TWI647220B - 雜芳基化合物及其用途 - Google Patents

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Abstract

本發明提供適用作蛋白激酶之抑制劑的化合物、其醫藥學上可接受之組合物及使用其之方法。

Description

雜芳基化合物及其用途 相關申請案之交叉引用
本申請案主張2013年3月15日申請之美國臨時申請案第61/793,113號之優先權,該案之全部內容以引用的方式併入本文中。
本發明係關於適用作蛋白激酶之抑制劑的化合物。本發明亦提供包含本發明化合物的醫藥學上可接受之組合物及使用該等組合物治療多種病症之方法。
近年來,藉由更好地理解與疾病相關之酶及其他生物分子之結構,已對新穎治療劑之研究提供極大幫助。已成為廣泛研究對象之一個重要酶類別為蛋白激酶。
蛋白激酶構成負責控制細胞內多種信號轉導過程之結構上相關之酶的巨大家族。由於蛋白激酶之結構及催化功能保守,因此認為其自共同祖先基因演化而來。幾乎所有激酶均含有類似的250-300個胺基酸催化域。激酶可根據其磷酸化之受質而分類成各家族(例如蛋白質-酪胺酸、蛋白質-絲胺酸/蘇胺酸、脂質等)。
一般而言,蛋白激酶藉由實現信號傳導路徑中涉及的自三磷酸核苷至蛋白質受體之磷醯基轉移來介導細胞內信號傳導。此等磷酸化事件充當可調節或調控目標蛋白生物功能之分子開/關轉換器。此等 磷酸化事件最終回應於多種細胞外刺激及其他刺激引發。該等刺激之實例包括環境及化學應力信號(例如滲壓衝擊、熱衝擊、紫外輻射、細菌內毒素及H2O2)、細胞因子(例如介白素-1(IL-1)及腫瘤壞死因子α(TNF-α))及生長因子(例如顆粒球巨噬細胞群落刺激因子(GM-CSF)及纖維母細胞生長因子(FGF))。細胞外刺激可影響與細胞生長、遷移、分化、激素分泌、轉錄因子活化、肌肉收縮、葡萄糖代謝、蛋白質合成之控制及細胞週期之調控相關的一或多個細胞反應。
多種疾病與由如上文所述之蛋白激酶介導之事件引發的異常細胞反應有關。此等疾病包括(但不限於)自體免疫疾病、發炎疾病、骨骼疾病、代謝疾病、神經及神經退化性疾病、癌症、心血管疾病、過敏症及哮喘、阿茲海默氏病(Alzheimer's disease)及激素相關疾病。因此,仍需要尋找適用作治療劑之蛋白激酶抑制劑。
現已發現本發明化合物及其醫藥學上可接受之組合物有效用作一或多種蛋白激酶之抑制劑。該等化合物具有通式I
或其醫藥學上可接受之鹽,其中環A、R1、R2、R3、X1、X2、X3、X4、X5、G、Y、T及q中之每一者如本文實施例中所定義及描述。在某些實施例中,R1為彈頭基團。
本發明化合物及其醫藥學上可接受之組合物適用於治療與蛋白激酶介導之事件引發的異常細胞反應相關之多種疾病、病症或病況。 該等疾病、病症或病狀包括本文所述者。
本發明提供之化合物亦適用於研究生物學及病理學現象中之激酶;該等激酶介導之細胞內信號轉導路徑之研究;及新激酶抑制劑之比較性評估。
圖1:I-1對FGFR4之質量修正。
圖2:顯示化合物I-69對MDA-MB-453細胞中pFGFR4信號傳導具有長期作用持續(PDA)的資料與FGFR4之再合成速率一致。
圖3:顯示化合物I-1對MDA-MB-453細胞中之pFGFR4信號傳導具有PDA的資料與FGFR4之再合成速率一致,而其非共價可逆類似物I-234不具有PDA。
圖4:FGFR4之胺基酸序列(SEQ ID NO.1)。
1. 本發明化合物之一般描述
在特定實施例中,本發明提供FGFR4之不可逆抑制劑。在一些實施例中,該等化合物包括具有本文所述化學式者,或其醫藥學上可接受之鹽,其中各變數如本文所定義及描述。
2. 化合物及定義
本發明化合物包括上文一般描述之化合物且由本文所揭示之類別、子類及種類進一步說明。除非另有指出,否則如本文所用之以下定義應適用。對於本發明,根據Periodic Table of the Elements,CAS版,Handbook of Chemistry and Physics,第75版識別化學元素。此外,有機化學之一般原理描述於「Organic Chemistry」,Thomas Sorrell,University Science Books,Sausalito:1999及「March's Advanced Organic Chemistry」,第5版,Smith,M.B.及March,J.編,John Wiley & Sons,New York:2001中,其全部內容以引用的方式併 入本文中。
如本文所用,術語「脂族」或「脂族基團」意謂完全飽和或含有一或多個不飽和單元之直鏈(亦即未分支)或分支鏈、經取代或未經取代之烴鏈,或完全飽和或含有一或多個不飽和單元,但不為芳族之單環烴或雙環烴(本文中亦稱為「碳環」、「環脂族」或「環烷基」),其具有與分子其餘部分之單一連接點。除非另外規定,否則脂族基團含有1至6個脂族碳原子。在一些實施例中,脂族基團含有1至5個脂族碳原子。在其他實施例中,脂族基團含有1至4個脂族碳原子。在其他實施例中,脂族基團含有1至3個脂族碳原子,且在其他實施例中,脂族基團含有1至2個脂族碳原子。在一些實施例中,「環脂族」(或「碳環」或「環烷基」)係指完全飽和或含有一或多個不飽和單元之單環C3-C6烴,但其不為芳族的,具有與分子其餘部分之單一連接點。例示性脂族基團或直鏈或分支鏈、經取代或未經取代之烷基、烯基、炔基及其氫化物,諸如(環烷基)烷基、(環烯基)烷基或(環烷基)烯基。
如本文所用,術語「橋接雙環」係指任何雙環系統,亦即碳環或雜環、飽和或部分不飽和、具有至少一個橋。如IUPAC所定義,「橋」為連接兩個橋頭之原子或價鍵的未分支鏈,其中「橋頭」為環系統的鍵結於三個或三個以上骨架原子(氫除外)之任何骨架原子。在一些實施例中,橋接雙環具有7至12個環成員及0至4個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子。該等橋接雙環基團為此項技術所熟知且包括下文所述之基團,其中各基團在任何可取代碳或氮原子處連接於分子之其餘部分。除非另外規定,否則橋接雙環基團視情況經一或多個如針對脂族基團所述之取代基取代。另外或替代地,橋接雙環基團之任何可取代氮視情況經取代。例示性橋接雙環包括:
術語「低碳烷基」係指C1-4直鏈或分支鏈烷基。例示性低碳烷基為甲基、乙基、丙基、異丙基、丁基、異丁基及第三丁基。
術語「低碳鹵烷基」係指經一或多個鹵素原子取代之C1-4直鏈或分支鏈烷基。
術語「雜原子」意謂氧、硫、氮或磷(包括氮、硫或磷之任何氧化形式;任何鹼性氮之四級銨化形式;或雜環之可取代氮,例如N(如3,4-二氫-2H-吡咯基中)、NH(如吡咯啶基中)或NR+(如N-取代之吡咯啶基中))中之一或多者。
如本文所用,術語「不飽和」意謂具有一或多個不飽和單元之部分。
如本文所用,術語「二價C1-8(或C1-6)飽和或不飽和直鏈或分支鏈烴鏈」係指如本文所定義之直鏈或分支鏈二價伸烷基、伸烯基及伸炔基鏈。
術語「伸烷基」係指二價烷基。「伸烷基鏈」為聚亞甲基,亦即-(CH2)n-,其中n為正整數,較佳1至6、1至4、1至3、1至2或2至3。經 取代伸烷基鏈為一或多個亞甲基氫原子置換為取代基的聚亞甲基。適合取代基包括下文針對經取代脂族基團所述之取代基。
術語「伸烯基」係指二價烯基。經取代伸烯基鏈為一或多個氫原子置換為取代基的含有至少一個雙鍵之聚亞甲基。適合取代基包括下文針對經取代脂族基團所述之取代基。
如本文所用,術語「環丙烯基」係指具有以下結構之二價環丙基:
術語「鹵素」意謂F、Cl、Br或I。
單獨使用或用作「芳烷基」、「芳烷氧基」或「芳氧基烷基」中較大部分之術語「芳基」係指總共具有五至十四個環成員的單環及雙環系統,其中系統中至少一個環為芳族的且其中系統中之各環含有三至七個環成員。術語「芳基」與術語「芳基環」可互換使用。在本發明之某些實施例中,「芳基」係指芳族環系統。例示性芳基為苯基、聯苯基、萘基、蒽基及其類似基團,其視情況包括一或多個取代基。如本文所用,術語「芳基」之範疇內亦包括為芳族環稠合於一或多個非芳族環之基團,諸如茚滿基、鄰苯二甲醯亞胺基、萘醯亞胺基、啡啶基或四氫萘基,及其類似基團。
單獨使用或用作較大部分(例如「雜芳烷基」或「雜芳烷氧基」)之部分的術語「雜芳基」及「雜芳-」係指具有5至10個環原子,較佳5、6或9個環原子;環陣列中具有6、10或14個共用π電子;且除碳原子外具有一至五個雜原子的基團。術語「雜原子」係指氮、氧或硫,且包括氮或硫之任何氧化形式,及鹼性氮之任何四級銨化形式。雜芳基包括(但不限於)噻吩基、呋喃基、吡咯基、咪唑基、吡唑基、***基、四唑基、噁唑基、異噁唑基、噁二唑基、噻唑基、異噻唑基、噻二唑基、吡啶基、噠嗪基、嘧啶基、吡嗪基、吲哚嗪基、嘌呤基、 啶基及喋啶基。如本文所用,術語「雜芳基」及「雜芳-」亦包括雜芳族環稠合於一或多個芳基、環脂族或雜環基環的基團,其中基團或連接點在雜芳族環上。非限制性實例包括吲哚基、異吲哚基、苯并噻吩基、苯并呋喃基、二苯并呋喃基、吲唑基、苯并咪唑基、苯并噻唑基、喹啉基、異喹啉基、啉基、酞嗪基、喹唑啉基、喹喏啉基、4H-喹嗪基、咔唑基、吖啶基、啡嗪基、啡噻嗪基、啡噁嗪基、四氫喹啉基、四氫異喹啉基及吡啶并[2,3-b]-1,4-噁嗪-3(4H)-酮。雜芳基視情況為單環或雙環。術語「雜芳基」與術語「雜芳基環」、「雜芳基」或「雜芳族」可互換使用,該等術語中任一者包括視情況經取代之環。術語「雜芳烷基」係指經雜芳基取代之烷基,其中烷基及雜芳基部分獨立地視情況經取代。
如本文所用,術語「雜環」(「heterocycle」、「heterocyclic ring」)及「雜環基」(「heterocyclyl」、「heterocyclic radical」)可互換使用且係指飽和或部分不飽和,且除碳原子外具有一或多個,較佳一至四個如上文定義之雜原子的穩定5至7員單環或7至10員雙環雜環部分。當關於雜環之環原子使用時,術語「氮」包括經取代氮。舉例而言,在具有0至3個選自氧、硫或氮之雜原子的飽和或部分不飽和環中,氮為N(如3,4-二氫-2H-吡咯基中)、NH(如吡咯啶基中)或+NR(如N-取代之吡咯啶基)。
雜環可在導致穩定結構之任何雜原子或碳原子處及可視情況經取代之任何環原子處連接於其側接基團。該等飽和或部分不飽和雜環基之實例包括(但不限於)四氫呋喃基、四氫噻吩基、吡咯啶基、哌啶基、吡咯啉基、四氫喹啉基、四氫異喹啉基、十氫喹啉基、噁唑啶基、哌嗪基、二氧雜環己烷基、二氧戊環基、二氮呯基、噁氮呯基、噻氮呯基、嗎啉基及啶基。術語「雜環」(「heterocycle」、「heterocyclic ring」)、「雜環基」(「heterocyclyl」、「heterocyclic group」、「heterocyclic radical」)、「雜環基環」及「雜環部分」在本文中可互換使用,且亦包括雜環基環稠合於一或多個芳基、雜芳基或環脂族環的基團,諸如吲哚啉基、3H-吲哚基、烷基、啡啶基或四氫喹啉基,其中基團或連接點在雜環基環上。雜環基視情況為單環或雙環。術語「雜環烷基」係指經雜環基取代之烷基,其中烷基及雜環基部分獨立地視情況經取代。
如本文所用,術語「部分不飽和」係指包括至少一個雙鍵或參鍵之環部分。術語「部分不飽和」欲涵蓋具有多個不飽和位點之環,但不欲包括如本文所定義之芳基或雜芳基部分。
如本文所述,本發明之某些化合物含有「視情況經取代之」部分。一般而言,術語「經取代」不管是否冠以術語「視情況」皆意謂指定部分之一或多個氫置換為適合取代基。「經取代」適用於由結構 明示或暗示之一或多個氫(例如係指至少;且 係指至少)。除非另外指出, 否則「視情況經取代之」基團在基團之各可取代位置具有適合取代基,且當任何既定結構中之一個以上位置經一個以上選自規定基團之取代基取代時,每一位置之取代基可能相同或不同。本發明設想之取代基組合較佳為導致形成穩定或化學上可行之化合物的組合。如本文所用,術語「穩定」係指當經受允許製造、偵測及在某些實施例中回收、純化及用於本文揭示之一或多種目的的條件時未發生實質改變之化合物。
「視情況經取代之」基團的可取代碳原子上之適合單價取代基獨立地為鹵素;-(CH2)0-4R;-(CH2)0-4OR;-O(CH2)0-4R;-O-(CH2)0-4C(O)OR;- (CH2)0-4CH(OR)2;-(CH2)0-4SR;視情況經R取代之-(CH2)0-4Ph;視情況經R取代之-(CH2)0-4O(CH2)0-1Ph;視情況經R取代之-CH=CHPh;視情況經R取代之-(CH2)0-4O(CH2)0-1-吡啶基;-NO2;-CN;-N3;-(CH2)0-4N(R)2;-(CH2)0-4N(R)C(O)R;-N(R)C(S)R;-(CH2)0-4N(R)C(O)NR 2;-N(R)C(S)NR 2;-(CH2)0-4N(R)C(O)OR;-N(R)N(R)C(O)R;-N(R)N(R)C(O)NR 2;-N(R)N(R)C(O)OR;-(CH2)0-4C(O)R;-C(S)R;-(CH2)0-4C(O)OR;-(CH2)0-4C(O)SR;-(CH2)0-4C(O)OSiR 3;-(CH2)0-4OC(O)R;-OC(O)(CH2)0-4SR;SC(S)SR;-(CH2)0-4SC(O)R;-(CH2)0-4C(O)NR 2;-C(S)NR 2;-C(S)SR;-SC(S)SR,-(CH2)0-4OC(O)NR 2;-C(O)N(OR)R;-C(O)C(O)R;-C(O)CH2C(O)R;-C(NOR)R;-(CH2)0-4SSR;-(CH2)0-4S(O)2R;-(CH2)0-4S(O)2OR;-(CH2)0-4OS(O)2R;-S(O)2NR 2;-(CH2)0-4S(O)R;-N(R)S(O)2NR 2;-N(R)S(O)2R;-N(OR)R;-C(NH)NR 2;-P(O)2R;-P(O)R 2;-OP(O)R 2;-OP(O)(OR)2;SiR 3;-(C1-4直鏈或分支鏈伸烷基)O-N(R)2;或-(C1-4直鏈或分支鏈伸烷基)C(O)O-N(R)2,其中各R如下文所定義視情況經取代且獨立地為氫、C1-6脂族基、-CH2Ph、-O(CH2)0-1Ph、-CH2-(5至6員雜芳基環),或具有0至4個選自氮、氧或硫之雜原子的5至6員飽和、部分不飽和或芳基環,或儘管上文定義,但兩個獨立存在之R與其***原子一起形成具有0至4個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的3至12員飽和、部分不飽和或芳基單環或雙環,其如下文所定義視情況經取代。
R(或兩個獨立存在之R與其***原子一起形成之環)上的適合單價取代基獨立地為鹵素、-(CH2)0-2R˙、-(鹵基R˙)、-(CH2)0-2OH、-(CH2)0-2OR˙、-(CH2)0-2CH(OR˙)2;-O(鹵基R˙)、-CN、-N3、-(CH2)0-2C(O)R˙、-(CH2)0-2C(O)OH、-(CH2)0-2C(O)OR˙、-(CH2)0-2SR˙、- (CH2)0-2SH、-(CH2)0-2NH2、-(CH2)0-2NHR˙、-(CH2)0-2NR˙ 2、-NO2、-SiR˙ 3、-OSiR˙ 3、-C(O)SR˙、-(C1-4直鏈或分支鏈伸烷基)C(O)OR˙或-SSR˙,其中各R˙未經取代或冠以「鹵基」時僅經一或多個鹵素取代,且獨立地選自C1-4脂族基、-CH2Ph、-O(CH2)0-1Ph或具有0至4個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的5至6員飽和、部分不飽和或芳基環。R之飽和碳原子上的適合二價取代基包括=O及=S。
「視情況經取代之」基團的飽和碳原子上之適合二價取代基包括以下:=O、=S、=NNR* 2、=NNHC(O)R*、=NNHC(O)OR*、=NNHS(O)2R*、=NR*、=NOR*、-O(C(R* 2))2-3O-或-S(C(R* 2))2-3S-,其中各獨立存在之R*係選自氫、如下文所定義經取代之C1-6脂族基,或具有0至4個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的未經取代之5至6員飽和、部分不飽和或芳基環。鍵結於「視情況經取代之」基團之鄰近可取代碳的適合二價取代基包括:-O(CR* 2)2-3O-,其中各獨立存在之R*係選自氫、如下文所定義視情況經取代之C1-6脂族基,或具有0至4個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的未經取代之5至6員飽和、部分不飽和或芳基環。
R*之脂族基團上的適合取代基包括鹵素、-R˙、-(鹵基R˙)、-OH、-OR˙、-O(鹵基R˙)、-CN、-C(O)OH、-C(O)OR˙、-NH2、-NHR˙、-NR˙ 2或-NO2,其中各R˙未經取代或冠以「鹵基」時僅經一或多個鹵素取代,且獨立地為C1-4脂族基、-CH2Ph、-O(CH2)0-1Ph或具有0至4個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的5至6員飽和、部分不飽和或芳基環。
「視情況經取代之」基團之可取代氮上的適合取代基包括-R、-NR 2、-C(O)R、-C(O)OR、-C(O)C(O)R、-C(O)CH2C(O)R、-S(O)2R、-S(O)2NR 2、-C(S)NR 2、-C(NH)NR 2或-N(R)S(O)2R;其中各R獨立地為氫、如下文所定義視情況經取代之C1-6脂族基、未經取代之-OPh 或具有0至4個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的未經取代之5至6員飽和、部分不飽和或芳基環,或儘管上文定義,但兩個獨立存在之R與其***原子一起形成具有0至4個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的未經取代之3至12員飽和、部分不飽和或芳基單環或雙環。
R之脂族基團上的適合取代基獨立地為鹵素、-R˙、-(鹵基R˙)、-OH、-OR˙、-O(鹵基R˙)、-CN、-C(O)OH、-C(O)OR˙、-NH2、-NHR˙、-NR˙ 2或-NO2,其中各R˙未經取代或冠以「鹵基」時僅經一或多個鹵素取代,且獨立地為C1-4脂族基、-CH2Ph、-O(CH2)0-1Ph或具有0至4個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的5至6員飽和、部分不飽和或芳基環。
如本文所用,術語「醫藥學上可接受之鹽」係指在正確醫學判斷之範疇內,適用於與人類及低等動物之組織接觸而無不當毒性、刺激、過敏反應及其類似反應,且與合理收益/風險比相稱之彼等鹽。此項技術中熟知醫藥學上可接受之鹽。舉例而言,S.M.Berge等人在以引用方式併入本文中之J.Pharmaceutical Sciences,1977,66,1-19中詳細描述醫藥學上可接受之鹽。本發明化合物之醫藥學上可接受之鹽包括自適合無機及有機酸及鹼衍生之鹽。醫藥學上可接受之無毒酸加成鹽之實例為胺基與無機酸(諸如鹽酸、氫溴酸、磷酸、硫酸及高氯酸)或有機酸(諸如乙酸、乙二酸、順丁烯二酸、酒石酸、檸檬酸、丁二酸或丙二酸)形成之鹽,或藉由使用此項技術中所用的諸如離子交換之其他方法形成之鹽。其他醫藥學上可接受之鹽包括己二酸鹽、海藻酸鹽、抗壞血酸鹽、天冬胺酸鹽、苯磺酸鹽、苯甲酸鹽、硫酸氫鹽、硼酸鹽、丁酸鹽、樟腦酸鹽、樟腦磺酸鹽、檸檬酸鹽、環戊烷丙酸鹽、二葡糖酸鹽、十二烷基硫酸鹽、乙烷磺酸鹽、甲酸鹽、反丁烯二酸鹽、葡糖庚酸鹽、甘油磷酸鹽、葡糖酸鹽、半硫酸鹽、庚酸鹽、己酸鹽、氫碘酸鹽、2-羥基-乙烷磺酸鹽、乳糖酸鹽、乳酸鹽、月桂 酸鹽、月桂基硫酸鹽、蘋果酸鹽、順丁烯二酸鹽、丙二酸鹽、甲烷磺酸鹽、2-萘磺酸鹽、菸鹼酸鹽、硝酸鹽、油酸鹽、乙二酸鹽、棕櫚酸鹽、雙羥萘酸鹽、果膠酸鹽、過硫酸鹽、3-苯基丙酸鹽、磷酸鹽、特戊酸鹽、丙酸鹽、硬脂酸鹽、丁二酸鹽、硫酸鹽、酒石酸鹽、硫氰酸鹽、對甲苯磺酸鹽、十一烷酸鹽、戊酸鹽及其類似鹽。
自適當鹼衍生之鹽包括鹼金屬、鹼土金屬、銨及N+(C1-4烷基)4鹽。代表性鹼金屬或鹼土金屬鹽包括鈉、鋰、鉀、鈣、鎂及其類似物。適當時,其他醫藥學上可接受之鹽包括無毒銨、四級銨及使用相對離子形成之胺陽離子,該等相對離子諸如鹵離子、氫氧根、羧酸根、硫酸根、磷酸根、硝酸根、低碳烷基磺酸根及芳基磺酸根。
除非另外說明,否則本文描繪之結構亦欲包括該結構之所有異構(例如對映異構、非對映異構及幾何異構(或構形異構))形式;例如,各不對稱中心之R及S構形、Z及E雙鍵異構體,以及Z及E構形異構體。因此,本發明化合物之單個立體化學異構體以及對映異構、非對映異構及幾何異構(或構形異構)混合物在本發明範疇內。除非另外說明,否則本發明化合物之所有互變異構形式在本發明範疇內。此外,除非另外說明,否則本文描繪之結構亦欲包括僅在存在一或多種同位素增濃原子方面不同之化合物。舉例而言,具有本發明結構且包括以氘或氚置換氫或以13C或14C增濃碳置換碳之化合物在本發明範疇內。該等化合物例如適用作分析工具、生物分析法中之探針或本發明之治療劑。在一些實施例中,R1基團包含一或多個氘原子。
如本文所用,術語「不可逆」或「不可逆抑制劑」係指能夠以實質上不可逆方式共價結合於目標蛋白激酶的抑制劑(亦即化合物)。亦即,鑒於可逆抑制劑能夠結合於目標蛋白激酶(但一般不能形成共價鍵),且因此可與目標蛋白激酶解離,不可逆抑制劑在形成共價鍵後將保持與目標蛋白激酶實質上結合。不可逆抑制劑一般呈現時間依 賴性,抑制程度藉此隨抑制劑與酶的接觸時間增加。在某些實施例中,不可逆抑制劑在共價鍵形成後將保持與激酶實質上結合且將保持結合的時間將比蛋白質壽命長。
一般技術者熟知識別化合物是否用作不可逆抑制劑之方法。該等方法包括(但不限於)具有蛋白激酶目標之化合物的抑制概況之酶動力學分析、使用在抑制劑化合物存在下修飾之蛋白質藥物目標之質譜法、不連續暴露(亦稱為「洗脫」)實驗及使用標記(諸如放射性標記抑制劑)顯示酶之共價修飾,以及熟習此項技術者已知的其他方法。
一般技術者將瞭解某些反應性官能基可用作「彈頭」。如本文所用,術語「彈頭」或「彈頭基團」係指本發明化合物上存在之官能基,其中該官能基能夠共價結合於目標蛋白之結合袋中存在的胺基酸殘基(諸如半胱胺酸、離胺酸、組胺酸或能夠共價修飾之其他殘基),藉此不可逆抑制蛋白質。應瞭解,如本文所定義及描述之-L-Y基團提供用於共價及不可逆抑制蛋白質的該等彈頭基團。在某些情形中,使用「前彈頭基團」替換彈頭基團。該等前彈頭基團活體內或活體外轉化為彈頭基團。
如本文所用,術語「抑制劑」定義為以可量測親和力結合及/或抑制目標蛋白激酶之化合物。在某些實施例中,抑制劑具有小於約50μM,小於約1μM,小於約500nM,小於約100nM或小於約10nM之IC50及/或結合常數。
如本文所用,術語「可量測親和力」及「可量測抑制」意謂在無該化合物或其組合物存在下,包含本發明化合物或其組合物及FGFR4之樣品與包含FGFR4之等效樣品之間的FGFR4活性之可量測改變。
本發明設想之取代基及變數之組合僅為導致形成穩定化合物之組合。如本文所用,術語「穩定」係指具有足以允許製造之穩定性及 保持化合物完整性持續足以適用於本文詳述目的(例如向個體治療性或預防性投與)之時段的化合物。
化學基團清單在本文變數之任何定義中的敍述包括彼變數作為任何單個基團或所列基團之組合的定義。本文變數之實施例的敍述包括作為任何單個實施例或與任何其他實施例或其部分組合的實施例。
3. 例示性化合物之描述
根據一個態樣,本發明提供式I化合物,
或其醫藥學上可接受之鹽,其中:X1為-NR4、N、-CR4R4'或-CR4;X2為-NR5、N、-CR5R5'或-CR5;X3為N或CR6;X4為N或CR7;X5為N、C或CH;其中X1、X2、X3、X4或X5中至少一者為N;G為H、O、OR或N(R)(R);環A為視情況經取代之選自以下之基團:苯基、3至8員飽和或部分不飽和碳環、具有1至4個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的5至6員單環雜芳基環、具有1至4個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的4至7員飽和或部分不飽和雜環,或7至10員雙環飽和、部分不飽和或芳基環;各R獨立地為氫或視情況經取代之選自以下之基團:C1-6脂族 基、苯基、3至8員飽和或部分不飽和碳環、具有1至4個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的4至7員雜環,或具有1至4個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的5至6員單環雜芳基環;或同一氮原子上之兩個R基團與其所連接之該氮原子一起形成具有0至2個獨立地選自氮、氧或硫之額外雜原子的4至7員雜環,或具有0至4個獨立地選自氮、氧或硫之額外雜原子的4至7員雜芳基環;R1為彈頭基團;其中R1連接於與T連接之原子相鄰的原子;各R2獨立地為-R、鹵素、-鹵烷基、-OR、-SR、-CN、-NO2、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R、-C(O)N(R)2、-NRC(O)R、-NRC(O)N(R)2、-NRSO2R或-N(R)2;R3為氫、C2-6烯基、-W-Cy或C1-6烷基,其中該C1-6烷基視情況經1至3個獨立地選自以下之基團取代:鹵素、-CN、側氧基(oxo)、-OR'或-C(O)O(C1-6烷基);W不存在或為視情況經一或多個R"取代的二價C1-3伸烷基鏈且其中W之一個亞甲基單元視情況置換為-O-、-S-或-NR'-;各R'獨立地為氫或C1-6烷基;各R"獨立地為鹵素或C1-6烷基,其中該C1-6烷基視情況經1至3個獨立地選自以下之基團取代:鹵素、-CN、側氧基或-OR';Cy為苯基、C3-7環烷基或具有1至3個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的3至7員單環或5至10員雙環飽和、部分不飽和或雜芳基環,其中Cy視情況經1至3個Rx取代;各Rx獨立地為H、-CN、側氧基、-NH2、C1-6烷基、鹵素、-OR'、-N(R')2、-NHC(O)(C1-6烷基)、-C(O)N(R')2、-C(O)O(C1-6烷基)、-NHSO2(C1-6烷基)或-SO2N(R')2;或若化合價不允許,則R3不存在;R4及R4'中之每一者獨立地為氫或視情況經取代的選自以下之基 團:C1-6脂族基、苯基、視情況橋接之3至8員飽和或部分不飽和碳環、具有1至4個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的4至7員雜環、具有1至4個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的5至6員單環雜芳基環,或視情況橋接之7至10員雙環飽和、部分不飽和或芳基環;R5及R5'中之每一者獨立地為-R、鹵素、-OR、-SR、-CN、-NO2、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R、-C(O)N(R)2、-NRC(O)R、-NRC(O)N(R)2、-NRSO2R或-N(R)2;Y為O或NRa;Ra為氫或視情況經取代之C1-6脂族基團;T為共價鍵或二價直鏈或分支鏈、飽和或不飽和C1-6烴鏈,其中一或多個亞甲基單元視情況經以下置換:-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-S(O)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-;q為0-6;且R6及R7中之每一者獨立地為-R、鹵素、-OR、-SR、-CN、-NO2、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R、-C(O)N(R)2、-NRC(O)R、-NRC(O)N(R)2、-NRSO2R或-N(R)2
在某些實施例中,X1為-NR4。在某些實施例中,X1為N。在某些實施例中,X1為-CR4R4'。在某些實施例中,X1為-CR4
在某些實施例中,X2為-NR5。在某些實施例中,X2為N。在某些實施例中,X2為-CR5R5'。在某些實施例中,X2為-CR5
在某些實施例中,X3為N。在某些實施例中,X3為CR6
在某些實施例中,X4為N。在某些實施例中,X4為CR7
在某些實施例中,X5為N。在某些實施例中,X5為C。在某些實施例中,X5為CH。
在某些實施例中,G為H。在某些實施例中,G為O。在某些實施 例中,G為OR。在某些實施例中,G為N(R)(R)。
在某些實施例中,G為OMe。在某些實施例中,G為NH2
在某些實施例中,Y為O。在某些實施例中,Y為NRa
如上文一般定義,環A為視情況經取代之選自以下之基團:苯基、3至8員飽和或部分不飽和碳環、具有1至4個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的5至6員單環雜芳基環、具有1至4個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的4至7員飽和或部分不飽和雜環,或7至10員雙環飽和、部分不飽和或芳基環。
在某些實施例中,環A為視情況經取代之苯基。在一些實施例中,環A為視情況經取代之3至8員飽和或部分不飽和碳環。在一些實施例中,環A為具有1至4個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的視情況經取代之5至6員單環雜芳基環。在一些實施例中,環A為具有1至4個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的視情況經取代之4至7員飽和或部分不飽和雜環。在一些實施例中,環A為視情況經取代之7至10員雙環飽和、部分不飽和或芳基環。
在多個實施例中,環A為環丙基、環丁基、環戊基、環己基、環庚基、金剛烷基、環辛基、[3.3.0]雙環辛基、[4.3.0]雙環壬基、[4.4.0]雙環癸基、[2.2.2]雙環辛基、茀基、苯基、萘基、茚滿基、四氫萘基、吖啶基、氮基、苯并咪唑基、苯并呋喃基、苯并噻喃基、苯并噻吩基、苯并噁唑基、苯并噻唑基、苯并***基、苯并四唑基、苯并異噁唑基、苯并異噻唑基、苯并咪唑啉基、咔唑基、NH-咔唑基、咔啉基、烷基、烯基、啉基、十氫喹啉基、2H,6H-1,5,2-二噻嗪基、二氫呋喃并[2,3-b]四氫呋喃基、呋喃基、呋呫基、咪唑啶基、咪唑啉基、咪唑基、1H-吲唑基、吲哚烯基、吲哚啉基、吲哚嗪基、吲哚基、3H-吲哚基、異吲哚啉基、異吲哚烯基、異苯并呋喃基、異烷基、異吲唑基、異吲哚啉基、異吲哚基、異喹啉基、異噻 唑基、異噁唑基、嗎啉基、啶基、八氫異喹啉基、噁二唑基、1,2,3-噁二唑基、1,2,4-噁二唑基、1,2,5-噁二唑基、1,3,4-噁二唑基、噁唑啶基、噁唑基、噁唑啶基、嘧啶基、啡啶基、啡啉基、啡嗪基、啡噻嗪基、啡噁噻基、啡噁嗪基、酞嗪基、哌嗪基、哌啶基、喋啶基、嘌呤基、哌喃基、吡嗪基、吡唑啶基、吡唑啉基、吡唑基、噠嗪基、吡啶并噁唑基、吡啶并咪唑基、吡啶并噻唑基、吡啶基(pyridinyl、pyridyl)、嘧啶基、吡咯啶基、吡咯啉基、2H-吡咯基、吡咯基、喹唑啉基、喹啉基、4H-喹嗪基、喹喏啉基、啶基、四氫呋喃基、四氫異喹啉基、四氫喹啉基、6H-1,2,5-噻二嗪基、1,2,3-噻二唑基、1,2,4-噻二唑基、1,2,5-噻二唑基、1,3,4-噻二唑基、噻噁基、噻唑基、噻吩基、噻吩并噻唑基、噻吩并噁唑基、噻吩并咪唑基、噻吩基、三嗪基、1,2,3-***基、1,2,4-***基、1,2,5-***基、1,3,4-***基或基。
在某些實施例中,環A為苯基、環己基、環己烯基、環戊基、環丁基、環丙基、吡啶、嘧啶、吡嗪、噠嗪、吡咯、吡唑、哌啶、哌啶酮、吡咯啶、四氫哌喃、四氫呋喃、四氫噻吩二氧化物或環丁烯二酮。
在某些實施例中,環A為視情況經取代之選自以下之基團:苯基、環己基、7至8員飽和或部分不飽和碳環或具有1至3個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的4至7員飽和或部分不飽和雜環。
在多個實施例中,環A為視情況及取代之選自苯基或環己基之基團。
在某些實施例中,環A如本文所定義經取代。在一些實施例中,環A經一個、兩個或三個各自經獨立選擇之R2基團取代。環A上之例示性取代基包括Br、I、Cl、F、Me、-CF3、-OMe、-OR、-N(R)2、吡唑基、噻唑基、哌啶基、哌嗪基或嗎啉基。
下文闡述例示性環A基團:
在一些實施例中,環A包含一或多個具有特定構形之對掌性中心。
在某些實施例中,環A為3至8員飽和或部分不飽和碳環、具有1至4個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的4至7員飽和或部分不飽和雜環或7至10員雙環飽和或部分不飽和環,其中環A之取代基-T-Y-及R1為「順式」構形。
熟習化學技術者將瞭解在環A之取代基-T-Y-及R1的情形中,「順式」意謂化合物包含以下環A構形中之任一者:
其中環A、R1、R2、R3、X1、X2、X3、X4、X5、G、Y、T及q中 之每一者如上文定義且在上文及此處之實施例、類別及子類中單獨或組合描述。
在一些實施例中,本發明化合物具有式I-順(1) 或其醫藥學上可接受之鹽,或其醫藥學上可接受之鹽,其中環A、R1、R2、R3、X1、X2、X3、X4、X5、G、Y、T及q中之每一者如上文定義且在上文及此處之實施例、類別及子類中單獨或組合描述。
舉例而言,在一些實施例中,本發明提供式I-順(1)化合物,其中環A為3至8員飽和或部分不飽和碳環。在一些實施例中,本發明提供式I-順(1)化合物,其中環A為具有1至4個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的4至7員飽和或部分不飽和雜環。在一些實施例中,本發明提供式I-順(1)化合物,其中環A為7至10員雙環飽和或部分不飽和環。
在某些實施例中,本發明提供式I-順(1)化合物,其中環A視情況經取代且係選自環己基、環己烯基、環戊基、環丁基、環丙基、哌啶基、哌啶酮基、吡咯啶基、四氫哌喃基、四氫呋喃基、四氫噻吩二氧化物或環丁烯二酮基。在某些實施例中,本發明提供式I-順(1)化合物,其中環A為視情況經取代之四氫呋喃。
I-順(1)之例示性化合物包括例如化合物I-82、I-92、I-114、I-241、I-186及其類似物。
在一些實施例中,本發明提供式I-順(2)化合物,其中環A為上文及此處所述結構中之任一者,其在式I-順(1)中描繪之位點處能夠具有 對掌性中心。
在一些實施例中,本發明化合物具有式I-順(2)
或其醫藥學上可接受之鹽,或其醫藥學上可接受之鹽,其中環A、R1、R2、R3、X1、X2、X3、X4、X5、G、Y、T及q中之每一者如上文定義且在上文及此處之實施例、類別及子類中單獨或組合描述。
舉例而言,在一些實施例中,本發明提供式I-順(2)化合物,其中環A為3至8員飽和或部分不飽和碳環。在一些實施例中,本發明提供式I-順(2)化合物,其中環A為具有1至4個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的4至7員飽和或部分不飽和雜環。在一些實施例中,本發明提供式I-順(2)化合物,其中環A為7至10員雙環飽和或部分不飽和環。
在某些實施例中,本發明提供式I-順(2)化合物,其中環A視情況經取代且係選自環己基、環己烯基、環戊基、環丁基、環丙基、哌啶基、哌啶酮基、吡咯啶基、四氫哌喃基、四氫呋喃基、四氫噻吩二氧化物或環丁烯二酮基。在某些實施例中,本發明提供式I-順(2)化合物,其中環A為視情況經取代之四氫呋喃。
I-順(2)之例示性化合物包括例如化合物I-66、I-93、I-119、I-240、I-185及其類似物。
在一些實施例中,本發明提供式I-順(2)化合物,其中環A為上文及此處所述結構中之任一者,其在式I-順(2)中描繪之位點處能夠具有對掌性中心。
在另一實施例中,各R2獨立地為-R。
在另一實施例中,各R2為氫。
在另一實施例中,各R2獨立地為鹵素、-鹵烷基、-OR、-SR、-CN、-NO2、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R、-C(O)N(R)2、-NRC(O)R、-NRC(O)N(R)2、-NRSO2R或-N(R)2
在某些實施例中,各R2獨立地為甲基、乙基、丙基、異丙基、F、Cl、Br、I、CF3、哌啶基、哌嗪基、嗎啉基、四氫吡啶基、吡唑基、噻唑基或四唑基。
在某些實施例中,各R2獨立地為-CH3、-Cl、-F、-CF3或-OMe;或係選自
在某些實施例中,環A係選自
在多個實施例中,R3為氫。
在多個實施例中,R3為C2-6烯基、-W-Cy或C1-6烷基,其中C1-6烷基視情況經1至3個獨立地選自以下之基團取代:鹵素、-CN、側氧基、-OR'或-C(O)O(C1-6烷基)。
在某些實施例中,W不存在(亦即W為共價鍵)。在某些實施例中,W為視情況經一或多個R"取代的二價C1-3伸烷基鏈且其中W之一個亞甲基單元視情況置換為-O-、-S-或-NR'-。在某些實施例中,Cy為苯基,其中Cy視情況經1至3個Rx取代。在某些實施例中,Cy為C3-7環烷基,其中Cy視情況經1至3個Rx取代。在某些實施例中,Cy為具有1至3個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的3至7員單環或5至10員雙環飽和或部分不飽和雜環,其中Cy視情況經1至3個Rx取代。在某些實施例中,Cy為具有1至3個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的3至7員單環或5至10員雙環雜芳基環,其中Cy視情況經1至3個Rx取代。
在一些實施例中,各Rx獨立地為H、-CN、側氧基、-NH2、C1-6烷基、鹵素、-OR'、-N(R')2、-C(O)R'、-NHC(O)(C1-6烷基)、- C(O)N(R')2、-C(O)O(C1-6烷基)、-NHSO2(C1-6烷基)或-SO2N(R')2
在一些實施例中,Rx為-C(O)R'。在一些實施例中,Rx為-C(O)Me。
在某些實施例中,R3為C1-6烷基。
在某些實施例中,R3為環丙基、環丁基、環戊基、環己基、環庚基、氧雜環丁烷基、苯基、哌啶基、吡啶基、吡唑基、噻唑基或吡啶酮基。
在某些實施例中,R3
在一些實施例中,R3
在某些實施例中,R3不存在。
在某些實施例中,R4及R4'中之每一者獨立地為氫。
在某些實施例中,R4及R4'中之每一者獨立地為視情況經取代之苯基。在某些實施例中,R4及R4'中之每一者獨立地為視情況經取代之C1-6脂族基。在某些實施例中,R4及R4'中之每一者獨立地為3至8員飽和或部分不飽和碳環。在其他實施例中,R4及R4'中之每一者獨立地為具有1至4個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的視情況經取代之4至7員雜環,或具有1至4個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的5至6員單環雜芳基環。
在某些實施例中,R4及R4'中之每一者獨立地為視情況經取代之苯基或3至8員飽和或部分不飽和碳環。在某些實施例中,R4及R4'中之每一者獨立地為視情況經取代之苯基。
在某些實施例中,R4及R4'中之每一者獨立地為視情況經取代之環丙基、環丁基、環戊基、環己基、環庚基、氧雜環丁烷基、苯基、哌啶基、吡啶基、吡唑基、噻唑基或吡啶酮基。
在某些實施例中,R4及R4'中之每一者獨立地為乙基、苯基、環己基、
在某些實施例中,R5及R5'中之每一者獨立地為-R。
在某些實施例中,R5及R5'中之每一者獨立地為H。在某些實施例中,R5及R5'皆為H。在某些實施例中,R5及R5'中之一者為H。在某些實施例中,R5及R5'獨立地為H或-Me。
在某些實施例中,R5及R5'中之每一者獨立地為鹵素、-OR、-SR、-CN、-NO2、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R、-C(O)N(R)2、-NRC(O)R、-NRC(O)N(R)2、-NRSO2R或-N(R)2
在一些實施例中,Ra為氫。在一些實施例中,Ra為視情況經取代之C1-6脂族基團。
在另一實施例中,T為共價鍵。在另一實施例中,T為二價直鏈或分支鏈、飽和或不飽和C1-6烴鏈,其中一或多個亞甲基單元視情況經以下置換:-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-S(O)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-。
在另一實施例中,其中T為二價直鏈或分支鏈、飽和或不飽和C1-6烴鏈,其中一或多個亞甲基單元視情況置換為-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-。
在另一實施例中,T為共價鍵或二價直鏈或分支鏈、飽和或不飽和C1-6烴鏈。
在某些實施例中,q為0。在其他實施例中,q為1。在其他實施例中,q為2-6。
在某些實施例中,本發明提供式I-a化合物,
或其醫藥學上可接受之鹽,其中R1、R2、R3、R4、R5、R5'、Ra、T及q中之每一者如上文定義且在上文及此處之實施例、類別及子類中單獨或組合描述。
在某些實施例中,化合物具有式I-b 或其醫藥學上可接受之鹽,其中環A、R1、R2、R3、R4、T及q中之每一者如上文定義且在上文及此處之實施例、類別及子類中單獨或組合描述。
在某些實施例中,本發明提供式I-c化合物: 或其醫藥學上可接受之鹽,其中R1、R2、R3、R4、Ra及q中之每一者如上文定義且在上文及此處之實施例、類別及子類中單獨或組合描述。
在某些實施例中,本發明提供式I-d化合物: 或其醫藥學上可接受之鹽,其中R1、R2、R3、R4、Ra及q中之每一者如上文定義且在上文及此處之實施例、類別及子類中單獨或組合描述。
在其他實施例中,本發明提供式I-e化合物: 或其醫藥學上可接受之鹽,其中環A、R1、R2、R3、R5、R5'、Ra及q中之每一者如上文定義且在上文及此處之實施例、類別及子類中 單獨或組合描述。
在其他實施例中,本發明提供式I-f化合物: 或其醫藥學上可接受之鹽,其中環A、R1、R2、R3、R5、R5'、Ra及q中之每一者如上文定義且在上文及此處之實施例、類別及子類中單獨或組合描述。
在某些實施例中,本發明提供式I-g化合物: 或其醫藥學上可接受之鹽,其中環A、R1、R2、R3、R4、Ra及q中之每一者如上文定義且在上文及此處之實施例、類別及子類中單獨或組合描述。
在某些實施例中,本發明提供式I-h化合物: 或其醫藥學上可接受之鹽,其中環A、R1、R2、R3、R4、Ra及q中之每一者如上文定義且在上文及此處之實施例、類別及子類中單獨或組合描述。
在某些實施例中,本發明提供式I-h化合物,其中環A為視情況經取代之選自以下之基團:苯基、3至8員飽和或部分不飽和碳環、具有1至4個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的5至6員單環雜芳基環、具有1至4個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的4至7員飽和或部分不飽和雜環,或7至10員雙環飽和、部分不飽和或芳基環。
在一些實施例中,化合物具有式I-h且環A為視情況經取代之單環。在一些實施例中,化合物具有式I-h且環A為視情況經取代之單環碳環。在一些實施例中,化合物具有式I-h且環A為視情況經取代之單環雜環。
在一些實施例中,化合物具有式I-h且環A為視情況經取代之芳基。在某些實施例中,化合物具有式I-h且環A為視情況經取代之苯基。
在一些實施例中,化合物具有式I-h且環A為視情況經取代之雜芳基。在某些實施例中,化合物具有式I-h且環A為視情況經取代之吡啶基。
在一些實施例中,化合物具有式I-h且環A為具有1至3個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的視情況經取代之4至7員飽和或部分不飽和雜環。在某些實施例中,化合物具有式I-h且環A為具有1至3個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的視情況經取代之5員飽和雜環。
在某些實施例中,化合物具有式I-h且環A為苯基、環己基、環己烯基、環戊基、環丁基、環丙基、吡啶、嘧啶、吡嗪、噠嗪、吡咯、吡唑、哌啶、哌啶酮、吡咯啶、四氫哌喃、四氫呋喃、四氫噻吩二氧化物或環丁烯二酮。
在某些實施例中,化合物具有式I-h且環A為視情況經取代之選自以下之基團:四氫哌喃、四氫呋喃或四氫噻吩二氧化物。在某些實施例中,化合物具有式I-h且環A為視情況經取代之四氫哌喃。在某些實施例中,化合物具有式I-h且環A為未經取代之四氫哌喃。在某些實施例中,化合物具有式I-h且環A為視情況經取代之四氫呋喃。在某些實施例中,化合物具有式I-h且環A為未經取代之四氫呋喃。在某些實施例中,化合物具有式I-h且環A為視情況經取代之四氫噻吩二氧化物。在某些實施例中,化合物具有式I-h且環A為未經取代之四氫噻吩二氧化物。
在某些實施例中,化合物具有式I-h且環A如本文所定義經取代。
在一些實施例中,化合物具有式I-h且環A經一個、兩個或三個各自經獨立地選擇之R2基團取代。環A上之例示性取代基包括Br、I、Cl、F、Me、-CF3、-OMe、-OR、-N(R)2、吡唑基、噻唑基、哌啶基、哌嗪基或嗎啉基。
在一些實施例中,化合物具有式I-h且環A經一個、兩個或三個各自經獨立地選擇之R2基團取代。環A上之例示性取代基包括Br、I、Cl、F、Me、-CF3、-OMe、-OR、-N(R)2、-C(O)R'、=O或視情況經取代之選自以下之基團:環烷基、吡唑基、噻唑基、哌啶基、哌嗪基、噠嗪基、咪唑基或嗎啉基。
在一些實施例中,化合物具有式I-h且環A為具有1至3個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的4至7員飽和或部分不飽和雜環,其中環A經一個、兩個或三個各自獨立地選擇之R2基團取代。
在一些實施例中,化合物具有式I-h且環A為經一個、兩個或三個各自經獨立地選擇之R2基團取代之四氫哌喃。
在一些實施例中,化合物具有式I-h且環A為經一個、兩個或三 個各自經獨立地選擇之R2基團取代之四氫呋喃。
在一些實施例中,化合物具有式I-h且環A為經一個、兩個或三個各自經獨立地選擇之R2基團取代之四氫噻吩二氧化物。
在某些實施例中,化合物具有式I-h且各R2獨立地為甲基、乙基、丙基、異丙基、F、Cl、Br、I、CF3、哌啶基、哌嗪基、嗎啉基、四氫吡啶基、吡唑基、噻唑基或四唑基。
在一些實施例中,化合物具有式I-h且R2為視情況經取代之吡唑基。在一些實施例中,化合物具有式I-h且R2為n-取代之吡唑基。在一些實施例中,化合物具有式I-h且R2為n-烷基吡唑基。在一些實施例中,化合物具有式I-h且R2為n-甲基吡唑基。
在一些實施例中,化合物具有式I-h且R2為視情況經取代之吡啶基。在一些實施例中,化合物具有式I-h且R2為未經取代之吡啶基。
在一些實施例中,化合物具有式I-h且R2為n-取代之四唑基。在一些實施例中,化合物具有式I-h且R2為n-烷基四唑基。在一些實施例中,化合物具有式I-h且R2為n-甲基四唑基。
在一些實施例中,化合物具有式I-h且R2為視情況經取代之哌嗪基。在一些實施例中,化合物具有式I-h且R2為n-取代之哌嗪基。在一些實施例中,化合物具有式I-h且R2為n-烷基哌嗪基。在一些實施例中,化合物具有式I-h且R2為n-甲基哌嗪基。在一些實施例中,化合物具有式I-h且R2為n-乙基哌嗪基。
在一些實施例中,化合物具有式I-h且各R2獨立地為鹵素、-鹵烷基、-OR、-SR、-CN、-NO2、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R、-C(O)N(R)2、-NRC(O)R、-NRC(O)N(R)2、-NRSO2R或-N(R)2
在一些實施例中,化合物具有式I-h且R2為-OR。在某些實施例中,化合物具有式I-h且R2為-OH。
在一些實施例中,化合物具有式I-h且R2為-C(O)R。在某些實施 例中,化合物具有式I-h且R2為-C(O)Me。
在一些實施例中,化合物具有式I-h且各R2獨立地為-R。
在一些實施例中,化合物具有式I-h且R2為視情況經取代之環烷基。在一些實施例中,化合物具有式I-h且R2為視情況經取代之環丙基。在一些實施例中,化合物具有式I-h且R2為未經取代之環丙基。
在一些實施例中,化合物具有式I-h且R3為C2-6烯基、-W-Cy或C1-6烷基,其中C1-6烷基視情況經1至3個獨立地選自以下之基團取代:鹵素、-CN、側氧基、-OR'或-C(O)O(C1-6烷基)。
舉例而言,在某些實施例中,化合物具有式I-h且R3為C1-6烷基,其中C1-6烷基視情況經1至3個-OH基團取代。在某些實施例中,化合物具有式I-h且R3為C1-6烷基,其中C1-6烷基視情況經1至2個-OH基團取代。在某些實施例中,化合物具有式I-h且R3為視情況經1至3個-OH基團取代之C3-6烷基。在某些實施例中,化合物具有式I-h且R3為視情況經1至2個-OH基團取代之C3-6烷基。
在一些實施例中,化合物具有式I-h且R3為C1-6烷基。在一些實施例中,化合物具有式I-h且R3為甲基、乙基或丙基。在某些實施例中,化合物具有式I-h且R3為甲基。在某些實施例中,化合物具有式I-h且R3為乙基。在某些實施例中,化合物具有式I-h且R3為丙基,例如異丙基。
在一些實施例中,化合物具有式I-h且R3為-W-Cy。在某些實施例中,化合物具有式I-h,R3為-W-Cy,且W不存在(亦即W為共價鍵)。
在某些實施例中,化合物具有式I-h,R3為-W-Cy且W為視情況經一或多個R"取代的二價C1-3伸烷基鏈且其中W之一個亞甲基單元視情況置換為-O-、-S-或-NR'-。在某些實施例中,化合物具有式I-h,R3為-W-Cy,且Cy為C3-7環烷基,其中Cy視情況經1至3個Rx取代。
在某些實施例中,化合物具有式I-h,R3為-W-Cy,且Cy為具有1 至3個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的3至7員單環飽和環,其中Cy視情況經1至3個Rx取代。在某些實施例中,化合物具有式I-h,R3為-W-Cy,W為視情況經一或多個R"取代之二價C1-3伸烷基鏈,且Cy為具有1至3個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的3至7員單環飽和環,其中Cy視情況經1至3個Rx取代。在某些實施例中,化合物具有式I-h,R3為-W-Cy,W為視情況經一或多個R"取代之二價C1伸烷基鏈,且Cy為具有1至3個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的3至7員單環飽和環,其中Cy視情況經1至3個Rx取代。在某些實施例中,化合物具有式I-h,R3為-W-Cy,W為視情況經一或多個R"取代之二價C1-3伸烷基鏈,且Cy為具有1至3個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的3至5員單環飽和環,其中Cy視情況經1至3個Rx取代。在某些實施例中,化合物具有式I-h,R3為-W-Cy,W為視情況經一或多個R"取代之二價C1伸烷基鏈,且Cy為具有1至3個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的5員單環飽和環,其中Cy視情況經1至3個Rx取代。在某些實施例中,化合物具有式I-h,R3為-W-Cy,W為視情況經一或多個R"取代之二價C1伸烷基鏈,且Cy為具有1個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的5員單環飽和環,其中Cy視情況經1至3個Rx取代。在某些實施例中,R3如上文所定義且Rx為-C(O)R'。在某些實施例中,R3如上文所定義且Rx為-C(O)Me。
在某些實施例中,化合物具有式I-h且R3
在某些實施例中,化合物具有式I-h且R3為:
在某些實施例中,化合物具有式I-h且R4為視情況經取代之苯基。在某些實施例中,化合物具有式I-h且R4為視情況經1至5個鹵素取代之苯基。在某些實施例中,化合物具有式I-h且R4為視情況經1至5個烷氧基取代之苯基。在某些實施例中,化合物具有式I-h且R4為視 情況經1至5個獨立地選自鹵素及烷氧基之基團取代之苯基。在某些實施例中,化合物具有式I-h且R4為視情況經1至5個獨立地選自氯、氟、甲氧基及乙氧基之基團取代之苯基。在某些實施例中,化合物具有式I-h且R4為視情況經取代之苯基,其中該視情況存在之取代為上文及此處所述之任一者。
在某些實施例中,化合物具有式I-h且R4為乙基、苯基、環己基、
在某些實施例中,化合物具有式I-h且R4
在一些實施例中,式I-h化合物具有式I-h(順)(1)I-h(順)(2)
或其醫藥學上可接受之鹽,其中環A、R1、R2、R3、R4、Ra及q中之每一者如上文定義且在上文及此處之實施例、類別及子類中單獨或組合描述。
在某些實施例中,式I-h化合物具有式I-h(順)(1)
或其醫藥學上可接受之鹽,其中環A、R1、R2、R3、R4、Ra及q中之每一者如上文定義且在上文及此處之實施例、類別及子類中單獨 或組合描述。
在某些實施例中,式I-h化合物具有式I-H(順)(2):
或其醫藥學上可接受之鹽,其中環A、R1、R2、R3、R4、Ra及q中之每一者如上文定義且在上文及此處之實施例、類別及子類中單獨或組合描述。
在某些實施例中,本發明提供式I-j化合物: 或其醫藥學上可接受之鹽,其中環A、R1、R2、R4、Ra及q中之每一者如上文定義且在上文及此處之實施例、類別及子類中單獨或組合描述。
在某些實施例中,本發明提供式I-k化合物: 或其醫藥學上可接受之鹽,其中環A、R1、R2、R3、R4、Ra及q中之每一者如上文定義且在上文及此處之實施例、類別及子類中單獨或組合描述。
在某些實施例中,本發明提供式I-n化合物: 或其醫藥學上可接受之鹽,其中環A、R1、R2、R3、R4及q中之每一者如上文定義且在上文及此處之實施例、類別及子類中單獨或組合描述。
在某些實施例中,化合物具有式I-q 或其醫藥學上可接受之鹽,其中環A、R1、R2、R3、R4、T及q中之每一者如上文定義且在上文及此處之實施例、類別及子類中單獨或組合描述。
在某些實施例中,本發明提供選自表1或表2之化合物:表1
在某些實施例中,本發明提供選自表2之化合物:
在某些實施例中,本發明提供選自以下之化合物:
在一些實施例中,本發明提供選自表3之化合物表3
在一些實施例中,本發明提供選自上文描繪之化合物的化合物或其醫藥學上可接受之鹽。
如上文一般定義,本文任何化學式之R1基團為-L-Y,其中:L為共價鍵或二價C1-8飽和或不飽和直鏈或分支鏈烴鏈,其中L之一個、兩個或三個亞甲基單元視情況且獨立地置換為伸環丙基、-NR-、-N(R)C(O)-、-C(O)N(R)-、-N(R)SO2-、-SO2N(R)-、-O-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-S-、-SO-、-SO2-、-C(=S)-、-C(=NR)-、-N=N-或-C(=N2)-;Y為氫、視情況經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C1-6脂族基,或具有0至3個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的3至10員單環或雙環飽和、部分不飽和或芳基環,且其中該環經1至4個Re基團取代;且各Re係獨立地選自-Q-Z、側氧基、NO2、鹵素、CN、適合離去基或視情況經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C1-6脂族基,其中:Q為共價鍵或二價C1-6飽和或不飽和直鏈或分支鏈烴鏈,其中Q之一個或兩個亞甲基單元視情況且獨立地由以下置換:-N(R)-、-S-、-O-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-SO-或-SO2-、-N(R)C(O)-、-C(O)N(R)-、-N(R)SO2-或-SO2N(R)-;且Z為氫或視情況經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C1-6脂族基。
在某些實施例中,L為共價鍵。
在某些實施例中,L為二價C1-8飽和或不飽和直鏈或分支鏈烴鏈。在某些實施例中,L為-CH2-。
在某些實施例中,L為共價鍵、-CH2-、-NH-、-CH2NH-、-NHCH2-、-NHC(O)-、-NHC(O)CH2OC(O)-、-CH2NHC(O)-、-NHSO2-、-NHSO2CH2-、-NHC(O)CH2OC(O)-或-SO2NH-。
在一些實施例中,L為二價C2-8直鏈或分支鏈烴鏈,其中L具有至少一個雙鍵且L之一個或兩個額外亞甲基單元視情況且獨立地由以下 置換:-NRC(O)-、-C(O)NR-、-N(R)SO2-、-SO2N(R)-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-OC(O)-、-C(O)O-、伸環丙基、-O-、-N(R)-或-C(O)-。
在某些實施例中,L為二價C2-8直鏈或分支鏈烴鏈,其中L具有至少一個雙鍵且L之至少一個亞甲基單元置換為-C(O)-、-NRC(O)-、-C(O)NR-、-N(R)SO2-、-SO2N(R)-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-OC(O)-或-C(O)O-,且L之一個或兩個額外亞甲基單元視情況且獨立地置換為伸環丙基、-O-、-N(R)-或-C(O)-。
在一些實施例中,L為二價C2-8直鏈或分支鏈烴鏈,其中L具有至少一個雙鍵且L之至少一個亞甲基單元置換為-C(O)-,且L之一個或兩個額外亞甲基單元視情況且獨立地置換為伸環丙基、-O-、-N(R)-或-C(O)-。
如上文所述,在某些實施例中,L為二價C2-8直鏈或分支鏈烴鏈,其中L具有至少一個雙鍵。一般技術者將瞭解,該雙鍵可存在於烴鏈主鏈內或在主鏈「外」,且因此形成亞烷基。舉例而言,該具有亞烷基分支鏈之L基團包括-CH2C(=CH2)CH2-。因此,在一些實施例中,L為二價C2-8直鏈或分支鏈烴鏈,其中L具有至少一個亞烷基雙鍵。例示性L基團包括-NHC(O)C(=CH2)CH2-。
在某些實施例中,L為二價C2-8直鏈或分支鏈烴鏈,其中L具有至少一個雙鍵且L之至少一個亞甲基單元置換為-C(O)-。在某些實施例中,L為-C(O)CH=CH(CH3)-、-C(O)CH=CHCH2NH(CH3)-、-C(O)CH=CH(CH3)-、-C(O)CH=CH-、-CH2C(O)CH=CH-、-CH2C(O)CH=CH(CH3)-、-CH2CH2C(O)CH=CH-、-CH2CH2C(O)CH=CHCH2-、-CH2CH2C(O)CH=CHCH2NH(CH3)-或-CH2CH2C(O)CH=CH(CH3)-,或-CH(CH3)OC(O)CH=CH-。
在某些實施例中,L為二價C2-8直鏈或分支鏈烴鏈,其中L具有至少一個雙鍵且L之至少一個亞甲基單元置換為-OC(O)-。
在一些實施例中,L為二價C2-8直鏈或分支鏈烴鏈,其中L具有至少一個雙鍵且L之至少一個亞甲基單元置換為-NRC(O)-、-C(O)NR-、-N(R)SO2-、-SO2N(R)-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-OC(O)-或-C(O)O-,且L之一個或兩個額外亞甲基單元視情況且獨立地置換為伸環丙基、-O-、-N(R)-或-C(O)-。在一些實施例中,L為-CH2OC(O)CH=CHCH2-、-CH2-OC(O)CH=CH-或-CH(CH=CH2)OC(O)CH=CH-。
在某些實施例中,L為-NRC(O)CH=CH-、-NRC(O)CH=CHCH2N(CH3)-、-NRC(O)CH=CHCH2O-、-CH2NRC(O)CH=CH-、-NRSO2CH=CH-、-NRSO2CH=CHCH2-、-NRC(O)(C=N2)-、-NRC(O)(C=N2)C(O)-、-NRC(O)CH=CHCH2N(CH3)-、-NRC(O)C(=CH2)CH2-、-CH2NRC(O)-、-CH2CH2NRC(O)-或-CH2NRC(O)伸環丙基-;其中R為H或視情況經取代之C1-6脂族基;且Y為氫或視情況經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C1-6脂族基。
在某些實施例中,L為-NHC(O)CH=CH-、-NHC(O)CH=CHCH2N(CH3)-、-NHC(O)CH=CHCH2O-、-CH2NHC(O)CH=CH-、-NHSO2CH=CH-、-NHSO2CH=CHCH2-、-NHC(O)(C=N2)-、-NHC(O)(C=N2)C(O)-、-NHC(O)C(=CH2)CH2-、-CH2NHC(O)-、-CH2CH2NHC(O)-或-CH2NHC(O)伸環丙基-。
在一些實施例中,L為二價C2-8直鏈或分支鏈烴鏈,其中L具有至少一個參鍵。在某些實施例中,L為二價C2-8直鏈或分支鏈烴鏈,其中L具有至少一個參鍵且L之一或兩個額外亞甲基單元視情況且獨立地置換為-NRC(O)-、-C(O)NR-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-C(=S)-、-C(=NR)-、-O-、-N(R)-或-C(O)-。在一些實施例中,L具有至少一個參鍵且L之至少一個亞甲基單元置換為-N(R)-、-N(R)C(O)-、-C(O)-、-C(O)O-或-OC(O)-,或-O-。
例示性L基團包括-C≡C-、-C≡CCH2N(異丙基)-、- NHC(O)C≡CCH2CH2-、-CH2-C≡C-CH2-、-C≡CCH2O-、-CH2C(O)C≡C-、-C(O)C≡C-或-CH2OC(=O)C≡C-。
在某些實施例中,L為二價C2-8直鏈或分支鏈烴鏈,其中L之一個亞甲基單元置換為伸環丙基且L之一或兩個額外亞甲基單元獨立地置換為-C(O)-、-NRC(O)-、-C(O)NR-、-N(R)SO2-或-SO2N(R)-。例示性L基團包括-NHC(O)-伸環丙基-SO2-及-NHC(O)-伸環丙基-。
如上文一般定義,Y為氫、視情況經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C1-6脂族基,或具有0至3個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的3至10員單環或雙環飽和、部分不飽和或芳基環,且其中該環經1至4個Re基團取代,各Re係獨立地選自-Q-Z、側氧基、NO2、鹵素、CN、適合離去基或C1-6脂族基,其中Q為共價鍵或二價C1-6飽和或不飽和直鏈或分支鏈烴鏈,其中Q之一或兩個亞甲基單元視情況且獨立地置換為-N(R)-、-S-、-O-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-SO-或-SO2-、-N(R)C(O)-、-C(O)N(R)-、-N(R)SO2-或-SO2N(R)-;且Z為氫或視情況經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C1-6脂族基。
在某些實施例中,Y為氫。
在某些實施例中,Y為視情況經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C1-6脂族基。在一些實施例中,Y為視情況經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C2-6烯基。在其他實施例中,Y為視情況經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C2-6炔基。在一些實施例中,Y為C2-6烯基。在其他實施例中,Y為C2-4炔基。
在其他實施例中,Y為經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C1-6烷基。該等Y基團包括-CH2F、-CH2Cl、-CH2CN及-CH2NO2
在某些實施例中,Y為具有0至3個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的飽和3至6員單環,其中Y經1至4個Re基團取代,其中各Re如上文所定義且如本文所述。
在一些實施例中,Y為具有1個選自氧或氮之雜原子的飽和3至4員雜環,其中該環經1至2個Re基團取代,其中各Re如上文所定義且如本文所述。例示性所述環為環氧化物及氧雜環丁烷環,其中各環經1至2個Re基團取代,其中各Re如上文所定義且如本文所述。
在其他實施例中,Y為具有1至2個選自氧或氮之雜原子的飽和5至6員雜環,其中該環經1至4個Re基團取代,其中各Re如上文所定義且如本文所述。該等環包括哌啶及吡咯啶,其中各環經1至4個Re基團取代,其中各Re如上文所定義且如本文所述。在某些實施例中,Y為 ,其中各R、Q、Z及Re如上文所定義 且如本文所述。
在一些實施例中,Y為飽和3至6員碳環,其中該環經1至4個Re基團取代,其中各Re如上文所定義且如本文所述。在某些實施例中,Y為環丙基、環丁基、環戊基或環己基,其中各環經1至4個Re基團取代,其中各Re如上文所定義且如本文所述。在某些實施例中,Y為 ,其中Re如上文所定義且如本文所述。在某些實施例中,Y為 視情況經鹵素、CN或NO2取代之環丙基。
在某些實施例中,Y為具有0至3個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的部分不飽和3至6員單環,其中該環經1至4個Re基團取代,其中各Re如上文所定義且如本文所述。
在一些實施例中,Y為部分不飽和3至6員碳環,其中該環經1至4個Re基團取代,其中各Re如上文所定義且如本文所述。在一些實施例中,Y為環丙烯基、環丁烯基、環戊烯基或環己烯基,其中各環經1至4個Re基團取代,其中各Re如上文所定義且如本文所述。在某些實 施例中,Y為,其中各Re如上文所定義且如本文所述。
在某些實施例中,Y為具有1至2個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的部分不飽和4至6員雜環,其中該環經1至4個Re基團取代,其中各Re如上文所定義且如本文所述。在某些實施例中,Y係選自:
其中各R及Re如上文所定義且如本文所述。
在某些實施例中,Y為具有0至2個氮之6員芳族環,其中該環經1至4個Re基團取代,其中各Re基團如上文所定義且如本文所述。在某些實施例中,Y為苯基、吡啶基或嘧啶基,其中各環經1至4個Re基團取代,其中各Re如上文所定義且如本文所述。
在一些實施例中,Y係選自:
其中各Re如上文所定義且如本文所述。
在其他實施例中,Y為具有1至3個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的5員雜芳基環,其中該環經1至3個Re基團取代,其中各Re基團如上文所定義且如本文所述。在一些實施例中,Y為具有1至3個獨立地選自氮、氧及硫之雜原子的5員部分不飽和或芳基環,其中該環經1至4個Re基團取代,其中各Re基團如上文所定義且如本文所述。例示性該等環為異噁唑基、噁唑基、噻唑基、咪唑基、吡唑基、吡咯基、呋喃基、噻吩基、***基、噻二唑基及噁二唑基,其中各環經1至3個Re基團取代,其中各Re基團如上文所定義且如本文所述。在某些實施例中,Y係選自:
其中各R及Re如上文所定義且如本文所述。
在某些實施例中,Y為具有0至3個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的8至10員雙環、飽和、部分不飽和或芳基環,其中該環經1至4個Re基團取代,其中Re如上文所定義且如本文所述。根據另一態樣,Y為具有1至3個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的9至10員雙環、部分不飽和或芳基環,其中該環經1至4個Re基團取代,其中Re如上文所定義且如本文所述。例示性所述雙環包括2,3-二氫苯并[d]異噻唑,其中該環經1至4個Re基團取代,其中Re如上文所定義且如本文所述。
如上文一般定義,各Re基團獨立地選自-Q-Z、側氧基、NO2、鹵素、CN、適合離去基或視情況經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C1-6脂族基,其中Q為共價鍵或二價C1-6飽和或不飽和、直鏈或分支鏈烴鏈,其中Q之一或兩個亞甲基單元視情況且獨立地置換為-N(R)-、-S-、-O-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-SO-或-SO2-、-N(R)C(O)-、-C(O)N(R)-、-N(R)SO2-或-SO2N(R)-;且Z為氫或視情況經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C1-6脂族基。
在某些實施例中,Re為視情況經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C1-6脂族基。在其他實施例中,Re為側氧基、NO2、鹵素或CN。
在一些實施例中,Re為-Q-Z,其中Q為共價鍵且Z為氫(亦即Re為 氫)。在其他實施例中,Re為-Q-Z,其中Q為二價C1-6飽和或不飽和直鏈或分支鏈烴鏈,其中Q之一或兩個亞甲基單元視情況且獨立地置換為-NR-、-NRC(O)-、-C(O)NR-、-S-、-O-、-C(O)-、-SO-或-SO2-。在其他實施例中,Q為具有至少一個雙鍵之二價C2-6直鏈或分支鏈烴鏈,其中Q之一或兩個亞甲基單元視情況且獨立地置換為-NR-、-NRC(O)-、-C(O)NR-、-S-、-O-、-C(O)-、-SO-或-SO2-。在某些實施例中,Re基團之Z部分為氫。在一些實施例中,-Q-Z為-NHC(O)CH=CH2或-C(O)CH=CH2
在某些實施例中,各Re係獨立地選自側氧基、NO2、CN、氟、氯、-NHC(O)CH=CH2、-C(O)CH=CH2、-CH2CH=CH2、-C≡CH、-C(O)OCH2Cl、-C(O)OCH2F、-C(O)OCH2CN、-C(O)CH2Cl、-C(O)CH2F、-C(O)CH2CN或-CH2C(O)CH3
在某些實施例中,Re為適合離去基,亦即經受親核置換之基團。「適合離去基」為容易由所要引入化學部分(諸如所關注半胱胺酸之硫醇部分)置換的化學基團。適合離去基為此項技術中熟知,例如參看「Advanced Organic Chemistry,」Jerry March,第5版,第351頁-第357頁,John Wiley and Sons,N.Y。該等離去基包括(但不限於)鹵素、烷氧基、磺醯氧基、視情況經取代之烷基磺醯氧基、視情況經取代之烯基磺醯氧基、視情況經取代之芳基磺醯氧基、醯基及重氮鹽部分。適合離去基之實例包括氯、碘、溴、氟、乙醯氧基、甲烷磺醯氧基(甲磺醯氧基)、甲苯磺醯氧基、三氟甲磺醯氧基、硝基-苯基磺醯氧基(硝基苯磺醯氧基)及溴-苯基磺醯氧基(溴苯磺醯氧基)。
在某些實施例中,-L-Y之以下實施例及組合適用:(a)L為二價C2-8直鏈或分支鏈烴鏈,其中L具有至少一個雙鍵且L之一或兩個額外亞甲基單元視情況且獨立地置換為-NRC(O)-、-C(O)NR-、-N(R)SO2-、-SO2N(R)-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-OC(O)-、- C(O)O-、伸環丙基、-O-、-N(R)-或-C(O)-;且Y為氫或視情況經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C1-6脂族基;或(b)L為二價C2-8直鏈或分支鏈烴鏈,其中L具有至少一個雙鍵且L之至少一個亞甲基單元置換為-C(O)-、-NRC(O)-、-C(O)NR-、-N(R)SO2-、-SO2N(R)-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-OC(O)-或-C(O)O-,且L之一個或兩個額外亞甲基單元視情況且獨立地置換為伸環丙基、-O-、-N(R)-或-C(O)-;且Y為氫或視情況經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C1-6脂族基;或(c)L為二價C2-8直鏈或分支鏈烴鏈,其中L具有至少一個雙鍵且L之至少一個亞甲基單元置換為-C(O)-,且L之一個或兩個額外亞甲基單元視情況且獨立地置換為伸環丙基、-O-、-N(R)-或-C(O)-;且Y為氫或視情況經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C1-6脂族基;或(d)L為二價C2-8直鏈或分支鏈烴鏈,其中L具有至少一個雙鍵且L之至少一個亞甲基單元置換為-C(O)-;且Y為氫或視情況經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C1-6脂族基;或(e)L為二價C2-8直鏈或分支鏈烴鏈,其中L具有至少一個雙鍵且L之至少一個亞甲基單元置換為-OC(O)-;且Y為氫或視情況經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C1-6脂族基;或(f)L為-NRC(O)CH=CH-、-NRC(O)CH=CHCH2N(CH3)-、-NRC(O)CH=CHCH2O-、-CH2NRC(O)CH=CH-、-NRSO2CH=CH-、-NRSO2CH=CHCH2-、-NRC(O)(C=N2)-、-NRC(O)(C=N2)C(O)-、-NRC(O)CH=CHCH2O-、-NRC(O)C(=CH2)CH2-、-CH2NRC(O)-、-CH2CH2NRC(O)-或-CH2NRC(O)伸環丙基-;其中R為H或視情況經取代之C1-6脂族基;且Y為氫或視情況經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C1-6脂族基;或(g)L為-NHC(O)CH=CH-、-NHC(O)CH=CHCH2N(CH3)-、- NHC(O)CH=CHCH2O-、-CH2NHC(O)CH=CH-、-NHSO2CH=CH-、-NHSO2CH=CHCH2-、-NHC(O)(C=N2)-、-NHC(O)(C=N2)C(O)-、-NHC(O)C(=CH2)CH2-、-CH2NHC(O)-、-CH2CH2NHC(O)-或-CH2NHC(O)伸環丙基-;且Y為氫或視情況經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C1-6脂族基;或(h)L為二價C2-8直鏈或分支鏈烴鏈,其中L具有至少一個亞烷基雙鍵且L之至少一個亞甲基單元置換為-C(O)-、-NRC(O)-、-C(O)NR-、-N(R)SO2-、-SO2N(R)-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-OC(O)-或-C(O)O-,且L之一或兩個額外亞甲基單元視情況且獨立地置換為伸環丙基、-O-、-N(R)-或-C(O)-;且Y為氫或視情況經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C1-6脂族基;或(i)L為二價C2-8直鏈或分支鏈烴鏈,其中L具有至少一個參鍵且L之一或兩個額外亞甲基單元視情況且獨立地置換為-NRC(O)-、-C(O)NR-、-N(R)SO2-、-SO2N(R)-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-OC(O)-或-C(O)O-,且Y為氫或視情況經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C1-6脂族基;或(j)L為-C≡C-、-C≡CCH2N(異丙基)-、-NHC(O)C≡CCH2CH2-、-CH2-C≡C-CH2-、-C≡CCH2O-、-CH2C(O)C≡C-、-C(O)C≡C-或-CH2OC(=O)C≡C-;且Y為氫或視情況經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C1-6脂族基;或(k)L為二價C2-8直鏈或分支鏈烴鏈,其中L之一個亞甲基單元置換為伸環丙基且L之一或兩個額外亞甲基單元獨立地置換為-NRC(O)-、-C(O)NR-、-N(R)SO2-、-SO2N(R)-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-OC(O)-或-C(O)O-;且Y為氫或視情況經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C1-6脂族基;或(l)L為共價鍵且Y係選自: (i)經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C1-6烷基;(ii)視情況經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C2-6烯基;或(iii)視情況經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C2-6炔基;或(iv)具有1個選自氧或氮之雜原子的飽和3至4員雜環,其中該環經1至2個Re基團取代,其中各Re如上文所定義且如本文所述;或(v)具有1至2個選自氧或氮之雜原子的飽和5至6員雜環,其中該環經1至4個Re基團取代,其中各Re如上文所定義且如本文所述;或 (vi),其中各R、Q、Z及Re如上 文所定義且如本文所述;或(vii)飽和3至6員碳環,其中該環經1至4個Re基團取代,其中各Re如上文所定義且如本文所述;或(viii)具有0至3個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的部分不飽和3至6員單環,其中該環經1至4個Re基團取代,其中各Re如上文所定義且如本文所述;或(ix)部分不飽和3至6員碳環,其中該環經1至4個Re基團取代,其中各Re如上文所定義且如本文所述;或 (x),其中各Re如上文所定義且如本文所述;或 (xi)具有1至2個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的部分不飽和4至6員雜環,其中該環經1至4個Re基團取代,其中各Re如上文所定義且如本文所述;或 (xii)
其中各R及Re如上文所定義且如本文所述;或 (xiii)具有0至2個氮之6員芳族環,其中該環經1至4個Re基團取代,其中各Re基團如上文所定義且如本文所述;或 (xiv)
其中各Re如上文所定義且如本文所述;或(xv)具有1至3個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的5員雜芳基環,其中該環經1至3個Re基團取代,其中各Re基團如上文所定義且如本文所述;或 (xvi)
其中各R及Re如上文所定義且如本文所述;或(xvii)具有0至3個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的8至10員雙環、飽和、部分不飽和或芳基環,其中該環經1至4個Re基團取代,其中Re如上文所定義且如本文所述;(m)L為-C(O)-且Y係選自:(i)經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C1-6烷基;或(ii)視情況經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C2-6烯基;或(iii)視情況經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C2-6炔基;或(iv)具有1個選自氧或氮之雜原子的飽和3至4員雜環,其中該環經1至2個Re基團取代,其中各Re如上文所定義且如本文所述;或(v)具有1至2個選自氧或氮之雜原子的飽和5至6員雜環,其中該 環經1至4個Re基團取代,其中各Re如上文所定義且如本文所述;或 (vi),其中各R、Q、Z及Re如上 文所定義且如本文所述;或(vii)飽和3至6員碳環,其中該環經1至4個Re基團取代,其中各Re如上文所定義且如本文所述;或(viii)具有0至3個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的部分不飽和3至6員單環,其中該環經1至4個Re基團取代,其中各Re如上文所定義且如本文所述;或(ix)部分不飽和3至6員碳環,其中該環經1至4個Re基團取代,其中各Re如上文所定義且如本文所述;或 (x),其中各Re如上文所定義且如本文所述;或 (xi)具有1至2個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的部分不飽和4至6員雜環,其中該環經1至4個Re基團取代,其中各Re如上文所定義且如本文所述;或 (xii) 其中各R及Re如上文所定義且如本文所述;或(xiii)具有0至2個氮之6員芳族環,其中該環經1至4個Re基團取代,其中各Re基團如上文所定義且如本文所述;或 (xiv)
其中各Re如上文所定義且如本文所述;或(xv)具有1至3個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的5員雜芳基 環,其中該環經1至3個Re基團取代,其中各Re基團如上文所定義且如本文所述;或 (xvi)
其中各R及Re如上文所定義且如本文所述;或(xvii)具有0至3個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的8至10員雙環、飽和、部分不飽和或芳基環,其中該環經1至4個Re基團取代,其中Re如上文所定義且如本文所述;(n)L為-N(R)C(O)-且Y係選自:(i)經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C1-6烷基;或(ii)視情況經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C2-6烯基;或(iii)視情況經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C2-6炔基;或(iv)具有1個選自氧或氮之雜原子的飽和3至4員雜環,其中該環經1至2個Re基團取代,其中各Re如上文所定義且如本文所述;或(v)具有1至2個選自氧或氮之雜原子的飽和5至6員雜環,其中該環經1至4個Re基團取代,其中各Re如上文所定義且如本文所述;或 (vi),其中各R、Q、Z及Re如上 文所定義且如本文所述;或(vii)飽和3至6員碳環,其中該環經1至4個Re基團取代,其中各Re 如上文所定義且如本文所述;或(viii)具有0至3個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的部分不飽和3至6員單環,其中該環經1至4個Re基團取代,其中各Re如上文所定義且如本文所述;或(ix)部分不飽和3至6員碳環,其中該環經1至4個Re基團取代,其中各Re如上文所定義且如本文所述;或 (x),其中各Re如上文所定義且如本文所述;或 (xi)具有1至2個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的部分不飽和4至6員雜環,其中該環經1至4個Re基團取代,其中各Re如上文所定義且如本文所述;或 (xii)
其中各R及Re如上文所定義且如本文所述;或(xiii)具有0至2個氮之6員芳族環,其中該環經1至4個Re基團取代,其中各Re基團如上文所定義且如本文所述;或 (xiv)
其中各Re如上文所定義且如本文所述;或(xv)具有1至3個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的5員雜芳基環,其中該環經1至3個Re基團取代,其中各Re基團如上文所定義且如本文所述;或 (xvi)
其中各R及Re如上文所定義且如本文所述;或(xvii)具有0至3個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的8至10員雙環、飽和、部分不飽和或芳基環,其中該環經1至4個Re基團取代,其中Re如上文所定義且如本文所述;(o)L為二價C1-8飽和或不飽和直鏈或分支鏈烴鏈;且Y係選自:(i)經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C1-6烷基;(ii)視情況經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C2-6烯基;或(iii)視情況經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C2-6炔基;或(iv)具有1個選自氧或氮之雜原子的飽和3至4員雜環,其中該環經1至2個Re基團取代,其中各Re如上文所定義且如本文所述;或(v)具有1至2個選自氧或氮之雜原子的飽和5至6員雜環,其中該環經1至4個Re基團取代,其中各Re如上文所定義且如本文所述;或 (vi),其中各R、Q、Z及Re如上 文所定義且如本文所述;或(vii)飽和3至6員碳環,其中該環經1至4個Re基團取代,其中各Re如上文所定義且如本文所述;或(viii)具有0至3個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的部分不飽和3至6員單環,其中該環經1至4個Re基團取代,其中各Re如上文所定義且如本文所述;或 (ix)部分不飽和3至6員碳環,其中該環經1至4個Re基團取代,其中各Re如上文所定義且如本文所述;或 (x),其中各Re如上文所定義且如本文所述;或 (xi)具有1至2個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的部分不飽和4至6員雜環,其中該環經1至4個Re基團取代,其中各Re如上文所定義且如本文所述;或 (xii)
其中各R及Re如上文所定義且如本文所述;或(xiii)具有0至2個氮之6員芳族環,其中該環經1至4個Re基團取代,其中各Re基團如上文所定義且如本文所述;或 (xiv)
其中各Re如上文所定義且如本文所述;或(xv)具有1至3個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的5員雜芳基環,其中該環經1至3個Re基團取代,其中各Re基團如上文所定義且如本文所述;或 (xvi)
其中各R及Re如上文所定義且如本文所述;或(xvii)具有0至3個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的8至10員雙環、飽和、部分不飽和或芳基環,其中該環經1至4個Re基團取代,其中Re如上文所定義且如本文所述;(p)L為共價鍵、-CH2-、-NH-、-C(O)-、-CH2NH-、-NHCH2-、-NHC(O)-、-NHC(O)CH2OC(O)-、-CH2NHC(O)-、-NHSO2-、-NHSO2CH2-、-NHC(O)CH2OC(O)-或-SO2NH-;且Y係選自:(i)經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C1-6烷基;或(ii)視情況經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C2-6烯基;或(iii)視情況經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C2-6炔基;或(iv)具有1個選自氧或氮之雜原子的飽和3至4員雜環,其中該環經1至2個Re基團取代,其中各Re如上文所定義且如本文所述;或(v)具有1至2個選自氧或氮之雜原子的飽和5至6員雜環,其中該環經1至4個Re基團取代,其中各Re如上文所定義且如本文所述;或 (vi),其中各R、Q、Z及Re如上 文所定義且如本文所述;或(vii)飽和3至6員碳環,其中該環經1至4個Re基團取代,其中各Re如上文所定義且如本文所述;或(viii)具有0至3個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的部分不飽和3至6員單環,其中該環經1至4個Re基團取代,其中各Re如上文所定義且如本文所述;或(ix)部分不飽和3至6員碳環,其中該環經1至4個Re基團取代,其中各Re如上文所定義且如本文所述;或 (x),其中各Re如上文所定義且如本文所述;或 (xi)具有1至2個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的部分不飽和4至6員雜環,其中該環經1至4個Re基團取代,其中各Re如上文所定義且如本文所述;或 (xii)
其中各R及Re如上文所定義且如本文所述;或(xiii)具有0至2個氮之6員芳族環,其中該環經1至4個Re基團取代,其中各Re基團如上文所定義且如本文所述;或 (xiv)
其中各Re如上文所定義且如本文所述;或(xv)具有1至3個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的5員雜芳基環,其中該環經1至3個Re基團取代,其中各Re基團如上文所定義且如本文所述;或 (xvi)
其中各R及Re如上文所定義且如本文所述;或(xvii)具有0至3個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的8至10員雙環、飽和、部分不飽和或芳基環,其中該環經1至4個Re基團取代,其中Re如上文所定義且如本文所述。
(q)L為二價C2-8直鏈或分支鏈烴鏈,其中L之兩個或三個亞甲基單元視情況且獨立地置換為-NRC(O)-、-C(O)NR-、-N(R)SO2-、-SO2N(R)-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-OC(O)-、-C(O)O-、伸環丙基、-O-、-N(R)-或-C(O)-;且Y為氫或視情況經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C1-6脂族基。
(r)L-Y為活體外或活體內轉化為不可逆彈頭之「前彈頭」。在某 些實施例中,L-Y為,其中LG為離去基。在某些實施例 中,L-Y為。在某些實施例中,「前彈 頭」根據以下轉化為不可逆彈頭:
在某些實施例中,本文任何化學式之Y基團係選自表1、表2、表3、表7或表8中所述者,其中各波形線指示與分子其餘部分之連接點。
在某些實施例中,R1為-L-Y,其中:L為共價鍵或二價C1-8飽和或不飽和直鏈或分支鏈烴鏈,其中L之一個、兩個或三個亞甲基單元視情況且獨立地置換為-N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)SO2-、-O-、-C(O)-或-SO2-;且Y為氫或視情況經側氧基、鹵素、N(R)2、NO2或CN取代之C1-6脂族基。
在某些實施例中,R1基團之Y基團-L-Y係選自下表4中所述者,其中各波形線指示與分子其餘部分之連接點。
其中各Re獨立地為適合離去基、NO2、CN或側氧基。
在某些實施例中,R1為-C(O)CH2CH2C(O)CH=C(CH3)2、- C(O)CH2CH2C(O)CH=CH(環丙基)、-C(O)CH2CH2C(O)CH=CHCH3、-C(O)CH2CH2C(O)CH=CHCH2CH3或-C(O)CH2CH2C(O)C(=CH2)CH3。在某些實施例中,R1為-C(O)CH2NHC(O)CH=CH2、-C(O)CH2NHC(O)CH2CH2C(O)CH=CHCH3或-C(O)CH2NHC(O)CH2CH2C(O)C(=CH2)CH3。在某些實施例中,R1為-S(O)2CH2CH2NHC(O)CH2CH2C(O)CH=C(CH3)2、-S(O)2CH2CH2NHC(O)CH2CH2C(O)CH=CHCH3或-S(O)2CH2CH2NHC(O)CH2CH2C(O)CH=CH2。在某些實施例中,R1為-C(O)(CH2)3NHC(O)CH2CH2C(O)CH=CHCH3或-C(O)(CH2)3NHC(O)CH2CH2C(O)CH=CH2
在某些實施例中,R1為-C≡CH、-C≡CCH2NH(異丙基)、-NHC(O)C≡CCH2CH3、-CH2-C≡C-CH3、-C≡CCH2OH、-CH2C(O)C≡CH、-C(O)C≡CH或-CH2OC(=O)C≡CH。在一些實施例中,R1係選自-NHC(O)CH=CH2、-NHC(O)CH=CHCH2N(CH3)2或-CH2NHC(O)CH=CH2
在某些實施例中,R1係選自下表5中所述者,其中各波形線指示與分子其餘部分之連接點。
其中各Re獨立地為適合離去基、NO2、CN或側氧基。
在某些實施例中,R1係選自
在某些實施例中,R1係選自
在某些實施例中,R1係選自:
在一些實施例中,R1係選自表1、表2、表3、表7或表8中所描繪者。
如上文一般定義,R1為彈頭基團。不希望受任何特定理論約束,咸信該等R1基團(亦即彈頭基團)尤其適於共價結合於某些蛋白激酶之結合域中之關鍵半胱胺酸殘基。在結合域中具有半胱胺酸殘基之蛋白激酶為一般技術者所已知且包括FGFR4或其突變體。圖4提供SEQ ID NO.1,其為FGFR4之胺基酸序列。在某些實施例中,本發明化合物具有彈頭基團,其特徵在於本發明化合物以半胱胺酸552殘基(其在圖4中由方框強調且在下文中為粗體加下劃線)為目標:含有C552之FGFR4子序列:LGVCTQEGPLYVIVE C AAKGNLREFLRARRP
因此,在一些實施例中,R1特徵在於-L-Y部分能夠共價結合於半胱胺酸552殘基,藉此不可逆抑制酶。半胱胺酸殘基為FGFR4或其突變體之Cys552,其中所提供之殘基編號是根據Uniprot P22455
一般技術者將瞭解多種如本文所定義之彈頭基團適於該共價結合。
在某些實施例中,R1特徵在於-L-Y部分能夠共價結合於FGFR4之半胱胺酸殘基,藉此不可逆抑制酶。在一些實施例中,半胱胺酸殘基為Cys 552。
一般技術者將瞭解多種如本文所定義之彈頭基團適於該共價結合。該等R1基團包括(但不限於)本文所述及上文描繪者。
在某些實施例中,本發明提供上文任何表中描繪之任何化合物 或其醫藥學上可接受之鹽。
如本文所述,本發明化合物為FGFR4或其突變體之不可逆抑制劑。
在某些實施例中,本發明提供式A結合物: Cys552-修飾子-抑制部分 A 其中:Cys552為FGFR4之Cys552;修飾子為由彈頭基團與FGFR4激酶之Cys552共價結合而產生之二價基團;該彈頭基團為能夠共價結合於Cys552之官能基;且該抑制部分為在該FGFR4激酶之結合位點結合的部分。
在某些實施例中,結合物A之抑制部分具有式I-i
其中波形線指示經修飾子與結合物A之Cys552的連接點;且其中式I-i 之環A、R2、R3、X1、X2、X3、X4、X5、Y、G、T及q中之每一者如上文針對式I所定義且如本文實施例中定義及描述。
在某些實施例中,結合物A之抑制部分具有式I-a-i
其中波形線指示經修飾子與結合物A之Cys552的連接點;且其中式I-a-i 之環A、R2、R3、R4、R5、R5'、Ra、T及q中之每一者如上文針對式I-a所定義且如本文實施例中定義及描述。
在某些實施例中,結合物A之抑制部分具有式I-b-i
其中波形線指示經修飾子與結合物A之Cys552的連接點;且其中式I-b-i 之環A、R2、R3、R4、T及q中之每一者如上文針對式I-b所定義且如本文實施例中定義及描述。
在某些實施例中,結合物A之抑制部分具有式I-c-i
其中波形線指示經修飾子與結合物A之Cys552的連接點;且其中 式I-c-i 之R2、R3、R4、Ra及q中之每一者如上文針對式I-c所定義且如本文實施例中定義及描述。
在某些實施例中,結合物A之抑制部分具有式I-d-i
其中波形線指示經修飾子與結合物A之Cys552的連接點;且其中式I-d-i 之R2、R3、R4、Ra及q中之每一者如上文針對式I-d所定義且如本文實施例中定義及描述。
在某些實施例中,結合物A之抑制部分具有式I-e-i
其中波形線指示經修飾子與結合物A之Cys552的連接點;且其中式I-e-i 之環A、R2、R3、R5、R5'、Ra及q中之每一者如上文針對式I-e所定義且如本文實施例中定義及描述。
在某些實施例中,結合物A之抑制部分具有式I-f-i
其中波形線指示經修飾子與結合物A之Cys552的連接點;且其中式I-f-i 之環A、R2、R3、R5、R5'、Ra及q中之每一者如上文針對式I-f所定義且如本文實施例中定義及描述。
在某些實施例中,結合物A之抑制部分具有式I-g-i
其中波形線指示經修飾子與結合物A之Cys552的連接點;且其中式I-g-i 之環A、R2、R3、R4、Ra及q中之每一者如上文針對式I-g所定義且如本文實施例中定義及描述。
在某些實施例中,結合物A之抑制部分具有式I-h-i
其中波形線指示經修飾子與結合物A之Cys552的連接點;且其中式I-h-i 之環A、R2、R3、R4、Ra及q中之每一者如上文針對式I-h所定 義且如本文實施例中定義及描述。
在某些實施例中,結合物A之抑制部分具有式I-j-i
其中波形線指示經修飾子與結合物A之Cys552的連接點;且其中式I-j-i 之環A、R2、R4、Ra及q中之每一者如上文針對式I-j所定義且如本文實施例中定義及描述。
在某些實施例中,結合物A之抑制部分具有式I-k-i
其中波形線指示經修飾子與結合物A之Cys552的連接點;且其中式I-k-i 之環A、R2、R3、R4、Ra及q中之每一者如上文針對式I-k所定義且如本文實施例中定義及描述。
在某些實施例中,結合物A之抑制部分具有式I-n-i
其中波形線指示經修飾子與結合物A之Cys552的連接點;且其中 式I-n-i 之環A、R2、R3、R4及q中之每一者如上文針對式I-n所定義且如本文實施例中定義及描述。
在某些實施例中,結合物A之抑制部分具有式I-q-i
其中波形線指示經修飾子與結合物A之Cys552的連接點;且其中式I-q-i 之環A、R2、R3、R4、Ra、T及q中之每一者如上文針對式I-q所定義且如本文實施例中定義及描述。
在某些實施例中,本發明提供下式中任一者之結合物:
其中關於上式之Cys552、修飾子、環A、R2、R3、R4、R5、R5'、Ra、X1、X2、X3、X4、X5、T、Y、G及q中之每一者如針對式II-aI-bI-cI-dI-eI-fI-gI-hI-jI-kI-nI-q之本文實施例中所定義及描述。
在其他實施例中,上文所述結合物中任一者之修飾子部分係選自下表6中所述者。例示性修飾子進一步包括表1、表2、表3、表5、表7或表8中存在之彈頭部分與FGFR4之半胱胺酸552的共價鍵結形成的任何二價基團。應理解,下文之例示性修飾子顯示結合於Cys552之巰基。
表6. 結合於Cys552之例示性修飾子:
4. 用途、調配及投與 醫藥學上可接受之組合物
根據另一實施例,本發明提供一種組合物,其包含本發明之化合物或其醫藥學上可接受之衍生物及醫藥學上可接受之載劑、佐劑或媒劑。本發明組合物中化合物之量可有效以可量測方式抑制生物樣品 或患者中之蛋白激酶(尤其FGFR4)或其突變體。在某些實施例中,本發明組合物中化合物之量可有效以可量測方式抑制生物樣品或患者中之FGFR4或其突變體。在某些實施例中,本發明組合物經調配用於向需要該組合物之患者投與。在一些實施例中,本發明組合物經調配用於向患者經口投與。
如本文所用,術語「患者」意謂動物,較佳為哺乳動物,且最佳為人類。
術語「醫藥學上可接受之載劑、佐劑或媒劑」係指不會破壞所調配化合物之藥理學活性之無毒載劑、佐劑或媒劑。用於本發明組合物之醫藥學上可接受之載劑、佐劑或媒劑包括(但不限於)離子交換劑;氧化鋁;硬脂酸鋁;卵磷脂;血清蛋白,諸如人血清白蛋白;緩衝物質,諸如磷酸鹽;甘胺酸;山梨酸;山梨酸鉀;飽和植物脂肪酸之偏甘油酯混合物;水;鹽或電解質,諸如硫酸魚精蛋白、磷酸氫二鈉、磷酸氫鉀、氯化鈉、鋅鹽;膠狀二氧化矽;三矽酸鎂;聚乙烯吡咯啶酮;基於纖維素之物質;聚乙二醇;羧甲基纖維素鈉;聚丙烯酸酯;蠟;聚乙烯-聚氧丙烯-嵌段聚合物;聚乙二醇及羊毛脂。
「醫藥學上可接受之衍生物」意謂向接受者投與後能夠直接或間接提供本發明化合物或其抑制活性代謝物或殘基的本發明化合物之任何無毒鹽、酯、酯之鹽或其他衍生物。
如本文所用,術語「其抑制活性代謝物或殘基」意謂其代謝物或殘基亦為FGFR4或其突變體之抑制劑。
本發明組合物經口、非經腸、藉由吸入噴霧、局部、直腸、經鼻、經頰、經***或經植入儲集器投與。如本文所用,術語「非腸胃」包括皮下、靜脈內、肌肉內、關節內、滑膜內、胸骨內、鞘內、肝內、病灶內及顱內注射或輸液技術。該等組合物較佳經口、腹膜內或靜脈內投與。本發明組合物之無菌可注射形式包括水性或油性懸浮 液。此等懸浮液根據此項技術中已知之技術使用適合分散劑或濕潤劑及懸浮劑調配。無菌可注射製劑亦為無毒非經腸可接受之稀釋劑或溶劑中之無菌可注射溶液或懸浮液,例如1,3-丁二醇中之溶液。採用之可接受媒劑及溶劑為水、林格氏溶液(Ringer's solution)及等張氯化鈉溶液。此外,無菌不揮發性油習知用作溶劑或懸浮介質。
為此,採用之任何溫和不揮發性油包括合成單甘油酯或二甘油酯。諸如油酸之脂肪酸及其甘油酯衍生物適用於可注射製劑中,如尤其呈聚氧乙基化形式之天然醫藥學上可接受之油(諸如橄欖油或蓖麻油)。此等油溶液或懸浮液亦含有長鏈醇稀釋劑或分散劑,諸如羧甲基纖維素或類似分散劑,其通常用於調配醫藥學上可接受之劑型,包括乳液及懸浮液。其他通常使用之界面活性劑(諸如Tweens、Spans)及其他通常用於製造醫藥學上可接受之固體、液體或其他劑型之乳化劑或生物可用性增強劑亦可用於調配之目的。
本發明之醫藥學上可接受之組合物以任何經口可接受之劑型經口投與。例示性經口劑型為膠囊、錠劑、水性懸浮液或溶液。在經口使用之錠劑的情形中,常用載劑包括乳糖及玉米澱粉。通常亦添加諸如硬脂酸鎂之潤滑劑。對於以膠囊形式經口投與而言,適用之稀釋劑包括乳糖及經乾燥之玉米澱粉。當經口使用需要水性懸浮液時,將活性成分與乳化劑及懸浮劑組合。需要時,視情況亦添加某些甜味劑、調味劑或著色劑。
或者,本發明之醫藥學上可接受之組合物以用於直腸投與之栓劑形式投與。此等可藉由混合藥劑與適合非刺激性賦形劑來製備,該賦形劑在室溫下為固體但在直腸溫度下為液體,且因此將在直腸中熔融釋放藥物。該等材料包括可可脂、蜂蠟及聚乙二醇。
本發明之醫藥學上可接受之組合物亦局部投與,當治療目標包括藉由局部施用容易接近之區域或器官(包括眼睛、皮膚或下腸道之 疾病)時尤其如此。容易製備針對此等區域或器官中每一者的適合局部調配物。
下腸道之局部施用可以直腸栓劑調配物(參看上文)或適合灌腸劑調配物實現。亦使用局部經皮貼片。
對應局部施用,在含有懸浮或溶解於一或多種載劑中之活性組分的適合軟膏中調配所提供之醫藥學上可接受之組合物。用於局部投與此化合物之例示性載劑為礦物油、液體凡士林、白凡士林、丙二醇、聚氧乙烯、聚氧丙烯化合物、乳化蠟及水。或者,所提供醫藥學上可接受之組合物可在含有懸浮或溶解於一或多種醫藥學上可接受之載劑中的活性組分之適合洗劑或乳膏中調配。適合載劑包括(但不限於)礦物油、去水山梨醇單硬脂酸酯、聚山梨醇酯60、鯨蠟酯蠟、十六醇十八醇、2-辛基十二醇、苯甲醇及水。
對於眼用途,所提供醫藥學上可接受之組合物視情況在等張pH值調整無菌生理食鹽水中調配成微粒化懸浮液,或較佳在等張pH值調整無菌生理食鹽水中調配成溶液,其中具有或不具有防腐劑(諸如氯苄烷銨)。或者,對於眼用途,醫藥學上可接受之組合物在諸如凡士林之軟膏中調配。
本發明之醫藥學上可接受之組合物視情況藉由鼻用氣化噴霧劑投與或吸入投與。該等組合物根據醫藥調配領域中熟知之技術製備且在採用苯甲醇或其他適合防腐劑、提高生物可用性之吸收促進劑、氟碳化物及/或其他習知增溶劑或分散劑之生理食鹽水中製備為溶液。
本發明之醫藥學上可接受之組合物最佳調配用於經口投與。該等調配物可與食物一起或不與食物一起投與。在一些實施例中,本發明之醫藥學上可接受之組合物不與食物一起投與。在其他實施例中,本發明之醫藥學上可接受之組合物與食物一起投與。
視情況與載劑材料組合產生單個劑型之組合物的本發明化合物 之量將視待治療主體、特定投與模式而變化。較佳地,所提供組合物應經調配使得可向接受此等組合物之患者投與0.01-100mg/kg體重/天之劑量的抑制劑。
亦應理解,任何特定患者之特定劑量及治療方案將視多種因素而定,包括所用特定化合物之活性、年齡、體重、整體健康狀況、性別、飲食、投與時間、***速率、藥物組合及治療醫師之診斷以及所治療特定疾病之嚴重程度。組合物中本發明化合物之量亦將視組合物中之特定化合物而定。
化合物及醫藥學上可接受之組合物的用途
本文所述化合物及組合物一般適用於抑制一或多種酶之蛋白激酶活性。
耐藥性作為目標療法之重要挑戰顯現。舉例而言,Gleevec®及Iressa®以及正在研發之若干其他激酶抑制劑已報導耐藥性。此外,cKit及PDGFR受體已報導耐藥性。已報導不可逆抑制劑可有效抵抗蛋白激酶之耐藥性形式(Kwak,E.L.,R.Sordella等人,(2005).「Irreversible inhibitors of the EGF receptor may circumvent acquired resistance to gefitinib.」PNAS 102(21):7665-7670。)不希望受任何特定理論約束,本發明化合物為蛋白激酶之耐藥性形式的有效抑制劑。
由本文所述之化合物及組合物抑制且本文所述之方法適用之激酶實例包括FGFR4或其突變體。在一些實施例中,所提供化合物相較於其他FGFR抑制劑選擇性抑制FGFR4。
可活體外、活體內或在細胞株中測試本發明用作FGFR4或其突變體之測試化合物的化合物之活性。活體外分析包括判斷經活化FGFR4或其突變體之磷酸化活性及/或後續功能結果或ATP酶活性之抑制的分析法。替代活體外分析法定量測試化合物結合於FGFR4之能力。可在 結合、分離測試化合物/FGFR4複合物及測定放射性標記結合量之前藉由放射性標記抑制劑量測抑制劑結合。或者,可藉由進行競爭實驗測定測試化合物結合,其中新測試化合物用結合於已知放射性配位體之FGFR4培育。下文實例中闡述用於分析本發明用作FGFR4或其突變體之測試化合物的化合物之詳細條件。
蛋白質酪胺酸激酶為催化磷酸酯基自ATP或GTP轉移至位於蛋白質受質上的酪胺酸殘基之一類酶。受體酪胺酸激酶藉由經由磷酸化事件活化第二訊息效應子自細胞外部向內部傳輸信號。多種細胞過程由此等信號推動,包括增殖、碳水化合物利用、蛋白質合成、血管生成、細胞生長及細胞存活。
(a)FGFR家族
蛋白酪胺酸激酶(PTK)受體之纖維母細胞生長因子(FGF)家族調節生理功能之分集陣列,包括致有絲***、傷口癒合、細胞分化及血管新生,及發育。正常及惡性細胞生長以及增殖皆受FGF(用作自分泌以及旁分泌因子之細胞外信號傳導分子)局部濃度變化影響。自分泌FGF信號傳導在類固醇激素依賴性癌症進展至非激素依賴性狀態中可尤其重要(Powers等人,(2000)Endocr.Relat.Cancer,7,165-197)。
FGF及其受體在若干組織及細胞株中以高程度表現,且咸信過度表現造成惡性表型。
兩個原型成員為酸性纖維母細胞生長因子(aFGF或FGF1)及鹼性纖維母細胞生長因子(bFGF或FGF2),且迄今為止,至少已識別出二十種獨特FGF家族成員。經四種類型之高親和力跨膜蛋白酪胺酸激酶纖維母細胞生長因子受體(FGFR)第1號至第4號(FGFR1至FGFR4)傳輸FGF之細胞反應。在配位體結合後,受體二聚且自體磷酸化或反式磷酸化特異性細胞質酪胺酸殘基以傳輸細胞內信號,該信號最終調控核轉錄因子效應子。
抑制FGFR之化合物將適用於提供尤其藉由預防血管新生防止腫瘤生長或誘發腫瘤中之細胞凋亡的方式。因此預期將證明化合物適用於治療或預防增生性病症,諸如癌症。特定言之,具有受體酪胺酸激酶之活化突變體或受體酪胺酸激酶上調之腫瘤對抑制劑尤其敏感。
多個研究描述在細胞株模型中用抗體拮抗劑靶向FGFR4激酶活性或其配位體FGF 19中之任一者來抑制增殖及誘導細胞凋亡。Ho等人(2009)Journal of Hepatology,50顯示三分之一患者在表現高含量mRNA之FGFR4基因中具有常見多形現象,且此等腫瘤與高分泌量之肝細胞癌標記α-胎蛋白相關。
在某些實施例中,本發明提供一種用於抑制FGFR4或其突變體在患者或生物樣品中之活性之方法,其包含向該患者投與本發明化合物或使該生物樣品與本發明化合物接觸的步驟。
在某些實施例中,FGFR4或其突變體活性被不可逆抑制。在某些實施例中,FGFR4或其突變體活性藉由共價修飾FGFR4之Cys 552不可逆抑制。
在某些實施例中,本發明提供一種治療有需要患者之FGFR4介導之病症的方法,其包含向該患者投與本發明化合物或其醫藥學上可接受之組合物的步驟。
在一些實施例中,本發明提供一種治療有需要患者之肝細胞癌的方法,其包含向該患者投與本發明化合物或其醫藥學上可接受之組合物的步驟。
在一些實施例中,本發明提供一種治療有需要患者之橫紋肌肉瘤、食道癌、乳癌或頭或頸癌的方法,其包含向該患者投與本發明化合物或其醫藥學上可接受之組合物的步驟。
如本文所用,術語「臨床耐藥性」係指由於藥物目標中之突變,藥物目標對藥物治療失去易感性。
如本文所用,術語「耐藥性」係指編碼目標蛋白之野生型核酸序列,及/或目標之蛋白序列中改變、降低或消除抑制劑對目標蛋白之抑制作用的變化。
如本文所用,術語「治療」係指逆轉、減輕、延遲如本文所述之疾病或病症或其一或多種症狀之發作,或抑制其進展。在一些實施例中,在已產生一或多種症狀後投與治療。在其他實施例中,在無症狀存在下投與治療。舉例而言,在症狀發作之前(例如根據症狀史及/或根據遺傳或其他易感因素)向易感個體投與治療。在症狀已解決後亦繼續治療,例如以防止或延遲其復發。
使用有效治療上文提供之病症或減輕該病症嚴重程度的任何量及任何途徑之投與來投與根據本發明方法之化合物及組合物。所需確切量將視以下因素隨個體變化:物種、年齡及個體一般狀況、感染嚴重程度、特定藥劑、其投與模式及其類似因素。本發明化合物較佳調配為容易投與且劑量均勻的單位劑型。如本文所用,表述「單位劑型」係指適於待治療患者之藥劑的物理離散單元。然而,應理解,本發明之化合物及組合物之每日總用量將由主治醫師在正確醫學判斷範疇內來決定。針對任何特定患者或生物體之特定有效劑量將視多種因素而定,包括所治療之病症及該病症之嚴重程度;所用特定化合物之活性;所用特定組合物;患者之年齡、體重、一般健康狀況、性別及飲食;所採用特定化合物之投與時間、投與途徑及***速率;治療持續時間,與所採用特定化合物組合或一致之藥物,及醫學技術中熟知之類似因素。
本發明之醫藥學上可接受之組合物可視所治療感染之嚴重程度而定經口、經直腸、非經腸、腦池內、***內、腹膜內、局部(如藉由粉末、軟膏或滴劑)、經頰、作為經口或經鼻噴霧或其類似物向人類及其他動物投與。在某些實施例中,本發明之化合物可以每天每公 斤個體體重約0.01毫克至約50毫克且較佳每公斤個體體重約1毫克至約25毫克,每天一或多次經口或非經腸投與,以獲得所要治療效應。
用於經口投與之液體劑型包括(但不限於)醫藥學上可接受之乳液、微乳液、溶液、懸浮液、糖漿及酏劑。除活性化合物之外,液體劑型視情況含有通常用於此項技術中之惰性稀釋劑,諸如水或其他溶劑、增溶劑及乳化劑,諸如乙醇、異丙醇、碳酸乙酯、乙酸乙酯、苯甲醇、苯甲酸苯甲酯、丙二醇、1,3-丁二醇、二甲基甲醯胺、油(詳言之棉籽油、花生油、玉米油、胚芽油、橄欖油、蓖麻油及芝麻油)、甘油、四氫糠醇、聚乙二醇及脫水山梨糖醇之脂肪酸酯,及其混合物。除惰性稀釋劑之外,經口組合物亦可包括佐劑,諸如濕潤劑、乳化劑及懸浮劑、甜味劑、調味劑及芳香劑。
根據已知技術使用適合分散劑或濕潤劑及懸浮劑調配可注射製劑,例如無菌可注射水性或油性懸浮液。無菌可注射製劑亦為無毒非經腸可接受之稀釋劑或溶劑中的無菌可注射溶液、懸浮液或乳液,例如1,3-丁二醇中之溶液。在可接受之媒劑及溶劑中,可採用水、林格氏溶液、U.S.P.及等張氯化鈉溶液。此外,無菌不揮發性油習知用作溶劑或懸浮介質。為此,可採用包括合成單甘油酯或二甘油酯之任何溫和不揮發性油。此外,使用諸如油酸之脂肪酸製備可注射製劑。
可對可注射調配物進行滅菌,例如藉由經細菌截留過濾器過濾,或藉由併入呈無菌固體組合物形式之滅菌劑,該等組合物可在使用之前溶解或分散於無菌水或其他無菌可注射介質中。
為了延長本發明化合物之作用,通常需要減緩自皮下或肌肉內注射之化合物的吸收。此藉由使用具有不良水溶性之結晶或非晶形材料之液體懸浮液來實現。化合物之吸收速率則視其溶解速率而定,而溶解速率又可視晶體大小及結晶形式而定。或者,非經腸投與之化合物形式的延遲吸收可藉由將化合物溶解或懸浮於油媒劑中來實現。藉 由在生物可降解之聚合物(諸如聚丙交酯-聚乙交酯)中形成化合物之微膠囊基質來製得可注射之儲槽形式。視化合物與聚合物之比率及所用特定聚合物之性質而定,可控制化合物釋放速率。其他生物可降解之聚合物的實例包括聚(原酸酯)及聚(酸酐)。亦藉由將化合物覆埋於與身體組織相容之脂質體或微乳液中來製備儲槽式可注射調配物。
用於經直腸或經***投與之組合物較佳為栓劑,其可藉由將本發明化合物與在環境溫度下為固體但在體溫下為液體且因此在直腸或***腔中熔融且釋放活性化合物之適合非刺激性賦形劑或載劑(諸如可可脂、聚乙二醇或栓劑蠟)混合來製備。
用於經口投與之固體劑型包括膠囊、錠劑、丸劑、散劑及顆粒。在該等固體劑型中,活性化合物與至少一種諸如檸檬酸鈉或磷酸二鈣之醫藥學上可接受之惰性賦形劑或載劑及/或以下混合:a)填充劑或增量劑,諸如澱粉、乳糖、蔗糖、葡萄糖、甘露糖醇及矽酸;b)黏合劑,諸如羧甲基纖維素、海藻酸鹽、明膠、聚乙烯吡咯啶酮、蔗糖及***膠(acacia);c)保濕劑,諸如甘油;d)崩解劑,諸如瓊脂-瓊脂、碳酸鈣、馬鈴薯或木薯澱粉、海藻酸、某些矽酸鹽及碳酸鈉;e)溶液阻滯劑,諸如石蠟;f)吸收促進劑,諸如四級銨化合物;g)濕潤劑,諸如十六醇及單硬脂酸甘油酯;h)吸附劑,諸如高嶺土及膨潤土;及i)潤滑劑,諸如滑石、硬脂酸鈣、硬脂酸鎂、固體聚乙二醇、月桂基硫酸鈉及其混合物。在膠囊、錠劑及丸劑情形中,劑型亦視情況包含緩衝劑。
亦使用相似類型之固體組合物作為軟填充及硬填充明膠膠囊中之填充劑,該等膠囊使用賦形劑,諸如乳糖以及高分子量聚乙二醇及其類似物。可以包衣劑及結殼劑(諸如腸溶衣及醫藥調配技術中熟知之其他包衣劑)製備錠劑、糖衣藥丸、膠囊、丸劑及顆粒的固體劑型。其視情況含有遮光劑,且亦可為僅在或較佳在腸道某特定部分釋 放或視情況以延遲方式釋放活性成分的組合物。可使用之包埋組合物的實例包括聚合物質及蠟。亦使用相似類型之固體組合物作為軟填充及硬填充明膠膠囊中之填充劑,該等膠囊使用賦形劑,諸如乳糖以及高分子量聚乙二醇及其類似物。
活性化合物亦可與一或多種上述賦形劑一起存在於微膠囊形成中。可以包衣劑及結殼劑(諸如腸溶衣、控制釋放包衣劑及醫藥調配技術中熟知之其他包衣劑)製備錠劑、糖衣藥丸、膠囊、丸劑及顆粒的固體劑型。在該等固體劑型中,活性化合物可與至少一種惰性稀釋劑(諸如蔗糖、乳糖或澱粉)混雜。在通常實踐中,該等劑型亦包含惰性稀釋劑之外的額外物質,例如製錠潤滑劑及其他製錠助劑,諸如硬脂酸鎂及微晶纖維素。在膠囊、錠劑及丸劑情形中,劑型亦視情況包含緩衝劑。其視情況含有遮光劑,且亦可為僅在或較佳在腸道某特定部分釋放或視情況以延遲方式釋放活性成分的組合物。可使用之包埋組合物的實例包括聚合物質及蠟。
用於局部或經皮投與本發明化合物之劑型包括軟膏、糊劑、乳膏、洗液、凝膠、散劑、溶液、噴霧劑、吸入劑或皮膚貼。在無菌條件下,將活性組分與醫藥學上可接受之載體及任何所需防腐劑或緩衝劑按要求混雜。眼用調配物、滴耳劑及滴眼劑亦涵蓋於本發明之範疇內。此外,本發明涵蓋皮膚貼之用途,其具有提供控制本發明化合物至身體之傳遞的額外優勢。可藉由將化合物溶解或分散於適當介質中來製造該等劑型。亦可使用吸收增進劑來增加化合物的透皮量。速率可藉由提供速率控制膜或將化合物分散於聚合物基質或凝膠中來控制。
根據一個實施例,本發明係關於抑制生物樣品中之蛋白激酶活性的方法,其包含使該生物樣品與本發明化合物或包含該化合物之組合物接觸的步驟。
根據另一實施例,本發明係關於一種抑制生物樣品中FGFR4或其突變體活性之方法,其包含使該生物樣品與本發明化合物或包含該化合物之組合物接觸的步驟。在某些實施例中,本發明係關於一種不可逆抑制生物樣品中FGFR4或其突變體活性之方法,其包含使該生物樣品與本發明化合物或包含該化合物之組合物接觸的步驟。
如本文所用,術語「生物樣品」包括(但不限於)細胞培養物或其提取物;由哺乳動物所獲得之活組織檢查材料或其提取物;及血液、唾液、尿、糞便、***、眼淚或其他體液或其提取物。
生物樣品中FGFR4或其突變體活性之抑制適用於熟習此項技術者已知的多種目的。該等目的之實例包括(但不限於)輸血、器官移植、生物標本儲存及生物分析。
本發明之另一實施例係關於一種抑制患者體內蛋白激酶活性之方法,其包含向該患者投與本發明化合物或包含該化合物之組合物的步驟。
根據另一實施例,本發明係關於一種抑制患者體內FGFR4或其突變體活性之方法,其包含向該患者投與本發明化合物或包含該化合物之組合物的步驟。根據某些實施例,本發明係關於一種不可逆抑制患者體內FGFR4或其突變體活性之方法,其包含向該患者投與本發明化合物或包含該化合物之組合物的步驟。在其他實施例中,本發明提供一種治療有需要患者體內由FGFR4或其突變體介導之病症之方法,其包含向該患者投與本發明化合物或其醫藥學上可接受之組合物的步驟。該等病症在本文中詳細描述。
本發明化合物或其醫藥組合物視情況併入至用於塗覆可植入醫學裝置(諸如假體、人工瓣膜、人工血管、支架及導管)的組合物中。已使用例如血管支架克服再狹窄(損傷後血管壁再變窄)。然而,使用支架或其他可植入裝置之患者有凝塊形成或血小板活化之危險。藉由 用包含激酶抑制劑之醫藥學上可接受之組合物預塗該裝置來防止或減輕此等非所要作用。經本發明化合物塗覆之可植入裝置為本發明之另一實施例。
5. 探針化合物
在某些態樣中,本發明化合物繫栓至可偵測部分形成探針化合物。在一個態樣中,本發明之探針化合物包含本文所述之任何化學式的不可逆蛋白激酶抑制劑、可偵測部分及將抑制劑連接於可偵測部分之繫栓部分。
在一些實施例中,該等本發明之探針化合物包含所提供的本文所述之任何化學式之化合物,其藉由二價繫栓部分-T1-繫栓可偵測部分Rt。繫栓部分經環A、環B或R1連接於本發明化合物。一般技術者將瞭解當繫栓部分連接於R1時,R1為表示為R1'之二價彈頭基團。在某些實施例中,所提供之探針化合物係選自式I-t中之任一者:
其中環A、R1、R2、R3、X1、X2、X3、X4、X5、G、Y、T及q中之每一者如上文所定義且描述於此處之類別及子類中,R2'為二價R2;T1為二價繫栓部分;且Rt為可偵測部分。
在一些實施例中,Rt為選自一級標記或二級標記之可偵測部分。在某些實施例中,Rt為選自以下之可偵測部分:螢光標記(例如螢光染料或螢光團)、質量標籤、化學發光基團、發色團、電子緻密基團 或能量轉移劑。在一些實施例中,Rt為生物素、生物素亞碸、放射性同位素或螢光標記。
如本文所用,術語「可偵測部分」與術語「標記」及「報導體」可互換使用且係關於任何能夠被偵測之部分,例如一級標記及二級標記。可使用定量(絕對、近似或相對條件)所研究系統中之可偵測部分之方法量測可偵測部分之存在。在一些實施例中,該等方法為一般技術者所熟知且包括定量報導體部分(例如標記、染料、光交聯反應劑、細胞毒性化合物、藥物、親和力標記、光親和力標記、反應性化合物、抗體或抗體片段、生物材料、奈米粒子、自旋標記、螢光團、含有金屬之部分、放射性部分、量子點、新穎官能基、與其他分子共價或非共價相互作用之基團、光籠形部分、光化輻射激發部分、配位體、光異構化部分、生物素、生物素類似物(例如生物素亞碸)、併入重原子之部分、可化學裂解基團、可光裂解基團、氧化還原活性劑、同位素標記部分、生物物理探針、磷光基團、化學發光基團、電子緻密基團、磁性基團、嵌入基團、發色團、能量轉移劑、生物活性劑、可偵測標記及上述之任何組合)之任何方法。
諸如放射性同位素(例如氚、32P、33P、35S、14C、123I、124I、125I或131I)之一級標記、質量標籤為穩定同位素(例如13C、2H、17O、18O、15N、19F及127I)、正電子發射同位素(例如11C、18F、13N、124I及15O)及螢光標記,其為無需進一步修飾即可偵測到的產生信號之報導體基團。可偵測部分可藉由方法加以分析。例示性方法為螢光、正電子發射斷層攝影法、SPECT醫學成像、化學發光、電子自旋共振、紫外光/可見光吸收譜、質譜、核磁共振、磁共振、流動式細胞測量術、自放射攝影術、閃爍計數、磷光成像及電化學方法。
如本文所用,術語「二級標記」係指諸如生物素之部分及多種蛋白質抗原,其需要存在可產生偵測到信號之第二中間物。對於生物 素而言,二級中間物包括抗生蛋白鏈菌素-酶結合物。對於抗原標記而言,二級中間物包括抗體-酶結合物。一些螢光基團可用作二級標記,因為其在非輻射螢光共振能量轉移(FRET)過程中會向另一基團轉移能量,且第二基團會產生所偵測之信號。
如本文所用,術語「螢光標記」、「螢光染料」及「螢光團」係指吸收既定激發波長之光能且發射不同波長之光能的部分。螢光標記之實例包括(但不限於):Alexa Fluor染料(Alexa Fluor 350、Alexa Fluor 488、Alexa Fluor 532、Alexa Fluor 546、Alexa Fluor 568、Alexa Fluor 594、Alexa Fluor 633、Alexa Fluor 660及Alexa Fluor 680)、AMCA、AMCA-S、BODIPY染料(BODIPY FL、BODIPY R6G、BODIPY TMR、BODIPY TR、BODIPY 493/503、BODIPY 530/550、BODIPY 558/568、BODIPY 564/570、BODIPY 576/589、BODIPY 581/591、BODIPY 630/650、BODIPY 650/665)、羧基若丹明6G(Carboxyrhodamine 6G)、羧基-X-若丹明(ROX)、Cascade Blue、Cascade Yellow、Coumarin 343、Cyanine染料(Cy3、Cy5、Cy3.5、Cy5.5)、Dansyl、Dapoxyl、二烷基胺基香豆素、4',5'-二氯-2',7'-二甲氧基-螢光素、DM-NERF、曙紅(Eosin)、紅螢素(Erythrosin)、螢光素、FAM、羥基香豆素、IRDyes(IRD40、IRD 700、IRD 800)、JOE、麗絲胺若丹明B(Lissamine rhodamine B)、海藍(Marina Blue)、甲氧基香豆素、萘并螢光素、Oregon綠488、Oregon綠500、Oregon綠514、海水藍(Pacific Blue)、PyMPO、芘、若丹明B、若丹明6G、若丹明綠、若丹明紅、Rhodol綠、2',4',5',7'-四-溴碸-螢光素、四甲基-若丹明(TMR)、羧基四甲基若丹明(TAMRA)、Texas紅、Texas紅-X、5(6)-羧基螢光素、2,7-二氯螢光素、N,N-雙(2,4,6-三甲基苯基)-3,4:9,10-苝雙(二甲醯胺、HPTS、乙基曙紅、DY-490XL MegaStokes、DY-485XL MegaStokes、Adirondack綠520、ATTO 465、ATTO 488、 ATTO 495、YOYO-1,5-FAM、BCECF、二氯螢光素、若丹明110、若丹明123、YO-PRO-1、SYTOX綠、鈉綠(Sodium Green)、SYBR綠I、Alexa Fluor 500、FITC、Fluo-3、Fluo-4、氟-祖母綠、YoYo-1 ssDNA、YoYo-1 dsDNA、YoYo-1、SYTO RNASelect、福沙綠-FP(Diversa Green-FP)、深綠(Dragon Green)、EvaGreen、Surf綠EX、光譜綠(Spectrum Green)、NeuroTrace 500525、NBD-X、MitoTracker綠FM、LysoTracker綠DND-26、CBQCA、PA-GFP(活化後)、WEGFP(活化後)、FlASH-CCXXCC、單體阿茲米綠(Azami Green monomeric)、阿茲米綠、綠螢光素蛋白(GFP)、EGFP(Campbell Tsien 2003)、EGFP(Patterson 2001)、Kaede綠、7-苯甲基胺基-4-硝基苯-2-氧雜-1,3-二唑、Bexl、小紅莓、盧米奧綠(Lumio Green)及SuperGlo GFP。
如本文所用,術語「質量標籤」係指能夠使用質譜(MS)偵測技術藉助於質量唯一偵測之任何部分。質量標籤之實例包括電泳釋放標籤,諸如N-[3-[4'-[(對甲氧基四氟苯甲基)氧基]苯基]-3-甲基丙三醇基]異哌啶甲酸、4'-[2,3,5,6-四氟-4-(五氟苯氧基)]甲基苯乙酮及其衍生物。此等質量標籤之合成及效用描述於美國專利4,650,750、4,709,016、5,360,8191、5,516,931、5,602,273、5,604,104、5,610,020及5,650,270中。質量標籤之其他實例包括(但不限於)核苷酸、雙脫氧核苷酸、不同長度及鹼基組成之寡核苷酸、寡肽、寡醣及不同長度及單體組成之其他合成聚合物。適當質量範圍(100-2000道爾頓(Dalton))之多種有機分子(中性及帶電)(生物分子或合成化合物)亦用作質量標籤。適合同位素(例如13C、2H、17O、18O及15N)亦用作質量標籤。
如本文所用,術語「化學發光基團」係指由於未添加熱量之化學反應發光的基團。舉例而言,魯米諾(uminol)(5-胺基-2,3-二氫-1,4-酞嗪二酮)與如過氧化氫(H2O2)之氧化物在鹼及金屬催化劑存在下反 應產生激發態產物(3-胺基鄰苯二甲酸酯,3-APA)。
如本文所用,術語「化學發光基團」係指吸收可見波長、UV波長或IR波長之光的分子。
如本文所用,術語「染料」係指含有發色團之可溶性著色物質。
如本文所用,術語「電子緻密基團」係指當用電子束照射時散射電子之基團。該等基團包括(但不限於)鉬酸銨、次硝酸鉍、碘化鎘、碳醯肼、六水合氯化鐵、六亞甲基四胺、無水三氯化銦、硝酸鑭、三水合乙酸鉛、三水合檸檬酸鉛、硝酸鉛、高碘酸、磷鉬酸、磷鎢酸、鐵氰化鉀、亞鐵氰化鉀、釕紅、硝酸銀、「強」蛋白銀(Ag分析:8.0-8.5%)、四苯基卟啉銀(S-TPPS)、氯金酸鹽鈉、鎢酸鈉、硝酸鉈、胺基硫脲(TSC)、乙酸鈾醯、硝酸鈾醯及硫酸氧釩。
如本文所用,術語「能量轉移劑」係指貢獻能量或自另一分子接受能量之分子。僅舉例而言,螢光共振能量轉移(FRET)為螢光供體分子之激發態能量藉以非輻射性轉移至未激發受體分子,未激發受體分子接著以較長波長螢光發射所貢獻能量的偶極子-偶極子偶合過程。
如本文所用,術語「併有重原子之部分」係指併有一般比碳重之原子的離子之基團。在一些實施例中,該等離子或原子包括(但不限於)矽、鎢、金、鉛及鈾。
如本文所用,術語「光親和力標記」係指具有暴露於光時與標記具有親和力之分子形成鍵聯之基團的標記。
如本文所用,術語「光籠形部分」係指在特定波長下照射時共價或非共價結合其他離子或分子之基團。
如本文所用,術語「光異構化部分」係指用光照射時從一種異構形式變為另一種異構形式之基團。
如本文所用,術語「放射性部分」係指核自發發出核輻射,諸如α、β或γ粒子之基團;其中α粒子為氦核,β粒子為電子且γ粒子為高能光子。
如本文所用,術語「自旋標記」係指含有展現未成對電子自旋(亦即穩定順磁性基團)之原子或原子基團之分子,該未成對電子自旋在一些實施例中由電子自旋共振光譜偵測且在其他實施例中連接於另一分子。該等自旋標記分子包括(但不限於)硝醯基及氮氧化物,且在一些實施例中為單自旋標記或雙自旋標記。
如本文所用,術語「量子點」係指在一些實施例中在近紅外中偵測且具有極高量子產率(亦即在適度照明時極亮)的膠狀半導體奈米晶體。
一般技術者將瞭解可偵測部分經適合取代基連接於所提供化合物。如本文所用,術語「適合取代基」係指能夠共價連接於可偵測部分之部分。該等部分為一般技術者所熟知且包括含有例如(略舉數例)羧酸酯部分、胺基部分、硫醇部分或羥基部分之基團。應瞭解,該等部分直接或經繫栓部分(諸如二價飽和或不飽和烴鏈)連接於所提供化合物。
在一些實施例中,可偵測部分經點擊化學連接於所提供化合物。在一些實施例中,該等部分經疊氮化物與炔烴視情況在銅催化劑存在下1,3-環加成連接.使用點擊化學之方法為此項技術中已知且包括Rostovtsev等人,Angew.Chem.Int.Ed.2002,41,2596-99及Sun等人,Bioconjugate Chem.,2006,17,52-57所述者。在一些實施例中,提供點擊準備抑制劑部分且與點擊準備-T-Rt部分反應。如本文所用,「點擊準備」係指部分含有用於點擊化學反應之疊氮化物或炔烴。在一些實施例中,點擊準備抑制劑部分包含疊氮化物。在某些實施例中,點擊準備-T-Rt部分包含用於無銅點擊化學反應之應變環辛炔(例如使用 Baskin等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 2007,104,16793-16797中所述之方法)。
在一些實施例中,可偵測部分Rt係選自標記、染料、光交聯反應劑、細胞毒性化合物、藥物、親和力標記、光親和力標記、反應性化合物、抗體或抗體片段、生物材料、奈米粒子、自旋標記、螢光團、含有金屬之部分、放射性部分、量子點、新穎官能基、與其他分子共價或非共價相互作用之基團、光籠形部分、光化輻射激發部分、配位體、光異構化部分、生物素、生物素類似物(例如生物素亞碸)、併入重原子之部分、可化學裂解基團、可光裂解基團、氧化還原活性劑、同位素標記部分、生物物理探針、磷光基團、化學發光基團、電子緻密基團、磁性基團、嵌入基團、發色團、能量轉移劑、生物活性劑、可偵測標記或其組合。
在一些實施例中,Rt為生物素或其類似物。在某些實施例中,Rt為生物素。在某些其他實施例中,Rt為生物素碸。
在另一實施例中,Rt為螢光團。在另一實施例中,螢光團係選自Alexa Fluor染料(Alexa Fluor 350、Alexa Fluor 488、Alexa Fluor 532、Alexa Fluor 546、Alexa Fluor 568、Alexa Fluor 594、Alexa Fluor 633、Alexa Fluor 660及Alexa Fluor 680)、AMCA、AMCA-S、BODIPY染料(BODIPY FL、BODIPY R6G、BODIPY TMR、BODIPY TR、BODIPY 493/503、BODIPY 530/550、BODIPY 558/568、BODIPY 564/570、BODIPY 576/589、BODIPY 581/591、BODIPY 630/650、BODIPY 650/665)、羧基若丹明6G、羧基-X-若丹明(ROX)、Cascade Blue、Cascade Yellow、Coumarin 343、Cyanine染料(Cy3、Cy5、Cy3.5、Cy5.5)、Dansyl、Dapoxyl、二烷基胺基香豆素、4',5'-二氯-2',7'-二甲氧基-螢光素、DM-NERF、曙紅、紅螢素、螢光素、FAM、羥基香豆素、IRDyes(IRD40、IRD 700、IRD 800)、 JOE、麗絲胺若丹明B、海藍、甲氧基香豆素、萘并螢光素、Oregon綠488、Oregon綠500、Oregon綠514、海水藍、PyMPO、芘、若丹明B、若丹明6G、若丹明綠、若丹明紅、Rhodol綠、2',4',5',7'-四-溴碸-螢光素、四甲基-若丹明(TMR)、羧基四甲基若丹明(TAMRA)、Texas紅、Texas紅-X、5(6)-羧基螢光素、2,7-二氯螢光素、N,N-雙(2,4,6-三甲基苯基)-3,4:9,10-苝雙(二甲醯胺、HPTS、乙基曙紅、DY-490XL MegaStokes、DY-485XL MegaStokes、Adirondack綠520、ATTO 465、ATTO 488、ATTO 495、YOYO-1,5-FAM、BCECF、二氯螢光素、若丹明110、若丹明123、YO-PRO-1、SYTOX綠、鈉綠、SYBR綠I、Alexa Fluor 500、FITC、Fluo-3、Fluo-4、氟-祖母綠、YoYo-1 ssDNA、YoYo-1 dsDNA、YoYo-1、SYTO RNASelect、福沙綠-FP、深綠、EvaGreen、Surf綠EX、光譜綠、NeuroTrace 500525、NBD-X、MitoTracker綠FM、LysoTracker綠DND-26、CBQCA、PA-GFP(活化後)、WEGFP(活化後)、FlASH-CCXXCC、單體阿茲米綠、阿茲米綠、綠螢光素蛋白(GFP)、EGFP(Campbell Tsien 2003)、EGFP(Patterson 2001)、Kaede綠、7-苯甲基胺基-4-硝基苯-2-氧雜-1,3-二唑、Bexl、小紅莓、盧米奧綠或SuperGlo GFP。
如上文一般描述,所提供探針化合物包含繫栓部分-T-,其將不可逆抑制劑連接於可偵測部分。如本文所用,術語「繫栓」或「繫栓部分」係指任何二價化學間隔基團。例示性繫栓為共價鍵、聚合物、水溶性聚合物、視情況經取代之烷基、視情況經取代之雜烷基、視情況經取代之雜環烷基、視情況經取代之環烷基、視情況經取代之雜環基、視情況經取代之雜環烷基烷基、視情況經取代之雜環烷基烯基、視情況經取代之芳基、視情況經取代之雜芳基、視情況經取代之雜環烷基烯基烷基、視情況經取代之醯胺部分、醚部分、酮部分、酯部分、視情況經取代之胺基甲酸酯部分、視情況經取代之腙部分、視情 況經取代之肼部分、視情況經取代之肟部分、二硫化物部分、視情況經取代之亞胺部分、視情況經取代之磺醯胺部分、碸部分、亞碸部分、硫醚部分或其任何組合。
在一些實施例中,繫栓部分-T1-係選自共價鍵、聚合物、水溶性聚合物、視情況經取代之烷基、視情況經取代之雜烷基、視情況經取代之雜環烷基、視情況經取代之環烷基、視情況經取代之雜環烷基烷基、視情況經取代之雜環烷基烯基、視情況經取代之芳基、視情況經取代之雜芳基及視情況經取代之雜環烷基烯基烷基。在一些實施例中,繫栓部分為視情況經取代之雜環。在一些實施例中,雜環係選自氮丙啶、環氧乙烷、環氧硫化物、氮雜環丁烷、氧雜環丁烷、吡咯啉、四氫呋喃、四氫噻吩、吡咯啶、吡唑、吡咯、咪唑、***、四唑、噁唑、異噁唑、環氧乙烯、噻唑、異噻唑、二硫雜環戊烷、呋喃、噻吩、哌啶、四氫哌喃、硫化環戊烷、吡啶、哌喃、噻喃酮、噠嗪、嘧啶、吡嗪、哌嗪、噁嗪、噻嗪、二噻烷及二噁烷。在一些實施例中,雜環為哌嗪。在其他實施例中,繫栓部分視情況經鹵素、-CN、-OH、-NO2、烷基、S(O)及S(O)2取代。在其他實施例中,水溶性聚合物為PEG基團。
在其他實施例中,繫栓部分在可偵測部分與蛋白激酶抑制部分之間提供充分空間分離。在其他實施例中,繫栓部分穩定。在另一實施例中,繫栓部分不會實質影響可偵測部分之反應。在其他實施例中,繫栓部分向探針化合物提供化學穩定性。在其他實施例中,繫栓部分向探針化合物提供足夠可溶性。
在一些實施例中,繫栓部分-T1-(諸如水溶性聚合物)的一端偶合於所提供之不可逆抑制劑且另一端偶合於可偵測部分Rt。在其他實施例中,水溶性聚合物經所提供不可逆抑制劑之官能基或取代基偶合。在其他實施例中,水溶性聚合物經報導體部分之官能基或取代基偶 合。
在一些實施例中,用於繫栓部分-T1-中之親水性聚合物之實例包括(但不限於):聚烷基醚及其烷氧基封端之類似物(例如聚氧乙二醇、聚氧乙二醇/丙二醇及其甲氧基或乙氧基封端之類似物、聚氧乙二醇,聚氧乙二醇亦稱為聚乙二醇或PEG);聚乙烯吡咯啶酮;聚乙烯烷基醚;聚噁唑啉、聚烷基噁唑啉及聚羥基烷基噁唑啉;聚丙烯醯胺、聚烷基丙烯醯胺及聚羥基烷基丙烯醯胺(例如聚羥基丙基甲基丙烯醯胺及其衍生物);聚丙烯酸羥基烷基酯;聚唾液酸及其類似物、親水性肽序列;多醣及其衍生物,包括葡聚糖及葡聚糖衍生物,例如羧甲基葡聚糖、硫酸葡聚糖、胺基葡聚糖;纖維素及其衍生物,例如羧甲基纖維素、羥基烷基纖維素;幾丁質及其衍生物,例如聚葡萄胺糖、丁二醯基聚葡萄胺糖、羧甲基幾丁質、羧甲基聚葡萄胺糖;玻尿酸及其衍生物;澱粉;海藻酸鹽;硫酸軟骨素;白蛋白;普魯蘭及羧甲基普魯蘭;聚胺基酸及其衍生物,例如聚麩胺酸、聚離胺酸、聚天冬胺酸、聚天冬醯胺;順丁烯二酸酐共聚物,諸如:苯乙烯順丁烯二酸酐共聚物、二乙烯基乙基醚順丁烯二酸酐共聚物;聚乙烯醇;其共聚物、其三元共聚物,其混合物,及前述之衍生物。在其他實施例中,水溶性聚合物為任何結構形式。例示性形式為線性、分叉或分支鏈。在其他實施例中,多官能聚合物衍生物包括(但不限於)具有兩個末端之線性聚合物,各末端鍵結於相同或不同之官能基。
在一些實施例中,水聚合物包含聚(乙二醇)部分。在其他實施例中,聚合物之分子量具有廣泛範圍。例示性範圍為約100Da至約100,000Da或100,000Da以上。在其他實施例中,聚合物之分子量為約100Da至約100,000Da、約100,000Da、約95,000Da、約90,000Da、約85,000Da、約80,000Da、約75,000Da、約70,000Da、約65,000Da、約60,000Da、約55,000Da、約50,000Da、約45,000Da、 約40,000Da、約35,000Da、30,000Da、約25,000Da、約20,000Da、約15,000Da、約10,000Da、約9,000Da、約8,000Da、約7,000Da、約6,000Da、約5,000Da、約4,000Da、約3,000Da、約2,000Da、約1,000Da、約900Da、約800Da、約700Da、約600Da、約500Da、約400Da、約300Da、約200Da及約100Da。在一些實施例中,聚合物之分子量為約100Da至50,000Da。在一些實施例中,聚合物之分子量為約100Da至40,000Da。在一些實施例中,聚合物之分子量為約1,000Da至40,000Da。在一些實施例中,聚合物之分子量為約5,000Da至40,000Da。在一些實施例中,聚合物之分子量為約10,000Da至40,000Da。在一些實施例中,聚(乙二醇)分子為分支鏈聚合物。在其他實施例中,分支鏈PEG之分子量為約1,000Da至約100,000Da。例示性範圍為約100,000Da、約95,000Da、約90,000Da、約85,000Da、約80,000Da、約75,000Da、約70,000Da、約65,000Da、約60,000Da、約55,000Da、約50,000Da、約45,000Da、約40,000Da、約35,000Da、約30,000Da、約25,000Da、約20,000Da、約15,000Da、約10,000Da、約9,000Da、約8,000Da、約7,000Da、約6,000Da、約5,000Da、約4,000Da、約3,000Da、約2,000Da及約1,000Da。在一些實施例中,分支鏈PEG之分子量為約1,000Da至約50,000Da。在一些實施例中,分支鏈PEG之分子量為約1,000Da至約40,000Da。在一些實施例中,分支鏈PEG之分子量為約5,000Da至約40,000Da。在一些實施例中,分支鏈PEG之分子量為約5,000Da至約20,000Da。實質上水溶性主鏈之上述清單絕非詳盡的且僅為說明性的,且在一些實施例中,具有上文所述品質之聚合材料適用於本文所述之方法及組合物中。
一般技術者應瞭解,當-T1-Rt經R2基團連接於本文化學式之化合物時,則所得繫栓部分包含R2基團。
在某些實施例中,繫栓部分-T1-具有以下結構中之一者:
在一些實施例中,繫栓部分-T1-具有以下結構:
在一些實施例中,繫栓部分-T1-具有以下結構:
在其他實施例中,繫栓部分-T1-具有以下結構:
在某些其他實施例中,繫栓部分-T1-具有以下結構:
在其他實施例中,繫栓部分-T1-具有以下結構:
在一些實施例中,繫栓部分-T1-具有以下結構:
在一些實施例中,-T1-Rt具有以下結構:
在一些實施例中,-T1-Rt具有以下結構:
在其他實施例中,-T1-Rt具有以下結構:
在某些實施例中,-T1-Rt具有以下結構:
在一些實施例中,式I-t之探針化合物衍生自本文所述之任何化合物。
在某些實施例中,探針化合物具有以下結構中之一者:
應瞭解,許多-T1-Rt試劑市場有售。舉例而言,眾多生物素標記試劑獲自例如Thermo Scientific,具有不同繫栓長度。該等試劑包括NHS-PEG4-生物素及NHS-PEG12-生物素。
在一些實施例中,與上文例示者類似之探針結構使用如本文所述之點擊準備抑制部分及點擊準備-T1-Rt部分製備。
在一些實施例中,所提供探針化合物共價修飾蛋白激酶之磷酸化構形。在一個態樣中,蛋白激酶之磷酸化構形為蛋白激酶之活性或非活性形式。在某些實施例中,蛋白激酶之磷酸化構形為該激酶之活性形式。在某些實施例中,探針化合物可滲透細胞。
在一些實施例中,本發明提供一種判斷患者體內所提供不可逆抑制劑(亦即本文呈現之任何化學式之化合物)對蛋白激酶之佔有率之方法,其包含提供自投與至少一種劑量之該不可逆抑制劑之化合物的患者獲得的一或多種組織、細胞類型或其溶解產物,使該組織、細胞 類型或其溶解產物與探針化合物(亦即式I-t之化合物)接觸以共價修飾該溶解產物中存在的至少一種蛋白激酶,且量測由探針化合物共價修飾之該蛋白激酶之量以判斷相較於該探針化合物對該蛋白激酶之佔有率,該化合物對該蛋白激酶之佔有率。在某些實施例中,該方法進一步包含調整本文呈現之化學式之化合物的劑量以提高蛋白激酶之佔有率的步驟。在某些其他實施例中,該方法進一步包含調整本文呈現之化學式之化合物的劑量以降低蛋白激酶之佔有率的步驟。
如本文所用,術語「佔有率」或「佔有」係指蛋白激酶被所提供共價抑制劑化合物修飾的程度。一般技術者應瞭解,需要投與可能達到蛋白激酶之所要有效佔有率的最低劑量。
在一些實施例中,待修飾之蛋白激酶為FGFR4。
在一些實施例中,探針化合物包含正測定佔有率之不可逆抑制劑。
在一些實施例中,本發明提供一種評定所提供不可逆抑制劑於哺乳動物體內之功效的方法,其包含向該哺乳動物投與所提供之不可逆抑制劑,向自該哺乳動物分離之組織或細胞或其溶解產物投與所提供之探針化合物,量測探針化合物之可偵測部分之活性,且比較該可偵測部分之活性與標準物之活性。
在其他實施例中,本發明提供一種評定所提供不可逆抑制劑於哺乳動物中之藥物動力學之方法,其包含向該哺乳動物投與所提供之不可逆抑制劑,向自該哺乳動物分離之一或多種細胞類型或其溶解產物投與本文呈現之探針化合物,及在投與抑制劑之後在不同時間點量測探針化合物之可偵測部分的活性。
在其他實施例中,本發明提供一種活體外標記蛋白激酶之方法,其包含使該蛋白激酶與本文所述之探針化合物接觸。在一個實施例中,接觸步驟包含用本文呈現之探針化合物培育蛋白激酶。
在某些實施例中,本發明提供一種活體外標記蛋白激酶之方法,其包含使表現蛋白激酶之一或多種細胞或組織或其溶解產物與本文所述之探針化合物接觸。
在某些其他實施例中,本發明提供一種偵測經標記蛋白激酶之方法,其包含藉由電泳法分離蛋白質(該等蛋白質包含由本文所述之探針化合物標記的蛋白激酶)及藉由螢光偵測探針化合物。
在一些實施例中,本發明提供一種活體外評定所提供不可逆抑制劑之藥物動力學之方法,其包含用目標蛋白激酶培育所提供之不可逆抑制劑,向目標蛋白激酶添加本文呈現之探針化合物,且測定探針化合物修飾之目標的量。
在某些實施例中,探針化合物藉由結合於抗生物素蛋白、抗生蛋白鏈菌素、親和素或卡普他維汀(captavidin)偵測。
在一些實施例中,探針藉由西方墨點法(Western blot)偵測。在其他實施例中,探針藉由ELISA偵測。在某些實施例中,探針藉由流動式細胞測量術偵測。
在其他實施例中,本發明提供一種用不可逆抑制劑探測激酶組之方法,其包含用生物素標記探針化合物培育一或多種細胞類型或其溶解產物產生用生物素部分修飾之蛋白質,消化蛋白質,用抗生物素蛋白或其類似物捕捉,且執行多個二維LC-MS-MS識別藉由探針化合物修飾之蛋白激酶及該等激酶之內收位點。
在某些實施例中,本發明提供一種量測細胞中蛋白質合成之方法,其包含用目標蛋白之不可逆抑制劑培育細胞,在特殊時間點形成細胞溶解產物,且用本發明探針化合物培育該等細胞溶解產物量測游離蛋白質很長一段時間的外觀。
在其他實施例中,本發明提供一種測定使哺乳動物體內目標蛋白激酶佔有率最大的給藥時程之方法,其包含分析一或多種自哺乳動 物分離且來自投與所提供具有本文呈現之化學式中任一者的不可逆抑制劑之哺乳動物的細胞類型或其溶解產物(源自例如脾細胞、周邊B細胞、全血、淋巴結、腸組織或其他組織),其中該分析步驟包含使該一或多種組織、細胞類型或其溶解產物與所提供探針化合物接觸且量測藉由探針化合物共價修飾之蛋白激酶之量。
範例
如下文實例中描繪,在某些例示性實施例中,根據以下一般程序製備化合物。應瞭解,儘管一般方法描繪本發明某些化合物之合成,但以下一般方法及一般技術者已知之其他方法可應用於如本文所述之所有化合物及此等化合物中每一者之子類及種類。
下文實例中所用之化合物編號對應於上文所述之化合物編號。
在下文說明性實例中,除非另外說明,否則在室溫或環境溫度下,在18至25℃範圍內進行反應。經無水硫酸鎂或硫酸鈉乾燥有機溶液且使用旋轉式汽化器在減壓下蒸發溶劑。一般而言,反應過程繼之以TLC或LCMS且反應時間為代表性的。產量僅針對說明給出且不必為勤勞過程開發可獲得者。1HNMR資料為相對於四甲矽烷(TMS)或殘餘溶劑以百萬分率(ppm)給出的主要診斷質子之δ值。在400MHz下測定1HNMR譜。根據體積:體積(v/v)給出溶劑比。質譜(MS)資料在LCMS系統上產生,其中HPLC組件一般包含Agilent或Shimadzu LCMS-2020儀器,且在Sepax BR-C18(4.6×50mm,3μm)管柱或類似物上操作,其以酸性溶離劑(例如使用0-95%水/具有0.1%甲酸或三氟乙酸之乙腈的梯度)溶離。層析在正、負及/或UV之電噴霧(ESI)中進行。全文提供LCMS值(m/z)且一般僅報導指示母核質量之離子。除非另外指出,否則引用之值為針對正離子模式之(M+H)+或(M+1)+。製備型HPLC在使用漸減極性混合物(例如水與含有1%三氟乙酸之乙腈的漸減極性混合物)作為溶離劑之C18逆相二氧化矽上進行。對映異構 增濃中間物及最終化合物藉由『abs』命名且外消旋類似物藉由『rac』命名。對映異構增濃產物及中間物藉由使用CHIRALPAK AD-H(6×150mm,5μm)管柱或類似物之對掌性HPLC表徵且一般具有95:5之對映異構比。除非另外規定,否則起始物質市場有售或根據已知方法合成。
TFA;三氟乙酸
THF;四氫呋喃; DMF;N,N-二甲基甲醯胺
EtOAc;乙酸乙酯
DCM;二氯甲烷
DMSO;二甲亞碸
DIPEA;N,N-二異丙基乙胺
TBAF;氟化四-正丁基銨
DMAP;4-二甲基胺基吡啶
NMO;N-甲基嗎啉N-氧化物
TBDPSCl:第三丁基(氯)二苯基矽烷
NMP;N-甲基-2-吡咯啶酮
Ms;甲磺醯基,甲烷磺醯基
SFC;超臨界流體層析法
er;對映異構比
h:小時
min:分鐘
aq:水溶液
sat:飽和
PBS;磷酸鹽緩衝鹽水
DTT;二硫蘇糖醇
ATP;三磷酸腺苷
實例1:合成共用中間物6
步驟1:中間物1
向裝備有機械攪拌器之1L三頸燒瓶裝入尿嘧啶(45.0g,401mmol)及三聚甲醛(14.5g,483mmol)。以一份添加氫氧化鉀溶液(0.5M,600mL,0.30mol)。在55℃下攪拌所得混合物隔夜。在冰水浴中冷卻混合物且用12N HCl將pH值調整至6。藉由過濾收集所得沈澱物且乾燥獲得呈白色固體狀之標題化合物(46.0g),其未經進一步純化即用於下一步驟中。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ 4.12(d,2H),4.78(t,1H),7.24(s,1H),10.64(s,1H),10.98(s,1H)。
步驟2:中間物2
向裝備有機械攪拌器之500mL三頸燒瓶裝入中間物1(25.0g, 176mmol)、甲苯(30mL)及***(125mL)。經10分鐘逐滴添加DIPEA(130mL)。在回流下加熱所得混合物隔夜。濃縮溶液且將所得殘餘物緩慢倒入冷(0℃)1.5M HCl上且用EtOAc萃取。有機相用水、NaHCO3飽和水溶液、鹽水洗滌,經無水Na2SO4乾燥且濃縮獲得標題化合物(32.0g),其未經進一步純化即用於下一步驟中。1H NMR(400MHz,CDCl3):δ 4.64(s,2H),8.66(s,1H)。
步驟3:中間物3
向裝備有機械攪拌器之500mL三頸燒瓶裝入中間物2(32.0g,111mmol)、丙酮(150mL)、NaI(26.5g,177mmol)。在環境溫度下攪拌混合物15分鐘,接著在回流下加熱30分鐘。將混合物冷卻至環境溫度且過濾移除所得固體。濃縮濾液獲得46.0g標題化合物,其未經進一步純化即用於下一步驟中。1H NMR(400MHz,CDCl3):δ 4.39(s,2H),8.60(s,1H)。
步驟4:中間物4
在環境溫度下攪拌中間物3(15.0g,47.9mmol)、3,5-二甲氧基苯胺(8.80g,57.4mmol)及K2CO3(14.4g,104mmol)於丙酮(150mL)中之混合物隔夜。在冰水浴中冷卻溶液且過濾移除所得固體。濃縮濾液且用EtOH(100mL)濕磨殘餘物,接著在0℃下攪拌30分鐘。藉由過濾收集沈澱物且乾燥獲得9.40g標題化合物。MS m/z:314.2(M+H+)。1H NMR(400MHz,CDCl3):δ 3.73(s,6H),4.22(br s,1H),4.40(s,2H),5.74(d,2H),5.94(t,1H),8.53(s,1H)。
步驟5:中間物5
在密封試管中,在60℃下攪拌中間物4(9.40g,29.9mmol)、DIPEA(9.60g,74.3mmol)及MeNH2HCl(2.40g,35.8mmol)於二噁烷(150mL)中之溶液隔夜。使溶液冷卻至環境溫度。添加DIPEA(9.60g,74.3mmol),隨後緩慢添加含三光氣(9.30g,31.3mmol)之二噁烷(60mL)。在環境溫度下攪拌溶液1小時,此後將其加熱至70℃持續3小時。濃縮溶液,添加水,且在環境溫度下攪拌混合物30分鐘。藉由過濾收集所得固體,接著溶解於MeOH/H2O(135mL/15mL)中,且在回流下加熱10分鐘,此後在冰水浴中冷卻溶液且藉由過濾收集所得固體,用冷MeOH/H2O(v/v:18/2)洗滌且乾燥獲得標題化合物(5.80g),其未經進一步純化即用於下一步驟中。MS m/z:335.3(M+H+)。1H NMR(400MHz,CDCl3):δ 3.46(s,3H),3.79(s,6H),4.74(s,2H),6.41(t,1H),6.46(d,2H),8.12(s,1H)。
步驟6:共用中間物6
中間物5(5.50g,16.4mmol)於DCM(150mL)中之溶液冷卻至0℃且逐滴添加含SO2Cl2(4.70g,34.8mmol)之DCM(20mL)。在0℃下攪拌所得混合物1小時,此後將其倒入NaHCO3飽和水溶液中且分離有機相,用水、鹽水洗滌,經Na2SO4乾燥且濃縮獲得6.00g標題化合物。MS m/z:403.3(M+H+)。1H NMR(400MHz,CDCl3):δ 3.47(s, 3H),3.95(s,6H),4.65(s,2H),6.62(s,1H),8.12(s,1H)。
實例2:合成共用中間物8
步驟1:中間物2
根據中間物1之文獻程序(EP2112150 A1,2009)製備中間物2
步驟2:中間物3
中間物2(2.10g,11.0mmol)於140mL 1,4-二噁烷中之懸浮液 中添加3-硝基苯甲基胺鹽酸鹽(2.49g,13.2mmol)及三乙胺(5.22mL,37.5mmol)。在95℃下攪拌混合物24小時。添加額外3-硝基苯甲基胺鹽酸鹽(208mg,1.10mmol)及三乙胺(3.08mL,22.1mmol)且在100℃下攪拌反應物17小時。濃縮反應混合物且對粗產物進行矽膠急驟層析法(用含50-100% EtOAc之庚烷之梯度溶離)。接著用EtOAc濕磨所得殘餘物獲得2.05g標題化合物。MS m/z:307.0(M+H)+1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ:8.18(1H,s),7.85(1H,s),7.74(1H,d),7.59(2H,m),5.11(1H,t),4.66(2H,d),4.35(2H,d),2.28(3H,s)。
步驟3:中間物4
中間物3(2.10g,6.69mmol)於140mL DCM中之溶液中添加氧化錳(8.02g,53.5mmol)且在環境溫度下攪拌混合物17小時。反應混合物經矽藻土過濾,用DCM洗滌且在減壓下濃縮濾液獲得1.85g標題化合物,其未經純化即直接使用。MS m/z:305.1(M+H+)。1H NMR(400MHz,CDCl3):δ:9.75(1H,s),9.08(1H,br s),8.38(1H,s),8.20(1H,s),8.15(1H,d),7.66(1H,d),7.52(1H,t),4.87(2H,d),2.48(3H,s)。
步驟4:中間物5
在氬氣下,向中間物4(500mg,1.64mmol)於9mL DCM中之溶液中添加3,5-二甲氧基苯胺(229mg,1.49mmol)及乙酸(94.1μL,1.64 mmol)。在環境溫度下攪拌混合物15分鐘,隨後分2份添加三乙醯氧基硼氫化鈉(2×238mg,2.24mmol),之間間隔15分鐘。在環境溫度下攪拌反應物17小時,添加額外三乙醯氧基硼氫化鈉(476mg,2.24mmol)且再攪拌混合物6小時。反應物用10mL 1M NaOH淬滅,此導致氣體劇烈逸出,此後攪拌混合物15分鐘。水層以DCM(×3)萃取,且經合併之有機層用鹽水洗滌,乾燥(Na2SO4),過濾且濃縮。對粗產物進行矽膠急驟層析法(用含50% EtOAc之庚烷溶離),獲得591mg標題化合物。MS m/z:442.1(M+H)+
步驟5:中間物6
在氬氣下,向中間物5(591mg,1.34mmol)於6mL 2-MeTHF中之溶液中添加三光氣(437mg,1.47mmol),隨後緩慢添加三乙胺(578μL,4.15mmol)。在環境溫度下攪拌混合物1小時,接著在70℃下攪拌1.5小時。反應物用NaHCO3飽和水溶液/H2O之1:1混合物(12mL)淬滅,且藉由過濾移除所得固體且用EtOAc洗滌。分離濾液層且用EtOAc,隨後用DCM萃取水層。用鹽水洗滌經合併之有機層,乾燥(Na2SO4),過濾且真空濃縮。對粗產物進行乾式-矽膠急驟層析法(用含50-70% EtOAc之庚烷之梯度溶離)。所得殘餘物接著用Et2O濕磨獲得398mg標題化合物。MS m/z:468.0(ES+,M+H+)。1H NMR(400MHz,CDCl3):δ:8.34(1H,s),8.11(2H,m),7.80(1H,d),7.47(1H,t),6.47(2H,d),6.40(1H,t),5.38(2H,s),4.73(2H,s),3.77(6H,s),2.52(3H,s)。
步驟6:中間物7
中間物6(396mg,0.847mmol)於7mL MeCN及15mL DCM中之經冷卻(0℃)溶液中添加硫醯氯(137μL,1.69mmol)。在0℃下攪拌反應物15分鐘。反應物用NaHCO3飽和水溶液淬滅且水相用DCM(×2)萃取。經合併之有機層乾燥(Na2SO4),過濾且真空濃縮獲得452mg標題產物,其未經純化即直接使用。MS m/z:536.0(H+)。1H NMR(400MHz,CDCl3):δ:8.32(1H,s),8.09(2H,m),7.78(1H,d),7.46(1H,t),6.61(1H,s),5.38(2H,s),4.65(2H,s),3.94(6H,s),2.49(3H,s)。
步驟7:中間物8
中間物7(451mg,0.841mmol)於10mL DCM中之溶液中添加mCPBA(228mg,0.925mmol)。在環境溫度下攪拌反應物1小時,接著用6mL NaHCO3飽和水溶液及4mL2M硫代硫酸鈉淬滅。攪拌混合物15分鐘,接著用H2O稀釋且用DCM(×3)萃取水相。經合併之有機層乾燥(Na2SO4),過濾且濃縮獲得468mg標題產物,其未經純化即直接使用。MS m/z:552.0(M+H+)。
實例3:合成I-1
步驟1:中間物2
向來自實例2之中間物8(150mg,0.27mmol)於1,4-二噁烷(8mL)中之溶液中添加苯-1,2-二胺(88.1mg,0.82mmol)及對甲苯磺酸(23.4mg,0.14mmol)。在100℃下,在氮氣下,加熱混合物隔夜。使混合物冷卻至環境溫度,添加水且過濾所得懸浮液獲得145mg標題化合物。MS m/z:596.3(M+H)+
步驟2:中間物3
中間物2(145mg,0.24mmol)於THF(15mL)中之溶液中添加三乙胺(98.0mg,0.97mmol)及(Boc)2O(106mg,0.48mmol)。在回流下加熱反應混合物隔夜。使混合物冷卻至環境溫度,添加水,且用EtOAc(30mL×3)萃取水層。乾燥(Na2SO4)經合併之有機層,過濾且濃縮。對粗產物進行矽膠急驟層析法(65% EtOAc/己烷)獲得121mg標題化合物。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ 1.44(s,9H),3.97(s,6H),4.62(s,2H),5.16(s,2H),6.96-7.11(m,3H),7.39(d,1H),7.47-7.57(m,3H),8.04-8.07(m,2H),8.16(s,1H),8.48(s,1H),8.58(s,1H)。
步驟3:中間物4
中間物3(112mg,0.16mmol)於乙醇(8mL)及水(4mL)中之溶液中添加鐵粉(54.0mg,0.96mmol)及NH4Cl(52mg,0.96mmol)。在回流下加熱混合物1.5小時。使反應混合物冷卻至環境溫度,過濾,且濃縮濾液。向所得殘餘物中添加水且用EtOAc(30mL×3)萃取水層。經合併之有機層用飽和NaHCO3洗滌,乾燥(Na2SO4),過濾且濃縮獲得104.4mg標題化合物,其未經純化即直接用於下一步驟。MS m/z:666.4[M+H]+
步驟4:中間物5
使中間物4(98.6mg,0.15mmol)、丙酸(16.4mg,0.22mmol)及HATU(113mg,0.30mmol)於DMF(6mL)中之混合物冷卻至0℃。添加DIPEA(57.3mg,0.44mmol)且在環境溫度下攪拌反應混合物隔夜。添加水且用EtOAc(60mL×3)萃取所得混合物。乾燥(Na2SO4)經合併之有機層,過濾且濃縮。對粗產物進行矽膠急驟層析法(3% MeOH/DCM)獲得74mg標題化合物。MS m/z:722.4[M+H]+
步驟5:中間物6
中間物5(74.0mg,0.10mmol)於DCM(2mL)中之溶液中添加TFA(2mL),且在環境溫度下攪拌溶液30分鐘。移除溶劑且向殘餘物中添加水,用EtOAc(30mL×3)萃取殘餘物。經合併之有機層用飽和NaHCO3洗滌,乾燥(Na2SO4),過濾且濃縮獲得79mg標題化合物,其未經純化即使用。MS m/z:622.4[M+H]+
步驟6:I-1
中間物6(79.0mg,0.13mmol)及DIPEA(33.0mg,o.25mmol)於THF(3mL)中之經冷卻(0℃)溶液中添加丙烯醯氯(13.8mg,0.15mmol)。在0℃下攪拌反應物10分鐘。以NaHCO3飽和水溶液淬滅反應物,且用EtOAc(30mL×3)萃取。用NaHCO3飽和水溶液洗滌經合併之有機層,乾燥(Na2SO4),過濾且濃縮。對粗產物進行矽膠急驟層析法(5% MeOH/DCM)獲得34.3mg標題化合物。MS m/z:676.4[M+H]+1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ 1.08(t,3H),2.29(q,2H),3.96(s,6H),4.60(s,2H),5.06(s,2H),5.68-5.83(m,1H),6.26(dd,1H),6.40-6.56(m,1H),6.83(d,1H),6.95-7.09(m,3H),7.16(t,1H),7.37-7.48(m,1H),7.50-7.53(m,3H),8.14(s,1H),8.53(s,1H),9.70(s,1H),9.74(s,1H)。
實例4:合成I-2
步驟1:中間物2
在氮氣下,在回流下加熱中間物1(如實例2中所述,在步驟2中使用甲胺代替3-硝基苯甲基胺製備(106mg,0.25mmol))、苯-1,2-二胺(80mg,0.74mmol)及p-TsOH(21.2mg,0.12mmol)於1,4-二噁烷(8mL)中之混合物16小時。使反應混合物冷卻至環境溫度且分配於EtOAc與水之間。用NaHCO3飽和水溶液、鹽水洗滌有機相,乾燥(Na2SO4)且真空濃縮。用矽膠管柱層析法(5% MeOH/DCM)純化粗產物獲得標題化合物(69.3mg)。MS m/z:475.3(M+H)+1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ 3.23(s,3H),3.97(s,6H),4.50(s,2H),4.81(s,2H),6.57(t,1H),6.70-6.79(m,1H),6.83-6.94(m,1H),6.99(s,1H),7.35(d,1H),8.04(s,1H),8.45(s,1H)。
步驟2:I-2
中間物2(69.1mg,0.15mmol)及DIPEA(37.4mg,0.29mmol)於THF(10mL)中之經冷卻(0℃)溶液中添加丙烯醯氯(15.8mg,0.17mmol)。在0℃下攪拌反應物10分鐘。用NaHCO3飽和水溶液淬滅反應物,且用EtOAc(40mL×3)萃取。用NaHCO3飽和水溶液洗滌經合併之有機層,乾燥(Na2SO4),過濾且真空濃縮。藉由矽膠管柱層析法(3% MeOH/DCM)純化粗產物獲得I-2(23.3mg)。MS m/z:529.3(M+H)+1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ 3.22(s,3H),3.96(s,6H), 4.52(s,2H),5.77(dd,2.0Hz,1H),6.27(dd,2.0Hz,1H),6.47-6.54(m,1H),6.99(s,1H),7.108-7.13(m,1H),7.17-7.22(m,1H),7.56(d,1H),7.80(d,1H),8.09(s,1H),8.59(s,1H),9.76(s,1H)。
實例5:合成I-3
步驟1:中間物2
中間物1之混合物(如實例1中所述,在步驟4中使用苯甲基胺代替甲胺製備(54.0mg,0.11mmol))中添加苯-1,2-二胺(24.0mg,0.22mmol)於1,4-二噁烷(2mL)及一滴TFA。在密封試管中,在回流下加熱反應混合物16小時,此後將其冷卻至環境溫度且分配於EtOAc與水之間。用NaHCO3飽和水溶液、鹽水洗滌有機相,乾燥(Na2SO4)且真空濃縮。用矽膠管柱層析法(用100% EtOAc溶離)純化粗產物獲得標題化合物(34.5mg)。MS m/z:551.0(M+H)+
步驟2:I-3
中間物2(14.0mg,0.025mmol)於THF(1mL)中之經冷卻(0℃)溶液中添加丙烯醯氯(1.9μL,0.023mmol)。在0℃下攪拌反應物10分鐘,此後藉由逆相HPLC(用含0-90% MeCN之水之梯度溶離)純化。與NaHCO3飽和水溶液一起攪拌經合併之溶離份,用DCM萃取,且濃縮有機層獲得10.6mg標題化合物。MS m/z:605.2(M+H)+
實例6:合成I-4
如實例3中所述,在步驟1中使用3-胺基苯甲基胺基甲酸第三丁酯代替苯-1,2-二胺,製備標題化合物。MS m/z:690.2(M+H+)。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ:8.07(1H,s),7.63(1H,s),7.45(1H,s),7.32(2H,m),7.23(2H,m),7.00(2H,m),6.90(1H,s),6.26(2H,m),5.66(1H,m),5.28(2H,s),4.68(2H,s),4.33(2H,s),3.96(6H,s),2.34(2H,q),1.89(3H,t)。
實例7:合成I-5
步驟1:中間物2
向來自實例1之中間物5(30.1mg,0.09mmol)及苯-1,2-二胺(19.5mg,0.18mmol)於1,4-二噁烷(1mL)中之混合物中添加一滴TFA。在密封試管中,在回流下加熱反應混合物16小時,此後將其冷卻至環境溫度且分配於EtOAc與水之間。用NaHCO3飽和水溶液、鹽水洗滌有機相,乾燥(Na2SO4)且真空濃縮。經矽膠管柱層析法(用100% EtOAc溶離)純化粗產物獲得標題化合物(16.7mg)。MS m/z:551.0(M+H)+
步驟2:I-5
中間物2(14.0mg,0.034mmol)於THF(1mL)中之經冷卻(0℃) 溶液中添加丙烯醯氯(2.8μL,0.034mmol)。在0℃下攪拌反應物10分鐘,此後藉由逆相HPLC(用含0-90% MeCN之水(具有0.1% TFA)之梯度溶離)純化。濃縮經合併之溶離份,與NaHCO3飽和水溶液一起攪拌,用DCM萃取,且濃縮有機層獲得14.6mg標題化合物。MS m/z:407.2(M+H)+1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ 3.23(s,3H),3.75(s,6H),4.72(s,2H),5.79(dd,1H),6.28(dd,1H),6.56-6.45(m,2H),6.60(s,2H),7.25-7.27(m,2H),7.59(d,1H),7.72(d,1H),8.09(s,1H),9.41(br s,1H),9.88(s,1H)。
實例8:合成I-6
如實例5中所述,在步驟1中使用(2-胺基-4-(三氟甲基)苯基)胺基甲酸第三丁酯代替苯-1,2-二胺製備化合物I-6。MS m/z:673.1(M+H)+
實例9:合成I-7,(外消旋)
步驟1:中間物2
向來自實例2之中間物8(150mg,0.27mmol)於二噁烷(15mL)中之溶液中添加反-環己烷-1,2-二胺(62mg,0.54mmol)及催化劑對甲苯磺酸。在回流下加熱所得混合物16小時。將反應混合物分配於EtOAc與NaHCO3飽和水溶液之間。分離有機層,乾燥(Na2SO4)且蒸發至乾燥。藉由製備型TLC(含6.6%甲醇之二氯甲烷)純化粗產物獲得標題化合物(150mg)。MS m/z:602.3(M+H)+
步驟2:中間物3
中間物2(150mg,0.25mmol)於DCM(15mL)中之溶液中添加三乙胺(50mg,0.49mmol)及二碳酸二第三丁酯(65mg,0.29mmol)。在環境溫度下攪拌所得混合物2小時。將反應混合物分配於EtOAc與水之間。分離有機相,用1N HCl、NaHCO3飽和水溶液洗滌,經無水硫酸鈉乾燥且蒸發至乾燥獲得標題化合物(130mg)。MS m/z:702.3(M+H)+
步驟3:中間物4
中間物3(130mg,0.180mmol)於乙醇(15mL)及NH4Cl飽和水溶液(2mL)中之懸浮液中添加Fe粉(83.0mg,1.48mmol)且在回流下加熱所得混合物2小時,此後用DCM(60mL)稀釋,分離有機相,經無水硫酸鈉乾燥,且蒸發至乾燥獲得標題化合物(120mg)。
步驟4:中間物5
中間物4(110mg,0.16mmol)、丙酸(18.0mg,0.24mmol)及 HATU(124mg,0.33mmol)溶解於DMF(10mL)中。在N2下,將反應混合物冷卻至0℃,且緩慢添加DIPEA(63mg,0.49mmol),且在環境溫度下攪拌混合物16小時。將反應混合物分配於EtOAc與水之間。分離有機相,用水洗滌,經無水硫酸鈉乾燥且蒸發至乾燥。藉由矽膠管柱層析法(含4% MeOH之DCM)純化殘餘物獲得標題產物(80mg)。MS m/z:728.4(M+H)+
步驟5:I-7
中間物5(80.0mg,0.11mmol)溶解於DCM(2mL)中,隨後添加TFA(5mL)。在環境溫度下攪拌所得混合物1小時,此後濃縮。將殘餘物溶解於DCM中,且添加DIPEA直至pH=7。將溶液冷卻至0℃,添加丙烯醯氯(15.0mg,0.17mmol),且在0℃下攪拌混合物10分鐘。藉由添加NaHCO3飽和水溶液淬滅反應物,用EtOAc萃取,且經無水Na2SO4乾燥有機層且濃縮。藉由製備型TLC(含4% MeOH之DCM)純化殘餘物獲得標題化合物(20mg,兩個步驟26%)。MS m/z:682.4(M+H)+1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ:1.02-1.11(t,3H),1.16-1.30(m,3H),1.49-1.70(m,3H),1.76-1.94(m,2H),2.28(q,2H),3.66-3.75(m,1H),3.96(s,6H),4.50(s,2H),5.11(s,2H),5.46-5.54(m,1H),6.01(d,1H),6.03-6.15(m,1H),6.61-6.70(m,1H),6.99(s,1H),6.94(d,1H),7.18(s,1H),7.34-7.43(m,1H),7.57-7.65(m,1H),7.96(s,1H),9.76(s,1H)。
實例10:合成I-8,(外消旋)
步驟1:中間物2
向來自實例2之中間物8(150mg,0.27mmol)於1,4-二噁烷(8mL)中之溶液中添加順-環己烷-1,2-二胺(93.0mg,0.82mmol)及p-TSA(23.4mg,0.14mmol)。在100℃下加熱反應混合物16小時。添加水,且用EtOAc(50mL×3)萃取所得混合物。經Na2SO4乾燥經合併之有機 層,過濾且真空濃縮獲得標題化合物(164mg),其未經進一步純化即可使用。MS m/z:602.3[M+1]+
步驟2:中間物3
中間物2(164mg,0.27mmol)於DCM(6mL)中之溶液中添加三乙胺(82.6mg,0.82mmol)及二碳酸二第三丁酯(89.0mg,0.41mmol)。在環境溫度下攪拌反應混合物2小時。濃縮反應混合物且對粗產物進行矽膠管柱層析法(2% MeOH/DCM)獲得標題化合物(159mg)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ 1.34(s,9H),1.42-1.52(m,2H),1.56-1.77(m,2H),3.25(d,2H),3.48-3.64(m,1H),3.75-3.91(m,1H),3.97(s,6H),4.55(s,2H),5.25(s,2H),6.31-6.47(m,1H),6.54-6.64(m,1H),7.01(s,1H),7.62(t,1H),7.76(d,1H),8.02(s,1H),8.07-8.18(m,2H)。
步驟3:中間物4
中間物3(153mg,0.22mmol)於EtOH(10mL)及水(5mL)中之溶液中添加Fe粉(72.0mg,1.31mmol)及NH4Cl(70.0mg,1.31mmol)。在回流下加熱混合物2小時。過濾反應混合物,且真空濃縮濾液。向殘餘物中添加水且用EtOAc(50mL×3)萃取水溶液。用飽和 NaHCO3洗滌經合併之有機層,經Na2SO4乾燥,過濾且真空濃縮獲得標題化合物(96.7mg),其未經純化即使用。MS m/z:672.4(M+H)+
步驟4:中間物5
中間物4(96.7mg,0.14mmol)於DMF(6mL)中之溶液中添加丙酸(16.0mg,0.22mmol)及HATU(109.5mg,0.29mmol)。使混合物冷卻至0℃,且添加DIPEA(55.7mg,0.43mmol)。在環境溫度下攪拌反應混合物16小時。添加水,且用EtOAc(50mL×3)萃取混合物。用鹽水洗滌經合併之有機層,乾燥(Na2SO4),且真空濃縮。對粗產物進行矽膠管柱層析法(3% MeOH/DCM)獲得標題化合物(98.0mg)。MS m/z:728.5(M+H)+
步驟5:中間物6
中間物5(98.0mg,0.13mmol)於DCM(2mL)中之溶液中添加TFA(2mL),且在環境溫度下攪拌反應混合物30分鐘。真空濃縮反應混合物,添加水且用EtOAc(50mL×3)萃取所得混合物。用NaHCO3飽和水溶液洗滌經合併之有機層,乾燥(Na2SO4),且真空濃縮獲得標題化合物(88.3mg),其未經進一步純化即使用。MS m/z:628.4(M+H)+
步驟6:I-8
中間物6(88.3mg,0.14mmol)及DIPEA(36.1mg,0.28mmol)於4mL THF中之經冷卻(0℃)溶液中添加丙烯醯氯(15.3mg,0.17mmol)。在0℃下攪拌反應物10分鐘。用NaHCO3飽和水溶液淬滅混合物,且用EtOAc(40mL×3)萃取。用NaHCO3飽和水溶液洗滌經合併之有機層,乾燥(Na2SO4),且真空濃縮。對所得殘餘物進行矽膠管柱層析法(5% MeOH/DCM)獲得標題化合物(55.9mg)。MS m/z:682.3(M+H)+1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ 1.07(t,3H),1.22-1.83(m,8H),2.28(q,2H),3.96(s,6H),4.13(br,1H),4.51(s,2H),5.04-5.14(m,2H),5.55(dd,2.4Hz,1H),5.74(s,1H),6.05(dd,1H),6.22-6.41(m,1H),6.60(br s,1H),6.91-7.05(m,2H),7.18(t,1H),7.41(d,1H),7.58(s,1H),7.67(d,1H),7.98(s,1H),9.73(s,1H)。
實例11:合成I-9
如實例17(下文)中所述,在步驟2中使用1-(2-甲氧基乙基)哌嗪代替N-乙基哌啶且使用如實例2中針對中間物6所述之方式製備的中間物,其使用實例2中所述之mCPBA氧化,製備標題化合物。MS m/z:750.3(M+H+)。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ:7.97(1H,s),7.63(1H, s),7.40(2H,d),7.33(2H,m),7.16(1H,t),6.87(2H,m),6.57(2H,s),6.45(1H,dd),6.39(1H,m),5.75(1H,dd),5.13(2H,s),4.75(2H,s),3.77(6H,s),3.76(1H,m),3.43(3H,s),2.36(2H,q),1.62(3H,t)
實例12:合成I-10
如實例5中所述,在步驟1中使用(2-胺基-5-(三氟甲基)苯基)胺基甲酸第三丁酯代替苯-1,2-二胺製備化合物I-10。MS m/z:673.1(M+H+)。
實例13:合成I-11
如實例5中所述,在步驟1中使用4,5-二氯苯-1,2-二胺代替苯-1,2-二胺製備化合物I-11。MS m/z:673.1(M+H+)。
實例14:合成I-12
如實例5中所述,在步驟1中使用(3-氟苯基)甲胺代替甲胺製備化 合物I-12。MS m/z:623.3(M+H+)。
實例15:合成I-13
如實例17(下文)中所述,在步驟2中使用2-甲氧基-N-甲基甲胺代替N-乙基哌啶且在步驟4中使用來自實例1之中間物5之衍生物(在步驟5中使用苯甲胺代替甲胺製備)代替中間物4,製備標題化合物。MS m/z:624.3(M+H+)。1H NMR(400MHz,CDCl3):δ:7.92(1H,s),7.29(1H,d),7.21(6H,m),6.78(1H,dd),6.55(2H,s),6.46(1H,s),6.41(2H,m),5.77(1H,dd),5.15(2H,s),4.51(2H,s),3.78(6H,s),3.60(2H,t),3.54(2H,t),3.06(3H,t)。
實例16:合成I-14
如實例17中所述,在步驟2中使用2-甲氧基-1-乙醇代替N-乙基哌啶且在步驟4中使用來自實例1之中間物5之衍生物(在步驟5中使用苯甲胺代替甲胺製備)代替中間物4,製備化合物I-14。MS m/z:611.3(M+H+)。
實例17:合成I-15
步驟1:中間物2
中間物1(2.34g,15.0mmol)於DMF(50mL)中之溶液中添加(Boc)2O(6.60g,30.3mmol)及DMAP(600mg,4.9mmol)。在室溫下攪拌反應物隔夜。在減壓下移除DMF後,藉由矽膠層析法分離產物。MS m/z:357.2(M+H+)。
步驟2
在DMF(3.0mL)中混合中間物2(300mg,084mmol)與N-乙基哌 啶(0.30mL,2.19mmol)。在110℃下加熱混合物3.0小時。接著,真空濃縮反應物且藉由矽膠急驟層析法純化獲得330mg標題化合物。MS m/z:351.3(M+H)+
步驟3:中間物3
將來自步驟2之產物溶解於MeOH(10mL)中,且添加10重量% Pd/C(100mg)。在環境溫度下,在H2氣球下,攪拌反應混合物4.5小時。經短矽藻土栓過濾反應混合物且真空濃縮獲得275mg標題化合物,其未經純化即使用。MS m/z:292.1(M+H+)。
步驟4:中間物5
中間物3(200mg,0.68mmol)、中間物6(來自實例1)(150mg,0.37mmol)及TFA(5.0μL)溶解於1,4-二噁烷(2.0mL)中,且在110℃下加熱反應混合物16小時。將反應混合物冷卻至環境溫度,濃縮且藉由矽膠層析法純化獲得110mg標題化合物。MS m/z:619.8(M+H)+
步驟4:I-15
在環境溫度下,將中間物5溶解於20% TFA/DCM中,且攪拌3.5小時。濃縮反應混合物,將所得殘餘物溶解於DCM中且用二氧化矽支撐之碳酸鹽處理,且過濾混合物。濃縮濾液,接著溶解於THF(2.0mL)中,且冷卻至-10℃,隨後添加丙烯醯氯(7.0μL,0.086mmol)。10分鐘後,濃縮反應物且藉由製備型HPLC純化。MS m/z:573.2(M+H+)。1H NMR(400MHz,CDCl3):δ:8.67(1H,s),7.78(1H,s),7.67(1H,s),7.48(1H,d),6.67(1H,dd),6.40(5H,m),5.74(1H,dd),4.63(2H,s),3.77(6H,s),3.66(4H,m),3.41(2H,m),3.33(3H,s),3.14(2H,m),2.89(2H,m),1.39(3H,t)。
實例18:合成I-16
如實例5中所述,使用(4-甲氧基苯基)甲胺代替甲胺製備起始物質,製備化合物I-16。MS m/z:635.4(M+H+)。
實例19:合成I-17
如實例17中所述,在步驟2中使用嗎啉代替N-乙基哌啶且在步驟4中使用來自實例1之中間物5代替中間物6,製備標題化合物。MS m/z:546.2(M+H+)。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ:7.87(1H,s),7.40(1H,d),7.25(1H,s),6.98(1H,dd),6.54(2H,s),6.46(1H,m),6.35(1H,dd),5.80(1H,dd),4.71(2H,s),3.84(4H,t),3.77(6H,s),3.38(3H,s),3.21(4H,t)。
實例20:合成I-18(外消旋)
如實例21中所述,在步驟1中使用mCPBA代替SO2Cl2(實例2,步驟7中描述mCPBA氧化)製備化合物I-18。MS m/z:476.4(M+H+)。
實例21:合成I-19,(外消旋)
步驟1:中間物2
中間物1(如實例2中所述,在步驟2中使用甲胺代替3-硝基苯甲基胺且跳過步驟6製備)(250mg,0.72mmol)於MeCN(2mL)及DCM(4mL)之冰冷卻之溶液中添加硫醯氯(0.12mL,1.44mmol)。在0℃下攪拌反應物15分鐘。用NaHCO3飽和水溶液淬滅反應物且用DCM(30mL×3)萃取水層。乾燥(Na2SO4)經合併之有機層,過濾且真空濃縮。藉由矽膠管柱層析法(2% MeOH/DCM)純化粗產物獲得192mg標題化合物。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ 2.96(s,3H),3.41(s,3H),4.03(s,6H),4.81(s,2H),7.08(s,1H),8.64(s,1H)。
步驟2:中間物3
中間物2(60.0mg,0.14mmol)於1,4-二噁烷(5mL)中之溶液中添加順-環己烷-1,2-二胺(47.7mg,0.42mmol)及p-TSA(12.0mg,0.07mmol)。在105℃下加熱反應物隔夜。使混合物冷卻至環境溫度,添加水,且用EtOAc(50mL×3)萃取所得混合物。用NaHCO3飽和水溶液洗滌經合併之有機層,乾燥(Na2SO4),過濾且真空濃縮。藉由矽膠管柱層析法(10% MeOH/DCM)純化粗產物獲得73.9mg標題化合物。MS m/z:481.3(M+1)+
步驟3:I-19
中間物3(73.9mg,0.15mmol)及DIPEA(39.7mg,0.31mmol)於THF(3mL)中之冰冷卻溶液中添加丙烯醯氯(16.7mg,0.18 mmol)。在0℃下攪拌反應物10分鐘。以NaHCO3飽和水溶液淬滅反應物,且用EtOAc(30mL×3)萃取。用NaHCO3飽和水溶液洗滌經合併之有機層,乾燥(Na2SO4),過濾且真空濃縮。藉由矽膠管柱層析法(5% MeOH/DCM)純化粗產物獲得40.7mg標題化合物。MS m/z:535.3(M+1)+1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ1.35-1.84(m,8H),3.96(s,6H),4.11-4.29(m,2H),4.44(s,2H),5.50-5.75(m,1H),5.99-6.25(m,1H),6.23-6.47(m,1H),6.52-6.86(m,1H),6.97-7.18(m,1H),7.66-7.90(m,1H),7.96-8.14(m,1H)。
實例22:合成I-20
如實例17中所述,在步驟2中使用1-(2-甲氧基乙基)哌嗪代替N-乙基哌啶且在步驟4中使用中間物5(來自實例1)代替中間物6,製備標題化合物。MS m/z:603.3(M+H+)。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ:7.94(1H,s),7.50(1H,d),7.40(1H,d),7.00(1H,dd),6.54(2H,s),6.44(2H,m),6.39(1H,m),5.80(1H,dd),4.71(2H,s),3.79(6H,s),3.44(5H,m),3.31(3H,s)。
實例23:合成I-21
如實例17中所述,在步驟2中使用2-甲氧基-N-甲基乙胺代替N-乙 基哌啶且在步驟4中使用中間物5(來自實例1)代替中間物6,製備標題化合物。MS m/z:548.3(M+H+)。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ:7.86(1H,s),7.39(1H,d),7.15(1H,s),6.85(1H,dd),6.53(2H,m),6.46(1H,m),6.35(1H,m),5.79(1H,dd),4.70(2H,s),3.77(6H,s),3.59(2H,s),3.38(3H,s),3.06(3H,s)。
實例24:合成I-22(外消旋)
如實例21中所述,在步驟2中使用反-環己烷-1,2-二胺代替順-環己烷-1,2-二胺,製備化合物I-22。MS m/z:535.3(M+H+)。
實例25:合成I-23
步驟1:中間物2
在環境溫度下攪拌中間物1(750mg,3.93mmol)於環丙胺(5mL)中之溶液隔夜,此後濃縮溶液,用EtOAc濕磨且過濾獲得700mg標題化合物。MS m/z:212.1(M+H)+
步驟2:中間物3
中間物2(700mg,3.32mmol)於DCM(30mL)中之溶液中添加氧化錳(2.30g,26.4mmol)且在環境溫度下攪拌混合物3小時。經矽藻土過濾反應混合物且用DCM洗滌,且濃縮濾液獲得550mg標題化合物。MS m/z:210.2(M+H)+
步驟3:中間物4
在氮氣下,向中間物3(550mg,2.63mmol)於DCM(20mL)中之溶液中添加3,5-二甲氧基苯胺(480mg,3.14mmol)及乙酸(0.13g,2.17mmol)。在環境溫度下攪拌混合物15分鐘,隨後以15分鐘間隔分兩份添加NaBH(OAc)3(0.55g×2,5.19mmol)。在環境溫度下攪拌反應物17小時,隨後用1M NaOH淬滅且攪拌15分鐘。用DCM(50mL×3)萃取水層,且經合併之有機層用鹽水洗滌,乾燥(Na2SO4),過濾且濃縮。對粗產物進行矽膠急驟層析法(含10% EtOAc之DCM)獲得0.83g標題化合物。MS m/z:347.2(M+H)+
步驟4:中間物5
在氮氣下,向中間物4(830mg,2.41mmol)於THF(20mL)中之溶液中添加三光氣(890mg,3.57mmol),隨後添加三乙胺(1.20g,11.9mmol)。在環境溫度下攪拌混合物1小時,接著在回流下攪拌3小時。用NaHCO3飽和水溶液/H2O之1:1混合物(20mL)淬滅反應物且用 EtOAc(60mL×3)萃取。用鹽水洗滌經合併之有機層,乾燥(Na2SO4),過濾且濃縮。用己烷洗滌粗產物獲得500mg標題化合物。MS m/z:373.3(M+H)+
步驟5:中間物6
中間物5(150mg,0.40mmol)於MeCN(6mL)及DCM(12mL)中之冰冷卻溶液中添加硫醯氯(108mg,0.80mmol)。在0℃下攪拌反應物10分鐘。用NaHCO3飽和水溶液淬滅反應物且用DCM(50mL×3)萃取水相。乾燥(Na2SO4)經合併之有機層,過濾且濃縮。藉由製備型TLC(含5% MeOH之DCM)純化粗產物獲得60mg標題化合物。MS m/z:457.2(M+H)+1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ 0.62-0.70(m,2H),1.09-1.00(m,2H),2.73-2.83(m,1H),2.91(s,3H),3.97(s,6H),4.60-4.69(m,2H),7.01(s,1H),8.62(s,1H)
步驟6:中間物7
中間物6(60mg,0.13mmol)於二噁烷(10mL)中之溶液中添加苯-1,2-二胺(43mg,0.39mmol)及催化劑p-TSA(2mg)。將所得混合物加熱至回流隔夜。將反應混合物冷卻至環境溫度,用EtOAc稀釋,用NaHCO3飽和水溶液洗滌,經Na2SO4乾燥且濃縮。藉由製備型TLC(含2% MeOH之DCM)純化粗產物獲得30mg標題化合物。MS m/z:501.3 (M+H)+1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ 0.62(d,2H),0.95(d,2H),2.60(dd,1H),3.95(s,6H),4.39(s,2H),4.83(s,2H),6.47-6.63(m,1H),6.73(dd,1H),6.82-6.86(m,1H),6.98(s,1H),8.06(s,1H),7.51(d,1H),8.39(s,1H)。
步驟7:I-23
中間物7(30mg,0.06mmol)於THF(10mL)中之溶液中添加DIPEA(15mg,0.12mmol)且冷卻至-78℃。向反應混合物中添加丙烯醯氯(6.5mg,0.07mmol)。在-78℃下攪拌反應混合物10分鐘,此後將其用NaHCO3飽和水溶液淬滅,用EtOAc萃取且濃縮。藉由製備型TLC(含3至4% MeOH之DCM)純化粗產物獲得20mg標題化合物。MS m/z:555.3(M+H)+1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ 0.55-0.67(m,2H),0.96(q,2H),2.61-2.64(m,1H),3.95(s,6H),4.41(s,2H),5.78(dd,1H),6.28(dd,1H),6.52(dd,1H),6.98(s,1H),7.06-7.12(m,1H),7.17-7.24(m,1H),7.51(d,1H),7.98(d,1H),8.11(s,1H),8.53(s,1H),9.83(s,1H)。
實例26:合成I-24
如實例25中所述,在步驟2中使用(4-氯-3-甲氧基苯基)甲胺代替 環丙胺製備化合物I-24。MS m/z:669.4(M+H+)。
實例27:合成I-25
如實例25中所述,在步驟2中使用(4-氟苯基)甲胺代替環丙胺製備化合物I-25。MS m/z:623.3(M+H+)。
實例28:合成I-26
如實例3之多個步驟中所述,但使用以下順序:步驟1、步驟6、步驟3製備化合物I-26。MS m/z:620.4(M+H+)。
實例29:合成I-27
步驟:中間物2
中間物1(466mg,2.15mmol)於DMF(6.0mL)中之溶液中添加(Boc)2O(515mg,2.36mmol)及DMAP(20mg)。在環境溫度下攪拌反應物16小時。在減壓下移除DMF且藉由矽膠層析法純化獲得480mg標題化合物。MS m/z:317.1(M+H+)。
步驟2中間物4
在1,4-二噁烷(5mL)及2MNa2CO3水溶液(l.2mL)中合併中間物2(90mg,0.28mmol)、中間物3(120mg,0.58mmol)及Pd(dppf)Cl2(22.0mg,0.03mmol)。在110℃下加熱混合物30分鐘。以EtOAc稀釋反應混合物,用NaHCO3飽和水溶液及鹽水洗滌,乾燥(Na2SO4),過濾且真空濃縮。對殘餘物進行矽膠急驟層析法獲得47mg標題化合物。MS m/z:319.2(M+H+)。
步驟3中間物4
中間物4(47.0mg,0.15mmol)溶解於MeOH(5mL)中,向其中添加10重量% Pd/C(20mg)。在環境溫度下,在H2氣球下,攪拌反應混合物3.5小時。經短矽藻土栓過濾反應混合物且真空濃縮獲得標題化合物(定量),其直接使用。MS m/z:288.1(M+H+)。
I-27
如實例5中所述,使用來自實例1之共用中間物5製備標題化合物。MS m/z:541.2(M+H+)。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ:7.92(1H,s),7.31(2H,m),7.18(2H,m),6.92(1H,m),6.86(1H,s),6.53(2H,m),6.46(1H,dd),5.44(1H,dd),5.01(2H,s),4.89(6H,s),4.64(1H,m),4.57(1H,s),3.93(3H,s),3.87(2H,m),3.29(1H,m)。
實例30:合成I-28
如實例5中所述製備化合物I-28。使用(3-甲氧基苯基)甲胺代替甲胺製備起始物質。MS m/z:654.5(M+H+)。
實例31:合成I-29
步驟1:中間物2
在環境溫度下攪拌中間物1(3.0g,21.3mmol)於甲胺(乙醇溶液,30mL)中之溶液2小時,此後在減壓下蒸發揮發物。向殘餘物中添加NaHCO3水溶液(50mL)且用EtOAc(30mL×3)萃取混合物。經Na2SO4乾燥經合併之有機層且濃縮獲得3.53g標題化合物。1H NMR(400MHz,CDCl3):δ3.03(d,3H),6.63-6.67(m,1H),6.84(d,1H),7.43-7.48(m,1H),7.99(br s,1H),8.17(dd,1H)。
步驟2:中間物3
中間物3(500mg,3.29mmol)及DIPEA(900mg,7.0mmol)於DMF(5mL)中之溶液中添加丙烯醯氯(1.92g,21.4mmol)。在環境溫度下攪拌反應物2.5小時。將混合物分配於EtOAc與水之間。分離有機層且用水、鹽水洗滌,經Na2SO4乾燥且對粗產物進行矽膠急驟層析法(用含6% MeOH之DCM溶離)獲得583mg標題化合物。MS m/z:207.2(M+1)+1H NMR(400MHz,CDCl3):δ3.32(s,3H),5.53(d,1H),5.82-5.89(m,1H),6.37(d,1H),7.37(d,1H),7.56(t,1H),7.67-7.71(m,1H),8.01(d,1H)。
步驟3:中間物4
在80℃下攪拌中間物3(200mg,0.97mmol)及Fe(272mg,4.85mmol)於NH4Cl水溶液(3mL)及EtOH(6mL)中之混合物1小時。藉由過濾移除固體且濃縮濾液。用水稀釋殘餘物且用EtOAc(20mL×3)萃 取,用鹽水洗滌有機層,乾燥(Na2SO4)且真空濃縮。藉由矽膠急驟層析法(用含5% MeOH之DCM溶離)純化粗產物獲得105mg標題化合物。MS m/z:177.2(M+1)+1H NMR(400MHz,CDCl3):δ3.26(s,3H),3.76(br,2H),5.52(dd,1H),6.07(dd,1H),6.39(dd,1H),6.74-6.80(m,1H),6.99(dd,1H),7.14-7.18(m,1H),7.26(s,1H)
步驟4:I-29
在95℃下,在N2下攪拌來自實例1之中間物6(100mg,0.24mmol)、中間物4(44mg,0.24mmol)、Cs2CO3(162mg,0.48mmol)、Pd2(dba)3(21.4mg,0.038mmol)及Xantphos(43.0mg,0.076mmol)於1,4-二噁烷(2mL)中之混合物5小時。在減壓下蒸發揮發物。將殘餘物分配於EtOAc與水之間,且用鹽水洗滌有機層,乾燥(Na2SO4),過濾,且真空濃縮。對粗產物進行矽膠急驟層析法(用含50% EtOAc之己烷溶離)獲得29.8mg標題化合物。MS m/z:543.3(M+1)+1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ3.15(s,3H),3.25(s,3H),4.00(s,6H),4.52(s,2H),5.34-5.57(m,1H),5.88-6.16(m,2H),7.00(s,1H),7.17-7.23(m,2H),7.34-7.43(m,1H),7.87(d,1H),8.05(s,1H),8.76(s,1H)。
實例32:合成I-30
如實例17中所述,使用中間物5(來自實例1)代替中間物6製備化合物I-30。MS m/z:573.5(M+H+)。
實例33:合成I-31
步驟1:中間物2
中間物1(2.34g,15.0mmol)於DMF(50mL)中之溶液中添加(Boc)2O(6.60g,30.3mmol)及DMAP(600mg,4.9mmol)。在環境溫度下攪拌反應物隔夜。在減壓下移除DMF,且藉由矽膠層析法分離標題化合物。MS m/z:257.2(M+H+)。
步驟2:中間物3
在DMF(6.0mL)中合併中間物2(660mg,2.57mmol)及哌啶(0.65mL,6.60mmol)。在110℃下加熱反應混合物3小時。真空濃縮反應物且藉由矽膠急驟層析法純化獲得660mg標題化合物。MS m/z:322.3(M+H+)。
步驟3:中間物4
中間物3(660mg,2.06mmol)溶解於MeOH(10mL)中,向其中添加10重量% Pd/C(100mg)。在H2氣球下,攪拌反應物4.5小時。經短矽藻土栓過濾反應物且真空濃縮。粗產物(定量)未經純化直接用於下一步驟中。MS m/z:292.1(M+H)+
I-31
使用如實例5中所述之程序,自中間物4中間物5(來自實例1)製備標題化合物。MS m/z:544.3(M+H+)。1H NMR(400MHz,CDCl3):δ:8.65(1H,s),8.24(1H,s),7.71(1H,m),7.44(1H,m),6.41(5H,m),5.79(1H,dd),4.65(2H,s),3.77(6H,s),3.39(4H,m),3.34 (3H,s),2.00(4H,m),1.67(2H,m)。
實例34:合成I-32
如實例25中所述,在步驟1中使用烯丙基胺代替環丙胺且在步驟5中使用mCPBA代替SO2Cl2(實例2,步驟7中描述mCPBA氧化),製備化合物I-32。MS m/z:487.1(M+H+)。
實例35:合成I-33
如實例25中所述,在步驟1中使用3-胺基丙-1,2-二醇代替環丙胺且在步驟5中使用mCPBA代替SO2Cl2(實例2,步驟7中描述mCPBA氧化),製備化合物I-33。MS m/z:521.2(M+H+)。
實例36:合成I-34
如實例7中所述製備化合物I-34。如實例1中所述,在步驟5中使用環丙胺代替甲胺,製備起始物質。MS m/z:487.3(M+H+)。
實例37:合成I-35(外消旋)
如實例21中所述製備化合物I-35。如實例2中所述,在步驟2中使用吡啶-3-基甲胺代替3-硝基苯甲胺,製備起始物質。MS m/z:612.3(M+H+)。
實例38:合成I-36
如實例7中所述製備化合物I-36。如實例2中所述,在步驟2中使用3-胺基哌啶-1-甲酸第三丁酯代替3-硝基苯甲基胺且跳過步驟6,製備初始物質。MS m/z:630.3(M+H+)。
實例39:合成I-37
如實例5中所述,在步驟1中使用(2-胺基苯基)(甲基)胺基甲酸第三丁酯代替1,2-苯二胺製備化合物I-37。在步驟2之前執行脫除BOC保護基步驟(如實例3,步驟5中所述)。MS m/z:619.4(M+H+)。
實例40:合成I-38
如實例53中所述,在步驟1中使用苯胺代替環丙胺製備化合物I-38。MS m/z:401.3(M+H+)。
實例41:合成I-39(外消旋)
如實例21中所述,在步驟1中使用mCPBA代替SO2Cl2(實例2,步驟7中描述mCPBA氧化)且在步驟2中使用(順-2-胺基環己基)(甲基)胺基甲酸第三丁酯代替順-環己烷-1,2-二胺,製備化合物I-39。在步驟3之前執行脫除BOC保護基步驟(如實例3,步驟5中所述)。MS m/z:481.5(M+H+)。
實例42:合成I-40
如實例7中所述製備標題化合物。如實例2中所述,在步驟2中使用3-胺基哌啶-1-甲酸第三丁酯代替4-硝基苯甲基胺且跳過步驟6,製備初始物質。如實例3,步驟5中所述執行最終脫除BOC保護基步驟。 MS m/z:544.3(M+H+)。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ:8.02(1H,s),7.76(1H,d),7.55(1H,d),7.36(2H,m),6.53(2H,s),6.46(1H,m),6.36(1H,dd),5.80(1H,dd),4.73(2H,s),3.82(2H,d),3.77(6H,s),3.30(2H,s),2.81(2H,t),1.92(1H,m),1.68(2H,m),1.30(2H,q)。
實例43:合成I-41
如實例7中所述,在步驟1中使用(2-胺基-5-甲基苯基)胺基甲酸第三丁酯代替1,2-苯二胺製備化合物I-41。在步驟2之前執行脫除BOC保護基步驟(如實例3,步驟5中所述)。MS m/z:475.4(M+H+)。
實例44:合成I-42
如實例7中所述,在步驟1中使用(2-胺基-5-三氟甲基苯基)胺基甲酸第三丁酯代替1,2-苯二胺製備化合物I-42。在步驟2之前執行脫除BOC保護基步驟(如實例3,步驟5中所述)。MS m/z:529.4(M+H+)。
實例45:合成I-43
如實例7中所述製備標題化合物。如實例2中所述,在步驟2中使用3-胺基哌啶-1-甲酸第三丁酯代替3-硝基苯甲基胺且跳過步驟6,製備初始物質。如實例3,步驟5中所述執行最終脫除BOC保護基步驟。MS m/z:530.2(M+H+)。1H NMR(400MHz,CDCl3):δ:7.87(1H,s),7.68(1H,m),7.43(1H,m),7.24(1H,m),7.18(2H,m),6.32(4H,m),5.68(1H,dd),4.85(1H,m),4.52(2H,s),4.13(1H,m),3.70(6H,s),3.30(3H,m),2.39(2H,m),1.72(2H,m),1.88(2H,m)。
實例46:合成I-44
如實例5中所述製備標題化合物。如實例1中所述,在步驟5中使用吡啶-3-基甲胺代替甲胺製備中間物1。MS m/z:538.3(M+H+)。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ:8.62(2H,m),8.23(1H,d),8.05(1H,s),7.78(1H,m),7.65(1H,dd),7.48(1H,dd),7.31(2H,m),6.55(2H,s),6.46(1H,s),6.36(2H,m),5.77(1H,dd),5.22(2H,dd),4.75(2H,s),3.77(6H,s)。
實例47:合成I-45(外消旋)
如實例10中所述製備化合物I-45。如實例2中所述,在步驟2中使用3-胺基哌啶-1-甲酸第三丁酯代替3-硝基苯甲基胺且跳過步驟6,製備初始物質。MS m/z:636.3(M+H+)。
實例48:I-46(外消旋)
如實例21中所述,在步驟1中使用mCPBA代替SO2Cl2(實例2,步驟7中描述mCPBA氧化)製備標題化合物。如實例2中所述,在步驟2中使用3-胺基哌啶-1-甲酸第三丁酯代替3-硝基苯甲基胺且跳過步驟6,製備初始物質。如實例3,步驟5中所述執行最終脫除BOC保護基步驟。MS m/z:536.3(M+H+)。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ:7.98(1H,s),6.51(2H,s),6.46(1H,s),6.17(2H,m),5.62(1H,dd),5.03(1H,m),4.62(2H,m),4.28(1H,m),3.93(1H,m),3.77(6H,s),3.40(2H,m),2.94(1H,m),2.59(1H,m),2.10(2H,m),1.96(2H,m),1.77(6H,m),1.54(2H,m)。
實例49:I-47,(外消旋)
如實例21中所述製備標題化合物。如實例2中所述,在步驟2中使用2-胺基乙腈代替3-硝基苯甲胺,製備起始物質。MS m/z:560.2(M+H+)。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ:8.07(1H,s),6.92(1H,s),6.33(1H,m),6.18(1H,dd),5.63(1H,dd),5.01(2H,s),4.61(2H,s),4.48(2H,m),3.97(6H,s),1.79(6H,m),1.55(2H,m)。
實例50:I-48,
如實例4中所述製備標題化合物。如實例2中所述,在步驟2中使用2-胺基乙腈代替3-硝基苯甲胺且跳過步驟6,製備起始物質。MS m/z:486.2(M+H+)。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ:8.06(1H,s),7.76(1H,d),7.51(1H,d),7.32(2H,m),6.56(2H,s),6.47(3H,m),5.79(1H,dd),4.7(2H,s),4.72(2H,s),3.77(6H,s)。
實例51:合成I-49
如實例7中所述,在步驟1中使用(2-胺基-5-甲基苯基)胺基甲酸第 三丁酯代替1,2-苯二胺製備化合物I-49。在步驟2之前執行脫除BOC保護基步驟(如實例3,步驟5中所述)。MS m/z:475.4(M+H+)。
實例52:合成I-50
如實例7中所述,在步驟1中使用(2-胺基-5-三氟甲基苯基)胺基甲酸第三丁酯代替1,2-苯二胺製備化合物I-50。在步驟2之前執行脫除BOC保護基步驟(如實例3,步驟5中所述)。MS m/z:529.4(M+H+)。
實例53:I-51
步驟1:中間物1
向2,4-二氯-5-(碘甲基)嘧啶(1.70g,5.88mmol)於MeCN(5mL)及甲苯(15mL)中之溶液中添加NaOH水溶液(1.5mL,5.88mmol),含環丙胺(580mg,5.88mmol)之MeCN(6mL)/甲苯(6mL)。在0℃下攪拌混合物4小時。將混合物分配於EtOAc與H2O之間。用鹽水洗滌有機層,經Na2SO4乾燥且濃縮。藉由矽膠管柱層析法(用含30% EtOAc之己烷溶離)純化殘餘物獲得540mg標題化合物。MS m/z:218.2 (M+1)+1H NMR(400MHz,CDCl3):δ 0.40-0.54(m,4H),2.13-2.18(m,1H),3.97(s,2H),8.62(s,1H)
步驟2:中間物2
在0℃下攪拌中間物1(540mg,2.55mmol)於甲胺(乙醇溶液,10mL)中之溶液1小時。在減壓下蒸發揮發物。將殘餘物分配於EtOAc與水之間且用鹽水洗滌有機層,經Na2SO4乾燥且濃縮。藉由矽膠管柱層析法(用含5% MeOH之DCM溶離)純化殘餘物獲得350mg標題化合物。MS m/z:213.3(M+1)+1H NMR(400MHz,CDCl3):δ 0.29~0.33(m,2H),0.45-0.50(m,2H),2.08-2.13(m,1H),2.98(d,3H),3.74(s,2H),7.17(br,1H),7.75(s,1H)。
步驟3:中間物3
在80℃下攪拌中間物2(100mg,0.47mmol)、三光氣(83mg,0.28mmol)、TEA(95mg,0.94mmol)於THF(3mL)中之混合物16小時。將混合物分配於EtOAc與H2O之間。用鹽水洗滌有機層,經Na2SO4乾燥且濃縮。藉由矽膠管柱層析法(用含2% MeOH之DCM溶離)純化殘餘物獲得60mg標題化合物。MS m/z:239.3(M+1)+
步驟4:中間物4
在90℃下,在N2氛圍下,攪拌中間物3(60mg,0.25mmol)、苯- 1,2-二胺(32.7mg,0.30mmol)、Cs2CO3(164mg,0.50mmol)、Pd2(dba)3(21.7mg,0.038mmol)及Xantphos(43.7mg,0.076mmol)於1,4-二噁烷(2mL)中之混合物16小時。在減壓下蒸發揮發物。用水稀釋殘餘物,且用EtOAc(20mL×3)萃取。用鹽水洗滌有機層,經Na2SO4乾燥且濃縮。藉由矽膠管柱層析法(用含5% MeOH之DCM溶離)純化殘餘物獲得39mg標題化合物。MS m/z:311.3(M+1)+
步驟5:I-51
在-78℃下,向中間物4(39mg,0.13mmol)及DIPEA(38.7mg,0.3mmol)於THF(5mL)中之溶液中添加丙烯醯氯(13.6g,0.15mmol)。在-78℃下攪拌反應混合物20分鐘。添加水且用EtOAc(20mL×3)萃取混合物。用鹽水洗滌有機層,經Na2SO4乾燥且濃縮。藉由矽膠管柱層析法(用含5% MeOH之DCM溶離)純化殘餘物獲得9.3mg標題化合物。MS m/z:365.4(M+1)+1H NMR(400MHz,CDCl3):δ 0.63-0.71(m,2H),0.88(q,2H),2.62-2.69(m,1H),3.30(s,3H),4.25(s,2H),5.71(d,1H),6.21(dd,1H),6.38(d,1H),7.18-7.22(m,2H),7.28(br s,1H),7.50(br,1H),7.89(s,1H),8.38(br s,1H)。
實例54:合成I-52
如實例53中所述,在步驟1中使用環己胺代替環丙胺製備化合物I-52。MS m/z:407.4(M+H+)。
實例55:合成I-53
如實例21中所述,在步驟2中使用(順-2-胺基環己基)(甲基)胺基甲酸第三丁酯代替順-環己烷-1,2-二胺,製備化合物I-53。在步驟3之前執行脫除BOC保護基步驟(如實例3,步驟5中所述)。MS m/z:549.5(M+H+)。
實例56:合成I-54
如實例17中所述,使用(2-胺基-5-(1-乙基哌啶-4-基)苯基)胺基甲酸第三丁酯代替中間物3製備化合物I-54。MS m/z:572.6(M+H+)。
實例57:合成I-55
如實例17中所述,使用(5-(4-乙醯基哌嗪-1-基)-2-胺基苯基)胺基甲酸第三丁酯代替中間物3製備化合物I-55。MS m/z:587.5(M+H+)。
實例58:合成I-56
如實例17中所述,使用(2-胺基-5-(1-乙基-1,2,3,6-四氫吡啶-4基)苯基)胺基甲酸第三丁酯代替中間物3製備化合物I-56。MS m/z:570.6(M+H+)。
實例59:合成I-57
如實例25中所述,在步驟1中使用丁-3-烯-1-胺代替環丙胺且在步驟5中使用mCPBA代替SO2Cl2(實例2,步驟7中描述mCPBA氧化),製備化合物I-57。MS m/z:501.1(M+H+)。
實例60:合成I-58
如實例25中所述,在步驟1中使用4-胺基丁-1,2-二醇代替環丙胺且在步驟5中使用mCPBA代替SO2Cl2(實例2,步驟7中描述mCPBA氧化),製備化合物I-58。MS m/z:535.1(M+H+)。
實例61:I-59
如實例7中所述製備標題化合物。如實例1中所述,在步驟5中使用2-甲氧基乙胺代替甲胺且跳過步驟6,製備起始物質。MS m/z:505.3(M+H+)。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ:7.97(1H,s),7.67(1H,m),7.56(1H,m),7.34(2H,m),6.53(2H,s),6.46(2H,m),6.39(1H,m),5.80(1H,dd),4.70(2H,s),4.20(2H,t),3.77(6H,s),3.57(2H,t),3.25(3H,s)。
實例62:合成I-60
如實例25中所述,在步驟1中使用4-(胺基甲基)哌啶-1-甲酸第三丁酯代替環丙胺且在步驟5中使用mCPBA代替SO2Cl2(實例2,步驟7中描述mCPBA氧化),製備化合物I-60。MS m/z:644.7(M+H+)。
實例63:I-61,(外消旋)
如實例116中所述製備標題化合物。如實例1中所述,在步驟5中使用2-甲氧基乙胺代替甲胺,製備起始物質。MS m/z:579.2(M+H+)。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ:7.97(1H,s),6.91(1H,s), 6.34(1H,m),6.17(1H,dd),5.63(1H,d),4.59(2H,m),4.48(1H,br s),4.37(1H,br s),4.29(2H,m),3.97(6H,s),3.48(2H,s),3.35(3H,s),1.76(6H,m)。
實例64:合成I-62
如實例17中所述,在步驟2中使用哌嗪-1-甲酸第三丁酯代替N-乙基哌嗪製備化合物I-62。MS m/z:713.5(M+H+)。
實例65:合成I-63(外消旋)
如實例21中所述製備化合物I-63。如實例2中所述,在步驟2中使用苯甲胺代替3-硝基苯甲胺,製備中間物1。MS m/z:611.4(M+H+)。
實例66:合成I-64
如實例7中所述製備化合物I-64。如實例1中所述,在步驟5中使用噻唑-4-基甲胺代替甲胺,製備起始物質。MS m/z:544.4(M+H+)。
實例67:I-65
步驟1:中間物2
在100℃下加熱來自實例1之中間物6(100mg,0.25mmol)、2-硝基苯酚(51.7mg,0.37mmol)、Cs2CO3(162mg,0.50mmol)於NMP(5mL)中之混合物16小時。使混合物冷卻至環境溫度。添加水且用EtOAc(35mL×3)萃取所得混合物。用鹽水洗滌經合併之有機層,乾燥(Na2SO4),過濾且真空濃縮。藉由矽膠管柱層析法(4% EtOAc/DCM)純化粗產物獲得52.5mg標題化合物。
步驟2:中間物3
中間物2(52.5mg,0.10mmol)、Fe(34.5mg,0.62mmol)、NH4Cl(33.3mg,0.62mmol)於乙醇(4mL)及H2O(2mL)中之混合物加熱至回流2小時。接著,使混合物冷卻至環境溫度且過濾。真空濃縮濾液,添加水且用EtOAc(35mL×3)萃取所得混合物。用飽和NaHCO3洗滌經合併之有機層,乾燥(Na2SO4),過濾且真空濃縮。藉由矽膠管柱層析法(3% MeOH/DCM)純化粗產物獲得7.1mg標題化合物。MS m/z:476.3(M+1)+
步驟3:I-65
中間物3(7.10mg,0.02mmol)及DIPEA(3.9mg,0.03mmol)於THF(4mL)中之經冷卻(0℃)溶液中添加丙烯醯氯(1.6mg,0.02mmol)。在0℃下攪拌反應物10分鐘,此後用飽和NaHCO3淬滅且用EtOAc(20mL×3)萃取。用飽和NaHCO3洗滌經合併之有機層,乾燥(Na2SO4),過濾且真空濃縮。藉由矽膠管柱層析法(含4% EtOAc之DCM)純化殘餘物獲得3.0mg標題化合物。MS m/z:530.4(M+1)+1H NMR(400MHz,CDCl3):δ 3.45(s,3H),3.94(s,6H),4.57(s,2H),6.08(d,1H),6.41(dd,1H),6.61(s,1H),6.67(d,1H),7.05-7.11(m,1H),7.20(d,1H),7.27-7.30(m,1H),7.97(s,1H),8.38(d,1H)。
實例68:I-66
如實例84中所述,在步驟3中使用(1R,2S)-2-胺基環己基)胺基甲酸第三丁酯代替(1S,2R)-2-胺基環己基)胺基甲酸第三丁酯製備標題化合物(40mg)。MS m/z:611.1(M+H+)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ:7.96(1H,d),7.71(1H,d),7.28(4H,m),7.2(1H,m),7.0(1H,s),6.3(1H,dd),6.05(1H,dd),5.55(1H,dd),5.12(1H,br s),4.5(2H,s),3.96(6H,s),1.2-1.8(8H,m)。
實例69:I-67
步驟1:中間物2
在90℃下,在氮氣氛圍下,攪拌來自實例1之中間物5(150mg, 0.45mmol)、苯-1,2-二胺(48.5mg,0.45mmol)、Cs2CO3(292mg,0.90mmol)、Pd2(dba)3(41.0mg,0.045mmol)及xantphos(51.8mg,0.09mmol)於1,4-二噁烷(6mL)中之混合物5小時。使混合物冷卻至環境溫度。添加水且用EtOAc(30mL×3)萃取所得混合物。用鹽水洗滌經合併之有機層,乾燥(Na2SO4),過濾且真空濃縮。藉由矽膠管柱層析法(3% MeOH/DCM)純化粗產物獲得88.5mg標題化合物。MS m/z:407.4(M+1)+
步驟2:I-67
中間物2(88.2mg,0.22mmol)及Et3N(87.8mg,0.87mmol)於THF(6mL)中之經冷卻(0℃)溶液中添加2-氯乙烷磺醯氯(35.4mg,0.22mmol)。在40℃下加熱反應物6小時。添加水且用EtOAc(30mL×3)萃取所得混合物。乾燥(Na2SO4)經合併之有機層,過濾且真空濃縮。藉由矽膠管柱層析法(3% MeOH/DCM)純化粗產物獲得8.8mg標題化合物。MS m/z:497.4(M+1)+1H NMR(400MHz,CDCl3):δ 3.40(s,3H),3.79(s,6H),4.64(s,2H),5.86(d,1H),6.14(d,1H),6.39(s,1H),6.48(d,2H),6.55(dd,9.6Hz,1H),7.17-7.27(m,3H),7.46-7.52(m,2H),7.95(s,1H),8.12(s,1H)。
實例70:合成I-68(外消旋)
如實例21中所述,使用來自實例25之中間物6代替中間物2製備化合物I-68。MS m/z:561.5(M+H+)。
實例71:合成I-69(外消旋)
如實例21中所述,使用來自實例116之中間物1代替中間物2製備化合物I-69。MS m/z:618.4(M+H+)。
實例72:合成I-70(外消旋)
如實例21中所述製備化合物I-70。如實例2中所述,在步驟2中使用環丁胺代替3-硝基苯甲胺,製備起始物質。MS m/z:575.3(M+H+)。
實例73:合成I-71(外消旋)
如實例10中所述,在步驟1中使用7-氯-3-(3,5-二甲氧基苯基)-1,4-二甲基-3,4-二氫嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮代替中間物8(如實例2中所述,在步驟2中使用1-(2,4-二氯嘧啶-5-基)乙酮代替中間物2,使用甲胺代替3-硝基苯甲基胺且忽略步驟6製備)且忽略步驟2至5,製備化合物I-71。MS m/z:481.5(M+H+)。
實例74:合成I-72(外消旋)
如實例4中所述,在步驟1中使用7-氯-3-(3,5-二甲氧基苯基)-1,4-二甲基-3,4-二氫嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮代替中間物1(如實例2中所述,在步驟2中使用1-(2,4-二氯嘧啶-5-基)乙酮代替中間物2,使用甲胺代替3-硝基苯甲基胺且忽略步驟6製備),製備化合物I-72。MS m/z:475.5(M+H+)。
實例75:合成I-73(外消旋)
如實例21中所述製備化合物I-73。如實例2中所述,在步驟2中使 用氨(amonia)代替3-硝基苯甲胺,製備起始物質。MS m/z:521.2(M+H+)。
實例76:I-74
如實例29中所述,使用來自實例1之中間物6代替中間物5製備標題化合物。MS m/z:609.0(M+H+)。1H NMR(400MHz,CDCl3):δ:8.01(1H,s),7.95(2H,m),7.84(1H,s),7.52(1H,dd),7.44(1H,dd),6.88(1H,s),6.47(1H,dd),6.38(1H,dd),5.80(1H,dd),4.60(2H,s),3.95(6H,s),3.91(3H,s),3.35(3H,s)。
實例77:合成I-75
如實例102中所述,在步驟5中使用甲胺代替環丙胺製備化合物I-75。MS m/z:495.3(M+H+)。
實例78:合成I-76(外消旋)
如實例21中所述製備化合物I-76。如實例2中所述,在步驟2中使用甲胺代替3-硝基苯甲胺,在步驟4中使用2-氯-3,5-二甲氧基苯胺代替3,5-二甲氧基苯胺且跳過步驟6,製備起始物質。MS m/z:501.3(M+H+)。
實例79;I-77
如實例29中所述,在步驟1中使用5-溴-2硝基苯胺代替中間物1製備標題化合物。MS m/z:541.2(M+H+)。1H NMR(400MHz,CDCl3):δ:8.00(1H,s),7.95(1H,s),7.84(1H,s),7.77(1H,s),7.64(1H,d),7.53(1H,m),6.54(2H,s),6.46(1H,m),6.41(1H,m),5.83(1H,dd),4.71(2H,s),3.93(3H,s),3.78(6H,s),3.36(3H,s)。
實例80:I-78
如實例29中所述,在步驟2中使用2-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧硼-2-基)噻唑代替中間物3,製備標題化合物。MS m/z:544.2(M+H+)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ:9.94(1H,s),8.91(1H,s),8.52(1H,s),8.12(1H,s),7.89(1H,d),7.74(1H,d),7.68(1H,dd),6.54(3H,m),6.41(1H,m),6.27(1H,dd),5.79(1H,dd),4.69(2H,s),3.72(6H,s),3.26(3H,s)。
實例81:合成I-79
如實例7中所述製備化合物I-79。如實例1中所述,在步驟5中使用1-甲基哌啶-4-胺代替甲胺,製備起始物質。MS m/z:468.3(M+H+)。
實例82:合成I-80
如實例7中所述製備化合物I-80。如實例1中所述,在步驟5中使用1-乙基哌啶-4-胺代替甲胺,製備起始物質。MS m/z:558.4(M+H+)。
實例83:合成I-81
如實例7中所述製備化合物I-81。如實例1中所述,在步驟5中使用4-胺基哌啶-1-甲酸第三丁酯代替甲胺,製備起始物質。執行最終脫除BOC保護基(如實例3,步驟5中所述)。MS m/z:530.3(M+H+)。
實例84:合成I-82
步驟1:中間物2
如實例1中所述,在步驟5中使用苯甲胺代替甲胺,製備標題化合物。
步驟2:中間物3
如文獻(Chemistry & Biology 2010,17,285-295)中所述製備標題化合物。將中間物2(150mg,0.31mmol)及HOBT(78mg,0.51mmoL)溶解於4mL DMF中且攪拌90分鐘。添加氨(3.8mL,二噁烷中0.5N,1.9mmoL)且在環境溫度下攪拌反應混合物隔夜。減壓移除溶劑,且將反應混合物分配於水、鹽水及氯仿之間。經硫酸鈉乾燥有機相,且減壓移除溶劑獲得300mg標題化合物,其原樣用於下一反應中。MS m/z:578.2(M+H+)。
步驟3:中間物4
中間物3(300mg,0.52mmoL)、((1S,2R)-2-胺基環己基)胺基甲酸第三丁酯(214mg,1mmoL)及DIPEA(170μL,1.56mmoL)於4mL DMF中之溶液加熱至70℃持續4小時。使反應混合物冷卻,且分配於水、鹽水及EtOAc之間。經硫酸鈉乾燥有機相,且使溶劑減壓。對粗產物進行矽膠層析法(用含0-75% EtOAc之庚烷梯度溶離),獲得57mg標題化合物。MS m/z:657.2(M+H+)。
步驟4:中間物5
中間物4(57mg,0.087mmol)於5mL DCM中之溶液中添加500μL HCl(二噁烷中4N)且在環境溫度下攪拌反應物1小時。加壓移除溶 劑,獲得77mg標題化合物。MS m/z:557.2(M+H+)。
步驟5:I-82
中間物5(77mg,0.13mmoL)及丙烯酸(9μl,0.13mmoL)於500μL of DMF中之溶液中添加DIPEA(114μL,0.65mmoL)及HATU(49mg,0.13mmoL)。在環境溫度下攪拌反應物15分鐘,接著藉由急驟層析法(用含0-70%丙酮之庚烷梯度溶離)直接純化,獲得16mg標題化合物。MS m/z:611.1(M+H+)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ:7.96(1H,d),7.72(1H,d),7.28(4H,m),7.2(1H,m),7.0(1H,s),6.31(1H,dd),6.05(1H,dd),5.55(1H,dd),5.12(2H,br s),4.5(2H,s),3.96(6H,s),1.2-1.8(8H,m)。
實例85:合成I-83
步驟1:中間物2
根據文獻程序(WO 01/29042;PCT/EP00/10088)自中間物1製備標題化合物。
步驟2:中間物3
在微波中,在120℃下均勻加熱中間物2(53mg,0.14mmol)及苯二胺(74mg,0.69mmoL)30分鐘。對粗產物進行矽膠急驟層析法(用含0-80% EtOAc之庚烷梯度溶離),獲得30mg標題化合物。MS m/z:415.1(M+H+)。
步驟3:I-83
中間物3(30mg,0.072mmol)於500μL THF中之經冷卻(-10℃)溶液中添加丙烯醯氯(6.1μL,0.076mmoL)。在-10℃下攪拌反應物5分鐘,接著用DIPEA(14μL,0.079mmoL)處理且再攪拌5分鐘。將反應混合物分配於水、鹽水之間,且分離有機層,且使用矽膠急驟層析法(用含0-100% EtOAc之庚烷梯度溶離)純化,獲得25mg標題化合物。MS m/z:469.1(M+H+)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ:8.68(1H,s),8.12(1H,s),7.8(1H,d),7.64(2H,d),7.58(1H,d),7.48(1H,t),7.2(1H,t),7.12(1H,t),6.5(1H,dd),6.3(1H,dd),5.79(1H,dd), 4.57(2H,s),3.25(3H,s)。
實例86:合成I-84
如實例31中所述,在步驟2中使用2-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧硼-2-基)噻唑代替中間物3,製備化合物I-84。MS m/z:544.4(M+H+)。
實例87:合成I-85
如實例7中所述製備化合物I-85。如實例1中所述,在步驟5中使用4-胺基哌啶-1-甲酸第三丁酯代替甲胺,製備起始物質。執行最終脫除BOC保護基(如實例3,步驟5中所述)。MS m/z:598.2(M+H+)。
實例88:合成I-86
如實例7中所述製備化合物I-86。如實例1中所述,在步驟5中使用噻唑-4-基甲胺代替甲胺,製備起始物質。MS m/z:612.3(M+H+)。
實例89:合成I-87
如實例7中所述製備化合物I-87。如實例1中所述,在步驟5中使用4-(胺基甲基)吡啶-2-胺代替甲胺,製備起始物質。MS m/z:553.4(M+H+)。
實例90:合成I-88
如實例7中所述製備化合物I-88。如實例1中所述,在步驟5中使用氧雜環丁-3-胺代替甲胺,製備起始物質。MS m/z:503.4(M+H+)。
實例91:合成I-89(外消旋)
如實例21中所述製備化合物I-89。使用N-(3-((7-氯-3-(2,6-二氯-3,5-二甲氧基苯基)-2-側氧基-3,4-二氫嘧啶并[4,5-d]嘧啶-1(2H)-基)甲基)苯基)甲烷磺醯胺代替中間物2且其如實例1中所述,在步驟5中使用N-(3-(胺基甲基)苯基)甲烷磺醯胺代替甲胺製備。MS m/z:704.3 (M+H+)。
實例92:合成I-90
如實例7中所述製備化合物I-90。如實例1中所述,在步驟5中使用3-(胺基甲基)苯甲腈代替甲胺,製備起始物質。MS m/z:562.5(M+H+)。
實例93:I-91
如實例5中所述製備標題化合物。如實例1中所述,在步驟5中使用噻唑-2-基甲胺代替甲胺,製備起始物質。MS m/z:612.0(M+H+)。1H NMR(400MHz,CDCl3):δ:8.07(1H,s),7.11(1H,d),7.51(3H,m),7.23(2H,m),6.90(1H,s),6.45(1H,dd),6.34(1H,dd),5.79(1H,dd),5.50(2H,s),4.67(2H,s),3.96(6H,s)。
實例94:I-92
如實例116中所述製備標題化合物。如實例1中所述,在步驟5中使用噻唑-2-基甲胺代替甲胺,製備起始物質。MS m/z:618.2(M+H+)。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ:8.00(1H,s),7.70(1H,d),7.52(1H,d),6.92(1H,s),6.32(1H,dd),6.16(1H,d),5.62(1H,dd),5.56(2H,br),4.65(2H,s),3.97(6H,s),1.69(6H,br),1.51(2H,br)。
實例95:合成I-93
如實例116中所述,在步驟2中使用((1R,2S)-2-胺基環己基)胺基甲酸第三丁酯代替((1S,2R)-2-胺基環己基)胺基甲酸第三丁酯製備化合物I-93。如實例1中所述,在步驟5中使用噻唑-2-基甲胺代替甲胺,製備起始物質。MS m/z:618.1(M+H+)。
實例96:合成I-94
如實例116中所述,在步驟2中使用((1R,2S)-2-胺基環己基)胺基甲酸第三丁酯代替((1S,2R)-2-胺基環己基)胺基甲酸第三丁酯製備化合物I-94。起始物質為來自實例1之中間物6。MS m/z:535.1(M+H+)。
實例97:合成I-95
步驟1:中間物2
如實例84中所述,在步驟2中使用6-CF3-HOBT代替HOBT,自中間物6(實例1)製備標題化合物(645mg,MS m/z:570.0(M+H+))。
步驟2:中間物3
如實例84,步驟3中所述,自中間物2製備標題化合物(440mg,MS m/z:581.2(M+H+)。
步驟3:中間物4
中間物3(440mg,0.76mmol)於10mL DCM中之溶液中添加10mL HCl(二噁烷中4N)且在環境溫度下攪拌反應物2小時。減壓移除溶劑且所得固體直接用於後續反應中。
步驟4:I-95
如實例84,步驟5中所述製備標題化合物(190mg)。MS m/z:535.1(M+H)+1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ:7.96(1H,s),7.77(1H,d),6.98(1H,s),6.7(1H,br s),6.32(1H,br s),6.04(1H,d),5.55(1H,dd),4.44(2H,s),4.14(2H,m),3.97(6H,s),3.22(3H,s),1.37-1.76(8H,m)。
實例98:合成I-96
如實例7中所述製備化合物I-96。如實例1中所述,在步驟5中使用2-胺基乙酸第三丁酯代替甲胺,製備起始物質。MS m/z:561.5(M+H+)。
實例99:合成I-97
如實例7中所述製備化合物I-97。如實例1中所述,在步驟5中使用3-(胺基甲基)苯甲胺代替甲胺,製備起始物質。MS m/z:580.4(M+H+)。
實例100:合成I-98
如實例7中所述製備化合物I-98。如實例1中所述,在步驟5中使用環丙基甲胺代替甲胺,製備起始物質。MS m/z:501.5(M+H+)。
實例101:合成I-99
如實例7中所述製備化合物I-99。如實例1中所述,在步驟5中使用2,2-二氟丙-1-胺代替甲胺,製備起始物質。MS m/z:511.6(M+H+)。
實例102:I-100
步驟1:中間物2
向125mL密封試管中,向甲苯(50mL,469mmol)中添加3,5-二甲氧基苯胺(2.00g,13.1mmol)。緩慢添加乙酸酐(1.36mL,14.4mmol)且形成沈澱物。將反應物加熱至45℃持續30分鐘,接著在室溫下攪拌反應物隔夜。第二天,用己烷稀釋反應物且過濾,用額外己烷沖洗且真空乾燥獲得2.5g標題化合物。MS m/z:196.2(M+H)+
步驟2:中間物3
向250mL圓底燒瓶中添加含N-(3,5-二甲氧基苯基)乙醯胺(3.20 g,16.4mmol)之DCM(75mL)。使反應混合物冷卻至0℃。緩慢添加含N-氯丁二醯亞胺(2.30g,17.2mmol)之25mL DCM且在環境溫度下攪拌混合物16小時。濃縮反應物且溶解於己烷-EtOAc之1-1混合物中。過濾所得沈澱物,濃縮濾液,溶解於1:1己烷-EtOAc中且過濾固體獲得第二批固體。合併所收集之沈澱物,且藉由矽膠(用含25% EtOAc之己烷溶離)純化獲得1.50g標題化合物。MS m/z:230.2(M+H)+
步驟3:中間物4
向125mL密封燒瓶中添加含中間物3(1.90g,8.27mmol)之EtOH(50mL,856mmol),隨後添加含氫氧化鉀(2.32g,41.4mmol)之10mL水。在95℃下攪拌反應物16小時,隨後冷卻且濃縮。將所得油狀物分配於水與EtOAc之間,經MgSO4乾燥有機層,過濾且濃縮獲得1.00g標題化合物。MS m/z:188.1(M+H)+
步驟4:合成中間物5
向密封容器中,添加含中間物4(1.50g,8.00mmol)之DMA(5mL,53.3mmol),隨後添加DIPEA(820μl,8.80mmol)。在環境溫度下攪拌反應混合物10分鐘,且添加來自實例1之2,4-二氯-5-(碘甲基)嘧啶(2.31g,8.00mmol)。在60℃下攪拌反應混合物7.5小時,接著在環境溫度下攪拌16小時。濃縮反應混合物且與甲苯共沸若干次。添加EtOAc,且用鹽水(3×)洗滌有機層。用硫酸鈉乾燥有機層,濃縮且藉由急驟管柱層析法(用含5-25% EtOAc之庚烷)純化獲得1.75g標題化合 物。MS m/z:348.2(M+H)+
步驟5:合成中間物6
將中間物5(1.50g,4.30mmol)溶解於1,4-二噁烷(20mL)中。添加環丙基甲胺(612mg,8.61mmol)及DIPEA(1.54mL,8.61mmol)。在35℃下攪拌溶液3小時。添加水(20mL),且分離有機層,經硫酸鎂乾燥、過濾且減壓濃縮。對殘餘物進行矽膠層析法(用DCM溶離)獲得1.17g標題化合物。MS m/z:383.4(M+H)+
步驟6:中間物7
中間物6(1.16g,3.03mmol)溶解於DCM(15mL)中。以一份添加三光氣(873mg,3.33mmol)。黃色溶液變得部分混濁,接著變回溶液。在環境溫度下攪拌混合物30分鐘。添加三乙胺(2.11 mL,15.13mmol),且在環境溫度下攪拌所得懸浮液18小時。觀測到形成氯甲酸酯中間物([M+H]+=445m/z)。將懸浮液轉移至壓力容器中且在50℃下再攪拌48小時。使混合物冷卻且用水(20mL)及碳酸氫鈉飽和水溶液(20mL)洗滌有機相。經硫酸鎂乾燥有機層,過濾且減壓濃縮。對殘餘物進行矽膠層析法(含0-5% EtOAC之DCM)獲得1.04g標題化合物。MS m/z:409.4(M+H)+
步驟7:中間物8
中間物7溶解於1,4-二噁烷(3mL)中,且添加苯-1,2-二胺(52.85mg,489μmol)及TFA(244μmol)。在95℃下攪拌溶液20小時。用EtOAc稀釋溶液且用碳酸氫鈉飽和水溶液(5mL)及鹽水(5mL)洗滌,接著經硫酸鈉乾燥,過濾且減壓濃縮。對殘餘物進行矽膠層析法(含5% MeOH之DCM)獲得100mg標題化合物。MS m/z:481.5(M+H)+
步驟8:I-100
中間物8(98.0mg,204μmol)溶解於DCM(2mL)中。添加Et3N(56.8μl,408μmol),隨後添加丙烯醯氯(19.9μl,245μmol)。在環境溫度下攪拌溶液30分鐘,接著添加MeOH,且減壓濃縮反應混合物。經逆相層析法(用MeOH,接著含1N NH3之甲醇預溶離)層析殘餘物。隨後經矽膠(含20-30% EtOAc之DCM)層析獲得21.0mg標題化合物。MS m/z:535.6(M+H)+1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 9.84(s,1H),8.56(s,1H),8.08(d,1H),7.74(dd,1H),7.57(d,1H),7.19(td,1H),7.12(td,1H),6.76(dd,2H),6.52(dd,1H),6.28(dd,1H),5.78(dd,1H),4.78-4.67(m,1H),4.47(d,1H),4.14-3.93(m,1H),3.87(s,3H),3.79(m,5H),1.17(m,1H),1.01-0.69(m,1H),0.48-0.10(m,4H)。
實例103:I-101
步驟1:中間物2
將來自實例102之中間物7(100mg,244μmol)與順環己烷-1,2-二胺(69.75mg,610.85μmol)合併且溶解於1,4-二噁烷(3mL)中。在95℃下攪拌溶液20小時。使溶液冷卻至環境溫度且減壓濃縮。對殘餘物進行矽膠層析法(3%含MeOH中1N NH3之DCM)獲得90mg標題化合物。MS m/z:487.5(M+H)+
步驟2:I-101
中間物2(90mg,185μmol)溶解於DCM(2mL)中。添加三乙胺(51.5μl,370μmol),隨後添加丙烯醯氯(18.0μl,222μmol)。在環境溫度下攪拌溶液30分鐘,此後用MeOH淬滅且減壓濃縮。經逆相HPLC層析殘餘物,接著矽膠層析獲得標題化合物。MS m/z:541.6(M+H)+1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 7.95(s,1H),7.74(d,1H), 6.78(t,1H),),6.73(d,1H),6.60(br s,1H),6.34(dd,2H),6.04(dd,1H),5.56(dd,1H),4.64(d,1H),4.41(d,1H),4.22(br s,1H),4.05(br s,1H),3.90-3.80(3,7H),1.84-1.03(m,10H),0.92-0.73(m,1H),0.61-0.3(m,4H)。
實例104:合成I-102
如實例7中所述製備化合物I-102。如實例1中所述,在步驟5中使用2-氟丙-1-胺代替甲胺,製備起始物質。MS m/z:493.6(M+H+)。
實例105:合成I-103
如實例7中所述製備化合物I-103。如實例1中所述,在步驟5中使用2,2-二氟丙-1-胺代替甲胺,製備起始物質。MS m/z:579.5(M+H+)。
實例106:合成I-104
如實例7中所述製備化合物I-104。如實例1中所述,在步驟5中使 用2,2-二氟丙-1-胺代替甲胺且在步驟4中使用2-氯-3,5-二甲氧基苯胺代替3,5-二甲氧基苯胺,製備起始物質。MS m/z:545.5(M+H+)。
實例107:合成I-105(外消旋)
如實例21中所述製備化合物I-105。使用7-氯-3-(2,6-二氯-3,5-二甲氧基苯基)-1-(2,2-二氟乙基)-3,4-二氫嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮代替中間物2且如實例1中所述在步驟5中使用2,2-二氟丙-1-胺代替甲胺製備。MS m/z:585.5(M+H+)。
實例108:合成I-106(外消旋)
如實例21中所述製備化合物I-106。使用7-氯-3-(2,6-二氯-3,5-二甲氧基苯基)-1-(2-氟乙基)-3,4-二氫嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮代替中間物2且如實例1中所述在步驟5中使用2-氟丙-1-胺代替甲胺製備。MS m/z:567.5(M+H+)。
實例109:合成I-107(外消旋)
如實例21中所述製備化合物I-107。使用7-氯-3-(2-氯-3,5-二甲氧基苯基)-1-(2,2-二氟乙基)-3,4-二氫嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮代替中間物2且如實例1中所述在步驟5中使用2,2-二氟丙-1-胺代替甲胺且在步驟4中使用2-氯-3,5-二甲氧基苯胺代替3,5-二甲氧基苯胺製備。MS m/z:551.6(M+H+)。
實例110:合成I-108
步驟1:中間物1
向125mL密封試管中,添加含3,5-二甲氧基苯胺(2.00g,13.1mmol)之甲苯(50mL)。添加乙酸酐(1.36mL,14.4mmol)且開始形成沈澱物。將反應物加熱至45℃持續30分鐘,接著冷卻至環境溫度且攪拌16小時。用己烷稀釋反應混合物且過濾。用額外己烷沖洗固體且真 空乾燥濾液獲得2.50g標題化合物。MS m/z:196.2(M+H)+
步驟2:中間物2
向125mL圓底燒瓶中添加selectfluor(5.99g,16.9mmol)及MeCN(40mL)且冷卻至0℃。在0℃下添加含中間物1(3.00g,15.4mmol)之10mL MeCN且攪拌反應物且升溫至環境溫度16小時。濃縮反應物,添加EtOAc及H2O,且分離有機層,經MgSO4乾燥,過濾且濃縮濾液。對所得殘餘物進行矽膠(用DCM-EtOAc溶離)純化。第二次純化(用含4% MeOH之DCM溶離)獲得800mg標題化合物。LC.MS m/z:214.2(M+H)+
步驟3:中間物3
向125mL圓底燒瓶中添加含中間物2(700mg,3.28mmol)之EtOH(9.6mL)及含氫氧化鉀(918mg,16.4mmol)之4mL H2O,且密封反應物,且在90℃下加熱20小時。濃縮反應混合物,添加H2O及EtOAc,且分離有機層,經MgS04乾燥,過濾且濃縮。藉由矽膠(用含40% EtOAc之己烷溶離)純化所得固體獲得450mg標題化合物。LC.MS m/z:172.1(M+H)+
步驟4:中間物4
向密封容器中添加中間物3(2.38g,13.9mmol)、DMA(20mL)及DIPEA(27.8mmol,2.59mL)。在環境溫度下攪拌反應混合物15分 鐘,此後添加2,4-二氯-5-(碘甲基)嘧啶(4.02g,13.9mmol)。在50℃下加熱反應混合物16小時,此後使其冷卻至環境溫度,接著分配於NH4Cl飽和水溶液(40mL)與EtOAc(40mL)之間。收集有機相且再用EtOAc(40mL)萃取水相一次。合併有機相,經MgSO4乾燥且濃縮。藉由矽膠急驟層析法(用含30% EtOAc之己烷溶離)純化獲得4.07g標題化合物。MS m/z:332.2(M+H)+
步驟5:中間物5
中間物4(1.00g,3.00mmol)於二噁烷(10mL)中之溶液中添加DIPEA(0.70mL,7.53mmol)及含2M甲胺之THF(4.52mL,9.03mmol)。將反應混合物加熱至50℃持續16小時。添加額外甲胺(9.03mmol,4.52mL),且在50℃下再攪拌反應混合物16小時。濃縮反應混合物且藉由矽膠急驟層析法(用含50% EtOAC之庚烷溶離)純化獲得570mg標題化合物。MS m/z:327.3(M+H)+
步驟6:中間物6
在環境溫度下,向中間物5(570mg,1.74mmol)於THF(10mL)中之溶液中添加三光氣(1.92mmol,569mg)。在環境溫度下攪拌混合物30分鐘,此後添加Et3N(0.74mL,5.23mmol),且在環境溫度下攪拌反應混合物5小時。向反應混合物(5mL)中緩慢添加H2O,隨後添加NaH2CO3飽和水溶液(20mL)直至達到pH 10。
用EtOAc(2×20mL)萃取反應混合物,用鹽水洗滌經合併之有機 相且經MgSO4乾燥,且減壓移除溶劑。用Et2O濕磨所得殘餘物,且過濾固體獲得490mg標題化合物。濃縮濾液獲得額外100mg標題化合物,其藉由矽膠急驟層析法(用含10% EtOAc之DCM溶離)純化獲得額外20mg標題化合物。MS m/z:353.3(M+H)+
步驟7:中間物7
在環境溫度下,向中間物6(250mg,0.71mmol)於1,4-二噁烷(5mL)中之溶液中添加1,2-苯二胺(230mg,2.3mmol),隨後添加2滴TFA。在95℃下加熱反應混合物16小時,此後使其冷卻至環境溫度,且分配於NH4Cl飽和水溶液(10mL)與EtOAc(20mL)之間。用鹽水洗滌有機相,經MgSO4乾燥,減壓濃縮且藉由矽膠急驟層析法(用含20% EtOAc之DCM溶離)純化所得殘餘物獲得163mg標題化合物。MS m/z:425.5(M+H)+
步驟8:I-108
中間物7(163mg,0.38mmol)於DCM(5mL)中之溶液中添加Et3N(0.05mL,0.38mmol)。使混合物冷卻至0℃,且逐滴添加丙烯醯氯(34.8mg,0.38mmol)。在0℃下攪拌反應混合物5分鐘,接著升溫至環境溫度持續30分鐘。將反應混合物分配於NH4Cl飽和水溶液(10mL)與EtOAc(20mL)之間。經MgSO4乾燥有機相,濃縮,且藉由矽膠急驟層析法(用含60% EtOAc之DMC溶離)純化殘餘物獲得32mg標題 化合物。MS m/z:479.5(M+H)+1H NMR(400MHz,CDCl3):δ 3.4(s,3H),3.80(s,3H),3.90(s,3H),4.6(s,2H),5.75(d,1H),6.2(m,1H),6.4(m,2H),6.55(d,1H),7.25(m,3H),7.5(s,1H),7.8(s,1H),7.9(s,1H),8.4(s,1H)。
實例111:合成I-109
如實例7中所述製備化合物I-109。如實例1中所述,在步驟5中使用環丙基甲胺代替甲胺且在步驟4中使用2-氟-3,5-二甲氧基苯胺代替3,5-二甲氧基苯胺,製備起始物質。MS m/z:519.6(M+H+)。
實例112:合成I-110
如實例7中所述製備化合物I-110。如實例1中所述,在步驟5中使用2-氟丙-1-胺代替甲胺且在步驟4中使用2-氯-3,5-二甲氧基苯胺代替3,5-二甲氧基苯胺,製備起始物質。MS m/z:527.5(M+H+)。
實例113:合成I-111(外消旋)
如實例21中所述製備化合物I-111。使用7-氯-3-(2-氯-3,5-二甲氧基苯基)-1-(2-氟乙基)-3,4-二氫嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮代替中間物2且如實例1中所述在步驟5中使用2-氟丙-1-胺代替甲胺且在步驟4中使用2-氯-3,5-二甲氧基苯胺代替3,5-二甲氧基苯胺製備。MS m/z:533.5(M+H+)。
實例114:合成I-112(外消旋)
如實例21中所述,在步驟2中使用順-環戊烷-1,2-二胺代替順-環己烷-1,2-二胺,製備化合物I-112。MS m/z:521.3(M+H+)。
實例115:合成I-113(外消旋)
如實例21中所述,在步驟2中使用順-環己-4-烯-1,2-二胺代替順-環己烷-1,2-二胺,製備化合物I-113。MS m/z:533.4(M+H+)。
實例116:合成I-114
步驟1:中間物2
根據經修正文獻程序(WO 2009;PCT/US2009/002401)自中間物1製備標題化合物。如實例1中所述,在步驟5中使用噻唑-4-基甲胺代替甲胺製備中間物1。將中間物1(540mg,1.11mmoL)、HOBT(340mg,2.23mmoL)及NMP(735μL,6.68mmoL)裝入12mL二噁烷中;加熱至100℃持續2小時。減壓移除溶劑,且添加水以引起沈澱,藉由過濾移除所得固體且濃縮濾液獲得672mg標題化合物,其直接用於下一反應中。MS m/z:585.0(M+H+)。
步驟2:中間物3
中間物2(672mg,1.15mmoL)、((1S,2R)-2-胺基環己基)胺基甲酸第三丁酯(492mg,2.3mmoL)及NMP(400μL,3.67mmoL)於12mL DMF/1.2mL NMP中之溶液加熱至100℃持續16小時。減壓移除溶劑且對粗產物進行矽膠層析法(用含0-100% EtOAc之庚烷梯度溶離),獲得650mg標題化合物。MS m/z:664.1(M+H+)。
步驟3:中間物4
中間物3(650mg,0.98mmoL)於10mL DCM中之溶液中添加10mL HCl(二噁烷中4N)且在環境溫度下攪拌反應物2小時。減壓移除溶劑獲得標題化合物。MS m/z:564.0(M+H+)。
步驟4:I-114
在冰水/甲醇浴中冷卻中間物4(552mg,0.98mmoL)於3mL DMF中之溶液且添加丙烯酸(62μl,0.98mmoL)。向混合物中添加DIPEA(1mL,5.9mmoL),接著添加HATU(345mg,0.98mmoL)。在環境溫度下攪拌反應物15分鐘,且藉由急驟層析法(用含0-100%丙酮之庚烷梯度溶離)直接純化,獲得515mg標題化合物。MS m/z:618.0(M+H+)。
實例117:合成I-115
步驟1:中間物1
向1000mL圓底燒瓶中添加selectfluor(13.5g,38.2mmol)及MeCN(400mL)。將懸浮液冷卻至0℃,且經10分鐘緩慢添加含3,5-二甲氧基苯甲酸甲酯(5.00g,25.5mmol)之最少MeCN。攪拌反應混合物且經2天升溫至室溫,此後添加碳酸鈉飽和水溶液且攪拌反應混合物15分鐘,且減壓移除MeCN。添加水及EtOAc,且用NaCl飽和水溶液(3×)洗滌有機層。經MgSO4乾燥有機層,過濾且乾燥濃縮且經矽膠急驟層析法(用含30至50%己烷之DCM溶離)純化獲得1.0g標題化合物。MS m/z:233.3(M+H+)。
步驟2:合成中間物2
向125mL密封試管中添加含甲基中間物1(1.00g,4.31mmol)及KOH(507mg,9.04mmol)之EtOH(25mL)。將反應混合物加熱至90℃持續20小時,接著冷卻且濃縮。添加水且用1N HCl處理所得溶液直至達到pH <3。形成白色沈澱物,將其過濾且用水沖洗。將固體溶解於EtOAc中,經MgSO4乾燥,且濃縮有機濾液獲得600mg標題化合物。MS m/z:219.2(M+H+)。
步驟3:中間物3
向125mL圓底試管中添加含中間物2(0.62g,2.84mmol)、疊氮磷酸二苯酯(647μl,2.98mmol)、Et3N(416μl,2.98mmol)及2-甲基丙-2-醇(299μl,3.13mmol)之甲苯(5mL)且密封反應混合物且加熱至70℃持續2小時。冷卻反應混合物,且減壓移除甲苯。添加EtOAc且依序用Na2CO3飽和水溶液(2×)及NaCl飽和水溶液(2×)洗滌有機相。經MgSO4乾燥有機相,濃縮,且藉由矽膠(用含100% EtOAc之DMC溶離)純化所得殘餘物獲得500mg標題化合物。1H NMR(500MHz,DMSO-d6):δ 8.81(s,1H),6.89(t,1H),3.32(s,6H),1.42(s,9H)。
步驟4:中間物4
向125mL圓底燒瓶中添加中間物3(500mg,1.73mmol)、含4N HCl之二噁烷(8.64mL,34.6mmol)且在環境溫度下攪拌反應混合物5小時,此後濃縮獲得標題化合物之HCl鹽。1H NMR(500MHz,DMSO-d6):δ 6.17(s,2H),3.77(s,6H)。
步驟5:中間物5
向125mL試管中添加含中間物4(360mg,1.60mmol)、2,4-二氯-5-(碘甲基)嘧啶(461mg,1.60mmol)及DIPEA(848μl,4.79mmol)之DMA(4mL)。密封試管且在攪拌下將反應混合物加熱至65℃持續4小時,隨後冷卻,濃縮且與甲苯共蒸發若干次。將所得油狀物溶解於EtOAc中,且藉由過濾移除固體。濃縮濾液,溶解於DCM中且藉由矽膠急驟層析法(用EtOAc/己烷溶離)純化獲得350mg標題化合物。MS m/z:350.3(M+H+)。
步驟6:中間物6
中間物5(128mg,365.56μmol)及2,2-二氟乙胺(59.3mg,731μmol)溶解於1,4-二噁烷中。添加DIPEA(131μl,731μmol)且在45℃下攪拌溶液5小時,接著在40℃下攪拌2天。減壓濃縮溶液,且經矽膠急驟層析法(含30% EtOAc之己烷)純化所得殘餘物獲得105mg標題化合物。MS m/z:395.4(M+H+)。
步驟7:中間物7
中間物6(103mg,261μmol)溶解於DCM(2mL)中且添加三光氣(85.2mg,287μmol)。在環境溫度下攪拌溶液1小時。添加Et3N(182μl,1.30mmol)且再攪拌溶液1小時。LCMS顯示中間物6消失且形成胺甲醯氯中間物。在50℃下加熱反應混合物持續72小時,此後使其冷卻至環境溫度且添加水(2mL),隨後添加碳酸氫鈉飽和水溶液(3mL)。在環境溫度下攪拌混合物30分鐘,接著用DCM萃取且經MgSO4乾燥有機層,過濾且減壓濃縮。經矽膠急驟層析法(用DCM溶離)純化所得殘餘物獲得80mg標題化合物。MS m/z:421.4(M+H+)。
步驟8:中間物8
中間物7(32.0mg,76.1μmol)溶解於1,4-二噁烷(0.5mL)中且添加順-環己烷-1,2-二胺(21.7mg,190μmol)。在密封試管中,在90℃下攪拌溶液18小時,隨後減壓濃縮且經矽膠急驟層析法(用含10% MeOH之DCM溶離)純化所得殘餘物獲得33mg標題化合物。MS m/z:499.6(M+H+)。
步驟9:I-115
中間物8(30mg,60.2μmol)溶解於DCM中。將溶液冷卻至0℃,且添加Et3N(16.8μl,120μmol),隨後添加丙烯醯氯(4.87μl,60.2μmol)。在0℃下攪拌懸浮液45分鐘。添加甲醇且減壓濃縮所得溶液。對殘餘物進行矽膠層析法(用含60% EtOAc之DCM溶離)獲得20mg標題化合物。MS m/z:553.6(M+H+)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 8.01(s,1H),7.76(m,1H),7.07(t,1H),7.00-6.60(m,1H),6.48-6.11(m,2H),6.03(dd,1H),5.54(dd,1H),4.57(s,2H),4.37(m,2H),4.18(m,2H),4.09(s,6H),1.86-1.24(m,8H)。
實例118:合成I-116
步驟1:中間物2
將來自實例117之中間物7溶解於1,4-二噁烷(0.5mL)中,且添加苯-1,2-二胺(16.5mg,152μmol)及2滴TFA。密封容器,且在90℃下攪拌溶液18小時,隨後減壓濃縮反應混合物且經矽膠層析法(用含60% EtOAc之DCM溶離)純化所得殘餘物獲得21.0mg標題化合物。MS m/z:493.5(M+H+)。
步驟2:I-116
中間物2(20.0mg,40.6μmol)溶解於DCM中且將溶液冷卻至0℃。添加Et3N(11.3μl,81.2μmol),隨後添加丙烯醯氯(3.21μl,40.6μmol)。在0℃下攪拌懸浮液1.5小時,隨後添加甲醇且減壓濃縮混合物。對所得殘餘物進行矽膠層析法(含30% EtOAc之DCM)獲得11.0mg標題化合物。MS m/z:547.6(M+H+)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 9.82(s,1H),8.75(s,1H),8.14(s,1H),7.72(dd,1H),7.65-7.53(m,1H),7.25-7.01(m,3H),6.51(dd,1H),6.40-6.04(m,2H),5.78(dd,1H),4.65(s,2H),4.32(m,2H),3.90(s,6H)。
實例119;合成I-117
步驟1:中間物2
向10mL試管中添加含來自實例1之中間物6(140mg,347μmol)、碳酸鉀(240mg,1.73mmol)、Brett Phos(16.2mg,17.3μmol)、1-甲基-1H-吡唑-3,4-二胺二鹽酸鹽(64.2mg,347μmol)之第三丁醇(6ml,62.7mmol),且密封反應混合物且用氮氣淨化。將混合物加熱至110℃持續8小時,隨後濕氣冷卻至環境溫度且添加水。經過濾收集所得沈澱物。且用DCM萃取濾液。經MgSO4乾燥有機層,過濾且濃縮。藉由矽膠急驟層析法(MeOH/DCM)純化經合併之固體獲得48.0mg標題化合物。MS m/z:479.4(M+H)+1HNMR符合單種異構體,儘管2D NMR相互關係未確認形成何種異構體。指派材料之區位化學性,中間物2之指派基於N-甲基吡唑胺降低之親電子性且材料用於下一步驟。
步驟2:I-117
中間物2(48.0mg,100μmol)溶解於DCM(1ml)中。將懸浮液冷卻至0℃。添加Et3N(27.9μl,200μmol),隨後添加丙烯醯氯(7.92μl,100μmol)。在0℃下攪拌所得懸浮液90分鐘。添加甲醇且減壓濃縮混合物。經矽膠急驟層析法(含30% DCM之EtOAc)純化所得殘餘物獲得30.0mg標題化合物。MS m/z:533.5(M+H)+1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 10.74(s,1H),8.95(s,1H),8.10(d,2H),7.01(s,1H),6.53(m,1H),6.36(m,1H),5.82(dd,1H),4.53(s,2H),3.98(s,6H),3.81(s,3H)。
實例120:I-119
如實例116中所述,在步驟2中使用((1R,2S)-2-胺基環己基)胺基甲酸第三丁酯代替((1S,2R)-2-胺基環己基)胺基甲酸第三丁酯製備標題化合物。MS m/z:618.0(M+H+)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ:9.01(1H,d),8.0(1H,s),7.69(1H,d),6.99(1H,s),6.3(1H,dd),6.05(1H,dd),5.55(1H,dd),5.26(2H,bs),4.52(2H,s),3.96(6H,s),3.3(4H,m),2.16(4H,m),1.9(4H,m)。
實例121:合成I-120
如實例53中所述,在步驟1中使用乙胺代替環丙胺且在步驟2中代替甲胺,製備化合物I-120。MS m/z:367.3(M+H+)。
實例122:合成I-121
如實例7中所述製備化合物I-121。如實例1中所述,在步驟5中使用(1H-吡唑-4-基)甲胺代替甲胺,製備起始物質。MS m/z:527.5(M+H+)。
實例123;合成I-122
步驟1,中間物2
在110℃下加熱含中間物1(57.0mg,0.034mmol)及PMB-NH2(0.13mL,1.01mmol)之DMF(2.0mL)4小時。真空移除DMF,且將所得殘餘物溶解於DCM(5mL)中,隨後添加AcOH(0.1mL)及N-乙基哌嗪(0.10mL,7.90mmol)。1小時後,添加NaHB(OAc)3(100mg,0.47mmol)且攪拌反應物16小時。添加EtOAc且用NaHCO3飽和水溶液及鹽水洗滌有機相,乾燥(Na2SO4),過濾且真空濃縮。矽膠急驟層析法獲得80mg標題化合物。MS m/z:385.2(M+H+)。
步驟2:中間物3
在環境溫度下用含20體積% TFA之DCM處理中間物2(80.0mg,0.21mmol)且攪拌反應混合物30分鐘。真空濃縮反應混合物,且用二氧化矽支撐之碳酸鹽處理所得殘餘物,過濾且濃縮獲得定量產量之標題化合物,其未經進一步純化即使用。MS m/z:265.2(M+H+)。
步驟3,中間物4
中間物3(56.0mg,0.21mmol)於DMF(4.0mL)中之溶液中添加(Boc)2O(100mg,0.46mmol)及DMAP(10.0mg,0.08mmol)。在環 境溫度下攪拌反應物隔夜。在減壓下移除DMF,且藉由矽膠層析法分離產物(98.0mg)。MS m/z:465.3(M+H+)。
步驟4,中間物5
在0℃下,向中間物4(98.0mg,0.21mmol)於MeOH(5mL)中之溶液中添加NiCl2-6H2O及NaBH4。30分鐘後,藉由添加水淬滅反應物,經矽藻土過濾,且濃縮獲得62.0mg標題化合物,其未經進一步純化即使用。MS m/z:335.3(M+H+)。
步驟5:I-122
如實例5中所述,使用來自實例1之中間物5製備標題化合物。MS m/z:587.3(M+H+)。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ:8.00(1H,s),7.79(1H,d),7.64(1H,s),7.55(1H,d),7.29(1H,dd),6.53(2H,s),6.45(2H,m),5.81(1H,dd),4.71(2H,s),3.78(6H,s),3.77(2H,s),3.35(3H,s),3.35(4H,d)3.30(4H,d)3.19(2H,q),1.32(3H,t)。
實例124:合成I-123
如實例128中所述,在步驟2中使用丁二酸代替N-生物素基-NH-(PEG)2-COOH,製備化合物I-123。MS m/z:713.5(M+H+)。
實例125:合成I-124
如實例7中所述製備化合物I-124。如實例1中所述,在步驟5中使用4-(胺基甲基)-1H-吡唑-1-甲酸第三丁酯代替甲胺,製備起始物質。執行最終脫除BOC保護基步驟(如實例3,步驟5中所述)。MS m/z:595.4(M+H+)。
實例126:合成I-125
如實例7中所述製備化合物I-125。如實例1中所述,在步驟5中使用氨代替甲胺,製備起始物質。MS m/z:447.4(M+H+)。
實例127:合成I-126
步驟1:中間物2
中間物1(2.00g,28.53mmol)於50mL丙酮/H2O(4:1)中之溶液中添加NMO(10g,50%水溶液,42.7mmol)及K2OsO4.2H2O(210mg,0.57mmol)。在環境溫度下攪拌反應混合物16小時。添加Na2SO3(8.0g)且攪拌所得混合物10分鐘。將反應混合物蒸發至乾燥且將殘餘物溶解於EtOAc。過濾所得懸浮液且將濾液蒸發至乾燥獲得2.50g標題化合物。
步驟2:中間物3
中間物2(2.50g,24.0mmol)及Et3N(12.2g,121mmol)於 DCM(50mL)中之冰冷卻溶液中添加甲烷磺醯氯(13.8g,121mmol)。在0℃下攪拌混合物30分鐘。添加Na2CO3飽和水溶液且將反應混合物分配於DCM與水之間。分離有機層,用鹽水洗滌,經無水Na2SO4乾燥且蒸發。用乙醇再結晶粗固體獲得4.83g標題化合物。1H NMR(400MHz,CDCl3):δ 3.15(s,6H),3.98-4.02(m,2H),4.14-4.19(m,2H),5.18-5.21(m,2H)。
步驟3:中間物4
中間物3(4.83g,18.6mmol)於DMF(50mL)中之溶液中添加15-冠-5(0.40g,1.82mmol)及NaN3(6.03g,92.8mmol)。在N2下,將混合物加熱至100℃隔夜。用EtOAc稀釋反應混合物,用水及鹽水洗滌,經無水Na2SO4乾燥且蒸發至乾燥獲得2.60g標題化合物。
步驟4:中間物5
中間物4(2.60g,16.9mmol)於MeOH(15mL)中之溶液中添加Pd/C(10重量%,0.78g)且在環境溫度下攪拌反應混合物16小時。過濾反應混合物且濃縮濾液獲得1.45g標題化合物,其未經進一步純化即使用。
步驟5:中間物6
中間物5(0.90g,8.81mmol)及來自實例1之中間物6(1.42g,0.40當量)於NMP(10mL)中之溶液中添加DIPEA(2.30g,17.8mmol)。在氮氣下,在100℃下加熱反應混合物16小時。使反應混合物冷卻至環境溫度,添加水,且用EtOAc(40mL×3)萃取水層。乾燥(無水Na2SO4)經合併之有機層,過濾且濃縮。藉由矽膠管柱層析法(含5% MeOH之DCM)純化獲得162mg標題化合物。MS m/z:469.4(M+H)+
步驟9:I-126
中間物6(162mg,0.35mmol)及Et3N(37.5mg,0.41mmol)於DCM(10mL)中之冰冷卻溶液中添加丙烯醯氯(41.9mg,0.41mmol)。在0℃下攪拌混合物10分鐘。用NaHCO3飽和水溶液淬滅反應混合物且用EtOAc萃取所得混合物。乾燥有機相,濃縮,且藉由矽膠管柱層析法(含3% MeOH之DCM)純化殘餘物獲得112mg標題化合物。MS m/z:523.4(M+H)+1H NMR(400MHz,CDCl3)δ:3.39(s,3H),3.71-3.81(m,2H),3.94(s,6H),4.17-4.21(m,2H),4.52(s,2H),4.73-4.79(m,2H),5.62-5.65(m,2H),6.02-6.07(m,1H),6.26(d,1H),6.32(br,1H),6.60(s,1H),7.84(s,1H)。
實例128:合成I-127
I-62(30.0mg,0.042mmol)於2mL DCM中之溶液中添加200μL TFA,且在環境溫度下攪拌反應混合物1小時。減壓移除溶劑且將所得固體溶解於300μl DMF中。向此溶液中添加N-生物素基-NH-(PEG)2-COOH.DIPEA(35mg,0.049mmol)、HOBT(7mg,0.046mmol)、EDC(9mg,0.046mmol)及NMM(30μL,0.28mmol),且在環境溫度下攪拌混合物16小時。藉由逆相製備型HPLC(用含10-90% MeCN之具有0.1% TFA水溶液之H2O梯度溶離)純化粗產物,獲得22mg標題化合物。MS m/z:1155.3(M+H+)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ:9.73(1H,s),8.05(1H,s),7.77(2H,m),7.47(1H,d),7.3(1H,s),7.0(1H,s),6.86(1H,dd),6.5(1H,dd),6.45(1H,br s),6.25(1H,dd),5.77(1H,dd),4.51(2H,s),4.3(1H,m),4.1-3.0(31H,m),2.8(1H,dd),2.34(3H,m),2.08(5H,tt),1.73(3H,m),1.6(6H,m),1.5-1.2(8H,m)。
實例129:合成I-128
步驟1:中間物2
根據文獻程序(WO 01/19825;PCT/US00/17037;WO 2008/051820;PCT/US2007/081899)自中間物1製備標題化合物。
步驟2:中間物3
中間物2(200mg,1.04mmol)及mono-BOC苯二胺(450mg,2.07mmol)於9mL 1:2 THF/IPA中之溶液加熱至100℃持續l小時。減壓移除溶劑且將反應混合物分配於水與EtOAc之間。經Na2SO4乾燥有機層,過濾且減壓濃縮。對粗產物進行矽膠層析法(用含0-50% EtOAc之庚烷梯度溶離),獲得150mg標題化合物。MS m/z:361.1(M+H+)
步驟3:中間物4
中間物3(250mg,0.69mmol)於6mL二噁烷中之溶液中添加亞硫酸氫鈉(1.5g,12mL水中8.68mmol)及500μl濃氫氧化銨。用超音波處理所形成之固體直至獲得溶液。濃縮溶液且分配於鹽水與EtOAc之間;用Na2SO4乾燥有機層,過濾且減壓移除溶劑獲得260mg標題化合物。MS m/z:331.1(M+H+)
步驟4:中間物5
使中間物4(260mg,0.79mmol)及2-(3,5-二甲氧基苯基)-2-側氧基乙酸乙酯(220mg,0.94mmol)於含有400μl乙酸之10mL EtOH中之溶液回流16小時。過濾所形成之固體獲得150mg標題化合物。MS m/z:505.2(M+H+)
步驟6:I-128
向中間物5(150mg,0.3mmol)於10mL DCM中之溶液中添加2mL TFA,且在環境溫度下攪拌反應混合物2小時。減壓移除溶劑且分配於冷(0℃)飽和NaHCO3與EtOAc之間。過濾所形成之固體獲得122mg游離胺中間物。MS m/z:405.2(M+H+)。接著將固體懸浮於5mL THF及500μL DMF中,且在冰水/甲醇浴中冷卻溶液。添加丙烯醯氯 (20μL,0.23mmol)且在-10℃下攪拌反應混合物5分鐘,此後用DIPEA(50μL,0.276mmol)處理且在環境溫度下攪拌30分鐘。減少溶劑體積,且對粗產物進行矽膠層析法(用含0-75% EtOAc之庚烷梯度溶離)。藉由逆相製備型HPLC(用含10-90%乙腈之具有0.1% TFA水溶液之H2O梯度溶離)進一步純化標題化合物,獲得10mg標題化合物。MS m/z:459.0(M+H+)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ:9.87(1H,s),9.43(1H,s),8.87(1H,s),7.81(1H,d),7.649(1H,d),7.408(2H,d),7.25(2H,m),6.64(1H,dd),6.5(1H,dd),6.3(1H,dd),5.78(1H,dd),3.8(6H,s),3.50(3H,s)。
實例130:合成I-129(外消旋)
如實例21中所述製備化合物I-129。使用7-氯-1-(環丙基甲基)-3-(2,6-二氯-3,5-二甲氧基苯基)-3,4-二氫嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮代替中間物2且其如實例1中所述在步驟5中使用環丙基甲胺代替甲胺製備。MS m/z:575.5(M+H+)。
實例131:合成I-130
如實例7中所述製備化合物I-130。如實例1中所述,在步驟5中使 用環丙基甲胺代替甲胺,製備起始物質。MS m/z:569.5(M+H+)。
實例132:合成I-131
如實例7中所述製備化合物I-131。如實例1中所述,在步驟4中使用2,6-二氟-3,5-二甲氧基苯胺代替3,5-二甲氧基苯胺,製備起始物質。MS m/z:497.5(M+H+)。
實例133:合成I-132
步驟1:中間物3
在1,4-二噁烷(5mL)中合併來自實例1之中間物4(380mg,1.21mmol)、中間物2(如US 7713994中所述製備)(251mg,1.81mmol)及DIPEA(642μl,3.63mmol)。密封反應容器,且加熱至50℃持續16小時,隨後濃縮且將所得殘餘物溶解於DCM中。過濾固體且經矽膠急驟層析法(用含1-5% MeOH之EtOAc溶離)純化濾液獲得160mg具有20%區位異構體雜質之標題化合物,其未經進一步純化即使用。MS m/z:416.4(M+H+)。
步驟4:中間物4
在THF(5mL)中合併中間物3(160mg,385μmol)及三光氣(120mg,404μmol)且攪拌30分鐘。添加Et3N(154μl,1.15mmol)且將反應物加熱至50℃持續16小時,隨後冷卻至環境溫度且經矽膠急驟層析法(用MeOH/DCM溶離)純化所得殘餘物獲得60mg標題化合物。MS m/z:442.4(M+H+)。
步驟5:中間物5
中間物4(56mg,127μmol)溶解於MeCN(0.3mL)及DCM(0.3mL)中。將溶液冷卻至0℃且添加二硫醯氯(20.6μl,254μmol)。在0℃下攪拌混合物2小時。添加水,隨後添加碳酸氫鈉飽和水溶液,且在環境溫度下再攪拌混合物20分鐘。用DCM萃取反應混合物,且經MgSO4乾燥經合併之有機層,且減壓濃縮且藉由矽膠急驟層析法(用含30% EtOAc之DCM溶離)純化獲得16mg標題化合物。MS m/z:510(M+H+)。
步驟6:中間物6
中間物5(16.0mg,31.3μmol)懸浮於1,4-二噁烷(0.5mL)中且添加(順)-環己烷-1,2-二胺(7.15mg,62.3μmol)及Et3N(13.1μl,94.0μmol)。在95℃下攪拌所得懸浮液6小時,隨後減壓濃縮反應混合物且藉由矽膠急驟層析法(用含15% MeOH之DCM溶離)純化所得殘餘物獲得15.0mg標題化合物。
步驟7:I-132
中間物6(15.0mg,25.5μmol)懸浮於DCM(0.25mL)中且添加Et3N(7.11μg,51.0μmol)。將混合物冷卻至0℃且添加丙烯醯氯(1.60μl,25.5μmol)。在0℃下攪拌混合物30分鐘,接著添加MeOH(3mL)。減壓濃縮溶液,且經矽膠急驟層析法(含10% MeOH之DCM)純化所得殘餘物獲得5mg標題化合物。MS m/z:642.6(M+H+)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 8.01(m,1H),7.68(d,1H),7.61(d,1H),7.00(s,1H),6.74(m,1H),6.40-6.23(m,1H),6.17-5.98(m,3H),5.54(dt,1H),4.91(s,2H),4.53(s,2H),3.96(s,5H),4.01(m,1H),3.36(s,6H),1.87-1.11(m,8H)。
實例134:合成I-133
如實例21中所述製備化合物I-133。使用1-((2-胺基吡啶-4-基)甲基)-7-氯-3-(2,6-二氯-3,5-二甲氧基苯基)-3,4-二氫嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮代替中間物2且其如實例1中所述在步驟5中使用4-(胺基甲基)吡啶-2-胺代替甲胺製備。MS m/z:627.5(M+H+)。
中間物135:合成I-134
如實例7中所述製備化合物I-134。如實例1中所述,在步驟5中使用(2-甲基噻唑-4-基)甲胺代替甲胺,製備起始物質。MS m/z:626.4(M+H+)。
實例136:合成I-135
如實例7中所述製備化合物I-135。如實例1中所述,在步驟5中使用4-(胺基甲基)吡啶-2-胺代替甲胺,製備起始物質。MS m/z:621.4(M+H+)。
實例137:合成I-136
如實例7中所述製備化合物I-136。如實例1中所述,在步驟5中使用(1-甲基-1H-吡唑-3-基)甲胺代替甲胺,製備起始物質。MS m/z:609.4(M+H+)。
實例138:合成I-137
如實例21中所述製備化合物I-137。使用7-氯-3-(2,6-二氯-3,5-二甲氧基苯基)-1-((2-甲基噻唑-4-基)甲基)-3,4-二氫嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮代替中間物2且如實例1中所述在步驟5中使用(2-甲基噻唑-4-基)甲胺代替甲胺製備。MS m/z:632.5(M+H+)。
中間物139:合成I-138(外消旋)
如實例21中所述,在步驟2中使用順-1-甲基吡咯啶-3,4-二胺代替順-環己烷-1,2-二胺,製備化合物I-138。MS m/z:536.4(M+H+)。
實例140:合成I-139(外消旋)
如實例21中所述,在步驟2中使用順-1-(3,4-二胺基吡咯啶-1-基)乙酮代替順-環己烷-1,2-二胺製備化合物I-139。MS m/z:564.5(M+H+)。
實例141:合成I-140
如實例84中所述,在步驟3中使用((3R,4R)-4-胺基四氫-2H-哌喃-3-基)胺基甲酸第三丁酯代替((1S,2R)-2-胺基環己基)胺基甲酸酯,且以來自實例1之中間物6之衍生物(在步驟5中使用苯甲胺代替甲胺製備)為起始物質,製備標題化合物(2mg)。MS m/z:537.2(M+H+)。
實例142:合成I-141
如實例29中所述,在步驟2中使用1-甲基-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧硼-2-基)-1H-吡唑代替中間物3且在步驟4中使用來自實例1之共用中間物6,製備化合物I-141。MS m/z:609.4(M+H+)。
實例143:合成I-142
步驟1:I-142
將來自實例4之中間物2(43.0mg,90.5μmol)懸浮於DCM(1mL)中且添加Et3N(37.8μl,272μmol)。將懸浮液冷卻至0℃且添加甲基丙烯醯氯(9.81μl,99.5μmol)。在0℃下攪拌反應混合物45分鐘,在0℃下添加甲醇,且減壓濃縮反應混合物。經矽膠急驟層析法(含5% EtOAc之DCM)純化所得殘餘物獲得3.4mg標題化合物。MS m/z:543.5(M+H+)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 9.49(s,1H),8.71(s,1H),8.11(d,1H),7.74(dd,1H),7.50(dd,1H),7.17(ddd,2H),7.00(s,1H),5.80(m,1H),5.52(t,1H),4.52(s,2H),3.96(s,6H),3.22(s,3H),1.94(s,3H)。
實例144:I-143
如實例84中所述,自步驟2開始,製備標題化合物。如實例117,中間物7中所述,在步驟6中用甲胺代替2,2-二氟乙胺,製備中間物2。MS m/z:503.1(M+H+)。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ:7.94(1H,s),6.96(1H,t),6.29(1H,br),6.19(1H,dd),5.64(1H,dd),4.65(2H,s),4.44(2H,br),3.92(6H,s),3.42(3H,s),1.78(6H,br),1.56(2H,br)。
實例145:合成I-144
如實例7中所述製備化合物I-144。如實例1中所述,在步驟5中使 用(5-(胺基甲基)-2-氟苯基)胺基甲酸第三丁酯代替甲胺,製備起始物質。執行最終脫除BOC保護基步驟(如實例3,步驟5中所述)。MS m/z:638.5(M+H+)。
實例146:合成I-145
如實例17中所述,使用4-(2-甲基-2H-四唑-5-基)-2-硝基苯胺(Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters,18(18),4997-5001;2008)代替中間物1,且跳過步驟2,製備化合物I-145。MS m/z:611.4(M+H+)。
實例147:合成I-146
如實例17中所述,使用4-(2-甲基-2H-四唑-5-基)-2-硝基苯胺(Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters,18(18))代替中間物1,使用來自實例1之中間物5且跳過步驟2,製備化合物I-146。MS m/z:543.5(M+H+)。
實例148:合成I-147
如實例116中所述製備化合物I-147。如實例1中所述,在步驟5中使用(1-甲基-1H-吡唑-3-基)甲胺代替甲胺,製備起始物質。MS m/z:615.5(M+H+)。
實例149:合成I-148
如實例116中所述製備化合物I-148。如實例1中所述,在步驟5中使用(1-甲基-1H-吡唑-4-基)甲胺代替甲胺,製備起始物質。MS m/z:605.6(M+H+)。
實例150:合成I-149
如實例7中所述製備化合物I-149。如實例1中所述,在步驟5中使用(1-甲基-1H-吡唑-4-基)甲胺代替甲胺,製備起始物質。MS m/z:522.6(M+H+)。
實例151:合成I-150
如實例7中所述製備化合物I-150。在步驟1中使用(2-胺基-5-((1-甲基哌啶-4-基)胺甲醯基)苯基)胺基甲酸第三丁酯代替苯-1,2-二胺。使用來自實例1之中間物6代替中間物5。MS m/z:669.5(M+H+)。
實例152:合成I-151
如實例7中所述製備化合物I-151。在步驟1中使用(2-胺基-5-((1-甲基哌啶-3-基)胺甲醯基)苯基)胺基甲酸第三丁酯代替苯-1,2-二胺。MS m/z:601.5(M+H+)。
實例153:合成I-152
如實例116中所述製備化合物I-152。如實例1中所述,在步驟5中使用4-(胺基甲基)-1H-吡唑-1-甲酸第三丁酯代替甲胺,製備起始物質。如實例3,步驟5中所述執行最終脫除BOC保護基步驟。MS m/z:601.4(M+H+)。
實例154:合成I-153
如實例17中所述,使用4-(1-甲基-1H-四唑-5-基)-2-硝基苯胺(如2007年6月14日之PCT國際申請案2007066201中所述製備)代替中間物1,且跳過步驟2,製備化合物I-154。MS m/z:611.4(M+H+)。
實例155:合成I-154(外消旋)
如實例7中所述製備化合物I-155。在步驟1中使用順-1-(1-甲基哌啶-4-基)吡咯啶-3,4-二胺代替苯-1,2-二胺。使用來自實例1之中間物6代替中間物5。MS m/z:547.1(M+H+)。
實例156:I-155
中間物7
根據文獻(J.Med.Chem. 2005,48,4628-4653)且如上文流程中所述製備標題化合物。
如實例7步驟2中所述,自中間物7製備標題化合物。MS m/z:443.1(M+H+)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ .9.92(1H,br s),9.51(1H,br s),8.99(1H,s),8.15(2H,br s),7.76-7.67(2H,m),7.26-7.26(2H,m),6.64-6.62(4H,m),6.62(1H,dd),6.28(1H,dd),5.78(1H, dd)。
實例157:合成I-156
如實例116中所述製備化合物I-156。如實例1中所述,在步驟5中使用3-(胺基甲基)-1H-吡唑-1-甲酸第三丁酯代替甲胺,製備起始物質。如實例3,步驟5中所述執行最終脫除BOC保護基步驟。MS m/z:601.4(M+H+)。
實例158:合成I-157
如實例7中所述製備化合物I-157。如實例1中所述,在步驟5中使用5-(胺基甲基)-1H-吡唑-1-甲酸第三丁酯代替甲胺,製備起始物質。如實例3,步驟5中所述執行最終脫除BOC保護基步驟。MS m/z:595.4(M+H+)。
實例159:合成I-158
如實例17中所述,使用4-(1-甲基-1H-四唑-5-基)-2-硝基苯胺(如 2007年6月14日之PCT國際申請案2007066201中所述製備)代替中間物1,來自實例1之中間物5代替中間物6且跳過步驟2,製備化合物I-158。MS m/z:543.5(M+H+)。
實例160:合成I-159(外消旋)
如實例7中所述製備化合物I-159。在步驟1中使用順-3,4-二胺基吡咯啶-1-甲酸第三丁酯代替苯-1,2-二胺。使用來自實例1之中間物6代替中間物5。MS m/z:622.5(M+H+)。
實例161:合成I-160(外消旋)
如實例7中所述製備化合物I-160。在步驟1中使用(2-((順)-3,4-二胺基吡咯啶-1-基)-2-側氧基乙基)胺基甲酸第三丁酯代替苯-1,2-二胺。使用來自實例1之中間物6代替中間物5。如實例3,步驟5中所述執行最終脫除BOC保護基步驟。MS m/z:579.5(M+H+)。
實例162:合成I-161(外消旋)
如實例7中所述製備化合物I-161。在步驟1中使用1-((順)-3,4-二胺基吡咯啶-1-基)-2-羥基乙酮代替苯-1,2-二胺。使用來自實例1之中間物6代替中間物5。MS m/z:580.4(M+H+)。
實例163:合成I-162
如實例116中所述,在步驟2中使用((1S,2R)-2-胺基環戊基)胺基甲酸第三丁酯代替((1S,2R)-2-胺基環己基)胺基甲酸第三丁酯,且以來自實例1之中間物6為起始物質,製備化合物I-162。MS m/z:521.1(M+H+)。
實例164:合成I-163
如實例7中所述製備化合物I-163。如實例1中所述,在步驟5中使用5-(胺基甲基)-1H-咪唑-1-甲酸第三丁酯代替甲胺,製備起始物質。如實例3,步驟5中所述執行最終脫除BOC保護基步驟。MS m/z:595.4(M+H+)。
實例165:合成I-164
如實例7中所述製備化合物I-164。在步驟1中使用((順)-3,4-二胺基吡咯啶-1-基)(1-甲基哌啶-4-基)甲酮代替苯-1,2-二胺。使用來自實例1之中間物6代替中間物5。MS m/z:647.5(M+H+)。
實例166:合成I-165
向來自實例178之中間物10(86.0mg,0.13mmoL)於2mL DCM中之溶液中添加200μL HCl(二噁烷中4N)且在室溫下攪拌反應物30分鐘。減壓移除溶劑獲得胺鹽酸鹽。MS m/z:553.2(M+H+)。在冰水/甲醇浴中冷卻鹽及丙烯酸(10μL,0.13mmoL)於500μL DMF中之溶液。向混合物中添加DIEA(130μL,0.74mmol),接著添加HATU(55mg,0.13mmol)。在室溫下攪拌反應物15分鐘,且藉由急驟層析法(用含0-70%丙酮之庚烷梯度溶離)直接純化,獲得36mg標題化合物。 MS m/z:607.1(M+H+)。
實例167:合成I-166(外消旋)
如實例7中所述製備化合物I-166。在步驟1中使用((順)-3,4-二胺基吡咯啶-1-基)(1-甲基哌啶-2-基)甲酮代替苯-1,2-二胺。使用來自實例1之中間物6代替中間物5。MS m/z:647.5(M+H+)。
實例168:合成I-167(外消旋)
如實例7中所述製備化合物I-167。在步驟1中使用((順)-3,4-二胺基吡咯啶-1-基)(1-甲基哌啶-3-基)甲酮代替苯-1,2-二胺。使用來自實例1之中間物6代替中間物5。MS m/z:647.5(M+H+)。
實例169:合成I-168
向來自實例166之I-165(34.0mg,0.06mmoL)於各500μl IPA、THF及水中之溶液添加單水合LiOH(7.50mg,0.18mmoL),且在環境溫度下攪拌反應混合物2小時。減壓移除溶劑且用2滴3N HCl處理所得殘餘物引起沈澱。過濾沈澱物且乾燥獲得14.0mg標題化合物。MS m/z:579.2(M+H+)。
實例170:合成I-169
如實例116中所述製備化合物I-169。如實例1中所述,在步驟4中使用3-甲氧基-5-(三氟甲基)苯胺代替3,5-二甲氧基苯胺且跳過步驟7,製備起始物質。MS m/z:505.5(M+H+)。
實例171:合成I-170(外消旋)
如實例7中所述製備化合物I-170。在步驟1中使用(順)-1-(吡啶-2-基)吡咯啶-3,4-二胺代替苯-1,2-二胺。使用來自實例1之中間物6代替中間物5。MS m/z:559.4(M+H+)。
實例172:合成I-171
如實例116中所述製備化合物I-171。如實例1中所述,在步驟5中使用5-(胺基甲基)-1H-咪唑-1-甲酸第三丁酯代替甲胺,製備起始物質。如實例3,步驟5中所述執行最終脫除BOC保護基步驟。MS m/z:601.4(M+H+)。
實例173:合成I-172(外消旋)
如實例174中所述且跳過步驟4製備化合物I-172。MS m/z:463.2(M+H+)。
實例174:合成I-173
步驟1-2:中間物2
在110℃下加熱中間物1(WO 2009153313)(102mg,0.37mmol)及順-1,2-二胺基環己烷(0.20mL,1.67mmol)於二噁烷(2.0mL)中之混合物16小時。使反應混合物冷卻至環境溫度,濃縮至乾燥,溶解於DCM(20mL)中且且環境溫度下用(Boc)2O(1.20g)處理,接著攪拌隔夜。接著濃縮粗反應物且進行矽膠急驟層析法(0-100% EtOAc/己烷)獲得50mg標題化合物。MS:452.2[M+H]+
步驟3:中間物3
在二噁烷(3mL)及2.0M Na2CO3水溶液(0.7mL)中合併中間物2(50.0mg,0.110mmol)及2-(3,5-二甲氧基苯基)-4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧硼(60.0mg,0.22mmol),及Pd(dppf)Cl2(10.0mg,0.014mmol)。在微波反應器中,在120℃下加熱混合物30分鐘。用EtOAc稀釋反應混合物,用NaHCO3飽和水溶液、鹽水洗滌,經Na2SO4乾燥,過濾且真空濃縮。藉由矽膠急驟層析法純化所得殘餘物獲得48mg標 題化合物。MS m/z:509.4(M+H+)。
步驟4-5:中間物4
中間物3(40.0mg,0.079mmol)溶解於DCM(2mL)及MeCN(2mL)中。在0℃下,添加SO2Cl2(13μL,0.16mmol)且將反應物保持於0℃下2.5小時。移除溶劑後,在室溫下用20% TFA/DCM(4.0mL)處理粗混合物30分鐘。蒸發所有揮發物後,將殘餘物溶解於DCM中且用二氧化矽支撐之碳酸鹽處理使鹼性胺游離。過濾且濃縮後,獲得定量產物且粗產物原樣用於下一步驟中。MS m/z:477.4(M+H+)。
步驟6:I-173
中間物4(40mg,0.088mmol)溶解於THF(3.0mL)中且冷卻至-10℃。添加丙烯醯氯(7.2μL,0.088mmol)且在-10℃下攪拌反應混合物10分鐘。濃縮反應混合物且將所得殘餘物溶解於DMSO中且藉由製備型HPLC純化。MS m/z:531.2(M+H+)。1H NMR(400MHz,CD3OD):9.25(1H,s),8.15(1H,s),7.77(1H,s),6.91(1H,s),6.36(1H,dd),6.16(1H,dd),5.62(1H,dd),4.56(2H,m),3.97(6H,s),3.95(3H,s),1.86(6H,m),1.60(2H,m)。
實例175:合成I-174(外消旋)
如實例7中所述製備化合物I-174。在步驟1中使用((反)-4-胺基-6-側氧基哌啶-3-基)胺基甲酸第三丁酯代替苯-1,2-二胺。使用來自實例1之中間物6代替中間物5。如實例3,步驟5中所述執行最終脫除BOC保護基步驟。MS m/z:550.4(M+H+)。
實例176:合成I-175
如實例102中所述製備標題化合物,其中氯嘧啶環脲中間物(實例102中中間物7之等效物)如實例102中所述,在步驟5中使用2-氯-6-氟-3,5-二甲氧基苯胺代替中間物4,使用甲胺代替環丙基甲胺,且在步驟7中使用((1S,2R)-2-胺基環己基)胺基甲酸第三丁酯代替1,2-苯二胺製備。MS m/z:519.4(M+H)+1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ 7.81(s,1H),6.63(d,1H),6.23(ddd,1H),6.03(ddd,1H),5.59(ddd,1H),4.52(d,2H),4.41(s,1H),4.17(d,1H),3.92(d,6H),3.38(s,3H),2.00-1.00(m,9H)。
實例177:合成I-176
如實例116中所述製備化合物I-176。如實例1中所述,在步驟4中使用4-甲氧基苯胺代替3,5-二甲氧基苯胺且跳過步驟7,製備起始物質。MS m/z:437.4(M+H+)。
實例178:合成I-177
步驟1:中間物10
根據文獻且如上文流程中所述製備標題化合物。將中間物8(US 2005/0020645 A1;Bioorganic & Medicinal Chemistry,2009,17,1193-1206)(45.0mg,0.16mmoL)、如實例116中所述之方式使用來自實例1之中間物6製備之中間物9(45mg,0.08mmoL)、NMM(26μL,0.24mmoL)於1mL二噁烷及100μL NMP中之溶液加熱至100℃持續16小時。減壓移除溶劑且藉由矽膠急驟層析法(用含0-100% EtOAc之庚烷梯度溶離)純化所得殘餘物,獲得40mg標題化合物。MS m/z:653.2(M+H+)。
步驟2:中間物11
中間物10(100mg,0.15mmoL)於1mL THF及500μL水中之溶液中添加單水合LiOH(20.0mg,0.46mmoL),且在60℃下攪拌反應物2小時。減壓移除溶劑且用5滴3N HCl處理所得殘餘物引起沈澱。過濾沈澱物且乾燥獲得50mg標題化合物。MS m/z:625.1(M+H+)。
步驟3:中間物12
中間物11(50mg,0.08mmoL)於500μL THF中之溶液中添加 HATU(30.0mg,0.08mmoL)、NMM(26μL,0.24mmoL)及過量乙胺(THF中2M,5mL)。在環境溫度下攪拌反應混合物5天。減壓移除溶劑且藉由矽膠急驟層析法(用含0-100%丙酮之庚烷梯度溶離)純化所得殘餘物,獲得25.0mg標題化合物。MS m/z:652.2(M+H+)。
步驟4及5:I-177
中間物12(25mg,0.04mmol)於5mL DCM中之溶液中添加1mL HCl(二噁烷中4N)且在環境溫度下攪拌反應物30分鐘。減壓移除溶劑獲得中間物12之胺鹽酸鹽,MS m/z:552.2(M+H+),將其溶解於500μL DMF中且添加丙烯酸(2.4μl,0.04mmoL)。在冰水/甲醇浴中冷卻反應混合物且添加DIPEA(40μL,0.21mmoL),隨後添加HATU(14.0mg,0.04mmol)。在環境溫度下攪拌反應混合物15分鐘,接著藉由製備型HPLC(用10-90%含有0.1%TFA及MeCN之水梯度溶離)純化,獲得7.0mg標題化合物。MS m/z:606.2(M+H+)。
實例180:合成I-179
如實例3中所述製備標題化合物。在步驟1中使用3-胺基苯甲基胺基甲酸第三丁酯代替苯-1,2-二胺,且跳過步驟2之Boc保護。MS m/z:690.2(M+H+)。
實例181:合成I-180
如實例3中所述製備標題化合物。在步驟1中使用3-胺基苯甲基胺基甲酸第三丁酯代替苯-1,2-二胺。在步驟2之前執行脫除BOC保護基步驟(如實例3,步驟5中所述)。MS m/z:690.1(M+H+)。
實例182:合成I-181
如實例7中所述製備標題化合物。在步驟1中使用3-胺基苯甲基胺基甲酸第三丁酯代替苯-1,2-二胺。使用來自實例1之中間物6代替中間物5。在步驟2之前執行脫除BOC保護基步驟(如實例3,步驟5中所述之脫除BOC保護基)。MS m/z:543.3(M+H+)。
實例183:合成I-182(外消旋)
如實例7中所述製備標題化合物。在步驟1中使用4,5-二甲氧基環己烷-順-1,2-二胺代替苯-1,2-二胺。使用來自實例1之中間物6代替中 間物5。MS m/z:595.5(M+H+)。
實例184:合成I-183(外消旋)
如實例7中所述製備標題化合物。在步驟1中使用順-1-(吡嗪-3-基)吡咯啶-3,4-二胺代替苯-1,2-二胺。使用來自實例1之中間物6代替中間物5。MS m/z:600.4(M+H+)。
實例185:合成I-184(外消旋)
如實例116中所述製備標題化合物。如實例1中所述,在步驟4中使用2-氯-6-氟-3,5-二甲氧基苯胺代替3,5-二甲氧基苯胺且跳過步驟7製備起始物質。MS m/z:519.4(M+H+)。
實例186:對掌性分離I-185與I-186
對掌性分離I-126(Chiralpak IA,250mm×4.6mm ID,5μm,0.4mL/min,含30%庚烷之EtOH)獲得Rt=23及31min之兩種對映異構體,其分別指派為絕對構型I-186I-185(>98% ee)。基於酶促及細胞功效類似於I-94I-95指派絕對構型。
I-185:MS m/z:523.5(M+H+),[α]D=-20(C=1.00mg/mL,CH2Cl2,23℃),1H NMR(400MHz,CDCl3)δ:3.39(s,3H),3.71-3.81(m,2H),3.94(s,6H),4.17-4.21(m,2H),4.52(s,2H),4.73-4.79(m,2H),5.62-5.65(m,2H),6.02-6.07(m,1H),6.26(d,1H),6.32(br,1H),6.60(s,1H),7.84(s,1H)。
I-186:MS m/z:523.5(M+H+),[α]D=+38(C=1.00mg/mL,CH2Cl2,23℃),1H NMR(400MHz,CDCl3)δ:3.39(s,3H),3.71-3.81(m,2H),3.94(s,6H),4.17-4.21(m,2H),4.52(s,2H),4.73-4.79(m,2H),5.62-5.65(m,2H),6.02-6.07(m,1H),6.26(d,1H),6.32(br,1H),6.60(s,1H),7.84(s,1H)。
藉由根據下文流程之對映選擇性合成確認之I-186絕對構型。根據文獻(JACS, 1995,117,5897-5898)且如實例226中所述製備N-((3R,4S)-4-胺基四氫呋喃-3-基)丙烯醯胺,且在實例127中用於代替順-四氫呋喃-3,4-二胺。
I-186之立體化學證據及對映選擇性合成
根據實例226中所述之程序合成中間物7(上文流程)。藉由與來自實例127之中間物6偶合,隨後使用如實例127中所述之程序脫除Boc保護基及丙烯醯胺形成,使用中間物7製備I-186I-186:MS m/z:523.5(M+H+),1H NMR(400MHz,CDCl3)δ:3.39(s,3H),3.71-3.81(m,2H),3.94(s,6H),4.17-4.21(m,2H),4.52(s,2H),4.73-4.79(m,2H),5.65(dd,1H),6.02-6.07(m,1H),6.26(d,1H),6.32(br,1H),6.60(s,1H),7.84(s,1H)。
實例187:合成
使用本文所述之技術,製備以下化合物。對於製備為外消旋或非對映異構混合物形式之化合物,可藉由採用對掌性起始物質或執行對掌性層析法製備光學純形式之單個異構體。
化合物I-187
如實例7中所述製備標題化合物。如實例1中所述,在步驟4中使用4-胺基雙環并[2.2.2]辛-1-醇代替3,5-二甲氧基苯胺且跳過步驟7,製備起始物質。
化合物I-188
如實例7中所述製備標題化合物。如實例1中所述,在步驟4中使 用4-胺基雙環并[2.2.2]辛-1-醇代替3,5-二甲氧基苯胺,在步驟5中使用苯甲胺代替甲胺且跳過步驟7,製備起始物質。
化合物I-189
如實例7中所述製備標題化合物。如實例1中所述,在步驟4中使用4-胺基雙環并[2.2.2]辛-1-醇代替3,5-二甲氧基苯胺,在步驟5中使用環丙胺代替甲胺且跳過步驟7,製備起始物質。
化合物I-190
如實例116中所述製備標題化合物。如實例1中所述,在步驟5中使用3-(胺基甲基)苯磺醯胺代替甲胺,製備起始物質。
化合物I-191
如實例7中所述,在步驟1中使用(2-胺基-5-(4-乙基哌嗪-1-基)環己基)胺基甲酸第三丁酯代替苯-1,2-二胺,使用來自實例1之中間物6代替中間物5,且添加如實例3,步驟5中所述之最終脫除BOC保護基 步驟,製備標題化合物。
化合物I-193
如實例7中所述,在步驟1中使用((順)-5-胺基-2-側氧基哌啶-4-基)胺基甲酸第三丁酯代替苯-1,2-二胺,使用來自實例1之中間物6代替中間物5,且添加如實例3,步驟5中所述之最終脫除BOC保護基步驟,製備標題化合物。
化合物I-194
如實例7中所述,在步驟1中使用((順)-4-胺基-6-側氧基哌啶-3-基)胺基甲酸第三丁酯代替苯-1,2-二胺,使用來自實例1之中間物6代替中間物5,且添加如實例3,步驟5中所述之最終脫除BOC保護基步驟,製備標題化合物。
化合物I-195
如實例7中所述,在步驟1中使用((反)-5-胺基-2-側氧基哌啶-4-基)胺基甲酸第三丁酯代替苯-1,2-二胺,使用來自實例1之中間物6代替中間物5,且添加如實例3,步驟5中所述之最終脫除BOC保護基步驟,製備標題化合物。
實例188:合成I-196
如實例7中所述,在步驟1中使用((反)-4-胺基-6-側氧基哌啶-3-基)胺基甲酸第三丁酯代替苯-1,2-二胺,使用來自實例1之中間物6代替中間物5,且添加如實例3,步驟5中所述之最終脫除BOC保護基步驟,製備標題化合物。MS m/z:550.4(M+H+)。
實例189:合成
使用本文所述之技術,製備以下化合物。對於製備為外消旋或非對映異構混合物形式之化合物,可藉由採用對掌性起始物質或執行對掌性層析法製備光學純形式之單個異構體。
化合物I-197
如實例127中所述製備標題化合物。如實例1中所述,在步驟4中使用3,5-二甲氧基-2,6-二甲基苯胺代替3,5-二甲氧基苯胺,且跳過步驟7,製備氯環脲衍生物。
化合物I-198
如實例127中所述製備標題化合物。如實例1中所述,在步驟4中使用2,6-二氟-3,5-二甲氧基苯胺代替3,5-二甲氧基苯胺,且跳過步驟7,製備氯環脲衍生物。MS m/z:491.5(M+H+)。
化合物I-199
如實例116中所述製備標題化合物。如實例1中所述,在步驟4中使用2,6-二甲基-3,5-二甲氧基苯胺代替3,5-二甲氧基苯胺且跳過步驟7,製備起始物質。
化合物I-200
如實例127中所述,使用2,5-二氫噻吩代替中間物2且如文獻(JOC,2010, 75,4629-4631)中所述執行硫之氧化,製備標題化合物。MS m/z:571.4(M+H+)。
化合物I-201
如實例7中所述,在步驟1中使用(順)-1-(嘧啶-4-基)吡咯啶-3,4-二胺代替苯-1,2-二胺,且使用來自實例1之中間物6代替中間物5,製備標題化合物。MS m/z:600.5(M+H+)。
實例190:合成I-202
如實例7中所述,在步驟1中使用(順)-1-(吡啶-2-基)吡咯啶-3,4-二胺代替苯-1,2-二胺,且使用來自實例1之中間物6代替中間物5,製備標題化合物。MS m/z:599.4(M+H+)。
實例191:合成
使用本文所述之技術,製備以下化合物。對於製備為外消旋或非對映異構混合物形式之化合物,可藉由採用對掌性起始物質或執行對掌性層析法製備光學純形式之單個異構體。
化合物I-203
如實例7中所述,在步驟1中使用(順)-1-(1H-吡唑-3-基)吡咯啶- 3,4-二胺代替苯-1,2-二胺,且使用來自實例1之中間物6代替中間物5,製備標題化合物。
實例192:合成I-204
如實例7中所述,在步驟1中使用(順)-1-(1-甲基-1H-吡唑-3-基)吡咯啶-3,4-二胺代替苯-1,2-二胺,且使用來自實例1之中間物6代替中間物5,製備標題化合物。MS m/z:602.5(M+H+)。
實例193:合成I-205
如實例127中所述製備標題化合物。如實例1中所述,在步驟4中使用3,5-二乙氧基苯胺代替3,5-二甲氧基苯胺製備氯環脲衍生物。MS m/z:551.5(M+H+)。
實例194:合成I-206
如實例127中所述製備標題化合物。如實例1中所述,在步驟4中使用2-氟-6-氟-3,5-二甲氧基苯胺代替3,5-二甲氧基苯胺,且跳過步驟 7,製備氯環脲衍生物。MS m/z:507.4(M+H+)。
實例195:合成I-207
如實例127中所述製備標題化合物。如實例1中所述,在步驟4中使用3,4,5-三甲氧基苯胺代替3,5-二甲氧基苯胺且跳過步驟7製備氯環脲衍生物。MS m/z:485.5(M+H+)。
實例196:合成I-208
如實例127中所述製備標題化合物。如實例1中所述,在步驟4中使用3,4,5-三甲氧基苯胺代替3,5-二甲氧基苯胺製備氯環脲衍生物。MS m/z:553.4(M+H+)。
實例197:合成I-209
如實例127中所述製備標題化合物。如實例1中所述,在步驟4中使用4-甲氧基苯胺代替3,5-二甲氧基苯胺且跳過步驟7製備氯環脲衍生物。MS m/z:425.4(M+H+)。
實例198:合成I-210
如實例127中所述製備標題化合物。如實例1中所述,在步驟5中使用噻唑-4-基甲胺代替甲胺,製備氯環脲衍生物。MS m/z:606.4(M+H+)。
實例199:合成I-212
如實例127中所述製備標題化合物。如實例1中所述,在步驟5中使用環丙基甲胺代替甲胺,製備氯環脲衍生物。MS m/z:563.4(M+H+)。
實例200:合成I-213
如實例127中所述製備標題化合物。如實例1中所述,在步驟5中使用(1-甲基-1H-吡唑-4-基)甲胺代替甲胺,製備氯環脲衍生物。MS m/z:603.5(M+H+)。
實例201:合成I-214
如實例127中所述製備標題化合物。如實例1中所述,在步驟5中使用(1H-吡唑-4-基)甲胺代替甲胺,製備氯環脲衍生物。MS m/z:589.5(M+H+)。
實例202:合成I-215
如實例127中所述製備標題化合物。如實例1中所述,在步驟5中使用(1-甲基-1H-吡唑-3-基)甲胺代替甲胺,製備氯環脲衍生物。MS m/z:603.5(M+H+)。
實例203:合成I-216
如實例127中所述製備標題化合物。如實例1中所述,在步驟5中使用(1H-吡唑-3-基)甲胺代替甲胺,製備氯環脲衍生物。MS m/z:589.5(M+H+)。
實例204:合成I-217
如實例127中所述製備標題化合物。如實例1中所述,在步驟5中使用乙胺代替甲胺,製備氯環脲衍生物。MS m/z:537.4(M+H+)。
實例205:合成I-218
如實例127中所述,在步驟5之前使用甲基化步驟(如實例31,步驟1中所述),製備標題化合物。MS m/z:537.5(M+H+)。
實例206:合成I-219
如實例116中所述製備標題化合物。如實例1中所述,在步驟4中使用3,5-二乙氧基苯胺代替3,5-二甲氧基苯胺製備起始物質。MS m/z:563.5(M+H+)。
實例207:合成I-220
如實例116中所述製備標題化合物。如實例1中所述,在步驟4中使用3,4,5-三甲氧基苯胺代替3,5-二甲氧基苯胺且跳過步驟7,製備起始物質。MS m/z:497.5(M+H+)。
實例208:合成
使用本文所述之技術,製備以下化合物。對於製備為外消旋或非對映異構混合物形式之化合物,可藉由採用對掌性起始物質或執行對掌性層析法製備光學純形式之單個異構體。
化合物I-221
如實例116中所述製備標題化合物。如實例1中所述,在步驟4中使用3,4,5-三甲氧基苯胺代替3,5-二甲氧基苯胺,製備起始物質。MS m/z:565.5(M+H+)。
實例209:合成I-222
如實例116中所述製備標題化合物。如實例1中所述,在步驟4中使用4-甲氧基苯胺代替3,5-二甲氧基苯胺且跳過步驟7,製備起始物 質。MS m/z:437.5(M+H+)。
實例210:合成I-223
如實例224中所述,在步驟1中使用((1S,2R)-2-胺基環己基)胺基甲酸第三丁酯代替順-四氫呋喃-3,4-二胺,製備標題化合物。MS m/z:532.5(M+H+)。1HNMR(400MHz,CDCl3):1.50-1.78(m,8H),3.68(s,3H),3.95(s,6H),4.30(br,1H),4.53(br,1H),5.61(d,1H),5.99-6.05(m,1H),6.26(d,1H),6.63(s,1H),7.41(s,1H),8.44(s,1H)。
實例211:合成
使用本文所述之技術,製備以下化合物。對於製備為外消旋或非對映異構混合物形式之化合物,可藉由採用對掌性起始物質或執行對掌性層析法製備光學純形式之單個異構體。
化合物I-224
如實例116中所述製備標題化合物。如實例1中所述,在步驟4中使用3,5-雙(三氟甲氧基)苯胺代替3,5-二甲氧基苯胺,製備起始物質。
化合物I-225
如實例127中所述製備標題化合物。如實例1中所述,在步驟4中使用3,5-雙(三氟甲氧基)苯胺代替3,5-二甲氧基苯胺,製備氯環脲衍生物。
化合物I-226
如實例7中所述,在步驟1中使用3,4-二胺基環丁-3-烯-1,2-二酮代替苯-1,2-二胺,且使用來自實例1之中間物6代替中間物5,製備標題化合物。
化合物I-227
如實例7中所述製備標題化合物。如實例1中所述,在步驟4中使用2-溴-6-氟-3,5-二甲氧基苯胺代替3,5-二甲氧基苯胺,在步驟5中使用環丙基甲胺代替甲胺且跳過步驟7,製備起始物質。
實例212:合成I-228
如實例116中所述製備標題化合物。如實例1中所述,在步驟4中使用2-溴-6-氟-3,5-二甲氧基苯胺代替3,5-二甲氧基苯胺且跳過步驟7,製備起始物質。MS m/z:563.4(M+H+)。
實例213:合成
使用本文所述之技術,製備以下化合物。對於製備為外消旋或非對映異構混合物形式之化合物,可藉由採用對掌性起始物質或執行對掌性層析法製備光學純形式之單個異構體。
化合物I-229
如實例116中所述製備標題化合物。如實例1中所述,在步驟4中使用2,4,6-三氟-3,5-二甲氧基苯胺代替3,5-二甲氧基苯胺且跳過步驟7,製備起始物質。
化合物363 I-230
如實例116中所述製備標題化合物。如實例1中所述,在步驟4中 使用2-環丙基-6-氟-3,5-二甲氧基苯胺代替3,5-二甲氧基苯胺且跳過步驟7,製備起始物質。
化合物I-231
如實例116中所述製備標題化合物。如實例1中所述,在步驟4中使用2-環丙基-6-氯-3,5-二甲氧基苯胺代替3,5-二甲氧基苯胺且跳過步驟7,製備起始物質。
實例214:合成I-118
如實例116中所述,在步驟4中使用丙酸代替丙烯酸,製備化合物I-118。MS m/z:602.2(M+H+)。
實例215:合成I-232
如實例3中所述製備化合物I-232。在步驟1中使用(3-胺基苯基)胺基甲酸第三丁酯代替苯-1,2-二胺。MS m/z:676.4(M+H+)。
實例216:合成I-233
如實例3中所述製備化合物I-233。在步驟1中使用(4-胺基苯基)胺基甲酸第三丁酯代替苯-1,2-二胺。MS m/z:676.3(M+H+)。
實例217:合成I-234
如實例3中所述製備化合物I-234。在步驟6中使用丙醯氯代替丙烯醯氯。MS m/z:678.2(M+H+)。
實例218:合成I-235
如實例7中所述製備化合物I-235。使用來自實例1之中間物6代替中間物5。在步驟2中使用丙醯氯代替丙烯醯氯。MS m/z:531.0(M+H+)。
實例219:合成I-236
如實例5中所述製備化合物I-236。在步驟2中使用丙醯氯代替丙烯醯氯。MS m/z:607.1(M+H+)。
實例220:合成I-237
如實例7中所述製備化合物I-237。在步驟1中使用苯胺代替苯-1,2-二胺。MS m/z:392.3(M+H+)。
實例221:合成I-238
如實例7中所述製備化合物I-238。在步驟1中使用苯胺代替苯-1,2-二胺。使用來自實例1之中間物6代替中間物5。MS m/z:460.1(M+H+)。
實例222:合成I-239
向中間物I-186(3.80mg,0.007mmoL)於500μL THF中之溶液中添加催化劑10%Pd/C。經氣球引入1atm H2且在環境溫度下攪拌反應混合物1小時。經矽藻土墊過濾反應混合物,且減壓移除溶劑獲得3.7mg標題化合物。MS m/z:525.2(M+H+)。
實例223:合成共用中間物8
步驟1:中間物2
向中間物1(1.35g,6.88mmol)於EtOH中之混合物中添加濃H2SO4(4滴)。在85℃下加熱反應混合物16小時,隨後使其冷卻至環境 溫度且濃縮。用水(20mL)稀釋所得殘餘物且用DCM(25mL×3)萃取。用鹽水(50mL)洗滌經合併之有機層,經Na2SO4乾燥且濃縮獲得呈黃色固體狀之標題化合物(2.85g,100%)。
步驟2:中間物4
在0℃下,將含甲胺之EtOH(33%,17.5mL,140mmol)緩慢添加至中間物3(10.0g,43.1mmol)於120mL二氯甲烷中之溶液中。攪拌溶液30分鐘。添加水(150ml),且分離所得混合物,經MgSO4乾燥有機層,過濾且濃縮獲得呈白色固體狀之標題化合物(9.77g,100%)。
步驟3:中間物5
在0℃下,向LAH(2.45g,64.6mmol)於無水THF(30mL)中之混合物中逐滴添加中間物4(9.77g,43.0mmol)於無水THF(45mL)中之溶液。在環境溫度下攪拌反應混合物15分鐘。小心地逐滴添加水(18mL)。攪拌混合物30分鐘。逐滴添加NaOH水溶液(15%,8.5mL),隨後添加水(26mL)。在環境溫度下攪拌所得懸浮液17小時,隨後過濾反應混合物,且依序用THF(100mL×2)洗滌。濃縮經合併之濾液及洗滌液且將所得殘餘物懸浮於乙酸乙酯/己烷(體積比:2:1,200mL)中。藉由過濾收集固體獲得呈黃色固體狀之標題化合物(4.23g,53%)。
步驟4:中間物6
將化合物5(4.23g,23.2mmol)溶解於二氯甲烷(1L)中且在攪拌下用二氧化錳(18.0g,207mmol)處理。攪拌所得懸浮液24小時,接著經矽藻土過濾,用二氯甲烷(100mL)洗滌,且濃縮經合併之有機層獲得標題化合物(3.00g,75%)。
步驟5:中間物7
將中間物2(1.29g,5.75mmol)、中間物6(1.00g,5.46mmol)及K2CO3(1.50g,10.9mmol)於DMF(100mL)中之混合物加熱至110℃持續4小時。將混合物冷卻至環境溫度,倒入至水中,過濾,且乾燥固體獲得呈白色固體狀之標題化合物(1.20g,63%)。
步驟6:中間物8
在0℃下,向中間物7(1.33g,3.88mmol)於DCM(15mL)及NMP(5mL)中之溶液逐滴添加SO2Cl2(2.10g,15.6mmol)。在0℃下攪拌所得混合物30分鐘,隨後濃縮,用水稀釋,用EtOAc(25mL×4)萃取且經Na2SO4乾燥經合併之有機層。濃縮有機層獲得呈白色固體狀之標題化合物(1.50g,87%)。用乙酸乙酯再結晶所得固體或藉由矽膠管柱層析法純化獲得呈白色固體狀之標題化合物(1.20g,70%)。
實例224:合成I-211
步驟1:中間物1
將來自實例223之共用中間物8(300mg,0.68mmol)、順-四氫呋喃-3,4-二胺(204mg,2.0mmol)及DIPEA(387mg,3.0mmol)於NMP(5mL)中之混合物加熱至80℃持續3小時。使混合物冷卻至環境溫度且分配於EtOAc與水之間。分離有機相,用水、鹽水洗滌,經無水Na2SO4乾燥且經二氧化矽管柱層析法純化所得殘餘物獲得標題化合物(137mg,44%)。MS m/z:466.3(M+H+)。
步驟2:I-211
在0℃下,向中間物1(3.50g,7.5mmol)、DIPEA(1.94g,15mmol)於無水DCM(100mL)中之溶液中逐滴添加丙烯醯氯(680mg,7.50mmol)於無水DCM(5mL)中之溶液。攪拌反應混合物10分鐘,隨 後分配於DCM與H2O之間。分離有機相,用鹽水洗滌,經Na2SO4乾燥且經矽膠管柱層析法純化粗產物獲得標題化合物(2.90g,74%)。MS m/z:520.4(M+H+)。1HNMR(400Hz,CDCl3):3.68-3.85(m,5H),3.95(s,6H),4.16-4.24(m,2H),4.87(br,2H),5.62(d,1H),6.02-6.08(m,1H),6.24-6.39(m,3H),6.63(s,1H),7.43(s,1H),8.47(s,1H)。
實例225:對掌性分離I-211獲得I-240及I-241
對掌性SFC分離I-211(ChiralCel OD-3,150×4.6mm,5μm,2.4mL/min,CO2中40%具有0.05% DEA之MeOH)獲得Rt=3.46及4.89min之兩種對映異構體,其分別指派I-240I-241之絕對構形(>98% ee)。基於酶促及細胞功效類似於I-94I-95指派絕對構型。
I-241:MS m/z:520.4(M+H+),[α]D=+75(C=4.00mg/mL,CH2Cl2,23℃),1HNMR(400Hz,CDCl3):3.68-3.85(m,5H),3.95(s,6H),4.16-4.24(m,2H),4.87(br,2H),5.62(d,1H),6.02-6.08(m,1H),6.24-6.39(m,3H),6.63(s,1H),7.43(s,1H),8.47(s,1H)。
I-240:MS m/z:520.4(M+H+),[α]D=-65(C=4.00mg/mL,CH2Cl2,23℃),1HNMR(400Hz,CDCl3):3.68-3.85(m,5H),3.95(s,6H),4.16-4.24(m,2H),4.87(br,2H),5.62(d,1H),6.02-6.08(m,1H),6.24-6.39(m,3H),6.63(s,1H),7.43(s,1H),8.47(s,1H)。
藉由根據下文流程之對映選擇性合成確認之I-241絕對構型。根據文獻(JACS, 1995,117,5897-5898)且如實例226中所述製備N- ((3R,4S)-4-胺基四氫呋喃-3-基)丙烯醯胺,且在實例224中用於代替順-四氫呋喃-3,4-二胺。
實例226:I-241之立體化學證據及對映選擇性合成
步驟1:中間物2,((3R,4S)-4-疊氮基四氫呋喃-3-基氧基)三甲基矽烷
向裝備有攪拌棒之燒瓶中裝入(R,R)-Salen催化劑(600mg,0.02當量,Sigma Aldrich,目錄號531944,CAS # 164931-83-3),且用N2吹拂。在環境溫度下依序添加環氧環戊烷(4.30g,50.0mmol)及TMSN3(6.00g,1.05當量)。攪拌反應混合物12小時,此時減壓移除過量TMSN3,且藉由矽膠管柱層析法(用30% EtOAc/己烷溶離)純化殘餘物獲得呈黃色油狀之標題化合物(7.80g,78%,91% ee,JACS, 1995,117,5897-5898)。1HNMR(CDCl3,400MHz):δ 0.00(s,9H),3.46-3.49(m,1H),3.64-3.69(m,2H),3.83(dd,1H),3.89(dd,,1H),4.08-4.11(m,1H)。
步驟2:中間物3,(3R,4S)-4-胺基四氫呋喃-3-醇
向((3R,4S)-4-疊氮基四氫呋喃-3-基氧基)三甲基矽烷(7.80g,38.8mmol)於MeOH(100mL)中之溶液中添加TFA(10.0mg,0.002當量),且在室溫下攪拌混合物30分鐘。用Pd/C(1.90g,25wt%)處理所得溶液且在環境溫度下,在H2氛圍下攪拌40小時。經矽藻土過濾反應 溶液,且用MeOH洗滌濾餅。減壓濃縮經合併之有機物獲得標題化合物(3.10g)。1HNMR(CDCl3,400MHz):δ 3.38-3.40(m,2H),3.54(m,2H),3.68-3.72(m,2H),3.75(dd,1H),3.83(dd,1H),4.00-4.03(m,1H)。
步驟3:中間物4,(3S,4R)-4-羥基四氫呋喃-3-基胺基甲酸第三丁酯
向(3R,4S)-4-胺基四氫呋喃-3-醇(1.00g,9.71mmol)於THF(30mL)中之溶液添加(Boc)2O(2.70g,1.30當量)。在環境溫度下攪拌混合物隔夜。減壓濃縮反應溶液。將殘餘物分配於EtOAc與水之間,用水及鹽水洗滌有機層,經無水Na2SO4乾燥且減壓濃縮。藉由管柱層析法(用5% EtOAc/己烷溶離)純化粗產物獲得呈白色固體形式之標題化合物(1.20g,61%)。1HNMR(CDCl3,400MHz):δ 1.45(s,9H),3.11(s,1H),3.60-3.63(m,1H),3.68-3.71(1H),3.95(s,br,1H),4.04-4.11(m,2H),4.28-4.30(m,1H),4.74(s,br,1H)。
步驟4:中間物5,(3R,4S)-4-(第三丁氧羰基胺基)四氫呋喃-3-基甲烷磺酸酯
在0℃下,在氮氣氛圍下,向(3S,4R)-4-羥基四氫呋喃-3-基胺基甲酸第三丁酯(1.20g,5.91mmol)及TEA(0.89g,1.50當量)於DCM(40mL)中之溶液中分部分添加甲烷磺醯氯(0.88g,1.30當量)。使混合物緩慢升溫至室溫且攪拌1小時。用水、1N HCl及碳酸氫鈉飽和水溶液洗滌所得溶液,經無水Na2SO4乾燥且減壓濃縮獲得標題化合物(1.60g,96%)。1HNMR(CDCl3,400MHz):δ 1.45(s,9H),3.21(s,3H),3.70-3.73(m,1H),3.97-3.99.(m,1H),4.05-4.07(m,1H),4.17-4.19(m,2H),4.76(s,1H),5.05(d,1H)。
步驟5,中間物6,(3R,4S)-4-疊氮基四氫呋喃-3-基胺基甲酸第三丁酯:
向(3R,4S)-甲烷磺酸4-(第三丁氧羰基胺基)四氫呋喃-3-基酯(1.60g,5.70mmol)於NMP(10mL)中之溶液中添加NaN3(0.92g,2.50當 量)。在95℃下攪拌混合物5小時。用水淬滅所得溶液且用乙酸乙酯萃取。用鹽水洗滌有機相,經硫酸鈉乾燥,過濾且減壓濃縮獲得標題化合物(620mg,48%)。1HNMR(CDCl3,400MHz):δ 1.47(s,9H),3.45(t,1H),3.87-3.89(m,1H),4.02-4.07(m,2H),4.21(s,br,1H),4.36-4.44(m,1H),4.85(s,br,1H)。
步驟6:中間物7,(3R,4S)-4-胺基四氫呋喃-3-基胺基甲酸第三丁酯
向(3R,4S)-4-疊氮基四氫呋喃-3-基胺基甲酸第三丁酯(620mg,2.72mmol)於甲醇(15ml)中之溶液中添加Pd/C(10%,170mg)。在環境溫度下,在氫氣下氫化(3atm)混合物隔夜,隨後過濾反應混合物,且濃縮濾液獲得標題化合物(350mg,63%,91% ee)。1HNMR(CDCl3,400MHz):δ 1.26(s,br,1H),1.46(s,9H),1.68(s,br,1H),3.47-3.49(m,1H),3.57-3.59(m,2H),3.98-4.06(m,2H),4.10(d,1H),5.24(s,br,1H)。
藉由與來自實例224之中間物8偶合,隨後使用如實例224中所述之程序脫除Boc保護基及丙烯醯胺形成,使用中間物7製備I-241I-241:MS m/z:520.4(M+H+),1HNMR(400MHz,CDCl3):3.68-3.85(m,5H),3.95(s,6H),4.16-4.24(m,2H),4.87(br,2H),5.62(d,1H),6.02-6.08(m,1H),6.24-6.39(m,3H),6.63(s,1H),7.43(s,1H),8.47(s,1H)。
實例227:合成I-242
步驟1:中間物1
向4-甲氧基-2-硝基苯胺(170mg,1.02mmol)於無水NMP(5mL)中之溶液中添加NaH(60%,42.0mg,1.02mmol)。在室溫下攪拌反應混合物10分鐘,隨後在100℃下加熱0.5小時,隨後添加來自實例223之共用中間物8(300mg,0.68mmol)。在100℃下攪拌反應混合物隔夜,隨後冷卻至室溫且分配於EtOAc與水之間。分離有機相且用水、鹽水洗滌,經無水Na2SO4乾燥且經矽膠管柱層析法純化粗產物獲得標題化合物(200mg,55%)。MS m/z:532.4(M+H+)。
步驟2:中間物2
將中間物1(200mg,0.38mmol)、Fe(130mg,2.26mmol)及NH4Cl(130mg,2.43mmol)於EtOH(10mL)與H2O(6mL)中之混合物加熱至回流持續1小時。藉由過濾移除所得固體且用DCM萃取濾液。 用鹽水洗滌有機相,經Na2SO4乾燥且經矽膠管柱層析法純化粗產物獲得標題化合物(180mg,95%)。MS m/z:502.4(M+H+)。
步驟3:I-242
在0℃下,向中間物2(180mg,0.36mmol)及DIPEA(70mg,0.54mmol)於無水DCM(5mL)中之溶液中逐滴添加丙烯醯氯(40mg,0.43mmol)於無水DCM(1mL)中之溶液。10分鐘後,將反應混合物分配於DCM/H2O之間,且分離有機相,用鹽水洗滌且經Na2SO4乾燥。經矽膠管柱層析法純化所得固體獲得標題化合物(60.0mg,30%)。MS m/z:556.4(M+H+)。1HNMR(400Hz,DMSO-d6):δ 3.48(s,3H),3.78(s,3H),3.96(q,6H),5.74(d,1H),6.27(dd,1H),6.53(q,1H),6.82(dd,1H),6.99(s,1H),7.40(br,1H),7.58(br,1H),7.76(s,1H),8.73(s,1H),9.15(s,1H),9.68(br,1H)。
實例228:合成I-243
如實例227中所述,在步驟1中使用4-甲基-2-硝基苯胺代替4-甲氧基-2-硝基苯胺製備標題化合物。MS m/z:540.5(M+H+)。
實例229:合成I-244
如實例227中所述,在步驟1中使用2-硝基苯胺代替4-甲氧基-2-硝基苯胺製備標題化合物。MS m/z:526.4(M+H+)。
實例230:合成I-245
如實例227中所述,在步驟1中使用4-氟-2-硝基苯胺代替4-甲氧基-2-硝基苯胺製備標題化合物。MS m/z:544.4(M+H+)。
實例231:合成I-246
如實例127中所述,在步驟5中使用4-氯-3-(7-氯-1-甲基-2-側氧基-1,2-二氫嘧啶并[4,5-d]嘧啶-3(4H)-基)-N-(3-(2-氰基丙-2-基)苯基)苯甲醯胺代替中間物6(其如實例1中所述,在步驟4中使用3-胺基-4-氯-N-(3-(2-氰基丙-2-基)苯基)苯甲醯胺代替3,5-二甲氧基苯胺製備),製備 標題化合物。MS m/z:615.6(M+H+)。
實例232:合成I-247
如實例127中所述,在步驟5中使用N-(3-(第三丁基)苯基)-4-氯-3-(7-氯-1-甲基-2-側氧基-1,2-二氫嘧啶并[4,5-d]嘧啶-3(4H)-基)苯甲醯胺代替中間物6(其如實例1中所述,在步驟4中使用3-胺基-N-(3-(第三丁基)苯基)-4-氯苯甲醯胺代替3,5-二甲氧基苯胺製備),製備標題化合物。MS m/z:604.6(M+H+)。
實例233:共用中間物2
步驟1:中間物1
在0℃下,向來自實例223之共用中間物8(3.50g,7.88mmol)於THF/H2O(50/50mL)中之混合物中分部分添加KOH(1.30g,23.6mmol)。在室溫下攪拌所得混合物4小時,隨後濃縮且將pH值調整至2。藉由過濾收集所得沈澱物,且乾燥獲得呈白色固體狀之標題化合物(2.50g,83%)。LCMS:382.3[M+1]+1H NMR(400MHz,DMSO-d 6):δ 3.46(s,3H),3.96(s,6H),6.99(s,1H),7.63(s,1H),8.57(s,1H), 12.43(s,1H)。
步驟2:共用中間物2
向中間物1(2.50g,6.56mmol)於CH3CN(80mL)中之混合物中添加POCl3(10.0mL)。在90℃下攪拌混合物6小時,隨後濃縮且溶解於水中。過濾沈澱物且乾燥(Na2SO4)獲得呈白色固體狀之標題化合物(2.50g,95%)。LCMS:400.3[M+1]+1H NMR(400MHz,DMSO-d 6):δ 3.65(s,3H),3.98(s,6H),7.04(s,1H),8.09(s,1H),9.08(s,1H)。
實例234:I-248
步驟1:中間物2
在室溫下,向1-甲基-1H-吡唑-3-胺(2.0g,20.6mmol)、3-溴丙-1-烯(5.25g,43.4mmol)於無水THF(50mL)中之溶液中分部分添加NaH(60%,1.73g,43.3mmol)。在60℃下攪拌混合物16小時。將混合物冷卻至室溫,且藉由在冷卻下逐滴添加水小心地淬滅。濃縮反應混合物且用EtOAc(50mL×2)萃取。用鹽水(50mL)洗滌經合併之有 機層,經無水Na2SO4乾燥且濃縮。藉由矽膠層析法(用含50% EtOAc之己烷溶離)純化粗產物獲得呈黃色油狀之標題化合物(2.07g,54%)。
步驟2:中間物3
向中間物2(1.00g,5.65mmol)於甲苯(50mL)中之溶液中添加Grubbs第二代催化劑(50mg,43.3mmol)。在氮氣氛圍下,在95℃下攪拌混合物16小時,隨後冷卻至室溫且濃縮。藉由矽膠層析法(用含50% EtOAc之己烷溶離)純化所得殘餘物獲得呈黃色油狀之標題化合物(130mg,15%)。LCMS:150.2[M+1]+1H NMR(400MHz,CDCl3):δ3.61-3.64(m,2H),3.75(s,3H),3.77-3.82(m,2H),5.26-5.29(m,2H),5.46(d,1H),7.15(d,1H)。
步驟3:中間物4
向中間物3(130mg,0.87mmol)及K2OsO4 2H2O(38.0mg,0.10mmol)於THF(50mL)中之溶液中添加50% NMO(306mg,1.31mmol)。在室溫下攪拌混合物4小時。添加Na2SO3(200mg)且再攪拌反應混合物30分鐘。濃縮混合物,且藉由矽膠層析法(用含5% MeOH之DCM溶離)純化所得殘餘物獲得呈無色油狀之標題化合物(90mg,60%)。LCMS:184.2[M+1]+1H NMR(400MHz,CDCl3):δ 3.27-3.30(m,2H),3.70(s,3H),3.47-3.51(m,2H),4.28(m,2H),5.41(d,1H),7.09(d,1H)。
步驟4:中間物5
在0℃下,向中間物4(456mg,2.49mmol)及Et3N(754mg,7.47mmol)於DCM(20mL)中之溶液中逐滴添加MsCl(115mg,7.43mmol)。在0℃下攪拌混合物30分鐘。用H2O(25mL)淬滅混合物且用DCM(50mL×2)萃取。用鹽水(50mL)洗滌經合併之有機層,經無水Na2SO4乾燥且濃縮獲得呈淡黃色固體狀之標題化合物(103g),其未經進一步純化即使用。LCMS:340.2[M+1]+
步驟5:中間物6
在NMP(4mL)中合併中間物5(103mg,3.03mmol)、NaN3(601mg,9.25mmol)及15-冠-5(102mg,0.46mmol),且在85℃下攪拌所得混合物隔夜。使混合物冷卻至室溫且分配於EtOAc與水之間。用水、鹽水洗滌有機相,經無水Na2SO4乾燥,且濃縮獲得呈淡黃色油狀之標題化合物(905mg),其未經進一步純化即使用。LCMS:234.2[M+1]+1H NMR(400MHz,CDCl3):δ 3.38-3.42(m,2H),3.58-3.62(m,2H),3.70(s,3H),4.13-4.17(m,2H),5.41(d,1H),7.10(d,1H)。
步驟6:中間物7
向中間物6(905mg,3.88mmol)於MeOH(50mL)中之溶液中添加 10% Pd/C(200mg)。在真空下脫氣所得懸浮液且用H2淨化。在室溫下,在氫氣氛圍下攪拌混合物16小時。經矽藻土墊過濾懸浮液,且用MeOH洗滌。將經合併之濾液濃縮至乾燥獲得呈淡黃色油狀之標題化合物(682mg,97%)。MS:182.2[M+1
步驟7:中間物8
將中間物7(100mg,0.55mmol)、來自實例233之共用中間物2(148mg,0.37mmol)及DIPEA(142mg,1.10mmol)於NMP(10mL)中之混合物脫氣且用N2淨化。在100℃下加熱所得反應混合物1小時。使反應混合物冷卻至室溫且倒入冰水中。過濾所得固體,用水洗滌且乾燥獲得粗產物,將其藉由矽膠層析法(用含5% MeOH之DCM溶離)純化獲得呈黃色固體狀之標題化合物(170mg,84%)。LCMS:545.6[M+1]+1H NMR(400MHz,CDCl3):δ 3.27-3.35(m,2H),3.63-3.67(m,1H),3.73(br,3H),3.75(s,3H),3.77-3.81(m,2H),3.95(s,6H),4.67-4.68(m,1H),5.49(d,1H),6.63(s,1H),7.14(d,1H),7.42(s,1H),8.47(s,1H)。
步驟8:I-248
在0℃下,向中間物8(190mg,0.35mmol)及DIPEA(90.0mg,0.70mmol)於DCM(10mL)中之溶液中逐滴添加丙烯醯氯(31.6mg,0.35mmol)。在0℃下攪拌混合物30分鐘。用水淬滅混合物且用DCM (50mL×3)萃取。用鹽水(50mL)洗滌經合併之有機層,經無水Na2SO4乾燥且濃縮。藉由矽膠層析法(用含5% MeOH之DCM溶離)純化殘餘物獲得呈灰白色固體狀之標題化合物(90.0mg,43%)。MS:599.5[M+1]+1H NMR(400MHz,CDCl3):δ 3.38-3.46(m,2H),3.71-3.76(m,7H),3.81-3.85(m,1H),3.95(s,6H),4.91-4.93(m,2H),5.51(d,1H),5.63(d,1H),6.03-6.10(m,1H),6.28(d,1H),6.35(br,1H),6.63(s,1H),7.17(d,1H),7.40(s,1H),8.45(s,1H)。
實例235:I-252
步驟1:中間物1
在80℃下,在N2下加熱來自實例233之共用中間物2(200mg,0.45mmol)、順-3,4-二胺基吡咯啶-1-甲酸第三丁酯(180mg,0.90mmol)及DIPEA(116.mg,0.90mmol)於NMP(4mL)中之混合物1小時。使混合物冷卻至室溫且分配於EtOAc與水之間。分離有機相,用水、鹽水洗滌,經無水Na2SO4乾燥且蒸發獲得呈黃色固體狀之標題化合物(270mg,91%)。
步驟2:中間物2
根據上文流程且如先前所述進行丙醯化獲得標題化合物。
步驟3:中間物3
根據上文流程且如先前所述進行脫除Boc保護基獲得標題化合物。
步驟3:中間物4
向中間物3(207mg,0.40mmol)於1,4-二噁烷(8mL)中之溶液添加2-氯吡啶(37.0mg,0.36mmol)、BINAP(46.0mg,0.08mmol)、Pd2(dba)3(37.0mg,0.04mmol)及Cs2CO3(260mg,0.80mg),且在95℃下,在N2下攪拌混合物隔夜。使混合物冷卻至室溫且分配於DCM與水之間。分離有機相,用飽和NaHCO3洗滌,經無水Na2SO4乾燥,且進行矽膠管柱層析法(用含5% MeOH之DCM溶離)獲得標題化合物(35.0mg,15%)。LCMS:596.1[M+1]+1H NMR(400MHz,CDCl3)δ3.53(dd,1H),3.61(dd,1H),3.71(s,3H),3.95(s,6H),3.96-4.07(m,2H),4.95(s,2H),5.66(d,1H),6.06(dd,1H),6.30(d,1H),6.41(d,1H),6.61-6.67(m,2H),7.41(s,1H),7.48(t,1H),8.18(d,1H), 8.46(s,1H)。
實例236:I-253
步驟1:中間物2
在110℃下,在1,4-二噁烷(2.0mL)中加熱來自實例223之共用中間物8(96.0mg,0.22mmol)及((1S,2R)-2-胺基環戊基)胺基甲酸第三丁酯(200mg,1.00nmol)持續20小時。濃縮反應混合物且藉由矽膠層析法(0-100% EtOAc/己烷)純化獲得標題化合物(120mg,97%)。LCMS m/z:564.2[M+H]+
步驟2:中間物3
在室溫下,將中間物2(120mg)溶解於4.0M HCl/二噁烷中且攪拌2小時,隨後將反應混合物蒸發至乾燥且所得殘餘物未經進一步純化即用於下一步驟中。
步驟3:I-253
向中間物3(23.0mg,0.046mmol)於DCM(2.0mL)中之溶液中添加DIPEA(100μL)及3-氯丙烷-1-磺醯氯(8μL,0.066mmol)。在室溫下攪拌反應混合物4小時,接著濃縮且藉由製備型HPLC純化獲得標題化合物,LCMS:554.2[M+H]+
實例237:I-255
步驟1:中間物2
如實例223中所述,在步驟6中使用3當量SO2Cl2製備中間物1。將中間物1(139mg,0.37mmol)、如實例226中所述製備之(3R,4S)-4-胺基四氫呋喃-3-基胺基甲酸第三丁酯(112mg,0.55mmol)及DIPEA(95.0mg,0.74mmol)溶解於NMP(6mL)中且加熱至80℃持續1小時。使混合物冷卻至室溫且分配於EtOAc與水之間。分離有機相,用水、鹽水洗滌,經無水Na2SO4乾燥且濃縮。經矽膠層析法(含10% MeOH之DCM)純化所得殘餘物獲得標題化合物(90.0mg,49%)。LCMS:498.6[M+1]+1HNMR(400MHz,CDCl3):1.38(s,9H),2.00-2.04(m,1H),2.36-2.40(m,1H),3.73(s,3H),3.95(s,6H),3.83(s,6H),4.23- 4.27(m,1H),4.51(br,1H),4.76-4.81(m,1H),4.90(d,1H),6.48(t,1H),6.82(d,2H),7.63(s,1H),8.49(s,1H)。
步驟2:中間物3
向中間物2(70.0mg,0.14mmol)於DCM(2mL)中之溶液中添加TFA(4mL)。在室溫下攪拌反應混合物1小時。濃縮反應混合物獲得呈黃色固體狀之標題化合物。LCMS:398.4[M+1]+
步驟3:I-255
在-78℃下,向中間物2及DIPEA(39.0mg,0.30mmol)於無水DCM(6mL)中之溶液中逐滴添加丙烯醯氯(14.0mg,0.15mmol)於無水DCM(1mL)中之溶液。攪拌反應物10分鐘,隨後將其分配於DCM與H2O之間。分離有機相,用鹽水洗滌且經Na2SO4乾燥。經矽膠層析法純化所得殘餘物獲得標題化合物(50.0mg,74%)。LCMS:452.4[M+1]+1HNMR(400MHz,CDCl3):3.72(s,3H),3.75-3.79(m,8H),4.18-4.21(m,1H),4.25-4.29(m,1H),4.83-4.88(m,2H),5.63(dd,1H),5.86(br,1H),5.98-6.05(m,2H),6.26(dd,1H),6.49(t,1H),6.81(d,2H),7.62(s,1H),8.49(s,1H)。
中間物238:I-256
步驟1:中間物2
在25℃下,向中間物1(120mg,0.207mmol)於DCM(5mL)中之溶液中添加m-CPBA(89.0mg,0.517mmol)。在25℃下攪拌混合物5小時,隨後濃縮且藉由矽膠層析法(含5% MeOH之DCM)純化所得殘餘物獲得呈白色固體狀之標題化合物(40.0mg,31%)。LCMS:614.5[M+1]+
步驟2:中間物3
在25℃下,向中間物2(40.0mg,0.065mmol)於DCM(4mL)中之溶液中添加TFA(4mL),且在25℃下攪拌混合物4小時。濃縮混合物獲得呈黃色油狀之標題化合物,其未經進一步純化即使用。
步驟3:I-256
在-20℃下,向中間物3(33.5mg,0.065mmol)於THF(20mL)中之溶液中添加丙烯醯氯(6.48mg,0.072mmol)。在-20℃下攪拌混合物30分鐘,隨後用水淬滅且用EtOAc萃取。用鹽水(50mL)洗滌經合併之有機層,經無水Na2SO4乾燥且濃縮。經矽膠層析法(含5% MeOH之DCM)純化所得殘餘物獲得呈白色固體狀之標題化合物(13.5mg,36%)。LCMS:568.5[M+1]+1H NMR(400MHz,DMSO-d 6):δ 3.42-3.59(m,1H),3.65(s,3H),3.67-3.77(m,3H),3.96(s,6H),5.00-5.09(m,3H),5.60-5.62(m,1H),6.09-6.23(m,3H),6.97(s,1H),7.75(s,1H),8.72(s,1H)。
實例239:I-257
步驟1:中間物1
在100℃下,在氮氣氛圍下,加熱來自實例233之共用中間物2(100mg,0.28mmol)、4,5-二氟苯-1,2-二胺(48.0mg,0.34mmol)、Pd2(dba)3(50.0mg,0.05mmol)、Davephos(43.0mg,0.11mmol)及Na2CO3(206mg,1.95mmol)於第三戊醇(4mL)中之混合物3小時。將反應混合物冷卻至室溫,且用水(25mL)稀釋。用DCM萃取所得混合物。用鹽水(20mL)洗滌經合併之有機層,經無水Na2SO4乾燥且濃縮。藉由矽膠管柱層析法(用含1-2% MeOH之DCM溶離)純化所得殘餘物獲得標題化合物(25mg,18%)。LCMS:508.4[M+H]+1H NMR(400MHz,CDCl3):δ10.88(s,1H),9.28(d,1H),8.74(s,1H),8.60(s, 1H),7.92(d,1H),7.58(s,1H),6.66(s,1H),3.96(s,6H),3.84(s,3H)。
步驟2:I-257
在0℃下,向中間物1(30.0mg,0.05mmol)、DIPEA(14.2mg,0.05mmol)於DCM(10mL)中之混合物中添加丙烯醯氯(5.30mg,0.06mmol),且在0℃下攪拌所得混合物10分鐘。用水淬滅反應物且用EtOAc萃取水性混合物。用鹽水洗滌經合併之有機層,乾燥(Na2SO4),過濾且濃縮。藉由矽膠管柱層析法(用含2-5% MeOH之DCM溶離)純化所得殘餘物獲得呈白色固體狀之標題化合物(12.1mg,42%)。LCMS:562.5[M+H]+1H NMR(400MHz,CDCl3):δ 8.53(s,1H),7.94(s,1H),7.83(t,1H),7.68-7.62(m,1H),7.48(s,1H),6.64(s,1H),6.48(d,1H),6.27(q,1H),5.81(d,1H),3.95(s,6H),3.69(s,3H)。
實例240:I-258
步驟1:中間物1
在25℃下,向2-硝基-5-(三氟甲基)苯胺(100mg,0.23mmol)於NMP(10mL)中之溶液中逐滴添加NaH(5.40mg,0.23mmol)。在25℃下攪拌混合物0.5小時。添加來自實例223之共用中間物8(100mg,0.23mmol)且在100℃下攪拌所得混合物1小時。用水淬滅反應物,用EtOAc萃取,且用鹽水洗滌經合併之有機層,乾燥(Na2SO4),過濾且真空濃縮獲得呈黃色固體狀之標題化合物(100mg,78%)。
步驟2:中間物2
使中間物1(100mg,0.17mmol)、Fe(59.0mg,1.05mmol)及NH4Cl(57.0mg,1.05mmol)於EtOH(10mL)/水(10mL)中之混合物回流1小時。藉由過濾移除固體且濃縮濾液。用EtOAc萃取所得殘餘物且用鹽水洗滌經合併之有機層,經無水Na2SO4乾燥且濃縮。藉由矽膠管柱層析法(用含2-5% MeOH之DCM溶離)純化殘餘物獲得呈黃色固體狀之標題化合物(10.0mg,11%)。LCMS:540.5[M+H]+
步驟3:I-258
在25℃下攪拌中間物2(10.0mg,0.02mmol)、DIPEA(4.70mg,0.04mmoL)於THF(10mL)中之混合物。在0℃下添加丙烯醯氯(2.00mg,0.02mmol)且在0℃下攪拌所得混合物10分鐘。用水淬滅反應物 且用EtOAc萃取。用鹽水洗滌經合併之有機層,乾燥(Na2SO4),過濾且真空濃縮。藉由矽膠管柱層析法(用含2-5% MeOH之DCM溶離)純化殘餘物獲得呈黃色固體狀之標題化合物(4.60mg,42%)。LCMS:594.5[M+H]+1H NMR(400MHz,CD3OD):δ 8.65(s,1H),8.29(s,1H),7.72(d,1H),7.62(s,1H),7.40(d,1H),6.78(s,1H),6.45-6.31(m,2H),5.73(d,1H),3.86(s,6H),3.56(s,3H)。
實例241:I-259
步驟1:中間物1
在100℃下,在N2氛圍下,加熱來自實例223之共用中間物2(50.0mg,0.13mmol)、2-氟-6-硝基苯胺(23.5mg,0.15mmol)、Pd2(dba)3(24.0mg,0.026mmol)、Davephos(20.0mg,0.052mmol)及Na2CO3(96.0mg,0.91mmol)於第三戊醇(2mL)中之混合物持續4小時。使反應混合物冷卻至室溫且分配於DCM與水之間。分離有機層,用鹽水洗滌,經無水Na2SO4乾燥且濃縮。藉由製備型TLC純化所得殘餘物獲得標題化合物(20.0mg,31%)。LCMS:520.4[M+1]+
步驟2:中間物2
將中間物1(20.0mg,0.038mmol)、Fe(13.0mg,1.40mmol)及NH4Cl(80.0mg,1.40mmol)於EtOH/H2O(10/10ml)中之混合物加熱至80℃且攪拌4小時。過濾懸浮液,且濃縮濾液。藉由製備型TLC純化所得殘餘物獲得呈黃色固體狀之產物(10.0mg,53%)。LCMS:490.4[M+1]+
步驟3:I-259
如先前實例中所述進行中間物2之丙醯化獲得標題化合物。LCMS:544.5[M+1]+1H NMR(400MHz,CD3OD):δ 3.45(s,3H),3.86(s,6H),5.64-5.67(m,1H),6.24-6.29(m,1H),6.33-6.40(m,1H),6.78(s,1H),6.98-7.03(m,1H),7.22-7.27(m,1H),7.55(d,1H),7.60(s,1H),8.58(s,1H)。
實例242:I-265
步驟1:中間物1
使4-氯-3-甲基苯甲酸甲酯(4.00g,24.0mmol)、n-溴丁二醯亞胺(NBS,4.30g,24.0mmol)及過氧化苯甲醯(BPO,0.58g,2.40mmol)於CCl4(50mL)中之混合物回流4小時。使混合物冷卻至室溫,過濾,且濃縮濾液。藉由矽膠管柱層析法(用含2-5% EtOAc之己烷溶離)純化所得殘餘物獲得呈白色固體狀之標題化合物(2.70g,43%)。1H NMR(400MHz,CDCl3):δ 8.12(d,1H),7.92(dd,Hz,1H),7.47(d,1H),4.61(s,2H),3.93(s,3H)。
步驟2:中間物2
使中間物1(1.00g,3.80mmol)、TMSNC(0.56g,5.69mmol)及K2CO3(786mg,5.69mmol)於CH3CN(50mL)中之混合物回流16小時。使混合物冷卻至室溫,過濾,且濃縮濾液。藉由矽膠管柱層析法(用含5-10% EtOAc之己烷溶離)純化所得殘餘物獲得呈白色固體狀之標題化合物(590mg,75%)。1H NMR(400MHz,CDCl3):δ 8.18(d,1H),7.99(dd,1H),7.52(d,1H),3.94(s,3H),3.88(s,2H)。
步驟3:中間物3
在25℃下,向中間物2(920mg,4.41mmol)於MeOH(10mL)中之溶液中添加H2SO4(4mL)。在60℃下攪拌混合物16小時。用Na2CO3飽和水溶液將混合物鹼化至pH 8且用DCM萃取。經無水Na2SO4乾燥經合併之有機層且濃縮獲得呈灰白色固體狀之標題化合物(910mg,86%)。1H NMR(400MHz,CDCl3):δ 7.97(d,1H),7.46(d,1H),7.90(dd,1H),3.91(s,3H),3.83(s,2H),3.72(s,3H)。
步驟4:中間物4
在25℃下,向中間物3(270mg,1.11mmol)及4-(甲基胺基)-2-(甲硫基)嘧啶-5-甲醛(204mg,1.11mmol)於DMF(10mL)中之溶液中添加K2CO3(307mg,2.22mmol)。在110℃下攪拌混合物4小時,隨後添加水且藉由過濾收集沈澱物獲得標題化合物(320mg,77%)。LCMS:376.3[M+H]+
步驟5:中間物5
向中間物4(320mg,0.85mmol)於THF(10mL)中之溶液中添加5M NaOH(5mL)。在室溫下攪拌混合物4小時,隨後用1M HCl鹼化至pH=6且藉由過濾收集固體獲得標題化合物(150mg,49%)。
步驟6:中間物6
在室溫下,向中間物5(180mg,0.50mmol)、HATU(87.0mg,0.23mmol)及3-第三丁基苯胺(67.4mg,0.45mmol)於DMF(20mL)中之溶液中逐滴添加DIPEA(117mg,0.90mmol)。在40℃下攪拌混合物4小時,隨後將其分配於EtOAc與H2O之間。用鹽水洗滌有機相,經Na2SO4乾燥,濃縮且藉由矽膠管柱層析法(用含5-10% EtOAc之己烷溶離)純化所得殘餘物獲得呈黃色粉末狀之標題化合物(100mg,41%)。LCMS:493.5[M+1]+
步驟7:中間物7
在0℃下,向中間物6(100mg,0.20mmol)於DCM(10mL)中之溶液中添加m-CPBA(87mg,0.51mmol)。在室溫下攪拌混合物16小時。將混合物分配於EtOAc與H2O之間。用鹽水洗滌有機相,經Na2SO4乾燥,濃縮且藉由矽膠管柱層析法(用含2-5% MeOH之DCM溶離)純化粗產物獲得呈黃色粉末狀之標題化合物(80mg,75%)。
步驟8:中間物8
將中間物7(80.0mg,0.15mmol)、如實例226中所述製備之(3R,4S)-4-胺基四氫呋喃-3-基胺基甲酸第三丁酯(61.0mg,0.30mmol)及DIPEA(39.0mg,0.30mmol)於NMP中之溶液脫氣且用N2淨化。在80℃下攪拌混合物1小時,隨後將其分配於EtOAc與H2O之間。用鹽水洗滌有機層,經Na2SO4乾燥,濃縮且藉由矽膠管柱層析法(用含2-5% MeOH之DCM溶離)純化所得殘餘物獲得標題化合物(30.0mg,31%)。LCMS:647.7[M+1]+
步驟9:I-265
在25℃下,攪拌中間物8(30.0mg,0.05mmol)於DCM(2mL)及TFA(2mL)中之溶液1小時。濃縮混合物且用DIPEA將pH值調整至>7。在0℃下,向混合物中添加丙烯醯氯(4.20mg,0.05mmol)。再攪拌反應混合物10分鐘,隨後用NaHCO3飽和水溶液(25mL)淬滅且用 DCM萃取。用鹽水洗滌經合併之有機層,經無水Na2SO4乾燥且濃縮。藉由矽膠管柱層析法(用含5-10% MeOH之DCM溶離)純化所得殘餘物獲得呈黃色固體狀之標題化合物(7.50mg,25%)。LCMS:601.6[M+H]+1H NMR(400MHz,CDCl3):δ 9.81(s,1H),8.27(s,1H),8.01(s,1H),7.85(d,2H),7.61-7.55(m,3H),7.50(d,1H),7.30(t,1H),7.20(d,1H),6.62(s,1H),6.26(d,1H),6.14(q,1H),5.67(d,1H),5.04-4.96(m,1H),4.91-4.88(m,1H),4.24-4.17(m,2H),3.96-3.93(m,1H),3.88-3.83(m,1H),3.72(s,3H),1.32(s,9H)。
實例243:I-269
步驟1:中間物1
在100℃下,攪拌5-氟-2-硝基苯胺(2.00g,12.8mmol)、1-乙基哌嗪(1.60g,14.1mmol)及K2CO3(2.65g,119.2mmol)於DMSO(50mL)中之混合物12小時。將反應混合物分配於EtOAc與H2O之間,用鹽水洗滌有機層,乾燥(Na2SO4),過濾且真空濃縮。經矽膠(DCM:MeOH=30:1)純化所得殘餘物獲得呈黃色固體狀之標題化合物(1.40g,44%)。
步驟2:中間物2
將丙烯醯氯(867mg,9.6mmol)逐滴添加至中間物1(400mg,1.60mmol)及DIPEA(2.06g,16.0mmol)於NMP(10mL)中之混合物中。在30℃下攪拌反應混合物12小時。將反應混合物分配於EtOAc與H2O之間,用鹽水洗滌經合併之有機層,乾燥(Na2SO4),過濾且真空濃縮獲得呈黃色油狀之中間物2(400mg,粗產物)。LCMS:305.4[M+1]+1H NMR(400MHz,DMSO-d 6):δ1.03(t,3H),2.36(q,2H),3.47-3.49(m,4H),3.41-3.44(m,4H),5.84-5.87(m,1H),6.27-6.31(m,1H),6.50-6.56(m,1H),6.84(dd,1H),7.75(d,1H),8.01(d,1H),10.65(s,1H)。
步驟3:中間物3
來自先前步驟之中間物2、Fe(1.16g,20.7mmol)及NH4Cl(1.12g,20.7mmol)溶解於EtOH/H2O(20mL/10mL)中且在75℃下攪拌2小時,隨後冷卻反應混合物,過濾且用MeOH洗滌沈澱物。真空濃縮濾液,接著分配於EtOAc與NaHCO3水溶液之間。用鹽水洗滌有機層,乾燥(Na2SO4),過濾且濃縮。藉由矽膠層析法(DCM:MeOH:NH4OH=400:8:4)純化所得殘餘物獲得呈黃色固體狀之標題化合物(200mg,22%)。LCMS:275.4[M+1]+
步驟4:I-269
在100℃下,在N2下,攪拌中間物3(200mg,0.73mmol)、來自實例233之共用中間物2(290mg,0.73mmol)及對甲苯磺酸(62.0mg,0.36mmol)於1,4-二噁烷(10mL)中之混合物12小時。將反應混合物分配於EtOAc與NaHCO3水溶液之間,且用鹽水洗滌有機層,乾燥(Na2SO4),過濾且真空濃縮。藉由逆相製備型HPLC純化所得殘餘物獲得呈黃色固體狀之標題化合物(29.2mg,6%)。LCMS:638.6[M+1]+1H NMR(400MHz,CDCl3):δ 1.43(t,3H),3.12-3.15(m,2H),3.24-3.33(m,4H),3.63(s,3H),3.70-3.73(m,2H),3.91-3.98(m,8H),5.79(dd,1H),6.37-6.52(m,2H),6.91(s,1H),7.02(dd,1H),7.43(s,1H),7.68-7.70(m,2H),8.70(s,1H)。
實例244:I-274
步驟1:中間物1
向3,5-二甲氧基苯甲酸甲酯(2.00g,10.2mmol)於CH3CN(20mL)中之溶液中添加1-(氯甲基)-4-氟-1,4-二氮鎓雙環[2.2.2]辛烷二-四氟硼酸酯(SelectfluorTM,5.40g,15.2mmol)。在室溫下攪拌反應物隔夜,隨後用水稀釋且用乙酸乙酯萃取。用水及鹽水洗滌有機層,經硫酸鈉乾燥且真空濃縮。藉由管柱層析法(己烷/乙酸乙酯:10/1)純化所得殘餘物獲得呈白色固體狀之標題化合物(800mg,38%)。1H NMR(400MHz,CDCl3):δ 3.81(s,3H),3.87(s,3H),3.93(s,3H),6.70(dd,1H),6.91(dd,1H)。
步驟2:中間物2
向中間物1(800mg,3.70mmol)於THF(10mL)中之冰冷卻溶液中分部分添加LiAlH4(0.30g,7.90mmol)。在室溫下攪拌反應物30分鐘,接著向混合物中緩慢添加水且藉由過濾移除所得固體。真空濃縮濾液獲得呈油狀之標題化合物(610mg,87.9%),其直接用於下一步驟中。1H NMR(400MHz,CDCl3):δ 3.79(s,3H),3.86(s,3H),3.88(s,1H),4.74(d,2H),6.45-6.49(m,1H),6.49-6.55(m,1H)。
步驟3:中間物3
在0℃下,向中間物2(610mg,3.30mmol)於DCM(10mL)中之溶液中添加PBr3(1.06g,3.90mmol)。在室溫下攪拌反應物4小時。向反應混合物中添加NaHCO3飽和水溶液且用水稀釋且用乙酸乙酯萃取。用水及鹽水洗滌有機層,經硫酸鈉乾燥且真空濃縮。藉由管柱層析法(己烷/乙酸乙酯:10/1)純化所得殘餘物獲得呈白色固體狀之標題化合物(640mg,79%)。
步驟4:中間物4
向中間物3(640mg,2.60mmol)於DCM(15mL)中之溶液中添加TMSCN(510mg,5.1mmol)及K2CO3(709mg,5.10mmol)。在60℃下攪拌反應物隔夜,隨後用水稀釋反應混合物且用乙酸乙酯萃取。用水及鹽水洗滌有機層,經硫酸鈉乾燥且真空濃縮。藉由管柱層析法(己烷/乙酸乙酯:10/1)純化粗產物獲得呈白色固體狀之標題化合物(454mg,90%)。
步驟5:中間物5
向中間物4(454mg,2.30mmol)於EtOH(4mL)中之溶液中添加濃H2SO4(1mL)。在90℃下攪拌反應物4小時。用水稀釋反應混合物且用乙酸乙酯萃取。用水及鹽水洗滌有機層,經硫酸鈉乾燥且真空濃縮獲得標題化合物(400mg,59%),其未經進一步純化即用於下一步驟中。
步驟6:中間物6
向中間物5(400mg,1.65mmol)於DMF(10mL)中之溶液中添加4-(甲基胺基)-2-(甲硫基)嘧啶-5-甲醛(302.6mg,1.65mmol)及K2CO3(456mg,3.3mmol)。在110℃下攪拌反應物4小時。用水稀釋反應混合物,且藉由過濾收集沈澱物獲得呈白色固體狀之標題化合物(500mg,84%)。LCMS:362.4[M+1]+
步驟7:中間物7
向中間物6(500mg,1.38mmol)於DCM(10mL)中之溶液中添加m-CPBA(594mg,3.45mmol)。在室溫下攪拌反應物隔夜,隨後過濾且濃縮。藉由矽膠管柱層析法(DCM/MeOH:40/1)純化所得殘餘物獲得呈淡黃色固體狀之標題化合物(210mg,30%)。LCMS:394.3[M+1]+
步驟8:中間物8
向中間物7(50.0mg,0.13mmol)於NMP(5mL)中之溶液中添加(3R,4S)-4-胺基四氫呋喃-3-基胺基甲酸第三丁酯(38.5mg,0.19mmol)及DIPEA(33.0mg,0.26mmol)。在100℃下攪拌反應物1小時,隨後冷卻至室溫,用水稀釋且用乙酸乙酯萃取。用水及鹽水洗滌有機層,經硫酸鈉乾燥且真空濃縮。藉由矽膠管柱層析法(DCM/MeOH:20/1)純化粗產物獲得呈白色固體狀之標題化合物(60.0mg,92%)。LCMS:516.6[M+1]+
步驟9:中間物9
向中間物8(60.0mg,0.11mmol)於DCM(3mL)中之溶液中添加TFA(3mL)。在環境溫度下攪拌反應混合物30分鐘,隨後真空蒸發溶 劑獲得標題化合物(52.0mg),其未經進一步純化即用於下一步驟中。
步驟10:I-274
在0℃下向中間物9(52.0mg,0.11mmol)於DCM(5mL)中之溶液中添加DIPEA(28.4mL,0.22mmol)及丙烯醯氯(9.00mg,0.10mmol)。在攪拌下將反應物升溫至室溫持續30分鐘。用水稀釋反應混合物且用DCM萃取。用水及鹽水洗滌有機層,經硫酸鈉乾燥且真空濃縮。藉由矽膠管柱層析法(DCM/MeOH:20/1)純化所得殘餘物獲得呈白色固體狀之標題化合物(7.10mg,12%)。LCMS:470.5[M+1]+1H NMR(400MHz,CDCl3):δ 3.71(s,3H),3.75-3.78(m,1H),3.80(s,3H),3.81-3.85(m,1H),3.89(s,3H),4.17-4.22(m,1H),4.24-4.31(m,1H),4.81-4.90(m,2H),5.65(dd,1H),5.80-5.89(m,1H),6.04(d,2H),6.26(dd,1H),6.56(dd,2H),7.62(s,1H),8.47(s,1H)。
實例245:I-276
步驟1:中間物1
在25℃下,向4-(1-甲基-1H-四唑-5-基)-2-硝基苯胺(30.0mg,0.14mmol)於NMP(5mL)中之溶液中添加NaH(11.3mg,0.47mmol)。在25℃下攪拌混合物0.5小時。添加來自實例233之共用中間物2(50.0mg,0.11mmol)且在100℃下攪拌所得混合物1小時。用水淬滅反應物且用EtOAc萃取。用鹽水洗滌經合併之有機層,乾燥(Na2SO4),過濾且真空濃縮獲得呈黃色固體狀之標題化合物(47.0mg,73%)。LCMS:584.4[M+H]+
步驟2:中間物2
將中間物1(47.0mg,0.08mmol)、Fe(27.0mg,0.48mol)及NH4Cl(26.0mg,0.48mol)溶解於EtOH(10mL)/水(10mL)中且回流1小時。藉由過濾移除固體且濃縮濾液。將所得殘餘物溶解於EtOAc中,用鹽水洗滌,經無水Na2SO4乾燥,濃縮且藉由矽膠層析法(用含2-5% MeOH之DCM溶離)純化獲得呈黃色固體狀之標題化合物(30.0mg,68%)。
步驟3:I-276
在25℃下攪拌中間物2(30.0mg,0.05mmol)及DIPEA(14.0mg,0.10mmoL)於DCM(10mL)中之溶液。在0℃下添加丙烯醯氯(5.00 mg,0.05mmol)且在0℃下攪拌所得混合物10分鐘。用水淬滅反應物且用EtOAc萃取。用鹽水洗滌有機層,乾燥(Na2SO4),過濾且真空濃縮。藉由矽膠管柱層析法(用含2-5% MeOH之DCM溶離)純化所得殘餘物獲得呈黃色固體狀之標題化合物(3.60mg,12%)。LCMS:608.6[M+H]+1H NMR(400MHz,DMSO-d 6):δ10.01(s,1H),9.63(s,1H),8.85(s,1H),8.22(s,1H),8.15(d,1H),7.84(s,1H),7.75(d,1H),7.00(s,1H),6.60-6.52(m,1H),6.32(d,1H),5.81(d,1H),4.23(s,3H),3.96(s,6H),3.56(s,3H)。
實例246,I-278
步驟1:中間物1
在室溫下,在氫氣氛圍下,攪拌6-甲基-3-硝基吡啶-2-胺(500mg,3.26mmol)及Pt/C(250mg)於MeOH(12mL)中之混合物4小時。過濾反應混合物且濃縮濾液獲得黃色固體(300mg,75%產率)。LCMS:124.3[M+1]+
步驟2:中間物2
在100℃下加熱中間物1(56.0mg,0.45mmol)、來自實例233之共用中間物2(150mg,0.38mmol)及p-TSA(10.0mg,0.06mmol)於1,4-二噁烷(12mL)中之混合物隔夜。冷卻至室溫後,濃縮混合物且將所得殘餘物溶解於DCM中,用NaHCO3飽和水溶液及鹽水洗滌,濃縮且經矽膠管柱層析法(含10% MeOH之DCM)純化獲得呈黃色固體狀之標題化合物(32.0mg,17%產率)。LCMS:487.4[M+1]+
步驟3:I-278
向中間物2(32.0mg,0.07mmol)及DIPEA(17.0mg,0.131mmol)於DCM(6mL)中之經冷卻(0℃)溶液中添加丙烯醯氯(6.00mg,0.07mmol)。在0℃下攪拌反應物10分鐘,隨後藉由添加水淬滅且用DCM萃取。用鹽水洗滌經合併之有機層,乾燥(Na2SO4),過濾且真空濃縮。藉由矽膠管柱層析法(含1% MeOH之DCM)純化所得殘餘物獲得呈白色固體狀之標題化合物(20.0mg,56%)。LCMS:541.5[M+1]+1HNMR(400MHz,CDCl3):δ 2.55(s,3H),3.71(s,3H),3.97(s,6H),5.92(d,1H),6.49-6.54(m,1H),6.59-6.67(m,2H),7.19(br,1H),7.46(s,1H),8.50(br,1H),8.57(s,1H),9.50(br,1H)。
實例247:I-279
步驟1:中間物1
向如實例244中所述製備之6-(2-氟-3,5-二甲氧基苯基)-8-甲基-2-(甲基磺醯基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(160mg,0.40mmol)於DCM(10mL)中之冰冷卻溶液中添加SO2Cl2(55.0mg,0.38mmol),且在0℃下攪拌反應物30分鐘。添加飽和NaHCO3,且分離有機層,用鹽水洗滌,乾燥且真空濃縮獲得標題化合物(162mg,94%)。
步驟2:中間物2
在85℃下,在N2下,將中間物1(180mg,0.42mmol)、如實例226中所述製備之(3R,4S)-4-胺基四氫呋喃-3-基胺基甲酸第三丁酯(97.0mg,0.48mmol)、DIPEA(10.mg,0.80mmol)於NMP(5mL)中之混合物加熱3小時。使混合物冷卻至室溫且分配於EtOAc與水之間。分離有機相,用水、鹽水洗滌,經無水Na2SO4乾燥,且對所得殘餘物進行矽膠管柱層析法(用含5% MeOH之DCM溶離)獲得呈黃色固體狀之標題化合物(90.0mg,40%)。LCMS:550.5[M+1]+
步驟3:I-279
如先前所述進行丙醯化獲得標題化合物(34%)。對掌性HPLC表明滯轉異構體之1:1混合物,其藉由MG II製備型SFC層析法分離,該層析法使用ChiralCel OD-H管柱,移動相為含60% CO2之乙醇(0.1%NH3‧H2O)且流動速率為50mL/min。分離純溶離份且在室溫下儲存時平衡成混合物,因此獲得呈滯轉異構體混合物形式之I-279。LCMS:504.5[M+1]+1H NMR(400MHz,CDCl3):δ3.71(s,3H),3.76(dd,1H),3.83(dd,1H),3.92(d,6H),4.19(dd,1H),4.22-4.30(m,1H),4.86(s,2H),5.63(d,1H),6.03(dd,1H),6.26(d,2H),6.66(d,1H),7.52(s,1H),8.47(s,1H)。
實例248:I-281
步驟1:中間物1
向3,5-二甲氧基苯甲酸甲酯(500mg,2.55mmol)於CH3CN(25mL)中之溶液中分小份添加1-(氯甲基)-4-氟-1,4-二氮鎓雙環[2.2.2]辛烷二-四氟硼酸酯(SelectfluorTM,1.80g,5.10mmol)。在室溫下攪拌所得混合物隔夜。將混合物倒入水中,用EtOAc萃取,乾燥且蒸發至乾燥。經矽膠層析法(用含20% EtOAc之己烷溶離)純化所得殘餘物獲得標題化合物(240mg,49%)。1H NMR(400MHz,CDCl3):δ 3.89(s,6H),3.96(s,3H),6.73(t,1H)。
步驟2:中間物2
向中間物1(240mg,1.03mmol)於THF中之冰冷卻溶液中添加LAH(60.0mg,1.58mmol),且在0℃下攪拌混合物30分鐘。添加EtOAc及水,且用EtOAc萃取所得混合物,乾燥且真空蒸發。經矽膠層析法(用含30% EtOAc之己烷溶離)純化所得殘餘物獲得標題化合物(100mg,43%)。1H NMR(400MHz,CDCl3):δ 1.93(t,1H),3.88(s,6H),4.80(d,2H),6.62(t,1H)。
步驟3:中間物3
在0℃下,向中間物2(670mg,3.28mmol)及Et3N(660mg,6.0mmol)於DCM(20mL)中之冰冷卻溶液中緩慢添加MsCl(83.0g,310mmol),且在0℃下攪拌混合物0.5小時。用冰水淬滅混合物,用DCM萃取,經無水Na2SO4乾燥且蒸發至乾燥獲得標題化合物(920mg,99%)。
步驟4:中間物4
向中間物3(0.92g,3.28mmol)及TMSCN(650mg,6.57mmol)於CH3CN(15mL)中之溶液中添加K2CO3(0.97g,6.57mmol)。在80℃下,在N2下攪拌混合物隔夜。用NaHCO3飽和水溶液淬滅混合物,用乙酸乙酯萃取,經無水Na2SO4乾燥且蒸發至乾燥獲得呈褐色油狀之標題化合物,其靜置時固化(0.60g,85%)。1HNMR(400MHz,CDCl3):δ 3.74(s,2H),3.89(s,6H),6.65(t,1H)。
步驟5:中間物5
向中間物4(600mg,2.82mmol)於EtOH(8mL)中之溶液中緩慢添加H2SO4(4mL),且將混合物加熱至回流16小時。用Na2CO3飽和水溶液淬滅混合物,將pH值調整至>7。用乙酸乙酯萃取水層,經無水Na2SO4乾燥且蒸發至乾燥獲得標題化合物(600mg,82%)。1HNMR(400MHz,CDCl3):δ 1.26(t,3H),3.71(t,2H),3.89(s,6H),4.18(q,2H),6.59(t,1H)。
步驟6:中間物6
向4-(甲基胺基)-2-(甲硫基)嘧啶-5-甲醛(349mg,1.92mmol)於DMF(10mL)中之溶液中添加中間物5(500mg,1.92mmol)及K2CO3(530mg,3.84mmol),且在100℃下攪拌混合物20小時。使反應混合物冷卻至室溫且倒入水中。過濾所得固體,用水洗滌,且自乙醇再結 晶獲得呈黃色固體狀之標題化合物(250mg,34%)。LCMS:380.2[M+1]+
步驟7:中間物7
向中間物6(210mg,0.55mmol)於DCM(20mL)中之溶液中以一份添加m-CPBA(146mg,0.85mmol),且在室溫下攪拌混合物30分鐘。用DCM稀釋混合物,用飽和Na2SO3及飽和NaHCO3洗滌。分離有機層,經Na2SO4乾燥,且真空濃縮獲得呈淡黃色固體狀之標題化合物(210mg,97%)。LCMS:396.2[M+1]+
步驟8:中間物8
在85℃下,在N2下,加熱中間物7(100mg,0.25mmol)、如實例226中所述製備之((3R,4S)-4-胺基四氫呋喃-3-基)胺基甲酸第三丁酯(77.0mg,0.38mmol)、DIPEA(10.0mg,0.80mmol)於NMP(3mL)中之混合物1.5小時。使反應混合物冷卻至室溫且分配於EtOAc與水之間。分離有機相,用水、鹽水洗滌,且經無水Na2SO4乾燥。對所得殘餘物進行矽膠管柱層析法(用含5% MeOH之DCM溶離)獲得呈黃色固體狀之標題產物(106mg,79%)。LCMS:534.5[M+1]+
步驟9:I-281
根據上文流程且如先前所述進行丙醯化獲得標題化合物(54.0mg,69%)。LCMS:488.5[M+1]+
1H NMR(400MHz,CDCl3):δ 3.71(s,3H),3.75-3.80(m,1H),3.83(dd,1H),3.89(s,6H),4.16-4.22(m,1H),4.24-4.31(m,1H),4.82-4.90(m,2H),5.64(d,1H),6.02(dd,2H),6.27(d,1H),6.69(t,1H),7.59(s,1H),8.47(s,1H)。
實例249:I-286
步驟1:中間物1
將化合物環戊-3-烯醇(1.5g,17.9mmol)於10mL DMF中之溶液 冷卻至0℃且在N2下向混合物中添加TBDPSCl(7.35g,26.8mmol)、咪唑(3.6g,53.6mmol)及DMAP(0.2g,1.8mmol)。在28℃下,在N2下攪拌混合物隔夜,隨後藉由添加NaHCO3飽和水溶液淬滅,用EtOAc萃取,乾燥且蒸發至乾燥。(5.0g,87%)。1H NMR(400MHz,CDCl3):δ1.08(s,9H),2.32-2.51(m,4H),4.54-4.59(m,1H)5.62(s,2H),7.35-7.46(m,6H),7.68(dd,4H)。
步驟2:中間物5
根據上文流程,使用如實例226中所述之方案,將中間物1轉化為中間物5。
步驟6:中間物6
將中間物5(233mg,0.57mmol)、來自實例233之共用中間物2(200mg,0.57mmol)及DIPEA(125mg,1.00mmol)於NMP(6mL)中之混合物加熱至80℃持續1小時。使混合物冷卻至室溫且分配於EtOAc與水之間。分離有機相,用水、鹽水洗滌,經無水Na2SO4乾燥且經管柱層析法純化所得殘餘物獲得標題化合物(60.0mg,15%)。LCMS:818.7[M+1]+
步驟7:中間物7
向中間物6(500mg,0.69mmol)於20mL DCM中之溶液中添加(Boc)2O(304mg,1.38mmol)且在30℃下攪拌混合物2小時。用NaHSO4(10%)、飽和NaCl(飽和水溶液)及飽和NaHCO3(飽和水溶液)淬滅混合物,用DCM萃取,乾燥且濃縮獲得標題化合物(400mg,71%)。LCMS:818.6[M+H]+
步驟8:中間物8
向中間物7(300mg,0.37mmol)於8mL THF中之溶液中添加TBAF(311mg,0.73mmol)且在室溫下攪拌混合物2小時。用水淬滅混合物,用EtOAc萃取,乾燥且蒸發至乾燥獲得標題化合物。(160mg,74%)。LCMS:580.5[M+H]+
步驟9:中間物9
向中間物8(160mg,0.27mmol)於6mL DCM中之溶液中添加戴斯-馬汀高碘烷(Dess-Martin Periodinane)(234mg,0.54mmol)且在室溫下攪拌混合物2小時。用飽和NaHCO3(飽和水溶液)淬滅混合物,用 DCM萃取,乾燥且蒸發至乾燥。藉由管柱層析法(DCM:MeOH=20:1)純化所得殘餘物獲得標題化合物。(120mg,76%)。LCMS:578.5[M+H]+
步驟10:中間物10
向中間物9(50.0mg,0.087mmol)於DCM(2mL)中之溶液中添加TFA(2mL),且在室溫下攪拌混合物30分鐘。真空移除溶劑獲得呈TFA鹽形式之產物。
步驟11:I-286
根據上文流程且如先前所述進行中間物10之丙醯化獲得標題化合物。LCMS:532.5[M+H]+1H NMR(400MHz,CDCl3):δ2.47-2.61(m,2H),2.80(s,2H),3.63(d,3H),3.95(d,6H),4.81-4.99(m,2H),5.63(s,1H),6.09(dd,1H),6.28(dd,1H),6.63(s,1H),7.44(s,1H),8.48(s,1H)。
實例250:I-288
步驟1:中間物2
使來自實例249之中間物1(60.0mg,0.10mmol)於10mL DCM中之溶液冷卻至0℃且逐滴添加二乙基胺基三氟化硫(DAST)(8mL)。在0℃下攪拌混合物0.5小時。用飽和NaHCO3淬滅混合物,用DCM萃取,乾燥且濃縮。藉由管柱層析法(DCM:MeOH=30:1)純化所得殘餘物獲得標題化合物(40mg,67%)。LCMS:600.5[M+H]+
步驟2:I-288
如先前所述自中間物2製備I-288。LCMS:554.5(M+H)+1H NMR(400MHz,CDCl3):δ 2.28-2.41(m,2H),2.65-2.79(m,2H),3.68(s,3H),3.95(s,6H),4.74-4.90(m,2H),5.64(dd,1H),6.02(dd,2H),6.26(dd,1H),6.63(s,1H),7.43(s,1H),8.47(s,1H)。
實例251:I-290
步驟1:中間物1
在0℃下,向(9.0g,42mmol)於無水THF(50mL)中之溶液中分部分添加LiAlH4(3.2g,84mmol),隨後在室溫下攪拌混合物1小時。向混合物中添加Na2SO4-10H2O,隨後過濾。濃縮濾液獲得呈黃色固體狀之標題化合物(7.55g)。LCMS:172.3[M+1]+1H NMR(400MHz,CDCl3):δ1.38(dd,3H),2.52(s,3H),4.34(q,2H),5.62-5.49(m,1H),8.70(s,1H)。
步驟2:中間物2
在室溫下攪拌中間物1(7.5g,44mmol)及MnO2(55g,630mmol)於DCM(60mL)中之混合物隔夜。過濾混合物,且濃縮濾液。藉由管柱層析法(DCM:MeOH=20:1)純化所得殘餘物獲得呈淡黃色固體狀之標題化合物(3.85g,52%)。LCMS:170.2[M+1]+1HNMR (400MHz,CDCl3):δ 2.55(s,3H),8.42(s,1H),9.78(s,1H)。
步驟3:中間物3
將中間物2(500mg,3.0mmol)、2-(3,5-二甲氧基苯基)乙酸乙酯(1.0g,4.5mmol)及K2CO3(1.3g,9.4mmol)於DMF(20mL)中之混合物加熱至110℃隔夜。用水稀釋混合物且過濾所得懸浮液。用水洗滌沈澱物且乾燥獲得呈白色固體狀之標題化合物(830mg)。LCMS:330.3[M+1]+1H NMR(400MHz,DMSO-d 6):δ 2.59(s,3H),3.79(s,6H),6.55(t,1H),6.89(d,2H),8.14(s,1H),8.89(s,1H),12.55(s,1H)。
步驟4:中間物4
在-10℃下,向中間物3(500mg,1.5mmol)於NMP(10mL)中之溶液中逐滴添加SO2Cl2(620mg,4.6mmol),且攪拌所得混合物1小時。用水稀釋混合物,藉由過濾收集沈澱物,且乾燥獲得呈灰白色固體狀之標題化合物(770mg,100%)。LCMS:430.3[M+1]+1H NMR(400MHz,CDCl3):δ 3.45-3.35(m,3H),3.95(t,6H),6.68(s,1H),7.75(s,1H),9.04(s,1H),9.48(s,1H)。
步驟5:中間物5
將中間物4(200mg,0.47mmol)、DIPEA(91mg,0.71mmol)及來自實例226之(3R,4S)-4-胺基四氫呋喃-3-基胺基甲酸第三丁酯(110mg,0.55mmol)溶解於NMP(10mL)中且在85℃下,在N2氛圍下攪拌3小時。使混合物冷卻至室溫,用水稀釋且用乙酸乙酯萃取。用鹽水洗滌有機層,經無水Na2SO4乾燥且濃縮。藉由管柱層析法(5% MeOH/DCM)純化所得殘餘物獲得呈白色固體狀之標題化合物(214mg,85%)。LCMS:552.5[M+1]+
步驟6:中間物6
向中間物5(214mg)於DCM(8mL)中之溶液中添加TFA(4ml),且在室溫下攪拌混合物0.5小時。真空移除TFA,用DCM(20mL)稀釋殘餘物,用飽和碳酸氫鈉洗滌,乾燥且濃縮獲得呈淡黃色固體狀之標題化合物(170mg)。LCMS:452.4[M+1]+
步驟7:I-290
如先前所述進行中間物6之丙醯化獲得呈白色固體狀之標題化合物(50mg,55%)。LCMS:506.4[M+1]+1HNMR(400MHz,DMSO-d 6):δ3.72-3.92(m,2H),3.98(d,8H),4.83-4.96(m,2H),5.46-5.54(m,1H),5.71-5.81(m,1H),6.07-6.16(m,1H),6.65(s,1H),7.06-7.11(m,1H),7.60(s,1H),8.64(s,1H),8.85-8.77(m,1H)。
實例252:I-292、I-293
步驟1-10:中間物10
根據上文流程且如針對I-248所述製備中間物10。LCMS:585.2[M+1]+1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 ):δ 3.28-3.31(m,1H),3.39-3.43(m,1H),3.53-3.56(m,1H),3.59(s,3H),3.66-3.70(m,1H),3.96(s,6H),4.70-4.84(m,2H),5.49-5.59(m,2H),5.98-6.08(m,1H),6.18-6.25(m,1H),6.98(s,1H),7.44(s,1H),7.71(s,1H),7.85(d,1H),8.26(d,1H),8.65(s,1H),11.73(br,1H)。
步驟11:I-292、I-293
藉由製備型SFC層析法純化中間物10獲得>98% er標題化合物(ChiralCel OJ-H管柱,250×30mmI.D,移動相含60% CO2之MEOH,0.1% NH3‧H2O,流動速率=50ml/min,38℃)。基於酶促及細胞功效類似於I-94/I-95及I-240/I-241指派絕對構型。
實例253:I-294
步驟1:中間物1
在氮氣氛圍下,在250ml 3頸燒瓶中,將1-溴-3,5-二甲氧基苯(3.5g)溶解於DMF中且冷卻至-20℃。經加料漏斗逐滴添加POCl3(4.8g),同時保持反應溫度低於5℃。接著使反應混合物升溫至90℃且攪拌隔夜。將混合物倒入冰水中,用EtOAc萃取,用NaHCO3洗滌,經無水Na2SO4乾燥且真空濃縮。所得殘餘物(5.0g,0.02mol)直接用於下一步驟中。1H NMR(400MHz,CDCl3):δ 3.88(d,6H),6.44(d,1H),6.79(d,1H),10.32(s,1H)。
步驟2:中間物2
向中間物2(5.0g,0.021mol)於乙二醇(10mL)中之溶液中添加KOH(3.5g,6.3mmol)及N2H4.H2O(2.1g,42mmol)。在回流下加熱反應物3小時,接著冷卻至室溫,用水稀釋且用EtOAc萃取。用NaHCO3洗滌有機層,經無水Na2SO4乾燥且真空濃縮。所得殘餘物直接用於下一步驟中。1H NMR(400MHz,CDCl3):δ 2.22(s,3H),378(d,6H),6.38(d,1H),6.70(d,1H)。
步驟3:中間物3
用於合成中間物3之程序與中間物1相同。1H NMR(400MHz,CDCl3):δ 2.28(s,3H),3.92(d,6H),6.43(s,1H),10.38(s,1H)。
步驟4:中間物4
用於合成中間物4之程序與中間物2相同。1H NMR(400MHz,CDCl3):δ 2.27(s,6H),3.82(d,6H),6.43(s,1H)。
步驟5:中間物5
在-78℃下,向中間物4(1.0g,4.1mmol)於THF(5mL)中之溶液中逐滴添加正丁基鋰(2mL,己烷中2.5M,4.9mmol)於THF(10mL)中之溶液。30分鐘後,添加硼酸三甲酯(0.9g,8.2mol),且使混合物升溫至室溫隔夜。將混合物倒至10% HCl上,且用EtOAc萃取。用飽和鹽水洗滌有機層,乾燥(Na2SO4)且濃縮獲得呈褐色油狀之標題化合物。1HNMR(400MHz,CDCl3):δ 0.07(s,1H),2.27(s,6H),3.82(s,6H),6.43(s,1H)。
步驟6:中間物6
向((3R,4S)-4-((6-溴-8-甲基-7-側氧基-7,8-二氫吡啶并[2,3-d]嘧啶-2-基)胺基)四氫呋喃-3-基)胺基甲酸酯(150mg,0.34mmol)於甲苯/H2O(5mL/0.5mL)中之溶液中添加中間物5(200mg,0.68mmol)、Pd(PPh3)4(39mg,0.03mmol)及Na2CO3(73mg,0.7mmol)。在95℃下攪拌所得混合物隔夜。用EtOAc稀釋混合物,用水及鹽水洗滌,經無水Na2SO4乾燥且濃縮。經矽膠層析法(用含50% EtOAc之己烷溶離)純化所得殘餘物獲得標題化合物(80mg,45%)。LCMS:526.3[M+1]+
步驟7:I-294
向中間物6(80mg,0.15mmol)於DCM(5mL)中之溶液中添加TFA(5mL),且在室溫下攪拌混合物30分鐘。蒸發揮發物獲得呈TFA鹽形式之標題化合物,將其溶解於DCM(10mL)中。添加DIPEA直至pH>7,將混合物冷卻至0℃,且逐滴添加丙烯醯氯(14mg,0.15mmol)於DCM(1mL)中之溶液。攪拌反應混合物10分鐘,隨後將其分配於DCM與水之間,分離有機相,用鹽水洗滌,經Na2SO4乾燥且經矽膠管柱層析法純化所得殘餘物獲得標題化合物(24mg,34%)。LCMS:480.3[M+1]+1HNMR(400MHz,CDCl3):δ 1.90(d,6H),3.73(s,3H),3.87(d,7H),3.96(dd,1H),4.18-4.24(m,2H),4.92(s,1H),5.02(d,1H),5.66(d,1H),6.15(d,1H),6.26(d,1H),6.52(s,1H),6.79-6.81(dd,1H),7.27(s,1H),8.20(s,1H)。
實例254:I-296
步驟1:中間物1
在60℃下攪拌4-氯-2-(甲硫基)嘧啶-5-甲酸乙酯(5.0g,21mmol)及丙-2-胺(2.5g,43mmol)於NMP(15mL)中之混合物隔夜。用水稀釋混合物且過濾所得懸浮液,乾燥,濃縮且藉由管柱層析法(含12.5%乙酸乙酯之己烷)純化獲得呈灰白色固體狀之標題化合物(4.9g,98%)。LCMS:256.3[M+1]+
步驟2:中間物2
在0℃下,向中間物1(4.9g,19mmol)於無水THF(50mL)中之溶液中分部分添加LiAlH4(1.4g,39mmol)。在室溫下攪拌混合物1小 時,接著逐滴添加Na2SO4-10H2O。過濾反應混合物,且濃縮濾液獲得呈灰白色固體形式之標題化合物(4.23g,100%)。LCMS:214.3[M+1]+
步驟3:中間物3
在室溫下攪拌中間物2(4.2g,19mmol)及MnO2(18g,210mmol)於DCM(50mL)中之混合物隔夜。過濾混合物,且濃縮濾液且藉由矽膠層析法(DCM:MeOH=20:1)純化獲得呈褐色固體狀之標題化合物(3.0g,75%)。LCMS:212.2[M+1]+
步驟4:中間物4
在室溫下攪拌2-(3,5-二甲氧基苯基)乙酸乙酯(59mg,2.6mmol)、KF/Al2O3(1.7g,12mmol)及中間物3(500mg,2.4mmol)於NMP(20ml)中之混合物0.5小時。將混合物添加至鹽水中,用EtOAc萃取,經(Na2SO4)乾燥且真空濃縮獲得呈油狀之標題化合物。LCMS:312.4[M+1]+
步驟5:中間物5
在-10℃下,向中間物4(880mg,2.4mmol)於DCM(30mL)中之 溶液中逐滴添加SO2Cl2(640mg,4.7mmol)。攪拌所得混合物1小時,隨後用飽和NaHCO3淬滅且用DCM萃取。用飽和NaHCO3洗滌經合併之有機層,乾燥且真空濃縮獲得呈灰白色固體狀之標題化合物(860mg,79%)。LCMS:456.1[M+1]+
步驟6:中間物6
將中間物5(200mg,0.44mmol)、DIPEA(85mg,0.66mmol)及來自實例226之(3R,4S)-4-胺基四氫呋喃-3-基胺基甲酸第三丁酯(107mg,0.53mmol)在NMP(10mL)中合併且在85℃下,在N2氛圍下攪拌2小時。使混合物冷卻至室溫,用水稀釋,用乙酸乙酯萃取且用鹽水洗滌有機層,經無水Na2SO4乾燥且濃縮。藉由管柱層析法(1% MeOH/DCM)純化所得殘餘物獲得呈白色固體狀之標題化合物(190mg,73%)。LCMS:594.2[M+1]+.
步驟7:中間物7
如先前所述進行中間物6之脫除Boc保護基獲得標題化合物(170mg)。1HNMR(400MHz,CDCl3):δ 2.05(s,3H),3.62-3.66(m,1H),3.68-3.77(m,2H),3.94(s,6H),4.12(q,3H),4.23-4.31(m,1H),4.46-4.55(m,1H),5.80(s,1H),6.61(s,1H),7.37(s,1H),8.44(s,1H)。
步驟8:I-296
如先前所述進行中間物7之丙醯化獲得呈白色固體狀之標題化合物(40mg,46%)。LCMS:548.3[M+1]+1HNMR(400MHz,CDCl3):δ1.61(d,6H),3.86(s,3H),3.94(s,6H),4.23(dd,2H),4.78-4.93(m,2H),5.66(dd,1H),5.74(d,1H),6.12(d,1H),6.29(dd,2H),6.62(s,1H),7.37(s,1H),8.42(s,1H)。
實例255:I-307
步驟1:中間物2
將來自實例251之中間物1(654mg,1.99mmol)、(R)-3-(((甲基磺醯基)氧基)甲基)吡咯啶-1-甲酸第三丁酯(832mg,2.98mmol)及K2CO3(550mg,3.98mmol)於NMP(20mL)中之混合物加熱至80℃持續3小時。使混合物冷卻至室溫且分配於EtOAc與水之間。分離有機相,用水、鹽水洗滌,且經無水Na2SO4乾燥。經矽膠管柱層析法(DCM:MeOH=120:1)純化所得殘餘物獲得呈白色固體狀之標題產物(1.0g,99%)。LCMS:513.3[M+1]+
步驟2:中間物3
在室溫下,攪拌中間物2(1.00g,1.95mmol)及TFA(8mL)於DCM(16mL)中之混合物1小時。將溶液之pH值調整至9,用DCM稀釋,用水、鹽水洗滌,經無水Na2SO4乾燥且濃縮。經矽膠管柱層析法(DCM:MeOH:NH4OH=300:10:4)純化所得殘餘物獲得呈黃色固體狀之標題化合物(600mg,75%)。LCMS:413.3[M+1]+
步驟3:中間物4
在0℃下,將Ac2O(178mg,1.75mmol)逐滴添加至中間物3(600mg,1.46mmol)及Et3N(220mg,2.18mmol)於DCM(20mL)中之混合物中。攪拌混合物0.5小時,隨後用1N.HCl、NaHCO3水溶液及鹽水洗滌。經無水Na2SO4乾燥有機層且濃縮獲得呈黃色油狀之標題化合物 (600mg,91%)。LCMS:455.3[M+1]+
步驟4:中間物5
在0℃下,向中間物4(200mg,0.44mmol)於DCM(20mL)中之溶液中逐滴添加SO2Cl2(148mg,1.1mmol),接著在0℃下攪拌混合物30分鐘,用NaHCO3水溶液淬滅,用鹽水洗滌,經無水Na2SO4乾燥且濃縮獲得呈黃色油狀之標題產物(270mg),其直接用於下一步驟中。LCMS:677.3[M+1]+
步驟5:中間物6
將中間物5(270mg,0.48mmol)、((3R,4S)-4-胺基四氫呋喃-3-基)胺基甲酸第三丁酯(127mg,0.63mmol)、DIPEA(186mg,1.44mmol)於NMP(10mL)中之混合物加熱至80℃持續3小時。使混合物冷卻至室溫且分配於EtOAc與水之間。分離有機相,用水、鹽水洗滌,且經無水Na2SO4乾燥。經管柱層析法(DCM:MeOH=40:1)純化所得殘餘物獲得呈白色固體狀之標題產物(200mg,61%)。
步驟6:中間物7
在室溫下,攪拌中間物6(100mg,0.15mmol)及TFA(2mL)於DCM(4mL)中之混合物0.5小時。濃縮反應溶液且所得殘餘物直接用於下一步驟中(假定100%產率)。LCMS:577.2[M+1]+
步驟7:I-307
在冰-鹽水浴中,向中間物7及DIPEA(194mg,1.5mmol)於無水DCM(20mL)中之溶液中逐滴添加丙烯醯氯(13mg,0.15mmol)於無水DCM(2mL)中之溶液。攪拌反應混合物10分鐘,隨後將其分配於DCM與H2O之間。分離有機相,用鹽水洗滌,經Na2SO4乾燥且經製備型HPLC純化粗產物獲得呈白色固體狀之標題化合物(20mg)。LCMS[M+1]+:631.2。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ 1.86-2.06(m,5H),2.94-3.00(m,1H),3.32-3.33(m,2H),3.39-3.98(m,10H),4.13-4.24(m,2H),4.47-4.64(m,2H),4.80-4.85(m,1H),4.94-4.97(m,1H),5.54-5.60(m,1H),6.08-6.16(m,2H),6.90(s,1H),7.66(s,1H),8.63(s,1H)。
實例256:額外化合物
如先前實例中所述合成及表徵下表7及8中呈現之化合物。
實例257:蛋白質質量修正分析
將FGFR4完整蛋白質(來自SignalChem(表9中之方法)或Invitrogen(表9中之方法)與本發明化合物(化合物對於蛋白質10倍過量)培育60分鐘。培育後,在使用micro C4 ZipTip方案脫鹽之前用15μL 0.2% TFA稀釋5μL樣品等分試樣,將其直接添加至使用芥子酸作為解吸附基質的MALDI目標(0.1% TFA:乙腈50:50(體積比)中10mg/mL)。將對照樣品中FGFR4之質心質量與用本發明化合物培育之FGFR4的質心質量比較。經處理FGFR4之質心質量相較於未經處理FGFR4之移位除以本發明化合物之分子量。此計算提供培育1小時後的經修飾蛋白質百分比。此分析確認FGFR4目標是否共價結合於測試化合物(亦即蛋白質質量是否經修飾)。
舉例而言,為了評定FGFR4經I-1之質量修正,完整FGFR4(Invitrogen,目錄號:P3054)單獨培育及用I-1(I-1相對於蛋白質10倍過量)培育。60分鐘後,稀釋蛋白質樣品且蛋白質樣品如上文所述製備。蛋白質之質心質量(m/z:42761.7;顯示於圖1,畫面A中)與經處理蛋白質之質心質量(m/z:43350.2;顯示於圖1,畫面B中)比較。589Da(87%)之質心質量移位表明I-1完全修飾FGFR4。其他化合物亦使用此方式測試。此等實驗之結果描繪於表9中。
表9、表10及表11顯示所選本發明化合物在多種FGFR分析中之活性。表9、表10及表11中之化合物編號與上文化合物編號對應。
活性命名為「A」之化合物提供EC50/IC50/GI50 100nM;活性命名為「B」之化合物提供101-500nM之EC50/IC50/GI50;活性命名為「C」之化合物提供501-999nM之EC50/IC50/GI50;活性命名為「D」之化合物提供EC50/IC50/GI50 1000nM。
活性命名為「E」之化合物提供70%之質量修正;活性命名為「F」之化合物提供31-69%之質量修正;活性命名為「G」之化合物 提供30%之質量修正。
實例257:對FGFR 4酶之功效評定的咬封蓋分析方案
對應於表10中之方法a的FGFR4-WT之10倍儲備溶液(PR4380C或P3054)(來自Invitrogen,Carlsbad,CA)如下文所述製備。或者,對應於表10中之方法b的FGFR4-WT(F01-11G)之10倍儲備溶液(SignalChem,Richmond,BC)如下文所述製備。在由20mM Tris,pH 7.5、5mM MgCl2、1mM EGTA、5mM β-甘油磷酸酯、5%甘油(10×儲備液,KB002A)及0.2mM DTT(DS001A)組成之1×激酶反應緩衝液中製備1.4×ATP(AS001A)及5×Tyr-Sox結合肽受質(KNZ3101)之溶液。將5μL FGFR4吸入Corning(#3574)384孔白色未結合表面微量滴定盤(Corning,NY)中,該盤中含有0.5μL體積之100% DMSO。在Tecan EVO100上製備連續稀釋化合物。向各孔中添加第二次添加之10μl Tyr-Sox FGFR4受質,且藉由添加35μL 1.4×ATP開始激酶反應。在來自BioTek之Synergy板讀取器(Winooski,VT)中,在λex360/λem485下,每71秒監測反應,持續240分鐘。在各分析結束時,檢驗各孔之發展曲線的線性反應動力學及擬合統計學(R2、95%信賴區間、絕對平方和)。自相對螢光單元對於時間(秒)之曲線的斜率測定各反應之初始速度(0分鐘至約60分鐘),接著針對抑制劑濃度繪 製曲線以自log[抑制劑]對於反應(來自GraphPad Software之GraphPad Prism中的可變斜率模型(San Diego,CA))估算IC50
方法:a)[FGFR4-WT]=10nM,[ATP]=300μM,[Y10-Sox]=10μM(ATP KMapp~300μM),b)[FGFR4-WT]=2.5nM,[ATP]=250μM,[Y10-Sox]=10μM(ATP KMapp~250μM),tools.invitrogen.com/content/sfs/manuals/omnia_kinase_assay_man.pdf
此等實驗之結果(以IC50形式報導)顯示本發明化合物抑制FGFR酶活性之能力且描繪於表10中。
實例258:FGFR4信號傳導
細胞製備:使用MDA-MB-453(乳癌)及Huh7(肝細胞癌)細胞。在補充有10% FBS(Invitrogen)及1%青黴素(Penicillin)-鏈黴素(Streptomycin)(P/S,Lonza,Walkersville,MD)之DMEM(Invitrogen,Carlsbad,CA)中生長Huh7細胞。在補充有10% FBS及1% P/S之完全RPMI 1640(Invitrogen)中生長MDA-MB-453細胞。在37℃下,在5% CO2含濕氣培育箱中,所有細胞均以單層培養物形式維持及增殖。
對於MSD及ELISA分析,全體FGFR4抗體獲自R&D Systems(Minneapolis,MN)且在1:500下使用。對於免疫墨點(西方墨點)分析,全體FGFR4抗體獲自Santa Cruz(Santa Cruz,CA)且在1:1000下使用。磷酸基-FGFR抗體獲自Cell Signaling(Danvers,MA)或R&D Systems且在1:1000下使用。來自Cell Signaling之磷酸基-FGFR抗體用於免疫墨點,而來自R&D之磷酸基-FGFR抗體用於MSD及ELISA分析。二級抗體在1:10,000下使用。山羊抗小鼠IgG IRDye 800CW抗體獲自LiCor Biosciences(Lincoln,NE)且山羊抗家兔IgG Alexa Fluor 680獲自Invitrogen。抗家兔Sulfo標籤及抗-抗生蛋白鏈菌素Sulfo標籤抗體獲自Meso Scale Discovery(Gaithersburg,MD),且分別在1:1000及1:5000下使用。
免疫墨點(西方墨點,WB)-方法A(僅針對MDA-MB-453)
對於MDA-MB-453細胞信號傳導,細胞在96孔聚D-離胺酸板(BD Bioscience,San Jose,CA)中生長至90%匯合,接著在低血清(0.1% FBS)介質中培育16-18小時。接著在低血清(0.1% FBS)培養基中用5、1.25、0.31、0.078、0.020或0.005μM測試化合物處理細胞1小時。處理後,細胞用冷PBS(Invitrogen)洗滌且藉由在32μL冷細胞提取緩衝液(Invitrogen)中冷凍/熔融3次立即溶解,該緩衝液中補充有完全蛋白酶抑制劑(Roche,Indianapolis,IN)及PhosphoSTOP(Roche)磷酸酶抑制劑。
藉由BCA分析(Pierce,Rockford,IL)測定MDA-MB-453蛋白質濃度。50-100μg各溶解產物樣品藉由4-12%梯度(SDS-PAGE(Invitrogen))分離,轉移至硝基纖維素膜(Biorad,Hercules,CA)且用特異性抗體探測。使用Odyssey紅外成像(Li-Cor Biosciences)定量磷酸基-蛋白質信號。
為了評定磷酸基-FGFR信號傳導,用抗磷酸基-FGFR (Y653/Y654)及全體抗FGFR抗體探測墨點。磷酸基FGFR信號根據各樣品之全體FGFR表現標準化。結果根據DMSO對照%表示。使用S形曲線分析程式(Graph Pad Prism第5版)擬合標準化資料與可變希爾斜率(Hill slope),以測定EC50值。結果提供於表11中的題為「信號傳導EC50(nM)」欄中。
Meso Scale分析(MSD)-方法B(用於MDA-MB-453及Huh7)
MDA-MB-453及Huh7細胞在96孔聚-D-離胺酸板(BD Bioscience,San Jose,CA)中生長至90%匯合。接著在低血清(0.1% FBS)培養基中培育細胞16-18小時,接著在低血清(0.1% FBS)培養基中用5、1.67、0.56、0.185、0.068、0.021或0.007μM測試化合物處理1小時。處理後,細胞用冷PBS(Invitrogen)洗滌且藉由在32μL冷細胞提取緩衝液(Invitrogen)中冷凍/熔融3次立即溶解,該緩衝液中補充有完全蛋白酶抑制劑(Roche)及PhosphoSTOP(Roche)磷酸酶抑制劑。
在4℃下,用全體FGFR-4抗體塗覆MSD板(Meso Scale Discovery)隔夜。在4℃下,將溶解產物(25μL)添加至MSD板隔夜。藉由在室溫下用磷酸基-FGFR抗體(R&D Systems)及抗家兔磺基標籤抗體(Meso Scale)培育2小時獲得MSD信號。結果根據DMSO對照%表示。使用S形曲線分析程式(Graph Pad Prism第5版)擬合資料與可變希爾斜率(Hill slope),以測定EC50值。結果提供於表11中的題為「信號傳導EC50(nM)」欄中。
ELISA-方法C(僅用於MDA-MB-453)
MDA-MB-453細胞在96孔聚-D-離胺酸板(BD Bioscience,San Jose,CA)中生長至90%匯合。接著在低血清(0.1% FBS)培養基中培育細胞16-18小時。接著在低血清(0.1% FBS)培養基中用5、1.67、0.56、0.185、0.068、0.021或0.007μM測試化合物處理MDA-MB-453細胞1小時。處理後,MDA-MB-453細胞用冷PBS(Invitrogen)洗滌且 藉由在32μL冷細胞提取緩衝液(Invitrogen)中冷凍/熔融3次立即溶解,該緩衝液中補充有完全蛋白酶抑制劑(Roche)及PhosphoSTOP(Roche)磷酸酶抑制劑。
在4℃下,用全體FGFR-4抗體塗覆Nunc免疫板(96孔;Sigma,St.Louis,MO)隔夜。在室溫下,向板中添加溶解產物(25μL)持續2小時。在室溫下,每孔添加磷酸基-FGFR偵測抗體(100μL)持續2小時,隨後添加山羊抗家兔HRP抗體(100μL)持續45分鐘。結果根據DMSO對照%表示。使用S形曲線分析程式(Graph Pad Prism第5版)擬合資料與可變希爾斜率(Hill slope),以測定EC50值。
此等實驗之結果顯示本發明化合物抑制細胞中FGFR4之磷光體信號傳導的能力。結果描繪於表11中的題為「信號傳導EC50(nM)」欄中。MDA-MB-453細胞結果歸入標題「pFGFR4(MDA)」且Huh7結果歸入標題「pFGFR4(Huh)」
實例259:細胞增殖
MDA-MB-453及Huh7細胞接種於96孔組織培養板(Corning)中補充有5% FBS及1% P/S之適當生長培養基中,如表11中所指示。對於MDA-MB-453及Huh7細胞兩者,起始密度為每孔5000個細胞。使細胞沈降4小時,接著用5、1.25、0.31、0.078、0.020或0.005μM測試化合物處理:MDA-MB-453處理96小時且Huh7細胞處理120小時。藉由CellTiter Glo(Promega,Madison,WI)測定細胞活力且使用標準曲線將結果轉化為細胞編號。藉由Graph Pad Prism測定生長抑制(GI50)值
此等實驗之結果顯示化合物抑制FGFR依賴細胞株中細胞生長之能力且描繪於表11中題為「細胞增殖GI50(nM)」欄中。MDA-MB-453細胞結果歸入標題「MDA」且Huh7細胞結果歸入標題「Huh」。
實例260:目標佔有率分析
利用生物素標記共價探針評定游離FGFR4蛋白質。如實例235, 方法B中所述,用測試化合物處理MDA-MB-453細胞,洗滌及溶解。各溶解產物(25μL)添加至96孔板中且添加2μM生物素標記共價探針(I-127)。在室溫下培育反應物2小時。在室溫下,將樣品及探針混合物轉移至FGFR4塗覆之MSD板中持續2小時。在室溫下,用抗-抗生蛋白鏈菌素Sulfo標籤(Meso Scale)抗體獲得MSD信號持續1小時。結果根據DMSO對照%表示。使用S形曲線分析程式(Graph Pad Prism第5版)擬合資料與可變希爾斜率(Hill slope),以測定EC50值。
此等實驗之結果藉由評定游離FGFR4蛋白質之量顯示本發明化合物共價修飾MDA-MB-453細胞中之FGFR4的能力。若化合物完全(100%)共價修飾FGFR4,則無游離FGFR4可用於供生物素標記探針共價修飾及隨後結合於抗生蛋白鏈菌素及偵測。結果描繪於表11中的題為「FGFR4佔有率EC50(nM)」欄中。
實例261:洗脫實驗
將MDA-MB-453細胞接種於12孔或96孔組織培養板中之補充有10% FBS及1% P/S之適當生長培養基中直至90%匯合。使細胞沈降4小時,接著保持於低血清(0.1% FBS)培養基中隔夜。
第二天早晨,移除培養基且在低血清培養基中用1000-2000nM測試化合物處理1小時。用PBS(Invitrogen)洗滌細胞,使其不含測試化合物(3×)。一組細胞如上文所述立即溶解(0小時時間點)。用適當完全生長培養基(10-20% FBS)培育剩餘細胞持續1、2、4、8、16(在某些情形中)及24小時。在所有時間點收集DMSO(0.5%)對照。
代表性資料顯示於圖2及圖3中。藉由細胞洗滌後磷酸化FGFR4(pFGFR4)之偵測評定,圖2中之資料顯示代表性化合物I-69對FGFR4自體磷酸化提供長期抑制。圖2中之圖形顯示pFGFR4之抑制與所檢驗細胞中FGFR4之再合成速率(T1/2~4-8h)一致。圖3中之資料比較共價改質(不可逆)化合物I-1及其相應非共價改質(可逆)類似物I-234之作用持續時間。共價修飾FGFR4之I-1具有長期作用持續時間,此與細胞中FGFR4之再合成速率一致,而I-234在洗脫後不顯示長期作用持續時間。
儘管本文描述本發明之大量實施例,但顯而易知可對基本實例作出改變,以提供其他利用本發明化合物及方法之實施例。因此,應瞭解,本發明之範疇由隨附申請專利範圍而非以實例方式提出之特定實施例界定。

Claims (75)

  1. 一種式I化合物,
    Figure TWI647220B_C0001
    或其醫藥學上可接受之鹽,其中:X1為-NR4、N、-CR4R4'或-CR4;X2為-NR5、N、-CR5R5'或-CR5;X3為N或CR6;X4為N或CR7;X5為N、C或CH;其中X1、X2、X3、X4或X5中至少一者為N;G為H、O、OR或N(R)(R);環A為視情況經取代之選自以下之基團:3至8員飽和或部分不飽和碳環、具有1至4個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的5至6員單環雜芳基環、具有1至4個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的4至7員飽和或部分不飽和雜環,或7至10員雙環飽和、部分不飽和或芳基環;各R獨立地為氫或視情況經取代之選自以下之基團:C1-6脂族基、苯基、3至8員飽和或部分不飽和碳環、具有1至4個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的4至7員雜環,或具有1至4個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的5至6員單環雜芳基環;或同一氮原子上之兩個R基團與其所連接之該氮原子一起形成具有0至2個獨立地選自氮、氧或硫之額外雜原子的4至7員雜環,或具有0至4個獨立地選自氮、氧或硫之額外雜原子的4至7員雜芳基環;R1為彈頭基團-L-Y;其中R1連接於與T連接之原子相鄰的原子,其中:R1係選自
    Figure TWI647220B_C0002
    Figure TWI647220B_C0003
    Figure TWI647220B_C0004
    Figure TWI647220B_C0005
    Figure TWI647220B_C0006
    Figure TWI647220B_C0007
    Figure TWI647220B_C0008
    Figure TWI647220B_C0009
    ;或L為二價C2-8直鏈或分支烴鏈,其中L具有至少一個雙鍵且L之一或兩個亞甲基單元視情況且獨立地置換為-NRC(O)-、-C(O)NR-、-N(R)SO2-、-SO2N(R)-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-OC(O)-、-C(O)O-、伸環丙基、-O-、-N(R)-或-C(O)-;或L為二價C2-8直鏈或分支烴鏈,其中L具有至少一個亞烷基雙鍵且L之至少一個亞甲基單元置換為-C(O)-、-NRC(O)-、-C(O)NR-、-N(R)SO2-、-SO2N(R)-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-OC(O)-或-C(O)O-,且L之一個額外亞甲基單元視情況置換為伸環丙基、-O-、-N(R)-或-C(O)-;或L為二價C2-8直鏈或分支烴鏈,其中L之一個亞甲基單元置換為伸環丙基且L之一個額外亞甲基單元置換為-C(O)-、-NRC(O)-、-C(O)NR-、-N(R)SO2-、-SO2N(R)-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-OC(O)-或-C(O)O-;或L為二價C2-8直鏈或分支烴鏈,其中L具有至少一個參鍵且L之一或兩個亞甲基單元視情況且獨立地置換為-C(O)-、-NRC(O)-、-C(O)NR-、-N(R)SO2-、-SO2N(R)-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-OC(O)-或-C(O)O-,且R1之該Y基團為氫、視情況經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C1-6脂族基,或具有0至3個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的3至10員單環或雙環(飽和、部分不飽和)或芳基環,且其中該環經1至4個Re基團取代;或L為共價鍵、-CH2-、-NH-、-C(O)-、-CH2NH-、-NHCH2-、-NHC(O)-、-NHC(O)CH2OC(O)-、-CH2NHC(O)-、-NHSO2-、-NHSO2CH2-或-SO2NH-,且R1之該Y基團係選自:(i)經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C1-6烷基;或(ii)經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C2-6烯基;或(iii)視情況經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C2-6炔基;或(iv)具有1個選自氧或氮之雜原子的飽和3至4員雜環,其中該環經1至2個Re基團取代;或(v)具有1至2個選自氧或氮之雜原子的飽和5至6員雜環,其中該環經1至4個Re基團取代;或(vi)
    Figure TWI647220B_C0010
    Figure TWI647220B_C0011
    Figure TWI647220B_C0012
    ;或(vii)飽和3至6員碳環,其中該環經1至4個Re基團取代;或(viii)具有0至3個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的部分不飽和3至6員單環,其中該環經1至4個Re基團取代;或(ix)部分不飽和3至6員碳環,其中該環經1至4個Re基團取代;或(x)
    Figure TWI647220B_C0013
    ;或(xi)具有1至2個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的部分不飽和4至6員雜環,其中該環經1至4個Re基團取代;或(xii)
    Figure TWI647220B_C0014
    Figure TWI647220B_C0015
    ;或(xiii)具有0至2個氮之6員芳族環,其中該環經1至4個Re基團取代;或(xiv)
    Figure TWI647220B_C0016
    Figure TWI647220B_C0017
    ;或(xv)具有1至3個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的5員雜芳基環,其中該環經1至3個Re基團取代;或(xvi)
    Figure TWI647220B_C0018
    Figure TWI647220B_C0019
    Figure TWI647220B_C0020
    Figure TWI647220B_C0021
    ;或(xvii)具有0至3個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的8至10員雙環(飽和、部分不飽和)或芳基環,其中該環經1至4個Re基團取代;或L為共價鍵、-C(O)-、-N(R)C(O)-或二價C1-8飽和或不飽和直鏈或分支烴鏈;且R1之該Y基團係選自:(i)經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C1-6烷基;或(ii)視情況經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C2-6烯基;或(iii)視情況經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C2-6炔基;或(iv)具有1個選自氧或氮之雜原子的飽和3至4員雜環,其中該環經1至2個Re基團取代;或(v)具有1至2個選自氧或氮之雜原子的飽和5至6員雜環,其中該環經1至4個Re基團取代;或(vi)
    Figure TWI647220B_C0022
    Figure TWI647220B_C0023
    Figure TWI647220B_C0024
    ;或(vii)飽和3至6員碳環,其中該環經1至4個Re基團取代;或(viii)具有0至3個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的部分不飽和3至6員單環,其中該環經1至4個Re基團取代;或(ix)部分不飽和3至6員碳環,其中該環經1至4個Re基團取代;或(x)
    Figure TWI647220B_C0025
    ;或(xi)具有1至2個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的部分不飽和4至6員雜環,其中該環經1至4個Re基團取代;或(xii)
    Figure TWI647220B_C0026
    Figure TWI647220B_C0027
    ;或(xiii)具有0至2個氮之6員芳族環,其中該環經1至4個Re基團取代;或(xiv)
    Figure TWI647220B_C0028
    Figure TWI647220B_C0029
    ;或(xv)具有1至3個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的5員雜芳基環,其中該環經1至3個Re基團取代;或(xvi)
    Figure TWI647220B_C0030
    Figure TWI647220B_C0031
    (xvii)具有0至3個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的8至10員雙環(飽和、部分不飽和)或芳基環,其中該環經1至4個Re基團取代;各Re係獨立地選自-Q-Z、側氧基、NO2、鹵素、CN、視情況經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C1-6脂族基、或選自以下之適合的離去基:烷氧基、磺醯氧基、視情況經取代之烷基磺醯氧基、視情況經取代之烯基磺醯氧基、視情況經取代之芳基磺醯氧基、醯基或重氮鹽,其中:Q為二價C1-6飽和或不飽和直鏈或分支烴鏈,其中Q之一個或兩個亞甲基單元視情況且獨立地由以下置換:-N(R)-、-S-、-O-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-SO-或-SO2-、-N(R)C(O)-、-C(O)N(R)-、-N(R)SO2-或-SO2N(R)-;且各Z獨立地為氫或經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C1-6脂族基;各R2獨立地為-R、鹵素、-鹵烷基、-OR、-SR、-CN、-NO2、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R、-C(O)N(R)2、-NRC(O)R、-NRC(O)N(R)2、-NRSO2R或-N(R)2;R3為氫、C2-6烯基、-W-Cy或C1-6烷基,其中該C1-6烷基視情況經1至3個獨立地選自以下之基團取代:鹵素、-CN、側氧基(oxo)、-OR'或-C(O)O(C1-6烷基);W不存在或為視情況經一或多個R"取代的二價C1-3伸烷基鏈且其中W之一個亞甲基單元視情況置換為-O-、-S-或-NR'-;各R'獨立地為氫或C1-6烷基;各R"獨立地為鹵素或C1-6烷基,其中該C1-6烷基視情況經1至3個獨立地選自以下之基團取代:鹵素、-CN、側氧基或-OR';Cy為苯基、C3-7環烷基或具有1至3個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的3至7員單環或5至10員雙環飽和、部分不飽和或雜芳基環,其中Cy視情況經1至3個Rx取代;各Rx獨立地為H、-CN、側氧基、-NH2、C1-6烷基、鹵素、-OR'、-N(R')2、-NHC(O)(C1-6烷基)、-C(O)N(R')2、-C(O)O(C1-6烷基)、-NHSO2(C1-6烷基)或-SO2N(R')2;或若化合價不允許,則R3不存在;R4及R4'中之每一者獨立地為氫或視情況經取代的選自以下之基團:C1-6脂族基、苯基、視情況橋接之3至8員飽和或部分不飽和碳環、具有1至4個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的4至7員雜環、具有1至4個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的5至6員單環雜芳基環,或視情況橋接之7至10員雙環飽和、部分不飽和或芳基環;R5及R5'中之每一者獨立地為-R、鹵素、-OR、-SR、-CN、-NO2、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R、-C(O)N(R)2、-NRC(O)R、-NRC(O)N(R)2、-NRSO2R或-N(R)2;Y為O或NRa;Ra為氫或視情況經取代之C1-6脂族基團;T為共價鍵或二價直鏈或分支、飽和或不飽和C1-6烴鏈,其中一或多個亞甲基單元視情況經以下置換:-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-S(O)-、-SO2-、-SO2N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-;q為0-6;且R6及R7中之每一者獨立地為-R、鹵素、-OR、-SR、-CN、-NO2、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R、-C(O)N(R)2、-NRC(O)R、-NRC(O)N(R)2、-NRSO2R或-N(R)2
  2. 如請求項1之化合物,其中環A為環己基、環己烯基、環戊基、環丁基、環丙基、吡啶、嘧啶、吡嗪、噠嗪、吡咯、吡唑、哌啶、哌啶酮、吡咯啶、四氫哌喃、四氫呋喃、四氫噻吩二氧化物或環丁烯二酮。
  3. 如請求項1之化合物,其中環A為
    Figure TWI647220B_C0032
  4. 如請求項3之化合物,其中各R2獨立地為鹵素、-鹵烷基、-OR、-SR、-CN、-NO2、-SO2R、-SOR、-C(O)R、-CO2R、-C(O)N(R)2、-NRC(O)R、-NRC(O)N(R)2、-NRSO2R或-N(R)2
  5. 如請求項3之化合物,其中各R2獨立地為-CH3、-Cl、-F、-CF3或-OMe;或係選自
    Figure TWI647220B_C0033
  6. 如請求項1之化合物,其中環A係選自:
    Figure TWI647220B_C0034
  7. 如請求項1之化合物,其中R3
    Figure TWI647220B_C0035
    Figure TWI647220B_C0036
  8. 如請求項1之化合物,其中R4為視情況經取代之苯基。
  9. 如請求項1之化合物,其中R4為視情況經取代之C1-6脂族基,或視情況經取代之選自以下之環:3至8員飽和或部分不飽和碳環、具有1至2個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的4至7員雜環或具有1至4個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的5至6員單環雜芳基環。
  10. 如請求項1之化合物,其中R4為乙基、苯基、環己基、
    Figure TWI647220B_C0037
    Figure TWI647220B_C0038
  11. 如請求項1之化合物,其中R5及R5'中之每一者獨立地為H或-Me。
  12. 如請求項1之化合物,其中T為共價鍵。
  13. 如請求項1之化合物,其中T為二價直鏈或分支、飽和或不飽和C1-6烴鏈,其中一或多個亞甲基單元視情況置換為-O-、-S-、-N(R)-、-C(O)-、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)N(R)-、-N(R)C(O)-、-N(R)C(O)N(R)-、-N(R)SO2-或-N(R)SO2N(R)-。
  14. 如請求項1之化合物,其中該化合物具有選自以下任一者之化學式:
    Figure TWI647220B_C0039
    Figure TWI647220B_C0040
    或其醫藥學上可接受之鹽。
  15. 如請求項1之化合物,其中該化合物為式I-h化合物:
    Figure TWI647220B_C0041
    或其醫藥學上可接受之鹽。
  16. 如請求項1之化合物,其係選
    Figure TWI647220B_C0042
    Figure TWI647220B_C0043
    Figure TWI647220B_C0044
    Figure TWI647220B_C0045
    Figure TWI647220B_C0046
    Figure TWI647220B_C0047
    Figure TWI647220B_C0048
    Figure TWI647220B_C0049
    Figure TWI647220B_C0050
    Figure TWI647220B_C0051
    Figure TWI647220B_C0052
    Figure TWI647220B_C0053
    Figure TWI647220B_C0054
    Figure TWI647220B_C0055
    Figure TWI647220B_C0056
    Figure TWI647220B_C0057
    選自:
    Figure TWI647220B_C0058
    Figure TWI647220B_C0060
    Figure TWI647220B_C0061
    Figure TWI647220B_C0062
    Figure TWI647220B_C0063
    或其醫藥學上可接受之鹽。
  17. 如請求項1之化合物,其係選自
    Figure TWI647220B_C0064
    Figure TWI647220B_C0065
    或其醫藥學上可接受之鹽。
  18. 如請求項1之化合物,其中:L為二價C2-8直鏈或分支烴鏈,其中L具有至少一個雙鍵且L之一個或兩個亞甲基單元視情況且獨立地由以下置換:-NRC(O)-、-C(O)NR-、-N(R)SO2-、-SO2N(R)-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-OC(O)-、-C(O)O-、伸環丙基、-O-、-N(R)-或-C(O)-。
  19. 如請求項18之化合物,其中:L為二價C2-8直鏈或分支烴鏈,其中L具有至少一個雙鍵且L之至少一個亞甲基單元置換為-C(O)-、-NRC(O)-、-C(O)NR-、-N(R)SO2-、-SO2N(R)-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-OC(O)-或-C(O)O-,且L之一個額外亞甲基單元視情況置換為伸環丙基、-O-、-N(R)-或-C(O)-;且R1之該Y基團為氫或視情況經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C1-6脂族基。
  20. 如請求項19之化合物,其中L為二價C2-8直鏈或分支烴鏈,其中L具有至少一個雙鍵且L之至少一個亞甲基單元置換為-C(O)-,且L之一個額外亞甲基單元視情況置換為伸環丙基、-O-、-N(R)-或-C(O)-。
  21. 如請求項19之化合物,其中L為二價C2-8直鏈或分支烴鏈,其中L具有至少一個雙鍵且L之至少一個亞甲基單元置換為-OC(O)-。
  22. 如請求項19之化合物,其中L為-NRC(O)CH=CH-、-NRC(O)CH=CHCH2N(CH3)-、-NRC(O)CH=CHCH2O-、-CH2NRC(O)CH=CH-、-NRSO2CH=CH-、-NRSO2CH=CHCH2-或-NRC(O)C(=CH2)CH2-;其中L之該R基團為H或視情況經取代之C1-6脂族基;且R1之該Y基團為氫或視情況經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C1-6脂族基。
  23. 如請求項22之化合物,其中L為-NHC(O)CH=CH-、-NHC(O)CH=CHCH2N(CH3)-、-NHC(O)CH=CHCH2O-、-CH2NHC(O)CH=CH-、-NHSO2CH=CH-、-NHSO2CH=CHCH2-或-NHC(O)C(=CH2)CH2-。
  24. 如請求項1之化合物,其中L為二價C2-8直鏈或分支烴鏈,其中L具有至少一個亞烷基雙鍵且L之至少一個亞甲基單元置換為-C(O)-、-NRC(O)-、-C(O)NR-、-N(R)SO2-、-SO2N(R)-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-OC(O)-或-C(O)O-,且L之一個額外亞甲基單元視情況置換為伸環丙基、-O-、-N(R)-或-C(O)-。
  25. 如請求項1之化合物,其中:L為二價C2-8直鏈或分支烴鏈,其中L具有至少一個參鍵且L之一個或兩個亞甲基單元視情況且獨立地置換為-C(O)-、-NRC(O)-、-C(O)NR-、-N(R)SO2-、-SO2N(R)-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-OC(O)-或-C(O)O-。
  26. 如請求項25之化合物,其中R1之該Y基團為氫或視情況經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C1-6脂族基。
  27. 如請求項26之化合物,其中L為-C≡C-、-NHC(O)C≡CCH2CH2-、-CH2-C≡C-CH2-、或-CH2OC(=O)C≡C-。
  28. 如請求項1之化合物,其中:L為二價C2-8直鏈或分支烴鏈,其中L之一個亞甲基單元置換為伸環丙基且L之一個額外亞甲基單元置換為-C(O)-、-NRC(O)-、-C(O)NR-、-N(R)SO2-、-SO2N(R)-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-OC(O)-或-C(O)O-。
  29. 如請求項1之化合物,其中:L為共價鍵、-C(O)-、-N(R)C(O)-或二價C1-8飽和或不飽和直鏈或分支烴鏈。
  30. 如請求項1之化合物,其中L為共價鍵、-CH2-、-NH-、-C(O)-、-CH2NH-、-NHCH2-、-NHC(O)-、-NHC(O)CH2OC(O)-、-CH2NHC(O)-、-NHSO2-、-NHSO2CH2-或-SO2NH-。
  31. 如請求項30之化合物,其中L為共價鍵。
  32. 如請求項1之化合物,其中R1之該Y基團係選自:
    Figure TWI647220B_C0066
    Figure TWI647220B_C0067
    Figure TWI647220B_C0068
    其中各Re係獨立地選自鹵素。
  33. 如請求項1之化合物,其中R1係選自:
    Figure TWI647220B_C0069
    Figure TWI647220B_C0070
    Figure TWI647220B_C0071
    Figure TWI647220B_C0072
    Figure TWI647220B_C0073
    其中各Re獨立地為適合離去基、NO2、CN或側氧基。
  34. 如請求項1之化合物,其中R1係選自:
    Figure TWI647220B_C0074
  35. 一種組合物,其包含如請求項1之化合物及醫藥學上可接受之佐劑、載劑或媒劑。
  36. 一種如請求項1之化合物之用途,其用於製備抑制FGFR4或其突變體在患者或生物樣品中之活性之藥劑。
  37. 如請求項36之用途,其中該FGFR4或其突變體之活性被不可逆地抑制。
  38. 如請求項37之用途,其中該FGFR4或其突變體之活性係藉由共價修飾FGFR4之Cys 552不可逆地抑制。
  39. 一種如請求項1之化合物之用途,其用於製備治療FGFR4介導之病症之藥劑。
  40. 如請求項15之化合物,其中環A為視情況經取代之選自3至8員飽和或部分不飽和碳環或具有1至4個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的4至7員飽和或部分不飽和雜環;R1為彈頭基團-L-Y;其中R1連接於與T連接之原子相鄰的原子,其中:L為二價C2-8直鏈或分支烴鏈,其中L具有至少一個雙鍵且L之一或兩個亞甲基單元視情況且獨立地置換為-NRC(O)-、-C(O)NR-、-N(R)SO2-、-SO2N(R)-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-OC(O)-、-C(O)O-、伸環丙基、-O-、-N(R)-或-C(O)-;且R1之該Y基團為氫、視情況經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C1-6脂族基,或具有0至3個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的3至10員單環或雙環飽和、部分不飽和或芳基環,且其中該環經1至4個Re基團取代;R3為C1-6烷基;R4為視情況經取代的苯基;且Ra為氫。
  41. 如請求項15之化合物,其中
    Figure TWI647220B_C0075
    係選自
    Figure TWI647220B_C0076
    R1為彈頭基團-L-Y;其中:L為二價C2-8直鏈或分支烴鏈,其中L具有至少一個雙鍵且L之一或兩個亞甲基單元視情況且獨立地置換為-NRC(O)-、-C(O)NR-、-N(R)SO2-、-SO2N(R)-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-OC(O)-、-C(O)O-、伸環丙基、-O-、-N(R)-或-C(O)-;且R1之該Y基團為氫、視情況經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C1-6脂族基,或具有0至3個獨立地選自氮、氧或硫之雜原子的3至10員單環或雙環飽和、部分不飽和或芳基環,且其中該環經1至4個Re基團取代;R3為C1-6烷基;R4為視情況經取代的苯基;且Ra為氫。
  42. 如請求項40之化合物,其中L為-NRC(O)CH=CH-、-NRC(O)CH=CHCH2N(CH3)-、-NRC(O)CH=CHCH2O-、-CH2NRC(O)CH=CH-、-NRSO2CH=CH-、-NRSO2CH=CHCH2-或-NRC(O)C(=CH2)CH2-;其中L之該R基團為H或視情況經取代之C1-6脂族基;且R1之該Y基團為氫或視情況經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C1-6脂族基。
  43. 如請求項40之化合物,其中R1
    Figure TWI647220B_C0077
  44. 如請求項43之化合物,其中R4選自
    Figure TWI647220B_C0078
    Figure TWI647220B_C0079
  45. 如請求項1之化合物,其係選自
    Figure TWI647220B_C0080
    或其醫藥學上可接受之鹽。
  46. 如請求項1之化合物,其中該化合物係
    Figure TWI647220B_C0081
    或其醫藥學上可接受之鹽。
  47. 如請求項1之化合物,其中該化合物係
    Figure TWI647220B_C0082
    或其醫藥學上可接受之鹽。
  48. 如請求項1之化合物,其中該化合物係
    Figure TWI647220B_C0083
    或其醫藥學上可接受之鹽。
  49. 如請求項1之化合物,其中該化合物係
    Figure TWI647220B_C0084
    或其醫藥學上可接受之鹽。
  50. 一種組合物,其包含如請求項40之化合物及醫藥學上可接受之佐劑、載劑或媒劑。
  51. 一種組合物,其包含如請求項46之化合物或其醫藥學上可接受之鹽及醫藥學上可接受之佐劑、載劑或媒劑。
  52. 一種組合物,其包含如請求項47之化合物或其醫藥學上可接受之鹽及醫藥學上可接受之佐劑、載劑或媒劑。
  53. 一種組合物,其包含如請求項48之化合物或其醫藥學上可接受之鹽及醫藥學上可接受之佐劑、載劑或媒劑。
  54. 一種組合物,其包含如請求項49之化合物或其醫藥學上可接受之鹽及醫藥學上可接受之佐劑、載劑或媒劑。
  55. 如請求項39之用途,其中該FGFR4介導之病症為肝細胞癌、橫紋肌肉瘤、食道癌、乳癌或頭或頸癌。
  56. 如請求項55之用途,其中該FGFR4介導之病症為肝細胞癌。
  57. 如請求項55之用途,其中該FGFR4介導之病症為橫紋肌肉瘤。
  58. 一種如請求項40之化合物之用途,其用於製備抑制FGFR4或其突變體在患者或生物樣品中之活性之藥劑。
  59. 一種如請求項40之化合物之用途,其用於製備治療FGFR4介導之病症之藥劑。
  60. 如請求項59之用途,其中該FGFR4介導之病症為肝細胞癌或橫紋肌肉瘤。
  61. 如請求項60之用途,其中L為-NRC(O)CH=CH-、-NRC(O)CH=CHCH2N(CH3)-、-NRC(O)CH=CHCH2O-、-CH2NRC(O)CH=CH-、-NRSO2CH=CH-、-NRSO2CH=CHCH2-或-NRC(O)C(=CH2)CH2-;其中L之該R基團為H或視情況經取代之C1-6脂族基;且R1之該Y基團為氫或視情況經側氧基、鹵素、NO2或CN取代之C1-6脂族基。
  62. 如請求項61之用途,其中R1
    Figure TWI647220B_C0085
  63. 如請求項62之化合物,其中R4選自:
    Figure TWI647220B_C0086
  64. 一種如請求項46之化合物或其醫藥學上可接受之鹽之用途,其用於製備治療FGFR4介導之病症之藥劑。
  65. 如請求項64之用途,其中該FGFR4介導之病症為肝細胞癌。
  66. 如請求項64之用途,其中該FGFR4介導之病症為橫紋肌肉瘤。
  67. 一種如請求項47之化合物或其醫藥學上可接受之鹽之用途,其用於製備治療FGFR4介導之病症之藥劑。
  68. 如請求項67之用途,其中該FGFR4介導之病症為肝細胞癌。
  69. 如請求項67之用途,其中該FGFR4介導之病症為橫紋肌肉瘤。
  70. 一種如請求項48之化合物或其醫藥學上可接受之鹽之用途,其用於製備治療FGFR4介導之病症之藥劑。
  71. 如請求項70之用途,其中該FGFR4介導之病症為肝細胞癌。
  72. 如請求項70之用途,其中該FGFR4介導之病症為橫紋肌肉瘤。
  73. 一種如請求項49之化合物或其醫藥學上可接受之鹽之用途,其用於製備治療FGFR4介導之病症之藥劑。
  74. 如請求項73之用途,其中該FGFR4介導之病症為肝細胞癌。
  75. 如請求項73之用途,其中該FGFR4介導之病症為橫紋肌肉瘤。
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