CN103890007A - 神经调节蛋白抗体及其用途 - Google Patents

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Abstract

本发明提供了抗神经调节蛋白抗体和在治疗疾病或病症（诸如癌症）中使用该抗体的方法。在一个具体的实施方案中，所述抗神经调节蛋白抗体结合神经调节蛋白1α和神经调节蛋白1β同等型二者。

Description

神经调节蛋白抗体及其用途
对相关申请的交叉引用
本申请要求2011年8月17日提交的美国临时专利申请61/524,421的优先权，通过提及而将其公开内容完整收入本文。
序列表
本申请含有序列表，已经以ASCII格式经EFS-WEB提交且通过述及完整收入本文。2012年8月14日创建的所述ASCII拷贝命名为P4727R1WO_ST25.txt，并且大小为64,664个字节。
发明领域
本发明提供了神经调节蛋白抗体和在治疗疾病或病症（诸如癌症）中使用该抗体的方法。
发明背景
对于大多数癌症，对化疗的响应较差或化疗后疾病复发是死亡的一个主要原因。非小细胞肺癌(NSCLC)尤其如此，因为化疗用于治疗具有所有阶段的疾病的患者。超过三分之二的患者呈现不可切除的晚期疾病且用前线化疗、放疗或二者的组合治疗。然而，尽管在NSCLC的治疗中攻击性使用化疗，局部晚期和晚期疾病的5年存活率仍然分别为8%和3.5%(Doebele et al)。
对化疗的部分响应和化疗后的复发提示肿瘤细胞在它们的药物敏感性方面是异质的。一些肿瘤细胞被给定药剂有效杀死，而其它肿瘤细胞幸免。癌干细胞(CSC)在最近几年成为热烈研究的一个领域，因为它们为现有疗法的失败提供一种可能的解释。数个小组报告了CSC显示增强的对常规化疗剂和放射治疗的抗性(Bao et al.,2006;Costello et al.,2000;Dean et al.,2005;Dylla et al.,2008;Matsui et al.,2004;Phillips et al.,2006)。然而，CSC在维持已建立肿瘤的生长中或在化疗后在原发性或远距离部位再启动肿瘤中的作用仍然有待确定。负责化疗后肿瘤再生长的细胞可能根本不是干细胞，而是经由可能反映细胞周期的阶段、基质-生态位相互作用、或促存活信号的水平的其它特性实现抗性的细胞。这些细胞称作“肿瘤再启动细胞”或TRIC。美国专利公开文本20110229493。
表皮生长因子受体(EGFR)抑制剂频繁用于治疗NSCLC患者且显示出有效治疗其肿瘤包含EGFR激活性突变的大多数患者。已经显示了经由过表达或激活突变的EGFR信号传导脱调节(deregulation)是肺腺癌中的一个相对频繁事件(综述见Dahabreh et al.,2010)。EGFR是ErbB或HER酪氨酸激酶家族的原型成员，该家族包括EGFR(HER1)、HER2、HER3和HER4。最近的证据显示了其它HER家族成员也可能在NSCLC中发挥作用。然而，它们对疾病的贡献是不太充分表征的，并且大多数研究聚焦于其激活EGFR信号传导的能力(Ding et al.,2008;Johnson and Janne,2006;Kuyama et al.,2008;Zhou et al.,2006)。神经调节蛋白1(NRG1)，也称作调蛋白1，是HER3和HER4受体的一种配体。
神经调节蛋白家族有4种已知的成员，即NRG1、NRG2、NRG3、和NRG4(Falls2003;Hirsch and Wu2007)。NRG1转录物经历广泛的可变剪接，生成至少15种不同同等型。所有活性同等型共享对于活性必需且足够的EGF样域(Holmes1992,Yarden1991)。
已经显示了NRG1自分泌信号传导调节肺上皮细胞增殖，并且在人肺发育中发挥作用(Patel et al.,2000)，而且牵涉NSCLC对EGFR抑制剂的不敏感性(Zhou et al.,2006)。
发明概述
本发明提供抗神经调节蛋白1（抗NRG1）抗体及使用它们的方法。
本发明的一个方面提供一种分离的抗NRG1抗体，其结合神经调节蛋白1α和神经调节蛋白1β。在一个实施方案中，所述抗NRG1抗体结合神经调节蛋白1β的EGF域和神经调节蛋白1α的EGF域。在一个实施方案中，所述抗NRG1抗体结合神经调节蛋白1β的EGF域的亲和力比它结合神经调节蛋白1α的EGF域的亲和力大。在具体的实施方案中，所述抗NRG1抗体结合神经调节蛋白1β的EGF域的亲和力比它结合神经调节蛋白1α的EGF域的亲和力大20倍，50倍，100倍，200倍，500倍，1000倍。
在一个实施方案中，所述抗NRG1抗体以10nM或更少的kD结合神经调节蛋白1β的EGF域且以10nM或更少的kD结合神经调节蛋白1α的EGF域。在具体的实施方案中，所述抗NRG1抗体以10nM或更少，1nM或更少，1x10-1nM或更少，1x10-2nM或更少，或1x10-3nM或更少的kD结合神经调节蛋白1β的EGF域。在一个实施方案中，所述抗NRG1抗体的亲和力是通过表面等离振子共振测定法测量的。
本发明的一个方面提供一种分离的抗NRG1抗体，其结合神经调节蛋白1β表位，其中该神经调节蛋白1β表位包含SEQ ID NO：4氨基酸1-37的氨基酸序列或SEQ ID NO：4氨基酸38-64的氨基酸序列。在一个实施方案中，所述神经调节蛋白1β表位包含氨基酸序列SEQ ID NO：4。在一个实施方案中，所述抗NRG1抗体进一步结合神经调节蛋白1α表位，其中该神经调节蛋白1α表位包含SEQ ID NO：3氨基酸1-36的氨基酸序列或SEQ ID NO：3氨基酸37-58的氨基酸序列。在一个实施方案中，所述神经调节蛋白1α表位包含氨基酸序列SEQ ID NO：3。
在某些实施方案中，所述抗NRG1抗体为单克隆抗体。在某些实施方案中，所述抗NRG1抗体为人抗体，人源化抗体，或嵌合抗体。在某些实施方案中，所述抗NRG1抗体为结合神经调节蛋白1α和神经调节蛋白1β的抗体片段。
本发明的另一个方面提供一种分离的抗NRG1抗体，其包含：(a)包含氨基酸序列SEQ ID NO：5的HVR-H1，(b)包含氨基酸序列SEQ ID NO：6的HVR-H2，和(c)包含氨基酸序列SEQ ID NO：7的HVR-H3。
本发明的另一个方面提供一种分离的抗NRG1抗体，其包含：(a)包含氨基酸序列SEQ ID NO：16的HVR-L1，(b)包含氨基酸序列SEQ ID NO：17的HVR-L2，和(c)包含氨基酸序列SEQ ID NO：18的HVR-L3。在一个实施方案中，所述抗NRG1进一步包含：(a)包含氨基酸序列SEQ ID NO：16的HVR-L1，(b)包含氨基酸序列SEQ ID NO：17的HVR-L2，和(c)包含氨基酸序列SEQ ID NO：18的HVR-L3。
本发明的另一个方面提供一种分离的抗NRG1抗体，其包含：(a)包含氨基酸序列SEQ ID NO：76的HVR-H1，(b)包含氨基酸序列SEQ ID NO：29的HVR-H2，和(c)包含氨基酸序列SEQ ID NO：43的HVR-H3。
本发明的另一个方面提供一种分离的抗NRG1抗体，其包含：(a)包含氨基酸序列SEQ ID NO：31的HVR-L1，(b)包含氨基酸序列SEQ ID NO：32的HVR-L2，和(c)包含氨基酸序列SEQ ID NO：33的HVR-L3。在一个实施方案中，所述抗NRG1抗体进一步包含：(a)包含氨基酸序列SEQ ID NO：31的HVR-L1，(b)包含氨基酸序列SEQ ID NO：32的HVR-L2，和(c)包含氨基酸序列SEQ ID NO：33的HVR-L3。
本发明的另一个方面提供一种分离的抗NRG1抗体，其包含：(a)与氨基酸序列SEQ ID NO：21具有至少95%序列同一性的VH序列；(b)与氨基酸序列SEQ ID NO：26具有至少95%序列同一性的VL序列；或(c)(a)中的VH序列和(b)中的VL序列。在一个实施方案中，所述抗NRG1抗体包含VH序列SEQ IDNO：21。在一个实施方案中，所述抗NRG1抗体包含VL序列SEQ ID NO：26。在一个实施方案中，所述抗NRG1抗体包含VH序列SEQ ID NO：21和VL序列SEQ ID NO：26。
本发明的一个方面提供一种分离的抗NRG1抗体，其包含VH序列SEQ IDNO：53和VL序列SEQ ID NO：63。
本发明的另一个方面提供一种分离的核酸，其编码抗NRG1抗体。本发明的另一个方面提供一种宿主细胞，其包含编码抗NRG1抗体的核酸。
本发明的另一个方面提供一种生成抗NRG1抗体的方法，其包括培养此类宿主细胞，使得该抗体生成。
本发明的另一个方面提供一种免疫偶联物，其包含抗NRG1抗体和细胞毒剂。
本发明的另一个方面提供一种药物配制剂，其包含抗NRG1抗体和药学可接受载体。在一个实施方案中，所述药物配制剂进一步包含别的治疗剂，诸如吉西他滨，帕利他赛，或顺铂，或帕利他赛和顺铂的组合。
本发明的另一个方面提供抗NRG1抗体，其用作药物。
本发明的另一个方面提供抗NRG1抗体，其用于治疗癌症。
本发明的另一个方面提供抗NRG1抗体，其在药物制备中。在一个实施方案中，所述药物用于治疗癌症，诸如非小细胞肺癌，乳腺癌，卵巢癌，头和颈癌，***，膀胱癌，食道癌，***癌，和结肠直肠癌。
本发明的另一个方面提供一种治疗具有癌症的个体的方法，其包括对该个体施用有效量的抗NRG1抗体。要治疗的癌症为例如非小细胞肺癌，乳腺癌，卵巢癌，头和颈癌，***，膀胱癌，食道癌，***癌，和结肠直肠癌。在一个实施方案中，所述方法进一步包括对该个体施用别的治疗剂，诸如吉西他滨，帕利他赛，卡铂，和顺铂或帕利他赛，卡铂，和顺铂中两种或所有三种的组合。
本发明的另一个方面提供一种在癌症患者中延长肿瘤再发生前时间的方法，其包括对该患者施用有效量的抗NRG1抗体。在一个实施方案中，所述方法进一步包括对该患者施用治疗剂。在一个实施方案中，所述治疗剂为化学治疗剂或第二抗体。所述化学治疗剂为例如吉西他滨，帕利他赛，卡铂，和顺铂或帕利他赛，卡铂，和顺铂中两种或所有三种的组合。在某些实施方案中，所述第二抗体结合EGFR，HER2，HER3，或HER4，或结合这些靶物中的两种或更多种。在某些实施方案中，要治疗的癌症为非小细胞肺癌，乳腺癌，卵巢癌，头和颈癌，***，膀胱癌，食道癌，***癌，和/或结肠直肠癌。在一个实施方案中，肿瘤再发生前时间的延长为比所述抗体缺失下的再发生前时间长至少1.25倍。在一个实施方案中，肿瘤再发生前时间的延长为比所述抗体缺失下的再发生前时间长至少1.50倍。
附图简述
图1A：图显示了在其随意的饮用水中施用媒介物（蔗糖）或dox(2gm/L)的具有已建立的Calu3-shNRG1异种移植物肿瘤的小鼠的肿瘤生长曲线。对肿瘤体积一周测量两次，持续整个研究。数据以线性混合效应(Linear MixedEffect,LME)模型对肿瘤体积产生的拟合呈现，作为具有自动确定的纽结(auto-determined knot)的三次样条(cubic splines)绘图。
图1B：图显示了用化疗+蔗糖或化疗+dox处理的具有已建立的Calu3-shNRG1异种移植物肿瘤的小鼠的肿瘤生长曲线。数据以LME模型对肿瘤体积产生的拟合呈现，作为具有自动确定的纽结的三次样条绘图。
图2A：图显示了用蔗糖或dox处理的具有已建立的H441-shNRG1异种移植物肿瘤的小鼠的肿瘤生长曲线（n=12只/组）。数据以肿瘤体积的LME拟合分析呈现，作为具有自动确定的纽结的三次样条绘图。
图2B：图显示了用化疗+蔗糖或化疗+dox处理的具有已建立的H441-shNRG1异种移植物肿瘤的小鼠的肿瘤生长曲线（n=12只/组）。数据以肿瘤体积的LME拟合分析呈现，作为具有自动确定的纽结的三次样条绘图。
图3A：图显示了用媒介物+对照IgG(n=6)、顺铂+对照IgG(n=6)、或顺铂+HER4ECD-Fc(n=8)处理的LSL-K-rasG12D；p53Fl/+小鼠的平均肿瘤体积+/-SEM。豚草，对照鼠IgG2a抗体。
图3B：图显示了通过治疗方案得到的肿瘤负荷的每日倍数变化及95%置信区间。
图3C：图显示了用媒介物+对照IgG(n=10)、顺铂+对照IgG(n=11)、顺铂+HER4-ECD(n=8)或媒介物+HER4-ECD(n=7)处理的LSL-K-rasG12D；p53Fl/Fl小鼠的肿瘤负荷自基线的平均百分比变化±SEM。
图4A：图显示了来自Kras-LSL-G12D小鼠NSCLC模型的残余肿瘤细胞中NRG1mRNA富集，显示的数据来自一种微阵列探针且经独立样品之qPCR验证。
图4B：图显示了如qPCR所评估，在媒介处理和残余化疗处理Calu3肿瘤细胞中NRG1之表达。
图4C：图显示了如qPCR所评估，在媒介处理和残余化疗处理H441肿瘤细胞中NRG1之表达。
图4D：图显示了如qPCR所评估，在媒介处理和残余吉西他滨和长春瑞滨处理Calu3和H441肿瘤细胞中NRG1之表达。
图5：NRG1α(SEQ ID NO：3)或NRG2β(SEQ ID NO：4)之EGF域的比对。
图6：图显示了抗NRG1抗体抑制125I-NRGβ1结合HER3-Fc。
图7：图显示了亲和力成熟的抗NRG1抗体变体抑制125I-NRGβ1结合HER3-Fc。
图8：BIAcoreTM测定法所测量的538.24亲和力成熟变体抗NRG1IgG对NRG1β的结合亲和力。
图9：BIAcoreTM测定法所测量的538.24亲和力成熟变体抗NRG1IgG对NRG1α的结合亲和力。
图10：BIAcoreTM测定法所测量的538.24.71抗NRG1抗体对NRG1β和NRG1α的结合亲和力。
图11：BIAcoreTM测定法所测量的538.24.71抗NRG1抗体对NRG1β和NRG1α的结合亲和力。
图12：图显示了526.09抗体与538.24.71抗体竞争结合HRG1α和HRG1β二者。
图13：表显示了KIRA测定法中526.09抗NGR1抗体的亲和力成熟变体阻断NRG1α和NRG1β结合抗HER3抗体之能力。
图14：图显示了526.90亲和力成熟变体的BV测试的结果。
图15：BIAcoreTM测定法所测量的538.90.28抗NRG1抗体对NRG1β和NRG1α的结合亲和力。
图16：如使用KIRA测定的，图显示了抗NRG1抗体526.90.28和538.24.71阻断NRG1α诱导HER3活化之能力。
图17：如使用KIRA测定的，图显示了抗NRG1抗体526.90.28和538.24.71阻断NRG1β诱导HER3活化之能力。
图18：Western印迹显示了在人和小鼠二者细胞中抗NRG1抗体抑制NRG1自分泌信号传导之能力。
图19：图显示了在小鼠模型***中抗NRG1抗体+/-化疗对HNSCC肿瘤生长之作用。
图20：显示小鼠模型***中抗NRG1抗体+/-化疗对肺癌肿瘤生长之作用的肿瘤生长曲线以及显示该模型***中的无进展存活的Kaplan-Meier曲线。
图21：显示小鼠模型***中抗NRG1抗体+/-化疗对NSCLC LKPH2肿瘤生长之作用的肿瘤生长曲线以及显示该模型***中的无进展存活的Kaplan-Meier曲线。
图22：显示小鼠模型***中抗NRG1抗体+/-学疗对NSCLC H596肿瘤生长之作用的肿瘤生长曲线。
图23：显示小鼠模型***中抗NRG1抗体+/-化疗对NSCLC LKPH2肿瘤生长之作用的肿瘤生长曲线以及显示该模型***中的无进展存活的Kaplan-Meier曲线。
图24：显示抗NRG1抗体对NRG1-HER3信号传导驱动之肿瘤生长(A)以及对NRG1-HER4信号传导驱动之肿瘤生长(B)的作用的肿瘤生长曲线。
图25：抗NRG抗体的重链可变区氨基酸序列（SEQ ID NO：20）。
图26：抗NRG抗体的轻链可变区氨基酸序列（分别是SEQ ID NO：22-27）。
图27：抗NRG抗体的重链可变区氨基酸序列（分别是SEQ ID NO：52,54,56,58,60,62,63,64,66,68,70）。
图28：抗NRG抗体的轻链可变区氨基酸序列（分别是SEQ ID NO：53,55,57,59,61,53,53,65,67,69,71）。
发明详述
I.定义
出于本文中的目的，“受体人框架”指包含自人免疫球蛋白框架或如下文定义的人共有框架衍生的轻链可变域(VL)框架或重链可变域(VH)框架的氨基酸序列的框架。自人免疫球蛋白框架或人共有框架“衍生”的受体人框架可以包含其相同的氨基酸序列，或者它可以含有氨基酸序列变化。在一些实施方案中，氨基酸变化的数目是10或更少、9或更少、8或更少、7或更少、6或更少、5或更少、4或更少、3或更少、或2或更少。在一些实施方案中，VL受体人框架与VL人免疫球蛋白框架序列或人共有框架序列在序列上相同。
“亲和力”指分子（例如抗体）的单一结合位点与其结合配偶体（例如抗原）之间全部非共价相互作用总和的强度。除非另有指示，如本文中使用的，“结合亲和力”指反映结合对的成员（例如抗体和抗原）之间1:1相互作用的内在结合亲和力。分子X对其配偶体Y的亲和力通常可以用解离常数(Kd)来表述。亲和力可以通过本领域知道的常用方法来测量，包括本文中所描述的方法。下文描述了用于测量结合亲和力的具体的说明性和例示性的实施方案。
“亲和力成熟的”抗体指在一个或多个高变区(HVR)中具有一处或多处改变的抗体，与不拥有此类改变的亲本抗体相比，此类改变导致该抗体对抗原的亲和力改善。
术语“抗NRG1抗体”和“结合NRG1的抗体”指能够以足够的亲和力结合神经调节蛋白1(NRG1)，使得抗体可用作靶向NRG1中的诊断和/或治疗剂的抗体。在一个实施方案中，抗NRG1抗体对无关的、非NRG1蛋白的结合程度小于抗体对NRG1的结合的约10%，如例如通过放射性免疫测定法(RIA)测量的。在某些实施方案中，结合NRG1的抗体具有≤1μM、≤100nM、≤10nM、≤1nM、≤0.1nM、≤0.01nM、或≤0.001nM（例如10-8M或更少，例如10-8M至10-13M，例如10-9M至10-13M）的解离常数(Kd)。在某些实施方案中，抗NRG1抗体结合来自不同物种的NRG1间保守的NRG1表位。
本文中的术语“抗体”以最广义使用，并且涵盖各种抗体结构，包括但不限于单克隆抗体、多克隆抗体、多特异性抗体（例如双特异性抗体）、和抗体片段，只要它们展现出期望的抗原结合活性。
“抗体片段”指与完整抗体不同的分子，其包含完整抗体中与完整抗体结合的抗原结合的部分。抗体片段的例子包括但不限于Fv、Fab、Fab’、Fab’-SH、F(ab’)2；双抗体；线性抗体；单链抗体分子（例如scFv）；和由抗体片段形成的多特异性抗体。
与参照抗体“结合相同表位的抗体”指在竞争测定法中将参照抗体对其抗原的结合阻断50%或更多的抗体，且相反，参照抗体在竞争测定法中将该抗体对其抗原的结合阻断50%或更多。本文中提供了一种例示性的竞争测定法。
术语“嵌合”抗体指其中的重和/或轻链的一部分自特定的来源或物种衍生，而重和/或轻链的剩余部分自不同来源或物种衍生的抗体。
术语“癌症”和“癌性”指或描述哺乳动物中特征通常为细胞生长/增殖不受调节的生理状况。癌症的例子包括但不限于癌瘤、淋巴瘤（例如，何杰金(Hodgkin)氏和非何杰金氏淋巴瘤）、母细胞瘤、肉瘤、和白血病。此类癌症的更具体的例子包括鳞状细胞癌、小细胞肺癌、非小细胞肺癌、肺的腺癌、肺的鳞癌、腹膜癌、肝细胞癌、胃肠癌、胰腺癌、胶质瘤、***、卵巢癌、肝癌、膀胱癌、肝瘤(hepatoma)、乳腺癌、结肠癌、结肠直肠癌、子宫内膜癌或子宫癌、唾液腺癌、肾癌、肝癌、***癌、外阴癌、甲状腺癌、肝癌(hepatic carcinoma)、白血病和其它淋巴增殖性病症、和各种类型的头和颈癌。
抗体的“类”指其重链拥有的恒定域或恒定区的类型。抗体有5大类：IgA、IgD、IgE、IgG、和IgM，并且这些中的几种可以进一步分成亚类（同种型），例如，IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1、和IgA2。与不同类免疫球蛋白对应的重链恒定域分别称作α、δ、ε、γ、和μ。
如本文中所使用的，术语“细胞毒剂”指抑制或阻止细胞功能和/或引起细胞死亡或破坏的物质。细胞毒剂包括但不限于：放射性同位素（例如At211、I131、I125、Y90、Re186、Re188、Sm153、Bi212、P32、Pb212和Lu的放射性同位素）；化学治疗剂或药物（例如甲氨蝶呤(methotrexate)、阿霉素(adriamicin)、长春花生物碱类(vinca alkaloids)（长春新碱(vincristine)、长春碱(vinblastine)、依托泊苷(etoposide)）、多柔比星(doxorubicin)、美法仑(melphalan)、丝裂霉素(mitomycin)C、苯丁酸氮芥(chlorambucil)、柔红霉素(daunorubicin)或其它嵌入剂）；生长抑制剂；酶及其片段，诸如溶核酶；抗生素；毒素，诸如小分子毒素或者细菌、真菌、植物或动物起源的酶活性毒素，包括其片段和/或变体；及下文公开的各种抗肿瘤或抗癌剂。
“效应器功能”指那些可归于抗体Fc区且随抗体同种型而变化的生物学活性。抗体效应器功能的例子包括：C1q结合和补体依赖性细胞毒性(CDC)；Fc受体结合；抗体依赖性细胞介导的细胞毒性(ADCC)；吞噬作用；细胞表面受体（例如B细胞受体）下调；和B细胞活化。
药剂（例如药物配制剂）的“有效量”指在必需的剂量和时段上有效实现期望的治疗或预防结果的量。
本文中的术语“Fc区”用于定义免疫球蛋白重链中至少含有恒定区一部分的C端区。该术语包括天然序列Fc区和变体Fc区。在一个实施方案中，人IgG重链Fc区自Cys226，或自Pro230延伸至重链的羧基端。然而，Fc区的C端赖氨酸(Lys447)可以存在或不存在。除非本文中另有规定，Fc区或恒定区中的氨基酸残基的编号方式依照EU编号***，又称作EU索引，如记载于Kabat等,Sequences of Proteins of Immunological Interest,第5版Public HealthService,National Institutes of Health,Bethesda,MD,1991。
“框架”或“FR”指除高变区(HVR)残基外的可变域残基。一般地，可变域的FR由4个FR域组成：FR1、FR2、FR3、和FR4。因而，HVR和FR序列在VH（或VL）中一般以如下的顺序出现：FR1-H1(L1)-FR2-H2(L2)-FR3-H3(L3)-FR4。
术语“全长抗体”、“完整抗体”、和“全抗体”在本文中可互换使用，指与天然抗体结构具有基本上类似的结构或者具有含有如本文中所限定的Fc区的重链的抗体。
术语“宿主细胞”、“宿主细胞系”、和“宿主细胞培养物”可互换使用，并且指已经导入外源核酸的细胞，包括此类细胞的后代。宿主细胞包括“转化体”和“经转化的细胞”，其包括原代的经转化的细胞及自其衍生的后代而不考虑传代的次数。后代在核酸内容物上可以与亲本细胞不完全相同，而是可以含有突变。本文中包括具有与在初始转化细胞中筛选或选择的相同的功能或生物学活性的突变体后代。
“人抗体”指拥有与由人或人细胞生成的或利用人抗体全集或其它人抗体编码序列自非人来源衍生的抗体的氨基酸序列对应的氨基酸序列的抗体。人抗体的此定义明确排除包含非人抗原结合残基的人源化抗体。
“人共有框架”指代表人免疫球蛋白VL或VH框架序列选集中最常存在的氨基酸残基的框架。通常，人免疫球蛋白VL或VH序列选集来自可变域序列亚组。通常，序列亚组是如Kabat等，Sequences of Proteins of ImmunologicalInterest,第五版,NIH Publication91-3242,Bethesda MD(1991),第1-3卷中的亚组。在一个实施方案中，对于VL，亚组是如Kabat等，见上文中的亚组κI。在一个实施方案中，对于VH，亚组是如Kabat等，见上文中的亚组III。
“人源化”抗体指包含来自非人HVR的氨基酸残基和来自人FR的氨基酸残基的嵌合抗体。在某些实施方案中，人源化抗体会包含至少一个，通常两个基本上整个可变域，其中所有或基本上所有HVR（例如，CDR）对应于非人抗体的那些，且所有或基本上所有FR对应于人抗体的那些。任选地，人源化抗体可以至少包含自人抗体衍生的抗体恒定区的一部分。抗体（例如非人抗体）的“人源化形式”指已经经历人源化的抗体。
如本文中所使用的，术语“高变区”或“HVR”指抗体可变域中在序列上高变的和/或形成结构上限定的环（“高变环”）的每个区。一般地，天然的4链抗体包含6个HVR；三个在VH中（H1、H2、H3），且三个在VL中（L1、L2、L3）。HVR一般包含来自高变环和/或来自“互补决定区”(CDR)的氨基酸残基，后一种是最高序列变异性的和/或牵涉抗原识别。例示性的高变环存在于氨基酸残基26-32(L1)、50-52(L2)、91-96(L3)、26-32(H1)、53-55(H2)、和96-101(H3)(Chothia和Lesk,J.Mol.Biol.196:901-917(1987))。例示性的CDR(CDR-L1、CDR-L2、CDR-L3、CDR-H1、CDR-H2、和CDR-H3)存在于L1的氨基酸残基24-34、L2的50-56、L3的89-97、H1的31-35B、H2的50-65、和H3的95-102(Kabat等,Sequences of Proteins of Immunological Interest,第5版Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,MD(1991))。除了VH中的CDR1外，CDR一般包含形成高变环的氨基酸残基。CDR还包含“特异性决定残基”，或“SDR”，其是接触抗原的残基。SDR包含在称作缩短的-CDR，或a-CDR的CDR区内。例示性的a-CDR(a-CDR-L1、a-CDR-L2、a-CDR-L3、a-CDR-H1、a-CDR-H2、和a-CDR-H3)存在于L1的氨基酸残基31-34、L2的50-55、L3的89-96、H1的31-35B、H2的50-58、和H3的95-102(见Almagro和Fransson,Front.Biosci.13:1619-1633(2008))。除非另有指示，可变域中的HVR残基和其它残基（例如，FR残基）在本文中依照Kabat等，见上文编号。
“免疫缀合物”指与一种或多种异源分子（包括但不限于细胞毒剂）缀合的抗体。
“个体”或“受试者”或“患者”是哺乳动物。哺乳动物包括但不限于驯养的动物（例如，牛、绵羊、猫、犬、和马）、灵长类（例如，人和非人灵长类诸如猴）、家兔、和啮齿类（例如，小鼠和大鼠）。在某些实施方案中，个体、受试者、或患者是人。
“分离的”抗体指已经与其天然环境的组分分开的抗体。在一些实施方案中，抗体纯化至大于95%或99%的纯度，如通过例如电泳（例如，SDS-PAGE、等电聚焦(IEF)、毛细管电泳）或层析（例如，离子交换或反相HPLC）测定的。关于用于评估抗体纯度的方法的综述，见例如Flatman等,J.Chromatogr.B848:79-87(2007)。
“分离的”核酸指已经与其天然环境的组分分开的核酸分子。分离的核酸包括通常含有核酸分子的细胞中含有的核酸分子，但是核酸分子在染色体外或在与其天然染色***置不同的染色***置处存在。
“编码抗NRG1抗体的分离的核酸”指编码抗体重和轻链（或其片段）的一种或多种核酸分子，包括单一载体或分开的载体中的此类核酸分子，和存在于宿主细胞中的一个或多个位置的此类核酸分子。
如本文中所使用的，术语“单克隆抗体”指从一群基本上同质的抗体获得的抗体，即构成群体的各个抗体是相同的和/或结合相同表位，除了例如含有天然存在的突变或在单克隆抗体制备物的生成期间发生的可能的变体抗体外，此类变体一般以极小量存在。与通常包含针对不同决定簇（表位）的不同抗体的多克隆抗体制备物不同，单克隆抗体制备物的每个单克隆抗体针对抗原上的单一决定簇。如此，修饰语“单克隆”指示抗体自一群基本上同质的抗体获得的特征，而不应解释为要求通过任何特定方法来生成抗体。例如，可以通过多种技术来生成要依照本发明使用的单克隆抗体，包括但不限于杂交瘤方法、重组DNA方法、噬菌体展示方法、和利用含有所有或部分人免疫球蛋白基因座的转基因动物的方法，本文中描述了用于生成单克隆抗体的此类方法和其它例示性方法。
“裸抗体”指未与异源模块（例如细胞毒性模块）或放射性标记物缀合的抗体。裸抗体可以存在于药物配制剂中。
“天然抗体”指具有不同结构的天然存在的免疫球蛋白分子。例如，天然IgG抗体是约150,000道尔顿的异四聚糖蛋白，由二硫化物键合的两条相同轻链和两条相同重链构成。从N至C端，每条重链具有一个可变区(VH)，又称作可变重域或重链可变域，接着是三个恒定域（CH1、CH2、和CH3）。类似地，从N至C端，每条轻链具有一个可变区(VL)，又称作可变轻域或轻链可变域，接着是一个恒定轻(CL)域。根据其恒定域氨基酸序列，抗体轻链可归入两种型中的一种，称作卡帕(κ)和拉姆达(λ)。
术语“包装插页”用于指治疗产品的商业包装中通常包含的用法说明书，其含有关于涉及此类治疗产品应用的适应症、用法、剂量、施用、联合疗法、禁忌症和/或警告的信息。
关于参照多肽序列的“百分比(%)氨基酸序列同一性”定义为比对序列并在必要时引入缺口以获取最大百分比序列同一性后，且不将任何保守替代视为序列同一性的一部分时，候选序列中与参照多肽序列中的氨基酸残基相同的氨基酸残基的百分率。为测定百分比氨基酸序列同一性目的的对比可以以本领域技术范围内的多种方式进行，例如使用公众可得到的计算机软件，诸如BLAST、BLAST-2、ALIGN或Megalign(DNASTAR)软件。本领域技术人员可以决定用于比对序列的合适参数，包括对所比较序列全长获得最大对比所需的任何算法。然而，为了本发明的目的，%氨基酸序列同一性值是使用序列比较计算机程序ALIGN-2产生的。ALIGN-2序列比较计算机程序由Genentech,Inc.编写，并且源代码已经连同用户文档一起提交给美国版权局(US Copyright Office,Washington D.C.,20559)，其中其以美国版权注册号TXU510087注册。公众自Genentech,Inc.(South San Francisco,California)可获得ALIGN-2程序，或者可以从源代码编译。ALIGN2程序应当编译成在UNIX操作***（包括数码UNIX V4.0D）上使用。所有序列比较参数由ALIGN-2程序设定且不变。
在采用ALIGN-2来比较氨基酸序列的情况中，给定氨基酸序列A相对于(to)、与(with)、或针对(against)给定氨基酸序列B的%氨基酸序列同一性（或者可表述为具有或包含相对于、与、或针对给定氨基酸序列B的某一%氨基酸序列同一性的给定氨基酸序列A）如下计算：
分数X/Y乘100
其中X是由序列比对程序ALIGN-2在该程序的A和B比对中评分为相同匹配的氨基酸残基数，且其中Y是B中的氨基酸残基总数。应当领会，若氨基酸序列A的长度与氨基酸序列B的长度不相等，则A相对于B的%氨基酸序列同一性将不等于B相对于A的%氨基酸序列同一性。除非另有明确说明，本文中所使用的所有%氨基酸序列同一性值都是依照上一段所述，使用ALIGN-2计算机程序获得的。
术语“药物配制剂”指所处形式使得容许其中含有的活性成分的生物学活性是有效的，且不含对会接受配制剂施用的受试者具有不可接受的毒性的别的组分的制剂。
“药学可接受载体”指药物配制剂中与活性成分不同的，且对受试者无毒的成分。药学可接受载体包括但不限于缓冲剂、赋形剂、稳定剂、或防腐剂。
如本文中所使用的，术语“NRG”指来自任何脊椎动物来源，包括哺乳动物诸如灵长类（例如人）和啮齿类（例如，小鼠和大鼠）的任何天然的神经调节蛋白（又称为调蛋白），除非另有指示。该术语涵盖“全长”、未加工的NRG及源自细胞中的加工的任何形式的NRG。该术语还涵盖NRG的天然存在的变体，例如剪接变体或等位变体。存在着4种已知形式的NRG：NRG1(Holmes,W.E.等,Science256:1205-1210(1992))；NRG2(Caraway,K.L.等,Nature387:512-516(1997))；NRG3(Zhang,E.等,Proc Natl Acad Sci USA94:9562-9567))；和NRG4(Harari,D.等,Oncogene18:2681-2689))。由于可变剪接，受体结合需要的NRG1EGF样域存在着两种活性同等型，称为NRG1阿尔法(NRG1α)和NRG1贝塔(NRG1β)。在Genbank登录号BK000383(Falls,D.L.,Ex Cell Res,284:14-30(2003)和美国专利No.5,367,060中显示了例示性的人NRG1的序列。在一个实施方案中，NRG1α包含Swiss Prot登录号Q7RTV8的氨基酸序列(SEQ ID NO：1)。在一个实施方案中，NRG1α的EGF域包含SEQID NO：1氨基酸S177-K241的氨基酸序列(SEQ ID NO：3)。在一个实施方案中，NRG1β包含NCBI登录号NP_039250的氨基酸序列(SEQ ID NO：2)。在一个实施方案中，NRG1β的EGF域包含SEQ ID NO：2氨基酸T176-K246的氨基酸序列(SEQ ID NO：4)。
如本文中所使用的，“治疗/处理”（及其语法变型）指试图改变所治疗个体的天然过程的临床干预，并且可以为了预防或者在临床病理学的过程期间实施。治疗的期望效果包括但不限于预防疾病的发生或再发生、减轻症状、减轻/减少疾病的任何直接或间接病理后果、预防转移、降低疾病进展速率、改善或减轻疾病状态、和消退或改善的预后。在一些实施方案中，使用本发明的抗NRG1抗体来延迟疾病的形成、减缓疾病的进展、预防复发、或延长肿瘤再发生前时间。在某些实施方案中，治疗导致肿瘤再启动细胞的数目减少或完全缺乏；实体瘤中的肿瘤再启动细胞相对于肿瘤中不是肿瘤再启动细胞的细胞的数目减少；和/或抑制肿瘤再启动细胞的增殖。在某些实施方案中，用抗NRG1抗体的治疗导致比在没有用抗NRG1抗体治疗的情况中的肿瘤再发生前时间大至少1.25、1.50、1.75、2.0倍的肿瘤再发生前时间延长。
术语“可变区”或“可变域”指抗体重或轻链中牵涉抗体结合抗原的域。天然抗体的重链和轻链可变域（分别为VH和VL）一般具有类似的结构，其中每个域包含4个保守的框架区(FR)和3个高变区(HVR)（见例如Kindt等KubyImmunology,第6版,W.H.Freeman and Co.,第91页(2007)）。单个VH或VL域可以足以赋予抗原结合特异性。此外，可以分别使用来自结合抗原的抗体的VH或VL域筛选互补VL或VH域的文库来分离结合特定抗原的抗体。见例如，Portolano等,J.Immunol.150:880-887(1993);Clarkson等,Nature352:624-628(1991)。
如本文中所使用的，术语“载体”指能够增殖与其连接的另一种核酸的核酸分子。该术语包括作为自身复制型核酸结构的载体及整合入接受其导入的宿主细胞的基因组中的载体。某些载体能够指导与其可操作连接的核酸的表达。此类载体在本文中称为“表达载体”。
II.组合物和方法
能经由HER3(ErbB3)或HER4(ErbB4)受体任一发生的神经调节蛋白(NRG1)信号传导能触发多种信号传导级联，包括PI3K/Akt，PKC，MAPK和Ras信号传导途径（Junttila,T.T.,et al.(2009);Lee-Hoeflich et al.,(2008);WO2011103242;美国专利公开文本No.20110229493）。而且，抑制NRG1信号传导导致治疗剂治疗后肿瘤复发或再发生的延迟或预防（实施例2-4和WO2011103242；美国专利公开文本No.20110229493）。抑制NRG1诱导的信号传导的抗NRG1抗体可用于治疗与NRG1信号传导（包括自分泌NRG1信号传导）有关的癌症。
因而，本发明的一个方面提供结合NRG1的抗体（抗NRG1抗体）。这些抗体可用于治疗癌症及预防用治疗剂治疗后的癌症再发生和/或抗性。
在一个实施方案中，所述抗NRG1抗体结合神经调节蛋白1α和神经调节蛋白1β同等型二者。在一个实施方案中，所述抗NRG1抗体结合神经调节蛋白1β的EGF域和神经调节蛋白1α的EGF域。
在一些实施方案中，所述抗NRG1抗体以10nM，1nM，1x10-1nM，1x10-2nM，1x10-3nM或更少的kD结合神经调节蛋白1β且以10nM，1nM，1x10-1nM，1x10-2nM，1x10-3nM或更少的kD结合神经调节蛋白1α。
在一些实施方案中，所述抗NRG1抗体以10nM，1nM，1x10-1nM，1x10-2nM，1x10-3nM或更少的kD结合神经调节蛋白1β的EGF域且以10nM，1nM，1x10-1nM，1x10-2nM，1x10-3nM或更少的kD结合神经调节蛋白1α的EGF域。
在一些实施方案中，所述抗NRG1抗体以10nM，1nM，1x10-1nM，1x10-2nM，1x10-3nM或更少的kD结合神经调节蛋白1β。
在一些实施方案中，所述抗NRG1抗体以10nM，1nM，1x10-1nM，1x10-2nM，1x10-3nM或更少的kD结合神经调节蛋白1β的EGF域。
在一些实施方案中，所述抗NRG1抗体结合神经调节蛋白1β的亲和力等于或大于它结合神经调节蛋白1α的亲和力。在一些实施方案中，所述抗NRG1抗体结合神经调节蛋白1β的亲和力比它结合神经调节蛋白1α的亲和力大10，20，30，40，50，60，70，80，90，100，125，150，200，250，300，350，400，450，500，550，600，650，700，750，800，850，900，950，1000，1500，2000倍或更多。
在一些实施方案中，所述抗NRG1抗体结合神经调节蛋白1β的EGF域的亲和力等于或大于它结合神经调节蛋白1α的EGF域的亲和力。在一些实施方案中，所述抗NRG1抗体结合神经调节蛋白1β的EGF域的亲和力比它结合神经调节蛋白1α的EGF域的亲和力大10，20，30，40，50，60，70，80，90，100，125，150，200，250，300，350，400，450，500，550，600，650，700，750，800，850，900，950，1000，1500，2000倍或更多。
在一些实施方案中，所述抗NRG1抗体结合神经调节蛋白1α的亲和力等于或大于它结合神经调节蛋白1β的亲和力。在一些实施方案中，所述抗NRG1抗体结合神经调节蛋白1α的亲和力比它结合神经调节蛋白1β的亲和力大10，20，30，40，50，60，70，80，90，100，125，150，200，250，300，350，400，450，500，550，600，650，700，750，800，850，900，950，1000，1500，2000倍或更多。
在一些实施方案中，所述抗NRG1抗体结合神经调节蛋白1α的EGF域等于或大于它结合神经调节蛋白1β的EGF域的亲和力。在一些实施方案中，所述抗NRG1抗体结合神经调节蛋白1α的EGF域的亲和力比它结合神经调节蛋白1β的EGF域的亲和力大10，20，30，40，50，60，70，80，90，100，125，150，200，250，300，350，400，450，500，550，600，650，700，750，800，850，900，950，1000，1500，2000倍或更多。
在一个实施方案中，所述抗NRG1抗体结合神经调节蛋白1β表位和神经调节蛋白1α表位。在一个实施方案中，所述表位存在于神经调节蛋白1β和神经调节蛋白1α的EGF域中。在一个实施方案中，抗NRG1抗体结合的神经调节蛋白1β表位来自氨基酸序列SEQ ID NO：4，在氨基酸序列SEQ ID NO：4内，或与氨基酸序列SEQ ID NO：4交叠。在一个实施方案中，抗NRG1抗体结合的神经调节蛋白1β表位来自氨基酸序列SEQ ID NO：4的一个区段，在氨基酸序列SEQ ID NO：4的一个区段内，或与氨基酸序列SEQ ID NO：4的一个区段交叠，所述区段诸如例如SEQ ID NO：4的氨基酸1-37或SEQ ID NO：4的氨基酸38-64。
在一个实施方案中，所述抗NRG1抗体结合的神经调节蛋白1α来自氨基酸序列SEQ ID NO：3，在氨基酸序列SEQ ID NO：3内，或与氨基酸序列SEQID NO：3交叠。在一个实施方案中，抗NRG1抗体结合的神经调节蛋白1α表位来自氨基酸序列SEQ ID NO：3的一个区段，在氨基酸序列SEQ ID NO：3的一个区段内，或与氨基酸序列SEQ ID NO：3的一个区段交叠，所述区段诸如例如SEQ ID NO：3的氨基酸1-36of或SEQ ID NO：3的氨基酸37-58的氨基酸序列。
另一方面，本发明提供与本文中提供的抗NRG1抗体结合相同表位的抗NRG1抗体。另一方面，本发明提供与本文中提供的抗NRG1抗体竞争结合相同表位的抗NRG1抗体。
A.例示性NRG抗体
一方面，本发明提供一种抗NRG1抗体，其包含：包含选自SEQ ID NO：5，28，34，37，39，41，和76的氨基酸序列的HVR-H1，包含选自SEQ ID NO：6和29的氨基酸序列的HVR-H2，和包含选自SEQ ID NO：7，30，42，43，44，48，和50的氨基酸序列的HVR-H3。一方面，本发明提供一种抗NRG1抗体，其包含：包含选自SEQ ID NO：8，12，16，19，和31的氨基酸序列的HVR-L1，包含选自SEQ ID NO：9，13，17，32，46，和49的氨基酸序列的HVR-L2，和包含选自SEQ ID NO：10，11，14，15，18，20，33，35，36，38，40，45，47，和51的氨基酸序列的HVR-L3。一方面，本发明提供一种抗NRG1抗体，其包含：包含选自SEQ ID NO：5，28，34，37，39，41，和76的氨基酸序列的HVR-H1，包含选自SEQ ID NO：6和29的氨基酸序列的HVR-H2，和包含选自SEQ ID NO：7，30，42，43，44，48，和50的氨基酸序列的HVR-H3，包含选自SEQ ID NO：8，12，16，19，和31的氨基酸序列的HVR-L1，包含选自SEQ ID NO：9，13，17，32，46，和49的氨基酸序列的HVR-L2，和包含选自SEQ ID NO：10，11，14，15，18，20，33，35，36，38，40，45，47，和51的氨基酸序列的HVR-L3。
一方面，本发明提供一种抗NRG1抗体，其包含：包含氨基酸序列SEQ IDNO：5的HVR-H1，包含氨基酸序列SEQ ID NO：6的HVR-H2，和包含氨基酸序列SEQ ID NO：7的HVR-H3。一方面，本发明提供一种抗NRG1抗体，其包含：包含选自SEQ ID NO：8，12，16，和19的氨基酸序列的HVR-L1，包含选自SEQ ID NO：9，13，和17的氨基酸序列的HVR-L2，和包含选自SEQID NO：10，11，14，15，18，和20的氨基酸序列的HVR-L3。一方面，本发明提供一种抗NRG1抗体，其包含：包含氨基酸序列SEQ ID NO：5的HVR-H1，包含氨基酸序列SEQ ID NO：6的HVR-H2，和包含氨基酸序列SEQ ID NO：7的HVR-H3，包含选自SEQ ID NO：8，12，16，和19的氨基酸序列的HVR-L1，包含选自SEQ ID NO：9，13，和17的氨基酸序列的HVR-L2，和包含选自SEQID NO：10，11，14，15，18，和20的氨基酸序列的HVR-L3。
一方面，本发明提供一种抗NRG1抗体，其包含：包含选自SEQ ID NO：28，34，37，39，41，和76的氨基酸序列的HVR-H1，包含氨基酸序列SEQ IDNO：6的HVR-H2，和包含选自SEQ ID NO：30，42，43，44，48，和50的氨基酸序列的HVR-H3。一方面，本发明提供一种抗NRG1抗体，其包含：包含选自SEQ ID NO：19和31的氨基酸序列的HVR-L1，包含选自SEQ ID NO：32，46，和49的氨基酸序列的HVR-L2，和包含选自SEQ ID NO：33，35，36，38，40，45，47，和51的氨基酸序列的HVR-L3。一方面，本发明提供一种抗NRG1抗体，其包含：包含选自SEQ ID NO：28，34，37，39，41，和76的氨基酸序列的HVR-H1，包含氨基酸序列SEQ ID NO：6的HVR-H2，和包含选自SEQ ID NO：30，42，43，44，48，和50的氨基酸序列的HVR-H3，包含选自SEQ ID NO：19和31的氨基酸序列的HVR-L1，包含选自SEQ IDNO：32，46，和49的氨基酸序列的HVR-L2，和包含选自SEQ ID NO：33，35，36，38，40，45，47，和51的氨基酸序列的HVR-L3。
一方面，本发明提供一种抗NRG1抗体，其包含至少一种，两种，三种，四种，五种，或六种选自下述的HVR：(a)包含氨基酸序列SEQ ID NO：5的HVR-H1；(b)包含氨基酸序列SEQ ID NO：6的HVR-H2；(c)包含氨基酸序列SEQ ID NO：7的HVR-H3；(d)包含氨基酸序列SEQ ID NO：16的HVR-L1；(e)包含氨基酸序列SEQ ID NO：17的HVR-L2；和(f)包含氨基酸序列SEQ ID NO：18的HVR-L3。
一方面，本发明提供一种抗体，其包含至少一种，至少两种，或所有三种选自下述的VH HVR序列：(a)包含氨基酸序列SEQ ID NO：5的HVR-H1；(b)包含氨基酸序列SEQ ID NO：6的HVR-H2；和(c)包含氨基酸序列SEQ IDNO：7的HVR-H3。在又一个实施方案中，所述抗体包含：(a)包含氨基酸序列SEQ ID NO：5的HVR-H1；(b)包含氨基酸序列SEQ ID NO：6的HVR-H2；和(c)包含氨基酸序列SEQ ID NO：7的HVR-H3。
一方面，本发明提供一种抗体，其包含至少一种，至少两种，或所有三种选自下述的VL HVR序列：(a)包含氨基酸序列SEQ ID NO：16的HVR-L1；(b)包含氨基酸序列SEQ ID NO：17的HVR-L2；和(c)包含氨基酸序列SEQID NO：18的HVR-L3。在一个实施方案中，所述抗体包含：(a)包含氨基酸序列SEQ ID NO：16的HVR-L1；(b)包含氨基酸序列SEQ ID NO：17的HVR-L2；和(c)包含氨基酸序列SEQ ID NO：18的HVR-L3。
另一方面，本发明的抗体包含：(a)包含至少一种，至少两种，或所有三种选自下述的VH HVR序列的VH域：(i)包含氨基酸序列SEQ ID NO：5的HVR-H1，(ii)包含氨基酸序列SEQ ID NO：6的HVR-H2，和(iii)包含氨基酸序列SEQ ID NO：7的HVR-H3；和(b)包含至少一种，至少两种，或所有三种选自下述的VL HVR序列的VL域：(i)包含氨基酸序列SEQ ID NO：16的HVR-L1，(ii)包含氨基酸序列SEQ ID NO：17的HVR-L2，和(c)包含氨基酸序列SEQ ID NO：18的HVR-L3。
另一方面，本发明提供一种抗体，其包含(a)包含氨基酸序列SEQ IDNO：5的HVR-H1；(b)包含氨基酸序列SEQ ID NO：6的HVR-H2；(c)包含氨基酸序列SEQ ID NO：7的HVR-H3；(d)包含氨基酸序列SEQ ID NO：16的HVR-L1；(e)包含氨基酸序列SEQ ID NO：17的HVR-L2；和(f)包含氨基酸序列SEQ ID NO：18的HVR-L3。
一方面，本发明提供一种抗NRG1抗体，其包含至少一种，两种，三种，四种，五种，或六种选自下述的HVR：(a)包含氨基酸序列SEQ ID NO：76的HVR-H1；(b)包含氨基酸序列SEQ ID NO：29的HVR-H2；(c)包含氨基酸序列SEQ ID NO：43的HVR-H3；(d)包含氨基酸序列SEQ ID NO：31的HVR-L1；(e)包含氨基酸序列SEQ ID NO：32的HVR-L2；和(f)包含氨基酸序列SEQ ID NO：33的HVR-L3。
一方面，本发明提供一种抗体，其包含至少一种，至少两种，或所有三种选自下述的VH HVR序列：(a)包含氨基酸序列SEQ ID NO：76的HVR-H1；(b)包含氨基酸序列SEQ ID NO：29的HVR-H2；和(c)包含氨基酸序列SEQID NO：43的HVR-H3。在又一个实施方案中，所述抗体包含：(a)包含氨基酸序列SEQ ID NO：76的HVR-H1；(b)包含氨基酸序列SEQ ID NO：29的HVR-H2；和(c)包含氨基酸序列SEQ ID NO：43的HVR-H3。
一方面，本发明提供一种抗体，其包含至少一种，至少两种，或所有三种选自下述的VL HVR序列：(a)包含氨基酸序列SEQ ID NO：31的HVR-L1；(b)包含氨基酸序列SEQ ID NO：32的HVR-L2；和(c)包含氨基酸序列SEQID NO：33的HVR-L3。在一个实施方案中，所述抗体包含：(a)包含氨基酸序列SEQ ID NO：31的HVR-L1；(b)包含氨基酸序列SEQ ID NO：32的HVR-L2；和(c)包含氨基酸序列SEQ ID NO：33的HVR-L3。
另一方面，本发明的抗体包含：(a)包含至少一种，至少两种，或所有三种选自下述的VH HVR序列的VH域：(i)包含氨基酸序列SEQ ID NO：76的HVR-H1，(ii)包含氨基酸序列SEQ ID NO：29的HVR-H2，和(iii)包含氨基酸序列SEQ ID NO：43的HVR-H3；和(b)包含至少一种，至少两种，或所有三种选自下述的VL HVR序列的VL域：(i)包含氨基酸序列SEQ ID NO：31的HVR-L1，(ii)包含氨基酸序列SEQ ID NO：32的HVR-L2，和(c)包含氨基酸序列SEQ ID NO：33的HVR-L3。
另一方面，本发明提供一种抗体，其包含：(a)包含氨基酸序列SEQ IDNO：76的HVR-H1；(b)包含氨基酸序列SEQ ID NO：29的HVR-H2；(c)包含氨基酸序列SEQ ID NO：43的HVR-H3；(d)包含氨基酸序列SEQ ID NO：31的HVR-L1；(e)包含氨基酸序列SEQ ID NO：32的HVR-L2；和(f)包含氨基酸序列SEQ ID NO：33的HVR-L3。
一方面，本发明提供一种抗NRG1抗体，其包含重链可变区(VH)，该重链可变区(VH)包含氨基酸序列SEQ ID NO：21。一方面，本发明提供一种抗NRG1抗体，其包含轻链可变区(VL)，该轻链可变区(VL)包含选自SEQ IDNO：22，23，24，25，26，和27的氨基酸序列。一方面，本发明提供一种抗NRG1抗体，其包含VH和VL，该VH包含氨基酸序列SEQ ID NO：21，该VL包含选自SEQ ID NO：22，23，24，25，26，和27的氨基酸序列。
一方面，本发明提供一种抗NRG1抗体，其包含重链可变区(VH)，该重链可变区(VH)包含选自SEQ ID NO：52，54，56，58，60，62，63，64，66，68，70，和72的氨基酸序列。一方面，本发明提供一种抗NRG1抗体，其包含轻链可变区(VL)，该轻链可变区(VL)包含选自SEQ ID NO：53，55，57，59，61，63，65，67，69，71，73，和75的氨基酸序列。一方面，本发明提供一种抗NRG1抗体，其包含VH和VL，该VH包含选自SEQ ID NO：52，54，56，58，60，62，63，64，66，68，70，和72的氨基酸序列，该VL包含选自SEQ ID NO：53，55，57，59，61，63，65，67，69，71，73，和75的氨基酸序列。
另一方面，抗NRG1抗体包含与氨基酸序列SEQ ID NO：21具有至少90%，91%，92%，93%，94%，95%，96%，97%，98%，99%，或100%序列同一性的VH序列。另一方面，抗NRG1抗体包含与选自SEQ ID NO：22，23，24，25，26，和27的氨基酸序列具有至少90%，91%，92%，93%，94%，95%，96%，97%，98%，99%，或100%序列同一性的VL序列。另一方面，抗NRG1抗体包含与氨基酸序列SEQ ID NO：21具有至少90%，91%，92%，93%，94%，95%，96%，97%，98%，99%，或100%序列同一性的VH序列和与选自SEQ ID NO：22，23，24，25，26，和27的氨基酸序列具有至少90%，91%，92%，93%，94%，95%，96%，97%，98%，99%，或100%序列同一性的VL序列。
另一方面，抗NRG1抗体包含与选自SEQ ID NO：52，54，56，58，60，62，63，64，66，68，70，和72的氨基酸序列具有至少90%，91%，92%，93%，94%，95%，96%，97%，98%，99%，或100%序列同一性的VH序列。另一方面，抗NRG1抗体包含与选自SEQ ID NO：53，55，57，59，61，63，65，67，69，71，73，和75的氨基酸序列具有至少90%，91%，92%，93%，94%，95%，96%，97%，98%，99%，或100%序列同一性的VL序列。另一方面，抗NRG1抗体包含与选自SEQ ID NO：52，54，56，58，60，62，63，64，66，68，70，和72的氨基酸序列具有至少90%，91%，92%，93%，94%，95%，96%，97%，98%，99%，或100%序列同一性的VH序列和与选自SEQID NO：53，55，57，59，61，63，65，67，69，71，73，和75的氨基酸序列具有至少90%，91%，92%，93%，94%，95%，96%，97%，98%，99%，或100%序列同一性的VL序列。
另一方面，抗NRG1抗体包含与氨基酸序列SEQ ID NO：21具有至少90%，91%，92%，93%，94%，95%，96%，97%，98%，99%，或100%序列同一性的VH序列。在某些实施方案中，具有至少90%，91%，92%，93%，94%，95%，96%，97%，98%，或99%同一性的VH序列相对于参照序列含有替代（例如保守替代），***，或删除，但是包含该序列的抗NRG1抗体保留结合NRG1α和NRG1β的能力。在某些实施方案中，在SEQ ID NO：21中替代，***和/或删除总共1至10个氨基酸。在某些实施方案中，在HVR以外的区域中（即在FR中）发生替代，***，或删除。任选地，抗NRG1抗体包含VH序列SEQ ID NO：21，包括该序列的翻译后修饰。在一个特别的实施方案中，VH包含一种，两种或三种选自下述的HVR：(a)包含氨基酸序列SEQID NO：5的HVR-H1，(b)包含氨基酸序列SEQ ID NO：6的HVR-H2，和(c)包含氨基酸序列SEQ ID NO：7的HVR-H3。
另一方面，提供一种抗NRG1抗体，其中该抗体包含与氨基酸序列SEQID NO：26具有至少90%，91%，92%，93%，94%，95%，96%，97%，98%，99%，或100%序列同一性的轻链可变域(VL)。在某些实施方案中，具有至少90%，91%，92%，93%，94%，95%，96%，97%，98%，或99%同一性的VL序列相对于参照序列含有替代（例如保守替代），***，或删除，但是包含该序列的抗NRG1抗体保留结合NRG1α和NRG1β的能力。在某些实施方案中，在SEQ ID NO：26中替代，***和/或删除总共1至10个氨基酸。在某些实施方案中，在HVR以外的区域中（即在FR中）发生替代，***，或删除。任选地，抗NRG1抗体包含VL序列SEQ ID NO：26，包括该序列的翻译后修饰。在一个特别的实施方案中，VL包含一种，两种或三种选自下述的HVR：(a)包含氨基酸序列SEQ ID NO：16的HVR-L1；(b)包含氨基酸序列SEQ IDNO：17的HVR-L2；和(c)包含氨基酸序列SEQ ID NO：18的HVR-L3。
另一方面，提供一种抗NRG1抗体，其中该抗体包含上文提供的任何实施方案中的VH和上文提供的任何实施方案中的VL。在一个实施方案中，该抗体包含分别在SEQ ID NO：21和SEQ ID NO：26中的VH和VL序列，包括那些序列的翻译后修饰。
另一方面，抗NRG1抗体包含与氨基酸序列SEQ ID NO：63具有至少90%，91%，92%，93%，94%，95%，96%，97%，98%，99%，或100%序列同一性的VH序列。在某些实施方案中，具有至少90%，91%，92%，93%，94%，95%，96%，97%，98%，或99%同一性的VH序列相对于参照序列含有替代（例如保守替代），***，或删除，但是包含该序列的抗NRG1抗体保留结合NRG1α和NRG1β的能力。在某些实施方案中，在SEQ ID NO：63中替代，***和/或删除总共1至10个氨基酸。在某些实施方案中，在HVR以外的区域中（即在FR中）发生替代，***，或删除。任选地，抗NRG1抗体包含VH序列SEQ ID NO：63，包括该序列的翻译后修饰。在一个特别的实施方案中，VH包含一种，两种或三种选自下述的HVR：(a)包含氨基酸序列SEQID NO：76的HVR-H1，(b)包含氨基酸序列SEQ ID NO：29的HVR-H2，和(c)包含氨基酸序列SEQ ID NO：43的HVR-H3。
另一方面，提供一种抗NRG1抗体，其中该抗体包含与氨基酸序列SEQID NO：53具有至少90%，91%，92%，93%，94%，95%，96%，97%，98%，99%，或100%序列同一性的轻链可变域(VL)。在某些实施方案中，具有至少90%，91%，92%，93%，94%，95%，96%，97%，98%，或99%同一性的VL序列相对于参照序列含有替代（例如保守替代），***，或删除，但是包含该序列的抗NRG1抗体保留结合NRG1α和NRG1β的能力。在某些实施方案中，在SEQ ID NO：53中替代，***和/或删除总共1至10个氨基酸。在某些实施方案中，在HVR以外的区域中（即在FR中）发生替代，***，或删除。任选地，抗NRG1抗体包含VL序列SEQ ID NO：53，包括该序列的翻译后修饰。在一个特别的实施方案中，VL包含一种，两种或三种选自下述的HVR：(a)包含氨基酸序列SEQ ID NO：31的HVR-L1；(b)包含氨基酸序列SEQ IDNO：32的HVR-L2；和(c)包含氨基酸序列SEQ ID NO：33的HVR-L3。
另一方面，提供一种抗NRG1抗体，其中该抗体包含上文提供的任何实施方案中的VH和上文提供的任何实施方案中的VL。在一个实施方案中，该抗体包含分别在SEQ ID NO：63和SEQ ID NO：53中的VH和VL序列，包括那些序列的翻译后修饰。
另一方面，抗NRG1抗体包含与氨基酸序列SEQ ID NO：72具有至少90%，91%，92%，93%，94%，95%，96%，97%，98%，99%，或100%序列同一性的重链序列。在某些实施方案中，具有至少90%，91%，92%，93%，94%，95%，96%，97%，98%，或99%同一性的重链序列相对于参照序列含有替代（例如保守替代），***，或删除，但是包含该序列的抗NRG1抗体保留结合NRG1α和NRG1β的能力。在某些实施方案中，在SEQ ID NO：72中替代，***和/或删除总共1至10个氨基酸。在某些实施方案中，在HVR以外的区域中（即在FR中）发生替代，***，或删除。任选地，抗NRG1抗体包含重链序列SEQ ID NO：72，包括该序列的翻译后修饰。
另一方面，提供一种抗NRG1抗体，其中该抗体包含与氨基酸序列SEQID NO：73具有至少90%，91%，92%，93%，94%，95%，96%，97%，98%，99%，或100%序列同一性的轻链。在某些实施方案中，具有至少90%，91%，92%，93%，94%，95%，96%，97%，98%，或99%同一性的轻链序列相对于参照序列含有替代（例如保守替代），***，或删除，但是包含该序列的抗NRG1抗体保留结合NRG1α和NRG1β的能力。在某些实施方案中，在SEQID NO：73中替代，***和/或删除总共1至10个氨基酸。在某些实施方案中，在HVR以外的区域中（即在FR中）发生替代，***，或删除。任选地，抗NRG1抗体包含轻链序列SEQ ID NO：73，包括该序列的翻译后修饰。
另一方面，提供一种抗NRG1抗体，其中该抗体包含上文提供的任何实施方案中的重链和上文提供的任何实施方案中的轻链。在一个实施方案中，该抗体包含分别在SEQ ID NO：72和SEQ ID NO：73中的重链和轻链序列，包括那些序列的翻译后修饰。
另一方面，抗NRG1抗体包含与氨基酸序列SEQ ID NO：74具有至少90%，91%，92%，93%，94%，95%，96%，97%，98%，99%，或100%序列同一性的重链序列。在某些实施方案中，具有至少90%，91%，92%，93%，94%，95%，96%，97%，98%，或99%同一性的重链序列相对于参照序列含有替代（例如保守替代），***，或删除，但是包含该序列的抗NRG1抗体保留结合NRG1α和NRG1β的能力。在某些实施方案中，在SEQ ID NO：74中替代，***和/或删除总共1至10个氨基酸。在某些实施方案中，在HVR以外的区域中（即在FR中）发生替代，***，或删除。任选地，抗NRG1抗体包含重链序列SEQ ID NO：74，包括该序列的翻译后修饰。
另一方面，提供一种抗NRG1抗体，其中该抗体包含与氨基酸序列SEQID NO：75具有至少90%，91%，92%，93%，94%，95%，96%，97%，98%，99%，或100%序列同一性的轻链。在某些实施方案中，具有至少90%，91%，92%，93%，94%，95%，96%，97%，98%，或99%同一性的轻链序列相对于参照序列含有替代（例如保守替代），***，或删除，但是包含该序列的抗NRG1抗体保留结合NRG1α和NRG1β的能力。在某些实施方案中，在SEQID NO：75中替代，***和/或删除总共1至10个氨基酸。在某些实施方案中，在HVR以外的区域中（即在FR中）发生替代，***，或删除。任选地，抗NRG1抗体包含轻链序列SEQ ID NO：75，包括该序列的翻译后修饰。
另一方面，提供一种抗NRG1抗体，其中该抗体包含上文提供的任何实施方案中的重链和上文提供的任何实施方案中的轻链。在一个实施方案中，抗体包含分别在SEQ ID NO：74和SEQ ID NO：75中的重链和轻链序列，包括那些序列的翻译后修饰。
又一方面，本发明提供与本文中提供的抗NRG1抗体结合相同表位的抗体。在一个实施方案中，提供与下述抗NRG1抗体结合相同表位的抗体，该抗NRG1抗体包含：(a)包含氨基酸序列SEQ ID NO：5的HVR-H1；(b)包含氨基酸序列SEQ ID NO：6的HVR-H2；(c)包含氨基酸序列SEQ ID NO：7的HVR-H3；(d)包含氨基酸序列SEQ ID NO：16的HVR-L1；(e)包含氨基酸序列SEQ ID NO：17的HVR-L2；和(f)包含氨基酸序列SEQ ID NO：18的HVR-L3。
在一个实施方案中，提供与下述抗NRG1抗体结合相同表位的抗体，该抗NRG1抗体包含：(a)包含氨基酸序列SEQ ID NO：76的HVR-H1；(b)包含氨基酸序列SEQ ID NO：29的HVR-H2；(c)包含氨基酸序列SEQ ID NO：43的HVR-H3；(d)包含氨基酸序列SEQ ID NO：31的HVR-L1；(e)包含氨基酸序列SEQ ID NO：32的HVR-L2；和(f)包含氨基酸序列SEQ ID NO：33的HVR-L3。
在一个实施方案中，提供与包含VH序列SEQ ID NO：21和VL序列SEQID NO：26的抗NRG1抗体结合相同表位的抗体。在一个实施方案中，提供与包含VH序列SEQ ID NO：63和VL序列SEQ ID NO：53的抗NRG1抗体结合相同表位的抗体。
在其它实施方案中，提供与本文所述抗NRG1抗体竞争结合相同表位的抗体。
在一个实施方案中，抗NRG1抗体结合神经调节蛋白1β表位和神经调节蛋白1α表位。在一个实施方案中，所述表位存在于神经调节蛋白1β和神经调节蛋白1α的EGF域中。在一个实施方案中，抗NRG1抗体结合来自氨基酸序列SEQ ID NO：4，在氨基酸序列SEQ ID NO：4内，或与氨基酸序列SEQ IDNO：4交叠的神经调节蛋白1β表位。在一个实施方案中，抗NRG1抗体结合的神经调节蛋白1β表位来自氨基酸序列SEQ ID NO：4的一个区段，在氨基酸序列SEQ ID NO：4的一个区段内，或与氨基酸序列SEQ ID NO：4的一个区段交叠，所述区段诸如例如SEQ ID NO：4的氨基酸1-37of或SEQ ID NO：4的氨基酸38-64。
在一个实施方案中，抗NRG1抗体结合来自氨基酸序列SEQ ID NO：3，在氨基酸序列SEQ ID NO：3内，或与氨基酸序列SEQ ID NO：3交叠的神经调节蛋白1α表位。在一个实施方案中，抗NRG1抗体结合的神经调节蛋白1α表位来自氨基酸序列SEQ ID NO：3的一个区段，在氨基酸序列SEQ ID NO：3的一个区段内，或与氨基酸序列SEQ ID NO：3的一个区段交叠，所述区段诸如例如SEQ ID NO：3的氨基酸1-36或SEQ ID NO：3的氨基酸37-58的氨基酸序列。
在本发明的又一个方面，依照任何上述实施方案的抗NRG1抗体为单克隆抗体，包括嵌合抗体，人源化抗体或人抗体。在一个实施方案中，抗NRG1抗体为抗体片段，例如Fv，Fab，Fab’，scFv，双抗体，或F(ab’)2片段。在另一个实施方案中，抗体为全长抗体，例如完整IgG1抗体或其它抗体类或同种型，如本文中定义的。
在又一个方面，依照任何上述实施方案的抗NRG1抗体可单一地或组合地并入下文1-7节中描述的任何特征：
1)抗体亲和力
在某些实施方案中，本文中提供的抗体具有≤1μM、≤100nM、≤10nM、≤1nM、≤0.1nM、≤0.01nM、或≤0.001nM（例如10-8M或更少，例如10-8M至10-13M，例如，10-9M至10-13M）的解离常数(Kd)。
在一个实施方案中，Kd是通过如下述测定法所述用Fab型式的感兴趣抗体及其抗原实施的放射性标记抗原结合测定法(RIA)来测量的。通过在存在未标记抗原的滴定系列的情况中用最小浓度的(125I)标记抗原平衡Fab，然后用抗Fab抗体包被板捕捉结合的抗原来测量Fab对抗原的溶液结合亲和力（见例如Chen等,J.Mol.Biol.293:865-881(1999)）。为了建立测定法的条件，将
Figure BDA0000491186630000261
多孔板(Thermo Scientific)用50mM碳酸钠(pH9.6)中的5μg/ml捕捉用抗Fab抗体(Cappel Labs)包被过夜，随后用PBS中的2%(w/v)牛血清清蛋白于室温（约23℃）封闭2-5小时。在非吸附板(Nunc#269620)中，将100pM或26pM125I-抗原与连续稀释的感兴趣Fab混合（例如与Presta等,Cancer Res.57:4593-4599(1997)中抗VEGF抗体，Fab-12的评估一致）。然后将感兴趣的Fab温育过夜；然而，温育可持续更长时间（例如约65小时）以确保达到平衡。此后，将混合物转移至捕捉板，于室温温育（例如1小时）。然后除去溶液，并用PBS中的0.1%聚山梨酯20
Figure BDA0000491186630000271
洗板8次。平板干燥后，加入150μl/孔闪烁液(MICROSCINT-20TM;Packard)，然后在TOPCOUNT TM伽马计数器(Packard)上对平板计数10分钟。选择各Fab给出小于或等于最大结合之20%的浓度用于竞争性结合测定法。
依照另一个实施方案，Kd是使用表面等离振子共振测定法使用
Figure BDA0000491186630000272
或
Figure BDA0000491186630000273
(BIAcore,Inc.,Piscataway,NJ)于25℃使用固定化抗原CM5芯片在约10个响应单位(RU)测量的。简言之，依照供应商的用法说明书用盐酸N-乙基-N’-(3-二甲氨基丙基)-碳二亚胺(EDC)和N-羟基琥珀酰亚胺(NHS)活化羧甲基化右旋糖苷生物传感器芯片(CM5,BIACORE,Inc.)。将抗原用10mM乙酸钠pH4.8稀释至5μg/ml（约0.2μM），然后以5μl/分钟的流速注射以获得约10个响应单位(RU)的偶联蛋白质。注入抗原后，注入1M乙醇胺以封闭未反应基团。为了进行动力学测量，于25℃以约25μl/分钟的流速注入在含0.05%聚山梨酯20(TWEEN-20TM)表面活性剂的PBS(PBST)中两倍连续稀释的Fab（0.78nM至500nM）。使用简单一对一朗格缪尔(Langmuir)结合模型
Figure BDA0000491186630000274
Evaluation Software version3.2)通过同时拟合结合和解离传感图计算结合速率(kon)和解离速率(koff)。平衡解离常数(Kd)以比率koff/kon计算。见例如Chen等,J.Mol.Biol.293:865-881(1999)。如果根据上文表面等离振子共振测定法，结合速率超过106M-1s-1，那么结合速率可使用荧光淬灭技术来测定，即根据分光计诸如配备了断流装置的分光光度计(Aviv Instruments)或8000系列SLM-AMINCOTM分光光度计(ThermoSpectronic)中用搅拌比色杯的测量，在存在浓度渐增的抗原的情况中，测量PBS pH7.2中20nM抗抗原抗体（Fab形式）于25℃的荧光发射强度（激发=295nm；发射=340nm，16nm带通）的升高或降低。
2)抗体片段
在某些实施方案中，本文中提供的抗体是抗体片段。抗体片段包括但不限于Fab、Fab’、Fab’-SH、F(ab’)2、Fv、和scFv片段，及下文所描述的其它片段。关于某些抗体片段的综述，见Hudson等Nat.Med.9:129-134(2003)。关于scFv片段的综述，见例如Pluckthün,于The Pharmacology of MonoclonalAntibodies,第113卷,Rosenburg和Moore编,(Springer-Verlag,New York),第269-315页(1994);还可见WO93/16185;及美国专利No.5,571,894和5,587,458。关于包含补救受体结合表位残基且具有延长的体内半衰期的Fab和F(ab’)2片段的讨论，见美国专利No.5,869,046。
双抗体是具有两个抗原结合位点的抗体片段，其可以是二价的或双特异性的。见例如EP404,097;WO1993/01161;Hudson等,Nat.Med.9:129-134(2003);及Hollinger等,Proc.Natl.Acad.Sci.USA90:6444-6448(1993)。三抗体和四抗体也记载于Hudson等,Nat.Med.9:129-134(2003)。
单域抗体是包含抗体的整个或部分重链可变域或整个或部分轻链可变域的抗体片段。在某些实施方案中，单域抗体是人单域抗体（Domantis,Inc.,Waltham,MA；见例如美国专利No.6,248,516B1）。
可以通过多种技术，包括但不限于对完整抗体的蛋白水解消化及重组宿主细胞（例如大肠杆菌或噬菌体）的生成来生成抗体片段，如本文中所描述的。
3)嵌合的和人源化的抗体
在某些实施方案中，本文中提供的抗体是嵌合抗体。某些嵌合抗体记载于例如美国专利No.4,816,567;及Morrison等,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,81:6851-6855(1984))。在一个例子中，嵌合抗体包含非人可变区（例如，自小鼠、大鼠、仓鼠、家兔、或非人灵长类，诸如猴衍生的可变区）和人恒定区。在又一个例子中，嵌合抗体是“类转换的”抗体，其中类或亚类已经自亲本抗体的类或亚类改变。嵌合抗体包括其抗原结合片段。
在某些实施方案中，嵌合抗体是人源化抗体。通常，将非人抗体人源化以降低对人的免疫原性，同时保留亲本非人抗体的特异性和亲和力。一般地，人源化抗体包含一个或多个可变域，其中HVR，例如CDR（或其部分）自非人抗体衍生，而FR（或其部分）自人抗体序列衍生。任选地，人源化抗体还会至少包含人恒定区的一部分。在一些实施方案中，将人源化抗体中的一些FR残基用来自非人抗体（例如衍生HVR残基的抗体）的相应残基替代，例如以恢复或改善抗体特异性或亲和力。
人源化抗体及其生成方法综述于例如Almagro和Fransson,Front.Biosci.13:1619-1633(2008)，并且进一步记载于例如Riechmann等,Nature332:323-329(1988);Queen等,Proc.Nat’l Acad.Sci.USA86:10029-10033(1989);美国专利No.5,821,337,7,527,791,6,982,321和7,087,409;Kashmiri等,Methods36:25-34(2005)（描述了SDR(a-CDR)嫁接）；Padlan,Mol.Immunol.28:489-498(1991)（描述了“重修表面”）；Dall’Acqua等,Methods36:43-60(2005)（描述了“FR改组”）；及Osbourn等,Methods36:61-68(2005)和Klimka等,Br.J.Cancer,83:252-260(2000)（描述了FR改组的“引导选择”方法）。
可以用于人源化的人框架区包括但不限于：使用“最佳拟合(best-fit)”方法选择的框架区（见例如Sims等J.Immunol.151:2296(1993)）；自轻或重链可变区的特定亚组的人抗体的共有序列衍生的框架区（见例如Carter等Proc.Natl.Acad.Sci.USA,89:4285(1992);及Presta等J.Immunol.,151:2623(1993)）；人成熟的（体细胞突变的）框架区或人种系框架区（见例如Almagro和Fransson,Front.Biosci.13:1619-1633(2008)）；和通过筛选FR文库衍生的框架区（见例如Baca等,J.Biol.Chem.272:10678-10684(1997)及Rosok等,J.Biol.Chem.271:22611-22618(1996)）。
4)人抗体
在某些实施方案中，本文中提供的抗体是人抗体。可以使用本领域中已知的多种技术来生成人抗体。一般地，人抗体记载于van Dijk和van de Winkel,Curr.Opin.Pharmacol.5:368-74(2001)及Lonberg,Curr.Opin.Immunol.20:450-459(2008)。
可以通过对转基因动物施用免疫原来制备人抗体，所述转基因动物已经修饰为响应抗原性攻击而生成完整人抗体或具有人可变区的完整抗体。此类动物通常含有所有或部分人免疫球蛋白基因座，其替换内源免疫球蛋白基因座，或者其在染色体外存在或随机整合入动物的染色体中。在此类转基因小鼠中，一般已经将内源免疫球蛋白基因座灭活。关于自转基因动物获得人抗体的方法的综述，见Lonberg,Nat.Biotech.23:1117-1125(2005)。还可见例如美国专利No.6,075,181和6,150,584，其描述了XENOMOUSETM技术；美国专利No.5,770,429，其描述了
Figure BDA0000491186630000291
技术；美国专利No.7,041,870，其描述了K-M
Figure BDA0000491186630000292
技术，和美国专利申请公开文本No.US2007/0061900，其描述了
Figure BDA0000491186630000293
技术）。可以例如通过与不同人恒定区组合进一步修饰来自由此类动物生成的完整抗体的人可变区。
也可以通过基于杂交瘤的方法生成人抗体。已经描述了用于生成人单克隆抗体的人骨髓瘤和小鼠-人异源骨髓瘤细胞系（见例如Kozbor J.Immunol.,133:3001(1984);Brodeur等,Monoclonal Antibody Production Techniques andApplications,第51-63页(Marcel Dekker,Inc.,New York,1987)；及Boerner等,J.Immunol.,147:86(1991)）。经由人B细胞杂交瘤技术生成的人抗体也记载于Li等,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,103:3557-3562(2006)。其它方法包括那些例如记载于美国专利No.7,189,826（其描述了自杂交瘤细胞系生成单克隆人IgM抗体）和Ni,Xiandai Mianyixue,26(4):265-268(2006)（其描述了人-人杂交瘤）的。人杂交瘤技术（Trioma技术）也记载于Vollmers和Brandlein,Histology and Histopathology,20(3):927-937(2005)及Vollmers和Brandlein,Methods and Findings in Experimental and Clinical Pharmacology,27(3):185-91(2005)。
也可以通过分离自人衍生的噬菌体展示文库选择的Fv克隆可变域序列生成人抗体。然后，可以将此类可变域序列与期望的人恒定域组合。下文描述了自抗体文库选择人抗体的技术。
5)文库衍生的抗体
可以通过对组合文库筛选具有期望的一种或多种活性的抗体来分离本发明的抗体。例如，用于生成噬菌体展示文库并对此类文库筛选拥有期望结合特征的抗体的多种方法是本领域中已知的。此类方法综述于例如Hoogenboom等于Methods in Molecular Biology178:1-37(O’Brien等编,Human Press,Totowa,NJ,2001)，并且进一步记载于例如McCafferty等,Nature348:552-554;Clackson等,Nature352:624-628(1991);Marks等,J.Mol.Biol.222:581-597(1992);Marks和Bradbury,于Methods in Molecular Biology248:161-175(Lo编,Human Press,Totowa,NJ,2003);Sidhu等,J.Mol.Biol.338(2):299-310(2004);Lee等,J.Mol.Biol.340(5):1073-1093(2004);Fellouse,Proc.Natl.Acad.Sci.USA101(34):12467-12472(2004);及Lee等,J.Immunol.Methods284(1-2):119-132(2004)。
在某些噬菌体展示方法中，将VH和VL基因的全集分别通过聚合酶链式反应(PCR)克隆，并在噬菌体文库中随机重组，然后可以对所述噬菌体文库筛选抗原结合噬菌体，如记载于Winter等,Ann.Rev.Immunol.,12:433-455(1994)的。噬菌体通常以单链Fv(scFv)片段或以Fab片段展示抗体片段。来自经免疫的来源的文库提供针对免疫原的高亲和力抗体，而不需要构建杂交瘤。或者，可以（例如自人）克隆未免疫全集以在没有任何免疫的情况中提供针对一大批非自身和还有自身抗原的抗体的单一来源，如由Griffiths等,EMBO J,12:725-734(1993)描述的。最后，也可以通过自干细胞克隆未重排的V基因区段，并使用含有随机序列的PCR引物编码高度可变的CDR3区并在体外实现重排来合成生成未免疫文库，如由Hoogenboom和Winter,J.Mol.Biol.,227:381-388(1992)所描述的。描述人抗体噬菌体文库的专利公开文本包括例如：美国专利No.5,750,373、和美国专利公开文本No.2005/0079574,2005/0119455,2005/0266000,2007/0117126,2007/0160598,2007/0237764,2007/0292936和2009/0002360。
认为自人抗体文库分离的抗体或抗体片段是本文中的人抗体或人抗体片段。
6)多特异性抗体
在某些实施方案中，本文中提供的抗体是多特异性抗体，例如双特异性抗体。多特异性抗体是对至少两种不同位点具有结合特异性的单克隆抗体。在某些实施方案中，结合特异性之一针对NRG1，而另一种针对任何其它抗原。在某些实施方案中，双特异性抗体可以结合NRG1的两种不同表位。也可以使用双特异性抗体来将细胞毒剂定位于表达NRG1的细胞。双特异性抗体可以以全长抗体或抗体片段制备。
用于生成多特异性抗体的技术包括但不限于具有不同特异性的两对免疫球蛋白重链-轻链的重组共表达（见Milstein和Cuello,Nature305:537(1983))、WO93/08829、和Traunecker等,EMBO J.10:3655(1991)）、和“突起-入-空穴”工程化（见例如美国专利No.5,731,168）。也可以通过用于生成抗体Fc-异二聚体分子的工程化静电操纵效应(WO2009/089004A1)；交联两种或更多种抗体或片段（见例如美国专利No.4,676,980,及Brennan等,Science,229:81(1985)）；使用亮氨酸拉链来生成双特异性抗体（见例如Kostelny等,J.Immunol.,148(5):1547-1553(1992)）；使用用于生成双特异性抗体片段的“双抗体”技术（见例如Hollinger等,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,90:6444-6448(1993)）；及使用单链Fv(sFv)二聚体（见例如Gruber等,J.Immunol.,152:5368(1994)）；及如例如Tutt等J.Immunol.147:60(1991)中所描述的，制备三特异性抗体来生成多特异性抗体。
本文中还包括具有三个或更多个功能性抗原结合位点的工程化改造抗体，包括“章鱼抗体”（见例如US2006/0025576A1）。
本文中的抗体或片段还包括包含结合NRG1及另一种不同抗原的抗原结合位点的“双重作用FAb”或“DAF”（见例如US2008/0069820）。
7)抗体变体
在某些实施方案中，涵盖本文中提供的抗体的氨基酸序列变体。例如，可以期望改善抗体的结合亲和力和/或其它生物学特性。可以通过将合适的修饰引入编码抗体的核苷酸序列中，或者通过肽合成来制备抗体的氨基酸序列变体。此类修饰包括例如对抗体的氨基酸序列内的残基的删除、和/或***和/或替代。可以进行删除、***、和替代的任何组合以得到最终的构建体，只要最终的构建体拥有期望的特征，例如，抗原结合。
a.替代、***、和删除变体
在某些实施方案中，提供了具有一处或多处氨基酸替代的抗体变体。替代诱变感兴趣的位点包括HVR和FR。保守替代在表1中在“保守替代”的标题下显示。更实质的变化在表1中在“例示性替代”的标题下提供，并且如下文参照氨基酸侧链类别进一步描述的。可以将氨基酸替代引入感兴趣的抗体中，并且对产物筛选期望的活性，例如保留/改善的抗原结合、降低的免疫原性、或改善的ADCC或CDC。
表1
Figure BDA0000491186630000321
初始残基 例示性替代 优选的替代
Met(M) Leu;Phe;Ile Leu
Phe(F) Trp;Leu;Val;Ile;Ala;Tyr Tyr
Pro(P) Ala Ala
Ser(S) Thr Thr
Thr(T) Val;Ser Ser
Trp(W) Tyr;Phe Tyr
Tyr(Y) Trp;Phe;Thr;Ser Phe
Val(V) Ile;Leu;Met;Phe;Ala;正亮氨酸 Leu
依照共同的侧链特性，氨基酸可以如下分组：
(1)疏水性的：正亮氨酸,Met,Ala,Val,Leu,Ile；
(2)中性、亲水性的：Cys,Ser,Thr,Asn,Gln；
(3)酸性的：Asp,Glu；
(4)碱性的：His,Lys,Arg；
(5)影响链取向的残基：Gly,Pro；
(6)芳香族的：Trp,Tyr,Phe。
非保守替代会需要用这些类别之一的成员替换另一个类别的。
一类替代变体牵涉替代亲本抗体（例如人源化或人抗体）的一个或多个高变区残基。一般地，为进一步研究选择的所得变体相对于亲本抗体会具有某些生物学特性的改变（例如改善）（例如升高的亲和力、降低的免疫原性）和/或会基本上保留亲本抗体的某些生物学特性。一种例示性的替代变体是亲和力成熟的抗体，其可以例如使用基于噬菌体展示的亲和力成熟技术诸如本文中所描述的那些技术来方便地生成。简言之，将一个或多个HVR残基突变，并将变体抗体在噬菌体上展示，并对其筛选特定的生物学活性（例如结合亲和力）。
可以对HVR做出变化（例如，替代），例如以改善抗体亲和力。可以对HVR“热点”，即由在体细胞成熟过程期间以高频率经历突变的密码子编码的残基（见例如Chowdhury,Methods Mol.Biol.207:179-196(2008)），和/或SDR(a-CDR)做出此类变化，对所得的变体VH或VL测试结合亲和力。通过次级文库的构建和再选择进行的亲和力成熟已经记载于例如Hoogenboom等于Methods in Molecular Biology178:1-37(O’Brien等编,Human Press,Totowa,NJ,(2001))。在亲和力成熟的一些实施方案中，通过多种方法（例如，易错PCR、链改组、或寡核苷酸指导的诱变）将多样性引入为成熟选择的可变基因。然后，创建次级文库。然后，筛选文库以鉴定具有期望的亲和力的任何抗体变体。另一种引入多样性的方法牵涉HVR指导的方法，其中将几个HVR残基（例如，一次4-6个残基）随机化。可以例如使用丙氨酸扫描诱变或建模来特异性鉴定牵涉抗原结合的HVR残基。特别地，经常靶向CDR-H3和CDR-L3。
在某些实施方案中，可以在一个或多个HVR内发生替代、***、或删除，只要此类变化不实质性降低抗体结合抗原的能力。例如，可以对HVR做出保守变化（例如，保守替代，如本文中提供的），其不实质性降低结合亲和力。此类变化可以在HVR“热点”或SDR外部。在上文提供的变体VH和VL序列的某些实施方案中，每个HVR是未改变的，或者含有不超过1、2或3处氨基酸替代。
一种可用于鉴定抗体中可以作为诱变靶位的残基或区域的方法称作“丙氨酸扫描诱变”，如由Cunningham和Wells(1989)Science,244:1081-1085所描述的。在此方法中，鉴定一个残基或一组靶残基（例如，带电荷的残基诸如arg、asp、his、lys、和glu），并用中性或带负电荷的氨基酸（例如，丙氨酸或多丙氨酸）替换以测定抗体与抗原的相互作用是否受到影响。可以在对初始替代表明功能敏感性的氨基酸位置引入进一步的替代。或者/另外，利用抗原-抗体复合物的晶体结构来鉴定抗体与抗原间的接触点。作为替代的候选，可以靶向或消除此类接触残基和邻近残基。可以筛选变体以确定它们是否含有期望的特性。
氨基酸序列***包括长度范围为1个残基至含有100或更多个残基的多肽的氨基和/或羧基端融合，及单个或多个氨基酸残基的序列内***。末端***的例子包括具有N端甲硫氨酰基残基的抗体。抗体分子的其它***变体包括抗体的N或C端与酶（例如对于ADEPT）或延长抗体的血清半衰期的多肽的融合物。
b.糖基化变体
在某些实施方案中，改变本文中提供的抗体以提高或降低抗体糖基化的程度。可以通过改变氨基酸序列，使得创建或消除一个或多个糖基化位点来方便地实现对抗体的糖基化位点的添加或删除。
在抗体包含Fc区的情况中，可以改变其附着的碳水化合物。由哺乳动物细胞生成的天然抗体通常包含分支的、双触角寡糖，其一般通过N连接附着于Fc区的CH2域的Asn297。见例如Wright等TIBTECH15:26-32(1997)。寡糖可以包括各种碳水化合物，例如，甘露糖、N-乙酰葡糖胺(GlcNAc)、半乳糖、和唾液酸，以及附着于双触角寡糖结构“主干”中的GlcNAc的岩藻糖。在一些实施方案中，可以对本发明抗体中的寡糖进行修饰以创建具有某些改善的特性的抗体变体。
在一个实施方案中，提供了抗体变体，其具有缺乏附着（直接或间接）于Fc区的岩藻糖的碳水化合物结构。例如，此类抗体中的岩藻糖量可以是1%至80%、1%至65%、5%至65%或20%至40%。通过相对于附着于Asn297的所有糖结构（例如，复合的、杂合的和高甘露糖的结构）的总和，计算Asn297处糖链内岩藻糖的平均量来测定岩藻糖量，如通过MALDI-TOF质谱术测量的，例如如记载于WO2008/077546的。Asn297指位于Fc区中的约第297位（Fc区残基的Eu编号方式）的天冬酰胺残基；然而，Asn297也可以由于抗体中的微小序列变异而位于第297位上游或下游约±3个氨基酸，即在第294位和第300位之间。此类岩藻糖基化变体可以具有改善的ADCC功能。见例如美国专利公开文本No.US2003/0157108(Presta,L.);US2004/0093621(KyowaHakko Kogyo Co.,Ltd)。涉及“脱岩藻糖基化的”或“岩藻糖缺乏的”抗体变体的出版物的例子包括：US2003/0157108;WO2000/61739;WO2001/29246;US2003/0115614;US2002/0164328;US2004/0093621;US2004/0132140;US2004/0110704;US2004/0110282;US2004/0109865;WO2003/085119;WO2003/084570;WO2005/035586;WO2005/035778;WO2005/053742;WO2002/031140;Okazaki等J.Mol.Biol.336:1239-1249(2004);Yamane-Ohnuki等Biotech.Bioeng.87:614(2004)。能够生成脱岩藻糖基化抗体的细胞系的例子包括蛋白质岩藻糖基化缺陷的Lec13CHO细胞(Ripka等Arch.Biochem.Biophys.249:533-545(1986);美国专利申请No US2003/0157108A1,Presta,L;及WO2004/056312A1,Adams等，尤其在实施例11)，和敲除细胞系，诸如α-1,6-岩藻糖基转移酶基因FUT8敲除CHO细胞（见例如Yamane-Ohnuki等Biotech.Bioeng.87:614(2004);Kanda,Y.等,Biotechnol.Bioeng.,94(4):680-688(2006);及WO2003/085107）。
进一步提供了具有两分型寡糖的抗体变体，例如其中附着于抗体Fc区的双触角寡糖是通过GlcNAc两分的。此类抗体变体可以具有降低的岩藻糖基化和/或改善的ADCC功能。此类抗体变体的例子记载于例如WO2003/011878（Jean-Mairet等）；美国专利No.6,602,684（Umana等）；及US2005/0123546（Umana等）。还提供了在附着于Fc区的寡糖中具有至少一个半乳糖残基的抗体变体。此类抗体变体可以具有改善的CDC功能。此类抗体变体记载于例如WO1997/30087（Patel等）；WO1998/58964(Raju,S.)；及WO1999/22764(Raju,S.)。
c.Fc区变体
在某些实施方案中，可以将一处或多处氨基酸修饰引入本文中提供的抗体的Fc区中，由此生成Fc区变体。Fc区变体可以包含在一个或多个氨基酸位置包含氨基酸修饰（例如替代）的人Fc区序列（例如，人IgG1、IgG2、IgG3或IgG4Fc区）。
在某些实施方案中，本发明涵盖拥有一些但不是所有效应器功能的抗体变体，所述效应器功能使其成为如下应用的期望候选物，其中抗体的体内半衰期是重要的，而某些效应器功能（诸如补体和ADCC）是不必要的或有害的。可以进行体外和/或体内细胞毒性测定法以确认CDC和/或ADCC活性的降低/消减。例如，可以进行Fc受体(FcR)结合测定法以确保抗体缺乏FcγR结合（因此有可能缺乏ADCC活性），但是保留FcRn结合能力。介导ADCC的主要细胞NK细胞仅表达FcγRIII，而单核细胞表达FcγRI、FcγRII和FcγRIII。在Ravetch和Kinet,Annu.Rev.Immunol.9:457-492(1991)的第464页上的表3中汇总了造血细胞上的FcR表达。评估感兴趣分子的ADCC活性的体外测定法的非限制性例子记载于美国专利No.5,500,362（见例如Hellstrom,I.等Proc.Nat’l Acad.Sci.USA83:7059-7063(1986)）和Hellstrom,I等,Proc.Nat’l Acad.Sci.USA82:1499-1502(1985);5,821,337（见Bruggemann,M.等,J.Exp.Med.166:1351-1361(1987)）。或者，可以采用非放射性测定方法（见例如用于流式细胞术的ACTITM非放射性细胞毒性测定法(CellTechnology,Inc.MountainView,CA；和CytoTox
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非放射性细胞毒性测定法(Promega,Madison,WI)）。对于此类测定法有用的效应细胞包括外周血单个核细胞(PBMC)和天然杀伤(NK)细胞。或者/另外，可以在体内评估感兴趣分子的ADCC活性，例如在动物模型中，诸如披露于Clynes等Proc.Nat’l Acad.Sci.USA95:652-656(1998)的。也可以实施C1q结合测定法以确认抗体不能结合C1q，并且因此缺乏CDC活性。见例如WO2006/029879和WO2005/100402中的C1q和C3c结合ELISA。为了评估补体激活，可以实施CDC测定法（见例如Gazzano-Santoro等,J.Immunol.Methods202:163(1996);Cragg,M.S.等,Blood101:1045-1052(2003);及Cragg,M.S.和M.J.Glennie,Blood103:2738-2743(2004)）。也可以使用本领域中已知的方法来实施FcRn结合和体内清除/半衰期测定（见例如Petkova,S.B.等,Int’l.Immunol.18(12):1759-1769(2006)）。
具有降低的效应器功能的抗体包括那些具有Fc区残基238,265,269,270,297,327和329中的一个或多个的替代的（美国专利No.6,737,056）。此类Fc突变体包括在氨基酸位置265、269、270、297和327中的两处或更多处具有替代的Fc突变体，包括残基265和297替代成丙氨酸的所谓的“DANA”Fc突变体（美国专利No.7,332,581）。
描述了具有改善的或降低的对FcR的结合的某些抗体变体（见例如美国专利No.6,737,056;WO2004/056312，及Shields等,J.Biol.Chem.9(2):6591-6604(2001)）。
在某些实施方案中，抗体变体包含具有改善ADCC的一处或多处氨基酸替代，例如Fc区的位置298、333、和/或334（残基的EU编号方式）的替代的Fc区。
在一些实施方案中，对Fc区做出改变，其导致改变的（即，改善的或降低的）C1q结合和/或补体依赖性细胞毒性(CDC)，例如，如记载于美国专利No.6,194,551、WO99/51642、及Idusogie等J.Immunol.164:4178-4184(2000)的。
具有延长的半衰期和改善的对新生儿Fc受体(FcRn)的结合的抗体记载于US2005/0014934A1(Hinton等)，新生儿Fc受体(FcRn)负责将母体IgG转移至胎儿(Guyer等,J.Immunol.117:587(1976)及Kim等,J.Immunol.24:249(1994))。那些抗体包含其中具有改善Fc区对FcRn结合的一处或多处替代的Fc区。此类Fc变体包括那些在Fc区残基238,256,265,272,286,303,305,307,311,312,317,340,356,360,362,376,378,380,382,413,424或434中的一处或多处具有替代，例如，Fc区残基434的替代的（美国专利No.7,371,826）。
还可见Duncan和Winter,Nature322:738-40(1988);美国专利No.5,648,260;美国专利No.5,624,821;及WO94/29351，其关注Fc区变体的其它例子。
d.经半胱氨酸工程化改造的抗体变体
在某些实施方案中，可以期望创建经半胱氨酸工程化改造的抗体，例如，“thioMAb”，其中抗体的一个或多个残基用半胱氨酸残基替代。在具体的实施方案中，替代的残基存在于抗体的可接近位点。通过用半胱氨酸替代那些残基，反应性硫醇基团由此定位于抗体的可接近位点，并且可以用于将抗体与其它模块，诸如药物模块或接头-药物模块缀合，以创建免疫缀合物，如本文中进一步描述的。在某些实施方案中，可以用半胱氨酸替代下列残基之任一个或多个：轻链的V205（Kabat编号方式）；重链的A118（EU编号方式）；和重链Fc区的S400（EU编号方式）。可以如例如美国专利No.7,521,541所述生成经半胱氨酸工程化改造的抗体。
e.抗体衍生物
在某些实施方案中，可以进一步修饰本文中提供的抗体以含有本领域知道的且易于获得的额外非蛋白质性质模块。适合于抗体衍生化的模块包括但不限于水溶性聚合物。水溶性聚合物的非限制性例子包括但不限于聚乙二醇(PEG)、乙二醇/丙二醇共聚物、羧甲基纤维素、右旋糖苷、聚乙烯醇、聚乙烯吡咯烷酮、聚-1,3-二氧戊环、聚-1,3,6-三口恶烷、乙烯/马来酸酐共聚物、聚氨基酸（均聚物或随机共聚物）、和右旋糖苷或聚(n-乙烯吡咯烷酮)聚乙二醇、丙二醇均聚物、环氧丙烷/环氧乙烷共聚物、聚氧乙烯化多元醇（例如甘油）、聚乙烯醇及其混合物。由于其在水中的稳定性，聚乙二醇丙醛在生产中可能具有优势。聚合物可以是任何分子量，而且可以是分支的或不分支的。附着到抗体上的聚合物数目可以变化，而且如果附着了超过一个聚合物，那么它们可以是相同或不同的分子。一般而言，可根据下列考虑来确定用于衍生化的聚合物的数目和/或类型，包括但不限于抗体要改进的具体特性或功能、抗体衍生物是否将用于指定条件下的治疗等。
在另一个实施方案中，提供了抗体和可以通过暴露于辐射选择性加热的非蛋白质性质模块的缀合物。在一个实施方案中，非蛋白质性质模块是碳纳米管(Kam等,Proc.Natl.Acad.Sci.USA102:11600-11605(2005))。辐射可以是任何波长的，并且包括但不限于对普通细胞没有损害，但是将非蛋白质性质模块加热至抗体-非蛋白质性质模块附近的细胞被杀死的温度的波长。
B.重组方法和组合物
可以使用重组方法和组合物来生成抗体，例如，如记载于美国专利No.4,816,567的。在一个实施方案中，提供了编码本文中所描述的抗NRG1抗体的分离的核酸。此类核酸可以编码包含抗体VL的氨基酸序列和/或包含VH的氨基酸序列（例如，抗体的轻和/或重链）。在又一个实施方案中，提供了包含此类核酸的一种或多种载体（例如，表达载体）。在又一个实施方案中，提供了包含此类核酸的宿主细胞。在一个此类实施方案中，宿主细胞包含（例如，已经用下述各项转化）：(1)包含核酸的载体，所述核酸编码包含抗体VL的氨基酸序列和包含抗体VH的氨基酸序列，或(2)第一载体和第二载体，所述第一载体包含编码包含抗体VL的氨基酸序列的核酸，所述第二载体包含编码包含抗体VH的氨基酸序列的核酸。在一个实施方案中，宿主细胞是真核的，例如中国仓鼠卵巢(CHO)细胞或淋巴样细胞（例如，Y0、NS0、Sp20细胞）。在一个实施方案中，提供了生成抗NRG1抗体的方法，其中该方法包括在适合于表达抗体的条件下培养包含编码抗体的核酸的宿主细胞，如上文提供的，并且任选地，自宿主细胞（或宿主细胞培养液）回收抗体。
对于抗NRG1抗体的重组生成，将编码抗体的核酸（例如如上文所描述的）分离，并***一种或多种载体中，以在宿主细胞中进一步克隆和/或表达。可以使用常规规程将此类核酸容易地分离并测序（例如，通过使用寡核苷酸探针来进行，所述寡核苷酸探针能够特异性结合编码抗体的重和轻链的基因）。
适合于克隆或表达抗体编码载体的宿主细胞包括本文中所描述的原核或真核细胞。例如，可以在细菌中生成抗体，特别是在不需要糖基化和Fc效应器功能时。对于抗体片段和多肽在细菌中的表达，见例如美国专利No.5,648,237,5,789,199和5,840,523（还可见Charlton,Methods in MolecularBiology,第248卷(B.K.C.Lo编,Humana Press,Totowa,NJ,2003),第245-254页，其描述了抗体片段在大肠杆菌(E.coli.)中的表达）。表达后，可以将抗体在可溶性级分中自细菌细胞浆分离，并可以进一步纯化。
在原核生物外，真核微生物诸如丝状真菌或酵母是适合于抗体编码载体的克隆或表达宿主，包括其糖基化途径已经“人源化”，导致生成具有部分或完全人的糖基化样式的抗体的真菌和酵母菌株。见Gerngross,Nat.Biotech.22:1409-1414(2004);及Li等,Nat.Biotech.24:210-215(2006)。
适合于表达糖基化抗体的宿主细胞也自多细胞生物体（无脊椎动物和脊椎动物）衍生。无脊椎动物细胞的例子包括植物和昆虫细胞。已经鉴定出许多杆状病毒株，其可以与昆虫细胞一起使用，特别是用于转染草地夜蛾(Spodoptera frugiperda)细胞。
也可以利用植物细胞培养物作为宿主。见例如美国专利No.5,959,177,6,040,498,6,420,548,7,125,978和6,417,429（其描述了用于在转基因植物中生成抗体的PLANTIBODIESTM技术）。
也可以使用脊椎动物细胞作为宿主。例如，适应于在悬浮液中生长的哺乳动物细胞系可以是有用的。有用的哺乳动物宿主细胞系的其它例子是经SV40转化的猴肾CV1系(COS-7)；人胚肾系（293或293细胞，如记载于例如Graham等,J.Gen Virol.36:59(1977)的）；幼年仓鼠肾细胞(BHK)；小鼠塞托利(sertoli)细胞（TM4细胞，如记载于例如Mather,Biol.Reprod.23:243-251(1980)的）；猴肾细胞(CV1)；非洲绿猴肾细胞(VERO-76)；人***细胞(HELA)；犬肾细胞(MDCK；牛鼠(buffalo rat)肝细胞(BRL3A)；人肺细胞(W138)；人肝细胞(Hep G2)；小鼠***肿瘤(MMT060562)；TRI细胞，如记载于例如Mather等,Annals N.Y.Acad.Sci.383:44-68(1982)的；MRC5细胞；和FS4细胞。其它有用的哺乳动物宿主细胞系包括中国仓鼠卵巢(CHO)细胞，包括DHFR-CHO细胞(Urlaub等,Proc.Natl.Acad.Sci.USA77:4216(1980))；和骨髓瘤细胞系诸如Y0、NS0和Sp2/0。关于适合于抗体生成的某些哺乳动物宿主细胞系的综述，见例如Yazaki和Wu,Methods in Molecular Biology,第248卷(B.K.C.Lo编,Humana Press,Totowa,NJ),第255-268页(2003)。
C.测定法
可以通过本领域中已知的多种测定法对本文中提供的NRG1抗体鉴定、筛选、或表征其物理/化学特性和/或生物学活性。
在一方面，对本发明的抗体测试其抗原结合活性，例如通过已知的方法诸如ELISA、Western印迹等来进行。
在另一方面，提供了用于鉴定具有生物学活性的抗NRG1抗体的测定法。生物学活性可以包括例如，抑制NRG1诱导的受体酪氨酸激酶信号传导、抑制肿瘤生长、抑制细胞增殖、等等。还提供了在体内和/或体外具有此类生物学活性的抗NRG1抗体。
在某些实施方案中，对本发明的抗NRG1抗体测试此类生物学活性。在一个实施方案中，可以通过在存在和没有潜在的抗NRG1抗体的情况中测定受体酪氨酸激酶的酪氨酸残基的NRG1诱导的磷酸化的水平来测量抗NRG1抗体抑制NRG1诱导的受体酪氨酸激酶信号传导的能力。Holmes,等1992。以下是测定受体酪氨酸激酶的磷酸化状态的一种例示性测定法。在与潜在的抗NRG1抗体或缓冲液（对照）一起预温育60分钟后用10nM NRG刺激表达Her2和Her3的细胞（诸如Caov3细胞，或工程化改造为表达Her2和Her3的细胞）。在用抗磷酸酪氨酸抗体探查的Western印迹上分析全细胞裂解物以测定酪氨酸磷酸化的水平。可以扫描印迹以定量抗磷酸酪氨酸信号。与缓冲液对照相比，抗NRG1抗体会降低酪氨酸磷酸化的水平。在一个实施方案中，与未处理的对照相比，抗NRG1抗体将NRG1诱导的酪氨酸激酶信号传导抑制至少30%、40%、50%、60%70%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%。
在某些实施方案中，对本发明的抗体测试其在体外抑制细胞生长或增殖的能力。用于抑制细胞生长或增殖的测定法是本领域中公知的。以本文中所描述的“细胞杀伤”测定法例示的用于细胞增殖的某些测定法测量细胞存活力。一种此类测定法是CellTiter-GloTM发光细胞存活力测定法，其可购自Promega(Madison,WI)。所述测定法基于指示代谢活性细胞的所存在的ATP的定量来测定培养物中的活细胞的数目。见Crouch等(1993)J.Immunol.Meth.160:81-88，美国专利No.6602677。可以以96或384孔形式进行测定法，使其适合于自动化高通量筛选(HTS)。见Cree等(1995)AntiCancer Drugs6:398-404。该测定法规程牵涉对培养的细胞直接添加单一试剂
Figure BDA0000491186630000411
这导致细胞裂解，并产生由萤光素酶反应生成的发光信号。发光信号与存在的ATP量成比例，所述ATP量与存在于培养物中的活细胞数目成正比。可以通过发光计或CCD照相机成像装置记录数据。发光输出表示为相对光单位(RLU)。
用于细胞增殖的另一种测定法是“MTT”测定法，即一种比色测定法，其测量线粒体还原酶将3-(4,5-二甲基噻唑-2-基)-2,5-二苯基四唑溴化物氧化成甲月替(formazan)。与CellTiter-GloTM测定法一样，此测定法指示细胞培养物中存在的代谢活性细胞的数目。见例如Mosmann(1983)J.Immunol.Meth.65:55-63及Zhang等(2005)Cancer Res.65:3877-3882。
在一方面，对抗NRG1抗体测试其在体外诱导细胞死亡的能力。用于诱导细胞死亡的测定法是本领域中公知的。在一些实施方案中，此类测定法测量例如膜完整性的丧失，如通过碘化丙啶(PI)、锥虫蓝（见Moore等(1995)Cytotechnology,17:1-11）、或7AAD的摄取指示的。在一种例示性的PI摄取测定法中，将细胞在补充有10%热灭活的FBS(Hyclone)和2mM L-谷氨酰胺的Dulbecco氏改良的Eagle培养基(D-MEM):Ham氏F-12(50:50)中培养。如此，在没有补体和免疫效应细胞的情况中实施测定法。将细胞在100x20mm皿中以每皿3x106的密度接种，并容许附着过夜。将培养基除去，并用单独的新鲜培养基或含有各个浓度的抗体或免疫缀合物的培养基更换。将细胞温育3天的时段。在处理后，将单层用PBS清洗，并通过胰蛋白酶处理分离。然后，将细胞以1200rpm于4℃离心5分钟，将团粒在3ml冷的Ca2+结合缓冲液(10mMHepes,pH7.4,140mM NaCl,2.5mM CaCl2)中重悬，并等分取样入35mm滤网加帽的12x75mm管中（每管1ml，每个处理组3管）以除去细胞块。然后，管接受PI(10μg/ml)。使用FACSCANTM流式细胞仪和FACSCONVERTTMCellQuest软件(Becton Dickinson)分析样品。如此，鉴定诱导统计学显著的细胞死亡水平的抗体，如通过PI摄取测定的。
在一方面，对抗NRG1测试其在体外诱导凋亡（程序性细胞死亡）的能力。一种用于诱导凋亡的抗体或免疫缀合物的例示性测定法是膜联蛋白结合测定法。在一个例示性的膜联蛋白结合测定法中，将细胞培养，并在皿中接种，如前一段中所讨论的。将培养基除去，并用单独的新鲜培养基或含有0.001至10μg/ml的抗体或免疫缀合物的培养基替换。在3天温育期后，将单层用PBS清洗，并通过胰蛋白酶处理分离。然后，将细胞离心，在Ca2+结合缓冲液中重悬，并等分取样入管中，如前一段中所讨论的。然后，管接受经标记的膜联蛋白（例如膜联蛋白V-FITC）(1μg/ml)。使用FACSCANTM流式细胞仪和FACSCONVERTTM CellQuest软件(BD Biosciences)分析样品。如此，鉴定相对于对照诱导统计学显著的膜联蛋白结合水平的抗体。用于诱导凋亡的抗体或免疫缀合物的另一种例示性测定法是用于检测基因组DNA的核小体间降解的组蛋白DNA ELISA比色测定法。可以使用例如细胞死亡检测ELISA试剂盒(Roche,Palo Alto,CA)实施此类测定法。
在任何上述体外测定法中使用的细胞包括天然表达NRG1或已经工程化改造为表达NRG1的细胞或细胞系。此类细胞包括相对于同一组织起源的正常细胞过表达NRG1的肿瘤细胞。此类细胞还包括表达NRG1的细胞系（包括肿瘤细胞系）和通常不表达NRG1，但是已经用编码NRG1的核酸转染的细胞系。
在一方面，对抗NRG1抗体测试其在体内抑制细胞生长或增殖的能力。在某些实施方案中，对抗NRG1抗体测试其在体内抑制肿瘤生长的能力。可以使用体内模型***，诸如异种移植物模型来进行此类测试。在一种例示性的异种移植物***中，将人肿瘤细胞导入适当地免疫受损的非人动物，例如，无胸腺“裸”鼠中。对动物施用本发明的抗体。测量抗体抑制或降低肿瘤生长的能力。在上述异种移植物***的某些实施方案中，人肿瘤细胞是来自人患者的肿瘤细胞。此类异种移植物模型可购自Oncotest GmbH(Frieberg,Germany)。在某些实施方案中，人肿瘤细胞是来自人肿瘤细胞系的细胞。在某些实施方案中，通过皮下注射或通过移植入合适的部位，诸如***脂肪垫中来将人肿瘤细胞导入适当地免疫受损的非人动物中。
在某些实施方案中，与未处理的对照相比，抗NRG1抗体将细胞增殖抑制至少30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%。在其它实施方案中，与未处理的对照相比，抗NRG1抗体将肿瘤生长抑制至少30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%。
D.免疫缀合物
本发明还提供了包含与一种或多种细胞毒剂，诸如化学治疗剂或药物、生长抑制剂、毒素（例如，蛋白质毒素、细菌、真菌、植物、或动物起源的酶活性毒素、或其片段）、或放射性同位素缀合的本文中的抗NRG1抗体的免疫缀合物。
在一个实施方案中，免疫缀合物是抗体-药物缀合物(ADC)，其中抗体与一种或多种药物缀合，包括但不限于美登木素生物碱（见美国专利No.5,208,020、5,416,064和欧洲专利EP0425235B1）；auristatin诸如单甲基auristatin药物模块DE和DF（MMAE和MMAF）（见美国专利No.5,635,483和5,780,588及7,498,298)；多拉司他汀(dolastatin)；加利车霉素(calicheamicin)或其衍生物（见美国专利No.5,712,374,5,714,586,5,739,116,5,767,285,5,770,701,5,770,710,5,773,001和5,877,296;Hinman等,Cancer Res.53:3336-3342(1993);及Lode等,Cancer Res.58:2925-2928(1998)）；蒽环类抗生素诸如道诺霉素(daunomycin)或多柔比星(doxorubicin)（见Kratz等,CurrentMed.Chem.13:477-523(2006);Jeffrey等,Bioorganic&Med.Chem.Letters16:358-362(2006);Torgov等,Bioconj.Chem.16:717-721(2005);Nagy等,Proc.Natl.Acad.Sci.USA97:829-834(2000);Dubowchik等,Bioorg.&Med.Chem.Letters12:1529-1532(2002);King等,J.Med.Chem.45:4336-4343(2002);及美国专利No.6,630,579）；甲氨蝶呤；长春地辛(vindesine)；紫杉烷(taxane)诸如多西他赛(docetaxel)、帕利他塞(paclitaxel)、larotaxel、tesetaxel、和ortataxel；单端孢霉素(trichothecene)；和CC1065。
在另一个实施方案中，免疫缀合物包含与酶活性毒素或其片段缀合的如本文中所描述的抗体，所述酶活性毒素包括但不限于白喉A链、白喉毒素的非结合活性片段、外毒素A链（来自铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)）、蓖麻毒蛋白(ricin)A链、相思豆毒蛋白(abrin)A链、蒴莲根毒蛋白(modeccin)A链、α-帚曲霉素(sarcin)、油桐(Aleutites fordii)毒蛋白、香石竹(dianthin)毒蛋白、美洲商陆(Phytolaca americana)蛋白（PAPI、PAPII和PAP-S）、苦瓜(Momordica charantia)抑制物、麻疯树毒蛋白(curcin)、巴豆毒蛋白(crotin)、肥皂草(sapaonaria officinalis)抑制剂、白树毒蛋白(gelonin)、丝林霉素(mitogellin)、局限曲菌素(restrictocin)、酚霉素(phenomycin)、依诺霉素(enomycin)和单端孢菌素(trichothecenes)。
在另一个实施方案中，免疫缀合物包含与放射性原子缀合以形成放射性缀合物的如本文中所描述的抗体。多种放射性同位素可用于生成放射性缀合物。例子包括At211、I131、I125、Y90、Re186、Re188、Sm153、Bi212、P32、Pb212和Lu的放射性同位素。在使用放射性缀合物进行检测时，它可以包含供闪烁法研究用的放射性原子，例如tc99m或I123，或供核磁共振(NMR)成像（又称为磁共振成像，mri）用的自旋标记物，诸如再一次的碘-123、碘-131、铟-111、氟-19、碳-13、氮-15、氧-17、钆、锰或铁。
可以使用多种双功能蛋白质偶联剂来生成抗体和细胞毒剂的缀合物，诸如N-琥珀酰亚氨基3-(2-吡啶基二硫代)丙酸酯(SPDP)，琥珀酰亚氨基-4-(N-马来酰亚氨基甲基)环己烷-1-羧酸酯(SMCC)，亚氨基硫烷(IT)，亚氨酸酯（诸如盐酸己二酰亚氨酸二甲酯）、活性酯类（诸如辛二酸二琥珀酰亚氨基酯）、醛类（诸如戊二醛）、双叠氮化合物（诸如双(对-叠氮苯甲酰基)己二胺）、双重氮衍生物（诸如双(对-重氮苯甲酰基)-乙二胺）、二异硫氰酸酯（诸如甲苯2,6-二异氰酸酯）、和双活性氟化合物（诸如1,5-二氟-2,4-二硝基苯）的双功能衍生物。例如，可以如Vitetta等,Science238:1098(1987)中所述制备蓖麻毒蛋白免疫毒素。碳-14标记的1-异硫氰酸苄基-3-甲基二亚乙基三胺五乙酸(MX-DTPA)是用于将放射性核苷酸与抗体偶联的例示性螯合剂。参见WO94/11026。接头可以是便于在细胞中释放细胞毒性药物的“可切割接头”。例如，可使用酸不稳定接头、肽酶敏感性接头、光不稳定接头、二甲基接头或含二硫化物接头(Chari等,Cancer Res52:127-131(1992);美国专利No.5,208,020)。
本文中的免疫缀合物或ADC明确涵盖，但不限于用交联试剂制备的此类缀合物，所述交联试剂包括但不限于BMPS、EMCS、GMBS、HBVS、LC-SMCC、MBS、MPBH、SBAP、SIA、SIAB、SMCC、SMPB、SMPH、sulfo-EMCS、sulfo-GMBS、sulfo-KMUS、sulfo-MBS、sulfo-SIAB、sulfo-SMCC、和sulfo-SMPB，及SVSB(琥珀酰亚氨基-(4-乙烯基砜)苯甲酸酯)，它们是商品化的（例如，来自Pierce Biotechnology,Inc.,Rockford,IL.,U.S.A）。
E.用于诊断和检测的方法和组合物
在某些实施方案中，本文中提供的抗NRG1抗体可用于检测生物学样品中NRG1的存在。如本文中所使用的，术语“检测”涵盖定量或定性检测。在某些实施方案中，生物学样品包含细胞或组织，诸如肺组织或***组织。
在一个实施方案中，提供了在诊断或检测方法中使用的抗NRG1抗体。在又一方面，提供了检测生物学样品中NRG1的存在的方法。在某些实施方案中，该方法包括在容许抗NRG1抗体结合NRG1的条件下使生物学样品与抗NRG1抗体接触，如本文中所描述的，并检测是否在抗NRG1抗体与NRG1间形成复合物。此类方法可以是体外或体内方法。在一个实施方案中，使用抗NRG1抗体来选择适合用抗NRG1抗体治疗的受试者，例如其中NRG1是一种用于选择患者的生物标志。
在一个实施方案中，若患者具有要或有可能变得对疗法有抗性的癌症，则选择该患者用抗NRG1抗体治疗。本发明的一方面提供了一种测定法，其测定患者是否具有要或有可能变得对疗法有抗性的癌症。在一个实施方案中，该测定法包括对自患者采集的肿瘤细胞测定NRG1表达，其中NRG1的表达指示患者具有要或有可能变得对疗法有抗性的癌症。在一个实施方案中，若肿瘤中的NRG1表达水平小于肿瘤TRIC中的NRG1表达水平，则患者选择为具有要或有可能变得对疗法有抗性的癌症的。
在一个实施方案中，若患者具有在用治疗剂治疗后有可能复发的癌症，则选择该患者用抗NRG1抗体治疗。本发明的一方面提供了一种测定法，其测定患者是否具有在用治疗剂治疗后有可能复发的癌症。在一个实施方案中，该测定法包括对自患者采集的肿瘤细胞测定NRG1表达，其中NRG1的表达指示患者具有在用治疗剂治疗后有可能复发的癌症。在一个实施方案中，若肿瘤中的NRG1表达水平小于肿瘤TRIC中的NRG1表达水平，则患者选择为具有在用治疗剂治疗后有可能复发的癌症的。
在某些实施方案中，诊断测定法包括使用例如免疫组织化学、原位杂交、或RT-PCR测定肿瘤细胞中神经调节蛋白的表达。在其它实施方案中，诊断测定法包括使用例如定量RT-PCR测定肿瘤细胞中神经调节蛋白的表达水平。在一些实施方案中，诊断测定法进一步包括与对照组织诸如例如非癌性相邻组织相比测定神经调节蛋白的表达水平。
在某些实施方案中，提供了经标记的抗NRG1抗体。标记物包括但不限于直接检测的标记物或模块（诸如荧光、发色、电子致密、化学发光、和放射性标记物）、及例如经由酶反应或分子相互作用间接检测的模块，诸如酶或配体。例示性的标记物包括但不限于放射性同位素32P、14C、125I、3H、和131I、荧光团诸如稀土螯合物或荧光素及其衍生物、罗丹明(rhodamine)及其衍生物、丹酰、伞形酮、萤光素酶，例如，萤火虫萤光素酶和细菌萤光素酶（美国专利No.4,737,456）、萤光素、2,3-二氢酞嗪二酮、辣根过氧化物酶(HRP)、碱性磷酸酶、β-半乳糖苷酶、葡糖淀粉酶、溶菌酶、糖类氧化酶，例如，葡萄糖氧化酶、半乳糖氧化酶、和葡萄糖-6-磷酸脱氢酶、杂环氧化酶诸如尿酸酶和黄嘌呤氧化酶（其与采用过氧化氢氧化染料前体的酶诸如HRP偶联）、乳过氧化物酶、或微过氧化物酶、生物素/亲合素、自旋标记物、噬菌体标记物、稳定的自由基、等等。
F.药物配制剂
通过混合具有期望纯度的此类抗体与一种或多种任选的药学可接受载体(Remington’s Pharmaceutical Sciences第16版,Osol,A.编(1980))混合以冻干配制剂或水性溶液形式制备如本文中所描述的抗NRG1抗体的药物配制剂。一般地，药学可接受载体在所采用的剂量和浓度对接受者是无毒的，而且包括但不限于缓冲剂，诸如磷酸盐、柠檬酸盐和其它有机酸；抗氧化剂，包括抗坏血酸和甲硫氨酸；防腐剂（诸如氯化十八烷基二甲基苄基铵；氯化己烷双胺；苯扎氯铵、苯索氯铵；酚、丁醇或苯甲醇；对羟基苯甲酸烃基酯，诸如对羟基苯甲酸甲酯或丙酯；邻苯二酚；间苯二酚；环己醇；3-戊醇；和间甲酚）；低分子量（少于约10个残基）多肽；蛋白质，诸如血清清蛋白、明胶或免疫球蛋白；亲水性聚合物，诸如聚乙烯吡咯烷酮；氨基酸，诸如甘氨酸、谷氨酰胺、天冬酰胺、组氨酸、精氨酸或赖氨酸；单糖、二糖和其它碳水化合物，包括葡萄糖、甘露糖或糊精；螯合剂，诸如EDTA；糖类，诸如蔗糖、甘露醇、海藻糖或山梨醇；成盐相反离子，诸如钠；金属复合物（例如Zn-蛋白质复合物）；和/或非离子表面活性剂，诸如聚乙二醇(PEG)。本文中的例示性的药学可接受载体进一步包含间质药物分散剂诸如可溶性中性活性透明质酸酶糖蛋白(sHASEGP)，例如人可溶性PH-20透明质酸酶糖蛋白，诸如rHuPH20
Figure BDA0000491186630000471
,Baxter International,Inc.)。某些例示性的sHASEGP和使用方法，包括rHuPH20记载于美国专利公开文本No.2005/0260186和2006/0104968。在一方面，将sHASEGP与一种或多种别的糖胺聚糖酶诸如软骨素酶组合。
例示性的冻干抗体配制剂记载于美国专利No.6,267,958。水性抗体配制剂包括那些记载于美国专利No.6,171,586和WO2006/044908的，后一种配制剂包含组氨酸-乙酸盐缓冲液。
本文中的配制剂还可含有超过一种所治疗具体适应症所必需的活性组分，优选那些活性互补且彼此没有不利影响的化合物。例如，可能期望进一步提供帕利他赛、卡铂、和顺铂或帕利他赛、卡铂、和顺铂中两种或所有三种的组合。又例如，可能期望进一步提供抗HER抗体。此类活性组分适于以有效用于所需目的的量而组合存在。
活性成分可包载于例如通过凝聚技术或通过界面聚合制备的微胶囊中（例如分别是羟甲基纤维素或明胶微胶囊和聚(甲基丙烯酸甲酯)微胶囊），在胶状药物投递***中（例如脂质体、清蛋白微球体、微乳剂、纳米颗粒和纳米胶囊），或在粗滴乳状液中。此类技术披露于例如Remington'sPharmaceutical Sciences,第16版,Osol,A.编(1980)。
可以制备持续释放制剂。持续释放制剂的合适的例子包括含有抗体或免疫偶联物的固体疏水性聚合物的半透性基质，该基质为成形商品形式，例如膜，或微胶囊。
用于体内施用的配制剂一般是无菌的。无菌性可容易地实现，例如通过穿过无菌滤膜过滤。
G.治疗性方法和组合物
可以在治疗性方法中使用本文中提供的抗NRG1抗体。
本发明的一个方面提供治疗癌症的方法。本发明的一个方面提供通过对患者施用抗NRG1抗体预防患者中对用治疗剂治疗的抗性的方法。本发明的另一方面提供通过对患者施用抗NRG1抗体预防用治疗剂治疗后癌症再发生。
具体的方面包括预防肿瘤再发生或延长肿瘤再发生前时间的方法，包括对患者施用有效量的抗NRG1抗体。在一个实施方案中，已经用治疗剂，诸如化学治疗剂或抗原结合剂，诸如抗体治疗患者。在一个实施方案中，癌症包含肿瘤再启动细胞。在一个实施方案中，癌症是非小细胞肺癌。在一个实施方案中，癌症是乳腺癌。在一个实施方案中，用化学治疗剂治疗患者。在一个实施方案中，化学治疗剂是作为癌症的护理治疗标准使用的药剂。在一个实施方案中，化学治疗剂是吉西他滨、帕利他塞或顺铂或帕利他塞和顺铂的组合。在一个实施方案中，化学治疗剂不是酪氨酸激酶抑制剂。在另一个实施方案中，化学治疗剂是酪氨酸激酶抑制剂。在一个实施方案中，化学治疗剂是EGFR、HER2、HER3和/或HER4抑制剂。另一个实施方案另外包括与抗NRG1抗体组合对患者施用化学治疗剂。
在另一个实施方案中，用抗体治疗患者。在一个实施方案中，抗体是抗酪氨酸激酶抗体。在一个实施方案中，抗体是EGFR、HER2、HER3和/或HER4抗体。另一个实施方案另外包括与抗NRG1抗体组合对患者施用抗体。
在某些实施方案中，肿瘤再发生前时间比在没有抗NRG1抗体的情况中的肿瘤再发生前时间大至少1.25、1.50、1.75、2.0、2.5、5.0、10、20或50倍。
另一方面提供了治疗具有抗性癌症的患者的方法，包括对患者施用有效量的抗NRG1抗体。在一个实施方案中，癌症包含肿瘤再启动细胞。在一个实施方案中，癌症是非小细胞肺癌。在一个实施方案中，癌症是乳腺癌。在一个实施方案中，癌症对用化学治疗剂治疗有抗性。在一个实施方案中，癌症对用吉西他滨、帕利他塞、卡铂、和顺铂或帕利他塞、卡铂、和顺铂中两种或所有三种的组合治疗有抗性。在一个实施方案中，癌症对用酪氨酸激酶抑制剂治疗有抗性。在一个实施方案中，癌症对用EGFR、HER2、HER3和/或HER4抑制剂治疗有抗性。另一个实施方案另外包括对患者施用化学治疗剂。在一个实施方案中，化学治疗剂是吉西他滨、帕利他塞、卡铂、和顺铂或帕利他塞、卡铂、和顺铂中两种或所有三种的组合。在一个实施方案中，化学治疗剂是EGFR、HER2、HER3和/或HER4抑制剂。
在一个实施方案中，癌症对用治疗性抗体治疗有抗性。在一个实施方案中，癌症对用EGFR、HER2、HER3、或HER4抗体治疗有抗性。另一个实施方案另外包括对患者施用抗体。在一个实施方案中，抗体是曲妥单抗(trastuzumab)或帕妥珠单抗(pertuzumab)。
另一方面提供了预防癌症中的抗性的方法，包括对具有癌症的患者施用有效量的抗NRG1抗体和治疗剂。在一个实施方案中，癌症包含肿瘤再启动细胞。在一个实施方案中，癌症是非小细胞肺癌。在一个实施方案中，癌症是乳腺癌。在一个实施方案中，癌症对用化学治疗剂治疗有抗性。在一个实施方案中，癌症对用吉西他滨、帕利他塞、卡铂、和顺铂或帕利他塞、卡铂、和顺铂中两种或所有三种的组合治疗有抗性。在一个实施方案中，化学治疗剂不是酪氨酸激酶抑制剂。在另一个实施方案中，化学治疗剂是酪氨酸激酶抑制剂。在一个实施方案中，化学治疗剂是EGFR、HER2、HER3和/或HER4抑制剂。另一个实施方案另外包括对患者施用化学治疗剂。在一个实施方案中，化学治疗剂是吉西他滨、帕利他塞、卡铂、和顺铂或帕利他塞、卡铂、和顺铂中两种或所有三种的组合。
在一个实施方案中，癌症对用治疗性抗体治疗有抗性。在一个实施方案中，癌症对用EGFR、HER2、HER3、或HER4抗体治疗有抗性。另一个实施方案另外包括对患者施用抗体。在一个实施方案中，抗体是曲妥单抗或帕妥珠单抗。
在某些实施方案中，提供了在治疗方法中使用的抗NRG1抗体。在某些实施方案中，本发明提供了在治疗具有癌症的个体的方法中使用的抗NRG1抗体，所述方法包括对个体施用有效量的抗NRG1抗体。在一个此类实施方案中，所述方法进一步包括对个体施用有效量的至少一种别的治疗剂，例如，如下文所描述的。在别的实施方案中，本发明提供了在治疗经历癌症再发生的患者中使用的抗NRG1抗体。在某些实施方案中，本发明提供了在预防个体中对用治疗剂治疗的抗性的方法中使用的抗NRG1抗体，所述方法包括对个体施用有效量的抗NRG1抗体以预防对治疗剂的抗性。
在又一方面，本发明提供了抗NRG1抗体在制造或制备药物中的用途。在一个实施方案中，药物用于治疗癌症。在又一个实施方案中，药物在治疗癌症的方法中使用，所述方法包括对具有癌症的个体施用有效量的药物。在一个此类实施方案中，所述方法进一步包括对个体施用有效量的至少一种别的治疗剂，例如如下文所描述的。在又一个实施方案中，所述药物用于预防患者中对用治疗剂治疗的抗性。在又一个实施方案中，所述药物用于预防患者中癌症的再发生。
在又一方面，本发明提供了药物配制剂，其包含本文中提供的任何抗NRG1抗体，例如在任何上述治疗性方法中使用。在一个实施方案中，药物配制剂包含本文中提供的任何抗NRG1抗体和药学可接受载体。在另一个实施方案中，药物配制剂包含本文中提供的抗NRG1抗体和至少一种别的治疗剂，例如如下文所描述的。
可以单独或与疗法中的其它药剂组合使用本发明的抗体。例如，可以与至少一种别的治疗剂共施用本发明的抗体。下文描述了别的治疗剂的例子。
上文记录的此类联合疗法涵盖联合施用（其中两种或更多种治疗剂包含在相同或不同配制剂中），和分开施用，在该情况中，可以在施用别的治疗剂和/或辅助剂之前、同时和/或之后施用本发明的抗体。也可以与放射疗法组合使用本发明的抗体。
可以通过任何合适的手段，包括胃肠外、肺内、和鼻内，及若期望用于局部治疗的话，损伤内施用来施用本发明的抗体（和任何别的治疗剂）。胃肠外输注包括肌肉内、静脉内、动脉内、腹膜内、或皮下施用。部分根据施用是短暂的还是长期的，剂量给药可以通过任何合适的路径，例如通过注射，诸如静脉内或皮下注射进行。本文中涵盖各种剂量给药日程表，包括但不限于单次施用或在多个时间点里的多次施用、推注施用、和脉冲输注。
本发明的抗体会以一种符合良好的医学实践的方式配制、确定剂量及给药。关于这一点考虑的因素包括在治疗的特定病症、在治疗的特定哺乳动物、患者个体的临床状态、病症的起因、药物递送部位、给药方法、给药日程以及其它为开业医生所知的因素。抗体无需但可任选地与一种或多种目前用于预防或治疗所述病症的药物一起配制。上述其它药物的有效量取决于制剂中所存在的抗体的量、所治疗病症的类型、以及其它上述讨论的因素。这些药物通常以与本文所述相同的剂量和给药途径使用，或以约1-99%的本文所述剂量使用，或以任何剂量并通过任何途径使用，所述剂量和途径是凭经验/临床确定为合适的。
为了预防或治疗疾病，本发明的抗体(当单独或与一种或多种其它别的治疗剂联合使用时)的合适剂量会取决于所要治疗的疾病的类型、抗体的种类、疾病的严重性和病程、所给予抗体的预防或治疗目的、之前的治疗、患者的临床史和对抗体的应答、以及主治医师的斟酌决定。一次或在一系列治疗里对患者适当施用抗体。根据疾病的类型和严重性，约1μg/kg至15mg/kg（例如0.1mg/kg-10mg/kg）抗体可以是对患者施用的初始候选剂量，无论例如通过一次或多次分开施用，或者通过连续输注进行。根据上文所提及的因素，一种典型的每日剂量的范围可以是约1μg/kg至100mg/kg或更多。对于几天或更长里的重复施用，根据状况，一般会持续治疗，直至发生对疾病症状的期望抑制。抗体的一种例示性剂量会在约0.05mg/kg至约10mg/kg的范围中。如此，可以对患者施用一或多剂的约0.5mg/kg、2.0mg/kg、4.0mg/kg或10mg/kg（或其任何组合）。可以例如每周或每三周间歇施用此类剂量（例如使得患者接受约2至约20，或例如约6剂抗体）。可以施用初始的较高加载剂量，接着是较低的一或多剂。通过常规的技术和测定法容易监测此疗法的进展。
应当理解，可以替换抗NRG1抗体或在抗NRG1抗体外使用本发明的免疫缀合物实施任何上述配制剂或治疗性方法。
别的治疗剂
在某些实施方案中，别的治疗剂是抑制酪氨酸激酶受体途径的药剂。在一个实施方案中，别的治疗剂抑制HER途径。在一个实施方案中，别的治疗剂是EGFR、HER2、HER3、和/或HER4的抑制剂。
如本文中所使用的，术语“EGFR抑制剂”指结合EGFR或以其它方式与EGFR直接相互作用，并且阻止或降低其信号传导活性的化合物，并且或者称为“EGFR拮抗剂”。此类药剂的例子包括结合EGFR的抗体和小分子。结合EGFR的抗体的例子包括单抗579(ATCC CRL HB8506)、单抗455(ATCCCRL HB8507)、单抗225(ATCC CRL8508)、单抗528(ATCC CRL8509)（见美国专利No.4,943,533,Mendelsohn等）及其变体，诸如嵌合化的225（C225或西妥昔单抗(Cetuximab)；
Figure BDA0000491186630000511
）和重构人225(H225)（见WO96/40210,Imclone Systems Inc.）；IMC-11F8，即一种完全人的、EGFR靶向性抗体(Imclone)；结合II型突变体EGFR的抗体（美国专利No.5,212,290）；结合EGFR的人源化的和嵌合的抗体，如记载于美国专利No.5,891,996的；和结合EGFR的人抗体，诸如ABX-EGF或帕尼单抗(Panitumumab)（见WO98/50433,Abgenix/Amgen）；EMD55900(Stragliotto等Eur.J.Cancer32A:636-640(1996));EMD7200（马妥珠单抗(matuzumab)），即一种针对EGFR的人源化EGFR抗体，其与EGF和TGF-α两者竞争EGFR结合(EMD/Merck)；人EGFR抗体HuMax-EGFR(GenMab)；称为E1.1、E2.4、E2.5、E6.2、E6.4、E2.11、E6.3和E7.6.3并记载于US6,235,883的完全人抗体；MDX-447(Medarex Inc)；和单抗806或人源化单抗806(Johns等,J.Biol.Chem.279(29):30375-30384(2004))。可以将抗EGFR抗体与细胞毒剂缀合，如此生成免疫缀合物（见例如EP659,439A2,Merck Patent GmbH）。EGFR拮抗剂包括小分子诸如记载于美国专利No:5,616,582,5,457,105,5,475,001,5,654,307,5,679,683,6,084,095,6,265,410,6,455,534,6,521,620,6,596,726,6,713,484,5,770,599,6,140,332,5,866,572,6,399,602,6,344,459,6,602,863,6,391,874,6,344,455,5,760,041,6,002,008和5,747,498，及下列PCT公开文本：WO98/14451,WO98/50038,WO99/09016和WO99/24037的化合物。具体的小分子EGFR拮抗剂包括OSI-774（CP-358774、埃罗替尼(erlotinib)，
Figure BDA0000491186630000522
Genentech/OSIPharmaceuticals）；PD183805（CI1033、2-丙烯酰胺、N-[4-[(3-氯-4-氟苯基)氨基]-7-[3-(4-吗啉基)丙氧基]-6-喹唑啉基]-、二氢氯化物，Pfizer Inc.）；ZD1839、吉非替尼(gefitinib)(IRESSATM)4-(3’-氯-4’-氟苯胺基)-7-甲氧基-6-(3-吗啉代丙氧基)喹唑啉，AstraZeneca）；ZM105180((6-氨基-4-(3-甲基苯基-氨基)-喹唑啉，Zeneca)；BIBX-1382(N8-(3-氯-4-氟-苯基)-N2-(1-甲基-哌啶-4-基)-嘧啶并[5,4-d]嘧啶-2,8-二胺，Boehringer Ingelheim)；PKI-166((R)-4-[4-[(1-苯基乙基)氨基]-1H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-基]-酚)；(R)-6-(4-羟基苯基)-4-[(1-苯基乙基)氨基]-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶)；CL-387785(N-[4-[(3-溴苯基)氨基]-6-喹唑啉基]-2-丁烯酰胺(butynamide))；EKB-569(N-[4-[(3-氯-4-氟苯基)氨基]-3-氰基-7-乙氧基-6-喹啉基]-4-(二甲氨基)-2-丁烯酰胺)(Wyeth)；AG1478(Pfizer)；AG1571(SU5271;Pfizer)；双重EGFR/HER2酪氨酸激酶抑制剂诸如拉帕替尼(lapatinib)(
Figure BDA0000491186630000521
GSK572016或N-[3-氯-4-[(3-氟苯基)甲氧基]苯基]6[5[[[2甲基磺酰基)乙基]氨基]甲基]-2-呋喃基]-4-喹唑啉胺；Glaxo-SmithKline)。
如本文中所使用的，术语“HER2抑制剂”指结合HER2或以其它方式与HER2直接相互作用，并且阻止或降低其信号传导活性的化合物，并且或者称为“HER2拮抗剂”。此类药剂的例子包括结合HER2的抗体和小分子。特定的HER2抗体包括帕妥珠单抗(pertuzumab)和曲妥单抗(trastuzumab)。如本文中所使用的，术语“HER3抑制剂”指结合HER3或以其它方式与HER3直接相互作用，并且阻止或降低其信号传导活性的化合物，并且或者称为“HER3拮抗剂”。此类药剂的例子包括结合HER3的抗体和小分子。如本文中所使用的，术语“HER4抑制剂”指结合HER4或以其它方式与HER4直接相互作用，并且阻止或降低其信号传导活性的化合物，并且或者称为“HER4拮抗剂”。此类药剂的例子包括结合HER4的抗体和小分子。
涉及HER抗体的专利公开文本包括：美国专利No.5,677,171,美国专利No.5,720,937,美国专利No.5,720,954,美国专利No.5,725,856,美国专利No.5,770,195,美国专利No.5,772,997,美国专利No.6,165,464,美国专利No.6,387,371,美国专利No.6,399,063,US2002/0192211A1,美国专利No.6,015,567,美国专利No.6,333,169,美国专利No.4,968,603,美国专利No.5,821,337,美国专利No.6,054,297,美国专利No.6,407,213,美国专利No.6,719,971,美国专利No.6,800,738,US2004/0236078A1,美国专利No.5,648,237,美国专利No.6,267,958,美国专利No.6,685,940,美国专利NO.6,821,515,WO98/17797,美国专利No.6,333,398,美国专利No.6,797,814,美国专利No.6,339,142,美国专利No.6,417,335,美国专利No.6,489,447,WO99/31140,US2003/0147884A1,US2003/0170234A1,US2005/0002928A1,美国专利No.6,573,043,US2003/0152987A1,WO99/48527,US2002/0141993A1,WO01/00245,US2003/0086924,US2004/0013667A1,WO00/69460,WO01/00238,WO01/15730,美国专利No.6,627,19681,美国专利No.6,632,979B1,WO01/00244,US2002/0090662A1,WO01/89566,US2002/0064785,US2003/0134344,WO04/24866,US2004/0082047,US2003/0175845A1,WO03/087131,US2003/0228663,WO2004/008099A2,US2004/0106161,WO2004/048525,US2004/0258685A1,美国专利No.5,985,553,美国专利No.5,747,261,美国专利No.4,935,341,美国专利No.5,401,638,美国专利No.5,604,107,WO87/07646,WO89/10412,WO91/05264,EP412,116B1,EP494,135B1,美国专利No.5,824,311,EP444,181B1,EP1,006,194A2,US2002/0155527A1,WO91/02062,美国专利No.5,571,894,美国专利No.5,939,531,EP502,812B1,WO93/03741,EP554,441B1,EP656,367A1,美国专利No.5,288,477,美国专利No.5,514,554,美国专利No.5,587,458,WO93/12220,WO93/16185,美国专利No.5,877,305,WO93/21319,WO93/21232,美国专利No.5,856,089,WO94/22478,美国专利No.5,910,486,美国专利No.6,028,059,WO96/07321,美国专利No.5,804,396,美国专利No.5,846,749,EP711,565,WO96/16673,美国专利No.5,783,404,美国专利No.5,977,322,美国专利No.6,512,097,WO97/00271,美国专利No.6,270,765,美国专利No.6,395,272,美国专利No.5,837,243,WO96/40789,美国专利No.5,783,186,美国专利No.6,458,356,WO97/20858,WO97/38731,美国专利No.6,214,388,美国专利No.5,925,519,WO98/02463,美国专利No.5,922,845,WO98/18489,WO98/33914,美国专利No.5,994,071,WO98/45479,美国专利No.6,358,682B1,US2003/0059790,WO99/55367,WO01/20033,US2002/0076695A1,WO00/78347,WO01/09187,WO01/21192,WO01/32155,WO01/53354,WO01/56604,WO01/76630,WO02/05791,WO02/11677,美国专利No.6,582,919,US2002/0192652A1,US2003/0211530A1,WO02/44413,US2002/0142328,美国专利No.6,602,670B2,WO02/45653,WO02/055106,US2003/0152572,US2003/0165840,WO02/087619,WO03/006509,WO03/012072,WO03/028638,US2003/0068318,WO03/041736,EP1,357,132,US2003/0202973,US2004/0138160,美国专利No.5,705,157,美国专利No.6,123,939,EP616,812B1,US2003/0103973,US2003/0108545,美国专利No.6,403,630B1,WO00/61145,WO00/61185,美国专利No.6,333,348B1,WO01/05425,WO01/64246,US2003/0022918,US2002/0051785A1,美国专利No.6,767,541,WO01/76586,US2003/0144252,WO01/87336,US2002/0031515A1,WO01/87334,WO02/05791,WO02/09754,US2003/0157097,US2002/0076408,WO02/055106,WO02/070008,WO02/089842,WO03/86467和US2010/0255010。
在某些实施方案中，别的治疗剂是化学治疗剂。“化学治疗剂”指可用于治疗癌症的化学化合物。化学治疗剂的例子包括烷化剂类(alkylating agents)，诸如塞替派(thiotepa)和环磷酰胺(cyclosphosphamide)
Figure BDA0000491186630000541
磺酸烃基酯类(alkyl sulfonates)，诸如白消安(busulfan)、英丙舒凡(improsulfan)和哌泊舒凡(piposulfan)；氮丙啶类(aziridines)，诸如苯佐替派(benzodepa)、卡波醌(carboquone)、美妥替派(meturedepa)和乌瑞替派(uredepa)；乙撑亚胺类(ethylenimines)和甲基蜜胺类(methylamelamines)，包括六甲蜜胺(altretamine)、三乙撑蜜胺(triethylenemelamine)、三乙撑磷酰胺(triethylenephosphoramide)、三乙撑硫代磷酰胺(triethylenethiophosphoramide)和三羟甲蜜胺(trimethylomelamine)；番荔枝内酯类(acetogenin)（尤其是布拉他辛(bullatacin)和布拉他辛酮(bullatacinone)）；δ-9-四氢***酚(tetrahydrocannabinol)（屈***酚(dronabinol)，
Figure BDA0000491186630000551
）；β-拉帕醌(lapachone)；拉帕醇(lapachol)；秋水仙素类(colchicines)；白桦脂酸(betulinic acid)；喜树碱(camptothecin)（包括合成类似物托泊替康(topotecan)
Figure BDA0000491186630000552
CPT-11（伊立替康(irinotecan)，
Figure BDA0000491186630000553
乙酰喜树碱、东莨菪亭(scopoletin)和9-氨基喜树碱）；苔藓抑素(bryostatin)；callystatin；CC-1065（包括其阿多来新(adozelesin)、卡折来新(carzelesin)和比折来新(bizelesin)合成类似物）；鬼臼毒素(podophyllotoxin)；鬼臼酸(podophyllinic acid)；替尼泊苷(teniposide)；隐藻素类(cryptophycin)（特别是隐藻素1和隐藻素8）；多拉司他汀(dolastatin)；duocarmycin（包括合成类似物，KW-2189和CB1-TM1）；艾榴塞洛素(eleutherobin)；pancratistatin；sarcodictyin；海绵抑素(spongistatin)；氮芥类(nitrogen mustards)，诸如苯丁酸氮芥(chlorambucil)、萘氮芥(chlornaphazine)、胆磷酰胺(chlorophosphamide)、雌莫司汀(estramustine)、异环磷酰胺(ifosfamide)、双氯乙基甲胺(mechlorethamine)、盐酸氧氮芥(mechlorethamineoxide hydrochloride)、美法仑(melphalan)、新氮芥(novembichin)、苯芥胆甾醇(phenesterine)、泼尼莫司汀(prednimustine)、曲磷胺(trofosfamide)、尿嘧啶氮芥(uracil mustard)；亚硝脲类(nitrosoureas)，诸如卡莫司汀(carmustine)、氯脲菌素(chlorozotocin)、福莫司汀(fotemustine)、洛莫司汀(lomustine)、尼莫司汀(nimustine)和雷莫司汀(ranimnustine)；抗生素类，诸如烯二炔类抗生素(enediyne)（例如加利车霉素(calicheamicin)，尤其是加利车霉素γ1I和加利车霉素ωI1（见例如Nicolaou等,Angew.Chem Intl.Ed.Engl.,33:183-186(1994)）；CDP323，即一种口服α-4整联蛋白抑制剂；蒽环类抗生素(dynemicin)，包括蒽环类抗生素A；埃斯波霉素(esperamicin)；以及新制癌素(neocarzinostatin)发色团和相关色蛋白烯二炔类抗生素发色团）、阿克拉霉素(aclacinomycin)、放线菌素(actinomycin)、氨茴霉素(anthramycin)、偶氮丝氨酸(azaserine)、博来霉素(bleomycin)、放线菌素C(cactinomycin)、carabicin、洋红霉素(carminomycin)、嗜癌霉素(carzinophilin)、色霉素(chromomycins)、放线菌素D(dactinomycin)、柔红霉素(daunorubicin)、地托比星(detorubicin)、6-二氮-5-氧-L-正亮氨酸、多柔比星(doxorubicin)（包括
Figure BDA0000491186630000561
吗啉代多柔比星、氰基吗啉代多柔比星、2-吡咯代多柔比星和盐酸多柔比星脂质体注射液脂质体多柔比星TLC D-99
Figure BDA0000491186630000563
PEG化的脂质体多柔比星
Figure BDA0000491186630000564
和脱氧多柔比星）、表柔比星(epirubicin)、依索比星(esorubicin)、伊达比星(idarubicin)、麻西罗霉素(marcellomycin)、丝裂霉素类(mitomycins)诸如丝裂霉素C、霉酚酸(mycophenolic acid)、诺拉霉素(nogalamycin)、橄榄霉素(olivomycin)、培洛霉素(peplomycin)、potfiromycin、嘌呤霉素(puromycin)、三铁阿霉素(quelamycin)、罗多比星(rodorubicin)、链黑菌素(streptonigrin)、链佐星(streptozocin)、杀结核菌素(tubercidin)、乌苯美司(ubenimex)、净司他丁(zinostatin)、佐柔比星(zorubicin)；抗代谢物类，诸如甲氨蝶呤、吉西他滨(gemcitabine)
Figure BDA0000491186630000565
替加氟(tegafur)
Figure BDA0000491186630000566
卡培他滨(capecitabine)
Figure BDA0000491186630000567
埃博霉素(epothilone)和5-氟尿嘧啶(5-FU)；叶酸类似物，诸如二甲叶酸(denopterin)、甲氨蝶呤、蝶酰三谷氨酸(pteropterin)、三甲曲沙(trimetrexate)；嘌呤类似物，诸如氟达拉滨(fludarabine)、6-巯基嘌呤(mercaptopurine)、硫咪嘌呤(thiamiprine)、硫鸟嘌呤(thioguanine)；嘧啶类似物，诸如安西他滨(ancitabine)、阿扎胞苷(azacitidine)、6-氮尿苷、卡莫氟(carmofur)、阿糖胞苷(cytarabine)、双脱氧尿苷(dideoxyuridine)、去氧氟尿苷(doxifluridine)、依诺他滨(enocitabine)、氟尿苷(floxuridine)；雄激素诸如卡普睾酮(calusterone)、屈他雄酮(dromostanolonepropionate)、环硫雄醇(epitiostanol)、美雄烷(mepitiostane)、睾内酪(testolactone)；抗肾上腺类，诸如氨鲁米特(aminoglutethimide)、米托坦(mitotane)、曲洛司坦(trilostane)；叶酸补充剂，诸如亚叶酸(folinic acid)；醋葡醛内酯(aceglatone)；醛磷酰胺糖苷(aldophosphamide glycoside)；氨基乙酰丙酸(aminolevulinic acid)；恩尿嘧啶(eniluracil)；安吖啶(amsacrine)；bestrabucil；比生群(bisantrene)；依达曲沙(edatraxate)；地磷酰胺(defofamine)；地美可辛(demecolcine)；地吖醌(diaziquone)；elfornithine；依利醋铵(elliptiniumacetate)；埃博霉素(epothilone)；依托格鲁(etoglucid)；硝酸镓；羟脲(hydroxyurea)；香菇多糖(lentinan)；氯尼达明(lonidainine)；美登木素生物碱类(maytansinoids)，诸如美登素(maytansine)和安丝菌素(ansamitocin)；米托胍腙(mitoguazone)；米托蒽醌(mitoxantrone)；莫哌达醇(mopidamol)；二胺硝吖啶(nitracrine)；喷司他丁(pentostatin)；蛋氨氮芥(phenamet)；吡柔比星(pirarubicin)；洛索蒽醌(losoxantrone)；2-乙基酰肼(ethylhydrazide)；丙卡巴肼(procarbazine)；
Figure BDA0000491186630000571
多糖复合物(JHS Natural Products,Eugene,OR)；雷佐生(razoxane)；根霉素(rhizoxin)；西索菲兰(sizofiran)；螺旋锗(spirogermanium)；细交链孢菌酮酸(tenuazonic acid)；三亚胺醌(triaziquone)；2,2’,2’-三氯三乙胺；单端孢菌素类(trichothecenes)（尤其是T-2毒素、疣孢菌素(verrucarin)A、杆孢菌素(roridin)A和蛇行菌素(anguidin)）；乌拉坦(urethan)；长春地辛(vindesine)
Figure BDA0000491186630000572
达卡巴嗪(dacarbazine)；甘露醇氮芥(mannomustine)；二溴甘露醇(mitobronitol)；二溴卫矛醇(mitolactol)；哌泊溴烷(pipobroman)；gacytosine；阿糖胞苷(arabinoside)（“Ara-C”）；塞替派(thiotepa)；类紫杉醇(taxoid)，例如帕利他塞(paclitaxel)清蛋白改造的纳米颗粒剂型帕利他塞(ABRAXANETM)和多西他塞(doxetaxel)
Figure BDA0000491186630000574
苯丁酸氮芥(chloranbucil)；6-硫鸟嘌呤(thioguanine)；巯基嘌呤(mercaptopurine)；甲氨蝶呤(methotrexate)；铂剂，诸如顺铂(cisplatin)、奥沙利铂(oxaliplatin)（例如
Figure BDA0000491186630000575
）、和卡铂(carboplatin)；长***类(vincas)（其阻止微管蛋白聚合形成微管），包括长春碱(vinblastine)
Figure BDA0000491186630000576
长春新碱(vincristine)
Figure BDA0000491186630000577
长春地辛(vindesine)
Figure BDA0000491186630000578
和长春瑞滨(vinorelbine)
Figure BDA0000491186630000579
依托泊苷(etoposide)(VP-16)；异环磷酰胺(ifosfamide)；米托蒽醌(mitoxantrone)；亚叶酸(leucovorin)；能灭瘤(novantrone)；依达曲沙(edatrexate)；道诺霉素(daunomycin)；氨基蝶呤(aminopterin)；伊本膦酸盐(ibandronate)；拓扑异构酶抑制剂RFS2000；二氟甲基鸟氨酸(DMFO)；类视黄酸(retinoids)，诸如视黄酸(retinoic acid)，包括贝沙罗汀(bexarotene)
Figure BDA00004911866300005710
二膦酸盐类(bisphosphonates)，诸如氯膦酸盐(clodronate)（例如
Figure BDA00004911866300005711
或依替膦酸钠(etidronate)
Figure BDA00004911866300005713
NE-58095、唑来膦酸/唑来膦酸盐(zoledronic acid/zoledronate)
Figure BDA00004911866300005714
阿伦膦酸盐(alendronate)
Figure BDA00004911866300005715
帕米膦酸盐(pamidronate)
Figure BDA00004911866300005716
替鲁膦酸盐(tiludronate)
Figure BDA00004911866300005717
或利塞膦酸盐(risedronate)
Figure BDA00004911866300005718
曲沙他滨(troxacitabine)（1,3-二氧戊环核苷胞嘧啶类似物）；反义寡核苷酸，特别是抑制牵涉异常(abherant)细胞增殖的信号传导途径中的基因表达的反义寡核苷酸，诸如例如PKC-α、Raf、H-Ras和表皮生长因子受体(EGF-R)；疫苗，诸如
Figure BDA00004911866300005719
疫苗和基因疗法疫苗，例如
Figure BDA00004911866300005720
疫苗、
Figure BDA0000491186630000581
疫苗和疫苗；拓扑异构酶1抑制剂（例如
Figure BDA0000491186630000583
）；rmRH（例如）；BAY439006（索拉非尼(sorafenib)；Bayer）；SU-11248（舒尼替尼(sunitinib)，
Figure BDA0000491186630000585
Pfizer）；哌立福辛(perifosine)、COX-2抑制剂（例如塞来考昔(celecoxib)或依托昔布(etoricoxib)）、蛋白体抑制剂（例如PS341）；保特佐米(bortezomib)
Figure BDA0000491186630000586
CCI-779；替吡法尼(tipifarnib)(R11577)；orafenib、ABT510；Bcl-2抑制剂诸如奥利默森钠(oblimersen sodium)
Figure BDA0000491186630000587
pixantrone；EGFR抑制剂（见下文定义）；酪氨酸激酶抑制剂（见下文定义）；丝氨酸-苏氨酸激酶抑制剂诸如雷帕霉素(rapamycin)（西罗莫司(sirolimus),法尼基转移酶抑制剂诸如洛那法尼(lonafarnib)(SCH6636,SARASARTM)；及任何上述物质的药学可接受盐、酸或衍生物；以及两种或更多种上述物质的组合，诸如CHOP（环磷酰胺、多柔比星、长春新碱和***龙联合疗法的缩写）和FOLFOX（奥沙利铂（ELOXATINTM）联合5-FU和亚叶酸的治疗方案的缩写）。
如本文中所定义的，化学治疗剂包括“抗激素剂”或“内分泌治疗剂”，其作用为调节、降低、阻断、或抑制可促进癌症生长的激素的效果。它们自身可以是激素，包括但不限于：具有混合的激动剂/拮抗剂概况的抗***，包括他莫昔芬(tamoxifen)
Figure BDA0000491186630000589
4-羟基他莫昔芬、托瑞米芬(toremifene)
Figure BDA00004911866300005810
艾多昔芬(idoxifene)、屈洛昔芬(droloxifene)、雷洛昔芬(raloxifene)
Figure BDA00004911866300005811
曲沃昔芬(trioxifene)、那洛昔芬(keoxifene)、和选择性***受体调节剂类(SERM)诸如SERM3；没有激动剂特性的纯抗***，诸如氟维司群(fulvestrant)
Figure BDA00004911866300005812
和EM800（此类药剂可以阻断***受体(ER)二聚化，抑制DNA结合，增加ER周转，和/或抑制ER水平）；芳香酶抑制剂，包括类固醇芳香酶抑制剂诸如福美坦(formestane)和依西美坦(exemestane)
Figure BDA00004911866300005813
和非类固醇芳香酶抑制剂诸如阿那曲唑(anastrazole)
Figure BDA00004911866300005814
来曲唑(letrozole)
Figure BDA00004911866300005815
和氨鲁米特(aminoglutethimide)，而其它芳香酶抑制剂包括伏罗唑(vorozole)醋酸甲地孕酮(megestrol acetate)法倔唑(fadrozole)、和4(5)-咪唑；促黄体生成激素释放激素激动剂，包括亮丙瑞林(leuprolide)
Figure BDA00004911866300005818
戈舍瑞林(goserelin)、布舍瑞林(buserelin)、和曲普瑞林(tripterelin)；性类固醇，包括妊娠素(progestines)诸如醋酸甲地孕酮和醋酸甲羟孕酮、***诸如己烯雌酚和倍美力(premarin)、和雄激素/类视黄醇诸如氟***(fluoxymesterone)、全反式视黄酸(transretionicacid)和芬维A胺(fenretinide)；奥那司酮(onapristone)；抗孕酮；***受体下调剂(ERD)；抗雄激素诸如氟他胺(flutamide)、尼鲁米特(nilutamide)和比卡米特(bicalutamide)；及任何上述物质的药学可接受盐、酸或衍生物；以及两种或更多种上述物质的组合。
此类联合疗法还包括：(i)脂质激酶抑制剂；(ii)反义寡核苷酸，特别是那些抑制牵涉异常细胞增殖的信号传导途径中的基因表达的，诸如例如PKC-α、Ralf和H-Ras；(iii)核酶诸如VEGF表达抑制剂（例如，
Figure BDA0000491186630000591
核酶）和HER2表达抑制剂；(iv)疫苗诸如基因疗法疫苗，例如，
Figure BDA0000491186630000592
疫苗、
Figure BDA0000491186630000593
疫苗、和
Figure BDA0000491186630000594
疫苗；rIL-2；
Figure BDA0000491186630000596
拓扑异构酶1抑制剂；rmRH；(v)抗血管生成剂诸如贝伐单抗(bevacizumab)Genentech)；和任何上述物质的药学可接受盐、酸或衍生物。
上文记录的此类联合疗法涵盖联合施用（其中两种或更多种治疗剂包含在相同或不同配制剂中），和分开施用，在该情况中，可以在施用别的治疗剂和/或辅佐剂之前、同时、和/或之后发生本发明的抗NRG1抗体的施用。
H.制品
在本发明的另一方面，提供了一种制品，其含有可用于治疗、预防和/或诊断上文所描述的病症的材料。制品包含容器和容器上或与容器联合的标签或包装插页。合适的容器包括例如瓶、管形瓶、注射器、IV溶液袋、等等。容器可以由多种材料诸如玻璃或塑料形成。容器容纳单独或与另一种组合物组合有效治疗、预防和/或诊断状况的组合物，并且可以具有无菌存取口（例如，容器可以是具有由皮下注射针可穿过的塞子的管形瓶或静脉内溶液袋）。组合物中的至少一种活性剂是本发明的抗体。标签或包装插页指示使用组合物来治疗选择的状况。此外，制品可以包含(a)其中装有组合物的第一容器，其中组合物包含本发明的抗体；和(b)其中装有组合物的第二容器，其中组合物包含别的细胞毒性或其它方面治疗性的药剂。在本发明的此实施方案中的制品可以进一步包含包装插页，其指示可以使用组合物来治疗特定的状况。或者/另外，制品可以进一步包含第二（或第三）容器，其包含药学可接受缓冲液，诸如抑菌性注射用水(BWFI)、磷酸盐缓冲盐水、Ringer氏溶液和右旋糖溶液。它可以进一步包含从商业和用户观点看期望的其它材料，包括其它缓冲液、稀释剂、滤器、针、和注射器。
III.实施例
以下是本发明的方法和组合物的实施例。应当理解，鉴于上文提供的一般描述，可以实施各种其它实施方案。
实施例1：方法
细胞系
NSCLC细胞系Calu3、H441、H1299、H1993、A549和H596、和KPL4乳腺癌细胞系获自美国典型培养物保藏中心(American Type CultureCollection,ATCC),Manassas,VA。将这些细胞系在含有10%FBS、Pen/Strep和L-谷氨酰胺的RPMI中维持。将Calu3在替换RPMI的ATCC培养基中培养。用TZV-b-肌动蛋白-eGFP慢病毒转导Calu3、H441和KPL4细胞系。在多次传代后，分选并扩增高GFP表达细胞以得到约95%GFP阳性细胞，并且这些亚系描述为Calu3-GFP和H441-GFP和KPL4-GFP。小鼠NSCLC细胞系LKPH1和LKPH2自来自携带KrasLSL-G12D/+;p53FL/+;Z/EG肺肿瘤的小鼠的两个独立肿瘤衍生。最初，细胞系在含有5%FBS、牛垂体提取物、N2补充物、EGF、FGF、Pen/Strep和L-谷氨酰胺的DMEM/F12培养基中建立。将LKPH1和LKPH2在含有10%FBS、Pen/Strep和L-谷氨酰胺的DMEM高葡萄糖培养基中培养。
诱导型shRNA慢病毒：本研究中使用的发夹寡核苷酸如下：
shNRG1：5’-GATCCCCCATGGTGAACATAGCGAATTTCAAGAGAATTCGCTATGTTCACCATGTTTTTTGGAAA-3’（有义）(SEQ ID NO：77)和
5’-AGCTTTTCCAAAAAACATGGTGAACATAGCGAATTCTCTTGAAATTCGCTATGTTCACCATGGGG-3’（反义）(SEQ ID NO：78)。
shNRG1.2：5’-GATCCCCGAGTATATGTGCAAAGTGATTCAAGAGATCACTTTGCACATATACTCTTTTTTGGAAA-3’（有义）(SEQ ID NO：79)和
5’-AGCTTTTCCAAAAAAGAGTATATGTGCAAAGTGATCTCTTGAATCACTTTGCACATATACTCGGG-3’（反义）(SEQ ID NO：80)。
shErbB4：5’-GATCCCCGATCACAACTGCTGCTTAATTCAAGAGATTAAGCAGCAGTTGTGATCTTTTTTGGAAA-3’（有义）(SEQ ID NO：81)和
5’-AGCTTTTCCAAAAAAGATCACAACTGCTGCTTAATCTCTTGAATTAAGCAGCAGTT GTGATCGGG-3’（反义）(SEQ ID NO：82)。
shErbB3：5’-GATCCCCAAGAGGATGTCAACGGTTATTCAAGAGATAACCGTTGACATCCTCTTTTTTTTGGAAA-3’（有义）(SEQ ID NO：83)和
5’-AGCTTTTCCAAAAAAAAGAGGATGTCAACGGTTATCTCTTGAATAACCGTTGACATCCTCTTGGG-3’（反义）(SEQ ID NO：84)。
小鼠shNRG1：5’-GATCCCCCATGGTGAACATAGCGAATTTCAAGAGAATTCGCTATGTTCACCATGTTTTTTGGAAA-3’（有义）(SEQ ID NO：85)和
5’-AGCTTTTCCAAAAAACATGGTGAACATAGCGAATTCTCTTGAAATTCGCTATGTTCACCATGGGG-3’（反义）(SEQ ID NO：86)。
将互补的双链shRNA寡核苷酸***Tet诱导型病毒基因转移载体中，如描述的(Hoeflich等Cancer Res.2006)。载体***由穿梭载体和dsRed表达病毒载体主链构成，其含有经密码子优化的Tet阻抑物-内部核糖体进入位点-dsRed盒以实现Tet调节的shRNA表达。先前描述了萤光素酶shRNA构建体(Hoeflich等)。
病毒包装和细胞系生成：基于先前描述的方法使用Lipofectamine(Invitrogen,Carlsbad,CA)通过在HEK293T细胞中共转染含有期望的shRNA的pHUSH-Lenti-dsRed构建体与表达水泡性口膜炎病毒(VSV-G)包膜糖蛋白和HIV-1包装蛋白(GAG-POL)的质粒来生成携带诱导型shRNA的慢病毒构建体。用这些病毒转导靶细胞。在大于3次传代后，使用FACS分选来选择前约20%dsRed表达肿瘤细胞，将其收集、合并并扩充。
体外研究：为了诱导shRNA表达，将含有多西环素(doxycycline)诱导型shNRG1或sh萤光素酶的稳定细胞系在1ug/ml多西环素中培养总共6天。诱导第一天将细胞在10%FBS中培养，接着在4天的过程里滴定FBS。然后，在生长的最后6小时期间将细胞完全血清饥饿。然后，将细胞加工以进行RNA提取或Western印迹。对于小鼠肺肿瘤细胞系中的HER4ECD研究，将LKPH细胞在血清饥饿条件中培养24小时，之后添加2mg/ml浓度的HER4ECD。然后，将LKPH细胞再温育48小时，之后加工以进行Western印迹。如下实施在H441细胞上添加外源NRG1：将H441细胞进行血清饥饿达18小时，之后添加1uM重组人NRG1β-1胞外域(R&D systems)或1uM抗豚草(ragweed)IgG2A作为对照。添加NRG1或豚草后10分钟，加工细胞以进行Western印迹。
RNA分离、cDNA制备和qPCR：使用Qiagen RNeasy微型试剂盒来分离RNA。使用ABI高保真度试剂盒依照制造商的用法说明书自总RNA制备互补DNA。使用ABI基因特异性引物/探针通过定量实时PCR(ABI7500)测定NRG1α、NRG1β、HER3、HER4表达。使用GAPDH或RAB14持家基因标准化基因表达。
体内异种移植物肿瘤研究：将肿瘤细胞(1000-2000万)移植入无胸腺裸鼠的右体侧中。在肿瘤大小达到约200mm3时，将小鼠分成不同处理组。然后，对于初始研究用媒介物或化学疗法（帕利他塞，i.v.+顺铂，i.p.）处理小鼠。化学疗法剂量给药方案是隔天的帕利他塞20mg/kg i.v.达5剂和第1天和第7天（对于Calu3模型）及第1天和第14天（对于H441模型）的顺铂5mg/kg i.p.。在最后一剂化疗后至少1周收集消退的肿瘤和时间匹配媒介物对照。使用分散酶/胶原酶分离肿瘤，并将样品进行FACS分选以收集GFP阳性肿瘤细胞。对于NRG1敲低研究，处理组是：蔗糖、多西环素(dox)、化学疗法+蔗糖、和化学疗法+多西环素。在与第一剂化学疗法相同的时间开始用蔗糖或多西环素的处理，并且继续进行，持续整个研究。对媒介物组任意提供5%蔗糖水，并且对多西环素组提供5%蔗糖中的1mg/ml多西环素。
异种移植物肿瘤生长分析：为了适当地分析随时间来自同一动物的肿瘤体积的重复测量，使用混合建模方法(Pinheiro等2009)。此方法可以解决重复测量和由于研究结束前非处理相关动物终止所致的适度退出率(drop out rate)两者。对每个处理组使用三次回归样条来将非线性概况(profile)拟合至log2肿瘤体积的时间过程。
体内LSL-K-rasG12D;p53Fl/+和LSL-K-rasG12D;p53Fl/Fl Her4ECD研究：用Adeno-Cre病毒感染LSL-K-rasG12D;p53Fl/+，并容许肿瘤诱导后成熟16周。在肿瘤诱导后16周（研究的第0天）实施基线CT扫描，并将小鼠分组，使得每组的平均起始肿瘤体积是相等的。用顺铂(7mg/kg)或磷酸盐缓冲盐水一周一次持续三周，及用HER4ECD-Fc(25mg/kg)或抗豚草IgG2A(25mg/kg)两周一次持续整个研究对小鼠给药。在第14天、第45天和第66天实施系列CT扫描。
X射线微型计算机断层摄影术（micro-CT）：利用两个micro-CT***（vivaCT40和vivaCT75,Scanco Medical,Switzerland）进行纵向肺成像。将动物在micro-CT***间随机化，并在用于基线成像的同一***上再扫描。以38μm(vivaCT40)或50μm(vivaCT75)各向同性体元大小、1000次投影(projection)、250ms(vivaCT40)或200ms(vivaCT75)积分时间、45keV光子能、和177mA电流获得数据。对于体内成像的持续时间，将动物用医用空气中的2%异氟烷麻醉，并通过受调节的温暖气流维持于恒定的37℃温度。每次对话的成像时间是每只动物约15分钟(vivaCT75)或25分钟(vivaCT40)，并且估计的放射剂量是约0.2Gy(vivaCT75)或0.1Gy(vivaCT40)。使用图像分析软件包Analyze(AnalyzeDirect,Inc.,Lenexa,KS,USA)在冠状平面中评估成像数据。一旦鉴定出每个肿瘤的最大截面平面，测定最大肿瘤直径(d1)和最大垂直直径(d2)的估计量。总肿瘤负荷以所有肿瘤的方向估计量的向量积(d1x d2)的总和计算。先前验证了体内micro-CT肿瘤分析，并且发现与通过离体micro-CT分析(Singh等,2010)测定的总肿瘤体积良好地相关联。
siRNA：HER3(M-003127-03)、HER1(M-003114-01)、HER2、HER4和非靶向对照(D-001206-14-20)的小干扰RNA寡聚物(siRNA)集合购自DharmaconLafayette,CO。通过逆转染将siRNA导入H522细胞中。在96孔微量滴定板中接种细胞/孔，所述96孔微量滴定板含有50mmol/L的合并的RNAi寡聚物和在OPTI-MEM(Invitrogen)中稀释的DharmaFECT#(T-2001-02,Dharmacon)转染试剂的预温育混合物，按照制造商的推荐进行。转染后96小时，通过AlamarBlue染色测量对细胞增殖的影响。
Western印迹：对于体外细胞培养物的Western印迹，将粘附细胞用冰冷的1x磷酸盐缓冲盐水(PBS)清洗三次，并在RIPA缓冲液(Pierce Biotechnology)、Halt蛋白酶抑制剂、和Halt磷酸酶抑制剂混合物(Thermo Scientific)中裂解。将裂解物收集，均质化，并通过离心10分钟来澄清。在不进行PBS清洗的情况中制备原发性小鼠肿瘤裂解物，如上文所述的。将上清液蛋白质在4-12%NuPAGE Novex bis-tris凝胶(Invitrogen)中分级。使用iBlot干印迹***(Invitrogen)依照制造商的说明书实施印迹。使用Odyssey Western印迹分析和红外成像***(Li-Cor Biosciences)依照制造商的用法说明书实施硝酸纤维素膜封闭和抗体染色。在Odyssey扫描仪(Li-Cor Biosciences)上显现印迹。
抗体：在Western印迹实验中使用下列一抗：抗肌动蛋白(612656,BDBiosciences)、抗GAPDH(sc-25778,Santa Cruz Biotechnology)、抗EGF受体(2232,Cell Signaling Technology)、抗Neu(sc-284,Santa Cruz Biotechnology)、抗ErbB3(sc-285,Santa Cruz Biotechnology)、抗磷酸HER3(4791,CellSignaling Technology)、抗ErbB4(sc-283,Santa Cruz Biotechnology)、抗磷酸HER4(4757,Cell Signaling Technology)、抗Akt(4691,Cell SignalingTechnology)、抗磷酸Akt(4058,Cell Signaling Technology)、Stat/磷酸Stat抗体取样器试剂盒(9939/9914,Cell Signaling Technology)、抗MEK1/2(9126,CellSignaling Technology)、抗磷酸MEK1/2(2338,Cell Signaling Technology)。使用来自Li-Cor Biosciences的下列二抗：IRDye680缀合的山羊抗小鼠IgG、IRDye800CW缀合的山羊抗家兔IgG。
BIAcore
用BIAcoreTM-T100仪器通过表面等离振子共振(SRP)测量抗NRG1IgG的结合亲和力。通过包被在CM5生物传感器芯片上的小鼠抗人Fc抗体(GEHealthcare,产品目录号BR-1008-39)捕捉抗NRG1人IgG以获得大约1000个应答单位(RU)。为了动力学测量，将两倍系列稀释(从500nM稀释至0.245nM)于HBS-T缓冲液(GE Healthcare,产品目录号BR-1003-68)中的人NRG1-α和NRG1-β在25℃以流速30μl/分钟注入。用简单的一对一Langmuir结合模型(BIAcore评估软件版本3.2)计算结合速率(kon)和解离速率(koff)。以koff/kon比例计算平衡解离常数(KD)。
KIRA
培养MCF7细胞
将含10%胎牛血清(FBS)(Sigma Aldrich Corporation;St.Louis,MO)的RPMI培养基中的MCF7细胞以5,000个细胞/孔的接种密度加入96孔培养板(No.1270,BD Falcon;Franklin Lakes,NJ)中。将平板在5%CO2中37℃培养3天。在第3天将MCF7细胞转换至无血清培养基中并37℃连续温育超过6小时，然后加入神经调节蛋白和测试材料。
NRG1a和NRG1b诱导的Her3异二聚体磷酸化的抑制
用含0.5%BSA、青霉素(100μ/mL,Gibco Invitrogen;Carlsbad,CA)、链霉素(100μg/mL,Gibco Invitrogen)和L-谷氨酰胺(10mM,Genentech)的无血清RPMI培养基将测试材料(538.24.71和526.90.28抗体)系列稀释成总共10个浓度。用无血清培养基（如上所述）制备重组人神经调节蛋白1-α(rhNRG1a,R&D system产品目录号296-HR/CF,Minneapolis,MN)。将各个已稀释测试材料与等体积的rhNRG1a(终浓度0.5nM)混合。将重组人神经调节蛋白1-β(rhNRG1b,Genentech)用无血清培养基（如上所述）稀释。将各个已稀释测试材料与等体积的rhNRG1b(终浓度0.2nM)混合。
将含MCF7细胞的平板从温箱中拿出。然后在各个孔中加入含测试材料和rhNRG1a或rhNRG1b的混合物。将细胞在37℃用5%CO2温育15分钟。将含样品的培养基轻轻倒出，然后将平板在纸巾上轻叩。为了裂解细胞并溶解受体，将含蛋白酶抑制剂混合物套组I(No.539131,Calbiochem)的已稀释细胞裂解缓冲液(Cell Signaling Technologies,产品目录号9803)加入各个孔中。将平板室温振荡温育15至60分钟以完成裂解。将裂解物或者贮存于-80℃冰柜或者立即用于通过ELISA对磷酸化进行定量。
关于激酶受体活化的ELISA
将Maxisorp免疫板(4-64718,Nunc;Neptune,NJ)用PBS中的抗erb3单抗(R+D Systems Duo Set IC Phospho-ErbB3kit part#841428,Minneapolis,MN)包被过夜。次日，去除捕获单抗并将平板用清洗缓冲液(含0.05%Tween20的PBS,pH7.4)清洗，然后用封闭缓冲液(含0.5%BSA的PBS)封闭12小时。用清洗缓冲液清洗平板，然后在已封闭平板中加入细胞裂解物和对照(R+DSystems Duo Set IC Phospho-ErbB3kit part#841430,Minneapolis,MN)并将平板室温振荡温育2小时以使其充分结合。温育后，将平板用清洗缓冲液清洗6次，然后在各孔中加入缀合了辣根过氧化物酶(HRP)的抗磷酸酪氨酸单抗(R+D Systems Duo Set IC Phospho-ErbB3kit part#841403,Minneapolis,MN)。将平板室温温育1小时。再次清洗平板并加入比色底物四甲基联苯胺(Kirkegaard&Perry Laboratories;Gaithersburg,MD)。允许显色20分钟。然后加入H3PO4终止反应。在微量板读数仪(Thermo Lab Systems;Waltham,MA)上以620nm为参照波长对平板进行450nm波长的读数。将吸光度作图并对抑制作用进行分析。将数据转移至KaleidaGraph4.0软件(Synergy Software;Reading,PA)上，用四参数S形曲线拟合计算半最大抑制浓度(IC50)值。
实施例2：NRG1敲低抑制肿瘤生长及延迟化学疗法后的肿瘤复发
通过评估单独的或与化学疗法组合的NRG1敲低的效果测定NRG1敲低对原发性肿瘤生长和化学疗法后的复发的影响。在本研究中使用三种人NSCLC模型，其展现出HER家族受体的不同表达样式。Calu3模型具有所有受体的高蛋白质水平，H441显示HER2和HER3的强烈表达和中等的HER1，而H1299显示中等水平HER1、2和3。
为了测定NRG1靶向在Calu3模型中的效力，将携带Calu3-shNRG1肿瘤的小鼠归入4组；1)媒介物+蔗糖，2)媒介物+dox，3)化学疗法+蔗糖，和4)化学疗法+dox。化学疗法由帕利他赛（20mg/kg，i.v.，隔天，5剂）和顺铂（5mg/kg，i.p.，每7天，2剂）组成，并在任意的饮用水中口服施用5%蔗糖或dox(2g/L)。研究期间一周两次测量肿瘤体积。对研究中使用的小鼠个体（对于媒介物+蔗糖，n=12只小鼠，而对于媒介物+dox，n=13只小鼠）生成肿瘤生长曲线，并以肿瘤体积的线性混合效应(LME)模型产生的拟合呈现，在图1A和1B中作为具有自动确定纽结的三次样条绘图。媒介物+dox组（倍增前时间(TDT)=44.5天）与媒介物+蔗糖（TDT=17天）相比有肿瘤体积倍增时间的显著延迟，提示NRG1敲低部分抑制肿瘤生长（图1A）。
通过比较化学疗法+蔗糖中的肿瘤生长与化学疗法+dox组中的肿瘤生长评估NRG1对肿瘤复发的影响。在化学疗法+dox组（TDT大于181天，到研究结束没有达到）中与化学疗法+蔗糖（TDT=124天）相比在肿瘤复发上有显著延迟（图1B）。此外，在有和没有化学疗法的这两种情况中来自经dox处理的小鼠的许多复发性肿瘤主要由仅具有小的可见肿瘤组织区的呈褐色/黑色粘液样液体构成。因此，dox处理组中测量的体积比实际的肿瘤体积大得相当多。在Calu3-shLuc对照研究中的任何组间没有观察到差异。另外，在最后一剂化学疗法后3天对Calu3肿瘤在增殖标志物Ki67方面实施免疫组织化学(IHC)。与化学疗法+蔗糖肿瘤相比，在经化学疗法+dox处理的肿瘤中有显著更低的Ki67阳性细胞比例，提示了NRG1信号传导在化学疗法后的残留肿瘤细胞中刺激增殖。
测定早期和晚期时间点收集的肿瘤细胞中NRG1α和NRG1β同等型的mRNA水平。NRG1转录物在晚期时间点时增加，指示敲低在体内没有得到维持。
还检查H441异种移植物模型中NRG1敲低的效果。虽然对原发性肿瘤生长有最低限度的影响（图2A（n=12/组），肿瘤生长曲线以肿瘤体积的LME拟合分析呈现，作为具有自动确定的纽结的三次样条绘图），在化学疗法+dox组（TDT大于150天，到研究结束没有达到）中与化学疗法+蔗糖（TDT=94天）相比肿瘤复发有显著延迟（图2B（n=12/组））。在H441-shLuc体内研究中肿瘤体积没有此类差异。与Calu3异种移植物模型相似，H441模型在晚期时间点时也展现出升高的NRG1转录物水平。
为了调查NRG1水平恢复后面的机制，对肿瘤细胞分析经慢病毒转导的基因的表达。因为用于以shRNA转导细胞的慢病毒还包括dsRed标志物基因，所以通过流式细胞术比较早期和晚期时间点时的dsRED阳性肿瘤细胞的比例。通过检查表达慢病毒dsRed转基因的肿瘤细胞（人特异性ESA阳性）的比例的FACS分析在早期（5天）和晚期时间点（大于100天）对肿瘤评估慢病毒基因表达的体内损失。早期时间点的小鼠接受蔗糖或dox，而晚期时间点的小鼠接受化疗+蔗糖或化疗+dox。观察到经蔗糖和dox处理的肿瘤两者在晚期时间点的dsRed阳性细胞比例的显著降低，降低对于经dox处理的肿瘤显著更大（1.8倍对4.1倍，p=0.007）。这提示了病毒转基因表达的损失与NRG1水平的恢复相关联。
Calu3和H441细胞两者都显示升高的HER3蛋白水平，提出如下的问题，即NRG1在肿瘤复发中的作用对于具有受体过表达的肿瘤是否是特异性的。为了解决此问题，使用具有低得多的HER3水平的H1299异种移植物模型。与H441模型相似，单独的对NRG1的敲低对原发性肿瘤生长仅具有适度的影响。比较而言且尽管H1299肿瘤有非常攻击性的生长，NRG1敲低导致所得的对化学疗法的响应增强和在化学疗法+dox组（TDT=30.45天）相对于化学疗法+蔗糖（TDT=11.5天）中肿瘤复发的显著延迟（n=12/组）。
此外，生成表达针对NRG1的不同shRNA(shNRG1.2)的H1299的稳定亚系，其导致NRG1mRNA水平的更适度(modest)的降低。用H1299-shNRG1.2进行的体内研究还表明在NRG1敲低后对化学疗法的响应增强。然而，生长抑制的幅度在此模型中较小，这与NRG1敲低的程度较轻一致。在H1299-shLuc体内研究中在有或没有化学疗法的情况中在蔗糖和dox处理组间在肿瘤体积上没有差异。
shRNA介导的敲低对NRG1自分泌信号传导的抑制对原发性肿瘤生长仅具有适度至中等的影响，但是显著延迟化学疗法后的肿瘤复发。尽管不能在异种移植物模型中维持对NRG1的长期敲低，我们观察到NRG1敲低后肿瘤复发的显著延迟。这些发现提示了调节原发性肿瘤生长，与化学抗性和复发的关键途径上有差异。
实施例3：对NRG1信号传导的抑制延迟肿瘤复发
为了测试NRG1信号传导在LSL-K-rasG12D;p53Fl/+小鼠模型中在促进化学疗法后的复发中的作用，采用在体内隔离NRG1并阻止其结合受体的配体陷阱方法。生成与鼠IgG2A Fc融合的人HER4胞外域(HER4-ECD)的融合物。HER4显示对NRG1的高亲和力结合(Tzahar等,1994)。在体外对经血清饥饿的LKPH1和LKPH2细胞添加HER4-ECD时，观察到对NRG1/HER3信号传导的抑制，如通过降低的p-HER3水平表明的。如此，分子在体外如预期的在干扰自分泌介导的NRG1信号传导中运行。
在研究开始时（第0天）通过X射线微型计算机断层摄影术（micro-CT）对携带肺肿瘤的LSL-K-rasG12D;p53Fl/+小鼠成像，将其分成相等起始肿瘤负荷的三组，并如下处理：1)PBS+对照IgG2A；2)顺铂+对照IgG2A；和3)顺铂+HER4-ECD。小鼠经历纵向micro-CT扫描以测量肿瘤负荷的变化。平均肿瘤负荷（图3A（图代表平均肿瘤体积+/-SEM，豚草，对照鼠IgG2a抗体））和肿瘤生长率（（图3B（图显示了通过处理方案得到的肿瘤负荷的每日倍数变化及95%置信区间））的分析揭示了仅顺铂+HER4-ECD的组合，而不是单独的顺铂导致对肿瘤生长的显著抑制。虽然经顺铂处理的小鼠显示化学疗法后的第一次micro-CT扫描时其肿瘤生长的停滞，但是在研究结束时平均肿瘤负荷和总体肿瘤生长率在媒介物和顺铂处理组间没有显著差异（图3A-B）。
在LSL-K-rasG12D;p53Fl/Fl小鼠中实施第二项研究，如上文所描述的。然而，在上文所描述的组外，本研究包括HER4-ECD单一药剂臂。在第28天通过micro-CT对肿瘤负荷的分析揭示了与经顺铂+媒介物处理的小鼠和所有其它组相比，经顺铂+HER4-ECD处理的小鼠中肿瘤负荷显著降低（图3C）。比较而言，单独的HER4-ECD处理对肿瘤生长没有影响，进一步支持了NRG1自分泌信号传导在化学抗性和/或肿瘤再生长中的独特作用。在此研究中，用媒介物+对照IgG(n=10)、顺铂+对照IgG(n=11)、顺铂+HER4-ECD(n=8)或媒介物+HER4-ECD(n=7)处理LSL-K-rasG12D;p53Fl/Fl小鼠。图3C中的图代表自基线的肿瘤负荷的平均百分比变化±SEM。利用Dunnett氏多重比较检验来针对媒介物对照比较所有处理组。**p=0.0016。使用未配对的t检验针对其单一疗法评估组合活性。*p<0.05，**p<0.01。
实施例4：NRG1在化学疗法后幸存的残留肿瘤细胞中富集
用与Z/EG Cre-受体株系（Novak et al.,2000）杂交的NSCLC的LSL-K-rasG12D遗传工程小鼠模型（GEMM）（Jackson et al.,2001）对TRIC群体进行表征。LSL-K-rasG12D小鼠的顺铂处理导致肿瘤负荷减少但未导致存活延长，表明在治疗后肿瘤恢复生长（Oliver et al.,2010）。此外，还使用了两种人异种移植物模型，其中肿瘤响应顺铂+帕利他赛双重化疗而消退，但在停止治疗数周后恢复生长。建立了Calu3和H441人NSCLC异种移植物模型的GFP表达亚系以便通过荧光激活细胞分选（FACS）分离肿瘤细胞。对于每种模型，在肿瘤再生长开始前分离在化疗后幸存的GFP阳性细胞，因为它们包含TRIC群体。
分析LSL-K-rasG12D小鼠模型中的TRIC。在最后一剂顺铂后1周收集肺，并通过FACS分离GFP阳性肿瘤细胞。为了表征媒介处理的和残留的肿瘤细胞的基因表达概况的差异，从肿瘤细胞（PI-&GFP+）分离RNA，并实施表达概况分析。在阵列上的所有基因中，NRG1显示出在残留的化疗处理的肿瘤细胞中有最统计学显著的富集，13.7倍富集（p<0.001，q=1；n=6/组）。对独立产生的样品进行的定量实时PCR(qPCR)验证了微阵列结果（图4A）。
对自Calu3和H441异种移植物模型分离的TRIC中NRG1表达进行了分析。由于可变剪接，受体结合所必需的NRG1EGF样域存在两种活性同种型，称为NRG1α和NRG1β。NRG1α和NRG1β的表达在来自这些模型的残留的化疗处理的肿瘤细胞中显著富集。Calu3肿瘤模型显示出NRG1α有4.7倍的富集（p=0.02），而NRG1β有3.4倍的富集（p=0.04）（图4B）。H441肿瘤模型显示出NRG1α有11.4倍的富集（p=0.02），而NRG1β有12.1倍的富集（p=0.04）。（图4C）。有趣的是，HER3和HER4受体表达都不是在所有模型中一致富集的。
在用通常用于治疗NSCLC的其它化疗剂处理后自Calu3和H441异种移植物模型分离的TRIC中的NRG1表达。吉西他滨处理在这些模型的每一个中都导致肿瘤消退，而且残余的肿瘤细胞高度富集NRG1。Calu3肿瘤模型显示出NRG1富集52.5倍（p=0.011）。H441肿瘤模型显示出NRG1富集11.7倍（p=0.025）（图4D）。然而，Calu3和H441肿瘤在用长春瑞滨处理后继续生长，而且处理未导致NRG1富集。
还通过Western印迹对NRG1蛋白水平及NRG1受体HER3的活化进行了评估。据测定残余肿瘤细胞中的NRG1蛋白水平和磷酸Her3水平一致地比媒介处理的肿瘤细胞中的高。通过针对磷酸HER3进行肿瘤免疫染色检查HER3的活化。残余肿瘤中的大多数肿瘤细胞是p-HER3阳性的，而媒介处理的肿瘤显示出只有p-HER3阳性细胞的分散簇。因此，残余肿瘤细胞表达NRG1且显示出增强的受体活化，表明了NRG1自分泌信号传导增加。
实施例5：NSCLC中的NRG1受体用法
为了了解NSCLC中的NRG1自分泌信号传导中采用哪些HER受体，评估了HER3和HER4敲低对肿瘤细胞增殖的影响。与其它细胞系相比，Calu3NSCLC模型表达高水平的所有HER家族受体。生成稳定的dox诱导型shHER3(Calu3-shHER3)和shHER4(Calu3-shHER4)Calu3细胞亚系，及携带针对萤光素酶的dox诱导型shRNA的对照细胞系。HER3和HER4转录物水平在存在dox(2ug/ml)的情况中在Calu3-shHER3和Calu3-shHER4中分别是降低的，如通过qPCR测量的，导致降低的蛋白质水平，如通过Western印迹测量的。令人感兴趣地，在存在dox的情况中在Calu3-shHER3中观察到的p-AKT下调程度比在Calu3-shHER4中看到的大得多，提示了HER3是介导Calu3模型中的NRG1自分泌信号传导的主要受体。
为了在体内确认此作用，使用用蔗糖或dox处理的Calu3-shHER3和Calu3-shHER4异种移植物模型实施研究。给具有建立的Calu3-shHER3或Calu3-shHer4异种移植物肿瘤的小鼠施用在其任意的饮用水中的媒介物（蔗糖）或dox(2gm/L)（n=14/组）。与接受蔗糖处理的那些小鼠（TDT=11天）相比，接受dox处理的小鼠中有对Calu3-shHER3肿瘤生长的实质性抑制（TDT=19天）。然而，在Calu3-shHER4体内研究中没有对肿瘤生长的显著抑制。
体外受体分析和体内研究指示尽管有高的HER4水平，NRG1自分泌信号传导在此模型中主要经由HER3发生。
在H522人NSCLC细胞系中评估NRG1自分泌信号传导，H522人NSCLC细胞系表达高水平的HER4，而没有可检出的HER3。生成H522-shNRG1亚系。对经血清饥饿的H522-shNRG1细胞施用dox导致降低的磷酸HER4和磷酸S6水平。在H522-shLuc对照细胞中没有观察到差异。使用siRNA介导的敲低来测试细胞增殖中对每种HER家族成员的需要。仅对HER4而非其它HER家族受体的敲低导致降低的细胞增殖。这些数据提示了NRG1自分泌信号传导在H522细胞中经由HER4发生。如此，NSCLC中的NRG1自分泌信号传导可以由HER3和HER4两者介导。
实施例6：抗NGR1抗体的产生
文库分选和筛选以鉴定抗NRG1抗体
将重组人NRG1-αEGF域（R&D Systems，产品目录号296-HR/CF）（SEQID NO：3）和NRG1-βECD域（R&D Systems，产品目录号377-HB/CF）（SEQID NO：4）用作抗原进行文库分选。图5。将Nunc96孔Maxisorp免疫板用靶抗原（10μg/ml）4℃包被过夜，并用噬菌体封闭缓冲液PBST（磷酸盐缓冲盐水（PBS）和1%（w/v）牛血清清蛋白（BSA）和0.05%（v/v）tween-20）室温封闭1小时。将抗体噬菌体文库（Lee et al.，J.Mol.Biol340，1073-1093，2004；Liang et al.，JMB.366:815-829，2007）分开加入抗原平板并于室温温育过夜。次日用PBT（含0.05%Tween-20的PBS）清洗抗原包被平板10次，并用50mM HCl和500mM NaCl洗脱结合的噬菌体30分钟并用等体积的1MTris碱（pH7.5）中和。将回收的噬菌体在大肠杆菌XL-1Blue细胞中扩增。在随后的选择轮次期间，抗体噬菌体与抗原包被平板的一起温育缩短至2-3个小时，而平板清洗的严谨度逐渐增加。
经5轮淘选后，观察到了显著的富集。从文库分选中挑选了1000个克隆以确定它们是否与人NRG1-α和NRG1-β二者特异性结合。对这些克隆的可变区进行测序以鉴定独特的序列克隆。
用斑点竞争ELISA对噬菌体抗体的亲和力进行排序。将噬菌体上清液1:5稀释于总体积100μl内含有或不含有75nM NRG1-α的ELISA（酶联免疫吸附测定法）缓冲液（含0.5%BSA，0.05%Tween20的PBS）中并在F平板（NUNC）中室温温育至少1小时。将含有或不含有靶蛋白的95μl混合物并行转移至靶蛋白包被平板（1ug/ml NRG1-α包被过夜）。将平板温和摇动15分钟以使得未结合的噬菌体被靶蛋白包被平板捕获。用PBS-0.05%Tween20清洗平板10次。通过加入ELISA缓冲液（1:5000）中的辣根过氧化物酶（HRP）缀合之抗M13抗体并室温温育30分钟对结合进行定量。用PBS-0.05%Tween20清洗平板10次。接着，在孔中加入100μl/孔1:1比例的3,3',5,5'-四甲基联苯胺（TMB）过氧化物酶底物和过氧化物酶溶液B（H2O2）（Kirkegaard-Perry Laboratories（Gaithersburg，MD））并室温温育5分钟。在各孔中加入100μl0.1M磷酸（H3PO4）并使其室温温育5分钟终止反应。用标准ELISA平板读数仪在450nm测定各个孔中黄色的OD（光密度）。用以下公式计算OD减少（%）。
OD450nm减少(%)=[(有竞争物的孔的OD450nm)/(无竞争物的孔的OD450nm)]*100
挑选对于NRG1-α靶而言OD450nm减少（%）低于30%的克隆，并通过将个体克隆的VL和VH区分别克隆入LPG3和LPG4载体来重新格式化成全长人IgG1。随后在哺乳动物CHO细胞中瞬时表达这些克隆，并用蛋白A柱进行纯化。
功能性抗体的选择
测试抗体抑制NRG1β结合HER3-Fc的能力。如前所述（Sliwkowski et alJBC1994）在Genentech生成125I-HRG。在Nunc解体条板孔（Thermo-FisherScientific，Rochester，NY）中进行结合测定法。将平板用碳酸盐缓冲液（pH9.6）中的250ng/孔HER3-ECD-Fc融合蛋白4℃包被过夜。将平板用清洗缓冲液（PBS/0.05%Tween20）漂洗两次，并用含1%牛血清清蛋白（BSA）的100μLPBS封闭30分钟。将含0.2%BSA的RPMI1640培养基（Invitrogen;Carlsbad，CA）中浓度渐增的抗NRG1抗体与HER3-ECD Fc预结合。总测定体积达130μL后立即加入125I-HRG（比活性：266mCi/mg，75,000cpm/孔）。将平板室温温育2小时，漂洗两次，并用100Series Iso Data伽马计数器对各个孔进行计数。样品一式三份进行测定。用KaleidaGraph3.6软件进行绘图。图6中所示数据显示NRGβ受到测试的亲本抗NRG1抗体的一个子集的剂量依赖性抑制，其中526.02、538.24和526.90代表了最有力的阻断剂。（这些克隆及其亲和力成熟变体在本文一些地方以数字标识符前面带“YW”加以鉴别。）
对抗体的重和轻链的氨基酸序列进行测定。图25、图26、图27和图28。实施例7：抗NRG1抗体的亲和力成熟
将选定的抗NRG1抗体进行亲和力成熟。亲本及亲和力成熟变体的氨基酸序列如图25、图26、图27和图28中所示。
为自V H 或V H V L 文库衍生的克隆的亲和力提高构建文库
将噬菌粒pW0703（衍生自噬菌粒pV0350-2b（Lee et al.，J.Mol.Biol340，1073-1093（2004）），在所有的CDR-L3位置包含终止密码子（TAA）且在M13噬菌体表面上展示单价Fab）用作文库模板来从VH文库嫁接感兴趣克隆的重链可变域（VH），用于进行亲和力成熟。将硬（hard）和软（soft）两种随机化策略都用于亲和力成熟。对于硬随机化而言，利用设计为模拟天然人抗体的氨基酸将含三个轻链CDR之选定位置的一个轻链文库进行随机化且设计的DNA简并性如Lee等（J.Mol.Biol340，1073-1093（2004））中所述。为了达到软随机化条件，即在选定位置引入大约50%的成熟率，用偏向野生型核苷酸的70-10-10-10碱基混合物合成诱变DNA（Gallop et al.，Journal ofMedicinal Chemistry37:1233-1251（1994））。对于软随机化而言，靶向CDR-L3的第91-96位、CDR-H1的第30-33、35位、CDR-H2的第50、52、53-54和56位、CDR-H3的第95-98位残基；而且选择CDR环的两种不同组合即H1/H3/L3、H2/L3和H3/L3进行随机化。
对于源自VHVL文库的克隆，各自产生在每个CDR中含4个终止密码子（TAA）且在M13噬菌体表面展示单价Fab的噬菌粒，并充当kunkel诱变的模板用于构建亲和力成熟文库。只有软随机化策略用于自VHVL文库衍生的克隆，因为CDR-L3的多样性嵌入未免疫文库中。为了达到软随机化条件，靶向CDR-L1的第28-31位、CDR-L2的第50、53-55位、CDR-L3的第91-96位、CDR-H1的第30-35位、CDR-H2的第50-56位、CDR-H3的第95-100位残基；并选择CDR环的10种不同组合即H1*/H3、H1*/H2、H2*/L3，H3*、H3*/L2、L1*/L2、L1*/L3、H3/L3*、L2/L3*和H1/L3*（其中*指示模板上终止密码子的位置）进行随机化。
用于造成亲和力提高的噬菌体分选策略
为了亲和力提高选择，首先将NRG1-β或NRG1-α在限制性试剂条件下生物素化并进行反相层析以获得单生物素化种类。以逐渐提高的严谨性对噬菌体文库进行6轮溶液分选。对于第一轮溶液分选，将1%BSA和0.05%Tween20中的3O.D./ml噬菌体输入与预包被NRG1-α或NRG1-β的平板一起温育3小时。用PBS-0.05%Tween20清洗孔10次。结合的噬菌体用150ul/孔50mM HCl，500mM KCl洗脱30分钟，随后用50ul/孔1M Tris pH8进行中和，滴定，并扩增，用于下一轮。对于随后的轮次，以溶液相完成噬菌体文库的淘选，其中将噬菌体文库与100nM生物素化靶蛋白（浓度基于亲本克隆噬菌体IC50值）在含1%Superblock（Pierce Biotechnology）和0.05%Tween20的100μl缓冲液中室温温育2小时。将混合物用1%Superblock进一步10倍稀释，并以100μl/孔加到中性亲合素包被孔（10μg/ml）中室温温和摇动30分钟。为了测定背景结合，于中性亲合素包被板上捕捉含噬菌体的对照孔。然后如第一轮所述清洗、洗脱并扩增结合的噬菌体。以逐渐提高的选择严谨性再进行5轮溶液分选。其中前两轮是通过从100nM至0.1nM降低生物素化靶蛋白浓度进行的结合速率选择，而其中最后两轮是通过在室温添加过量的非生物素化靶蛋白（多300至1000倍）将较弱的结合物竞争掉进行的解离速率选择。
高通量亲和筛选ELISA（单点竞争）
从第六轮筛选挑取菌落。将菌落在96孔板（Falcon）中150μl/孔含50μg/ml羧苄青霉素和1x1010/ml M13KO7的2YT培养基中37℃培养过夜。从同一平板挑取感染了亲本噬菌体的一个XL-1菌落作为对照。用100μl/孔PBS中的NRG1-α或NRG1-β（0.5μg/ml）4℃包被96孔Nunc Maxisorp平板过夜。将平板用150μl含1%BSA和0.05%Tween20的PBS封闭1小时。
将35ul噬菌体上清液用75ul含或不含5nM NRG1-α或NRG1-β的ELISA（酶联免疫吸附测定法）缓冲液（含0.5%BSA，0.05%Tween20的PBS）稀释并在F平板（NUNC）中室温温育1小时。将95μl混合物并行转移至抗原包被平板。将平板温和摇动15分钟，并用PBS-0.05%Tween20清洗10次。通过加入ELISA缓冲液（1:2500）中的辣根过氧化物酶（HRP）缀合之抗M13抗体并室温温育30分钟对结合进行定量。用PBS-0.05%Tween20清洗平板10次。接着，将100μl/孔过氧化物酶底物加入孔中并室温温育5分钟。通过在各个孔中加入100μl0.1M磷酸（H3PO4）并使其室温温育5分钟终止反应。用标准ELISA平板读数仪在450nm测定各个孔中黄色的OD（光密度）。与亲本噬菌体孔的OD450nm降低（%）（100%）相比，挑选OD450nm降低（%）少于50%的克隆进行序列分析。选择独特的克隆进行噬菌体制备来与亲本克隆比较测定针对NRG1-α和NRG1-β二者的结合亲和力（噬菌体IC50）。然后将亲和力提高最多的克隆重新格式化成人IgG1，以进行抗体生成和进一步的BIAcore结合动力学分析及其它体外或体内测定法。
实施例8：亲和力成熟的538.24抗NRG1抗体的表征
对亲和力成熟变体测试其阻断HRGβ结合HER3-Fc的能力。如前所述（Sliwkowski et al JBC1994）在Genentech生成125I-HRG。用Nunc解体条板孔（Thermo-Fisher Scientific，Rochester，NY）进行结合测定法。将平板用碳酸盐缓冲液（pH9.6）中的250ng/孔HER3-ECD-Fc融合蛋白4℃包被过夜。将平板用清洗缓冲液（PBS/0.05%Tween20）漂洗两次，并用100μL含1%牛血清清蛋白（BSA）的PBS封闭30分钟。将含0.2%BSA的RPMI1640培养基（Invitrogen;Carlsbad，CA）中浓度渐增的抗NRG1抗体与HER3-ECD Fc预结合。总测定体积达130μL后立即加入125I-HRG（比活性：266mCi/mg，75,000cpm/孔）。将平板室温温育2小时，漂洗两次，并用100Series Iso Data伽马计数器对各个孔进行计数。样品一式三份进行测定。用KaleidaGraph3.6软件进行绘图。
图7中所示数据显示538.24抗体的数个亲和力成熟克隆剂量依赖性抑制125I-NRG1β结合Her3。除538.24.38外所有其它克隆均高效阻断结合，IC50值在亚纳摩尔范围内。
如实施例1中所述利用BIAcoreTM-T100仪器通过表面等离振子共振（SRP）测量538.24亲和力成熟变体抗NRG1IgG对NRG1α和NRG1β的结合亲和力。使用125nM NRG1β得到的数据见图8，而使用250nM NRG1α获得的数据见图9。
利用6.25nM NRG1β或6.25nM NRG1β对抗体538.24.71，以及利用7.8nM NRG1β或7.8nM NRG1β对抗体538.24.94进行进一步的亲和力分析。结果如图10（538.24.71）和图11（538.24.94）中所示。
实施例9：526.09和526.02抗NRG1抗体及其亲和力成熟变体的表征
进行竞争测定法以测定526.09和526.02抗体的结合特异性。如图12中所示，526.90与538.24.17竞争HRG1α和HRG1β二者，表明526.90与这两种HRG1同种型均结合。
如实施例7中所述产生526.09抗体的数种亲和力成熟变体并如实施例1中所详述的在KIRA测定法中分析它们阻断NRG1α和NRG1β结合抗HER3抗体的能力。简言之，将血清饥饿的MCF-7细胞用固定量的神经调节蛋白1-α或神经调节蛋白-β以及渐增量的测试材料（YW538.24.71和YW526.90.28）在CO2温箱中处理15分钟。将培养基轻轻倒出后，裂解细胞并用前述ELISA进行分析（Sadick et al.1999）。用抗HER3作为捕捉单抗（R+D Systems Duo SetIC Phospho-ErbB3kit part#841428，Minneapolis，MN）且用缀合了辣根过氧化物酶（HRP）的抗磷酸酪氨酸单抗作为检测剂（R+D Systems Duo Set ICPhospho-ErbB3kit part#841403，Minneapolis，MN）测量Her3磷酸化。添加比色底物后，在微量板读数仪（Thermo Lab Systems;Waltham，MA）上以620nm作为参照在450nm对平板进行读数。将吸光度作图并对抑制作用进行分析。这些测定法的组合结果如图13中所示。
还用BV测试测试亲和力成熟变体，结果见图14。
如实施例1中所述利用BIAcoreTM-T100仪器通过表面等离振子共振（SRP）测量526.90.28抗NRG1抗体对NRG1α和NRG1β的结合亲和力。使用6.25nM NRG1β和6.25nM NRG1α得到的数据见图15。
实施例10：抗NRG1抗体抑制Her3磷酸化
如实施例1和9中所述利用KIRA测定法测试抗NRG1抗体抑制响应外源NRG1配体刺激之Her3磷酸化的能力。YW538.24.71和YW526.90.28都以相似的IC50（分别是14+2.8nM和13.9+4.8nM）抑制响应NRG1α刺激的Her3活化（图16）。然而，YW538.24.71是比YW526.90.28更有力的阻断NRG1β诱导之Her3活化的阻断剂（IC50分别是0.12+0.017和1.44+0.5nM）（图17）。
实施例11：抗NRG1抗体对神经调节蛋白是特异性的
为了证实抗体特异性，对抗体与相关EGF家族配体EGF、HB-EGF和Betacellulin（BTC）的结合进行了评估。通过ELISA测定时检测不到这些配体与YW538.24.71和YW526.90.28的结合。
NRG1、HB-EGF和BTC还是HER4受体的配体。因此，在基于细胞的测定法中分析了YW538.24.71和YW526.90.28抑制BTC和HB_EGF诱导之HER4磷酸化的能力。尽管YW538.24.71可能抑制NRG1-B诱导之磷酸化作用，但在通过Western印迹分析测量时，它对BTC或HB-EGF诱导之磷酸化无影响。
实施例12：抗NRG1抗体抑制NRG1自分泌信号传导
对抗NRG1抗体抑制NRG1自分泌信号传导的能力进行了测定。
将细胞在含0.1%FBS+所示抗体的培养基中培养48小时。用1x PBS清洗细胞3次，并用含蛋白酶和磷酸酶抑制剂的RIPA缓冲液裂解。收集裂解物并为Western印迹进行加工。
正如通过磷酸Her3和磷酸AKT水平的剂量依赖性降低所显示的，数据表明抗NRG1抗体YW538.24.71在人和小鼠细胞二者中都抑制NRG1自分泌信号传导。图18。
实施例13：抗NRG1抗体抑制HNSCC肿瘤生长
对抗NRG1抗体在头和颈鳞癌（HNSCC）的小鼠模型***中抑制肿瘤生长的能力进行了测定。在C.B-17SCID小鼠右侧皮下接种500万个肿瘤HNSCCFADU细胞。当肿瘤达到均值150-250mm3时，将动物依相当的均值起始肿瘤体积分成处理组。用所示抗体和剂量处理各组，IP施用，qwk x4。在研究期间至少每周一次测量肿瘤。图19中所示结果表明两种代表性抗NRG1抗体均抑制HNSCC肿瘤生长。
实施例14：抗NRG1抗体抑制肺癌肿瘤生长
对抗NRG1抗体在肺癌的小鼠模型***中抑制肿瘤生长的能力进行了测定。在无胸腺裸鼠右侧皮下接种1500万个人肺腺癌细胞系Calu3细胞。当肿瘤达到均值150-250mm3时，将动物依照相当的均值起始肿瘤体积分成处理组。动物处理如下：
组1：媒介（抗体缓冲液/卡铂缓冲液），i.p.qwk X2+帕利他赛缓冲液，IV q2dX5；
组2：538.24.71，25mg/kg，IP，qwk研究期间+卡铂缓冲液，IP qwk X2+帕利他赛缓冲液，IV q2d X5；
组3：526.90.28，25mg/kg，IP qwk研究期间+卡铂缓冲液，IP qwk X2+帕利他赛缓冲液，IV q2d X5；
组4：卡铂，60mg/kg，IP qwk X2+帕利他赛，20mg/kg，IV q2d X5；
组5：538.24.71，25mg/kg，IP qwk研究期间+卡铂，60mg/kg，IP qwk X+帕利他赛，20mg/kg，IV q2d X5；
组6：526.90.28，25mg/kg，IP，qwk研究期间+卡铂，60mg/kg，IP qwk X+帕利他赛，20mg/kg，IV q2d X5。
肿瘤生长曲线以线性混合效应(Linear Mixed Effect,LME)模型对肿瘤体积产生的拟合呈现，作为具有自动确定的纽结的三次样条绘图。还呈现了显示无进展存活（进展定义为肿瘤两次达到其起始体积）的Kaplan-Meier曲线。通过Gehan-Breslow-Wilocoxon检验计算P值。图20。
数据显示单一药剂抗NRG1处理显著抑制肿瘤生长。此外，抗NRG1处理延长了响应护理标准化疗的持续时间，推迟了肿瘤再生长。
实施例15：抗NRG1抗体抑制NSCLC肿瘤生长
对抗NRG1抗体在非小细胞肺癌（NSCLC）的小鼠模型***中抑制肿瘤生长的能力进行了测定。在无胸腺裸鼠右侧皮下接种a)2000万个H596细胞或b)200万个LKPH2细胞。当肿瘤达到均值150-250mm3时，将动物依照相当的均值起始肿瘤体积分成处理组。动物处理如下：
组1：媒介：抗豚草，20mg/kg，IP qwk研究期间+卡铂缓冲液，IP q4d X5+帕利他赛缓冲液，IV q4d x5；
组2：Y538.24.71：Y538.24.71，20mg/kg，IP qwk研究期间+卡铂缓冲液，IP q4d X5+帕利他赛缓冲液，IV q4d X5；
组3：化疗+豚草：抗豚草，20mg/kg，IP qwk研究期间+卡铂，60mg/kg IPq4d X5+帕利他赛20mg/kg，IV q4d x5；
组4：化疗+538.24.71：538.24.71，20mg/kg，IP qwk研究期间+卡铂，60mg/kg IP q4d X5+帕利他赛20mg/kg，IV q4d x5。
如实施例15中所述生成肿瘤生长曲线和Kaplan-Meier曲线。图21和22。
数据显示抗NRG1处理在NSCLC模型中增强了对化学疗法的响应的程度，而NSCLC模型在响应单独的化学疗法时并无消退。这种与化学疗法的协同作用甚至在如H596研究中所见的单一药剂抗NRG1处理对肿瘤生长无作用的情况下也可存在。
此外，YW538.24.71还增强了LKPH2肿瘤对通常用于治疗NSCLC的另一种化疗剂吉西他滨处理的响应（图23）。在此研究中，对小鼠每4天施用100mg/kg吉西他滨，共4剂。如实施例15所述生成肿瘤生长曲线和Kaplan-Meier曲线。
实施例16：抗NRG1抗体抑制乳癌肿瘤生长
对抗NRG1抗体在乳腺癌的小鼠模型***中抑制肿瘤生长的能力进行了测定。将MDA-MB-175T肿瘤碎片植入米色裸鼠的乳腺脂肪垫。在肿瘤植入前1-3天植入0.36mg***团粒。当肿瘤达到均值150-250mm3时，将动物分组并处理如下：
组1：媒介（PBS），IP，1x/周x4，n=8-10；
组2：抗HER3抗体，50mg/kg，IP，1x/周x4，n=8-10；
组3：538.24.71，25mg/kg，IP，qwk x4，n=8-10。
总注射体积（每个处理日）不会超过300μl/小鼠。
在右侧皮下注射1:1HBSS:Matrigel溶液中的NCI-H522细胞。当肿瘤达到均值150-250mm3时，将动物分组并处理如下：
组1：媒介（PBS），IP，1x/周x4周，n=8-10；
组2：帕妥珠单抗，25mg/kg，IP，1x/周x4周，n=8-10；
组3：HER4：1462，25mg/kg，IP，1x/周x4周，n=8-10；
组4：526.90.28，25mg/kg，IP，1x/周x4周，n=8-10；
组5：538.24.71，25mg/kg，IP，1x/周x4周，n=8-10。
研究期间至少每周一次测量肿瘤且至少每周两次监测动物。根据需要对肿瘤部位除毛以方便肿瘤测量。
肿瘤生长曲线以线性混合效应(LME)模型对肿瘤体积产生的拟合呈现，作为具有自动确定的纽结的三次样条绘图。如实施例15所述生成肿瘤生长曲线和Kaplan-Meier曲线。%TGI是只对于所有治疗组仍有一些动物存在的那些天而言基于拟合曲线与对照相比的百分比AUC/天（在初始mm3体积尺度上）减少。图24。
这些数据显示了用抗NRG1抗体进行的单一药剂处理显著抑制了NRG1自分泌信号传导所驱动的肿瘤生长。MDA-MB-175模型中的肿瘤生长抑制证明了抗NRG1抗体抑制HER3受体介导之NRG1信号传导驱动的肿瘤生长的能力（图24A），而不表达Her3的H522模型中的生长抑制证明了抗NRG1抗体抑制NRG1-HER4信号传导驱动的肿瘤生长的能力（图24B）。
表A–序列表检索表
Figure BDA0000491186630000791
Figure BDA0000491186630000801
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Claims (44)

1.一种分离的抗NRG1抗体，其结合神经调节蛋白1α和神经调节蛋白1β。
2.权利要求1的抗体，其中所述抗体结合神经调节蛋白1β的EGF域和神经调节蛋白1α的EGF域。
3.权利要求2的抗体，其中所述抗体结合神经调节蛋白1β的EGF域的亲和力比它结合神经调节蛋白1α的EGF域的亲和力大20倍，50倍，100倍，200倍，500倍，或1000倍。
4.权利要求1-3任一项的抗体，其中所述抗体以10nM或更少的kD结合神经调节蛋白1β的EGF域且以10nM或更少的kD结合神经调节蛋白1α的EGF域。
5.权利要求1-4任一项的抗体，其中所述抗体以10nM或更少，1nM或更少，1x10-1nM，1x10-2nM，或1x10-3nM的kD结合神经调节蛋白1β的EGF域。
6.权利要求3-5任一项的抗体，其中所述亲和力是通过表面等离振子共振测定法测量的。
7.权利要求1-6任一项的抗体，其中所述抗体结合神经调节蛋白1β表位，其中该神经调节蛋白1β表位包含SEQ ID NO：4氨基酸1-37的氨基酸序列或SEQ ID NO：4氨基酸38-64的氨基酸序列。
8.权利要求7的抗体，其中所述神经调节蛋白1β表位包含氨基酸序列SEQID NO：4。
9.权利要求7或8的的抗体，其中所述抗体进一步结合神经调节蛋白1α表位，其中该神经调节蛋白1α表位包含SEQ ID NO：3氨基酸1-36的氨基酸序列或SEQ ID NO：3氨基酸37-58的氨基酸序列。
10.权利要求9的抗体，其中所述神经调节蛋白1α表位包含氨基酸序列SEQID NO：3。
11.权利要求1-10任一项的抗体，其为单克隆抗体。
12.权利要求1-11任一项的抗体，其为人抗体，人源化抗体，或嵌合抗体。
13.一种分离的抗NRG1抗体，其包含：(a)包含氨基酸序列SEQ ID NO：5的HVR-H1，(b)包含氨基酸序列SEQ ID NO：6的HVR-H2，和(c)包含氨基酸序列SEQ ID NO：7的HVR-H3。
14.一种分离的抗NRG1抗体，其包含：(a)包含氨基酸序列SEQ ID NO：16的HVR-L1，(b)包含氨基酸序列SEQ ID NO：17的HVR-L2，和(c)包含氨基酸序列SEQ ID NO：18的HVR-L3。
15.权利要求13的抗体，其进一步包含：(a)包含氨基酸序列SEQ ID NO：16的HVR-L1，(b)包含氨基酸序列SEQ ID NO：17的HVR-L2，和(c)包含氨基酸序列SEQ ID NO：18的HVR-L3。
16.一种分离的抗NRG1抗体，其包含：(a)包含氨基酸序列SEQ ID NO：76的HVR-H1，(b)包含氨基酸序列SEQ ID NO：29的HVR-H2，和(c)包含氨基酸序列SEQ ID NO：43的HVR-H3。
17.一种分离的抗NRG1抗体，其包含：(a)包含氨基酸序列SEQ ID NO：31的HVR-L1，(b)包含氨基酸序列SEQ ID NO：32的HVR-L2，和(c)包含氨基酸序列SEQ ID NO：33的HVR-L3。
18.权利要求16的抗体，其进一步包含：(a)包含氨基酸序列SEQ ID NO：31的HVR-L1，(b)包含氨基酸序列SEQ ID NO：32的HVR-L2，和(c)包含氨基酸序列SEQ ID NO：33的HVR-L3。
19.权利要求1-12任一项的抗体，其包含：(a)与氨基酸序列SEQ ID NO：21具有至少95%序列同一性的VH序列；(b)与氨基酸序列SEQ ID NO：26具有至少95%序列同一性的VL序列；或(c)(a)中的VH序列和(b)中的VL序列。
20.一种分离的抗NRG1抗体，其包含VH序列SEQ ID NO：21和VL序列SEQID NO：26。
21.一种分离的抗NRG1抗体，其包含VH序列SEQ ID NO：53和VL序列SEQID NO：63。
22.分离的核酸，其编码权利要求1-21任一项的抗体。
23.一种宿主细胞，其包含权利要求22的核酸。
24.一种生成抗体的方法，其包括培养权利要求23的宿主细胞，使得该抗体生成。
25.一种免疫偶联物，其包含权利要求1-21任一项的抗体和细胞毒剂。
26.一种药物配制剂，其包含权利要求1-21任一项的抗体和药学可接受载体。
27.权利要求26的药物配制剂，其进一步包含别的治疗剂。
28.权利要求27的药物配制剂，其中所述别的治疗剂为吉西他滨(gemcitabine)，帕利他赛(paclitaxal)，或顺铂(cisplatin)，或帕利他赛和顺铂的组合。
29.权利要求1-21任一项的抗体，其用作药物。
30.权利要求1-21任一项的抗体，其用于治疗癌症。
31.权利要求1-21任一项的抗体在制备药物中的用途。
32.权利要求31的用途，其中所述药物用于治疗癌症。
33.权利要求30的抗体或权利要求32的用途，其中所述癌症选自下组：非小细胞肺癌，乳腺癌，卵巢癌，头和颈癌，***，膀胱癌，食道癌，***癌，和结肠直肠癌。
34.一种治疗具有癌症的个体的方法，其包括对该个体施用有效量的权利要求1-21任一项的抗体。
35.权利要求34的方法，其中所述癌症选自下组：非小细胞肺癌，乳腺癌，卵巢癌，头和颈癌，***，膀胱癌，食道癌，***癌，和结肠直肠癌。
36.权利要求34或35的方法，其进一步包含对该个体施用别的治疗剂。
37.权利要求36的方法，其中所述别的治疗剂选自下组：吉西他滨，帕利他赛，卡铂(carboplatin)，和顺铂或帕利他赛，卡铂，和顺铂中两种或所有三种的组合。
38.一种在癌症患者中延长肿瘤再发生前时间的方法，其包括对该患者施用有效量的权利要求1-21任一项的抗体。
39.权利要求38的方法，其进一步是包括对该患者施用治疗剂。
40.权利要求39的方法，其中所述治疗剂为化学治疗剂或第二抗体。
41.权利要求40的方法，其中所述化学治疗剂选自下组：吉西他滨，帕利他赛，卡铂，和顺铂或帕利他赛，卡铂，和顺铂中两种或所有三种的组合。
42.权利要求40的方法，其中所述第二抗体结合选自下组的靶物：EGFR，HER2，HER3，或HER4，或结合两种或更多种选自下组的靶物：EGFR，HER2，HER3，或HER4。
43.权利要求42的方法，其中所述癌症选自下组：非小细胞肺癌，乳腺癌，卵巢癌，头和颈癌，***，膀胱癌，食道癌，***癌，和结肠直肠癌。
44.权利要求38的方法，其中肿瘤再发生前时间的延长为比所述抗体缺失下的再发生前时间长至少1.25倍或至少1.50倍。
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