体化合物可以是游离酸或它们可以是药学上可接受的盐。在具体实施例中,它们是乙酸盐。
在某些实施例中,本发明包括肽二聚体化合物,包括其药学上可接受的盐,其中两个单体子单元经其C末端连接,具有式(X)的结构:
其中R1和R2是H或Me;
n是2到10的任何整数;
X是CH2、NHCO、CONH、S-S、C=O、CHOH、S、S=O、NH或O;以及
Y是连接子部分。
在具体实施例中,连接子部分Y是本文所示的那些中的任一个,包括(但不限于)下文所示的那些中的任一个。在具体实施例中,连接子部分选自DIG、PEG13、PEG25、PEG1K、PEG2K、PEG3.4K、PEG4K、PEG5K、IDA、IDA-Palm、IDA-Boc、IDA-Ac、IDA-异戊酸、ADA三嗪、三嗪-Boc、间苯二甲酸、1,3-苯二乙酸、Glu、Asp、D-Glu、D-Asp、1,4-苯二乙酸、联苯二乙酸、环丙基乙酸、丁二酸、戊二酸、十二烷二酸、适合脂肪族二酸、适合芳香族二酸、杂芳香族化合物以及分子量为约400Da到约40,000Da的聚乙二醇。在具体实施例中,连接子是双官能连接子(例如二酸、二胺、二卤化物、N-羟基丁二酰亚胺(NHS)活化的二酯、双-顺丁烯二酰亚胺,其可能能够经胺、酯、硫醚、二硫基或醚键连接两个单体子单元。
在某些实施例中,式(X)的肽二聚体化合物具有下文所示的结构(化合物X)。
在具体实施例中,式(X)的化合物和化合物X是盐形式。在一个实施例中,它们是乙酸盐。
在某些实施例中,本发明包括肽二聚体化合物,包括其药学上可接受的盐,其中两个单体子单元经其N末端连接,具有式(H)的结构:
其中R1和R2是H或Me;
n是2到10的任何整数;
X是CH2、NHCO、CONH、S-S、C=O、CHOH、S、S=O、NH或O;
Y是连接子部分;以及
Z是NHAc、不存在或H。
在具体实施例中,连接子部分是本文所示的那些中的任一个,包括(但不限于)下文所示的那些。在具体实施例中,连接子部分选自DIG、PEG13、PEG25、PEG1K、PEG2K、PEG3.4K、PEG4K、PEG5K、IDA、IDA-Palm、IDA-Boc、IDA-Ac、IDA-异戊酸、ADA三嗪、三嗪-Boc、间苯二甲酸、1,3-苯二乙酸、Glu、Asp、D-Glu、D-Asp、1,4-苯二乙酸、联苯二乙酸、环丙基乙酸、丁二酸、戊二酸、十二烷二酸、适合脂肪族二酸、适合芳香族二酸、杂芳香族化合物以及分子量为约400Da到约40,000Da的聚乙二醇。在具体实施例中,连接子是双官能连接子(例如二酸、二胺、二卤化物、N-羟基丁二酰亚胺(NHS)活化的二酯、双-顺丁烯二酰亚胺,其可能能够经胺、酯、硫醚、二硫基或醚键连接两个单体子单元。
在某些实施例中,式(H)的肽二聚体化合物具有下文所示的结构(化合物H):
本发明的实施例包括化合物H的药学上可接受的盐形式,例如化合物H的乙酸盐。
在某些具体实施例中,本发明包括肽二聚体化合物,其包含一个或两个包含以下氨基酸序列中的一个的单体子单元,其中肽二聚体的单体子单元经其C末端连接:
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe-(4-COOH)-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-(N-Me-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-Glu-(N-Me-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(D-Lys);或
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-(N-Me-D-Lys),
并且其中在单体子单元中的两个Pen残基之间存在二硫键。
在具体实施例中,单体子单元的肽进一步包含N末端Ac和/或C末端NH2或OH。在具体实施例中,在单体子单元的两个Pen残基之间存在二硫键。
在某些具体实施例中,本发明包括肽二聚体化合物,其包含一个或两个包含以下氨基酸序列中的一个的单体子单元,其中肽二聚体的单体子单元经其N末端或其C末端连接:
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe-(4-COOH)-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu;
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-Glu;
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu);或
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu,
其中二硫键连接单体二聚体子单元内的Pen残基。
在单体子单元经其N末端连接的具体实施例中,它们经结合于各单体子单元的N末端Pen残基的连接子连接。在单体子单元经其N末端连接的其它实施例中,单体子单元包含至少一个额外N末端氨基酸,并且其中单体子单元的N末端氨基酸经连接子连接到另一单体子单元。在具体实施例中,额外N末端氨基酸选自由以下各项组成的群组:具有胺侧链的任何氨基酸、Lys、D-Lys、N-Me-Lys、D-N-Me-Lys、Orn、Dab、Dap、HomoLys、D-Dap、D-Dab、D-Orn、Cys、HomoCys、Pen、D-HomoCys、D-Cys、D-Pen、Asp、Glu、D-Asp、D-Glu以及HomoSer、Asp、Glu、homoGlu、D-Asp、D-Glu、D-homoGlu、N-Me-Glu、N-Me-Asp、N-Me-D-Glu以及N-Me-D-Asp。在具体实施例中,单体子单元的肽进一步包含N末端Ac和/或C末端NH2或OH。
一方面,本发明提供一种式(IV)的肽单体化合物:
Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4-Xaa5-Xaa6-Xaa7-Xaa8-Xaa9-Xaa10-Xaa11-Xaa12-Xaa13-Xaa14(式(IV))
或其药学上可接受的盐,
其中肽化合物在Xaa4和Xaa10之间包含二硫键、内酰胺键、烯烃键、***键、硒醚键或二硒键,其中:
Xaa1是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa2是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa3是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa4是能够与Xaa10形成键的任何氨基酸;
Xaa5选自由以下各项组成的群组:N-Me-Arg、Arg、N-Me-Lys、Phe(4-胍基)、Phe(4-氨甲酰基)、Cit、Phe(4-NH2)、N-Me-HomoArg、homoArg、Tyr、Dap、Dab、Arg-Me-sym、Arg-Me-asym、Cav以及His;
Xaa6是Ser、Gly、Thr或Ile;
Xaa7是Asp、D-Asp、Asp(OMe)或N-Me-Asp;
Xaa8选自由以下各项组成的群组:Thr、Val、Ile、Leu、homoLeu、Gln、Ser、Asp、Pro、Gly、His、Ala、Phe、Lys、Arg、Asn、Glu、Tyr、Trp、Met、Nle以及N-甲基氨基酸,包括N-Me-Thr;
Xaa9选自由以下各项组成的群组:Gln、Ser、Asp、Pro、Gly、Ala、Phe、Glu、Ile、Val、N-丁基Ala、N-戊基Ala、N-己基Ala、环丁基Ala、环戊基Ala、Leu、Nle、Cba、homoLeu、Cpa、Aoc以及N-Me-Leu;
Xaa10是能够与Xaa4形成键的任何氨基酸;
Xaa11不存在或选自由以下各项组成的群组:Trp、Phe、2-Nal、1-Nal、Tyr、His、Phe(4-F)、Phe(4-CF3)、Phe(4-CH3)、Phe(4-tBu)、Bip、Phe(4-COOH)、Gly、3,3-二苯基Gly、3,3-二苯基Ala、Tic、β-homoTrp、D-1-Nal、D-2-Nal、Phe(2,4-二Cl)、Phe(3,4-二Cl)、Phe(4-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Phe(2-氨甲酰基)、Tyr(Me)、HomoPhe、N-Me-Phe、N-Me-Tyr、Ser、Sar、2,3-二氢-Trp、Ile、Leu、Arg、Thr、芳香族氨基酸、经取代的芳香族氨基酸以及Tic;
Xaa12不存在或选自由以下各项组成的群组:芳香族氨基酸、经取代的芳香族氨基酸、Glu、D-Glu、homoGlu、Asp、D-Asp、D-homoGlu、Gla、β-homoGlu、Tic、Aic、Gln、Cit、Glu(OMe)、Asn、D-His、Tic、Phe(3-COOH)、D-Arg、Bip、D-Trp、Phe、D-Phe、D-Val、D-Thr、D-Tyr、D-Lys、D-Ile、D-His、N-Me-Glu、N-Me-Asp、α-homoGlu、联苯基-Gly、联苯基-Ala、homoPhe、D-1-Nal、D-2-Nal、Thr以及Val,以及相应D-氨基酸和电子等排体;
Xaa13是不存在、Pro或任何氨基酸;以及
Xaa14是任何氨基酸。
在式(IV)的某些实施例中,Xaa7是Asp、Asp(OMe)或N-Me-Asp。
在式(IV)的某些实施例中,Xaa12不存在或选自由以下各项组成的群组:芳香族氨基酸、经取代的芳香族氨基酸、Glu、D-Glu、homoGlu、Asp、D-Asp、D-homoGlu、Gla、β-homoGlu、Tic以及相应D-氨基酸和电子等排体。
在式(IV)的某些实施例中,Xaa11选自由以下各项组成的群组:Tic、Phe(2-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Phe(4-COOH)、Phe(4-OMe)、Phe(4-tBu)、Phe(4-CF3)、Phe(3-CF3)、Phe(CF3)、homo-Phe、D-Phe、Phe(2,3-二-Cl)、Phe(3,4-二-Cl)、N-Me-Tyr、N-Me-Phe、Phe(4-F)、Phe(3-F)、Phe(4-Me)、Phe(3-Me)、Phe(2-Me)、Phe(3,4--二-Me)、Phe(2,4-二-Phe)、β-甲基Phe以及联苯基-Ala。
在式(IV)的具体实施例中,Xaa12选自由以下各项组成的群组:Aic、Gln、Cit、Glu(OMe)、Asn、D-His、Tic、Phe(3-COOH)、D-Arg、Bip、D-Trp、Phe、D-Phe、D-Val、D-Thr、D-Tyr、D-Lys、D-Ile、D-His、N-Me-Glu、N-Me-Asp、α-homoGlu、联苯基-Gly、联苯基-Ala、Homo-Phe、D-1-Nal、D-2-Nal、Thr以及Val。
在式(IV)的具体实施例中,Xaa12选自由以下各项组成的群组:芳香族氨基酸、经取代的芳香族氨基酸、Glu、D-Glu、homoGlu、Asp、D-Asp、D-homoGlu、Gla、β-homoGlu、Tic以及相应D-氨基酸和电子等排体。
在式(IV)的某些实施例中,Xaa5选自由以下各项组成的群组:Cit、Phe(4-氨甲酰基)以及N-Me-homoArg;Xaa8选自由以下各项组成的群组:Leu、HomoLeu、Nle以及Val;Xaa9选自由以下各项组成的群组:Cba、HomoLeu以及Cpa;Xaa11选自由以下各项组成的群组:Tic、Phe(2-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Phe(4-COOH)、Phe(4-OMe)以及Phe(4-tBu);Xaa12选自由以下各项组成的群组:Aic、Gln、Cit、Glu(OMe)、D-His、Tic、Phe(3-COOH)、D-Arg、Bip、D-Trp、Phe、D-Phe、D-Val、D-Thr、D-1-Nal、D-2-Nal、Thr、Val;或Xaa13是Pro。在具体实施例中,分子内键是二硫键。
在式(IV)的具体实施例中,Xaa12不存在或选自由以下各项组成的群组:芳香族氨基酸、经取代的芳香族氨基酸、Glu、D-Glu、homoGlu、Asp、D-Asp、D-homoGlu、Gla、β-homoGlu、Tic以及相应D-氨基酸和适合电子等排体;并且Xaa13是不存在或Pro。
在某些实施例中,直接处于Xaa10的C末端的氨基酸残基选自芳香族氨基酸、经取代的芳香族氨基酸以及Tic。在某些实施例中,直接处于Xaa10的C末端的氨基酸是芳香族氨基酸。
在某些实施例中,Xaa14或C末端氨基酸不包含游离胺。
在某些实施例中,Xaa14是Lys、D-Lys、N-Me-Lys、D-N-Me-Lys、Orn、Dab、Dap、HomoLys、D-Dap、D-Dab或D-Orn。
在某些实施例中,Xaa14或C末端包含NH2或OH。
在某些实施例中,C末端氨基酸中的游离胺例如经乙酰基封端。
在某些实施例中,肽在Xaa4和Xaa10之间包含分子内键。在某些实施例中,键是二硫键、内酰胺键、烯烃键、***、硒醚或二硒键。在某些实施例中,键直接存在于两个氨基酸残基之间。
在某些实施例中,Xaa4选自由以下各项组成的群组:Cys、Pen、HomoCys、D-Cys、D-Pen、D-HomoCys、Asp、Glu、HomoGlu、β-Asp、β-Glu、Lys、HomoLys、Orn、Dap、Dap、2-烯丙基甘氨酸、2-(3'-丁烯基)甘氨酸、2-(4'-戊烯基)甘氨酸或2-(5'-己烯基)甘氨酸、相应D--氨基酸和适合电子等排体,并且Xaa10选自由以下各项组成的群组:Cys、Asp、Lys、Glu、Pen、HomoAsp、HomoGlu、HomoCys、D-Cys、D-Pen、HomoLys、Orn、β-Asp、β-Glu、Dap、Dab、D-HomoCys、2-烯丙基甘氨酸、2-(3'-丁烯基)甘氨酸、2-(4'-戊烯基)甘氨酸或2-(5'-己烯基)甘氨酸、相应D-氨基酸和适合电子等排体。
在环肽在Xaa4和Xaa10之间包含二硫键的某些实施例中,Xaa4和Xaa10各自选自由以下各项组成的群组:Cys和Pen。在某些实施例中,Xaa4和Xaa10都是Pen。
在环肽在Xaa4和Xaa10之间包含内酰胺键的某些实施例中,Xaa4和Xaa10各自选自由以下各项组成的群组:Lys、HomoLys、Orn、Dap、Dab、Asp、Glu、HomoGlu、D-Dap、D-Dab、D-Asp、D-Glu或D-Lys。在某些实施例中,Xaa10是Lys、HomoLys、Orn、Dap或Dab;并且Xaa4是Asp、Glu或HomoGlu。在某些实施例中,Xaa4是Lys、HomoLys、Orn、Dap或Dab;并且Xaa10是Asp、Glu或HomoGlu。
在环肽在Xaa4和Xaa10之间包含内酰胺键的某些实施例中,Xaa10选自由以下各项组成的群组:Asp、HAsp、Glu和HGlu、HLys,并且Xaa4选自由以下各项组成的群组:Lys、Dap、Dab、HLys、Orn以及HGl。在某些实施例中,Xaa10选自由以下各项组成的群组:Lys、Dap、Dab、HLys、Orn以及HGlu,并且Xaa4选自由以下各项组成的群组:Asp、HAsp、Glu、HGlu以及HLys。
在某些实施例中,Xaa4选自由以下各项组成的群组:Asp、HAsp、Glu、HGlu以及Hlys,Xaa10选自由以下各项组成的群组:Lys、Dap、Dab、HLys、Orn以及HGlu,并且Xaa4和Xaa10经酰胺键环化。
在环肽在Xaa4和Xaa10之间包含烯烃键的某些实施例中,Xaa4和Xaa10各自选自由以下各项组成的群组:2-烯丙基甘氨酸、2-(3'-丁烯基)甘氨酸、2-(4'-戊烯基)甘氨酸或2-(5'-己烯基)甘氨酸,并且肽经闭环岐化发生环化,获得相应烯烃/“订书钉肽”。
在某些实施例中,Xaa4是Cys、Pen或homoCys。在某些实施例中,Xaa4和Xaa10各自是β-叠氮基-Ala-OH或炔丙基甘氨酸,并且肽经点击化学发生环化,产生***环。
在具体实施例中,分子内键是二硫键或内酰胺键。
一方面,本发明提供一种式(IV')的肽单体化合物:
Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4-Xaa5-Xaa6-Xaa7-Xaa8-Xaa9-Xaa10-Xaa11-Xaa12-Xaa13-Xaa14(式(IV')),
或其药学上可接受的盐,其中:
Xaa1是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa2是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa3是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa4是能够与Xaa10形成键的任何氨基酸;
Xaa5选自由以下各项组成的群组:N-Me-Arg、Arg、N-Me-Lys、Phe(4-胍基)、Phe(4-氨甲酰基)、Cit、Phe(4-NH2)、N-Me-homoArg、homoArg、Tyr Dap、Dab、Arg-Me-sym、Arg-Me-asym、Cav以及His;
Xaa6是Ser Gly、Thr或Ile;
Xaa7是Asp或D-Asp、Asp(OMe)或N-Me-Asp;
Xaa8选自由以下各项组成的群组:Thr、Val、Ile、Leu、homoLeu、Gln、Ser、Asp、Pro、Gly、His、Ala、Phe、Lys、Arg、Asn、Glu、Tyr、Trp、Met、Nle以及N-甲基氨基酸,包括N-Me-Thr;
Xaa9选自由以下各项组成的群组:Gln、Ser、Asp、Pro、Gly、Ala、Phe、Glu、Ile、Val、N-丁基Ala、N-戊基Ala、N-己基Ala、环丁基Ala、环戊基-Ala、Leu、Nle、Cpa、Cba、homoLeu、Aoc以及N-Me-Leu;
Xaa10是能够与Xaa4形成键的任何氨基酸;以及
Xaa11不存在或选自由以下各项组成的群组:Trp、Phe、2-Nal、1-Nal、Tyr、His、Phe(4-F)、Phe(4-CF3)、Phe(4-CH3)、Phe(4-tBu)、Bip、Phe(4-COOH)、Gly、3,3-二苯基Gly、3,3-二苯基Ala、Tic、β-homoTrp、D-1-Nal、D-2-Nal、Phe(2,4-二Cl)、Phe(3,4-二Cl)、Phe(4-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Phe(2-氨甲酰基)、Tyr(Me)、homoPhe、N-Me-Phe、N-Me-Tyr、Ser、Sar、二氢Trp、Ile、Leu、Ser、Arg、Thr、芳香族氨基酸、经取代的芳香族氨基酸以及Tic;
Xaa12不存在或选自由以下各项组成的群组:芳香族氨基酸、经取代的芳香族氨基酸、Glu、D-Glu、homoGlu、Asp、D-Asp、D-homoGlu、Gla、β-homoGlu、Tic以及相应D-氨基酸和适合电子等排体;
Xaa13是不存在或Pro;以及
Xaa14是任何氨基酸。
在式(IV')的具体实施例中,Xaa5选自由以下各项组成的群组:Cit、Phe(4-氨甲酰基)以及N-Me-homoArg;Xaa8选自由以下各项组成的群组:Leu、homoLeu、Nle以及Val;Xaa9选自由以下各项组成的群组:Cba、homoLeu以及Cpa;Xaa11选自由以下各项组成的群组:Tic、Phe(2-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Phe(4-COOH)、Phe(4-OMe)以及Phe(4-tBu);Xaa12选自由以下各项组成的群组:Aic、Gln、Cit、Glu(OMe)、D-His、Tic、Phe(3-COOH)、D-Arg、Bip、D-Trp、Phe、D-Phe、D-Val、D-Thr、D-1-Nal、D-2-Nal、Thr、Val;或Xaa13是Pro。
在多个实施例中,针对式(IV)所述的特征或限制中的任一个可以存在于式(IV')中。
一方面,本发明提供一种式(V)的肽化合物:
Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4-Xaa5-Xaa6-Xaa7-Xaa8-Xaa9-Xaa10
(式(V))
或其药学上可接受的盐,其中肽化合物在Xaa1和Xaa7之间包含二硫键、内酰胺键、烯烃键、***键、硒醚键或二硒键,其中式(V)的Xaa1-Xaa10对应于式(IV)的Xaa4-Xaa13
在式(V)的某些实施例中,Xaa2选自由以下各项组成的群组:Cit、Phe(4-氨甲酰基)以及N-Me-homoArg;Xaa5选自由以下各项组成的群组:Leu、HomoLeu、Nle以及Val;Xaa6选自由以下各项组成的群组:Cba、homoLeu以及Cpa;Xaa8选自由以下各项组成的群组:Tic、Phe(2-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Phe(4-COOH)、Phe(4-OMe)以及Phe(4-tBu);Xaa9选自由以下各项组成的群组:Aic、Gln、Cit、Glu(OMe)、D-His、Tic、Phe(3-COOH)、D-Arg、Bip、D-Trp、Phe、D-Phe、D-Val、D-Thr、D-1-Nal、D-2-Nal、Thr、Val;或Xaa10是Pro。在具体实施例中,分子内键是二硫键或内酰胺键。
在式(IV)的一个实施例(本文称为式(IV-A))中,
Xaa1是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa2是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa3是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa4是Pen;
Xaa5选自由以下各项组成的群组:N-Me-Arg、Arg、N-Me-Lys、Phe(4-胍基)、Phe(4-氨甲酰基氨基)、Cit、Phe(4-NH2)、N-Me-homoArg、homoArg、Tyr以及His;
Xaa6是Ser、Gly、Thr、Ile;
Xaa7是Asp或D-Asp;
Xaa8选自由以下各项组成的群组:Thr、Val、Ile、Leu、homoLeu、Nle以及Val;
Xaa9选自由以下各项组成的群组:Ile、环丁基Ala、环戊基Ala、Leu、Nle、Cpa、homoLeu、Aoc以及N-Me-Leu;
Xaa10是Pen;
Xaa11不存在或选自由以下各项组成的群组:Trp、Phe、2-Nal、1-Nal、Tyr、His、Phe(4-F)、Phe(4-CF3)、Phe(4-CH3)、Phe(4-tBu)、Bip、Phe(4-COOH)、Gly、3,3-二苯基Gly、3,3-二苯基Ala、Tic、β-homoTrp、D-1-Nal、D-2-Nal、Phe(2,4-二Cl)、Phe(3,4-二Cl)、Phe(4-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Phe(2-氨甲酰基)、Tyr(Me)、homoPhe、N-Me-Phe、N-Me-Tyr、Ser、Sar、2,3-二氢Trp、Ile、Leu、Arg以及Thr;
Xaa12不存在或选自由以下各项组成的群组:Glu、D-Glu、homoGlu、Asp、D-Asp、D-homoGlu、D-Asp、Gla、β-homoGlu、相应D-氨基酸、任何芳香族氨基酸以及电子等排体;
Xaa13是不存在或任何氨基酸;以及
Xaa14是任何氨基酸。
在某些实施例中,Xaa4和Xaa10例如经二硫键连接。
在某些实施例中,Xaa7是Asp。
在式(IV)的一个实施例(本文称为式(IV-B))中,
Xaa1是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa2是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa3是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa4是Pen或Cys;
Xaa5是N-Me-Arg;
Xaa6是Ser;
Xaa7是Asp或D-Asp;
Xaa8选自由以下各项组成的群组:Thr、Val、Ile、Leu、homoLeu以及Nle;
Xaa9选自由以下各项组成的群组:Leu、Nle、Cpa、Cba、homoLeu、Aoc以及N-Me-Leu;
Xaa10是Pen或Cys;
Xaa11选自由以下各项组成的群组:Trp、Phe、2-Nal、1-Nal、Tyr、His、Phe(4-F)、Phe(4-CF3)、Phe(4-CH3)、Phe(4-tBu)、Bip、Phe(4-COOH)、Gly、3,3-二苯基Gly、3,3-二苯基Ala、Tic、β-homoTrp、D-1-Nal、D-2-Nal、Phe(2,4-二Cl)、Phe(3,4-二Cl)、Phe(4-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Tyr(Me)、homoPhe、N-Me-Phe、N-Me-Tyr、Ser、Sar、2,3-二氢Trp、Ile、Leu、Arg、Thr、任何经取代的芳香族氨基酸以及相应D-氨基酸;
Xaa12选自由以下各项组成的群组:Glu、D-Glu、homoGlu、Asp、D-Asp、D-homoGlu、Gla、β-homoGlu、相应D-氨基酸以及任何芳香族氨基酸和相应电子等排体;
Xaa13不存在;以及
Xaa14是任何氨基酸。在某些实施例中,Xaa4和Xaa10例如经二硫键或内酰胺键连接。
在具体实施例中,Xaa7是Asp。
在式(IV)的一个实施例(本文称为式(IV-C))中,
Xaa1是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa2是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa3是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa4是Pen;
Xaa5是N-Me-Arg;
Xaa6是Ser、Gly、Thr、Ile;
Xaa7是Asp或D-Asp;
Xaa8选自由以下各项组成的群组:Thr、Val、Ile、Leu、homoLeu以及Nle;
Xaa9选自由以下各项组成的群组:Leu、Nle、Cpa、Cba、homoLeu、Aoc以及N-Me-Leu;
Xaa10是Pen;
Xaa11选自由以下各项组成的群组:Trp、Phe、2-Nal、1-Nal、Tyr、His、Phe(4-F)、Phe(4-CF3)、Phe(4-CH3)、Phe(4-tBu)、Bip、Phe(4-COOH)、Gly、3,3-二苯基Gly、3,3-二苯基Ala、Tic、β-homoTrp、D-1-Nal、D-2-Nal、Phe(2,4-二Cl)、Phe(3,4-二Cl)、Phe(4-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Tyr(Me)、HomoPhe、N-Me-Phe、N-Me-Tyr、Ser、Sar、二氢Trp、Ile、Leu、Ser、Arg以及Thr;
Xaa12选自由以下各项组成的群组:Glu、D-Glu、homoGlu、Asp、D-Asp、D-homoGlu、Gla、β-homoGlu、相应D-氨基酸以及任何芳香族氨基酸和相应电子等排体;
Xaa13是不存在或任何氨基酸;以及
Xaa14是任何氨基酸。
在某些实施例中,Xaa4和Xaa10例如经二硫键或内酰胺键连接。
在具体实施例中,Xaa7是Asp。
在式(IV)的一个实施例(本文称为式(IV-D))中,
Xaa1是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa2是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa3是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa4是Pen;
Xaa5是N-Me-Arg;
Xaa6是Ser;
Xaa7是Asp或D-Asp;
Xaa8是Thr或Val;
Xaa9选自由以下各项组成的群组:Leu、Nle、Cpa、Cba、HomoLeu、Aoc以及N-Me-Leu;
Xaa10是Pen;
Xaa11选自由以下各项组成的群组:Trp、Phe、2-Nal、1-Nal、Tyr、His、Phe(4-F)、Phe(4-CF3)、Phe(4-CH3)、Phe(4-tBu)、Bip、Phe(4-COOH)、Gly、3,3-二苯基Gly、3,3-二苯基Ala、Tic、b-homoTrp、D-1-Nal、D-2-Nal、Phe(2,4-二Cl)、Phe(3,4-二Cl)、Phe(4-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Tyr(Me)、HomoPhe、N-Me-Phe、N-Me-Tyr、Ser、Sar、2,3-二氢Trp、Ile、Leu、Arg以及Thr;
Xaa12不存在或选自由以下各项组成的群组:任何芳香族氨基酸、Glu、D-Glu、homoGlu、Asp、D-Asp、D-homoGlu、Gla、β-homoGlu、相应D-氨基酸以及其电子等排体;
Xaa13不存在;以及
Xaa14是任何氨基酸。
在某些实施例中,Xaa4和Xaa10例如经二硫键连接。
在具体实施例中,Xaa7是Asp。
在式(IV)的一个实施例(本文称为式(IV-E))中,
Xaa1是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa2是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa3是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa4是Pen;
Xaa5是N-Me-Arg;
Xaa6是Ser;
Xaa7是Asp或D-Asp;
Xaa8是Thr或Val;
Xaa9选自由以下各项组成的群组:Leu、Nle、Cpa、Cba、homoLeu、Aoc以及N-Me-Leu;
Xaa10是Pen;
Xaa11选自由以下各项组成的群组:Trp、Phe、2-Nal、1-Nal、Tyr、His、Phe(4-F)、Phe(4-CF3)、Phe(4-CH3)Phe(4-tBu)、Bip、Phe(4-COOH)、Gly、3,3-二苯基Gly、3,3-二苯基Ala、Tic、β-homoTrp、D-1-Nal、D-2-Nal、Phe(2,4-二Cl)、Phe(3,4-二Cl)、Phe(4-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Tyr(Me)、homoPhe、N-Me-Phe、N-Me-Tyr、Ser、Sar、2,3-二氢Trp、Ile、Leu、Arg以及Thr;
Xaa12不存在或选自由以下各项组成的群组:任何芳香族氨基酸、Glu、D-Glu以及β-homoGlu;
Xaa13不存在;以及
Xaa14是任何氨基酸。
在某些实施例中,Xaa4和Xaa10例如经二硫键或内酰胺键连接。
在具体实施例中,Xaa7是Asp。
在式(IV)的一个实施例(本文称为式(IV-F))中,
Xaa1是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa2是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa3是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa4是Pen;
Xaa5是N-Me-Arg;
Xaa6是Ser;
Xaa7是Asp或D-Asp;
Xaa8是Thr或Val;
Xaa9是Leu;
Xaa10是Pen;
Xaa11选自由以下各项组成的群组:Trp、Phe、2-Nal、1-Nal、Tyr、His、Phe(4-F)、Phe(4-CF3)、Phe(4-CH3)、Phe(4-tBu)、Bip、Phe(4-COOH)、Gly、3,3-二苯基Gly、3,3-二苯基Ala、Tic、β-homoTrp、D-1-Nal、D-2-Nal、Phe(2,4-二Cl)、Phe(3,4-二Cl)、Phe(4-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Tyr(Me)、homoPhe、N-Me-Phe、N-Me-Tyr、Ser、Sar、2,3-二氢Trp、Ile、Leu、Arg以及Thr;
Xaa12选自由以下各项组成的群组:任何芳香族氨基酸、Glu、D-Glu、β-homoGlu以及相应D-氨基酸和其电子等排体;
Xaa13不存在;以及
Xaa14是任何氨基酸。
在某些实施例中,Xaa4和Xaa10例如经二硫键或内酰胺键连接。
在具体实施例中,Xaa7是Asp。
在式(IV)的一个实施例(本文称为式(IV-G))中,
Xaa1是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa2是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa3是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa4是Pen;
Xaa5是N-Me-Arg;
Xaa6是Ser;
Xaa7是Asp或D-Asp;
Xaa8是Thr或Val;
Xaa9是Leu;
Xaa10是Pen;
Xaa11选自由以下各项组成的群组:Trp、Phe、2-Nal、1-Nal、Tyr、His、Phe(4-F)、Phe(4-CF3)、Phe(4-CH3)、Phe(4-tBu)、Bip、Phe(4-COOH)、Gly、3,3-二苯基Gly、3,3-二苯基Ala、Tic、b-homoTrp、D-1-Nal、D-2-Nal、Phe(2,4-二Cl)、Phe(3,4-二Cl)、Phe(4-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Tyr(Me)、homoPhe、N-Me-Phe、N-Me-Tyr、Ser、Sar、2,3-二氢Trp、Ile、Leu、Arg以及Thr;
Xaa12选自由以下各项组成的群组:任何芳香族氨基酸、Glu、D-Glu以及β-homoGlu;
Xaa13不存在;以及
Xaa14是任何氨基酸。
在某些实施例中,Xaa4和Xaa10例如经二硫键或内酰胺键连接。
在具体实施例中,Xaa7是Asp。
在式(IV)的一个实施例(本文称为式(IV-H))中,
Xaa1是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa2是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa3是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa4是Pen;
Xaa5是N-Me-Arg;
Xaa6是Ser;
Xaa7是Asp;
Xaa8是Thr或Val;
Xaa9是Leu;
Xaa10是Pen;
Xaa11选自由以下各项组成的群组:Trp、Phe、2-Nal、1-Nal、Tyr、His、Phe(4-F)、Phe(4-CF3)、Phe(4-CH3)、Phe(4-tBu)、Bip、Phe(4-COOH)、Gly、3,3-二苯基Gly、3,3-二苯基Ala、Tic、β-homoTrp、D-1-Nal、D-2-Nal、Phe(2,4-二Cl)、Phe(3,4-二Cl)、Phe(4-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Tyr(Me)、HomoPhe、N-Me-Phe、N-Me-Tyr、Ser、Sar、2,3-二氢Trp、Ile、Leu、Ser、Arg或Thr;
Xaa12选自由以下各项组成的群组:任何芳香族氨基酸、Glu、D-Glu以及β-homoGlu;
Xaa13不存在;以及
Xaa14是任何氨基酸。
在某些实施例中,Xaa4和Xaa10例如经二硫键连接。
在式(IV)的一个实施例(本文称为式(IV-I))中,
Xaa1是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa2是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa3是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa4是Pen;
Xaa5是N-Me-Arg;
Xaa6是Ser;
Xaa7是Asp或D-Asp;
Xaa8是Thr或Val;
Xaa9是Leu;
Xaa10是Pen;
Xaa11选自由以下各项组成的群组:Trp、Phe、2-Nal、1-Nal、Tyr、His、Phe(4-F)、Phe(4-CF3)、Phe(4-CH3)、Phe(4-tBu)、Bip、Phe(4-COOH)、Gly、3,3-二苯基Gly、3,3-二苯基Ala、Tic、β-homoTrp、D-1-Nal、D-2-Nal、Phe(2,4-二Cl)、Phe(3,4-二Cl)、Phe(4-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Tyr(Me)以及homoPhe;
Xaa12选自由以下各项组成的群组:任何芳香族氨基酸、Glu、D-Glu以及β-homoGlu;
Xaa13不存在;以及
Xaa14是任何氨基酸。在某些实施例中,Xaa4和Xaa10例如经二硫键或内酰胺键连接。
在具体实施例中,Xaa7是Asp。
在式(IV)的一个实施例(本文称为式(IV-J))中,
Xaa1是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa1是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa1是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa4是Pen;
Xaa5是N-Me-Arg;
Xaa6是Ser;
Xaa7是Asp;
Xaa8是Thr;
Xaa9是Leu;
Xaa10是Pen;
Xaa11是Phe(4-tBu)
Xaa12是β-homoGlu;
Xaa13不存在;
并且Xaa14是D-Lys。
在式(IV-J)的具体实施例中,Xaa4和Xaa10经二硫键连接。
在式(IV-A)、(IV-B)、(IV-C)、(IV-D)、(IV-E)、(IV-F)、(IV-G)、(IV-H)、(IV-I)或(IV-J)中的任一个的某些实施例中,Xaa14选自由以下各项组成的群组:Lys、D-Lys、N-Me-Lys、D-N-Me-Lys。
在一个实施例中,本发明的肽单体化合物或肽二聚体化合物包含式(C)的肽分子:
Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4-Xaa5-Xaa6-Xaa7-Xaa8-Xaa9-Xaa10
(式(C))
或其药学上可接受的盐,其中
Xaa1是Cys或Pen;
Xaa2是N-甲基-Arg;
Xaa3是Ser;
Xaa4是Asp;
Xaa5是Thr或Val;
Xaa6是Leu或Nle;
Xaa7是Cys或Pen;
Xaa8是Trp、Tic、Bip、1-Nal、2-Nal、Phe(4-tBu)、Phe、Tyr或Phe(4-COOH);
Xaa9是Glu、β-homoGlu或D-Glu;以及
Xaa10是任何氨基酸,
其中肽分子在Xaa1和Xaa7之间包含二硫键。
在式(C)的具体实施例中,Xaa10是D-Lys、N-Me-Lys或N-Me-D-Lys。在具体实施例中,Xaa1和/或Xaa7是Pen。
在某些实施例中,肽的Xaa10或C末端包含NH2或OH。
在某些实施例中,C末端氨基酸中的游离胺例如经乙酰基封端。
本发明的说明性肽单体化合物显示于实例和附图中。在某些实施例中,肽单体化合物具有下文所示的结构(化合物U)。在具体实施例中,化合物U是药学上可接受的盐形式。在一个实施例中,它是乙酸盐。
本发明的一些序列来源于式(IV)(包括IV-A、IV-B、IV-C、IV-D、IV-E、IV-F、IV-G、IV-H、IV-I以及IV-J中的任一个)、式(V)、式(A)、式(B)、式(C)或式(D)中提供的通用序列。举例来说,由式(IV)的Xaa4-Xaa13或式(V)、(VI)、(A)、(B)、(C)或(D)的Xaa1-Xaa10表示的十肽的N末端可以经一到三个如式(IV)的Xaa1、Xaa2以及Xaa3表示的适合基团修饰。N末端可以进一步经酰化。在具体实施例中,N末端可以用选自由以下各项组成的群组的酰化有机化合物酰化:2-甲基-三氟丁基、三氟戊基、乙酰基、辛酰基、丁基、戊基、己基、棕榈基、月桂基、油酰基以及月桂基、三氟甲基丁酸、环戊烷甲酸、环丙基乙酸、4-氟苯甲酸、4-氟苯基乙酸、3-苯基丙酸、四氢-2H-吡喃-4甲酸、丁二酸以及戊二酸。在一些情况下,小PEG(例如PEG4-PEG13)用作酰化之前的间隔基团。在一些情况下,Glu、IsoGlu或Asp用作酰化的间隔基团。在一些实施例中,式(IV)(包括I-A、I-B、I-C、I-D、I-E、I-F、I-G、I-H以及I-I中的任一个)的Xaa1、Xaa2以及Xaa3不存在。在其它实施例中,Xaa1不存在,并且Xaa2和Xaa3表示用于修饰肽(例如式(IV)的残基Xaa4-Xaa13和式(V)的残基Xaa1-Xaa10表示的十肽)的N末端的适合基团。另外,在一些实施例中,式(IV)(包括IV-A、IV-B、IV-C、IV-D、IV-E、IV-F、IV-G、IV-H、IV-I以及IV-J中的任一个)的Xaa1和Xaa2不存在,并且式(IV)(包括IV-A、IV-B、IV-C、IV-D、IV-E、IV-F、IV-G、IV-H、IV-I以及IV-J中的任一个)的Xaa3表示用于修饰十肽子单元的N末端的单个适合基团。在一些实施例中,式(IV)(包括IV-A、IV-B、IV-C、IV-D、IV-E、IV-F、IV-G、IV-H、IV-I以及IV-J中的任一个)的Xaa1和Xaa2不存在,并且式(IV)的Xaa3是Ac。在一些实施例中,式(IV)、(V)、(VI)、(A)、(B)、(C)或(D)的肽的N末端氨基酸残基经酰化。在具体实施例中,N末端可以用选自由以下各项组成的群组的酰化有机化合物酰化:2-甲基-三氟丁基、三氟戊基、乙酰基、辛酰基、丁基、戊基、己基、棕榈基、月桂基、油酰基以及月桂基、三氟甲基丁酸、环戊烷甲酸、环丙基乙酸、4-氟苯甲酸、4-氟苯基乙酸、3-苯基丙酸、四氢-2H-吡喃-4甲酸、丁二酸以及戊二酸。在一些情况下,小PEG(例如PEG4-PEG13)用作酰化之前的间隔基团。在一些情况下,Glu、IsoGlu或Asp用作酰化的间隔基团。
类似地,肽,例如式(IV)(包括IV-A、IV-B、IV-C、IV-D、IV-E、IV-F、IV-G、IV-H、IV-I以及IV-J中的任一个)、式(V)、式(VI)、式(A)、式(B)、式(C)或式(D)表示的肽的C末端可以经适合基团修饰。C末端可以进一步经酰化。在具体实施例中,C末端可以用选自由以下各项组成的群组的酰化有机化合物酰化:2-甲基-三氟丁基、三氟戊基、乙酰基、辛酰基、丁基、戊基、己基、棕榈基、月桂基、油酰基以及月桂基、三氟甲基丁酸、环戊烷甲酸、环丙基乙酸、4-氟苯甲酸、4-氟苯基乙酸、3-苯基丙酸、四氢-2H-吡喃-4甲酸、丁二酸以及戊二酸。在一些情况下,小PEG(例如PEG4-PEG13)用作酰化之前的间隔基团。在一些情况下,Glu、IsoGlu或Asp用作酰化的间隔基团。在式(IV)(包括IV-A、IV-B、IV-C、IV-D、IV-E、IV-F、IV-G、IV-H、IV-I以及IV-J中的任一个)的肽的某些实施例中,Xaa11、Xaa12以及Xaa13不存在。在其它实施例中,Xaa12和Xaa13不存在。在其它实施例中,Xaa13不存在。在具体实施例中,Xaa14是肽的C末端氨基酸。在具体实施例中,Xaa14经修饰。在某些实施例中,Xaa14是赖氨酸、D-赖氨酸、N-甲基-赖氨酸、Dap或Dab。在具体实施例中,Xaa14是Dap或Dab。在某些实施例中,Xaa14包含NH2部分。
在一些实施例中,Xaa1-Xaa4中的任何一个或多个经酰化。在具体实施例中,Xaa1-Xaa4中的任何一个或多个用选自由以下各项组成的群组的酰化有机化合物酰化:2-甲基-三氟丁基、三氟戊基、乙酰基、辛酰基、丁基、戊基、己基、棕榈基、月桂基、油酰基以及月桂基、三氟甲基丁酸、环戊烷甲酸、环丙基乙酸、4-氟苯甲酸、4-氟苯基乙酸、3-苯基丙酸、四氢-2H-吡喃-4甲酸、丁二酸以及戊二酸。在一些情况下,小PEG(例如PEG4-PEG13)用作酰化之前的间隔基团。在一些情况下,Glu、IsoGlu或Asp用作酰化的间隔基团。
在Xaa4和Xaa10都是Cys或Pen的某些实施例中,肽经Xaa4和Xaa10之间的二硫键或内酰胺键环化。优选地,在一个实施例中,Xaa4是Cys。在另一实施例中,Xaa4优选是Pen。在具体实施例中,Xaa4是Pen;在其它实施例中,Xaa10是Pen;在其它实施例中,Xaa4和Xaa10都是Pen。
在本文所述的肽二聚体或单体化合物中的任一个的某些实施例中,Xaa5是N-Me-Arg。在某些实施例中,Xaa6是Ser。在某些实施例中,Xaa7是Asp。在某些实施例中,Xaa8是Thr。在某些实施例中,Xaa9是Leu。在一个实施例中,Xaa10是Pen。在另一实施例中,Xaa10是Cys。在具体实施例中,Xaa11选自由以下各项组成的群组:Tic、Phe(2-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Phe(4-COOH)、Phe-(4-OMe)、Phe(4-tBu)、Phe(4-F)、Phe(4-CN)、N-Me-Phe、N-Me-Tyr、β-homoTrp以及五氟-Phe。在具体实施例中,Xaa12Glu、D-Glu、βhomoGlu,在具体实施例中,Xaa13是Pro,并且Xaa11和/或Xaa12存在,在具体实施例中,Xaa14是选自由以下各项组成的群组的氨基酰基残基:天然氨基酸、Dap、Dab、Orn、D-Orn、N-Me-Orn、N-Me-Dap、N-Me-Dab、N-Me Lys、D-Dap、D-Dab、D-Lys、N-Me-D-Lys、电子等排体替代物、相应D-氨基酸以及相应N-甲基氨基酸。在至少一个实施例中,Xaa14是C末端。当Xaa14是子单元的C末端时,Xaa14可以经修饰以包括根据本发明的连接子部分。另外,在一些实施例中,Xaa14经N(α)甲基化。对于一些实施例,Xaa1-Xaa5、Xaa7-Xaa9和Xaa11-Xaa12中的任一个经N(α)甲基化。Xaa5可以进一步为Arg-Me-sym或Arg-Me-asym,并且Xaa11可以是O-Me-Tyr、N-Me-Lys(Ac)或4-Me-Phe。在一些情况下,Xaa1-Xaa4和Xaa11-Xaa14中的任一个经酰化。举例来说,在一些情况下,位置Xaa1-Xaa4和Xaa11-Xaa14处的一个或多个残基经选自由以下各项组成的群组的酰化有机化合物酰化:2-甲基-三氟丁基、三氟戊基、乙酰基、辛酰基、丁基、戊基、己基、棕榈基、月桂基、油酰基以及月桂基、三氟甲基丁酸、环戊烷甲酸、环丙基乙酸、4-氟苯甲酸、4-氟苯基乙酸、3-苯基丙酸、四氢-2H-吡喃-4甲酸、丁二酸以及戊二酸。在一些情况下,小PEG(例如PEG4-PEG13)用作酰化之前的间隔基团。在一些情况下,Glu、IsoGlu或Asp用作酰化的间隔基团。
在本文所述的任何肽(包括(但不限于)式(IV)(包括IV-A、IV-B、IV-C、IV-D、IV-E、IV-F、IV-G、IV-H以及IV-I中的任一个)的那些或式(V)、(IV-A)、(A)、(B)、(C)或(D)的相应残基)的具体实施例中,Xaa5选自由以下各项组成的群组:N-Me-Ar、Phe(4-胍基)、Phe(4-NH2)、N-Me-homoArg、homoArg、Tyr以及His;Xaa8选自由以下各项组成的群组:Leu、homoLeu、Nle以及Val;Xaa9是CPA或Aoc;Xaa11选自由以下各项组成的群组:Tic、Phe(2-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Phe(4-氨甲酰基)、Phe(4-COOH)、Phe(4-OMe)以及Phe(4-tBu);Xaa12选自由以下各项组成的群组:Aic、Gln、Cit、Glu(OMe)、D-His、Tic、Phe(3-COOH)、D-Arg、Bip、D-Trp、Phe、D-Phe、D-Val、D-Thr、D-1-Nal、D-2-Nal、Thr、Val;或Xaa13是Pro。
在本文所述的化合物和属中的任一个的具体实施例中,Xaa5选自由以下各项组成的群组:Cit、Phe(4-氨甲酰基)以及N-Me-homoArg;Xaa8选自由以下各项组成的群组:Leu、homoLeu、Nle以及Val;Xaa9选自由以下各项组成的群组:Cba、homoLeu以及Cpa;Xaa11选自由以下各项组成的群组:Tic、Phe(2-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Phe(4-COOH)、Phe(4-OMe)以及Phe(4-tBu);Xaa12选自由以下各项组成的群组:Aic、Gln、Cit、Glu(OMe)、D-His、Tic、Phe(3-COOH)、D-Arg、Bip、D-Trp、Phe、D-Phe、D-Val、D-Thr、D-1-Nal、D-2-Nal、Thr、Val;或Xaa13是Pro。
在一些实施例中,本文所述的肽中的任一个,例如式(IV)(包括IV-A、IV-B、IV-C、IV-D、IV-E、IV-F、IV-G、IV-H以及IV-I中的任一个)或式(V)(包括V-A)、式(VI)、式(A)、式(B)、式(C)或式(D)的C末端残基进一步包含选自由以下各项组成的群组的连接子部分:DIG、PEG13、PEG25、PEG1K、PEG2K、PEG3.4K、PEG4K、PEG5K、IDA、IDA-Palm、IDA-Boc、IDA-异戊酸、三嗪、三嗪-Boc、间苯二甲酸、1,3-苯二乙酸、1,4-苯二乙酸、戊二酸、壬二酸、庚二酸、十二烷二酸、适合脂肪族化合物、芳香族化合物、杂芳香族化合物以及分子量为约400Da到约40,000Da的聚乙二醇类连接子。
本发明的一些实施例进一步包括肽单体,其中所述肽单体包含由附图和表中所示的至少一个序列表示的氨基酸序列、基本上由所述氨基酸序列组成或由所述氨基酸序列组成。
另外,本发明包括的化合物包含本文所述或附图中的任一个所示的氨基酸序列中的任一个,基本上由其组成或由其组成。在某些实施例中,肽进一步包含一个或多个修饰基团和/或连接子。在某些实施例中,肽的N或C末端中的一个或两个经修饰。在具体实施例中,N末端经酰化。在一些实施例中,N末端用选自由以下各项组成的群组的酰化有机化合物酰化:2-甲基-三氟丁基、三氟戊基、乙酰基、辛酰基、丁基、戊基、己基、棕榈基、月桂基、油酰基以及月桂基、三氟甲基丁酸、环戊烷甲酸、环丙基乙酸、4-氟苯甲酸、4-氟苯基乙酸、3-苯基丙酸、四氢-2H-吡喃-4甲酸、丁二酸以及戊二酸。在一些情况下,小PEG(例如PEG4-PEG13)用作酰化之前的间隔基团。在一些情况下,Glu、IsoGlu或Asp用作酰化的间隔基团。在具体实施例中,C末端包含游离胺,例如NH2。在具体实施例中,肽例如在式(IV)的Xaa4和Xaa10之间(或式(V)、(VI)、(A)、(B)、(C)以及(D)中的Xaa1和Xaa7之间)包含分子内键。本发明还包括具有本文所述的任何结构或如附图中的任一个所示的化合物。
在某些实施例中,本发明提供式(VI)的肽:
Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4-Xaa5-Xaa6-Xaa7-Xaa8-Xaa9-Xaa10
(式(VI))
或其药学上可接受的盐,在Xaa1和Xaa7之间包含二硫键,并且其中:
Xaa1是Pen;
Xaa2是N-Me-Arg;
Xaa3是Ser;
Xaa4是Asp;
Xaa5是Thr;
Xaa6是Leu;
Xaa7是Pen;
Xaa8是Trp;
Xaa9不存在或选自由以下各项组成的群组:Glu、D-Glu、β-homoGlu;以及
Xaa10是任何氨基酸。
在具体实施例中,Xaa1和Xaa7经二硫键连接。
在具体实施例中,Xaa10选自由以下各项组成的群组:D-Lys、N-Me-Lys以及D-N-Me-Lys。
在具体实施例中,Xaa9存在。
在式(VI)的具体实施例中,Xaa1经酰化。在一些实施例中,Xaa1用选自由以下各项组成的群组的酰化有机化合物酰化:2-甲基-三氟丁基、三氟戊基、乙酰基、辛酰基、丁基、戊基、己基、棕榈基、月桂基、油酰基以及月桂基、三氟甲基丁酸、环戊烷甲酸、环丙基乙酸、4-氟苯甲酸、4-氟苯基乙酸、3-苯基丙酸、四氢-2H-吡喃-4甲酸、丁二酸以及戊二酸。在一些情况下,小PEG(例如PEG4-PEG13)用作酰化之前的间隔基团。在一些情况下,Glu、IsoGlu或Asp用作酰化的间隔基团。在式(VI)的具体实施例中,Xaa10包含NH2或OH。
在一个实施例中,本发明的肽单体化合物或肽二聚体化合物包含式(D)的肽分子:
Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4-Xaa5-Xaa6-Xaa7-Xaa8-Xaa9-Xaa10
(式(D))
或其药学上可接受的盐,其中
Xaa1是Cys或Pen;
Xaa2是N-甲基-Arg;
Xaa3是Ser;
Xaa4是Asp;
Xaa5是Thr;
Xaa6是Leu或Nle;
Xaa7是Cys、Pen或D-Pen;
Xaa8是Trp、Tic、Bip、1-Nal、2-Nal、Phe(4-tBu)或Phe(4-COOH);
Xaa9是Glu、β-homoGlu、D-Glu或Glu(OMe);以及
Xaa10是任何氨基酸,
其中肽分子在Xaa1和Xaa7之间包含一键。
在式(D)的具体实施例中,Xaa1和Xaa7中的一个或两个是Pen。
在式(D)的具体实施例中,Xaa7是Cys或Pen。
在式(D)的具体实施例中,Xaa10是D-Lys或N-Me-Lys。
在式(D)的某些实施例中,肽的Xaa10或C末端包含NH2或OH。在某些实施例中,C末端氨基酸中的游离胺例如经乙酰基封端。在式(D)的具体实施例中,Xaa1经酰化。在一些实施例中,Xaa1用选自由以下各项组成的群组的酰化有机化合物酰化:2-甲基-三氟丁基、三氟戊基、乙酰基、辛酰基、丁基、戊基、己基、棕榈基、月桂基、油酰基以及月桂基、三氟甲基丁酸、环戊烷甲酸、环丙基乙酸、4-氟苯甲酸、4-氟苯基乙酸、3-苯基丙酸、四氢-2H-吡喃-4甲酸、丁二酸以及戊二酸。在一些情况下,小PEG(例如PEG4-PEG13)用作酰化之前的间隔基团。在一些情况下,Glu、IsoGlu或Asp用作酰化的间隔基团。在式(D)的具体实施例中,Xaa10包含NH2或OH。
在本文的任何肽单体化合物(包括式(IV)(包括(IV-A)-(IV-J))、式(V)、式(VI)、式(C)以及式(D)中的任一个的肽单体化合物)的替代实施例中,C末端氨基酸(例如Xaa14或Xaa10)选自由以下各项组成的群组:具有胺侧链的任何氨基酸、Lys、D-Lys、N-Me-Lys、D-N-Me-Lys、Orn、Dab、Dap、HomoLys、D-Dap、D-Dab、D-Orn、Cys、HomoCys、Pen、D-HomoCys、D-Cys、D-Pen、Asp、Glu、D-Asp、D-Glu以及HomoSer、Asp、Glu、homoGlu、D-Asp、D-Glu、D-homoGlu、N-Me-Glu、N-Me-Asp、N-Me-D-Glu以及N-Me-D-Asp。在本文的肽单体化合物(包括式(IV)(包括(IV-A)-(IV-J))、式(V)、式(VI)、式(C)以及式(D)中的任一个的肽单体化合物)的其它替代实施例中,C末端氨基酸(例如Xaa14或Xaa10)、C末端残基选自由以下各项组成的群组:Asp、Glu、homoGlu、D-Asp、D-Glu、D-homoGlu、N-Me-Glu、N-Me-Asp、N-Me-D-Glu以及N-Me-D-Asp。
在其它实施例中,本发明包括包含氨基酸序列或具有实例或任何附图中所示的结构的肽单体中的任一个。在某些实施例中,这些序列可以在形成分子内键的位置(例如式(IV)的Xaa4和Xaa10)处包括不同氨基酸残基,包括本文所述的那些中的任一个,以允许形成特定类型的键,例如二硫键、内酰胺、烯烃、***(例如点击化学)、硒醚或二硒键。
本发明进一步包含的肽包含本文所述的氨基酸序列中的任一个(例如随附表或图中所示的氨基酸序列中的任一个)或由其组成,但不存在任何连接子。另外,其包括的这类肽具有天然N末端和/或C末端、本文描绘的N末端和/或C末端修饰或其它N末端或C末端修饰。
在某些实施例中,肽的Xaa10或C末端包含NH2或OH。在某些实施例中,C末端氨基酸中的游离胺例如经乙酰基封端。在式(B)的具体实施例中,Xaa1经酰化。在一些实施例中,Xaa1用选自由以下各项组成的群组的酰化有机化合物酰化:2-甲基-三氟丁基、三氟戊基、乙酰基、辛酰基、丁基、戊基、己基、棕榈基、月桂基、油酰基以及月桂基、三氟甲基丁酸、环戊烷甲酸、环丙基乙酸、4-氟苯甲酸、4-氟苯基乙酸、3-苯基丙酸、四氢-2H-吡喃-4甲酸、丁二酸以及戊二酸。在一些情况下,小PEG(例如PEG4-PEG13)用作酰化之前的间隔基团。在一些情况下,Glu、IsoGlu或Asp用作酰化的间隔基团。在式(B)的具体实施例中,Xaa10包含NH2或OH。在式(B)的二聚体的具体实施例中,两个单体子单元经其各别C末端经连接子部分(例如DIG)连接。在多个实施例中,肽可以进一步包含一个或多个连接子或例如附接到C和/或N末端的其它修饰基团。
在其它实施例中,本发明包括包含氨基酸序列或具有实例和附图中的任一个所示的结构的肽单体中的任一个。在某些实施例中,这些序列可以在形成分子内键的位置(例如式(IV)的Xaa4和Xaa10)处包括不同氨基酸残基,包括本文所述的那些中的任一个,以允许形成特定类型的键,例如二硫键、内酰胺、烯烃、***(例如点击化学)、硒醚或二硒键。
在其它实施例中,Xaa4选自由Cys或Pen组成的群组。在一些实施例中,Xaa10选自由Cys或Pen组成的群组。在具体实施例中,Xaa5选自由以下各项组成的群组:Phe(4-胍基)、Phe(4-NH2)、N-Me-homoArg、homoArg、Tyr以及His;Xaa8选自由以下各项组成的群组:Leu、homoLeu、Nle以及Val;Xaa9是CPA或Aoc;Xaa10是homoCys;Xaa11选自由以下各项组成的群组:Tic、Phe(2-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Phe(4-氨甲酰基)、Phe(4-COOH)、Phe(4-OMe)以及Phe(4-tBu);Xaa12选自由以下各项组成的群组:Aic、Gln、Cit、Glu(OMe)、D-His、Tic、Phe(3-COOH)、D-Arg、Bip、D-Trp、Phe、D-Phe、D-Val、D-Thr、D-1-Nal、D-2-Nal、Thr、Val;或Xaa13是Pro。
另外,应理解针对本文所述的化合物或化学式中的任一个所述的专有特征中的任一个可以并入本文所述的任何其它化合物或化学式中。另外,本文所述的组合物或方法中的任一个可以使用本文所述的任何化合物或本文所述的任何化学式的化合物进行实践。
在本文所述的多种化学式中的任一个的具体实施例中,不包括具有与PCT/US2013/064439、PCT/US2014/032391或PCT/US2014/032392中所披露相同的结构或序列的肽。
在某些实施例中,本发明包括的肽包含本文所述的任何肽中存在的氨基酸序列中的任一个。在具体实施例中,本发明包括的肽包含以下氨基酸序列中的一个或由以下氨基酸序列中的一个组成。在具体实施例中,本发明包括的肽单体化合物包含以下氨基酸序列中的一个或由以下氨基酸序列中的一个组成。在具体实施例中,本发明包括的肽二聚体化合物包含具有以下氨基酸序列中的一个的单体子单元或由所述单体子单元组成:
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe-(4-COOH)-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-(N-Me-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-Glu-(N-Me-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(D-Lys);或
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-(N-Me-D-Lys)。
在某些实施例中,本发明的任何肽包含10-35、10-30、10-25、10-20或10-15个氨基酸。在具体实施例中,肽内的Pen残基经二硫键连接。
在某些实施例中,本发明包括的肽单体化合物包含具有以下序列中的任一个的肽,其中在某些实施例中,肽单体化合物进一步包含N末端Ac和/或C末端NH2或OH:
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe-(4-COOH)-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu;
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-Glu;
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu);或
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu。
在具体实施例中,肽单体化合物内的Pen残基经二硫键连接。
肽结构和生物活性
本发明提供多种新颖拮抗剂肽。已经测试出这些化合物更明确表征针对α4β7结合的增加的亲和力、针对α4β1的增加的选择性以及在模拟肠液(SIF)中的增加的稳定性。这些新颖拮抗剂分子展示对α4β7的高结合亲和力,由此防止α4β7和MAdCAM配位体之间的结合。因此,这些拮抗剂肽已经显示有效消除和/或减轻多种实验中的发炎过程。
本发明因此提供多种单体和二聚体肽化合物,其与血清和SIF中的α4β7整合素结合或缔合以中断或阻断α4β7和MAdCAM配位体之间的结合。多种本发明的肽化合物可以由天然氨基酸单独建构。或者,肽化合物可以包括非天然氨基酸,包括(但不限于)经修饰的氨基酸。经修饰的氨基酸包括已经化学修饰以包括所述氨基酸上天然不存在的基团或化学部分的天然氨基酸。本发明的肽化合物可以另外包括D-氨基酸。另外,本发明的肽化合物可以包括氨基酸类似物。
在某些实施例中,本发明的肽分子抑制或减少α4β7和MAdCAM配位体之间的结合。在某些实施例中,与阴性对照肽相比,本发明的肽使α4β7和MAdCAM配位体的结合减少至少20%、至少30%、至少40%、至少50%、至少60%、至少70%、至少80%或至少90%。测定结合的方法在所属领域中已知并且包括例如ELISA分析。
在某些实施例中,本发明的肽分子在结合于α4β7或抑制α4β7与其受体结合方面的IC50<500nM、<250nM、<100nM、<50nM、<25nM、<10nM、<5nM、<3nM或<2nM。测定活性的方法在所属领域中已知并且包括随附实例中所述的那些中的任一个。
某些肽二聚体化合物和肽单体化合物(例如含有二硫键的二聚体和单体)已经显示胃肠稳定并且提供针对α4β7整合素高水平的特异性和亲和力。本发明的一些实施例提供在暴露于模拟肠道流体(SIF)时半衰期超过60分钟的肽单体化合物或肽二聚体化合物。一些实施方案进一步提供在SIF中半衰期为约1分钟到约60分钟的肽单体化合物或肽二聚体化合物。本发明的一些实施例提供当暴露于SIF时半衰期超过180分钟的肽分子。一些实施方案进一步提供在SIF中半衰期为约60分钟到约180分钟的肽分子。类似地,这些肽在还原条件下稳定,并且在某些实施例中,当在DTT(二硫苏糖醇)分析法中测试时半衰期>120min。
在某些实施例中,本发明的肽单体或二聚体与对照肽相比具有增加的稳定性、增加的胃肠稳定性、在模拟肠液(stimulated intestinal fluid,SIF)中增加的稳定性或在模拟胃液(SGF)中增加的稳定性。在具体实施例中,对照肽是具有与肽相同或高度相关氨基酸序列(例如>90%序列一致性),但不形成环状结构(例如经二硫键或内酰胺键)的肽。在具体实施例中,对照肽是具有与肽相同或高度相关氨基酸序列(例如>90%序列一致性)但经两个Cys残基(例如与两个Pen残基相对)形成二硫键的肽。在具体实施例中,肽和对照肽之间仅有的差异在于肽包含向肽中引入一个或多个氨基酸残基的一个或多个氨基酸取代,其中引入的残基与肽中的另一残基形成二硫键或内酰胺键。
测定肽稳定性的方法在所属领域中已知。在某些实施例中,肽的稳定性例如随附实例中所述使用SIF分析法、SGF分析法、DTT分析法或Cys/CysS分析法测定。在具体实施例中,本发明的肽在指定条件设定(例如温度)下暴露于SIF或SGF时的半衰期超过1分钟、超过10分钟、超过20分钟、超过30分钟、超过60分钟、超过90分钟、超过120分钟、超过3小时或超过四小时。在某些实施例中,温度是约25℃、约4℃或约37℃,并且pH是生理pH,或pH约7.4。
在一些实施例中,使用所属领域中已知的任何适合方法体外测量半衰期,例如在一些实施例中,本发明的肽的稳定性通过在37℃下用预先升温的人类血清(Sigma)培育肽来测定。在多个时间点(通常高达24小时)取得样品,并且通过分离肽单体或二聚体与血清蛋白,接着使用LC-MS分析所关注的肽的存在来分析样品的稳定性。
在一些实施例中,本发明的肽与对照肽相比展现改良的溶解度或改良的聚集特征。溶解度可以通过所属领域中已知的任何适合方法测定。在一些实施例中,所属领域中已知的测定溶解度的适合方法包括在多种缓冲液(乙酸盐pH4.0、乙酸盐pH5.0、Phos/柠檬酸盐pH5.0、Phos柠檬酸盐pH6.0、Phos pH 6.0、Phos pH 7.0、Phos pH7.5、强PBS pH 7.5、Tris pH7.5、Tris pH 8.0、甘氨酸pH 9.0、水、乙酸(pH 5.0和所属领域中已知的其它pH值)中培育肽并且使用标准技术测试聚集或溶解度。这些例如包括(但不限于)可见沉淀、动态光散射、测量表面疏水性的圆二色谱和荧光染料以及检测聚集或纤维性颤动。在一些实施例中,改良的溶解度意思是肽在指定液体中的溶解度比对照肽在指定液体中的溶解度高。
在一些实施例中,本发明的肽的降解率比对照肽低(即降解稳定性高),例如降解率低超过或约10%、低超过或约20%、低超过或约30%、低超过或约40%或低超过或约50%。在一些实施例中,经所属领域中已知的任何适合方法测定降解稳定性。在一些实施例中,所属领域中已知的适于测定降解稳定性的方法包括霍(Hawe)等人药物科学杂志(JPharm Sci),第101卷,第3期,2012,第895页-第913页中所述的方法,其全部并入本文中。这类方法在一些实施例中用于选择具有提升的保存期限的强效肽单体或二聚体分子。
在某些实施例中,本发明的肽抑制或减轻α4β7介导的发炎。在相关实施例中,本发明的肽抑制或减轻一种或多种细胞因子的α4β7介导的分泌。所属领域中已知测定细胞因子分泌的抑制和信号传导分子的抑制的方法。
在某些实施例中,本发明的肽表面提高的结合选择性。在某些情况中,本发明的肽以比结合于α4β1的肽高至少两倍、三倍、五倍或十倍的亲和力结合于α4β7。
在某些实施例中,肽拮抗剂在经口投予之后展现有限的全身暴露和/或GI受限定位。在具体实施例中,超过50%、超过60%、超过70%、超过80%或超过90%经口投予的肽抑制剂集中在胃肠器官和组织。在具体实施例中,经口投予的肽抑制剂的血浆水平低于小肠、结肠或近端结肠中存在的肽抑制剂水平的20%、低于10%、低于5%、低于2%、低于1%或低于0.5%。
在某些实施例中,本发明的肽拮抗剂有效治疗结肠炎,例如溃疡性结肠炎,并且针对α4β7的IC50如ELISA或T细胞分析法所测定低于2nm或低于1nM,在模拟肠液(SIF)、大鼠肠液(RIW)、人类肠液(HIF)、结肠清洗液(CW)、肠道粘膜匀浆(IMH)、肠粘膜匀浆(CMH)、模拟胃液(SGF)、血浆、Hu S9或RL S9中的半衰期超过4小时、超过5小时、超过6小时、超过12小时或超过24小时。在具体实施例中,它们在艰难梭菌(C.difficile)、脆弱拟杆菌(B.fragilis)、大肠杆菌(E.coli)、双歧杆菌(B.bifidum)以及嗜酸乳杆菌(L.acidophilus)的厌氧培养物中培育12小时、24小时或48小时之后稳定。在具体实施例中,它们对在厌氧条件下生长的肠道细菌不显示显著抗微生物活性。在具体实施例中,当经口投予时,肽拮抗剂在血浆/尿液中显示最小暴露,并且在正常动物和患有结肠炎的动物的GI中展现大致相等的暴露。
肠道特异性归巢淋巴细胞上存在的α4β7整合素是IBD的特异性并且经临床验证的目标。最近批准的α4β7拮抗剂抗体药物Entyvio(维多珠单抗)因为其组合的功效和安全性已经描述为有前途的前线靶向疗法。本发明提供针对这一整合素目标的新颖强效目标特异性和经口稳定肽,其包括有限全身暴露的α4β7整合素的选择性经口肽拮抗剂,并且其有效阻断T细胞、预防IBD鼠类模型中的粘膜破坏,并且如血球和胃肠组织中的受体占有率所评定啮合整合素目标。本发明的某些肽拮抗剂(包括随附实例中描述的肽X)在多种体外细胞结合分析法中具有与维多珠单抗相当的效能和选择性。然而,本发明的肽拮抗剂(包括肽X)作为经口药物以及其在小肠和结肠中的显著药物暴露而出名,为扩展用靶向疗法治疗的IBD患者群体提供可能。
本发明的化合物是通过在C末端或N末端处连接两个子单元单体形成的肽均二聚体或杂二聚体。单体子单元的二聚证明优于其非二聚单体类似物的效能增加。一些本发明的肽单体和肽二聚体化合物证实由于用N-甲基化类似残基取代多种天然氨基酰基残基引起的进一步效能增加。更进一步地,一些本发明的肽单体和二聚体化合物包含发生独立环化的单体子单元,由此环状结构证明优于其非环状二聚体类似物的稳定性增加。
现参看表3和4,提供的图表包括说明多种根据本发明的非限制性肽分子的稳定性增加的多种数据。对大多数本发明的肽分子进行模拟肠液(SIF)稳定性分析法。这些结果的选择性抽样提供于表3和4中。
根据本文所述的方案,申请人成功地合成和纯化整合素拮抗剂肽单体分子并且成功地合成、纯化和二聚附图和表中所示的大多数整合素拮抗剂肽二聚体分子。对于未显示数据的那些肽,预期其在α4β7ELISA或细胞粘附分析法中的IC50<100nM。
另外,在精氨酸处用N-Me-Arg取代大体上提高在SIF中的半衰期。在一些实施例中,用青霉胺(Pen)取代Cys显著提高在模拟肠液(SIF)中的稳定性。用Pen取代Cys还在指示胃稳定性改良的还原条件(DTT)下提高稳定性。
现参看表3和4,提供的图表包括说明对多种根据本发明的非限制性样品肽二聚体分子的效能、选择性和/或稳定性增加的多种数据。肽还证明与α4β7相比针对α4β1的低功效,由此表明针对α4β7的选择性。
单体肽子单元的二聚一般证实与单体二硫键子单元肽相比导致对α4β1选择性增加的对α4β7增加的亲和力和/或对α4β1降低的亲和力。
在C末端和N末端二聚之后,通常还观测到对α4β7的效能显著改良。另外,二聚还导致ELISA和细胞粘附分析法中对α4β1的效能降低或效能无显著改变,这导致对α4β7的选择性增加。
当Arg置换为N-Me-Arg时,在ELISA和细胞粘附分析法中都显示对α4β7的效能显著改良。N(α)甲基化进一步证实分子稳定性增加。所属领域的技术人员将了解精氨酸的甲基化电子等排体可以进一步证实效能和/或稳定性的类似增加。
本发明提供一种用于稳定肽二聚体化合物或肽单体化合物的方法,所述方法包含用选自由Cys和Pen组成的群组的氨基酸残基取代Xaa4和Xaa10的步骤,其中Xaa4和Xaa10经二硫键形成环状结构。
一个实施例包括一种用于稳定肽二聚体化合物或肽单体化合物的方法,所述方法用能够经二硫键或内酰胺键中的至少一个形成环状结构的相容氨基酸残基取代Xaa4和Xaa10(或式(II)、(III)、(IV)、(V)、(VI)、(A)、(B)、(C)或(D)中的Xaa1和Xaa7)。在某些实施例中,相容氨基酸选自由Cys和Pen组成的群组,并且Xaa4和Xaa10经二硫键形成环状结构。在某些实施例中,Xaa4选自由以下各项组成的群组:Lys HLys、Orn、Dap以及Dab,Xaa10选自由以下各项组成的群组:Asp、Glu、HGlu、β-Asp以及β-Glu,并且Xaa4和Xaa10经内酰胺键环化。
某些实施例包括一种用于提高本发明的肽二聚体或肽单体化合物的SIF稳定性的方法,其包含用N-Me-Arg取代一个或多个未甲基化的精氨酸残基。其它实施例包括一种用于提高本发明的肽单体化合物的SIF稳定性的方法,其包含用Pen取代一个或多个半胱氨酸残基的步骤。
其它实施例包括用于提高根据本发明的肽二聚体化合物或肽单体化合物的氧化还原稳定性的方法,其包含用Pen取代一个或多个半胱氨酸残基的步骤。
治疗方法和药物组合物
如上文所论述,整合素是充当细胞粘附分子的杂二聚体。α4整合素(α4β1和α4β7)在淋巴细胞于整个胃肠道中迁移时起基本作用。它们在大部分白血球(包括B和T淋巴细胞、单核细胞和树突状细胞)上表达,其中它们经结合到其各别主要配位体(即血管细胞粘附分子(VCAM)和粘膜地址素细胞粘附分子(MAdCAM))来介导细胞粘附。VCAM和MAdCAM的结合特异性不同,不同之处在于VCAM结合α4β1和α4β7,而MAdCAM对α4β7具有高度特异性。
VCAM和MAdCAM的表达谱的差异提供它们在发炎疾病中的作用的最有说服力的证据。它们都在肠道中组成性表达;然而,VCAM表达延伸到周边器官中,而MAdCAM表达限于胃肠道的器官。另外,在肠道中的升高的MAdCAM表达现在已经与若干肠道相关发炎疾病(包括克罗恩氏病、溃疡性结肠炎和C型肝炎)关联。
包括(但不限于)随附实例中规定的那些的本发明的化合物具有整合素拮抗剂活性。在一个实施例中,病状或医学适应症包含以下中的至少一个:发炎性肠病(IBD)(包括成人IBD、儿科IBD和青年IBD)、溃疡性结肠炎、克罗恩氏病、乳糜泻(非热带口炎性腹泻)、与血清反应阴性的关节病有关的肠病、显微镜下结肠炎、胶原性结肠炎、嗜酸性球性胃肠炎、放射疗法、化学疗法、直肠结肠切除术和回肠肛管吻合术之后引起的结肠袋炎、胃肠癌、胰脏炎、胰岛素依赖性糖尿病、乳腺炎、胆囊炎、胆管炎、胆管周围炎、慢性支气管炎、慢性鼻窦炎、哮喘、原发性硬化性胆管炎、胃肠道中的人类免疫缺陷病毒(HIV)感染、嗜酸性球性哮喘、嗜酸性球性食道炎、胃炎、结肠炎、显微镜下结肠炎、移植物抗宿主疾病(GVDH)(包括肠道GVDH)、与放射疗法或化学疗法有关的结肠炎、如白血球粘附缺乏症-1中的与先天免疫障碍有关的结肠炎、慢性肉芽肿性疾病、1b型糖原贮积病、赫曼斯基-普德拉克综合症、薛迪克-东氏综合症以及韦斯考特-奥德里奇综合症,或直肠结肠切除术和回肠肛管吻合术之后引起的结肠袋炎,和多种形式的胃肠癌、骨质疏松症、关节炎、多发性硬化症、慢性疼痛、体重增加以及抑郁症。在另一实施例中,所述病状是胰脏炎、胰岛素依赖性糖尿病、乳腺炎、胆囊炎、胆管炎、胆管周围炎、慢性支气管炎、慢性鼻窦炎、哮喘或移植物抗宿主疾病。另外,这些化合物在与当前可用疗法、医学程序以及治疗剂组合使用时可适用于预防或逆转这些疾病。
本发明化合物可以与其它组合物和程序组合使用来治疗疾病。另外,本发明的化合物可以与药学上可接受的赋形剂、载剂和稀释剂,以及任选地持续释放基质(例如生物可降解聚合物)组合,形成治疗性组合物。
在一些实施例中,本发明提供一种用于治疗罹患特征为整合素结合的病状或适应症的个体的方法,其中所述方法包含向个体投予根据式(I)(包括I-A、I-B、I-C、I-D、I-E、I-F、I-G、I-H、I-I以及I-J中的任一个)、式(II)、式(III)、式(A)、式(B)、式(C)、式(D)、式(S)、式(X)或式(H)的整合素拮抗剂二聚体分子或根据式(IV)(包括IV-A、IV-B、IV-C、IV-D、IV-E、IV-F、IV-G、IV-H、IV-I以及IV-J中的任一个)、式(V)(包括V-A)、式(VI)、式(A)、式(B)、式(C)或式(D)的整合素拮抗剂单体分子,或本文所述的任何化合物。
在一个实施例中,提供一种用于治疗罹患特征为表达α4β7的细胞不当运输到包含表达MAdCAM的细胞的组织的病状或适应症的个体的方法,其包含向个体投予足以抑制(部分或完全)表达α4β7的细胞运输到包含表达MAdCAM的细胞的组织的量的根据式(I)、式(II)、式(III)、式(A)、式(B)、式(C)、式(D)、式(S)、式(X)或式(H)的α4β7-拮抗剂二聚体分子,或根据式(IV)、式(V)、式(VI)、式(A)、式(B)、式(C)或式(D)的α4β7-拮抗剂单体分子,或本文所述的任何化合物。
在相关实施例中,本发明提供用于抑制CD4+记忆T细胞粘附到MAdCAM-1和/或血液中的初级白血球的方法,其包含向有需要的个体提供有效量的本发明的肽二聚体化合物或肽单体化合物。本发明进一步提供选择性抑制CD4+记忆T细胞粘附到胃肠道中表达MAdCAM-1的组织或抑制α4β7+细胞浸润到小肠和结肠(例如远端结肠)中的方法,其包含向有需要的个体提供有效量的本发明的肽二聚体化合物或肽单体化合物。
在另一实施例中,本发明提供一种抑制MAdCAM-1结合到α4β7整合素的方法,其包含使MAdCAM-1与本发明的整合素拮抗剂接触。本发明的方法的多个实施例可以体外、离体或体内进行。在具体实施例中,投予的肽拮抗剂在胃肠组织中的暴露比血液中的暴露高至少10倍、至少20倍、至少50倍或至少100倍。
在其它相关实施例中,本发明提供一种用于减少胃肠道(例如MLN)、经分离的淋巴滤泡和/或派氏***中的α4β7+T细胞的方法,其包含向有需要的个体提供有效量的本发明的肽二聚体化合物或肽单体化合物。在具体实施例中,所述方法还引起脾脏和/或血液中α4β7+T细胞同时增加。
在另一相关实施例中,本发明提供一种用于提高α4β7+白血球(包括记忆T细胞)的受体占有率和/或提高血液中循环α4β7+记忆T细胞的百分比的方法,其包含向有需要的个体提供有效量的本发明的肽二聚体化合物或肽单体化合物。
在一些实施例中,本发明提供一种向个体投予包含根据式(I)(包括I-A、I-B、I-C、I-D、I-E、I-F、I-G、I-H、I-I以及I-J中的任一个)、式(II)(包括II-A)、式(III)、式(A)、式(B)、式(C)、式(D)、式(S)、式(X)、式(H)的整合素拮抗剂二聚体分子或根据式(IV)(包括IV-A、IV-B、IV-C、IV-D、IV-E、IV-F、IV-G、IV-H、IV-I以及IV-J中的任一个)、式(V)(包括V-A)、式(VI)、式(A)、式(B)、式(C)或式(D)的整合素拮抗剂单体分子或本文所述的任何化合物的药物组合物作为初步治疗的方法。在另一实施例中,所述方法进一步包含向个体投予第二治疗。在另一实施例中,在向个体投予药物组合物之前和/或同时和/或之后向个体投予第二治疗。在其它实施例中,第二治疗包含消炎剂。在另一实施例中,第二药物组合物包含选自由以下各项组成的群组的药剂:非类固醇消炎药物、类固醇以及免疫调节剂。在另一实施例中,所述方法包含向个体投予第三治疗。
在一个实施例中,提供一种用于治疗罹患特征为α4β7整合素结合的病状或适应症的个体的方法,其中所述方法包含向个体投予有效量的本发明的肽二聚体化合物或肽单体化合物,例如含有式(I)(包括I-A、I-B、I-C、I-D、I-E、I-F、I-G、I-H、I-I以及I-J中的任一个)、式(II)(包括II-A)、式(III)、式(A)、式(B)、式(C)、式(D)、式(S)、式(X)或式(H)的子单元的α4β7整合素拮抗剂二聚体分子,或本文所述的任何化合物。在一些情况下,向个体投予具有选自和对应于式(I)、式(II)、式(III)、式(A)、式(B)、式(C)、式(D)、式(S)、式(X)或式(H)的子单元的α4β7整合素拮抗剂二聚体分子或根据式(IV)(包括IV-A、IV-B、IV-C、IV-D、IV-E、IV-F、IV-G、IV-H、IV-I以及IV-J中的任一个)、式(V)(包括V-A)、式(VI)、式(A)、式(B)、式(C)或式(D)的α4β7整合素拮抗剂单体分子或本文描述并且对α4β7具有高度特异性的任何化合物作为特征为α4β7整合素结合的病状或适应症的治疗性处理的部分。
本发明的另一方面提供一种用于治疗需要α4β7特异性拮抗剂疗法的个体的组合物,其包含向个体提供式(I)的肽二聚体化合物,或本文或附图和表中所述的对α4β7整合素具有高度选择性的任何其它化合物,以及药学上可接受的载剂。
本发明的另一方面提供一种用于治疗需要α4β7特异性拮抗剂疗法的个体的组合物,其包含向个体提供式(I)化合物,或本文或附图和表中所述的对针对α4β1整合素的α4β7具有高度选择性的任何其它化合物,以及药学上可接受的载剂。
本发明的另一方面提供一种用于治疗需要α4β7特异性拮抗剂疗法的个体的组合物,其包含向个体提供式(I)化合物,或本文或附图或表中所述的对针对αEβ7整合素的α4β7具有高度选择性的任何其它化合物,以及药学上可接受的载剂。
本发明的另一方面提供一种用于治疗需要α4β7特异性拮抗剂疗法的个体的组合物,其包含向个体提供式(I)化合物,或本文或附图或表中所述的对针对αEβ7整合素的α4β7具有低选择性的任何其它化合物,以及药学上可接受的载剂。
本发明的另一方面提供一种用于治疗需要整合素-拮抗剂疗法的个体的方法,其包含向个体提供式(I)的肽,或本文或附图和表中所述的任何其它化合物。
本发明的一些实施例进一步提供一种使用悬浮于持续释放基质中的α4β7整合素拮抗剂单体或二聚体分子治疗个体的方法。如本文所用的持续释放基质是由酶促或酸类水解或溶解可降解的材料(通常聚合物)制成的基质。一旦***到身体中,基质就受到酶和体液影响。持续释放基质适宜选自生物相容性材料,例如脂质体、聚丙交脂(聚乳酸)、聚乙交酯(乙醇酸的聚合物)、聚丙交酯-共乙交酯(乳酸和乙醇酸的共聚物)聚酸酐、聚(邻)酯、多肽、玻尿酸、胶原蛋白、硫酸软骨素、羧酸、脂肪酸、磷脂、多糖、核酸、聚氨基酸、氨基酸(例如苯丙氨酸、酪氨酸、异白氨酸)、多核苷酸、聚乙烯丙烯、聚乙烯吡咯烷酮以及硅酮。优选的生物可降解基质是聚丙交酯、聚乙交酯或聚丙交酯共乙交酯(乳酸和乙醇酸的共聚物)中的一个的基质。
一些方面,本发明提供一种用于经口传递的药物组合物。可以制备本发明的多个实施例和单体和二聚体组合物用于根据本文所述的方法、技术和/或传递媒剂中的任一个经口投予。另外,所属领域的技术人员应了解本发明的单体和二聚体组合物可以修饰或整合到并非本文所披露但所属领域中众所周知并且与小二聚体肽分子的经口传递相容的***或递送媒剂中。
与本发明的单体或二聚体肽一起使用时相容的口服剂型或单位剂量可以包括肽活性药物组分,和非药物组分或赋形剂,以及其它不可重新使用的材料(可视为成分或包装)的混合物。口服组合物可以包括液体、固体和半固体剂型中的至少一个。在一些实施例中,提供一种口服剂型,其包含有效量的具有选自和对应于式(I)(包括I-A、I-B、I-C、I-D、I-E、I-F、I-G、I-H、I-I以及I-J中的任一个)、式(II)(包括II-A)、式(III)、式(A)、式(B)、式(C)、式(D)、式(S)、式(X)或式(H)的子单元的二聚体肽或选自和对应于式(IV)(包括IV-A、IV-B、IV-C、IV-D、IV-E、IV-F、IV-G、IV-H、IV-I、IV-J中的任一个)、式(V)(包括V-A)、式(VI)、式(A)、式(B)、式(C)或式(D)的单体肽,或本文所述的任何化合物,其中剂型包含丸剂、片剂、胶囊、凝胶、糊状物、饮品、糊浆、软膏以及栓剂中的至少一个。在一些情况下,提供一种口服剂型,其设计和配置成实现肽二聚体在个体小肠和/或结肠中的延时释放。
在一个实施例中,根据本文所述的任何化学式的经口药物组合物包含设计成在小肠中延迟释放肽的肠溶包衣。在至少一些实施例中,提供一种药物组合物,其包含在延时释放药物调配物中的具有选自和对应于式(I)(包括I-A、I-B、I-C、I-D、I-E、I-F、I-G、I-H、I-I以及I-J中的任一个)、式(II)(包括II-A)、式(III)、式(A)或式(B)、式(C)、式(D)、式(S)、式(X)或式(H)的子单元的肽二聚体化合物或选自和对应于式(IV)(包括IV-A、IV-B、IV-C、IV-D、IV-E、IV-F、IV-G、IV-H、IV-I以及IV-J中的任一个)、式(V)(包括V-A)、式(VI)、式(A)、式(B)、式(C)或式(D)的单体肽,或本文所述的任何化合物,以及蛋白酶抑制剂(例如抑肽酶)。在一些情况下,优选的是本发明的药物组合物包含在pH为约5.0或更高的胃液中可溶的肠溶包衣。在至少一个实施例中,提供一种药物组合物,其包含的肠溶包衣包含具有可解离羧基的聚合物,例如纤维素的衍生物,包括邻苯二甲酸羟丙基甲基纤维素、邻苯二甲酸乙酸纤维素以及苯偏三酸乙酸纤维素,以及纤维素的类似衍生物和其它碳水化合物聚合物。
在一个实施例中,在肠溶包衣中提供具有选自和对应于式(I)(包括I-A、I-B、I-C、I-D、I-E、I-F、I-G、I-H、I-I以及I-J中的任一个)、式(II)(包括II-A)、式(III)、式(A)或式(B)、式(C)、式(D)、式(S)、式(X)或式(H)的子单元或选自和对应于式(IV)(包括IV-A、IV-B、IV-C、IV-D、IV-E、IV-F、IV-G、IV-H、IV-I、IV-J中的任一个)、式(V)(包括V-A)、式(VI)、式(A)、式(B)、式(C)或式(D)的单体肽,或本文所述的任何化合物的药物组合物,所述肠溶包衣设计成在个体的下胃肠***内以控制方式保护和释放药物组合物并且避免全身性副作用。除了肠溶包衣之外,本发明的单体或二聚体肽可以在任何相容经口药物传递***或组分内囊封、涂布、啮合或者缔合。举例来说,在一些实施例中,本发明的肽提供于包含聚合水凝胶、纳米粒子、微球体、微胞和其它脂质***中的至少一个的脂质载剂***中。
为了克服小肠中的肽降解,本发明的一些实施方案包含水凝胶聚合物载剂***,其中含有根据本发明的肽单体或二聚体,由此水凝胶聚合物保护肽以免在小肠和/或结肠中发生蛋白质水解。本发明的肽可以进一步调配以与设计成提高溶解动力学和提高肽的肠道吸收的载剂***相容的使用。这些方法包括使用脂质体、微胞和纳米粒子来提高肽的胃肠道渗透率。
多种生物反应性***还可以与一种或多种本发明的肽单体或二聚体组合来提供用于经口传递的药剂。在一些实施例中,本发明的肽单体或二聚体与生物反应性***(例如水凝胶和具有氢键结基团的粘膜粘附聚合物(例如PEG、聚(甲基丙烯)酸[PMAA]、纤维素、聚葡萄胺糖以及海藻酸盐))组合使用以提供用于经口投予的治疗剂。其它实施例包括一种用于优化或延长本文所披露的肽单体或二聚体的药物滞留时间的方法,其中肽单体或二聚体的表面经氢键、连接有粘蛋白的聚合物或/和疏水性相互作用修饰以包含粘膜粘附特性。根据本发明的所需特征,这些经修饰的单体或二聚体分子可以证实个体内增加的药物滞留时间。另外,靶向粘膜粘附***可以特异性结合于肠上皮细胞和M-细胞表面处的受体,由此进一步提高含有二聚体肽的粒子的摄入。
其它实施例包含一种用于经口传递具有选自和对应于式(I)(包括I-A、I-B、I-C、I-D、I-E、I-F、I-G、I-H、I-I以及I-J中的任一个)、式(II)(包括II-A)、式(III)、式(A)或式(B)、式(C)、式(D)、式(S)、式(X)或式(H)的子单元的二聚体肽或选自和对应于式(IV)(包括IV-A、IV-B、IV-C、IV-D、IV-E、IV-F、IV-G、IV-H、IV-I以及IV-J中的任一个)、式(V)(包括V-A)、式(VI)、式(A)、式(B)、式(C)或式(D)的单体肽,或本文所述的任何化合物的方法,其中二聚体肽与通过提高细胞旁或细胞间渗透率来促进二聚体肽跨越肠道粘膜传输的穿透增强剂组合使用。举例来说,在一个实施例中,渗透强化子与具有选自和对应于式(I)(包括I-A、I-B、I-C、I-D、I-E、I-F、I-G、I-H、I-I以及I-J中的任一个)、式(II)(包括II-A)、式(III)、式(A)或式(B)、式(C)、式(D)、式(S)、式(X)或式(H)的子单元的二聚体肽或选自和对应于式(IV)(包括IV-A、IV-B、IV-C、IV-D、IV-E、IV-F、IV-G、IV-H、IV-I、IV-J中的任一个),式(V)(包括V-A)、式(VI)、式(A)、式(B)、式(C)或式(D)的单体肽,或本文所述的任何化合物组合,其中渗透强化子包含长链脂肪酸、胆汁盐、两亲性表面活性剂以及螯合剂中的至少一个。在一个实施例中,包含N-[羟基苯甲酰基)氨基]辛酸钠的渗透强化子用于与本发明的二聚体肽形成弱非共价缔合,其中渗透率强化子有利于膜传输并且在到达血液循环之后进一步解离。在另一实施例中,本发明的肽二聚体结合到寡精氨酸,由此提高单体或二聚体肽向多种细胞类型中的细胞渗透。另外,在至少一个实施例中,在具有选自和对应于式(I)(包括I-A、I-B、I-C、I-D、I-E、I-F、I-G、I-H、I-I、I-J中的任一个)、式(II)(包括II-A)、式(III)、式(A)或式(B)、式(C)、式(D)、式(S)、式(X)或式(H)的子单元的单体或二聚体肽,或选自和对应于式(IV)(包括IV-A、IV-B、IV-C、IV-D、IV-E、IV-F、IV-G、IV-H、IV-I以及IV-J中的任一个)、式(V)(包括V-A)、式(VI)、式(A)、式(B)、式(C)或式(D)的单体肽,或本文所述的任何化合物与选自由环糊精(CD)和树形分子组成的群组的渗透强化子之间提供非共价键,其中渗透强化子减少肽聚集并且提高肽分子的稳定性和溶解度。
具体实施例包括一种用于治疗个体的病状的方法,其包含向个体投予包含本文所述的肽二聚体化合物或肽单体化合物的药物组合物,其中所述病状可以通过降低个体体内的α4β7活性(部分或完全)来治疗。在某些实施例中,个体是人类。在某些实施例中,病状是胃肠***的发炎性病状。
其它实施例包括一种用于治疗罹患与生物功能α4β7有关的病状的人类的方法并且包含向个体投予足以在一个或多个表达MAdCAM的组织中抑制(部分或完全)α4β7的生物功能的量的本文所述的肽二聚体化合物或肽单体化合物。在一个实施例中,病状是发炎性肠病。在某些实施例中,病状选自由以下各项组成的群组:发炎性肠病(IBD)(包括成人IBD、儿科IBD和青年IBD)、溃疡性结肠炎、克罗恩氏病、乳糜泻(非热带口炎性腹泻)、与血清反应阴性的关节病有关的肠病、显微镜下结肠炎、胶原性结肠炎、嗜酸性球性胃肠炎、放射疗法、化学疗法、直肠结肠切除术和回肠肛管吻合术之后引起的结肠袋炎、胃肠癌、胰脏炎、胰岛素依赖性糖尿病、乳腺炎、胆囊炎、胆管炎、胆管周围炎、慢性支气管炎、慢性鼻窦炎、哮喘、原发性硬化性胆管炎、胃肠道中的人类免疫缺陷病毒(HIV)感染、嗜酸性球性哮喘、嗜酸性球性食道炎、胃炎、结肠炎、显微镜下结肠炎、移植物抗宿主疾病(GVDH)(包括肠道GVDH)、与放射疗法或化学疗法有关的结肠炎、如白血球粘附缺乏症-1中的与先天免疫障碍有关的结肠炎、慢性肉芽肿性疾病、1b型糖原贮积病、赫曼斯基-普德拉克综合症、薛迪克-东氏综合症以及韦斯考特-奥德里奇综合症,或直肠结肠切除术和回肠肛管吻合术之后引起的结肠袋炎,和多种形式的胃肠癌、骨质疏松症、关节炎、多发性硬化症、慢性疼痛、体重增加以及抑郁症。在另一实施例中,所述病状是胰脏炎、胰岛素依赖性糖尿病、乳腺炎、胆囊炎、胆管炎、胆管周围炎、慢性支气管炎、慢性鼻窦炎、哮喘或移植物抗宿主疾病。
在本文所述的任何治疗方法的多个实施例中,向个体投予选自由以下各项组成的群组的投予形式的肽二聚体化合物或肽单体化合物:经口、静脉内、腹膜、皮内、皮下、肌肉内、鞘内、吸入、气化、雾化、舌下、经颊、肠胃外、直肠、经***以及局部。
在具体实施例中,α4β7整合素拮抗剂分子包含增加的半衰期。在一个实施例中,增加的半衰期是体外或体内至少一天。在其它实施例中,增加的半衰期等于或大于与不超过每天两次体内给药相符的时间段,α4β7整合素拮抗剂肽二聚体化合物或肽单体化合物包含经口投予的药物组合物或存在于经口投予的药物组合物中。在某些实施例中,增加的半衰期是体内约12小时到超过24小时,并且α4β7整合素拮抗剂肽二聚体化合物或肽单体化合物包含肠胃外投予的药物组合物或存在于肠胃外投予的药物组合物中。在某些实施例中,增加的半衰期是体内约12小时到超过24小时,并且α4β7整合素拮抗剂肽单体化合物包含局部投予的药物制剂或存在于局部投予的药物制剂中。
本发明的相关实施例提供一种使用具有增加的半衰期的α4β7整合素拮抗剂单体或二聚体分子治疗有需要的个体的方法。一方面,本发明提供一种整合素拮抗剂单体或二聚体分子,其半衰期是足以每天一次(q.d.)、每天两次(b.i.d.)或每天三次(t.i.d.)给予治疗有效量的体外或体内至少几个小时到一天(例如当向人类个体投予时)。在另一实施例中,单体或二聚体分子具有足以每周一次(q.w.)给予治疗有效量的三天或更长的半衰期。另外,在另一实施例中,单体或二聚体分子具有足以每两周一次(b.i.w.)或每月一次给予治疗有效量的八天或更长的半衰期。在另一实施例中,单体或二聚体分子经衍生或改性以使得与未经衍生或改性的二聚体分子相比具有较长半衰期。在另一实施例中,单体或二聚体分子含有一个或多个化学改性来提高血清半衰期。
当用于本文所述的治疗或传递***中的至少一个时,治疗有效量的本发明的化合物中的一个可以纯形式采用,或以药学上可接受的盐形式(如果存在这类形式)存在。如本文所用,“治疗有效量”的本发明的化合物打算描述足以使用适用于任何药物治疗的所需效益/风险比治疗整合素相关疾病(例如减轻与IBD有关的发炎)的量的肽单体或二聚体化合物。然而,应了解,本发明的化合物和组合物的每日总用量将由主治医师在合理医学判断范围内来决定。用于任何特定个体的特定治疗有效剂量水平将取决于多种因素,包括:a)待治疗的病症和病症的严重程度;b)所用特定化合物的活性;c)所用特定组合物、个体的年龄、体重、一般健康状况、性别以及饮食;d)投予时间、投予途径以及所采用的特定化合物的***速率;e)治疗持续时间;f)与所采用的特定化合物组合或同时使用的药物;以及医学技术中众所周知的类似因素。举例来说,以低于实现所要治疗效果所需的水平开始给予化合物并且逐渐提高剂量直到实现所要作用是在所属领域的技艺范围内。
或者,本发明化合物可以作为含有所关注的化合物以及一种或多种药学上可接受的赋形剂的药物组合物形式投予。药学上可接受的载剂或赋形剂指的是无毒固体、半固体或液体填充剂、稀释剂、包封材料或任何类型的调配助剂。组合物可以肠胃外、脑池内、***内、腹膜内、直肠内、局部(以粉末、软膏、滴剂、栓剂或经皮贴片形式)或经颊投予。如本文所用的术语“肠胃外”指的是包括静脉内、肌肉内、腹膜内、胸骨内、皮下、皮内和关节内注射和输注的投予模式。
用于肠胃外注射的药物组合物包含药学上可接受的无菌水性或非水性溶液、分散液、悬浮液或乳液,以及在即将使用之前在无菌可注射溶液或分散液中复原的无菌粉末。适合水性和非水性载剂、稀释剂、溶剂或媒剂的实例包括水、乙醇、多元醇(例如丙三醇、丙二醇、聚乙二醇等)、羧基甲基纤维素以及其适合混合物、植物油(例如橄榄油),以及可注射有机酯,例如油酸乙酯。可以例如通过使用涂层材料(例如卵磷脂)、通过在分散液情况下维持所需粒径和通过使用表面活性剂来维持适当流动性。
这些组合物还可以含有佐剂,例如防腐剂、湿润剂、乳化剂以及分散剂。微生物的作用的预防可以通过各种抗细菌和抗真菌剂来确保,例如对羟基苯甲酸酯、氯丁醇、酚类山梨酸等。还理想的包括等渗剂,例如糖、氯化钠等。可以通过纳入延迟吸收的试剂(例如单硬脂酸铝和明胶)来延长可注射药物形式的吸收。
通过在例如聚丙交酯-聚乙交酯、聚(原酸酯)、聚(酸酐)以及(聚)二醇(例如PEG)的生物可降解聚合物中形成药物的微胶囊基质来制备可注射储槽形式。取决于药物与聚合物的比率和所用具体聚合物的性质,可以控制药物释放速率。也可以通过将药物包覆在与身体组织相容的脂质体或微乳液中来制备储槽可注射调配物。
可注射调配物可以例如通过经细菌截留过滤器过滤或通过并入灭菌剂来灭菌,所述灭菌剂呈在即将使用前可以溶解或分散于无菌水或其它无菌可注射介质中的无菌固体组合物形式。
局部投予包括向皮肤或粘膜(包括肺和眼睛的表面)投予。用于局部肺投予的组合物(包括用于吸入和鼻内的那些)可能涉及水性和非水性调配物中的溶液和悬浮液并且可以制备成干燥粉末,其可加压或未加压。在未加压粉末组合物中,细粉状形式的活性成分可用于具有较大尺寸的药学上可接受的惰性载剂(包含尺寸例如高达100微米直径的粒子)的掺合物中。适合惰性载剂包括糖,例如乳糖。
或者,组合物可以加压并且含有压缩气体,例如氮气或液化气推进剂。液化推进剂介质和实际上全部组合物优选地使得不会以任何显著程度溶解活性成分。加压组合物还可以含有表面活性剂(例如液体或固体非离子表面活性剂)或可以是固体阴离子表面活性剂。优选地使用钠盐形式的固体阴离子表面活性剂。
局部投予的另一形式是向眼睛投予。本发明化合物在药学上可接受的眼科媒剂中传递,使得化合物保持与眼表面接触足以允许化合物穿透角膜和眼睛内部区域(例如前房、后房、玻璃体、眼房水、玻璃体液、角膜、虹膜/睫状体、晶体、脉络膜/视网膜以及巩膜)的时间段。药学上可接受的眼科媒剂可以例如是软膏、植物油或包封材料。或者,本发明化合物可以直接注射到玻璃体和眼房水中。
用于经直肠或经***投予的组合物优选是可以通过将本发明化合物与在室温下是固体但在体温下是液体并且因此在直肠或***腔中熔融并且释放活性化合物的适合无刺激性赋形剂或载剂(例如可可脂、聚乙二醇或栓剂蜡)混合而制备的栓剂。
本发明的化合物还可以脂质体形式投予。如所属领域中已知,脂质体一般来源于磷脂或其它脂质物质。脂质体通过分散于水性介质中的单个或多个层状水合液晶形成。可以使用能够形成脂质体的任何无毒生理学上可接受并且可代谢的脂质。除了本发明化合物之外,脂质体形式的本发明组合物可以含有稳定剂、防腐剂、赋形剂等。优选脂质是磷脂,包括天然和合成的磷脂酰胆碱(卵磷脂)和丝氨酸。所属领域中已知形成脂质体的方法。
打算以单个剂量或分次剂量向人类或其它哺乳动物宿主投予的本发明的组合物的每日总剂量可以是例如每天0.0001到300mg/千克体重并且更通常1到300mg/千克体重的量。
肠道发炎的无创检测
本发明的肽可用于通过显微PET成像使用本文描述并且经作为无创诊断程序的部分的螯合基和可检测标记中的至少一个进一步标记的经口稳定化合物检测、评定和诊断肠道发炎。在一个实施例中,整合素拮抗剂单体或二聚体分子与双官能螯合剂结合以提供经口稳定单体或二聚体分子。在另一实施例中,整合素拮抗剂单体或二聚体分子经放射性标记以提供经口稳定单体或二聚体分子。经口稳定、螯合或放射性标记的单体或二聚体分子接着经口或经直肠向个体投予。在一个实施例中,经口稳定单体或二聚体分子包括于饮用水中。在摄入单体或二聚体分子之后,可以使用显微PET成像来观察个体的整个肠道和消化道的发炎。
测定受体占有率和整合素表达的方法
本发明的肽可以用于测定例如CD4T细胞、原生CD4T细胞或B细胞上肽的结合和α4β7整合素受体占有率。举例来说,血细胞的受体占有率可以使用例如当化合物向个体经口投予时从已经投予本发明的肽二聚体化合物或肽单体化合物的个体(例如哺乳动物或人类)获得的血液测定。或者,可以基于本发明的肽二聚体化合物或肽单体化合物的体外结合和竞争测定受体占有率。
在FACS分析的某些实施例中,来自动物的肝素化全血*例如氰化合物(cyanos))用两组抗体中的每一个染色来进行评估:(1)用本文所述的肽二聚体化合物或肽单体化合物处理的样品中α4β7受体占有程度;以及(2)循环α4β7+、αEβ7+以及α4β7+αEβ7+淋巴细胞亚群的丰度。评定记忆CD4T细胞、原生CD4T细胞以及B细胞内的受体占有率和整合素表达。为了评估受体占有率,全血样品首先用1mM MnCl2处理以允许肽结合,接着预先培育+/-1μM未标记的肽来完全占据(即阻断)α4β7受体。阻断和未阻断的样品用1nM Alexa 647标记的肽染色,随后用针对α4β7、CD45、CD4、CD45RA以及CD19的抗体染色。加工样品以溶解红血球和固定白血球,随后是用第二步骤试剂(抗生蛋白链菌素-BV421)染色和洗涤步骤。为了评定整合素表达和细胞亚群丰度,除了针对CD45、CD4、CD45RA和CD19的抗体之外,全血样品用针对α4、β7和αE的抗体染色。加工样品来溶解红血球和固定白血球,随后是用第二步骤试剂(抗生蛋白链菌素-BV421)染色和洗涤步骤。经染色的样品通过流动式细胞量测术分析,收集恒定样品体积以允许计算绝对细胞计数。
在测定受体占有率的一个实施例中,从已经投予(例如经口)本发明的肽二聚体化合物或肽单体化合物的个体获得的血液样品与可检测标记型式的相同肽二聚体化合物或肽单体化合物一起在足以允许经标记的肽与血液样品内的细胞结合的条件和时间下培育。样品接着用结合于α4β7整合素,以及CD4T细胞的其它标记物、原生CD4T细胞和/或B细胞的抗体和/或其它试剂染色。样品接着加工以溶解红血球和固定白血球,用第二步骤试剂染色例如以允许抗体检测和/或细胞分拣,洗涤,并且通过流动式细胞量测术分析以测定竞争对手肽结合到CD4T细胞、原生CD4T细胞和/或B细胞的量。肽二聚体化合物或肽单体化合物的受体占有率可以基于检测到结合到细胞的经标记的肽的量,任选地另外考虑细胞上检测到的α4β7的量测定。
在测定受体占有率的另一实施例中,从供体动物(例如未用肽处理的哺乳动物或人类)获得的血液样品与未标记的本发明的肽二聚体化合物或肽单体化合物或阴性对照(例如仅缓冲剂或不相关肽)一起在足以允许未标记肽结合到血液样品内的细胞的条件和时间下培育。样品接着用可检测标记型式的相同本发明的肽二聚体化合物或肽单体化合物(在足以允许经标记肽结合到血液样品内的细胞的条件和时间下)染色,接着用结合于α4β7整合素,以及CD4T细胞的其它标记物、原生CD4T细胞和/或B细胞的抗体和/或其它试剂染色。样品接着加工以溶解红血球和固定白血球,用第二步骤试剂染色例如以允许抗体检测和/或细胞分拣,洗涤,并且通过流动式细胞量测术分析以测定竞争对手肽结合到CD4T细胞、原生CD4T细胞和/或B细胞的量。所测试肽的受体占有率可以基于检测到结合到细胞的经标记的肽的量,任选地另外考虑细胞上检测到的α4β7的量测定。
在评估测试肽的受体占有率的另一实施例中,血液样品与未标记测试肽或阴性对照(例如仅缓冲剂或不相关肽)一起在足以允许测试肽结合到血液样品内的细胞的条件和时间下培育。样品接着用可检测标记的本发明的肽二聚体化合物或肽单体化合物(竞争对手肽)染色,接着用结合于α4β7整合素,以及CD4T细胞的其它标记物、原生CD4T细胞和/或B细胞的抗体和/或其它试剂染色。样品接着加工以溶解红血球和固定白血球,用第二步骤试剂染色例如以允许抗体检测和/或细胞分拣,洗涤,并且通过流动式细胞量测术分析以测定竞争对手肽结合到CD4T细胞、原生CD4T细胞和/或B细胞的量。测试肽的受体占有率可以基于检测到结合到细胞的竞争对手肽的量,另外考虑细胞上检测到的α4β7的量测定。
在一个实例中,全血样品(例如小鼠、大鼠或人类血液)首先用1mM MnCl2处理以允许测试肽结合,接着预先培育+/-1μM未经标记的肽X以结合(即阻断)α4β7受体,或不使用肽或阴性对照肽(未阻断)。阻断和未阻断的样品用1nM Alexa 647标记的肽X染色,随后用针对α4β7、CD45、CD4、CD45RA以及CD19的抗体染色。加工样品以溶解红血球和固定白血球,随后是用第二步骤试剂(抗生蛋白链菌素-BV421)染色和洗涤步骤。全部经染色的样品通过流动式细胞量测术分析,收集恒定样品体积以允许计算绝对细胞计数。
为了评定整合素表达和细胞亚群丰度,除了针对CD45、CD4、CD45RA以及CD19的抗体之外,全血样品用针对α4、β7以及αE的抗体染色。加工样品以溶解红血球和固定白血球,随后是用第二步骤试剂(抗生蛋白链菌素-BV421)染色和洗涤步骤。全部经染色的样品通过流动式细胞量测术分析,收集恒定样品体积以允许计算绝对细胞计数。
在具体实施例中,为了防止受体内化,细胞在固定之前的全部步骤期间都保持低温,并且在4℃下培育(红血球溶解除外)。
下文描述分析法的一个实施例的详细说明。
向约1mM最终浓度的各血液样品(约100μL)添加MnCl2;混合样品并且在4℃下培育10-15分钟。
向样品添加最终浓度为1μM的未标记的肽(或对照物)或向适当血液样品添加DMSO媒剂对照物(匹配DMSO的浓度),混合并且在4℃下培育60分钟。
以最终浓度1nM向适当血液样品添加经标记的肽,混合并且在4℃下培育60分钟。
向各血液样品添加抗体染色混合物,例如整合素a4/b7/ae混合物,其包括结合CD45(C45V500)、CD4(CD4Ax700)、CD45RA(CD45RA FITC)、CD19(C19PE-CF594)、整合素α4(整合素α4生物素)、整合素β7(整合素β7PE)或整合素αE(整合素αE PE-Cy7)的经标记抗体;或受体占有染色混合物,其包括CD45V500、CD4Ax700、CD45Ra FITc、CD19PE-CF594、维多珠单抗-生物素以及整合素αE PE-Cy7;混合并且在4℃下培育30分钟。
样品接着用10体积过量的1×FACS溶解溶液(从10×原料稀释)处理来溶解红细胞,彻底混合并且在室温下培育10分钟。样品在400×g下离心5分钟,去除上清液,并且将细胞再悬浮于PBS/BSA/MnCl2中进行洗涤。细胞再次类似地离心并且去除上清液;重复洗涤。
细胞用抗生蛋白链菌素BV421在/BSA/MnCl2中的1:1000倍最终稀释液染色,彻底混合并且在4℃下培育30分钟。
细胞如上所述用PBS/BSA/MnCl2洗涤两次,接着再悬浮于PBS/BSA/MnCl2中。
在流式细胞仪上操作样品,对所有样品收集一致样品体积以允许经FAC分析计算绝对事件计数。可以基于与用测试肽阻断的样品相比结合于未阻断样品的竞争对手肽的相对量来测定测试肽的受体占有率。
在另一特定实例中,来自人类供体的肝素化全血用两组抗体中的每一个染色来评估(1)肽处理样品中α4β7受体占有程度和(2)循环α4β7+、αEβ7+以及α4β7+aEβ7+淋巴细胞亚群的丰度。评定记忆CD4T细胞、原生CD4T细胞以及B细胞内的受体占有率和整合素表达。
为了评估受体占有率,全血样品首先用1mM MnCl2处理以允许肽结合,接着预先培育+/-1μM未标记的肽来完全占据(即阻断)α4β7受体。阻断和未阻断的样品用1nM Alexa647标记的肽染色,随后用针对α4β7、CD45、CD4、CD45RA以及CD19的抗体染色。接着加工样品以溶解红血球和固定白血球,随后是用第二步骤试剂(抗生蛋白链菌素-BV421)染色和洗涤步骤。
为了评定整合素表达和细胞亚群丰度,除了针对CD45、CD4、CD45RA以及CD19的抗体之外,全血样品用针对α4、β7以及αE的抗体染色。接着加工样品以溶解红血球和固定白血球,随后是用第二步骤试剂(抗生蛋白链菌素-BV421)染色和洗涤步骤。
全部经染色的样品通过流动式细胞量测术分析,收集恒定样品体积以允许计算绝对细胞计数。在一种情况中,通过测定血细胞已经与未标记的肽接触之后结合于血细胞的经标记的肽的量,并且测定细胞上呈现的α4β7的量来测定受体占有率,其中细胞上呈现的a4β7的量与经标记的肽所结合的量之间的差异表示未标记的肽的受体占有率。
在某些实施例中,本发明包括经标记(例如可检测标记)的本文所述的化合物或肽,包括(但不限于)本文所述的任何肽二聚体化合物,例如根据式(I)(包括I-A、I-B、I-C、I-D、I-E、I-F、I-G、I-H、I-I以及I-J中的任一个)、式(II)、式(III)、式(A)、式(B)、式(C)、式(D)、式(S)、式(X)或式(H)的肽二聚体化合物,或本文所述的任何肽单体化合物,例如根据式(IV)(包括IV-A、IV-B、IV-C、IV-D、IV-E、IV-F、IV-G、IV-H、IV-I以及IV-J中的任一个)、式(V)(包括V-A)、式(VI)、式(A)、式(B)、式(C)或式(D)的肽单体化合物。在具体实施例中,肽化合物或肽经荧光标记。
在某些实施例中,本发明包括可检测标记的本发明的肽、肽单体化合物或肽二聚体化合物,其包含本文所述的任何肽中存在的任何氨基酸序列。在具体实施例中,肽化合物或肽经荧光标记。
在具体实施例中,本发明包括包含以下氨基酸序列中的任一个的肽、肽二聚体化合物或肽单体化合物:
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe-(4-COOH)-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-(N-Me-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-Glu-(N-Me-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(D-Lys);或
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-(N-Me-D-Lys),
其中两个Pen残基之间任选地存在二硫键。
在具体实施例中,肽二聚体化合物包含以下序列或结构中的一个:
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(D-Lys)]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe-(4-COOH)-(β-homoGlu)-(D-Lys)]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-(N-Me-Lys)]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys)]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys)]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-Glu-(N-Me-Lys)]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-(D-Lys)]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys)]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(D-Lys)]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-(N-Me-D-Lys)]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(D-Lys)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe-(4-COOH)-(β-homoGlu)-(D-Lys)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-(N-Me-Lys)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-Glu-(N-Me-Lys)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-(D-Lys)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(D-Lys)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-(N-Me-D-Lys)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(D-Lys)-OH]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe-(4-COOH)-(β-homoGlu)-(D-Lys)-OH]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-(N-Me-Lys)-OH]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys)-OH]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys)-OH]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-Glu-(N-Me-Lys)-OH]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-(D-Lys)-OH]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)-OH]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)-OH]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)-OH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys)-OH]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)-OH]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(D-Lys)-OH]2-DIG;或
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-(N-Me-D-Lys)-OH]2-DIG,
其中在某些实施例中,在两个Pen残基之间存在二硫键。
在具体实施例中,肽单体化合物包含以下序列或结构中的一个:
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe-(4-COOH)-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-(N-Me-Lys);
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-Glu-(N-Me-Lys);
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys);
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys);
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys);
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys);
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-(N-Me-D-Lys);
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(D-Lys)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe-(4-COOH)-(β-homoGlu)-(D-Lys)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-(N-Me-Lys)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-Glu-(N-Me-Lys)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-(D-Lys)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(D-Lys)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-(N-Me-D-Lys)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(D-Lys)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe-(4-COOH)-(β-homoGlu)-(D-Lys)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-(N-Me-Lys)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-Glu-(N-Me-Lys)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-(D-Lys)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(D-Lys)-NH2;或
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-(N-Me-D-Lys)-NH2
其中在某些实施例中,在两个Pen残基之间存在二硫键。
在具体实施例中,肽、肽单体化合物或肽二聚体化合物经标记,例如经可检测标记,例如经荧光团荧光标记或经放射性同位素放射性标记。可使用多种可检测分子,例如放射性同位素、荧光染料、染料、酶、纳米粒子、化学发光标记物、生物素,或所属领域中已知可以直接(例如通过发光)或间接(例如通过结合荧光标记的抗体)检测的其它单体。
可检测标记的用途在所属领域中众所周知。可以根据本发明使用可检测标记。结合多肽和可检测标记的方法在所属领域中众所周知,如使用可检测标记成像的方法。用可检测标记标记的嵌合多肽感测器可用于采用多种标记的多种分析法中。在本发明的一些实施例中,可以通过将可检测标记连接到嵌合多肽感测器来促进泛素蛋白质或泛素样蛋白质的种类检测。在一些实施例中,可以通过将可检测标记连接到竞争对手泛素蛋白质或竞争对手泛素样蛋白质来促进泛素蛋白质种类或泛素样蛋白质种类的检测。
可检测标记的实例包括(但不限于)放射性核素、酶、辅酶、荧光剂、化学发光剂、色原、酶底物或辅因子、酶抑制剂、辅基复合物、自由基、粒子、染料等。若干放射性同位素可以用作用于标记肽的可检测分子,包括例如32P、33P、35S、3H以及125I。适合酶的实例包括辣根过氧化酶、碱性磷酸酶、β-半乳糖苷酶或乙酰胆碱酯酶;适合辅基复合物的实例包括抗生蛋白链菌素/生物素和抗生物素蛋白/生物素;适合荧光材料的实例包括伞酮、荧光素、异硫氰酸荧光素、若丹明、二氯三嗪基胺荧光素、丹磺酰氯或藻红蛋白、香豆素、Alexa488、俄勒冈绿488(Oregon green 488)、若丹明绿、Alexa 532、Cy3、Bodipy 588/586、Alexa586、TAMRA、Rox、Alexa 594、德克萨斯红(Texas red)、Bodipy 630/650、Cy5、Alexa647、IR染料680、IR染料680、IR染料700DX、Cy5.5、Alexa 750、IR染料800CW、IR染料800、Atto 532、Atto465;发光材料的实例是鲁米诺(luminol);生物发光材料的实例包括萤光素酶、荧光素和发光蛋白质;以及适合放射性材料的实例包括125I、131I、35S或3H。在一些实施例中,可检测标记包括荧光蛋白。适合荧光蛋白包括TagBFP、mTagBFP2、Azurite、EBFP2、mKalama1、Sirius、Sapphire、T-Sapphire、ECFP、Cerulean、SCFP3A、mTurquoise、mTurquoise2、单体Midoriishi-青、TagCFP、mTFP1、GFP、EGFP、Emeral、Superfolder GFP、单体Azami绿、TagGFP2、mUKG、mWasabi、Clover、mNeonGreen、EYFP、YFP、Citrine、Venus、SYFP2、TagYFP、单体Kusabira橙、MKOK、mKO2、mOrange、mOrange2、mRaspberry、mCherry、mStrawberry、mTangerine、tdTomato、TagRFP、TagRFP1、mApple、mRuby、mRuby2、TagRFP675、IFP1.4、iFRP、mKeima红、LSS-mKate1、LSS-mKate2、mBeRFP、PA-GFP、PAmCherry1、PATagRFP、Kaede绿、Kaede红、KikGR1绿、KikGR1红、PS-CFP2、mEos2绿、mEos2红、mEos3.2绿、mEos3.2红、PSmOrange。在本发明的一些实施例中,可检测标记还包括适于荧光共振能量传递法(FRET)配对的淬灭剂。适合淬灭剂的实例包括Dabcyl、BHQ1、BHQ2、BHQ3、CY5Q、CY7Q、IowablackFQ、Iowablack RQ、IR染料QC-1、QSY35、QSKY7、QXL570、QXL610、QXL680。
实例
实例1
肽分子的合成
本发明的肽单体化合物和肽二聚体化合物可以通过所属领域的技术人员已知的许多技术合成。使用本文提供的技术合成、纯化和二聚新颖肽单体和肽二聚体子单元。
合成
使用梅里菲尔德固相合成技术(Merrifield solid phase synthesistechnique)在蛋白质技术的交响曲多通道合成器(Symphony multiple channelsynthesizer)上使用标准Fmoc化学方法合成本发明的肽。所用氨基酸是标准侧链保护基与Fmoc化学方法相容的Fmoc氨基酸。使用HBTU(六氟磷酸O-苯并***-N,N,N',N'-四甲基-脲鎓)、二异丙基乙胺(DIEA)偶合条件装配肽。对于一些氨基酸偶合,使用PyAOP六氟磷酸(7-氮杂苯并***-1-基氧基)三吡咯烷基鏻)和DIEA条件。对于一些氨基酸偶合,使用Oxyma((羟亚氨基)氰基乙酸乙酯)和DIC条件。具有C末端酰胺的肽使用林克酰胺MBHA树脂(RinkAmide MBHA resin)(100-200目,0.57mmol/g)并且具有C末端酸的肽使用具有N-a-Fmoc保护的氨基酸的预加载Wang树脂。制备100mmol浓度的偶合剂(HBTU和DIEA预混合)。类似地,制备100mmol浓度的氨基酸溶液。
装配
使用针对Fmoc化学方法的标准交响曲合成器方案装配肽。如下装配肽序列:各反应小瓶中的树脂(250mg,0.14mmol)用4ml DMF洗涤两次,随后用2.5ml 20%4-甲基哌啶(Fmoc脱除保护)处理10分钟。树脂接着过滤并且用DMF(4ml)洗涤两次,并且用N-甲基哌啶再重新处理30分钟。树脂再用DMF(4ml)洗涤三次,随后添加2.5ml氨基酸和2.5ml HBTU-DIEA混合物。45min频繁搅拌之后,将树脂过滤并且用DMF洗涤三次(各4ml)。在偶合反应完成之后,树脂用DMF洗涤三次(各4ml),随后进行下一次氨基酸偶合。针对肽序列中特定数目的氨基酸重复Fmoc脱除保护基和氨基酸偶合循环。对于偶合到N-Me-Arg的Pen(Trt),使用2.0当量氨基酸、2.2当量oxyma以及2.0当量DIC,并且使用四氯醌测试监测反应的完成。
裂解
在肽装配完成之后,通过用裂解试剂,例如试剂K(82.5%三氟乙酸(gluoroaceticacid)、5%水、5%硫代苯甲醚、5%酚类或2.5%1,2-乙烷二硫醇)处理从树脂裂解肽。裂解试剂能够成功地从树脂以及全部剩余侧链保护基裂解肽。
裂解肽在冷***中沉淀,随后用***洗涤两次。倒出滤液并且添加第二等分试样的冷***,并且重复所述程序。将粗肽溶解于乙腈:水溶液(具有1%TFA的7:3)中并且过滤。接着在纯化之前使用电喷雾电离质谱(ESI-MS)(Micromass/Waters ZQ)检验线性肽的质量。
经氧化形成二硫键
将50mg粗裂解肽溶解于20ml水:乙腈中。接着在搅拌下逐滴添加乙酸中的饱和碘直到持续为黄色。搅拌溶液15分钟,并且使用分析HPLC和LCMS监测反应。当反应完成时,添加固体抗坏血酸直到溶液变得澄清。接着通过首先用水稀释,接着装载到逆相HPLC机(LunaC18支撑物,10μ,100A,移动相A:含有0.1%TFA的水,移动相B:含有0.1%TFA的乙腈(ACN),梯度以5%B开始,并且在15ml/min下经60分钟变成50%B)上来纯化溶剂混合物。接着在冻干器中冷冻干燥含有纯产物的溶离份。
内酰胺键形成
将100mg粗裂解肽(约0.12mmol)溶解于100ml无水二氯甲烷中。添加HOBt(1-羟基苯并***水合物)(0.24mmol,2当量),随后DIEA(N,N-二异丙基乙胺)(1.2mmol,10当量)和TBTU(四氟硼酸O-(苯并***-1-基)-N,N,N',N'-四甲基脲鎓)(0.24mmol,2当量)。搅拌混合物隔夜,并且通过HPLC追踪反应。当反应完成时,蒸发二氯甲烷并且用水和乙腈稀释,接着装载到逆相HPLC机(Luna C18支撑物,10μ,100A,移动相A:含有0.1%TFA的水,移动相B:含有0.1%TFA的乙腈(ACN),梯度以5%B开始,接着经60分钟变成50%B,15ml/min流动速率)上。接着在冻干器中冷冻干燥含有纯产物的溶离份。
纯化
在Gemini C18柱(4.6mm×250mm)(菲罗门(Phenomenex))上进行分析型逆相高效液相色谱(HPLC)。在Gemini 10μm C18柱(22mm×250mm)(菲罗门)或Jupiter 10μm,300A°C18柱(21.2mm×250mm)(菲罗门)上进行半制备型逆相HPLC。使用线性梯度的缓冲液含B的A(移动相A:含有0.15%TFA的水,移动相B:含有0.1%TFA的乙腈(ACN)),流动速率1mL/min(分析型)和15mL/min(制备型)实现分离。使用线性梯度的缓冲液含B的A(移动相A:含有0.15%TFA的水,移动相B:含有0.1%TFA的乙腈(ACN)),流动速率1mL/min(分析型)和15mL/min(制备型)实现分离。
连接子活化和二聚
小规模DIG连接子活化程序:向含有IDA二酸(304.2mg,1mmol)、N-羟基丁二酰亚胺(NHS,253.2mg,2.2当量,2.2mmol)和搅拌棒的玻璃小瓶中添加5mL NMP。在室温下搅拌混合物以完全溶解固体起始物质。接着向混合物添加N,N'-二环己基碳二亚胺(DCC,453.9mg,2.2当量,2.2mmol)。10分钟内出现沉淀,并且在室温下进一步搅拌反应混合物隔夜。接着过滤反应混合物去除沉淀的二环己基脲(DCU)。在用于二聚之前,经活化的连接子保持于封闭小瓶中。经活化的连接子的标称浓度为约0.20M。
对于使用PEG连接子二聚,不涉及预先活化步骤。使用可在市面上购得的预先活化的双官能PEG连接子。
二聚程序:向含有肽单体(0.1mmol)的小瓶添加2mL无水DMF。使用DIEA将肽的pH调整到8~9。接着向单体溶液添加经活化的连接子(DIG、IDA或PEG13、PEG25)(相对于单体0.48当量,0.048mmol)。在室温下搅拌反应混合物一小时。使用分析型HPLC监测二聚反应的完成。完成二聚反应的时间视连接子而变化。反应完成之后,肽在冷***中沉淀并且离心。弃去上清液***层。重复沉淀步骤两次。粗二聚体接着使用逆相HPLC(Luna C18支撑物,10μ,100A,移动相A:含有0.1%TFA的水,流动相B:含有0.1%TFA的乙腈(ACN)、15%B梯度并且经60分钟变成45%B,流动速率15ml/min)纯化。接着在冻干器中冷冻干燥含有纯产物的溶离份。
实例2
肽二聚体分子的表征
使用多种体外和体内分析法测定特定肽单体化合物和肽二聚体化合物的稳定性、效能和选择性。
α4β7-MAdCAM竞争ELISA
用rh整合素α4β7(安迪生物公司(R&D Systems)#5397-A30)以800ng/孔涂布镍涂布的培养盘(Pierce#15442)并且在室温下在振荡下培育1小时。接着通过振荡去除溶液并且用分析缓冲剂(50mM Tris-HCl pH7.6、150mM NaCl、1mM MnCl2或MgCl2、0.05%Tween-20以及0.5%BSA)以250μl/孔阻断。培养盘接着在室温下培育1小时。各孔用洗涤缓冲液(50mMTris-HCl pH7.6,100mM NaCl,1mM MnCl2或MgCl2,0.05%Tween-20)洗涤3次。向各孔添加25μl肽连续稀释液(在分析缓冲液中3倍稀释),其在20μM开始。接着向各孔添加固定浓度20nM的25μl重组人类MAdCAM-1(安迪生物公司#6056-MC)。最终起始肽浓度为10μM,并且最终MAdCAM-1浓度为10nM。培养盘接着在室温下培育1小时以达到结合平衡。各孔接着用洗涤缓冲液洗涤三次。接着向各孔添加在分析缓冲液中1:2000倍稀释的50μl小鼠抗人类IgG1-HRP(英杰公司(Invitrogen)#A10648)。各孔在室温下在振荡下培育45分钟。各孔接着用洗涤缓冲液洗涤3次。接着向各孔中添加100μl 3,3',5,5'--四甲基联苯胺(TMB)并且在形成时间期间密切观察。用2N H2SO4停止反应并且在450nm下读取吸光度。
TMB是适用于利用辣根过氧化酶结合物的ELISA程序中的显色底物。这一底物产生蓝色并且可以在370或655nm处以分光光度法读取的可溶性最终产物。可以使用2M H2SO4停止反应,产生在450nm处读取的黄色溶液。各片剂含有1mg TMB底物。为了制备TMB底物溶液,在1ml DMSO中溶解一片3,3',5,5'--四甲基联苯胺片剂并且添加到9ml 0.05M磷酸盐-柠檬酸盐缓冲液,pH 5.0中。在即将使用之前,每10ml底物缓冲溶液添加2μl新鲜30%过氧化氢(产品号H 1009)。
α4β1-VCAM竞争ELISA
Nunc MaxiSorp培养盘用每孔50μl中1×PBS中的400ng/孔rh VCAM-1/CD106Fc嵌合体(R&D#862-VC)涂布并且在4℃下培育隔夜。通过振荡去除溶液,接着每孔用250μl含1%BSA的1×PBS阻断。各孔接着在室温下在振荡下培育1小时。各孔接着用洗涤缓冲液(50mMTris-HCl pH7.6,100mM NaCL,1mM MnCl2或MgCl2,0.05%Tween-20)洗涤一次。向各孔添加以200μM开始的分析缓冲液(分析缓冲液:50mM Tris-HCl pH7.6、100mM NaCl、1mM MnCl2或MgCl2、0.05%Tween-20)中的25μl肽连续稀释液。另外,向各孔添加120nM固定浓度的25μlα4β1(安迪生物公司#5668-A4)。最终肽和α4β1浓度分别是100μM和60nM。培养盘接着在37℃下培育2小时。接着通过振荡去除溶液,并且各孔用洗涤缓冲液洗涤三次。接着向各孔添加50μl 4μg/ml 9F10抗体(经纯化的小鼠抗人类CD49d,碧迪生物科学(BD Bioscience)目录号555502),在室温下在振荡下培育培养盘1小时。再次通过振荡去除溶液,并且各孔用洗涤缓冲液洗涤三次。向各孔添加在分析缓冲液中1:5000倍稀释的50μl过氧化酶结合的AffiniPure山羊抗小鼠IgG(杰克逊免疫研究(Jackson immune research)目录号115-035-003)。培养盘在室温下在振荡下培育30分钟。各孔接着用洗涤缓冲液洗涤3次。接着向各孔添加100μl TMB且在形成时间期间密切观察。用2N H2SO4停止反应并且在450nm下读取吸光度。
α4β7-MAdCAM细胞粘附分析法
在补充有10%血清(胎牛血清,英杰公司#16140-071)、1mM丙酮酸钠(英杰公司#11360-070)、2mM L-谷氨酰胺(英杰公司#25030-081)以及每毫升100单位青霉素和100μg链霉素的青霉素-链霉素(英杰公司#15140-122)的RPMI 1640HEPES培养基(英杰公司#22400-089)中培养RPMI 8866人类细胞(西格玛(Sigma)#95041316)。细胞在补充有0.1%BSA、10mMHEPES pH 7和1mM MnCl2的DMEM培养基(ATCC#30-2002)中洗涤两次。细胞以4×106个细胞/ml的密度再悬浮于补充DMEM培养基中。
Nunc MaxiSorp培养盘用每孔50μl 1×PBS中的200ng/孔rh MAdCAM-1/Fc嵌合体(R&D#6065-MC)涂布并且在4℃下培育隔夜。接着通过振荡去除溶液,用每孔250μl含有1%BSA的PBS阻断,并且在37℃下培育1小时。通过振荡去除溶液。通过连续稀释以每孔50μl最终体积(2×浓度)来稀释肽。向各孔添加50μl细胞(200,000个细胞)并且在37℃,5%CO2下培育培养盘30-45分钟以允许细胞粘附。用经补充的DMEM手动洗涤各孔三次(每次洗涤100μl)。最终洗涤之后,添加100μl/孔经补充的DMEM和10μl/孔MTT试剂(ATTC目录号30-1010K)。培养盘在37℃,5%CO2下培育2-3小时,直到可见紫色沉淀物。向各孔添加100μl清洁剂试剂(ATTC目录号30-1010K)。将培养盘盖上盖子以免光照,包覆在石蜡膜中防止蒸发,并且在暗处保持于室温下隔夜。振荡培养盘5分钟并且在570nm下测量吸光度。为了计算剂量反应,从各测试孔减去不含细胞的对照孔的吸光度值。
α4β1-VCAM细胞粘附分析法
在补充有10%血清(胎牛血清,英杰公司#16140-071)、1mM丙酮酸钠(英杰公司#11360-070)、2mM L-谷氨酰胺(英杰公司#25030-081)以及每毫升100单位青霉素和100μg链霉素的青霉素-链霉素(英杰公司#15140-122)的RPMI 1640HEPES培养基(英杰公司#22400-089)中培养Jurkat E6.1人类细胞(西格玛#88042803)。细胞在补充有0.1%BSA、10mMHEPES pH 7和1mM MnCl2的DMEM培养基(ATCC#30-2002)中洗涤两次。细胞以4×106个细胞/ml的密度再悬浮于补充DMEM培养基中。
Nunc MaxiSorp培养盘用每孔50μl中1×PBS中的400ng/孔rh VCAM-1/CD106Fc嵌合体(R&D#862-VC)涂布并且在4℃下培育隔夜。接着通过振荡去除溶液,用每孔250μl含有1%BSA的PBS阻断,并且在37℃下培育1小时。通过振荡去除溶液。通过连续稀释以每孔50μl最终体积(2×浓度)来稀释肽。向各孔添加50μl细胞(200,000个细胞)并且在37℃,5%CO2下培育培养盘30-45分钟以允许细胞粘附。用经补充的DMEM手动洗涤各孔三次(每次洗涤100μl)。最终洗涤之后,添加100μl/孔经补充的DMEM和10μl/孔MTT试剂(ATTC目录号30-1010K)。培养盘在37℃,5%CO2下培育2-3小时,直到可见紫色沉淀物。向各孔添加100μl清洁剂试剂(ATTC目录号30-1010K)。将培养盘盖上盖子以免光照,包覆在石蜡膜中防止蒸发,并且在暗处保持于室温下隔夜。振荡培养盘5分钟并且在570nm下测量吸光度。为了计算剂量反应,从各测试孔减去不含细胞的对照孔的吸光度值。
α4β7细胞粘附分析法(小鼠)
TK1细胞(ATCC#ATCC-CRL-2396)在具有2mM L-谷氨酰胺的RPMI 1640中培养,RPMI1640调整成含有1.5g/L碳酸氢钠、4.5g/L葡萄糖、10mM HEPES以及1.0mM丙酮酸钠(ATCC#30-2001)并且补充有0.1mM非必需氨基酸(ATCC#30-2116)、0.05mM 2-巯基乙醇(英杰公司#21985)和10%血清(胎牛血清,英杰公司#16140-071),以及每毫升100单位青霉素和100μg链霉素的青霉素-链霉素(英杰公司#15140-122)。细胞在补充有0.1%BSA、10mM HEPES pH7和1mM MnCl2的DMEM培养基(ATCC#30-2002)中洗涤两次。细胞以4×106个细胞/ml的密度再悬浮于补充DMEM培养基中。
Nunc MaxiSorp培养盘用每孔100μl 1×PBS中的200ng/孔重组人类MAdCAM-1Fc嵌合体(R&D#6065-MC)涂布并且在4℃下培育隔夜。接着通过振荡去除溶液,用每孔250μl含有1%BSA的PBS阻断,并且在37℃下培育1小时。通过振荡去除溶液。通过连续稀释以每孔50μl最终体积(2×浓度)来稀释DATK 32(抗小鼠α4β7)和肽。向各孔添加50μl细胞(200,000个细胞)并且在37℃,5%CO2下培育培养盘30-45分钟以允许细胞粘附。用经补充的DMEM手动洗涤培养盘三次,每次洗涤100μl。最终洗涤之后,向各孔添加100μl/孔经补充的DMEM和10μL/孔MTT试剂(ATTC目录号30-1010K)。各孔在37℃,5%CO2下培育2-3小时,直到可见紫色沉淀物。向各孔添加100μl清洁剂试剂(ATTC目录号30-1010K)。接着用石蜡膜包覆培养盘以防止蒸发,并且在暗处保持于室温下隔夜。振荡培养盘5分钟并且在570nm下测量吸光度。为了计算剂量反应,从各测试孔减去不含细胞的对照孔的吸光度值。
PBMC记忆T细胞粘附分析法
从亚拉贡生命科学公司(Aragen Bioscience Inc.)(加利福尼亚州摩根山(Morgan Hill,CA))的人类末梢血液单核细胞(PBMC)供体分离新鲜CD4+/CD45RO+记忆T细胞。使用以500ng/孔固定于Greiner Fluotrac培养盘上的50mM碳酸氢钠缓冲液pH 9.5,ON,4C中的IgG Fc捕捉抗体(驴抗人类)(每孔100μl)制备分析培养盘。培养盘用阻断缓冲液(25mM Tris HCl,pH7.5、150mM NaCl、1.5%BSA、.05%Tween)冲洗两次,并且用每孔200μl阻断缓冲液在37℃下阻断2小时或在室温下阻断5小时。去除阻断缓冲液并且添加400ng/孔阻断缓冲液中的MAdCAM-1或VCAM-1,并且培养盘在4℃下培育隔夜(每孔100μl)。培养盘用阻断缓冲液洗涤两次,并且用200μl结合培养基(不含DMEM酚红,10mM HEPES、1×丙酮酸Na、1×谷氨酰胺并且在使用之前补充1mM MnCl2)冲洗一次。为了制备细胞,使用血球计通过锥蓝排除法计数约25,000,000个CD4+/CD45RO+记忆T细胞,测定活力和细胞数。将细胞转移到50ml圆锥管,并且在1200rpm下离心10分钟。抽吸培养基并且将细胞团再悬浮于15ml结合培养基中。将细胞再次离心并且再悬浮于适当量的结合培养基中以用于分析(在2×最终密度下每孔50μl细胞)。向各孔添加相等体积(50μl)测试化合物并且在37℃,5%CO2下培育培养盘1.5小时。各孔用每孔150μl结合培养基冲洗3×。如制造商所提议制备CyQuant NF试剂),并且每孔添加100μl CyQuant NF试剂。培养盘在37℃,5%CO2下培育45分钟。通过使用黑色粘合密封件来保护培养盘免受光照。使用分子装置Gemini EM荧光盘读取器(Ex 485/Em530,底部读取,读取灵敏度=20)测量荧光强度。使用Graph Pad Prism产生IC50曲线,并且使用非线性回归(四参数)算法分析曲线。绘制log(浓度)对比RFU(Ex485/Em530)来测定IC50值。
模拟肠液(SIF)稳定性分析法
在模拟肠液(SIF)中进行研究来评估本发明的肽分子的肠道稳定性。为了制备SIF试剂,通过将0.348g NaOH、3.954g单水合磷酸二氢钠和6.186g NaCl溶解于最终体积1L水(最终pH=6.5)中来制备空白FASSIF。向这一溶液中添加24g猪胰酶(西格玛产品目录P7545)并且搅拌30分钟(最终胰酶浓度是2.4%)。溶液经厚棉布和1号惠特曼过滤器(Whatman filter)过滤,并且10ml等分试样储存于-70℃下。为了进行反应,10ml等分试样在37℃下解冻,并且去除125μl等分试样并且与相等体积的空白FASSIF混合。肽储备溶液(100%DMSO中10mM)在空白FASSIF中稀释75倍。稀释肽的50μl等分试样与125μl胰酶(2.4%)和125μl空白FASSIF组合产生最终浓度1%胰酶和22μM肽。反应物在37℃下培育,并且在多个时间点去除50μl等分试样并且添加到200μl含有50%乙腈、50%甲醇、5%甲酸和1μg/ml内标的淬灭溶液中。淬灭的样品在10,000rpm下离心10分钟,并且通过LCMS/MS分析上清液。基于测试化合物比内标的峰面积反应比计算每个时间点的剩余百分比。通过使用GraphPad与一级指数衰减方程拟合来计算半衰期。
肠道清洗液分析法
从提前禁食至少6小时的大鼠制备肠道清洗液分析溶液。对动物实施安乐死并且从颚部的点到耻骨做中线切开。通过在任一侧对前胸壁做2个切口来打开腹部和胸部。使用止血钳夹掉动物胃两端的食道与胃会合之处和胃与十二指肠会合之处。还使用止血钳夹住从胃与十二指肠会合处开始肠道下方2-3cm。
通过从主体分离20cm小肠来制备肠道清洗液分析溶液。分离20cm之后,用止血钳夹住末端并且从主体切下所述区段,将止血钳原地留在去除的区段上。使用1mL注射器抽取1mL冷却的生理食盐水。抬高肠道的一端并且去除钳子。将约2-2.5cm管饲针***到肠道中,并且缓慢注入生理食盐水。使用戴手套的手指沿着肠道的长度向下按揉流体。去除管饲针并且更换肠道末端的夹子。将肠道捋直并且q尖端紧紧的沿着超过肠道的长度向上并且向下操作约3-6次以混合酶与生理食盐水。抬高肠道的一端并且自上而下小心地移动一些流体。去除钳子并且将肠道的所述末端安置于冰上的小称重舟皿上。小心地拾起肠道的另一端并且保持竖直。用戴手套的手指沿着它温柔地向下并且将流体挤入容器中。上述步骤生理食盐水注射和流体取得步骤使用仅0.5mL冷生理食盐水重复两次。用移液管将样品从称重舟皿移取到离心管中并且置于冰上。全部肠道清洗液样品以12,000×g在冷离心机中旋转下来持续10分钟。用移液管将来自各离心样品顶部的上清液移取到冷冻管中,并且在冰上保存直到使用。
使用如上文所述制备的肠道清洗液分析溶液进行肠道清洗液分析。解冻足够量的大鼠肠道清洗液。对于各样品,用移液管将200μL大鼠肠道清洗流体移取到1.5mL微量离心管(Eppendorf tube)中(用于实验的试管数目=测试肽数目×N)。试管在水浴中在37℃下预先培育约10分钟。
通过组合2μl 10mM DMSO原料与128μl 100mM Tris pH 7.5来制备肽工作溶液(2mM)。
制备肽淬灭溶剂(50%ACN-50%MeOH-5%甲酸)+IS(5μg/ml;每2mL淬灭溶剂1μl10mg/mL IS),并且制备淬灭培养盘并置于冰上。针对T=0、10、20、30、60以及180min收集,向淬灭培养盘的各孔中添加200μl淬灭溶液。
对于各测试样品和阳性对照,向肠道清洗流体的试管中添加30μl肽工作溶液。试管温和涡旋并且立即去除30μl,并且在淬灭培养盘的T=0孔中淬灭(用移液管直接移取到淬灭溶液中)。将这一孔紧紧地盖上盖子以防止蒸发。在T=10min、T=20min、T=30min、T=60min以及T=180min去除30μl等分试样并且淬灭。当收集了全部时间点时,淬灭培养盘在10,000rpm下离心10分钟。将150μL各上清液转移到聚丙烯96孔收集培养盘中。向各收集物中添加300μl移动相A,并且进行LC/MS/MS分析来测定各测试样品和阳性对照中剩余的肽的量或浓度。.
模拟胃液(SGF)分析法
通过向10ml水添加20mg NaCl、32mg猪胃蛋白酶(MP生物化学(MP Biochemicals),产品目录02102599)以及70μl HCl来制备SGF(最终pH=2)。SGF等分试样(各0.5ml)在37℃下预先升温。对于所测试的各肽,为了开始反应,向0.5ml SGF添加1μl肽储备溶液(DMSO中10mM)并且彻底混合使得最终肽浓度为20μM。在37℃下在温和振荡下培育反应物。在各时间点(0、15、30、60min),去除50μl等分试样并且添加到200μl含有0.1%甲酸的乙腈中来淬灭反应物。样品在4℃下储存直到实验结束并且在10,000rpm下离心5分钟。去除上清液的等分试样,在含有内标的蒸馏水中1:1倍稀释,并且通过LCMS/MS分析。基于测试化合物比内标的峰面积反应比计算每个时间点的剩余百分比。时间0设定成100%,并且相对于时间0计算全部稍后时间点。通过使用GraphPad与一级指数衰减方程拟合来计算半衰期。
血浆稳定性分析法
向96孔聚丙烯培养盘的每个孔添加0.5mL大鼠血浆(每种肽一个试管,体积取决于打算收集多少个时间点,每个时间点50μL),并且试管在轻缓振荡下预设到37℃的热水浴中培育。向各试管中添加1μL 10mM肽储备溶液,接着向各试管添加200μL乙腈w/0.1%甲酸(1:4)。在以下时间点收集样品:0、10、30、45、60、120、180min。当收集了全部时间点时,培养盘在5000rpm下离心5分钟。通过用移液管将100μL各样品移取到96孔深培养盘的适当孔中来进行LCM分析。向各孔添加移动相A中的100μL内标肽(1μg/mL)。涡旋和注射培养盘。
二硫苏糖醇(DTT)氧化还原稳定性分析法
对于所测试的各肽,通过向1ml 100mM Tris-Cl,pH 7.5(最终肽浓度是50μM)中添加5μl 10mM含肽储备溶液的DMSO来进行DTT稳定性分析法。在时间0min,向含有肽的培育试管添加5μl新鲜解冻的100mM DTT溶液,使得最终DTT浓度是0.5mM。在室温下培育反应物。在高达120分钟的不同时间点(20min、40min、80min、120min),去除50μl等分试样,并且通过添加10μl 5M乙酸来淬灭反应。为了测量亲本肽的消失,通过逆相HPLC和220nm处的UV吸光度来分析淬灭样品(30μl)。剩余的氧化部分对比时间绘曲线图,并且通过使用Excel与一级指数衰减方程拟合来计算半衰期。
半胱氨酸/胱氨酸氧化还原稳定性分析法
通过向495.45μl 100mM Tris-Cl,pH 7.5添加4.545μl 10mM肽DMSO原料将肽稀释到90μM。将75μl等分试样转移到96孔培养盘的一列8个孔中。向各孔添加20μl含2.5mM胱氨酸的100mM Tris-Cl,pH 7.5。新鲜制备以下浓度的100mM Tris-Cl,pH7.5中的半胱氨酸储备溶液:400mM、200mM、80mM、44mM、22mM、11mM、5.5mM以及空白。在时间0,向55μl胱氨酸/肽溶液添加25μl各半胱氨酸储备溶液,并且在室温下培育混合物40min。通过添加20μl 5M乙酸淬灭样品并且通过逆相HPLC分析。计算氧化肽的部分并且如能斯特方程(Nernstequation)所定义针对所计算的氧化还原电势(ORP)绘图。下文显示保留一半氧化肽的ORP。
[半胱氨酸],mM [胱氨酸],mM ORP,mV
1.375 0.5 -176
2.375 0.5 -194
5.5 0.5 -213
11 0.5 -231
20 0.5 -247
50 0.5 -271
100 0.5 -290
表3提供表明多种本发明的肽单体和二聚体的效能、选择性和稳定性的数据。肽单体或肽二聚体子单元的氨基酸序列提供于表3A中,从左到右显示从N末端到C末端,并且由序列识别符编号识别。各肽的随附数据显示于表3B和3C中。二聚体由圆括号后面加下标2来表示。N末端和C末端基团例如分别指示Ac和NH2。二聚体在其单体子单元的C末端处连接,并且连接子表示在肽序列的右侧。所示肽序列中的每一个在位于位置4和位置10处的氨基酸残基(例如Pen和Pen)之间包括二硫键。表4提供证明本发明的肽单体化合物和肽二聚体化合物的更高效能、选择性和稳定性的比较数据。肽单体或肽二聚体子单元的氨基酸序列提供于表4A中,从左到右显示从N末端到C末端,并且由序列识别符编号识别。各肽的随附数据显示于表4B和4C中。二聚体由圆括号后面加下标2来表示。N末端和C末端基团例如分别指示Ac和NH2。所示肽序列中的每一个在位于位置4和位置10处的氨基酸残基(例如Pen和Pen)之间包括二硫键。对于稳定性分析数据,分析法进行不同持续时间,因此t1/2大于某一值的指示意思是在可以测得半衰期之前在所述时间停止分析。对于不显示包含两个Pen残基的肽的数据的DTT分析,预测的DTT分析稳定性超过二小时。
表3-B.说明性肽单体和二聚体的效能、选择性和稳定性
对于IC50数据:≤10是小于或等于10nM;>10是大于10nM并且小于或等于25nM;>25是大于25nM并且小于或等于50nM;>50是大于50nM并且小于或等于100nM;>100是大于100nM并且小于或等于500nM;>500是大于500nM并且小于或等于1,000nM;>1,000是大于1,000nM并且小于或等于10,000nM;>10,000是大于>10,000nM但小于或等于>100,000nM;并且>100,000是大于100,000nM。对于稳定性数据:>180意思是实验在180分钟后停止并且未达到半衰期;>360意思是实验在360分钟之后停止并且未达到半衰期。
表4-A肽单体和二聚体的比较-序列
表4-B肽单体和二聚体的比较--效能和选择性
表4-C肽单体和肽二聚体的比较-稳定性
实例3
生物化学和细胞结合分析法中说明性肽二聚体分子的表征
本发明的某些实施例涉及各自具有下文所示的氨基酸序列的两个肽单体子单元的α4β7整合素拮抗剂肽二聚体:
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-[Phe(4-tBu)]-(β-homoGlu)-(D-Lys)。
两个肽单体子单元各自在各肽单体子单元中存在的两个Pen残基之间含有分子内二硫键。两个肽单体子单元中的每一个含有N末端乙酰基,并且两个肽单体子单元在其C末端中的每一个经DIG连接子二聚产生在本文中称为肽X的肽二聚体,其在下文中图示:
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe(4-tBu))-(β-homoGlu)-(D-Lys)]2-DIG。
进行体外生物化学和细胞结合分析法来进一步表征肽X。
生物化学和细胞结合分析法
对α4β7和α4β1整合素进行生物化学竞争ELISA分析。针对α4β7的ELISA分析法是基于MAdCAM-1与固定α4β7的结合,而α4β1ELISA依赖于可溶性α4β1与固定VCAM-1的结合。这些分析法描述于实例2中。在1mM Mg2+结合条件下,肽X的IC50是3nM并且对α4β7和α4β1分别>10,000nM。另外,肽X的IC50对于α4β1和αLβ2都>100μM。肽X对α4β7T细胞的IC50是1nM。
肽X还阻断MAdCAM-1到表达α4β7整合素的经转型细胞株的粘附。阻断人类B细胞类淋巴母细胞RPMI8866或小鼠T细胞TK1细胞株到MAdCAM-1的粘附的肽X IC50分别是0.72nM和0.50nM。
肽X在细胞粘附分析法中具有高度选择性。人类Jurkat细胞株表达分别特异性粘附到VCAM-1或ICAM-1的α4β1和αLβ2整合素。在Jurkat/VCAM-1或Jurkat/ICAM-1细胞粘附分析法中,肽X在最大测试浓度下失活(IC50>100,000nM)。总体来说,这些结果指示肽X对α4β7特异,并且不阻断α4β1和αLβ2整合素。
肽X还阻断自人类PBMC供体分离的记忆T细胞的粘附。肽X阻断记忆T细胞到MAdCAM-1的粘附。使用自4种不同供体分离的细胞,肽X平均IC50是1.3nM。相比之下,肽X在对α4β1和αLβ2特异的细胞粘附分析法中测试的最高浓度下失活(表5)。
表5.肽X针对自人类PBMC供体分离的记忆T细胞的效能。
整合素 α4β7 α4β1 αLβ2
配位体 MAdCAM-1 VCAM-1 ICAM-1
IC50(nM) 1.3 >100,000 >100,000
使用表面电浆子共振(SPR)进一步评估肽X的结合特性。合成含有经PEG连接子连接到肽X的生物素基团的肽X类似物(肽X-生物素)。还合成与肽X密切相关的具有以下结构的另一肽二聚体并且用生物素标记:
(Ac-Pen-(N-Me-Arg)-S-D-T-L-Pen-W-E-k-NH2)2-DIG
(肽Z)。
维多珠单抗还用化学方式生物素化。将肽X-生物素、肽Z-生物素或生物素标记的维多珠单抗抗体固定到抗生蛋白链菌素涂布的SPR芯片上,并且测量可溶性α4β7整合素的结合。感测器图谱显示肽X-生物素从α4β7整合素解离的计算半衰期是667分钟,或约11小时。这一半衰期非常长,并且可以由肽和整合素上结合的Mn2+金属离子之间的紧密缔合引起。这些SPR研究还显示肽X-生物素的KD是15nM,它比生物素标记的维多珠单抗(59nM;表6)低3.8倍。另外,肽X-生物素的KD大体上低于肽Z-生物素的KD。总之,这些数据显示肽X的结合常数优于抗体维多珠单抗或密切相关的肽二聚体的结合常数。如SPR所测,肽X-生物素的Kon/Koff与维多珠单抗相当或优于维多珠单抗。
表6.肽X、肽Z和维多珠单抗的结合速率常数概述。
解离半衰期t1/2(sec)=ln2/kd
使用席尔德分析(Schild analysis)测定肽X是否以简单竞争机制阻断MAdCAM与α4β7整合素结合。通过ELISA测量在不同肽X浓度下可溶性MAdCAM与固定α4β7整合素蛋白质的结合,并且结果显示通过提高MAdCAM浓度可以克服拮抗作用。这一结果指示肽X与α4β7整合素的结合是可逆的。基于剂量反应偏移,使用整体拟合席尔德分析来测定席尔德斜率和平衡解离常数(KB)。斜率为约1,指示关于MAdCAM的抑制是正立体拮抗作用,并且并非变构拮抗作用。这表明肽X和MAdCAM结合于α4β7整合素上的同一位点。估算的KB值是1nM,其与不同分析法中的其它肽X效能值类似。
体外FACS研究
为了进一步评估人类血液中肽X的选择性,荧光染料Alexa 647在与用于连接生物素的相同位置处结合到肽X。肽X Alexa 647结合物(肽X-Alexa647)在RPMI8866/MAdCAM细胞粘附分析法(IC50=0.15nM)中有活性。肝素化人类全血补充有1mm MnCl2,并且在室温下用肽X-Alexa647结合物或生物素化维多珠单抗染色1小时。固定(红细胞溶解)和洗涤样品。维多珠单抗样品分别在室温下使用用于染色的抗生蛋白链菌素Alexa 647染色30分钟。使用FACS分析评定肽或维多珠单抗到广泛范围的细胞类型的结合,包括NK细胞、嗜碱性球、单核球、嗜酸性球、嗜中性球、CD4原生细胞、CD4记忆T细胞、CD8原生T细胞、CD8记忆T细胞以及B细胞。图10显示与人类全血一起在1mM MnCl2存在下培育的肽X-Alexa647或结合到AlexaFluor 647的维多珠单抗的结合特异性。表3显示全血中几乎相同的维多珠单抗和肽X的结合特异性。表7中所示的维多珠单抗的结合特异性还与文献(佐勒(Soler)等人,JPET 330:864--875,2009)中报道的非常类似。
表7.全血中维多珠单抗或肽X-Alexa647(1nM)的结合特异性。
还通过FACS分析食蟹猕猴的血液。这些研究显示表达α4β7的细胞可以同时结合维多珠单抗和肽X。因此,肽X结合于α4β7上不同于维多珠单抗结合位点的位点。
还测试食蟹猕猴血液中与αEβ7整合素的结合。食蟹猕猴血液与1nM肽X-Alexa647一起培育,并且通过FACS分析表达α4β7或αEβ7的细胞。对于CD4记忆T细胞,肽X-Alexa647结合于α4β7+而非αEβ7+细胞。与α4β7的结合是特异性的,因为其可在大量过量(1μM)未标记的肽X存在下阻断。因此在这些条件下,可以推断肽X结合α4β7而非αEβ7。
实例4
说明性肽二聚体分子的体内表征
还在动物研究(包括食蟹猕猴中的药物动力学研究和小鼠DSS结肠炎模型中的功效研究)中测定肽X的体内药物动力学和功效特征。
食蟹猕猴中的药物动力学研究
为了测定经口投予肽X之后的组织暴露,向食蟹猕猴给予12.5mg/kg、25mg/kg或75mg/kg的肽X PO QD持续8天。媒剂是50mM磷酸盐缓冲液,pH 7。食蟹猕猴中的经口生物可用性(%F)是约0.3%。在最后一次给药之后4小时收集样品。肽X含量通过质谱分析法测量并且以nM作为单位显示于表8中,表明肠道组织中的肽X暴露比血浆中高得多。
表8.食蟹猕猴组织中的肽X暴露
剂量(mg/kg) 血浆 结肠 小肠 肠系膜***
12.5 2 4157 661 1501
25 5 1549 293 138
75 21 15460 7842 1980
为了进一步评估高等物种中肽X的体内特性,向食蟹猕猴给予肽X持续7天。每天一次经口(鼻胃管插管)给予。在第0天(给药之前)和第6天(最后一次给药之后1小时)收集全血(约3.5mL)用于PK和PD分析。第6天,还从未给药动物收集血液。对于PD,使用FACS分析测量受体占有率,下调α4β7表达和表达整合素α4β7的T细胞的循环含量。表9显示测试基团的组构。
表9.7天食蟹猕猴研究的测试基团的组构
对于FACS分析,来自食蟹猕猴的肝素化全血用两组抗体中的每一个染色来评估(1)肽X处理样品中α4β7受体占有程度和(2)循环α4β7+、αEβ7+以及α4β7+aEβ7+淋巴细胞亚群的丰度。评定记忆CD4T细胞、原生CD4T细胞以及B细胞内的受体占有率和整合素表达。为了评估受体占有率,全血样品首先用1mM MnCl2处理以允许肽X结合,接着预先培育+/-1μM未标记的肽X来完全占据(即阻断)α4β7受体。阻断和未经阻断的样品用1nM Alexa 647标记的肽X染色,随后用针对α4β7、CD45、CD4、CD45RA以及CD19的抗体染色。加工样品来溶解红血球和固定白血球,随后是用第二步骤试剂(抗生蛋白链菌素-BV421)染色和洗涤步骤。为了评定整合素表达和细胞亚群丰度,除了针对CD45、CD4、CD45RA以及CD19的抗体之外,全血样品用针对α4、β7以及αE的抗体染色。加工样品以溶解红血球和固定白血球,随后是用第二步骤试剂(抗生蛋白链菌素-BV421)染色和洗涤步骤。全部经染色的样品通过流动式细胞量测术分析,收集恒定样品体积以允许计算绝对细胞计数。
图14显示血液中的受体占有率百分比随着经口剂量增加,并且最高剂量下的受体占有率超过90%。
图15显示各动物的受体占有率百分比对比肽X血浆浓度。通过外推法估算约0.35nM的肽X血浆浓度足以占据血液中50%α4β7受体。
图16展示CD4记忆T细胞上的α4β7表达在全部剂量下都降低。这与诱发一些α4β7内化的肽X结合相符。
还测量循环α4β7+记忆T细胞的含量。图17显示肽X给药引起根据全部CD4细胞标准化的α4β7+记忆T细胞的百分比增加。这与小鼠研究类似。阻断α4β7+记忆T细胞复位到肠道,导致其再分布到血液。
肽X对DSS小鼠中α4β7记忆T细胞的运输的作用
在小鼠DSS结肠炎模型中显示肽X对记忆T细胞运输的作用。这一研究显示肽X通过从肠道淋巴性组织向血液和脾脏分流α4β7记忆T细胞来影响T细胞复位。
通过从第0天到第5天暴露于3%DSS处理的饮用水在C57BL/6雄性小鼠(每组10只动物)中诱发结肠炎,此时将动物转移到标准饮用水。每天一次记录动物死亡情况,并且对存活动物称重并且目测腹泻和/或血便的存在。在第9天即将处死之前,使用视频内窥镜检查评定全部动物中的结肠炎严重程度,并且所得图像由对群组身份不知情的观察者对结肠炎严重程度进行评分。
在第0天开始,每天两次向小鼠给予经口剂量的媒剂/模拟对照(第1组)或肽X(第2组:10mg/kg,PO,BID)。第9天,仅投与AM治疗剂量。还在第2组的动物的饮用水中投予0.2mg/mL浓度的肽X。测量第1组和第2组的饮用水瓶子重量,并且使用耗水量来评估经饮用水摄取的肽剂量。基于每日耗水量,估算出来自经口管饲和饮用水的组合的平均每日肽X剂量是49mg/kg。
第9天,在最终管饲剂量投予之后约四个小时处死小鼠。从各动物收集脾脏、派氏***(PP)、肠系膜***(MLN)以及血液并且针对TH记忆细胞上α4和β7表达的FACS分析进行加工。在同一天进行记录和FACS分析。
这些研究显示用肽X处理对体重减轻、流体摄入、结肠重量或长度、或血便和腹泻的存在(数据未显示)没有显著作用。用肽X处理对内窥镜检查评分具有显著作用,使评分从2.60±1.6(媒剂)到1.78±1.5(肽X)(平均值±SD;图8)减少了32%。内窥镜检查图像的目测评定指示肽X与媒剂对照物相比降低结肠脆度并且提高粘膜愈合(图9)。
用肽X处理对血液和脾脏中的记忆T细胞群体具有显著作用(图10)。每毫升血液的全部α4β7记忆细胞有42%增加(10A),并且从脾脏回收的全部α4β7记忆细胞有73%增加(10B)。对于血液和脾脏,记忆细胞(作为TH细胞的百分比)和全部记忆细胞的数目也有显著增加。血液或脾脏中的细胞总数没有发现显著差异。
用肽X处理对MLN和派氏***中的α4β7+记忆T细胞群体具有显著作用(图11)。与媒剂对照物相比,MLN(11A)和派氏***(11B)中α4β7+记忆细胞相对于全部细胞的百分比分别降低23%和55%。
对于PK测量,在最后一次AM剂量之后约4小时从近端和远端结肠收集结肠区段并且通过质谱分析法分析。近端结肠中的暴露比远端结肠中的暴露高约3倍(图12)。血液中的肽X浓度与近端和远端结肠中相比分别低84倍和31倍。然而此时,血浆浓度比阻断α4β7结合到MAdCAM的肽IC50值高约80倍。
进行额外DSS结肠炎研究,其显示用肽X处理减少肠道淋巴性组织中的α4β7+T细胞并且将其重新定向到血液(图13)。在这9天DSS结肠炎研究中,C57BL/6小鼠从第1天到第6天用3%DSS处理,并且换成标准水直到第10天。日常给药是PO BID加上用于肽X的饮用水,并且每3天25mg/kg IP抗α4β7抗体DATK32。收集PP和血液并且通过FACS分析α4β7+记忆T细胞的含量。
慢性DSS结肠炎小鼠模型中肽抑制剂的功效
为了进一步评估本发明的肽处理结肠炎的功效,使用慢性DSS结肠炎小鼠模型检查与媒剂对照物或抗体MECA 367和DATK32相比经口投予的肽X或另一肽(肽XX)的作用。肽XX是具有以下结构的二聚体,其中DIG连接两个肽单体的C末端:
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-S-D-T-L-Pen-W-(β-HomoGlu)-(D-Lys)-NH2]2-DIG。
在这15天慢性DSS结肠炎研究中,BALB/c小鼠用2.5%DSS持续处理。肽X给药是饮用水中55mg/kg/天、17mg/kg/天或6mg/kg/天。肽XX给药是10mg/kg PO BID加上饮用水中的0.2mg/ml。抗α4β7Ab DATK32以25mg/kg IP每3天给予一次,并且抗MAdCAM Ab MECA 367以8mg/kg IP每天给予一次。记录后,远端结肠区段针对组织病理学固定并且针对使用抗β7抗体M293的β7+细胞IH染色加工。
图18显示肽XX使结肠宏观和组织病理学评分的降低比得上鼠类15天慢性DSS模型中的抗体。
图19显示肽XX减少B7+细胞向远端结肠的固有层中的浸润。
图22显示全部剂量的肽X减少B7+细胞向远端结肠的固有层中的浸润。
在向标准C57BL6小鼠(n=每组2只小鼠)经口投予媒剂或10mg/kg或90mg/kg与Alexa 488结合的肽X之后进行荧光成像。最后一次给药之后3小时捕获小鼠并且收集以下组织:3.8cm近端小肠和3.8cm远端结肠。样品固定于PFA中并且在OCT中冷冻,福马林固定和石蜡包埋。5微米切片用DAPI复染来观察核并且在40X下进行荧光显微镜检查。
媒剂处理的动物显示在小肠或结肠中无荧光信号。10mg/kg PO处理的动物显示小肠中的信号聚集在腺窝(腺细胞)中。90mg/kg PO处理的动物在上皮细胞衬里、***以及腺细胞中显示弱信号,并且信号较强聚集在小肠粘膜中的腺窝和腺细胞中。结肠的上皮细胞加衬中存在弱信号。
小肠样品还使用PFA固定的组织的抗Alexa 488抗体通过免疫组织化学检验。如图21中所示,在用10mg/kg或90mg/kg与Alexa 488结合的化合物X处理的动物的整个固有层或***中观测到化合物X染色。
这些实例确定本发明的肽X和其它肽是具有最小全身暴露的α4β7整合素的选择性经口肽拮抗剂,并且在IBD鼠类模型中有效阻断T细胞复位和防止粘膜破坏。肽X和临床上验证的抗α4β7抗体维多珠单抗在多种分析法(包括细胞粘附和结合到人类CD4+记忆T细胞)中具有相当的效能和选择性。标准或硫酸葡聚糖钠(DSS)处理的小鼠和大鼠中的PK研究显示经口给药导致小肠、派氏***、结肠和肠系膜***(MLN)中的显著药物暴露,但在血液和尿液中没有显著可测量的含量。为了测量经口给药对内源性记忆T细胞运输的作用,向DSS小鼠每天一次经口给予肽X持续9天,并且通过FACS分析采集的组织。FACS分析显示CD4+CD44CD45RBβ7+T细胞在MLN和派氏***中剂量依赖性减少,并且在脾脏和血液中相伴提高。体重减轻和粘膜损伤也如内窥镜检查所评定剂量依赖性减少。肽X还对多种胃肠(GI)液、代谢酶和肠道细菌显示稳定性。肽X显示对α4β7整合素有效的经口拮抗剂选择性。在鼠类结肠炎模型中,肽X和相似类似物阻断T细胞运输并且将组织病理学降低到与路径特异性抗体相似的水平。在食蟹猕猴的血液中,肽X使血液受体占有率饱和并且增加α4β7CD4T细胞的循环含量。肽X的低血液暴露和高GI暴露表明其在肠道淋巴性区室内局部起作用来阻断记忆T细胞病变。
本文所述的全部公开案和专利申请案都以全文引用的方式并入本文中。
本发明可以其它特性形式实施而不脱离本文广泛描述和下文中要求的其结构、方法或其它基本特征。所描述的实施例应视为在所有方面都仅为说明性而非限制性的。因此,本发明的范围由所附权利要求书而不是由前述描述指示。在权利要求书等效物的含义和范围内的所有改变都涵盖在其范围内。

Claims (41)

1.一种肽二聚体化合物,其包含两个经连接的式(I)的单体子单元:
Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4-Xaa5-Xaa6-Xaa7-Xaa8-Xaa9-Xaa10-Xaa11-Xaa12-Xaa13-Xaa14
(式(I))
或其药学上可接受的盐,
其中:
Xaa1是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa2是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa3是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa4是Pen或Cys;
Xaa5选自由以下各项组成的群组:N-Me-Arg、Arg、N-Me-Lys、Phe(4-胍基胍基)、Phe(4-氨甲酰基)、Cit、Phe(4-NH2)、N-Me-homoArg、homoArg、Tyr、Dap、Dab、Arg-Me-sym、Arg-Me-asym、Cav以及His;
Xaa6是Ser、Gly、Thr或Ile;
Xaa7是Asp、Asp(OMe)或N-Me-Asp;
Xaa8选自由以下各项组成的群组:Thr、Val、Ile、Leu、homoLeu、Gln、Ser、Asp、Pro、Gly、His、Ala、Phe、Lys、Arg、Asn、Glu、Tyr、Trp、Met、Nle以及N-甲基氨基酸,包括N-Me-Thr;
Xaa9选自由以下各项组成的群组:Gln、Ser、Asp、Pro、Gly、Ala、Phe、Glu、Ile、Val、N-丁基Ala、N-戊基Ala、N-己基Ala、环丁基Ala、环戊基Ala、Leu、Nle、Cba、homoLeu、Cpa、Aoc以及N-Me-Leu;
Xaa10是Pen;
Xaa11不存在或选自由以下各项组成的群组:芳香族氨基酸、经取代的芳香族氨基酸以及Tic;
Xaa12不存在或选自由以下各项组成的群组:芳香族氨基酸、经取代的芳香族氨基酸、Glu、D-Glu、homoGlu、Asp、D-Asp、D-homoGlu、Gla、β-homoGlu、Tic、Aic、Gln、Cit、Glu(OMe)、Asn、D-His、Tic、Phe(3-COOH)、D-Arg、Bip、D-Trp、Phe、D-Phe、D-Val、D-Thr、D-Tyr、D-Lys、D-Ile、D-His、N-Me-Glu、N-Me-Asp、α-homoGlu、联苯基-Gly、联苯基-Ala、Homo-Phe、D-1-Nal、D-2-Nal、Thr以及Val,以及相应D-氨基酸和电子等排体;
Xaa13是不存在或Pro或任何氨基酸;以及
Xaa14选自由以下各项组成的群组:具有胺侧链的任何氨基酸、Lys、D-Lys、N-Me-Lys、D-N-Me-Lys、Orn、Dab、Dap、HomoLys、D-Dap、D-Dab、D-Orn、Cys、HomoCys、Pen、D-HomoCys、D-Cys、D-Pen、Asp、Glu、D-Asp、D-Glu以及HomoSer、HomoGlu、D-homoGlu、N-Me-Glu、N-Me-Asp、N-Me-D-Glu以及N-Me-D-Asp;
其中:
Xaa5选自由以下各项组成的群组:Cit、Phe(4-氨甲酰基氨基)以及N-Me-homoArg;
Xaa8选自由以下各项组成的群组:Leu、homoLeu、Nle以及Val;
Xaa9选自由以下各项组成的群组:Cba、homoLeu以及Cpa;
Xaa11选自由以下各项组成的群组:Tic、Phe(2-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Phe(4-COOH)、Phe(4-OMe)以及Phe(4-tBu);
Xaa12选自由以下各项组成的群组:Aic、Gln、Cit、Glu(OMe)、D-His、Tic、Phe(3-COOH)、D-Arg、Bip、D-Trp、Phe、D-Phe、D-Val、D-Thr、D-1-Nal、D-2-Nal、Thr、Val;或
Xaa13是Pro;以及
其中所述肽二聚体化合物的一个或两个单体子单元在Xaa4和Xaa10之间包含二硫键。
2.根据权利要求1所述的肽二聚体化合物,其进一步包含连接所述两个单体子单元的连接子部分,其中所述连接子部分任选地选自由以下各项组成的群组:DIG、PEG13、PEG25、PEG1K、PEG2K、PEG3.4K、PEG4K、PEG5K、IDA、IDA-Palm、IDA-Boc、IDA-异戊酸、三嗪、三嗪-Boc、间苯二甲酸、1,3-亚苯基二乙酸、1,4-亚苯基二乙酸、环丙基乙酸、4-氟苯甲酸、4-氟苯基乙酸、3-苯基丙酸、丁二酸、生物素、戊二酸、壬二酸、庚二酸、十二烷二酸、脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、杂芳香族化合物、分子量为约400Da到约40,000Da的聚乙二醇、双官能连接子、N-羟基丁二酰亚胺(NHS)活化的二酯以及双-顺丁烯二酰亚胺。
3.根据权利要求2所述的肽二聚体化合物,其中各单体子单元的N末端经所述连接子部分连接以提供N末端二聚体化合物。
4.根据权利要求2所述的肽二聚体化合物,其中各单体子单元的C末端经所述连接子部分接合以提供C末端二聚体化合物。
5.根据权利要求1到4中任一项所述的肽二聚体化合物,其中Xaa5是N-Me-Arg。
6.根据权利要求1到5中任一项所述的肽二聚体化合物,其中Xaa6是Ser,Xaa7是Asp,Xaa8是Thr和/或Xaa9是Leu。
7.根据权利要求1到6中任一项所述的肽二聚体化合物,其中Xaa11是Tic、Phe(2-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Phe(4-COOH)、Phe(4-OMe)或Phe(4-tBu)。
8.根据权利要求1到4中任一项所述的肽二聚体化合物,
其中:
Xaa5是N-甲基-Arg;
Xaa6是Ser;
Xaa7是Asp;
Xaa8是Thr或Val;
Xaa9是Leu;
Xaa11选自由以下各项组成的群组:Trp、Phe、2-Nal、1-Nal、Tyr、His、Phe(4-F)、Phe(4-CF3)、Phe(4-CH3)、Phe(4-tBu)、Bip、Phe(4-COOH)、Gly、3,3-二苯基Gly、3,3二苯基Ala、Tic、β-homoTrp、D-1-Nal、D-2-Nal、Phe(2,4-二Cl)、Phe(3,4-二Cl)、Phe(4-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Tyr(Me)以及HomoPhe;
Xaa12选自由以下各项组成的群组:任何芳香族氨基酸、Glu、D-Glu以及β-homoGlu;
Xaa13不存在;以及
Xaa14选自由以下各项组成的群组:D-Lys、N-Me-Lys以及D-N-Me-Lys。
9.根据权利要求8所述的肽二聚体化合物,其中两个子单元都包含以下序列中的一个:
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe-(4-COOH)-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-(N-Me-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-Glu-(N-Me-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(D-Lys);或
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-(N-Me-D-Lys),
其中所述子单元经其C末端连接。
10.根据权利要求8所述的肽二聚体化合物,其中两个子单元都包含以下序列中的一个:
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe-(4-COOH)-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu;
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-Glu;
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu);或
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu,
其中所述子单元经其N末端连接。
11.根据权利要求9或10所述的肽二聚体化合物,其中所述子单元经DIG连接子连接。
12.根据权利要求9或权利要求10所述的肽二聚体化合物,其中所述肽二聚体化合物具有以下结构中的一个:
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(D-Lys)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe-(4-COOH)-(β-homoGlu)-(D-Lys)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-(N-Me-Lys)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-Glu-(N-Me-Lys)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-(D-Lys)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(D-Lys)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-(N-Me-D-Lys)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(D-Lys)-OH]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe-(4-COOH)-(β-homoGlu)-(D-Lys)-OH]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-(N-Me-Lys)-OH]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys)-OH]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys)-OH]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-Glu-(N-Me-Lys)-OH]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-(D-Lys)-OH]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)-OH]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)-OH]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)-OH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys)-OH]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)-OH]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(D-Lys)-OH]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-(N-Me-D-Lys)-OH]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe-(4-COOH)-(β-homoGlu)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-Glu-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-NH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-OH]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe-(4-COOH)-(β-homoGlu)-OH]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-OH]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-OH]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-OH]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-Glu-OH]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-OH]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-OH]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-OH]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-OH2]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-OH]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-OH]2-DIG;
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-OH]2-DIG;或
[Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-OH]2-DIG。
13.根据权利要求12所述的肽二聚体化合物,其中所述肽二聚体化合物是乙酸盐。
14.根据权利要求1到4中任一项所述的肽二聚体化合物,其中所述肽二聚体化合物C末端OH。
15.根据权利要求1所述的肽二聚体化合物,其进一步包含在选自由Xaa3、Xaa5、Xaa7-Xaa9以及Xaa11-Xaa13组成的群组的一个或多个位置处的N(α)甲基化。
16.根据权利要求1所述的肽二聚体化合物,其进一步包含在选自由Xaa1-Xaa3和Xaa11-Xaa14组成的群组的一个或多个位置处的酰化。
17.根据权利要求1所述的肽二聚体化合物,其中Xaa1和Xaa2不存在,并且Xaa3为Ac。
18.根据权利要求1所述的肽二聚体化合物,其中Xaa11、Xaa12和Xaa13中的一个或多个不存在。
19.一种式(IV)的肽单体化合物:
Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4-Xaa5-Xaa6-Xaa7-Xaa8-Xaa9-Xaa10-Xaa11-Xaa12-Xaa13-Xaa14
(式(IV))
或其药学上可接受的盐,
其中:
Xaa1是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa2是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa3是不存在、Ac或任何氨基酸;
Xaa4是Pen和Cys;
Xaa5选自由以下各项组成的群组:N-Me-Arg、Arg、N-Me-Lys、Phe(4-胍基)、Phe(4-氨甲酰基氨基)、Cit、Phe(4-NH2)、N-Me-homoArg、homoArg、Tyr、Dap、Dab、Arg-Me-sym、Arg-Me-asym、Cav以及His;
Xaa6是Ser、Gly、Thr或Ile;
Xaa7是Asp、Asp(OMe)或N-Me-Asp;
Xaa8选自由以下各项组成的群组:Thr、Val、Ile、Leu、homoLeu、Gln、Ser、Asp、Pro、Gly、His、Ala、Phe、Lys、Arg、Asn、Glu、Tyr、Trp、Met、Nle以及N-甲基氨基酸,包括N-Me-Thr;
Xaa9选自由以下各项组成的群组:Gln、Ser、Asp、Pro、Gly、Ala、Phe、Glu、Ile、Val、N-丁基Ala、N-戊基Ala、N-己基Ala、环丁基Ala、环戊基Ala、Leu、Nle、Cpa、Cba、homoLeu、Aoc以及N-Me-Leu;
Xaa10是Pen或Cys;
Xaa11不存在或选自由以下各项组成的群组:Trp、Phe、2-Nal、1-Nal、Tyr、His、Phe(4-F)、Phe(4-CF3)、Phe(4-CH3)、Phe(4-tBu)、Bip、Phe(4-COOH)、Gly、3,3-二苯基Gly、3,3-二苯基Ala、Tic、b-homoTrp、D-1-Nal、D-2-Nal、Phe(2,4-二Cl)、Phe(3,4-二Cl)、Phe(4-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Phe(2-氨甲酰基)、Tyr(Me)、homoPhe、N-Me-Phe、N-Me-Tyr、Ser、Sar、二氢Trp、Ile、Leu、Arg、Thr、芳香族氨基酸、经取代的芳香族氨基酸以及Tic;
Xaa12不存在或选自由以下各项组成的群组:芳香族氨基酸、经取代的芳香族氨基酸、Glu、D-Glu、homoGlu、Asp、D-Asp、D-homoGlu、Gla、β-homoGlu、Tic、Aic、Gln、Cit、Glu(OMe)、Asn、D-His、Tic、Phe(3-COOH)、D-Arg、Bip、D-Trp、Phe、D-Phe、D-Val、D-Thr、D-Tyr、D-Lys、D-Ile、D-His、N-Me-Glu、N-Me-Asp、α-homoGlu、联苯基-Gly、联苯基-Ala、Homo-Phe、D-1-Nal、D-2-Nal、Thr以及Val,以及相应D-氨基酸和电子等排体;
Xaa13是不存在或Pro或任何氨基酸;以及
Xaa14是任何氨基酸,
其中
Xaa5选自由以下各项组成的群组:Cit、Phe(4-氨甲酰基)以及N-Me-homoArg;
Xaa8选自由以下各项组成的群组:Leu、homoLeu、Nle以及Val;
Xaa9选自由以下各项组成的群组:Cba、homoLeu以及Cpa;
Xaa11选自由以下各项组成的群组:Tic、Phe(2-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Phe(4-COOH)、Phe(4-OMe)以及Phe(4-tBu);
Xaa12选自由以下各项组成的群组:Aic、Gln、Cit、Glu(OMe)、D-His、Tic、Phe(3-COOH)、D-Arg、Bip、D-Trp、Phe、D-Phe、D-Val、D-Thr、D-1-Nal、D-2-Nal、Thr、Val;或
Xaa13是Pro;以及
其中所述肽单体化合物在Xaa4和Xaa10之间包含二硫键。
20.一种式(V)的肽单体化合物:
Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4-Xaa5-Xaa6-Xaa7-Xaa8-Xaa9-Xaa10
(式(V))
或其药学上可接受的盐,
其中所述肽化合物包含二硫键Xaa1和Xaa7
其中式(V)的Xaa1-Xaa10对应于式(IV)的Xaa4-Xaa13,以及
其中
Xaa1是Pen或Cys;
Xaa2选自由以下各项组成的群组:Cit、Phe(4-氨甲酰基)以及N-Me-homoArg;
Xaa3是Ser Gly、Thr或Ile;
Xaa4是Asp、D-Asp、Asp(OMe)或N-Me-Asp;
Xaa5选自由以下各项组成的群组:Leu、HomoLeu、Nle以及Val;
Xaa6选自由以下各项组成的群组:Cba、HomoLeu以及Cpa;
Xaa7是Pen或Cys;
Xaa8选自由以下各项组成的群组:Tic、Phe(2-氨甲酰基)、Phe(3-氨甲酰基)、Phe(4-COOH)、Phe(4-OMe)以及Phe(4-tBu);
Xaa9选自由以下各项组成的群组:Aic、Gln、Cit、Glu(OMe)、D-His、Tic、Phe(3-COOH)、D-Arg、Bip、D-Trp、Phe、D-Phe、D-Val、D-Thr、D-1-Nal、D-2-Nal、Thr、Val;以及
Xaa10是Pro。
21.根据权利要求20所述的肽单体化合物,其中Xaa5是N-Me-Arg。
22.根据权利要求19或权利要求21所述的肽单体化合物,其中Xaa1和Xaa2不存在,并且Xaa3是Ac,和/或其中Xaa11、Xaa12和Xaa13中的一个或多个不存在。
23.根据权利要求19或权利要求21所述的肽单体化合物,其中所述肽单体化合物包含以下序列或结构中的一个:
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe(4-COOH))-(Glu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe(4-COOH))-(β-homo-Glu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe(4-tBu))-Glu-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe(4-tBu))-(β-homo-Glu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe(4-tBu))-Glu-(N-Me-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Bip-Glu-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Bip-(β-homo-Glu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe-(4-COOH)-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-(N-Me-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-Glu-(N-Me-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(D-Lys);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-(N-Me-D-Lys);
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(D-Lys)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe-(4-COOH)-(β-homoGlu)-(D-Lys)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-(N-Me-Lys)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-Glu-(N-Me-Lys)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-(D-Lys)-OH;Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(D-Lys)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-(N-Me-D-Lys)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(D-Lys)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe-(4-COOH)-(β-homoGlu)-(D-Lys)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-(N-Me-Lys)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-Glu-(N-Me-Lys)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-(D-Lys)-NH2;Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(D-Lys)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-(N-Me-Lys)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-(D-Lys)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-(N-Me-D-Lys)-NH2;或
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe(4-COOH))-(Glu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe(4-COOH))-(β-homo-Glu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe(4-tBu))-Glu;
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe(4-tBu))-(β-homo-Glu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe(4-tBu))-Glu;
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Bip-Glu;
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Bip-(β-homo-Glu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe-(4-COOH)-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu;
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-Glu;
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu);
Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe-(4-COOH)-(β-homoGlu)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-Glu-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-OH;
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-(Phe-(4-COOH)-(β-homoGlu)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-Glu-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Phe(4-tBu)-(β-homoGlu)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-2-Nal-(β-homoGlu)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-1-Nal-(β-homoGlu)-NH2
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-(β-homoGlu)-NH2;或
Ac-Pen-(N-Me-Arg)-Ser-Asp-Thr-Leu-Pen-Trp-Glu-NH2
24.根据权利要求1到23中任一项所述的化合物,其中所述化合物经可检测的标记。
25.一种药学组合物,其包含根据权利要求1到23中任一项所述的化合物。
26.根据权利要求24所述的组合物,其进一步包含肠溶包衣,其中所述肠溶包衣在个体的下胃肠***内保护和释放药学组合物。
27.一种用于治疗罹患与α4β7整合素的生物功能有关的病状的个体的方法,所述方法包含向人类投予有效量的根据权利要求1到23中任一项所述的化合物或根据权利要求25到26中任一项所述的组合物。
28.根据权利要求27所述的方法,其中所述病状选自由以下各项组成的群组:发炎性肠病(IBD)、溃疡性结肠炎、克罗恩氏病(Crohn's disease)、乳糜泻(非热带口炎性腹泻(nontropical Sprue))、与血清反应阴性的关节病有关的肠病、显微镜下结肠炎、胶原性结肠炎、嗜酸性球性胃肠炎、放射疗法、化学疗法、直肠结肠切除术和回肠肛管吻合术之后引起的结肠袋炎、胃肠癌、胰脏炎、胰岛素依赖性糖尿病、乳腺炎、胆囊炎、胆管炎、胆管周围炎、慢性支气管炎、慢性鼻窦炎、哮喘、原发性硬化性胆管炎、胃肠道中的人类免疫缺陷病毒(HIV)感染、嗜酸性球性哮喘、嗜酸性球性食道炎、胃炎、结肠炎、显微镜下结肠炎、移植物抗宿主疾病、与放射疗法或化学疗法有关的结肠炎、如白血球粘附缺乏症-1中的与先天免疫障碍有关的结肠炎、慢性肉芽肿性疾病、1b型糖原贮积病、赫曼斯基-普德拉克综合症(Hermansky-Pudlak syndrome)、薛迪克-东氏综合症(Chediak-Higashi syndrome)以及韦斯考特-奥德里奇综合症(Wiskott-Aldrich Syndrome),或直肠结肠切除术和回肠肛管吻合术之后引起的结肠袋炎,和多种形式的胃肠癌、骨质疏松症、关节炎、多发性硬化症、慢性疼痛、体重增加以及抑郁症;在另一实施例中,所述病状是胰脏炎、胰岛素依赖性糖尿病、乳腺炎、胆囊炎、胆管炎、胆管周围炎、慢性支气管炎、慢性鼻窦炎、哮喘或移植物抗宿主疾病。
29.根据权利要求28所述的方法,其中所述病状是发炎性肠病。
30.根据权利要求28所述的方法,其中所述发炎性肠病是溃疡性结肠炎。
31.根据权利要求30所述的方法,其中所述发炎性肠病是克罗恩氏病。
32.根据权利要求27所述的方法,其中所述肽二聚体化合物或肽单体化合物抑制α4β7与MAdCAM结合。
33.根据权利要求30所述的方法,其中所述肽二聚体化合物或肽单体化合物选择性抑制α4β7与MAdCAM结合。
34.根据权利要求27所述的方法,其中所述个体是人类。
35.根据权利要求34所述的方法,其中所述肽二聚体化合物或肽单体化合物通过选自由以下各项组成的群组的投予形式投予:经口、静脉内、腹膜、皮内、皮下、肌肉内、鞘内、吸入、气化、雾化、舌下、经颊、肠胃外、直肠、经***以及局部。
36.根据权利要求34所述的方法,其中所述肽二聚体化合物或肽单体化合物以初始剂量,随后一个或多个后续剂量投予,并且任何两次剂量之间的最小间隔是小于1天的时间段,并且其中所述剂量中的每一个包含有效量的所述肽二聚体化合物。
37.根据权利要求34所述的方法,其中所述肽二聚体化合物或肽单体化合物的有效量足以实现选自由以下各项组成的群组中的至少一个:a)α4β7整合素分子上MAdCAM结合位点的约50%或更高饱和度;b)细胞表面上约50%或更高的α4β7整合素表达抑制;以及c)α4β7分子上MAdCAM结合位点的约50%或更高饱和度和细胞表面上约50%或更高的α4β7整合素表达抑制,其中i)所述饱和度维持与不超过每天两次的给药频率相符的时间段;ii)所述抑制维持与不超过每天两次的给药频率相符的时间段;或iii)所述饱和度和所述抑制各自维持与不超过每天两次的给药频率相符的时间段。
38.根据权利要求34所述的方法,其中所述肽二聚体化合物或肽单体化合物经口投予。
39.根据权利要求34所述的方法,其中所述肽二聚体化合物或肽单体化合物肠胃外投予。
40.根据权利要求34所述的方法,其中所述肽二聚体化合物或肽单体化合物局部投予。
41.根据权利要求34所述的方法,其中所述肽二聚体化合物或肽单体化合物以选自由以下各项组成的群组的间隔投予:一整天、每小时、每四小时、每天一次、每天两次、每天三次、每天四次、每隔一天、每周、每两周以及每个月。
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Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN109195618A (zh) * 2016-03-23 2019-01-11 领导医疗有限公司 用于合成α4β7肽拮抗剂的方法

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* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
LT2968443T (lt) 2013-03-15 2021-12-10 Protagonist Therapeutics, Inc. Hepcidino analogai ir jų naudojimas
EP3960754A3 (en) 2014-05-16 2022-07-06 Protagonist Therapeutics, Inc. Alpha4beta7 integrin thioether peptide antagonists
RU2736637C9 (ru) 2014-07-17 2021-02-08 Протагонист Терепьютикс, Инк. Пептидные ингибиторы рецептора интерлейкина-23 для перорального приема и их применение для лечения воспалительных заболеваний кишечника
US10301371B2 (en) 2014-10-01 2019-05-28 Protagonist Therapeutics, Inc. Cyclic monomer and dimer peptides having integrin antagonist activity
EP3200812B8 (en) 2014-10-01 2021-04-28 Protagonist Therapeutics, Inc. Novel alpha4beta7 peptide monomer and dimer antagonists
US10787490B2 (en) 2015-07-15 2020-09-29 Protaganist Therapeutics, Inc. Peptide inhibitors of interleukin-23 receptor and their use to treat inflammatory diseases
WO2017079820A1 (en) 2015-11-11 2017-05-18 Encycle Therapeutics, Inc. CYCLIC PEPTIDES TARGETING α4β7 INTEGRIN
CA3009834A1 (en) 2015-12-30 2017-07-06 Protagonist Therapeutics, Inc. Analogues of hepcidin mimetics with improved in vivo half lives
WO2017217545A1 (ja) 2016-06-16 2017-12-21 国立大学法人東京大学 プレキシンの結合調節剤
JP7035044B2 (ja) * 2016-11-11 2022-03-14 ジーランド ファーマ エー/エス α4β7インテグリンを標的とする環状ペプチド多量体
CA3062385A1 (en) 2017-05-10 2018-11-15 Encycle Therapeutics, Inc. Homodetic cyclic peptides targeting a4s7 1ntegrin
TW201920234A (zh) 2017-09-11 2019-06-01 美商領導醫療有限公司 類鴉片促效劑肽及其用途
WO2019147824A1 (en) 2018-01-26 2019-08-01 Progenity, Inc. Treatment of a disease of the gastrointestinal tract with a pde4 inhibitor
CA3089868A1 (en) 2018-02-08 2019-08-15 Protagonist Therapeutics, Inc. Conjugated hepcidin mimetics
WO2019246455A1 (en) 2018-06-20 2019-12-26 Progenity, Inc. Treatment of a disease of the gastrointestinal tract with an integrin inhibitor
EP3997105A4 (en) 2019-07-10 2023-09-13 Protagonist Therapeutics, Inc. PEPTIDE INHIBITORS OF THE INTERLEUKIN-23 RECEPTOR AND THEIR USE IN THE TREATMENT OF INFLAMMATORY DISEASES
CA3166637A1 (en) * 2020-01-10 2021-07-15 Protagonist Therapeutics, Inc. Methods for treating inflammatory bowel diseases with .alpha.4.beta.7 integrin antagonists
CN115279782A (zh) 2020-01-15 2022-11-01 詹森生物科技公司 白介素-23受体的肽抑制剂及其用于治疗炎性疾病的用途
WO2021146441A1 (en) 2020-01-15 2021-07-22 Janssen Biotech, Inc. Peptide inhibitors of interleukin-23 receptor and their use to treat inflammatory diseases
WO2021174024A1 (en) 2020-02-28 2021-09-02 First Wave Bio, Inc. Methods of treating iatrogenic autoimmune colitis
US11939361B2 (en) 2020-11-20 2024-03-26 Janssen Pharmaceutica Nv Compositions of peptide inhibitors of Interleukin-23 receptor

Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2014059213A1 (en) * 2012-10-11 2014-04-17 Protagonist Therapeutics, Inc. NOVEL α4ß7 PEPTIDE DIMER ANTAGONISTS

Family Cites Families (114)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4684620A (en) 1984-09-04 1987-08-04 Gibson-Stephens Neuropharmaceuticals, Inc. Cyclic polypeptides having mu-receptor specificity
US4724229A (en) 1986-09-30 1988-02-09 Smithkline Beckman Corporation Arg-arg-arg-vasopressin antagonists
US5192746A (en) 1990-07-09 1993-03-09 Tanabe Seiyaku Co., Ltd. Cyclic cell adhesion modulation compounds
JPH06509551A (ja) 1991-04-05 1994-10-27 ジェネンテク,インコーポレイテッド Gp II↓bIII↓aに対する高い特異性を有する血小板凝集阻害剤
AU673731B2 (en) 1993-06-03 1996-11-21 Banyu Pharmaceutical Co., Ltd. Novel endothelin antagonistic peptide
US6037324A (en) 1996-01-04 2000-03-14 Leukosite, Inc. Inhibitors of MAdCAM-1-mediated interactions and methods of use therefor
US5990084A (en) 1996-04-19 1999-11-23 Novo Nordisk A/S Compounds with growth hormone releasing properties
GB9613112D0 (en) 1996-06-21 1996-08-28 Zeneca Ltd Chemical compounds
US7122623B2 (en) 1996-07-12 2006-10-17 Adherex Technologies, Inc. Compounds and methods for modulating cell adhesion
JP3149958B2 (ja) 1996-08-30 2001-03-26 ノボ ノルディスク アクティーゼルスカブ Glp―1誘導体
US5942492A (en) 1996-11-12 1999-08-24 Angstrom Pharmaceuticals, Inc. Cyclic peptides that bind to urokinase-type plasminogen activator receptor
AU8399998A (en) 1997-07-11 1999-02-08 Innerdyne, Inc. Methods and systems for preparing and sealing radiation delivery structures
US6818617B1 (en) 1997-08-15 2004-11-16 Temple University- Of The Commonwealth System Of Higher Education EC-3, an inhibitor of α4β1 and α4β7 integrins
JP2001523711A (ja) 1997-11-24 2001-11-27 メルク エンド カムパニー インコーポレーテッド 細胞接着阻害薬としての環状アミノ酸誘導体
US6248057B1 (en) 1998-07-28 2001-06-19 Innerdyne, Inc. Absorbable brachytherapy and chemotherapy delivery devices and methods
EP1105427A2 (en) 1998-08-17 2001-06-13 Abgenix, Inc. Generation of modified molecules with increased serum half-lives
US6087334A (en) 1998-08-21 2000-07-11 Amylin Pharmaceuticals, Inc. Anti-diabetic peptides
AUPP616498A0 (en) 1998-09-25 1998-10-15 University Of Queensland, The Synthesis of cyclic peptides
AUPP616598A0 (en) 1998-09-25 1998-10-15 University Of Queensland, The Auxiliary for amide bond formation
AUPP660698A0 (en) 1998-10-21 1998-11-12 University Of Queensland, The A method of protein engineering
US6451987B1 (en) 1999-03-15 2002-09-17 Novo Nordisk A/S Ion exchange chromatography of proteins and peptides
CN1344248A (zh) 1999-03-17 2002-04-10 诺沃挪第克公司 肽的酰化方法和新酰化剂
TR200102959T2 (tr) 1999-04-12 2002-04-22 Aventis Pharma Limited İntegrin antagonistleri olarak ikame edilmiş bisiklik heteroaril bileşikleri
WO2001068586A2 (en) 2000-03-14 2001-09-20 Novartis Ag α4β1 AND α4β7 INTEGRIN INHIBITORS
KR20030068205A (ko) 2001-01-09 2003-08-19 메르크 파텐트 게엠베하 수용체 타이로신 키나아제 저해제 및 혈관형성 저해제를사용하는 병용 요법
DE10107707A1 (de) 2001-02-19 2002-08-29 Wilex Biotechnology Gmbh Antagonisten für alpha¶4¶beta¶7¶-Integrin
AUPS039702A0 (en) 2002-02-08 2002-03-07 University Of Queensland, The Common protein surface shapes and uses therefor
US20030166138A1 (en) 2002-02-21 2003-09-04 Todd Kinsella Cyclic peptides and analogs useful to treat allergies
CA2484941A1 (en) 2002-07-24 2004-02-05 Intercell Ag Antigens encoded by alternative reading frame from pathogenic viruses
AU2003301059A1 (en) 2002-12-18 2004-07-22 Wyeth Methods for screening, treating and diagnosing inflammatory bowel disease and compositions thereof
US20070032417A1 (en) 2002-12-24 2007-02-08 Walter And Eliza Hall Institute Of Medical Research Peptides and therapeutic uses thereof
WO2004092405A2 (en) 2003-04-15 2004-10-28 Xenon Pharmaceuticals Inc. Juvenile hemochromatosis gene (hfe2a), expression products and uses thereof
CN107090025A (zh) 2003-11-05 2017-08-25 达纳-法伯癌症研究所股份有限公司 稳定的α螺旋肽及其用途
US20060030053A1 (en) 2003-12-19 2006-02-09 Applera Corporation Methods and systems for protein and peptide evidence assembly
NL1027975C2 (nl) 2004-01-09 2005-12-23 Pfizer Antilichamen tegen MAdCAM.
US8536140B2 (en) 2004-03-12 2013-09-17 Mti Meta Tech Inc. Methods for treating inflammatory bowel disease
JP2008504239A (ja) 2004-06-24 2008-02-14 ザ ウォルター アンド エリザ ホール インスティテュート オブ メディカル リサーチ 複合体およびその治療的使用
JP5154935B2 (ja) 2004-09-23 2013-02-27 ザ・ユニヴァーシティ・オブ・メルボーン Porphyromonasgingivalis感染を診断および治療するための抗原複合体
WO2006062685A2 (en) 2004-11-11 2006-06-15 Affymax, Inc. Novel peptides that bind to the erythropoietin receptor
EP1828243A2 (en) 2004-11-30 2007-09-05 Gastrotech Pharma A/S Growth hormone secretagogue receptor 1a ligands
US20100183617A1 (en) 2005-02-23 2010-07-22 University Of Virginia Patent Foundation Compositions and methods for regulating sas1r
US7534764B2 (en) 2005-06-29 2009-05-19 The Regents Of The University Of California Competitive regulation of hepcidin mRNA by soluble and cell-associated hemojuvelin
US8076306B2 (en) 2006-04-12 2011-12-13 Isis Pharmaceuticals, Inc. Compositions and their uses directed to hepcidin
GB0610395D0 (en) 2006-05-25 2006-07-05 Ge Healthcare Ltd Novel imaging agents
CA2655372A1 (en) 2006-06-13 2007-12-21 Zymogenetics, Inc. Il-17 and il-23 antagonists and methods of using the same
US20080019913A1 (en) 2006-07-07 2008-01-24 University Of Arizona Office Of Technology Transfer Enkepahlin analogs with improved bioavailability
WO2008045252A2 (en) 2006-10-04 2008-04-17 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Engineered integrin binding peptides
US7713937B2 (en) 2006-11-10 2010-05-11 Cara Therapeutics, Inc. Synthetic peptide amides and dimeric forms thereof
EP2109480B1 (en) 2006-12-07 2017-06-28 The Government of the United States of America as Represented by the Secretary of the Department of Health and Human Services Use of antagonists of the interaction between hiv gp120 and alpha4beta7 integrin
PE20130588A1 (es) 2007-02-02 2013-05-21 Amgen Inc Hepcidina, antagonistas de la hepcidina y metodos de uso
DK2426144T3 (en) 2007-02-23 2019-01-07 Merck Sharp & Dohme Manipulated Anti-IL-23P19 Antibodies
US20080260820A1 (en) 2007-04-19 2008-10-23 Gilles Borrelly Oral dosage formulations of protease-resistant polypeptides
EP2150564A2 (en) 2007-04-27 2010-02-10 ZymoGenetics, Inc. Antagonists to il-17a, il-17f, and il-23p19 and methods of use
US8313950B2 (en) 2007-05-21 2012-11-20 The Ohio State University Research Foundation Hepcidins as biomarkers for impending lupus nephritis flare
WO2009002947A2 (en) 2007-06-22 2008-12-31 Affymax, Inc. Compounds and peptides that bind the trail receptor
CN101990547A (zh) 2007-07-06 2011-03-23 瓦勒瑞萨欣Hsj有限合伙公司 Il-23受体拮抗剂以及其应用
CN101358201A (zh) 2007-07-31 2009-02-04 钱忠明 重组人铁调素腺病毒、其制备方法及应用
CN101307085B (zh) 2007-08-01 2012-06-13 香港理工大学深圳研究院 抑制铁调素调节蛋白的siRNA、重组慢病毒及其应用
CA2707840A1 (en) 2007-08-20 2009-02-26 Allozyne, Inc. Amino acid substituted molecules
GR1006896B (el) 2007-08-24 2010-07-20 Ελληνικο Ινστιτουτο Παστερ, Μεθοδος παραγωγης μιας πεπτιδικης ορμονης
WO2009039185A1 (en) 2007-09-17 2009-03-26 The Trustees Of Columbia University In The City Of New York Uses of immunologically modified scaffold for tissue prevascularization and cell transplantation
WO2009045536A2 (en) 2007-10-05 2009-04-09 The University Of North Carolina At Chapel Hill Receptor targeted oligonucleotides
US8435941B2 (en) 2008-12-05 2013-05-07 The Regents Of The University Of California Mini-hepcidin peptides and methods of using thereof
DE102009007381A1 (de) 2009-01-29 2010-08-05 Amp-Therapeutics Gmbh & Co. Kg Antibiotische Peptide
US8999935B2 (en) 2009-02-11 2015-04-07 New York University Treatment of osteoporosis in peri- and post-menopausal women with hepcidin
JP5669728B2 (ja) 2009-04-08 2015-02-12 武田薬品工業株式会社 ニューロメジンu誘導体
TWI578992B (zh) 2009-04-30 2017-04-21 諾克森製藥股份有限公司 與鐵調節激素(hepcidin)結合之核酸類
JP2013518057A (ja) 2010-01-25 2013-05-20 コーネル ユニヴァーシティー 芳香族カチオン性ペプチドおよびその使用
US9523073B2 (en) 2010-03-31 2016-12-20 Medical Diagnostic Laboratories, Llc Elisa for a naturally-occurring soluble truncated form of IL-23 receptor
JP2011231085A (ja) 2010-04-30 2011-11-17 Osaka Prefecture Univ 環状ペプチド
WO2011149942A2 (en) 2010-05-24 2011-12-01 Children's Medical Center Corporation Compositions and methods for plasma peptide analysis
EP3626253B8 (en) 2010-08-11 2022-04-20 Ironwood Pharmaceuticals, Inc. Stable formulations of linaclotide
EP2444101A1 (en) 2010-10-21 2012-04-25 Universitätsklinikum Freiburg Selective targeting of the CD40L/Mac-1 interaction by small peptide inhibitors and its use for the treatment of inflammation and atherogenesis
EP2668199B1 (en) 2011-01-27 2017-09-06 Ramot at Tel Aviv University, Ltd. Glycogen synthase kinase-3 inhibitors
US9605027B2 (en) 2011-06-14 2017-03-28 Medical Diagnostic Laboratories, Llc Polypeptides that bound to IL-23 receptor and inhibit binding of IL-23 and cell signaling thereof
US8946150B2 (en) 2011-06-14 2015-02-03 Medical Diagnostic Laboratories, LLC. Polypeptides that bound to IL-23 receptor and inhibit binding of IL-23 and cell signaling thereof
US9169292B2 (en) 2011-06-14 2015-10-27 Medical Diagnostic Laboratories, Llc Polypeptides that bound to IL-23 receptor and inhibit binding of IL-23 and cell signaling thereof
CN105126071A (zh) 2011-06-14 2015-12-09 康肽德生物医药技术有限公司 芳香族阳离子肽及其用途
AU2012327226C1 (en) 2011-12-09 2017-03-02 The Regents Of The University Of California Modified mini-hepcidin peptides and methods of using thereof
WO2013177432A1 (en) 2012-05-23 2013-11-28 The University Of Chicago Methods of treating obesity
KR20150127622A (ko) 2013-02-15 2015-11-17 에스알엑스 카디오, 엘엘씨 혈청 저밀도 지단백질 (ldl) 수준을 조절하기 위한 전구단백질 컨버타제 서브틸리신/켁신 유형 9 (pcsk9) 알로스테릭 결합 리간드
LT2968443T (lt) 2013-03-15 2021-12-10 Protagonist Therapeutics, Inc. Hepcidino analogai ir jų naudojimas
US20140294901A1 (en) 2013-04-02 2014-10-02 Protagonist Therapeutics, Inc. Novel a4b7 peptide dimer antagonists
US20140294902A1 (en) 2013-04-02 2014-10-02 Protagonist Therapeutics, Inc. Novel a4b7 peptide antagonists
RS60180B1 (sr) 2013-06-24 2020-06-30 Canbas Co Ltd Kombinovana upotreba peptida i peptidomimetika i tretman subpopulacija pacijenata obolelih od kancera
WO2014210056A1 (en) 2013-06-27 2014-12-31 Stealth Peptides International, Inc. Peptide therapeutics and methods for using same
EP3065757A4 (en) 2013-10-09 2017-08-23 Synergy Pharmaceuticals Inc. Agonists of guanylate cyclase useful for downregulation of pro-inflammatory cytokines
WO2015112700A1 (en) 2014-01-22 2015-07-30 Wisconsin Alumni Research Foundation Alpha/beta-peptide mimics of z-domain peptides
US9315545B2 (en) 2014-04-07 2016-04-19 Merganser Biotech, Inc. Hepcidin mimetic peptides and uses thereof
EP3960754A3 (en) 2014-05-16 2022-07-06 Protagonist Therapeutics, Inc. Alpha4beta7 integrin thioether peptide antagonists
WO2015183963A2 (en) 2014-05-28 2015-12-03 Stealth Peptides International, Inc. Therapeutic compositions including redox-active parabenzoquinones and uses thereof
CA2953721A1 (en) 2014-06-27 2015-12-30 Protagonist Therapeutics, Inc. Hepcidin and mini-hepcidin analogues and uses therof
WO2016004093A2 (en) 2014-07-01 2016-01-07 Stealth Biotherapeutics Corp Therapeutic compositions including galectin-3 inhibitors and uses thereof
RU2736637C9 (ru) 2014-07-17 2021-02-08 Протагонист Терепьютикс, Инк. Пептидные ингибиторы рецептора интерлейкина-23 для перорального приема и их применение для лечения воспалительных заболеваний кишечника
EP3200812B8 (en) 2014-10-01 2021-04-28 Protagonist Therapeutics, Inc. Novel alpha4beta7 peptide monomer and dimer antagonists
US10301371B2 (en) 2014-10-01 2019-05-28 Protagonist Therapeutics, Inc. Cyclic monomer and dimer peptides having integrin antagonist activity
US20170362292A1 (en) 2014-12-29 2017-12-21 The Regents Of The University Of California S-Alkylated Hepcidin Peptides and Methods of Making and Using Thereof
US20160199437A1 (en) 2015-01-08 2016-07-14 D. Travis Wilson Therapeutic compositions including iron chelators and uses thereof
WO2016115168A1 (en) 2015-01-12 2016-07-21 Synthorx, Inc. Incorporation of unnatural nucleotides and methods thereof
US20160228491A1 (en) 2015-02-09 2016-08-11 Stealth Biotherapeutics Corp Therapeutic compositions including phenazine-3-one and phenothiazine-3-one derivatives and uses thereof
WO2016195663A1 (en) 2015-06-02 2016-12-08 Stealth Peptides International, Inc. Therapeutic compositions including bpm 31510, variants and analogues thereof, and uses thereof
WO2016200364A1 (en) 2015-06-08 2016-12-15 Stealth Peptides International, Inc. THERAPEUTIC COMPOSITIONS INCLUDING SkQ COMPOUNDS AND USES THEREOF
CN108348580B (zh) 2015-07-15 2022-05-10 领导医疗有限公司 白细胞介素-23受体的肽抑制剂以及其治疗炎症性疾病的用途
US10787490B2 (en) 2015-07-15 2020-09-29 Protaganist Therapeutics, Inc. Peptide inhibitors of interleukin-23 receptor and their use to treat inflammatory diseases
CA3009834A1 (en) 2015-12-30 2017-07-06 Protagonist Therapeutics, Inc. Analogues of hepcidin mimetics with improved in vivo half lives
US10407468B2 (en) 2016-03-23 2019-09-10 Protagonist Therapeutics, Inc. Methods for synthesizing α4β7 peptide antagonists
US20190270786A1 (en) 2016-07-27 2019-09-05 Protagonist Therapeutics, Inc. Peptide inhibitors of interleukin-23 and their use to treat inflammatory diseases
WO2018089693A2 (en) 2016-11-09 2018-05-17 Protagonist Therapeutics, Inc. Methods for determining and monitoring gastrointestinal inflammation
JP2020505352A (ja) 2017-01-18 2020-02-20 プロタゴニスト セラピューティクス, インコーポレイテッド インターロイキン−23受容体のペプチド阻害剤および炎症性疾患を治療するためのそれらの使用
TW201920234A (zh) 2017-09-11 2019-06-01 美商領導醫療有限公司 類鴉片促效劑肽及其用途
CA3089868A1 (en) 2018-02-08 2019-08-15 Protagonist Therapeutics, Inc. Conjugated hepcidin mimetics
EP3810094A1 (en) 2018-06-20 2021-04-28 Progenity, Inc. Treatment of a disease of the gastrointestinal tract with a jak or other kinase inhibitor
TW202019948A (zh) 2018-07-12 2020-06-01 美商領導醫療有限公司 介白素-23受體之肽抑制劑及其治療發炎疾病之用途
TW202116793A (zh) 2019-07-10 2021-05-01 美商領導醫療有限公司 介白素-23受體之肽抑制劑及其於治療發炎疾病的用途

Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2014059213A1 (en) * 2012-10-11 2014-04-17 Protagonist Therapeutics, Inc. NOVEL α4ß7 PEPTIDE DIMER ANTAGONISTS

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN109195618A (zh) * 2016-03-23 2019-01-11 领导医疗有限公司 用于合成α4β7肽拮抗剂的方法

Also Published As

Publication number Publication date
EP3200812A4 (en) 2018-02-28
RU2017114414A3 (zh) 2019-04-29
US9809623B2 (en) 2017-11-07
KR20170108936A (ko) 2017-09-27
EP3200812B1 (en) 2020-11-25
JP2017535527A (ja) 2017-11-30
US9518091B2 (en) 2016-12-13
WO2016054411A1 (en) 2016-04-07
CN106999537B (zh) 2020-01-31
US20160159862A1 (en) 2016-06-09
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