ES2475207T3 - Compuestos de unión a IAP - Google Patents

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ES2475207T3 ES05792764.2T ES05792764T ES2475207T3 ES 2475207 T3 ES2475207 T3 ES 2475207T3 ES 05792764 T ES05792764 T ES 05792764T ES 2475207 T3 ES2475207 T3 ES 2475207T3
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Stephen M. Condon
Matthew G. Laporte
Yijun Deng
Susan R. Rippin
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Abstract

Un compuesto: que tiene la estructura de fórmula (2): donde: A1 y A2 son independientemente hidrógeno, alquilo, arilo, o alquilarilo, R1a es H o metilo; R1b es alquilo o arilo; X1 es -O-, -S-, -CH2-, o -NH-, J es -CH- o -N-, siempre que cuando J es -N-, X-1 sea -CH2- o -NH-; Y es H o alquilo; Z es -OH, ariloxi, alcoxi, benciloxi, amino, arilamino, alquilamino, bencilamino; R2 es:**Fórmula**

Description

Compuestos de unión a IAP
Referencia a solicitudes relacionadas
La presente solicitud reivindica el beneficio de la solicitud provisional de patente de los Estados Unidos No. 60/588,050 presentada el 15 de julio de 2004.
Antecedentes
La apoptosis, muerte celular programada, juega un rol central en el desarrollo y la homeostasis de todos los organismos multicelulares. Las alteraciones de las vías apopt�ticas se han relacionado con muchos tipos de patologías humanas, que incluyen trastornos de desarrollo, cáncer, enfermedades autoinmunes, as� como trastornos neurodegenerativos.
Las vías de muerte celular programada se han convertido en objetivos para el desarrollo de agentes terapéuticos. En algunos casos, dado que es más fácil destruir células enfermas que mantenerlas, se han utilizado terapias anticancer�genas que utilizan agentes pro-apopt�ticos como la radiación convencional y la quimioterapia para disparar la activación de las vías apopt�ticas mediadas por mitocondria. Sin embargo, estas terapias carecen de especificidad molecular y se necesitan más objetivos moleculares específicos.
La apoptosis se ejecuta principalmente mediante caspasas activadas, una familia de ciste�na proteasas con especificidad de aspartato en sus sustratos. Las caspasas se producen en células como zim�genos catal�ticamente inactivos y deben procesarse proteol�ticamente para convertirse en proteasas activas durante la apoptosis. En células sobrevivientes normales que no han recibido un estímulo apopt�tico, la mayoría de las caspasas siguen inactivas. Aún si algunas caspasas se activan de manera aberrante, su actividad proteol�tica puede inhibirse por completo mediante una familia de proteínas evolucionariamente conservadas llamadas IAP (inhibidores de proteínas de apoptosis) (Deveraux & Reed, Genes Dev. 13: 239-252, 1999). Cada una de las IAP contiene de 1 a 3 copias del llamado dominio BIR (repetición de la IAP del baculovirus) e interact�a directamente con e inhibe la actividad enzim�tica de caspasas maduras. Varios IAP de mamíferos, que incluyen XIAP, survivina, y LIVIN/ML-IAP (Kasof and Gomes, J. Biol. Chem. 276: 3238-3246, 2001; Vucic et al. Curr. Biol. 10: 1359-1366, 2000; Ashhab et al. FEBS Lett. 495: 56-60, 2001), han sido identificadas y exhiben actividad antiapop�tica en cultivo celular (Deveraux & Reed, 1999, supra). Como las IAP se expresan en la mayoría de células cancerígenas, pueden contribuir directamente con la progresión tumoral y la resistencia posterior al tratamiento con fármaco.
En células normales señaladas para someterse a apoptosis, es necesario eliminar el efecto inhibidor mediado por IAP, proceso que al menos en parte se realiza mediante una proteína de la mitocondria denominada Smac, segundo activador de caspasas derivado de mitocondria; (Du et al. Cell 102: 33-42, 2000) o DIABLO (proteína directa de unión con IAP con pI bajo; Verhagen et al. Cell 102: 43-53, 2000). Smac/DIABLO, sintetizada en el citoplasma, se dirige al espacio entre las membranas de la mitocondria. Con el estímulo apopt�tico, se libera Smac de la mitocondria hacia el cistosol, junto con citocromo c. Aunque el citocromo c induce la multimerizaci�n de Apaf-1 para activar procaspasa-9 y proscapasa-3, Smac elimina el efecto inhibidor de múltiples IAP. Smac interact�a con todos las IAP que han sido examinados a la fecha, que incluyen XIAP, c-IAP1, c-IAP2, ML-IAP, y survivina. Smac parece ser un regulador de apoptosis en mamíferos. Además de la inhibición de caspasas, IAP sobre-expresados pueden funcionar para unir Smac y evitar que se una a XIAP y libere caspasas (Vucic et. al., Biochem. J. 385(Pt 1):11-20, 2005).
Smac se sintetiza con una molécula precursora de 239 amino�cidos; los 55 residuos N-terminales sirven como la secuencia dirigida a la mitocondria que se elimina después de la importación. La forma madura de Smac contiene 184 amino�cidos y se comporta como un olig�mero en solución. Smac y varios de sus fragmentos han sido propuestos para el uso como objetivos para la identificación de agentes terapéuticos. Se cree que la actividad biológica de Smac est� relacionada con la unión de sus cuatro residuos N-terminales a una ranura de superficie incluida en una porción de XIAP denominada dominio BIR3. Esta unión evita que XIAP ejerza su función de supresión de apoptosis en la célula. Se considera que los tetrap�ptidos N-terminales de proteínas de unión con IAP de las proteínas Hid, Grim y Reaper proapopte�ticas de Drosophila funcionan de la misma manera.
WO 02/096930, presentada el 31 de mayo de 2002, divulga ensayos para uso en la selección de alto rendimiento de agentes que se unen a un dominio BIR de una IAP, aliviando la supresión mediada por IAP de apoptosis. Los ensayos utilizan un p�ptido de unión con IAP etiquetado o peptidomim�tico que se une a un dominio BIR de una IAP, donde al menos una característica mensurable de los cambios de etiquetado como una función del compuesto de unión con IAP unido al IAP o libre en solución. El dominio BIR de una IAP est� en contacto con el p�ptido o peptidomim�tico de IAP etiquetado para formar un complejo, y el complejo se expone a un compuesto a probar para la unión con BIR. Se mide el desplazamiento del p�ptido o peptidomim�tico con IAP etiquetado respecto del
5 complejo, de existir, mediante el compuesto de ensayo.
Las desventajas en el uso de p�ptidos para la administración in vivo como agentes de diagnóstico o terapéutico pueden incluir su media vida corta debido a la degradación proteol�tica del p�ptido en el cuerpo, la baja absorción a través de las paredes intestinales, las posibles reacciones inmunog�nicas, as� como el gasto involucrado en la síntesis del p�ptido. Sería beneficioso preparar compuestos de unión con IAP no pept�dicos que tengan actividad
10 biológica comparable de p�ptidos bioactivos, pero posean mejores propiedades farmacol�gicas y sean más fáciles o más económicos para sintetizar.
En relación con los tetrap�ptidos Smac, sería importante avanzar en la técnica para desarrollar compuestos de unión con IAP que pueden utilizarse para promover la apoptosis, a la vez que tienen mejores propiedades asociadas con compuestos no pept�dicos. Dichos compuestos pueden utilizarse como agentes de diagnóstico y terapéuticos en el
15 tratamiento de trastornos relacionados con la apoptosis.
Sumario de la invención
Una realización de la presente invención es un compuesto o una composición que comprende un compuesto de la fórmula general (2):
benciloxi, benciloxi, amino, arilamino, aquilamino, grupo bencilamino; R2 es:
30 M es alquileno, alquenileno, alquinileno, heteroalquileno, heteroalquenileno, o grupo heteroalquinileno, G se selecciona de un enlace, —O—; —N(R2d)— donde R2d es H, alquilo, cicloalquilo, o arilo; o —S(O)m— donde m es 0, 1, o 2; y R10 es cicloalquilo, arilo, heterocicloalquilo, heterocicloalquenilo, o heteroarilo; n es independiente el número entero 0, 1, 2, 3, 4, o 5.
Otra realización de la presente invención es un compuesto o una composición que incluye un compuesto de la 35 fórmula general (3):
donde A1 es H, alquilo inferior, o un grupo alquilo inferior opcionalmente sustituido; R1a y R1b son independientemente H, alquilo inferior, alquilo inferior opcionalmente sustituido; o A1 junto con R1a o R1b forman un 5 grupo heterocicloalquilo opcionalmente sustituido de 3 a 6 átomos; Y es H, un grupo alquilo, un grupo alquinilo, un grupo cicloalquilo de 3 a 7 átomos de carbono, arilo, heteroarilo, arilalquilo, versiones opcionalmente sustituidas de estos grupos, versiones sustituidas con hidroxi de estos grupos, o Y junto con Z, M, G o R10 forma un anillo carboc�clico o un anillo heteroc�clico que contiene de 1 a 5 hetero�tomos, donde Y est� unido a Z, M, G, o R10; Z es H, alquilo, hidroxi, amino, alquilamino, dialquilamino, alcoxi, cicloalquilo, cicloalquiloxi, arilo, heteroarilo, ariloxi, o un 10 grupo heteroariloxi; o Z junto con Y, M, G, o R10 forman un anillo carboc�clico o un anillo heteroc�clico que contiene de 1 a 5 hetero�tomos, donde Z est� unido a Y, M, G, o R10; M es un alquileno opcionalmente sustituido, alquenileno, o un grupo alquinileno de 1 a 5 átomos de carbono; G es un enlace, un hetero�tomo, —(C=O)—; — S(O)t— donde t=0, 1, o 2; —NR18—; —NCOR18—; o —NS(O)xR18— donde x=0, 1, o 2, y R18 es alquilo inferior, alquilo inferior opcionalmente sustituido, o cicloalquilo o R18 est� contenido en un anillo carboc�clico o heteroc�clico 15 que contiene de 1 a 5 hetero�tomos donde R18 est� unido a Z, M, o R10; R10 es un arilo, un grupo heteroarilo, un arilo
25 donde X2 es un hetero�tomo e independientemente grupos R11, R'11, R12 o cualquiera de R13-17 es H, halógeno, alquilo, alquenilo, alquinilo, arilo, heteroarilo, hidroxilo, alcoxi, polialquil�ter, amino, alquilamino, dialquilamino, alquiloxialquilo, ariloxi acilo, acetilo, carboxilato, sulfonato, sulfona, imina, oxima o heteroariloxi; independientemente R11, R'11, R12, o cualquiera de R13-17 es alquilo sustituido, alquenilo, alquinilo, arilo, heteroarilo, alcoxi, polialquil�ter, alquilamino, dialquilamino, alquiloxialquilo, ariloxi, o heteroariloxi; o grupos R11, R'11, R12 o cualquiera de R13-17, est�
30 contenido en un anillo carboc�clico o un anillo heteroc�clico que contiene de 1 a 5 hetero�tomos, y unido a grupos en la posición Y, Z, M, G, R11, R'11, R12 o cualquiera de R13-17.
Otra realización es un compuesto o una composición que comprende un compuesto de la fórmula general (5)
donde A1 es H, o alquilo inferior; R1a es H; R1b es un grupo alquilo inferior; Y es un grupo alquilo, un grupo cicloalquilo de 3 a 7 átomos de carbono, versiones opcionalmente sustituidas de estos grupos, versiones sustituidas con hidroxi de estos grupos; Z1a y Z1b son independientemente H, hidroxi, alcoxi, ariloxi, o un grupo heteroariloxi; M es un grupo alquileno opcionalmente sustituido de 1 a 5 átomos de carbono; G es un enlace, un hetero�tomo, o —NCOR18— y R18 es un alquilo inferior, un grupo alquilo inferior opcionalmente sustituido; R10 es cualquiera de las estructuras (4a), (4b), (4c) o (4d):
donde X2 es un hetero�tomo e independientemente grupos R11, R' 11, R12, o cualquiera de R13-17 son H, halógeno, alquilo, alquenilo, alquinilo, arilo, heteroarilo, hidroxilo, alcoxi, polialquil�ter, amino, alquilamino, dialquilamino, alquiloxialquilo, ariloxi, acilo, acetilo, carboxilato, sulfonato, sulfona, imina, oxima o heteroariloxi; independientemente R11, R' 11, R12 o cualquiera de R13-17 son alquilo sustituido, arilo, alquenilo, alquinilo, heteroarilo, alcoxi, polialquil�ter,
15 alquilamino, dialquilamino, alquiloxialquilo, ariloxi o heteroariloxi; o grupos R11, R' 11, R12 o cualquiera de R13-17, est� contenido en un anillo carboc�clico o un anillo heteroc�clico, que contiene de 1 a 5 hetero�tomos en Y, Z1a, Z1b, M, G, R11, R' 11, R12 o cualquiera de R13-17.
En una realización preferida, la presente invención es un compuesto o una composición que comprende un compuesto de la fórmula general (5)
15 donde X2 es un hetero�tomo e independientemente los grupos R11, R' 11, R12 o cualquiera de R13-17, son H, halógeno, alquilo, alquenilo, alquinilo, arilo, heteroarilo, hidroxilo, alcoxi, polialquil�ter, amino, alquilamino, dialquilamino, alquiloxialquilo, ariloxi acilo, acetilo, carboxilato, sulfonato, sulfona, imina, oxima o heteroariloxi; independientemente R11, R' 11, R12, o cualquiera de R13-17, son alquilo sustituido, arilo, alquenilo, alquinilo, heteroarilo, alcoxi, polialquil�ter, alquilamino, dialquilamino, alquiloxialquilo, ariloxi o heteroariloxi o los grupos R11, R' 11, R12, o cualquiera de R13-17,
20 est�n contenido en un anillo carboc�clico o heteroc�clico que contiene de 1 a 5 hetero�tomos, y unidos a grupos en posición Y, Z1a, Z1b, M, G, R11, R' 11, R12, o cualquiera de R13-17. Aún más preferentemente, X2 es nitrógeno.
Otras realizaciones de la presente invención incluyen moléculas y composiciones que pueden ser útiles para modificar o regular apoptosis en células. Estas moléculas de unión con IAP pueden unirse a una variedad de IAP (inhibidor de las proteínas de apoptosis). Estas moléculas pueden ser mon�meros o d�meros y pueden incluir una
25 etiqueta detectable o porción terapéutica y pueden formularse como composiciones farmacéuticas o diagnósticas que contiene estas moléculas. También se describen los procedimientos para usar estos compuestos son agentes terapéuticos y de diagnóstico.
Las moléculas de unión con IAP de la presente invención, que también se denominan moléculas cargo de unión con IAP pueden penetrarse, transfectarse o transportarse activa o pasivamente en células y pueden utilizarse para
30 desplazar IAP de otras proteínas como caspasas o Smac en células. Al menos una porción de la molécula cargo de unión con IAP se une a un dominio BIR de una IAP. La molécula cargo de unión con IAP puede brindar un efecto terapéutico para un trastorno de proliferaci�n celular y puede incluir sustituyentes terapéuticos, diagnósticos adicionales u otros sustituyentes en la molécula. Las realizaciones de las moléculas de unión con IAP incluyen derivados de pirrolidina que se unen a un dominio BIR de una IAP.
35 Las realizaciones de la presente invención incluyen moléculas de unión con IAP y sales farmac�uticamente aceptables de estas que tienen la estructura general de la fórmula (2):
donde: A1 y A2 pueden ser independientemente hidrógeno, alquilo, arilo, o un grupo alquilarilo, R1a puede ser H o un grupo metilo; R1b puede ser un grupo alquilo o arilo, en algunas realizaciones, R1b es metilo, etilo, n-propilo,
10 isopropilo, o un grupo etenilo; X1 puede ser un grupo —O—, —S—, —CH2—, o—NH— y J puede ser un grupo — CH—, o—N— , siempre que cuando J es —N—, X1 sea —CH2—, o un grupo —NH—; Y puede ser H, o un grupo alquilo; Z puede ser H, —OH, ariloxi, alcoxi, benciloxi, amino, arilamino, alquilamino, un grupo bencilamino, en algunas realizaciones Z es —OH, ariloxi, alcoxi, benciloxi, amino, arilamino, alquilamino, un grupo bencilamino; R2 es:
M puede ser alquileno, alquenileno, alquileno, heteroalquileno, heteroalquenileno, un grupo heteroalquileno, en algunas realizaciones M es:
En algunas realizaciones G puede seleccionarse de un enlace (es decir, G est� ausente); —O—; —N(R2d)— donde R2d puede ser H, alquilo, cicloalquilo, o arilo; o —S(O)m— donde m es 0, 1, o 2;
25 En algunas realizaciones, R10 puede ser cicloalquilo, arilo, heterocicloalquilo, heterocicloalquenilo, o heteroarilo, en otras realizaciones R10 es:
donde R3, R' 3, R4, R5, R' 5, R6, R7, R8 y R9 puede ser cada uno, independientemente H, metilo, etilo, n-propilo, isopropilo, halo, ciano, —(CH2)pC(=O)OH, —(CH2)pC(=O)O-alquilo, —(CH2)pC(=O)NH2; n y p son números enteros 35 y preferentemente n es independientemente, el número entero 0, 1, 2, 3, 4, o 5 y p es independientemente, el número entero 0, 1, 2, o 3; preferentemente al menos uno de R3, R' 3, R4, y R' 5, R5 o al menos dos de R6, R7, R8 and R9 son independientemente H, metilo, etilo, n-propilo, isopropilo, halo, o ciano; siempre que cuando uno o más de R3, R' 3, R' 5, y R5 es isopropilo, R4 sea distinto a isopropilo; siempre que cuando R4 es isopropilo, R3, R' 3, R' 5, y R5 son cada uno, independientemente, diferente a isopropilo; siempre que cuando R8 sea isopropilo, R9 sea distinto a
40 isopropilo; y siempre que en una composición terapéutica, (2) no sea la estructura donde R2 es
10 (2) tienen Kd como se determina mediante los procedimientos descritos, por ejemplo, en el Ejemplo 1 de menos de 100 micromolar, preferentemente, menos de 1 micromolar y aún más preferentemente menos de 0,1 micromolar.
Algunas realizaciones de los compuestos de unión con IAP o moléculas cargo de unión con IAP de estructura (2), donde A2 es H, X1 es —NH—, J es —CH—, y n es 0 para R2, pueden describirse mediante la estructura (3):
15 (3)
En algunas realizaciones de compuestos de estructura (3), A1 puede ser H, alquilo inferior, o un grupo alquilo inferior opcionalmente sustituido; R1a y R1b pueden ser, independientemente, H, alquilo inferior, alquilo inferior opcionalmente sustituido, alquileno inferior, un grupo alquileno inferior opcionalmente sustituido; o A1 junto con R1a o R1b pueden formar un grupo heterocicloalquilo opcionalmente sustituido de 3 a 6 átomos;
20 Y puede ser H, un grupo alquilo, un grupo alquilo de 1 a 10 átomos de carbono, un grupo alquilo ramificado de 1 a 10 átomos de carbono, un grupo alquinilo, un grupo cicloalquilo de 3 a 7 átomos de carbono, arilo, heteroarilo, o grupo arilalquilo; versiones opcionalmente sustituidas de los grupos anteriores; versiones sustituidas con hidroxi de los grupos anteriormente mencionados; o Y junto con Z, M, G, o R10 forma un anillo carboc�clico opcionalmente sustituido, o un anillo heteroc�clico opcionalmente sustituido que contiene de 1 a 5 hetero�tomos, donde Y est�
25 unido a Z, M, G, o R10; preferentemente Y est� unido a M, G, o R10 por cualquier número de átomos de hasta aproximadamente 20 átomos.
Z puede ser H, alquilo, hidroxi, amino, alquilamino, dialquilamino, alcoxi, cicloalquilo, cicloalquiloxi, arilo, heteroarilo, ariloxi, o un grupo heteroariloxi; o Z junto con Y, M, G, o R10 forman un anillo carboc�clico opcionalmente sustituido, o un anillo heteroc�clico opcionalmente sustituido que contiene de 1 a 5 hetero�tomos, donde Z est� unido a Y, M, G, o 30 R10; preferentemente Z est� unido a Y, M, G, o R10 por un número de átomos de hasta aproximadamente 20 átomos.
M puede ser un grupo alquileno, alquenilo, o alquinileno opcionalmente sustituido de 1 a 5 átomos de carbono.
G puede estar ausente (un enlace) o ser un hetero�tomo que incluye—O—; —NH—; —(C=O)—; —S(O)t— donde t es el número entero 0, 1, o 2; —NR18—; —NCOR18—; o —NS(O)xR18— donde x es el número entero 0, 1, o 2, y R18 puede ser un alquilo inferior, un alquilo inferior opcionalmente sustituido, o cicloalquilo o R18 est� contenido en un
35 anillo carboc�clico opcionalmente sustituido, o un anillo heteroc�clico opcionalmente sustituido que contiene de 1 a 5 hetero�tomos, donde R18 est� unido a Z, M, o R10, preferentemente R18 est� unido a Z, M, o R10, por cualquier número de átomos de hasta aproximadamente 20 átomos.
R10 puede ser un arilo, un grupo heteroarilo, un arilo fusionado, un grupo heteroarilo fusionado, o versiones opcionalmente sustituidas de estos grupos; o R10 puede ser cualquiera de las estructuras (4a), (4b), (4c), o (4d):
donde X2 es un hetero�tomo en estructuras (4a) o (4b), o X2 es un enlace carbono-carbono como se ilustra en estructuras (4c) o (4d), e independientemente, los grupos R11, R' 11, R12, o cualquiera de R13-17 pueden ser H, 5 halógeno, alquilo, alquenilo, alquinilo, arilo, heteroarilo, hidroxilo, alcoxi, polialquil�ter, amino, alquilamino, dialquilamino, alquiloxialquilo, ariloxi, acilo, acetilo, carboxilato, sulfonato, sulfona, imina, oxima o heteroariloxi; o independientemente R11, R' 11, R12, o cualquiera de R13-17, puede ser alquilo sustituido, alquenilo, alquinilo, arilo, heteroarilo, alcoxi, polialquil�ter, alquilamino, dialquilamino, alquiloxialquilo, ariloxi, o heteroariloxi; o grupos R11, R' 11, R12, o cualquiera de R13-17, puede contenerse en un anillo carboc�clico opcionalmente sustituido, o un anillo
10 heteroc�clico opcionalmente sustituido que contiene de 1 a 5 hetero�tomos, y puede unirse a grupos en posición Y, Z, M, G, R11, R' 11, R12, o cualquiera de R13-17, preferentemente estos grupos est�n unidos por un número de átomos de hasta aproximadamente 20 átomos. Algunas realizaciones de compuestos de estructura (3) tienen un Kd como lo determinan los procedimientos descritos, por ejemplo, en el Ejemplo 1 de menos de 100 micromolar, preferentemente menos de 1 micromolar, y aún más preferentemente menos de 0,1 micromolar.
15 Algunas realizaciones incluyen compuestos de estructura (5) donde:
A1 puede ser H, o alquilo inferior, o A1 y R1b juntos forman un anillo de 3 a 5 átomos;
R1a puede ser H; R1b puede ser un grupo alquilo inferior, o junto con A1 forma un anillo de 3 a 5 átomos;
25 Y puede ser un grupo alquilo, un grupo alquilo de 1 a 10 átomos de carbono; un grupo alquilo ramificado de 1 a 10 átomos de carbono, un grupo alquinilo, un grupo cicloalquilo de 3 a 7 átomos de carbono, versiones opcionalmente sustituidas de los grupos anteriormente mencionados, versiones sustituidas con hidroxi de los grupos anteriormente mencionados o Y junto con Z1a, Z1b, o R10 forma un anillo carboc�clico o un anillo heteroc�clico que contiene de 1 a 5 hetero�tomos, donde Y puede unirse a Z1a, Z1b, o R10; preferentemente Y est� unido a Z1a, Z1b, o R10 por cualquier
30 número de átomos de hasta aproximadamente 20 átomos.
Z1a y Z1b puede independientemente ser H, hidroxi, amino, alquilamino, dialquilamino, alcoxi, ariloxi, o un grupo heteroariloxi; o Z1a, Z1b, junto con Y o R10 forman un anillo carboc�clico o un anillo heteroc�clico que contiene de 1 a 5 hetero�tomos, donde Z1a o Z1b, est� unido a Y o R10; preferentemente Z1a o Z1b est� unido a Y o R10 por cualquier número de átomos de hasta aproximadamente 20 átomos.
35 M puede ser un grupo alquileno opcionalmente sustituido de 1 a 5 átomos de carbono.
G puede estar ausente (un enlace), o ser un hetero�tomo que incluye —O—;—(C=O)—; —NR18—; —NCOR18—; o —NS(O)xR18— donde x=0, 1, o 2, y R18 puede ser un alquilo inferior, un grupo alquilo inferior opcionalmente sustituido.
R10 puede ser arilo, un grupo heteroarilo, o R10 puede ser cualquiera de las estructuras (4a), (4b), (4c), o (4d):
donde X2 puede ser un hetero�tomo en las estructuras (4a) o 4(b) o X2 es un enlace carbono-carbono como se ilustra en las estructuras (4c) o (4d), e independientemente grupos R11, R' 11, R12, o cualquiera de R13-17, puede ser H, 15 halógeno, grupos alquilo, alquenilo, alquinilo, arilo, heteroarilo, hidroxilo, alcoxi, polialquil�ter, amino, alquilamino, dialquilamino, alquiloxialquilo, ariloxi o acilo o acetilo, carboxilato, sulfonato, sulfona, imina, oxima o heteroariloxi; o independientemente R11, R' 11, R12, o cualquiera de R13-17 puede ser alquilo sustituido, alquenilo, alquinilo, arilo heteroarilo, alcoxi, polialquil�ter, alquilamino, dialquilamino, alquiloxialquilo, ariloxi, o heteroariloxi o grupos R11, R' 11, R12, o cualquiera de R13-17, puede estar contenido en un anillo carboc�clico o un anillo heteroc�clico que contiene de 1
20 a 5 hetero�tomos y unido a grupos en posición Y, Z1a, Z1b, M, G, R11, R' 11, R12, o cualquiera de R13-17, preferentemente estos grupos est�n unidos por cualquier número de átomos de hasta aproximadamente 20 átomos. Algunas realizaciones de compuestos de estructura (5) tienen un Kd como est� descrito en los procedimientos, por ejemplo, en el Ejemplo 1 de menos de 100 micromolar, preferentemente menos de 1 micromolar, y aún más preferentemente menos de 0,1 micromolar.
25 Algunas realizaciones incluyen compuestos de estructura (5) donde:
A1 puede ser H, metilo, etilo, o A1 y R1b juntos forman un anillo de 3 a 5 átomos.
R1a puede ser H; R1b puede ser un grupo metilo o un grupo etilo o junto con A1 forma un anillo de 3 a 5 átomos.
35 Y puede ser un grupo alquilo, un grupo alquilo de 1 a 10 átomos de carbono, un grupo alquilo ramificado de 1 a 10 átomos de carbono, un grupo alquinilo, un grupo cicloalquilo de 3 a 7 átomos de carbono, versiones opcionalmente sustituidas de los grupos anteriormente mencionados; versiones sustituidas con hidroxi de los grupos anteriormente mencionados; o Y junto con Z1a, Z1b, o R10 forma un anillo carboc�clico o un anillo heteroc�clico que contiene de 1 a 5 hetero�tomos, donde Y se une a Z1a, Z1b, o R10; preferentemente Y se une a Z1a, Z1b, o R10 mediante cualquier
40 número de átomos de hasta aproximadamente 20 átomos.
Z1a y Z1b pueden, independientemente, ser H, hidroxi, amino, alquilamino, dialquilamino, alcoxi, ariloxi, o un grupo heteroariloxi, o Z1a o Z1b, junto con Y o R10 forman un anillo carboc�clico o un anillo heteroc�clico que contiene de 1 a 5 hetero�tomos, donde Z1ao Z1b est�n unidos a Y o R10; preferentemente, Z1a o Z1b, est� unido a Y o R10 mediante cualquier número de átomos de hasta aproximadamente 20 átomos.
5 M puede ser un grupo alquileno opcionalmente sustituido de 1 a 5 átomos de carbono.
G puede estar ausente (un enlace), o ser un hetero�tomo que incluye —O—;—(C=O)—; —NR18—; —NCOR18—; o —NS(O)xR18— donde x puede ser un número entero 0, 1, o 2, y R18 puede ser alquilo inferior, un grupo alquilo inferior opcionalmente sustituido.
R10 puede ser un arilo fusionado, un grupo heteroarilo fusionado, o preferentemente, R10 es cualquiera de las 10 estructuras (4a) o (4b), (4c), o (4d):
20 donde X2 puede ser un hetero�tomo (4a) o (4b) o X2 puede ser un enlace carbono-carbono (4c) o (4d), e independientemente grupos R11, R' 11, R12, o cualquiera de R13-17 puede ser un H, halógeno, alquilo, alquenilo, alquinilo, arilo, heteroarilo, hidroxilo, alcoxi, polialquil�ter, amino, alquilamino, dialquilamino, alquiloxialquilo, ariloxi, acilo, acetilo, carboxilato, sulfonato, sulfona, imina, oxima o heteroariloxi; o independientemente R11, R' 11, R12 o cualquiera de R13-17, puede ser un alquilo sustituido, alquenilo, alquinilo, arilo, heteroarilo, hidroxilo, alcoxi,
25 polialquil�ter, amino, alquilamino, dialquilamino, alquiloxialquilo, ariloxi o heteroariloxi; o grupos R11, R' 11, R12, o cualquiera de R13-17, puede estar contenido en un anillo carboc�clico o un anillo heteroc�clico que contiene de 1 a 5 hetero�tomos y unido a grupos en posición Y, Z1a, Z1b, M, G, R11, R' 11, R12, o cualquiera de R13-17, preferentemente estos grupos est�n unidos por cualquier número de átomos de hasta aproximadamente 20 átomos.
Algunas realizaciones incluyen compuestos de estructura (5) donde:
A1 puede ser H, o un grupo metilo; R1a es H; R1b puede ser un grupo metilo o etilo.
En la estructura (5) Y puede ser un grupo alquilo, un grupo alquilo de 1 a 10 átomos de carbono, un grupo alquilo ramificado de 1 a 10 átomos de carbono, un grupo alquinilo, un grupo cicloalquilo de 3 a 7 átomos de carbono, 40 versiones opcionalmente sustituidas de los grupos anteriormente mencionados, versiones sustituidas con hidroxi de los grupos anteriormente mencionados, o Y junto con R10 forma un anillo carboc�clico o un anillo heteroc�clico que
contiene de 1 a 5 hetero�tomos, donde Y est� unido a R10; preferentemente Y est� unido a R10 mediante cualquier número de átomos de hasta aproximadamente 20 átomos. Z1a y Z1b pueden ser independientemente H, un grupo hidroxi, alcoxi o ariloxi. M puede ser metileno, o un grupo alquileno opcionalmente sustituido de 1 a 5 átomos de carbono. G puede estar ausente (un enlace), o ser un hetero�tomo que incluye —O—; R10 puede ser un arilo, un grupo heteroarilo, o en algunas realizaciones R10 puede ser una estructura de fórmula (4a):
donde X2 es un hetero�tomo e independientemente, grupos R11, R12, o cualquiera de R14-17 puede ser H, o halógeno, grupos alquilo, arilo, alquenilo, alquinilo, heteroarilo, hidroxilo, alcoxi, polialquil�ter, amino, alquilamino, dialquilamino, alquiloxialquilo, ariloxi, acilo, acetilo, carboxilato, sulfonato, sulfona, imina, oxima o heteroariloxi, o independientemente R11, R12, o cualquiera de R14-17 puede ser alquilo sustituido, alquenilo, alquinilo, arilo, heteroarilo, alcoxi, polialquil�ter, alquilamino, dialquilamino, alquiloxialquilo, ariloxi, o heteroariloxi; o grupos R11, R12,
o cualquiera de R14-17 pueden estar contenidos en un anillo carboc�clico o un anillo heteroc�clico que contiene de 1 a 5 hetero�tomos, y unido a grupos en posición Y, Z1a, Z1b, M, G, R11, R12, o cualquiera de R14-17, preferentemente estos grupos est�n unidos por cualquier número de átomos de hasta aproximadamente 20 átomos.
Los compuestos de unión con IAP o moléculas cargo de unión con IAP en varias realizaciones de fórmula (2), (3), o
(5)
pueden utilizarse en la fabricación de un medicamento para el tratamiento terapéutico y/o profiláctico de un cáncer o un trastorno de proliferaci�n celular (que incluye trastornos de desarrollo, cáncer, enfermedades autoinmunes, as� como trastornos neurodegenerativos). Los compuestos de unión con IAP o las moléculas cargo de unión con IAP en varias realizaciones de fórmula (2), (3), o (5) pueden utilizarse en la preparación de un fármaco para tratar cáncer o un trastorno de proliferaci�n celular listo para usarse. El fármaco puede administrarse a un paciente para tratar o prevenir el cáncer o un trastorno de proliferaci�n celular. Listo para usarse se refiere a que los compuestos est�n presentados para su venta y pueden incluir los compuestos en comprimidos, líquido, u otra forma de administración, envase adecuado, instrucciones u otros artículos.
La invención es útil en un procedimiento para tratar células o tejido que incluye administrar a células con un trastorno de proliferaci�n, por ejemplo células HeLa conocidas por sobreexpresar IAP (otras células pueden incluir a modo no taxativo, aquellas con trastornos de desarrollo, cáncer, enfermedades autoinmunes, as� como trastornos neurodegenerativos), una cantidad de compuestos de unión con IAP o moléculas cargo de unión con IAP en varias realizaciones de fórmula (2), (3), o (5) que es efectiva para reducir o eliminar el trastorno de proliferaci�n celular en la muestra de células o tejido.
Otro uso de la presente invención consiste en un procedimiento para tratar trastornos asociados con la proliferaci�n celular, que incluyen, a modo no taxativo, trastornos y enfermedades proliferativas. Dichos procedimientos incluyen la administración de los compuestos de la presente invención solos o en combinación con otros agentes activos, que incluyen agentes farmacéuticos y quimioterap�uticos. Por ejemplo, los d�meros de los compuestos de unión con IAP de la presente invención pueden administrarse solos o en combinación con agentes quimioterap�uticos como se
divulga en la solicitud provisional de patente de los Estados Unidos No. 60/692,111 que comúnmente se tiene.
Estos compuestos de unión con IAP, as� como las sales farmac�uticamente aceptables y solvatos de estos, pueden formularse como composiciones farmacéuticas o como agentes de diagnóstico o ambos. Estas composiciones farmacéuticas y agentes de diagnóstico pueden utilizarse para el tratamiento y la detección de trastornos celulares proliferativos, as� como en ensayos de selección para el descubrimiento y desarrollo de agentes de diagnóstico y terapéuticos adicionales para modificar la proliferaci�n celular y detectar trastornos celulares proliferativos.
En la presente se divulga un ensayo para uso en la selección de alto rendimiento o el diseño racional del fármaco de compuestos de unión con IAP que, al igual que el tetrap�ptido Smac o sus homólogos en otras especies, pueden unirse a un dominio BIR de una IAP modificando y preferentemente aliviando la supresión mediada por IAP de la apoptosis. La unión de los compuestos de ensayo puede utilizarse en el diseño de compuestos de unión con IAP y moléculas cargo de unión con IAP para la identificación, prevención y tratamiento de enfermedades relacionadas con la proliferaci�n celular. La molécula cargo o los compuestos de unión con IAP en realizaciones de la presente invención pueden unirse a proteínas como a través del dominio BIR de una IAP. En algunas realizaciones, la molécula de unión con IAP interact�a con el dominio BIR3 de la proteína XIAP o el dominio BIR2 de DIAP1. La molécula de unión con IAP puede interactuar con la proteína a través de una hendidura de unión específica del dominio BIR.
El ensayo incluye las etapas de suministrar un compuesto de unión con IAP etiquetado o una molécula cargo de unión con IAP de la estructura (2), (3), o (5) que se une a un dominio BIR adecuado de la IAP, donde, preferentemente, al menos una característica mensurable del compuesto de unión con IAP etiquetado cambia como una función del compuesto de unión con IAP etiquetado unido a IAP o libre en solución. El ensayo puede incluir poner en contacto el dominio BIR de una IAP con el compuesto de unión con IAP etiquetado en condiciones que permiten la unión del compuesto de unión con IAP etiquetado con el dominio BIR, formando un complejo de un compuesto de unión con IAP enlazado a BIR etiquetado que tiene la característica mensurable. El complejo del compuesto de unión con IAP enlazado a BIR etiquetado puede entrar en contacto con otros p�ptidos, compuestos de unión con IAP, o compuestos de ensayo en desarrollo, para medir la unión de los p�ptidos, compuestos de unión con IAP, o compuesto de ensayo para el dominio BIR midiendo el desplazamiento del compuesto de unión con IAP etiquetado del complejo del compuesto de unión con IAP enlazado con BIR. El desplazamiento del compuesto de unión con IAP etiquetado del complejo del compuesto de unión con IAP enlazado a BIR etiquetado por los p�ptidos, compuestos de unión con IAP, o compuesto de ensayo puede determinarse midiendo el cambio en la característica mensurable del compuesto de unión con IAP etiquetado, determinando as� si el compuesto de ensayo es capaz de unirse al dominio BIR de la IAP y la fuerza de la interacción.
La presente invención se relaciona con el tratamiento de los trastornos y enfermedades de proliferaci�n celular y más específicamente, trastornos donde la actividad de IAP en células, tejidos o un individuo es anormal. La invención caracteriza moléculas que son compuestos de unión con IAP de la estructura (2), (3), o (5), que se unen a IAP como por ejemplo, a XIAP, c-LAP1, c-IAP2, ML-IAP y survivina en células. Las células miméticas incluyen, opcionalmente, una porción de cargo integral o unido que puede incluir una funcionalidad terapéutica o de diagnóstico. Las moléculas del compuesto de unión con IAP pueden administrarse en células, un tejido o un paciente que necesita un tratamiento o la detección de un trastorno o enfermedad de proliferaci�n celular. La necesidad de un tratamiento puede identificarse poniendo en contacto células o un tejido, preferentemente del paciente, con una molécula de unión con IAP que tiene una etiqueta o cargo detectable que cambia cuando la molécula se une a una IAP en el tejido o en las células. La unión de la molécula del compuesto de unión con IAP con la IAP en las células puede utilizarse para modificar un trastorno o enfermedad de proliferaci�n celular o puede combinarse con otros tratamientos terapéuticos como radioterapia. La actividad de IAP en las células o el progreso de un tratamiento para un trastorno o enfermedad de proliferaci�n celular puede medirse con una molécula cargo de unión con IAP que tiene una etiqueta detectable.
Asimismo, se brinda un procedimiento de identificación selectiva de células neopl�sicas o cancerígenas en una población mezclada de células. El procedimiento incluye poner en contacto la población celular mezclada con una molécula cargo de unión con IAP permeable de estructura (2), (3), o (5) en condiciones que permiten que la molécula cargo de unión con IAP se una a una proteína como una IAP en las células neopl�sicas, identificando de manera selectiva las células neopl�sicas mediante una propiedad detectable de la molécula cargo de unión con IAP, y en algunas realizaciones un cambio en una propiedad detectable de la molécula cargo de unión con IAP en complejamiento con IAP en las células neopl�sicas. Las células pueden ser células cultivadas o células primarias de un paciente (ser humano o animal). De manera alternativa, las células pueden estar presentes en el paciente y el contacto logrado mediante la introducción de la molécula cargo de unión con IAP en el paciente.
En una realización de la molécula cargo de unión con IAP, la porción cargo de la molécula comprende un etiquetado de tinta. En otras realizaciones, la porción cargo de la molécula puede, a modo no taxativo, ser un núcleo activo en RMN o un agente de contraste MRI. La identificación selectiva de tejidos o células que tienen IAP se realiza a través de resonancia magnética nuclear o imágenes por resonancia magnética. De manera alternativa, la molécula cargo de unión con IAP etiquetada comprende un radiois�topo y la identificación selectiva se realiza a través de tomografía por emisión de positrones.
En la presente se divulga un procedimiento de dañar o inducir, selectivamente, la apoptosis en células neopl�sicas matando algunas o todas las células neopl�sicas en una población mezclada de células. El procedimiento incluye poner en contacto una muestra de la población celular mezclada con una molécula cargo de unión con IAP de la fórmula (2), (3), o (5). La porción de unión con IAP de la molécula o la porción cargo de la molécula puede incluir una porción o sustituyente que es directa o indirectamente tóxico para las células, como por ejemplo, un radiois�topo o agente fotosensibilizante. La porción de unión con IAP de la molécula se une a una proteína como una IAP en las células neopl�sicas, donde la porción tóxica de la molécula cargo de unión con IAP ejerce, de manera directa o indirecta, su efecto tóxico dañando o matando al menos una porción de las células neopl�sicas en una población mezclada de células.
La presente invención puede brindarse como una composición que incluye células y una molécula cargo de unión con IAP. La molécula cargo de unión con IAP se une a una proteína IAP, como XIAP, c-IAP1, c-IAP2, ML-IAP, o survivina, preferentemente se une a una hendidura de superficie BIR de una proteína IAP. En algunas realizaciones, la molécula de unión con IAP se une a una hendidura de superficie BIR3 de una proteína XIAP. La molécula cargo de unión con IAP de estructura (2), (3), o (5) puede penetrar o ser transfectada en las células y por ejemplo, puede utilizarse para desplazar una o más proteínas IAP de caspasas en las células o desplazar una proteína como Smac secuestrada por IAPS. La molécula cargo de unión con IAP tiene una propiedad detectable que se modifica con la interacción física, química o una combinación de estas interacciones, de la molécula de unión con IAP con la proteína IAP en las células. Esta composición es útil como un control para monitorear la presencia de IAP en las células bajo tratamiento o para uso como un estándar en la detección de niveles anormales de IAP en una muestra de células. La propiedad detectable puede ser la emisión de luz por parte de la porción cargo de la molécula que cambia cuando la porción de enlace con IAP de la molécula se une a una proteína IAP.
Los compuestos de unión con IAP o las moléculas cargo de unión con IAP de estructura (2), (3), o (5) en realizaciones de la invención pueden caracterizarse por tener una constante de unión con IAP Kd. En algunas realizaciones, Kd es menos que aproximadamente 10 !M, en otras realizaciones, Kd es menos que aproximadamente 1 !M, y aun en otras realizaciones Kd es menos que 0,1 !M como est� determinado por los procedimientos descritos en el Ejemplo 1 o equivalentes de estos procedimientos conocidos por los entendidos en la técnica. Las moléculas de fórmula (2), (3), o (5) que tienen Kd de menos de aproximadamente 10 !M pueden utilizarse en un ensayo de unión in vitro con el dominio BIR de una IAP y en algunas realizaciones, el dominio BIR3 de XIAP. La molécula cargo de unión con IAP y preferentemente la porción cargo de la molécula incluye, a modo no taxativo, un grupo fluorog�nico, un radiois�topo, u otro grupo cromog�nico. En otras realizaciones, la molécula cargo de unión con IAP puede incluir otro p�ptido o unidad peptidomim�tica (por ejemplo, un d�mero). La molécula cargo de unión con IAP puede incluir un núcleo activo en RMN o un agente de contraste MRI y la identificación selectiva de la porción cargo de la molécula realizada a través de resonancia magnética o imágenes por resonancia magnética. Una o más células en la composición pueden incluir, a modo no taxativo, células de un fluido corporal, tejido, tumor, fibroide, células neopl�sicas, células madre, células del sistema nervioso o una combinación de estas de un animal, un mamífero o un ser humano. Las células en la composición pueden extraerse de tejido que se sospecha exhibe un nivel anormal de IAP en base a la examinaci�n física, ensayos de habilidades motoras o detección de palpaci�n de un nudo en una parte del cuerpo. La composición puede incluir uno o más excipientes farmac�uticamente aceptables.
La presente invención también es útil en un procedimiento para identificar IAP en células que incluye monitorear una mezcla de una o más moléculas cargo de unión con IAP que comprenden la estructura (2), (3) o (5) o d�meros de estas, con una o más células de muestra para la presencia de una etiqueta detectable de una molécula cargo de unión con IAP o un cambio en una propiedad detectable de una o más moléculas cargo de unión con IAP en la mezcla. Preferentemente, la propiedad detectable de la molécula cargo de unión con IAP cambia con la formación de un complejo entre la molécula cargo de unión con IAP y el dominio BIR de una proteína IAP, las IAP pueden incluir, a modo no taxativo XIAP, c-IAP1, c-IAP2, ML-IAP, o survivina en las células de muestra. En la muestra, la IAP puede estar unido a una caspasa, otras proteínas como Smac o combinaciones de estas en la célula. El monitoreo puede realizarse en células y una molécula cargo de unión con IAP en una muestra de fluido, un fluido en circulación o fluidos seguido de purificación. Esta invención puede utilizarse para detectar expresión anormal, sobre
o sub expresión de IAP en células y la indicación de una expresión anormal utilizada para comenzar un curso de tratamiento de las células. Preferentemente, la molécula cargo de unión con IAP se utiliza para detectar la sobre expresión de IAP en células. El procedimiento puede incluir, además, el acto de comparar un cambio de una propiedad detectable de una o más moléculas cargo de unión con IAP mezcladas con una o más células de control con el cambio detectable en la propiedad de una o más moléculas cargo de unión con IAP mezcladas con una o más células de la muestra. La comparación puede relacionarse con la cantidad o actividad de IAP en las células de la muestra. El procedimiento puede incluir el acto de combinar una o más moléculas cargo de unión con IAP con una o más células que incluyen, a modo no taxativo, células de la muestra, células de control o varias combinaciones de estas células. El monitoreo puede utilizar la absorción o emisión de energía radiante mediante la mezcla de moléculas cargo de unión con IAP y las células, que incluyen, a modo no taxativo, resonancia magnética, fluorescencia, quimioluminiscencia, imágenes por resonancia magnética y tomografía por emisión de positrones. Preferentemente, el cambio en la propiedad detectable de una o más moléculas cargo de unión con IAP en la mezcla unidas química o físicamente al IAP en las células es un cambio en la intensidad de la emisión fluorescente de la molécula de unión con IAP. En algunas realizaciones, se produce un cambio en la emisión fluorescente de una
o más moléculas cargo de unión con IAP capaz de desplazar IAP de caspasas o Smac de IAP en las células de la muestra.
Un procedimiento para tratar células descrito en la presente incluye la identificación de la expresión de IAP en células y la administración de una cantidad de una molécula cargo de unión con IAP permeable en células u otro agente terapéutico en las células para modificar la actividad de IAP en las células. La molécula cargo de unión con IAP puede formularse con un excipiente farmac�uticamente aceptable. Por ejemplo, tras la identificación de niveles anormales de IAP en una muestra de células (opcionalmente por comparación con una muestra de control de células), se pueden agregar Smac purificada, un compuesto de unión con IAP o una molécula cargo de unión con IAP a las células para inducir apoptosis. Esta invención puede utilizarse para identificar células que necesitan tratamiento, tratar las células y monitorear el progreso del tratamiento de las células que tienen los niveles anormales de IAP. El acto de identificar células que tienen expresión IAP anormal incluye el monitoreo de una mezcla de una o más moléculas cargo de unión con IAP con una o más células de la muestra para un cambio en una propiedad detectable de una o más moléculas cargo de unión con IAP. La propiedad detectable cambia con la formación de un complejo entre la molécula de unión con IAP y IAP en las células de la muestra.
La presente invención puede proporcionarse como un artículo o kit que incluye material de envasado que contiene una composición de compuesto de unión con IAP o una molécula cargo de unión con IAP de fórmula (2), (3), o (5) o un d�mero de esta. El material de envasado tiene una etiqueta que indica cómo la composición cargo de unión con IAP puede utilizarse para la administración, tratamiento o detección de niveles de IAP en una muestra de células. La etiqueta puede indicar cómo la molécula cargo de unión con IAP u otra molécula cargo de unión con IAP incluida en la composición farmacéutica puede utilizarse para tratar células donde se determina un nivel anormal de expresión de IAP.
La presente invención puede utilizarse en un procedimiento para identificar, de manera selectiva, células neopl�sicas en una población mezclada de células. En el procedimiento, una muestra de la población celular mezclada se pone en contacto con una o más células cargo de unión con IAP de fórmula (2), (3) o (5) o d�meros de estas en condiciones que permiten que la molécula cargo de unión con IAP se una a IAP en las células neopl�sicas e identificar, de manera selectiva, las células neopl�sicas. Las células pueden incluir, a modo no taxativo, células cultivadas, células que son removidas de un sujeto por biopsia, o células de un fluido. El contacto puede lograse introduciendo la molécula cargo de unión con IAP etiquetada en una muestra de tejido o un tejido en un sujeto vivo que posee o se sospecha que posee las células neopl�sicas. La molécula cargo de unión con IAP puede tener una porción de cargo de etiqueta con tinta y preferentemente, la tinta es una tinta fluorog�nica. La molécula cargo de unión con IAP etiquetada puede tener un núcleo activo en RMN o un agente de contraste y la identificación selectiva realizada a través de resonancia magnética nuclear o imágenes por resonancia magnética. La molécula cargo de unión con IAP etiquetada puede tener una porción cargo de la molécula que es un radiois�topo y donde la identificación selectiva se ha realizado a través de tomografía por emisión de positrones. La molécula cargo de unión con IAP puede formularse con excipientes farmac�uticamente aceptables y opcionalmente, otros agentes terapéuticos para modificar la apoptosis en la muestra de las células.
La presente invención también es útil en un procedimiento para dañar o matar células neopl�sicas de manera selectiva en una población mezclada de células normales y neopl�sicas. El procedimiento incluye poner en contacto una muestra de la población celular mezclada con una molécula cargo de unión con IAP permeable en células de fórmula (2), (3) o (5) o d�meros de esta que incluyen un agente que es directa o indirectamente tóxico para las células, preferentemente la porción cargo de la molécula es un agente que es directa o indirectamente tóxico en
c�lulas. En condiciones que permiten que la molécula cargo de unión con IAP se una a IAP en las células neopl�sicas, el agente directa o indirectamente ejerce su efecto tóxico, dañando o matando al menos una porción de células neopl�sicas. El procedimiento puede utilizar un agente tóxico que es un radiois�topo. El procedimiento puede usar un agente tóxico fotosensible y el daño o muerte selectiva se produce por exposición de la población celular a la luz.
Descripci�n detallada de la invención
Antes de describir las composiciones y procedimientos, se entiende que esta invención no se limita a las moléculas, composiciones, metodolog�as o protocolos particulares descritos, dado que pueden variar. También se entiende que la terminología utilizada en la descripción es para describir las versiones particulares o realizaciones únicamente, y no pretende limitar el alcance de la presente invención, que estar� limitada por las reivindicaciones adjuntas.
Debe notarse que como se utiliza en la presente y en las reivindicaciones adjuntas, las formas singulares “un”, “una” y “el/la” incluyen su referencia en plural salvo que el contexto claramente indique lo contrario. Por lo tanto, por ejemplo, la referencia a una “célula” es una referencia a una o más células y equivalentes de ésta conocidos por los entendidos en la técnica, etc. Salvo que se indique lo contrario, todos los términos técnicos y científicos utilizados en la presente tienen los mismos significados que comúnmente son entendidos por un entendido en la técnica. Aunque todo procedimiento y material similar o equivalente a los descritos en la presente pueden utilizarse en la práctica o ensayo de las realizaciones de la presente invención, se describen los procedimientos de la realización, los dispositivos y materiales. Ninguna disposición en la presente ha de ser interpretada como una aceptación de que la invención no puede preceder dicha divulgación por una invención anterior.
“Opcional” u “opcionalmente” significa que el evento o circunstancia posteriormente descrito puede producirse o no y que la descripción incluye instancias donde el evento se produce e instancias en las que no.
Las moléculas de unión con IAP de la presente invención y las composiciones farmacéuticas que contienen estos compuestos pueden unirse a IAP (inhibidor de proteínas de apoptosis) como por ejemplo, XIAP, c-IAP1, c-IAP2, survina, y LIVIN/ML-IAP. Estos compuestos pueden incluir porciones o sustituyentes de diagnóstico o terapéuticos como parte de la porción de unión de la molécula o unidos a la porción de unión de la molécula. Las moléculas cargo de unión con IAP pueden dividirse arbitrariamente para incluir una porción de unión con IAP y una porción cargo. La porción de unión con IAP de la molécula interact�a con una proteína IAP, preferentemente el dominio BIR de una proteína IAP y puede ser un mon�mero o d�mero. En algunas realizaciones, la porción de unión con IAP de la molécula interact�a con la hendidura de la superficie BIR3 de XIAP. La porción cargo de la molécula puede ser parte de la columna o porción de unión con IAP de la molécula o la porción cargo puede estar químicamente unida a la porción de unión con IAP de la molécula. La porción cargo de la molécula puede incluir, a modo no taxativo, estructuras, porciones y sustituyentes para imágenes, terapia, catéteres, etiquetas o marcadores. La porción cargo y la porción de unión con IAP de la molécula pueden estar conectados mediante un enlace químico a la porción de unión con IAP que incluye, a modo no taxativo, enlaces de amida, éster o disulfuro, quelaci�n, o mediante un grupo de unión como diaminobutano, etilenglicol y sus olig�meros donde es deseable separar la porción de unión con IAP de la molécula de la porción cargo de la molécula. Uno o más átomos en cualquier porción de la molécula cargo de unión con IAP puede ser un radiois�topo y utilizarse para detección o tratamiento. En otras realizaciones, la porción cargo puede constituir un segundo mon�mero, formando as� una molécula dim�rica mediante un grupo de unión. La porción de unión del compuesto de unión con IAP confiere especificidad de proteína objetivo IAP a la molécula y la porción cargo puede proporcionar un grupo funcional a la molécula para monitorear o evaluar la ubicación de la molécula o proveer una terapia a dicha ubicación dentro de una muestra celular o un tejido en un mamífero. Los compuestos de unión con IAP pueden utilizarse para desplazar proteínas secuestradas en células, por ejemplo, caspasa-3, 7, o 9 o Smac que interact�a con una IAP, para que la proteína liberada pueda utilizarse para promover la apoptosis en la célula. En los casos en que la porción cargo de la molécula est� unida a la porción de unión con IAP, la porción cargo puede enlazarse o unirse químicamente a cualquier porción de la porción de unión con IAP de la molécula para no afectar el enlace IAP, la permeabilidad celular o la transfecci�n en células de manera adversa. Aunque se puede producir la interacción química entre la porción de unión con IAP y la porción cargo de la molécula, la molécula est� hecha para que la permeabilidad celular de la molécula, su propiedad de unión con IAP, y la función de la porción cargo no se vean afectados de manera adversa por su combinación. La adecuación de toda molécula cargo de unión con IAP hecha por el procedimiento divulgado puede probarse contra el p�ptido etiquetado de manera fluorescente [AbuRPF-K(5-Fam)-NH2] en células como por ejemplo, carcinoma celular, cáncer de pulmón de células no pequeñas, células HeLa, u otras conocidas por sobreexpresar IAP u otras células que tienen un trastorno de proliferaci�n. Las moléculas de unión con IAP de la presente invención son capaces de permeabilizar células de interés, unirse a IAP en las células y opcionalmente transmitir el cargo a las células.
Realizaciones de compuestos de estructura (2), (3), (5) incluyen 2 pirrolidina-1-carbonilos sustituidos, o 2,4pirrolidina-1-carbonilos independientemente sustituidos que tienen Kd como se determina en los procedimientos descritos, por ejemplo, en el Ejemplo 1 de menos de 100 micromolar, preferentemente menos de 1 micromolar y aún más preferentemente menos de 0,1 micromolar.
Los compuestos farmac�uticamente activos de la invención suelen denominarse fármacos en la presente, para resaltar su utilidad terapéutica en promover apoptosis uniendo IAP. Sin embargo, otra realización de la invención utiliza los compuestos como agentes de diagnóstico para detectar IAP in vitro, in situ o in vivo, o para ensayos de unión con IAP. En estas realizaciones, los compuestos de la invención est�n etiquetados de manera detectable, por ejemplo, con un fluor�foro. Otra realización de la invención utiliza los compuestos como agentes meta, es decir, incorporando en su estructura agentes aniquiladores de células tumorales o agentes anti-tumorales o terapéuticos como radion�clidos. Por lo tanto, los fármacos hacen referencia a compuestos farmac�uticamente/biol�gicamente activos (es decir, de unión con IAP) de la invención, para uso como agentes terapéuticos, profilácticos o de diagnóstico.
El término hetero�tomo se refiere a nitrógeno, oxígeno, azufre, otros átomos o grupos donde el nitrógeno, azufre, y otros átomos puede oxidarse opcionalmente y el nitrógeno puede estar opcionalmente cuaternarizado. Se asume que todo hetero�tomo con valencias no satisfechas tiene átomos de hidrógeno suficientes para satisfacer las valencias. En algunas realizaciones, por ejemplo, donde el hetero�tomo es nitrógeno e incluye un hidrógeno u otro grupo para satisfacer la valencia del átomo de hidrógeno, el reemplazo del nitrógeno en una estructura similar por otro hetero�tomo, por ejemplo, por oxígeno, resultar� en la ausencia del hidrógeno o grupo previamente enlazado al nitrógeno. El término hetero�tomo puede incluir a modo no taxativo —O—, —S—, —S(O)—, —S(O)2—, —N—, — N(H)—, y —N(alquiloC1-C6).
El término alquilo se refiere a un hidrocarburo recto, ramificado o cíclico saturado que tiene entre aproximadamente 1 y aproximadamente 30 átomos de carbono (y todas las combinaciones y subcombinaciones de intervalos y números específicos de átomos de carbono). El grupo alquilo inferior se refiere a un hidrocarburo recto, ramificado o cíclico saturado que tiene un grupo de 1 a 10 átomos de carbono, más preferentemente de 1 a 5 átomos de carbono y todas las combinaciones y subcombinaciones de intervalos y números específicos de átomos de carbono. Los grupos alquilo incluyen, a modo no taxativo, metilo, etilo, n-propilo, isopropilo, n-butilo, isobutilo, t-butilo, n-pentilo, ciclopropilo, metilciclopropilo, ciclopentilo, isopentilo, neopentilo, n-hexilo, isohexilo, ciclohexilo, ciclooctilo, adamantilo, 3-metilpentilo, 2,2-dimetilbutilo, y 2,3-dimetilbutilo.
El término alquilo sustituido se refiere a un hidrocarburo recto, ramificado o cíclico saturado que tiene entre aproximadamente 1 y 30 átomos de carbono (y todas las combinaciones y subcombinaciones de intervalos y números específicos de átomos de carbono) que tienen entre 1 y 5 sustituyentes. Un grupo alquilo inferior sustituido se refiere a un hidrocarburo recto, ramificado o cíclico saturado de 1 a 10 átomos de carbono, más preferentemente, de 1 a 5 átomos de carbono (y todas las combinaciones y subcombinaciones de intervalos y números específicos de átomos de carbono) que tienen de 1 a 5 sustituyentes. Los radicales alquilo sustituidos y los grupos alquilo inferior sustituidos pueden tener entre 1 y 5 sustituyentes, que incluyen a modo no taxativo, alcoxi, alcoxi sustituido, acilamino, tiocarbonilamino, aciloxi, amino, amidino, alquilamidino, amidalquil (como —CH2C(=O)NH2 o — CH2CH2C(=O)NH2), tioamidino, acilalquilamino, ciano, átomos de halógeno (F, Cl, Br, I) para generar grupos alquilo halogenados o parcialmente halogenados, que incluyen, a modo no taxativo,—CF3, —CF2CF3, —CH2CF2Cl y similar, hidroxi, nitro, carboxilo, carboxialquilo, carboxilheteroc�clico, heteroc�clico sustituido por carboxilo, cicloalquilo, guanidino, heteroarilo, arilo, heteroc�clico, alquilamino, dialquilamino o versiones opcionalmente sustituidas de cualquiera de los grupos anteriormente mencionados.
El término radical alquileno como se utiliza en la presente incluye referencia a un radical hidrocarburo di-funcional saturado ramificado o no ramificado que contiene de 1 a 30 átomos de carbono e incluye, por ejemplo, metileno (— CH2—), etileno (—CH2CH2—), propileno (—CH2CH2CH2—), 2-metilpropileno (—CH2CH(CH3)CH2—), hexileno (— (CH2)6—) y similar. El alquileno inferior incluye un grupo alquileno de 1 a 10 o más preferentemente, de 1 a 5 átomos de carbono.
Los radicales alquileno sustituidos incluyen referencia a un radical alquileno di-funcional saturado ramificado o no ramificado o grupo que tiene de 1 a 30 átomos de carbono y tiene de 1 a 5 sustituyentes. Los radicales alquileno inferiores sustituidos se refieren a un grupo radical alquileno sustituido, que tiene de 1 a 10 átomos de carbono, preferentemente de 1 a 5 átomos de carbono y tiene de 1 a 5 sustituyentes. Los sustituyentes pueden incluir a modo no taxativo grupos alquilo.
El término radical alquenilo como se utiliza en la presente incluye referencia a un hidrocarburo cíclico ramificado o
radical hidrocarburo no ramificado de 2 a 30 átomos de carbono que contienen al menos un enlace doble carbonocarbono, como etenilo, n-propenilo, isopropenilo, n-butenilo, isobutenilo, t-butenilo, octenilo, decenilo, tetradecenilo, hexadecenilo, eicosenilo, tetracosenilo y similar. El término alquenilo inferior incluye un grupo alquenilo de 2 a 10 átomos de carbono, preferentemente de 2 a 5 átomos de carbono, que contienen al menos un enlace doble carbonocarbono. El o los enlaces dobles carbono-carbono pueden tener, independientemente, una configuración cis o trans. El radical alquenilo sustituido se refiere a un radical alquenilo o un grupo alquenilo inferior que tiene de 1 a 5 sustituyentes que pueden incluir, a modo no taxativo, aquellos para los grupos alquilo.
El término radical alquenileno incluye referencia a un radical o grupo hidrocarburo disfuncional ramificado o no ramificado que tiene de 20 a 30 átomos de carbono y al menos un enlace doble carbono-carbono. “Alquenileno inferior” incluye un grupo alquenileno de 2 a 10, más preferentemente, de 2 a 5 átomos de carbono, que contiene un enlace doble carbono-carbono. El radical alquenileno sustituido se refiere a un radical alquenileno o grupo alquenilo inferior que tiene de 1 a 5 sustituyentes que incluyen, a modo no taxativo, aquellos para los grupos alquilo.
El término radical o grupo alquinilo se refiere a un radical hidrocarburo de cadena recta o ramificada que tiene de 2 a 12 átomos de carbono y al menos un enlace triple, algunas realizaciones incluyen grupos alquinilo de 2 a 6 átomos de carbono que tienen un enlace triple. Un alquinilo sustituido contendr� uno, dos o tres sustituyentes como se define para grupos alquilo sustituidos. Alquinileno incluye referencia a una cadena de hidrocarburo disfuncional ramificada o no ramificada que tiene de 2 a 12 átomos de carbono y al menos un enlace triple carbono-carbono; algunas realizaciones incluyen grupos alquinileno de 2 a 6 átomos de carbono con un enlace triple. Un alquinileno sustituido contendr� uno, dos, o tres sustituyentes como se define para grupos alquilo sustituidos.
Como se utiliza en la presente, “halo” o halógeno se refiere a cualquier halógeno, como I, Br, Cl o F. Como se utiliza en la presente, “ciano” se refiere al grupo —C=N.
El término radical o grupo arilo se refiere a radicales de anillo aromático mono o bic�clico opcionalmente sustituido que tiene entre aproximadamente 5 y aproximadamente 14 átomos de carbono (y todas las combinaciones y subcombinaciones de intervalos y números específicos de átomos de carbono), con preferencia por aproximadamente 6 a 10 carbonos. Los ejemplos no limitantes o grupos arilo incluyen, por ejemplo, fenilo y naftilo. Un grupo arilo sustituido contendr� uno o más sustituyentes como se define para grupos alquilo sustituidos.
El radical aralquilo se refiere a radicales alquilo que tienen un sustituyente arilo y tienen entre aproximadamente 6 y 20 átomos de carbono (y todas las combinaciones y subcombinaciones de intervalos y números específicos de átomos de carbono), con preferencia por entre aproximadamente 6 y aproximadamente 12 átomos de carbono. Los grupos aralquilo pueden ser opcionalmente sustituidos. Los ejemplos no limitantes, incluyen, por ejemplo, bencilo, naftilmetilo, difenilmetilo, trifenilmetilo, feniletilo y difeniletilo. Un grupo arilalquilo sustituido contendr� uno o más sustituyentes en el grupo arilo o alquilo como se define para grupos alquilo sustituidos.
El radical o grupo cicloalquilarilo se refiere a un radical cicloalquilo fusionado a un grupo arilo, que incluye todas las combinaciones de alquil cicloalquilarilos independientemente sustituidos, el grupo cicloalquilo y el grupo arilo que tienen dos átomos en común. Los ejemplos de los grupos cicloalquilarilo fusionados utilizados en compuestos de la presente invención pueden incluir 1-indanilo, 2-indanilo, 1-(1,2,3,4-tetrahidronaftilo), y similar. Tetrahidronaftilo, más específicamente, se refiere a aquellos radicales o grupos univalentes derivados de hidrocarburos polic�clicos fusionados que incluyen todas las combinaciones de alquil tetrahidronaftilos independientemente sustituidos. Estos radicales pueden tener un punto de unión en (C1) o equivalentemente (C4) en estructura (11), o posición etiquetada (C2) y equivalentemente (C3) en estructura (11a). Los átomos de carbono quirales C1-4 en tetrahidronaftaleno y sus derivados sustituidos con alquilo pueden tener una configuración (R) o (S).
El radical o grupo cicloalquilo más específicamente incluye referencia a un radical alquilo carboc�clico saturado
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monovalente que consiste en uno o más anillos en sus estructuras y tiene entre aproximadamente 3 y aproximadamente 14 átomos de carbono (y todas las combinaciones y subcombinaciones de intervalos y números específicos de átomos de carbono), con preferencia por entre aproximadamente 3 y aproximadamente 7 átomos de carbono. Las estructuras multianulares pueden ser estructuras anulares fusionadas o en puente. Los anillos pueden sustituirse opcionalmente con uno o más sustituyentes para los grupos alquilo. Los ejemplos de grupos cicloalquilo incluyen, a modo no taxativo, ciclopropilo, ciclobutilo, ciclopentilo, ciclohexilo, ciclooctilo y adamantilo. Un grupo cicloalquilo sustituido contendr� uno o más sustituyentes como se define para grupos alquilo sustituidos.
El radical cicloalquilo más específicamente se refiere a radicales alquilo que tienen un sustituyente cicloalquilo y tienen entre aproximadamente 4 y aproximadamente 20 átomos de carbono (y todas las combinaciones y subcombinaciones de intervalos y números específicos de átomos de carbono) y con preferencia por aproximadamente 6 a 12 átomos de carbono y pueden incluir, a modo no taxativo, grupos metil-ciclopropilo, metilciclohexilo, isopropilciclohexilo y butil-ciclohexilo. El radical o grupo cicloalquilalquilo puede sustituirse opcionalmente con uno o más sustituyentes para los grupos alquilo que incluyen, a modo no taxativo, hidroxi, ciano, alquilo, alcoxi, tioalquilo, halo, haloalquilo, hidroxialquilo, nitro, amino, alquilamino, dialquilamino.
El término acilo se refiere un alquilo, alquilo sustituido, alquenilo, alquinilo, cicloalquilo, cicloalquenilo, arilo, heteroarilo, o grupo heterociclilo como se definió anteriormente, enlazado a través de uno o más grupos carbonilo — C(=O)— para generar un grupo de fórmula —C(=O)R donde R es el alquilo sustituido, alquenilo, alquinilo, cicloalquilo, cicloalquenilo, arilo, heteroarilo, o grupo heterociclilo. Cuando el término acilo se utiliza junto con otro grupo, como en acilamino, esto se refiere al grupo carbonilo {—C(=O)} unido al segundo grupo nombrado. Por lo tanto, acilamino o carbamo�lo se refiere a —C(=O)NH2, acilalquilamino puede referirse a grupos como—C(=O)NR'R" donde R' y R" pueden ser H o alquilo. Amidalquilo se refiere a grupos como —CH2C(=O)NH2, —CH2CH2C(=O)NH2) y más generalmente —(CH2)pC(=O)NH2.Carboxi se refiere al radical o grupo —C(=O)OH, carboxialquilo se refiere a los grupos como —(CH2)pC(=O)OH, alquil carboxialquilo se refiere a grupos como (—C(=O)O-(alquilo)), y alquilcarbonilo o acilalcoxi se refiere al grupo (—C(=O)O-(alquilo)), donde alquilo se definió anteriormente. Como se utiliza en la presente, ario�lo o acilarilo se refiere a un grupo (—C(=O)(arilo)) donde arilo es como se definió anteriormente. Los grupos aro�lo ejemplares incluyen benzo�lo y nafto�lo. Acetilo se refiere al grupo CH3C(=O)— y puede abreviarse con el término “Ac” como se demuestra en la Tabla 5. Formilo se refiere al radical o grupo HC(=O)—. En el grupo anteriormente mencionado, el grupo p puede ser independientemente, el número entero 0, 1, 2, o 3.
El radical ariloxi se refiere a un radical aromático mono o bic�clico opcionalmente sustituido que tiene entre aproximadamente 5 y aproximadamente 14 átomos de carbono y un grupo radical (arilo-O—) donde arilo es como se definió anteriormente. Dichos radicales ariloxi incluyen, a modo no taxativo, aquellos ilustrados por el radical de fórmula (12). Los sustituyentes opcionales en el anillo arilo en el radical ariloxi pueden incluir, a modo no taxativo, hidrógeno, alquilo, halógeno, hidroxi, alcoxi, alcoxicarbonilo u otros sustituyentes. Las realizaciones de compuestos de unión con IAP de la presente invención pueden incluir un grupo opcionalmente ariloxi como el radical fenoxi unido al anillo pirrolidina como se ilustra pero no se limita a compuestos en la Tabla 5. Alguna realización de los compuestos de unión con IAP incluyen un radical fenoxi donde Kd como se determina mediante los procedimientos descritos, por ejemplo, en el Ejemplo 1 es menor que aproximadamente 0,1 micromolar.
Los términos “alcoxi” y “alcoxilo” se refieren a un radical o grupo (alquilo-O—) opcionalmente sustituido donde alquilo es como se definió anteriormente. Los radicales o grupos alcoxi ejemplares incluyen metoxi, etoxi, n-propoxi, ipropoxi, n-butoxi, ciclopropil-metoxi, y heptoxi. Los radicales alcoxi pueden incluir también alquilo opcionalmente sustituido en el grupo alquilo-O—. Alcoxi puede incluir grupos arilo opcionalmente sustituidos como se definió e ilustr� anteriormente mediante el radical no limitante de fórmula (13). Un grupo “alcoxi inferior” se refiere a un grupo alcoxi opcionalmente sustituido de uno a cinco átomos de carbono. “Poli�ter” se refiere a un compuesto o porción que posea uniones múltiples de éter, como, por ejemplo, polietilenglicoles o propilenglicoles. “Polialquil�teres” se refiere a alquilos interconectados por o que poseen uniones múltiples de éter como se ilustra mediante la estructura no limitante de fórmula (85) en el Esquema VIII del Ejemplo 16. “Arilalquiloxi” significa un grupo arilalquilo en donde el grupo arilalquilo es como se describió anteriormente. Los grupos arilalquiloxi ejemplares incluyen radical benciloxi (C6H5CH2O—) (BnO—), o 1- o 2-naftalenometoxi. Los sustituyentes opcionales en el anillo arilo en el radical benciloxi pueden incluir a modo no taxativo hidrógeno, alquilo, halógeno, hidroxi, alcoxi y alcoxicarbonilo u otros sustituyentes como se define para el grupo alquilo.
El radical arilamino se refiere a un radical aromático mono o bic�clico opcionalmente sustituido que tiene entre aproximadamente 5 y aproximadamente 14 átomos de carbono y un grupo radical (—NH(arilo)) donde arilo puede sustituirse opcionalmente como se definió anteriormente para alquilo. Los sustituyentes opcionales en el anillo arilo en el radical arilamino pueden incluir, a modo no taxativo, hidrógeno, alquilo, halógeno, hidroxi, alcoxi y alcoxicarbonilo. Un ejemplo de un grupo arilamino es el radical o grupo anilino. Amino se refiere a un grupo—NH2 y alquilamino se refiere a un grupo radical (—NH R') donde R' es H, alquilo, cicloalquilo, arilo, heteroarilo, aralquilo o versiones opcionalmente sustituidas de estos como se definió anteriormente. Los grupos radicales alquilamino ejemplares incluyen metilamino, etilamino, n-propilamino, i-propilamino, n-butilamino y heptilamino. El radical bencilamino se refiere al grupo arilamino C6H5CH2NH—, el grupo arilo puede tener sustituyentes opcionales que incluyen, a modo no taxativo, hidrógeno, alquilo, halógeno, hidroxi, alcoxi, y alcoxicarbonilo u otros sustituyentes.
Dialquilamino incluye referencia a un radical (—NR'R"), donde R' y R" pueden ser independientemente H, alquilo, cicloalquilo, arilo, heteroarilo, aralquilo o versiones opcionalmente sustituidas de estos como se definió previamente. Los ejemplos de radicales dialquilamino incluyen, a modo no taxativo, dimetilamino, metiletilamino, dietilamino, di(1metiletil)amino y similares.
Heteroarilo incluye referencia a un radical o grupo aromático monovalente que tiene uno o más anillos que incorporan uno, dos o tres hetero�tomos en el anillo (elegido de nitrógeno, oxígeno o azufre). Estos heteroarilos pueden tener opcionalmente átomos de hidrógeno sustituidos con uno o más sustituyentes. Los ejemplos de estos radicales heteroarilo incluyen benzofuranos opcionalmente sustituidos, benzo[b]tiofeno 1-óxido, indoles, 2- o 3tienilos o tiofenilos, tiazo�los, pirazinas, piridinas, o las estructuras de (4a) o (4b). Por ejemplo, la estructura de la fórmula (E10) con derivados enumerados en la Tabla 9 puede incluir un anillo fusionado R10 con un hetero�tomo X2 (N, O, u otro) y sustituyentes como R11 o R' 11 que incluyen, a modo no taxativo, hidrógeno, halógenos, heteroarilos opcionalmente sustituidos como piridina, benzofurano, índoles, tiazo�lo, pirazina, un alcoxiheteroarilo como metoxi, piridina u otros grupos.
Los términos heteroalquilo, heteroalquileno, heteroalquenilo, heteroalquenileno, heteroalquinilo y heteroalquinileno incluyen referencia a radicales o grupos alquilo, alquileno, alquenilo, alquenileno, alquinilo, y alquinileno, en donde uno o más de los átomos de carbono han sido reemplazados o sustituidos con átomos como, por ejemplo, un nitrógeno de enlace único o múltiple, azufre, oxígeno, o estos átomos que tienen uno o más hidrógenos para satisfacer los requisitos de valencia del átomo. Dichas sustituciones pueden utilizarse para formar moléculas que tienen grupos funcionales, que incluyen, a modo no taxativo, aminas, �teres, y sulfuros. Un ejemplo no limitante de un grupo heteroalquinilo se ilustra mediante el grupo —CH(Me)OCH2C=CH.
El radical heterocicloalquilo incluye referencia a un radical o grupo carboc�clico monovalente saturado que consiste en uno o más anillos, que incorporan uno, dos o tres hetero�tomos (elegidos de nitrógeno, oxígeno o azufre) que pueden sustituirse opcionalmente con uno o más sustituyentes.
Heterocicloalquenilo incluye referencia a un radical carboc�clico monovalente no saturado que consiste en uno o más anillos que contiene uno o más enlaces dobles carbono-carbono donde los átomos de carbono son reemplazados o sustituidos por uno, dos o tres hetero�tomos en uno o más anillos, los hetero�tomos elegidos de nitrógeno, oxígeno,
o azufre, el heterocicloalquenilo puede ser opcionalmente sustituido por uno o más sustituyentes.
Varios grupos utilizados en las moléculas de la presente invención pueden tener uno o más átomos de hidrógeno sustituidos por porciones químicas u otros sustituyentes. Los sustituyentes pueden incluir, a modo no taxativo, halo o halógeno (por ejemplo, F, Cl, Br, I), haloalquilos como —CF3, —CF2CF3, —CH2CF3 y similar, tioalquilo, nitro, alquilo opcionalmente sustituido, cicloalquilo, aralquilo, arilo, heteroarilos como benzofuranos, indoles, tienilos, tiofenilos, tiazo�los, pirazinas, piridinas, alcoxi piridina, hidroxi (—OH), alcoxi (—OR), ariloxi, alcoxiheteroarilo, ciano (—CN), carbonilo —C(=O)—, carboxi (—COOH) y sales de carboxilato; —(CH2)pC(=O)OH, grupos o radicales — (CH2)pC(=O)O(alquilo), y —(CH2)pC(=O)NH2 donde p es independientemente, el número entero 0, 1, 2 o 3; sulfonatos como, por ejemplo, tosilo, brosilo o mesilo; grupos sulfona, imina u oxima, grupos como — alquilo (C=O)O, aminocarbonilo o carbamo�lo —(C=O)NH2), —aminocarbonilo N-sustituido —(C=O)NHR", amino, alquilamino (—NHR') y dialquilamino (—NHR'R"). En relación con el amino y grupos relacionados anteriormente mencionados, cada porción R' o R" puede incluir independientemente H, alquilo, cicloalquilo, arilo, heteroarilo,
aralquilo o alquilo opcionalmente sustituido, cicloalquilo, arilo, heteroarilo, araalquilo. Donde uno o más átomos de hidrógeno se sustituyen por porciones químicas u otros sustituyentes, los sustituyentes pueden elegirse para que los compuestos de unión con IAP de fórmula (2), (3) o (5) que los contienen tengan Kd como se mide mediante los procedimientos descritos, por ejemplo, en el Ejemplo 1 de menos de aproximadamente 100 micromolar, en algunas realizaciones tengan un Kd de menos de 1 micromolar y en otras realizaciones tengan Kd de menos de 0,1 micromolar. En realizaciones donde uno o más átomos de hidrógeno son sustituidos por porciones químicas u otros sustituyentes, los sustituyentes pueden elegirse para que los compuestos de unión con IAP de fórmula (2), (3), o (5) que los contienen tengan EC50 como se mide mediante los procedimientos descritos, por ejemplo, en el Ejemplo 2 de menos de aproximadamente 0,5 micromolar, en algunas realizaciones tengan EC50 de menos de aproximadamente 0,06 micromolar. En realizaciones donde uno o más átomos de hidrógeno son sustituidos por porciones químicas u otros sustituyentes, los sustituyentes pueden elegirse para que los compuestos de unión con IAP de fórmula (2), (3),
o (5) que los contienen tengan una constante de unión Kd de menos de aproximadamente 1 micromolar, preferentemente menos de 0,1 micromolar y EC50 de menos de aproximadamente 1 micromolar, preferentemente menos de aproximadamente 0,5 micromolar, y en algunas realizaciones EC50 de menos de aproximadamente 0,06 micromolar.
Los amino�cidos pueden usarse en el compuesto de unión con IAP de esta invención y pueden incluir los 20 amino�cidos naturales, amino�cidos artificiales conocidos como amino�cidos beta o gama, y amino�cidos que contienen cadenas laterales no naturales, y/u otros mon�meros similares como hidroxi�cidos. Preferentemente, los amino�cidos utilizados en los compuestos de unión con IAP de la presente invención son los 20 amino�cidos naturales. Los amino�cidos o amino�cidos artificiales se eligen para que que el compuesto de unión con IAP correspondiente se una a IAP y preferentemente una el dominio BIR de una IAP y el compuesto de unión con IAP resultante es permeable a la célula. Un ejemplo no limitante de dicho amino�cido incluye el uso de Abu (ácido 2aminobut�rico) como un amino�cido en la molécula cargo de unión con IAP. Donde la molécula de estructura (2), (3)
o (5) incluye amino�cidos, se prefiere que el amino�cido N-terminal sea Ala o Abu.
Donde uno o más centros quirales existen en un amino�cido, amino�cido artificial, o átomo de un compuesto de unión con IAP de estructura (2), (3) o (5), cualquiera de los enanti�meros, configuración D o L y más generalmente, configuración R o S, o diastereosi�meros pueden utilizarse opcionalmente en el compuesto de unión con IAP.
Cuando se produce una variable más de una vez en un constituyente o en una fórmula, su definición en cada ocurrencia es independiente de su definición en cada otra ocurrencia. Las combinaciones de sustituyentes y/o variables son permitidas sólo si dichas combinaciones resultan en compuestos estables.
Se cree que las fórmulas y nombres químicos utilizados en la presente reflejan de manera correcta y exacta los compuestos químicos subyacentes. Sin embargo, la naturaleza y el valor de la presente invención no dependen de la exactitud teórica de estas fórmulas, en todo o en parte. Por lo tanto, se entiende que las fórmulas utilizadas en la presente, as� como los nombres químicos atribuidos a los compuestos correctamente indicados, no pretenden limitar la invención de manera alguna, que incluye restringirla a cualquier forma taut�mera específica o a cualquier óptica específica; o isómero geométrico, salvo donde dicha estereoqu�mica est� claramente definida.
En realizaciones de compuestos de estructura (2), (3) o (5), se pueden elegir los sustituyentes como A1, A2, R1a, y R1b, R2, X1, Y, Z, M, G, o R10, de manera independiente para que los compuestos de estructura (2), (3), o (5) no sean un trip�ptido o un tetrap�ptido de amino�cidos, por ejemplo AVPI o AVP.
Algunas realizaciones de los compuestos de estructura (2), cuando A2 es H, X1 es —NH—, J es —CH—, y n es 0 para R2, pueden describirse mediante la estructura (3):
En algunas realizaciones de compuestos de estructura (3), A1 es H, alquilo inferior, o un grupo alquilo inferior opcionalmente sustituido; R1a y R1b son independientemente H, alquilo inferior, alquilo inferior opcionalmente sustituido o A1 junto con R1a o R1b forman un grupo heterocicloalquilo opcionalmente sustituido de 3 a 6 átomos, como se ilustra en las realizaciones no limitantes de compuestos en la Tabla 5.
En los compuestos de unión con IAP de estructura (3), Y puede ser H, un grupo alquilo, un grupo alquilo de 1 a 10 átomos de carbono, un grupo alquilo ramificado de 1 a 10 átomos de carbono, un grupo alquinilo, heteroalquinilo, un grupo cicloalquilo de 3 a 7 átomos de carbono, arilo, heteroarilo, arilalquilo; versiones opcionalmente sustituidas de los grupos anteriormente mencionados como grupo alquilo opcionalmente sustituido, grupo alquilo opcionalmente sustituido de 1 a 10 átomos de carbono, un grupo alquilo ramificado opcionalmente sustituido de 1 a 10 átomos de carbono, un grupo alquinilo opcionalmente sustituido, un grupo cicloalquilo opcionalmente sustituido de 3 a 7 átomos de carbono, un grupo arilo opcionalmente sustituido, un grupo heteroarilo opcionalmente sustituido, un grupo arilalquilo opcionalmente sustituido; en algunas realizaciones, el sustituyente o porción para el grupo sustituido anteriormente mencionado incluye uno o más grupos hidroxi; o Y junto con Z, M, G o R10 pueden formar un anillo carboc�clico o un anillo heteroc�clico que contiene de 1 a 5 hetero�tomos, donde Y est� unido a Z, M, G, o R10; preferentemente, Y est� unido a Y, M, G, o R10 por cualquier número de átomos de hasta aproximadamente 20 átomos. Un ejemplo no limitante de dicho anillo heteroc�clico es ilustrado por la molécula de unión con IAP que tiene la estructura de fórmula (E12-2) en el Ejemplo 12.
En compuestos de unión con IAP de estructura (3), Z puede ser H, alquilo, hidroxi, amino, alquilamino, dialquilamino, alcoxi, cicloalquil, cicloalquiloxi, arilo, heteroarilo, ariloxi, heteroariloxi; o Z junto con Y, M, G o R10 pueden formar un anillo carboc�clico o un anillo heteroc�clico que contiene entre 1 y 5 hetero�tomos donde Z est� unido a Y, M, G o R10; preferentemente, Z est� unido a Y, M, G, o R10 por cualquier número de átomos de hasta aproximadamente 20 átomos. En algunas realizaciones, Z es un alquilo, hidroxi, amino, alquilamino, dialquilamino, alcoxi, cicloalquilo, cicloalquiloxi, arilo, heteroarilo, ariloxi, o grupo heteroariloxi. La estereoqu�mica del sustituyente o grupo Z puede indicarse utilizando un enlace encastrado en negrita para demostrar un grupo Z que proviene del plano de la página
o un enlace encastrado de puntos para demostrar un grupo Z detrás del plano de la página. En realizaciones de (3), la molécula de unión con IAP puede tener una estructura donde el grupo Z se dirige fuera del plano de la página, la molécula de unión con IAP puede tener una estructura donde el grupo Z est� dirigido detrás del plano de la página, o la molécula de unión con IAP puede incluir una mezcla donde el grupo Z es una combinación de estos.
En compuestos de unión con IAP de estructura (3), M puede ser alquileno opcionalmente sustituido, alquenileno o un grupo alquinileno de 1 a 5 átomos de carbono. En algunas realizaciones, por ejemplo, sin limitarse a compuestos de unión con IAP de estructura (E6) o (E14), M es un alquileno diradical como el grupo metileno unido a un extremo del grupo metileno de la posición 2 del anillo de pirrolidina y en el otro extremo del grupo metilo a un grupo arilo, un grupo heteroarilo o un grupo heteroarilo opcionalmente sustituido como un grupo benzofurano o indol, o versiones opcionalmente sustituidas de grupos de estructura (4a-d).
En compuestos de unión con IAP de estructura (3), G puede estar ausente (un enlace) como en los ejemplos no limitantes de compuestos de estructura (E6) o (E14), o G puede ser un hetero�tomo que incluye a modo no taxativo —O—;—(C=O)—; —S(O)t— donde t puede ser el número entero 0, 1, o 2; —NR18—; —NCOR18—; o — NS(O)XR18— donde x puede ser el número entero 0, 1, o 2, y R18 puede ser alquilo inferior, alquilo inferior opcionalmente sustituido, o cicloalquilo o R18 puede estar contenido en un anillo carboc�clico o heteroc�clico que contiene de 1 a 5 hetero�tomos donde R18 est� unido a Z, M, o R10, preferentemente R18 est� unido a Z, M, o R10, por cualquier número de átomos de hasta aproximadamente 20 átomos.
En compuestos de unión con IAP de estructura (3), R10 puede ser un arilo, un grupo heteroarilo, un arilo fusionado, o un grupo heteroarilo fusionado. En algunas realizaciones, por ejemplo, pero sin estar limitadas a compuestos de la tabla 5, R10 puede ser arilo sustituido, un grupo heteroarilo sustituido, un arilo fusionado sustituido, o un grupo heteroarilo fusionado sustituido. En algunas realizaciones, R10 puede ser cualquiera de las estructuras (4a), (4b), (4c), o (4d):
10 e independientemente grupos R11, R' 11, R12, o cualquiera de R13-17, puede ser H, halógeno, alquilo, alquenilo, alquinilo, arilo, heteroarilo, hidroxilo, alcoxi, polialquil�ter, amino, alquilamino, dialquilamino, alquiloxialquilo, ariloxi, acilo, acetilo, carboxilato, sulfonato, sulfona, imina, oxima o heteroariloxi, versiones opcionalmente sustituidas de estos grupos. En realizaciones donde R11 o R' 11 es un grupo heteroarilo, puede ser 2- o 3-tienilo SC4H3— grupo (tiofenilo), piridina, pirazina, o versiones opcionalmente sustituidas de estas. En algunas realizaciones, R12 puede ser
15 un grupo arilo o heteroarilo, como, por ejemplo, benzofurano, indol, benzo[b]tiofeno-1-óxido o benzo[b]tiofeno-1,1di�xido o versiones opcionalmente sustituidas de estas. Donde X2 es —O— o —S(O)k—, para el entero k que puede ser independientemente 0, 1, o 2, R12 est� ausente. Independientemente R11, R' 11, R12, o cualquiera de R13-17, puede ser alquilo sustituido, alquenilo, alquinilo, arilo, heteroarilo, hidroxilo, alcoxi, polialquil�ter, carboxialquilo, alquil carboxialquilo, amino, alquilamino, dialquilamino, alquiloxialquilo, ariloxi o heteroariloxi; o grupos R11, R' 11, R12, o
20 cualquiera de R13-17, puede contenerse en un anillo carboc�clico o un anillo heteroc�clico que contiene de 1 a 5 hetero�tomos, y unidos a grupos en posición Y, Z, M, G, R11, R' 11, R12, o cualquiera de R13-7, preferentemente estos grupos est�n unidos por cualquier número de átomos de hasta aproximadamente 20 átomos. En algunas realizaciones, R10 puede ser cicloalquilo, arilo, heterocicloalquilo, heterocicloalquenilo, heteroarilo o realizaciones opcionalmente sustituidas de estos. En algunas realizaciones, R10 puede ser el grupo:
donde R3, R' 3, R4, R5, R' 5, pueden ser, independientemente, H, alquilo, cicloalquilo, alquileno, arilo, heteroarilo, alcoxi, alquilo opcionalmente sustituido, cicloalquilo, alquileno, arilo, heteroarilo, halo, ciano, —(CH2)pC(=O)OH, — (CH2)pC(=O)O-alquilo, —(CH2)pC(=O)NH2, p es independientemente el número entero 0, 1, 2, o 3. Por ejemplo, en
35 el compuesto de unión con IAP de estructura (E4), donde M es alquenileno, G es un hetero�tomo como —O—, R10 puede ser un arilo opcionalmente sustituido que tiene sustituyentes por ejemplo, hidrógeno, cloro, bromo, alquilo, alquileno, alcoxi, o combinaciones de estos.
Algunas realizaciones de compuestos de unión con IAP de fórmula (3) incluyen compuestos de estructura (5) donde:
A1 es H, o alquilo inferior, o A1 y R1b juntos forman un anillo de 3 a 5 átomos. En estas realizaciones, R1a es H y R1b puede ser un grupo alquilo inferior, o junto con A1 forma un anillo de 3 a 5 átomos.
5 En realizaciones de compuestos de unión con IAP de estructura (5), Y puede ser un grupo alquilo, un grupo alquilo de 1 a 10 átomos de carbono, un grupo alquilo ramificado de 1 a 10 átomos de carbono, un grupo alquinilo, un grupo cicloalquilo de 3 a 7 átomos de carbono, versiones opcionalmente sustituidas de los grupos anteriormente mencionados y/o versiones sustituidas con hidroxi de los grupos anteriormente mencionados o Y junto con Z1a o Z1b,
o R10 forma un anillo carboc�clico o un anillo heteroc�clico que contiene de 1 a 5 hetero�tomos, donde Y est� unido a
10 Z1a o Z1b, o R10; preferentemente Y est� unido a Z1a o Z1b, o R10 por cualquier número de átomos de hasta aproximadamente 20 átomos;
En realizaciones de compuestos de unión con IAP de estructura (5), Z1a y Z1b pueden ser independientemente H, hidroxi, amino, alquilamino, dialquilamino, alcoxi, ariloxi, o grupo heteroariloxi; o Z1a, o Z1b, junto con Y o R10 forman un anillo carboc�clico o un anillo heteroc�clico que contiene de 1 a 5 hetero�tomos donde Z1a o Z1b, est� unido a Y o
15 R10; preferentemente Z1a o Z1b, est� unido a Y o R10 por cualquier número hasta aproximadamente 20 átomos;
En realizaciones de los compuestos de unión con IAP de estructura (5), M puede ser un grupo alquileno opcionalmente sustituido de 1 a 5 átomos de carbono. En estas estructuras, G puede estar ausente (un enlace) o ser un hetero�tomo que incluye—O—; —NH—; —(C=O)—; —NR18—; —NCOR18—; o —NS(O)xR18— donde x=0, 1, o 2, y R18 es alquilo inferior, grupo alquilo inferior opcionalmente sustituido.
20 Los compuestos o moléculas de unión con IAP de estructura (2), (3), o (5) pueden prepararse mediante varios procesos, que se describen mediante Esquemas no limitantes en los Ejemplos y que también forman parte del objeto de la presente invención. Estas moléculas de unión con IAP pueden prepararse de moléculas de estructura (6a) o (6b):
donde Y, M, Z, G, R2 y R10 se describieron anteriormente y donde R' y R" pueden ser H, o un grupo protector. La estereoqu�mica del sustituyente o grupo Z o M puede indicarse utilizando un enlace encastrado en negrita para mostrar el grupo que sale del plano de la página o un grupo encastrado punteado para mostrar un grupo Z o M 35 detrás del plano de la página. En realizaciones de estructura (6a) o (6b), la molécula de unión con IAP puede tener una estructura donde el grupo Z o M est� dirigido fuera del plano de la página, la molécula de unión con IAP puede tener una estructura donde el grupo Z o M est� dirigido detrás del plano de la página, o la molécula de unión con IAP puede incluir una mezcla donde el grupo Z o M incluye una combinación de estos. Las estructuras de la estructura de fórmula (6a) o (6b) pueden prepararse a partir de compuestos que incluyen, a modo no taxativo pirrolidinas como
(1) en Esquema I o (29) en Esquema IVa utilizando los procedimientos o procesos similares descritos en la presente. Las estructuras de la estructura de fórmula (6a) o (6b) pueden reaccionar para generar moléculas de unión con IAP de estructura (2), (3), o (5) mediante tratamiento con un amino�cido N-Boc u otra amina adecuada que contiene una porción que incluye A1, A2, R1a, o R1b o combinaciones de estos como se describe en la presente.
Algunos compuestos ácidos o básicos de la presente invención pueden existir como zwitteriones. Todas las formas de los compuestos, que incluyen ácido libre, base libre y zwitteriones est�n contemplados dentro del alcance de la presente invención. Es conocido en la técnica que los compuestos que contienen grupos amino y carboxilo suelen existir en equilibrio con sus formas zwitteri�nicas. Por lo tanto, cualquiera de los compuestos descritos en la presente que contiene, tanto grupos amino y carboxilo también incluyen referencia a sus zwitteriones correspondientes.
En cualquiera de las divulgaciones anteriores, una molécula cargo de unión con IAP u otro compuesto de unión con IAP de la invención puede ser un compuesto de una de las fórmulas descritas en la presente, o un estereois�mero, prof�rmaco, sal farmac�uticamente aceptable, hidrato, solvato, hidrato de sal ácida, o una forma cristalina isomórfica de este.
La sal farmac�uticamente aceptable se refiere a aquellas sales de las moléculas cargo de unión con IAP y compuestos de unión con IAP de estructura (2), (3), o (5) o d�meros de estos que retienen la efectividad biológica y las propiedades de las bases libres o ácidos libres, permeabilidad celular y unión con IAP, y que no son biol�gicamente indeseables u otro. Si el compuesto existe como una base libre, la sal deseada puede prepararse mediante procedimientos conocidos por los entendidos en la técnica, dicho tratamiento del compuesto con un ácido inorgánico como ácido clorhídrico, ácido bromh�drico, ácido sulfúrico, ácido n�tr�co, ácido fosf�rico, y similares; o con un ácido orgánico como ácido acético, ácido propi�nico, ácido glic�lico, ácido pir�vico, ácido ox�lico, ácido maleico, ácido mal�nico, ácido succ�nico, ácido fum�rico, ácido tartárico, ácido cítrico, ácido benzoico, ácido cinn�mico, ácido mand�lico, ácido metanolsuf�nico, ácido etanosulf�nico, ácido p-toluenosulf�nico, ácido salicílico y similar. Si el compuesto existe como un ácido libre, la sal deseada puede prepararse mediante procedimientos conocidos por los entendidos en la técnica, como el tratamiento del compuesto con una base inorgánica o una base orgánica. Las sales derivadas de bases inorgánicas incluyen, a modo no taxativo, sales sádicas, de potasio, litio, amonio, calcio, magnesio, hierro, zinc, cobre, manganeso, aluminio y similares. Las sales derivadas de bases inorgánicas incluyen, a modo no taxativo, sales de aminas primarias, secundarias y terciarias, aminas sustituidas que incluyen aminas sustituidas naturales, aminas cíclicas y resinas básicas de intercambio iónico como resinas de isopropilamina, trimetilamina, dietilamina, trietilamina, tripropilamina, etanolamina, 2-dimetilaminoetanol, 2-dietilaminoetanol, trimetamina, diciclohexilamina, lisina, arginina, histidina, cafeína, proca�na, hidrabamina, colina, beta�na, etilendiamina, glucosamina, metilglucamina, teobromina, purinas, piperazina, piperidina, N-etilpiperidina, poliamina y similares.
Las moléculas cargo de unión con IAP o sus sales farmac�uticamente aceptables pueden incluir moléculas de disolvente farmac�uticamente aceptables en su red cristalina. Donde el disolvente es agua, los compuestos pueden formar hidratos, en el caso de otros disolventes y en particular, disolventes orgánicos como por ejemplo etanol, los compuestos pueden formar solvatos. Las moléculas cargo de unión con IAP o compuestos de unión con IAP de estructura (2), (3) o (5) y sus homólogos pueden ser formulados, aislados o purificados como solvatos.
Los compuestos empleados en los procedimientos de la presente invención pueden existir en forma de prof�rmaco. El prof�rmaco incluye todo vehículo enlazado de manera covalente que libera el fármaco de origen activo, por ejemplo, de conformidad con la fórmula (2) u otras fórmulas o compuestos empleados en los procedimientos de la presente invención in vivo cuando dicho prof�rmaco se administra a un mamífero. Dado que los prof�rmacos son conocidos por mejorar numerosas cualidades deseables de farmacéuticos (por ejemplo, solubilidad, biodisponibilidad, fabricación, etc.), los compuestos empleados en estos procedimientos pueden, si se desea, administrarse en forma de prof�rmaco. Por lo tanto, la presente invención contempla procedimientos para administrar prof�rmacos. Los prof�rmacos de los compuestos empleados en la presente invención, por ejemplo, fórmula (2), pueden prepararse modificando grupos funcionales presentes en el compuesto de forma tal que las modificaciones se escinden, en manipulación de rutina o in vivo, del compuesto de origen.
Por lo tanto, los prof�rmacos incluyen, por ejemplo, compuestos descritos en la presente en donde un grupo hidroxi, amino o carboxi est� enlazado a cualquier grupo que, cuando el prof�rmaco se administra a un mamífero, se escinde para formar un hidroxilo libre, amino libre, o ácido carbox�lico, respectivamente. Los ejemplos incluyen, a modo no taxativo, acetato, formato y benzoato, derivados de alcohol y grupos funcionales de amina; y alquilo, ésteres carboc�clicos, arilo y alquilarilo como ésteres de metilo, etilo, n-propilo, iso-propilo, butilo, isobutilo, sec
butilo, terc-butilo, ciclopropilo, fenilo, bencilo, y fenetilo y similar.
Los compuestos empleados en los procedimientos de la presente invención pueden prepararse de distintas formas conocidas para los entendidos en la técnica. Los compuestos pueden sintetizarse, por ejemplo, mediante los procedimientos descritos en la memoria descriptiva y ejemplo o variaciones sobre ella como un entendido en la técnica aprecia. Todos los procesos divulgados en asociación con la presente invención son contemplados para ser practicados sobre cualquier escala, que incluye microgramo, miligramo, gramo, multigramo, kilogramo, multikilogramo o escala industrial comercial.
Los compuestos de unión con IAP de estructura (2), (3) o (5) pueden mezclarse o combinarse con excipientes farmac�uticamente aceptables o tratados con liofilización. Estas composiciones farmacéuticas pueden administrarse de manera típica, local o sistemática en una muestra de células, un tejido o paciente. La administración típica o local puede permitir un mayor control de la aplicación de la composición farmacéutica. Las moléculas o compuestos de unión con IAP que incluyen estructura (2), (3) o (5) pueden, en forma individual o en combinación, mezclarse con un vehículo farmacéutico apropiado antes de la administración. Los ejemplos de vehículos farmacéuticos generalmente utilizados y aditivos que pueden usarse para formar una composición farmacéutica, de diagnóstico o terapéutica de las moléculas de unión con IAP pueden incluir, por ejemplo, diluyentes convencionales, ligantes, lubricantes, agentes colorantes, agentes desintegrantes, agentes tampón, agentes isotonizantes, conservantes, anestésicos y similares. Los vehículos farmacéuticos que pueden utilizarse incluyen, a modo no taxativo, agua, solución salina, etanol, dextrano, sacarosa, lactosa, maltosa, xilosa, trehalosa, manitol, xilitol, sorbitol, inositol, albúmina s�rica, gelatina, creatinina, polietilenglicol, tensioactivos no iónicos (por ejemplo, sorbit�n ésteres de ácido graso polioxietileno, aceite de ricino endurecido con polioexietileno, ésteres de sacarosa con ácidos grasos, polioxipropilen glicol con polioxietileno) y compuestos similares. Los vehículos farmacéuticos y excipientes as� como las moléculas de unión con IAP pueden utilizarse en combinación.
Los estereois�meros son compuestos que tienen fórmula molecular idéntica y naturaleza o secuencia de enlace pero difieren en el orden de sus átomos en espacio e incluyen isómeros ópticos y geométricos. Los compuestos de la presente invención, o sus sales farmac�uticamente aceptables pueden tener uno o más átomos de carbono asimétricos u otros átomos asimétricos en su estructura, y pueden existir como estereois�meros únicos, entanti�meros, diastereois�meros, racematos y mezclas de enanti�meros o diastere�meros. Estos compuestos también pueden incluir isómeros geométricos. Todos dichos estereois�meros, racematos y mezclas de los compuestos de unión con IAP y moléculas cargo de unión con IAP de la presente invención pretenden estar dentro del alcance de la invención salvo que la estereoqu�mica específica o forma isómera se indique específicamente. Es conocida en la técnica la forma en que se preparan y aíslan dichas formas activas. Por ejemplo, las mezclas de estereois�meros pueden separarse mediante técnicas estándar que incluyen, a modo no taxativo, la resolución de formas rac�micas, cromatograf�a normal, de fase inversa y quiral, formación preferencial de sales, recristalizaci�n y similares, o mediante síntesis quiral de materiales de inicio quirales o mediante síntesis deliberada de centros quirales meta.
Las moléculas de unión con IAP de estructuras (2), (3) o (5) que contienen centros quirales y las moléculas pueden tener la forma de un enanti�mero único o una mezcla rac�mica de enanti�meros. En algunos casos, es decir, respecto de la estructura de algunas moléculas de unión con IAP, la quiralidad (es decir, la estereoqu�mica relativa) de los sustituyentes o grupos se indica en la estructura utilizando un enlace encastrado en negrita para indicar un sustituyente que sale del plano de la página y un enlace encastrado punteado para indicar un sustituyente detrás del plano de la página. En otros casos, la estereoqu�mica no est� indicada y dichas estructuras pretenden abarcar tanto las formas enantiom�ricamente puras o purificadas del compuesto mostrado as� como una mezcla rac�mica de enanti�meros.
Como se entiende, los grupos funcionales presentes pueden contener grupos protectores durante la síntesis. Los grupos protectores son grupos funcionales químicos que pueden adjuntarse selectivamente a y ser eliminados de funcionalidades, como amina, grupos hidroxilo o carboxilo. Estos grupos est�n presentes en un compuesto químico para prestar dicha funcionalidad inerte a las condiciones de reacción química a la que el compuesto se expone. Cualquier variedad de grupo protector puede emplearse en la presente invención. Los grupos protectores incluyen el grupo benciloxicarbonilo y el grupo terc-butiloxicarbonilo. El término “grupo protector” o “grupo bloqueador” se refiere a cualquier grupo que, cuando se une a uno o más grupos hidroxilo, amino, carboxilo u otros grupos de los compuestos (que incluyen intermedios de estos como los aminolactamos, aminolactonas, etc.) evita que se produzcan reacciones en esos grupos y qué grupo protector puede eliminarse opcionalmente mediante etapas químicas o enzim�ticas convencionales para restablecer el grupo hidroxilo, amino, carboxilo para uso en un compuesto de unión con IAP. El grupo bloqueador particular removible empleado no es fundamental y los grupos
bloqueadores de hidroxilo o amina removibles preferidos incluyen sustituyentes convencionales como alilo, bencilo, acetilo, cloroacetilo tiobencilo, bencilidina, fenacilo, t-butil-difenilsililo, carbamato de t-butilo, carbamato de bencilo, y cualquier otro grupo que puede introducirse químicamente en un hidroxilo, amina u otra funcionalidad y posteriormente removerse selectivamente mediante procedimientos químicos o enzim�ticos en condiciones leves con la naturaleza del producto.
La porción cargo de la molécula puede ser parte de la columna o la porción de unión con IAP de la molécula o la porción cargo puede enlazarse o unirse químicamente a la porción de unión con IAP de la molécula. Por ejemplo, la porción cargo puede ser otra unidad de la fórmula (2), (3) o (5) unida por un grupo de unión a la primera unidad, formando as� un d�mero y puede comprender una porción cargo adicional. La porción cargo también puede ser cualquiera de los sustituyentes A1, A2, R1a, R1b, Y, R2, o Z en moléculas de la fórmula (2), preferentemente la porción cargo est� unida a Y, R2, o Z en moléculas de la fórmula (2). En moléculas de la fórmula (3) o (5), la porción cargo puede ser cualquiera de los sustituyentes A1, R1a, R1b, R10, Y, M, G, o Z (incluyes Z1a y Z1b), preferentemente la porción cargo incluye un sustituyente unido a Y, Z (incluye Z1a y Z1b), o R10. La porción cargo de la molécula puede incluir a modo no taxativo estructuras, porciones, y sustituyentes para imágenes, terapéuticos, grupos detectables, sondas, etiquetas o marcadores. La porción cargo y la porción de unión con IAP de la molécula pueden estar conectadas por un enlace químico a la porción de unión con IAP que incluye, a modo no taxativo, enlaces de amida, éster o disulfuro, quelaci�n o mediante un grupo de unión como diaminobutano o etilenglicol y sus olig�meros donde se desea separar la porción de unión con IAP de la molécula de la porción cargo de la molécula. Uno o más átomos en cualquier porción de la molécula cargo de unión con IAP puede ser un radiois�topo y utilizarse para detección o tratamiento.
La capacidad para probar rápidamente pequeñas moléculas para verificar su efectividad en la interrupción de interacciones de proteína-proteína puede utilizarse en el desarrollo de candidatos de fármaco viables. Un aspecto de la presente invención comprende un ensayo que puede utilizarse para probar la afinidad de unión de una bibliografía de compuestos de unión con IAP para verificar su capacidad para unirse al dominio BIR de un inhibidor de la proteína de apoptosis (IAP), por ejemplo, el dominio BIR3 de XIAP mamífero. El ensayo puede basarse en la etiqueta detectable, que puede ser una molécula de tinta fluorog�nica que es la porción cargo de una molécula cargo de unión con IAP. La etiqueta detectable puede ser cualquiera de los sustituyentes en las moléculas de fórmula (2), (3), o (5). Por ejemplo, la etiqueta detectable puede unirse al sustituyente R2, o a los sustituyentes R2ac supra en moléculas que tienen la estructura de fórmula (2).
De manera similar, la etiqueta detectable puede unirse a sustituyentes como Y, Z, M, G, R10, u otros sustituyentes en moléculas que tienen la estructura de fórmula (3), o (5) y sales farmac�uticamente aceptables de estas.
Una etiqueta detectable incluida en una molécula de fórmula (2), (3) o (5) puede ser una tinta como una tinta fluorog�nica cuya emisión es sensible al ambiente de la tinta. Sin embargo, la porción de etiqueta detectable de una molécula cargo de unión con IAP puede ser también un núcleo activo en RMN o un agente de contraste y la identificación selectiva se realiza a través de resonancia magnética nuclear o imágenes por resonancia magnética. La etiqueta detectable en una molécula cargo de unión con IAP también puede ser un radiois�topo y donde se realiza la identificación selectiva a través de tomografía por emisión de positrones. La porción cargo de la molécula también puede utilizarse para destruir células a través de un efecto tóxico de la porción cargo de la molécula.
Sin estar limitados por la teoría, se cree que la molécula de la estructura (2), (3) o (5) se coloca en el dominio BIR de una IAP. Donde la molécula de la estructura (2), (3) o (5) tiene una tinta fluorog�nica como un sustituyente cargo, preferentemente el envasado de la molécula de la estructura (2), (3) o (5) en la hendidura de BIR de una IAP genera un gran cambio en el máximo de emisión y la intensidad de la tinta cuando el entorno de la molécula cargo de unión
con IAP cambia de agua al compartimiento o se une en o cerca de la hendidura de la IAP. Si una molécula (por ejemplo, la proteína Smac nativa o un compuesto de unión con IAP de ensayo) desplaza la molécula cargo de unión con IAP de la fórmula (2), (3), o (5) con la tinta fluorog�nica de la IAP, la emisión volver� al espectro observado para la molécula cargo de unión con IAP con la tinta fluorog�nica en agua. Como la intensidad de la emisión est� relacionada con la unión de un p�ptido de ensayo o compuesto de unión con IAP con la IAP, la intensidad puede utilizarse para estimar la constante de equilibrio, Ka, para el desplazamiento de la molécula de fórmula (2), (3), o (5) mediante el compuesto de unión con IAP; Ka se refiere a una constante de equilibrio para la asociación que est� inversamente relacionada a la disociaci�n Kd=1/Ka. Cuanto mayor es la constante de equilibrio Ka, mayor es la afinidad que tiene el compuesto de unión con IAP con BIR o BIR3. Esto permite que los inhibidores prometedores se determinen rápidamente y la información estructural sobre los inhibidores efectivos pueda incorporarse en el diseño de los candidatos para la siguiente ronda de pruebas. Una molécula cargo de unión con IAP de fórmula (2) que tiene una etiqueta detectable puede acomplejarse a una IAP y utilizarse para seleccionar otros compuestos de unión con IAP.
Los entendidos en la técnica entenderán que, aunque la molécula cargo de unión con IAP de fórmula (2), (3), o (5) descrita anteriormente se ejemplifica y prefiere para la práctica de la invención, varias combinaciones de compuestos de unión con IAP, dominios de unión con BIR de IAP diferentes y etiquetas detectables pueden utilizarse indistintamente para crear variaciones del ensayo anteriormente descrito.
La molécula cargo de unión con IAP de estructura (2), (3), o (5) o d�meros de esta pueden comprender cualquier molécula terapéutica o etiqueta detectable, como por ejemplo, un fluor�foro, radiois�topo, o núcleo activo en RMN de forma tal que la unión de la molécula de unión con IAP al dominio BIR de una IAP y preferentemente la hendidura BIR3 de XIAP no se ve afectada por la presencia de la etiqueta detectable o terapéutico en la molécula cargo de unión con IAP. Preferentemente, la molécula es permeable a las células. Un ejemplo no limitante de una etiqueta detectable que puede acoplarse a los compuestos de unión con IAP y moléculas cargo de unión con IAP de la estructura (2), (3) o (5) es la tinta fluorog�nica de 6-bromoacetil-2-dimetilaminonaftaleno (badan). Badan es una tinta fluorog�nica cuya sensibilidad a los cambios ambientales se ha utilizado anteriormente para probar las interacciones de unión con proteína.
Las moléculas cargo de unión con IAP de la estructura (2), (3) o (5) pueden utilizarse en un ensayo de compuestos de ensayo que pueden unirse al dominio BIR de una IAP. Estas moléculas pueden utilizarse por ejemplo para aliviar la supresión de la apoptosis o para liberar proteínas secuestradas como Smac de IAP en células. Un ensayo libre de células de alto rendimiento para compuestos de estructura (2), (3) o (5) también puede prepararse utilizando un p�ptido etiquetado de manera fluorescente como (AbuRPF-K(5-Fam)-NH2). Una amplia variedad de compuestos de unión con IAP pueden seleccionarse o probarse para verificar su capacidad para unirse al dominio BIR de IAP. Las moléculas de unión con IAP con mayor capacidad de unión que Smac natural o moléculas de unión con IAP que pueden liberar Smac secuestrado de IAP en células pueden identificarse mediante dicho ensayo. Estos compuestos pueden desarrollarse como agentes terapéuticos, composiciones farmacéuticas para la modificación y preferentemente, la promoción de apoptosis en el tratamiento de enfermedades o trastornos patológicos en donde la proliferaci�n celular desempeña un papel. Estos compuestos identificados pueden utilizarse como profilácticos y también pueden modificarse para incluir etiquetas detectables o agentes tóxicos. El ensayo puede utilizarse además en la selección de alto rendimiento de grandes paneles de compuestos generados por la química combinatoria u otras vías de diseño racional de fármacos. El ensayo de fluorescencia puede utilizarse para probar la unión de una bibliografía de moléculas cargo de unión con IAP modelada en la unión de Smac y sus homólogos y preferentemente, la unión de N-terminal de Smac al compartimiento de superficie de la región BIR3 de XIAP. Los resultados de dicha selección permiten analizar la contribución de cada porción en la estructura de la molécula cargo de unión con IAP a la unión total de la interacción. Por ejemplo, comparando la unión, Kd, de moléculas (5-54) y (555) en la Tabla 5 para grupos alquilo de diferente tamaño para R1b, la contribución del grupo metileno al Kd de unión con IAP puede utilizarse para realizar nuevas modificaciones en las moléculas.
La presente invención incluye compuestos de unión con IAP y procedimientos para su uso para unirse al inhibidor de proteínas de apoptosis (IAP) que incluye a modo no taxativo XIAP, c-IAP1, c-IAP2, survivina, ML-IAP o combinaciones de estas. Una función de IAP es suprimir la muerte celular programada, mientras que Smac o compuestos de unión con IAP de la estructura (2), (3) o (5) pueden utilizarse para aliviar dicha supresión. La proteína de unión con IAP Smac en mamíferos depende de la unión de sus cuatro residuos N-terminal a la hendidura de superficie caracterizada en una porción de XIAP denominada dominio BIR3. Esta unión evita que XIAP ejerza su función de supresión de apoptosis con caspasas en la célula. Una molécula cargo de unión con IAP, como aquellas de la fórmula (2), (3) o (5) pueden utilizarse para aliviar la supresión de apoptosis mediada por IAP o por XIAP en células mamíferas y puede brindar, de manera opcional, un grupo funcional que tiene una propiedad
detectable o una función terapéutica en la célula. La molécula cargo de unión con IAP, como aquellas de la fórmula (2), (3) o (5) puede utilizarse para liberar proteínas secuestradas como Smac en IAP en células.
Una realización de la invención es un procedimiento para usar versiones de compuestos de unión con IAP de fórmula (2), (3) o (5) que puede incluir la administración a células anormales o tejido que puede ser conocido por sobreexpresar IAP as� como otras líneas celulares relacionadas con trastornos de desarrollo, cáncer, enfermedades autoinmunes, as� como trastornos neurodegenerativos como, por ejemplo, células SK-OV-3, células HeLa, u otras células, una cantidad de los compuestos de unión con IAP o moléculas cargo de unión con IAP en varias realizaciones de fórmula (2), (3) o (5) que es efectiva para reducir, eliminar o tratar la muestra de células. Una cantidad de los compuestos de unión con IAP o moléculas cargo de unión con IAP en varias realizaciones de fórmula (2), (3) o (5) pueden administrarse a células normales o tejido como un control. La cantidad del compuesto de fórmula (2), (3) o (5), combinaciones de estas o combinaciones que incluyen otros compuestos terapéuticos que son efectivos para reducir la proliferaci�n pueden determinarse a partir de cambios en la densidad óptica de muestras de célula o tejido tratadas y de control. El compuesto administrado de la estructura (2), (3) o (5) en algunas realizaciones, incluye aquellos con EC50 como se mide utilizando el procedimiento descrito, por ejemplo, en el Ejemplo 1 para los compuestos de unión con IAP de menos de aproximadamente 1 micromolar, en otras realizaciones EC50 de menos de aproximadamente 0,5 micromolar y en aún otras realizaciones, EC50 para los compuestos de unión con IAP administrados de la estructura (2), (3) o (5) puede ser de menos de aproximadamente 0,06 micromolar.
El término compuesto de unión con IAP se refiere a una molécula que proporciona unión o actividad terciaria con el dominio funcional de la proteína que contiene BIR (por ejemplo, motivo de unión o sitio activo) de una IAP. Estos compuestos de unión con IAP pueden ser agentes no p�ptidos como fármacos de molécula pequeña de la estructura (2), (3) o (5) o que incluyen moléculas de la estructura (2), (3), o (5). Conociendo las características estructurales y enlace de moléculas cargo de unión con IAP naturales, como Smac y sus homólogos, es ventajoso producir compuestos de unión con IAP que tienen unión similar o mejorada en comparación con tetrap�ptidos Nterminales de unión con IAP principales de Smac y sus homólogos. Una ventaja agregada de las moléculas cargo de unión con IAP de la estructura (2), (3) o (5) en varias realizaciones de la invención es que los compuestos de este tamaño y estructura puedan prepararse mediante síntesis a gran escala, que puedan modificarse químicamente para tener mejor solubilidad en solución acuosa, tengan mejor permeabilidad celular, y faciliten la administración de objetivos seleccionados in vivo.
Las moléculas cargo de unión con IAP de la invención pueden incluir amino�cidos as� como moléculas donde los amino�cidos se modifican para producir compuestos de unión con IAP mediante la eliminación, el reemplazo o la modificación de una o más cadenas laterales naturales de los amino�cidos codificados genéticamente. El reemplazo puede incluir el intercambio de uno o más de los amino�cidos L con amino�cidos D. Donde las cadenas laterales naturales de los amino�cidos son reemplazadas, se pueden utilizar los grupos como alquilo, alquilo inferior, alquilo cíclico de 4, 5, 6, o 7 miembros, amida, alquil amida inferior, di(alquil)amida inferior, alcoxi inferior, hidroxi, carboxi y los derivados de éster inferior de estas, y con heteroc�clicos de 4, 5, 6, o 7 miembros. Por ejemplo, los análogos de prolina pueden producirse, donde el tamaño anular del residuo de prolina cambia de 5 miembros a 4, 6, o 7 miembros o se agregan sustituyentes en varias posiciones (2, 3, 4 o 5) en el anillo. Por ejemplo, en la estructura de fórmula (2), los sustituyentes pueden ser un grupo éster R2, o un grupo ariloxi Z. Los grupos cíclicos pueden ser saturados o no saturados y si son no saturados, pueden ser aromáticos o no aromáticos. Los grupos heteroc�clicos pueden utilizarse como un grupo lateral en R2 en las moléculas de fórmula (2), (3), o (5). Los heteroc�clicos pueden contener uno o más de hetero�tomos de nitrógeno, oxígeno y/o azufre. Los ejemplos de dichos grupos heteroc�clicos incluyen furazanilo, furilo, imidazolidinilo, imidazolilo, imidazolinilo, isotiazolilo, isoxazolilo, morfoilinilo (por ejemplo, morfolino), oxazolilo, piperazinilo (por ejemplo, 1-piperazinilo), piperidilo (por ejemplo, 1-piperidilo, piperidino), piranilo, pirazinilo, pirazolidinilo, pirazolinilo, pirazolilo, piridazinilo, piridilo, pirimidinilo, pirrolidinilo (por ejemplo, 1-pirrolidinilo), pirrolinilo, pirrolilo, tiadiazolilo, tiazolilo, tienilo, tiomorfolinilo (por ejemplo, tiomorfolino) y triazolilo. Estos grupos heteroc�clicos pueden ser sustituidos o no sustituidos. Donde un grupo es sustituido, el sustituyente puede ser alquilo, alcoxi, halógeno, oxígeno, o fenilo sustituido o no sustituido. Los compuestos de unión con IAP pueden tener también residuos de amino�cidos que han sido químicamente modificados mediante fosforilaci�n, sulfonaci�n, biotinilaci�n u otra adición o liberación de otras porciones.
Una variedad de técnicas sintéticas conocidas para los entendidos en la técnica est�n disponibles para construir compuestos de unión con IAP con igual o similar actividad biológica deseada que el p�ptido nativo correspondiente pero con actividad más favorable que el p�ptido respecto de la solubilidad, estabilidad, permeabilidad celular, inmunogenicidad, y/o susceptibilidad a la hidrólisis o prote�lisis. Estas moléculas cargo de unión con IAP son compuestos sintéticos que tienen una estructura tridimensional (es decir, un “motivo p�ptido”) en base a la estructura
tridimensional de un p�ptido Smac u homólogo seleccionado. El motivo p�ptido proporciona el compuesto de unión con IAP con la actividad biológica deseada, es decir, unión a IAP, donde la actividad de unión del compuesto de unión con IAP no se reduce sustancialmente, y suele ser igual que o mayor que la actividad del p�ptido nativo sobre el cual el compuesto de unión con IAP se modela. Las moléculas cargo de unión con IAP de la presente invención pueden tener características beneficiosas adicionales que mejoran su aplicación terapéutica, como un menor costo para la síntesis, mayor permeabilidad celular, mayor estabilidad a elementos radiol�gicos, mayor afinidad y/o avidez para IAP meta y vida media biológica prolongada.
En una clase de compuestos de unión con IAP, la columna puede incluir varios enlaces químicos como enlaces de éster, tio�ster, tioamida, retroamida, carbonilo reducido, dimetileno, y quetometileno para modificar la unión con IAP en los compuestos cargo de unión con IAP.
Dado que las caspasas son enzimas citos�licas, las moléculas cargo de unión con IAP de diagnóstico, imágenes, profilácticas y terapéuticas que se unen químicamente con proteínas IAP cruzan preferentemente membranas celulares. Los complejos de la molécula cargo de unión con IAP con permeabilidad en la membrana celular de la presente invención son preferentemente aquellos que confieren la translocaci�n intracelular deseada y las propiedades de unión con IAP en las moléculas cargo de unión con IAP. Preferentemente, estas moléculas cargo de unión con IAP se caracterizan por su capacidad para conferir translocaci�n transmembrana e internalizaci�n de un complejo de molécula cargo de unión con IAP de la estructura (2), (3) o (5) cuando se administra a la superficie externa de una célula, tejido u órgano intactos. La capacidad de las moléculas cargo de unión con IAP de la presente invención para permeabilizar la célula y localizarse en los compartimientos citopl�smicos y/o nucleares puede demostrarse mediante una variedad de procedimientos de detección como, por ejemplo, microscopio fluorescente, microscopio confocal, microscopio electrónico, autoradiograf�a o inmunohistoqu�mica.
Sin quedar limitados por la teoría, la molécula cargo de unión con IAP de la estructura (2), (3) o (5) puede unirse a IAP en la célula y puede, por ejemplo, desplazar competitivamente el enlace de IAP a una caspasa en las células o liberar Smac secuestrada con IAP en las células. La molécula cargo de unión con IAP puede química, físicamente o por una combinación de estos, unirse a una proteína IAP y puede desplazarse de una caspasa madura o proteína Smac en una célula. La interacción física entre la porción de unión con IAP de la molécula cargo de unión con IAP y una proteína IAP puede utilizarse para modificar la apoptosis en células.
Las moléculas de unión o moléculas cargo de unión con IAP de la fórmula (2), (3) o (5) pueden tener una porción de unión con IAP que puede, por ejemplo, desplazar una molécula o polip�ptido como una caspasa madura o p�ptido etiquetado de manera fluorescente (AbuRPF-K(5-Fam)-NH2) del dominio BIR de una IAP. Donde se desea un aumento en apoptosis en células, las moléculas de unión con IAP de la fórmula (2), (3), o (5) que tienen una constante de unión Kd como se mide mediante procedimientos descritos, por ejemplo, en el Ejemplo 1 para el desplazamiento de (AbuRPF-K(5-Fam)-NH2) del dominio BIR de una IAP puede ser de menos de aproximadamente 10 !M, en algunas realizaciones Kd puede ser de menos de aproximadamente 1 !M, y en aún otras realizaciones, Kd puede ser de menos de aproximadamente 0,1 micromolar en condiciones de ensayo descritas en los ejemplos.
La molécula cargo de unión con IAP etiquetada de la estructura (2), (3) o (5) puede incluir cualquier etiqueta detectable adecuada, que incluye fluor�foros, crom�foros, nanopart�culas fluorescentes, y otras tintas, isótopos, radiois�topos, metales, moléculas pequeñas y similares. Donde la etiqueta est� unida o enlazada a la porción de unión con IAP de la molécula, la etiqueta no interfiere, preferentemente, de manera sustancial con la permeabilidad celular o unión de la molécula a IAP y permite su uso en aplicaciones de diagnóstico o terapéuticas. En la selección de una etiqueta, preferentemente, una propiedad detectable de la etiqueta cambia con la unión de la molécula cargo de unión con IAP al dominio BIR de una proteína IAP. La propiedad detectable de la etiqueta puede cambiar dada la interacción de la etiqueta con el entorno celular cambia cuando la molécula se une a IAP mejorando o disminuyendo la propiedad.
Las moléculas cargo de unión con IAP también pueden encontrar utilidad como agentes terapéuticos. En una instancia, la unión de la molécula cargo de unión con IAP a IAP en células puede utilizarse para modificar apoptosis en células en necesidad de tratamiento. En otra instancia, una molécula cargo de unión con IAP donde la porción cargo est� radioetiquetada puede utilizarse para la radioterapia. A través del uso de estas moléculas cargo, los átomos radioactivos pueden administrarse a un tumor, tejido u otra población de células cancerígenas que sobreexpresan la proteína IAP. El IAP en el tumor se enlaza a la molécula cargo de unión con IAP con el radion�cleo. De manera similar, las moléculas cargo de unión con IAP pueden diseñarse para incorporar una tinta que es activa en terapia fotodin�mica. Otras utilidades terapéuticas ser�n evidentes para los entendidos en la técnica.
Las células evaluadas para detectar niveles anormales de IAP en las células pueden mezclarse e incubarse opcionalmente con una molécula cargo de unión con IAP en una muestra de fluido en un recipiente o pocillos, un fluido de circulación o fluidos posteriormente a la purificación. Estas muestras pueden monitorearse para verificar cambios en una propiedad detectable de la molécula cargo de unión con IAP. Por ejemplo, la citometr�a de flujo es un procedimiento para analizar células etiquetadas con una molécula con sonda fluorescente en un cit�metro de flujo. En un cit�metro de flujo, las células pasan de una vez a través de un haz de láser enfocado donde emiten fluorescencia de la sonda dentro de la célula que puede detectarse mediante tubos fotomultiplicadores del cit�metro. Las células con expresión anormal, alta o baja, de IAP pueden contactarse y opcionalmente incubarse con moléculas cargo de unión con IAP de la estructura (2), (3) o (5) que tiene una porción cargo de sonda fluorescente. La unión de las moléculas cargo de unión con IAP a la proteína IAP en las células puede detectarse mediante el cit�metro de flujo. La intensidad de la emisión de fluorescencia puede medirse, digitalizarse, y almacenarse en una computadora para su análisis y comparación con la emisión fluorescente de las células de control, las muestras de células tratadas, u otras muestras celulares cuya expresión IAP ha de ser determinada.
Se proporciona un procedimiento de selección de proteínas IAP en células con una molécula que se une al dominio BIR en una proteína IAP. El procedimiento incluye la combinación de una molécula cargo de unión con IAP de fórmula (2), (3) o (5) y las proteínas IAP de células, en condiciones donde la molécula cargo de unión con IAP y proteína IAP pueden combinarse. Puede incluir la etapa de incubaci�n de una muestra de células con una molécula cargo de unión con IAP. La unión con IAP por la molécula, un indicio de la presencia de IAP en las células, puede determinarse mediante el monitoreo de una propiedad de unión detectable de la molécula cargo de unión con IAP. Un cambio en la propiedad detectable de la molécula de unión con IAP puede utilizarse para determinar la expresión de IAP en las células. Donde la proteína IAP est� sobreexpresada en células, la molécula cargo de unión con IAP puede utilizarse para unir la IAP y liberar la inhibición mediada por IAP de la actividad caspasa en la célula. De manera alternativa, donde una proteína IAP secuestra una proteína como Smac u otra proteína involucrada en apoptosis, la molécula cargo de unión con IAP de la estructura (2), (3) o (5) puede utilizarse para liberar la Smac secuestrada u otra proteína de IAP y modificar la apoptosis en las células. Se pueden administrar otras moléculas cargo de unión con IAP a las células si se desea o resulta necesario en el tratamiento. Estas moléculas cargo de unión con IAP adicionales pueden tener una afinidad de unión diferente para la IAP y pueden incluir, opcionalmente, una porción cargo que es un agente terapéutico como un radiois�topo.
Las moléculas cargo de unión con IAP, por ejemplo, aquellas de la fórmula (2), pueden utilizarse en varios ensayos para seleccionar e identificar compuestos capaces de actuar como agonistas o antagonistas de la proteína caspasa IAP o interacciones de Smac IAP en las células. Por ejemplo, las moléculas cargo de unión con IAP que pueden interrumpir la interacción de caspasa con IAP, antagonistas de esta interacción son útiles como fármacos proapopt�ticos para el tratamiento de enfermedades de proliferaci�n celular como el cáncer. Los agonistas de esta interacción pueden ser útiles como fármacos anti-apopt�ticos para el tratamiento de enfermedades donde se necesita la inhibición de apoptosis, por ejemplo, enfermedades degenerativas como la enfermedad de Alzheimer.
Un sistema vivo puede incluir plantas, animales, organismos uni o multicelulares e insectos. El término mamífero incluye seres humanos y todos los animales domésticos y silvestres, que incluyen, a modo no taxativo, ganado, caballos, cerdos, ovejas, cabras, perros, gatos y similares.
Una cantidad efectiva se refiere a aquella cantidad de molécula cargo de unión con IAP de la fórmula (2), (3) o (5) de la presente invención que, cuando es administrada a una muestra de una o más células que incluyen tejido o un sistema vivo como un animal, preferentemente un mamífero que la necesita, es suficiente para la detección efectiva de IAP en tejido o células, profilaxis de tejido o células o tratamiento terapéutico de IAP en las células o tejido, preferentemente aquellas en un sistema vivo. Para las enfermedades mitigadas por la inhibición de la actividad de la IAP, la cantidad de un compuesto de la presente invención que constituye una cantidad terapéuticamente efectiva que modifica o promueve la apoptosis en una o más células, que incluyen un tejido o un sujeto variar� dependiendo del compuesto, el estado de la enfermedad y su gravedad y el mamífero a tratar, pero puede ser determinada rutinariamente por un entendido en la técnica en base a su propio conocimiento y a esta divulgación. Una cantidad diagn�sticamente efectiva es una cantidad de una molécula cargo de unión con IAP suficiente para permitir la detección de IAP en células o tejido y puede, por ejemplo, variar dependiendo de la ubicación de la célula o el tejido y la estabilidad de la molécula cargo de unión con IAP. Una cantidad profil�cticamente efectiva es una cantidad de una molécula cargo de unión con IAP que evita la ocurrencia de una enfermedad y puede determinarse mediante la administración profiláctica de moléculas cargo de unión con IAP, tejido o animales de ensayo con controles y posteriormente mediante la exposición de estos a condiciones conocidas para inducir la proliferaci�n celular anormal y posteriormente determinar la cantidad profil�cticamente efectiva de la molécula cargo de unión con IAP.
Tratar o el tratamiento de una enfermedad en una muestra de células, un tejido, un mamífero y particularmente un ser humano puede incluir detectar la presencia de una enfermedad en las células utilizando compuestos de la estructura (2), (3) o (5) de la presente invención y donde una enfermedad se detecta, opcionalmente seguido por la administración de compuestos de la presente invención a una o más células, a un animal o tejido que incluye seres humanos, para modificar y preferentemente promover la apoptosis. Esta enfermedad en el caso de la sobreexpresi�n de las proteínas IAP en células puede mitigarse mediante la inhibición de una interacción de IAP y caspasa o una interacción de IAP y Smac mediante la administración de moléculas cargo de unión con IAP de la presente invención a las células causando una regresión de la enfermedad. El tratamiento también puede incluir: la prevención de la enfermedad en un mamífero. Por ejemplo, en un mamífero que tiene predisposición a la enfermedad caracterizada por la inhibición de la apoptosis, pero al mamífero aún no se le ha diagnosticado la enfermedad; una cantidad efectiva de los compuestos de unión con IAP de la presente invención puede administrarse a las células o al paciente para inhibir la enfermedad o detener su desarrollo.
En una realización, las moléculas de la estructura (2), (3) o (5) pueden administrarse como una composición para brindar una distribución sist�mica de las moléculas de unión con IAP como la administración oral, bucal o parenteral en el mamífero o ser humano. La administración puede estar incluida en un procedimiento para tratar mamíferos, especialmente seres humanos, que sufren de un trastorno de proliferaci�n o existe riesgo de ello. “En riesgo” se refiere a mamíferos como personas cuyo genotipo, historia familiar, u otros factores de riesgo indican una mayor posibilidad de que la persona sufra un trastorno de proliferaci�n si no se trata.
La expresión de IAP en células puede detectarse en pacientes sin necesidad de una cirugía. Por lo tanto, la presente invención abarca compuestos y procedimientos para detectar actividades bioquímicas intracelulares en sistemas vivos como, animales, tejidos o células, administrando moléculas cargo de unión con IAP de esta invención que se transfieren a células y que son detectables en células vivas a distancias removidas de las células por la presencia de un tejido interviniente. Los procedimientos y las composiciones pueden utilizarse para identificar células o tejido que tiene expresión anormal de IAP en una combinación de una o más células o tejidos; y administrar una cantidad efectiva de una molécula cargo de unión con IAP para unirse con IAP en las células de muestra y modificar la actividad de la IAP en las células o tejido. Los ejemplos de tejidos a los que los procedimientos y composiciones de la presente invención pueden aplicarse incluyen, por ejemplo, células cancerígenas, en particular, tumores del sistema nervioso central, cáncer de mama, cáncer de hígado, pulmón, cabeza y cuello, linfomas, leucemias, mieloma múltiple, cáncer de vejiga, cáncer de ovarios, cáncer de pr�stata, tumores renales, sarcomas, cáncer de colon u otro cáncer gastrointestinal, metástasis y melanomas. Otros ejemplos de enfermedades, trastornos o condiciones donde la modificación de apoptosis o actividad IAP anormal est�n involucrados y a los cuales los procedimientos y composiciones de la presente invención pueden aplicarse incluyen, a modo no taxativo, infección, inflamación, enfermedades neurodegenerativas como enfermedad de Alzheimer y Parkinson. Un trastorno de proliferaci�n puede incluir un trastorno en donde la actividad de la IAP inhibe la apoptosis en células que reciben un estímulo apopt�tico.
La apoptosis puede promoverse en una muestra de células mediante la administración a las células de una cantidad de una molécula cargo de unión con IAP efectiva para estimular la apoptosis en las células. Las células pueden ser células cultivadas, células de un tejido, y el tejido se ubica, preferentemente, en un organismo vivo, preferentemente, un animal, más preferentemente, un mamífero y aún más preferentemente un ser humano. Estas últimas realizaciones se llevan a cabo mediante la formulación de moléculas cargo de unión con IAP de la invención en una cantidad terapéuticamente efectiva como una preparación farmacéutica para la administración al mamífero. Dicha preparación farmacéutica constituye otro aspecto de la presente invención.
La capacidad de un agente farmacéutico para estimular o inhibir la apoptosis puede probarse en un ensayo de actividad libre de células de objetivos corriente abajo de IAP. Ante la ausencia de una molécula cargo de unión con IAP, la IAP puede por ejemplo interactuar con Smac o inhibir la actividad de las caspasas, deteniendo la apoptosis. Dichos ensayos incluyen, a modo no taxativo, ensayos de actividad directa de caspasa-9 y ensayos de activación de caspasa (escisión de procaspasas). En estos ensayos, una molécula cargo de unión con IAP de la invención, que tiene un nivel predeterminado de actividad en dichos ensayos, se utiliza como un control positivo y opcionalmente, una molécula correspondiente conocida por no ser activa en el ensayo se utiliza como un control negativo. Los ensayos pueden realizarse utilizando estos controles y las células que pasan por el tratamiento evaluado acerca del alivio de la inhibición de Smac o actividad carpasa por IAP en presencia de la molécula cargo de unión con IAP de la estructura (2), (3) o (5). Las células que pasan por apoptosis pueden diferenciarse de las células normales mediante cambios morfológicos o marcadores moleculares, como la escisión de cromosomas en escaleras de nucleosomas (detectadas mediante manchado de ADN)
Las moléculas cargo de unión con IAP farmac�uticamente activas o biol�gicamente activas de la invención son aquellas que se unen a IAP (inhibidor de proteína de apoptosis), especialmente el dominio BIR de IAP, más específicamente, la hendidura de unión BIR3 de XIAP. Esta actividad biológica puede medirse respecto de cualquier IAP, que incluye, a modo no taxativo, XIAP, c-IAP1, c-IAP2, survivina, ML-LIP, y DIAP.
Varios aspectos de la presente invención se ilustrarán con referencia a los siguientes ejemplos no limitantes.
Ejemplo 1
Las constantes de unión (Kd) se midieron utilizando polarización de fluorescencia como se describe por Zaneta Nikolovska-Coleska, Renxiao Wang, Xueliang Fang, Hongguang Pan, York Tomita, Peng Li, Peter P. Roller, Krzysztof Krajewski, Naoyuki Saito, Jeanne Stuckey and Shaomeng Wang, en “Development and Optimization of a Binding Assay for the XIAP BIR3 Domain Using Fluorescence Polarization”, Analytical Biochemistry 2004, 332, 261273). Brevemente, los compuestos de unión con IAP de ensayo en varias concentraciones para mediciones de unión se mezclaron con 5 nM de p�ptido etiquetado de manera fluorescente (AbuRPF-K(5-Fam)-NH2) y 40 nM de XIAP-BIR3 durante 15 minutos a temperatura ambiente en 100 !L de 0,1M de tampón de fosfato de potasio, pH 7,5 que contiene 100 !g/ml de y-globulina bovina. Después de la incubaci�n, se midieron los valores de polarización (mP) en un Victor2V utilizando un filtro de excitación de 485 nm y un filtro de emisión de 520 nm. Los valores de IC50 se determinaron a partir del gráfico utilizando un análisis de mínimos cuadrados no lineal, con Prisma de GraphPad. Los valores Kd de los inhibidores competitivos se calcularon utilizando la ecuación descrita por Zaneta Nikolovska-Coleska et al. en base a los valores IC50 medidos, el valor de Kd de la sonda del complejo XIAP BIR3, y las concentraciones de la proteína y sonda en el ensayo de competición. En varios ejemplos de intervalos de moléculas cargo de unión con IAP o moléculas de unión con IAP para los valores de Kd: Grupo A: Kd<0,1 !M; Grupo B: Kd=0,11 !M; Grupo C: Kd=1-10 !M; Grupo D: Kd>10 !M.
Ejemplo 2
Este ejemplo ilustra el uso de compuestos de realizaciones de la presente invención que pueden utilizarse en un procedimiento para tratar células. El procedimiento que utiliza estos compuestos de unión con IAP puede incluir la administración a células anormales, que pueden ser conocidas por sobreexpresar IAP as� como otras líneas celulares relacionadas con trastornos de desarrollo, cáncer, enfermedades autoinmunes, as� como trastornos neurodegenerativos como por ejemplo, células SK-OV-3, células HeLa u otras células, una cantidad de los compuestos de unión con IAP o moléculas cargo de unión con IAP en varias realizaciones de fórmula (2), (3), o (5) que es efectiva para reducir, eliminar, o tratar la muestra de células.
El ensayo de MTT es un ejemplo de un ensayo que ha sido utilizado para medir el cultivo celular como se describió anteriormente (Hansen, M. B., Nielsen, S. E., y Berg, K. J. Immunol. Methods 1989, 119, 203-210) e incorporado a la presente a modo de referencia en su totalidad. Brevemente, las células SK-OV-3 se cultivaron en placas de 96 pocillos en un medio McCoy que contiene un10% de albúmina s�rica bovina fetal (20.000 por pocillo) e incubadas durante la noche a 37� C. El día siguiente, los compuestos de ensayo se agregaron en varias concentraciones típicamente entre aproximadamente 10 y aproximadamente 0,0001 !M y las placas se incubaron a 37� C. durante 72 hs adicionales. Este tiempo de incubaci�n fue óptimo para medir los efectos inhibitorios de diferentes análogos. Se agregaron 50 microlitros de 5 mg/mL del reactivo MTT en cada pocillo y las placas se incubaron a 37� C durante 3 horas. Al final del período de incubaci�n, se agregaron 50 microlitros de DMSO en cada pocillo para disolver células y la densidad óptica (DO) de los pocillos se midió con un lector de microplacas (Victor2 1420, Wallac, Finlandia) a 535 nm. La supervivencia celular (CS) se calcul� con la siguiente ecuación:
CS=(DO pocillo tratado/media DO pocillos de control)�100%
La EC50, definida como la concentración de fármaco que resulta en un 50% de CS, se deriv� calculando el punto donde la curva dosis-respuesta cruza el punto de 50% de CS utilizando un GraphPad Prism.
Los resultados representativos para los compuestos de unión de IAP son: Tabla 1
Entrada
A1 R1b Y Z R12 R14-17 R11 EC50, !M (�sd)
1-1
Me Me tBu H MeO(CH2CH2O)2CH2CH2 6-F(R16) H 0,092 � 0,077
1-2
Me Me cHex H MeO(CH2CH2O)2CH2CH2 6-F(R16) H 0,060 � 0,026
1-3
Me Me cHex H H 6-F(R16) H 0,515 � 0,093
10 Ejemolo 3
Este ejemplo ilustra la preparación de derivados de pirrolidina de la Tabla 2. Los ejemplos incluyen moléculas de fórmula (E3) que pueden incluir sustituyentes heteroalquinilo. Esquema I
Preparaci�n de hidrocloruro de 2S-amino-N-[2-metil-1S-(4S-fenoxi-2S-fenoximetil-pirrolidina-1-carbonil)-propil]propionamida (7):
A. Terc-butil éster del ácido (4S)-fenoxi-(2S)-fenoximetil-pirrolidina-1-carbox�lico (2): A una solución de alcohol 1 (0,53 g, 1,8 mmol) en DCM anhidro (10 mL) se agregó fenol (0,21 g, 2,3 mmol), Ph3P (0,52 g, 2,0 mmol), y 1,1'(azodicarbonil)-dipiperidina (ADDP, 0,50 g, 1,9 mmol) en orden secuencial. Después de 2 hr a temperatura ambiente, la mezcla de reacción heterogénea se filtr�. El sólido blanco se lav� con DCM y el filtrado clarificado se lav� con NaOH 2M, agua, salmuera, se secó con Na2SO4 anhidro, se filtr� y se concentr�. El éter ar�lico en bruto se purificó mediante cromatograf�a ultrarrápida en gel de sílice (3:1 hexano/EtOAc) para proporcionar 0,36 g (54%) de 2 como un aceite incoloro. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 7,29-7,24 (m, 4H), 6,94-6,82 (m, 6H), 4,91 (t, J=5,1 Hz, 1H), 4,37-4,28 (m, 2H), 4,12-4,05 (m, 1H), 3,79-3,64 (m, 2H), 2,48 (app d, J=13,8 Hz, 1H), 2,32-2,25 (m, 1H), 1,48 (s, 9H) ppm.
B. (4S)-Fenoxi-(2S)-fenoximetil-pirrolidina (3): Se agregó ácido trifluoroac�tico (2 mL) a temperatura ambiente a una solución de 2 (0,36 g, 0,98 mmol) en DCM (10 mL). Después de 1,5 h, la solución se concentr� a sequedad y el producto en bruto se disolvió en EtOAc. La solución orgánica se lav� con NaHCO3 acuoso, salmuera, se secó sobre Na2SO4 anhidro, se filtr�, y se concentr�. La pirrolidina en bruto se purificó mediante cromatograf�a ultrarrápida en gel de sílice (MeOH 10%/DCM) para proporcionar 0,23 g (88%) de 3 como un aceite marrón-anaranjado. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 7,32-7,26 (m, 4H), 6,98-6,87 (m, 6H), 4,90-4,87 (m, 1H), 4,07-4,01 (m, 2H), 3,63-3,57 (m, 1H), 3,35 (app d, J=12,3 Hz, 1H), 3,17 (app q, J=5,4 Hz, 1H), 2,77 (br s, 1H), 2,45-2,35 (m, 1H), 1,93-1,86 (m, 1H) ppm.
C. Terc-butil éster del ácido [2-Metil-1-(4S-fenoxi-2S-fenoximetil-pirrolidina-1-carbonil)-propil]-carb�mico (4): Se agregó O-(7-azabenzotriazol-1-il)-N,N,N,',N'-tetrametiluronio PF6 (HATU, 0,38 g, 1,0 mmol) a una solución de N-Boc-Val (0,28 g, 1,3 mmol) en NMP anhidro (5 mL) a temperatura ambiente. Se agregó N-metilmorfolina (0,1 mL) a la mezcla de reacción. Después de 10 min, se agregó pirrolidina 3 (0,23 g, 0,86 mmol) en NMP (5 mL). Después de 2 h, la mezcla de reacción se diluyó con EtOAc y se lav� con NaHCO3 acuoso diluido, HCl 1N, agua, y salmuera. La fase orgánica se secó sobre Na2SO4 anhidro, se filtr� y se concentr�. La amida en bruto se purificó mediante cromatograf�a ultrarrápida en gel de sílice (3:1 hexano/EtOAc) para proporcionar 0,36 g (90%) de 4 como un aceite incoloro. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 7,34-7,26 (m, 4H), 7,03-6,82 (m, 6H), 5,30 (d, J=9,3 Hz, 1H), 5,01-4,99 (m, 1H), 4,69-4,65 (m, 1H), 4,38-4,34 (m, 1H), 4,27-4,07 (m, 3H), 3,83-3,78 (m, 1H), 2,53-2,48 (m, 1H), 2,38-2,31 (m, 1H), 2,00-1,94 (m, 1H), 1,48 (s, 9H), 0,97 (d, J=7,2 Hz, 3H), 0,93 (d, J =7,2 Hz, 3H) ppm.
D. 2-Amino-3-metil-1-(4S-fenoxi-2S-fenoximetil-pirrolidin-1-il)-butan-1-ona (5): Se agregó ácido trifluoroac�tico (2 mL) a temperatura ambiente a una solución de 4 (0,36 g, 0,79 mmol) en DCM (10 mL). Después de 1,5 h, la solución se concentr� a sequedad y el producto en bruto se disolvió en EtOAc. La solución orgánica se lav� con NaHCO3 acuoso, salmuera, se secó sobre Na2SO4 anhidro, se filtr� y se concentr�. La amida en bruto se purificó mediante cromatograf�a ultrarrápida en gel de sílice (5% MeOH/DCM) para proporcionar 0,27 g (96%) de 5 como un aceite amarillo claro. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 7,32-7,01 (m, 4H), 7,01-6,82 (m, 6H), 4,99 (m, 1H), 4,67-4,48 (m, 1H), 4,38-4,27 (m, 1H), 4,16-4,05 (m, 1H), 3,99 (app q, J=5,1 Hz, 1H), 3,78-3,72 (m, 1H), 2,50-2,28 (m, 2H), 1,86 (br s, 2H), 0,97 (d, J=7,2 Hz, 3H), 0,91 (d, J=7,2 Hz, 3H) ppm.
E. Terc-butil éster del ácido {1S-[2-Metil-1S-(4S-fenoxi-2S-fenoximetil-pirrolidina-1-carbonil)-propilcarbamoil]-etil}carb�mico (6): Se agregó O-(7-azabenzotriazol-1-il)-N,N,N',N'-tetrametiluronio PF6 (HATU, 0,23 g, 0,61 mmol) a una solución de N-Boc-Ala (0,14 g, 0,74 mmol) en NMP anhidro (3 mL) a temperatura ambiente. Se agregó Nmetilmorfolina (0,1 mL) a la mezcla de reacción. Después de 10 min, se agregó pirrolidina 5 (0,17 g, 0,48 mmol) en NMP (5 mL). Después de 16 h, la mezcla de reacción se diluyó con EtOAc y se lav� con NaHCO3 acuoso diluido, HCl 1N, agua, y salmuera. La fase orgánica se secó sobre Na2SO4 anhidro, se filtr� y se concentr�. La amida en bruto se purificó mediante cromatograf�a ultrarrápida en gel de sílice (1:1 hexano/EtOAc) para proporcionar 0,23 g (92%) de 6 como un aceite incoloro. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 7,33-7,23 (m, 4H), 7,02-6,87 (m, 6H), 5,02-4,99 (m, 2H), 4,68-4,48 (m, 2H), 4,33 (dd, J=3,9, 9,3 Hz, 1H), 4,23-4,09 (m, 4H), 3,83-3,78 (m, 1H), 2,52-2,47 (m, 1H), 2,38-2,28 (m, 1H), 2,08-1,99 (m, 1H), 1,80 (br s, 1H), 1,45 (s, 9H), 1,36 (d, J=6,9 Hz, 3H), 0,95 (d, J=6,9 Hz, 3H), 0,90 (d, J=7,0 Hz, 3H) ppm.
F. Hidrocloruro de 2S-amino-N-[2-metil-1S-(4S-fenoxi-2S-fenoximetil-pirrolidina-1-carbonil)-propil]-propionamida (7): Se agregó ácido trifluoroac�tico (2 mL) a temperatura ambiente a una solución de 6 (0,23 g, 0,44 mmol) en DCM (10 mL). Después de 1,5 h, la solución se concentr� a sequedad y el producto en bruto se disolvió en EtOAc. La solución orgánica se lav� con NaHCO3 acuoso, salmuera, se secó sobre Na2SO4 anhidro, se filtr�, y se concentr�. La amida en bruto se disolvió en éter diet�lico y se trat� con HCl(g). La sal en bruto se tritur� con éter diet�lico y hexano para proporcionar 0,13 g (65%) de 7 como un sólido blanco. 1H NMR, free base (CDCl3, 300 MHz) 5 7,89-7,87 (m, 1H), 7,32-7,24 (m, 4H), 7,01-6,79 (m, 5H), 5,01-4,98 (m, 1H), 4,68-4,62 (m, 1H), 4,51-4,43 (m, 1H), 4,36-4,26 (m, 2H), 4,18-4,10 (m, 1H), 3,84-3,78 (m, 1H), 2,51-2,46 (m, 1H), 2,35-2,28 (m, 1H), 2,09-2,02 (m, 1H), 1,38-1,25 (m, 4H), 0,96-0,92 (m, 6H) ppm. Espectro de masa, m/z=440 [(M+H)+].
Tabla 2
Entrada
A1 R1b Y Z R3-5, R' 3-5, R4 MS (M+H)+ Intervalo KD
2-1
H Me iPr (S)- OPh H 440,3 B
2-2
Me Me iPr (S)- OPh H 454,3 B
2-3
H Me iPr H H 348,3 B
2-4
H Me iPr H 2,3(CH2)4 402,3 B
2-5
Me Me iPr H 2-Ph 438,3 B
2-6
H Me iPr H 2-Ph 424,2 B
2-7
H Me —CH(Me)OCH2C=CH (S)-OPh H 480,2 A
Ejemplo 4
Este Ejemplo ilustra la preparación de pirrolidinas sustituidas de la Tabla 3. Esquema II
Preparaci�n de trans-2S-amino-N-(1S-{2S-[3-(2-etil-fenoxi)-propenil]-4S-fenoxi-pirrolidina-1-carbonil}-2-metil-propil)propionamida (14):
20 A. Terc-butil éster del ácido trans-2S-[3-(2-etil-fenoxi)-propenil]-4S-fenoxi-pirrolidina-1-carbox�lico (9): A una solución de alcohol 8 (0,3 g, 0,94 mmol) en DCM (6 mL) se agregó 2-etilfenol (0,14 g, 1,16 mmol) y Ph3P (0,27 g, 1,03 mmol). La solución se enfri� a 0� C y se agregó ADDP (0,28 g, 1,13 mmol) en una porción. Después de 10 min, la mezcla de reacción se dej� calentar a temperatura ambiente y se continu� agitando durante 16 h. El precipitado blanco se elimin� por filtración y se lav� con DCM. El filtrado clarificado se lav� sucesivamente con NaOH 1M, agua, y
25 salmuera. La fase orgánica se secó con Na2SO4 anhidro, se filtr�, y se concentr�. El éter en bruto se purificó mediante cromatograf�a ultrarrápida en gel de sílice (3:1 hexano/EtOAc) para proporcionar 0,18 g (45%) de 9 como un aceite incoloro. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 7,30-7,26 (m, 2H); 7,15 (m, 2H); 7,00-6,79 (m, 4H); 6,01-5,98 (m, 1H), 5,84 (m, 1H); 4,92 (br s, 1H); 4,53-4,43 (m, 3H); 3,76 (m, 2H); 2,65 (q, 2H); 2,39 (m, 1H); 2,16 (d, 1H); 1,46 (s, 9H), 1,21 (t, 3H) ppm.
30 B. Trans-2S-[3-(2-etil-fenoxi)-propenil]-4S-fenoxi-pirrolidina (10): Se agregó ácido trifluoroac�tico (2 mL) a temperatura ambiente a una solución de 9 (0,18 g, 0,43 mmol) en DCM (10 mL). Después de 1 h, la solución se concentr� a sequedad y el producto en bruto se disolvió en EtOAc. La solución orgánica se lav� con NaHCO3 acuoso, salmuera, se secó sobre anhidro MgSO4, se filtr�, y se concentr�. La amida en bruto (10) se us� sin purificación adicional (se obtuvieron 0,13 g),1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 57,31-7,25 (m, 3H); 7,17-7,11 (m, 2H); 6,97
35 6,80 (m, 4H); 5,97-5,88 (m, 2H); 4,86 (m, 1H); 4,54-4,50 (m, 2H); 3,70 (q, 1H); 3,34 (d, 1H); 3,07 (d of d, 1H); 2,66 (q, 2H); 2,48-2,41 (m, 1H); 1,82-1,75 (m, 2H); 1,20 (t, 3H) ppm.
C. Terc-butil éster del ácido trans-(1S-{2S-[3-(2-Etil-fenoxi)-propenil]-4S-fenoxi-pirrolidina-1-carbonil}-2-metil-propil)carb�mico (11): Se agregó O-(7-azabenzotriazol-1-il)-N,N,N',N'-tetrametiluronio PF6 (HATU, 0,23 g, 0,62 mmol) a una solución de N-Boc-Val (0,18 g, 0,82 mmol) en NMP anhidro (3 mL) a temperatura ambiente. Se agregó N
40 metilmorfolina (0,12 mL) a la mezcla de reacción. Después de 10 min, se agregó amina 10 (0,13 g, 0,41 mmol) en NMP (3 mL). Después de 16 h, la mezcla de reacción se diluyó con EtOAc y se lav� con NaHCO3 acuoso diluido, HCl 1N, agua, y salmuera. La fase orgánica se secó sobre Na2SO4 anhidro, se filtr� y se concentr�. La amida en bruto se purificó mediante cromatograf�a ultrarrápida en gel de sílice (3:2 hexano/EtOAc) para proporcionar 0,20 g (92%, 2 etapas) de 11 como un aceite incoloro. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 7,32-7,24 (m, 2H); 7,15-7,06 (m, 2H); 6,99 (t, 1H); 6,89-6,77 (m, 4H); 5,96-5,91 (m, 2H); 5,23-5,20 (m, 1H); 5,01-4,86 (m, 2H); 4,53 (m, 2H); 4,21-4,09 (m, 2H); 4,09-3,97 (m, 1H); 2,68 (q, 2H); 2,36-2,32 (m, 1H); 2,18 (d, 1H); 1,97-1,91 (m, 1H); 1,44 (s, 9H); 1,29-1,18 (m,
5 6H); 0,99-0,81 (m, 6H) ppm.
D. Trans-2S-amino-1-{2S-[3-(2-etil-fenoxi)-propenil]-4S-fenoxi-pirrolidin-1-il}-3-metil-butan-1-ona (12): Se agregó ácido trifluoroac�tico (2 mL) a temperatura ambiente a una solución de 11 (0,20 g, 0,39 mmol) en DCM (10 mL). Después de 1 h, la solución se concentr� a sequedad y el producto en bruto se disolvió en EtOAc. La solución orgánica se lav� con NaHCO3 acuoso, salmuera, se secó sobre MgSO4 anhidro, se filtr�, y se concentr�. La amida
10 en bruto (12) se us� sin purificación adicional (0,14 g se obtuvieron). 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 7,28-7,26 (m, 2H); 7,15 (m, 2H); 6,99 (m, 1H); 6,89-6,76 (m, 4H); 6,10-5,86 (m, 2H); 5,01-4,95 (m, 2H); 4,56 (m, 3H); 3,92-3,79 (m, 1H); 3,31 (m, 1H); 2,66 (q, 2H); 2,32-2,16 (m, 1H); 1,68 (m, 4H); 1,28-1,19 (m, 3H); 0,97-0,81 (m, 6H) ppm.
E. Terc-butil éster del ácido trans-[1S-(1S-{2S-[3-(2-etil-fenoxi)-propenil]-4S-fenoxi-pirrolidina-1-carbonil}-2-metilpropilcarbamoil)-etil]-carb�mico (13): Se agregó O-(7-azabenzotriazol-1-il)-N,N,N',N'-tetrametiluronio PF6 (HATU, 15 0,19 g, 0,51 mmol) a una solución de N-Boc-Ala (0,13 g, 0,67 mmol) en NMP anhidro (3 mL) a temperatura ambiente. Se agregó N-metilmorfolina (0,1 mL) a la mezcla de reacción. Después de 10 min, se agregó amina 12 (0,14 g, 0,34 mmol) en NMP (3 mL). Después de 72 h, la mezcla de reacción se diluyó con EtOAc y se lav� con NaHCO3 acuoso diluido, HCl 1N, agua, y salmuera. La fase orgánica se secó sobre Na2SO4 anhidro, se filtr� y se concentr�. La amida en bruto se purificó mediante cromatograf�a ultrarrápida en gel de sílice (1:1 hexano/EtOAc)
20 para proporcionar 0,11 g (49%, 2 etapas) de 13 como un aceite incoloro. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 7,31-7,22 (m, 2H); 7,15-6,95 (m, 3H); 6,88-6,76 (m, 4H); 5,96-5,87 (m, 2H); 5,19 (br, 1H); 5,00 (m, 1H); 4,86 (t, 1H); 4,51-4,49 (m, 3H); 4,17-4,10 (m, 2H); 3,89-3,80 (m, 1H); 2,64 (q, 2H); 2,34-2,29 (m, 1H); 2,21-2,14 (m, 1H); 2,04-1,98 (m, 1H); 1,44 s, 9H); 1,35-1,23 (m, 4H); 1,17 (t, 3H); 0,97-0,87 (m, 6H) ppm.
F. Trans-2S-amino-N-(1S-{2S-[3-(2-etil-fenoxi)-propenil]-4S-fenoxi-pirrolidina-1-carbonil}-2-metil-propil)-propionamida
25 (14): Se agregó ácido trifluoroac�tico (2 mL) a temperatura ambiente a una solución de 13 (0,11 g, 0,18 mmol) en DCM (10 mL). Después de 1 h, la solución se concentr� a sequedad y el producto en bruto se disolvió en EtOAc. La solución orgánica se lav� con NaHCO3 acuoso, salmuera, se secó sobre Na2SO4 anhidro, se filtr�, y se concentr� para proporcionar 0,068 g (76%) de 14 como un sólido blanco. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 7,86 (br, 1H); 7,31-7,22 (m, 2H); 7,15-7,05 (m, 2H); 6,98 (t, 1H); 6,88-6,76 (m, 4H); 5,97-5,86 (m, 2H); 5,00-4,98 (m, 1H); 4,88-4,83 (m, 1H);
30 4,57-4,51 (m, 2H); 4,44 (t, 1H); 4,21 (d of d, 1H); 3,89-3,82 (m, 1H); 2,64 (q, 2H); 2,33-2,29 (m, 1H); 2,17 (d, 1H); 2,04-2,00 (m, 1H); 1,36-1,25 (m, 6H); 1,17 (t, 3H); 0,99-0,88 (m, 6H) ppm.
Tabla 3
Entrada
A1 R1b Y Z R3-5, R' 3-5, R4 MS(M+H)+ Intervalo KD
3-8
H Me iPr OPh H 466,2 B
3-9
H Me iPr OPh 2-Br 544,0 B
3-10
H Me iPr OPh 2,3-di-Cl 534,1 B
3-11
H Me iPr OPh 2,4-di-Cl 534,1 B
3-12
H Me iPr OPh 2-Et 494,4 B
3-13
Me Me iPr OPh 2,3-di-Cl 548,2 B
3-14
H Me iPr OPh 3-Br 544,1 B
3-15
H Me iPr OPh 2-iPrO 524,3 B
3-16
Boc Me iPr OPh 3,4-(CH2)4 620,3 D
3-17
H Me iPr OPh 3,4-(CH2)4 520,3 C
3-18
H Me iPr OPh 2-MeO 496,3 B
3-19
H H iPr OPh 2-MeO 482,3 D
3-20
H Me iPr OPh 2-Ph 542,3 B
3-21
H Me iPr OPh 2-ciclopentil 534,3 C
3-22
H Me iPr OPh 2,6-di-Me 494,3 A
Ejemplo 5
Este Ejemplo ilustra la preparación de derivados de pirrolidina de la Tabla 4, 5 Esquema III
Preparaci�n de 2S-amino-N-(1S-{2S-[3-(2-etil-fenoxi)-propil]-4S-fenoxi-pirrolidina-1-carbonil}-2-metil-propil)propionamida (21):
A. Terc-butil éster del ácido 2S-(3-Hidroxi-propil)-4S-fenoxi-pirrolidina-1-carbox�lico (15): [Re: SRR-006-062] se
20 agregó paladio sobre carbono (10%, 0,3 g) a una solución de alcohol 8 (3 g, 9,4 mmol) en EtOAc (30 mL). La mezcla de reacción se colocó en un agitador Parr y se presuriz� a 45 PSI H2 (g). La mezcla heterogénea se agit� durante 24 h a temperatura ambiente. El catalizador se elimin� mediante filtración a través de un disco de filtro PVDF de 0,45 !m (Millipore Millex-HV�) y el filtrado clarificado se concentr� al vacío para proporcionar 2,9 g (97%) de 15 que se utilizó sin purificación adicional. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 7,29 (t, 2H); 6,96 (t, 1H); 6,85 (d, 2H); 4,88 (br s, 1H);
25 4,08-3,74 (m, 2H); 3,67-3,65 (m, 2H); 3,55 (d, 1H); 2,27-2,23 (m, 2H); 2,05-1,90 (m, 2H); 1,76-1,65 (m, 1H); 1,55 (q, 2H); 1,47 (s, 9H) ppm.
B. Terc-butil éster del ácido 2S-[3-(2-Etil-fenoxi)-propil]-4S-fenoxi-pirrolidina-1-carbox�lico (16): A una solución de alcohol 15 (0,61 g, 1,91 mmol) en DCM (10 mL) se agregó 2-etilfenol (0,28 g, 2,33 mmol) y Ph3P (0,55 g, 2,09 mmol). La solución se enfri� a 0� C. y se agregó en una porción ADDP (0,58 g, 2,29 mmol). Después de 10 min, la 30 mezcla de reacción se dej� calentar a temperatura ambiente y se continu� agitando durante 16 h. El precipitado blanco se elimin� por filtración y se lav� con DCM. El filtrado clarificado se lav� sucesivamente con NaOH 1M, agua, y salmuera. La fase orgánica se secó con Na2SO4 anhidro, se filtr�, y se concentr�. El éter en bruto se purificó mediante cromatograf�a ultrarrápida en gel de sílice (3:1 hexano/EtOAc) para proporcionar 0,46 g de 16 como un aceite incoloro. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 7,28 (t, 2H); 7,13 (t, 2H); 6,96 (t, 1H); 6,89-6,84 (m, 3H); 6,78 (d, 1H);
35 4,91-4,87 (m, 1H); 3,96 (br, 4H); 3,56 (d, 1H); 2,63 (q, 2H); 2,28-2,26 (m, 1H); 2,11-2,06 (m, 2H); 1,86-1,77 (m, 3H); 1,46 (s, 9H); 1,17 (t, 3H) ppm.
C. 2S-[3-(2-Etil-fenoxi)-propil]-4S-fenoxi-pirrolidina (17): Se agregó ácido trifluoroac�tico (2 mL) a temperatura ambiente a una solución de 16 (0,46 g, 1,08 mmol) en DCM (10 mL). Después de 1 h, la solución se concentr� a sequedad y el producto en bruto se disolvió en EtOAc. La solución orgánica se lav� con NaHCO3 acuoso, salmuera,
40 se secó sobre Na2SO4 anhidro, se filtr�, y se concentr� para proporcionar 0,30 g (85%) de 17 como un aceite incoloro. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 7,32-7,26 (m, 3H); 7,16-7,12 (m, 2H); 6,98 6,78 (m, 4H); 4,86 (s, 1H); 3,993,97 (m, 2H); 3,35 (d, 1H); 3,23 (m, 1H); 3,08 (m, 1H); 2,74-2,60 (m, 3H); 2,42 (m, 2H); 1,90-1,85 (m, 3H); 1,67-1,61 (m, 1H); 1,16 (t, 3H) ppm.
D. Terc-butil éster del ácido (1S-{2S-[3-(2-Etil-fenoxi)-propil]-4S-fenoxi-pirrolidina-1-carbonil}-2-metil-propil)carb�mico (18): Se agregó O-(7-azabenzotriazol-1-il)-N,N,N',N'-tetrametiluronio PF6 (HATU, 0,39 g, 1,03 mmol) a una solución de N-Boc-Val (0,30 g, 1,38 mmol) en NMP anhidro (3 mL) a temperatura ambiente. Se agregó Nmetilmorfolina (0,2 mL) a la mezcla de reacción. Después de 10 min, se agregó amina 17 (0,22 g, 0,67 mmol) en NMP (3 mL). Después de 16 h, la mezcla de reacción se diluyó con EtOAc y se lav� con NaHCO3 acuoso diluido, HCl 1N, agua, y salmuera. La fase orgánica se secó sobre Na2SO4 anhidro, se filtr� y se concentr�. La amida en bruto se purificó mediante cromatograf�a ultrarrápida en gel de sílice (3:1 hexano/EtOAc) para proporcionar 0,30 g (83%) de 18 como un aceite incoloro. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 7,33-7,26 (m, 2H); 7,12 (t, 2H); 6,99 (t, 1H); 6,896,77 (m, 4H); 5,28-5,24 (m, 1H); 5,00-4,98 (m, 1H); 4,39-4,36 (m, 1H); 4,22-4,17 (m, 2H); 4,02-3,94 (m, 2H); 3,72 (d of d, 1H); 2,61 (q, 2H); 2,30-2,24 (m, 1H); 2,14-2,07 (1H); 1,98-1,89 (m, 1H); 1,82-1,74 (m, 4H); 1,44 (s, 9H); 1,181,13 (m, 3H); 0,99-0,93 (m, 6H) ppm.
E. 25-Amino-1-{2S-[3-(2-etil-fenoxi)-propil]-4S-fenoxi-pirrolidin-1-il}-3-metil-butan-1-ona (19): Se agregó ácido trifluoroac�tico (2 mL) a temperatura ambiente a una solución de 18 (0,30 g, 0,57 mmol) en DCM (10 mL). Después de 1 h, la solución se concentr� a sequedad y el producto en bruto se disolvió en EtOAc. La solución orgánica se lav� con NaHCO3 acuoso, salmuera, se secó sobre Na2SO4 anhidro, se filtr�, y se concentr� para proporcionar 0,23 g de 19 como un aceite incoloro. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 7,33-7,28 (m, 2H); 7,17-7,12 (m, 2H); 6,99 (t, 1H); 6,89-6,83 (m, 3H); 6,78 (d, 1H); 4,98 (br, 2H); 4,39 (br, 1H), 4,07-3,92 (m, 4H); 3,75-3,67 (m, 1H); 2,61 (q, 2H); 2,312,24 (m, 2H); 2,13-2,08 (m, 2H); 1,94-1,75 (m, 6H); 1,16 (t, 3H); 1,01-0,85 (m, 6H) ppm.
F. Terc-butil éster del ácido [1S-(1S-{2S-[3-(2-Etil-fenoxi)-propil]-4S-fenoxi-pirrolidina-1-carbonil}-2-metilpropilcarbamoil)-etil]-carb�mico (20): Se agregó O-(7-azabenzotriazol-1-il)-N,N,N',N'-tetrametiluronio PF6 (HATU, 0,11 g, 0,27 mmol) a una solución de N-Boc-Ala (0,07 g, 0,37 mmol) en NMP anhidro (3 mL) a temperatura ambiente. Se agregó N-metilmorfolina (0,05 mL) a la mezcla de reacción. Después de 10 min, se agregó amina 19 (0,078 g, 0,18 mmol) en NMP (1 mL). Después de 16 h, la mezcla de reacción se diluyó con EtOAc y se lav� con NaHCO3 acuoso diluido, HCl 1N, agua, y salmuera. La fase orgánica se secó sobre Na2SO4 anhidro, se filtr� y se concentr�. La amida en bruto se purificó mediante cromatograf�a ultrarrápida en gel de sílice (1:1 hexano/EtOAc) para proporcionar 0,038 g de 20 como un aceite incoloro. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 7,33-7,26 (m, 2H); 7,12 (t, 2H); 6,99 (t, 1H); 6,88-6,76 (m, 4H); 5,08-5,00 (m, 1H); 4,98-4,96 (m, 1H); 4,52-4,47 (m, 1H); 4,37 4,34 (m, 1H); 4,214,16 (m, 2H); 3,98-3,92 (m, 2H); 3,75 (d, 1H); 2,61 (q, 2H); 2,32-2,22 (m, 1H); 2,14-1,99 (m, 4H); 1,86-1,77 (m, 3H); 1,44-1,41 (m, 8H); 1,36-1,13 (m, 4H); 1,16 (t, 3H); 0,96-0,88 (m, 6H) ppm.
G. 2S-Amino-N-(1S-{2S-[3-(2-etil-fenoxi)-propil]-4S-fenoxi-pirrolidina-1-carbonil}-2-metil-propil)-propionamida (21): Se agregó ácido trifluoroac�tico (1 mL) a temperatura ambiente a una solución de 20 (0,038 g, 0,06 mmol) en DCM (5 mL). Después de 1 h, la solución se concentr� a sequedad y el producto en bruto se disolvió en EtOAc. La solución orgánica se lav� con NaHCO3 acuoso, salmuera, se secó sobre Na2SO4 anhidro, se filtr�, y se concentr�. La amida en bruto se disolvió en éter diet�lico y se trat� con HCl(g). La sal en bruto se tritur� con éter diet�lico y hexano para proporcionar 0,022 g de 21 como un sólido blanco. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 7,87 (br, 1H); 7,33-7,25 (m, 2H); 7,12 (t, 2H); 6,96 (t, 1H), 6,89-6,77 (m, 4H); 4,98-4,96 (m, 1H); 4,45 (t, 1H); 4,37-4,25 (m, 2H); 4,00-3,94 (m, 2H); 3,77 (d, 1H); 2,61 (q, 2H); 2,32-2,21 (m, 1H); 2,14-2,04 (m, 3H); 1,61 (br, 2H); 1,35-1,25 (m, 4H); 1,16 (t, 3H); 0,970,89 (m, 6H) ppm.
Tabla 4
Entrad a
A1 R1b Y Z R3-5, R' 3-5, R4 MS (M+H)+ Intervalo KD
4-23
H Me iPr OPh 2-Br 524,3 B
4-24
H Me iPr OPh 2-Ph 543,7 B
4-25
H Me iPr OPh 2-Et 552,4 B
4-26
Me Me iPr OPh 2-Et 510,3 B
4-27
H H iPr OPh 2-Et 482,3 D
4-28
Me Me iPr OPh 2-Et 524,2 B
4-29
H Me iPr OPh 2-iPrO 526,3 B
4-30
H Me iPr OPh 2-iPr 510,3 B
4-31
H Me iPr OPh 2,6-di-Me 496,2 B
4-32
H Me iPr H 2-Ph 452,3 B
4-33
H H iPr H 2-Ph 438,3 D
4-34
H Me iPr H 2-Et 404,3 C
4-35
H Me iPr H 2-iPrO 434,3 B
4-36
H (R)-Me iPr H 2-Ph 452,3 B
4-37
H Me iPr H H 376,3 D
4-38
H Me iPr H 2,6-di-Me 404,3 C
Ejemplo 6
5 Este ejemplo ilustra derivados de pirrolidina de la Tabla 5. Esquema IV (a)
Preparaci�n de 2S-Amino-N-[1S-(2S-benzofuran-3-ilmetil-pirrolidina-1-carbonil)-2-metil-propil]-propionamida (29):
A. Terc-butil éster del ácido trans-2S-[3-(2-yodo-fenoxi)-propenil]-pirrolidina-1-carbox�lico (23): A una solución de alcohol 22 (10,4 g, 0,04 mol) en DCM (300 mL) se agregó 2-yodofenol (12,1 g, 0,05 mol) y Ph3P (14,4 g, 0,05 mol). A temperatura ambiente, se agregó en una porción ADDP (13,8 g, 0,05 mol). Después de 16 h, el precipitado blanco 20 se elimin� por filtración y se lav� con DCM. El filtrado clarificado se lav� sucesivamente con NaOH 1M, agua, y salmuera. La fase orgánica se secó con Na2SO4 anhidro, y posteriormente se filtr� a través una columna corta de gel de sílice. El producto se eluy� con DCM y posteriormente 1:1 hexano/EtOAc para proporcionar 15,5 g (79%) de 23 como un aceite incoloro. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 7,76 (dd, J=7,6, 1,1 Hz, 1H), 7,27 (app t, J=7,6, 1,1 Hz, 1H), 6,78 (dd, J=7,6, 1,1 Hz, 1H), 6,70 (app t, J=7,6, 1,1 Hz, 1H), 5,74 (m, 2H), 4,58 (app d, J=4,7 Hz, 2H), 4,33 (m, 1H),
25 3,40 (m, 2H), 2,02-1,75 (m, 4H), 1,43 (s, 9H) ppm.
B. Terc-butil éster del ácido 2S-benzofuran-3-ilmetil-pirrolidina-1-carbox�lico (24): A una solución de 23 (15,5 g, 36,1 mmol) en DMF anhidro (250 mL) se agregó n-Bu4NCl (10,0 g, 36,1 mmol), K2CO3 (5,0 g, 36,1 mmol), NaHCO3 (2,45 g, 36,1 mmol), y Pd(OAc)2 (0,16 g, 0,72 mmol). La mezcla de reacción anaranjada-marrón se sumergió en un baño de aceite precalentado (100� C.). Después de 2 h, la mezcla de reacción se enfri� a temperatura ambiente y se 30 diluyó con éter diet�lico y agua. Las capas se separaron y la fase acuosa se extrajo dos veces con éter diet�lico. El extracto orgánico combinado se lav� con agua, salmuera, se secó sobre Na2SO4 anhidro, se filtr�, y se concentr�. El benzofurano en bruto se purificó mediante cromatograf�a ultrarrápida en gel de sílice (4:1 hexano/EtOAc) y posteriormente mediante HPLC de fase normal (30% EtOAc/hexano) para proporcionar 4,6 g (42%) de 24 como un aceite incoloro. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 7,62 (m, 1H), 7,46 (m, 1H), 7,26 (m, 3H), 4,13 (m, 1H), 3,40-3,21 (m,
35 2H), 3,15 (m, 1H), 2,68 (m, 1H), 1,80-1,61 (m, 4H), 1,51 (s, 9H) ppm.
C. 2S-Benzofurano-3-ilmetil-pirrolidina (25): Se agregó ácido trifluoroac�tico (2 mL) a 0� C. a una solución de 24 (0,5 g, 1,65 mmol) en DCM (40 mL). Después de 2 h, una porción adicional de TFA (2 mL) se agregó. Después de 1 h, la reacción se inactiv� mediante la adición cuidadosa de NaHCO3 acuoso. La mezcla de reacción se diluyó con agua y el producto en bruto se extrajo con éter diet�lico. El extracto orgánico se lav� con NaHCO3 acuoso, salmuera, se
40 secó sobre Na2SO4 anhidro, se filtr�, y se concentr�. La amida en bruto se purificó mediante HPLC de fase inversa (C18; ACN 10-100%/agua, TFA 0,1%) que, seguido de neutralización, proporcion� 0,24 g (72%) de 25 como un aceite incoloro. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 7,53 (app d, J=8,7 Hz, 2H), 7,43 (d, J=8,2 Hz, 1H), 7,27 (dd, J=7,0, 8,2 Hz, 1H), 7,21 (dd, J=7,0, 8,7 Hz, 1H), 6,96 (br s, 1H), 3,59 (m, 1H), 3,16-2,86 (m, 4H), 1,96-1,75 (m, 3H), 1,60 (m, 1H) ppm.
D. Terc-butil éster del ácido [1S-(2S-benzofuran-3-ilmetil-pirrolidina-1-carbonil)-2-metil-propil]-carb�mico (26): Una solución de N-Boc L-valina (121 mg, 0,56 mmol) en NMP (3 mL) se trat� con HATU (182 mg, 0,48 mmol) seguido de N-metilmorfolina (0,1 mL, 0,9 mmol) a temperatura ambiente. Después de 10 min, se agregó por goteo amina 25 (80 mg, 0,4 mmol) en NMP (5 mL). Después de 16 h, la reacción se diluyó con EtOAc, se lav� con NaHCO3 saturado, HCl 1M, salmuera, se secó sobre Na2SO4, se filtr� y se concentr�. El aceite residual se purificó mediante HPLC (20% EtOAc/hexano) para proporcionar 111 mg (69%) de 26 como un aceite incoloro. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 7,87 (d, J=6,9 Hz, 1H), 7,48-7,32 (m, 2H), 7,30-7,24 (m, 4H), 5,35 (d, J=9,3 Hz, 1H), 4,53-4,47 (m, 1H), 4,31 (dd, J=6,6. 9,6 Hz, 1H), 3,72-3,56 (m, 2H), 3,31 (dd, J=3,0, 13,2 Hz, 1H), 2,49 (dd, J=10,5, 13,5 Hz, 1H), 2,05-1,74 (m, 6H), 1,44 (s, 9H), 1,03 (d, J=6,9 Hz, 3H), 097 (d, J=6,6 Hz, 3H) ppm.
E. 2S-Amino-1-(2S-benzofuran-3-ilmetil-pirrolidin-1-il)-3-metil-butan-1-ona (27): Una solución de carbamato 26 (111 mg, 0,28 mmol) en DCM (10 mL) se trat� con TFA (1 mL) a temperatura ambiente. Después de 2 h, la mezcla de reacción se concentr�, se diluyó con EtOAc, se lav� con NaHCO3 acuoso saturado y salmuera, se secó sobre Na2SO4, se filtr� y se concentr� para proporcionar 67 mg (80%) de 27 como un aceite amarillo claro. El producto se us� sin purificación adicional. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 7,89 (d, J=8,1 Hz, 1H), 7,47-7,44 (m, 2H), 7,32-7,27 (m, 3H), 4,54-4,49 (m, 1H), 3,59-3,53 (m, 2H), 3,33 (d, J=13,5 Hz, 1H), 2,50 (dd, J=10,8, 13,5 Hz, 1H), 2,03-1,72 (m, 6H), 1,04 (d, J=7,2 Hz, 3H), 0,99 (d, J=7,0 Hz, 3H) ppm.
F. Terc-butil éster del ácido {1S-[1S-(2S-Benzofurano-3-ilmetil-pirrolidina-1-carbonil)-2-metil-propilcarbamoil]-etil}carb�mico (28): Una solución de N-Boc L-alanina (46 mg, 0,24 mmol) en NMP (3 mL) se trat� con HATU (72 mg, 0,19 mmol) seguido de N-metilmorfolina (0,1 mL, 0,9 mmol) a temperatura ambiente. Después de 10 min, se agregó por goteo amina 27 (41 mg, 0,14 mmol) en NMP (5 mL). Después de 16 h, la reacción se diluyó con EtOAc, se lav� con NaHCO3 saturado, HCl 1M, y salmuera, se secó sobre Na2SO4, se filtr� y se concentr�. El aceite residual se purificó mediante cromatograf�a ultrarrápida en gel de sílice (1:1 hexano/EtOAc) para proporcionar 62 mg (93%) de 28 como un aceite incoloro. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 7,85 (d, J=6,6 Hz, 1H), 7,48-7,44 (m, 2H), 7,33-7,25 (m, 3H), 6,93 (d, J=8,7 Hz, 1H), 5,08 (d, J=7,8 Hz, 1H), 4,62 (dd, J=6,3, 8,7 Hz, 1H), 4,50-4,43 (m, 1H), 4,23-4,16 (m, 1H), 3,74-3,55 (m, 3H), 3,32 (dd, J=2,4, 14,1 Hz, 1H), 2,49 (dd, J=10,8, 13,5 Hz, 1H), 2,14-1,71 (m, 6H), 1,46 (s, 9H), 1,37 (d, J=6,9 Hz, 3H), 1,02 (d, J=6,9 Hz, 3H), 0,97 (d, J=7,2 Hz, 3H) ppm.
G. 2S-Amino-N-[1S-(2S-benzofuran-3-ilmetil-pirrolidina-1-carbonil)-2-metil-propil]-propionamida (29): Una solución de carbamato 28 (62 mg, 0,13 mmol) en DCM (10 mL) se trat� con TFA (1 mL) a temperatura ambiente. Después de 1,5 h, la reacción se concentr�, se diluyó con EtOAc, se lav� con NaHCO3 saturado y salmuera, se secó sobre Na2SO4, se filtr� y se concentr�. El residuo se purificó mediante cromatograf�a ultrarrápida en gel de sílice (5% MeOH/DCM) para proporcionar 38 mg (72%) de 29 como un aceite incoloro. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 7,92 (d, J=9,3 Hz, 1H), 7,87-7,84 (m, 1H), 7,48-7,44 (m, 2H), 7,32-7,23 (m, 2H), 4,59 (dd, J=6,9, 9,3 Hz, 1H), 4,52-4,45 (m, 1H), 3,84-3,76 (m, 1H), 3,67-3,60 (m, 1H), 3,57-3,50 (m, 1H), 3,34 (dd, J=3,0, 13,0 Hz, 1H), 2,50 (dd, J=10,5, 13,8 Hz, 1H), 2,16-1,91 (m, 3H), 1,82-1,69 (m, 2H), 1,65 (bs, 2H), 1,38 (d, J=7,2 Hz, 3H), 1,03 (d, J=6,9 Hz, 3H), 0,99 (d, J=6,9 Hz, 3H) ppm. La amina libre (29) se diluyó con Et2O y se trat� con HCl (g) para formar un sólido blanco. La solución se concentr� y el sólido se tritur� con Et2O y hexanos para proporcionar 29.HCl.
Tabla 5
Entrada
A1 R1b Y Z R11 R14-17 MS (M+H)+ Intervalo KD
5-39
H Me iPr (S)-OPh H 464,2 A
5-40
H Me tBu (S)-OPh H 478,3 A
5-41
H Me iPr H H 372,2 A
5-42
H Me cHex (S)- OPh H 504,2 A
5-43
Me Me cHex (S)- OPh H 518,2 A
5-44
H Et iPr (S)- OPh H 478,2 A
5-45
Me Me iPr (S)- OPh H 478,2 A
5-46
H H iPr H H 358,3 D
5-47
H Me cHex H H 412,3 A
5-48
Me Me cHex H H 426,2 A
5-49
H Me iPr H 5- Me (R15) 386,3 A
5-50
Me Me iPr H 5- Me (R15) 400,3 A
5-51
Me Me iPr H 5- F (R15) 404,2 A
5-52
H H iPr (S)- OPh H 450,2 C
5-53
H (R)- Me iPr (S)- OPh H 464,2 C
5-54
H Me Et (S)- OPh H 450,2 A
5-55
H Et Et (S)- OPh H 464,2 B
5-56
H Et cHex (S)- OPh H 518,2 B
5-57
Me Me iPr H H 386,3 A
5-58
H Et iPr H H 386,2 B
5-59
H Me Et H H 358,3 B
5-60
H Me —CH(Me)OCH2C=CH H H 412,2 A
5-61
H Me iPr H 5- Cl (R15) 406,2 A
5-62
Me Me iPr H 5- Cl (R15) 420,2 A
5-63
H Me iPr H 5- BnO (R15) 478,2 B
5-64
H gemdi-Me iPr H H 386,3 D
5-65
Ac Me iPr H H 414,4 D
5-66
H2NCO Me iPr H H 416,2 D
5-67
HCO Me iPr H H 400,3 D
5-68
Et Me iPr H H 400,3 C
5-69
iPr Me iPr H H 413,3 C
5-70
cPrCH2 Me iPr H H 426,2 C
5-71
HC=CCH2 Me iPr H H 409,2 D
5-72
(CH2)2 iPr H H 384,3 B
5-73
CH2 iPr H H 370,2 D
5-74
(CH2)3 iPr H H 398,4 D
Ejemplo 7
Este ejemplo ilustra derivados de pirrolidina de la Tabla 6. Esquema IV (b)
Preparaci�n de 2-Amino-N-{1-[2-(5-hidroxi-benzofuran-3-ilmetil)-pirrolidina-1-carbonil]-2-metil-propil}-propionamida (32):
A. Terc-butil éster del ácido (1-{1-[2-(5-hidroxi-benzofuran-3-ilmetil)-pirrolidina-1-carbonil]-2-metil-propilcarbamoil}etil)-carb�mico (31): Una mezcla de 30 (0,52 g, 0,90 mmol) y Pd 10%-sobre-carbono (0,05 g) en EtOAc (25 mL) se 20 colocó en un aparato Parr y se presuriz� a 45 PSI en atmósfera H2. La mezcla de reacción se agit� durante 24 h. El análisis mediante TLC mostr� que solamente material de partida sin consumir por lo que el catalizador se elimin� por filtración y el filtrado clarificado se concentr� a sequedad. El residuo se volvió a disolver en EtOAc (25 mL) y se agregó Pd 10%-sobre-carbono (0,208 g). La mezcla de reacción se agit� bajo una atmósfera de H2 (45 PSI) durante 4 h y en ese momento se agregó una segunda porción de catalizador de paladio (0,05 g). Se continu� la
25 hidrogenación hasta que todo el material de partida se había consumido (~2 h). El catalizador se elimin� por filtración y el filtrado se concentr� bajo presión reducida. El producto en bruto se purificó mediante cromatograf�a ultrarrápida en gel de sílice (EtOAc/hexano, 1:1) para proporcionar 0,37 g (84%) de 31 como un sólido blanco. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 7,37 (s, 1H); 7,33-7,31 (m, 1H); 7,28-7,26 (m, 1H), 6,88-6,85 (m, 2H); 5,18 (br, 1H); 4,56 (t, 1H); 4,45-4,24 (m, 3H); 3,82-3,74 (m, 1H); 3,66-3,58 (m, 1H); 3,22 (d, 1H); 2,44-2,36 (m, 1H); 2,12-2,09 (m, 1H); 2,03-1,89 (m, 2H); 1,73-1,67 (m, 2H); 1,45 (s, 9H); 1,37 (d, 3H); 1,02-0,97 (m, 6H) ppm.
B. 2-Amino-N-{1-[2-(5-hidroxi-benzofuran-3-ilmetil)-pirrolidina-1-carbonil]-2-metil-propil}-propionamida (32): A una solución de 31 (0,04 g, 0,082 mmol) en DCM (5 mL) se agregó TFA (1 mL) a temperatura ambiente. Después de 1 h, 5 el solvente se elimin� bajo presión reducida. El residuo se disolvió en EtOAc y se lav� con NaHCO3 acuoso, salmuera, se secó sobre Na2SO4 anhidro, se filtr� y se concentr�. El producto en bruto se purificó mediante cromatograf�a ultrarrápida en gel de sílice (MeOH 10%/DCM) para proporcionar 0,011 g (37%) de 32 como un sólido blanco. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 58,54 (d, 1H); 7,37 (s, 11H); 7,31 (d, 1H); 7,09 (d, 1H); 6,83 (dd, 1H); 4,64 (t, 1H); 4,56-4,51 (m, 1H); 4,09-3,93 (m, 2H); 3,73-3,65 (m, 1H); 3,36 (dd, 1H); 2,35 (t, 1H); 2,19-1,94 (m, 3H); 1,77-1,69 (m,
10 2H); 1,33 (d, 2H); 1,25-1,19 (m, 1H); 1,04-1,00 (m, 5H); 0,94 (t, 1H) ppm.
Tabla 6
Entrada
A1 R1b Y Z R11, 12, R14-17 MS (M+H)+ Intervalo KD
6-75
H Me iPr H 5- OH(R15) 388,3 C
25
Ejemplo 8 Este ejemplo ilustra derivados de pirrolidina de la Tabla 7. Esquema IV(c)
30
Preparaci�n de 2-Amino-N-{1-[2-(5-metoxi-benzofuran-3-ilmetil)-pirrolidina-1-carbonil]-2-metil-propil}-propionamida (34):
A. Terc-butil éster del ácido (1-{1-[2-(5-Metoxi-benzofuran-3-ilmetil)-pirrolidina-1-carbonil]-2-metil-propilcarbamoil}etil)-carb�mico (33): A una solución de 32 (0,06 g, 0,12 mmol) en DCM anhidro (3 mL) se agregó MeOH (10 !L),15 Ph3P (0,036 g, 0,13 mmol), y ADDP (0,037 g, 0,14 mmol). La mezcla de reacción se mantuvo a temperatura ambiente durante 16 h y en ese momento el análisis mediante TLC mostr� que la reacción estaba incompleta. Una segunda porción de MeOH (100 !L), Ph3P (0,036 g, 0,13 mmol), y ADDP (0,037 g, 0,14 mmol) se agregó y la mezcla de reacción se mantuvo durante 5 h adicionales a temperatura ambiente. La mezcla de reacción se diluyó con DCM y se lav� dos veces con NaOH 1N, seguido de salmuera, se secó sobre Na2SO4 anhidro, se filtr� y se concentr�. El
20 producto en bruto se purificó mediante cromatograf�a ultrarrápida en gel de sílice (EtOAc/hexano, 2:1) para proporcionar 0,057 g (91%) de 33 como un sólido blanco. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 57,41 (s, 1H); 7,38-7,33 (m, 1H); 7,30-7,28 (m, 1H); 6,90 (dd, 1H); 6,77 (d, 1H); 4,98 (br, 1H); 4,64-4,59 (m, 1H); 4,48-4,43 (m, 1H); 4,21-4,14 (m, 1H); 3,88 (s, 3H); 3,72-3,53 (m, 2H); 3,30-3,25 (m, 1H); 2,51-2,43 (m, 1H); 2,13-1,72 (m, 5H); 1,45 (s, 9H); 1,37 (d, 3H); 1,03-0,95 (m, 6H) ppm.
25 B. 2-Amino-N-{1-[2-(5-metoxi-benzofuran-3-ilmetil)-pirrolidina-1-carbonil]-2-metil-propil}-propionamida (34): A una solución de 33 (0,057 g, 0,11 mmol) en DCM (5 mL) se agregó TFA (1 mL) a temperatura ambiente. Después de 1 h, el solvente se elimin� bajo presión reducida. El residuo se disolvió en EtOAc y se lav� con NaHCO3 acuoso, salmuera, se secó sobre Na2SO4 anhidro, se filtr� y se concentr�. El producto en bruto se purificó mediante cromatograf�a ultrarrápida en gel de sílice (MeOH 10%/DCM) para proporcionar 0,015 g (35%) de 34 como un sólido
30 blanco. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 7,42 (m, 1H); 7,35 (d, 1H); 7,28 (m, 1H); 6,90 (dd, 1H); 4,60 (m, 1H); 4,48-4,45 (m, 1H); 3,89-3,76 (m, 4H); 3,65-3,56 (m, 2H); 3,31 (dd, 1H); 2,52-2,44 (m, 1H); 2,13-1,72 (m, 6H); 1,43-1,27 (m, 5H); 1,05-0,97 (m, 6H) ppm.
Tabla 7
Entrada
A1 R1b Y Z R11,12, R14-17 MS (M+H)+ KD Intervalo
7-76
H Me iPr H 5- MeO(R15) 402,2 C
7-77
H Me iPr H 5- cPrCH2O(R15) 442,2 D
Ejemplo 9
Este ejemplo ilustra derivados de pirrolidina de la Tabla 8. Esquema IV (d)
20 Preparación de 2-Amino-N-{2-metil-1-[2-(5-piridin-2-il-benzofuran-3-ilmetil)-pirrolidina-1-carbonil]-propil}propionamida (37)
A. 3-{1-[2-(2-Terc-butoxicarbonilamino-propionilamino)-3-metil-butiril]-pirrolidin-2-ilmetil}-benzofuran-5-il éster del ácido trifluoro-metanosulf�nico (35): A una solución de 32 (0,16 g, 0,32 mmol) y DIPEA (60 !L, 0,32 mmol) en DCM anhidro (4 mL) se agregó N-fenil-bis(trifluorometanosulfonimida) (0,14 g, 0,38 mmol) a 0� C. Después de 10 min, la 25 mezcla de reacción se dej� calentar a temperatura ambiente y posteriormente se mantuvo durante 16 h. La mezcla de reacción se concentr� y el residuo se disolvió en EtOAc, se lav� con agua, salmuera, se secó sobre Na2SO4 anhidro, se filtr� y se concentr�. El producto en bruto se purificó mediante cromatograf�a ultrarrápida en gel de sílice (EtOAc/hexano, 1:1) para proporcionar 126 mg (63%) de 35 como un sólido blanco. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 7,73 (d, 1H); 7,55-7,48 (m, 2H); 7,20 (dd, 1H); 6,78-6,75 (m, 1H); 4,99 (br, 1H); 4,63-4,58 (m, 1H); 4,41-4,35 (m, 1H);
30 4,19 (m, 1H); 3,75-3,68 (m, 1H); 3,64-3,57 (m, 1H); 3,29 (dd, 1H); 2,54-2,46 (m, 1H); 1,99-1,84 (m, 3H); 1,71-1,66 (m, 2H); 1,45 (s, 9H); 1,37 (d, 3H); 1,02-0,94 (m, 6H) ppm.
B. Terc-butil éster del ácido (1-{2-Metil-1-[2-(5-piridin-3-il-benzofuran-3-ilmetil)-pirrolidina-1-carbonil]-propilcarbamoil}etil)-carb�mico (36): Una mezcla de 35 (0,063 g, 0,10 mmol), K2CO3 (70 mg, 0,50 mmol), ácido 3-piridinabor�nico (0,015 g, 0,12 mmol), y (Ph3P)4Pd (5 mg, 3 mol %) en tolueno anhidro (5 mL) se calentó a 100� C en un tubo sellado
35 durante 1 h. La mezcla de reacción se enfri� a temperatura ambiente, se diluyó con EtOAc, se lav� con NaHCO3 acuoso saturado, salmuera, se secó sobre Na2SO4 anhidro, se filtr� y se concentr�. El producto en bruto se purificó mediante cromatograf�a ultrarrápida en gel de sílice (EtOAc) para proporcionar 40 mg (72%) de 36 como un aceite. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 8,94 (d, 1H); 8,59 (d, 1H); 8,01-7,95 (m, 1H); 7,74-7,64 (m, 1H); 7,58-7,37 (m, 4H); 6,94 (d, 1H); 4,61 (t, 1H); 4,50-4,47 (m, 1H); 4,30 (t, 1H0; 4,21 (br, 1H); 3,79-3,71 (m, 1H); 3,66-3,59 (m, 1H); 2,42-3,36 (m, 1H); 2,58-2,50 (m, 1H); 2,13-2,09 (m, 1H); 2,01-1,71 (m, 4H); 1,45 (m, 9H); 1,37 (d, 3H); 1,03-0,94 (m,
5 6H) ppm.
C. 2-Amino-N-{2-metil-1-[2-(5-piridin-2-il-benzofuran-3-ilmetil)-pirrolidina-1-carbonil]-propil}-propionamida (37): A una solución de 36 (0,04 g, 0,07 mmol) en DCM (5 mL) se agregó TFA (1 mL) a temperatura ambiente. Después de 1 h, el solvente se elimin� bajo presión reducida. El residuo se disolvió en EtOAc y se lav� con NaHCO3 acuoso, salmuera, se secó sobre Na2SO4 anhidro, se filtr� y se concentr�. El producto en bruto se purificó mediante
10 cromatograf�a ultrarrápida en gel de sílice (MeOH 10%/DCM) para proporcionar 0,024 g (76%) de 37 como un sólido blanco. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 8,0 (s, 1H); 7,95 (d, 1H); 7,71-7,64 (m, 2H); 7,56-7,46 (m, 4H); 4,61-4,48 (m, 2H); 4,29 (t, 1H); 3,83-3,77 (m, 1H); 3,67-3,54 (m, 2H); 3,41 (dd, 1H); 2,58-2,49 (m, 1H); 2,13-1,70 (m, 5H); 1,40-1,25 (m, 5H); 1,04-0,84 (m 6H) ppm.
Entrada
A1 R1b Y Z R11,12, R14-17 MS (M+H)+ Intervalo KD
8-78
H Me iPr H 5-(4- Pir) 449,2 B
8-79
H Me iPr H 5-(3- Pir) (R15) 449,2 C
25
Ejemplo 10 Este ejemplo ilustra derivados de pirrolidina de la Tabla 9. Esquema V
30
Preparaci�n de 2S-Amino-N-{2-metil-1S-[2S-(2-piridin-4-il-benzofuran-3-ilmetil)-pirrolidina-1-carbonil]-propil}15 propionamida (44):
A. Terc-butil éster del ácido 2S-(2-Bromo-benzofuran-3-ilmetil)-pirrolidina-1-carbox�lico (38): Una solución de 22 (1,4 g, 4,7 mmol) en CHCl3 (20 mL) se enfri� a 0� C. y se trat� con KOAc (2,5 g, 26 mmol). Una solución de bromo (0,3 mL, 5,8 mmol) en CHCl3 (10 mL) se agregó por goteo durante 30 min. Después de la adición, la solución se mantuvo de color amarillo anaranjado. Después de que la TLC había indicado que el material de partida se había consumido,
20 la mezcla de reacción se diluyó con H2O, se lav� con Na2S2O8 saturado, se secó sobre Na2SO4, se filtr�, y se concentr�. La purificación del residuo mediante cromatograf�a ultrarrápida en gel de sílice (3:1 hexano/EtOAc) proporcion� 1,1 g (61%) de 38 como un aceite amarillo. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 7,57-7,52 (m, 1H), 7,43-7,41 (m, 1H), 7,26-7,20 (m, 2H), 4,20 (m, 1H), 3,43-3,30 (m, 2H), 3,17-3,01 (m, 1H), 2,73-2,58 (m, 1H), 1,89-1,69 (m, 4H), 1,48 (s, 9H) ppm.
25 B. 2S-(2-Bromo-benzofuran-3-ilmetil)-pirrolidina (39): Una solución de 38 (1,1 g, 2,9 mmol) en DCM (20 mL) se trat� con TFA (2 mL) a temperatura ambiente. Después de 1,5 h, la mezcla de reacción se concentr�, se diluyó con EtOAc, se lav� con NaHCO3 saturado, salmuera, se secó sobre Na2SO4, se filtr� y se concentr� para proporcionar 0,8 g de 39 como un aceite anaranjado que se utilizó sin purificación adicional. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 8,84 (br s, 1H), 7,42-7,39 (m, 2H), 7,28-7,21 (m, 2H), 3,70-3,66 (m, 1H), 3,48-3,39 (m, 1H), 3,31-3,21 (m, 2H) 2,95 (dd, J=9,9
30 Hz, 13,5 Hz, 1H), 2,06-1,99 (m, 1H), 1,91-1,79 (m, 2H), 1,74-1,66 (m, 1H) ppm.
C. Terc-butil éster del ácido {1S-[2S-(2-Bromo-benzofuran-3-ilmetil)-pirrolidina-1-carbonil]-2-metil-propil}-carb�mico (40): Una solución de N-Boc L-valina (656 mg, 3,0 mmol) en NMP (6 mL) se trat� con HATU (1,2 g, 3,1 mmol) seguido de N-metilmorfolina (0,4 mL, 3,6 mmol) a temperatura ambiente. Después de 10 min, se agregó por goteo 39 en bruto (0,8 g, 2,9 mmol) en NMP (6 mL). Después de 16 h, la mezcla de reacción se diluyó con EtOAc, se lav� 35 con NaHCO3 saturado, salmuera, se secó sobre Na2SO4, se filtr� y se concentr�. El residuo se purificó mediante cromatograf�a ultrarrápida en gel de sílice (3:1 hexano/EtOAc) para proporcionar 853 mg (61%) de 40 como una espuma amarilla. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 7,89-7,86 (m, 1H), 7,42-7,38 (m, 1H), 7,29-7,25 (m, 3H), 5,35 (d, J=9,3 Hz, 1H), 4,55-4,51 (m, 1H), 4,29 (dd, J=6,0, 9,6 Hz, 1H), 3,71-3,66 (m, 1H), 3,27 (dd, J=3,3, 13,5 Hz, 1H), 2,45 (dd, J=10,8, 13,5 Hz, 1H), 2,15-1,92 (m, 3H), 1,79-1,74 (m, 2H), 1,42 (s, 9H), 1,03 (d, J=6,9 Hz, 3H), 0,96 (d, J=7,2
40 Hz, 3H) ppm.
D. 2S-Amino-1-[2S-(2-bromo-benzofuran-3-ilmetil)-pirrolidin-1-il]-3-metil-butan-1-ona (41): Una solución de carbamato 40 (853 mg, 1,8 mmol) en DCM (20 mL) se trat� con TFA (2 mL) a temperatura ambiente. Después de 1,5 h, la mezcla de reacción se concentr�, se diluyó con EtOAc, se lav� con NaHCO3 saturado, salmuera, se secó sobre Na2SO4, se filtr� y se concentr� para proporcionar 0,66 g de 41 como una espuma amarilla que se utilizó sin
purificaci�n adicional. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 7,92-7,89 (m, 1H), 7,44-7,39 (m, 1H), 7,30-7,25 (m, 3H), 4,55 (m, 1H), 3,66-3,51 (m, 2H), 3,29 (dd, J=2,4, 13,5 Hz, 1H), 2,45 (dd, J=11,1, 12,9 Hz, 1H), 2,15-1,97 (m, 2H), 1,78-1,71 (m, 2H), 1,06 (d, J=6,3 Hz, 3H), 1,01 (d, J=6,6 Hz, 3H) ppm.
E. Terc-butil éster del ácido (1S-{1S-[2S-(2-bromo-benzofuran-3-ilmetil)-pirrolidina-1-carbonil]-2-metilpropilcarbamoil}-etil)-carb�mico (42): Una solución de N-Boc-L-alanina (394 mg, 2,1 mmol) en NMP (6 mL) se trat� con HATU (763 mg, 2,0 mmol) seguido de N-metilmorfolina (0,3 mL, 2,7 mmol) a temperatura ambiente. Después de 10 min, se agregó por goteo 41 en bruto (0,66 mg, 1,7 mmol) en NMP (6 mL). Después de 16 h, la mezcla de reacción se diluyó con EtOAc, se lav� con NaHCO3 saturado, HCl 1M, salmuera, se secó sobre Na2SO4, se filtr� y se concentr�. El aceite residual se purificó mediante cromatograf�a ultrarrápida en gel de sílice (2:1 hexano/EtOAc-to
1:1
hexano/EtOAc) para proporcionar 0,9 g (96%) de 42 como una espuma blancuzca. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 7,86-7,84 (m, 1H), 7,43-7,40 (m, 1H), 7,29-7,25 (m, 2H), 7,01 (d, J=8,7 Hz, 1H), 5,10 (d, J=6,6 Hz, 1H), 4,62 (dd, J=6,3, 8,7 Hz, 1H), 4,53-4,48 (m, 1H), 4,23-4,19 (m, 1H), 3,75-3,66 (m, 2H), 3,27 (dd, J=3,3, 13,5 Hz, 1H), 2,45 (dd, J=10,5, 13,5 Hz, 1H), 2,16-2,08 (m, 2H), 2,02-1,97 (m, 2H), 1,79-1,73 (m, 2H), 1,45 (s, 9H), 1,36 (d, J=6,9 Hz, 3H), 1,02 (d, J=6,3 Hz, 3H), 0,97 (d, J=7,2 Hz, 3H) ppm.
F.
Terc-butil éster del ácido (1S-{2-Metil-1S-[2S-(2-piridin-4-il-benzofuran-3-ilmetil)-pirrolidina-1-carbonil]propilcarbamoil}-etil)-carb�mico (43): Una solución de 42 (36 mg, 0,07 mmol) en tolueno (4 mL) se trat� con K2CO3 (38 mg, 0,28 mmol) y Pd(PPh3)4 (2 mg) seguido de ácido 4-piridinabor�nico (12 mg, 0,1 mmol) en EtOH (2 mL). La reacción se calentó a reflujo durante la noche. La solución se enfri� a temperatura ambiente, se diluyó con H2O, se extrajo con EtOAc, salmuera, se secó sobre Na2SO4, se filtr� y se concentr� para proporcionar 44 mg de 43 como un aceite amarillo claro que se utilizó sin purificación adicional. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 8,74 (d, J=5,1 Hz, 1H), 7,99 (d, J=5,7 Hz, 1H), 7,86-7,81 (m, 1H), 7,71-7,64 (m, 1H), 7,56-7,46 (m, 3H), 7,41-7,27 (m, 2H), 6,87 (d, J=8,7 Hz, 1H), 5,01 (m, 1H), 4,62 (app t, J=8,7 Hz, 1H), 4,56-4,46 (m, 1H), 4,20 (m, 1H), 3,72-3,67 (m, 2H), 2,84 (dd, J=11,7, 13,5 Hz, 1H), 2,16-1,93 (m, 2H), 1,78-1,62 (m, 2H), 1,46 (s, 9H), 1,37 (d, J=7,2 Hz, 3H), 1,04 (d, J=6,6 Hz, 3H), 0,98 (d, J=6,3 Hz, 3H) ppm.
G.
2S-Amino-N-{2-metil-1S-[2-(2S-piridin-4-il-benzofuran-3-ilmetil)-pirrolidina-1-carbonil]-propil}-propionamida (44): Una solución de 43 (44 mg, 0,08 mmol) en DCM (10 mL) se trat� con TFA (1 mL) a temperatura ambiente. Después de 1,5 h, la mezcla de reacción se concentr�, se diluyó con EtOAc, se lav� con NaHCO3 saturado, salmuera, se secó sobre Na2SO4, se filtr� y se concentr�. El residuo se purificó mediante HPLC de fase inversa (C18; ACN 10-100%/H2O con tampón AcOH 0,1%). Las fracciones que contenían puro producto se liofilizaron para proporcionar 21 mg de 44 como un sólido blanco. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 8,75 (bs, 1H), 8,00 (m, 1H), 7,90-7,82 (m, 1H), 7,717,64 (m, 1H), 7,55-7,47 (m, 3H), 7,38-7,27 (m, 2H), 4,61-4,52 (m, 1H), 3,83-3,62 (m, 2H), 3,07-3,00 (m, 1H), 2,84 (dd, J=11,1, 13,5 Hz, 1H), 2,16-1,94 (m, 2H), 1,74-1,61 (m, 2H), 1,41 (d, J=6,9 Hz, 3H), 1,05 (d, J=6,6 Hz, 3H), 0,99 (d, J=6,9 Hz, 3H) ppm.
Tabla 9
Entrada
A1 R1b Y Z X2 R11 MS (M+H)+ Intervalo KD
9-80
H Me iPr H O Br 450,4 B
9-81
H Me iPr H O 4-Pir 449,2 A
Entrada
A1 R1b Y Z X2 R11 MS (M+H)+ Intervalo KD
9-81
H Me iPr H O 3-Pir 449,2 B
9-83
H Me iPr H O 5-[(2-MeO)Pir] 479,2 B
9-84
H Me iPr H O 2-Pir 449,3 A
9-85
H Me iPr H O 2-tiazoil 455,2 B
9-86
H Me iPr H O 2-pirazina 450,1 A
9-87
H Me iPr H O Ph 448,3 B
9-88
H Me iPr H N Ph, (R12 es H) 447,2 C
Ejemplo 11
Este ejemplo ilustra derivados de pirrolidina de la Tabla 10. Esquema V(a)
Preparaci�n de etil éster del ácido 3-(3-{1-[2-(2-amino-propionilamino)-3-metil-butiril]-pirrolidin-2-ilmetil}-benzofuran2-il)-propi�nico (52):
A. Bencil éster del ácido 2-(2-bromo-benzofuran-3-ilmetil)-pirrolidina-1-carbox�lico (46): A una solución fría (0� C.) de 45 (4,1 g, 12,2 mmol) en CHCl3 (70 mL) se agregó KOAc (3,6 g, 36,7 mmol) seguido de la adición por goteo de
25 Br2 (2,3 g, 14,6 mmol) en CHCl3 (30 mL) durante ~20 min. Después de 30 min, la mezcla de reacción se diluyó con salmuera y se satur� con Na2S2O8. El producto se extrajo con DCM y los extractos DCM combinados se lavaron con
salmuera, se secaron sobre Na2SO4 anhidro, se filtraron y se concentraron para proporcionar 5 g (cuant.) de 46 como un aceite anaranjado que se utilizó sin purificación adicional. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 7,75-7,72 & 6,98 (rot�meros, m y app t, J=7,5 Hz, 1H), 7,44-7,10 (m, 8H), 5,24-5,17 (m, 2H), 4,28 & 4,17 (rot�mero, 2 m, 1H), 3,543,38 (m, 2H), 3,21 & 3,00 (rot�mero, 2 dd, J=2,4, 13,5 Hz, 1H), 2,72-2,55 (m, 1H), 1,97-1,75 (m, 4H) ppm.
B. Bencil éster del ácido 2-[2-(2-etoxicarbonil-vinil)-benzofuran-3-ilmetil]-pirrolidina-1-carbox�lico (47): Una solución que contenía 46 en bruto (5,0 g, 12,1 mmol), acrilato de etilo (2,7 g, 27,7 mmol), tetrabutilcloruro de amonio (3,5 g, 12,6 mmol), NaHCO3(2,0 g, 23,8 mmol), y Pd(OAc)2 (0,107 g, 0,46 mmol) en DMF (40 mL) se calentó a 100� C durante 16 h. Después de enfriar a temperatura ambiente, la mezcla de reacción se diluyó con éter diet�lico y se lav� con agua, salmuera, se secó sobre Na2SO4 anhidro, se filtr� y se concentr�. El producto en bruto se purificó mediante cromatograf�a ultrarrápida en gel de sílice (EtOAc/hexano, 1:3) para proporcionar 3,7 g (70%) de 47 como un aceite color anaranjado. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 57,81 & 6,99 (rot�mero, app d, J=7,5 Hz, app t, J=7,5 Hz, 1H), 7,61 (dd, J=15,9, 18,3 Hz, 1H), 7,47-7,20 (m, 8H), 6,58 (dd, J=5,7, 15,6 Hz, 1H), 5,27-5,16 (m, 2H), 4,24 (q, J=7,2 Hz, 2H), 4,17-4,08 (m, 1H), 3,51-3,35 (m, 2H), 3,38 & 3,17 (rot�mero, 2 dd, J=3,6, 14,1 Hz, 1H), 2,89-2,69 (m, 1H), 1,94-1,64 (m, 4H), 1,36 (t, J=7,2 Hz, 2H) ppm.
C. Etil éster del ácido 3-(3-pirrolidin-2-ilmetil-benzofuran-2-il)-propi�nico (48): Una mezcla que contenía 47 (1,0 g, 2,3 mmol) y Pd 10%-sobre-carbono (˜1 g) en MeOH anhidro (20 mL) se colocó bajo una atmósfera de hidrógeno (45 PSI) y se agit� utilizando un aparato Parr durante 1 h. El catalizador se elimin� por filtración y los sólidos se lavaron con EtOAc y MeOH. El filtrado clarificado se concentr� para proporcionar 634 mg (91%) de 48 como un aceite anaranjado que se utilizó sin purificación adicional. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 57,51-7,49 (m, 1H), 7,38-7,35 (m, 1H), 7,21-7,17 (m, 2H), 4,16-4,09 (m, 2H), 3,68-3,59 (m, 2H), 3,12-3,07 (m, 2H), 2,88-2,73 (m, 4H), 1,84-1,69 (m, 4H), 1,43-1,39 (m, 1H), 1,26-1,20 (m, 3H) ppm.
D. Etil éster del ácido 3-{3-[1-(2-terc-butoxicarbonilamino-3-metil-butiril)-pirrolidin-2-ilmetil]-benzofuran-2-il}propi�nico (49): Una solución que contenía Boc-L-valina (352 mg, 1,6 mmol) en NMP (3 mL) se trat� con HATU (543 mg, 1,4 mmol) seguido de NMM (0,2 mL, 1,8 mmol) a temperatura ambiente. Después de 10 min, amina 48 (0,4 g, 1,3 mmol) en NMP (5 mL) se agregó por goteo. Después de 16 h, la mezcla de reacción se diluyó con éter diet�lico y se lav� sucesivamente con NaHCO3, HCl 1M, agua, y salmuera. El extracto orgánico se secó sobre Na2SO4 anhidro, se filtr� y se concentr� para proporcionar 630 mg (96%) de 49 que se utilizó sin purificación adicional. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 57,82-7,79 (m, 1H), 7,38-7,35 (m, 1H), 7,28-7,21 (m, 2H), 5,37 (d, J=9,3 Hz, 1H), 4,50-4,44 (m, 1H), 4,31 (dd, J=6,0, 9,0 Hz, 1H), 4,14 (q, J=6,9 Hz, 2H), 3,72-3,60 (m, 3H), 3,38 (t, J=7,2 Hz, 1H), 3,29 (dd, J=3,0, 13,5 Hz, 1H), 3,12 (app t, J=7,5 Hz, 2H), 2,80-2,74 (m, 4H), 2,46-2,35 (m, 2H), 2,11-1,92 (m, 2H), 1,81-1,73 (m, 1H), 1,69-1,65 (m, 1H), 1,44 (s, 9H), 1,25 (t, J=6,0 Hz, 3H), 1,03 (d, J=6,3 Hz, 3H), 0,96 (d, J=6,6 Hz, 3H) ppm. Espectro de masa: m/z 501 [M+H]+; y 523 [M+Na]+.
E. Etil éster del ácido 3-{3-[1-(2-amino-3-metil-butiril)-pirrolidin-2-ilmetil]-benzofuran-2-il}-propi�nico (50): A una solución de 49 (302 mg, 0,6 mmol) en DCM (10 mL) se agregó TFA (2 mL) a temperatura ambiente. Después de 2 h, el solvente se elimin� bajo presión reducida. El residuo se disolvió en EtOAc y se lav� con NaHCO3 acuoso, salmuera, se secó sobre Na2SO4 anhidro, se filtr� y se concentr� para proporcionar 235 mg (97%) de 50 como un aceite anaranjado que se utilizó sin purificación adicional,1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 7,86-7,83 (m, 1H), 7,43-7,34 (m, 1H), 7,27-7,19 (m, 3H), 4,49 (m, 1H), 4,14 (q, J=6,9 Hz, 2H), 3,60-3,53 (m, 2H), 3,32 (d, J=12,9 Hz, 1H), 3,12 (app t, J=7,2 Hz, 2H), 2,81-2,74 (m, 2H), 2,42 (app t, J=12,3 Hz, 1H), 2,10-1,91 (m, 2H), 1,74-1,66 (m, 2H), 1,24 (t, J=7,2 Hz, 3H), 1,06-0,99 (m, 6H) ppm. Espectro de masa: m/z 401 [M+H]+.
F. Etil éster del ácido 3-(3-{1-[2-(2-terc-butoxicarbonilamino-propionilamino)-3-metil-butiril]-pirrolidin-2-ilmetil}benzofuran-2-il)-propi�nico (51): Una solución que contenía Boc-L-alanina (69 mg, 0,37 mmol) en NMP (3 mL) se trat� con HATU (131 mg, 0,34 mmol) seguido de NMM (0,1 mL, 0,9 mmol) a temperatura ambiente. Después de 10 min, se agregó por goteo amina 50 (111 mg, 0,28 mmol) en NMP (5 mL). Después de 5 h, la mezcla de reacción se diluyó con éter diet�lico y se lav� sucesivamente con NaHCO3, HCl 1M, agua, y salmuera. El extracto orgánico se secó sobre Na2SO4 anhidro, se filtr� y se concentr� para proporcionar 160 mg (cuant.) de 51 que se utilizó sin purificación adicional. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 57,81-7,78 (m, 1H), 7,38-7,36 (m, 1H), 7,28-7,21 (m, 3H), 6,86 (d, J=8,7 Hz, 1H), 5,04 (d, J=6,9 Hz, 1H), 4,61 (dd, J=6,3, 8,7 Hz, 1H), 4,48-4,42 (m, 1H), 4,22 (m, 1H), 4,13 (q, J=6,9 Hz, 2H), 3,73-3,62 (m, 2H), 3,41-3,36 (m, 2H), 3,28 (dd, J=3,0, 13,5 Hz, 1H), 3,11 (app t, J=6,9 Hz, 2H), 2,85-2,73 (m, 4H), 2,38 (app t, J=8,1 Hz, 2H), 2,13-1,98 (m, 2H), 1,80-1,64 (m, 1H), 1,45 (s, 9H), 1,37 (d, J=6,9 Hz, 3H), 1,26 (t, J=7,5 Hz, 3H), 1,03-0,95 (m, 6H) ppm. Espectro de masa: m/z 572 [M+H]+; y 594 [M+Na]+.
G. Etil éster del ácido 3-(3-{1-[2-(2-amino-propionilamino)-3-metil-butiril]-pirrolidin-2-ilmetil}-benzofuran-2-il)propi�nico (52): A una solución de 51 (160 mg, 0,28 mmol) en DCM (10 mL) se agregó TFA (2 mL) a temperatura ambiente. Después de 2,5 h, el solvente se elimin� bajo presión reducida. El residuo se disolvió en EtOAc y se lav� con NaHCO3 acuoso, salmuera, se secó sobre Na2SO4 anhidro, se filtr� y se concentr�. Una porción (~50%) del material en bruto se purificó mediante HPLC de fase inversa (C18, ACN 10-100%/agua que contenía HOAc 0,1%) para proporcionar 56 mg de 52 como un sólido blanco. 1H NMR (DMSO, 300 MHz) 5 8,03 (d, J=8,7 Hz, 1H), 7,77 (m, 1H), 7,43-7,41 (m, 1H), 7,21 (m, 2H), 4,37 (app t, J=8,1 Hz, 1H), 4,19 (m, 1H), 4,01 (q, J=7,2 Hz, 2H), 3,65 (m, 1H), 3,56 (app d, J=6,6 Hz, 1H), 3,28 (m, 1H), 3,06-3,01 (m, 3H), 2,68 (app t, J=7,2 Hz, 2H), 2,07-1,96 (m, 1H), 1,63 (m, 1H), 1,54 (m, 1H), 1,13-1,09 (m, 6H), 0,90 (d, J=6,3 Hz, 3H), 0,85 (d, J=6,3 Hz, 3H) ppm. Espectro de masa: m/z 472 [M+H]+; y 494 [M+Na]+.
Tabla 10
Entrada
A1 R1b Y Z X2 R11 MS (M+H)+ Intervalo KD
10-89
H Me iPr H O —CH2CH2CO2Et 472,3 C
10-90
H Me iPr H O —CH2CH2CO2H 444,2 B
20 Ejemplo 12 Este ejemplo ilustra derivados de pirrolidina de la Tabla 11 y Tabla 12. Esquema V(b)
La preparación de lactam derivado de ornitina (59)
A. Etil éster del ácido 3-{3-[1-(5-Benciloxicarbonilamino-2-terc-butoxicarbonilamino-pentanoil)-pirrolidin-2-ilmetil]
20 benzofuran-2-il}-propi�nico (53): Una solución que contenía Boc-L-ornitina (2,3 g, 6,3 mmol) en NMP (5 mL) se trat� con HATU (2,4 g, 6,3 mmol) seguido de NMM (1,5 mL, 13,7 mmol) a temperatura ambiente. Después de 10 min, se agregó por goteo amina 48 (1,6 g, 5,3 mmol) en NMP (10 mL). Después de 16 h, la mezcla de reacción se diluyó con éter diet�lico y se lav� sucesivamente con NaHCO3, HCl 1M, agua, y salmuera. El extracto orgánico se secó sobre Na2SO4 anhidro, se filtr� y se concentr� para proporcionar 3,0 g (87%) de 53 como un aceite color anaranjado que
25 se utilizó sin purificación adicional. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 7,78-7,75 (m, 1H), 7,40-7,20 (m, 8H), 5,48 (d, J=8,4 Hz, 1H), 5,10 (s, 2H), 4,48-4,42 (m, 1H), 4,17-4,09 (m, 2H), 3,64-3,56 (m, 1H), 3,27-3,19 (m, 1H), 3,12 (app t, J=7,8 Hz, 1H), 2,81-2,74 (m, 2H), 2,52-2,35 (m, 1H), 2,09-1,95 (m, 2H), 1,83-1,63 (m, 4H), 1,45 (s, 9H), 1,29-1,19 (m, 6H) ppm.
B. ácido 3-{3-[1-(5-benciloxicarbonilamino-2-terc-butoxicarbonilamino-pentanoil)-pirrolidin-2-ilmetil]-benzofuran-2-il}
30 propi�nico (54): Una solución que contenía 53 en bruto (3,0 g, 4,6 mmol) en THF (20 mL) se trat� con NaOH 3M (8 mL) a temperatura ambiente. La mezcla de reacción se calentó a reflujo moderado y se mantuvo durante 2,5 h. La mezcla de reacción se concentr� al vacío y el residuo se disolvió en EtOAc. La solución orgánica se lav� con HCl 1N y se secó sobre Na2SO4 anhidro, se filtr� y se concentr� para proporcionar ~3 g (cuant.) de 54 como una espuma color blancuzco que se utilizó directamente sin purificación adicional. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 7,69-7,67 (m, 1H),
35 7,39-7,20 (m, 8H), 5,70 (d, J=8,4 Hz, 1H), 5,13-5,09 (m, 2H), 4,50-4,45 (m, 1H), 3,67-3,54 (m, 1H), 3,22-3,18 (m, 2H), 3,13 (t, J=6,9 Hz, 1H), 2,85-2,78 (m, 2H), 2,09-1,97 (m, 3H), 1,76-1,62 (m, 4H), 1,43 (s, 9H) ppm.
C. ácido 3-{3-[1-(5-Amino-2-terc-butoxicarbonilamino-pentanoil)-pirrolidin-2-ilmetil]-benzofuran-2-il}-propi�nico (55): Una solución de 54 en bruto (~3 g, 4,8 mmol) en MeOH (30 mL) se cargó con Pd al 10% sobre carbono (~1 g) y se colocó bajo una atmósfera de gas hidrógeno (45 PSI). La mezcla de reacción se agit� utilizando un aparato Parr
40 durante 2 h. Después de eliminar del catalizador por filtración sobre celite, el filtrado clarificado se concentr� al vacío. El residuo bruto se recogió en DCM y se secó utilizando Na2SO4 anhidro, se filtr� y se concentr� para proporcionar 2,3 g (cuant.) de 55 como un residuo espumoso que se utilizó sin purificación adicional. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 7,51 (m, 1H), 7,34-7,32 (m, 1H), 7,18-7,15 (m, 2H), 6,19 (m, 1H), 4,36 (m, 2H), 3,62-3,48 (m, 2H), 3,10-2,99 (m, 2H), 2,85-1,81 (m, 2H), 2,66-2,60 (m, 2H), 1,99-1,71 (m, 6H), 1,41 (s, 9H) ppm. Espectro de masa, m/z 488 [M+H]+.
D. Lactama Boc-protegida Des-alanina derivada de ornitina (56): Una solución que contenía 55 (2,3 g, 4,7 mmol) en
5 1:1 NMP/DCM (30 mL) se trat� con HATU (2,1 g, 5,5 mmol) y NMM (0,6 mL, 5,5 mmol) a temperatura ambiente. Después de 18 h, la mezcla de reacción se diluyó con éter diet�lico y se lav� sucesivamente con acuoso Na2SO4, HCl diluido acuoso, agua, salmuera, y se secó sobre Na2SO4 anhidro, se filtr� y se concentr� para proporcionar 1,5 g (68%) de 56 como una espuma color blancuzco que se utilizó sin purificación adicional. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 7,70-7,66 (m, 1H), 7,33 (m, 1H), 7,19-7,18 (m, 2H), 5,70 (m, 1H), 4,42 (m, 1H), 4,10 (m, 1H), 3,55 (m, 3H), 3,24-3,09
10 (m, 4H), 2,61-2,46 (m, 2H), 1,63 (m, 7H), 1,44 (s, 9H) ppm. Espectro de masa, m/z 470 [M+H]+, 492 [M+Na]+.
E. Lactama Des-alanina derivada de ornitina (57): A una solución de en bruto 56 (1,5 g, 3,1 mmol) en DCM (20 mL) se agregó TFA (4 mL) a temperatura ambiente. Después de 2 h, el solvente se elimin� bajo presión reducida. El residuo se disolvió en EtOAc y se lav� con NaHCO3 acuoso, y salmuera. Los lavados acuosos combinados se extrajeron nuevamente con MeOH 5%/DCM. Los extractos orgánicos combinados se secaron sobre Na2SO4
15 anhidro, se filtraron y se concentraron para proporcionar 0,8 g (68%) de 57 como una espuma color blancuzco que se utilizó directamente en la siguiente reacción. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 7,41-7,38 (m, 1H), 7,27-7,20 (m, 3H), 5,99 (d, J=9,3 Hz, 1H), 4,39-4,33 (m, 1H), 3,96-3,84 (m, 1H), 3,70-3,65 (m, 2H), 3,55-3,38 (m, 2H), 3,20-3,05 (m, 2H), 2,90-2,83 (m, 3H), 2,77-2,71 (m, 2H), 2,66-2,62 (m, 2H), 2,19-1,98 (m, 2H), 1,78-1,66 (m, 2H), 1,38-1,08 (m, 2H) ppm.
20 F. Lactama Boc-protegida derivada de ornitina (58): Una solución que contenía Boc-L-alanina (526 mg, 2,8 mmol) en NMP (5 mL) se trat� con HATU (1,1 g, 2,9 mmol) seguido de NMM (0,3 mL, 2,9 mmol) a temperatura ambiente. Después de 10 min, se agregó por goteo amina 57 en bruto (0,8 mg, 2,2 mmol) en NMP (10 mL). Después de 2 d, la mezcla de reacción se diluyó con éter diet�lico y se lav� sucesivamente con NaHCO3, HCl 1M, agua, y salmuera. El extracto orgánico se secó sobre Na2SO4 anhidro, se filtr� y se concentr� para proporcionar ~1 g (84%) de 58 como
25 un aceite de color amarillo que se utilizó sin purificación adicional. Espectro de masa: m/z 541 [M+H]+, y 563 [M+Na]+.
G. Lactama derivada de ornitina (59): A una solución de en bruto 58 (˜1 g, 1,9 mmol) en DCM (10 mL) se agregó TFA (4 mL) a temperatura ambiente. Después de 1 h, el solvente se elimin� bajo presión reducida. El residuo se disolvió en EtOAc y se lav� con NaHCO3 acuoso, y salmuera. Los lavados acuosos combinados se extrajeron
30 nuevamente con MeOH 5%/DCM y los extractos orgánicos combinados se secaron sobre Na2SO4 anhidro, se filtraron y se concentraron. Una porción del producto en bruto se purificó mediante HPLC de fase inversa (C18, ACN 10-100%/agua que contenía HOAc 0,1%) para proporcionar 28 mg de 59 como un sólido blanco. 1H NMR (DMSO, 300 MHz) 5 8,14 (m, 1H), 7,88 (m, 1H), 7,68-7,66 (m, 1H), 7,35 (m, 1H), 7,12 (m, 2H), 4,43 (m, 1H), 4,12 (m, 1H), 3,48 (m, 2H), 2,91 (m, 4H), 1,48-1,36 (m, 4H), 1,10 (d, J=6,3 Hz, 3H) ppm. Espectro de masa: m/z 441 [M+H]+.
45 Tabla 11
Entrada
A1 R1b Y Z X2 R11,12, R14-17 MS (M+H)+ Intervalo KD
11-91
H Me Y unido a R11 H O R11 unido a Y 441,3 B
10 Tabla 12
Entrada
A1 R1b Y Z X2 R11,12, R14-17 MS(M+H)+ Intervalo KD
12-92
H Me Y unido a R11 H O R11 unido a Y 455,2 C
Ejemplo 13
Este ejemplo ilustra derivados de pirrolidina de la Tabla 13.
Esquema Vc
15
20
25
Preparaci�n de éter cíclico derivado de tirosina (66):
A. Bencil éster del ácido 2-[2-(3-hidroxi-propenil)-benzofuran-3-ilmetil]-pirrolidina-1-carbox�lico (60): A −78� C, se
5 agregó BF3. �terato (0,6 mL, 4,8 mmol) a una solución que contenía 47 (1,7 g, 3,9 mmol) en DCM anhidro (40 mL). Después de 10 min, se agregó por goteo DIBAL (1 M/DCM, 10 mL, 10 mmol) desde un embudo de adición. Después de 5 min después de la adición completa de la solución DIBAL, se agregó EtOAc (10 mL) para desactivar el reactivo sobrante. Se agregó lentamente HCl diluido acuoso y la mezcla de reacción se dej� calentar lentamente a temperatura ambiente. El producto se extrajo con DCM y EtOAc y los extractos orgánicos combinados se lavaron
10 con HCl diluido acuoso, agua, salmuera, se secó sobre Na2SO4 anhidro, se filtr� y se concentr�. El producto en bruto se purificó mediante cromatograf�a ultrarrápida en gel de sílice (EtOAc/hexano, 1:2) para proporcionar 1,1 g (72%) de 60 como un aceite de color amarillo. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 7,65 & 7,03 (rot�mero, d y app t, J=6,9, 7,8 Hz, 1H), 7,38 (m, 5H), 7,26-7,19 (m, 2H), 6,70-6,52 (m, 2H), 5,26-5,14 (m, 2H), 4,38 (m, 1H), 4,28 (m, 1H), 4,14 (m, 1H), 3,43 (m, 2H), 3,27 & 3,02 (rot�mero, 2 m, 1H), 2,76-2,68 (m, 1H), 2,45 (m, 1H), 1,77-1,68 (m, 5H) ppm.
15 B. 3-(3-Pirrolidin-2-ilmetil-benzofuran-2-il)-propan-1-ol (61): Una mezcla de 60 (1,1 g, 2,8 mmol) y Pd 10%-sobrecarbono (1 g) en MeOH (40 mL) se colocó bajo una atmósfera de gas hidrógeno (45 PSI) y se agit� durante 2 h utilizando un aparato Parr. El catalizador se elimin� por filtración a través de un lecho de celite y el filtrado clarificado se concentr� al vacío para proporcionar 725 mg (cuant.) de 61 como un aceite amarillo que se utilizó sin purificación adicional. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 7,47-7,36 (m, 2H), 7,21-7,17 (m, 2H), 4,59 (br s, 2H), 3,57-3,50 (m, 2H),
20 3,40-3,31 (m, 1H), 3,08-2,94 (m, 1H), 2,89-2,69 (m, 2H), 2,05-1,95 (m, 2H), 1,93-1,49 (m, 2H) ppm.
C. Terc-butil éster del ácido (1-(4-Hidroxi-bencil)-2-{2-[2-(3-hidroxi-propil)-benzofuran-3-ilmetil]-pirrolidin-1-il}-2-oxoetil)-carb�mico (62): Una solución que contenía Boc-L-tirosina (577 mg, 2,1 mmol) y HATU (716 mg, 1,8 mmol) en NMP anhidro (6 mL) se trat� con NMM (0,3 mL, 2,7 mmol) a temperatura ambiente. Después de 10 min, se agregó una solución que contenía 61 (429 mg, 1,7 mmol) en NMP (5 mL). Después de 2 d, la mezcla de reacción se diluyó
25 con agua y el producto se extrajo con éter diet�lico. Los extractos de éter combinados se lavaron con agua y NaHCO3 acuoso diluido, salmuera, se secaron sobre Na2SO4 anhidro, se filtraron y se concentraron. El producto en bruto se purificó mediante cromatograf�a ultrarrápida en gel de sílice (MeOH 10%/DCM) para proporcionar 821 mg (92%) de 62 como un espuma amarillo pálido. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 8,54 (br 2, 1H), 7,66-7,63 (m, 1H), 7,367,32 (m, 1H), 7,21-7,06 (m, 5H), 6,83 (d, J=8,4 Hz, 2H), 5,58 (d, J=9,0 Hz, 1H), 4,64-4,56 (m, 1H), 4,34-4,31 (m, 1H),
3,92-3,88 (m, 1H), 3,70 (app t, J=5,7 Hz, 2H), 3,51-3,26 (m, 1H), 3,18-2,79 (m, 4H), 2,01-1,97 (m, 2H), 1,69-1,47 (m, 1H), 1,42 (s, 9H) ppm.
D. éter Des-alanina Boc-protegido cíclico derivado de tirosina (63): A una solución que contenía 62 (821 mg, 1,6 mmol) en DCM (40 mL) se agregó Ph3P (431 mg, 1,6 mmol) y ADDP (491 mg, 1,9 mmol) a temperatura ambiente. Después de 16 h, la mezcla de reacción se concentr� al vacío y se disolvió en éter diet�lico. El sólido blanco insoluble se elimin� por filtración y el filtrado clarificado se concentr�. El producto en bruto se purificó mediante cromatograf�a ultrarrápida en gel de sílice (EtOAc/hexano, 1:2 a 1:1) para proporcionar 160 mg (19%) de 63 como un espuma color amarillo claro. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 7,47 (d, J=7,5 Hz, 1H), 7,34 (d, J=7,8 Hz, 1H), 7,28-7,24 (m, 2H), 7,22-7,11 (m, 2H), 7,00 (dd, J=2,7, 8,1 Hz, 1H), 6,69 (dd, J=3,0, 8,7 Hz, 1H), 5,28 (d, J=9,6 Hz, 1H), 4,884,79 (m, 1H), 4,51-4,41 (m, 1H), 4,23-4,17 (m, 1H), 3,97-3,89 (m, 1H), 3,84-3,76 (m, 1H), 3,46-3,29 (m, 2H), 2,752,62 (m, 4H), 2,17-2,09 (m, 1H), 1,99-1,90 (m, 1H), 1,72-1,54 (m, 2H), 1,45 (s, 9H) ppm.
E. éter Des-alanina cíclico derivado de tirosina (64): A una solución de 63 (160 mg, 0,32 mmol) en DCM (10 mL) se agregó TFA (2 mL) a temperatura ambiente. Después de 1,5 h, el solvente se elimin� bajo presión reducida. El residuo se disolvió en EtOAc y se lav� con NaHCO3 acuoso, salmuera, se secó sobre Na2SO4 anhidro, se filtr� y se concentr� para proporcionar 130 mg (cuant.) de 64 como un sólido color blancuzco que se utilizó directamente en la siguiente reacción. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 7,46 (d, J=7,8 Hz, 1H), 7,34 (d, J=8,4 Hz, 1H), 7,21-7,19 (m, 2H), 7,16-7,10 (m, 2H), 6,97 (dd, J=2,4, 8,1 Hz, 1H), 6,70-6,68 (m, 1H), 4,47 (m, 1H), 4,21-4,13 (m, 2H), 3,93 (t, J=9,3 Hz, 1H), 3,51-3,36 (m, 4H), 2,73-2,68 (m, 4H), 2,15-2,07 (m, 1H), 1,98-1,90 (m, 1H), 1,70-1,46 (m, 3H), 1,19-1,13 (m, 1H), 0,64-0,55 (m, 1H) ppm.
F. éter Boc-protegido cíclico derivado de tirosina (65): Una solución que contenía Boc-L-alanina (63 mg, 0,33 mmol) en NMP (3 mL) se trat� con HATU (125 mg, 0,33 mmol) seguido de NMM (0,1 mL, 0,9 mmol) a temperatura ambiente. Después de 10 min, se agregó por goteo amina 64 en bruto (125 mg, 0,31 mmol) en NMP (5 mL). Después de 16 h, la mezcla de reacción se diluyó con éter diet�lico y se lav� sucesivamente con NaHCO3, HCl 1M, agua, y salmuera. El extracto orgánico se secó sobre Na2SO4 anhidro, se filtr� y se concentr�. El producto en bruto se purificó mediante cromatograf�a ultrarrápida en gel de sílice (EtOAc/hexano, 1:1 to 2:1) para proporcionar 137 mg (76%) de 65 como un sólido color amarillo claro. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 7,46 (d, J=7,8 Hz, 1H), 7,34 (d, J=7,8 Hz, 1H), 7,19-7,12 (m, 3H), 7,05-6,99 (m, 2H), 6,70 (dd, J=2,4, 8,4 Hz, 1H), 5,14-5,08 (m, 2H), 4,48-4,42 (m, 1H), 4,26-4,18 (m, 2H), 3,93 (app t, J=9,3 Hz, 1H), 3,84-3,76 (m, 1H), 3,47-3,31 (m, 2H), 2,84-2,64 (m, 4H), 2,15-2,08 (m, 1H), 1,97-1,93 (m, 1H), 1,71-1,52 (m, 3H), 1,48 (s, 9H), 1,38 (d, J=7,2 Hz, 3H), 1,18-1,12 (m, 1H), 0,64-0,56 (m, 1H) ppm.
G. éter cíclico derivado de tirosina (66): A una solución de 65 (137 mg, 0,23 mmol) en DCM (10 mL) se agregó TFA (2 mL) a temperatura ambiente. Después de 1,5 h, el solvente se elimin� bajo presión reducida. El residuo se disolvió en EtOAc y se lav� con NaHCO3 acuoso, salmuera, se secó sobre Na2SO4 anhidro, se filtr� y se concentr�. El producto en bruto se purificó mediante HPLC de fase inversa (C18, ACN 10-100%/agua que contenía HOAc 0,1%) para proporcionar 90 mg (82%) de 66 como un sólido blanco. 1H NMR (DMSO, 300 MHz) 58,23 (d, J=6,9 Hz, 1H), 7,46-7,39 (m, 3H), 7,23-7,12 (m, 2H), 7,01-6,99 (m, 2H), 6,85-6,82 (m, 1H), 4,86 (m, 1H), 4,27 (m, 1H), 4,16 (m, 1H), 3,98-3,84 (m, 1H), 3,44-3,33 (m, 1H), 3,16-3,10 (m, 1H), 2,76-2,67 (m, 3H), 1,99 (m, 1H), 1,57 (app t, J=5,7 Hz, 2H), 1,45-1,39 (m, 1H), 1,16 (d, J=6,3 Hz, 3H), 1,02-0,97 (m, 1H), 0,58-0,49 (m, 1H) ppm. Espectro de masa: m/z 476,2 [M+H]+.
Tabla 13
Entrada
A1 R1b Y Z X2 R11,12, R14-17 MS (M+H)+ Intervalo KD
13-93
H Me Y unido con R11 H O R11 unido con Y 476,2 B
Ejemplo 14
Este ejemplo ilustra derivados de pirrolidina de la Tabla 14 Esquema VI
Preparaci�n de 2S-amino-N-{1S-[2S-(1H-indol-3-ilmetil)-pirrolidina-1-carbonil]-2-metil-propil}-propionamida (76):
25 A. Terc-butil éster del ácido trans-2S-(3-metanosulfoniloxi-propenil)-pirrolidina-1-carbox�lico (67): A una solución de 22 (2 g, 8,8 mmol) en DCM (10 mL) se agregó trietilamina (2,5 mL, 17,6 mmol). La solución se enfri� en un baño de hielo y se agregó por goteo cloruro de metanosulfonilo (0,74 mL, 9,68 mmol) y se agit� a temperatura ambiente durante 30 min. Se agregó agua (10 mL) y el producto se extrajo con DCM (3�50 mL). La capa orgánicas se combinaron y se lavaron con 5 mL HCl 1N, agua (10 mL), y salmuera, y se secaron sobre Na2SO4 anhidro, el
30 solvente se evapor� bajo presión reducida para obtener 9,5 g de 67 que se utilizó sin purificación. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz): 5 4,4-4,0 (m, 2H), 3,42-3,21 (m, 3H), 3,0 (s, 3H), 2-1,6 (m, 4H), 1,42 (s, 9H) ppm.
B. Terc-butil éster del ácido trans-2S-{3-[acetil-(2-yodo-fenil)-amino]-propenil}-pirrolidina-1-carbox�lico (68): Una solución de o-yodoacetanilida (1,1 g, 4,21 mmol) en DMF (10 mL) se enfri� en un baño de hielo y se agregó en porciones NaH (dispersi�n 60% en aceite mineral, 0,24 g, 6,31 mmol) y se agit� a temperatura ambiente durante 10 min. Se agregó por goteo mesilato 67 en bruto (1,28 g, 4,21 mmol) en DMF (5 mL) a temperatura ambiente y se agit� durante 30 min. Se agregó agua (10 mL) y el producto se extrajo con éter diet�lico (3�50 mL). Los extractos de éter combinados se lavaron con agua (3�50 mL) y salmuera, se secó sobre Na2SO4, el solvente se evapor� bajo presión reducida y se purificó mediante cromatograf�a ultrarrápida en gel de sílice (3:1 hexanos/acetato de etilo) para proporcionar 1,17 g de 68 como un sólido blanco. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz): 5 7,85 (d, J=9,9 Hz, 1H), 7,4-7,0 (m, 3H), 5,6 (m, 1H), 5,28 (m, 1H), 4,86 (m, 1H), 3,3 (m, 3H), 2,0-1,6 (m, 4H), 1,4 (s, 9H) ppm.
C. Terc-butil éster del ácido 2S-(1-acetil-1H-indol-3-ilmetil)-pirrolidina-1-carbox�lico (69): A una solución de 68 (1,1 g, 2,33 mmol) en DMF (15 mL) se agregó K2CO3 (0,41 g, 3,02 mmol), NaHCO2 (0,16 g, 2,44 mmol) seguido de tetrabutilcloruro de amonio (0,64 g, 2,33 mmol) y Pd(OAc)2 (0,02 g, 0,07 mmol) y el recipiente de reacción se sumergió en un baño de aceite precalentado (100� C.). Después de 40 min., se agregó agua (10 mL) y el producto se extrajo con éter diet�lico (3�50 mL). Los extractos éter diet�lico se lavaron con agua (3�50 mL), salmuera y se secaron sobre Na2SO4, el solvente se evapor� bajo presión reducida y se purificó mediante cromatograf�a ultrarrápida en gel de sílice (3:1 hexanos/acetato de etilo) para proporcionar 0,37 g de 69 como un sólido blanco. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz): 5 8,4 (s, 1H), 7,78-7,6 (dd, J=10,7, 10,7 Hz, 1H), 4,2-4,0 (m, 1H), 3,45-3,0 (m, 3H), 2,7-2,6 (m, 1H), 2,6 (s, 3H), 1,9-1,65 (m, 4H), 1,5 (s, 9H) ppm.
D. 1-(3-Pirrolidin-2S-ilmetil-indol-1-il)-etanona (70): A una solución de 69 (0,37 g, 1,08 mmol) en DCM (20 mL) se agregó TFA (4 mL) y se agit� a temperatura ambiente durante 30 min. Se agregó NaHCO3 acuoso (5 mL) y la mezcla de reacción se concentr� bajo presión reducida. El producto se extrajo con DCM (3�50 mL) y el extracto orgánico se lav� con NaHCO3 acuoso, agua y salmuera, y se secó sobre Na2SO4 anhidro, el solvente se elimin� bajo presión reducida y se purificó mediante cromatograf�a en columna de gel de sílice (10:1 DCM/MeOH) para proporcionar 0,26 g de 70 como un sólido blanco. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz): 5 8,6 (d, J=11 Hz, 1H), 7,5 (d, J=11 Hz, 1H), 7,4-7,2 (m, 3H), 3,8-3,6 (m, 1H), 3,2-2,9 (m, 4H), 2,8 (s, 3H), 2,2-1,6 (m, 4H) ppm.
E. Terc-butil éster del ácido {1S-[2S-(1-acetil-1H-indol-3-ilmetil)-pirrolidina-1-carbonil]-2-metil-propil}-carb�mico (71): A una solución de Boc-L-valina (0,25 g, 1,18 mmol) en NMP (5 mL), se agregó HATU (0,44 mg, 1,18 mmol) seguido de NMM (0,3 mL, 2,67 mmol). Después de 5 min., se agregó 70 (0,25 g, 0,11 mmol) y se agit� a temperatura ambiente durante 30 min. Se agregó acetato de etilo (20 mL) y la solución orgánica se lav� con NaHCO3 acuoso (10 mL), HCl 1N (10 mL), agua, y salmuera, se secó sobre Na2SO4, el solvente se elimin� bajo presión reducida y el producto se purificó mediante cromatograf�a ultrarrápida en gel de sílice para proporcionar 0,36 mg de 71 como un sólido blanco. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz): 5 8,4 (m, 1H), 7,88 (d, J=11 Hz, 1H), 7,4-7,2 (m, 3H), 4,4-4,2 (m, 1H), 3,83,4 (m, 3H), 3,38 (d, J=11 Hz, 1H), 2,65 (d, J=11 Hz, 1H), 2,6 (s, 3H), 2,5-2,4 (m, 1H), 2,1-1,7 (m, 4H), 1,4 (s, 9H), 1,05 (d, J=5,5 Hz, 3H), 0,95 (d, J=5,5 Hz, 3H) ppm.
F. 1-[2S-(1-Acetil-1H-indol-3-ilmetil)-pirrolidin-1-il]-2S-amino-3-metil-butan-1-ona (72): A una solución de 71 (0,36 g, 0,81 mmol) en DCM (20 mL) se agregó TFA (4 mL) y la mezcla de reacción se agit� a temperatura ambiente durante 30 min. Se agregó NaHCO3 acuoso a la mezcla de reacción y TFA y DCM se eliminaron bajo presión reducida. El producto se extrajo con DCM (3�50 mL) y los extractos DCM combinados se lavaron con agua y salmuera y se secaron sobre Na2SO4 anhidro, el solvente se elimin� bajo presión reducida y el producto se purificó mediante cromatograf�a ultrarrápida en gel de sílice (10:1 DCM/MeOH) para proporcionar 0,27 g de 72 como un sólido blanco. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz): 5 8,4 (m, 1H), 7,88 (d, J=11 Hz, 1H), 7,4-7,2 (m, 3H), 4,4-4,2 (m, 1H), 3,8-3,4 (m, 3H), 3,38 (d, J=11 Hz, 1H), 2,65 (d, J=11 Hz, 1H), 2,6 (s, 3H), 2,5-2,4 (m, 1H), 2,1-1,7 (m, 4H), 1,05 (d, J=5,5 Hz, 3H), 0,95 (d, J=5,5 Hz, 3H) ppm.
G. Terc-butil éster del ácido (1S-{1S-[2S-(1-acetil-1H-indol-3-ilmetil)-pirrolidina-1-carbonil]-2-metil-propilcarbamoil}etil)-carb�mico (73): A una solución de BOC-L-alanina (0,13 g, 0,38 mmol) en NMP (3 mL) se agregó HATU (0,16 mg, 0,41 mmol) seguido de NMM (0,1 mL, 0,95 mmol). Después de 5 min., se agregó 72 (0,12 g, 0,34 mmol) y la mezcla de reacción se agit� a temperatura ambiente durante 30 min. Se agregó acetato de etilo (20 mL) a la mezcla de reacción y la solución orgánica se lav� con NaHCO3 acuoso (10 mL), HCl 1N (10 mL), agua, y salmuera, se secó sobre Na2SO4, el solvente se elimin� bajo presión reducida y el producto se purificó mediante cromatograf�a ultrarrápida en gel de sílice para proporcionar 0,15 mg de 73 como un sólido blanco. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz): 5 8,4 (m, 1H), 7,88 (d, J=10,9 Hz, 1H), 7,4-7,2 (m, 3H), 7,0-6,8 (m, 1H), 4,6 (m, 1H), 4,5-4,4 (m, 1H), 4,2 (m, 1H), 3,83,6 (m, 2H), 3,38 (d, J=10,9 Hz, 1H), 2,65 (d, J=10,9 Hz, 1H), 2,6 (s, 3H), 2,5-2,4 (m, 1H), 2,1-1,7 (m, 4H), 1,45 (s, 9H), 1,4 (d, J=10,9 Hz, 3H), 1,05 (d, J=5,5 Hz, 3H), 0,95 (d, J=5,5 Hz, 3H) ppm.
H. N-{1S-[2S-(1-Acetil-1H-indol-3-ilmetil)-pirrolidina-1-carbonil]-2-metil-propil}-2S-amino-propionamida (74): A una
soluci�n de 73 (0,15 g, 0,29 mmol) en DCM (20 mL) se agregó TFA (4 mL) y la mezcla de reacción se agit� a temperatura ambiente durante 30 min. Se agregó NaHCO3 acuoso a la mezcla de reacción y TFA y DCM se eliminaron bajo presión reducida. El producto se extrajo con DCM (3�50 mL) y los extractos DCM se lavaron con agua, salmuera y se secaron sobre Na2SO4 anhidro, el solvente se elimin� bajo presión reducida y el producto se
5 purificó mediante cromatograf�a ultrarrápida en gel de sílice (10:1 DCM/MeOH) para proporcionar 0,12 g de 74 como un sólido blanco. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz): 5 8,4 (m, 1H), 7,88 (d, J=10,9 Hz, 1H), 7,85 (d, J=10,9 Hz, 1H), 7,4-7,2 (m, 3H), 4,6 (m, 1H), 4,5-4,4 (m, 1H), 3,8 (m, 1H), 3,75-3,4 (m, 2H), 3,38 (d, J=10,9 Hz, 1H), 2,65 (d, J=10,9 Hz, 1H), 2,6 (s, 3H), 2,5-2,4 (m, 1H), 2,1-1,7 (m, 4H), 1,4 (d, J=10,9 Hz, 3H), 1,05 (d, J=5,5 Hz, 3H), 0,95 (d, J=5,5 Hz, 3H) ppm.
10 2S-Amino-N-{1S-[2S-(1H-indol-3-ilmetil)-pirrolidina-1-carbonil]-2-metil-propil}-propionamida (75): A una solución de 74 (0,12 g, 0,291 mmol) en MeOH seco (3 mL) se agregó 3 mL de NaOH 10%/MeOH. Después de 15 min., se agregó agua (2 mL) a la mezcla de reacción y el solvente se elimin� bajo presión reducida. El producto se extrajo con acetato de etilo (3�50 mL) y los extractos orgánicos se lavaron con agua, salmuera y se secaron sobre Na2SO4, el solvente se elimin� bajo presión reducida y el producto se purificó mediante cromatograf�a ultrarrápida en gel de
15 sílice (10:1 DCM/MeOH) para proporcionar 0,06 g de 75 como un sólido blanco. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz): 5 8,4 (m, 1H), 7,88 (d, J=10,9 Hz, 1H), 7,85 (d, J=10,9 Hz, 1H), 7,4-7,2 (m, 3H), 4,6 (m, 1H), 4,5-4,4 (m, 1H), 3,8 (m, 1H), 3,75-3,4 (m, 2H), 3,38 (d, J=10,9 Hz, 1H), 2,65 (d, J=10,9 Hz, 1H), 2,5-2,4 (m, 1H), 2,1-1,7 (m, 4H), 1,4 (d, J=10,9
Tabla 14
Entrada
A1 R1b Y Z X2 R14-17 R11 MS (M+H)+ Intervalo KD
14-94
H Me iPr H Ac H H 413,2 A
14-95
H H iPr H Ac H H 399,3 D
14-96
Me Me tBu H Ac 6- F (R16) H 459,2 B
14-97
Me Me cHex H Ac 6- F(R16) H 485,3 B
14-98
H Me iPr H Ac 7- Me (R16) H 426,8 A
14-99
H Me iPr H H H H 371,3 B
14-100
H Me iPr H H 7- Me (R16) H 385,5 A
14-101
Boc Me iPr H Boc H H 571,3 D
14-102
H Me iPr H MeC=CCH2 H H 423,3 B
14-103
H Me iPr H HC=CCH2 H H 409,3 A
14-104
Me Me cHex H H 6- F(R16) H B
14-105
H H tBu H Ac 6-F H D
Ejemplo 15
Este ejemplo ilustra derivados de pirrolidina de la Tabla 15. Esquema Vll
Preparaci�n de 2S-amino-N-(2-metil-1S-{2S-[1-(tolueno-4-sulfonil)-1H-indol-3-ilmetil]-pirrolidina-1-carbonil}-propil)propionamida (78):
A. Terc-butil éster del ácido (1S-{1S-[2S-(1H-Indol-3-ilmetil)-pirrolidina-1-carbonil]-2-metil-propilcarbamoil}-etil)carb�mico (76): A una solución de 73 (0,70 g, 1,36 mmol) en MeOH seco (10 mL) se agregó 5 mL de NaOH 20 10%/MeOH y se agit� durante 15 min. Se agregó agua (5 mL) a la mezcla de reacción y el solvente se elimin� bajo presión reducida. El producto se extrajo con acetato de etilo (3�50 mL) y los extractos orgánicos se lavaron con agua, salmuera y se secaron sobre Na2SO4, el solvente se elimin� bajo presión reducida y el producto se purificó mediante cromatograf�a ultrarrápida en gel de sílice (10:1 DCM/MeOH) para proporcionar 0,53 g de 76 como un sólido blanco. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz): 5 8,0 (s, 1H), 7,9 (d, J=9,9 Hz, 1H), 7,38 (d, J=9,9 Hz, 1H), 7,3-7,1 (m,
25 3H), 6,8 (m, 1H), 4,62 (m 1H), 4,5-4,4 (m 1H), 4,4-4,0 (m, 2H), 3,7-3,5 (m, 2H), 3,4 (m, 1H), 2,5 (m, 1H), 2,2-1,8 (m, 4H), 1,48 (s, 9H), 1,35 (d, J=9,9 Hz, 3H), 1,05 (d, J=5,5 Hz, 3H), 0,95 (d, J=5,5 Hz, 3H) ppm.
B. Terc-butil éster del ácido [1S-(2-Metil-1S-{2S-[1-(tolueno-4-sulfonil)-1H-indol-3-ilmetil]-pirrolidina-1-carbonil}propilcarbamoil)-etil]-carb�mico (77): A una solución de 76 (0,05 g, 0,11 mmol) en DCM (1 mL) se agregó NaOH (0,01 g, 0,13 mmol) y se agit� a temperatura ambiente durante 30 min. Se agregó cloruro de tosilo (0,03 g, 0,16 30 mmol) y la mezcla de reacción se calentó hasta 35� C. durante 1 h. Se agregó agua (5 mL) a la mezcla de reacción y el producto se extrajo con DCM (3�30 mL). Los extractos de DCM se lavaron con agua, salmuera y se secaron sobre Na2SO4, el solvente se elimin� bajo presión reducida y el producto se purificó mediante cromatograf�a ultrarrápida en gel de sílice (3:1 hexano/acetato de etilo) para proporcionar 61 mg de 77 como un sólido blanco. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz): 5 7,95 (d, J=9,9 Hz, 1H), 7,82 (d, J=9,9 Hz, 1H), 7,7 (d, J=9,9 Hz, 2H), 7,4-7,2 (m, 5H), 6,8
35 (m, 1H), 4,6 (m, 1H), 4,4 (m, 1H), 4,3-4,18 (m, 2H), 3,8-3,5 (m, 2H), 3,3 (m, 1H), 2,45 (m, 1H), 2,35 (s, 3H), 2,2-1,8 (m, 4H), 1,43 (s, 9H), 1,38 (d, J=9,9 Hz, 3H), 1,05 (d, J=5,5 Hz, 3H), 0,95 (d, J=5,5 Hz, 3H) ppm.
C. 2S-Amino-N-(2-metil-1S-{2S-[1-(tolueno-4-sulfonil)-1H-indol-3-ilmetil]-pirrolidina-1-carbonil}-propil)-propionamida (78): A una solución de 77 (0,06 g, 0,096 mmol) en DCM (10 mL) se agregó TFA (2 mL) y la mezcla de reacción se agit� a temperatura ambiente durante 30 min. Se agregó NaHCO3 acuoso a la mezcla de reacción y se eliminaron
40 TFA y DCM bajo presión reducida. El producto se extrajo con DCM (3�25 mL) y los extractos DCM se lavaron con
agua, salmuera y se secaron sobre Na2SO4 anhidro, el solvente se elimin� bajo presión reducida y el producto se purificó mediante cromatograf�a ultrarrápida en gel de sílice (10:1 DCM/MeOH) para proporcionar 0,04 g de 78 como un sólido blanco. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz): 5 7,95 (d, J=9,9 Hz, 1H), 7,82 (d, J=9,9 Hz, 1H), 7,7 (d, J=9,9 Hz, 2H), 7,4-7,2 (m, 5H), 6,8 (m, 1H), 4,6 (m, 1H), 4,4 (m, 1H), 4,3-4,18 (m, 2H), 3,8-3,5 (m, 2H), 3,3 (m, 1H), 2,45 (m, 1H), 2,35 (s, 3H), 2,2-1,8 (m, 4H), 1,38 (d, J=9,9 Hz, 3H), 1,05 (d, J=5,5 Hz, 3H), 0,95 (d, J=5,5 Hz, 3H) ppm.
Tabla 15 Preparación de N-{1-Ciclohexil-2-[2-(6-fluoro-1-{2-[2-(2-metoxi-etoxi)-etoxi]-etil}-1H-indol-3-ilmetil)-pirrolidin-1-il]-2oxo-etil}-2-metilamino-propionamida (85):
Entrada
A1 R1b Y Z R12 R14-17 R11 MS (M+H)+ Intervalo KD
15-104
H Me iPr H MeC=CCH2 H H 423,3 B
15-105
H Me iPr H HC=CCH2 H H 409,3 A
15-106
Me Me iPr H H 7-BnO(R17) H 491,3 C
15-107
H Me iPr H Tosilo H H 525,3 A
15-108
Me Me tBu H H 6-F(R16) 2-tiofenilo 499,5 A
20
Ejemplo 16 Este ejemplo ilustra derivados de pirrolidina de la Tabla 16. Esquema VIII
25
A. Terc-butil éster del ácido 2-(6-Fluoro-1-{2-[2-(2-metoxi-etoxi)-etoxi]-etil}-1H-indol-3-ilmetil)-2S-pirrolidina-1carbox�lico (80): A una suspensión de NaH (72 mg, 1,8 mmol, suspensión 60% de aceite mineral) en DMF (1 mL) se agregó 79 (180 mg, 0,60 mmol) en DMF (1 mL) a temperatura ambiente. La mezcla se agit� durante 1 h a temperatura ambiente, seguido de la adición de tri(etileno glicol)monometil éter (182 mg, 0,57 mmol) en DMF (1 mL). La mezcla resultante se agit� a temperatura ambiente durante la noche, y se desactiv� mediante la adición de solución acuosa de NH4Cl a 0� C. El producto en bruto se extrajo con EtOAc. La fase orgánica se lav� con salmuera y se secó sobre Na2SO4, Luego de eliminar del solvente, el residuo se purificó mediante cromatograf�a ultrarrápida en gel de sílice (50% EtOAc en hexanos) para proporcionar 250 mg de 80 (93%). [TLC (EtOAc 60%/hexano): Rf(80)=0,22)]. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 7,65-7,76 (1H), 7,33 (m, 1H), 7,20 (m, 1H), 7,09 (m, 1H), 6,95 (s, 1H), 4,27 (t, J=8,4 Hz, 2H), 3,79 (t, J=5,7 Hz, 2H), 3,40-3,70 (9H), 3,37 (s, 3H), 3,10-3,40 (2H), 2,65 (m, 1H), 1,75 (brs, 4H), 1,55 (s, 9H) ppm.
B. 6-Fluoro-1-{2-[2-(2-metoxi-etoxi)-etoxi]-etil}-3-pirrolidin-2-ilmetil-1H-indol (81): Una solución de 80 (250 mg, 0,56 mmol) en DCM (5 mL) se trat� con TFA (1 mL) a temperatura ambiente. Después de 2 h, la mezcla de reacción se concentr�, se diluyó con EtOAc, se lav� con NaOH 1N acuoso y salmuera, se secó sobre Na2SO4, se filtr� y se concentr� para proporcionar 190 mg (98%) de 81 como un aceite amarillo claro. El producto se us� sin purificación adicional.
C. Terc-butil éster del ácido {1-ciclohexil-2-[2-(6-fluoro-1-{2-[2-(2-metoxi-etoxi)-etoxi]-etil}-1H-indol-3-ilmetil)-pirrolidin1-il]-2-oxo-etil}-carb�mico (82): A una solución de Boc-L-ciclohexilglicina (172 mg, 0,67 mmol) en NMP (2 mL) se agregó HATU (255 mg, 0,67 mmol) seguido de NMM (0,1 mL, 0,95 mmol). Después de 5 min, se agregó 81 (190 mg, 0,55 mmol) en DCM (1 mL) y la mezcla de reacción se agit� a temperatura ambiente durante la noche. Se agregó acetato de etilo (20 mL) a la mezcla de reacción y la solución orgánica se lav� con agua, HCl 1N (5 mL), NaHCO3 acuoso (10 mL), y salmuera, se secó sobre Na2SO4, el solvente se elimin� bajo presión reducida y el producto se purificó mediante cromatograf�a ultrarrápida en gel de sílice para proporcionar 280 mg (85%) de 82 como una cera. [TLC (EtOAc 60%/hexano): Rf(82)=0,18)]. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 7,83 (m, 1H), 7,32 (m, 1H), 7,20 (m, 1H), 7,09 (m, 1H), 6,98 (s, 1H), 5,32 (m, 1H), 4,0-4,6 (5H), 3,79 (t, J=5,7 Hz, 2H), 3,40-3,70 (9H), 3,37 (s, 3H), 2,65 (m, 1H), 1,6-2,0 (10H), 1,46 (s, 9H), 1,0-1,4 (6H) ppm.
D. 2-Amino-2-ciclohexil-1-[2-(6-fluoro-1-{2-[2-(2-metoxi-etoxi)-etoxi]-etil}-1H-indol-3-ilmetil)-pirrolidin-1-il]-etanona (83): Una solución de 82 (250 mg, 0,43 mmol) en DCM (5 mL) se trat� con TFA (1 mL) a temperatura ambiente. Después de 2 h, la mezcla de reacción se concentr�, se diluyó con EtOAc, se lav� con NaOH 1N acuoso y salmuera, se secó sobre Na2SO4, se filtr� y se concentr� para proporcionar 210 mg (100%) de 83 como una cera amarillo claro. El producto se us� sin purificación adicional.
E. Terc-butil éster del ácido (1-{1-Ciclohexil-2-[2-(6-fluoro-1-{2-[2-(2-metoxi-etoxi)-etoxi]-etil}-1H-indol-3-ilmetil)pirrolidin-1-il]-2-oxo-etilcarbamoil}-etil)-metil-carb�mico (84): A una solución de Boc-L-N-metilanalina (91 mg, 0,48 mmol) en NMP (2 mL) se agregó HATU (183 mg, 0,48 mmol) seguido de NMM (0,1 mL, 0,95 mmol). Después de 5 min., se agregó 83 (210 mg, 0,43 mmol) en DCM (1 mL) y la mezcla de reacción se agit� a temperatura ambiente durante la noche. Se agregó acetato de etilo (20 mL) a la mezcla de reacción y la solución orgánica se lav� con agua, HCl 1N (5 mL), NaHCO3 acuoso (10 mL), y salmuera, se secó sobre Na2SO4, el solvente se elimin� bajo presión reducida y el producto se purificó mediante cromatograf�a ultrarrápida en gel de sílice para proporcionar 188 mg (65%) de 84 como una cera. [TLC (EtOAc 80%/hexano): Rf(84)=0,20)]. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 7,80 (m, 1H), 7,35 (m, 1H), 7,19 (m, 1H), 7,10 (m, 1H), 6,95 (s, 1H), 4,62 (m, 1H), 4,46 (m, 1H), 4,20 (t, J=6,7 Hz, 2H), 3,77 (, t, J=5,4 Hz, 2H), 3,2-3,7 (5H), 3,36 (s, 3H), 2,48 (d, J=7,5 Hz, 3H) (t, J=5,7 Hz, 2H), 3,40-3,70 (9H), 3,37 (s, 3H), 2,65 (m, 1H), 2,57 (m, 1H), 1,6-2,0 (8H), 1,51 (S, 9H), 1,38 (d, J=6,6 Hz, 3H), 1,0-1,4 (4H) ppm.
F. Terc-butil éster del ácido 2-(6-fluoro-1-{2-[2-(2-metoxi-etoxi)-etoxi]-etil}-1H-indol-3-ilmetil)-2S-pirrolidina-1carbox�lico (85): Una solución de 84 (188 mg, 0,28 mmol) en DCM (5 mL) se trat� con TFA (1 mL) a temperatura ambiente. Después de 2 h, la mezcla de reacción se concentr�, se diluyó con EtOAc, se lav� con NaOH 1N acuoso y salmuera, se secó sobre Na2SO4, se filtr� y se concentr�. El residuo se purificó mediante HPLC para proporcionar 110 mg (65%) sal de acetato of 85 como un sólido blanco. [TLC (20% MeOH en EtOAc): Rf(85)=0,20)]. 1H NMR (CDCl3, 300 MHz) 5 7,79 (br d, 2H), 7,34 (d, J=7,2 Hz, 1H), 7,21 (m, 1H), 7,10 (m, 1H), 6,96 (d, J=9,0 Hz, 1H), 6,23 (br s, 2H), 4,61 (m, 1H), 4,44 (m, 1H), 4,24 (t, J=5,4 Hz, 2H), 3,78 (t, J=5,4 Hz, 2H), 3,4-3,8 (12H), 3,36 (s, 3H), 2,60 (m, 1H), 2,48 (d, J=7,5 Hz, 3H), 1,6-2,0 (8H), 1,39 (d, J=6,6 Hz, 3H), 1,0-1,4 (4H) ppm. Espectro de masa, m/z 571,3 [M+H]+.
Tabla 16
Entrada
A1 R1b Y Z R12 R14-17 R11 MS(M+ H)+ KD Interval o
16-108
Me Me tBu H MeO(CH2CH2O)CH2CH2 6-F(R16) H 563,4 B
16-109
Me Me cHex H MeO(CH2CH2O)CH2CH2 6-F(R16) H 589,4 B
16-110
Me Et cHex H MeO(CH2CH2O)CH2CH2 H H 585,5 B
16-111
Me Me cHex H MeO(CH2CH2O)CH2CH2 H H 571,5 B
16-112
Me Me tBu H HO(CH2CH2O)CH2CH2 6-F(R16) Br 627,3 A
16-113
Me Me tBu H MeO(CH2CH2O)CH2CH2 6-F(R16) Br 641,3 A
16-114
Me Me tBu H MeO(CH2CH2O)CH2CH2 6-F(R16) tiofe nilo 645,4 A
Aunque la presente invención se ha descrito en un grado considerable de detalle con referencia a algunas de sus realizaciones preferidas, otras versiones son posibles.

Claims (32)

  1. REIVINDICACIONES
    1. Un compuesto: que tiene la estructura de fórmula (2):
    donde: A1 y A2 son independientemente hidrógeno, alquilo, arilo, o alquilarilo, R1a es H o metilo; R1b es alquilo o arilo; X1 es -O-, -S-, -CH2-, o -NH-, J es -CH- o -N-, siempre que cuando J es -N-, X-1 sea -CH2- o -NH-; Y es H o alquilo; Z es -OH, ariloxi, alcoxi, benciloxi, amino, arilamino, alquilamino, bencilamino; R2 es:
    M es alquileno, alquenileno, alquinileno, heteroalquileno, heteroalquenileno, o heteroalquinileno, G es un enlace, —O—; —N(R2d)— donde R2d es H, alquilo, cicloalquilo, o arilo; o —S(O)m— donde m es 0, 1, o 2; R10 es cicloalquilo, arilo, heterocicloalquilo, heterocicloalquenilo, o heteroarilo; n es independientemente el entero 0, 1, 2, 3, 4, o 5;
    o una sal farmac�uticamente aceptable de este.
  2. 2. Una composición que comprende el compuesto o una sal de este de la reivindicación 1 junto con un vehículo farmac�uticamente aceptable.
  3. 3. Un compuesto: que tiene la estructura de fórmula (3):
    donde A1 es H, o alquilo de 1 a 10 átomos de carbono opcionalmente sustituido con halógeno; haloalquilo; tioalquilo; nitro; cicloalquilo; aralquilo; arilo; heteroarilo; hidroxi; alcoxi; ariloxi; alcoxiheteroarilo; ciano; carbonilo; carboxi; sal carboxilato; -(CH2)pC(=O)OH, -(CH2)pC(=O)O(alquilo),—(CH2)pC (=O)NH2, donde p es independientemente el entero 0, 1, 2, o 3; sulfonato; sulfona, imina, oxima; -(C=O)O-alquilo, aminocarbonilo; aminocarbonilo -N-sustituido; amino; alquilamino; o dialquilamino;
    R1a y R1b son por separado H, alquilo de 1 a 10 átomos de carbono opcionalmente sustituido con halógeno; haloalquilo; tioalquilo; nitro; cicloalquilo; aralquilo; arilo; heteroarilo; hidroxi; alcoxi; ariloxi; alcoxiheteroarilo; ciano; carbonilo; carboxi; sal carboxilato; -(CH2)pC(=O)OH, -(CH2)pC(=O)O(alquilo), —(CH2)pC (=O)NH2, donde p es independientemente el entero 0, 1, 2, o 3; sulfonato; sulfona, imina, oxima; -(C=O)O-alquilo, aminocarbonilo; aminocarbonilo -N-sustituido; amino; alquilamino; o dialquilamino; o A1 junto con tanto R1a o R1b forma un heterocicloalquilo de 3 a 6 átomos opcionalmente sustituido con halógeno; haloalquilo; tioalquilo; nitro; cicloalquilo; aralquilo; arilo; heteroarilo; hidroxi; alcoxi; ariloxi; alcoxiheteroarilo; ciano; carbonilo; carboxi; sal carboxilato; (CH2)pC(=O)OH, -(CH2)pC(=O)O(alquilo), -(CH2)pC (=O)NH2, donde p es independientemente el entero 0, 1, 2, o 3; sulfonato; sulfona, imina, oxima; -(C=O)O-alquilo, aminocarbonilo; aminocarbonilo -N-sustituido; amino; alquilamino;
    o dialquilamino;
    Y es H, alquilo, alquinilo, cicloalquilo de 3 a 7 átomos de carbono, arilo, heteroarilo, arilalquilo, cada uno de los cuales puede ser opcionalmente sustituido con halógeno; haloalquilo; tioalquilo; nitro; cicloalquilo; aralquilo; arilo; heteroarilo; hidroxi; alcoxi; ariloxi; alcoxiheteroarilo; ciano; carbonilo; carboxi; sal carboxilato; -(CH2)pC(=O)OH, (CH2)pC(=O)O(alquilo), -(CH2)pC (=O)NH2, donde p es independientemente el entero 0, 1, 2, o 3; sulfonato; sulfona, imina, oxima; -(C=O)O-alquilo, aminocarbonilo; aminocarbonilo -N-sustituido; amino; alquilamino; o dialquilamino, o Y junto con Z, M, G, o R10 forma un anillo carbox�lico, o un anillo heteroc�clico que contiene 1 a 5 hetero�tomos, donde Y est� unido a Z, M, G, o R10;
    Z es H, alquilo, hidroxi, amino, alquilamino, dialquilamino, alcoxi, cicloalquilo, cicloalquiloxi, arilo, heteroarilo, ariloxi, o heteroariloxi; o Z junto con Y, M, G, o R10 forma un anillo carbox�lico, o un anillo heteroc�clico que contiene 1 a 5 hetero�tomos, donde Z est� unido a Y, M, G, o R10;
    M es alquileno, alquenileno, o alquinileno de 1 a 5 átomos de carbono cada uno opcionalmente sustituido con halógeno; haloalquilo; tioalquilo; nitro; cicloalquilo; aralquilo; arilo; heteroarilo; hidroxi; alcoxi; ariloxi; alcoxiheteroarilo; ciano; carbonilo; carboxi; sal carboxilato; -(CH2)pC(=O)OH, -(CH2)pC(=O)O(alquilo), -(CH2)pC (=O)NH2, donde p es independientemente el entero 0, 1, 2, o 3; sulfonato; sulfona, imina, oxima; -(C=O)O-alquilo, aminocarbonilo; aminocarbonilo -N-sustituido; amino; alquilamino; o dialquilamino;
    G es un enlace, un hetero�tomo, -(C=O)-; -S(O)t- donde t = 0, 1, o 2; -NR18-; -NCOR18-; o -NS(O)xR18- donde x = 0, 1, o 2, y R18 es alquilo de 1 a 10 átomos de carbono opcionalmente sustituido con halógeno; haloalquilo; tioalquilo; nitro; cicloalquilo; aralquilo; arilo; heteroarilo; hidroxi; alcoxi; ariloxi; alcoxiheteroarilo; ciano; carbonilo; carboxi; sal carboxilato; -(CH2)pC(=O)OH, -(CH2)pC(=O)O(alquilo), —(CH2)pC (=O)NH2, donde p es independientemente el entero 0, 1, 2, o 3; sulfonato; sulfona, imina, oxima; -(C=O)O-alquilo, aminocarbonilo; aminocarbonilo -N-sustituido; amino; alquilamino; o dialquilamino, o cicloalquilo o R18 est� contenido dentro de un anillo carboc�clico, o heteroc�clico que contiene 1 a 5 hetero�tomos, donde R18 est� unido a Z, M, o R10;
    donde X2 es un hetero�tomo e independientemente grupos R11, R'11, R12, o cualquiera de R13-17 es H, halógeno, alquilo, alquenilo, alquinilo, arilo, heteroarilo, hidroxilo, alcoxi, polialquil�ter, amino, alquilamino, dialquilamino, alquiloxialquilo, ariloxi, acilo, acetilo, carboxilato, sulfonato, sulfona, imina, oxima, o heteroariloxi, donde cada uno de 5 los alquilo, alquenilo, alquinilo, arilo, heteroarilo, alcoxi, polialquil�ter, alquilamino, dialquilamino, alquiloxialquilo, ariloxi, o heteroariloxi pueden estar opcionalmente sustituidos con halógeno; haloalquilo; tioalquilo; nitro; cicloalquilo; aralquilo; arilo; heteroarilo; hidroxi; alcoxi; ariloxi; alcoxiheteroarilo; ciano; carbonilo; carboxi; sal carboxilato; -(CH2)pC(=O)OH, -(CH2)pC(=O)O(alquilo), —(CH2)pC (=O)NH2, donde p es independientemente el entero 0, 1, 2, o 3; sulfonato; sulfona, imina, oxima; -(C=O)O-alquilo, aminocarbonilo; aminocarbonilo -N-sustituido; amino;
    10 alquilamino; o dialquilamino; o grupos R11, R'11, R12, o cualquiera de R13-17 est� contenido dentro de un anillo carbox�lico, o un anillo heteroc�clico que contiene 1 a 5 hetero�tomos, y unido a grupos en la posición Y, Z, M, G, R11, R'11, R12, o cualquiera de R13-17;
    o una sal farmac�uticamente aceptable de este.
  4. 4. Una composición que comprende el compuesto o una sal de este de la reivindicación 3 junto con un 15 vehículo farmac�uticamente aceptable.
  5. 5. El compuesto de la reivindicación 3 donde:
    R10 es cualquiera de las estructuras (4a), (4b), (4c) o (4d): donde cada uno de los grupos X2, R11, R'11, R12 y R13-17 son como se definen en la reivindicación 3,
    o una sal farmac�uticamente aceptable de este.
    5 6. Una composición que comprende el compuesto o una sal de este de la reivindicación 5 junto con un vehículo farmac�uticamente aceptable.
  6. 7. Un compuesto:
    15 donde A1 es H, o alquilo de 1 a 5 átomos de carbono, o A1 y R1b forman juntos un anillo de 3-5 átomos;
    R1a es H;
    R1b es alquilo de 1 a 5 átomos de carbono, o junto con A1 forma un anillo de 3 a 5 átomos;
    Y es alquilo, alquinilo, o cicloalquilo de 3 a 7 átomos de carbono, cada uno de los cuales puede estar opcionalmente sustituido con halógeno; haloalquilo; tioalquilo; nitro; cicloalquilo; aralquilo; arilo; heteroarilo; hidroxi; alcoxi; ariloxi;
    20 alcoxiheteroarilo; ciano; carbonilo; carboxi; sal carboxilato; -(CH2)pC(=O)OH, -CH2)pC(=O)O(alquilo), -(CH2)pC (=O)NH2, donde p es independientemente el entero 0, 1, 2, o 3; sulfonato; sulfona, imina, oxima; -(C=O)O-alquilo, aminocarbonilo; aminocarbonilo -N-sustituido; amino; alquilamino; o dialquilamino, o Y junto con Z1a, Z1b, o R10 forma un anillo carbox�lico, o un anillo heteroc�clico que contiene 1 a 5 hetero�tomos, donde Y est� unido a Z1a, Z1b, o R10; Z1a y Z1b son independientemente H, hidroxi, amino, alquilamino, dialquilamino, alcoxi, ariloxi, o heteroariloxi; o Z1a o Z1b, junto con Y o R10 forma un anillo carbox�lico, o un anillo heteroc�clico que contiene 1 a 5 hetero�tomos, donde Z1a o Z1b, est� unido a Y o R10;
    M es alquileno de 1 a 5 átomos de carbono opcionalmente sustituido con halógeno; haloalquilo; tioalquilo; nitro;
    5 cicloalquilo; aralquilo; arilo; heteroarilo; hidroxi; alcoxi; ariloxi; alcoxiheteroarilo; ciano; carbonilo; carboxi; sal carboxilato; -(CH2)pC(=O)OH, -(CH2)pC(=O)O(alquilo), -(CH2)pC (=O)NH2, donde p es independientemente el entero 0, 1, 2, o 3;
    sulfonato; sulfona, imina, oxima; -(C=O)O-alquilo, aminocarbonilo; aminocarbonilo -N-sustituido; amino; alquilamino;
    o dialquilamino;
    10 G es un enlace, un hetero�tomo, -(C=O)-; -NR18-; -NCOR18-; o -NS(O)xR18- donde x = 0, 1, o 2, y R18 es alquilo de 1 a 5 átomos de carbono opcionalmente sustituido con halógeno; haloalquilo; tioalquilo; nitro; cicloalquilo; aralquilo; arilo; heteroarilo; hidroxi; alcoxi; ariloxi; alcoxiheteroarilo; ciano; carbonilo; carboxi; sal carboxilato; -(CH2)pC(=O)OH, (CH2)pC(=O)O(alquilo),
    —(CH2)pC (=O)NH2, donde p es independientemente el entero 0, 1, 2, o 3; sulfonato; sulfona, imina, oxima; 15 (C=O)O-alquilo, aminocarbonilo; aminocarbonilo -N-sustituido; amino; alquilamino; o dialquilamino;
    R10 es arilo, a heteroarilo, o R10 es cualquiera de las estructuras (4a), (4b), (4c) o (4d):
    donde X2 es un hetero�tomo e independientemente grupos R11, R'11, R12, o cualquiera de R13-17 es H, halógeno,
    20 alquilo, alquenilo, alquinilo, arilo, heteroarilo, hidroxilo, alcoxi, polialquil�ter, amino, alquilamino, dialquilamino, alquiloxialquilo, ariloxi, acilo, acetilo, carboxilato, sulfonato, sulfona, imina, oxima, o heteroariloxi, donde cada uno de los alquilo, alquenilo, alquinilo, arilo, heteroarilo, alcoxi, polialquil�ter, alquilamino, dialquilamino, alquiloxialquilo, ariloxi, o heteroariloxi pueden estar opcionalmente sustituidos con halógeno; haloalquilo; tioalquilo; nitro; cicloalquilo; aralquilo; arilo; heteroarilo; hidroxi; alcoxi; ariloxi; alcoxiheteroarilo; ciano; carbonilo; carboxi; sal
    25 carboxilato;
    -
    (CH2)pC(=O)OH, -(CH2)pC(=O)O(alquilo), —(CH2)pC (=O)NH2, donde p es independientemente el entero 0, 1, 2, o 3; sulfonato; sulfona, imina, oxima; -(C=O)O-alquilo, aminocarbonilo; aminocarbonilo -N-sustituido; amino; alquilamino;
    o dialquilamino; o grupos R11, R'11, R12, o cualquiera de R13-17 est� contenido dentro de un anillo carbox�lico, o un
    anillo heteroc�clico que contiene 1 a 5 hetero�tomos, y unido a grupos en la posición Y, Z, M, G, R11, R'11, R12, o cualquiera de R13-17;
    o una sal farmac�uticamente aceptable de este.
  7. 8. El compuesto de la reivindicación 7 que tiene un Kd para IAP o menos que aproximadamente 1 micromolar; 5 o una sal farmac�uticamente aceptable de este.
  8. 9. El compuesto de la reivindicación 7 donde A1 es H, metilo, o etilo,
    o una sal farmac�uticamente aceptable de este.
  9. 10. El compuesto de la reivindicación 7 donde R1a, es H; R1b es metilo o etilo;
    o una sal farmac�uticamente aceptable de este.
    10 11. El compuesto de la reivindicación 7 donde Y es un alquilo de 1 a 10 átomos de carbono, un alquilo ramificado de 1 a 10 átomos de carbono, un alquinilo, a cicloalquilo de 3 a 7 átomos de carbono, cada uno de los cuales pueden estar opcionalmente sustituidos con halógeno; haloalquilo; tioalquilo; nitro; cicloalquilo; aralquilo; arilo; heteroarilo; hidroxi; alcoxi; ariloxi; alcoxiheteroarilo; ciano; carbonilo; carboxi; sal carboxilato; -(CH2)pC(=O)OH, -(CH2)pC(=O)O(alquilo), —(CH2)pC (=O)NH2, donde p es independientemente
    15 el entero 0, 1, 2, o 3; sulfonato; sulfona, imina, oxima; -(C=O)O-alquilo, aminocarbonilo; aminocarbonilo -Nsustituido; amino; alquilamino; o dialquilamino o una sal farmac�uticamente aceptable de este.
  10. 12. El compuesto de la reivindicación 7 donde Z1a y Z1b son independientemente H, hidroxi, amino, alquilamino, dialquilamino, alcoxi, ariloxi, o heteroariloxi; o una sal farmac�uticamente aceptable de este.
  11. 13. El compuesto de la reivindicación 7 donde M es alquileno de 1 a 5 átomos de carbono; o una sal 20 farmac�uticamente aceptable de este.
  12. 14. El compuesto de la reivindicación 7 donde R10 es:
    y R3, R'3, R4, R5, R'5, son cada uno independientemente H, alquilo, cicloalquilo, arilo, heteroarilo, alcoxi opcionalmente sustituido alquilo, cicloalquilo, alquileno, arilo, heteroarilo, halo, ciano, —(CH2)pC(=O)OH, —25 (CH2)pC(=O)O-alquilo, o —(CH2)pC (=O)NH2 y donde p es independientemente el entero 0, 1, 2, o 3.
  13. 15. El compuesto de cualquiera de las reivindicaciones 7 a 12 donde R10 es cualquiera de las estructuras (4a), (4b), (4c) o (4d):
    donde X2 es un hetero�tomo e independientemente grupos R11, R'11, R12, o cualquiera de R13-17 es H, halógeno, alquilo, alquenilo, alquinilo, arilo, heteroarilo, hidroxilo, alcoxi, polialquil�ter, amino, alquilamino, dialquilamino, alquiloxialquilo, ariloxi, acilo, acetilo, carboxilato, sulfonato, sulfona, imina, oxima, o heteroariloxi, donde cada uno de los alquilo, alquenilo, alquinilo, arilo, heteroarilo, alcoxi, polialquil�ter, alquilamino, dialquilamino, alquiloxialquilo, ariloxi, o heteroariloxi pueden estar opcionalmente sustituidos con halógeno; haloalquilo; tioalquilo; nitro; cicloalquilo; aralquilo; arilo; heteroarilo; hidroxi; alcoxi; ariloxi; alcoxiheteroarilo; ciano; carbonilo; carboxi; sal carboxilato; -(CH2)pC(=O)OH, -(CH2)pC(=O)O(alquilo), —(CH2)pC (=O)NH2, donde p es independientemente el entero 0, 1, 2, o 3; sulfonato; sulfona, imina, oxima; -(C=O)O-alquilo, aminocarbonilo; aminocarbonilo -N-sustituido; amino; alquilamino; o dialquilamino;
    o una sal farmac�uticamente aceptable de este.
  14. 16. El compuesto de la reivindicación 7 donde R10 tiene la estructura de fórmula (4a):
    donde X2 es un hetero�tomo e independientemente grupos R11, R12, o cualquiera de R14-17 es H, halógeno, alquilo, alquenilo, alquinilo, arilo, heteroarilo, hidroxilo, alcoxi, polialquil�ter, amino, alquilamino, dialquilamino, alquiloxialquilo, ariloxi, acilo, acetilo, carboxilato, sulfonato, sulfona, imina, oxima, o heteroariloxi, donde cada uno de los alquilo, arilo, alquenilo, alquinilo, heteroarilo, alcoxi, polialquil�ter, alquilamino, dialquilamino, alquiloxialquilo, ariloxi, o heteroariloxi pueden estar opcionalmente sustituidos con halógeno; haloalquilo; tioalquilo; nitro; cicloalquilo; aralquilo; arilo; heteroarilo; hidroxi; alcoxi; ariloxi; alcoxiheteroarilo; ciano; carbonilo; carboxi; sal carboxilato; -(CH2)pC(=O)OH, -(CH2)pC(=O)O(alquilo), —(CH2)pC (=O)NH2, donde p es independientemente el entero 0, 1, 2, o 3; sulfonato; sulfona, imina, oxima; -(C=O)O-alquilo, aminocarbonilo; aminocarbonilo -N-sustituido; amino; alquilamino; o dialquilamino;
    o una sal farmac�uticamente aceptable de este.
  15. 17. El compuesto de la reivindicación 7 donde A1 es H, o alquilo de 1 a 10 átomos de carbono; R1a es H; R1b es alquilo de 1 a 10 átomos de carbono; Y es alquilo, o cicloalquilo de 3 a 7 átomos de carbono, cada uno de los cuales pueden estar opcionalmente sustituidos con halógeno; haloalquilo; tioalquilo; nitro; cicloalquilo; aralquilo; arilo; heteroarilo; hidroxi; alcoxi; ariloxi; alcoxiheteroarilo; ciano; carbonilo; carboxi; sal carboxilato; -(CH2)pC(=O)OH,
    (CH2)pC(=O)O(alquilo), -(CH2)pC (=O)NH2, donde p es independientemente el entero 0, 1, 2, o 3; sulfonato; sulfona, imina, oxima; -(C=O)O-alquilo, aminocarbonilo; aminocarbonilo -N-sustituido; amino; alquilamino; o dialquilamino;
    Z1a y Z1b son independientemente H, hidroxi, alcoxi, ariloxi, o heteroariloxi;
    M es alquileno de 1 a 5 átomos de carbono opcionalmente sustituido con halógeno; haloalquilo; tioalquilo; nitro; cicloalquilo; aralquilo; arilo; heteroarilo; hidroxi; alcoxi; ariloxi; alcoxiheteroarilo; ciano; carbonilo; carboxi; sal carboxilato; -(CH2)pC(=O)OH, -(CH2)pC(=O)O(alquilo),-(CH2)pC (=O)NH2, donde p es independientemente el entero 0, 1, 2, o 3; sulfonato; sulfona, imina, oxima;
    (C=O)O-alquilo, aminocarbonilo; aminocarbonilo -N-sustituido; amino; alquilamino; o dialquilamino;
    G es un enlace, un hetero�tomo, o -NCOR18- y R18 es alquilo de 1 a 10 átomos de carbono opcionalmente sustituido con halógeno; haloalquilo; tioalquilo; nitro; cicloalquilo; aralquilo; arilo; heteroarilo; hidroxi; alcoxi; ariloxi; alcoxiheteroarilo; ciano; carbonilo; carboxi; sal carboxilato; -(CH2)pC(=O)OH, -(CH2)pC(=O)O(alquilo), -(CH2)pC (=O)NH2, donde p es independientemente el entero 0, 1, 2, o 3; sulfonato; sulfona, imina, oxima;
    (C=O)O-alquilo, aminocarbonilo; aminocarbonilo -N-sustituido; amino; alquilamino; o dialquilamino;
    R10 es cualquiera de las estructuras (4a), (4b), (4c) o (4d): donde X2 es un hetero�tomo e independientemente grupos R11, R'11, R12, o cualquiera de R13-17 son H, halógeno, alquilo, alquenilo, alquinilo, arilo, heteroarilo, hidroxilo, alcoxi, polialquil�ter, amino, alquilamino, dialquilamino, alquiloxialquilo, ariloxi, acilo, acetilo, carboxilato, sulfonato, sulfona, imina, oxima, o heteroariloxi, donde cada uno de los alquilo, arilo, alquenilo, alquinilo, heteroarilo, alcoxi, polialquil�ter, alquilamino, dialquilamino, alquiloxialquilo, ariloxi, o heteroariloxi pueden estar opcionalmente sustituidos con halógeno; haloalquilo; tioalquilo; nitro; cicloalquilo; aralquilo; arilo; heteroarilo; hidroxi; alcoxi; ariloxi; alcoxiheteroarilo; ciano; carbonilo; carboxi; sal carboxilato;
    (CH2)pC(=O)OH, -(CH2)pC(=O)O(alquilo), —(CH2)pC (=O)NH2, donde p es independientemente el entero 0, 1, 2, o 3; sulfonato; sulfona, imina, oxima;
    (C=O)O-alquilo, aminocarbonilo; aminocarbonilo -N-sustituido; amino; alquilamino; o dialquilamino; o grupos R11, R'11, R12, o cualquiera de R13-17 est�n contenidos dentro de un anillo carbox�lico, o un anillo heteroc�clico que contiene 1 a 5 hetero�tomos, y unido a grupos en la posición Y, Z1a, Z1b, M, G, R11, R'11, R12, o cualquiera de R13-17;
    o una sal farmac�uticamente aceptable de este.
  16. 18. El compuesto de la reivindicación 7 donde
    A1 es H, o metilo;
    R1a es H;
    R1b es metilo o etilo;
    Y es alquilo, o cicloalquilo de 3 a 7 átomos de carbono, cada uno de los cuales est� opcionalmente sustituido con halógeno; haloalquilo; tioalquilo; nitro; cicloalquilo; aralquilo; arilo;
    heteroarilo; hidroxi; alcoxi; ariloxi; alcoxiheteroarilo; ciano; carbonilo; carboxi; sal carboxilato;
    -
    (CH2)pC(=O)OH, -(CH2)pC(=O)O(alquilo), —(CH2)pC (=O)NH2, donde p es independientemente el entero 0, 1, 2, o 3; sulfonato; sulfona, imina, oxima; -(C=O)O-alquilo, aminocarbonilo; aminocarbonilo -N-sustituido; amino; alquilamino;
    o dialquilamino; Z1a y Z1b son independientemente un H, hidroxi, o alcoxi; M es metileno; G es un enlace; R10 es arilo, heteroarilo, o R10 es cualquiera de las estructuras (4a) o (4b):
    donde X2 es un hetero�tomo e independientemente grupos R11, R'11, R12, o cualquiera de R13-17 son H, halógeno, alquilo, alquenilo, alquinilo, arilo, heteroarilo, hidroxilo, alcoxi, polialquil�ter, amino, alquilamino, dialquilamino, alquiloxialquilo, ariloxi, acilo, acetilo, carboxilato, sulfonato, sulfona, imina, oxima, o heteroariloxi, donde cada uno de los alquilo, arilo, alquenilo, alquinilo, heteroarilo, alcoxi, polialquil�ter, alquilamino, dialquilamino, alquiloxialquilo, ariloxi, o heteroariloxi pueden estar opcionalmente sustituidos con halógeno; haloalquilo; tioalquilo; nitro; cicloalquilo; aralquilo; arilo; heteroarilo; hidroxi; alcoxi; ariloxi; alcoxiheteroarilo; ciano; carbonilo; carboxi; sal carboxilato; -(CH2)pC(=O)OH, -(CH2)pC(=O)O(alquilo), —(CH2)pC (=O)NH2, donde p es independientemente el entero 0, 1, 2, o 3; sulfonato; sulfona, imina, oxima; -(C=O)O-alquilo, aminocarbonilo; aminocarbonilo -N-sustituido; amino; alquilamino; o dialquilamino; o grupos R11, R'11, R12, o cualquiera de R13-17 est�n contenidos dentro de un anillo carbox�lico, o un anillo heteroc�clico que contiene 1 a 5 hetero�tomos, y unido a grupos en la posición Y, Z1a, Z1b, M, G, R11, R'11, R12, o cualquiera de R13-17,;
    o una sal farmac�uticamente aceptable de este.
  17. 19. El compuesto de la reivindicación 18, en el que R10 es:
    donde grupos X2, R11, R12, R14 a R17 se definen en la reivindicación 18 o una sal farmac�uticamente aceptable de
    este.
  18. 20.
    El compuesto de la reivindicación 18, en el que X2 es nitrógeno; o una sal farmac�uticamente aceptable de este.
  19. 21.
    Una composición que comprende el compuesto o una sal de este de cualquiera de las reivindicaciones 7 a 20 junto con un vehículo farmac�uticamente aceptable.
  20. 22.
    La composición de cualquiera de las reivindicaciones 4 y 6 para reducir un trastorno de proliferaci�n celular en células.
  21. 23.
    La composición de la reivindicación 22 donde el compuesto de unión a IAP tiene un EC50 de menos que aproximadamente 1 micromolar.
  22. 24.
    La composición de la reivindicación 22 donde el compuesto de unión a IAP tiene un EC50 de menos que aproximadamente 0,06 micromolar.
  23. 25.
    La composición de la reivindicación 24 donde el compuesto tiene un Kd para IAP de menos que aproximadamente 0,1 micromolar.
  24. 26.
    El compuesto de la reivindicación 3, donde A1 es H, o alquilo de 1 a 10 átomos de carbono;
    R1a y R1b son por separado H, alquilo de 1 a 10 átomos de carbono; o A1 junto con tanto R1a o R1b forma un heterocicloalquilo de 3 a 6 átomos; Y es H, alquilo, alquinilo, cicloalquilo de 3 a 7 átomos de carbono, arilo, heteroarilo, arilalquilo, o Y junto con Z, M, G,
    o R10 forma un anillo carbox�lico, o un anillo heteroc�clico que contiene 1 a 5 hetero�tomos, donde Y est� unido a Z, M, G, o R10;
    Z es H, alquilo, hidroxi, amino, alquilamino, dialquilamino, alcoxi, cicloalquilo, cicloalquiloxi, arilo, heteroarilo, ariloxi, o heteroariloxi; o Z junto con Y, M, G, o R10 forma un anillo carbox�lico, o un anillo heteroc�clico que contiene 1 a 5 hetero�tomos, donde Z est� unido a Y, M, G, o R10;
    M es alquileno, alquenileno, o alquinileno de 1 a 5 átomos de carbono;
    G es un enlace, un hetero�tomo, —(C=O)—; —S(O)t— donde t = 0, 1, o 2; -NR18-; —NCOR18—; o —NS(O)xR18— donde x = 0, 1, o 2, y R18 es alquilo de 1 a 10 átomos de carbono, o cicloalquilo o R18 est� contenido dentro de un anillo carboc�clico, o heteroc�clico que contiene 1 a 5 hetero�tomos, donde R18 est� unido a Z, M, o R10;
    R10 es arilo, heteroarilo, un arilo fusionado, un heteroarilo fusionado; o R10 es cualquiera de las estructuras (4a), (4b), (4c) o (4d):
    5 alquiloxialquilo, ariloxi, acilo, acetilo, carboxilato, sulfonato, sulfona, imina, oxima, o heteroariloxi; o grupos R11, R'11, R12, o cualquiera de R13-17 est� contenido dentro de un anillo carbox�lico, o un anillo heteroc�clico que contiene 1 a 5 hetero�tomos, y unido a grupos en la posición Y, Z, M, G, R11, R'11, R12, o cualquiera de R13-17; o una sal farmac�uticamente aceptable de este.
  25. 27. El compuesto de la reivindicación 26 en el que R10 es cualquiera de las estructuras (4a), (4b),
    10 (4c) o (4d):
    donde grupos X2, R11, R'11, R12, y R13-17 son como se definen en la reivindicación 26, o una sal farmac�uticamente aceptable de este.
  26. 28. El compuesto de la reivindicación 3 seleccionado de
    o una sal farmac�uticamente aceptable de este.
  27. 29. Un d�mero que comprende 1) dos compuestos como se reivindica en la reivindicación 1, unido a Y, Z o R2;
    o 2) dos compuestos como se reivindica en la reivindicación 3, unido a Y, Z o R10; o 3) dos compuestos como se reivindica en la reivindicación 7, unido a Y, Z1a o Z1b, o R10, pero excluidos los siguientes compuestos:
  28. 30.
    El d�mero de la reivindicación 29 que comprende dos compuestos como se reivindica en la reivindicación 1, unido a Y, Z o R2.
  29. 31.
    El d�mero de la reivindicación 29 que comprende dos compuestos como se reivindica en la reivindicación 3, unido a Y, Z o R10.
  30. 32.
    El d�mero de la reivindicación 29 que comprende dos compuestos como se reivindica en la reivindicación 7, unido a Y, Z1a, Z1b, o R10.
  31. 33. El d�mero de la reivindicación 32 donde R10 es un grupo de fórmula (4a)
    donde X2 es un hetero�tomo e independientemente grupos R11, R12, o cualquiera de R14-17 es H, halógeno, alquilo, alquenilo, alquinilo, arilo, heteroarilo, hidroxilo, alcoxi, polialquil�ter, amino, alquilamino, dialquilamino, alquiloxialquilo, ariloxi, acilo, acetilo, carboxilato, sulfonato, sulfona, imina, oxima, o heteroariloxi, donde cada uno de los alquilo, arilo, alquenilo, alquinilo, heteroarilo, hidroxilo, alcoxi, polialquil�ter, amino, alquilamino, dialquilamino, alquiloxialquilo, ariloxi, o heteroariloxi pueden estar opcionalmente sustituidos con halógeno; haloalquilo; tioalquilo; nitro; cicloalquilo; aralquilo; arilo; heteroarilo; hidroxi; alcoxi; ariloxi; alcoxiheteroarilo; ciano; carbonilo; carboxi; sal carboxilato; -(CH2)pC(=O)OH, -(CH2)pC(=O)O(alquilo), —(CH2)pC (=O)NH2, donde p es independientemente el entero 0, 1, 2, o 3; sulfonato; sulfona, imina, oxima; -(C=O)O-alquilo, aminocarbonilo; aminocarbonilo -N-sustituido; amino; alquilamino; o dialquilamino.
  32. 34. El d�mero como se reivindica en cualquiera de las reivindicaciones 31 a 33, unido a R10.
    .
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