TWI641621B - 與４-１ｂｂ結合之分子類 - Google Patents

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Abstract

本揭示內容提供與人4-1BB結合之經分離之結合分子、編碼該結合分子之胺基酸序列之核酸分子、包含該核酸分子之載體、包含該載體之宿主細胞、製備該結合分子之方法、包含該結合分子之醫藥組成物、及使用該結合分子或組成物之方法。

Description

與4-1BB結合之分子類
本發明關於抗體類，特別是與人4-1BB結合之抗體類。
4-1BB(亦稱為CD137、TNFRSF9等)是一種腫瘤壞死因子受體超家族(TNFRS)之跨膜蛋白質。目前對4-1BB的了解顯示，表現通常係活化依賴性且存在於廣泛之免疫細胞亞群，包括經活化之NK及NKT細胞、調節性T細胞、樹突細胞(DC)、經刺激之肥胖細胞、分化中之骨髓細胞、單核球、嗜中性球及嗜酸性球(Wang,2009,Immunological Reviews 229：192-215)。4-1BB表現亦已被證實在腫瘤血管上(Broll,2001,Amer.J Clin.Pathol.115(4)：543-549；Seaman,2007,Cancer Cell 11：539-554)及發炎或動脈粥樣硬化之內皮細胞部位表現(Drenkard,2007 FASEB J.21：456-463；Olofsson,2008,Circulation 117：1292-1301)。刺激4-1BB之配體，即4-1BB配體(4-1BBL)係表現於經活化之抗原表現細胞(APC)、骨髓祖細胞及造 血幹細胞上。
人4-1BB係255個胺基酸之蛋白質(登錄號NM_001561；NP_001552)。完整之人4-1BB胺基酸序列係提供於SEQ ID NO：68。該蛋白質包含信號序列(胺基酸殘基1-17)，之後為胞外域(169個胺基酸)、跨膜區(27個胺基酸)及胞內域(42個胺基酸)(Cheuk ATC et al.2004 Cancer Gene Therapy 11：215-226)。該受體係以單體及雙體形式表現於細胞表面上，且可能與4-1BB配體三聚化以傳訊。
許多鼠及人T細胞之試驗顯示4-1BB促進增強之細胞增生、存活及細胞介素產生(Croft,2009,Nat Rev Immunol 9：271-285)。試驗顯示一些4-1BB促效劑mAb增加共同刺激分子表現及顯著增加溶細胞性T淋巴細胞反應，導致多種模型中之抗腫瘤療效。4-1BB促效劑mAb在預防及治療模式上具有經證實之療效。另外，4-1BB單一及組合治療腫瘤模式具有已建立之持久抗腫瘤保護性T細胞記憶反應(Lynch,2008,Immunol Rev.22：277-286)。4-1BB促效劑亦經證實可在該技藝公認之各種自體免疫模型中抑制自體免疫反應(Vinay,2006,J Mol Med 84：726-736)。4-1BB之此雙重活性提供在抑制可與破壞免疫耐受性之免疫治療方法有關之自體免疫不良反應時，同時提供抗腫瘤活性之潛力。
長久以來，對於與人4-1BB結合、增加4-1BB媒介之反應及藉此提供潛在治療劑以治療各種疾病及狀況(包 括癌)之抗體的需求一直未被滿足。
本發明之目的係提供一種經分離之與人4-1BB結合之結合分子，諸如抗體或彼之結合片段，或彼之衍生物。本發明之另一目的係提供一種組成物，該組成物包含與4-1BB結合之結合分子。本發明還有一個目的係提供治療與4-1BB傳訊有關或由4-1BB傳訊媒介之疾病及/或狀況之方法，該方法藉由使用一或多種本發明之結合分子。本發明之這些及其他目的係更詳細地敘述如下。
在一些態樣中，本發明提供與人4-1BB結合之經分離之抗體。
在一特定態樣中，該經分離之抗體與人4-1BB之包含SEQ ID NO：68之胺基酸殘基115至156之表位結合。在一些特定實施態樣中，該抗體包含SEQ ID NO：29之H-CDR1胺基酸序列、SEQ ID NO：30之H-CDR2胺基酸序列、及SEQ ID NO：31之H-CDR3胺基酸序列。在其他特定實施態樣中，該抗體包含SEQ ID NO：34之L-CDR1胺基酸序列、SEQ ID NO：35之L-CDR2胺基酸序列、及SEQ ID NO：36之L-CDR3胺基酸序列。
在另一特定態樣中，該經分離之抗體以600nM或更少、100nM或更少、50nM或更少、10nM或更少、5nM或更少、或1nM或更少之KD與人4-1BB之胞外域結合，其係利用本發明所描述之BIACore試驗測量。
在另一特定態樣中，該經分離之抗體包含：(a)如SEQ ID NO：1、SEQ ID NO：15、或SEQ ID NO：29所示之H-CDR1；(b)如SEQ ID NO：2、SEQ ID NO：16、或SEQ ID NO：30所示之H-CDR2；及(c)如SEQ ID NO：3、SEQ ID NO：17、或SEQ ID NO：31所示之H-CDR3。
在另一特定態樣中，該經分離之抗體包含：(a)如SEQ ID NO：6、SEQ ID NO：20、或SEQ ID NO：34所示之L-CDR1；(b)如SEQ ID NO：7、SEQ ID NO：21、或SEQ ID NO：35所示之L-CDR2；及(c)如SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：22、SEQ ID NO：36、或SEQ ID NO：55所示之L-CDR3。
在又一態樣中，該經分離之抗體包含：(a)如SEQ ID NO：1、SEQ ID NO：15、或SEQ ID NO：29所示之H-CDR1；(b)如SEQ ID NO：2、SEQ ID NO：16、或SEQ ID NO：30所示之H-CDR2；及(c)如SEQ ID NO：3、SEQ ID NO：17、或SEQ ID NO：31所示之H-CDR3；且另包含：(d)如SEQ ID NO：6、SEQ ID NO：20、或SEQ ID NO：34所示之L-CDR1；(e)如SEQ ID NO：7、SEQ ID NO：21、或SEQ ID NO：35所示之L-CDR2；及(f)如SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：22、SEQ ID NO：36、或SEQ ID NO：55所示之L-CDR3。
在一些其他特定態樣中，該經分離之抗體係選自：(a)抗體或彼之抗原結合部分，其包含：如SEQ ID NO：1所示之H-CDR1、如SEQ ID NO：2所示之H-CDR2、 及如SEQ ID NO：3所示之H-CDR3；(b)抗體或彼之抗原結合部分，其包含：如SEQ ID NO：15所示之H-CDR1、如SEQ ID NO：16所示之H-CDR2、及如SEQ ID NO：17所示之H-CDR3；或(c)抗體或彼之抗原結合部分，其包含：如SEQ ID NO：29所示之H-CDR1、如SEQ ID NO：30所示之H-CDR2、及如SEQ ID NO：31所示之H-CDR3。
在一些其他態樣中，本發明提供一種與人4-1BB特異性結合之經分離之抗體或彼之抗原結合部分，其中該抗體或抗原結合部分係選自：(a)抗體或彼之抗原結合部分，其包含：如SEQ ID NO：6所示之L-CDR1、如SEQ ID NO：7所示之L-CDR2、及如SEQ ID NO：8所示之L-CDR3；(b)抗體或彼之抗原結合部分，其包含：如SEQ ID NO：20所示之L-CDR1、如SEQ ID NO：21所示之L-CDR2、及如SEQ ID NO：22所示之L-CDR3；(c)抗體或彼之抗原結合部分，其包含：如SEQ ID NO：34所示之L-CDR1、如SEQ ID NO：35所示之L-CDR2、及如SEQ ID NO：36所示之L-CDR3；或(d)抗體或彼之抗原結合部分，其包含：如SEQ ID NO：34所示之L-CDR1、如SEQ ID NO：35所示之L-CDR2、及如SEQ ID NO：55所示之L-CDR3。
在一些其他特定態樣中，該經分離之抗體係選自：(a)抗體或彼之抗原結合部分，其包含：如SEQ ID NO：1所示之H-CDR1、如SEQ ID NO：2所示之H-CDR2、如SEQ ID NO：3所示之H-CDR3；如SEQ ID NO：6所示之L-CDR1、如SEQ ID NO：7所示之L-CDR2、及如SEQ ID NO：8所示之L-CDR3；(b)抗體或彼之抗原結合部分，其包含：如SEQ ID NO：15所示之H-CDR1、如SEQ ID NO：16所示之H-CDR2、如SEQ ID NO：17所示之H-CDR3；如SEQ ID NO：20所示之L-CDR1、如SEQ ID NO：21所示之L-CDR2、及如SEQ ID NO：22所示之L-CDR3；(c)抗體或彼之抗原結合部分，其包含：如SEQ ID NO：29所示之H-CDR1、如SEQ ID NO：30所示之H-CDR2、如SEQ ID NO：31所示之H-CDR3；如SEQ ID NO：34所示之L-CDR1、如SEQ ID NO：35所示之L-CDR2、及如SEQ ID NO：36所示之L-CDR3；或(d)抗體或彼之抗原結合部分，其包含：如SEQ ID NO：29所示之H-CDR1、如SEQ ID NO：30所示之H-CDR2、如SEQ ID NO：31所示之H-CDR3；如SEQ ID NO：34所示之L-CDR1、如SEQ ID NO：35所示之L-CDR2、及如SEQ ID NO：55所示之L-CDR3。
在另一特定態樣中，該經分離之抗體包含如SEQ ID NO：4、SEQ ID NO：18、SEQ ID NO：32或SEQ ID NO：43所示之VH鏈胺基酸序列。
在另一特定態樣中，該經分離之抗體包含如SEQ ID NO：9、SEQ ID NO：23、SEQ ID NO：37、SEQ ID NO：45、 SEQ ID NO：51、SEQ ID NO：56、SEQ ID NO：60、或SEQ ID NO：64所示之VL鏈胺基酸序列。
在另一特定態樣中，該經分離之抗體包含如SEQ ID NO：4、18、32或43中任一者所示之VH結構域胺基酸序列，且另包含如SEQ ID NO：9、SEQ ID NO：23、SEQ ID NO：37、SEQ ID NO：45、SEQ ID NO：51、SEQ ID NO：56、SEQ ID NO：60、或SEQ ID NO：64中任一者所示之VL結構域胺基酸序列。
在其他特定態樣中，該經分離之抗體係選自：(a)包含如SEQ ID NO：4所示之VH鏈胺基酸序列及如SEQ ID NO：9所示之VL鏈胺基酸序列之抗體；(b)包含如SEQ ID NO：18所示之VH鏈胺基酸序列及如SEQ ID NO：23所示之VL鏈胺基酸序列之抗體；(c)包含如SEQ ID NO：32所示之VH鏈胺基酸序列及如SEQ ID NO：37或SEQ ID NO：56所示之VL鏈胺基酸序列之抗體；或(d)包含如SEQ ID NO：43所示之VH鏈胺基酸序列及如SEQ ID NO：45、SEQ ID NO：51、SEQ ID NO：60或SEQ ID NO：64所示之VL鏈胺基酸序列之抗體。
在仍為其他特定態樣中，本發明所提供之經分離之抗體包含由下列編碼之VH鏈：(i)包含SEQ ID NO：11、SEQ ID NO：25、SEQ ID NO：39、或SEQ ID NO：47之核酸序列，或(ii)在高度嚴謹度條件下與SEQ ID NO：11、SEQ ID NO：25、SEQ ID NO：39、或SEQ ID NO：47之互補股雜交 之核酸序列。
在仍為其他特定態樣中，該經分離之抗體包含由下列編碼之VL鏈：(i)包含SEQ ID NO：12、SEQ ID NO：26、SEQ ID NO：40、SEQ ID NO：48、SEQ ID NO：53、SEQ ID NO：58、SEQ ID NO：62、或SEQ ID NO：66之核酸序列，或(ii)在高度嚴謹度條件下與SEQ ID NO：12、SEQ ID NO：26、SEQ ID NO：40、SEQ ID NO：48、SEQ ID NO：53、SEQ ID NO：58、SEQ ID NO：62、或SEQ ID NO：66之互補股雜交之核酸序列。
在其他特定態樣中，本發明提供一種經分離之抗體，該經分離之抗體與選自MOR-6032、MOR-7361、MOR-7480、MOR-7480.1、MOR-7480.2、MOR 7483、MOR-7483.1、或MOR-7483.2之示範性抗體競爭及/或交叉競爭與人4-1BB之結合。
在其他特定態樣中，本發明提供一種經分離之抗體，該經分離之抗體和此處所揭示之抗體中之任一者與人4-1BB上之相同表位結合。在一些實施態樣中，本發明提供一種經分離之抗體，該經分離之抗體和選自MOR-6032、MOR-7361、MOR-7480、MOR-7480.1、MOR-7480.2、MOR 7483、MOR-7483.1、或MOR-7483.2之示範性抗體與人4-1BB上之相同表位結合。
在其他特定態樣中，本發明提供一種與人4-1BB結合之經分離之抗體，該經分離之抗體包含人VH 3-23基因、VH 1-69基因、或VH 5之產物或衍生物之重鏈可變區。在 另一特定態樣中，本發明提供一種與人4-1BB結合之經分離之抗體，該經分離之抗體包含人VL λ3、或λ1-13基因之產物或衍生物之輕鏈可變區。
在一些實施態樣中，本發明所描述之經分離之抗體具有下列性質或特徵之一或多者：a)與人4-1BB特異性結合；b)與人及馬來猴(cynomolgus)4-1BB結合；c)與人4-1BB或馬來猴4-1BB結合，但不與大鼠或小鼠4-1BB結合；d)係IgG，諸如IgG1、IgG2、IgG3、或IgG4；及e)係人抗體，或人化抗體。
在一些其他態樣中，本發明提供由本揭示內容所提供之抗體中之任一者之抗原結合部分。在一些實施態樣中，該抗原結合部分係Fab或scFv片段。
在一些其他態樣中，本發明提供由本揭示內容所提供之抗體中之任一者之衍生物。
在一些其他態樣中，本發明提供一種經分離之核酸，該核酸編碼與人4-1BB結合之抗體或彼之抗原結合部分之VH鏈，該核酸係選自：(i)編碼如SEQ ID NO：4、SEQ ID NO：18、SEQ ID NO：32或SEQ ID NO：43所示之VH鏈胺基酸序列之核酸序列；(ii)如SEQ ID NO：11、SEQ ID NO：25、SEQ ID NO：39或SEQ ID NO：47所示之核酸序列；或 (iii)在高度嚴謹度條件下與如SEQ ID NO：11、SEQ ID NO：25、SEQ ID NO：39或SEQ ID NO：47所示之核酸序列之互補股雜交之核酸序列。
在一些其他態樣中，本發明提供一種經分離之核酸，該核酸編碼與人4-1BB結合之抗體或彼之抗原結合部分之VL鏈，該核酸係選自：(i)編碼如SEQ ID NO：9、SEQ ID NO：23、SEQ ID NO：37、SEQ ID NO：45、SEQ ID NO：51、SEQ ID NO：56、SEQ ID NO：60、或SEQ ID NO：64所示之VL鏈胺基酸序列之核酸序列；(ii)如SEQ ID NO：12、SEQ ID NO：26、SEQ ID NO：40、SEQ ID NO：48、SEQ ID NO：53、SEQ ID NO：58、SEQ ID NO：62、或SEQ ID NO：66所示之核酸序列；或(iii)在高度嚴謹度條件下與如SEQ ID NO：12、SEQ ID NO：26、SEQ ID NO：40、SEQ ID NO：48、SEQ ID NO：53、SEQ ID NO：58、SEQ ID NO：62、或SEQ ID NO：66所示之核酸序列之互補股雜交之核酸序列。
在一些其他態樣中，本發明提供包含此處所描述之核酸之任一者之載體。在又其他態樣中，本發明提供包含此處所描述之載體之任一者之宿主細胞。該等宿主細胞可為細菌細胞或哺乳動物細胞。
在一些其他態樣中，本發明提供一種醫藥組成物，該醫藥組成物包含抗體、彼之抗原結合部分之任一者或彼之衍生物及醫藥上可接受之載劑。
本發明另提供治療有需要之個體之異常細胞生長之方法，該方法包含投予有效量之本發明之結合分子或此處所述之醫藥組成物至該個體。本發明另提供減少個體之腫瘤細胞轉移之方法，該方法包含投予有效量之結合分子或此處所述之醫藥組成物至該個體。
在其他態樣中，本發明提供該等結合分子之任一者或此處所描述之醫藥組成物用於製造藥物以治療有此需要之個體之異常細胞生長之用途。在其他態樣中，本發明提供如此處所描述之結合分子或醫藥組成物以用於治療有此需要之個體之異常細胞生長。在仍為其他態樣中，本發明提供如此處所描述之結合分子或醫藥組成物以用於治療有此需要之個體之腫瘤細胞轉移。在仍為其他態樣中，本發明提供該等結合分子之任一者或此處所描述之醫藥組成物用於製造藥物以治療有此需要之個體之腫瘤細胞轉移之用途。
本發明之詳細說明 A. 定義
除非此處另外加以定義，關於本發明所使用之科學性及技術性用語應具有該領域之一般技藝人士所通常了解之意義。另外，除非內文另外要求，單數用語應包括複數意義且複數用語應包括單數意義。一般來說，與此處所描述之細胞培養、組織培養、分子生物學、免疫學、微生物學、基因學以及蛋白質及核酸化學和雜交有關所使用之命 名法及技術係該領域所廣為周知且經常使用者。
如在本發明之使用，下列用語各具有與在本節中相關之意義。
用語「4-1BB抗體」係指如此處定義之能與人4-1BB受體結合之抗體。
用語「4-1BB」及「4-1BB受體」在本申請案中可互相交換使用，包括人4-1BB受體及彼之變異體、異構體、及物種同源物。因此，此處所定義及揭示之結合分子亦可與除了人以外之物種的4-1BB結合。在其他例中，結合分子可能具有對人4-1BB之完全特異性，而不展現物種或其他類型之交叉反應。
冠詞「一」係指一或超過一個(即至少一個)該冠詞之文法對象。舉例來說，「一元件」係指一個元件或超過一個元件。
用語「促效劑」係指如此處定義之結合分子，當其與4-1BB結合時，(1)刺激或活化4-1BB，(2)增進、增加、促進、誘導或延長4-1BB之活性、功能或存在，或(3)增進、增加、促進或誘導4-1BB之表現。
用語「胺基酸」係指天然發生及合成之胺基酸，亦指功能與該天然發生之胺基酸類似之胺基酸類似物及胺基酸擬似物。天然發生之胺基酸係該些由基因密碼所編碼者，亦包括該些後來經修飾之胺基酸，例如羥基脯胺酸、γ-羧基麩胺酸及O-磷酸絲胺酸。用語「胺基酸類似物」係指具有和天然發生之胺基酸相同之基本化學結構，但是C端羧 基、N端胺基或側鏈官能基係經化學修飾成另一種官能基之化合物。用語「胺基酸擬似物」係指具有與胺基酸之一般化學結構不同之結構，但是功能與天然發生之胺基酸類似之化學化合物。
用語「抗體」係該領域公認之用語，係指抗原結合蛋白(即免疫球蛋白)，其具有由二條相同之重(H)鏈及二條相同之輕(L)鏈組成之基本四多肽鏈結構。各L鏈係以一個共價雙硫鍵與H鏈連接，而該二條H鏈係由一或多個取決於該H鏈同型之雙硫鍵彼此互相連接。每條重鏈具有在N端之可變區(在此處簡寫為VH)及其後之恆定區。該重鏈恆定區包含三個結構域CH1、CH2、及CH3。每條輕鏈具有在N端之可變區(在此處簡寫為VL)及其後在彼之另一端之恆定區。該輕鏈恆定區包含一個結構域CL。該VL係與該VH對齊，且該CL係與重鏈之第一恆定結構域(CH1)對齊。該VH及VL配對(pairing)在一起形成單一抗原結合部位。IgM抗體係由5個基本的異型四聚體單位與稱為J鏈之額外多肽組成，因此IgM抗體包含10個抗原結合部位，然而經分泌之IgA抗體可聚合以形成包含2至5個該基本四鏈單位以及J鏈之多價集合體。
該VH及VL區可進一步再分成稱為互補決定區(CDR)之超變異區域，該等超變異區域之間係由較具保守性之稱為骨架區(FR)之區域相隔。該CDR區可利用卡巴(Kabat)或柯西亞(Chothia)編號系統決定，二者皆為該領域之技藝人士所廣為周知。見例如Kabat,E.A.,et al.(1991) Sequences of Proteins of Immunological Interest,Fifth Edition,U.S.Department of Health and Human Services,NIH Publication No.91-3242；Chothia and Lesk,J.Mol.Biol.196：901-917(1987)。每個VH及VL係由三個CDR及四個FR組成，以下列順序自胺基端至羧基端排列：FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、FR4。在本發明中，重鏈之三個CDR被稱為H-CDR1、H-CDR2、及H-CDR3。同樣地，輕鏈之三個CDR被稱為L-CDR1、L-CDR2、及L-CDR3。該重鏈及輕鏈之可變區包含與抗原交互作用之結合結構域。該等抗體之恆定區可能媒介該免疫球蛋白與宿主組織或因子之結合，包括免疫系統之各種細胞(例如效應細胞)及典型補體系統之第一成分(Clq)。在輕鏈及重鏈之內，該可變區及恆定區係由約12或更多個胺基酸之"J"區連接，該重鏈亦包括約10或更多個胺基酸之"D"區。見一般性之Fundamental Immunology第7章(Paul,W.,ed.,2nd ed.Raven Press,N.Y.(1989))。
來自任何脊椎動物物種之L鏈可根據彼等之恆定結構域的胺基酸序列被分配至稱為κ及λ之二種明顯不同型式中之一者。根據抗體之重鏈的恆定結構域(CH)之胺基酸序列，抗體可被分成不同類型或同型。有五種抗體類型：分別具有稱為α(alpha)、δ(delta)、ε(epsilon)、γ(gamma)、及μ(mu)之重鏈的IgA、IgD、IgE、IgG、及IgM。IgG類型之抗體可分別藉由γ重鏈Y1至Y4再被分成四個亞型IgG1、IgG2、IgG3、及IgG4。
用語「抗體衍生物」或抗體之「衍生物」係指能與該抗體所結合之相同抗原(例如4-1BB)結合，且包含與額外之分子實體連接之該抗體之胺基酸序列之分子。包含於抗體衍生物中之抗體的胺基酸序列可為抗體之全長重鏈、全長輕鏈、全長重鏈之任何部分或多個部分、全長輕鏈之任何部分或多個部分、抗體之任何其他片段、或該完整抗體。該額外之分子實體可為化學或生物分子。額外之分子實體之實例包括化學基、胺基酸、肽、蛋白質(諸如酶、抗體)、及化學化合物。該額外之分子實體可具有任何用途，諸如用來作為檢測劑、標記、標誌、醫藥或治療劑。抗體之胺基酸序列可藉由化學耦合、基因融合、非共價連接或其他方式與該額外之分子實體連接。用語「抗體衍生物」亦包含嵌合抗體、人化抗體及衍生自4-1BB抗體之胺基酸序列的修飾諸如保守性胺基酸取代、添加及***之分子。
抗體之「抗原結合片段」或「抗原結合部分」之用語係指抗體之一或多個部分，該部分(或多個部分)保留與該抗體所結合之抗原(例如4-1BB)結合之能力。抗體之「抗原結合片段」之實例包括(i)Fab片段，其係由VL、VH、CL及CH1結構域組成之單價片段；(ii)F(ab')2片段，包含由絞鏈區之雙硫鍵所連接之二個Fab片段之雙價片段；(iii)Fd片段，其係由VH及CH1結構域所組成；(iv)Fv片段，其係由抗體之單臂的VL及VH結構域組成；(v)dAb片段(Ward et al.,Nature 341：544-546(1989))，其係由VH結構域組成；及(vi)經分離之互補決定區(CDR)。
用語「結合分子」包含(1)抗體、(2)抗體之抗原結合片段、及(3)抗體之衍生物，各具有如此處之定義。
用語「結合之4-1BB」、「結合4-1BB」、「結合至4-1BB」或「與4-1BB結合」係指如此處定義之結合分子在活體外試驗(例如於實施例6中所述之BIAcore試驗)中，以500nM或小於500nM之親和性(KD)與人4-1BB結合。
用語「嵌合抗體」係指包含衍生自不同動物物種之胺基酸序列的抗體，諸如該些具有衍生自人抗體之可變區及鼠免疫球蛋白恆定區之抗體。
用語「競爭結合」係指二個抗體在彼等與結合標靶之結合上的交互作用。若第一抗體與彼之同源表位之結合在第二抗體存在時相較於該第一抗體在該第二抗體不存在時之結合係可偵測地減少，則該第一抗體與第二抗體競爭結合。或者，該情況可為但不一定是該第二抗體與彼之表位之結合亦因該第一抗體之存在而可偵測地降低。也就是說，第一抗體可抑制第二抗體與彼之表位之結合，但第二抗體不抑制該第一抗體與彼之個別表位之結合。然而，當各種抗體不論以相同、較高或較低程度可偵測地抑制另一抗體與彼之同源表位結合時，該等抗體被稱為彼此「交叉競爭」與彼等之個別表位之結合。
用語「表位」係指抗原之一部分，抗體(或彼之抗原結合片段)與該部分結合。表位可自連續胺基酸或藉由蛋白質之三級摺疊並列之非連續胺基酸形成。自連續胺基酸形成之表位在暴露於變性溶劑時通常仍被保留，然而藉由三 級摺疊形成之表位通常在變性溶劑處理後消失。表位可包括不同數量之呈獨特空間構形之胺基酸。測定表位之空間構形之方法包括例如x光結晶學及二維核磁共振。見例如Epitope Mapping Protocols in Methods in Molecular Biology,Vol.66,G.E.Morris,Ed.(1996)。一旦在抗原上之所欲表位被測定後，針對該表位之抗體可利用例如此處所描述之技術產製。抗體之產製及特徵化亦可闡釋有關所欲表位之資訊。有此資訊即有可能競爭性地篩選與該相同表位結合之抗體。一種達到此目的之方法係進行交叉競爭試驗以找到彼此互相競爭結合之抗體，即該等抗體競爭與抗原之結合。一種根據抗體之交叉競爭之用於篩選(binning)抗體之高通量方法係描述於PCT公開號WO 03/48731。
用語「種系」係指當親代經由生殖細胞傳給後代之抗體基因及基因區段之核苷酸序列。種系序列係與在成熟B細胞中編碼抗體之核苷酸序列不同，該在成熟B細胞中之核苷酸序列已在B細胞成熟過程中藉由重組及超突變事件被改變。
用語「糖基化位點」係指由真核細胞辨識以作為連接糖殘基之位置之胺基酸殘基。被碳水化合物諸如寡糖連接之胺基酸通常係天冬醯胺酸(N-鍵接)、絲胺酸(O-鍵接)及蘇胺酸(O-鍵接)殘基。該特定連接位點通常以胺基酸之序列作為信號，該胺基酸之序列在此處稱為「糖基化位點序列」。用於N-連接糖基化之糖基化位點序列係-Asn-X-Ser- 或-Asn-X-Thr-，其中X可為除脯胺酸以外之傳統胺基酸之任一者。用語「N-連接」及「O-連接」係指作為該糖分子及該胺基酸殘基之間的連接位點之化學基。N-連接之糖係經由胺基連接；O-連接之糖係經由羥基連接。用語「聚糖佔據」係指與糖基化位點連接之碳水化合物基團之存在(即該聚糖位點係經佔據)。當多肽上至少有二個潛在糖基化位點時，沒有(0-聚糖位點佔據)、一個(1-聚糖位點佔據)或二個(2-聚糖位點佔據)位點可被碳水化合物基團佔據。
用語「宿主細胞」係指可經工程化以產製受到關注之蛋白質、蛋白質片段或肽之細胞系統。宿主細胞包括但不限於經培養之細胞，例如衍生自囓齒動物(大鼠、小鼠、天竺鼠或倉鼠)之哺乳動物培養細胞，諸如CHO、BHK、NSO、SP2/0、YB2/0；或人組織、雜交瘤細胞、酵母菌細胞及昆蟲細胞，及包含於基因轉殖動物或培養組織中之細胞。該用語不僅包含該特定個體細胞，亦包括該細胞之子代。由於後繼世代可能因為突變或環境影響而發生特定改質，因此該子代可能不與親代細胞完全相同，但仍包括在用語「宿主細胞」之範圍內。
用語「人抗體」係指其中該輕鏈及重鏈之完整胺基酸序列係來自人免疫球蛋白基因之抗體。人抗體若在鼠、鼠細胞或衍生自鼠細胞之雜交瘤中產製，可能包含鼠之碳水化合物鏈。人抗體可利用該領域已知之多種方法製備。
用語「人化抗體」係指包含衍生自人抗體序列之胺基酸殘基的嵌合抗體。人化抗體可包含來自非人動物抗體之一 些或所有CDR，而該抗體之骨架區及恆定區包含衍生自人抗體序列之胺基酸殘基。
用語「示例性抗體」係指於本揭示內容中所描述之抗體之任一者，且命名為MOR-6032、MOR-7361、MOR-7480、MOR-7480.1、MOR-7480.2、MOR-7483、MOR-7483.1、及MOR-7483.2。這些抗體可能係任何類型(例如IgA、IgD、IgE、IgG、及IgM)。因此，以上列出之各種抗體包含具有相同之VL及VH區之胺基酸序列的所有五種類型之抗體。另外，IgG類型之抗體可能為任何亞型(例如IgG1、IgG2、IgG3、及IgG4)。因此，以上列出之各種IgG亞型之抗體包含具有相同之VL及VH區之胺基酸序列的所有四種亞型之抗體。五種類型及四種IgG亞型之人抗體的重鏈恆定區之胺基酸序列係該領域所知。舉例來說，人IgG1及IgG2恆定區之胺基酸序列係分別提供於SEQ ID NO：69及71。各種示例性抗體之IgG2亞型的全長重鏈之胺基酸序列係提供於本揭示內容。
用語「經分離之抗體」或「經分離之結合分子」係指如此處所定義之抗體或結合分子，其(1)不與在彼之天然狀態下伴隨彼之天然相關成分相關，(2)不含來自該相同物種之其他蛋白質，(3)係由來自不同物種之細胞表現，或(4)不在天然中發生。經分離之抗體實例包括已利用4-1BB進行親和性純化之4-1BB抗體、已藉由雜交瘤或其他細胞系在活體外產製之4-1BB抗體，及衍生自基因轉殖動物之4-1BB抗體。
用語「經分離之核酸」係指基因組、cDNA或合成性來源之核酸分子或彼等之組合，該核酸分子係與存在於該核酸之天然來源的其他核酸分子分開。舉例來說，以基因組DNA而言，用語「經分離」包括與該基因組DNA所天然相關之染色體分開之核酸分子。較佳地，「經分離之」核酸係不含天然夾側該核酸之序列(即位於該受到關注之核酸的5'及3'端之序列)。
用語「ka」係指特定抗體-抗原交互作用之結合速率常數，然而用語「kd」係指特定抗體-抗原交互作用之解離速率常數。
用語「KD」係指特定抗體-抗原交互作用之平衡解離常數。其係得自kd與ka之比(即kd/ka)且係以莫耳濃度(M)表示。KD係用來作為抗體與彼之結合伴之結合的親和性之測量值。該KD值越小，該抗體之結合越緊密，或該抗體與抗原之間的親和性越高。舉例來說，具有奈莫耳(nM)解離常數之抗體相較於具有微莫耳(μM)解離常數之抗體與特定抗原更為緊密地結合。抗體之KD值可利用該領域完整建立之方法測定。一種用於測定抗體之KD之方法係藉由利用表面電漿共振，通常使用諸如Biacore®系統之生物感測器系統。使用BIACORETM系統(BIAcore試驗)之測定方法係描述於本發明之實施例部分。
用語「哺乳動物」係指哺乳動物綱中之任何動物物種。哺乳動物之實例包括人；實驗室動物諸如大鼠、小鼠、類人猿及天竺鼠；家畜諸如貓、狗、兔、牛、綿羊、山羊、 馬及豬；及捕獲之野生動物諸如獅、虎、象及類似動物。
用語「單株抗體」係指自實質上同源之抗體族群獲得之抗體，即除了可能少量存在之可能天然發生之突變以外，組成該族群之個別抗體係相同的。單株抗體具高度專一性，其係以單一抗原部位為目標。另外，和包含拮抗不同決定簇(表位)之不同抗體的多株抗體製劑不同的是，各單株抗體係以抗原上之單一決定簇為目標。除了彼等之專一性之外，單株抗體具有在不受其他抗體污染下合成之優點。修飾語「單株」不應被視為需要藉由任何特定方法產製該抗體。舉例來說，單株抗體可能藉由雜交瘤方法製備或可能利用重組DNA方法在細菌、真核動物或植物細胞中製造(見例如美國專利第4,816,567號)。單株抗體亦可利用例如Clackson et al.,Nature,352：624-628(1991)及Marks et al.,J.Mol.Biol.,222：581-597(1991)所描述之技術自噬菌體抗體庫分離。
就哺乳動物之某些疾病狀況而言，用語「預防」或「防止」係指預防或延緩疾病之發生，或預防彼之臨床或次臨床症狀之表現。
用語「重組抗體」係指藉由重組手段製備、表現、產生或分離之抗體，諸如自基因轉殖另一物種之免疫球蛋白基因之動物分離之抗體、利用經轉染至宿主細胞之重組表現載體表現之抗體、自重組組合式抗體庫分離之抗體、或藉由任何其他涉及裁剪免疫球蛋白基因序列成為其他DNA序列之手段加以製備、表現、產生或分離之抗體。
如此處所使用，在二個多肽序列之間的「序列一致性」表示該等序列之間相同之胺基酸的百分比。多肽之胺基酸序列一致性可利用已知之電腦程式諸如Bestfit、FASTA、或BLAST以習知方式測定(見例如Pearson,Methods Enzymol.183：63-98(1990)；Pearson,Methods Mol.Biol.132：185-219(2000)；Altschul et al.,J.Mol.Biol.215：403-410(1990)；Altschul et al.,Nucelic Acids Res.25：3389-3402(1997))。當使用Bestfit或任何其他序列排比程式以測定特定序列是否與參考胺基酸序列具有95%之一致性時，該等參數係經設定以使該一致性之百分比係以該參考胺基酸序列之全長計算，並允許最高5%之該參考序列之胺基酸殘基總數之同源性缺口。此前述之測定多肽之間一致性百分比之方法係適用於此處所揭示之所有蛋白質、片段或彼等之變異體。
當提到如此處所定義之結合分子(例如抗體)與彼之結合伴(例如抗原)之交互作用時，用語「特異性結合」或「與...特異性結合」係指該結合分子在一組給定條件下區別來自一動物物種之受到關注之抗原與來自不同動物物種之同源基因抗原之能力。若4-1BB結合分子以低於其在活體外試驗中與大鼠或小鼠之4-1BB結合時所測定之EC50的50%之EC50與人4-1BB結合，該結合分子被稱為與人4-1BB特異性結合。抗體之結合特異性可利用該領域已知之方法測定。該等方法之實例包括使用經PHA刺激之初代細胞之FACS、西方墨點法、ELISA試驗、RIA試驗、ECL試 驗、IRMA試驗及肽掃描。
當提到如此處所定義之結合分子(例如抗體)與彼之結合伴(例如抗原)之交互作用時，用語「選擇性結合」或「與...選擇性結合」係指該結合分子在一組給定條件下區別來自一動物物種之受到關注之抗原(諸如人4-1BB)與來自該相同動物物種之不同抗原(諸如人CD40)之能力。若4-1BB結合分子以低於其在活體外試驗中與人CD40或人CD134結合時所測定之EC50的10%之EC50與人4-1BB結合，該結合分子被稱為與人4-1BB選擇性結合。
當提到哺乳動物之某種疾病狀況時，用語「治療」係指在具有該疾病狀況之哺乳動物體內導致所欲或有利之效應。該所欲或有利之效應可包括減少該疾病之一或多種症狀(即腫瘤生長及/或轉移，或由免疫細胞之數量及/或活性所媒介之其他效應及類似者)之頻率或嚴重性，或阻止或抑制該疾病、狀況或病狀之進一步發展。在治療哺乳動物之癌的情況中，該所欲或有利之效應可包括抑制癌細胞之繼續生長或擴散、癌細胞之死亡、抑制癌之復發、減少與該癌相關之疼痛、或增進該哺乳動物之存活。該效應可為主觀或客觀。舉例來說，若該哺乳動物係人，該人可能注意到增進活力或精力或減少疼痛以為改善或治療反應之主觀症狀。或者，該臨床醫師可能根據理學檢查、實驗室參數、腫瘤標記或放射線學發現注意到腫瘤大小或腫瘤負荷之減少。臨床醫師可能觀察到以作為治療反應之一些實驗室徵候包括測試之正常化，諸如白血球數、紅血球數、血 小板數、紅血球沉降速率及各種酶之量。此外，臨床醫師可能觀察可檢測之腫瘤標記之減少。或者，其他測試可被用於評估客觀改善，諸如超音波、核磁共振檢查及正子發射檢查。
用語「載體」係指能運送外來核酸分子之核酸分子。該外來核酸分子係藉由重組技術諸如接合或重組與該載體核酸分子連接。此允許該外來核酸分子在宿主細胞或有機體中被複製、選擇、進一步操作或表現。載體可為質體、噬菌體、轉位子、黏質體、染色體、病毒或病毒粒子。一種類型之載體在被導入宿主細胞內時可被整合至該宿主細胞之基因組中，以藉此隨著該宿主基因組一起複製(例如非附加型哺乳動物載體)。另一類型之載體可在其被導入之宿主細胞內自主複製(例如具有細菌性複製起點之細菌性載體及附加型哺乳動物載體)。另一特定類型之能引導其所可操作性連接之可表現之外來核酸表現之載體通常被稱為「表現載體」。表現載體通常具有驅使該可表現之外來核酸表現之控制序列。較簡單之載體稱為「轉錄載體」，其僅能被轉錄但無法被轉譯，它們可在標靶細胞中複製但無法表現。用語「載體」包含所有類型之載體，不論彼等之功能為何。能引導其所可操作性連接之可表現之核酸表現之載體通常被稱為「表現載體」。
本發明之方法及技術通常根據該領域所廣為周知之方法進行，除非另外說明否則如同本說明書各處引述及討論之各種一般性及更具體之參考文獻所述。該等參考文獻包 括例如Sambrook and Russell,Molecular Cloning,A Laboratory Approach,Cold Spring Harbor Press,Cold Spring Harbor,NY(2001)、Ausubel et al.,Current Protocols in Molecular Biology,John Wiley & Sons,NY(2002)、及Harlow and Lane Antibodies：A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Laboratory Press,Cold Spring Harbor,NY(1990)。酶反應及純化技術係根據製造商說明書，以該領域經常完成或此處所描述之方式進行。與此處所述之分析化學、合成有機化學、醫學及製藥化學有關所使用之命名和實驗室方法及技術係該領域所廣為周知且經常使用者。標準技術係用於化學合成、化學分析、醫藥製備、醫藥調製、醫藥遞送及病患治療。
本發明所使用之該20種習用之胺基酸及彼等之縮寫遵照習慣用法。見Immunology--A Synthesis(2nd Edition,E.S.Golub and D.R.Gren,Eds.,Sinauer Associates,Sunderland,Mass.(1991))。
B. 與人4-1BB結合之結合分子
本發明提供與人4-1BB結合之經分離之結合分子，包括4-1BB抗體、該等4-1BB抗體之抗原結合片段及該等4-1BB抗體之衍生物。
B-1. 4-1BB抗體
在一些態樣中，本發明提供與在SEQ ID NO：68之胺 基酸殘基115至156內之人4-1BB表位結合之經分離之抗體。在一些實施態樣中，該經分離之抗體包含SEQ ID NO：29之H-CDR1胺基酸序列、SEQ ID NO：30之H-CDR2胺基酸序列、及SEQ ID NO：31之H-CDR3胺基酸序列。在一些其他實施態樣中，該經分離之抗體包含SEQ ID NO：34之L-CDR1胺基酸序列、SEQ ID NO：35之L-CDR2胺基酸序列、及SEQ ID NO：36之L-CDR3胺基酸序列。在一些其他實施態樣中，以上所描述之抗體具有一或多種如本發明下述之生物特性。
在其他態樣中，本發明提供與人4-1BB結合之經分離之抗體，其中該抗體包含：(a)如SEQ ID NO：1、SEQ ID NO：15、或SEQ ID NO：29所示之H-CDR1；(b)如SEQ ID NO：2、SEQ ID NO：16、或SEQ ID NO：30所示之H-CDR2；及(c)如SEQ ID NO；3、SEQ ID NO：17、或SEQ ID NO：31所示之H-CDR3。
在另一態樣中，本發明提供與人4-1BB結合之經分離之抗體，其中該抗體包含：(a)如SEQ ID NO：6、SEQ ID NO：20、或SEQ ID NO：34所示之L-CDR1；(b)如SEQ ID NO：7、SEQ ID NO：21、或SEQ ID NO：35所示之L-CDR2；及(c)如SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：22、SEQ ID NO：36、或SEQ ID NO：55所示之L-CDR3。
在其他態樣中，本發明提供與人4-1BB結合之經分離之抗體，其中該抗體包含：(a)如SEQ ID NO：1、SEQ ID NO：15、或SEQ ID NO：29所示之H-CDR1；(b)如SEQ ID NO：2、SEQ ID NO：16、或SEQ ID NO：30所示之H-CDR2；及(c)如SEQ ID NO：3、SEQ ID NO：17、或SEQ ID NO：31所示之H-CDR3；且另包含：(d)如SEQ ID NO：6、SEQ ID NO：20、或SEQ ID NO：34所示之L-CDR1；(e)如SEQ ID NO：7、SEQ ID NO：21、或SEQ ID NO：35所示之L-CDR2；及(f)如SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：22、SEQ ID NO：36、或SEQ ID NO：55所示之L-CDR3。
在一些其他態樣中，本發明提供一種與人4-1BB結合之經分離之抗體，其中該抗體係選自：(a)包含如SEQ ID NO：1所示之H-CDR1、如SEQ ID NO：2所示之H-CDR2、及如SEQ ID NO：3所示之H-CDR3之抗體；(b)包含如SEQ ID NO：15所示之H-CDR1、如SEQ ID NO：16所示之H-CDR2、及如SEQ ID NO：17所示之H-CDR3之抗體；或(c)包含如SEQ ID NO：29所示之H-CDR1、如SEQ ID NO：30所示之H-CDR2、及如SEQ ID NO：31所示之H-CDR3之抗體。
在一些其他態樣中，本發明提供一種與人4-1BB結合之經分離之抗體，其中該抗體係選自：(a)包含如SEQ ID NO：6所示之L-CDR1、如SEQ ID NO：7所示之L-CDR2、及如SEQ ID NO：8所示之L-CDR3之抗體；(b)包含如SEQ ID NO：20所示之L-CDR1、如SEQ ID NO：21所示之L-CDR2、及如SEQ ID NO：22所示之L-CDR3之抗體；(c)包含如SEQ ID NO：34所示之L-CDRI、如SEQ ID NO：35所示之L-CDR2、及如SEQ ID NO：36所示之L-CDR3之抗體；或(d)包含如SEQ ID NO：34所示之L-CDR1、如SEQ ID NO：35所示之L-CDR2、及如SEQ ID NO：55所示之L-CDR3之抗體。
在一些其他態樣中，本發明提供一種與人4-1BB結合之經分離之抗體，其中該抗體係選自：(a)包含如SEQ ID NO：1所示之H-CDR1、如SEQ ID NO：2所示之H-CDR2、如SEQ ID NO：3所示之H-CDR3；如SEQ ID NO：6所示之L-CDR1、如SEQ ID NO：7所示之L-CDR2、及如SEQ ID NO：8所示之L-CDR3之抗體；(b)包含如SEQ ID NO：15所示之H-CDR1、如SEQ ID NO：16所示之H-CDR2、如SEQ ID NO：17所示之H-CDR3；如SEQ ID NO：20所示之L-CDR1、如SEQ ID NO：21所示之L-CDR2、及如SEQ ID NO：22所示之L-CDR3之抗體；(c)包含如SEQ ID NO：29所示之H-CDRI、如SEQ ID NO：30所示之H-CDR2、如SEQ ID NO：31所示之H-CDR3；如SEQ ID NO：34所示之L-CDR1、如SEQ ID NO：35所示之L-CDR2、及如SEQ ID NO：36所示之L- CDR3之抗體；或(d)包含如SEQ ID NO：29所示之H-CDR1、如SEQ ID NO：30所示之H-CDR2、如SEQ ID NO：31所示之H-CDR3；如SEQ ID NO：34所示之L-CDR1、如SEQ ID NO：35所示之L-CDR2、及如SEQ ID NO：55所示之L-CDR3之抗體。
在另一態樣中，本發明提供一種與人4-1BB結合之經分離之抗體，其中該抗體包含包含如SEQ ID NO：4、SEQ ID NO：18、SEQ ID NO：32或SEQ ID NO：43所示之VH鏈胺基酸序列。
在另一態樣中，本發明提供一種與人4-1BB結合之經分離之抗體，其中該抗體包含如SEQ ID NO：9、SEQ ID NO：23、SEQ ID NO：37、SEQ ID NO：45、SEQ ID NO：51、SEQ ID NO：56、SEQ ID NO：60、或SEQ ID NO：64所示之VL鏈胺基酸序列。
在其他態樣中，本發明提供一種與人4-1BB結合之經分離之抗體，其中該抗體包含(1)如SEQ ID NO：4、SEQ ID NO：18、SEQ ID NO：32或SEQ ID NO：43所示之VH鏈胺基酸序列，及(2)如SEQ ID NO：9、SEQ ID NO：23、SEQ ID NO：37、SEQ ID NO：45、SEQ ID NO：51、SEQ ID NO：56、SEQ ID NO：60、或SEQ ID NO：64所示之VL鏈胺基酸序列。
在其他態樣中，本發明提供一種與人4-1BB結合之經分離之抗體，其中該抗體係選自： (a)包含如SEQ ID NO：4所示之VH鏈胺基酸序列及如SEQ ID NO：9所示之VL鏈胺基酸序列之抗體；(b)包含如SEQ ID NO：18所示之VH鏈胺基酸序列及如SEQ ID NO：23所示之VL鏈胺基酸序列之抗體；(c)包含如SEQ ID NO：32所示之VH鏈胺基酸序列及如SEQ ID NO：37或SEQ ID NO：56所示之VL鏈胺基酸序列之抗體；或(d)包含如SEQ ID NO：43所示之VH鏈胺基酸序列及如SEQ ID NO：45、SEQ ID NO：51、SEQ ID NO：60或SEQ ID NO：64所示之VL鏈胺基酸序列之抗體。
在一些實施態樣中，本發明以上所描述之抗體(包括參照表位結合所描述之抗體及參照CDR或可變區之特定胺基酸序列所描述之抗體)具有下列功能特性之至少一者：(a)以500nM或更低之KD與人4-1BB結合；(b)對人4-1BB具有促效劑活性；(c)在濃度高達1000nM時不與人CD40受體結合；(d)在濃度高達1000nM時不與人CD134受體結合；(e)在濃度高達100nM時不與大鼠或小鼠4-1BB結合；(h)能抑制腫瘤細胞生長；及(i)對癌具有治療效應。在一些其他實施態樣中，該等抗體以500nM或更少、100nM或更少、50nM或更少、10nM或更少、5nM或更少、或1nM或更少之KD與人4-1BB之胞外域特異性結合，其係利用本發明所描述之BIACore試驗測量。在仍為其他實施態樣中，該等抗體係人抗體或人化抗體，其以500nM或更少、100nM或更少、50nM或更少、10 nM或更少、5nM或更少、或1nM或更少之KD與人4-1BB之胞外域特異性結合，其係利用本發明所描述之BIACore試驗測量。在一些其他實施態樣中，該抗體係與人4-1BB特異性及選擇性結合之人抗體。
在其他實施態樣中，以上所描述之該等抗體包含來自特定種系重鏈免疫球蛋白基因之重鏈可變區及/或來自特定種系輕鏈免疫球蛋白基因之輕鏈可變區，諸如包含人VH 1-69基因、VH 3-23基因、或VH 5基因之產物或衍生物之重鏈可變區的抗體。示範性抗體包括MOR-7480.1、MOR-7480.2、MOR-7483.1、及MOR-7483.2，彼等各自包含衍生自人種系VH5基因之胺基酸。
在仍為其他實施態樣中，以上描述之抗體包含衍生自人VL λ3基因之輕鏈可變區。在仍為其他實施態樣中，以上描述之抗體包含係為人VH 1-69基因、VH 3-23基因、或VH 5基因之產物或衍生物之重鏈可變區，且另包含係為人VL λ3基因之產物或衍生物之輕鏈可變區，其中該抗體或彼之部分與人4-1BB特異性結合。示範性抗體包括MOR-7480.1、MOR-7480.2、MOR-7483.1、及MOR-7483.2，彼等各自分別包含衍生自人種系VH5基因及VL λ3基因之胺基酸。
如此處所使用，人抗體包含「衍生自」特定種系序列之重鏈或輕鏈可變區，若該抗體之可變區係得自使用人種系免疫球蛋白基因之系統。該等系統包括以受到關注之抗原免疫攜帶人免疫球蛋白基因之基因轉殖小鼠或以受到關注 之抗原篩選展示在噬菌體上之人免疫球蛋白基因庫。「衍生自」人種系免疫球蛋白序列之人抗體可藉由比較該人抗體之胺基酸序列與人種系免疫球蛋白之胺基酸序列及選擇在序列上與該人抗體之序列最靠近(即最高之一致性百分比)之人種系免疫球蛋白序列加以識別。「衍生自」特定人種系免疫球蛋白序列之人抗體可能因為例如天然發生之體突變或故意導入之定點突變而包含相較於該種系序列之胺基酸差異。然而，經選擇之人抗體之胺基酸序列通常與由人種系免疫球蛋白基因所編碼之胺基酸序列具有至少90%之一致性且包含當與其他物種之種系免疫球蛋白胺基酸序列(例如鼠種系序列)比較時識別該人抗體為人之胺基酸殘基。在某些情況中，人抗體之胺基酸序列可能與該種系免疫球蛋白基因所編碼之胺基酸序列具有至少95%，或甚至至少96%、97%、98%、或99%之一致性。在某些情況中，該人抗體之胺基酸序列係與該種系Ig基因所編碼之胺基酸序列相同。通常，衍生自特定人種系序列之人抗體將展示與該人種系免疫球蛋白基因所編碼之胺基酸序列不超過10個胺基酸差異。在某些情況中，該人抗體可展示與該種系免疫球蛋白基因所編碼之胺基酸序列不超過5個，或甚至不超過4、3、2、或1個胺基酸差異。該等示例性抗體及該相關種系之可變區的胺基酸序列之排比係提供於圖6。
在另一態樣中，本發明提供與本揭示內容之示例性抗體之任一者諸如MOR-6032、MOR-7361、MOR-7480、 MOR-7480.1、MOR-7480.2、MOR-7483、MOR-7483.1、或MOR-7483.2競爭或交叉競爭與人4-1BB結合之經分離之抗體。在特定實施態樣中，本發明提供與本揭示內容之示例性抗體之任一者競爭或交叉競爭與該人4-1BB上之相同表位結合之經分離之抗體。抗體與另一抗體競爭或交叉競爭結合之能力可利用該領域已知之標準結合試驗測定，諸如BIAcore分析、ELISA試驗、或流式細胞分析。舉例來說，可允許本發明之示例性抗體在飽和條件下與人4-1BB結合，接著測量測試抗體與該4-1BB結合之能力。若該測試抗體能在和該示例性抗體相同的時間內與該4-1BB結合，則該測試抗體與異於該示例性抗體之不同表位結合。然而，若該測試抗體無法在相同時間內與4-1BB結合，則該測試抗體與該相同表位、重疊表位或靠近該示例性抗體所結合之表位的表位結合。此實驗可利用各種方法進行，諸如ELISA、RIA、FACS或表面電漿共振。
此處所描述之4-1BB抗體可為任何類型，諸如IgG、IgM、IgE、IgA、或IgD。較佳地，該4-1BB抗體係IgG類型，諸如IgG1、IgG2、IgG3、或IgG4亞型，更佳地IgG2亞型。4-1BB抗體可利用該領域已知之方法從一類型或亞型被轉換成另一類型或亞型。用於產製所欲類型或亞型之抗體的示範性方法包含分離編碼4-1BB抗體之重鏈之核酸及編碼4-1BB抗體之輕鏈之核酸、分離編碼該VH區之序列、連接該VH序列與編碼該所欲類型或亞型之重鏈恆定區的序列、在細胞內表現該輕鏈基因及該重鏈建構 體、及收集該4-1BB抗體之步驟。
另外，本發明所提供之抗體可為單株或多株抗體，但較佳者為單株抗體。
由本發明所提供之特定經分離之抗體的實例包括下列示例性抗體：MOR-6032、MOR-7361、MOR-7480、MOR-7480.1、MOR-7480.1、MOR-7480.2、MOR-7483、MOR-7483、MOR-7483.1、及MOR-7483.2。這些抗體之重鏈可變區、IgG2亞型之全長重鏈、輕鏈可變區及全長輕鏈之核苷酸及胺基酸序列係於本發明中提供；這些序列之SEQ ID NO之索引係提供於表1。這些示例性抗體之CDR的胺基酸序列係顯示於表2。
本發明之抗體可藉由該領域已知之技術產製，包括習用之單株抗體方法，例如標準體細胞雜交技術(見例如Kohler and Milstein,Nature 256：495(1975))、B淋巴細胞之病毒或致癌轉形、或如此處以下詳細描述之重組抗體技 術。
雜交瘤產製係發展非常成熟之技術。該用於製備雜交瘤之常見動物系統係鼠系統。用於分離經免疫之脾細胞以用於融合之免疫方法及技術係該領域所知。融合伴(例如鼠骨髓瘤細胞)及融合方法亦為所知。一種可被用於製備本發明所提供之人4-1BB抗體之廣為周知之方法涉及使用XenoMouseTM動物系統。XenoMouseTM小鼠係經工程化之小鼠品系，其包含大片段之人免疫球蛋白重鏈及輕鏈基因座且缺乏小鼠抗體產製。見例如Green et al.,Nature Genetics 7：13-21(1994)及WO2003/040170。該動物係經4-1BB抗原免疫。該4-1BB抗原係經分離及/或純化之4-1BB，較佳地4-1BB。其可能為4-1BB之片段，諸如4-1BB之胞外域，特別是包含SEQ ID NO：68之胺基酸殘基115至156之4-1BB胞外域片段。動物之免疫可藉由該領域已知之任何方法進行。見例如Harlow and Lane,Antibodies：A Laboratory Manual,New York：Cold Spring Harbor Press,1990。用於免疫非人動物諸如小鼠、大鼠、綿羊、山羊、豬、牛及馬之方法係該領域所廣為周知。見例如Harlow and Lane，同上，及美國專利第5,994,619號。該4-1BB抗原可與佐劑一起投予以刺激該免疫反應。示範性佐劑包括完全或不完全弗氏(Freund’s)佐劑、RIBI(胞壁醯基二肽)或ISCOM(免疫刺激複合物)。在以4-1BB抗原免疫動物之後，產製抗體之永生化細胞系係自該經免疫之動物所分離之細胞製備。在免疫之後，該動物被 犧牲且淋巴結及/或脾臟B細胞被永生化。永生化細胞之方法包括但不限於轉移致癌基因至細胞、以致癌病毒感染細胞、在選擇永生化細胞之條件下培養細胞、使細胞受到致癌或突變化合物之影響、融合彼等至永生化細胞例如骨髓瘤細胞、及不活化腫瘤抑制基因。見例如Harlow and Lane，同上。若利用與骨髓瘤細胞融合，該骨髓瘤細胞較佳地不分泌免疫球蛋白多肽(非分泌性細胞系)。永生化細胞係利用4-1BB、彼之部分或表現4-1BB之細胞篩選。4-1BB抗體產製細胞例如雜交瘤係經篩選、選殖及進一步篩選所欲之特徵，包括強健生長、高抗體產製及所欲之抗體特徵，如下進一步討論。雜交瘤可在同源動物中、缺乏免疫系統之動物例如裸鼠中活體內擴增，或在活體外之細胞培養中擴增。篩選、選殖及擴增雜交瘤之方法係為該領域之一般技藝人士所廣為周知。
本發明之抗體亦可利用噬菌體展示方法製備。該等用於分離人抗體之噬菌體展示方法已建立於該領域，諸如實施例1中進一步描述之HuCAL®庫。亦見例如Achim Knappik,et al：Fully Synthetic Human Combinatorial Antibody Libraries(HuCAL)Based on Modular Consensus Frameworks and CDRs Randomized with Trinucleotides.J.Mol.Biol.(2000)296,57-86。
B-2. 抗原結合片段
在一些其他態樣中，本發明提供由本揭示內容所提供 之4-1BB抗體中之任一者之抗原結合片段。
該抗原結合片段可包含該抗體之任何序列。在一些實施態樣中，該抗原結合片段包含下列胺基酸序列：(1)4-1BB抗體之輕鏈、(2)4-1BB抗體之重鏈、(3)4-1BB抗體之輕鏈之可變區、(4)4-1BB抗體之重鏈之可變區、(5)4-1BB抗體之一或多個CDR(二、三、四、五或六個CDR)、或(6)來自4-1BB抗體之輕鏈的三個CDR及重鏈的三個CDR。
在一些特定實施態樣中，本發明提供選自下列抗體之抗原結合片段：MOR-6032、MOR-7361、MOR-7480、MOR-7480.1、MOR-7480.2、MOR-7483、MOR-7483.1、或MOR-7483.2。
在一些其他特定實施態樣中，4-1BB抗體之抗原結合片段包括：(i)Fab片段，其係由VL、VH、CL及CH1結構域組成之單價片段；(ii)F(ab')2片段，其係包含二個由絞鏈區之雙硫鍵連接之Fab片段之雙價片段；(iii)由VH及CH1結構域組成之Fd片段；(iv)由抗體單臂之VL及VH結構域組成之Fv片段；(v)dAb片段(Ward et al.,(1989)Nature 341：544-546)，其係由VH結構域組成；(vi)經分離之CDR；及(vii)單鏈抗體(scFv)，其係包含與抗體之VH區連接之抗體之VL區的多肽。Bird et al.,(1988)Science 242：423-426及Huston et al.,(1988)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 85：5879-5883。
在一些特定實施態樣中，該抗原結合片段係選自Fab- 6032、Fab-7361、Fab-7480及Fab-7483之Fab片段。
B-3. 抗體衍生物
在一些其他態樣中，本發明提供由本揭示內容所提供之4-1BB抗體中之任一者之衍生物。
在一態樣中，該抗體衍生物係衍生自本發明之示例性抗體(「母體抗體」)之胺基酸序列之修飾，同時保存該母體抗體胺基酸序列之整體分子結構。該母體抗體鏈之任何區域的胺基酸序列可經修飾，諸如骨架區、CDR區或恆定區。修飾之類型包括取代、***、刪除該母體抗體之一或多個胺基酸、或彼等之組合。在一些實施態樣中，該抗體衍生物包含與SEQ ID NO：4、18、32、或43中任一者所示之胺基酸序列具有至少65%、至少75%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%一致性之VH區。在一些其他實施態樣中，該抗體衍生物包含與SEQ ID NO：9、23、37、45、51、56、60或64中任一者所示之胺基酸序列具有至少65%、至少75%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%一致性之VL區。在一些特定實施態樣中，該衍生物包含1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、或15個保守性或非保守性取代、及/或1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、或15個添加及/或刪除如SEQ ID NO：4、18、32、43、9、23、37、45、51、56、60、或64之任一者所 示之胺基酸序列。
胺基酸取代包含保守性取代及非保守性取代二者。用語「保守性胺基酸取代」係指以另一胺基酸取代一個胺基酸，其中該二個胺基酸在某些物理化學性質上具有類似性，諸如極性、帶電性、可溶性、疏水性、親水性、及/或該相關殘基之兩親性。舉例來說，取代通常在下列各種類組中進行：(a)非極性(疏水性)胺基酸，諸如丙胺酸、白胺酸、異白胺酸、纈胺酸、脯胺酸、***酸、色胺酸及甲硫胺酸；(b)極性中性胺基酸，諸如甘胺酸、絲胺酸、蘇胺酸、半胱胺酸、酪胺酸、天冬醯胺酸及麩醯胺酸；(c)帶正電(鹼性)胺基酸，諸如精胺酸、離胺酸、及組胺酸；及(d)帶負電(酸性)胺基酸，諸如天冬胺酸及麩胺酸。
該等修飾可發生在該抗體之胺基酸序列的任何位置，包括CDR、骨架區或恆定區。在一實施態樣中，本發明提供一種包含本發明之示例性抗體之VH及VL CDR序列，但包含與該示例性抗體不同之骨架序列之抗體衍生物。該等骨架序列可得自公眾DNA資料庫或包括種系抗體基因序列之公開參考文獻。舉例來說，人重鏈及輕鏈可變區基因之種系DNA序列可見於Genbank資料庫或VBase人種系序列資料庫(Kabat,E.A.,et al.,Sequences of Proteins of Immunological Interest,Fifth Edition,U.S.Department of Health and Human Services,NIH Publication No.91-3242(1991)；Tomlinson,I.M.,et al.,J.Mol.Biol.227：776-798(1992)；及Cox,J.P.L.et al.,Eur.J.Immunol. 24：827-836(1994))。可被用於建構抗體衍生物之骨架序列包括該些結構上類似本發明之示例性抗體所使用之骨架序列者，例如類似本發明之示例性抗體所使用之VH 3-23骨架序列及/或VL λ3或λ1-13骨架序列。舉例來說，示例性抗體之H-CDR1、H-CDR2及H-CDR3序列及L-CDR1、L-CDR2及L-CDR3序列可被移植至與該骨架序列所源自之種系免疫球蛋白基因具有相同序列之骨架區，或該等CDR序列可被移植至相較於該等種系序列包含一或多個突變之骨架區。
在特定實施態樣中，該抗體衍生物係包含本發明之示例性抗體之胺基酸序列的嵌合性抗體。在一實例中，一或多個來自一或多個示例性人抗體之CDR係與來自非人動物諸如小鼠或大鼠之抗體的CDR組合。在另一實例中，該嵌合抗體之所有CDR係源自一或多個示例性抗體。在一些特定實施態樣中，該嵌合抗體包含一、二、或三個來自示例性抗體之重鏈可變區或輕鏈可變區之CDR。嵌合抗體可利用該領域已知之習知方法製備。
另一類型之修飾係使VH及/或VL鏈之CDR1、CDR2及/或CDR3區內之胺基酸殘基突變。可進行定點突變形成或PCR媒介之突變形成以導入突變，其對抗體結合或其他受到關注之功能特性之影響可在該領域已知之活體外或活體內試驗中評估。通常導入保守性取代。該等突變可為胺基酸添加及/或刪除。另外，通常不改變超過一、二、三、四或五個CDR區內之殘基。在一些實施態樣 中，該抗體衍生物包含H-CDR及/或輕鏈CDR中之1、2、3、或4個胺基酸取代。在另一實施態樣中，該胺基酸取代係將抗體中之一或多個半胱胺酸變成另一殘基，諸如但不限於丙胺酸或絲胺酸。該半胱胺酸可為典型或非典型半胱胺酸。在一實施態樣中，該抗體衍生物在H-CDR區相較於示例性抗體之胺基酸序列具有1、2、3、或4個保守性胺基酸取代。
修飾亦可發生於該VH及/或VL區內之骨架殘基。通常，該等骨架變異體係經產生以減少該抗體之免疫原性。一種方法係「回復突變」一或多個骨架殘基為該對應之種系序列。經歷體突變之抗體可能包含與該抗體所源自之種系序列不同之骨架殘基。該等殘基可藉由比較該抗體骨架序列與該抗體所源自之種系序列加以識別。為了使該骨架區序列回復成彼等之種系構形，該等體突變可藉由例如定點突變形成或PCR媒介之突變形成被「回復突變」成該種系序列。本發明之一些示例性抗體產生該等「回復突變」成某些種系序列，如實施例6中進一步描述。
此外，修飾亦可在示例性抗體之Fc區內產生，通常是為了改變該抗體之一或多種功能特性，諸如血清半衰期、補體固定、Fc受體結合、及/或抗原依賴性細胞性細胞毒性。在一例中，CH1之絞鏈區係經修飾以使該絞鏈區中之半胱胺酸殘基之數量改變，例如增加或減少。此方法係進一步描述於美國專利第5,677,425號。在CH1之絞鏈區中的半胱胺酸殘基之數量係經改變以例如促進該輕鏈與 重鏈之組合，或增加或減少該抗體之穩定性。在另一例中，抗體之Fc絞鏈區係經突變以減少該抗體之生物半衰期。
另外，本發明之抗體可被修飾以改變彼之潛在糖基化位置或模式。二種示例性抗體MOR-7480及MOR-7483、和彼等之任何種系變異體、以及包含MOR-7480及MOR-7483之重鏈可變區之胺基酸序列之抗體包含在該重鏈可變結構域之天冬醯胺酸59處之潛在N-連接糖基化位點(NYS)。這些抗體之IgG版本另包含在該重鏈Fc結構域中之第二N-連接糖基化位點。更特定地，以這些抗體之IgG2版本而言，該Fc N-連接之糖基化位點(NST)發生在該重鏈CH2結構域之天冬醯胺酸292處。因此，各重鏈可包含0-、1-(在Fab處或Fc處)或2-聚糖佔據，以使包含二條重鏈及二條輕鏈之抗體可包含介於0-聚糖佔據(即四個潛在糖基化位點之任一者皆無糖基化)至4-聚糖佔據(即各鏈之Fab及Fc二個位點皆經糖基化)之任何組合。在另一態樣中，本發明提供本發明之4-1BB抗體之衍生物，其包含在輕鏈或重鏈可變區之至少一種突變，該突變改變該可變區中之糖基化模式。該抗體衍生物可能具有增加之親和性及/或經修飾之與抗原結合之特異性。該等突變可能添加新的糖基化位點至該V區、改變一或多個V區糖基化位點之位置，或移除原先存在之V區糖基化位點。在一實施態樣中，本發明提供在重鏈可變區之天冬醯胺酸59處具有潛在N-連接之糖基化位點之4-1BB抗體之 衍生物，其中在一個重鏈可變區之潛在N-連接糖基化位點係經移除。在另一實施態樣中，本發明提供在重鏈可變區之天冬醯胺酸59處具有潛在N-連接之糖基化位點之4-1BB抗體之衍生物，其中在二個重鏈可變區之潛在N-連接糖基化位點係經移除。改變抗體之糖基化模式之方法係該領域所知，諸如該些於美國專利第6,933,368號所述者，彼之揭示內容係以參照方式納入此處。
在另一態樣中，本發明提供一種抗體衍生物，其包含與額外之分子實體連接之如此處所述之4-1BB抗體或彼之抗原結合片段。額外之分子實體實例包括醫藥劑、肽或蛋白質、偵測劑、偵測標記及抗體。
在一些實施態樣中，該抗體衍生物包含與醫藥劑連接之本發明之抗體。醫藥劑之實例包括細胞毒性劑或其他癌治療劑及放射性同位素。細胞毒性劑之特定實例包括紫杉醇(taxol)、細胞鬆弛素B、短桿菌素D、溴化乙啶、吐根鹼、絲裂黴素、依妥普賽(etoposide)、替尼泊苷(tenoposide)、長春新鹼(vincristine)、長春鹼(vinblastine)、秋水仙鹼(colchicin)、多柔比星(doxorubicin)、正定黴素(daunorubicin)、二羥基蒽二酮、雙羥葱醌(mitoxantrone)、光輝黴素(mithramycin)、放線菌素D、l-去氫睪固酮、糖皮質素、普魯卡因、四卡因、利多卡因(lidocaine)、普壓律(propranolol)、嘌呤黴素(puromycin)及彼等之類似物或同源物。治療劑亦包括例如抗代謝劑(例如甲胺喋呤(methotrexate)、6-巰基嘌呤、6-硫鳥嘌呤、阿糖胞苷、5- 氟尿嘧啶、達卡巴仁)、烷化劑(例如雙氯乙基甲胺、噻替派、氯芥苯丁酸、黴法蘭、卡氮芥(BSNU)及羅氮芥(CCNU)、環磷醯胺、白消安(busulfan)、二溴甘露醇、鏈脲佐菌素、絲裂黴素C、及順-二氯二胺鉑(II)(DDP)順鉑)、蒽環類(例如正定黴素(舊稱道諾黴素(daunomycin))及多柔比星(doxorubicin))、抗生素(例如達克黴素(dactinomycin)(舊稱放線菌素)、博來黴素(bleomycin)、光輝黴素(mithramycin)、及安曲黴素(anthramycin)(AMC))、及抗有絲***劑(例如長春新鹼(vincristine)及長春鹼(vinblastine))。可與抗體共軛以用於診斷或治療之放射性同位素之實例包括但不限於碘131、銦111、釔90及鎦177。用於連接抗體與醫藥劑之方法係該領域所知，諸如使用各種連接子技術。連接子類型之實例包括腙(hydrazones)、硫醚、酯、二硫化物及含肽連接子。有關連接子及用於連接治療劑至抗體之方法之進一步討論亦可見Saito et al.,Adv.Drug Deliv.Rev.55：199-215(2003)；Trail,et al.,Cancer Immunol.Immunother.52：328-337(2003)；Payne,Cancer Cell 3：207-212(2003)；Allen,Nat.Rev.Cancer 2：750-763(2002)；Pastan,I.and Kreitman,Curr.Opin.Investig.Drugs 3：1089-1091(2002)；Senter,P.D.and Springer,C.J.(2001)Adv.Drug Deliv.Rev.53：247-264。
在一特定態樣中，該抗體衍生物係4-1BB抗體多體，其係4-1BB抗體之多聚形式，諸如抗體二聚體、三聚體或單體抗體之高階多體。在抗體多體中之個別單體可相同或 不同。此外，在多體內之個別抗體可具有相同或不同之結合特異性。抗體之多聚化可經由抗體之天然聚集達成。舉例來說，某些比例之經純化之抗體製劑(例如經純化之IgG1分子)自然地形成含有抗體同型二聚體及其他高階抗體多聚物之蛋白質聚集物。或者，抗體同型二聚體可經由該領域已知之化學鍵結技術形成，諸如經由使用交聯劑。適當之交聯劑包括具有由適當間隔子分開之二個不同之反應基之雜雙官能基者(諸如m-順丁烯二醯亞胺基苯甲醯基-N-羥基琥珀醯亞胺酯、琥珀醯亞胺基4-(順丁烯二醯亞胺基甲基)環己烷-1-羧酸酯、及N-琥珀醯亞胺基S-乙醯硫-乙酸酯)或同雙官能基者(諸如二琥珀醯亞胺基辛二酸酯)。該等連接子可自商業途徑獲得，例如購自伊利諾州羅克福市(Rockford,IL)皮爾斯(Pierce)化學公司。抗體亦可經由該領域已知之重組DNA技術加以多聚化。
其他由本發明所提供之抗體衍生物之實例包括單鏈抗體、雙價抗體、結構域抗體、奈米抗體及單抗體(unibodies)。「單鏈抗體」(scFv)係由包含與VH結構域連接之VL結構域之單一多肽鏈組成，其中VL結構域及VH結構域係經配對以形成單價分子。單鏈抗體可利用該領域已知之方法製備(見例如Bird et al.,(1988)Science 242：423-426及Huston et al.,(1988)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 85：5879-5883)。「雙價抗體」係由二鏈組成，各鏈包含在相同多肽鏈上由短肽連接子所連接之重鏈可變區及輕鏈可變區，其中在該相同鏈上之二區不互相配對，但與另一鏈上 之互補結構域配對以形成雙特異性分子。製備雙價抗體之方法係該領域所知(見例如Holliger P.et al.,(1993)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 90：6444-6448及Poljak R.J.et al.,(1994)Structure 2：1121-1123)。結構域抗體(dAbs)係抗體之小型功能性結合單位，其對應抗體之重鏈或輕鏈之可變區。結構域抗體可在細菌、酵母菌及哺乳動物細胞系統中表現。其他有關結構域抗體之詳細資訊及產製方法係該領域所知(見例如美國專利第6,291,158、6,582,915、6,593,081、6,172,197、6,696,245號、歐洲專利第0368684及0616640號、WO05/035572、WO04/101790、WO04/081026、WO04/058821、WO04/003019及WO03/002609)。奈米抗體係源自抗體之重鏈。奈米抗體通常包含一個可變結構域及二個恆定結構域(CH2及CH3)且維持該原始抗體之抗原結合能力。奈米抗體可利用該領域已知之方法製備(見例如美國專利第6,765,087號、美國專利第6,838,254號、WO 06/079372)。單抗體係由IgG4抗體之一條輕鏈及一條重鏈組成。單抗體可藉由移除IgG4抗體之絞鏈區加以製備。有關單抗體之其他細節及製備方法可見WO2007/059782。
C. 產製4-1BB抗體之核酸、載體、宿主細胞及重組方法
本發明之另一態樣提供經分離之核酸分子，其包含編碼本發明所提供之結合分子之胺基酸序列的核苷酸序列。由該核苷酸序列所編碼之胺基酸序列可為抗體之任何部 分，諸如CDR、包含一、二、或三個CDR之序列、重鏈之可變區、輕鏈之可變區，或可為全長重鏈或全長輕鏈。本發明之核酸可為例如DNA或RNA，且可包含或不包含內含子序列。通常，該核酸係cDNA分子。
在一些實施態樣中，本發明提供經分離之核酸分子，該分子包含編碼選自下列之胺基酸序列之核苷酸序列，或由該核苷酸序列組成：(1)示例性抗體之H-CDR3或L-CDR3之胺基酸序列；(2)示例性抗體之重鏈可變區或輕鏈可變區；或(3)示例性抗體之全長重鏈或全長輕鏈。
在其他實施態樣中，該核酸分子包含編碼如SEQ ID NO：1至10、15至24、29至38、43、44、45、46、51、52、55至57、60、61、64、及65中任一者所示之胺基酸序列之核苷酸序列或由該核苷酸序列組成。
在又其他實施態樣中，該核酸分子包含選自SEQ ID NO：11至14、25至28、39至42、47至50、53、54、58、59、62、63、66或67之核苷酸序列或由該核苷酸序列組成。
本發明之核酸可利用任何適當之分子生物學技術獲得。以雜交瘤表現之抗體而言，編碼由該雜交瘤所產製之抗體的輕鏈及重鏈之cDNA可藉由PCR擴增或cDNA選殖技術獲得。以得自免疫球蛋白基因庫之抗體而言(例如使用噬菌體展示技術)，編碼該抗體之核酸可自該庫獲得。
編碼VH區之經分離之DNA可藉由可操作地連接該 VH編碼DNA與另一編碼重鏈恆定區(CH1、CH2及CH3)之DNA分子以轉換成全長重鏈基因。人重鏈恆定區基因之序列係該領域所知(見例如Kabat et al.(1991)Sequences of Proteins of Immunological Interest,Fifth Edition,U.S.Department of Health and Human Services,NIH Publication No.91-3242)且包含該些區之DNA片段可藉由標準PCR擴增獲得。該重鏈恆定區可為IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA、IgE、IgM或IgD恆定區，但最佳者為IgG1或IgG4恆定區。IgG1恆定區序列可為任何已知發生在不同個體之各種等位基因或同種異型，諸如Gm(1)、Gm(2)、Gm(3)及Gm(17)。該些同種異型代表在IgG1恆定區中天然發生之胺基酸取代。就Fab片段重鏈基因而言，該VH編碼DNA可與另一僅編碼重鏈CH1恆定區之DNA分子可操作地連接。
編碼VL區之經分離之DNA可藉由可操作地連接該VL編碼DNA與另一編碼輕鏈恆定區(CL)之DNA分子以轉換成全長輕鏈基因(或Fab輕鏈基因)。人輕鏈恆定區基因之序列係該領域所知(見例如Kabat et al.(1991)Sequences of Proteins of Immunological Interest,Fifth Edition,U.S.Department of Health and Human Services,NIH Publication No.91-3242)且包含該些區之DNA片段可藉由標準PCR擴增獲得。該輕鏈恆定區可為κ或λ恆定區。
為了產生scFv基因，該VH及VL編碼DNA片段係與 編碼可彎折之連接子例如編碼胺基酸序列(Gly4-Ser)3之另一片段可操作地連接，以使該VH及VL序列可被表現為連續性單鏈蛋白質，其中該VL及VH區係以可彎折之連接子連接(見例如Bird et al.,Science 242：423-426(1988)；Huston et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 85：5879-5883(1988)；及McCafferty et al.,Nature 348：552-554(1990))。
本發明另提供載體，其包含由本發明所提供之核酸分子。該核酸分子可編碼輕鏈或重鏈之一部分(諸如CDR或可變區)、全長輕鏈或重鏈、包含一部分或全長重鏈或輕鏈之多肽、或抗體衍生物或抗原結合片段之胺基酸序列。在一些實施態樣中，該載體係可用於表現結合分子，諸如抗體或彼之抗原結合片段之表現載體。
為了表現本發明之結合分子，編碼部分或全長輕鏈及重鏈之DNA被***表現載體，以使該DNA分子與轉錄及轉譯控制序列可操作性連接。在此上下文中，用語「可操作性連接」係指抗體基因與載體連接以使該載體內之轉錄及轉譯控制序列得以進行彼等之調節該DNA分子之轉錄及轉譯之預定功能。該表現載體及表現控制序列係經選擇以和所使用之表現宿主細胞相容。該抗體輕鏈基因及抗體重鏈基因可被***分開之載體中，或更典型地，二個基因被***相同之表現載體中。該等抗體基因係藉由任何適當之方法被***表現載體中(例如連接該抗體基因片段及載體上之互補限制位點，或若無限制位點存在則以鈍端連 接)。本發明所描述之抗體的輕鏈及重鏈可變區可被用於產製任何抗體同型及亞型之全長抗體基因，其係藉由將它們***已經編碼該所欲同型及亞型之重鏈恆定區及輕鏈恆定區之表現載體中，以使該VH區係與該載體內之CH區可操作性連接且該VK區係與該載體內之CL區可操作性連接。此外或可選地，該重組表現載體可編碼有利於該抗體鏈自宿主細胞分泌之信號肽。該抗體鏈基因可被選殖至該載體中，以使該信號肽被符合讀框地連接至該抗體鏈基因之胺基端。該信號肽可為免疫球蛋白信號肽或異源性信號肽(即來自非免疫球蛋白之蛋白質的信號肽)。
除了抗體鏈基因之外，本發明之表現載體通常攜帶控制該抗體鏈基因在宿主細胞中表現之調節序列。用語「調節序列」係意圖包括啟動子、增強子及其他控制該抗體鏈基因之轉錄或轉譯之表現控制元件(例如聚腺苷酸化信號)。該等調節序列係描述於例如Goeddel(Gene Expression Technology.Methods in Enzymology 185,Academic Press,San Diego,CA(1990))。該領域之技藝人士將了解，該表現載體之設計(包括調節序列之選擇)可視諸如將被轉形之宿主細胞之選擇、所欲蛋白質之表現量等因子而定。用於哺乳動物宿主細胞表現之調節序列之實例包括引導在哺乳動物細胞內高量之蛋白質表現之病毒元件，諸如衍生自巨細胞病毒(CMV)、猿猴病毒40(SV40)、腺病毒(例如腺病毒主要晚期啟動子(AdMLP))及多瘤病毒之啟動子及/或增強子。或者，可使用非病毒性調節序 列，諸如泛素啟動子或β-球蛋白啟動子。另外，調節元件係由來自不同來源之序列組成，諸如SR啟動子系統，其包含來自SV40早期啟動子及第一型人T細胞白血病病毒之長末端重複之序列(Takebe,Y.et al.(1988)Mol.Cell.Biol.8：466-472)。
除了抗體鏈基因及調節序列之外，表現載體可攜帶額外之序列，諸如調節該載體在宿主細胞內之複製之序列(例如複製起點)及可選擇之標誌基因。該可選擇之標誌基因有利於已被導入該載體之宿主細胞之篩選(見例如美國專利第4,399,216、4,634,665及5,179,017號，發明人皆為Axel et al.)。舉例來說，通常該可選擇之標誌基因授予已被導入該載體之宿主細胞對藥物之抗藥性，諸如G418、潮黴素或甲胺喋呤。可選擇之標誌基因包括二氫葉酸還原酶(DHFR)基因(用於以甲胺喋呤篩選/擴增之dhfr-宿主細胞)及neo基因(用於G418篩選)。
以輕鏈及重鏈之表現而言，編碼該重鏈及輕鏈之表現載體係藉由任何適當技術轉染至宿主細胞中。用語「轉染」之各種形式係意圖包含各式各樣之經常用於導入外源性DNA至原核或真核宿主細胞之技術，例如電穿孔、磷酸鈣沉澱、DEAE-葡聚糖轉染及類似者。雖然在原核或真核宿主細胞中表現本發明之抗體皆有可能，但通常係在真核細胞尤其是哺乳動物宿主細胞中表現抗體。
本發明另提供宿主細胞，其包含由本發明所提供之核酸分子。該宿主細胞幾乎可為任何可使用表現載體之細 胞。其可為例如高等真核宿主細胞(諸如哺乳動物細胞)、低等真核宿主細胞(諸如酵母菌細胞)，亦可為原核細胞(諸如細菌細胞)。導入重組核酸建構體至宿主細胞內可藉由磷酸鈣轉染、DEAE、葡聚糖媒介之轉染、電穿孔或噬菌體感染達成。
可被轉形之適當原核宿主包括大腸桿菌(E.coli)、枯草桿菌(Bacillus subtilis)、鼠傷寒沙門氏菌(Salmonella typhimurium)及在假單胞菌屬、鏈黴菌屬、及葡萄球菌屬內之各種菌種。
用於表現本發明之結合分子之哺乳動物宿主細胞包括例如中國倉鼠卵巢(CHO)細胞(包括dhfr-CHO細胞(描述於Urlaub and Chasin,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 77：4216-4220(1980))，其係與DHFR可選擇性標誌一起使用(例如於Kaufman and Sharp,J.Mol.Biol.159：601-621(1982)中所述))、NS0骨髓瘤細胞、COS細胞及Sp2細胞。特別是用於NS0骨髓瘤或CHO細胞時，另一表現系統係WO 87/04462、WO 89/01036及EP 338,841所揭示之GS(麩醯胺酸合成酶)基因表現系統。當編碼抗體基因之表現載體被導入哺乳動物宿主細胞內時，該抗體係藉由培養該宿主細胞一段足夠的時間，以允許該抗體於宿主細胞內表現或分泌該抗體至該宿主細胞所生長之培養基中加以產製。抗體可利用任何適當之蛋白質純化方法自該培養基收集。
D. 組成物
在其他態樣中，本發明提供一種包含本發明之結合分子之組成物。在一態樣中，該組成物係包含結合分子及醫藥上可接受之載劑之醫藥組成物。該等組成物可利用該領域已知之習知方法製備。
用語「醫藥組成物」及「醫藥調製劑」係指包含如此處所述之該等結合分子之任一者、該等抗體之任一者、彼等之抗原結合部分之任一者、或彼等之衍生物與一或多種視製備該用於有效遞送該結合分子之劑型所需之醫藥上可接受之賦形劑、稀釋劑或載劑之組成物。
在一些實施態樣中，本發明提供一種包含本發明之抗體或彼之抗原結合部分及醫藥上可接受之載劑之組成物，其中該抗體或抗原結合部分包含可變結構域，該可變結構域包含如SEQ ID NO：30所示之CDR胺基酸序列，且其中相較於存在於該組成物中之抗體或彼之抗原結合部分之總量，該組成物包含不超過約11%、10%、8%、5%、3%、或2%之該抗體或抗原結合部分在該胺基酸序列之天冬醯胺酸處係經糖基化。在另一實施態樣中，相較於存在該組成物中之抗體或彼之抗原結合部分之總量，該組成物包含至少約2%之該抗體或抗原結合部分在該SEQ ID NO：30之胺基酸序列之天冬醯胺酸處係經糖基化。
此處所使用之用語「賦形劑」係指用於調製活性醫藥成分於醫藥調製劑中之物質；在較佳之實施態樣中，賦形劑不降低或干擾該活性醫藥成分之主要治療效應。較佳地，賦形劑係治療惰性。用語「賦形劑」包含載劑、稀釋劑、載 具、助溶劑、穩定劑、增量劑、酸性或鹼性pH調整劑及結合劑。賦形劑亦可為該些因為製造過程之間接或非故意結果而存在於醫藥調製劑中之物質。較佳地，賦形劑係經核准用於人及動物投藥或被認為可安全用於人及動物投藥，即GRAS物質(通常認為是安全)。美國食品藥物管理局將GRAS物質列於聯邦法規(CFR)之21 CFR 182及21 CFR 184，以參照方式納入本發明。
用語「醫藥上可接受之載劑」係指任何適合用於調製劑中以遞送結合分子之非活性物質。載劑可為抗黏著劑、結合劑、包覆劑、崩解劑、填料或稀釋劑、保存劑(諸如抗氧化劑、抗細菌劑、或抗真菌劑)、甜味劑、吸收延緩劑、潤濕劑、乳化劑、緩衝劑及該類似物。適當醫藥上可接受之載劑之實例包括水、乙醇、多元醇(諸如甘油、丙二醇、聚乙二醇、及類似者)、葡萄糖、植物油(諸如橄欖油)、鹽水、緩衝劑、經緩衝之鹽水、及等滲劑諸如糖、多醇、山梨醇及氯化鈉。
用語「緩衝劑」係指醫藥上可接受之賦形劑，其穩定醫藥製劑之pH。適當緩衝液係該領域廣為周知，可見於文獻中。舉例來說，可使用組胺酸緩衝液、甘胺酸緩衝液、tris緩衝液、醋酸緩衝液、及/或彼等之個別游離酸或鹼，以及各種鹽之混合物及/或彼等之酸及鹼。在特定實施態樣中，緩衝液係組胺酸緩衝液，即具有組胺酸(通常是L-組胺酸)作為緩衝劑之緩衝液。特定緩衝液係L-組胺酸/HCl緩衝液，其包含L-組胺酸、L-組胺酸鹽酸鹽或L-組 胺酸及L-組胺酸鹽酸鹽之混合物。該L-組胺酸緩衝液通常係以約0.05mg/ml至約10mg/ml、約0.1mg/ml至約5mg/ml、或約0.5mg/ml至約1mg/ml之濃度使用。該L-組胺酸鹽酸鹽緩衝液通常係以約0.1mg/ml至約10mg/ml、約1mg/ml至約5mg/ml、或約2mg/ml至約4mg/ml之濃度使用。
不論所使用之緩衝液為何，該pH可利用該領域已知之酸或鹼調整至介於約4.0至約7.0、或約5.0至約6.0之值，例如鹽酸、醋酸、磷酸、硫酸、檸檬酸、氫氧化鈉及氫氧化鉀。
在一態樣中，本發明關於一種醫藥組成物，其包含：0.1至1mg/ml之L-組胺酸；1至5mg/ml之L-組胺酸鹽酸鹽；50至100mg/ml之海藻糖去水物；0.01至0.1mg/mL之乙二胺四乙酸二鈉二水合物；及0.05至1mg/mL之聚山梨醇酯80；pH介於4.0至7.0。
在特定實施態樣中，本發明之組成物所包含之結合分子之濃度係介於約10至約22mg/ml。
在另一特定實施態樣中，本發明之組成物所包含之緩衝劑係組胺酸緩衝液(例如L-組胺酸/HCl緩衝液)、或醋酸緩衝液或醋酸鈉緩衝液。在特定實施態樣中，該緩衝劑係L-組胺酸/HCl。
在特定實施態樣中，該緩衝液之濃度係約0.1mM至約50mM，或自1mM至約25mM。
本發明之組成物之pH可選自下列範圍：3至10，或 4至9。在特定實施態樣中，該緩衝劑提供5.0至6.0或5.5±0.3之pH。例行性調整在這些範圍以內或以外之pH可能是改善該組成物之多肽或其他成分之溶解性或穩定性所必須。
在一實施態樣中，該組成物包含聚山梨醇酯，例如聚山梨醇酯20或聚山梨醇酯80。在特定實施態樣中，該聚山梨醇酯80之濃度係0.01至10mg/ml、0.5至5mg/ml或0.1至0.5mg/ml。
在一實施態樣中，本發明之組成物所包含之至少一種穩定劑係選自鹽類(例如氯化鈉)、醣類(諸如海藻糖二水化物或蔗糖)或胺基酸(諸如精胺酸鹽酸鹽)。在特定實施態樣中，至少一種穩定劑之濃度係10至200mg/ml、20至150mg/ml或50至100mg/ml。
此處所使用之用語「螯合劑」通常指可與金屬離子形成至少一個鍵結(例如共價鍵、離子鍵或其他鍵結)之賦形劑。螯合劑通常係多齒配體，其可被用於經選擇之液體組成物以作為與可能增進不穩定性之物種錯合之穩定劑。通常，可作為螯合劑之化合物將具有多電子之官能基。適當之多電子官能基包括羧酸基團、羥基及胺基。這些基團於胺基多羧酸、羥基多羧酸、羥基胺基羧酸及類似者中之排列導致具有與金屬結合之能力之基團。
然而，本發明並不意圖限制於主要藉由螯合劑與金屬離子形成鍵結之能力以增進抗體穩定性之螯合劑。因此，本發明並不意圖受到該螯合劑穩定本發明之組成物之特定 機轉之限制，在本發明中稱為螯合劑之賦形劑主要可經由和該螯合劑與金屬離子形成鍵結之能力完全無關之機轉達成彼等之抗體穩定性增進特性。
適合用於本發明之螯合劑包括但不限於胺基多羧酸、羥基胺基羧酸、N-取代之甘胺酸、2-(2-胺基-2-側氧基乙基)胺基乙磺酸(BES)、去鐵胺(DEF)、檸檬酸、菸鹼醯胺及去氧膽酸鹽。適當之胺基多羧酸之實例包括乙二胺四乙酸(EDTA)、二乙烯三胺五乙酸(DTPA)、氮三乙酸(NTA)、N-2-乙醯胺基-2-亞胺基二乙酸(ADA)、雙(胺基乙基)醇醚、N,N,N',N'-四乙酸-(EGTA)、反式-環己二胺四乙酸(DCTA)、麩胺酸及天冬胺酸。適當之羥基胺基羧酸之實例包括N-羥基乙基亞胺基二乙酸(HIMDA)、N,N-雙-羥基乙基甘胺酸(bicine)及N-(三羥基甲基甲基)甘胺酸(tricine)。適當之N-取代之甘胺酸之實例係甘胺醯基甘胺酸。適當之去氧膽酸鹽之實例係去氧膽酸鈉。
用於本發明之螯合劑若可能的話可以該化合物之游離酸或游離鹼形式(例如在此處可互相交換地稱為乙二胺四乙酸(EDTA)或乙二胺四乙酸鹽(edetate))或以對應之鹽形式(例如該對應之酸添加鹽或鹼添加鹽諸如乙二胺四乙酸二鈉)存在。適當之酸添加鹽例如包括鹼金屬鹽(例如鈉鹽或鉀鹽)、鹼土金屬鹽(例如鈣)及鹽類可利用其他微弱結合之金屬離子製備。如該領域所知，該鹽之性質及所欲中和之電荷數量將依該存在之羧基數量以及該供應之穩定性螯合劑之pH而定。該領域中亦知的是，螯合劑以不同強度 與特定標靶離子結合。進一步說明，適當之EDTA之鹽包括乙二胺四乙酸二鉀、乙二胺四乙酸二鈉、乙二胺四乙酸二鈉鈣、乙二胺四乙酸鈉、乙二胺四乙酸三鈉、及乙二胺四乙酸鉀；適當之去鐵胺(DEF)之鹽係去鐵胺甲磺酸鹽(DFM)。
用於本發明之螯合劑可以該化合物或對應鹽之脫水、溶劑合或水合形式存在。當該螯合劑係以溶劑合或水合形式存在時，其可以各種溶劑合或水合之狀態存在(包括例如脫水、水合、二水合及三水合形式)。進一步說明，適當之EDTA之水合物係EDTA二鈉二水合物。在一實施態樣中，該EDTA二鈉二水合物之濃度係0.001至5mg/ml、0.01至2mg/ml或0.02至0.5mg/ml。在另一實施態樣中，該螯合劑可減少或預防此處所述之組成物中之抗體聚集。該等螯合劑可減少或預防抗體之降解，該抗體係在無螯合劑保護下調製。
醫藥組成物通常可根據特定所欲之投予途徑設計。多種投予化合物之技術存在於該領域，包括但不限於經口、氣霧、非經腸及局部投予。該等組成物可呈任何適當之形式，諸如液體、半固體及固體劑型。液體劑型之實例包括溶液(例如注射及輸注溶液)、微乳化液、脂質體、分散液或懸浮液。固體劑型之實例包括錠劑、丸劑、膠囊、微膠囊及粉劑。適合用於遞送結合分子之組成物特定形式係用於注射或輸注之無菌液體，諸如溶液、懸浮液或分散液。無菌溶液可藉由將該所需量之抗體併入適當之載劑中，接 著藉由滅菌微過濾加以製備。通常，製備分散液係藉由將該抗體併入含有基本之分散媒質和其他載體之無菌載劑中。對於供製備無菌液體之無菌粉末而言，製備之方法包括真空乾燥和冷凍乾燥(凍乾)以自彼等之先前經無菌過濾之溶液產生活性成分連同任何額外所欲之成分之粉末。該等組成物之各種劑型可利用該領域已知之習知技術製備。
包含在組成物中之結合分子之相對量將依多項因子決定，諸如所使用之特定結合分子及載劑、劑型，及所欲之釋放及藥物藥效學特徵。在一實施態樣中，該組成物包含結合分子，其中該結合分子之濃度介於1至100mg/ml、介於5至50mg/ml，或介於10至22mg/ml。在單一劑型中之結合分子之量通常將為產生治療效應之量，但也可能是較少之量。通常，此量將介於相對於該劑型之總重量之約0.01%至約99%、自約0.1%至約70%，或自約1%至約30%。
除了該結合分子之外，一或多種額外之治療劑可被包括於該組成物中。額外治療劑之實例係於下描述。將被包括於該組成物中之額外治療劑之適當量可由該領域之技藝人士輕易選擇，且將依許多因子而定，諸如所使用之特定劑及載劑、劑型，及所欲之釋放及藥物藥效學特徵。在單一劑型中所包含之額外治療劑之量通常將為產生治療效應之該劑之量，但也可能是較少之量。
E. 該結合分子及醫藥組成物之用途
本發明所提供之結合分子及醫藥組成物可用於治療、診斷或其他目的，諸如增進免疫反應、治療癌、增進其他癌治療之療效、增進疫苗療效或治療自體免疫性疾病。因此，在其他態樣中，本發明提供使用該結合分子或醫藥組成物之方法。在一態樣中，本發明提供治療哺乳動物之疾病之方法，該方法包含對需要治療之哺乳動物投予治療有效量之本發明之結合分子。該結合分子可為4-1BB促效劑或拮抗劑。在一些實施態樣中，該結合分子係4-1BB促效劑。在一些實施態樣中，該哺乳動物係人。
在一些實施態樣中，該疾病係癌。多種與4-1BB有關之癌(不論是惡性或良性及不論是原發性或繼發性)可利用本發明所提供之方法治療或預防。該等癌之實例包括肺癌諸如支氣管癌(例如鱗狀細胞癌、小細胞癌、大細胞癌及腺癌)、肺泡細胞癌、支氣管腺瘤、軟骨瘤性錯構瘤(非癌性)及肉瘤(癌性)；心臟癌諸如黏液瘤、纖維瘤及橫紋肌肉瘤；骨癌諸如骨軟骨瘤、軟骨瘤、軟骨胚細胞瘤、軟骨黏液纖維瘤、骨樣骨瘤、巨細胞腫瘤、軟骨肉瘤、多發性骨髓瘤、骨肉瘤、纖維肉瘤、惡性纖維組織細胞瘤、尤因氏(Ewing's)腫瘤(尤因氏肉瘤)、及網狀細胞肉瘤；腦癌諸如神經膠質瘤(例如多形神經膠母細胞瘤)、退行性星狀細胞瘤、星狀細胞瘤、寡樹突細胞瘤、神經管胚細胞瘤、脊索瘤、神經鞘瘤、室管膜瘤、腦脊髓膜瘤、腦下垂體腺瘤、松果體瘤、骨瘤、血管母細胞瘤、顱咽管瘤、脊索瘤、胚細胞瘤、畸胎瘤、皮樣囊腫及血管瘤；消化系統之癌諸如 平滑肌瘤、表皮樣癌、腺癌、平滑肌肉瘤、胃腺癌、小腸脂瘤、小腸神經纖維瘤、小腸纖維瘤、大腸息肉、及結直腸癌；肝癌諸如肝細胞腺瘤、血管瘤、肝細胞癌、纖維板層癌、膽管癌、肝母細胞瘤及血管肉瘤；腎癌諸如腎腺癌、腎細胞癌、腎上腺瘤及腎盂移行細胞癌；膀胱癌；血癌諸如急性淋巴細胞性(淋巴胚細胞)白血病、急性骨髓樣(骨髓細胞性、骨髓性、骨髓胚細胞性、骨髓單球性)白血病、慢性淋巴細胞性白血病(例如西澤里(Sezary)症候群及髮樣細胞白血病)、慢性骨髓細胞性(骨髓樣、骨髓性、顆粒球性)白血病、霍奇金氏(Hodgkin's)淋巴瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、B細胞淋巴瘤、蕈狀肉芽腫、及骨髓增生性疾病諸如真性多血症、骨髓纖維化、血小板增多症、及慢性骨髓細胞性白血病)；皮膚癌諸如基底細胞癌、鱗狀細胞癌、黑色素瘤、卡波西氏(Kaposi's)肉瘤、及佩吉特氏(Paget's)症；頭頸癌；眼相關性癌諸如視網膜胚細胞瘤及眼內黑癌；雄性生殖系統癌諸如良性***增生、***癌、及睪丸癌(例如精細胞瘤、畸胎瘤、胚胎性癌、及絨毛膜癌)；乳癌；雌性生殖系統癌諸如子宮癌(子宮內膜癌)、子宮頸癌症(子宮頸癌)、卵巢之癌(卵巢癌)、***癌、***癌、輸卵管癌、及水囊狀胎塊；甲狀腺癌(包括乳突性、濾泡性、退行性、或髓質癌)；嗜鉻細胞瘤(腎上腺)；副甲狀腺之非癌性生長；胰癌；及血癌諸如白血病、骨髓瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、及霍奇金氏淋巴瘤。
在一些其他實施態樣中，該疾病係自體免疫性疾病。 可利用該結合分子治療之自體免疫性疾病之實例包括自體免疫性腦脊髓炎、紅斑性狼瘡、及類風濕性關節炎。該結合分子亦可被用於治療發炎(諸如過敏性氣喘)及慢性移植物抗宿主病。
在另一態樣中，本發明提供增進哺乳動物之免疫反應之方法，該方法包含對哺乳動物投予治療有效量之本發明之結合分子。在一些實施態樣中，該結合分子係4-1BB抗體或彼之抗原結合片段且該哺乳動物係人。在其他實施態樣中，該結合分子係4-1BB促效劑抗體或彼之抗原結合片段。用語「增進免疫反應」或彼之文法變異體係指刺激、引起、增加、改善、或放大哺乳動物免疫系統之任何反應。該免疫反應可為細胞反應(即細胞媒介性，諸如細胞毒性T淋巴細胞媒介性)或體液反應(即抗體媒介性反應)，且可為原發性或繼發性免疫反應。增進免疫反應之實例包括CD4+輔助T細胞活性增加及產生溶細胞性T細胞。免疫反應之增進可利用該領域之技藝人士所知之多種活體外或活體內測試評估，包括但不限於細胞毒性T淋巴細胞測試、細胞介素之釋放(例如IL-2產製)、腫瘤消退、荷瘤動物之存活、抗體產製、免疫細胞增生、細胞表面標誌之表現、及細胞毒性。通常，當與未經治療之哺乳動物或非利用本發明之方法治療之哺乳動物之免疫反應比較時，本發明之方法增進哺乳動物之免疫反應。在一實施態樣中，該結合分子係用於增進人對微生物病原體(諸如病毒)之免疫反應。在另一實施態樣中，該結合分子係用於增進人對疫 苗之免疫反應。該結合分子可為4-1BB促效劑或拮抗劑。在一些實施態樣中，該結合分子係4-1BB促效劑。在一實施態樣中，該方法增進細胞性免疫反應，特別是細胞毒性T細胞反應。在另一實施態樣中，該細胞性免疫反應係T輔助細胞反應。在又一實施態樣中，該免疫反應係細胞介素之產製，特別是IL-2之產製。該結合分子可被用於增進人對微生物病原體(諸如病毒)或疫苗之免疫反應。該結合分子可為4-1BB促效劑或拮抗劑。在一些實施態樣中，該結合分子係4-1BB促效劑。
在實施該治療性方法時，該結合分子可被當作單一療法單獨投予，或與一或多種額外之治療劑或療法組合投予。因此，在另一態樣中，本發明提供一種組合療法，其包含結合分子與一或多種額外之療法或治療劑之組合以用於分開、依序或同時投予。用語「額外療法」係指不使用本發明所提供之結合分子作為治療劑之療法。用語「額外治療劑」係指除本發明所提供之結合分子以外之任何治療劑。在一特定態樣中，本發明提供一種用於治療哺乳動物之癌之組合療法，其包含對該哺乳動物投予治療有效量之由本發明所提供之結合分子與一或多種額外治療劑之組合。在另一實施態樣中，該哺乳動物係人。
各種癌治療劑可與本發明所提供之結合分子組合使用。該領域之技藝人士將了解其他可被用於與本發明之方法及結合分子組合之癌療法的存在及發展，且將不會受限於本發明所列示之該些治療形式。可被用於組合療法以治 療癌之額外治療劑之類別實例包括(1)化學治療劑、(2)免疫治療劑，及(3)荷爾蒙治療劑。
用語「化學治療劑」係指可造成癌細胞死亡，或干擾癌細胞之生長、***、修復、及/或功能之化學或生物物質。化學治療劑之實例包括該些於WO 2006/088639、WO 2006/129163、及US 20060153808所揭示者，彼等之揭示內容係以參照方式納入此處。特定化學治療劑之實例包括：(1)烷化劑，諸如氯芥苯丁酸(LEUKERAN)、環磷醯胺(CYTOXAN)、異環磷醯胺(IFEX)、雙氯乙基甲胺鹽酸鹽(MUSTARGEN)、噻替派(THIOPLEX)、鏈脲佐菌素(ZANOSAR)、卡氮芥(BICNU、GLIADEL WAFER)、羅氮芥(CEENU)、及氮烯唑胺(DTIC-DOME)；(2)生物鹼或植物長春花生物鹼，包括細胞毒性抗生素，諸如多柔比星(ADRIAMYCIN)、表阿黴素(ELLENCE、PHARMORUBICIN)、正定黴素(CERUBIDINE、DAUNOXOME)、奈莫柔比星、伊達比星(IDAMYCIN PFS、ZAVEDOS)、雙羥葱醌(DHAD、NOVANTRONE)、達克黴素(放線菌素D、COSMEGEN)、普卡黴素(MITHRACIN)、絲裂黴素(MUTAMYCIN)、博來黴素(BLENOXANE)、長春瑞濱酒石酸鹽(NAVELBINE)、長春鹼(VELBAN)、長春新鹼(ONCOVIN)、及長春地辛(ELDISINE)；(3)抗代謝劑，諸如卡培他濱(XELODA)、阿糖胞苷(CYTOSAR-U)、氟達拉濱(FLUDARA)、吉西他濱(GEMZAR)、羥基尿素(HYDRA)、甲胺喋呤(FOLEX、MEXATE、TREXALL)、奈拉濱(ARRANON)、三甲喋呤 (NEUTREXIN)、及培美曲塞(ALIMTA)；(4)嘧啶拮抗劑，諸如5-氟尿嘧啶(5-FU)、卡培他濱(XELODA)、雷替曲塞(TOMUDEX)、替加氟-尿嘧啶(UFTORAL)、及吉西他濱(GEMZAR)；(5)紫杉烷，諸如多西紫杉醇(TAXOTERE)、太平洋紫杉醇(TAXOL)；(6)鉑藥物，諸如順鉑(PLATINOL)、卡鉑(PARAPLATIN)、及奧沙利鉑(ELOXATIN)；(7)拓撲異構酶抑制劑，諸如伊立替康(CAMPTOSAR)、拓撲替康(HYCAMTIN)、依妥普賽(ETOPOPHOS、VEPESSID、TOPOSAR)、及替尼泊苷(VUMON)；(8)表鬼臼毒素(鬼臼毒素衍生物)，諸如依妥普賽(ETOPOPHOS、VEPESSID、TOPOSAR)；(9)葉酸衍生物，諸如菊白葉酸(WELLCOVORIN)；(10)亞硝基脲，諸如卡氮芥(BiCNU)、羅氮芥(CeeNU)；(11)受體酪胺酸激酶之抑制劑，包括表皮生長因子受體(EGFR)、血管內皮生長因子(VEGF)、胰島素受體、類胰島素生長因子受體(IGFR)、肝細胞生長因子受體(HGFR)、及血小板衍生性生長因子受體(PDGFR)，諸如吉非替尼(IRESSA)、埃羅替尼(TARCEVA)、硼替佐米(VELCADE)、甲磺酸伊馬替尼(GLEEVEC)、吉非替尼、拉帕替尼、索拉非尼、沙利竇邁、舒尼替尼(SUTENT)、阿西替尼、利妥昔單抗(RITUXAN、MABTHERA)、曲妥珠單抗(HERCEPTIN)、西妥昔單抗(ERBITUX)、貝伐珠單抗(AVASTIN)、蘭尼單抗(LUCENTIS)、lym-1(ONCOLYM)、在WO2002/053596中揭示之抗類胰島素生長因子1受體(IGF-1R)之抗體；(12)血管生成抑制劑，諸如貝伐珠單抗 (AVASTIN)、蘇拉明(GERMANIN)、血管抑素、SU5416、沙利竇邁、及基質金屬蛋白酶抑制劑(諸如巴馬司他及馬立馬司他)、及該些於WO2002055106中所揭示者；及(13)蛋白酶體抑制劑，諸如硼替佐米(VELCADE)。
用語「免疫治療劑」係指可增進哺乳動物之免疫反應之化學或生物物質。免疫治療劑之實例包括：卡介苗(BCG)；細胞介素諸如干擾素；疫苗諸如MyVax個人化免疫療法、Onyvax-P、Oncophage、GRNVAC1、FavId、Provenge、GVAX、Lovaxin C、BiovaxID、GMXX、及NeuVax；及抗體諸如阿來組單抗(CAMPATH)、貝伐珠單抗(AVASTIN)、西妥昔單抗(ERBITUX)、吉妥珠單抗奧唑米星(MYLOTARG)、替伊莫單抗(ZEVALIN)、帕尼單抗(VECTIBIX)、利妥昔單抗(RITUXAN、MABTHERA)、曲妥珠單抗(HERCEPTIN)、妥司莫單抗(BEXXAR)、伊匹單抗(YERVOY)、曲美木單抗、CAT-3888、抗OX40受體之促效劑抗體(諸如該些於WO2009/079335中揭示者)、抗CD40受體之促效劑抗體(諸如該些於WO2003/040170中揭示者)、及TLR-9促效劑(諸如該些於WO2003/015711、WO2004/016805、及WO2009/022215中揭示者)。
用語「荷爾蒙治療劑」係指抑制或消除荷爾蒙之產生，或抑制或反作用於荷爾蒙對癌細胞生長及/或存活之效應之化學或生物物質。適用於本發明之方法之該等劑的實例包括該些於US20070117809中所揭示者。特定荷爾蒙治療劑之實例包括它莫西芬(NOLVADEX)、托瑞米芬 (Fareston)、氟維司群(FASLODEX)、阿那曲唑(ARIMIDEX)、依西美坦(AROMASIN)、來曲唑(FEMARA)、醋酸甲地孕酮(MEGACE)、戈舍瑞林(ZOLADEX)、及柳普林(LUPRON)。本發明之結合分子亦可與非藥物荷爾蒙療法組合使用，諸如(1)移除所有或部分參與該荷爾蒙產製之器官或腺體之手術方法，諸如卵巢、睪丸、腎上腺、及腦下垂體，及(2)放射線治療，其中病患之器官或腺體接受足以抑制或消除該目標荷爾蒙之產製之量的放射線。
用於治療癌之組合療法亦包含結合分子與移除腫瘤之手術之組合。該結合分子可在手術之前、手術期間或手術之後投予至哺乳動物。
用於治療癌之組合療法亦包含結合分子與放射療法之組合，諸如游離(電磁)輻射療法(例如X光或伽瑪射線)及粒子束輻射療法(例如高線性能量輻射)。該放射源可在哺乳動物之體外或體內。該結合分子可在放射療法之前、放射療法期間或放射療法之後投予至哺乳動物。
本發明所提供之結合分子及組成物可經由任何適當之經腸投予途徑或非經腸投予途徑投予。用語「經腸投予途徑」係指經由消化道之任何部分投予。經腸途徑之實例包括經口、經黏膜、經頰、經直腸或胃內途徑。「非經腸投予途徑」係指除經腸途徑以外之投予途徑。非經腸投予途徑之實例包括靜脈內、肌肉內、皮內、腹膜內、腫瘤內、經膀胱、動脈內、脊椎鞘內、囊內、眼眶內、心內、經氣管、關節內、囊下、蜘蛛膜下腔、脊椎內、硬膜外、胸骨 內、皮下或局部投予。本發明之抗體及組成物可利用任何適當之方法投予，諸如藉由經口攝取、鼻胃管、胃管、注射、輸注、植入式輸注幫浦及滲透泵。該適當之投予途徑及方法可視多種因素而定，諸如所使用之特定抗體、所欲之吸收速度、所使用之特定調製劑或劑型、所欲治療之疾病的種類或嚴重性、該特定之作用部位及該病患之狀況，且可由該領域之技藝人士輕易地選擇。
用語結合分子之「治療有效量」係指對於所意圖之治療性目的有效之量。舉例來說，在增進免疫反應之上下文中，「治療有效量」係指能有效刺激、引起、增加、改善、或放大哺乳動物免疫系統之任何反應之任何量。在治療疾病之上下文中，「治療有效量」係指足以在該被治療之哺乳動物體內造成任何所欲或有利效應之任何量。特別地，在治療癌之情況中，所欲或有利效應之實例包括抑制癌細胞之繼續生長或擴散、癌細胞之死亡、抑制癌之復發、減少與該癌相關之疼痛、或增進該哺乳動物之存活。該4-1BB抗體之治療有效量通常介於該哺乳動物之體重的約0.001至約500mg/kg，更常介於約0.01至約100mg/kg。舉例來說，該量可為該哺乳動物之體重的約0.3mg/kg、1mg/kg、3mg/kg、5mg/kg、10mg/kg、50mg/kg、或100mg/kg。在一些實施態樣中，該4-1BB抗體之治療有效量係介於該哺乳動物之體重的約0.01至30mg/kg。在一些其他實施態樣中，該4-1BB抗體之治療有效量係介於該哺乳動物之體重的約0.05至15mg/kg。該將被投予之精準 劑量可由該領域之技藝人士輕易決定，並視一些因素而定，諸如所欲治療之疾病的類型及嚴重性，所使用之特定結合分子、投予途徑、投予時間、治療期間、所使用之特定額外治療、所治療之病患的年齡、性別、體重、條件、健康狀況及先前病史，及該醫學領域所廣為周知之類似因素。
結合分子或組成物通常經多次投予。單次劑量之間的間隔可為例如每周、每月、每三個月或每年。示範性治療療法需要每周一次、每二周一次、每三周一次、每四周一次、每個月一次、每三個月一次、或每三至六個月一次之投予。4-1BB抗體之典型給藥方案包括經靜脈投予1mg/kg體重或3mg/kg體重，使用下列投藥計畫中之一者：(i)每四周投予一次共投予六次，接著每三個月投予一次；(ii)每三周投予一次；(iii)投予3mg/kg體重一次，接著每三周投予1mg/kg體重。
本發明繼續以下列實施例說明，該些實施例不應被視為進一步之限制。所有圖表及在本發明中各處所引述之所有參考文獻、專利及公開專利申請案之內容係明確地藉由參照方式整體納入此處。
圖1係四個顯示未經刺激(黑色)及經PHA刺激之(淺灰色)初代PBMC之平均螢光強度的柱狀圖，該等初代PBMC係來自人(左上圖)、馬來猴(cynomolgus)(右上圖)、 犬(左下圖)、及大鼠(右下圖)並以該所示之與Alexafluor 647共軛之4-1BB抗體或對照抗體培養。該圖顯示與經PHA刺激之人及馬來猴PBMC結合。
圖2係二個顯示4-1BB表現293T細胞之螢光素酶報導子活性之折線圖，該等細胞以數種濃度之4-1BB特異性mAb或同型對照mAb刺激。左圖顯示表現馬來猴4-1BB之細胞中的報導子活性。右圖顯示表現人4-1BB之細胞中的活性。該資料以高於同型對照之刺激倍數表示。
圖3(3A及3B)顯示以抗CD3及數種濃度之4-1BB抗體刺激人T細胞72小時後，存在於細胞培養基中之人IL-2濃度之折線圖。各圖(A及B)代表不同來源。
圖4係顯示人週邊血液單核細胞於經4-1BB mAb或同型對照mAb處理之小鼠體內擴張之分佈圖。資料係以在試驗第24至28天個別NSG小鼠之週邊血液中表現人CD45之細胞百分比表示，該等NSG小鼠在試驗第0天接受6百萬人週邊血液單核細胞注射及在第9天接受1mg/kg 4-1BB mAb或同型對照mAb注射。統計顯著性係利用雙尾曼-惠特尼(Mann-Whitney)檢定測定*p<0.05，**p<0.005。無HBPT係指未經注射人細胞之動物。
圖5的二個柱狀圖顯示在投予4-1BB mAb至馬來猴後不同時間點之增生性CD8中央記憶T細胞之變化。資料係以代表個別動物(以劑量-動物編號命名)之柱顯示，以Ki-67+細胞數量相對於試驗前數量之動物內變化表示{[(該所示天數之Ki-67+細胞數-投藥前之Ki-67+細胞數)/投藥 前之Ki-67+細胞數]*100}。CD8中央記憶細胞被識別為CD3+、CD8+、CD28+及CD95+。
圖6係顯示在試驗第0天皮下注射腫瘤細胞(左圖PC3，右圖LOVO)及人週邊血液單核細胞之腫瘤生長之折線圖。小鼠在第0天接受10mg/kg之該所示4-1BB mAb之注射。
圖7之左圖係顯示同時具有T細胞表面標記CD8+及在以4-1BB mAb或載具對照處理4-1BB基因置入小鼠之後納入BrdU核苷類似物之PBMC百分比之分佈圖。右圖之折線圖顯示鼠黑色素瘤之生長，該黑色素瘤係經皮下注射至4-1BB基因置入小鼠並以該所示濃度之4-1BB mAb治療。
圖8顯示重鏈可變區及輕鏈可變區(畫線部分為CDR)之胺基酸序列與相關種系序列之排比。
實施例1：產製與4-1BB結合之FAB片段
本發明所提供之某些抗體原本係自與人4-1BB結合之Fab產製。該等Fab係自噬菌體展示庫(MorphoSys HuCAL GOLD®噬菌體庫)篩選，之後輪流篩選4-1BB FC及表現人4-1BB之細胞。這些Fab包括該些被命名為“Fab-6032”、“Fab-7361”、“Fab-7480”及“Fab-7483”之Fab。本申請案所揭示之4-1BB抗體MOR-6032、MOR-7361、MOR-7480、及MOR-7483係分別自“Fab-6032”、“Fab-7361”、“Fab- 7480”及“Fab-7483”產製。給定Fab之輕鏈可變區及重鏈可變區之胺基酸序列係分別與使用與該Fab之命名相同數字編號之命名的示例性抗體之輕鏈可變區及重鏈可變區之胺基酸序列相同。舉例來說，Fab-7480和抗體MOR-7480在彼等之輕鏈可變區及重鏈可變區分別具有相同之胺基酸序列。
該噬菌體庫係根據HuCAL®概念(Knappik et al.,2000,J.Mol.Biol.296(1)：57-86)且使用CysDisplayTM技術以在該噬菌體表面展示Fab(Löhning,WO 01/05950)。HuCAL GOLD®提供利用六個單一子庫進行篩選，各子庫包含與所有七個VL主宰基因組合之一個VH(VH1、VH2、VH3、VH4、VH5、VH6)主宰基因，或利用經組合之噬菌體庫進行篩選之選擇。在第一輪篩選中使用之噬菌體係以Hyperphage製備(M13KO7△pIII，得自德國海德堡Progen公司)。HuCAL GOLD®係詳細描述於Christine Rothe,et.al,J.Mol.Biol.(2008)376,1182-1200。
固相篩選係利用重組人4-1BB-Fc(明尼蘇達州明尼亞波利(Minneapolis,MN)R&D系統公司產品編號838-4B)進行。
實施例2：FAB之特徵
在實施例1中所描述之四種Fab之特徵係利用下列試驗測定，使用包含具有Flag/His標籤之Fab的單價Fab形式。
2A 以溶液平衡滴定(SET)方法測定親和性
四種Fab之親和性(以KD表示)係利用SET方法測定，使用來自美索尺度發現(Meso Scale Discovery)公司(“MSD”)之儀器設備。使用抗體蛋白質之單體組分(以分析性SEC分析至少含有90%單體；分別以Superdex75(Amersham Pharmacia)分析Fab，或以Tosoh G3000SWXL(Tosoh Bioscience)分析IgG)。
在溶液中之親和性測定基本上係如文獻所述進行(Friguet et al.1985)。為了提高SET方法之敏感性及正確性，從典型ELISA方法改為ECL基底之技術(Haenel et al.2005)。
1mg/ml山羊抗人(Fab)2片段特異性抗體(Dianova)係使用MSD Sulfo-TAGTM NHS-酯(Meso Scale Discovery,Gaithersburg,MD,USA)根據製造商之說明加以標示。
該等實驗係於聚丙烯微滴定盤中進行，使用含0.5% BSA及0.02% Tween 20之PBS pH 7.4作為檢測緩衝液。未經標示之人4-1BB係以2n倍數稀釋，始於至少比該預期之KD高出10倍之濃度。不含抗原之孔槽係用於測定Bmax值；檢測緩衝液之孔槽係用於測定背景。在添加例如30pM之Fab後(在60μL終體積中之終濃度)，該混合物係於室溫中隔夜培養。該施用之Fab濃度係類似於或在該預期之KD以下。
標準MSD盤係以0.05μg/ml人4-1BB於PBS中(30 μL/孔)包覆，經隔夜培養，以3% BSA於PBS中封閉1小時。在以檢測緩衝液清洗該盤後，該些平衡之樣本被轉移至該等盤中(每孔30μL)並培養20分鐘。在清洗後，30μL/孔之終稀釋倍數1：1500之MSD Sulfo-標籤標示之檢測抗體(山羊抗人(Fab)2)被添加至該MSD盤，在微量離心管震盪器(700rpm)上培養30分鐘。
在清洗該盤及添加30μL/孔之含界面活性劑之MSD讀取緩衝液T後，利用Sector Imager 6000(美國馬里蘭州蓋士堡(Gaithersburg,MD)Meso Scale Discovery)檢測電化學發光信號。
該資料係以XLfit(IDBS)軟體評估，使用客製化之擬合模型。以Fab分子之KD測定而言，使用下列擬合模型(Haenel et al.,2005)並根據Abraham et al.(1996,J.Molec.Recog.9(5-6)：456-461)加以修飾：
[Fab]t：所施用之總Fab濃度
x：所施用之總可溶性抗原濃度(結合部位)
Bmax：無抗原時Fab之最大信號
KD：親和性
結果顯示於表3。
2B 以Biacore測定對直接包覆抗原之KD
為了測定KD，單體Fab組分(以分析性SEC分析至少含有90%單體；安法瑪亞(Amersham Pharmacia)公司Superdex75)係用來作為分析物。與經固定之抗原之結合係利用BIAcore3000儀器設備(瑞典Biacore公司)分析。
動力學速率常數kon及koff係由該各別Fab之連續稀釋液與共價固定之抗原CD137/人4-1BB之結合測定，使用Biacore 3000儀器設備(瑞典烏普薩拉市(Uppsala)Biacore公司)。利用標準EDC-NHS胺偶合化學進行共價抗原固定。動力學測量係於流速20μl/分鐘之HBS-EP(10mM HEPES；pH 7.4；150mM NaCl；3mM EDTA；Tween20 0.005%)中進行，使用介於約16至500nM之Fab濃度。各種濃度之注射時間為1分鐘，之後為至少3分鐘之解離相。以再生而言，使用一或多次5μl之甘胺酸/HCl pH2注射。
以預測全IgG分子之KD而言，以IgG作為樣本注射至F1感應晶片上，該晶片具有經2n連續稀釋成介於16至500nM之濃度的低密度共價固定之人4-1BB(約130 RU)。感應圖係利用雙價擬合模型評估，經定性比較以排序該對應之KD值。
所有感應圖係利用BIA評估軟體3.1(Biacore)擬合。結果顯示於表3。
2C Fab於ELISA試驗中之結合
該四種Fab之結合係利用標準ELISA技術於直接包 覆之人4-1BB/Fc上測定。結果顯示於表3。
2D Fab於FACS試驗中之結合
該四種Fab之結合係利用標準FACS試驗技術於穩定轉染及表現人4-1BB之HEK293細胞以及300.19(鼠B細胞系)陰性對照細胞上測定。結果顯示於表3。
實施例3：IgG之特徵
由本處所述之篩選獲得之數種Fab，包括Fab-6032、Fab-7361、Fab-7480、及Fab-7483係經選擇以轉換成為全長抗體之IgG1及IgG4形式，以用於如此實施例中所述之進一步特徵化。該四種在本實施例中所識別之示例性抗體即MOR-6032、MOR-7361、MOR-7480、及MOR-7483係分別自Fab-6032、Fab-7361、Fab-7480、及Fab-7483轉換。該等呈IgG形式之抗體係經表現及純化，接著於ELISA、FACS、及螢光素酶報導基因試驗中特徵化。
3A 轉換成IgG
為了表現全長IgG，重鏈可變結構域片段(VH)及輕鏈可變結構域片段(VL)係自Fab表現載體次殖株至適當之pMorph®_hIgG載體以表現人IgG1及人IgG4。
3B 人IgG之過渡表現及純化
全長人IgG之過渡表現係於HKB11細胞中進行，該等細胞係經1：1比例之IgG重鏈及輕鏈表現載體轉染。在轉染後分別收集細胞培養上清液並增量至3倍轉染體積。藉由離心及過濾使上清液澄清，接著進行標準蛋白質A親和性層析(MabSelect SURE，GE醫療集團)。蛋白質係經洗脫及中和。接下來的下游處理涉及緩衝液交換及無菌過濾。蛋白質濃度利用UV分光光度計測定。IgG之純度在變性還原及變性非還原之條件下於SDS-PAGE或利用安捷倫(Agilent)公司之BioAnalyzer分析。HP-SEC係經進行以分析天然狀態下之IgG製劑。
3C IgG於ELISA試驗中之特徵
IgG被用於直接包覆設定之人4-1BB/Fc及小鼠4-1BB/Fc以進行ELISA結合特徵化。下表4列出抗體MOR-6032、MOR-7361、MOR-7480、及MOR-7483(皆呈IgG1形式)之ELISA結合結果。
3D 抗體之結合選擇性(FACS試驗)
抗體對4-1BB之選擇性係針對4-1BB及該TNFR超家族之其他成員之胞外域蛋白質測定。這些受體包括CD40(TNFRSF5)及OX-40(CD134、TNFRSF4)。IgG係用於FACS結合特徵化，使用陰性對照HEK293細胞、穩定轉染及表現人4-1BB之HEK293T-h4-1BB細胞，以及表現OX-40之300.19穩定轉染細胞和穩定轉染及表現CD40之300.19細胞。抗體MOR-6032、MOR-7361、MOR-7480、及MOR-7483(所有皆呈1gG1形式)之FACS結合結果係顯示於表5。濃度高達1000nM時對OX-40或CD40並未顯示顯著結合，表示該等抗體對4-1BB之選擇性相較於其他受測之相關家族成員至少高出100倍。
3E IgG於螢光素酶報導基因試驗中之特徵
IgG於螢光素酶報導基因試驗中之結合特性亦經特徵化，使用HEK293T-h4-1BB細胞進行平板結合試驗、可溶性結合試驗及交聯結合試驗。表6列出抗體MOR-6032、MOR-7361、MOR-7480、及MOR-7483(皆呈IgG1形式)之螢光素酶報導基因試驗之結果。
實施例4：抗體MOR-6032、MOR-7361、MOR-7480、及MOR-7483之結構特徵
如上面實施例1至3中所描述之方法被用來產製數種全人抗4-1BB IgG2抗體，包括命名為“MOR-6032”、 “MOR-7361”、“MOR-7480”、及“MOR-7483”之抗體。編碼MOR-6032、MOR-7361、MOR-7480、及MOR-7483單株抗體之重鏈及輕鏈可變區之cDNA序列係利用標準PCR技術獲得，並利用標準DNA定序技術定序。
抗體MOR-6032、MOR-7361、MOR-7480、MOR-7480.1、MOR-7480.2、MOR-7483、MOR-7483.1、及MOR-7483.2之重鏈可變區、IgG2亞型之全長重鏈、輕鏈可變區及全長輕鏈之核苷酸及胺基酸序列係於本發明中提供；這些序列之SEQ ID NO之索引係提供於表1。
比較MOR-6032重鏈免疫球蛋白序列與該些已知之人種系免疫球蛋白重鏈序列，顯示該MOR-6032重鏈利用來自人種系VH 1-69之VH區段、來自人種系4-23之D區段，及來自人種系JH 4a之JH區段。
進一步利用卡巴系統之CDR區測定分析MOR-6032 VH序列得到分別如SEQ ID NO：1、2及3所示之H-CDR1、H-CDR2及H-CDR3區。
比較MOR-7361重鏈免疫球蛋白序列與該些已知之人種系免疫球蛋白重鏈序列，顯示該7361重鏈利用來自人種系VH 3-23之VH區段、來自人種系2-8之D區段，及來自人種系JH 4a之JH區段。
進一步利用卡巴系統之CDR區測定分析MOR-7361 VH序列得到分別如SEQ ID NO：15、16及17所示之重鏈H-CDR1、H-CDR2及H-CDR3區。
比較MOR-7480及MOR-7483重鏈免疫球蛋白序列與 該些已知之人種系免疫球蛋白重鏈序列，顯示該7480及7483重鏈利用來自人種系VH 5之VH區段、來自人種系5-18之D區段，及來自人種系JH 4a之JH區段。
進一步利用卡巴系統之CDR區測定分析7480及7483 VH序列得到分別如SEQ ID NO：29、30及31所示之H-CDR1、H-CDR2及H-CDR3區。
比較MOR-6032、MOR-7361、MOR-7480及MOR-7483輕鏈免疫球蛋白序列與該些已知之人種系免疫球蛋白輕鏈序列，顯示該等6032、7361、7480及7483輕鏈皆利用來自人種系λ3-r之VL區段及來自人種系JL 3b之JL區段。
進一步利用卡巴系統之CDR區測定分析MOR-6032 VL序列得到分別如SEQ ID NO：6、7及8所示之輕鏈CDR1、CDR2及CDR3區。
進一步利用卡巴系統之CDR區測定分析MOR-7361 VL序列得到分別如SEQ ID NO：20、21及22所示之L-CDR1、L-CDR2及L-CDR3區。
進一步利用卡巴系統之CDR區測定分析MOR-7480 VL序列得到分別如SEQ ID NO：34、35及36所示之L-CDR1、L-CDR2及L-CDR3區。
進一步利用卡巴系統之CDR區測定分析MOR-7483 VL序列得到分別如SEQ ID NO：34、35及55所示之L-CDR1、L-CDR2及L-CDR3區。
實施例5：抗體MOR-7480及MOR-7483之種系版本
為了最小化MOR-7480及MOR-7483抗體之免疫原性，數個胺基酸殘基係經突變回種系序列，如下所示。MOR-7480之種系版本(命名為MOR-7480.1)係藉由將該重鏈可變區之FR1區中之二個胺基酸回復成種系序列加以製備。更特定地，在胺基酸殘基數1之Q被回復成種系E，在胺基酸殘基數19之K被回復成R。該二個被改變之重鏈可變區中之胺基酸殘基可藉由比較MOR-7480(SEQ ID NO：32)與MOR-7480.1(SEQ ID NO：43)之胺基酸序列得知。在MOR-7480之輕鏈可變區中，FR1區中之五個胺基酸(D1S、I2Y、A13S、R19S、S21T)、FR2區中之二個胺基酸(A42S、V45L)及FR3區中之一個胺基酸(E80M)被回復成種系序列。該八個被改變之輕鏈可變區中之胺基酸可藉由比較MOR-7480(SEQ ID NO：37)與MOR-7480.1(SEQ ID NO：45)之胺基酸序列得知。
另外，第三種版本之MOR-7480係藉由以MOR-7480.1(SEQ ID NO：45)之輕鏈可變區開始，將L45回復成V以產生MOR-7480.2(SEQ ID NO：51)加以製備。
MOR-7483之種系版本(命名為MOR-7483.1)係藉由將該重鏈可變區之FR1區中之二個胺基酸回復突變成種系序列加以製備。該等種系版本可藉由始於該抗體鏈之種系版本，接著改變該CDR中所欲之胺基酸，或始於任何版本之任何突變之組合加以製備。要產生MOR-7483.1，在胺基酸殘基數1之Q被回復成種系E，在胺基酸殘基數19 之K被回復成R。該二個被改變之重鏈可變區中之胺基酸殘基可藉由比較MOR-7483(SEQ ID NO：32)與MOR-7483.1(SEQ ID NO：43)之序列得知。在MOR-7483之輕鏈可變區中，FR1區中之五個胺基酸(D1S、I2Y、A13S、R19S、S21T)、FR2區中之二個胺基酸(A42S、V45L)及FR3區中之一個胺基酸(E80M)被回復成種系序列。該八個被改變之輕鏈可變區中之胺基酸可藉由比較MOR-7483(SEQ ID NO：56)與MOR-7483.1(SEQ ID NO：60)之胺基酸序列得知。
另外，第三種版本之MOR-7483係藉由將MOR-7483.1(SEQ ID NO：60)之輕鏈可變區序列之L45回復突變成種系V45以產生MOR-7483.2(SEQ ID NO：64)加以製備。
實施例6：抗體之活體外特性，包括種系版本 抗體之結合親和性(BIAcore試驗)
某些抗體結合人4-1BB之結合動力學係利用Biacore 3000儀器設備(GE醫療集團)，藉由表面電漿共振(SPR)技術測量。包含SEQ ID NO：68之胺基酸24-186之重組人4-1BB/Fc嵌合性蛋白質係購自R&D系統公司(#838-4B)。該經凍乾之蛋白質被溶解於含有150mM NaCl、25mM HEPES pH 8.0、6mM MgCl2、0.005%聚山梨醇酯20、及0.5mM疊氮鈉之緩衝液中，根據由R&D系統公司所提供之預測分子量(44.8kDa)使終濃度成為80nM。該分子之 Fc部分係由牛因子Xa(皮爾斯(Pierce)公司，#32521)處理切割，在150mM NaCl、25mM HEPES pH 8.0、6mM MgCl2、0.005%聚山梨醇酯20、0.5mM疊氮鈉中使用3%因子Xa(每100μg 4-1BB嵌合物使用3μg因子Xa)於22℃培養20小時。該分子之4-1BB部分包含人4-1BB蛋白質之胺基酸殘基24至186。結合實驗係於25℃之包含150mM NaCl、25mM HEPES pH 8.0、6mM MgCl2、0.005%聚山梨醇酯20、及0.5mM疊氮鈉之流動緩衝液(running buffer)中進行。抗體係利用標準胺偶和固定至CM5感應晶片(GE醫療集團)，使用於10mM醋酸鈉pH 5.0中之0.1mg/mL抗體溶液。4-1BB係以介於80nM至0.16nM之濃度範圍注射，流速50μL/分鐘，注射3.6分鐘之後為26分鐘之解離期，使用Biacore 3000儀器設備之Kinject性能。該經結合之複合物係藉由10mM磷酸於水中之1分鐘脈衝再生。資料分析係利用Scrubber2軟體(BioLogic Software)進行。感應圖被代入簡單1：1蘭繆爾(Langmuir)結合模型。該等抗體係經顯示為可逆性地與重組人4-1BB結合。結果(平均值)顯示於表7。
與4-1BB之胞外域之結合(ELISA試驗)
人4-1BB IgG1Fc嵌合物(R&D Systems,Minneapolis,MN)係以含有0.1%牛血清白蛋白(BSA)之達爾柏克(Dulbecco)氏磷酸緩衝鹽水(DPBS)重新懸浮至0.2mg/ml，並以DPBS稀釋至終濃度0.03ug/ml。Nunc-Immuno Maxisorp 96孔盤係以每孔0.1ml之重組4-1BB嵌合物包覆，留下空孔槽以用於非特異性結合對照，於4℃隔夜培養。移除該4-1BB溶液，孔盤以0.2ml之清洗緩衝液(0.05% Tween-20於DPBS中)清洗三次。在所有孔槽中添加0.2ml之封閉液(5% BSA，0.05% Tween-20於DPBS中)，於4℃混合培養1小時。移除該封閉液，以0.2ml清洗緩衝液清洗孔盤三次。4-1BB測試抗體之連續稀釋液係於DPBS中製備，在每孔中添加0.1ml經稀釋之抗體。孔盤於室溫中培養1.5小時。移除該抗體溶液，孔盤以每孔0.2ml之清洗緩衝液清洗三次。經辣根過氧化酶標示之山羊抗人IgG，即F(ab’)2特異性F(ab’)2抗體(傑克森免疫研究(Jackson ImmunoResearch)公司#109-036-097，賓州西格魯(West Grove,PA))係以DPBS稀釋為1：5000並在每孔中添加0.1ml。該孔盤係於室溫中培養1小時，以每孔0.2ml之清洗緩衝液清洗。添加0.1ml之SureBlue TMB微孔過氧化酶受質(Kirkegaard & Perry Labs,Gaithersburg,MD)，於室溫中培養20分鐘。該反應係藉由添加等量之2M H2SO4加以停止，在Molecular Devices Spectra Max 340(分子儀器(Molecular Devices)公司，Sunnyvale,CA)上以450nm波長讀取吸光度。結果顯示於表8。
配體競爭結合(ELISA試驗)
抗體係經測定彼等阻斷該人4-1BB_IgG1Fc嵌合物與吸附於孔盤上之重組4-1BB配體(4-1BBL)結合之能力。重 組人4-1BB配體(生物來源(Biosource)公司/英維特基(Invitrogen)公司，加州卡斯巴德市(Carlsbad,CA))係於DPBS+0.1%牛血清白蛋白中重新懸浮至0.2mg/mL，然後以DPBS稀釋至1μg/mL。Nunc-Immuno Maxisorp surface 96孔盤係以每孔0.1ml之4-1BBL溶液於4℃隔夜包覆。隔天移除該4-1BBL溶液，添加0.2mL之封閉液(1%牛血清白蛋白，0.05% Tween-20於DPBS中)，在室溫中培養2小時。在該封閉步驟期間，該抗體保存液係經DPBS稀釋至介於8ng/mL至6μg/mL之範圍。重組人4-1BB_IgG1Fc(R&D系統公司，明尼蘇達州明尼亞波利(Minneapolis,MN))係於DPBS+0.1%牛血清白蛋白中重新懸浮至0.2mg/mL，然後以DPBS稀釋至0.02μg/mL。該經封閉之4-1BBL包覆孔盤係以0.2mL之沖洗液(0.05% Tween 20於DPBS中)沖洗三次。添加60μL之抗體稀釋液與60μL之4-1BB_IgG1Fc嵌合物，於室溫中培養1.5小時。孔盤係如先前所述清洗。辣根過氧化酶抗6x組胺酸標籤抗體(R&D Systems,Minneapolis MN #MAB050H)係以DPBS稀釋1：1000，將50μL該形成之溶液添加至該經清洗之孔槽中，並於室溫中培養1小時。孔盤係如前述清洗，添加50μL TMB受質溶液至各孔，於室溫中培養20分鐘。該反應以每孔50微升之0.2N H2SO4停止，使用Molecular Devices孔盤讀取儀讀取450奈米之吸光值。結果顯示於表8。
抗體之物種交叉反應
該示範性抗體之物種交叉反應係利用經植物血凝素(PHA)刺激之人、馬來猴(cyno)、狗及大鼠之初代週邊血液單核細胞(PBMC)測量。細胞係根據以下描述之方法分離。細胞(~5.0×105細胞/試管)係經冷清洗緩衝液清洗一次(PBS、2% FBS及0.02%疊氮鈉)，在各樣本中添加100μl/管之Alexa Fluor 647共軛對照或15.5μg/mL之4-1BB反應性抗體(100nM)及經標示之物種特異性T細胞標記抗體。所使用之T細胞標記抗體如下：FITC抗人CD3e(BD Pharmingen,#555332)、FITC抗大鼠CD3e(BD Pharmingen,#559975)、FITC抗兔CD4+FITC抗兔CD8(AbD Serotec,#MCA799F及#MCA1576F)、FITC抗犬CD3e(AbD Serotec,#MCA1774F)及PerCP抗人/馬來猴CD3e(BD Pharmingen,#552851)。該等細胞係於暗室中與螢光抗體在冰上培養30分鐘，清洗三次並重新懸浮於0.3ml清洗緩衝液以供分析。抗體染色係利用貝克頓迪更生(Becton-Dickenson)公司FACS Calibur儀及FlowJo 8.8.2軟體測試及分析。
人T淋巴細胞之分離以含有1mL 0.5M EDTA之針筒採集人全血，接著換至Sigma Accuspin試管(Sigma,St.Louis,MO)以根據製造商之說明分離週邊血液單核細胞(PBMC)。該等PBMC係以含有5mM EDTA之DPBS清洗二次，利用T細胞純化管柱根據製造商(R&D Systems,Minneapolis,MN)之說明分離T淋巴細胞。簡言之，將PBMC重新懸浮於2mL之管柱緩衝液中，裝入預先清洗 過之T細胞分離管柱。使PBMC在室溫中培養10分鐘，以管柱緩衝液洗脫T細胞，清洗一次及重新懸浮於TCM中成為2x106細胞/mL，該TCM係由RPMI 1640(Sigma,St Louis,MO)添加10%胎牛血清(Sigma,St.Louis,MO)及L-麩醯胺酸(2mM)、Hepes(10mM)、青黴素(100U/ml)、鏈黴素(50ug/ml)(Gibco,Grand Island,NY.)組成。
馬來猴PBMC之分離馬來猴全血(生物改良(Bioreclaimation)公司，Hicksville,NY)係經收集於檸檬酸鈉CPT採血管(BD；Franklin Lakes,NJ)，接著於室溫中以1500 x g離心20分鐘。試管於4℃隔夜運送。該PBMC組分係自該CPT管收集，以含有5mM EDTA之PBS清洗二次。在清洗步驟後，PBMC係經計數並重新調整為2x106細胞/mL於組織培養基(TCM)中。TCM係由RPMI 1640(Sigma,St Louis,MO)添加10%胎牛血清(Sigma,St Louis,MO)及購自吉布可(Gibco)公司(紐約州格蘭德島(Grand Island,NY))之L-麩醯胺酸(2mM)、HEPES(10mM)、青黴素(100U/mL)、鏈黴素(50μg/mL)所組成。細胞係經10μg/mL PHA刺激2至3天以誘導4-1BB之表現。
犬PBMC之分離犬全血係以肝素化採血管(BD；Franklin Lakes,NJ)收集，以含有5mM EDTA之PBS稀釋為1：2。在混合後，4mL之經稀釋血液被小心地置放於3mL哺乳動物淋巴細胞分離液(Cedarlane Laboratories,Westbury,NY)上，於25℃以800 x g離心20分鐘。收集 該PBMC介面，以PBS清洗二次，並重新懸浮成2×106細胞/mL於含有10μg/mL PHA之TCM中(Remel,Lenexa,KS)。該等細胞在利用流式細胞分析測試抗體結合之前係經培養48至72小時。
大鼠PBMC之分離 大鼠全血係以肝素化採血管(BD；Franklin Lakes,NJ)收集，以含有5mM EDTA之PBS稀釋為1：3。在混合後，6mL之經稀釋血液被小心地置放於4.5mL哺乳動物淋巴細胞分離液(Cedarlane Laboratories,Westbury,NY)上，於25℃以800 x g離心20分鐘。收集該PBMC介面，以PBS清洗二次，並重新懸浮成2×106細胞/mL於含有10μg/mL PHA之TCM中(Remel,Lenexa,KS)。該等細胞在利用流式細胞分析測試抗體結合之前係經培養48至72小時。
該結合結果係提供於圖1。該些抗體被發現可與人及馬來猴4-1BB以高親和性結合，但是在100nM之濃度下(最高測試濃度)仍未觀察到與犬及大鼠4-1BB之結合。
表位定位
為了測定該4-1BB促效劑抗體之表位結合區，在人4-1BB胞外結構域中製作一系列經公開之犬4-1BB序列(參考序列XM_845243)之突變(表9)。
所有人至犬突變係由Gene Dynamics公司(Portland,OR)於反轉錄病毒表現載體pMSCVpuro(Clontech Laboratories Mountain View,CA)中製備。另外，該全犬cDNA序列係經由對應參照序列XM_845243之基因合成製備。
病毒製劑係藉由過渡性轉染大約長滿T-75角瓶40至50%之293T細胞建立。在培養後，該病毒上清液接著係經無菌過濾及進行濃縮。該經濃縮之病毒係經收集及儲存於-80℃。
對數生長300-19細胞係經反轉錄病毒轉導，使用 1：250稀釋之濃縮病毒加8ug/ml凝聚胺於完全DMEM中。經24小時培養後，2ug/ml嘌呤黴素被添加至該培養物並於該試驗期間維持。
由嘌呤黴素篩選庫所陽性表現之4-1BB受體係藉由以1ug/ml之多株山羊抗人4-1BB抗體(R&D Systems Inc.)加1：200稀釋之PE標示之驢抗山羊IgG(H+L)F(ab’)2(Jackson Immunoresearch Inc.)染色證實。為了測定該測試抗體辨識該經突變之4-1BB受體，該嘌呤黴素篩選庫係以該未經標示之一級抗體之100nM稀釋液於冰上染色30分鐘，接著以FACS緩衝液清洗二次，加入1：200稀釋之物種特異性PE標示之驢抗IgG(H+L)F(ab’)2。細胞係利用BD FACS Calibur及FlowJo 8.8.6軟體進行FACS分析。
各細胞庫之相對染色係摘要於表10。
具有類似序列之抗體之間(MOR-7480、MOR-7480.1、MOR-7480.2、MOR-7483、及MOR-7483.1)的結合差異係顯示於殖株N&E.5內之突變，表示抗體辨識之決定簇係位於該突變區以內。
為了測定這些抗體對人4-1BB胞外結構域及人4-1BB胞外結構域之突變(N&E.5突變)的相對親和性，測定各種 抗體之劑量反應FACS曲線。經Alexa Fluor 647標示之MOR_7480、MOR_7480.1、及MOR_7480.2係稀釋於自1uM於8點1：5稀釋系列之FACS緩衝液中，並用於染色親代300-19、hu4-1BB、hu4-1BB N&E.5、及犬4-1BB細胞庫。該等細胞係利用BD FACS Calibur及FlowJo 8.8.6軟體進行FACS分析。各種受體表現庫之幾何平均螢光係經標準化至親代細胞之染色並以倍數染色表現，測定劑量反應之EC50。該EC50資料顯示於表11。注意到MOR_7480.2及MOR_7480二者對人4-1BB突變N&E.5之結合降低超過5倍。
抗體之促效劑活性(螢光素酶活性試驗)
表現人4-1BB與穩定嵌入NFkB螢光素酶報導子之293T細胞係經製備。細胞係經收集、清洗及重新懸浮於不含酚紅之完全培養基(含10%胎牛血清、HEPES緩衝液、非必需胺基酸及L-麩醯胺酸之DMEM)，密度為0.6×106細胞/mL。50μl之細胞被接種於白色96孔盤(麻州瓦爾珊(Waltham,MA)珀金埃爾默(Perkin Elmer)公司)之各測試孔槽。測試抗體被以2.5：1比例添加於存在交叉連接抗體 Fab’山羊抗人IgG Fc(Jackson ImmunoResearch,West Grove,PA)之各孔槽中。該孔盤係於37℃培養5小時。75μl之Bright-Glo螢光素酶試劑(普羅麥加(Promega)公司，Madison WI)係經添加，該螢光素酶活性之量係利用Packard TopCount NXT閃爍計數器測量。
表現馬來猴4-1BB之293T細胞係藉由病毒轉導及以2μg/ml嘌呤黴素篩選穩定庫製備。表現Cyno 4-1BB之293T細胞係經接種至T-75角瓶至大約長滿60至70%，接著以10μg pLuc_6xNFkB加0.1μg pRL-CMV作為轉染對照加以轉染。轉染係利用Fugene 6轉染試劑(羅氏(Roche)藥廠，Indianapolis,IN)進行，以6μl Fugene對1μg質體DNA之比例根據製造商說明進行。細胞在隔天經收集、清洗及重新懸浮於不含酚紅之完全培養基(含10%胎牛血清、非必需胺基酸及L-麩醯胺酸之DMEM)，密度為0.6×106細胞/mL。50μl之細胞被接種於白色96孔盤(麻州瓦爾珊(Waltham,MA)珀金埃爾默(Perkin Elmer)公司)之各測試孔槽。測試抗體被以2.5：1比例添加於存在交叉連接Fab’山羊抗人IgG Fc抗體(Jackson ImmunoResearch,West Grove,PA)之各孔槽中。該孔盤係於37℃培養5小時。75μl之螢光素酶試劑係經添加，該螢火蟲螢光素酶活性之量係利用Packard TopCount NXT閃爍計數器測量。此外，75μl之Stop & Glo試劑係經添加以評估水母冷光酶活性。該水母冷光酶活性之量係利用Pakcard TopCount NXT閃爍計數器測量。結果顯示於圖2。
抗體之促效劑活性(初代T細胞IL-2釋放試驗)
Nunc Maxisorp 96孔盤在進行孔盤包覆前以UV滅菌。測試抗體係於PBS中稀釋至60μg/ml。0.2ml之該經稀釋之抗體被分至聚丙烯96孔盤之2孔，並以1：3連續稀釋。50μl之該經稀釋之Ab係經添加至該無菌Maxisorp 96孔測試板，並立刻添加50μl之20μg/ml抗人CD3ε殖株UCHT1(Biolegend San Diego,CA)。所有孔盤接著於4℃隔夜培養。隔天經Ab包覆之孔盤以PBS清洗一次，添加0.15ml RPMI完全培養基至該Nunc Maxisorp孔盤之孔槽。人T細胞係以本發明先前他處所述之方式分離，在各孔中添加50μl之2×106細胞/ml之經純化之T細胞(100,000細胞/孔)。細胞係於37℃、5%CO2中培養3天。收集各孔之上清液，立刻進行測試或儲存於-20℃直到測試。在進行IL-2 ELISA試驗前(R&D Systems,Minneapolis,MN)，上清液係以完全培養基稀釋。結果顯示於圖3。
實施例7：由4-1BB抗體於活體內所誘導之人淋巴球擴增
由於缺乏可偵測之該等4-1BB抗體與該鼠4-1BB之交叉反應及需要人免疫細胞之存在，因此需要開發模型以用於活體內評估該等4-1BB抗體之功能。具有NOD基因背景之帶有嚴重複合性免疫不全(SCID)突變及IL-2受體共同γ鏈缺損(統稱為NSG)之小鼠能支持大量人週邊血液白血球(huPBL)之植入及維持植入至少30天(King,2008, Clin.Immunol.126：303-314)。此小鼠模型(亦稱為huPBL-NSG模型)係用於評估活體內全身性投予該等抗體對人免疫細胞之功能效應。特別地，6百萬個新鮮分離之人PBMC經靜脈注射過繼轉移至NOD.Cg-Prkdcscid Il2rgtmlWjl/SzJ(NSG)宿主小鼠。在PBMC注射9天後，該等動物經腹膜內注射投予單一1mg/kg劑量之MOR7480、MOR7480.1或IgG2同型對照抗體。在PBMC植入後第24至28天，PBMC係以抗人及鼠CD45之抗體染色並由流式細胞分析檢測。前向及側向散射圖被用於測定淋巴細胞閘極。如圖4所示，MOR7480及MOR7480.1能增強人淋巴球之擴增，其中人CD45+細胞於經植入小鼠之週邊血液中之比例增加。在各組中，n6隻小鼠。
此外，以MOR7480.1處理馬來猴增加PBMC樣本中細胞毒性中央記憶T細胞(CD8 TCM)之增生。馬來猴(每劑量2隻動物)係經給予所示劑量之MOR7480.1之單一靜脈注射。PBMC係於該抗體劑量之前(投藥前)7天及相對於投予MOR7480.1(試驗第1天)之該所示之試驗天數收集。PBMC係以抗CD3、CD4、CD8、CD28、CD95、及Ki-67之抗體染色，並經由流式細胞分析測定。資料係於Canto II(Beckton Dickinson)上收集，並利用DIVA軟體(Becton Dickinson)分析。CD8中央記憶細胞被識別為CD3+、CD8+、CD28+及CD95+。資料係以個別動物(以劑量-動物編號命名)顯示，以Ki-67+細胞數量相對於試驗前數量之動物內變化表示{[(該所示天數之Ki-67+細胞數-投藥前之 Ki-67+細胞數)/投藥前之Ki-67+細胞數]*100}。如圖5所示，在試驗的頭7至13天在所有以0.3mg/kg或更高劑量治療之組別中的至少一隻動物發現增生性中央記憶T細胞增加1.5倍或更高。
實施例8：4-1BB抗體之抗腫瘤活性(活體內模型) PC3人***癌模型
該等4-1BB抗體缺乏鼠交互反應使標準鼠同源或人異種移植腫瘤模型無法用於評估該等抗體之抗人腫瘤療效。因此，新的huPBL-SCID-Bg異種腫瘤小鼠模型係利用SCID-Bg小鼠(CB.17/lcr.Cg PkrdcscidLystbg/Crl)建立，其具有beige(Bg)突變缺乏小鼠T及B淋巴細胞及功能性NK細胞。該等4-1BB抗體之抗人腫瘤療效係利用此模型如下所述之評估。
該PC3人***或LOVO人結腸細胞系係得自美國菌種保存中心(American Type Culture Collection)，並於添加下列Invitrogen添加物之RPMI-1640(Invitrogen)中培養：L-麩醯胺酸、丙酮酸鈉、非必需胺基酸、青黴素/鏈黴素、Hepes、及10%熱不活化之胎牛血清(FBS；產品編號F2442，西格瑪奧德里奇(Sigma Aldrich)公司)。細胞係於T-225 Falcon角瓶中生長至長滿。接著，細胞以胰蛋白酶消化(胰蛋白酶0.25%-EDTA；產品編號2500-056，Invitrogen)，使細胞於Hyperflask(產品編號3319，康寧生命科學(Corning Life Sciences)公司)中放大生長三天。使 用胰蛋白酶收集細胞系，該細胞系以添加10% FBS之冰冷PRMI清洗三次。自健康志願者收集不超過300ml之週邊血液。週邊血液淋巴細胞(PBMC)係自根據製造商說明使用Accuspin試管(產品編號A0561-100x 15ml，奧德里奇(Aldrich)公司)取得之肝素化血液分離。經計算之細胞懸浮液係經組合以使各小鼠在單一快速濃注之0.2mL PBS中接受1.5×106 PBMC及3×106腫瘤細胞之注射。該經組合之細胞懸浮液係以冷PBS清洗二次後置於冰上，並立即注射至準備好之小鼠。
每隻小鼠在該動物之右側腹皮下注射0.2mL體積之該經組合之細胞懸浮液，並在左側腹皮下注射給予單一劑量(0.2mL)之4-1BB抗體或對照抗體。腫瘤測量係在試驗期間每周以Pressier卡尺測量二次，同時記錄體重。腫瘤體積係利用下式計算：長度×寬度2×0.44=體積(mm3)。在實驗結束前，若腫瘤體積達到2000mm3或動物體重減輕20%，則自該試驗移除該小鼠。在第23天，所有組別之小鼠皆根據IACUC之規定安樂死(圖6)。腫瘤生長抑制百分比係於該試驗最後一天測量並以100-{1-(治療組最後一天/對照組最後一天)}計算。在注射後第6天測量腫瘤時觀察到類似結果，該等動物根據腫瘤體積隨機分組，並在移植後第7天給予單一4-1BB mAb劑量。對大部分試驗而言，各組包含8隻小鼠。
實施例9：活體內評估4-1BB抗體於人4-1BB基因置入小 鼠體內之活性 人4-1BB基因置入小鼠之產製
為了更清楚地了解該些不與鼠4-1BB交叉反應之抗人4-1BB單株抗體的免疫調節活性，產製其中小鼠4-1BB基因係由人4-1BB基因取代之小鼠模型。攜帶人或鼠4-1BB基因組片段之細菌性人工染色體(BAC)殖株係購自Invitrogen公司(Carlsbad,CA)，並根據Red/ET重組技術(Zhang,1998,Nat Genet 20：123-128)用於建構該4-1BB標的載體。首先，在pBR322主鏈上組裝挽回載體，以使得在被Xba1消化打開時，該二個鼠/人嵌合性同源臂(各為400bps)將自該人4-1BB BAC殖株取回19,994bps之始於位於外顯子2之轉譯起始密碼子ATG及終於外顯子8之終止密碼子TGA之人4-1BB基因組序列。第二，在PGK/EM7啟動子控制下之新黴素表現匣係經組裝，旁側連接與該人4-1BB基因之內含子2序列同源之100個鹼基對(bps)之序列。此新黴素表現匣接著被標的進入得自步驟1之該取回之人4-1BB基因組片段。最後，攜帶該新黴素表現匣之該經取回之人4-1BB基因組片段被標的進入鼠BAC殖株，以利用該經修飾之自ATG起始密碼子至TGA終止密碼子之人4-1BB基因組片段取代該鼠4-1BB基因。
此BAC標的載體係遵照電穿孔標準程序進入具有C57BL/6NTAC背景之鼠胚胎幹細胞系(PRX-BL6N #1,Primogenix,Laurie,MO.)，在G418(又稱遺傳黴素)篩選下 存活之殖株由二個針對鼠4-1BB基因之內含子2及外顯子8之Taqman試驗篩選，以識別在該鼠4-1BB基因座之處已被同源性重組機轉修飾之殖株。在116個經篩選之ES殖株中，7個殖株被發現已經喪失該鼠4-1BB基因座之一個等位基因(標的效率6%)。核型分析及原位雜交(FISH)係由科里爾(Coriell)醫學研究所(紐澤西州肯頓市(Camden,N.J.)進行。以LH15殖株而言，20個細胞中之19個係40XY，以LH80而言，20個細胞中之20個係40XY。在這二個殖株中，使用攜帶該4-1BB基因作為探針之鼠BAC殖株之FISH顯示，在E2條帶之區域中的染色體4對之各者上有一個4-1BB雜交信號。在任何其他位置皆未見信號。
二個殖株LH15及LH80都被注射至BALB/c小鼠品系之胚囊，將胚胎植入CD1假懷孕母鼠以懷孕。雄性嵌合體動物係與C57BL/6背景之EIIa-cre小鼠交配以移除新黴素抗藥性匣，具人4-1BB基因同型接合子之小鼠被用於此試驗中。
4-1BB促效劑單株抗體媒介淋巴細胞增生
4-1BB促效劑單株抗體誘導淋巴細胞增生之能力係於4-1BB基因置入小鼠評估。4-1BB基因置入小鼠於試驗第0天經由腹膜內注射30mg/kg之MOR7480.1(每周投藥之動物於第0天及第7天接受4-1BB單株抗體注射)。在樣本收集前24小時，動物經腹膜內注射2mg BrdU。在該 所示之投藥後天數，經由心臟穿刺採集週邊血液樣本。PBMC係以抗CD3、CD4、CD8、及BrdU之抗體染色，並經由流式細胞分析評估。結果顯示於圖7之A圖。
4-1BB促效劑單株抗體媒介抗腫瘤療效
MOR7480.1之抗腫瘤療效係於4-1BB基因置入小鼠中評估，使用經工程化以表現卵白蛋白(OVA)模型抗原及螢光素酶(luc)之B16-OVA/luc黑色素瘤細胞系。一百萬個腫瘤細胞被植入4-1BB基因置入小鼠之側腹。當腫瘤長至大約50-100mm3時(腫瘤接種後大約7至10天)，根據腫瘤大小使動物隨機分組，給予該所示劑量之4-1BB單株抗體之單次注射。腫瘤大小係以卡尺測量評估，每周二至三次直到試驗結束。結果顯示於圖7之B圖。
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Claims (24)

  1. 一種與4-1BB結合之人單株抗體或彼之抗原結合部分，其中該單株抗體或彼之抗原結合部分包含：(a)包含SEQ ID NO：1之胺基酸序列的VH CDR1結構域；包含SEQ ID NO：2之胺基酸序列的VH CDR2結構域；包含SEQ ID NO：3之胺基酸序列的VH CDR3結構域；包含SEQ ID NO：6之胺基酸序列的VL CDR1結構域；包含SEQ ID NO：7之胺基酸序列的VL CDR2結構域；及，包含SEQ ID NO：8之胺基酸序列的VL CDR3結構域；(b)包含SEQ ID NO：15之胺基酸序列的VH CDR1結構域；包含SEQ ID NO：16之胺基酸序列的VH CDR2結構域；包含SEQ ID NO：17之胺基酸序列的VH CDR3結構域；包含SEQ ID NO：20之胺基酸序列的VL CDR1結構域；包含SEQ ID NO：21之胺基酸序列的VL CDR2結構域；及，包含SEQ ID NO：22之胺基酸序列的VL CDR3結構域；或(c)包含SEQ ID NO：29之胺基酸序列的VH CDR1結構域；包含SEQ ID NO：30之胺基酸序列的VH CDR2結構域；包含SEQ ID NO：31之胺基酸序列的VH CDR3結構域；包含SEQ ID NO：34之胺基酸序列的VL CDR1結構域；包含SEQ ID NO：35之胺基酸序列的VL CDR2結構域；及，包含SEQ ID NO：55之胺基酸序列的VL CDR3結構域。
  2. 如申請專利範圍第1項之單株抗體或彼之抗原結合部分，其中該單株抗體或彼之抗原結合部分具有至少一種選自下述之性質：(a)與人4-1BB結合且包含人VH 3-23基因、VH 1-69基因或VH 5基因之產物或衍生物之重鏈可變區；和(b)與人4-1BB結合且包含人VL λ3或λ1-13基因之產物或衍生物之輕鏈可變區。
  3. 如申請專利範圍第1項之單株抗體或彼之抗原結合部分，其中該單株抗體或彼之抗原結合部分具有下列性質或特徵之一或多者：(a)與人4-1BB特異性結合；(b)與人和馬來猴(cynomolgus)4-1BB結合；(c)與人4-1BB或馬來猴4-1BB結合，但不與大鼠或小鼠4-1BB結合；及(d)係IgG。
  4. 如申請專利範圍第2項之單株抗體或彼之抗原結合部分，其中該單株抗體或彼之抗原結合部分具有該等性質(a)和(b)二者。
  5. 如申請專利範圍第1至4項中任一項之單株抗體或彼之抗原結合部分，其包含(a)SEQ ID NO：4之VH區胺基酸序列和SEQ ID NO：9之VL區胺基酸序列；(b)SEQ ID NO：18之VH區胺基酸序列和SEQ ID NO：23之VL區胺基酸序列；(c)SEQ ID NO：32之VH區胺基酸序列和SEQ ID NO：56之VL區胺基酸序列；(d)SEQ ID NO：43之VH區胺基酸序列和SEQ ID NO：60之VL區胺基酸序列；或(e)SEQ ID NO：43之VH區胺基酸序列和SEQ ID NO：64之VL區胺基酸序列。
  6. 如申請專利範圍第1至4項中任一項之單株抗體或彼之抗原結合部分，其中該單株抗體包含(a)SEQ ID NO：5之重鏈胺基酸序列和SEQ ID NO：10之輕鏈胺基酸序列；(b)SEQ ID NO：19之重鏈胺基酸序列和SEQ ID NO：24之輕鏈胺基酸序列；(c)SEQ ID NO：33之重鏈胺基酸序列和SEQ ID NO：57之輕鏈胺基酸序列；(d)SEQ ID NO：44之重鏈胺基酸序列和SEQ ID NO：61之輕鏈胺基酸序列；或(e)SEQ ID NO：44之重鏈胺基酸序列和SEQ ID NO：65之輕鏈胺基酸序列。
  7. 如申請專利範圍第5項之單株抗體或彼之抗原結合部分，其係IgG1。
  8. 如申請專利範圍第1至4項中任一項之單株抗體或彼之抗原結合部分，其中該單株抗體或彼之抗原結合部分與人4-1BB胞外域結合，且其中該結合經SEQ ID NO：68之一或多個選自K115Q、C121R、R134Q、R154S或V156A之突變而喪失。
  9. 如申請專利範圍第8項之單株抗體或彼之抗原結合部分，其中該SEQ ID NO：68之一或多個突變包含K115Q、C121R、R134Q、R154S及V156A。
  10. 如申請專利範圍第1至4項中任一項之單株抗體或彼之抗原結合部分，其中該單株抗體包含人IgG1恆定結構域，該人IgG1恆定結構域包含SEQ ID NO：69之胺基酸序列。
  11. 如申請專利範圍第10項之單株抗體或彼之抗原結合部分，其中SEQ ID NO：69之C端離胺酸殘基不存在。
  12. 一種醫藥組成物，其包含如申請專利範圍第1至11項中任一項之單株抗體或彼之抗原結合部分及醫藥上可接受之載劑。
  13. 一種如申請專利範圍第1至11項中任一項之單株抗體或彼之抗原結合部分或如申請專利範圍第12項之醫藥組成物於製備供減緩腫瘤生長的藥物之用途。
  14. 一種如申請專利範圍第1至11項中任一項之單株抗體或彼之抗原結合部分或如申請專利範圍第12項之醫藥組成物於製備供減少腫瘤細胞轉移的藥物之用途。
  15. 一種如申請專利範圍第1至11項中任一項之單株抗體或彼之抗原結合部分或如申請專利範圍第12項之醫藥組成物於製備供治療癌症的藥物之用途。
  16. 如申請專利範圍第15項之用途，其中該癌症選自：肺癌、肺泡細胞癌、支氣管腺瘤、軟骨瘤性錯構瘤、肉瘤、骨癌、尤因氏(Ewing's)肉瘤、網狀細胞肉瘤、腦癌、神經膠質瘤、退行性星狀細胞瘤、星狀細胞瘤、寡樹突細胞瘤、神經管胚細胞瘤、脊索瘤、神經鞘瘤、室管膜瘤、腦脊髓膜瘤、腦下垂體腺瘤、松果體瘤、骨瘤、血管母細胞瘤、顱咽管瘤、脊索瘤、胚細胞瘤、畸胎瘤、皮樣囊腫、血管瘤、消化系統之癌、平滑肌瘤、表皮樣癌、腺癌、平滑肌肉瘤、胃腺癌、小腸脂瘤、小腸神經纖維瘤、小腸纖維瘤、大腸息肉、結直腸癌、肝癌、肝細胞腺瘤、肝血管瘤、肝細胞癌、纖維板層癌、膽管癌、肝母細胞瘤、血管肉瘤、腎癌、腎腺癌、腎細胞癌、腎上腺瘤、腎盂移行細胞癌、膀胱癌、血癌、急性淋巴細胞性(淋巴胚細胞)白血病、急性骨髓樣(骨髓細胞性、骨髓性、骨髓胚細胞性、骨髓單球性)白血病、慢性淋巴細胞性白血病、西澤里(Sezary)症候群、髮樣細胞白血病、慢性骨髓細胞性(骨髓樣、骨髓性、顆粒球性)白血病、霍奇金氏(Hodgkin's)淋巴瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、B細胞淋巴瘤、蕈狀肉芽腫、骨髓增生性疾病、真性多血症、骨髓纖維化、血小板增多症、慢性骨髓細胞性白血病、皮膚癌、基底細胞癌、鱗狀細胞癌、黑色素瘤、卡波西氏(Kaposi's)肉瘤、佩吉特氏(Paget's)症、頭頸癌、眼相關性癌、視網膜胚細胞瘤、眼內黑癌、雄性生殖系統癌、良性***增生、***癌、睪丸癌、精細胞瘤、畸胎瘤、胚胎性癌、絨毛膜癌、乳癌、雌性生殖系統癌、子宮癌、子宮內膜癌、子宮頸癌症、子宮頸癌、卵巢之癌、卵巢癌、***癌、***癌、輸卵管癌、水囊狀胎塊、甲狀腺癌、乳突性癌、濾泡性癌、退行性癌、髓質癌、嗜鉻細胞瘤、副甲狀腺之非癌性生長、胰癌、白血病及骨髓瘤。
  17. 如申請專利範圍第16項之用途，其中該癌症選自結直腸癌、非霍奇金氏(Hodgkin's)淋巴瘤、***癌或黑色素瘤。
  18. 如申請專利範圍第13至17項中任一項之用途，其中該藥物另包含免疫治療劑。
  19. 如申請專利範圍第18項之用途，其中該免疫治療劑係利妥昔單抗(rituximab)。
  20. 一種經分離之核酸分子，其包含編碼多肽之核苷酸序列，該多肽包含如申請專利範圍第1至11項中任一項之單株抗體或彼之抗原結合部分的如SEQ ID NO：5、SEQ ID NO：19、SEQ ID NO：33或SEQ ID NO：44所示之重鏈胺基酸序列和如SEQ ID NO：10、SEQ ID NO：24、SEQ ID NO：57、SEQ ID NO：61或SEQ ID NO：65所示之輕鏈胺基酸序列。
  21. 如申請專利範圍第20項之經分離之核酸分子，其包含一或多個選自SEQ ID NO：11、12、13、14、25、26、27、28、39、41、47、49、58、59、62、63、66或67之核苷酸序列。
  22. 一種載體，其包含如申請專利範圍第21項之經分離之核酸分子。
  23. 一種宿主細胞，其包含如申請專利範圍第22項之載體。
  24. 一種產製如申請專利範圍第1至11項中任一項之單株抗體或彼之抗原結合部分之方法，其包含於如申請專利範圍第23項之宿主細胞中表現該單株抗體。
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