TR201816438T4 - Katalizörsüz yüzey işlevselleştirme ve polimer aşılama. - Google Patents
Katalizörsüz yüzey işlevselleştirme ve polimer aşılama. Download PDFInfo
- Publication number
- TR201816438T4 TR201816438T4 TR2018/16438T TR201816438T TR201816438T4 TR 201816438 T4 TR201816438 T4 TR 201816438T4 TR 2018/16438 T TR2018/16438 T TR 2018/16438T TR 201816438 T TR201816438 T TR 201816438T TR 201816438 T4 TR201816438 T4 TR 201816438T4
- Authority
- TR
- Turkey
- Prior art keywords
- optionally substituted
- alkyl
- silane
- substrate
- group
- Prior art date
Links
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 title claims abstract description 51
- 238000006557 surface reaction Methods 0.000 title 1
- 239000000758 substrate Substances 0.000 claims abstract description 106
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract description 71
- BLRPTPMANUNPDV-UHFFFAOYSA-N Silane Chemical compound [SiH4] BLRPTPMANUNPDV-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 35
- 229910000077 silane Inorganic materials 0.000 claims abstract description 33
- 239000000017 hydrogel Substances 0.000 claims abstract description 21
- 150000001925 cycloalkenes Chemical class 0.000 claims abstract description 19
- 150000004756 silanes Chemical class 0.000 claims abstract description 17
- 150000002848 norbornenes Chemical class 0.000 claims abstract 6
- 125000000217 alkyl group Chemical group 0.000 claims description 55
- 125000003118 aryl group Chemical group 0.000 claims description 52
- 125000000623 heterocyclic group Chemical group 0.000 claims description 51
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 claims description 34
- 239000001257 hydrogen Substances 0.000 claims description 34
- JFNLZVQOOSMTJK-KNVOCYPGSA-N norbornene Chemical compound C1[C@@H]2CC[C@H]1C=C2 JFNLZVQOOSMTJK-KNVOCYPGSA-N 0.000 claims description 31
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims description 24
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 claims description 23
- 125000001072 heteroaryl group Chemical group 0.000 claims description 19
- 125000004429 atom Chemical group 0.000 claims description 17
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 claims description 12
- 125000003178 carboxy group Chemical class [H]OC(*)=O 0.000 claims description 10
- 150000002825 nitriles Chemical class 0.000 claims description 10
- OAKJQQAXSVQMHS-UHFFFAOYSA-N hydrazine Substances NN OAKJQQAXSVQMHS-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 9
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 8
- 125000005647 linker group Chemical group 0.000 claims description 8
- 150000003536 tetrazoles Chemical class 0.000 claims description 8
- 125000004104 aryloxy group Chemical group 0.000 claims description 7
- 125000000852 azido group Chemical group *N=[N+]=[N-] 0.000 claims description 7
- 125000000753 cycloalkyl group Chemical group 0.000 claims description 7
- 150000007857 hydrazones Chemical class 0.000 claims description 7
- XUIMIQQOPSSXEZ-UHFFFAOYSA-N Silicon Chemical group [Si] XUIMIQQOPSSXEZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 6
- 239000002245 particle Substances 0.000 claims description 6
- 125000005017 substituted alkenyl group Chemical group 0.000 claims description 6
- 125000000547 substituted alkyl group Chemical group 0.000 claims description 6
- 125000003107 substituted aryl group Chemical group 0.000 claims description 6
- 125000000524 functional group Chemical group 0.000 claims description 5
- 150000002429 hydrazines Chemical class 0.000 claims description 5
- 125000004435 hydrogen atom Chemical class [H]* 0.000 claims description 5
- 125000000449 nitro group Chemical group [O-][N+](*)=O 0.000 claims description 5
- 150000003573 thiols Chemical class 0.000 claims description 5
- 239000012634 fragment Substances 0.000 claims description 4
- 229910052736 halogen Inorganic materials 0.000 claims description 3
- 150000002367 halogens Chemical class 0.000 claims description 3
- 230000003100 immobilizing effect Effects 0.000 claims description 3
- 150000004905 tetrazines Chemical class 0.000 claims description 3
- URYYVOIYTNXXBN-OWOJBTEDSA-N trans-cyclooctene Chemical compound C1CCC\C=C\CC1 URYYVOIYTNXXBN-OWOJBTEDSA-N 0.000 claims description 3
- CWGBFIRHYJNILV-UHFFFAOYSA-N (1,4-diphenyl-1,2,4-triazol-4-ium-3-yl)-phenylazanide Chemical compound C=1C=CC=CC=1[N-]C1=NN(C=2C=CC=CC=2)C=[N+]1C1=CC=CC=C1 CWGBFIRHYJNILV-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 125000005553 heteroaryloxy group Chemical group 0.000 claims description 2
- 125000002768 hydroxyalkyl group Chemical group 0.000 claims description 2
- 125000005415 substituted alkoxy group Chemical group 0.000 claims description 2
- 125000004356 hydroxy functional group Chemical class O* 0.000 claims 3
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 abstract description 39
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 abstract description 39
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 abstract description 39
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 abstract description 33
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 abstract description 32
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 abstract description 5
- 239000002777 nucleoside Substances 0.000 abstract description 4
- 150000003833 nucleoside derivatives Chemical class 0.000 abstract description 4
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 abstract description 4
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 abstract description 2
- 230000021615 conjugation Effects 0.000 abstract description 2
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 abstract description 2
- 238000001712 DNA sequencing Methods 0.000 abstract 1
- -1 Benzoyl BOC Chemical class 0.000 description 81
- 125000005843 halogen group Chemical group 0.000 description 46
- VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N Silicium dioxide Chemical compound O=[Si]=O VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 37
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 33
- 125000004122 cyclic group Chemical group 0.000 description 33
- 125000000304 alkynyl group Chemical group 0.000 description 32
- 125000004432 carbon atom Chemical group C* 0.000 description 32
- 125000003342 alkenyl group Chemical group 0.000 description 31
- 125000004452 carbocyclyl group Chemical group 0.000 description 31
- 125000004169 (C1-C6) alkyl group Chemical group 0.000 description 29
- 239000011230 binding agent Substances 0.000 description 29
- 125000003545 alkoxy group Chemical group 0.000 description 28
- 125000002947 alkylene group Chemical group 0.000 description 26
- 125000001313 C5-C10 heteroaryl group Chemical group 0.000 description 24
- 238000000576 coating method Methods 0.000 description 23
- 125000005842 heteroatom Chemical group 0.000 description 23
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 23
- 125000004191 (C1-C6) alkoxy group Chemical group 0.000 description 19
- 125000001188 haloalkyl group Chemical group 0.000 description 18
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 description 17
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 17
- 125000004438 haloalkoxy group Chemical group 0.000 description 17
- 150000002431 hydrogen Chemical class 0.000 description 17
- 239000011248 coating agent Substances 0.000 description 16
- 239000000463 material Substances 0.000 description 16
- 239000000377 silicon dioxide Substances 0.000 description 16
- 125000001424 substituent group Chemical group 0.000 description 16
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 15
- 239000011521 glass Substances 0.000 description 15
- 125000000171 (C1-C6) haloalkyl group Chemical group 0.000 description 14
- HRPVXLWXLXDGHG-UHFFFAOYSA-N Acrylamide Chemical compound NC(=O)C=C HRPVXLWXLXDGHG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 14
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 14
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 14
- UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N Hydrogen Chemical compound [H][H] UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 13
- 239000004793 Polystyrene Substances 0.000 description 13
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 13
- 229910052751 metal Inorganic materials 0.000 description 13
- 239000002184 metal Substances 0.000 description 13
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 13
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 13
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 13
- 239000002585 base Substances 0.000 description 12
- 125000004404 heteroalkyl group Chemical group 0.000 description 12
- 125000004737 (C1-C6) haloalkoxy group Chemical group 0.000 description 11
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 11
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 11
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 11
- 125000004450 alkenylene group Chemical group 0.000 description 10
- 150000007523 nucleic acids Chemical group 0.000 description 10
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 150000001345 alkine derivatives Chemical group 0.000 description 9
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 9
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 9
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 9
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 9
- 229910052717 sulfur Inorganic materials 0.000 description 9
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N Diethyl ether Chemical compound CCOCC RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- NINIDFKCEFEMDL-UHFFFAOYSA-N Sulfur Chemical compound [S] NINIDFKCEFEMDL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 150000001721 carbon Chemical group 0.000 description 8
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 8
- 125000003518 norbornenyl group Chemical group C12(C=CC(CC1)C2)* 0.000 description 8
- 229920003023 plastic Polymers 0.000 description 8
- 239000004033 plastic Substances 0.000 description 8
- 238000002444 silanisation Methods 0.000 description 8
- 239000011593 sulfur Substances 0.000 description 8
- 125000003396 thiol group Chemical group [H]S* 0.000 description 8
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 150000001540 azides Chemical class 0.000 description 7
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 7
- 125000004414 alkyl thio group Chemical group 0.000 description 6
- 150000002148 esters Chemical class 0.000 description 6
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 6
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 6
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 6
- 238000007363 ring formation reaction Methods 0.000 description 6
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 6
- YUYCVXFAYWRXLS-UHFFFAOYSA-N trimethoxysilane Chemical compound CO[SiH](OC)OC YUYCVXFAYWRXLS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 125000004209 (C1-C8) alkyl group Chemical group 0.000 description 5
- 108091093088 Amplicon Proteins 0.000 description 5
- YMWUJEATGCHHMB-UHFFFAOYSA-N Dichloromethane Chemical compound ClCCl YMWUJEATGCHHMB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- KDCGOANMDULRCW-UHFFFAOYSA-N Purine Natural products N1=CNC2=NC=NC2=C1 KDCGOANMDULRCW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 125000005631 S-sulfonamido group Chemical group 0.000 description 5
- ZMANZCXQSJIPKH-UHFFFAOYSA-N Triethylamine Chemical compound CCN(CC)CC ZMANZCXQSJIPKH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 150000001336 alkenes Chemical class 0.000 description 5
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 5
- 239000007864 aqueous solution Substances 0.000 description 5
- 125000003710 aryl alkyl group Chemical group 0.000 description 5
- 125000005110 aryl thio group Chemical group 0.000 description 5
- 239000003054 catalyst Substances 0.000 description 5
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 5
- 125000000392 cycloalkenyl group Chemical group 0.000 description 5
- 238000013467 fragmentation Methods 0.000 description 5
- 238000006062 fragmentation reaction Methods 0.000 description 5
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 5
- 125000004474 heteroalkylene group Chemical group 0.000 description 5
- 150000002739 metals Chemical class 0.000 description 5
- 125000002496 methyl group Chemical group [H]C([H])([H])* 0.000 description 5
- 229920002401 polyacrylamide Polymers 0.000 description 5
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 5
- 230000008569 process Effects 0.000 description 5
- 125000000472 sulfonyl group Chemical group *S(*)(=O)=O 0.000 description 5
- GQHTUMJGOHRCHB-UHFFFAOYSA-N 2,3,4,6,7,8,9,10-octahydropyrimido[1,2-a]azepine Chemical compound C1CCCCN2CCCN=C21 GQHTUMJGOHRCHB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- ZTWMBHJPUJJJME-UHFFFAOYSA-N 3,4-dimethylpyrrole-2,5-dione Chemical compound CC1=C(C)C(=O)NC1=O ZTWMBHJPUJJJME-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- JGFZNNIVVJXRND-UHFFFAOYSA-N N,N-Diisopropylethylamine (DIPEA) Chemical compound CCN(C(C)C)C(C)C JGFZNNIVVJXRND-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 4
- PXIPVTKHYLBLMZ-UHFFFAOYSA-N Sodium azide Chemical compound [Na+].[N-]=[N+]=[N-] PXIPVTKHYLBLMZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 125000002777 acetyl group Chemical group [H]C([H])([H])C(*)=O 0.000 description 4
- 125000002252 acyl group Chemical group 0.000 description 4
- 238000007792 addition Methods 0.000 description 4
- OIRDTQYFTABQOQ-KQYNXXCUSA-N adenosine Chemical compound C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H]1O OIRDTQYFTABQOQ-KQYNXXCUSA-N 0.000 description 4
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 4
- QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N atomic oxygen Chemical compound [O] QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000000460 chlorine Substances 0.000 description 4
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 4
- 238000005859 coupling reaction Methods 0.000 description 4
- RGWHQCVHVJXOKC-SHYZEUOFSA-N dCTP Chemical compound O=C1N=C(N)C=CN1[C@@H]1O[C@H](CO[P@](O)(=O)O[P@](O)(=O)OP(O)(O)=O)[C@@H](O)C1 RGWHQCVHVJXOKC-SHYZEUOFSA-N 0.000 description 4
- HAAZLUGHYHWQIW-KVQBGUIXSA-N dGTP Chemical compound C1=NC=2C(=O)NC(N)=NC=2N1[C@H]1C[C@H](O)[C@@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O)O1 HAAZLUGHYHWQIW-KVQBGUIXSA-N 0.000 description 4
- NHVNXKFIZYSCEB-XLPZGREQSA-N dTTP Chemical compound O=C1NC(=O)C(C)=CN1[C@@H]1O[C@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O)[C@@H](O)C1 NHVNXKFIZYSCEB-XLPZGREQSA-N 0.000 description 4
- JXTHNDFMNIQAHM-UHFFFAOYSA-N dichloroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(Cl)Cl JXTHNDFMNIQAHM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 4
- 238000003379 elimination reaction Methods 0.000 description 4
- 239000000839 emulsion Substances 0.000 description 4
- 125000001495 ethyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 4
- 239000012530 fluid Substances 0.000 description 4
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 4
- 150000002430 hydrocarbons Chemical group 0.000 description 4
- 125000002887 hydroxy group Chemical group [H]O* 0.000 description 4
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 4
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 4
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 description 4
- 125000004043 oxo group Chemical group O=* 0.000 description 4
- 229910052760 oxygen Inorganic materials 0.000 description 4
- 239000001301 oxygen Substances 0.000 description 4
- 239000012071 phase Substances 0.000 description 4
- 238000005498 polishing Methods 0.000 description 4
- 238000006116 polymerization reaction Methods 0.000 description 4
- OSFBJERFMQCEQY-UHFFFAOYSA-N propylidene Chemical compound [CH]CC OSFBJERFMQCEQY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 125000006239 protecting group Chemical group 0.000 description 4
- 150000003254 radicals Chemical class 0.000 description 4
- 229920006395 saturated elastomer Polymers 0.000 description 4
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 4
- 229910052710 silicon Inorganic materials 0.000 description 4
- 235000012239 silicon dioxide Nutrition 0.000 description 4
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 4
- 125000006727 (C1-C6) alkenyl group Chemical group 0.000 description 3
- 125000006716 (C1-C6) heteroalkyl group Chemical group 0.000 description 3
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 3
- SJECZPVISLOESU-UHFFFAOYSA-N 3-trimethoxysilylpropan-1-amine Chemical compound CO[Si](OC)(OC)CCCN SJECZPVISLOESU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- WFDIJRYMOXRFFG-UHFFFAOYSA-N Acetic anhydride Chemical compound CC(=O)OC(C)=O WFDIJRYMOXRFFG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 241001286462 Caio Species 0.000 description 3
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-M Chloride anion Chemical compound [Cl-] VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- ZMXDDKWLCZADIW-UHFFFAOYSA-N N,N-Dimethylformamide Chemical compound CN(C)C=O ZMXDDKWLCZADIW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- CZPWVGJYEJSRLH-UHFFFAOYSA-N Pyrimidine Chemical compound C1=CN=CN=C1 CZPWVGJYEJSRLH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 238000003559 RNA-seq method Methods 0.000 description 3
- DPOPAJRDYZGTIR-UHFFFAOYSA-N Tetrazine Chemical compound C1=CN=NN=N1 DPOPAJRDYZGTIR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 3
- NIXOWILDQLNWCW-UHFFFAOYSA-N acrylic acid group Chemical group C(C=C)(=O)O NIXOWILDQLNWCW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 125000006620 amino-(C1-C6) alkyl group Chemical group 0.000 description 3
- 239000011324 bead Substances 0.000 description 3
- JFDZBHWFFUWGJE-UHFFFAOYSA-N benzonitrile Chemical compound N#CC1=CC=CC=C1 JFDZBHWFFUWGJE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 125000001797 benzyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C([H])([H])* 0.000 description 3
- 230000008859 change Effects 0.000 description 3
- 238000005229 chemical vapour deposition Methods 0.000 description 3
- 238000004140 cleaning Methods 0.000 description 3
- 238000007334 copolymerization reaction Methods 0.000 description 3
- 125000000113 cyclohexyl group Chemical group [H]C1([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])(*)C([H])([H])C1([H])[H] 0.000 description 3
- OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N cytosine Natural products NC=1C=CNC(=O)N=1 OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- SUYVUBYJARFZHO-RRKCRQDMSA-N dATP Chemical compound C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1[C@H]1C[C@H](O)[C@@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O)O1 SUYVUBYJARFZHO-RRKCRQDMSA-N 0.000 description 3
- SUYVUBYJARFZHO-UHFFFAOYSA-N dATP Natural products C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1C1CC(O)C(COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O)O1 SUYVUBYJARFZHO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 230000008030 elimination Effects 0.000 description 3
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 3
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 3
- 238000002866 fluorescence resonance energy transfer Methods 0.000 description 3
- 239000005350 fused silica glass Substances 0.000 description 3
- 125000004051 hexyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 3
- 238000011065 in-situ storage Methods 0.000 description 3
- 238000002493 microarray Methods 0.000 description 3
- 239000000178 monomer Substances 0.000 description 3
- 238000010899 nucleation Methods 0.000 description 3
- 230000000269 nucleophilic effect Effects 0.000 description 3
- 230000003647 oxidation Effects 0.000 description 3
- 238000007254 oxidation reaction Methods 0.000 description 3
- 125000001997 phenyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(*)C([H])=C1[H] 0.000 description 3
- 230000005855 radiation Effects 0.000 description 3
- 230000009257 reactivity Effects 0.000 description 3
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 3
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 3
- 239000010703 silicon Substances 0.000 description 3
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 description 3
- 238000004528 spin coating Methods 0.000 description 3
- 230000008646 thermal stress Effects 0.000 description 3
- 125000000391 vinyl group Chemical group [H]C([*])=C([H])[H] 0.000 description 3
- 125000006728 (C1-C6) alkynyl group Chemical group 0.000 description 2
- LBUJPTNKIBCYBY-UHFFFAOYSA-N 1,2,3,4-tetrahydroquinoline Chemical compound C1=CC=C2CCCNC2=C1 LBUJPTNKIBCYBY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- WSLDOOZREJYCGB-UHFFFAOYSA-N 1,2-Dichloroethane Chemical compound ClCCCl WSLDOOZREJYCGB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- SMZOUWXMTYCWNB-UHFFFAOYSA-N 2-(2-methoxy-5-methylphenyl)ethanamine Chemical compound COC1=CC=C(C)C=C1CCN SMZOUWXMTYCWNB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- ASJSAQIRZKANQN-CRCLSJGQSA-N 2-deoxy-D-ribose Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)CC=O ASJSAQIRZKANQN-CRCLSJGQSA-N 0.000 description 2
- NHQDETIJWKXCTC-UHFFFAOYSA-N 3-chloroperbenzoic acid Chemical compound OOC(=O)C1=CC=CC(Cl)=C1 NHQDETIJWKXCTC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- ZCYVEMRRCGMTRW-UHFFFAOYSA-N 7553-56-2 Chemical compound [I] ZCYVEMRRCGMTRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- NLZUEZXRPGMBCV-UHFFFAOYSA-N Butylhydroxytoluene Chemical compound CC1=CC(C(C)(C)C)=C(O)C(C(C)(C)C)=C1 NLZUEZXRPGMBCV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- ZAMOUSCENKQFHK-UHFFFAOYSA-N Chlorine atom Chemical compound [Cl] ZAMOUSCENKQFHK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 2
- 102000016928 DNA-directed DNA polymerase Human genes 0.000 description 2
- 108010014303 DNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 2
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 2
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 2
- 239000004593 Epoxy Substances 0.000 description 2
- PXGOKWXKJXAPGV-UHFFFAOYSA-N Fluorine Chemical compound FF PXGOKWXKJXAPGV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- SIKJAQJRHWYJAI-UHFFFAOYSA-N Indole Chemical compound C1=CC=C2NC=CC2=C1 SIKJAQJRHWYJAI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101100042271 Mus musculus Sema3b gene Proteins 0.000 description 2
- JRNVZBWKYDBUCA-UHFFFAOYSA-N N-chlorosuccinimide Chemical compound ClN1C(=O)CCC1=O JRNVZBWKYDBUCA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- PXHVJJICTQNCMI-UHFFFAOYSA-N Nickel Chemical compound [Ni] PXHVJJICTQNCMI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 2
- KDLHZDBZIXYQEI-UHFFFAOYSA-N Palladium Chemical compound [Pd] KDLHZDBZIXYQEI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- JUJWROOIHBZHMG-UHFFFAOYSA-N Pyridine Chemical compound C1=CC=NC=C1 JUJWROOIHBZHMG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- PYMYPHUHKUWMLA-LMVFSUKVSA-N Ribose Natural products OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)C=O PYMYPHUHKUWMLA-LMVFSUKVSA-N 0.000 description 2
- KJTLSVCANCCWHF-UHFFFAOYSA-N Ruthenium Chemical compound [Ru] KJTLSVCANCCWHF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- BUGBHKTXTAQXES-UHFFFAOYSA-N Selenium Chemical compound [Se] BUGBHKTXTAQXES-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108020004682 Single-Stranded DNA Proteins 0.000 description 2
- ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N Uracil Chemical compound O=C1C=CNC(=O)N1 ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 150000003926 acrylamides Chemical class 0.000 description 2
- HFBMWMNUJJDEQZ-UHFFFAOYSA-N acryloyl chloride Chemical compound ClC(=O)C=C HFBMWMNUJJDEQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000003213 activating effect Effects 0.000 description 2
- 239000000654 additive Substances 0.000 description 2
- GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N adenyl group Chemical group N1=CN=C2N=CNC2=C1N GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000004183 alkoxy alkyl group Chemical group 0.000 description 2
- HMFHBZSHGGEWLO-UHFFFAOYSA-N alpha-D-Furanose-Ribose Natural products OCC1OC(O)C(O)C1O HMFHBZSHGGEWLO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000003277 amino group Chemical group 0.000 description 2
- 238000003491 array Methods 0.000 description 2
- UDLLFLQFQMACJB-UHFFFAOYSA-N azidomethylbenzene Chemical compound [N-]=[N+]=NCC1=CC=CC=C1 UDLLFLQFQMACJB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 2
- ISAOCJYIOMOJEB-UHFFFAOYSA-N benzoin Chemical compound C=1C=CC=CC=1C(O)C(=O)C1=CC=CC=C1 ISAOCJYIOMOJEB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- QDNSAFCVPAMWCJ-UHFFFAOYSA-N bicyclo[6.1.0]non-4-yne Chemical compound C1CC#CCCC2CC21 QDNSAFCVPAMWCJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000000484 butyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 2
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 2
- 229910052801 chlorine Inorganic materials 0.000 description 2
- 150000001805 chlorine compounds Chemical class 0.000 description 2
- 125000004093 cyano group Chemical group *C#N 0.000 description 2
- 230000001351 cycling effect Effects 0.000 description 2
- 125000001995 cyclobutyl group Chemical group [H]C1([H])C([H])([H])C([H])(*)C1([H])[H] 0.000 description 2
- HGCIXCUEYOPUTN-UHFFFAOYSA-N cyclohexene Chemical compound C1CCC=CC1 HGCIXCUEYOPUTN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000000596 cyclohexenyl group Chemical group C1(=CCCCC1)* 0.000 description 2
- 125000001511 cyclopentyl group Chemical group [H]C1([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])(*)C1([H])[H] 0.000 description 2
- 125000001559 cyclopropyl group Chemical group [H]C1([H])C([H])([H])C1([H])* 0.000 description 2
- 238000000151 deposition Methods 0.000 description 2
- 230000008021 deposition Effects 0.000 description 2
- RAFNCPHFRHZCPS-UHFFFAOYSA-N di(imidazol-1-yl)methanethione Chemical compound C1=CN=CN1C(=S)N1C=CN=C1 RAFNCPHFRHZCPS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 2
- 229960005215 dichloroacetic acid Drugs 0.000 description 2
- 125000002534 ethynyl group Chemical group [H]C#C* 0.000 description 2
- 239000011737 fluorine Substances 0.000 description 2
- 229910052731 fluorine Inorganic materials 0.000 description 2
- 238000007306 functionalization reaction Methods 0.000 description 2
- UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N guanine Chemical compound O=C1NC(N)=NC2=C1N=CN2 UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000004366 heterocycloalkenyl group Chemical group 0.000 description 2
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 2
- 239000011630 iodine Substances 0.000 description 2
- 229910052740 iodine Inorganic materials 0.000 description 2
- 125000000959 isobutyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])(C([H])([H])[H])C([H])([H])* 0.000 description 2
- 125000001449 isopropyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])(*)C([H])([H])[H] 0.000 description 2
- 239000010410 layer Substances 0.000 description 2
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 2
- 238000012544 monitoring process Methods 0.000 description 2
- 125000002950 monocyclic group Chemical group 0.000 description 2
- SYSQUGFVNFXIIT-UHFFFAOYSA-N n-[4-(1,3-benzoxazol-2-yl)phenyl]-4-nitrobenzenesulfonamide Chemical class C1=CC([N+](=O)[O-])=CC=C1S(=O)(=O)NC1=CC=C(C=2OC3=CC=CC=C3N=2)C=C1 SYSQUGFVNFXIIT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000004108 n-butyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 2
- 150000007855 nitrilimines Chemical class 0.000 description 2
- LQNUZADURLCDLV-UHFFFAOYSA-N nitrobenzene Chemical compound [O-][N+](=O)C1=CC=CC=C1 LQNUZADURLCDLV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000004433 nitrogen atom Chemical group N* 0.000 description 2
- 239000012038 nucleophile Substances 0.000 description 2
- 230000001590 oxidative effect Effects 0.000 description 2
- 125000004430 oxygen atom Chemical group O* 0.000 description 2
- UKODFQOELJFMII-UHFFFAOYSA-N pentamethyldiethylenetriamine Chemical compound CN(C)CCN(C)CCN(C)C UKODFQOELJFMII-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 150000002972 pentoses Chemical class 0.000 description 2
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 description 2
- 229910052698 phosphorus Inorganic materials 0.000 description 2
- 229920003229 poly(methyl methacrylate) Polymers 0.000 description 2
- 239000004926 polymethyl methacrylate Substances 0.000 description 2
- 229920002223 polystyrene Polymers 0.000 description 2
- 125000001436 propyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 2
- KIDHWZJUCRJVML-UHFFFAOYSA-N putrescine Chemical compound NCCCCN KIDHWZJUCRJVML-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000000197 pyrolysis Methods 0.000 description 2
- 238000012175 pyrosequencing Methods 0.000 description 2
- 239000010453 quartz Substances 0.000 description 2
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 2
- 125000000548 ribosyl group Chemical group C1([C@H](O)[C@H](O)[C@H](O1)CO)* 0.000 description 2
- 238000007142 ring opening reaction Methods 0.000 description 2
- 229910052707 ruthenium Inorganic materials 0.000 description 2
- 229910052711 selenium Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000011669 selenium Substances 0.000 description 2
- 239000004065 semiconductor Substances 0.000 description 2
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 2
- 239000012453 solvate Substances 0.000 description 2
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 2
- 125000006850 spacer group Chemical group 0.000 description 2
- 125000003003 spiro group Chemical group 0.000 description 2
- 125000005346 substituted cycloalkyl group Chemical group 0.000 description 2
- 125000000475 sulfinyl group Chemical group [*:2]S([*:1])=O 0.000 description 2
- 125000000999 tert-butyl group Chemical group [H]C([H])([H])C(*)(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 description 2
- ILMRJRBKQSSXGY-UHFFFAOYSA-N tert-butyl(dimethyl)silicon Chemical group C[Si](C)C(C)(C)C ILMRJRBKQSSXGY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N thymine Chemical compound CC1=CNC(=O)NC1=O RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- ZGYICYBLPGRURT-UHFFFAOYSA-N tri(propan-2-yl)silicon Chemical compound CC(C)[Si](C(C)C)C(C)C ZGYICYBLPGRURT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000000876 trifluoromethoxy group Chemical group FC(F)(F)O* 0.000 description 2
- 239000001226 triphosphate Substances 0.000 description 2
- 235000011178 triphosphate Nutrition 0.000 description 2
- UNXRWKVEANCORM-UHFFFAOYSA-N triphosphoric acid Chemical compound OP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O UNXRWKVEANCORM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- LWAVGNJLLQSNNN-UHFFFAOYSA-N (2,5-dioxopyrrolidin-1-yl) 4-azidobenzoate Chemical compound C1=CC(N=[N+]=[N-])=CC=C1C(=O)ON1C(=O)CCC1=O LWAVGNJLLQSNNN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- YXMISKNUHHOXFT-UHFFFAOYSA-N (2,5-dioxopyrrolidin-1-yl) prop-2-enoate Chemical compound C=CC(=O)ON1C(=O)CCC1=O YXMISKNUHHOXFT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000003088 (fluoren-9-ylmethoxy)carbonyl group Chemical group 0.000 description 1
- GBLQGXFTPLQBTA-UHFFFAOYSA-N 1,2,3-triazoline Chemical compound C1CN=NN1 GBLQGXFTPLQBTA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- IGERFAHWSHDDHX-UHFFFAOYSA-N 1,3-dioxanyl Chemical group [CH]1OCCCO1 IGERFAHWSHDDHX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- JPRPJUMQRZTTED-UHFFFAOYSA-N 1,3-dioxolanyl Chemical group [CH]1OCCO1 JPRPJUMQRZTTED-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KFHQOZXAFUKFNB-UHFFFAOYSA-N 1,3-oxathiolanyl Chemical group [CH]1OCCS1 KFHQOZXAFUKFNB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000005940 1,4-dioxanyl group Chemical group 0.000 description 1
- KJUGUADJHNHALS-UHFFFAOYSA-N 1H-tetrazole Substances C=1N=NNN=1 KJUGUADJHNHALS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OXBLVCZKDOZZOJ-UHFFFAOYSA-N 2,3-Dihydrothiophene Chemical compound C1CC=CS1 OXBLVCZKDOZZOJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SFAXANKELJNWSA-UHFFFAOYSA-N 2-azido-1,3,5-trinitrobenzene Chemical compound [O-][N+](=O)C1=CC([N+]([O-])=O)=C(N=[N+]=[N-])C([N+]([O-])=O)=C1 SFAXANKELJNWSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000000069 2-butynyl group Chemical group [H]C([H])([H])C#CC([H])([H])* 0.000 description 1
- 125000001731 2-cyanoethyl group Chemical group [H]C([H])(*)C([H])([H])C#N 0.000 description 1
- ZKJDBBCUZKKIRI-UHFFFAOYSA-N 2-dimethylsilyl-2-ethoxybutanal Chemical compound C(C)OC(C=O)(CC)[SiH](C)C ZKJDBBCUZKKIRI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000000094 2-phenylethyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 1
- PHIYHIOQVWTXII-UHFFFAOYSA-N 3-amino-1-phenylpropan-1-ol Chemical compound NCCC(O)C1=CC=CC=C1 PHIYHIOQVWTXII-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UUEWCQRISZBELL-UHFFFAOYSA-N 3-trimethoxysilylpropane-1-thiol Chemical compound CO[Si](OC)(OC)CCCS UUEWCQRISZBELL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- XDLMVUHYZWKMMD-UHFFFAOYSA-N 3-trimethoxysilylpropyl 2-methylprop-2-enoate Chemical compound CO[Si](OC)(OC)CCCOC(=O)C(C)=C XDLMVUHYZWKMMD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000006163 5-membered heteroaryl group Chemical group 0.000 description 1
- HBAQYPYDRFILMT-UHFFFAOYSA-N 8-[3-(1-cyclopropylpyrazol-4-yl)-1H-pyrazolo[4,3-d]pyrimidin-5-yl]-3-methyl-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-2-one Chemical class C1(CC1)N1N=CC(=C1)C1=NNC2=C1N=C(N=C2)N1C2C(N(CC1CC2)C)=O HBAQYPYDRFILMT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N Acetonitrile Chemical compound CC#N WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- NIXOWILDQLNWCW-UHFFFAOYSA-M Acrylate Chemical compound [O-]C(=O)C=C NIXOWILDQLNWCW-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 229930024421 Adenine Natural products 0.000 description 1
- 238000006596 Alder-ene reaction Methods 0.000 description 1
- WKBOTKDWSSQWDR-UHFFFAOYSA-N Bromine atom Chemical compound [Br] WKBOTKDWSSQWDR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000002126 C01EB10 - Adenosine Substances 0.000 description 1
- 125000000882 C2-C6 alkenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 229910052684 Cerium Inorganic materials 0.000 description 1
- 229920000089 Cyclic olefin copolymer Polymers 0.000 description 1
- HMFHBZSHGGEWLO-SOOFDHNKSA-N D-ribofuranose Chemical compound OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H]1O HMFHBZSHGGEWLO-SOOFDHNKSA-N 0.000 description 1
- 238000005698 Diels-Alder reaction Methods 0.000 description 1
- BWGNESOTFCXPMA-UHFFFAOYSA-N Dihydrogen disulfide Chemical compound SS BWGNESOTFCXPMA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VGGSQFUCUMXWEO-UHFFFAOYSA-N Ethene Chemical compound C=C VGGSQFUCUMXWEO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000005977 Ethylene Substances 0.000 description 1
- GYHNNYVSQQEPJS-UHFFFAOYSA-N Gallium Chemical compound [Ga] GYHNNYVSQQEPJS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- NYHBQMYGNKIUIF-UUOKFMHZSA-N Guanosine Chemical compound C1=NC=2C(=O)NC(N)=NC=2N1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H]1O NYHBQMYGNKIUIF-UUOKFMHZSA-N 0.000 description 1
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N Hydrochloric acid Chemical compound Cl VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000005684 Liebig rearrangement reaction Methods 0.000 description 1
- 108060001084 Luciferase Proteins 0.000 description 1
- 239000005089 Luciferase Substances 0.000 description 1
- CERQOIWHTDAKMF-UHFFFAOYSA-M Methacrylate Chemical group CC(=C)C([O-])=O CERQOIWHTDAKMF-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 101100000209 Mus musculus Orm3 gene Proteins 0.000 description 1
- KWYHDKDOAIKMQN-UHFFFAOYSA-N N,N,N',N'-tetramethylethylenediamine Chemical compound CN(C)CCN(C)C KWYHDKDOAIKMQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZKGNPQKYVKXMGJ-UHFFFAOYSA-N N,N-dimethylacetamide Chemical compound CN(C)C(C)=O.CN(C)C(C)=O ZKGNPQKYVKXMGJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- NQTADLQHYWFPDB-UHFFFAOYSA-N N-Hydroxysuccinimide Chemical compound ON1C(=O)CCC1=O NQTADLQHYWFPDB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000005481 NMR spectroscopy Methods 0.000 description 1
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 description 1
- CWRVKFFCRWGWCS-UHFFFAOYSA-N Pentrazole Chemical compound C1CCCCC2=NN=NN21 CWRVKFFCRWGWCS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OAICVXFJPJFONN-UHFFFAOYSA-N Phosphorus Chemical compound [P] OAICVXFJPJFONN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000008331 Pinus X rigitaeda Nutrition 0.000 description 1
- 235000011613 Pinus brutia Nutrition 0.000 description 1
- 241000018646 Pinus brutia Species 0.000 description 1
- 239000004698 Polyethylene Substances 0.000 description 1
- 239000002202 Polyethylene glycol Substances 0.000 description 1
- 239000004642 Polyimide Substances 0.000 description 1
- 239000004743 Polypropylene Substances 0.000 description 1
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 description 1
- 229910052581 Si3N4 Inorganic materials 0.000 description 1
- BQCADISMDOOEFD-UHFFFAOYSA-N Silver Chemical compound [Ag] BQCADISMDOOEFD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 244000028419 Styrax benzoin Species 0.000 description 1
- 235000000126 Styrax benzoin Nutrition 0.000 description 1
- 102000004523 Sulfate Adenylyltransferase Human genes 0.000 description 1
- 108010022348 Sulfate adenylyltransferase Proteins 0.000 description 1
- 235000008411 Sumatra benzointree Nutrition 0.000 description 1
- QYTDEUPAUMOIOP-UHFFFAOYSA-N TEMPO Chemical group CC1(C)CCCC(C)(C)N1[O] QYTDEUPAUMOIOP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OBNDGIHQAIXEAO-UHFFFAOYSA-N [O].[Si] Chemical compound [O].[Si] OBNDGIHQAIXEAO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SORGEQQSQGNZFI-UHFFFAOYSA-N [azido(phenoxy)phosphoryl]oxybenzene Chemical compound C=1C=CC=CC=1OP(=O)(N=[N+]=[N-])OC1=CC=CC=C1 SORGEQQSQGNZFI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000010521 absorption reaction Methods 0.000 description 1
- 230000001133 acceleration Effects 0.000 description 1
- 238000009825 accumulation Methods 0.000 description 1
- DHKHKXVYLBGOIT-UHFFFAOYSA-N acetaldehyde Diethyl Acetal Natural products CCOC(C)OCC DHKHKXVYLBGOIT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 description 1
- 125000000641 acridinyl group Chemical group C1(=CC=CC2=NC3=CC=CC=C3C=C12)* 0.000 description 1
- 229920006322 acrylamide copolymer Polymers 0.000 description 1
- 150000001252 acrylic acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 125000003647 acryloyl group Chemical group O=C([*])C([H])=C([H])[H] 0.000 description 1
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 1
- 229960000643 adenine Drugs 0.000 description 1
- 229960005305 adenosine Drugs 0.000 description 1
- 238000004026 adhesive bonding Methods 0.000 description 1
- 125000004419 alkynylene group Chemical group 0.000 description 1
- IYABWNGZIDDRAK-UHFFFAOYSA-N allene Chemical group C=C=C IYABWNGZIDDRAK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000000746 allylic group Chemical group 0.000 description 1
- HSFWRNGVRCDJHI-UHFFFAOYSA-N alpha-acetylene Natural products C#C HSFWRNGVRCDJHI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052782 aluminium Inorganic materials 0.000 description 1
- XAGFODPZIPBFFR-UHFFFAOYSA-N aluminium Chemical compound [Al] XAGFODPZIPBFFR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000001412 amines Chemical class 0.000 description 1
- 125000004103 aminoalkyl group Chemical group 0.000 description 1
- 230000003416 augmentation Effects 0.000 description 1
- 125000002785 azepinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000003785 benzimidazolyl group Chemical group N1=C(NC2=C1C=CC=C2)* 0.000 description 1
- 229960002130 benzoin Drugs 0.000 description 1
- QUNPTMGXSSDZHZ-UHFFFAOYSA-N benzonitrile oxide Chemical compound O=N#CC1=CC=CC=C1 QUNPTMGXSSDZHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000001164 benzothiazolyl group Chemical group S1C(=NC2=C1C=CC=C2)* 0.000 description 1
- 125000004196 benzothienyl group Chemical group S1C(=CC2=C1C=CC=C2)* 0.000 description 1
- 125000004541 benzoxazolyl group Chemical group O1C(=NC2=C1C=CC=C2)* 0.000 description 1
- 125000003236 benzoyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C(*)=O 0.000 description 1
- 125000001743 benzylic group Chemical group 0.000 description 1
- 125000001584 benzyloxycarbonyl group Chemical group C(=O)(OCC1=CC=CC=C1)* 0.000 description 1
- GDTBXPJZTBHREO-UHFFFAOYSA-N bromine Substances BrBr GDTBXPJZTBHREO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052794 bromium Inorganic materials 0.000 description 1
- VNJDGPAEVCGZNX-UHFFFAOYSA-N butan-2,2-diyl Chemical group [CH2-]C[C+]=C VNJDGPAEVCGZNX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000004369 butenyl group Chemical group C(=CCC)* 0.000 description 1
- 125000000480 butynyl group Chemical group [*]C#CC([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 125000000609 carbazolyl group Chemical group C1(=CC=CC=2C3=CC=CC=C3NC12)* 0.000 description 1
- 239000011203 carbon fibre reinforced carbon Substances 0.000 description 1
- 150000001732 carboxylic acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 230000003197 catalytic effect Effects 0.000 description 1
- 238000006555 catalytic reaction Methods 0.000 description 1
- 210000005056 cell body Anatomy 0.000 description 1
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 1
- 239000000919 ceramic Substances 0.000 description 1
- 239000013043 chemical agent Substances 0.000 description 1
- 125000003636 chemical group Chemical group 0.000 description 1
- 239000003638 chemical reducing agent Substances 0.000 description 1
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 1
- 238000012650 click reaction Methods 0.000 description 1
- 229910052681 coesite Inorganic materials 0.000 description 1
- 210000001072 colon Anatomy 0.000 description 1
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 1
- 239000002131 composite material Substances 0.000 description 1
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 1
- 238000001816 cooling Methods 0.000 description 1
- 229920001577 copolymer Polymers 0.000 description 1
- 229910000365 copper sulfate Inorganic materials 0.000 description 1
- ARUVKPQLZAKDPS-UHFFFAOYSA-L copper(II) sulfate Chemical compound [Cu+2].[O-][S+2]([O-])([O-])[O-] ARUVKPQLZAKDPS-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 230000008878 coupling Effects 0.000 description 1
- 238000010168 coupling process Methods 0.000 description 1
- 229910052906 cristobalite Inorganic materials 0.000 description 1
- 229920006037 cross link polymer Polymers 0.000 description 1
- 238000004132 cross linking Methods 0.000 description 1
- 239000003431 cross linking reagent Substances 0.000 description 1
- 238000005686 cross metathesis reaction Methods 0.000 description 1
- 239000013078 crystal Substances 0.000 description 1
- 125000001651 cyanato group Chemical group [*]OC#N 0.000 description 1
- MGNCLNQXLYJVJD-UHFFFAOYSA-N cyanuric chloride Chemical compound ClC1=NC(Cl)=NC(Cl)=N1 MGNCLNQXLYJVJD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000005724 cycloalkenylene group Chemical group 0.000 description 1
- 125000002993 cycloalkylene group Chemical group 0.000 description 1
- 125000004850 cyclobutylmethyl group Chemical group C1(CCC1)C* 0.000 description 1
- 125000006622 cycloheptylmethyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000004210 cyclohexylmethyl group Chemical group [H]C([H])(*)C1([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C1([H])[H] 0.000 description 1
- BESIOWGPXPAVOS-OWOJBTEDSA-N cyclononene Chemical class C1CCC\C=C\CCC1 BESIOWGPXPAVOS-OWOJBTEDSA-N 0.000 description 1
- 125000004851 cyclopentylmethyl group Chemical group C1(CCCC1)C* 0.000 description 1
- 125000004186 cyclopropylmethyl group Chemical group [H]C([H])(*)C1([H])C([H])([H])C1([H])[H] 0.000 description 1
- 229940104302 cytosine Drugs 0.000 description 1
- 101150047356 dec-1 gene Proteins 0.000 description 1
- 238000000354 decomposition reaction Methods 0.000 description 1
- 239000000412 dendrimer Substances 0.000 description 1
- 229920000736 dendritic polymer Polymers 0.000 description 1
- 239000005549 deoxyribonucleoside Substances 0.000 description 1
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 1
- 238000009792 diffusion process Methods 0.000 description 1
- JMRYOSQOYJBDOI-UHFFFAOYSA-N dilithium;di(propan-2-yl)azanide Chemical compound [Li+].CC(C)[N-]C(C)C.CC(C)N([Li])C(C)C JMRYOSQOYJBDOI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- MKRTXPORKIRPDG-UHFFFAOYSA-N diphenylphosphoryl azide Chemical compound C=1C=CC=CC=1P(=O)(N=[N+]=[N-])C1=CC=CC=C1 MKRTXPORKIRPDG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- XPPKVPWEQAFLFU-UHFFFAOYSA-J diphosphate(4-) Chemical compound [O-]P([O-])(=O)OP([O-])([O-])=O XPPKVPWEQAFLFU-UHFFFAOYSA-J 0.000 description 1
- 235000011180 diphosphates Nutrition 0.000 description 1
- 150000002019 disulfides Chemical class 0.000 description 1
- UZZWBUYVTBPQIV-UHFFFAOYSA-N dme dimethoxyethane Chemical compound COCCOC.COCCOC UZZWBUYVTBPQIV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- CETRZFQIITUQQL-UHFFFAOYSA-N dmso dimethylsulfoxide Chemical compound CS(C)=O.CS(C)=O CETRZFQIITUQQL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000005684 electric field Effects 0.000 description 1
- 230000005670 electromagnetic radiation Effects 0.000 description 1
- 239000012039 electrophile Substances 0.000 description 1
- 230000009881 electrostatic interaction Effects 0.000 description 1
- 239000003623 enhancer Substances 0.000 description 1
- 238000005530 etching Methods 0.000 description 1
- 125000005678 ethenylene group Chemical group [H]C([*:1])=C([H])[*:2] 0.000 description 1
- OJCSPXHYDFONPU-UHFFFAOYSA-N etoac etoac Chemical compound CCOC(C)=O.CCOC(C)=O OJCSPXHYDFONPU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000005284 excitation Effects 0.000 description 1
- 238000001917 fluorescence detection Methods 0.000 description 1
- 230000004907 flux Effects 0.000 description 1
- 125000002485 formyl group Chemical group [H]C(*)=O 0.000 description 1
- 125000002541 furyl group Chemical group 0.000 description 1
- 229910052733 gallium Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000005251 gamma ray Effects 0.000 description 1
- 238000007429 general method Methods 0.000 description 1
- 238000003205 genotyping method Methods 0.000 description 1
- PCHJSUWPFVWCPO-UHFFFAOYSA-N gold Chemical compound [Au] PCHJSUWPFVWCPO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052737 gold Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000010931 gold Substances 0.000 description 1
- 229920000578 graft copolymer Polymers 0.000 description 1
- 235000019382 gum benzoic Nutrition 0.000 description 1
- 125000006484 halo alkoxy aryl group Chemical group 0.000 description 1
- 230000008642 heat stress Effects 0.000 description 1
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 1
- 125000004475 heteroaralkyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000004446 heteroarylalkyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000005549 heteroarylene group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006038 hexenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000005980 hexynyl group Chemical group 0.000 description 1
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 1
- 150000004677 hydrates Chemical class 0.000 description 1
- 125000000717 hydrazino group Chemical group [H]N([*])N([H])[H] 0.000 description 1
- 238000005984 hydrogenation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000007062 hydrolysis Effects 0.000 description 1
- 238000006460 hydrolysis reaction Methods 0.000 description 1
- 125000002883 imidazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 150000002466 imines Chemical class 0.000 description 1
- PQNFLJBBNBOBRQ-UHFFFAOYSA-N indane Chemical compound C1=CC=C2CCCC2=C1 PQNFLJBBNBOBRQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZUGYBSSWYZCQSV-UHFFFAOYSA-N indium(3+);phosphite Chemical compound [In+3].[O-]P([O-])[O-] ZUGYBSSWYZCQSV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PZOUSPYUWWUPPK-UHFFFAOYSA-N indole Natural products CC1=CC=CC2=C1C=CN2 PZOUSPYUWWUPPK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- RKJUIXBNRJVNHR-UHFFFAOYSA-N indolenine Natural products C1=CC=C2CC=NC2=C1 RKJUIXBNRJVNHR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000001041 indolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 1
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 1
- 238000011081 inoculation Methods 0.000 description 1
- 150000002484 inorganic compounds Chemical class 0.000 description 1
- 229910010272 inorganic material Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 1
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 1
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 1
- 230000002452 interceptive effect Effects 0.000 description 1
- 238000003402 intramolecular cyclocondensation reaction Methods 0.000 description 1
- 150000002500 ions Chemical class 0.000 description 1
- IQPQWNKOIGAROB-UHFFFAOYSA-N isocyanate group Chemical group [N-]=C=O IQPQWNKOIGAROB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000004594 isoindolinyl group Chemical group C1(NCC2=CC=CC=C12)* 0.000 description 1
- 125000000904 isoindolyl group Chemical group C=1(NC=C2C=CC=CC12)* 0.000 description 1
- 125000003253 isopropoxy group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])(O*)C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 125000002183 isoquinolinyl group Chemical group C1(=NC=CC2=CC=CC=C12)* 0.000 description 1
- 238000011901 isothermal amplification Methods 0.000 description 1
- 125000001786 isothiazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 150000002540 isothiocyanates Chemical group 0.000 description 1
- 125000003965 isoxazolidinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000003971 isoxazolinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000000842 isoxazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 238000004895 liquid chromatography mass spectrometry Methods 0.000 description 1
- 238000004020 luminiscence type Methods 0.000 description 1
- 230000014759 maintenance of location Effects 0.000 description 1
- 238000004949 mass spectrometry Methods 0.000 description 1
- BCVXHSPFUWZLGQ-UHFFFAOYSA-N mecn acetonitrile Chemical compound CC#N.CC#N BCVXHSPFUWZLGQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 1
- COTNUBDHGSIOTA-UHFFFAOYSA-N meoh methanol Chemical compound OC.OC COTNUBDHGSIOTA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QSHDDOUJBYECFT-UHFFFAOYSA-N mercury Chemical compound [Hg] QSHDDOUJBYECFT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052753 mercury Inorganic materials 0.000 description 1
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 1
- 229910044991 metal oxide Inorganic materials 0.000 description 1
- 150000004706 metal oxides Chemical class 0.000 description 1
- 238000005649 metathesis reaction Methods 0.000 description 1
- 125000000956 methoxy group Chemical group [H]C([H])([H])O* 0.000 description 1
- GDOPTJXRTPNYNR-UHFFFAOYSA-N methyl-cyclopentane Natural products CC1CCCC1 GDOPTJXRTPNYNR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000011859 microparticle Substances 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 239000003607 modifier Substances 0.000 description 1
- 230000004001 molecular interaction Effects 0.000 description 1
- 125000002757 morpholinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 238000000465 moulding Methods 0.000 description 1
- KVLNTIPUCYZQHA-UHFFFAOYSA-N n-[5-[(2-bromoacetyl)amino]pentyl]prop-2-enamide Chemical compound BrCC(=O)NCCCCCNC(=O)C=C KVLNTIPUCYZQHA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WOOWBQQQJXZGIE-UHFFFAOYSA-N n-ethyl-n-propan-2-ylpropan-2-amine Chemical compound CCN(C(C)C)C(C)C.CCN(C(C)C)C(C)C WOOWBQQQJXZGIE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000001127 nanoimprint lithography Methods 0.000 description 1
- 239000002105 nanoparticle Substances 0.000 description 1
- 125000001624 naphthyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000001326 naphthylalkyl group Chemical group 0.000 description 1
- 229910052759 nickel Inorganic materials 0.000 description 1
- QJGQUHMNIGDVPM-UHFFFAOYSA-N nitrogen group Chemical group [N] QJGQUHMNIGDVPM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- MUYAFSXTHFIVON-UHFFFAOYSA-N non-3-yne Chemical compound [CH2]CC#CCCCCC MUYAFSXTHFIVON-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- XLFQYKAOGKEOKU-UHFFFAOYSA-N non-4-yne Chemical compound [CH2]CCC#CCCCC XLFQYKAOGKEOKU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000006574 non-aromatic ring group Chemical group 0.000 description 1
- 229920001778 nylon Polymers 0.000 description 1
- 238000010915 one-step procedure Methods 0.000 description 1
- 150000002894 organic compounds Chemical class 0.000 description 1
- 125000000962 organic group Chemical group 0.000 description 1
- 239000003960 organic solvent Substances 0.000 description 1
- 150000001282 organosilanes Chemical class 0.000 description 1
- 125000000160 oxazolidinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000005968 oxazolinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000002971 oxazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 239000007800 oxidant agent Substances 0.000 description 1
- BPUBBGLMJRNUCC-UHFFFAOYSA-N oxygen(2-);tantalum(5+) Chemical compound [O-2].[O-2].[O-2].[O-2].[O-2].[Ta+5].[Ta+5] BPUBBGLMJRNUCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052763 palladium Inorganic materials 0.000 description 1
- 125000002255 pentenyl group Chemical group C(=CCCC)* 0.000 description 1
- 125000001147 pentyl group Chemical group C(CCCC)* 0.000 description 1
- 125000005981 pentynyl group Chemical group 0.000 description 1
- 230000000737 periodic effect Effects 0.000 description 1
- 230000035699 permeability Effects 0.000 description 1
- XEBWQGVWTUSTLN-UHFFFAOYSA-M phenylmercury acetate Chemical compound CC(=O)O[Hg]C1=CC=CC=C1 XEBWQGVWTUSTLN-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 125000004344 phenylpropyl group Chemical group 0.000 description 1
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K phosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 125000002467 phosphate group Chemical group [H]OP(=O)(O[H])O[*] 0.000 description 1
- 150000008300 phosphoramidites Chemical class 0.000 description 1
- 239000011574 phosphorus Substances 0.000 description 1
- 125000004592 phthalazinyl group Chemical group C1(=NN=CC2=CC=CC=C12)* 0.000 description 1
- 125000004193 piperazinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000003386 piperidinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 229920000962 poly(amidoamine) Polymers 0.000 description 1
- 239000004417 polycarbonate Substances 0.000 description 1
- 229920000515 polycarbonate Polymers 0.000 description 1
- 125000003367 polycyclic group Chemical group 0.000 description 1
- 229920000728 polyester Polymers 0.000 description 1
- 229920000573 polyethylene Polymers 0.000 description 1
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 1
- 229920001721 polyimide Polymers 0.000 description 1
- 229920006254 polymer film Polymers 0.000 description 1
- 229920000307 polymer substrate Polymers 0.000 description 1
- 229920001155 polypropylene Polymers 0.000 description 1
- 229920001296 polysiloxane Polymers 0.000 description 1
- 229920000915 polyvinyl chloride Polymers 0.000 description 1
- 239000004800 polyvinyl chloride Substances 0.000 description 1
- USHAGKDGDHPEEY-UHFFFAOYSA-L potassium persulfate Chemical compound [K+].[K+].[O-]S(=O)(=O)OOS([O-])(=O)=O USHAGKDGDHPEEY-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 239000008057 potassium phosphate buffer Substances 0.000 description 1
- 239000002244 precipitate Substances 0.000 description 1
- 239000000047 product Substances 0.000 description 1
- 125000001325 propanoyl group Chemical group O=C([*])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 125000004368 propenyl group Chemical group C(=CC)* 0.000 description 1
- 125000002568 propynyl group Chemical group [*]C#CC([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 230000009145 protein modification Effects 0.000 description 1
- IGFXRKMLLMBKSA-UHFFFAOYSA-N purine Chemical compound N1=C[N]C2=NC=NC2=C1 IGFXRKMLLMBKSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000003373 pyrazinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000003072 pyrazolidinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000002755 pyrazolinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000003226 pyrazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000002098 pyridazinyl group Chemical group 0.000 description 1
- UMJSCPRVCHMLSP-UHFFFAOYSA-N pyridine Natural products COC1=CC=CN=C1 UMJSCPRVCHMLSP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000004076 pyridyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000000714 pyrimidinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000000168 pyrrolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 238000003908 quality control method Methods 0.000 description 1
- 125000002943 quinolinyl group Chemical group N1=C(C=CC2=CC=CC=C12)* 0.000 description 1
- 238000006894 reductive elimination reaction Methods 0.000 description 1
- 230000003252 repetitive effect Effects 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 229920005989 resin Polymers 0.000 description 1
- 239000011347 resin Substances 0.000 description 1
- 230000000717 retained effect Effects 0.000 description 1
- 229910052703 rhodium Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000002342 ribonucleoside Substances 0.000 description 1
- 239000011435 rock Substances 0.000 description 1
- 125000005920 sec-butoxy group Chemical group 0.000 description 1
- 125000002914 sec-butyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])(*)C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 239000002094 self assembled monolayer Substances 0.000 description 1
- 239000013545 self-assembled monolayer Substances 0.000 description 1
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 1
- 238000007873 sieving Methods 0.000 description 1
- HQVNEWCFYHHQES-UHFFFAOYSA-N silicon nitride Chemical compound N12[Si]34N5[Si]62N3[Si]51N64 HQVNEWCFYHHQES-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052709 silver Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000004332 silver Substances 0.000 description 1
- 239000002356 single layer Substances 0.000 description 1
- 239000002002 slurry Substances 0.000 description 1
- 238000010532 solid phase synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 238000000527 sonication Methods 0.000 description 1
- 238000013112 stability test Methods 0.000 description 1
- 239000012086 standard solution Substances 0.000 description 1
- 230000003068 static effect Effects 0.000 description 1
- 229910052682 stishovite Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000035882 stress Effects 0.000 description 1
- 125000004426 substituted alkynyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000005717 substituted cycloalkylene group Chemical group 0.000 description 1
- 239000004094 surface-active agent Substances 0.000 description 1
- 230000001360 synchronised effect Effects 0.000 description 1
- 229910001936 tantalum oxide Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000008685 targeting Effects 0.000 description 1
- 125000004213 tert-butoxy group Chemical group [H]C([H])([H])C(O*)(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 125000005931 tert-butyloxycarbonyl group Chemical group [H]C([H])([H])C(OC(*)=O)(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- WHRNULOCNSKMGB-UHFFFAOYSA-N tetrahydrofuran thf Chemical compound C1CCOC1.C1CCOC1 WHRNULOCNSKMGB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000003718 tetrahydrofuranyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000001412 tetrahydropyranyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000003507 tetrahydrothiofenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000004632 tetrahydrothiopyranyl group Chemical group S1C(CCCC1)* 0.000 description 1
- 125000005247 tetrazinyl group Chemical group N1=NN=NC(=C1)* 0.000 description 1
- 125000003831 tetrazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- WROMPOXWARCANT-UHFFFAOYSA-N tfa trifluoroacetic acid Chemical group OC(=O)C(F)(F)F.OC(=O)C(F)(F)F WROMPOXWARCANT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000001113 thiadiazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000001984 thiazolidinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000002769 thiazolinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000000335 thiazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 230000008719 thickening Effects 0.000 description 1
- 125000001544 thienyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000001583 thiepanyl group Chemical group 0.000 description 1
- 150000003555 thioacetals Chemical class 0.000 description 1
- ZMZDMBWJUHKJPS-UHFFFAOYSA-M thiocyanate group Chemical group [S-]C#N ZMZDMBWJUHKJPS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 125000000858 thiocyanato group Chemical group *SC#N 0.000 description 1
- 125000004568 thiomorpholinyl group Chemical group 0.000 description 1
- RYYWUUFWQRZTIU-UHFFFAOYSA-K thiophosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=S RYYWUUFWQRZTIU-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 229940113082 thymine Drugs 0.000 description 1
- 125000004306 triazinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000001425 triazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- WLPUWLXVBWGYMZ-UHFFFAOYSA-N tricyclohexylphosphine Chemical compound C1CCCCC1P(C1CCCCC1)C1CCCCC1 WLPUWLXVBWGYMZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052905 tridymite Inorganic materials 0.000 description 1
- 125000002221 trityl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C1C([*])(C1=C(C(=C(C(=C1[H])[H])[H])[H])[H])C1=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C1[H] 0.000 description 1
- 229940035893 uracil Drugs 0.000 description 1
- 238000002255 vaccination Methods 0.000 description 1
- 229960005486 vaccine Drugs 0.000 description 1
- 239000003981 vehicle Substances 0.000 description 1
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 1
Classifications
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B32—LAYERED PRODUCTS
- B32B—LAYERED PRODUCTS, i.e. PRODUCTS BUILT-UP OF STRATA OF FLAT OR NON-FLAT, e.g. CELLULAR OR HONEYCOMB, FORM
- B32B27/00—Layered products comprising a layer of synthetic resin
- B32B27/28—Layered products comprising a layer of synthetic resin comprising synthetic resins not wholly covered by any one of the sub-groups B32B27/30 - B32B27/42
- B32B27/283—Layered products comprising a layer of synthetic resin comprising synthetic resins not wholly covered by any one of the sub-groups B32B27/30 - B32B27/42 comprising polysiloxanes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C08—ORGANIC MACROMOLECULAR COMPOUNDS; THEIR PREPARATION OR CHEMICAL WORKING-UP; COMPOSITIONS BASED THEREON
- C08J—WORKING-UP; GENERAL PROCESSES OF COMPOUNDING; AFTER-TREATMENT NOT COVERED BY SUBCLASSES C08B, C08C, C08F, C08G or C08H
- C08J7/00—Chemical treatment or coating of shaped articles made of macromolecular substances
- C08J7/12—Chemical modification
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J19/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J19/0046—Sequential or parallel reactions, e.g. for the synthesis of polypeptides or polynucleotides; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making molecular arrays
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B32—LAYERED PRODUCTS
- B32B—LAYERED PRODUCTS, i.e. PRODUCTS BUILT-UP OF STRATA OF FLAT OR NON-FLAT, e.g. CELLULAR OR HONEYCOMB, FORM
- B32B7/00—Layered products characterised by the relation between layers; Layered products characterised by the relative orientation of features between layers, or by the relative values of a measurable parameter between layers, i.e. products comprising layers having different physical, chemical or physicochemical properties; Layered products characterised by the interconnection of layers
- B32B7/04—Interconnection of layers
- B32B7/10—Interconnection of layers at least one layer having inter-reactive properties
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C08—ORGANIC MACROMOLECULAR COMPOUNDS; THEIR PREPARATION OR CHEMICAL WORKING-UP; COMPOSITIONS BASED THEREON
- C08F—MACROMOLECULAR COMPOUNDS OBTAINED BY REACTIONS ONLY INVOLVING CARBON-TO-CARBON UNSATURATED BONDS
- C08F8/00—Chemical modification by after-treatment
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C09—DYES; PAINTS; POLISHES; NATURAL RESINS; ADHESIVES; COMPOSITIONS NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; APPLICATIONS OF MATERIALS NOT OTHERWISE PROVIDED FOR
- C09D—COATING COMPOSITIONS, e.g. PAINTS, VARNISHES OR LACQUERS; FILLING PASTES; CHEMICAL PAINT OR INK REMOVERS; INKS; CORRECTING FLUIDS; WOODSTAINS; PASTES OR SOLIDS FOR COLOURING OR PRINTING; USE OF MATERIALS THEREFOR
- C09D133/00—Coating compositions based on homopolymers or copolymers of compounds having one or more unsaturated aliphatic radicals, each having only one carbon-to-carbon double bond, and at least one being terminated by only one carboxyl radical, or of salts, anhydrides, esters, amides, imides, or nitriles thereof; Coating compositions based on derivatives of such polymers
- C09D133/24—Homopolymers or copolymers of amides or imides
- C09D133/26—Homopolymers or copolymers of acrylamide or methacrylamide
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6813—Hybridisation assays
- C12Q1/6834—Enzymatic or biochemical coupling of nucleic acids to a solid phase
- C12Q1/6837—Enzymatic or biochemical coupling of nucleic acids to a solid phase using probe arrays or probe chips
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6869—Methods for sequencing
- C12Q1/6874—Methods for sequencing involving nucleic acid arrays, e.g. sequencing by hybridisation
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00277—Apparatus
- B01J2219/00497—Features relating to the solid phase supports
- B01J2219/00527—Sheets
- B01J2219/00529—DNA chips
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00277—Apparatus
- B01J2219/00497—Features relating to the solid phase supports
- B01J2219/00527—Sheets
- B01J2219/00533—Sheets essentially rectangular
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00583—Features relative to the processes being carried out
- B01J2219/00603—Making arrays on substantially continuous surfaces
- B01J2219/00605—Making arrays on substantially continuous surfaces the compounds being directly bound or immobilised to solid supports
- B01J2219/00614—Delimitation of the attachment areas
- B01J2219/00617—Delimitation of the attachment areas by chemical means
- B01J2219/00619—Delimitation of the attachment areas by chemical means using hydrophilic or hydrophobic regions
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00583—Features relative to the processes being carried out
- B01J2219/00603—Making arrays on substantially continuous surfaces
- B01J2219/00605—Making arrays on substantially continuous surfaces the compounds being directly bound or immobilised to solid supports
- B01J2219/00623—Immobilisation or binding
- B01J2219/00626—Covalent
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00583—Features relative to the processes being carried out
- B01J2219/00603—Making arrays on substantially continuous surfaces
- B01J2219/00605—Making arrays on substantially continuous surfaces the compounds being directly bound or immobilised to solid supports
- B01J2219/00632—Introduction of reactive groups to the surface
- B01J2219/00637—Introduction of reactive groups to the surface by coating it with another layer
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00718—Type of compounds synthesised
- B01J2219/0072—Organic compounds
- B01J2219/00722—Nucleotides
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C08—ORGANIC MACROMOLECULAR COMPOUNDS; THEIR PREPARATION OR CHEMICAL WORKING-UP; COMPOSITIONS BASED THEREON
- C08F—MACROMOLECULAR COMPOUNDS OBTAINED BY REACTIONS ONLY INVOLVING CARBON-TO-CARBON UNSATURATED BONDS
- C08F220/00—Copolymers of compounds having one or more unsaturated aliphatic radicals, each having only one carbon-to-carbon double bond, and only one being terminated by only one carboxyl radical or a salt, anhydride ester, amide, imide or nitrile thereof
- C08F220/02—Monocarboxylic acids having less than ten carbon atoms; Derivatives thereof
- C08F220/52—Amides or imides
- C08F220/54—Amides, e.g. N,N-dimethylacrylamide or N-isopropylacrylamide
- C08F220/60—Amides, e.g. N,N-dimethylacrylamide or N-isopropylacrylamide containing nitrogen in addition to the carbonamido nitrogen
- C08F220/603—Amides, e.g. N,N-dimethylacrylamide or N-isopropylacrylamide containing nitrogen in addition to the carbonamido nitrogen and containing oxygen in addition to the carbonamido oxygen and nitrogen
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C08—ORGANIC MACROMOLECULAR COMPOUNDS; THEIR PREPARATION OR CHEMICAL WORKING-UP; COMPOSITIONS BASED THEREON
- C08J—WORKING-UP; GENERAL PROCESSES OF COMPOUNDING; AFTER-TREATMENT NOT COVERED BY SUBCLASSES C08B, C08C, C08F, C08G or C08H
- C08J2335/00—Characterised by the use of homopolymers or copolymers of compounds having one or more unsaturated aliphatic radicals, each having only one carbon-to-carbon double bond, and at least one being terminated by a carboxyl radical, and containing at least one other carboxyl radical in the molecule, or of salts, anhydrides, esters, amides, imides or nitriles thereof; Derivatives of such polymers
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2527/00—Reactions demanding special reaction conditions
- C12Q2527/125—Specific component of sample, medium or buffer
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2565/00—Nucleic acid analysis characterised by mode or means of detection
- C12Q2565/50—Detection characterised by immobilisation to a surface
- C12Q2565/537—Detection characterised by immobilisation to a surface characterised by the capture oligonucleotide acting as a primer
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2565/00—Nucleic acid analysis characterised by mode or means of detection
- C12Q2565/60—Detection means characterised by use of a special device
- C12Q2565/629—Detection means characterised by use of a special device being a microfluidic device
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Polymers & Plastics (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Immunology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Materials Engineering (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)
- Laminated Bodies (AREA)
- Surface Treatment Of Glass (AREA)
- Transition And Organic Metals Composition Catalysts For Addition Polymerization (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Dispersion Chemistry (AREA)
- Application Of Or Painting With Fluid Materials (AREA)
Abstract
Burada tarif edilen bazı uygulamalar, bir polimer, bir hidrojel, bir amino asit, bir nükleosit, bir nükleotit, bir peptit, bir polinükleotid veya bir protein gibi, işlevselleştirilmiş bir molekül ile doğrudan konjugasyon için isteğe bağlı olarak ikame edilmiş sikloalkene veya isteğe bağlı olarak ikame edilmiş heterosikloalkene kovalent olarak bağlı bir silan veya bir silan türevini içeren bir yüzeye sahip bir substrat ile ilgilidir. Bazı düzenlemelerde, silan veya silan türevi isteğe bağlı olarak ikame edilmiş norbornen veya norbornen türevleri içerir. İşlevsel bir yüzeyin hazırlanması için yöntem ve DNA dizilemede ve diğer teşhis uygulamalarında kullanım da açıklanmaktadır.
Description
Tarifnamede
ve ekteki istemlerde kullanildigi gibi, tekil formlar "bir",
referanslari içerir. Aksi belirtilmedikçe, geleneksel kütle
spektroskopisi, NMR, HPLC, protein kimyasi, biyokimya,
rekombinant DNA teknikleri ve farmakoloji yöntemleri
kullanilmaktadir. "Veya" veya "ve" nin kullanimi, aksi
belirtilmedikçe "ve / veya" anlamina gelir. Ayrica, "içerme"
teriminin yani sira "içermek", "içerir" ve "dahil" gibi diger
formlarin kullanimi sinirlayici degildir. Bu tarifnamede
kullanildigi üzere, bir geçis cümleciginde veya istemin
gövdesinde, "içerme (ler)" ve "içeren" terimlerinin kullanimi
açik uçlu bir anlami oldugu seklinde yorumlanmalidir. Yani,
terimler "en azindan" veya "en azindan dahil" ifadeleriyle es
anlamli olarak yorumlanmalidir. Bir islem baglaminda
kullanildiginda, "içerme" terimi, islemin en azindan belirtilen
adimlari içerdigi, ancak ilave adimlar içerebileçegi anlamina
gelir. Bir bilesik, bilesim veya cihaz baglaminda
kullanildiginda, "içeren" terimi, bilesigin, bilesimin veya
cihazin en azindan belirtilen özellikleri veya bilesenleri
içerdigi, fakat ayrica ek özellikler veya bilesenler
içerebilecegi anlamina gelir.
Burada kullanilan bölüm basliklari sadece organizasyon amaçlari
içindir ve açiklanan konuyu sinirlayici olarak
yorumlanmamalidir.
Burada kullanildigi gibi, ortak organik kisaltmalar asagidaki
gibi tanimlanmaktadir:
Ac Asetil
AC2O Asetik anhidrit
APTS aminopropil silan
APTES (3-aminopropil)
trietoksisilan
APTMS (3-aminopropil)
trimetoksisilan
azidoasetamidilpentil)
akrilamid
BCN Bicyclo [6.1.0] non-
4-yne
BHT Bütilhidroksitoluen
Bn Benzyl
Brapa veya BRAPA N-(5-
bromoasetamidilpentil)
akrilamid Bz Benzoil
BOC veya Boc tert-Butoksikarbonil
Bu n-Butil
cat. Katalitik
Cbz Karbobenziloksi
CMP Kimyasal mekanik parlatma
CyCl Siyanürik klorür
CVD Kimyasal buhar biriktirme
° C Sicaklik santigrat derece
dATP Dezoksiadenozin trifosfat
dCTP Deoksisitidin trifosfat
dGTP Deoksiguanosin trifosfat
dTTP Deoksitimidin trifosfat
DBU 1,8-Diazabisiklo [5.4.0] undek-7-en
DCA Dikloroasetik asit
DCE 1,2-Dikloroetan
DCM Metilen klorür
DIEA Diizopropiletilamin
DIPEA Diizopropiletilamin
DMA Dimetilasetamid
DME Dimetoksietan
DMF N, N'-Dimetilformamid
DMSO Dimetilsülfoksit
DPPA Difenilfosforil azit
EtOAc Etil asetat
GPC Jel geçirgenlik
kromatografisi
h veya hr saat(ler)
iPr Izopropil
KPi PH 7.0'da lO mM potasyum fosfat tamponu
KPS Potasyum persülfat
LCMS Sivi kromatografi-kütle
spektrometresi
LDA Lityum diizopropilamit
m veya min dakika(lar)
MCPBA meta-
Kloroperoksibenzoik Asit
MeOH Metanol
MeCN Asetonitril
mL mililitre(ler)
NaN3 Sodyum Azid
NHS N-hidroksisüksinimit
NHS-AA Akrilik asit N-hidroksisüksinimit ester
PAZAM herhangi bir akrilamidin Azapa oranina sahip
poli (N- (5-azidometil pentil) akrilamid-ko-akrilamid)
PG Koruma grubu Ph Fenil
PMEDTA N, N, N ', N", N "-Pentametildietilenetriamin
ppt Çökelti
rt Oda sicakligi
SBS Sentez yoluyla dizileme
SFA 20ll/0059865 numarali ABD Patent Yayininda
tanimlandigi gibi Silansiz Akrilamid Sulfo-HSAB veya
SHSAB N-Hidroksisüksinimidil-4-azidobenzoate
TEA Trietilamin
TEMPO (2,2,6,6-Tetrametilpiperidin-l-il) oksil
TCDI l,l'-Tiokarbonil diimidazol
Tert, t tertiari
TFA Trifloroasetik asit
THF Tetrahidrofuran
TEMED tetrametllendiamin
YES YieldMühendislik Sistemleri
mL Mikrolitre(ler)
Burada kullanildigi sekliyle "dizi" terimi, farkli prob
moleküllerinin göreceli konuma göre birbirinden ayrilabildigi
sekilde bir veya daha fazla substrata baglanan farkli prob
moleküllerinin bir popülasyonuna karsilik gelir. Bir dizi, her
biri bir substrat üzerinde farkli adreslenebilir bir konumda
bulunan farkli prob molekülleri içerebilir. Alternatif veya ek
olarak, bir dizi, her biri farkli bir prob molekülünü tasiyan
ayri substratlar içerebilir olup, özelligi; farkli prob
molekülleri, substratlarin tutturuldugu bir yüzey 'üzerindeki
substratlarin yerlerine göre veya akiskan substratlarin
yerlerine göre tanimlanabilir olmasidir. Ayri substratlarin bir
yüzey üzerinde yer aldigi örnek diziler, sinirlama olmaksizin,
tarif edildigi gibi kuyulardaki boncuklar da dahil olmak üzere
WO 00/63437 da tarif edilmistir. Mevcut uygulamada, örnegin bir
flüoresan aktiflestirilmis hücre ayiklayicisi (FACS) gibi bir
mikroakiskan cihaz kullanilarak, tanecikleri sivi bir dizide
ayirmak için kullanilabilen örnek biçimler, örnegin ABD Patent
No. 6,524,793'te tarif edilmistir. Uygulamada kullanilabilen
diger dizi örnekleri arasinda, sinirlama olmaksizin, 5,429,807
Bu tarifnamede kullanildigi haliyle, "kovalent olarak baglanmis"
ya da "kovalent olarak sinirlandirilmis" terimi, atomlar
arasinda elektron çiftlerinin paylasilmasi ile karakterize
edilen bir kimyasal bagin olusturulmasina isaret etmektedir.
Örnegin, kovalent olarak baglanmis bir polimer kaplama, yüzeye,
örnegin adezyon veya elektrostatik etkilesim gibi baska yollarla
baglanmaya kiyasla, bir substratin islevsellestirilmis bir
yüzeyi ile kimyasal baglar olusturan bir polimer kaplamaya
deginmektedir. Bir yüzeye kovalent olarak baglanan polimerlerin,
kovalent baglamaya ek olarak, örnegin, fiziksel sogurum gibi
vasitalarla da baglanabilecegi takdir edilecektir.
Burada kullanildigi üzere, "a" ve "b” “Ca ila Cb" veya "Cab",
belirtilen gruptaki karbon atomlarinin sayisini belirten tam
sayilardir. Yani, grup "a" ila "b” karbon atomlarini
kapsayabilir. Bu nedenle, örnegin, bir bir "C1 ila C4 alkil"
veya "CLA alkil" grubu, 1 ila 4 karbon atomuna sahip olan tüm
alkil gruplarina, yani CH3-, CH3CH2-, CH3CH3CH3-, (CH3)2CH-,
CH&HhCH2CH2-, CH3CH2CH (CH3)- ve (CH3) 3C-'e isaret eder.
Burada kullanildigi sekliyle "halojen" veya "halo" terimi,
Elementlerin Periyodik Tablosunun 7. sütununun atomlarindan
herhangi birini ifade eder, florin, klorin, bromin veya iyodin
gibi ve florin ve klorin tercih edilendir.
Burada kullanildigi sekliyle "alkil", tamamen doymus olan düz
veya dallanmis bir hidrokarbon zincirini belirtir (yani çift
veya üçlü bag içermez). Alkil grubu 1 ila 20 karbon atomuna sahip
olabilir (bu burada ne zaman görünürse, "1 ila 20" gibi bir
sayisal aralik, verilen araliktaki her bir tam sayiyi belirtir;
Örnegin "1 ila 20 karbon atomu” alkil grubunun 20 karbon atomuna
kadar ve dahil olmak üzere 1 karbon atomu, 2 karbon atomu, 3
karbon atomu vb. içerebilecegi anlamina gelir ve ayni zamanda,
mevcut tanim sayisal araligin belirtilmedigi "alkil" teriminin
ortaya çikmasini da kapsamaktadir.) Alkil grubu ayrica 1 ila 9
karbon atomuna sahip bir orta boy alkil olabilir. Alkil grubu
ayrica 1 ila 4 karbon atomuna sahip bir alt alkil olabilir. Alkil
grubu "Ora alkil" veya benzer isaretler olarak tanimlanabilir.
Sadece örnek olarak, "014 alkil", alkil zincirinde bir ila dört
karbon atomu bulunduguna isaret eder, yani, alkil zinciri,
metil, etil, propil, izo-propil, n- butil, izobütil, sek-bütil
ve t-bütil grubundan seçilir. Tipik alkil gruplari, sinirlayici
olmamakla birlikte, metil, etil, propil, izopropil, butil,
izobütil, tersiyer butil, pentil, heksil ve benzerlerini içerir.
Burada kullanildigi haliyle, alkoksi -OR formülüme isaret edip,
özelligi; R'nin yukarida tanimlandigi, metoksi, etoksi, n-
propoksi, l-metiletoksi (izopropoksi), n-bütoksi, izo-butoksi,
sek-bütoksi ve tert-bütoksi ve benzerleri dahil ancak bunlarla
sinirli olmamak üzere "Cpg" gibi bir bir alkil olmasidir.
Burada kullanildigi haliyle, "alkiltiyo", -SR formülüne isaret
edip; özelligi, "Cia alkiltiyo" ve benzerleri gibi, R, yukarida
tanimlandigi gibi ve bunlarla sinirli olmamak üzere,
metilmercapto, etilmerkapto, n-propilmerkapto, l-metiletil-
metilkapto (izopropilmerkapto), n-butilmerkapto, izo-
butilmerkapto, sek-butilmerkapto, tert-butilmerkapto ve
benzerlerini içeren bir alkildir.
Burada kullanildigi haliyle, “alkenil", bir veya daha fazla çift
bag içeren düz veya dallanmis bir hidrokarbon zincirini
belirtir. Alkenil grubu 2 ila 20 karbon atomuna sahip olabilir,
ancak mevcut tanim ayrica sayisal araligin belirtilmedigi
ayrica 2 ila 9 karbon atomuna sahip bir orta boy alkenil de
olabilir. Alkenil grubu ayrica 2 ila 4 karbon atomuna sahip daha
düsük bir alkenil olabilir. Alkinil grubu, "Czi alkenil" veya
benzer isaretlerle tanimlanabilir. Sadece örnek olarak, "Cß4
alkenil", alkenil zincirinde iki ila dört karbon atomu oldugunu
gösterir, yani alkenil zinciri etenil, propen-l-il, propen-Z-
il, propen-3-il, buten-l-il, buten-Z-il, buten-3-il, buten-4-
il, 2-metil-propen-3-il, buta-l,3-dienil, buta-l,2, -dienil ve
buta-l,2-dien-4-il'den olusan gruptan seçilir. Tipik alkenil
gruplari, sinirlayici olmamakla birlikte, ethenil, propenil,
bütenil, pentenil ve heksenil ve benzerlerini içerir.
Burada kullanilan "alkinil", bir veya daha fazla üçlü bag içeren
düz veya dallanmis bir hidrokarbon zincirini belirtir. Alkinil
grubu, 2 ila 20 karbon atomuna sahip olabilir, ancak mevcut
tanim, sayisal araligin belirtilmedigi "alkinil" teriminin
olusumunu da kapsar. Alkinil grubu ayrica 2 ila 9 karbon atomuna
sahip bir orta boy alkinil de olabilir. Alkinil grubu ayrica 2
ila 4 karbon atomuna sahip daha düsük bir alkinil olabilir.
Alkinil grubu "C24 alkinil" veya benzeri gösterimler ile
tanimlanabilir.
Sadece örnek olarak, "Cß4 alkinil", alkinil zincirinde iki ila
dört karbon atomu oldugunu gösterir, yani yani, alkinil zinciri,
etinil, propin-l-il, propin-2-il, butin-l-il, bütin-3-il, bütin-
4-il ve 2-bütinilden olusan gruptan seçilir. Tipik alkinil
gruplari, sinirlayici olmamkla beraber, etinil, propinil,
butinil, pentinil ve heksinil ve benzerlerini içerir.
Burada kullanildigi haliyle, "heteroalkil", bir veya daha fazla
heteroatom içeren düz veya dallanmis bir hidrokarbon zincirini,
yani zincir omurgasinda, azot, oksijen ve sülfür dahil, ancak
bunlarla sinirli olmamak üzere karbondan baska bir elementi
belirtir. Mevcut tanim ayrica sayisal araligin belirtilmedigi
heteroalkil grubu 1 ila 20 karbon atomuna sahip olabilir.
Heteroalkil grubu ayrica 1 ila 9 karbon atomuna sahip bir orta
boy heteroalkil olabilir. Heteroalkil grubu ayrica 1 ila 4 karbon
atomuna sahip daha düsük bir heteroalkil olabilir. Heteroalkil
grubu, "Cp4 heteroalkil" veya benzeri gösterimlerle
tanimlanabilir. Heteroalkil grubu bir veya daha fazla heteroatom
içerebilir. Sadece örnek olarak, "CLA heteroalkil", heteroalkil
zincirinde bir ila dört karbon atomu ve ayrica zincirin
omurgasinda bir veya daha fazla heteroatom olduguna isaret eder.
Burada kullanildigi sekliyle "alkilen", molekülün geri kalanina
iki nokta (yani bir alkanedil) ile baglanan sadece karbon ve
hidrojen içeren bir dallanmis veya düz Zincirli tam doymus di-
radikal kimyasal grup anlamina gelir. Alkilen grubu, 1 ila 20,000
karbon atomuna sahip olabilir, ancak mevcut tanim, sayisal
araligin belirtilmedigi alkilen terimini de kapsar. Alkilen
grubu ayrica 1 ila 9 karbon atomuna sahip orta boy bir alkilen
de olabilir. Alkilen grubu ayrica 1 ila 4 karbon atomuna sahip
daha düsük bir alkilen de olabilir. Alkilen grubu "C14 alkilen"
veya benzeri gösterimlerle tanimlanabilir. Sadece örnek olarak,
oldugunu gösterir, yani, alkilen zinciri, metilen, etilen, etan-
metiletilen, bütilen, bütandan olusan gruptan seçilir. -l,l-
diil, bütan-2,2-diil, 2-metil-propan-l,l-diil, l-metil-
propilen, 2-metil-propilen, l,l-dimetil-etilen, l, 2-dimetil-
etilen ve l-etilileten' den olusan guptan seçilir.
Burada kullanildigi sekliyle "heteroalkilen" terimi, alkilenin
bir veya daha fazla iskelet atomunun karbon, örnegin oksijen,
azot, sülfür, fosfor veya bunlarin kombinasyonlari disindaki bir
atomdan seçildigi bir alkilen zincirini belirtir. Heteroalkilen
zinciri 2 ila 20,000 arasinda bir uzunluga sahip olabilir. Örnek
niteligindeki heteroalkilenler, ama bunlarla sinirli olmamak
CHzNHCH2-, -CH2NHCH2CH2-, ve benzerlerini içerir.
Burada kullanildigi sekliyle "alkenilen", sadece karbon ve
hidrojen içeren ve molekülün geri kalanina iki noktadan baglanan
en az bir karbon-karbon çift bagi içeren düz veya dallanmis
Zincirli bir di-radikal kimyasal grup anlamina gelir. Alkenilen
grubu 2 ila 20,000 karbon atomuna sahip olabilir, ancak mevcut
tanim ayrica sayisal araligin belirtilmedigi alkenilen terimini
de kapsar. Alkenilen grubu ayrica 2 ila 9 karbon atomuna sahip
orta boy bir alkenilen olabilir. Alkenilen grubu ayrica 2 ila 4
karbon atomuna sahip daha düsük bir alkenil olabilir. Alkenilen
grubu, "C24 alkenilen" veya benzeri gösterimlerle
tanimlanabilir. Sadece örnek olarak, "C24 alkenilen", alkenilen
zincirinde iki ila dört karbon atomu olduguna isaret eder, yani
alkenilen zinciri etenilen, eten-l,l-diil, propenilen, propen-
l,1-diil, prop-Z-en-l,l-diil, l-metil-etenilen, but-l-enilen,
1,1-diil, but-2-en-l,l-diil, but-3-en-l, l-diil, l-metil-prop-
2-en-l,l-diil, 2-metil-prop-2-en-l,l-diil, l-etil-eteilen, 1,2-
dimetil- etenilen, l-metil-propenilen, 2-metil-propenilen, 3-
metil-propenilen, 2-metil-pro-pen-1,l-diil ve 2,2-dimetil-eten-
l,l-diil'den olusan gruptan seçilir.
Bu tarifnamede kullanildigi haliyle, "alkinilen", sadece karbon
ve hidrojen içeren ve molekülün geri kalanina iki noktadan
baglanan en az bir karbon-karbon üçlü bagi içeren bir düz ya da
dallanmis Zincirli di-radikal kimyasal grup anlamina
gelmektedir.
bir halka veya halka sistemini belirtir ve hem› karbosiklik
aromatik (örnegin, fenil) ve heterosiklik. aromatik gruplari
(örnegin, piridin) içerir. Terim, tüm halka sisteminin aromatik
olmasi kosuluyla nwnosiklik veya kaynasik halkali polisiklik
(yani, bitisik atom çiftlerini paylasan halkalar) gruplarini
Burada kullanildigi sekliyle "aril", halka omurgasinda sadece
karbon içeren bir aromatik halka veya halka sistemine (yani iki
bitisik karbon atomunu paylasan iki veya daha fazla kaynasmis
halka) isaret eder. Aril bir halka sistemi oldugunda, sistemdeki
her halka aromatiktir. Aril grubu, 6 ila 18 karbon atomuna sahip
olabilir, ancak mevcut tanim, sayisal araligin belirtilmedigi
karbon atomuna sahiptir. Aril grubu, "Cano aril", "Ceveya Cm
aril" veya benzer gösterimlerle tanimlanabilir. Aril gruplarinin
örnekleri, bunlarla sinirli kalmamak kaydiyla, fenil, naftil,
Burada kullanildigi sekliyle "arilen", iki noktadan baglanma
yoluyla molekülün geri kalan kismina baglanan sadece karbon ve
hidrojen içeren bir aromatik halka veya halka sistemini
belirtir.
Burada kullanildigi sekliyle "ariloksi" ve "ariltiyo", R-Ve RS-
benzerleri gibi, yukarida tanimlandigi gibi bir arildir; ancak
feniloksi ile sinirli degildir.
Bir "aralkil" veya "arilalkil", bir ikame olarak, "C7-l4
aralkil" gibi bir alkilen grubu ve benzil, 2-feniletil, 3-
fenilpropil ve naftilalkil dahil, ancak bunlarla sinirli olmamak
üzere, benzerleri ile baglanan bir aril grubudur. Bazi
durumlarda, alkilen grubu daha düsük bir alkilen grubudur (yani
bir Ci-4 alkilen grubu).
Burada kullanildigi haliyle, "heteroaril", halka omurgasinda,
azot, oksijen ve sülfür dahil, ancak bunlarla sinirli olmamak
üzere, karbondan baska bir element olan bir veya daha fazla
heteroatom içeren bir aromatik halka veya halka sistemini (yani,
iki bitisik atomu paylasan iki veya daha fazla kaynasmis halka)
isaret eder. Heteroaril bir halka sistemi oldugunda, sistemdeki
her halka aromatiktir. Heteroaril grubu, 5-18 halka üyesine
(yani, karbon atomlari ve heteroatomlar dahil olmak üzere halka
omurgasini olusturan atomlarin sayisi) sahip olabilir, ancak
mevcut tanim, sayisal araligin belirtilmedigi "heteroaril"
teriminin olusmasini da kapsar. Bazi uygulamalarda, heteroaril
grubu 5 ila 10 halka üyesine veya 5 ila 7 halka üyesine sahiptir.
Heteroaril grubu, "5-7 üyeli heteroaril", "5-10 üyeli
heteroaril" veya benzer gösterimlerle tanimlanabilir. Heteroaril
halkalarinin örnekleri, fakat bunlarla sinirli olmamak üzere,
furil, tiyenil, ftalazinil, pirolil, oksazolil, tiazolil,
imidazolil, pirazolil, izoksazolil, izotiazolil, triazolil,
tiadiazolil, piridinil, piridazinil, pirimidinil, pirazinil,
triazinil, kinolinil, izokinolinil, benzimidazolil,
benzoksazolil, benzotiazolil, indolil, izoindolil ve benzotienil
Bu tarifnamede kullanildigi haliyle, "heteroarilen", iki
noktadan baglanma yoluyla molekülün geri kalan kismina baglanan
halka omurgasinda bir ya da daha fazla heteroatom ihtiva eden
bir aromatik halka ya da halka sistemini belirtmektedir.
Bir "heteroaralkil" veya "heteroarilalkil", bir alkilen grubu
yoluyla bir ikame edici olarak baglanmis heteroaril grubudur.
Örnekler, bunlarla sinirli olmamak üzere, 2-tiyenilmetil, 3-
tiyenilmetil, furilmetil, tieniletil, pirrolilalkil, piridil-
lakil, izoksazolilalkil ve imidazolilalkil içerir.
Bazi durumlarda, alkilen grubu daha düsük bir alkilen grubudur
(yani bir Ci-4 alkilen grubu gibi).
Burada kullanildigi haliyle, "karbosiklil", halka sistemi
omurgasinda sadece karbon atomlari içeren, aromatik olmayan bir
döngüsel halka veya halka sistemi anlamina gelir. Karbosiklil
bir halka sistemi oldugunda, iki veya daha fazla halka kaynasmis
bir araya, köprülü veya spiro baglantili bir tarzda
birlestirilebilir. Bir halka sistemindeki en az bir halkanin
aromatik olmamasi kosuluyla, karbosikller herhangi bir doyma
derecesine sahip olabilir. Bu nedenle, karbosikliller,
sikloalkilleri, sikloalkenilleri ve sikloalkinilleri içerir.
Karboksil grubu, 3 ila 20 karbon atomuna sahip olabilir, ancak
mevcut tanim, sayisal araligin belirtilmedigi "karbosiklil"
teriminin olusumunu da kapsar. Karbosiklil grubu ayrica 3 ila 10
karbon atomuna sahip orta boy bir karbosiklil olabilir.
Karbosiklil grubu ayrica 3 ila 6 karbon atomuna sahip bir
karbosiklil olabilir. Karbosiklil grubu "C&ß karbosiklil" veya
benzer gösterimlerle tanimlanabilir.
Karbosiklil halkalarinin örnekleri, bunlarlar sinirli olmamak
üzere, siklopropil, siklobutil, siklopentil, sikloheksil,
sikloheksenil, 2,3-dihidro-inden, bisiklet [2.2.2] oktanil,
adenil ve spiro [4.4] nonanil içerir.
Bir "(karbosiklil) alkil", bir ikame edici olarak "C4-lO
(karbosiklil) alkil" ve benzerleri gibi bir alkilen grubu
yoluyla baglanan bir karbosiklil grubudur, siklopropilmetil,
siklobütilmetil, siklopropiletil, siklopropilbütil,
siklobütiletil, siklopropilizopropil, siklopentilmetil,
siklopentiletil, sikloheksilmetil, sikloheksiletil,
sikloheptilmetil ve benzerleri dahil olmak üzere ama bunlarla
sinirli degildir. Bazi durumlarda, alkilen grubu, daha düsük bir
alkilen grubudur.
Burada kullanildigi sekliyle "sikloalkil", tamamen doymus bir
karbosiklil halkasi veya halka sistemi anlamina gelir. Örnekler,
siklopropil, siklobutil, siklopentil ve sikloheksili içerir.
Burada kullanildigi sekliyle "sikloalkilen", molekülün geri
kalanina iki noktadan baglanan tam olarak doymus bir karbosiklil
halkasi veya halka sistemi anlamina gelir.
Burada kullanildigi sekliyle "sikloalkenil" veya "sikloalken",
en az bir çift baga sahip olan bir karbosiklil halkasi veya halka
sistemi anlamina gelip, özelligi; halka sistemindeki hiçbir
halkanin aromatik olmamasidir. Bir örnek sikloheksenil veya
sikloheksendir. Baska bir örnek norbornen veya norbornenildir.
Burada kullanildigi sekliyle "heterosikloalkenil" veya
halka sistemindeki hiçbir halkanin aromatik olmadigi en az bir
heteroatom içeren bir karbosiklil halkasi veya halka sistemi
anlamina gelir.
Burada kullanildigi sekliyle "sikloalkinil" veya "sikloalkin",
en az bir üçlü baga sahip olan bir karbosiklil halkasi veya halka
sistemi anlamina gelip, özelligi; halka sistemindeki hiçbir
halkanin aromatik olmamasidir. Bir örnek siklooktindir. Baska
bir örnek bisiklonindir.
Burada kullanildigi haliyle, "heterosikloalkinil" veya
en az bir heteroatom içeren bir karbosiklil halkasi veya halka
sistemi anlamina gelip, özelligi; halka sistemindeki hiçbir
Burada kullanildigi sekliyle "heterosiklil", halka omurgasinda
en az bir heteroatom içeren aromatik olmayan bir döngüsel halka
veya halka sistemi anlamina gelir. Heterosikliller kaynasik bir
sekilde biraraya gelerek köprülü veya spiro baglantili bir tazda
birlestirilebilir. Halka sistemindeki en az bir halkanin
aromatik olmamasi kosuluyla, heterosiklillerin herhangi bir
doygunluk derecesi olabilir. Heteroatom (lar), halka sisteminde
aromatik olmayan veya aromatik bir halkada mevcut olabilir.
Heterosiklil grubu 3 ila 20 halka üyesine sahip olabilir (yani,
karbon atomlari ve heteroatomlar dahil olmak üzere halka
omurgasini olusturan atomlarin sayisi), ancak mevcut tanim
ayrica sayisal araligin belirtilmedigi "heterosiklil" teriminin
olusumunu da kapsar. Heterosiklil grubu ayrica 3 ila 10 halka
üyesine sahip bir orta boy heterosiklil olabilir. Heterosiklil
grubu ayrica 3 ila 6 halka üyesine sahip bir heterosiklil
olabilir. Heterosiklil grubu "3-6 üyeli heterosiklil" veya
benzer gösterimlerle taminlanabilir. Tercih edilen alti elemanli
monosiklik heterosiklillerde, heteroatom (lar) bire kadar 0, N
veya S arasindan seçilir ve tercih edilen bes üyeli monosiklik
heterosiklilde heteroatom (lar) 0, N veya S'dn seçilen bir veya
iki heteroatomdan seçilir.
Heterosiklil halkalarinin örnekleri, bunlarla sinirli olmamak
üzere, azepinil, akridinil, karbazolil, sinolinil, dioksolanil,
imidazolinil, imidazolidinil, morfolilil, oksiranil, oksepanil,
thiepanyl, piperidinil, piperazinil, dioksopiperazinil,
pirazolinil, pirazolidinil, 1,3-dioksinil, 1,3-dioksanil, 1,4-
dioksinil, 1,4-dioksanil, 1,3-Oksathianil, 1,4-oksathiinil,
1,4-oksathianil, 2H-l,2-oksazinil, trioksanil, heksahidro-l,
3,5-triazinil, 1,3-dioksolil, 1,3-dioksolanil, 1,3-ditiyolil,
1,3-ditmi! Enil, izoksazolinil, izoksazolidinil, oksazolinil,
oksazolidinil, oksazolidinonil, tiyazolinil, tiyazolidinil,
1,3- oksatiyolanil, in-dolinil, izoindolinil,
tetrahidrofuranil, tetrahidropiranil, tetrahidrotiofenil,
tetrahidrotiopiranil, tetrahidro-l,4-tiyazinil, tiamorfolinil,
dihidrobenzofuranil, benzimidazolidinil ve tetrahidrokinolin
Burada kullanildigi sekliyle "heterosiklil", molekülün geri
kalan kismina iki noktadan baglanan en az bir heteroatom içeren
bir aromatik olmayan döngüsel halka veya halka sistemi anlamina
Bir "(heterosiklil) alkil", bir alkilen grubu yoluyla bir ikame
edici olarak baglanmis bir heterosiklil grubudur. Örnekler,
bunlarla sinirli olmamakla birlikte, imidazolinilmetil ve
indolinyiletil içerir.
Burada kullanildigi haliyle, `"asil", -C (= 0) R'ye isaret
etmekte olup, özelligi; R, burada tanimlandigi gibi hidrojen,
Ci4 alkil, Czß alkenil, CZß alkinil, C3q karbosiklil, C640 aril,
-10 üyeli heteroaril ve 5-10 üyeli heterosiklil olmasidir.
Sinirlayici olmayan örnekler, formil, asetil, propanoil, benzoil
ve akril içerir.
Bir "O-karboksi" grubu bir "-OC (= 0) R" grubuna karsilik
gelmekte olup, özelligi; R'nin, burada tanimlandigi gibi,
hidrojen, Ci-6 alkil, Cßß alkenil, C2% alkinil, C34 karbosiklil,
Cödo aril, 5-10 üyeli heteroaril ve 5-10 üyeli heterosiklilden
seçilmesidir.
Bir "C-karboksi" grubu bir "-C (= 0) OR" grubuna isaret
etmektedir, burada, R'nin, tanimlandigi gibi, hidrojen, Ci-6
alkil, C2-6 alkenil, C24 alkinil, C34 karbosiklil, ngo aril, 5-
üyeli heteroaril ve 5-10 üyeli heterosiklilden seçilmektedir.
Sinirlayici olmayan bir örnek, karboksili (yani, -C (= 0) OH)
Bir "asetal" grubu RC (H) (OR ') 2'ye isaret etmekte olup,
özelligi; R ve R"nin, burada tanimlandigi gibi, bagimsiz olarak
hidrojen, Cim alkil, C2% alkenil, C2% alkinil, C34 karbosiklil,
C640 aril, 5-10 üyeli heteroaril ve 5-10 üyeli heterosiklilden
seçilmesidir.
Bir "siyano" grubu bir "-CN" grubuna isaret eder.
Bir "siyanato" grubu bir "-OCN" grubuna isaret eder.
Bir "izosiyanat" grubu bir "-NCO" grubuna isaret eder.
Bir "tiyosiyanat" grubu bir "-SCN" grubuna isaret eder.
Bir "izotiyosiyanat" grubu, bir "-NCS" grubuna isaret eder.
Bir "sülfinil" grubu bir "-8 (= 0) R" grubuna isaret eder, burada
R, burada tanimlandigi gibi, hidrojen, Cye alkil, Cßß alkenil,
cis alkinil, C}a karbosiklil, Ceqo aril, 5-10 üyeli heteroaril
ve 5-10 üyeli heterosiklilden seçilir.
Bir "sülfonil" grubu bir "-SOZR" grubuna isaret eder, burada R,
burada tanimlandigi gibi, hidrojen, Cim alkil, Czw alkenil, cis
alkinil, C34 karbosiklil, Csqo aril, 5-l0 üyeli heteroaril ve 5-
lO üyeli heterosiklilden seçilir. Bir "S-sülfonamido" grubu bir
burada tanimlandigi gibi, bagimsiz olarak hidrojen, CLß alkil,
Cßß alkenil, C24 alkinil, C3q karbosiklil, Cano aril, 5-10 üyeli
heteroaril ve 5-10 üyeli heterosiklilden seçilir.
Bir "N-sülfonamido" grubu bir "-N (RA) SOzRB" grubuna isaret eder,
burada RA ve RB'nin her biri, burada tanimlandigi gibi, bagimsiz
olarak hidrojen, ciß alkil, C2% alkenil, Cat alkinil, C3;
karbosiklil, Caio aril, 5-10 üyeli heteroaril ve 5-10 üyeli
heterosiklilden seçilir.
Burada kullanilan "nitril oksit", "RC=N%T" grubuna isaret eder,
burada R, burada tanimlandigi gibi, hidrojen, Cye alkil, Cß6
alkenil, Cß6 alkinil, Cy7 karbosiklil, Ceqo aril, 5-10 üyeli
heteroaril veya 5-10 üyeli heterosiklilden seçilir. Nitril
oksidin hazirlanmasina yönelik sinirlayici olmayan örnekler
arasinda kloramid-T ile muamele ile aldoximlerden in situ
üretimi veya bazin imidoil klorürler üzerindeki etkisi [RC(Cl)=
NOH] yer alir.
Burada kullanilan "nitron", "Rýgc = NRc+O”'grubuna isaret eder,
burada RA, RE ve Rc'nin her biri, burada, tanimlandigi gibi,
bagimsiz olarak hidrojen, Cyß alkil, C}6 alkenil, Cßß alkinil,
C34 karbosiklil, Caqo aril, 5-10 üyeli heteroaril veya 5-10 üyeli
heterosiklilden seçilir.
Bir "O-karbamil" grubu bir "-OC(=O)NRý@" grubuna isaret eder,
burada RA ve RB'nin her biri, burada tanimlandigi gibi, bagimsiz
olarak hidrojen, CLß alkil, Czß alkenil, Cßß alkinil, C34
karbosiklil, Caio aril, 5-10 üyeli heteroaril ve 5-10 üyeli
heterosiklilden seçilir.
Bir "N-karbamil" grubu bir "-N(RA)OC(=O)RB" grubuna isaret eder,
burada RA ve RB'nin her biri, burada tanimlandigi gibi, bagimsiz
olarak hidrojen, Cyt alkil, Czß alkenil, Czr alkinil, C34
karbosiklil, Caio aril, 5-lO üyeli heteroaril ve 5-lO üyeli
heterosiklilden seçilir.
Bir "O-tiyokarbamil" grubu bir "-OC(=S)NRARE' grubuna isaret
eder, burada RA ve Rß'nin her biri, burada tanimlandigi gibi,
bagimsiz olarak hidrojen, C1% alkil, Cß6 alkenil, C}6 alkinil,
C34 karbosiklil, Cano aril, 5-10 üyeli heteroaril ve 5-10 üyeli
heterosiklilden seçilir.
Bir "N-tiyokarbamil" grubu bir "-N(RA)OC(=S)R5' grubuna isaret
eder, burada RA ve RB'nin her biri, burada tanimlandigi gibi,
bagimsiz olarak hidrojen, Cy6 alkil, Czß alkenil, Cßß alkinil,
C34 karbosiklil, Cana aril, 5-10 üyeli heteroaril ve 5-10 üyeli
heterosiklilden seçilir.
Bir "C-amido" grubu bir "-C(=O)NR&@" grubuna isaret eder, burada
RA ve RB'nin her biri, burada tanimlandigi gibi, bagimsiz olarak
hidrojen, C1% alkil, C2% alkenil, Czß alkinil, ng karbosiklil,
ngo aril, 5-lO üyeli heteroaril ve 5-10 üyeli heterosiklilden
seçilir.
Bir "N-amido" grubu bir "-N(RA)C(:O)R5' grubuna isaret eder,
burada RA ve RB'nin her biri, burada tanimlandigi gibi, bagimsiz
olarak hidrojen, CL& alkil, C2% alkenil, Czß alkinil, an
karbosiklil, Cale aril, 5-10 üyeli heteroaril ve 5-10 üyeli
heterosiklilden seçilir.
Bir "amino" grubu bir "-NRARB" grubuna isaret eder, burada RA ve
RB'nin her biri, burada tanimlandigi gibi, bagimsiz olarak
hidrojen, Cim alkil, C2% alkenil, C2% alkinil, C34 karbosiklil,
C640 aril, 5-lO üyeli heteroaril ve 5-10 üyeli heterosiklilden
seçilir. Sinirlayici olmayan bir örnek, serbest amino (yani, -
NH2) içerir.
Bir "aminoalkil" grubu, bir alkilen grubu yoluyla baglanan bir
amino grubuna karsilik gelir.
Bir "alkoksialkil" grubu, bir "Czß alkoksialkil" ve benzerleri
gibi bir alkilen grubu yoluyla baglanan bir alkoksi grubunu ifade
Burada kullanildigi haliyle, "hidrazin" veya "hidrazinil"
terimi, bir -NHNHZ grubuna karsilik gelir.
Burada kullanildigi haliyle "hidrazon" veya "hidrazonil" terimi
bu gruba isaret etmektedir;
Burada kullanilan sekliyle "formil"
terimi, bir -C(O)H grubuna karsilik
Burada kullanilan "epoksi" terimi,
su sekli ifade etmektedir;
Burada kullanilan "ester" terimi, R-C(=O) O-R' anlamina gelip,
özelligi; R ve R 'bagimsiz olarak alkil, alkenil, alkinil,
sikloalkil, sikloalkenil, sikloalkinil, aril, heteroaril,
heteroalisiklil, aralkil, (heteroalisiklil) alkil veya bunlarin
istege bagli olarak ikame edilmis varyantlari olabilmesidir.
Burada kullanildigi haliyle, "karboksilik asit" veya "karboksil"
terimi -C(O)OH'yi belirtir.
Burada kullanilan "tiyosiyanato" terimi -S-C = N grubuna
karsilik gelir.
Burada kullanilan "okso-amino" terimi, -NHz'nin bir veya daha
fazla. hidrojenin istege bagli olarak bir R grubu ile ikame
edilebildigi -O-NH2 grubuna karsilik gelir. R bagimsiz olarak
hidrojen, alkil, alkenil, alkinil, sikloalkil, sikloalkenil,
sikloalkinil, aril, heteroaril, heteroalisiklil, aralkil veya
(heteroalisiklil) alkil olabilir.
Burada kullanildigi haliyle, bir "nükleotit", heterosiklik baz,
bir seker ve bir veya daha fazla fosfat grubu içeren bir nitrojen
içerir. Bunlar bir nükleik asit dizisinin monomerik
birimleridir. RNA'da, seker bir ribozdur` ve DNA'da ise bir
deoksiribozdur, yani ribozda 2' konumunda bulunan bir hidroksil
grubundan yoksun bir sekerdir. Nitrojen içeren heterosiklik baz,
pürin veya pirimidin bazi olabilir. Pürin bazlari, adenin (A) ve
guanin (G) ve degistirilmis türevleri veya bunlarin analoglarini
içerir. Pirimidin bazlari arasinda sitosin (C), timin (T) ve
urasil (U) ve bunlarin degistirilmis türevleri veya analoglari
bulunur. C-l deoksiriboz atomu bir pirimidin N-l veya bir purinin
N-9'una baglanir.
Burada kullanildigi haliyle, bir "nükleosit", yapisal olarak bir
nükleotide benzer, ancak 5' konumunda herhangi bir fosfat
parçasindan yoksundur. "Nükleosit" terimi, buradaki normal
anlaminda yani teknikte kalifiye olmus kisiler tarafindan
anlasildigi gibi kullanilmaktadir. Örnekler, bunlarla sinirli
olmamak kaydiyla, bir ribonükleosit bir riboz kismi ve bir
deoksiriboz parçasi içeren bir deoksiribonükleosit içerir.
Degistirilmis bir pentoz kismi, bir oksijen atomunun bir karbon
ile degistirildigi ve / veya bir karbonun bir sülfür veya bir
oksijen atomu ile degistirildigi bir pentoz grubudur. Bir
sahip olabilen bir monomerdir. Ek olarak, daha büyük DNA ve /
veya RNA. polimerleri ve oligomerlerine bir nükleosit dahil
edilebilir.
Burada kullanildigi haliyle, "polinükleotid" terimi, genel
olarak DNA (örn., Genomik DNA cDNA), RNA (örnegin mRNA), sentetik
oligonükleotidler ve sentetik nükleik asit analoglari dahil
olmak üzere nükleik asitlere karsilik gelir. Polinükleotitler,
dogal veya dogal olmayan bazlari veya bunlarin kombinasyonlarini
ve dogal veya dogal olmayan omurga baglantilarini, ör.
fosforotiozlar, PNA veya 2'-O-metil-RNA veya bunlarin
kombinasyonlarini içerir.
Burada kullanildigi üzere bir "BCN primer" veya "BCN modifiye
primer", 5' terminusunda kovalent olarak eklenmis bisiklo
bir serbest 3 'OH gruba sahip tek iplikli DNA (ssDNA) molekülü
ve baglama tepkimelerine izin vermek için 5' termininde bir
modifikasyon olarak tanimlanir. Primer uzunlugu herhangi bir
sayida baz olabilir ve çesitli dogal olmayan nükleotidleri
içerebilir.
Burada kullanildigi sekliyle "silan" terimi, bir veya daha fazla
silikon atomu içeren bir organik veya inorganik bilesige isaret
eder. Bir inorganik silan bilesiginin sinirlayici olmayan bir
örnegi SiH4 ya da hidrojenin bir ya da daha fazla halojen atomu
ile degistirildigi halojenli SiH4'tür. Bir organik silan
bilesiginin sinirlayici olmayan bir örnegi, X-RF-Si(ORM3 olup,
özelligi; X'in amino, vinil, epoksi, metakrilat, sülfür, alkil,
alkenil, alkinil gibi hidrolize girmeyen bir organik grup
olmasi; RC -(CHûn- gibi bir ara parça olup, özellligi; n'in 0
ila 1000 olmasidir; RP, hidrojen, tercihe göre ikameli alkil,
tercihe göre ikameli alkenil, tercihe göre ikameli alkinil,
tercihe göre ikameli karbosiklil, tercihe göre ikameli aril,
tercihe göre ikameli 5-10 üyeli heteroaril ve istege bagli olarak
ornatilmis 5-10 üyeli heterosiklilden seçilmesidir. Burada
kullanildigi haliyle, "silan" terimi, farkli silan
bilesiklerinin karisimlarini içerebilir.
Burada kullanildigi haliyle, "tetrazin" veya "tetrazinil"
terimi, dört nitrojen atomunu içeren alti üyeli heteroaril
grubunu ifade eder. Tetrazin istege bagli olarak ikame
edilebilir.
Burada kullanilan "tetrazol" veya "tetrazolil" terimi, dört
nitrojen atomunu içeren bes üyeli heterosiklik gruba karsilik
gelir. Tetrazol istege bagli olarak ikame edilebilir
Burada kullanildigi haliyle, "doymamis molekül parçasi" terimi,
en az bir çift bag veya bir üçlü bag içeren sikloalkenler,
sikloalkinler, heterosikloalkenler, heterosikloalkinler veya
bunlarin istege göre ikame edilmis varyantlarini içeren bir
kimyasal grubu belirtir. Doymamis molekük parçalari tek
degerlikli veya iki degerlikli olabilir. Doymamis molekük
parçasi tek degerlikli oldugunda sikloalken, sikloalkin,
heterosikloalken, heterosikloalkin, sikloalkenil, sikloalkinil,
heterosikloalkenil, heterosikloalkinil ile birbirinin yerine
kullanilabilir. Doymamis molekül parçasi iki degerlikli
oldugunda, sikloalken, sikloalkin, heterosikloalken,
heterosikloalkin, sikloalkenilen, sikloalkinilen,
heterosikloalkenilen, heterosikloalkinilen ile birbirinin
yerine kullanilabilir.
Burada kullanildigi sekliyle "polimer" terimi, tekrarlanan
birçok alt birimden olusan bir molekülü isaret eder. Polimerler
dogrusal, dallanmis veya asiri dallanmis olabilir. Dallanmis
polimerlerin sinirlayici olmayan örnekleri arasinda, yildiz
polimerler, tarak polimerleri, firça polimerleri, dendronize
polimerler, merdivenler ve dendrimerler bulunur. Burada tarif
edilen polimerler, polimer nanopartikülleri seklinde de
olabilir.
Burada kullanilan "isik" ya da "foto-" önekleri, isik ya da
elektromanyetik radyasyon ile ilgili anlamina gelir. Terim,
spektrumun radyo, mikrodalga, kizil ötesi, görünür, ultraviyole,
X-isini veya gama isini kisimlari olarak bilinen araliklarin bir
veya daha fazlasini içeren, ancak bunlarla sinirli olmayan
elektromanyetik spektrumun tamamini veya bir kismini
kapsayabilir. Spektrumun bir kismi, burada ortaya konulan
metaller gibi bir yüzeyin metal bir bölgesi tarafindan bloke
edilmis olabilir. Alternatif olarak veya ek olarak, spektrumun
parçasi, cam, plastik, silika veya burada ortaya konan baska bir
materyalden yapilmis bir bölge gibi bir yüzeyin bir interstisyel
bölgesinden geçebilen olabilir. Özel uygulamalarda, bir metalden
geçebilen radyasyon kullanilabilir. Alternatif olarak veya ek
olarak, cam, plastik, silika veya burada ortaya konan baska bir
materyalle maskelenen radyasyon kullanilabilir.
Burada kullanilan "reaktif bölge" terimi, bir kimyasal reaksiyon
veya moleküler etkilesim yoluyla bir veya daha fazla molekülü
baglamak için kullanilabilen, burada tarif edilen
islevsellestirilmis molekül kaplamalari üzerinde bir alan
anlamina gelir. Bu baglanma, bir kovalent bag yoluyla veya diger
birlestirme veya interaktif kuvvetler yoluyla olabilir.
Burada kullanildigi sekliyle "YES metodu" terimi, Verumina, Inc.
tarafindan gelistirilen kimyasal buhar biriktirme prosesi ile
Verim Mühendislik Sistemleri ("YES") tarafindan saglanan
kimyasal buhar biriktirme aracini ifade eder. Üç farkli buhar
biriktirme sistemi içerir. Otomatik YES-VertaCoat silan buhar
sistemi, 200 veya 300 mm'lik plakalari barindirabilen esnek bir
plaka tasima modülü ile hacim üretimi için tasarlanmistir.
Manuel yüklemeli YES-1224? Silane Buhar Sistemi,
yapilandirilabilirf büyük kapasiteli hazneleri ile çok yönlü
hacim üretimi için tasarlanmistir. YES-LabKote, fizibilite
çalismalari ve Ar-Ge çalismalari için ideal olan düsük maliyetli
bir masaüstü sürümüdür.
Burada kullanildigi haliyle, ikame edilmis bir grup, baska bir
atom veya grup için bir veya daha fazla hidrojen atomunun
degistirildigi ikame edilmemis ana gruptan türetilir. Aksi
belirtilmedikçe, bir grup "ikame edilmis" olarak kabul
edildiginde, grubun bagimsiz olarak asagidakilerden seçilen bir
veya daha fazla ikame edici ile ikame edildigi ifade edilir:
C1-06 alkil, Ci-Cs alkenil, Ci-Cs alkinil, Ci-Cg heteroalkil, C3-
C7 karboksil (istege bagli olarak halo, Ci-Ca alkil, C1-C6
alkoksi, Ci-Ce haloalkil, and Ch-Ce haloalkoksi ile le ikame
edilmis), C3-C7-karbosiklil-Ci-CG-alkil (istege bagli olarak
halo, C1-C6 alkil, Ci-Ce alkoksi, C1-C6 haloalkil, and C1-C6
haloalkoksi ile ikame edilmis), 5-10 üyeli heterosiklil (istege
bagli olarak halo, C1-C6 alkil, C1-C6 alkoksi, Ci-Cs haloalkil,
and Ci-Cs haloalkoksi ile ikame edilmis), 5-10 üyeli
heterosiklil- Ci-Cs-alkil (istege bagli olarak halo, Ci-Cg alkil,
Ci-Ce alkoksi, C1-C6 haloalkil, and C1-C6 haloalkoksi ile ikame
edilmis), aril (istege bagli olarak halo, Ci-Ca alkil, Ci-Cg
alkoksi, Ci-Cg haloalkil, and C1-C6 haloalkoksi ile ikame
edilmis), aril(C1-C6)alkil (istege bagli olarak halo, Ci-Cs alkil,
C1-C6 alkoksi, Ci-Cs haloalkil, and Ci-Cs haloalkoksi), 5-10 üyeli
heteroaril (istege bagli olara halo, C1-C6 alkil, Ci-Ce alkoksi,
Ci-Cs haloalkyi, and C1-C6 haloalkoksi), 5-10 üyeli heteroaril(C1-
C6)alkil (istege bagli olarak halo, Ci-Cs alkil, Ci-Cs alkoksi,
Ci-Ce haloalkil, and Ci-Cahaloalkoksi), halo, siyano, hidroksi,
Ci-C6 alkoksi, C1-C6 alkoksi(C1-C6)alkil (yani, eter), ariloksi,
sülfhidril (mercapto), halo(C1-C6)alkil (e.g., -CF3), halo(C1-
C6)alkoksi (yani, -OCE3), Ci-Ce alkiltiyo, ariltiyo, amino,
amino(Ci-C6)alkil, nitro, O-karbamil, N-karbamil, O-tiokarbamil,
N-tiokarbamil, C-amido, N-amido, S-sulfonamido, N-sulfonamido,
C-karboksi, O-karboksi, asil, siyanato, izosiyanato,
tiosiyanato, izotiyosiyanato, sülfinil, sülfonil, ve okso (=O).
Bir grup "istege bagli olarak ikame edilmis" olarak
tanimlandiginda, bu grup yukaridaki ikame ediciler ile ikame
edilebilir.
Bazi radikal adlandirma kurallarinin, içerige bagli olarak bir
mono-radikal veya bir di-radikal içerebilecegi anlasilmalidir.
Örnegin, bir ornatigin` molekülünv geri kalanina iki noktadan
baglanmasi gerektirdigi yerde, ornatigin bir di-radikal oldugu
anlasilmaktadir. Örnegin, iki baglanti noktasi gerektiren bir
alkil olarak tanimlanan bir ornatik, -CH2-, -CHzCHrn -
CHzCH(CH3)CHT- ve benzeri di-radikalleri içerir. Diger radikal
adlandirma kurallari, radikalin "alkilen" veya "alkenilen" gibi
bir di-radikal oldugunu açikça gösterir.
Bir ornatigin bir di-radikal olarak gösterilmesi durumunda
(yani, molekülün geri kalan kismina iki baglanti noktasi
vardir), aksi belirtilmedikçe ornatigin herhangi bir yönsel
konfigürasyonda baglanabilecegi anlasilmalidir. Bu nedenle,
örnegin, -AE- olarak gösterilen bir ornatik
ya da "A" ifadesi, A'nin molekülün en soldaki tutturma noktasinda
ve molekülün en sagdaki baglanti noktasinda A'nin tutturuldugu
durumda tutturulacagi sekilde yönlendirilir.
Burada açiklanan bilesiklerin en az bir stereo merkeze sahip
olmasi durumunda, bunlar bireysel enantiyomerler ve
diastereomerler~ olarak veya rasematlar dahil olmak üzere bu
izomerlerin karisimlari olarak mevcut olabilir. Bireysel
izomerlerin ayrilmasi veya tek tek izomerlerin seçici sentezi,
teknikte uygulayicilar tarafindan iyi bilinen çesitli
yöntemlerin uygulanmasiyla gerçeklestirilir. Aksi
belirtilmedikçe, bu tür tüm izomerler ve bunlarin karisimlari,
burada açiklanan bilesiklerin kapsamina dahil edilir. Ayrica,
burada açiklanan bilesikler bir veya daha fazla kristalli veya
amorf formda bulunabilir. Aksi belirtilmedikçe, bu tür tüm
formlar, herhangi bir polimorfik form dahil olmak üzere, burada
açiklanan bilesiklerin kapsamina dahil edilir. Ek olarak, burada
açiklanan bilesiklerin bazilari, suyla (diger bir deyisle,
hidratlar) veya ortak organik çözücülerle solvatlar
olusturabilir. Aksi belirtilmedikçe, bu tür solvatlar* burada
açiklanan bilesiklerin kapsamina dahil edilir.
Burada kullanildigi haliyle, "kalan yüzeyin yüzdesi" terimi, P5
/ P7 yüzey primerlerini koyulastirmak (kimyasal madde ile) için
bir TET QC kullanilarak ölçülen yogunluga isaret edebilir. P5 ve
P7 primerleri, HiSeq, MiSeq, Genome Analyzer ve NextSeq
platformlarinda siralamak için Illumina Inc. tarafindan satilan
ticari akis hücrelerinin yüzeyinde kullanilir. Primer dizileme,
Patent yayininda tarif edilmistir. TET, PS / P7 primerlerine
karsi serbest diziye sahip bir boya etiketli oligonükleotittir.
TET, bir yüzey üzerinde PS / P7 primerlerine hibritlenebilir;
Asiri TET, yikanabilir` ve eklenmis boya konsantrasyonu, bir
Tayfun Scanner (General Electric) gibi bir tarama aleti
kullanilarak floresan tespiti ile ölçülebilir.
Teknikte uzman bir kisi, burada tarif edilen bazi yapilarin,
diger kimyasal yapilar tarafindan oldukça temsil edilebilen
rezonans formlari veya bilesiklerin totomerleri olabilecegini
kabul edecektir; zanaatkar, bu tür yapilarin, sadece bu tür
bilesik(ler) in bir numunesinin çok küçük bir kismini temsil
edebilecegini kabul eder. Bu tür bilesikler tasvir edilen
yapilar kapsaminda düsünülür, ancak bu tür rezonans formlari
veya totomerler burada temsil edilmez.
Silan veya Silan Türevleri
Burada açiklanan bazi uygulamalar, sikloalkenler, sikloalkinler,
heterosikloalkenler, heterosikloalkinler veya istege bagli
olarak ikame edilmis varyantlar veya bunlarin
kombinasyonlarindan seçilen çok sayida doymamis molekül
parçacigi içeren silan veya silan türevleri ile ilgilidir.
Burada kullanildigi sekliyle "sikloalken", en az bir çift baga
sahip olan bir karbosiklil halkasi veya halka sistemi anlamina
gelip, özeliigi; halka sistemindeki hiçbir halkanin aromatik
olmamasidir. Burada kullanildigi sekliyle "heterosikloalken",
bir karboksil halkasi veya halka sistemi, halka omurgasinda en
az bir çift baga sahip en az bir heteroatom içerdigi anlamina
gelip, özelligi; halka sistemindeki hiçbir halkanin aromatik
olmamasidir. Burada kullanildigi sekliyle "sikloalkin", en az
bir üçlü baga sahip bir karbosiklil halkasi veya halka sistemi
anlamina gelip, özelligi; halka sistemindeki hiçbir halkanin
aromatik olmamasidir. Burada kullanildigi haliyle,
omurgasinda en az bir heteroatom içeren bir karbosiklil halkasi
veya halka sistemi anlamina gelip, özelligi; halka sistemindeki
hiçbir halkanin aromatik olmamasidir. Bazi uygulamalarda,
heterosikloalken içindeki heteroatom, FL 0 veya S'den olusan
gruptan seçilir. Hem sikloalken hem de heterosikloalken, istege
bagli olarak ikame edilebilir. Doymamis molekül parçalari tek
degerlikli veya iki degerlikli olabilir. Doymamis molekül
parçalari, silan veya silan türevlerinin silikon atomlarina
kovalent olarak ya dogrudan baglanabilir veya baglayicilar
yoluyla dolayli olarak baglanabilir. Doymamis molekül parçalari,
islevsellestirilmis moleklüle daha da sinirlandirilabilir. Bazi
uygulamalarda, doymamis molekül parçalari, istege bagli olarak
norbornen ve bunlari türevleri gibi sikloalkenlerle ikame
edilir. Bazi uygulamalarda, doymamis molekül parçalari istege
bagli olarak ikame edilmis siklooktin ya da bisiklonindir. Halka
susu sunan diger sikloalkenler, heterosikloalkenler,
sikloalkinler, heterosikloalkinler de doymamis moleküül
parçalari olarak kullanilabilir.
Norbornenler
Bazi uygulamalarda, sikloalken norbornen veya bir norbornen
türevidir.
Bazi uygulamalarda norbornen, asagidaki seçilenlerden seçilen
bir veya daha fazla ikame edici ile ikame edilebilir: Ci-Cgalkil,
Ci-C6 alkenil, Ci-Ce alknil, C1-C6 heteroalkil, C3-C7 karbosiklil
(istege bagli olarak halo, Ci-Cs alkil, Ci-Cs alkokss, C1-C6
haloalkil, and Ci-Cs haloalkoksi ile ikame edilmis), C3-C7-
karbosiklil-Cy4k-alkil (istege bagli olarak halo, Ci-Cs alkil,
Ci-Cg alkoksi, Ci-Cs haloalkil, and Ci-Cs haloalkoksi), 5-10 üyeli
heterosiklil (istege bagli olarak halo, Ci-Cs alkil, Ci-Ca
alkoksi, Ci-Cs haloalkil, and. C1-C6 haloalkoksi), 5-10 üyeli
heterosikil- Ci-CG-alkil (istege bagli olarak halo, Ci-Cs alkil,
Ci-Ce alkoksi, Ci-Cs haloalkil, and Ci-Ca haloalkoksi ile ikame
edilmis), aril (istege bagli olarak halo, Ci-Ce alkil, Ci-C6
alkoksi, Ci-Ce haloalkil, ve Ci-Ce haloalkoksi ile ikame edilmis),
aril(Cy{%)alkil (istege bagli olarak halo, Ci-Ce alkil, Ci-Cg
alkoksi, Ci-Ce haloalkil, ve Ci-Ce haloalkoksi ile ikame edilmis),
-10 üyeli heteroaril (istege bagli olarak halo, C1-C6 alkil,
Cl-C6 alkoksi, Cl-C6 haloalkil, ve Cl-C6 haloalkoksi), 5-10
üyeli heteroaril(Cl-C6)alkil (istege bagli olarak halo, C1-C6
alkil, Cl-C6 alkoksi, Cl-C6 haloalkil, ve Cl-C6 haloalkoksi ile
ikame edilmis), halo, siyano, hidroksi, Cl-C6 alkoksi, Cl-C6
alkoksi(Cl-C6)alkil (yani eter), ariloksi, sülfhidril
(mercapto), halo(Cl-C6)alkil (örn, -CF3), halo(Cl-C6)alkoksi
(örn, -OCF3), Cl-C6 alkiltiyo, ariltiyo, amino, amino(C1-
C6)alkil, nitro, O-karbamil, N-karbamil, O-tiyokarbamil, N-
tiyokarbamil, C-amido, N-amido, S-sülfonamido, N-sülfonamido, C-
karboksi, O-karboksi, asil, siyanato, izosiyanato,
tiyosiyanato, izotiyosiyanato, sülfinil, sülfonil ve okso (= 0).
Alternatif olarak, norbornen üzerindeki iki bitisik ornatik,
ilave halkalar olusturabilir. Örnegin,
bir di-ikameli norborneni temsil edip, özelligi; burada Ra ve
Rh, eklendikleri atom ile birlikte, istege bagli olarak ikame
edilmis bir aril, istege bagli olarak ikame edilmis bir
heteroaril, istege bagli olarak ikame edilmis bir sikloalkil
veya istege bagli olarak ikame edilmis bir heterosiklil
olusturmak üzere bir araya getirilebilmesidir.
Bazi uygulamalarda, norbornen, baska sikloalkenlerle yer
degistirebilir. Sinirlayici olmayan örnekler, istege bagli
olarak ikame edilmis trans-siklookteni, istege bagli olarak
ikame edilmis trans-siklopenten, istege bagli olarak ikame
edilen trans-siklohepeni, istege bagli olarak ikame edilen
trans-siklononen, istege bagli olarak ikame edilmis bicyclo
bicyclo[4.3.l]dec-l(9)-ene, istege bagli olarak ikame edilmis
bicyclo[4.2.l]non-l(8)-ene ve istege bagli olarak ikame edilmis
bicyclo[4.2.l]-non- l-ene içerir.
Hetero(norbornenler)
Bazi uygulamalarda, burada kullanilan heterosikloalken bir
heteronorbornendir. Bu tarifnamede kullanildigi haliyle,
(hetero) norbornen, bir ya da daha fazla heteroatom ile yer
degistiren bir norbornen molekülünde bir ya da daha fazla karbon
atomu anlamina gelir. (Hetero) norbornenlerin sinirlayici
olmayan örnekleri bu sekildekileri
ya da bunlarin istege bagli olarak ikame edilmis varyantlarini
Örnek Norbornen Reaksiyonlari
A Azides ile 1,3-Dipolar Halkalasma Reaksiyonu
1,2,3-triazolin olusumuna yol açan organik azidlerin ve olefinik
baglarin tepkisi ilk olarak 1912 yilinda Wolff tarafindan
bildirilmistir. Bkz. Wolff, Liebigs. Ann., 1912, 394, 23. Bu
tip reaksiyon, 1,3-dipolar halkalasma reaksiyonu olarak
adlandirilir. Terminal alkin'e olan azid ilaveleri, Huisgen'in
arastirmasindan elde edilen 1,3-dipolar halkalasma reaksiyonunun
bir örnegi olarak kabul edildi. Bkz. Kimyasal Toplumun
norbornene kinetik arastirmasini bildirmistir (bkz. Scheiner ve
semasi asagidaki gibi gösterilmistir:
1,3-dipolar halkalasma reaksiyonu
Ek olarak, Shea ve dig. 2,4,6-trinitrofenil azid ile 1,3-dipolar
siklokatlarda burulma ile gerilmis çift baglarin reaktivitesi
ile ilgili çalismalari rapor etmistir. Trans-sikloalkenler ve
köprübasi alkenleri içeren bir dizi mono- ve bi- siklik olefinler
test edildi. Bakiniz, Shea ve arkadaslari, J. Am. Chem. Soc.
B Tetrazinler ile Kenetlenme Reaksiyonu
Polimer fonksiyonellesmesi için katki maddesi içermeyen
(DAinV) tetrazin ve norbornen reaksiyonu ile eslestirme Hansell
ve digerleri tarafinda rapor edilmistir. (Bkz. Hansell ve
reaksiyon semasi asagidaki gibi gösterilmistir:
ÖgraxfN . "î ÇA` .' s N %rêivf\`v”&î
Diger örnek metal içermeyen `tiklama' tepkimeleri, Hoyle ve
digerleri tarafindan bildirildigi üzere (hetero-) Diels-Alder
ve radikal bazli tiol-ene reaksiyonunu içerir ((1995) Soc.
0 Tetrazoller ve Hidrazonlar ile Kenetlenme Reaksiyonu
Kaya. ve digerleri. bir` bakir içermeyen tiklama reaksiyonunda
protein modifikasyonu için bir norbornen amino asidi (1) rapor
etmistir. Kaya ve digerleri, Angew. Chem. Int. Ed. 2012, 51,
4466-4469. Birinci Örnekte, bir nitril imin hidrazonil klorürden
baz destekli HCl eliminasyonu ile üretildi ve daha sonra
norbornen türeviyle (1) bir sikloidleme reaksiyonunda
kullanildi. Ikinci örnekte, nitril imin bir foto-kimyasal
reaksiyonda bir tetrazolden üretildi.
NH; Q Click g Hidrazanol ;Ipi N
HO 1 v __ . ` ;L Â` Reaksiycinu à klorür .. R
Foto-click 3;/ g
reaksiyonu '
D. Olefinlerle Halka Açma Reaksiyonu
Kim ve digerleri bir normale ait yüzeyde baslatilan halka açici
metatez polimerizasyonu kullanilarak bir dogal oksit (Si / SiOZ)
tasiyan bir silikon gofretin yüzeyinden ince polimer filmlerin
büyütülmesi için bir yöntem bildirmistir. Asagidaki sema üç
adimli bir prosedürü Özetlemektedir:(i) norbornenil gruplarini
içeren silikon üzerinde kendinden birlestirilmis tek tabakanin
olusturulmasi; (ii) bir rutenyum katalizörünün [(Cy3P) 2C12Ru =
CHPh, Cy = sikloheksil] yüzeye baglanmasi ve (iii) filmi üretmek
için eklenen monomerlerin polimerizasyonu. Bkz Kim ve digerleri,
Benzer sekilde, Liu ve digerleri sagidaki semada gösterildigi
gibi, bir rutenyum katalizörü tarafindan katalize edilen,
elektron bakimindan zengin olefinler ile norbornen türevlerinin,
bölge seçici halka açma / çapraz-metatez reaksiyonlarini
bildirmistir. Bakiniz Liu ve arkadaslari, Org. Lett, 2005, 7,
131-133.
3 \ HIM?? L \
45`Y `
Nitril Oksitler ile Halkalasma Reaksiyonu
R'(I`ê-5N(î1i:~4 _Ir -
Gutsmiedl ve digerleri norbornen ile modifiye edilmis DNA
substrati içeren gerginlige karsi uyarlanmis nitril oksit
siklojenin ilk örneklerini rapor etmislerdir. Gerilmis alken ya
hidroksamoil klorürlerden ya da dogrudan ana oksimin N-
Klorosüksinimit ile muamele edilmesi yoluyla in situ olarak
üretilen çesitli nitril oksitlerle sikloza karsi uygundur.
Siklooktin
getirilmesi ve bahsedilen substratlar üzerinde biyolojik
moleküllerin hareketsizlestirilmesi için bir alkin fonksiyonu
içeren bir siklik karbon zincirine sahip silan bilesiklerini
tarif etmektedir.
Mevcut açiklamanin bazi düzenlemelerinde, sikloalkin, C1-C6
alkil, C1-C6 alkenil, C1-C6 alkinil, Ci-C6 heteroalkil, C3-C7
karboksiklil (istege bagli olarak halo, C1_C6 alkil, Ci-Ca
alkoksi, Ci-Cg haloalkil, ve C1-C6 haloalkoksi ile ikame
edilmis), C3-C7-carbosiklil-Ci-Ce-alkil (istege bagli olarak
halo, Ci-Cg alkil, C1-C6 alkoksi, C1-C6 haloalkil, ve Ci-Cg
haloalkoksi ile ikame edilmis), 5-10 üyeli heterosiklil
(istege bagli olarak halo, Ci-Cs alkil, Ci-Ce alkoksi, C1-C6
haloalkil, ve Ci-Cs haloalkoksi ile ikame edilmis), 5-10 üyeli
heterosiklil-Ci-Ca-alkil (istege bagli olarak halo, Ci-Ce alkil,
Ci-Ce alkoksi, C1-C6 haloalkil, ve Ci-Cs haloalkoksi), aril
(istege bagli olarak halo, Ci-Ca alkil, C1-C6 alkoksi, Ci-Cs
haloalkil, ve Ci-Cghaloalkoksi ile ikame edilmis), aril(C1-
C6)alkil (istege bagli olarak halo, Ci-Ca alkil, Ci-Ce alkoksi,
Ci-Ce haloalkil, ve Ci-Cehaloalkoksi), 5-10 üyeli heteroaril
(istege bagli olarak halo, Ci-Cs alkil, Ci-Cs alkoksi, Ci-Cs
haloalkil, ve Ci-Cs haloalkoksi), 5-10 üyeli heteroaril(Ci-
C6)alkil (istege bagli olarak halo, Ci-Cs alkil, Ci-Ce alkoksi,
Cyfk haloalkil, ve Cyfk haloalkoksi ile ikame edilmis), halo,
siyano, hidroksi, Ci-Ce alkoksi, Ci-Ce alkoksi(C1-C6)alkil
(yani, eter), ariloksi, sülfihidril (mercapto), halo(Ci-
C6)alkil (örn, -CF3), halo(C1-C6)alkoksi (orn, -OCF3), Ci-Cg
alkiltiyo, ariltiyo, amino, amino(Cy{%)alkil, nitro, O-
karbamil, N-karbamil, O-tiyokarbamil, N-tiyokarbamil, C-amido,
N-amido, S-sülfonamido, N-sülfonamido, C-karboksi, O-karboksi,
sülfinil, sülfonil, ve okso (=O)'den seçilen bir veya daha
fazla ikame edici ile ikame edilebilir.
Alternatif olarak, siklooktinin iki bitisik ikamesi, ilave
halkalar olusturabilir. Örnegin,
bir di-ikameli siklooktini temsil edip, burada, burada R? ve Rb,
eklendikleri atom ile birlikte, istege göre ikame edilmis bir
aril, tercihe göre ikameli bir heteroaril, tercihe göre ikameli
bir sikloalkil veya istege göre ikame edilmis bir heterosiklil
olusturmak üzere bir araya getirilebilir. Bazi uygulamalarda,
siklooktin türevi asagidaki yapilari içerebilir:
/.11:*.:::~\` "JIOR Meû` /nm\\ ,.-" W\ f; ..f/
.(1 3 5 3" \
Gerinim arttirici azid-alkin halkalasma veya nitril oksit-
alkin halkalasma
Siklooktinler azides ile 1,3-halkalasma olabilir. Bu tür
gerinim arttirici azid-alkin halkalasma (SPAAC) reaksiyonu,
bakir içermeyen DNA ligasyonunda kullanilmistir. Van Geel ve
digerleri, azid etiketli proteinleri etkili bir sekilde
etiketlemek için çesitli gergin oktillerin kullanilabilecegini
rapor etmislerdir. Bkz. R. van Geel ve dig., "Thiol-yne
ilavesinin önlenmesi, Gerinim Arttirici Azide-Alkin
Halkalasmasinin Özelligini Gelistirir", Bioconjugate Chem.,
tarafindan gerilmis alkinlerin amino asitli filizlere florofor
eklemek için kullanilabilecegini gösteren bir çalismada da
bildirilmistir. Bkz. Tao ve dig., "Enzim aracili azid
ligasyonu ve sus destekli siklojeksiyon yoluyla hücresel
proteinleri hedefleyen fluorofor", J. Am. Chem. 800., 2012,
Nitloil oksitlerin nispi aktivitesi, azot dipollere karsi
alternatif olarak nitronlarin siklooktinlerle reaksiyona girmesi
üzerine yapilan çalismalar, gerilme-destekli alkin / nitril
oksit halkalasmasi için üstün reaktiviteler önermistir. Bakiniz
2] bisiklo [ 'nin benzonitril okside
eklenmesi için hiz sabitinin, benzil azit ile ilgili reaksiyon
için asilmis olandan 10 kat daha fazla oldugu gözlenmistir.
Benzer sonuçlar dibenzosiklo-aktinol (DIBO) ve benzonitril oksit
(in situ hidroksamoil klorürden elde edilen) veya benzil azid
arasindaki siklokasyonda da gözlenmistir. Çalisma, önceki
reaksiyonun ikincisinden yaklasik 60 kat daha hizli oldugunu
göstermektedir.
Bisikloninler
Bazi uygulamalarda, sikloalkinler bisiklik halka sistemini,
örnegin bisiklononinleri içerebilir. Bazi uygulamalarda,
bisiklononinler bisiklo [6.1.0] non-4-yne veya bunlarin
türevlerinden seçilebilir. Bazi baska uygulamalarda,
bisiklononinler bisiklo [6.1.0] non-Z-yne veya bisiklo [6.1.0]
non-3-yne arasindan seçilebilir. Bazi uygulamalarda
bisiklononinler, asagidakilerden seçilen bir *veya daha fazla
ikame edici ile ikame edilebilir: C1-C6 alkil, C1-C6 alkenil, C1-
C6 alkinil, C1-C6 heteroalkil, C3-C7 karbosiklil (istege bagli
olarak halo, Ci-Cs alkil, Ci-Cs alkoksi, Ci-Cs haloalkil, ve C1-C6
haloalkoksi ile ikame edilmis), C3-C7-karbosiklil-Ci-Cg-alkil
(istege bagli olarak halo, Ci-Cs alkil, Ci-Cs alkoksi, C1-C6
haloalkil, ve Ci-Ca haloalkoksi ile ikame edilmis), 5-10 üyeli
heterosiklil (istege bagli olarak halo, C1-C6 alkil, C1-C6
alkoksi, Ci-Cs haloalkil, ve C1-C6 haloalkoksi ile ikame edilmis),
-10 üyeli heterosiklil- Ci-Cs-alkil (istege bagli olarak halo,
Ci-Ce alkil, Ci-Cs alkoksi, Ci-Cs haloalkil, ve Ci-Ce haloalkoksi
ile ikame edilmis), aril (istege bagli olarak halo, Cy4k alkil,
Ci-Cg alkoksi, Ci-Cg haloalkil, ve C1-C6 haloalkoksi ile ikame
edilmis), aril(C1-C6)alkil (istege bagli olarak halo, Ci-Cs alkil,
Ci-Ca alkoksi, Ci-Ce haloalkil, ve Ci-Cs haloalkoksi), 5-10 üyeli
heteroaril (istege bagli olarak halo, Ci-Ce alkil, Ci-C6 alkoksi,
Ci-Ce haloalkil, ve Ci-Cs haloalkoksi ile ikame edilmis), 5-10
üyeli heteroaril(C1-C6)alkil (istege bagli olarak halo, C1-C6
alkil, Ci-Ce alkoksi, Ci-Cs haloalkil, ve (h-Cg haloalkoksi ile
ikame edilmis), halo, siyano, hidroksi, Ci-C6 alkoksi, C1-C6
alkoksi(Cy%k)alkil (yani, eter), ariloksi, sülfihidril
(mercapto), halo(Ci-C6)alkil (örn, -CF3), halo(C1-C6)alkoksi
(örn, -OCE3), Ci-Cg alkiltiyo, ariltiyo, amino, amino(Ci-C6)alkil,
nitro, O-karbamil, N-karbamil, O-tiyokarbamil, N-tiyokarbamil,
C-amido, N-amido, S-sülfonamido, N-sülfonamido, C-karboksi, O-
karboksi, asil, siyanato, izosiyanato, tiyosianato,
izotiyosianato, sülfinil, sülfonil, ve okso (=O).
Alternatif olarak, bir bisiklonin üzerinde iki bitisik ikame
edici, ilave halkalar olusturabilir. Örnegin,
di-ikameli bisiklo [6.l.0] non-4-yne'yi temsil eder, burada, Ra
ve Rb bagli olduklari atom. ile birlikte, istege göre ikame
edilmis bir aril, tercihe göre ikameli bir heteroaril, tercihe
göre ikameli bir sikloalkil veya istege göre ikame edilmis bir
heterosiklil olusturmak üzere bir araya getirilebilir.
Bisiklononinler, bisiklik halka sistemindeki gerilime bagli
olarak sikloo-tiyole iliskin olarak yukarida tarif edildigi gibi
azidler veya nitril oksitleri ile benzer SPAAC alkin sikloza
maruz kalabilirler.
Hidrojeller
Burada tarif edilen bazi uygulamalar, fonksiyonellestirilmis
bir hidrojelin, fonksiyonellestirilmis silan veya silan
türevlerinin doymamis molekül parçalari vasitasiyla bir
substratin bir yüzeyine hareketsizlestirilmesini içerir.
Mevcut uygulamada hidrojellerin sinirlayici olmayan örnekleri
kullanilabilir.
WO OO/3ll48, poliakrilamid hidrojeni ve poliakrilamid
prepolimeri olarak adlandirilan, tercihen akrilamid ve bir
akrilik asit veya bir Vinil grubu içeren bir akrilik asit
türevinden olusan poliakrilamid hidrojel bazli dizileri
açiklamaktadir. Ön polimerin Çapraz baglanmasi bundan sonra
etkilenebilir. Bu sekilde üretilen hidrojeller, tercihen cam
üzerinde kati desteklidir. Kati-destekli hidrojelin
islevsellestirilmesi de gerçeklestirilebilir.
birlikte, hidrojel, bu tür biyomoleküllerin immobilize edilmis
dizilerini olusturmak üzere bir biyomolekül ile bir [2 -+ 2]
fotocycloaddition reaksiyonuna katilabilen islevselligi
tasimasi bakimindan farklidir. Dimetilmaleimid (DMI) özellikle
tercih edilen bir islevselliktir. Poliakrilamid bazli mikrodizi
teknolojisi baglaminda [2 + 2] fotohalkalasma reaksiyonlarinin
açiklanmaktadir.
6,465,178 sayili ABD Patenti, nükleik asitlerin mikrodizilerinin
hazirlanmasinda. kullanilmak› üzere aktiflestirilmis slaytlarin
temin edilmesinde reaktif bilesimlerinin kullanimini
anlatmaktadir; Reaktif bilesimleri arasinda akrilamid
kopolimerleri bulunur. Aktive edilen slaytlarin, mikrodizilerin
hazirlanmasinda geleneksel (ör., Sililatlanmis) cam slaytlarin
yerini almak için özellikle uygun olduklari belirtilmektedir.
WO 00/53812, DNA'nin poliakrilamid bazli hidrojel dizilerinin
hazirlanmasini ve bu dizilerin çogaltma amplifikasyonu içinde
kullanimini açiklar.
Hidrojeller olusturulduktan sonra moleküller, istenirse,
moleküler diziler üretecek sekilde bunlara eklenebilir. Ek,
önceki teknikte farkli sekillerde gerçeklestirilmistir.
Örnegin, 6,372,813 sayili ABD Patenti, dimetilmaleimid gruplari
tasiyan polinükleotidlerin, immobilize edilecek polinükleotide
baglanmis iki dimetilfaleimit grubu-bir hidrojenden bir sarkan
arasinda bir [2 + 2] fotoisiklik giderme asamasi
gerçeklestirerek dimetil-maleimid gruplari tasiyan hidrojellere
immobilizasyonunu ögretmektedir.
Hidrojenin olusturulmasindan sonra moleküler dizilimin olustugu
yerde, bu 'uca 'ulasmak. için iki strateji kullanilmistir. Ilk
olarak, hidrojel üretildikten sonra kimyasal olarak modifiye
edilebilir. Bu yaklasimla ilgili sorunlar dizinin
hazirlanmasinda genel olarak düsük bir verimi ve özellikle
yüksek sicakliklara, iyonik çözeltilere ve çoklu yikama
adimlarina. maruz kalmaya bagli olarak, baglanma kimyasi ile
ilgili düsük stabiliteyi içerir.
Daha yaygin bir alternatif polimerizasyonun, dizilecek
moleküller ile reaksiyona girecek sekilde baslatilmis veya ön-
aktiviteye sahip bir ko-monomer ile gerçeklestirilmesidir.
Hidrojellerin ilk formasyonuna alternatifler` ve bunu takiben
moleküllerin daha sonra dizilmesi, hidrojenin üretildigi sirada
dizinin olusturuldugu önceki teknikte tarif edilmistir. Bu,
örnegin, akrilamid türevli polinükleotidlerin dogrudan
kopolimerizasyonuyla gerçeklestirilebilir. Bu yaklasimin bir
örnegi, akrilamid türevli polinükleotidlerin solüsyonlarla
karistirildigi, akrilamid ve polimerizasyonun dogrudan
etkilendigi WOl / 62982'de tarif edilmistir.
Mosaic Teknolojileri (Boston, Mass., ABD), elde edilen monomerin
akrilamid ile kopolimerlestirilmesinden önce polinükleotidlerle
reaksiyona girebilen ACRYDITE TM (bir akrilamid. fosforamidit)
4426), akrilamidin, reaktif akrilik asit türevlerinin ve 5'-
veya 3'-sahip olan modifiye edilmis polinükleotidlerin
kopolimerizasyonunun yapildigi bir hidrojel / dizi eszamanli
olusumunun bir baska örnegini açiklar. Terminal akrilamid
gruplari etkilenir.
Polimerler
Burada tarif edilen bazi düzenlemeler, bir
fonksiyonellestirilmis polimerin bir substratin yüzeyine
sikloalken veya heterosikloalken fonksiyonellestirilmis silan
veya silan türevleri vasitasiyla hareketsizlestirilmesini
içerir. Mevcut uygulamada kullanilabilecek polimerlerin
sinirlayici olmayan örnekleri ABD Ser. 13 / 784,368 ve ABD
Patenti No. Yay. 20ll/OOS9865'Da tarif edilmistir, ki bunlar
burada bütünlügüyle referans olarak bulunmaktadir.
Bazi uygulamalarda, burada kullanilan polimer, tekrarlayan bir
Formül (I) ünitesini ve tekrar eden Formül (II) birimini
izle“ 1/)`\jrf
burada: Rl, H veya alkildir; RA, azido, istege bagli olarak ikame
edilmis amino, istege bagli olarak ikame edilmis alkenil, istege
göre ikame edilmis hidrazon, istege bagli olarak ikame edilmis
hidrazin, karboksil, hidroksi, istege bagli olarak ikame edilmis
tetrazol, istege göre ikame edilmis tetrazin ve tiyolden olusan
gruptan seçilir; X, istege göre ikame edilmis bir alkilen
baglayici veya istege bagli olarak ikame edilmis bir
heteroalkilen baglayicidir; R4, R4 ', R5 ve R5' in her biri
bagimsiz olarak H, R6, OR6, -C (0) OR6, -C (0) R6, -OC (0) R6,
-C (0) NR7R8'den seçilir veya - NR7R8'dir; R6 bagimsiz olarak H,
OH, alkil, sikloalkil, hidroksialkil, aril, heteroaril,
heterosiklil veya istege göre ikame edilmis varyantlarindan
seçilir; R7 ve R8'in her biri bagimsiz olarak H veya alkilden
seçilir, veya R7 ve R8 bir heterosiklik olusturmak üzere
baglandiklari atom veya atomlarla birlikte birlestirilir.
Bazi uygulamalarda RA, azidodur. Bazi uygulamalarda, X, istege
göre ikame edilmis bir alkilen baglayicidir. Bazi uygulamalarda,
R1, hidrojendir, diger bazi uygulamalarda, Rl metildir. Bazi
uygulamalarda, R4, hidrojendir ve R”, -C(O)NR7R8'dir. Bazi
uygulamalarda, R5 ve R5' in her biri hidrojendir. Bazi
uygulamalarda, R5 hidrojendir ve R5 metildir.
Bazi uygulamalarda, burada kullanilan polimer bir Formül (III)
veya (III ') polimerini içerir:
R1 R5 (m) R5 R* (mü:
burada: R1, H veya istege göre ikame edilmis alkilden seçilir;
RA, azido, istege bagli olarak ikame edilmis amino, istege bagli
olarak ikame edilmis alkenil, istege göre ikame edilmis
hidrazon, istege bagli olarak ikame edilmis hidrazin, karboksil,
hidroksi, istege bagli olarak ikame edilmis tetrazol, istege
göre ikame edilmis tetrazin ve tiyolden olusan gruptan seçilir;
- (CHZ) -p'nin her biri istege göre ikame edilebilir; p, 1-50
araliginda bir tamsayidir; R5, H veya istege göre ikame edilmis
alkilden seçilir; n, 1 ila 50,000 arasinda bir tamsayidir; ve m,
1 ila 100,000 arasinda bir tamsayidir. Bazi özel uygulamalarda,
p 5'dir. Bazi uygulamalarda RA, azidodur.
Bir uygulamada, Formül (III) veya (III ')' ün polimeri
ayrica Formül (IIIa) veya (IIIb) ile temsil edilir:
” m (ma) m (Hits)
burada, n, l-20.000 araliginda bir tamsayidir ve m, 1-
100.000 araliginda bir tamsayidir.
Bazi uygulamalarda, dogrudan konjugasyon için kullanilan
islevsellestirilmis molekül, poli (N- (5-azidoasetami-
dilpentil) akrilamid-ko-akrilamid) (PAZAM) 'dir. Bazi
düzenlemelerde, PAZAM dogrusal bir polimerdir. Bazi diger
uygulamalarda, PAZAM hafifçe çapraz bagli bir polimerdir.
Bazi uygulamalarda, PAZAM yüzeye sulu bir çözelti olarak
uygulanir. Bazi diger uygulamalarda, PAZAM, yüzeye, etanol
gibi bir veya daha fazla çözücü katki maddesi ile sulu bir
çözelti halinde uygulanir. Farkli PAZAM polimerlerinin
hazirlanmasi için yöntem ABD Ser. No. l3/784,368 da
tartisilmistir.
Substratlar
Bazi uygulamalarda, bu basvuruda kullanilan substratlar, cam,
kaynasmis silika ve diger silika-içeren malzemeler gibi silika
bazli substratlari içerir. Bazi uygulamalarda, silika bazli
substratlar ayrica silikon, silikon dioksit, silikon nitrür,
silikon hidritler olabilir. Bazi uygulamalarda, bu basvuruda
kullanilan substratlar arasinda, polietilen, polistiren, poli
(Vinil klorür), polipropilen, naylonlar, polyesterler,
polikarbonatlar ve poli (metil metakrilat) gibi plastik
malzemeler bulunur. Tercih edilen plastik malzeme poli (metil
metakrilat), polistiren ve siklik olefin polimer
substratlaridir. Bazi uygulamalarda, substrat, silika bazli bir
materyal veya plastik bir malzemedir. Bir uygulamada, substrat,
cam içeren en az bir yüzeye sahiptir.
Bazi diger uygulamalarda, substratlar bir metal olabilir. Bu
gibi bazi uygulamalarda, metal altindir. Bazi uygulamalarda,
substrat, bir metal oksit içeren en az bir yüzeye sahiptir. Bir
uygulamada, yüzey bir tantal oksit içerir.
Akrilamid, enon veya akrilat ayrica bir substrat malzemesi
olarak kullanilabilir. Diger substrat malzemeleri arasinda,
bunlarla sinirli olmamakla birlikte galyum aresnid, indiyum
fosfit, alüminyum, seramikler, poliimid, kuartz, reçineler,
polimerler ve kopolimerler sayilabilir. Yukaridaki listeler
açiklayicidir ancak mevcut uygulama ile sinirli degildir.
Bazi uygulamalarda, substrat ve/veya substrat yüzeyi kuartz
olabilir. Bazi diger düzenlemelerde, substrat ve/Veya substrat
yüzeyi, yari iletken, yani GaA veya ITO olabilir.
Substratlar tek bir materyal veya çok sayida farkli materyal
içerebilir. Substratlar kompozit veya laminat olabilir. Yüzey
düz, yuvarlak, dokulu ve desenli olabilir. Desenler, örnegin,
metal olmayan yüzeyler üzerinde özellikler olusturan metal
pedlerle olusturulabilir. Örnegin, ABD Patent Basvurusu Seri No.
13 / 661,524'te açiklandigi gibi. Bir baska kullanisli desenli
yüzey, bir yüzey üzerinde olusturulmus iyi özelliklere sahip
olan bir yüzeydir, örnegin ABD Ser. No. l3/787,396, ABD Patent
tarif edildigi gibi. Desenli bir substrat kullanan
uygulamalar için, bir jel, model özelliklerine seçici olarak
eklenebilir (örnegin, metal tamponlara veya jele takilabilir,
kuyucuklarin içine jel eklenebilir) veya alternatif olarak jel,
model özellikleri ve interstisyel bölgeler boyunca esit olarak
eklenebilir.
Moleküler dizilerin hazirlanmasinda ve kullanilmasinda plastik
bazli substratlann kullanilmasindaki avantajlar arasinda maliyet
bulunur: Uygun plastik bazli substratlarin, örnegin enjeksiyonlu
kaliplama ile hazirlanmasi, genellikle silika bazli
substratlarin asindirma ve yapistirma ile hazirlanmasindan daha
ucuzdur. Diger bir avantaj, destegin optik özelliklerinin,
amaçlandigi veya uygulanabilecegi uygulamaya uyacak sekilde ince
ayarini saglayan neredeyse sinirsiz plastik çesididir.
Metallerin substrat olarak veya substrat üzerinde ped olarak
kullanildigi durumlarda, bu, istenen uygulamadan
kaynaklanabilir: metallerin iletkenligi, DNA tabanli
sensörlerdeki elektrik alaninin modülasyonuna izin verebilir. Bu
sekilde, DNA uyumsuzlugu ayrimciligi arttirilabilir, immobilize
edilmis oligonükleotid moleküllerinin oryantasyonu
etkilenebilir veya DNA hibridizasyon kinetikleri
hizlandirilabilir.
Tercihen, substrat silika esaslidir, fakat kullanilan substratin
sekli, mevcut uygulamanin uygulandigi uygulamaya göre
degistirilebilmektedir. Bununla birlikte, genellikle, silika,
ör. kaynasmis silika, moleküllerin hazirlanmasi ve müteakip
entegrasyonunda özellikle faydalidir. Mevcut basvurunun
uygulamasinda özellikle kullanim, SPECTRASIL m ticari ismi
altinda satilan eritilmis silika slaytlardir. Buna ragmen, uzman
kisi için, bu basvurunun, boncuklar, çubuklar ve benzerleri gibi
diger substrat sunumlarina (silika bazli destekler dahil) esit
olarak uygulanabilecegi açiktir.
Bazi uygulamalarda, substratin yüzeyi hem fonksiyonel moleküller
kapli bölgeleri hem de kaplama içermeyen inert bölgeleri içerir.
Bu gibi bazi düzeneklerde islevsellestirilmis molekül
kaplamalari hidrojel veya polimer kaplamalardir. Fonksiyonel
moleküller kapli bölgeler reaktif bölgeler içerebilir ve bu
nedenle molekülleri kimyasal baglama veya diger moleküler
etkilesimler yoluyla baglamak için kullanilabilir. Bazi
düzenlemelerde, fonksiyonel moleküller kapli bölgeler (örnegin
reaktif özellikler, pedler, boncuklar veya oyuklar) ve inert
bölgeler (ara bölgeler olarak refere edilir), bir model veya bir
izgara olusturacak sekilde degisebilir. Bu tür desenler bir veya
iki boyutta olabilir. Bazi uygulamalarda, inert bölgeler cam
bölgelerden, metal bölgelerden, maske bölgelerinden veya ara
bölgelerden seçilebilir. Alternatif olarak bu malzemeler reaktif
bölgeler olusturabilir. Inertlik. veya reaktivite, substratta
kullanilan kimya ve süreçlere bagli olacaktir. Bir uygulamada,
yüzey cam bölgeleri içerir. Baska bir uygulamada, yüzey metal
bölgeleri içerir. Yine baska bir uygulamada, yüzey maske
bölgelerini içerir. Burada açiklanan bilesimlerin bazi
uygulamalarinda, substrat bir parçacik olabilir. Mevcut
tarifnamenin bir polimeri ile kaplanabilen veya baska bir
sekilde burada belirtilen bir bilesim veya yöntemde
kullanilabilen sinirlayici olmayan örnek substrat malzemeleri
Bazi uygulamalarda, burada tarif edilen bir substrat, bir akis
hücresinin en azindan bir kismini olusturur veya bir akis
hücresinde bulunur. Bu gibi bazi uygulamalarda, akis hücreleri
ayrica, substratin yüzeyine, örnegin bir polimer kaplama gibi
fonksiyonel moleküller kaplamasiyla baglanan polinükleotidleri
içerir. Bazi uygulamalarda, polinükleotidler, polinükleotid
kümelerindeki akis hücrelerinde bulunur, burada polinükleotit
kümelerinin polinükleotidleri, polimer kaplama yoluyla akis
hücresinin bir yüzeyine baglanir. Bu gibi uygulamalarda,
polinükleotitlerin baglandigi akis hücresi gövdesinin yüzeyi,
substrat olarak kabul edilir. Baska uygulamalarda, polimer kapli
bir yüzeye sahip ayri bir substrat, akis hücresinin gövdesine
sokulur. Tercih edilen düzenlemelerde, akis hücresi çok sayida
serit veya çok sayida sektöre bölünen bir akis bölünebilir olup,
özelligi, burada tarif edildigi gibi, çok sayida serit veya çok
sayida sektör bir veya daha fazla sayida kovalent olarak eklenmis
polimer kaplama ile kaplanmis bir yüzey içermesidir. Burada
tarif edilen akis hücrelerinin bazi uygulamalarinda, bir tekli
polinükleotid kümesindeki baglanmis polinükleotidler ayni veya
benzer nükleotit dizilemesine sahiptir. Burada tarif edilen akis
hücrelerinin bazi uygulamalarinda, farkli polinükleotid
kümelerinin bagli polinükleotidleri farkli veya benzer olmayan
nükleotit sekanslarina sahiptir. Burada ortaya konan yöntem veya
kompozisyonda kullanilabilen akis hücrelerinin üretimi için
örnek akis hücreleri ve substratlari, bunlarla sinirli olmamak
kaydiyla, Illumina, Inc.'den ticari olarak temin edilebilir (San
tarif edilir.
silika Bazli Substrat
Bazi uygulamalarda, mevcut basvuruda kullanilan substratlar
silika bazli substratlardir. Genel olarak, silika bazli substrat
yüzeyi, islevsellestirilmis moleküller, örnegin hidrojel,
polimer veya kismen olusturulmus bir hidrojel (örnegin bir
prepolimer (PRP)) ile reaksiyona girebilen kimyasal olarak
reaktif bir grubu kovalent olarak baglayacak sekilde kimyasal
olarak modifiye edilir. . Yüzey aktive edici kimyasal tipik
olarak bir organosilan bilesigidir.
Monoethoksidimetilsililbutanal, 3-merkaptopropil-
trimetoksisilan ve 3-aminopropiltrimetoksisilan (hepsi
Aldrich'den temin edilebilir) gibi diger silikon bazli yüzey
aktive edici maddeler de bilinmekle beraber, Bir uygulamada,
yüzey aktive edici madde, "Bind Silane" veya "Crosslink Silane"
olarak bilinen ve Pharmacia'dan ticari olarak temin edilebilen
P-metakriloksipropiltrimetoksisilan dir. Bu sekilde, silikaya,
amino gruplari, aldehidro gruplari veya polimerlestirilebilen
gruplar (ör., Olefinler) gibi asma fonksiyonel gruplari
eklenebilir.
Mevcut basvuru, kovalent olarak eklenmis sikloalkenleri veya
heterosikloalkenleri içeren organosilan bilesiklerini kullanir.
Bazi uygulamalarda, sikloalken istege bagli olarak ikame edilmis
bir norbornendir. Bazi düzenlemelerde, organosilan
bilesiklerinin silan molekül parçalari asagidaki yapiya sahip
burada, RÃ, R2 ve Ryün her biri bagimsiz olarak hidrojen,
halojen, istege bagli olarak ikame edilmis alkil, istege göre
ikame edilmis alkoksi, istege bagli olarak ikame edilmis aril,
istege bagli olarak ikame edilmis ariloksi, istege bagli olarak
ikame edilmis heteroaril veya istege göre ikame edilmis
heteroariloksi arasindan seçilir. Bu gibi bazi uygulamalarda,
R1, R2 and R3 bagimsiz olarak istege göre ikame edilmis
alkoksidir. Bazi ileri uygulamalarda, R4, R2 and R3 `ün her biri
metoksidir. Bir düzenekte organosilan bilesigi, [(5-bisiklo
Baglayici
Burada açiklanan bazi uygulamalarda, silan veya silan türevi ve
sikloalken veya heterosikloalken arasindaki baglayici, istege
bagli olarak ikame edilmis bir alkilen, istege bagli olarak ikame
edilmis bir heteroalkilen, istege bagli olarak ikame edilmis bir
sikloalkilen, istege bagli olarak ikame edilmis bir
heterosiklien, istege bagli olarak ikame edilmis bir aril,
istege bagli olarak ikame edilmis bir heteroaril, istege bagli
olarak ikame edilmis bir polietilen glikol, bir parçalanabilir
baglayici veya bunlarin bir kombinasyonu arasindan seçilir.
Bazi uygulamalarda, burada tarif edilen baglayici istege bagli
olarak ikame edilmis bir alkilen baglayicidir. Bazi düzeneklerde
baglayici, -(CH2)n-' dir` ve burada. n, ]. ila 20,000 arasinda
seçilir. Bir uygulamalarda n, 2'yi ifade eder. Bazi diger
uygulamalarda, burada tarif edilen baglayici, istege bagli
olarak ikame edilmis bir heteroalkilen baglayicidir. Örnegin,
baglayici, -(CHûn- dir, burada n, 1 ila 20,000 arasinda seçilir
ve iskeletteki karbon atomlarinin bir veya daha fazlasi, 0, S,
N veya P'den seçilen bir veya daha fazla heteroatom ile
degistirilir.
Bazi uygulamalarda, burada açiklanan baglayici parçalanabilir
baglayicidir. Bazi uygulamalarda, baglayici, asit degisken
baglayicilar ((dialkoksibenzil baglayicilar, Sieber
baglayicilar, indol baglayicilar, t-bütil Sieber baglayicilar
dahil), elektrofilik olarak parçalanabilen baglayicilar,
nükleofilik olarak parçalanabilen baglayicilar, foto-
kirilabilir baglayicilar, indirgeyici kosullar altinda bölünme,
oksidatif kosullar, güvenlik-yakalayici baglayicilarin
kullanimi ile parçalanma ve eleme mekanizmalari arasindan
seçilir. Bu gibi bazi düzeneklerde LA, bir disülfit baglayici (-
S-S-), ester, nitrobenzen, imin, enzimatik veya kimyasal olarak
bölünebilen peptit ve DNA gibi polinükleotit arasindan seçilir.
Parçalanabilir baglayicilar teknikte bilinmektedir ve geleneksel
kimya bir nükleotid bazina ve bir etikete bir baglayici eklemek
için uygulanabilir. Baglayici, asitler, bazlar, nükleofiller,
elektrofiller, radikaller, metaller, indirgeyici veya
oksitleyici maddeler, isik, sicaklik, enzimler Vb. gibi herhangi
bir uygun yöntemle ayrilabilir. Burada tartisildigi gibi
baglayici, 3'-O-koruma grubu bagini ayirmak için kullanilanla
ayni katalizörle de ayrilabilir. Uygun baglayicilar Greene &
Wuts, Organik Sentezde Koruyucu Gruplar, John Wiley & Sons veya
Greg T. Hermanson'un "Bioconjugate Teknikleri", Academic
Press'te açiklandigi gibi standart kimyasal koruyucu gruplardan
uyarlanabilir. Kati faz sentezinde kullanilan diger uygun
bölünebilir baglayicilar Guillier ve dig. Tarafindan
baglayicinin, örnegin reaktif heterosiklinden çikarilmasi
gerektigi anlamina gelmez. Bir örnek olarak, parçalanma bölgesi,
baglayici üzerindeki bir parçanin, ayrilmadan sonra baglayicinin
bir kisminin heterosikle bagli kalmasini saglayan bir konuma
yerlestirilebilir.
A Elektrofilik olarak ayrik baglayicilar
Elektrofilik olarak ayrik baglayicilar tipik olarak protonlar
tarafindan parçalanir ve asitlere duyarli bölünmeler içerir.
Uygun baglayicilar arasinda tritil, p-alkoksibenzil esterler ve
p-alkoksibenzil amidler gibi modifiye edilmis benzilik sistemler
yer alir. Diger uygun baglayicilar arasinda tert-
butiloksikarbonil (Boc) gruplari ve asetal sistemi bulunur.
Tiyoasetal veya diger kükürt içeren koruyucu gruplarin
ayrilmasinda nikel, gümüs veya civa gibi tiofilik metallerin
kullanilmasi uygun baglayici moleküllerin hazirlanmasi için de
düsünülebilir.
3 Nükleofilik olarak ayrilan baglayicilar
Nükleofilik parçalanma ayrica baglayici moleküllerin
hazirlanmasinda iyi bilinen bir yöntemdir. Suda kararsiz olan
esterler (örnegin, bazik pH'ta basitçe bölünebilir) gibi gruplar
ve susuz nükleofillere karsi kararsiz olan gruplar
kullanilabilir. Florür iyonlari, triizopropil silan (TIPS) veya
t-bütildimetil silan (TBDMS) gibi gruplarda silikon-oksijen
baglarini parçalamak için kullanilabilir.
0 Isikla Parçalanabilir baglayicilar
yaygin olarak kullanilmaktadir. Bölünmeyi aktive etmek için
gerekli olan isigin, modifiye edilmis nükleotidlerin diger
bilesenlerini etkilememesi tercih edilir. Örnegin, bir florofor,
etiket olarak kullanildiginda, bu, baglayici molekülün ayrilmasi
için gerekli olana farkli bir dalga boyunun isigini emerse tercih
edilir. Uygun baglayicilar, O-nitrobenzil bilesikleri ve
nitroveratril bilesiklerine dayananlari içerir. Benzoin
kimyasina dayali baglayicilar da kullanilabilir. Bakiniz Sanders
D Indirgeyici kosullar altinda parçalanma
Indirgeyici parçalanmaya açik olan birçok baglayici vardir.
Paladyum bazli katalizörler kullanilarak katalitik
hidrojenasyon, benzil ve benziloksikarbonil gruplarini ayirmak
için kullanilmistir. Disülfid baginin indirgenmesi de teknikte
bilinmektedir.
E Oksidatif kosullar altinda parçalanma
Oksidasyona dayali yaklasimlar teknikte iyi bilinmektedir.
Bunlar p-alkoksibenzil gruplarinin oksidasyonunu ve sülfür ve
selenyum baglayicilarin oksidasyonunu içerir. Disülfürleri ve
diger kükürt veya selenyum bazli baglayicilari ayirmak için sulu
iyot kullanimi da bu basvurunun kapsamindadir.
R Emniyet Mandalli baglayicilar
Emniyet mandalli baglayicilar iki adimda parçalananlardir.
Tercih edilen bir sistemde, ilk asama, reaktif nükleofilik bir
merkezin üretilmesi ve ardindan, parçalanmaya neden olan bir
intra-moleküler siklizasyonun dahil oldugu ikinci bir adimdir.
Örnegin, levulinik ester baglari, aktif bir amin salinmasi için
hidrazin veya fotokimya ile muamele edilebilir, bu daha sonra
molekülün baska bir yerinde bir esterin bölünmesi için siklize
edilebilir. (Burgess ve arkadaslari, J. Org. Chem. 62: 5165-
5168, 1997).
G.Eleme mekanizmalari ile parçalanma
Eliminasyon reaksiyonlari da kullanilabilir. Örnegin, Fmoc ve
siyanoetil gibi gruplarin baz katalizli eliminasyonu ve alilik
sistemlerin palladyum katalizörlü indirgeyici eliminasyonu
kullanilabilir.
Bazi uygulamalarda, baglayici bir ara parça birimi içerebilir.
sayili ABD Yayininda tartisilmistir.
Dizileme Uygulamasi
Burada belirtilen yöntem çesitli amplifikasyon tekniklerinden
herhangi birini kullanabilir. Kullanilabilen Örnek teknikler
arasinda, bunlarla sinirli olmamak üzere, polimeraz zincir
reaksiyonu (PCR), yuvarlama çember* büyütme (RCA), çoklu yer
degistirme amplifikasyonu (MDA) veya rastgele ana amplifikasyon
(RPA) yer alir. Özel uygulamalarda, amplifikasyon amaciyla
kullanilan bir veya daha fazla primer bir polimer kaplamaya
baglanabilir. PCR uygulamalarinda, amplifikasyon amaciyla
kullanilan primerlerin biri veya her ikisi de bir polimer
kaplamaya baglanabilir. Iki tür eklenmis primer kullanan
formatlar genellikle köprü büyütme olarak adlandirilir, çünkü
çift seritli amplikonlar, kopyalanmis olan sablon sekansini
kusatan iki bagli primerler arasinda köprü benzeri bir yapi
olusturur. Köprü amplifikasyonu için kullanilabilecek örnek
reaktifler ve kosullar, örnegin, ABD Pat. 5,641,658; ABD Patent
tarif edilmistir. PCR amplifikasyonu ayrica bir polimer
kaplamaya eklenmis amplifikasyon primerlerinden ve solüsyondaki
ikinci primerden biri ile de gerçeklestirilebilir. Bir
birlestirilmis primer ve çözünebilir primerden olusan bir
kombinasyonu kullanan örnek bir format, Dressman ve digerleri,
edildigi gibi emülsiyon PCR'dir. Emülsiyon PCR formatin
tasvirini göstermektedir ve burada ortaya konan yöntemlerin
amaçlari için bir emülsiyonun kullaniminin istege bagli oldugu
ve bazi düzenlemeler için bir emülsiyonun kullanilmadigi
anlasilacaktir. Ayrica, primerler ePCR referanslarinda
belirtildigi gibi dogrudan alt tabakaya veya kati desteklere
baglanmaya ihtiyaç duymazlar ve bunun yerine burada belirtildigi
gibi bir polimer kaplamaya eklenebilirler.
RCA teknikleri, mevcut açiklamanin bir tekniginde kullanilmak
üzere modifiye edilebilir. RCA reaksiyonunda kullanilabilecek
örnek bilesenler ve RCA'nin amplikon ürettigi prensipler Lizardi
çözelti içinde olabilir veya bir polimer kaplamaya baglanabilir.
MDA teknikleri, mevcut açiklamanin bir teknigindekullanilmak
üzere modifiye edilebilir. MDA için bazi temel prensipler ve
kullanisli kosullar, örnegin, Dean ve digerleri, Proc Natl.
için Moleküler Yöntemler, Academic Press, Inc., 1995; Walker ve
için kullanilan primerler çözelti içinde olabilir veya bir
polimer kaplamaya baglanabilir.
Özel uygulamalarda, yukarida örnek verilen amplifikasyon
tekniklerinin bir kombinasyonu kullanilabilir. Örnegin RCA ve
MDA, RCA'nin solüsyonda bir konkatamerik amplikon (örnegin, faz-
faz primerleri kullanarak) üretmek için kullanildigi bir
kombinasyonda kullanilabilir. Amplikon daha sonra bir polimer
kaplamaya baglanan primerler kullanilarak MDA için bir sablon
olarak kullanilabilir. Bu örnekte, birlestirilmis RCA ve MDA
asamalarindan sonra üretilen amplikonlar polimer kaplamasina
eklenecektir.
Bazi uygulamalarda, burada tarif edilen islevsellestirilmis
hidrojel veya polimer kapli substrat, bir polinükleotidin bir
nükleotit sekansinin saptanmasi için kullanilabilir. Bu tür
uygulamalarda, yöntem, (a) bir polinükleotid polimerazin, burada
tarif edilen polimer veya hidrojel kaplamalardan herhangi biri
ile bir substratin bir yüzeyine tutturulmus polinükleotid
kümeleriyle temas ettirilmesini; (b) bir veya daha fazla
nükleotid. polinükleotid polimeraz tarafindan kullanildiginda
saptanabilir bir sinyalin üretilecegi sekilde substratin polimer
kapli yüzeyine nükleotidler saglanmasini; (c) bir veya daha
fazla polinükleotit kümesinde sinyallerin saptanmasini; ve (d)
bir veya daha fazla polinükleotit kümesinde mevcut olan bir
polinükleotidin bir nükleotid dizisini belirleyerek (b) ve (c)
asamalarini tekrarlamayi kapsayabilir.
Nükleik asit dizilemesi, teknikte bilinen çesitli islemlerle bir
polinükleotidin bir nükleotit dizisini belirlemek için
kullanilabilir. Tercih edilen bir yöntemde, dizilim-sentez
(SBS), burada tarif edilen polimer kaplamalarin herhangi biri
araciligiyla bir substratin bir yüzeyine baglanmis bir
polinükleotitin bir nükleotid dizisini belirlemek için
kullanilir. Böyle bir islemde, bir polinükleotid polimeraz ile
iliskili bir sablon polinükleotitine bir veya daha fazla
nükleotid saglanir. Polinükleotid polimeraz, bir veya daha fazla
nükleotidi, polinükleotid sablonuna tamamlayici olan yeni
sentezlenmis bir` nükleik asit zincirine dahil eder. Sentez,
sablon polinükleotitin bir kismina veya sablon polinükleotitin
bir ucuna kovalent olarak baglanan bir evrensel veya degisken
olmayan nükleik asidin bir bölümüne tamamlayici olan bir
oligonükleotid primerinden baslatilir. Nükleotidler, sablon
polinükleotide karsi eklendikçe, siralama isleminin her bir
asamasinda hangi nükleotidin dahil edildiginin belirlenmesine
izin veren saptanabilir bir sinyal üretilir. Bu sekilde, sablon
polinükleotidin en azindan bir bölümüne tamamlayici olan bir
nükleik asit dizisi üretilebilir, böylece sablon
polinükleotitinin en azindan bir kisminin nükleotid dizisinin
saptanmasina izin verilir. Akis hücreleri, mevcut açiklamanin
yöntemleriyle üretilen bir diziyi barindirmak için uygun bir
format saglar ve bu, bir dizi sentezleme sentezine (SBS) veya
reaktiflerin döngü içinde tekrar tekrar verilmesini içeren baska
bir saptama teknigine tabi tutulur. Örnegin, bir birinci SBS
döngüsünü baslatmak için, bir veya daha fazla etiketli
nükleotid, DNA polimerazi, vb., Burada ortaya konan yöntemlerle
yapilan bir nükleik asit dizisine ev sahipligi yapan bir akis
hücresine akabilir. Primer ekstansiyonun bir etiketlenmis
nükleotidin eklenmesine neden oldugu bir dizinin yerleri tespit
edilebilir. Istege bagli olarak, nükleotidler ayrica bir primere
bir nükleotid eklendikten sonra primer ekstansiyonu sona erdiren
bir tersine çevrilebilir sonlandirma özelligini içerebilir.
Örnegin, tersine çevrilebilir bir terminatör parçasina sahip
olan bir nükleotid analogu, bir prime eklenebilmekte, böylelikle
bir uzantiyi çikarmak için bir deblokaj maddesi verilinceye
kadar müteakip uzanti olusamaz. Bu nedenle, tersine çevrilebilir
fesih kullanan düzenlemeler için, bir deblokaj reaktifi akis
hücresine iletilebilir (tespit edilmeden önce veya sonra).
Yikamalar çesitli dagitim adimlari arasinda
gerçeklestirilebilir. Döngü daha sonra n-nükleotidlerle primerin
uzatilmasi için n kez tekrarlanabilir, böylece n uzunlugunda bir
dizi tespit edilir. Mevcut açiklamanin yöntemleri ile üretilen
bir dizi ile kullanim için kolayca uyarlanabilen örnek SBS
prosedürleri, akiskan sistemleri ve tespit platformlari,
Pirosekanslama gibi siklik reaksiyonlari kullanan diger dizileme
prosedürleri kullanilabilir. Pirosekanslama inorganik
pirofosfatin (PPi) salinimini algilar, çünkü Özel nükleotidler
bir nükleik asit dizisine dahil edilir (Ronaghi ve digerleri,
Pirodizilemede, serbest PPi, ATP sülfurylaz ile adenosin
trifosfata (ATP) hemen dönüstürülerek saptanabilir ve üretilen
ATP seviyesi, lusiferaz tarafindan üretilen fotonlar ile tespit
edilebilir. Böylece, siralama reaksiyonu bir lüminesans algilama
sistemi ile izlenebilir. Floresan bazli tespit sistemleri için
kullanilan uyarim radyasyon kaynaklari pirositma prosedürleri
için gerekli degildir. Mevcut açiklamanin dizilerine
pirosekanlamanin uygulanmasi için kullanilabilecek yararli
akiskan sistemler, detektörler ve prosedürler, örnegin WO
Ligasyon yoluyla dizileme reaksiyonlari ayica, Shendure ve dig.
tarif edildigi gibi kullanislidir. Bunlarin her biri bütün
olarak referans ile bu bulusa dahil edilmistir. Bazi
uygulamalar melezleme yoluyla dizileme prosedürlerini, örnegin
edildigi gibi içermektedir. Baglama yoluyla dizileme ve
hibridizasyon yoluyla dizileme prosedürlerinde, bir dizinin
bölgelerinde bulunan nükleik asitler tekrarlanan oligonükleotit
verme ve saptama döngülerine tabi tutulur. Burada veya burada
belirtilen referanslarda belirtildigi gibi SBS yöntemleri için
akiskan sistemleri, ligasyon. yoluyla› dizileme 'veya Jnelezleme
yoluyla dizileme prosedürleri için reaktiflerin verilmesi için
kolaylikla adapte edilebilir. Tipik olarak, oligonükleotidler,
floresan olarak etiketlenir ve burada veya burada belirtilen
referanslarda SBS prosedürleri ile ilgili olarak tarif
edilenlere benzer floresan detektörleri kullanilarak
bulgulanabilir.
Bazi uygulamalar, DNA polimeraz aktivitesinin gerçek zamanli
izlenmesini içeren yöntemleri faydali kilabilir. Örnegin,
nükleotid olusumlari, bir florofor içeren polimeraz ve y-fosfat
etiketli nükleotidler veya zeromode dalga kilavuzlari (ZMW'ler)
arasindaki floresan rezonans enerji transferi (FRET)
etkilesimleri vasitasiyla tespit edilebilir. FRET tabanli
dizileme için teknikler` ve reaktifler, örnegin, Levene dig.
1181 (2008) tarafindan tarif edildigi gibidir.
Bazi SBS uygulamalari bir nükleotidin bir uzatma ürününe
katilmasi üzerine salinan bir protonun saptanmasini içerir.
Örnegin, serbest birakilan protonlarin tespitine dayali
dizileme, Ion Torrent'den ticari olarak temin edilebilen
(Guilford, CT, bir Life Technologies yan kurulusu) veya ABD
bir elektrik detektörü ve ilgili teknikleri kullanabilir.
Mevcut açiklamanin bir dizisi için, örnegin, burada ortaya konan
bir yöntemle üretilmis olan bir baska yararli uygulama, gen
anlatim analizidir. Gen anlatimi, dijital RNA dizilemesi olarak
adlandirilanlar gibi RNA dizileme teknikleri kullanilarak
saptanabilir veya sayisal olarak belirlenebilir. RNA dizileme
teknikleri, yukarida belirtilenler gibi teknolojide bilinen
dizileme metodolojileri kullanilarak gerçeklestirilebilir. Gen
anlatimi, bir diziye dogrudan hibridizasyon ile gerçeklestirilen
hibridizasyon teknikleri kullanilarak 'veya bir dizi üzerinde
tespit edilen bir multipleks deney kullanilarak, saptanabilir
veya sayisallastirilabilir. Mevcut tarifnamenin bir dizisi,
örnegin burada ortaya konulan bir yöntemle üretilmistir ve bir
veya daha fazla kisiden bir genomik DNA numunesi için
genotiplerin belirlenmesi için de kullanilabilir. Bu açiklamanin
bir dizisi üzerinde gerçeklestirilebilen dizi bazli ifade ve
genotipleme analizi için örnek yöntemler, ABD Patent
kullanildigi yukarida tarif edilen yöntemin bazi
düzenlemelerinde, tek bir akis asamasi sirasinda akis hücresinde
sadece tek bir tipte nükleotit bulunur. Bu gibi uygulamalarda
nükleotid, dATP, dCTP, dGTP, dTTP ve bunlarin analoglarindan
olusan gruptan seçilebilir. Bir' akis hücresinin kullanildigi
yukarida tarif edilen yöntemin diger uygulamalarinda, tek bir
akis asamasi sirasinda akis hücresinde birçok farkli tipte
nükleotit bulunur. Bu gibi yöntemlerde, nükleotidler dATP, dCTP,
dGTP, dTTP ve bunlarin analoglari arasindan seçilebilir.
Akis hücresinde mevcut olan substratin yüzeyi üzerindeki polimer
kaplamasina baglanmis bir veya daha fazla polinükleotid için her
bir akis basamaginda dahil edilen nükleotit veya nükleotitlerin
belirlenmesi, polinükleotid sablonunda veya bunun yakininda
üretilen bir sinyalin saptanmasiyla elde edilir.
Yukarida tarif edilen metotlarin bazi uygulamalarinda,
saptanabilir sinyal, optik sinyal içerir. Diger uygulamalarda,
saptanabilir sinyal optik olmayan bir sinyali içerir. Bu gibi
uygulamalarda, optik olmayan sinyal, polinükleotid sablonlarinin
birinde veya daha fazlasinda veya yakininda pH'ta bir degisiklik
ÖRNEKLER
Ek uygulamalar, herhangi bir sekilde istemlerin kapsamini
sinirlama amaci tasimayan asagidaki örneklerde daha ayrintili
olarak açiklanmaktadir.
PAZAM'in Norbornene la Silanize Cam Yüzeyinde
Hareketsizlestirilmesi
MeO Si ..4 `Via / M _ F' / PALM!' _________ kova lent
OMG 015:*xo/îîxoxsxo/î'xo _ olarak bagli
1a J 5 g g 1 1 halkalaSma
Yüzey Silanizasyonu
Yöntem 1 (cam vakum desikatör kullanilarak silanizasyon): 200
mL-SOO mL sivi norbornen silan, bir cam sise içine yerlestirildi
ve bir cam vakum desikatörünün içine yerlestirildi. Cam
substratlar da desikatörün içine yerlestirildi. Desikatör daha
sonra 15-30 mTorr basinçta bosaltilmis ve 60-125 C arasinda
bir sicaklikta bir firinin içine yerlestirilmistir. Silanizasyon
1 saat devam ettirildi, sonra desikatör firindan çikarildi,
sogutuldu ve havada havalandirildi. Bu asamadan sonra
substratlar kullanildi veya ek bir kürleme asamasina (lOO ° C'de
1 saat) ve / veya bir etanol durulama gibi bir çözücü yikama
asamasina tabi tutuldular.
Yöntem 2 (YES CVD firini kullanilarak silanizasyon): Ilk olarak,
substratlar CVD firin bölmesine yerlestirildi ve hazne 300 mTorr
basinca kadar bosaltildi. Numuneler baslangiçta 10 dakika
boyunca bir oksijen plazma ile muamele edildi. Plazma
aktivasyonundan sonra, hazne tahliye edildi ve 500 mTorr bir baz
basinçta 0.5 mL su enjekte edilerek 10 dakikalik bir rehidrasyon
döngüsü gerçeklestirildi. Ilave bir temizleme döngüsünden sonra,
silanizasyon programi yürütüldü. 15 dakikalik bir gecikme
süresinden sonra, silan valfi, 0.15 saniye süreyle açilacak ve
saniye boyunca kapanacak sekilde ayarlandi. Silanizasyon 500
mTorr'lik bir baz basinçta ve 60 dakika boyunca 125 ° C'lik bir
oda sicakliginda gerçeklestirildi ve ardindan 125 ° C'de 2 azot
temizleme döngüsü yapildi. Bölme daha sonra 3 dakika boyunca
havalandirildi. YES firinin silanizasyon döngüsü yüksek oranda
otomatiklestirildi ve kontrol edildi. Silanizasyon asamasi
sirasinda, norbornen silan tanki 120 C'de tutuldu ve silan
buhar hatlari sabit bir 125 ° C'de tutuldu. Vakum hatlari 145 °
C'de tutuldu. Çevrim tamamlandiktan sonra, substratlar
çikarildi, kisa bir süre boyunca firinin disinda sogutuldu ve
daha sonra ilave çalisma olmaksizin kullanildi. Bu substratlar,
silanizasyondan en az bir ay sonra uygulanabilirdi.
PAZAM Biriktirme ve Yüzey Çaprazlama
Norbornen silanize cam substratin üzerine 500 mL sulu PAZAM
(%0.25 +%5 etanol) konuldu ve yüzeye yayildi. PAZAM' a ait ince
film asagidaki prosedür izlenerek döndürmeli kaplama yoluyla
elde edilebilir: Adim 1- 600 rpm, 5 sn, hizlanma 1500 rpm / sn;
5000 rpm / sn. Diger döndürmeli kaplama tarifleri de
kullanilabilir. Döndürerek kaplamadan sonra, substratlar 1 saat
boyunca firin veya sicak plakada 65-75 ° C'de isitildi.
Yikayip temizlemek: Isitma asamasindan sonra, substratlar, 45
C'de bir sonikasyon adimi (10 dakika) ilave edilerek baglanmamis
PAZAM'i uzaklastirmak için su içinde yikanabilir, ardindan genis
su ile durulanir ve bir nitrojen tabancasiyla kurutulur.
Primer asilama: Hazirlanan substrat, KPI (10 mM) içindeki alkin
oligonükleotitlerini PMDETA, bakir sülfat ve NaAsc (500 mg / mL
sulu çözelti) ile 60 ° C'de 30 dakika boyunca reaksiyona sokarak
primer asilama asamasinda kullanilmistir.
QC Primer asilama asamasi tamamlandiktan sonra, asili primerler
TET kalite kontrolüne tabi tutuldu. TET, P5 / P7 primerine karsi
serbest diziye sahip bir etiketli oligonükleotittir. TET, bir
yüzey üzerinde P5 ,/ P7 primerine hibritlenebilir; Asiri TET,
yikanabilir ve eklenmis boya konsantrasyonu, bir Tayfun Scanner
(General Electric) gibi bir tarama aleti kullanilarak floresan
tespiti ile ölçülebilir. Boya konsantrasyonunun yogunlugu,
hidrojel immobilizasyonundan sonra kalan yüzeyin yüzdesinin bir
göstergesi olarak ölçüldü. PAZAM biriktirme ve yüzey çapraz
baglama prosedürleri, 13/784,368 sayili ABD Basvurusunda da
açiklanmistir.
SEKIL 1A, norbornen-silan türevi [(5-bisik [2.2.1] hept-Z-enil)
etil] trimetoksisilan (la) ile silanize edilmis ve daha sonra
PAZAM ile kaplanmis ve termal olarak çapraz baglanmis bir D263
Schott cam alt-tabakasini göstermektedir. Karanlik alan, PS / P7
primerlerinin asilanmasi ve TET-boya türevlendirilmis
tamamlayici iplikler ile melezlenerek gözlemlenen fiili floresan
yogunlugudur. SEKIL 1B, ayni TET boya içeren oligonükleotid
sekansi ile hibridize edilmis ayni asilanmis norbornen (la)
silanize / PAZAM kapli tek yanli yüzeyin her seridi için ilgili
ortalama floresan yogunluk grafigini gösterir.
Nanowell Substrat üzerinde PAZAM ile Desenli Yüzey Hazirlanmasi
Nanowell substratlarinin PAZAM polimeri ve kimyasal mekanik
cilalama (CMP) ile entegre edilmesiyle, desenli, sekanslanabilir
kümeler olusturuldu. Nanowell substrati (400 nm çapli 750 nm
zift, 300 nm derinlik kuyu) Illumina tarafindan gelistirilen ve
nanoimprint litografi kullanilarak Tayvan Semiconductor
Manufacturing Company Ltd'ye (TSMC) dis kaynakli tescilli bir
nanofabrikasyon ile imal edilmistir. Örnek 1 'in norbornen
silani, substratin tüm yüzeyi üzerinde CVD ile çökeltildi ve
PAZAM, 60-70 ° C'de spinle kaplandi ve isitildi ve bu, polimerin
substrat yüzeyine kovalent bir baglanti olusturmasini sagladi.
Interstisyel kovalent olarak baglanmis polimer, CMP islemiyle
yüzeyin agirlikça%lO agirlik oraninda 3 mm SiO2 mikro partikül
bulamaciyla parlatilmasiyla uzaklastirilmistir. Desenli polimer
substrat daha sonra standart Illumina protokolünü takiben
primerler ile asilandi. Alt tabaka üzerindeki desenli primerler
bir Tayfun görüntüleyici ile görüntülendi. Substrat daha sonra,
Twus DX kitinden (izotermal amplifikasyon) türetilen ve
dizilenmis olan Illumina'nin tescilli amplifikasyon protokolüyle
kümelenen phiX DNA ile tohumlandi. Dizilim, standart SBS
dizileme reaktif kitini kullanarak bir Illumina HiSeq 2000
üzerinde gerçeklestirildi ve metrikler, Illumina dizileme analiz
görüntüleyicisi kullanilarak ekstrakte edildi. Dizileme analizi
verileri, norbornen silanize edilmis substrat akisinin dizilim
ölçümlerinin akrilamidlerle fonksiyonellestirilmis
substratlarinkilere esdeger oldugunu gösterdi.
SEKIL 2A, norbornen-silah türevi (la) ile silanize edilmis ve
daha sonra PAZAM ile kaplanmis ve termal olarak çapraz baglanmis
nanowells desenli bir D263 Schott cam substrati gösterir.
Karanlik alan, fazla PAZAM'in kimyasal mekanik parlatilmasindan
sonra ve P5 / P7 primerlerinin asilanmasi ve bir TET-boya
türevlendirilmis tamamlayici seritlerle melezlestirilmesinden
sonra gözlemlenen fiili floresan yogunlugudur. SEKIL 2B, bir
serbest TET boya içeren oligonükleotid sekansi ile hibridize
edilmis ayni asilanmis norbornen (la) silanize / PAZAM kapli
tek-tabakali yüzeyin her seridi için ilgili ortalama floresan
yogunluk grafigini gösterir.
Norbornen silanize edilmis substrat ek çapraz baglama maddesi
ihtiyacini ortadan kaldirmakla kalmamis, norbornen silanize
edilmis substratlar PAZAM için tercihli bir afinite sergilemis
ve sulu PAZAM çözeltisinin yayilmasini kolaylastirmistir. Sonuç
olarak, PAZAM kaplamalari, substrat kalitesindeki degisikliklere
daha homojen ve daha az duyarlidir. SEKIL 3A, standart
akrilamidlerin islevsellestirilmis yüzey kullanilarak
döndürmeli kaplamanin tipik basarisiz bir sonucu olarak olusan
akis hücresinin tayfun görüntüsünü göstermektedir. SEKIL 3B,
norbornen silan türevi (la) silanlastirilmis akis hücresinin,
daha homojen bir kaplamayla sonuçlanan tayfun görüntüsünü
gösterir. SEKIL 3C, %0.25'lik sulu bir PAZAM çözeltisinin, kati-
sivi ara yüzünün yüzey enerjileri arasinda büyük bir enerji
uyumsuzlugunun varliginda bile, su lekeleri ile
karsilastirildiginda norbornen silan türevi (la) silanize
edilmis bir yüzey islattigini göstermektedir.
Yüzey Kararlilik Testi
Norbornen› silanize / PAZAM kapli substratlar ayrica iyi raf
ömrüne sahiptir. Çesitli desenli ve desensiz substratlar, YES
metodu kullanilarak Örnek 1 norbornen silan ile silanize edildi,
daha sonra PAMAM kaplamasina tabi tutuldu ve Örnek 1 ve 2'de
tarif edilen metot kullanilarak çapraz baglamaya tabi tutuldu.
Desenli substratlar, bir desikatör içinde, oda sicakliginda
karanlikta bir slayt tasiyicisinda saklandi. 30 gün sonra, bu
substratlar sekanslandi ve kabul edilebilir TET QC sonuçlari ve
siralama metrikleri saglandi (Sekil 4).
BCN ile modifiye edilmis oligos ile primer asilama
MN.`?ÖO MNIO ' î( `Z ; Cl) : KO"
PAZAM Primer = PS veya P?
PAZAM mN' I? `2,45
PAZAM / 1 ;FH
BCN ile modifiye edilmis oligolarin PAZAM kapli bir yüzeye
asilanmasi için yöntemin bir uygulamasi asagidaki gibidir:
Standart PS ve P7 (tiofosfat ve alkin) oligolari ile ayni
dizileri ihtiva eden modifiye edilmis BCN PS ve P7 oligolari,
herhangi bir katalizör olmaksizin PAZAM (%0.25 a / h) ile
kaplanmis bir akis hücresi yüzeyi ile reaksiyona girmek için
kullanilmistir (Sema 2).
PAZAM kaplanmis yüzey, doymamis akrilamid gruplarini olusturmak
için pH = , ilk olarak yüzeyin 3-
aminopropiltrimetoksisilan (APTMS) ile islenmesi, akrilloil
klorür (80mL neat akriloil klorür ve l880mL susuz MeCN'de 40mL
DIPEA) veya aktive edilmis akriloil NHS ester (KPi'de 20mg / mL)
ile muamele edilerek hazirlandi. Doymamis akrilamid gruplarini
olusturmak için pH = . Daha sonra, doymamis yüzeye
PAZAM sokuldu ve substrat 50-75 dakika (statik) için 60 ° C'de
inkübe edildi. Genel yöntem l3/784,368 sayiili ABD Basvurusunda
tarif edilmistir. Akis hücresinin her seridi için detayli deney
kosullari, asagidaki Tablo 1'de gösterilmistir.
Detaylar Toplam [alkin] / uM
PAZAM, Bakirsiz Asilama, PS ve P7 BCN Primerleri
PAZAM, Bakirsiz Asilama, PS ve P7 BCN Primerleri
PAZAM, Bakirsiz Asilama, PS ve P7 BCN Primerleri
Yukarida tarif edilen BCN nwdifiye edilmis oligolarin
katalizörsüz asisi kullanilarak akis hücresinin asilanmis
yüzeyinin bir ilk Tayfun görüntüsü, SEKIL 5A'da tasvir
edilmistir. Akis hücresi yüzeyi, asilanmis kaplamanin
saglamligini belirlemek için bir termal Stres testine tabi
tutuldu ve Sekil 5B'de gösterilen sonuç, sinyal azalmasinin
(yüzey kaybi ile yaklasik korelasyon) minimum oldugunu ve
standart seritlerle tutarli oldugunu gösterdi.
Optimal primer yogunluklari elde etme amaciyla deney kosullarini
arastirmak için farkli BCN modifiye oligo konsantrasyonlari da
test edilmistir (Tablo 2). PAZAM kapli akis hücre yüzeyi, Örnek
l'de tarif edilen benzer prosedür kullanilarak bir norbornen
modifiye silandan hazirlandi. Daha sonra farkli BCN modifiye
primer konsantrasyonlari polimer tabakasina asilandi. Bakirsiz
asilama yöntemi ve farkli BCN primer konsantrasyonlari
kullanilarak bir akis hücresinin asilanmis yüzeyinin ilk Tayfun
görüntüsü, SEKIL 6A'da gösterilmistir. Akis hücresi yüzeyi ayni
zamanda bir termal Stres testine tabi tutulmustur ve Sekil 6B
yüzey isil gerilmesinden önce ve sonra gerçeklestirilen TET QC
analizlerinin sonuçlarini göstermektedir.
Kanallar Detaylar Toplam
3 %0.25 PAZAM, P5 ve P7 BCN 4
4 primerleri kullanilarak bakirsiz 4
2 asilama :g
Her iki asilanmis akis hücresi yüzeyinde gerçeklestirilen köprü
amplifikasyonu sorunsuz ilerledi. Kümeler bir floresan mikroskop
kullanilarak incelendi ve kontrol seritlerinde yetistirilenlerle
karsilastirilabilir göründüler. SEKIL 7A, bir BCN primer asili
yüzeyden büyütülen kümelerin bir flüoresan görüntüsünü gösterir.
Sablon tohumlama konsantrasyonu 0.5 pM olmustur. Benzer sekilde,
SEKIL 7B, sablon konsantrasyonunun 3 pM oldugu bir BCN primer
asilanmis yüzeyinden büyütülen kümelerin flüoresans
görüntülerini gösterir.
BCN modifiye edilmis oligos-asilanmis akis hücresi yüzeyleri
daha sonra bir HiSeq cihazi kullanilarak birkaç dizi siralama
yoluyla alinmistir. Üst düzey ölçümler kontrol seritleriyle
karsilastirilabilirdi. SBS verilerinin karsilastirilmasi,
yüksek seviyeli siralama ölçümlerinin, standart alkin oligos
kullanilarak asilanmis PAZAM yüzeylerinden elde edilen
sonuçlarla çok benzer oldugunu göstermektedir.
BCN-oligos ile primer asilama
Burada tarif edilen substrat yüzey hazirlama islemlerinin bazi
uygulamalarinda, ham substratlar ilk olarak bir silan türevi,
ör. Norbornen türevli silan. ile kaplanir, daha sonra PAZAM,
yüzeye sikica kaplanir. Substrat daha sonra parlatilir ve
birlestirilir, daha sonra primer asilama ve QC'ye maruz
birakilir. PAZAM'in çözelti içindeki standart PS ve P7 oligolari
ile fonksiyonellestirilmesiyle önceden asilanmis PAZAM
kullanilarak substratin hazirlanmasina yönelik alternatif
yaklasim da yüzeylerin elde edilmesi için Özel akiskan
enstrümantasyonunun kullanilmasi ihtiyacini ortadan kaldirdigi
için, bitmis bir substratin is akisi kisaltilabilir.
Karisik PS / P7 BCN modifiye primerlerin (toplam konsantrasyon
= 15 mM) bir solüsyonu sulu bir PAZAM çözeltisine (agirlik /
hacim olarak%0,5) ilave edildi ve elde edilen karisim 2 saat 70
° C'de isitildi. Oda sicakligina sogutulduktan sonra, karisim
standart bir HiSeq akis hücresinin kaplanmasi için kullanilmis,
bir norbornen türevli silan tabakasi ile önceden kimyasal isleme
tabi tutulmustur (Sema 3).
m; v.. w. QC, dehyb,
i köprü
amplifikasyonu
CVD yoluyla
biriktime Sema 3
Önceden asilanmis yüzey standart termal stres testine tabi
tutulmus ve sinyal kayiplari (yüzey kayiplarina karsilik gelen)
kontrol ile karsilastirilabilir olmustur. Bir 2x26 HiSeq SBS
dizileme deneyi, lllumina standart protokolünde tarif edilen
standart reaktifler kullanilarak. gerçeklestirildi. SEKIL 8A,
Önceden hazirlanmis bir PAZAM yüzeyinden elde edilen kümelerin
türünü gösterir. Tohumlama sablonu konsantrasyonu azaltildi (. SEKIL 8B'de, ayni akis hücresindeki bir kanalin alt yüzeyi,
tohumlama konsantrasyonu 3 pM'ye yükseltimis olarak gösterilir.
Küme yogunlugundaki degisim beklenen limitlerdedir ve bu nedenle
bu yeni yüzeyin kontrol yüzeylerine çok benzer sekilde
davrandigini göstermektedir. Görüntülerin incelenmesi (SEKILLER
8A ve 8B), kümelerin, Tam Genislik Yarim Max (FWHM) dikkate
alinarak tahmin edilen "küme" görünür küme oldugu tek varyasyon
ile tipik oldugunu göstermistir, ki görünen kümelenme boyutu
için bir proxy olarak dahili olarak kullanilir. Bu, bu kümelerin
azaltilmis yogunlugu ile tutarlidir. Asilanmis, kontrol ve BCN
modifiye primer asili kanallar için SBS ölçümleri arasinda bir
karsilastirma, SBS döngülerinin yüzey üzerinde olusturulan
kümelerden ilerledigini teyit eder.
Benzer, daha uzun bir SBS çalismasi bir MiSeq cihazi kullanilarak
gerçeklestirilmistir. Bu durumda, standart bir PAZAM çözeltisi,
70 ° C'de 3 saat BCN-degistirilmis primerler ile inkübe edildi.
Elde edilen asilanmis polimer karisimi daha sonra standart
protokolleri izleyen bir norbornen islevsellestirilmis MiSeq
akis hücrelerine uygulandi. Yerlesik küme üretimini, standart
bir dört kanalli sistem kullanilarak gerçeklestirilen bir 23151
döngü SBS çalismasi izledi. Sekil 9, standart bir MidSeq
sisteminden ( elde edilen önceden konjuge PAZAM
karisimi ile kaplanmis bir kanal yüzeyinden büyütülen kümelerin
bir küçük resmini göstermektedir. Görüntünün sag kismi
görüntünün sol kisminin büyütülmesidir.
Bu çalismadaki tüm döngülerin SBS görüntüleri, standart (SFA ve
PAZAM) SBS deneylerinden elde edilenlerle karsilastirilabilir.
Sinyal-gürültü ölçümleri ayni zamanda standart yüzeylere kiyasla
çok. benzerdir, bu da boya Inoleküllerinin bariz tutulmasinin
siralama sirasinda gerçeklesmedigini göstermektedir (yani
polimer kaplama ek degisikliklere ugramamaktadir).
Claims (1)
- ISTEMLER .Islevsellestirilmis molekülün, sikloalkenlerden, heteronorbornenlerden veya bunlarin istege bagli olarak ikame edilmis varyantlardan veya adi geçen silan veya silan türevine kovalent olarak bagli bunlarin kombinasyonlarindan seçilen doymamis molekül parçalarinin birinci çogüllugü ile reaksiyona sokulmasi yoluyla islevsellesmis moleküle kovalent olarak bagli silan veya bir silan türevi içeren bir birinci yüzeyi içeren bir substrat. .Istem l'in substrati olup, özelligi; bahsedilen doymamis molekül parçlarinin birinci çogullugunun, norbornen, heteronorbornenler, norbornen türevleri, trans-siklookten, trans-siklookten türevleri veya bunlarin istege bagli olarak ikame edilmis varyantlari veya bunlarin kombinasyonlari arasindan seçilmesidir. .Istem 1 veya 2'nin substrati olup, özelligi; bahsedilen doymamis molekül parçlarinin birinci çogullugu istege bagli olarak ikame edilmis norbornendir. .Istem 1 ila 3'ten herhangi birine göre bir substrat olup, özelligi; silan veya silan türevi nin asagidaki formülü içermesi olup burada; R1, R2 ve R3'ün her birinin bagimsiz olarak hidrojen, halojen, istege bagli olarak ikame edilmis alkil, istege göre ikame edilmis alkoksi, istege bagli olarak ikame edilmis aril, istege bagli olarak ikame edilmis ariloksi, istege bagli olarak ikame edilmis heteroaril veya istege bagli olarak ikame edilmis heteroariloksi arasindan seçilmesidir. .Istem 1 ila 4'ten herhangi birine göre bir substrat olup, özelligi; ayrica bahsedilen silan veya silan türevinin silikon atomlari ve doymamis molekül parçalarinin birinci çogullugunun arasinda kovalent olarak baglanan baglayicilar içermesidir. .Istem 1 ila 5'ten herhangi birine göre bir substrat olup, özelligi; silan veya silan türevinin istege bagli olarak ikame edilmis norbornene kovalent olarak eklenmis asagidaki formülü içermesidir. .Istem 1 ila 6'dan herhangi birine göre bir substrat olup, özelligi; islevsellestirilmis molekül, azido, istege göre ikame edilmis amino, istege göre ikame edilmis alkenil, istege göre ikame edilmis hidrazon, istege bagli olarak ikame edilmis hidrazin, karboksil, hidroksi, istege göre ikame edilmis tetrazol, istege bagli olarak ikame edilmis tetrazin, nitril oksit, nitron veya tiol veya bunlarin kombinasyonlari arasidan seçilen bir veya daha fazla fonksiyonel grup içeren bir hidrojel veya polimerdir. .Istem 7'nin göre substrati olup, özelligi; islevsellestirilmis molekül tekrarlayan bir Formül (I) ünitesini ve tekrarlayan bir Formül (II) birimini içerir: Rl ifadesi H veya alkildir; RA, azido, istege bagli olarak ikame edilmis amino, istege bagli olarak ikame edilmis alkenil, istege bagli olarak ikame edilmis hidrazon, istege bagli olarak ikame edilmis hidrazin, karboksil, hidroksi, istege bagli olarak ikame edilmis tetrazol, istege bagli olarak ikame edilmis tetrazin, nitril oksit, nitro ve tiyolden olusan gruptan seçilir; X, istege göre ikame edilmis bir alkilen baglayici veya istege bagli olarak ikame edilmis bir heteroalkilen baglayicidir; RA, R”, R5 and R9 in her biri bagimsiz olarak H, R6, OR6, - C(O)OR5, -C(O)R6,-OC(O)R6, -C(O) NR7R8, veya -NR.7R8 `den seçilir. Rß bagimsiz olarak H, OH, alkil, sikloalkil, hidroksialkil, aril, heteroaril, heterosiklil veya bunlarin istege bagli olarak ikame edilmis varyantlarindan seçilir; ve R7 ve RB'in her biri bagimsiz olarak H veya alkilden seçilir veya R7 ve R3 bir heterosikl olusturmak üzere baglandiklari atom veya atomlarla birlikte birlestirilir. 9.Istem 7'nin substrati olup, özelligi; fonksiyonellestirilmis molekülün bir Formül (III) veya (III ') polimeri içermesidir: R5 (iii) R5 R1 (iii') R1 ifadesi H veya istege bagli olarak ikame edilmis alkildir; RA, azido, istege bagli olarak ikame edilmis amino, istege bagli olarak ikame edilmis alkenil, istege bagli olarak ikame edilmis hidrazon, istege bagli olarak ikame edilmis hidrazin, karboksil, hidroksi, istege bagli olarak ikame edilmis tetrazol, istege bagli olarak ikame edilmis tetrazin ve tiyolden olusan gruptan seçilir; R5, H veya Istege bagli olarak ikame alkil arasindan seçilir; - (CH2) -p'nin her biri istege bagli olarak ikame edilebilir; p, 1 ila 50 arasinda bir tamsayidir; n, 1 ila 50,000 arasinda bir tamsayidir; ve m, 1 ila 100,000 arasinda bir tamsayidir. 10. Istem 1 ila 9'dan herhangi birine göre bir substrat olup, özelligi; islevsellestirilmis molekülün poli(N-(5- azidoasetamidilpentil) akrilamid-ko-akrilamid) olmasidir. 11. Istem 1 ila lO'dan herhangi birine göre bir substrat olup, ayrica, sikloalkenler, sikloalkinler, heterosikloalkenler, heterosikloalkinler veya bunlarin istege bagli olarak ikame edilmis varyantlari veya bunlarin kombinasyonlarindan seçilen doymamis molekül parçasinin ikinci bir çogullugu ile reaksiyon yoluyla fonksiyonellestirilmis moleküle kovalent olarak baglanmis oligonükleotidleri içerir. 12. Istem ll'in substrati olup, özelligi; bahsedilen doymamis molekül parçasinin ikinci bir çogullugu, istege bagli olarak ikame edilmis bisiklononinlerden arasindan, tercihen bisiklo 13. Islevsel gruplar içeren islevsellesmis molekülün, substratin birinci yüzeyine hareketsizlestirilmesinin yöntemi olup, bahsedilen yöntem asagidakileri içerir: substratin, sikloalkenlerden, heterosikloalkenlerden veyabunlarin istege bagli olarak ikame edilmis varyantlardan veya bunlarin kombinasyonlarindan seçilen doymamis bir leekül parçaciklarinin birinci çogullugunu içeren bir silan veya bir silan türevine kovalent olarak eklenmis birinci yüzeyi içeren substrati saglamasini; ve islevsellestirilmis molekülün fonksiyonel gruplarinin bahsedilen doymamis molekül parçaciciklarinin birinci çogullugu ile reaksiyona sokulmasiyla, fonksiyonellestirilmis molekülün, bahsedilen silan veya silan türevine kovalent olarak baglanmasini. Istem 13'e göre yöntem olup, özelligi; ayrica asagidakileri içermesidir: sikloalkenler, sikloalkinler, heterosikloalkenler, heterosikloalkinler veya bunlarin istege bagli olarak ikame edilmis varyantlari veya kombinasyonlarindan seçilen ikinci bir çok sayida doymamis molekül parçalari içeren oligonükleotidlerin saglanmasini; bahsedilen oligonükleotidlerin bahsedilen doymamis molekül parçalarinin ikinci bir çogullugu ile kovalent baglanmayi olusturmak üzere fonksiyonellestirilmis molekülün fonksiyonel gruplari ile reaksiyona sokulmasini. Istem 14'e göre yöntem olup, özelligi; islevsellestirilmis molekülün, silan veya silan türevi ile reaksiyona girmeden önce oligonükleotidlere kovalent olarak baglanmasidir. Istem 14'e göre yöntem olup, özelligi; islevsellestirilmis molekülünün, silan veya silan türevi ile reaksiyona girdikten sonra oligonükleotidlere kovalent olarak baglanmasidir. Istem 13 ila 16'ya göre yöntem olup, özelligi; bahsedilen doymamis molekül parçalarinin birinci çogullugunun istege bagli olarak ikame edilmis norbornen olmasidir.
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US201361841647P | 2013-07-01 | 2013-07-01 | |
US201461971381P | 2014-03-27 | 2014-03-27 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
TR201816438T4 true TR201816438T4 (tr) | 2018-11-21 |
Family
ID=51211889
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
TR2018/16438T TR201816438T4 (tr) | 2013-07-01 | 2014-06-26 | Katalizörsüz yüzey işlevselleştirme ve polimer aşılama. |
Country Status (17)
Country | Link |
---|---|
US (4) | US9994687B2 (tr) |
EP (3) | EP3919624A3 (tr) |
JP (3) | JP6511046B2 (tr) |
KR (3) | KR102266002B1 (tr) |
CN (2) | CN109734946B (tr) |
AU (3) | AU2014284584B2 (tr) |
CA (1) | CA2915598C (tr) |
DK (2) | DK3017065T3 (tr) |
ES (2) | ES2700529T3 (tr) |
HK (1) | HK1223655A1 (tr) |
HU (1) | HUE041318T2 (tr) |
IL (2) | IL273519B2 (tr) |
MX (1) | MX363806B (tr) |
PL (2) | PL3017065T3 (tr) |
PT (1) | PT3017065T (tr) |
TR (1) | TR201816438T4 (tr) |
WO (1) | WO2015002813A1 (tr) |
Families Citing this family (85)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CA2794522C (en) | 2010-04-05 | 2019-11-26 | Prognosys Biosciences, Inc. | Spatially encoded biological assays |
US10787701B2 (en) | 2010-04-05 | 2020-09-29 | Prognosys Biosciences, Inc. | Spatially encoded biological assays |
GB201106254D0 (en) | 2011-04-13 | 2011-05-25 | Frisen Jonas | Method and product |
US9879313B2 (en) | 2013-06-25 | 2018-01-30 | Prognosys Biosciences, Inc. | Methods and systems for determining spatial patterns of biological targets in a sample |
TR201816438T4 (tr) * | 2013-07-01 | 2018-11-21 | Illumina Inc | Katalizörsüz yüzey işlevselleştirme ve polimer aşılama. |
CA3171807A1 (en) | 2013-12-19 | 2015-06-25 | Illumina, Inc. | Substrates comprising nano-patterning surfaces and methods of preparing thereof |
JP6601852B2 (ja) | 2014-07-31 | 2019-11-06 | イルミナ インコーポレイテッド | ハイブリッドナノポアセンサ |
CN107076739B (zh) | 2014-08-21 | 2018-12-25 | 伊卢米纳剑桥有限公司 | 可逆表面官能化 |
WO2016066586A1 (en) | 2014-10-31 | 2016-05-06 | Illumina Cambridge Limited | Novel polymers and dna copolymer coatings |
EP4119677B1 (en) | 2015-04-10 | 2023-06-28 | Spatial Transcriptomics AB | Spatially distinguished, multiplex nucleic acid analysis of biological specimens |
KR102333255B1 (ko) | 2015-05-11 | 2021-12-01 | 일루미나, 인코포레이티드 | 치료제의 발견 및 분석을 위한 플랫폼 |
CN107924121B (zh) | 2015-07-07 | 2021-06-08 | 亿明达股份有限公司 | 经由纳米压印的选择性表面图案化 |
WO2017015018A1 (en) * | 2015-07-17 | 2017-01-26 | Illumina, Inc. | Polymer sheets for sequencing applications |
AU2016330924A1 (en) * | 2015-10-02 | 2018-04-26 | PixarBio Corporation | Compositions for an injectable, in situ forming neuroscaffold and methods of using the same |
ES2861478T3 (es) | 2016-05-18 | 2021-10-06 | Illumina Inc | Estampación de autoensamblado que utiliza superficies hidrófobas estampadas |
EP3488002B1 (en) | 2016-07-22 | 2021-03-31 | Oregon Health & Science University | Single cell whole genome libraries and combinatorial indexing methods of making thereof |
EP3558510B1 (en) | 2016-12-22 | 2022-11-23 | Illumina, Inc. | Array including sequencing primer and non-sequencing entity |
AU2017382163B2 (en) | 2016-12-22 | 2022-06-09 | Illumina Cambridge Limited | Imprinting apparatus |
AU2017379872A1 (en) | 2016-12-22 | 2019-06-20 | Illumina, Inc. | Arrays with quality control tracers |
EP3558511A4 (en) | 2016-12-22 | 2020-11-25 | Illumina, Inc. | ARRAYS WITH A RESIN FILM AND A STRUCTURED POLYMER LAYER |
WO2018119101A1 (en) | 2016-12-22 | 2018-06-28 | Illumina, Inc. | Flow cell package and method for making the same |
SG11201907230RA (en) * | 2017-02-24 | 2019-09-27 | Illumina Inc | Calcium carbonate slurry |
ES2937929T3 (es) | 2017-04-23 | 2023-04-03 | Illumina Inc | Composiciones y métodos para mejorar la identificación de muestras en bibliotecas de ácido nucleico indexadas |
FI3872187T3 (fi) | 2017-04-23 | 2022-12-15 | Koostumuksia ja menetelmiä näytteiden identifioinnin parantamiseksi indeksoiduissa nukleiinihappokirjastoissa | |
CN110785492B (zh) | 2017-04-23 | 2024-04-30 | 伊鲁米纳剑桥有限公司 | 用于改进编索引的核酸文库中的样品鉴定的组合物和方法 |
NL2019044B1 (en) * | 2017-05-11 | 2018-11-15 | Illumina Inc | Protective surface coatings for flow cells |
CN110997932B (zh) | 2017-06-07 | 2024-06-04 | 俄勒冈健康科学大学 | 用于甲基化测序的单细胞全基因组文库 |
WO2019014644A1 (en) * | 2017-07-14 | 2019-01-17 | Cedars-Sinai Medical Center | GLASS L: NEW FUNCTIONALIZATION PROCESS FOR COVALENT FIXATION OF ECM PROTEIN ON OPTICAL GLASS |
EP3662482A1 (en) | 2017-07-31 | 2020-06-10 | Illumina Inc. | Sequencing system with multiplexed biological sample aggregation |
SG11201911869XA (en) | 2017-08-01 | 2020-01-30 | Illumina Inc | Spatial indexing of genetic material and library preparation using hydrogel beads and flow cells |
US10919033B2 (en) * | 2017-12-21 | 2021-02-16 | Illumina, Inc. | Flow cells with hydrogel coating |
NL2020625B1 (en) | 2017-12-22 | 2019-07-02 | Illumina Inc | Two-filter light detection devices and methods of manufacturing same |
CN111065453B (zh) * | 2017-12-22 | 2022-07-05 | 伊鲁米那股份有限公司 | 催化活性物质 |
KR102383799B1 (ko) | 2018-04-02 | 2022-04-05 | 일루미나, 인코포레이티드 | 서열-기반의 유전 검사용 대조군을 제조하기 위한 조성물 및 방법 |
EP4306532A3 (en) | 2018-05-15 | 2024-04-10 | Illumina, Inc. | Chemical cleavage and deprotection |
KR102640255B1 (ko) | 2018-05-17 | 2024-02-27 | 일루미나, 인코포레이티드 | 감소된 증폭 편향을 갖는 고속-대량 단일 세포 서열분석 |
KR102393414B1 (ko) | 2018-06-04 | 2022-05-02 | 일루미나, 인코포레이티드 | 고속 대량 단일 세포 전사체 라이브러리 그리고 이의 제조 및 사용 방법 |
AU2019275675A1 (en) | 2018-06-29 | 2020-01-16 | Illumina Cambridge Limited | Flow cells |
EP3824122A4 (en) * | 2018-07-18 | 2022-07-20 | Shanghaitech University | INDEPENDENT MARKING OF THE FUNCTIONALITY OF ORGANIC COMPOUNDS |
TW202019989A (zh) * | 2018-08-06 | 2020-06-01 | 美商康寧公司 | 具有穩定聚合物塗層之流動槽及其用於基因定序之用途 |
CN111100785B (zh) * | 2018-10-25 | 2023-08-11 | 深圳市真迈生物科技有限公司 | 固相基底、其处理方法和确定处理条件的方法 |
SG11202102703VA (en) * | 2018-10-26 | 2021-04-29 | Illumina Inc | Modulating polymer beads for dna processing |
SG11202012634UA (en) | 2018-12-17 | 2021-01-28 | Illumina Inc | Flow cells and sequencing kits |
EP3899029A1 (en) | 2018-12-21 | 2021-10-27 | Illumina, Inc. | Nuclease-based rna depletion |
US11649485B2 (en) | 2019-01-06 | 2023-05-16 | 10X Genomics, Inc. | Generating capture probes for spatial analysis |
US11926867B2 (en) | 2019-01-06 | 2024-03-12 | 10X Genomics, Inc. | Generating capture probes for spatial analysis |
BR112021006234A2 (pt) | 2019-03-01 | 2021-09-28 | Illumina, Inc. | Bibliotecas de células únicas e núcleos únicos de alto rendimento e métodos de preparo e uso |
NL2023311B9 (en) | 2019-03-21 | 2021-03-12 | Illumina Inc | Artificial intelligence-based generation of sequencing metadata |
NL2023310B1 (en) | 2019-03-21 | 2020-09-28 | Illumina Inc | Training data generation for artificial intelligence-based sequencing |
US11210554B2 (en) | 2019-03-21 | 2021-12-28 | Illumina, Inc. | Artificial intelligence-based generation of sequencing metadata |
WO2020191387A1 (en) | 2019-03-21 | 2020-09-24 | Illumina, Inc. | Artificial intelligence-based base calling |
NL2023316B1 (en) | 2019-03-21 | 2020-09-28 | Illumina Inc | Artificial intelligence-based sequencing |
WO2021028815A1 (en) | 2019-08-09 | 2021-02-18 | Illumina Inc. | System and method for patterning flow cell substrates |
NL2023679B1 (en) | 2019-08-09 | 2021-04-13 | Illumina Inc | System and method for patterning flow cell substrates |
JP2023508792A (ja) | 2019-12-19 | 2023-03-06 | イルミナ インコーポレイテッド | ハイスループット単一細胞ライブラリー、並びに製造方法及び使用方法 |
US11821035B1 (en) | 2020-01-29 | 2023-11-21 | 10X Genomics, Inc. | Compositions and methods of making gene expression libraries |
WO2021168326A1 (en) * | 2020-02-21 | 2021-08-26 | Readcoor, Llc | Compositions, methods and systems for sample processing |
KR20230007915A (ko) * | 2020-04-24 | 2023-01-13 | 일루미나 케임브리지 리미티드 | 플로우 셀 |
US11188778B1 (en) | 2020-05-05 | 2021-11-30 | Illumina, Inc. | Equalization-based image processing and spatial crosstalk attenuator |
US20210355518A1 (en) | 2020-05-12 | 2021-11-18 | Illumina, Inc. | Generating nucleic acids with modified bases using recombinant terminal deoxynucleotidyl transferase |
WO2021252617A1 (en) | 2020-06-09 | 2021-12-16 | Illumina, Inc. | Methods for increasing yield of sequencing libraries |
JP2023532231A (ja) | 2020-06-30 | 2023-07-27 | イルミナ インコーポレイテッド | 傷なしdnaを生成するための触媒的に制御された合成による配列決定 |
WO2022010965A1 (en) | 2020-07-08 | 2022-01-13 | Illumina, Inc. | Beads as transposome carriers |
CN111743857A (zh) * | 2020-07-30 | 2020-10-09 | 瑞希(重庆)生物科技有限公司 | 一种壳聚糖水凝胶及其制备方法 |
BR112022027055A2 (pt) * | 2020-10-20 | 2023-05-09 | Illumina Inc | Células de fluxo |
US11361194B2 (en) | 2020-10-27 | 2022-06-14 | Illumina, Inc. | Systems and methods for per-cluster intensity correction and base calling |
CN117043352A (zh) | 2021-01-29 | 2023-11-10 | 伊鲁米纳公司 | 使用多核苷酸改善流通池的接种效率的方法、组合物和试剂盒 |
US20230249176A1 (en) * | 2021-02-22 | 2023-08-10 | Illumina, Inc. | Hybrid glass plastic flow cell and fabrication methods |
EP4305193A1 (en) * | 2021-03-09 | 2024-01-17 | Illumina, Inc. | Polymers, methods of making polymers, and methods of coupling oligonucleotides to polymers |
KR102488382B1 (ko) * | 2021-04-19 | 2023-01-17 | 한국화학연구원 | 클릭반응을 이용한 고밀도 및 고안정성 cnt 필름 코팅 기판 및 이의 제조방법 |
EP4355476A1 (en) | 2021-06-15 | 2024-04-24 | Illumina, Inc. | Hydrogel-free surface functionalization for sequencing |
WO2023003757A1 (en) | 2021-07-19 | 2023-01-26 | Illumina Software, Inc. | Intensity extraction with interpolation and adaptation for base calling |
US11455487B1 (en) | 2021-10-26 | 2022-09-27 | Illumina Software, Inc. | Intensity extraction and crosstalk attenuation using interpolation and adaptation for base calling |
US20230116852A1 (en) | 2021-07-23 | 2023-04-13 | Illumina, Inc. | Methods for preparing substrate surface for dna sequencing |
WO2023069927A1 (en) | 2021-10-20 | 2023-04-27 | Illumina, Inc. | Methods for capturing library dna for sequencing |
CN114231401B (zh) * | 2022-02-21 | 2022-05-03 | 北京芯迈微生物技术有限公司 | 一种核酸检测试剂盒及检测方法 |
CA3222807A1 (en) | 2022-03-22 | 2023-09-28 | Alexandra SZEMJONOV | Substrate with orthogonally functional nanodomains |
CA3223722A1 (en) | 2022-04-07 | 2023-10-12 | Illumina, Inc. | Altered cytidine deaminases and methods of use |
CN115010852B (zh) * | 2022-06-01 | 2023-10-10 | 郑州玛特瑞斯生物科技有限公司 | 一种测序芯片表面修饰用聚合物、测序芯片及其表面修饰方法 |
WO2023239917A1 (en) | 2022-06-09 | 2023-12-14 | Illumina, Inc. | Dependence of base calling on flow cell tilt |
WO2024073043A1 (en) | 2022-09-30 | 2024-04-04 | Illumina, Inc. | Methods of using cpg binding proteins in mapping modified cytosine nucleotides |
WO2024073047A1 (en) | 2022-09-30 | 2024-04-04 | Illumina, Inc. | Cytidine deaminases and methods of use in mapping modified cytosine nucleotides |
WO2024069581A1 (en) | 2022-09-30 | 2024-04-04 | Illumina Singapore Pte. Ltd. | Helicase-cytidine deaminase complexes and methods of use |
US20240199659A1 (en) * | 2022-12-01 | 2024-06-20 | Gelest, Inc. | Cycloalkylnorbornene compounds with heterocyclic functionality for voc-free crosslinking and surface functionalization |
WO2024123748A1 (en) | 2022-12-07 | 2024-06-13 | Illumina, Inc. | Etch-free photoresist patterning in multi-depth nanowells |
Family Cites Families (108)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
GB8810400D0 (en) | 1988-05-03 | 1988-06-08 | Southern E | Analysing polynucleotide sequences |
US5130238A (en) | 1988-06-24 | 1992-07-14 | Cangene Corporation | Enhanced nucleic acid amplification process |
GB8822228D0 (en) | 1988-09-21 | 1988-10-26 | Southern E M | Support-bound oligonucleotides |
US5800992A (en) | 1989-06-07 | 1998-09-01 | Fodor; Stephen P.A. | Method of detecting nucleic acids |
US6346413B1 (en) | 1989-06-07 | 2002-02-12 | Affymetrix, Inc. | Polymer arrays |
DE3924454A1 (de) | 1989-07-24 | 1991-02-07 | Cornelis P Prof Dr Hollenberg | Die anwendung von dna und dna-technologie fuer die konstruktion von netzwerken zur verwendung in der chip-konstruktion und chip-produktion (dna chips) |
EP0450060A1 (en) | 1989-10-26 | 1991-10-09 | Sri International | Dna sequencing |
US5455166A (en) | 1991-01-31 | 1995-10-03 | Becton, Dickinson And Company | Strand displacement amplification |
WO1993006121A1 (en) | 1991-09-18 | 1993-04-01 | Affymax Technologies N.V. | Method of synthesizing diverse collections of oligomers |
DE69233087T2 (de) | 1991-11-22 | 2003-12-24 | Affymetrix Inc N D Ges D Staat | Verfahren zur Herstellung von Polymerarrays |
EP1382386A3 (en) | 1992-02-19 | 2004-12-01 | The Public Health Research Institute Of The City Of New York, Inc. | Novel oligonucleotide arrays and their use for sorting, isolating, sequencing, and manipulating nucleic acids |
US5583211A (en) | 1992-10-29 | 1996-12-10 | Beckman Instruments, Inc. | Surface activated organic polymers useful for location - specific attachment of nucleic acids, peptides, proteins and oligosaccharides |
US5472672A (en) | 1993-10-22 | 1995-12-05 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Apparatus and method for polymer synthesis using arrays |
AU8126694A (en) | 1993-10-26 | 1995-05-22 | Affymax Technologies N.V. | Arrays of nucleic acid probes on biological chips |
US6156501A (en) | 1993-10-26 | 2000-12-05 | Affymetrix, Inc. | Arrays of modified nucleic acid probes and methods of use |
US5429807A (en) | 1993-10-28 | 1995-07-04 | Beckman Instruments, Inc. | Method and apparatus for creating biopolymer arrays on a solid support surface |
WO1995025180A1 (en) | 1994-03-16 | 1995-09-21 | Gen-Probe Incorporated | Isothermal strand displacement nucleic acid amplification |
US5552278A (en) | 1994-04-04 | 1996-09-03 | Spectragen, Inc. | DNA sequencing by stepwise ligation and cleavage |
US5807522A (en) | 1994-06-17 | 1998-09-15 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Methods for fabricating microarrays of biological samples |
US5641658A (en) | 1994-08-03 | 1997-06-24 | Mosaic Technologies, Inc. | Method for performing amplification of nucleic acid with two primers bound to a single solid support |
US5556752A (en) | 1994-10-24 | 1996-09-17 | Affymetrix, Inc. | Surface-bound, unimolecular, double-stranded DNA |
US5750341A (en) | 1995-04-17 | 1998-05-12 | Lynx Therapeutics, Inc. | DNA sequencing by parallel oligonucleotide extensions |
US5624711A (en) | 1995-04-27 | 1997-04-29 | Affymax Technologies, N.V. | Derivatization of solid supports and methods for oligomer synthesis |
US5545531A (en) | 1995-06-07 | 1996-08-13 | Affymax Technologies N.V. | Methods for making a device for concurrently processing multiple biological chip assays |
EP0852004B1 (en) | 1995-10-11 | 2011-01-19 | Luminex Corporation | Multiplexed analysis of clinical specimens |
US5658734A (en) | 1995-10-17 | 1997-08-19 | International Business Machines Corporation | Process for synthesizing chemical compounds |
US6458530B1 (en) | 1996-04-04 | 2002-10-01 | Affymetrix Inc. | Selecting tag nucleic acids |
CA2253587C (en) | 1996-05-09 | 2008-01-29 | 3-Dimensional Pharmaceuticals, Inc. | Microplate thermal shift assay and apparatus for ligand development and multi-variable protein chemistry optimization |
GB9620209D0 (en) | 1996-09-27 | 1996-11-13 | Cemu Bioteknik Ab | Method of sequencing DNA |
GB9626815D0 (en) | 1996-12-23 | 1997-02-12 | Cemu Bioteknik Ab | Method of sequencing DNA |
US6297006B1 (en) | 1997-01-16 | 2001-10-02 | Hyseq, Inc. | Methods for sequencing repetitive sequences and for determining the order of sequence subfragments |
US7622294B2 (en) | 1997-03-14 | 2009-11-24 | Trustees Of Tufts College | Methods for detecting target analytes and enzymatic reactions |
EP1498494A3 (en) | 1997-04-01 | 2007-06-20 | Solexa Ltd. | Method of nucleic acid sequencing |
US6465178B2 (en) | 1997-09-30 | 2002-10-15 | Surmodics, Inc. | Target molecule attachment to surfaces |
US6485944B1 (en) | 1997-10-10 | 2002-11-26 | President And Fellows Of Harvard College | Replica amplification of nucleic acid arrays |
US6087102A (en) | 1998-01-07 | 2000-07-11 | Clontech Laboratories, Inc. | Polymeric arrays and methods for their use in binding assays |
US6287776B1 (en) | 1998-02-02 | 2001-09-11 | Signature Bioscience, Inc. | Method for detecting and classifying nucleic acid hybridization |
JP3944996B2 (ja) | 1998-03-05 | 2007-07-18 | 株式会社日立製作所 | Dnaプローブアレー |
US6031078A (en) | 1998-06-16 | 2000-02-29 | Millennium Pharmaceuticals, Inc. | MTbx protein and nucleic acid molecules and uses therefor |
AR021833A1 (es) | 1998-09-30 | 2002-08-07 | Applied Research Systems | Metodos de amplificacion y secuenciacion de acido nucleico |
US6277628B1 (en) | 1998-10-02 | 2001-08-21 | Incyte Genomics, Inc. | Linear microarrays |
US6391937B1 (en) | 1998-11-25 | 2002-05-21 | Motorola, Inc. | Polyacrylamide hydrogels and hydrogel arrays made from polyacrylamide reactive prepolymers |
DK1923471T3 (da) | 1999-04-20 | 2013-04-02 | Illumina Inc | Detektion af nukleinsyrereaktioner på bead-arrays |
US6355431B1 (en) | 1999-04-20 | 2002-03-12 | Illumina, Inc. | Detection of nucleic acid amplification reactions using bead arrays |
US20050191698A1 (en) | 1999-04-20 | 2005-09-01 | Illumina, Inc. | Nucleic acid sequencing using microsphere arrays |
US20060275782A1 (en) | 1999-04-20 | 2006-12-07 | Illumina, Inc. | Detection of nucleic acid reactions on bead arrays |
FR2792631B1 (fr) * | 1999-04-21 | 2004-03-19 | Pasteur Institut | Support solide fonctionnalise pour la synthese de composes comportant au moins une fonction alpha oxoaldehyde et ses applications. |
US6372813B1 (en) | 1999-06-25 | 2002-04-16 | Motorola | Methods and compositions for attachment of biomolecules to solid supports, hydrogels, and hydrogel arrays |
US6664061B2 (en) | 1999-06-25 | 2003-12-16 | Amersham Biosciences Ab | Use and evaluation of a [2+2] photoaddition in immobilization of oligonucleotides on a three-dimensional hydrogel matrix |
US6274320B1 (en) | 1999-09-16 | 2001-08-14 | Curagen Corporation | Method of sequencing a nucleic acid |
US7244559B2 (en) | 1999-09-16 | 2007-07-17 | 454 Life Sciences Corporation | Method of sequencing a nucleic acid |
ATE492652T1 (de) | 2000-02-07 | 2011-01-15 | Illumina Inc | Nukleinsäuredetektionsverfahren mit universellem priming |
US6913884B2 (en) | 2001-08-16 | 2005-07-05 | Illumina, Inc. | Compositions and methods for repetitive use of genomic DNA |
US7582420B2 (en) | 2001-07-12 | 2009-09-01 | Illumina, Inc. | Multiplex nucleic acid reactions |
WO2001059432A2 (en) | 2000-02-10 | 2001-08-16 | Illumina, Inc. | Array of individual arrays as substrate for bead-based simultaneous processing of samples and manufacturing method therefor |
US6770441B2 (en) | 2000-02-10 | 2004-08-03 | Illumina, Inc. | Array compositions and methods of making same |
WO2001062982A2 (en) | 2000-02-25 | 2001-08-30 | Mosaic Technologies, Inc. | Methods for multi-stage solid phase amplification of nucleic acids |
JP2003535317A (ja) | 2000-05-01 | 2003-11-25 | プロリゴ・エルエルシー | 付加環化バイオコンジュゲーション法を利用してオリゴヌクレオチドを固定化する方法 |
EP2100971A3 (en) | 2000-07-07 | 2009-11-25 | Visigen Biotechnologies, Inc. | Real-time sequence determination |
WO2002012566A2 (en) | 2000-08-09 | 2002-02-14 | Motorola, Inc. | The use and evaluation of a [2+2] photocycloaddition in immobilization of oligonucleotides on a three-dimensional hydrogel matrix |
US7211414B2 (en) | 2000-12-01 | 2007-05-01 | Visigen Biotechnologies, Inc. | Enzymatic nucleic acid synthesis: compositions and methods for altering monomer incorporation fidelity |
AR031640A1 (es) | 2000-12-08 | 2003-09-24 | Applied Research Systems | Amplificacion isotermica de acidos nucleicos en un soporte solido |
US20030027226A1 (en) | 2001-05-10 | 2003-02-06 | Cory Abate-Shen | Monoclonal antibody for NKX3.1 and method for detecting same |
GB0127564D0 (en) | 2001-11-16 | 2002-01-09 | Medical Res Council | Emulsion compositions |
US7057026B2 (en) | 2001-12-04 | 2006-06-06 | Solexa Limited | Labelled nucleotides |
US20040002090A1 (en) | 2002-03-05 | 2004-01-01 | Pascal Mayer | Methods for detecting genome-wide sequence variations associated with a phenotype |
JP2004085556A (ja) * | 2002-06-28 | 2004-03-18 | Canon Inc | プローブ担体の製造方法、製造装置及び品質保証方法 |
SI3587433T1 (sl) | 2002-08-23 | 2020-08-31 | Illumina Cambridge Limited | Modificirani nukleotidi |
US7595883B1 (en) | 2002-09-16 | 2009-09-29 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Biological analysis arrangement and approach therefor |
JP4480715B2 (ja) | 2003-01-29 | 2010-06-16 | 454 コーポレーション | 二重末端シーケンシング |
WO2005003304A2 (en) | 2003-06-20 | 2005-01-13 | Illumina, Inc. | Methods and compositions for whole genome amplification and genotyping |
EP2532745B1 (en) | 2003-07-05 | 2015-09-09 | The Johns Hopkins University | Method and Compositions for Detection and Enumeration of Genetic Variations |
WO2005065814A1 (en) | 2004-01-07 | 2005-07-21 | Solexa Limited | Modified molecular arrays |
CN101914620B (zh) | 2004-09-17 | 2014-02-12 | 加利福尼亚太平洋生命科学公司 | 核酸测序的方法 |
DK1907583T4 (da) | 2005-06-15 | 2020-01-27 | Complete Genomics Inc | Enkeltmolekyle-arrays til genetisk og kemisk analyse |
US7892737B2 (en) * | 2005-06-30 | 2011-02-22 | Life Technologies Corporation | Compositions, kits and methods pertaining to stability modulation of PNA oligomer/nucleic acid complexes |
GB0514909D0 (en) * | 2005-07-20 | 2005-08-24 | Solexa Ltd | Methods of nucleic acid amplification and sequencing |
GB0514936D0 (en) * | 2005-07-20 | 2005-08-24 | Solexa Ltd | Preparation of templates for nucleic acid sequencing |
US7405281B2 (en) | 2005-09-29 | 2008-07-29 | Pacific Biosciences Of California, Inc. | Fluorescent nucleotide analogs and uses therefor |
JP5127718B2 (ja) * | 2005-10-29 | 2013-01-23 | バイエル・テクノロジー・サービシズ・ゲゼルシヤフト・ミツト・ベシユレンクテル・ハフツング | 複雑な組成を有する生物学的起源のサンプル中の1種若しくはそれ以上の被検体の測定方法およびその使用 |
GB0522310D0 (en) | 2005-11-01 | 2005-12-07 | Solexa Ltd | Methods of preparing libraries of template polynucleotides |
CN101415839B (zh) * | 2006-02-08 | 2012-06-27 | 亿明达剑桥有限公司 | 对多核苷酸模板进行测序的方法 |
US20080009420A1 (en) | 2006-03-17 | 2008-01-10 | Schroth Gary P | Isothermal methods for creating clonal single molecule arrays |
WO2007123744A2 (en) | 2006-03-31 | 2007-11-01 | Solexa, Inc. | Systems and devices for sequence by synthesis analysis |
US7754429B2 (en) * | 2006-10-06 | 2010-07-13 | Illumina Cambridge Limited | Method for pair-wise sequencing a plurity of target polynucleotides |
US8343746B2 (en) | 2006-10-23 | 2013-01-01 | Pacific Biosciences Of California, Inc. | Polymerase enzymes and reagents for enhanced nucleic acid sequencing |
EP2092322B1 (en) | 2006-12-14 | 2016-02-17 | Life Technologies Corporation | Methods and apparatus for measuring analytes using large scale fet arrays |
US8262900B2 (en) | 2006-12-14 | 2012-09-11 | Life Technologies Corporation | Methods and apparatus for measuring analytes using large scale FET arrays |
US8349167B2 (en) | 2006-12-14 | 2013-01-08 | Life Technologies Corporation | Methods and apparatus for detecting molecular interactions using FET arrays |
JP5532648B2 (ja) * | 2008-04-03 | 2014-06-25 | 信越化学工業株式会社 | カルボキシル基を有するオルガノポリシロキサンで表面処理された粉体、該粉体の分散物および該粉体を含む化粧料 |
JP5285949B2 (ja) * | 2008-04-16 | 2013-09-11 | Rimtec株式会社 | 複合成形体 |
US20100137143A1 (en) | 2008-10-22 | 2010-06-03 | Ion Torrent Systems Incorporated | Methods and apparatus for measuring analytes |
FR2943344B1 (fr) * | 2009-03-18 | 2011-04-15 | Commissariat Energie Atomique | Nouveaux composes silanes porteurs d'une chaine carbonee cyclique comprenant une fonction alcyne pour fonctionnaliser des supports solides et immobiliser sur ces supports des molecules biologiques |
US20110143966A1 (en) * | 2009-12-15 | 2011-06-16 | Affymetrix, Inc. | Surface Modifications and Methods for their Synthesis and Use |
US8496997B2 (en) * | 2010-03-10 | 2013-07-30 | The University Of Melbourne | Process for the preparation of a cross-linked multilayer film |
EP3928867A1 (en) | 2010-10-27 | 2021-12-29 | Illumina, Inc. | Microdevices and biosensor cartridges for biological or chemical analysis and systems and methods for the same |
WO2012079030A2 (en) | 2010-12-10 | 2012-06-14 | The Regents Of The University Of California | Bioconjugation using bifunctional linkers |
US8951781B2 (en) | 2011-01-10 | 2015-02-10 | Illumina, Inc. | Systems, methods, and apparatuses to image a sample for biological or chemical analysis |
US8778848B2 (en) * | 2011-06-09 | 2014-07-15 | Illumina, Inc. | Patterned flow-cells useful for nucleic acid analysis |
EP2532639A1 (en) | 2011-06-09 | 2012-12-12 | ModiQuest B.V. | Method for preparing a reactive coating |
EP2753607B1 (en) | 2011-09-09 | 2016-04-13 | Berry And Associates, Inc. | Bicyclo[6.1.0]non-4-yne reagents for chemical modification of oligonucleotides |
CA2856163C (en) | 2011-10-28 | 2019-05-07 | Illumina, Inc. | Microarray fabrication system and method |
JP2013151468A (ja) * | 2011-11-30 | 2013-08-08 | Agilent Technologies Inc | オリゴマーの合成及び精製の新規方法 |
CA2858806A1 (en) * | 2011-12-23 | 2013-06-27 | Innate Pharma | Enzymatic conjugation of polypeptides |
US9012022B2 (en) | 2012-06-08 | 2015-04-21 | Illumina, Inc. | Polymer coatings |
US9512422B2 (en) * | 2013-02-26 | 2016-12-06 | Illumina, Inc. | Gel patterned surfaces |
TR201816438T4 (tr) * | 2013-07-01 | 2018-11-21 | Illumina Inc | Katalizörsüz yüzey işlevselleştirme ve polimer aşılama. |
CN107076739B (zh) * | 2014-08-21 | 2018-12-25 | 伊卢米纳剑桥有限公司 | 可逆表面官能化 |
-
2014
- 2014-06-26 TR TR2018/16438T patent/TR201816438T4/tr unknown
- 2014-06-26 DK DK14741745.5T patent/DK3017065T3/en active
- 2014-06-26 WO PCT/US2014/044356 patent/WO2015002813A1/en active Application Filing
- 2014-06-26 CN CN201910037119.9A patent/CN109734946B/zh active Active
- 2014-06-26 PL PL14741745T patent/PL3017065T3/pl unknown
- 2014-06-26 IL IL273519A patent/IL273519B2/en unknown
- 2014-06-26 ES ES14741745T patent/ES2700529T3/es active Active
- 2014-06-26 PL PL18193819T patent/PL3431614T3/pl unknown
- 2014-06-26 MX MX2015018049A patent/MX363806B/es active IP Right Grant
- 2014-06-26 KR KR1020207031892A patent/KR102266002B1/ko active IP Right Grant
- 2014-06-26 EP EP21183122.7A patent/EP3919624A3/en not_active Withdrawn
- 2014-06-26 ES ES18193819T patent/ES2899618T3/es active Active
- 2014-06-26 EP EP14741745.5A patent/EP3017065B1/en active Active
- 2014-06-26 KR KR1020207001606A patent/KR102177225B1/ko active IP Right Grant
- 2014-06-26 EP EP18193819.2A patent/EP3431614B1/en active Active
- 2014-06-26 HU HUE14741745A patent/HUE041318T2/hu unknown
- 2014-06-26 US US14/316,478 patent/US9994687B2/en active Active
- 2014-06-26 KR KR1020167002434A patent/KR102070483B1/ko active IP Right Grant
- 2014-06-26 DK DK18193819.2T patent/DK3431614T3/da active
- 2014-06-26 AU AU2014284584A patent/AU2014284584B2/en active Active
- 2014-06-26 CA CA2915598A patent/CA2915598C/en active Active
- 2014-06-26 JP JP2016524198A patent/JP6511046B2/ja active Active
- 2014-06-26 PT PT14741745T patent/PT3017065T/pt unknown
- 2014-06-26 CN CN201480042380.3A patent/CN105431554B/zh active Active
-
2015
- 2015-12-15 IL IL243132A patent/IL243132B/en active IP Right Grant
-
2016
- 2016-10-11 HK HK16111713.5A patent/HK1223655A1/zh unknown
-
2018
- 2018-05-24 US US15/989,079 patent/US10975210B2/en active Active
-
2019
- 2019-04-05 JP JP2019072560A patent/JP6744944B2/ja active Active
- 2019-10-11 AU AU2019246865A patent/AU2019246865B2/en active Active
-
2020
- 2020-07-31 JP JP2020130006A patent/JP6873300B2/ja active Active
- 2020-09-14 AU AU2020233601A patent/AU2020233601B2/en active Active
-
2021
- 2021-03-05 US US17/194,019 patent/US11618808B2/en active Active
-
2023
- 2023-03-27 US US18/190,685 patent/US20230250248A1/en active Pending
Also Published As
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
TR201816438T4 (tr) | Katalizörsüz yüzey işlevselleştirme ve polimer aşılama. | |
CN107108822B (zh) | 聚合物以及dna共聚物涂层 |