JP4772245B2 - 治療上有用な合成オリゴヌクレオチド - Google Patents

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Description

【0001】
[発明の分野]
本発明は、癌治療用オリゴヌクレオチド組成物に関する。
【0002】
[発明の背景]
癌は、異型細胞の異所性網状蓄積であり、過剰な増殖、細胞死の不全、またはその2つの組合せの結果生じ得る。
【0003】
増殖は、結果として1つの細胞を2つの細胞に分割する細胞周期による細胞進行の極致である。細胞周期の5つの主要な期は、G0、G1、S、G2およびMである。G0期中、細胞は静止状態である。体内のほとんどの細胞が、常にこの段階にある。G1期中、細胞は、***するためのシグナルに応答し、RNAおよび、DNA合成に必要なタンパク質を産生する。S期(SE:初期S期、SM:中間S期、およびSL:後期S期)中、細胞は、それらのDNAを複製する。G2期中、タンパク質が、細胞***のために合成される。***(M)期中、細胞は、2つの娘細胞に***する。細胞周期進行における変化が、すべての癌で起こり、遺伝子の過剰発現、調節遺伝子の突然変異、またはDNA損傷チェックポイントの抑止の結果起こり得る(Hochhauser D. Anti-Cancer Chemotherapeutic Agents 8: 903, 1997)。
【0004】
癌細胞と異なり、たいていの正常細胞は、細胞老化と呼ばれる過程により、無限に増殖することはできない。細胞老化は、細胞の成長停止を引き起こすプログラム細胞死応答である(Dimri et al. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 92:20, 1995)。DNA損傷、結腸癌、乳癌および卵巣癌細胞のトポイソメラーゼ阻害剤への曝露、ならびに鼻咽頭癌細胞のシスプラチンへの曝露は、老化の誘発によりこれらの細胞増殖を防止することが報告されている(Wang et al. Cancer Res. 58:5109, 1998; Poele et al. Br. J. Cancer 80:9, 1999)。
【0005】
合成オリゴヌクレオチドは、細胞中にインターナライズされるポリアニオン性配列である(Vlassov et al. Biochim. Biophys. Acta 1197:95, 1994)。核酸に(Wagner, R. Nature: 372:333, 1994)、特定の細胞タンパク質に(Bates et al. J. Biol. Chem. 274:26369, 1999)に、および特定の核タンパク質(Scaggiante et al. Eur. J. Biochem. 252:207, 1998)に、選択的に結合して癌細胞の増殖を抑制する合成オリゴヌクレオチドが報告されている。
【0006】
グアニン(G)および可変量のチミン(T)を含有する合成27塩基配列(オリゴヌクレオチドGTn)(ここで、nは、1以上または7以下であり、塩基数は、20以上である)(Scaggiante et al. Eur. J. Biochem. 252:207, 1998)は、45kDaの核タンパク質に特異的に結合する配列によって癌細胞系の成長を抑制することが報告されているのに対し、GTn(ここで、塩基数は20以下である)は、癌細胞系に対して不活性であることが報告されている(Morassuitti et al. Nucleosides and Nucleotides 18:1711, 1999)。3’アミノアルキル修飾を有する15および29塩基の2つのGTリッチな合成オリゴヌクレオチドは、ヌクレオリンに結合するG四分子を形成し、癌細胞系の増殖を抑制することが報告されている(Bates et al. J. Biol. Chem. 274:26369, 1999)。哺乳動物テロメア反復配列の配列と同一の配列を有する合成6塩基TTAGGG−ホスホロチオエートは、in vitroおよびin vivoにて、バーキットリンパ腫細胞の増殖を抑制することが報告されている(Mata et al. Toxicol. Applied Pharmacol. 144:189, 1997)。しかしながら、合成6塩基TTAGGG−ホスホジエステルは、抗テロメラーゼ活性を有さないことが報告されている(米国特許第5,643,890号)。
【0007】
細胞死は、アポトーシスを促進する免疫媒介物質により、および細胞死を引き起こす経路を直接開始するアポトーシス誘発物質により達成される(Muzio et al. Cell 85:817, 1996; Levine, A. Cell 88:323, 1997)。アポトーシスは、核クロマチンの凝集、細胞収縮、核壊変、原形質膜の小疱形成、および膜結合アポトーシス体の形成を含む特有の形態学的変化を特徴とする活性細胞死プロセスである(Wyllie et al. Int. Rev. Cytol. 68:251, 1980)。アポトーシスの分子的特徴は、内因性エンドヌクレアーゼの活性化の結果としての、細胞核DNAのオリゴヌクレオソーム長断片への分解である(Wyllie A. Nature 284:555, 1980)。
【0008】
カスパーゼ(システイン−アスパルチル−特異的プロテアーゼ)は、アポトーシスの後期段階の実行に重要な酵素として含意されてきた。カスパーゼファミリーは、少なくとも14の関連システインアスパルチルプロテアーゼから構成される。すべてのカスパーゼは、保存QACXG(ここで、Xは、R、QまたはGである)ペンタペプチド活性部位モチーフを含有する(Cohen G. Biochim. Biophys. Acta 1366:139, 1997)。多数のカスパーゼは、カスパーゼ特異的切断部位での切断後に活性化される不活性プロ酵素として(Cohen G. Biochim. Biophys. Acta 1366:139, 1997)、または活性化用調節分子との会合を要する不活性酵素として(Stennicke et al. J. Biol. Chem. 274:8359, 1999)合成される。
【0009】
カスパーゼは、アポトーシスでの役割のほかに、BおよびTリンパ球の活性化ならびに増殖、炎症中のサイトカイン成熟、赤血球新生中の前駆細胞の分化、ならびに水晶体線維の発達に関与する(Fadeel et al. Leukemia 14:1514, 2000)。BおよびTリンパ球に関して、カスパーゼ3は、Bリンパ球、ならびにTリンパ球のCD4(+)、CD8(+)、CD45RA(+)およびCD45RO(+)サブセットの活性化中にプロセシングされる(Alam et al. J. Exp. Med. 190:1879, 1999)。さらに、***促進因子およびインターロイキン−2によるTリンパ球の刺激は、カスパーゼ経路の活性化およびPARP切断に関連する(Wilheim et al. Eur. J. Immunol. 28:891, 1998)。サイトカインに関して、カスパーゼ3活性は、活性化Tリンパ球によるIL−2の放出に(Posmantur et al. Exp. Cell Res. 244:302, 1998)、および炎症誘発性サイトカインインターロイキン−16のプロセシングおよび成熟に(Zhang et al. J. Biol. Chem. 273:1144, 1998)必要である。赤血球新生に関して、カスパーゼ活性化は、赤血球新生調節に関与し、赤血球前駆体の成熟に極めて重要なGATA−1、核調節タンパク質を調節することがわかっている(De Maria, et al. Nature 401:489, 1999)。
【0010】
細胞溶解は、細胞の完全または部分的破壊であり、免疫系により媒介される。活性化マクロファージおよび単球は、サイトカインを含むが、それらに限定されない生理活性分子を産生する。サイトカインとしては、インターロイキン(IL)−1、IL−1ベータ、IL−6、IL−10、IL−12、およびTNF−アルファが挙げられるが、これらに限定されない。
【0011】
IL−1ベータは、細胞減少性薬剤、照射および自家骨髄移植にて薬剤を用いたin vitroでの腫瘍細胞パージングに対する骨髄細胞の感受性を減少する(Dalmau et al. Bone Marrow Transplant. 12:551, 1993)。
【0012】
IL−6は、B細胞分化を誘発し、IgG分泌を刺激し(Taga et al. J. Exp. Med. 166:967, 1987)、細胞障害性T細胞分化を誘発し(Lee et al. Vaccine 17:490, 1999)、巨核球成熟を促進し(Ishibashi et al. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 86:8953, 1989)、癌細胞のための抗増殖因子(Mori et al. Biochem. Biophys. Res. Comm. 257:609, 1999; Alexandroff et al. Biochem. Soc. Trans. 25:270, 1997; Takizawa et al. Cancer Res. 53:18, 1993: Novick et al. Cytokine 4:6, 1992)およびプロ増殖因子 (Okamoto et al. Cancer Res. 57:141, 1997; Okamoto et al. Int. J. Cancer 72:149, 1997; Chiu et al. Clin. Cancer Res. 2:215, 1996; Lu et al. Clin. Cancer Res. 2:1417, 1996)の両方として機能する。
【0013】
IL−10は、マウス腫瘍モデルにおけるワクチンの有効性を高め(Kauffman et al. J. Immunother. 22: 489, 1999)、また抗癌自己反応性T細胞応答を上方制御する(Alleva et al. Immunobiol. 192:155, 1995)。
【0014】
IL−12は、単独で、および他のサイトカインと組み合わせて、白血球の成熟を促進し、インターフェロン−ガンマの分泌を誘発する。IL−12は、特定の細胞溶解性Tリンパ球の活性化、ナチュラルキラー(NK)細胞の活性化ならびに抗血管新生タンパク質IP−10およびMiGの誘発を含むが、これらに限定されない抗癌活性を有することが報告されている(Stine et al. Annals NY Academy of Science 795:420, 1996; Chen et al. Journal of Immunol. 159:351, 1997)。
【0015】
TNF−アルファは、固形腫瘍の壊死をもたらし(Porter et al. Trends in Biotech. 9:158, 1991)、癌細胞をガンマ照射誘発アポトーシスに対して敏感にし(Kimura et al. Cancer Res. 59:1606, 1999)、抗悪性腫瘍剤の影響から骨髄前駆細胞を保護する(Dalmau et al. Bone Marrow Transplant. 12:551,1993)。
【0016】
しかしながら、細胞周期停止の誘導、増殖の抑制、アポトーシスの誘発または免疫系の刺激に関するものであろうと、ほとんどの従来技術の抗癌治療は、臨床用途に適するに至らないことが判明している。これらの治療の多くは、効果がないか、または毒性があり、かなりの不都合な副作用を有し、結果として薬物耐性または免疫感作の発生をもたらし、レシピエントを衰弱させる。
【0017】
したがって、癌細胞にて細胞周期停止を誘導し、癌細胞の増殖を抑制し、癌細胞にてカスパーゼを活性化し、癌細胞にてアポトーシスを誘発し、免疫系細胞によるサイトカイン産生を刺激する新規組成物および方法が引き続き必要である。
【0018】
[発明の概要]
本発明は、(Gxyn、(Tyxn、a(Gxyn、a(Tyxn、(Gxynb、(Tyxnb、a(Gxynb、a(Tyxnb(ここで、xおよびyは、1〜7の整数であり、nは、1〜12の整数であり、aおよびbは、1つまたはそれ以上のA、C、GまたはTである)からなる群から選択される2〜20塩基3’−OH,5’−OH合成オリゴヌクレオチド(これ以降、「配列」)を含む組成物および方法であって、上記配列は、癌細胞における細胞周期停止の誘導、増殖の抑制、カスパーゼの活性化およびアポトーシスの誘発、ならびに免疫系細胞によるサイトカインの産生からなる群から選択される応答を誘発する組成物および方法を提供することにより、この要求を満たす。
【0019】
配列および薬学的に許容可能なキャリアを含む組成物は、癌を有する、ヒトを含む動物に、上記動物において癌を治療するのに有効な量で投与される。癌細胞において細胞周期停止を誘導する、増殖を抑制する、カスパーゼを活性化する、およびアポトーシスを誘発する、ならびに免疫系細胞によるサイトカイン産生を刺激する、配列の予期せぬ、かつ驚くべき能力は、医療技術における長い間切実に感じられてきた満たされてない要求に対処するものであり、ヒトを含む動物のために重要な有益性を提供する。
【0020】
したがって、本発明の目的は、ヒトを含む動物において、疾患を治療するのに有効な組成物および方法を提供することである。
【0021】
本発明の別の目的は、癌を治療するのに有効な組成物および方法を提供することである。
【0022】
本発明の別の目的は、細胞において老化を誘発する組成物および方法を提供することである。
【0023】
本発明の別の目的は、細胞において細胞周期停止を誘導する組成物および方法を提供することである。
【0024】
本発明の別の目的は、癌細胞において細胞周期停止を誘発する組成物および方法を提供することである。
【0025】
本発明の別の目的は、細胞の増殖を抑制する組成物および方法を提供することである。
【0026】
本発明の別の目的は、癌細胞の増殖を抑制する組成物および方法を提供することである。
【0027】
本発明の別の目的は、細胞においてアポトーシスを誘発する組成物および方法を提供することである。
【0028】
本発明の別の目的は、癌細胞においてアポトーシスを誘発する組成物および方法を提供することである。
【0029】
本発明の別の目的は、癌細胞においてFas非依存的にアポトーシスを誘発する組成物および方法を提供することである。
【0030】
本発明の別の目的は、癌細胞においてTNFR1非依存的にアポトーシスを誘発する組成物および方法を提供することである。
【0031】
本発明の別の目的は、癌細胞においてp53/p21非依存的にアポトーシスを誘発する組成物および方法を提供することである。
【0032】
本発明の別の目的は、癌細胞においてp21/waf−1/CIP非依存的にアポトーシスを誘発する組成物および方法を提供することである。
【0033】
本発明の別の目的は、癌細胞においてp15ink4B非依存的にアポトーシスを誘発する組成物および方法を提供することである。
【0034】
本発明の別の目的は、癌細胞においてp16ink4非依存的にアポトーシスを誘発する組成物および方法を提供することである。
【0035】
本発明の別の目的は、癌細胞においてカスパーゼ3非依存的にアポトーシスを誘発する組成物および方法を提供することである。
【0036】
本発明の別の目的は、癌細胞においてTGF−ベータ1受容体非依存的にアポトーシスを誘発する組成物および方法を提供することである。
【0037】
本発明の別の目的は、癌細胞においてホルモン依存性に非依存的にアポトーシスを誘発する組成物および方法を提供することである。
【0038】
本発明の別の目的は、癌細胞において薬剤耐性に非依存的にアポトーシスを誘発する組成物および方法を提供することである。
【0039】
本発明の別の目的は、細胞においてカスパーゼを活性化する組成物および方法を提供することである。
【0040】
本発明の別の目的は、癌細胞においてカスパーゼを活性化する組成物および方法を提供することである。
【0041】
本発明の別の目的は、自己免疫疾患を治療するための組成物および方法を提供することである。
【0042】
本発明の別の目的は、リンパ球増殖疾患を治療するための組成物および方法を提供することである。
【0043】
本発明の別の目的は、感染を治療するための組成物および方法を提供することである。
【0044】
本発明の別の目的は、炎症を治療するための組成物および方法を提供することである。
【0045】
本発明の別の目的は、TまたはB細胞活性化を調節するための組成物および方法を提供することである。
【0046】
本発明の別の目的は、前駆細胞成熟を調節するための組成物および方法を提供することである。
【0047】
本発明の別の目的は、赤血球新生を調節するための組成物および方法を提供することである。
【0048】
本発明の別の目的は、細胞における転写因子を調節するための組成物および方法を提供することである。
【0049】
本発明の別の目的は、細胞に対する他の治療薬の効果を増強する組成物および方法を提供することである。
【0050】
本発明の別の目的は、癌細胞に対する化学療法剤の効果を増強する組成物および方法を提供することである。
【0051】
本発明の別の目的は、照射の抗腫瘍性効果を増強する組成物および方法を提供することである。
【0052】
本発明の別の目的は、免疫系の細胞によるサイトカイン産生を刺激する組成物および方法を提供することである。
【0053】
本発明の別の目的は、免疫系の細胞によるIL−1ベータ産生を刺激する組成物および方法を提供することである。
【0054】
本発明の別の目的は、免疫系の細胞によるIL−6産生を刺激する組成物および方法を提供することである。
【0055】
本発明の別の目的は、免疫系の細胞によるIL−10産生を刺激する組成物および方法を提供することである。
【0056】
本発明の別の目的は、免疫系の細胞によるIL−12産生を刺激する組成物および方法を提供することである。
【0057】
本発明の別の目的は、免疫系の細胞によるTNF−α産生を刺激する組成物および方法を提供することである。
【0058】
本発明の別の目的は、調製するのが容易である組成物を提供することである。
【0059】
本発明の別の目的は、レシピエントにとって最小限の毒性である組成物を提供することである。
【0060】
本発明のこれらおよび他の目的、特徴および利点は、以下に開示される実施形態の詳細な説明および上記特許請求の範囲を読んだ後に明らかになるであろう。
【0061】
[発明の詳細な説明]
本発明は、(Gxyn、(Tyxn、a(Gxyn、a(Tyxn、(Gxynb、(Tyxnb、a(Gxynb、a(Tyxnb(ここで、xおよびyは、1〜7の整数であり、nは、1〜12の整数であり、aおよびbは、1つまたはそれ以上のA、C、GまたはTである)からなる群から選択される2〜20塩基3’−OH,5’−OH合成オリゴヌクレオチド(これ以降、「配列」)を含む組成物であって、上記配列は、癌細胞における細胞周期停止の誘発、増殖の抑制、カスパーゼの活性化およびアポトーシスの誘発、ならびに免疫系細胞によるサイトカインの産生からなる群から選択される応答を誘発する組成物を提供する。
【0062】
配列および薬学的に許容可能なキャリアを含む組成物は、癌を有する、ヒトを含む動物に、ヒトを含む動物において癌を治療するのに有効な量で投与される。癌細胞において細胞周期停止を誘導する、増殖を抑制する、アポトーシスを誘発する、およびカスパーゼを活性化する、ならびに免疫系細胞によるサイトカイン産生を刺激する、配列の予期せぬ、かつ驚くべき能力は、医療技術において長い間切実に感じられてきた満たされてない要求に対処するものであり、ヒトを含む動物のために重要な有益性を提供する。
【0063】
本明細書中で使用する「配列」という言葉は、A、C、GおよびT塩基を含む2〜20塩基3’−OH,5’OH合成オリゴヌクレオチドを指す。
【0064】
本明細書中で使用する「GT」、「AG」、「CG」、「GG」、「AGT」および「CGT」という略語は、任意の順序で合成される指定塩基を含む配列を指す。
【0065】
本明細書で使用する「応答」という言葉は、癌細胞における細胞周期停止の誘導、増殖の抑制、カスパーゼの活性化およびアポトーシスの誘発、ならびに免疫系細胞によるサイトカイン産生の刺激を指す。
【0066】
本明細書中で使用する「治療上の処置」および「に有効な量」という語句は、癌細胞において、細胞周期停止を誘導する、増殖を抑制する、カスパーゼを活性化する、およびアポトーシスを誘発する、ならびに免疫系細胞によるサイトカイン産生を刺激するのに有効な配列の量を指す。
【0067】
本明細書中で使用する「懸濁(suspension)腫瘍モデル」および「固形腫瘍モデル」という語句は、原発もしくは転移性癌腫または肉腫を指す。
【0068】
本明細書中で使用する「化学療法」という語句は、国もしくは州政府の管理機関により是認されているか、または、米国薬局方もしくは他の一般に認められている薬局方にて列挙されている、ヒトを含む動物において癌を治療するためのいずれの薬剤を指す。
【0069】
本明細書中で使用する「抗腫瘍性」という言葉は、癌細胞の発達、成熟、増殖または展開を防止することを指す。
【0070】
本明細書で使用する「増強する」という言葉は、各薬剤の加法的活性よりも大きな相乗作用の程度を指す。
【0071】
本明細書中で使用する「相乗作用」という言葉は、2つまたはそれ以上の薬剤の協調作用を指す。
【0072】
ヒトを含む動物への、有効量の本発明の配列の投与は、癌、慢性関節リウマチ、リンパ球増殖性疾患およびぜん息を含むが、これらに限定されない疾患を防止、治療または除去する治療上の処置である。癌としては、扁平上皮癌、線維肉腫、類肉腫、黒色腫、乳癌、肺癌、結腸直腸癌、腎臓癌、骨肉腫、皮膚黒色腫、基底細胞癌、膵臓癌、膀胱癌、脳癌、卵巣癌、前立腺癌、白血病、リンパ腫、およびそれら由来の転移が挙げられるが、これらに限定されない。
【0073】
配列の治療上の有効性は、塩基、糖もしくはリン酸骨格を化学的に修飾すること、配列を化学的に補うか、または適切な配列を含有する細菌プラスミドを用いて配列を生物工学的に増幅すること、生物学的もしくは化学的キャリアと配列の複合体を形成すること、あるいは組織型もしくは細胞型指向性リガンドまたは抗体に配列を連結することを含むが、これらに限定されない方法により増加されてもよい。
【0074】
1つまたはそれ以上の配列および薬学的に許容可能なキャリアを含む組成物は、配列および薬学的に許容可能なキャリアを均一かつ密接に会合させることにより調製される。薬学的に許容可能なキャリアとしては、液体キャリア、固体キャリアあるいはその両方が挙げられる。液体キャリアは、水性キャリア、非水性キャリアあるいはその両方であり、懸濁水溶液、油性乳濁液、油中水型乳濁液、水中油中水型乳濁液、部位特異的乳濁液、長期滞留乳濁液、粘着性乳濁液、ミクロエマルションおよびナノエマルションが挙げられるが、これらに限定されない。固体キャリアは、生物学的キャリア、化学的キャリアまたはその両方であり、ウイルスベクター系、粒子、ミクロ粒子、ナノ粒子、ミクロスフェア、ナノスフェア、ミニポンプ、細菌細胞壁抽出物、および配列を持続性放出することが可能な生分解性または非生分解性の天然もしくは合成ポリマーが挙げられるが、これらに限定されない。固体キャリアと配列の複合体を形成するのに用いる方法としては、固体キャリアの表面への直接吸着、直接的な、または結合部分を介した固体キャリアの表面への共有結合、および固体キャリアを作製するのに用いるポリマーへの共有結合が挙げられるが、これらに限定されない。任意に、配列は、ポリオキシエチレンソルビタンモノオレエート(ツイーン)もしくはヒアルロン酸のような非イオン性またはイオン性ポリマーの添加により安定化され得る。
【0075】
好ましい水性キャリアとしては、水、生理食塩水、および薬学的に許容可能な緩衝液が挙げられるが、これらに限定されない。好ましい非水性キャリアとしては、鉱油および中性油、ならびにそれらの混合物が挙げられるが、これらに限定されない。任意に、応答細胞に配列を呈するのに用いられる薬学的に許容可能なキャリアに関係なく、賦形剤が含まれてもよい。これらの賦形剤としては、酸化防止剤、緩衝液、および静菌薬が挙げられるが、これらに限定されず、沈殿防止剤および増粘剤も挙げることができる。
【0076】
1つまたはそれ以上の配列は、単独で、または化学療法剤、免疫療法剤、抗菌剤、抗ウイルス剤を含むが、これらに限定されない他の治療上の様式と併用して、もしくは放射線治療と併用して、投与されてもよい。化学療法剤としては、代謝拮抗物質、DNA損傷剤、微小管不安定化剤、微小管安定化剤、アクチン脱重合剤、成長抑制剤、トポイソメラーゼ抑制剤、HMG−CoA抑制剤、プリン抑制剤、ピリミジン抑制剤、メタロプロテイナーゼ抑制剤、CDK抑制剤、血管新生抑制剤、および分化促進剤が挙げられるが、これらに限定されない。
【0077】
投与経路としては、経口、局所、皮下、経皮、皮下、筋肉内、腹腔内、膀胱内、関節内、動脈内、静脈内、皮内、頭蓋内、病変内、腫瘍内、眼内、肺内、髄腔内、前立腺内、体腔内配置、鼻吸入、肺吸入、皮膚への圧痕、およびエレクトロコーポレイション(electrocorporation)が挙げられるが、これらに限定されない。
【0078】
投与経路に依存して、一回用量についての容量は、好ましくは一回用量につき約0.001〜100ml、より好ましくは一回用量につき約0.01〜50ml、最も好ましくは一回用量につき約0.1〜30mlである。好ましくは、一回用量につき投与される配列量は、約0.001〜100mg/kg、より好ましくは約0.01〜10mg/kg、最も好ましくは約0.1〜5mg/kgである。配列または配列および治療薬は、治療される疾患、レシピエントの状態および投与経路に適切なスケジュールに基づいて、かつ適切な期間にわたって、単一用量治療、複数用量治療、または連続的に注入され得る。さらに、配列は、治療薬の投与前に、その投与と同時に、またはその投与後に投与され得る。
【0079】
化学療法剤と組み合わせた配列は、化学療法剤の抗腫瘍性効果を増強するのに有効な量で、癌を有する動物に投与される。好ましくは、一回用量につき投与される治療薬の量は、約0.001〜1000mg/m2または約0.01〜1000mg/kg、より好ましくは約0.01〜500mg/m2または約0.01〜500mg/kg、最も好ましくは約0.1〜100mg/m2または約0.1〜100mg/kgである。投与される特定の配列および特定の治療薬、一回用量についての量、用量スケジュールおよび投与経路は、当業者に既知の方法を用いて、実行者により決定されるべきであり、癌の型、癌の重度、癌の位置、ならびにレシピエントの大きさ、重さおよび物理的状態のような他の臨床因子に依存するであろう。さらに、in vitroアッセイは、配列投与ならびに配列および治療薬投与のための最適範囲を同定する助けのために任意に用いてもよい。
【0080】
以下の仮説によって拘束されることを望まないものであるが、本発明の配列は、構造の新たなファミリーを形成し、それらはアンチセンスRNA、アンチセンスDNA、三重らせん体形成DNA、テロメラーゼ抑制剤、転写活性化因子または転写抑制剤として機能しないと思われる。
【0081】
以下の実施例は、本発明を、本発明をさらに説明するのに役立つであろうが、その際に、本発明のいかなる限定をも構成しない。反対に、様々な他の実施形態、変更およびそれらの均等物に対する方策がなされてもよく、本明細書中の説明を読んだ後に、これらが、本発明の精神から逸脱することなく当業者に示唆されるであろうことは明らかに理解されるべきである。
【0082】
実施例1
配列の調製
ホスホジエステルおよびホスホロチオエート配列は、EXPEDITE(商標)8900自動化DNA合成システム(PersSeptive Biosystems, Inc., Farminghan, MA)を用いて、HUKABEL Scientific Ltd, (Montreal, Quebec, Canada)により、およびAbacus Segmented合成技術を用いて、Sigma-Genosys(Woodlands, TX)により調製された。別記しない限りは、使用する配列は、ホスホジエステル配列であった。別記しない限りは、使用する直前に、高圧滅菌した脱イオン水、または生理食塩水のような(しかし、それに限定されない)高圧滅菌した薬学的に許容可能な緩衝液中に、配列を分散した。
【0083】
実施例2
細胞および試薬
すべての細胞系は、American Type Culture Collection (ATCC, Rockville, MD)から得られ、ATCCが推奨する培地中で培養した。表1は、細胞系、それらの由来、およびそれらの特性を示す。
【0084】
【表1】
Figure 0004772245
【0085】
細胞を、6(1ml/ウェル)、24(0.5ml/ウェル)または96(0.1ml/ウェル)ウェルの平底マイクロプレートにて播種し、5%CO2雰囲気中にて37℃で維持した。別記しない限り、2.5×105細胞/mlを、A、C、GおよびTを含有する2〜45塩基配列0μg/ml(対照)および100μg/ml(処理)とともに、48時間インキュベートした。
【0086】
実施例3
細胞増殖の測定
ジメチルチアゾールジフェニルテトラゾリウム(MTT)還元(Mosman et al. J. Immunol. Methods 65:55, 1983)を用いて、細胞増殖を測定した。MTTは、マルチプレート分光光度計読取り装置(ELX800, Bio-TEK Instruments Inc., Winooski, VT)を用いて、570nmの波長にて測定した。
【0087】
実施例4
ジャーカットヒト白血病T細胞増殖の抑制
ジャーカットヒト白血病T細胞は、異型多数薬剤耐性ヒト懸濁腫瘍細胞モデルである。ジャーカット細胞を、27塩基GTおよびCT配列(表2)とともにインキュベートした。
【0088】
【表2】
Figure 0004772245
【0089】
表2に示すように、ジャーカットT細胞増殖は、試験したGT配列により抑制されたが、試験したCT配列によっては抑制されなかった。
【0090】
ジャーカットT細胞を、3、6、9、12、14、15、18、21および24塩基GT配列とともにインキュベートした(表3)。
【0091】
【表3】
Figure 0004772245
【0092】
表3に示すように、3、6、9、12、14、15および18塩基GT配列は、21および24塩基GT配列と同程度に効果的に、ジャーカットT細胞増殖を抑制した。
【0093】
ジャーカットT細胞を、6塩基GT、AG、CG、GG、AGTおよびCGT配列とともにインキュベートした(表4)。
【0094】
【表4】
Figure 0004772245
【0095】
表4に示すように、6塩基GT配列は、ジャーカットT細胞増殖を抑制した。GT配列番号25は、増殖を60%抑制し、AGT配列番号49は、増殖を45%抑制した。PHARM/PCS−4ソフトウェア(Microcomputer Specialists, Philadelphia, PA)を用いたGT配列番号25およびAGT配列番号49の相対効力の比較により、GT配列番号25の効力は、AGT配列番号49の効力の3.4倍であることがわかった。AGT配列番号49ホスホロチオエートは、バーキットリンパ腫細胞において、テロメラーゼ活性を抑制し、アポトーシスを誘発することが報告されている(Mata et al. Toxicol. Appl. Pharmacol. 144:189, 1997)。
【0096】
テロメラーゼ活性を測定するために、2×105個のジャーカットT細胞からの抽出物を、PCRテロメア反復増幅プロトコール(TRAP)(Roche, Laval, Quebec, Canada)を用いてアッセイした。1〜100μg/mlの濃度にて、GT配列番号25−ホスホジエステルは、0〜10%の抗テロメラーゼ活性を示したのに対し、AGT配列番号49−ホスホロチオエートは、30〜75%の抗テロメラーゼ活性を示した。GT配列番号25−ホスホロチオエートおよびGT配列番号49−ホスホジエステルはいずれも、抗テロメラーゼ活性を示さなかった。
【0097】
ジャーカットT細胞を、2、3、4、5、6および7塩基GT配列とともにインキュベートした(表5)。
【0098】
【表5】
Figure 0004772245
【0099】
表5に示すように、2、3、4、5、6および7塩基GT配列は、ジャーカットT細胞増殖を抑制した。
【0100】
実施例5
HL−60ヒト前骨髄球白血病細胞増殖の抑制
HL−60前骨髄球白血病細胞は、p53突然変異ヒト懸濁腫瘍モデルである。HL−60細胞を、6塩基GT配列とともにインキュベートした(表6)。
【0101】
【表6】
Figure 0004772245
【0102】
表6に示すように、6塩基GT配列は、HL−60細胞増殖を抑制した。
【0103】
実施例6
MCF−7ヒト乳癌細胞増殖の抑制
MCF−7ヒト乳癌細胞は、カスパーゼ3陰性、エストロゲン依存性のヒト固形腫瘍モデルである。MCF−7細胞(5×105細胞/ml)を、3および6塩基GT配列とともにインキュベートした(表7)。
【0104】
【表7】
Figure 0004772245
【0105】
表7に示すように、6および7塩基GT配列は、MCF−7細胞増殖を抑制した。
【0106】
実施例7
PC−3ヒト前立腺癌細胞増殖の抑制
PC−3前立腺癌細胞は、p53突然変異、アンドロゲン非依存性のヒト固形腫瘍モデルである。PC−3細胞(5×105細胞/ml)を、3および6塩基GT配列とともにインキュベートした(表8)。
【0107】
【表8】
Figure 0004772245
【0108】
表8に示すように、3および6塩基GT配列は、PC−3細胞増殖を抑制した。
【0109】
実施例8
LNCaPヒト前立腺癌細胞増殖の抑制
LNCaP前立腺癌細胞は、TGF−ベータ1受容体陰性、アンドロゲン非依存性の転移性ヒト固形腫瘍モデルである。LNCaP細胞(5×105細胞/ml)を、6塩基GT配列とともにインキュベートした(表9)。
【0110】
【表9】
Figure 0004772245
【0111】
表9に示すように、6塩基GT配列は、LNCaP細胞増殖を抑制した。
【0112】
実施例9
THP−1ヒト急性単球性白血病細胞増殖の抑制
THP−1急性単球性白血病細胞は、p53欠損ヒト懸濁腫瘍モデルである。THP−1細胞(1.6×106細胞/ml)を、6塩基GT配列とともにインキュベートした(表10)。
【0113】
【表10】
Figure 0004772245
【0114】
表10に示すように、6塩基GT配列は、THP−1細胞増殖を抑制した。
【0115】
実施例10
OVCAR−3ヒト卵巣癌細胞増殖の抑制
OVCAR−3卵巣癌細胞は、p53突然変異、p21/waf−1/Cip欠失の転移性ヒト固形腫瘍モデルである。OVCAR−3細胞(5×105細胞/ml)を、2、6および18塩基GT配列ならびに6塩基AGT配列とともにインキュベートした(表11)。
【0116】
【表11】
Figure 0004772245
【0117】
表11に示すように、2、6および18塩基GT配列ならびに6塩基AGT配列は、OVCAR−3細胞増殖を抑制した。
【0118】
実施例11
SK−OV−3ヒト卵巣癌細胞増殖の抑制
SK−OV−3卵巣癌細胞は、p53突然変異、p21/waf−1/Cip欠失、p15ink4B欠失、P16ink4欠失の転移性ヒト固形腫瘍モデルである。SK−OV−3細胞(5×105細胞/ml)を、2、6および18塩基GT配列とともにインキュベートした(表12)。
【0119】
【表12】
Figure 0004772245
【0120】
表12に示すように、2、6および18塩基GT配列は、SK−OV−3細胞増殖を抑制した。
【0121】
実施例12
ホスホジエステルおよびホスホロチオエート配列による細胞増殖の抑制
1つまたはそれ以上のリン酸基上の非架橋酸素原子を、硫黄原子で置換することによる天然のホスホジエステル配列の修飾は、生物学的液体および細胞におけるエンドヌクレアーゼに対するオリゴヌクレオチド配列の安定性を増加させることが報告されている(Crooke et al. Anticancer Drugs 6:609, 1991)。
【0122】
ジャーカットヒト白血病T細胞(表13)、LNCaPヒト前立腺癌細胞(5×105細胞/ml)(表14)およびMCF−7ヒト乳癌細胞(5×105細胞/ml)(表15)を、リン酸基上の非架橋原子として、酸素(ホスホジエステル)または硫黄(ホスホロチオエート)を有する6塩基GT配列とともにインキュベートした。
【0123】
【表13】
Figure 0004772245
【0124】
【表14】
Figure 0004772245
【0125】
【表15】
Figure 0004772245
【0126】
表13、14および15に示すように、6塩基GT−ホスホジエステル配列は、6塩基GT−ホスホロチオエート配列よりも効果的に、ジャーカットT、LNCaPおよびMCF−7細胞増殖を抑制した。
【0127】
実施例13
混合ホスホジエステルおよびホスホロチオエート配列による細胞増殖の抑制
ジャーカットヒト白血病T細胞(表16)およびMCF−7ヒト乳癌細胞(5×105細胞/ml)(表17)を、6塩基GT配列番号25とともにインキュベートした。ここで、酸素(ホスホジエステル)または硫黄(ホスホロチオエート)が、リン酸基上の非架橋原子であった。
【0128】
【表16】
Figure 0004772245
【0129】
【表17】
Figure 0004772245
【0130】
表16および17に示すように、6塩基GT配列番号25の1つまたはそれ以上のリン酸基上の非架橋酸素原子を硫黄原子で置換することにより、ジャーカットTおよびMCF−7細胞増殖の抑制の著しい減少という結果を生じた。
【0131】
実施例14
マウス癌細胞増殖の抑制
EL−4マウスリンパ腫T細胞は、懸濁腫瘍モデルである。EL−4マウスリンパ腫T細胞を、6、18、27および33塩基GT配列、ならびに15塩基ACG配列とともにインキュベートした(表18)。
【0132】
【表18】
Figure 0004772245
【0133】
表18に示すように、6、18、27および33塩基GT配列、ならびに15塩基ACG配列は、EL−4マウス細胞増殖を抑制しなかった。
【0134】
A20マウス白血病B細胞は、懸濁腫瘍モデルである。A20マウス白血病B細胞を、6塩基GT配列とともにインキュベートした(表19)。
【0135】
【表19】
Figure 0004772245
【0136】
表19に示すように、6塩基GT配列は、A20マウスB白血病細胞増殖を抑制した。
【0137】
実施例15
イヌ癌細胞増殖の抑制
D−17イヌ骨肉腫細胞およびCF−51イヌ乳腺癌細胞は、固形腫瘍モデルである。D−17イヌ骨肉腫細胞(5×105細胞/ml)(表20)およびCF51−イヌ乳腺癌細胞(5×105細胞/ml)(表21)を、6、9、17、27および33塩基GT配列、ならびに15塩基ACG配列とともにインキュベートした。
【0138】
【表20】
Figure 0004772245
【0139】
【表21】
Figure 0004772245
【0140】
表20および21に示すように、6、9、17、27および33塩基GT配列、ならびに15塩基ACG配列は、D−17およびCF−51イヌ細胞増殖の両方を抑制した。
【0141】
実施例16
癌細胞増殖の抑制
6塩基GT配列番号25によるヒト、マウスおよびイヌ癌細胞増殖の抑制を表22に要約する。
【0142】
【表22】
Figure 0004772245
【0143】
表22に示すように、6塩基GT配列番号25による増殖の抑制に対して、ヒト癌細胞は、イヌ癌細胞およびマウス癌細胞よりも感受性が高い。
【0144】
実施例17
増殖の抑制に対する2つの6塩基GT配列の相乗効果
ジャーカットヒト白血病T細胞を、最適下限濃度(5.0μg/ml)の6塩基GT配列(表23)とともにインキュベートした。
【0145】
【表23】
Figure 0004772245
【0146】
表23に示すように、2つの6塩基GT配列の同時使用は、ジャーカットT細胞増殖の抑制に対して相乗効果があった。
【0147】
実施例18
化学療法薬剤の抗腫瘍性効果の増強作用
ジャーカットヒト白血病T細胞を、5−フルオロウラシルまたはシスプラチン0、0.1、1.0または10.0μg/mlの存在下にて、1.0μg/mlの6塩基GT配列番号25および27塩基GT配列番号1とともにインキュベートした(表24)。5−フルオロウラシルは、DNAおよびRNA合成を妨害する代謝拮抗物質である。シスプラチンは、DNAを架橋して、DNA前駆体を阻害するアルキル化剤である。
【0148】
【表24】
Figure 0004772245
【0149】
表24に示すように、6塩基GT配列番号25および27塩基GT配列番号1は、ジャーカットT細胞増殖に対して、5−フルオロウラシル0.1および1.0μg/mlの抗腫瘍性効果を増強し、GT配列番号25は、ジャーカットT細胞増殖に対するシスプラチン0.1および1.0μg/mlの抗腫瘍性効果を増強した。
【0150】
MCF−7ヒト乳癌細胞(5×105細胞/ml)を、5−フルオロウラシルまたはタモキシフェン0、0.1、1.0または10.0μg/mlの存在下にて、1.0μg/mlの6塩基GT配列番号25および27塩基GT配列番号1とともにインキュベートした(表25)。タモキシフェンは、エストロゲン拮抗物質である。
【0151】
【表25】
Figure 0004772245
【0152】
表25に示すように、6塩基配列番号25は、MCF−7細胞増殖に対して、5−フルオロウラシル0.1μg/mlおよびタモキシフェン0.1μg/mlの抗腫瘍性効果を増強した。27塩基配列番号1は、MCF−7細胞増殖に対する5−フルオロウラシルまたはタモキシフェンの抗腫瘍性活性を増強しなかった。
【0153】
実施例19
6塩基GT配列番号25の反復による増殖の抑制
ジャーカットヒト白血病T細胞を、6塩基GG(GT)1GG(配列番号25)の1、2、3および4反復とともにインキュベートした(表26)。
【0154】
【表26】
Figure 0004772245
【0155】
表26に示すように、ジャーカットT細胞増殖の抑制は、6塩基GT配列番号25を用いた場合60%であり、12塩基GT配列番号68、18塩基GT配列番号69および24塩基GT配列番号70を用いた場合、減少した。6塩基GT配列番号25の融点(Tm)は2.5℃であり、GT配列番号68を用いた場合56.8℃に、GT配列番号69を用いた場合76.3℃に、GT配列番号70を用いた場合86.3℃に増加した。
【0156】
実施例20
バチルスカルメットゲラン(BCG)由来配列による増殖の抑制
BCG由来配列は、in vivoにて腫瘍成長を抑制すると報告されている(Kataoka et al. Jpn. J. Cancer Res. 83:244, 1992)。さらに、A−2(配列番号72)およびBCG A−4(配列番号74)は、IMC細胞と予め混合して、CDF−1マウスに注射すると、それぞれ88%および37%分IMC腫瘍成長を抑制することが報告されている。
【0157】
ジャーカットヒト白血病T細胞を、BCG由来の45塩基配列とともにインキュベートした(表27)。
【0158】
【表27】
Figure 0004772245
【0159】
表27に示すように、BCG由来配列は、ジャーカットT細胞増殖を24%以下で抑制した。
【0160】
実施例21
細胞周期停止の誘導
CYCLETEST(商標)PLUS DNA市販用キット(Becton Dickinson)を用いて、細胞周期段階を測定した。要するに、非イオン性界面活性剤中に細胞膜を溶解し、トリプシンを用いて細胞骨格および核タンパク質を除去して、細胞RNAをRNアーゼで消化して、核クロマチンをスペルミンで安定化することにより、細胞からの核を得た。ヨウ化プロピジウムを細胞核に添加して、それらの蛍光を、電子二重識別能力を装備したフローサイトメーター(FACSCalibur, Becton Dickinson, San Jose, CA)にて分析した。細胞周期のG0/G1、初期S(SE)、中間S(SM)、後期S(SL)またはG2/M期における細胞の蓄積を、MODFIT LTソフトウェア(Verity Software House Inc., Topsham, MA)を用いて分析した。
【0161】
指数関数的に成長するジャーカットヒト白血病T細胞(表28)およびMCF−7ヒト乳癌細胞(5×105細胞/ml)(表29)を、A、C、GおよびTを含有する2、6、15、18、27および45塩基配列とともに、24時間インキュベートした。細胞を収集して、遠心分離し、細胞周期段階を測定した。
【0162】
【表28】
Figure 0004772245
【0163】
表28に示すように、ジャーカットT細胞において、2、6および27塩基GT配列は、細胞周期のSE期における停止を誘導し、6塩基CGおよびAGT、18塩基GTおよび45塩基BCG−A−1配列は、細胞周期のSM期における停止を誘導し、6塩基AG配列は、細胞周期のG0/G1期における停止を誘導した。
【0164】
【表29】
Figure 0004772245
【0165】
表29に示すように、MCF−7細胞において、2および6塩基GT配列は、細胞周期のSE期における停止を誘導し、6塩基AGT配列および18塩基GT配列は、細胞周期のSM期における停止を誘導した。
【0166】
実施例22
GT配列番号25、AC配列番号79およびGT配列番号25+AC配列番号79による細胞周期停止の誘導
【0167】
ジャーカットヒト細胞白血病T細胞(1×106細胞/ml)を、6塩基GT配列番号25、相補的6塩基AC配列番号79、および6塩基GT配列番号25+6塩基AC配列番号79とともに、24時間インキュベートした。GT配列番号25およびAC配列番号79を、このオリゴヌクレオチド(1:1)を混合し、65℃にて10分間、加熱することによりハイブリダイズした。対照として、GT配列番号25およびAC配列番号79を、65℃にて10分間、加熱した(表30)。
【0168】
【表30】
Figure 0004772245
【0169】
表30に示すように、6塩基GT配列番号25は、細胞周期のSE期の末期における停止を誘導したのに対し、相補的6塩基AC配列番号79は、細胞周期に対する効果がなかった。GT配列番号25およびAC配列番号79のハイブリダイゼーションは、GT配列番号25による細胞周期停止の誘導を無効にした。これらのデータは、効果的であるためには、本発明の配列は、一本鎖でなくてはならないことを実証している。
【0170】
実施例23
アポトーシスの誘発
原形質膜ホスファチジルセリンの再分布および核マトリックスタンパク質(NuMA)の放出は、アポトーシスを受けている細胞の特質である(Martin et al. J. Exp. Med., 182:1545, 1995; Miller et al. Biotechniques, 15:1042, 1993)。
【0171】
FITC結合アネキシンV(BD Pharmingen, San Diego, CA)を用いたフローサイトメトリーにより、アポトーシス中の原形質膜におけるホスファチジルセリンの再分布を測定した。市販用ELISAキット(Oncogen/Calbiochem, Cambridge, MA)を用いて、上清へのNuMA放出を測定した。
【0172】
ジャーカット白血病T細胞を、3、4、5、6および7GT塩基配列、5塩基ACGT配列、6塩基AG、GG、AGTおよびCGT配列、ならびに7塩基GG配列50μMとともにインキュベートした。表31は、アポトーシス(ホスファチジルセリン/アネキシンV染色(PS/A−V)に関して陽性)の状態にある細胞%および細胞から放出されるNuMA%を示す。
【0173】
【表31】
Figure 0004772245
【0174】
表31に示すように、3、4、5および6塩基GT、AG、CGおよびAGT配列は、ジャーカットT細胞のアポトーシスを誘発した。5塩基ACGTおよび6塩基CGTおよびGG配列は、ジャーカットT細胞のアポトーシスを誘発しなかった。
【0175】
実施例24
細胞内カルシウム(Ca2+iの増加
細胞内カルシウム(Ca2+iの増加は、アポトーシス誘発に関連があることが報告されている(Lam et al. Mol. Endocrinol. 7:686, 1993)。(Ca2+iは、蛍光プローブFluo−3−AM(Cell Permaant, Molecular Probes, Inc., Eugene, OR)を用いて追跡される。Fluo−3−AM蛍光の増加は、(Ca2+iの増加を示す。
【0176】
ジャーカットヒト白血病T細胞を、6塩基GT配列番号25とともに、24時間インキュベートした。遠心分離により、細胞を収集し、1%FBSを含有するPBS中に懸濁させ、Fluo−3−AM 10μMとともに、37℃にて1時間負荷した。488nm励起および530nm発光(FL1検出器)にて、細胞蛍光を測定した。プログラムCellQUEST(Becton Dickinson)を用いて、FACSCALIBURにてデータを分析した。
【0177】
図1に示すように、6塩基GT配列番号25とともにジャーカットT細胞をインキュベーションすることにより、細胞蛍光の88%増加をもたらし、(CA2+iの増加を示した。
【0178】
実施例25
アポトーシスの誘発
アポトーシスは、Fas(CD95)および腫瘍壊死因子(TNF)を含むが、これらに限定されない細胞表面受容体に結合するリガンドによって開始され得る。FasリガンドへのFas結合、およびTNF受容体1へのTNF結合が、細胞内シグナル伝達を開始し、結果としてシステインアスパルチルプロテアーゼ(カスパーゼ)の活性化を生じる。カスパーゼは、核DNA断片化、核マトリックスタンパク質(NuMA)の放出および細胞基質接触の損失に関連したアポトーシス実行の致死的タンパク質分解カスケードを開始する。
【0179】
ジャーカットヒト白血病T細胞(1×106/ml)を、6および27GT塩基配列とともにインキュベートした(表32)。NuMAは、実施例23と同様に測定した。
【0180】
【表32】
Figure 0004772245
【0181】
表32に示すように、6塩基GT配列番号25を用いた場合のNuMA放出%は、27塩基GT配列番号1、2、3および4を用いた場合のNuMA放出%よりも多かった。
【0182】
実施例26
6塩基GT配列番号25および6塩基AC配列番号79によるアポトーシスの誘発
ジャーカットヒト細胞白血病T細胞を、6塩基GT配列番号25、相補的6塩基AC配列番号79、および6塩基GT配列番号25+6塩基AC配列番号79とともに、24時間インキュベートした。GT配列番号25およびAC配列番号79を、この配列(1:1)を混合し、65℃にて10分間、加熱することによりハイブリダイズする。対照として、GT配列番号25およびAC配列番号79を、65℃にて10分間、加熱した(表33)。アポトーシスは、実施例23と同様に評価した。
【0183】
【表33】
Figure 0004772245
【0184】
表33に示すように、6塩基GT配列番号25は、ジャーカットT細胞のアポトーシスを誘発したのに対し、相補的AC配列番号79は、アポトーシスに対する効果がなかった。さらに、GT配列番号25およびAC配列番号79のハイブリダイゼーションは、GT配列番号25のアポトーシス誘発を無効にした。これらのデータは、効果的であるためには、本発明の配列は、一本鎖でなくてはならないことを実証する。
【0185】
実施例27
チモテ菌(Mycobacterium phlei)由来のGTリッチおよびACリッチな配列による、増殖の抑制、細胞周期停止およびアポトーシスの誘発
ジャーカットヒト白血病T細胞を、チモテ菌のmurA遺伝子(ジーンバンク:アクセッション番号X99776)由来のGTリッチまたはACリッチな配列とともにインキュベートした。増殖の抑制は、実施例3と同様に、MTTの還元により測定し、細胞周期停止は、実施例21と同様に、ヨウ化プロピジウムを用いたフローサイトメトリーにより検出し、アポトーシスは、実施例23と同様に、アネキシン−V−FITCを用いたフローサイトメトリーにより評価した。
【0186】
【表34】
Figure 0004772245
【0187】
表34に示すように、GTリッチな配列番号81、82および83は、ジャーカットT細胞の増殖を抑制し、この細胞にて細胞周期停止を誘導し、この細胞のアポトーシスを誘発したのに対し、ACリッチな配列番号15は、ジャーカットT細胞の増殖を抑制せず、この細胞にて細胞周期停止も誘導せず、また、この細胞のアポトーシスをも誘発しなかった。
【0188】
実施例28
GT配列によるカスパーゼ活性化の調節
カスパーゼは、3つの主要なペプチド基質配列:1)Tyr−Val−Ala−Asp(YVAD、カスパーゼ−1、−4および−5)(配列番号84)、2)Asp−Glu−Val−Asp(DEVD、カスパーゼ−2、−3および−7)(配列番号85)および3)Ile−(Leu)−Glu−X−Asp(I(L)EXD、カスパーゼ−8および−10)(配列番号86)を認識する(Thornberry et al. J. Biol. Chem. 272:17907, 1997)。タンパク質標的における配列認識は、第1の例:カスパーゼ3によるカスパーゼ7の調節と同様に、または第2の例:ラミンを含むが、これらに限定されない構造タンパク質標的の分解と同様に、または第3の例:PARPを含むが、これらに限定されない酵素の活性化と同様に、標的の限られた、かつ特異的なタンパク質分解という結果を生じる。
【0189】
NH2−XXXD−COO−GT配列構築物は、5’−C2アミドスペーサーアームを用いて合成したオリゴヌクレオチド、および標準アミド−カルボキシル水溶性カルボヘキシイミド結合法(Guy et al. J. Chromatography. B. Biomed. Sci. Appl. 706:149, 1998)を用いて、NH2−YVAD−COOH(配列番号84)、NH2−DEVD−COOH(配列番号85)およびNH2−IEGD−COOH(配列番号87)からなる群から選択される化学的に保護されたペプチドへの、化学的に保護されたGT配列または化学的に保護されたAC配列の化学結合により生成される。反応性カルボキシレートおよび反応性アミン基は、結合後に脱保護される。
【0190】
NH2−YVAD−COO−GT、NH2−DEVD−COO−GT、およびNH2−I(L)EXD−COO−GTを含むが、これらに限定されないペプチド−GT(以降、PGT)配列構築物は、カスパーゼ、癌転移関連酵素、コラゲナーゼおよびメタロプロテイナーゼを含むが、これらに限定されない酵素により、DおよびGT配列間のカルボキシレート官能基にて切断される。かかる切断により、PGTからカスパーゼ活性化GT配列の放出が生じる。その結果得られる細胞内カスパーゼ活性の増加は、例えば、複数薬剤耐性癌細胞における化学療法剤の治療上の効果または弱い抗原性刺激に対する免疫応答を高める。
【0191】
カスパーゼ活性化を測定するために、対照および処理細胞を洗浄し、固定し、透過化処理し、製造者が推奨する条件を用いてカスパーゼの活性体を認識するFITC−結合抗体(Pharmingen, San Diego, CA)とともにインキュベートした。活性カスパーゼ3と関連する蛍光は、プログラムCellQUEST(Becton Dickinson)を用いて、FACSCALIBURにてフローサイトメトリーにより分析する。あるいは、カスパーゼ活性化は、着色レポーター分子p−ニトロアニリドに結合したカスパーゼ特異的ペプチドの切断に基づくアッセイを用いて、比色的に測定するが、それは405nmの波長にて分光光度的に定量することができる。
【0192】
実施例29
GT配列番号66、81、82および83、ならびにAGC配列番号67によるカスパーゼ3の活性化
ジャーカットT細胞白血病細胞を、33塩基GT配列番号66、11塩基GT配列番号81(GT配列番号66の塩基1〜11)、11塩基GT配列番号82(GT配列番号66の塩基12〜22)、11塩基GT配列番号83(GT配列番号66の塩基23〜33)、および15塩基ACG配列番号67とともに、72時間インキュベートした。活性カスパーゼ3(17〜22kDa)は、実施例28と同様に、FITC結合抗体(クローン:C92−605)を用いて測定した。
【0193】
図2Aに示すように、33塩基GT配列番号66および11塩基GT配列番号81、82および83各々は、不活性プロカスパーゼ3の活性カスパーゼ3へのプロセシングを誘発したのに対し、15塩基ACG配列番号67は、不活性プロカスパーゼ3の活性カスパーゼ3へのプロセシングを誘発しなかった。
【0194】
カスパーゼ3活性化はまた、実施例28と同様に、比色的に測定した。図2Bに示すように、33塩基GT配列番号66および11塩基GT配列番号81、82および83処理細胞におけるカスパーゼ3活性化は、対象細胞における活性化よりも、105%、77%、100%および60%高いのに対して、15塩基ACG配列番号67処理細胞では、カスパーゼ3活性化は、対照細胞とほぼ同じであった。
【0195】
実施例30
6塩基GT配列番号25によるカスパーゼ3活性の活性化
ジャーカットT細胞白血病細胞を、6塩基GT配列番号とともに、72時間インキュベートした。カスパーゼ3活性化は、実施例28と同様に、比色的に測定した。図3Aに示すように、6塩基GT配列番号25処理細胞におけるカスパーゼ3活性化は、対照細胞における活性化よりも323%高かった。
【0196】
実施例31
GT配列番号25によるカスパーゼ−7の活性化およびPARP切断
ジャーカットT細胞白血病細胞を、6塩基GT配列番号25とともに、72時間インキュベートした。細胞をPBSで3回洗浄し、5mMのMgCl2、1mMジチオトレイトール、1.5nMアプロチニン、10mMロイペプチンおよび2.5μmオルトバナジン酸ナトリウムを含有する10mMのHEPES(pH7.5)、を用いて溶解させて、溶解産物のタンパク質含有量を測定した(Bradford J. Anal. Biochem. 72:248, 1976)。
【0197】
活性化されたカスパーゼ7およびPARP切断は、ウェスタンブロット解析により検出された。溶解産物を、Laemmli緩衝液(Laemmli U. Nature 15:680, 1970)と混合し、振盪し、100℃にて4分間加熱した。タンパク50μgを、各レーンに添加し、10%(カスパーゼ)または17%(PARP)ドデシル硫酸ナトリウム−ポリアクリルアミドゲル(SDS−PAGE)にて、約1.5時間、100Vの一定電圧で電気泳動することにより、タンパクを分離した。分離したタンパクを、PVDF膜上にエレクトロブロットした。膜のポンソーレッド染色により、均等なタンパク負荷をモニターした。
【0198】
1%トリス緩衝食塩水(2mMトリス−HCl、13.7mMのNaCl、pH7.6、および0.1%ポリエチレンソルビタンモノラウレート(ツイーン20)(TBST)+5%脱脂粉乳を含有する緩衝液を用いて、4℃にて一晩、膜をブロックした。膜を洗浄して、マウスモノクローナルIgG抗カスパーゼ7抗体(Pharmingen)(TBST+1%BSA中にて1:1000希釈)またはマウスモノクローナルIgG抗PARP抗体(TBST+1%BSA中にて1:1000希釈)(Pharmingen)とともに、室温にて1時間インキュベートした。カスパーゼ7またはPARPに結合したIgGを、ホースラディッシュペルオキシダ−ゼに結合したヒツジ抗マウスIgG(TBST+5%脱脂粉乳中にて1:1000希釈)(Parmingen)を用いて検出した。ブロットは、強化化学発光検出システム(ELC, Amersham, Corp., Amersham, UK)を用いて発色させた。
【0199】
図3Bに示すように、6塩基GT配列番号25は、不活性プロカスパーゼ(30kDa)の活性カスパーゼ7(19〜20kDa)へのプロセシング、および活性PARPの不活性85kDa分解産物へのプロセシングを誘発した。
【0200】
実施例32
カスパーゼ活性化の正のフィードバック増幅
ジャーカットヒト白血病T細胞を、NH2−YVAD−CO−GG(GT)GG、NH2−DEVD−CO−GG(GT)GG、NH2−IEGD−COO−GG(GT)GG、NH2−YVAD−CO−AACCACAAGCCCAAC、NH2−DVED−CO−AACCACAAGCCCAAC、およびNH2−IEGD−CO−AACCACAAGCCCAACとともに、72時間インキュベートした。カスパーゼ3およびカスパーゼ7活性化を測定した。
【0201】
NH2−YVAD−CO−GT、NH2−DEVD−CO−GT、およびNH2−IEGD−COO−GT各々は、活性カスパーゼ3への不活性カスパーゼ3のプロセシング、および活性カスパーゼ7への不活性カスパーゼ7のプロセシングを誘発するのに対し、NH2−YVAD−CO−ACG、NH2−DVED−CO−ACG、およびNH2−IEGD−CO−ACGは、活性カスパーゼ3への不活性カスパーゼ3のプロセシング、および活性カスパーゼ7への不活性カスパーゼ7のプロセシングを誘発しない。
【0202】
以下の仮説によって拘束されることを望まないものであるが、カスパーゼ含有細胞内での基本的カスパーゼ活性は、タンパク質分解/加水分解によるNH2−XXXD−COO−GT構築物からのカスパーゼ活性化GT配列の放出を媒介すると思われる。このことが、放出されるカスパーゼ活性化GT配列による細胞内のカスパーゼ活性の正の増幅(カスパーゼ3およびカスパーゼ7のレベル増加)という結果を生じる。
【0203】
実施例33
サイトカイン産生の誘発
別記しない限り、1×106細胞を、各試験配列100μg/mlともに、5%CO2中にて37℃で48時間インキュベートした。サイトカインIL−6,IL−10、IL−12、IL−1ベータ、およびTNF−アルファの産生を、適切な市販用ELISA(BioSource, Camarillo CA)を用いて、培養上清100μl中で、pg/mlにて測定した。IL−12ELISAは、IL−12p70複合体および遊離p40サブユニットの両方を測定する。結果は、対照細胞と比較して、処理細胞によるサイトカイン産生の「倍」(×)増として表す。
【0204】
THP−1ヒト急性単球性白血病細胞を、2、3、6、9、12、14、15および18塩基GT配列とともにインキュベートし、サイトカインIL−6の産生を測定した(表35)。
【0205】
【表35】
Figure 0004772245
【0206】
表35に示すように、2、3、6、9、12、14、15および18塩基GT配列は、THP−1細胞のサイトカインIL−6産生を増加させた。
【0207】
THP−1ヒト急性単球性白血病細胞を、6塩基GT、AG、CG、GG、AGTおよびCGT配列とともにインキュベートし、サイトカインIL−12およびIL−6の産生を測定した(表36)。
【0208】
【表36】
Figure 0004772245
【0209】
表36に示すように、6塩基GT、AG、CG、GG、AGTおよびGCT配列は、THP−1細胞のサイトカインIL−12およびIL−6産生を増加させた。
【0210】
表37は、6塩基配列によるIL−12およびIL−6の誘発を要約する。
【0211】
【表37】
Figure 0004772245
【0212】
BCG由来の配列A−3(配列番号73)、A−4(配列番号74)、A−6(配列番号75)、A−7(配列番号76)、M3(配列番号77)およびアルファ1(配列番号78)は、in vivoでNK細胞を活性化することが報告されている(Kataoka et al. Jpn. J. Cancer Res. 83:244, 1992)。THP−1ヒト急性単球性白血病細胞を、45塩基BCG由来配列とともにインキュベートし、サイトカインIL−12およびIL−6の産生を測定した(表38)。
【0213】
【表38】
Figure 0004772245
【0214】
表38に示すように、45塩基BCG由来配列は、THP−1細胞のIL−12およびIL−6産生を最低限に増加させた。
【0215】
実施例34
ホスホジエステルおよびホスホロチオエート配列によるIL−12産生の誘発
THP−1ヒト急性単球性白血病細胞を、リン酸基上の非架橋原子として、酸素(ホスホジエステル)または硫黄(ホスホロチオエート)を有する6塩基GT配列とともにインキュベートし、サイトカインIL−12の産生を測定した(表39)。
【0216】
【表39】
Figure 0004772245
【0217】
表39に示すように、リン酸基上の非架橋酸素原子(ホスホジエステル)を硫黄原子(ホスホロチオエート)で置換することは、THP−1細胞のIL−12産生の著しい減少という結果を生じた。
【0218】
THP−1ヒト急性単球性白血病細胞を、リン酸基上の非架橋原子として、酸素(ホスホジエステル)または硫黄(ホスホロチオエート)を有する6塩基GT配列番号25とともにインキュベートし、サイトカインIL−12の産生を測定した(表40)。
【0219】
【表40】
Figure 0004772245
【0220】
表40に示すように、6塩基GT配列番号25において非架橋酸素原子(ホスホジエステル)を硫黄原子(ホスホロチオエート)で置換することは、THP−1細胞のIL−12産生の著しい減少という結果を示した。
【0221】
実施例35
ヒト末梢血単核細胞におけるサイトカイン合成の刺激
末梢血単核細胞(これ以降、「PBMC」)は、全血の密度勾配遠心分離により、フィコール・ハイパック(Amersham Pharmacia Biotech, Baie d'Urfee, Quebec, Canada)により、7人の健常者から単離した。PBMCを、6塩基GT、AGT、CGT、AG、CGおよびGG配列とともにインキュベートし、サイトカインIL−1ベータ、IL−6、IL−10およびIL−12の産生を測定した。
【0222】
【表41】
Figure 0004772245
【0223】
表41に示すように、6塩基GT、AGT、CGT、AG、CGおよびGG配列は、ヒトPBMC細胞のサイトカインIL−1ベータ、IL−6、IL−10およびIL−12産生を増加させた。
【0224】
実施例36
チンパンジー末梢血単核細胞によるサイトカイン合成
実施例35と同様に、4匹の健常なチンパンジーから、PBMCを単離した。チンパンジーPBMCを、6塩基GT、AGT、CGT、AG、CGおよびGG配列とともにインキュベートし、サイトカインIL−10、IL−12およびTNF−アルファの産生を測定した(表42)。
【0225】
【表42】
Figure 0004772245
【0226】
表42に示すように、6塩基GT、AGT、CGT、AG、CGおよびGG配列は、チンパンジーPBMC細胞のサイトカインIL−10およびIL−12ならびにTNF−アルファの産生を増加させた。
【0227】
実施例37
アカゲザル末梢血単核細胞によるサイトカイン合成
実施例35と同様に、4匹の健常なアカゲザルから、PBMCを単離した。PBMCを、6塩基GT、AGT、CGT、AG、CGおよびGG配列とともにインキュベートし、サイトカインIL−6、IL−12およびTNF−アルファの産生を測定した(表43)。
【0228】
【表43】
Figure 0004772245
【0229】
表43に示すように、6塩基GT、AGT、CGT、AG、CGおよびGG配列は、アカゲザルPBMC細胞のサイトカインIL−10、IL−12およびTNF−アルファの産生を増加させた。
【0230】
実施例38
MCF−7ヒト胸部腫瘍に対する6塩基GT配列番号25+5−フルオロウラシル、および6塩基GT配列番号25+タモキシフェンの6塩基GT配列番号25の効果
MCF−7ヒト乳癌細胞を、雌ヌードBALB/cマウスに、異種移植片として皮下に移植する。マウスを、10匹のマウスの6群に分ける。0日目に、群1マウスには、生理食塩水を与え、群2マウスには、6塩基GT配列番号25を与え、群3マウスには、5−フルオロウラシルを与え、群4マウスには、タモキシフェンを与え、群5マウスには、6塩基GT配列番号25+5−フルオロウラシルを与え、群6マウスには、6塩基GT配列番号25+タモキシフェンを与える。処理4週後に、マウスを屠殺し、腫瘍サイズを測定する。群1マウスは、最も大きな腫瘍サイズを有し、群2、3および4マウスは、群1マウスよりも小さな腫瘍サイズを有し、群5および6マウスは、群1、2、3および4マウスよりも小さな腫瘍サイズを有する。
【0231】
実施例39
LNCaPヒト前立腺癌腫瘍に対する3および6塩基GT配列ならびに45塩基BCG A−3配列の効果
LNCaPヒト前立腺癌細胞を、雄ヌードnu/nuマウスに、異種移植片として皮下に移植する。マウスを、10匹の5群に分ける。0日目に、群1マウスには、生理食塩水を与え、群2マウスには、3塩基配列番号8を与え、群3マウスには、6塩基GT配列番号25を与え、群4マウスには、6塩基AG配列番号45を与え、群5マウスには、45塩基BCG A−3配列番号69を与える。処理4週後に、マウスを屠殺し、腫瘍サイズを測定する。群1マウスは、最も大きな腫瘍サイズを有し、群5マウスは、群1マウスよりも小さな腫瘍サイズを有し、群2、3および4マウスは、群1および5マウスよりも小さな腫瘍サイズを有する。
【0232】
実施例41
EL−4マウスTリンパ腫に対する3、6、8および27塩基の効果
EL−4マウスTリンパ腫細胞を、C57/BL6マウスに移植する。マウスを、10匹の6群に分ける。0日目に、群1マウスには、生理食塩水を与え、群2マウスには、3塩基GT配列番号8を与え、群3マウスには、6塩基配列番号25を与え、群4マウスには、6塩基AG配列番号45を与え、群5マウスには、18塩基GT配列番号18を与え、群6マウスには、27塩基GT配列番号1を与える。処理4週後に、マウスを屠殺し、腫瘍サイズを測定する。群1マウスは、最も大きな腫瘍サイズを有し、群2、3、4、5および6マウスは、群1マウスよりも小さな腫瘍サイズを有する。
【0233】
実施例42
ヒト結腸癌細胞系を、付着細胞培養物として維持する。指数関数的成長相における細胞を、0μg/ml〜100μl/mlの用量範囲にて、2〜20塩基GT、GA、GCまたはGG配列で24〜72時間処理する。細胞増殖の抑制をMTT還元により測定し、細胞周期停止をフローサイトメトリーにより測定し、アポトーシスをアネキシン−V結合またはNuMA放出により測定する。GT、GA、GCまたはGG配列は、結腸癌細胞系において、増殖を抑制し、細胞周期停止を誘導し、アポトーシスを誘発する。
【0234】
皮下ヒト結腸直腸癌細胞系を有するSCIDマウスを、生理食塩水、あるいはin vitroでヒト結腸直腸癌細胞系に対して抗癌活性を有する2〜20塩基GT、GA、GCまたはGG配列で処理する。in vitroでヒト結腸直腸癌細胞系に対して抗癌活性を有する2〜20塩基GT、GA、GCまたはGG配列で処理したマウスは、生理食塩水で処理したマウスと比較して、腫瘍サイズの有意な減少を示す。
【0235】
本発明について、それらの特定の実施形態を参照して詳述してきたが、本発明の精神および範囲から逸脱することなく、さまざまな改変および変更がなされ得ることは、当業者には明らかであろう。
【図面の簡単な説明】
【図1】0μg/mlおよび100μg/mlの6塩基GT配列番号25とともにインキュベートしたジャーカットヒトT白血病細胞の蛍光[Fluo−3−AM]。
【図2】細胞計算的に(A)および比色的に(B)測定した0μg/mlおよび100μg/mlのGT配列番号66、67、81、82および83なしでインキュベートしたジャーカットヒトT細胞白血病細胞におけるカスパーゼ3の活性化。
【図3】ジャーカットヒトT細胞白血病細胞におけるカスパーゼの活性化。(A)0μg/mlおよび100μg/mlの6塩基GT配列番号25とともにインキュベートした細胞におけるカスパーゼ3の活性化、(B)0μg/mlおよび100μg/mlの6塩基GT配列番号25とともにインキュベートした細胞におけるカスパーゼ7の活性化(a)およびPARP内容物(b)。
【配列表】
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Claims (12)

  1. 3'−OH,5'−OH合成ホスホジエステルヌクレオチド配列、化学療法剤、及び薬学的に許容可能なキャリアを含む、癌を治療するための組成物であって、前記合成ホスホジエステルヌクレオチド配列は配列番号8−10、25、26、41−43、45及び46からなる群から選択される、組成物。
  2. 前記化学療法剤は、代謝拮抗物質、アルキル化剤又はホルモン拮抗物質である、請求項1に記載の組成物。
  3. 前記合成ホスホジエステルヌクレオチド配列が配列番号8である、請求項1又は2に記載の組成物。
  4. 前記合成ホスホジエステルヌクレオチド配列が配列番号9である、請求項1又は2に記載の組成物。
  5. 前記合成ホスホジエステルヌクレオチド配列が配列番号10である、請求項1又は2に記載の組成物。
  6. 前記合成ホスホジエステルヌクレオチド配列が配列番号25である、請求項1又は2に記載の組成物。
  7. 前記合成ホスホジエステルヌクレオチド配列が配列番号26である、請求項1又は2に記載の組成物。
  8. 前記合成ホスホジエステルヌクレオチド配列が配列番号41である、請求項1又は2に記載の組成物。
  9. 前記合成ホスホジエステルヌクレオチド配列が配列番号42である、請求項1又は2に記載の組成物。
  10. 前記合成ホスホジエステルヌクレオチド配列が配列番号43である、請求項1又は2に記載の組成物。
  11. 前記合成ホスホジエステルヌクレオチド配列が配列番号45である、請求項1又は2に記載の組成物。
  12. 前記合成ホスホジエステルヌクレオチド配列が配列番号46である、請求項1又は2に記載の組成物。
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