CN112094269B - 一类饱和六元环并杂环类化合物、制备方法和用途 - Google Patents

一类饱和六元环并杂环类化合物、制备方法和用途 Download PDF

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Abstract

本发明公开了一类饱和六元环并杂环类化合物、制备方法和用途。一种如通式I所示的饱和六元环并杂环类化合物、或其药学上可接受的盐、或其对映异构体、非对映异构体、互变异构体、扭转异构体、溶剂化物、多晶型物或前药、其制备方法及在药学上的应用,其中各基团的定义如说明书中所述。

Description

一类饱和六元环并杂环类化合物、制备方法和用途
技术领域
本发明属于药物化学领域,具体地,涉及一类饱和六元环并杂环类化合物,具有抑制Ras突变蛋白活性的化合物、制备方法和用途。
背景技术
RAS是第一个在人类肿瘤中被鉴定出来的致癌基因,最早在两种鼠肉瘤病毒中被发 现。RAS基因家族有三个成员,分别是Hras、Kras、Nras。在人类肿瘤中,Kras突变最 为常见,约占85%。先前研究表明,Kras突变之所以能致癌,是因为第12号密码子发 生了错义突变,改变了Kras蛋白质的结构并使其一直处于激活状态。Ras在信号通路传 递中的作用主要是活化控制基因转录的激酶,从而调节细胞分化和增生,与肿瘤细胞的 生存、增殖、迁移、转移和血管生成密切相关。据统计,有11%-16%的肺腺癌病例中存 在Kras G12C突变,胰腺癌、结直肠癌、卵巢癌、胆管癌里也有一部分是Kras突变导 致。然而,距离首次发现Kras致癌基因已过去三十余年,EGFR、BCL等常见原癌基因 的靶向药物已历经数代,针对Kras的靶向药却始终未能成功研发出来。一直以来,针对 KRas通路突变型肿瘤的靶向药物主要集中在法尼基转移酶抑制剂和Raf-MEK通路抑制 剂上,但是收效甚微。近年来,针对KRas特定基因突变的抑制剂研发成为热点,部分 抑制剂逐渐由临床前孵化走向临床研究,如KRas G12C抑制剂AMG510,MRTX1257 等,并且在早期临床实验中显示了一定的疗效。全球首款KRASG12C抑制剂AMG 510 的第一项临床数据终于在2019年6月举行的美国临床肿瘤学会正式公布,在这项临床研 究中,安进药物AMG 510显示出能够阻止大多数具有KRas突变的非小细胞肺癌和结直 肠癌患者的肿瘤生长。因此,发现和寻找特异性高、成药性优异的针对KRas特定突变 基因的靶向药物成为工业界一大热点。
发明内容
本发明需要解决的技术问题之一是提供一种新型的KRasG12C抑制剂,用于制备 肿瘤治疗药物。
解决上述技术问题的方案如下:
本发明第一方面,提供一种具有如通式I所示的饱和六元环并杂环类化物,或 其药学上可接受的盐、或其对映异构体、非对映异构体、互变异构体、溶剂化物、 多晶型物或前药,
Figure BDA0002733786720000021
式中:
R1独立地选自氢、卤素、氰基、硝基、C1-C6烷基、C1-C6烷基-SO2-、C1-C6烷 基-SO-、或C1-C6卤代烷基;
R2、R3独立地选自氢、卤素、氰基、硝基、C1-C6烷基、C1-C6烷基-SO2-、C1- C6烷基-SO-、N(R2a)(R2b)-(CH2)x-;或者,R2a和R2b共同构成一个5-10元的被C1-C6烷基取代的含氮杂环烷基;其中,R2a和R2b各自独立地选自氢或C1-C6烷基,x选 自0-5中的任一整数;
Ra,Rb,Rc,Rd,Re,Rf,Rg,Rh分别独立地选自氢、卤素、C1-C6烷基、烷氧基、卤代 烷基等,或者Ra,Rb,Rc,Rd,Re,Rf和Rg两两之间形成3-8元的饱和或部分不饱和环 系;
M独立地选自N或CR4,R4选自H、卤素、氰基、氨基、羟基、硝基、C1-C6烷基、C1-C6烷氧基、烯基、炔基等,并且Rg或Rh可以与R4基团形成5-10元饱 和或部分不饱和环系;M1独立地选自CH或N;
R5独立地选自氢、卤素、C1-C6烷基、C1-C6卤代烷基、烷氧基、卤代烷氧基、 氧代等,m独立地选自0-6的整数;
X,Y,Z独立地选自O,N,C=O或CR6,R6独立地选自H、卤素、氰基、氨基、羟 基、硝基、C1-C6烷基、C1-C6烷氧基、卤代烷基、卤代烷氧基、烯基、炔基、3-8元 环烷基或杂环烷基、5-12元芳基或杂芳基等;
Ar独立地选自5-12元芳香环或芳香稠环、5-12元芳香杂环或芳香稠杂环;并且 Ar环可以被一个或多个以下基团所取代:氢、卤素、C1-C6烷基、烷氧基、3-8元环 烷基或杂环烷基、C1-C6卤代烷氧基、C2-C6烯基、C2-C6炔基、取代或未取代的氨 基、酰胺基、磺酰胺基等;
上述的任一基团上的一个或多个氢原子可以被选自下组的取代基取代:包括但不限于氘、卤素、羟基、氨基或环氨基、氰基、硝基、砜基或亚砜基、C1-C8烷基、3- 8元环烷基或杂环烷基、C1-C8烷氧基、C1-C8烷氨基、烯基、炔基、酰基或磺酰基、 脲或磺酰脲、5~8元芳基或杂芳基;其中,所述的杂芳基包含1-3个选自下组的杂原 子:N、O、P或S,所述的杂环烷基包含1-3个选自下组的杂原子:N、O、P或S, 所述的环系包含螺环、桥环、稠环、并环等饱和或部分不饱和的环系。
在另一优选例中,具有通式(I)所述的化合物,或其药学上可接受的盐、或其对 映异构体、非对映异构体、互变异构体、溶剂化物、多晶型物或前药,其优选为通式(IIA)、(IIB)、(IIC)所示的化合物,或其药学上可接受的盐、或其对映异构体、 非对映异构体、互变异构体、溶剂化物、多晶型物或前药:
Figure BDA0002733786720000031
其中R1、R2、R3、R5、R6、Ra、Rb、Rc、Rd、Re、Rf、Rg、Rh、M、M1、Ar、 m如上文中所定义。
在另一优选例中,M独立地选自N或或CR4;其中,R4选自H、卤素、氰基、 羟基、硝基、C1-C6烷基、C1-C6烷氧基;
或者R4与Rh形成5-8元饱和或部分不饱和环系;所述环上的一个或多个氢原 子可以被选自下组的取代基取代:氘、卤素、羟基、氨基或环氨基、氰基、硝基、砜 基或亚砜基、C1-C8烷基、3-8元环烷基或杂环烷基、C1-C8烷氧基、C1-C8烷氨基、 烯基、炔基、酰基或磺酰基、脲或磺酰脲、5~8元芳基或杂芳基;其中,所述的杂芳 基包含1-3个选自下组的杂原子:N、O、P或S,所述的杂环烷基包含1-3个选自下 组的杂原子:N、O、P或S,所述的环系包含螺环、桥环、稠环、并环等饱和或部分 不饱和的环系。
在另一优选例中,所述的式I化合物,或其药学上可接受的盐、或其对映异构体、非对映异构体、互变异构体、溶剂化物、多晶型物或前药,其具有式(III-A)所示的 结构:
Figure BDA0002733786720000032
其中,Ri和Rj各自独立地选自:H、卤素、羟基、氰基、硝基、C1-C6烷基、 C1-C6卤代烷基;或者Ri和Rj结合形成=O;
G选自O、NR7、CR8R9;其中,R7选自:H、C1-C6烷基、C1-C6卤代烷 基,R8和R9各自独立地选自:H、卤素、羟基、氰基、硝基、C1-C6烷基、C1-C6 卤代烷基;
R1、R2、R3、R5、Ra、Rb、Rc、Rd、Re、Rf、Ar、m、X和Y如权利要求1 中所定义。
在另一优选例中,R1选自氢、氟、甲基、氰基。
在另一优选例中,R2、R3各自独立地选自氢、卤素、氰基、硝基、C1-C6烷 基,优选地R2、R3各自独立地为H。
在另一优选例中,Ra、Rb、Rc、Rd、Re、Rf、Rg、Rh分别独立地选自氢、 氟、甲基、羟甲基、氰基亚甲基。
在另一优选例中,式(III-A)中,Ra、Rb、Rc、Rd、Re、Rf分别独立地选自 氢、氟、甲基、羟甲基、氰基亚甲基。
在另一优选例中,式(III-A)中,X为N或CH。
在另一优选例中,式(III-A)中,Y为N。
在另一优选例中,Ar独立地选自取代或未取代的苯基和吡啶基,或者取代或未 取代的萘基、萘啶基、吲唑基、苯并咪唑基;所述的取代是指被选自下组的一个或 多个取代基取代:氢、卤素、C1-C4的烷基、羟基、氨基、氰基、C1-C4烷氧基、 C1-C4卤代烷基、C1-C4卤代烷氧基。
在另一优选例中,Ar选自:
Figure BDA0002733786720000041
其中Rp选自:卤 素、C1-C4的烷基、羟基、氨基、氰基、C1-C4烷氧基、C1-C4卤代烷基、C1-C4卤 代烷氧基,n为1、2、3、4或5。
在另一优选例中,具有通式I所述的化合物,或其药学上可接受的盐、或其对 映异构体、非对映异构体、互变异构体、溶剂化物、多晶型物或前药,其中,
R1优选自氢、氟、甲基、氰基等;
Ra、Rb、Rc、Rd、Re、Rf、Rg、Rh分别独立地优选自氢、氟、甲基、羟甲 基、氰基亚甲基;
M独立地优选自N或CH、C-F、C-CN、C-Cl、C-Me、C-OMe等;或者R4与 Rh形成5-8元饱和或部分不饱和环;
M1优选自N;
R5独立地选自氢,卤素、C1-C6烷基、C1-C6烷氧基等;m优选自0,1,2;
Ar独立地优选自取代或未取代的苯基和吡啶基等单环芳香基团,或者取代或未取代的萘基、萘啶基、吲唑基、苯并咪唑基等双环芳香基团;所述的一个或多个取 代基优选自下组:氢、卤素、C1-C4的烷基、羟基、氨基、氰基、C1-C4烷氧基、 C1-C4卤代烷基、C1-C4卤代烷氧基等;其它基团的范围如上文所定义。
在另一优选例中,R1、R2、R3、R5、Ra、Rb、Rc、Rd、Re、Rf、Ar、m、X、 Y和Z为实施例各具体化合物所对应基团。
在另一优选例中,通式(I)优选化合物,包括但不限于以下结构:
Figure BDA0002733786720000051
Figure BDA0002733786720000061
Figure BDA0002733786720000071
在另一优选例中,所述的式I化合物选自实施例中所示的化合物。
本发明第二方面,提供一种制备式(I)化合物的方法,所述方法包括步骤a-f:
a)在碱性条件下,将原料通式(A)化合物与单保护哌嗪类原料反应,得到中间 体通式化合物(B);
b)将中间体通式(B)化合物转换成中间体通式(C)化合物;
c)将中间体通式(C)化合物通过常规官能团脱除保护基团Pg,得到中间体通式(D)化合物;
d)将中间体通式(D)化合物与芳基硼酸或芳基硼酸酯或芳基卤代物等通过过渡金属催化偶联反应转化成中间体通式(E)化合物;
e)将中间体通式(E)化合物通过常规官能团脱除保护基团Pg1,得到中间体通 式(F)化合物;
f)将通式(F)化合物和丙烯酸或者丙烯酰氯或者氯丙酰氯在适当条件下反应生成通式(I)化合物。
Figure BDA0002733786720000081
所示各基团的定义如上所述,其中,Pg和Pg1各自独立地选自:苄氧羰基、叔 丁氧羰基、邻苯二甲酰基、苄基、对甲苯磺酰基、三氟乙酰基、芴甲氧羰基、烯丙 氧羰基、邻(对)硝基苯磺酰基、三苯甲基。
优选地,所述步骤a)、b)、c)、d)、e)、f)各自在溶剂中进行,且所述溶剂选 自下组:水、甲醇、乙醇、异丙醇、丁醇、乙二醇、乙二醇甲醚、N-甲基吡咯烷酮、 二甲基亚砜,四氢呋喃、甲苯、二氯甲烷、1,2-二氯乙烷、乙腈、N,N-二甲基甲酰胺、 N,N-二甲基乙酰胺、二氧六环,或其组合物。
优选地,所述过渡金属催化剂选自下组:三(二亚苄基丙酮)二钯(Pd2(dba)3)、四(三 苯基膦)钯(Pd(PPh3)4)、醋酸钯、氯化钯、二氯二(三苯基膦)钯、三氟醋酸钯、三苯基 膦醋酸钯、[1,1'-双(二苯基膦基)二茂铁]二氯化钯、双(三邻苯甲基膦)二氯化钯、1,2- 二(二苯基膦基)乙烷二氯化钯,或其组合物;所述催化剂配体选自下组:三叔丁基膦、 四氟硼酸三叔丁基膦、三正丁基膦、三苯基膦、三对苯甲基膦、三环己基膦、三邻苯 甲基膦,或其组合物。
优选地,所述缩合试剂选自下组:N,N'-二环己基碳二亚胺(DCC)、N,N'-二异丙 基碳二亚胺(DIC)、N,N'-羰基二咪唑(CDI)、1-乙基-(3-二甲基氨基丙基)碳酰二亚 胺盐酸盐(EDCI)、1-羟基-7-氮杂苯并三氮唑(HOAt)、1-羟基苯并三氮唑(HOBt)、 苯并三氮唑-1-基氧基三(二甲基氨基)磷鎓六氟磷酸盐(BOP)、苯并三氮唑-1-基氧基 三(吡咯烷基)磷鎓六氟磷酸盐(PyBOP)、2-(7-氮杂苯并三氮唑)-N,N,N',N'-四甲基脲 六氟磷酸盐(HATU)、O-苯并三氮唑-N,N,N',N'-四甲基脲四氟硼酸盐(TBTU)等, 或其组合物。
优选地,所述无机碱选自下组:氢化钠、氢氧化钾、醋酸钠、醋酸钾、叔丁醇钾、 叔丁醇钠、氟化钾、氟化铯、磷酸钾、碳酸钾、碳酸氢钾、碳酸钠、碳酸氢钠,或其 组合物;所述有机碱选自下组:吡啶,三乙胺,N,N-二异丙基乙胺、1,8-二氮杂二环 [5.4.0]十一碳-7-烯(DBU)、六甲基二硅基锂、六甲基二硅基钠、二甲基吡啶,或其 组合物。
优选地,所述酸选自下组:盐酸、硫酸、磷酸、甲磺酸、甲苯磺酸、三氟乙酸、 甲酸、乙酸,三氟甲磺酸或其组合物。
优选地,所述还原剂选自下组:铁粉、锌粉、氯化亚锡、硫代硫酸钠、亚硫酸钠、 氢气等。
本发明第三方面,提供一种药物组合物,其包含(i)第一方面式I所示的饱和六 元环并杂环类化合物,或其药学上可接受的盐、或其对映异构体、非对映异构体、互 变异构体、溶剂化物、多晶型物或前药和(ii)药学上可接受的载体。
在另一优选例中,所述药物组合物还包含选自下组的药物:
PD-1抑制剂(如nivolumab,pembrolizumab,pidilizumab等)、PD-L1抑制剂(如durvalumab,atezolizumab,avelumab,等)、CD20抗体(如rituximab,obinutuzumab)、 ALK抑制剂(如Ceritinib、奥卡替尼)、PI3K抑制剂(如Idelalisib、Duvelisib等)、 BTK抑制剂(如Ibrutinib)、EGFR抑制剂(如Afatinib、Gefitinib等)或其组合。
在另一优选例中,提供一种药物组合物的制备方法,包括步骤:将药学上可接受的载体与本发明所述通式(I)所述的化合物,或其药学上可接受的盐、或其对映异构 体、非对映异构体、互变异构体、溶剂化物、多晶型物或前药进行混合,从而形成药 物组合物。
本发明第四方面,提供一种第一方面所述或其药学上可接受的盐、或其对映异构体、非对映异构体、互变异构体、溶剂化物、多晶型物或前药的用途,
用于制备治疗与Ras突变蛋白活性或表达量相关的疾病的药物,特别是肿瘤的治疗药物。所述的肿瘤独立地选自非小细胞肺癌、小细胞肺癌、肺腺癌、肺鳞癌、乳腺 癌、***癌、肝癌、皮肤癌、胃癌、肠癌、胆管癌、脑癌、白血病、淋巴癌、纤维 瘤、肉瘤、基底细胞癌、胶质瘤、肾癌、黑色素瘤、骨癌、甲状腺癌、鼻咽癌、胰腺 癌等。
本发明第五方面,提供了一种非诊断性、非治疗性地抑制KRASG12C的方法,它 包括步骤:向所需患者施用有效量的第一方面所述的通式(I)化合物、或其药学上可 接受的盐、或其对映异构体、非对映异构体、互变异构体、溶剂化物、多晶型物或 前药,或施用第三方面所述的药物组合物。
本发明涉及具有通式(I)结构特征的化合物,可以抑制多种肿瘤细胞,尤其是能高效地杀死KRasG12C突变蛋白信号通路异常相关的肿瘤,是一类全新作用机制的治 疗药物。
应理解,在本发明范围内中,本发明的上述各技术特征和在下文(如实施例)中具体描述的各技术特征之间都可以互相组合、从而构成新的或优选的技术方案。限于篇 幅在此不再一一累述。
具体实施方式
发明人经过长期而深入的研究,制备了一类具有式I所示结构新颖的化合物,并发现其具有较好的抑制KRasG12C蛋白抑制活性,且所述的化合物在极低浓度(可低至小 于100nM)下,即对KRasG12C蛋白产生特异性抑制作用,并且对KRasG12C相关的细 胞增殖抑制活性相当优异,且所述的化合物在极低浓度(可低至小于100nM)下,即对 KRasG12C阳性的肿瘤细胞具有较强的杀伤作用,因而可以用于治疗与KRasG12C突变 或表达量异常引起的相关疾病如肿瘤。基于上述发现,发明人完成了本发明。
术语
除非另有定义,否则本文所有科技术语具有的涵义与权利要求主题所属领域技术人员通常理解的涵义相同。除非另有说明,本文全文引用的所有专利、专利申请、公 开材料通过引用方式整体并入本文。
应理解,上述简述和下文的详述为示例性且仅用于解释,而不对本发明主题作任何限制。在本申请中,除非另有具体说明,否则使用单数时也包括复数。必须注意, 除非文中另有清楚的说明,否则在本说明书和权利要求书中所用的单数形式包括所指 事物的复数形式。还应注意,除非另有说明,否则所用“或”、“或者”表示“和/或”。此 外,所用术语“包括”以及其它形式,例如“包含”、“含”和“含有”并非限制性。
可在参考文献(包括Carey and Sundberg"ADVANCED ORGANIC CHEMISTRY 4THED."Vols.A(2000)and B(2001),Plenum Press,New York)中找到对标准化学术 语的定义。除非另有说明,否则采用本领域技术范围内的常规方法,如质谱、NMR、 IR和UV/VIS光谱法和药理学方法。除非提出具体定义,否则本文在分析化学、有机 合成化学以及药物和药物化学的有关描述中采用的术语是本领域已知的。可在化学合 成、化学分析、药物制备、制剂和递送,以及对患者的治疗中使用标准技术。例如, 可利用厂商对试剂盒的使用说明,或者按照本领域公知的方式或本发明的说明来实施 反应和进行纯化。通常可根据本说明书中引用和讨论的多个概要性和较具体的文献中 的描述,按照本领域熟知的常规方法实施上述技术和方法。在本说明书中,可由本领 域技术人员选择基团及其取代基以提供稳定的结构部分和化合物。
当通过从左向右书写的常规化学式描述取代基时,该取代基也同样包括从右向左书写结构式时所得到的在化学上等同的取代基。举例而言,-CH2O-等同于-OCH2-。
本文所用的章节标题仅用于组织文章的目的,而不应被解释为对所述主题的限制。 本申请中引用的所有文献或文献部分包括但不限于专利、专利申请、文章、书籍、操 作手册和论文,均通过引用方式整体并入本文。
在本文中定义的某些化学基团前面通过简化符号来表示该基团中存在的碳原子总数。例如,C1-6烷基是指具有总共1至6个碳原子的如下文所定义的烷基。简化 符号中的碳原子总数不包括可能存在于所述基团的取代基中的碳。
除前述以外,当用于本申请的说明书及权利要求书中时,除非另外特别指明,否则以下术语具有如下所示的含义。
在本申请中,术语“卤素”是指氟、氯、溴或碘;“羟基”是指-OH基团;“羟基烷基”是指被羟基(-OH)取代的如下文所定义的烷基;“羰基”是指-C(=O)-基团;“硝基”是指- NO2;“氰基”是指-CN;“氨基”是指-NH2;“取代的氨基”是指被一个或两个如下文所定义 的烷基、烷基羰基、芳烷基、杂芳烷基取代的氨基,例如,单烷基氨基、二烷基氨基、 烷基酰氨基、芳烷基氨基、杂芳烷基氨基;“羧基”是指-COOH。
在本申请中,作为基团或是其它基团的一部分(例如用在卤素取代的烷基等基团中),术语“烷基”意指仅由碳原子和氢原子组成、不含不饱和键、具有例如1至12个 (优选为1至8个,更优选为1至6个)碳原子且通过单键与分子的其余部分连接的 直链或支链的烃链基团。烷基的实例包括但不限于甲基、乙基、正丙基、异丙基、正 丁基、异丁基、仲丁基、叔丁基、正戊基、2-甲基丁基、2,2-二甲基丙基、正己基、庚 基、2-甲基己基、3-甲基己基、辛基、壬基和癸基等。
在本申请中,作为基团或是其它基团的一部分,术语“烯基”意指仅由碳原子和氢原子组成、含有至少一个双键、具有例如2至14个(优选为2至10个,更优选为2 至6个)碳原子且通过单键与分子的其余部分连接的直链或支链的烃链基团,例如但 不限于乙烯基、丙烯基、烯丙基、丁-1-烯基、丁-2-烯基、戊-1-烯基、戊-1,4-二烯基 等。
在本申请中,作为基团或是其它基团的一部分,术语“炔基”意指仅由碳原子和氢原子组成、含有至少一个三键和任选的一个或多个双键、具有例如2至14个(优选 为2至10个,更优选为2至6个)碳原子且通过单键与分子的其余部分连接的直链 或支链的烃链基团,例如但不限于乙炔基、丙-1-炔基、丁-1-炔基、戊-1-烯-4-炔基等。
在本申请中,作为基团或是其它基团的一部分,术语“环烷基”意指仅由碳原子和氢原子组成的稳定的非芳香族单环或多环烃基,其可包括稠合环体系、桥环体系或螺 环体系,具有3至15个碳原子,优选具有3至10个碳原子,更优选具有3至8个碳 原子,且其为饱和或不饱和并可经由任何适宜的碳原子通过单键与分子的其余部分连 接。除非本说明书中另外特别指明,环烷基中的碳原子可以任选地被氧化。环烷基的 实例包括但不限于环丙基、环丁基、环戊基、环戊烯基、环己基、环己烯基、环己二 烯基、环庚基、环辛基、1H-茚基、2,3-二氢化茚基、1,2,3,4-四氢-萘基、5,6,7,8-四氢 -萘基、8,9-二氢-7H-苯并环庚烯-6-基、6,7,8,9-四氢-5H-苯并环庚烯基、5,6,7,8,9,10-六 氢-苯并环辛烯基、芴基、二环[2.2.1]庚基、7,7-二甲基-二环[2.2.1]庚基、二环[2.2.1]庚 烯基、二环[2.2.2]辛基、二环[3.1.1]庚基、二环[3.2.1]辛基、二环[2.2.2]辛烯基、二环 [3.2.1]辛烯基、金刚烷基、八氢-4,7-亚甲基-1H-茚基和八氢-2,5-亚甲基-并环戊二烯基 等。
在本申请中,作为基团或是其它基团的一部分,术语“杂环基”意指由2至14个 碳原子以及1至6个选自氮、磷、氧和硫的杂原子组成的稳定的3元至20元非芳香 族环状基团。除非本说明书中另外特别指明,否则杂环基可以为单环、双环、三环或 更多环的环体系,其可包括稠合环体系、桥环体系或螺环体系;其杂环基中的氮、碳 或硫原子可任选地被氧化;氮原子可任选地被季铵化;且杂环基可为部分或完全饱和。 杂环基可以经由碳原子或者杂原子并通过单键与分子其余部分连接。在包含稠环的杂 环基中,一个或多个环可以是下文所定义的芳基或杂芳基,条件是与分子其余部分的 连接点为非芳香族环原子。就本发明的目的而言,杂环基优选为包含1至3个选自 氮、氧和硫的杂原子的稳定的4元至11元非芳香性单环、双环、桥环或螺环基团, 更优选为包含1至3个选自氮、氧和硫的杂原子的稳定的4元至8元非芳香性单环、 双环、桥环或螺环基团。杂环基的实例包括但不限于:吡咯烷基、吗啉基、哌嗪基、 高哌嗪基、哌啶基、硫代吗啉基、2,7-二氮杂-螺[3.5]壬烷-7-基、2-氧杂-6-氮杂-螺[3.3] 庚烷-6-基、2,5-二氮杂-双环[2.2.1]庚烷-2-基、氮杂环丁烷基、吡喃基、四氢吡喃基、 噻喃基、四氢呋喃基、噁嗪基、二氧环戊基、四氢异喹啉基、十氢异喹啉基、咪唑啉 基、咪唑烷基、喹嗪基、噻唑烷基、异噻唑烷基、异噁唑烷基、二氢吲哚基、八氢吲 哚基、八氢异吲哚基、吡咯烷基、吡唑烷基、邻苯二甲酰亚氨基等。
在本申请中,作为基团或是其它基团的一部分,术语“芳基”意指具有6至18个 碳原子(优选具有6至10个碳原子)的共轭烃环体系基团。就本发明的目的而言, 芳基可以为单环、双环、三环或更多环的环体系,还可以与上文所定义的环烷基或杂 环基稠合,条件是芳基经由芳香环上的原子通过单键与分子的其余部分连接。芳基的 实例包括但不限于苯基、萘基、蒽基、菲基、芴基、2,3-二氢-1H-异吲哚基、2-苯并噁 唑啉酮、2H-1,4-苯并噁嗪-3(4H)-酮-7-基等。
在本申请中,术语“芳基烷基”是指被上文所定义的芳基所取代的上文所定义的烷基。
在本申请中,作为基团或是其它基团的一部分,术语“杂芳基”意指环内具有1至15个碳原子(优选具有1至10个碳原子)和1至6个选自氮、氧和硫的杂原子的5 元至16元共轭环系基团。除非本说明书中另外特别指明,否则杂芳基可为单环、双 环、三环或更多环的环体系,还可以与上文所定义的环烷基或杂环基稠合,条件是杂 芳基经由芳香环上的原子通过单键与分子的其余部分连接。杂芳基中的氮、碳或硫原 子可任选地被氧化;氮原子可任选地被季铵化。就本发明的目的而言,杂芳基优选为 包含1至5个选自氮、氧和硫的杂原子的稳定的5元至12元芳香性基团,更优选为 包含1至4个选自氮、氧和硫的杂原子的稳定的5元至10元芳香性基团或者包含1 至3个选自氮、氧和硫的杂原子的5元至6元芳香性基团。杂芳基的实例包括但不限 于噻吩基、咪唑基、吡唑基、噻唑基、噁唑基、噁二唑基、异噁唑基、吡啶基、嘧啶 基、吡嗪基、哒嗪基、苯并咪唑基、苯并吡唑基、吲哚基、呋喃基、吡咯基、***基、 四唑基、三嗪基、吲嗪基、异吲哚基、吲唑基、异吲唑基、嘌呤基、喹啉基、异喹啉基、二氮萘基、萘啶基、喹噁啉基、蝶啶基、咔唑基、咔啉基、菲啶基、菲咯啉基、 吖啶基、吩嗪基、异噻唑基、苯并噻唑基、苯并噻吩基、噁***基、噌啉基、喹唑啉 基、苯硫基、中氮茚基、邻二氮杂菲基、异噁唑基、吩噁嗪基、吩噻嗪基、4,5,6,7-四 氢苯并[b]噻吩基、萘并吡啶基、[1,2,4]***并[4,3-b]哒嗪、[1,2,4]***并[4,3-a]吡嗪、[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶、[1,2,4]***并[4,3-a]吡啶、咪唑并[1,2-a]吡啶、咪唑并[1,2- b]哒嗪、咪唑并[1,2-a]吡嗪等。
在本申请中,术语“杂芳基烷基”是指被上文所定义的杂芳基所取代的上文所定义的烷基。
在本申请中,“饱和或部分不饱和环”是指如上所定义的环烷基或杂环基。
在本申请中,“任选的”或“任选地”表示随后描述的事件或状况可能发生也可能不发生,且该描述同时包括该事件或状况发生和不发生的情况。例如,“任选地被取代 的芳基”表示芳基被取代或未被取代,且该描述同时包括被取代的芳基与未被取代的 芳基。
本文所用术语“部分”、“结构部分”、“化学部分”、“基团”、“化学基团”是指分子 中的特定片段或官能团。化学部分通常被认为是嵌入或附加到分子上的化学实体。
“立体异构体”是指由相同原子组成,通过相同的键键合,但具有不同三维结构的化合物。本发明将涵盖各种立体异构体及其混合物。
当本发明的化合物中含有烯双键时,除非另有说明,否则本发明的化合物旨在包含E-和Z-几何异构体。
“互变异构体”是指质子从分子的一个原子转移至相同分子的另一个原子而形成的异构体。本发明的化合物的所有互变异构形式也将包含在本发明的范围内。
在本发明中,上述的烷基、烯基、炔基、环烷基、杂环基、芳基、杂芳基、芳基 烷基、杂芳基烷基等中各基团可以是取代的或未取代的,所述的“取代”是指被选自下 组的一个或多个基团取代:氘、卤素、羟基、氨基或环氨基、氰基、硝基、砜基或亚 砜基、C1-C8烷基、3-8元环烷基或杂环烷基、C1-C8烷氧基、C1-C8烷氨基、烯基、 炔基、酰基或磺酰基、脲或磺酰脲、5~8元芳基或杂芳基,优选地选自:氘、卤素、 C1-C8烷基、3-8元环烷基或杂环烷基。
本发明中,
Figure BDA0002733786720000132
表示单键或双键。
活性成分
如本文所用,术语“本发明的化合物”或“本发明的活性成分”可互换使用,指式I化合物,或其药学上可接受的盐、或其对映异构体、非对映异构体、互变异构体、 溶剂化物、多晶型物或前药。
本发明中,所述的式I化合物具有如下结构:
Figure BDA0002733786720000131
式中,R1、R2、R3、R5、Ra、Rb、Rc、Rd、Re、Rf、Rg、Rh、M、M1、 Ar、m、X、Y和Z的定义如上所述。
优选地,所述的式I化合物具有式(IIA)、(IIB)、(IIC)所示结构:
Figure RE-GDA0002793663860000011
其中,R1、R2、R3、R5、R6、Ra、Rb、Rc、Rd、Re、Rf、Rg、Rh、M、M1、 Ar、m如上所定义。
优选地,式I化合物具有式(III-A)所示的结构:
Figure BDA0002733786720000142
其中,Ri和Rj各自独立地选自:H、卤素、羟基、氰基、硝基、C1-C6烷基、 C1-C6卤代烷基;或者Ri和Rj结合形成=O;
G选自O、NR7、CR8R9;其中,R7选自:H、C1-C6烷基、C1-C6卤代烷 基,R8和R9各自独立地选自:H、卤素、羟基、氰基、硝基、C1-C6烷基、C1-C6 卤代烷基;
R1、R2、R3、R5、Ra、Rb、Rc、Rd、Re、Rf、Ar、m、X和Y如上所定义。
优选地,上述各式中,R1选自氢、氟、甲基、氰基;
Ra、Rb、Rc、Rd、Re、Rf、Rg、Rh分别独立地选自氢、氟、甲基、羟甲基、 氰基亚甲基;
M独立地选自N或CH、C-F、C-CN、C-Cl、C-Me、C-OMe;或者R4与Rh形 成5-8元饱和环;
M1选自N;
R5独立地选自氢、卤素、C1-C6烷基、C1-C6烷氧基;m选自0、1、2;
Ar独立地选自取代或未取代的苯基和吡啶基,或者取代或未取代的萘基、萘啶基、吲唑基、苯并咪唑基,;所述的一个或多个取代基选自下组:氢、卤素、C1-C4 的烷基、羟基、氨基、氰基、C1-C4烷氧基、C1-C4卤代烷基、C1-C4卤代烷氧 基;优选地,Ar选自:
Figure BDA0002733786720000151
其中Rp选自:卤素、 C1-C4的烷基、羟基、氨基、氰基、C1-C4烷氧基、C1-C4卤代烷基、C1-C4卤代烷 氧基,n为1、2、3、4或5。
本发明的化合物或其药学上可接受的盐可能含有一个或多个手性碳原子,且因此可产生对映异构体、非对映异构体及其它立体异构形式。每个手性碳原子可以基于立 体化学而被定义为(R)-或(S)-。本发明旨在包括所有可能的异构体,以及其外消旋体和 光学纯形式。本发明的化合物的制备可以选择外消旋体、非对映异构体或对映异构体 作为原料或中间体。光学活性的异构体可以使用手性合成子或手性试剂来制备,或者 使用常规技术进行拆分,例如采用结晶以及手性色谱等方法。
制备/分离个别异构体的常规技术包括由合适的光学纯前体的手性合成,或者使用例如手性高效液相色谱法拆分外消旋体(或盐或衍生物的外消旋体),例如可参见Gerald Gübitz and Martin G.Schmid(Eds.),Chiral Separations,Methods andProtocols, Methods in Molecular Biology,Vol.243,2004;A.M.Stalcup,ChiralSeparations,Annu. Rev.Anal.Chem.3:341-63,2010;Fumiss et al.(eds.),VOGEL'SENCYCLOPEDIA OF PRACTICAL ORGANIC CHEMISTRY 5.sup.TH ED.,Longman Scientificand Technical Ltd.,Essex,1991,809-816;Heller,Acc.Chem.Res.1990,23,128。
在本申请中,术语“药学上可接受的盐”包括药学上可接受的酸加成盐和药学上可接受的碱加成盐。
“药学上可接受的酸加成盐”是指能够保留游离碱的生物有效性而无其它副作用的,与无机酸或有机酸所形成的盐。无机酸盐包括但不限于盐酸盐、氢溴酸盐、硫酸 盐、硝酸盐、磷酸盐等;有机酸盐包括但不限于甲酸盐、乙酸盐、2,2-二氯乙酸盐、 三氟乙酸盐、丙酸盐、己酸盐、辛酸盐、癸酸盐、十一碳烯酸盐、乙醇酸盐、葡糖酸 盐、乳酸盐、癸二酸盐、己二酸盐、戊二酸盐、丙二酸盐、草酸盐、马来酸盐、琥珀 酸盐、富马酸盐、酒石酸盐、柠檬酸盐、棕榈酸盐、硬脂酸盐、油酸盐、肉桂酸盐、 月桂酸盐、苹果酸盐、谷氨酸盐、焦谷氨酸盐、天冬氨酸盐、苯甲酸盐、甲磺酸盐、 苯磺酸盐、对甲苯磺酸盐、海藻酸盐、抗坏血酸盐、水杨酸盐、4-氨基水杨酸盐、萘 二磺酸盐等。这些盐可通过本专业已知的方法制备。
“药学上可接受的碱加成盐”是指能够保持游离酸的生物有效性而无其它副作用的、与无机碱或有机碱所形成的盐。衍生自无机碱的盐包括但不限于钠盐、钾盐、锂 盐、铵盐、钙盐、镁盐、铁盐、锌盐、铜盐、锰盐、铝盐等。优选的无机盐为铵盐、 钠盐、钾盐、钙盐及镁盐。衍生自有机碱的盐包括但不限于以下的盐:伯胺类、仲胺 类及叔胺类,被取代的胺类,包括天然的被取代胺类、环状胺类及碱性离子交换树脂, 例如氨、异丙胺、三甲胺、二乙胺、三乙胺、三丙胺、乙醇胺、二乙醇胺、三乙醇胺、 二甲基乙醇胺、2-二甲氨基乙醇、2-二乙氨基乙醇、二环己胺、赖氨酸、精氨酸、组 氨酸、咖啡因、普鲁卡因、胆碱、甜菜碱、乙二胺、葡萄糖胺、甲基葡萄糖胺、可可 碱、嘌呤、哌嗪、哌啶、N-乙基哌啶、聚胺树脂等。优选的有机碱包括异丙胺、二乙 胺、乙醇胺、三甲胺、二环己基胺、胆碱及咖啡因。这些盐可通过本专业已知的方法 制备。
“多晶型物”是指本发明的某些化合物在固体状态下由于存在两种或两种以上不同分子排列而产生的不同固体结晶相。本发明的某些化合物可以存在多于一种晶型, 本发明旨在包括各种晶型及其混合物。
通常,结晶化作用会产生本发明化合物的溶剂化物。本发明中使用的术语“溶剂化物”是指包含一个或多个本发明化合物分子与一个或多个溶剂分子的聚集体。溶剂 可以是水,该情况下的溶剂化物为水合物。或者,溶剂可以是有机溶剂。因此,本发 明的化合物可以以水合物存在,包括单水合物、二水合物、半水合物、倍半水合物、 三水合物、四水合物等,以及相应的溶剂化形式。本发明化合物可形成真实的溶剂化 物,但在某些情况下,也可以仅保留不定的水或者水加上部分不定溶剂的混合物。本 发明的化合物可以在溶剂中反应或者从溶剂中沉淀析出或结晶出来。本发明化合物的 溶剂化物也包含在本发明的范围之内。
本发明还包括上述化合物的前药。在本申请中,术语“前药”表示可在生理学条件下或通过溶剂分解而被转化成本发明的生物活性化合物的化合物。因此,术语“前药” 是指本发明的化合物的药学上可接受的代谢前体。当被给予有需要的个体时,前药可 以不具有活性,但在体内被转化成本发明的活性化合物。前药通常在体内迅速转化, 而产生本发明的母体化合物,例如通过在血液中水解来实现。前药化合物通常在哺乳 动物生物体内提供溶解度、组织相容性或缓释的优点。前药包括已知的氨基保护基和 羧基保护基。具体的前药制备方法可参照Saulnier,M.G.,et al.,Bioorg.Med.Chem. Lett.1994,4,1985-1990;Greenwald,R.B.,et al.,J.Med.Chem.2000,43,475。
在本申请中,“药物组合物”是指本发明化合物与本领域通常接受的用于将生物活性化合物输送至哺乳动物(例如人)的介质的制剂。该介质包括药学上可接受的载体。 药物组合物的目的是促进生物体的给药,利于活性成分的吸收进而发挥生物活性。
本文所用术语“药学上可接受的”是指不影响本发明化合物的生物活性或性质的物质(如载体或稀释剂),并且相对无毒,即该物质可施用于个体而不造成不良的生 物反应或以不良方式与组合物中包含的任意组分相互作用。
在本申请中,“药学上可接受的载体”包括但不限于任何被相关的政府管理部门许可为可接受供人类或家畜使用的佐剂、载体、赋形剂、助流剂、增甜剂、稀释剂、防 腐剂、染料/着色剂、矫味剂、表面活性剂、润湿剂、分散剂、助悬剂、稳定剂、等渗 剂、溶剂或乳化剂。
本发明所述“肿瘤”,“细胞增殖异常相关疾病”等包括但不限于白血病、胃肠间质瘤、组织细胞性淋巴瘤、非小细胞肺癌、小细胞肺癌、胰腺癌、肺鳞癌、肺腺癌、乳 腺癌、***癌、肝癌、皮肤癌、上皮细胞癌、***、卵巢癌、肠癌、鼻咽癌、脑 癌、骨癌、食道癌、黑色素瘤、肾癌、口腔癌等疾病。
本文所用术语“预防的”、“预防”和“防止”包括使病患减少疾病或病症的发生或恶化的可能性。
本文所用的术语“治疗”和其它类似的同义词包括以下含义:
(i)预防疾病或病症在哺乳动物中出现,特别是当这类哺乳动物易患有该疾病或病症,但尚未被诊断为已患有该疾病或病症时;
(ii)抑制疾病或病症,即遏制其发展;
(iii)缓解疾病或病症,即,使该疾病或病症的状态消退;或者
(iv)减轻该疾病或病症所造成的症状。
本文所使用术语“有效量”、“治疗有效量”或“药学有效量”是指服用后足以在某种程度上缓解所治疗的疾病或病症的一个或多个症状的至少一种药剂或化合物的量。其 结果可以为迹象、症状或病因的消减和/或缓解,或生物***的任何其它所需变化。例 如,用于治疗的“有效量”是在临床上提供显著的病症缓解效果所需的包含本文公开化 合物的组合物的量。可使用诸如剂量递增试验的技术测定适合于任意个体病例中的有 效量。
本文所用术语“服用”、“施用”、“给药”等是指能够将化合物或组合物递送到进行生物作用的所需位点的方法。这些方法包括但不限于口服途径、经十二指肠途径、胃 肠外注射(包括静脉内、皮下、腹膜内、肌内、动脉内注射或输注)、局部给药和经 直肠给药。本领域技术人员熟知可用于本文所述化合物和方法的施用技术,例如在 Goodman and Gilman,The Pharmacological Basis of Therapeutics,current ed.;Pergamon; andRemington's,Pharmaceutical Sciences(current edition),Mack Publishing Co.,Easton, Pa中讨论的那些。在优选的实施方案中,本文讨论的化合物和组合物通过口服施用。
本文所使用术语“药物组合”、“药物联用”、“联合用药”、“施用其它治疗”、“施用其它治疗剂”等是指通过混合或组合不止一种活性成分而获得的药物治疗,其包括活 性成分的固定和不固定组合。术语“固定组合”是指以单个实体或单个剂型的形式向患 者同时施用至少一种本文所述的化合物和至少一种协同药剂。术语“不固定组合”是指 以单独实体的形式向患者同时施用、合用或以可变的间隔时间顺次施用至少一种本文 所述的化合物和至少一种协同制剂。这些也应用到鸡尾酒疗法中,例如施用三种或更 多种活性成分。
本领域技术人员还应当理解,在下文所述的方法中,中间体化合物官能团可能 需要由适当的保护基保护。这样的官能团包括羟基、氨基、巯基及羧酸。合适的羟 基保护基包括三烷基甲硅烷基或二芳基烷基甲硅烷基(例如叔丁基二甲基甲硅烷 基、叔丁基二苯基甲硅烷基或三甲基甲硅烷基)、四氢吡喃基、苄基等。合适的氨 基、脒基及胍基的保护基包括叔丁氧羰基、苄氧羰基等。合适的巯基保护基包括- C(O)-R”(其中R”为烷基、芳基或芳烷基)、对甲氧基苄基、三苯甲基等。合适的 羧基保护基包括烷基、芳基或芳烷基酯类。
保护基可根据本领域技术人员已知的和如本文所述的标准技术来引入和除去。保护基的使用详述于Greene,T.W.与P.G.M.Wuts,Protective Groups in OrganicSynthesis,(1999),4th Ed.,Wiley中。保护基还可为聚合物树脂。
本发明具有以下主要优点:
(1)所述化合物对KRASG12C具有很好的选择性抑制作用;
(2)所述化合物具有更好的药效学、药代动力学性能和更低的毒副作用。
下面结合具体实施例、进一步阐述本发明。应理解、这些实施例仅用于说明本发明而不用于限制本发明的范围。下列实施例中未注明具体条件的实验方法、通常按照 常规条件、或按照制造厂商所建议的条件。除非另外说明、否则百分比和份数是重量 百分比和重量份数。
中间体制备方法一:哌啶并环类化合物的合成
中间体1A:7-苄基-2,4-二氯-5,6,7,8-四氢-1,7-萘啶
Figure BDA0002733786720000181
第一步:将1-苄基-3-氧代哌啶-4-羧酸乙酯盐酸盐(40.0g,134.7mmol)溶于乙 醇(EtOH)(600mL),加入醋酸铵(NH4OAc)(103.4g,1.34mol),室温反应 3小时,LC-MS检测显示反应完全。加入1M氢氧化钠(NaOH)水溶液,调至pH =9,滤出固体,水相用二氯甲烷(DCM)萃取后浓缩,合并柱层析纯化得到5-氨基 -1-苄基-1,2,3,6-四氢吡啶-4-羧酸乙酯(29.2g,白色固体)。LC-MS:ESI[M+H]+= 261.4。
第二步:将钠(Na)粒(3.2g,139.1mmol)分批慢慢加入EtOH(250mL),室 温搅拌至Na粒完全消失,加入5-氨基-1-苄基-1,2,3,6-四氢吡啶-4-羧酸乙酯(18.0g, 69.2mmol)和丙二酸二乙酯(22.2g,138.8mmol),闷罐加热至120度反应四天。冷 却后过滤,滤饼EtOH打浆纯化得到7-苄基-2,4-二羟基-5,6,7,8-四氢-1,7-萘啶-3-羧酸 乙酯(22.3g,黄色固体)。LC-MS:ESI[M+H]+=329.4。
第三步:将7-苄基-2,4-二羟基-5,6,7,8-四氢-1,7-萘啶-3-羧酸乙酯(22.3g,68.0 mmol)加入到3M的HCl水溶液(200mL),100度反应16小时。减压浓缩得到7- 苄基-5,6,7,8-四氢-1,7-萘啶-2,4-二酚盐酸盐(17.5g,黄色固体),直接用于下步反应。LC-MS:ESI[M+H]+=256.9。
第四步:将7-苄基-5,6,7,8-四氢-1,7-萘啶-2,4-二酚盐酸盐(2.0g,6.8mmol)溶于 三氯氧磷(POCl3)(20mL),滴加N,N-二甲基甲酰胺(DMF)(2滴),80度搅 拌2小时。减压浓缩,残留物溶于乙酸乙酯中,依次用饱和碳酸氢钠(NaHCO3)水 溶液和水洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,柱层析纯化得到中间体1A(白色固体)。LC- MS:ESI[M+H]+=293.1/295.1;1H-NMR(DMSO_d6,400MHz):7.60(s,1H),7.26-7.34(m, 5H),3.68(s,2H),3.54(s,2H),2.74(s,4H)。
中间体1B:1-(2,4-二氯-3-硝基-5,8-二氢-1,7-萘啶-7(6H)-基)-2,2,2-三氟乙基-1-酮
Figure BDA0002733786720000191
第一步:将7-苄基-5,6,7,8-四氢-1,7-萘啶-2,4-二酚盐酸盐(4.0g,13.7mmol)溶于MeOH(100mL),加入10%Pd/C(400mg),室温反应2天,LCMS检测显示 反应完全。过滤,滤液减压浓缩得到5,6,7,8-四氢-1,7-萘啶-2,4-二酚盐酸盐(2.8g,白 色固体),直接用于下步反应。LC-MS:ESI[M+H]+=167.1。
第二步:将5,6,7,8-四氢-1,7-萘啶-2,4-二酚盐酸盐(7.9g,39.1mmol),三氟乙酸酐(8.2g,39.1mmol)和三乙胺(TEA)(11.8g,117.3mmol)溶于DCM(80mL), 室温搅拌过夜。减压浓缩,剩余物柱层析纯化得到1-(2,4-二羟基-5,8-二氢-1,7-萘啶- 7(6H)-基)-2,2,2-三氟乙基-1-酮(3.0g,白色固体)。LC-MS:ESI[M+H]+=263.0;1H- NMR(DMSO_d6,400MHz):10.93(brs,2H),5.51(s,1H),4.45(s,2H),3.73-3.80(m,2H), 2.41-2.51(m,2H)。
第三步:将1-(2,4-二羟基-5,8-二氢-1,7-萘啶-7(6H)-基)-2,2,2-三氟乙基-1-酮(2.1 g,8.0mmol)溶于浓硫酸(60mL),0度下滴加70%硝酸(HNO3)(6mL),室温 反应1小时。倒入冰水混合物中,滤出黄色固体,水相用DCM萃取后浓缩,合并后 用水打浆纯化得到1-(2,4-二羟基-3-硝基-5,8-二氢-1,7-萘啶-7(6H)-基)-2,2,2-三氟乙基- 1-酮(1.6g,黄色固体)。LC-MS:ESI[M+H]+=308.0;1H-NMR(DMSO_d6,400MHz): 12.01(brs,2H),4.48-4.57(m,2H),3.76-3.82(m,2H),2.50-2.57(m,2H)。
第四步:将1-(2,4-二羟基-3-硝基-5,8-二氢-1,7-萘啶-7(6H)-基)-2,2,2-三氟乙基-1- 酮(690mg,2.25mmol)溶于POCl3(10mL)中,滴加DMF(2滴),80度搅拌3 小时。减压浓缩,残留物溶于乙酸乙酯中,依次用饱和NaHCO3水溶液和水洗涤,无 水硫酸钠干燥,浓缩,柱层析纯化得到目标化合物1B(黄色固体)。LC-MS:ESI[M+H]+=344.2/346.2;1H-NMR(DMSO_d6,400MHz):4.84-4.86(m,2H),3.94(brs,2H),2.95- 3.01(m,2H)。
中间体1C:1-(2,4-二氯-3-硝基-5,8-二氢-1,7-萘啶-7(6H)-基)-2,2,2-三氟乙基-1-酮
Figure BDA0002733786720000201
第一步:将7-苄基-2,4-二羟基-5,6,7,8-四氢-1,7-萘啶-3-羧酸乙酯(2.0g,6.1mmol) 溶于乙醇/浓氨水(20mL,1/1)的混合溶剂中,置于闷罐中,加热至100度搅拌6小时。反应完毕,反应液减压浓缩得到7-苄基-2,4-二羟基-5,6,7,8-四氢-1,7-萘啶-3-酰胺(白色固体),直接用于下步反应。LC-MS:ESI[M+H]+=167.1。
第二步:将7-苄基-2,4-二羟基-5,6,7,8-四氢-1,7-萘啶-3-酰胺(2.0g,crude)溶于 POCl3(20mL)中,滴加DMF(2滴),80度搅拌6小时。减压浓缩,残留物溶于 乙酸乙酯中,依次用饱和NaHCO3水溶液和水洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,柱层析 纯化得到中间体1C(白色固体)。LC-MS:ESI[M+H]+=318.1/320.1。
中间体制备方法二:哌嗪类化合物的合成
参照专利WO2019110751A1和US20190062330A1的合成路线和方法,制备得到 哌嗪类中间体化合物2A-2D
Figure BDA0002733786720000202
实施例通用制备方法一
Figure BDA0002733786720000203
第一步:将哌啶二氯嘧啶类中间体(1eq.)溶于无水四氢呋喃中,冰浴冷却下 依次加入N,N-二异丙基乙胺(DIPEA)(1.6eq.)和哌嗪类中间体(1.5eq.),加毕反应 液室温搅拌至TLC监测反应完全。反应液加入水和二氯甲烷分相,水相用二氯甲烷 萃取三次,萃取液无水硫酸钠干燥,减压浓缩,剩余物用硅胶柱层析分离纯化得到 目标产物,采用核磁和质谱确认结构。
第二步:将上述第一步产物(1eq.)溶于二氯甲烷中,加入三氟乙酸(3 eq.),氮气保护下搅拌至TLC监测反应完全。减压浓缩得到粗品直接用于下一步反 应,采用质谱确认结构。
第三步:将上述第二步产物(1eq.)、芳基卤代物或者芳基磺酸酯(1eq.)、1,1'-联萘-2,2'-双二苯膦(BINAP)(0.2eq.)和叔丁醇钠(3eq.)溶于甲苯中,混合物用氩气鼓泡 五分钟后,快速加入三(二亚苄基丙酮)二钯(Pd2(dba)3)(0.1eq.),氩气保护下加热至100 度搅拌过夜。反应液冷却至室温,硅藻土过滤,乙酸乙酯洗涤,滤液减压浓缩,剩余 物用硅胶柱层析分离纯化得到目标产物,采用核磁和质谱确认结构。
第四步:将上述第三步产物(1eq.)溶于四氢呋喃中,分别加入胺的四氢呋喃溶 液或者水合肼(10eq.),室温至加热回流条件下搅拌至反应结束。冷却至室温,析 出固体,过滤,洗涤干燥,得到目标化合物,并经核磁和质谱确定结构。
第五步:将上述第四步产物,参照文献 (WO201383604/WO201276430/WO200626703)方法进行官能团转化,得到稠环嘧啶 并咪唑或嘧啶并三氮唑中间体,并经核磁和质谱确定结构。
第六步:将上述第五步产物(1eq.)溶于甲醇中,氮气保护下快速加入催化量的10%Pd/C,在氢气压力下室温反应6小时。反应液硅藻土过滤,乙酸乙酯洗涤,滤 液减压浓缩,剩余物用硅胶柱层析分离纯化得到目标产物,采用核磁和质谱确认结 构。
第七步:将上述第六步产物(1eq.)溶于二氯甲烷中,0度下依次加入DIPEA (2eq.)和丙烯酰氯(1eq.),搅拌0.5小时,反应液用饱和氯化铵溶液和饱和食 盐水洗涤,无水硫酸钠干燥,过滤,减压浓缩,剩余物用硅胶柱层析分离纯化得到 目标化合物,采用核磁和质谱确认结构。
实施例通用制备方法二
Figure BDA0002733786720000221
第一步:将哌啶二氯吡啶类中间体(1eq.)溶于无水四氢呋喃中,冰浴冷却下 依次加入DIPEA(1.6eq.)和哌嗪类中间体(1.5eq.),加毕反应液60度搅拌至TLC 监测反应完全。反应液加入水和二氯甲烷分相,水相用二氯甲烷萃取三次,萃取液 无水硫酸钠干燥,减压浓缩,剩余物用硅胶柱层析分离纯化得到目标产物,采用核 磁和质谱确认结构。
第二步:将上述第一步产物(1eq.)溶于二氯甲烷中,加入α-氯-氯甲酸乙酯(2eq.),氮气保护下室温搅拌2小时,加入甲醇,60度搅拌至TLC监测反应完 全。减压浓缩,加入饱和碳酸氢钠溶液和二氯甲烷分相,水相用二氯甲烷萃取三 次,萃取液无水硫酸钠干燥,减压浓缩,得到粗品直接用于下一步反应,采用质谱 确认结构。
第三步:将上述第二步产物(1eq.)、芳基卤代物或者芳基磺酸酯(1eq.)、BINAP(0.2 eq.)和叔丁醇钠(3eq.)溶于甲苯中,混合物用氩气鼓泡五分钟后,快速加入Pd2(dba)3(0.1eq.),氩气保护下加热至100度搅拌过夜。反应液冷却至室温,硅藻土过滤,乙 酸乙酯洗涤,滤液减压浓缩,剩余物用硅胶柱层析分离纯化得到目标产物,采用核磁 和质谱确认结构。
第四步:将上述第三步产物(1eq.)溶于四氢呋喃中,分别加入胺的四氢呋喃溶 液或者水合肼(10eq.),室温至加热回流条件下搅拌至反应结束。冷却至室温,析 出固体,过滤,洗涤干燥,得到目标化合物,并经核磁和质谱确定结构。
第五步:将上述第四步产物,参照文献 (WO201383604/WO201276430/WO200626703)方法进行官能团转化,得到稠环嘧啶 并咪唑或嘧啶并三氮唑中间体,并经核磁和质谱确定结构。
第六步:将上述第五步产物(1eq.)溶于甲醇中,氮气保护下快速加入催化量的10%Pd/C,在氢气压力下室温反应6小时。反应液硅藻土过滤,乙酸乙酯洗涤,滤 液减压浓缩,剩余物用硅胶柱层析分离纯化得到目标产物,采用核磁和质谱确认结 构。
第七步:将上述第六步产物(1eq.)溶于二氯甲烷中,0度下依次加入DIPEA (2eq.)和丙烯酰氯(1eq.),搅拌0.5小时,反应液用饱和氯化铵溶液和饱和食 盐水洗涤,无水硫酸钠干燥,过滤,减压浓缩,剩余物用硅胶柱层析分离纯化得到 目标化合物,采用核磁和质谱确认结构。
实施例通用制备方法三
Figure BDA0002733786720000231
第一步:将哌啶二氯吡啶类中间体(1eq.)溶于无水四氢呋喃中,冰浴冷却下 依次加入DIPEA(1.6eq.)和哌嗪类中间体(1.5eq.),加毕反应液60度搅拌至TLC 监测反应完全。反应液加入水和二氯甲烷分相,水相用二氯甲烷萃取三次,萃取液 无水硫酸钠干燥,减压浓缩,剩余物用硅胶柱层析分离纯化得到目标产物,采用核 磁和质谱确认结构。
第二步:将上述第一步产物(1eq.)溶于N-甲基吡咯烷酮(NMP)中,加入双三 甲基硅基胺基锂(LHMDS)(3eq.),氮气保护下加热至100度搅拌8小时。TLC监 测反应完全,冷却至室温,倒入饱和氯化铵水溶液中,有固体析出,过滤,滤饼真 空干燥得到目标产物,采用核磁和质谱确认结构。
第三步:将上述第二步产物(1eq.)、芳基卤代物或者芳基磺酸酯(1eq.)、BINAP(0.2 eq.)和叔丁醇钠(3eq.)溶于甲苯中,混合物用氩气鼓泡五分钟后,快速加入Pd2(dba)3(0.1eq.),氩气保护下加热至100度搅拌过夜。反应液冷却至室温,硅藻土过滤,乙 酸乙酯洗涤,滤液减压浓缩,剩余物用硅胶柱层析分离纯化得到目标产物,采用核磁 和质谱确认结构。
第四步:将上述第三步产物(1eq.)溶于四氢呋喃中,分别加入胺的四氢呋喃溶 液或者水合肼(10eq.),室温至加热回流条件下搅拌至反应结束。冷却至室温,析 出固体,过滤,洗涤干燥,得到目标化合物,并经核磁和质谱确定结构。
第五步:将上述第四步产物,参照文献(WO201383604/WO201276430/WO200626703)方法进行官能团转化,得到稠环嘧啶 并咪唑或嘧啶并三氮唑中间体,并经核磁和质谱确定结构。
第六步:将上述第五步产物(1eq.)溶于二氯甲烷中,氮气保护下加入三氟乙 酸,在室温反应2小时。反应液减压浓缩得到粗品直接用于下一步反应,采用质谱 确认结构。
第七步:将上述第六步产物(1eq.)溶于二氯甲烷中,0度下依次加入DIPEA (2eq.)和丙烯酰氯(1eq.),搅拌0.5小时,反应液用饱和氯化铵溶液和饱和食 盐水洗涤,无水硫酸钠干燥,过滤,减压浓缩,剩余物用硅胶柱层析分离纯化得到 目标化合物,采用核磁和质谱确认结构。
实施例通用制备方法四
Figure BDA0002733786720000241
第一步:将哌啶二氯吡啶类中间体(1eq.)溶于无水四氢呋喃中,冰浴冷却下 依次加入DIPEA(1.6eq.)和哌嗪类中间体(1.5eq.),加毕反应液60度搅拌至TLC 监测反应完全。反应液加入水和二氯甲烷分相,水相用二氯甲烷萃取三次,萃取液 无水硫酸钠干燥,减压浓缩,剩余物用硅胶柱层析分离纯化得到目标产物,采用核 磁和质谱确认结构。
第二步:将上述第一步产物(1eq.)溶于无水冰醋酸中,慢慢加入还原铁粉(3eq.),氮气保护下加热至80度搅拌0.5小时。反应完毕,硅藻土过滤,乙酸乙酯洗涤,滤液 浓缩。剩余物用二氯甲烷稀释,依次用饱和碳酸氢钠溶液和饱和食盐水洗涤,无水硫 酸钠干燥,过滤,减压浓缩,剩余物用硅胶柱层析分离纯化得到目标产物,采用核磁 和质谱确认结构。
第三步:将上述第二步产物(1eq.)溶于乙腈中,加入碳酸钾(1.5eq.)和碘甲烷(1.1eq.),室温下反应过夜。反应完毕,反应液减压浓缩,剩余物加入0.5N氢氧化 钠,搅拌0.5小时,二氯甲烷萃取,无水硫酸钠干燥,过滤,减压浓缩得到粗品直接 用于下一步反应,采用核磁和质谱确认结构。
第四步:将上述第三步产物(1eq.)、芳基卤代物或者芳基磺酸酯(1eq.)、BINAP(0.2 eq.)和叔丁醇钠(3eq.)溶于甲苯中,混合物用氩气鼓泡五分钟后,快速加入Pd2(dba)3(0.1eq.),氩气保护下加热至100度搅拌过夜。反应液冷却至室温,硅藻土过滤,乙 酸乙酯洗涤,滤液减压浓缩,剩余物用硅胶柱层析分离纯化得到目标产物,采用核磁 和质谱确认结构。
第五步:将上述第四步产物(1eq.)溶于四氢呋喃中,分别加入胺的四氢呋喃溶 液或者水合肼(10eq.),室温至加热回流条件下搅拌至反应结束。冷却至室温,析 出固体,过滤,洗涤干燥,得到目标化合物,并经核磁和质谱确定结构。
第六步:将上述第五步产物,参照文献 (WO201383604/WO201276430/WO200626703)方法进行官能团转化,得到稠环嘧啶 并咪唑或嘧啶并三氮唑中间体,并经核磁和质谱确定结构。
第七步:将上述第六步产物(1eq.)溶于二氯甲烷中,氮气保护下加入三氟乙 酸,在室温反应2小时。反应液减压浓缩得到粗品直接用于下一步反应,采用质谱 确认结构。
第八步:将上述第七步产物(1eq.)溶于二氯甲烷中,0度下依次加入DIPEA (2eq.)和丙烯酰氯(1eq.),搅拌0.5小时,反应液用饱和氯化铵溶液和饱和食 盐水洗涤,无水硫酸钠干燥,过滤,减压浓缩,剩余物用硅胶柱层析分离纯化得到 目标化合物,采用核磁和质谱确认结构。
实施例
实施例1:(S)-1-(4-(8-(5-甲基-1H-吲唑-4-基)-1-(1-甲基吡咯啉-2-基)- 6,7,8,9-四氢吡啶并[4,3-e][1,2,4]三氮唑并[4,3-a]嘧啶-5-基)哌嗪-1-基)丙-2- 烯-1-酮
Figure BDA0002733786720000261
第一步:将2,4-二氯-5,8-二氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-7(6H)-羧酸叔丁酯(10.4g,34.3 mmol)和哌嗪-1-羧酸苄酯(7.5g,34.1mmol)溶于1,4-二氧六环(200mL)中,加入DIPEA(13.2g,102mmol)。室温反应2天,减压浓缩,剩余物柱层析纯化得到4- (4-((苄氧基)羰基)哌嗪-1-基)-2-氯-5,8-二氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-7(6H)-羧酸叔丁酯(11g, 白色固体)。LC-MS:ESI[M+H]+=488.5;1HNMR(400MHz,DMSO-d6):δ7.33-7.39(m, 5H),5.11(s,2H),4.37(brs,2H),3.50(brs,10H),2.63-2.65(m,2H),1.44(s,9H)。
第二步:将4-(4-((苄氧基)羰基)哌嗪-1-基)-2-氯-5,8-二氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-7(6H)- 羧酸叔丁酯(5.2g,10.7mmol)溶于DMF(50mL),加入甲硫醇钠(1.49g,21.3mmol),氮气保护下室温搅拌过夜。反应液倒入200mL饱和NH4Cl水溶液中,乙酸 乙酯(100mLx 2)萃取两次,有机相用无水硫酸镁(MgSO4)干燥30分钟,过滤, 浓缩,柱层析纯化得到4-(4-((苄氧基)羰基)哌嗪-1-基)-2-甲硫基-5,8-二氢吡啶并[3,4-d] 嘧啶-7(6H)-羧酸叔丁酯(4.5g,白色固体)。LC-MS:ESI[M+H]+=500.6。
第三步:将4-(4-((苄氧基)羰基)哌嗪-1-基)-2-甲硫基-5,8-二氢吡啶并[3,4-d]嘧啶- 7(6H)-羧酸叔丁酯(4.5g,9.02mmol)溶于二氯甲烷(20mL),加入三氟乙酸(7 mL),室温下搅拌过夜。浓缩,残留物溶于DCM(100mL)中,用50mL饱和NaHCO3水溶液洗涤两次,有机相MgSO4干燥,柱层析纯化得到4-(2-(甲硫基)-5,6,7,8-四氢吡 啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-羧酸苄酯(3.1g,白色固体)。LC-MS:ESI[M+H]+=400.5。
第四步:将4-(2-(甲硫基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-羧酸苄酯 (3.65g,9.15mmol)和4-溴-5-甲基-1-((2-(三甲基硅基)乙氧基)甲基)-1H-吲唑(4.68 g,13.8mmol)溶于1,4-二氧六环(50mL)中,氩气保护下,分别加入碳酸铯(Cs2CO3)(7.45g,22.9mmol)、2-二环己基磷-2',6'-二异丙氧基-1,1'-联苯(Ru-phos)(857mg,1.84mmol)和Pd-Ruphos-G3(382mg,0.46mmol),加完后氩气置换三次,加热至 90度反应过夜,LC-MS显示反应未完全。冷却至室温,补加Pd-Ruphos-G3(382mg, 0.46mmol),氩气置换三次,升温至110度反应24小时。冷却至室温,减压浓缩, 柱层析纯化得到4-(7-(5-甲基-1-((2-(三甲基硅基)乙氧基)甲基)-1H-吲唑-4-基)-2-(甲硫 基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-羧酸苄酯(3.89g,白色固体)。LC- MS:ESI[M+H]+=660.8;1H NMR(400MHz,CDCl3):δ8.00(s,1H),7.34-7.38(m,5H), 7.26-7.28(m,2H),5.69(s,2H),5.17(s,2H),4.31(s,2H),3.63-3.65(m,4H),3.49-3.56(m, 8H),2.73-2.75(m,2H),2.51(s,3H),2.42(s,3H),0.86-0.91(m,2H),-0.07(s,9H)。
第五步:将4-(7-(5-甲基-1-((2-(三甲基硅基)乙氧基)甲基)-1H-吲唑-4-基)-2-(甲硫 基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-羧酸苄酯(1.5g,2.28mmol)溶于二 氯甲烷(20mL),加入间氯过氧苯甲酸(m-CPBA)(85%纯度,0.98g,4.84mmol), 室温下搅拌过夜。加入40mL饱和连二亚硫酸钠(Na2S2O4)水溶液,搅拌1小时, 用DCM(40mL)萃取两次,有机相用50mL饱和NaHCO3水溶液洗两次,MgSO4干 燥,过滤,浓缩得到4-(7-(5-甲基-1-((2-(三甲基硅基)乙氧基)甲基)-1H吲唑-4-基)-2-(甲 亚砜基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-羧酸苄酯(1.3g,深红色固体), 直接用于下步反应。LC-MS:ESI[M+H]+=676.3。
第六步:将4-(7-(5-甲基-1-((2-(三甲基硅基)乙氧基)甲基)-1H-吲唑-4-基)-2-(甲亚 砜基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-羧酸苄酯(1.3g,1.9mmol)溶于乙 醇(20mL)中,加入80%水合肼(5mL),加热至90度搅拌过夜。减压蒸去乙醇, 水相用乙酸乙酯(50mL)萃取两次,有机相用饱和食盐水(50mL)洗涤两次,MgSO4 干燥,过滤,浓缩得到粗品4-(2-肼基-7-(5-甲基-1-((2-(三甲基硅基)乙氧基)甲基)-1H- 吲唑-4-基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-羧酸苄酯(0.95g,深红色固体)。 LC-MS:ESI[M+H]+=644.8;1H NMR(400MHz,CDCl3):δ8.08(s,1H),7.33-7.47(m,7H), 6.00(s,1H),5.76(s,2H),5.24(s,2H),4.32(s,2H),3.96(brs,2H),3.49-3.71(m,12H), 2.77(t,J=4.8MHz,2H),2.50(s,3H),0.93-0.98(m,2H),-0.07(s,9H)。
第七步:将4-(2-肼基-7-(5-甲基-1-((2-(三甲基硅基)乙氧基)甲基)-1H-吲唑-4-基)- 5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-羧酸苄酯(0.95g,1.5mmol)和甲基-L-脯 氨酸(232mg,1.8mmol)溶于二氯甲烷(20mL)中,加入三乙胺(TEA)(303mg,3.0mmol)、2-氯-1-甲基吡啶碘化物(CMPI)(586mg,2.3mmol)和4-二甲氨基吡 啶(DMAP)(37mg,0.3mmol),室温搅拌过夜。反应液倒入饱和氯化铵水溶液中, 水相用二氯甲烷萃取三次,合并有机相,无水MgSO4干燥,过滤,浓缩,柱层析纯 化得到4-(7-(5-甲基-1-((2-(三甲基硅基)乙氧基)甲基)-1H-吲唑-4-基)-2-(2-(甲基-L-脯 氨酸基)肼基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-羧酸苄酯(0.6g,黄色固体)。 LC-MS:ESI[M+H]+=755.8;1H NMR(400MHz,CDCl3):δ9.13(brs,1H),8.09(s,1H), 7.33-7.45(m,7H),6.74(brs,1H),5.76(s,2H),5.23(s,2H),4.21(s,2H),3.48-3.68(m, 12H),3.06-3.20(m,2H),2.77(brs,2H),2.53(s,3H),2.48(s,3H),2.26-2.44(m,2H),1.83- 2.05(m,3H),0.93-0.98(m,2H),-0.07(s,9H)。
第八步:将4-(7-(5-甲基-1-((2-(三甲基硅基)乙氧基)甲基)-1H-吲唑-4-基)-2-(2-(甲 基-L-脯氨酸基)肼基)-5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-羧酸苄酯(0.6g,0.79 mmol)、三苯基膦(PPh3)(407mg,1.59mmol)和TEA(313mg,3.1mmol)溶于 四氢呋喃(20mL)中,加入六氯乙烷(372mg,1.59mmol),回流搅拌过夜。冷却 至室温,反应液减压浓缩,剩余物柱层析纯化得到(S)-4-(8-(5-甲基-1-((2-(三甲基硅基) 乙氧基)甲基)-1H-吲唑-4-基)-1-(1-甲基吡咯啉-2-基)-6,7,8,9-四氢吡啶并[4,3-e][1,2,4] 三氮唑[4,3-a]嘧啶-5-基)哌嗪-1-羧酸苄酯(0.29g,黄色固体)。LC-MS:ESI[M+H]+= 737.8。
第九步:将(S)-4-(8-(5-甲基-1-((2-(三甲基硅基)乙氧基)甲基)-1H-吲唑-4-基)-1-(1- 甲基吡咯啉-2-基)-6,7,8,9-四氢吡啶并[4,3-e][1,2,4]三氮唑[4,3-a]嘧啶-5-基)哌嗪-1-羧 酸苄酯(0.29g,0.39mmol)溶于6N盐酸(10mL)中,升温至60度搅拌过夜。冷却至室温,反应液倒入饱和NaHCO3水溶液中,水相用二氯甲烷萃取三次,合并有机 相,无水MgSO4干燥,过滤,浓缩得到(S)-8-(5-甲基-1H-吲唑-4-基)-1-(1-甲基吡咯啉 -2-基)-5-(哌嗪-1-基)-6,7,8,9-四氢吡啶并[4,3-e][1,2,4]三氮唑[4,3-a]嘧啶(70mg,黄色固体)。LC-MS:ESI[M+H]+=473.8。
第十步:将(S)-8-(5-甲基-1H-吲唑-4-基)-1-(1-甲基吡咯啉-2-基)-5-(哌嗪-1-基)- 6,7,8,9-四氢吡啶并[4,3-e][1,2,4]三氮唑[4,3-a]嘧啶(50mg,0.11mmol)溶于二氯甲烷 (10mL)中,0度下依次加入DIPEA(42mg,0.33mmol)和丙烯酰氯(10mg,0.11 mmol),室温搅拌2小时。反应液用饱和氯化铵溶液和饱和食盐水洗涤,无水硫酸钠 干燥,过滤,减压浓缩,剩余物制备色谱纯化得到目标化合物(黄色固体,2.3mg)。LC- MS:ESI[M+H]+=527.8。
实施例2:1-(4-(8-(5-甲基-1H-吲唑-4-基)-6,7,8,9-四氢吡啶并[4,3-e][1,2,4] 三氮唑并[4,3-a]嘧啶-5-基)哌嗪-1-基)丙-2-烯-1-酮
Figure BDA0002733786720000281
第一步:将4-(2-肼基-7-(5-甲基-1-((2-(三甲基硅基)乙氧基)甲基)-1H-吲唑-4-基)- 5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-d]嘧啶-4-基)哌嗪-1-羧酸苄酯(0.5g,0.79mmol)溶于二氯甲 烷(15mL)中,加入原甲酸三甲酯(340mg,3.2mmol),搅拌十分钟后,再加入三 氟乙酸(95mg,0.83mmol)。室温继续搅拌1小时后,减压浓缩,剩余物用硅胶柱 层析分离纯化得到4-(8-(5-甲基-1-((2-(三甲基硅基)乙氧基)甲基)-1H-吲唑-4-基)- 6,7,8,9-四氢吡啶并[4,3-e][1,2,4]三氮唑[4,3-a]嘧啶-5-基)哌嗪-1-羧酸苄酯(320mg,黄 色固体)。LC-MS:ESI[M+H]+=654.7;1H NMR(400MHz,DMSO_d6):δ9.04(s,1H), 8.38(s,1H),7.41-7.58(m,7H),5.79(s,2H),5.21(s,2H),4.64(s,2H),3.56-3.68(m,12H), 2.97(brs,2H),2.51(s,3H),0.90(t,J=8.0MHz,2H),-0.07(s,9H)。
第二步:将4-(8-(5-甲基-1-((2-(三甲基硅基)乙氧基)甲基)-1H-吲唑-4-基)-6,7,8,9- 四氢吡啶并[4,3-e][1,2,4]三氮唑[4,3-a]嘧啶-5-基)哌嗪-1-羧酸苄酯(320mg,0.49mmol) 溶于6N盐酸(15mL)中,升温至60度搅拌过夜。冷却至室温,反应液倒入饱和NaHCO3水溶液中,水相用二氯甲烷萃取三次,合并有机相,无水MgSO4干燥,过 滤,浓缩得到8-(5-甲基-1H-吲唑-4-基)-5-(哌嗪-1-基)-6,7,8,9-四氢吡啶并[4,3-e][1,2,4] 三氮唑[4,3-a]嘧啶(140mg,黄色固体)。LC-MS:ESI[M+H]+=390.2。
第三步:将8-(5-甲基-1H-吲唑-4-基)-5-(哌嗪-1-基)-6,7,8,9-四氢吡啶并[4,3-e][1,2,4] 三氮唑[4,3-a]嘧啶(70mg,0.18mmol)溶于二氯甲烷(10mL)中,0度下依次加入 DIPEA(70mg,0.54mmol)和丙烯酰氯(17mg,0.19mmol),室温搅拌2小时。 反应液用饱和氯化铵溶液和饱和食盐水洗涤,无水硫酸钠干燥,过滤,减压浓缩,剩 余物制备色谱纯化得到目标化合物(黄色固体,7.5mg)。LC-MS:ESI[M+H]+=444.3。
采用中间体1-2以及其它商品化的试剂为原料,分别采用实施例通用制备方法一到四的合成方法制备得到如下实施例化合物。
Figure BDA0002733786720000291
Figure BDA0002733786720000301
Figure BDA0002733786720000311
测试例1KrasG12C功能分析
采用CisBio的KRASG12C/SOS1试剂盒,利用Binding assay的方法测试化合物抑 制SOS1与KRASG12C之间的蛋白-蛋白相互作用的功效,结果以IC50值表示。
测试方法:(1)受试化合物测试浓度为1000nM,384孔板中稀释成200倍终浓度的100%DMSO溶液3倍稀释化合物,10个浓度。使用分液器Echo 550向目的板384well plate转移50nL 200倍终浓度的化合物。阴性对照孔和阳性对照孔中分别加50nL的 100%DMSO;(2)用Diluent buffer配制4倍终浓度的Tag1 SOS1溶液;(3)在384孔板中 加入2.5μL的4倍终浓度的Tag1 SOS1溶液;(4)用Diluent buffer配制4倍终浓度的 Tag2 KRASG12C溶液;(5)在化合物孔和阳性对照孔分别加2.5μL的4倍终浓度的Tag2 KRASG12C溶液;在阴性对照孔中加2.5μL的diluent buffer;(6)将384孔板1000rpm离 心30秒,振荡混匀后室温孵育15min;(7)用Detection buffer配制1倍终浓度的Anti Tag1 TB3+溶液和1倍终浓度的Anti Tag2XL665溶液,将两溶液混匀之后,每孔加5μL 的混合溶液;(8)将384孔板1000rpm离心30秒,振荡混匀后室温孵育120分钟;(9)用 Envision酶标仪读数Em665/620;(10)数据分析,计算公式
Figure BDA0002733786720000321
其中Min signal阴性对照孔均值Max signal阳性对照孔均 值。拟合量效曲线以浓度的log值作为X轴,百分比抑制率为Y轴,采用分析软件GraphPad Prism 5的log(inhibitor)vs.response Variable slope拟合量效曲线,从而得出各 个化合物对酶活性的IC50值。拟合公式为:Y=Bottom+(Top Bottom)/(1+10^((LogIC50X)* HillSlope))。
结果:本发明的大部分实施例化合物对KRasG12C-SOS1具有明显的抑制作用,抑制活性IC50小于5000nM,部分实施例化合物如实施例5、9、15的IC50值小于200nM。
测试例2本发明化合物对NCI-H358、MiaPaca-2细胞增殖和下游信号ERK磷酸 化能力的影响试验
测试例一(2D):分别将NCI-H358(肺癌)和MiaPaca-2细胞(胰腺癌)细胞(100μL/孔,20000个细胞/mL)接种在96孔培养板中,并补充有10%胎牛血清和1%青霉素/硫酸 链霉素。用0.5%二甲亚砜作为空白对照,用起始浓度为10μM,八梯度三倍稀释的待测 化合物溶液处理细胞,并在5%CO2培养箱中孵育一定的时间(7天)。在孵育结束时,向每 个孔中加入10μL的MTT储备溶液(5mg/mL)。将培养板在37℃下孵育4小时,然后去 除培养基。将二甲亚砜(100μL)加入每个孔中,然后充分摇动。在Thermo Scientific Varioskan Flash多模式阅读器上,在570nm处测量甲臜产物的吸光度。通过使用GraphPad Prism 6.0软件将剂量反应数据拟合到三参数非线性回归模型中获得IC50值。
结果:本发明提供的实施例化合物对NCI-H358和MiaPaca-2细胞的增值抑制活性,IC50值均小于5000nM,部分实施例化合物如5、11、13、15的细胞增殖抑制活性小于1000 nM。
测试例二(3D):将处于对数生长期的肿瘤细胞用培养液稀释至一定的浓度接种于超 低附着表面的96孔板,培养介质为80μL/孔。细胞在湿度室中以37℃孵育过夜。第二天板中加入系列稀释的受试化合物(10个浓度,3倍稀释),20μL/孔,培养箱孵育96h。取 出板放置室温后加入等体积的CellTiter
Figure BDA0002733786720000322
3D试剂孵育1h,En VisionTM读板器检测信 号。使用以下公式将信号转换为百分比抑制:%抑制=100-[(测试化合物信号-中位最小 信号)/(中位最大信号-中位最小信号)x 100]。最大信号是无抑制剂孔的信号值,最小信 号是含有足以完全抑制细胞增殖的参考抑制剂的孔的信号值,对化合物各个浓度的百分 比抑制率进行四参数非线性回归拟合曲线并计算IC50。本发明化合物的IC50值如表1所 示,其中,A<200nM,200nM≤B<1000,1000nM≤C<5000nM,
表1
化合物 NCI-H358细胞活性(nM) MiaPaca-2细胞活性(nM)
实施例1 C C
实施例2 C C
实施例3 B B
实施例4 B B
实施例5 A A
实施例6 C C
实施例7 C C
实施例8 B B
实施例9 B B
实施例10 C C
实施例11 A A
实施例12 B B
实施例13 A A
实施例14 B B
实施例15 A A
结果:本发明提供的实施例化合物对NCI-H358和MiaPaca-2细胞的增值抑制活性,IC50均小于5000nM,部分实施例如实施例5、11、13、15对NCI-H358和MiaPaca-2的 细胞增殖抑制活性IC50小于200nM。
测试例三(ERK磷酸化):将Miapaca-2或H358细胞按照一定的浓度接种于96孔板放置于37℃,5%CO2的细胞培养箱培养过夜,第二天板中加入系列稀释的受试化合物(5 个浓度,3倍稀释)作用24h(Miapaca-2)或3h(H358),然后加入含蛋白酶和磷酸酶抑制 剂的裂解液裂解细胞提取蛋白,western blot方法检测p-ERK的水平。
结果:本发明提供的实施例化合物对NCI-H358和MiaPaca-2的磷酸化ERK水平抑制作用明显,IC50小于500nM,如实施例5、11、13。
在本发明提及的所有文献都在本申请中引用作为参考,就如同每一篇文献被单独引 用作为参考那样。此外应理解,在阅读了本发明的上述讲授内容之后,本领域技术人员可 以对本发明作各种改动或修改,这些等价形式同样落于本申请所附权利要求书所限定的 范围。

Claims (16)

1.一种如通式I所示的饱和六元环并杂环类化合物,或其药学上可接受的盐,
Figure FDA0003205537040000011
式中:
R1独立地选自氢、卤素;
R2、R3独立地为氢;
Ra、Rb、Rc、Rd、Re、Rf、Rg、Rh分别独立地选自氢、卤素、C1-C6烷基、卤代C1-C6烷基,其中,所述C1-C6烷基可以被氰基取代;
M独立地选自N或CR4,R4选自H、卤素、氰基、C1-C6烷基,或者Rg或Rh可以与R4基团形成5-8元饱和或部分不饱和环系;所述环上的一个或多个氢原子可以被选自下组的取代基取代:氘、卤素、羟基、C1-C8烷基、酰基;
M1独立地为N;
R5独立地选自氢、卤素,m独立地选自0-6的整数;
X、Y、Z独立地选自N或CR6,R6独立地选自H、卤素、C1-C6烷基、3-8元环烷基或杂环烷基、5-12元芳基或杂芳基;
Ar独立地选自取代或未取代的苯基和吡啶基,或者取代或未取代的萘基、萘啶基、吲唑基、苯并咪唑基;所述的取代是指被选自下组的一个或多个取代基取代:氢、卤素、C1-C4的烷基、羟基、氨基、氰基、C1-C4烷氧基、C1-C4卤代烷基、C1-C4卤代烷氧基。
2.如权利要求1所述的化合物,其为通式(IIA)、(IIB)、(IIC)所示的化合物,或其药学上可接受的盐:
Figure FDA0003205537040000012
其中,R1、R2、R3、R5、R6、Ra、Rb、Rc、Rd、Re、Rf、Rg、Rh、M、M1、Ar、m如权利要求1中所定义。
3.如权利要求1或2所述的化合物,或其药学上可接受的盐,其特征在于,M独立地选自N或CR4;其中,R4选自H、氰基;
或者R4与Rh形成5-8元饱和或部分不饱和环系;所述环上的一个或多个氢原子可以被选自下组的取代基取代:氘、C1-C8烷基、酰基。
4.如权利要求1所述的式I化合物,或其药学上可接受的盐,其特征在于,其具有式(III-A)所示的结构:
Figure FDA0003205537040000021
其中,Ri和Rj各自独立地选自:H、卤素、羟基、C1-C6烷基;或者Ri和Rj结合形成=O;
G选自O、NR7、CR8R9;其中,R7选自:H、C1-C6烷基、C1-C6卤代烷基,R8和R9各自独立地选自:H、卤素;
R1、R2、R3、R5、Ra、Rb、Rc、Rd、Re、Rf、Ar、m、X和Y如权利要求1中所定义。
5.如权利要求1所述的式I化合物,或其药学上可接受的盐,其特征在于,Ar独立地选自取代或未取代的苯基和吡啶基,或者取代或未取代的萘基、萘啶基、吲唑基、苯并咪唑基;所述的取代是指被选自下组的一个或多个取代基取代:氢、卤素、C1-C4的烷基、羟基、C1-C4烷氧基、C1-C4卤代烷基、C1-C4卤代烷氧基。
6.如权利要求1或2所述的化合物,或其药学上可接受的盐,其特征在于,R1选自氢、氟、甲基、氰基。
7.如权利要求5所述的化合物,或其药学上可接受的盐,其特征在于,Ar独立地选自取代或未取代的苯基,或者取代或未取代的萘基、萘啶基、吲唑基、苯并咪唑基;所述的取代是指被选自下组的一个或多个取代基取代:氢、卤素、C1-C4的烷基、羟基。
8.如权利要求1或2所述的化合物,或其药学上可接受的盐,其特征在于,Ra、Rb、Rc、Rd、Re、Rf、Rg、Rh分别独立地选自氢、氟、甲基、羟甲基、氰基亚甲基。
9.如权利要求4所述的化合物,或其药学上可接受的盐,其特征在于,Ra、Rb、Rc、Rd、Re、Rf分别独立地选自氢、氟、甲基、羟甲基、氰基亚甲基。
10.如权利要求1或2所述的化合物,或其药学上可接受的盐,其特征在于,Ar选自:
Figure FDA0003205537040000031
其中Rp选自:卤素、C1-C4的烷基、羟基、氨基、氰基、C1-C4烷氧基、C1-C4卤代烷基、C1-C4卤代烷氧基,n为1、2、3、4或5。
11.如权利要求1或2所述的化合物,或其药学上可接受的盐,其特征在于,
R1选自氢、氟;
Ra、Rb、Rc、Rd、Re、Rf、Rg、Rh分别独立地选自氢、氟、甲基、羟甲基、氰基亚甲基;
M独立地选自N或CH、C-F、C-CN、C-Cl、C-Me、C-OMe;或者R4与Rh形成5-8元饱和或部分不饱和环;
M1选自N;
R5独立地选自氢、卤素、C1-C6烷基、C1-C6烷氧基;m选自0、1、2;
Ar独立地选自取代或未取代的苯基和吡啶基,或者取代或未取代的萘基、萘啶基、吲唑基、苯并咪唑基;所述的一个或多个取代基选自下组:氢、卤素、C1-C4的烷基、羟基、氨基、氰基、C1-C4烷氧基、C1-C4卤代烷基、C1-C4卤代烷氧基;
其它基团如权利要求1中所定义。
12.如权利要求1或2所述的化合物,或其药学上可接受的盐,其特征在于,所述化合物具有如下结构:
Figure FDA0003205537040000032
Figure FDA0003205537040000041
13.如权利要求1-12中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐的用途,其特征在于,用于制备治疗与Ras蛋白突变相关的疾病的药物。
14.如权利要求13所述的用途,其特征在于,与Ras蛋白突变相关的疾病是肿瘤。
15.如权利要求14所述的用途,其特征在于,所述的肿瘤独立地选自肺癌、胰腺癌、肝癌、结直肠癌、胆管癌、脑癌、白血病、淋巴癌、黑色素瘤、甲状腺癌、鼻咽癌。
16.一种药物组合物,其特征在于,所述的药物组合物包括:
(i)有效量的如权利要求1-12中任一项所述的化合物,或其药学上可接受的盐;和
(ii)药学上可接受的载体。
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GR01 Patent grant
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