ES2322809T3 - Metodo de transformacion de plantas con ensamblaje in vivo de un tratamiento. - Google Patents
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Abstract
Un proceso para dotar a una planta o a células vegetales de un rasgo de interés mediante la expresión de una secuencia de ARN de interés, comprendiendo dicho proceso: la provisión mediante cotransformación a la planta o a las células de dicha planta de un primer vector y un segundo vector y la selección de las células dotadas de dicho rasgo de interés, donde dicho primer vector contiene una primera secuencia de nucleótidos con un primer segmento que codifica, en dirección 5'' a 3'': - una parte 5'' de dicha secuencia de ARN de interés y - una parte 5'' de un intrón; y dicho segundo vector contiene una segunda secuencia de nucleótidos con un segundo segmento que codifica, en dirección 5'' a 3'': - una parte 3'' de un intrón y - una parte 3'' de dicha secuencia de ARN de interés.
Description
Método de transformación de plantas con
ensamblaje in vivo de un tratamiento.
La presente invención se refiere a un proceso
para dotar a una planta o a células vegetales de un rasgo de
interés. Además, la invención se refiere a un proceso para
seleccionar secuencias de nucleótidos por un fenotipo deseado en
plantas. La invención se refiere también a plantas transgénicas y a
bibliotecas de plantas o de semillas de plantas obtenidas u
obtenibles de acuerdo con los procesos de la invención. Además, la
invención se refiere a vectores para estos procesos y a plantas o
células vegetales transformadas con los mismos.
Los métodos actualmente utilizados para la
transformación estable de plantas emplean normalmente la
administración directa (bombardeo con microproyectiles,
electroporación o tratamiento de protoplastos mediado por PEG, para
una revisión ver: Gelvin, S.B., 1998, Curr. Opin.
Biotechnol., 9, 227-232; Hansen &
Wright, 1999, Trends Plant Sci., 4,
226-231) o la administración mediada por
Agrobacterium de vectores de ADN de interés preconstruidos a
las células de la planta. Las manipulaciones con dichos vectores de
ADN in planta se limitan a simplificar la resolución de
patrones de integración complejos (US6114600; Srivastava & Ow,
2001, Plant Mol. Biol., 46, 561-566;
Srivastava y col., 1999, Proc. Natl. Acad. Sci. USA,
96, 11117-11121) o a la eliminación de
secuencias de ADN auxiliares de vectores integrados de manera
estable en el ADN cromosómico. Los métodos para la integración
estable en células vegetales de regiones de ADN-T
mediada por Agrobacterium, utilizan una secuencia de ADN
deseada que va a ser integrada flanqueada por secuencias limitantes
izquierda (LB) y derecha (RB) necesarias para la transferencia del
ADN-T y la integración en el ADN cromosómico del
huésped (US4940838; US5464763; EP0224287; US6051757; US5731179;
WO9400977; EP0672752). En la mayoría de los casos, los
procedimientos están dirigidos a la integración de una región de
ADN-T específica en el ADN cromosómico, menos
frecuentemente los procedimientos están diseñados para la
cointegración de dos o más regiones de ADN-T
diferentes (US4658082). Este último procedimiento es utilizado para
segregar diferentes ADN-Ts en la progenie con
diferentes fines. Por ejemplo, Komari y colaboradores (US5731179)
describen un método para transformar simultáneamente células
vegetales con dos ADN-Ts, uno de ellos portador de
un marcador seleccionable funcional en plantas, mientras que el
otro ADN-T contiene una secuencia de ADN deseada que
va a ser introducida en las células vegetales. Esto permite
segregar en la progenie plantas transgénicas sin un marcador
seleccionable.
La integración de un gen de interés en el ADN
cromosómico para expresar dicho gen puede ser llevada a cabo
también con la ayuda de vectores que no contengan promotores
transcripcionales funcionales, sino elementos reguladores de la
traducción (WO0246440) denominados IRESs (sitios internos de entrada
de ribosomas). Tales vectores pueden proporcionar la expresión del
gen de interés tras la integración en la región transcripcionalmente
activa del ADN cromosómico. Otro procedimiento para proporcionar la
expresión de un gen sin promotor o de un gen con un promotor
mínimo, depende también de la integración en regiones
transcripcionalmente activas (Stangeland y col., 2003, J. Exp.
Bot., 54, 279-290;
Baxter-Burrell y col., 2003, Ann. Bot.
(Lond), 91, 129-141) o muy próximas a
intensificadores transcripcionales potentes
(Baxter-Burrell y col., 2003, Ann. Bot.
(Lond), 91, 129-141).
En general, las regiones de ADN diseñadas para
la integración estable en células vegetales son preconstruidas
in vitro empleando técnicas estándar de biología molecular
(Sambrook, Fritsch & Maniatis, 1989, Molecular cloning: A
laboratory manual, 2ª ed., Cold Spring Harbor, NY: CSH Laboratory
Press). Además, se utiliza la ingeniería in vivo en células
bacterianas con el fin de, por ejemplo, ensamblar un vector binario
con la ayuda de recombinación homóloga (US5731179). Las
manipulaciones con ADN-T in planta están
limitadas a regiones de ADN-T preintegradas en un
cromosoma. Tales manipulaciones fueron realizadas para eliminar
ciertas secuencias del ADN-T, por ejemplo
secuencias que codifican marcadores seleccionables que incluyen
genes que inducen una anormalidad morfológica. La eliminación de
fragmentos de ADN indeseables de las regiones del
ADN-T fue intentada con la ayuda de recombinación
específica de sitio (WO9742334; Endo y col., 2002, Plant J.,
30, 115-122) o por medio de transposición
(US5792924). Aunque la escisión de ADN específica de sitio mediada
por recombinasa/integrasa es más eficaz que la integración, la
selección por acontecimientos de escisión es una necesidad que da
lugar a una etapa adicional más de cultivo de tejidos o de selección
de la progenie por los acontecimientos de recombinación deseados.
En resumen, todos los procesos de manipulación con
ADN-Ts integrados de manera estable en los
cromosomas de plantas requieren mucho tiempo, son inflexibles y en
general se limitan a una simple escisión (con menor eficacia a la
integración) de los fragmentos de ADN deseados. Además, estos
procesos están normalmente muy limitados en cuanto a diversidad
combinatoria, ya que se limitan a simples manipulaciones con un
número limitado de genes y elementos reguladores conocidos.
Frecuentemente, las regiones de
ADN-T se cointegran en el mismo locus (Jorgensen y
col., 1987, Mol. Gen. Genet., 207,
471-477; Castle y col., 1993, Mol. Gen.
Genet., 241, 504-514; Cluster y col.,
1996, Plant. Mol. Biol., 32,
1197-1203; DeNeve y col., 1997, Plant J.,
11, 15-29) formando multímeros de regiones
de ADN-T. Sin embargo, tales acontecimientos de
integración complejos son normalmente indeseables en cualquier
aspecto, ya que tales ordenamientos complejos están acompañadas por
la inactivación del transgén (Cluster y col., 1996, Plant Mol.
Biol., 32, 1197-1203; Jorgensen y col.,
1996, Plant Mol. Biol., 31, 957-973).
La transformación de plantas con dos regiones diferentes de
ADN-T, una de ellas portadora de una secuencia
codificadora de un marcador de la transformación, fue utilizada para
generar plantas transgénicas libres de marcador de la
transformación (Komari y col., 1996, Plant J., 10,
165-174). La cointegración de dos copias de
ADN-Ts, una de ellas portadora de un promotor y la
otra portadora del gen de la fosfotransferasa de neomicina sin
promotor, fue utilizada para estudiar el patrón de cointegración del
ADN-T (Krizkova & Hrouda, 1998, Plant
J., 16, 673-680).
Los métodos descritos anteriormente presentan
varios inconvenientes. En el método de Krizkova y Hrouda, no se
selecciona por la cointegración de ambos vectores (o de ambas copias
del mismo vector). En su lugar, se selecciona por la transformación
expresable del gen de la fosfotransferasa de neomicina, que puede
ser debida a la inserción fortuita del gen de la fosfotransferasa
de neomicina sin promotor en una región cromosómica
transcripcionalmente activa. Además, en los métodos que utilizan un
único vector de transformación, se requieren procedimientos de
clonaje complejos y de larga duración, por ejemplo si las células
vegetales van a ser transformadas con una combinación compleja de
secuencias de interés (por ejemplo, más de un gen a ser expresado
junto con elementos específicos como sitios de recombinación,
secuencias reguladoras, secuencias de transposones, etc.). Además,
los métodos anteriores no son adecuados para métodos de ingeniería
in vivo como la redistribución de genes (o de dominios
proteicos) o la evolución dirigida. Además, los métodos anteriores
no permiten obtener plantas transgénicas biológicamente seguras,
por lo que el transgén de dichas plantas transgénicas se pierde o
se convierte en no funcional en la progenie de dichas plantas
transgénicas.
Por tanto, es un objeto de la invención
proporcionar un proceso eficaz, rápido y muy versátil para producir
una planta transgénica o células vegetales transgénicas. Es otro
objeto de la invención proporcionar un método de selección por la
cointegración de dos o más vectores transformados en células
vegetales. Es otro objeto de la invención proporcionar un proceso
para la producción de plantas transgénicas transformadas en un
cromosoma, mediante el cual las secuencias de ADN de interés serán
construidas in planta (por ejemplo para reducir el trabajo
de clonaje o para transformar una secuencia de interés que tenga
efectos tóxicos sobre las bacterias que se utilizan para el
clonaje). Es otro objeto de la invención proporcionar un proceso
para la transformación genética estable de células vegetales, que
permita la producción de una biblioteca de rasgos o funciones y/o
la selección por un rasgo (o función) deseado a partir de la
biblioteca de rasgos (o funciones). Es un objeto adicional de la
invención proporcionar un proceso para producir plantas transgénicas
medioambientalmente seguras, que transfieran la función o el rasgo
transgénico a la progenie con una baja probabilidad.
Los objetos anteriores se consiguen mediante un
proceso para dotar a una planta o a células vegetales de un rasgo
de interés mediante la expresión de una secuencia de ARN de interés,
comprendiendo dicho proceso:
el suministro a la planta o a células de dicha
planta de un primer vector y un segundo vector y la selección de
las células dotadas de dicho rasgo de interés, en el cual
dicho primer vector contiene una primera
secuencia de nucleótidos con un primer segmento que codifica, en
dirección 5' a 3':
- -
- una parte 5' de dicha secuencia de ARN de interés y
- -
- una parte 5' de un intrón; y
dicho segundo vector contiene una segunda
secuencia de nucleótidos con un segundo segmento que codifica, en
dirección 5' a 3':
- -
- una parte 3' de un intrón y
- -
- una parte 3' de dicha secuencia de ARN de interés,
según se define en la reivindicación 1.
\vskip1.000000\baselineskip
La invención proporciona además células
vegetales, plantas o partes de las mismas, tales como semillas, que
están dotadas de un rasgo de interés de acuerdo con el proceso
anterior. Además, se proporciona una biblioteca de plantas o de
semillas de plantas. Preferiblemente, los miembros de dicha
biblioteca están dotados de diferentes rasgos de interés. Además,
se proporciona un kit de partes que contiene dicho primer y dicho
segundo vector de la invención. Preferiblemente, dicho primer y/o
dicho segundo vector de dicho kit de partes no contiene un lugar de
recombinación específica de sitio para prevenir la recombinación
específica de sitio entre dicho primer vector y dicho segundo
vector.
La invención está basada en el hallazgo
sorprendente de que puede conseguirse un ensamblaje eficaz de
secuencias transcritas, en particular de una secuencia codificadora
que codifica o tiene como resultado un rasgo de interés, mediante
la transformación de células vegetales con dos o más vectores,
portando cada uno de ellos un segmento que codifica una parte de
una secuencia transcrita o una parte de dicha secuencia
codificadora. El proporcionar, mediante cotransformación, a células
vegetales dicho primer y dicho segundo vector, tiene como resultado
una elevada probabilidad de integración de dichos vectores cerca
uno de otro en un cromosoma de dichas células vegetales.
De este modo, puede formarse en dicho cromosoma
una unidad de transcripción funcional que contenga secuencias de
ambos (diferentes) vectores y seleccionarse por la misma. La
colocación adecuada de partes 5' y 3' de un intrón permite el
procesamiento mediante el ayuste ("splicing") de intrones de un
transcrito primario derivado de dicha unidad de transcripción,
mediante lo cual se forma dicha secuencia de ARN de interés. Fue
sorprendente encontrar la elevada eficacia con la cual células
vegetales o plantas dotadas con un rasgo de interés pueden ser
obtenidas mediante el proceso de la invención, no sólo si dicho
primer vector y dicho segundo vector están integrados en un
cromosoma de manera contigua, sino también si secuencias
cromosómicas del huésped separan las secuencias de los vectores
integrados. Dicha eficacia es comparable a la de una transformación
estándar con un único vector mediada por Agrobacterium. El
hallazgo más sorprendente fue la capacidad de las secuencias de los
vectores cointegradas (en particular de ADN-Ts) para
expresar una proteína de interés (como dicho rasgo de interés) en
dichas células vegetales, cuando la secuencia que codifica dicha
proteína de interés es dividida en partes y cada parte es
proporcionada a dichas células con un vector diferente.
El proceso de la invención permite producir
plantas o células vegetales transgénicas que están transformadas de
manera estable en un cromosoma con secuencias que derivan al menos
de un primer vector y un segundo vector. La transformación estable
de un cromosoma indica la integración en dicho cromosoma, de tal
manera que dicha secuencia de ADN de interés se replique junto con
dicho cromosoma. Preferiblemente, dicha secuencia de ADN de interés
puede ser heredada durante la división celular y la reproducción del
organismo durante varias generaciones.
En el proceso de la invención, se dota a una
planta o a células vegetales de un rasgo de interés. Ejemplos de
rasgos de interés incluyen la expresión de una proteína de interés
(por ejemplo un marcador seleccionable, una proteína que confiera
resistencia frente a, por ejemplo, insectos, pesticidas, herbicidas,
calor o una proteína que vaya a ser producida con fines
industriales o farmacéuticos) o la disminución regulada de un gen
nativo de las células huésped mediante, por ejemplo, interferencia
con el ARN. Dicho rasgo de interés requiere la expresión de dicha
secuencia de ARN de interés. La traducción de dicha secuencia de ARN
de interés puede dar lugar a la expresión de una proteína de
interés, por lo que dicha parte 5' de dicha secuencia de ARN de
interés puede codificar la parte N-terminal de dicha
proteína de interés, y dicha parte 3' de dicha secuencia de ARN de
interés puede codificar la parte C-terminal de dicha
proteína de interés. Además, dicha parte 5' o dicha parte 3' de
dicha secuencia de ARN de interés puede ser o puede contener un
elemento regulador para la traducción de una parte de dicha
secuencia de ARN de interés en una proteína de interés.
Alternativamente, dicha secuencia de ARN de interés puede producir
dicha disminución regulada de un gen nativo de las células huésped.
Dicho primer vector contiene una primera secuencia de nucleótidos
con un primer segmento que codifica, en dirección 5' a 3', una
parte 5' de dicha secuencia de ARN de interés y una parte 5' de un
intrón. Dicho segundo vector contiene una segunda secuencia de
nucleótidos con un segundo segmento que codifica, en dirección 5' a
3', una parte 3' de un intrón y una parte 3' de dicha secuencia de
ARN de interés. Dicha primera y dicha segunda secuencia de
nucleótidos son introducidas en dichas células vegetales por dicho
primer y dicho segundo vector. Dicha primera y dicha segunda
secuencia de nucleótidos son adaptadas de tal manera que dichas
plantas o dichas células puedan ser dotadas preferiblemente con
dicho rasgo de interés si, y sólo si, a dichas células vegetales se
les proporciona dicho primer vector y dicho segundo vector. Dicha
secuencia de ARN de interés, preferiblemente, no puede ser
expresada y dichas células vegetales no pueden ser dotadas de dicho
rasgo de interés si a dichas células vegetales o a dicha planta se
les proporciona únicamente dicho primer vector o únicamente dicho
segundo vector. Sin embargo, el proceso de la invención puede ser
llevado a cabo de tal manera que se requiera adicionalmente un
tercer vector (o vectores adicionales) para expresar dicha secuencia
de ARN de interés (cf. Fig. 1 II).
De acuerdo con la invención, dichos vectores
tienen una elevada probabilidad de formar una unidad de
transcripción que contenga dicha primera y dicha segunda secuencia
de nucleótidos. Tal unidad de transcripción puede ser formada
mediante cointegración de dichos vectores en una región
transcripcionalmente activa de un cromosoma. Sin embargo,
preferiblemente, está incluido un promotor de la transcripción en
dicha primera secuencia de nucleótidos corriente arriba de dicho
primer segmento.
En la primera etapa del proceso de la invención,
se proporciona a células vegetales o a una planta al menos dicho
primer y dicho segundo vector. Puede proporcionarse a las células
vegetales dichos al menos dos vectores diferentes en cultivo de
tejidos, en particular en tejido de fragmentos de hojas o en cultivo
de tejidos de protoplastos de células vegetales. Además, pueden
proporcionarse dicho primer y dicho segundo vector a explantes (por
ejemplo explantes de raíz, discos de hoja) de una planta. Además,
pueden proporcionarse dichos vectores a plantas completas o a
partes de plantas completas. Preferiblemente, dicho primer vector y
dicho segundo vector son proporcionados de tal manera que se
integren en un cromosoma de dichas células vegetales. Dicho
cromosoma puede ser un cromosoma nuclear o un cromosoma de un
orgánulo (plastídico o mitocondrial). Preferiblemente, dicho primer
vector y dicho segundo vector se integran en un cromosoma nuclear.
En cualquier caso, dichos vectores deben integrarse en el mismo
cromosoma, en particular en el mismo cromosoma nuclear, lo cual
puede ser conseguido mediante una selección adecuada según se
describe posteriormente.
Dichos vectores pueden ser proporcionados a
dichas células vegetales mediante cualquier método de transformación
conocido, ejemplos de los cuales son el bombardeo de partículas, la
electroporación y la transformación mediada por
Agrobacterium. Sin embargo, con el fin de conseguir una
elevada probabilidad de integración de dicho primer vector y dicho
segundo vector próximos entre sí en dicho cromosoma, se prefiere
enormemente proporcionar dichos vectores mediante transformación
mediada por Agrobacterium. En este caso, dicho primer vector
y dicho segundo vector pueden derivar de un plásmido Ti y dicha
primera y dicha segunda secuencia de nucleótidos residirán cada una
de ellas entre las secuencias del límite izquierdo y del límite
derecho del ADN-T. Dichas secuencias del límite
izquierdo y del límite derecho pueden proporcionar posteriormente la
integración de dichos ADN-Ts en dicho cromosoma.
Dicho primer vector y dicho segundo vector pueden ser proporcionados
a dichas células de manera consecutiva. Sin embargo, la eficacia
del proceso disminuye al aumentar el tiempo entre el suministro de
dichos vectores. Preferiblemente, se proporcionan por tanto dicho
primer y dicho segundo vector a dicha planta o a dichas células
vegetales en un procedimiento de una sola etapa, esto es mediante
cotransformación. En el caso de la administración directa de los
vectores, esto significa que se utilizan preferiblemente mezclas de
dichos vectores. En el caso de la administración de
ADN-T mediada por Agrobacterium, pueden
utilizarse mezclas de cepas (o células) de Agrobacterium, por
lo que cada célula o cepa contendrá un plásmido Ti diferente con
dicho primer vector o dicho segundo vector (y opcionalmente con un
tercer vector). El suministrar a dichas células vegetales o a
dichas plantas dichos vectores en un procedimiento de una sola
etapa, en particular de manera simultánea, es eficaz y proporciona
una buena eficacia total del proceso de la invención.
La selección de las células vegetales dotadas de
dicho rasgo de interés puede ser realizada de acuerdo con métodos
generalmente conocidos. El método de selección depende en general
del método de transformación. Dicha primera o dicha segunda
secuencia de nucleótidos puede contener un marcador seleccionable.
Preferiblemente, dicho rasgo de interés es la resistencia frente a
un agente selectivo, permitiendo la selección de las células
transformadas en las que ha tenido lugar con éxito el proceso de la
invención.
En el proceso de la invención, pueden ponerse en
contacto secuencias transcritas codificadas por diferentes vectores
en dicha secuencia de ARN de interés para producir dicho rasgo de
interés. Ejemplos de tales secuencias transcritas son secuencias
que codifican una proteína de interés y secuencias implicadas en la
regulación de la transcripción (como un elemento IRES, una
secuencia 5' no traducida o una región 3' no traducida) y una
secuencia de ARN para interferencia con el ARN. Los promotores no
son secuencias transcritas. En una realización básica, el proceso
de la invención comprende la traducción de dicha secuencia de ARN de
interés para producir una proteína de interés. Dicho rasgo de
interés puede ser debido a dicha proteína de interés. En este caso,
dicha proteína de interés puede ser expresada preferiblemente
únicamente si a dichas células vegetales se les ha proporcionado
dicho primer vector y dicho segundo vector, lo cual puede ser
realizado de varias formas. Dicho primer segmento o dicho segundo
segmento pueden codificar, por ejemplo, un elemento regulador de la
traducción (como un sitio interno de entrada de ribosomas IRES, o
una región 5' no traducida o una región 3' no traducida) y el otro
segmento puede codificar dicha proteína de interés. Preferiblemente,
sin embargo, dicho primer segmento codifica una parte 5' de dicha
proteína de interés y dicho segundo segmento codifica una parte 3'
de dicha proteína de interés, preferiblemente de tal manera que
dicho rasgo de interés sea producido únicamente si dicho primer
vector y dicho segundo vector son proporcionados a dichas células
vegetales o a dicha planta. Uno o ambos de dichos segmentos puede
contener además un elemento regulador de la traducción u otras
secuencias no traducidas.
Si dicho rasgo de interés es debido a una
proteína de interés, dicho ARN de interés puede ser traducido en
dichas células para expresar dicha proteína de interés. La expresión
de dicha proteína de interés demuestra que dicha secuencia de ARN
de interés ha sido expresada. La expresión de la proteína de interés
requiere el ayuste de intrones de un transcrito primario para
formar dicha secuencia de ARN de interés por medio de dicha parte
5' y dicha parte 3' del intrón. Dichas partes del intrón deben ser
adaptadas de tal manera que el ayuste del transcrito primario de
lugar a una secuencia de ARN de interés con el marco de lectura
correcto para la expresión de una proteína de interés funcional.
Para este fin, dicha parte 5' de dicha secuencia de ARN de interés
está preferiblemente contigua a la parte 5' de un intrón y dicha
parte 3' de un intrón está preferiblemente contigua a la parte 3'
de dicha secuencia de ARN de
interés.
interés.
Dicha parte 5' de un intrón y dicha parte 3' de
un intrón están codificadas por dicho primer segmento y dicho
segmento, respectivamente. Las secuencias que codifican las partes
del intrón pueden ser tomadas de un intrón conocido. Dicho intrón
puede ser un intrón de autoayuste, por ejemplo un intrón del grupo I
o del grupo II. Alternativamente, dicho intrón puede ser un intrón
de un pre-ARNm nuclear para el ayuste mediado por
ayustosomas ("spliceosomes"). Los más preferidos son los
intrones de un pre-ARNm nuclear para el ayuste
mediado por ayustosomas. Una secuencia de ADN que codifica un
intrón puede ser dividida en secuencias que codifiquen dichas partes
5' y 3' del intrón e incorporadas, respectivamente, en dicho primer
segmento y en dicho segundo segmento. Tal división tiene que ser de
tal manera que dichas partes 5' y 3' del intrón sean funcionales
como un intrón, lo cual puede ser analizado experimentalmente. Un
intrón existente de forma natural puede ser modificado siempre que
dichas partes del intrón permanezcan funcionales como un intrón. Las
secuencias que codifican dichas partes del intrón pueden ser
también, por supuesto, sintetizadas artificialmente e incorporadas a
dicho primer segmento y a dicho segundo segmento (ver los
ejemplos).
ejemplos).
Una realización básica de la invención está
ejemplificada en la Fig. 10 y en la Fig. 11. De acuerdo con la Fig.
10, dicho primer vector contiene una primera secuencia de
nucleótidos (mostrada en A) con un primer segmento que codifica la
parte 5' de un marcador seleccionable y la parte 5' de un intrón.
Dicho segundo vector contiene una segunda secuencia de nucleótidos
(mostrada en B) con un segundo segmento que codifica la parte 3' de
un intrón y la parte 3' de un marcador seleccionable. La aplicación
de un agente selectivo a las células transformadas con dicho primer
vector y dicho segundo vector permite la selección por tal modo de
cointegración, en la cual dichos vectores forman una unidad de
transcripción funcional (representada en C). Un transcrito primario
producido en células vegetales bajo el control de un promotor
corriente arriba de dicho primer segmento da lugar a un transcrito
primario que contiene, en dirección 5' a 3', la parte 5' de dicho
marcador seleccionable, la parte 5' de dicho intrón, posiblemente
secuencias derivadas del cromosoma del huésped, la parte 3' de dicho
intrón y la parte 3' de dicho marcador seleccionable. Dichas partes
del intrón permiten el ayuste del intrón de dicho transcrito
primario para formar dicha secuencia de ARN de interés. La
traducción de dicha secuencia de ARN de interés proporciona a
dichas células resistencia a dicho agente selectivo como rasgo de
interés. Según se muestra en la Fig. 11, el marcador seleccionable
puede ser cualquier gen de interés. De acuerdo con el conocimiento
general, dicha parte 5' de un intrón y dicha parte 3' de un intrón
pueden ser adaptadas de tal manera que dicha secuencia de ARN de
interés contenga el marco de lectura correcto para que una proteína
sea expresada.
Dicha primera o dicha segunda secuencia de
nucleótidos puede contener genes o secuencias codificadoras de
interés adicionales, opcionalmente con elementos reguladores como un
promotor, un elemento IRES, etc., para dotar a dichas células de un
rasgo de interés adicional. De esta forma, pueden expresarse dos,
tres o más proteínas o rasgos de interés. Además, secuencias de
nucleótidos complejas pueden ser cointegradas en un cromosoma,
mediante lo cual pueden obtenerse patrones de integración complejos
según está ejemplificado en la Fig. 12C. El clonaje de vectores
como los mostrados en la Fig. 12A y B es mucho más fácil que el
clonaje de un vector que contenga todos los elementos mostrados en
la Fig. 12C, lo cual constituye una importante ventaja en el
proceso de la
invención.
invención.
En una realización adicional (ver la Fig. 1 II),
se proporciona además a dichas células vegetales o a dicha planta
un tercer vector conteniendo una tercera secuencia de nucleótidos
que codifica, en dirección 5' a 3':
- -
- una parte 3' de un intrón funcional con dicha parte 5' de un intrón de dicha primera secuencia de nucleótidos,
- -
- una parte central de dicha secuencia de ARN de interés, y
- -
- una parte 5' de un intrón funcional con dicha parte 3' de un intrón de dicha segunda secuencia de nucleótidos.
\vskip1.000000\baselineskip
En este caso, la expresión de dicho rasgo de
interés requiere preferiblemente la formación de una unidad de
transcripción en el cromosoma de la planta que contenga secuencias
de los tres vectores.
En una realización adicional, el método de la
invención puede ser utilizado para someter a selección un conjunto
de primeros vectores y un conjunto de segundos vectores por una
combinación de un primer y un segundo vector, dando lugar dicha
combinación a plantas o a células vegetales dotadas de un rasgo
deseado. Esta realización del proceso de la invención comprende las
etapas (A) y (B) siguientes:
- (A)
- el suministro a plantas o a células vegetales de una mezcla de
- (i)
- un conjunto de m primeros vectores que tienen cada uno de ellos una primera secuencia de nucleótidos con un primer segmento que codifica una parte 5' de dicha secuencia de ARN de interés, siendo seleccionada dicha parte 5' de dicha secuencia de ARN de interés del conjunto (a_{1}, a_{2}, ..., a_{m}) y
- (ii)
- un conjunto de n segundos vectores que tienen cada uno de ellos una segunda secuencia de nucleótidos con un segundo segmento que codifica una parte 3' de dicha secuencia de ARN de interés, estando seleccionada dicha parte 3' de dicha secuencia de ARN de interés del conjunto (b_{1}, b_{2}, ..., b_{n}),
- \quad
- donde
- \quad
- m y n son independientes uno de otro y son ambos números enteros >1,
- \quad
- dichos primeros vectores y dichos segundos vectores están adaptados para producir diferentes secuencias de ARN de interés,
- (B)
- la selección de las plantas o células vegetales transformadas dotadas de un rasgo de interés.
\vskip1.000000\baselineskip
Dicho conjunto de primeros vectores y dicho
conjunto de segundos vectores pueden ser bibliotecas de primeras o
segundas secuencias de nucleótidos, respectivamente, en dichos
vectores. Para m=3 y n=2, como ejemplo, pueden obtenerse células
vegetales que expresen las secuencias de ARN de interés
a_{1}b_{1}, a_{1}b_{2}, a_{2}b_{1}, a_{2}b_{2},
a_{3}b_{1} y a_{3}b_{2} las cuales, por traducción, pueden
dar lugar a diferentes proteínas de interés o diferentes rasgos de
interés. Cada célula vegetal o planta que expresa una secuencia de
ARN de interés particular representa un miembro de una biblioteca de
plantas obtenidas mediante la invención. Pueden producirse semillas
de tales plantas para obtener una biblioteca de semillas de plantas.
En la forma de semillas, la biblioteca puede ser fácilmente
almacenada y la biblioteca puede ser mantenida o propagada, si es
necesario. La etapa (B) de las realizaciones anteriores puede ser
posteriormente llevada a cabo independientemente de la etapa (A),
por ejemplo mucho tiempo después de llevar a cabo la etapa (A).
Esta realización es particularmente útil para redistribuir y
seleccionar por una combinación de dominios proteicos de una
proteína con múltiples dominios.
En el método de selección anterior, puede
formarse la variedad combinatoria de rasgos de interés más grande
(y por tanto de plantas o de células vegetales transgénicas). Una
realización más especial comprende las etapas (A) y (B)
siguientes:
- (A)
- el suministro a plantas o a células vegetales de una mezcla de
- (i)
- un primer vector que tiene una primera secuencia de nucleótidos con un primer segmento que codifica una parte 5' de dicha secuencia de ARN de interés a_{1} y
- (ii)
- un conjunto de n segundos vectores que tienen cada uno de ellos una segunda secuencia de nucleótidos con un segundo segmento que codifica una parte 3' de dicha secuencia de ARN de interés seleccionada del conjunto (b_{1}, b_{2}, ..., b_{n}),
- \quad
- donde
- \quad
- n es un número entero >1,
- \quad
- dicho primer vector y dichos segundos vectores están adaptados para expresar secuencias de ARN de interés del tipo (a_{1}b_{1}, a_{1}b_{2}, ..., a_{1}b_{n}) o del tipo (b_{1}a_{1}, b_{2}a_{1}, ..., b_{n}a_{1}),
- (B)
- la selección de las plantas o células vegetales transformadas dotadas de un rasgo de interés.
\vskip1.000000\baselineskip
Pueden posteriormente formarse diferentes
secuencias de ARN de interés, conteniendo cada una de ellas una
porción de la secuencia de dicho primer segmento y una porción de la
secuencia de un segundo segmento.
El primer vector puede proporcionar, por
ejemplo, secuencias reguladoras de la traducción que conviertan en
traducibles las porciones de las secuencias de los segundos vectores
después del ensamblaje de una secuencia de ARN de interés que
contenga una porción de la secuencia de dicho primer vector y una
porción de la secuencia de un vector de dicho conjunto de segundos
vectores.
El proceso total de la invención tiene
suficiente eficacia para permitir aplicaciones rutinarias del
proceso de la invención. Por ejemplo, el proceso de selección de
bibliotecas de ADN por un rasgo útil puede ser llevado a cabo in
planta con un peligro bajo de perder miembros de la biblioteca
que no sean compatibles con los sistemas procarióticos utilizados
para el clonaje en los procedimientos tradicionales. Esto permite
combinar los procesos de producción de vectores (por ejemplo con
fines de genómica funcional o de evolución dirigida) con la
creación de transformantes estables, acelerando así
significativamente el proceso de selección por las combinaciones
deseadas de los elementos genéticos que estén siendo analizados.
Tiene también una característica ventajosa adicional, ya que
permite incluir elementos reguladores residentes en el proceso de
selección mediante atrapamiento entre las secuencias intrónicas 5'
y 3', por ejemplo durante el proceso de "intronización".
El proceso de la invención tiene variabilidad
combinatoria a nivel de los transformantes primarios, permitiendo
de este modo combinar en un experimento la evolución dirigida de
secuencias codificadoras de interés (por ejemplo la redistribución
de dominios de una proteína de interés con múltiples dominios) y la
generación y selección de transformantes primarios que presenten el
rasgo de interés.
El proceso tiene muchas aplicaciones
importantes, entre las cuales pueden mencionarse su utilización en
procesos de selección de bibliotecas de ADN, el análisis de la
función génica y la genómica funcional y la evolución dirigida
incluyendo la redistribución de genes. Además, las secuencias de ADN
de interés complejas y/o grandes que van a ser introducidas en el
cromosoma de una planta pueden ser ensambladas in planta a
partir de precursores más pequeños (ver la Fig. 12). El proceso de
la invención puede ser también utilizado, sin embargo, con el fin
de introducir un gen para que sea expresado en un cromosoma de una
célula vegetal o de una planta. En una realización importante,
todos los genes y/o secuencias codificadoras y/o secuencias
expresables de dicha secuencia de ADN de interés integrados en un
cromosoma son de origen vegetal, por lo que no pueden cruzarse
secuencias no naturales procedentes de las plantas transgénicas de
la invención a otros organismos.
Una aplicación importante más de la invención es
en procesos para conseguir plantas medioambientalmente seguras que
tengan dos secuencias transgénicas en los mismos loci de cromosomas
homólogos. Según se describe en WO03/102197 (PCT/EP03/02986), tal
combinación de dos secuencias transgénicas pueden dar lugar juntas a
un rasgo de interés, pero dicho rasgo de interés tiene una baja
probabilidad de ser transferido a la progenie, ya que dichas dos
secuencias transgénicas se segregarán en la progenie. Las Figs. 12 y
13 ejemplifican la utilización de la presente invención en un
proceso para producir plantas medioambientalmente seguras.
\newpage
\global\parskip0.900000\baselineskip
Un proceso para dotar a una planta o a células
vegetales de un rasgo de interés mediante la expresión de una
secuencia de ARN de interés, comprendiendo dicho proceso:
la transformación de células vegetales o de una
planta mediante transformación mediada por Agrobacterium con
un primer ADN-T y un segundo ADN-T y
la selección de las células dotadas de dicho rasgo de interés,
donde
dicho primer ADN-T contiene una
primera secuencia de nucleótidos con un promotor transcripcional y
un primer segmento que codifica en dirección 5' a 3':
- -
- una parte 5' de dicha secuencia de ARN de interés y
- -
- una parte 5' de un intrón; y
dicho segundo ADN-T contiene una
segunda secuencia de nucleótidos con un segundo segmento que
codifica en dirección 5' a 3':
- -
- una parte 3' de un intrón y
- -
- una parte 3' de dicha secuencia de ARN de interés.
\vskip1.000000\baselineskip
En un proceso preferido de la invención, dicho
rasgo de interés es producido por la expresión de una proteína de
interés. Tal proceso preferido puede ser un proceso para dotar a una
planta o a células vegetales de un rasgo de interés mediante la
expresión de una proteína de interés, comprendiendo dicho
proceso:
el suministro a células vegetales o a una planta
de un primer vector y de un segundo vector y la selección de las
células dotadas de tal rasgo de interés, donde
dicho primer vector contiene una primera
secuencia de nucleótidos con un primer segmento que codifica en
dirección 5'a 3':
- -
- una parte N-terminal de dicha proteína de interés y
- -
- una parte 5' de un intrón; y
dicho segundo vector contiene una segunda
secuencia de nucleótidos con un segundo segmento que codifica en
dirección 5' a 3':
- -
- una parte 3' de un intrón y
- -
- una parte C-terminal de dicha proteína de interés.
\vskip1.000000\baselineskip
En las realizaciones preferidas de la invención,
dicho primer vector y dicho segundo vector son incapaces de
recombinarse entre sí mediante recombinación específica de sitio. La
incapacidad de recombinación puede ser debida a la falta de un
lugar de recombinación específica de sitio en dicho primer vector o
en dicho segundo vector, o puede ser debida a la ausencia de una
recombinasa específica de sitio que pueda reconocer lugares de
recombinación específica de sitio en dichos vectores.
La Fig. 1 muestra esquemáticamente tres
realizaciones generales del proceso de la invención. A la izquierda,
se representan (como recuadros) secuencias de nucleótidos (A, B, C)
de un primer, un segundo y, opcionalmente, un tercer vector
proporcionadas a células vegetales que están integradas de manera
estable en el cromosoma de una planta. Las secuencias de
nucleótidos integradas están representadas por recuadros conectados
por una línea que indica el ADN cromosómico del huésped. SD y SA
significan sitios donantes de ayuste y aceptadores de ayuste,
respectivamente. I5' y I3' indican las partes 5' y 3' de un
intrón.
I - ensamblaje por transcripción y ayuste de una
secuencia de ARN de interés (AB) que contiene secuencias
codificadas por una primera (A) y una segunda (B) secuencia de
nucleótidos de un primer vector y un segundo vector,
respectivamente.
II - ensamblaje por transcripción y ayuste de
una secuencia de ARN de interés (ACB) a partir de tres secuencias
de nucleótidos diferentes de tres vectores (A, C y B). El tercer
vector C contiene una tercera secuencia de nucleótidos con un
tercer segmento que codifica en dirección 5' a 3':
- -
- una parte 3' de un intrón preferiblemente funcional con dicha parte 5' de un intrón de dicha primera secuencia de nucleótidos,
\global\parskip1.000000\baselineskip
- -
- una parte central de dicha secuencia de ARN de interés y
- -
- una parte 5' de un intrón preferiblemente funcional con dicha parte 3' de un intrón de dicha segunda secuencia de nucleótidos.
III - ensamblaje por transcripción y ayuste de
varias secuencias de ARN de interés (A_{n}B_{n}) a partir de
una biblioteca de los vectores A y de una biblioteca de vectores B,
donde n es el número de vectores de la biblioteca.
La Fig. 2 representa esquemáticamente las
regiones de ADN-T de los vectores binarios pICBV19 y
pICH10605.
GUS - gen de la
beta-glucuronidasa; P35S - promotor de CaMV35S; BAR
- gen de la acetiltransferasa de fosfinotricina (pICH10605 tiene
secuencias codificadoras de BAR que alteran el intrón); PNOS -
promotor del gen de la sintasa de nopalina de Agrobacterium;
TNOS - región de terminación de la transcripción del gen de la
sintasa de nopalina de Agrobacterium; TOCS - región de
terminación de la transcripción del gen de la sintasa de
octopina.
La Fig. 3 representa esquemáticamente la región
del ADN-T del vector binario pICH7410.
GFP - gen que codifica la proteína fluorescente
verde; NPT - gen de la fosfotransferasa II de neomicina que
confiere resistencia a kanamicina; POCS - región promotora del gen
de la sintasa de octopina de Agrobacterium; NTR - región 3'
no traducida del ARN del virus del mosaico del tabaco (TMV); AttB -
lugar de recombinación.
La Fig. 4 representa esquemáticamente las
regiones de ADN-T de los plásmidos pICH11140 y
pICH11150.
PACT2-i - promotor del gen de
actina2 de Arabidopsis con el primer intrón.
La Fig. 5 representa las regiones de
ADN-T de los vectores binarios pICBV16 y
pICH8430.
PACT2 - promotor del gen de actina2 de
Arabidopsis; polimerasa de TVCV - ARN polimerasa dependiente
de ARN del virus del aclaramiento de las venas del nabo (TVCV); MP
- proteína de movimiento tobamovírica; IRESmp75 - IRES de la
proteína de movimiento de crTMV.
La Fig. 6 representa esquemáticamente las
regiones de ADN-T de los vectores binarios pICH11160
y pICH11170.
La Fig. 7 representa esquemáticamente las
regiones de ADN-T resultantes de (A) la
cointegración y (B) la recombinación específica de sitio entre los
ADN-Ts de pICH11150 y pICH11170. La región del
ADN-T lleva un gen BAR interrumpido por un intrón
que contiene un sitio de AttR. El ayuste del intrón después de la
transcripción permite la expresión de una proteína BAR
funcional.
La Fig. 8 representa esquemáticamente las
regiones del ADN-T de los vectores binarios
pICH12022 y pICH12031 diseñados para la transformación de plantas
monocotiledóneas. PUBQ - promotor del gen de la ubiquitina del
maíz; PACT1 - promotor del gen de actina1 del arroz; IPT - gen que
codifica la isopentenil transferasa.
La Fig. 9 representa esquemáticamente las
regiones de ADN-T resultantes de (A) la
cointegración y (B) la recombinación específica de sitio entre las
regiones del ADN-T de los vectores binarios
pICH12022 y pICH12031. La región lleva un gen BAR funcional
interrumpido por un intrón bajo el control del promotor PACT1 del
gen de la actina1 del arroz.
La Fig. 10 representa un esquema de
cointegración de dos ADN-Ts (A y B) que incluye el
ensamblaje de un gen marcador seleccionable funcional a partir de
fragmentos de dicho gen marcador seleccionable denominados
"Seleccionable" y "marcador". Simultáneamente, un intrón
(denominado "INTRÓN") es ensamblado a partir de los fragmentos
intrónicos denominados "INT" y "RON". P - promotor; T -
región de terminación de la transcripción; IRES - sitio interno de
entrada de ribosomas. La selección por la cointegración funcional
puede ser realizada mediante la aplicación de un antibiótico
adecuado para dicho marcador seleccionable.
La Fig. 11 representa un esquema de
cointegración de dos ADN-Ts (A y B) incluyendo el
ensamblaje de un gen funcional de interés a partir de fragmentos de
dicho gen de interés denominados "Gen de" e "Interés".
Dicha cointegración ensambla también un intrón funcional a partir
de una parte 5' ("INT") y una parte 3' ("RON") de dicho
intrón. El fragmento de ADN cromosómico del huésped (indicado por
líneas que conectan los recuadros "INT" y "RON") y las
partes de los vectores pueden ser eliminados mediante ayuste en cis
del ARN procedente de un transcrito formado bajo el control del
promotor "P". Un marcador seleccionable bajo el control
transcripcional de un elemento IRES es convertido en expresable
mediante la transcripción bajo el control del promotor. P -
promotor; T - región de terminación de la transcripción; IRES -
sitio interno de entrada de ribosomas.
La Fig. 12 representa esquemáticamente la
cointegración in planta de los vectores A y B para dar lugar
al patrón de cointegración C. Las plantas o las células vegetales
que contienen C pueden ser utilizadas para obtener plantas
transgénicas medioambientalmente seguras (ver la Fig. 13) que tienen
secuencias transgénicas en localizaciones alélicas, esto es una
secuencia transgénica en un locus de un cromosoma y otra secuencia
transgénica en el mismo locus de un cromosoma homólogo (alélico). P
- promotor; T - región de terminación de la transcripción; CSM -
marcador contraseleccionable; IRES - sitio de interno de entrada de
ribosomas; Ds (3' o 5') - extremos de un elemento transponible no
autónomo (Ds) reconocidos por la Ac transposasa; dSpm (3' o 5') -
extremos de un elemento transponible no autónomo (dSpm) reconocidos
por la Spm transposasa; GOI - gen de interés.
La Fig. 13 representa esquemáticamente un método
para generar plantas o células vegetales transgénicas
medioambientalmente seguras con secuencias transgénicas en
localizaciones alélicas. La Fig. 13(A) representa un
ADN-T integrado en un cromosoma de acuerdo con la
Fig. 12. El tratamiento de las células que contienen el
ADN-T mostrado en (A) con Ac transposasa permite
obtener células que contienen el ADN-T mostrado en
(B). El tratamiento de las células que contienen el
ADN-T mostrado en (A) con la Spm transposasa permite
obtener células que contienen el ADN-T mostrado en
(C). La hibridación de células o plantas que contienen (B) con
células o plantas que contienen (C), da lugar a células o plantas
con los ADN-Ts (A) y (B) en localizaciones alélicas.
P - promotor; T- región de terminación de la transcripción; CSM -
marcador contraseleccionable; IRES - sitio interno de entrada de
ribosomas; Ds (3' o 5') - extremos de un elemento transponible no
autónomo (Ds) reconocidos por la Ac transposasa; dSpm (3' o 5') -
extremos de un elemento transponible no autónomo (dSpm) reconocidos
por la Spm transposasa; GOI - gen de interés.
La Fig. 14 representa los patrones de
cointegración del ADN-T que pueden proporcionar el
ensamblaje del transcrito de BAR funcional (ver el Ejemplo 4). Las
posiciones de los cebadores pr1-4, que fueron
utilizados para el análisis mediante PCR, están mostradas por
flechas. Las regiones amplificadas mediante PCR están mostradas por
una línea gruesa. Las representaciones y orientaciones esquemáticas
de las regiones del ADN-T en (a), (b) y (c) están
indicadas por flechas, donde la flecha oval representa la posición
del límite derecho (RB) del ADN-T.
La Fig. 15 muestra los resultados del análisis
mediante PCR de líneas de tabaco resistentes a PPT cotransformadas
con las construcciones pICH11140 y pICH11170. Se utiliza la
combinación de los cebadores Pr1 y Pr2 para analizar el patrón de
integración del ADN-T mostrado en (a). Calles
1-26 - análisis mediante PCR de las líneas
resistentes a PPT cotransformadas con pICH11140 y pICH11170; nc -
control negativo (planta de tipo salvaje); pc - control positivo,
ADN de la planta transformada con pICBV19.
En esta invención describimos un proceso para el
ensamblaje rápido, barato, in planta de un rasgo de interés
a partir de secuencias derivadas de al menos dos vectores integrados
de manera estable en el cromosoma de una planta. Este procedimiento
permite, inter alia, la optimización rápida de las secuencias
que van a ser expresadas mediante el análisis de diferentes
unidades de transcripción o traducción, de unidades con diferentes
fusiones de proteínas o con una vectorización de proteínas o una
modificación post-traduccional diferentes, etc.
Puede ser utilizado eficazmente para someter a selección bibliotecas
de secuencias codificadoras o reguladoras de interés. Otra
aplicación de la invención es el diseño de plantas transgénicas
medioambientalmente seguras que son incapaces de transferir la
secuencia transgénica de interés a otras plantas a través de la
transferencia del gen ilícito. Además, puede evitarse el clonaje
difícil durante el diseño de regiones de ADN complejas (por ejemplo
que muestren inestabilidad durante los procedimientos de clonaje en
células bacterianas) para una transformación nuclear estable, ya
que dos o más fragmentos de ADN complejos pueden ser ligados
funcionalmente in planta después de su integración en un
cromosoma de la planta. Además, la invención ofrece también la
posibilidad de introducir dos o más ADN-Ts
diferentes en el mismo locus mediante la selección por regiones
cointegradas de ADN-T que tienen como resultado el
ensamblaje mediado por un intrón de una secuencia de ARN de interés
que codifica un marcador seleccionable. De este modo, pueden
seleccionarse los acontecimientos de cointegración. Posteriormente,
una de las dos regiones de ADN-T cointegradas, o
partes de las mismas, pueden ser eliminadas mediante, por ejemplo,
transposición o recombinación específica de sitio (cf. Fig. 13),
proporcionando dos regiones de ADN-T diferentes en
posiciones isoalélicas.
Dicha parte 5' y dicha parte 3' del intrón
pueden derivar de un intrón natural y de derivados del mismo.
Existen diferentes grupos/clases de intrones que son clasificados
según su organización interna y su mecanismo de ayuste. Los
intrones nucleares tienen en común la posesión de dinucleótidos
GT-AG en los extremos 5' y 3' y, normalmente,
requieren la formación de ayustosomas para su ayuste. Los intrones
del grupo I y del grupo II fueron denominados por los intrones
encontrados en diferentes genes mitocondriales fúngicos. Se
clasifican según su organización interna, pero tienen en común la
capacidad de autocatalizar su propio ayuste (intrones de
autoayuste). Existen diferentes grupos de intrones y diferentes
reacciones de ayuste de ARN. Algunos intrones requieren factores
adicionales para ser funcionales, mientras que otros no (como los
intrones de autoayuste). Hay intrones que pueden llevar a cabo un
ayuste en cis e intrones que llevan a cabo reacciones de ayuste en
trans.
El ayuste de los intrones nucleares se lleva a
cabo a través de un mecanismo mediado por sn-RNP
(mediado por ayustosomas). Existe una abundante literatura que
describe los mecanismos de ayuste en cis, incluyendo el ayuste
alternativo de genes nucleares en diferentes organismos eucarióticos
(para una revisión ver Adams y col., 1996, Curr. Opin. Cell
Biol., 8, 331-339; Hastings & Krainer, 2001,
Curr. Opin. Cell Biol., 13, 302-309).
Se ha descrito un ayuste en trans que tiene lugar de forma natural
con la implicación de un mecanismo mediado por snRNP para la unión
de ARN SL (líder ayustado) al extremo 5' de ARNms en tripanosomas
(Agabian, N., 1990, Cell, 61,
1157-1160; Luo y col., 1999, J. Biol. Chem.,
274, 31947-31954) y Caenorhabditis
elegans (Hirsh & Huang, 1990, Mol. Biol. Rep.,
14, 115). Estos pequeños ARNs "líder ayustado" constan
de un exón 5' fusionado a secuencias que pueden sustituir
funcionalmente al ARNsn U1 en extractos de ayuste por snRNP en
mamíferos. Se ha observado también en cordados un ayuste en trans
similar del ARN SL.
Los intrones de grupo I y II tienen la capacidad
de ayustarse ellos mismos para salir del pre-ARNm.
Esta reacción puede ser realizada in vitro por el ARN solo.
Tales ARNs con actividad catalítica son denominados generalmente
ribozimas. Los intrones del grupo I y del grupo II son ambos capaces
de ayustarse (incluyendo ayuste en trans) en sistemas artificiales
(Been y col., 1986, Cell, 47, 207-216;
Jacquier y col., 1986, Science, 234,
1099-1194; Jarrell y col., 1988, Mol. Cell
Biol., 8, 2361-2366). Se encontró también
ayuste en trans en intrones del grupo II en genes divididos de
cloroplastos (Kohchi y col., 1988, Nucl. Acids Res.,
16, 10025-10036) y en un intrón del grupo I
en un gen dividido artificial de Escherichia coli
(Galloway-Salvo y col., 1990, J. Mol. Biol.,
211, 537-549). Los intrones del grupo I
fueron descubiertos por vez primera en ARNr de Tetrahymena
thermophila (Cech, T.R., 1990, Ann. Rev. Biochem.,
59, 543-568). Los mismos requieren un U en
la secuencia diana inmediatamente 5' del sitio de corte y se unen a
4-6 nucleótidos en el lado 5' del sitio de corte.
Hasta el momento existen más de 75 miembros conocidos de este grupo.
Se encontraron también en mitocondrias fúngicas y de plantas
(Richard & Dujon, 1997, Curr. Genet., 32,
175-181; Cho y col., 1998, Proc. Natl. Acad.
Sci. USA, 95, 14244-14249), en
cloroplastos (Turmel y col., 1993, J. Mol. Biol.,
232, 446-46), en el fago T4 (Galloway y col.,
1990, J. Mol. Biol., 211, 537-549), en
algas verdiazules y en otros organismos.
Se han desarrollado varios procedimientos para
utilizar intrones y ribozimas construidos que pueden ser utilizados
para la práctica de esta invención (referencias anteriormente
citadas). Los mismos cubren los todos los tipos conocidos de
intrones para la creación de acontecimientos de ayuste en células
eucarióticas. Los ribozimas construidos sobre la base de intrones
de Tetrahymena del grupo I (US6.015.794; Ayre y col., 1998,
Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 96,
3507-3512), mediados por ayustosomas (Puttaraju y
col., 1999, Nature Biotech., 17,
246-252; Liu y col., 2001, Nature Biotech.,
20, 47-52; US6.083.702) o por ayuste en trans
mediado por intrones del grupo II (Mikheeva & Jarrell, 1996,
Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 93,
7486-7490; US5.498.531) pueden ser utilizados para
la presente invención.
Como el ayuste en cis, según se utiliza en la
presente invención, es más eficaz que el ayuste en trans, se
prefieren en la presente los intrones de ayuste en cis, siendo los
más preferidos los intrones para el ayuste en cis mediado por
ayustosomas. Tales intrones pueden ser modificados mediante la
inserción de secuencias heterólogas adicionales sin pérdida de la
funcionalidad, lo cual es de particular importancia para esta
invención, ya que pueden estar presentes secuencias cromosómicas
del huésped entre dicha parte 5' de un intrón y dicha parte 3' de
un intrón después de la integración de dichos vectores.
Pueden utilizarse muchos intrones nucleares en
la práctica de esta invención. Ejemplos de tales intrones incluyen
los intrones de los genes del arroz tpi Act1 y salT
(Rethmeier y col., 1997, Plant J., 12,
895-899; Xu y col., 1994, Plant Physiol,
100, 459-467; McElroy y col., 1990, Plant
Cell, 2, 163-171); de los genes Adh1, GapA1, de
la actina y Bz1 del maíz (Callis y col., 1987, Genes Dev.,
1, 1183-11200; Donath y col., 1995, Plant
Mol. Biol., 28, 667-676; Maas y col.,
1991, Plant Mol. Biol., 16, 199-207;
Sinibaldi & Mettler, 1992, en W.E. Cohn, K. Moldave, eds.,
Progress in Nucleic Acids Research and Molecular Biology,
vol. 42, Academic Press, New York, pp. 229-257), del
gen SSU301 de la petunia rubisco (Dean y col., 1989, Plant
Cell, 1, 201-208), de los genes A1
EF1\alpha, UBQ10, UBQ3, PAT1 de Arabidopsis (Curie y col.,
1993, Mol. Gen. Genet., 228, 428-436;
Norris y col., 1993, Plant Mol. Biol., 21,
895-906; Rose & Last, 1997, Plant J.,
11, 455-464) y muchos otros. No existen
requisitos específicos concernientes a la división de una secuencia
que codifica un intrón para obtener dicha parte 5' y dicha parte 3'.
Sin embargo, se prefiere dividir el intrón en un lugar que esté a
una distancia similar del extremo 5' y del extremo 3' del intrón
con el fin de no alterar la capacidad de ayuste del intrón. Pueden
utilizarse para practicar esta invención intrones de diferente
tamaño (tan pequeños como de 50 pb y tan grandes como de varias
kpb). Los intrones más pequeños utilizables pueden estar limitados
a los sitios donantes y aceptores de ayuste que flanquean
normalmente las secuencias internas del intrón. El origen del
intrón, su estructura y su tamaño pueden ser seleccionados
individualmente dependiendo de la naturaleza del rasgo o proteína de
interés. Pueden utilizarse experimentos de expresión transitoria
para analizar la eficacia de un intrón seleccionado o de las partes
del intrón correspondientes.
La utilización de un intrón en la invención
tiene la ventaja adicional de que la introducción de intrones en
regiones codificadoras da lugar normalmente a un incremento de la
eficacia de la expresión de transgenes en organismos eucarióticos,
incluyendo plantas (Rethmeier y col., 1997, Plant J.,
12, 895-899; Bourdon y col., 2001, EMBO
Rep., 2, 394-398; Rose & Beliakoff,
2000, Plant Physiol., 122, 535-542;
para una revisión ver Le Hir y col., 2003, Trends Biochem.
Sci., 28, 215-220).
Los métodos actuales para la expresión
transitoria o constitutiva de transgenes en plantas emplean
normalmente la introducción en las células de la planta de
vector(es) ensamblado(s) con el(los)
gen(es) de interés. Esta invención, preferiblemente, no
tiene que ver con la expresión transitoria de una secuencia de
interés. Las diferencias entre la expresión transitoria y
constitutiva de transgenes están muy bien ejemplificadas, por
ejemplo dentro del marco de trabajo de la genómica funcional en
plantas, cuando la utilización de vectores víricos puede
proporcionar de manera relativamente rápida cierta información
inicial sobre una posible función de un transgén en algunos casos
(WO993651; Kumagai y col., 1995, Proc. Natl. Acad. Sci. USA,
95, 1679-1683). En muchos otros casos, no se
obtiene ninguna información ni ningún artefacto. Además, la
utilización de vectores víricos no permite un estudio posterior de
la función del transgén, por ejemplo durante el desarrollo de la
planta, etc. Además, los vectores de Agrobacteria o víricos pueden
producir como tales cambios importantes en las células de la
planta, haciendo de este modo difícil estudiar, por ejemplo, las
funciones de los genes implicados en las interacciones
planta-patógeno. Se requieren plantas transgénicas
transformadas de manera estable con diferentes patrones de
expresión (por ejemplo una compartimentalización intercelular o
intracelular, una expresión específica de un tejido, un órgano o
una célula) para el estudio detallado de un gen de interés. De
acuerdo con la presente invención, el ensamblaje, la optimización y
la identificación de una secuencia de ARN o de un rasgo de interés
pueden llevarse a cabo con una elevada eficacia in planta,
por lo que pueden combinarse por tanto con la transformación de la
planta como un procedimiento de una sola etapa.
En la Figura 1 se muestra es esquema general del
ensamblaje de un rasgo de interés a partir de dos o más vectores
mediante cointegración. La realización más sencilla de la invención
es la creación de una secuencia de ARN de interés AB a partir de
dos vectores A y B cointegrados (Fig. 1, I). Tales acontecimientos
de cointegración deben ser seleccionables. Esto puede conseguirse
si, por ejemplo, la cointegración tiene como resultado la expresión
de un marcador para la selección.
En una realización de la invención, una región
de ADN-T (Fig. 7) es ensamblada a partir de dos
vectores representados por otras dos regiones de
ADN-T (Figs. 4 y 6, parte inferior) utilizando
recombinación mediada por la integrasa de PhiC31. La región de
ADN-T ensamblada puede contener un gen BAR funcional
que esté ausente en dichos vectores, permitiendo de este modo la
selección por acontecimientos de recombinación. La integrasa
necesaria para el ensamblaje de la región de ADN-T
puede ser proporcionada de manera transitoria por uno de los
vectores, pICH11150 (Fig. 4). Debido a la irreversibilidad de las
reacciones catalizadas por la integrasa de PhiC31, dicha integrasa
puede ser también expresada constitutivamente por una planta o por
una célula vegetal producidas mediante ingeniería genética. Al
analizar los transformantes primarios transformados con dichos
vectores, encontramos sorprendentemente que la mayoría de los
transformantes contenían dicha región de ADN-T
representada en la Fig. 7-A en lugar del producto
de recombinación representado en la Fig. 7-B. La
selección de los transformantes que tenían el patrón de integración
de la Fig. 7-A por resistencia a Basta fue posible a
pesar de la gran distancia entre las dos partes de las secuencias
que codificaban BAR. Este fenómeno es el resultado de un ayuste en
cis eficaz de la región "intronizada" (región flanqueada por
las partes 5' y 3' del intrón) que incluía otros casetes de
transcripción y secuencias de ADN del huésped y preparó el terreno
para el desarrollo de esta invención.
Otra realización preferida de la invención
comprende la generación de un producto de cointegración, en
particular para plantas monocotiledóneas (Fig. 9), a partir de un
primer y un segundo vector (Fig. 8). Dichos vectores son similares
a los descritos anteriormente para la transformación de plantas
dicotiledóneas, pero contienen elementos reguladores de la
transcripción específicos de monocotiledóneas. Las plantas
transformadas proporcionaban la expresión de BAR, lo cual puede
tener lugar no sólo por recombinación específica de sitio entre
dicho primer y dicho segundo vector (Fig. 9-B),
sino también debido a cointegración sin que tengan lugar eventos de
recombinación (Fig. 9-A).
Pueden utilizarse diferentes métodos para
proporcionar a una célula vegetal dichos primer y segundo (o más)
vectores. Dichos vectores pueden ser transformados en las células
vegetales por un vector plasmídico Ti portado por
Agrobacterium (US5.591.616; US4.940.838; US5.464.763) o por
bombardeo de partículas o microproyectiles (US05100792;
EP00444882B1; EP00434616B1). Pueden utilizarse también otros métodos
de transformación de plantas como microinyección (WO09209696;
WO09400583A1; EP175966B1), electroporación (EP00564595B1;
EP00290395B1; WO08706614A1) o transformación de protoplastos
mediada por PEG, etc. La elección del método para el suministro de
los vectores puede depender de la especie de planta que vaya a ser
transformada. Por ejemplo, se prefiere generalmente el bombardeo de
microproyectiles para la transformación de monocotiledóneas,
mientras que para dicotiledóneas la transformación mediada por
Agrobacterium produce en general mejores resultados.
En la realización anteriormente descrita,
nosotros utilizamos la administración de vectores mediada por
Agrobacterium a células de Nicotiana. Sin embargo,
dichos vectores pueden ser introducidos en las plantas de acuerdo
con cualquiera de las técnicas estándar adecuadas para la
transformación estable de la especie de planta de interés. La
técnicas de transformación de dicotiledóneas son bien conocidas en
el oficio e incluyen técnicas basadas en Agrobacterium y
técnicas que no requieren Agrobacterium. Las técnicas que no
requieren Agrobacterium implican la captación del material
genético exógeno directamente por protoplastos o células. Estas
técnicas incluyen la captación mediada por PEG o por
electroporación, la administración mediada por bombardeo de
partículas y la microinyección. Ejemplos de estas técnicas están
descritos en Paszkowski y col., EMBO J., 3,
2717-2722 (1984), Potrykus y col., Mol. Gen.
Genet., 199, 169-177 (1985), Reich y
col., Biotechnology, 4, 1001-1004
(1986) y Klein y col., Nature, 327,
70-73 (1987). En cada caso, las células
transformadas son regeneradas para dar lugar a plantas completas
utilizando técnicas estándar.
La transformación mediada por
Agrobacterium es una técnica preferida para la transformación
de dicotiledóneas debido a su elevada eficacia de transformación y
a su amplia utilidad con muchas especies diferentes. Las muchas
especies de cultivo que pueden ser transformadas de manera rutinaria
por Agrobacterium incluyen tabaco, tomate, girasol, algodón,
colza, patata, soja, alfalfa y chopo (EP0317511 (algodón), EP0249432
(tomate), WO87/072299 (Brassica), Patente de EE.UU.
4.795.855 (chopo)). La transformación con Agrobacterium
implica típicamente la transferencia del vector binario portador del
ADN foráneo de interés a una cepa de Agrobacterium
apropiada, lo cual puede depender del complemento de genes
vir que lleve la cepa huésped de Agrobacterium en un
plásmido co-residente o bien cromosómicamente (Uknes
y col., Plant Cell, 5, 159-169
(1993)). La transferencia del vector binario recombinante a
Agrobacterium puede ser llevada a cabo mediante un
procedimiento de apareamiento triparental utilizando E. coli
portadora del vector binario recombinante, una cepa de E.
coli cooperadora que lleve un plásmido tal como pRK2013, que es
capaz de movilizar el vector binario recombinante hacia la cepa de
Agrobacterium diana. Alternativamente, el vector binario
recombinante puede ser transferido a Agrobacterium mediante
transformación del ADN (Höfgen y Willmitzer, Nucl. Acids
Res., 16, 9877 (1988)).
La transformación de la especie de planta diana
por Agrobacterium recombinante implica normalmente el
cocultivo de Agrobacterium con explantes de la planta
siguiendo protocolos conocidos en la técnica. El tejido
transformado portador de un marcador de resistencia a un antibiótico
o a un herbicida presente entre los límites del
ADN-T del plásmido binario puede ser regenerado en
medio seleccionable. Las técnicas de transformación preferidas para
monocotiledóneas incluyen la transferencia directa de genes a los
protoplastos utilizando PEG o técnicas de electroporación y el
bombardeo de partículas en tejido calloso.
Las solicitudes de patente EP0292435, EP0392225
y WO93/07278 describen técnicas para la preparación de callos y
protoplastos de maíz, la transformación de protoplastos utilizando
PEG o electroporación y la regeneración de plantes de maíz a partir
de los protoplastos transformados. Gordon-Kamm y
col., Plant Cell, 2, 603-618 (1990) y
Fromm y col., Biotechnology, 11,
194-200 (1993), describen técnicas para la
transformación de líneas endogámicas de élite del maíz mediante
bombardeo de partículas.
La transformación del arroz puede ser llevada a
cabo también mediante técnicas de transferencia génica directa
utilizando protoplastos o bombardeo de partículas. La transformación
mediada por protoplastos ha sido descrita para los tipos
Japonica e Indica (Zhange y col., Plant Cell
Rep., 7, 739-384 (1988); Shimamoto y col.,
Nature, 338, 274-277 (1989); Datta y
col., Biotechnology, 8, 736-740
(1990)). Ambos tipos son también transformables de forma rutinaria
utilizando bombardeo de partículas (Christou y col.,
Biotechnology, 9, 957-962 (1991). Es
también aplicable la transformación del arroz mediada por
Agrobacterium (Chan y col., 1993, Plant Mol. Biol.,
22, 491-506).
EP0332581 describe técnicas para la generación,
transformación y regeneración de protoplastos de Pooideae.
Además, la transformación del trigo está descrita por Vasil y col.,
Biotechnology, 10, 667-674 (1992)
utilizando bombardeo de partículas en células de callos regenerables
de larga duración de tipo C, Vasil y col., Biotechnology,
11, 1553-1558 (1993) y Weeks y col., Plant
Physiol., 102, 1077-1084 (1993) describen
el bombardeo con partículas de embriones inmaduros y de callos
derivados de embriones inmaduros.
La transformación de células de monocotiledóneas
tales como Zea mays puede ser conseguida poniendo en
contacto las células de la monocotiledónea con una multiplicidad de
cuerpos similares a agujas sobre los cuales estas células pueden
ser ensartadas, produciéndose una ruptura de la pared celular y
permitiendo de este modo la entrada del ADN transformante en las
células (ver la Patente de EE.UU. 5.302.523). Técnicas de
transformación aplicables a monocotiledóneas y dicotiledóneas están
también descritas en las Patentes de EE.UU. siguientes: 5.240.855
(pistola de partículas); 5.204.253 (microproyectiles acelerados por
un choque de gas frío); 5.179.022 (aparato biolístico); 4.743.548 y
5.114.854 (microinyección); y 5.149.655, 5.120.257 (transformación
mediada por partículas aceleradas); 5.066.587 (acelerador de
microproyectiles dirigido por gas); 5.015.580 (transformación de
plantas de soja mediada por partículas); 5.013.660 (transformación
mediada por rayos láser); 4.849.355 y 4.663.292.
Las células vegetales transgénicas o el tejido
vegetal transgénico transformados mediante uno de los métodos
anteriormente descritos por al menos dicho primer vector y dicho
segundo vector, pueden cultivarse posteriormente para dar plantas
completas de acuerdo con técnicas estándar. Pueden obtenerse
semillas transgénicas de plantas con flores transgénicas de acuerdo
con técnicas estándar. De igual modo, plantas sin flores tales como
la patata o la remolacha azucarera pueden ser propagadas mediante
una variedad de procedimientos conocidos. Ver, por ejemplo, Newell
y col., Plant Cell Rep., 10, 30-34
(1991) (que describe la transformación de la patata mediante
cultivo del tallo).
En una realización preferida, se utiliza una
mezcla de un conjunto de primeros vectores y/o y un conjunto de
segundos vectores para ensamblar varias secuencias de ARN de
interés. Dichas secuencias de ARN de interés pueden ser el
resultado de acontecimientos de cointegración aleatorios entre dos
conjuntos de vectores (conjunto A_{m} y conjunto B_{n}, Fig. 1,
III) seguido por transcripción. Un conjunto de secuencias de ARN de
interés del tipo a_{m}b_{n} puede ser generado en un conjunto
de células vegetales mediante cointegración aleatoria de un
conjunto de primeros vectores (A_{1}, A_{2}, ..., A_{m}) con
un conjunto de segundos vectores (B_{1}, B_{2}, ..., B_{n}),
donde m y n son el número de primeros vectores A diferentes y
segundos vectores B diferentes, respectivamente. Se necesitan al
menos tres vectores diferentes para dotar a la célula de al menos
dos secuencias de ARN de interés diferentes.
Ejemplos de partes 5' y 3' de dicha secuencia de
ARN de interés que son unidas pueden ser secuencias codificadoras o
partes de las mismas o cualquier elemento genético transcrito. En la
presente, tal elemento genético (o elemento regulador) puede ser
cualquier elemento de la secuencia que tenga una función genética
característica preferiblemente a nivel de ARN. Ejemplos de tales
elementos genéticos incluyen: intensificadores transcripcionales,
intensificadores traduccionales, lugares de recombinación,
secuencias de terminación de la transcripción, lugares internos de
entrada de ribosomas (IRESes), sitios de restricción, secuencias de
replicación autónoma u orígenes de replicación.
En esta invención, la secuencia de ARN de
interés puede derivar de componentes procedentes de más de dos
vectores. En la Fig. 1, II, se muestra el ensamblaje de tal
secuencia de ARN de interés que contiene porciones de secuencias de
tres vectores diferentes, A, B y C. Sin embargo, la eficacia del
ensamblaje de tal secuencia de ARN de interés será menor que en el
caso de dos vectores diferentes (Fig. 1, I).
El ensamblaje de dicha secuencia de ARN de
interés permite la selección de células vegetales que tengan dicho
primer vector y dicho segundo vector integrados adecuadamente de
acuerdo con la invención. Un posible mecanismo de selección es el
ensamblaje de un marcador seleccionable funcional a nivel de ARN,
según se describe con detalle en los Ejemplos 1-3 y
se muestra de manera general en la Figura 10. El ensamblaje de dicha
secuencia de ARN de interés que codifica una proteína funcional de
interés puede ser una ventaja, por ejemplo cuando la proteína de
interés (o el gen que la codifica) es tóxica para células
bacterianas. El marcador seleccionable en tales casos puede ser una
parte de una construcción bicistrónica bajo el control de un
elemento IRES (Figura 11). La cointegración de dichos vectores (A y
B en la Fig. 11) puede dar lugar a la formación de una unidad de
transcripción (C en la Fig. 11) que lleve la construcción
bicistrónica funcional con el gen de interés seguido por un gen
marcador seleccionable controlado por un IRES. La utilización de
elementos IRES en plantas es conocida en la técnica anterior
(WO9854342; WO0246440; Dorokhov y col., 2002, Proc. Natl. Acad.
Sci. USA, 99, 5301-5306) y puede ser practicada
de manera rutinaria en combinación con la presente invención.
El ensamblaje de vectores complejos in
planta a partir de vectores precursores que tienen una
estructura más sencilla puede ser una ventaja adicional,
permitiendo evitar etapas de clonaje y/o manipulación complejas con
estructuras de ADN inestables en células bacterianas. El ensamblaje
de la secuencia de interés para generar diferentes vectores
derivados en posición alélica unos respecto de otros está mostrado
en la Fig. 12. Dicha secuencia de ADN de interés (Fig. 12, C)
integrada de manera estable en el ADN cromosómico de la planta puede
ser expuesta posteriormente a una transposasa de elección (Ac o
Spm, Fig. 13), permitiendo la eliminación de las secuencias diana
(flanqueadas por las secuencias Ds para Ac o por las secuencias dSpm
para Spm). Los vectores derivados B y C finales (Fig. 13) están en
relación alélica entre sí y codifican diferentes partes de un gen
de interés (GOI) que pueden ser ensambladas mediante ayuste en trans
mediado por inteína. Este procedimiento aborda un tema de
bioseguridad, por ejemplo el control de la segregación del transgén,
ya que los dos fragmentos del mismo gen que proporcionan el rasgo
de interés se segregarán siempre a diferentes gametos debido a su
posición alélica.
En la realización más preferida de esta
invención, no se utilizó recombinasa en el proceso de la invención
para ensamblar dicha secuencia de ARN de interés. Según se mencionó
anteriormente, la función de interés se expresaba (resistencia a
PPT) incluso cuando dichos dos vectores, después de la integración
en un cromosoma, estaban separados por largos tramos de regiones
cromosómicas del huésped y/o regiones de ADN-T
interferentes (Ejemplo 4; Figura 14). Nosotros estudiamos la
organización de los sitios de integración del ADN-T
de plantas resistentes a PPT mediante la utilización de PCR (Figura
15) y encontramos, sorprendentemente, que la longitud del ADN
cromosómico del huésped que separaba dicha primera y dicha segunda
secuencia de nucleótidos no interfería significativamente con la
expresión de dicho rasgo de interés, por ejemplo resistencia a PPT.
La explicación más probable de este fenómeno es la formación y el
procesamiento eficaz de transcritos largos que contenían dos
fragmentos de secuencias codificadoras del gen BAR.
Las plantas o las células vegetales transgénicas
producidas de acuerdo con la invención pueden ser utilizadas para
muchas finalidades diferentes según se mencionó anteriormente. En
otra aplicación, las células vegetales que tienen integrados dicho
primer vector y dicho segundo vector pueden ser también utilizadas a
su vez como precursoras para procesos corriente abajo.
Las secuencias (o vectores) integradas pueden
ser inducidas, por ejemplo, para que formen un ADN extracromosómico
como un vector episómico mantenido independientemente. Esta
inducción puede ser conseguida, por ejemplo, cruzando una planta
transgénica obtenida mediante el proceso de la invención con otra
planta que proporcione un factor capaz de ejercer la función
inductora o de activar la formación de dicho ADN
extracromosómico/episómico. Alternativamente, la formación de tal
ADN episómico puede ser producida, por ejemplo, por la expresión
transitoria de un factor (por ejemplo una transposasa, una
replicasa vírica, etc.) capaz de activar la formación del ADN
extracromosómico/episómico a partir de dichas secuencias
integradas. Dicho ADN episómico puede ser capaz de reintegrarse
posteriormente (por ejemplo, puede ser o puede tener propiedades de
un elemento transponible) o puede ser capaz de mantenerse
independientemente durante las divisiones celulares (derivado de un
vector vírico de
ADN).
ADN).
La presente invención es preferiblemente llevada
a cabo con plantas superiores, multicelulares. Las plantas
preferidas para ser utilizadas en esta invención incluyen cualquier
especie de planta, dándose preferencia a las especies importantes
desde el punto de vista agronómico y hortícola. Plantas de cultivo
comunes para ser utilizadas en la presente invención incluyen
alfalfa, cebada, alubias, canola, arveja de vaca, algodón, maíz,
trébol, loto, lentejas, altramuz, mijo, avena, guisantes,
cacahuetes, arroz, centeno, trébol dulce, girasol, guisante de
olor, soja, sorgo triticale, jícama, frijol terciopelo, arveja,
trigo, vistaria y plantas de nuez. Las especies de plantas
preferidas para practicar esta invención están incluidas en, pero no
limitadas a:
Plantas representativas de Gramineae,
Compositeae, Solanaceae y Rosaceae.
Adicionalmente, las especies preferidas para ser
utilizadas en la invención, además de las especificadas
anteriormente, son plantas de los géneros: Arabidopsis,
Agrostis, Allium, Antirrhinum, Apium, Arachis, Asparagus, Atropa,
Avena, Bambusa, Brassica, Bromus, Browaalia, Camellia, Cannabis,
Capsicum, Cicer, Chenopodium, Chichorium, Citrus, Coffea, Coix,
Cucumis, Cucurbita, Cynodon, Dactylis, Datura, Daucus, Digitalis,
Dioscorea, Elaeis, Eleusine, Festuca, Fragaria, Geranium, Glycine,
Helianthus, Heterocallis, Hevea, Hordeum, Hyoscyamus, Ipomoea,
Lactuca, Lens, Lilium, Linum, Lolium, Lotus, Lycopersicon, Majorana,
Malus, Mangifera, Manihot, Medicago, Nemesia, Nicotiana,
Onobrychis, Oryza, Panicum, Pelargonium, Pennisetum, Petunia, Pisum,
Phaseolus, Phleum, Poa, Prunus, Ranunculus, Raphanus, Ribes,
Ricinus, Rubus, Saccharum, Salpiglossis, Secale, Senecio, Setaria,
Sinapis, Solanum, Sorghum, Stenotaphrum, Theobroma, Trifolium,
Trigonella, Triticum, Vicia, Vigna, Vitis, Zea y las
Olyreae, Pharoideae y muchas otras.
Dentro del ámbito de esta invención, se
prefieren específicamente las especies de plantas que no están
incluidas en la cadena alimenticia o de forrajes para la producción
de proteínas farmacéuticas y técnicas. Entre ellas, las especies de
Nicotiana son las más preferidas, ya que son especies fáciles
de transformar y cultivar con sistemas de vectores de expresión
bien desarrollados (especialmente vectores víricos).
Genes de interés, sus fragmentos (funcionales o
no funcionales) y sus derivados artificiales que pueden ser
expresados en plantas o en células vegetales utilizando la presente
invención incluyen, pero no se limitan a: enzimas modificadores del
almidón (sintasa del almidón, enzima para la fosforilación del
almidón, enzima desramificador, enzima ramificador del almidón,
enzima ramificador del almidón II, sintasa de almidón unida a
gránulos), fosfato sintasa de sacarosa, fosforilasa de sacarosa,
poligalacturonasa, polifructán sucrasa, pirofosforilasa de ADP
glucosa, glucosil transferasa de ciclodextrina, transferasa de
fructosilo, sintasa de glucógeno, esterasa de pectina, aprotinina,
avidina, levansucrasa bacteriana, proteína glgA de E. coli,
MAPK4 y ortólogos, enzima para la asimilación/metabolismo del
nitrógeno, sintasa de glutamina, osmotina vegetal, albúmina 2S,
taumatina, recombinasa/integrasa específica de sitio (FLP, Cre,
recombinasa R, Int, integrasa R de SSVI, integrasa de PhiC31 o un
fragmento activo o variantes de las mismas), enzimas modificadores
de aceites (como las desaturasas de ácidos grasos, elongasas,
etc.), transferasa de isopentenilo, Sca M5 (calmodulina de soja),
toxina de tipo coleóptero o un fragmento insecticidamente activo,
proteínas de fusión del enzima conjugador de ubiquitina (E2),
enzimas que metabolizan lípidos, aminoácidos, azúcares, ácidos
nucleicos y polisacáridos, superóxido dismutasa, la forma de
proenzima inactivo de una proteasa, toxinas proteicas vegetales,
rasgos que alteran la fibra en las plantas productoras de fibra, la
toxina activa contra coleópteros de Bacillus thuringiensis
(toxina Bt2, proteína cristalina insecticida (ICP), toxina CrylC,
endotoxina delta, toxina polipeptídica, protoxina, etc.), la toxina
AalT específica de insectos, enzimas que degradan celulosa, celulasa
E1 de Acidothermus celluloticus, enzimas modificadores de
lignina, alcohol deshidrogenasa de cinnamoilo, sintasa de
trehalosa-6-fosfato, enzimas de la
ruta metabólica de citoquininas, HMG-CoA reductasa,
pirofosfasa inorgánica de E. coli, proteína de
almacenamiento de semillas, sintasa de licopeno de Erwinia
herbicola, oxidasa ACC, proteína codificada por pTOM36, fitasa,
cetohidrolasa, acetoacetil CoA reductasa, sintasa de PHB
(polihidroxibutanoato), enzimas implicados en la síntesis de
polihidroxialcanoatos (PHA), proteína transportadora de acilo,
napina, EA9, sintasa de fitoeno de plantas no superiores, proteína
codificada por pTOM5, ETR (receptor de etileno), piruvato fosfato
diquinasa plastídica, proteína del poro transmembranal inducible por
nematodos, un rasgo que incremente la función fotosintética o
plastídica de la célula vegetal, sintasa de estilbeno, un enzima
capaz de hidroxilar fenoles, catecol dioxigenasa, catecol
2,3-dioxigenasa, cicloisomerasa de cloromuconato,
sintasa de antranilato, proteína AGL15 de Brassica, fructosa
1,6-bifosfatasa (FBPasa), ARN3 de AMV, replicasa de
PVY, replicasa de PLRV, proteína del revestimiento de potivirus,
proteína de revestimiento de CMV, proteína de revestimiento de TMV,
replicasa de luteovirus, ARN mensajero de MDMV, replicasa
geminivírica mutante, acil-ACP tioesterasa de
preferencia C12:0 de Umbellularia californica,
acil-ACP tioesterasa vegetal de preferencia C10 o
C12:0, acil-ACP tioesterasa de preferencia C14:0
(luxD), factor A de la sintasa vegetal, factor B de la sintasa
vegetal, desaturasa D6, proteína con actividad enzimática en la
\beta-oxidación peroxisómica de ácidos grasos en
células vegetales, acil-CoA oxidasa,
3-cetoacil-CoA tiolasa, lipasa,
acetil-CoA-carboxilasa del maíz,
sintasa de
5-enolpiruvilshikimato-3-fosfato
(EPSP), acetil transferasa de fosfinotricina (BAR, PAT), proteína
CP4, desaminasa de ACC, proteína con un sitio de corte
post-traduccional, gen DHPS que confiere resistencia
a sulfonamidas, nitrilasa bacteriana,
2,4-D-monooxigenasa, sintasa de
acetolactato o sintasa de acetohidroxiácido (ALS, AHAS),
poligalacturonasa, polimerasa Taq, nitrilasa bacteriana, muchos
otros enzimas de bacterias o fagos incluyendo endonucleasas de
restricción, metilasas, ADN y ARN ligasas, ADN y ARN polimerasas,
transcriptasas inversas, nucleasas (ADNasa y ARNasa), fosfatasas,
transferasas, etc.
La presente invención puede ser también
utilizada con el fin de la producción molecular y la purificación
de proteínas valiosas desde el punto de vista comercial e
importantes desde el punto de vista farmacéutico, incluyendo
enzimas industriales (celulosas, lipasas, proteasas, fitasas, etc.)
y proteínas fibrosas (colágeno, proteína de la seda de araña,
etc.). Proteínas para la salud humana o animal pueden ser expresadas
y purificadas utilizando los métodos descritos en el procedimiento
de nuestra invención. Ejemplos de tales proteínas de interés
incluyen, inter alia, proteínas de la respuesta inmune
(anticuerpos monoclonales, anticuerpos de una sola cadena,
receptores de células T, etc.), antígenos, incluyendo los derivados
de microorganismos patógenos, factores estimuladores de colonias,
relaxinas, hormonas polipeptídicas incluyendo somatotropina (HGH) y
proinsulina, citoquinas y sus receptores, interferones, factores de
crecimiento y factores de coagulación, enzima lisosómico
enzimáticamente activo, polipéptidos fibrinolíticos, factores de
coagulación sanguínea, tripsinógeno, antitripsina a1 (AAT),
seroalbúmina humana, glucocerebrosidasas, toxina B nativa del
cólera, así como proteínas conservadoras de la función como
fusiones, versiones mutantes y derivados sintéticos de las
proteínas anteriores.
Las proteínas anteriores y otras pueden ser
optimizadas para una finalidad deseada mediante la introducción de
mutaciones aleatorias en su secuencia codificadora o mediante
métodos de redistribución de genes. La selección de una proteína
que tenga propiedades optimizadas para el fin deseado puede ser
realizada posteriormente utilizando el proceso de la presente
invención.
Los ejemplos siguientes se presentan para
ilustrar la presente invención. Las personas expertas será capaces
de modificar los ejemplos siguientes de tal manera que no pueda
tener lugar una recombinación específica de sitio entre dichos
vectores, por ejemplo haciendo que el gen de la integrasa no sea
expresable o no sea funcional, o bien eliminando los lugares de
recombinación específica de sitio.
Esta construcción fue producida sobre la base
del vector binario pICBV-19 (Figura 2). Como una
primera etapa del clonaje, se introdujeron sitios de restricción de
BsaI dianas para la inserción del intrón en el gen BAR
(construcción pICH10605, Figura 2). El enzima BsaI corta el ADN
fuera del sitio de reconocimiento, haciendo que sobresalgan 4
nucleótidos. En el caso de pICH10605, el enzima BsaI fue utilizado
para introducir sitios aceptores y donantes de ayuste para la
inserción posterior del intrón. Como etapa siguiente, un fragmento
de PCR amplificado sobre la construcción pICH7410 (Figura 3) con los
oligos int-ad-9
(5'-tttttggtc cgacctgcaa caataagaac aaaaagtcat
aaatt-3') y attbpr11 (5'-tttaagcttg
agctctttcc taggctcgaa gccgcggtgc gggtg-3') fue
insertado en pICH10605 utilizando los sitios de restricción de BsaI
y HindIII. El fragmento de PCR que contenía AttB y la parte 3' del
intrón, además de sitios de restricción de AvrII y SacI, sustituyó
al casete de expresión de GUS y a la parte 5' del casete de
expresión de BAR. La parte de ADN-T de la
construcción resultante (pICH11140, Figura 4) contenía la parte 3'
del casete de expresión de BAR: AttB, parte 3' del intrón, parte 3'
del gen BAR y el terminador de OCS, además de sitios de restricción
de AvrII y SacI. Como etapa final del clonaje de la construcción
3', un casete de expresión de la integrasa de PhiC31 que contenía el
promotor de actina 2 de Arabidopsis, la integrasa de PhiC31
y el terminador de NOS, fue introducido en pICH11140 utilizando los
sitios de restricción de AvrII y SacI. La construcción final
pICH11150 que contenía una parte 3' del gen BAR con AttB, un lugar
de recombinación junto con el extremo 3' del intrón, además del
casete de expresión de la integrasa de PhiC31, está mostrada en la
Figura 4.
Esta construcción fue producida sobre la base
del vector binario pICBV-16 (Figura 5). El fragmento
amplificado por PCR de pICH8430 (Figura 5) con los oligos
int-ad-10
(5'-tttaagcttg aattcttttg gtctcaggta agtttcattt
tcataattac aca-3') y attppr14
(5'-tttttcaatt ggagctccta cgcccccaac
tgagagaac-3') fue cortado con los enzimas de
restricción HindIII y MfeI e introducido en pICBV16 digerido con
HindIII y EcoRI. El fragmento de PCR que contenía la parte 5' de un
intrón y AttP, además de sitios de restricción de BsaI y EcoRI,
sustituyó al casete de expresión de GUS en la construcción
intermedia pICH11160 (Figura 6). Como etapa final del clonaje, un
fragmento EcoRI/BsaI de pICH10605 (Fig. 2), que contenía un
promotor de NOS y la parte 5' del gen BAR, fue insertado en
pICH11160. La región de ADN-T de la construcción
final pICH11170 está mostrada en la Figura 6.
\vskip1.000000\baselineskip
Las construcciones pICH11150 y pICH11170 fueron
inmovilizadas en A. tumefaciens (GV3101) y utilizadas para
la transformación mediada por Agrobacterium de discos de hoja
de plantas de Nicotiana (Horsh y col., 1985, Science,
227, 1229-1231) utilizando 10 mg/l de
fosfinotricina (PPT) como marcador seleccionable. Plantas de tabaco
regeneradas fueron analizadas mediante PCR para detectar la
presencia de una región de ADN-T ensamblada in
planta integrada de manera estable en el ADN cromosómico (Figura
7) y para detectar la ausencia de regiones de ADN-T
de pICH11150 y pICH11170.
\vskip1.000000\baselineskip
Para el diseño de construcciones utilizando un
gen BAR dividido con el fin de monitorizar el ensamblaje de una
región de ADN-T deseada in planta, se
utilizaron las construcciones originales pICH11150 y pICH11170 (ver
el Ejemplo 1). La construcción pICH11150 fue modificada sustituyendo
el promotor de la actina2 de Arabidopsis
(PACT2-i) por el promotor de la actina1 del arroz
(PACT1) (McElroy, D. y col., 1991, Mol. Gen Genet.,
231, 150-160) produciendo la construcción
pICH12022 (Figura 8). La construcción pICH11170 fue modificada
sustituyendo el promotor de la sintasa de nopalina (PNOS), que
dirige la expresión del fragmento del gen BAR, por el promotor de
la actina1 del arroz (PACT1) y el casete de expresión de NPTII por
el casete de expresión de IPT (transferasa de isopentenilo, Nº de
Acceso del Gene Bank: X14410) bajo el control del promotor del gen
de la ubiquitina del maíz (PUBQ) (Christensen, A.H. & Quail,
P.H., 1996, Transgenic Res., 5,
213-218) produciendo la construcción pICH12031
(Figura 8). Todas las manipulaciones para el diseño de las
construcciones fueron llevadas a cabo utilizando procedimientos
estándar de clonaje (Sambrook, Fritsch & Maniatis, 1989,
Molecular cloning: A laboratory manual, 2ª ed., Cold Spring Harbor,
NY: CSH Laboratoy Press).
Se utilizó la línea PEN3 de Pennisetum
glaucum para la transformación mediada por Agrobacterium
con los plásmidos pICH12022 y pICH12031. Alícuotas de la cepa AGL1
de Agrobacterium tumefaciens portadora de pICH12022 o de
pICH12031 fueron mezcladas en iguales proporciones y utilizadas para
la transformación según se describe a continuación.
El medio de cultivo incluía sales de Murashige y
Skoog (MS) y vitaminas: (Referencia: Murashige, T. & Skoog,
F.A., 1962, Physiol. Plant., 15,
473-497) con 2,0 mg/l de 2,4-D, que
es ácido 2,4-diclorofenoxiacético, 30 g/l de
sacarosa y un 0,3% de gelrita. El medio de regeneración contenía
sales MS de fuerza iónica media y vitaminas con 20 g/l de maltosa,
1 mg/l de IAA, 1 mg/l de Zeatina y un 0,6% de gelrita.
El medio de infección (IM) contenía sales MS de
fuerza iónica media y vitaminas con 2 mg/l de 2,4-D,
10 g/l de glucosa, 60 g/l de maltosa, 50 mg/l de ácido ascórbico, 1
g/l de MES (ácido
2-N-morfolinoetanosulfónico) y 40
mg/l de Acetosiringona (AS). El pH del medio fue ajustado a 5,2 con
KOH 1 N. El medio de cocultivo (CM) fue el mismo que el IM
(excluyendo el ácido ascórbico) y fue solidificado mediante la
adición de un 0,6% de gelrita. El medio de infección fue
esterilizado por filtración, mientras que todos los demás medios
fueron autoclavados. Después de la esterilización se añadió AS
disuelta en DMSO (400 mg/ml).
Se hicieron crecer cultivos de agrobacterias
(cepas AGL1, EHA105, A4, etc.) con los plásmidos binarios apropiados
durante 3 días a temperatura ambiente en placas de LB2N (medio LB
con 2 g/l de NaCl y un 1,5% de agar) suplementado con los
antibióticos apropiados. Las bacterias fueron extraídas de las
placas mediante rascado y resuspendidas en IM en tubos Falcon de 50
ml. Los tubos fueron fijados horizontalmente a una plataforma
agitadora y agitados a baja velocidad durante 4 a 5 horas a
temperatura ambiente. Se midió la densidad óptica de la suspensión
y se ajustó la DO600 a 1,0.
Se incubaron fragmentos de callos en la
suspensión de agrobacterias durante 3 horas a temperatura ambiente
y se transfirieron al CM solidificado con gelrita con 60 g/l de
maltosa.
Después de 3 días de cultivo en CM, los callos
fueron lavados cinco veces con medio conteniendo MS de fuerza
iónica media con 60 g/l de sacarosa y transferidos al CM
solidificado con gelrita con 60 g/l de sacarosa y 5 mg/l de
fosfinotricina (PPT) y, en algunos casos, con 150 mg/l de Timentina.
Los callos resistentes a fosfinotricina desarrollados bajo
selección fueron sembrados en el medio de regeneración con 5 mg/l de
PPT.
Los tejidos de las plantas PPT^{R} que se
regeneraban fueron inicialmente analizados visualmente para detectar
la ausencia de un gen IPT funcional que originara la formación
adventicia de brotes en medio sin hormonas (Ooms y col., 1983,
Theor. Appl. Genet., 66, 169-172;
Smigocki, A.C. & Owens, L.D., 1989, Plant Physiol., 91,
808-811, Smigocki, A.C. & Owens, L.D., 1988,
Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 85,
5131-5135). Se llevó a cabo un proceso de selección
secundario para seleccionar plantas portadoras de la región de
ADN-T ensamblada in planta (Figura 9) y para
seleccionar por la ausencia de regiones de ADN-T
procedentes de pICH12022 y pICH12031, mediante la utilización de
análisis por PCR del tejido de las plantas PPT^{R} para determinar
la presencia de secuencias del gen de la integrasa de PhiC31 y del
gen IPT.
\vskip1.000000\baselineskip
Las construcciones pICH11140 y pICH11170 (Fig.
14) fueron inmovilizadas en A. tumefaciens (GV3101) y
utilizadas para la transformación mediada por Agrobacterium
de discos de hojas de plantas de Nicotiana tabacum (Horsh y
col., 1985, Science, 227, 1229-1231)
utilizando 10 mg/l de fosfinotricina (PPT) como agente selectivo.
Las plantas de tabaco regeneradas fueron analizadas mediante PCR
para detectar la presencia de distintos ADN-Ts
cointegrados en el ADN cromosómico en orientación
cabeza-con-cola (Figura 14). Se
analizaron tres patrones de integración que podían proporcionar el
ensamblaje del transcrito de BAR funcional. La presencia del patrón
(A) en el que el LB del ADN-T 5' (pICH11170) está
flanqueado por el RB del ADN-T 3' (pICH11140) sin
ningún espacio o con un espacio relativamente pequeño entre los
límites del ADN-T, fue comprobada mediante PCR con
los oligos Pr1 (138directo-bar:
5'-ccg tac cga gcc gca gga ac-3') y
Pr2 (581inverso-bar: 5'-cag atc tcg
gtg acg ggc agg ac-3'). Este patrón de integración
fue encontrado en el 60% de las plantas analizadas (29 de 48). La
presencia del patrón (B) en el que los ADN-Ts 5' y
3' están separados por la inserción de ADN-T 5' en
orientación invertida fue analizada con los oligos Pr2
(581inverso-bar: 5'-cag atc tcg gtg
acg ggc agg ac-3') y Pr3 (barpr2:
5'-gac cgt gct tgt ctc gat gta
g-3'). Este patrón de integración fue encontrado en
el 8% de las plantas analizadas (4 de 48). La presencia del patrón
(C), en el que los ADN-Ts 5' y 3' están separados
por la inserción de ADN-T 3' en orientación
invertida, fue analizada con los oligos Pr1
(138directo-bar: 5'-ccg tac cga gcc
gca gga ac-3') y Pr4 (barpr4:
5'-ggt ttc tgg cag ctg gac ttc-3').
Este patrón de integración no se encontró entre las plantas
analizadas. En conjunto, cualquiera de estos patrones fue detectado
en el 69% de las plantas resistentes a PPT analizadas (33 de
48).
Claims (26)
1. Un proceso para dotar a una planta o a
células vegetales de un rasgo de interés mediante la expresión de
una secuencia de ARN de interés, comprendiendo dicho proceso:
la provisión mediante cotransformación a la
planta o a las células de dicha planta de un primer vector y un
segundo vector y la selección de las células dotadas de dicho rasgo
de interés,
donde
dicho primer vector contiene una primera
secuencia de nucleótidos con un primer segmento que codifica, en
dirección 5' a 3':
- -
- una parte 5' de dicha secuencia de ARN de interés y
- -
- una parte 5' de un intrón; y
dicho segundo vector contiene una segunda
secuencia de nucleótidos con un segundo segmento que codifica, en
dirección 5' a 3':
- -
- una parte 3' de un intrón y
- -
- una parte 3' de dicha secuencia de ARN de interés.
\vskip1.000000\baselineskip
2. El proceso de acuerdo con la reivindicación
1, en el que dicho primer vector y dicho segundo vector son
adaptados para la integración de dichos vectores o de partes de
dichos vectores en un cromosoma de dichas células
vegetales.
vegetales.
3. El proceso de la reivindicación 2, en el que
dicho cromosoma es un cromosoma nuclear.
4. El proceso de acuerdo con una de las
reivindicaciones 1 a 3, mediante el cual dicha parte 5' de un intrón
y dicha parte 3' de un intrón son adaptadas para formar dicha
secuencia de ARN de interés mediante el ayuste de un transcrito
primario que contiene dicha parte 5' de dicha secuencia de ARN de
interés, dicha parte 5' de un intrón, dicha parte 3' de un intrón y
dicha parte 3' de dicha secuencia de ARN de interés, formándose de
este modo dicha secuencia de ARN de interés como un transcrito
secundario.
5. El proceso de acuerdo con una de las
reivindicaciones 1 a 4, en que dicho primer vector y/o dicho segundo
vector deriva de un plásmido Ti.
6. El proceso de acuerdo con una de las
reivindicaciones 1 a 5, en el que dicha primera y dicha segunda
secuencia de nucleótidos son proporcionadas a dichas células
vegetales como ADN-T.
7. El proceso de acuerdo con una de las
reivindicaciones 1 a 6, en el que dicho primer vector y dicho
segundo vector son proporcionados a dichas células vegetales
mediante transformación mediada por Agrobacterium.
8. El proceso de acuerdo con una de las
reivindicaciones 1 a 7, en el que dicha primera secuencia de
nucleótidos contiene un promotor transcripcional corriente arriba
de dicho primer segmento.
9. El proceso de acuerdo con una de las
reivindicaciones 1 a 8, que comprende la traducción de dicha
secuencia de ARN de interés para producir una proteína de
interés.
10. El proceso de la reivindicación 9, en el que
dicho primer segmento codifica una parte 5' de dicha proteína de
interés y dicho segundo segmento codifica una parte 3' de dicha
proteína de interés.
11. El proceso de acuerdo con una de las
reivindicaciones 1 a 10, en el que dicho primer segmento o dicho
segundo segmento codifica un elemento regulador de la
traducción.
12. El proceso de acuerdo con una de las
reivindicaciones 1 a 11, en el que dicho rasgo de interés es
resistencia frente a un agente selectivo para permitir la selección
de las células vegetales o de las plantas que tengan dicho primer
vector y dicho segundo vector cointegrados en un cromosoma.
13. El proceso de acuerdo con una de las
reivindicaciones 1 a 12, en el que dicha primera y/o dicha segunda
secuencia de nucleótidos contiene un gen que va a ser expresado para
dotar a dicha o a dichas células vegetales de un rasgo de interés
adicional.
\newpage
14. El proceso de acuerdo con una de las
reivindicaciones 1 a 13, en el que a dichas células vegetales o a
dicha planta se les proporciona además un tercer vector que contiene
una tercera secuencia de nucleótidos que codifica, en dirección 5'
a 3':
- -
- una parte 3' de un intrón preferiblemente funcional con dicha parte 5' de un intrón de dicha primera secuencia de nucleótidos,
- -
- una parte central de dicha secuencia de ARN de interés, y
- -
- una parte 5' de un intrón preferiblemente funcional con dicha parte 3' de un intrón de dicha segunda secuencia de nucleótidos.
\vskip1.000000\baselineskip
15. El proceso de acuerdo con cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 14, en el que dicho primer vector o dicho
segundo vector no pueden recombinarse entre sí mediante
recombinación específica de sitio.
16. El proceso de acuerdo con una de las
reivindicaciones 1 a 14, en el que
- -
- dicha primera secuencia de nucleótidos contiene corriente abajo de dicho primer segmento un lugar de recombinación para recombinación específica de sitio,
- -
- dicha segunda secuencia de nucleótidos contiene corriente arriba de dicho segundo segmento un lugar de recombinación para recombinación específica de sitio,
mediante lo cual dichos lugares de recombinación
son adaptados para recombinarse entre sí, opcionalmente en
presencia de una recombinasa específica de sitio.
\vskip1.000000\baselineskip
17. El proceso de acuerdo con la reivindicación
16, en el que dicha primera o dicha segunda secuencia de
nucleótidos contiene un gen de una recombinasa específica de sitio
funcional con dichos lugares de recombinación.
18. El proceso de acuerdo con una de las
reivindicaciones 1 a 17, en el que se proporcionan tres o más
vectores diferentes a las células vegetales y en el que se obtienen
dos o más células vegetales o plantas transgénicas diferentes,
expresando dichas células vegetales o plantas transgénicas
diferentes secuencias de ARN de interés diferentes.
19. El proceso de una de las reivindicaciones 1
a 18, que comprende las etapas (A) y (B) siguientes:
- (A)
- la provisión a plantas o a células vegetales de una mezcla de
- (i)
- un conjunto de m primeros vectores que tienen cada uno de ellos una primera secuencia de nucleótidos con un primer segmento que codifica una parte 5' de dicha secuencia de ARN de interés seleccionada del conjunto (a_{1}, a_{2}, ..., a_{m}) y
- (ii)
- un conjunto de n segundos vectores que tienen cada uno de ellos una segunda secuencia de nucleótidos con un segundo segmento que codifica una parte 3' de dicha secuencia de ARN de interés seleccionada del conjunto (b_{1}, b_{2}, ..., b_{n}),
- \quad
- donde
- \quad
- m y n son independientes uno de otro y son ambos números enteros >1,
- \quad
- dichos primeros vectores y dichos segundos vectores son adaptados para producir diferentes secuencias de ARN de interés,
- (B)
- la selección de las plantas o células vegetales transformadas dotadas de un rasgo de interés.
\vskip1.000000\baselineskip
20. El proceso de una de las reivindicaciones 1
a 19, que comprende las etapas (A) y (B) siguientes:
- (A)
- la provisión a plantas o a células vegetales de una mezcla de
- (i)
- un primer vector que tiene una primera secuencia de nucleótidos con un primer segmento que codifica una parte 5' de dicha secuencia de ARN de interés a_{1} y
- (ii)
- un conjunto de n segundos vectores que tienen cada uno de ellos una segunda secuencia de nucleótidos con un segundo segmento que codifica una parte 3' de dicha secuencia de ARN de interés seleccionada del conjunto (b_{1}, b_{2}, ..., b_{n}),
- \quad
- donde
- \quad
- n es un número entero >1,
- \quad
- dicho primer vector y dichos segundos vectores están adaptados para expresar secuencias de ARN de interés del tipo (a_{1}b_{1}, a_{1}b_{2}, ..., a_{1}b_{n}) o del tipo (b_{1}a_{1}, b_{2}a_{1}, ..., b_{n}a_{1}),
- (B)
- la selección de las plantas o células vegetales transformadas dotadas de un rasgo de interés.
\vskip1.000000\baselineskip
21. El proceso de acuerdo con una de las
reivindicaciones 1 a 20, en el que dicha primera y dicha segunda
secuencia de nucleótidos son adaptadas de tal manera que dichas
plantas o dichas células pueden ser dotadas de dicho rasgo de
interés si, y sólo si, a dichas células vegetales se les proporciona
dicho primer vector y dicho segundo vector.
22. El proceso de acuerdo con una de las
reivindicaciones 1 a 8, en el que dicha secuencia de ARN de interés
produce dicho rasgo de interés causando la degradación o la
supresión de un ARN mensajero de dichas células vegetales.
23. Células vegetales, plantas o partes
transformadas de las mismas como semillas producidas o producibles
de acuerdo con el proceso de cualquiera de las reivindicaciones 1 a
22.
24. Las células vegetales, las plantas o partes
de las mismas como semillas de acuerdo con la reivindicación 23, en
las que todas las secuencias expresables de dicha primera o dicha
segunda secuencia de nucleótidos son de origen vegetal.
25. Una biblioteca de plantas o de semillas de
plantas obtenida u obtenible de acuerdo con una de las
reivindicaciones 19 ó 20.
26. Un kit de partes que contiene dicho primer y
dicho segundo vector según se definieron en una de las
reivindicaciones 1 a 22.
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