CN109563100B - ***并嘧啶化合物的晶体形式 - Google Patents

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Abstract

本文提供***并嘧啶化合物的结晶形式,其可用于治疗PRC2介导的疾病或病症。

Description

***并嘧啶化合物的晶体形式
技术领域
本发明涉及N-((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)-8-(2-甲基吡啶-3-基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶-5-胺盐酸盐的结晶形式,包含其的药物组合物,以及使用该结晶形式的治疗方法和制备结晶形式的方法。
技术背景
多梳组(PcG)蛋白是在许多人类癌症中失调的染色质修饰酶。多梳蛋白复合物2(PRC2)包括SUZ12(zeste 12的抑制子)、EED(胚胎外胚层发育)和催化亚基EZH2(zeste同源物2的增强子),通过在靶基因的启动子区域和周围甲基化核心组蛋白H3赖氨酸27(H3K27me3)来抑制基因。PRC2是参与基因转录的表观遗传调控的细胞机制的关键组成部分,并且在发育、组织分化和再生中起关键作用。虽然EZH2是催化亚基,但对于其甲基转移酶活性,PRC2至少需要EED和SUZ12。EED、SUZ12和EZH2在许多癌症中过表达,包括但不限于乳腺癌、***癌、肝细胞癌等。在弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)和滤泡性淋巴瘤(FL)患者中已经发现EZH2激活突变。DLBCL中与辅因子S-腺苷甲硫氨酸(SAM)竞争的化合物对PRC2甲基转移酶活性的抑制逆转H3K27甲基化,重新激活靶基因的表达并抑制肿瘤生长/增殖。因此,PRC2为DLBCL和其他癌症提供了药理靶点。
在制备药物组合物中,寻求一种具有平衡所需性质的治疗剂形式,例如溶出速率、溶解度、生物利用度和/或储存稳定性。多种固体形式(通常称为多晶型物)的存在对于固体药物化合物是众所周知的,并且这些化合物的化学和物理稳定性以及处理性质通常取决于使用哪种固体形式。因此,选择活性药物物质的特定固体形式(例如,盐形式、水合或溶剂合形式或多晶形式)对于设计可靠和可重复的生产工艺以及储存、处理和分配原料药的安全、有效形式通常非常重要。
“杂质:残留溶剂指南”是药品中允许的残留溶剂量的指导原则,由国际人用药品技术要求协调委员会(ICH)制定。本指南建议在原料药和剂型的制造中使用毒性较小的溶剂,并对药品中的残留溶剂(有机挥发性杂质)设定药学限制。本指南将溶剂基于风险分为三类:1类溶剂,已知会产生不可接受的毒性;2类溶剂,与较不严重的毒性有关;以及3类溶剂,具有低毒性。
根据ICH指南,不需理由就可以接受每天50mg或更少(相当于5000ppm或0.5%)的3类溶剂的残留量。通过假设每天施用10g的产品质量,使用下面的等式计算浓度限制:
浓度(ppm)=(1000X PDE)/剂量
PDE(允许的每日暴露)以mg/天给出,剂量以g/天给出。更高量的3类溶剂也是可以接受的,只要其在制造能力和药品生产质量管理规范方面切实可行。
编号14/977,273的美国专利申请公开了某些用于治疗PRC2介导的疾病或病症的***并嘧啶化合物,其通过引用并入本文。该专利申请作为US2016-0176882于2016年6月23日公开。该申请中公开的一种化合物是N-((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)-8-(2-甲基吡啶-3-基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶-5-胺(游离形式)及其盐酸盐。游离形式(在此称为化合物A)具有以下结构:
Figure GDA0003082385510000021
盐酸盐(在此称为化合物X)具有以下结构:
Figure GDA0003082385510000022
游离形式化合物A在生理学相关的pH水平7.4和模拟胃液(SGF)中均显示出低水溶性。在啮齿动物药代动力学研究中,发现化合物A在更高剂量下的暴露比例不足,这可能导致临床环境中暴露不足和可变。进行实验寻找合适的盐以提高水溶性。在测试了包括磷酸盐、富马酸盐、酒石酸盐、琥珀酸盐、马来酸盐和甲磺酸盐在内的多种盐之后,发现只有盐酸盐才能提供必要的溶解度改善,并且证明了在啮齿动物中剂量成比例暴露。
US14/977,273中描述的制备化合物X的方法使用异丙醇(IPA,3类溶剂)作为介质。在通过1H NMR测定的US14/977,273中描述的方法获得的不同批次的化合物X中观察到可变量的IPA(以下表2中的条目1为例),一些批次中的IPA量大于0.5重量%。从最终产品中除去残留的IPA也是非常困难的。另外,根据XRPD光谱判断,由此获得的化合物X显示出低且可变的结晶度。努力去除残留的IPA并改善结晶度,但是没有太大成功。因此,需要能够一致地生产所需形式(即基本上不含残余有机溶剂并且显示出改进的和可靠的结晶度的形式)的化合物X的方法。
发明内容
本发明提供化合物X(N-((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)-8-(2-甲基吡啶-3-基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶-5-胺盐酸盐的结晶形式。
这些结晶形式的实施方式包括本文中表征为形式A、HA和HB的那些以及这些结晶形式的组合或混合物。
表1
化合物X 形式
无水 A
一水合物 H<sub>A</sub>
二水合物 H<sub>B</sub>
本文用于表征特定形式的名称,例如“HA”等,不应视为对具有类似或相同物理和化学特性的任何其他物质具有限制,而是应当理解这些名称仅仅是标识符,应当根据本文也呈现的表征信息对其进行解释。
本发明提供了制备化合物X的结晶形式的方法。
本发明还提供药物组合物,其包括化合物X的结晶形式和至少一种药学上可接受的载体、稀释剂或赋形剂。所述药物组合物可进一步包括至少一种附加治疗剂。特别感兴趣的是选自其他抗癌剂、免疫调节剂、抗过敏剂、抗恶心剂(或止吐剂)、止痛剂、细胞保护剂及其组合的附加治疗剂。
本发明的化合物X的结晶形式可用于治疗由EED和/或PRC2介导的疾病或病症。
本发明的化合物X的结晶形式可用于治疗。
本发明的化合物X的结晶形式可用于制造用于治疗由EED和/或PRC2介导的疾病或病症的药物。
从下面的详细说明书中,本公开的其他特征和优点将显而易见。
附图简要说明
图1描绘了形式A(无水形式)的代表性X射线粉末衍射图。
图2描绘了形式A的差示扫描量热法(DSC)/热重分析(TGA)温谱图。
图3描绘了形式A在25℃下的动态蒸汽吸附(DVS)图。
图4描绘了形式HA(一水合物形式)的代表性X射线粉末衍射图。
图5描绘了形式HA的差示扫描量热法(DSC)/热重分析(TGA)温谱图。
图6描绘了形式HA在25℃下的动态蒸汽吸附图。
图7描绘了形式HA在50℃下的动态蒸汽吸附图。
图8描绘了形式HB(二水合物形式)的代表性X射线粉末衍射图。
图9描绘了形式HB的差示扫描量热法(DSC)/热重分析(TGA)温谱图。
图10描绘了形式HB在25℃下的动态蒸汽吸附图。
图11描绘了通过以下实施例3中描述的方法(A)获得的形式A与通过下文实施例2中描述的方法(B)获得的形式A的比较(也描述于US 14/977,273中)。
发明详述
以下列举的本发明的实施方式是代表性的:
1.N-((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)-8-(2-甲基吡啶-3-基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶-5-胺盐酸盐的结晶形式A,其中所述形式A含有少于0.5重量%的残余有机溶剂。
2.N-((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)-8-(2-甲基吡啶-3-基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶-5-胺盐酸盐的结晶形式A,其中所述形式A含有少于0.2重量%的残余有机溶剂。
3.N-((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)-8-(2-甲基吡啶-3-基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶-5-胺盐酸盐的结晶形式A,其中所述形式A含有少于0.1重量%的残余有机溶剂。
4.通过包括以下步骤的方法获得的化合物X的结晶形式A:
1)将N-((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)-8-(2-甲基吡啶-3-基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶-5-胺(化合物A)悬于水和水混溶性有机溶剂的混合物中;
2)将所得悬浮液加热至约50℃或高于50℃;
3)将所得悬浮液酸化,形成澄清溶液,同时保持温度在约50℃或高于50℃;和
4)降低所得溶液的温度,得到化合物X的形式A。
5.通过包括以下步骤的方法获得的如实施方式1-3中任一项的化合物X的结晶形式A:
1)将N-((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)-8-(2-甲基吡啶-3-基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶-5-胺(化合物A)悬于水和水混溶性有机溶剂的混合物中;
2)将所得悬浮液加热至约50℃或高于50℃;
3)将所得悬浮液酸化,形成澄清溶液,同时保持温度在约50℃或高于50℃;和
4)降低所得溶液的温度,得到化合物X的形式A。
6.通过工艺获得的如实施方式5的化合物X的结晶形式A,其中:
在步骤1)中,水混溶性有机溶剂选自乙醇和丙酮;
在步骤2)中,将所得悬浮液加热至约50℃-75℃;
在步骤3)中,通过在水和所述水混溶性有机溶剂的混合物中加入0.5N HCl的溶液来酸化所得悬浮液以形成澄清溶液,同时保持温度在约50-75℃;和
在步骤4)中,降低所得溶液的温度,得到化合物X的形式A。
7.一种N-((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)-8-(2-甲基吡啶-3-基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶-5-胺盐酸盐的水合固体形式。
8.如实施方式7的水合固体形式,其中所述水合形式是一水合物形式HA
9.如实施方式7的水合固体形式,其中所述水合形式是二水合物形式HB
10.一种N-((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)-8-(2-甲基吡啶-3-基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶-5-胺盐酸盐的结晶形式(形式HA),其具有包含以下2θ值的X射线粉末衍射图(CuKα
Figure GDA0003082385510000061
):13.8±0.1、20.8±0.1、26.2±0.1、26.7±0.1和28.2±0.1。在一些实施方式中,形式HA具有一个或多个(例如2、3、4或5个)选自列表2中的那些的另外的2θ值。
11.一种N-((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)-8-(2-甲基吡啶-3-基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶-5-胺盐酸盐的结晶形式(形式HB),其具有包含以下2θ值的X射线粉末衍射图(CuKα
Figure GDA0003082385510000062
):9.0±0.1、17.1±0.1、22.8±0.1、26.9±0.1和35.3±0.1。在一些实施方式中,形式HB具有一个或多个(例如2、3、4或5个)选自列表3中的那些的另外的2θ值。
12.药物组合物,其包含一种或多种药学上可接受的载体和实施方式1-6中任一项所描述的形式A。
13.如实施方式12所述的药物组合物,其特征在于进一步包括至少一种附加治疗剂。
14.如实施方式13的药物组合物,其中所述附加治疗剂选自其他抗癌剂、免疫调节剂、抗过敏剂、止吐剂、止痛剂、细胞保护剂及其组合。
15.实施方式1-6中任一项所述的结晶形式A,用于治疗。
16.根据实施方式1-6中任一项所述的形式A在制备用于治疗由EED和/或PRC2介导的疾病或病症的药物中的用途。
17.如实施方式16的用途,其中所述疾病或病症选自弥漫性大B细胞淋巴瘤、滤泡性淋巴瘤、其他淋巴瘤、白血病、多发性骨髓瘤、间皮瘤、胃癌、恶性横纹肌瘤、肝细胞癌、***癌,乳腺癌、胆管癌和胆囊癌、膀胱癌、脑肿瘤包括神经母细胞瘤、神经鞘瘤、胶质瘤、胶质母细胞瘤和星形细胞瘤、***、结肠癌、黑色素瘤、子宫内膜癌、食管癌、头颈癌、肺癌、鼻咽癌、卵巢癌、胰腺癌、肾细胞癌、直肠癌、甲状腺癌、甲状旁腺肿瘤、子宫肿瘤和软组织肉瘤。
18.制备化合物X的结晶形式A的方法,包括以下步骤:
1)将N-((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)-8-(2-甲基吡啶-3-基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶-5-胺(化合物A)悬于水和水混溶性有机溶剂的混合物中;
2)将所得悬浮液加热至约50℃或高于50℃;
3)将所得悬浮液酸化,形成澄清溶液,同时保持温度在约50℃或高于50℃;和
4)降低所得溶液的温度,得到化合物X的形式A。
19.一种制备化合物X的结晶形式A的方法,所述结晶形式A包含小于0.5重量%的残余有机溶剂,优选小于0.3重量%的残余有机溶剂,更优选小于0.1重量%的残余有机溶剂,所述方法包括以下步骤:
1)将N-((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)-8-(2-甲基吡啶-3-基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶-5-胺(化合物A)悬于水和水混溶性有机溶剂的混合物中;
2)将所得悬浮液加热至约50℃或高于50℃;
3)将所得悬浮液酸化,形成澄清溶液,同时保持温度在约50℃或高于50℃;和
4)降低所得溶液的温度以促进晶体形成,得到化合物X的形式A。
20.如实施方式19的方法,其中:
在步骤1)中,水混溶性有机溶剂选自乙醇和丙酮;
在步骤2)中,将所得悬浮液加热至约50℃-75℃;
在步骤3)中,通过在水和所述水混溶性有机溶剂的混合物中加入0.5NHCl的溶液来酸化所得悬浮液以形成澄清溶液,同时保持温度在约50-75℃;和
在步骤4)中,降低所得溶液的温度,得到化合物X的形式A。
据推测,当化合物X在异丙醇介质中形成时,IPA可能被捕获在晶格中,因为在整个成盐过程中,材料保持为“浆液”并且从未完全溶解。表2总结了用所选的3类溶剂及其组合进行的实验所获得的结果。意外发现EtOH/水和丙酮/水(条目11和12)使得化合物X完全溶解并且在最佳时间段内保持过饱和状态,尤其是在升高的温度下。这些组合提供了基本上不含有机溶剂的化合物X的结晶形式,例如,在常规干燥后含有按重量不超过0.3%且通常不超过0.1%的有机溶剂。
表2
Figure GDA0003082385510000081
Figure GDA0003082385510000091
使用所选择的溶剂对来进一步优化结晶条件,如表3中所列。发现表3中的条目5和6中所示的条件产生具有低得多的残余有机溶剂含量和更高结晶度的材料,而使用条目5中的条件获得更好的产率。条目5的条件也可以以多克规模重现,如表3中的条目7所示。
Figure GDA0003082385510000101
化合物X的形式A(无水形式)
在一个实施方式中,化合物X作为包含形式A的结晶材料提供。化合物X的结晶形式包含本文称为化合物X的“形式A”的结晶形式。
在一个实施方式中,化合物X的形式A的特征在于晶胞参数大致等于以下:
晶胞尺寸:
Figure GDA0003082385510000111
α=102.58(2)°
Figure GDA0003082385510000112
β=92.45(3)°
Figure GDA0003082385510000113
γ=99.26(3)°
空间群:P-1
化合物X的分子/不对称单位:2
体积/晶胞中的
Figure GDA0003082385510000114
密度(计算得到)=1.449g/cm3
其中化合物X的形式A的晶胞参数是在约100(±2)K(-173℃)的温度下测量的。
在一个实施方式中,本发明提供化合物X的形式A,其特征在于包含以下2θ值的X射线粉末衍射图(CuKα
Figure GDA0003082385510000115
):12.5±0.1、13.0±0.1、25.2±0.1和30.8±0.1。在另一个实施方式中,除了上述特定的2θ值之外,形式A表现出一个或多个(例如2、3、4或5个)选自列表1中的那些的另外的2θ值。在另一个实施方式中,形式A表现出与图1中所示基本相同的X射线粉末衍射图。
列表1:化合物X的形式A的XRPD峰列表(2θ:最强峰加下划线)
Figure GDA0003082385510000116
Figure GDA0003082385510000121
在另一个实施方式中,化合物X的形式A在DSC期间在约264±1℃下表现出强吸热。
在另一个实施方式中,化合物X的形式A通过TGA逐渐丧失质量,至200℃总共损失约0.6%。
化合物X的形式HA(一水合物)
在一个实施方式中,化合物X以结晶形式提供为一水合物,在本文中称为化合物X的“形式HA”。对于化合物X的每个分子,化合物X的形式HA具有一分子水的化学计量。
在一个方面中,本发明提供化合物X的形式HA,其特征在于包含以下2θ值的X射线粉末衍射图(CuK
Figure GDA0003082385510000131
):13.8±0.1、20.8±0.1、26.2±0.1、26.7±0.1和28.2±0.1。在另一个实施方式中,除了上述特定的2θ值之外,形式HA表现出一个或多个(例如2、3、4或5个)选自列表2中的那些的另外的2θ值。在另一个实施方式中,形式HA表现出与图4中所示基本相同的X射线粉末衍射图。
列表2:化合物X的形式HA的XRPD峰列表(2θ:最强峰加下划线)
Figure GDA0003082385510000132
已经发现一水合物易于在水/溶剂混合物中形成,水活度高于0.5~0.6,并且它对湿度和温度显示出可接受的稳定性。
在另一个实施方式中,化合物X的形式HA在DSC期间在约256±1℃下表现出强吸热。
在另一个实施方式中,化合物X的形式HA通过TGA逐渐丧失质量,至111℃总共损失约4.2%。
化合物X的形式HB(二水合物)
在一个实施方式中,化合物X以结晶形式提供为二水合物,在本文中称为化合物X的“形式HB”。对于化合物X的每个分子,化合物X的形式HB具有两分子水的化学计量。
在一个方面中,本发明提供化合物X的形式HB,其特征在于包含以下2θ值的X射线粉末衍射图(CuKα
Figure GDA0003082385510000141
):9.0±0.1、17.1±0.1、22.8±0.1、26.9±0.1和35.3±0.1。在另一个实施方式中,除了上述特定的2θ值之外,形式HB表现出一个或多个(例如2、3、4或5个)选自列表3中的那些的另外的2θ值。在另一个实施方式中,形式HB表现出与图8中所示基本相同的X射线粉末衍射图。
列表3:化合物X的形式HB的XRPD峰列表(2θ:最强峰加下划线)
Figure GDA0003082385510000142
Figure GDA0003082385510000151
在另一个实施方式中,化合物X的形式HB在DSC期间在约244±1℃下表现出强吸热。
在另一个实施方式中,化合物X的形式HB通过TGA逐渐丧失质量,至122℃总共损失约8.5%。
反应杂质和/或加工杂质的存在可以通过本领域已知的分析技术确定,例如色谱法、核磁共振光谱法、质谱法或红外光谱法。
在本发明的一个方面,本发明的多晶型物具有结晶性质,优选至少50%结晶,更优选至少60%结晶,还更优选至少70%结晶,最优选至少80%结晶。可以通过常规X射线衍射技术估计结晶度。
在一些实施方式中,化合物X的固体形式包含一种或多种本文所述的形式。化合物X的固体形式可包括两种或更多种这些形式,即可以是两种或更多种形式的混合物。在一些实施方式中,固体形式的样品主要由选自形式A、HA和HB的单一形式组成,这意味着50%或更多的该材料是单一固体形式。可以从XRPD数据确定混合物中各种形式的相对量。如本文所述,一些形式可以在合适的条件下进化或互变,例如形式A和HA,其可以作为混合物出现,并且可以根据材料保存的相对湿度和温度进行相互转化。
在本发明的一个方面,本发明的多晶型物为50%、60%、70%、80%或90%至95%、96%、97%、98%、99%或100%的结晶。
在本说明书中,使用波长为
Figure GDA0003082385510000152
(α1)和
Figure GDA0003082385510000153
(α2)的铜X射线测量X射线粉末衍射峰(以2θ表示)。
本发明的结晶形式可以以非溶剂化或溶剂化形式存在。术语“溶剂化物”在本文中用于描述包含本发明化合物和一定量的一种或多种药学上可接受溶剂的分子复合物。药学上可接受溶剂的示例包括乙醇和水。当溶剂是水时,使用术语“水合物”。如本文所述的化合物X的两种多晶型物是水合物。
在另一个实施方式中,结晶形式是化合物X的形式A,其中所述形式A含有小于0.5重量%的残余有机溶剂。
在另一个实施方式中,结晶形式是化合物X的形式A,其中所述形式A含有小于0.4重量%的残余有机溶剂。
在另一个实施方式中,结晶形式是化合物X的形式A,其中所述形式A含有小于0.3重量%的残余有机溶剂。
在另一个实施方式中,结晶形式是化合物X的形式A,其中所述形式A含有小于0.2重量%的残余有机溶剂。
在另一个实施方式中,结晶形式是化合物X的形式A,其中所述形式A含有小于0.1重量%的残余有机溶剂。
在另一个实施方式中,结晶形式是化合物X的形式HA
在另一个实施方式中,结晶形式是化合物X的形式HB
在另一个实施方式中,结晶形式是化合物X的形式A与化合物X的形式HA的组合。
在另一个实施方式中,结晶形式是化合物X的形式A与化合物X的形式HA的组合。
在另一个实施方式中,结晶形式是化合物X的形式A与化合物X的形式HB的组合。
在另一个实施方式中,结晶形式是化合物X的形式A与化合物X的形式HA以及化合物X的形式HB的组合。
在另一个实施方式中,本发明提供一种组合物,其包含选自上述任何实施方式的一种固体形式。
在另一个实施方式中,本发明提供一种药物组合物,其包含选自上述任何实施方式的一种固体形式以及至少一种药学上可接受的载体、稀释剂或赋形剂。
在另一个实施方式中,本发明提供一种药物组合物,其包含治疗有效量的选自上述任何实施方式的一种固体形式以及至少一种药学上可接受的载体、稀释剂或赋形剂。
药物组合物可用于治疗由EED和/或PRC2介导的疾病或病症。
在另一个实施方式中,本发明提供如上所述的药物组合物,进一步包括附加治疗剂。
在另一个实施方式中,本发明提供选自上述任何实施方式的一种固体形式,用于单独或任选地与本发明的另一化合物和/或至少一种其它类型的治疗剂结合的治疗。
在另一个实施方式中,本发明提供选自上述任何实施方式的一种固体形式,用于治疗由EED和/或PRC2介导的疾病或病症,单独和/或与至少一种其它治疗剂一起。
在另一个实施方式中,本发明提供了一种治疗由EED和/或PRC2介导的疾病或病症的方法,包括向需要这种治疗的患者施用治疗有效量的选自上述任意实施方式的一种固体形式,单独地和/或与至少一种其他类型的治疗剂组合。
在另一个实施方式中,本发明提供一种治疗由EED和/或PRC2介导的疾病或病症的方法,包括向有需要的患者施用治疗有效量的第一和第二治疗剂,其中所述第一治疗剂是选自上述任意实施方式的一种固体形式,所述第二治疗剂是其他类型的治疗剂。
在另一个实施方式中,本发明还提供选自上述任何实施方式的一种固体形式在制造治疗由EED和/或PRC2介导的疾病或病症的药物中的应用,其单独或可任选地与至少一种其它治疗剂一起。
在另一个实施方式中,本发明提供选自上述任意实施方式的一种固体形式和额外治疗剂的联合制剂用于治疗。
在另一个实施方式中,本发明提供选自上述任意实施方式的一种固体形式和额外治疗剂的组合同时或分开用于治疗。
在另一个实施方式中,本发明提供选自上述任意实施方式的一种固体形式和额外治疗剂的联合制剂,用于同时、分开或顺序地治疗由EED和/或PRC2介导的疾病或病症。所述固体形式可以作为本文所述的药物组合物施用。
EED和/或PRC2介导的疾病或病症的示例包括但不限于弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)、滤泡性淋巴瘤、其他淋巴瘤、白血病、多发性骨髓瘤、间皮瘤、胃癌、恶性横纹肌瘤、肝细胞癌、***癌,乳腺癌、胆管癌和胆囊癌、膀胱癌、脑肿瘤包括神经母细胞瘤、胶质瘤、胶质母细胞瘤和星形细胞瘤、***、结肠癌、黑色素瘤、子宫内膜癌、食管癌、头颈癌、肺癌、鼻咽癌、卵巢癌、胰腺癌、肾细胞癌、直肠癌、甲状腺癌、甲状旁腺肿瘤、子宫肿瘤和选自横纹肌肉瘤(RMS)、卡波济肉瘤、滑膜肉瘤、骨肉瘤和尤因肉瘤的软组织肉瘤。
在另一个实施方式中,本发明提供一种治疗由EED和/或PRC2介导的疾病或病症的方法,包括向有需要的患者施用治疗有效量的第一治疗剂,可选有第二治疗剂,其中所述第一治疗剂是选自上述任意实施方式的一种固体形式,所述第二治疗剂是其他类型的治疗剂,其中所述疾病或病症选自弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)、滤泡性淋巴瘤、其他淋巴瘤、白血病、多发性骨髓瘤、胃癌、恶性横纹肌瘤和肝细胞癌。
在另一个实施方式中,用于组合药物组合物或组合方法或组合用途的额外治疗剂选自下列一种或多种、优选一至三种治疗剂:其他抗癌剂、免疫调节剂、抗过敏剂、抗恶心剂(或止吐药)、止痛药、细胞保护剂及其组合。
在另一个实施方式中,本发明提供一种制备化合物X的结晶形式A的方法,其中所述形式A包含小于0.5重量%的残余有机溶剂,优选小于0.2重量%的残余有机溶剂,更优选小于0.1重量%的残余有机溶剂。
在另一个实施方式中,本发明提供制备化合物X的晶型A的方法,包括以下步骤:
1)将N-((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)-8-(2-甲基吡啶-3-基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶-5-胺(化合物A)悬于水和水混溶性有机溶剂的混合物中;
2)将所得悬浮液加热到至少约50℃;
3)将所得悬浮液酸化,形成澄清溶液,同时保持温度在至少约50℃;和
4)降低所得溶液的温度以促进晶体形成,得到化合物X的形式A。
在另一个实施方式中,本发明提供一种制备化合物X的结晶形式A的方法,其包含小于0.5重量%的残余有机溶剂,优选小于0.3重量%的残余有机溶剂,更优选小于0.1重量%的残余有机溶剂,包括以下步骤:
1)将N-((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)-8-(2-甲基吡啶-3-基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶-5-胺(化合物A)悬于水和水混溶性有机溶剂的混合物中;
2)将所得悬浮液加热至约50℃或高于50℃;
3)将所得悬浮液酸化,形成澄清溶液,同时保持温度在约50℃或高于50℃;和
4)降低所得溶液的温度以促进晶体形成,得到化合物X的形式A。
在另一个实施方式中,本发明提供制备化合物X的晶型A的方法,其包含小于0.5重量%的残余有机溶剂,包括以下步骤:
1)将化合物A悬浮在水和选自乙醇和丙酮的水混溶性有机溶剂的混合物中;
2)将所得悬浮液加热至约50℃-75℃;
3)通过在水和所述水混溶性有机溶剂的混合物中加入0.5N HCl的溶液来酸化所得悬浮液以形成澄清溶液,同时保持温度在约50-75℃;和
4)降低溶液的温度以促进晶体形成,得到化合物X的形式A。
在另一个实施方式中,本发明提供通过包括以下步骤的方法获得的化合物X的结晶形式A:
1)将N-((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)-8-(2-甲基吡啶-3-基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶-5-胺(化合物A)悬于水和水混溶性有机溶剂的混合物中;
2)将所得悬浮液加热至约50℃或高于50℃;
3)将所得悬浮液酸化,形成澄清溶液,同时保持温度在约50℃或高于50℃;和
4)降低所得溶液的温度以促进晶体形成,得到化合物X的形式A。
在另一个实施方式中,本发明提供化合物X的结晶形式A,其包含小于0.5重量%的残余有机溶剂,优选小于0.3重量%的残余有机溶剂,更优选小于0.1重量%的残余有机溶剂,获自包括以下步骤的方法:
1)将N-((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)-8-(2-甲基吡啶-3-基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶-5-胺(化合物A)悬于水和水混溶性有机溶剂的混合物中;
2)将所得悬浮液加热至约50℃或高于50℃;
3)将所得悬浮液酸化,形成澄清溶液,同时保持温度在约50℃或高于50℃;和
4)降低所得溶液的温度以促进晶体形成,得到化合物X的形式A。
在另一个实施方式中,本发明提供化合物X的结晶形式A,其包含小于0.5重量%的残余有机溶剂,优选小于0.3重量%的残余有机溶剂,更优选小于0.1重量%的残余有机溶剂,获自包括以下步骤的方法:
1)将化合物A悬浮在水和选自乙醇和丙酮的水混溶性有机溶剂的混合物中;
2)将所得悬浮液加热至约50℃-75℃;
3)通过在水和所述水混溶性有机溶剂的混合物中加入0.5N HCl的溶液来酸化所得悬浮液以形成澄清溶液,同时保持温度在约50-75℃;和
4)降低溶液的温度以促进晶体形成,得到化合物X的形式A。
在另一个实施方式中,本发明提供通过包括以下步骤的方法可获得的化合物X的结晶形式A:
1)将N-((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)-8-(2-甲基吡啶-3-基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶-5-胺(化合物A)悬于水和水混溶性有机溶剂的混合物中;
2)将所得悬浮液加热至约50℃或高于50℃;
3)将所得悬浮液酸化,形成澄清溶液,同时保持温度在约50℃或高于50℃;和
4)降低所得溶液的温度以促进晶体形成,得到化合物X的形式A。
在另一个实施方式中,本发明提供化合物X的结晶形式A,其包含小于0.5重量%的残余有机溶剂,优选小于0.3重量%的残余有机溶剂,更优选小于0.1重量%的残余有机溶剂,获自包括以下步骤的方法:
1)将N-((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)-8-(2-甲基吡啶-3-基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶-5-胺(化合物A)悬于水和水混溶性有机溶剂的混合物中;
2)将所得悬浮液加热至约50℃或高于50℃;
3)将所得悬浮液酸化,形成澄清溶液,同时保持温度在约50℃或高于50℃;和
4)降低所得溶液的温度以促进晶体形成,得到化合物X的形式A。
在另一个实施方式中,本发明提供化合物X的结晶形式A,其包含小于0.5重量%的残余有机溶剂,优选小于0.3重量%的残余有机溶剂,更优选小于0.1重量%的残余有机溶剂,可获自包括以下步骤的方法:
1)将化合物A悬浮在水和选自乙醇和丙酮的水混溶性有机溶剂的混合物中;
2)将所得悬浮液加热至约50℃-75℃;
3)通过在水和所述水混溶性有机溶剂的混合物中加入0.5N HCl的溶液来酸化所得悬浮液以形成澄清溶液,同时保持温度在约50-75℃;和
4)降低溶液的温度以促进晶体形成,得到化合物X的形式A。
在另一个实施方式中,本发明提供制备化合物X的晶型A的方法,包括以下步骤:
1)将N-((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)-8-(2-甲基吡啶-3-基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶-5-胺(化合物A)悬于水和水混溶性有机溶剂的混合物中;
2)将所得悬浮液加热到至少约50℃;
3)用盐酸将所得悬浮液酸化,形成澄清溶液,同时保持温度在至少约50℃;和
4)降低所得溶液的温度以促进晶体形成,得到化合物X的形式A。
在另一个实施方式中,本发明提供一种制备化合物X的结晶形式A的方法,其包含小于0.5重量%的残余有机溶剂,优选小于0.3重量%的残余有机溶剂,更优选小于0.1重量%的残余有机溶剂,包括以下步骤:
1)将N-((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)-8-(2-甲基吡啶-3-基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶-5-胺(化合物A)悬于水和水混溶性有机溶剂的混合物中;
2)将所得悬浮液加热至约50℃或高于50℃;
3)用盐酸将所得悬浮液酸化,形成澄清溶液,同时保持温度在约50℃或高于50℃;和
4)降低所得溶液的温度以促进晶体形成,得到化合物X的形式A。
在另一个实施方式中,本发明提供制备化合物X的晶型A的方法,其包含小于0.5重量%的残余有机溶剂,包括以下步骤:
1)将化合物A悬浮在水和选自乙醇和丙酮的水混溶性有机溶剂的混合物中;
2)将所得悬浮液加热至约50℃-75℃;
3)通过在水和所述水混溶性有机溶剂的混合物中加入0.5N HCl的溶液来用盐酸酸化所得悬浮液以形成澄清溶液,同时保持温度在约50-75℃;和
4)降低溶液的温度以促进晶体形成,得到化合物X的形式A。
在另一个实施方式中,本发明提供通过包括以下步骤的方法获得的化合物X的结晶形式A:
1)将N-((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)-8-(2-甲基吡啶-3-基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶-5-胺(化合物A)悬于水和水混溶性有机溶剂的混合物中;
2)将所得悬浮液加热至约50℃或高于50℃;
3)用盐酸将所得悬浮液酸化,形成澄清溶液,同时保持温度在约50℃或高于50℃;和
4)降低所得溶液的温度以促进晶体形成,得到化合物X的形式A。
在另一个实施方式中,本发明提供化合物X的结晶形式A,其包含小于0.5重量%的残余有机溶剂,优选小于0.3重量%的残余有机溶剂,更优选小于0.1重量%的残余有机溶剂,获自包括以下步骤的方法:
1)将N-((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)-8-(2-甲基吡啶-3-基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶-5-胺(化合物A)悬于水和水混溶性有机溶剂的混合物中;
2)将所得悬浮液加热至约50℃或高于50℃;
3)用盐酸将所得悬浮液酸化,形成澄清溶液,同时保持温度在约50℃或高于50℃;和
4)降低所得溶液的温度以促进晶体形成,得到化合物X的形式A。
在另一个实施方式中,本发明提供化合物X的结晶形式A,其包含小于0.5重量%的残余有机溶剂,优选小于0.3重量%的残余有机溶剂,更优选小于0.1重量%的残余有机溶剂,获自包括以下步骤的方法:
1)将化合物A悬浮在水和选自乙醇和丙酮的水混溶性有机溶剂的混合物中;
2)将所得悬浮液加热至约50℃-75℃;
3)通过在水和所述水混溶性有机溶剂的混合物中加入0.5N HCl的溶液来用盐酸酸化所得悬浮液以形成澄清溶液,同时保持温度在约50-75℃;和
4)降低溶液的温度以促进晶体形成,得到化合物X的形式A。
在另一个实施方式中,本发明提供通过包括以下步骤的方法可获得的化合物X的结晶形式A:
1)将N-((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)-8-(2-甲基吡啶-3-基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶-5-胺(化合物A)悬于水和水混溶性有机溶剂的混合物中;
2)将所得悬浮液加热至约50℃或高于50℃;
3)用盐酸将所得悬浮液酸化,形成澄清溶液,同时保持温度在约50℃或高于50℃;和
4)降低所得溶液的温度以促进晶体形成,得到化合物X的形式A。
在另一个实施方式中,本发明提供化合物X的结晶形式A,其包含小于0.5重量%的残余有机溶剂,优选小于0.3重量%的残余有机溶剂,更优选小于0.1重量%的残余有机溶剂,获自包括以下步骤的方法:
1)将N-((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)-8-(2-甲基吡啶-3-基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶-5-胺(化合物A)悬于水和水混溶性有机溶剂的混合物中;
2)将所得悬浮液加热至约50℃或高于50℃;
3)将所得悬浮液酸化,形成澄清溶液,同时保持温度在约50℃或高于50℃;和
4)降低所得溶液的温度以促进晶体形成,得到化合物X的形式A。
在另一个实施方式中,本发明提供化合物X的结晶形式A,其包含小于0.5重量%的残余有机溶剂,优选小于0.3重量%的残余有机溶剂,更优选小于0.1重量%的残余有机溶剂,可获自包括以下步骤的方法:
1)将化合物A悬浮在水和选自乙醇和丙酮的水混溶性有机溶剂的混合物中;
2)将所得悬浮液加热至约50℃-75℃;
3)通过在水和所述水混溶性有机溶剂的混合物中加入0.5N HCl的溶液来用盐酸酸化所得悬浮液以形成澄清溶液,同时保持温度在约50-75℃;和
4)降低溶液的温度以促进晶体形成,得到化合物X的形式A。
在制备化合物X的结晶形式A的上述方法的进一步的实施方式中,本发明提供以下优选的溶剂混合物比例:
H2O和EtOH的溶剂混合物的比例,其中EtOH为80至100重量%。
H2O和EtOH的溶剂混合物的比例,其中EtOH为85至100重量%。
H2O和EtOH的溶剂混合物的比例,其中EtOH为90至100重量%。
H2O和EtOH的溶剂混合物的比例,其中EtOH为95至100重量%。
H2O和EtOH的溶剂混合物的比例,其中EtOH为85至95重量%。
H2O和EtOH的溶剂混合物的比例,其中EtOH为90至95重量%。
在制备化合物X的结晶形式A的上述方法的进一步的实施方式中,本发明提供以下优选的步骤2的温度范围:
温度范围是50至75℃。
温度范围是60至75℃。
温度范围是70至75℃。
本文描述了本发明的各种(列举的)实施方式。将认识到,每个实施例中指定的特征可以与其他指定特征组合以提供本发明的进一步实施方式。还应理解,实施方式的每个单独元素是其各自的独立实施方式。
在以上对示例性实施方式的描述过程中,本发明的其他特征应变得显而易见,所述示例性实施方式是为了说明本发明而给出的,并不旨在限制本发明。
III.定义
除非另有说明,否则上文和下文中使用的一般术语优选地在本发明内容的范围内具有以下含义,其中使用的更一般的术语可以彼此独立地由更具体的定义替换或保留,从而定义更多本发明的详细实施方式。
在阅读以下详细描述后,本领域普通技术人员可以更容易地理解本发明的特征和优点。应当理解,为了清楚起见,在分开的实施方式的上下文中描述的本发明的某些特征也可以组合以形成单个实施方式。相反,为了简洁起见,在单个实施方式的上下文中描述的本发明的各种特征也可以组合以形成其子组合。
在本发明的语境中使用的术语“一个”、“一种”、“所述”以及类似术语应被解释为涵盖单数和复数,除非另有说明或与语境明显矛盾。
表示成分数量、重量百分比、温度等的所有数字前面都有单词“约”,应理解为仅近似值,以便可以使用高于和低于所述数字的轻微变化来获得与所示数字基本相同的结果。因此,除非有相反的指示,否则前面带有“约”字的数值参数是近似值,可根据试图获得的所需性质而变化。每个数值参数至少应根据所记录的有效数字的位数并考虑到常用四舍五入规则的运用来进行解释。
这里用来表征特定形式的名称,例如“HA”等,仅仅是根据本文呈现的特征信息解释的标识符,并且不限于排除具有类似或具有类似或相同的物理和化学特征的任何其他物质。
所有测量都受到实验误差的影响并且在本发明的精神内。
本文所述的所有方法可以以任何合适的顺序进行,除非本文另外指出或另外明显与语境相矛盾。本文提供的任何和所有实施例或示例性语言(例如“诸如”)的使用仅意在更好地说明本发明,而不是对本发明另行要求保护的范围进行限制。
短语“药学上可接受的”表示该物质或组合物必须在化学和/或毒理学上与包含制剂的其他成分和/或用其治疗的哺乳动物相容。
根据工艺条件,本发明的最终产物以游离(中性)或盐形式获得。这些最终产物的游离形式和盐都在本发明的范围内。如果需要,可将化合物的一种形式转化为另一种形式。游离碱或酸可以转化成盐;盐可以转化成游离化合物或另一种盐;本发明的异构化合物的混合物可被分离成单独的异构体。
本发明的药学上可接受的盐可以通过常规化学方法由含有碱性或酸性部分的母体化合物合成。通常,这些盐可以通过使这些化合物的游离酸或碱形式与化学计量的合适碱或酸在水中或在有机溶剂中或在两者的混合物中反应来制备;通常,优选非水介质如***、乙酸乙酯、乙醇、异丙醇或乙腈。合适的盐的列表可参见Allen,L.V.,Jr.,ed.,Remington:The Science and Practice of Pharmacy,第22版,Pharmaceutical Press,London,UK(2012),其发明内容在此引入作为参考。
如本文所用,“多晶型物”是指具有相同化学结构/组成但形成晶体的分子和/或离子的空间排列不同的晶体形式。
如本文所用,“无定形”是指分子、原子和/或离子的非结晶的固体形式。无定形固体不显示确定的X射线衍射图案。
出于药典目的,药物中的“残留有机溶剂”定义为在原料药或赋形剂的制造中或在药物产品的制备中使用或产生的有机挥发性化学物质。通过实际制造技术不能完全除去残留的有机溶剂。
如本文所用,“水混溶性有机溶剂”是指在室温下为液体并且与水完全混溶的有机溶剂,优选选自乙醇和丙酮。
如本文所用,“包含”选自特定峰组的多个峰的XRPD图谱意在包括具有未包括在指定峰组中的其他峰的XRPD图谱。
“EED”是指基因胚胎外胚层发育的蛋白质产物。
“PRC2”是指多梳蛋白抑制复合物2。
术语“PRC2介导的疾病或病症”是指由PRC2直接或间接调节的任何疾病或病症。这包括但不限于由EED直接或间接调节的任何疾病或病症。
术语“由EED和/或PRC2介导的疾病或病症”是指由EED和/或PRC2直接或间接调节的疾病或病症。
如本文所用,术语“患者”包括所有哺乳动物物种。
本文所用术语“对象”是指动物。通常动物是哺乳动物。“对象”还指可能受益于用EED抑制剂治疗的任何人或非人有机体。对象还指例如灵长类动物(例如人)、牛、绵羊、山羊、马、狗、猫、兔、大鼠、小鼠、鱼、鸟等。在某些实施方式中,对象是灵长类动物。在其他实施方式中,对象是人。示例性对象包括具有癌症疾病风险因素的任何年龄的人。
如本文所用,如果对象会从某种治疗中于生物学、医学或生活质量上受益,则该对象对该治疗“有需要”(优选人)。
如本文所用,术语“抑制”是指减少或抑制给定的状况、症状或病症或疾病,或者显著降低生物活动或过程的基线活性。
如本文所用,术语“治疗”或“处理”任何疾病/病症是指在哺乳动物特别是人类中的疾病/病症的治疗,并且包括:(a)改善疾病/病症,(即减缓或阻止或减少疾病/病症或其至少一种临床症状的发展);(b)缓解或调节疾病/病症(即导致疾病/病症在身体上(例如可辨别症状的稳定)、生理上(例如物理参数的稳定)或两者都消退);(c)减轻或改善至少一个物理参数,包括患者可能无法辨别的物理参数;和/或(d)预防或延迟疾病或病症的发作或发展或进展在哺乳动物中发生,特别是当此类哺乳动物易患该疾病或病症但尚未被诊断为患有该疾病或病症时。
如本文所用,“预防”或“阻止”涵盖哺乳动物特别是人类中亚临床疾病状态的预防性治疗(即预防和/或降低风险),旨在降低发生临床疾病状态的可能性。根据已知与普通人群相比增加患有临床疾病状态的风险的因素,选择患者进行预防性治疗。“预防”疗法可分为(a)一级预防和(b)二级预防。一级预防定义为在尚未呈现临床疾病状态的患者中的治疗,而二级预防定义为预防第二次发生相同或相似的临床疾病状态。
如本文所用,“风险降低”或“降低风险”包括降低临床疾病状态发展的发病率的疗法。因此,一级和二级预防疗法是降低风险的示例。
“治疗有效量”意在包括本发明化合物将引发对象的生物或医学反应的量,例如减少或抑制EED和/或PRC2活性,或改善症状,减轻病症,减缓或延缓疾病进展,或预防由PRC2介导的疾病或病症等。当应用于组合时,该术语是指引起预防或治疗效果的活性成分的组合量,无论是组合、连续或同时施用。
本文使用的缩写定义如下:“EtOH”表示乙醇,“1x”表示一次,“2x”表示两次,“3x”表示三次,“℃”表示摄氏度,“aq”表示水性的,“Col”表示列,“eq”表示当量,“g”表示克,“毫克”表示毫克,“L”表示升,“mL”表示毫升,“μL”表示微升,“N”表示正常,“M”表示摩尔浓度,“nM”表示纳摩尔浓度,“mol”表示摩尔,“mmol”表示毫摩尔,“min”表示分钟,“h”表示小时,“rt”表示室温,“RT”表示保留时间,“ON”表示过夜,“atm”表示大气压,“psi”表示磅每平方英寸,“conc.”表示浓缩物,“aq”表示水溶液,“sat”或“sat’d”表示饱和,“MW”表示分子量,“mw”或“μwave”表示微波,“mp”表示熔点,“Wt”表示重量,“MS”或“Mass Spec”表示质谱,“ESI”表示电喷雾电离质谱,“HR”表示高分辨率,“HRMS”表示高分辨率质谱,“LC-MS”表示液相色谱质谱,“HPLC”表示高压液相色谱,“RP HPLC”表示反相HPLC,“TLC”或“tlc”表示薄层色谱,“NMR”表示核磁共振光谱,“nOe”表示核的奥氏效应光谱,“H”表示质子,“δ”表示Δ,“s”代表单峰,“d”代表双峰体,“t”代表三重峰,“q”代表四重峰,“m”代表多重峰,“br”代表宽,“Hz”代表赫兹,“ee”代表对映体过量,且“α”、“β”、“R”、“S”、“E”和“Z”是本领域技术人员熟悉的立体化学名称。
一般方法
除非另有说明,否则在示例性实施例中使用以下方法。
结晶形式可通过各种方法制备,包括例如从合适的溶剂中结晶或重结晶、升华、从熔体中生长、从另一相固态转化、从超临界流体中结晶和喷射喷雾。从溶剂混合物中结晶或重结晶结晶形式的技术包括,例如,蒸发溶剂,降低溶剂混合物的温度,晶体接种分子和/或盐的过饱和溶剂混合物,冷冻干燥溶剂混合物,和向溶剂混合物中加入反溶剂(抗衡溶剂)。可以采用高通量结晶技术来制备包括多晶型物的结晶形式。
对于使用溶剂的结晶技术,溶剂或溶剂的选择通常取决于一种或多种因素,例如化合物的溶解度、结晶技术和溶剂的蒸气压。可以使用溶剂的组合,例如,可以将化合物溶解在第一溶剂中以提供溶液,然后加入反溶剂以降低化合物在溶液中的溶解度并提供晶体的形成。反溶剂是其中化合物具有低溶解度的溶剂。
在一种制备晶体的方法中,将化合物在合适的溶剂中悬浮和/或搅拌以得到浆液,可以将浆液加热以促进溶解。如本文所用,术语“浆液”是指化合物的饱和溶液,其还可含有额外量的化合物,以在给定温度下提供化合物和溶剂的非均相混合物。
可以将晶种加入任何结晶混合物中以促进结晶。接种可用于控制特定多晶型物的生长或控制结晶产物的粒度分布。通常,需要小尺寸的种子来有效地控制批次中晶体的生长。小尺寸的种子可以通过筛分、研磨或微粉化大晶体,或通过溶液的微结晶来产生。应注意晶体的研磨或微粉化,使其不导致所需晶体形式的任何结晶度变化(即,变为无定形或另一种多晶型)。
可以在真空下过滤冷却的结晶混合物,并且可以用合适的溶剂(例如冷重结晶溶剂)洗涤分离的固体,并在氮气吹扫下干燥,得到所需的结晶形式。可以通过合适的光谱或分析技术例如固态核磁共振、差示扫描量热法、X射线粉末衍射等来分析分离的固体,以确保形成产物的优选结晶形式。基于最初在结晶过程中使用的化合物的重量,所得结晶形式通常以大于约70重量%的分离产率、优选大于90重量%的分离产率的量产生。如果需要,可以将产品混合或通过网筛以使产品破碎。
结晶形式可以直接从制备化合物X的最终方法的反应介质中制备。例如,这可以通过在最终工艺步骤中使用化合物(I)可从中结晶的溶剂或溶剂混合物来实现。或者,可以通过蒸馏或溶剂添加技术获得结晶形式。用于此目的的合适溶剂包括,例如,上述非极性溶剂和极性溶剂,包括质子极性溶剂如醇,和非质子极性溶剂如酮。
X射线粉末衍射(XRPD)
使用具有CuK阳极的Bruker D8 Discover获得X射线粉末衍射(XRPD)数据。将粉末样品置于载玻片上并以X射线束为中心。样品-探测器距离约为30厘米,三帧合并。辐射为CuKα
Figure GDA0003082385510000291
收集数据2<2θ<45°,样本暴露时间至少为270秒。
导出的原子参数(坐标和温度因子)通过全矩阵最小二乘法求精。在求精中最小化的函数是Σw(|Fo|-|Fc|)2。R定义为Σ||F|-|F||/Σ|Fo|,而Rw=[Σw(|Fo|-|Fc|)2w|Fo|2]1/2其中w是基于观察到的强度误差的适当加权函数。在求精的所有阶段检查差异图。氢原子在各向同性温度因子的理想位置引入,但没有氢参数变化。
Figure GDA0003082385510000301
热重分析
使用TA Discovery TGA仪器对每种结晶形式进行热重分析。对于每次分析,用20ml/min的超高纯度氮气吹扫TGA池/样品室。在氮气吹扫下使用标准重量进行重量校准。在室温和300℃之间的温度范围内,加热速率为每分钟10℃。将重量百分比变化(wt%)相对于测量的样品温度作图。
差示扫描量热法
使用TA Discovery DSC对每种结晶形式进行差示扫描量热法。对于每次分析,用50ml/min的超高纯度氮气吹扫DSC池/样品室。仪器用高纯度铟校准。在30-300℃之间的温度范围内,加热速率为每分钟10℃。将样品重量归一化的热流相对于测量的样品温度作图。数据以瓦特/克为单位报告(“W/g”)。该图以吸热峰朝下制作。评估吸热熔融峰(熔点)的外推起始温度。
动态蒸汽吸附
在Surface Measurement Systems DVS Advantage仪器上进行动态蒸汽吸附。将大约10mg的材料装入样品盘中。将样品在10%相对湿度(RH)步骤中在25℃和50℃下在50%-90%-0%-90%-50%RH的范围内暴露于吸附/解吸循环。设定5分钟内质量变化小于0.002%的目标平衡条件,最小和最大平衡周期分别为10和360分钟。载气为氮气,流速为100mL/min。该***用饱和盐溶液校准。测量每个阶段样品的重量百分比变化(wt%)并相对目标分压作图。
Figure GDA0003082385510000311
用于表征实施例的NMR
1H NMR光谱用Bruker傅立叶变换光谱仪以如下频率操作获得:1H NMR:400MHz(Bruker).13C NMR:100MHz(Bruker).光谱数据以以下格式报告:化学位移(多重性、氢数)。化学位移以四甲基硅烷内标的ppm低场(单位,四甲基硅烷=0ppm)和/或参考溶剂峰来指定,所述参考溶剂峰在1H NMR光谱中对于CD2HSOCD3为2.49ppm,对于CD2HOD为3.30ppm,对于CD3CN为1.94和CDCl3为7.24ppm,在13C NMR谱中CD3SOCD3为39.7ppm,CD3OD为49.0ppm,CDCl3为77.0ppm。所有13C NMR光谱都是质子去耦合的。测量在室温下进行或以其他方式指定。根据相应1H NMR光谱中大多数代表性氢的积分计算溶剂残留物的量。
V.实施例
使用本文公开的方法制备、分离和表征以下实施例。以下实施例不意味限制本发明的范围。
实施例1:制备化合物A(N-((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)-8-(2-甲基吡啶-3-基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶-5-胺)
中间体3:8-溴-5-(甲硫基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶
Figure GDA0003082385510000321
5-溴-4-肼基-2-(甲硫基)嘧啶(2):向5-溴-4-氯-2-(甲硫基)嘧啶(1,49.0g,0.205mol)的乙醇(1000mL)溶液中加入肼(21.5g,0.430mol)。将反应在室温下搅拌4小时。过滤所得悬浮液,用己烷洗涤并真空干燥,得到目标化合物(44.1g,92%),为白色固体。1H-NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 2.42(s,3H),8.08(s,1H).LC-MS:[M+H]+=234.9;236.9.
中间体3:将5-溴-4-肼基-2-(甲硫基)嘧啶(2)(40.0g,0.17mol)溶于200mL原甲酸三乙酯中。将混合物加热回流并搅拌3小时。减压浓缩反应混合物,通过快速色谱法(EA:PE=1:15~1:1)纯化残余物,得到目标化合物(38.3g,92%),为白色固体。1H-NMR(400MHz,甲醇-d4)δppm 2.82(s,3H),8.03(s,1H),8.87(s,1H).LC-MS:[M+H]+=245.0;247.0.
中间体A1:8-溴-N-((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶-5-胺
Figure GDA0003082385510000331
2-溴-4-(2,2-二乙氧基乙氧基)-1-氟苯(A1.1):向3-溴-4-氟苯酚(500g,2.62mol)和2-溴-1,1-二乙氧基乙烷(670g,3.4mol)的2.0L DMF溶液中一次性加入K2CO3(1085g,7.86mol)。在N2下,将悬浮液在110℃下加热并搅拌过夜。冷却至室温后,用10.0LH2O稀释,用EtOAc(2.0L×3)萃取。将合并的有机相用盐水洗涤两次,经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。残余物用硅胶纯化(EtOAc/hexane=0:100至5:100),得到目标化合物(810g,80%),为黄色油状物。1H-NMR(400MHz,甲醇-d4)δppm 1.27(t,6H),3.65(q,2H),3.78(q,2H),3.97(d,2H),4.82(t,1H),3.97(d,2H),6.84(dd,1H),7.04(dd,1H),7.13(d,1H).
4-溴-5-氟苯并呋喃(A1.2a与区域异构体A1.2b):在95℃下,在30分钟内向PPA(1324g,3.93mol)的甲苯(2.0L)溶液中加入A1.1(810g,2.62mol)。反应混合物在95℃搅拌2小时。冷却至室温后,缓慢加入4.0L冰水。混合物用PE(2.0L×2)提取,将合并的有机相用盐水(2.0L×2)洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。残余物用硅胶纯化(EtOAc/PE=0:100至5:100),得到A1.2a和A1.2b的混合物(A1.2a:A1.2b=1:0.7,310g,55%产率),为黄色油状物。
5-氟苯并呋喃-4-甲腈(A1.3):在N2下,向A1.2a和A1.2b(310g,1.44mol)以及Zn(CN)2(253g,2.16mol)的1.0L DMF混合物中加入Pd(PPh3)4(162g,0.14mol)。反应混合物在100℃加热并搅拌18小时。冷却至室温后,混合物用5.0L水稀释,用EtOAc(1.0L×2)萃取。将合并的有机相用盐水洗涤(1L),经Na2SO4(无水)干燥,过滤并减压浓缩。残余物通过快速柱(流动相:30分钟内EtOAc/PE=1:70,保留时间=11分钟,流速:120mL/min)纯化,得到目标化合物(92g,40%),为白色固体。1H-NMR(400MHz,甲醇-d4)δppm 7.07(d,1H),7.30(dd,1H),7.89(dd,1H),8.10(dd,1H).
((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)氨基甲酸叔丁酯(A1.4):向A1.3(44.5g,276.4mmol)和Boc2O(90.0g,414.6mmol)的1.0L MeOH溶液中加入Pd/C(5g,10%wt)。将反应混合物用H2脱气并在H2下搅拌过夜。将混合物通过硅藻土过滤,用MeOH(300mL×2)洗涤,将滤液减压浓缩。残余物从PE中重结晶,得到目标化合物(61.0g,93%),为白色固体。1H-NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 1.38(s,9H),3.21(t,2H),4.12(d,2H),4.53(t,2H),6.63(dd,1H),6.86(dd,1H),7.25(br s,1H).LC-MS:[M-tBu+H]+=212.1.
(5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲胺(A1.5):A1.4(18.3g,68.5mmol)的50mLHCI/二氧六环(4mol/L)溶液在室温下搅拌4h。减压浓缩混合物。残余物用溶剂混合物(MeOH:MeCN=1:10,500mL)稀释,然后加入K2CO3(18.0g,342.5mmol)。将混合物在60℃下加热并搅拌3小时,冷却至室温,过滤,并在减压下浓缩。粗产物用硅胶纯化(MeOH:EtOAc=0:100至1:4),得到目标化合物(9.2g,80%),为黄色油状物。1H-NMR(400MHz,甲醇-d4)δppm3.27(t,2H),3.77(s,2H),4.56(t,2H),6.59(dd,1H),6.81(dd,1H).LC-MS:[M+H]+=168.1.
Figure GDA0003082385510000341
中间体A1:将A1.5(1.41g,8.2mmol)和8-溴-5-(甲硫基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶(3)(1.0g,4.1mmol)的混合物在40℃加热并搅拌16小时。冷却至室温后,将混合物用EtOAc(35mL)稀释。过滤沉淀物,用EtOAc(3mL×3)洗涤,真空干燥,得到目标化合物(1.0g,收率67%),为白色固体。1H NMR(500MHz,DMSO)δppm 3.27(t,2H),4.53(t,2H),4.66(d,2H),6.71(dd,1H),6.95(t,1H),7.85(s,1H),8.75(t,1H),9.48(s,1H).LC-MS:[M+H]+=363.7;365.7.
Figure GDA0003082385510000351
向A1(40mg,0.110mmol)在1,4-二氧六环(3mL)、MeCN(0.30mL)和水(0.30mL)的混合物中加入(2-甲基吡啶-3-基)硼酸(30.1mg,0.220mmol)、碳酸钾(45.5mg,0.330mmol)和Pd(Ph3P)4(12.69mg,10.98μmol)。将所得混合物在N2下在110℃下搅拌3小时,冷却至室温,并在真空下蒸发。将残余物在快速色谱上纯化(DCM:MeOH=10:1),得到N-((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)-8-(2-甲基吡啶-3-基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶-5-胺,为白色固体(20mg,46.0%)。
或者,如下制备N-((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)-8-(2-甲基吡啶-3-基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶-5-胺。向A1(25.5g,70mmol)、2-甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧硼杂环戊烷-2-基)-1H-吡唑(30.6g,140mmol)和NaHCO3(35.3g,420mmol)的二氧六环(2mL)与H2O(100mL)的悬液中加入PdCl2(dppf)(5.94g,612mmol)。将混合物用N2脱气,在110℃下加热1小时。将所得混合物冷却至室温并减压浓缩。通过柱色谱(EtOAc:MeOH=20:1)纯化残余物,得到14g所需产物。向产物中加入200mL丙酮,将所得悬浮液在50℃加热2小时。过滤收集白色固体,真空干燥,得到N-((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)-8-(2-甲基吡啶-3-基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶-5-胺(13.6g,52%)。1H-NMR(500MHz,DMSO-d6)δppm 2.40(s,3H),3.33(t,2H),4.56(t,2H),4.72(s,2H),6.72(dd,1H),6.96(dd,1H),7.31(dd,1H),7.66(s,1H),7.74(d,1H),8.51(d,1H),8.72(t,1H),9.49(s,1H).LC-MS:[M+H]+=376.9.
实施例2:用异丙醇(IPA)制备化合物X的形式A(N-((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)-8-(2-甲基吡啶-3-基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶-5-胺盐酸盐)(表2第1行)
在室温下,向N-((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)-8-(2-甲基吡啶-3-基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶-5-胺(6.0g,15.94mmol)在100mL IPA的悬液中滴加0.5N HCl的IPA(33.0mL,16.50mmol)溶液。将悬液在50℃下搅拌12个小时,然后冷却至室温,并搅拌5小时。过滤收集所得固体,并在40℃下真空干燥2天,得到化合物X的形式A的盐酸盐,为白色固体(6.5g,98%)。1H NMR(DMSO-d6)δppm 2.65(s,3H),3.35(t,2H),4.57(t,2H),4.74(d,2H),6.73(dd,1H),6.97(dd,1H),7.83(s,1H),7.85-7.94(m,1H),8.46(d,1H),8.80(dd,1H),9.07(t,1H),9.58(s,1H).LC-MS:[M+H]+=376.9.根据相应1H NMR光谱中大多数代表性氢的积分计算溶剂残留物的量。具体而言,代表IPA的甲基6个氢原子的在δ1.04处的积分为0.31,而2-甲基吡啶的甲基3个氢原子的在δ2.64处的积分为3。因此,IPA的摩尔百分比计算如下:0.31/6(1+0.31/6)=4.9%;而IPA的重量百分比计算如下:60x(0.31/6)/{(376.38+36.46+60x(0.31/6)}=0.74%{MW(IPA)=60,MW(化合物A)=376.40且MW(HCl)=36.46)}.
实施例3:用EtOH/H2O制备化合物X的形式A(N-((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)-8-(2-甲基吡啶-3-基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶-5-胺盐酸盐)(表2第7行)
向装有4.0g N-((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)-8-(2-甲基吡啶-3-基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶-5-胺的500mL烧瓶中加入200mL EtOH/H2O(95/5,v/v),并将混合物通过机械搅拌来搅拌。通过油浴将所得悬浮液加热至75℃并在该温度下保持1小时。向保持在75℃的悬浮液中滴加23.38mL 0.5NHCl的EtOH溶液(1.1当量)。加入盐酸后混合物变澄清。将所得溶液在75℃搅拌2小时。然后将混合物在3小时内冷却至室温,通过过滤收集得到的化合物X,为白色固体(3.5g,79.7%),并在真空下干燥6小时。根据1H NMR光谱中氢的积分计算EtOH残留物的量。具体而言,代表EtOH的甲基3个H的在δ1.06处的积分为0.01,而2-甲基吡啶的甲基3个氢原子的在δ2.65处的积分为3。因此,EtOH的摩尔百分比计算如下:0.01/3(1+0.01/3)=0.33%;而EtOH的重量百分比计算如下:46.07x(0.01/3)/{(376.38+36.46+x(0.01/3)}=0.04%{MW(EtOH)=46.07,MW(化合物A)=376.40且MW(HCl)=36.46).
实施例4:制备化合物X的形式HA
将1.0g化合物X的形式A加入到10mL乙醇/水(3:1)混合物中,得到悬液。将悬液在室温下搅拌3天。真空过滤收集所得固体,并在室温下干燥过夜。得到化合物X的形式HA(0.81g),收率77%。
实施例5:制备化合物X的形式HB
在60℃下,将200mg化合物X的形式A加入到最少量的丙酮/水(1:1)混合物中,得到澄清溶液。将溶液在室温下蒸发3至5天。真空过滤收集所得固体,并在室温下干燥过夜。获得化合物X的形式HB
在EtOH或丙酮中制备0.5N HCl:
将4.0mL市售的浓HCl(36.5%,w/w,在水中)加入96.0mL EtOH或丙酮(任选在降低的温度下),并将溶液充分混合,得到0.5N HCl的EtOH或丙酮溶液。
表2总结了实验步骤:
在50℃的样品瓶中向10mg化合物X滴加所选溶剂。当达到澄清溶液或溶剂量达到1mL时,停止加入溶剂。将所得混合物在50℃下连续搅拌2小时,然后冷却至室温,并搅拌过夜。在50℃和室温下的可溶性由所得混合物的均匀性决定。
表3总结了实验步骤:
表3中的条目1至6的实验根据实施例3中的盐形成中描述的步骤进行,但具有表3中列出的不同参数。
VI.药理学和用途
作为PRC2复合物的关键组分,EED没有内在的酶活性。但是,它对于恰当的PRC2功能至关重要。EED直接与H3K27me3结合,并且该结合事件将PRC2复合物定位于染色质底物并且变构地激活甲基转移酶活性。靶向PRC2调节EED亚基内的变构位点,可以提供新颖和独特的角度,以有利于或补充直接靶向EZH2或PRC2的SAM竞争机制。因此,靶向EED代表了用于开发治疗多种癌症的新疗法的极具吸引力的策略。特别是,需要通过靶向EED抑制PRC2活性的小分子。现已发现,目前公开的***并嘧啶衍生物可用于靶向EED治疗EED或PRC2介导的疾病或病症,特别是癌症。
本发明的化合物X的用途可以用下列任何试验步骤来证明。在生化测定中,评估了化合物X抑制EZH2、SUZ12、EED、Rbap48和AEBP五聚体复合物中PRC2活性的能力。通过在人细胞系中分析组蛋白H3赖氨酸27的甲基化来评估本发明化合物抑制PRC2细胞活性的能力。化合物X抑制癌症的能力来源于它们调节人癌细胞系活性的能力,该细胞系特异性依赖于PRC2活性以维持癌细胞生长。
通过AlphaScreen(α-筛选)进行EED-H3K27Me3肽竞争结合试验
为了评估化合物在EED-H3K27Me3竞争结合测定中的效力,将化合物在DMSO中连续稀释3倍以获得总共12个浓度。然后将每种浓度的化合物(每种75nL)通过Mosquito转移到384孔Perkin Elmer ProxiPlate 384plus板中。将在缓冲液(25mM HEPES,pH 8,0.02%Tween-20,0.5%BSA)中含有30nM EED(1-441)-His蛋白和15nM生物素-H3K27Me3(19-33)肽的8μL溶液加入孔中,然后与化合物一起温育20分钟。在临使用前通过将镍螯合物受体珠和链霉亲和素蛋白供体珠以1:1的比例(Perkin Elmer,产品号6760619C/M/R)混合到上述缓冲液中来制备AlphaScreen检测珠混合物。然后将4μL检测珠混合物加入板中并在黑暗中室温下孵育1小时。供体和受体珠的最终浓度分别为10μg/mL。在680nm的样品激发之后,使用适于用615nm滤波器进行最佳信号检测的AlphaScreen设置在EnVision(PerkinElmer)上读板。615nm处的发射信号被用来定量化合物抑制。AlphaScreen信号根据来自阳性(最大信号控制)和阴性对照(最小信号控制)的读数进行标准化,以给出剩余活性的百分比。然后使用程序Helios(Novartis)将数据拟合到剂量响应方程以获得IC50值。Helios是Novartis内部化验数据分析软件,其使用以下中描述的方法:Normolle,D.P.,Statistics in Medicine,12:2025-2042(1993);Formenko,I.等人,Computer Methods and Programs inBiomedicine,82,31-37(2006);Sebaugh,J.L.,Pharmaceutical Statistics,10:128-134(2011);Kelly,C.等人,Biometrics,46(4):1071-1085(1990);和Kahm,M.等人,Journal ofStatistical Software,33(7):(2010)(grofit:Fitting Biological Growth Curveswith R,第1-21页,获自http://www.jstatsoft.org/)。
对每种化合物进行反筛选以确定其是否干扰AlphaScreen珠子。如前面部分所述稀释化合物,通过在上述缓冲液中加入12μL 10nM生物素-miniPEG-His6肽,并在每次加入10μg/mL的珠子之前在室温孵育20分钟,进行测定。然后将板在室温下黑暗中温育1小时,然后在EnVison上读数。
EED LC-MS测定
本发明代表性化合物在DMSO中连续并分别稀释3倍,得到总共8或12个浓度。然后将每种浓度的测试化合物(每种120nL)通过Mosquito转移到384孔Perkin ElmerProxiPlate 384plus板中。将反应缓冲液(20mM Tris,pH 8.0,0.1%BSA,0.01%Triton,0.5mM DTT)中的24nM野生型PRC2(wtPRC2)复合物和2μM SAM的溶液(6μL)加入孔中,然后与测试化合物孵育20分钟。加入在反应缓冲液中的3μM肽底物H3K27Me0(组蛋白H3[21-44]-生物素)的6μL溶液以引发每个反应。反应溶液中的最终组分包括12nM wtPRC2复合物、1μMSAM、1.5μM H3K27me0肽以及不同浓度的化合物。阳性对照在不存在测试化合物的情况下由酶、1μM SAM和1.5μM底物组成,阴性对照仅由1μM SAM和1.5μM底物组成。每个反应在室温下孵育120分钟,然后通过每种淬灭溶液(含320nM d4-SAH的2.5%TFA)添加3μL而停止。将反应混合物在2000rpm下离心(Eppendorf离心机5810,Rotor A-4-62)2分钟,并用TurbulonSpray(Applied Biosystem)与Prominence UFLC(Shimadzu)偶联的API 4000三重四极杆质谱读数。然后基于来自阳性和阴性对照的值将SAH产生水平标准化以得到酶活性百分比。然后使用程序Helios将数据拟合至剂量响应方程以获得测试化合物的IC50值。
ELISA(H3K27甲基化)测定
将本发明代表性化合物在DMSO中连续并分别稀释3倍,得到总共8或12个浓度。然后将化合物加入到在384孔板中以1:500稀释培养的G401细胞中,以获得20μM的最高浓度。在ELISA步骤之前将细胞进一步培养48小时。
组蛋白提取:用PBS(10x PBS缓冲液(80g NaCl(Sigma,S3014)、2g KCl(Sigma,60128)、14.4g Na2HPO4(Sigma,S5136)、2.4g KH2PO4(Sigma,P9791)至1L水,pH至7.4)洗涤384孔板中的细胞,并加入裂解缓冲液(0.4N HCl;每孔45μL)裂解。将板在4℃温和搅动30分钟。用中和缓冲液(0.5M磷酸氢二钠,pH 12.5,1mM DTT;每孔36μL)中和细胞裂解物。搅动平板以确保在ELISA方案之前将裂解物充分混合。
ELISA方案:将细胞裂解物转移至384孔板的孔中,用PBS将最终体积调节至每孔50μL。将板密封,以2,000rpm离心2分钟,并在4℃下孵育约16小时。将板用TBST缓冲液(1×TBS(10×TBS:24.2g Tris(Sigma,T6066),80g NaCl(Sigma,S3014))至1L水并用HCl调节pH至7.6)含有0.1%吐温-20)洗涤。加入封闭缓冲液(TBST,5%BSA;每孔50μL)并将板在室温下温育1小时。除去封闭缓冲液并加入一抗(每孔30μL)。用封闭缓冲液进行以下稀释:对于抗H3K27me3抗体(Cell Signaling Technology,#9733),稀释度为1:1000;对于抗H3K27me2抗体(Cell Signaling Technology,#9288),稀释度为1:100;对于抗H3抗体(Abcam,Cat#24834),稀释度为1:1000。将一抗在板中在室温下孵育1小时。用TBST洗涤孔并在室温下与二抗孵育1小时。对于二抗,用封闭缓冲液进行以下稀释:抗兔抗体(JacksonImmunoResearch,#111-035-003),稀释度为1:2000;抗小鼠抗体(Cell signalingtechnology,#7076),稀释度为1:1000。在室温下孵育1小时后,用TBST洗涤孔。ECLsubstrate(Pierce,#34080)was added at 30μL per well and the plates werecentrifuged at 2,000rpm for 2min.The signal was read using a PerkinElmerEnvision Reader.使用H3信号对H3K27甲基化读数进行标准化,然后对照用DMSO处理的样品计算抑制百分比。然后使用程序Helios将数据拟合至剂量响应曲线以获得测试化合物的IC50值。
蛋白质印迹分析
分析了本发明的代表性化合物选择性抑制PRC2的能力。使用标准分子生物学技术进行蛋白质印迹。将细胞在SDS裂解缓冲液(Millipore,Cat#20-163)中裂解,并通过BCA蛋白质测定法测量蛋白质浓度(Pierce,Cat#PI-23221)。用于蛋白质印迹的抗体:抗EZH2(#3147)、抗H3(#9715)、抗H3K4me1(#9723)、抗H3K4me2(#9725)、抗H3K4me3(#9727)、抗H3K9me2(#9753)、抗H3K36me2(#9758)、抗H3K27me2(#9755)和抗H3K27me3(#9756)购自CellSignaling Technology(Danvers,MA,USA)。抗H3K9me1(#07-395)、抗H3K27me1(#07-448)和抗H3K36me1(#07-548)购自Millipore(Billerica,MA,USA)。抗H3K36me3(ab9050-100)购自Abcam(Cambridge,UK)。抗H3K9me3(#39161)购自Active Motif(Carlsbad,CA,USA)。
本发明化合物特异性地抑制PRC2底物H3K27的甲基化。这可以通过它们在许多人癌细胞系中抑制H3K27me2和H3K27me3的能力来证明,示例包括横纹肌样细胞(G401)和淋巴瘤细胞(WSU-DLCL2,KARPAS422,SU-DHL4)。选择性与许多其他甲基化标记相对应,例如:H3K4me2、H3K9me2、H3K36me3和H3K79me3。
细胞增殖分析
B细胞淋巴瘤细胞KARPAS422使用标准细胞培养条件在补充有15%FBS(Invitrogen,目录号10099-141)的RPMI-1640(Invitrogen,目录号#11875)中在37℃、5%CO2的潮湿培养箱中培养。为了评估PRC2抑制对细胞增殖的影响,将指数生长的细胞以1×105个细胞/mL的密度接种在12孔板(Corning,登记号CLS3513)中。细胞接种后,将本发明化合物加入细胞培养基中(浓度范围为0至100μM,3倍稀释系列)。使用Vi-CELL(BeckmanCoulter)每3-4天测定活细胞数,持续长达14天。在细胞计数的天数,补充新鲜生长培养基和化合物并将细胞拆分回1×105个细胞/mL的密度。总细胞数表示为拆分-调整的每mL活细胞。使用Prism产生剂量反应曲线和IC50值。
药代动力学性质分析
本发明化合物的药代动力学性质可通过使用下述方案确定。
将本发明的代表性化合物溶于10%PEG300、10%Solutol HS 15和80%pH 4.65乙酸盐缓冲液中,得到0.2mg/mL的终浓度,用于静脉内(IV)和口服(PO)施用。
对于大鼠PK研究,总共三只雄性Sprague Dawley大鼠各自分别用于大鼠IV和POPK研究。制剂溶液通过1mg/kg的单次推注IV和2mg/kg的单次口服强饲(PO)给药。在适当的时间点通过颈静脉插管收集血样(约150μL)。
对于小鼠PK研究,总共十二只雄性ICR小鼠分别用于IV和PO研究。制剂溶液通过1mg/kg的单次推注IV和2mg/kg的单次口服强饲(PO)给药。在适当的时间点于异氟醚麻醉后通过眼眶后穿刺(~150μL/小鼠)或通过心脏穿刺(终末收集)(n=3)收集血样(约150μL)。
将样品收集在含有K3-EDTA的试管中并储存在冰上直至离心。将血样在2-8℃下以约8000rpm离心6分钟,分离所得血浆并在约-80℃冷冻保存。添加内标后,使用校准曲线通过LC-MS/MS定量血浆样品。PK参数包括浓度曲线下面积(AUC)、平均停留时间(MRT)、血浆清除率(Cl)、稳态分布容积(Vdss)、消除半衰期(t1/2)、最大浓度(Cmax)、最大浓度时间(Tmax)和口服生物利用度(F%),使用以下等式计算:
Figure GDA0003082385510000421
Figure GDA0003082385510000422
t是时间C是时间(t)时的血浆浓度;
剂量iv是静脉内给药的剂量,剂量口服是口服给药的剂量。
CI=剂量iv/AUC
t1/2=0.693 x MRT
Vdss=Cl*MRT
F%=(剂量iv x AUC口服)/剂量口服 x AUCiv)x 100%
高通量平衡溶解度测定方案
首先将本发明化合物以10mM溶解在纯DMSO中。然后将20μL每种DMSO储备溶液转移到96孔板上的6个孔中。用GeneVac溶剂蒸发器在30℃、1毫巴真空下干燥DMSO溶剂1小时。在加入200μL缓冲溶液(pH 6.8或FaSSIF)后,将板密封并在室温下以160rpm摇动24小时。将板以3750rpm离心20分钟,将5μL上清液与495μL MeOH/H2O(1:1)混合。通过一系列稀释制备0.01μM、0.1μM、1μM、10μM储备溶液用于校准曲线。使用校准曲线通过HPLC或LC/MS定量上清液。根据上清液的浓度确定高通量平衡溶解度。
小鼠异种移植模型的功效研究
进行的所有实验均在AAALAC认证的设施中在雌性无胸腺Nude-nu小鼠中进行。将动物在SPF条件下保持在恒定温度和湿度(即20-26℃;40-70%)的各个通气笼中,每个笼中有5只或更少的动物。动物可以自由获得辐照灭菌的干燥颗粒食物和无菌饮用水。所有步骤和方案均经动物护理和使用机构批准。
将细胞Karpas 422人B细胞淋巴瘤在补充有15%FBS(Gibco;10099-141)和1%PenStrep(Gibco;15140-122)的RPMI-1640培养基(Gibco;11875-093)在37℃空气中5%CO2的气氛中培养。将细胞维持在悬浮培养物中,浓度为0.5-2×106个细胞/ml。细胞在每2~4天以1:3拆分。为了建立异种移植肿瘤模型,收集细胞,悬浮于PBS中,与Matrigel(BDBioscience)以1:1的体积比以1x108个细胞/mL的浓度混合,然后以每只动物5×106个细胞的浓度皮下注射到balb/c裸小鼠(Vital River)的右侧。
将该化合物配制成0.5%甲基纤维素(MC)和0.5%Tween 80的50mM pH6.8缓冲液(根据USP内部制备)中的悬浮液,并通过管饲法以特定剂量口服给药。
当平均肿瘤体积达到100-300mm3时开始治疗。定期监测肿瘤生长和体重。用卡尺手动测量异种移植肿瘤的两个最大直径,宽度(W)和长度(L),并使用下式估算肿瘤体积:0.5x L x W2.
适用时,结果表示为平均值±SEM。使用GraphPad Prism 5.00(GraphPadSoftware)进行图形化和统计学分析。统计分析肿瘤和体重变化数据。如果数据的方差是正态分布的(Bartlett等方差检验),则使用单因素方差分析和事后Dunnet检验对数据进行分析,以比较治疗组与对照组。事后Tukey检验用于组内比较。否则,使用Kruskal-Wallis排名检验事后Dunn's。
作为效力的度量,%T/C值在实验结束时根据以下公式计算:
(Δ肿瘤体积治疗后/Δ肿瘤体积对照)*100
根据以下公式计算肿瘤消退:
-(Δ肿瘤体积治疗后/Δ肿瘤体积治疗开始时)*100
其中Δ肿瘤体积代表评估日的平均肿瘤体积减去实验开始时的平均肿瘤体积。
N-((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)-8-(2-甲基吡啶-3-基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶-5-胺在EED(a)Alphascreen结合鉴定、(b)LC-MS鉴定和(c)ELISA鉴定的分析中测试,发现其具有EED抑制活性。
Figure GDA0003082385510000441
N-((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)-8-(2-甲基吡啶-3-基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶-5-胺处理14天后,B细胞淋巴瘤细胞KARPAS422的抗增殖活性(IC50值)为0.0030μM。
因此,已发现N-((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)-8-(2-甲基吡啶-3-基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶-5-胺抑制EED,因此可用于治疗与EED和PRC2相关的疾病或病症,包括但不限于弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)、滤泡性淋巴瘤、其他淋巴瘤、白血病、多发性骨髓瘤、间皮瘤、胃癌、恶性横纹肌瘤、肝细胞癌、***癌,乳腺癌、胆管癌和胆囊癌、膀胱癌、脑肿瘤包括神经母细胞瘤、胶质瘤、胶质母细胞瘤和星形细胞瘤、***、结肠癌、黑色素瘤、子宫内膜癌、食管癌、头颈癌、肺癌、鼻咽癌、卵巢癌、胰腺癌、肾细胞癌、直肠癌、甲状腺癌、甲状旁腺肿瘤、子宫肿瘤和选自横纹肌肉瘤(RMS)、卡波济肉瘤、滑膜肉瘤、骨肉瘤和尤因肉瘤的软组织肉瘤。
V.药物组合物和组合
“药学上可接受的载体(稀释剂或赋形剂)”是指本领域通常接受的用于将生物活性剂递送至动物、特别是哺乳动物的介质,包括通常认为是安全的(GRAS)溶剂、分散介质、包衣、表面活性剂、抗氧化剂、防腐剂(如抗菌剂、抗真菌剂)、等渗剂、吸收延迟剂、盐、防腐剂、药物稳定剂、粘合剂、缓冲剂(如马来酸、酒石酸、乳酸、柠檬酸、醋酸、碳酸氢钠,碳酸氢钠等)、崩解剂、润滑剂、甜味剂、调味剂、染料等及其组合,如本领域技术人员所已知(参见,例如,Allen,L.V.,Jr.等人,Remington:The Science and Practice of Pharmacy(2卷),第22版,Pharmaceutical Press(2012)。可以使用常规的溶解和混合步骤制备制剂。例如,在存在上述一种或多种赋形剂的情况下,将原料药物质(即,本发明化合物或化合物的稳定形式(例如,与环糊精衍生物或其它已知络合剂的络合物))溶解在适当的溶剂中。
化合物X可通过任何适当的方法用于以本文描述的任何用途施用,例如口服,例如片剂、胶囊(每个胶囊包括缓释或定时释放制剂)、丸剂、粉末、颗粒、酏剂、酊剂、混悬液(包括纳米混悬液、微悬浮液、喷雾干燥分散体)、糖浆和乳剂;舌下;颊部;肠胃外,如皮下注射、静脉内注射、肌内注射或胸骨内注射或输注技术(如无菌注射水溶液或非水溶液或混悬剂);鼻腔,包括鼻腔膜的给药,如吸入喷雾;局部的,如乳膏或软膏的形式;或直肠,如栓剂形式。它们可以单独给药,但通常与基于所选给药途径和标准药学实践与所选的药物载体一起给药。
通常将化合物X配制成药物剂型,以提供易于控制的药物剂量,并为患者提供优雅且易于操作的产品。当然,本发明化合物的剂量方案将根据已知的因素而变化,例如特定制剂的药效学特征及其给药方式和途径;接受者的物种、年龄、性别、健康、医疗条件和重量;症状的性质和程度;同时治疗的种类;治疗频率;给药途径、患者的肾和肝功能以及期望的效果。化合物X可以单日剂量给药,或者总日剂量可以每天分两次、三次或四次给药。
在某些情况下,将化合物X与至少一种另外的药物(或治疗)试剂,例如其他抗癌剂、免疫调节剂、抗过敏剂、抗恶心剂(或抗呕吐剂)、止痛剂、细胞保护剂及其组合联合应用可能是有利的。
术语“组合疗法”是指施用两种或更多种治疗剂以治疗本发明中描述的治疗性疾病、病症或病状。这种施用包括以基本上同时的方式共同施用这些治疗剂,例如在具有固定比例的活性成分的单一胶囊中。或者,这种施用包括对每个活性成分在多个或分开的容器(例如胶囊、粉末和液体)中进行联合施用。化合物X和另外的治疗剂可以通过相同的施用途径或不同的施用途径来施用。在施用前可以将粉末和/或液体重溶或稀释到所需的剂量。此外,这种施用也包括以顺序方式在大约同时或不同时间使用每种类型的治疗剂。无论哪种情况,治疗方案将提供药物组合在治疗本文所述病症或紊乱中的有益效果。
考虑用于联合治疗的一般化疗剂包括阿那曲唑
Figure GDA0003082385510000461
比卡鲁胺
Figure GDA0003082385510000462
硫酸博来霉素
Figure GDA0003082385510000463
白消安
Figure GDA0003082385510000464
白消安注射液
Figure GDA0003082385510000465
卡培他滨
Figure GDA0003082385510000466
N4-戊氧羰基-5-脱氧-5-氟胞苷、卡铂
Figure GDA0003082385510000467
卡莫司汀
Figure GDA0003082385510000468
苯丁酸氮芥
Figure GDA0003082385510000469
顺铂
Figure GDA00030823855100004610
克拉屈滨
Figure GDA00030823855100004611
环磷酰胺(
Figure GDA00030823855100004612
Figure GDA00030823855100004613
)、阿糖胞苷、胞嘧啶阿糖胞苷
Figure GDA00030823855100004614
阿糖胞苷脂质体注射液
Figure GDA00030823855100004615
达卡巴嗪
Figure GDA00030823855100004616
放线菌素(放线菌素D,Cosmegan)、盐酸柔红霉素
Figure GDA00030823855100004617
柠檬酸柔红霉素脂质体注射液
Figure GDA00030823855100004618
***、多西他赛
Figure GDA00030823855100004619
盐酸多柔比星
Figure GDA00030823855100004620
依托泊苷
Figure GDA00030823855100004621
磷酸氟达拉滨
Figure GDA00030823855100004622
5-氟尿嘧啶
Figure GDA00030823855100004623
Figure GDA00030823855100004624
氟他胺
Figure GDA00030823855100004625
替扎他滨、吉西他滨(二氟脱氧胞苷)、羟基脲
Figure GDA00030823855100004626
伊达比星
Figure GDA00030823855100004627
异环磷酰胺
Figure GDA00030823855100004628
伊立替康
Figure GDA00030823855100004629
L-天冬酰胺酶
Figure GDA00030823855100004630
甲酰四氢叶酸钙、美法仑
Figure GDA00030823855100004631
6-巯基嘌呤
Figure GDA00030823855100004632
甲氨蝶呤
Figure GDA00030823855100004633
米托蒽醌
Figure GDA00030823855100004634
麦罗塔、紫杉醇
Figure GDA00030823855100004635
白蛋白结合型紫杉醇
Figure GDA00030823855100004636
菲尼克斯(Yttrium90/MX-DTPA)、喷司他丁、以聚本苯丙生20为载体的卡莫司汀植入剂
Figure GDA00030823855100004637
柠檬酸他莫昔芬
Figure GDA00030823855100004638
替尼泊苷
Figure GDA00030823855100004639
6-硫鸟嘌呤、噻替派、替拉扎明
Figure GDA00030823855100004640
注射用托泊替康盐酸盐
Figure GDA00030823855100004641
长春碱
Figure GDA00030823855100004642
长春新碱
Figure GDA00030823855100004643
和长春瑞滨
Figure GDA00030823855100004644
特别感兴趣的与化合物X组合的抗癌剂可包括:细胞周期素依赖性激酶(CDK)抑制剂、检查点激酶(CHK)抑制剂、C-RAF抑制剂、磷酸肌醇3-激酶(PI3K)抑制剂、BCL-2抑制剂、丝裂原活化蛋白激酶(MEK)抑制剂、拓扑异构酶II抑制剂、SRC抑制剂、组蛋白去乙酰化酶(HDAC)抑制剂、抗肿瘤抗生素、去甲基化剂和抗***。
一些患者在给药期间或之后可能经历对本发明化合物和/或其他抗癌剂的过敏反应;因此,通常施用抗过敏剂以最小化过敏反应的风险。合适的抗过敏剂包括皮质类固醇(Knutson,S.等人,PLoS One,DOI:10.1371/journal.pone.0111840(2014)),例如***(例如
Figure GDA0003082385510000471
),倍氯米松(例如
Figure GDA0003082385510000472
),氢化可的松(也称为可的松,氢化可的松琥珀酸钠,氢化可的松磷酸钠,以商品名
Figure GDA0003082385510000473
磷酸氢化可的松、
Figure GDA0003082385510000474
Figure GDA0003082385510000475
Figure GDA0003082385510000476
出售),***龙(以商品名
Figure GDA0003082385510000477
Figure GDA0003082385510000478
Figure GDA0003082385510000479
出售),***(以商品名
Figure GDA00030823855100004710
Figure GDA00030823855100004711
Figure GDA00030823855100004712
销售),甲基强的松龙(也称为6-甲基强的松龙,甲基强的松龙醋酸酯,甲基强的松龙琥珀酸钠,以商品名
Figure GDA00030823855100004713
Figure GDA00030823855100004714
Figure GDA00030823855100004715
销售);抗组胺药,例如苯海拉明(例如
Figure GDA00030823855100004716
),羟嗪和赛庚啶;和支气管扩张剂,例如β-肾上腺素能受体激动剂,沙丁胺醇(例如
Figure GDA00030823855100004717
)和特布他林
Figure GDA00030823855100004718
特别感兴趣的与本发明化合物组合的免疫调节剂包括以下一或多种:共刺激分子的激活剂或免疫检查点分子的抑制剂(例如,PD-1、PD-L1、LAG-3、TIM-3或CTLA4的一或多种抑制剂)或其任何组合。
在某些实施方式中,免疫调节剂是共刺激分子的激活剂。在一个实施方式中,共刺激分子的激动剂选自OX40、CD2、CD27、CDS、ICAM-1、LFA-1(CD11a/CD18)、ICOS(CD278)、4-1BB(CD137)、GITR、CD30、CD40、BAFFR、HVEM、CD7、LIGHT、NKG2C、SLAMF7、NKp80、CD160、B7-H3或CD83配体的激动剂(例如,激动剂抗体或其抗原结合片段,或可溶性融合物)。
在某些实施方式中,免疫调节剂是免疫检查点分子的抑制剂。在一个实施方式中,免疫调节剂是PD-1、PD-L1、PD-L2、CTLA4、TIM3、LAG3、VISTA、BTLA、TIGIT、LAIR1、CD160、2B4和/或TGFRβ的抑制剂。在一个实施方式中,免疫检查点分子的抑制剂抑制PD-1、PD-L1、LAG-3、TIM-3或CTLA4,或其任何组合。术语“抑制”或“抑制剂”包括给定分子(例如免疫检查点抑制剂)的某些参数(例如活性)的减少。例如,该术语包括至少5%、10%、20%、30%、40%或更多的活性(例如PD-1或PD-L1活性)的抑制。因此,抑制不需要是100%。
一些患者在施用本发明的化合物和/或其他抗癌剂期间和之后可能感到恶心;因此,用抗呕吐剂预防恶心(上胃)和呕吐。合适的止吐药包括阿瑞匹坦
Figure GDA0003082385510000481
昂丹司琼
Figure GDA0003082385510000482
盐酸格拉司琼
Figure GDA0003082385510000483
劳拉西泮
Figure GDA0003082385510000484
***
Figure GDA0003082385510000485
丙氯拉嗪
Figure GDA0003082385510000486
卡索匹坦(
Figure GDA0003082385510000487
Figure GDA0003082385510000488
),及其组合。
通常处方用于缓解治疗期间所经历疼痛的药物以使患者更舒适。通常使用常见的非处方镇痛药,如
Figure GDA0003082385510000489
然而,阿片类镇痛药如氢可酮/醋氨酚或氢可酮/对乙酰氨基酚(如
Figure GDA00030823855100004810
)、***(如
Figure GDA00030823855100004811
Figure GDA00030823855100004812
)、羟考酮(如
Figure GDA00030823855100004813
Figure GDA00030823855100004814
)、盐酸羟***酮
Figure GDA00030823855100004815
芬太尼(如
Figure GDA00030823855100004816
)也适用于中度或重度疼痛。
为了保护正常细胞免受治疗毒性并限制器官毒性,可以使用细胞保护剂(例如神经保护剂、自由基清除剂、心脏保护剂、蒽环类外渗中和剂、营养素等)作为辅助疗法。合适的细胞保护剂包括氨磷汀
Figure GDA00030823855100004817
谷氨酰胺、地美司钠
Figure GDA00030823855100004818
美司钠
Figure GDA00030823855100004819
右雷佐生(
Figure GDA00030823855100004820
Figure GDA00030823855100004821
)、扎利罗登
Figure GDA00030823855100004822
和甲酰四氢叶酸(也称为亚叶酸钙、亚叶酸因子和亚叶酸)。
通过编号、通用名或商品名识别的活性化合物的结构可以取自标准纲要“TheMerck Index”的实际版本或来自数据库,例如国际专利(例如IMS World Publications)。
在一个实施方式中,本发明提供药物组合物,其包含化合物X以及适于施用于人或动物对象的药学上可接受载体,单独使用或与其他抗癌药物一起使用。
在一个实施方式中,本发明提供治疗患有细胞增殖性疾病(例如癌症)的人或动物对象的方法。本发明提供治疗需要这种治疗的人或动物对象的方法,包括向对象施用治疗有效量的本发明化合物(例如,本发明化合物)或其药学上可接受的盐,单独使用或与其他抗癌药物联合使用。
特别地,组合物可以作为组合治疗剂一起配制或分开施用。
在用于治疗恶性肿瘤的组合疗法中,化合物X和其他抗癌剂可以同时、同步或没有特定的时间限制地顺序施用其中这种施用在对象体内提供治疗有效水平的两种化合物。
在一个优选的实施方式中,化合物X和其他抗癌剂通常通过输注或口服以任何顺序依次施用。给药方案可根据疾病的阶段、患者的身体状况、个体药物的安全性、各药物的耐受性以及施用组合的主治医师和医疗从业人员所熟知的其他标准而变化。本发明化合物和其他抗癌剂可以根据用于治疗的特定周期在彼此间隔几分钟、小时、天甚至几周内给药。此外,该周期可以包括在治疗周期中以一种药物比另一种药物更频繁地施用,并且在每次给药时以不同的剂量施用。
在本发明的另一个方面,提供了包括化合物X和本文所公开的组合伴侣的试剂盒。代表性试剂盒包括(a)化合物X,(b)至少一种组合伴侣,例如如上所述,其中所述试剂盒可包含包装说明书或包括施用说明的其他标记。
化合物X还可以与已知的治疗方法有利地结合使用,例如施用激素或特别是放射。化合物X尤其可以用作放射增敏剂,特别是用于治疗对放射疗法表现出差的敏感性的肿瘤。
在本发明的另一个方面,提供了包括化合物X和本文所公开的组合伴侣的试剂盒。代表性试剂盒包括(a)化合物X,(b)至少一种组合伴侣,例如如上所述,其中所述试剂盒可包含包装说明书或包括施用说明的其他标记。
在本发明的组合疗法中,化合物X和其他治疗试剂可以由相同或不同的制造商制造和/或配制。此外,可以将化合物X和其他治疗剂(或药剂)一起放入联合疗法中:(i)在向医师发布组合产品之前(例如在药盒包含化合物X和其他治疗剂的情况下);(ii)在施用前不久由医师自己(或在医师指导下);(iii)患者本身,例如在顺序施用化合物X和其他治疗剂的过程中。
用于应用的药物组合物(或制剂)可以根据用于施用药物的方法以多种方式包装。通常,用于分配的制品包括其中以适当的形式置有药物制剂的容器。合适的容器是本领域技术人员熟知的,包括诸如瓶子(塑料和玻璃)、小袋、安瓿、塑料袋、金属圆筒等材料。容器还可以包括防篡改组件,以防止对包装内容物的不当访问。此外,容器在其上放置了描述容器内容的标签。标签还可以包括适当的警告。

Claims (20)

1.一种N-((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)-8-(2-甲基吡啶-3-基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶-5-胺盐酸盐的结晶形式,其具有包含以下2θ值的X射线粉末衍射图(CuKα
Figure FDA0003000927890000011
):12.5±0.1、13.0±0.1、14.2±0.1、18.7±0.1、25.2±0.1和30.8±0.1,其中所述结晶形式含有少于0.5重量%的残余有机溶剂,且其中所述有机溶剂是选自下组的水混溶性有机溶剂:乙醇和丙酮。
2.如权利要求1所述的结晶形式,其中所述结晶形式含有小于0.2重量%的所述残余有机溶剂。
3.如权利要求1所述的结晶形式,其中所述结晶形式含有小于0.1重量%的所述残余有机溶剂。
4.通过包括以下步骤的方法获得的如权利要求1-3中任一项所述的N-((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)-8-(2-甲基吡啶-3-基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶-5-胺盐酸盐的结晶形式:
1)将N-((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)-8-(2-甲基吡啶-3-基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶-5-胺悬于水和所述水混溶性有机溶剂的混合物中;
2)将所得悬浮液加热至50℃-75℃;
3)用盐酸将所得悬浮液酸化,形成澄清溶液,同时保持温度在50℃-75℃;和
4)降低所得溶液的温度,得到N-((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)-8-(2-甲基吡啶-3-基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶-5-胺盐酸盐的所述结晶形式。
5.如权利要求4所述的N-((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)-8-(2-甲基吡啶-3-基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶-5-胺盐酸盐的结晶形式,
其中,在步骤3)中,通过在水和所述水混溶性有机溶剂的混合物中加入0.5N HCl的溶液来酸化所得悬浮液,同时保持温度在50-75℃。
6.((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)-8-(2-甲基吡啶-3-基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶-5-胺盐酸盐的水合固体形式。
7.如权利要求6所述的水合固体形式,其中所述水合形式是一水合物形式HA
8.如权利要求6所述的水合固体形式,其中所述水合形式是二水合物形式HB
9.如权利要求7所述的水合固体形式,其具有包含以下2θ值(CuKα
Figure FDA0003000927890000021
)的X射线粉末衍射图案:13.8±0.1、20.8±0.1、26.2±0.1、26.7±0.1和28.2±0.1。
10.如权利要求8所述的水合固体形式,其具有包含以下2θ值(CuKα
Figure FDA0003000927890000022
)的X射线粉末衍射图案:9.0±0.1、17.1±0.1、22.8±0.1、26.9±0.1和35.3±0.1。
11.药物组合物,其包含一种或多种药学上可接受的载体和权利要求1-5中任一项所述的N-((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)-8-(2-甲基吡啶-3-基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶-5-胺盐酸盐的所述结晶形式或如权利要求6-10中任一项所述的((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)-8-(2-甲基吡啶-3-基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶-5-胺盐酸盐的水合固体形式。
12.如权利要求11所述的药物组合物,其进一步包括至少一种附加治疗剂。
13.如权利要求12所述的药物组合物,其中所述至少一种附加治疗剂选自抗癌剂、免疫调节剂、抗过敏剂、止吐剂、止痛剂、细胞保护剂及其组合。
14.权利要求1-5中任一项所述的N-((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)-8-(2-甲基吡啶-3-基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶-5-胺盐酸盐的结晶形式或如权利要求6-10中任一项所述的((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)-8-(2-甲基吡啶-3-基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶-5-胺盐酸盐的水合固体形式在制备用于治疗由EED和/或PRC2介导的疾病或病症的药物中的用途。
15.如权利要求14所述的用途,其中所述疾病或病症选自淋巴瘤、白血病、多发性骨髓瘤、间皮瘤、胃癌、恶性横纹肌瘤、肝细胞癌、***癌,乳腺癌、胆管和胆囊癌、膀胱癌、脑肿瘤、***、结肠癌、黑色素瘤、子宫内膜癌、食管癌、头颈癌、肺癌、鼻咽癌、卵巢癌、胰腺癌、肾细胞癌、直肠癌、甲状腺癌、甲状旁腺肿瘤、子宫肿瘤和软组织肉瘤。
16.如权利要求15所述的用途,其中所述疾病或病症为选自下组的淋巴瘤:弥漫性大B细胞淋巴瘤和滤泡性淋巴瘤。
17.如权利要求15所述的用途,其中所述疾病或病症为选自下组的脑肿瘤:神经母细胞瘤、神经鞘瘤、胶质瘤、胶质母细胞瘤和星形细胞瘤。
18.如权利要求15所述的用途,其中所述疾病或病症为胃癌。
19.制备N-((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)-8-(2-甲基吡啶-3-基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶-5-胺盐酸盐的结晶形式的方法,所述结晶形式具有包含以下2θ值的X射线粉末衍射图(CuKα
Figure FDA0003000927890000031
):12.5±0.1、13.0±0.1、14.2±0.1、18.7±0.1、25.2±0.1和30.8±0.1,所述方法包括以下步骤:
1)将N-((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)-8-(2-甲基吡啶-3-基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶-5-胺悬于水和水混溶性有机溶剂的混合物中,其中所述水混溶性有机溶剂选自:乙醇和丙酮;
2)将所得悬浮液加热至50℃-75℃;
3)用盐酸将所得悬浮液酸化,形成澄清溶液,同时保持温度在50℃-75℃;和
降低所得溶液的温度,得到N-((5-氟-2,3-二氢苯并呋喃-4-基)甲基)-8-(2-甲基吡啶-3-基)-[1,2,4]***并[4,3-c]嘧啶-5-胺盐酸盐的所述结晶形式。
20.权利要求19所述的方法,其特征在于:
在步骤3)中,通过在水和所述水混溶性有机溶剂的混合物中加入0.5N HCl的溶液来酸化所得悬浮液,同时保持温度在50-75℃。
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