KR20230025691A - 삼중 음성 유방암을 치료하기 위한 방법과 조성물 - Google Patents

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안 응위엔 두크
스테판 추이
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제넨테크, 인크.
에프. 호프만-라 로슈 아게
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Abstract

본원 발명은 개체에서 유방암(예를 들면, TNBC(예를 들면, eTNBC))을 치료하기 위한 방법과 조성물(예를 들면, 약학적 조성물)을 제공한다. 일부 양상에서, 이들 방법은 PD-1 축 결합 길항제(예를 들면, 항-PD-L1 항체(예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산(예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린(예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신), 그리고 알킬화제(예를 들면, 질소 머스타드 유도체(예를 들면, 시클로포스파미드))를 포함하는 치료 섭생을 개체에게 투여하는 단계를 포함한다. 일부 양상에서, 치료 섭생은 PD-1 축 결합 길항제 없이 탁산, 안트라사이클린 및 알킬화제를 이용한 치료와 비교하여, 병리학적 완전 반응(pCR)을 경험할 개체의 가능성을 증가시킨다. 개체에서 유방암(예를 들면, TNBC(예를 들면, eTNBC))을 치료하는 데 이용하기 위한 약학적 조성물 역시 제공된다.

Description

삼중 음성 유방암을 치료하기 위한 방법과 조성물
서열 목록
본 출원은 서열 목록을 내포하는데, 이것은 ASCII 형식으로 전자적으로 제출되었고 본원에서 온전히 참조로서 편입된다. 2021년 6월 11일 자에 작성된 상기 ASCII 사본은 51177-031WO2_Sequence_Listing_6_11_21_ST25로 명명되고 크기에서 23,399 바이트이다.
발명의 분야
본원 발명은 예를 들면, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)를 포함하는 치료 섭생을 투여함으로써, 유방암 (예를 들면, 삼중 음성 유방암 (TNBC), 예를 들면, 초기 TNBC (eTNBC))을 치료하기 위한 방법과 조성물 (예를 들면, 약학적 조성물)에 관계한다.
발명의 배경
암은 여전히 인간 건강에 대한 가장 치명적인 위협 중에서 한 가지이다. 암, 또는 악성 종양은 통제되지 않는 방식으로 급속하게 전이하고 성장하기 때문에, 이들의 적시적인 검출과 치료가 극히 어렵다. U.S.에서, 암은 매년 거의 1.3 백만 명의 새로운 환자에게 영향을 주고, 그리고 대략 사망자 4명 중 1명을 차지하는, 심장병에 뒤이은 사망의 두 번째 주도적인 원인이다. 고형 종양은 이들 사망 중에서 대부분에 대한 책임이 있다. 유방암은 여성 사이에서 가장 흔한 암이다. 유방암 중 대략 10-15%는 에스트로겐, 프로게스테론 및 HER2 수용체의 발현에 대해 삼중 음성이고, 삼중 음성 유방암 (TNBC)으로서 또한 지칭된다. TNBC는 통상적으로, 에스트로겐 수용체-양성 유방암 및 HER2-양성 유방암보다 더 공격적이고 치료하기 어려울 수 있다.
예정된 사멸-리간드 1 (PD-L1)은 암, 만성 감염, 임신, 조직 동종이식, 그리고 자가면역 질환 동안 면역계 반응의 억제에 관여하는 단백질이다. PD-L1은 T 세포, B 세포 및 단핵구의 표면 상에서 발현되는, 예정된 사멸 1 (PD-1)로서 알려져 있는 저해 수용체에 결합함으로써 면역 반응을 조절한다. PD-L1은 또한 다른 수용체, B7-1과의 상호작용을 통해 T 세포 기능을 음성적으로 조절한다. PD-L1/PD-1 및 PD-L1/B7-1 복합체의 형성은 T 세포 수용체 신호전달을 음성적으로 조절하여, T 세포 활성화의 차후 하향조절 및 항종양 면역 활성의 억제를 야기한다.
암 (예를 들면, 유방암 (예를 들면, TNBC (예를 들면, eTNBC)))의 치료에서 유의미한 진전에도 불구하고, 향상된 요법이 여전히 모색된다.
발명의 요약
본원 발명은 그 중에서도 특히, 개체에서 유방암 (예를 들면, TNBC (예를 들면, eTNBC))을 치료하기 위한 방법, 그리고 개체에서 유방암 (예를 들면, TNBC (예를 들면, eTNBC))을 치료하는 데 이용하기 위한 약학적 조성물에 관계한다. 일반적으로, 이용을 위한 방법 및 약학적 조성물은 PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드))를 포함하는 치료 섭생에 관계한다. 이용을 위한 방법 및 약학적 조성물은 예를 들면, 신보조 요법 및 보조 요법에서 이용될 수 있다.
한 가지 양상에서, 본원 발명은 개체에서 초기 삼중 음성 유방암 (eTNBC)을 치료하는 방법을 특징으로 하고, 상기 방법은 PD-1 축 결합 길항제, 탁산, 안트라사이클린 및 알킬화제의 효과량을 포함하는 치료 섭생을 개체에게 투여하는 단계를 포함하되, 상기 치료 섭생이 신보조 요법 또는 보조 요법이고, 그리고 상기 치료 섭생이 PD-1 축 결합 길항제 없이 탁산, 안트라사이클린 및 알킬화제를 이용한 치료와 비교하여, 병리학적 완전 반응 (pCR)을 경험할 개체의 가능성을 증가시킨다.
다른 양상에서, 본원 발명은 개체에서 eTNBC의 치료에서 이용을 위한, PD-1 축 결합 길항제를 포함하는 약학적 조성물을 특징으로 하고, 여기서 치료는 PD-1 축 결합 길항제, 탁산, 안트라사이클린 및 알킬화제의 효과량을 포함하는 치료 섭생의 투여를 포함하고, 여기서 상기 치료 섭생은 신보조 요법 또는 보조 요법이고, 그리고 여기서 상기 치료 섭생은 PD-1 축 결합 길항제 없이 탁산, 안트라사이클린 및 알킬화제를 이용한 치료와 비교하여, pCR을 경험할 개체의 가능성을 증가시킨다.
일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제는 항-PD-L1 항체 또는 항-PD-1 항체이다.
일부 양상에서, 항-PD-L1 항체는 아테졸리주맙이다.
일부 양상에서, 탁산은 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀이다.
일부 양상에서, 안트라사이클린은 독소루비신 또는 에피루비신이다.
일부 양상에서, 알킬화제는 질소 머스타드 유도체이다.
일부 양상에서, 질소 머스타드 유도체는 시클로포스파미드, 클로람부실, 우라무스틴, 멜팔란, 또는 벤다무스틴이다.
일부 양상에서, 질소 머스타드 유도체는 시클로포스파미드이다.
일부 양상에서, 치료 섭생은 (i) PD-1 축 결합 길항제 및 탁산을 개체에게 투여하는 것을 포함하는 일차 투약 주기, 그 이후에 (ii) PD-1 축 결합 길항제, 안트라사이클린 및 알킬화제를 개체에게 투여하는 것을 포함하는 이차 투약 주기를 포함한다.
일부 양상에서, 치료 섭생은 신보조 요법이고, 그리고 (i) 약 12 주 동안 2 주마다 약 840 mg의 아테졸리주맙 및 매주 약 125 mg/m2 냅-파클리탁셀을 개체의 정맥내에 투여하는 것을 포함하는 일차 투약 주기; 그 이후에 (ii) 약 8 주 동안 2 주마다 약 840 mg의 아테졸리주맙, 약 60 mg/m2 독소루비신 및 약 600 mg/m2 시클로포스파미드를 개체의 정맥내에 투여하는 것을 포함하는 이차 투약 주기를 포함한다.
일부 양상에서, 개체는 eTNBC에 대해 이전에 치료를 받지 않는다.
일부 양상에서, 개체는 (i) 유방암의 치료 또는 예방을 위한 선행 전신 요법; (ii) 임의의 악성종양에 대한 안트라사이클린 또는 탁산을 이용한 선행 요법; 또는 (iii) 선행 면역요법을 제공받지 않았다.
일부 양상에서, 개체로부터 획득된 종양 샘플은 종양 샘플 중 약 1% 이상을 구성하는 종양 침윤 면역 세포에서 PD-L1의 검출가능 발현 수준을 갖는다.
다른 양상에서, 본원 발명은 개체에서 eTNBC를 치료하는 방법을 특징으로 하고, 상기 방법은 아테졸리주맙, 냅-파클리탁셀, 독소루비신 및 시클로포스파미드의 효과량을 포함하는 치료 섭생을 개체에게 투여하는 단계를 포함하되, 상기 치료 섭생이 신보조 요법이고, 그리고 (i) 약 12 주 동안 2 주마다 약 840 mg의 아테졸리주맙 및 매주 약 125 mg/m2 냅-파클리탁셀을 개체의 정맥내에 투여하는 것을 포함하는 일차 투약 주기; 그 이후에 (ii) 약 8 주 동안 2 주마다 약 840 mg의 아테졸리주맙, 약 60 mg/m2 독소루비신 및 약 600 mg/m2 시클로포스파미드를 개체의 정맥내에 투여하는 것을 포함하는 이차 투약 주기를 포함하며, 그리고 상기 치료 섭생이 아테졸리주맙 없이 냅-파클리탁셀, 독소루비신 및 시클로포스파미드를 이용한 치료와 비교하여, pCR을 경험할 개체의 가능성을 증가시킨다.
다른 양상에서, 본원 발명은 개체에서 eTNBC의 치료에서 이용을 위한, 아테졸리주맙을 포함하는 약학적 조성물을 특징으로 하고, 여기서 치료는 아테졸리주맙, 냅-파클리탁셀, 독소루비신 및 시클로포스파미드의 효과량을 포함하는 치료 섭생을 개체에게 투여하는 단계를 포함하되, 상기 치료 섭생이 신보조 요법이고, 그리고 (i) 약 12 주 동안 2 주마다 약 840 mg의 아테졸리주맙 및 매주 약 125 mg/m2 냅-파클리탁셀을 개체의 정맥내에 투여하는 것을 포함하는 일차 투약 주기; 그 이후에 (ii) 약 8 주 동안 2 주마다 약 840 mg의 아테졸리주맙, 약 60 mg/m2 독소루비신 및 약 600 mg/m2 시클로포스파미드를 개체의 정맥내에 투여하는 것을 포함하는 이차 투약 주기를 포함하며, 그리고 상기 치료 섭생이 아테졸리주맙 없이 냅-파클리탁셀, 독소루비신 및 시클로포스파미드를 이용한 치료와 비교하여, pCR을 경험할 개체의 가능성을 증가시킨다.
본원에서 설명된 다양한 양상과 구체예의 특성 중에서 한 가지, 일부 또는 전부가 조합되어 본원 발명의 다른 양상과 구체예를 형성할 수 있는 것으로 이해된다. 본원 발명의 이런 저런 양상은 당업자에게 명백해질 것이다. 본원 발명의 이런 저런 양상과 구체예는 다음의 상세한 설명에 의해 더욱 설명된다.
도면의 간단한 설명
도 1은 임상 3상 단계 IMpassion031 임상 연구의 연구 설계를 보여주는 계통도이다. IC, 종양 침윤 면역 세포; IV, 정맥내; pCR, 병리학적 완전 반응; q2w, 2 주마다; q3w, 3 주마다; qw, 주 1회; R, 무작위배정. IC1/2/3 = IC에서 ≥ 1%의 PD-L1 발현; IC0 = IC에서 <1%의 PD-L1 발현.
도 2는 아테졸리주맙 + 화학요법 또는 위약 + 화학요법으로 치료를 받은 환자에 대한 IMpassion031 임상 연구의 치료 의도 (ITT) 모집단에서 pCR을 보여주는 그래프이다. CI, 신뢰 구간. * 편측 유의성 경계 = 0.0184 (적응 강화 설계를 설명).
도 3은 아테졸리주맙 + 화학요법 또는 위약 + 화학요법으로 치료를 받은 환자에 대한 IMpassion031 임상 연구의 PD-L1-양성 모집단에서 pCR을 보여주는 그래프. * 편측 유의성 경계 = 0.0184 (적응 강화 설계를 설명).
발명의 구체예의 상세한 설명
I. 도입
본원 발명은 암에 대한 치료를 이전에 받지 않았던 환자에서 암, 예를 들면, 유방암 (예를 들면, TNBC (예를 들면, eTNBC))에 대한 치료 방법 및 조성물 (예를 들면, 약학적 조성물)을 제공한다. 본원 발명은 PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드))를 포함하는 치료 섭생이 다른 치료 섭생, 예를 들면, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체)가 없는 치료 섭생과 비교하여, 개체에 대한 임상적 유익성을 향상시키는 데 예상치 않게 유효하다는 발견에 적어도 부분적으로 기초된다.
II. 정의
본원 발명을 상세하게 설명하기 전, 본원 발명은 특정 조성물 또는 생물학적 시스템에 한정되지 않으며, 이들은 당연히, 달라질 수 있는 것으로 이해되어야 한다. 또한, 본원에서 이용된 용어는 단지 특정한 양상 또는 구체예를 설명하기 위한 것이고, 그리고 한정하는 것으로 의도되지 않는 것으로 이해된다.
본 명세서 및 첨부된 특허청구범위에서 이용된 바와 같이, 단수 형태 ("a", "an" 및 "the")는 문맥에서 별도로 명시되지 않으면, 복수 지시대상을 포함한다. 따라서, 예를 들면, "분자"에 대한 언급은 두 개 이상의 이런 분자의 조합 등을 임의적으로 포함한다.
본원에서 이용된 바와 같이, 용어 "약"은 당업자에게 쉽게 공지된 개별 값에 대한 통상의 오차 범위를 지칭한다. 본원에서 값 또는 파라미터에서 "약"에 대한 언급은 상기 값 또는 파라미터 그 자체에 관계하는 구체예를 포함한다 (및 설명한다).
본원에서 설명된 발명의 양상과 구체예는 "포함하는", "구성되는" 및 "본질적으로 구성되는" 양상과 구체예를 포함하는 것으로 이해된다.
본원에서 용어 "예정된 사멸 리간드 1" 및 "PD-L1"은 선천적 서열 PD-L1 폴리펩티드, 폴리펩티드 변이체, 그리고 선천적 서열 폴리펩티드 및 폴리펩티드 변이체의 단편 (본원에서 더욱 규정된다)을 지칭한다. 본원에서 설명된 PD-L1 폴리펩티드는 다양한 공급원으로부터, 예컨대 인간 조직 유형으로부터 또는 다른 공급원으로부터 단리되거나, 또는 재조합 또는 합성 방법에 의해 제조되는 것일 수 있다.
"선천적 서열 PD-L1 폴리펩티드"는 자연으로부터 유래된 상응하는 PD-L1 폴리펩티드와 동일한 아미노산 서열을 갖는 폴리펩티드를 포함한다.
"PD-L1 폴리펩티드 변이체" 또는 이의 변이체는 본원에서 개시된 바와 같은 임의의 선천적 서열 PD-L1 폴리펩티드 서열과 적어도 약 80% 아미노산 서열 동일성을 갖는 본원에서 규정된 바와 같은 PD-L1 폴리펩티드, 일반적으로 활성 PD-L1 폴리펩티드를 의미한다. 이런 PD-L1 폴리펩티드 변이체는 예를 들면, 하나 이상의 아미노산 잔기가 선천적 아미노산 서열의 N 또는 C 말단에서 부가되거나 또는 결실되는 PD-L1 폴리펩티드를 포함한다. 통상적으로, PD-L1 폴리펩티드 변이체는 본원에서 개시된 바와 같은 선천적 서열 PD-L1 폴리펩티드 서열에 적어도 약 80% 아미노산 서열 동일성, 대안으로 적어도 약 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 또는 99% 아미노산 서열 동일성을 가질 것이다. 통상적으로, PD-L1 변이체 폴리펩티드는 길이에서 적어도 약 10개 아미노산, 대안으로 길이에서 적어도 약 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 110, 120, 130, 140, 150, 160, 170, 180, 190, 200, 210, 220, 230, 240, 250, 260, 270, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288 또는 289개, 또는 그 초과의 아미노산이다. 임의적으로, PD-L1 변이체 폴리펩티드는 선천적 PD-L1 폴리펩티드 서열과 비교하여 단지 하나의 보존성 아미노산 치환, 대안으로 선천적 PD-L1 폴리펩티드 서열과 비교하여 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 또는 10개 이내의 보존성 아미노산 치환을 가질 것이다.
본원에서 교체가능하게 이용된 바와 같이, "폴리뉴클레오티드" 또는 "핵산"은 임의의 길이의 뉴클레오티드의 중합체를 지칭하고 DNA 및 RNA를 포함한다. 뉴클레오티드는 데옥시리보뉴클레오티드, 리보뉴클레오티드, 변형된 뉴클레오티드 또는 염기 및/또는 이들의 유사체, 또는 DNA 또는 RNA 중합효소에 의해 또는 합성 반응에 의해 중합체 내로 통합될 수 있는 임의의 기질일 수 있다. 따라서, 예를 들면, 본원에서 규정된 바와 같은 폴리뉴클레오티드는 제한 없이, 단일 가닥과 이중 가닥 DNA, DNA 포함 단일 가닥과 이중 가닥 영역, 단일 가닥과 이중 가닥 RNA, RNA 포함 단일 가닥과 이중 가닥 영역, 그리고 단일 가닥 또는 더욱 전형적으로, 이중 가닥일 수 있거나 또는 단일 가닥과 이중 가닥 영역을 포함하는 DNA와 RNA를 포함하는 하이브리드 분자를 포함한다. 이에 더하여, 본원에서 이용된 바와 같이, 용어 "폴리뉴클레오티드"는 RNA 또는 DNA, 또는 RNA와 DNA 둘 모두를 포함하는 삼중 가닥 영역을 지칭한다. 이런 영역에서 가닥은 동일한 분자로부터 또는 상이한 분자로부터 유래될 수 있다. 이들 영역 모두 이들 분자 중에서 한 가지 이상을 포함할 수 있지만, 더욱 전형적으로는 이들 분자 중에서 일부의 영역만을 필요로 할 수 있다. 삼중-나선 영역의 분자 중에서 한 가지는 종종 올리고뉴클레오티드이다. 용어 "폴리뉴클레오티드"는 cDNAs를 특정적으로 포함한다.
본원에서 이용된 바와 같이, "올리고뉴클레오티드"는 일반적으로, 길이에서 약 250개 이하의 뉴클레오티드이지만 반드시 그러한 것은 아닌 짧은, 단일 가닥, 폴리뉴클레오티드를 지칭한다. 올리고뉴클레오티드는 합성일 수 있다. 용어 "올리고뉴클레오티드" 및 "폴리뉴클레오티드"는 상호간에 배타적이지 않다. 폴리뉴클레오티드에 대한 상기 설명은 올리고뉴클레오티드에 동등하게 및 완전히 적용 가능하다.
용어 "프라이머"는 핵산에 혼성화하고, 그리고 일반적으로 자유 3'-OH 기를 제공함으로써 상보성 핵산의 중합화를 허용할 수 있는 단일 가닥 폴리뉴클레오티드를 지칭한다.
용어 "검출"은 직접 검출 및 간접 검출을 비롯한, 임의의 검출 수단을 포함한다.
본원에서 이용된 바와 같이, 용어 "바이오마커"는 샘플에서 검출될 수 있는 지표, 예를 들면, 예측적, 진단적 및/또는 예후적 지표, 예를 들면, PD-L1를 지칭한다. 바이오마커는 일정한 분자적, 병리학적, 조직학적 및/또는 임상적 특질에 의해 특징화되는 질환 또는 장애 (예를 들면, 암)의 특정 아형의 지표로서 역할을 할 수 있다. 일부 구체예에서, 바이오마커는 유전자이다. 바이오마커는 폴리뉴클레오티드 (예를 들면, DNA 및/또는 RNA), 폴리뉴클레오티드 사본수 변경 (예를 들면, DNA 사본수), 폴리펩티드, 폴리펩티드와 폴리뉴클레오티드 변형 (예를 들면, 번역후 변형), 탄수화물 및/또는 당지질 기초된 분자 마커를 포함하지만 이들에 한정되지 않는다.
개체에 대한 증가된 임상적 유익성과 연관된 바이오마커의 "양" 또는 "수준"은 생물학적 샘플 내에서 검출 가능한 수준이다. 이들은 당업자에게 공지되고, 그리고 또한 본원에서 개시된 방법에 의해 계측될 수 있다. 사정된 바이오마커의 발현 수준 또는 양은 치료에 대한 반응을 결정하는 데 이용될 수 있다.
용어 "발현의 수준" 또는 "발현 수준"은 일반적으로 교체가능하게 이용되고, 그리고 일반적으로 생물학적 샘플에서 바이오마커의 양을 지칭한다. "발현"은 일반적으로 정보 (예를 들면, 유전자-인코딩된 및/또는 후성적 정보)가 세포에서 존재하고 작동하는 구조로 전환되는 과정을 지칭한다. 이런 이유로, 본원에서 이용된 바와 같이, "발현"은 폴리뉴클레오티드로의 전사 또는 폴리펩티드로의 번역을 지칭할 수 있다. 전사된 폴리뉴클레오티드의 단편, 번역된 폴리펩티드, 또는 폴리뉴클레오티드 및/또는 폴리펩티드 변형 (예를 들면, 폴리펩티드의 번역후 변형) 또한, 이들이 대안적 스플라이싱에 의해 생성된 전사체 또는 분해된 전사체로부터, 또는 예를 들면, 단백질분해에 의한 폴리펩티드의 번역후 처리로부터 유래하는지에 상관없이, 발현된 것으로 간주될 것이다. "발현된 유전자"는 mRNA로서 폴리뉴클레오티드로 전사되고, 이후 폴리펩티드로 번역되는 것들, 그리고 또한, RNA로 전사되지만 폴리펩티드로 번역되지 않는 것들 (예를 들면, 전달 및 리보솜 RNAs)을 포함한다.
"증가된 발현," "증가된 발현 수준," "증가된 수준," "상승된 발현," "상승된 발현 수준," 또는 "상승된 수준"은 대조, 예컨대 질환 또는 장애 (예를 들면, 암)로 고통받고 있지 않는 개체 또는 개체들, 또는 내부 대조 (예를 들면, 하우스키핑 바이오마커)에 비하여, 개체에서 바이오마커의 증가된 발현 또는 증가된 수준을 지칭한다.
"감소된 발현," "감소된 발현 수준," "감소된 수준," "축소된 발현," "축소된 발현 수준," 또는 "축소된 수준"은 대조, 예컨대 질환 또는 장애 (예를 들면, 암)로 고통받고 있지 않는 개체 또는 개체들, 또는 내부 대조 (예를 들면, 하우스키핑 바이오마커)에 비하여, 개체에서 바이오마커의 감소된 발현 또는 감소된 수준을 지칭한다. 일부 구체예에서, 감소된 발현은 발현이 거의 또는 전혀 없다.
용어 "하우스키핑 바이오마커"는 전형적으로 모든 세포 유형에서 유사하게 존재하는 바이오마커 또는 바이오마커의 군 (예를 들면, 폴리뉴클레오티드 및/또는 폴리펩티드)을 지칭한다. 일부 구체예에서, 하우스키핑 바이오마커는 "하우스키핑 유전자"이다. "하우스키핑 유전자"는 본원에서 세포 기능의 유지를 위해 활성이 필수적인 단백질을 인코딩하고, 그리고 전형적으로 모든 세포 유형에서 유사하게 존재하는 유전자 또는 유전자의 군을 지칭한다.
본원에서 이용된 바와 같이, "증폭"은 일반적으로 원하는 서열의 복수 사본을 생산하는 과정을 지칭한다. "복수 사본"은 적어도 2개의 사본을 의미한다. "사본"은 주형 서열에 대한 완벽한 서열 상보성 또는 동일성을 반드시 의미하는 것은 아니다. 예를 들면, 사본은 뉴클레오티드 유사체 예컨대 데옥시이노신, 의도적 서열 변경 (예컨대 주형에 혼성화 가능하지만 상보적이지는 않은 서열을 포함하는 프라이머를 통해 도입된 서열 변경) 및/또는 증폭 동안 발생하는 서열 오류를 포함할 수 있다.
용어 "멀티플렉스-PCR"은 단일 반응 동안 두 개 이상의 DNA 서열을 증폭할 목적으로, 하나 이상의 프라이머 세트를 이용하여 단일 공급원 (예를 들면, 개체)로부터 획득된 핵산에서 실행된 단일 PCR 반응을 지칭한다.
본원에서 이용된 바와 같이, "중합효소 연쇄 반응" 또는 "PCR"의 기술은 일반적으로, 핵산, RNA 및/또는 DNA의 극미한 양의 특정한 조각이 예를 들면 U.S. 특허 번호 4,683,195에서 설명된 바와 같이 증폭되는 절차를 지칭한다. 일반적으로, 올리고뉴클레오티드 프라이머가 설계될 수 있도록, 관심 영역의 단부 또는 그 너머로부터 서열 정보가 가용해야 한다; 이들 프라이머는 증폭되는 주형의 반대 가닥과 서열에서 동일하거나 또는 유사할 것이다. 이들 2개의 프라이머의 5' 말단 뉴클레오티드는 증폭되는 재료의 단부와 일치할 수 있다. PCR은 특정한 RNA 서열, 전체 유전체 DNA로부터 유래된 특정한 DNA 서열, 그리고 전체 세포 RNA, 박테리오파지 또는 플라스미드 서열 등으로부터 전사된 cDNA를 증폭하는 데 이용될 수 있다. 전반적으로 Mullis et al., Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. 51:263 (1987) 및 Erlich, ed., PCR Technology, (Stockton Press, NY, 1989)를 참조한다. 본원에서 이용된 바와 같이, PCR은 공지된 핵산 (DNA 또는 RNA)의 프라이머로서의 이용을 포함하는, 핵산 검사 샘플을 증폭하기 위한 핵산 중합효소 반응 방법의 한 가지, 하지만 유일하지 않은 실례인 것으로 고려되고, 그리고 핵산의 특정한 조각을 증폭하거나 또는 생성하기 위해, 또는 특정 핵산에 상보적인 핵산의 특정한 조각을 증폭하거나 또는 생성하기 위해 핵산 중합효소를 활용한다.
"정량적 실시간 중합효소 연쇄 반응" 또는 "qRT-PCR"은 PCR 산물의 양이 PCR 반응 동안 각 단계에서 계측되는 PCR의 형태를 지칭한다. 이러한 기술은 예를 들면, Cronin et al., Am. J. Pathol. 164(1):35-42 (2004) 및 Ma et al., Cancer Cell 5:607-616 (2004)을 비롯한 다양한 간행물에서 설명되었다.
용어 "마이크로어레이"는 기질 상에서 혼성화가능 어레이 요소, 바람직하게는 폴리뉴클레오티드 프로브의 정연한 배열을 지칭한다.
용어 "진단"은 분자 또는 병리학적 상태, 질환 또는 장애 (예를 들면, 암 (예를 들면, 유방암 (예를 들면, TNBC (예를 들면, eTNBC))))의 확인 또는 분류를 지칭하기 위해 본원에서 이용된다. 예를 들면, "진단"은 암의 특정 유형의 확인을 지칭할 수 있다. "진단"은 또한, 예를 들면, 조직병리학적 기준에 의한, 또는 분자 특질 (예를 들면, 바이오마커 (예를 들면, 특정 유전자 또는 상기 유전자에 의해 인코딩된 단백질) 중에서 한 가지 또는 이들의 조합의 발현에 의해 특징화되는 아형)에 의한, 암의 특정 아형의 분류를 지칭할 수 있다.
본원에서 이용된 바와 같이, 용어 "샘플"은 예를 들면, 물리적, 생화학적, 화학적 및/또는 생리학적 특징에 근거하여 특징화되고 및/또는 확인되는 세포 및/또는 다른 분자 실체를 내포하는 관심 개체 및/또는 피험자로부터 획득되거나 또는 유래되는 조성물을 지칭한다. 예를 들면, 관용구 "질환 샘플" 및 이의 변이는 특징화되는 세포 실체 및/또는 분자 실체를 내포할 것으로 예상되거나 또는 내포하는 것으로 알려져 있는 관심 개체로부터 획득된 임의의 샘플을 지칭한다. 샘플은 조직 샘플, 일차 또는 배양된 세포 또는 세포주, 세포 상층액, 세포 용해물, 혈소판, 혈청, 혈장, 유리체액, 림프액, 윤활액, 여포액, 정액, 양수, 유액, 전혈, 혈액 유래 세포, 소변, 뇌척수액, 타액, 객담, 눈물, 땀, 점액, 종양 용해물, 그리고 조직 배양 배지, 조직 추출물, 예컨대 균질화된 조직, 종양 조직, 세포 추출물, 그리고 이들의 조합을 포함하지만 이들에 한정되지 않는다.
"조직 샘플" 또는 "세포 샘플"은 개체 또는 피험자의 조직으로부터 획득된 유사한 세포의 수집물인 것으로 의미된다. 조직 또는 세포 샘플의 공급원은 신선한, 동결된 및/또는 보존된 장기, 조직 샘플, 생검 및/또는 흡인물로부터 고형 조직; 혈액 또는 임의의 혈액 성분, 예컨대 혈장; 체액, 예컨대 뇌척수액, 양수, 복막액, 또는 간질액; 개체의 임신 또는 발달에서 임의의 시점으로부터 세포일 수 있다. 조직 샘플은 또한, 일차 또는 배양된 세포 또는 세포주일 수 있다. 임의적으로, 조직 또는 세포 샘플은 질환 조직/장기로부터 획득된다. 예를 들면, "종양 샘플"은 종양 또는 다른 암성 조직으로부터 획득된 조직 샘플이다. 조직 샘플은 세포 유형의 혼합된 모집단 (예를 들면, 종양 세포 및 비종양 세포, 암성 세포 및 비암성 세포)을 내포할 수 있다. 조직 샘플은 자연에서 조직과 자연적으로 혼합되지 않는 화합물, 예컨대 보존제, 항응고제, 완충액, 고정제, 영양소, 항생제, 또는 기타 유사한 것을 내포할 수 있다.
본원에서 이용된 바와 같이, "종양 침윤 면역 세포"는 종양 또는 이의 샘플 내에서 존재하는 임의의 면역 세포를 지칭한다. 종양 침윤 면역 세포는 종양내 면역 세포, 종양주위 면역 세포, 다른 종양 간질 세포 (예를 들면, 섬유모세포), 또는 이들의 임의의 조합을 포함하지만 이들에 한정되지 않는다. 이런 종양 침윤 면역 세포는 예를 들면, T 림프구 (예컨대 CD8+ T 림프구 및/또는 CD4+ T 림프구), B 림프구, 또는 과립구 (예를 들면, 호중구, 호산구 및 호염기구), 단핵구, 대식세포, 수지상 세포 (예를 들면, 수지양 수지상 세포), 조직구 및 자연 킬러 세포를 비롯한 다른 골수-계통 세포일 수 있다.
본원에서 이용된 바와 같이, "종양 세포"는 종양 또는 이의 샘플 내에서 존재하는 임의의 종양 세포를 지칭한다. 종양 세포는 당해 분야에서 공지된 및/또는 본원에서 설명된 방법을 이용하여, 종양 샘플 내에서 존재할 수 있는 다른 세포, 예를 들면, 간질 세포 및 종양 침윤 면역 세포로부터 구별될 수 있다.
본원에서 이용된 바와 같이, "참조 샘플", "참조 세포", "참조 조직", "대조 샘플", "대조 세포", 또는 "대조 조직"은 비교 목적으로 이용되는 샘플, 세포, 조직, 표준 또는 수준을 지칭한다. 한 구체예에서, 참조 샘플, 참조 세포, 참조 조직, 대조 샘플, 대조 세포, 또는 대조 조직은 동일한 개체 또는 피험자의 건강한 및/또는 비-병든 신체 부위 (예를 들면, 조직 또는 세포)로부터 획득된다. 예를 들면, 참조 샘플, 참조 세포, 참조 조직, 대조 샘플, 대조 세포, 또는 대조 조직은 병든 세포 또는 조직에 인접한 건강한 및/또는 비-병든 세포 또는 조직 (예를 들면, 종양에 인접한 세포 또는 조직)일 수 있다. 다른 구체예에서, 참조 샘플은 동일한 개체 또는 피험자의 신체의 치료되지 않은 조직 및/또는 세포로부터 획득된다. 또 다른 구체예에서, 참조 샘플, 참조 세포, 참조 조직, 대조 샘플, 대조 세포, 또는 대조 조직은 개체 또는 피험자가 아닌 대상체의 건강한 및/또는 비-병든 신체 부위 (예를 들면, 조직 또는 세포)로부터 획득된다. 또 다른 구체예에서, 참조 샘플, 참조 세포, 참조 조직, 대조 샘플, 대조 세포, 또는 대조 조직은 개체 또는 피험자가 아닌 대상체의 신체의 치료되지 않은 조직 및/또는 세포로부터 획득된다.
본원에서 목적을 위해, 조직 샘플의 "섹션"은 조직 샘플의 단일 부분 또는 조각, 예를 들면, 조직 샘플 (예를 들면, 종양 샘플)로부터 절단된 조직 또는 세포의 얇은 슬라이스인 것으로 의미된다. 조직 샘플의 동일한 섹션이 형태학적 수준 및 분자 수준 둘 모두에서 분석될 수 있거나, 또는 폴리펩티드 (예를 들면, 면역조직화학에 의해) 및/또는 폴리뉴클레오티드 (예를 들면, 제자리 혼성화에 의해)에 대하여 분석될 수 있는 것으로 이해된다면, 조직 샘플의 복수의 섹션이 채취되고 분석이 진행될 수 있는 것으로 이해되어야 한다.
"상관시킨다" 또는 "상관시키는"은 일차 분석 또는 프로토콜의 성과 및/또는 결과를 이차 분석 또는 프로토콜의 성과 및/또는 결과와, 어떤 방식으로든 비교하는 것으로 의미된다. 예를 들면, 두 번째 프로토콜을 실행하는 데 일차 분석 또는 프로토콜의 결과가 이용될 수 있고 및/또는 이차 분석 또는 프로토콜이 수행되어야 하는지를 결정하기 위해 일차 분석 또는 프로토콜의 결과가 이용될 수 있다. 폴리펩티드 분석 또는 프로토콜의 구체예에 대하여, 특정한 치료 섭생이 수행되어야 하는지를 결정하기 위해 폴리펩티드 발현 분석 또는 프로토콜의 결과가 이용될 수 있다. 폴리뉴클레오티드 분석 또는 프로토콜의 구체예에 대하여, 특정한 치료 섭생이 수행되어야 하는지를 결정하기 위해 폴리뉴클레오티드 발현 분석 또는 프로토콜의 결과가 이용될 수 있다.
관용구 "에 근거하여"는 본원에서 이용될 때, 하나 이상의 바이오마커에 관한 정보가 치료 결정, 포장 삽입물 상에 제공된 정보, 또는 마케팅/홍보 지침, 기타 등등을 통지하는 데 이용된다는 것을 의미한다.
단어 "표지"는 본원에서 이용될 때, 시약 예컨대 폴리뉴클레오티드 프로브 또는 항체에 직접적으로 또는 간접적으로 접합되거나 또는 융합되고, 그리고 자신이 접합되거나 또는 융합되는 시약의 검출을 가능하게 하는 화합물 또는 조성물을 지칭한다. 표지는 그 자체로 검출 가능할 수 있거나 (예를 들면, 방사성동위원소 표지 또는 형광 표지), 또는 효소 표지의 경우에, 검출 가능한 기질 화합물 또는 조성물의 화학적 변경을 촉매작용할 수 있다. 상기 용어는 검출 가능한 물질을 프로브 또는 항체에 연계 (다시 말하면, 물리적으로 연결)함에 의한 프로브 또는 항체의 직접적인 표지화뿐만 아니라 직접적으로 표지화되는 다른 시약과의 반응성에 의한 프로브 또는 항체의 간접적인 표지화를 포괄하는 것으로 의도된다. 간접적인 표지화의 실례는 형광 표지화된 이차 항체를 이용한 일차 항체의 검출, 그리고 이것이 형광 표지화된 스트렙타비딘으로 검출될 수 있도록 DNA 프로브의 비오틴으로의 단부 표지화를 포함한다.
용어 "PD-1 축 결합 길항제"는 PD-1 신호전달 축에서 신호전달로부터 발생하는 T 세포 기능장애를 제거하기 위해 - 결과적으로 T 세포 기능 (예를 들면, 증식, 사이토킨 생산 및/또는 표적 세포 사멸)을 복원하거나 또는 증강하기 위해, PD-1 축 결합 파트너 및 이의 결합 파트너 중 하나 이상과의 상호작용을 저해하는 분자를 지칭한다. 본원에서 이용된 바와 같이, PD-1 축 결합 길항제는 PD-L1 결합 길항제, PD-1 결합 길항제 및 PD-L2 결합 길항제를 포함한다.
용어 "PD-L1 결합 길항제"는 PD-L1의 이의 결합 파트너 중 하나 이상, 예컨대 PD-1 및/또는 B7-1과의 상호작용으로부터 발생하는 신호 전달을 감소시키거나, 차단하거나, 저해하거나, 제거하거나 또는 간섭하는 분자를 지칭한다. 일부 구체예에서, PD-L1 결합 길항제는 결합 파트너에 대한 PD-L1의 결합을 저해하는 분자이다. 특정한 양상에서, PD-L1 결합 길항제는 PD-1 및/또는 B7-1에 대한 PD-L1의 결합을 저해한다. 일부 구체예에서, PD-L1 결합 길항제는 PD-L1의 이의 결합 파트너 중 하나 이상, 예컨대 PD-1 및/또는 B7-1과의 상호작용으로부터 발생하는 신호 전달을 감소시키거나, 차단하거나, 저해하거나, 제거하거나 또는 간섭하는 항-PD-L1 항체, 이들의 항원 결합 단편, 면역부착소, 융합 단백질, 올리고펩티드 및 기타 분자를 포함한다. 한 구체예에서, PD-L1 결합 길항제는 기능장애성 T 세포를 더 적게 기능장애성이 되도록 만들기 위해 (예를 들면, 항원 인식에 대한 효과 반응을 증강하기 위해), PD-L1을 통한 T 림프구 매개된 신호전달에서 발현된 세포 표면 단백질에 의해 또는 이들을 통해 매개되는 음성 동시자극성 신호를 감소시킨다. 일부 구체예에서, PD-L1 결합 길항제는 항-PD-L1 항체이다. 특정한 양상에서, 항-PD-L1 항체는 본원에서 설명된, 2015년 1월 16일 자 공개된 WHO Drug Information (International Nonproprietary Names for Pharmaceutical Substances), Proposed INN: List 112, Vol. 28, No. 4 (485 페이지 참조)에서 TECENTRIQ®로서 시판된 아테졸리주맙이다. 또 다른 특정 양상에서, 항-PD-L1 항체는 본원에서 설명된 MDX-1105이다. 또 다른 특정한 양상에서, 항-PD-L1 항체는 본원에서 설명된 YW243.55.S70이다. 또 다른 특정한 양상에서, 항-PD-L1 항체는 본원에서 설명된 MEDI4736 (더발루맙)이다. 또 다른 특정한 양상에서, 항-PD-L1 항체는 본원에서 설명된 MSB0010718C (아벨루맙)이다.
용어 "PD-1 결합 길항제"는 PD-1의 이의 결합 파트너 중 하나 이상, 예컨대 PD-L1 및/또는 PD-L2와의 상호작용으로부터 발생하는 신호 전달을 감소시키거나, 차단하거나, 저해하거나, 제거하거나 또는 간섭하는 분자를 지칭한다. 일부 구체예에서, PD-1 결합 길항제는 결합 파트너 중 하나 이상에 대한 PD-1의 결합을 저해하는 분자이다. 특정한 양상에서, PD-1 결합 길항제는 PD-L1 및/또는 PD-L2에 대한 PD-1의 결합을 저해한다. 예를 들면, PD-1 결합 길항제는 PD-1의 PD-L1 및/또는 PD-L2와의 상호작용으로부터 발생하는 신호 전달을 감소시키거나, 차단하거나, 저해하거나, 제거하거나 또는 간섭하는 항-PD-1 항체, 이들의 항원 결합 단편, 면역부착소, 융합 단백질, 올리고펩티드 및 기타 분자를 포함한다. 한 구체예에서, PD-1 결합 길항제는 기능장애성 T 세포를 더 적게 기능장애성이 되도록 만들기 위해 (예를 들면, 항원 인식에 대한 효과 반응을 증강하기 위해), PD-1을 통한 T 림프구 매개된 신호전달에서 발현된 세포 표면 단백질에 의해 또는 이것을 통해 매개되는 음성 동시자극성 신호를 감소시킨다. 일부 구체예에서, PD-1 결합 길항제는 항-PD-1 항체이다. 특정한 양상에서, PD-1 결합 길항제는 본원에서 설명된 MDX-1106 (니볼루맙)이다. 다른 특정한 양상에서, PD-1 결합 길항제는 본원에서 설명된 MK-3475 (펨블로리주맙)이다. 다른 특정한 양상에서, PD-1 결합 길항제는 본원에서 설명된 MEDI-0680 (AMP-514)이다. 다른 특정한 양상에서, PD-1 결합 길항제는 본원에서 설명된 PDR001이다. 다른 특정한 양상에서, PD-1 결합 길항제는 본원에서 설명된 REGN2810이다. 다른 특정한 양상에서, PD-1 결합 길항제는 본원에서 설명된 BGB-108이다.
용어 "PD-L2 결합 길항제"는 PD-L2의 이의 결합 파트너 중 하나 이상, 예컨대 PD-1과의 상호작용으로부터 발생하는 신호 전달을 감소시키거나, 차단하거나, 저해하거나, 제거하거나 또는 간섭하는 분자를 지칭한다. 일부 구체예에서, PD-L2 결합 길항제는 결합 파트너 중 하나 이상에 대한 PD-L2의 결합을 저해하는 분자이다. 특정한 양상에서, PD-L2 결합 길항제는 PD-1에 대한 PD-L2의 결합을 저해한다. 일부 구체예에서, PD-L2 길항제는 PD-L2의 이의 결합 파트너 중 하나 이상, 예컨대 PD-1과의 상호작용으로부터 발생하는 신호 전달을 감소시키거나, 차단하거나, 저해하거나, 제거하거나 또는 간섭하는 항-PD-L2 항체, 이들의 항원 결합 단편, 면역부착소, 융합 단백질, 올리고펩티드 및 기타 분자를 포함한다. 한 구체예에서, PD-L2 결합 길항제는 기능장애성 T 세포를 더 적게 기능장애성이 되도록 만들기 위해 (예를 들면, 항원 인식에 대한 효과 반응을 증강하기 위해), PD-L2를 통한 T 림프구 매개된 신호전달에서 발현된 세포 표면 단백질에 의해 또는 이것을 통해 매개되는 음성 동시자극성 신호를 감소시킨다. 일부 구체예에서, PD-L2 결합 길항제는 면역부착소이다.
본원에서 이용된 바와 같이, "탁산"은 튜불린에 결합할 수 있는, 미소관 조립과 안정화를 증진할 수 있는 및/또는 미소관 해중합화를 예방할 수 있는 작용제 (예를 들면, 디테르펜)이다. 예시적인 탁산은 파클리탁셀 (다시 말하면, TAXOL®, CAS # 33069-62-4), 도세탁셀 (다시 말하면, TAXOTERE®, CAS # 114977-28-5), 라로탁셀, 카바지탁셀, 밀라탁셀, 테세탁셀 및/또는 오라탁셀을 포함하지만 이들에 한정되지 않는다. 본원에 포함된 탁산은 또한, 탁소이드 10-데아세틸바카틴 III 및/또는 이의 유도체를 포함한다. 일부 구체예에서, 탁산은 알부민-코팅된 나노입자 (예를 들면, 나노-알부민 결합된 (냅)-파클리탁셀, 다시 말하면, ABRAXANE® 및/또는 냅-도세탁셀, ABI-008)이다. 일부 구체예에서, 탁산은 냅-파클리탁셀 (ABRAXANE®)이다. 일부 구체예에서, 탁산은 CREMAPHOR® (예를 들면, TAXOL®)에서 및/또는 TWEEN® 예컨대 폴리소르베이트 80 (예를 들면, TAXOTERE®)에서 조제된다. 일부 구체예에서, 탁산은 리포솜 캡슐화된 탁산이다. 일부 구체예에서, 탁산은 탁산의 전구약물 형태 및/또는 접합된 형태 (예를 들면, 파클리탁셀, 파클리탁셀 폴리글루멕스 및/또는 리놀레일 탄산염-파클리탁셀에 공유적으로 접합된 DHA)이다. 일부 구체예에서, 파클리탁셀은 실제적으로 계면활성제 없이 조제된다 (예를 들면, CREMAPHOR® 및/또는 TWEEN®의 부재에서, 예컨대 TOCOSOL® 파클리탁셀).
본원에서 이용된 바와 같이, "안트라사이클린"은 세포독성 활성을 나타내는 한 부류의 항생제 화합물을 지칭한다. 안트라사이클린은 DNA 개재, 국소이성화효소-II 매개 독성, 반응성 산소 종의 생성 및/또는 DNA 부가물 형성을 통해 세포독성을 야기할 수 있다. 예시적인 안트라사이클린은 독소루비신, 에피루비신, 이다루비신, 다우노루비신, 미톡산트론 및 발루비신을 포함하지만 이들에 한정되지 않는다. 일부 양상에서, 안트라사이클린은 독소루비신 또는 에피루비신이다. 일부 특정한 양상에서, 안트라사이클린은 독소루비신이다. 다른 특정한 양상에서, 안트라사이클린은 에피루비신이다.
본원에서 이용된 바와 같이, "알킬화제"는 알킬 기를 뉴클레오티드, 예를 들면, DNA에 부착하는 한 부류의 화학요법제를 지칭한다. 전형적으로, 알킬 기는 DNA의 구아닌 염기에 부착된다. 예시적인 알킬화제는 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드, 클로람부실, 우라무스틴, 멜팔란, 또는 벤다무스틴), 니트로소요소 (예를 들면, 카르무스틴, 로무스틴, 또는 스트렙토조신), 알킬 술포네이트 (예를 들면, 부술판), 트리아진 (예를 들면, 다카르바진 또는 테모졸로미드, 그리고 에틸렌이민 (예를 들면, 알트레타민 또는 티오테파)을 포함하지만 이들에 한정되지 않는다.
용어 "기능장애"는 면역 기능장애의 문맥에서, 항원 자극에 대한 감소된 면역 반응성의 상태를 지칭한다. 상기 용어는 항원 인식이 발생할 수 있지만 뒤이은 면역 반응이 감염 또는 종양 성장을 제어하는 데 무효한, "탈진" 및/또는 "아네르기" 둘 모두의 공통 요소를 포함한다.
본원에서 이용된 바와 같이, 용어 "기능장애"는 또한 항원 인식에 대한 불응 또는 무반응, 특이적으로, 항원 인식을 하류 T 세포 효과기 기능, 예컨대 증식, 사이토킨 생산 (예를 들면, IL-2) 및/또는 표적 세포 사멸로 번역하는 능력의 손상을 포함한다.
용어 "아네르기"는 T 세포 수용체를 통해 전달된 불완전한 또는 불충분한 신호 (예를 들면, ras-활성화의 부재에서 세포내 Ca+2의 증가)로부터 발생하는, 항원 자극에 대한 불응의 상태를 지칭한다. T 세포 아네르기는 또한, 동시자극의 부재에서 항원으로 자극 시에 발생하여, 세포가 심지어 동시자극의 맥락에서도 항원에 의한 후속 활성화에 불응성이 되도록 야기할 수 있다. 반응이 없는 상태는 종종, 인터류킨-2의 존재에 의해 무효화될 수 있다. 무력성 T 세포는 클론 확장을 겪지 않고 및/또는 효과기 기능을 획득하지 않는다.
용어 "탈진"은 많은 만성 감염 및 암 동안 발생하는 지속된 TCR 신호전달로부터 발생하는 T 세포 기능장애의 상태로서 T 세포 탈진을 지칭한다. 이것은 불완전한 또는 결함성 신호전달을 통해서가 아닌 지속된 신호전달로부터 발생한다는 점에서 아네르기와 구별된다. 이것은 불량한 효과기 기능, 저해 수용체의 지속된 발현, 그리고 기능적 효과기 또는 기억 T 세포의 것과 상이한 전사 상태에 의해 규정된다. 탈진은 감염 및 종양의 최적 제어를 방해한다. 탈진은 외인성 음성 조절 경로 (예를 들면, 면역조절성 사이토킨)뿐만 아니라 세포 내재성 음성 조절 (동시자극성) 경로 (PD-1, B7-H3, B7-H4 등) 둘 모두로부터 발생할 수 있다.
"종양 면역성"은 종양이 면역 인식과 제거를 회피하는 과정을 지칭한다. 따라서, 치료적 개념으로서, 종양 면역성은 이런 회피가 약화되고, 그리고 종양이 면역계에 의해 인식되고 공격될 때 "치료"된다. 종양 인식의 실례는 종양 결합, 종양 위축 및 종양 제거를 포함한다.
"면역원성"은 면역 반응을 유발하는 특정 물질의 능력을 지칭한다. 종양은 면역원성이고, 그리고 종양 면역원성을 증강하는 것은 면역 반응에 의한 종양 세포의 제거를 보조한다. 종양 면역원성을 증강하는 실례는 PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드))를 포함하는 치료 섭생을 이용한 치료를 포함한다.
본원 발명의 맥락에서 용어 "에 반응한다" 또는 "에 반응성"은 암 (예를 들면, 유방암 (예를 들면, TNBC (예를 들면, eTNBC))을 겪고 있거나, 겪는 것으로 의심되거나 또는 겪기 쉬운 환자가 요법, 예를 들면, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드))를 포함하는 치료 섭생에 대한 반응을 보여준다는 것을 암시한다. 당업자는 본원 발명의 방법에 따라서 PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드))를 포함하는 치료 섭생으로 치료된 개체가 반응을 보여주는지를 쉽게 결정하는 위치에 있을 것이다. 예를 들면, 반응은 암으로부터 감소된 고통, 예컨대 축소된 및/또는 중단된 종양 성장, 종양의 크기 감소 및/또는 암의 한 가지 이상의 증상의 개선에 의해 반영될 수 있다. 바람직하게는, 반응은 암의 전이성 전환의 감소된 또는 축소된 지수, 또는 암의 감소된 또는 축소된 지수, 예를 들면, 전이의 형성의 예방, 또는 전이의 수 또는 크기의 감소에 의해 반영될 수 있다. 반응은 예를 들면, 완전 반응 (예를 들면, 병리학적 완전 반응 (pCR)), 부분 반응, 진행 없는 생존에서 향상, 전체 생존에서 향상, 침습성 질환 없는 생존 (iDFS)에서 향상, 또는 지속된 반응일 수 있다.
"지속된 반응"은 치료의 휴지 후 종양 성장을 감소시키는 것에 대한 지속된 효과를 지칭한다. 예를 들면, 종양 크기가 투여 시기의 시작 시점에서 크기와 비교하여, 동일하거나 또는 더 작게 남아있을 수 있다. 일부 구체예에서, 지속된 반응은 치료 지속 기간과 적어도 동일하거나, 치료 지속 기간의 적어도 1.5X, 2.0X, 2.5X, 또는 3.0X 길이인 지속 기간을 갖는다.
본원에서 이용된 바와 같이, "암 재발을 감소시키거나 또는 저해하는"은 종양 또는 암 재발, 또는 종양 또는 암 진행을 감소시키거나 또는 저해하는 것을 의미한다. 본원에서 개시된 바와 같이, 암 재발 및/또는 암 진행은 암 전이를 제한 없이 포함한다.
본원에서 이용된 바와 같이, "완전 반응" 또는 "CR"은 모든 표적 병변의 소멸을 지칭한다.
본원에서 이용된 바와 같이, "병리학적 완전 반응" 또는 "pCR"은 유방 및 림프절 둘 모두로부터 침습성 종양의 부재를 지칭한다. 용어 pCR은 관상피내암과 상관없이, 유방 및 액와 림프절 내에 침습성 암의 부재 (다시 말하면, ypT0/is ypN0); 유방 및 액와 림프절 내에 침습성 암 및 제자리암의 부재 (다시 말하면, ypT0 ypN0); 그리고 관상피내암 또는 림프절 침범과 상관없이, 유방 내에 침습성 암의 부재 (다시 말하면, ypT0/is)를 포함한다. 특정한 양상에서, pCR은 관상피내암과 상관없이, 유방 및 액와 림프절 내에 침습성 암의 부재 (다시 말하면, ypT0/is ypN0)를 지칭한다.
본원에서 이용된 바와 같이, "부분 반응" 또는 "PR" 은 기준선 최장 직경 (SLD)을 기준으로서 간주할 때, 표적 병변의 SLD의 합계에서 적어도 30% 감소를 지칭한다.
본원에서 이용된 바와 같이, "안정적 질환" 또는 "SD"는 치료가 시작된 이후로 가장 작은 SLD를 기준으로서 간주할 때, 표적 병변에서 PR의 자격이 있을 만큼 충분한 위축이 없음 및 PD의 자격이 있을 만큼 충분한 증가가 없음을 지칭한다.
본원에서 이용된 바와 같이, "진행성 질환" 또는 "PD"는 치료가 시작되거나, 또는 하나 이상의 새로운 병변의 존재 이후로 기록된 가장 작은 SLD를 기준으로서 간주할 때, 표적 병변의 SLD에서 적어도 20% 증가를 지칭한다.
본원에서 이용된 바와 같이, "진행 없는 생존" (PFS)은 치료 동안 및 치료 후, 치료되는 질환 (예를 들면, 암)이 악화되지 않는 기간을 지칭한다. 진행 없는 생존은 환자가 완전 반응 또는 부분 반응을 경험한 시간의 양뿐만 아니라 환자가 안정적 질환을 경험한 시간의 양을 포함할 수 있다.
본원에서 이용된 바와 같이, "전체 반응률" 또는 "객관적인 반응률" (ORR)은 완전 반응 (CR) 비율 및 부분 반응 (PR) 비율의 합계를 지칭한다.
본원에서 이용된 바와 같이, "전체 생존" (OS)은 특정 지속 기간 후 살아있을 가능성이 높은 군에서 개체의 백분율을 지칭한다.
본원에서 이용된 바와 같이, 용어 "치료"는 임상 병리학의 코스 동안 치료되는 개체 또는 세포의 자연적인 코스를 변경하도록 설계된 임상적 개입을 지칭한다. 바람직한 치료 효과는 질환 진행의 속도 감소, 질환 상태의 개선 또는 완화, 그리고 관해 또는 향상된 예후를 포함한다. 예를 들면, 만약 암성 세포의 증식을 감소시키고 (또는 이들 세포를 파괴하고), 질환으로부터 발생하는 증상을 감소시키고, 질환을 겪는 개체의 삶의 질을 증가시키고, 질환을 치료하는 데 필요한 다른 약제의 용량을 감소시키고 및/또는 개체의 생존을 연장하는 것을 포함하지만 이들에 한정되지 않는, 암과 연관된 한 가지 이상의 증상이 경감되거나 또는 제거되면, 개체는 성공적으로 "치료"된다.
본원에서 이용된 바와 같이, 질환의 "진행을 지연시키는" 것은 상기 질환 (예컨대 암)의 발달을 미루고, 방해하고, 늦추고, 지연시키고, 안정시키고 및/또는 연기시키는 것을 의미한다. 이러한 지연은 질환의 이력 및/또는 치료되는 개체에 따라 시간 길이가 변할 수 있다. 당업자에게 명백한 바와 같이, 충분한 또는 유의미한 지연은 개체에서 질환이 발달하지 않는다는 점에서, 실제로 예방을 포괄할 수 있다. 예를 들면, 후기 단계 암, 예컨대 전이의 발달이 지연될 수 있다.
본원에서 교체가능하게 이용된 바와 같이, "효과량" 또는 "치료 효과량"은 특정 장애의 계측 가능한 향상 또는 예방을 달성하는 데 필요한 적어도 최소량이다. 본원에서 효과량은 인자, 예컨대 환자의 질환 상태, 연령, 성별 및 체중, 그리고 개체에서 원하는 반응을 이끌어 내는 작용제의 능력에 따라서 변할 수 있다. 효과량은 또한, 치료의 임의의 독성 또는 유해한 효과보다 치료적으로 유익한 효과가 우위에 있는 것이다. 예방적 용도의 경우에, 유익한 또는 원하는 결과는 위험을 제거하거나 또는 감소시키고, 심각도를 줄이고, 또는 질환의 생화학적, 조직학적 및/또는 행동 증상, 이의 합병증 및 상기 질환의 발달 동안 나타나는 중간 병리학적 표현형을 비롯하여 상기 질환의 개시를 지연시키는 것과 같은 결과를 포함한다. 치료적 용도의 경우에, 유익한 또는 원하는 결과는 질환으로부터 발생하는 한 가지 이상의 증상을 감소시키고, 질환으로 고통받는 개체의 삶의 질을 증가시키고, 질환을 치료하는 데 필요한 다른 약제의 용량을 감소시키고, 그리고 예컨대 표적화를 통해 다른 약제의 효과를 증강하고, 질환의 진행을 지연시키고 및/또는 생존을 연장하는 것과 같은 임상적 결과를 포함한다. 암 또는 종양의 경우에, 약물의 효과량은 암 세포의 숫자를 감소시키고; 종양 크기를 감소시키고; 주변 장기 내로 암 세포 침윤을 저해하고 (다시 말하면, 얼마간 늦추거나 또는 바람직하게는 중단시키고); 종양 전이를 저해하고 (다시 말하면, 얼마간 늦추고 바람직하게는 중단시키고); 종양 성장을 얼마간 저해하고; 및/또는 장애와 연관된 증상 중에서 한 가지 이상을 얼마간 완화하는 데 효과를 가질 수 있다. 효과량은 1회 이상의 투여에서 투여될 수 있다. 본원 발명을 위해, 약물, 화합물 또는 약학적 조성물의 효과량은 예방적 또는 치료적 처치를 직접적으로 또는 간접적으로 달성하는 데 충분한 양이다. 임상적 맥락에서 이해되는 바와 같이, 약물, 화합물 또는 약학적 조성물의 효과량은 다른 약물, 화합물 또는 약학적 조성물과 함께 달성되거나 또는 달성되지 않을 수 있다. 따라서, "효과량"은 한 가지 이상의 치료제 (예를 들면, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드))를 포함하는 치료 섭생)를 투여하는 맥락에서 고려될 수 있고, 그리고 단일 작용제는 한 가지 이상의 다른 작용제와 함께, 바람직한 결과가 달성될 수 있거나 또는 달성되면, 효과량으로 제공된 것으로 고려될 수 있다.
본원에서 이용된 바와 같이, "병용으로" 또는 "함께"는 다른 치료 양식에 더하여 한 가지 치료 양식의 투여를 지칭한다. 따라서, "함께"는 개체에게 다른 치료 양식의 투여 이전, 동안 또는 이후, 한 가지 치료 양식의 투여를 지칭한다.
"장애"는 포유동물을 문제되는 장애에 취약하게 만드는 병리학적 상태를 비롯한 만성과 급성 장애 또는 질환을 포함하지만 이들에 한정되지 않는, 치료로부터 유익성을 얻을 임의의 상태이다.
용어 "세포 증식성 장애" 및 "증식성 장애"는 어느 정도의 비정상 세포 증식과 연관되는 장애를 지칭한다. 한 구체예에서, 세포 증식성 장애는 암이다. 한 구체예에서, 세포 증식성 장애는 종양이다.
본원에서 이용된 바와 같이, 용어 "종양"은 악성 또는 양성인지에 상관없이 모든 신생물 세포 성장과 증식, 그리고 모든 전암성과 암성 세포와 조직을 지칭한다. 용어 "암", "암성", "세포 증식성 장애", "증식성 장애", 그리고 "종양"은 본원에서 상호간에 배타적으로 지칭되지 않는다.
용어 "암" 및 "암성"은 전형적으로, 조절되지 않은 세포 성장에 의해 특징되는, 포유동물에서 생리학적 상태를 지칭하거나 또는 설명한다. 용어 "유방암"은 HER2+ 유방암, 그리고 암 세포가 에스트로겐 수용체 (ER-), 프로게스테론 수용체 (PR-) 및 HER2 (HER2-)에 대해 음성인 유방암의 형태이고 국소 진행성, 절제 불가능 및/또는 전이성일 수 있는 삼중 음성 유방암 (TNBC) (예를 들면, 전이성 삼중 음성 유방암 (mTNBC))을 포함하지만 이들에 한정되지 않는다. 본원에서 설명된 방법은 국소 진행성 및/또는 전이성인 암을 비롯하여, 다양한 시기의 암의 치료에 적합하다. 암 병기결정에서, 국소 진행성은 일반적으로, 국지적 부위로부터 인근 조직 및/또는 림프절로 확산한 암으로서 규정되었다. 로마 숫자 병기결정 시스템에서, 국소 진행성은 통상적으로, II 기 또는 III 기로 분류된다. 전이성인 암은 암이 멀리 떨어진 조직과 장기까지 신체 전반으로 확산하는 시기 (IV 기)이다.
본원에서 이용된 바와 같이, 용어 "초기 TNBC" 및 "eTNBC"는 I 기-III 기 TNBC를 비롯한, 초기 단계 TNBC를 지칭한다. 초기 TNBC는 진단된 모든 새로운 초기 유방암의 10% 내지 20%를 차지하는데, 신보조 안트라사이클린 및 탁산 요법을 이용한 치료 후 3-년 무병 생존율이 74% 내지 76%이다.
본원에서 이용된 바와 같이, 용어 "화학요법제"는 암, 예컨대 mTNBC의 치료에 유용한 화합물을 포함한다. 화학요법제의 실례는 에를로티닙 (TARCEVA®, Genentech/OSI Pharm.), 보르테조밉 (VELCADE®, Millennium Pharm.), 디술피람, 에피갈로카테킨 갈산염, 살리노스포라미드 A, 카르필조밉, 17-AAG (젤다나마이신), 라디시콜, 유산 탈수소효소 A (LDH-A), 풀베스트란트 (FASLODEX®, AstraZeneca), 수니팁 (SUTENT®, Pfizer/Sugen), 레트로졸 (FEMARA®, Novartis), 이마티닙 메실레이트 (GLEEVEC®, Novartis), 피나수네이트 (VATALANIB®, Novartis), 옥살리플라틴 (ELOXATIN®, Sanofi), 5-FU (5-플루오로우라실), 류코보린, 라파마이신 (시로리무스, RAPAMUNE®, Wyeth), 라파티닙 (TYKERB®, GSK572016, Glaxo Smith Kline), 로나파밉 (SCH 66336), 소라페닙 (NEXAVAR®, Bayer Labs), 제피티닙 (IRESSA®, AstraZeneca), AG1478, 알킬화제 예컨대 티오테파 및 CYTOXAN® 시클로포스파미드; 알킬 술폰산염 예컨대 부술판, 임프로술판 및 피포술판; 아지리딘 예컨대 벤조도파, 카르보쿠온, 메투레도파 및 우레도파; 알트레타민, 트리에틸렌멜라민, 트리에틸렌포스포르아미드, 트리에틸렌티오포스포르아미드 및 트리메틸로멜라민을 비롯한 에틸렌이민 및 메틸아멜라민; 아세토제닌 (특히 불라탁신 및 불라타시논); 캄프토테신 (토포테칸 및 이리노테칸 포함); 브리오스타틴; 칼리스타틴; CC-1065 (이의 아도젤레신, 카르젤레신 및 비젤레신 합성 유사체 포함); 크립토피신 (특히 크립토피신 1 및 크립토피신 8); 부신피질 스테로이드 (프레드니손 및 프레드니솔론 포함); 시프로테론 아세트산염; 피나스테리드 및 두타스테리드를 비롯한 5α-환원효소); 보리노스탯, 로미뎁신, 파노비노스탯, 발프로산, 모세티노스탯 돌라스타틴; 알데스류킨, 탈크 듀오카마이신 (합성 유사체, KW-2189 및 CB1-TM1 포함); 엘루테로빈; 판크라티스타틴; 사르코딕틴; 스폰지스타틴; 질소 머스타드 예컨대 클로람부실, 클로마파진, 클로로포스파미드, 에스트라무스틴, 이포스파미드, 메클로르에타민, 메클로르에타민 산화물 염산염, 멜팔란, 노벰비킨, 페네스테린, 프레드니무스틴, 트로포스파미드, 우라실 머스타드; 니트로소요소 예컨대 카르무스틴, 클로로조토신, 포테무스틴, 로무스틴, 니무스틴 및 라니무스틴; 항생제 예컨대 에네다인 항생제 (예를 들면, 칼리키아마이신, 특히 칼리키아마이신 γ1I 및 칼리키아마이신 ω1I (Angew Chem. Intl. Ed. Engl. 33:183-186 (1994)); 디네미신 A를 비롯한 디네미신; 비스포스포네이트, 예컨대 클로드로네이트; 에스페라마이신; 뿐만 아니라 네오카르지노스타틴 발색단 및 관련된 색단백질 에네다인 항균성 발색단), 아클라시노마이신, 악티노마이신, 오트라마이신, 아자세린, 블레오마이신, 칵티노마이신, 카라비신, 카미노마이신, 카르지노필린, 크로모마이신, 닥티노마이신, 다우노루비신, 데토루비신, 6-디아조-5-옥소-L-노르류신, ADRIAMYCIN® (독소루비신), 모르폴리노-독소루비신, 시아노모르폴리노-독소루비신, 2-피롤리노-독소루비신 및 데옥시독소루비신), 에피루비신, 에소루비신, 이다루비신, 마르셀로마이신, 미토마이신 예컨대 미토마이신 C, 마이코페놀산, 노갈라마이신, 올리보마이신, 페플로마이신, 포르피로마이신, 푸로마이신, 켈라마이신, 로도루비신, 스트렙토니그린, 스트렙토조신, 튜베르시딘, 우베니멕스, 지노스타틴, 조루비신; 대사길항물질 예컨대 메토트렉사트 및 5-플루오로우라실 (5-FU); 엽산 유사체 예컨대 데노프테린, 메토트렉사트, 프테로프테린, 트리메트렉사트; 퓨린 유사체 예컨대 플루다라빈, 6-메르캅토푸린, 티아미프린, 티오구아닌; 피리미딘 유사체 예컨대 안시타빈, 아자시티딘, 6-아자우리딘, 카르모푸르, 시타라빈, 디데옥시우리딘, 독시플루리딘, 에노시타빈, 플록수리딘; 안드로겐 예컨대 칼루스테론, 드로모스타놀론 프로피온산염, 에피티오스타놀, 메피티오스탄, 테스톨락톤; 항아드레날제 예컨대 아미노글루테티미드, 미토탄, 트릴로스탄; 엽산 보충물 예컨대 프로릴산; 아세글라톤; 알도포스파미드 글리코시드; 아미노레불린산; 에니루라실; 암사크린; 베스트라부실; 비산트렌; 에다트렉사트; 데포파민; 데메콜신; 디아지쿠온; 엘포미틴; 엘립티니움 아세트산염; 에포틸론; 에토글루시드; 갈륨 질산염; 히드록시요소; 렌티난; 로니다이닌; 메이탄시노이드 예컨대 메이탄신 및 안사미토신; 미토구아존; 미톡산트론; 모피담놀; 니트라에린; 펜토스타틴; 페나메트; 피라루비신; 로속산트론; 포도필린산; 2-에틸히드라지드; 프로카르바진; PSK® 다당류 복합체 (JHS Natural Products, Eugene, Oreg.); 라족산; 리족신; 시조푸란; 스피로게르마늄; 테누아존산; 트리아지쿠온; 2,2',2''-트리클로로트리에틸아민; 트리코테센 (특히 T-2 독소, 베라쿠린 A, 로리딘 A 및 안구이딘); 우레탄; 빈데신; 다카르바진; 만노무스틴; 미토브로니톨; 미토락톨; 피포브로만; 가시토신; 아라비노시드 ("Ara-C"); 시클로포스파미드; 티오테파; 탁산; 클로람부실; GEMZAR® (젬시타빈); 6-티오구아닌; 메르캅토푸린; 메토트렉사트; 빈블라스틴; 에토포시드 (VP-16); 이포스파미드; 미톡산트론; 빈크리스틴; NAVELBINE® (비노렐빈); 노반트론; 테니포시드; 에다트렉사트; 다우노마이신; 아미노프테린; 카페시타빈 (XELODA®); 이반드로네이트; CPT-11; 국소이성화효소 저해제 RFS 2000; 디플루오로메틸오르니틴 (DMFO); 레티노이드 예컨대 레티노산; 그리고 전술한 것들 중 어느 것의 약학적으로 허용되는 염, 산 및 유도체를 포함한다.
화학요법제는 또한, "백금 기반" 화학요법제를 포함하는데, 이들은 백금을 분자의 필수적인 부분으로서 내포하는 유기 화합물을 포함한다. 전형적으로, 백금 기반 화학요법제는 백금의 배위 복합체이다. 백금 기반 화학요법제는 당해 분야에서 때때로 "플라틴"으로 불린다. 백금 기반 화학요법제의 실례는 카르보플라틴, 시스플라틴 및 옥살리플라틴을 포함하지만 이들에 한정되지 않는다.
화학요법제는 또한, (i) 예를 들면, 타목시펜 (NOLVADEX®; 타목시펜 구연산염 포함), 랄록시펜, 드롤록시펜, 요오독시펜, 4-히드록시타목시펜, 트리녹시펜, 케옥시펜, LY117018, 오나프리스톤 및 FARESTON® (토레미핀 구연산염)을 비롯하여, 종양에 대한 호르몬 작용을 조절하거나 또는 저해하는 작용을 하는 항호르몬 작용제 예컨대 항에스트로겐 및 선택적 에스트로겐 수용체 조절인자 (SERMs); (ii) 부신에서 에스트로겐 생산을 조절하는 효소 아로마타아제를 저해하는 아로마타아제 저해제, 예컨대 예를 들면, 4(5)-이미다졸, 아미노글루테티미드, MEGASE® (메게스트롤 아세트산염), AROMASIN® (엑세메스테인; Pfizer), 포르메스타니, 파드로졸, RIVISOR® (보로졸), FEMARA® (레트로졸; Novartis) 및 ARIMIDEX® (아나스트로졸; AstraZeneca); (iii) 항안드로겐 예컨대 플루타미드, 닐루타미드, 비칼루타미드, 류프롤라이드 및 고세렐린; 부세렐린, 트립테렐린, 메드록시프로게스테론 아세트산염, 디에틸스틸베스트롤, 프레마린, 플루오시메스테론, 모든 트랜스레티노산, 펜레티나이드뿐만 아니라 트록사시타빈 (1,3-디옥솔란 뉴클레오시드 시토신 유사체); (iv) 단백질 키나아제 저해제; (v) 지질 키나아제 저해제; (vi) 안티센스 올리고뉴클레오티드, 특히 일탈적 세포 증식에 연루된 신호전달 경로에서 유전자, 예컨대 예를 들면, PKC-알파, Ralf 및 H-Ras의 발현을 저해하는 것들; (vii) 리보자임 예컨대 VEGF 발현 저해제 (예를 들면, ANGIOZYME®) 및 HER2 발현 저해제; (viii) 백신 예컨대 유전자 요법 백신, 예를 들면, ALLOVECTIN®, LEUVECTIN® 및 VAXID®; PROLEUKIN®, rIL-2; 국소이성화효소 1 저해제 예컨대 LURTOTECAN®; ABARELIX® rmRH; 그리고 (ix) 전술한 것들 중 어느 것의 약학적으로 허용되는 염, 산 및 유도체를 포함한다.
화학요법제는 또한, 항체 예컨대 알렘투주맙 (Campath), 베바시주맙 (AVASTIN®, Genentech); 세툭시맙 (ERBITUX®, Imclone); 파니투무맙 (VECTIBIX®, Amgen), 리툭시맙 (RITUXAN®, Genentech/Biogen Idec), 페르투주맙 (OMNITARG®, 2C4, Genentech), 트라스투주맙 (HERCEPTIN®, Genentech), 토시투모맙 (벡사르, Corixia), 그리고 항체 약물 접합체, 겜투주맙 오조가마이신 (MYLOTARG®, Wyeth)을 포함한다. 본원 발명의 화합물과 병용으로 작용제로서 치료 잠재력을 갖는 추가의 인간화 단일클론 항체는 아폴리주맙, 아셀리주맙, 아틀리주맙, 바피네우주맙, 비바투주맙 메르탄신, 칸투주맙 메르탄신, 세델리주맙, 세르톨리주맙 페골, 시드푸시투주맙, 시드투주맙, 다클리주맙, 에쿨리주맙, 에팔리주맙, 에프라투주맙, 에를리주맙, 펠비주맙, 폰톨리주맙, 겜투주맙 오조가마이신, 이노투주맙 오조가마이신, 이플리무맙, 라베투주맙, 린투주맙, 마투주맙, 메폴리주맙, 모타비주맙, 모토비주맙, 나탈리주맙, 니모투주맙, 놀로비주맙, 누마비주맙, 오크렐리주맙, 오말리주맙, 팔리비주맙, 파스콜리주맙, 펙푸시투주맙, 펙투주맙, 펙셀리주맙, 랄리비주맙, 라니비주맙, 레슬리비주맙, 레슬리주맙, 레시비주맙, 로벨리주맙, 루플리주맙, 시브로투주맙, 시플리주맙, 손투주맙, 타카투주맙 테트라제탄, 타도시주맙, 탈리주맙, 테피바주맙, 토실리주맙, 토랄리주맙, 투코투주맙 셀모루킨, 투쿠시투주맙, 우마비주맙, 우르톡사주맙, 우스테키누맙, 비실리주맙, 그리고 인터류킨-12 p40 단백질을 인식하도록 유전적으로 변형된 재조합, 배타적으로 인간-서열, 전장 IgG1 λ 항체인 항-인터류킨-12 (ABT-874/J695, Wyeth Research and Abbott Laboratories)를 포함한다.
화학요법제는 또한, "EGFR 저해제"를 포함하는데, 이들은 EGFR에 결합하거나 또는 만약 그렇지 않으면 이것과 직접적으로 상호작용하고 이의 신호전달 활성을 예방하거나 또는 감소시키는 화합물을 지칭하고, 그리고 "EGFR 길항제"로서 대체 지칭된다. 이런 작용제의 실례는 EGFR에 결합하는 항체 및 소형 분자를 포함한다. EGFR에 결합하는 항체의 실례는 MAb 579 (ATCC CRL HB 8506), MAb 455 (ATCC CRL HB8507), MAb 225 (ATCC CRL 8508), MAb 528 (ATCC CRL 8509) (참조: US 특허 번호 4,943, 533) 및 이의 변이체, 예컨대 키메라화 225 (C225 또는 세툭시맙; ERBUTIX®) 및 재성형된 인간 225 (H225) (참조: 예를 들면, WO 96/40210, Imclone Systems Inc.); IMC-11F8, 완전 인간, EGFR-표적화된 항체 (Imclone); II형 돌연변이체 EGFR에 결합하는 항체 (US 특허 번호 5,212,290); US 특허 번호 5,891,996에서 설명된 바와 같이 EGFR에 결합하는 인간화 및 키메라 항체; 그리고 EGFR에 결합하는 인간 항체, 예컨대 ABX-EGF 또는 파니투무맙 (참조: WO98/50433, Abgenix/Amgen); EMD 55900 (Stragliotto et al. Eur. J. Cancer 32A:636-640 (1996)); EMD7200 (마투주맙), EGFR 결합에 대해 EGF 및 TGF-알파 둘 모두와 경쟁하는, EGFR을 향해 지향된 인간화 EGFR 항체 (EMD/Merck); 인간 EGFR 항체, HuMax-EGFR (GenMab); E1.1, E2.4, E2.5, E6.2, E6.4, E2.11, E6. 3 및 E7.6. 3으로서 알려져 있고 US 6,235,883에서 설명된 완전 인간 항체; MDX-447 (Medarex Inc); 및 mAb 806 또는 인간화 mAb 806 (Johns et al., J. Biol. Chem. 279(29):30375-30384 (2004))을 포함한다. 항-EGFR 항체는 세포독성 작용제와 접합되어 면역접합체를 생성할 수 있다 (참조: 예를 들면, EP659439A2, Merck Patent GmbH). EGFR 길항제는 소형 분자 예컨대 US 특허 번호: 5,616,582, 5,457,105, 5,475,001, 5,654,307, 5,679,683, 6,084,095, 6,265,410, 6,455,534, 6,521,620, 6,596,726, 6,713,484, 5,770,599, 6,140,332, 5,866,572, 6,399,602, 6,344,459, 6,602,863, 6,391,874, 6,344,455, 5,760,041, 6,002,008 및 5,747,498뿐만 아니라 하기의 PCT 공보: WO98/14451, WO98/50038, WO99/09016 및 WO99/24037에서 설명된 화합물을 포함한다. 특정 소형 분자 EGFR 길항제는 OSI-774 (CP-358774, 에를로티닙, TARCEVA® Genentech/OSI Pharmaceuticals); PD 183805 (CI 1033, 2-프로펜아미드, N-[4-[(3-클로로-4-플루오로페닐)아미노]-7-[3-(4-모르폴리닐)프로폭시]-6-퀴나졸리닐]-, 중염산염, Pfizer Inc.); ZD1839, 제피티닙 (IRESSA®) 4-(3'-클로로-4'-플루오로아닐리노)-7-메톡시-6-(3-모르폴리노프로폭시)퀴나졸린, AstraZeneca); ZM 105180 ((6-아미노-4-(3-메틸페닐-아미노)-퀴나졸린, Zeneca); BIBX-1382 (N8-(3-클로로-4-플루오로-페닐)-N2-(1-메틸-피페리딘-4-일)-피리미도[5,4-d]피리미딘-2,8-디아민, Boehringer Ingelheim); PKI-166 ((R)-4-[4-[(1-페닐에틸)아미노]-1H-피롤로[2,3-d]피리미딘-6-일]-페놀); (R)-6-(4-히드록시페닐)-4-[(1-페닐에틸)아미노]-7H-피롤로[2,3-d]피리미딘); CL-387785 (N-[4-[(3-브로모페닐)아미노]-6-퀴나졸리닐]-2-부티나미드); EKB-569 (N-[4-[(3-클로로-4-플루오로페닐)아미노]-3-시아노-7-에톡시-6-퀴놀리닐]-4-(디메틸아미노)-2-부텐아미드) (Wyeth); AG1478 (Pfizer); AG1571 (SU 5271; Pfizer); 이중 EGFR/HER2 티로신 키나아제 저해제 예컨대 라파티닙 (TYKERB®, GSK572016 또는 N-[3-클로로-4-[(3 플루오로페닐)메톡시]페닐]-6[5[[[2메틸술포닐)에틸]아미노]메틸]-2-푸라닐]-4-퀴나졸린아민)을 포함한다.
화학요법제는 또한, 선행하는 단락에서 언급된 EGFR-표적화된 약물; 소형 분자 HER2 티로신 키나아제 저해제 예컨대 Takeda로부터 가용한 TAK165; CP-724,714, ErbB2 수용체 티로신 키나아제의 경구 선택적 저해제 (Pfizer 및 OSI); EGFR에 우선적으로 결합하지만 HER2 및 EGFR-과다발현 세포 둘 모두를 저해하는 이중-HER 저해제 예컨대 EKB-569 (Wyeth로부터 가용); 라파티닙 (GSK572016; Glaxo-SmithKline으로부터 가용), 경구 HER2 및 EGFR 티로신 키나아제 저해제; PKI-166 (Novartis로부터 가용); 범-HER 저해제 예컨대 카넬티니브 (CI-1033; Pharmacia); Raf-1 신호전달을 저해하는 Raf-1 저해제 예컨대 ISIS Pharmaceuticals로부터 가용한 안티센스 작용제 ISIS-5132; 비-HER 표적화된 티로신 키나아제 저해제 예컨대 이마티닙 메실레이트 (GLEEVEC®, Glaxo SmithKline으로부터 가용); 다중표적화된 티로신 키나아제 저해제 예컨대 수니티닙 (SUTENT®, Pfizer로부터 가용); VEGF 수용체 티로신 키나아제 저해제 예컨대 바탈라닙 (PTK787/ZK222584, Novartis/Schering AG로부터 가용); MAPK 세포외 조절된 키나아제 I 저해제 CI-1040 (Pharmacia로부터 가용); 퀴나졸린, 예컨대 PD 153035,4-(3-클로로아닐리노) 퀴나졸린; 피리도피리미딘; 피리미도피리미딘; 피롤로피리미딘, 예컨대 CGP 59326, CGP 60261 및 CGP 62706; 피라졸로피리미딘, 4-(페닐아미노)-7H-피롤로[2,3-d] 피리미딘; 쿠르쿠민 (디페룰로일 메탄, 4,5-비스 (4-플루오로아닐리노)프탈리미드); 니트로티오펜 모이어티를 내포하는 티르포스틴; PD-0183805 (Warner-Lamber); 안티센스 분자 (예를 들면, HER-인코딩 핵산에 결합하는 것들); 퀴녹살린 (US 특허 번호 5,804,396); 트리포스틴 (US 특허 번호 5,804,396); ZD6474 (Astra Zeneca); PTK-787 (Novartis/Schering AG); 범-HER 저해제 예컨대 CI-1033 (Pfizer); 아피니탁 (ISIS 3521; Isis/Lilly); 이마티닙 메실레이트 (GLEEVEC®); PKI 166 (Novartis); GW2016 (Glaxo SmithKline); CI-1033 (Pfizer); EKB-569 (Wyeth); 세막시닙 (Pfizer); ZD6474 (AstraZeneca); PTK-787 (Novartis/Schering AG); INC-1C11 (Imclone), 라파마이신 (시로리무스, RAPAMUNE®); 또는 임의의 하기 특허 공보에서 설명된 바와 같은 것들: US 특허 번호 5,804,396; WO 1999/09016 (American Cyanamid); WO 1998/43960 (American Cyanamid); WO 1997/38983 (Warner Lambert); WO 1999/06378 (Warner Lambert); WO 1999/06396 (Warner Lambert); WO 1996/30347 (Pfizer, Inc); WO 1996/33978 (Zeneca); WO 1996/3397 (Zeneca) 및 WO 1996/33980 (Zeneca)을 비롯한 "티로신 키나아제 저해제"를 포함한다.
화학요법제는 또한, 덱사메타손, 인터페론, 콜히친, 메토프린, 시클로스포린, 암포테리신, 메트로니다졸, 알렘투주맙, 알리트레티노인, 알로푸리놀, 아미포스틴, 삼산화비소, 아스파라기나아제, BCG 라이브, 베바시주맙, 벡사로텐, 클라드리빈, 클로파라빈, 다베포에틴 알파, 데닐류킨, 덱스라족세인, 에포에틴 알파, 엘로티닙, 필그라스팀, 히스트렐린 아세트산염, 이브리투모맙, 인터페론 알파-2a, 인터페론 알파-2b, 레날리도미드, 레바미솔, 메스나, 메톡살렌, 난드롤론, 넬라라빈, 노페투모맙, 오프렐베킨, 팔리페르민, 파미드로네이트, 페가데마제, 페가스파르가제, 페그필그라스팀, 페메트렉시드 이나트륨, 플리카마이신, 포르피머 나트륨, 퀴나크린, 라스부리카제, 사르그라모스팀, 테모졸로미드, VM-26, 6-TG, 토레미펜, 트레티노인, ATRA, 발루비신, 졸레드로네이트 및 졸레드론산, 그리고 이들의 약학적으로 허용되는 염을 포함한다.
화학요법제는 또한, 히드로코르티손, 히드로코르티손 아세트산염, 코르티손 아세트산염, 틱소코르톨 피발레이트, 트리암시놀론 아세토니드, 트리암시놀론 알코올, 모메타손, 암시노니드, 부데소니드, 데소니드, 플루오시노니드, 플루오시놀론 아세토니드, 베타메타손, 베타메타손 인산나트륨, 덱사메타손, 덱사메타손 인산나트륨, 플루오코르톨론, 히드로코르티손-17-부티르산염, 히드로코르티손-17-발레르산염, 아클로메타손 디프로피오네이트, 베타메타손 발레르산염, 베타메타손 디프로피오네이트, 프레드니카르베이트, 클로베타손-17-부티르산염, 클로베타솔-17-프로피온산염, 플루오코르톨론 카프론산염, 플루오코르톨론 피발레이트 및 플루프레드니덴 아세트산염; 면역 선택적 항염증성 펩티드 (ImSAIDs) 예컨대 페닐알라닌-글루타민-글리신 (FEG) 및 이의 D-이성질체 형태 (feG) (IMULAN BioTherapeutics, LLC); 항류마티스 약물 예컨대 아자티오프린, 시클로스포린 (시클로스포린 A), D-페니실라민, 금염, 히드록시클로로퀸, 레플루노미드미노사이클린, 술파살라진, 종양 괴사 인자 알파 (TNFα) 차단제 예컨대 예컨대 에타네르셉트 (ENBREL®), 인플릭시맙 (REMICADE®), 아달리무맙 (HUMIRA®), 세르톨리주맙 페골 (CIMZIA®), 골리무맙 (SIMPONI®), 인터류킨 1 (IL-1) 차단제 예컨대 아나킨라 (KINERET®), T 세포 동시자극 차단제 예컨대 아바타셉트 (ORENCIA®), 인터류킨 6 (IL-6) 차단제 예컨대 토실리주맙 (ACTEMERA®); 인터류킨 13 (IL-13) 차단제 예컨대 레브리키주맙; 인터페론 알파 (IFN) 차단제 예컨대 론탈리주맙; 베타 7 인테그린 차단제 예컨대 rhuMAb Beta7; IgE 경로 차단제 예컨대 항-M1 프라임; 분비된 동종삼합체성 LTa3 및 막 결합된 이종삼합체 LTa1/β2 차단제 예컨대 항-림프독소 알파 (LTa); 방사성동위원소 (예를 들면, At211, I131, I125, Y90, Re186, Re188, Sm153, Bi212, P32, Pb212 및 Lu의 방사성동위원소); 기타 치료 시험약 예컨대 티오플라틴, PS-341, 페닐부티레이트, ET-18- OCH3, 또는 파르네실 전달효소 저해제 (L-739749, L-744832); 폴리페놀 예컨대 퀘르세틴, 레스베라트롤, 피세아타놀, 에피갈로카테킨 갈산염, 테아플라빈, 플라바놀, 프로시아니딘, 베툴린산 및 이의 유도체; 자가포식 저해제 예컨대 클로로퀸; 델타-9-테트라히드로칸나비놀 (드로나비놀, MARINOL®); 베타-라파촌; 라파콜; 콜키시네스; 베툴린산; 아세틸캄포테신, 스코폴렉틴 및 9-아미노캄포테신); 포도필로톡신; 테가푸르 (UFTORAL®); 벡사로텐 (TARGRETIN®); 비스포스포네이트 예컨대 클로드로네이트 (예를 들면, BONEFOS® 또는 OSTAC®), 에티드로네이트 (DIDROCAL®), NE-58095, 졸레드론산/졸레드로네이트 (ZOMETA®), 알렌드로네이트 (FOSAMAX®), 파미드로네이트 (AREDIA®), 틸루드로네이트 (SKELID®), 또는 리세드로네이트 (ACTONEL®); 및 표피 성장 인자 수용체 (EGF-R); 백신 예컨대 THERATOPE® 백신; 페리포신, COX-2 저해제 (예를 들면. 셀레콕시브 또는 에토리콕시브), 프로테오솜 저해제 (예를 들면. PS341); CCI-779; 티피파르닙 (R11577); 오라페닙, ABT510; Bcl-2 저해제 예컨대 오블리메르센 나트륨 (GENASENSE®); 픽산트론; 파르네실전달효소 저해제 예컨대 로나파르닙 (SCH 6636, SARASARTM); 그리고 전술한 것들 중 어느 것의 약학적으로 허용되는 염, 산 또는 유도체; 뿐만 아니라 상기 중에서 두 가지 이상의 조합 예컨대 시클로포스파미드, 독소루비신, 빈크리스틴 및 프레드니솔론의 병용 요법에 대한 약어인 CHOP; 및 5-FU와 류코보린과 조합된 옥살리플라틴 (ELOXATINTM)을 이용한 치료 섭생에 대한 약어인 FOLFOX를 포함한다.
화학요법제는 또한, 진통, 해열 및 항염증 효과를 갖는 비스테로이드성 항염증성 약물을 포함한다. NSAIDs는 효소 시클로옥시게나아제의 비선택적 저해제를 포함한다. NSAIDs의 특정한 실례는 아스피린, 프로피온산 유도체 예컨대 이부프로펜, 페노프로펜, 케토프로펜, 플루르비프로펜, 옥사프로진 및 나프록센, 아세트산 유도체 예컨대 인도메타신, 술린닥, 에토돌락, 디클로페낙, 에놀산 유도체 예컨대 피록시캄, 멜록시캄, 테녹시캄, 드록시캄, 로르녹시캄 및 이속시캄, 페남산 유도체 예컨대 메페남산, 메클로페남산, 플루페나믹산, 톨페나믹산, 그리고 COX-2 저해제 예컨대 셀레콕시브, 에토리콕시브, 루미라콕시브, 파레콕시브, 로페콕시브, 로페콕시브 및 발데콕시브를 포함한다. NSAIDs는 질환 예컨대 류마티스성 관절염, 골관절염, 염증성 관절병증, 강직성 척추염, 건선성 관절염, 라이터 증후군, 급성 통풍, 월경곤란증, 전이성 뼈 통증, 두통 및 편두통, 수술후 통증, 염증 및 조직 손상에 기인한 경등도 내지 중등도 통증, 열병, 일레우스, 그리고 신장 산통의 증후 경감을 위해 처방될 수 있다.
본원에서 이용된 바와 같이, 용어 "세포독성 작용제"는 세포에게 유해한 (예를 들면, 세포 사멸을 유발하거나, 증식을 저해하거나, 또는 만약 그렇지 않으면 세포 기능을 방해하는) 임의의 작용제를 지칭한다. 세포독성 작용제는 방사성동위원소 (예를 들면, At211, I131, I125, Y90, Re186, Re188, Sm153, Bi212, P32, Pb212 및 Lu의 방사성동위원소); 화학요법제; 성장 저해제; 효소 및 이들의 단편, 예컨대 핵산분해 효소; 그리고 독소, 예컨대 소형 분자 독소, 또는 세균, 진균, 식물 또는 동물 기원의 효소적으로 활성 독소뿐만 아니라 이들의 단편 및/또는 변이체를 포함하지만 이들에 한정되지 않는다. 예시적인 세포독성 작용제는 항미소관 작용제, 백금 배위 복합체, 알킬화제, 항생제, 국소이성화효소 II 저해제, 대사길항물질, 국소이성화효소 I 저해제, 호르몬 및 호르몬 유사체, 신호 전달 경로 저해제, 비-수용체 티로신 키나아제 혈관형성 저해제, 면역치료제, 친아폽토시스성 작용제, LDH-A의 저해제, 지방산 생합성의 저해제, 세포 주기 신호전달 저해제, HDAC 저해제, 프로테아좀 저해제, 그리고 암 물질대사의 저해제에서 선택될 수 있다. 한 구체예에서 세포독성 작용제는 백금 기반 화학요법제이다. 한 구체예에서 세포독성 작용제는 EGFR의 길항제이다. 한 구체예에서 세포독성 작용제는 N-(3-에티닐페닐)-6,7-비스(2-메톡시에톡시)퀴나졸린-4-아민 (예를 들면, 에를로티닙, TARCEVA™)이다. 한 구체예에서 세포독성 작용제는 RAF 저해제이다. 한 구체예에서, RAF 저해제는 BRAF 및/또는 CRAF 저해제이다. 한 구체예에서 RAF 저해제는 베무라페닙이다. 한 구체예에서 세포독성 작용제는 PI3K 저해제이다.
본원에서 이용될 때 "성장 저해제"는 시험관내에서 또는 생체내에서 세포의 성장을 저해하는 화합물 또는 조성물을 지칭한다. 한 구체예에서, 성장 저해제는 항체가 결합하는 항원을 발현하는 세포의 증식을 예방하거나 또는 감소시키는 성장 저해 항체이다. 다른 구체예에서, 성장 저해제는 S 기에서 세포의 백분율을 유의미하게 감소시키는 것일 수 있다. 성장 저해제의 실례는 세포 주기 진행을 차단하는 작용제 (S 기 이외의 위치에서), 예컨대 G1 정지 및 M-기 정지를 유도하는 작용제를 포함한다. 고전적인 M-기 차단제는 빈카 (빈크리스틴 및 빈블라스틴), 탁산, 그리고 국소이성화효소 II 저해제 예컨대 독소루비신, 에피루비신, 다우노루비신, 에토포시드 및 블레오마이신을 포함한다. G1을 정지시키는 작용제, 예를 들면, DNA 알킬화제 예컨대 타목시펜, 프레드니손, 다카르바진, 메클로르에타민, 시스플라틴, 메토트렉사트, 5-플루오로우라실 및 ara-C는 또한 S-기 정지로 월경한다. 추가 정보는 Murakami et al. (W.B. Saunders, Philadelphia, 1995)에 의한 "Cell cycle regulation, oncogenes, and antineoplastic drugs"라는 제목으로 Mendelsohn and Israel, eds., The Molecular Basis of Cancer, Chapter 1, 특히 p. 13에서 발견될 수 있다.
본원에서 이용된 바와 같이, 용어 "전구약물"은 부모 약물과 비교하여 종양 세포에 대한 세포독성이 덜하고, 그리고 더 높은 활성의 부모 형태로 효소적으로 활성화되거나 또는 전환될 수 있는, 약학적으로 활성 물질의 전구체 또는 유도체 형태를 지칭한다. 참조: 예를 들면, Wilman, "Prodrugs in Cancer Chemotherapy" Biochemical Society Transactions, 14, pp. 375-382, 615th Meeting Belfast (1986) 및 Stella et al., "Prodrugs: A Chemical Approach to Targeted Drug Delivery," Directed Drug Delivery, Borchardt et al., (ed.), pp. 247-267, Humana Press (1985). 본원 발명의 전구약물은 더 높은 활성의 세포독성 자유 약물로 전환될 수 있는 인산염-내포 전구약물, 티오포스페이트-내포 전구약물, 황산염-내포 전구약물, 펩티드-내포 전구약물, D-아미노산-변형된 전구약물, 글리코실화된 전구약물, β-락탐-내포 전구약물, 임의적으로 치환된 페녹시아세트아미드-내포 전구약물 또는 임의적으로 치환된 페닐아세트아미드-내포 전구약물, 5-플루오로시토신 및 다른 5-플루오로우리딘 전구약물을 포함하지만 이들에 한정되지 않는다. 본원 발명에서 이용을 위한 전구약물 형태로 유도체화될 수 있는 세포독성 약물의 실례는 전술된 화학요법제를 포함하지만 이들에 한정되지 않는다.
"방사선요법"은 정상적으로 기능하는 능력을 제한할 만큼 충분한 손상을 세포에 유도하거나 또는 세포를 완전히 파괴하기 위한 지향된 감마선 또는 베타선의 이용인 것으로 의미된다. 치료의 선량 및 지속 기간을 결정하기 위한 많은 방식이 당해 분야에서 알려져 있는 것으로 인지될 것이다. 전형적인 치료는 1회 투여 및 하루에 10 내지 200 단위 (Grays)의 전형적인 선량 범위로서 제공된다.
"항혈관형성 작용제" 또는 "혈관형성 저해제"는 혈관형성, 혈관신생, 또는 바람직하지 않은 혈관 투과성을 직접적으로 또는 간접적으로 저해하는 작은 분자량 물질, 폴리뉴클레오티드, 폴리펩티드, 단리된 단백질, 재조합 단백질, 항체, 또는 이들의 접합체 또는 융합 단백질을 지칭한다. 항혈관형성 작용제는 혈관형성 인자 또는 이의 수용체에 결합하고 이의 혈관형성 활성을 차단하는 작용제를 포함하는 것으로 이해되어야 한다. 예를 들면, 항혈관형성 작용제는 앞서 규정된 바와 같은 혈관형성 작용제에 대한 항체 또는 다른 길항제, 예를 들면, VEGF-A에 대한 항체 (예를 들면, 베바시주맙) 또는 VEGF-A 수용체 (예를 들면, KDR 수용체 또는 Flt-1 수용체)에 대한 항체, 항-PDGFR 저해제 예컨대 GLEEVEC™ (이마티닙 메실레이트)이다. 항혈관형성 작용제는 또한, 선천적 혈관형성 저해제, 예를 들면, 앤지오스타틴, 엔도스타틴 등을 포함한다. 참조: 예를 들면, Klagsbrun and D'Amore, Annu. Rev. Physiol., 53:217-39 (1991); Streit and Detmar, Oncogene, 22:3172-3179 (2003) (예를 들면, 악성 흑색종에서 항혈관형성 요법을 열거하는 표 3 목록); Ferrara & Alitalo, Nature Medicine 5(12):1359-1364 (1999); Tonini et al., Oncogene, 22:6549-6556 (2003), 그리고 Sato Int. J. Clin. Oncol., 8:200-206 (2003).
치료의 목적으로 본원에서 교체가능하게 이용된 바와 같이, 용어 "개체," "피험자," 또는 "환자"는 인간, 사육용 및 경작용 동물, 그리고 동물원용, 스포츠용, 또는 애완 동물, 예컨대 고양이, 개, 말, 소 등을 비롯한, 포유동물로서 분류된 임의의 동물을 지칭한다. 바람직하게는, 포유동물은 인간이다.
용어 "항체"는 본원에서 가장 넓은 의미에서 이용되고, 그리고 단일클론 항체 (전장 단일클론 항체 포함), 다중클론 항체, 다중특이적 항체 (예를 들면, 이중특이적 항체), 그리고 항체 단편 (이들이 원하는 생물학적 활성을 나타내기만 하면)을 특정적으로 커버한다.
"단리된" 항체는 자연 환경의 성분으로부터 확인되고, 분리되고 및/또는 회수된 것이다. 자연 환경의 오염체 성분은 상기 항체에 대한 연구적, 진단적 또는 치료적 이용을 간섭하는 물질이고, 그리고 효소, 호르몬, 그리고 다른 단백질성 또는 비단백질성 용질을 포함할 수 있다. 일부 구체예에서, 항체는 (1) 예를 들면, 로리법에 의해 결정될 때 항체의 중량으로 95%보다 크게, 그리고 일부 구체예에서, 중량으로 99%보다 크게; (2) 예를 들면, 스피닝 컵 서열분석기의 이용에 의해 N 말단 또는 내부 아미노산 서열의 적어도 15개 잔기를 획득하는 데 충분한 정도까지, 또는 (3) 예를 들면, 쿠마시 블루 또는 은 염색을 이용하여 환원 또는 비환원 조건하에 SDS-PAGE에 의해 균질성까지 정제된다. 단리된 항체는 재조합 세포 내에서 원지에서 항체를 포함하는데, 그 이유는 항체의 자연 환경의 적어도 한 가지 성분이 존재하지 않을 것이기 때문이다. 하지만, 통상적으로, 단리된 항체는 적어도 하나의 정제 단계에 의해 제조될 것이다.
"선천적 항체"는 통상적으로, 2개의 동일한 경쇄 (L) 및 2개의 동일한 중쇄 (H)로 구성되는 약 150,000 달톤의 이종사합체성 당단백질이다. 각 경쇄는 하나의 공유 이황화 결합에 의해 중쇄에 연결되고, 반면 이황화 연쇄의 숫자는 상이한 면역글로불린 아이소타입의 중쇄 사이에서 서로 다르다. 각 중쇄와 경쇄는 또한, 규칙적으로 이격된 사슬내 이황화 다리를 갖는다. 각 중쇄는 한쪽 단부에서 가변 도메인 (VH), 그 이후에 다수의 불변 도메인을 갖는다. 각 경쇄는 한쪽 단부에서 가변 도메인 (VL) 및 다른 단부에서 불변 도메인을 갖는다; 경쇄의 불변 도메인은 중쇄의 첫 번째 불변 도메인과 함께 정렬되고, 그리고 경쇄 가변 도메인은 중쇄의 가변 도메인과 함께 정렬된다. 특정 아미노산 잔기는 경쇄와 중쇄 가변 도메인 사이에 인터페이스를 형성하는 것으로 생각된다.
용어 "불변 도메인"은 항원 결합 부위를 내포하는 면역글로불린의 다른 부분인 가변 도메인에 비하여 더욱 보존된 아미노산 서열을 갖는 면역글로불린 분자의 부분을 지칭한다. 불변 도메인은 중쇄의 CH1, CH2 및 CH3 도메인 (집합적으로, CH) 및 경쇄의 CHL (또는 CL) 도메인을 내포한다.
항체의 "가변 영역" 또는 "가변 도메인"은 항체의 중쇄 또는 경쇄의 아미노 말단 도메인을 지칭한다. 중쇄의 가변 도메인은 "VH"로서 지칭될 수 있다. 경쇄의 가변 도메인은 "VL"로서 지칭될 수 있다. 이들 도메인은 일반적으로, 항체의 최대 가변 부분이고 항원 결합 부위를 내포한다.
용어 "가변"은 가변 도메인의 일정한 부분이 항체 사이에서 서열에서 광범위하게 상이하고, 그리고 특정 항원에 대한 각 특정 항체의 결합과 특이성에 이용된다는 사실을 지칭한다. 하지만, 가변성은 항체의 가변 도메인의 전역에서 균등하게 분포되지 않는다. 이것은 경쇄와 중쇄 가변 도메인 둘 모두에서 초가변 영역 (HVR)으로 불리는 3개의 분절에서 농축된다. 가변 도메인의 더 고도로 보존된 부분은 프레임워크 영역 (FR)으로 불린다. 선천적 중쇄와 경쇄의 가변 도메인은 각각, 3개의 HVR에 의해 연결된, 베타-시트 입체형상을 주로 채택하는 4개의 FR 영역을 포함하고, 이들은 루프 연결을 형성하고, 그리고 일부 경우에, 베타-시트 구조의 일부를 형성한다. 각 사슬에서 HVR은 FR 영역에 의해 매우 근접하여 묶여지고, 그리고 다른 사슬로부터 HVR과 함께, 항체의 항원 결합 부위의 형성에 기여한다 (Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, Fifth Edition, National Institute of Health, Bethesda, Md. (1991)을 참조한다). 불변 도메인은 항체를 항원에 결합시키는 데 직접적으로 관련되지 않지만, 다양한 효과기 기능, 예컨대 항체 의존성 세포 독성에서 항체의 참여를 나타낸다.
임의의 포유류 종으로부터 항체 (면역글로불린)의 "경쇄"는 그들의 불변 도메인의 아미노산 서열에 근거하여, 카파("κ")와 람다("λ")로 불리는 2가지 명확하게 상이한 유형 중에서 한 가지에 배정될 수 있다.
본원에서 이용된 바와 같이, 용어 IgG "아이소타입" 또는 "하위부류"는 그들의 불변 영역의 화학적 및 항원성 특징에 의해 규정되는 면역글로불린의 임의의 하위부류인 것으로 의미된다.
중쇄의 불변 도메인의 아미노산 서열에 따라서, 항체 (면역글로불린)는 상이한 부류에 배정될 수 있다. 면역글로불린의 5가지 주요 부류: IgA, IgD, IgE, IgG 및 IgM이 있고, 그리고 이들 중에서 몇몇은 하위부류 (아이소타입), 예를 들면, IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1 및 IgA2로 더욱 세분될 수 있다. 면역글로불린의 상이한 부류에 상응하는 중쇄 불변 도메인은 각각, α, γ, ε, γ 및 μ로 불린다. 면역글로불린의 상이한 부류의 이들 아단위 구조 및 3차원 입체형상은 널리 알려져 있고, 그리고 예를 들면, Abbas et al. Cellular and Mol. Immunology, 4th ed. (W.B. Saunders, Co., 2000)에서 전반적으로 설명된다. 항체는 항체 및 하나 이상의 다른 단백질 또는 펩티드의 공유 또는 비공유 연관에 의해 형성되는, 더 큰 융합 분자의 부분일 수 있다.
용어 "전장 항체", "무손상 항체" 및 "전체 항체"는 아래에 규정된 바와 같은 항체 단편이 아닌, 실제적으로 무손상 형태에서 항체를 지칭하기 위해 본원에서 교체가능하게 이용된다. 이들 용어는 특히, Fc 영역을 내포하는 중쇄를 갖는 항체를 지칭한다.
본원에서 목적을 위해 "나신 항체"는 세포독성 모이어티 또는 방사성 표지에 접합되지 않는 항체이다.
"항체 단편"은 무손상 항체의 부분을 포함하고, 바람직하게는 이의 항원 결합 영역을 포함한다. 일부 구체예에서, 본원에서 설명된 항체 단편은 항원 결합 단편이다. 항체 단편의 실례는 Fab, Fab', F(ab')2 및 Fv 단편; 디아바디; 선형 항체; 단일 사슬 항체 분자; 그리고 항체 단편으로부터 형성된 다중특이적 항체를 포함한다.
항체의 파파인 소화는 "Fab" 단편으로 불리는 2개의 동일한 항원 결합 단편을 생산하고, 이들은 각각 단일 항원 결합 부위를 갖고, 그리고 쉽게 결정화하는 능력을 반영하는 명칭인 잔여 "Fc" 단편을 생산한다. 펩신 처리는 F(ab')2 단편을 생성하는데, 이것은 2개의 항원 결합 부위를 갖고 항원을 여전히 교차연결할 수 있다.
"Fv"는 완전 항원 결합 부위를 내포하는 최소 항체 단편이다. 한 구체예에서, 2-사슬 Fv 종류는 단단한, 비공유 연관에서 하나의 중쇄와 하나의 경쇄 가변 도메인의 이합체로 구성된다. 단일 사슬 Fv (scFv) 종류에서, 하나의 중쇄와 하나의 경쇄 가변 도메인은 이러한 경쇄와 중쇄가 2-사슬 Fv 종류에서와 유사한 "이합체성" 구조로 연관할 수 있도록 유연한 펩티드 링커에 의해 공유 연결될 수 있다. 이러한 입체형상에서 각 가변 도메인의 3개의 HVR은 상호작용하여 VH-VL 이합체의 표면상에서 항원 결합 부위를 규정한다. 집합적으로, 6개 HVR은 항체에 항원 결합 특이성을 부여한다. 하지만, 심지어 단일 가변 도메인 (또는 항원에 특이적인 단지 3개의 HVR만을 포함하는 Fv의 절반)도 비록 전체 결합 부위보다 친화성이 낮긴 하지만, 항원을 인식하고 이에 결합하는 능력을 갖는다.
Fab 단편은 중쇄와 경쇄 가변 도메인을 내포하고, 그리고 또한, 경쇄의 불변 도메인 및 중쇄의 첫 번째 불변 도메인 (CH1)을 내포한다. Fab' 단편은 항체 힌지 영역으로부터 하나 이상의 시스테인을 포함하는 중쇄 CH1 도메인의 카르복시 말단에서 소수 잔기의 부가에 의해 Fab 단편과 상이하다. Fab'-SH는 본원에서, 불변 도메인의 시스테인 잔기(들)가 자유 티올 기를 보유하는 Fab'에 대한 명칭이다. F(ab')2 항체 단편은 Fab' 단편의 쌍으로서 최초 생산되었는데, 이들은 그들 사이에 힌지 시스테인을 갖는다. 항체 단편의 다른 화학적 연계 역시 알려져 있다.
"단일 사슬 Fv" 또는 "scFv" 항체 단편은 항체의 VH와 VL 도메인을 포함하는데, 여기서 이들 도메인은 단일 폴리펩티드 사슬에서 존재한다. 일반적으로, scFv 폴리펩티드는 VH와 VL 도메인 사이에 폴리펩티드 링커를 더욱 포함하는데, 이것은 scFv가 항원 결합을 위한 원하는 구조를 형성할 수 있게 한다. scFv에 관한 검토를 위해, 예를 들면, Pluckth
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n, in The Pharmacology of Monoclonal Antibodies, vol. 113, Rosenburg and Moore eds., (Springer-Verlag, New York, 1994), pp. 269-315를 참조한다.
용어 "디아바디"는 2개의 항원 결합 부위를 갖는 항체 단편을 지칭하는데, 이들 단편은 동일한 폴리펩티드 사슬 (VH-VL) 내에서 경쇄 가변 도메인 (VL)에 연결된 중쇄 가변 도메인 (VH)을 포함한다. 너무 짧아 동일한 사슬 상에서 두 도메인 사이에 대합을 허용하지 않는 링커를 이용함으로써, 이들 도메인은 다른 사슬의 상보성 도메인과 대합을 이루고 2개의 항원 결합 부위를 창출하도록 강제된다. 디아바디는 이가 또는 이중특이적일 수 있다. 디아바디는 예를 들면, EP 404,097; WO 1993/01161; Hudson et al., Nat. Med. 9:129-134 (2003); 그리고 Hollinger et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90: 6444-6448 (1993)에서 더 충분히 설명된다. 트리아바디 및 테트라바디 역시 Hudson et al., Nat. Med. 9:129-134 (2003)에서 설명된다.
본원에서 이용된 바와 같이, 용어 "단일클론 항체"는 실제적으로 동질성 항체의 모집단으로부터 획득된 항체를 지칭한다, 예를 들면, 상기 모집단을 구성하는 개별 항체는 소량으로 존재할 수 있는 가능한 돌연변이, 예를 들면, 자연 발생 돌연변이를 제외하고 동일하다. 따라서, 수식어 "단일클론"은 구별된 항체의 혼합물이 아니라는, 항체의 특징을 표시한다. 일정한 구체예에서, 이런 단일클론 항체는 전형적으로, 표적에 결합하는 폴리펩티드 서열을 포함하는 항체를 포함하는데, 여기서 표적-결합 폴리펩티드 서열은 복수의 폴리펩티드 서열로부터 단일 표적 결합 폴리펩티드 서열의 선택을 포함하는 과정에 의해 획득되었다. 예를 들면, 선택 과정은 복수의 클론, 예컨대 하이브리도마 클론, 파지 클론, 또는 재조합 DNA 클론의 풀로부터 고유한 클론의 선별일 수 있다. 선택된 표적 결합 서열은 예를 들면, 표적에 대한 친화성을 향상시키고, 표적 결합 서열을 인간화하고, 세포 배양 동안 이의 생산을 향상시키고, 생체내에서 이의 면역원을 감소시키고, 다중특이적 항체를 창출하고, 기타 등등을 위해 더욱 변경될 수 있고, 그리고 변경된 표적 결합 서열을 포함하는 항체 역시 본원 발명의 단일클론 항체인 것으로 이해되어야 한다. 상이한 결정인자 (에피토프)에 대해 지향된 상이한 항체를 전형적으로 포함하는 다중클론 항체 제조물과 대조적으로, 단일클론 항체 제조물의 각 단일클론 항체는 항원 상에서 단일 결정인자에 대해 지향된다. 단일클론 항체 제조물은 그들의 특이성에 더하여, 전형적으로 다른 면역글로불린에 의해 오염되지 않는다는 점에서 유리하다.
수식어 "단일클론"은 항체의 실제적으로 동질성 모집단으로부터 획득되는 것으로서 항체의 특징을 표시하고, 그리고 임의의 특정 방법에 의한 항체의 생산을 필요로 하는 것으로 해석되지 않는다. 예를 들면, 본원 발명에 따라서 이용되는 단일클론 항체는 예를 들면, 하이브리도마 방법 (예를 들면, Kohler and Milstein., Nature, 256:495-97 (1975); Hongo et al., Hybridoma, 14 (3): 253-260 (1995), Harlow et al., Antibodies: A Laboratory Manual, (Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2nd ed. 1988); Hammerling et al., in: Monoclonal Antibodies and T-Cell Hybridomas 563-681 (Elsevier, N.Y., 1981)), 재조합 DNA 방법 (예를 들면, U.S. 특허 번호 4,816,567을 참조한다), 파지 전시 기술 (예를 들면, Clackson et al., Nature, 352: 624-628 (1991); Marks et al., J. Mol. Biol. 222: 581-597 (1992); Sidhu et al., J. Mol. Biol. 338(2): 299-310 (2004); Lee et al., J. Mol. Biol. 340(5): 1073-1093 (2004); Fellouse, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 101(34): 12467-12472 (2004); 및 Lee et al., J. Immunol. Methods 284(1-2): 119-132 (2004)를 참조한다), 그리고 인간 면역글로불린 서열을 인코딩하는 인간 면역글로불린 좌위 또는 유전자 중에서 일부 또는 전부를 갖는 동물에서 인간 또는 인간-유사 항체를 생산하기 위한 기술 (예를 들면, WO 1998/24893; WO 1996/34096; WO 1996/33735; WO 1991/10741; Jakobovits et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90: 2551 (1993); Jakobovits et al., Nature 362: 255-258 (1993); Bruggemann et al., Year in Immunol. 7:33 (1993); U.S. 특허 번호 5,545,807; 5,545,806; 5,569,825; 5,625,126; 5,633,425; 및 5,661,016; Marks et al., Bio/Technology 10: 779-783 (1992); Lonberg et al., Nature 368: 856-859 (1994); Morrison, Nature 368: 812-813 (1994); Fishwild et al., Nature Biotechnol. 14: 845-851 (1996); Neuberger, Nature Biotechnol. 14: 826 (1996); 그리고 Lonberg et al., Intern. Rev. Immunol. 13: 65-93 (1995)를 참조한다)를 비롯한 다양한 기술에 의해 만들어질 수 있다.
본원에서 단일클론 항체는 중쇄 및/또는 경쇄의 일부가 특정 종으로부터 유래되거나 또는 특정 항체 부류 또는 하위부류에 속하는 항체에서 상응하는 서열과 동일하거나 또는 이들 서열에 상동하고, 반면 사슬(들)의 나머지 부분이 다른 종으로부터 유래되거나 또는 다른 항체 부류 또는 하위부류에 속하는 항체에서 상응하는 서열과 동일하거나 또는 이들 서열에 상동한 "키메라" 항체뿐만 아니라 원하는 생물학적 활성을 나타내기만 하면, 이런 항체의 단편을 특정적으로 포함한다 (예를 들면, U.S. 특허 번호 4,816,567; 및 Morrison et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81:6851-6855 (1984)를 참조한다). 키메라 항체는 PRIMATIZED® 항체를 포함하는데, 여기서 상기 항체의 항원 결합 영역은 예를 들면, 마카크 원숭이를 관심되는 항원으로 면역화함으로써 생산된 항체로부터 유래된다.
비인간 (예를 들면, 뮤린) 항체의 "인간화" 형태는 비인간 면역글로불린으로부터 유래된 최소 서열을 내포하는 키메라 항체이다. 한 구체예에서, 인간화 항체는 수용자의 HVR로부터 잔기가 원하는 특이성, 친화성 및/또는 수용력을 갖는, 비인간 종 (공여자 항체), 예컨대 생쥐, 쥐, 토끼 또는 비인간 영장류의 HVR로부터 잔기에 의해 대체되는 인간 면역글로불린 (수용자 항체)이다. 일부 구체예에서, 인간 면역글로불린의 FR 잔기가 상응하는 비인간 잔기에 의해 대체된다. 게다가, 인간화 항체는 수용자 항체에서 또는 공여자 항체에서 발견되지 않는 잔기를 포함할 수 있다. 이들 변형은 항체 성능을 더욱 정밀화하기 위해 만들어질 수 있다. 일반적으로, 인간화 항체는 적어도 1개, 그리고 전형적으로 2개의 가변 도메인을 실제적으로 모두 포함할 것인데, 여기서 초가변 루프의 전부 또는 실제적으로 전부가 비인간 면역글로불린의 것들에 상응하고, 그리고 FR의 전부 또는 실제적으로 전부가 인간 면역글로불린 서열의 것들이다. 인간화 항체는 임의적으로 또한, 전형적으로 인간 면역글로불린의 면역글로불린 불변 영역 (Fc)의 적어도 일부를 포함할 것이다. 추가 상세를 위해, 예를 들면, Jones et al., Nature 321:522-525 (1986); Riechmann et al., Nature 332:323-329 (1988); 및 Presta, Curr. Op. Struct. Biol. 2:593-596 (1992)을 참조한다. 또한 예를 들면, Vaswani and Hamilton, Ann. Allergy, Asthma & Immunol. 1:105-115 (1998); Harris, Biochem. Soc. Transactions 23:1035-1038 (1995); Hurle and Gross, Curr. Op. Biotech. 5:428-433 (1994); 그리고 U.S. 특허 번호 6,982,321 및 7,087,409를 참조한다.
"인간 항체"는 인간에 의해 생산된 항체의 아미노산 서열에 상응하는 아미노산 서열을 소유하고 및/또는 본원에서 개시된 바와 같은 인간 항체를 만들기 위한 임의의 기술을 이용하여 만들어진 항체이다. 인간 항체의 이러한 정의는 비인간 항원 결합 잔기를 포함하는 인간화 항체를 특정적으로 배제한다. 인간 항체는 파지 전시 라이브러리를 비롯한, 당해 분야에서 공지된 다양한 기술을 이용하여 생산될 수 있다. Hoogenboom and Winter, J. Mol. Biol., 227:381 (1991); Marks et al., J. Mol. Biol., 222:581 (1991). 인간 단일클론 항체의 제조를 위해 Cole et al., Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy, Alan R. Liss, p. 77 (1985); Boerner et al., J. Immunol., 147(1):86-95 (1991)에서 설명된 방법이 또한 가용하다. 또한, van Dijk and van de Winkel, Curr. Opin. Pharmacol., 5: 368-74 (2001)를 참조한다. 인간 항체는 항원 공격에 대한 응답으로 이런 항체를 생산하도록 변형되지만, 내인성 좌위에 장애가 있는 유전자도입 동물, 예컨대 면역화된 제노마우스에 항원을 투여함으로써 제조될 수 있다 (예를 들면, XENOMOUSETM 기술에 관하여 U.S. 특허 번호 6,075,181 및 6,150,584를 참조한다). 또한, 인간 B 세포 하이브리도마 기법을 통해 생성된 인간 항체에 관하여, 예를 들면, Li et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 103:3557-3562 (2006)를 참조한다.
"종 의존성 항체"는 이것이 두 번째 포유류 종으로부터 유래된 항원의 동족체에 대해 갖는 것보다, 첫 번째 포유류 종으로부터 항원에 대해 더 강한 결합 친화성을 갖는 것이다. 통상적으로, 종 의존성 항체는 인간 항원에 "특이적으로 결합하지만" (예를 들면, 약 1x10-7 M 이내, 바람직하게는 약 1x10-8 M 이내, 그리고 바람직하게는 약 1x10-9 M 이내의 결합 친화성 (Kd) 값을 갖지만), 두 번째 비인간 포유류 종으로부터 유래된 항원의 동족체에 대해, 인간 항원에 대한 이의 결합 친화성보다 적어도 약 50배, 또는 적어도 약 500배, 또는 적어도 약 1000배 약한 결합 친화성을 갖는다. 종 의존성 항체는 앞서 규정된 바와 같은 다양한 유형의 항체 중 어느 것일 수 있지만, 바람직하게는 인간화 또는 인간 항체이다.
본원에서 이용될 때, 용어 "초가변 영역", "HVR" 또는 "HV"는 서열에서 초가변성이고 및/또는 구조적으로 규정된 루프를 형성하는 항체 가변 도메인의 영역을 지칭한다. 일반적으로, 항체는 6개의 HVR; VH에서 3개 (H1, H2, H3), 그리고 VL에서 3개 (L1, L2, L3)를 포함한다. 선천적 항체에서, H3 및 L3은 6개 HVR 중에서 최대 다양성을 나타내고, 그리고 H3은 특히, 항체에 뛰어난 특이성을 부여하는 데 고유한 역할을 수행하는 것으로 생각된다. 참조: 예를 들면, Xu et al., Immunity 13:37-45 (2000); Johnson 및 Wu, in Methods in Molecular Biology 248:1-25 (Lo, ed., Human Press, Totowa, N.J., 2003). 실제로, 중쇄 단독으로 구성되는 자연 발생 낙타과 항체는 경쇄의 부재에서도 기능적이고 안정적이다. 참조: 예를 들면, Hamers-Casterman et al., Nature 363:446-448 (1993); Sheriff et al., Nature Struct. Biol. 3:733-736 (1996).
다수의 HVR 묘사가 본원에서 이용되고 포괄된다. Kabat 상보성 결정 영역 (CDR)은 서열 가변성에 근거되고, 그리고 가장 흔히 이용되는 것이다 (Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, Md. (1991)). Chothia는 그 대신에, 구조적 루프의 위치를 지칭한다 (Chothia and Lesk J. Mol. Biol. 196:901-917 (1987)). AbM HVR은 Kabat HVR 및 Chothia 구조적 루프 사이에 타협을 나타내고, 그리고 Oxford Molecular의 AbM 항체 모형화 소프트웨어에 의해 이용된다. "접촉" HVR은 가용한 복합 결정 구조의 분석에 근거된다. 이들 HVR 각각으로부터 잔기는 아래에서 제시된다.
루프 Kabat AbM Chothia 접촉
L1 L24-L34 L24-L34 L26-L32 L30-L36
L2 L50-L56 L50-L56 L50-L52 L46-L55
L3 L89-L97 L89-L97 L91-L96 L89-L96
H1 H31-H35B H26-H35B H26-H32 H30-H35B (Kabat 넘버링)
H1 H31-H35 H26-H35 H26-H32 H30-H35 (Chothia 넘버링)
H2 H50-H65 H50-H58 H53-H55 H47-H58
H3 H95-H102 H95-H102 H96-H101 H93-H101
HVR은 아래와 같은 "연장된 HVR"을 포함할 수 있다: VL에서 24-36 또는 24-34 (L1), 46-56 또는 50-56 (L2) 및 89-97 또는 89-96 (L3), 그리고 VH에서 26-35 (H1), 50-65 또는 49-65 (H2) 및 93-102, 94-102 또는 95-102 (H3). 가변 도메인 잔기는 이들 정의 각각에 대해 Kabat et al., 위와 같음에 따라 넘버링된다.
"프레임워크" 또는 "FR" 잔기는 본원에서 규정된 바와 같은 HVR 잔기 이외에 가변 도메인 잔기이다.
용어 "Kabat의 경우에서와 같은 가변 도메인 잔기 넘버링" 또는 "Kabat의 경우에서와 같은 아미노산 위치 넘버링", 그리고 이들의 변이는 Kabat et al., 위와 같음에서 항체의 편집의 중쇄 가변 도메인 또는 경쇄 가변 도메인에 이용되는 넘버링 시스템을 지칭한다. 이러한 넘버링 시스템을 이용하여, 실제 선형 아미노산 서열은 가변 도메인의 FR 또는 HVR의 단축, 또는 이것 내로 삽입에 상응하는 더 적은 또는 추가 아미노산을 내포할 수 있다. 예를 들면, 중쇄 가변 도메인은 H2의 잔기 52 뒤에 단일 아미노산 삽입물 (Kabat에 따라 잔기 52a), 그리고 중쇄 FR 잔기 82 뒤에 삽입된 잔기 (예를 들면, Kabat에 따라 잔기 82a, 82b 및 82c 등)를 포함할 수 있다. 잔기의 Kabat 넘버링은 항체의 서열 및 "표준" Kabat 넘버링된 서열의 상동성의 영역에서 정렬에 의해 소정의 항체에 대해 결정될 수 있다.
가변 도메인 내에 잔기 (대략, 경쇄의 잔기 1-107 및 중쇄의 잔기 1-113)를 지칭할 때, Kabat 넘버링 시스템이 일반적으로 이용된다 (예를 들면, Kabat et al., Sequences of Immunological Interest. 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, Md. (1991)). "EU 넘버링 시스템" 또는 "EU 색인"은 일반적으로, 면역글로불린 중쇄 불변 영역에서 잔기를 지칭할 때 이용된다 (예를 들면, Kabat et al., 위와 같음에서 보고된 EU 색인). "Kabat의 경우에서와 같은 EU 색인"은 인간 IgG1 EU 항체의 잔기 넘버링을 지칭한다.
표현 "선형 항체"는 Zapata et al. (Protein Eng, 8(10):1057-1062, 1995)에서 설명된 항체를 지칭한다. 간단히 말하면, 이들 항체는 한 쌍의 탠덤 Fd 분절 (VH-CH1-VH-CH1)을 포함하는데, 이들은 상보성 경쇄 폴리펩티드와 함께, 한 쌍의 항원 결합 영역을 형성한다. 선형 항체는 이중특이적 또는 단일특이적일 수 있다.
본원에서 이용된 바와 같이, 용어 "결합한다", "특이적으로 결합한다" 또는 "특이적이다"는 계측 가능하고 재현 가능한 상호작용, 예컨대 표적 및 항체 사이의 결합을 지칭하는데, 이것은 생물학적 분자를 비롯한 분자의 이질성 모집단의 존재에서 표적의 존재를 결정한다. 예를 들면, 표적 (이것은 에피토프일 수 있다)에 결합하거나 또는 특이적으로 결합하는 항체는 이것이 다른 표적에 결합하는 것보다 더 큰 친화성으로, 결합능으로, 더 쉽게 및/또는 더 큰 지속 기간에서 이러한 표적에 결합하는 항체이다. 한 구체예에서, 관련 없는 표적에 항체의 결합의 정도는 예를 들면, 방사면역검정 (RIA)에 의해 계측될 때 표적에 대한 상기 항체의 결합의 약 10%보다 적다. 일정한 구체예에서, 표적에 특이적으로 결합하는 항체는 ≤ 1 μM, ≤ 100 nM, ≤ 10 nM, ≤ 1 nM, 또는 ≤ 0.1 nM의 해리 상수 (Kd)를 갖는다. 일정한 구체예에서, 항체는 상이한 종으로부터 단백질 사이에서 보존되는 단백질 상에 에피토프에 특이적으로 결합한다. 다른 구체예에서, 특이적 결합은 배타적 결합을 포함할 수 있지만, 이를 필요로 하지는 않는다.
본원에서 확인된 폴리펩티드 서열에 대하여 "퍼센트 (%) 아미노산 서열 동일성"은 최대 퍼센트 서열 동일성을 달성하기 위해 서열을 정렬하고 필요하면, 갭을 도입한 후에, 그리고 임의의 보존성 치환을 서열 동일성의 일부로서 고려하지 않고, 비교되는 폴리펩티드 내에 아미노산 잔기와 동일한, 후보 서열 내에 아미노산 잔기의 백분율로서 규정된다. 퍼센트 아미노산 서열 동일성을 결정하는 목적을 위한 정렬은 당해 분야의 기술 범위 안에 있는 다양한 방식으로, 예를 들면, 공개적으로 가용한 컴퓨터 소프트웨어, 예컨대 BLAST, BLAST-2, ALIGN 또는 Megalign (DNASTAR) 소프트웨어를 이용하여 달성될 수 있다. 당업자는 비교되는 서열의 전장에 걸쳐 최대 정렬을 달성하기 위해 필요한 임의의 알고리즘을 비롯하여, 정렬을 계측하기 위한 적절한 파라미터를 결정할 수 있다. 하지만, 본원에서 목적을 위해, % 아미노산 서열 동일성 값은 서열 비교 컴퓨터 프로그램 ALIGN-2를 이용하여 생성된다. ALIGN-2 서열 비교 컴퓨터 프로그램은 Genentech, Inc.에 의해 저술되었고, 그리고 소스 코드가 사용자 문서로 U.S. Copyright Office, Washington D.C., 20559에 제출되었는데, 여기서 이것은 U.S. Copyright 등록 번호 TXU510087하에 등록된다. ALIGN-2 프로그램은 Genentech, Inc., South San Francisco, California를 통해 공개적으로 가용하다. ALIGN-2 프로그램은 UNIX 운영 체계, 바람직하게는 디지털 UNIX V4.0D에서 이용을 위해 편집되어야 한다. 모든 서열 비교 파라미터는 ALIGN-2 프로그램에 의해 세팅되고 변하지 않는다.
ALIGN-2가 아미노산 서열 비교에 이용되는 상황에서, 소정의 아미노산 서열 B에 대한 소정의 아미노산 서열 A의 % 아미노산 서열 동일성 (이것은 대안으로, 소정의 아미노산 서열 B에 대해 일정한 % 아미노산 서열 동일성을 갖거나 또는 포함하는 소정의 아미노산 서열 A로서 표현될 수 있다)은 아래와 같이 계산된다:
100 곱하기 분율 X/Y
여기서 X는 서열 정렬 프로그램 ALIGN-2에 의해, 상기 프로그램의 A와 B의 정렬에서 동일한 정합으로서 채점된 아미노산 잔기의 숫자이고, 그리고 여기서 Y는 B에서 아미노산 잔기의 총수이다. 아미노산 서열 A의 길이가 아미노산 서열 B의 길이와 동등하지 않은 경우에, B에 대한 A의 % 아미노산 서열 동일성은 A에 대한 B의 % 아미노산 서열 동일성과 동등하지 않을 것으로 인지될 것이다. 별도로 특정되지 않으면, 본원에서 이용된 모든 % 아미노산 서열 동일성 값은 ALIGN-2 컴퓨터 프로그램을 이용하여 직전 단락에서 설명된 바와 같이 획득된다.
본원에서 설명된 아미노산 서열은 별도로 명시되지 않으면 연속 아미노산 서열이다.
용어 "포장 삽입물"은 치료 산물의 상업적인 패키지 내에 관례적으로 포함되는 사용설명서를 지칭하는 데 이용되는데, 이것은 이런 치료 산물의 이용에 관련된 징후, 용법, 용량, 투여, 병용 요법, 금기 및/또는 주의사항에 관한 정보를 내포한다.
용어 "약학적 제제" 및 "약학적 조성물"은 본원에서 교체가능하게 이용되고, 그리고 그 안에 내포된 활성 성분의 생물학적 활성이 효과적이도록 허용하는 그런 형태이고, 그리고 이러한 제제가 투여될 개체에게 받아들이기 어려울 정도로 독성인 추가 성분을 내포하지 않는 제조물을 지칭한다. 이런 제제는 무균이다. 바람직한 구체예에서, 약학적 조성물 또는 약학적 제제는 인간 개체에게 투여된다.
"무균" 약학적 제제는 무균이거나 또는 모든 살아있는 미생물 및 이들의 포자가 없거나 또는 본질적으로 없다.
"약학적으로 허용되는 운반체"는 개체에게 비독성인, 약학적 제제에서 활성 성분 이외의 성분을 지칭한다. 약학적으로 허용되는 운반체는 완충액, 부형제, 안정제 또는 보존제를 포함하지만 이들에 한정되지 않는다.
본원에서 이용된 바와 같이, "투여하는"은 1회 용량의 화합물 (예를 들면, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드))), 또는 조성물 (예를 들면, 약학적 조성물, 예를 들면, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드))를 포함하고, 추가 치료제를 임의적으로 또한 포함하는 약학적 조성물)을 개체에게 제공하는 방법인 것으로 의미된다. 본원에서 설명된 방법에서 활용되는 조성물은 예를 들면, 유리체내, 근육내, 정맥내, 피내, 경피, 동맥내, 복막내, 병변내, 두개내, 관절내, 전립선내, 흉강내, 기관내, 척수강내, 비내, 질내, 직장내, 국소, 종양내, 복막, 피하, 결막하, 방광내, 점막, 심낭내, 배꼽내, 안구내, 안와내, 경구, 국소, 경피, 눈주위, 결막, 건주하, 전방내, 망막하, 안구후, 소관내, 흡입에 의해, 주사에 의해, 이식에 의해, 주입에 의해, 연속 주입에 의해, 표적 세포를 직접적으로 베이딩하는 국부 관류에 의해, 카테터에 의해, 세척액에 의해, 크렘에서, 또는 지질 조성물에서 투여될 수 있다. 본원에서 설명된 방법에서 활용되는 조성물은 또한 전신 또는 국부 투여될 수 있다. 투여 방법은 다양한 인자 (예를 들면, 투여되는 화합물 또는 조성물, 그리고 치료되는 상태, 질환 또는 장애의 중증도)에 따라서 변할 수 있다.
III. 유방암의 치료를 위한 방법, 이용을 위한 조성물 및 용도
개체에서 유방암 (예를 들면, TNBC (예를 들면, eTNBC))을 치료하거나 또는 이의 진행을 지연시키기 위한 방법이 본원에서 제공되는데, 이들 방법은 PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드))를 포함하는 치료 섭생의 효과량을 상기 개체에게 투여하는 단계를 포함한다. 일부 구체예에서, 치료는 개체에서 반응을 야기한다. 일부 구체예에서, 반응은 완전 반응 (CR) (예를 들면, 병리학적 완전 반응 (pCR))이다. 본원에서 설명된 방법은 증강된 면역원이 요망되는 질환을 치료하는, 예컨대 암의 치료를 위해 종양 면역원을 증가시키는 데에서 용도를 발견할 수 있다. 유방암 (예를 들면, TNBC (예를 들면, eTNBC))을 겪는 개체에서 면역 기능을 증강하는 방법 역시 본원에서 제공되는데, 이들 방법은 PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드))를 포함하는 치료 섭생의 효과량을 개체에게 투여하는 단계를 포함한다. 당해 분야에서 알려져 있거나 또는 본원에서 설명된 임의의 PD-1 축 결합 길항제, 탁산, 안트라사이클린, 또는 알킬화제가 이들 방법에서 이용될 수 있다.
한 가지 양상에서, 개체에서 유방암 (예를 들면, TNBC, 예를 들면, eTNBC)을 치료하는 방법이 본원에서 제공되는데, 상기 방법은 PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및/또는 알킬화제 (예를 들면, 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드))의 효과량을 포함하는 치료 섭생을 상기 개체에게 투여하는 단계를 포함하되, 상기 치료 섭생이 PD-1 축 결합 길항제 없이 탁산, 안트라사이클린 및/또는 알킬화제를 이용한 치료와 비교하여 반응 (예를 들면, CR, 예를 들면, pCR)을 경험할 개체의 가능성을 증가시킨다.
다른 양상에서, 개체에서 유방암 (예를 들면, TNBC, 예를 들면, eTNBC)의 치료에서 이용을 위한 PD-1 축 결합 길항제를 포함하는 약학적 조성물이 본원에서 제공되는데, 여기서 상기 치료는 PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및/또는 알킬화제 (예를 들면, 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드))의 효과량을 포함하는 치료 섭생의 투여를 포함하고, 그리고 여기서 상기 치료 섭생은 PD-1 축 결합 길항제 없이 탁산, 안트라사이클린 및/또는 알킬화제를 이용한 치료와 비교하여 반응 (예를 들면, CR, 예를 들면, pCR)을 경험할 개체의 가능성을 증가시킨다.
다른 양상에서, 개체에서 유방암 (예를 들면, TNBC, 예를 들면, eTNBC)의 치료를 위한 약제의 제조에서 PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체)를 포함하는 약학적 조성물의 용도가 본원에서 제공되는데, 여기서 상기 치료는 PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및/또는 알킬화제 (예를 들면, 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드))의 효과량을 포함하는 치료 섭생의 투여를 포함하고, 그리고 여기서 상기 치료 섭생은 PD-1 축 결합 길항제 없이 탁산, 안트라사이클린 및/또는 알킬화제를 이용한 치료와 비교하여 반응 (예를 들면, CR, 예를 들면, pCR)을 경험할 개체의 가능성을 증가시킨다.
예를 들면, 일부 양상에서, 치료 섭생은 PD-1 축 결합 길항제 없이 탁산, 안트라사이클린 및/또는 알킬화제를 이용한 치료와 비교하여, 객관적인 반응 (예를 들면, CR)을 경험할 개체의 가능성을 증가시키고, 개체의 진행 없는 생존 (PFS)을 연장하고, 개체의 전체 생존 (OS)을 연장하고, 개체의 질환 없는 생존 (DFS) (예를 들면, 침습성 DFS (iDFS))을 연장하고, 개체의 무병 생존 (EFS)을 연장하고, 및/또는 개체의 반응 지속 기간 (DOR)을 연장한다.
일부 양상에서, 치료 섭생은 PD-1 축 결합 길항제 없이 탁산, 안트라사이클린 및/또는 알킬화제를 이용한 치료와 비교하여 객관적인 반응을 경험할 개체의 가능성을 증가시킨다.
일부 양상에서, 치료 섭생은 PD-1 축 결합 길항제 없이 탁산, 안트라사이클린 및/또는 알킬화제를 이용한 치료와 비교하여 CR (예를 들면, pCR)을 경험할 개체의 가능성을 증가시킨다.
일부 양상에서, 치료 섭생은 PD-1 축 결합 길항제 없이 탁산, 안트라사이클린 및/또는 알킬화제를 이용한 치료와 비교하여 개체의 PFS를 연장한다.
일부 양상에서, 치료 섭생은 PD-1 축 결합 길항제 없이 탁산, 안트라사이클린 및/또는 알킬화제를 이용한 치료와 비교하여 개체의 OS를 연장한다.
일부 양상에서, 치료 섭생은 PD-1 축 결합 길항제 없이 탁산, 안트라사이클린 및/또는 알킬화제를 이용한 치료와 비교하여 개체의 PFS를 연장한다.
일부 양상에서, 치료 섭생은 PD-1 축 결합 길항제 없이 탁산, 안트라사이클린 및/또는 알킬화제를 이용한 치료와 비교하여 개체의 질환 없는 생존 (DFS)를 연장한다.
일부 양상에서, 치료 섭생은 PD-1 축 결합 길항제 없이 탁산, 안트라사이클린 및/또는 알킬화제를 이용한 치료와 비교하여 개체의 침습성 질환 없는 생존 (iDFS)를 연장한다.
일부 양상에서, 치료 섭생은 PD-1 축 결합 길항제 없이 탁산, 안트라사이클린 및/또는 알킬화제를 이용한 치료와 비교하여 개체의 무병 생존 (EFS)을 연장한다.
일부 양상에서, 치료 섭생은 PD-1 축 결합 길항제 없이 탁산, 안트라사이클린 및/또는 알킬화제를 이용한 치료와 비교하여 개체의 DOR을 연장한다.
특정한 양상에서, 치료 섭생은 pCR을 경험할 개체의 가능성을 증가시킬 수 있다.
한 가지 양상에서, 개체에서 유방암 (예를 들면, TNBC, 예를 들면, eTNBC)을 치료하는 방법이 본원에서 제공되는데, 상기 방법은 PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및/또는 알킬화제 (예를 들면, 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드))의 효과량을 포함하는 치료 섭생을 상기 개체에게 투여하는 단계를 포함하되, 상기 치료 섭생이 PD-1 축 결합 길항제 없이 탁산, 안트라사이클린 및/또는 알킬화제를 이용한 치료와 비교하여 pCR을 경험할 개체의 가능성을 증가시킨다.
다른 양상에서, 개체에서 유방암 (예를 들면, TNBC, 예를 들면, eTNBC)의 치료에서 이용을 위한 PD-1 축 결합 길항제를 포함하는 약학적 조성물이 본원에서 제공되는데, 여기서 상기 치료는 PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및/또는 알킬화제 (예를 들면, 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드))의 효과량을 포함하는 치료 섭생의 투여를 포함하고, 그리고 여기서 상기 치료 섭생은 PD-1 축 결합 길항제 없이 탁산, 안트라사이클린 및/또는 알킬화제를 이용한 치료와 비교하여 pCR을 경험할 개체의 가능성을 증가시킨다.
다른 양상에서, 개체에서 유방암 (예를 들면, TNBC, 예를 들면, eTNBC)의 치료를 위한 약제의 제조에서 PD-1 축 결합 길항제를 포함하는 약학적 조성물의 용도가 본원에서 제공되는데, 여기서 상기 치료는 PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및/또는 알킬화제 (예를 들면, 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드))의 효과량을 포함하는 치료 섭생의 투여를 포함하고, 그리고 여기서 상기 치료 섭생은 PD-1 축 결합 길항제 없이 탁산, 안트라사이클린 및/또는 알킬화제를 이용한 치료와 비교하여 pCR을 경험할 개체의 가능성을 증가시킨다.
일부 양상에서, 치료 섭생은 개체의 원발암 치료일 수 있다.
다른 양상에서, 치료 섭생은 원발암 치료, 예를 들면, 수술 이전, 동안 또는 이후 임의의 시기에 개체에게 투여될 수 있다. 일부 양상에서, 원발암 치료는 수술 (예를 들면, 유방 보존 수술 (예를 들면, 종괴절제술, 사분구절제술, 부분 유방절제술, 또는 구획 유방절제술), 또는 유방절제술 (단일 유방절제술 또는 양측 유방절제술 포함)이다. 일부 양상에서, 치료 섭생은 신보조 요법 또는 보조 요법이다. 일부 양상에서, 치료 섭생은 신보조 요법이다. 다른 양상에서, 치료 섭생은 보조 요법이다.
한 가지 양상에서, 개체에서 유방암 (예를 들면, TNBC, 예를 들면, eTNBC)을 치료하는 방법이 본원에서 제공되는데, 상기 방법은 PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및/또는 알킬화제 (예를 들면, 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드))의 효과량을 포함하는 치료 섭생을 상기 개체에게 투여하는 단계를 포함하되, 상기 치료 섭생이 신보조 요법 또는 보조 요법이고, 그리고 상기 치료 섭생이 PD-1 축 결합 길항제 없이 탁산, 안트라사이클린 및 알킬화제를 이용한 치료와 비교하여 pCR을 경험할 개체의 가능성을 증가시킨다.
다른 양상에서, 개체에서 유방암 (예를 들면, TNBC, 예를 들면, eTNBC)의 치료에서 이용을 위한 PD-1 축 결합 길항제를 포함하는 약학적 조성물이 본원에서 제공되는데, 여기서 상기 치료는 PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및/또는 알킬화제 (예를 들면, 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드))의 효과량을 포함하는 치료 섭생의 투여를 포함하고, 여기서 상기 치료 섭생은 신보조 요법 또는 보조 요법이고, 그리고 여기서 상기 치료 섭생은 PD-1 축 결합 길항제 없이 탁산, 안트라사이클린 및/또는 알킬화제를 이용한 치료와 비교하여 pCR을 경험할 개체의 가능성을 증가시킨다.
다른 양상에서, 개체에서 유방암 (예를 들면, TNBC, 예를 들면, eTNBC)의 치료를 위한 약제의 제조에서 PD-1 축 결합 길항제를 포함하는 약학적 조성물의 용도가 본원에서 제공되는데, 여기서 상기 치료는 PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및/또는 알킬화제 (예를 들면, 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드))의 효과량을 포함하는 치료 섭생의 투여를 포함하고, 여기서 상기 치료 섭생은 신보조 요법 또는 보조 요법이고, 그리고 여기서 상기 치료 섭생은 PD-1 축 결합 길항제 없이 탁산, 안트라사이클린 및/또는 알킬화제를 이용한 치료와 비교하여 pCR을 경험할 개체의 가능성을 증가시킨다.
임의의 적합한 유방암이 치료될 수 있다. 일부 양상에서, 유방암은 TNBC이다.
한 가지 양상에서, 개체에서 TNBC를 치료하는 방법이 본원에서 제공되는데, 상기 방법은 PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및/또는 알킬화제 (예를 들면, 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드))의 효과량을 포함하는 치료 섭생을 상기 개체에게 투여하는 단계를 포함하되, 상기 치료 섭생이 신보조 요법 또는 보조 요법이고, 그리고 상기 치료 섭생이 PD-1 축 결합 길항제 없이 탁산, 안트라사이클린 및/또는 알킬화제를 이용한 치료와 비교하여 병리학적 완전 반응 (pCR)을 경험할 개체의 가능성을 증가시킨다.
다른 양상에서, 개체에서 TNBC의 치료에서 이용을 위한 PD-1 축 결합 길항제를 포함하는 약학적 조성물이 본원에서 제공되는데, 여기서 상기 치료는 PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및/또는 알킬화제 (예를 들면, 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드))의 효과량을 포함하는 치료 섭생의 투여를 포함하고, 여기서 상기 치료 섭생은 신보조 요법 또는 보조 요법이고, 그리고 여기서 상기 치료 섭생은 PD-1 축 결합 길항제 없이 탁산, 안트라사이클린 및/또는 알킬화제를 이용한 치료와 비교하여 pCR을 경험할 개체의 가능성을 증가시킨다.
다른 양상에서, 개체에서 TNBC의 치료를 위한 약제의 제조에서 PD-1 축 결합 길항제를 포함하는 약학적 조성물의 용도가 본원에서 제공되는데, 여기서 상기 치료는 PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및/또는 알킬화제 (예를 들면, 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드))의 효과량을 포함하는 치료 섭생의 투여를 포함하고, 여기서 상기 치료 섭생은 신보조 요법 또는 보조 요법이고, 그리고 여기서 상기 치료 섭생은 PD-1 축 결합 길항제 없이 탁산, 안트라사이클린 및/또는 알킬화제를 이용한 치료와 비교하여 pCR을 경험할 개체의 가능성을 증가시킨다.
임의의 적합한 TNBC가 치료될 수 있다. 일부 양상에서, TNBC는 eTNBC이다.
예를 들면, 한 가지 양상에서, 개체에서 eTNBC를 치료하는 방법이 본원에서 제공되는데, 상기 방법은 PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및/또는 알킬화제 (예를 들면, 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드))의 효과량을 포함하는 치료 섭생을 상기 개체에게 투여하는 단계를 포함하되, 상기 치료 섭생이 신보조 요법 또는 보조 요법이고, 그리고 상기 치료 섭생이 PD-1 축 결합 길항제 없이 탁산, 안트라사이클린 및/또는 알킬화제를 이용한 치료와 비교하여 병리학적 완전 반응 (pCR)을 경험할 개체의 가능성을 증가시킨다.
다른 양상에서, 개체에서 eTNBC의 치료에서 이용을 위한 PD-1 축 결합 길항제를 포함하는 약학적 조성물이 본원에서 제공되는데, 여기서 상기 치료는 PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및/또는 알킬화제 (예를 들면, 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드))의 효과량을 포함하는 치료 섭생의 투여를 포함하고, 여기서 상기 치료 섭생은 신보조 요법 또는 보조 요법이고, 그리고 여기서 상기 치료 섭생은 PD-1 축 결합 길항제 없이 탁산, 안트라사이클린 및/또는 알킬화제를 이용한 치료와 비교하여 pCR을 경험할 개체의 가능성을 증가시킨다.
다른 양상에서, 개체에서 eTNBC의 치료를 위한 약제의 제조에서 PD-1 축 결합 길항제를 포함하는 약학적 조성물의 용도가 본원에서 제공되는데, 여기서 상기 치료는 PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및/또는 알킬화제 (예를 들면, 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드))의 효과량을 포함하는 치료 섭생의 투여를 포함하고, 여기서 상기 치료 섭생은 신보조 요법 또는 보조 요법이고, 그리고 여기서 상기 치료 섭생은 PD-1 축 결합 길항제 없이 탁산, 안트라사이클린 및/또는 알킬화제를 이용한 치료와 비교하여 pCR을 경험할 개체의 가능성을 증가시킨다.
일부 양상에서, pCR은 유방 조직 및 림프절에서 암의 부재이다.
일부 양상에서, pCR은 관상피내암의 존재 또는 부재를 포함한다.
일부 양상에서, eTNBC는 I 기, II 기, 또는 III 기 eTNBC이다.
일부 양상에서, eTNBC는 II 기 또는 III 기 eTNBC이다.
일부 양상에서, 치료 섭생은 PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및/또는 알킬화제 (예를 들면, 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드)) 중에서 한 가지, 두 가지, 세 가지 또는 네 가지 모두의 임의의 조합을 포함한다.
예를 들면, 일부 양상에서, 치료 섭생은 PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및/또는 알킬화제 (예를 들면, 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드)) 중에서 한 가지를 포함한다. 예를 들면, 한 가지 특정한 양상에서, 치료 섭생은 PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체)를 포함한다. 다른 특정한 양상에서, 치료 섭생은 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀)을 포함한다. 다른 특정한 양상에서, 치료 섭생은 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신)을 포함한다. 다른 특정한 양상에서, 치료 섭생은 알킬화제 (예를 들면, 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드))를 포함한다.
다른 실례에서, 일부 양상에서, 치료 섭생은 PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및/또는 알킬화제 (예를 들면, 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드)) 중에서 두 가지를 포함한다. 예를 들면, 한 가지 특정한 양상에서, 치료 섭생은 PD-1 축 결합 길항제 및 탁산을 포함한다. 다른 특정한 양상에서, 치료 섭생은 PD-1 축 결합 길항제 및 알킬화제를 포함한다. 다른 특정한 양상에서, 치료 섭생은 PD-1 축 결합 길항제 및 안트라사이클린을 포함한다. 다른 특정한 양상에서, 치료 섭생은 탁산 및 알킬화제를 포함한다. 다른 특정한 양상에서, 치료 섭생은 탁산 및 안트라사이클린을 포함한다. 다른 특정한 양상에서, 치료 섭생은 알킬화제 및 안트라사이클린을 포함한다.
또 다른 실례에서, 일부 양상에서, 치료 섭생은 PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및/또는 알킬화제 (예를 들면, 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드)) 중에서 세 가지를 포함한다. 예를 들면, 한 가지 특정한 양상에서, 치료 섭생은 PD-1 축 결합 길항제, 탁산 및 알킬화제를 포함한다. 다른 특정한 양상에서, 치료 섭생은 PD-1 축 결합 길항제, 탁산 및 안트라사이클린을 포함한다. 또 다른 특정한 양상에서, 치료 섭생은 PD-1 축 결합 길항제, 알킬화제 및 안트라사이클린을 포함한다. 다른 특정한 양상에서, 치료 섭생은 탁산, 알킬화제 및 안트라사이클린을 포함한다.
특정 실례에서, 일부 양상에서, 치료 섭생은 PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드)) 중에서 네 가지 모두를 포함한다. 구체적인 특정한 실례에서, 일부 양상에서, 치료 섭생은 PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드))로 본질적으로 구성되거나 또는 이들로 구성된다.
당해 분야에서 알려져 있거나 또는 본원에서, 예를 들면, 아래의 섹션 V에서 설명된 임의의 PD-1 축 결합 길항제를 비롯한, 임의의 적합한 PD-1 축 결합 길항제가 이용될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제는 PD-L1 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙)), PD-1 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-1 항체), 또는 PD-L2 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L2 항체)이다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제는 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체이다.
임의의 적합한 PD-L1 결합 길항제가 이용될 수 있다. 일부 양상에서, PD-L1 결합 길항제는 항-PD-L1 항체이다. 임의의 적합한 항-PD-L1 항체가 이용될 수 있다. 한 가지 특정한 양상에서, 항-PD-L1 항체는 아테졸리주맙이다. 다른 특정한 양상에서, 항-PD-L1 항체는 MDX-1105이다. 또 다른 특정한 양상에서, 항-PD-L1 항체는 YW243.55.S70이다. 또 다른 특정한 양상에서, 항-PD-L1 항체는 MEDI4736 (더발루맙)이다. 또 다른 특정한 양상에서, 항-PD-L1 항체는 MSB0010718C (아벨루맙)이다.
일부 특정한 양상에서, 항-PD-L1 항체는 아테졸리주맙이다.
다른 양상에서, 임의의 적합한 PD-1 결합 길항제가 이용될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 결합 길항제는 항-PD-1 항체이다. 특정한 양상에서, 항-PD-1 항체는 MDX-1106 (니볼루맙)이다. 다른 특정한 양상에서, 항-PD-1 항체는 MK-3475 (펨브로리주맙)이다. 다른 특정한 양상에서, 항-PD-1 항체는 MEDI-0680 (AMP-514)이다. 다른 특정한 양상에서, 항-PD-1 항체는 PDR001이다. 다른 특정한 양상에서, 항-PD-1 항체는 REGN2810이다. 다른 특정한 양상에서, 항-PD-1 항체는 BGB-108이다. 일부 구체예에서, PD-1 결합 길항제는 면역부착소 (예를 들면, 불변 영역 (예를 들면, 면역글로불린 서열의 Fc 영역)에 융합된 PD-L1 또는 PD-L2의 세포외 또는 PD-1 결합 부분을 포함하는 면역부착소이다. 일부 구체예에서, PD-1 결합 길항제는 AMP-224이다.
임의의 적합한 탁산이 이용될 수 있다. 예를 들면, 일부 양상에서, 탁산은 냅-파클리탁셀, 파클리탁셀, 도세탁셀, 라로탁셀, 카바지탁셀, 밀라탁셀, 테세탁셀 및/또는 오라탁셀을 포함한다. 일부 양상에서, 탁산은 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀이다. 일부 특정한 양상에서, 탁산은 냅-파클리탁셀이다. 다른 특정한 양상에서, 탁산은 파클리탁셀이다.
임의의 적합한 안트라사이클린이 이용될 수 있다. 예를 들면, 일부 양상에서, 안트라사이클린은 독소루비신, 에피루비신, 이다루비신, 다우노루비신, 미톡산트론 및/또는 발루비신을 포함한다. 일부 양상에서, 안트라사이클린은 독소루비신 또는 에피루비신이다. 일부 특정한 양상에서, 안트라사이클린은 독소루비신이다. 다른 특정한 양상에서, 안트라사이클린은 에피루비신이다.
임의의 적합한 알킬화제가 이용될 수 있다. 예를 들면, 일부 양상에서, 알킬화제는 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드, 클로람부실, 우라무스틴, 멜팔란, 또는 벤다무스틴), 니트로소요소 (예를 들면, 카르무스틴, 로무스틴, 또는 스트렙토조신), 알킬 술포네이트 (예를 들면, 부술판), 트리아진 (예를 들면, 다카르바진 또는 테모졸로미드, 그리고 에틸렌이민 (예를 들면, 알트레타민 또는 티오테파)이다. 일부 양상에서, 알킬화제는 질소 머스타드 유도체이다.
임의의 적합한 질소 머스타드 유도체가 이용될 수 있다. 일부 양상에서, 질소 머스타드 유도체는 시클로포스파미드, 클로람부실, 우라무스틴, 멜팔란, 또는 벤다무스틴이다. 일부 특정한 양상에서, 질소 머스타드 유도체는 시클로포스파미드이다.
일부 양상에서, 치료 섭생은 적어도 일차 투약 주기 및 이차 투약 주기를 포함한다. 일부 양상에서, 치료 섭생은 (i) PD-1 축 결합 길항제 및 탁산을 개체에게 투여하는 것을 포함하는 일차 투약 주기, 그 이후에 (ii) PD-1 축 결합 길항제, 안트라사이클린 및 알킬화제를 개체에게 투여하는 것을 포함하는 이차 투약 주기를 포함한다.
일부 양상에서, 일차 투약 주기는 PD-1 축 결합 길항제를 매주, 2 주마다, 3 주마다, 또는 4 주마다 투여하고, 그리고 탁산을 매주, 2 주마다, 3 주마다, 또는 4 주마다 투여하는 것을 포함한다. 일부 양상에서, 일차 투약 주기는 2 주마다 PD-1 축 결합 길항제 및 매주 탁산을 투여하는 것을 포함한다.
일차 투약 주기는 임의의 적합한 길이를 가질 수 있다. 예를 들면, 일차 투약 주기는 약 1 주, 약 2 주, 약 3 주, 약 4 주, 약 5 주, 약 6 주, 약 7 주, 약 8 주, 약 9 주, 약 10 주, 약 11 주, 약 12 주, 약 13 주, 약 14 주, 약 15 주, 약 16 주, 약 17 주, 약 18 주, 약 19 주, 약 20 주, 약 21 주, 약 22 주, 약 23 주, 또는 약 24 주의 길이를 가질 수 있다. 특정한 양상에서, 일차 투약 주기는 약 12 주의 길이를 갖는다.
일부 양상에서, 이차 투약 주기는 PD-1 축 결합 길항제를 매주, 2 주마다, 3 주마다, 또는 4 주마다 투여하고; 안트라사이클린을 매주, 2 주마다, 3 주마다, 또는 4 주마다 투여하고; 그리고 알킬화제를 매주, 2 주마다, 3 주마다, 또는 4 주마다 투여하는 것을 포함한다. 일부 양상에서, 이차 투약 주기는 PD-1 축 결합 길항제를 2 주마다 투여하고; 안트라사이클린을 2 주마다 투여하고; 그리고 알킬화제를 2 주마다 투여하는 것을 포함한다.
이차 투약 주기는 임의의 적합한 길이를 가질 수 있다. 예를 들면, 이차 투약 주기는 약 1 주, 약 2 주, 약 3 주, 약 4 주, 약 5 주, 약 6 주, 약 7 주, 약 8 주, 약 9 주, 약 10 주, 약 11 주, 약 12 주, 약 13 주, 약 14 주, 약 15 주, 약 16 주, 약 17 주, 약 18 주, 약 19 주, 약 20 주, 약 21 주, 약 22 주, 약 23 주, 또는 약 24 주의 길이를 가질 수 있다. 특정한 양상에서, 이차 투약 주기는 약 8 주의 길이를 갖는다.
일부 양상에서, 투약 섭생은 유지기를 더욱 포함할 수 있다. 일부 양상에서, 유지기는 PD-1 축 결합 길항제를 예를 들면, 매주, 2 주마다, 3 주마다, 또는 4 주마다 환자에게 투여하는 것을 포함한다. 일부 양상에서, 유지기는 PD-1 축 결합 길항제를 예를 들면, 3 주마다 환자에게 투여하는 것을 포함한다. 유지기는 임의의 적합한 길이, 예를 들면, 약 1 주, 약 2 주, 약 3 주, 약 4 주, 약 5 주, 약 6 주, 약 7 주, 약 8 주, 약 9 주, 약 10 주, 약 11 주, 약 12 주, 약 13 주, 약 14 주, 약 15 주, 약 16 주, 약 17 주, 약 18 주, 약 19 주, 약 20 주, 약 21 주, 약 22 주, 약 23 주, 약 24 주, 약 25 주, 약 26 주, 약 27 주, 약 28 주, 약 29 주, 약 30 주, 약 31 주, 약 32 주, 약 33 주, 약 34 주, 약 35 주, 약 36 주, 약 37 주, 약 38 주, 약 39 주, 약 40 주, 약 41 주, 약 42 주, 약 43 주, 약 44 주, 약 45 주, 약 46 주, 약 47 주, 약 48 주, 약 49 주, 약 50 주, 약 51 주, 약 52 주, 또는 그 초과를 가질 수 있다. 일부 양상에서, 유지기는 PD-1 축 결합 길항제를 총 11회 용량을 위해 3 주마다 투여하는 것을 포함한다. 일부 양상에서, 유지기는 PD-1 축 결합 길항제를 치료의 일차 투약 후 1년까지 동안 3 주마다 투여하는 것을 포함한다. 일부 사례에서, 유지기는 반응이 달성될 때까지 투여된다. 다른 사례에서, 유지기는 진행이 발생할 때까지 투여된다.
일부 양상에서, 치료 섭생은 신보조 요법이다.
일부 양상에서, 치료 섭생은 신보조 요법이고, 그리고 (i) 약 12 주 동안 2 주마다 약 840 mg의 아테졸리주맙 및 매주 약 125 mg/m2 냅-파클리탁셀을 개체의 정맥내에 투여하는 것을 포함하는 일차 투약 주기; 그 이후에 (ii) 약 8 주 동안 2 주마다 약 840 mg의 아테졸리주맙, 약 60 mg/m2 독소루비신 및 약 600 mg/m2 시클로포스파미드를 개체의 정맥내에 투여하는 것을 포함하는 이차 투약 주기를 포함한다.
일부 양상에서, 치료 섭생은 보조 요법이다.
일부 양상에서, 치료 섭생은 보조 요법이고, 그리고 (i) 약 12 주 동안 2 주마다 약 840 mg의 아테졸리주맙 및 매주 약 80 mg/m2 파클리탁셀을 개체의 정맥내에 투여하는 것을 포함하는 일차 투약 주기; 그 이후에 (ii) 약 8 주 동안 2 주마다 약 840 mg의 아테졸리주맙, 약 60 mg/m2 독소루비신 및 약 90 mg/m2 에피루비신을 개체의 정맥내에 투여하는 것을 포함하는 이차 투약 주기를 포함한다.
일부 양상에서, 치료 섭생은 이차 투약 주기 이후에 유지기를 더욱 포함하고, 상기 유지기는 3 주마다 약 1200 mg의 아테졸리주맙을 개체의 정맥내에 투여하는 것을 포함한다.
일부 양상에서, 개체는 유방암 (예를 들면, TNBC, 예를 들면, eTNBC)에 대해 이전에 치료를 받지 않는다.
일부 양상에서, 개체는 (i) 유방암의 치료 또는 예방을 위한 선행 전신 요법; (ii) 임의의 악성종양에 대한 안트라사이클린 또는 탁산을 이용한 선행 요법; 또는 (iii) 선행 면역요법을 제공받지 않았다.
일부 양상에서, 개체는 (i) 조직학적으로 확증된 유방암 (예를 들면, TNBC, 예를 들면, eTNBC); (ii) 0 또는 1의 동부 종양학 협력 그룹 (ECOG) 수행 상태; (iii) 약 2 cm 초과의 원발성 유방 종양 크기; 및/또는 (iv) 치료의 개시 시점에서 TNM 악성 종양 분류 (TNM) 분류 체계에 따른 cT2-cT4, cN0-cN3, cM0의 암 병기를 겪는다.
다른 양상에서, 개체에서 eTNBC를 치료하는 방법이 본원에서 제공되는데, 상기 방법은 아테졸리주맙, 냅-파클리탁셀, 독소루비신 및 시클로포스파미드의 효과량을 포함하는 치료 섭생을 개체에게 투여하는 단계를 포함하되, 상기 치료 섭생이 신보조 요법이고, 그리고 (i) 약 12 주 동안 2 주마다 약 840 mg의 아테졸리주맙 및 매주 약 125 mg/m2 냅-파클리탁셀을 개체의 정맥내에 투여하는 것을 포함하는 일차 투약 주기; 그 이후에 (ii) 약 8 주 동안 2 주마다 약 840 mg의 아테졸리주맙, 약 60 mg/m2 독소루비신 및 약 600 mg/m2 시클로포스파미드를 개체의 정맥내에 투여하는 것을 포함하는 이차 투약 주기를 포함하며, 그리고 상기 치료 섭생이 아테졸리주맙 없이 냅-파클리탁셀, 독소루비신 및 시클로포스파미드를 이용한 치료와 비교하여, pCR을 경험할 개체의 가능성을 증가시킨다.
다른 양상에서, 개체에서 eTNBC의 치료에서 이용을 위한, 아테졸리주맙을 포함하는 약학적 조성물이 본원에서 제공되는데, 상기 치료는 아테졸리주맙, 냅-파클리탁셀, 독소루비신 및 시클로포스파미드의 효과량을 포함하는 치료 섭생을 개체에게 투여하는 단계를 포함하되, 상기 치료 섭생이 신보조 요법이고, 그리고 (i) 약 12 주 동안 2 주마다 약 840 mg의 아테졸리주맙 및 매주 약 125 mg/m2 냅-파클리탁셀을 개체의 정맥내에 투여하는 것을 포함하는 일차 투약 주기; 그 이후에 (ii) 약 8 주 동안 2 주마다 약 840 mg의 아테졸리주맙, 약 60 mg/m2 독소루비신 및 약 600 mg/m2 시클로포스파미드를 개체의 정맥내에 투여하는 것을 포함하는 이차 투약 주기를 포함하며, 그리고 상기 치료 섭생이 아테졸리주맙 없이 냅-파클리탁셀, 독소루비신 및 시클로포스파미드를 이용한 치료와 비교하여, pCR을 경험할 개체의 가능성을 증가시킨다.
다른 양상에서, 개체에서 eTNBC의 치료를 위한 약제의 제조에서 아테졸리주맙을 포함하는 약학적 조성물의 용도가 본원에서 제공되는데, 상기 치료는 아테졸리주맙, 냅-파클리탁셀, 독소루비신 및 시클로포스파미드의 효과량을 포함하는 치료 섭생을 개체에게 투여하는 단계를 포함하되, 상기 치료 섭생이 신보조 요법이고, 그리고 (i) 약 12 주 동안 2 주마다 약 840 mg의 아테졸리주맙 및 매주 약 125 mg/m2 냅-파클리탁셀을 개체의 정맥내에 투여하는 것을 포함하는 일차 투약 주기; 그 이후에 (ii) 약 8 주 동안 2 주마다 약 840 mg의 아테졸리주맙, 약 60 mg/m2 독소루비신 및 약 600 mg/m2 시클로포스파미드를 개체의 정맥내에 투여하는 것을 포함하는 이차 투약 주기를 포함하며, 그리고 상기 치료 섭생이 아테졸리주맙 없이 냅-파클리탁셀, 독소루비신 및 시클로포스파미드를 이용한 치료와 비교하여, pCR을 경험할 개체의 가능성을 증가시킨다.
다른 양상에서, 개체에서 eTNBC를 치료하는 방법이 본원에서 제공되는데, 상기 방법은 아테졸리주맙, 파클리탁셀, 독소루비신 또는 에피루비신, 그리고 시클로포스파미드의 효과량을 포함하는 치료 섭생을 개체에게 투여하는 단계를 포함하되, 상기 치료 섭생이 보조 요법이고, 그리고 (i) 약 12 주 동안 2 주마다 약 840 mg의 아테졸리주맙 및 매주 약 80 mg/m2 파클리탁셀을 개체의 정맥내에 투여하는 것을 포함하는 일차 투약 주기; 그 이후에 (ii) 약 8 주 동안 2 주마다 약 840 mg의 아테졸리주맙, 약 60 mg/m2 독소루비신 또는 약 90 mg/m2 에피루비신, 그리고 약 600 mg/m2 시클로포스파미드를 개체의 정맥내에 투여하는 것을 포함하는 이차 투약 주기; 그 이후에 (iii) 3 주마다 약 1200 mg의 아테졸리주맙을 개체의 정맥내에 투여하는 것을 포함하는 유지기를 포함하며, 그리고 상기 치료 섭생이 아테졸리주맙 없이 파클리탁셀, 독소루비신 또는 에피루비신, 그리고 시클로포스파미드를 이용한 치료와 비교하여, 개체의 iDFS를 효과적으로 연장한다.
다른 양상에서, 개체에서 eTNBC의 치료에서 이용을 위한, 아테졸리주맙을 포함하는 약학적 조성물이 본원에서 제공되는데, 상기 치료는 아테졸리주맙, 파클리탁셀, 독소루비신 또는 에피루비신, 그리고 시클로포스파미드의 효과량을 포함하는 치료 섭생을 개체에게 투여하는 단계를 포함하되, 상기 치료 섭생이 보조 요법이고, 그리고 (i) 약 12 주 동안 2 주마다 약 840 mg의 아테졸리주맙 및 매주 약 80 mg/m2 파클리탁셀을 개체의 정맥내에 투여하는 것을 포함하는 일차 투약 주기; 그 이후에 (ii) 약 8 주 동안 2 주마다 약 840 mg의 아테졸리주맙, 약 60 mg/m2 독소루비신 또는 약 90 mg/m2 에피루비신, 그리고 약 600 mg/m2 시클로포스파미드를 개체의 정맥내에 투여하는 것을 포함하는 이차 투약 주기; 그 이후에 (iii) 3 주마다 약 1200 mg의 아테졸리주맙을 개체의 정맥내에 투여하는 것을 포함하는 유지기를 포함하며, 그리고 상기 치료 섭생이 아테졸리주맙 없이 파클리탁셀, 독소루비신 또는 에피루비신, 그리고 시클로포스파미드를 이용한 치료와 비교하여, 개체의 침습성 질환 없는 생존 (iDFS)를 효과적으로 연장한다.
다른 양상에서, 개체에서 eTNBC의 치료를 위한 약제의 제조에서 아테졸리주맙을 포함하는 약학적 조성물의 용도가 본원에서 제공되는데, 상기 치료는 아테졸리주맙, 냅-파클리탁셀, 독소루비신 및 시클로포스파미드의 효과량을 포함하는 치료 섭생을 개체에게 투여하는 단계를 포함하되, 상기 치료 섭생이 신보조 요법이고, 그리고 (i) 약 12 주 동안 2 주마다 약 840 mg의 아테졸리주맙 및 매주 약 125 mg/m2 냅-파클리탁셀을 개체의 정맥내에 투여하는 것을 포함하는 일차 투약 주기; 그 이후에 (ii) 약 8 주 동안 2 주마다 약 840 mg의 아테졸리주맙, 약 60 mg/m2 독소루비신 및 약 600 mg/m2 시클로포스파미드를 개체의 정맥내에 투여하는 것을 포함하는 이차 투약 주기를 포함하며, 그리고 상기 치료 섭생이 아테졸리주맙 없이 냅-파클리탁셀, 독소루비신 및 시클로포스파미드를 이용한 치료와 비교하여, pCR을 경험할 개체의 가능성을 증가시킨다.
다른 양상에서, 개체에서 eTNBC의 치료를 위한 약제의 제조에서 아테졸리주맙을 포함하는 약학적 조성물의 용도가 본원에서 제공되는데, 상기 치료는 아테졸리주맙, 파클리탁셀, 독소루비신 또는 에피루비신, 그리고 시클로포스파미드의 효과량을 포함하는 치료 섭생을 개체에게 투여하는 단계를 포함하되, 상기 치료 섭생이 보조 요법이고, 그리고 (i) 약 12 주 동안 2 주마다 약 840 mg의 아테졸리주맙 및 매주 약 80 mg/m2 파클리탁셀을 개체의 정맥내에 투여하는 것을 포함하는 일차 투약 주기; 그 이후에 (ii) 약 8 주 동안 2 주마다 약 840 mg의 아테졸리주맙, 약 60 mg/m2 독소루비신 또는 약 90 mg/m2 에피루비신, 그리고 약 600 mg/m2 시클로포스파미드를 개체의 정맥내에 투여하는 것을 포함하는 이차 투약 주기; 그 이후에 (iii) 3 주마다 약 1200 mg의 아테졸리주맙을 개체의 정맥내에 투여하는 것을 포함하는 유지기를 포함하며, 그리고 상기 치료 섭생이 아테졸리주맙 없이 파클리탁셀, 독소루비신 또는 에피루비신, 그리고 시클로포스파미드를 이용한 치료와 비교하여, 개체의 침습성 질환 없는 생존 (iDFS)를 효과적으로 연장한다.
일부 양상에서, 치료 섭생은 G-CSF 및/또는 GM-CSF (예를 들면, 필그라스팀 및/또는 페그필그라스팀)의 효과량을 개체에게 투여하는 단계를 포함할 수 있다.
PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및/또는 알킬화제 (예를 들면, 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드))의 효과량이 질환의 예방 또는 치료를 위해 투여될 수 있다. PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및/또는 알킬화제 (예를 들면, 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드))의 적절한 용량은 치료되는 질환의 유형, PD-1 축 결합 길항제 및 탁산의 유형, 질환의 중증도와 경과, 개체의 임상적 상태, 개체의 임상 병력 및 치료에 대한 반응, 그리고 주치의의 재량에 근거하여 결정될 수 있다.
암 (예를 들면, 유방암, 예를 들면, TNBC, 예를 들면, eTNBC)의 예방 또는 치료를 위해, 본원에서 설명된 PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, PD-L1 결합 길항제, 예를 들면, 항-PD-L1 항체, 예를 들면, 아테졸리주맙) (단독으로 이용되거나 또는 하나 이상의 다른 추가 치료제(들)와 병용될 때)의 적절한 용량은 치료되는 질환의 유형, 질환의 중증도와 경과, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, PD-L1 결합 길항제, 예를 들면, 항-PD-L1 항체, 예를 들면, 아테졸리주맙)가 예방적 또는 치료적 목적으로 투여되는지의 여부, 선행 요법, 환자의 임상 병력 및 PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, PD-L1 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체, 예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 PD-1 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-1 항체))에 대한 반응, 그리고 주치의의 재량에 의존할 것이다. PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, PD-L1 결합 길항제, 예를 들면, 항-PD-L1 항체, 예를 들면, 아테졸리주맙)는 한꺼번에 또는 일련의 치료에 걸쳐 적절하게 환자에게 투여된다. 한 가지 전형적인 일일량은 전술된 인자에 따라서, 약 1 μg/kg 내지 100 mg/kg 이상의 범위일 수도 있다. 수일 이상에 걸쳐 반복된 투여의 경우에, 상태에 따라서, 치료는 일반적으로, 질환 증상의 원하는 억제가 발생할 때까지 지속될 것이다. 이런 용량은 간헐적으로, 예를 들면, 매주 또는 3 주마다 (예를 들면, 환자가 예를 들면, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, PD-L1 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체, 예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 PD-1 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-1 항체)))의 약 2 내지 약 20회, 또는 예를 들면, 약 6회 분량을 제공받도록) 투여될 수 있다. 초기 더 높은 부하 용량, 그 이후에 1회 이상의 더 낮은 용량이 투여될 수 있다. 하지만, 다른 투약 섭생이 유용할 수도 있다. 이러한 요법의 진행은 전통적인 기술과 검정에 의해 쉽게 모니터링된다.
일부 사례에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, PD-L1 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체, 예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 PD-1 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-1 항체))의 효과량은 약 60 mg 내지 약 5000 mg 사이 (예를 들면, 약 60 mg 내지 약 4500 mg 사이, 약 60 mg 내지 약 4000 mg 사이, 약 60 mg 내지 약 3500 mg 사이, 약 60 mg 내지 약 3000 mg 사이, 약 60 mg 내지 약 2500 mg 사이, 약 650 mg 내지 약 2000 mg 사이, 약 60 mg 내지 약 1500 mg 사이, 약 100 mg 내지 약 1500 mg 사이, 약 300 mg 내지 약 1500 mg 사이, 약 500 mg 내지 약 1500 mg 사이, 약 700 mg 내지 약 1500 mg 사이, 약 1000 mg 내지 약 1500 mg 사이, 약 1000 mg 내지 약 1400 mg 사이, 약 1100 mg 내지 약 1300 mg 사이, 약 1150 mg 내지 약 1250 mg 사이, 약 1175 mg 내지 약 1225 mg 사이, 또는 약 1190 mg 내지 약 1210 mg 사이, 예를 들면, 약 1200 mg ± 5 mg, 약 1200 ± 2.5 mg, 약 1200 ± 1.0 mg, 약 1200 ± 0.5 mg, 약 1200 ± 0.2 mg, 또는 약 1200 ± 0.1 mg)일 수 있다. 일부 사례에서, 상기 방법은 PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, PD-L1 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체, 예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 PD-1 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-1 항체))를 약 1200 mg (예를 들면, 약 1200 mg 또는 약 15 mg/kg의 고정된 용량)으로 개체에게 투여하는 단계를 포함한다.
일부 사례에서, 개체 (예를 들면, 인간)에게 투여되는 PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, PD-L1 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체, 예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 PD-1 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-1 항체))의 양은 약 0.01 내지 약 50 mg/개체의 체중의 kg (예를 들면, 약 0.01 내지 약 45 mg/kg 사이, 약 0.01 mg/kg 내지 약 40 mg/kg 사이, 약 0.01 mg/kg 내지 약 35 mg/kg 사이, 약 0.01 mg/kg 내지 약 30 mg/kg 사이, 약 0.1 mg/kg 내지 약 30 mg/kg 사이, 약 1 mg/kg 내지 약 30 mg/kg 사이, 약 2 mg/kg 내지 약 30 mg/kg 사이, 약 5 mg/kg 내지 약 30 mg/kg 사이, 약 5 mg/kg 내지 약 25 mg/kg 사이, 약 5 mg/kg 내지 약 20 mg/kg 사이, 약 10 mg/kg 내지 약 20 mg/kg 사이, 또는 약 12 mg/kg 내지 약 18 mg/kg 사이, 예를 들면, 약 15 ± 2 mg/kg, 약 15 ± 1 mg/kg, 약 15 ± 0.5 mg/kg, 약 15 ± 0.2 mg/kg, 또는 약 15 ± 0.1 mg/kg)의 범위 안에 있을 수 있다. 일부 사례에서, 상기 방법은 PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, PD-L1 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체, 예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 PD-1 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-1 항체))를 약 15 mg/kg으로 개체에게 투여하는 단계를 포함한다.
일부 사례에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, PD-L1 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체, 예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 PD-1 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-1 항체))는 3 주마다 (q3w) 1200 mg으로 개체 (예를 들면, 인간)에게 정맥내 투여된다. 용량은 단회 용량으로서, 또는 복수 용량 (예를 들면, 2, 3, 4, 5, 6, 7회, 또는 7회 초과의 용량), 예컨대 주입으로서 투여될 수 있다.
일부 사례에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, PD-L1 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체, 예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 PD-1 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-1 항체))는 2 주마다 약 840 mg의 용량으로 예를 들면, 정맥내 투여될 수 있다.
일부 사례에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, PD-L1 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체, 예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 PD-1 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-1 항체))는 3 주마다 약 1200 mg의 용량으로 예를 들면, 정맥내 투여될 수 있다.
일부 사례에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, PD-L1 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체, 예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 PD-1 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-1 항체))는 4 주마다 약 1680 mg의 용량으로 예를 들면, 정맥내 투여될 수 있다.
일부 사례에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, PD-L1 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체, 예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 PD-1 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-1 항체))는 60 분에 걸쳐 정맥내 (예를 들면, 주입에 의해) 투여될 수 있다. 일부 사례에서, 예를 들면, 만약 첫 번째 용량이 내약성이면, 후속 용량이 30 분에 걸쳐 정맥내 (예를 들면, 주입에 의해) 투여될 수 있다.
일부 사례에서, 아테졸리주맙은 2 주마다 약 840 mg의 용량으로 정맥내 투여될 수 있다.
일부 사례에서, 아테졸리주맙은 3 주마다 약 1200 mg의 용량으로 정맥내 투여될 수 있다.
일부 사례에서, 아테졸리주맙은 4 주마다 약 1680 mg의 용량으로 예를 들면, 정맥내 투여될 수 있다.
일부 사례에서, 아테졸리주맙은 2 주마다 840 mg의 용량으로 정맥내 투여될 수 있다.
일부 사례에서, 아테졸리주맙은 3 주마다 1200 mg의 용량으로 정맥내 투여될 수 있다.
일부 사례에서, 아테졸리주맙은 4 주마다 1680 mg의 용량으로 예를 들면, 정맥내 투여될 수 있다.
아테졸리주맙은 60 분에 걸쳐 정맥내 (예를 들면, 주입에 의해) 투여될 수 있다. 일부 사례에서, 예를 들면, 만약 첫 번째 용량이 내약성이면, 아테졸리주맙의 후속 용량이 30 분에 걸쳐 정맥내 (예를 들면, 주입에 의해) 투여될 수 있다.
병용 치료에서 투여되는 항체의 용량은 단일 치료와 비교하여 감소될 수 있다. 이러한 요법의 진행은 전통적인 기술에 의해 쉽게 모니터링된다. 한 가지 사례에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, PD-L1 결합 길항제, 예를 들면, 항-PD-L1 항체, 예를 들면, 아테졸리주맙)는 암을 치료하기 위한 단일요법으로서 개체에게 투여된다. 다른 사례에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, PD-L1 결합 길항제, 예를 들면, 항-PD-L1 항체, 예를 들면, 아테졸리주맙)는 암을 치료하기 위한, 본원에서 설명된 바와 같은 병용 요법으로서 개체에게 투여된다.
일부 양상에서, 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀, 파클리탁셀, 또는 도세탁셀)의 효과량이 개체에게 투여된다. 탁산은 임의의 적합한 용량으로 투여될 수 있다. 일반 명제로서, 인간에게 투여되는 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀)의 치료 효과량은 1회 이상의 투여에 의하는지의 여부와 상관없이, 약 25 내지 약 300 mg/m2의 범위 안에 있을 것이다 (예를 들면, 약 25 mg/m2, 약 50 mg/m2, 약 75 mg/m2, 약 100 mg/m2, 약 125 mg/m2, 약 150 mg/m2, 약 175 mg/m2, 약 200 mg/m2, 약 225 mg/m2, 약 250 mg/m2, 약 275 mg/m2, 또는 약 300 mg/m2). 일부 양상에서, 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀)은 예를 들면, 주 1회, 2 주마다, 3 주마다, 4 주마다, 각 21-일 주기의 1, 8 및 15일 자에, 또는 각 28-일 주기의 1, 8 및 15일 자에 투여될 수 있다.
일부 양상에서, 탁산은 냅-파클리탁셀이다. 일부 양상에서, 냅-파클리탁셀은 매주 약 50 mg/m2 내지 약 200 mg/m2의 용량으로 개체에게 투여된다. 예를 들면, 일부 양상에서, 약 100 mg/m2의 냅-파클리탁셀이 투여된다. 일부 양상에서, 냅-파클리탁셀은 매주 약 100 mg/m2의 용량으로 개체에게 투여된다. 다른 양상에서, 약 125 mg/m2의 냅-파클리탁셀이 투여된다. 일부 양상에서, 냅-파클리탁셀은 매주 약 125 mg/m2의 용량으로 개체에게 투여된다. 특정한 양상에서, 냅-파클리탁셀은 매주 약 125 mg/m2의 용량으로 투여될 수 있다. 일부 양상에서, 냅-파클리탁셀은 약 1 주, 약 2 주, 약 3 주, 약 4 주, 약 5 주, 약 6 주, 약 7 주, 약 8 주, 약 9 주, 약 10 주, 약 11 주, 약 12 주, 약 13 주, 약 14 주, 약 15 주, 약 16 주, 약 17 주, 약 18 주, 약 19 주, 약 20 주, 약 21 주, 약 22 주, 약 23 주, 약 24 주, 또는 그 초과 동안 매주 약 125 mg/m2의 용량으로 투여될 수 있다. 특정한 양상에서, 냅-파클리탁셀은 약 12 주 동안 매주 약 125 mg/m2의 용량으로 투여될 수 있다.
다른 양상에서, 탁산은 파클리탁셀이다. 일부 양상에서, 파클리탁셀은 매주 약 40 mg/m2 내지 약 200 mg/m2의 용량으로 개체에게 투여된다. 일부 양상에서, 파클리탁셀은 약 80 mg/m2의 용량으로 개체에게 투여된다. 일부 양상에서, 파클리탁셀은 매주 약 80 mg/m2의 용량으로 개체에게 투여된다. 다른 양상에서, 파클리탁셀은 100 mg/m2으로 투여된다. 다른 양상에서, 파클리탁셀은 약 125 mg/m2의 용량으로 개체에게 투여된다. 일부 양상에서, 파클리탁셀은 약 1 주, 약 2 주, 약 3 주, 약 4 주, 약 5 주, 약 6 주, 약 7 주, 약 8 주, 약 9 주, 약 10 주, 약 11 주, 약 12 주, 약 13 주, 약 14 주, 약 15 주, 약 16 주, 약 17 주, 약 18 주, 약 19 주, 약 20 주, 약 21 주, 약 22 주, 약 23 주, 약 24 주, 또는 그 초과 동안 매주 약 80 mg/m2의 용량으로 투여될 수 있다. 특정한 양상에서, 파클리탁셀은 약 12 주 동안 매주 약 80 mg/m2의 용량으로 투여될 수 있다.
일부 양상에서, 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신)의 효과량이 개체에게 투여된다. 안트라사이클린은 임의의 적합한 용량으로 투여될 수 있다. 예를 들면, 안트라사이클린은 약 1 mg/m2 내지 약 200 mg/m2 사이의 용량, 예를 들면, 약 1 mg/m2, 약 5 mg/m2, 약 10 mg/m2, 약 15 mg/m2, 약 20 mg/m2, 약 25 mg/m2, 약 30 mg/m2, 약 35 mg/m2, 약 40 mg/m2, 약 45 mg/m2, 약 50 mg/m2, 약 55 mg/m2, 약 60 mg/m2, 약 65 mg/m2, 약 70 mg/m2, 약 75 mg/m2, 약 80 mg/m2, 약 85 mg/m2, 약 90 mg/m2, 약 95 mg/m2, 약 100 mg/m2, 약 105 mg/m2, 약 110 mg/m2, 약 115 mg/m2, 약 120 mg/m2, 약 125 mg/m2, 약 130 mg/m2, 약 135 mg/m2, 약 140 mg/m2, 약 145 mg/m2, 약 150 mg/m2, 약 155 mg/m2, 약 160 mg/m2, 약 165 mg/m2, 약 170 mg/m2, 약 175 mg/m2, 약 180 mg/m2, 약 185 mg/m2, 약 190 mg/m2, 약 195 mg/m2, 또는 약 200 mg/m2으로 투여될 수 있다. 일부 양상에서, 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신)은 매주, 2 주마다, 3 주마다, 또는 4 주마다 개체에게 투여된다. 특정한 양상에서, 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신)은 2 주마다 약 60 mg/m2의 용량으로 투여된다. 일부 양상에서, 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신)은 약 4 주, 약 5 주, 약 6 주, 약 7 주, 약 8 주, 약 9 주, 약 10 주, 약 11 주, 약 12 주, 약 13 주, 약 14 주, 약 15 주, 약 16 주, 약 17 주, 약 18 주, 약 19 주, 약 20 주, 약 21 주, 약 22 주, 약 23 주, 약 24 주, 또는 그 초과 동안 2 주마다 약 60 mg/m2 의 용량으로 투여된다. 일부 양상에서, 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신)은 약 8 주 동안 2 주마다 약 60 mg/m2의 용량으로 투여된다. 다른 특정한 양상에서, 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신)은 2 주마다 약 90 mg/m2의 용량으로 투여된다. 일부 양상에서, 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신)은 약 4 주, 약 5 주, 약 6 주, 약 7 주, 약 8 주, 약 9 주, 약 10 주, 약 11 주, 약 12 주, 약 13 주, 약 14 주, 약 15 주, 약 16 주, 약 17 주, 약 18 주, 약 19 주, 약 20 주, 약 21 주, 약 22 주, 약 23 주, 약 24 주, 또는 그 초과 동안 2 주마다 약 90 mg/m2 의 용량으로 투여된다. 일부 양상에서, 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신)은 약 8 주 동안 2 주마다 약 90 mg/m2의 용량으로 투여된다.
예를 들면, 일부 양상에서, 독소루비신은 약 4 주, 약 5 주, 약 6 주, 약 7 주, 약 8 주, 약 9 주, 약 10 주, 약 11 주, 약 12 주, 약 13 주, 약 14 주, 약 15 주, 약 16 주, 약 17 주, 약 18 주, 약 19 주, 약 20 주, 약 21 주, 약 22 주, 약 23 주, 약 24 주, 또는 그 초과 동안 2 주마다 약 60 mg/m2 의 용량으로 투여된다. 일부 양상에서, 독소루비신은 약 8 주 동안 2 주마다 약 60 mg/m2의 용량으로 투여된다.
다른 실례에서, 일부 양상에서, 에피루비신은 약 4 주, 약 5 주, 약 6 주, 약 7 주, 약 8 주, 약 9 주, 약 10 주, 약 11 주, 약 12 주, 약 13 주, 약 14 주, 약 15 주, 약 16 주, 약 17 주, 약 18 주, 약 19 주, 약 20 주, 약 21 주, 약 22 주, 약 23 주, 약 24 주, 또는 그 초과 동안 2 주마다 약 90 mg/m2 의 용량으로 투여된다. 일부 양상에서, 에피루비신은 약 8 주 동안 2 주마다 약 90 mg/m2의 용량으로 투여된다.
일부 양상에서, 알킬화제 (예를 들면, 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드))의 효과량이 개체에게 투여된다. 알킬화제는 임의의 적합한 용량으로 투여될 수 있다. 예를 들면, 알킬화제는 약 1 mg/m2 내지 약 2000 mg/m2 사이, 예를 들면, 약 1 mg/m2, 약 50 mg/m2, 약 100 mg/m2, 약 150 mg/m2, 약 200 mg/m2, 약 250 mg/m2, 약 300 mg/m2, 약 350 mg/m2, 약 400 mg/m2, 약 450 mg/m2, 약 500 mg/m2, 약 550 mg/m2, 약 600 mg/m2, 약 650 mg/m2, 약 700 mg/m2, 약 750 mg/m2, 약 800 mg/m2, 약 850 mg/m2, 약 900 mg/m2, 약 950 mg/m2, 약 1000 mg/m2, 약 1050 mg/m2, 약 1100 mg/m2, 약 1150 mg/m2, 약 1200 mg/m2, 약 1250 mg/m2, 약 1300 mg/m2, 약 1350 mg/m2, 약 1400 mg/m2, 약 1450 mg/m2, 약 1500 mg/m2, 약 1550 mg/m2, 약 1600 mg/m2, 약 1650 mg/m2, 약 1700 mg/m2, 약 1750 mg/m2, 약 1800 mg/m2, 약 1850 mg/m2, 약 1900 mg/m2, 약 1950 mg/m2, 또는 약 2000 mg/m2의 용량으로 투여될 수 있다. 일부 양상에서, 알킬화제 (예를 들면, 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드))는 매주, 2 주마다, 3 주마다, 또는 4 주마다 개체에게 투여된다. 일부 양상에서, 알킬화제 (예를 들면, 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드))는 약 4 주, 약 5 주, 약 6 주, 약 7 주, 약 8 주, 약 9 주, 약 10 주, 약 11 주, 약 12 주, 약 13 주, 약 14 주, 약 15 주, 약 16 주, 약 17 주, 약 18 주, 약 19 주, 약 20 주, 약 21 주, 약 22 주, 약 23 주, 약 24 주, 또는 그 초과 동안 2 주마다 약 600 mg/m2 의 용량으로 투여된다. 일부 양상에서, 알킬화제 (예를 들면, 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드))는 약 8 주 동안 2 주마다 동안 2 주마다 약 600 mg/m2의 용량으로 투여된다.
일부 양상에서, 본원 발명의 병용 요법은 PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)의 투여를 포함한다. PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및/또는 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 당해 분야에서 공지된 임의의 적합한 방식으로 투여될 수 있다. 예를 들면, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및/또는 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 순차적으로 (상이한 시점에서) 또는 동시에 (동일한 시점에서) 투여될 수 있다. 일부 양상에서, 각 작용제는 별개의 조성물 내에 있다. 예를 들면, 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체)는 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및/또는 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)와 별개의 조성물 내에 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체)는 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및/또는 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)와 동일한 조성물 내에 있다.
PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및/또는 알킬화제 (예를 들면, 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드))는 동일한 투여 루트에 의해 또는 상이한 투여 루트에 의해 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체)는 정맥내, 근육내, 피하, 국소, 경구, 경피, 복막내, 안와내, 이식에 의해, 흡입에 의해, 척수강내, 심실내, 또는 비내 투여된다. 일부 양상에서, 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀)은 정맥내, 근육내, 피하, 국소, 경구, 경피, 복막내, 안와내, 이식에 의해, 흡입에 의해, 척수강내, 심실내, 또는 비내 투여된다. 일부 양상에서, 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신)은 정맥내, 근육내, 피하, 국소, 경구, 경피, 복막내, 안와내, 이식에 의해, 흡입에 의해, 척수강내, 심실내, 또는 비내 투여된다. 일부 양상에서, 알킬화제 (예를 들면, 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드))는 정맥내, 근육내, 피하, 국소, 경구, 경피, 복막내, 안와내, 이식에 의해, 흡입에 의해, 척수강내, 심실내, 또는 비내 투여된다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드))는 정맥내 투여된다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및/또는 알킬화제 (예를 들면, 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드))는 주입에 의해 정맥내 투여된다.
일부 양상에서, 이들 방법은 추가 요법을 더욱 포함할 수 있다. 추가 요법은 방사선요법, 수술 (예를 들면, 종괴절제술 및 유방절제술), 화학요법, 유전자 요법, DNA 요법, 바이러스 요법, RNA 요법, 면역요법, 골수 이식, 나노요법, 단일클론 항체 요법, 또는 전술된 것들의 병용일 수 있다. 추가 요법은 보조 또는 신보조 요법의 형태일 수 있다. 일부 양상에서, 추가 요법은 소형 분자 효소 저해제 또는 항전이 작용제의 투여이다. 일부 양상에서, 추가 요법은 부작용 제한 작용제 (예를 들면, 치료의 부작용의 발생 및/또는 심각도를 줄이도록 의도된 작용제, 예컨대 항메스꺼움 작용제 등)의 투여이다. 일부 양상에서, 추가 요법은 방사선요법이다. 일부 양상에서, 추가 요법은 수술이다. 일부 양상에서, 추가 요법은 방사선요법 및 수술의 병용이다. 일부 양상에서, 추가 요법은 감마선 조사이다. 일부 양상에서, 추가 요법은 PI3K/AKT/mTOR 경로를 표적으로 하는 요법, HSP90 저해제, 튜불린 저해제, 아폽토시스 저해제 및/또는 화학예방성 작용제이다. 추가 요법은 본원에서 설명된 화학요법제 중에서 한 가지 이상일 수 있다. 추가 요법은 G-CSF 및/또는 GM-CSF (예를 들면, 필그라스팀 및/또는 페그필그라스팀)를 포함할 수 있다.
일부 양상에서, 개체로부터 획득된 종양 샘플은 이러한 종양 샘플의 약 1% 이상 (예를 들면, 약 1% 이상, 2% 이상, 3% 이상, 5% 이상, 6% 이상, 7% 이상, 8% 이상, 9% 이상, 10% 이상, 11% 이상, 12% 이상, 13% 이상, 14% 이상, 15% 이상, 16% 이상, 17% 이상, 18% 이상, 19% 이상, 20% 이상, 21% 이상, 22% 이상, 23% 이상, 24% 이상, 25% 이상, 26% 이상, 27% 이상, 28% 이상, 29% 이상, 30% 이상, 31% 이상, 32% 이상, 33% 이상, 34% 이상, 35% 이상, 36% 이상, 37% 이상, 38% 이상, 39% 이상, 40% 이상, 41% 이상, 42% 이상, 43% 이상, 44% 이상, 45% 이상, 46% 이상, 47% 이상, 48% 이상, 49% 이상, 약 50% 이상, 약 60% 이상, 약 70% 이상, 약 80% 이상, 약 90% 이상, 약 95% 이상, 약 96% 이상, 약 97% 이상, 약 98% 이상, 약 99% 이상, 또는 100%)을 구성하는 종양 침윤 면역 세포에서 PD-L1의 검출가능 발현 수준을 갖는 것으로 결정되었다. 예를 들면, 일부 양상에서, 개체로부터 획득된 종양 샘플은 이러한 종양 샘플의 약 1% 내지 약 5% 미만 (예를 들면, 1% 내지 4.9%, 1% 내지 4.5%, 1% 내지 4%, 1% 내지 3.5%, 1% 내지 3%, 1% 내지 2.5%, 또는 1% 내지 2%)을 구성하는 종양 침윤 면역 세포에서 PD-L1의 검출가능 발현 수준을 갖는 것으로 결정되었다.
일부 양상에서, 개체로부터 획득된 종양 샘플은 이러한 종양 샘플 내에 종양 침윤 면역 세포 중 약 1% 이상 (예를 들면, 약 1% 이상, 2% 이상, 3% 이상, 5% 이상, 6% 이상, 7% 이상, 8% 이상, 9% 이상, 10% 이상, 11% 이상, 12% 이상, 13% 이상, 14% 이상, 15% 이상, 16% 이상, 17% 이상, 18% 이상, 19% 이상, 20% 이상, 21% 이상, 22% 이상, 23% 이상, 24% 이상, 25% 이상, 26% 이상, 27% 이상, 28% 이상, 29% 이상, 30% 이상, 31% 이상, 32% 이상, 33% 이상, 34% 이상, 35% 이상, 36% 이상, 37% 이상, 38% 이상, 39% 이상, 40% 이상, 41% 이상, 42% 이상, 43% 이상, 44% 이상, 45% 이상, 46% 이상, 47% 이상, 48% 이상, 49% 이상, 약 50% 이상, 약 60% 이상, 약 70% 이상, 약 80% 이상, 약 90% 이상, 약 95% 이상, 약 96% 이상, 약 97% 이상, 약 98% 이상, 약 99% 이상, 또는 100%)에서 PD-L1의 검출가능 발현 수준을 갖는 것으로 결정되었다. 예를 들면, 일부 양상에서, 개체로부터 획득된 종양 샘플은 이러한 종양 샘플 내에 종양 침윤 면역 세포 중 약 1% 내지 약 5% 미만 (예를 들면, 1% 내지 4.9%, 1% 내지 4.5%, 1% 내지 4%, 1% 내지 3.5%, 1% 내지 3%, 1% 내지 2.5%, 또는 1% 내지 2%)에서 PD-L1의 검출가능 발현 수준을 갖는 것으로 결정되었다.
다른 양상에서, 개체로부터 획득된 종양 샘플은 이러한 종양 샘플의 약 5% 이상을 구성하는 종양 침윤 면역 세포에서 PD-L1의 검출가능 발현 수준을 갖는 것으로 결정되었다. 예를 들면, 일부 양상에서, 개체로부터 획득된 종양 샘플은 이러한 종양 샘플의 약 5% 내지 약 10% 미만 (예를 들면, 5% 내지 9.5%, 5% 내지 9%, 5% 내지 8.5%, 5% 내지 8%, 5% 내지 7.5%, 5% 내지 7%, 5% 내지 6.5%, 5% 내지 6%, 5% 내지 5.5%, 6% 내지 9.5%, 6% 내지 9%, 6% 내지 8.5%, 6% 내지 8%, 6% 내지 7.5%, 6% 내지 7%, 6% 내지 6.5%, 7% 내지 9.5%, 7% 내지 9%, 7% 내지 7.5%, 8% 내지 9.5%, 8% 내지 9%, 또는 8% 내지 8.5%)을 구성하는 종양 침윤 면역 세포에서 PD-L1의 검출가능 발현 수준을 갖는 것으로 결정되거나 또는 결정되었다.
또 다른 양상에서, 개체로부터 획득된 종양 샘플은 이러한 종양 샘플 내에 종양 침윤 면역 세포 중 약 5% 이상에서 PD-L1의 검출가능 발현 수준을 갖는 것으로 결정되었다. 예를 들면, 일부 양상에서, 개체로부터 획득된 종양 샘플은 이러한 종양 샘플 내에 종양 침윤 면역 세포 중 약 5% 내지 약 10% 미만 (예를 들면, 5% 내지 9.5%, 5% 내지 9%, 5% 내지 8.5%, 5% 내지 8%, 5% 내지 7.5%, 5% 내지 7%, 5% 내지 6.5%, 5% 내지 6%, 5% 내지 5.5%, 6% 내지 9.5%, 6% 내지 9%, 6% 내지 8.5%, 6% 내지 8%, 6% 내지 7.5%, 6% 내지 7%, 6% 내지 6.5%, 7% 내지 9.5%, 7% 내지 9%, 7% 내지 7.5%, 8% 내지 9.5%, 8% 내지 9%, 또는 8% 내지 8.5%)에서 PD-L1의 검출가능 발현 수준을 갖는 것으로 결정되었다.
다른 추가의 양상에서, 개체로부터 획득된 종양 샘플은 이러한 종양 샘플의 약 10% 이상 (예를 들면, 10% 이상, 11% 이상, 12% 이상, 13% 이상, 14% 이상, 15% 이상, 16% 이상, 17% 이상, 18% 이상, 19% 이상, 20% 이상, 21% 이상, 22% 이상, 23% 이상, 24% 이상, 25% 이상, 26% 이상, 27% 이상, 28% 이상, 29% 이상, 30% 이상, 31% 이상, 32% 이상, 33% 이상, 34% 이상, 35% 이상, 36% 이상, 37% 이상, 38% 이상, 39% 이상, 40% 이상, 41% 이상, 42% 이상, 43% 이상, 44% 이상, 45% 이상, 46% 이상, 47% 이상, 48% 이상, 49% 이상, 50% 이상, 60% 이상, 70% 이상, 80% 이상, 90% 이상, 95% 이상, 96% 이상, 97% 이상, 98% 이상, 99% 이상, 또는 100%)을 구성하는 종양 침윤 면역 세포에서 PD-L1의 검출가능 발현 수준을 갖는 것으로 결정되었다.
다른 추가의 양상에서, 개체로부터 획득된 종양 샘플은 이러한 종양 샘플 내에 종양 침윤 면역 세포 중 약 10% 이상 (예를 들면, 10% 이상, 11% 이상, 12% 이상, 13% 이상, 14% 이상, 15% 이상, 16% 이상, 17% 이상, 18% 이상, 19% 이상, 20% 이상, 21% 이상, 22% 이상, 23% 이상, 24% 이상, 25% 이상, 26% 이상, 27% 이상, 28% 이상, 29% 이상, 30% 이상, 31% 이상, 32% 이상, 33% 이상, 34% 이상, 35% 이상, 36% 이상, 37% 이상, 38% 이상, 39% 이상, 40% 이상, 41% 이상, 42% 이상, 43% 이상, 44% 이상, 45% 이상, 46% 이상, 47% 이상, 48% 이상, 49% 이상, 50% 이상, 60% 이상, 70% 이상, 80% 이상, 90% 이상, 95% 이상, 96% 이상, 97% 이상, 98% 이상, 99% 이상, 또는 100%)에서 PD-L1의 검출가능 발현 수준을 갖는 것으로 결정되었다.
또 다른 양상에서, 개체로부터 획득된 종양 샘플은 이러한 종양 샘플 내에 종양 세포 중 약 50% 이상 (예를 들면, 약 50% 이상, 51% 이상, 52% 이상, 53% 이상, 54% 이상, 55% 이상, 56% 이상, 57% 이상, 58% 이상, 59% 이상, 60% 이상, 61% 이상, 62% 이상, 63% 이상, 64% 이상, 65% 이상, 66% 이상, 67% 이상, 68% 이상, 69% 이상, 70% 이상, 71% 이상, 72% 이상, 73% 이상, 74% 이상, 75% 이상, 76% 이상, 77% 이상, 78% 이상, 79% 이상, 80% 이상, 81% 이상, 82% 이상, 83% 이상, 84% 이상, 85% 이상, 86% 이상, 87% 이상, 88% 이상, 89% 이상, 90% 이상, 91% 이상, 92% 이상, 93% 이상, 94% 이상, 95% 이상, 96% 이상, 97% 이상, 98% 이상, 또는 99% 이상)에서 PD-L1의 검출가능 발현 수준 및/또는 이러한 종양 샘플의 약 10% 이상 (예를 들면, 10% 이상, 11% 이상, 12% 이상, 13% 이상, 14% 이상, 15% 이상, 16% 이상, 17% 이상, 18% 이상, 19% 이상, 20% 이상, 21% 이상, 22% 이상, 23% 이상, 24% 이상, 25% 이상, 26% 이상, 27% 이상, 28% 이상, 29% 이상, 30% 이상, 31% 이상, 32% 이상, 33% 이상, 34% 이상, 35% 이상, 36% 이상, 37% 이상, 38% 이상, 39% 이상, 40% 이상, 41% 이상, 42% 이상, 43% 이상, 44% 이상, 45% 이상, 46% 이상, 47% 이상, 48% 이상, 49% 이상, 50% 이상, 60% 이상, 70% 이상, 80% 이상, 90% 이상, 95% 이상, 96% 이상, 97% 이상, 98% 이상, 99% 이상, 또는 100%)을 구성하는 종양 침윤 면역 세포에서 PD-L1의 검출가능 발현 수준을 갖는 것으로 결정되었다.
임의의 선행하는 방법에서, 종양 샘플 내에서 종양 침윤 면역 세포가 차지하는 백분율은 예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, SP142 항체)를 이용한 IHC에 의해 사정될 때, 개체로부터 획득된 종양 샘플의 절편에서 종양 침윤 면역 세포에 의해 커버되는 종양 구역의 백분율의 관점에서일 수 있는 것으로 이해되어야 한다. 예를 들면, 실시예 1 (예를 들면, 표 4)을 참조한다.
일부 양상에서, 개체로부터 획득된 종양 샘플은 이러한 종양 샘플 내에 종양 세포 중 약 1% 이상 (예를 들면, 약 1% 이상, 2% 이상, 3% 이상, 5% 이상, 6% 이상, 7% 이상, 8% 이상, 9% 이상, 10% 이상, 11% 이상, 12% 이상, 13% 이상, 14% 이상, 15% 이상, 16% 이상, 17% 이상, 18% 이상, 19% 이상, 20% 이상, 21% 이상, 22% 이상, 23% 이상, 24% 이상, 25% 이상, 26% 이상, 27% 이상, 28% 이상, 29% 이상, 30% 이상, 31% 이상, 32% 이상, 33% 이상, 34% 이상, 35% 이상, 36% 이상, 37% 이상, 38% 이상, 39% 이상, 40% 이상, 41% 이상, 42% 이상, 43% 이상, 44% 이상, 45% 이상, 46% 이상, 47% 이상, 48% 이상, 49% 이상, 50% 이상, 51% 이상, 52% 이상, 53% 이상, 54% 이상, 55% 이상, 56% 이상, 57% 이상, 58% 이상, 59% 이상, 60% 이상, 61% 이상, 62% 이상, 63% 이상, 64% 이상, 65% 이상, 66% 이상, 67% 이상, 68% 이상, 69% 이상, 70% 이상, 71% 이상, 72% 이상, 73% 이상, 74% 이상, 75% 이상, 76% 이상, 77% 이상, 78% 이상, 79% 이상, 80% 이상, 81% 이상, 82% 이상, 83% 이상, 84% 이상, 85% 이상, 86% 이상, 87% 이상, 88% 이상, 89% 이상, 90% 이상, 91% 이상, 92% 이상, 93% 이상, 94% 이상, 95% 이상, 96% 이상, 97% 이상, 98% 이상, 또는 99% 이상)에서 PD-L1의 검출가능 발현 수준을 갖는 것으로 결정되었다. 예를 들면, 일부 양상에서, 개체로부터 획득된 종양 샘플은 이러한 종양 샘플 내에 종양 세포 중 약 1% 내지 약 5% 미만 (예를 들면, 1% 내지 4.9%, 1% 내지 4.5%, 1% 내지 4%, 1% 내지 3.5%, 1% 내지 3%, 1% 내지 2.5%, 또는 1% 내지 2%)에서 PD-L1의 검출가능 발현 수준을 갖는 것으로 결정되었다. 다른 양상에서, 개체로부터 획득된 종양 샘플은 이러한 종양 샘플 내에 종양 세포 중 약 1% 미만에서 PD-L1의 검출가능 발현 수준을 갖는 것으로 결정되었다.
다른 양상에서, 개체로부터 획득된 종양 샘플은 이러한 종양 샘플 내에 종양 세포 중 약 5% 이상에서 PD-L1의 검출가능 발현 수준을 갖는 것으로 결정되었다. 예를 들면, 일부 양상에서, 개체로부터 획득된 종양 샘플은 이러한 종양 샘플 내에 종양 세포 중 약 5% 내지 50% 미만 (예를 들면, 5% 내지 49.5%, 5% 내지 45%, 5% 내지 40%, 5% 내지 35%, 5% 내지 30%, 5% 내지 25%, 5% 내지 20%, 5% 내지 15%, 5% 내지 10%, 5% 내지 9%, 5% 내지 8%, 5% 내지 7%, 5% 내지 6%, 10% 내지 49.5%, 10% 내지 40%, 10% 내지 35%, 10% 내지 30%, 10% 내지 25%, 10% 내지 20%, 10% 내지 15%, 15% 내지 49.5%, 15% 내지 45%, 15% 내지 40%, 15% 내지 35%, 15% 내지 30%, 15% 내지 30%, 15% 내지 25%, 15% 내지 20%, 20% 내지 49.5%, 20% 내지 45%, 20% 내지 40%, 20% 내지 35%, 20% 내지 30%, 20% 내지 25%, 25% 내지 49.5%, 25% 내지 45%, 25% 내지 40%, 25% 내지 35%, 25% 내지 30%, 30% 내지 49.5%, 30% 내지 45%, 30% 내지 40%, 30% 내지 35%, 35% 내지 49.5%, 35% 내지 45%, 35% 내지 40%, 40% 내지 49.5%, 40% 내지 45%, 또는 45% 내지 49.5%)에서 PD-L1의 검출가능 발현 수준을 갖는 것으로 결정되었다.
또 다른 양상에서, 개체로부터 획득된 종양 샘플은 이러한 종양 샘플 내에 종양 세포 중 약 50% 이상 (예를 들면, 약 50% 이상, 51% 이상, 52% 이상, 53% 이상, 54% 이상, 55% 이상, 56% 이상, 57% 이상, 58% 이상, 59% 이상, 60% 이상, 61% 이상, 62% 이상, 63% 이상, 64% 이상, 65% 이상, 66% 이상, 67% 이상, 68% 이상, 69% 이상, 70% 이상, 71% 이상, 72% 이상, 73% 이상, 74% 이상, 75% 이상, 76% 이상, 77% 이상, 78% 이상, 79% 이상, 80% 이상, 81% 이상, 82% 이상, 83% 이상, 84% 이상, 85% 이상, 86% 이상, 87% 이상, 88% 이상, 89% 이상, 90% 이상, 91% 이상, 92% 이상, 93% 이상, 94% 이상, 95% 이상, 96% 이상, 97% 이상, 98% 이상, 또는 99% 이상)에서 PD-L1의 검출가능 발현 수준을 갖는 것으로 결정되었다. 일부 양상에서, 개체로부터 획득된 종양 샘플은 이러한 종양 샘플 내에 종양 세포 중 약 50% 내지 약 99% (예를 들면, 50% 내지 99%, 50% 내지 95%, 50% 내지 90%, 50% 내지 85%, 50% 내지 80%, 50% 내지 75%, 50% 내지 70%, 50% 내지 65%, 50% 내지 60%, 50% 내지 55%, 55% 내지 99%, 55% 내지 95%, 55% 내지 90%, 55% 내지 85%, 55% 내지 80%, 55% 내지 75%, 55% 내지 70%, 55% 내지 65%, 55% 내지 60%, 60% 내지 99%, 60% 내지 95%, 60% 내지 90%, 60% 내지 85%, 60% 내지 80%, 60% 내지 75%, 60% 내지 70%, 60% 내지 65%, 65% 내지 99%, 65% 내지 95%, 65% 내지 90%, 65% 내지 85%, 65% 내지 80%, 65% 내지 75%, 65% 내지 70%, 70% 내지 99%, 70% 내지 95%, 70% 내지 90%, 70% 내지 85%, 70% 내지 80%, 70% 내지 75%, 75% 내지 99%, 75% 내지 95%, 75% 내지 90%, 75% 내지 85%, 75% 내지 80%, 80% 내지 99%, 80% 내지 95%, 80% 내지 90%, 80% 내지 85%, 85% 내지 99%, 85% 내지 95%, 85% 내지 90%, 90% 내지 99%, 또는 90% 내지 95%)에서 PD-L1의 검출가능 발현 수준을 갖는 것으로 결정되었다.
본원에서 설명된 임의의 방법은 PD-L1의 존재 및/또는 발현 수준을 결정하는 단계를 포함할 수 있다.
임의의 선행하는 양상 중 일부 양상에서, 종양 샘플은 포르말린 고정되고 파라핀 포매된 (FFPE) 종양 샘플, 과거 종양 샘플, 신선한 종양 샘플, 또는 동결된 종양 샘플이다.
본원에서 설명된 임의의 바이오마커 (예를 들면, PD-L1)의 존재 및/또는 발현 수준은 본원에서 설명된 임의의 방법을 이용하거나, 또는 당해 분야에서 공지된 접근법을 이용하여 결정될 수 있다.
전술된 임의의 바이오마커 (PD-L1 (예를 들면, 환자로부터 획득된 종양 샘플 내에 종양 침윤 면역 세포 (IC) 상에서 PD-L1 발현 및/또는 환자로부터 획득된 종양 샘플 내에 종양 세포 (TC) 상에서 PD-L1 발현) 포함)의 존재 및/또는 발현 수준은 DNA, mRNA, cDNA, 단백질, 단백질 단편 및/또는 유전자 사본수를 포함하지만 이들에 한정되지 않는, 당해 분야에서 공지된 임의의 적합한 기준에 근거하여 정성적으로 및/또는 정량적으로 사정될 수 있다. IHC, 웨스턴 블롯 분석, 면역침전, 분자 결합 검정, ELISA, ELIFA, 형광 활성화된 세포 분류 ("FACS"), MassARRAY, 단백질체학, 정량적 혈액 기반 검정 (예를 들면, 혈청 ELISA), 생화학적 효소 활성 검정, 제자리 혼성화 (ISH), 형광 제자리 혼성화 (FISH), 서던 분석, 노던 분석, 전체 유전체 염기서열분석, 정량적 실시간 PCR (qRT-PCR)을 비롯한 중합효소 연쇄 반응 (PCR) 및 다른 증폭 유형 검출 방법, 예컨대 예를 들면, 분지된 DNA, SISBA, TMA 등, RNASeq, 마이크로어레이 분석, 유전자 발현 프로파일링, 전체-유전체 염기서열분석 (WGS) 및/또는 유전자 발현의 연속 분석 ("SAGE")뿐만 아니라 단백질, 유전자 및/또는 조직 어레이 분석에 의해 수행될 수 있는 매우 다양한 검정 중에서 한 가지를 포함하지만 이들에 한정되지 않는, 이런 바이오마커를 계측하기 위한 방법론은 당해 분야에서 공지되고 당업자에 의해 이해된다. 유전자 및 유전자 산물의 상태를 평가하기 위한 전형적인 프로토콜은 예를 들면, Ausubel et al. eds. (Current Protocols In Molecular Biology, 1995), Units 2 (Northern Blotting), 4 (Southern Blotting), 15 (Immunoblotting) 및 18 (PCR Analysis)에서 발견된다. 다중화된 면역검정 예컨대 Rules Based Medicine 또는 Meso Scale Discovery ("MSD")로부터 가용한 것들 역시 이용될 수 있다.
일부 양상에서, 바이오마커의 발현 수준은 단백질 발현 수준일 수 있다. 일정한 양상에서, 상기 방법은 본원에서 설명된 바이오마커의 결합을 허용하는 조건하에 샘플을 상기 바이오마커에 특이적으로 결합하는 항체와 접촉시키는 단계, 그리고 복합체가 이들 항체 및 바이오마커 사이에 형성되는지를 검출하는 단계를 포함한다. 이런 방법은 시험관내 또는 생체내 방법일 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제, 예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체를 포함하는 항암 요법을 이용한 치료에 적격인 환자를 선택하는 데 항체, 예를 들면, 개체의 선택을 위한 바이오마커가 이용된다.
당해 분야에서 공지되거나 또는 본원에서 제공된 단백질 발현 수준을 계측하는 임의의 방법이 이용될 수 있다. 예를 들면, 일부 양상에서, 바이오마커의 단백질 발현 수준은 면역조직화학 (IHC), 유세포분석 (예를 들면, 형광 활성화 세포 분류 (FACS™)), 웨스턴 블롯, 효소 결합 면역흡착 검정 (ELISA), 면역침전, 면역형광, 방사면역검정, 도트 블로팅, 면역검출 방법, HPLC, 표면 플라스몬 공명, 광학적 분광법, 질량 분광분석법, 그리고 HPLC로 구성된 군에서 선택되는 방법을 이용하여 결정된다.
일부 양상에서, 바이오마커의 단백질 발현 수준은 종양 침윤 면역 세포에서 결정된다. 일부 양상에서, 바이오마커의 단백질 발현 수준은 종양 세포에서 결정된다. 일부 양상에서, 바이오마커의 단백질 발현 수준은 종양 침윤 면역 세포에서 및/또는 종양 세포에서 결정된다. 일부 양상에서, 바이오마커의 단백질 발현 수준은 말초혈 단핵 세포 (PBMC)에서 결정된다.
일정한 양상에서, 샘플 내에서 바이오마커 단백질의 존재 및/또는 발현 수준/양은 IHC 및 염색 프로토콜을 이용하여 조사된다. 조직 절편의 IHC 염색은 샘플 내에서 단백질의 존재를 결정하거나 또는 검출하는 신뢰성 있는 방법인 것으로 밝혀졌다. 임의의 방법, 검정 및/또는 키트의 일부 양상에서, 바이오마커는 PD-L1 또는 CD8의 단백질 발현 산물 중에서 한 가지 이상이다. 한 가지 양상에서, 바이오마커의 발현 수준은 (a) 항체를 이용하여 샘플 (예컨대 환자로부터 획득된 종양 샘플)의 IHC 분석을 수행하는 단계; 그리고 (b) 샘플 내에서 바이오마커의 발현 수준을 결정하는 단계를 포함하는 방법을 이용하여 결정된다. 일부 양상에서, IHC 염색 강도는 참조에 상대적으로 결정된다. 일부 구체예에서, 참조는 참조값이다. 일부 양상에서, 참조는 참조 샘플 (예를 들면, 대조 세포주 염색 샘플, 비암성 환자로부터 획득된 조직 샘플, 또는 관심되는 바이오마커에 대해 음성인 것으로 결정되는 종양 샘플)이다.
예를 들면, 일부 양상에서, PD-L1의 단백질 발현 수준은 IHC를 이용하여 결정된다. 일부 양상에서, PD-L1의 단백질 발현 수준은 항-PD-L1 항체를 이용하여 검출된다. 임의의 적합한 항-PD-L1 항체가 이용될 수 있다. 일부 양상에서, 항-PD-L1 항체는 SP142이다.
IHC는 추가 기술 예컨대 형태학적 염색 및/또는 제자리 혼성화 (예를 들면, ISH)와 조합으로 수행될 수 있다. IHC의 두 가지 일반적인 방법이 가용하다; 직접 검정 및 간접 검정. 첫 번째 검정에 따라서, 표적 항원에 대한 항체의 결합이 직접적으로 결정된다. 이러한 직접 검정은 추가 항체 상호작용 없이 가시화될 수 있는 표지화된 시약, 예컨대 형광 태그 또는 효소-표지화 일차 항체를 이용한다. 전형적인 간접 검정에서, 접합되지 않은 일차 항체가 항원에 결합하고, 그리고 이후 표지화된 이차 항체가 일차 항체에 결합한다. 이차 항체가 효소 표지에 접합되는 경우에, 항원의 가시화를 제공하기 위해 발색 또는 형광원 기질이 첨가된다. 여러 이차 항체가 일차 항체 상에서 상이한 에피토프와 반응할 수 있기 때문에, 신호 증폭이 발생한다.
IHC에 이용되는 일차 및/또는 이차 항체는 전형적으로, 검출가능 모이어티로 표지화될 것이다. 다양한 표지가 가용한데, 이들은 일반적으로 하기의 범주로 군화될 수 있다: (a) 방사성동위원소, 예컨대 35S, 14C, 125I, 3H 및 131I; (b) 콜로이드 금 입자; (c) 희토류 킬레이트 (유로퓸 킬레이트), 텍사스 레드, 로다민, 플루오레세인, 단실, 리사민, 움벨리페론, 피코크리테린, 피코시아닌, 또는 상업적으로-가용한 형광단 예컨대 SPECTRUM ORANGE7 및 SPECTRUM GREEN7 및/또는 전술한 것들 중에서 한 가지 이상의 유도체를 포함하지만 이들에 한정되지 않는 형광 표지; (d) 다양한 효소-기질 표지가 가용하고, 그리고 U.S. 특허 번호 4,275,149에서는 이들 중에서 일부에 관한 검토를 제공한다. 효소 표지의 실례는 루시페라아제 (예를 들면, 개똥벌레 루시페라아제 및 세균 루시페라아제; 참조: 예를 들면, U.S. 특허 번호 4,737,456), 루시페린, 2,3-디히드로프타라진디온, 말산 탈수소효소, 요소분해효소, 퍼옥시다아제 예컨대 양고추냉이 과산화효소 (HRPO), 알칼리 인산분해효소, β-갈락토시다아제, 글루코아밀라아제, 라이소자임, 당류 옥시다아제 (예를 들면, 글루코오스 옥시다아제, 갈락토오스 옥시다아제 및 글루코오스-6-인산염 탈수소효소), 헤테로환상 옥시다아제 (예컨대 요산분해효소 및 크산틴 옥시다아제), 락토퍼옥시다아제, 마이크로페록시다아제 등을 포함한다.
효소-기질 조합의 실례는 예를 들면, 기질로서 수소 퍼옥시다아제와 양고추냉이 과산화효소 (HRPO)의 조합; 발색 기질로서 파라-니트로페닐 인산염과 알칼리 인산분해효소 (AP)의 조합; 그리고 발색 기질 (예를 들면, p-니트로페닐-β-D-갈락토시다아제) 또는 형광원 기질 (예를 들면, 4-메틸움베릴페릴-β-D-갈락토시다아제)와 β-D-갈락토시다아제 (β-D-Gal)의 조합을 포함한다. 이들에 관한 전반적인 검토를 위해, 예를 들면, U.S. 특허 번호 4,275,149 및 4,318,980을 참조한다.
검체는 예를 들면, 수동으로, 또는 자동화 염색 기기 (예를 들면, Ventana BenchMark XT 또는 Benchmark ULTRA 기기)를 이용하여 준비될 수 있다. 이렇게 준비된 검체는 샘플고정되고 커버슬립될 수 있다. 슬라이드 평가가 이후, 예를 들면, 현미경을 이용하여 결정되고, 그리고 당해 분야에서 일과적으로 이용되는 염색 강도 기준이 이용될 수 있다. 한 가지 양상에서, 종양으로부터 획득된 세포 및/또는 조직이 IHC를 이용하여 조사될 때, 염색은 종양 세포(들) 및/또는 조직 (샘플 내에 존재할 수 있는 간질 또는 주변 조직과는 대조적으로)에서 결정되거나 또는 사정될 수 있는 것으로 이해되어야 한다. 다른 양상에서, 염색은 샘플 내에 존재할 수 있는 간질 또는 주변 조직에서 결정되거나 또는 사정될 수 있다. 일부 양상에서, 종양으로부터 획득된 세포 및/또는 조직이 IHC를 이용하여 조사될 때, 염색은 종양내 또는 종양주위 면역 세포를 비롯한 종양 침윤 면역 세포를 결정하거나 또는 사정하는 단계를 포함하는 것으로 이해된다. 일부 양상에서, 바이오마커의 존재는 샘플 중 >0%에서, 샘플 중 적어도 1%에서, 샘플 중 적어도 5%에서, 샘플 중 적어도 10%에서, 샘플 중 적어도 15%에서, 샘플 중 적어도 15%에서, 샘플 중 적어도 20%에서, 샘플 중 적어도 25%에서, 샘플 중 적어도 30%에서, 샘플 중 적어도 35%에서, 샘플 중 적어도 40%에서, 샘플 중 적어도 45%에서, 샘플 중 적어도 50%에서, 샘플 중 적어도 55%에서, 샘플 중 적어도 60%에서, 샘플 중 적어도 65%에서, 샘플 중 적어도 70%에서, 샘플 중 적어도 75%에서, 샘플 중 적어도 80%에서, 샘플 중 적어도 85%에서, 샘플 중 적어도 90%에서, 샘플 중 적어도 95%에서, 또는 그 초과에서 IHC에 의해 검출된다. 샘플은 예를 들면, 병리학자 또는 자동화 이미지 분석에 의해 당해 분야에서 공지된 임의의 방법을 이용하여 채점될 수 있다.
임의의 방법의 일부 양상에서, 바이오마커는 진단용 항체 (다시 말하면, 일차 항체)를 이용한 면역조직화학에 의해 검출된다. 일부 양상에서, 진단용 항체는 인간 항원에 특이적으로 결합한다. 일부 양상에서, 진단용 항체는 비인간 항체이다. 일부 양상에서, 진단용 항체는 쥐, 생쥐, 또는 토끼 항체이다. 일부 양상에서, 진단용 항체는 토끼 항체이다. 일부 양상에서, 진단용 항체는 단일클론 항체이다. 일부 양상에서, 진단용 항체는 직접적으로 표지화된다. 다른 양상에서, 진단용 항체는 간접적으로 표지화된다 (예를 들면, 이차 항체에 의해).
임의의 선행하는 방법의 다른 양상에서, 바이오마커의 발현 수준은 핵산 발현 수준 (예를 들면, DNA 발현 수준 또는 RNA 발현 수준 (예를 들면, mRNA 발현 수준))일 수 있다. 핵산 발현 수준을 결정하는 임의의 적합한 방법이 이용될 수 있다. 일부 양상에서, 핵산 발현 수준은 RNAseq, RT-qPCR, qPCR, 멀티플렉스 qPCR 또는 RT-qPCR, 마이크로어레이 분석, SAGE, MassARRAY 기술, ISH, 또는 이들의 조합을 이용하여 결정된다.
세포에서 mRNA의 평가를 위한 방법은 널리 알려져 있고, 그리고 예를 들면, 유전자 발현의 연속 분석 (SAGE), 전체 유전체 염기서열분석 (WGS), 상보성 DNA 프로브를 이용한 혼성화 검정 (예컨대 하나 이상의 유전자에 대해 특이적인 표지화된 리보프로브를 이용한 제자리 혼성화, 노던 블롯 및 관련된 기술) 및 다양한 핵산 증폭 검정 (예컨대 하나 이상의 유전자에 대해 특이적인 상보성 프라이머를 이용한 RT-PCR (예를 들면, qRT-PCR), 그리고 다른 증폭 유형 검출 방법, 예컨대 예를 들면, 분지된 DNA, SISBA, TMA 등)을 포함한다. 이에 더하여, 이런 방법은 생물학적 샘플 내에서 표적 mRNA의 수준을 결정하는 (예를 들면, "하우스키핑" 유전자 예컨대 액틴 패밀리 구성원의 비교 대조 mRNA 서열의 수준을 동시에 조사함으로써) 것을 가능하게 하는 하나 이상의 단계를 포함할 수 있다. 임의적으로, 증폭된 표적 cDNA의 서열이 결정될 수 있다. 임의적 방법은 마이크로어레이 기술에 의해 조직 또는 세포 샘플에서 mRNAs, 예컨대 표적 mRNAs를 조사하거나 또는 검출하는 프로토콜을 포함한다. 핵산 마이크로어레이를 이용하여, 검사와 대조 조직 샘플으로부터 검사와 대조 mRNA 샘플은 cDNA 프로브를 생성하기 위해 역전사되고 표지화된다. 이들 프로브는 이후, 고체 지지체 위에 고정된 핵산의 어레이에 혼성화된다. 어레이는 이러한 어레이의 각 구성원의 순서와 위치가 알려지도록 설정된다. 예를 들면, 면역요법 및 억제성 간질 길항제를 포함하는 치료법의 증가된 또는 감소된 임상적 유익성과 발현이 상관하는 선별된 유전자가 고체 지지체 상에 배열될 수 있다. 표지화된 프로브의 특정 어레이 구성원과의 혼성화는 상기 프로브가 유래된 샘플이 이러한 유전자를 발현한다는 것을 지시한다.
임의의 선행하는 양상 중 일부 양상에서, 샘플은 항암 요법의 투여에 앞서 (예를 들면, 수 분, 수 시간, 수 일, 수 주 (예를 들면, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 또는 7 주), 수개월, 또는 수년 앞서) 개체로부터 획득된다. 임의의 선행하는 방법의 일부 양상에서, 개체로부터 획득된 샘플은 항암 요법의 투여 후 약 2 내지 약 10 주 (예를 들면, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 또는 10 주)째에 획득된다. 일부 양상에서, 개체로부터 획득된 샘플은 항암 요법의 투여 후 약 4 내지 약 6 주째에 획득된다.
일부 양상에서, 바이오마커의 발현 수준 또는 개수는 조직 샘플, 일차 또는 배양된 세포 또는 세포주, 세포 상층액, 세포 용해물, 혈소판, 혈청, 혈장, 유리체액, 림프액, 윤활액, 여포액, 정액, 양수, 유액, 전혈, 혈액 유래 세포, 소변, 뇌척수액, 타액, 객담, 눈물, 땀, 점액, 종양 용해물, 그리고 조직 배양 배지, 조직 추출물 예컨대 균질화된 조직, 종양 조직, 세포 추출물, 또는 이들의 임의의 조합에서 검출된다. 일부 양상에서, 샘플은 조직 샘플 (예를 들면, 종양 조직 샘플), 세포 샘플, 전혈 샘플, 혈장 샘플, 혈청 샘플, 또는 이들의 조합이다. 일부 양상에서, 종양 조직 샘플, 여기서 종양 조직 샘플은 종양 세포, 종양 침윤 면역 세포, 간질 세포, 또는 이들의 조합을 포함한다. 일부 양상에서, 종양 조직 샘플은 포르말린 고정되고 파라핀 포매된 (FFPE) 샘플, 과거 샘플, 신선한 샘플, 또는 동결된 샘플이다.
예를 들면, 임의의 선행하는 방법의 일부 양상에서, 바이오마커의 발현 수준은 공지된 기술 (예를 들면, IHC, 면역형광 현미경검사, 또는 유세포분석)을 이용하여, 종양 침윤 면역 세포, 종양 세포, PBMC, 또는 이들의 조합에서 검출된다. 종양 침윤 면역 세포는 종양내 면역 세포, 종양주위 면역 세포 또는 이들의 임의의 조합, 그리고 다른 종양 간질 세포 (예를 들면, 섬유모세포)를 포함하지만 이들에 한정되지 않는다. 이런 종양 침윤 면역 세포는 T 림프구 (예컨대 CD8+ T 림프구 (예를 들면, CD8+ T 효과기 (Teff) 세포) 및/또는 CD4+ T 림프구 (예를 들면, CD4+ Teff 세포), B 림프구, 또는 과립구 (호중구, 호산구, 호염기구), 단핵구, 대식세포, 수지상 세포 (예를 들면, 수지양 수지상 세포), 조직구 및 자연 킬러 (NK) 세포를 비롯한 다른 골수-계통 세포일 수 있다. 일부 양상에서, 바이오마커에 대한 염색은 막 염색, 세포질 염색, 또는 이들의 조합으로서 검출된다. 다른 양상에서, 바이오마커의 부재는 참조 샘플에 비하여, 샘플 내에서 염색의 부재 또는 없음으로서 검출된다.
임의의 선행하는 방법의 특정한 양상에서, 바이오마커의 발현 수준은 암 세포를 내포하거나 또는 내포하는 것으로 의심되는 샘플에서 사정된다. 샘플은 예를 들면, 암 (예를 들면, 유방암 (예를 들면, TNBC (예를 들면, eTNBC)))을 겪거나, 이것을 겪는 것으로 의심되거나, 또는 이것으로 진단된 환자로부터 획득된 조직 생검 또는 전이성 병변일 수 있다. 일부 양상에서, 샘플은 유방 조직의 샘플, 유방 종양의 생검, 알려져 있거나 또는 의심되는 전이성 유방암 병변 또는 절편, 또는 순환 암 세포, 예를 들면, 유방암 세포를 포함하는 것으로 알려져 있거나 또는 의심되는 혈액 샘플, 예를 들면, 말초혈 샘플이다. 샘플은 암 세포, 다시 말하면, 종양 세포 및 비암성 세포 (예를 들면, 림프구, 예컨대 T 세포 또는 NK 세포) 둘 모두를 포함할 수 있고, 그리고 일정한 양상에서, 암성 및 비암성 세포 둘 모두를 포함한다. 조직 적출, 생검 및 체액을 포함하는 생물학적 샘플, 예를 들면, 암/종양 세포를 포함하는 혈액 샘플을 획득하는 방법은 당해 분야에서 널리 공지된다.
환자는 암의 진행성, 불응성, 재발성, 화학요법-내성 및/또는 백금-내성 형태를 겪을 수도 있다.
일정한 양상에서, 첫 번째 샘플에서 바이오마커의 존재 및/또는 발현 수준/양은 두 번째 샘플에서 존재/부재 및/또는 발현 수준/양과 비교하여 증가되거나 또는 상승된다. 일정한 양상에서, 첫 번째 샘플에서 바이오마커의 존재/부재 및/또는 발현 수준/양은 두 번째 샘플에서 존재 및/또는 발현 수준/양과 비교하여 감소되거나 또는 하락된다. 일정한 양상에서, 두 번째 샘플은 참조 샘플, 참조 세포, 참조 조직, 대조 샘플, 대조 세포, 또는 대조 조직이다.
일정한 양상에서, 참조 샘플, 참조 세포, 참조 조직, 대조 샘플, 대조 세포, 또는 대조 조직은 검사 샘플이 획득될 때와 상이한 하나 이상의 시점에서 획득되는, 동일한 환자 또는 피험자로부터 단일 샘플 또는 결합된 복수 샘플이다. 예를 들면, 참조 샘플, 참조 세포, 참조 조직, 대조 샘플, 대조 세포, 또는 대조 조직은 검사 샘플이 획득될 때보다 앞선 시점에서, 동일한 환자 또는 피험자로부터 획득된다. 이런 참조 샘플, 참조 세포, 참조 조직, 대조 샘플, 대조 세포, 또는 대조 조직은 만약 참조 샘플이 암의 초기 진단 동안 획득되고 검사 샘플이 암이 전이성이 될 때 추후 획득되면 유용할 수 있다.
일정한 양상에서, 참조 샘플, 참조 세포, 참조 조직, 대조 샘플, 대조 세포, 또는 대조 조직은 환자가 아닌 한 명 이상의 건강한 개체로부터 획득된 결합된 복수 샘플이다. 일정한 양상에서, 참조 샘플, 참조 세포, 참조 조직, 대조 샘플, 대조 세포, 또는 대조 조직은 환자 또는 피험자가 아닌, 질환 또는 장애 (예를 들면, 암)를 겪는 한 명 이상의 개체로부터 획득된 결합된 복수 샘플이다. 일정한 양상에서, 참조 샘플, 참조 세포, 참조 조직, 대조 샘플, 대조 세포, 또는 대조 조직은 정상적인 조직으로부터 획득된 혼주 RNA 샘플, 또는 환자가 아닌 한 명 이상의 개체로부터 획득된 혼주 혈장 또는 혈청 샘플이다. 일정한 양상에서, 참조 샘플, 참조 세포, 참조 조직, 대조 샘플, 대조 세포, 또는 대조 조직은 종양 조직으로부터 획득된 혼주 RNA 샘플, 또는 환자가 아닌 질환 또는 장애 (예를 들면, 암)를 겪는 한 명 이상의 개체로부터 획득된 혼주 혈장 또는 혈청 샘플이다.
IV. 다른 병용 요법
다른 항암제 또는 암 요법과 함께 PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)를 개체에게 투여하는 단계를 포함하는, 개체에서 유방암 (예를 들면,TNBC (예를 들면, eTNBC))을 치료하거나 또는 이의 진행을 지연시키기 위한 방법 역시 본원에서 제공된다. 일부 양상에서, 상기 방법은 PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드), 그리고 추가 치료제를 개체에게 투여하는 단계를 포함한다. 임의의 적합한 항암제, 암 요법 및/또는 추가 치료제가 이용될 수 있다.
일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 추가 화학요법 또는 화학요법제와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 방사선요법 또는 방사성치료제와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 표적화된 요법 또는 표적화된 치료제와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 추가 면역요법 또는 면역치료제, 예를 들면, 단일클론 항체와 함께 투여될 수 있다.
이론에 한정됨 없이, 활성화 동시자극성 분자를 증진함으로써 또는 음성 동시자극성 분자를 저해함으로써 T 세포 자극을 증강하는 것은 종양 세포 사멸을 증진하고, 그것에 의하여 암을 치료하거나 또는 이의 진행을 지연시킬 수 있는 것으로 생각된다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 활성화 동시자극성 분자를 향해 지향되는 효현제와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, 활성화 동시자극성 분자는 CD40, CD226, CD28, OX40, GITR, CD137, CD27, HVEM, 또는 CD127을 포함할 수 있다. 일부 양상에서, 활성화 동시자극성 분자를 향해 지향되는 효현제는 CD40, CD226, CD28, OX40, GITR, CD137, CD27, HVEM, 또는 CD127에 결합하는 효현제 항체이다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 저해성 동시자극성 분자를 향해 지향되는 길항제와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, 저해성 동시자극성 분자는 CTLA-4 (CD152로서 또한 알려져 있음), PD-1, TIM-3, BTLA, VISTA, LAG-3, B7-H3, B7-H4, IDO, TIGIT, MICA/B, 또는 아르기나아제를 포함할 수 있다. 일부 양상에서, 저해성 동시자극성 분자를 향해 지향되는 길항제는 CTLA-4, PD-1, TIM-3, BTLA, VISTA, LAG-3, B7-H3, B7-H4, IDO, TIGIT, MICA/B, 또는 아르기나아제에 결합하는 길항제 항체이다.
일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 CTLA-4 (CD152로서 또한 알려져 있음)를 향해 지향되는 길항제, 예를 들면, 차단 항체와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 이필리무맙 (MDX-010, MDX-101, 또는 YERVOY®로서 또한 알려져 있음)과 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 트레멜리무맙 (티실리무맙 또는 CP-675,206으로서 또한 알려져 있음)과 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 B7-H3 (CD276으로서 또한 알려져 있음)을 향해 지향되는 길항제, 예를 들면, 차단 항체와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 MGA271과 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 TGF 베타를 향해 지향되는 길항제, 예를 들면, 메텔리무맙 (CAT-192로서 또한 알려져 있음), 프레솔리무맙 (GC1008로서 또한 알려져 있음), 또는 LY2157299와 함께 투여될 수 있다.
일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 키메라 항원 수용체 (CAR)를 발현하는 T 세포 (예를 들면, 세포독성 T 세포 또는 CTL)의 입양 전달을 포함하는 치료와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 우성 음성 TGF 베타 수용체, 예를 들면, 우성 음성 TGF 베타 II형 수용체를 포함하는 T 세포의 입양 전달을 포함하는 치료와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 HERCREEM 프로토콜 (참조: 예를 들면, ClinicalTrials.gov Identifier NCT00889954)을 포함하는 치료와 함께 투여될 수 있다.
일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 CD137 (TNFRSF9, 4-1BB, 또는 ILA로서 또한 알려져 있음)을 향해 지향되는 효현제, 예를 들면, 활성화 항체와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 우렐루맙 (BMS-663513으로서 또한 알려져 있음)과 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 CD40을 향해 지향되는 효현제, 예를 들면, 활성화 항체와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 CP-870893과 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 OX40 (CD134로서 또한 알려져 있음)을 향해 지향되는 효현제, 예를 들면, 활성화 항체와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 항-OX40 항체 (예를 들면, AgonOX)와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 CD27을 향해 지향되는 효현제, 예를 들면, 활성화 항체와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 CDX-1127과 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 인돌아민-2,3-디옥시게나아제 (IDO)를 향해 지향되는 길항제와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, IDO 길항제는 1-메틸-D-트립토판 (1-D-MT로서 또한 알려져 있음)이다.
일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 항체-약물 접합체와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, 항체-약물 접합체는 메르탄신 또는 모노메틸 아우리스타틴 E (MMAE)를 포함한다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 항-NaPi2b 항체-MMAE 접합체 (DNIB0600A 또는 RG7599로서 또한 알려져 있음)와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 트라스투주맙 엠탄신 (T-DM1, 아도-트라스투주맙 엠탄신, 또는 KADCYLA®, Genentech로서 또한 알려져 있음)과 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 DMUC5754A와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 엔도텔린 B 수용체 (EDNBR)를 표적으로 하는 항체-약물 접합체, 예를 들면, MMAE와 접합된 EDNBR을 향해 지향된 항체와 함께 투여될 수 있다.
일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 혈관형성 저해제와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 VEGF, 예를 들면, VEGF-A를 향해 지향된 항체와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체, 예를 들면, MPDL3280A) 및 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀)은 베바시주맙 (AVASTIN®, Genentech로서 또한 알려져 있음)과 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 안지오포이에틴 2 (Ang2로서 또한 알려져 있음)을 향해 지향된 항체와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 MEDI3617와 함께 투여될 수 있다.
일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 항신생물제와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 CSF-1R (M-CSFR 또는 CD115로서 또한 알려져 있음)을 표적으로 하는 작용제과 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 항-CSF-1R (IMC-CS4로서 또한 알려져 있음)과 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 인터페론, 예를 들면 인터페론 알파 또는 인터페론 감마와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 로페론-A (재조합 인터페론 알파-2a로서 또한 알려져 있음)와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 GM-CSF (재조합 인간 과립구 대식세포 집락 자극 인자, rhu GM-CSF, 사르그라모스팀, 또는 LEUKINE®로서 또한 알려져 있음)과 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 IL-2 (알데스류킨 또는 PROLEUKIN®으로서 또한 알려져 있음)과 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 IL-12와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 CD20을 표적으로 하는 항체와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, CD20을 표적으로 하는 항체는 오비누투주맙 (GA101 또는 GAZYVA®로서 또한 알려져 있음) 또는 리툭시맙이다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 GITR을 표적으로 하는 항체와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, GITR을 표적으로 하는 항체는 TRX518이다.
일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 암 백신과 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, 암 백신은 펩티드 암 백신이며, 이것은 일부 양상에서 개인맞춤된 펩티드 백신이다. 일부 양상에서 펩티드 암 백신은 다가 긴 펩티드, 다중펩티드, 펩티드 칵테일, 하이브리드 펩티드, 또는 펩티드 펄싱된 수지상 세포 백신이다 (참조: 예를 들면, Yamada et al., Cancer Sci. 104:14-21, 2013). 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 보조제와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 TLR 효현제, 예를 들면, 폴리-ICLC (HILTONOL®로서 또한 알려져 있음), LPS, MPL, 또는 CpG ODN을 포함하는 치료와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 종양 괴사 인자 (TNF) 알파와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 IL-1과 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 HMGB1과 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 IL-10 길항제와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 IL-4 길항제와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 IL-13 길항제와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 HVEM 길항제와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 예를 들면, ICOS-L, 또는 ICOS를 향해 지향되는 효현성 항체의 투여에 의해 ICOS 효현제와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 CX3CL1을 표적으로 하는 치료와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 CXCL9를 표적으로 하는 치료와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 CXCL10을 표적으로 하는 치료와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 CCL5를 표적으로 하는 치료와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 LFA-1 또는 ICAM1 효현제와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 셀렉틴 효현제와 함께 투여될 수 있다.
일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 표적화된 요법과 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 B-Raf의 저해제와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 베무라페닙 (ZELBORAF®로서 또한 알려져 있음)과 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 다브라페닙 (TAFINLAR®로서 또한 알려져 있음)과 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 에를로티닙 (TARCEVA®로서 또한 알려져 있음)과 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 MEK, 예컨대 MEK1 (MAP2K1로서 또한 알려져 있음) 또는 MEK2 (MAP2K2로서 또한 알려져 있음)의 저해제와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 코비메티닙 (GDC-0973 또는 XL-518로서 또한 알려져 있음)과 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 트라메티닙 (MEKINIST®로서 또한 알려져 있음)과 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 K-Ras의 저해제와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 c-Met의 저해제와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 오나르투주맙 (MetMAb로서 또한 알려져 있음)과 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 Alk의 저해제와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 AF802 (CH5424802 또는 알렉티닙으로서 또한 알려져 있음)와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 포스파티딜이노시톨 3-키나아제 (PI3K)의 저해제와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 BKM120과 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 이델라리십 (GS-1101 또는 CAL-101로서 또한 알려져 있음)과 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 페리포신 (KRX-0401로서 또한 알려져 있음)과 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 Akt의 저해제와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제는 MK2206과 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 GSK690693과 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 GDC-0941과 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 mTOR의 저해제와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 시로리무스 (라파마이신으로서 또한 알려져 있음)와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 템시로리무스 (CCI-779 또는 TORISEL®로서 또한 알려져 있음)와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 에베로리무스 (RAD001로서 또한 알려져 있음)와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 리다포로리무스 (AP-23573, MK-8669, 또는 데포로리무스로서 또한 알려져 있음)와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 OSI-027과 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 AZD8055와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 INK128과 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 이중 PI3K/mTOR 저해제와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 XL765와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 GDC-0980과 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 BEZ235 (NVP-BEZ235로서 또한 알려져 있음)와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 BGT226과 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 GSK2126458과 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 PF-04691502와 함께 투여될 수 있다. 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 시클로포스파미드)는 PF-05212384 (PKI-587로서 또한 알려져 있음)와 함께 투여될 수 있다.
임의의 선행하는 양상에서, PD-1 축 결합 길항제는 인간 PD-1 축 결합 길항제일 수 있다.
임의의 선행하는 양상 중 일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제는 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체이다.
임의의 선행하는 양상 중 일부 양상에서, 탁산은 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀이다.
임의의 선행하는 양상 중 일부 양상에서, 안트라사이클린은 독소루비신 또는 에피루비신이다.
임의의 선행하는 양상 중 일부 양상에서, 알킬화제는 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드, 클로람부실, 우라무스틴, 멜팔란, 또는 벤다무스틴)이다. 일부 양상에서, 알킬화제는 시클로포스파미드이다.
V. PD-1 축 결합 길항제
개체에서 유방암 (예를 들면, TNBC (예를 들면, eTNBC))을 치료하거나 또는 이의 진행을 지연시키기 위한 방법이 본원에서 제공되는데, 이들 방법은 PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드))를 포함하는 치료 섭생의 효과량을 상기 개체에게 투여하는 단계를 포함한다. 일부 양상에서, 치료는 개체에서 반응을 야기한다. 일부 양상에서, 반응은 완전 반응 (예를 들면, 병리학적 완전 반응)이다. 유방암 (예를 들면, TNBC (예를 들면, eTNBC))을 겪는 개체에서 면역 기능을 증강하는 방법 역시 본원에서 제공되는데, 이들 방법은 PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드))를 포함하는 치료 섭생의 효과량을 개체에게 투여하는 단계를 포함한다. 본원에서 설명된 임의의 방법은 아래에 설명된 임의의 PD-1 축 결합 길항제를 수반할 수 있다.
예를 들면, PD-1 축 결합 길항제는 PD-L1 결합 길항제, PD-1 결합 길항제 및 PD-L2 결합 길항제를 포함한다. PD-L1 (예정된 사멸 리간드 1)은 또한, 당해 분야에서 "예정된 세포 사멸 1 리간드 1", "PDCD1LG1", "CD274", "B7-H" 및 "PDL1"로서 지칭된다. 예시적인 인간 PD-L1은 UniProtKB/Swiss-Prot 수탁 번호 Q9NZQ7.1에서 도시된다. PD-1 (예정된 사멸 1)은 또한, 당해 분야에서 "예정된 세포 사멸 1", "PDCD1", "CD279" 및 "SLEB2"로서 지칭된다. 예시적인 인간 PD-1은 UniProtKB/Swiss-Prot 수탁 번호 Q15116에서 도시된다. PD-L2 (예정된 사멸 리간드 2)는 또한, 당해 분야에서 "예정된 세포 사멸 1 리간드 2", "PDCD1LG2", "CD273", "B7-DC", "Btdc" 및 "PDL2"로서 지칭된다. 예시적인 인간 PD-L2는 UniProtKB/Swiss-Prot 수탁 번호 Q9BQ51에서 도시된다. 일부 양상에서, PD-L1, PD-1 및 PD-L2는 인간 PD-L1, PD-1 및 PD-L2이다.
일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제는 항-PD-L1 항체이다. 일부 양상에서, 항-PD-L1 항체는 아테졸리주맙, YW243.55.S70, MDX-1105, MEDI4736 (더발루맙), 그리고 MSB0010718C (아벨루맙)로 구성된 군에서 선택된다. 항체 YW243.55.S70은 WO 2010/077634에서 설명된 항-PD-L1 항체이다. BMS-936559로서 또한 알려져 있는 MDX-1105는 WO2007/005874에서 설명된 항-PD-L1 항체이다. MEDI4736은 WO2011/066389 및 US2013/034559에서 설명된 항-PD-L1 단일클론 항체이다. 일부 양상에서, 항-PD-L1 항체는 PD-L1 및 PD-1 사이의 및/또는 PD-L1 및 B7-1 사이의 결합을 저해할 수 있다. 일부 양상에서, 항-PD-L1 항체는 단일클론 항체이다. 일부 양상에서, 항-PD-L1 항체는 Fab, Fab'-SH, Fv, scFv 및 (Fab')2 단편으로 구성된 군에서 선택되는 항체 단편이다. 일부 양상에서, 항-PD-L1 항체는 인간화 항체이다. 일부 양상에서, 항-PD-L1 항체는 인간 항체이다.
본원 발명의 방법에 유용한 항-PD-L1 항체의 실례, 그리고 이들을 만들기 위한 방법은 PCT 특허 출원 번호 WO 2010/077634, WO 2007/005874, WO 2011/066389에서 및 US 2013/034559에서 설명되고, 이들은 본원에서 참조로서 편입된다. 본원 발명에서 유용한 항-PD-L1 항체 및 이런 항체를 내포하는 조성물은 암을 치료하기 위해 탁산, 안트라사이클린 및 알킬화제와 병용될 수 있다.
일부 양상에서, PD-1 결합 길항제는 리간드 결합 파트너에 대한 PD-1의 결합을 저해하는 분자이다. 특정한 양상에서 PD-1 리간드 결합 파트너는 PD-L1 및/또는 PD-L2이다. 다른 양상에서, PD-L1 결합 길항제는 결합 파트너에 대한 PD-L1의 결합을 저해하는 분자이다. 특정한 양상에서, PD-L1 결합 파트너는 PD-1 및/또는 B7-1이다. 다른 양상에서, PD-L2 결합 길항제는 결합 파트너에 대한 PD-L2의 결합을 저해하는 분자이다. 특정한 양상에서, PD-L2 결합 파트너는 PD-1이다. 길항제는 항체, 이의 항원 결합 단편, 면역부착소, 융합 단백질, 또는 올리고펩티드일 수 있다.
일부 양상에서, PD-1 결합 길항제는 항-PD-1 항체 (예를 들면, 인간 항체, 인간화 항체, 또는 키메라 항체)이다. 일부 양상에서, 항-PD-1 항체는 MDX 1106 (니볼루맙), MK-3475 (펨브로리주맙), MEDI-0680 (AMP-514), PDR001, REGN2810, 그리고 BGB-108로 구성된 군에서 선택된다. 일부 양상에서, PD-1 결합 길항제는 면역부착소 (예를 들면, 불변 영역 (예를 들면, 면역글로불린 서열의 Fc 영역)에 융합된 PD-L1 또는 PD-L2의 세포외 또는 PD-1 결합 부분을 포함하는 면역부착소이다. 일부 양상에서, PD-1 결합 길항제는 AMP-224이다. 일부 양상에서, PD-L1 결합 길항제는 항-PD-L1 항체이다. MDX-1106-04, ONO-4538, BMS-936558, 또는 니볼루맙으로서 또한 알려져 있는 MDX-1106은 WO2006/121168에서 설명된 항-PD-1 항체이다. 람브롤리주맙으로서 또한 알려져 있는 MK-3475는 WO2009/114335에서 설명된 항-PD-1 항체이다. B7-DCIg로서 또한 알려져 있는 AMP-224는 WO2010/027827 및 WO2011/066342에서 설명된 PD-L2-Fc 융합 가용성 수용체이다.
항-PD-L1 항체
일부 양상에서, 제제 내에 항체는 중쇄 및/또는 경쇄 서열 내에 적어도 하나의 (예를 들면, 적어도 두 개의, 적어도 세 개의, 또는 적어도 네 개의) 트립토판을 포함한다. 일부 양상에서, 아미노산 트립토판은 항체의 HVR 영역, 프레임워크 영역 및/또는 불변 영역 내에 있다. 일부 양상에서, 항체는 HVR 영역 내에 두 개 또는 세 개의 트립토판 잔기를 포함한다. 일부 양상에서, 제제 내에 항체는 항-PD-L1 항체이다. PDL1, B7-H1, B7-4, CD274 및 B7-H로서 또한 알려져 있는 PD-L1 (예정된 사멸 리간드 1)은 막경유 단백질이고, 그리고 이의 PD-1과의 상호작용은 T 세포 활성화 및 사이토킨 생산을 저해한다. 일부 양상에서, 본원에서 설명된 항-PD-L1 항체는 인간 PD-L1에 결합한다. 본원에서 설명된 방법에서 이용될 수 있는 항-PD-L1 항체의 실례는 PCT 특허 출원 WO 2010/077634 A1 및 U.S. 특허 번호 8,217,149에서 설명되는데, 이들은 본원에서 온전히 참조로서 편입된다.
일부 양상에서, 항-PD-L1 항체는 PD-L1 및 PD-1 사이의 및/또는 PD-L1 및 B7-1 사이의 결합을 저해할 수 있다. 일부 양상에서, 항-PD-L1 항체는 단일클론 항체이다. 일부 양상에서, 항-PD-L1 항체는 Fab, Fab'-SH, Fv, scFv 및 (Fab')2 단편으로 구성된 군에서 선택되는 항체 단편이다. 일부 양상에서, 항-PD-L1 항체는 인간화 항체이다. 일부 양상에서, 항-PD-L1 항체는 인간 항체이다.
WO 2010/077634 A1 및 US 8,217,149에서 설명된 항-PD-L1 항체가 본원에서 설명된 방법에서 이용될 수 있다. 일부 양상에서, 항-PD-L1 항체는 서열 번호: 3의 중쇄 가변 영역 서열 및/또는 서열 번호: 4의 경쇄 가변 영역 서열을 포함한다. 다른 추가의 양상에서, 중쇄 가변 영역 및/또는 경쇄 가변 영역 서열을 포함하는 단리된 항-PD-L1 항체가 제공되는데, 여기서:
(a) 중쇄 서열은 하기 중쇄 서열에 적어도 85%, 적어도 90%, 적어도 91%, 적어도 92%, 적어도 93%, 적어도 94%, 적어도 95%, 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 적어도 99% 또는 100% 서열 동일성을 갖고:EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSDSWIHWVRQAPGKGLEWVAWISPYGGSTYYADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCARRHWPGGFDYWGQGTLVTVSA (서열 번호: 3), 그리고
(b) 경쇄 서열은 하기 경쇄 서열에 적어도 85%, 적어도 90%, 적어도 91%, 적어도 92%, 적어도 93%, 적어도 94%, 적어도 95%, 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 적어도 99% 또는 100% 서열 동일성을 갖는다: DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDVSTAVAWYQQKPGKAPKLLIYSASFLYSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQYLYHPATFGQGTKVEIKR (서열 번호: 4).
한 가지 양상에서, 항-PD-L1 항체는 HVR-H1, HVR-H2 및 HVR-H3 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역을 포함하는데, 여기서:
(a) HVR-H1 서열은 GFTFSX1SWIH (서열 번호: 5)이고;
(b) HVR-H2 서열은 AWIX2PYGGSX3YYADSVKG (서열 번호: 6)이고;
(c) HVR-H3 서열은 RHWPGGFDY (서열 번호: 7)이고;
더 나아가 여기서: X1은 D 또는 G이고; X2는 S 또는 L이고; X3은 T 또는 S이다. 한 가지 특정한 양상에서, X1은 D이고; X2는 S이고 X3은 T이다.
다른 양상에서, 폴리펩티드는 화학식: (HC-FR1)-(HVR-H1)-(HC-FR2)-(HVR-H2)-(HC-FR3)-(HVR-H3)-(HC-FR4)에 따라서, 이들 HVR 사이에 병치된 가변 영역 중쇄 프레임워크 서열을 더욱 포함한다. 또 다른 양상에서, 프레임워크 서열은 인간 공통 프레임워크 서열로부터 유래된다. 추가의 양상에서, 프레임워크 서열은 VH 하위군 III 공통 프레임워크이다. 다른 추가의 양상에서, 프레임워크 서열 중에서 적어도 하나는 아래와 같다:
HC-FR1은 EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAAS (서열 번호: 8)이고
HC-FR2는 WVRQAPGKGLEWV (서열 번호: 9)이고
HC-FR3은 RFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCAR (서열 번호: 10)이고
HC-FR4는 WGQGTLVTVSA (서열 번호: 11)이다.
다른 추가의 양상에서, 중쇄 폴리펩티드는 HVR-L1, HVR-L2 및 HVR-L3을 포함하는 가변 영역 경쇄와 더욱 조합되고, 여기서:
(a) HVR-L1 서열은 RASQX4X5X6TX7X8A (서열 번호: 12)이고;
(b) HVR-L2 서열은 SASX9LX10S (서열 번호: 13)이고;
(c) HVR-L3 서열은 QQX11X12X13X14PX15T (서열 번호: 14)이고; 여기서: X4는 D 또는 V이고; X5는 V 또는 I이고; X6은 S 또는 N이고; X7은 A 또는 F이고; X8은 V 또는 L이고; X9는 F 또는 T이고; X10은 Y 또는 A이고; X11은 Y, G, F, 또는 S이고; X12는 L, Y, F 또는 W이고; X13은 Y, N, A, T, G, F 또는 I이고; X14는 H, V, P, T 또는 I이고; X15는 A, W, R, P 또는 T이다. 다른 추가의 양상에서, X4는 D이고; X5는 V이고; X6은 S이고; X7은 A이고; X8은 V이고; X9는 F이고; X10은 Y이고; X11은 Y이고; X12는 L이고; X13은 Y이고; X14는 H이고; X15는 A이다.
다른 추가의 양상에서, 경쇄는 화학식: (LC-FR1)-(HVR-L1)-(LC-FR2)-(HVR-L2)-(LC-FR3)-(HVR-L3)-(LC-FR4)에 따라서, 이들 HVR 사이에 병치된 가변 영역 경쇄 프레임워크 서열을 더욱 포함한다. 다른 추가의 양상에서, 프레임워크 서열은 인간 공통 프레임워크 서열로부터 유래된다. 다른 추가의 양상에서, 프레임워크 서열은 VL 카파 I 공통 프레임워크이다. 다른 추가의 양상에서, 프레임워크 서열 중에서 적어도 하나는 아래와 같다:
LC-FR1은 DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC (서열 번호: 15)이고
LC-FR2는 WYQQKPGKAPKLLIY (서열 번호: 16)이고
LC-FR3은 GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC (서열 번호: 17)이고
LC-FR4는 FGQGTKVEIKR (서열 번호: 18)이다.
다른 양상에서, 중쇄와 경쇄 가변 영역 서열을 포함하는 단리된 항-PD-L1 항체 또는 항원 결합 단편이 제공되는데, 여기서:
(a) 중쇄는 HVR-H1, HVR-H2 및 HVR-H3을 포함하고, 여기서 더 나아가:
(i) HVR-H1 서열은 GFTFSX1SWIH (서열 번호: 5)이고
(ii) HVR-H2 서열은 AWIX2PYGGSX3YYADSVKG (서열 번호: 6)이고
(iii) HVR-H3 서열은 RHWPGGFDY (서열 번호: 7)이고, 그리고
(b) 경쇄는 HVR-L1, HVR-L2 및 HVR-L3을 포함하고, 여기서 더 나아가:
(i) HVR-L1 서열은 RASQX4X5X6TX7X8A (서열 번호: 12)이고
(ii) HVR-L2 서열은 SASX9LX10S (서열 번호: 13)이고
(iii) HVR-L3 서열은 QQX11X12X13X14PX15T; (서열 번호: 14)이고
여기서: X1은 D 또는 G이고; X2는 S 또는 L이고; X3은 T 또는 S이고; X4는 D 또는 V이고; X5는 V 또는 I이고; X6은 S 또는 N이고; X7은 A 또는 F이고; X8은 V 또는 L이고; X9는 F 또는 T이고; X10은 Y 또는 A이고; X11은 Y, G, F, 또는 S이고; X12는 L, Y, F 또는 W이고; X13은 Y, N, A, T, G, F 또는 I이고; X14는 H, V, P, T 또는 I이고; X15는 A, W, R, P 또는 T이다. 특정한 양상에서, X1은 D이고; X2는 S이고 X3은 T이다. 다른 양상에서, X4는 D이고; X5는 V이고; X6은 S이고; X7은 A이고; X8은 V이고; X9는 F이고; X10은 Y이고; X11은 Y이고; X12는 L이고; X13은 Y이고; X14는 H이고; X15는 A이다. 또 다른 양상에서, X1은 D이고; X2는 S이고, X3은 T이고, X4는 D이고; X5는 V이고; X6은 S이고; X7은 A이고; X8은 V이고; X9는 F이고; X10은 Y이고; X11은 Y이고; X12는 L이고; X13은 Y이고; X14는 H이고 X15는 A이다.
추가의 양상에서, 중쇄 가변 영역은 (HC-FR1)-(HVR-H1)-(HC-FR2)-(HVR-H2)-(HC-FR3)-(HVR-H3)-(HC-FR4)로서, 이들 HVR 사이에 병치된 하나 이상의 프레임워크 서열을 포함하고, 그리고 경쇄 가변 영역은 (LC-FR1)-(HVR-L1)-(LC-FR2)-(HVR-L2)-(LC-FR3)-(HVR-L3)-(LC-FR4)로서, 이들 HVR 사이에 병치된 하나 이상의 프레임워크 서열을 포함한다. 다른 추가의 양상에서, 프레임워크 서열은 인간 공통 프레임워크 서열로부터 유래된다. 다른 추가의 양상에서, 중쇄 프레임워크 서열은 Kabat 하위군 I, II, 또는 III 서열로부터 유래된다. 다른 추가의 양상에서, 중쇄 프레임워크 서열은 VH 하위군 III 공통 프레임워크이다. 다른 추가의 양상에서, 중쇄 프레임워크 서열 중에서 하나 이상은 서열 번호: 8, 9, 10 및 11로서 진술된다. 다른 추가의 양상에서, 경쇄 프레임워크 서열은 Kabat 카파 I, II, II 또는 IV 하위군 서열로부터 유래된다. 다른 추가의 양상에서, 경쇄 프레임워크 서열은 VL 카파 I 공통 프레임워크이다. 다른 추가의 양상에서, 경쇄 프레임워크 서열 중에서 하나 이상은 서열 번호: 15, 16, 17 및 18로서 진술된다.
다른 추가의 특정한 양상에서, 항체는 인간 또는 뮤린 불변 영역을 더욱 포함한다. 다른 추가의 양상에서, 인간 불변 영역은 IgG1, IgG2, IgG2, IgG3 및 IgG4로 구성된 군에서 선택된다. 다른 추가의 특정한 양상에서, 인간 불변 영역은 IgG1이다. 다른 추가의 양상에서, 뮤린 불변 영역은 IgG1, IgG2A, IgG2B 및 IgG3으로 구성된 군에서 선택된다. 다른 추가의 양상에서, 뮤린 불변 영역은 IgG2A이다. 다른 추가의 특정한 양상에서, 항체는 감소되거나 또는 최소 효과기 기능을 갖는다. 다른 추가의 특정한 양상에서, 최소 효과기 기능은 "효과기-없는 Fc 돌연변이" 또는 비글리코실화로부터 발생한다. 다른 추가의 양상에서, 효과기 결여 Fc 돌연변이는 불변 영역에서 N297A 또는 D265A/N297A 치환이다.
또 다른 양상에서, 중쇄와 경쇄 가변 영역 서열을 포함하는 항-PD-L1 항체가 제공되는데, 여기서:
(a) 중쇄는 GFTFSDSWIH (서열 번호: 19), AWISPYGGSTYYADSVKG (서열 번호: 20) 및 RHWPGGFDY (서열 번호: 21)에 각각, 적어도 85% 서열 동일성을 갖는 HVR-H1, HVR-H2 및 HVR-H3 서열을 더욱 포함하거나, 또는
(b) 경쇄는 RASQDVSTAVA (서열 번호: 22), SASFLYS (서열 번호: 23) 및 QQYLYHPAT (서열 번호: 24)에 각각, 적어도 85% 서열 동일성을 갖는 HVR-L1, HVR-L2 및 HVR-L3 서열을 더욱 포함한다.
특정한 양상에서, 서열 동일성은 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 또는 100%이다.
다른 양상에서, 중쇄 가변 영역은 (HC-FR1)-(HVR-H1)-(HC-FR2)-(HVR-H2)-(HC-FR3)-(HVR-H3)-(HC-FR4)로서, 이들 HVR 사이에 병치된 하나 이상의 프레임워크 서열을 포함하고, 그리고 경쇄 가변 영역은 (LC-FR1)-(HVR-L1)-(LC-FR2)-(HVR-L2)-(LC-FR3)-(HVR-L3)-(LC-FR4)로서, 이들 HVR 사이에 병치된 하나 이상의 프레임워크 서열을 포함한다. 또 다른 양상에서, 프레임워크 서열은 인간 공통 프레임워크 서열로부터 유래된다. 다른 추가의 양상에서, 중쇄 프레임워크 서열은 Kabat 하위군 I, II, 또는 III 서열로부터 유래된다. 다른 추가의 양상에서, 중쇄 프레임워크 서열은 VH 하위군 III 공통 프레임워크이다. 다른 추가의 양상에서, 중쇄 프레임워크 서열 중에서 하나 이상은 서열 번호: 8, 9, 10 및 11로서 진술된다. 다른 추가의 양상에서, 경쇄 프레임워크 서열은 Kabat 카파 I, II, II 또는 IV 하위군 서열로부터 유래된다. 다른 추가의 양상에서, 경쇄 프레임워크 서열은 VL 카파 I 공통 프레임워크이다. 다른 추가의 양상에서, 경쇄 프레임워크 서열 중에서 하나 이상은 서열 번호: 15, 16, 17 및 18로서 진술된다.
다른 추가의 특정한 양상에서, 항체는 인간 또는 뮤린 불변 영역을 더욱 포함한다. 다른 추가의 양상에서, 인간 불변 영역은 IgG1, IgG2, IgG2, IgG3, IgG4로 구성된 군에서 선택된다. 다른 추가의 특정한 양상에서, 인간 불변 영역은 IgG1이다. 다른 추가의 양상에서, 뮤린 불변 영역은 IgG1, IgG2A, IgG2B, IgG3으로 구성된 군에서 선택된다. 다른 추가의 양상에서, 뮤린 불변 영역은 IgG2A이다. 다른 추가의 특정한 양상에서, 항체는 감소되거나 또는 최소 효과기 기능을 갖는다. 다른 추가의 특정한 양상에서, 최소 효과기 기능은 "효과기-없는 Fc 돌연변이" 또는 비글리코실화로부터 발생한다. 다른 추가의 양상에서, 효과기 결여 Fc 돌연변이는 불변 영역에서 N297A 또는 D265A/N297A 치환이다.
다른 추가의 양상에서, 중쇄와 경쇄 가변 영역 서열을 포함하는 단리된 항-PD-L1 항체가 제공되는데, 여기서:
(a) 중쇄 서열은 하기 중쇄 서열에 적어도 85% 서열 동일성을 갖고: EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSDSWIHWVRQAPGKGLEWVAWISPYGGSTYYADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCARRHWPGGFDYWGQGTLVTVSS (서열 번호: 25), 및/또는
(b) 경쇄 서열은 하기 경쇄 서열에 적어도 85% 서열 동일성을 갖는다: DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDVSTAVAWYQQKPGKAPKLLIYSASFLYSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQYLYHPATFGQGTKVEIKR (서열 번호: 4).
특정한 양상에서, 서열 동일성은 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 또는 100%이다. 다른 양상에서, 중쇄 가변 영역은 (HC-FR1)-(HVR-H1)-(HC-FR2)-(HVR-H2)-(HC-FR3)-(HVR-H3)-(HC-FR4)로서, 이들 HVR 사이에 병치된 하나 이상의 프레임워크 서열을 포함하고, 그리고 경쇄 가변 영역은 (LC-FR1)-(HVR-L1)-(LC-FR2)-(HVR-L2)-(LC-FR3)-(HVR-L3)-(LC-FR4)로서, 이들 HVR 사이에 병치된 하나 이상의 프레임워크 서열을 포함한다. 또 다른 양상에서, 프레임워크 서열은 인간 공통 프레임워크 서열로부터 유래된다. 추가의 양상에서, 중쇄 프레임워크 서열은 Kabat 하위군 I, II, 또는 III 서열로부터 유래된다. 다른 추가의 양상에서, 중쇄 프레임워크 서열은 VH 하위군 III 공통 프레임워크이다. 다른 추가의 양상에서, 중쇄 프레임워크 서열 중에서 하나 이상은 서열 번호: 8, 9, 10 및 WGQGTLVTVSS (서열 번호: 27)로서 진술된다.
다른 추가의 양상에서, 경쇄 프레임워크 서열은 Kabat 카파 I, II, II 또는 IV 하위군 서열로부터 유래된다. 다른 추가의 양상에서, 경쇄 프레임워크 서열은 VL 카파 I 공통 프레임워크이다. 다른 추가의 양상에서, 경쇄 프레임워크 서열 중에서 하나 이상은 서열 번호: 15, 16, 17 및 18로서 진술된다.
다른 추가의 특정한 양상에서, 항체는 인간 또는 뮤린 불변 영역을 더욱 포함한다. 다른 추가의 양상에서, 인간 불변 영역은 IgG1, IgG2, IgG2, IgG3, IgG4로 구성된 군에서 선택된다. 다른 추가의 특정한 양상에서, 인간 불변 영역은 IgG1이다. 다른 추가의 양상에서, 뮤린 불변 영역은 IgG1, IgG2A, IgG2B, IgG3으로 구성된 군에서 선택된다. 다른 추가의 양상에서, 뮤린 불변 영역은 IgG2A이다. 다른 추가의 특정한 양상에서, 항체는 감소되거나 또는 최소 효과기 기능을 갖는다. 다른 추가의 특정한 양상에서, 최소 효과기 기능은 원핵 세포에서 생산으로부터 발생한다. 다른 추가의 특정한 양상에서, 최소 효과기 기능은 "효과기-없는 Fc 돌연변이" 또는 비글리코실화로부터 발생한다. 다른 추가의 양상에서, 효과기 결여 Fc 돌연변이는 불변 영역에서 N297A 또는 D265A/N297A 치환이다.
추가의 양상에서, 중쇄 가변 영역은 (HC-FR1)-(HVR-H1)-(HC-FR2)-(HVR-H2)-(HC-FR3)-(HVR-H3)-(HC-FR4)로서, 이들 HVR 사이에 병치된 하나 이상의 프레임워크 서열을 포함하고, 그리고 경쇄 가변 영역은 (LC-FR1)-(HVR-L1)-(LC-FR2)-(HVR-L2)-(LC-FR3)-(HVR-L3)-(LC-FR4)로서, 이들 HVR 사이에 병치된 하나 이상의 프레임워크 서열을 포함한다. 다른 추가의 양상에서, 프레임워크 서열은 인간 공통 프레임워크 서열로부터 유래된다. 다른 추가의 양상에서, 중쇄 프레임워크 서열은 Kabat 하위군 I, II, 또는 III 서열로부터 유래된다. 다른 추가의 양상에서, 중쇄 프레임워크 서열은 VH 하위군 III 공통 프레임워크이다. 다른 추가의 양상에서, 중쇄 프레임워크 서열 중에서 하나 이상은 아래와 같다:
HC-FR1 EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFS (서열 번호: 29)
HC-FR2 WVRQAPGKGLEWVA (서열 번호: 30)
HC-FR3 RFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCAR (서열 번호: 10)
HC-FR4 WGQGTLVTVSS (서열 번호: 27).
다른 추가의 양상에서, 경쇄 프레임워크 서열은 Kabat 카파 I, II, II 또는 IV 하위군 서열로부터 유래된다. 다른 추가의 양상에서, 경쇄 프레임워크 서열은 VL 카파 I 공통 프레임워크이다. 다른 추가의 양상에서, 경쇄 프레임워크 서열 중에서 하나 이상은 아래와 같다:
LC-FR1 DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC (서열 번호: 15)
LC-FR2 WYQQKPGKAPKLLIY (서열 번호: 16)
LC-FR3 GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC (서열 번호: 17)
LC-FR4 FGQGTKVEIK (서열 번호: 28).
다른 추가의 특정한 양상에서, 항체는 인간 또는 뮤린 불변 영역을 더욱 포함한다. 다른 추가의 양상에서, 인간 불변 영역은 IgG1, IgG2, IgG2, IgG3, IgG4로 구성된 군에서 선택된다. 다른 추가의 특정한 양상에서, 인간 불변 영역은 IgG1이다. 다른 추가의 양상에서, 뮤린 불변 영역은 IgG1, IgG2A, IgG2B, IgG3으로 구성된 군에서 선택된다. 다른 추가의 양상에서, 뮤린 불변 영역은 IgG2A이다. 다른 추가의 특정한 양상에서, 항체는 감소되거나 또는 최소 효과기 기능을 갖는다. 다른 추가의 특정한 양상에서, 최소 효과기 기능은 "효과기-없는 Fc 돌연변이" 또는 비글리코실화로부터 발생한다. 다른 추가의 양상에서, 효과기 결여 Fc 돌연변이는 불변 영역에서 N297A 또는 D265A/N297A 치환이다.
또 다른 양상에서, 중쇄와 경쇄 가변 영역 서열을 포함하는 항-PD-L1 항체가 제공되는데, 여기서:
(c) 중쇄는 GFTFSDSWIH (서열 번호: 19), AWISPYGGSTYYADSVKG (서열 번호: 20) 및 RHWPGGFDY (서열 번호: 21)에 각각, 적어도 85% 서열 동일성을 갖는 HVR-H1, HVR-H2 및 HVR-H3 서열을 더욱 포함하고, 및/또는
(d) 경쇄는 RASQDVSTAVA (서열 번호: 22), SASFLYS (서열 번호: 23) 및 QQYLYHPAT (서열 번호: 24)에 각각, 적어도 85% 서열 동일성을 갖는 HVR-L1, HVR-L2 및 HVR-L3 서열을 더욱 포함한다.
특정한 양상에서, 서열 동일성은 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 또는 100%이다.
다른 양상에서, 중쇄 가변 영역은 (HC-FR1)-(HVR-H1)-(HC-FR2)-(HVR-H2)-(HC-FR3)-(HVR-H3)-(HC-FR4)로서, 이들 HVR 사이에 병치된 하나 이상의 프레임워크 서열을 포함하고, 그리고 경쇄 가변 영역은 (LC-FR1)-(HVR-L1)-(LC-FR2)-(HVR-L2)-(LC-FR3)-(HVR-L3)-(LC-FR4)로서, 이들 HVR 사이에 병치된 하나 이상의 프레임워크 서열을 포함한다. 또 다른 양상에서, 프레임워크 서열은 인간 공통 프레임워크 서열로부터 유래된다. 다른 추가의 양상에서, 중쇄 프레임워크 서열은 Kabat 하위군 I, II, 또는 III 서열로부터 유래된다. 다른 추가의 양상에서, 중쇄 프레임워크 서열은 VH 하위군 III 공통 프레임워크이다. 다른 추가의 양상에서, 중쇄 프레임워크 서열 중에서 하나 이상은 서열 번호: 8, 9, 10 및 WGQGTLVTVSSASTK (서열 번호: 31)로서 진술된다.
다른 추가의 양상에서, 경쇄 프레임워크 서열은 Kabat 카파 I, II, II 또는 IV 하위군 서열로부터 유래된다. 다른 추가의 양상에서, 경쇄 프레임워크 서열은 VL 카파 I 공통 프레임워크이다. 다른 추가의 양상에서, 경쇄 프레임워크 서열 중에서 하나 이상은 서열 번호: 15, 16, 17 및 18로서 진술된다. 다른 추가의 특정한 양상에서, 항체는 인간 또는 뮤린 불변 영역을 더욱 포함한다. 다른 추가의 양상에서, 인간 불변 영역은 IgG1, IgG2, IgG2, IgG3, IgG4로 구성된 군에서 선택된다. 다른 추가의 특정한 양상에서, 인간 불변 영역은 IgG1이다. 다른 추가의 양상에서, 뮤린 불변 영역은 IgG1, IgG2A, IgG2B, IgG3으로 구성된 군에서 선택된다. 다른 추가의 양상에서, 뮤린 불변 영역은 IgG2A이다. 다른 추가의 특정한 양상에서, 항체는 감소되거나 또는 최소 효과기 기능을 갖는다. 다른 추가의 특정한 양상에서, 최소 효과기 기능은 "효과기-없는 Fc 돌연변이" 또는 비글리코실화로부터 발생한다. 다른 추가의 양상에서, 효과기 결여 Fc 돌연변이는 불변 영역에서 N297A 또는 D265A/N297A 치환이다.
다른 추가의 양상에서, 중쇄와 경쇄 가변 영역 서열을 포함하는 단리된 항-PD-L1 항체가 제공되는데, 여기서:
(a) 중쇄 서열은 하기 중쇄 서열에 적어도 85% 서열 동일성을 갖고: EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSDSWIHWVRQAPGKGLEWVAWISPYGGSTYYADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCARRHWPGGFDYWGQGTLVTVSSASTK (서열 번호: 26), 또는
(b) 경쇄 서열은 하기 경쇄 서열에 적어도 85% 서열 동일성을 갖는다: DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDVSTAVAWYQQKPGKAPKLLIYSASFLYSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQYLYHPATFGQGTKVEIKR (서열 번호: 4).
일부 양상에서, 중쇄와 경쇄 가변 영역 서열을 포함하는 단리된 항-PD-L1 항체가 제공되는데, 여기서 경쇄 가변 영역 서열은 서열 번호: 4의 아미노산 서열에 적어도 85%, 적어도 86%, 적어도 87%, 적어도 88%, 적어도 89%, 적어도 90%, 적어도 91%, 적어도 92%, 적어도 93%, 적어도 94%, 적어도 95%, 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 적어도 99% 또는 100% 서열 동일성을 갖는다. 일부 양상에서, 중쇄와 경쇄 가변 영역 서열을 포함하는 단리된 항-PD-L1 항체가 제공되는데, 여기서 중쇄 가변 영역 서열은 서열 번호: 26의 아미노산 서열에 적어도 85%, 적어도 86%, 적어도 87%, 적어도 88%, 적어도 89%, 적어도 90%, 적어도 91%, 적어도 92%, 적어도 93%, 적어도 94%, 적어도 95%, 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 적어도 99% 또는 100% 서열 동일성을 갖는다. 일부 양상에서, 중쇄와 경쇄 가변 영역 서열을 포함하는 단리된 항-PD-L1 항체가 제공되는데, 여기서 경쇄 가변 영역 서열은 서열 번호: 4의 아미노산 서열에 적어도 85%, 적어도 86%, 적어도 87%, 적어도 88%, 적어도 89%, 적어도 90%, 적어도 91%, 적어도 92%, 적어도 93%, 적어도 94%, 적어도 95%, 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 적어도 99%, 또는 100% 서열 동일성을 갖고, 그리고 중쇄 가변 영역 서열은 서열 번호: 26의 아미노산 서열에 적어도 85%, 적어도 86%, 적어도 87%, 적어도 88%, 적어도 89%, 적어도 90%, 적어도 91%, 적어도 92%, 적어도 93%, 적어도 94%, 적어도 95%, 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 적어도 99%, 또는 100% 서열 동일성을 갖는다. 일부 양상에서, 중쇄 및/또는 경쇄의 N 말단에서 1개, 2개, 3개, 4개, 또는 5개의 아미노산 잔기가 결실되거나, 치환되거나 또는 변형될 수 있다.
다른 추가의 양상에서, 중쇄와 경쇄 서열을 포함하는 단리된 항-PD-L1 항체가 제공되는데, 여기서:
(a) 중쇄 서열은 하기 중쇄 서열에 적어도 85% 서열 동일성을 갖고: EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSDSWIHWVRQAPGKGLEWVAWISPYGGSTYYADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCARRHWPGGFDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYASTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG (서열 번호: 32), 및/또는
(b) 경쇄 서열은 하기 경쇄 서열에 적어도 85% 서열 동일성을 갖는다: DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDVSTAVAWYQQKPGKAPKLLIYSASFLYSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQYLYHPATFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC (서열 번호: 33).
일부 양상에서, 중쇄와 경쇄 서열을 포함하는 단리된 항-PD-L1 항체가 제공되는데, 여기서 경쇄 서열은 서열 번호: 33의 아미노산 서열에 적어도 85%, 적어도 86%, 적어도 87%, 적어도 88%, 적어도 89%, 적어도 90%, 적어도 91%, 적어도 92%, 적어도 93%, 적어도 94%, 적어도 95%, 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 또는 적어도 99% 서열 동일성을 갖는다. 일부 양상에서, 중쇄와 경쇄 서열을 포함하는 단리된 항-PD-L1 항체가 제공되는데, 여기서 중쇄 서열은 서열 번호: 32의 아미노산 서열에 적어도 85%, 적어도 86%, 적어도 87%, 적어도 88%, 적어도 89%, 적어도 90%, 적어도 91%, 적어도 92%, 적어도 93%, 적어도 94%, 적어도 95%, 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 또는 적어도 99% 서열 동일성을 갖는다. 일부 양상에서, 중쇄와 경쇄 서열을 포함하는 단리된 항-PD-L1 항체가 제공되는데, 여기서 경쇄 서열은 서열 번호: 33의 아미노산 서열에 적어도 85%, 적어도 86%, 적어도 87%, 적어도 88%, 적어도 89%, 적어도 90%, 적어도 91%, 적어도 92%, 적어도 93%, 적어도 94%, 적어도 95%, 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 또는 적어도 99% 서열 동일성을 갖고, 그리고 중쇄 서열은 서열 번호: 32의 아미노산 서열에 적어도 85%, 적어도 86%, 적어도 87%, 적어도 88%, 적어도 89%, 적어도 90%, 적어도 91%, 적어도 92%, 적어도 93%, 적어도 94%, 적어도 95%, 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 또는 적어도 99% 서열 동일성을 갖는다.
일부 양상에서, 단리된 항-PD-L1 항체는 비글리코실화된다. 항체의 글리코실화는 전형적으로, N-연결되거나 또는 O-연결된다. "N-연결된"은 아스파라긴 잔기의 측쇄에 탄수화물 모이어티의 부착을 지칭한다. 삼중펩티드 서열 아스파라긴-X-세린 및 아스파라긴-X-트레오닌 (여기서 X는 프롤린을 제외한 임의의 아미노산이다)은 아스파라긴 측쇄에 탄수화물 모이어티의 효소적 부착을 위한 인식 서열이다. 따라서, 폴리펩티드 내에 이들 삼중펩티드 서열 중 어느 하나의 존재는 잠재적 글리코실화 부위를 창출한다. O-연결된 글리코실화는 비록 5-히드록시프롤린 또는 5-히드록시리신 또한 이용될 수 있긴 하지만, 히드록시아미노산, 가장 흔하게는 세린 또는 트레오닌에 당 N-아세틸갈락토사민, 갈락토오스, 또는 자일로오스 중에서 한 가지의 부착을 지칭한다. 항체로부터 글리코실화 부위의 제거는 전술된 트리펩티드 서열 (N-연결된 글리코실화 부위의 경우) 중에서 한 가지가 제거되도록, 아미노산 서열을 변경함으로써 편의하게 달성된다. 변경은 글리코실화 부위 내에 아스파라긴, 세린 또는 트레오닌 잔기의 다른 아미노산 잔기로의 치환 (예를 들면, 글리신, 알라닌 또는 보존성 치환)에 의해 만들어질 수 있다.
본원에서 임의의 양상에서, 단리된 항-PD-L1 항체는 인간 PD-L1, 예를 들면, UniProtKB/Swiss-Prot 수탁 번호 Q9NZQ7.1에서 도시된 바와 같은 인간 PD-L1, 또는 이의 변이체에 결합할 수 있다.
항-PD-1 항체
일부 양상에서, 항-PD-1 항체는 MDX-1106이다. "MDX-1106"에 대한 대안적 명칭은 MDX-1106-04, ONO-4538, BMS-936558, 또는 니볼루맙을 포함한다. 일부 양상에서, 항-PD-1 항체는 니볼루맙 (CAS 등록 번호: 946414-94-4)이다. 다른 추가의 양상에서, 서열 번호: 1로부터 중쇄 가변 영역 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역 및/또는 서열 번호: 2로부터 경쇄 가변 영역 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역을 포함하는 단리된 항-PD-1 항체가 제공된다. 다른 추가의 양상에서, 중쇄 및/또는 경쇄 서열을 포함하는 단리된 항-PD-1 항체가 제공되는데, 여기서:
(a) 중쇄 서열은 하기 중쇄 서열에 적어도 85%, 적어도 90%, 적어도 91%, 적어도 92%, 적어도 93%, 적어도 94%, 적어도 95%, 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 적어도 99% 또는 100% 서열 동일성을 갖고:QVQLVESGGGVVQPGRSLRLDCKASGITFSNSGMHWVRQAPGKGLEWVAVIWYDGSKRYYADSVKGRFTISRDNSKNTLFLQMNSLRAEDTAVYYCATNDDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTKTYTCNVDHKPSNTKVDKRVESKYGPPCPPCPAPEFLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLGK (서열 번호: 1), 그리고
(b) 경쇄 서열은 하기 경쇄 서열에 적어도 85%, 적어도 90%, 적어도 91%, 적어도 92%, 적어도 93%, 적어도 94%, 적어도 95%, 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 적어도 99% 또는 100% 서열 동일성을 갖는다:EIVLTQSPATLSLSPGERATLSCRASQSVSSYLAWYQQKPGQAPRLLIYDASNRATGIPARFSGSGSGTDFTLTISSLEPEDFAVYYCQQSSNWPRTFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC (서열 번호: 2).
핵산, 숙주 세포 및 벡터
다른 추가의 양상에서, 본원에서 설명된 임의의 항체를 인코딩하는 단리된 핵산이 제공된다. 일부 양상에서, 핵산은 임의의 전술된 항-PD-L1 항체를 인코딩하는 핵산의 발현에 적합한 벡터를 더욱 포함한다. 다른 추가의 특정한 양상에서, 벡터는 핵산의 발현에 적합한 숙주 세포 내에 있다. 다른 추가의 특정한 양상에서, 숙주 세포는 진핵 세포 또는 원핵 세포이다. 다른 추가의 특정한 양상에서, 진핵 세포는 포유류 세포, 예컨대 중국 햄스터 난소 (CHO) 세포이다.
항체 또는 이의 항원 결합 단편은 당해 분야에서 공지된 방법을 이용하여, 예를 들면, 발현에 적합한 형태에서 임의의 전술된 항-PD-L1 항체 또는 항원 결합 단편을 인코딩하는 핵산을 내포하는 숙주 세포를 이런 항체 또는 단편을 생산하는 데 적합한 조건하에 배양하고, 그리고 상기 항체 또는 단편을 회수하는 단계를 포함하는 과정에 의해, 또는 아래의 섹션 VI에서 설명된 임의의 방법에 따라서 만들어질 수 있다.
VI. 항체 특성 및 제조
본원에서 설명된 항체는 항체를 생성하기 위한 당해 분야에서 가용한 기술을 이용하여 제조되고, 이들의 예시적인 방법은 하기 섹션에서 더 상세하게 설명된다.
항체는 관심되는 항원 (예를 들면, PD-L1 (예컨대 인간 PD-L1), PD-1 (예컨대 인간 PD-1), PD-L2 (예컨대 인간 PD-L2) 등)을 향해 지향된다. 바람직하게는, 항원은 생물학적으로 중요한 폴리펩티드이고, 그리고 장애를 앓는 포유동물에게 항체의 투여는 상기 포유동물에서 치료적 유익성을 유발할 수 있다.
일정한 양상에서, 본원에서 제공된 항체는 ≤ 1μM, ≤ 150 nM, ≤ 100 nM, ≤ 50 nM, ≤ 10 nM, ≤ 1 nM, ≤ 0.1 nM, ≤ 0.01 nM, 또는 ≤ 0.001 nM (예를 들면, 10-8 M 이하, 예를 들면 10-8 M 내지 10-13 M, 예를 들면 10-9 M 내지 10-13 M)의 해리 상수 (Kd)를 갖는다.
한 가지 양상에서, Kd는 하기 검정에 의해 설명된 바와 같이, 관심되는 항체의 Fab 이형 및 이의 항원으로 수행된 방사성표지화된 항원 결합 검정 (RIA)에 의해 계측된다. 항원에 대한 Fab의 용해 결합 친화성은 표지화되지 않은 항원의 적정 연속의 존재에서 Fab를 최소 농도의 (125I)-표지화 항원과 평형시키고, 이후 결합된 항원을 항-Fab 항체-코팅된 평판으로 포획함으로써 계측된다 (참조: 예를 들면, Chen et al., J. Mol. Biol. 293:865-881(1999)). 검정을 위한 조건을 확립하기 위해, MICROTITER® 다중웰 평판 (Thermo Scientific)이 50 mM 탄산나트륨 (pH 9.6)에서 5 μg/ml의 포획 항-Fab 항체 (Cappel Labs)로 하룻밤 동안 코팅되고, 그리고 차후에, 실온 (대략 23℃)에서 2 내지 5 시간 동안 PBS에서 2% (w/v) 소 혈청 알부민으로 차단된다. 비흡착성 평판 (Nunc #269620)에서, 100 pM 또는 26 pM [125I]-항원이 관심되는 Fab의 연속 희석액과 혼합된다. 관심되는 Fab는 이후, 하룻밤 동안 항온처리된다; 하지만, 항온처리는 평형이 도달되도록 담보하기 위해 더 긴 기간 (예를 들면, 약 65 시간) 동안 계속될 수도 있다. 그 후에, 혼합물이 실온에서 항온처리를 위해 포획 평판으로 이전된다 (예를 들면, 1 시간 동안). 용액은 이후, 제거되고, 그리고 평판이 PBS에서 0.1% 폴리소르베이트 20 (TWEEN-20®)으로 8회 세척된다. 평판이 건조될 때, 150 μl/웰의 신틸란트 (MICROSCINT-20TM; Packard)가 첨가되고, 그리고 이들 평판은 TOPCOUNT™ 감마 계수기 (Packard)에서 10 분 동안 계수된다. 최대 결합의 20%보다 적거나 같은 결합을 제공하는 각 Fab의 농도가 경쟁적 결합 검정에서 이용을 위해 선택된다.
다른 양상에 따라서, Kd는 대략 10 반응 단위 (RU)에서 고정된 항원 CM5 칩으로 25℃에서 BIACORE®-2000 또는 BIACORE®-3000 (BIAcore, Inc., Piscataway, NJ)을 이용한 표면 플라스몬 공명 검정을 이용하여 계측된다. 간단히 말하면, 카르복시메틸화된 덱스트란 바이오센서 칩 (CM5, BIACORE, Inc.)은 공급업체의 사용설명서에 따라서 N-에틸-N'- (3-디메틸아미노프로필)-카르보디이미드 염산염 (EDC) 및 N-히드록시숙신이미드 (NHS)로 활성화된다. 항원은 거의 10 반응 단위 (RU)의 연계된 단백질을 달성하기 위해, 5 μl/분의 유속으로 주입 전 10 mM 아세트산나트륨, pH 4.8로 5 μg/ml (대략 0.2 μM)까지 희석된다. 항원의 주입 이후에, 반응하지 않은 기를 차단하기 위해 1 M 에탄올아민이 주입된다. 동역학 계측을 위해, Fab의 2배 연속 희석액 (0.78 nM 내지 500 nM)이 거의 25 μl/분의 유속에서 25℃에서 0.05% 폴리소르베이트 20 (TWEEN-20™) 계면활성제 (PBST)를 포함하는 PBS에 주입된다. 연관 속도 (k온) 및 해리 속도 (k오프)는 연관 및 해리 센서그램을 동시에 적합시킴으로써 단순한 1 대 1 랭뮤어 결합 모형 (BIACORE® 평가 소프트웨어 버전 3.2)을 이용하여 계산된다. 평형 해리 상수 (Kd)는 비율 k오프/k온으로서 계산된다. 참조: 예를 들면, Chen et al., J. Mol. Biol. 293:865-881 (1999). 온 레이트가 상기 표면 플라스몬 공명 검정에 의해 106 M-1 s-1를 초과하면, 온 레이트는 분광계, 예컨대 정지-유동 구비된 분광광도계 (Aviv Instruments) 또는 교반 큐벳이 달린 8000-시리즈 SLM-AMINCOTM 분광광도계 (ThermoSpectronic)에서 계측될 때 증가하는 농도의 항원의 존재에서 PBS, pH 7.2에서, 20 nM 항-항원 항체 (Fab 형태)의 25℃에서 형광 방출 강도 (여기 = 295 nm; 방출 = 340 nm, 16 nm 대역)의 증가 또는 감소를 계측하는 형광 퀀칭 기술을 이용함으로써 결정될 수 있다.
(i) 항원 제조
다른 분자에 임의적으로 접합된 가용성 항원 또는 이들의 단편이 항체를 생성하기 위한 면역원으로서 이용될 수 있다. 막경유 분자, 예컨대 수용체의 경우에, 이들의 단편 (예를 들면, 수용체의 세포외 도메인)이 면역원으로서 이용될 수 있다. 대안으로, 막경유 분자를 발현하는 세포가 면역원으로서 이용될 수 있다. 이런 세포는 자연 공급원 (예를 들면, 암 세포주)로부터 유래될 수 있거나, 또는 막경유 분자를 발현하기 위해 재조합 기술에 의해 형질전환된 세포일 수 있다. 항체를 제조하는 데 유용한 다른 항원 및 이들의 형태는 당업자에게 명백할 것이다.
(ii) 일정한 항체 기반 방법
다중클론 항체는 바람직하게는, 유관한 항원 및 보조제의 복수의 피하 (s.c.) 또는 복막내 (i.p.) 주사에 의해 동물에서 조성된다. 이것은 이중기능성 또는 유도체화 작용제, 예를 들면, 말레이미도벤조일 술포숙신이미드 에스테르 (시스테인 잔기를 통한 접합), N-히드록시숙신이미드 (리신 잔기를 통해), 글루타르알데히드, 숙신산 무수물, SOCl2, 또는 R1N=C=NR (여기서 R과 R1은 상이한 알킬 기이다)를 이용하여, 면역화되는 종에서 면역원성인 단백질, 예를 들면, 키홀 림펫 헤모시아닌, 혈청 알부민, 소 티로글로불린, 또는 콩 트립신 저해제에 유관한 항원을 접합하는 데 유용할 수 있다.
동물은 예를 들면, 100 μg 또는 5 μg의 단백질 또는 접합체 (각각, 토끼 또는 생쥐의 경우)를 3 용적의 프로인드 완전 보조제와 조합하고 용액을 복수 부위에서 피내 주사함으로써, 항원, 면역원성 접합체, 또는 유도체에 대항하여 면역화된다. 1 개월 후, 이들 동물은 복수 부위에서 피하 주사에 의해, 프로인드 완전 보조제에서 펩티드 또는 접합체의 최초 양의 1/5 내지 1/10로 추가접종된다. 7 내지 14 일 후, 이들 동물은 채혈되고, 그리고 혈청이 항체 역가에 대해 검정된다. 동물은 역가가 안정 상태를 유지할 때까지 추가접종된다. 바람직하게는, 동물은 동일한 항원의 접합체로 추가접종되지만, 상이한 단백질에 및/또는 상이한 교차연결 시약을 통해 접합된다. 접합체는 또한, 재조합 세포 배양 동안 단백질 융합체로서 만들어질 수 있다. 또한, 응집 작용제, 예컨대 백반이 면역 반응을 증강하는 데 적절하게 이용된다.
본원 발명의 단일클론 항체는 인간-인간 하이브리도마에 관하여 Kohler et al., Nature, 256:495 (1975)에 의해 처음 설명되고, 그리고 예를 들면, Hongo et al., Hybridoma, 14 (3): 253-260 (1995), Harlow et al., Antibodies: A Laboratory Manual, (Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2nd ed. 1988); Hammerling et al., in: Monoclonal Antibodies and T-Cell Hybridomas 563-681 (Elsevier, N.Y., 1981), 그리고 Ni, Xiandai Mianyixue, 26(4):265-268 (2006)에서 더욱 설명되는 하이브리도마 방법을 이용하여 만들어질 수 있다. 추가 방법은 예를 들면, 하이브리도마 세포주로부터 단일클론 인간 자연 IgM 항체의 생산에 관하여 U.S. 특허 번호 7,189,826에서 설명된 것들을 포함한다. 인간 하이브리도마 기법 (트리오마 기술)은 Vollmers and Brandlein, Histology and Histopathology, 20(3):927-937 (2005) 및 Vollmers and Brandlein, Methods and Findings in Experimental and Clinical Pharmacology, 27(3):185-91 (2005)에서 설명된다.
다양한 다른 하이브리도마 기술에 대해, 예를 들면, U.S. 특허 공개 번호 2006/258841; 2006/183887 (완전 인간 항체), 2006/059575; 2005/287149; 2005/100546; 및 2005/026229; 그리고 U.S. 특허 번호 7,078,492 및 7,153,507을 참조한다. 하이브리도마 방법을 이용하여 단일클론 항체를 생산하기 위한 예시적인 프로토콜은 하기와 같이 설명된다. 한 가지 양상에서, 생쥐 또는 다른 적절한 숙주 동물, 예컨대 햄스터는 면역화에 이용된 단백질에 특이적으로 결합할 항체를 생산하거나 또는 생산할 수 있는 림프구를 이끌어 내기 위해 면역화된다. 항체는 본원 발명의 폴리펩티드 또는 이의 단편, 그리고 보조제, 예컨대 모노포스포릴 지질 A (MPL)/트레할로스 디크리노미콜레이트 (TDM)의 복수의 피하 (SC) 또는 복막내 (IP) 주사에 의해 동물에서 조성된다 (Ribi Immunochem. Research, Inc., Hamilton, MT). 폴리펩티드 (예를 들면, 항원) 또는 이의 단편은 당해 분야에서 널리 공지된 방법, 예컨대 재조합 방법을 이용하여 제조될 수 있는데, 이들 중에서 일부는 본원에서 더욱 설명된다. 면역화된 동물로부터 혈청은 항-항원 항체에 대해 검정되고, 그리고 부스터 면역화가 임의적으로 투여된다. 항-항원 항체를 생산하는 동물로부터 림프구가 단리된다. 대안으로, 림프구는 시험관내에서 면역화될 수 있다.
림프구는 이후, 하이브리도마 세포를 형성하기 위해, 적합한 융합 작용제, 예컨대 폴리에틸렌 글리콜을 이용하여 골수종 세포주와 융합된다. 참조: 예를 들면, Goding, Monoclonal Antibodies: Principles and Practice, pp. 59-103 (Academic Press, 1986). 효율적으로 융합하고, 선별된 항체 생산 세포에 의한 항체의 안정된 높은-수준 생산을 뒷받침하고, 그리고 배지, 예컨대 HAT 배지에 민감한 골수종 세포가 이용될 수 있다. 예시적인 골수종 세포는 뮤린 골수종 라인, 예컨대 Salk Institute Cell Distribution Center, San Diego, Calif. USA로부터 가용한 MOPC-21과 MPC-11 생쥐 종양으로부터 유래된 것들, 그리고 American Type Culture Collection, Rockville, Md. USA로부터 가용한 SP-2 또는 X63-Ag8-653 세포를 포함하지만 이들에 한정되지 않는다. 인간 단일클론 항체의 생산을 위한 인간 골수종 및 생쥐-인간 헤테로골수종 세포주 또한 설명되었다 (Kozbor, J. Immunol., 133:3001 (1984); Brodeur et al., Monoclonal Antibody Production Techniques and Applications, pp. 51-63 (Marcel Dekker, Inc., New York, 1987)).
이렇게 제조된 하이브리도마 세포는 적합한 배양 배지, 예를 들면, 융합되지 않은, 부모 골수종 세포의 성장 또는 생존을 저해하는 한 가지 이상의 물질을 내포하는 배지에서 파종되고 성장된다. 예를 들면, 부모 골수종 세포가 효소 하이포크산틴 구아닌 포스포리보실 전달효소 (HGPRT 또는 HPRT)를 결여하면, 하이브리도마에 대한 배양 배지는 전형적으로, 하이포크산틴, 아미노프테린 및 티미딘 (HAT 배지)을 포함할 것인데, 이들 물질은 HGPRT-결함성 세포의 성장을 예방한다. 바람직하게는, 혈청 없는 하이브리도마 세포 배양 방법이 예를 들면, Even et al., Trends in Biotechnology, 24(3), 105-108 (2006)에서 설명된 바와 같이, 동물 유래된 혈청, 예컨대 소 태아 혈청의 이용을 감소시키는 데 이용된다.
하이브리도마 세포 배양액의 생산성을 향상시키기 위한 도구로서 올리고펩티드는 Franek, Trends in Monoclonal Antibody Research, 111-122 (2005)에서 설명된다. 구체적으로, 표준 배양 배지는 일정한 아미노산 (알라닌, 세린, 아스파라긴, 프롤린)으로, 또는 단백질 가수분해 분획물로 농축되고, 그리고 아폽토시스가 3 내지 6개의 아미노산 잔기로 구성되는 합성 올리고펩티드에 의해 유의미하게 억제될 수 있다. 이들 펩티드는 밀리몰 이상의 농도로 존재한다.
하이브리도마 세포가 성장하는 배양 배지는 본원에서 개시된 항체에 결합하는 단일클론 항체의 생산에 대해 검정될 수 있다. 하이브리도마 세포에 의해 생산된 단일클론 항체의 결합 특이성은 면역침전에 의해 또는 시험관내 결합 검정, 예컨대 방사면역검정 (RIA) 또는 효소 결합 면역흡착 검정 (ELISA)에 의해 결정될 수 있다. 단일클론 항체의 결합 친화성은 예를 들면, 스캐차드 분석에 의해 결정될 수 있다. 참조: 예를 들면, Munson et al., Anal. Biochem., 107:220 (1980).
원하는 특이성, 친화성 및/또는 활성의 항체를 생산하는 하이브리도마 세포가 확인된 후, 클론은 제한 희석 절차에 의해 하위클로닝되고 표준 방법에 의해 성장될 수 있다. 참조: 예를 들면, Goding, 위와 같음. 이런 목적으로 적합한 배양 배지는 예를 들면, D-MEM 또는 RPMI-1640 배지를 포함한다. 이에 더하여, 하이브리도마 세포는 동물 내에 복수 종양으로서 생체내에서 성장될 수 있다. 하위클론에 의해 분비된 단일클론 항체는 전통적인 면역글로불린 정제 절차, 예컨대 예를 들면, 단백질 A-세파로오스, 수산화인회석 크로마토그래피, 겔 전기이동, 투석, 또는 친화성 크로마토그래피에 의해 배양 배지, 복수 유체 또는 혈청으로부터 적절하게 분리된다. 하이브리도마 세포로부터 단백질의 단리를 위한 한 가지 절차는 US 2005/176122 및 U.S. 특허 번호 6,919,436에서 설명된다. 상기 방법은 결합 과정에서 최소의 염, 예컨대 친액 염을 이용하고, 그리고 바람직하게는 또한, 용리 과정에서 소량의 유기 용매를 이용하는 단계를 포함한다.
(iii) 라이브러리 유래된 항체
본원에서 개시된 항체는 원하는 활성 또는 활성들을 갖는 항체에 대해 조합 라이브러리를 선별검사함으로써 단리될 수 있다. 예를 들면, 파지 전시 라이브러리를 생성하고, 그리고 원하는 결합 특징을 소유하는 항체에 대해 이런 라이브러리를 선별검사하기 위한 다양한 방법이 당해 분야에서 공지된다. 추가 방법은 예를 들면, Hoogenboom et al., in Methods in Molecular Biology 178:1-37 (O'Brien et al., ed., Human Press, Totowa, NJ, 2001)에서 검토되고, 그리고 예를 들면, McCafferty et al., Nature 348:552-554; Clackson et al., Nature 352: 624-628 (1991); Marks et al., J. Mol. Biol. 222: 581-597 (1992); Marks and Bradbury, in Methods in Molecular Biology 248:161-175 (Lo, ed., Human Press, Totowa, NJ, 2003); Sidhu et al., J. Mol. Biol. 338(2): 299-310 (2004); Lee et al., J. Mol. Biol. 340(5): 1073-1093 (2004); Fellouse, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 101(34): 12467-12472 (2004); 및 Lee et al., J. Immunol. Methods 284(1-2): 119-132(2004)에서 더욱 설명된다.
일정한 파지 전시 방법에서, VH와 VL 유전자의 레퍼토리는 중합효소 연쇄 반응 (PCR)에 의해 별개로 클로닝되고 파지 라이브러리에서 무작위로 재조합되는데, 이들 라이브러리는 이후, Winter et al., Ann. Rev. Immunol., 12: 433-455 (1994)에서 설명된 바와 같이 항원 결합 파지에 대해 선별검사될 수 있다. 파지는 전형적으로, 단일 사슬 Fv (scFv) 단편으로서 또는 Fab 단편으로서 항체 단편을 전시한다. 면역화된 공급원으로부터 라이브러리는 하이브리도마를 작제하는 요건 없이 면역원에 대한 높은 친화성 항체를 제공한다. 대안으로, 미경험 레퍼토리는 Griffiths et al., EMBO J, 12: 725-734 (1993)에 의해 설명된 바와 같이, 면역화 없이 넓은 범위의 비자가 및 또한 자가 항원에 대한 항체의 단일 공급원을 제공하도록 클로닝될 수 있다 (예를 들면, 인간으로부터). 최종적으로, 미경험 라이브러리는 또한, Hoogenboom and Winter, J. Mol. Biol., 227: 381-388 (1992)에 의해 설명된 바와 같이, 줄기 세포로부터 재배열되지 않은 V-유전자 분절을 클로닝하고, 그리고 고도로 가변적 CDR3 영역을 인코딩하고 시험관내에서 재배열을 달성하기 위한 무작위 서열을 내포하는 PCR 프라이머를 이용함으로써 합성적으로 만들어질 수 있다. 인간 항체 파지 라이브러리를 설명하는 특허 공보는 예를 들면, US 특허 번호 5,750,373, 그리고 US 특허 공개 번호 2005/0079574, 2005/0119455, 2005/0266000, 2007/0117126, 2007/0160598, 2007/0237764, 2007/0292936 및 2009/0002360을 포함한다.
인간 항체 라이브러리로부터 단리된 항체 또는 항체 단편은 본원에서 인간 항체 또는 인간 항체 단편인 것으로 고려된다.
(iv) 키메라, 인간화 및 인간 항체
일정한 양상에서, 본원에서 제공된 항체는 키메라 항체이다. 일정한 키메라 항체는 예를 들면, U.S. 특허 번호 4,816,567; 및 Morrison et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 81:6851-6855 (1984)에서 설명된다. 한 가지 실례에서, 키메라 항체는 비인간 가변 영역 (예를 들면, 생쥐, 쥐, 햄스터, 토끼, 또는 비인간 영장류, 예컨대 원숭이로부터 유래된 가변 영역) 및 인간 불변 영역을 포함한다. 추가의 실례에서, 키메라 항체는 "부류 전환된" 항체인데, 여기서 부류 또는 하위부류가 부모 항체의 것으로부터 변화되었다. 키메라 항체는 이들의 항원 결합 단편을 포함한다.
일정한 양상에서, 키메라 항체는 인간화 항체이다. 전형적으로, 비인간 항체는 부모 비인간 항체의 특이성 및 친화성을 유지하면서, 인간에 대한 면역원성을 감소시키기 위해 인간화된다. 일반적으로, 인간화 항체는 HVR, 예를 들면 CDR (또는 이들의 부분)이 비인간 항체로부터 유래되고, 그리고 FR (또는 이들의 부분)이 인간 항체 서열로부터 유래되는 하나 이상의 가변 도메인을 포함한다. 인간화 항체는 임의적으로, 인간 불변 영역의 적어도 일부를 또한 포함할 것이다. 일부 양상에서, 인간화 항체에서 일부 FR 잔기는 예를 들면, 항체 특이성 또는 친화성을 복원하거나 또는 향상시키기 위해, 비인간 항체 (예를 들면, HVR 잔기가 유래되는 항체)로부터 상응하는 잔기로 치환된다.
인간화 항체 및 이들을 만드는 방법은 예를 들면, Almagro and Fransson, Front. Biosci. 13:1619-1633 (2008)에서 검토되고, 그리고 예를 들면, Riechmann et al., Nature 332:323-329 (1988); Queen et al., Proc. Nat'l Acad. Sci. USA 86:10029-10033 (1989); US 특허 번호 5, 821,337, 7,527,791, 6,982,321 및 7,087,409; Kashmiri et al., Methods 36:25-34 (2005) (SDR (a-CDR) 합체를 설명); Padlan, Mol. Immunol. 28:489-498 (1991) ("표면치환"을 설명); Dall'Acqua et al., Methods 36:43-60 (2005) ("FR 셔플링"을 설명); 그리고 Osbourn et al., Methods 36:61-68 (2005) 및 Klimka et al., Br. J. Cancer, 83:252-260 (2000) (FR 셔플링에 대한 "보도된 선택" 접근법을 설명)에서 더욱 설명된다.
인간화에 이용될 수 있는 인간 프레임워크 영역은 다음을 포함하지만 이들에 한정되지 않는다: "최고 적합" 방법을 이용하여 선택된 프레임워크 영역 (참조: 예를 들면, Sims et al. J. Immunol. 151:2296 (1993)); 경쇄 또는 중쇄 가변 영역의 특정 하위군의 인간 항체의 공통 서열로부터 유래된 프레임워크 영역 (참조: 예를 들면, Carter et al. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 89:4285 (1992); 및 Presta et al. J. Immunol., 151:2623 (1993)); 인간 성숙 (체성으로 돌연변이된) 프레임워크 영역 또는 인간 생식계열 프레임워크 영역 (참조: 예를 들면, Almagro and Fransson, Front. Biosci. 13:1619-1633 (2008)); 그리고 선별검사 FR 라이브러리로부터 유래된 프레임워크 영역 (참조: 예를 들면, Baca et al., J. Biol. Chem. 272:10678-10684 (1997) 및 Rosok et al., J. Biol. Chem. 271:22611-22618 (1996)).
일정한 양상에서, 본원에서 제공된 항체는 인간 항체이다. 인간 항체는 당해 분야에서 공지된 다양한 기술을 이용하여 생산될 수 있다. 인간 항체는 van Dijk and van de Winkel, Curr. Opin. Pharmacol. 5: 368-74 (2001) 및 Lonberg, Curr. Opin. Immunol. 20:450-459 (2008)에서 전반적으로 설명된다.
인간 항체는 항원 공격에 대한 응답으로 무손상 인간 항체 또는 인간 가변 영역을 포함하는 무손상 항체를 생산하도록 변형된 유전자도입 동물에 면역원을 투여함으로써 제조될 수 있다. 이런 동물은 전형적으로, 내인성 면역글로불린 좌위를 대체하거나, 또는 염색체외로 존재하거나 또는 동물의 염색체 내로 무작위로 통합되는 인간 면역글로불린 좌위 중에서 전부 또는 일부를 내포한다. 이런 유전자도입 생쥐에서, 내인성 면역글로불린 좌위는 일반적으로 비활성화된다. 유전자도입 동물로부터 인간 항체를 획득하기 위한 방법에 관한 검토를 위해, Lonberg, Nat. Biotech. 23:1117-1125 (2005)를 참조한다. 또한, 예를 들면, XENOMOUSETM 기술을 설명하는 U.S. 특허 번호 6,075,181 및 6,150,584; HUMAB® 기술을 설명하는 U.S. 특허 번호 5,770,429; K-M MOUSE® 기술을 설명하는 U.S. 특허 번호 7,041,870, 그리고 VELOCIMOUSE® 기술을 설명하는 U.S. 특허 출원 공개 번호 US 2007/0061900을 참조한다). 이런 동물에 의해 생성된 무손상 항체로부터 인간 가변 영역은 예로서, 상이한 인간 불변 영역과 조합함으로써 더욱 변형될 수 있다.
인간 항체는 또한, 하이브리도마-기초된 방법에 의해 만들어질 수 있다. 인간 단일클론 항체의 생산을 위한 인간 골수종 및 생쥐-인간 헤테로골수종 세포주가 설명되었다. (참조: 예를 들면, Kozbor J. Immunol., 133: 3001 (1984); Brodeur et al., Monoclonal Antibody Production Techniques and Applications, pp. 51-63 (Marcel Dekker, Inc., New York, 1987); 및 Boerner et al., J. Immunol., 147: 86 (1991).) 인간 B 세포 하이브리도마 기법을 통해 생성된 인간 항체 역시 Li et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 103:3557-3562 (2006)에서 설명된다. 추가 방법은 예를 들면, U.S. 특허 번호 7,189,826 (하이브리도마 세포주로부터 단일클론 인간 IgM 항체의 생산을 설명) 및 Ni, Xiandai Mianyixue, 26(4):265-268 (2006) (인간-인간 하이브리도마를 설명)에서 설명된 것들을 포함한다. 인간 하이브리도마 기법 (트리오마 기술) 역시 Vollmers and Brandlein, Histology and Histopathology, 20(3):927-937 (2005) 및 Vollmers and Brandlein, Methods and Findings in Experimental and Clinical Pharmacology, 27(3):185-91 (2005)에서 설명된다.
인간 항체는 또한, 인간-유래된 파지 전시 라이브러리에서 선택되는 Fv 클론 가변 도메인 서열을 단리함으로써 생성될 수 있다. 이런 가변 도메인 서열은 이후, 원하는 인간 불변 도메인과 조합될 수 있다. 항체 라이브러리로부터 인간 항체를 선택하기 위한 기술은 아래에 설명된다.
(v) 항체 단편
항체 단편은 전통적인 수단, 예컨대 효소적 소화에 의해, 또는 재조합 기술에 의해 생성될 수 있다. 일정한 환경에서는 전체 항체보다 항체 단편을 이용하는 것이 이점이 있다. 단편의 더 작은 크기는 신속한 청소를 허용하고, 그리고 고형 종양에 대한 향상된 접근을 야기할 수 있다. 일정한 항체 단편에 관한 검토를 위해, Hudson et al. (2003) Nat. Med. 9:129-134를 참조한다.
항체 단편의 생산을 위한 다양한 기술이 개발되었다. 전통적으로, 이들 단편은 무손상 항체의 단백질분해성 소화를 통해 도출되었다 (예를 들면, Morimoto et al., Journal of Biochemical and Biophysical Methods 24:107-117 (1992); 및 Brennan et al., Science, 229:81 (1985)을 참조한다). 하지만, 이들 단편은 현재, 재조합 숙주 세포에 의해 직접적으로 생산될 수 있다. Fab, Fv 및 scFv 항체 단편은 모두 대장균 (E. coli)에서 발현되고 이들로부터 분비될 수 있고, 따라서 이들 단편의 손쉬운 대량 생산이 가능하다. 항체 단편은 상기 논의된 항체 파지 라이브러리로부터 단리될 수 있다. 대안으로, Fab'-SH 단편은 대장균 (E. coli)으로부터 직접적으로 회수되고 화학적으로 연계되어 F(ab')2 단편을 형성할 수 있다 (Carter et al., Bio/Technology 10:163-167 (1992)). 다른 접근법에 따라서, F(ab')2 단편은 재조합 숙주 세포 배양액으로부터 직접적으로 단리될 수 있다. 구제 수용체 결합 에피토프 잔기를 포함하는, 생체내에서 증가된 반감기를 갖는 Fab와 F(ab')2 단편은 U.S. 특허 번호 5,869,046에서 설명된다. 항체 단편의 생산을 위한 다른 기술은 당업자에게 명백할 것이다. 일정한 양상에서, 항체는 단일 사슬 Fv 단편 (scFv)이다. 참조: 예를 들면, WO 93/16185; U.S. 특허 번호 5,571,894; 및 5,587,458. Fv 및 scFv는 불변 영역을 결여하는 무손상 조합 부위를 갖는 유일한 종류들이다; 따라서, 이들은 생체내 이용 동안 감소된 비특이적 결합에 적합할 수 있다. scFv 융합 단백질은 scFv의 아미노 또는 카르복시 말단 중 어느 한 가지에서 효과기 단백질의 융합을 생성하기 위해 작제될 수 있다. 참조: Antibody Engineering, ed. Borrebaeck, 위와 같음. 항체 단편은 또한, 예를 들면, U.S. 특허 번호 5,641,870에서 설명된 바와 같은 "선형 항체"일 수 있다. 이런 선형 항체는 단일특이적 또는 이중특이적일 수 있다.
(vi) 다중특이적 항체
다중특이적 항체는 적어도 2개의 상이한 에피토프에 대한 결합 특이성을 갖는데, 여기서 이들 에피토프는 통상적으로 상이한 항원으로부터 유래된다. 이런 분자는 정상적으로는 2개의 상이한 에피토프 (다시 말하면, 이중특이적 항체, BsAbs)에만 결합할 것이지만, 본원에서 이용될 때 이러한 표현은 추가 특이성을 갖는 항체, 예컨대 삼중특이적 항체를 포괄한다. 이중특이적 항체는 전장 항체 또는 항체 단편 (예를 들면, F(ab')2 이중특이적 항체)으로서 제조될 수 있다.
이중특이적 항체를 만들기 위한 방법은 당해 분야에서 공지된다. 전장 이중특이적 항체의 전통적인 생산은 2개의 면역글로불린 중쇄-경쇄 쌍의 공동발현에 기초되는데, 여기서 2개의 사슬은 상이한 특이성을 갖는다 (참조: 예를 들면, Millstein et al., Nature, 305:537-539 (1983)). 면역글로불린 중쇄와 경쇄의 무작위 조합 때문에, 이들 하이브리도마 (쿠아드로마)는 10가지 상이한 항체 분자의 잠재적 혼합물을 생산하는데, 이들 중에서 단지 하나만 정확한 이중특이적 구조를 갖는다. 통상적으로 친화성 크로마토그래피 단계에 의해 행위되는 정확한 분자의 정제는 상당히 번거롭고, 그리고 산물 수율이 낮다. 유사한 절차가 WO 93/08829에서 및 Traunecker et al., EMBO J., 10:3655-3659 (1991)에서 개시된다.
이중특이적 항체를 만들기 위한 당해 분야에서 공지된 한 가지 접근법은 "노브 인투 홀" 또는 "공동 내로의 융기" 접근법이다 (참조: 예를 들면, US 특허 번호 5,731,168). 이러한 접근법에서, 2개의 면역글로불린 폴리펩티드 (예를 들면, 중쇄 폴리펩티드)는 각각 인터페이스를 포함한다. 한쪽 면역글로불린 폴리펩티드의 인터페이스가 다른 면역글로불린 폴리펩티드 상에서 상응하는 인터페이스와 상호작용하고, 그것에 의하여 이들 2개의 면역글로불린 폴리펩티드는 연관할 수 있게 된다. 이들 인터페이스는 한쪽 면역글로불린 폴리펩티드의 인터페이스에서 위치된 "노브" 또는 "융기" (이들 용어는 본원에서 교체가능하게 이용될 수 있다)가 다른 면역글로불린 폴리펩티드의 인터페이스에서 위치된 "홀" 또는 "공동" (이들 용어는 본원에서 교체가능하게 이용될 수 있다)과 부합하도록 조작될 수 있다. 일부 양상에서, 홀은 노브와 동일하거나 또는 유사한 크기이고, 그리고 2개의 인터페이스가 상호작용할 때, 한쪽 인터페이스의 노브가 다른 인터페이스의 상응하는 홀에서 위치가능하도록 적절하게 배치된다. 이론에 한정됨 없이, 이것은 이종다합체를 안정시키고, 그리고 다른 종류, 예를 들면 동종다합체에 비하여 이종다합체의 형성에 대해 우호적인 것으로 생각된다. 일부 양상에서, 이러한 접근법은 2개의 상이한 면역글로불린 폴리펩티드의 이종다합체화를 증진하여, 상이한 에피토프에 대한 결합 특이성을 갖는 2개의 면역글로불린 폴리펩티드를 포함하는 이중특이적 항체를 창출하는 데 이용될 수 있다.
일부 양상에서, 노브는 작은 아미노산 측쇄를 더 큰 측쇄로 대체함으로써 작제될 수 있다. 일부 양상에서, 홀은 큰 아미노산 측쇄를 더 작은 측쇄로 대체함으로써 작제될 수 있다. 노브 또는 홀은 본래 인터페이스 내에 존재할 수 있거나, 또는 이들은 합성적으로 도입될 수 있다. 예를 들면, 노브 또는 홀은 인터페이스를 인코딩하는 핵산 서열을 변경하여, 적어도 하나의 "본래" 아미노산 잔기를 적어도 하나의 "외래" 아미노산 잔기로 대체함으로써 합성적으로 도입될 수 있다. 핵산 서열을 변경하기 위한 방법은 당해 분야에서 널리 공지된 표준 분자생물학 기술을 포함할 수 있다. 다양한 아미노 잔기의 측쇄 용적이 다음의 표에서 도시된다. 일부 양상에서, 본래 잔기는 작은 측쇄 용적 (예를 들면, 알라닌, 아스파라긴, 아스파르트산, 글리신, 세린, 트레오닌, 또는 발린)을 갖고, 그리고 노브를 형성하기 위한 외래 잔기는 자연 발생 아미노산이고 아르기닌, 페닐알라닌, 티로신 및 트립토판을 포함할 수 있다. 일부 양상에서, 본래 잔기는 큰 측쇄 용적 (예를 들면, 아르기닌, 페닐알라닌, 티로신 및 트립토판)을 갖고, 그리고 홀을 형성하기 위한 외래 잔기는 자연 발생 아미노산이고 알라닌, 세린, 트레오닌 및 발린을 포함할 수 있다.
표 1. 아미노산 잔기의 특성
아미노산 1 문자 약어 질량 a
(달톤) 		용적 b
(Å 3 ) 		접근가능 표면적 c (Å 2 )
알라닌 (Ala) A 71.08 88.6 115
아르기닌 (Arg) R 156.20 173.4 225
아스파라긴 (Asn) N 114.11 117.7 160
아스파르트산 (Asp) D 115.09 111.1 150
시스테인 (Cys) C 103.14 108.5 135
글루타민 (Gln) Q 128.14 143.9 180
글루타민산 (Glu) E 129.12 138.4 190
글리신 (Gly) G 57.06 60.1 75
히스티딘 (His) H 137.15 153.2 195
이소류신 (Ile) I 113.17 166.7 175
류신 (Leu) L 113.17 166.7 170
리신 (Lys) K 128.18 168.6 200
메티오닌 (Met) M 131.21 162.9 185
페닐알라닌 (Phe) F 147.18 189.9 210
프롤린 (Pro) P 97.12 122.7 145
세린 (Ser) S 87.08 89.0 115
트레오닌 (Thr) T 101.11 116.1 140
트립토판 (Trp) W 186.21 227.8 255
티로신 (Tyr) 예 163.18 193.6 230
발린 (Val) V 99.14 140.0 155
a물의 분자량을 제외한 아미노산의 분자량. Handbook of Chemistry and Physics, 43rd ed. Cleveland, Chemical Rubber Publishing Co., 1961로부터 값.
bA.A. Zamyatnin, Prog. Biophys. Mol. Biol. 24:107-123, 1972로부터 값.
cC. Chothia, J. Mol. Biol. 105:1-14, 1975로부터 값. 접근 가능한 표면 구역은 상기 참고문헌의 도 6-20에서 규정된다.
일부 양상에서, 노브 또는 홀을 형성하기 위한 본래 잔기는 이종다합체의 3차원 구조에 근거하여 확인된다. 3차원 구조를 획득하기 위한 당해 분야에서 공지된 기술은 엑스선 결정학 및 NMR을 포함할 수 있다. 일부 양상에서, 인터페이스는 면역글로불린 불변 도메인의 CH3 도메인이다. 이들 양상에서, 인간 IgG1의 CH3/CH3 인터페이스는 4개의 역평행 β-가닥 상에 위치된 각 도메인에서 16개의 잔기를 수반한다. 이론에 한정됨 없이, 돌연변이된 잔기는 바람직하게는, 노브가 파트너 CH3 도메인 내에 보상 홀보다는, 주변 용매에 의해 수용될 수 있는 위험을 최소화하기 위해, 2개의 중심 역평행 β-가닥 상에 위치된다. 일부 양상에서, 2개의 면역글로불린 폴리펩티드에서 상응하는 노브와 홀을 형성하는 돌연변이는 다음의 표에서 제공된 하나 이상의 쌍에 상응한다.
표 2. 상응하는 노브-형성 및 홀-형성 돌연변이의 예시적인 세트
첫 번째 면역글로불린의 CH3 두 번째 면역글로불린의 CH3
T366Y Y407T
T366W Y407A
F405A T394W
Y407T T366Y
T366Y:F405A T394W:Y407T
T366W:F405W T394S:Y407A
F405W:Y407A T366W:T394S
F405W T394S
돌연변이는 본래 잔기, 그 이후에 EU 넘버링 시스템을 이용한 위치, 이후 외래 잔기에 의해 표시된다 (모든 잔기는 1 문자 아미노산 코드로 제공된다). 복수의 돌연변이는 콜론에 의해 분리된다.
일부 양상에서, 면역글로불린 폴리펩티드는 상기 표 2에서 열거된 하나 이상의 아미노산 치환을 포함하는 CH3 도메인을 포함한다. 일부 양상에서, 이중특이적 항체는 표 2의 왼쪽 칼럼에서 열거된 하나 이상의 아미노산 치환을 포함하는 CH3 도메인을 포함하는 첫 번째 면역글로불린 폴리펩티드, 그리고 표 2의 오른쪽 칼럼에서 열거된 하나 이상의 상응하는 아미노산 치환을 포함하는 CH3 도메인을 포함하는 두 번째 면역글로불린 폴리펩티드를 포함한다.
상기 논의된 바와 같은 DNA의 돌연변이 이후에, 하나 이상의 상응하는 노브-형성 또는 홀-형성 돌연변이를 갖는 변형된 면역글로불린 폴리펩티드를 인코딩하는 폴리뉴클레오티드는 당해 분야에서 공지된 표준 재조합 기술 및 세포 시스템을 이용하여 발현되고 정제될 수 있다. 참조: 예를 들면, U.S. 특허 번호 5,731,168; 5,807,706; 5,821,333; 7,642,228; 7,695,936; 8,216,805; U.S. 공개 번호 2013/0089553; 및 Spiess et al., Nature Biotechnology 31: 753-758, 2013. 변형된 면역글로불린 폴리펩티드는 원핵 숙주 세포, 예컨대 대장균 (E. coli), 또는 진핵 숙주 세포, 예컨대 CHO 세포를 이용하여 생산될 수 있다. 상응하는 노브-와 홀-보유 면역글로불린 폴리펩티드는 공동배양 중 숙주 세포에서 발현되고 이종다합체로서 함께 정제될 수 있거나, 또는 이들은 단일 배양액에서 발현되고, 별개로 정제되고, 시험관내에서 조립될 수 있다. 일부 양상에서, 세균 숙주 세포의 2가지 균주 (노브를 갖는 면역글로불린 폴리펩티드를 발현하는 균주, 그리고 홀을 갖는 면역글로불린 폴리펩티드를 발현하는 다른 균주)가 당해 분야에서 공지된 표준 세균 배양 기술을 이용하여 공동배양된다. 일부 양상에서, 이들 2가지 균주는 예를 들면, 배양 중 동등한 발현 수준을 달성하기 위해, 특정한 비율로 혼합될 수 있다. 일부 양상에서, 이들 2가지 균주는 50:50, 60:40, 또는 70:30 비율로 혼합될 수 있다. 폴리펩티드 발현 후, 세포가 함께 용해될 수 있고, 그리고 단백질이 추출될 수 있다. 동종다합체성 종류 대 이종다합체성 종류의 존재비를 계측하는 것을 가능하게 하는, 당해 분야에서 공지된 표준 기술은 크기 배제 크로마토그래피를 포함할 수 있다. 일부 양상에서, 각 변형된 면역글로불린 폴리펩티드는 표준 재조합 기술을 이용하여 별개로 발현되고, 그리고 이들은 시험관내에서 함께 조립될 수 있다. 조립은 예를 들면, 각 변형된 면역글로불린 폴리펩티드를 정제하고, 이들을 동등한 질량으로 함께 혼합하고 배양하며, 이황화물을 환원시키고 (예를 들면, 디티오트레이톨로 처리함으로써), 농축하고, 그리고 이들 폴리펩티드를 재산화시킴으로써 달성될 수 있다. 형성된 이중특이적 항체는 양이온-교환 크로마토그래피를 비롯한 표준 기술을 이용하여 정제되고, 그리고 크기 배제 크로마토그래피를 비롯한 표준 기술을 이용하여 계측될 수 있다. 이들 방법에 관한 더 상세한 설명을 위해, Speiss et al., Nat. Biotechnol. 31:753-8, 2013을 참조한다. 일부 양상에서, 변형된 면역글로불린 폴리펩티드는 CHO 세포에서 별개로 발현되고 전술된 방법을 이용하여 시험관내에서 조립될 수 있다.
상이한 접근법에 따라서, 원하는 결합 특이성을 갖는 항체 가변 도메인 (항체-항원 결합 부위)이 면역글로불린 불변 도메인 서열에 융합된다. 융합은 바람직하게는, 힌지, CH2 및 CH3 영역의 적어도 일부를 포함하는 면역글로불린 중쇄 불변 도메인과의 융합이다. 이들 융합 중에서 적어도 하나에 존재하는, 경쇄 결합에 필요한 부위를 내포하는 첫 번째 중쇄 불변 영역 (CH1)을 갖는 것이 전형적이다. 면역글로불린 중쇄 융합 및 원하는 경우에, 면역글로불린 경쇄를 인코딩하는 DNA는 별개의 발현 벡터 내로 삽입되고, 그리고 적합한 숙주 생명체 내로 동시형질감염된다. 이것은 작제에서 이용된 3개의 폴리펩티드 사슬의 부동 비율이 최적 수율을 제공하는 양상에서 이들 3개의 폴리펩티드 단편의 상호간의 비율을 조정하는 데 상당한 유연성을 제공한다. 하지만, 동등한 비율에서 적어도 2개의 폴리펩티드 사슬의 발현이 높은 수율을 유발하거나 또는 이들 비율이 특별한 의미가 없을 때, 2개 폴리펩티드 사슬 또는 3개 폴리펩티드 사슬 전부에 대한 코딩 서열을 하나의 발현 벡터에 삽입하는 것이 가능하다.
이러한 접근법의 한 가지 양상에서, 이중특이적 항체는 한쪽 팔에서 첫 번째 결합 특이성을 갖는 하이브리드 면역글로불린 중쇄, 그리고 다른 팔에서 하이브리드 면역글로불린 중쇄-경쇄 쌍 (두 번째 결합 특이성을 제공)으로 구성된다. 이러한 비대칭 구조는 원치 않는 면역글로불린 사슬 조합으로부터 원하는 이중특이적 화합물의 분리를 용이하게 하는 것으로 밝혀졌는데, 그 이유는 이중특이적 분자의 단지 한쪽 절반에서만 면역글로불린 경쇄의 존재가 분리의 손쉬운 방식을 제공하기 때문이다. 이러한 접근법은 WO 94/04690에서 개시된다. 이중특이적 항체를 생성하는 것에 관한 추가 상세를 위해, 예를 들면 Suresh et al., Methods in Enzymology, 121:210 (1986)을 참조한다.
WO96/27011에서 설명된 다른 접근법에 따라서, 한 쌍의 항체 분자 사이에 인터페이스는 재조합 세포 배양으로부터 회수되는 이종이합체의 백분율을 최대화하도록 조작될 수 있다. 한 가지 인터페이스는 항체 불변 도메인의 CH3 도메인의 적어도 일부를 포함한다. 이러한 방법에서, 첫 번째 항체 분자의 인터페이스로부터 하나 이상의 작은 아미노산 측쇄가 더 큰 측쇄 (예를 들면, 티로신 또는 트립토판)로 대체된다. 큰 측쇄(들)와 동일한 또는 유사한 크기의 보상성 "공동" 은 큰 아미노산 측쇄를 더 작은 아미노산 측쇄 (예를 들면, 알라닌 또는 트레오닌)로 대체함으로써 두 번째 항체 분자의 인터페이스 상에 창출된다. 이것은 다른 원치 않는 최종 산물, 예컨대 동종이합체에 비하여 이종이합체의 수율을 증가시키기 위한 기전을 제공한다.
이중특이적 항체는 교차연결된 또는 "헤테로접합체" 항체를 포함한다. 예를 들면, 헤테로접합체 내에 항체 중에서 한 가지는 아비딘에 연계될 수 있고, 다른 것은 비오틴에 연계될 수 있다. 이런 항체는 예를 들면, 면역계 세포를 원치 않는 세포에 표적화 (U.S. 특허 번호 4,676,980)하고, 그리고 HIV 감염의 치료 (WO 91/00360, WO 92/200373 및 EP 03089)를 위한 것으로 제안되었다. 헤테로접합체 항체는 임의의 편의한 교차연결 방법을 이용하여 만들어질 수 있다. 적합한 교차연결 작용제는 당해 분야에서 널리 알려져 있고, 그리고 다수의 교차연결 기술과 함께, U.S. 특허 번호 4,676,980에서 개시된다.
항체 단편으로부터 이중특이적 항체를 생성하기 위한 기술 또한 기존 문헌에서 설명되었다. 예를 들면, 이중특이적 항체는 화학적 연쇄를 이용하여 제조될 수 있다. Brennan et al., Science, 229: 81 (1985)은 무손상 항체가 단백질분해적으로 개열되어 F(ab')2 단편이 생성되는 절차를 설명한다. 이들 단편은 인접 디티올을 안정시키고 분자간 이황화물 형성을 예방하기 위한 디티올 복합화 작용제 아비산나트륨의 존재에서 환원된다. 산출된 Fab' 단편은 이후, 티오니트로벤조산염 (TNB) 유도체로 전환된다. Fab'-TNB 유도체 중에서 한 가지는 이후, 메르캅토에틸아민으로 환원에 의해 Fab'-티올로 다시 전환되고, 그리고 동몰량의 다른 Fab'-TNB 유도체와 혼합되어 이중특이적 항체를 형성한다. 생산된 이중특이적 항체는 효소의 선택적 고정을 위한 작용제로서 이용될 수 있다.
최근의 진전은 대장균 (E. coli)으로부터 Fab'-SH 단편의 직접적인 회수를 가능하게 하였는데, 이들 단편은 화학적으로 연계되어 이중특이적 항체를 형성할 수 있다. Shalaby et al., J. Exp. Med., 175: 217-225 (1992)는 완전 인간화 이중특이적 항체 F(ab')2 분자의 생산을 설명한다. 각 Fab' 단편은 대장균 (E. coli)으로부터 별개로 분비되고, 그리고 시험관내에서 지향된 화학적 연계가 진행되어 이중특이적 항체가 형성되었다.
재조합 세포 배양액으로부터 직접적으로 이중특이적 항체 단편을 만들고 단리하기 위한 다양한 기술 역시 설명되었다. 예를 들면, 이중특이적 항체는 류신 지퍼를 이용하여 생산되었다. Kostelny et al., J. Immunol., 148(5):1547-1553 (1992). Fos와 Jun 단백질로부터 류신 지퍼 펩티드는 유전자 융합에 의해 두 가지 상이한 항체의 Fab' 부분에 연결되었다. 항체 동종이합체는 힌지 영역에서 환원되어 단량체가 형성되고, 그리고 이후, 재산화되어 항체 이종이합체가 형성되었다. 이러한 방법은 항체 동종이합체의 생산에도 활용될 수 있다. Hollinger et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90:6444-6448 (1993)에 의해 설명된 "디아바디" 기술은 이중특이적 항체 단편을 만들기 위한 대안 기전을 제공하였다. 이들 단편은 동일한 사슬 상에서 2개의 도메인 사이의 대합을 허용하기에는 너무 짧은 링커에 의해 경쇄 가변 도메인 (VL)에 연결된 중쇄 가변 도메인 (VH)을 포함한다. 따라서, 한쪽 단편의 VH와 VL 도메인은 다른 단편의 상보성 VL과 VH 도메인과 대합을 이루도록 강제되고, 따라서 2개의 항원 결합 부위를 형성한다. 단일 사슬 Fv (sFv) 이합체의 이용에 의해 이중특이적 항체 단편을 만들기 위한 다른 전략 역시 보고되었다. 참조: Gruber et al, J. Immunol, 152:5368 (1994).
이중특이적 항체 단편을 만들기 위한 다른 기술은 "이중특이적 T 세포 인게이저" 또는 BiTE® 접근법이다 (참조: 예를 들면, WO2004/106381, WO2005/061547, WO2007/042261 및 WO2008/119567). 이러한 접근법은 단일 폴리펩티드 상에 배열된 2개의 항체 가변 도메인을 활용한다. 예를 들면, 단일 폴리펩티드 사슬은 2개의 도메인 사이에 분자내 연관을 가능하게 하는 데 충분한 길이의 폴리펩티드 링커에 의해 분리된 가변 중쇄 (VH) 및 가변 경쇄 (VL) 도메인을 각각 갖는 2개의 단일 사슬 Fv (scFv) 단편을 포함한다. 이러한 단일 폴리펩티드는 2개의 scFv 단편 사이에 폴리펩티드 스페이서 서열을 더욱 포함한다. 각 scFv는 상이한 에피토프를 인식하고, 그리고 이들 에피토프는 각 scFv가 이의 동계 에피토프와 맞물릴 때, 두 가지 상이한 세포 유형의 세포가 매우 근접하게 놓이고 묶이도록 상이한 세포 유형에 대해 특이적일 수 있다. 이러한 접근법의 한 가지 특정한 양상은 면역 세포에 의해 발현된 세포 표면 항원을 인식하는 scFv, 예를 들면, 표적 세포, 예컨대 악성 또는 종양 세포에 의해 발현된 세포 표면 항원을 인식하는 다른 scFv에 연결된, T 세포 상에서 CD3 폴리펩티드를 포함한다.
이것이 단일 폴리펩티드이기 때문에, 이중특이적 T 세포 인게이저는 당해 분야에서 공지된 임의의 원핵 또는 진핵 세포 발현 시스템, 예를 들면, CHO 세포를 이용하여 발현될 수 있다. 하지만, 특정한 정제 기술 (참조: 예를 들면, EP1691833)이 단량체의 의도된 활성 이외의 생물학적 활성을 가질 수 있는 다른 다합체성 종류로부터 단량체성 이중특이적 T 세포 인게이저를 분리하는 데 필요할 수도 있다. 한 가지 예시적인 정제 기법에서, 분비된 폴리펩티드를 내포하는 용액에 먼저 금속 친화성 크로마토그래피가 진행되고, 그리고 폴리펩티드가 이미다졸 농도의 구배로 용리된다. 이러한 용출물은 음이온 교환 크로마토그래피를 이용하여 더욱 정제되고, 그리고 폴리펩티드가 염화나트륨 농도의 구배를 이용하여 용리된다. 최종적으로, 다합체성 종류로부터 단량체를 분리하기 위해, 이러한 용출물에 크기 배제 크로마토그래피가 진행된다.
2 초과의 결합가를 갖는 항체가 예기된다. 예를 들면, 삼중특이적 항체가 제조될 수 있다. 참조: 예를 들면, Tuft et al. J. Immunol. 147: 60 (1991).
(vii) 단일 도메인 항체
일부 양상에서, 본원에서 개시된 항체는 단일 도메인 항체이다. 단일 도메인 항체는 항체의 중쇄 가변 도메인 중에서 전부 또는 일부 또는 경쇄 가변 도메인 중에서 전부 또는 일부를 포함하는 단일 폴리펩티드 사슬이다. 일정한 양상에서, 단일 도메인 항체는 인간 단일 도메인 항체이다 (Domantis, Inc., Waltham, Mass.; 예를 들면, U.S. 특허 번호 6,248,516 B1을 참조한다). 한 가지 양상에서, 단일 도메인 항체는 항체의 중쇄 가변 도메인 중에서 전부 또는 일부로 구성된다.
(viii) 항체 변이체
일부 양상에서, 본원에서 설명된 항체의 아미노산 서열 변형(들)이 예기된다. 예를 들면, 항체의 결합 친화성 및/또는 다른 생물학적 특성을 향상시키는 것이 바람직할 수 있다. 항체의 아미노산 서열 변이체는 상기 항체를 인코딩하는 뉴클레오티드 서열 내로 적절한 변화를 도입함으로써, 또는 펩티드 합성에 의해 제조될 수 있다. 이런 변형은 예를 들면, 항체의 아미노산 서열로부터 결실 및/또는 이들 서열 내로 삽입 및/또는 이들 서열 내에 잔기의 치환을 포함한다. 최종 작제물이 원하는 특징을 소유한다면, 최종 작제물에 도달하기 위해 결실, 삽입 및 치환의 임의의 조합이 만들어질 수 있다. 아미노산 변경은 서열이 만들어지는 시점에 요지 항체 아미노산 서열에서 도입될 수 있다.
(ix) 치환, 삽입 및 결실 변이체
일정한 양상에서, 하나 이상의 아미노산 치환을 갖는 항체 변이체가 제공된다. 치환적 돌연변이유발을 위한 관심되는 부위는 HVR 및 FR을 포함한다. 보존성 치환은 "보존성 치환"의 표제하에 표 1에서 도시된다. 더 실제적인 변화는 "예시적인 치환"의 표제하에 표 1에서 제공되고, 그리고 아미노산 측쇄 부류에 관하여 아래에 더욱 설명된다. 아미노산 치환은 관심되는 항체 내로 도입될 수 있고, 그리고 산물은 원하는 활성, 예를 들면, 유지된/향상된 항원 결합, 감소된 면역원성, 또는 향상된 ADCC 또는 CDC에 대해 선별검사될 수 있다.
표 3. 예시적인 치환
본래 잔기 예시적인 치환 바람직한 치환
Ala (a) Val; Leu; Ile Val
Arg (R) Lys; Gln; Asn Lys
Asn (N) Gln; His; Asp, Lys; Arg Gln
Asp (D) Glu; Asn Glu
Cys (C) Ser; Ala Ser
Gln (Q) Asn; Glu Asn
Glu (E) Asp; Gln Asp
Gly (G) Ala Ala
His (H) Asn; Gln; Lys; Arg Arg
Ile (I) Leu; Val; Met; Ala; Phe; 노르류신 Leu
Leu (L) 노르류신; Ile; Val; Met; Ala; Phe Ile
Lys (K) Arg; Gln; Asn Arg
Met (M) Leu; Phe; Ile Leu
Phe (F) Trp; Leu; Val; Ile; Ala; Tyr Tyr
Pro (P) Ala Ala
Ser (S) Thr Thr
Thr (T) Val; Ser Ser
Trp (W) Tyr; Phe Tyr
Tyr (Y) Trp; Phe; Thr; Ser Phe
Val (V) Ile; Leu; Met; Phe; Ala; 노르류신 Leu
아미노산은 공통 측쇄 특성에 따라 군화될 수 있다:
a. 소수성: 노르류신, Met, Ala, Val, Leu, Ile;
b. 중성 친수성: Cys, Ser, Thr, Asn, Gln;
c. 산성: Asp, Glu;
d. 염기성: His, Lys, Arg;
e. 사슬 배향정위에 영향을 주는 잔기: Gly, Pro;
f. 방향족: Trp, Tyr, Phe.
비보존성 치환은 이들 부류 중에서 한 가지의 구성원을 다른 부류로 교체하는 것을 수반할 것이다.
치환 변이체의 한 가지 유형은 부모 항체의 하나 이상의 초가변 영역 잔기를 치환하는 것을 수반한다 (예를 들면, 인간화 또는 인간 항체). 일반적으로, 추가 연구를 위해 선택되는 결과의 변이체(들)는 부모 항체에 비하여 일정한 생물학적 특성에서 변경 (예를 들면, 향상) (예를 들면, 증가된 친화성, 감소된 면역원성)을 가질 것이고 및/또는 부모 항체의 실제적으로 유지된 일정한 생물학적 특성을 가질 것이다. 예시적인 치환 변이체는 친화성 성숙된 항체인데, 이것은 예를 들면, 파지 전시 기반 친화성 성숙 기술, 예컨대 본원에서 설명된 것들을 이용하여 편의하게 생성될 수 있다. 간단히 말하면, 하나 이상의 HVR 잔기가 돌연변이되고, 그리고 변이체 항체가 파지에서 전시되고 특정 생물학적 활성 (예를 들면, 결합 친화성)에 대해 선별검사된다.
예를 들면, 항체 친화성을 향상시키기 위해 HVR에서 변경 (예를 들면, 치환)이 만들어질 수 있다. 이런 변경은 HVR "핫스팟", 다시 말하면, 체성 성숙 과정 동안 높은 빈도로 돌연변이를 겪는 코돈에 의해 인코딩된 잔기 (참조: 예를 들면, Chowdhury, Methods Mol. Biol. 207:179-196 (2008)) 및/또는 SDR (a-CDR)에서 만들어질 수 있고, 결과의 변이체 VH 또는 VL은 결합 친화성에 대해 검사된다. 이차 라이브러리를 구축하고 이들로부터 재선별함에 의한 친화성 성숙은 예를 들면, Hoogenboom et al. in Methods in Molecular Biology 178:1-37 (O'Brien et al., ed., Human Press, Totowa, NJ, (2001))에서 설명되었다. 친화성 성숙의 일부 양상에서, 다양성이 임의의 다양한 방법 (예를 들면, 오류 가능성 PCR, 사슬 셔플링, 또는 올리고뉴클레오티드-유도 돌연변이)에 의해, 성숙을 위해 선택된 가변적 유전자 내로 도입된다. 이차 라이브러리가 이후 창출된다. 상기 라이브러리는 이후, 원하는 친화성을 갖는 임의의 항체 변이체를 확인하기 위해 선별검사된다. 다양성을 도입하기 위한 다른 방법은 HVR-지향된 접근법을 수반하는데, 여기서 여러 HVR 잔기 (예를 들면, 한 번에 4-6개 잔기)가 무작위화된다. 항원 결합에 관련된 HVR 잔기는 예를 들면, 알라닌 스캐닝 돌연변이유발 또는 모형화를 이용하여 특이적으로 확인될 수 있다. 특히, CDR-H3 및 CDR-L3이 종종 표적화된다.
일정한 양상에서, 치환, 삽입 또는 결실은 이런 변경이 항원에 결합하는 항체의 능력을 실제적으로 감소시키지 않으면, 하나 이상의 HVR 내에서 일어날 수 있다. 예를 들면, 결합 친화성을 실제적으로 감소시키지 않는 보존성 변경 (예를 들면, 본원에서 제시된 바와 같은 보존성 치환)이 HVR에서 만들어질 수 있다. 이런 변경은 HVR "핫스팟" 또는 SDR의 외측일 수 있다. 앞서 제공된 변이체 VH와 VL 서열의 일정한 양상에서, 각 HVR은 변경되지 않거나, 또는 단지 1개, 2개 또는 3개의 아미노산 치환을 내포한다.
돌연변이유발을 위해 표적화될 수 있는 항체의 잔기 또는 영역의 확인을 위한 유용한 방법은 Cunningham and Wells (1989) Science, 244:1081-1085에 의해 설명된 바와 같이 "알라닌 스캐닝 돌연변이유발"로 불린다. 이러한 방법에서, 잔기 또는 표적 잔기의 군 (예를 들면, 하전된 잔기, 예컨대 Arg, Asp, His, Lys 및 Glu)이 확인되고, 그리고 항체의 항원과의 상호작용이 영향을 받는지를 결정하기 위해 중성 또는 음성으로 하전된 아미노산 (예를 들면, 알라닌 또는 폴리알라닌)에 의해 대체된다. 추가 치환은 초기 치환에 기능적 감수성을 나타내는 아미노산 위치에서 도입될 수 있다. 대안으로 또는 부가적으로, 항체 및 항원 사이의 접촉 포인트를 확인하기 위한 항원 항체 복합체의 결정 구조. 이런 접촉 잔기 및 인접한 잔기는 치환을 위한 후보로서 표적화되거나 또는 제거될 수 있다. 변이체는 그들이 원하는 특성을 내포하는지를 결정하기 위해 선별검사될 수 있다.
아미노산 서열 삽입은 1개 잔기로부터 100개 이상의 잔기를 내포하는 폴리펩티드까지의 길이 범위에서 변하는 아미노 및/또는 카르복실 말단 융합뿐만 아니라 단일 또는 복수 아미노산 잔기의 서열내 삽입을 포함한다. 말단 삽입의 실례는 N 말단 메티오닐 잔기를 갖는 항체를 포함한다. 항체 분자의 다른 삽입 변이체는 항체의 혈청 반감기를 증가시키는 효소 (예를 들면, ADEPT의 경우) 또는 폴리펩티드에 대한 항체의 N 또는 C 말단에 융합을 포함한다.
(x) 글리코실화 변이체
일정한 양상에서, 본원에서 제공된 항체는 항체가 글리코실화되는 정도가 증가하거나 또는 감소하도록 변형된다. 항체에 글리코실화 부위의 부가 또는 결실은 하나 이상의 글리코실화 부위가 창출되거나 또는 제거되도록 아미노산 서열을 변형함으로써 편의하게 달성될 수 있다.
항체가 Fc 영역을 포함하는 경우에, 거기에 부착된 탄수화물은 변형될 수 있다. 포유류 세포에 의해 생산된 선천적 항체는 전형적으로, Fc 영역의 CH2 도메인의 Asn297에 N-연쇄에 의해 일반적으로 부착되는 분지된, 바이안테나리 올리고당류를 포함한다. 참조: 예를 들면, Wright et al. TIBTECH 15:26-32 (1997). 올리고당류는 다양한 탄수화물, 예를 들면, 만노오스, N-아세틸 글루코사민 (GlcNAc), 갈락토오스 및 시알산뿐만 아니라 바이안테나리 올리고당류 구조의 "줄기"에서 GlcNAc에 부착된 푸코오스를 포함할 수 있다. 일부 양상에서, 본원에서 개시된 항체에서 올리고당류의 변형은 일정한 향상된 특성을 갖는 항체 변이체를 창출하기 위해 만들어질 수 있다.
한 가지 양상에서, ADCC 기능을 향상시킬 수 있는, Fc 영역에 부착된 탄수화물 구조가 감소된 푸코오스를 갖거나 또는 푸코오스를 결여하는 Fc 영역을 포함하는 항체 변이체가 제공된다. 구체적으로, 야생형 CHO 세포에서 생산된 동일한 항체 상에서 푸코오스의 양에 비하여 감소된 푸코오스를 갖는 항체가 본원에서 예기된다. 다시 말하면, 이들은 만약 그들이 선천적 CHO 세포 (예를 들면, 선천적 글리코실화 패턴을 생성하는 CHO 세포, 예컨대, 선천적 FUT8 유전자를 내포하는 CHO 세포)에 의해 생산되면 가졌을 양보다 더 적은 양의 푸코오스를 갖는 것에 의해 특징화된다. 일정한 양상에서, 상기 항체는 그 위에서 N-연결된 글리칸 중 약 50%, 40%, 30%, 20%, 10%, 또는 5% 미만이 푸코오스를 포함하는 것이다. 예를 들면, 이런 항체에서 푸코오스의 양은 1% 내지 80%, 1% 내지 65%, 5% 내지 65% 또는 20% 내지 40%일 수 있다. 일정한 양상에서, 상기 항체는 그 위에서 N-연결된 글리칸 중 어느 것도 푸코오스를 포함하지 않는 것이다, 다시 말하면, 상기 항체는 푸코오스가 완전히 없거나, 또는 푸코오스를 갖지 않거나 또는 비푸코실화된다. 푸코오스의 양은 예를 들면, WO 2008/077546에서 설명된 바와 같이, MALDI-TOF 질량 분광분석법에 의해 계측될 때, Asn 297에 부착된 모든 당구조의 총합 (예를 들면, 복합체, 하이브리드 및 높은 만노오스 구조)에 비하여, Asn297에서 당 사슬 내에 푸코오스의 평균량을 계산함으로써 결정된다. Asn297은 Fc 영역 내에 대략 위치 297 (Fc 영역 잔기의 EU 넘버링)에서 위치된 아스파라긴 잔기를 지칭하고; 하지만, Asn297은 또한, 항체에서 경미한 서열 변이로 인해, 위치 297의 대략 ± 3개 아미노산 상류 또는 하류에, 다시 말하면, 위치 294 및 300 사이에 위치될 수 있다. 이런 푸코실화 변이체는 향상된 ADCC 기능을 가질 수 있다. 참조: 예를 들면, US 특허 공개 번호 US 2003/0157108 (Presta, L.); US 2004/0093621 (Kyowa Hakko Kogyo Co., Ltd). "탈푸코실화된" 또는 "푸코오스-결함성" 항체 변이체에 관련된 간행물의 실례는 다음을 포함한다: US 2003/0157108; WO 2000/61739; WO 2001/29246; US 2003/0115614; US 2002/0164328; US 2004/0093621; US 2004/0132140; US 2004/0110704; US 2004/0110282; US 2004/0109865; WO 2003/085119; WO 2003/084570; WO 2005/035586; WO 2005/035778; WO2005/053742; WO2002/031140; Okazaki et al. J. Mol. Biol. 336:1239-1249 (2004); Yamane-Ohnuki et al. Biotech. Bioeng. 87: 614 (2004). 탈푸코실화된 항체를 생산할 수 있는 세포주의 실례는 단백질 푸코실화에서 결함성인 Lec13 CHO 세포 (Ripka et al. Arch. Biochem. Biophys. 249:533-545 (1986); US 특허 출원 번호 US 2003/0157108 A1; 및 WO 2004/056312 A1, 특히 실시예 11), 그리고 녹아웃 세포주, 예컨대 알파-1,6-푸코실전달효소 유전자, FUT8, 녹아웃 CHO 세포 (참조: 예를 들면, Yamane-Ohnuki et al. Biotech. Bioeng. 87: 614 (2004); Kanda, Y. et al., Biotechnol. Bioeng., 94(4):680-688 (2006); 및 WO2003/085107)를 포함한다.
항체 변이체는 양분된 올리고당류가 더욱 제공되는데, 예를 들면, 여기서 항체의 Fc 영역에 부착된 바이안테나리 올리고당류는 GlcNAc에 의해 양분된다. 이런 항체 변이체는 감소된 푸코실화 및/또는 향상된 ADCC 기능을 가질 수 있다. 이런 항체 변이체의 실례는 예를 들면, WO 2003/011878; US 특허 번호 6,602,684; US 2005/0123546, 그리고 Ferrara et al., Biotechnology and Bioengineering, 93(5): 851-861 (2006)에서 설명된다. 올리고당류 내에 적어도 하나의 갈락토오스 잔기가 Fc 영역에 부착되는 항체 변이체 역시 제공된다. 이런 항체 변이체는 향상된 CDC 기능을 가질 수 있다. 이런 항체 변이체는 예를 들면, WO 1997/30087; WO 1998/58964; 및 WO 1999/22764에서 설명된다.
일정한 양상에서, 본원에서 설명된 Fc 영역을 포함하는 항체 변이체는 FcγRIII에 결합할 수 있다. 일정한 양상에서, 본원에서 설명된 Fc 영역을 포함하는 항체 변이체는 인간 야생형 IgG1Fc 영역을 포함하는, 다른 모든 면에서 동일한 항체와 비교하여, 인간 효과기 세포의 존재에서 ADCC 활성을 갖거나 또는 인간 효과기 세포의 존재에서 증가된 ADCC 활성을 갖는다.
(xi) Fc 영역 변이체
일정한 양상에서, 하나 이상의 아미노산 변형이 본원에서 제공된 항체의 Fc 영역 내로 도입되어, Fc 영역 변이체가 생성될 수 있다. Fc 영역 변이체는 하나 이상의 아미노산 위치에서 아미노산 변형 (예를 들면, 치환)을 포함하는 인간 Fc 영역 서열 (예를 들면, 인간 IgG1, IgG2, IgG3 또는 IgG4 Fc 영역)을 포함할 수 있다.
일정한 양상에서, 본원 발명은 전부는 아니지만 일부 효과기 기능을 소유하는 항체 변이체를 예기하는데, 이들 기능으로 인해 이것은 생체내에서 항체의 반감기가 중요하고, 반면 일정한 효과기 기능 (예를 들면, 보체 및 ADCC)이 불필요하거나 또는 유해한 적용을 위한 바람직한 후보가 된다. CDC 및/또는 ADCC 활성의 감소/고갈을 확증하기 위해 시험관내 및/또는 생체내 세포독성 검정이 수행될 수 있다. 예를 들면, 항체가 FcγR 결합을 결여 (따라서, ADCC 활성을 아마도 결여)하지만, FcRn 결합 능력을 유지하도록 담보하기 위해, Fc 수용체 (FcR) 결합 검정이 수행될 수 있다. ADCC를 매개하기 위한 일차 세포인 NK 세포는 단지 FcγRIII만을 발현하고, 반면 단핵구는 FcγRI, FcγRII 및 FcγRIII을 발현한다. 조혈 세포 상에서 FcR 발현은 Ravetch and Kinet, Annu. Rev. Immunol. 9:457-492 (1991)의 464 페이지 상에 표 3에서 요약된다. 관심되는 분자의 ADCC 활성을 사정하기 위한 시험관내 검정의 무제한적 실례는 U.S. 특허 번호 5,500,362 (예를 들면, Hellstrom et al. Proc. Nat'l Acad. Sci. USA 83:7059-7063 (1986)을 참조한다) 및 Hellstrom, I et al., Proc. Nat'l Acad. Sci. USA 82:1499-1502 (1985); 5,821,337 (Bruggemann et al., J. Exp. Med. 166:1351-1361 (1987)을 참조한다)에서 설명된다. 대안으로, 비방사성 검정 방법이 이용될 수 있다 (참조: 예를 들면, 유세포분석법의 경우에 ACTI™ 비방사성 세포독성 검정 (CellTechnology, Inc. Mountain View, CA); 및 CytoTox 96® 비방사성 세포독성 검정 (Promega, Madison, WI)). 이런 검정을 위한 유용한 효과기 세포는 말초혈 단핵 세포 (PBMC) 및 자연 킬러 (NK) 세포를 포함한다. 대안으로 또는 부가적으로, 관심되는 분자의 ADCC 활성은 생체내에서, 예를 들면, 동물 모형, 예컨대 Clynes et al. Proc. Nat'l Acad. Sci. USA 95:652-656 (1998)에서 개시된 것에서 사정될 수 있다. 항체가 C1q에 결합할 수 없고, 따라서 CDC 활성을 결여한다는 것을 확증하기 위해, C1q 결합 검정 또한 실행될 수 있다. 참조: 예를 들면, WO 2006/029879 및 WO 2005/100402에서 C1q와 C3c 결합 ELISA. 보체 활성화를 사정하기 위해, CDC 검정이 수행될 수 있다 (참조: 예를 들면, Gazzano-Santoro et al., J. Immunol. Methods 202:163 (1996); Cragg et al., Blood 101:1045-1052 (2003); 및 Cragg et al, Blood 103:2738-2743 (2004)). FcRn 결합 및 생체내 소실/반감기 결정이 또한, 당해 분야에서 공지된 방법을 이용하여 수행될 수 있다 (참조: 예를 들면, Petkova et al., Int'l. Immunol. 18(12):1759-1769 (2006)).
감소된 효과기 기능을 갖는 항체는 Fc 영역 잔기 238, 265, 269, 270, 297, 327 및 329 중에서 하나 이상의 치환을 갖는 것들을 포함한다 (U.S. 특허 번호 6,737,056). 이런 Fc 돌연변이체는 잔기 265 및 297의 알라닌으로의 치환을 갖는 이른바 "DANA" Fc 돌연변이체를 비롯하여, 아미노산 위치 265, 269, 270, 297 및 327 중 두 개 이상에서 치환을 갖는 Fc 돌연변이체를 포함한다 (US 특허 번호 7,332,581).
FcR에 향상된 또는 축소된 결합을 갖는 일정한 항체 변이체가 설명된다. (참조: 예를 들면, U.S. 특허 번호 6,737,056; WO 2004/056312, 그리고 Shields et al., J. Biol. Chem. 9(2): 6591-6604 (2001).)
일정한 양상에서, 항체 변이체는 ADCC를 향상시키는 하나 이상의 아미노산 치환, 예를 들면 Fc 영역의 위치 298, 333 및/또는 334 (잔기의 EU 넘버링)에서 치환을 갖는 Fc 영역을 포함한다. 예시적인 양상에서, Fc 영역 내에 하기의 아미노산 치환: S298A, E333A 및 K334A을 포함하는 항체.
일부 양상에서, 예를 들면, US 특허 번호 6,194,551, WO 99/51642 및 Idusogie et al. J. Immunol. 164: 4178-4184 (2000)에서 설명된 바와 같이, 변경된 (다시 말하면, 향상된 또는 축소된) C1q 결합 및/또는 보체 의존성 세포독성 (CDC)을 유발하는, Fc 영역 내에 변경이 만들어진다.
증가된 반감기, 그리고 태아에 모계 IgGs의 전달을 책임지는 신생아 Fc 수용체 (FcRn)에 향상된 결합을 갖는 항체 (Guyer et al., J. Immunol. 117:587 (1976) 및 Kim et al., J. Immunol. 24:249 (1994))는 US2005/0014934A1 (Hinton et al.))에서 설명된다. 이들 항체는 FcRn에 Fc 영역의 결합을 향상시키는, 그 안에 하나 이상의 치환을 갖는 Fc 영역을 포함한다. 이런 Fc 변이체는 다음의 Fc 영역 잔기: 238, 256, 265, 272, 286, 303, 305, 307, 311, 312, 317, 340, 356, 360, 362, 376, 378, 380, 382, 413, 424 또는 434 중 하나 이상에서 치환, 예를 들면, Fc 영역 잔기 434의 치환을 갖는 것들을 포함한다 (US 특허 번호 7,371,826). Fc 영역 변이체의 다른 실례와 관련하여, Duncan & Winter, Nature 322:738-40 (1988); U.S. 특허 번호 5,648,260; U.S. 특허 번호 5,624,821; 및 WO 94/29351을 또한 참조한다.
(xii) 항체 유도체
본원에서 개시된 항체는 당해 분야에서 공지되고 쉽게 가용한 추가의 비단백질성 모이어티를 내포하도록 더욱 변형될 수 있다. 일정한 양상에서, 항체의 유도체화에 적합한 모이어티는 수용성 중합체이다. 수용성 중합체의 무제한적 실례는 폴리에틸렌 글리콜 (PEG), 에틸렌 글리콜/프로필렌 글리콜의 공중합체, 카르복시메틸셀룰로오스, 덱스트란, 폴리비닐 알코올, 폴리비닐 피롤리돈, 폴리-1,3-디옥솔란, 폴리-1,3,6-트리옥산, 에틸렌/말레산 무수물 공중합체, 폴리아미노산 (동종중합체 또는 무작위 공중합체 중 어느 한 가지), 그리고 덱스트란 또는 폴리(n-비닐 피롤리돈)폴리에틸렌 글리콜, 프로프로필렌 글리콜 동종중합체, 프롤릴프로필렌 산화물/에틸렌 산화물 공중합체, 폴리옥시에틸화된 폴리올 (예를 들면, 글리세롤), 폴리비닐 알코올, 그리고 이들의 혼합물을 포함하지만 이들에 한정되지 않는다. 폴리에틸렌 글리콜 프로피온알데히드는 물에서 안정성으로 인해, 제조 시에 이점을 가질 수 있다. 중합체는 임의의 분자량일 수 있고, 그리고 분지되거나 또는 분지되지 않을 수 있다. 항체에 부착된 중합체의 숫자는 변할 수 있고, 그리고 하나 초과의 중합체가 부착되면, 이들은 동일하거나 상이한 분자일 수 있다. 일반적으로, 유도체화에 이용되는 중합체의 숫자 및/또는 유형은 향상되는 항체의 특정 특성 또는 기능, 항체 유도체가 규정된 조건하에 요법에서 이용될 것인지의 여부 등을 포함하지만 이들에 한정되지 않는 고려 사항에 근거하여 결정될 수 있다.
(xiii) 벡터, 숙주 세포 및 재조합 방법
항체는 또한 재조합 방법을 이용하여 생산될 수 있다. 항-항원 항체의 재조합 생산을 위해, 상기 항체를 인코딩하는 핵산은 단리되고, 그리고 추가 클로닝 (DNA의 증폭) 또는 발현을 위해 복제가능한 벡터 내로 삽입된다. 항체를 인코딩하는 DNA는 전통적인 절차를 이용하여 (예를 들면, 항체의 중쇄와 경쇄를 인코딩하는 유전자에 특이적으로 결합할 수 있는 올리고뉴클레오티드 프로브를 이용함으로써) 쉽게 단리되고 염기서열분석될 수 있다. 많은 벡터가 가용하다. 벡터 성분은 일반적으로, 다음 중에서 한 가지 이상을 포함하지만 이들에 한정되지 않는다: 신호 서열, 복제 기점, 하나 이상의 마커 유전자, 인핸서 요소, 프로모터, 그리고 전사 종결 서열.
(a) 신호 서열 성분
본원에서 개시된 항체는 직접적으로뿐만 아니라 이종성 폴리펩티드, 바람직하게는 신호 서열, 또는 성숙 단백질 또는 폴리펩티드의 N 말단에서 특이적 개열 부위를 갖는 다른 폴리펩티드와의 융합 폴리펩티드로서 재조합적으로 생산될 수 있다. 선택된 이종성 신호 서열은 바람직하게는, 숙주 세포에 의해 인식되고 처리되는 (예를 들면, 신호 펩티드분해효소에 의해 개열되는) 것이다. 선천적 항체 신호 서열을 인식하고 처리하지 않는 원핵 숙주 세포의 경우에, 신호 서열은 예를 들면, 알칼리 인산분해효소, 페니실린분해효소, Ipp, 또는 열저항 장독소 II 리더의 군에서 선택되는 원핵 신호 서열에 의해 치환된다. 효모 분비의 경우에 선천적 신호 서열은 예를 들면, 효모 전화효소 리더, 인자 리더 (사카로미세스 (Saccharomyces) 및 클루이베로미세스 (Kluyveromyces) α-인자 리더 포함), 또는 산성 인산분해효소 리더, 칸디다 알비칸스 (C. albicans) 글루코아밀라아제 리더, 또는 WO 90/13646에서 설명된 신호에 의해 치환될 수 있다. 포유류 세포 발현에서, 포유류 신호 서열뿐만 아니라 바이러스 분비 리더, 예를 들면, 단순 포진 gD 신호가 가용하다.
(b) 복제 기점
발현과 클로닝 벡터 둘 모두 벡터가 하나 이상의 선별된 숙주 세포에서 복제하는 것을 가능하게 하는 핵산 서열을 내포한다. 일반적으로, 클로닝 벡터에서 이러한 서열은 벡터가 숙주 염색체 DNA와 관계없이 복제할 수 있게 하고, 그리고 복제 기점 또는 자율적으로 복제하는 서열을 포함하는 것이다. 이런 서열은 다양한 세균, 효모 및 바이러스에 대해 널리 알려져 있다. 플라스미드 pBR322로부터 복제 기점은 대부분의 그람 음성균에 적합하고, 2μ 플라스미드 복제 기점은 효모에 적합하고, 그리고 다양한 바이러스 복제 기점 (SV40, 폴리오마, 아데노바이러스, VSV 또는 BPV)은 포유류 세포에서 클로닝 벡터에 유용하다. 일반적으로, 복제 기점 성분은 포유류 발현 벡터의 경우에 필요하지 않다 (SV40 복제 기점은 단지 이것이 초기 프로모터를 내포하기 때문에, 전형적으로 이용될 수 있다.
(c) 선별 유전자 성분
발현과 클로닝 벡터는 선별가능 마커로 또한 명명되는 선별 유전자를 내포할 수 있다. 전형적인 선별 유전자는 (a) 항생제 또는 다른 독소, 예를 들면, 암피실린, 네오마이신, 메토트렉사트 또는 테트라사이클린에 대한 내성을 부여하거나, (b) 영양요구성 결함을 보완하거나, 또는 (c) 복합 배지로부터 가용하지 않은 필수 영양소를 공급하는 단백질을 인코딩한다 (예를 들면, 바실루스의 경우에 D-알라닌 라세미화효소를 인코딩하는 유전자).
선별 계획의 한 가지 실례는 숙주 세포의 성장을 정지시키는 약물을 활용한다. 이종성 유전자로 성공적으로 형질전환되는 세포는 약제 내성을 부여하는 단백질을 생산하고, 따라서 선택 섭생에서 생존한다. 이런 우성 선별의 실례는 약물 네오마이신, 마이코페놀산 및 히그로마이신을 이용한다.
포유류 세포에 대한 적합한 선별가능 마커의 다른 실례는 항체-인코딩 핵산을 흡수하는 데 적격인 세포의 확인을 가능하게 하는 것들, 예컨대 DHFR, 글루타민 합성효소 (GS), 티미딘 키나아제, 메탈로티오네인-I 및 -II, 바람직하게는 영장류 메탈로티오네인 유전자, 아데노신 탈아미노효소, 오르니틴 탈카르복실화효소 등이다.
예를 들면, DHFR 유전자로 형질전환된 세포는 DHFR의 경쟁 길항제인 메토트렉사트 (Mtx)를 내포하는 배양 배지에서 형질전환체를 배양함으로써 확인된다. 이들 조건하에, DHFR 유전자는 임의의 다른 공동형질전환된 핵산과 함께 증폭된다. 내인성 DHFR 활성에서 결함되는 중국 햄스터 난소 (CHO) 세포주 (예를 들면, ATCC CRL-9096)가 이용될 수 있다.
대안으로, GS 유전자로 형질전환된 세포는 GS의 저해제인 L-메티오닌 술폭시민 (Msx)을 내포하는 배양 배지에서 형질전환체를 배양함으로써 확인된다. 이들 조건하에, GS 유전자는 임의의 다른 공동형질전환된 핵산과 함께 증폭된다. GS 선별/증폭 시스템은 전술된 DHFR 선별/증폭 시스템과 병용될 수 있다.
대안으로, 관심되는 항체, 야생형 DHFR 유전자, 그리고 다른 선별가능 마커, 예컨대 아미노글리코시드 3'-인산전달효소 (APH)를 인코딩하는 DNA 서열로 형질전환된 또는 공동형질전환된 숙주 세포 (특히, 내인성 DHFR을 내포하는 야생형 숙주)는 선별가능 마커, 예컨대 아미노글리코시딕 항균제, 예를 들면 카나마이신, 네오마이신, 또는 G418에 대한 선택 작용제를 내포하는 배지에서 세포 성장에 의해 선택될 수 있다. 참조: U.S. 특허 번호 4,965,199.
효모에서 이용을 위한 적합한 선택 유전자는 효모 플라스미드 YRp7 내에 존재하는 trp1 유전자이다 (Stinchcomb et al., Nature, 282:39 (1979)). trp1 유전자는 트립토판에서 성장하는 능력을 결여하는 효모의 돌연변이 균주에 대한 선별 마커, 예를 들면, ATCC 번호 44076 또는 PEP4-1을 제공한다. Jones, Genetics, 85:12 (1977). 효모 숙주 세포 유전체에서 trp1 병변의 존재는 이후, 트립토판의 부재에서 성장에 의해 형질전환을 검출하기 위한 효과적인 환경을 제공한다. 유사하게, Leu2-결함성 효모 균주 (ATCC 20,622 또는 38,626)는 Leu2 유전자를 보유하는 공지된 플라스미드에 의해 보완된다.
이에 더하여, 1.6 μm 환상 플라스미드 pKD1로부터 유래된 벡터가 클루이베로미세스 (Kluyveromyces) 효모의 형질전환에 이용될 수 있다. 대안으로, 재조합 송아지 키모신의 대규모 생산을 위한 발현 시스템이 클루이베로미세스 락티스 (K. lactis)에 대해 보고되었다. 참조: 예를 들면, Van den Berg, Bio/Technology, 8:135 (1990). 클루이베로미세스 (Kluyveromyces)의 산업용 균주에 의한 성숙 재조합 인간 혈청 알부민의 분비를 위한 안정된 멀티-사본 발현 벡터 또한 개시되었다. Fleer et al., Bio/Technology, 9:968-975 (1991).
(d) 프로모터 성분
발현과 클로닝 벡터는 일반적으로, 숙주 생명체에 의해 인식되고 항체를 인코딩하는 핵산에 작동가능하게 연결되는 프로모터를 내포한다. 원핵 숙주에서 이용하기 적합한 프로모터는 phoA 프로모터, β-락타마아제 및 락토오스 프로모터 시스템, 알칼리 인산분해효소 프로모터, 트립토판 (trp) 프로모터 시스템, 그리고 하이브리드 프로모터, 예컨대 tac 프로모터를 포함한다. 하지만, 다른 공지된 세균 프로모터가 적합하다. 세균 시스템에서 이용을 위한 프로모터는 또한, 항체를 인코딩하는 DNA에 작동가능하게 연결된 샤인 달가노 (S.D.) 서열을 내포할 것이다.
진핵생물에 대한 프로모터 서열은 알려져 있다. 사실상 모든 진핵 유전자가 전사가 시작되는 부위로부터 대략 25 내지 30개 염기 상류에 위치된 AT-풍부한 영역을 갖는다. 많은 유전자의 전사의 시작으로부터 70 내지 80개 염기 상류에서 발견되는 다른 서열은 CNCAAT 영역인데, 여기서 N은 임의의 뉴클레오티드일 수 있다. 대부분의 진핵 유전자의 3' 단부에는 AATAAA 서열이 있는데, 이것은 코딩 서열의 3' 단부에 폴리 A 꼬리의 부가를 위한 신호일 수 있다. 이들 모든 서열은 진핵 발현 벡터 내로 적절하게 삽입된다.
효모 숙주에서 이용하기 적합한 프로모터 서열의 실례는 3-포스포글리세린산 키나아제 또는 다른 당분해 효소, 예컨대 에놀라아제, 글리세르알데히드-3-인산염 탈수소효소, 헥소키나아제, 피루브산염 탈카르복실화효소, 포스포프룩토키나아제, 글루코오스-6-인산염 이성화효소, 3-포스포글리세린산 무타아제, 피루브산 키나아제, 삼탄당인산염 이성화효소, 포스포글루코오스 이성화효소 및 글루코키나아제에 대한 프로모터를 포함한다.
성장 조건에 의해 제어되는 전사의 추가 이점을 갖는 유도성 프로모터인 다른 효모 프로모터는 알코올 탈수소효소 2, 이소시토크롬 C, 산성 인산분해효소, 질소 물질대사와 연관된 분해 효소, 메탈로티오네인, 글리세르알데히드-3-인산염 탈수소효소, 그리고 말토오스와 갈락토오스 활용을 책임지는 효소에 대한 프로모터 영역이다. 효모 발현에서 이용을 위한 적합한 벡터와 프로모터는 EP 73,657에서 더욱 설명된다. 효모 인핸서 또한, 효모 프로모터와 함께 유리하게 이용된다.
포유류 숙주 세포에서 벡터로부터 항체 전사는 예를 들면, 바이러스, 예컨대 폴리오마 바이러스, 계두바이러스, 아데노바이러스 (예컨대, 아데노바이러스 2), 소 유두종 바이러스, 조류 육종 바이러스, 시토메갈로바이러스, 레트로바이러스, B형 간염 바이러스, 유인원 바이러스 40 (SV40)의 유전체로부터, 또는 이종성 포유류 프로모터, 예를 들면 액틴 프로모터 또는 면역글로불린 프로모터로부터, 열 충격 프로모터로부터 획득된 프로모터에 의해 제어될 수 있는데, 단서로써 이런 프로모터는 숙주 세포 시스템과 양립해야 한다.
SV40 바이러스의 초기와 후기 프로모터는 SV40 바이러스 복제 기점을 또한 내포하는 SV40 제한 단편으로서 편의하게 획득된다. 인간 시토메갈로바이러스의 극초기 프로모터는 HindIII E 제한 단편으로서 편의하게 획득된다. 소 유두종 바이러스를 벡터로서 이용하여 포유류 숙주에서 DNA를 발현하기 위한 시스템은 U.S. 특허 번호 4,419,446에서 개시된다. 이러한 시스템의 변형은 U.S. 특허 번호 4,601,978에서 설명된다. 단순 헤르페스 바이러스로부터 획득된 티미딘 키나아제 프로모터의 제어하에 생쥐 세포에서 인간 β-인터페론 cDNA의 발현에 관해 Reyes et al., Nature 297:598-601 (1982)을 또한 참조한다. 대안으로, 라우스 육종 바이러스 긴 말단 반복이 프로모터로서 이용될 수 있다.
(e) 인핸서 요소 성분
고등 진핵생물에 의한, 본원 발명의 항체를 인코딩하는 DNA의 전사는 종종, 인핸서 서열을 벡터 내로 삽입함으로써 증가된다. 포유류 유전자 (글로빈, 엘라스타아제, 알부민, α-태아단백질 및 인슐린)로부터 많은 인핸서 서열이 현재 알려져 있다. 하지만, 전형적으로, 진핵 세포 바이러스로부터 인핸서가 이용될 것이다. 실례는 복제 기점의 후기 측면에서 SV40 인핸서 (bp 100-270), 시토메갈로바이러스 초기 프로모터 인핸서, 복제 기점의 후기 측면에서 폴리오마 인핸서, 그리고 아데노바이러스 인핸서를 포함한다. 진핵 프로모터의 활성화를 위한 증강 요소에 대해, Yaniv, Nature 297:17-18 (1982)을 또한 참조한다. 인핸서는 항체-인코딩 서열의 5' 또는 3' 위치에서 벡터 내로 스플라이싱될 수 있지만, 바람직하게는 프로모터로부터 5' 부위에서 위치된다.
(f) 전사 종결 성분
진핵 숙주 세포 (효모, 균류, 곤충, 식물, 동물, 인간, 또는 다른 다세포 생물체로부터 유핵 세포)에서 이용되는 발현 벡터는 또한, 전사의 종결 및 mRNA 안정화에 필요한 서열을 내포할 것이다. 이런 서열은 통상적으로, 진핵 또는 바이러스 DNA 또는 cDNA의 5' 및 때때로 3' 비번역 영역으로부터 가용하다. 이들 영역은 항체를 인코딩하는 mRNA의 비번역 부분에서 폴리아데닐화된 단편으로서 전사된 뉴클레오티드 분절을 내포한다. 한 가지 유용한 전사 종결 성분은 소 성장 호르몬 폴리아데닐화 영역이다. WO94/11026 및 그 안에 개시된 발현 벡터를 참조한다.
(g) 숙주 세포의 선별 및 형질전환
본원에서 벡터에서 DNA를 클로닝하거나 또는 발현하기 위한 적합한 숙주 세포는 전술된 원핵생물, 효모, 또는 고등 진핵생물 세포이다. 이런 목적으로 적합한 원핵생물은 진정세균, 예컨대 그람 음성 또는 그람 양성 생물체, 예를 들면, 장내세균 (Enterobacteriaceae), 예컨대 에스케리키아 (Escherichia), 예를 들면 대장균 (E. coli), 엔테로박터 (Enterobacter), 에르위니아 (Erwinia), 클렙시엘라 (Klebsiella), 프로테우스 (Proteus), 살모넬라 (Salmonella), 예를 들면 살모넬라 티피뮤리움 (Salmonella typhimurium), 세라티아 (Serratia), 예를 들면 세라티아 마르세센스 (Serratia marcescans) 및 시겔라 (Shigella)뿐만 아니라 바실루스 (Bacilli), 예컨대 바실루스 서브틸리스 (B. subtilis) 및 바실루스 리체니포르미스 (B. licheniformis) (예를 들면, 1989년 4월 12일 자 공개된 DD 266,710에서 개시된 바실루스 리체니포르미스 (B. licheniformis) 41P), 슈도모나스 (Pseudomonas), 예컨대 녹농균 (P. aeruginosa) 및 스트렙토미세스 (Streptomyces)를 포함한다. 비록 다른 균주, 예컨대 대장균 (E. coli) B, 대장균 (E. coli) X1776 (ATCC 31,537) 및 대장균 (E. coli) W3110 (ATCC 27,325)이 적합하긴 하지만, 한 가지 바람직한 대장균 (E. coli) 클로닝 숙주는 대장균 (E. coli) 294 (ATCC 31,446)이다. 이들 실례는 제한하기 보다는 예시이다.
전장 항체, 항체 융합 단백질, 그리고 항체 단편은 특히 글리코실화 및 Fc 효과기 기능이 필요하지 않을 때, 예컨대 종양 세포 파괴에서 그 자체로 유용성을 보여주는 세포독성 작용제 (예를 들면, 독소)에 치료 항체가 접합될 때, 세균에서 생산될 수 있다. 전장 항체는 순환 동안 더 큰 반감기를 갖는다. 대장균 (E. coli)에서 생산은 더욱 빠르고 더욱 비용 효과적이다. 세균에서 항체 단편 및 폴리펩티드의 발현에 대해, 예를 들면, U.S. 특허 번호 5,648,237 (Carter et. al.), U.S. 특허 번호 5,789,199 (Joly et al.), U.S. 특허 번호 5,840,523 (Simmons et al.)을 참조하는데, 이들은 발현과 분비를 최적화하기 위한 번역 개시 영역 (TIR) 및 신호 서열을 설명한다. 대장균 (E. coli)에서 항체 단편의 발현을 설명하는, Charlton, Methods in Molecular Biology, Vol. 248 (B. K. C. Lo, ed., Humana Press, Totowa, N.J., 2003), pp. 245-254를 또한 참조한다. 발현 후, 항체는 가용성 분획물에서 대장균 (E. coli) 세포 페이스트로부터 단리될 수 있고, 그리고 예를 들면, 아이소타입에 따라서 단백질 A 또는 G 칼럼을 통해 정제될 수 있다. 최종 정제는 예를 들면, CHO 세포에서 발현된 항체를 정제하기 위한 과정과 유사하게 실행될 수 있다.
원핵생물에 더하여, 진핵 미생물, 예컨대 실모양 균류 또는 효모가 항체-인코딩 벡터에 대한 적합한 클로닝 또는 발현 숙주이다. 사카로미세스 세레비시에 (Saccharomyces cerevisiae), 또는 일반적인 빵 효모는 하등 진핵 숙주 미생물 사이에서 가장 흔히 이용되는 것이다. 하지만, 다수의 다른 속, 종 및 균주, 예컨대 쉬조사카로미세스 폼베 (Schizosaccharomyces pombe); 클루이베로미세스 (Kluyveromyces) 숙주, 예컨대 예를 들면 클루이베로미세스 락티스 (K. lactis), 클루이베로미세스 프라길리스 (K. fragilis) (ATCC 12,424), 클루이베로미세스 불가리쿠스 (K. bulgaricus) (ATCC 16,045), 클루이베로미세스 위케라미이 (K. wickeramii) (ATCC 24,178), 클루이베로미세스 왈티이 (K. waltii) (ATCC 56,500), 클루이베로미세스 드라소필라룸 (K. drosophilarum) (ATCC 36,906), 클루이베로미세스 써모톨레란스 (K. Thermotolerans) 및 클루이베로미세스 마르시아누스 (K. marxianus); 야로위아 (EP 402,226); 피치아 파스토리스 (Pichia pastoris) (EP 183,070); 칸디다 (Candida); 트리코더마 레시아 (Trichoderma reesia) (EP 244,234); 뉴로스포라 크라사 (Neurospora crassa); 쉬반니오미세스 (Schwanniomyces), 예컨대 쉬반니오미세스 옥시덴탈리스 (Schwanniomyces occidentalis); 그리고 실모양 균류, 예컨대 예를 들면 네우로스포라 (Neurospora), 페니실륨 (Penicillium), 톨리포클라디움 (Tolypocladium) 및 아스페르길루스 (Aspergillus) 숙주, 예컨대 아스페르길루스 니둘란스 (A. nidulans) 및 아스페르길루스 니게르 (A. niger)가 통상적으로 가용하고 본원에서 유용하다. 치료 단백질의 생산을 위한 효모 및 실모양 균류의 이용을 논의하는 검토를 위해, 예를 들면, Gerngross, Nat. Biotech. 22:1409-1414 (2004)를 참조한다.
글리코실화 경로가 "인간화"되어, 부분적으로 또는 완전 인간 글리코실화 패턴을 갖는 항체의 생산을 유발하는 일정한 균류 및 효모 균주가 선택될 수 있다. 참조: 예를 들면, Li et al., Nat. Biotech. 24:210-215 (2006) (피치아 파스토리스 (Pichia pastoris)에서 글리코실화 경로의 인간화를 설명); 그리고 Gerngross et al., 위와 같음.
글리코실화된 항체의 발현을 위한 적합한 숙주 세포는 또한, 다세포 생물체 (무척추동물 및 척추동물)로부터 유래된다. 무척추동물 세포의 실례는 식물과 곤충 세포를 포함한다. 숙주, 예컨대 스포도프테라 프루기페르다 (Spodoptera frugiperda) (애벌레), 아에데스 아에집티 (Aedes aegypti) (모기), 아에데스 알보픽투스 (Aedes albopictus) (모기), 노랑초파리 (Drosophila melanogaster) (초파리), 그리고 누에나방 (Bombyx mori)으로부터 다양한 바쿨로바이러스 계열과 변이체 및 상응하는 허용적 곤충 숙주 세포가 확인되었다. 형질감염을 위한 다양한 바이러스 계열, 예를 들면, 아우토그라파 칼리포니카 (Autographa californica) NPV의 L-1 변이체 및 누에나방 (Bombyx mori) NPV의 Bm-5 계열은 공개적으로 가용하고, 그리고 이런 바이러스는 특히 스포도프테라 프루기페르다 (Spodoptera frugiperda) 세포의 형질감염을 위한, 본원에서 본원 발명에 따른 바이러스로서 이용될 수 있다.
목화, 옥수수, 감자, 대두, 피튜니아, 토마토, 부평초 (렘나세아에 (Leninaceae)), 알팔파 (메디카고 트룬카툴라 (M. truncatula)), 그리고 담배의 식물 세포 배양액 또한 숙주로서 활용될 수 있다. 참조: 예를 들면, U.S. 특허 번호 5,959,177, 6,040,498, 6,420,548, 7,125,978 및 6,417,429 (유전자도입 식물에서 항체를 생산하기 위한 PLANTIBODIESTM 기술을 설명).
척추동물 세포가 숙주로서 이용될 수 있고, 그리고 배양 (조직 배양) 중인 척추동물 세포의 증식은 일과적인 절차가 되었다. 유용한 포유류 숙주 세포주의 실례는 SV40에 의해 형질전환된 원숭이 신장 CV1 라인 (COS-7, ATCC CRL 1651); 인간 배아 신장 라인 (현탁 배양에서 성장을 위해 하위클로닝된 293 또는 293 세포, Graham et al., J. Gen. Virol., 36:59 (1977)); 아기 햄스터 신장 세포 (BHK, ATCC CCL 10); 생쥐 세르톨리 세포 (TM4, Mather, Biol. Reprod., 23:243-251 (1980)); 원숭이 신장 세포 (CV1 ATCC CCL 70); 아프리카 녹색 원숭이 신장 세포 (VERO-76, ATCC CRL-1587); 인간 경부 암종 세포 (HELA, ATCC CCL 2); 개 신장 세포 (MDCK, ATCC CCL 34); 버팔로 쥐 간 세포 (BRL 3A, ATCC CRL 1442); 인간 폐 세포 (W138, ATCC CCL 75); 인간 간 세포 (Hep G2, HB 8065); 생쥐 유방 종양 (MMT 060562, ATCC CCL51); TRI 세포 (Mather et al., Annals N.Y. Acad. Sci. 383:44-68 (1982)); MRC 5 세포; FS4 세포; 및 인간 간암 라인 (Hep G2)이다. 다른 유용한 포유류 숙주 세포주는 DHFR- CHO 세포를 비롯한, 중국 햄스터 난소 (CHO) 세포 (Urlaub et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 77:4216 (1980)); 그리고 골수종 세포주, 예컨대 NS0 및 Sp2/0을 포함한다. 항체 생산에 적합한 일정한 포유류 숙주 세포주에 관한 검토를 위해, 예를 들면, Yazaki and Wu, Methods in Molecular Biology, Vol. 248 (B. K. C. Lo, ed., Humana Press, Totowa, N.J., 2003), pp. 255-268을 참조한다.
숙주 세포는 항체 생산을 위해 전술한 발현 또는 클로닝 벡터로 형질전환되고, 그리고 프로모터를 유도하거나, 형질전환체를 선택하거나, 또는 원하는 서열을 인코딩하는 유전자를 증폭하는 데 타당하면 변형된 전통적인 영양 배지에서 배양된다.
(h) 숙주 세포 배양
본원 발명의 항체를 생산하는 데 이용되는 숙주 세포는 다양한 배지에 배양될 수 있다. 상업적으로 가용한 배지, 예컨대 Ham's F10 (Sigma), 최소 필수 배지 ((MEM), (Sigma), RPMI-1640 (Sigma) 및 Dulbecco의 변형된 Eagle 배지 ((DMEM), Sigma)가 숙주 세포를 배양하는 데 적합하다. 이에 더하여, Ham et al., Meth. Enz. 58:44 (1979), Barnes et al., Anal. Biochem. 102:255 (1980), U.S. 특허 번호 4,767,704; 4,657,866; 4,927,762; 4,560,655; 또는 5,122,469; WO 90/03430; WO 87/00195; 또는 U.S. 특허 공보 30,985에서 설명된 임의의 배지가 숙주 세포를 위한 배양 배지로서 이용될 수 있다. 임의의 이들 배지는 필요에 따라, 호르몬 및/또는 다른 성장 인자 (예컨대, 인슐린, 트랜스페린, 또는 표피 성장 인자), 염 (예컨대, 염화나트륨, 칼슘, 마그네슘 및 인산염), 완충액 (예컨대, HEPES), 뉴클레오티드 (예컨대, 아데노신 및 티미딘), 항생제 (예컨대, GENTAMYCIN™ 약물), 미량 원소 (통상적으로 마이크로몰 범위의 최종 농도에서 존재하는 무기 화합물로서 규정됨), 그리고 글루코오스 또는 동등한 에너지 공급원으로 보충될 수 있다. 임의의 다른 필요한 보충물 또한, 당업자에게 공지될 적절한 농도에서 포함될 수 있다. 배양 조건, 예컨대 온도, pH 등은 발현을 위해 선택된 숙주 세포에서 기존에 이용된 것들이고, 그리고 당업자에게 명백할 것이다.
(xiv) 항체의 정제
재조합 기술을 이용할 때, 항체는 세포내에서 생산되거나, 원형질막주위 공간에서 생산되거나, 또는 배지 내로 직접적으로 분비될 수 있다. 항체가 세포내에서 생산되면, 첫 번째 단계로서, 미립자 조직파편 (숙주 세포 또는 용해된 단편)이 예를 들면, 원심분리 또는 한외여과에 의해 제거된다. Carter et al., Bio/Technology 10:163-167 (1992)은 대장균 (E. coli)의 원형질막주위 공간으로 분비되는 항체를 단리하기 위한 절차를 설명한다. 간단히 말하면, 세포 페이스트는 아세트산나트륨 (pH 3.5), EDTA 및 페닐메틸술포닐 플루오르화물 (PMSF)의 존재에서 약 30 분에 걸쳐 해동된다. 세포 조직파편은 원심분리에 의해 제거될 수 있다. 항체가 배지 내로 분비되는 경우에, 이런 발현 시스템으로부터 상층액은 일반적으로 먼저, 상업적으로 가용한 단백질 농축 필터, 예를 들면 Amicon 또는 Millipore Pellicon 한외여과 단위를 이용하여 농축된다. 단백질분해효소 저해제, 예컨대 PMSF가 단백질분해를 저해하기 위해 임의의 전술한 단계에 포함될 수 있고, 그리고 항생제가 우발적인 오염체의 성장을 예방하기 위해 포함될 수 있다.
세포로부터 제조된 항체 조성물은 예를 들면, 수산화인회석 크로마토그래피, 소수성 상호작용 크로마토그래피, 겔 전기이동, 투석, 그리고 친화성 크로마토그래피를 이용하여 정제될 수 있는데, 친화성 크로마토그래피가 전형적으로 바람직한 정제 단계 중에서 한 가지이다. 친화성 리간드로서 단백질 A의 적합성은 항체 내에 존재하는 임의의 면역글로불린 Fc 도메인의 종 및 아이소타입에 의존한다. 단백질 A는 인간 γ1, γ2 또는 γ4 중쇄에 기초되는 항체를 정제하는 데 이용될 수 있다 (Lindmark et al., J. Immunol. Meth. 62:1-13 (1983)). 단백질 G는 모든 생쥐 아이소타입 및 인간 γ3에 대해 권장된다 (Guss et al., EMBO J. 5:15671575 (1986)). 친화성 리간드가 부착되는 매트릭스는 주로 아가로오스이지만, 다른 매트릭스도 가용하다. 기계적으로 안정된 매트릭스, 예컨대 제어된 다공성 유리 또는 폴리(스티렌디비닐)벤젠은 아가로오스로 달성될 수 있는 것보다 더 빠른 유속 및 더 짧은 처리 시간을 허용한다. 항체가 CH3 도메인을 포함하는 경우에, Bakerbond ABXTM 수지 (J. T. Baker, Phillipsburg, N.J.)이 정제에 유용하다. 단백질 정제를 위한 다른 기술, 예컨대 이온 교환 칼럼에서 분별, 에탄올 침전, 역상 HPLC, 실리카에서 크로마토그래피, 헤파린 SEPHAROSETM에서 크로마토그래피, 음이온 또는 양이온 교환 수지 (예컨대, 폴리아스파르트산 칼럼)에서 크로마토그래피, 크로마토포커싱, SDS-PAGE 및 황산암모늄 침전 역시 회수되는 항체에 따라서 가용하다.
일반적으로, 전술된 방법론과 일치하는 및/또는 관심되는 특정 항체에 대해 당업자에 의해 적합한 것으로 간주되는, 연구, 검사 및 클리닉에서 이용을 위한 항체를 제조하기 위한 다양한 방법론은 당해 분야에서 충분히 확립된다.
(xv) 생물학적으로 활성 항체 선택
전술된 바와 같이 생산된 항체는 치료적 관점으로부터 유익한 특성을 갖는 항체를 선택하거나 또는 항체의 생물학적 활성을 유지하는 제제와 조건을 선택하기 위한 한 가지 이상의 "생물학적 활성" 검정이 진행될 수 있다. 항체는 자신이 조성된 항원에 결합하는 능력에 대해 검사될 수 있다. 예를 들면, 당해 분야에서 공지된 방법 (예컨대 ELISA, 웨스턴 블롯 등)이 이용될 수 있다.
예를 들면, 항-PD-L1 항체의 경우에, 상기 항체의 항원 결합 특성은 PD-L1에 결합하는 능력을 검출하는 검정에서 평가될 수 있다. 일부 양상에서, 항체의 결합은 예를 들면, 포화 결합; ELISA; 및/또는 경쟁 검정 (예를 들면, RIA의)에 의해 결정될 수 있다. 또한, 항체는 예를 들면, 치료제로서 이의 유용성을 평가하기 위해, 다른 생물학적 활성 검정이 진행될 수도 있다. 이런 검정은 당해 분야에서 공지되고, 그리고 상기 항체에 대한 표적 항원 및 의도된 용도에 의존한다. 예를 들면, 항체에 의한 PD-L1 차단의 생물학적 효과가 CD8+T 세포, 림프성 맥락수막염 바이러스 (LCMV) 생쥐 모형 및/또는 예를 들면 US 특허 8,217,149에서 설명된 바와 같은 동계 종양 모형에서 사정될 수 있다.
관심되는 항원 상에서 특정 에피토프에 결합하는 항체 (예를 들면, PD-L1에 대한 실례의 항-PD-L1 항체의 결합을 차단하는 것들)를 선별검사하기 위해, 일과적인 교차 차단 검정, 예컨대 Antibodies, A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, Ed Harlow and David Lane (1988)에서 설명된 것이 수행될 수 있다. 대안으로, 항체가 관심되는 에피토프에 결합하는지를 결정하기 위해, 예를 들면, Champe et al., J. Biol. Chem. 270:1388-1394 (1995)에서 설명된 바와 같은 에피토프 매핑이 수행될 수 있다.
VII. 약학적 조성물과 제제
PD-1 축 결합 길항제 및/또는 본원에서 설명된 항체 (예컨대 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체) 및 임의적으로, 약학적으로 허용되는 운반체를 포함하는 약학적 조성물과 제제 역시 본원에서 제공된다. 본원 발명은 또한, 탁산, 예를 들면, 냅-파클리탁셀 (ABRAXANE®), 파클리탁셀, 또는 도세탁셀을 포함하는 약학적 조성물과 제제를 제공한다. 본원 발명은 또한, 안트라사이클린, 예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신을 포함하는 약학적 조성물과 제제를 제공한다. 본원 발명은 또한, 알킬화제 (예를 들면, 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드))를 포함하는 약학적 조성물과 제제를 제공한다.
본원에서 설명된 바와 같은 약학적 조성물과 제제는 동결 건조된 제제 또는 수성 용액의 형태에서, 원하는 정도의 순도를 갖는 활성 성분 (예를 들면, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및/또는 알킬화제 (예를 들면, 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드)))를 하나 이상의 임의적 약학적으로 허용되는 운반체 (Remington's Pharmaceutical Sciences 16th edition, Osol, A. Ed. (1980))와 혼합함으로써 제조될 수 있다. 약학적으로 허용되는 운반체는 일반적으로, 이용된 용량과 농도에서 수용자에게 비독성이고, 그리고 다음을 포함하지만 이들에 한정되지 않는다: 완충액, 예컨대 인산염, 구연산염, 그리고 다른 유기 산; 아스코르빈산 및 메티오닌을 비롯한 항산화제; 보존제 (예컨대 옥타데실디메틸벤질 염화암모늄; 염화헥사메토늄; 염화벤잘코늄; 염화벤제토늄; 페놀, 부틸 또는 벤질 알코올; 알킬 파라벤, 예컨대 메틸 또는 프로필 파라벤; 카테콜; 레소르시놀; 시클로헥산올; 3-펜탄올; 및 m-크레졸); 저분자량 (약 10개 미만의 잔기) 폴리펩티드; 단백질, 예컨대 혈청 알부민, 젤라틴, 또는 면역글로불린; 친수성 중합체, 예컨대 폴리비닐피롤리돈; 아미노산, 예컨대 글리신, 글루타민, 아스파라긴, 히스티딘, 아르기닌 또는 리신; 글루코오스, 만노오스 또는 덱스트린을 비롯한 단당류, 이당류 및 다른 탄수화물; 킬레이트화제, 예컨대 EDTA; 당, 예컨대 수크로오스, 만니톨, 트레할로스 또는 소르비톨; 염-형성 반대 이온, 예컨대 나트륨; 금속 착물 (예를 들면, Zn-단백질 복합체); 및/또는 비이온성 계면활성제, 예컨대 폴리에틸렌 글리콜 (PEG). 본원에서 예시적인 약학적으로 허용되는 운반체는 틈새 약물 분산 작용제, 예컨대 가용성 중성 활성 히알루론산분해효소 당단백질 (sHASEGP), 예를 들면, 인간 가용성 PH-20 히알루론산분해효소 당단백질, 예컨대 rHuPH20 (HYLENEX®, Baxter International, Inc.)을 더욱 포함한다. rHuPH20을 포함하는 일정한 예시적인 sHASEGP 및 이용 방법은 US 특허 공개 번호 2005/0260186 및 2006/0104968에서 설명된다. 한 가지 양상에서, sHASEGP는 한 가지 이상의 추가 글리코사미노글리카나아제, 예컨대 콘드로이티나아제와 병용된다.
예시적인 동결 건조된 항체 제제는 U.S. 특허 번호 6,267,958에서 설명된다. 수성 항체 제제는 US 특허 번호 6,171,586 및 WO2006/044908에서 설명된 것들을 포함하는데, 후자 제제는 히스티딘-아세트산염 완충액을 포함한다.
본원에서 조성물과 제제는 또한, 치료되는 특정 적응증에 대해 필요에 따라 한 가지 이상의 활성 성분, 바람직하게는 서로에 부정적으로 영향을 주지 않는 상보적 활성을 갖는 것들을 내포할 수 있다. 이런 활성 성분은 적절하게는, 의도된 목적에 효과적인 양에서 조합으로 존재한다.
활성 성분은 예를 들면, 액적형성 기술에 의해 또는 계면 중합화에 의해 제조된 마이크로캡슐, 예를 들면 각각, 콜로이드성 약물 전달 시스템 (예를 들면, 리포솜, 알부민 마이크로스피어, 마이크로유제, 나노입자 및 나노캡슐)에서 또는 마크로유제에서 히드록시메틸셀룰로오스 또는 젤라틴-마이크로캡슐 및 폴리-(메틸메타크릴레이트) 마이크로캡슐 내에 포획될 수 있다. 이런 기술은 Remington's Pharmaceutical Sciences 16th edition, Osol, A. Ed. (1980)에서 개시된다.
지속된 방출 제조물이 제조될 수 있다. 지속된 방출 제조물의 적합한 실례는 항체를 내포하는 고체 소수성 중합체의 반투성 매트릭스를 포함하는데, 이들 매트릭스는 성형된 물품, 예를 들면, 필름 또는 마이크로캡슐의 형태이다. 생체내 투여에 이용되는 제제는 일반적으로 무균이다. 무균은 예를 들면, 무균 여과 막을 통한 여과에 의해 쉽게 달성될 수 있다.
VIII. 제조 물품 또는 키트
다른 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및 알킬화제 (예를 들면, 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드))를 포함하는 제조 물품 또는 키트가 제공된다. 일부 양상에서, 제조 물품 또는 키트는 개체에서 유방암 (예를 들면, TNBC (예를 들면, eTNBC))을 치료하거나 또는 이의 진행을 지연시키기 위한, 또는 유방암 (예를 들면, TNBC (예를 들면, eTNBC))을 겪는 개체의 면역 기능을 증강하기 위한, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및/또는 알킬화제 (예를 들면, 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드))의 사용법을 포함하는 포장 삽입물을 더욱 포함한다. 일부 양상에서, 제조 물품 또는 키트는 본원에서 개시된 방법 중 한 가지에 따라서 개체에서 유방암 (예를 들면, TNBC (예를 들면, eTNBC))을 치료하거나 또는 이의 진행을 지연시키기 위한, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및/또는 알킬화제 (예를 들면, 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드))의 사용법을 포함하는 포장 삽입물을 더욱 포함한다. 본원에서 설명된 임의의 PD-1 축 결합 길항제, 탁산, 안트라사이클린 및/또는 알킬화제가 제조 물품 또는 키트 내에 포함될 수 있다.
일부 양상에서, PD-1 축 결합 길항제 (예를 들면, 항-PD-L1 항체 (예를 들면, 아테졸리주맙) 또는 항-PD-1 항체), 탁산 (예를 들면, 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀), 안트라사이클린 (예를 들면, 독소루비신 또는 에피루비신) 및/또는 알킬화제 (예를 들면, 질소 머스타드 유도체 (예를 들면, 시클로포스파미드))는 동일한 용기 또는 별개의 용기 내에 있다. 적합한 용기는 예를 들면, 병, 바이알, 백 및 주사기를 포함한다. 용기는 다양한 재료, 예컨대 유리, 플라스틱 (예컨대, 폴리염화비닐 또는 폴리올레핀), 또는 금속 합금 (예컨대, 스테인리스강 또는 하스텔로이)으로부터 형성될 수 있다. 일부 양상에서, 용기는 제제를 유지하고, 그리고 용기 상에 또는 이와 결부된 라벨은 사용법을 표시할 수 있다. 제조 물품 또는 키트는 다른 완충액, 희석제, 필터, 바늘, 주사기, 그리고 사용설명서를 포함하는 포장 삽입물을 비롯하여, 상업적 관점 및 이용자 관점으로부터 바람직한 다른 물질을 더욱 포함할 수도 있다. 일부 양상에서, 제조 물품은 다른 작용제 (예를 들면, 화학요법제 및 항신생물제) 중에서 한 가지 이상을 더욱 포함한다. 한 가지 이상의 작용제에 대한 적합한 용기는 예를 들면, 병, 바이알, 백 및 주사기를 포함한다.
실시예
본원 발명은 하기 실시예를 참조하면 더 완전하게 이해될 것이다. 하지만, 이들은 발명의 범위를 제한하는 것으로 해석되지 않아야 한다. 본원에서 설명된 실시예와 구체예는 단지 예시적인 목적을 위한 것이고, 그리고 이에 비추어 다양한 변형 또는 변화가 당업자에게 제시되고 본원의 기술적 사상과 이해범위 및 첨부된 청구항의 범위 내에 포함되는 것으로 이해된다.
실시예 1: 초기 단계 삼중 음성 유방암 (TNBC)을 겪는 개체에서 신보조 세팅에서 위약 및 화학요법과 비교하여 아테졸리주맙 및 화학요법을 조사하는 임상 3상 단계 IMpassion031 연구로부터 결과
TNBC는 유방암 유형 중에서 예후가 가장 나쁘다. 초기 TNBC (eTNBC)에서, 안트라사이클린-탁산 기반 요법의 투여에도 불구하고, 5-년 전이 없는 생존이 단지 약 70%이다. IMpassion031은 냅-파클리탁셀 (nP)과 함께 신보조 아테졸리주맙 (atezo) 또는 위약 (P), 그 이후에 독소루비신 + 시클로포스파미드와 함께 atezo 또는 P의 효능과 안전성을 평가하는, 높은 위험 침습성 eTNBC를 겪는 환자에서 전역, 임상 3상 단계, 다중심, 이중 맹검, 무작위배정, 위약 대조 연구이다. 여기에서 우리는 IMpassion031로부터 일차 종결점을 보고한다.
방법
요약
적격 환자는 ≥ 18세이고, 임의의 N, M0, ECOG PS 0-1을 갖는 새로 진단되고, 이전에 치료되지 않고, 중심적으로 확증된, 침습성 eTNBC, cT2-T4d 및 PD-L1 상태에 대해 평가 가능한 종양 조직 (VENTANA SP142 IHC 검정에 따름)을 겪었다. Impassion031에 대한 연구 개요는 도 1에서 도시된다. 환자 (n = 205)는 6회 atezo 용량을 위해 atezo 840 mg 또는 P q2w + nP 125 mg/m2 qw, 그 이후에 4회 atezo 용량을 위해 atezo 840 mg 또는 P q2w + 독소루비신 60 mg/m2 + 시클로포스파미드 600 mg/m2 q2w, 그 이후에 수술을 제공받도록 1:1 무작위배정되었다. 수술 후, 병리학적 완전 반응 (pCR; 유방 및 림프절 둘 모두에서 종양 퇴치 [ypT0/is 및 ypN0])이 모든 환자에서 사정되었고, 그리고 시험책임자는 연구 치료에 대해 맹검해제되었다. atezo 부문에서 환자는 11회 용량을 위해 atezo 1200 mg q3w를 계속 제공받았다. P를 제공받는 환자는 단지 임상 추적 조사만을 받았다. 공동 일차 종결점은 신보조 치료 및 수술 후 ITT 또는 PD-L1+ 환자에서 pCR이 국지적으로 사정되었고, 그리고 안전성이 사정되었다. pCR 비율의 추정치가 카이제곱 검정을 이용하여 ITT 및 PD-L1+ (IC에서 ≥ 1% PD-L1) 모집단에서 atezo + 화학요법 및 P + 화학요법 사이에서 비교되었다.
핵심 포함 기준은 조직학적으로 확증된 TNBC (HER2, ER, 및 PgR 부정성에 대해 중앙 실험실 사정됨); ≥ 18세의 여성 또는 남성; 0 또는 1의 ECOG 수행 상태; > 2 cm의 원발성 유방 종양 크기; 등록의 시점에서 cT2-cT4, cN0-cN3, cM0의 병기; 그리고 PD-L1 발현에 대해 평가 가능한 FFPE 종양 조직 샘플을 포함하였다. 핵심 배제 기준은 유방암의 치료 또는 예방을 위한 선행 전신 요법 및 임의의 악성종양에 대한 안트라사이클린 또는 탁산을 이용한 선행 요법을 포함하였다.
치료 및 환자 사정
환자가 화학요법과 병용으로 아테졸리주맙 또는 위약을 제공받도록 1:1 무작위배정되었다 (도 1). 층화 인자는 진단 시 병기 (II 대 III) 및 종양 PD-L1 상태 (IC0 대 IC1/2/3)이었고, IC에서 ≥ 1%의 PD-L1 발현이 계층화 컷오프 (IC1/2/3)로서 이용되었다.
VENTANA SP142 IHC 검정이 제조업체의 사용설명서에 따라서 수행되었다. VENTANA SP142 IHC 검정을 위한 IC 및 TC IHC 진단 기준은 각각, 표 4와 5에서 설명된다. 또한, 국제 특허 출원 공개 번호 WO 2016/183326 및 WO 2016/196298에서 예를 들면, 실시예 1을 참조한다.
표 4. 종양 침윤 면역 세포 (IC) IHC 진단 기준
PD-L1 진단적 사정 IC 점수
임의의 식별 가능한 PD-L1 염색의 부재
또는
종양 세포, 연관된 종양내 간질, 그리고 인접한 종양주위 결합조직형성 간질에 의해 점유된 종양 면적 중 <1%를 커버하는 종양 침윤 면역 세포에서 임의의 강도의 식별 가능한 PD-L1 염색의 존재		 IC0
종양 세포, 연관된 종양내 간질, 그리고 인접한 종양주위 결합조직형성 간질에 의해 점유된 종양 면적 중 ≥1% 내지 <5%를 커버하는 종양 침윤 면역 세포에서 임의의 강도의 식별 가능한 PD-L1 염색의 존재 IC1
종양 세포, 연관된 종양내 간질, 그리고 인접한 종양주위 결합조직형성 간질에 의해 점유된 종양 면적 중 ≥5% 내지 <10%를 커버하는 종양 침윤 면역 세포에서 임의의 강도의 식별 가능한 PD-L1 염색의 존재 IC2
종양 세포, 연관된 종양내 간질, 그리고 인접한 종양주위 결합조직형성 간질에 의해 점유된 종양 면적 중 ≥10%를 커버하는 종양 침윤 면역 세포에서 임의의 강도의 식별 가능한 PD-L1 염색의 존재 IC3
표 5. 종양 세포 (TC) IHC 진단 기준
PD-L1 진단적 사정 TC 점수
임의의 식별 가능한 PD-L1 염색의 부재
또는
종양 세포 중 <1%에서 임의의 강도의 식별 가능한 PD-L1 염색의 존재		 TC0
종양 세포 중 ≥1% 내지 <5%에서 임의의 강도의 식별 가능한 PD-L1 염색의 존재 TC1
종양 세포 중 ≥5% 내지 <50%에서 임의의 강도의 식별 가능한 PD-L1 염색의 존재 TC2
종양 세포 중 ≥50%에서 임의의 강도의 식별 가능한 PD-L1 염색의 존재 TC3
수술 이후에, 환자는 맹검해제되었고, 그리고 아테졸리주맙 부문에서 환자는 11회 용량을 위해 3 주마다 아테졸리주맙 (1200 mg)을 계속 제공받았다.
탐색적 바이오마커 분석을 위해 종양 샘플, 혈장 및 혈액이 수집되었다. 종양 생검이 기준선에서, 치료 동안 (임의적), 수술 시, 그리고 재발후 채취되었다.
효능 목표
ㆍ 일차 종결점은 모든 환자에서 병리학적 완전 반응 (pCR)이었다.
o pCR은 유방 및 림프절 둘 모두로부터 침습성 종양의 퇴치 (ypT0/is ypN0)로서 규정된다.
ㆍ 이차 효능 종결점은 다음을 포함하였다:
o PD-L1 선택된 IC1/2/3 종양 하위군에서 pCR
o 모든 환자에서 및 PD-L1-선택된 IC1/2/3 하위군에서 무작위배정부터 첫 번째 문서화된 질환 재발, 진행, 또는 관련 없는 원인으로 인한 사망 때까지 시간으로서 규정된 무병 생존율.
o 모든 환자에서 및 PD-L1-선택된 IC1/2/3 하위군에서 무작위배정부터 관련 없는 원인으로 인한 사망 때까지 시간으로서 규정된 OS
o 환자 기록 결과가 유럽 암 연구 및 치료 기구 (EORTC) QLQ-30의 기능 및 건강 관련 삶의 질 (HRQoL) 척도에 따라서 계측되었다
ㆍ 주기별로 및 치료 부문 사이에 기능 및 전반적인 건강 상태/KRQoL에서 평균 및 기준선 점수로부터 평균 변화가 사정되었다.
안전성 목표
ㆍ 냅-파클리탁셀 + 아테졸리주맙, 그 이후에 독소루비신 + 시클로포스파미드 + 아테졸리주맙의 안전성과 내약성이 냅-파클리탁셀 + 위약, 그 이후에 독소루비신 + 시클로포스파미드 + 위약의 것과 비교되었다
o 부작용의 발생 및 심각도는 국립 암 연구소 이상 반응 공통 용어 기준 (CTCAE) v4.0에 의해 규정된 바와 같았다.
핵심 탐색적 목표
ㆍ 과거 및/또는 신선한 종양 조직과 혈액에서 예측적, 예후적 및 약력학적 탐색적 바이오마커, 그리고 pCR을 포함하지만 이에 한정되지 않는 효능 종결점과 이들의 연관
등록
대략 204명의 환자가 전 세계적으로 대략 66 곳의 현장에서 등록되었다.
결과 요약
효능
IMpassion031은 치료 의도 (ITT) 모집단에서 pCR의 통계학적으로 유의하고 임상적으로 의미 있는 향상을 나타내는, eTNBC에 대한 신보조 치료법으로서 화학요법 (냅-파클리탁셀, 그 이후에 독소루비신 및 시클로포스파미드 (AC))과 병용된 아테졸리주맙 (TECENTRIQ®)의 실증 연구이다 (도 2). pCR을 나타내는, ITT 모집단에서 환자의 백분율은 위약 + 화학요법 부문 (P = 0.0044)에서 41.1% (95% CI: 33.55, 48.91)와 비교하여, 아테졸리주맙 + 화학요법 부문에서 57.6% (95% CI: 49.65, 65.22)이었다 (도 2).
PD-L1-양성 모집단에서 pCR은 임상적으로는 의미가 있지만 통계학적으로 유의하지는 않은 수치 향상을 나타냈다 (도 3). pCR을 나타내는, PD-L1-양성 모집단에서 환자의 백분율은 위약 + 화학요법 부문 (P = 0.0206)에서 49.3% (95% CI: 37.58, 61.14)와 비교하여, 아테졸리주맙 + 화학요법 부문에서 68.8% (95% CI: 57.26, 78.91)이었다 (도 3).
안전성
신보조 화학요법과 병용된 아테졸리주맙은 내약성이 양호하고 각 개별 연구 약물의 공지된 위험과 부합하였다. 어떤 새로운 안전성 신호도 확인되지 않았다.
실시예 2: 수술가능 TNBC를 겪는 환자에서 화학요법 단독과 대비하여 보조 안트라사이클린/탁산 기반 화학요법과 병용된 아테졸리주맙을 비교하는 연구 (IMpassion030)
IMpassion030 연구 (ClinicalTrials.gov identifier NCT03498716)는 수술가능 II-III기 TNBC를 겪는 환자에서 화학요법 단독과 대비하여 보조 안트라사이클린/탁산 기반 화학요법과 병용된 아테졸리주맙의 효능, 안전성 및 약물동력학을 평가하는 다중심, 무작위배정, 개방 표지 연구이다.
참가자는 첫 번째 투약으로부터 1 년의 치료를 완료할 때까지, 10회 용량을 위해 2 주마다 840 mg으로 IV에 의해 투여된 아테졸리주맙 (아래에 설명된 바와 같이 화학요법과 병용으로), 그 이후에 3 주마다 1200 mg으로 IV에 의해 투여된 아테졸리주맙 유지 요법을 제공받는다. 화학요법은 12 주 동안 매주 80 mg/m2로 정맥내 투여된 파클리탁셀, 그 이후에 (i) 과립구 집락 자극 인자 (G-CSF) 또는 과립구-대식세포 집락 자극 인자 (GM-CSF)로 뒷받침된 4회 용량을 위해, 2 주마다 용량 집중 독소루비신 (60 mg/m2로 정맥내 투여됨) + 시클로포스파미드 (600 mg/m2로 정맥내 투여됨 또는 (ii) G-CSF 또는 GM-CSF로 뒷받침된 4회 용량을 위해, 2 주마다 용량 집중 에피루비신 (90 mg/m2로 정맥내 투여됨) + 시클로포스파미드 (600 mg/m2로 정맥내 투여됨)를 포함한다.
IMpassion030에 대한 일차 결과 척도는 침습성 질환 없는 생존 (iDFS)이다 (시간 프레임: 무작위배정부터, 연구 (대략 7 년)의 종료까지 iDFS 사건 또는 사망의 첫 번째 발생 때까지). iDFS 사건은 아래와 같이 규정된다:
1. 동측성 침습성 유방 종양 재발
2. 동측성 국부-영역 침습성 유방암 재발
3. 동측성 이차 원발성 침습성 유방암
4. 대측성 침습성 유방암
5. 원위 재발
6. 관련 없는 원인으로 인한 사망
IMpassion030에 대한 이차 결과 척도는 다음을 포함한다:
1. 전체 생존 (OS) (시간 프레임: 전체 생존 (OS) (시간 프레임: 무작위배정부터, 연구 (대략 7 년)의 종료까지 관련 없는 원인으로 인한 사망 때까지)
2. 질환 없는 생존 (DFS) (시간 프레임: 무작위배정부터, 연구 (대략 7 년)의 종료까지 DFS 사건의 첫 번째 발생 때까지). DFS는 일차 종결점의 임의의 사건 및 동측성 또는 대측성 비침습성 유방암의 새로운 진단으로서 규정된다.
3. 재발 없는 기간 (RFI) (시간 프레임: 무작위배정부터, 연구 (대략 7 년)의 종료까지 유방암의 국부, 지역, 또는 원위 질환 재발 때까지)
4. 원위 RFI (시간 프레임: 무작위배정부터, 연구 (대략 7 년)의 종료까지 원위 질환 재발 때까지)
5. 부작용을 겪는 참가자의 백분율 (시간 프레임: 기준선부터 연구의 종료 (대략 7 년)까지)
6. 아테졸리주맙의 혈청 농도 (시간 프레임: 주입전 (0 시간), 1주 차의 1일 자에 주입후 30 분 (주입 길이 = 60 분); 5, 9, 13, 21, 33 및 45주 차의 1일 자에 주입전; 치료 중단 시 (대략 1 년까지), 최종 투약 후 120 일)
7. PDL1-선택된 환자에서 침습성 질환 없는 생존 (iDFS) (시간 프레임: 무작위배정부터, 연구 (대략 7 년)의 종료까지 iDFS 사건 또는 사망의 첫 번째 발생 때까지)
8. 림프절 양성 질환에서 침습성 질환 없는 생존 (iDFS) (시간 프레임: 무작위배정부터, 연구 (대략 7 년)의 종료까지 iDFS 사건 또는 사망의 첫 번째 발생 때까지)
9. 이차 원발성 비-유방 침습성 암을 포함하는 침습성 질환 없는 생존 (iDFS) (시간 프레임: 무작위배정부터, 연구의 종료 (대략 7 년)까지 iDFS 사건 또는 사망의 첫 번째 발생 때까지)
10. 아테졸리주맙에 대한 항약물 항체 (ADA)를 겪는 참가자의 백분율 (시간 프레임: 1, 5, 9, 13, 21, 33 및 45주 차의 1일 자에 주입전 (0 시간); 치료 중단 시 (51주 차까지), 최종 투약 후 120 일)
11. 환자 기록 기능 (역할, 신체)에서 기준선으로부터 평균 변화 (시간 프레임: 기준선, 4차 주기의 1일 자, 16차 주기 (주기 = 21 일) 때까지 매 2회 주기의 1일 자, 치료 종료/중단 방문 시 ((대략 1 년까지), 그리고 연구 추적 조사 (대략 7 년까지) 동안).
12. 역할, 신체 기능에서 기준선 점수로부터 평균 변화가 유럽 암 연구 및 치료 기구 삶의 질 설문지 - 코어 30 (EORTC QLQ-C30)을 이용하여 사정될 것이다
13. 환자 기록 건강 관련 삶의 질 (HRQoL)에서 기준선으로부터 평균 변화 (시간 프레임: 시간 프레임: 기준선, 4차 주기의 1일 자, 16차 주기 (주기 = 21 일) 때까지 매 2회 주기의 1일 자, 치료 종료/중단 방문 시 (대략 1 년까지), 그리고 연구 추적 조사 (대략 7 년까지) 동안).
14. HRQoL에서 기준선 점수로부터 평균 변화가 유럽 암 연구 및 치료 기구 삶의 질 설문지 - 코어 30 (EORTC QLQ-C30)을 이용하여 사정될 것이다.
포함 기준은 다음을 포함한다:
ㆍ 비전이성 수술가능 II-III기 유방암
ㆍ 조직학적으로 문서화된 TNBC (삼중 음성 유방암)
ㆍ 대표적인 종양 조직 검체의 중심 검사를 통해 문서화된 바와 같은 확증된 종양 PD-L1 평가
ㆍ 적절하게 절제됨: 환자는 유방 보존 수술 또는 유방절제술/유두 또는 피부 보존 유방절제술 중 어느 한 가지를 받았어야 한다
다른 구체예
비록 전술된 발명이 이해의 명료함을 위해 예시와 실례로서 일부 상세하게 설명되긴 했지만, 이들 설명과 실례는 발명의 범위를 제한하는 것으로 해석되지 않아야 한다. 본원에서 인용된 모든 특허와 과학 문헌의 개시는 명시적으로 온전히 참조로서 편입된다.
SEQUENCE LISTING <110> Genentech, Inc. F. Hoffmann-La Roche AG <120> METHODS AND COMPOSITIONS FOR TREATING TRIPLE-NEGATIVE BREAST CANCER <130> 51177-031WO2 <150> US 63/039,952 <151> 2020-06-16 <160> 33 <170> PatentIn version 3.5 <210> 1 <211> 440 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Construct <400> 1 Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Asp Cys Lys Ala Ser Gly Ile Thr Phe Ser Asn Ser 20 25 30 Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val 35 40 45 Ala Val Ile Trp Tyr Asp Gly Ser Lys Arg Tyr Tyr Ala Asp Ser Val 50 55 60 Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Phe 65 70 75 80 Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys 85 90 95 Ala Thr Asn Asp Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser 100 105 110 Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Cys Ser 115 120 125 Arg Ser Thr Ser Glu Ser Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp 130 135 140 Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr 145 150 155 160 Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr 165 170 175 Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Lys 180 185 190 Thr Tyr Thr Cys Asn Val Asp His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp 195 200 205 Lys Arg Val Glu Ser Lys Tyr Gly Pro Pro Cys Pro Pro Cys Pro Ala 210 215 220 Pro Glu Phe Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro 225 230 235 240 Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val 245 250 255 Val Asp Val Ser Gln Glu Asp Pro Glu Val Gln Phe Asn Trp Tyr Val 260 265 270 Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln 275 280 285 Phe Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln 290 295 300 Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Gly 305 310 315 320 Leu Pro Ser Ser Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro 325 330 335 Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Gln Glu Glu Met Thr 340 345 350 Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser 355 360 365 Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr 370 375 380 Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr 385 390 395 400 Ser Arg Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Glu Gly Asn Val Phe 405 410 415 Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys 420 425 430 Ser Leu Ser Leu Ser Leu Gly Lys 435 440 <210> 2 <211> 214 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Construct <400> 2 Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly 1 5 10 15 Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Val Ser Ser Tyr 20 25 30 Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile 35 40 45 Tyr Asp Ala Ser Asn Arg Ala Thr Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly 50 55 60 Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Glu Pro 65 70 75 80 Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Ser Asn Trp Pro Arg 85 90 95 Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Arg Thr Val Ala Ala 100 105 110 Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gln Leu Lys Ser Gly 115 120 125 Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Arg Glu Ala 130 135 140 Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly Asn Ser Gln 145 150 155 160 Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser Leu Ser 165 170 175 Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His Lys Val Tyr 180 185 190 Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser Pro Val Thr Lys Ser 195 200 205 Phe Asn Arg Gly Glu Cys 210 <210> 3 <211> 118 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Construct <400> 3 Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asp Ser 20 25 30 Trp Ile His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val 35 40 45 Ala Trp Ile Ser Pro Tyr Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val 50 55 60 Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Ala Asp Thr Ser Lys Asn Thr Ala Tyr 65 70 75 80 Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys 85 90 95 Ala Arg Arg His Trp Pro Gly Gly Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr 100 105 110 Leu Val Thr Val Ser Ala 115 <210> 4 <211> 108 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Construct <400> 4 Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly 1 5 10 15 Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Asp Val Ser Thr Ala 20 25 30 Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile 35 40 45 Tyr Ser Ala Ser Phe Leu Tyr Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly 50 55 60 Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro 65 70 75 80 Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Leu Tyr His Pro Ala 85 90 95 Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Arg 100 105 <210> 5 <211> 10 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Construct <220> <221> Xaa <222> (6)..(6) <223> Xaa is D or G <400> 5 Gly Phe Thr Phe Ser Xaa Ser Trp Ile His 1 5 10 <210> 6 <211> 18 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Construct <220> <221> Xaa <222> (4)..(4) <223> Xaa is S or L <220> <221> Xaa <222> (10)..(10) <223> Xaa is T or S <400> 6 Ala Trp Ile Xaa Pro Tyr Gly Gly Ser Xaa Tyr Tyr Ala Asp Ser Val 1 5 10 15 Lys Gly <210> 7 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Construct <400> 7 Arg His Trp Pro Gly Gly Phe Asp Tyr 1 5 <210> 8 <211> 25 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Construct <400> 8 Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser 20 25 <210> 9 <211> 13 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Construct <400> 9 Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val 1 5 10 <210> 10 <211> 32 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Construct <400> 10 Arg Phe Thr Ile Ser Ala Asp Thr Ser Lys Asn Thr Ala Tyr Leu Gln 1 5 10 15 Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Arg 20 25 30 <210> 11 <211> 11 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Construct <400> 11 Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ala 1 5 10 <210> 12 <211> 11 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Construct <220> <221> Xaa <222> (5)..(5) <223> Xaa is D or V <220> <221> Xaa <222> (6)..(6) <223> Xaa is V or I <220> <221> Xaa <222> (7)..(7) <223> Xaa is S or N <220> <221> Xaa <222> (9)..(9) <223> Xaa is A or F <220> <221> Xaa <222> (10)..(10) <223> Xaa is V or L <400> 12 Arg Ala Ser Gln Xaa Xaa Xaa Thr Xaa Xaa Ala 1 5 10 <210> 13 <211> 7 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Construct <220> <221> Xaa <222> (4)..(4) <223> Xaa is F or T <220> <221> Xaa <222> (6)..(6) <223> Xaa is Y or A <400> 13 Ser Ala Ser Xaa Leu Xaa Ser 1 5 <210> 14 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Construct <220> <221> Xaa <222> (3)..(3) <223> Xaa is Y, G, F, or S <220> <221> Xaa <222> (4)..(4) <223> Xaa is L, Y, F, or W <220> <221> Xaa <222> (5)..(5) <223> Xaa is Y, N, A, T, G, F, or I <220> <221> Xaa <222> (6)..(6) <223> Xaa is H, V, P, T, or I <220> <221> Xaa <222> (8)..(8) <223> Xaa is A, W, R, P, or T <400> 14 Gln Gln Xaa Xaa Xaa Xaa Pro Xaa Thr 1 5 <210> 15 <211> 23 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Construct <400> 15 Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly 1 5 10 15 Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys 20 <210> 16 <211> 15 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Construct <400> 16 Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Tyr 1 5 10 15 <210> 17 <211> 32 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Construct <400> 17 Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr 1 5 10 15 Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys 20 25 30 <210> 18 <211> 11 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Construct <400> 18 Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Arg 1 5 10 <210> 19 <211> 10 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Construct <400> 19 Gly Phe Thr Phe Ser Asp Ser Trp Ile His 1 5 10 <210> 20 <211> 18 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Construct <400> 20 Ala Trp Ile Ser Pro Tyr Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val 1 5 10 15 Lys Gly <210> 21 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Construct <400> 21 Arg His Trp Pro Gly Gly Phe Asp Tyr 1 5 <210> 22 <211> 11 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Construct <400> 22 Arg Ala Ser Gln Asp Val Ser Thr Ala Val Ala 1 5 10 <210> 23 <211> 7 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Construct <400> 23 Ser Ala Ser Phe Leu Tyr Ser 1 5 <210> 24 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Construct <400> 24 Gln Gln Tyr Leu Tyr His Pro Ala Thr 1 5 <210> 25 <211> 118 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Construct <400> 25 Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asp Ser 20 25 30 Trp Ile His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val 35 40 45 Ala Trp Ile Ser Pro Tyr Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val 50 55 60 Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Ala Asp Thr Ser Lys Asn Thr Ala Tyr 65 70 75 80 Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys 85 90 95 Ala Arg Arg His Trp Pro Gly Gly Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr 100 105 110 Leu Val Thr Val Ser Ser 115 <210> 26 <211> 122 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Construct <400> 26 Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asp Ser 20 25 30 Trp Ile His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val 35 40 45 Ala Trp Ile Ser Pro Tyr Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val 50 55 60 Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Ala Asp Thr Ser Lys Asn Thr Ala Tyr 65 70 75 80 Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys 85 90 95 Ala Arg Arg His Trp Pro Gly Gly Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr 100 105 110 Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys 115 120 <210> 27 <211> 11 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Construct <400> 27 Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser 1 5 10 <210> 28 <211> 10 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Construct <400> 28 Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys 1 5 10 <210> 29 <211> 30 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Construct <400> 29 Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser 20 25 30 <210> 30 <211> 14 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Construct <400> 30 Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val Ala 1 5 10 <210> 31 <211> 15 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Construct <400> 31 Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys 1 5 10 15 <210> 32 <211> 447 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Construct <400> 32 Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asp Ser 20 25 30 Trp Ile His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val 35 40 45 Ala Trp Ile Ser Pro Tyr Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val 50 55 60 Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Ala Asp Thr Ser Lys Asn Thr Ala Tyr 65 70 75 80 Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys 85 90 95 Ala Arg Arg His Trp Pro Gly Gly Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr 100 105 110 Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro 115 120 125 Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly 130 135 140 Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn 145 150 155 160 Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln 165 170 175 Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser 180 185 190 Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser 195 200 205 Asn Thr Lys Val Asp Lys Lys Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr 210 215 220 His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser 225 230 235 240 Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg 245 250 255 Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro 260 265 270 Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala 275 280 285 Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Ala Ser Thr Tyr Arg Val Val 290 295 300 Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr 305 310 315 320 Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr 325 330 335 Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu 340 345 350 Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys 355 360 365 Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser 370 375 380 Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp 385 390 395 400 Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser 405 410 415 Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala 420 425 430 Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly 435 440 445 <210> 33 <211> 214 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Construct <400> 33 Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly 1 5 10 15 Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Asp Val Ser Thr Ala 20 25 30 Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile 35 40 45 Tyr Ser Ala Ser Phe Leu Tyr Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly 50 55 60 Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro 65 70 75 80 Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Leu Tyr His Pro Ala 85 90 95 Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Arg Thr Val Ala Ala 100 105 110 Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gln Leu Lys Ser Gly 115 120 125 Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Arg Glu Ala 130 135 140 Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly Asn Ser Gln 145 150 155 160 Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser Leu Ser 165 170 175 Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His Lys Val Tyr 180 185 190 Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser Pro Val Thr Lys Ser 195 200 205 Phe Asn Arg Gly Glu Cys 210

Claims (14)

  1. 개체에서 초기 삼중 음성 유방암(eTNBC)을 치료하는 방법에 있어서, 상기 방법은 PD-1 축 결합 길항제, 탁산, 안트라사이클린 및 알킬화제의 효과량을 포함하는 치료 섭생을 개체에게 투여하는 단계를 포함하되, 상기 치료 섭생이 신보조 요법 또는 보조 요법이고, 그리고 상기 치료 섭생이 PD-1 축 결합 길항제 없이 탁산, 안트라사이클린 및 알킬화제를 이용한 치료와 비교하여, 병리학적 완전 반응(pCR)을 경험할 개체의 가능성을 증가시키는, 방법.
  2. 청구항 제1항에 있어서, PD-1 축 결합 길항제는 항-PD-L1 항체 또는 항-PD-1 항체인, 방법.
  3. 청구항 제2항에 있어서, 항-PD-L1 항체는 아테졸리주맙인, 방법.
  4. 청구항 제1항 내지 제3항 중 어느 한 항에 있어서, 탁산은 냅-파클리탁셀 또는 파클리탁셀인, 방법.
  5. 청구항 제1항 내지 제4항 중 어느 한 항에 있어서, 안트라사이클린은 독소루비신 또는 에피루비신인, 방법.
  6. 청구항 제1항 내지 제5항 중 어느 한 항에 있어서, 알킬화제는 질소 머스타드 유도체인, 방법.
  7. 청구항 제6항에 있어서, 질소 머스타드 유도체는 시클로포스파미드, 클로람부실, 우라무스틴, 멜팔란, 또는 벤다무스틴인, 방법.
  8. 청구항 제1항 내지 제7항 중 어느 한 항에 있어서, 치료 섭생은 (i) PD-1 축 결합 길항제 및 탁산을 개체에게 투여하는 것을 포함하는 일차 투약 주기, 그 이후에 (ii) PD-1 축 결합 길항제, 안트라사이클린 및 알킬화제를 개체에게 투여하는 것을 포함하는 이차 투약 주기를 포함하는, 방법.
  9. 청구항 제8항에 있어서, 치료 섭생은 신보조 요법이고, 그리고 (i) 약 12 주 동안 2 주마다 약 840 mg의 아테졸리주맙 및 매주 약 125 mg/m2 냅-파클리탁셀을 개체의 정맥내에 투여하는 것을 포함하는 일차 투약 주기; 그 이후에 (ii) 약 8 주 동안 2 주마다 약 840 mg의 아테졸리주맙, 약 60 mg/m2 독소루비신 및 약 600 mg/m2 시클로포스파미드를 개체의 정맥내에 투여하는 것을 포함하는 이차 투약 주기를 포함하는, 방법.
  10. 청구항 제1항 내지 제9항 중 어느 한 항에 있어서, 개체는 eTNBC에 대해 이전에 치료를 받지 않은, 방법.
  11. 청구항 제10항에 있어서, 개체는 (i) 유방암의 치료 또는 예방을 위한 선행 전신 요법; (ii) 임의의 악성종양에 대한 안트라사이클린 또는 탁산을 이용한 선행 요법; 또는 (iii) 선행 면역요법을 제공받지 않은, 방법.
  12. 청구항 제1항 내지 제11항 중 어느 한 항에 있어서, 개체로부터 획득된 종양 샘플은 종양 샘플 중 약 1% 이상을 구성하는 종양 침윤 면역 세포에서 PD-L1의 검출가능 발현 수준을 갖는, 방법.
  13. 개체에서 eTNBC의 치료에서 이용을 위한, PD-1 축 결합 길항제를 포함하는 약학적 조성물에 있어서, 치료는 PD-1 축 결합 길항제, 탁산, 안트라사이클린 및 알킬화제의 효과량을 포함하는 치료 섭생의 투여를 포함하고, 여기서 상기 치료 섭생은 신보조 요법 또는 보조 요법이고, 그리고 여기서 상기 치료 섭생은 PD-1 축 결합 길항제 없이 탁산, 안트라사이클린 및 알킬화제를 이용한 치료와 비교하여, pCR을 경험할 개체의 가능성을 증가시키는, 약학적 조성물.
  14. 개체에서 eTNBC를 치료하는 방법에 있어서, 상기 방법은 아테졸리주맙, 냅-파클리탁셀, 독소루비신 및 시클로포스파미드의 효과량을 포함하는 치료 섭생을 개체에게 투여하는 단계를 포함하되, 상기 치료 섭생이 신보조 요법이고, 그리고 (i) 약 12 주 동안 2 주마다 약 840 mg의 아테졸리주맙 및 매주 약 125 mg/m2 냅-파클리탁셀을 개체의 정맥내에 투여하는 것을 포함하는 일차 투약 주기; 그 이후에 (ii) 약 8 주 동안 2 주마다 약 840 mg의 아테졸리주맙, 약 60 mg/m2 독소루비신 및 약 600 mg/m2 시클로포스파미드를 개체의 정맥내에 투여하는 것을 포함하는 이차 투약 주기를 포함하며, 그리고 상기 치료 섭생이 아테졸리주맙 없이 냅-파클리탁셀, 독소루비신 및 시클로포스파미드를 이용한 치료와 비교하여, pCR을 경험할 개체의 가능성을 증가시키는, 방법.
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