CN105441573A - 用于检测人类jak2基因v617f突变的引物、探针及试剂盒 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了用于检测人类JAK2基因V617F突变的引物、探针及试剂盒,其中引物及探针包括突变上游引物JW1-F,与JAK2基因保守序列结合;突变下游ARMS引物JM1-R,与V617F(1849G>T)位点突变序列特异性结合,选择性扩增突变序列;5’端标记有FAM信号3’端标记MGB的检测探针JW1-P,能与扩增片段结合;以及5’端双脱氧修饰3’端MGB标记的阻断探针JW1-B,能与V617F位点野生型序列特异性结合,抑制野生型非特异扩增。本发明的引物及探针特异性高、灵敏度好,检测能力高达1%。由其制备的试剂盒检测结果准确易读,操作简单快速,适用范围广。
Description
技术领域
本发明涉及生物技术领域,具体涉及用于检测人类JAK2基因V617F突变的引物、探针及试剂盒。
背景技术
骨髓增殖性肿瘤(myeloproliferativeneoplasms,MPN)的单病种发病率大多在1/10万以下,属于罕见疾病。近10年来,随着人们生活水平的提高及医疗条件的改善,已发现的MPN患者总数增加了三倍左右。JAK2基因在PV、ET、IMF中具有较高的突变几率(依次为~90%、~50%、~50%)。
JAK2是一类酪氨酸蛋白激酶,与造血生长因子受体结合后,通过信号转导子和转录激活子(STAT)来影响基因的转录调节(JAK-STAT途径)。JAK2基因V617F是在第14外显子617位点发生的点突变(G1849T),缬氨酸(valine,V)被苯丙氨酸(phenylalanine,F)取代。Val617位于JH2(假激酶区),JH2与JH1(激酶区)结合并抑制其活性;V617F突变使JH2失去了对JH1激酶活性的抑制作用,导致了JAK2的持续活化,在无需配体和造血生长因子受体结合的情况下,导致造血细胞的异常增生。
骨髓增殖性疾病(MPD)的遗传学基础长期不明,直到2005年研究人员在本类疾病中发现存在JAK2点突变(V617F),才使MPD的诊治进入了一个新纪元。除在体检中发现外周血异常而跟踪复查并确诊的患者外,本病的漏诊、误诊率很高。因此,JAK2基因是否存在突变对患者的诊断具有重要的意义。2008年,随着对MPD的肿瘤本质得到确认,WHO将MPD改名为MPN,并在修订的2008WHO分类***中,将是否存在JAK2基因V617F突变列入MPN(包括PV、ET、IMF)的诊断标准。
目前检测基因突变的方法主要有测序法、溶解曲线法和液相芯片法。直接测序的灵敏度低,检测灵敏度只有20~30%;实验操作复杂,检测效率低、样品易污染,通常要1~2天才可出检测结果。特别是对于小样本的检测,直接测序的方法几乎无法实现其准确检测,会导致大量漏检及假阴性的发生。而不管是染料溶解曲线还是探针溶解曲线法,都无法有效区分同一位点的多种突变类型。液相芯片法操作过程复杂,且容易污染,假阳性率高。
近年来,随着核酸扩增技术的不断优化,国外开始报道采用外周血标本检测游离DNA中基因突变的方法。外周血取样不仅取材简便,且检测准确度与组织标本的结果符合率较高。这不仅极大的促进了靶向药物基因突变检测方法的研究进展,也使以游离DNA为靶分子对临床药物疗效及预后进行实时检测成为研究的热点。但外周血中癌细胞突变DNA存在于大量野生型基因背景中,其比例较低。因此,需要高性能的检测技术来实现低突变含量的检出。
发明内容
为了解决现有检测技术出现的灵敏度低、检测时间长、检测效率低、样本易污染、假阳性率高等问题,本发明提供了用于检测人类JAK2基因V617F突变的引物和探针,灵敏度高,特异性强,有效避免假阳性。本发明还提供了包括上述引物和探针的试剂盒,检测方便快速,操作简单,结果易读,适用范围广。
本发明提供的用于检测人类JAK2基因V617F突变的引物和探针,其核苷酸序列如下:
突变上游引物JW1-F:SEQIDNO:1,
突变下游ARMS引物JM1-R:SEQIDNO:2,
检测探针JW1-P:SEQIDNO:3,
阻断探针JW1-B:SEQIDNO:4;
其中,检测探针核苷酸序列5’端标记有荧光基团,3’端标记有淬灭基团;阻断探针的核苷酸序列5’端经过双脱氧修饰,3’端标记有淬灭基团。
表1:JAK2基因V617F热点突变
突变名称 | 氨基酸变化 | 碱基变化 | CosmicID |
JM1 | V617F | 1849G>T | 12600 |
上述引物和探针是针对表1中位点突变设计的特异性检测引物,其中,JW1-F为突变上游引物,与JAK2基因保守序列结合;JM1-R为突变下游ARMS引物,与V617F(1849G>T)位点突变序列特异性结合,选择性扩增突变序列;JW1-P为5’端标记有FAM信号3’端标记MGB的检测探针,能与扩增片段结合;JW1-B为5’端双脱氧修饰3’端MGB标记的阻断探针,能与V617F位点野生型序列特异性结合,抑制野生型非特异扩增。
优选地,上述用于检测人类JAK2基因V617F突变的引物和探针,所述荧光基团为FAM,所述淬灭基团为MGB。MGB(MinorGrooveBinder)基团可与DNA螺旋小沟结合,进而提高MGB探针与对应模板的杂交稳定性(Tm值提高约10℃)。相对于普通TaqMan探针,MGB探针序列可设计得更短,特异性更强。
本发明提供的用于检测人类JAK2基因V617F突变的试剂盒,包括以上任一所述的用于检测人类JAK2基因V617F突变的引物和探针。
优选地,所述用于检测人类JAK2基因V617F突变的试剂盒,还包括外控引物和探针,核苷酸序列如下:
外控上游引物JW1-F:SEQIDNO:1,
外控下游引物JW1-R:SEQIDNO:5,
外控检测探针JW1-P:SEQIDNO:3,外控检测探针核苷酸序列的5’端标记有FAM,3’端标记有MGB。
其中,JW1-F和JW1-R为外控上下游引物,扩增JAK2基因上一段包含V617F位点的序列;JW1-P为5’端标记有FAM信号3’端标记MGB的检测探针,能与扩增片段结合。
优选地,所述用于检测人类JAK2基因V617F突变的试剂盒,还包括内控引物和探针,核苷酸序列如下:
内控上游引物IC-F:SEQIDNO:6,
内控下游引物IC-R:SEQIDNO:7,
内控检测探针IC-P:SEQIDNO:8,内控检测探针核苷酸序列的5’端标记有JOE,3’端标记有BHQ1。
其中,IC-F和IC-R为内控上下游引物,扩增matK基因保守序列;IC-P为5’端标记有JOE信号3’端标记BHQ1的检测探针,能与扩增片段结合。
优选地,所述用于检测人类JAK2基因V617F突变的试剂盒,还包括阳性对照品和内控品,阳性对照品包括含有发生1849G>T碱基变化的CKIT基因片段>gi|568815589:5073601-5074000的阳性质粒,含有JAK2基因保守序列>gi|568815589:5054501-5054900段碱基的外控质粒,含有matK基因保守序列>gi|11994090:c2400-2001段碱基的内控质粒;内控品为含有matK基因保守序列>gi|11994090:c2400-2001段碱基的内控质粒。
优选地,所述用于检测人类JAK2基因V617F突变的试剂盒,试剂盒中的反应体系分为两种:
检测反应体系:包括用于检测人类JAK2基因V617F突变的引物和探针,内控引物和探针,ABpremix,10×buffer和ddH2O;
质控反应体系:包括外控引物和探针,内控引物和探针,ABpremix,10×buffer和ddH2O;
所述ABpremix为美国应用生物***公司产品FastAdvancedMasterMix;所述10×buffer为10倍浓度的缓冲液,缓冲液中含有Mg2+。
本发明还提供上述用于检测人类JAK2基因V617F突变的试剂盒的使用方法,是首先提取待检样品的基因组DNA,分别加入到检测反应体系和质控反应体系,进行荧光定量PCR反应;另外设置非模板对照和阳性对照,与待检样品的基因组DNA进行同样的操作;根据Ct值分析检测结果:
首先需要满足JOE信号Ct值≤25,非模板对照的FAM信号不起线,阳性对照的FAM信号Ct值≤20;9<Ct质控≤18;然后按照△Ct=Ct检测-Ct质控判定,△Ct≤8为阳性,△Ct>8为阴性;
所述Ct检测为待检样品的基因组DNA在检测反应体系中进行荧光定量PCR获得的Ct值,所述Ct质控为待检样品的基因组DNA在质控反应体系中进行荧光定量PCR获得的Ct值。
优选地,上述用于检测人类JAK2基因V617F突变的试剂盒的使用方法中,荧光定量PCR反应的条件为:
95℃10min;
92℃15sec,58℃1min,共15个循环;
92℃15sec,60℃1min,共30个循环;在60℃时收集信号。
与现有技术相比,本发明具有以下有益效果:
(1)本发明采用了特异性突变引物和探针阻断技术,可以特异性的检测人类JAK2基因V617F突变。其中,特异性突变引物与突变序列匹配度高于相应的野生型序列;在此基础上,阻断探针与野生型序列特异性结合,有效抑制了野生型的非特异性扩增,进一步提高体系的特异性水平,从而实现了在高野生型基因背景下对低含量突变序列的检出。
(2)在本发明实时荧光PCR外控检测体系中,对目的基因保守区域进行PCR扩增。其FAM信号Ct值反映了待测样本基因组DNA的相关信息(DNA质量、纯度及上样量)。在本发明试剂盒的内控检测体系中,对非人类基因保守区进行PCR扩增。其JOE信号Ct值反应了实时荧光PCR扩增反应体系的相关信息(PCR反应是否正常,操作过程是否准确)。检测快速,且操作简单,结果易读。
(3)本方法灵敏度高,可实现50拷贝突变基因的稳定检出;特异性好,20ng野生型基因组DNA无非特异性扩增,检测能力高达1%。
附图说明
图1为实施例1中IC实验结果;
图2为实施例1中非模板对照(NTC)实验结果;
图3为实施例1中阳性对照(STD)实验结果;
图4为实施例1中灵敏度实验结果;
图5为实施例1中精密度实验结果;
图6为实施例2阴性样本实验结果;
图7为实施例2中阳性样本实验结果。
具体实施方式
下面结合具体实施例对本发明作进一步说明,以使本领域的技术人员可以更好的理解本发明并能予以实施,但所举实施例不作为对本发明的限定。
实施例1
1、突变检测引物及探针,质控引物及探针序列设计:
根据NCBI数据库公布的JAK2基因(NCBIReferenceSequence:NM_004972.3)野生型序列,以14号外显子V617F突变位点(见表1)为参考,设计特异性突变引物和探针(见表2)。以基因工程构建的突变质粒(***基因片段>gi|568815589:5073601-5074000,且发生V617F碱基变化)和野生型质粒(***基因片段>gi|568815589:5073601-5074000)为模板,建立实时荧光PCR突变(Mutation)检测体系,实现对JAK2基因V617F突变的高灵敏度和高特异性检测。
表2:用于人类JAK2基因V617F突变检测的特异性引物和探针组合
SEQ ID NO: | 名称 | 序列(5’→3’) | 末端修饰 |
1 | JW1-F | TCTTTGAAGCAGCAAGTATGATGAG | 无 |
2 | JM1-R | GTTTTACTGACTCTCGTCTCCACATAA | 无 |
3 | JW1-P | CCAAATGCTTGTGAGAAA | 5’端FAM,3’端MGB |
4 | JW1-B | TCTCCACAGACACATACT | 5’端双脱氧修饰,3’端MGB |
根据NCBI数据库公布的JAK2基因(NCBIReferenceSequence:NM_004972.3)野生型序列,以14号外显子V617F突变位点(见表1)为参考,设计外控引物和探针(见表3)。以基因工程构建的外控质粒(***基因片段>gi|568815589:5054501-5054900)为模板,建立实时荧光PCR外控(ExternalControl)检测体系,对待测样本基因组DNA的质量和上样量进行质控。
表3:用于JAK2基因突变检测样本质控的外控引物和探针组合
SEQ ID NO: | 名称 | 序列(5’→3’) | 末端修饰 |
1 | JW1-F | TCTTTGAAGCAGCAAGTATGATGAG | 无 |
5 | JW1-R | TAGTTTTACTCACTCTCGTCTCCACAG | 无4 --> |
3 | JW1-P | CCAAATGCTTGTGAGAAA | 5’端FAM,3’端MGB |
根据NCBI数据库公布的matK基因(NCBIReferenceSequence:NC_001666.2)保守序列(non-humanDNA),设计内控引物和探针(见表4)。以基因工程构建的内控质粒(***基因片段>gi|11994090:c2400-2001)为模板,建立了实时荧光PCR内控(InternalControl)检测体系,对实时荧光PCR反应体系和实验操作过程进行质控。
表4:用于PCR扩增反应内部质控的内控引物和探针组合
SEQ ID NO: | 名称 | 序列(5’→3’) | 末端修饰 |
6 | IC-F | TCGTAAGGAATCAAATGCTGGAG | 无 |
7 | IC-R | CAACGGGTTTACTAATAGGATGCC | 无 |
8 | IC-P | TCGATACCACAGTCCTTGCAACTCCCC | 5’端JOE,3’端BHQ1 |
2、检测人类JAK2基因V617F突变的检测试剂盒组成
表5:试剂盒组成成分
名称 | 成份 |
JAK2-8联PCR反应条 | 反应体系1~2(每个反应体系独立一管) |
JAK2-阳性对照 | 含JM1和JR质粒各8.3×102拷贝/μL;含IC质粒5×102拷贝/μL |
IC-内控模板 | 含IC质粒3×103拷贝/μL |
各反应体系组成如下:
表6:实时荧光PCR扩增反应体系组成
注:ABpremix全称FastAdvancedMasterMix,购自美国应用生物***公司;10×buffer(Mg2+Plus)购自宝生物工程(大连)有限公司。
PCR反应总体积25μL,含19μL的反应体系,1μL的IC模板和5μL的检测模板(阳性对照、非模板对照、质粒模板或待测样本基因组DNA),IC模板和检测模板可预混。
其中,反应体系1用于人类JAK2基因V617F突变的检测。体系包含用于突变目的序列扩增的特异性突变引物和探针组合(见表2)以及用于内控基因扩增的内控引物和探针组合(见表4)。
其中,反应体系2用于待测样本的质控。体系包含用于外控基因扩增的外控引物和探针组合(见表3)以及用于内控基因扩增的内控引物和探针组合(见表4)。
3、实时荧光PCR扩增反应体系设置:用2孔实时荧光PCR扩增反应进行JAK2基因V617F突变的检测。其中,反应体系1(见表6)包含实时荧光PCR突变检测体系和实时荧光PCR内控检测体系,反应体系2(见表6)包含实时荧光PCR外控检测体系和实时荧光PCR内控检测体系。
实时荧光PCR扩增反应基本原理:上述检测探针序列5’端连接荧光基团(FAM、JOE),3’端连接淬灭基团(MGB、BHQ1)。未进行PCR扩增反应前,检测探针5’端荧光基团与3’端的淬灭基团相互靠近,由于荧光共振能量转移的作用,荧光基团不能发出荧光。随着PCR扩增反应的进行,检测探针在DNA聚合酶的作用下发生水解,5’端荧光基团脱落而与淬灭基团相互分离,进而能发出荧光。通过仪器检测荧光信号的积累可反映待测模板目的片段的起始浓度。在突变检测探针、外控检测探针和阻断探针的3’端连接有MGB(MinorGrooveBinder)基团。MGB基团可与DNA螺旋小沟结合,进而提高MGB探针与对应模板的杂交稳定性(Tm值提高约10℃)。相对于普通TaqMan探针,MGB探针序列可设计得更短,特异性更强。
该试剂盒的优势:(1)在本发明实时荧光PCR突变检测体系中,对目的基因突变区域进行PCR扩增。其中,特异性突变引物与突变序列匹配度高于相应的野生型序列;在此基础上,阻断探针与野生型序列特异性结合,有效抑制了野生型的非特异性扩增,进一步提高体系的特异性水平,从而实现了在高野生型基因背景下对低含量突变序列的检出。(2)在本发明实时荧光PCR外控检测体系中,对目的基因保守区域进行PCR扩增。其FAM信号Ct值反映了待测样本基因组DNA的相关信息(DNA质量、纯度及上样量)。(3)在本发明实时荧光PCR内控检测体系中,对非人类基因保守区进行PCR扩增。其JOE信号Ct值反应了实时荧光PCR扩增反应体系的相关信息(PCR反应是否正常,操作过程是否准确)。
4、实时荧光PCR扩增反应:
将样本的基因组DNA用TE(10mmol/L,pH8.0)稀释到2~10ng/μL作为模板,加入到实时荧光PCR扩增反应体系中(见表6)进行扩增。
实时荧光PCR扩增反应条件设置:
表7:实时荧光PCR扩增反应条件
最优的,在Stage2阶段(15个循环),58℃的退火延伸温度,有利于突变模板的富集。在Stage3阶段(30个循环),60℃的退火延伸温度可以保证更好的扩增特异性。
5、检测结果分析
根据荧光定量PCR扩增仪Ct值分析检测结果:以JOE信号Ct值作为PCR反应是否成功的判定标准(JOE信号Ct值≤25,扩增正常),以非模板对照(NTC)和阳性对照(STD)FAM信号Ct值作为实验数据是否有效的判定标准(非模板对照FAM信号不起线,阳性对照FAM信号Ct值≤20,体系性能良好,结果有效);以外控检测孔FAM信号Ct值作为上样量质控标准(9<Ct质控≤18,Ct质控≤9,说明加入的基因组DNA浓度过高,应稀释后重新检测该样本;Ct质控>18或无扩增曲线,说明加入的基因组DNA浓度过低或存在降解,建议重新提取该样本基因组DNA后进行检测);以待测样本突变检测孔与外控检测孔FAM信号的△Ct值(△Ct=Ct检测-Ct质控)作为阴阳性判定标准(△Ct≤8为阳性,△Ct>8为阴性)。
6、用本发明的人类JAK2基因V617F突变检测试剂盒进行性能分析实验。
每次检测需同时进行非模板对照(NTC)实验和阳性对照(STD)实验。图1为IC检测结果,Ct质控≤25,符合要求;图2为NTC检测结果,反应体系1~2FAM均不起线,符合要求;图3为STD检测结果,反应体系1~2FAM信号均起线且Ct≤20,符合要求。
(1)灵敏度实验
将以现有基因工程技术合成的含有JAK2基因V617F突变序列的质粒DNA干粉用TE(10mmol/L,pH8.0)复溶,定量后稀释。取1×103拷贝/μL突变质粒DNA分别进行10倍稀释,稀释2个梯度,然后以3种浓度梯度(1×103拷贝/μL、1×102拷贝/μL和1×101拷贝/μL)的突变质粒DNA为模板,进行实时荧光PCR扩增反应(见图4)。由图4可见本发明的荧光PCR方法灵敏度高,10拷贝/μL突变基因即可检出。
(2)精密度实验
将以现有基因工程技术合成的含有JAK2基因V617F突变序列的质粒DNA干粉用TE(10mmol/L,pH8.0)复溶,定量后稀释。以5×101拷贝/μL突变质粒DNA为模板,进行实时荧光PCR扩增反应(见图5)。由图5可见本发明的实时荧光PCR扩增反应重复性好(20次重复实验结果稳定,CV<5%)。
实施例2
用本发明中人类JAK2基因V617F突变检测试剂盒来检测临床采集的血液样本。
本实施例中收集临床病理诊断为骨髓增殖性肿瘤(MPN)的患者血液样本,并从中提取基因组DNA。用人类JAK2基因V617F突变检测试剂盒检测待测样本中是否存在JAK2基因V617F突变。具体步骤如下:
(1)样本基因组DNA提取
血液样本的提取使用宁波有成血液基因组DNA提取试剂盒(KR008F)。按说明书提取待测样本基因组DNA,将抽提好的DNA样本,用紫外分光光度计检测浓度和DNA质量,DNA的浓度要求≥10ng/μL,DNA的质量OD260/280在1.8~2.0之间。将符合要求的基因组DNA用TE(10mmol/L,pH8.0)稀释到2~10ng/μL作为PCR模板,进行实时荧光PCR扩增反应。
(2)实时荧光PCR扩增反应
实时荧光PCR扩增反应条件见表7,按照人类JAK2基因V617F突变检测试剂盒说明书进行样本检测。
(3)结果判定
根据荧光定量PCR扩增仪Ct值分析检测结果:以JOE信号Ct值作为PCR反应是否成功的判定标准(JOE信号Ct值Ct≤25,扩增正常),以非模板对照(NTC)和阳性对照(STD)FAM信号Ct值作为实验数据是否有效的判定标准(非模板对照FAM信号不起线,阳性对照FAM信号Ct值Ct≤20,体系性能良好,结果有效);以待测样本突变检测孔和外控检测孔FAM信号△Ct值(△Ct=Ct检测-Ct质控)作为阴阳性判定标准(△Ct≤8为阳性,△Ct>8为阴性)。
图6中,Ct质控=13.1,符合要求;突变检测孔FAM信号均未起线,显示样本检测结果为阴性。
图7中,Ct质控=13.2,符合要求;JM1突变检测孔FAM信号起线,且Ct检测(JM1)=17.0,△Ct=3.8,显示样本检测结果为JM1(V617F)阳性。
以上所述实施例仅是为充分说明本发明而所举的较佳的实施例,本发明的保护范围不限于此。本技术领域的技术人员在本发明基础上所作的等同替代或变换,均在本发明的保护范围之内。本发明的保护范围以权利要求书为准。
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<211>23
<212>DNA
<213>人工序列
<400>6
tcgtaaggaatcaaatgctggag23
<210>7
<211>24
<212>DNA
<213>人工序列
<400>7
caacgggtttactaataggatgcc24
<210>8
<211>27
<212>DNA
<213>人工序列
<400>8
tcgataccacagtccttgcaactcccc27
Claims (9)
1.用于检测人类JAK2基因V617F突变的引物和探针,其特征在于,核苷酸序列如下:
突变上游引物JW1-F:SEQIDNO:1,
突变下游ARMS引物JM1-R:SEQIDNO:2,
检测探针JW1-P:SEQIDNO:3,
阻断探针JW1-B:SEQIDNO:4;
其中,检测探针核苷酸序列5’端标记有荧光基团,3’端标记有淬灭基团;阻断探针的核苷酸序列5’端经过双脱氧修饰,3’端标记有淬灭基团。
2.根据权利要求1所述的用于检测人类JAK2基因V617F突变的引物和探针,其特征在于,所述荧光基团为FAM,所述淬灭基团为MGB。
3.用于检测人类JAK2基因V617F突变的试剂盒,其特征在于,包括权利要求1或2所述的用于检测人类JAK2基因V617F突变的引物和探针。
4.根据权利要求3所述的用于检测人类JAK2基因V617F突变的试剂盒,其特征在于,还包括外控引物和探针,核苷酸序列如下:
外控上游引物JW1-F:SEQIDNO:1,
外控下游引物JW1-R:SEQIDNO:5,
外控检测探针JW1-P:SEQIDNO:3,外控检测探针核苷酸序列的5’端标记有FAM,3’端标记有MGB。
5.根据权利要求4所述的用于检测人类JAK2基因V617F突变的试剂盒,其特征在于,还包括内控引物和探针,核苷酸序列如下:
内控上游引物IC-F:SEQIDNO:6,
内控下游引物IC-R:SEQIDNO:7,
内控检测探针IC-P:SEQIDNO:8,内控检测探针核苷酸序列的5’端标记有JOE,3’端标记有BHQ1。
6.根据权利要求5所述的用于检测人类JAK2基因V617F突变的试剂盒,其特征在于,还包括阳性对照品和内控品,阳性对照品包括含有发生1849G>T碱基变化的CKIT基因片段>gi|568815589:5073601-5074000的阳性质粒,含有JAK2基因保守序列>gi|568815589:5054501-5054900段碱基的外控质粒,含有matK基因保守序列>gi|11994090:c2400-2001段碱基的内控质粒;内控品为含有matK基因保守序列>gi|11994090:c2400-2001段碱基的内控质粒。
7.根据权利要求5所述的用于检测人类JAK2基因V617F突变的试剂盒,其特征在于,试剂盒中的反应体系分为两种:
检测反应体系:包括用于检测人类JAK2基因V617F突变的引物和探针,内控引物和探针,ABpremix,10×buffer和ddH2O;
质控反应体系:包括外控引物和探针,内控引物和探针,ABpremix,10×buffer和ddH2O;
所述ABpremix为美国应用生物***公司产品FastAdvancedMasterMix;所述10×buffer为10倍浓度的缓冲液,缓冲液中含有Mg2+。
8.权利要求7所述的用于检测人类JAK2基因V617F突变的试剂盒的使用方法,其特征在于,提取待检样品的基因组DNA,分别加入到检测反应体系和质控反应体系,进行荧光定量PCR反应;另外设置非模板对照和阳性对照,与待检样品的基因组DNA进行同样的操作;根据Ct值分析检测结果:
首先需要满足JOE信号Ct值≤25,非模板对照的FAM信号不起线,阳性对照的FAM信号Ct值≤20;9<Ct质控≤18;然后按照△Ct=Ct检测-Ct质控判定,△Ct≤8为阳性,△Ct>8为阴性;
所述Ct检测为待检样品的基因组DNA在检测反应体系中进行荧光定量PCR获得的Ct值,所述Ct质控为待检样品的基因组DNA在质控反应体系中进行荧光定量PCR获得的Ct值。
9.根据权利要求8所述的用于检测人类JAK2基因V617F突变的试剂盒的使用方法,其特征在于,荧光定量PCR反应的条件为:
95℃10min;
92℃15sec,58℃1min,共15个循环;
92℃15sec,60℃1min,共30个循环;在60℃时收集信号。
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