JPH05502366A - 遺伝子工学処理した大腸菌菌株によるエタノール製造 - Google Patents

遺伝子工学処理した大腸菌菌株によるエタノール製造

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JPH05502366A JP1509287A JP50928789A JPH05502366A JP H05502366 A JPH05502366 A JP H05502366A JP 1509287 A JP1509287 A JP 1509287A JP 50928789 A JP50928789 A JP 50928789A JP H05502366 A JPH05502366 A JP H05502366A
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Abstract

(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるため要約のデータは記録されません。

Description

【発明の詳細な説明】 関連出願に対するクロスリファレンス 本発明は1988年8月31日に出願された継続中の米国出願第239.099 号の一部継続出願である。
発明の背景 解糖の間に、纏#@はグルコースなどの単純な糖をピルビン酸に転換し1.A  T PとN A D Hの正味の製造を伴う。
酸化的燐酸化のための、機能する電子伝達系の非存在下では、続けて解糖及びA TP生産を行なうための絶対要求であるところの、NへD゛を再生する短い経路 で少なくとも95%のピルビン酸が消費される。これらのN A D゛再生系の 廃物は一般に発酵生産物と呼ばれている。
異なる族によって生産される種々の発酵生産物について、微生物は特に幡々多擾 である(にrieg、N、R,及び、1.c。
Ho1t&I C19841系統的微生物学のバーギーのマニュアルCBerg ey’s manual of systematic bacteriolo gy)ボルチモアのウィリアム アントウィルキンスカンパニー、)。
これらの生産物には有機酸、例えば、ラクテート、アセテート、サクシネート及 びアチレート並びに中性生成物、例えばエタノール、アタノール、アセトン及び ブタンジオールが含まれる。実際、細菌からの発酵生産物の多種多様の物は、分 類学に於ける主要な決定因子としての用途につながっている(上記にrieg及 びHo1t [1984] )。
発酵の最終生産物は、いくつかの基本的な特徴を共通して有している。これらは 最初に製造された条件下では、比較的無毒であるが、蓄積してくるとより毒性と なる。
これらの直前の前駆体が解糖の間、一時的な電子受容体として役目をしたので、 これらはピルベートよりも還元されている。これらの発酵生栄物の微生物的生産 は、生物工学の最も古く、そし・て最も経済的に成功を収めた用途の基礎をなし 、それには乳製品、肉、飲料及び燃料が含まれる。近年、いくつかの微生物の遺 伝子的な構成を選択的に変更する研究を可能とする新しい技術の結果として、生 物工学の分野で多くの進歩がなされた。
大曙菌は生物工学に対する遺伝子のクローニング及び修飾のための重要なビヒク ルであり、そして組替え製品のa造の為の最も重要な宿主である。近年組替えD NA研究のために使用された宿主の範囲は、種々の細菌、酵母、真菌類およびい くつかの真核細胞を含むように拡大されている。ここに記載される本発明は、修 飾された宿主によって特定の有用な生産物を製造することを促進するための朝替 えD N A技術の使用に間している。
本発明の宿主を修飾するのに使用されたDNAは、スイモモナス モビリス(Z ymomonas w+obilis)から単離されたものである。Z、モビリ スは樹液及び蜜の中に一般に見出される通常の代謝特性を有する微生物である。
Z。
モビリスはバルキ(pulque) (メキシコのアルコール含有飲料)を製造 するための7ガバ(竜舌蘭頌の植物)の樹液の発酵のための天然の接種菌及びし ゅろ酒の接種菌として長い間部用されてきた。またこの生物は、燃料のエタノー ル製造に使用され、そして酵母よりも実質的に高いエタノール生産率が可能であ ると報告されてきた。
Z、モビリスは栄養的に単純で、アミノ酸ヌクレオチド及びビタミンを合成する ことができるが、この生物によって代謝されろ塘の範囲は非常に限られており、 通常はグルコース、フラクトース及びシュークロースからなる。これらの糖の発 酵からの基質レヘルの燐酸イヒは、生合成及び恒常性(ホメオスタシス)のため の唯一のエネルギー源である。Z、モビリスは発酵可能な糖なしではニュートリ エンドブロスなとの栄養に冨んだ培地の中でさえも生育できない。
Z、モビリスはmlL的燐酸化の為の作用系を欠いている絶対的な発酵細菌であ る。この生物はサツ力ロミセスセレビンアエ(Saccharomyces c erevisiae)のように、主要発酵生産物としてエタノール及び二酸化炭 素を!!遺する。Z、モビリスはエタノールを二つの酵素活性しか必要としない 短い経路によフて生産する。すなわち、ピルベートデカルボキシラーゼとアルコ ールデヒドロゲナーゼである。ヒルJ\−トデカルボキシラーゼはこの経路で鍵 となる@素であり、ヒル・\−トの流れをエタノールに転換する。ピルベートデ カルボキシラーゼはビルlベートの非酸化的なデカルボキシラーシヨンを触媒し 、アセトアルデヒドと二酸化炭素を生産する。二つのアルコールデヒドロゲナー ゼのアイソザイムがこの生物中に存在し、発酵のフにアセトアルデヒドのエタノ ールへの還元を触媒し、これにNAD HのNAD=への酸化が伴う。
細菌のアルコールデヒドロゲナーゼは多くの生物に共通しているが、ピルベート デカルボキシラーゼは少しの細菌しか有していない。エタノール生産者としての 商業的なそれの用途を補強するためのZ、モビリスを修飾する試みは、わずかの 成功しか達成していない。
多くの燃料エタノールはトウモロコシ澱粉又はさとうきびのシロップ中のヘキソ ース糖から現在製造されており、サツカロミセス セレビシアエ又はズイモモナ ス モビリスの何れかを利用している。しかし、これらはバイオマス糖として比 較的高価な供給源であり、食料としての競走的な価値を有している。澱粉と糖は 植物中の全炭水化物のわずかの部分でしかない。茎、葉、外皮、さや、穂髄なと の中の植物の炭水化物の主要な形態は、m造壁の重合体であるセルロール及びセ ミセルロースである。
これらの重合体の加水分解は、グルコース、キシロース、マンノース、ガラクト ール及びアラビノールを含めた天然の糖の潰合物を放出する。これらの糖を任意 の他の単一の価値ある生産物のエタノールに迅速かつ効率的に代謝できるとんな 一つの生物も天然に見出されていない。
Z、モビリス中のアルコールデヒドロゲナーゼ11及びビルヘートデカルボキン ラ〜ゼに対しコートしている遺伝子は、大腸菌中て別個にりC−ン化され、特性 が調べられ、そして表現されている(ブロワ、6.及びH,シャーム[1986 ]Arch、Microblol 、146:+05−110ニブロウ、B、及 びI。
シャーム[+ 986コArrh、Microhiol、+44:296−30 1:コンウニ(、T、、Y、A、t スマン、、1.1.コf ン、E、M、ホ フマン及びり、0゜イングラム[1987]J、Bacteriol、+69: 949−954:コンウェイ。
T、G、W、スウ、 ル、v、z、オスマン及びL 、 O、イングラム[:1 9B?]J、Bacteriol 、169:259+−2597+ネール、A 、D、、R,に、スコープ。
R,E、H,ウニラテンホール及びN、J、ホーゲンラドC1987]Nucl eic Ac1d、Res、+5:+753−1761:イングラムし、0.及 びT、コンウェイ[1988]App1.Environ、Microbiol 、54:397−404:イングラム、L、O,、T、コンウェイ、D、P、ク ラーク、G、W、スウェル及びJ、F、ブレストン[1987]Appl 、E nviron、Microbiol、53:24ブロー及びシャーム(ブロー、 8.及びH,シャーム[: 1986]Arch、Microbiol、 +4 4:296−301)は、エタノール生産がZ。
モビリスのピルベートデカルボキシラーゼのオバーエクスプレッション(過剰表 現)によって絡替え大llI菌中て増加てきたことを最初に実証したが、非常に 少ないエタノール濃度しかできなかった。トラン及びフィンのその後の研究は二 つの他の腸内Il菌を使用することにより(エルウィニア クリサンセミ(εr wir+ia chrysan the+si)、)ラン、j、s、及びR1に 、フィン[1987コApp1.Environ、Microbi。
1.53:2033−2038:クレブシェラ ブランティコラ(に1ebsi ella planticola) )ラン、 、1 、 S 、及びR,に、 フィン[1987]AI]111.Envlron、Microb+ol 、5 3:2039−2044)この研究を広げ、そしてヘキソース、ペントース及び 糖7π合物からより高いエタノール水準を+!成している。本発明は効率的なエ タノール生産系に対しコードしている新規なオペロンの製造および表現に関する ものであるa新規なオペロンは、形質転換微生物が、有用な量でエタノールをI !造することができるようにするために、微生物を形質転換するのに使用できる 。本発明者は、共通した制御系のもとて異なる生物からの遺伝子を異なる制御系 のもとて一つのオペロンにうまく絹合せろことを開示している先行技術をここに 記載された本発明は、エタノール発生経路のアルコールデヒドロゲナーゼ11及 びピルベートデカルボキシラーゼ活性の両方を含んでいるエタノール生産に対す る独特の可能性のあるオペロンの構築に間するものである。この独特のオペロン は、petオペロンと命名されるが、エタノール生産に必要とされる二つの遺伝 子を含有している。この系は好ス的及び嫌気的な条件の両方のもとで、生育の間 にビルJ\−トをエタノールに効率的に転換することができる。
またここにはエタノール生産オペロンを含有する大腸菌の新規な菌株も記載され る。これらのfill替え菌株は、糖を含有する平板培地上で大量のコロニーを 形成する有益なそして警くべき特徴を示す、またこれらのNIIvえ菌株は、バ ッチ培養基中で7倍より高い纏@密度に生育する。従ってここに述べられろ発明 は、とんな部品にせよ生成物を造る組替え微生物の生育及び収率を増加させるの に使用することができる。
区画の簡単な記載 ′!s1図はズイモモナスモビリスからのピルベートデカルボキシラーゼ及びア ルコールデヒドロゲナーゼ11をコートする遺伝子を含有しているpt、o l  295を製造する略図を示し、 襖2図はズイモモナスモビリスからのピルベートデカルボキシラーゼ及びアルコ ールデヒドロゲナーゼ11をコードする遺伝子を含有する幾つかのプラスミドを 示す略図であり、 第3図は菌株TC4及びエタノール発生酵素をコードしているプラスミドを含有 している絹替え菌の生育を示しており、 第41!lは組替え菌中に於けるビルヘートデカルボキンラーゼ活性と生育の程 度の間の間係を示す。
本発明の詳細な記載 ある種の細菌及び他の単純な生物はヘキソース、ペントース及びラクトースを含 めた多種多用の基質を盛んに代謝することができる。このことは大%I m t )i 絹替えDNAの製造面として、魅力的な宿主である理由である。ここに記 載される本発明は、木材及び食べられない植物の部分の主要部を占めるヘミセル ロース(キシロース、アラビノース等)及びホエイ(乳糖)等の、利用が充分て ないバイオマス源、ならびに他のバイオマス源からエタノールをIl造する単純 な生物の磁替え菌株の使用を可能にする。また、複雑な重合体の分解のための細 胞外酵素などの特別な能力を有する生物は、本発明を用いてエタノール生産者に 転換できる。
ここに記載した新規な発明は、多くの異なる宿主に間違して使用することができ る。例えば、大vAMに加えて、腸内細菌、例えば、エルウィニア クリサンセ ミ(Er讐1nIa chrysanthemi)及びクレブシェラ ブランテ ィコラ(K Iebsiella planticola)はペントース及びラ クトースを含めた広範囲な糖の利用を可能にするので、特に魅力的な宿主である 。追加的な可能性のある宿主には、他の細菌、酵母、真菌1および真核細胞が含 まれる。適当な表現系が間違する特定の宿主に対し使用される。適当な表現系を 確認することは、この分野で訓練を受けた科学技術者の技能の範囲内である。
本明細書に記載されるのは、エタノールを製造するように細胞をしむける新規な オペロンである。このオペロンは、petオペロンと命名されている。petオ ペロンは適当な制御配列と一緒にアルコールデヒドロゲナーゼ11及びピルベー トデカルボキシラーゼに対しコードしているZ、モビリス遺伝子からなる。制御 配列は、プロモーター、インデューサー、オペレーター、リポソーム結合位置、 ターミネーダー役び/又は他の制御配列からなりつる。以前の組替え系における エタノールa造は宿主生物の元来の活性に依存し・でいた。有益なことに、p  e t、オペロンを形成するためのアルコールデヒドロゲナーゼ11及びピルベ ートデカルボキシラーゼをコートしているZ。
モビリス遺伝子を組合せることによって、宿主のアルコールデヒドロゲナーゼ活 性に依存することが取除かれた。
本明細書に記載される材料及び方法を使用して、好気的、嫌気的条件下でpet オペロンを含有している組替え菌中てV意義な量のエタノールが製造出来る。
前記の議論から、本明細書に開示した概念、すなわち代rl1M路に対しコード している遺伝子を単一のオペロンと組合せることは極めて新規、かつ有用な方法 であることが当業者には明白となるはずである。有用なオペロンを造り出すため に異なる遺伝子座からの遺伝子が組合される種々の状況に、この概念を2用する ことは、本発明の一部をなすものとみなされろ。petオペロンの創造は、この 新規な発明性の単に一つの例である。従って、ここに記載の原理を用いて、アル コールデヒドロゲナーゼ活性に対するコートを有ずろ種々の生物からの遺伝子は 、所望の経路をコートするオペロンを造り出すために、ビルベートデヒトロゲナ ーゼ活性に対しコードする他の遺伝子と組合せることができる。他の経路に対し コードしているオペロンも造り出す事が出来る。当業者には、不明**に記載し たエタノール生産者 ルデヒドロゲナーゼに対しコードする遺伝子及びビルベートデヒトロゲナーセ活 性に対しコートする遺伝子が共通の制御下にある必要がないことが明らかである はずである。これらは、別個の制御下にあり得、そして異なるプラスミド中のも のであるか、または異なる遺伝子上に置かれることができる。
好気的な条件下では、大vaNの中て解糖からのビルヘートは、単にピルベート デヒドロケナーゼ複合体及びラクテートデヒドロゲナーゼによって主として代謝 され、(ゴットシャーク、G、[:1986]Bacterial metab oliss+、pp、210−2805pringer−Verlag(λブリ ングーヴエルラーグ)、ニューヨーク)そして過剰のアセチルCo A (Ac etyl coenzy+se A)がアセテートに転換される。これらの二つ の酵素に対する見掛けのに4はそれぞれ0.4+tび7.2n+Mである。
Z、モビリスのピルベートデカルボキシラーゼに対する見掛けのに一1二つの大 HMの酵素のものに等しいか(ビルベートデヒトロゲナーゼ)又はより小さい( ラクテートデヒドロゲナーゼ)のでアルデヒドの生産を促進する。好気的な条件 下でのNADH“の再生は、主として生合成から、及び(電子伝達系に結合され ている)NADHオキシダーセから見掛けのK 、50μ門て生しる。Z、モビ リスのアルコールデヒドロゲナーゼ1jに対する見掛けのに、は、大囁菌NAD “オキシダーセに対するものよりも、4倍以上低く、Z、モビリス酵素が有効に アセトアルデヒドのエタノールへの還元に対するNADHの内部的のプールと競 走することを可能とする。従って、Z。
モビ1ノスのエタノール発生#Wの性質及びそれらの比較的高い表現水準は、好 χ的な条件下で炭素の流れをエタノールに転換するのに良く適している。
大lII菌の中の嫌気的な条件下で、解糖がら生じるピルベートは主としてラク テートデヒドロゲナーゼ及びビル・\−トホルメートリアーゼによって代謝され る。これらの二つの@素に対する見掛けのに、Ilは、それぞれZ、モビリスの ビルヘートデカルボキンラーゼに対するものよりも18倍及び5@高い。同様に 大ll1l!菌におけるNADゝ再主において関与する主要な酵素に対する見掛 けのにカもZ、モビリスのアルコールデヒドロゲナーゼ11に対するものよりも かなり高い。このようにZ、モビリスからのエタノール発生酵素は、大腸菌の正 常な発酵酵素に対して、炭素(ピルベート)に対し、及び還元の能力(NADH )について、きわめて競走的であり、解糖の生産物をエタノールに効果的に切換 えることを可能とする。
petオペロンとして命名される二つのエタノール発生酵素をコートしている遺 伝子は、高水準で表現され、そして嫌気的な生育の間にピルベートからの炭素の 流れ、及びNADHの酸化を支配する。これらの条件下で、とルベートの炭素骨 格の流れは、大腸菌における主要な発酵生産物としては、有軸酸の製造からエタ ノールの生産に転換される。
槍の代謝からの有機酸の蓄積は、一般に嫌気的な生育の閏の発酵の結果としてみ なされる。しかし、アセテートのかなりの量が好気的な条件下の急激な攪拌の間 でさえも大腸菌TC4の親菌株によって製造される。菌株TC4によるアセテー トの製造は、生育の初期段階から累進的であり、寝111a度が高いときに後の 段階に限られるものではない。燐酸塩緩衝液を補充した培地における増加した最 終菌体密度によって実証されるように、このゲルコールからの酸の製造は、好気 的な条件下でさえも、ブロスにおける生育及び固体培地に於ける生育を制限する 働きをする。
宿主生物のエタノール発酵への転換は、宿主の表現系を用いて種々の組替え生成 物の生産を強めるのに使用できる。これらの生成物に於ける機能の維持は、濃厚 な培養基中ての生育の間のブロスのpHと関連している。菌体蛋白質の単位あた りのこの酸性化の程度は、有機酸よりもエタノールの!!道によって最小となる 。tlIgの移動はしばしば微生物の濃厚な培養基での生育の間、主要な限定要 因であり、酸の生産を生じそして生育培地のpHのドリフトを生しるのはこの制 限である。petオペロンを表現している組替え菌においてZ、モとリスのエタ ノール発生酵素は、解糖からのピルベートの一部を7セトアルデヒドに転換し、 N4へDHを再酸化し、エタノール、即ち代謝に少ないダメージしか与えない生 成物を生しる。
酸化的燗1ヒに対する機能できる呼吸の連鎖、およびエタノール生産酵素、の両 方を含有している菌株は、NAD″″の再生の間の両方の系の作用及び酸性の廃 棄物の減少のために、より高い菌体密度にさえも生育てきる。この様な固有の柔 軟性は、より小さい厳格なプロセスの制御要求並びに組替え生産物の増(支)し た収率を生じる。
特定して言えば本発明はさらに、ラクトース及びセルロースとへミセルロール中 に存在する全ての主要な糖(グルコース、キンコース、アラビノース、ガラクト ース、及びマンノース)がズイモモナス モビリスからのエタノール経路に対す る酵素をコードしているプラスミドにある遺伝子を含有している胡替え大腸菌に よってエタノールに転換できたことに間する。環境的な許容度、プラスミドの安 定性、Z、モビリスビルベートデカルボキシラーゼの表現、基質範囲、及びエタ ノール生産(グルコース、ラクトース及びキシa−ス)は、大II菌の8つの菌 株の閑で比較された。これらの8つの菌株から大III jI ATCC963 7(pi、I)1297)、ATCC11303(pLO1297)及UATC CI5244(pL01297)が環境的な耐久性及びエタノール生産に基つい てさらに、開発するために選択された。バッチ培養基中の時間当りのエタノール 生電性容量は、グルコース(12工)に対し、およそ1.4gエタノール/l、 ラクトース(12m)ニ対し、、 1.3g/l、ソシテキ’iロース(8%) ニ対し、0.64g/jであることが分った。Wf間当りのエタノール生産性は 、12%のグルコースて菌体乾燥重量g当り2.1gエタノールから8%キシロ ースで、菌体乾燥重量g当り1.3gのエタノールの範囲である。キシロースg 当りのエタノール収率は、グルコースに於いてサツ力ロミセスセルビシアエにつ いて一般的に報告されているよりも、組替え大腸菌がより高かった。グルコース (12り、ラクトース(121)、及びキシロース(8t)は、それぞれ7.2 zエタノール(容t)、6.5χエタノール、及び5.2zエタノールに転換さ れた。
基質の範囲及び環境的な耐久性(W許容度、塩許容度、エタノール許容度、低p Hに対する許容度及び熱許容度)を含めた種々の要因がエタノール生産に適した 大mW菌株を選択するのに考唯される必要がある。ここに記敏されるように、菌 株ATCC9637(ワックスマン菌株W)は、環境的な耐久性の点て優れな特 性を示しなか、グルコースからのエタノール生産は他の菌株よりも低かった。菌 株ATCC9637は主としてシュークロースを利用する独特の能力のために選 択された。有益なことに、このATCC9637の特性は、甜菜糖、砂糖きび糖 、及び他のシュークロースを有する試料の発酵にこの菌株を有用なものとしてい る。pLO1297を含有しているATCC11303(、ルリア菌株B)及び ATCC15244(ケベス菌株M L 300)は高水準のエタノールを生し 、許される水準の環境的耐久性を示した。
プラスミドはこれらの二つの構築物中で非常に安定であり、これらはエタノール 生産のそれ以後の開発に最良の候補者として選択された。これらの両方の構築物 は、効率的なエタノール生産に必要とするZ7モビリスビルヘートデカルポキシ ラーセの高水準を表現した(イングラム等[1987]App1.Enviro n、Microbiol、53.上記)。
Mssバイオマスの全ての主要な糖成分は、Z、モビリスからのエタノール経路 を含有している線替え大腸菌によって、エタノールに転換された。グルコース及 びキシロースのエタノールへの転換効率は、S、セレビシアエについて以前に報 告されたものを越えており(ロビットR。
W、、B、H,キン、G、−j、ジエン、及びJ、G、ゼイカス[1988コC RCCrit、Rev、biotechnol、7:107186)、そしてペ ントース発酵酵母系について以前に報告されたものを越えていた(へ゛ツクM、 J 、[: 1989 IB 1otechnol 、B i oeng i  n 、Symp 、 17 :617−627:ジエレリスT、W、、及びHl に、スリーナス[+988コBiotechnol、Bioeng、31:50 2−506:スクーグに、及びB、ハーノーハゲルダルj:1988コEnzy me Microbiol、Technol、IO:66−79ニスリンガ−P 、J、、R,J、ボサスト、M、R,オコス及び吋、R,ラディッシュ[198 5]Biotechno1.Lett、7:431−436)、キシロースはS 、セルビシアエによってグルコースが転換されるよりもより高い効率で組替え大 PIA薗によってエタノールに転換された(Lovitt et、 al、上記 )。キシロースでの異密に高いエタノール収率(論率の100羞を越える)は1 19tな栄養物の分解に由来するエタノールを含むかもしれない。多くのアミノ 酸及び11雑な培地の成分は、ビルへ一トに転換される解糖中間体に分解される 。このビルへ一トは次にエタノールに転換されつる。
この研究は、商業的なエタノール製造に対し、組替え菌が開発てきることを実証 し、微生物からの新規な生成物の未来における開発のための代謝の流れにおける 劇的な変化の可能性を説明する。さらに嫌気的な条件下で親生物が行なうよりも 、より高い菌体密度にpetオペロンを含有する菌株がグルコースで生育し、そ して酸の生産と関連する複雑化を減少する一方で、微生物における絹替え生産物 の11造の増加の可能性を提供している。
材料と方法 生物及び生育条件 大111[Tc4(コンウェイ、T、、Y。
A、オスマン、J、1.コナン、E、M、ホフマン、及びし、0.イングラム[ 1987]rズイモモナスモビリス ビルヘートデカルボキシラーゼのプロモー ターとヌクレオチド配列J J、Bacteriol、169:949−954 )及びプラスミド含有誘導体をこの実験で使用した。ビルヘートデカルポキシラ ーゼ遺伝子(、pL OI 276)及びアルコールデヒドロゲナーゼB遺伝子 (p L OI 284)を含有するプラスミドは以前に記載した(コンウェイ 及びオスマン 等口987]、上記の「・・・のプロモーターとヌクレオチド配 列」コンウニ(、T、、G。
讐、スウェル、’/、A、オスマン及びし、0.イングラム[1987]rズイ モモナスモビリスからのアルコールデヒドロゲナーゼ11遺伝子のクローニング と配列決定J 、1.8acterio1.169:259 +−2597)。
菌株及び生育条件 ブラスミFpUC18及びp U C19くヤニッシューベ ロン、C,j、ヴイエイラ及び、1.メツシンプロ985]r改良されたM+3 ファージクローニングヘクター及び宿主菌株: M +3wp18及びp U  C19ベクターのヌクレオチド配列J Gene33:103−119)、pL OI204(コンウェイ、T、、M、O,−に、バインクー及びし、0.イング ラム[1987]「ズイモモナスモビリス用の表現ベクターJ Apl、Enν 1ron、Microbiol、53:235−241)、及びp L Or  295 (イングラム等[1987]、上記)は以前に記載されている。pLO ■292、pLo I291. pLo 1297、p L OI 308、p Lo + 308−2、p L O+ 308−5及びp L OI 308− 10の構築及び性質は以下に記載される。
培養基を37℃で50gのグルコースをリットル当り含有しているシリアブロス 中で生育させ(ルリア、S、E、及び門。
デルプルツク[19841rウイルス抵抗性に対するウィルス感受性からの11 Mの突然変異化J Genetics 28:491−511)。
酵素分析用の菌体及び発酵研究用の接種菌は、31のブロスを含有している試験 管(+3X 100m11)中で37℃で試験管回転器(チューブローチーター )中で生育させた。
−夜培養基を新たな培地中に100倍に希釈した。好気的な培養基(250ml フラスコ中の501のブロス〉を往復する水浴中で[盪させた(分当り120回 の揺動)。嫌気的な培養基は、37℃のインキュベーター中て簀回攪拌(、15 0rpm)をさせながら、栓をした血清ビン(13(1mlのビン中の100m 1のブロス)中で生育させた。嫌気的な培養基は25ゲイジの針で排気口を設け 、ガス上の発酵生産物が逃げられるようにした。
生育はスペクトロニラクツ0分光光度計により(ボウシュ アンド ローム イ ンコーホレイテッド、ニューヨーク州ロチェスター) 550nmでモニターし た。使い捨て可能な培養基試験管(IOX 75m階)をキュベツトとして使用 した。我々の条件下での一つの吸光度単位は1当りおよそ0.25Bの菌体蛋白 質を含有していた。生育はAs2゜で瀾定し、1.0吸光度単位は1当りの0. 25Bの合計菌体蛋白質に等しい。
プラスミドp L O+ 308−10を含有する大mi宿主を1989年5月 15日にアメリカ合衆国メリーランド州208520ツクウィル バークロウノ ドライプ12301のアメリカンタイプカルチャーコレクション(ATCC)に 寄託した。培養基には、寄託機関によって次の寄託番号が付与された。
培養基 寄託番号 寄託日 大腸菌pLo13os−10ATCC679831989年5月15日この培養 基は、特許商標庁長官によって37CF R1,14及び35U S CI22 のもとて権限があると決定されたものに特許出願が継続している間、培養基を入 手可能にすることを保証するという条件下で寄託されている。W託物は、この出 願の対応物が出醸されている国の外国特許法によって、要求に従って入手可能で ある。しかしながら寄託物を入手可能であることは、行政行為によって付与され た特許file浸害1ノでこの特許を実施する実施権を構成するものではないこ とが理解されるべきである。
ざらにこの培養基寄託物は、微生物の寄託に対するブタベスト条約の条項に従っ て、保存され、かつ一般に入手可能とされるであろう。すなわち寄託物は、これ が生きたままモして、汚染されずに最も最近の寄託試料の提供の要求がされたの ち、少なくとも5年間のKF4 M、そしてとんな場合にも寄託の日ののち少な くとも30年荀の期間、又は培養基を開示している発酵されるとんな特許の権利 行使可能な期間(呆たれるように、必要なあらゆる注意を払って(呆存される。
寄託者は、寄託所が寄託菌の状態のために、要求された時に試料を提供すること が出来ないことがある場合には、寄託物を置き換える義務があることを認める。
全ての培養基寄託物の一般への入手可能性に対する全ての制限は、開示している 特許が付与されると永久に除かれる。
遺伝技術 杉質転換、プラスミド構築、DNA消fヒ、及び分析は前に記載の通 り実施された。!替え菌は2gのグルコース及び適当な抗生物質を含有している 固体培地(1,5$寒天〉上で選択された。Z、モビリスからの機能的にエタノ ール発生する遺伝子を含有している絹替え菌は、グルコースを含有しているルリ ア寒天平板培地上で、大きさが大きすぎるコロニーとしてのそれらの生育によっ て同定され、そしてグルコースを欠いているルリア寒天平板培地上での生育が悪 いこと及びアルデヒド指示薬培地上でのアルコールデヒドロゲナーゼの表現によ って確認された。
酵素検定 菌体を破壊し、加熱不活性化し、そして前に記載されたようにピルベ ートデカルボキシラーゼ活性(!ll!l安定)に対し検定した。(コンウヱイ 及びオスマン等[1987]上記「・・・プロモーター及びヌクレオチド配列」 >、8体を調製し、そして前に記載したようにエタノール酸化の方向でのアルコ ールデヒドロゲナーゼ11活性について検定したが、ただしニール等によって記 載されるように、新たに固体の硫酸アンモニウム第一鉄(j!終濃度0.51I M)及びアスコルビン酸ナトリウム(lo+wM)が加えられている30mM燐 酸カリウム緩衝液中で菌体をfc浄し、破壊したに−ル、A、[1,JJ、スク ープ、)0M、ケリー及びR2E、H,ウラテンホール[:1986]rズイモ モナスモビリスの二つのアルコールデヒドロゲナーゼ、ディフ7デンンヤル染料 す−ガントクロマトグラフィによる精製、分子特性決定および整理的役割J E ur、J、Biochem、+54:119−124)。
貯蔵なしのアルコールデヒドロゲナーゼ活性の即時検定と共に、この條飾は前に 報告されたものよりも、ずっと高い特異的活性を生した。蛋白質をフォリン(F olin)フェノール試薬で測定した(ローリ−1θ、 H、、N 、 、1  、ローズボコー、A、L、ファール及びR、j 、ラントール[1951:Ir フォリンフェノール試薬での蛋白if +11定」j、Biol、イ:hem、  193:265−発酵生産物の分析 発酵生産物は、屈折率モニター及び電子 インチグレーターを鴫えているミリボア/ウォータース高性能液体クロマトグラ フィー(ミリボアコーホ1ノージヨン マサチュウセッツ州へットフート)で、 透明なブロス中で測定した。分離は流速0.25m1/分(100μm注入容量 )の流速で65℃で、カリフォルニア州すッチモントのバイオラットラボラトリ −から購入したアミネックスHPX−87Hカラム(300X 7.8+*m) 土で実施した。ピークは本物の標準を用いて同定した。グルコースより前に溶I Hする二つのピーク及び45.4〜45.8分で溶離する後の未知のピークは接 種していない培地の成分であ以下は本発明を実施するための最良の杉態を含めた 手順を説明する実施例である。これらの実施例は限定的に解釈されるべきてはな い。他に示されていなければ、全てのパーセントは重量により、全ての溶媒混合 物割合は容量による。
実施f9111 菌株の構築 ビルヘートデカルポキシラーゼとアルコールデヒドロゲナーゼ11に対しコート する構造遺伝子の大きさはそれぞれ1.7F!?、ひ1.1キロへ−スであり、 これらの遺伝子は分子量60,000及び40.100の蛋白質に対しコードし ている。
これらの遺伝子はそれぞれlacプロモーターの制御下でp U C18の誘導 菌上に位置している。(第1図)。二つの遺伝子はpLO+284(アルコール デヒドロゲナーゼ)からの制限エンドヌクレアーゼEcoRI及び5ailによ って生したプロモーターなしの1.4キロヘースの断片をp L 01276の とルヘートデカルボキシラーゼ遺伝子から下流のBarn H位置に挿入するこ とによって結合された。これらのクローンはアシビシリシに対する抵抗性に対し 、そしてアルデヒドの生産を検出する新たに開発されたパラロブニリン−エタノ ール指示薬プレート上のアルコールデヒドロゲナーゼ活性の存在及び表現に対し 選択された。示された構築物を含有しているクローンpL 01295は添加さ れたグルコースの非存在下で、ルリア寒天プレート(好気性)の表面でうまく生 育しなかったが、2%グルコースを含有している寒天平板培地上でプラスミドの ないM株及びpL OI 276又はp L OI 284を含有する菌株より もずっと高い密度に生育した。
petオペロンを含有している絹替え菌は、グルコースを含有しているルリア寒 天平板培地(好気性)上でずつと大きな、より不透明なコロニーとして容易に検 出された。このコロニーの大きざの違い及び透明性の違いはアルコールデヒドロ ゲナーゼとピルベートデカルボキシラーゼの遺伝子の両方を表現するプラスミド を含有している絹替え菌の同定に対し、有用な目印であることが証明された。
p L Ol 295の完全な塩基配列は知られている。ピルベートデカルボキ シラーゼに対しコードする遺伝子の転写解読枠は、Iacプロモーターから下流 163塩基であり、アルコールデヒドロゲナーゼ11に対してコードしている遺 伝子の転写解読枠から上流の85塩基の二つのストップコドンで終っている。両 方の遺伝子が各転写解読枠からすぐ上流にリポソーム結合位置と類似している配 列を含んでいる。アルコールデヒドロゲナーゼ11に対しコードする遺伝子は、 単一のストップコドンに続いて転写ターミネータ−としての役目をする13個の 塩基対のパリンドローム配列を含んでいる。
実施例2 大勝菌中のZ、モビリス遺伝子の表現ピルベートデカルボキシラーゼ 及びアルコールデヒトコゲナーセI]遺伝子の両方ともが、単独で(p L O I 276及びpL OI 284のそれぞれ)及び−緒にlacプロモーター の制御下で大腸菌中て高水準に表現された。ピルベートデカルボキシラーゼは野 性型の大HM中には存在しないが、低い1度で誘導可能なアルコールデヒドロゲ ナーゼが存在する。グルコースの存在下での大111菌の生育の間2.モヒリス 酵素の特異的な活性はおよそ50%だけ下がり、このことはlacプロモーター のグルコースによるリブレッンヨン(抑制)と一致している。petオペロン申 の近い方の遺伝子(proximal gene)によりコートされるピルベー トデカルボキシラーゼの特異的な活性は、p L O[276におけるよりもp LOI295において3倍高い。アルコールデヒドロゲナーゼ11遺伝子、即ち 茜tオペロンに於ける遠い方の遺伝子の生成物の特異的な活性は、p L OI  295ではp L O+ 284における水準の2倍表現された。
実施例3 MWえ菌株によるグルコースの発酵大腸菌に於けるpetオペロンの 表現は、嫌気性の生育の間主要な発酵生産物として、エタノールの生壷を生じた 。親菌株は主要な発酵生産物としてサクシネートク1゜5+wM) 、ラクテー ト(1811M)及びアセテート(71M)を生した(第3A図)。同し発酵プ ロフィールがアルコールデヒドロゲナーゼ11遺伝子を持っているp L OI  284を含有する菌体中で観測されたく第3C図〉。ピルベートデカルボキシ ラーゼに対しコートする遺伝子を持っているp L○■276の場合は、エタノ ールのピークが明らかてあり(18mM)、蓄積した発酵生産物の3分の1に等 しい。このより高いエタノール水準は、Z、モビリスからのピルベートデカルボ キシラーゼ及び元来の大i11菌アルコールデヒトロケナーセの組合された活性 から生しるものである。petオペロンを含有するp L OI 295の場合 (Z、モビリスからのピルベートデカルボキシラーゼ及びアルコールデヒドロゲ ナーゼ11遺伝子の両方)、大腸菌は多量のエタノールを生産しく 750+1 M、4.3%容量/容量)、これは発酵生産物の95%を越えるのちを表してい る。
petオペロンを含有している菌体中で、製造されたアルコールデヒドロゲナー ゼ及びピルベートデカルボキシラーゼの高水準は、大腸菌のNへDH酸化を支配 した。
従ってこの生物の発酵は、S、セレビシアエ及びZ、モビリスの発酵と同等のも のに転換された。正常な発酵的生育の閑、ピルベートはピルベートデカルボキシ ラーゼ複合体によってアセチルコエンザイムに、ホスホエノールビルヘートカル ボキシラーゼによってオキザロアセテート(及びサクシネート)に、ビリベート ホルメートリアーゼによってホルメートとアセチルコエンザイムにそして、ラク テートデヒドロゲナーゼによってラクテートに転換される。この最後の経路は、 修飾されていない大腸菌菌株中のN、へD“の再生のための優勢な経路である。
しかじなが仁細菌のラクテートデヒドロゲナーゼに対するに1はきわめて高く、 lO〜1.000mMの範囲である(ガルビ、E、1.[:+9801「細菌ラ クテートデヒドロゲナーゼ」Microbllo、Rev、44:+06−13 9:ターミー、E、M、及び^、0.カブラン[1968]r大lII薗BD− ラクテートデヒドロゲナーゼの反応速度論及び立体配位に於けるピルベート制御 の変化に対する証拠(,1,8io1. CheQl、243: 2587−2 596)、 Z 、モビリスからのピルベートデカルボキシラーゼのに+wは0 .4mMである(ブリンガーーマイヤー等、S、に、−L、シムス及びH,ジャ ム[1986] rズイモモナス モビリスからのピルベートデカルボキシラー ゼ、単離及び部分的な特性決定」Arch、 Microbiol、 146:  105−110) 、この酵素が豊富にあることと、より低いKIwであるこ とが組合わされて効果的に解糖からのピルベートの流れをエタノールに転換する 。
ガス交換が制限されていない培養容器を橿やかに攪拌しながら混合生育する条件 の間に、高い菌体密度が達成される。これらの条件下で最終pH6,3以上が観 測されるが、これは通気の程度に依存する。
実彬例4 プラスミドの構築及び大腸菌中でのZ、モビリスエタノール発生酵素 の表現 ブラスミN’pLOT295は、Iacプロモーター制御下にありピルベートデ カルボキシラーゼ及びアルコールデヒドロゲナーゼ11をコートしているZ、モ ビリス遺伝子を含有している。この構造物はpetオペロンと呼ばれ、別のプロ モーターを有する追加的なプラスミドの構築のためのエタノール発生遺伝子様と して使用される。エタノール発生遺伝子を含有するp L OI 295からの EcoRl−3ail断片をDNAポリメラーゼのフレノウ断片で処理し、プラ ント末端を遺った。このプラント末端のDNA断片をlacプロモーターからす ぐ下流に、pdC遺伝子を有しているpUc+9のSma1位置に挿入した。生 しるプラスミドはpLO1293と呼ばれ、これはBamH1位置によってフラ ンクされているpet遺伝子を含有していた。プラスミドpLOI291及びp LOr292(逆の方向性)はエタノール発生#索をコートしている遺伝子を含 有するBamH[断片を表現・\クターpLOr294に挿入することによって 構築した。BamHI断片はリポソーム結合位置、両方の遺伝子に対する完全な 配列、及びadhBに遠い方のステム・ループターミネータ−(stem−1o op terminator)を含んでいる。pLO+292に於いて、二つの 遺伝子は元々の表現ベクター中に含有されるZ、モビリスプロモーターの制御下 で表現される。
プラスミドp L OI 308はlacプロモーターの制御からρet遺伝子 を除去するが、別のプロモーターの挿入の為の上流のBamH1位置を保持する ように構築された。
BamHIでのp L Ol 293の部分消化及びフレノウ処理をa d l IB +!伝子に対し遠い方のB a m H1位置を除去するのに使用した。
エタノール発生遺伝子は、プロモーターのないBamHT(pdcに対しすぐ隣 )−EcoRI (adhBに対し遠い)断片としてこのプラスミドから除かれ pLO[308を造る為に、p[JcI8のB amHI及びEcoR1位菫に 方向的に挿入された。このプラスミドはアルデヒド指示薬プレート上でadhB の低い水準を表現したが、他の機能的なpetブラスミF’ p L 0f29 5、p L O+ 291及U p L OI 292と関連シタ大コロニーの 表現型を示さなかった。
Z、モビリスからの染色体DNAは、殆どのDNAが4キロヘースの長さ未満に 見えるように、S a u 3Aで部分的に消化した。この分画していないDN Aをプロモーター断片の源として使用し、そしてp L OI 308の脱ホス ホリル化したBamH1位置に連結した。よく表現されたpetオペロンを有す るアンピシリン抵抗性の纏み替え菌はグルコースを含有するルリア寒大平板培養 基上で、大コロニーとして同定された。鞘み替え菌株の三つ、即ちp L O1 308−2、p L OI 308−5及びp L OI 308−10を試験 用に選択した。これらのプラスミド中のプロモーター活性を有するZ、モビリス DNA断片はそれぞれ、6.2、及び2キロヘースの長さであった。
表1は組み替え大1lII!rの一夜培養基中のピルベートデカルボキシラーゼ とアルコールデヒドロゲナーゼの活性をまとめている。ピルベートデカルボキシ ラーゼの活性の範囲は菌株T C4(p L OI 291)の菌体蛋白mgあ たり0.371UからTe3(pL01295)中の8.231Uの範囲である 。ヒルヘートデカルポキシラーセ活性についていえは、Te3の組み替え菌株は 以下の順序でありうる(最高から最低へ) : pLo 1295>pLo + 308−10>pLo 1308−2> p L O130B−5> p L  O+ 292> p L OI 291゜表1 大關菌中てのZ、モビリスから のエタノール発生酵素の表現 pLO12910,370,40,210,02pL+)1292 0.48  0.5 0.30 0.03pLOI308−2 2.26 2.3 +、54  0.21pLO1308−511] 1.1 0.76 0.10pLO13 0Fl−106,56,52,510,348合計薗体蛋白質mgあたりの分あ たり利用された基質のミクロモルとして表示。
b純粋な酵素に対し特異的活性+00を仮定して計算。
0元来のアルコールデヒドロゲナーゼ活性を引いた後の純粋な酵素に対し特異的 な活性?10を仮定して計算。
組み替え菌株中のアルコールデヒドロゲナーゼ活性はピルベートデカルボキシラ ーゼがそうであるように、異なるプラスミドからの表現の意味に於いて同し傾向 に従っている。測定されたアルコールデヒドロゲナーゼ活性は、大lII画元来 の酵素及びZ、モビリス酵素からのの組合わせを表わしている。プラスミドを欠 いている菌株TC4て観潮された水準は、Z、モビリス遺伝子を有するプラスミ ドを有している菌株で測定されたものと比較して相対的に小さい。Z、モビリス 酵素の活性〈元来の大腸菌アルコールデヒドロゲナーゼに対1./補正されてい る)は菌株TC4(+)LOI291)からの菌体蛋白質mgあたり0.131 LIからT C4(p L OI 295)中の9.61υの範囲てあ実施例5  Z、モビリスからのエタノール発生酵素を含有している絹み替え菌株の生育 グルコースの分解からエタノールの生産へのシフトも・生育の収率及び生育培地 のpHドリフトに影響する。醗酵生産物は比較的無毒であるが、これらは蓄積し て毒性水準になり得る。IOXグルコースを含有するルリアブロスを含有するビ ン中での嫌ス的な生育の間に、プラスミドを含有しない菌株及びpLOI284 を有している菌株(アルコールデヒドロゲナーゼ11に対しコートする遺伝子を 有している)は48時荀後渭1あたり0,25聯gの菌体蛋白質の最終密度を達 成し、最終pnは41.4であった6pLO■276を有している菌株(ピルベ ートデカルボキシラーゼに対しコードする遺伝子を含有する)中で菌体密度は二 倍増加し、最終pH4,5であった。 p L 01295(petオペロン) を有する菌株の最終菌体密度は2 、5B/s lであり、対照菌株よりも10 倍高かった。最終p)lは4.7であった。1あたり画体蛋白質2.5mgの密 度では、マグネシウムが臨界的であるようであり、0゜511M硫酸マグネシウ ムの添加によって更に1.5倍菌体密度の増加が容易に達成された。
組み替え菌株の生育を好気的及び嫌気的条件の両方で試験したく第3図)。好気 的条件下ぐ第3A図及び表2)では、2株TC4は最も急速な成長期の間におよ そ30分の発生時間で生育したepLO1308の誘導体を有している菌株TC 4は匹敵する最大生育速度を示し、発生時間426分と30分の間テアッた。菌 株TC4(p L O1295)はこれらの条件下でうまく生育せず(発生時間 71分)そして部分的な溶菌を伴った6菌株T C4(l L OI 291) 及びT C4(1) L O+ 292>は中間的な速度で生育し、各々発生時 間46分であった。
表2 好気的及び嫌気的生育の間に於ける最大発生時間、最終菌体密度、及びプ ロスの最終pH 薗菌体度均 発生時 生育条件 プラスミド (f臼lIIg/m1)tffi(分) 最終pj4a 好気的 なし 0.7 29 4.4 pLO12910,7465,3 pLO12921,3465,1 pLO+295 1.1 71 5.7pLOI308−2 l 、7 27  5.5pLO1308−50,8305,0 pLO1308−102,5265,0嫌気的 なし 0.3 32 4.4 pLO12910,4404,5 pし旧292 1.0 48 5.0 pLO12952,1394,7 pLO1308−20,8425,7 1]LO1308−50,4384,9pLO1308−1o 2.2 41  5.20生!24時閘後に瀾定。
好気的条件下(第3B図及び表2)では、プラスミドを欠いている菌株TC4に 対する発生時間は32分てあり、エタノール発生酵素を含有する組み替え菌株に 対するものよりもかなり短い。全ての絹み替え菌は類似の生育最大速度を示し、 発生時間は38分と41分の間であるが、例外的にT C4(p L 0129 2)は幾らかよりゆっくりと生育し発生時間48分である。
T C4(p L Or 295)を除いて全ての絹み替え菌は12時閏後嫌気 的及び好気的生育条件rでプラスミドを欠いている菌株TC4と等しいかより高 い菌体密度に生育したく第3A及びB図)。表2は生!24時間後の菌株TC4 と絡み替え菌のMt終菌体密度をまとめている。好気的な条件下てp L OI  308−1oを含有する菌株TC4は最も高い菌体密度に達し、これにp + −01308−2、I) L O1292、pL OI 295(幾らか溶菌が 見られる)及びp L O+ 308−5を含有するTe3が続く。
嫌気的条件下テIt p L O[308−10及びp L OI 295を含 有する菌株TC4の最終菌体密度はおよそ等しく、これにpLOI292、p  L O130B−2、p L OI 308−5及びpLOi291を含有する Te3が統く。
i1!4図は生w24時間後の菌体中のピルベートデカルボキシラーゼ活性の水 準とI!に$#薗菌体度の間の関係を示している。ピルベートデカルボキシラー ゼの合成は、これらの組み替え菌中てはアルコールデヒドロゲナーゼ11のもと の組合わされているので、このプロットはIk終菌体密度に対するNAI)”再 生に対する代替Z、モビリス系の効果を表わしている。これらの賃料から、Z、 モビリスのエタノール生学に対する経路の表現が嫌気的及び好気的条件の両方の 下で最終菌体密度を増加することが明らかである。菌株T C4(p L 01 308−1’o)中でピルベートデカルボキシラーゼ(6,5+1J)及びアル コールデヒドロゲナーゼ11(2,51U)の表現の水準は嫌気的及び好気的生 育の両方に対し殆と最適である。菌株Tc4(pLOT295)中のエタノール 発生酵素の表現水準は、過剰のよってあり、好気的条件下で部分的な溶菌を伴う 減少した菌体生育を生し、嫌気的条件下で僅かに減少した生育を生している。
生育の悪さと対称的に(蓋かな見掛けの溶菌を、そして急速に振盪したフラスコ に於ける生育の間の溶菌を伴う嫌気的条件下での菌株TC4(pLOI295) の生育の増加は、高度に好気的な環境がこの構築にはダメージを与えるものであ り得ることを示唆している。!!フラスコ中での生育の間に揺動の速度を173 に減少したときにこの組み替え菌の溶菌は劇的に減少し、最終菌体密度は増加し た。
実施例6 生育の間のプロスの酸性化に対するエタノール発生酵素の影響 第3C図は嫌気的な生育の間のプロスのpHの変化のプロットを示す。プラスミ ドを欠いているTe3の菌株の最初の6時間の生育の間はpHは急速に落ちるが 、エタノール発生Ws紫を含有する誘導菌ではよりゆっくりと減少するゆ最初の 12時間の間の酸性化は、pL OI 295を含有している菌株TCA中では 非常に減少し、l) L OI 308−10、p L O1308−2及びp  L O+ 308−5を含有するTC4がこれに続く。菌株TC4(pLOI 29+>及びTC4(pLO[292)の菌株のデータは示されていないがそれ ぞれTC4(p L O+ 308−5)の下及び上にくる。、組み替え菌は、 より高い最終菌体密度に達するが、嫌気的及び好気的な条件下のもとて24時間 生育された絹み替え菌からのブロスのpHはエタノール発生酵素を欠いている菌 株TC4からのブロスのものよりも酸性度が小さい(表2)。
増加した画体生育を伴った絹み替え菌中の酸性化の減少した速度及び程度は、p Hの落ち込みが非常に好気的な条件下でさえも生育を制限する主要な因子であっ たことを示唆した。この仮説は、1/10容量の1M燐酸ナトリウム緩衝液(p H7,0)を補充した培地中で生育した菌株TC4(プラスミドを欠いている) の最終菌体密度の85X増加によって支持される。緩衝液の添加のより低い水準 は中間の生育の水準を生した。
実施例711G酵生産物に対するエタノール発生酵素の影響 表3は好気的及び嫌気的条件下で24時間生育させた後の菌株TC4及び組み替 え菌によって造られた11B酵生産物の分析をまとめたものである。好気的条件 下ては、検出されるエタノールはなく、アセテートが、栄養に冨んだ培地中でプ ラスミドを欠いている菌株TC4の生育の間1E積した主要な醗酵生産物である 。製造されたアセテートの置はZ、モビリスからのエタノール発生酵素を含有し ている菌株中で廟的に減少し、エタノールが主要な醗酵生産物に見えた。p L  OI 308−1.0を含有するTC4の菌株は、殆とエタノールを生労し、 p L OI 295、pL Ol 30B−2、p L Ol 292、p  L Or 308−5及びpLO■291を含有するTC4がこれに続いた。こ れらの好気的な条件下で少量のラクテートも全てのこれらの菌株によって生産さ れた(0.6〜1,2頂M)。p L O[308−10を含有している菌株T C4のみが認められる量のサクシネートを蓄積したが、この生成物はそれても醗 酵生産物の[6’11zにすぎず、94zがエタノールである。
表3 好気的及び嫌気的生育の蘭の醗酵生産物の比較生育 醗酵生産物[wMぐ SD)] ]灸上−エユ昼上二一−コエユ−一上巨」−−n区」−一μソ」−pLO130 8−2Tr 1.2(0,3) 22(2) 98(3)pLO1308−57 r 0.9(0,2) 43(3)・ 15(2)pLO130H−1o 4. 9(0,5) 1.0(0,2) 17(2) 337(21)pLO1295 Tr 1.1(0,4) 13(1) 114(10)pLt)1291 Tr  O,6(0,2) 34(3) ?(1)pLO1292Tr 1.3(0, 2) 30(1,5) 24(1)pLO130B−20,8(0,1) ?( 0,5) 4(0,3) H(5)111月308−5 0.3(0,1) + 8(2) 6(1) 16(2)pLO1308−105,0(0,4) 10 (+) 1.2(0,2) 482(23)pLO12952,2(0,20)  6(1) 3(0,3) 90(2)pLO12911,0(0,1) +5 (0,5) ?(0,2) 4(0,5)pLO12922,3(0,2) 9 (0,7) 7.2(0,3) 21(1)嫌菌株的な条件下でラクテートはグ ルコースを含有している栄養に冨んだ培地に於いてプラスミドを欠く菌株TC4 の24時閏の生育の間に蓄積する主要なWa!S1生産物であり、より少ない量 のアセテート、サクシネート及びエタノールが存在する。ラクテートの生産は、 エタノール発生酵素を含有する菌株中で劇的に減少し、実質的な量のエタノール の生産が伴う、M株TC4(pLOI308−10)は最大量のエタノールを生 し、この生成物のみが全体の可溶性のis*生産物の97zを占める。試験され た生物の間でのエタノール生産の傾向は、好気的な生育の間に於けるものと同し てあった。T C4<pL OI 308−10)を除いて、全ての生物が実際 に嫌気的な条件下で24時間後、好気的な条件下よりも少ない合計のエタノール を生産した。このより低い水準の蓄積したエタノールは、これらの嫌菌株的な条 件下で造られる全体の菌体マスの減少によって生したよってあり、従ってエタノ ール容量生産の速度が減少した。
嫌気的及び好気的条件下でのエタノール生産の程度(表3)はZ、モとリスエタ ノール発生遺伝子の表現の水準と比例している(表1)。エタノール生産は菌株 TC4(p L OI 308−10)中で最適であるよってあり、ピルベート デカルボキシラーゼ活性が61[Jでアルコールデヒドロゲナーゼ11活性が2 .511Jである。
Z、モビリスからのエタノール発生酵素を表現するプラスミドを含有している大 腸菌TC4の誘導菌はプラスミドを欠いた親生物よりもより高い画体密度に生育 する。
最終菌体密度の増加、培地中にエタノールが蓄積する程度、及び生育の賞の培養 基ブロスの酸性化の速度の減少は全てZ、モビリスのエタノール発生酵素の表現 水準と相関している。外来のプロモーターが転写制御と関連する潜在的な問題を 最少にする為にp L O+ 295(lac)を除く全ての構築物に於いて遺 伝子を表現するのに使用した。
生育及びエタノール生産の為の最適に最も近い表現の水準はp L OI 30 8−10によって提供されたく全菌体蛋白質のmgあたりビルヘートデカルボキ ンラーゼ6.5目ノ及びアルコールデヒトコケナーゼ2.5NJ) 、大IIm 菌の表現のこの水準が常にNAD”の再生の為のエタノール経路のみを含有する Z、モビl/スCP4中に存在するものよりも高かった。
エタノール発生酵素の表現水準は菌株TC4(pLO+295)で過剰であるよ うに見えた(可溶2体蛋白質の17%)。
この表現の高水準(よ、好気的条件下で、部分的な溶菌、より遅い生育、及びエ タノール生産の減少を伴った。これらの効果はより遅い攪拌、嫌ス的条件下での 生育によって減少した6高度に好気的な生育の間に生した見掛けの損傷及び部分 的な溶菌はZ、モビリスのアルコールデヒドロゲナーゼ11及び元来のNADH オキシダーゼ(電子伝達系と結合している)の高水準の組合わせによるNADH の涸渇に開運していたかもしれない。
主要生成物としてのエタノールの生産は、犬囁菌TC4の生育速度に影響しない ようにみえる。petオペロンを表現し、エタノールを生産するpLo +30 8(Co l Elレプリコン)の誘導体を含有している菌株はグルコースを有 する好気的条件下での親生物と同し様に急速に生育して親生物よりも高い最終光 学密度に達した。RS F +0IL、プl/ j ン? 有fるpLO+29 1又はI) L OJ 292を含有する菌株は好気的な条件下でよりゆっくり と生育した。
これらの二つの構築物はより低い水準のエタノール発生酵素を表現し、p L  OI 308−10よりもより少ないエタノールを生産したのでより遅い生育の 理由はpetオペロンの表現より毛ヘクターの性質に起因ずろ。
実施ffq8 添加菌株のy4製 エタノール生産微生物として使用する為のよりすぐれた特性を有するm菌を得る 試みをし、かつ同定する為に、追加的な大HMM株を試験した6次の大1111 菌薗株が使用された。ATCC8677、A T CC8739、A T CC 9637、A T CC+1303、A T CC+1775、A T CC+ 4948、ATCC15244、及びA T CC23227,これらはトリプ トン(log/l) 、酵母抽出物(5呂/1)、塩化ナトリウム(5g/l) 及U醗酵可能なWを含有するルリアブロス(ルリア。
5、八、及び門、デルプル 中て30℃てtftijiする水浴中で生育された。別途示されない限り、グル コースとラクトースは100g/lの濃度で添加され、キシロースは80gだの 濃度で加えられた。糖は別々に、蒸留水中でダブルストレンスのオートクレーブ にかけられたく121℃15分)。キシロースくシグマケミカルカンパニー、ミ スリー州セントルイス)の溶液は酸性であり、オートクレーブ前に水酸化ナトリ ウムで中相され、この中和を失敗すると非常に褐色化し、分解する。類似の醗酵 結果かオートクレーブか瀘11!!滅菌した糖で得られた。エタノール経路の酵 素に対しコートする遺伝子を含有する組み習え菌株が、アロス中及び平板培地上 で生延びることは、醗酵可能な糖の存在を必要とする。示される場合にはテトラ サイクリンが最終濃度10mg/lて加えられた。
実施例9 追加的菌株の環境的な耐久性エタノール生産の為のプラスミドの導入 の前に大Il#1Mの以前に同定した8つの異なる菌株を環境的な耐久性につい て比較した。菌株をそれらの塩化ナトリウムと低いpH及びエタノールに対する 抵抗性につき試験した。塩化ナトリウム及び表4の糖の濃度はもともとの培地に 存在するものを含んでいる。培地の最初のpHは6.8であり、示されている場 合にはHCIでより低い値に調節した。
酸性化した培地を濾過で滅菌した。エタノールを冷却の後オートクレーブした培 地に加えた。糖は別にオートクレーブした.試験試薬の非存在下で各々の糖中て 生育した一夜培養基を31の試験培地を含有している13χ75−培養試験官中 に60倍に希釈した。生育は48時間後に5500■に於ける光学密度( Q  、 D 、 )として測定した。1.0の光′$密度は0.25mg/mlの菌 体蛋白質に等し・く、そして0.33℃gの菌体乾燥重電に等しい。環境的な耐 久性の試験に於いて、0、2以下の最終光学密度は二つのダアリング未満である ことを反映しており、−視てきるものと考えられろ。
表4はグルコースを含有ずろ培地に於けるこれらの結果をまとめたものである。
同様の結果がラクトース又はキシロースを含有している培地に於いて得られた。
菌株A T C C 8 6 7 7、A T C C 8 7 3 9及びA TCC11.775はエタノールの低い濃度による阻害に対し特に感受性であっ た。菌株ATCC9637及びATCCl1775は低いpHに最も抵抗性であ ったが、ATCC23227を除く全ての菌株はpH4.0で少なくとも2〜4 のダブリングて生育した。全ての菌株は45℃で生育し、より高い温度で生育は 限られており、45℃以上ではとれもサブtS *基にすることが出来なかった 。全ての菌株は20%グルコース、20%ラクトース又は12%キシロースを含 有する培地で生育した。
表4 化学的及び物理的なストレスの下でloOg/lグルコースを含有するシ リアプロス中での大膓菌の生育NaCl(g/1) 50 + ++ ++ ++++ ++ ++ ++60 0 + ++ ++ +++ ÷ 十+70 0 0 + + O÷ + + エタノール(容jl$ン 3.3 ++ ++ ++ ++++ ++ ++ ++5、Q ++ ++  + + ÷ + + +6.3 0 ++ + + + + 4 07.5 0  + + 0 0 + 0 08.8 0 0 0 0 0 0 0 0酸度 pH4,50++ ++ ++ ++ ++ ++ ++ ++pH4,25+ + ++ ++ + ++ ++ ++ +pH4,oo++ +++ ++  + + 。
pH3,7500+o + OOO 温度(’C) 45 ++ ++ 十+ +++ 十+ ++++0 =O,D、550に於い て2未満のダブリング+=2〜4のダブリング ++=4を越えるダブリング 実施fM10 追加の菌株の糖の利用 二つの方法で塘の利用を試験した。菌株は2χの炭水化物を補充したマツコンキ ー(MaConkey)寒天上に赤いコロニーを発達させた菌株を糖の利用あり と記録した(シルハビー、 T 、 j 、及びj、R,ヘラフライズ[198 5] Microbiol、 Rev、 49:39L418) a菌体は、製 造業社の指示に従い、バイオログ(Biolog) EC平板培養基(カリフォ ルニア州へイワートのバイオログインコーボレーテット1りを用いても試験した 。バイオログ平板培養基は迅速で都合がよく、基質の利用の目安としてNADH 生産を検出する(テトラゾニウム塩の不溶性ホルマザンへの転換)。両方の方法 は13個の試験した糖につき完全に一致するものであった。
全ての試験した菌株は、グルコース、プラクドース、ガラクトース、マンノース 、アラビノース、ラクトースグルクロン酸およびガラクツロン酸を利用した。菌 株11775はキシコースを利用しなかった。マルトースと、マルトトリオース はATCC11303とA T +: (: 23227によって使用されなか った。全ての菌株はセロヒオースで弱い正の反応を示した。菌株ATCC963 7のみがシュークロースを利用した。徳利用試験の結果を表5に示す。
表5 p L OI 297及U’ p L O+ 308−11:E有シテイ ルクールコース 無 4.0 3.7 6.1 6.0り゛ル]−1 pL11 1297 10.0 +0.5 10.5 10.0り″IIコース pLO1 308−119,89,511,411,2ラクトース 無 4.3 3.8  7.5 6.0ラクト−2pLO129713,06,811,610,8ラク トース pLO1308−1110,010,01+、5 11.0キJロース  輝 4.1 3.7 7.7 7.3キノO−2pLOI297 8.1 1 0.6 10.8 10.6−1IJロース pLO1308−1110,06 ,8+1.4 8.5クールコース = 4.7 5.6 7.0 6.6クー ルコース pLO+297 9.5 9.5 10.2り勺■コース pLO1 308−119,310,811,4ラクトース @ 4.5 6.1 ?、8  6.4ラクトース pLOI297 7.6 − 10.5 7.0ラクトー ス ρLOI308−11 − 7.3 10.0 +0.0キノロース $  4.9 5.9 7.2 7.0キJO−ス pLO12974,? −11, 011,ONNa−ス pLO1308−1t −11,4+0.6 12.0 横棒はデーターが人手出来なかったことを示す。
実施例11 追加の菌株の遺伝的な変更標準の方法を用いて二つの新たなプラス ミドを構築したくマニアティス、T1、E、F、フィッシュ及びJ、サンプルツ ク[+982コMo1ecular Cloning:A Labrntory  Manual 、コールドスプリングハーバ−ラボラトリ−、ニューヨーク州 コールトスプリングハーハー)、これらは、選択可能なマーカーとして、アンビ シl/ンとテトラサイクリンに対する抵抗性の遺伝子を含有している。クリプテ イック(criptic)なZ、モビl/スのプロモーター、ビルヘートデカル ポキシラーゼ、アルコールデヒドロゲナーゼ及び転写ターミネータ−を含有して いるエタノール生産オペコン(pet−オペコン)は、p L Or 308− 10 (イングラハム及びコンウェイ[1988]上記のもの)からの5.2k bのEcoRI断片として取除き、p B R322のEcoR1位置へ挿入し 、I) L O1308−11を遣った。プラスミドpLO■297はテトラサ イクリン抵抗遺伝子を含有するpCO52EMBL (ボーストカ^、、H,R ,ラックウィズ、A、−門。
フィッシャラフ及びH,レイラッチ[1984]Proc、Natl、Acad 。
Sci、tJSA 81:4129−4133)からの2.8kbE coRI 断片をpLOI295(イングラム等[+987]上記のもの)のS al 1 位置に挿入することによって構築した。粘着末端を連結前に大lII菌DNAポ リメラーゼ(マニアティス等上記)のフレノウ断片で処理することによって除去 した。
プラスミドをマントル及びヒガー(マントル、M、及びA。
ヒガ−C1970]J、Mo1.Biol、53:159−162)の塩化カル シウム手順を用いて形質転換により、大腸菌の異なる菌株中に導入した。選択は 2%グルコース及びテトラサイクリンを含有する固体培地上でなされた。プラス ミド安定性は、抗生物X選択の非存在下で、25世代の生育の後に抗生物質マー カーを保持している面体の%とじて表現される。
エタノール生産のための遺伝子を有するプラスミドを持っている組替え菌株は、 通掌大きなコロニーとして生育し、このコロニーは発酵可能な糖を含有している 固体培地上で、24〜48時間後に黄色に変る。液体培地では、これらの@替え 萌のI!l終萌体密度ζよ、プラスミドを欠いている対照よりも2倍〜3M高か った。形質転換は、数回の試みの後に、A T CC14948カラp L O r 297で、又はA T CC+1775カラp L Or 308−IIて 行なわれた。菌株A T CC11775ζよキンロースを利用せずこの菌株の 絹替え菌は、発酵可能な糖としてのキシロースで、対照よりもより高い密度に生 育しなかったが、ラクトースとグルコースでは増加した生育が認められた。
プラスミドの安定性は、25世代についてグルコースを含有する培地中で、生育 させた後に調べたく表6)。両方のプラスミドか同し、レプリコンを含有してお り、ATCC8677とへT CC8739を除いて全ての菌株でよく保持され た。
表6 抗生物質選択の非存在下でのグルコースでの匹pL Ol 297 L  OI 308−II9637 too 90 +1303 98 98 +5224 99 100 23227 9+ to。
横棒はデーターが人手出来なかったことを示す。
実施例12 遺伝的に変更された菌株におけるピルベートデカルボキシラーゼ活 性の表現 ピルベートデカルボキシラーゼ活性は、およそ最大生育の半分である光学密度4 .0で菌体が収穫されたことを除いて前に記載したように測定した(コンウェイ 等[1987コ上記、ニール等[,1987]上記)。Zモビリスのピルベート デカルボキシラーゼの活性の表現は、テトラサイクリンの存在下での生育の後に 調べた(表7)。p L 01297の場合、Zモとリス遺伝子は大腸菌1ac プロモーターの制御下で表現された。p L OI 308−11はpetオペ ロンの表現のためではクリプテイック(criptic)Z 、モビリスプロモ ーターを利用した。菌株ATCC11303(pL OI 297) 、A T  CC+1775 (p L OT 297)及ヒATCC15224(p L  OI 297)は最高の水準の活性を有した。
表7 グルコースでの生育の閘p L OI 297とpLOl 308−11 を持っている大lIIimr株中のZモビリスビルベートデカルボキシラーゼの 表現 ATCC菌株 ピルベートデカルボキシラーゼ活性8p L OT 297 L  OI 308−II8677 5.7 6.0 8739 0.8 1.4 9637 1.1 1.4 +1303 16.7 2.1 11775 17.1 14948 2.5 +5224 18.3 1.8 23227 2.3 1.7 1菌体蛋白1当りの1.U、ての活性 bダッシュはデーターが人手出来なかったことを示す。
実施例13 遺伝的に変更された菌株のエタノール生産ルリアブロスを最&fJ 度0.2Mの燐酸カリウム緩衝液(pH7,0)を含めることによって発酵実験 に対し修正した。燐酸緩衝液、複合培地成分及び糖を別個にオートクレイプにか け、冷却後混合した。テトラサイクリンを10mgだの濃度で含めた。接種菌は 24時閏新たに単離したコロニーから生育させ、試験されるべき発酵培地中で洗 浄し、そしておよそ1.0の550nm初期光学密度に加えた0発酵は30℃又 は37℃で801のブロスを含有し、ゴム隔壁を備え、そしてガスが逃げられる ように25ゲージの針を備えた1001の容積測定フラスコ中で30℃で又は3 7℃で実施した。!酵フラスコを温度制御水浴中に浸漬し、1100rpで磁器 攪拌機で攪拌した。
前記のように、ガスクロマトグラフィーでエタノール濃度を測定しくゾンデツク 、LM、及びり、0.イングラム[+985]App1.Environ、Mi crobiol、51:197−200)そして容積%として表現した。転換効 率は、100%効率が208のグルコース又はキシロース当り12.75m1の エタノール(Io、2g)の生産を、そして20g当りのラクトース13.5m lのエタノール(10,8g)を生じると仮定して加えた糖に基づいて計算した 。
全ての遺伝子工学的に処理した大腸菌の菌株は、有意幌な量のエタノールを糖か ら製造した(表8)。菌株Aカリウム緩衝液(pH7,0)を含有する培地中で より高い水準のエタノールが造られることが示された。同様の又はより優れた結 果がこの緩衝液の代りに自動化したpH調節を用いて得られることが予測される 。15%グルコスでは、より高いエタノール水準が48時間後37℃よりも■℃ で造られる。ラクトースとキシコースの発酵は、低温即ち30℃のみで調べられ た。一般に、高水準のエタノールがp L OI 308−11よりもpLOI 297を持っている菌株によって造られた。菌株へTCCI+303(+)LO +297)、ATCC1t775(pLo 1297)及びA T CC152 24(pL 01297)は、48時間後15%のゲルコールから最高水準のエ タノール即ち容量で5.8%〜6.9%を造った。はとんどの菌株は、最初の実 験でキシロースに対し許容度が小さく、発酵の比較は8%キシロースを用いて実 施された。A T CC9637(p L O+ 297) 、A T CC1 1303(pL 01297)及びA T CC15224(p L O129 7)は、72時間後8%のキシロースから最高水準のエタノール(4゜8%〜5 .2%)を造った。全ての菌株は15%ラクトース中でよく生育した。菌株へT  CC11303(1) L OI 297>及びA T CC15224(p  L O+ 297)は48時間後ラクトースから最高水準のエタノール即ちそ れぞれ6.1%と5.6%を遣った。
表8 p L OI 297とp L OI 308−11を持っている大11 1II菌株によるグルコース(48時間〉、キシロース(72時間)及びラクト ース(48時rfりからのバッチ発酵に於いて製造されたエタノール 15%クールコース pLO+2978 2.4 4.7 4.2 4.315 $り−a]−2pLO1308−11” 3.6 1.4 2.1 1.315 Xり−A14 pLl)1297” 3.2 4.7 4.1 5.8151り 一11コ−2pLOI308−11” 5.8 5.0 3.5 1..515 X5クト−2pLO1297” 2.3 4.4 5.3 6.+15HH−2 pL01308−111) 2.3 2.1 3.4 0.9EHEJO−2p LOI297b O,94,14,85,28HノG−2pLO1308−11 ’ 2.0 2.8 2.8 1.211775 14948 +5224 2 322715χり”ルコース pLO1297114,8−4,80,915z り″ルコース pLO1308−11’ −3,42,81,3151−A]− 2pL旧297b 6.9 − 6.1 3.115%り一!1m−2pLO1 308−11b −3,83,03,2151ラク12 pLO129T′)  4.5 − 5.6 3.715%5クト−2pLO1308−11b −2, 92,73,08[)0−ス pLl)1297t1 − 4.8 1.281 すo−1pL01308−110 − 2.0 3.5 1.0横棒はデーター が入手出来なかったことを示す’37℃でtf!養 I)30℃で培養 これらの比較実験に基づいてA T CC+1303 (p L 01297) とへT CC15224(pL OI 297)は、エタノール生産に対する最 良のllI築物であるように見えろ。生育の時間コース及びエタノール生産は1 2%のグルコース、12%ラクトース及び8%のキンロース中で両方の菌株にお いて試験された(第1図)。菌体マスはおよそ10倍増加し、リットル当り最終 畜度3.6g乾燥重量に達した。キシロースでは菌体マスは、グルコースまたは ラクトースで観測されたものの半分の速度で増加した。エタノールの生産と生育 はエタノールの濃度が5%に達するまで、3つの糖についておよそ線形であった 。
糖のエタノールへの転換効率を計算するために、120時閏後の最終エタノール 濃度を3つの実験のセ・ソトから平形したく表6)。12%グルコースと生育し た培養基における最終エタノールa度は、7.2%(容量)であり、グルコース からの理論収率の94%を表してしる。12%ラクトースでは最終エタノール濃 度は6.5%であり、ラクトースからの理論収率の80%である。8%キシロー スではつねに100%の収率またはそれ以上を得た。キシロースでのより遅い生 育の間におけるこれらの高い収率は、グルコースからのヒルへ−トのほかにエタ ノール中の複合栄lIsの分解からのビルヘートの転換を反映しているかもしれ ない。
エタノール生産の速度は、第1図のグラフから計算され、表9にまとめられてい る。エタノールの容量における生産性は、グルコースに対する時間当りの1.4 g/lからキシロースに対する時間当り0.643/lの範囲である。エタノー ルの特異的生産性は、3つの糖の各々に対し、初期生育期間の間に最も高かった 。最高の生産性は、グツしコースで得られ、時間当り2.1gのエタノール/g 乾燥菌体重量であった。糖のg当りのエタノールの最高収率はキシロースで得ら れ、糖単独に対する最大理論収率を越えていた。
表9 ATCC11303(pL01297)とATCC15224(pLOI 297)によるエタノール生産に対する平均された反発速度論ハラメーター 1225クト−21,32,00,4380152EH41−ス 0.6 +、 3 0.52 1021 421 時間当りのエタノール/リットル 6 時間当りのエタノールg1M体乾燥重量gアラビノース、ガラクトース及び マンノースからエタノール生産をすることを調べる為に、実験をA T CC1 1303(、pL OI 297)で実施した。エタノール1度3%〜4%を3 0℃で48時間後得々が、ざらに調べなかった。これらの糖をグルコースとキシ ロースに対するのと類似の経路によって代謝し、類似の収率を生しると干潮した くリン、 E、C,C,[:+987コ「糖、ポリオール及びカルボキシレート に対する類似しない経路J F、C,ニートバー1”、、l。
し、イングラハム、に、B、ロウ、B、マガサニク及び門、シャエチター編、大 腸菌とサルモネラティフィムリウム、1巻244〜284頁、アメリカンソサエ ティオブマイクロバイオロジー、ワイントンD、C,)。
本明細書に記載した実物例と具体例は、例示目的のみのためであって、種々の変 更または修正が当業者に示唆されうることてあり、そして本発明の精禅及び範囲 に含まれ、添付の特許請求の範囲に含まれることが理解されるべきである。
Figure 1 Fig、 3A、 Fig、 3B。
檀気的条う午下で゛9百贅つ主ル ご@Iし〜−1−〒°栖ル不涛シラーゼ゛ミ古fLFi詳τe4 国際調査報告 m+sm噛+1@Nml^HIItl−噛−””IIIcT/USB91037 53国際調査報告 PC丁/US t391037S3

Claims (34)

    【特許請求の範囲】
  1. 1.エタノールを生じるように細胞にしむけ、一方がアルコールデヒドロゲナー ゼ活性に対しコードし、他方がビルベートデカルボキシラーゼ活性に対しコード する、ズィモモナスモビリス(Zymomonasmobilis)に由来する 二つの遺伝子を含んでいる、新規なオベロン。
  2. 2.該オベロンが適当な制御配列と共に該ズィモモナスモビリス遺伝子を含んで いる、請求項1に記載の新規なオベロン。
  3. 3.該制御配列がプロモーター、インデューサー、オペレーター、リボソーム結 合位置、ターミネーター、及び/又は他の制御配列を含んでいる、請求項2に記 載の新規なオベロン。
  4. 4.該遺伝子がlacプロモーターの制御下にある請求項3に記載の新規なオベ ロン。
  5. 5.請求項1に記載のオベロンを含む組替えプラスミド。
  6. 6.アルコールデヒドロゲナーゼ及びビルベートデカルボキシラーゼ活性に対し てコードしており、pLOI295、pLOI308−10、pLOI308− 2、pLOI308−5、pLOI292、pLOI291、pLOI297、 及びpLOI308−11からなる群から選ばれる組替えプラスミド。
  7. 7.請求項1に記載のオベロンを含む組替え宿主。
  8. 8.該宿主が細菌、真菌類、酵母、及び原真核細胞からなる群から選ばれる請求 項7に記載の組替え宿主。
  9. 9.該宿主が大腸菌(Escherichia coli)である請求項7に記 載の組替え宿主。
  10. 10.請求項6に記載のプラスミドを含む組替え宿主。
  11. 11.該組替え宿主が大腸菌である請求項10に記載の組替え宿主。
  12. 12.ビルベートデカルボキシラーゼ及びアルコールデヒドロゲナーゼ活性に対 しコードする遺伝子を導入することによって宿主の代謝を変更することからなる 、エタノールの製造方法。
  13. 13.該遺伝子が宿主に導入されるプラスミド上に含まれている請求項12に記 載の方法。
  14. 14.該宿主が細菌、真菌類、酵母、及び真核細胞からなる群から選ばれる請求 項12に記載の方法。
  15. 15.該宿主が大腸菌(Eschericha coli)である請求項12に 記載の方法。
  16. 16.プラスミドが、pLOI295、pLOI308−10、pLOI308 −2、pLOI308−5、pLOI292、pLOI291、pLOI297 、及びpLOI308−11からなる群から選ばれる請求項13に記載の方法。
  17. 17.微生物又は真核細胞にズィモモナスモビリスのアルコールデヒドロゲナー ゼ及びビルベートデカルボキシラーゼ活性に対しコードする遺伝子を導入するこ とからなる、該微生物又は該真核細胞の成育を改良する方法。
  18. 18.微生物又は真核細胞にズィモモナスモビリスのアルコールデヒドロゲナー ゼ及びビルベートデカルボキシラーゼ活性に対しコードする遺伝子を導入するこ とからなる、該微生物又は該真核細胞の成育培地中の望ましくない代謝生産物の 蓄積を防止又は減少する方法。
  19. 19.成育培地にマグネシウムを添加することによって菌体(細胞)密度の増加 が達成される請求項17に記載の方法。
  20. 20.ビルベートデカルボキシラーゼとアルコールデヒドロゲナーゼの活性の表 現水準が約1.5IUと約10IUの間である請求項12に記載の方法。
  21. 21.大腸菌にアルコールデヒドロゲナーゼ活性とビルベートデカルボキシラー ゼ活性を与えるプラスミドで形質転換された大腸菌。
  22. 22.形質転換前の大腸菌がATCC8677、ATCC8739、ATCC9 637、ATCC11303、ATCC11775、ATCC14948、AT CC15224、及びATCC23227からなる群から選ばれる請求項21に 記載の大腸菌。
  23. 23.pLOI295、pLOI308−10、pLOI308−1、pLOI 308−5、pLOI292、pLOI297、及びpLOI308−11から なる群から選ばれるプラスミドで形質転換された請求項21に記載の大腸菌。
  24. 24.pLOI297で形質転換された請求項23に記載の大腸菌。
  25. 25.形質転換前の大腸菌が、ATCC9637、ATCC11303、及びA TCC15224からなる群から選ばれる請求項24に記載の大腸菌。
  26. 26.ATCC9637(pLOI297)の特性を有する請求項25に記載の 大腸菌。
  27. 27.ATCC11303(pLOI297)の特性を有する請求項25に記載 の大腸菌。
  28. 28.ATCC15224(pLOI297)の特性を有する請求項25に記載 の大腸菌。
  29. 29.アルコールデヒドロゲナーゼとビルベートデカルボキシラーゼの活性が与 えられるように遺伝物質で形質転換されている微生物。
  30. 30.代謝経路が機能するのに必要な活性に対しコードする遺伝子で適当な宿主 を形質転換することからなる、該宿主に機能し得る代謝経路を導入及び確立する 方法。
  31. 31.該遺伝子が天然に存在する場合に、該遺伝子が核生物中で同じ制御支配下 にはない請求項30に記載の方法。
  32. 32.該経路が酪酵経路である請求項30に記載の方法。
  33. 33.宿主中に天然では存在しない代謝経路を該宿主中に確立する外来遺伝子に よって形質転換されている組替え宿主。
  34. 34.代謝経路が酪酵経路である請求項33に記載の組替え宿主。
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