RU2020100074A - Композиции, содержащие куроны, и пути их применения - Google Patents

Композиции, содержащие куроны, и пути их применения Download PDF

Info

Publication number
RU2020100074A
RU2020100074A RU2020100074A RU2020100074A RU2020100074A RU 2020100074 A RU2020100074 A RU 2020100074A RU 2020100074 A RU2020100074 A RU 2020100074A RU 2020100074 A RU2020100074 A RU 2020100074A RU 2020100074 A RU2020100074 A RU 2020100074A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
kuron
synthetic
sequence
acid sequence
nucleic acid
Prior art date
Application number
RU2020100074A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2020100074A3 (ru
Inventor
Авак КАХВЕДЖАН
Эрика Габриэль ВАЙНШТЕЙН
Николас МакКартни ПЛУДЖИС
Кевин Джеймс ЛЕБО
Фернандо Мартин ДИАС
Дхананджай Маниклал НАВАНДАР
Original Assignee
Флэгшип Пайониринг Инновейшнз V, Инк.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Флэгшип Пайониринг Инновейшнз V, Инк. filed Critical Флэгшип Пайониринг Инновейшнз V, Инк.
Publication of RU2020100074A publication Critical patent/RU2020100074A/ru
Publication of RU2020100074A3 publication Critical patent/RU2020100074A3/ru

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/85—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells
    • C12N15/86—Viral vectors
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K48/00—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00—Antineoplastic agents
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P37/00—Drugs for immunological or allergic disorders
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/005—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from viruses
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/113—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/113—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
    • C12N15/1136—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing against growth factors, growth regulators, cytokines, lymphokines or hormones
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N7/00—Viruses; Bacteriophages; Compositions thereof; Preparation or purification thereof
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/10—Type of nucleic acid
    • C12N2310/14—Type of nucleic acid interfering N.A.
    • C12N2310/141—MicroRNAs, miRNAs
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2320/00—Applications; Uses
    • C12N2320/30—Special therapeutic applications
    • C12N2320/32—Special delivery means, e.g. tissue-specific
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2750/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssDNA viruses
    • C12N2750/00011—Details
    • C12N2750/00021—Viruses as such, e.g. new isolates, mutants or their genomic sequences
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2750/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssDNA viruses
    • C12N2750/00011—Details
    • C12N2750/00022—New viral proteins or individual genes, new structural or functional aspects of known viral proteins or genes
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2750/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssDNA viruses
    • C12N2750/00011—Details
    • C12N2750/00041—Use of virus, viral particle or viral elements as a vector
    • C12N2750/00043—Use of virus, viral particle or viral elements as a vector viral genome or elements thereof as genetic vector

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Endocrinology (AREA)
  • Communicable Diseases (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Medicinal Preparation (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
  • Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)

Claims (64)

1. Синтетический курон, содержащий:
(i) генетический элемент, содержащий промоторный элемент и последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую экзогенный эффектор, а также последовательность связывания белка, где генетический элемент содержит одну или обе из:
(a) последовательности, характеризующейся по меньшей мере 85% идентичностью последовательности по отношению к нуклеотидной последовательности консервативного домена 5'-UTR анелловируса из нуклеотидов 323-393 последовательности нуклеиновой кислоты из таблицы 11, или
(b) последовательности, характеризующейся по меньшей мере 85% идентичностью последовательности по отношению к GC-богатой области анелловируса из нуклеотидов 2868-2929 последовательности нуклеиновой кислоты из таблицы 11;
и
(ii) белковую наружную часть; где генетический элемент заключен в белковую наружную часть; и
где синтетический курон способен доставлять генетический элемент в эукариотическую клетку.
2. Синтетический курон по п. 1, где генетический элемент является однонитевым.
3. Синтетический курон по любому из предыдущих пунктов, где генетический элемент представляет собой ДНК.
4. Синтетический курон по п. 3, где генетический элемент представляет собой отрицательную нить ДНК.
5. Синтетический курон по любому из предыдущих пунктов, где генетический элемент интегрируется с частотой менее 10%, 8%, 6%, 4%, 3%, 2%, 1%, 0,5%, 0,2%, 0,1% относительно куронов, которые проникают в клетку, например, где синтетический курон является неинтегрирующим.
6. Синтетический курон по любому из предыдущих пунктов, где генетический элемент содержит последовательность из консенсусной последовательности нуклеиновой кислоты 5'-UTR, показанной в таблице 16-1.
7. Синтетический курон по любому из предыдущих пунктов, где генетический элемент содержит последовательность консенсусной GC-богатой области, показанной в таблице 16-2.
8. Синтетический курон по любому из предыдущих пунктов, где генетический элемент содержит последовательность, имеющую длину по меньшей мере 100 нуклеотидов, которая состоит из G или C в по меньшей мере 70% (например, приблизительно 70-100%, 75-95%, 80-95%, 85-95% или 85-90%) положений.
9. Синтетический курон по любому из предыдущих пунктов, где генетический элемент содержит последовательность, характеризующуюся по меньшей мере 85% идентичностью последовательности по отношению к нуклеотидной последовательности консервативного домена 5'-UTR анелловируса из нуклеотидов 1-393 последовательности нуклеиновой кислоты из таблицы 11, и последовательность, характеризующуюся по меньшей мере 85% идентичностью последовательности по отношению к GC-богатой области анелловируса из нуклеотидов 2868-2929 последовательности нуклеиновой кислоты из таблицы 11.
10. Синтетический курон по любому из предыдущих пунктов, где генетический элемент обладает по меньшей мере 75% идентичностью по отношению к нуклеотидной последовательности из таблицы 11.
11. Синтетический курон по любому из предыдущих пунктов, где промоторный элемент является экзогенным по отношению к анелловирусу дикого типа.
12. Синтетический курон по любому из пп. 1-10, где промоторный элемент является эндогенным по отношению к анелловирусу дикого типа.
13. Синтетический курон по любому из предыдущих пунктов, где экзогенный эффектор кодирует терапевтическое средство, например, терапевтический пептид или полипептид или терапевтическую нуклеиновую кислоту.
14. Синтетический курон по любому из предыдущих пунктов, где экзогенный эффектор содержит регуляторную нуклеиновую кислоту, например, miRNA, siRNA, мРНК, lncRNA, РНК, ДНК, антисмысловую РНК, gRNA; флуоресцентную метку или маркер, антиген, пептид, синтетический пептид или пептид-аналог природного биологически активного пептида, пептид-агонист или пептид-антагонист, противомикробный пептид, порообразующий пептид, бициклический пептид, целенаправленно воздействующий или цитотоксический пептид, пептид, индуцирующий разрушение или самоуничтожение, малую молекулу, иммунный эффектор (например, влияющий на восприимчивость к иммунному ответу/сигналу), белок клеточной гибели (например, индуктор апоптоза или некроза), нелитический ингибитор опухоли (например, ингибитор онкобелка), эпигенетическое модифицирующее средство, эпигенетический фермент, фактор транскрипции, фермент, модифицирующий ДНК или белок, ДНК-интеркалирующее средство, ингибитор эффлюксного насоса, активатор или ингибитор ядерных рецепторов, ингибитор протеасом, конкурентный ингибитор фермента, эффектор или ингибитор синтеза белка, нуклеазу, фрагмент или домен белка, лиганд, антитело, рецептор или систему или компонент CRISPR.
15. Синтетический курон по любому из предыдущих пунктов, где экзогенный эффектор содержит miRNA и снижает экспрессию гена хозяина.
16. Синтетический курон по любому из предыдущих пунктов, где экзогенный эффектор содержит последовательность нуклеиновой кислоты, имеющую длину приблизительно 20-200, 30-180, 40-160, 50-140 или 60-120 нуклеотидов.
17. Синтетический курон по любому из предыдущих пунктов, где последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующая экзогенный эффектор, имеет длину приблизительно 20-200, 30-180, 40-160, 50-140 или 60-120 нуклеотидов.
18. Синтетический курон по любому из предыдущих пунктов, где последовательность, кодирующая экзогенный эффектор, находится в одном или нескольких, в пределах одного или нескольких или рядом с одним или несколькими (например, в 5'- или 3'-направлении от них) из локуса ORF1, например, на C-конце локуса ORF1, или 3'-некодирующей области, расположенной ниже области поли(A).
19. Синтетический курон по любому из предыдущих пунктов, где последовательность, кодирующая экзогенный эффектор, расположена между областью поли(A) и GC-богатой областью генетического элемента.
20. Синтетический курон по любому из предыдущих пунктов, который содержит (например, в белковой наружной части) одну или несколько из аминокислотной последовательности, выбранной из ORF2, ORF2/2, ORF2/3, ORF1, ORF1/1 или ORF1/2 из таблицы 12, или аминокислотной последовательности, характеризующейся по меньшей мере 85% идентичностью последовательности по отношению к ней.
21. Синтетический курон по любому из предыдущих пунктов, где части генетического элемента без учета эффектора имеют совокупный размер приблизительно 2,5-5 т. о. (например, приблизительно 2,8-4 т. о., приблизительно 2,8-3,2 т. о., приблизительно 3,6-3,9 т. о. или приблизительно 2,8-2,9 т. о.), менее чем приблизительно 5 т. о. (например, менее чем приблизительно 2,9 т. о., 3,2 т. о., 3,6 т. о., 3,9 т. о. или 4 т. о.) или по меньшей мере 100 нуклеотидов (например, по меньшей мере 1 т. о.).
22. Синтетический курон по любому из предыдущих пунктов, где синтетический курон не содержит липидный бислой.
23. Синтетический курон по любому из предыдущих пунктов, где синтетический курон способен инфицировать клетки млекопитающих, например, клетки человека, например, иммунные клетки, клетки печени или клетки легочного эпителия.
24. Синтетический курон по любому из предыдущих пунктов, где генетический элемент способен реплицироваться, например, способен образовывать по меньшей мере 102, 2×102, 5×102, 103, 2×103, 5×103 или 104 геномных эквивалентов генетического элемента на клетку, например, согласно измерению с помощью анализа по методу количественной ПЦР.
25. Синтетический курон по любому из предыдущих пунктов, который является по сути непатогенным, например, не индуцирует выявляемый пагубный симптом у субъекта (например, повышенную клеточную гибель или токсичность, например, по сравнению с субъектом, не подвергающимся воздействию курона).
26. Синтетический курон по любому из предыдущих пунктов, который является по сути неиммуногенным, например, не индуцирует выявляемый и/или нежелательный иммунный ответ, например, выявляемый в соответствии со способом, описанным в примере 4.
27. Синтетический курон по п. 26, где по сути неиммуногенный курон характеризуется эффективностью у субъекта, которая составляет по меньшей мере приблизительно 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95% или 100% от эффективности у эталонного субъекта, не имеющего иммунного ответа.
28. Синтетический курон по п. 26 или 27, где иммунный ответ включает в себя одно или несколько из выработки антитела, специфичного к курону; клеточного ответа (например, ответа, опосредованного иммунными эффекторными клетками (например, T-клетками или NK-клетками)) на курон или клетки, содержащие курон; или поглощения макрофагами курона или клеток, содержащих курон.
29. Синтетический курон по любому из предыдущих пунктов, где популяция из по меньшей мере 1000 синтетических куронов способна доставлять по меньшей мере 100 копий генетического элемента в одну или несколько эукариотических клеток.
30. Синтетический курон, содержащий:
(i) генетический элемент, содержащий промоторный элемент и последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую экзогенный эффектор, а также последовательность связывания белка, где генетический элемент содержит одну или обе из:
(a) последовательности, характеризующейся по меньшей мере 85% идентичностью последовательности по отношению к консервативному домену 5'-UTR анелловируса с последовательностью нуклеиновой кислоты из таблицы 1, 3, 5, 7, 9 или 13; или
(b) последовательности, характеризующейся по меньшей мере 85% идентичностью последовательности по отношению к GC-богатой области анелловируса с последовательностью нуклеиновой кислоты из таблицы 1, 3, 5, 7, 9 или 13;
и
(ii) белковую наружную часть; где генетический элемент заключен в белковую наружную часть; и
где синтетический курон способен доставлять генетический элемент в эукариотическую клетку.
31. Синтетический курон по п. 30, который содержит (например, в белковой наружной части) одну или несколько из аминокислотной последовательности, выбранной из ORF2, ORF2/2, ORF2/3, ORF2t/3, ORF1, ORF1/1 или ORF1/2 из любой из таблиц 2, 4, 6, 8, 10 или 14, или аминокислотной последовательности, характеризующейся по меньшей мере 85% идентичностью последовательности по отношению к ней.
32. Молекула нуклеиновой кислоты, содержащая промоторный элемент и последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую экзогенный эффектор, а также последовательность связывания белка, где генетический элемент содержит одну или обе из:
(a) последовательности, характеризующейся по меньшей мере 85% идентичностью последовательности по отношению к нуклеотидной последовательности консервативного домена 5'-UTR анелловируса из нуклеотидов 323-393 последовательности нуклеиновой кислоты из таблицы 11, или
(b) последовательности, характеризующейся по меньшей мере 85% идентичностью последовательности по отношению к GC-богатой области анелловируса из нуклеотидов 2868-2929 последовательности нуклеиновой кислоты из таблицы 11.
33. Молекула нуклеиновой кислоты, содержащая промоторный элемент и последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую экзогенный эффектор, а также последовательность связывания белка, где генетический элемент содержит одну или обе из:
(a) последовательности, характеризующейся по меньшей мере 85% идентичностью последовательности по отношению к нуклеотидной последовательности консервативного домена 5'-UTR анелловируса с последовательностью нуклеиновой кислоты из таблицы 1, 3, 5, 7 или 13, или
(b) последовательности, характеризующейся по меньшей мере 85% идентичностью последовательности по отношению к GC-богатой области анелловируса с последовательностью нуклеиновой кислоты из таблицы 1, 3, 5, 7 или 13.
34. Фармацевтическая композиция, содержащая синтетический курон по любому из пп. 1-31 и фармацевтически приемлемый носитель или наполнитель.
35. Фармацевтическая композиция по п. 34, которая содержит по меньшей мере 103, 104, 105, 106, 107, 108 или 109 синтетических куронов.
36. Реакционная смесь, содержащая синтетический курон по любому из пп. 1-31 и вторую последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую одну или несколько из аминокислотной последовательности, выбранной из ORF2, ORF2/2, ORF2/3, ORF1, ORF1/1 или ORF1/2 из таблицы 12, или аминокислотной последовательности, характеризующейся по меньшей мере 85% идентичностью последовательности по отношению к ней.
37. Реакционная смесь, содержащая синтетический курон по любому из пп. 1-31 и вторую последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую одну или несколько из аминокислотной последовательности, выбранной из ORF2, ORF2/2, ORF2/3, ORF2t/3, ORF1, ORF1/1 или ORF1/2 из любой из таблиц 2, 4, 6, 8, 10 или 14, или аминокислотной последовательности, характеризующейся по меньшей мере 85% идентичностью последовательности по отношению к ней.
38. Реакционная смесь по п. 36 или 37, где вторая последовательность нуклеиновой кислоты является частью генетического элемента.
39. Реакционная смесь по п. 36 или 37, где вторая последовательность нуклеиновой кислоты не является частью генетического элемента, например, вторая последовательность нуклеиновой кислоты содержится в клетке-помощнике или вирусе-помощнике.
40. Применение синтетического курона по любому из пп. 1-31 или фармацевтической композиции по любому из пп. 34-35 для доставки генетического элемента в клетку-хозяина.
41. Применение синтетического курона по любому из пп. 1-31 или фармацевтической композиции по любому из пп. 34-35 для лечения заболевания или нарушения у субъекта.
42. Применение по п. 41, где заболевание или нарушение выбрано из иммунного нарушения, интерферонопатий (например, интерферонопатии I типа), инфекционного заболевания, воспалительного нарушения, аутоиммунного состояния, рака (например, солидной опухоли, например, рака легкого) и желудочно-кишечного нарушения.
43. Синтетический курон по любому из пп. 1-31 или фармацевтическая композиция по любому из пп. 34-35 для применения в лечении заболевания или нарушения у субъекта.
44. Способ лечения заболевания или нарушения у субъекта, при этом способ включает введение субъекту синтетического курона по любому из пп. 1-31 или фармацевтической композиции по любому из пп. 34-35, где заболевание или нарушение выбрано из иммунного нарушения, интерферонопатии (например, интерферонопатии I типа), инфекционного заболевания, воспалительного нарушения, аутоиммунного состояния, рака (например, солидной опухоли, например, рака легкого) и желудочно-кишечного нарушения.
45. Способ изготовления композиции на основе синтетического курона, включающий:
a) получение множества синтетических куронов по пп. 1-31 или композиции или фармацевтической композиции по любому из пп. 34-35;
b) необязательно оценивание множества в отношении одного или нескольких из загрязнителя, описанного в данном документе, измеренного значения оптической плотности (например, OD 260), количества частиц (например, с помощью HPLC), инфекционности (например, соотношения частицы:инфекционные единицы); и
c) составление множества синтетических куронов, например, в виде фармацевтической композиции, подходящей для введения субъекту, например, если один или несколько параметров из (b) соответствуют указанному пороговому значению.
RU2020100074A 2017-06-13 2018-06-13 Композиции, содержащие куроны, и пути их применения RU2020100074A (ru)

Applications Claiming Priority (7)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201762518898P 2017-06-13 2017-06-13
US62/518,898 2017-06-13
US201762597387P 2017-12-11 2017-12-11
US62/597,387 2017-12-11
US201862676730P 2018-05-25 2018-05-25
US62/676,730 2018-05-25
PCT/US2018/037379 WO2018232017A1 (en) 2017-06-13 2018-06-13 Compositions comprising curons and uses thereof

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2020100074A true RU2020100074A (ru) 2021-08-03
RU2020100074A3 RU2020100074A3 (ru) 2022-02-08

Family

ID=62846247

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2020100074A RU2020100074A (ru) 2017-06-13 2018-06-13 Композиции, содержащие куроны, и пути их применения

Country Status (12)

Country Link
US (4) US20200123203A1 (ru)
EP (1) EP3638797A1 (ru)
JP (2) JP2020524993A (ru)
KR (1) KR20200038236A (ru)
CN (1) CN111108208A (ru)
AU (1) AU2018285860A1 (ru)
BR (1) BR112019026226A2 (ru)
CA (1) CA3066750A1 (ru)
IL (1) IL271275A (ru)
MX (2) MX2019015018A (ru)
RU (1) RU2020100074A (ru)
WO (1) WO2018232017A1 (ru)

Families Citing this family (12)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2020123753A2 (en) * 2018-12-12 2020-06-18 Flagship Pioneering Innovations V, Inc. Anellosomes for delivering intracellular therapeutic modalities
US11166996B2 (en) 2018-12-12 2021-11-09 Flagship Pioneering Innovations V, Inc. Anellovirus compositions and methods of use
CN113631717A (zh) * 2018-12-12 2021-11-09 旗舰先锋创新V股份有限公司 用于递送分泌型治疗方式的指环体
KR20210131310A (ko) * 2018-12-12 2021-11-02 플래그쉽 파이어니어링 이노베이션스 브이, 인크. 아넬로좀 및 사용 방법
BR112021010925A2 (pt) * 2018-12-12 2021-08-31 Flagship Pioneering Innovations V, Inc Anelossomos para entrega de modalidades terapêuticas de substituição de proteína
JP2022542839A (ja) 2019-07-19 2022-10-07 フラッグシップ パイオニアリング イノベーションズ シックス，エルエルシー リコンビナーゼ組成物及び使用方法
MX2022015802A (es) * 2020-06-12 2023-03-28 Flagship Pioneering Innovations V Inc Construcciones de anellovirus en tandem.
TW202239762A (zh) * 2020-06-12 2022-10-16 美商旗艦先鋒創新公司 桿狀病毒表現系統
IL299082A (en) * 2020-06-17 2023-02-01 Flagship Pioneering Innovations V Inc Methods for identifying and characterizing analviruses and their uses
IL303892A (en) * 2020-12-23 2023-08-01 Flagship Pioneering Innovations V Inc In vitro assembly of RNA-encapsulating enalavirus capsids
AU2022216311A1 (en) * 2021-02-08 2023-08-17 Flagship Pioneering Innovations V, Inc. Hybrid aav-anellovectors
IL312184A (en) * 2021-10-18 2024-06-01 Flagship Pioneering Innovations Vii Llc DNA compositions and related methods

Family Cites Families (32)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
FR751473A (fr) * 1932-06-01 1933-09-04 Poste d'incendie
WO1998010088A1 (en) 1996-09-06 1998-03-12 Trustees Of The University Of Pennsylvania An inducible method for production of recombinant adeno-associated viruses utilizing t7 polymerase
US6693086B1 (en) 1998-06-25 2004-02-17 National Jewish Medical And Research Center Systemic immune activation method using nucleic acid-lipid complexes
US6395472B1 (en) * 1999-02-05 2002-05-28 Abbott Laboratories Methods of utilizing the TT virus
DK1519714T3 (da) 2002-06-28 2011-01-31 Protiva Biotherapeutics Inc Fremgangsmåde og apparat til fremstilling af liposomer
NZ544637A (en) 2003-07-16 2010-04-30 Protiva Biotherapeutics Inc Lipid encapsulated interfering RNA
EP1664316B1 (en) 2003-09-15 2012-08-29 Protiva Biotherapeutics Inc. Polyethyleneglycol-modified lipid compounds and uses thereof
US8084599B2 (en) 2004-03-15 2011-12-27 City Of Hope Methods and compositions for the specific inhibition of gene expression by double-stranded RNA
ATE536418T1 (de) 2004-06-07 2011-12-15 Protiva Biotherapeutics Inc Lipidverkapselte interferenz-rna
EP1781593B1 (en) 2004-06-07 2011-12-14 Protiva Biotherapeutics Inc. Cationic lipids and methods of use
CA2571899A1 (en) 2004-07-01 2006-08-03 Yale University Targeted and high density drug loaded polymeric materials
US7838658B2 (en) 2005-10-20 2010-11-23 Ian Maclachlan siRNA silencing of filovirus gene expression
CA2628300C (en) 2005-11-02 2018-04-17 Protiva Biotherapeutics, Inc. Modified sirna molecules and uses thereof
US7915399B2 (en) 2006-06-09 2011-03-29 Protiva Biotherapeutics, Inc. Modified siRNA molecules and uses thereof
PL2279254T3 (pl) 2008-04-15 2017-11-30 Protiva Biotherapeutics Inc. Nowe preparaty lipidowe do dostarczania kwasów nukleinowych
US20100249214A1 (en) 2009-02-11 2010-09-30 Dicerna Pharmaceuticals Multiplex dicer substrate rna interference molecules having joining sequences
AU2009336191B2 (en) 2008-12-18 2017-08-24 Dicerna Pharmaceuticals, Inc. Extended dicer substrate agents and methods for the specific inhibition of gene expression
WO2010099510A2 (en) 2009-02-27 2010-09-02 The Administrators Of The Tulane Educational Fund Amino acid-based compounds, their methods of use, and methods of screening
WO2011000108A1 (en) 2009-07-01 2011-01-06 Protiva Biotherapeutics, Inc. Compositions and methods for silencing apolipoprotein b
JP5766188B2 (ja) 2009-07-01 2015-08-19 プロチバ バイオセラピューティクス インコーポレイティッド 固形腫瘍に治療剤を送達するための脂質製剤
US9676828B2 (en) * 2010-06-23 2017-06-13 Deutsches Krebsforschungszentrum Rearranged TT virus molecules for use in diagnosis, prevention and treatment of cancer and autoimmunity
BR112013026199A2 (pt) * 2011-04-15 2017-11-07 Compugen Ltd polipeptídeo isolado, proteína de fusão, sequência de ácidos nucleicos, vetor de expressão ou um vírus, célula recombinante, método de produção de um polipeptídeo com ectodomínio solúvel lsr, ou seu fragmento ou proteína de fusão, composição farmacêutica, uso de um anticorpo monoclonal ou policlonal ou um seu fragmento de ligação ao antígeno, uso do anticorpo ou do fragmento de ligação ao antígeno, uso de qualquer um de um polipeptídeo isolado, método de regulação por cima de citocinas, indução da expansão de células t, promoção da imunidade de células t específica antigênica e promoção da ativação das células t cd4+ e/ou cd8+ em um sujeito, método para potenciação de uma resposta imune secundária a um antígeno em um paciente, método de uso de pelo menos um de: um polipeptídeo isolado, método para tratamento ou prevenção de uma condição relacionada com o sistema imune, método para tratamento ou prevenção de uma doença infecciosa, método para diagnóstico de uma doença em um sujeito, método de produção de um polipeptídeo com ectodomínio solúvel tmem25, vsig10, ly6g6f, ou seu fragmento ou proteína de fusão, anticorpo monoclonal ou policlonal ou um seu fragmento de ligação ao antígeno, método de imunoterapia em um paciente e método para combinação de vacinação terapêutica com um antígeno em conjunto com a administração de qualquer um de um polipeptídeo
MX362866B (es) 2012-05-25 2019-02-20 Univ California Metodos y composiciones para la modificacion de adn objetivo dirigida por arn y para la modulacion de la transcripcion dirigida por arn.
EP3372679A1 (en) 2012-10-23 2018-09-12 Toolgen Incorporated Composition for cleaving a target dna comprising a guide rna specific for the target dna and cas protein-encoding nucleic acid or cas protein, and use thereof
US20140310830A1 (en) 2012-12-12 2014-10-16 Feng Zhang CRISPR-Cas Nickase Systems, Methods And Compositions For Sequence Manipulation in Eukaryotes
US8993233B2 (en) 2012-12-12 2015-03-31 The Broad Institute Inc. Engineering and optimization of systems, methods and compositions for sequence manipulation with functional domains
CN113528577A (zh) 2012-12-12 2021-10-22 布罗德研究所有限公司 用于序列操纵的***、方法和优化的指导组合物的工程化
AU2013359212B2 (en) 2012-12-12 2017-01-19 Massachusetts Institute Of Technology Engineering and optimization of improved systems, methods and enzyme compositions for sequence manipulation
US8697359B1 (en) 2012-12-12 2014-04-15 The Broad Institute, Inc. CRISPR-Cas systems and methods for altering expression of gene products
US20140189896A1 (en) 2012-12-12 2014-07-03 Feng Zhang Crispr-cas component systems, methods and compositions for sequence manipulation
BR112016013213A2 (pt) * 2013-12-12 2017-12-05 Massachusetts Inst Technology administração, uso e aplicações terapêuticas dos sistemas crispr-cas e composições para visar distúrbios e doenças usando componentes de administração de partículas
US9790490B2 (en) 2015-06-18 2017-10-17 The Broad Institute Inc. CRISPR enzymes and systems

Also Published As

Publication number Publication date
MX2023011657A (es) 2023-10-11
BR112019026226A2 (pt) 2020-06-30
US20190211361A1 (en) 2019-07-11
EP3638797A1 (en) 2020-04-22
RU2020100074A3 (ru) 2022-02-08
AU2018285860A1 (en) 2020-01-02
MX2019015018A (es) 2020-09-10
US20230279423A1 (en) 2023-09-07
WO2018232017A1 (en) 2018-12-20
CN111108208A (zh) 2020-05-05
IL271275A (en) 2020-01-30
US20200123203A1 (en) 2020-04-23
US20200385757A1 (en) 2020-12-10
KR20200038236A (ko) 2020-04-10
CA3066750A1 (en) 2018-12-20
JP2023010961A (ja) 2023-01-20
JP2020524993A (ja) 2020-08-27

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2020100074A (ru) Композиции, содержащие куроны, и пути их применения
Ouyang et al. lncRNAs regulate the innate immune response to viral infection
Borkham-Kamphorst et al. Antisense strategy against PDGF B-chain proves effective in preventing experimental liver fibrogenesis
JP2020524993A5 (ru)
Ebert et al. 5′ Triphosphorylated small interfering RNAs control replication of hepatitis B virus and induce an interferon response in human liver cells and mice
JP2020022513A (ja) Ｃ／ＥＢＰα小分子活性化ＲＮＡ組成物
BR112020005287A2 (pt) composições e métodos para edição de gene ttr e tratar amiloidose attr
EA007232B1 (ru) Иммуностимулирующие олигонуклеотиды, содержащие комбинацию мотивов и обладающие повышенной активностью
Bortnik et al. Loss of HPV type 16 E7 restores cGAS-STING responses in human papilloma virus-positive oropharyngeal squamous cell carcinomas cells
CN113249380B (zh) 靶向covid-19新冠病毒的反义寡核苷酸、natac嵌合分子及其应用
Krześniak et al. Synergistic activation of p53 by actinomycin D and nutlin-3a is associated with the upregulation of crucial regulators and effectors of innate immunity
JP2023519140A (ja) Ｐｃｓｋ９のアンタゴニスト
Dai et al. Systematic identification of chicken type I, II and III interferon-stimulated genes
CN113321722A (zh) 白介素2突变体及其应用
CN110101862B (zh) 使用smad3抑制剂对癌症的治疗
Biswas et al. Evolutionary evidence of tumor necrosis factor super family members in the Japanese pufferfish (Takifugu rubripes): comprehensive genomic identification and expression analysis
WO2019010091A1 (en) METHODS AND COMPOSITIONS FOR FACILITATING HOMOLOGOUS RECOMBINATION
CN105143470A (zh) 用于将癌症分类为易感于tmepai定向疗法以及治疗所述癌症的方法
US11524047B2 (en) Pharmaceutical compositions for preventing or treating pulmonary metastasis of cancer including CHI3L1 inhibitor as active ingredient
BR112021009379A2 (pt) anelossomos para entrega de modalidades terapêuticas secretadas
CN116917470A (zh) PAN-RAS mRNA癌症疫苗
JP7258362B2 (ja) 炎症抑制用の組成物
CN113543789B (zh) 用于癌症治疗的脱氧胞苷或尿苷衍生物
JP5397692B2 (ja) 悪性黒色腫抗原の発現上昇剤及びその用途
JP2023548597A (ja) がんを処置するための可溶性インターロイキン－７受容体（ｓＩＬ７Ｒ）変調療法