ES2318167T3 - Compuestos de union a iap. - Google Patents

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ES2318167T3 ES03764670T ES03764670T ES2318167T3 ES 2318167 T3 ES2318167 T3 ES 2318167T3 ES 03764670 T ES03764670 T ES 03764670T ES 03764670 T ES03764670 T ES 03764670T ES 2318167 T3 ES2318167 T3 ES 2318167T3
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George Mclendon
Rachael A. Kipp
Martin Case
Yigong Shi
Martin F. Semmelhack
Philip A. Albiniak
Aislyn D. Wist
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Abstract

Compuesto de fórmula I: ** ver fórmula** en la que R1 es metilo, etilo, n-propilo, isopropilo o etenilo; R1a es H o metilo; X es -O-, -S-, -CH 2- o -NH-, y J es -CH- o -N-, siempre que cuando J es -N-, X es -CH 2- o -NH-; Y es H, metilo, etilo, n-propilo o isopropilo; R 2 es** ver fórmula** R 2a es cicloalquilo, cicloalquilalquilo, alfa-naftilmetilo, beta-naftilmetilo o un bencilo sustituido con uno o más halógeno, arilo, carboxilo, alcoxicarbonilo o aroílo, o combinaciones de los mismos: R 2b es H o alquilo; M es ** ver fórmula** Ar es ** ver fórmula** R 3 , R 4 , R 5 , R 6 , R 7 , R 8 y R 9 son cada uno independientemente H, metilo, etilo, n-propilo, isopropilo, halógeno, ciano, -(CH2)p-C(=O)OH, -(CHZ)p-C(=O)O-alquilo, -(CHZ)p-C(=O)NH2; 3; n y p son cada uno independientemente el número entero 0, 1, 2 ó 3, y la suma de (n + p) es el número entero 2 ó siempre que al menos uno de R 3 , R 4 y R 5 o al menos dos de R 6 , R 7 , R 8 y R 9 son cada uno independientemente H, metilo, etilo, n-propilo, isopropilo, halógeno o ciano; siempre que cuando uno o más de R 3 y R 5 es isopropilo, R 4 es diferente de isopropilo; siempre que cuando R 4 es isopropilo, R 3 y R 5 son cada uno independientemente diferentes de isopropilo; siempre que cuando R 8 es isopropilo, R 9 es diferente de isopropilo; y siempre que cuando R 1a es H, X es -NH-, J es -CH-, Y es H, metilo o isopropilo, y R 2 es: ** ver fórmula** R 1 es etenilo; o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo.

Description

Compuestos de unión a IAP.
Esta solicitud reivindica el beneficio de la solicitud provisional estadounidense nº 60/395.918, presentada el 15 de julio de 2002.
Campo de la invención
La presente invención se refiere al campo del diseño de de fármacos y el desarrollo para el diagnóstico, la prevención y el tratamiento de enfermedad proliferativa celular. Específicamente, la invención ofrece peptidomiméticos del tetrapéptido N-terminal de la proteína mitocondrial Smac/DIABLO (en lo sucesivo en el presente documento Smac), que promueve la apoptosis en células a través de una ruta que implica el inhibidor de proteínas de apoptosis (IAP), mostrado a modo de ejemplo mediante XLAP. Estos peptidomiméticos se unen a los IAP y ofrecen características farmacológicas mejoradas en comparación con el tetrapéptido.
Antecedentes de la invención
La apoptosis (muerte celular programada) desempeña un papel central en el desarrollo y la homeostasis de todos los organismos multicelulares. Alteraciones en las rutas apoptóticas se han implicado en muchos tipos de patologías humanas, incluyendo trastornos del desarrollo, cáncer, enfermedades autoinmunitarias, así como trastornos neurodegenerativos.
Por tanto, las rutas de muerte celular programada se han convertido en objetivos atractivos para el desarrollo de agentes terapéuticos. En particular, puesto que conceptualmente es más fácil matar que mantener células, la atención se ha centrado en tratamientos anticancerosos que usan agentes proapoptóticos tales como quimioterapia y radiación convencionales. En general, se cree que estos tratamientos provocan la activación de las rutas apoptóticas mediadas por mitocondrias. Sin embargo, estos tratamientos carecen de especificidad molecular y se necesitan dianas moleculares más específicas.
La apoptosis se ejecuta principalmente mediante caspasas activadas, una familia de cisteína proteasas con especificidad para aspartato en sus sustratos. Las caspasas se producen en células como zimógenos catalíticamente inactivos y deben procesarse de manera proteolítica para convertirse en proteasas activas durante la apoptosis. En células supervivientes normales que no han recibido un estímulo apoptótico, la mayoría de las caspasas permanece inactiva. Incluso si algunas caspasas se activan de manera anómala, su actividad proteolítica puede inhibirse completamente por una familia de proteínas conservadas en la evolución denominadas IAP (inhibidores de proteínas de apoptosis) (Deveraux & Reed, Genes Dev. 13: 239-252, 1999). Cada uno de los IAP contiene de 1-3 copias del denominado dominio BIR (repetición IAP de baculovirus) e interacciona directamente con e inhibe la actividad enzimática de caspasas maduras. Se han identificado varios IAP de mamífero distintos incluyendo XIAP, survivina y livina/ML-LAP (Kasof & Gomes, J. Biol. Chem. 276: 3238-3246, 2001; Vucic et al. Curr. Biol. 10: 1359-1366, 2000; Ashhab et al. FEBS Lett. 495: 56-60, 2001), y todos muestran actividad antiapoptótica en cultivo celular (Deveraux & Reed, 1999, citado anteriormente). Debido a que los IAP se expresan en la mayoría de las células cancerosas, pueden contribuir directamente a la progresión tumoral y posterior resistencia al tratamiento farmacológico.
Sin embargo, en células normales destinadas a experimentar apoptosis, el efecto inhibidor mediado por IAP debe eliminarse, un proceso realizado, al menos en parte, por una proteína mitocondrial denominada Smac (segundo activador de caspasas derivado de las mitocondrias; Du et al. Cell 102: 33-42, 2000) o DIABLO (proteína de unión directa a IAP con bajo pI; Verhagen et al. Cell 102: 43-53, 2000). La Smac, sintetizada en el citoplasma, se dirige al espacio intermembrana de la mitocondria. Tras estímulos apoptóticos, se libera Smac de la mitocondria de nuevo al citosol, junto con el citocromo c. Mientras que el citocromo c induce la multimerización de Apaf-1 para activar la procaspasa-9 y -3, Smac elimina el efecto inhibidor de múltiples IAP. Smac interacciona con todos los IAP que se han examinado hasta la fecha, incluyendo XIAP, c-IAP1, c-IAP2 y survivina (Du et al., 2000, citado anteriormente; Verhagen et al., 2000, citado anteriormente). Por tanto, Smac parece ser un regulador maestro de la apoptosis en
mamíferos.
Smac se sintetiza como una molécula precursora de 239 aminoácidos; los 55 residuos N-terminales sirven como la secuencia de direccionamiento a la mitocondria que se elimina tras el traslado (Du et al., 2000, citado anteriormente). La forma madura de Smac contiene 184 aminoácidos y se comporta como un oligómero en disolución (Du et al., 2000, citado anteriormente). Se han propuesto Smac y diversos fragmentos de la misma para su uso como dianas para la identificación de agentes terapéuticos. La patente estadounidense número 6.110.691 concedida a Wang et al. describe el polipéptido Smac y fragmentos que oscilan desde al menos 8 residuos de aminoácido de longitud. Sin embargo, la patente ni da a conocer ni enseña una base estructural para elegir un fragmento peptídico particular de Smac para su uso como diana o agente terapéutico.
De manera similar a los mamíferos, las moscas contienen dos IAP, DIAP1 y DIAP2, que se unen e inactivan varias caspasas de Drosophila (Hay, Cell Death Differ. 7: 1045-1056, 2000). DIAP1 contiene dos dominios BIR; el segundo dominio BIR (BIR2) es necesario y suficiente para bloquear la muerte celular en muchos contextos. En células de Drosophila, la función antimuerte de DIAP1 se elimina mediante tres proteínas proapoptóticas, Hid, Grim y Reaper, que interaccionan físicamente con el dominio BIR2 de DIAP1 y eliminan su efecto inhibidor sobre las caspasas. Por tanto Hid, Grim y Reaper representan los homólogos funcionales de la proteína de mamífero Smac. Sin embargo, excepto por sus 10 residuos N-terminales, Hid, Grim y Reaper no comparten homología de secuencia entre sí, y no hay homología evidente entre las tres proteínas de Drosophila y Smac.
En la solicitud estadounidense en tramitación junto con la presente y de propiedad común número 09/965.967, se da a conocer que la actividad biológica descrita anteriormente de Smac está relacionada con la unión de sus cuatro residuos N-terminales a una ranura superficial característica en una parte de XIAP denominada el dominio BIR3. Esta unión impide que XIAP ejerza su función de supresión de la apoptosis en la célula. Además se dio a conocer que los tetrapéptidos N-terminales de las proteínas de unión a IAP de las proteínas proapoptóticas de Drosophila Hid, Grim y Veto funcionan de la misma manera.
La solicitud internacional en tramitación junto con la presente y de propiedad común número PCT/US02/17342 describe ensayos para su uso en la selección de alto rendimiento o el diseño de fármacos racional de agentes que pueden, como el tetrapéptido de Smac o sus homólogos en otras especies, unirse a un dominio BIR de un IAP, aliviando de ese modo la supresión mediada por IAP de la apoptosis. Esos ensayos se basan en desplazamiento competitivo de un tetrapéptido de unión a IAP marcado por un compuesto de prueba. Esa solicitud describe también una biblioteca de péptidos y análogos de N-metil-péptidos que, mediante el método de ensayo, se demostró que se unían al dominio BIR3 de XIAP.
El uso de péptidos para administración in vivo como agentes terapéuticos o de diagnóstico está asociado con ciertas desventajas. Éstas incluyen una semivida corta debido a la degradación proteolitica en el organismo, baja absorción a través de las paredes intestinales y posibles reacciones inmunógenas, así como el gasto implicado en la síntesis peptídica. Por estos motivos, muchos esfuerzos actuales en el desarrollo de fármacos se centran en miméticos no peptídicos que imitan la estructura y actividad biológica de péptidos bioactivos, pero que presentan propiedades farmacológicas mejoradas y son más fáciles y más económicos de sintetizar.
El documento W002/26775 da a conocer péptidos y peptidomiméticos que pueden modular la apoptosis a través de sus interacción con IAP celulares. A este respecto se da a conocer la secuencia peptídica de AVPF.
En relación con los tetrapéptidos de Smac y homólogos descritos anteriormente, entonces, sería un avance significativo en la técnica desarrollar miméticos no peptídicos o peptídicos parciales de esas moléculas. Tales miméticos deben presentar la bioactividad de promoción de apoptosis y unión a IAP de los péptidos Smac, mientras que también tienen propiedades mejoradas asociadas con miméticos no peptídicos, para su uso como agentes terapéuticos y de diagnóstico en el tratamiento del cáncer.
Sumario de la invención
La presente invención se refiere en general a oligopéptidos y peptidomiméticos, a composiciones farmacéuticas que contienen estos compuestos y a métodos para su uso como agentes terapéuticos y de diagnóstico. Los compuestos ofrecidos en el presente documento son miméticos del tetrapéptido N-terminal de proteínas de unión a IAP (inhibidor de proteína de apoptosis), tales como la Smac/DIABLO de mamífero y sus homólogos, hid, grim y reaper.
En una realización, la invención se refiere a compuestos de fórmula I:
\vskip1.000000\baselineskip
1
\vskip1.000000\baselineskip
en la que:
R^{1} es metilo, etilo, n-propilo, isopropilo o etenilo;
R^{1a} es H o metilo;
X es -O-, -S-, -CH_{2}- o -NH-, y J es -CH- o -N-, siempre que cuando J es -N-, X es -CH_{2}- o -NH-;
Y es H, metilo, etilo, n-propilo o isopropilo;
\newpage
R^{2} es:
2
R^{2a} es cicloalquilo o cicloalquilalquilo, alfa-naftilmetilo, beta-naftilmetilo o un bencilo sustituido con uno o más halógeno, arilo, carboxilo, alcoxicarbonilo o aroilo, o combinaciones de los mismos;
R^{2b} es H o alquilo;
M es:
3
\vskip1.000000\baselineskip
Ar es:
300
R^{3}, R^{4}, R^{5}, R^{6}, R^{7}, R^{8} y R^{9} son cada uno independientemente H, metilo, etilo, n-propilo, isopropilo, halógeno, ciano, -(CH_{2})_{p}-C(-O)OH, -(CH_{2})_{p}-C(=O)O-alquilo, -(CH_{2})_{p}-C(=O)NH_{2};
n y p son cada uno independientemente el número entero 0, 1, 2 ó 3, y la suma de (n + p) es el número entero 2 ó 3; siempre que al menos uno de R^{3}, R^{4} y R^{5}, o al menos dos de R^{6}, R^{7}, R^{8} y R^{9} son cada uno independientemente H, metilo, etilo, n-propilo, isopropilo, halógeno o ciano;
siempre que cuando uno o más de R^{3} y R^{5} es isopropilo, R^{4} es diferente de isopropilo;
siempre que cuando R^{4} es isopropilo, R^{3} y R^{5} son cada uno independientemente diferentes de isopropilo;
siempre que cuando R^{8} es isopropilo, R^{9} es diferente de isopropilo; y
siempre que cuando R^{1a} es H, X es -NH-, J es -CH-, Y es H, metilo o isopropilo, y R^{2} es:
\vskip1.000000\baselineskip
4
\vskip1.000000\baselineskip
entonces
R^{1} es etenilo;
o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo.
En otra realización, la invención se refiere a compuestos de fórmula IIa o IIb:
5
en las que:
R^{1} es metilo, etilo, n-propilo, isopropilo o etenilo;
R^{1a} es H o metilo;
Q^{1} y Q^{3} son cada uno independientemente -O-, S- o -NH-;
Q^{2} es-CH- o -N-;
Q^{4} es -N-;
R^{2} es:
6
R^{2a} es cicloalquilo, cicloalquilalquilo, alfa-naftil-metilo, beta-naftilmetilo o un bencilo sustituido con uno o más halógeno, arilo, carboxilo, alcoxicarbonilo o aroílo o combinaciones de los mismos;
R^{2b} es H o alquilo;
M es:
7
Ar es:
700
R^{3}, R^{4}, R^{5}, R^{6}, R^{7}, R^{8} y R^{9} son cada uno independientemente H, metilo, etilo, n-propilo, isopropilo, halógeno, ciano, -(CH_{2})_{p}-C(-O)OH, -(CH_{2})_{p}-C(=O)O-alquilo, -(CH_{2})_{p}-C(=O)NH_{2};
R^{10} es H o metilo;
n y p son cada uno independientemente el número entero 0, 1, 2 ó 3, y la suma de (n + p) es el número entero 2 ó 3;
siempre que al menos uno de R^{3}, R^{4} y R^{5} o al menos dos de R^{6}, R^{7}, R^{8} y R^{9} son cada uno independientemente H, metilo, etilo, n-propilo, isopropilo, halógeno o ciano;
siempre que cuando uno o más de R^{3} y R^{5} es isopropilo, R^{4} es diferente de isopropilo;
siempre que cuando R^{4} es isopropilo, R^{3} y R^{5} son cada uno independientemente diferentes de isopropilo;
siempre que cuando R^{8} es isopropilo, R^{9} es diferente de isopropilo;
o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo.
Los compuestos anteriores pueden formularse como composiciones farmacéuticas o como agentes de diagnóstico o ambos. Tal como se describe en mayor detalle en el presente documento, estas composiciones farmacéuticas y agentes de diagnóstico son útiles para el tratamiento o la detección de trastornos proliferativos celulares, así como en ensayos de selección para el descubrimiento y desarrollo de agentes terapéuticos y de diagnóstico adicionales.
Otras características y ventajas de la invención se comprenderán con referencia a la descripción detallada y a los ejemplos que siguen.
Descripción detallada de realizaciones ilustrativas
Tal como se empleó anteriormente y en toda la descripción, a menos que se indique lo contrario, debe entenderse que los siguientes términos tienen los siguientes significados.
Las expresiones "farmacéuticamente activo" y "biológicamente activo" se refieren a la capacidad de los compuestos de la invención para unirse a IAP (inhibidor de proteína de apoptosis), específicamente a la ranura de unión BIR de IAP, más específicamente a la ranura de unión BIR3 de IAP. Esta actividad biológica puede medirse con respecto a cualquier IAP, siendo XIAP particularmente adecuado, y siendo una realización a modo de ejemplo un fragmento peptídico que comprende el dominio de unión BIR3 de XIAP.
Los compuestos farmacéuticamente activos de la invención se denominan algunas veces en el presente documento fármacos, para destacar su utilidad terapéutica para promover la apoptosis uniéndose IAP. Sin embargo, otra realización de la invención utiliza los compuestos como agentes de diagnóstico, para la detección de IAP in vitro, in situ o in vivo o para ensayos de unión a IAP. En esta realización, los compuestos de la invención se marcan de manera detectable, por ejemplo, con un fluoróforo tal como se describe en la solicitud internacional en tramitación junto con la presente y de propiedad común número PCT/US02/17342. Otra realización de la invención utiliza los compuestos como agentes de direccionamiento, es decir, incorporando en su estructura agentes de destrucción de células tumorales u otros agentes terapéuticos o antitumorales, tales como radionúclidos. Por consiguiente, el término "fármaco" tal como se usa en el presente documento pretende referirse a todos los compuestos de la invención farmacéuticamente/biológicamente activos (es decir, de unión a IAP), para su uso como agentes terapéuticos o de diagnóstico.
Tal como se usa en el presente documento, "alquilo" se refiere a un hidrocarburo saturado, lineal, ramificado o cíclico que tiene desde aproximadamente 1 hasta aproximadamente 10 átomos de carbono (y todas las combinaciones y subcombinaciones de intervalos y números específicos de átomos de carbono en el mismo), prefiriéndose desde aproximadamente 1 hasta aproximadamente 7 átomos de carbono. Los grupos alquilo incluyen, pero no se limitan a, metilo, etilo, n-propilo, isopropilo, n-butilo, isobutilo, t-butilo, n-pentilo, ciclopentilo, isopentilo, neopentilo, n-hexilo, isohexilo, ciclohexilo, ciclooctilo, adamantilo, 3-metilpentilo, 2,2-dimetilbutilo y 2,3-dimetilbutilo.
Tal como se usa en el presente documento, "halógeno" se refiere al resto Cl o F.
Tal como se usa en el presente documento, "ciano" se refiere al resto:
8
Tal como se usa en el presente documento, "arilo" se refiere a un sistema de anillo aromático mono- o bicíclico opcionalmente sustituido, que tiene desde aproximadamente 5 hasta aproximadamente 14 átomos de carbono (y todas las combinaciones y subcombinaciones de intervalos y números específicos de átomos de carbono en el mismo), prefiriéndose desde aproximadamente 6 hasta aproximadamente 10 carbonos. Los ejemplos no limitativos incluyen, por ejemplo, fenilo y naftilo.
Tal como se usa en el presente documento, "aralquilo" se refiere a radicales alquilo que portan sustituyentes arilo que tienen desde aproximadamente 6 hasta aproximadamente 20 átomos de carbono (y todas las combinaciones y subcombinaciones de intervalos y números específicos de átomos de carbono en el mismo), prefiriéndose desde aproximadamente 6 hasta aproximadamente 12 átomos de carbono. Los grupos aralquilo pueden estar opcionalmente sustituidos. Los ejemplos no limitativos incluyen, por ejemplo, bencilo, naftilmetilo, difenilmetilo, trifenilmetilo, feniletilo y difeniletilo.
Tal como se usa en el presente documento, "cicloalquilo" se refiere a un grupo alquilo opcionalmente sustituido, que tiene uno o más anillos en sus estructuras que tienen desde aproximadamente 3 hasta aproximadamente 14 átomos de carbono (y todas las combinaciones y subcombinaciones de intervalos y números específicos de átomos de carbono en el mismo), prefiriéndose desde aproximadamente 3 hasta aproximadamente 10 átomos de carbono. Las estructuras de anillos múltiples pueden ser grupos de estructuras de anillo condensadas o con puentes incluyen, pero no se limitan a, ciclopropilo, ciclobutilo, ciclopentilo, ciclohexilo, ciclooctilo y adamantilo.
Tal como se usa en el presente documento, "cicloalquilalquilo" se refiere a radicales alquilo que portan un sustituyente cicloalquilo y que tienen desde aproximadamente 4 hasta aproximadamente 20 átomos de carbono (y todas las combinaciones y subcombinaciones de intervalos y números específicos de átomos de carbono en el mismo), prefiriéndose desde aproximadamente 6 hasta aproximadamente 12 átomos de carbono.
Tal como se usa en el presente documento, los términos "alcoxi" y "alcoxilo" se refieren a un grupo alquil-O- opcionalmente sustituido en el que alquilo es tal como se definió anteriormente. Los grupos alcoxi y alcoxilo a modo de ejemplo incluyen metoxilo, etoxilo, n-propoxilo, i-propoxilo, a-butoxilo y heptoxilo.
Tal como se usa en el presente documento, "carboxilo" se refiere a un grupo -C(=O)OH.
Tal como se usa en el presente documento, "alcoxicarbonilo" se refiere a un grupo -C(-O)O-alquilo, en el que alquilo es tal como se definió anteriormente.
Tal como se usa en el presente documento, "aroílo" se refiere a un grupo -C(=O)-arilo, en el que arilo es tal como se definió anteriormente. Los grupos aroílo a modo de ejemplo incluyen benzoílo y naftoílo.
Normalmente, los restos químicos sustituidos incluyen uno o más sustituyentes que sustituyen a hidrógeno. Los sustituyentes a modo de ejemplo incluyen, por ejemplo, halógeno (por ejemplo, F, Cl), alquilo, cicloalquilo, aralquilo, arilo, hidroxilo (-OH), alcoxilo, ciano (-CN), carboxilo (-COOH), -C(=O)O-alquilo, aminocarbonilo (-C(=O)NH_{2}), aminocarbonilo -N-sustituido (-C(=O)NHR''), CF_{3}, CF_{2}CF_{3}, y similares. En relación con los sustituyentes mencionados anteriormente, cada resto R'' puede ser, independientemente, cualquiera de H, alquilo, cicloalquilo, arilo o aralquilo, por ejemplo.
Tal como se usa en el presente documento, "L-aminoácido" se refiere a cualquiera de los alfa-aminoácidos levógiros que se producen de manera natural normalmente presentes en proteínas o los ésteres alquílicos de esos alfa-aminoácidos. Los alfa-aminoácidos incluyen glicina, alanina, valina, leucina, isoleucina, metionina, prolina, fenilalanina, triptófano, asparagina, glutamina, serina, treonina, ácido aspártico, ácido glutámico, tirosina, cisteína, lisina, arginina e histidina.
Tal como se usa en el presente documento, "sales farmacéuticamente aceptables" se refiere a derivados de los compuestos dados a conocer en los que se modifica el compuesto original preparando sales de ácido o de base del mismo. Los ejemplos de sales farmacéuticamente aceptables incluyen, pero no se limitan a, sales de ácido orgánico o mineral de residuos básicos tales como aminas; sales orgánicas o alcalinas de residuos ácidos tales como ácidos carboxílicos; y similares. Las sales farmacéuticamente aceptables incluyen las sales no tóxicas convencionales o las sales de amonio cuaternario del compuesto original formado, por ejemplo, a partir de ácidos orgánicos o inorgánicos no tóxicos. Por ejemplo, tales sales no tóxicas convencionales incluyen aquéllas derivadas de ácidos inorgánicos tales como clorhídrico, bromhídrico, sulfúrico, sulfámico, fosfórico, nítrico y similares; y las sales preparadas a partir de ácidos orgánicos tales como acético, propiónico, succínico, glicólico, esteárico, láctico, málico, tartárico, cítrico, ascórbico, pamoico, maleico, hidroximaleico, fenilacético, glutámico, benzoico, salicílico, sulfanílico, 2-acetoxibenzoico, fumárico, toluenosulfónico, metanosulfónico, etanodisulfónico, oxálico, isetiónico, y similares. Estas sales fisiológicamente aceptables se preparan mediante métodos conocidos en la técnica, por ejemplo, disolviendo las bases de amina libres con un exceso del ácido en alcohol acuoso o neutralizando un ácido carboxílico libre con una base de metal alcalino tal como un hidróxido, o con una amina.
Cuando cualquier variable aparece más de una vez en cualquier constituyente o en cualquier fórmula, su definición en cada caso es independiente de su definición en cualquier otro caso. Combinaciones de sustituyentes y/o variables son aceptables solamente si tales combinaciones dan como resultado compuestos estables.
Se cree que los nombres y fórmulas químicos usados en el presente documento reflejan de manera correcta y precisa los compuestos químicos subyacentes. Sin embargo, la naturaleza y el valor de la presente invención no dependen de la exactitud teórica de estas fórmulas, en su totalidad o en parte. Por tanto se entiende que las fórmulas usadas en el presente documento, así como los nombres químicos atribuidos a los compuestos indicados correspondientemente, no pretenden limitar la invención de ningún modo, incluyendo restringirla a cualquier forma tautomérica específica o a cualquier forma óptica específica; o isómero geométrico, excepto cuando tal estereoquímica se defina clara-
mente.
Los compuestos descritos en todo el presente documento, pueden usarse o prepararse en formas alternas. Por ejemplo, muchos compuestos que contienen amino pueden usarse o prepararse como una sal de adición de ácido. A menudo tales sales mejoran el aislamiento y las propiedades de manejo del compuesto. Por ejemplo, dependiendo de los reactivos, condiciones de reacción y similares, los compuestos tal como se describen en el presente documento pueden usarse o prepararse, por ejemplo, como sus sales clorhidrato o tosilato.
Por consiguiente, en una realización, la invención proporciona compuestos farmacéuticamente activos novedosos de fórmula I:
9
en la que:
R^{1} es metilo, etilo, n-propilo, isopropilo o etenilo;
R^{1a} es H o metilo;
X es -O-, -S-, -CH_{2}- o -NH-, y J es -CH- o -N-, siempre que cuando J es -N-, X es -CH_{2}- o -NH-;
Y es H, metilo, etilo, n-propilo o isopropilo;
R^{2} es:
10
R^{2a} es cicloalquilo, cicloalquilalquilo, alfa-naftilmetilo, beta-naftilmetilo o un bencilo sustituido con uno o más halógeno, arilo, carboxilo, alcoxicarbonilo o aroílo, o combinaciones de los mismos;
R^{2b} es H o alquilo;
M es:
11
Ar es:
110
R^{3}, R^{4}, R^{5}, R^{6}, R^{7}, R^{8} y R^{9} son cada uno independientemente H, metilo, etilo, n-propilo, isopropilo, halógeno, ciano, -(CH_{2})_{p}-C(=O)OH, -(CH_{2})_{p}-C(=O)O-alquilo, -(CH_{2})_{p}-C(=O)NH_{2};
n y p son cada uno independientemente el número entero 0, 1, 2 ó 3, y la suma de (n + p) es el número entero 2 ó 3;
siempre que al menos uno de R^{3}, R^{4} y R^{5} o al menos dos de R^{6}, R^{8} y R^{9} son cada uno independientemente H, metilo, etilo, n-propilo, isopropilo, halógeno o ciano;
siempre que cuando uno o más de R^{3} y R^{5} es isopropilo, R^{4} es diferente de isopropilo;
siempre que cuando R^{4} es isopropilo, R^{3} y R^{5} son cada uno independientemente diferentes de isopropilo;
siempre que cuando R^{8} es isopropilo, R^{9} es diferente de isopropilo; y
siempre que cuando R^{1a} es H, X es -NH-, J es -CH-, Y es H, metilo o isopropilo y, R^{2} es:
12
entonces
R^{1} es etenilo;
o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo.
En algunas realizaciones de los compuestos de fórmula I, R^{1} es metilo, etilo o etenilo. Más preferiblemente, R^{1} es metilo.
En otras realizaciones de los compuestos de fórmula I, R^{1a} es H.
En algunas realizaciones de los compuestos de fórmula I Y es H, metilo, etilo, n-propilo o isopropilo. Más preferiblemente Y es H, metilo o isopropilo. Incluso más preferiblemente Y es metilo o isopropilo. Todavía más preferiblemente Y es isopropilo.
En otras realizaciones de los compuestos de fórmula I, Ar es:
13
En ciertas realizaciones más preferidas de los compuestos de fórmula I, cuando Ar es:
14
uno de R^{3}, R^{4} y R^{5} es -(CH_{2})_{p}-C(=O)OH, -(CH_{2})_{p}-C(=O)O-alquilo, -(CH_{2})_{p}-C(=O)NH_{2}. Más preferiblemente, cuando uno de R^{3}, R^{4} y R^{5} es -(CH_{2})_{p}-C(=O)OH, -(CH_{2})_{p}-C(=O)O-alquilo, -(CH_{2})_{p}-C(-O)NH_{2}, p es el número entero 0. Incluso más preferiblemente uno de uno de R^{3}, R^{4} y R^{5} es -(CH_{2})_{p}-C(=O)OH o -(CH_{2})_{p}-C(=O)O-alquilo. Más preferiblemente todavía, cuando uno de uno de R^{3}, R^{4} y R^{5} es -(CH_{2})_{p}-C(=O)OH o -(CH_{2})_{p}-C(=O)O-alquilo, p es el número entero 0. Aún más preferiblemente, uno de R^{3}, R^{4} y R^{5} es -(CH_{2})_{p}-C(=O)OH. Lo más preferiblemente, cuando uno de R^{3}, R^{4} y R^{5} es -(CH_{2})_{p}-C(=O)OH, p es el número entero 0.
En algunas realizaciones de los compuestos de fórmula I, la suma de (n + p) es el número entero 2 ó 3. Más preferiblemente es el número entero 2.
En algunas realizaciones de los compuestos de fórmula I en la que R^{2} es
15
M es preferiblemente
16
En otras realizaciones de los compuestos de fórmula I, Ar es:
17
En aún otras realizaciones de los compuestos de fórmula I, R^{2} es:
18
Preferiblemente, R^{2a} es ciclohexilo, alfa-naftilmetilo, beta-naftilmetilo o ciclohexilmetilo. Alternativamente, R^{2a} es bencilo sustituido con uno o más halógeno, arilo, carboxilo, alcoxicarbonilo o aroilo, o combinaciones de los mismos.
En otra realización, la invención proporciona compuestos farmacéuticamente activos novedosos de fórmula IIa o IIb:
19
en las que:
R^{1} es metilo, etilo, n-propilo, isopropilo o etenilo;
R^{1a} es H o metilo;
Q^{1} y Q^{3} son cada uno independientemente -O-, -S- o -NH-;
Q^{2} es -CH- o -N-;
Q^{4} es -N-;
R^{2} es:
20
R^{2a} es cicloalquilo, cicloalquilalquilo, alfa-naftilmetilo, beta-naftilmetilo o un bencilo sustituido con uno o más halógeno, arilo, carboxilo, alcoxicarbonilo o aroílo, o combinaciones de los mismos;
R^{2b} es H o alquilo;
M es:
21
Ar es:
210
R^{3}, R^{4}, R^{5}, R^{6}, R^{7}, R^{8} y R^{9} son cada uno independientemente H, metilo, etilo, n-propilo, isopropilo, halógeno, ciano, -(CH_{2})_{p}-C(=O)OH, -(CH_{2})_{p}-C(=O)O-alquilo, -(CH_{2})_{p}-C(=O)NH_{2};
R^{10} es H o metilo,
n y p son cada uno independientemente el número entero 0, 1, 2 ó 3, y la suma de (n + p) es el número entero 2 ó 3;
siempre que al menos uno de R^{3}, R^{4} y R^{5} o al menos dos de R^{6}, R^{7}, R^{8} y R^{9} son cada uno independientemente H, metilo, etilo, n-propilo, isopropilo, halógeno o ciano;
siempre que cuando uno o más de R^{3} y R^{5} es isopropilo, R^{4} es diferente de isopropilo;
siempre que cuando R^{4} es isopropilo, R^{3} y R^{5} son cada uno independientemente diferentes de isopropilo;
siempre que cuando R^{8} es isopropilo, R^{9} es diferente de isopropilo;
o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo.
En algunas realizaciones de los compuestos de fórmula IIa o IIb, R^{1} es metilo, etilo o etenilo. Más preferiblemente, R^{1} es metilo.
En otras realizaciones de los compuestos de fórmula IIa o IIb, R^{1a} es H.
En ciertas realizaciones de los compuestos de fórmula IIa o IIb, Y es H, metilo o isopropilo. Más preferiblemente, es isopropilo.
En otras realizaciones de los compuestos de fórmula IIa o IIb, Ar es:
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22
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En ciertas realizaciones más preferidas de los compuestos de fórmula IIa o IIb, cuando Ar es:
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23
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uno de R^{3}, R^{4} y R^{5} es -(CH_{2})_{p}-C(=O)OH, -(CH_{2})_{p}-C(=O)O-alquilo, -(CH_{2})_{p}-C(=O)NH_{2}. Más preferiblemente, cuando uno de R^{3}, R^{4} y R^{5} es -(CH_{2})_{p}-C(=O)OH, -(CH_{2})_{p}-C(=O)O-alquilo, -(CH_{2})_{p}-C(=O)NH_{2}, p es el número entero 0. Incluso más preferiblemente uno de uno de R^{3}, R^{4} y R^{5} es -(CH_{2})_{p}-C(=O)OH o -(CH_{2})_{p}-C(=O)O-alquilo. Más preferiblemente todavía, cuando uno de uno de R^{3}, R^{4} y R^{5} es -(CH_{2})_{p}-C(=O)OH o -(CH_{2})_{p}-C(=O)O-alquilo, p es el número entero 0. Aún más preferiblemente, uno de R^{3}, R^{4} y R^{5} es -(CH_{2})-C(=O)OH. Lo más preferiblemente, cuando uno de R^{3}, R^{4} y R^{5} es -(CH_{2})-C(=O)OH, p es el número entero 0.
En algunas realizaciones de los compuestos de fórmula IIa o IIb, la suma de (n + p) es el número entero 2 ó 3. Más preferiblemente es el número entero 2.
En algunas realizaciones de los compuestos de fórmula IIa o IIb en las que R^{2} es
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24
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M es preferiblemente
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240
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En otras realizaciones de los compuestos de fórmula IIa o IIb, Ar es:
25
En aún otras realizaciones de los compuestos de fórmula I, R^{2} es:
26
Preferiblemente, R^{2a} es ciclohexilo, alfa-naftilmetilo, beta-naftilmetilo o ciclohexilmetilo. Alternativamente, R^{2a} es bencilo sustituido con uno o más halógeno, arilo, carboxilo, alcoxicarbonilo o aroílo o combinaciones de los mismos.
En algunas realizaciones de los compuestos de fórmula IIa o IIb, R^{10} es H o metilo.
Preferiblemente, R^{10} es metilo.
Ciertos compuestos ácidos o básicos de la presente invención pueden existir como zwitteriones. Se contempla que todas las formas de los compuestos, incluyendo ácido libre, base libre y zwitteriones, están dentro del alcance de la presente invención. Se conoce bien en la técnica que los compuestos que contienen tanto grupos amino como carboxilo a menudo existen en equilibrio con sus formas zwitteriónicas. Por tanto, cualquiera de los compuestos descritos en todo el presente documento que contiene, por ejemplo, tanto grupos amino como carboxilo, incluyen también referencia a sus zwitteriones correspondientes.
En cualquiera de las enseñanzas anteriores, un compuesto de la invención puede ser o bien un compuesto de una de las fórmulas descritas en el presente documento o bien un estereoisómero, profármaco, forma de sal, hidrato, solvato, sal de ácido hidratada, N-óxido o cristalina isomórfica farmacéuticamente aceptable del mismo.
Los compuestos empleados en los métodos de la presente invención pueden prepararse de diversas maneras bien conocidas por los expertos en la técnica. Los compuestos pueden sintetizarse, por ejemplo, mediante los métodos descritos a continuación o variaciones de los mismos tal como aprecia el experto en la técnica. Se contempla que todos los procedimientos dados a conocer en asociación con la presente invención se contemplan se practican a cualquier escala, incluyendo escala de miligramos, gramos, multigramos, kilogramos, multikilogramos o industrial comercial.
Tal como se trató en detalle anteriormente, los compuestos empleados en los presentes métodos pueden contener uno o más átomos de carbono sustituidos de manera asimétrica y pueden aislarse en formas ópticamente activas o racémicas. Por tanto, se pretenden todas las formas racémicas, diastereoméricas, quirales y todas las formas isoméricas geométricas de una estructura, a menos que se indique específicamente la forma isomérica o estereoquímica específica. Se conoce bien en la técnica cómo preparar y aislar tales formas ópticamente activas. Por ejemplo, pueden separarse mezclas de estereoisómeros mediante técnicas convencionales que incluyen, pero sin limitarse a, resolución de formas racémicas, cromatografía normal, de fase inversa y quiral, formación de sal preferencial, recristalización y similares, o mediante síntesis quiral o bien a partir de materiales de partida quirales o bien mediante síntesis deliberada de centros quirales diana.
Tal como se entenderá fácilmente, los grupos funcionales presentes pueden contener grupos protectores durante el transcurso de la síntesis. Se conocen los grupos protectores per se como grupos funcionales químicos que pueden agregarse de manera selectiva a y eliminarse de funcionalidades, tales como grupos hidroxilo y grupos carboxilo. Estos grupos están presentes en un compuesto químico para proporcionar tal funcionalidad inerte a las condiciones de reacción química a las que se expone el compuesto. Cualquiera de una variedad de grupos protectores puede emplearse con la presente invención. Los grupos protectores preferidos incluyen el grupo benciloxicarbonilo y el grupo terc-butiloxicarbonilo. Otros grupos protectores preferidos que pueden emplearse según la presente invención pueden describirse en Greene, T.W. y Wuts, P.G.M., Protective Groups in Organic Synthesis 2ª Ed., Wiley & Sons, 1991.
La capacidad de los compuestos de la invención para unirse a IAP se mide normalmente mediante un ensayo de desplazamiento in vitro que utiliza el dominio de unión BIR3 y un análogo de tetrapéptido de Smac marcado, tal como colorante AVPC-badan. Composiciones y métodos para realizar un ensayo de este tipo se describen en la solicitud internacional en tramitación junto con la presente y de propiedad común número PCT/US02/17342. En resumen, se coloca una proteína que comprende el dominio BIR3 de un IAP en un medio de ensayo que comprende un tampón adecuado. Preferiblemente, ésta es una proteína recombinante que comprende el dominio BIR3, pero también puede usarse una proteína de IAP completa. Se añade una alícuota del colorante AVP a la mezcla de reacción, en presencia del compuesto de prueba. Los controles comprenden el BIR3 y el colorante en ausencia del compuesto de prueba y, opcionalmente, BIR3 y el colorante en presencia del tetrapéptido que se produce de manera natural, AVPI. Se mide la fluorescencia de la mezcla de reacción a una longitud de onda de excitación y emisión seleccionada, por ejemplo, 387 nm de excitación, 545 nm de emisión. Alternativamente, se mide un espectro de emisión a la longitud de onda de excitación seleccionada. En un tipo de medición, se añade el compuesto de prueba y se mide un espectro de emisión mediante barrido desde, por ejemplo, 460-480 nm. En otro tipo de medición, se mide la intensidad de emisión a una longitud de onda particular, por ejemplo, 470 nm. El espectro de emisión del colorante unido a BIR3 es claramente diferente del espectro del colorante en disolución. Por tanto, la afinidad de unión del compuesto de prueba puede calcularse como una función de su capacidad para desplazar el colorante del dominio BIR3.
Los siguientes ejemplos se proporcionan para describir la invención en mayor detalle. Pretenden ilustrar la invención.
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Ejemplo 1
Síntesis de ciertos compuestos de la invención y componentes de los mismos
27
(4-Bromo-butil)-benceno (50 a) (PAA 2-68). Se añadió tribromuro de fósforo (1,10 ml, 11,2 mmol) gota a gota a (4-hidroxi-butil)-benceno (5,04 g, 33,5 mmol) y se agitó durante 1 h bajo argón a 23ºC. Entonces se calentó el matraz hasta 100ºC mediante un baño de aceite de silicona y se dejó agitar durante 4 h. Se enfrió la mezcla de reacción, se extinguió con varios ml de H_{2}O fría, se diluyó con éter, se lavó con salmuera (2x20 ml), se secó sobre sulfato de sodio y se concentró a vacío dando 6,32 g (88%) de aceite incoloro. ^{1}H RMN (CDCl_{3}, 300 MHz) \delta 7,18-7,33 (m, 5H), 3,44 (t, J = 6,9 Hz, 2H), 2,66 (t, J = 6,9 Hz, 2H), 1,76-1,96 (m, 4H); ^{13}C RMN (CDCl_{3}, 75 MHz) \delta 147,8, 128,4, 125,8, 35,0, 33,7, 32,2, 29,8.
28
(5-Bromo-pentil)-benceno (50 b) (PAA 67). Se añadió tribromuro de fósforo (0,47 ml, 5,0 mmol) gota a gota a (5-hidroxi-pentil)-benceno (1,98 g, 12,0 mmol) y se agitó durante 1 h bajo argón a 23ºC. Entonces se calentó el matraz hasta 100ºC mediante un baño de aceite de silicona y se dejó agitar durante 4 h. Se enfrió la mezcla de reacción, se extinguió con varios ml de H_{2}O fría, se diluyó con éter, se lavó con salmuera (2x20 ml), se secó sobre sulfato de sodio y se concentró a vacío dando 2,48 g (91%) de aceite incoloro. ^{1}H RMN (CDCl_{3}, 300 MHz) \delta 7,18-7,33 (m, 5H), 3,45 (dt, J = 1,8, 6,9 Hz, 2H), 2,68 (t, J = 7,2 Hz, 2H), 1,95 (d quintetes, J = 1,84, 7,2 Hz, 2H), 1,71 (d quintetes, J = 1,84, 7,2 Hz, 2H), 1,49-1,59(m, 2H); ^{13}C RMN (CDCl_{3}, 75 MHz) \delta 142,2, 128,3, 128,2, 125,7, 35,7, 33,7, 32,6, 30,6, 27,8.
29
Bromuro de fenilmetil-trifenilfosfonio (51 a) (PAA 59). Se añadió trifenilfosfina (2,364 g, 9,00 mmol) a bromuro de bencilo (1,348 g, 8,00 mmol) en 35 ml de tolueno en un matraz de fondo redondo de 100 ml. Se calentó la mezcla a reflujo bajo argón y se agitó durante 24 h, entonces se concentró a vacío. Se trituró el sólido amorfo blanco resultante con éter (3x20 ml) proporcionando 3,268 g (94%) de polvo blanco. ^{1}H RMN (CDCl_{3}, 300 MHz) \delta 7,58-7,78 (m, 15 H), 7,10-7,26 (m, 5H), 5,34-5,42 (m, 2H).
30
Bromuro de (2-fenil-etil)-trifenilfosfonio (51 b) (PAA 62). Se añadió trifenilfosfina (2,364 g, 9,00 mmol) a (2-bromo-etil)-benceno (1,496 g, 8,00 mmol) en 35 ml de tolueno en un matraz de fondo redondo de 100 ml. Se calentó la mezcla a reflujo bajo argón y se agitó durante 48 h, entonces se concentró a vacío dando un aceite amarillo espeso. Se disolvió el aceite en EtOH en ebullición bajo argón. Se añadió benceno hasta que se separó un aceite de la disolución. Se calentó la disolución a vacío eliminando todo el disolvente y proporcionando 3,6 g (100%) de espuma blanca. ^{1}H RMN (CDCl_{3}, 300 MHz) \delta 7,67-7,91 (m, 15 H), 7,17-7,32 (m, 5H), 4,25 (dt, J = 12,6, 7,8 Hz, 2H), 3,08 (dt, J = 12,9, 7,8 Hz, 2H).
31
Bromuro de (3-fenil-propil) -trifenilfosfonio (51 c) (PAA 61). Se añadió trifenilfosfina (2,364 g, 9,00 mmol) a (3-bromo-propil)-benceno (1,552 g, 8,00 mmol) en 35 ml de tolueno en un matraz de fondo redondo de 100 ml. Se calentó la mezcla a reflujo bajo argón y se agitó durante 48 h, entonces se concentró a vacío. Se trituró el sólido amorfo blanco resultante con éter (3x20 ml) proporcionando 1,984 g (55%) de sólido blanco. ^{1}H RMN (CDCl_{3}, 300 MHz) \delta 7,66-7,83 (m, 15H), 7,19-7,27 (m, 5H), 3,92-4,02 (m, 2H), 3,06 (t, J = 7,2 Hz, 2H), 1,92-2,00 (m, 2H).
32
Bromuro de (4-fenil-butil)-trifenilfosfonio (51 d) (PAA 71). Se añadió trifenilfosfina (3,932 g, 15,0 mmol) a 50 a (3,070 g, 14,4 mmol) en 35 ml de tolueno en un matraz de fondo redondo de 100 ml. Se calentó la mezcla a reflujo bajo argón y se agitó durante 65 h, entonces se concentró a vacío dando un aceite amarillo espeso. Se disolvió el aceite en EtOH en ebullición bajo argón. Se añadió benceno hasta que se separó un aceite de la disolución. Se calentó la disolución a vacío eliminando todo el disolvente y proporcionando 6,59 g (96%) de espuma blanca. ^{1}H RMN (CDCl_{3}, 300 MHz) \delta 7,64-7,84 (m, 5H), 7,09-7,20 (m, 5H), 3,81-3,90 (m, 2H), 2,67 (t, J = 7,2 Hz, 2H), 2,01 (quintete, 7,2 Hz, 2H), 1,58-1,67 (m, 2H).
33
Bromuro de (5-fenil-fenil)-trifenilfosfonio (51 e) (PAA 70). Se añadió trifenilfosfina (2,620 g, 10,0 mmol) a 50 b (1,971 g, 8,70 mmol) en 35 ml de tolueno en un matraz de fondo redondo de 100 ml. Se calentó la mezcla a reflujo bajo argón y se agitó 65 h, entonces se concentró a vacío dando un aceite amarillo espeso. Se disolvió el aceite en EtOH en ebullición bajo argón. Se añadió benceno hasta que se separó un aceite de la disolución. Se calentó la disolución a vacío eliminando todo el disolvente y proporcionando 3,99 g (94%) de espuma blanca. ^{1}H RMN (CDCl_{3}, 300 MHz) \delta 7,61-7,79 (m, 5H), 7,04-7,29 (m, 5H), 3,63-3,71 (m, 2H), 2,49 (m, 7,2 Hz, 2H, 1,52-1,63 (m, 5H).
34
(S)-2-Estiril-N-Boc-pirrolidina (45 a) (PAA 2-18). Se añadió n-BuLi (0,730 ml, 1,05 mmol) gota a gota mediante jeringuilla a lo largo de 10 minutos a 51 a (0,442 g, 1,021 mmol) en 20 ml de THF bajo argón a -78ºC. Se agitó la mezcla en frío durante 1 h, entonces se calentó hasta 23ºC a lo largo de un periodo de 30 minutos. Inmediatamente se enfrió la mezcla de nuevo hasta -78ºC y se añadió Boc-L-prolinal (0,200 ml, 1,035 mmol) en 20 ml de THF gota a gota mediante cánula a lo largo de 5 minutos. Se dejó agitar la reacción en frío durante 1 h, entonces durante 24 h adicionales a 23ºC. Se extinguió la reacción con varios ml de agua, se diluyó con acetato de etilo, se lavó con salmuera (2x25 ml), se secó sobre sulfato de sodio y se concentró a vacío. La cromatografía en gel de sílice (hexanos/EtOAc 5:1) proporcionó 242 mg (73%) de sólido amarillo claro. R_{f}: 0,51 (hexanos/EtOAc 5:1). ^{1}H RMN (CDCl_{3}, 300 MHz) \delta 7,22-7,37 (m, 5H), 6,38-6,43 (m, 1H), 5,59-6,12 (m, 1H), 4,40-4,74 (m, 1H), 3,47 (s a, 1H), 1,80-2,20 (m, 4H), 1,43 (s, 9H).
35
(S)-2-(3-Fenil-propenil)-N-Boc-pirrolidina (45 b) (PAA 2-19). se añadió n-BuLi (1,2 ml, 1,9 mmol) gota a gota mediante jeringuilla a lo largo de 10 minutos a 51 b (0,769 g, 1,72 mmol) en 20 ml de THF bajo argón a -78ºC. Se agitó la mezcla en frío durante 1 h, entonces se calentó hasta 23ºC a lo largo de un periodo de 30 minutos. Inmediatamente se enfrió la mezcla de nuevo hasta -78ºC y se añadió Boc-L-prolinal (0,325 ml, 1,72 mmol) en 20 ml de THF gota a gota mediante cánula a lo largo de 5 minutos. Se dejó agitar la reacción en frío durante 1 h, entonces durante 24 h adicionales a 23ºC. Se extinguió la reacción con varios ml de agua, se diluyó con acetato de etilo, se lavó con salmuera (2x25 ml), se secó sobre sulfato de sodio y se concentró a vacío. La cromatografía en gel de sílice (hexanos/EtOAc 5:1) proporcionó 330 mg (67%) de aceite amarillo claro. R_{f}: 0,78 (hexanos/EtOAc 3:1). ^{1}H RMN (CDCl_{3}, 300 MHz) \delta 7,17-7,32 (m, 5H), 5,43-5,59 (m, 2H), 4,65 (s a, 1H), 3,38-3,57 (m, 4H), 2,08-2,14 (m, 1H), 1,79-1,96 (m, 2H), 1,65-1,73 (m, 1H), 1,47 (s, 9H).
36
(S)-2-(4-Fenil-but-1-enil)-N-Boc-pirrolidina (45 c) (PAA 82). Se añadió n-BuLi (0,730 ml, 1,05 mmol) gota a gota mediante jeringuilla a lo largo de 10 minutos a 51 c (0,478 g, 1,04 mmol) en 20 ml de THF bajo argón a -78ºC. Se agitó la mezcla en frío durante 1 h, entonces se calentó hasta 23ºC a lo largo de un periodo de 30 minutos. Inmediatamente se enfrió la mezcla de nuevo hasta -78ºC y se añadió Boc-L-prolinal (0,200 ml, 1,04 mmol) en 20 ml de THF gota a gota mediante cánula a lo largo de 5 minutos. Se dejó agitar la reacción en frío durante 1 h, entonces durante 24 h adicionales a 23ºC. Se extinguió la reacción con varios ml de agua, se diluyó con acetato de etilo, se lavó con salmuera (2x25 ml), se secó sobre sulfato de sodio y se concentró a vacío. La cromatografía en gel de sílice (hexanos/EtOAc 5:1) proporcionó 230 mg (73%) aceite amarillo claro. R_{f}: 0,82 (4:1 hexanos/EtOAc). ^{1}H RMN (CDCl_{3}, 300 MHz) \delta 7,17-7,31 (m, 5H), 5,30-5,39 (m, 2H), 4,43 (s a, 1H), 3,36-3,40 (m, 4H), 2,31-2,82 (m, 4H), 1,72-1,95 (m, 2H), 1,47 (s, 9H).
37
(S)-2-(5-Fenil-pent-1-enil)-N-Boc-pirrolidina (45 d) (PAA 82). Se añadió n-BuLi (0,900 ml, 1,29 mmol) gota a gota mediante jeringuilla a lo largo de 10 minutos a 51 d (0,620 g, 1,29 mmol) en 20 ml de THF bajo argón a -78ºC. Se agitó la mezcla en frío durante 1 h, entonces se calentó hasta 23ºC a lo largo de un periodo de 30 minutos. Inmediatamente se enfrió la mezcla de nuevo hasta -78ºC y se añadió Boc-L-prolinal (0,250 ml, 1,29 mmol) en 20 ml de THF gota a gota mediante cánula a lo largo de 5 minutos. Se dejó agitar la reacción en frío durante 1 h, entonces durante 24 h adicionales a 23ºC. Se extinguió la reacción con varios ml de agua, se diluyó con acetato de etilo, se lavó con salmuera (2x25 ml), se secó sobre sulfato de sodio y se concentró a vacío. La cromatografía en gel de sílice (hexanos/EtOAc 5:1) proporcionó 232 mg (60%) aceite amarillo claro. R_{f}: 0,55 (hexanos/EtOAc 5:1). ^{1}H RMN (CDCl_{3}, 300 MHz) \delta 7,18-7,31 (m, 5H), 5,36-5,38 (m, 2H), 4,47 (s a, 1H), 3,40 (s a, 1H), 2,64 (t, J = 7,2 Hz, 2H), 1,61-2,20 (m, 8H), 1,47 (s, 9H).
38
(S)-2-(6-Fenil-hex-1-enil)-N-Boc-pirrolidina (45 e) (PAA 81). Se añadió n-BuLi (0,900 ml, 1,29 mmol) gota a gota mediante jeringuilla a lo largo de 10 minutos a 51 d (0,620 g, 1,29 mmol) en 20 ml de THF bajo argón a -78ºC. Se agitó la mezcla en frío durante 1 h, entonces se calentó hasta 23ºC a lo largo de un periodo de 30 minutos. Inmediatamente se enfrió la mezcla de nuevo hasta -78ºC y se añadió Boc-L-prolinal (0,250 ml, 1,29 mmol) en 20 ml de THF gota a gota mediante cánula a lo largo de 5 minutos. Se dejó agitar la reacción en frío durante 1 h, entonces durante 24 h adicionales a 23ºC. Se extinguió la reacción con varios ml de agua, se diluyó con acetato de etilo, se lavó con salmuera (2x25 ml), se secó sobre sulfato de sodio y se concentró a vacío. La cromatografía en gel de sílice (hexanos/EtOAc 5:1) proporcionó 280 mg (69%) aceite amarillo claro. R_{f}: 0,64 (hexanos/EtOAc 5:1). ^{1}H RMN (CDCl_{3}, 300 MHz) \delta 7,17-7,32 (m, 5H), 5,29-5,34 (m, 2H), 4,49 (s a, 1H), 3,38-3,42 (m, 2H), 2,63 (t, J = 7,2 Hz, 2H), 1,38-2,11 (m, 10H), 1,44 (s, 9H).
39
(S)-2-Fenetil-N-Boc-pirrolidina (44 a) (PAA 2-28). Se cargó un matraz de fondo redondo de 10 ml equipado con una llave de tres vías y un balón con 160 mg de Pd al 10%-C. Se vació el matraz y se llenó con gas hidrógeno 10 veces. Se añadió EtOH (5 ml) mediante jeringuilla y se agitó durante varios minutos. Se añadió el alqueno 45 a (260 mg,) en 2 ml de EtOH mediante jeringuilla y se agitó durante 24 h. Se añadió gas hidrógeno a medida que se desinflaba el balón. Tras completarse la reacción se separó el catalizador mediante filtración. Se concentró el producto a vacío proporcionando 251 mg (97%) de aceite incoloro. ^{1}H RMN (CDCl_{3}, 300 MHz) \delta 7,19-7,30 (m, 5H), 3,76-3,88 (m a, 1H), 3,34-3,43 (m a, 2H), 2,59-2,62 (m, 2H), 1,62-2,16 (m, 6H), 1,46 (s, 9H).
40
\newpage
(S)-3-Fenpropil-N-Boc-pirrolidina (44 b) (PAA 2-29). Se cargó un matraz de fondo redondo de 10 ml equipado con una llave de tres vías y un balón con 157 mg de Pd al 10%-C. Se vació el matraz y se llenó con gas hidrógeno 10 veces. Se añadió EtOH (5 ml) mediante jeringuilla y se agitó durante varios minutos. Se añadió el alqueno 45 b (145 mg,) en 2 ml de EtOH mediante jeringuilla y se agitó durante 24 h. Se añadió gas hidrógeno a medida que se desinflaba el balón. Tras completarse la reacción se separó el catalizador mediante filtración. Se concentró el producto a vacío proporcionando 149 mg (100%) de aceite incoloro. ^{1}H RMN (CDCl_{3}, 300 MHz) \delta 7,16-7,30 (m, 5H), 3,71-3,83 (m a, 1H), 3,30-3,39 (m a, 2H), 2,60 (t, J = 7,2 Hz, 2H), 1,62-1,90 (m, 5H), 1,46 (s, 9H), 1,29-1,42 (m, 3H).
41
(S)-4-Fenbutil-N-Boc-pirrolidina (44 c) (PAA 2-160). Se cargó un matraz de fondo redondo de 50 ml equipado con una llave de tres vías y un balón con 400 mg de Pd al 10%-C. Se vació el matraz y se llenó con gas hidrógeno 10 veces. Se añadió MeOH (30 ml) mediante jeringuilla y se agitó durante varios minutos. Se añadió el alqueno 45 c (405 mg,) en 5 ml de EtOH mediante jeringuilla y se agitó durante 2 h. Se añadió gas hidrógeno a medida que se desinflaba el balón. Tras completarse la reacción se separó el catalizador mediante filtración. Se concentró el producto a vacío proporcionando 376 mg (93%) de aceite incoloro. ^{1}H RMN (CDCl_{3}, 300 MHz) \delta 7,15-7,31 (m, 5H), 3,70-3,76 (m a, 1H), 3,26-3,41 (m, 2H), 2,58-2,64 (m, 2H), 1,59-1,93 (m, 7H), 1,49 (s, 9H), 1,30-1,35 (m, 3H).
42
(S)-5-Fenpentil-N-Boc-pirrolidina (44 d) (PAA 2-27). Se cargó un matraz de fondo redondo de 10 ml equipado con una llave de tres vías y un balón con 100 mg de Pd al 10%-C. Se vació el matraz y se llenó con gas hidrógeno 10 veces. Se añadió EtOH (3 ml) mediante jeringuilla y se agitó durante varios minutos. Se añadió el alqueno 45 d (100 mg,) en 2 ml de EtOH mediante jeringuilla y se agitó durante 24 h. Se añadió gas hidrógeno a medida que se desinflaba el balón. Tras completarse la reacción se separó el catalizador mediante filtración. Se concentró el producto a vacío proporcionando 93,7 mg (94%) de aceite incoloro. ^{1}H RMN (CDCl_{3}, 300 MHz) \delta 7,17-7,31 (m, 5H), 3,70-3,76 (m a, 1H), 3,30-3,40 (m, 2H), 2,61 (7, J = 8,0 Hz, 2H), 1,73-1,90 (m, 3H), 1,59-1,65 (m, 3H), 1,47 (s, 9H), 1,29-1,40 (m, 6H).
43
(S)-6-Fenhexil-N-Boc-pirrolidina (44 e) (PAA 2-27). Se cargó un matraz de fondo redondo de 10 ml equipado con una llave de tres vías y un balón con 151 mg de Pd al 10%-C. Se vació el matraz y se llenó con gas hidrógeno 10 veces. Se añadió EtOH (3 ml) mediante jeringuilla y se agitó durante varios minutos. Se añadió el alqueno 45 e (301 mg,) en 2 ml de EtOH mediante jeringuilla y se agitó durante 24 h. Se añadió gas hidrógeno a medida que se desinflaba el balón. Tras completarse la reacción se separó el catalizador mediante filtración. Se concentró el producto a vacío proporcionando 285 mg (95%) de aceite incoloro. ^{1}H RMN (CDCl_{3}, 300 MHz) \delta 7,17-7,30 (m, 5H), 3,69-3,76 (m a, 1H), 3,30-3,39 (m, 2H), 2,61 (7, J = 7,6 Hz, 2H), 1,73-1,90 (m, 3H), 1,62-1,64 (m, 3H), 1,47 (s, 9H), 1,28-1,43 (m, 8H).
44
Boc-Ala-Val-OMe (53) (PAA 2-7). Se añadió EDC (1,521 g, 7,93 mmol) a Boc-Ala (1,500 g, 7,93 mmol) en 25 ml de cloroformo a 0ºC y se dejó agitar la mezcla durante 30 minutos. Se combinaron éster metílico de valina (1,329 g, 7,93 mmol), trietilamina (1,11 ml, 7,93 mmol) y 25 ml de cloroformo en un matraz de 50 ml separado y se agitó. Se transfirió esta mezcla a la disolución de Boc-alanina activada y se agitó a 0ºC durante 3 h. Se retiró el baño de hielo y se agitó la mezcla de reacción durante 27 h adicionales. Se añadieron tres gotas de ácido acético y se continuó la agitación durante 15 minutos. Se concentró la mezcla a vacío y entonces se volvió a disolver en EtOAc (50 ml). Se lavó la fase orgánica con NaHCO_{3} al 10% (2x25 ml), HCl 1 N (2x25 ml), agua (25 ml), se secó sobre sulfato de sodio y se concentró a vacío dando 1,848 g (81%) de producto. ^{1}H RMN (CDCl_{3}, 300 MHz) \delta 6,68 (d a, J = 5,4 Hz, 1H), 4,99 (s a, 1H), 4,53 (dd, J = 4,8, 8,7 Hz, 1H), 4,19 (t a, J = 7,5 Hz, 1H), 3,74 (s, 3H), 2,18 (septete, J = 6,9 Hz, 1H), 1,45 (s, 9H), 0,93 (d, J = 6,9 Hz, 3H), 0,90 (d, J = 6,9 Hz, 3H).
45
Boc-Ala-Val-OH (54) (PAA 2-32). Se agitó Boc-Ala-Val-OMe 53 (1,750 g, 5,79 mmol) en 40 ml de acetona. Se añadió disolución de NaOH (8,7 ml de disolución acuosa 2,0 M) y se agitó durante 2 h a 23ºC. Se separó la acetona a presión reducida y se diluyó la disolución resultante con EtOAc (20 ml). Se lavó la fracción orgánica con agua (2x20 ml), se secó sobre sulfato de sodio y se concentró a vacío proporcionando 1,561 g (99%) de producto. ^{1}H RMN (CDCl_{3}, 300 MHz) \delta 12,28 (s a, 1H), 7,69 (d, J = 8,7 Hz, 1H), 6,98 (d, J = 7,5 Hz, 1H), 4,15 (dd, J = 5,4, 8,4 Hz, 1H), 4,04 (quintete, J = 7,2 Hz, 1H), 3,35 (s a, 2H), 2,04 (octete, J = 6,6 Hz, 1H), 1,37 (s, 9H), 1,16 (d, J = 7,2 Hz, 3H), 0,87 (d, J = 7,2 Hz, 3H); ^{13}C RMN (CDCl_{3}, 75 MHz) \delta 172,9, 155,1, 78,1, 56,8, 30,2, 28,2, 19,0, 18,0, 17,8.
46
Boc-L-Prolinal (38) (PAA 2-226). Se combinó Boc-L-prolina (20,0 g, 92,9 mmol) con 200 ml de THF en un matraz de 500 ml equipado con un condensador de reflujo. Se añadió complejo de borano-sulfuro de metilo (70 ml, 140 mmol) a lo largo de un periodo de 30 minutos a 0ºC bajo argón. Cuando cesó el desprendimiento de gas se calentó el matraz a reflujo mediante baño de aceite de silicona y se agitó durante 1 h. Se enfrió la reacción hasta 23ºC y se extinguió lentamente con MeOH. Se añadieron 100 ml adicionales de MeOH y entonces se concentró a vacío. Se volvió a disolver la mezcla de reacción y se concentró con 200 ml de MeOH y entonces 2x100 ml de tolueno. Se concentró la muestra en la bomba de vacío durante la noche proporcionando 18,78 g de producto de alcohol sólido blanco. Se disolvió este material en 200 ml de diclorometano y se agitó bajo argón. Se añadieron PCC (28 g, 141 mmol) seguido de tamices moleculares de 4 \ring{A} (35 g) y 1 ml de AcOH a la mezcla a 0ºC. Se dejó agitar la mezcla de reacción durante 2,5 h a 23ºC. Se llenó el matraz con éter entonces se filtró sobre un lecho pequeño de gel de sílice. La cromatografía en gel de sílice proporcionó 13,1 g (70% en dos etapas) de aceite incoloro. R_{f}: 0,39 (hexanos/EtOAc 5:1). ^{1}H RMN (CDCl_{3}, 300 MHz) \delta 9,46-9,56 (m, 1H), 4,03-4,21 (m, 1H), 3,43-3,58 (m, 2H), 1,87-2,14 (m, 4H), 1,43-1,48 (m, 9H).
47
(S)-2-(1-Hidroxi-4-fenil-butil)-N-Boc-pirrolidina (57 y 58) (PAA 2-138). Se agitaron virutas de Mg (1,6 g, 67 mmol) bajo argón en 34 ml de éter. Se añadió (3-bromopropil)-benceno (8 ml, 52 mmol) en 10 ml de éter lentamente para minimizar la ebullición del disolvente. Tras 1 h, se transfirió la disolución de Grignard resultante separándola del magnesio en exceso mediante cánula y se almacenó bajo argón. Se cargó un matraz con 16 ml de disolución de Grignard 1,25 M y se enfrió hasta 0ºC bajo argón. Se transfirió prolinal (1,529 g, 7,7 mmol) en 10 ml de éter gota a gota al matraz mediante jeringuilla en el plazo de 10 min. Se agitó la mezcla de reacción durante 1 h, entonces se retiró el baño de hielo y se agitó la mezcla durante 3 h adicionales. Se extinguió la reacción lentamente con varios ml de NH_{4}Cl saturado, se extrajo con 50 ml de éter, se secó sobre sulfato de sodio y se concentró a vacío. La cromatografía en gel de sílice (hexanos/EtOAc 5:1) permitió la separación de los diastereómeros, 0,98 g de aceite y 0,63 g de sólido (rendimiento global del 67%). R_{f}: 0,32 (hexanos/EtOAc 5:1). 1H RMN (CDCl_{3}, 300 MHz) \delta; ^{13}C RMN (CDCl_{3}, 75 MHz) \delta 142,4, 128,4, 128,2, 125,6, 80,4, 75,2, 62,6, 47,1, 35,8, 34,2, 28,5, 28,4, 26,7, 24,0. R_{f}: 0,28 (hexanos/EtOAc 5: 1). ^{1}H RMN (CDCl_{3}, 300 MHz) \delta; ^{13}C RMN (CDCl_{3}, 75 MHz) \delta 124,4, 128,4, 128,2, 125,6, 79,8, 73,0, 62,8, 47,9, 35,8, 34,2, 32,0, 28,5, 28,4, 27,8, 24,2.
48
(S)-2-(4-Fenil-butiril)-N-Boc-pirrolidina (59) (PAA 2-245). Se agitó una mezcla de los alcoholes 57 y 58 (0,77 g, 2,4 mmol) en 25 ml de diclorometano y se agitó bajo argón. Se añadieron PCC (0,8 g, 3,6 mmol) seguido de tamices moleculares de 4 A (0,8 g) y varias gotas de AcOH a la mezcla a 0ºC. Se dejó agitar la mezcla de reacción durante 48 h a 23ºC. Se llenó el matraz con éter, entonces se filtró sobre un lecho pequeño de gel de sílice y se concentró. Se agitó el aceite resultante en bisulfito de sodio saturado durante 1 h. Se extrajo el producto con diclorometano y se concentró a vacío proporcionando 588 mg (77%) de sólido blanco, de olor desagradable. R_{f}: 0,32 (hexanos/EtOAc 5:1). ^{1}H RMN (CDCl_{3}, 300 MHz) \delta 7,17-7,30 (m, 5H), 4,33 (dd, J = 4,4, 8,8 Hz) + 4,21 (dd, J = 5,2, 8,8 Hz) 1H, 3,40-3,55 (m, 2H), 2,60-2,66 (m, 2H), 2,39-2,53 (m, 2H), 2,06-2,18 (m, 1H), 1,93 (quintete, J = 7,2 Hz, 1H), 1,74-1,86 (m, 3H), 1,532 + 1,37 (s, 9H); ^{13}C RMN (CDCl_{3}, 75 MHz) \delta 209,9, 154,5, 153,8, 141,6, 141,3, 128,4, 128,3, 128,2, 125,9, 125,8, 80,0, 79,7, 65,1, 64,6, 46,8, 46,6, 38,4, 37,5, 35,0, 29,9, 28,8, 28,4, 28,2, 24,6, 24,6, 24,3, 23,6.
49
(S)-2-(4-Fenil-butiril)-Boc-Val-pirrolidina (60) (PAA 2-211). Se agitó la cetona 59 en TFA/diclorometano 50:50 durante 2 horas. Tras la eliminación del disolvente, se combinó la sal de amina de TFA resultante (0,784 mmol) con Boc-Val-OH (170 mg, 0,784 mmol), NEt_{3} (0,330 ml, 2,35 mmol), BOP-Cl (300 mg, 1,18 mmol) en 15 ml de diclorometano a 0ºC bajo argón. Se dejó agitar la mezcla de reacción durante 24 h, entonces se lavó con HCl 1 N (10 ml), NaHCO_{3} saturado (10 ml) y salmuera (20 ml). Se secó la fracción orgánica sobre sulfato de sodio y se concentró a vacío. La cromatografía en gel de sílice (hexanos/éter 50:50) proporcionó 226 mg (71%) de aceite incoloro. R_{f}: 0,32 (hexanos/éter 50:50). ^{1}H RMN (CDCl_{3}, 300 MHz) \delta 7,13-7,27 (m, 5H), 5,20 (d, J = 9,3 Hz, 1H), 4,55 (dd, J = 6,0, 8,4 Hz) 1H, 4,25 (dd, J = 6,0, 9,3 Hz, 1H), 3,71-3,77 (m, 1H), 2,39-2,62 (m, 4H), 1,89-2,12 (m, 6H), 1,71 (septete, J = 6,6 Hz, 1H), 1,40 (s, 9H), 1,00 (d, J = 6,6 Hz, 3H), 0,90 (d, J = 6,6 Hz, 3H); ^{13}C RMN (CDCl_{3}, 75 MHz) \delta 208,0, 170,7, 156,7, 141,4, 128,3, 128,2, 125,7, 64,2, 56,5, 47,2, 39,3, 34,8, 31,1, 28,1, 27,9, 24,8, 24,6, 19,2, 17,2.
50
3-p-Tolil-propionaldehído (63 a) (PAA 2-259). Se cargó un matraz con p-yodotolueno (2,18 g, 10. mmol), alcohol alílico (1,0 ml, 15 mmol), bicarbonato de sodio (1,68 g, 20 mmol), cloruro de tetrabutilamonio (2,78 g, 10,0 mmol), acetato de paladio (45 mg, 2% en moles) y 10 ml de DMF. Se agitó la mezcla bajo argón a 40ºC durante 18 h. Se enfrió la mezcla de reacción, se diluyó con éter y se filtró sobre Celite. La cromatografía en gel de sílice (hexanos/EtOAc 5:1) proporcionó g (%) de aceite amarillo. R_{f}: 0,47 (hexanos/éter 3:1). ^{1}H RMN (CDCl_{3}, 300 MHz) \delta; ^{13}C RMN (CDCl_{3}, 75 MHz) \delta
51
3-Naftalen-2-il-propionaldehído (63 b) (PAA 2-260). Se cargó un matraz con 2-yodo-naftaleno (2,095 g, 8,25 mmol), alcohol alílico (0,83 ml, 12,38 mmol), bicarbonato de sodio (1,39 g, 16,5 mmol), cloruro de tetrabutilamonio (8,25 mmol), acetato de paladio (37 mg, 2% en moles) y 10 ml de DMF. Se agitó la mezcla bajo argón a 40ºC durante 18 h. Se enfrió la mezcla de reacción, se diluyó con éter y se filtró sobre Celite. La cromatografía en gel de sílice (hexanos/EtOAc 5:1) proporcionó 1,23 g (67%) de aceite amarillo. R_{f}: 0,40 (hexanos/éter 3: 1). ^{1}H RMN (CDCl_{3}, 300 MHz) \delta 9,87 (t, J = 1,2 Hz, 1H). 7,80-7,85 (m, 3H), 7,65 (s, 1H), 7,46-7,50 (m, 2H), 7,35 (dd, 1,8, 8,7 Hz, 1H), 3,14 (t, J = 7,5 Hz, 2H), 2,87 (ddt, 0,6, 1,2, 7,5 Hz, 2H); ^{13}C RMN (CDCl_{3}. 75 MHz) \delta 201,4, 137,8, 133,5, 132,1, 128,2, 127,6, 127,4, 126,9, 126,4, 126,1, 125,4, 45,1, 28,2.
52
Éster etílico del ácido 4-(3-oxo-propil)-benzoico (63 c) (PAA 2-264). Se cargó un matraz con éster etílico del ácido p-yodobenzoico (2,78 g, 10,0 mmol), alcohol alílico (1,0 ml, 15. mmol), bicarbonato de sodio (1,68 g, 20 mmol), cloruro de tetrabutilamonio (2,78 g, 10,0 mmol), acetato de paladio (37 mg, 2% en moles) y 10 ml de DMF. Se agitó la mezcla bajo argón a 40ºC durante 18 h. Se enfrió la mezcla de reacción, se diluyó con éter y se filtró sobre Celite. La cromatografía en gel de sílice (hexanos/EtOAc 5:1) proporcionó 1,27 g (61%) de aceite amarillo. R_{f}: 0,33 (hexanos/éter 5:1). ^{1}H RMN (CDCl_{3}, 300 MHz)) \delta 9,83 (t, J = 0,9 Hz, 1H), 7,94 (d, J = 8,4 Hz, 2H), 7,27 (d, 8,4 Hz, 2H), 4,37 (cuartete, J = 7,2 Hz, 2H), 3,02 (t, J = 7,5 Hz, 2H), 2,82 (d, J = 7,5 Hz, 2H), 1,39 (t, 7,2 Hz, 3H).
53
3-Naftalen-2-il-propanol (64 b) (PAA 2-266). Se añadió borohidruro de sodio (53 mg, 1,36 mmol) a 63 b en 10 ml de EtOH bajo argón. Se dejó agitar la mezcla durante 10 h a 23ºC. Se extinguió la reacción con ácido acético diluido. Se diluyó la mezcla de reacción con EtOAc, se lavó con agua (2x20 ml), se secó sobre sulfato de sodio y se concentró a vacío proporcionando 470 mg (94%) de sólido marrón claro. ^{1}H RMN (CDCl_{3}, 300 MHz) \delta 7,78-7,83 (m, 3H), 7,65 (d, 8,4 Hz, 2H), 7,43-7,47 (m, 2H), 7,35-7,37 (m, 1H), 3,74-3,90 (m, 2H), 2,89 (t, J = 6,9 Hz, 2H), 2,00 (quintete, J = 6,9 Hz, 2H).
54
Éster etílico del ácido 4-(3-hidroxi-propil)-benzoico (64 c) (PAA 2-267). Se añadió borohidruro de sodio (47 mg, 1,21 mmol) a 63 c (500 mg, 2,42 mmol) en 10 ml de EtOH bajo argón. Se dejó agitar la mezcla durante 10 h a 23ºC. Se extinguió la reacción con ácido acético diluido. Se diluyó la mezcla de reacción con EtOAc, se lavó con agua (2x20 ml), se secó sobre sulfato de sodio y se concentró a vacío proporcionando 422 mg (85%) de aceite incoloro. ^{1}H RMN (CDCl_{3}, 300 MHz) \delta 7,96 (d, J = 8,4 Hz, 2H), 7,25-7,27 (m, 2H), 4,36 (cuartete, J = 6,9 Hz, 2H), 3,68 (t, J = 6,0 Hz, 2H), 2,75 (quintete, J = 6,9 Hz, 2H), 2,09 (s, 1H), 1,93 (quintete, J = 6,9 Hz, 2H), 1,39 (t, 6,0 Hz, 3H).
55
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2-(3-bromo-propil)naftaleno (65 b) (PAA 2-271). Se añadió PBr_{3} (60 \mul, 0,53 mmol) mediante jeringuilla a 64 b (246 mg, 1,32 mmol) en 1 ml de tolueno bajo argón a 0ºC. Se agitó la mezcla durante la noche, entonces se calentó a reflujo durante 16 h. Se enfrió la mezcla, se lavó con agua (5 ml), salmuera (5 ml), se secó sobre sulfato de sodio y se concentró a vacío. ^{1}H RMN (CDCl_{3}, 300 MHz) \delta 7,81-7,86 (m, 3H), 7,68 (d, 8,4 Hz, 2H), 7,44-7,53 (m, 2H), 7,37 (dd, J = 1,5, 8,4 Hz, 1H), 3,45 (t, J = 6,6 Hz, 2H), 2,98 (t, J = 7,2 Hz, 2H), 2,29 (quintete, J = 6,6 Hz, 2H); ^{13}C RMN (CDCl_{3}, 75 MHz) \delta 137,9, 133,5, 132,1, 128,1, 127,1, 126,7, 126,0, 125,3, 34,1, 34,0, 33,1.
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56
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Éster etílico del ácido 4-(3-bromo-propil)-benzoico (65 c) (PAA 2-272). Se añadió PBr_{3} (40 \mul, 0,34 mmol) mediante jeringuilla a 64 b (175 mg, 0,84 mmol) en 1 ml de tolueno bajo argón a 0ºC. Se agitó la mezcla durante la noche, entonces se calentó a reflujo durante 16 h. Se enfrió la mezcla, se lavó con agua (5 ml), salmuera (5 ml), se secó sobre sulfato de sodio y se concentró a vacío. ^{1}H RMN (CDCl_{3}, 300 MHz) \delta 8,01 (d, J = 7,8 Hz, 2H), 7,29-7,31 (m, 2H), 4,40 (cuartete, J = 6,9 Hz, 2H), 3,42 (t, J = 6,6 Hz, 2H), 2,87 (quintete, J = 7,2 Hz, 2H), 2,21 (quintete, J = 6,6 Hz, 2H), 1,42 (t, J = 6,6 Hz, 3H); ^{13}C RMN (CDCl_{3}, 75 MHz) \delta 166,5, 145,8, 129,8, 128,5, 128,4, 60,8, 33,9, 33,7, 32,7, 14,3.
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Ejemplo 2
Síntesis de ciertos compuestos de oxazol Esquema sintético para compuestos de oxazol
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57
I. Formación de Boc-Ala-Ser-OMe (3)
Se añadió 1 eq. de éster de Boc-Ala-succinimida (2) a una disolución helada de DIPEA (2 eq.) y clorhidrato del éster H-Ser-metílico (R=H) o clorhidrato del éster H-Thr-metílico (R=CH3) (1) en THF seco bajo argón. Se dejó calentar la disolución hasta TA y se agitó durante la noche (Rocchi, R. et al. (1987) Int. J. Peptide Protein Res. 30, 240-256). Se separó el THF a vacío, se llevó la resina a acetato de etilo y se lavó tres veces, cada una con bicarbonato de sodio saturado, ácido cítrico al 5% y cloruro de sodio saturado. Se secó la disolución con sulfato de magnesio y se eliminó el disolvente a vacío dejando un sólido blanco. Un único punto en CCF (MeOH/CHCl_{3} 1:10). No fue necesaria ninguna purificación. Rendimiento del 75%.
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II. Formación de Boc-Ala-Ser-OMe-oxazolina (4)
Se añadieron 1,05 eq. de reactivo de Burgess en una porción a una disolución con agitación de 3 en THF seco y entonces se calentó la disolución resultante a 70ºC durante 12 h bajo una atmósfera de argón (Mink et al., (1998) Tetrahedron Lett. 39, 5709-5712). Se desarrolló la reacción tal como se describió en I anteriormente. Se purificó el producto mediante una columna de gel de sílice en acetato de etilo/hexanos 70/30. Rendimiento del 25%.
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III. Formación de Boc-Ala-Ser-OMe-oxazol (5)
Se enfrió una disolución de 4 en CH_{2}Cl_{2} hasta 0ºC y se añadieron 1,1 eq. de DBU. Se introdujeron 1,1 eq. de bromotriclorometano gota a gota mediante jeringuilla a lo largo de 10 min. Se agitó la reacción bajo argón hasta que se completó (8 h). Se purificó el producto mediante una columna de gel de sílice en acetato de etilo del 30 al 50% en hexano. Rendimiento del 55%.
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IV. Desprotección de ácido carboxílico de Boc-Ala-Ser-OMe-oxazol (6)
Se añadieron 2,3 eq. de LiOH monohidratado a una disolución con agitación 5 en McOH:H_{2}O (3:1) a 0ºC. Se agitó la disolución con calentamiento gradual hasta temperatura ambiente, hasta que se completó la reacción (monitorizado mediante CCF en MeOH/CHCl_{3} 1:10) (Aquilar, E. y Meyers, A. (1994) Tetrahedron Lett. 35, 2472-2480).
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V. Formación de Boc-Ala-Ser-Pro-AA-OMe-oxazol (7)
Se sintetizó Pro-AA (en el que AA es fenilalanina, isoleucina, tirosina o triptófano) tal como en I y se usó AA-NH_{2} o AA-OMe para proporcionar la amida, el éster metílico o el ácido libre, respectivamente, se disolvieron 1,1 eq. de Pro-Phe y 3 eq. de DIPEA en THF seco y se añadieron a una disolución de 6 y 1,4 eq. de BOP-Cl a 0ºC (Palomo-Coll, A.L. y Diago-Meseguer, J. (1980) Synthesis. 7, 547-551). Se agitó la reacción durante 12-14 h bajo Ar. Se eliminó el grupo Boc mediante TFA. Entonces, se desprotegió el Phe-OMe tal como en IV. Se purificaron el éster metílico, la amida y el ácido libre mediante HPLC y se caracterizaron mediante espectrometría de masas y ^{1}H RMN.
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Esquema sintético para análogos de oxazol no peptídicos
58
La reacción de acoplamiento entre el análogo de oxazol y los análogos de Pro-Phe se llevó a cabo tal como en V anteriormente. Se purificaron los compuestos mediante HPLC y se caracterizaron mediante espectrometría de masas y ^{1}H RMN.
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Ejemplo 3
Síntesis de compuestos que contienen derivados de prolina o fenilalanina
Materiales. A menos que se indique lo contrario, los materiales se adquirieron de Aldrich Chemical Co. (Milwaukee, WI) o Fisher Scientific (Pittsburgh, PA) y se usaron sin purificación adicional. Todos los derivados de fenilalanina no naturales se adquirieron de Advanced ChemTech (Louisville, KY) o Novabiochem (Calbiochem, San Diego, CA) como el aminoácido Fmoc-protegido. Éstos y los derivados de prolina se usaron en síntesis peptídica de la misma manera que se usaría un aminoácido que se produce de manera natural. La resina de síntesis peptídica en fase sólida metilbenzhidrilamina (MBHA), la resina Rink-amida y los aminoácidos protegidos con 9-fluorenilmetoxicarbonilo (Fmoc) se obtuvieron de Advanced ChemTech (Louisville, KY) y NovaBiochem (San Diego, CA). El colorante 6-bromoacetil-2-dimetilaminonaftaleno (badan) se obtuvo de Molecular Probes (Eugene, O).
Síntesis peptídica. Se sintetizaron moléculas peptídicas en un sintetizador peptídico automatizado 396 MPS de Advanced ChemTech mediante el protocolo de Fmoc en una resina Rink-amida. Las cadenas laterales de los aminoácidos que son susceptibles de reacciones secundarias se protegieron tal como sigue: los grupos hidroxilo en la 4-hidroxi-prolina y en la fenilalanina p-carboxi-sustituida se protegieron con t-butilo y se usó un grupo pentametildihidrobenzofurano para proteger la arginina. Después de añadirse el aminoácido final, se efectuó la desprotección y la escisión de los péptidos de la resina añadiendo 1 ml de una disolución del 95% de TFA, 2,5% de agua y 2,5% de triisopropilsilano (TIS) a cada pocillo y agitando durante 1 hora. Se recogió la disolución de escisión y se añadieron 0,5 ml adicionales de la disolución de escisión a cada pocillo y se mezclaron durante otra hora. Se añadieron las disoluciones de escisión combinadas a 20 ml de agua, se liofilizaron hasta sequedad, entonces se llevaron a 5 ml de agua antes de filtrarse a través de filtros de jeringa (0,2 \mum) y se liofilizaron de nuevo. Los péptidos que contenían derivados de prolina se purificaron mediante HPLC un una columna de escala preparativa C18 Vydac. La presencia de las moléculas deseadas se confirmó mediante espectroscopia de masas.
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Ejemplo 4
Ensayos
Se reconstituyeron los compuestos de prueba en agua y se prepararon disoluciones de prueba que eran aproximadamente 200 \muM en los compuestos de prueba. Se determinaron las concentraciones exactas para 10 disoluciones de prueba representativas para la biblioteca de fenilalanina, y para todos los miembros de las bibliotecas de prolina y oxazol. Se determinaron las concentraciones mediante ^{1}H-RMN usando una disolución de dioxano de concentración conocida como referencia externa. Se consideró que las concentraciones de las otras disoluciones peptídicas de la biblioteca de fenilalanina eran el valor promedio de las disoluciones conocidas de la misma síntesis de biblioteca.
Se estimaron las concentraciones de los compuestos con puente de metileno usando la absortividad molar de un anillo de fenilo en agua a 250 nm (E = 200 M^{-1}cm^{-1}). Estos compuestos no eran solubles en agua, de modo que se llevaron a una disolución acuosa de dimetilsulfóxido (DMSO) al 10%. La disolución de ensayo entonces era DMSO aproximadamente al 1%, que no tenía ningún efecto sobre la emisión observada a esa concentración.
Protocolo de fluorescencia. Se registraron los espectros de luminiscencia usando un fluorómetro de Photon Technologies, Inc. con una lámpara de arco de Xe y un detector PMT. La absorbancia de todas las disoluciones era inferior a 0,2 a la longitud de onda de excitación (387 nm). El tampón usado en todos los experimentos de fluorescencia fue fosfato de potasio 50 mM, NaCl 100 mM, 1,4-ditio-DL-treitol (DTT) 2 mM, pH 7.
Ensayo de compuestos de prueba. Se prepararon las muestras en una placa de 96 pocillos cubierta con tubos de vidrio, para evitar la adsorción del colorante al plástico. Se almacenó la placa sobre hielo en la oscuridad entre las mediciones. Se usó una cubeta de pequeño volumen, con una longitud de la trayectoria de 2 mm, para recoger el espectro de emisión. Se mezclaron una disolución acuosa 44 \muM de AVPC-badan, una disolución de BIR3 63 \muM y tampón dando una disolución madre que era 5,6 \muM tanto en AVPC-badan como en BIR3. Se añadieron 390 \mul de esta disolución madre a cada pocillo en la placa de 96 pocillos. Se añadieron 50 \mul de las disoluciones de compuesto de prueba y se mezclaron inmediatamente antes de tomar los espectros de emisión. Las disoluciones finales eran 5 \muM tanto en badan como en BIR3 y aproximadamente 20-30 \muM en las disoluciones de compuesto de prueba. Se añadieron 50 \mul de agua a tres de los pocillos a modo de controles, para determinar la intensidad observada cuando el AVPC-badan se unía a BIR3. Se mezclaron 190 \mul de AVPC-badan y 1020 \mul de tampón y se añadieron a tres pocillos en alícuotas de 390 \mul. Se añadieron 50 \mul de agua a estos pocillos, de nuevo como controles, para determinar la intensidad del colorante no unido. Se determinaron las constantes de equilibrio relacionando la intensidad observada de la disolución de prueba (tal como se determina por el área bajo la curva de emisión) con los valores promedio obtenidos de los experimentos control.
Resultados del ensayo
Los resultados del ensayo se notifican en relación con la K_{D} encontrada para AVPI, el tetrapéptido basado en la secuencia del componente de unión natural, en cada ensayo. De este modo, se normalizaron los resultados para la variación de un día a otro. Los resultados se notifican tal como sigue, como razones de la K_{D} del compuesto de prueba con respecto a la K_{D} de AVPI: "- -" = no se observó unión a la concentración usada en el ensayo; "NA" = no sometido a ensayo; \pm = razón superior a 10^{-4} (es decir, compuesto de prueba unido con K_{D} superior a 10^{-4} que la de AVPI); + = razón superior a 10^{-3}; ++ = razón superior a 10^{-2}; +++ = razón superior a 10^{-1}.
Compuestos con puente de metileno
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Compuestos a base de oxazol
60
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Derivados de fenilalanina
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63
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Derivados de prolina
64
65

Claims (37)

1. Compuesto de fórmula I:
66
en la que:
R^{1} es metilo, etilo, n-propilo, isopropilo o etenilo;
R^{1a} es H o metilo;
X es -O-, -S-, -CH_{2}- o -NH-, y J es -CH- o -N-, siempre que cuando J es -N-, X es -CH_{2}- o -NH-;
Y es H, metilo, etilo, n-propilo o isopropilo;
R^{2} es
67
R^{2a} es cicloalquilo, cicloalquilalquilo, alfa-naftilmetilo, beta-naftilmetilo o un bencilo sustituido con uno o más halógeno, arilo, carboxilo, alcoxicarbonilo o aroílo, o combinaciones de los mismos:
R^{2b} es H o alquilo;
M es
68
Ar es
69
R^{3}, R^{4}, R^{5}, R^{6}, R^{7}, R^{8} y R^{9} son cada uno independientemente H, metilo, etilo, n-propilo, isopropilo, halógeno, ciano, -(CH_{2})_{p}-C(=O)OH, -(CHZ)_{p}-C(=O)O-alquilo, -(CHZ)_{p}-C(=O)NH_{2};
n y p son cada uno independientemente el número entero 0, 1, 2 ó 3, y la suma de (n + p) es el número entero 2 ó 3;
siempre que al menos uno de R^{3}, R^{4} y R^{5} o al menos dos de R^{6}, R^{7}, R^{8} y R^{9} son cada uno independientemente H, metilo, etilo, n-propilo, isopropilo, halógeno o ciano;
siempre que cuando uno o más de R^{3} y R^{5} es isopropilo, R^{4} es diferente de isopropilo;
siempre que cuando R^{4} es isopropilo, R^{3} y R^{5} son cada uno independientemente diferentes de isopropilo;
siempre que cuando R^{8} es isopropilo, R^{9} es diferente de isopropilo; y
siempre que cuando R^{1a} es H, X es -NH-, J es -CH-, Y es H, metilo o isopropilo, y R^{2} es:
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70
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R^{1} es etenilo;
o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo.
2. Compuesto según la reivindicación 1, de fórmula I, en la que R^{1} es metilo.
3. Compuesto según una cualquiera de las reivindicaciones 1 y 2, de fórmula I, en la que R^{1a} es H.
4. Compuesto según cualquier reivindicación anterior, de fórmula I, en la que Y es H, metilo o isopropilo.
5. Compuesto según cualquier reivindicación anterior, de fórmula I, en la que Y es isopropilo.
6. Compuesto según cualquier reivindicación anterior, de fórmula I, en la que R^{2} es M(CH_{2})_{n}-Ar y uno de R^{3}, R^{4} y R^{5} es -(CH_{2})_{p}-C(=O)OH, -(CH_{2})_{p}-C(=O)O-alquilo o -(CH_{2})_{p}-C(=O)NH_{2}.
7. Compuesto según cualquier reivindicación anterior, de fórmula I, en la que R^{2} es M(CH_{2})_{n}-Ar y uno de R^{3}, R^{4} y R^{5} es -(CH_{2})_{p}-C(=O)OH o -(CH_{2})_{p}-C(=O)O-alquilo.
8. Compuesto según cualquier reivindicación anterior, de fórmula I, en la que R^{2} es M(CH_{2})_{n}-Ar y uno de R^{3}, R^{4} y R^{5} es -(CH_{2})_{p}-C(=O)OH.
9. Compuesto según cualquier reivindicación anterior, de fórmula I, en la que R^{2} es M(CH_{2})_{n}-Ar y p es el número entero 0.
10. Compuesto según cualquier reivindicación anterior, de fórmula I, en la que R^{2} es M(CH_{2})_{n}-Ar y la suma de (n + p) es el número entero 2.
11. Compuesto según cualquier reivindicación anterior, de fórmula I, en la que R^{2} es M(CH_{2})_{n}-Ar y M es
71
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12. Compuesto según cualquier reivindicación anterior, de fórmula I, en la que R^{2} es M(CH_{2})_{n}-Ar y Ar es:
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72
13. Compuesto según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 7, de fórmula I, en la que R^{2} es M(CH_{2})_{n}-Ar y Ar es:
73
14. Compuesto según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 5, de fórmula I, en la que R^{2} es:
74
15. Compuesto según la reivindicación 14, de fórmula I, en la que R^{2a} es ciclohexilo o ciclohexilmetilo.
16. Compuesto de fórmula IIa o IIb:
75
en las que:
R^{1} es metilo, etilo, n-propilo, isopropilo o etenilo;
R^{1a} es H o metilo;
Q^{1} y Q^{3} son cada uno independientemente -O-, -S- o -NH-;
Q^{2} es -CH- o -N-;
Q^{4} es -N-;
R^{2} es
76
R^{2a} es arilo, cicloalquilo, aralquilo opcionalmente sustituido o cicloalquilalquilo;
R^{2b} es H o alquilo;
M es:
77
Ar es:
770
R^{3}, R^{4}, R^{5}, R^{6}, R^{7}, R^{8} y R^{9} son cada uno independientemente H, metilo, etilo, n-propilo, isopropilo, halógeno, ciano, -(CH_{2})_{p}-C(=O)OH, -(CHz)_{p}-C(=O)O-alquilo, -(CHz)_{p}-C(=O)NH_{2};
R^{10} es H o metilo;
n y p son cada uno independientemente el número entero 0, 1, 2 ó 3, y la suma de (n + p) es el número entero 2 ó 3;
siempre que al menos uno de R^{3}, R^{4} y R^{5} o al menos dos de R^{6}, R^{7}, R^{8} y R^{9} son cada uno independientemente H, metilo, etilo, n-propilo, isopropilo, halógeno o ciano;
siempre que cuando uno o más de R^{3} y R^{5} es isopropilo, R^{4} es diferente de isopropilo;
siempre que cuando R^{4} es isopropilo, R^{3} y R^{5} son cada uno independientemente diferentes de isopropilo;
siempre que cuando R^{8} es isopropilo, R^{8} es diferente de isopropilo;
o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo.
17. Compuesto según la reivindicación 16, de fórmula IIa o fórmula IIb, en las que R^{1} es metilo.
18. Compuesto según una cualquiera de las reivindicaciones 16 y 17, de fórmula IIa o fórmula IIb, en las que R^{1a} es H.
19. Compuesto según una cualquiera de las reivindicaciones 16 a 18, de fórmula IIa o fórmula IIb, en las que R^{2} es M(CH_{2})_{n}-Ar y en las que uno de R^{3}, R^{4} y R^{5} es -(CH_{2})_{p}- C(=O)OH, -(CH_{2})_{p}-C(=O)O-alquilo o -(CH_{2})_{p}-C(=O)NH_{2}.
20. Compuesto según una cualquiera de las reivindicaciones 16 a 19, de fórmula IIa o fórmula IIb, en las que R^{2} es M(CH_{2})_{n}-Ar y en las que uno de R^{3}, R^{4} y R^{5} es -(CH_{2})_{p}-C(=O)OH o -(CH_{2})_{p}-C(=O) O-alquilo.
21. Compuesto según una cualquiera de las reivindicaciones 16 a 20, de fórmula IIa o fórmula IIb, en las que R^{2} es M(CH_{2})_{n}-Ar y en las que uno de R^{3}, R^{4} y R^{5} es -(CH_{2})_{p}-C(=O)OH.
22. Compuesto según una cualquiera de las reivindicaciones 16 a 21, de fórmula IIa o fórmula IIb, en las que R^{2} es M(CH_{2})_{n}-Ar y en las que p es el número entero 0.
23. Compuesto según una cualquiera de las reivindicaciones 16 a 22, de fórmula IIa o fórmula IIb, en las que R^{2} es M(CH_{2})_{n}-Ar y en las que la suma de (n+p) es el número entero 2.
24. Compuesto según una cualquiera de las reivindicaciones 16 a 23, de fórmula IIa o fórmula IIb, en las que R^{2} es M(CH_{2})_{n}-Ar y en las que M es:
78
25. Compuesto según la reivindicación 16, de fórmula IIa o fórmula IIb, en las que R^{2} es M(CH_{2})_{n}-Ar y en las que Ar es:
79
26. Compuesto según una cualquiera de las reivindicaciones 16 a 25, de fórmula IIa o fórmula IIb, en las que R^{2} es M(CH_{2})_{n}-Ar y en las que Ar es:
80
27. Compuesto según una cualquiera de las reivindicaciones 16 a 18, de fórmula IIa o IIb, en las que R^{2} es:
81
28. Compuesto según una cualquiera de las reivindicaciones 16 a 27, de fórmula IIa o IIb, en las que Q^{2} es -N-.
29. Compuesto según una cualquiera de las reivindicaciones 16 a 18, 27 ó 28, de fórmula IIa o IIb, en las que R^{2a} es aralquilo opcionalmente sustituido.
30. Compuesto según la reivindicación 29, de fórmula IIa o IIb, en las que R^{2a} es bencilo opcionalmente sustituido.
31. Compuesto según la reivindicación 30, de fórmula IIa o IIb, en las que dicho bencilo está sustituido con uno o más alquilo, halógeno, arilo, carboxilo, alcoxicarbonilo o aroílo.
32. Compuesto según una cualquiera de las reivindicaciones 16 a 18, 27 ó 28, de fórmula IIa o IIb, en las que R^{2a} es fenilo, ciclohexilo, alfa-naftilmetilo, beta-naftilmetilo, bencilo, feniletilo o ciclohexilmetilo.
33. Compuesto según una cualquiera de las reivindicaciones 16 a 32, de fórmula IIa o IIb, en las que R^{10} es metilo.
34. Composición farmacéutica que comprende el compuesto según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 15.
35. Composición farmacéutica que comprende el compuesto según una cualquiera de las reivindicaciones 16 a 33.
36. Agente de ensayo o de diagnóstico que comprende el compuesto según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 15 y una etiqueta detectable.
37. Agente de ensayo o de diagnóstico que comprende el compuesto según una cualquiera de las reivindicaciones 16 a 33 y una etiqueta detectable.
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