ES2533266T5 - Purificación de anticuerpos mediante cromatografía de intercambio catiónico - Google Patents

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Description

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DESCRIPCION
Purificación de anticuerpos mediante cromatografía de intercambio catiónico Solicitudes relacionadas Antecedentes de la invención Campo de la invención
Esta invención se refiere en líneas generales a la purificación de proteínas. En particular, la invención se refiere a un método para purificar anticuerpos de una composición que comprende el anticuerpo y al menos un contaminante usando cromatografía de intercambio catiónico, donde se usa una etapa de lavado a alto pH para retirar los contaminantes antes de eluir el anticuerpo deseado usando un tampón de elución con conductividad aumentada.
Descripción de la técnica relacionada
La purificación económica a gran escala de proteínas es un problema cada vez más importante para la industria de biotecnología. Generalmente, las proteínas se producen por cultivo celular, usando líneas celulares eucariotas o procariotas modificadas por ingeniería para producir la proteína de interés por inserción de un plásmido recombinante que contiene el gen para esa proteína. Como las células habitualmente usadas son organismos vivos, deben nutrirse con un medio de crecimiento complejo, que contiene azúcares, aminoácidos, y factores de crecimiento, habitualmente suministrados a partir de preparaciones de suero animal. La separación de la proteína deseada de la mezcla de compuestos suministrados a las células y de los subproductos de las propias células a una pureza suficiente para su uso como agente terapéutico humano supone un reto formidable.
Los procedimientos para la purificación de proteínas de los desechos celulares inicialmente dependen de la expresión de la proteína. Algunas proteínas pueden empacarse para secretarse desde la célula al medio de cultivo adyacente; otras pueden prepararse de forma intracelular. Para las últimas proteínas, la primera etapa de un proceso de purificación implica la lisis de la célula, que puede hacerse mediante diversos métodos, incluyendo corte mecánico, choque osmótico, o tratamientos enzimáticos. Dicha alteración libera los contenidos completos de la célula en el homogeneizado, y además produce fragmentos subcelulares que son difíciles de retirar debido a su pequeño tamaño. Éstos generalmente se retiran por centrifugación diferencial o por filtración. El mismo problema surge, aunque a menor escala, con proteínas secretadas directamente debido a la muerte natural de las células y liberación de las proteínas intracelulares de la célula hospedadora en el trascurso del proceso de producción de proteínas.
Una vez se ha obtenido una solución aclarada que contiene la proteína de interés, su separación de las otras proteínas producidas por la célula se intenta habitualmente usando una combinación de diferentes técnicas de cromatografía. Estas técnicas separan mezclas de proteínas en base a su carga, grado de hidrofobicidad, o tamaño. Están disponibles varias resinas de cromatografía diferentes para cada una de estas técnicas, que permiten la adaptación precisa del esquema de purificación a la proteína particular implicada. La esencia de cada uno de estos métodos de separación es que puede causarse que las proteínas se muevan a diferentes velocidades a lo largo de una columna, consiguiendo una separación física que aumenta según pasan bajando por la columna, o se adhieran selectivamente al medio de separación, eluyéndose entonces de forma diferencial por diferentes disolventes. En algunos casos, la proteína deseada se separa de las impurezas cuando las impurezas se adhieren específicamente a la columna, y la proteína de interés no, es decir, la proteína de interés está presente en el "flujo continuo".
La cromatografía de intercambio iónico es una técnica cromatográfica que se usa habitualmente para la purificación de proteínas. En cromatografía de intercambio iónico, parches cargados sobre la superficie del soluto se atraen por cargas opuestas unidas a la matriz de cromatografía, con la condición de que la fuerza iónica del tampón que rodea sea baja. La elución se consigue generalmente aumentando la fuerza iónica (es decir la conductividad) del tampón para competir con el soluto por los sitios cargados de la matriz de intercambio iónico. Cambiar el pH y de ese modo alter la carga del soluto es otro modo de conseguir la elución del soluto. El cambio en la conductividad o pH puede ser gradual (elución en gradiente) o por etapas (elución en etapas). En el pasado, estos cambios han sido progresivos; es decir, el pH o la conductividad se aumenta o disminuye en una única dirección
Las patentes de Estados Unidos N° 6.339.142, 6.417.355, 6.489.447, y 7.074.404 (Basey et al.) describen cromatografía de intercambio iónico para purificar polipéptidos. Las patentes de Estados Unidos N° 6.127.526, 6.333.398, y 6.797.814 (Blank, G.) describen purificación de proteínas, tales como anticuerpos anti-HER2, por cromatografía en proteína A. Los métodos para purificar proteínas, tales como anticuerpos, por cromatografía de intercambio iónico se describen en la publicación de solicitud de Estados Unidos N° 2004/0082047.
La patente de Estados Unidos N° 5.110.913 se refiere a la purificación de un anticuerpo en una solución acuosa uniendo el anticuerpo a una resina de intercambio iónico a un primer pH de 4,6, lavando a un segundo pH de 5,5, y eluyendo el anticuerpo a pH 6,5, donde la fuerza iónica de las soluciones de estas tres etapas permanece constante.
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Zhang et al. se refieren a cromatografía de intercambio aniónico en membrana Q de un anticuerpo humano (Zhang et al. "Q Membrane Chromatography Application for Human Antibody Purification Process," Póster presentado en BioProduction, Oct. 26-27, Múnich, Alemania, 2004). Otras publicaciones referentes a la purificación de proteínas incluyen: Barnthouse et al. J. Biotech. 66: 125-136 (1998); Blank et al. Bioseparation 10: 65-71 (2001); Follman y Fahrner J. Chromatog. 1024: 79-85 (2004); Iyer et al. BioPharm 15(1 ):14-16, 18, 20, 53 (2002); documento US 2004/0082047A1; documento EP 333.574; documento EP 460.426 B1; documento EP 556.083; documento WO
89/05157;
documento WO 92/22653; documento WO 93/06217; documento WO 95/22389; documento WO
96/33208;
documento WO 96/40883; documento US 4.753.894; documento US 4.966.851 documento US
5.110.913
; documento US 5.112.951; documento US 5.115.101; documento US 5.118.796 ; documento US
5.169.774
; documento US 5.196.323; documento US 5.256.769; documento US 5.279.823 ; documento US
5.429.746
; documento US 5.451.662; documento US 5.525.338; documento US 5.677.171 ; documento US
6.005.081
; documento US 6.054.561; documento US 6.127.526; documento US 6.267.958 ; documento US
6.339.142
documento US 6.417.335; documento US 6.489.447; Adachi et al., Journal of Chromatography. A. 763 (1-
2): 57-63 (Feb 28, 1997); Gagnon, P. Purification Tools for Monoclonal Antibodies, Tucson: Validated Biosystems, Inc., Capítulo 4, pág. 57-86 (1996); Graf et al., Bioseparation 4(1):7-20 (Feb 1994); Mhatre et al., Journal of Chromatography A 707(2):225-231 (Jul 21, 1995); Neidhardt et al., Journal of Chromatography 590(2): 255-261 (1992); Protein Purification Applications - A Practical Approach, Harris y Angal, IRL Press pág. 151-156 (1995); Sofer et al. Handbook of Process Chromatography: A Guide to Optimization, Scale-up, and Validation, San Diego: Academic Press pág. 65-80 (1997); Tishchenko et al., Journal of Chromatography B 706(1):157-166 (Feb 27, 1998).
Sumario de la invención
La invención de este documento se refiere a un método mejorado para cromatografía de intercambio catiónico de anticuerpos en que se usa una etapa de lavado a alto pH para retirar los contaminantes antes de eluir el producto deseado de anticuerpo. El proceso provoca, entre otras cosas, una eliminación mejorada de contaminantes de proteínas de ovario de hámster chino (CHOP).
De acuerdo con un primer aspecto, la invención proporciona un método para purificar un anticuerpo de una composición que comprende el anticuerpo y al menos un contaminante, comprendiendo dicho método las etapas secuenciales de:
(a) cargar la composición en un material de intercambio catiónico donde la composición está a un primer pH de 4,0 a 6,0;
(b) lavar el material de intercambio catiónico con un primer tampón de lavado a un pH que es mayor que el de la composición en (a), donde el pH del primer tampón de lavado es de aproximadamente 6,8 a aproximadamente
9,0;
(c) lavar el material de intercambio catiónico con un segundo tampón de lavado a un pH que es menor que el del primer tampón de lavado: donde el pH del segundo tampón de lavado es de 5,0 a 6,0
(d) eluir el anticuerpo del material de intercambio catiónico con un tampón de elución a una conductividad que es al menos 2mS/cm mayor que la del segundo tampón de lavado;
en el que el anticuerpo es bevacizumab.
En el presente documento se desvela a un método para purificar un anticuerpo que se une a CD20 humana de una composición que comprende el anticuerpo y uno o más contaminantes seleccionados entre el grupo que consiste en proteínas de ovario de hámster chino (CHOP), proteína A lixiviada, ADN, y anticuerpo agregado contra CD20, comprendiendo dicho método las etapas secuenciales de:
(a) cargar la composición en un material de intercambio catiónico donde la composición está a un pH de aproximadamente 4,0 a aproximadamente 6,0;
(b) lavar el material de intercambio catiónico con un primer tampón de lavado a un pH de aproximadamente 6,8 a aproximadamente 9,0;
(c) lavar el material de intercambio catiónico con un segundo tampón de lavado a un pH de aproximadamente 5,0 a aproximadamente 6,0; y
(d) eluir el anticuerpo del material de intercambio catiónico usando un tampón de elución con un pH de aproximadamente 5,0 a aproximadamente 6,0 y una conductividad de aproximadamente 10 a aproximadamente 100 mS/cm. Preferiblemente el anticuerpo contra CD20 es rituximab.
De acuerdo con una realización preferida, la invención se refiere a un método para purificar bevacizumab de una composición que comprende el anticuerpo y uno o más contaminantes seleccionados entre el grupo que consiste en un componente de medio de cultivo, garamicina, proteínas de ovario de hámster chino (CHOP), ADN, contaminante viral, y anticuerpo agregado contra VEGF, comprendiendo dicho método las etapas secuenciales de:
(a) cargar la composición en un material de intercambio catiónico donde la composición está a un pH de aproximadamente 4,0 a aproximadamente 6,0;
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(b) lavar el material de intercambio catiónico con un primer tampón de lavado a un pH de aproximadamente 6,8 a aproximadamente 8,0;
(c) lavar el material de intercambio catiónico con un segundo tampón de lavado a un pH de aproximadamente 5,0 a aproximadamente 6,0; y
(d) eluir el anticuerpo del material de intercambio catiónico usando un tampón de elución con un pH de aproximadamente 5,0 a aproximadamente 6,0 y una conductividad de aproximadamente 10 a aproximadamente 100 mS/cm.
Breve descripción de los dibujos
Las Figuras 1A y 1B proporcionan las secuencias de aminoácidos de la cadena pesada (SEC ID N° 1) y cadena ligera (SEC ID N° 2) del anticuerpo rituximab. Cada una de las regiones flanqueantes (FR1-4) y cada una de las regiones CDR (CDR1-3) en cada región variable están identificadas, que son la secuencia constante de cadena pesada gamma 1 humana y secuencia constante de cadena ligera kappa humana. La región pesada variable (VH) está en la SEC ID N° 3. La región ligera variable (VL) está en la SEC ID N° 4. Los identificadores de secuencia para las CDR son: CDR H1 (SEC ID N° 5), CDR H2 (SEC ID N° 6), CDR H3 (SEC ID N° 7), CDR L1 (SEC ID N° 8), CDR L2 (SEC ID N° 9), y CDR L3 (SEC ID N° 10).
Las Figuras 2A y 2B proporcionan las secuencias de aminoácidos de la cadena pesada (SEC ID N° 11) y cadena ligera (SEC ID N° 12) del anticuerpo bevacizumab. El extremo de cada región variable está indicado con ||. La región pesada variable (VH) está en la SEC ID N° 13. La región ligera variable (VL) está en la SEC ID N° 14. Cada una de las tres CDR en cada región variable está subrayada. Los identificadores de secuencia para las CDR son: CDR H1 (SEC ID N° 15), CDR H2 (SEC ID N° 16), CDR H3 (SEC ID N° 17), CDR L1 (SEC ID N° 18), CDR L2 (SEC ID N° 19), y CDR L3 (SEC ID N° 20).
La Figura 3 proporciona una comparación lado a lado de la eliminación de proteínas de la célula hospedadora por el proceso de cromatografía de intercambio catiónico del proceso mejorado de rituximab en comparación con el proceso original. Se consiguió eliminación superior de CHOP con el nuevo proceso.
Descripción detallada de la realización preferida
Definiciones:
En este documento, los intervalos numéricos o cantidades precedidos por el término "aproximadamente" incluyen expresamente el intervalo exacto o cantidad numérica exacta.
La "composición" a purificar en este documento comprende el anticuerpo de interés y uno o más contaminantes. La composición puede estar "parcialmente purificada" (es decir, se ha sometido a una o más etapas de purificación) o puede obtenerse directamente de una célula u organismo hospedador que produce el anticuerpo (por ejemplo, la composición puede comprender fluido recogido de cultivo celular).
Como se usa en este documento, "polipéptido" se refiere en líneas generales a péptidos y proteínas que tienen más de diez aminoácidos. Preferiblemente, el polipéptido es una proteína de mamífero, ejemplos de la cual incluyen: renina; una hormona del crecimiento, incluyendo hormona del crecimiento humana y hormona del crecimiento bovina; factor liberador de hormona del crecimiento; hormona paratiroides; hormona estimuladora de tiroides; lipoproteínas; alfa-1-antitripsina; cadena A de insulina; cadena B de insulina; proinsulina; hormona foliculoestimulante; calcitonina; hormona luteinizante; glucagón; factores de coagulación tales como factor VIIIC, factor IX, factor tisular, y factor de von Willebrand; factores anti-coagulantes tales como Proteína C; factor natriurético atrial; tensioactivo pulmonar; un activador de plasminógeno, tal como uroquinasa o activador de plasminógeno (t-PA) de orina humana o tipo tisular; bombesina; trombina; factor de crecimiento hemopoyético; factor de necrosis tumoral-alfa y -beta; encefalinasa; RANTES (regulada en activación normalmente expresada y secretada por células T); proteína inflamatoria de macrófagos humanos (MIP-1-alfa); una albúmina sérica tal como albúmina sérica humana; sustancia inhibidora Muelleriana; cadena A de relaxina; cadena B de relaxina; pro-relaxina; péptido asociado a gonadotropina de ratón; una proteína microbiana, tal como beta-lactamasa; DNasa; IgE; un antígeno asociado a linfocito T citotóxico (CTLA), tal como CTLA-4; inhibina; activina; factor de crecimiento del endotelio vascular (VEGF); receptores de hormonas o factores de crecimiento; Proteína A o D; factores reumatoides; un factor neurotrófico tal como factor neurotrófico derivado de hueso (BDNF), neurotrofina-3, -4, -5, o -6 (NT-3, NT-4, NT-5, o NT-6), o un factor de crecimiento nervioso tal como NGF-P; factor de crecimiento derivado de plaquetas (PDGF); factor de crecimiento de fibroblastos tal como aFGF y bFGF; factor de crecimiento epidérmico (EGF); factor de crecimiento transformante (TGF) tal como TGF-alfa y TGF-beta, incluyendo TGF-P, TGF-P2, TGF-P3, TGF-P4, o TGF-P5; factor de crecimiento tipo insulina-I y -II (IGF-I y IGF-II): des(1-3)-IGF-I (IGF-I cerebral), proteínas de unión al factor de crecimiento tipo insulina (IGFBP); proteínas cD tales como CD3, CD4, CD8, CD 19 y CD20; eritropoyetina; factores osteoinductores; inmunotoxinas; una proteína morfogenética ósea (BMP); un interferón tal como interferón-alfa, -beta, y - gamma; factores estimuladores de colonias (CSF), por ejemplo, M-CSF, GM-CSF, y G-CSF; interleuquinas (IL), por ejemplo, IL-1 a IL-10; superóxido dismutasa; receptores de células T; proteínas superficiales de membrana; factor de aceleración del deterioro; antígeno viral tal como, por ejemplo, una parte de la envuelta del SIDA; proteínas de transporte; receptores mensajeros; adresinas; proteínas reguladoras; integrinas tales como CD11a, CD11b, CD11c, CD18, una ICAM, VLA-4 y VCAM; un antígeno asociado a tumor tal como
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receptor HER2, HER3 o HER4; y fragmentos y/o variantes de cualquiera de los polipéptidos enumerados anteriormente así como anticuerpos, incluyendo fragmentos de anticuerpo, que se unen a cualquiera de los polipéptidos enumerados anteriormente. Un polipéptido preferido es un anticuerpo intacto o un fragmento de anticuerpo que se une a CD20 humana, por ejemplo, rituximab; o un anticuerpo intacto o un fragmento de anticuerpo que se une al factor de crecimiento del endotelio vascular (VEGF), por ejemplo bevacizumab.
Un "contaminante" es un material que es diferente del producto de anticuerpo deseado. El contaminante incluye, sin limitación: materiales de la célula hospedadora, tales como proteínas de ovario de hámster chino (CHOP); proteína A lixiviada; ácido nucleico; una variante, fragmento, agregado o derivado del anticuerpo deseado; otro polipéptido; endotoxina; contaminante viral; componente de medio de cultivo celular (por ejemplo, garamicina; GENTAMYCIN®) etc.
La expresión "material de intercambio catiónico" se refiere a una fase sólida que está cargada negativamente y tiene cationes libres para intercambio con cationes en una solución acuosa pasada sobre o a través de la fase sólida. La carga puede proporcionarse uniendo uno más ligandos cargados a la fase sólida, por ejemplo por unión covalente. Como alternativa, o adicionalmente, la carga puede ser una propiedad inherente de la fase sólida (por ejemplo, como es el caso para sílice, que tiene una carga global negativa). Materiales de intercambio catiónico disponibles en el mercado incluyen carboxi-metil-celulosa, BAKERBOND ABX™, sulfopropilo (SP) inmovilizado en agarosa (por ejemplo, SP-SEPHAROSE FAST FLOW™, SP-SEPHAROSE FAST FLOW XL™ o SP-SEPHAROSE HIGH PERFORMANCE™, de GE Healthcare), CAPTO S™ (GE Healthcare), FRACTOGEL-SO3™, FRACTOGEL-SE HICAP™, y FRACTOPREP™ (EMD Merck), sulfonilo inmovilizado en agarosa (por ejemplo, S-SEPHAROSE FAST FLOW™ de GE Healthcare), y SUPER SP™ (Tosoh Biosciences). Un material preferido de intercambio catiónico en este documento comprende partículas de flujo continuo de poli(estireno-divinilbenceno) reticulado (fase sólida) recubiertas con un polímero polihidroxilado funcionalizado con grupos sulfopropilo (por ejemplo, resina de cromatografía POROS 50 HS®).
Por "fase sólida" se entiende una matriz no acuosa a la cual se pueden adherir uno o más ligandos cargados. La fase sólida puede ser una columna de purificación (incluyendo, sin limitación, columnas de lecho expandido y de lecho compactado), una fase discontinua de partículas discretas, una membrana, o filtro etc. Ejemplos de materiales para formar la fase sólida incluyen polisacáridos (tales como agarosa y celulosa) y otras matrices mecánicamente estables tales como sílice (por ejemplo, vidrio de poro controlado), poli(estireno-divinilbenceno), poliacrilamida, partículas cerámicas y derivados de cualquiera de los anteriores.
El término "carga" en este documento se refiere a la composición cargada en el material de intercambio catiónico. Preferiblemente, el material de intercambio catiónico se equilibra con un tampón de equilibrado antes de cargar la composición que se tiene que purificar.
Un "tampón" es una solución que resiste cambios en el pH mediante la acción de sus componentes conjugados ácido-base. Se describen diversos tampones que pueden emplearse dependiendo, por ejemplo, del pH deseado del tampón en Buffers. A Guide for the Reparation and Use of Buffers in Biological Systems, Gueffroy, D., Ed. Calbiochem Corporation (1975).
Un "tampón de equilibrado" es un tampón que se usa para equilibrar el material de intercambio catiónico, antes de cargar la composición que comprende el anticuerpo de interés y uno o más contaminantes en el material de intercambio catiónico. Preferiblemente el pH del tampón de equilibrado de este documento está en el intervalo de aproximadamente 5,0 a aproximadamente 6,0, preferiblemente aproximadamente 5,5. Preferiblemente, la conductividad del tampón de equilibrado de este documento está en el intervalo de aproximadamente 1 a aproximadamente 8 mS/cm, preferiblemente de aproximadamente 4 a aproximadamente 8 mS/cm, y mucho más preferiblemente de aproximadamente 5 a aproximadamente 8 mS/cm. Opcionalmente, el tampón de equilibrado comprende una sal, tal como NaCl, por ejemplo, en una cantidad de aproximadamente 40 mM a aproximadamente 80 mM, preferiblemente NaCl aproximadamente 60 mM.
La expresión "tampón de lavado" se usa en este documento para hacer referencia al tampón que se pasa sobre el material de intercambio catiónico después de cargar una composición y antes de la elución de la proteína de interés. El tampón de lavado puede servir para retirar uno o más contaminantes del material de intercambio catiónico, sin elución sustancial del producto de anticuerpo deseado. De acuerdo con la realización preferida de la invención de este documento se usan un "primer tampón de lavado" y un "segundo tampón de lavado".
En este documento, la expresión "primer tampón de lavado" se refiere a un tampón de lavado que tiene un pH aumentado respecto al pH de la carga y/o tampón de equilibrado. El primer tampón de lavado puede usarse en este documento para eluir uno o más contaminantes del material de intercambio catiónico, sin eluir sustancialmente el producto de anticuerpo de interés del mismo. El término "primero" no debe interpretarse como excluyente del uso de uno o más tampones adicionales de lavado u otros tampones entre la carga y el primer tampón de lavado. El pH del primer tampón de lavado de este documento está en el intervalo de aproximadamente 6,8 a aproximadamente 9,0, preferiblemente de aproximadamente 7,0 a aproximadamente 8,0, y mucho más preferiblemente pH aproximadamente 7,0 o pH aproximadamente 7,8. Preferiblemente, la conductividad del primer tampón de lavado de
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este documento está en el intervalo de aproximadamente 0,01 a aproximadamente 5 mS/cm, preferiblemente de aproximadamente 0,1 a aproximadamente 3 mS/cm, y mucho más preferiblemente de aproximadamente 0,2 a aproximadamente 2 mS/cm. Opcionalmente, el primer tampón de lavado está sustancialmente libre de sal (tal como NaCl) en el mismo.
La expresión "segundo tampón de lavado" para los propósitos de esta solicitud se refiere a un tampón de lavado usado después del primer tampón de lavado para preparar el material de intercambio catiónico para elución del anticuerpo de interés. El término "segundo" no debe interpretarse como excluyente del uso de uno o más tampones adicionales de lavado u otros tampones entre el primer tampón de lavado y el segundo tampón de lavado. El pH del segundo tampón de lavado de este documento está en el intervalo de aproximadamente 5,0 a aproximadamente 6,0, preferiblemente aproximadamente 5,5, y mucho más preferiblemente pH 5,5. Preferiblemente, la conductividad del segundo tampón de lavado de este documento está en el intervalo de aproximadamente 0,01 a aproximadamente 5 mS/cm, preferiblemente aproximadamente 0,1 a aproximadamente 3 mS/cm, y mucho más preferiblemente de aproximadamente 0,5 a aproximadamente 3,0 mS/cm.
El "tampón de elución" se usa para eluir el anticuerpo de interés de la fase sólida. En este documento, el tampón de elución tiene una conductividad sustancialmente aumentada respecto a la del segundo tampón de lavado, de modo que el producto de anticuerpo deseado eluya del material de intercambio catiónico. La conductividad del tampón de elución es sustancialmente mayor que la de la carga y de cada uno de los tampones precedentes, concretamente del tampón de equilibrado, primer tampón de lavado, y segundo tampón de lavado. Por conductividad "sustancialmente mayor" se entiende, por ejemplo, que el tampón tiene una conductividad que es al menos 2, 3, 4, 5 o 6 unidades de conductividad (mS/cm) mayor que la de la composición o tampón con que se está comparando. En una realización, el pH del tampón de elución es sustancialmente igual al del tampón de equilibrado y/o segundo tampón de lavado. Preferiblemente el pH del tampón de elución de este documento está en el intervalo de aproximadamente 5,0 a aproximadamente 6,0, preferiblemente aproximadamente 5,5, y mucho más preferiblemente pH 5,5. Preferiblemente, la conductividad del tampón de elución de este documento está en el intervalo de aproximadamente 10 mS/cm a aproximadamente 100 mS/cm, preferiblemente de aproximadamente 12 mS/cm a aproximadamente 30 mS/cm, y mucho más preferiblemente de aproximadamente 12 a aproximadamente 20 mS/cm. La conductividad aumentada puede conseguirse mediante la adición de una sal, tal como cloruro sódico, acetato sódico, cloruro potásico al tampón de elución. Preferiblemente, el tampón de elución comprende NaCl aproximadamente 100 a aproximadamente 300 mM, preferiblemente NaCl aproximadamente 150 mM a aproximadamente 200 mM, por ejemplo NaCl aproximadamente 175 mM o NaCl aproximadamente 160 mM.
Puede usarse un "tampón de regeneración" para regenerar el material de intercambio catiónico de modo que pueda volver a usarse. El tampón de regeneración tiene una conductividad y/o pH necesarios para retirar sustancialmente todos los contaminantes y el anticuerpo de interés del material de intercambio catiónico.
El término "conductividad" se refiere a la capacidad de una solución acuosa de conducir una corriente eléctrica entre dos electrodos. En solución, la corriente fluye por transporte de iones. Por lo tanto, con una cantidad creciente de iones presente en la solución acuosa, la solución tendrá una mayor conductividad. La unidad básica de medida para la conductividad es el Siemen (o mho), mho (mS/cm), y puede medirse usando un medidor de conductividad, tal como diversos modelos de medidores de conductividad Orion. Como la conductividad electrolítica es la capacidad de los iones en solución de portar corriente eléctrica, la conductividad de una solución puede alterarse cambiando la concentración de los iones en la misma. Por ejemplo, la concentración de un agente tamponante y/o la concentración de una sal (por ejemplo, cloruro sódico, acetato sódico, o cloruro potásico) en la solución pueden alterarse para conseguir la conductividad deseada. Preferiblemente, la concentración salina de los diversos tampones se modifica para conseguir la conductividad deseada.
Por "purificar" un anticuerpo de una composición que comprende el anticuerpo y uno o más contaminantes se entiende aumentar el grado de pureza del anticuerpo en la composición retirando (completa o parcialmente) al menos un contaminante de la composición. Una "etapa de purificación" puede ser parte de un proceso global de purificación que produce una composición "homogénea". "Homogénea" se usa en este documento para hacer referencia a una composición que comprende al menos aproximadamente el 70 % en peso del anticuerpo de interés, en base al peso total de la composición, preferiblemente al menos aproximadamente el 80 % en peso, más preferiblemente al menos aproximadamente el 90 % en peso, incluso más preferiblemente al menos aproximadamente el 95 % en peso.
Por "unir" una molécula a un material de intercambio catiónico se entiende exponer la molécula al material de intercambio catiónico en condiciones apropiadas (pH y/o conductividad) de modo que la molécula se inmovilice de forma reversible en o sobre el material de intercambio catiónico en virtud de interacciones iónicas entre la molécula y un grupo cargado o grupos cargados del material de intercambio catiónico.
Por "lavar" el material de intercambio catiónico se entiende pasar un tampón apropiado a través de o sobre el material de intercambio catiónico.
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Por "eluir" una molécula (por ejemplo, anticuerpo o contaminante) de un material de intercambio catiónico se entiende retirar la molécula del mismo.
El anticuerpo a purificar en este documento es un anticuerpo recombinante. Un "anticuerpo recombinante" es uno que se ha producido en una célula hospedadora que se ha transformado o transfectado con ácido nucleico que codifica el anticuerpo, o produce el anticuerpo como resultado de recombinación homóloga. "Transformación" y "transfección" se usan de forma intercambiable para hacer referencia al proceso de introducir ácido nucleico en una célula. Después de la transformación o transfección, el ácido nucleico puede integrarse en el genoma de la célula hospedadora, o puede existir como un elemento extracromosómico. La "célula hospedadora" incluye una célula en cultivo celular in vitro así como una célula dentro de un animal hospedador. Se describen métodos para producción recombinante de polipéptidos en la patente de Estados Unidos N° 5.534.615, por ejemplo.
Una "variante" o "variante de secuencia de aminoácidos" de un polipéptido de partida es un polipéptido que comprenden una secuencia de aminoácidos diferente de la del polipéptido de partida. Generalmente, una variante poseerá al menos un 80 % de identidad de secuencia, preferiblemente al menos un 90 % de identidad de secuencia, más preferiblemente al menos un 95 % de identidad de secuencia, y mucho más preferiblemente al menos un 98 % de identidad de secuencia con el polipéptido nativo. El porcentaje de identidad de secuencia se determina, por ejemplo, por la versión de Fitch et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 80:1382-1386 (1983) del algoritmo descrito por Needleman et al., J. Mol. Biol. 48:443-453 (1970), después de alinear las secuencias para proporcionar la máxima homología. Pueden prepararse variantes de secuencia de aminoácidos de un polipéptido introduciendo cambios apropiados de nucleótidos en el ADN que codifica el polipéptido, o por síntesis peptídica. Dichas variantes incluyen, por ejemplo, deleciones de, y/o inserciones en y/o sustituciones de, restos dentro de la secuencia de aminoácidos del polipéptido de interés. Se hace cualquier combinación de deleción, inserción, y sustitución para llegar a la construcción final, con la condición de que la construcción final posea las características deseadas. Los cambios de aminoácido también pueden alterar el procesamiento post-traduccional del polipéptido, tal como cambiando la cantidad o posición de los sitios de glucosilación. Otras modificaciones post-traduccionales incluyen hidroxilación de prolina y lisina, fosforilación de grupos hidroxilo de restos serilo, treonilo o tirosilo, metilación de los grupos a-amino de cadenas laterales de lisina, arginina e histidina (T.E. Creighton, Proteins: Structure and Molecular Properties, W.H. Freeman & Co., San Francisco, pág. 79-86 (1983)). Se describen métodos para generar variantes de secuencia de aminoácidos de polipéptidos en la patente de Estados Unidos N° 5.534.615, por ejemplo.
El término "anticuerpo" se usa en el sentido más amplio y cubre específicamente anticuerpos monoclonales (incluyendo anticuerpos monoclonales de longitud completa), anticuerpos policlonales, anticuerpos multiespecíficos (por ejemplo, anticuerpos biespecíficos), y fragmentos de anticuerpo siembre que muestren la especificidad deseada de unión.
El anticuerpo de este documento está dirigido contra un "antígeno" de interés. Preferiblemente, el antígeno es un polipéptido biológicamente importante y la administración del anticuerpo a un mamífero que padece una enfermedad o trastorno puede producir un efecto terapéutico en ese mamífero. Sin embargo, también se contemplan anticuerpos dirigidos contra antígenos no polipeptídicos (tales como antígenos glucolipídicos asociados a tumor; véase la patente de Estados Unidos 5.091.178). Cuando el antígeno es un polipéptido, puede ser una molécula transmembrana (por ejemplo, receptor) o ligando tal como un factor de crecimiento. Antígenos a modo de ejemplo incluyen aquellos polipéptidos analizados anteriormente. Dianas moleculares preferidas para anticuerpos incluyen polipéptidos CD tales como CD3, CD4, CD8, CD19, CD20 y CD34; miembros de la familia de receptores HER tales como el receptor de EGF (HER1), receptor HER2, HER3 o HER4; moléculas de adhesión celular tales como LFA-1, Mac1, p150,95, VLA-4, ICAM-1, VCAM e integrina av/b3 incluyendo cualquiera de las subunidades a o b de la misma (por ejemplo, anticuerpos anti-CD11a, anti-CD18 o anti-CD11b); factores de crecimiento tales como VEGF; IgE; antígenos de grupo sanguíneo; receptor flk2/flt3; receptor de obesidad (OB); receptor mpl; CTLA-4; polipéptido C etc. Pueden usarse antígenos solubles o fragmentos de los mismos, opcionalmente conjugados con otras moléculas, como inmunógenos para generar anticuerpos. Para moléculas transmembrana, tales como receptores, pueden usarse fragmentos de éstos (por ejemplo, el dominio extracelular de un receptor) como inmunógeno. Como alternativa, pueden usarse células que expresan la molécula transmembrana como inmunógeno. Dichas células pueden derivarse de una fuente natural (por ejemplo, líneas celulares cancerosas) o pueden ser células que se han transformado por técnicas recombinantes para expresar la molécula transmembrana.
Ejemplos of anticuerpos a purificar en este documento incluyen, pero sin limitación: anticuerpos contra HER2 incluyendo trastuzumab (HeRcEPTIN®) (Carter et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 89:4285-4289 (1992), patente de Estados Unidos N° 5.725.856) y pertuzumab (OMNITARG™) (documento WO01/00245); anticuerpos contra CD20 (véase a continuación); anticuerpos contra IL-8 (St John et al., Chest, 103:932 (1993), y publicación internacional N° WO 95/23865); anticuerpos contra VEGF o el receptor de VEGF incluyendo anticuerpos humanizados y/o de afinidad madurada contra VEGF tales como el anticuerpo humanizado huA4.6.1 contra VEGF bevacizumab (AVASTIN®) y ranibizumab (LUCENTIS®) (Kim et al., Growth Factors, 7:53-64 (1992), publicación internacional N° WO 96/30046, y documento WO 98/45331, publicado el 15 de octubre de 1998); anticuerpos contra PSCA (documento WO01/40309); anticuerpos contra CD11a incluyendo efalizumab (RApTiVA®) (patente de Estados Unidos N° 5.622.700, documento WO 98/23761, Steppe et al., Transplant Intl. 4:3-7 (1991), y Hourmant et al., Transplantation 58:377-380 (1994)); anticuerpos que se unen a IgE incluyendo omalizumab (XOLAIR®) (Presta et
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al., J. Immunol. 151:2623-2632 (1993), y publicación internacional N° WO 95/19181; patente de Estados Unidos N° 5.714.338, expedida el 3 de febrero de 1998 o patente de Estados Unidos N° 5.091.313, expedida el 25 de febrero de 1992, documento WO 93/04173 publicado el 4 de marzo de 1993, o publicación internacional N° WO99/01556 presentada el 30 de junio de 1998, patente de Estados Unidos N° 5.714.338); anticuerpos contra CD18 (patente de Estados Unidos N° 5.622.700, expedida el 22 de abril de 1997, o como en el documento WO 97/26912, publicado el 31 de julio de 1997); anticuerpos contra el receptor Apo-2 (documento WO 98/51793 publicado el 19 de noviembre de 1998); anticuerpos contra el factor tisular (TF) (patente europea N° 0 420 937 B1 concedida el 9 de noviembre de 1994); anticuerpos contra integrina a4-a7 (documento WO 98/06248 publicado el 19 de febrero de 1998); anticuerpos contra EGFR (por ejemplo, anticuerpo quimerizado o humanizado 225, cetuximab, ERBUTIX® como en el documento WO 96/40210 publicado el 19 de diciembre de 1996); anticuerpos contra CD3 tales como OKT3 (patente de Estados Unidos N° 4.515.893 expedida el 7 de mayo de 1985); anticuerpos contra CD25 o Tac tales como CHI- 621 (SIMULECT®) y ZENAPAX® (véase la patente de Estados Unidos N° 5.693.762 expedida el 2 de diciembre de 1997); anticuerpos contra CD4 tales como el anticuerpo cM-7412 (Choy et al. Arthritis Rheum 39(1):52-56 (1996)); anticuerpos contra CD52 tales como CAMPATH-1H (ILEX/Berlex) (Riechmann et al. Nature 332:323-337 (1988)); anticuerpos contra el receptor Fc tales como el anticuerpo M22 dirigido contra FcgRI como en Graziano et al. J. Immunol. 155(10):4996-5002 (1995); anticuerpos contra el antígeno carcinoembrionario (CEA) tales como hMN-14 (Sharkey et al. Cancer Res. 55 (23Supl.): 5935s-5945s (1995)); anticuerpos dirigidos contra células epiteliales de mama incluyendo huBrE-3, hu-Mc 3 y cHl6 (Ceriani et al. Cancer Res. 55(23): 5852s-5856s (1995); y Richman et al. Cancer Res. 55(23 Sup.): 5916s-5920s (1995)); anticuerpos que se unen a células de carcinoma de colon tales como C242 (Litton et al. Eur J. Immunol. 26(1): 1 -9 (1996)); anticuerpos contra CD38, por ejemplo AT 13/5 (Ellis et al. J. Immunol. 155(2):925-937 (1995)); anticuerpos contra Cd33 tales como Hu M195 (Jurcic et al. Cancer Res 55(23 Supl.): 5908s-5910s (1995)) y CMA-676 o CDP771; anticuerpos contra EpCAM tales como 17-1A (PANOREX®); anticuerpos contra GpIIb/IIIa tales como abciximab o c7E3 Fab (REOPRO®); anticuerpos contra RSV tales como MEDI-493 (SYNAGIS®); anticuerpos contra CMV tales como PROTOVIR®; anticuerpos contra VIH tales como PRO542; anticuerpos contra hepatitis tales como el anticuerpo contra Hep B OSTAVIR®; anticuerpo contra CA 125 OvaRex; anticuerpo BEC2 contra epítopo GD3 idiotípico; anticuerpo contra avp3 (por ejemplo, VITAXIN®; Medimmune); anticuerpo contra carcinoma de células renales humanas tal como ch-G250; ING-1; anticuerpo anti- 17-1 An humano (3622W94); anticuerpo anti-tumor colorrectal humano (A33); anticuerpo R24 anti-melanoma humano dirigido contra gangliósido GD3; anticuerpo anti-carcinoma humano de células escamosas (SF-25); anticuerpo contra antígeno de leucocitos humanos (HLA) tal como Smart ID10 y el anticuerpo anti-HLA DR Oncolym (Lym-1); anticuerpo contra CD37 tal como TRU 016 (Trubion); anticuerpo contra IL-21 (Zymogenetics/Novo Nordisk); anticuerpo anti-células B (Impheron); MAb dirigido a células B (Immunogen/Aventis); 1D09C3 (Morphosys/GPC); LymphoRad 131 (HGS); anticuerpo contra Lym-1, tal como Lym-1Y-90 (USC) o anti-Lym-1 Oncolym (USC/Peregrine); LIF 226 (Enhanced Lifesci.); anticuerpo contra BAFF (por ejemplo, documento WO 03/33658); anticuerpo contra el receptor de BAFF (véase por ejemplo, el documento WO 02/24909); anticuerpo contra BR3; anticuerpo contra Blys tal como belimumab; LyMpHOSTAT - B™; ISF 154 (UCSD/Roche/Tragen); gomilixima (Idec 152; Biogen Idec); anticuerpo contra el receptor de IL-6 tal como atlizumab (ACTEMRA™; Chugai/Roche); anticuerpo contra IL-15 tal como HuMax-Il-15 (Genmab/Amgen); anticuerpo contra el receptor de quimioquinas, tal como un anticuerpo contra CCR2 (por ejemplo, MLN1202; Millieneum); anticuerpo anti-complemento, tal como anticuerpo contra C5 (por ejemplo, eculizumab, 5G1.1; Alexion); formulación oral de inmunoglobulina humana (por ejemplo, IgPO; Protein Therapeutics); anticuerpo contra IL-12 tal como ABT-874 (CAT/Abbott); Teneliximab (BMS- 224818; BMS); anticuerpos contra CD40, incluyendo S2C6 y variantes humanizadas del mismo (documento WO00/75348) y TNX 100 (Chiron/Tanox); anticuerpos contra TNF-a incluyendo cA2 o infliximab (REMICADE®), CDP571, MAK-195, adalimumab (HUMIRA™), fragmento pegilado de anticuerpo contra TNF-a tal como CDP-870 (Celltech), D2E7 (Knoll), anticuerpo policlonal anti-TNF-a (por ejemplo, PassTNF; Verigen); anticuerpos contra CD22 tales como LL2 o epratuzumab (LYMPHOCIDE®; Immunomedics), incluyendo epratuzumab Y-90 y epratzumab 1131, anticuerpo contra CD22 de Abiogen (Abiogen, Italia), CMC 544 (Wyeth/Celltech), combotox (UT Soutwestern), BL22 (NIH), y LympoScan Tc99 (Immunomedics). Preferiblemente, el anticuerpo que se purifica en este documento es un anticuerpo intacto desnudo que se une a CD20 humana, o un anticuerpo intacto desnudo que se une a VEGF humano.
El antígeno "CD20" humano, o "CD20," es una fosfoproteína no glucosilada de aproximadamente 35-kDa encontrada sobre la superficie de más del 90 % de las células B de la sangre periférica u órganos linfoides. CD20 está presente en células B normales así como en células B malignas, pero no se expresa en células madre. Otros nombres para CD20 en la bibliografía incluyen "antígeno restringido a linfocitos B " y "Bp35". El antígeno CD20 se describe en Clark et al., Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) 82:1766 (1985), por ejemplo.
Una " anticuerpo antagonista de CD20" en este documento es un anticuerpo que, tras unirse a CD20 en células B, destruye o agota las células B en un sujeto y/o interfiere con una o más funciones de células B, por ejemplo, reduciendo o evitando una respuesta humoral provocada por la célula B. El anticuerpo antagonista preferiblemente es capaz de agotar las células B (es decir, reduce los niveles en circulación de células B) en un sujeto tratado con el mismo. Dicho agotamiento puede conseguirse mediante diversos mecanismos tales como citotoxidad mediada por células dependiente de anticuerpos (ADCC) y/o citotoxicidad dependiente de complemento (CDC), inhibición de proliferación de células B y/o inducción de muerte de células B (por ejemplo, mediante apoptosis).
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Como se usa en este documento, "agotamiento de células B" se refiere a una reducción en los niveles de células B en un animal o ser humano generalmente después de tratamiento con fármaco o anticuerpo, en comparación con el nivel antes del tratamiento. El agotamiento de células B puede ser parcial o completo. Los niveles de células B se pueden medir usando técnicas bien conocidas tales como las descritas en Reff et al., Blood 83: 435-445 (1994), o la patente de Estados Unidos N° 5.736.137 (Anderson et al.). A modo de ejemplo, un mamífero (por ejemplo, un primate normal) puede tratarse con diversas dosificaciones del anticuerpo o inmunoadhesina, y las concentraciones de células B periféricas pueden determinarse, por ejemplo por un método FACS que cuenta las células B.
Ejemplos de anticuerpos contra CD20 incluyen: "C2B8," que ahora se llama "rituximab" ("RITUXAN®") (patente de Estados Unidos N° 5.736.137); el anticuerpo murino 2B8 marcado con itrio-[90] denominado "Y2B8" o "Ibritumomab Tiuxetan" (ZEVALIN®) disponible en el mercado en IDEC Pharmaceuticals, Inc. (patente de Estados Unidos N° 5.736.137; 2B8 depositado en la ATCC con el número de acceso HB11388 el 22 de junio de 1993); IgG2a murina "B1," también llamada "Tositumomab," opcionalmente marcada con 131I para generar el anticuerpo "131I-B1" o "yodo I131 tositumomab" (BEXXAR™) disponible en el mercado en Corixa (véase, también, la patente de Estados Unidos N° 5.595.721); anticuerpo monoclonal murino "1F5" (Press et al. Blood 69(2):584-591 (1987) y variantes del mismo incluyendo 1F5 de "región flanqueante parcheada" o humanizado (documento WO 2003/002607, Leung, S.; depósito ATCC HB-96450); anticuerpo 2H7 murino y 2H7 quimérico (patente de Estados Unidos N° 5.677.180); 2H7 humanizado (documento WO 2004/056312, Lowman et al., y como se expone a continuación); 2F2 (HuMax-CD20), un anticuerpo completamente humano, de alta afinidad dirigido a la molécula CD20 en la membrana celular de células B (Genmab, Dinamarca; véase, por ejemplo, Glennie y van de Winkel. Drug Discovery Today 8: 503-510 (2003) y Cragg et al., Blood 101: 1045-1052 (2003); documento WO 2004/035607; documento US2004/0167319); los anticuerpos monoclonales humanos expuestos en el documento WO 2004/035607 y el documento US2004/0167319 (Teeling et al.); los anticuerpos que tienen cadenas complejas de azúcar unidas en N-glucósido contra la región Fc descritos en el documento US 2004/0093621 (Shitara et al.); anticuerpos monoclonales y fragmentos de unión a antígeno que se unen a CD20 (documento WO 2005/000901, Tedder et al.) tales como HB20-3, HB20-4, HB20-25, y MB20-11; moléculas que se unen a CD20 tales como la serie AME de anticuerpos, por ejemplo, anticuerpos AME 33 como se expone en el documento WO 2004/103404 y el documento US2005/0025764 (Watkins et al., Eli Lilly/Applied Molecular Evolution, AME); moléculas que se unen a CD20 tales como las descritas en el documento US 2005/0025764 (Watkins et al.); anticuerpo A20 o variantes del mismo tales como anticuerpo quimérico o humanizado A20 (ca20, hA20, respectivamente) o IMMU-106 (documento US 2003/0219433, Immunomedics); anticuerpos que se unen a cD20, incluyendo Leu-16 de epítopo agotado, 1H4, o 2B8, opcionalmente conjugados con IL-2, como en el documento US 2005/0069545A1 y documento WO 2005/16969 (Carr et al.); anticuerpo biespecífico que se une a CD22 y CD20, por ejemplo, hLL2xhA20 (documento WO2005/14618, Chang et al.); anticuerpos monoclonales L27, G28-2, 93-1B3, B-C1 o NU-B2 disponibles en el International Leukocyte Typing Workshop (Valentine et al., En: Leukocyte Typing III (McMichael, Ed., p. 440, Oxford University Press (1987)); 1h4 (Haisma et al. Blood 92:184 (1998)); conjugado de auristatina E anti-CD20 (Seattle Genetics); anti-cD20-IL2 (EMD/Biovation/City of Hope); terapia de MAb anti-CD20 (EpiCyte); anticuerpo anti-CD20 TRU 015 (Trubion). Los anticuerpos preferidos contra cD20 en este documento son anticuerpos quiméricos, humanizados, o humanos contra CD20, más preferiblemente rituximab, 2H7 humanizado, 2F2 (Hu-Max-CD20) anticuerpo humano contra CD20 (Genmab), y A20 humanizado o anticuerpo IMMUN-106 (Immunomedics).
Para los propósitos de este documento, los términos "rituximab," "RITUXAN®," y "C2B8" en este documento se refieren a un anticuerpo quimérico recombinante que se une al antígeno CD20 humano como se describe en la patente de Estados Unidos N° 5.736.137, Anderson et al. Dicho anticuerpo preferiblemente comprende una cadena pesada que comprende CDR H1 (SEC ID N° 5), CDR H2 (SEC ID N° 6), CDR H3 (SEC ID N° 7), y una cadena ligera, donde la cadena ligera preferiblemente comprende cDr L1 (SEC iD N° 8), CdR L2 (SEC ID N° 9), y CDR L3 (SEC ID N° 10); preferiblemente la cadena pesada comprende una región pesada variable (VH) que comprende la SEC ID N° 3 y una región ligera variable (VL) que comprende la SEC ID N° 4; y mucho más preferiblemente comprende una cadena pesada que comprende la SEC ID N° 1 (con o sin un resto C-terminal de lisina), y una cadena ligera, donde la cadena ligera preferiblemente comprende la SEC ID N° 2. Las expresiones incluyen expresamente formas variantes tal como se describe en Moorhouse et al. J. Pharm Biomed. Anal. 16:593-603 (1997).
La expresión "VEGF humano" como se usa en este documento se refiere al factor de crecimiento celular del endotelio vascular humano de 165 aminoácidos, y los factores de crecimiento celular del endotelio vascular relacionados de 121, 189, y 206 aminoácidos, como se describe por Leung et al., Science 246:1306 (1989), y Houck et al., Mol. Endocrin. 5:1806 (1991) junto con las formas alélicas y procesadas de origen natural de esos factores de crecimiento.
Los anticuerpos antagonistas anti-VEGF son capaces de inhibir una o más de las actividades biológicas de VEGF, por ejemplo, su actividad mitogénica o angiogénica. Los antagonistas de VEGF actúan interfiriendo con la unión de VEGF a un receptor celular, incapacitando o eliminando células que se han activado por VEGF, o interfiriendo con la activación de células del endotelio vascular después de unión de VEGF a un receptor celular. Todos estos puntos de intervención por un antagonista de VEGF deben considerarse equivalentes.
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Para los propósitos de este documento, los términos "bevacizumab," "AVASTIN®," "F(ab)-12," y "rhuMAb VEGF" en este documento se refieren a un anticuerpo monoclonal humanizado recombinante que se une al antígeno factor de crecimiento del endotelio vascular (VEGF) (rhuMAb VEGF) como se describe en la patente de Estados Unidos N° 7.169.901, Presta et al. Dicho anticuerpo preferiblemente comprende una cadena pesada que comprende CDR H1 (SEC ID N° 15), CDR H2 (SEC ID N° 16), CDR H3 (SEC ID N° 17), y una cadena ligera, donde la cadena ligera preferiblemente comprende CDR L1 (SEC ID N° 18), CDR L2 (SEC ID N° 19), y CDR L3 (SEC ID N° 20); mucho más preferiblemente la cadena pesada comprende una región pesada variable (VH) que comprende la SEC ID N° 13 y una región ligera variable (VL) que comprende la SEC ID N° 14; y preferiblemente comprende una cadena pesada que comprende la SEC ID N° 11 (con o sin un resto C-terminal de lisina), y una cadena ligera, donde la cadena ligera preferiblemente comprende la SEC ID N° 12. Las expresiones incluyen expresamente formas variantes que se forman durante la producción del producto de anticuerpo recombinante.
La expresión "anticuerpo monoclonal" como se usa en este documento se refiere a un anticuerpo obtenido de una población de anticuerpos sustancialmente homogéneos, es decir, los anticuerpos individuales que comprenden la población son idénticos excepto por posibles mutaciones de origen natural que pueden estar presentes en cantidades minoritarias. Los anticuerpos monoclonales son altamente específicos, estando dirigidos contra un único sitio antigénico. Además, en contraste con las preparaciones convencionales (policlonales) de anticuerpo que normalmente incluyen diferentes anticuerpos dirigidos contra diferentes determinantes (epítopos), cada anticuerpo monoclonal está dirigido contra un único determinante en el antígeno. El modificador "monoclonal" indica el carácter del anticuerpo como obtenido de una población sustancialmente homogénea de anticuerpos, y no debe entenderse como que requiera producción del anticuerpo por ningún método particular. Por ejemplo, los anticuerpos monoclonales a usar de acuerdo con la presente invención pueden prepararse por el método de hibridoma descrito por primera vez por Kohler et al., Nature 256:495 (1975), o pueden prepararse por métodos de ADN recombinante (véase, por ejemplo, la patente de Estados Unidos N° 4.816.567). En una realización adicional, los "anticuerpos monoclonales" pueden aislarse de bibliotecas de fagos de anticuerpos generadas usando las técnicas descritas en McCafferty et al., Nature, 348:552-554 (1990). Clackson et al., Nature, 352:624-628 (1991) y Marks et al., J. Mol. Biol., 222:581-597 (1991) describen el aislamiento de anticuerpos murinos y humanos, respectivamente, usando bibliotecas de fagos. Publicaciones posteriores describen la producción de anticuerpos humanos de alta afinidad (intervalo nM) por redistribución de cadena (Marks et al., Bio/Technology, 10:779-783 (1992)), así como infección combinatoria y recombinación in vivo como estrategia para construir bibliotecas muy grandes de fagos (Waterhouse et al., Nuc. Acids. Res., 21:2265-2266 (1993)). Por tanto, estas técnicas son alternativas viables a las técnicas tradicionales de hibridoma de anticuerpos monoclonales para el aislamiento de anticuerpos monoclonales. Como alternativa, ahora es posible producir animales transgénicos (por ejemplo, ratones) que son capaces, tras inmunización, de producir un repertorio completo de anticuerpos humanos en ausencia de producción endógena de inmunoglobulinas. Por ejemplo, se ha descrito que la deleción homocigótica del gen de la región de unión (Jh) de la cadena pesada del anticuerpo en ratones quiméricos y mutantes de la línea germinal provoca la inhibición completa de producción endógena de anticuerpos. La transferencia de la serie de genes de inmunoglobulina humana de la línea germinal en dichos ratones mutantes de la línea germinal provoca la producción de anticuerpos humanos tras exposición a antígeno. Véase, por ejemplo, Jakobovits et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90:2551 (1993); Jakobovits et al., Nature, 362:255-258 (1993); Bruggermann et al., Year in Immuno., 7:33 (1993); y Duchosal et al. Nature 355:258 (1992).
Los anticuerpos monoclonales de este documento incluyen específicamente anticuerpos "quiméricos" (inmunoglobulinas) en que una parte de la cadena pesada y/o ligera es idéntica a u homóloga a secuencias correspondientes en anticuerpos derivados de una especie particular o que pertenecen a una clase o subclase particular de anticuerpo, mientras que el resto de la cadena o cadenas es idéntico a u homóloga a secuencias correspondientes en anticuerpos derivados de otra especie o que pertenecen a otra clase o subclase de anticuerpo, así como fragmentos de dichos anticuerpos, siembre que muestren la actividad biológica deseada (patente de Estados Unidos N° 4.816.567; y Morrison et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81:6851-6855 (1984)).
La expresión "región hipervariable" cuando se usa en este documento se refiere a los restos de aminoácido de un anticuerpo que son responsables de la unión a antígeno. La región hipervariable comprende restos de aminoácido de una "región determinante de complementariedad" o "CDR" (es decir los restos 24-34 (L1), 50-56 (L2) y 89-97 (L3) en el dominio variable de cadena ligera y 31-35 (H1), 50-65 (H2) y 95-102 (H3) en el dominio variable de cadena pesada; Kabat et al., Sequences of Polypeptides of Immunological Interest, 5a Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD. (1991)) y/o aquellos restos de un "bucle hipervariable" (es decir los restos 26-32 (L1), 50-52 (L2) y 91-96 (L3) en el dominio variable de cadena ligera y 26-32 (H1), 53-55 (H2) y 96-101 (H3) en el dominio variable de cadena pesada; Chotia y Lesk J. Mol. Biol. 196:901-917 (1987)). Los restos "flanqueantes" o "FR" son aquellos restos del dominio variable diferentes a los restos de la región hipervariable como se define en este documento.
Las formas "humanizadas" de anticuerpos no humanos (por ejemplo, murinos) son anticuerpos quiméricos que contienen secuencia mínima derivada de inmunoglobulina no humana. En su mayor parte, los anticuerpos humanizados son inmunoglobulinas humanas (anticuerpo receptor) en que los restos de una región hipervariable del receptor están remplazados por restos de una región hipervariable de una especie no humana (anticuerpo donante) tal como ratón, rata, conejo o primate no humano que tiene la especificidad, afinidad, y capacidad deseadas. En
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algunos casos, se remplazan restos de la región flanqueante (FR) Fv de la inmunoglobulina humana por restos no humanos correspondientes. Además, los anticuerpos humanizados pueden comprender restos que no se encuentran en el anticuerpo receptor o en el anticuerpo donante. Estas modificaciones se hacen para refinar adicionalmente el funcionamiento del anticuerpo. En general, el anticuerpo humanizado comprenderá sustancialmente todo de al menos uno, y normalmente dos, dominios variables, en que todo o sustancialmente todo lo de los bucles hipervariables corresponde a aquellos de una inmunoglobulina no humana y todos o sustancialmente todo lo de las regiones FR es de aquellas de una secuencia de inmunoglobulina humana. El anticuerpo humanizado opcionalmente también comprenderá al menos una parte de una región constante de inmunoglobulina (Fc), normalmente la de una inmunoglobulina humana.
La elección de los dominios variables humanos, tanto ligeros como pesados, a usar en la preparación de anticuerpos humanizados es muy importante para reducir la antigenicidad. De acuerdo con el llamado método de "mejor ajuste", la secuencia del dominio variable de un anticuerpo de roedor se explora frente a la biblioteca completa de secuencias conocidas de dominio variable humano. La secuencia humana que es más comparable a la del roedor entonces se acepta como la región flanqueante humana (FR) para el anticuerpo humanizado (Sims et al., J. Immunol., 151:2296 (1993); Chotia et al., J. Mol. Biol., 196:901 (1987)).
Otro método usa una región flanqueante particular derivada de la secuencia consenso de todos los anticuerpos humanos de un subgrupo particular de cadenas ligeras y pesadas. Puede usarse la misma región flanqueante para varios anticuerpos humanizados diferentes (Carter et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 89:4285 (1992); Presta et al., J. Immnol., 151:2623 (1993)).
Es adicionalmente importante que los anticuerpos se humanicen con retención de alta afinidad por el antígeno y otras propiedades biológicas favorables. Para conseguir este objetivo, de acuerdo con un método preferido, se preparan anticuerpos humanizados mediante un proceso de análisis de las secuencias precursoras y diversos productos humanizados conceptuales usando modelos tridimensionales de las secuencias precursoras y humanizadas. Están habitualmente disponibles modelos tridimensionales de inmunoglobulina y son familiares para los especialistas en la técnica. Están disponibles programas informáticos que ilustran y presentan estructuras confirmaciones tridimensionales probables de secuencias candidatas seleccionadas de inmunoglobulina. La inspección de estas presentaciones permite el análisis del papel probable de los restos en el funcionamiento de la secuencia candidata de inmunoglobulina, es decir, el análisis de restos que influyen en la capacidad de la inmunoglobulina candidata de unirse a su antígeno. De este modo, pueden seleccionarse restos FR y combinarse a partir de secuencias receptores y de importación de modo que se consiga la característica deseada del anticuerpo, tal como afinidad aumentada por el antígeno o antígenos diana. En general, los restos CDR están implicados directamente y de forma muy sustancial en la influencia sobre la unión a antígeno.
Los "fragmentos de anticuerpo" comprenden una parte de un anticuerpo de longitud completa, generalmente la región de unión a antígeno o variable del mismo. Ejemplos de fragmentos de anticuerpo incluyen fragmentos Fab, Fab', F(ab')2, y Fv; diacuerpos; anticuerpos lineales; moléculas de anticuerpo de cadena sencilla; y anticuerpos multiespecíficos formados a partir de fragmentos de anticuerpo. Se ha desarrollado diversas técnicas para la producción de fragmentos de anticuerpo. Tradicionalmente, estos fragmentos se obtenían mediante digestión proteolítica de anticuerpos intactos (véase, por ejemplo, Morimoto et al., Journal of Biochemical and Biophysical Methods 24:107-117 (1992) y Brennan et al., Science, 229:81 (1985)). Sin embargo, estos fragmentos ahora pueden producirse directamente por células hospedadoras recombinantes. Por ejemplo, los fragmentos de anticuerpo pueden aislarse de las bibliotecas de fagos de anticuerpo analizadas anteriormente. Como alternativa, pueden recuperarse directamente fragmentos Fab'-SH de E. coli y acoplarse químicamente para formar fragmentos F(ab')2 (Carter et al., Bio/Technology 10:163-167 (1992)). En otra realización, el F(ab')2 se forma usando GCN4 en cremallera de leucina para promover el ensamblaje de la molécula F(ab')2. De acuerdo con otro enfoque, los fragmentos F(ab')2 pueden aislarse directamente de cultivo de células hospedadoras recombinantes. Otras técnicas para la producción de fragmentos de anticuerpo serán evidentes para los especialistas en la técnica.
Un anticuerpo puede ser un fragmento Fv de cadena sencilla (scFv). Véase el documento WO 93/16185. Los fragmentos de anticuerpo "Fv de cadena sencilla" o "sFv" comprenden los dominios Vh y Vl de anticuerpo, donde estos dominios están presentes en una única cadena polipeptídica. Generalmente, el polipéptido Fv comprende adicionalmente un enlazador polipeptídico entre los dominios Vh y Vl que posibilita que el sFv forme la estructura deseada para la unión a antígeno. Para una revisión de sFv, véase Pluckthun in The Pharmacology of Monoclonal Antibodies, vol. 113, Rosenburg y Moore eds. Springer-Verlag, Nueva York, pág. 269-315 (1994).
El término "diacuerpos" se refiere a pequeños fragmentos de anticuerpo con dos sitios de unión a antígeno, comprendiendo estos fragmentos un dominio variable de cadena pesada (VH) conectado a un dominio variable de cadena ligera (Vl) en la misma cadena polipeptídica (Vh - Vl). Usando un enlazador que sea demasiado corto para permitir el apareamiento entre los dos dominios en la misma cadena, se fuerza a que los dominios apareen con los dominios complementarios de otra cadena y se crean dos sitios de unión a antígeno. Los diacuerpos se describen más completamente en, por ejemplo, el documento EP 404.097; documento WO 93/11161; y Hollinger et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90:6444-6448 (1993).
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La expresión "anticuerpos lineales" cuando se usa en toda esta solicitud se refiere a los anticuerpos descritos en Zapata et al. Polypeptide Eng. 8(10):1057-1062 (1995). En resumen, estos anticuerpos comprenden un par de segmentos Fd en tándem (Vh-Ch1-Vh-Ch1) que forman un par de regiones de unión a antígeno. Los anticuerpos lineales pueden ser biespecíficos o monoespecíficos.
Los "anticuerpos multiespecíficos" tienen especificidades de unión por al menos dos epítopos diferentes, donde los epítopos son habitualmente de diferentes antígenos. Aunque estas moléculas normalmente se unirán solamente a dos antígenos (es decir anticuerpos biespecíficos, BsAb), se abarcan anticuerpos con especificidades adicionales tales como anticuerpos triespecíficos por esta expresión cuando se usa en este documento. Ejemplos de BsAb incluyen aquellos con un brazo dirigido contra un antígeno de célula tumoral y el otro brazo dirigido contra una molécula activadora citotóxica tal como anti-FcgRI/anti-CD15, anti-p185HER2/FcyRIN (CD16), anti-CD3/anti-célula B maligna (1D10), anti-CD3/anti-p185HER2, anti-CD3/anti-p97, anti-CD3/anti-carcinoma de células renales, anti- CD3/anti-OVCAR-3, anti-CD3/L-D1 (anti-carcinoma de colon), anti-CD3/anti-análogo de hormona estimuladora de melanocitos, anti-receptor de EGF/anti-CD3, anti-CD3/anti-CAMA1, anti-CD3/anti-CD19, anti-CD3/MoV18, antimolécula de adhesión de células neurales (NCAM)/anti-CD3, anti-proteína de unión a folato (FBP)/anti-CD3, anti- antígeno asociado a carcinoma generalizado (AMOC-31)/anti-CD3; BsAb con un brazo que se une específicamente a un antígeno tumoral y un brazo que se une a una toxina tal como anti-saporina/anti-Id-1, anti-CD22/anti-saporina, anti-CD7/anti-saporina, anti-CD38/anti-saporina, anti-CEA/anti-cadena A de ricina, anti-interferón-a(IFN-a)/anti- idiotipo de hibridoma, anti-CEA/anti-alcaloide de la vinca; BsAb para convertir pro-fármacos activados por enzimas tales como anti-CD30/anti-fosfatasa alcalina (que cataliza la conversión del profármaco fosfato de mitomicina en alcohol de mitomicina); BsAb que pueden usarse como agentes fibrinolíticos tales como anti-fibrina/anti-activador de plasminógeno tisular (tPA), anti-fibrina/anti-activador de plasminógeno tipo uroquinasa (uPA); BsAb para abordar complejos inmunes con receptores de superficie celular tales como anti-lipoproteína de baja densidad (LDL)/anti- receptor Fc (por ejemplo, FcgRI, o FcgRIII); BsAb para uso en terapia de enfermedades infecciosas tales como anti- CD3/anti-virus del herpes simple (HSV), anti-complejo receptor de células T:CD3/anti-influenza, anti-FcgR/anti-VIH; BsAb para detección de tumores in vitro o in vivo tales como anti-CEA/anti-EOTUBE, anti-CEA/anti-DPTA, anti- p185HER2/anti-hapteno; BsAb como adyuvantes de vacuna; y BsAb como herramientas de diagnóstico tales como anti-IgG de conejo/anti-ferritina, anti-peroxidasa de rábano rusticano (HRP)/anti-hormona, anti-somatostatina/anti- sustancia P, anti-HRP/anti-FITC, anti-CEA/anti-b-galactosidasa. Ejemplos de anticuerpos triespecíficos incluyen anti- CD3/anti-CD4/anti-CD37, anti-CD3/anti-CD5/anti-CD37 y anti-CD3/anti-CD8/anti-CD37. Pueden prepararse anticuerpos biespecíficos como anticuerpos de longitud completa o fragmentos de anticuerpo (por ejemplo, anticuerpos biespecíficos F(ab')2).
Se contemplan anticuerpos con más de dos valencias. Por ejemplo, pueden prepararse anticuerpos triespecíficos. Tutt et al. J. Immunol. 147: 60 (1991).
Un "anticuerpo desnudo" para los propósitos de este documento es un anticuerpo que no está conjugado con un resto citotóxico o radiomarcador.
Un "anticuerpo intacto" en este documento es uno que comprende dos regiones de unión a antígeno, y una región Fc. Preferiblemente, el anticuerpo intacto tiene una región Fc funcional.
"Tratamiento" se refiere tanto a tratamiento terapéutico como a medidas profilácticas o preventivas. Aquellos que necesitan tratamiento incluyen aquellos ya con el trastorno así como aquellos en que tiene que prevenirse el trastorno.
Un "trastorno" es cualquier afección que se beneficiaría del tratamiento con el anticuerpo purificado como se describe en este documento. Esto incluye trastorno y enfermedades tanto crónicas como agudas y aquellas afecciones patológicas que predisponen al mamífero al trastorno en cuestión.
La palabra "marcador" cuando se usa en este documento se refiere a un compuesto o composición detectable que se conjuga directa o indirectamente con el anticuerpo. El marcador puede ser en sí mismo detectable (por ejemplo, marcadores de radioisótopo o marcadores fluorescentes) o, en el caso de un marcador enzimático, puede catalizar la alteración química de un compuesto o composición sustrato que es detectable.
La expresión "agente citotóxico" como se usa en este documento se refiere a una sustancia que inhibe o evita la función de células y/o causa destrucción de células. La expresión pretende incluir isótopos radiactivos (por ejemplo, At211, I131, I125, I90, Re186, Re188, Sm153, Bi212, P32 e isótopos radiactivos de Lu), agentes quimioterapéuticos, y toxinas tales como toxinas de molécula pequeña o toxinas enzimáticamente activas de origen bacteriano, fúngico, vegetal o animal, o fragmentos de las mismas.
Modos para realizar la invención
La invención de este documento proporciona métodos para purificar bevacizumab, como se expone en las reivindicaciones.
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Producción recombinante de anticuerpos
Para la producción recombinante del anticuerpo, se aísla el ácido nucleico que lo codifica y se inserta en un vector replicable para clonación adicional (amplificación del ADN) o para expresión. El ADN que codifica el anticuerpo se aísla fácilmente y se secuencia usando procedimientos convencionales (por ejemplo, usando sondas oligonucleotídicas que son capaces de unirse específicamente a genes que codifican las cadenas pesada y ligera del anticuerpo). Están disponibles muchos vectores. Los componentes del vector generalmente incluyen, pero sin limitación, uno o más de los siguientes: una secuencia señal, un origen de replicación, uno o más genes marcadores, un elemento potenciador, un promotor, y una secuencia de terminación de la transcripción (por ejemplo, como se describe en la patente de Estados Unidos 5.534.615).
Las células hospedadoras adecuadas para clonación o expresión del ADN en los vectores de este documento son las células procariotas, de levaduras, o eucariotas superiores. Los procariotas adecuados para este propósito incluyen eubacterias, tales como organismos Gram-negativos o Gram-positivos, por ejemplo, Enterobacteriaceae tales como Escherichia, por ejemplo, E. coli, Enterobacter, Erwinia, Klebsiella, Proteus, Salmonella, por ejemplo, Salmonella typhimurium, Serratia, por ejemplo, Serratia marcescans, y Shigella, así como Bacilli tales como B. subtilis y B. licheniformis (por ejemplo, B. licheniformis 41P descrito en el documento DD 266.710 publicado el 12 de abril de 1989), Pseudomonas tales como P. aeruginosa, y Streptomyces. Un hospedador de clonación preferido de E. coli es E. coli 294 (ATCC 31.446), aunque son adecuadas otras cepas tales como E. coli B, E. coli X1776 (ATCC 31.537), y E. coliW3110 (ATCC 27.325). Estos ejemplos son ilustrativos en lugar de limitantes.
Además de los procariotas, microbios eucariotas tales como hongos filamentosos o levaduras son hospedadores adecuados de clonación o expresión para vectores codificantes de anticuerpo. Saccharomyces cerevisiae, o la levadura común de panadería, es la más habitualmente usada entre los microorganismos hospedadores eucariotas inferiores. Sin embargo, están habitualmente disponibles otros varios géneros, especies, y cepas y son útiles en este documento, tales como Schizosaccharomyces pombe; hospedadores Kluyveromyces tales como, por ejemplo, K. lactis, K. fragilis (ATCC 12.424), K. bulgaricus (ATCC 16.045), K. wickeramii (ATCC 24.178), K. waltii (ATCC 56.500), K. drosophilarum (ATcC 36.906), K. thermotolerans, y K. marxianus; yarrowia (documento EP 402.226); Pichia pastoris (documento EP 183.070); Candida; Trichoderma reesia (documento EP 244.234); Neurospora crassa; Schwanniomyces tales como Schwanniomyces occidentalis; y hongos filamentosos tales como, por ejemplo, Neurospora, Penicillium, Tolypocladium, y hospedadores Aspergillus tales como A. nidulans y A. niger.
Se obtienen células hospedadoras adecuadas para la expresión de anticuerpo glucosilado de organismos multicelulares. Ejemplos de células de invertebrados incluyen células vegetales y de insecto. Se han identificado numerosas cepas baculovirales y variantes y células hospedadoras de insecto permisivas correspondientes de hospedadores tales como Spodoptera frugiperda (oruga), Aedes aegypti (mosquito), Aedes albopictus (mosquito), Drosophila melanogaster (mosca de la fruta), y Bombyx mori. Está disponible al público diversas cepas virales para transfección, por ejemplo, la variante L-1 de nPv de Autographa californica y la cepa Bm-5 de NPV de Bombyx mori, y dichos virus pueden usarse como el virus de este documento de acuerdo con la presente invención, particularmente para transfección de células de Spodoptera frugiperda. También pueden utilizarse cultivos de células vegetales de algodón, maíz, patata, soja, petunia, tomate, y tabaco como hospedadores.
Sin embargo, el interés ha sido mayor en células de vertebrados, y la propagación de células de vertebrados en cultivo (cultivo tisular) se ha convertido en un procedimiento rutinario. Ejemplos de líneas de células hospedadora útiles de mamífero incluyen, pero sin limitación, células de riñón de mono CV1 transformadas por SV40 (COS-7, ATCC CRL 1651); células renales embrionarias humanas (293 o células 293 subclonadas para crecimiento en cultivo en suspensión, Graham et al., J. Gen Virol. 36:59 (1977)); células renales de cría de hámster (BHK, ATCC CCL 10); células de ovario de hámster chino/-DHFR (CHO, Urlaub et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 77:4216 (1980)); células de sertoli de ratón (TM4, Mather, Biol. Reprod. 23:243-251 (1980)); células renales de mono (CV1 ATcC CCL 70); células renales de mono verde africano (VERO-76, ATCC CRL-1587); células de carcinoma cervical humano (HELA, ATCC CCL 2); células renales caninas (MDCK, ATCC CCL 34); células hepáticas de rata búfalo (BRL 3A, ATCC CRL 1442); células pulmonares humanas (W138, ATCC CCL 75); células hepáticas humanas (Hep G2, HB 8065); tumor mamario de ratón (MMT 060562, ATCC CCL51); células TRI (Mather et al., Annals N.Y. Acad. Sci. 383:44-68 (1982)); células MRC 5; células FS4; y células de hepatoma humano (Hep G2). A menudo, se prefieren células CHO para la expresión de anticuerpos, y pueden usarse ventajosamente para producir los anticuerpos purificados de acuerdo con la presente invención.
Las células hospedadoras se transforman con los vectores de expresión o clonación descritos anteriormente para la producción de anticuerpos y se cultivan en medio nutriente convencional modificado según lo apropiado para inducir promotores, seleccionar transformantes, o amplificar los genes que codifican las secuencias deseadas.
Las células hospedadoras usadas para producir anticuerpos pueden cultivarse en diversos medios. Son adecuados medios disponibles en el mercado tales como medio de Ham F10 (Sigma), medio esencial mínimo ((MEM), (Sigma), RPMI-1640 (Sigma), y medio de Eagle modificado por Dulbecco ((DMEM), Sigma) para cultivar las células hospedadoras. Además, cualquiera de los medios descritos en Ham et al., Meth. Enz. 58:44 (1979), Barnes et al., Anal. Biochem. 102:255 (1980), patentes de Estados Unidos N° 4.767.704; 4.657.866; 4.927.762; 4.560.655; o
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5.122.469; documento WO 90/03430; documento WO 87/00195; o patente de Estados Unidos Re. 30.985 puede usarse como medio de cultivo para las células hospedadoras. Cualquiera de estos medios puede suplementarse según lo necesario con hormonas y/u otros factores de crecimiento (tales como insulina, transferrina, o factor de crecimiento epidérmico), sales (tales como cloruro sódico, calcio, magnesio, y fosfato), tampones (tales como HEPES), nucleótidos (tales como adenosina y timidina), antibióticos (tales como garamicina; GENTAMYCIN®), elementos traza (definidos como compuestos inorgánicos habitualmente presentes a concentraciones finales en el intervalo micromolar), y glucosa o una fuente de energía equivalente. También puede incluirse cualquier otro suplemento necesario a concentraciones apropiadas que serán conocidas para los especialistas en la técnica. Las condiciones de cultivo, tales como temperatura, pH, y similares, son las previamente usadas con la célula hospedadora seleccionada para expresión, y serán evidentes para los especialistas en la técnica.
Cuando se usan técnicas recombinantes, el anticuerpo puede producirse de forma intracelular, en el espacio periplásmico, o secretarse directamente en el medio. Si el anticuerpo se produce de forma intracelular, como primera etapa, los desechos particulados, las células hospedadoras o las células lisadas (por ejemplo, resultantes de la homogenización), se retiran, por ejemplo, por centrifugación o ultra-filtración. Cuando el anticuerpo se secreta en el medio, los sobrenadante de dichos sistemas de expresión pueden concentrarse usando un filtro de concentración de proteínas disponible en el mercado, por ejemplo, una unidad de ultrafiltración Amicon o Millipore Pellicon.
El método de la invención de cromatografía de intercambio catiónico
En la realización preferida de la invención, la composición a someter al método de purificación de este documento se expresa por un cultivo de células hospedadoras recombinantes de ovario de hámster chino (CHO). Opcionalmente, la composición se ha sometido a al menos una etapa de purificación antes de cromatografía de intercambio catiónico. La composición contiene bevacizumab y uno o más contaminantes, tales como proteínas de ovario de hámster chino (CHOP); proteína A lixiviada; ácido nucleico; una variante, fragmento, agregado o derivado del anticuerpo deseado; otro polipéptido; endotoxina; contaminante viral; componente de medio de cultivo celular (por ejemplo, garamicina; GENTaMiCiNA®), etc.
Ejemplos de procedimientos adicionales de purificación que pueden realizarse antes de, durante, o después del método de cromatografía de intercambio catiónico incluyen fraccionamiento en una cromatografía de interacción hidrófoba (por ejemplo, en FENIL-SEPHAROSE™), precipitación en etanol, enfoque isoeléctrico, HPLC de fase inversa, cromatografía en sílice, cromatografía en HEPARINA SEPHAROSE™, cromatografía de intercambio aniónico, cromatografía adicional de intercambio catiónico, intercambio de iones en modo mixto, cromatoenfoque, SDS-PAGE, precipitación con sulfato de amonio, cromatografía con hidroxiapatita, electroforesis en gel, diálisis, cromatografía por inducción de carga hidrófoba, y cromatografía de afinidad (por ejemplo, usando proteína A, proteína G, un anticuerpo, o un sustrato específico, ligando o antígeno como reactivo de captura).
De acuerdo con la presente invención, el esquema de purificación de intercambio catiónico normalmente incluye las siguientes etapas realizadas secuencialmente: (1) equilibrado del material de intercambio catiónico; (2) carga de la composición a purificar en el material de intercambio catiónico, (3) una primera etapa de lavado; (4) una segunda etapa de lavado, y (5) elución del anticuerpo de interés.
Incluyendo al menos dos etapas de lavado en el esquema de purificación por intercambio catiónico, realizándose al menos la primera de ellas a elevado pH (aproximadamente pH 6,8 o mayor), puede mejorarse significativamente la eficacia de purificación. En particular, realizando la primera etapa de lavado usando un tampón de lavado con un pH en el intervalo de aproximadamente 6,8 a aproximadamente 9,0 (por ejemplo, de aproximadamente 7,0 a 8,0), tal como, por ejemplo, aproximadamente pH 7,8 o aproximadamente pH 7,0, se retiran los contaminantes descritos de forma más eficaz que usando el intervalo convencional de pH más bajo de aproximadamente 5,0 a aproximadamente 5,5. Como resultado, el contenido de proteínas celulares hospedadoras de la composición que comprende el anticuerpo eluido del material de intercambio catiónico normalmente es menor de aproximadamente 200 ppm, que está por debajo del nivel de aproximadamente 500 ppm conseguido usando una etapa de lavado a un pH de aproximadamente 5 a 5,5.
En la realización preferida de la invención, el material de intercambio catiónico comprende partículas de flujo continuo (fase sólida) de poli(estireno-divinilbenzeno) reticulado recubiertas con un polímero polihidroxilado funcionalizado con grupos sulfopropilo, por ejemplo, una columna POROS 50 HS® disponible en Applied Biosystems.
Habitualmente, se pasa un tampón de equilibrado sobre o a través del material de intercambio catiónico antes de cargar la composición que comprende el anticuerpo de interés y uno o más contaminantes en el material. En la realización preferida de la invención, el tampón de equilibrado tiene un pH de aproximadamente 5,0 a aproximadamente 6,0, por ejemplo aproximadamente pH 5,5. Un tampón de equilibrado a modo de ejemplo comprende MES 19 mM, NaCl 60 mM, pH 5,50. Otro tampón de equilibrado a modo de ejemplo comprende MES 23 mM, NaCl 60 mM, pH 5,50.
Después del equilibrado, se carga una solución acuosa que comprende el anticuerpo de interés y uno o más
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contaminantes en el material de intercambio catiónico. El pH de la carga está en el intervalo de aproximadamente
4.0 a aproximadamente 6,0, por ejemplo aproximadamente pH 5,0 o aproximadamente pH 5,5. En una realización preferida, se carga una combinación de productos condicionados de una etapa previa de purificación. En una realización, se carga una combinación de proteína A de una purificación previa por cromatografía con proteína A, pH
5.0 en el material de intercambio catiónico. En otra realización, se carga una combinación condicionada de Q- SEPHAROSE®, pH 5,0 en el material de intercambio catiónico. Las densidades de carga a modo de ejemplo están en el intervalo de aproximadamente 10 a aproximadamente 100 g/l de resina, preferiblemente de aproximadamente 10 a aproximadamente 60 g/l de resina, mucho más preferiblemente de aproximadamente 15 a aproximadamente 45 g/l de resina. El anticuerpo de interés se une al material de intercambio catiónico como resultado de esta etapa de carga.
Después de la carga, el material de intercambio catiónico se lava en una primera etapa de lavado con un primer tampón de lavado. Durante el proceso de lavado, el tampón de lavado se pasa sobre el material de intercambio catiónico. La composición del tampón de lavado se elige normalmente para eluir la mayor cantidad de contaminantes posible de la resina sin eluir una cantidad sustancial del anticuerpo de interés. El pH del primer tampón de lavado es generalmente superior al del tampón de equilibrado y/o de la composición cargada, por ejemplo aproximadamente 2 a aproximadamente 3 unidades de pH superior. Preferiblemente, el pH del primer tampón de lavado está en el intervalo de aproximadamente pH 6,8 a aproximadamente 9,0, preferiblemente de aproximadamente pH 6,8 a aproximadamente 8,0, por ejemplo aproximadamente pH 7,8 o aproximadamente pH 7,0. Ejemplos de tampones que tamponan en este intervalo de pH incluyen, aunque sin limitación, HEPES, MES, acetato sódico, TRIS/HCl, clorhidrato de trietanolamina/NaOH, Bicina/HCl, Tricina/HCl, etc. El primer tampón de lavado preferido comprende o consiste en: (1) HEPES 25 mM, pH 7,8 o (2) MOPS 25 mM, pH 7,0.
A este respecto, la presente descripción proporciona una composición que comprende un anticuerpo quimérico recombinante contra CD20, tal como rituximab, en HEPES 25 mM, pH 7,0. La descripción también proporciona un anticuerpo humanizado recombinante contra VEGF, tal como bevacizumab, en MOPS 25 mM, pH 7,0. Dichas composiciones son útiles, entre otras cosas, como composiciones intermedias usadas en la purificación de estos productos.
La invención de este documento generalmente implica al menos una etapa adicional, o segunda de lavado usando un segundo tampón de lavado. El pH del segundo tampón de lavado preferiblemente es inferior al del primer tampón de lavado, por ejemplo de aproximadamente 2 a aproximadamente 3 unidades de pH inferior. Por tanto, por ejemplo, el pH del segundo tampón de lavado puede estar en el intervalo de aproximadamente pH 5,0 a aproximadamente pH 6,0. Preferiblemente, el pH del segundo tampón de lavado es aproximadamente 5,5. Ejemplos de tampones que tamponan en este intervalo de pH incluyen, aunque sin limitación, MES, ácido acético/acetato sódico o NaOH, NaH2PO3/Na2HPO4, Bis.Tris/HCl. MES, pH 5,5 es el tampón preferido para el segundo lavado. En una realización, el segundo tampón de lavado comprende o consiste en: MES 19 mM, NaCl 10 mM, pH 5,50. En otra realización, el segundo tampón de lavado comprende o consiste en MES 23 mM, NaCl 10 mM, pH 5,50.
Aunque pueden emplearse etapas adicionales de lavado, preferiblemente se realiza solamente una primera y segunda etapa de lavado, antes de eluir el anticuerpo deseado. Los contaminantes tales como los analizados anteriormente se retiran del material de intercambio catiónico durante la primera y/o segunda etapa de lavado. Preferiblemente, la primera etapa de lavado retira la mayoría de los contaminantes.
Después de la etapa o etapas de lavado indicadas anteriormente, el anticuerpo deseado se eluye del material de intercambio catiónico. La elución del anticuerpo puede conseguirse aumentando la conductividad o fuerza iónica. De forma deseable, la conductividad del tampón de elución es mayor de aproximadamente 10 mS/cm. La conductividad aumentada puede conseguirse incluyendo una concentración salina relativamente elevada en el tampón de elución. Las sales a modo de ejemplo para este propósito incluyen, sin limitación, acetato sódico, cloruro sódico (NaCl), y cloruro potásico (KCl). En una realización, el tampón de elución comprende NaCl de aproximadamente 100 a aproximadamente 300 mM. El tampón de elución generalmente tendrá aproximadamente el mismo pH que el segundo tampón de lavado. Un tampón de elución preferido comprende: MES 19 mM, NaCl 160 mM, pH 5,5. Otro tampón de elución preferido comprende: MES 23 mM, NaCl 175 mM, pH 5,5. La elución preferiblemente implica elución por etapas (en oposición a elución en gradiente).
Aunque la etapa de elución viene seguida opcionalmente por una etapa de regeneración, ésta no es necesaria de acuerdo con la realización preferida de la invención.
Aunque se contemplan etapas adicionales, preferiblemente el método de purificación de intercambio catiónico de este documento consiste en solamente las siguientes etapas: equilibrado (por ejemplo, usando tampón de equilibrado pH aproximadamente 5,5), carga de una composición que comprende el anticuerpo y contaminante o contaminantes (por ejemplo, donde el pH de la composición cargada es aproximadamente 5,0 o aproximadamente 5,5), primera etapa de lavado para eluir los contaminantes (por ejemplo, usando un primer tampón de lavado pH aproximadamente 7,8 o un primer tampón de lavado pH aproximadamente 7,0), segunda etapa de lavado (por ejemplo, usando un segundo tampón de lavado pH aproximadamente 5,0), y elución (por ejemplo, usando tampón de elución pH aproximadamente 5,5, y conductividad aumentada respecto a cada una de las etapas anteriores para
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eluir el anticuerpo).
La preparación de anticuerpo obtenida de acuerdo con el método de cromatografía de intercambio catiónico de este documento puede someterse a etapas adicionales de purificación, si fuera necesario. Se han analizado anteriormente etapas adicionales de purificación a modo de ejemplo.
Opcionalmente, el anticuerpo se conjuga con una o más moléculas heterólogas según se desee. La molécula heteróloga puede, por ejemplo, ser una que aumente la semivida en suero del anticuerpo (por ejemplo, polietilenglicol, PEG), o puede ser un marcador (por ejemplo, una enzima, marcador fluorescente y/o radionúclido), o una molécula citotóxica (por ejemplo, una toxina, fármaco quimioterapéutico, o isotipo radiactivo, etc.).
Una formulación terapéutica que comprende el anticuerpo, opcionalmente conjugado con una molécula heteróloga, puede prepararse mezclando el anticuerpo que tiene el grado deseado de pureza con vehículos, excipientes o estabilizantes opcionales farmacéuticamente aceptables (Remington's Pharmaceutical Sciences 16a edición, Osol, A. Ed. (1980)), en forma de formulaciones liofilizadas o soluciones acuosas. Los vehículos, excipientes, o estabilizantes "farmacéuticamente aceptables" son no tóxicos para los destinatarios a las dosificaciones y concentraciones empleadas, e incluyen tampones tales como fosfato, citrato, y otros ácidos orgánicos; antioxidantes incluyendo ácido ascórbico y metionina; conservantes (tales como cloruro de octadecildimetilbenzil amonio; cloruro de hexametonio; cloruro de benzalconio, cloruro bencetonio; fenol, alcohol butílico o bencílico; alquil parabenos tales como metil o propil parabeno; catecol; resorcinol; ciclohexanol; 3-pentanol; y m-cresol); polipéptido de bajo peso molecular (menos de aproximadamente 10 restos); proteínas, tales como albumina sérica, gelatina, o inmunoglobulinas; polímeros hidrófilos tales como polivinilpirrolidona; aminoácidos tales como glicina, glutamina, asparagina, histidina, arginina, o lisina; monosacáridos, disacáridos, y otros carbohidratos incluyendo glucosa, manosa, o dextrinas; agentes quelantes tales como EDTA; azúcares tales como sacarosa, manitol, trehalosa o sorbitol; contra-iones que forman sales tales como sodio; complejos metálicos (por ejemplo, complejos Zn-proteína); y/o tensioactivos no iónicos tales como TWEEN™, PLURONICS™ o polietilenglicol (PEG).
Los ingredientes activos también pueden atraparse en microcápsulas preparadas, por ejemplo, por técnicas de coacervación o por polimerización interfacial, por ejemplo, microcápsula de hidroximetilcelulosa o gelatina y microcápsula de poli-(metilmetacrilato), respectivamente, en sistemas coloidales de suministro de fármacos (por ejemplo, liposomas, microesferas de albumina, microemulsiones, nanopartículas y nanocápsulas) o en macroemulsiones. Dichas técnicas se describen en Remington's Pharmaceutical Sciences 16a edición, Osol, A. Ed. (1980).
La formulación a usar para administración in vivo debe ser estéril. Esto se consigue fácilmente por filtración a través de membranas estériles de filtración.
Pueden prepararse preparaciones de liberación sostenida. Ejemplos adecuados de preparaciones de liberación sostenida incluyen matrices semipermeables de polímeros hidrófobos sólidos que contienen la variante de anticuerpo, estando dichas matrices en forma de artículos conformados, por ejemplo, películas o microcápsulas. Ejemplos de matrices de liberación sostenida incluyen poliésteres, hidrogeles (por ejemplo, poli(2- hidroxietilmetacrilato), o poli(alcohol vinílico)), polilactidas (patente de Estados Unidos N° 3.773.919), copolímeros de ácido L-glutámico y g etil-L-glutamato, acetato de etilen-vinilo no degradable, copolímeros de ácido láctico-ácido glicólico degradables tales como LUPRON DEPOT™ (microesferas inyectables compuestas por copolímero de ácido láctico-ácido glicólico y acetato de leuprolida), y ácido poli-D-(-)-3-hidroxibutírico.
El anticuerpo purificado como se describe en este documento o la composición que comprende el anticuerpo y un vehículo farmacéuticamente aceptable después se usa para diversos usos de diagnóstico, terapéuticos u otros usos conocidos para dichos anticuerpos y composiciones. Por ejemplo, el anticuerpo puede usarse para tratar un trastorno en un mamífero administrando una cantidad terapéuticamente eficaz del anticuerpo al mamífero. En el caso de un anticuerpo contra CD20 tal como rituximab, puede usarse para agotar las células B, tratar linfoma (por ejemplo, linfoma no Hodgkin, NHL), o leucemia (por ejemplo, leucemia linfocítica crónica, CLL) así como enfermedades autoinmunes tales como artritis reumatoide (RA), esclerosis múltiple (MS), lupus, etc. Para un anticuerpo que se une a VEGF, tal como bevacizumab, puede usarse para inhibir la angiogénesis, tratar el cáncer, y tratar la degeneración macular, etc.
Los siguientes ejemplos se ofrecen a modo de ilustración y no a modo de limitación.
Ejemplo 1: Purificación de un anticuerpo contra CD20
Este ejemplo describe un proceso mejorado de cromatografía de intercambio catiónico para purificar un anticuerpo contra CD20, rituximab. Rituximab se usa para terapia de NHL, CLL, RA, MS, etc. La estructura de la molécula de Rituximab se describe en el documento 5.736.137, Anderson et al., así como en las Fig. 1A-1B de este documento. Rituximab está disponible en el mercado en Genentech, Inc.
Se usa cromatografía de intercambio catiónico para reducir adicionalmente los niveles de CHOP, ADN, proteína A lixiviada, garamicina (GENTAMYCIN®), agregados de Rituximab, y virus potenciales. Rituximab se une a la columna
en las condiciones de carga. La columna después se lava, eluye, regenera/desinfecta, y almacena hasta el siguiente uso. Pueden usarse múltiples ciclos para procesar un lote completo de combinación de afinidad. La combinación de intercambio catiónico puede mantenerse a temperatura ambiente hasta 30 °C durante hasta 3 días o a 5 °C durante hasta 7 días.
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La resina de intercambio catiónico (POROS 50 HS®, Applied Biosystems) se compacta en una columna hasta una altura de lecho de 17-33 cm. Antes de cargar la combinación de afinidad, se purga la columna de intercambio catiónico de solución de almacenamiento con tampón de equilibrado. Después del equilibrado, la combinación de afinidad se carga en la columna. El producto se une a la columna en estas condiciones. La columna después se lava 10 con tampón de lavado 1, seguido de tampón de lavado 2. Rituximab se eluye de la columna usando un tampón de elución de alta fuerza iónica.
Se proporciona una comparación de las condiciones para el proceso de la presente invención en comparación con el proceso original (control) en la siguiente tabla.
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Tabla 1: Comparación de tampones para procesos de cromatografía de intercambio catiónico de Rituximab
Fase
Composición de tampón (proceso original) Composición de tampón (proceso ejemplificado)
Pre-equilibrado
MES 20 mM, NaCl 500 mM, pH 5,50 Ninguna
Equilibrado
MES 20 mM, NaCl 60 mM, pH 5,50 MES 19 mM, NaCl 60 mM, pH 5,50
Carga
Combinación de proteína A condicionada, pH 5,00, densidad de carga < 50 g/l de resina Combinación de proteína A condicionada, pH 5,00, densidad de carga < 50 g/l de resina
Lavado 1
MES 20 mM, NaCl 60 mM, pH 5,50 HEPES 25 mM, pH 7,80
Lavado 2
Ninguno MES 19 mM, NaCl 10 mM, pH 5,50
Elución
MES 20 mM, NaCl 160 mM, MES 19 mM, NaCl 160 mM,
pH 5,50 pH 5,50
Regeneración
MES 20 mM, NaCl 500 mM, pH 5,50 Ninguna
Desinfección
NaOH 0,5 N NaOH 0,5 N
Almacenamiento
NaOH 0,1 N NaOH 0,1 N
Los intervalos deseados de pH, conductividad y molaridad para la carga y los tampones en el proceso de rituximab se proporcionan en la siguiente tabla.
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______Tabla 2: Intervalos preferidos de pH, conductividad y molaridad para el proceso de Rituximab______
Tampón
Composición de tampón pH diana Intervalo preferido de molaridad de tampón Intervalo preferido de pH de tampón Intervalo permitido de conductividad para tampones
Equilibrado
MES 19 mM, NaCl 60 mM 5,5 MES 14 - 23mM NaCl 50 - 70 mM 5,0 - 6,0 5,0 - 7,2 mS/cm
Carga
Combinación de Proteína A condicionada 5,0 NA 4,5 - 5,5 2,5 - 5,5 mS/cm
Lavado 1
HEPES 25 mM 7,8 HEPES 15 - 35 mM 7,5 - 8,1 0,5 - 1,5 mS/cm
Lavado 2
MES 19 mM NaCl 10 mM 5,5 MES 14 - 23mM NaCl 5 - 15 mM 5,0 - 6,0 0,6 - 2,2 mS/cm
Elución
MES 19 mM NaCl 160 mM 5,5 MES 14 - 23 mM NaCl 140 - 180 mM 5,3 - 5,7 13,4 - 17,2 mS/cm
Desinfección
NaOH 0,5 N NA NA NA NA
Almacenamiento
NaOH 0,1 N NA NA NA NA
* Valores de conductividad medidos con compensación de temperatura en base a una temperatura de 20 °C y un valor alfa de 1,77._____________________________________________________________________________
El proceso ejemplificado para purificación de Rituximab potenció la robustez de la eliminación de proteínas de la célula hospedadora posibilitando una mayor retirada de proteínas de la célula hospedadora en las fases de lavado, 25 provocando niveles inferiores de proteínas de la célula hospedadora en la combinación de producto (combinación de elución) y facilitando la retirada de las impurezas en la posterior etapa corriente abajo. La Fig. 3 ilustra las ventajas del presente proceso en términos de retirada de proteínas de la célula hospedadora.
Ejemplo 2: Purificación de un anticuerpo contra VEGF
Este ejemplo describe un proceso de cromatografía de intercambio catiónico para purificar un anticuerpo recombinante humanizado contra el factor de crecimiento del endotelio vascular (rhuMAb VEGF), bevacizumab. La estructura de la molécula de bevacizumab se describe en la patente de Estados Unidos 7.169.901, Presta et al.
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Véanse también las Fig. 2A-2B de este documento. Bevacizumab está disponible en el mercado en Genentech, Inc. Este ejemplo resume los estudios de desarrollo realizados sobre la etapa de intercambio catiónico para un proceso mejorado de purificación de bevacizumab. Se evaluaron tres resinas de intercambio catiónico en estos estudios: CM SEPHAROSE FAST FLOW®, SP SEPHAROSE FAST FLOW® y POROS 50HS®. Los procesos de purificación por intercambio catiónico usando estas tres resinas se evaluaron con respecto a: rendimiento del proceso (retirada de impurezas, retirada de retrovirus, y rendimiento de la etapa), calidad del producto, robustez del proceso y ajuste del proceso a todos los sitios actuales de fabricación. En base a los datos generados en estos estudios, POROS 50HS® mostro rendimiento y robustez superiores del proceso y se seleccionó como la resina de intercambio catiónico para el proceso mejorado de purificación.
La cromatografía de intercambio catiónico es la etapa final de cromatografía en el proceso de purificación. Sirve para retirar los componentes del medio de cultivo celular (garamicina), impurezas derivadas de la célula hospedadora (CHOP, y ADN) y formas agregadas de bevacizumab. También funciona como etapa de eliminación viral.
La columna se hace funcionar en un modo de unión y elución y se realiza a temperatura ambiente. La columna usa una resina de intercambio catiónico (POROS 50HS®). La resina consiste en un soporte de lecho poroso de poliestireno-divinilbenceno acoplado con un grupo funcional cargado negativamente. La columna se retira del almacenamiento lavando con tampón de equilibrado. La combinación filtrada de virus se diluirá con 0,3 volúmenes de agua para inyección (WFI) para cumplir el límite de conductividad de < 5,5 mS/cm. La combinación filtrada de virus después se carga en la columna equilibrada. El producto se une a la resina. Después de la carga, la columna se lava con un tampón de alto pH para lavar abundantemente el material de carga a través de la columna y retirar las impurezas CHOP. La columna después se lava con un tampón de bajo contenido salino para bajar el pH y preparar la columna para elución. El producto se eluye usando una elución por etapas de tampón de alto contenido salino con un máximo de 7 volúmenes de columna. Después de la elución, la columna y el calzo se desinfectan con solución de desinfección (NaOH 0,5 N) antes de almacenamiento en solución de almacenamiento (NaOH 0,1 N) hasta su siguiente uso.
La siguiente tabla proporciona una descripción de las condiciones para el proceso de bevacizumab de la invención de este documento.
Tabla 3 - Proceso de Bevacizumab
Fase
Tampón / Solución Parámetro del proceso Caudal (cm/h)
Altura de lecho (cm)
N/A 30 N/A
Equilibrado
MES 23 mM / NaCl 60 mM pH 5,5, cond. 6,9 mS/cm 4 CV 100
Carga
Combinación filtrada de virus condicionada (VF) pH 5,5 ± 0,2, cond. < 5,5 mS/cm 15 - 45 g bevacizumab / l de resina 100
Lavado 1
MOPS 25 mM, pH 7,0 3 CV 100
Lavado 2
MES 23 mM / NaCl 10 mM pH 5,5, cond. 1,5 mS/cm 3 CV 100
Elución
MES 23 mM / NaCl 175 mM pH 5,5, cond. 18 mS/cm 7 CV 100
Combinación de partida
DO 280 ^ 0,5 N/A
Combinación final
DO 280 < 1,0 N/A
Desinfección
NaOH 0,5 N 3 - 6 CV 50 - 100
Almacenamiento
NaOH 0,1 N 3 - 6 CV 50 - 100
Los intervalos deseados de pH, conductividad y molaridad para la carga y los tampones en el proceso de bevacizumab se proporcionan en la siguiente tabla.
Tabla 4: Intervalos preferidos de pH, conductividad y molaridad para el proceso de Bevacizumab
Tampón diana Intervalo diana de pH Intervalo diana de conductividad Intervalo preferido de molaridad del tampón Intervalo preferido de pH del tampón
Equil.
MES 23 mM, NaCl 60 mM 5,4 - 5,60 6,1 - 7,7 mS/cm MES 13 - 33 mM NaCl 50 - 70 mM 5,1 - 5,9
Carga
Combinación VF diluida con agua para inyección (WFI) 5,3 - 5,7 < 5,5 mS/cm < 6,5 mS/cm 5,2 - 5,8
Lavado 1
MOPS 25 mM 6,9 - 7,1 0,2 - 1,2 mS/cm MOPS 15 - 35 mM 6,6 - 7,4
Lavado 2
MES 23 mM NaCl 10 mM 5,4 - 5,6 1,2 - 1,8 mS/cm MES 13 - 33 mM NaCl 5 - 20 mM 5,1 - 5,9
Elución
MES 23 mM NaCl 175 mM 5,45 - 5,55 17,5 - 18,5 mS/cm MES 13 - 33 mM NaCl 160 - 190 mM 5,4 - 5,6
5
10
15
20
25
30
Desinfección
NaOH 0,5 N NA 50 - 60 mS/cm (diluido 1:1) NaCl 0,5 N NA
Almacenamiento
NaOH 0,1 N NA 17 - 27 mS/cm NaOH 0,1 N NA
Se descubrió que el presente proceso es superior al proceso original de bevacizumab que usaba un primer tampón de lavado pH 5,5. El nuevo proceso de este documento era capaz de conseguir combinaciones con niveles inferiores de CHOP, consiguió un mayor rendimiento de etapa y fue un proceso global más robusto para ejecutar en fabricación.
Listado de secuencias
<110> GENENTECH, INC. Lebreton, Benedicte Andree O'Connor, Deborah Ann Safta, Aurelia Sharma, Mandakini
<120> PURIFICACIÓN DE ANTICUERPOS MEDIANTE CROMATOGRAFÍA DE INTERCAMBIO CATIÓNICO
<130> P2280R1 WO
<150> US 60/983.825 <151 >
<160> 20
<210> 1 <211> 432 <212> PRT
<213> Secuencia artificial <220>
<223> la secuencia está sintetizada <400> 1

Claims (10)

  1. 5
    10
    15
    20
    25
    30
    35
    40
    45
    50
    REIVINDICACIONES
    1. Un método para purificar un anticuerpo de una composición que comprende el anticuerpo y al menos un contaminante, comprendiendo dicho método las etapas secuenciales de:
    (a) cargar la composición en un material de intercambio catiónico en el que la composición está a un primer pH de 4,0 a 6,0;
    (b) lavar el material de intercambio catiónico con un primer tampón de lavado, en donde el pH del primer tampón de lavado es de 6,8 a 9,0;
    (c) lavar el material de intercambio catiónico con un segundo tampón de lavado de un pH de 5,0 a 6,0; y
    (d) eluir el anticuerpo del material de intercambio catiónico con un tampón de elución a una conductividad que es al menos 2 mS/cm mayor que la del segundo tampón de lavado,
    en el que el anticuerpo es bevacizumab.
  2. 2. El método de la reivindicación 1, en el que el pH del segundo tampón de lavado y el pH del tampón de elución son aproximadamente iguales.
  3. 3. El método de la reivindicación 1, en el que el pH de la composición en (a) es de 4,0 a 6,0, el pH del primer tampón
    de lavado es de 6,8 a 8,0, el pH del segundo tampón de lavado es de 5,0 a 6,0 y el pH del tampón de elución es de
    5,0 a 6,0.
  4. 4. El método de la reivindicación 1, en el que la conductividad del tampón de elución es de 10 mS/cm a 100 mS/cm.
  5. 5. El método de la reivindicación 1, en el que el tampón de elución comprende NaCl de 100 a 300 mM.
  6. 6. El método de la reivindicación 1, en el que el material de intercambio catiónico comprende partículas de flujo continuo de poli(estireno-divinilbenceno) reticulado recubiertas con un polímero polihidroxilado funcionalizado con grupos sulfopropilo.
  7. 7. El método de la reivindicación 1, en el que el contaminante se selecciona entre el grupo que consiste en proteínas de ovario de hámster chino (CHOP), proteína A lixiviada, ADN, anticuerpo agregado, componente de medio de cultivo celular, garamicina y contaminante viral.
  8. 8. Un método para purificar un anticuerpo que se une al factor de crecimiento endotelial vascular (VEGF) humano de una composición que comprende el anticuerpo y uno o más contaminantes seleccionados entre el grupo que consiste en un componente de medio de cultivo, garamicina, proteínas de ovario de hámster chino (CHOP), aDn, contaminante viral y anticuerpo agregado contra VEGF, comprendiendo el método las etapas secuenciales de:
    (a) cargar la composición en un material de intercambio catiónico en el que la composición está a un pH de 4,0 a
    6,0;
    (b) lavar el material de intercambio catiónico con un primer tampón de lavado a un pH de 6,8 a 8,0;
    (c) lavar el material de intercambio catiónico con un segundo tampón de lavado a un pH de 5,0 a 6,0; y
    (d) eluir el anticuerpo del material de intercambio catiónico usando un tampón de elución con un pH de 5,0 a 6,0 y una conductividad de 10 mS/cm a 100 mS/cm
    en el que el anticuerpo es bevacizumab
  9. 9. El método de la reivindicación 13, en el que el tampón de elución comprende NaCl de 100 a 300 mM.
    Ser
    3 6
    +1 FR1 10 15
    Gln Val G^n Leu Gln Gln Pro Gly Ala Glu Leu Val Lys Pro Gly Ala
    2 0
    25
    30
    Val Lys Met Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Tr.r.
    Trp
    4 0 FR2
    45
    45
    54
    Val Lys Gln Thr Pro Gly Arg Gly Leu Glu Trp lie Gly
    Asn

    31 CDR1 35

    Ser Tyr Aon Met His

    50 52 52A 53
    Ala lie Tyr Pro Gly
    55 CDR2 60 65
    Gly Asp Thr Ser Tyr Asn Gln Lys Phe Lys Gly Lys
    £6 FR3 70
    Lys Ala Thr Leu Thr Ala Asp
    75 30 82 82ñ 82B 32C 83 £5
    Ser Ser Ser Thr Ala Tyr Met Gln Leu Ser Ser Leu Thr Ser Glu Asp Ser ñla Va 1
    SO 94
    Tyr Tyr Cys Ala Arg Gly
    95 CDR3 100 lQOs I00e 100c IOCi 101 10:
    Ser Thr Tyr Tyr Gly Gly Asp Trp Tyr Phe ñau Val
    1 03
    Trp
    105 FR4 110 113 Ala Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ala Pro
    114 120
    Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe
    Constante gamma 1 humana
    130 133 14 0;
    Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr ñla ñla Leu Gly Cys Leu Val
    150 154 J56 157 J 6?
    Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Per 16S 171 180 182
    Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Le_ Ser Ser
    190 200 203 205 210
    Val Val Thr Val Pro Ser Sur Ser Leu Gly Thr G_n Thr Tyr lie Cys Asr. Va. Asn
    220 222
    His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Vai Asp Lys Lys
    225 25.: 22-2 2 35
    Al£ GlU Pro Lys Ser CVS Asp Lys
    24 0 24 3 24 4 250
    Thr Hii T: i Cys Pro Pro Cys Pro Ais Pro Glu Leu Ler Gly Gly Pro Ser Val Phe
  10. 260 .
    Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met lie Ser Are Thr Pro G-u Val Thr
    Constante gamma 1 humana - continuación

    280 OSO 252
    Cys Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val
    255 196 259 300 31C 314 317
    Asp Gly Val Gl’J Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Aro Glu Glu Gln Tyr Asn Ser

    320 330
    Thr Tyr Arq Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys
    Glu
    Tyr Lys 340 Cys Lys val Ser Asn Lys Al a Leu Pro Ala 35C Prc lia Glu Lys Thr 355 He
    357 Ser
    Lys Ale. 360 Lys 36» Gly 363 Gln Pro Arg Glu Pro Gln val 370 Tyr Th r Leu Pro Pro Ser ■Are
    376 361 390
    Asp Glu Leu Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro

    400 401 405 400 410 413 420
    Ser Asp lie Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys
    Thr

    428 430 433 440
    Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Lev Tyr Ser Lys Leu Tt.r Val

    450 460
    Asp Lys Ser Arq Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala
    4 70 ü6 Anno
    ácido # [Kabat)
    Leu .Mis Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Sei Leu Ser Pro Gly Lys TER
    + 1 FRl 10
    31r¡ lie Val Leu Ser Gln Ser Pro Ala lie Leu Ser Ala Ser
    20 23
    Pro Gly Glu Lys Val Thr Met. Thr Cys
    24 CDR1 27/ 29 30 34
    Arg Ala Ser Ser Ser Val Ser Tyr lie His
    35 FR2 40 45 49 | 50 CDR2
    Trp Phe Gln Gln Lys Pro Gly Ser Ser Pro Lys Pro Trp lie Tyr| Ala Thr Ser Asn
    55 56
    Leu Ala Ser
    75
    57
    60
    FR3
    65
    70
    80
    85
    CDR3 95 97
    Thr Ser Asn Pro Pro Thr
    98
    100 FR4
    105
    Thr
    Ser Tyr Ser
    88
    89 90
    Cys
    Gln G X n Trp
    107
    08 110
    Lya
    Arg Thr Val
    120
    Ala Ala Pro Ser Val Phe lie Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gln Leu Lys Ser Gly Thr
    Constante kappa humana

    130 140
    Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Arg Glu Ala Lys Val Gln Trp

    150 160
    Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly Asn Ser Gln Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp

    170 180 •
    Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser Leu Ser Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr

    190 200
    Glu Lys His Lys Val Tyr Ala Cys Glu Val Thr fiís Gln Gly Leu Ser Ser Pro Val

    210 214
    Thr Lys Ser Phe Asn Arg Gly Glu Cys TER
    Aminoácido # (kabat)
    EVOLVESGGGLVOPGGSLRLSCAASGYTFTNYGMNWVROAPGK
    GLEWVGWINTYTGEPTYAADFKRRrTFSLDTSKSTAYLOMNSLR
    AEDT A V Y Y CAKYPHYY G SSHWYFD VW GOG TLVTVSS ¡| ASTKGP
    SVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVH
    TFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSFJTKVDKK
    VEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTC
    VV VD V SHEDPEVKFN WY'VDG VEVHN AKTKPREEQ YM ST YRVVS
    VLT VLHQD WLN GKE YKCK V SNKALPAPIEKT1SKAKG QPREPQ V
    YTLPP SREEM TKNQV SLT CL VKGF YP SDIA VE WESNGQPENN YKT
    TPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYT
    QKSLSLSPGK
    Fig. 2B - Cadena ligera de bevacizumab
    DlOMTOSPSSLSASVGDRV'nTCSASODJSKYLNWYQOKPGKAPK VLTYFTSSLHSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLOPEDFATYYCQOYS TVPWTFGOGTKVE3KR j| TVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLN
    KADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
    Concentración de proteínas de la célula hospedadora (ng/ml)
    imagen1
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