BR112021008985A2 - Agentes miméticos de interleucina divididos e seus usos - Google Patents
Agentes miméticos de interleucina divididos e seus usos Download PDFInfo
- Publication number
- BR112021008985A2 BR112021008985A2 BR112021008985-3A BR112021008985A BR112021008985A2 BR 112021008985 A2 BR112021008985 A2 BR 112021008985A2 BR 112021008985 A BR112021008985 A BR 112021008985A BR 112021008985 A2 BR112021008985 A2 BR 112021008985A2
- Authority
- BR
- Brazil
- Prior art keywords
- seq
- polypeptide
- peptide
- amino acid
- residue
- Prior art date
Links
- 102000015696 Interleukins Human genes 0.000 title abstract description 5
- 108010063738 Interleukins Proteins 0.000 title abstract description 5
- 239000000018 receptor agonist Substances 0.000 claims abstract description 122
- 229940044601 receptor agonist Drugs 0.000 claims abstract description 122
- 102000010789 Interleukin-2 Receptors Human genes 0.000 claims abstract description 97
- 108010038453 Interleukin-2 Receptors Proteins 0.000 claims abstract description 90
- 239000000833 heterodimer Substances 0.000 claims abstract description 37
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract description 35
- 108010038486 Interleukin-4 Receptors Proteins 0.000 claims abstract description 18
- 102000010787 Interleukin-4 Receptors Human genes 0.000 claims abstract description 18
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims description 1047
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims description 588
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims description 570
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims description 351
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims description 130
- 230000008685 targeting Effects 0.000 claims description 121
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 claims description 83
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 80
- 230000027455 binding Effects 0.000 claims description 72
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims description 67
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 claims description 59
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 claims description 57
- -1 CAMPATH-1 Chemical compound 0.000 claims description 54
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 claims description 54
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 claims description 50
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 claims description 50
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 claims description 50
- 210000002865 immune cell Anatomy 0.000 claims description 41
- 239000002771 cell marker Substances 0.000 claims description 38
- 210000004881 tumor cell Anatomy 0.000 claims description 38
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 claims description 36
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims description 35
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 claims description 31
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims description 27
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims description 27
- 108040006852 interleukin-4 receptor activity proteins Proteins 0.000 claims description 26
- 102000052116 epidermal growth factor receptor activity proteins Human genes 0.000 claims description 25
- 108700015053 epidermal growth factor receptor activity proteins Proteins 0.000 claims description 25
- 230000028993 immune response Effects 0.000 claims description 25
- YOHYSYJDKVYCJI-UHFFFAOYSA-N n-[3-[[6-[3-(trifluoromethyl)anilino]pyrimidin-4-yl]amino]phenyl]cyclopropanecarboxamide Chemical compound FC(F)(F)C1=CC=CC(NC=2N=CN=C(NC=3C=C(NC(=O)C4CC4)C=CC=3)C=2)=C1 YOHYSYJDKVYCJI-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 25
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 claims description 24
- 239000000427 antigen Substances 0.000 claims description 22
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 claims description 22
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 claims description 22
- 101150029707 ERBB2 gene Proteins 0.000 claims description 21
- 101000628535 Homo sapiens Metalloreductase STEAP2 Proteins 0.000 claims description 21
- 102100026711 Metalloreductase STEAP2 Human genes 0.000 claims description 21
- 210000003719 b-lymphocyte Anatomy 0.000 claims description 21
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims description 21
- 210000003289 regulatory T cell Anatomy 0.000 claims description 21
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 claims description 20
- 101000623901 Homo sapiens Mucin-16 Proteins 0.000 claims description 18
- 102000003735 Mesothelin Human genes 0.000 claims description 18
- 108090000015 Mesothelin Proteins 0.000 claims description 18
- 102100023123 Mucin-16 Human genes 0.000 claims description 18
- 102100034922 T-cell surface glycoprotein CD8 alpha chain Human genes 0.000 claims description 18
- 210000001266 CD8-positive T-lymphocyte Anatomy 0.000 claims description 16
- 125000000151 cysteine group Chemical group N[C@@H](CS)C(=O)* 0.000 claims description 16
- 230000006870 function Effects 0.000 claims description 16
- 230000004927 fusion Effects 0.000 claims description 16
- 102100038078 CD276 antigen Human genes 0.000 claims description 15
- 101710185679 CD276 antigen Proteins 0.000 claims description 15
- 102100032768 Complement receptor type 2 Human genes 0.000 claims description 15
- 101001057504 Homo sapiens Interferon-stimulated gene 20 kDa protein Proteins 0.000 claims description 15
- 101001055144 Homo sapiens Interleukin-2 receptor subunit alpha Proteins 0.000 claims description 15
- 102100026878 Interleukin-2 receptor subunit alpha Human genes 0.000 claims description 15
- 102100032780 Semaphorin-5B Human genes 0.000 claims description 15
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 claims description 15
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 claims description 15
- XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N cysteine Natural products SCC(N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 15
- 210000004443 dendritic cell Anatomy 0.000 claims description 15
- 210000002540 macrophage Anatomy 0.000 claims description 15
- 101000716102 Homo sapiens T-cell surface glycoprotein CD4 Proteins 0.000 claims description 14
- 102000018697 Membrane Proteins Human genes 0.000 claims description 14
- 108010052285 Membrane Proteins Proteins 0.000 claims description 14
- 102100036011 T-cell surface glycoprotein CD4 Human genes 0.000 claims description 14
- 239000002458 cell surface marker Substances 0.000 claims description 14
- 210000002950 fibroblast Anatomy 0.000 claims description 13
- 108010021064 CTLA-4 Antigen Proteins 0.000 claims description 12
- 229940045513 CTLA4 antagonist Drugs 0.000 claims description 12
- 108010023729 Complement 3d Receptors Proteins 0.000 claims description 12
- 102100039498 Cytotoxic T-lymphocyte protein 4 Human genes 0.000 claims description 12
- 101000934338 Homo sapiens Myeloid cell surface antigen CD33 Proteins 0.000 claims description 12
- 101000654679 Homo sapiens Semaphorin-5B Proteins 0.000 claims description 12
- 101000835745 Homo sapiens Teratocarcinoma-derived growth factor 1 Proteins 0.000 claims description 12
- 102100025243 Myeloid cell surface antigen CD33 Human genes 0.000 claims description 12
- 102100026404 Teratocarcinoma-derived growth factor 1 Human genes 0.000 claims description 12
- 239000000556 agonist Substances 0.000 claims description 12
- 239000003446 ligand Substances 0.000 claims description 12
- 238000012737 microarray-based gene expression Methods 0.000 claims description 12
- 238000012243 multiplex automated genomic engineering Methods 0.000 claims description 12
- 210000002307 prostate Anatomy 0.000 claims description 12
- 230000004044 response Effects 0.000 claims description 12
- 238000011161 development Methods 0.000 claims description 11
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 claims description 11
- 230000001965 increasing effect Effects 0.000 claims description 11
- 230000002792 vascular Effects 0.000 claims description 11
- 102100024222 B-lymphocyte antigen CD19 Human genes 0.000 claims description 10
- 101000980825 Homo sapiens B-lymphocyte antigen CD19 Proteins 0.000 claims description 10
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 claims description 10
- 239000003814 drug Substances 0.000 claims description 10
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 claims description 10
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 claims description 10
- 102100027203 B-cell antigen receptor complex-associated protein beta chain Human genes 0.000 claims description 9
- 102100025218 B-cell differentiation antigen CD72 Human genes 0.000 claims description 9
- 102100022005 B-lymphocyte antigen CD20 Human genes 0.000 claims description 9
- 102100024220 CD180 antigen Human genes 0.000 claims description 9
- 101150013553 CD40 gene Proteins 0.000 claims description 9
- 108010001445 CD79 Antigens Proteins 0.000 claims description 9
- 102000000796 CD79 Antigens Human genes 0.000 claims description 9
- 102100024423 Carbonic anhydrase 9 Human genes 0.000 claims description 9
- 102000011412 Complement 3d Receptors Human genes 0.000 claims description 9
- 102100031511 Fc receptor-like protein 2 Human genes 0.000 claims description 9
- 102100041003 Glutamate carboxypeptidase 2 Human genes 0.000 claims description 9
- 101000897405 Homo sapiens B-lymphocyte antigen CD20 Proteins 0.000 claims description 9
- 101000980829 Homo sapiens CD180 antigen Proteins 0.000 claims description 9
- 101000941929 Homo sapiens Complement receptor type 2 Proteins 0.000 claims description 9
- 101000892862 Homo sapiens Glutamate carboxypeptidase 2 Proteins 0.000 claims description 9
- 101000998120 Homo sapiens Interleukin-3 receptor subunit alpha Proteins 0.000 claims description 9
- 101000777628 Homo sapiens Leukocyte antigen CD37 Proteins 0.000 claims description 9
- 101001103036 Homo sapiens Nuclear receptor ROR-alpha Proteins 0.000 claims description 9
- 101001136592 Homo sapiens Prostate stem cell antigen Proteins 0.000 claims description 9
- 101000844504 Homo sapiens Transient receptor potential cation channel subfamily M member 4 Proteins 0.000 claims description 9
- 101000851376 Homo sapiens Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8 Proteins 0.000 claims description 9
- 102100033493 Interleukin-3 receptor subunit alpha Human genes 0.000 claims description 9
- 102100031586 Leukocyte antigen CD37 Human genes 0.000 claims description 9
- 102100036735 Prostate stem cell antigen Human genes 0.000 claims description 9
- 101150117918 Tacstd2 gene Proteins 0.000 claims description 9
- 102100040245 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 5 Human genes 0.000 claims description 9
- 102100036857 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8 Human genes 0.000 claims description 9
- 102100027212 Tumor-associated calcium signal transducer 2 Human genes 0.000 claims description 9
- 238000003556 assay Methods 0.000 claims description 9
- 230000005945 translocation Effects 0.000 claims description 9
- 108010074708 B7-H1 Antigen Proteins 0.000 claims description 8
- 108700022150 Designed Ankyrin Repeat Proteins Proteins 0.000 claims description 8
- 102100024216 Programmed cell death 1 ligand 1 Human genes 0.000 claims description 8
- 101710089372 Programmed cell death protein 1 Proteins 0.000 claims description 8
- 102100040678 Programmed cell death protein 1 Human genes 0.000 claims description 8
- 210000000822 natural killer cell Anatomy 0.000 claims description 8
- 108091008875 B cell receptors Proteins 0.000 claims description 7
- 206010009944 Colon cancer Diseases 0.000 claims description 7
- 230000004913 activation Effects 0.000 claims description 7
- 102100038080 B-cell receptor CD22 Human genes 0.000 claims description 6
- 102100031658 C-X-C chemokine receptor type 5 Human genes 0.000 claims description 6
- 108700012439 CA9 Proteins 0.000 claims description 6
- 102000017420 CD3 protein, epsilon/gamma/delta subunit Human genes 0.000 claims description 6
- 108050005493 CD3 protein, epsilon/gamma/delta subunit Proteins 0.000 claims description 6
- 108010022366 Carcinoembryonic Antigen Proteins 0.000 claims description 6
- 102100025475 Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5 Human genes 0.000 claims description 6
- 102100025064 Cellular tumor antigen p53 Human genes 0.000 claims description 6
- 108010066687 Epithelial Cell Adhesion Molecule Proteins 0.000 claims description 6
- 102000018651 Epithelial Cell Adhesion Molecule Human genes 0.000 claims description 6
- 102100031517 Fc receptor-like protein 1 Human genes 0.000 claims description 6
- 101000914491 Homo sapiens B-cell antigen receptor complex-associated protein beta chain Proteins 0.000 claims description 6
- 101000934359 Homo sapiens B-cell differentiation antigen CD72 Proteins 0.000 claims description 6
- 101000884305 Homo sapiens B-cell receptor CD22 Proteins 0.000 claims description 6
- 101000721661 Homo sapiens Cellular tumor antigen p53 Proteins 0.000 claims description 6
- 101000846911 Homo sapiens Fc receptor-like protein 2 Proteins 0.000 claims description 6
- 101001103039 Homo sapiens Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1 Proteins 0.000 claims description 6
- 101001106413 Homo sapiens Macrophage-stimulating protein receptor Proteins 0.000 claims description 6
- 101000934372 Homo sapiens Macrosialin Proteins 0.000 claims description 6
- 101000946843 Homo sapiens T-cell surface glycoprotein CD8 alpha chain Proteins 0.000 claims description 6
- 101000830603 Homo sapiens Tumor necrosis factor ligand superfamily member 11 Proteins 0.000 claims description 6
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 claims description 6
- 102100039615 Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1 Human genes 0.000 claims description 6
- 102000004310 Ion Channels Human genes 0.000 claims description 6
- 108090000862 Ion Channels Proteins 0.000 claims description 6
- 102000052922 Large Neutral Amino Acid-Transporter 1 Human genes 0.000 claims description 6
- 108010006444 Leucine-Rich Repeat Proteins Proteins 0.000 claims description 6
- 102100021435 Macrophage-stimulating protein receptor Human genes 0.000 claims description 6
- 102100025136 Macrosialin Human genes 0.000 claims description 6
- 102100037603 P2X purinoceptor 5 Human genes 0.000 claims description 6
- 101710100969 Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3 Proteins 0.000 claims description 6
- 102100029986 Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3 Human genes 0.000 claims description 6
- 108091006232 SLC7A5 Proteins 0.000 claims description 6
- 102100038437 Sodium-dependent phosphate transport protein 2B Human genes 0.000 claims description 6
- 102100031228 Transient receptor potential cation channel subfamily M member 4 Human genes 0.000 claims description 6
- 102100024568 Tumor necrosis factor ligand superfamily member 11 Human genes 0.000 claims description 6
- 102100038929 V-set domain-containing T-cell activation inhibitor 1 Human genes 0.000 claims description 6
- 239000012620 biological material Substances 0.000 claims description 6
- 230000024245 cell differentiation Effects 0.000 claims description 6
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 claims description 6
- 108010087914 epidermal growth factor receptor VIII Proteins 0.000 claims description 6
- OVBPIULPVIDEAO-LBPRGKRZSA-N folic acid Chemical compound C=1N=C2NC(N)=NC(=O)C2=NC=1CNC1=CC=C(C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)C=C1 OVBPIULPVIDEAO-LBPRGKRZSA-N 0.000 claims description 6
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 claims description 6
- 238000009169 immunotherapy Methods 0.000 claims description 6
- 210000004901 leucine-rich repeat Anatomy 0.000 claims description 6
- 208000031261 Acute myeloid leukaemia Diseases 0.000 claims description 5
- 101000883798 Homo sapiens Probable ATP-dependent RNA helicase DDX53 Proteins 0.000 claims description 5
- 101000798702 Homo sapiens Transmembrane protease serine 4 Proteins 0.000 claims description 5
- 206010035226 Plasma cell myeloma Diseases 0.000 claims description 5
- 102100038236 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX53 Human genes 0.000 claims description 5
- 241000700605 Viruses Species 0.000 claims description 5
- 239000002253 acid Substances 0.000 claims description 5
- 208000029742 colonic neoplasm Diseases 0.000 claims description 5
- 201000001441 melanoma Diseases 0.000 claims description 5
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 claims description 4
- 230000003213 activating effect Effects 0.000 claims description 4
- 239000003937 drug carrier Substances 0.000 claims description 4
- 150000003384 small molecules Chemical class 0.000 claims description 4
- 230000029663 wound healing Effects 0.000 claims description 4
- BGFTWECWAICPDG-UHFFFAOYSA-N 2-[bis(4-chlorophenyl)methyl]-4-n-[3-[bis(4-chlorophenyl)methyl]-4-(dimethylamino)phenyl]-1-n,1-n-dimethylbenzene-1,4-diamine Chemical compound C1=C(C(C=2C=CC(Cl)=CC=2)C=2C=CC(Cl)=CC=2)C(N(C)C)=CC=C1NC(C=1)=CC=C(N(C)C)C=1C(C=1C=CC(Cl)=CC=1)C1=CC=C(Cl)C=C1 BGFTWECWAICPDG-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- LKKMLIBUAXYLOY-UHFFFAOYSA-N 3-Amino-1-methyl-5H-pyrido[4,3-b]indole Chemical compound N1C2=CC=CC=C2C2=C1C=C(N)N=C2C LKKMLIBUAXYLOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- WEVYNIUIFUYDGI-UHFFFAOYSA-N 3-[6-[4-(trifluoromethoxy)anilino]-4-pyrimidinyl]benzamide Chemical compound NC(=O)C1=CC=CC(C=2N=CN=C(NC=3C=CC(OC(F)(F)F)=CC=3)C=2)=C1 WEVYNIUIFUYDGI-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- 102100040079 A-kinase anchor protein 4 Human genes 0.000 claims description 3
- 101710109924 A-kinase anchor protein 4 Proteins 0.000 claims description 3
- 208000030507 AIDS Diseases 0.000 claims description 3
- 102100033793 ALK tyrosine kinase receptor Human genes 0.000 claims description 3
- 102100023635 Alpha-fetoprotein Human genes 0.000 claims description 3
- 102100032187 Androgen receptor Human genes 0.000 claims description 3
- 108091023037 Aptamer Proteins 0.000 claims description 3
- 101100208111 Arabidopsis thaliana TRX5 gene Proteins 0.000 claims description 3
- 102100024003 Arf-GAP with SH3 domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1 Human genes 0.000 claims description 3
- 102000030431 Asparaginyl endopeptidase Human genes 0.000 claims description 3
- 230000024704 B cell apoptotic process Effects 0.000 claims description 3
- 108010008014 B-Cell Maturation Antigen Proteins 0.000 claims description 3
- 102000006942 B-Cell Maturation Antigen Human genes 0.000 claims description 3
- 102100027205 B-cell antigen receptor complex-associated protein alpha chain Human genes 0.000 claims description 3
- 101710166261 B-cell antigen receptor complex-associated protein beta chain Proteins 0.000 claims description 3
- 101710129514 B-cell differentiation antigen CD72 Proteins 0.000 claims description 3
- 230000003844 B-cell-activation Effects 0.000 claims description 3
- 102100021663 Baculoviral IAP repeat-containing protein 5 Human genes 0.000 claims description 3
- 102100027522 Baculoviral IAP repeat-containing protein 7 Human genes 0.000 claims description 3
- 108010040422 Bone Morphogenetic Protein Receptors Proteins 0.000 claims description 3
- 102000001893 Bone Morphogenetic Protein Receptors Human genes 0.000 claims description 3
- 102100027052 Bone morphogenetic protein receptor type-1B Human genes 0.000 claims description 3
- 108010085074 Brevican Proteins 0.000 claims description 3
- 102100032312 Brevican core protein Human genes 0.000 claims description 3
- 108010029697 CD40 Ligand Proteins 0.000 claims description 3
- 108010061298 CXCR5 Receptors Proteins 0.000 claims description 3
- 101100463133 Caenorhabditis elegans pdl-1 gene Proteins 0.000 claims description 3
- 101100314454 Caenorhabditis elegans tra-1 gene Proteins 0.000 claims description 3
- 102100025570 Cancer/testis antigen 1 Human genes 0.000 claims description 3
- 102100036369 Carbonic anhydrase 6 Human genes 0.000 claims description 3
- 108010078791 Carrier Proteins Proteins 0.000 claims description 3
- 108010008955 Chemokine CXCL13 Proteins 0.000 claims description 3
- 102000006574 Chemokine CXCL13 Human genes 0.000 claims description 3
- 101710178046 Chorismate synthase 1 Proteins 0.000 claims description 3
- 102100038449 Claudin-6 Human genes 0.000 claims description 3
- 102100035167 Coiled-coil domain-containing protein 54 Human genes 0.000 claims description 3
- 102100030886 Complement receptor type 1 Human genes 0.000 claims description 3
- 102000002427 Cyclin B Human genes 0.000 claims description 3
- 108010068150 Cyclin B Proteins 0.000 claims description 3
- 101710152695 Cysteine synthase 1 Proteins 0.000 claims description 3
- 102100027417 Cytochrome P450 1B1 Human genes 0.000 claims description 3
- 102100036466 Delta-like protein 3 Human genes 0.000 claims description 3
- 102100026245 E3 ubiquitin-protein ligase RNF43 Human genes 0.000 claims description 3
- 101150049307 EEF1A2 gene Proteins 0.000 claims description 3
- 102100038083 Endosialin Human genes 0.000 claims description 3
- 101710144543 Endosialin Proteins 0.000 claims description 3
- 108010055196 EphA2 Receptor Proteins 0.000 claims description 3
- 102100030340 Ephrin type-A receptor 2 Human genes 0.000 claims description 3
- 102400001368 Epidermal growth factor Human genes 0.000 claims description 3
- 101800003838 Epidermal growth factor Proteins 0.000 claims description 3
- 101710120224 Fc receptor-like protein 1 Proteins 0.000 claims description 3
- 102100031507 Fc receptor-like protein 5 Human genes 0.000 claims description 3
- 101150051800 Fcrl1 gene Proteins 0.000 claims description 3
- 102000008857 Ferritin Human genes 0.000 claims description 3
- 108050000784 Ferritin Proteins 0.000 claims description 3
- 238000008416 Ferritin Methods 0.000 claims description 3
- 102000003688 G-Protein-Coupled Receptors Human genes 0.000 claims description 3
- 108090000045 G-Protein-Coupled Receptors Proteins 0.000 claims description 3
- 101001077417 Gallus gallus Potassium voltage-gated channel subfamily H member 6 Proteins 0.000 claims description 3
- 208000031886 HIV Infections Diseases 0.000 claims description 3
- 102100031546 HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain Human genes 0.000 claims description 3
- 108010027412 Histocompatibility Antigens Class II Proteins 0.000 claims description 3
- 102000018713 Histocompatibility Antigens Class II Human genes 0.000 claims description 3
- 101000779641 Homo sapiens ALK tyrosine kinase receptor Proteins 0.000 claims description 3
- 101000914489 Homo sapiens B-cell antigen receptor complex-associated protein alpha chain Proteins 0.000 claims description 3
- 101000936083 Homo sapiens Baculoviral IAP repeat-containing protein 7 Proteins 0.000 claims description 3
- 101000984546 Homo sapiens Bone morphogenetic protein receptor type-1B Proteins 0.000 claims description 3
- 101000922405 Homo sapiens C-X-C chemokine receptor type 5 Proteins 0.000 claims description 3
- 101000856237 Homo sapiens Cancer/testis antigen 1 Proteins 0.000 claims description 3
- 101000714525 Homo sapiens Carbonic anhydrase 6 Proteins 0.000 claims description 3
- 101000882898 Homo sapiens Claudin-6 Proteins 0.000 claims description 3
- 101000737052 Homo sapiens Coiled-coil domain-containing protein 54 Proteins 0.000 claims description 3
- 101000727061 Homo sapiens Complement receptor type 1 Proteins 0.000 claims description 3
- 101000725164 Homo sapiens Cytochrome P450 1B1 Proteins 0.000 claims description 3
- 101000928513 Homo sapiens Delta-like protein 3 Proteins 0.000 claims description 3
- 101000692702 Homo sapiens E3 ubiquitin-protein ligase RNF43 Proteins 0.000 claims description 3
- 101100119857 Homo sapiens FCRL2 gene Proteins 0.000 claims description 3
- 101000846908 Homo sapiens Fc receptor-like protein 5 Proteins 0.000 claims description 3
- 101000866281 Homo sapiens HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain Proteins 0.000 claims description 3
- 101000606465 Homo sapiens Inactive tyrosine-protein kinase 7 Proteins 0.000 claims description 3
- 101000868279 Homo sapiens Leukocyte surface antigen CD47 Proteins 0.000 claims description 3
- 101001065568 Homo sapiens Lymphocyte antigen 6E Proteins 0.000 claims description 3
- 101000578784 Homo sapiens Melanoma antigen recognized by T-cells 1 Proteins 0.000 claims description 3
- 101000628547 Homo sapiens Metalloreductase STEAP1 Proteins 0.000 claims description 3
- 101001133056 Homo sapiens Mucin-1 Proteins 0.000 claims description 3
- 101000623905 Homo sapiens Mucin-15 Proteins 0.000 claims description 3
- 101001024605 Homo sapiens Next to BRCA1 gene 1 protein Proteins 0.000 claims description 3
- 101000613490 Homo sapiens Paired box protein Pax-3 Proteins 0.000 claims description 3
- 101000601724 Homo sapiens Paired box protein Pax-5 Proteins 0.000 claims description 3
- 101001136981 Homo sapiens Proteasome subunit beta type-9 Proteins 0.000 claims description 3
- 101000880770 Homo sapiens Protein SSX2 Proteins 0.000 claims description 3
- 101001130286 Homo sapiens Rab GTPase-binding effector protein 2 Proteins 0.000 claims description 3
- 101000831949 Homo sapiens Receptor for retinol uptake STRA6 Proteins 0.000 claims description 3
- 101001012157 Homo sapiens Receptor tyrosine-protein kinase erbB-2 Proteins 0.000 claims description 3
- 101000738771 Homo sapiens Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C Proteins 0.000 claims description 3
- 101001094545 Homo sapiens Retrotransposon-like protein 1 Proteins 0.000 claims description 3
- 101100420560 Homo sapiens SLC39A6 gene Proteins 0.000 claims description 3
- 101000604039 Homo sapiens Sodium-dependent phosphate transport protein 2B Proteins 0.000 claims description 3
- 101000824971 Homo sapiens Sperm surface protein Sp17 Proteins 0.000 claims description 3
- 101000873927 Homo sapiens Squamous cell carcinoma antigen recognized by T-cells 3 Proteins 0.000 claims description 3
- 101000934341 Homo sapiens T-cell surface glycoprotein CD5 Proteins 0.000 claims description 3
- 101001010792 Homo sapiens Transcriptional regulator ERG Proteins 0.000 claims description 3
- 101000798700 Homo sapiens Transmembrane protease serine 3 Proteins 0.000 claims description 3
- 101000798548 Homo sapiens Transmembrane protein 238 Proteins 0.000 claims description 3
- 101001103033 Homo sapiens Tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR2 Proteins 0.000 claims description 3
- 101000808114 Homo sapiens Uroplakin-1b Proteins 0.000 claims description 3
- 101000955999 Homo sapiens V-set domain-containing T-cell activation inhibitor 1 Proteins 0.000 claims description 3
- 101000851007 Homo sapiens Vascular endothelial growth factor receptor 2 Proteins 0.000 claims description 3
- 206010020853 Hypertonic bladder Diseases 0.000 claims description 3
- 101710123134 Ice-binding protein Proteins 0.000 claims description 3
- 101710082837 Ice-structuring protein Proteins 0.000 claims description 3
- DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M Ilexoside XXIX Chemical compound C[C@@H]1CC[C@@]2(CC[C@@]3(C(=CC[C@H]4[C@]3(CC[C@@H]5[C@@]4(CC[C@@H](C5(C)C)OS(=O)(=O)[O-])C)C)[C@@H]2[C@]1(C)O)C)C(=O)O[C@H]6[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O6)CO)O)O)O.[Na+] DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M 0.000 claims description 3
- 102100039813 Inactive tyrosine-protein kinase 7 Human genes 0.000 claims description 3
- 102100031413 L-dopachrome tautomerase Human genes 0.000 claims description 3
- 101710093778 L-dopachrome tautomerase Proteins 0.000 claims description 3
- 102100032913 Leukocyte surface antigen CD47 Human genes 0.000 claims description 3
- 102100032131 Lymphocyte antigen 6E Human genes 0.000 claims description 3
- 206010025323 Lymphomas Diseases 0.000 claims description 3
- 108010010995 MART-1 Antigen Proteins 0.000 claims description 3
- 102000016200 MART-1 Antigen Human genes 0.000 claims description 3
- 108700012912 MYCN Proteins 0.000 claims description 3
- 101150022024 MYCN gene Proteins 0.000 claims description 3
- 102100028389 Melanoma antigen recognized by T-cells 1 Human genes 0.000 claims description 3
- 108010006035 Metalloproteases Proteins 0.000 claims description 3
- 102000005741 Metalloproteases Human genes 0.000 claims description 3
- 102100026712 Metalloreductase STEAP1 Human genes 0.000 claims description 3
- 102100034256 Mucin-1 Human genes 0.000 claims description 3
- 102100023128 Mucin-15 Human genes 0.000 claims description 3
- 101000623899 Mus musculus Mucin-13 Proteins 0.000 claims description 3
- 101100407308 Mus musculus Pdcd1lg2 gene Proteins 0.000 claims description 3
- 101100042271 Mus musculus Sema3b gene Proteins 0.000 claims description 3
- 102000055056 N-Myc Proto-Oncogene Human genes 0.000 claims description 3
- 108700026495 N-Myc Proto-Oncogene Proteins 0.000 claims description 3
- OVBPIULPVIDEAO-UHFFFAOYSA-N N-Pteroyl-L-glutaminsaeure Natural products C=1N=C2NC(N)=NC(=O)C2=NC=1CNC1=CC=C(C(=O)NC(CCC(O)=O)C(O)=O)C=C1 OVBPIULPVIDEAO-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- 101710043865 Nectin-4 Proteins 0.000 claims description 3
- 102100035486 Nectin-4 Human genes 0.000 claims description 3
- 108010038807 Oligopeptides Proteins 0.000 claims description 3
- 102000015636 Oligopeptides Human genes 0.000 claims description 3
- 101710189969 P2X purinoceptor 5 Proteins 0.000 claims description 3
- 102100040891 Paired box protein Pax-3 Human genes 0.000 claims description 3
- 102100037504 Paired box protein Pax-5 Human genes 0.000 claims description 3
- 108010092528 Phosphate Transport Proteins Proteins 0.000 claims description 3
- 102000016462 Phosphate Transport Proteins Human genes 0.000 claims description 3
- 102000004160 Phosphoric Monoester Hydrolases Human genes 0.000 claims description 3
- 108090000608 Phosphoric Monoester Hydrolases Proteins 0.000 claims description 3
- 102100022807 Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2 Human genes 0.000 claims description 3
- 108700030875 Programmed Cell Death 1 Ligand 2 Proteins 0.000 claims description 3
- 102100024213 Programmed cell death 1 ligand 2 Human genes 0.000 claims description 3
- 206010060862 Prostate cancer Diseases 0.000 claims description 3
- 208000000236 Prostatic Neoplasms Diseases 0.000 claims description 3
- 102100035764 Proteasome subunit beta type-9 Human genes 0.000 claims description 3
- 102100032831 Protein ITPRID2 Human genes 0.000 claims description 3
- 102100037686 Protein SSX2 Human genes 0.000 claims description 3
- 108010080192 Purinergic Receptors Proteins 0.000 claims description 3
- 102100031524 Rab GTPase-binding effector protein 2 Human genes 0.000 claims description 3
- 101001039269 Rattus norvegicus Glycine N-methyltransferase Proteins 0.000 claims description 3
- 102100024235 Receptor for retinol uptake STRA6 Human genes 0.000 claims description 3
- 102100030086 Receptor tyrosine-protein kinase erbB-2 Human genes 0.000 claims description 3
- 102100037422 Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C Human genes 0.000 claims description 3
- 102100037421 Regulator of G-protein signaling 5 Human genes 0.000 claims description 3
- 101710140403 Regulator of G-protein signaling 5 Proteins 0.000 claims description 3
- 102000014400 SH2 domains Human genes 0.000 claims description 3
- 108050003452 SH2 domains Proteins 0.000 claims description 3
- 108091006576 SLC34A2 Proteins 0.000 claims description 3
- 206010039491 Sarcoma Diseases 0.000 claims description 3
- 102000009203 Sema domains Human genes 0.000 claims description 3
- 108050000099 Sema domains Proteins 0.000 claims description 3
- 102000014105 Semaphorin Human genes 0.000 claims description 3
- 108050003978 Semaphorin Proteins 0.000 claims description 3
- 101710199399 Semaphorin-5B Proteins 0.000 claims description 3
- 101710173694 Short transient receptor potential channel 2 Proteins 0.000 claims description 3
- 102100035748 Squamous cell carcinoma antigen recognized by T-cells 3 Human genes 0.000 claims description 3
- 101100523267 Staphylococcus aureus qacC gene Proteins 0.000 claims description 3
- 108010002687 Survivin Proteins 0.000 claims description 3
- 102100025244 T-cell surface glycoprotein CD5 Human genes 0.000 claims description 3
- 102000003618 TRPM4 Human genes 0.000 claims description 3
- 102100038126 Tenascin Human genes 0.000 claims description 3
- 108010008125 Tenascin Proteins 0.000 claims description 3
- 101710098080 Teratocarcinoma-derived growth factor Proteins 0.000 claims description 3
- 108010000499 Thromboplastin Proteins 0.000 claims description 3
- 108060008245 Thrombospondin Proteins 0.000 claims description 3
- 102000002938 Thrombospondin Human genes 0.000 claims description 3
- 102100030859 Tissue factor Human genes 0.000 claims description 3
- 102100032476 Transmembrane protein 238 Human genes 0.000 claims description 3
- 102100029690 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C Human genes 0.000 claims description 3
- 101710178300 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C Proteins 0.000 claims description 3
- 101710107540 Type-2 ice-structuring protein Proteins 0.000 claims description 3
- 102100039616 Tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR2 Human genes 0.000 claims description 3
- 102100038853 Uroplakin-1b Human genes 0.000 claims description 3
- 108010079206 V-Set Domain-Containing T-Cell Activation Inhibitor 1 Proteins 0.000 claims description 3
- 108010073929 Vascular Endothelial Growth Factor A Proteins 0.000 claims description 3
- 102000005789 Vascular Endothelial Growth Factors Human genes 0.000 claims description 3
- 108010019530 Vascular Endothelial Growth Factors Proteins 0.000 claims description 3
- 102100033177 Vascular endothelial growth factor receptor 2 Human genes 0.000 claims description 3
- 102100023144 Zinc transporter ZIP6 Human genes 0.000 claims description 3
- 108010080146 androgen receptors Proteins 0.000 claims description 3
- 230000001093 anti-cancer Effects 0.000 claims description 3
- 108010055066 asparaginylendopeptidase Proteins 0.000 claims description 3
- 230000001086 cytosolic effect Effects 0.000 claims description 3
- 230000007123 defense Effects 0.000 claims description 3
- 230000007812 deficiency Effects 0.000 claims description 3
- 229940127276 delta-like ligand 3 Drugs 0.000 claims description 3
- 230000004069 differentiation Effects 0.000 claims description 3
- 230000009266 disease activity Effects 0.000 claims description 3
- 230000008482 dysregulation Effects 0.000 claims description 3
- 229940116977 epidermal growth factor Drugs 0.000 claims description 3
- 235000019152 folic acid Nutrition 0.000 claims description 3
- 239000011724 folic acid Substances 0.000 claims description 3
- 229960000304 folic acid Drugs 0.000 claims description 3
- 125000002446 fucosyl group Chemical group C1([C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O1)C)* 0.000 claims description 3
- 102000006495 integrins Human genes 0.000 claims description 3
- 108010044426 integrins Proteins 0.000 claims description 3
- 208000032839 leukemia Diseases 0.000 claims description 3
- 206010025135 lupus erythematosus Diseases 0.000 claims description 3
- 210000004698 lymphocyte Anatomy 0.000 claims description 3
- 230000036210 malignancy Effects 0.000 claims description 3
- 230000005012 migration Effects 0.000 claims description 3
- 238000013508 migration Methods 0.000 claims description 3
- 230000000869 mutational effect Effects 0.000 claims description 3
- 201000000050 myeloid neoplasm Diseases 0.000 claims description 3
- 230000004766 neurogenesis Effects 0.000 claims description 3
- 230000007310 pathophysiology Effects 0.000 claims description 3
- 108040000983 polyphosphate:AMP phosphotransferase activity proteins Proteins 0.000 claims description 3
- 102000016914 ras Proteins Human genes 0.000 claims description 3
- 229910052708 sodium Inorganic materials 0.000 claims description 3
- 239000011734 sodium Substances 0.000 claims description 3
- 239000001488 sodium phosphate Substances 0.000 claims description 3
- 229910000162 sodium phosphate Inorganic materials 0.000 claims description 3
- 101150050955 stn gene Proteins 0.000 claims description 3
- 230000005062 synaptic transmission Effects 0.000 claims description 3
- 230000009885 systemic effect Effects 0.000 claims description 3
- 101150047061 tag-72 gene Proteins 0.000 claims description 3
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 claims description 3
- 102000035160 transmembrane proteins Human genes 0.000 claims description 3
- 108091005703 transmembrane proteins Proteins 0.000 claims description 3
- RYFMWSXOAZQYPI-UHFFFAOYSA-K trisodium phosphate Chemical compound [Na+].[Na+].[Na+].[O-]P([O-])([O-])=O RYFMWSXOAZQYPI-UHFFFAOYSA-K 0.000 claims description 3
- VBEQCZHXXJYVRD-GACYYNSASA-N uroanthelone Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O)C(C)C)[C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC=1NC=NC=1)NC(=O)[C@H](CCSC)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CNC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H]1N(CCC1)C(=O)[C@H](CS)NC(=O)CNC(=O)[C@H]1N(CCC1)C(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O)C(C)C)[C@@H](C)CC)C1=CC=C(O)C=C1 VBEQCZHXXJYVRD-GACYYNSASA-N 0.000 claims description 3
- 208000024893 Acute lymphoblastic leukemia Diseases 0.000 claims description 2
- 208000014697 Acute lymphocytic leukaemia Diseases 0.000 claims description 2
- 102100023003 Ankyrin repeat domain-containing protein 30A Human genes 0.000 claims description 2
- 208000010839 B-cell chronic lymphocytic leukemia Diseases 0.000 claims description 2
- 206010008342 Cervix carcinoma Diseases 0.000 claims description 2
- 102100039585 Claudin-16 Human genes 0.000 claims description 2
- 208000001333 Colorectal Neoplasms Diseases 0.000 claims description 2
- 102000003817 Fos-related antigen 1 Human genes 0.000 claims description 2
- 108090000123 Fos-related antigen 1 Proteins 0.000 claims description 2
- 208000017604 Hodgkin disease Diseases 0.000 claims description 2
- 208000021519 Hodgkin lymphoma Diseases 0.000 claims description 2
- 208000010747 Hodgkins lymphoma Diseases 0.000 claims description 2
- 101000757191 Homo sapiens Ankyrin repeat domain-containing protein 30A Proteins 0.000 claims description 2
- 101000888608 Homo sapiens Claudin-16 Proteins 0.000 claims description 2
- 208000031422 Lymphocytic Chronic B-Cell Leukemia Diseases 0.000 claims description 2
- 208000002030 Merkel cell carcinoma Diseases 0.000 claims description 2
- 208000032818 Microsatellite Instability Diseases 0.000 claims description 2
- 208000034578 Multiple myelomas Diseases 0.000 claims description 2
- 208000033776 Myeloid Acute Leukemia Diseases 0.000 claims description 2
- 206010029266 Neuroendocrine carcinoma of the skin Diseases 0.000 claims description 2
- 208000015914 Non-Hodgkin lymphomas Diseases 0.000 claims description 2
- 206010033128 Ovarian cancer Diseases 0.000 claims description 2
- 206010061535 Ovarian neoplasm Diseases 0.000 claims description 2
- 206010061902 Pancreatic neoplasm Diseases 0.000 claims description 2
- 208000006664 Precursor Cell Lymphoblastic Leukemia-Lymphoma Diseases 0.000 claims description 2
- 208000006265 Renal cell carcinoma Diseases 0.000 claims description 2
- 206010041067 Small cell lung cancer Diseases 0.000 claims description 2
- 208000005718 Stomach Neoplasms Diseases 0.000 claims description 2
- 208000006105 Uterine Cervical Neoplasms Diseases 0.000 claims description 2
- 201000010881 cervical cancer Diseases 0.000 claims description 2
- 208000032852 chronic lymphocytic leukemia Diseases 0.000 claims description 2
- 208000017763 cutaneous neuroendocrine carcinoma Diseases 0.000 claims description 2
- 238000002405 diagnostic procedure Methods 0.000 claims description 2
- 206010017758 gastric cancer Diseases 0.000 claims description 2
- 206010073071 hepatocellular carcinoma Diseases 0.000 claims description 2
- 231100000844 hepatocellular carcinoma Toxicity 0.000 claims description 2
- 208000015486 malignant pancreatic neoplasm Diseases 0.000 claims description 2
- 208000002154 non-small cell lung carcinoma Diseases 0.000 claims description 2
- 208000008443 pancreatic carcinoma Diseases 0.000 claims description 2
- 208000015347 renal cell adenocarcinoma Diseases 0.000 claims description 2
- 208000000587 small cell lung carcinoma Diseases 0.000 claims description 2
- 206010041823 squamous cell carcinoma Diseases 0.000 claims description 2
- 208000017572 squamous cell neoplasm Diseases 0.000 claims description 2
- 201000011549 stomach cancer Diseases 0.000 claims description 2
- 206010044412 transitional cell carcinoma Diseases 0.000 claims description 2
- 208000029729 tumor suppressor gene on chromosome 11 Diseases 0.000 claims description 2
- 208000023747 urothelial carcinoma Diseases 0.000 claims description 2
- 102100032471 Transmembrane protease serine 4 Human genes 0.000 claims 4
- 102100040611 Endothelin receptor type B Human genes 0.000 claims 2
- 101710194572 Endothelin receptor type B Proteins 0.000 claims 2
- 101100174180 Caenorhabditis elegans fos-1 gene Proteins 0.000 claims 1
- 102100030099 Chloride anion exchanger Human genes 0.000 claims 1
- 101000727806 Homo sapiens Chloride anion exchanger Proteins 0.000 claims 1
- 108040006849 interleukin-2 receptor activity proteins Proteins 0.000 claims 1
- 201000002528 pancreatic cancer Diseases 0.000 claims 1
- 239000002699 waste material Substances 0.000 claims 1
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 abstract description 48
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 64
- 238000013461 design Methods 0.000 description 43
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 37
- 102000003812 Interleukin-15 Human genes 0.000 description 22
- 108090000172 Interleukin-15 Proteins 0.000 description 22
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 21
- 101001002657 Homo sapiens Interleukin-2 Proteins 0.000 description 19
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 19
- 102000004127 Cytokines Human genes 0.000 description 17
- 108090000695 Cytokines Proteins 0.000 description 17
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 17
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 14
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 13
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 12
- 238000002983 circular dichroism Methods 0.000 description 12
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 12
- AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N L-isoleucine Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 11
- 238000001943 fluorescence-activated cell sorting Methods 0.000 description 11
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 11
- 238000002703 mutagenesis Methods 0.000 description 11
- 231100000350 mutagenesis Toxicity 0.000 description 11
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 11
- ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N L-glutamine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N 0.000 description 10
- 241001529936 Murinae Species 0.000 description 10
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 10
- 235000014680 Saccharomyces cerevisiae Nutrition 0.000 description 10
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 10
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 10
- 102000004559 Interleukin-13 Receptors Human genes 0.000 description 9
- 108010017511 Interleukin-13 Receptors Proteins 0.000 description 9
- XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N L-Cysteine Chemical compound SC[C@H](N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N 0.000 description 9
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 239000012148 binding buffer Substances 0.000 description 9
- 238000012575 bio-layer interferometry Methods 0.000 description 9
- 239000002953 phosphate buffered saline Substances 0.000 description 9
- YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N (+)-Biotin Chemical group N1C(=O)N[C@@H]2[C@H](CCCCC(=O)O)SC[C@@H]21 YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 8
- WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N Glutamic acid Natural products OC(=O)C(N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-N L-arginine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 8
- DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N L-asparagine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N 0.000 description 8
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 8
- KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N L-lysine Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 8
- OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N L-tyrosine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 8
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 8
- 101001034843 Mus musculus Interferon-induced transmembrane protein 1 Proteins 0.000 description 8
- 239000002202 Polyethylene glycol Substances 0.000 description 8
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 8
- 238000004925 denaturation Methods 0.000 description 8
- 230000036425 denaturation Effects 0.000 description 8
- 101001002709 Homo sapiens Interleukin-4 Proteins 0.000 description 7
- CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N L-aspartic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N 0.000 description 7
- 238000007598 dipping method Methods 0.000 description 7
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 7
- 102000055229 human IL4 Human genes 0.000 description 7
- 238000000159 protein binding assay Methods 0.000 description 7
- WSFSSNUMVMOOMR-UHFFFAOYSA-N Formaldehyde Chemical compound O=C WSFSSNUMVMOOMR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 6
- COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N L-phenylalanine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 6
- AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N L-threonine Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N 0.000 description 6
- KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N Valine Natural products CC(C)C(N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 description 6
- 230000008045 co-localization Effects 0.000 description 6
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 6
- 230000001976 improved effect Effects 0.000 description 6
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 6
- 230000003278 mimic effect Effects 0.000 description 6
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 6
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 6
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 6
- 102200024843 rs779526456 Human genes 0.000 description 6
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 6
- 229940124597 therapeutic agent Drugs 0.000 description 6
- MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N (2S)-2-Amino-3-hydroxypropansäure Chemical compound OC[C@H](N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N 0.000 description 5
- BWGNESOTFCXPMA-UHFFFAOYSA-N Dihydrogen disulfide Chemical compound SS BWGNESOTFCXPMA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 5
- 101001043827 Mus musculus Interleukin-2 Proteins 0.000 description 5
- 229960002685 biotin Drugs 0.000 description 5
- 239000011616 biotin Substances 0.000 description 5
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 5
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 5
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 5
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 5
- 230000011664 signaling Effects 0.000 description 5
- 239000004094 surface-active agent Substances 0.000 description 5
- 231100000419 toxicity Toxicity 0.000 description 5
- 230000001988 toxicity Effects 0.000 description 5
- 125000001433 C-terminal amino-acid group Chemical group 0.000 description 4
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 4
- 125000001429 N-terminal alpha-amino-acid group Chemical group 0.000 description 4
- 239000004698 Polyethylene Substances 0.000 description 4
- 108010029477 STAT5 Transcription Factor Proteins 0.000 description 4
- 102100024481 Signal transducer and activator of transcription 5A Human genes 0.000 description 4
- 235000020958 biotin Nutrition 0.000 description 4
- 230000005754 cellular signaling Effects 0.000 description 4
- 230000004186 co-expression Effects 0.000 description 4
- 238000000684 flow cytometry Methods 0.000 description 4
- 238000005734 heterodimerization reaction Methods 0.000 description 4
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 4
- 108040002039 interleukin-15 receptor activity proteins Proteins 0.000 description 4
- 102000008616 interleukin-15 receptor activity proteins Human genes 0.000 description 4
- 230000001788 irregular Effects 0.000 description 4
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 4
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 4
- 238000010172 mouse model Methods 0.000 description 4
- 238000005457 optimization Methods 0.000 description 4
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 4
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 4
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 4
- JKMHFZQWWAIEOD-UHFFFAOYSA-N 2-[4-(2-hydroxyethyl)piperazin-1-yl]ethanesulfonic acid Chemical compound OCC[NH+]1CCN(CCS([O-])(=O)=O)CC1 JKMHFZQWWAIEOD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 102100023990 60S ribosomal protein L17 Human genes 0.000 description 3
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 description 3
- 108091007741 Chimeric antigen receptor T cells Proteins 0.000 description 3
- FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N D-Glucitol Natural products OC[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N 0.000 description 3
- FBPFZTCFMRRESA-JGWLITMVSA-N D-glucitol Chemical compound OC[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-JGWLITMVSA-N 0.000 description 3
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 3
- 239000007995 HEPES buffer Substances 0.000 description 3
- FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine Chemical compound CSCC[C@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 3
- 108010090804 Streptavidin Proteins 0.000 description 3
- 229930006000 Sucrose Natural products 0.000 description 3
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N Sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 description 3
- ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N arginine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 229960003121 arginine Drugs 0.000 description 3
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 3
- 238000004422 calculation algorithm Methods 0.000 description 3
- 239000006285 cell suspension Substances 0.000 description 3
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 3
- 230000000875 corresponding effect Effects 0.000 description 3
- 231100000673 dose–response relationship Toxicity 0.000 description 3
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 3
- 238000005305 interferometry Methods 0.000 description 3
- 238000011068 loading method Methods 0.000 description 3
- 229920001427 mPEG Polymers 0.000 description 3
- 238000001819 mass spectrum Methods 0.000 description 3
- 229930182817 methionine Natural products 0.000 description 3
- 125000000956 methoxy group Chemical group [H]C([H])([H])O* 0.000 description 3
- 230000026731 phosphorylation Effects 0.000 description 3
- 238000006366 phosphorylation reaction Methods 0.000 description 3
- 239000000843 powder Substances 0.000 description 3
- 230000000069 prophylactic effect Effects 0.000 description 3
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 3
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 3
- 238000013207 serial dilution Methods 0.000 description 3
- 235000020183 skimmed milk Nutrition 0.000 description 3
- 239000000600 sorbitol Substances 0.000 description 3
- 239000003381 stabilizer Substances 0.000 description 3
- 230000000087 stabilizing effect Effects 0.000 description 3
- 239000005720 sucrose Substances 0.000 description 3
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 3
- 230000004614 tumor growth Effects 0.000 description 3
- JNYAEWCLZODPBN-JGWLITMVSA-N (2r,3r,4s)-2-[(1r)-1,2-dihydroxyethyl]oxolane-3,4-diol Chemical compound OC[C@@H](O)[C@H]1OC[C@H](O)[C@H]1O JNYAEWCLZODPBN-JGWLITMVSA-N 0.000 description 2
- CFBILACNYSPRPM-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;2-[[1,3-dihydroxy-2-(hydroxymethyl)propan-2-yl]amino]acetic acid Chemical compound OCC(N)(CO)CO.OCC(CO)(CO)NCC(O)=O CFBILACNYSPRPM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- CFKMVGJGLGKFKI-UHFFFAOYSA-N 4-chloro-m-cresol Chemical compound CC1=CC(O)=CC=C1Cl CFKMVGJGLGKFKI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 2
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 2
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 2
- 231100000491 EC50 Toxicity 0.000 description 2
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- SQUHHTBVTRBESD-UHFFFAOYSA-N Hexa-Ac-myo-Inositol Natural products CC(=O)OC1C(OC(C)=O)C(OC(C)=O)C(OC(C)=O)C(OC(C)=O)C1OC(C)=O SQUHHTBVTRBESD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 2
- 101001055157 Homo sapiens Interleukin-15 Proteins 0.000 description 2
- 108010017535 Interleukin-15 Receptors Proteins 0.000 description 2
- ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P L-argininium(2+) Chemical compound NC(=[NH2+])NCCC[C@H]([NH3+])C(O)=O ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P 0.000 description 2
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 description 2
- 206010027476 Metastases Diseases 0.000 description 2
- ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N Phenol Chemical compound OC1=CC=CC=C1 ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000012979 RPMI medium Substances 0.000 description 2
- 239000006146 Roswell Park Memorial Institute medium Substances 0.000 description 2
- 101000677856 Stenotrophomonas maltophilia (strain K279a) Actin-binding protein Smlt3054 Proteins 0.000 description 2
- 239000012505 Superdex™ Substances 0.000 description 2
- 230000005867 T cell response Effects 0.000 description 2
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 description 2
- 239000013543 active substance Substances 0.000 description 2
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 2
- 210000000612 antigen-presenting cell Anatomy 0.000 description 2
- 229960003589 arginine hydrochloride Drugs 0.000 description 2
- 230000004888 barrier function Effects 0.000 description 2
- WPYMKLBDIGXBTP-UHFFFAOYSA-N benzoic acid Chemical compound OC(=O)C1=CC=CC=C1 WPYMKLBDIGXBTP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000011230 binding agent Substances 0.000 description 2
- 230000037396 body weight Effects 0.000 description 2
- 229940098773 bovine serum albumin Drugs 0.000 description 2
- 239000004067 bulking agent Substances 0.000 description 2
- 230000010261 cell growth Effects 0.000 description 2
- 238000007385 chemical modification Methods 0.000 description 2
- OSASVXMJTNOKOY-UHFFFAOYSA-N chlorobutanol Chemical compound CC(C)(O)C(Cl)(Cl)Cl OSASVXMJTNOKOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000001816 cooling Methods 0.000 description 2
- 230000007423 decrease Effects 0.000 description 2
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 description 2
- 230000001934 delay Effects 0.000 description 2
- LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I dipotassium trisodium dihydrogen phosphate hydrogen phosphate dichloride Chemical compound P(=O)(O)(O)[O-].[K+].P(=O)(O)([O-])[O-].[Na+].[Na+].[Cl-].[K+].[Cl-].[Na+] LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I 0.000 description 2
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 2
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 2
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 2
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 2
- 238000001502 gel electrophoresis Methods 0.000 description 2
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 2
- HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N histidine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000056003 human IL15 Human genes 0.000 description 2
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 description 2
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 description 2
- 239000002955 immunomodulating agent Substances 0.000 description 2
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 2
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 2
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 2
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 2
- 238000011081 inoculation Methods 0.000 description 2
- CDAISMWEOUEBRE-GPIVLXJGSA-N inositol Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)[C@@H]1O CDAISMWEOUEBRE-GPIVLXJGSA-N 0.000 description 2
- 229960000367 inositol Drugs 0.000 description 2
- BPHPUYQFMNQIOC-NXRLNHOXSA-N isopropyl beta-D-thiogalactopyranoside Chemical compound CC(C)S[C@@H]1O[C@H](CO)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O BPHPUYQFMNQIOC-NXRLNHOXSA-N 0.000 description 2
- RLSSMJSEOOYNOY-UHFFFAOYSA-N m-cresol Chemical compound CC1=CC=CC(O)=C1 RLSSMJSEOOYNOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000005439 maleimidyl group Chemical group C1(C=CC(N1*)=O)=O 0.000 description 2
- 238000002844 melting Methods 0.000 description 2
- 230000008018 melting Effects 0.000 description 2
- LXCFILQKKLGQFO-UHFFFAOYSA-N methylparaben Chemical compound COC(=O)C1=CC=C(O)C=C1 LXCFILQKKLGQFO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- QWVGKYWNOKOFNN-UHFFFAOYSA-N o-cresol Chemical compound CC1=CC=CC=C1O QWVGKYWNOKOFNN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- IWDCLRJOBJJRNH-UHFFFAOYSA-N p-cresol Chemical compound CC1=CC=C(O)C=C1 IWDCLRJOBJJRNH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000004806 packaging method and process Methods 0.000 description 2
- 230000008823 permeabilization Effects 0.000 description 2
- 230000003389 potentiating effect Effects 0.000 description 2
- 239000003755 preservative agent Substances 0.000 description 2
- 230000002335 preservative effect Effects 0.000 description 2
- 230000008569 process Effects 0.000 description 2
- 230000035755 proliferation Effects 0.000 description 2
- QELSKZZBTMNZEB-UHFFFAOYSA-N propylparaben Chemical compound CCCOC(=O)C1=CC=C(O)C=C1 QELSKZZBTMNZEB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000002818 protein evolution Methods 0.000 description 2
- 230000004853 protein function Effects 0.000 description 2
- 238000002708 random mutagenesis Methods 0.000 description 2
- 230000003252 repetitive effect Effects 0.000 description 2
- CDAISMWEOUEBRE-UHFFFAOYSA-N scyllo-inosotol Natural products OC1C(O)C(O)C(O)C(O)C1O CDAISMWEOUEBRE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000001542 size-exclusion chromatography Methods 0.000 description 2
- 238000002415 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 2
- DAEPDZWVDSPTHF-UHFFFAOYSA-M sodium pyruvate Chemical compound [Na+].CC(=O)C([O-])=O DAEPDZWVDSPTHF-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 239000007921 spray Substances 0.000 description 2
- 230000006918 subunit interaction Effects 0.000 description 2
- 229910052717 sulfur Inorganic materials 0.000 description 2
- 230000017423 tissue regeneration Effects 0.000 description 2
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 2
- 239000011534 wash buffer Substances 0.000 description 2
- HDTRYLNUVZCQOY-UHFFFAOYSA-N α-D-glucopyranosyl-α-D-glucopyranoside Natural products OC1C(O)C(O)C(CO)OC1OC1C(O)C(O)C(O)C(CO)O1 HDTRYLNUVZCQOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZXSBHXZKWRIEIA-JTQLQIEISA-N (2s)-3-(4-acetylphenyl)-2-azaniumylpropanoate Chemical group CC(=O)C1=CC=C(C[C@H](N)C(O)=O)C=C1 ZXSBHXZKWRIEIA-JTQLQIEISA-N 0.000 description 1
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 1
- ZORQXIQZAOLNGE-UHFFFAOYSA-N 1,1-difluorocyclohexane Chemical compound FC1(F)CCCCC1 ZORQXIQZAOLNGE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BFSVOASYOCHEOV-UHFFFAOYSA-N 2-diethylaminoethanol Chemical compound CCN(CC)CCO BFSVOASYOCHEOV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- XZIIFPSPUDAGJM-UHFFFAOYSA-N 6-chloro-2-n,2-n-diethylpyrimidine-2,4-diamine Chemical compound CCN(CC)C1=NC(N)=CC(Cl)=N1 XZIIFPSPUDAGJM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101150076725 AGA2 gene Proteins 0.000 description 1
- 102000007469 Actins Human genes 0.000 description 1
- 108010085238 Actins Proteins 0.000 description 1
- 108010088751 Albumins Proteins 0.000 description 1
- 102000009027 Albumins Human genes 0.000 description 1
- 239000012117 Alexa Fluor 700 Substances 0.000 description 1
- 239000012099 Alexa Fluor family Substances 0.000 description 1
- MQLZLIYPFDIDMZ-HAFWLYHUSA-N Asn-Ile Chemical group CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O MQLZLIYPFDIDMZ-HAFWLYHUSA-N 0.000 description 1
- DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N Asparagine Natural products OC(=O)C(N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000005711 Benzoic acid Substances 0.000 description 1
- 241000283690 Bos taurus Species 0.000 description 1
- 238000011357 CAR T-cell therapy Methods 0.000 description 1
- 101100506090 Caenorhabditis elegans hil-2 gene Proteins 0.000 description 1
- 241000282472 Canis lupus familiaris Species 0.000 description 1
- GHXZTYHSJHQHIJ-UHFFFAOYSA-N Chlorhexidine Chemical compound C=1C=C(Cl)C=CC=1NC(N)=NC(N)=NCCCCCCN=C(N)N=C(N)NC1=CC=C(Cl)C=C1 GHXZTYHSJHQHIJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N D-Mannitol Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N 0.000 description 1
- 150000008574 D-amino acids Chemical class 0.000 description 1
- 229920002307 Dextran Polymers 0.000 description 1
- UPEZCKBFRMILAV-JNEQICEOSA-N Ecdysone Natural products O=C1[C@H]2[C@@](C)([C@@H]3C([C@@]4(O)[C@@](C)([C@H]([C@H]([C@@H](O)CCC(O)(C)C)C)CC4)CC3)=C1)C[C@H](O)[C@H](O)C2 UPEZCKBFRMILAV-JNEQICEOSA-N 0.000 description 1
- 102000010180 Endothelin receptor Human genes 0.000 description 1
- 108050001739 Endothelin receptor Proteins 0.000 description 1
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 1
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 1
- 241000283086 Equidae Species 0.000 description 1
- CTKXFMQHOOWWEB-UHFFFAOYSA-N Ethylene oxide/propylene oxide copolymer Chemical compound CCCOC(C)COCCO CTKXFMQHOOWWEB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010015548 Euthanasia Diseases 0.000 description 1
- 241000282326 Felis catus Species 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 1
- 101100232357 Homo sapiens IL13RA1 gene Proteins 0.000 description 1
- 101100232360 Homo sapiens IL13RA2 gene Proteins 0.000 description 1
- 101001046686 Homo sapiens Integrin alpha-M Proteins 0.000 description 1
- 102000039990 IL-2 family Human genes 0.000 description 1
- 108091069192 IL-2 family Proteins 0.000 description 1
- 206010061218 Inflammation Diseases 0.000 description 1
- 102100022338 Integrin alpha-M Human genes 0.000 description 1
- 102100022297 Integrin alpha-X Human genes 0.000 description 1
- 102100020791 Interleukin-13 receptor subunit alpha-1 Human genes 0.000 description 1
- 102000004556 Interleukin-15 Receptors Human genes 0.000 description 1
- 108010002350 Interleukin-2 Proteins 0.000 description 1
- 102000000588 Interleukin-2 Human genes 0.000 description 1
- 102000004388 Interleukin-4 Human genes 0.000 description 1
- 108090000978 Interleukin-4 Proteins 0.000 description 1
- QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N L-alanine Chemical compound C[C@H](N)C(O)=O QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- 125000000998 L-alanino group Chemical group [H]N([*])[C@](C([H])([H])[H])([H])C(=O)O[H] 0.000 description 1
- 150000008575 L-amino acids Chemical class 0.000 description 1
- 229930182816 L-glutamine Natural products 0.000 description 1
- LRQKBLKVPFOOQJ-YFKPBYRVSA-N L-norleucine Chemical compound CCCC[C@H]([NH3+])C([O-])=O LRQKBLKVPFOOQJ-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N L-tryptophane Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N 0.000 description 1
- 125000000510 L-tryptophano group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C2N([H])C([H])=C(C([H])([H])[C@@]([H])(C(O[H])=O)N([H])[*])C2=C1[H] 0.000 description 1
- KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N L-valine Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N Leucine Natural products CC(C)CC(N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000003960 Ligases Human genes 0.000 description 1
- 108090000364 Ligases Proteins 0.000 description 1
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 1
- 229930195725 Mannitol Natural products 0.000 description 1
- 208000009869 Neu-Laxova syndrome Diseases 0.000 description 1
- 108010077850 Nuclear Localization Signals Proteins 0.000 description 1
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 1
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 description 1
- 229920006771 PE-C Polymers 0.000 description 1
- 206010057249 Phagocytosis Diseases 0.000 description 1
- 229920001213 Polysorbate 20 Polymers 0.000 description 1
- 229920001219 Polysorbate 40 Polymers 0.000 description 1
- 229920001214 Polysorbate 60 Polymers 0.000 description 1
- 229920002642 Polysorbate 65 Polymers 0.000 description 1
- 229920002651 Polysorbate 85 Polymers 0.000 description 1
- ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N Proline Natural products OC(=O)C1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010001267 Protein Subunits Proteins 0.000 description 1
- 102000002067 Protein Subunits Human genes 0.000 description 1
- 241000508269 Psidium Species 0.000 description 1
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- IYFATESGLOUGBX-YVNJGZBMSA-N Sorbitan monopalmitate Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OC[C@@H](O)[C@H]1OC[C@H](O)[C@H]1O IYFATESGLOUGBX-YVNJGZBMSA-N 0.000 description 1
- HVUMOYIDDBPOLL-XWVZOOPGSA-N Sorbitan monostearate Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OC[C@@H](O)[C@H]1OC[C@H](O)[C@H]1O HVUMOYIDDBPOLL-XWVZOOPGSA-N 0.000 description 1
- 239000004098 Tetracycline Substances 0.000 description 1
- AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N Threonine Natural products CC(O)C(N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004473 Threonine Substances 0.000 description 1
- 108090000190 Thrombin Proteins 0.000 description 1
- 108060008539 Transglutaminase Proteins 0.000 description 1
- 102100032454 Transmembrane protease serine 3 Human genes 0.000 description 1
- HDTRYLNUVZCQOY-WSWWMNSNSA-N Trehalose Natural products O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O1 HDTRYLNUVZCQOY-WSWWMNSNSA-N 0.000 description 1
- 239000007983 Tris buffer Substances 0.000 description 1
- QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N Tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- IJCWFDPJFXGQBN-RYNSOKOISA-N [(2R)-2-[(2R,3R,4S)-4-hydroxy-3-octadecanoyloxyoxolan-2-yl]-2-octadecanoyloxyethyl] octadecanoate Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OC[C@@H](OC(=O)CCCCCCCCCCCCCCCCC)[C@H]1OC[C@H](O)[C@H]1OC(=O)CCCCCCCCCCCCCCCCC IJCWFDPJFXGQBN-RYNSOKOISA-N 0.000 description 1
- 238000010521 absorption reaction Methods 0.000 description 1
- 239000008351 acetate buffer Substances 0.000 description 1
- 230000009471 action Effects 0.000 description 1
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 description 1
- 230000002411 adverse Effects 0.000 description 1
- 238000001042 affinity chromatography Methods 0.000 description 1
- 230000009824 affinity maturation Effects 0.000 description 1
- 230000008484 agonism Effects 0.000 description 1
- 208000037883 airway inflammation Diseases 0.000 description 1
- 235000004279 alanine Nutrition 0.000 description 1
- 125000001931 aliphatic group Chemical group 0.000 description 1
- HDTRYLNUVZCQOY-LIZSDCNHSA-N alpha,alpha-trehalose Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 HDTRYLNUVZCQOY-LIZSDCNHSA-N 0.000 description 1
- UPEZCKBFRMILAV-UHFFFAOYSA-N alpha-Ecdysone Natural products C1C(O)C(O)CC2(C)C(CCC3(C(C(C(O)CCC(C)(C)O)C)CCC33O)C)C3=CC(=O)C21 UPEZCKBFRMILAV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 1
- 230000003127 anti-melanomic effect Effects 0.000 description 1
- 230000000259 anti-tumor effect Effects 0.000 description 1
- 230000006023 anti-tumor response Effects 0.000 description 1
- 239000002246 antineoplastic agent Substances 0.000 description 1
- 230000005975 antitumor immune response Effects 0.000 description 1
- 125000003118 aryl group Chemical group 0.000 description 1
- 230000001174 ascending effect Effects 0.000 description 1
- 235000009582 asparagine Nutrition 0.000 description 1
- 229960001230 asparagine Drugs 0.000 description 1
- 235000003704 aspartic acid Nutrition 0.000 description 1
- 230000010310 bacterial transformation Effects 0.000 description 1
- 210000003651 basophil Anatomy 0.000 description 1
- 230000009286 beneficial effect Effects 0.000 description 1
- 229960000686 benzalkonium chloride Drugs 0.000 description 1
- 229960003872 benzethonium Drugs 0.000 description 1
- 235000010233 benzoic acid Nutrition 0.000 description 1
- CADWTSSKOVRVJC-UHFFFAOYSA-N benzyl(dimethyl)azanium;chloride Chemical compound [Cl-].C[NH+](C)CC1=CC=CC=C1 CADWTSSKOVRVJC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N beta-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N 0.000 description 1
- OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N beta-carboxyaspartic acid Natural products OC(=O)C(N)C(C(O)=O)C(O)=O OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000003115 biocidal effect Effects 0.000 description 1
- 230000008827 biological function Effects 0.000 description 1
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 1
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 1
- 239000001506 calcium phosphate Substances 0.000 description 1
- 229910000389 calcium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000011010 calcium phosphates Nutrition 0.000 description 1
- 238000004364 calculation method Methods 0.000 description 1
- 244000309466 calf Species 0.000 description 1
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 1
- 210000000170 cell membrane Anatomy 0.000 description 1
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 1
- 230000036755 cellular response Effects 0.000 description 1
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 1
- 230000008859 change Effects 0.000 description 1
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 1
- 230000014564 chemokine production Effects 0.000 description 1
- 238000002512 chemotherapy Methods 0.000 description 1
- 229960003260 chlorhexidine Drugs 0.000 description 1
- 229960004926 chlorobutanol Drugs 0.000 description 1
- 229960002242 chlorocresol Drugs 0.000 description 1
- 239000013611 chromosomal DNA Substances 0.000 description 1
- 239000007979 citrate buffer Substances 0.000 description 1
- 238000000975 co-precipitation Methods 0.000 description 1
- 238000011278 co-treatment Methods 0.000 description 1
- 230000001143 conditioned effect Effects 0.000 description 1
- 230000002596 correlated effect Effects 0.000 description 1
- 230000008878 coupling Effects 0.000 description 1
- 238000010168 coupling process Methods 0.000 description 1
- 238000005859 coupling reaction Methods 0.000 description 1
- 230000009260 cross reactivity Effects 0.000 description 1
- 239000013078 crystal Substances 0.000 description 1
- 238000012258 culturing Methods 0.000 description 1
- 230000016396 cytokine production Effects 0.000 description 1
- 210000001151 cytotoxic T lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 229940127089 cytotoxic agent Drugs 0.000 description 1
- 230000003013 cytotoxicity Effects 0.000 description 1
- 231100000135 cytotoxicity Toxicity 0.000 description 1
- 230000009849 deactivation Effects 0.000 description 1
- 230000002950 deficient Effects 0.000 description 1
- 230000002939 deleterious effect Effects 0.000 description 1
- 230000000368 destabilizing effect Effects 0.000 description 1
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 1
- 230000001627 detrimental effect Effects 0.000 description 1
- 239000008121 dextrose Substances 0.000 description 1
- 238000006471 dimerization reaction Methods 0.000 description 1
- SIYLLGKDQZGJHK-UHFFFAOYSA-N dimethyl-(phenylmethyl)-[2-[2-[4-(2,4,4-trimethylpentan-2-yl)phenoxy]ethoxy]ethyl]ammonium Chemical compound C1=CC(C(C)(C)CC(C)(C)C)=CC=C1OCCOCC[N+](C)(C)CC1=CC=CC=C1 SIYLLGKDQZGJHK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 1
- UPEZCKBFRMILAV-JMZLNJERSA-N ecdysone Chemical compound C1[C@@H](O)[C@@H](O)C[C@]2(C)[C@@H](CC[C@@]3([C@@H]([C@@H]([C@H](O)CCC(C)(C)O)C)CC[C@]33O)C)C3=CC(=O)[C@@H]21 UPEZCKBFRMILAV-JMZLNJERSA-N 0.000 description 1
- 239000002158 endotoxin Substances 0.000 description 1
- 230000002708 enhancing effect Effects 0.000 description 1
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 1
- 210000003979 eosinophil Anatomy 0.000 description 1
- 230000007717 exclusion Effects 0.000 description 1
- 230000001747 exhibiting effect Effects 0.000 description 1
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 1
- 230000002349 favourable effect Effects 0.000 description 1
- 230000001605 fetal effect Effects 0.000 description 1
- 238000001914 filtration Methods 0.000 description 1
- MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N fluorescein-5-isothiocyanate Chemical compound O1C(=O)C2=CC(N=C=S)=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000007850 fluorescent dye Substances 0.000 description 1
- 238000001215 fluorescent labelling Methods 0.000 description 1
- 102000034287 fluorescent proteins Human genes 0.000 description 1
- 108091006047 fluorescent proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000034238 globular proteins Human genes 0.000 description 1
- 108091005896 globular proteins Proteins 0.000 description 1
- 235000013922 glutamic acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000004220 glutamic acid Substances 0.000 description 1
- ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N glutamine Natural products OC(=O)C(N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000013595 glycosylation Effects 0.000 description 1
- 238000006206 glycosylation reaction Methods 0.000 description 1
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 1
- 230000036541 health Effects 0.000 description 1
- 230000003284 homeostatic effect Effects 0.000 description 1
- 238000002744 homologous recombination Methods 0.000 description 1
- 230000006801 homologous recombination Effects 0.000 description 1
- 230000002209 hydrophobic effect Effects 0.000 description 1
- 238000001597 immobilized metal affinity chromatography Methods 0.000 description 1
- 210000000987 immune system Anatomy 0.000 description 1
- 230000005847 immunogenicity Effects 0.000 description 1
- 230000002434 immunopotentiative effect Effects 0.000 description 1
- 238000000099 in vitro assay Methods 0.000 description 1
- 230000002779 inactivation Effects 0.000 description 1
- 230000004054 inflammatory process Effects 0.000 description 1
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 1
- 238000007689 inspection Methods 0.000 description 1
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 1
- 230000002452 interceptive effect Effects 0.000 description 1
- 229940028885 interleukin-4 Drugs 0.000 description 1
- 229940047122 interleukins Drugs 0.000 description 1
- 230000002601 intratumoral effect Effects 0.000 description 1
- 229960000310 isoleucine Drugs 0.000 description 1
- AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N isoleucine Natural products CCC(C)C(N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000002502 liposome Substances 0.000 description 1
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 1
- 230000004807 localization Effects 0.000 description 1
- 230000007774 longterm Effects 0.000 description 1
- 210000001165 lymph node Anatomy 0.000 description 1
- 210000005210 lymphoid organ Anatomy 0.000 description 1
- UEGPKNKPLBYCNK-UHFFFAOYSA-L magnesium acetate Chemical compound [Mg+2].CC([O-])=O.CC([O-])=O UEGPKNKPLBYCNK-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 235000011285 magnesium acetate Nutrition 0.000 description 1
- 239000011654 magnesium acetate Substances 0.000 description 1
- 229940069446 magnesium acetate Drugs 0.000 description 1
- 239000000594 mannitol Substances 0.000 description 1
- 235000010355 mannitol Nutrition 0.000 description 1
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 1
- 239000000155 melt Substances 0.000 description 1
- 239000004292 methyl p-hydroxybenzoate Substances 0.000 description 1
- 235000010270 methyl p-hydroxybenzoate Nutrition 0.000 description 1
- 229960002216 methylparaben Drugs 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 1
- 210000001616 monocyte Anatomy 0.000 description 1
- 238000000569 multi-angle light scattering Methods 0.000 description 1
- 230000036438 mutation frequency Effects 0.000 description 1
- 210000000581 natural killer T-cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000007935 neutral effect Effects 0.000 description 1
- 210000000440 neutrophil Anatomy 0.000 description 1
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000010606 normalization Methods 0.000 description 1
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 1
- 244000309459 oncolytic virus Species 0.000 description 1
- 230000006320 pegylation Effects 0.000 description 1
- 230000008782 phagocytosis Effects 0.000 description 1
- 229960003742 phenol Drugs 0.000 description 1
- WVDDGKGOMKODPV-ZQBYOMGUSA-N phenyl(114C)methanol Chemical compound O[14CH2]C1=CC=CC=C1 WVDDGKGOMKODPV-ZQBYOMGUSA-N 0.000 description 1
- COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N phenylalanine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PDTFCHSETJBPTR-UHFFFAOYSA-N phenylmercuric nitrate Chemical compound [O-][N+](=O)O[Hg]C1=CC=CC=C1 PDTFCHSETJBPTR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000008363 phosphate buffer Substances 0.000 description 1
- 229910052698 phosphorus Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000000865 phosphorylative effect Effects 0.000 description 1
- 229940044519 poloxamer 188 Drugs 0.000 description 1
- 229920001993 poloxamer 188 Polymers 0.000 description 1
- 230000008488 polyadenylation Effects 0.000 description 1
- 239000000256 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Substances 0.000 description 1
- 235000010486 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Nutrition 0.000 description 1
- 239000000244 polyoxyethylene sorbitan monooleate Substances 0.000 description 1
- 235000010482 polyoxyethylene sorbitan monooleate Nutrition 0.000 description 1
- 239000000249 polyoxyethylene sorbitan monopalmitate Substances 0.000 description 1
- 235000010483 polyoxyethylene sorbitan monopalmitate Nutrition 0.000 description 1
- 239000001818 polyoxyethylene sorbitan monostearate Substances 0.000 description 1
- 235000010989 polyoxyethylene sorbitan monostearate Nutrition 0.000 description 1
- 239000001816 polyoxyethylene sorbitan tristearate Substances 0.000 description 1
- 235000010988 polyoxyethylene sorbitan tristearate Nutrition 0.000 description 1
- 229940068977 polysorbate 20 Drugs 0.000 description 1
- 229940101027 polysorbate 40 Drugs 0.000 description 1
- 229940113124 polysorbate 60 Drugs 0.000 description 1
- 229940099511 polysorbate 65 Drugs 0.000 description 1
- 229920000053 polysorbate 80 Polymers 0.000 description 1
- 229940068968 polysorbate 80 Drugs 0.000 description 1
- 229940113171 polysorbate 85 Drugs 0.000 description 1
- 210000004986 primary T-cell Anatomy 0.000 description 1
- RVQDZELMXZRSSI-UHFFFAOYSA-N prolyl-lysine Chemical group NCCCCC(C(O)=O)NC(=O)C1CCCN1 RVQDZELMXZRSSI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000001737 promoting effect Effects 0.000 description 1
- 239000004405 propyl p-hydroxybenzoate Substances 0.000 description 1
- 235000010232 propyl p-hydroxybenzoate Nutrition 0.000 description 1
- 229960003415 propylparaben Drugs 0.000 description 1
- 230000012743 protein tagging Effects 0.000 description 1
- 238000001959 radiotherapy Methods 0.000 description 1
- 230000007115 recruitment Effects 0.000 description 1
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 1
- 230000001172 regenerating effect Effects 0.000 description 1
- 238000011069 regeneration method Methods 0.000 description 1
- 238000002271 resection Methods 0.000 description 1
- 230000000717 retained effect Effects 0.000 description 1
- 230000001177 retroviral effect Effects 0.000 description 1
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 1
- 102220022330 rs193922746 Human genes 0.000 description 1
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 1
- 230000003248 secreting effect Effects 0.000 description 1
- 238000012772 sequence design Methods 0.000 description 1
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 1
- 238000004088 simulation Methods 0.000 description 1
- 238000004513 sizing Methods 0.000 description 1
- 229940054269 sodium pyruvate Drugs 0.000 description 1
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 1
- 229940100515 sorbitan Drugs 0.000 description 1
- 229940035044 sorbitan monolaurate Drugs 0.000 description 1
- 239000001593 sorbitan monooleate Substances 0.000 description 1
- 235000011069 sorbitan monooleate Nutrition 0.000 description 1
- 229940035049 sorbitan monooleate Drugs 0.000 description 1
- 239000001570 sorbitan monopalmitate Substances 0.000 description 1
- 235000011071 sorbitan monopalmitate Nutrition 0.000 description 1
- 229940031953 sorbitan monopalmitate Drugs 0.000 description 1
- 239000001587 sorbitan monostearate Substances 0.000 description 1
- 235000011076 sorbitan monostearate Nutrition 0.000 description 1
- 229940035048 sorbitan monostearate Drugs 0.000 description 1
- 239000001589 sorbitan tristearate Substances 0.000 description 1
- 235000011078 sorbitan tristearate Nutrition 0.000 description 1
- 229960004129 sorbitan tristearate Drugs 0.000 description 1
- 241000894007 species Species 0.000 description 1
- 210000000952 spleen Anatomy 0.000 description 1
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 1
- 210000000130 stem cell Anatomy 0.000 description 1
- 150000003431 steroids Chemical class 0.000 description 1
- 238000003860 storage Methods 0.000 description 1
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 1
- 229960002180 tetracycline Drugs 0.000 description 1
- 229930101283 tetracycline Natural products 0.000 description 1
- 235000019364 tetracycline Nutrition 0.000 description 1
- 150000003522 tetracyclines Chemical class 0.000 description 1
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 1
- RTKIYNMVFMVABJ-UHFFFAOYSA-L thimerosal Chemical compound [Na+].CC[Hg]SC1=CC=CC=C1C([O-])=O RTKIYNMVFMVABJ-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 229940033663 thimerosal Drugs 0.000 description 1
- 229960004072 thrombin Drugs 0.000 description 1
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 1
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 1
- 102000003601 transglutaminase Human genes 0.000 description 1
- 230000032258 transport Effects 0.000 description 1
- QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H tricalcium bis(phosphate) Chemical compound [Ca+2].[Ca+2].[Ca+2].[O-]P([O-])([O-])=O.[O-]P([O-])([O-])=O QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H 0.000 description 1
- 230000001960 triggered effect Effects 0.000 description 1
- LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N tris Chemical compound OCC(N)(CO)CO LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N tyrosine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000701447 unidentified baculovirus Species 0.000 description 1
- 239000004474 valine Substances 0.000 description 1
- 239000003981 vehicle Substances 0.000 description 1
- 238000012795 verification Methods 0.000 description 1
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 1
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/52—Cytokines; Lymphokines; Interferons
- C07K14/54—Interleukins [IL]
- C07K14/55—IL-2
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C40—COMBINATORIAL TECHNOLOGY
- C40B—COMBINATORIAL CHEMISTRY; LIBRARIES, e.g. CHEMICAL LIBRARIES
- C40B40/00—Libraries per se, e.g. arrays, mixtures
- C40B40/04—Libraries containing only organic compounds
- C40B40/10—Libraries containing peptides or polypeptides, or derivatives thereof
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
- A61K38/16—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- A61K38/17—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- A61K38/19—Cytokines; Lymphokines; Interferons
- A61K38/20—Interleukins [IL]
- A61K38/2013—IL-2
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
- A61K38/16—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- A61K38/17—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- A61K38/19—Cytokines; Lymphokines; Interferons
- A61K38/20—Interleukins [IL]
- A61K38/2026—IL-4
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
- A61K38/16—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- A61K38/17—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- A61K38/19—Cytokines; Lymphokines; Interferons
- A61K38/20—Interleukins [IL]
- A61K38/2086—IL-13 to IL-16
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P37/00—Drugs for immunological or allergic disorders
- A61P37/02—Immunomodulators
- A61P37/04—Immunostimulants
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/52—Cytokines; Lymphokines; Interferons
- C07K14/54—Interleukins [IL]
- C07K14/5406—IL-4
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/52—Cytokines; Lymphokines; Interferons
- C07K14/54—Interleukins [IL]
- C07K14/5437—IL-13
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/52—Cytokines; Lymphokines; Interferons
- C07K14/54—Interleukins [IL]
- C07K14/5443—IL-15
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K48/00—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
- C07K2319/30—Non-immunoglobulin-derived peptide or protein having an immunoglobulin constant or Fc region, or a fragment thereof, attached thereto
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Zoology (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Public Health (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
Abstract
agentes miméticos de interleucina divididos e seus usos. trata-se de agonistas de receptor condicionalmente ativos que, quando ativados, se ligam ao heterodímero ßyc do receptor de il-2 (il-2rßyc), heterodímero ayc do receptor de il-4 (il-4rayc) ou subunidade a do receptor de il-13 (il-13ra), assim como dos componentes dos agonistas do receptor condicionalmente ativos e métodos para usar os agonistas do receptor condicionalmente ativos.
Description
[0001] Este pedido reivindica prioridade para o Pedido Provisório de Patente nº de série U.S. 62/770152, depositado em 20 de novembro de 2018, incorporado neste documento a título de referência em sua totalidade.
[0002] O potencial considerável de interleucinas de citocinas imunes centrais, como IL-2 e IL-4, para o tratamento do câncer desencadeou vários esforços para melhorar suas propriedades terapêuticas por mutação e/ou modificação química. No entanto, como essas abordagens estão intimamente ligadas à IL-2 ou IL-4 nativa, elas não podem eliminar propriedades indesejáveis, como baixa estabilidade e ligação à subunidade do receptor de IL-2 (IL-2R ), ao heterodímero c do receptor de IL-4 (IL-4R c) ou à subunidade do receptor de IL-13 (IL-13R ).
[0003] Em um aspecto, a divulgação fornece agonistas de receptor condicionalmente ativos de ocorrência não natural, compreendendo um primeiro componente polipeptídico e um segundo componente polipeptídico, em que o primeiro componente polipeptídico e o segundo componente polipeptídico não estão presentes em uma proteína de fusão, em que, no total, o primeiro polipeptídeo componente e o segundo componente polipeptídico compreendem os domínios X1, X2, X3 e X4, em que:
[0004] (a) X1 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos de pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica ao comprimento total do peptídeo (PKKKIQ)LHAEHALYDAL(MILNI) (SEQ ID NO: 4);
[0005] (b) X2 é qualquer domínio de peptídeo helicoidal com pelo menos 8 aminoácidos de comprimento;
[0006] (c) X3 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos de pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica ao comprimento total do peptídeo (LE)DYAFNFELI(LEEIARLFESG) (SEQ ID NO: 5); e
[0007] (d) X4 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos de pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica ao comprimento total do peptídeo (EDEQEEMANAI)ITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 6).
[0008] em que:
[0009] (i) os resíduos de aminoácidos entre parênteses podem estar presentes ou ausentes;
[0010] (ii) o primeiro componente polipeptídico compreende pelo menos um de X1, X2, X3 e X4, mas não compreende cada um de X1, X2, X3 e X4; e
[0011] (iii) o segundo componente polipeptídico compreende cada um de X1, X2, X3 e X4 que não está presente no primeiro componente polipeptídico;
[0012] em que o primeiro componente polipeptídico e o segundo componente polipeptídico não são agonistas do receptor ativo individualmente, e em que o primeiro componente polipeptídico e o segundo polipeptídeo interagem para formar um agonista ativo do heterodímero c do receptor de IL-2 (IL-2R c), heterodímero c do receptor de IL-4 (IL-4R c), IL- 13 alfa ou heterodímero de IL-4Ralfa/IL13Ralfa. Numerosas modalidades do primeiro e do segundo polipeptídeos são fornecidas aqui. Em modalidades exemplificativas,
[0013] (i) o primeiro componente polipeptídico inclui um de X1, X2, X3 e X4, e o segundo componente polipeptídico inclui os três de
X1, X2, X3 e X4 que não estão presentes no primeiro componente polipeptídico; ou
[0014] (ii) o primeiro componente polipeptídico inclui dois de X1, X2, X3 e X4, e o segundo componente polipeptídico inclui os dois de X1, X2, X3 e X4 que não estão presentes no primeiro componente polipeptídico. Em outras modalidades exemplificativas,
[0015] (i) o primeiro polipeptídeo compreende X1 e o segundo polipeptídeo compreende X2, X3 e X4;
[0016] (ii) o primeiro polipeptídeo compreende X2 e o segundo polipeptídeo compreende X1, X3 e X4;
[0017] (iii) o primeiro polipeptídeo compreende X3 e o segundo polipeptídeo compreende X1, X2 e X4;
[0018] (iv) o primeiro polipeptídeo compreende X4 e o segundo polipeptídeo compreende X1, X2 e X3;
[0019] (v) o primeiro polipeptídeo compreende X1 e X2, e o segundo polipeptídeo compreende X3 e X4;
[0020] (vi) o primeiro polipeptídeo compreende X1 e X3, e o segundo polipeptídeo compreende X2 e X4;
[0021] (vii) o primeiro polipeptídeo compreende X1 e X4, e o segundo polipeptídeo compreende X2 e X3;
[0022] (viii) o primeiro polipeptídeo compreende X2 e X3, e o segundo polipeptídeo compreende X1 e X4;
[0023] (ix) o primeiro polipeptídeo compreende X2 e X4, e o segundo polipeptídeo compreende X1 e X3;
[0024] (x) o primeiro polipeptídeo compreende X3 e X4, e o segundo polipeptídeo compreende X1 e X2;
[0025] (xi) o primeiro polipeptídeo compreende X1, X2 e X3 e o segundo polipeptídeo compreende X4;
[0026] (xii) o primeiro polipeptídeo compreende X1, X2 e X4 e o segundo polipeptídeo compreende X3;
[0027] (xiii) o primeiro polipeptídeo compreende X1, X3 e X4 e o segundo polipeptídeo compreende X2; ou
[0028] (xiv) o primeiro polipeptídeo compreende X2, X3 e X4 e o segundo polipeptídeo compreende X1.
[0029] Em outras modalidades exemplificativas, o primeiro componente polipeptídico e o segundo componente polipeptídico podem estar associados de forma não covalente e/ou o primeiro componente polipeptídico e o segundo componente polipeptídico podem ser indiretamente ligados um ao outro através de um receptor. Em outra modalidade exemplificativa, o primeiro componente polipeptídico compreende ainda um primeiro domínio de direcionamento e/ou o segundo componente polipeptídico compreende ainda um segundo domínio de direcionamento; em algumas modalidades, o primeiro domínio de direcionamento, quando presente, é uma fusão de tradução com o primeiro polipeptídeo, e em que o segundo domínio de direcionamento, quando presente, é uma fusão de tradução com o segundo polipeptídeo. Em algumas modalidades, os domínios de direcionamento podem se ligar a uma proteína da superfície celular.
[0030] Em outro aspecto, a divulgação fornece polipeptídeos compreendendo 1, 2 ou 3, mas não todos os 4 domínios X1, X2, X3 e X4, em que:
[0031] (a) X1, quando presente, é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos de pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica ao comprimento total do peptídeo (PKKKIQ)LHAEHALYDAL(MILNI); (SEQ ID NO: 4);
[0032] (b) X2, quando presente, é qualquer domínio de peptídeo helicoidal;
[0033] (c) X3, quando presente, é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos de pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98%
ou 100% idêntica ao comprimento total do peptídeo (LE)DYAFNFELILEE(IARLFESG) (SEQ ID NO: 5); e
[0034] (d) X4, quando presente, é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos de pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica ao comprimento total do peptídeo (EDEQEEMANAI)ITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 6);
[0035] resíduos de aminoácidos entre parênteses podem estar presentes ou ausentes. Numerosas modalidades dos polipeptídeos são fornecidas. Em algumas modalidades exemplificativas, o polipeptídeo compreende:
[0036] (i) um polipeptídeo compreendendo X1 e excluindo X2, X3 e X4;
[0037] (ii) um polipeptídeo compreendendo X2 e excluindo X1, X3 e X4;
[0038] (iii) um polipeptídeo compreendendo X3 e excluindo X1, X2 e X4;
[0039] (iv) um polipeptídeo compreendendo X4 e excluindo X1, X2 e X3;
[0040] (v) um polipeptídeo compreendendo X1 e X2, e excluindo X3 e X4;
[0041] (vi) um polipeptídeo compreendendo X1 e X3, e excluindo X2 e X4;
[0042] (vii) um polipeptídeo compreendendo X1 e X4, e excluindo X2 e X3;
[0043] (viii) um polipeptídeo compreendendo X2 e X3, e excluindo X1 e X4;
[0044] (ix) um polipeptídeo compreendendo X2 e X4, e excluindo X1 e X3;
[0045] (x) um polipeptídeo compreendendo X3 e X4,
e excluindo X1 e X2;
[0046] (xi) um polipeptídeo compreendendo X1, X2 e X3 e excluindo X4;
[0047] (xii) um polipeptídeo compreendendo X1, X2 e X4 e excluindo X3;
[0048] (xiii) um polipeptídeo compreendendo X1, X3 e X4 e excluindo X2; e
[0049] (xiv) um polipeptídeo compreendendo X2, X3 e X4 e excluindo X1.
[0050] Em outra modalidade exemplificativa, o polipeptídeo compreende ainda um domínio de direcionamento incluindo, mas sem limitação ao domínio de direcionamento, sendo uma fusão de tradução com o polipeptídeo. Em algumas modalidades, os domínios de direcionamento podem se ligar a uma proteína da superfície celular.
[0051] Em outros aspectos, a divulgação fornece ácidos nucleicos que codificam o polipeptídeo, primeiro polipeptídeo ou segundo polipeptídeo de qualquer modalidade divulgada; vetores de expressão compreendendo os ácidos nucleicos operacionalmente ligados a um promotor; células hospedeiras compreendendo os ácidos nucleicos e/ou vetores de expressão divulgados neste documento e composição farmacêutica, compreendendo o agonista de receptor condicionalmente ativo, polipeptídeo, ácido nucleico, vetor de expressão ou célula hospedeira de qualquer modalidade divulgada e um carreador farmaceuticamente aceitável.
[0052] A divulgação também fornece métodos para o tratamento de câncer, compreendendo a administração a um sujeito em necessidade do agonista de receptor condicionalmente ativo de qualquer modalidade aqui divulgada, sob condições em que o primeiro componente polipeptídico e o segundo componente polipeptídico interagem nas células do tumor para tratar o câncer.
[0053] Em outro aspecto, a divulgação fornece o agonista de receptor condicionalmente ativo, polipeptídeo, ácido nucleico, vetor de expressão, célula hospedeira ou composição farmacêutica de qualquer modalidade divulgada para uso como um medicamento para tratar câncer e/ou para modular uma resposta imune em um sujeito.
[0054] Em um aspecto adicional, a divulgação fornece métodos para agonizar o receptor de IL-2 ou o receptor de IL-4, compreendendo a administração a um sujeito do agonista de receptor condicionalmente ativo de qualquer modalidade aqui divulgada, sob condições em que o primeiro componente polipeptídico e o segundo componente polipeptídico interagem com o receptor.
[0055] As seguintes figuras estão de acordo com modalidades exemplificativas:
[0056] Figuras 1A a 1C. Projeto computacional de agentes miméticos de citocinas de novo. Figura 1A) Os agentes miméticos não divididos projetados têm quatro hélices; três interações miméticas de IL-2 com hIL-2R c, enquanto a quarta mantém as três primeiras no lugar. Superior: na primeira geração de projetos, cada um dos elementos centrais de IL-2 (hélices H1-H4) foram idealizados de forma independente usando a montagem de fragmentos de um banco de dados de fragmentos ideais agrupados (tamanho: 4 a.a.); inferior: na segunda geração de projetos, os elementos centrais foram construídos usando equações paramétricas que recapitulam a forma de cada hélice desincorporada, permitindo mudanças no comprimento de cada hélice em +/- 8 a.a.; Figura 1B) Pares de hélices foram reconectados usando fragmentos de alça ideais (tamanho: 4 a.a. ou 7 a.a., para gen-1 e gen-2, respectivamente, ver Métodos), exemplos representativos são mostrados com elementos recém- construídos conectando cada par de hélices; Figura 1C) Os grampos de cabelo em hélice gerados na Figura 1B foram montados em todas as combinações possíveis para gerar estruturas de proteínas totalmente conectadas.
[0057] Figura 2. Caracterização de neoleucina-
2/15. Experimentos de ligação (Biolayer Interferometry) mostram que a neoleucina-2/15 pode ser incubada por 2 horas a 80 °C sem qualquer perda perceptível de ligação, enquanto a IL-2 humana e murina rapidamente perdem atividade.
[0058] Figuras 3A a 3C. Reengenharia de neoleucina-2/15 em um mimético de interleucina-4 (hIL-4) humano (neoleucina-4). Figura 3A) Neo-2/15 estruturalmente alinhada na estrutura de IL-4 em complexo com IL-4R e c (do código PDB 3BPL). Quatorze resíduos de IL-4 que entram em contato com IL-4R e que foram enxertados em Neo-2/15 são rotulados. Figura 3B) Neoleucina-4 (Neo-4), uma nova proteína com dezesseis mutações de aminoácidos em comparação com Neo-2/15. Essas mutações são rotuladas; treze desses foram derivados dos resíduos de IL-4 representados no painel a) que medeiam o contato com IL-4R , e três deles (H8M, K68I e I98F, sublinhados na figura) foram introduzidos por evolução direcionada usando mutagênese aleatória e triagem para variantes de alta afinidade de ligação. Figura 3C) Dados de interferometria de biocamada mostrando que Neo-4, como IL-4, se liga a IL-4R sozinho, não tem afinidade para c so inho, mas se liga a c quando IL-4R está presente na solução.
[0059] Figuras 4A a 4D. Conservação de sequência geral em resíduos de ligação para cada uma das quatro hélices comuns, combinando informações de três diferentes miméticos de IL-2 projetados de novo. Logotipos de sequência foram gerados usando dados combinados de experimentos de ligação (usando o IL-2R c de camundongo heterodimérico) a partir de três bibliotecas de mutagênese de SSM independentes para G2_neo2_40_1F_seq27, G2_neo2_40_1F_seq29 e G2_neo2_40_1F_seq36 (Figuras 11 a 13). Todas essas proteínas são agentes miméticos funcionais de novo de alta afinidade de IL-2 humana e de camundongo, alguns com topologias que diferem daquele de Neo-2/15, mas todos contendo as quatro hélices H1 (Figura 4A; Neo-2/15 1-22 é SEQ ID NO:04, IL-2 6-27 é SEQ ID NO:248, IL-15 1-15 é SEQ ID NO:249), H3 (Figura 4B; Neo-2/15 34-55 é SEQ ID NO:05, IL-2
82-103 é SEQ ID NO:250, IL-15 59-80 SEQ ID NO:251), H2 (Figura 4C; Neo- 2/15 58-76 é SEQ ID NO:07, IL-2 50-68 é SEQ ID NO:252, IL-15 34-52 é SEQ ID NO:253) e H4 (Figura 4D; Neo-2/15 80-100 é SEQ ID NO:06, IL-2 111-131 é SEQ ID NO:254, IL-15 93-113 é SEQ ID NO:255). Os logotipos mostram as informações combinadas para cada hélice de forma independente. Abaixo de cada logotipo, um gráfico de linha mostra a pontuação de probabilidade (médias mais altas mais conservadas) para cada aminoácido na sequência de Neo-2/15. A linha sólida horizontal destaca as posições onde o aminoácido Neo-2/15 tem uma pontuação de probabilidade 30% (ou seja, esses amino cidos contribuem de forma mais geral para ligação ao receptor, pois são globalmente enriquecidos nas populações de ligação em todos os miméticos de novo de IL-2 testados). A topologia de cada hélice na Neo-2/15 é mostrada à esquerda de cada logotipo. As sequências das hélices de Neo-2/15 e as das hélices correspondentes (estruturalmente alinhadas) em IL-2 e IL-15 humanas são mostradas abaixo dos gráficos, destacando a distinção das hélices de Neo-2/15 e interfaces de ligação.
[0060] Figuras 5A a 5D. Otimização experimental de G1_neo2_40. Figuras 5A a 5C) Mapas de calor para biblioteca de mutagênese de sítio único de G1_neo2_40 mostrando enriquecimento em posições específicas após rodadas consecutivas de seleção crescente com ao heterodímero de IL-2R c de 50 nM da Figura 5A), de 2 nM da Figura 5B) e de 0,1 nM da Figura 5C). Com base nesses dados de enriquecimento, uma biblioteca combinatória foi projetada com diversidade de 1,5 × 10 6 nucleotídeos. Figura 5D) Os resíduos de aminoácidos disponíveis na biblioteca combinatória inicial são representados indicando resíduos previstos como vantajosos (mostrados acima da sequência original) e deletérios (mostrados abaixo da sequência original; na representação da sequência original, o preto indica resíduos que são representados na biblioteca combinatória e cinza, resíduos não representados na biblioteca combinatória.
[0061] Figuras 6A a 6E. Otimização experimental de G2_neo2_40_1F_seq27. Mapas de calor para biblioteca de mutagênese de sítio único de G2_neo2_40_1F_seq27 mostrando enriquecimento em posições específicas após rodadas consecutivas de seleção crescente com o heterodímero de IL-2R c de 10 nM da Figura 6A), de 1 nM da Figura 6B), de 0,1 nM da Figura 6C) e de 0,1 nM da Figura 6D). Com base nesses dados de enriquecimento, uma biblioteca combinatória foi projetada com diversidade de 5,3 × 106 nucleotídeos. Figura 6E) Os resíduos de aminoácidos disponíveis na biblioteca combinatória inicial são representados indicando os resíduos que se prevê serem vantajosos; preto indica resíduos na sequência inicial representada na biblioteca combinatória.
[0062] Figuras 7A a 7E. Otimização experimental de G2_neo2_40_1F_seq29. Mapas de calor para biblioteca de mutagênese de sítio único de G2_neo2_40_1F_seq29 mostrando enriquecimento em posições específicas após rodadas consecutivas de seleção crescente com o heterodímero de IL-2R c de 10 nM da Figura 7A), de 1 nM da Figura 7B), de 0,1 nM da Figura 7C) e de 0,1 nM da Figura 7D). Com base nesses dados de enriquecimento, uma biblioteca combinatória foi projetada com diversidade de 2,9 × 106 nucleotídeos. Figura 7E) Os resíduos de aminoácidos disponíveis na biblioteca combinatória inicial são representados indicando os resíduos que se prevê serem vantajosos; preto indica resíduos na sequência inicial representada na biblioteca combinatória.
[0063] Figuras 8A a 8E. Otimização experimental de G2_neo2_40_1F_seq36. Mapas de calor para a biblioteca de mutagênese de sítio único de G2_neo2_40_1F_seq36 mostrando enriquecimento em posições específicas após rodadas consecutivas de seleção crescente com o heterodímero de IL-2R c de 10 nM da Figura 8A), de 1 nM da Figura 8B), de 0,1 nM da Figura 8C) e de 0,1 nM da Figura 8D). Com base nesses dados de enriquecimento, uma biblioteca combinatória foi projetada com diversidade de 2,7 × 106 nucleotídeos. Figura 8E) Os resíduos de aminoácidos disponíveis na biblioteca combinatória inicial são representados indicando os resíduos que se prevê serem vantajosos; preto indica resíduos na sequência inicial representada na biblioteca combinatória.
[0064] Figuras 9A a 9B. Experimentos de desnaturação térmica de dicroísmo circular (CD) para vários agentes miméticos projetados de novo de IL-2/IL-15, geração-1. Figura 9A) Curvas de desnaturação térmica e Figura 9B) varreduras de comprimento de onda.
[0065] Figuras 10A a 10B. Experimentos de desnaturação térmica de dicroísmo circular (CD) para múltiplos agentes miméticos projetados de novo de IL-2/IL-15, geração 1 otimizada experimentalmente. Figura 10A) Curvas de desnaturação térmica e Figura 10B) varreduras de comprimento de onda.
[0066] Figuras 11A a 11D. Fusão térmica de dicroísmo circular para projetos miméticos de IL-2/IL-15 geração-2. Figura 11A e Figura 11C) Curvas de desnaturação térmica e Figura 11B e Figura 11D) varreduras de comprimento de onda.
[0067] Figuras 12A a 12C. Caracterização de expressão, purificação e desnaturação térmica de neoleucina-2/15. Figura 12A) Eletroforese em gel SDS Tris-Tricina mostrando expressão e purificação sobre coluna de afinidade. Figura 12B) Dicroísmo circular a 222 nm durante fusão térmica de 25 °C a 95 °C, mostrando robusta estabilidade de temperatura. Figura 12C) Varreduras de comprimento de onda de dicroísmo circular a 25 °C, 95 °C e, em seguida, novamente a 25 °C, mostrando que a neoleucina-2/15 não se funde totalmente a 95 °C e se dobra totalmente após o resfriamento de volta a 25 °C.
[0068] Figuras 13A a 13B. Robustez de neoleucina- 2/15 para mutantes de cisteína de ponto único em posições de interface de não ligação. Figura 13A) Esquema mostrando posições mutantes pontuais em neolucina-2/15 que podem ser mutadas individualmente para cisteína sem interferir na expressão da proteína ou ligação a IL-2R c. As posições foram escolhidas para evitar interferência na ligação ao receptor. Figura 13B) Cinética de associação de mutantes de Neoleucina-2/15 cisteína com IL-2R c medida usando interferometria de biocamada. Todas as variantes se associam ao receptor de forma aproximadamente semelhante à Neo-2/15.
[0069] Figuras 14A a 14C. Caracterização de expressão, purificação e desnaturação térmica de neoleucina-4. Figura 14A) Eletroforese em gel SDS Tris-Tricina mostrando expressão e purificação sobre coluna de afinidade. Figura 14B) Dicroísmo circular a 222 nm durante fusão térmica de 25 °C a 95 °C, mostrando robusta estabilidade de temperatura. Figura 14C) Varreduras de comprimento de onda de dicroísmo circular a 25 °C, 95 °C e, em seguida, novamente a 25 °C, mostrando que a neoleucina-4 não se funde totalmente a 95 °C e se dobra totalmente após o resfriamento de volta a 25 °C.
[0070] Figuras 15A a 15C. As variantes de Neo-2/15 dividida podem reconstituir a atividade da Neoleucina-2/15 ligando-se ao receptor de IL-2 humana. a. Ensaio de ligação de Interferometria de Biocamada de Neo-2/15 dividida entre hélices H1 + H3-H2'-H4 (Neo2A1 e Neo2B1, respectivamente) para receptor de IL-2 humana. Os dados de ligação foram coletados em um Octet RED96 (ForteBio) e processados usando o software de análise de dados ForteBioTM versão 9.0.0.10. O receptor-alvo biotinilado de c humana foi imobilizado em biossensores revestidos com estreptavidina (SA ForteBio) a 1 g/ml em tampão de ligação (HEPES a 10 mM (pH 7,4), NaCl a 150 mM, EDTA a 3 mM, tensoativo P20 a 0,05%, leite em pó desnatado a 0,5%) por 300 segundos. Depois de carregar o receptor-alvo de c no biossensor, a medição de linha de base foi realizada mergulhando os biossensores em tampão de ligação sozinho, então, a cinética de ligação foi monitorada mergulhando os biossensores em poços contendo a proteína analito-alvo (etapa de associação) e, em seguida, mergulhando os sensores de volta na linha de base/tampão (dissociação). Para a etapa de associação, proteínas analíticas (ou seja, Neoleucina-2/15, Neo2A1, Neo2B1 e uma razão equimolar de Neo2A1 + Neo2B1) foram diluídas dos estoques concentrados em tampão de ligação para uma concentração final de 100 nM. IL-2R humana também foi adicionada em solução na concentração de saturação (250 nM). b. Ensaio de ligação de interferometria de biocamada de Neo-2/15 dividido em hélices H1-H3 + H2'-H4 (Neo2A2 e Neo2B2, respectivamente), seguindo o protocolo experimental mencionado. c. Ensaio de interferometria de biocamada de ligação de Neo-2/15 dividido em hélices H1-H3-H2' + H4 (Neo2A3 e Neo2B3, respectivamente), seguindo o protocolo experimental acima mencionado.
[0071] Figuras 16A a 16C. As variantes de Neo-2/15 dividida estimulam a sinalização celular por fosforilação STAT5 em linhas de células CTLL-2 murinas. a. As células CTLL-2 foram submetidas à privação de meios sem citocinas (RPMI, 10% FBS, + piruvato de sódio a 1 mM, + L- glutamina a 2 mM, P/S a 1%) por 2 horas antes do ensaio. As células foram plaqueadas em uma placa de 96 poços e ressuspensas em meio RPMI contendo diluições em série de amostras de proteínas: Neoleucina-2/15, Neo2A1, Neo2B1 e Neo2A1 + Neo2B1 em razões equimolares. As células foram estimuladas durante 15 minutos a 37 °C e imediatamente fixadas por adição de formaldeído a 1,5% e incubação de 10 minutos à temperatura ambiente. As células foram permeabilizadas por ressuspensão em metanol 100% frio durante 30 min a 4 °C. As células fixadas e permeabilizadas foram lavadas duas vezes com tampão FACS (PBS pH 7,2 contendo 0,1% de albumina de soro bovino) e incubadas com anti-STAT5 pY694 (BD Biosciences) conjugado com Alexa TM Fluor 647, diluído 1:50 em tampão FACS por 2 h em temperatura ambiente. As células foram então lavadas duas vezes em tampão FACS e a intensidade média de fluorescência (MFI) foi determinada em um citômetro de fluxo Guava easyCyte TM (Millipore). As curvas de dose-resposta foram ajustadas a um modelo logístico e metade da concentração efetiva máxima (valores de EC50) foi calculada usando o software de análise de dados GraphPad Prism após subtração do MFI de células não estimuladas e normalização para a intensidade máxima do sinal. b. Ensaio de ligação de interferometria de biocamada de Neo-2/15 dividida em hélices H1-H3 + H2'-H4 (Neo2A3 e Neo2B3, respectivamente), seguindo o protocolo experimental acima mencionado. c. Ensaio de ligação de interferometria de biocamada de Neo-2/15 dividida em hélices H1-H3-H2 + H4 (Neo2A2 e Neo2B2, respectivamente), seguindo o protocolo experimental mencionado.
[0072] Figuras 17A a 17B. As fusões de variantes Neo2/15 dividida para os domínios de direcionamento ligam-se ao receptor de IL-2. a. As variantes da proteína dividida Neo2A e Neo2B se fundiram aos domínios de direcionamento anti-EGFR e anti-Her2 DARPin. b. Ensaio de ligação de interferometria de biocamada de fusões de proteína Neo-2/15 dividida ao receptor de IL-2 de camundongo. Os dados de ligação foram coletados em um Octet RED96 (ForteBio) e processados usando o software de análise de dados ForteBioTM versão 9.0.0.10. O receptor-alvo biotinilado de c humana foi imobilizado em biossensores revestidos com estreptavidina (SA ForteBio) a 1 g/ml em tampão de ligação (HEPES a 10 mM (pH 7,4), NaCl a 150 mM, EDTA a 3 mM, tensoativo P20 a 0,05%, leite em pó desnatado a 0,5%) por 300 segundos. Depois de carregar o receptor-alvo no biossensor, a medição da linha de base foi realizada mergulhando os biossensores no tampão de ligação sozinho, então, a cinética de ligação foi monitorada mergulhando os biossensores em poços contendo a proteína-alvo (etapa de associação) e, em seguida, mergulhando os sensores de volta na linha de base/tampão (dissociação). Para a etapa de associação, proteínas analíticas (ou seja, aHer2Neo2A1 + Neo2B1-aEGFR, aHer2Neo2A2 + Neo2B2-aEGFR, aHer2Neo2A3 + Neo2B3-aEGFR) foram diluídas em quantidades equimolares de estoques concentrados em tampão de ligação para uma concentração final de 100 nM. A IL-2R de camundongo também foi adicionada em solução na concentração de saturação (250 nM).
[0073] Figuras 18A a 18C. Reconstituição direcionada de Neoleucina-2/15 dividida na superfície de células K562 que expressam Her2 e EGFR. a. As variantes da proteína dividida Neo2A e Neo2B se fundiram aos domínios de direcionamento anti-EGFR e anti-Her2 DARPin. b. Linhas de células tumorais K562 projetadas transduzidas para expressão de marcadores de superfície Her2+/eGFP+, EGFR+/iRFP+ ou Her2+/eGFP+ e
EGFR+/iRFP+. c. Ensaio de reconstituição funcional de variantes Neo2A direcionadas a Her2 (aHer2Neo2A1, aHer2Neo2A2 e aHer2Neo2A3) e variantes Neo2B direcionadas a EGFR (Neo2B1-aEGFR, Neo2B2-aEGFR e Neo2B3- aEGFR) para a superfície das quatro linhas celulares K562 mencionadas acima. Todas as linhas celulares foram misturadas em razão equivalente (50.000 de cada tipo de célula por poço) e transferidas para uma placa de fundo em V a
200.000 células/poço. As células foram incubadas por 30 minutos à temperatura ambiente com uma razão equimolar de variantes anti-Her2-Neo2, anti-Her2- Neo2A + anti-EGFR-Neo2B, a uma concentração final de 10 nM em tampão FACS (PBS (Gibco), BSA a 0,5%). As células foram então lavadas duas vezes (PBS (Gibco), BSA a 0,5%) e subsequentemente incubadas por 5 minutos com os seguintes componentes: 50 nM de receptor gama comum humano solúvel biotinilado, 50 nM de IL-2R humana solúvel e 15 nM de conjugado de estreptavidina-ficoeritrina (SAPE). As células foram lavadas novamente e analisadas por citometria de fluxo em um instrumento LSRII. As células Her2+ foram classificadas para fluorescência eGFP (Ex/Em=488/508), as células EGFR+ foram classificadas para fluorescência iRFP (Ex/Em=637/670), as células Her2+/EGFR+ foram identificadas pela expressão simultânea de eGFP e iRFP. A reconstituição da atividade da Neoleucina-2/15 e a ligação ao receptor da IL-2 foram identificadas por meio da análise da fluorescência de PE (Ex/Em=561/582) na superfície de cada subconjunto de células.
[0074] Figuras 19A a 19C. Ambos os fragmentos das variantes Neo-2/15 dividida são necessários para permitir a reconstituição funcional na superfície das células K562 que expressam Her2 e EGFR. a. Ensaio de reconstituição funcional de variantes Neo2A direcionadas a Her2 (aHer2-Neo2A1) e variantes Neo2B direcionadas a EGFR (Neo2B1-aEGFR) à superfície de quatro linhas celulares K562 que expressam os seguintes marcadores: Nenhum, Her2+/eGFP+, EGFR+/iRFP+, Her2+/eGFP+/EGFR+/iRFP+. Todas as linhas celulares foram misturadas em razão equivalente (50.000 de cada tipo de célula por poço) e transferidas para uma placa de fundo em V a 200.000 células/poço. As células foram incubadas por 30 minutos à temperatura ambiente com anti-Her2-Neo2A1, Neo2B1- antiEGFR ou anti-Her2-Neo2A1 + Neo2B1-antiEGFR para uma concentração final de 810 nM em tampão FACS (PBS (Gibco), BSA a 0,5%). As células foram então lavadas duas vezes (PBS (Gibco), BSA a 0,5%) e subsequentemente incubadas por 5 minutos com os seguintes componentes: 50 nM de receptor gama comum humano solúvel biotinilado, 50 nM de IL-2R humana solúvel e 15 nM de conjugado de estreptavidina-ficoeritrina (SAPE). As células foram lavadas novamente e analisadas por citometria de fluxo em um instrumento LSRII. As células Her2+ foram classificadas para fluorescência eGFP (Ex/Em=488/508), as células EGFR+ foram classificadas para fluorescência iRFP (Ex/Em=637/670), as células Her2+/EGFR+ foram identificadas pela expressão simultânea de eGFP e iRFP. A reconstituição da atividade da Neoleucina-2/15 e a ligação ao receptor da IL-2 foram identificadas por meio da análise da fluorescência de PE (Ex/Em=561/582) na superfície de cada subconjunto de células. Como observado, ambos os fragmentos são necessários para reconstituir a atividade da Neoleucina-2/15 funcional na superfície de células duplamente positivas. b. Mesmo ensaio descrito em (a) usando aHer2-Neo2A2 e Neo2B2-aEGFR. c. Mesmo ensaio descrito em (a) usando aHer2-Neo2A3 e Neo2B3-aEGFR.
[0075] Figuras 20A a 20B. Ilustração de modos alternativos de ação da plataforma Neo-2 dividida para ativação altamente específica de subtipos de células imunes. a. Direcionamento seletivo de Neo- 2 dividida para dois marcadores de superfície para estimular a expansão de um subtipo específico de células imunes (por exemplo, células CD8+, células T CAR ou células T regulatórias) b. Direcionamento simultâneo de tumor e células T pelo sistema de Neoleucina-2/15 dividida para induzir a proliferação específica de subconjunto de células imunes no ambiente de células tumorais-alvo.
[0076] Figura 21A. Fragmentos divididos de neoleucina-4 podem reconstituir a atividade total quando combinados.
Ensaio de ligação de interferometria de biocamada de Neo-4 dividida em hélices H1 (Neo4A1) + H3-H2'-H4 (Neo4B1) para receptor de IL-4 humana. Os dados de ligação foram coletados em um Octet RED96 (ForteBio) e processados usando o software de análise de dados ForteBio TM versão 9.0.0.10. O receptor- alvo biotinilado de c humana foi imobili ado em biossensores re estidos com estreptavidina (SA ForteBio) a 1 g/ml em tampão de ligação (HEPES a 10 mM (pH 7,4), NaCl a 150 mM, EDTA a 3 mM, tensoativo P20 a 0,05%, leite em pó desnatado a 0,5%) por 300 segundos. Depois de carregar o receptor-alvo no biossensor, a medição da linha de base foi realizada em tampão de ligação sozinho, então, a cinética de ligação foi monitorada mergulhando os biossensores em poços contendo a proteína-alvo na concentração indicada (etapa de associação) e, em seguida, mergulhando os sensores de volta em linha de base/tampão (dissociação). Para a etapa de associação, proteínas analíticas (ou seja, Neoleucina-4, Neo4A1, Neo4B1 e uma razão equimolar de Neo4A1+Neo4B1) foram diluídas a partir de estoques concentrados em tampão de ligação para uma concentração final de 100 nM, IL-4R humana também foi adicionada em solução à concentração de saturação (250 nM).
[0077] Conforme usado neste documento e a menos que indicado de outra forma, os termos um e uma significam um/uma , pelo menos um/uma ou um/uma ou mais . A menos que exigido de outra forma pelo contexto, os termos singulares usados neste documento devem incluir pluralidades e os termos plurais devem incluir o singular.
[0078] A menos que o contexto exija claramente o contrário, em toda a descrição e as reivindicações, as palavras compreender , que compreende e semelhantes de em ser interpretadas em um sentido inclusivo ou aberto, em oposição a um sentido exclusivo ou exaustivo; isto é, no sentido de incluir, por m sem limita o . Pala ras que usam o n mero singular ou plural também incluem o número plural e o singular, respectivamente. Além disso, as pala ras neste documento , acima e abai o e pala ras de importância semelhante, quando usadas neste pedido, devem se referir a este pedido como um todo e não a qualquer parte específica do pedido.
[0079] Tal como aqui utilizado, os resíduos de aminoácidos são abreviados da seguinte forma: alanina (Ala; A), asparagina (Asn; N), ácido aspártico (Asp; D), arginina (Arg; R), cisteína (Cys; C), glutâmico ácido (Glu; E), glutamina (Gln; Q), glicina (Gly; G), histidina (His; H), isoleucina (Ile; I), leucina (Leu; L), lisina (Lys; K), metionina (Met; M), fenilalanina (Phe; F), prolina (Pro; P), serina (Ser; S), treonina (Thr; T), triptofano (Trp; W), tirosina (Tyr; Y) e valina (Val; V).
[0080] Todas as modalidades de qualquer aspecto da divulgação podem ser usadas em combinação, a menos que o contexto indique claramente o contrário.
[0081] Em um primeiro aspecto, a divulgação fornece agonistas de receptor condicionalmente ativos de ocorrência não natural, compreendendo um primeiro componente polipeptídico e um segundo componente polipeptídico, em que o primeiro componente polipeptídico e o segundo componente polipeptídico não estão presentes em uma proteína de fusão, em que, no total, o primeiro componente polipeptídico e o segundo componente polipeptídico compreendem os domínios X1, X2, X3 e X4, em que:
[0082] (a) X1 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos de pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica ao comprimento total do peptídeo (PKKKIQ)LHAEHALYDAL(MILNI) (SEQ ID NO: 4);
[0083] (b) X2 é qualquer domínio de peptídeo helicoidal;
[0084] (c) X3 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos de pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica ao comprimento total do peptídeo (LE)DYAFNFELILEE(IARLFESG) (SEQ ID
NO: 5); e
[0085] (d) X4 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos de pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica ao comprimento total do peptídeo (EDEQEEMANAI)ITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 6).
[0086] em que:
[0087] (i) os resíduos de aminoácidos entre parênteses podem estar presentes ou ausentes;
[0088] (ii) o primeiro componente polipeptídico compreende pelo menos um de X1, X2, X3 e X4, mas não compreende cada um de X1, X2, X3 e X4; e
[0089] (iii) o segundo componente polipeptídico compreende cada um de X1, X2, X3 e X4 que não está presente no primeiro componente polipeptídico;
[0090] em que o primeiro componente polipeptídico e o segundo componente polipeptídico não são agonistas do receptor individualmente ativo, e em que o primeiro componente polipeptídico e o segundo polipeptídeo interagem para formar um agonista ativo do heterodímero c do receptor de IL-2 (IL-2R c), heterodímero c do receptor de IL-4 (IL-4R c), IL-13 alfa ou heterodímero de IL-4Ralfa/IL13Ralfa.
[0091] Conforme mostrado nos exemplos a seguir, como descrito em detalhes no pedido PCT nº de série PCT/US2019/038703, depositado em 29 de junho de 2019, e como descrito em Silva et al., Nature 565, página 186, 10 de janeiro de 2019, polipeptídeos que incluem todos os X1-X4 foram mostradas anteriormente como sendo (a) agentes miméticos de IL-2 e interleucina-15 (IL-15) que se ligam ao heterodímero c do receptor de IL-2 (IL-2R c), mas não têm sítio de ligação para IL-2R ou IL-15R , ou (b) agentes miméticos de IL-4 que se ligam ao heterodímero c do receptor de IL-4 (IL-4R c) ou subunidade do receptor de IL-13 (IL-13R ) (IL-4 natural e os agentes miméticos de IL-4 aqui descritos apresentam reação cruzada com o receptor de IL-13, formando um heterodímero de IL-4R /IL13R ). Os polipeptídeos de comprimento total mostraram ser hiperestáveis, ligam-se a IL-2R c ou IL-4R c humana e de camundongo com maior afinidade do que as citocinas naturais e induzem sinalização celular a jusante independente de IL-2R e IL-15R , ou independente de IL-13R . Os polipeptídeos de comprimento total podem ser usados, por exemplo, para tratar o câncer.
[0092] Em contrapartida, a presente divulgação demonstra surpreendentemente agonistas de receptor condicionalmente ativos compreendendo o primeiro e segundo polipeptídeos separados recitados que individualmente não são agonistas de receptor, mas que podem interagir de forma não covalente para formar um agonista ativo do heterodímero c do receptor de IL-2 (IL-2R c), heterodímero c do receptor de IL-4 (IL-4R c), IL-13 alfa ou heterodímero IL-4Ralfa/IL13Ralfa. A afinidade dessa interação não co alente entre os componentes de di is o (ou seja: o primeiro polipept deo e o segundo polipeptídeo) é tal que a interação ocorre apenas na presença do receptor apropriado, e também apenas quando ambos os componentes de divisão são colocalizados. Assim, os agonistas de receptor condicionalmente ativos da presente divulgação podem ser usados para quaisquer usos para os quais os polipeptídeos que incluem todo o X1-X4 podem ser usados. Além disso, os agonistas do receptor condicionalmente ativos permitem a reconstituição dependente da colocalização do agonista e, assim, a ativação condicional do receptor.
[0093] O termo mimético de proteína, tal como aqui utilizado, refere-se a uma proteína que imita certos aspectos da função de outra proteína. As duas proteínas normalmente têm sequências de aminoácidos diferentes e/ou estruturas diferentes. Fornecidos aqui, entre outras coisas, agentes miméticos condicionalmente ativos de IL-2 e IL-15. Os aspectos da função de IL-2 e IL-15 que esses agentes miméticos condicionalmente ativos imitam é a indução da heterodimerização de IL-2R c, le ando à fosforilação de
STAT5. Devido ao fato de que IL-2 e IL-15 sinalizam através da heterodimerização de IL-2R c, esses agentes miméticos condicionalmente ativos imitam essa função biológica de IL-2 e IL-15. Esses agentes miméticos condicionalmente ativos podem ser referidos aqui como agentes miméticos de IL-2, de IL-15 ou de IL-2 e IL-15.
[0094] Também são fornecidos agentes miméticos condicionalmente ativos de IL-4. Esses agentes miméticos condicionalmente ativos são capazes de imitar certas funções da IL-4. A função de IL-4 que esses agentes miméticos imitam é a indução de heterodimerização de IL-4R c (e/ou heterodimerização de IL-4R /IL-13R ).
[0095] Em uma modalidade, o primeiro componente polipeptídico e o segundo polipeptídeo interagem para formar um agonista do heterodímero c do receptor de IL-2 (IL-2R c). Em outra modalidade, o primeiro componente polipeptídico e o segundo polipeptídeo interagem para formar um agonista do heterodímero c do receptor de IL-4 (IL-4R c), IL-13 alfa ou heterodímero de IL-4Ralfa/IL13Ralfa.
[0096] HIL-2 nativo compreende quatro hélices conectadas por longas voltas irregulares. A hélice N-terminal (H1) interage com as subunidades beta e gama, a terceira hélice (H3) interage com a subunidade beta e a hélice C-terminal (H4) com a subunidade gama; a superfície de interação da subunidade alfa é formada pela segunda hélice irregular (H2) e duas voltas longas, uma conectando H1 a H2 e a outra conectando H3 e H4. As proteínas idealizadas foram projetadas e produzidas nas quais H1, H3 e H4 são substituídas por domínios estruturais idealizados, incluindo, mas sem limitação as hélices e fitas beta (referidas como domínios X1, X3 e X4, respectivamente) exibindo uma interface IL-2R c ou IL-4R c inspirada em H1, H3 e H4, e na qual H2 é substituída por uma hélice idealizada (referida como domínio X2) que oferece melhor empacotamento. Como mostrado nos exemplos, estudos mutacionais extensivos foram realizados, demonstrando que a sequência de aminoácidos de cada domínio de peptídeo pode ser extensivamente modificada sem perda de ligação ao receptor de IL-2 ou IL-4, e que os domínios podem ser colocados em qualquer ordem enquanto retêm a ligação condicional ao receptor de IL-2 ou IL-4. Os polipeptídeos podem compreender aminoácidos L e glicina, aminoácidos D e glicina, ou combinações dos mesmos. Conforme descrito neste documento, as proteínas idealizadas podem ser divididas em dois polipeptídeos que separadamente têm ligação desprezível ao receptor relevante, mas quando misturados juntos podem reconstituir a atividade do receptor. As proteínas são normalmente divididas em locais que não interferem na função da proteína (por exemplo, seções de ligante em modalidades com ligantes). Além disso, assim como os domínios X1, X2, X3 e X4 nas proteínas não divididas podem ser enrolados juntos em qualquer ordem, as proteínas divididas podem compreender qualquer combinação dos domínios.
[0097] Assim, X1, X2, X3 e X4 podem estar em qualquer ordem no primeiro e no segundo polipeptídeo; em modalidades não limitativas:
[0098] (i) o primeiro polipeptídeo compreende X1 e o segundo polipeptídeo compreende X2, X3 e X4;
[0099] (ii) o primeiro polipeptídeo compreende X2 e o segundo polipeptídeo compreende X1, X3 e X4;
[0100] (iii) o primeiro polipeptídeo compreende X3 e o segundo polipeptídeo compreende X1, X2 e X4;
[0101] (iv) o primeiro polipeptídeo compreende X4 e o segundo polipeptídeo compreende X1, X2 e X3;
[0102] (v) o primeiro polipeptídeo compreende X1 e X2, e o segundo polipeptídeo compreende X3 e X4;
[0103] (vi) o primeiro polipeptídeo compreende X1 e X3, e o segundo polipeptídeo compreende X2 e X4;
[0104] (vii) o primeiro polipeptídeo compreende X1 e X4, e o segundo polipeptídeo compreende X2 e X3;
[0105] (viii) o primeiro polipeptídeo compreende X2 e
X3, e o segundo polipeptídeo compreende X1 e X4;
[0106] (ix) o primeiro polipeptídeo compreende X2 e X4, e o segundo polipeptídeo compreende X1 e X3;
[0107] (x) o primeiro polipeptídeo compreende X3 e X4, e o segundo polipeptídeo compreende X1 e X2;
[0108] (xi) o primeiro polipeptídeo compreende X1, X2 e X3 e o segundo polipeptídeo compreende X4;
[0109] (xii) o primeiro polipeptídeo compreende X1, X2 e X4 e o segundo polipeptídeo compreende X3;
[0110] (xiii) o primeiro polipeptídeo compreende X1, X3 e X4 e o segundo polipeptídeo compreende X2; ou
[0111] (xiv) o primeiro polipeptídeo compreende X2, X3 e X4 e o segundo polipeptídeo compreende X1.
[0112] Quando o primeiro polipeptídeo e/ou o segundo polipeptídeo incluem mais de um domínio de X1, X2, X3 e X4, os domínios podem, em algumas modalidades, ser separados por ligantes de aminoácidos de qualquer comprimento adequado ou composição de aminoácidos. Não há requisitos para ligantes; em uma modalidade, não há ligantes presentes entre qualquer um dos domínios. Em outras modalidades, um ligante de aminoácido pode estar presente entre 0, 1 ou 2 junções entre os domínios X1, X2, X3 e X4 no primeiro polipeptídeo e/ou no segundo polipeptídeo. Os ligantes de aminoácidos podem ser de qualquer comprimento considerado apropriado para um uso pretendido. Em alguns aspectos, um ligante está no N- terminal ou C-terminal e é referido como um ligante apesar de não ligar dois domínios juntos. Em alguns aspectos, o ligante é referido como um ligante, uma vez que estava presente em uma proteína não dividida ligando dois domínios.
[0113] Em todas essas modalidades, X1, X3 e X4 podem ter qualquer comprimento adequado, o que significa que cada domínio pode conter qualquer número adequado de aminoácidos adicionais que não os peptídeos de SEQ ID NOS: 4, 5 e 6, respectivamente. Os resíduos entre parênteses são opcionais e, portanto, podem estar presentes ou ausentes. Como será entendido pelos versados na técnica, isso significa, por exemplo, que os 6 aminoácidos N-terminais e os 5 resíduos de aminoácidos C-terminais de (PKKKIQ)LHAEHALYDAL(MILNI) (SEQ ID NO: 4) são opcionais. Como será mais bem compreendido pelos versados na técnica: (i) se um aminoácido N- terminal estiver ausente, será o aminoácido mais N-terminal (isto é: o resíduo P N-terminal SEQ ID NO: 4); (ii) se dois aminoácidos N-terminais estiverem ausentes, serão os dois aminoácidos mais N-terminais (isto é: o dipeptídeo PK N-terminal em SEQ ID NO: 4); (iii) se um resíduo de aminoácido C-terminal estiver ausente, será o aminoácido mais C-terminal (isto é: o resíduo I C-terminal em SEQ ID NO: 4); (iv) se dois resíduos de aminoácidos C-terminais estiverem ausentes, serão os dois aminoácidos mais C-terminais mais aminoácidos (isto é: o dipeptídeo NI C-terminal em SEQ ID NO: 4), etc. Assim, será claro para aqueles versados na técnica que um ou mais resíduos de aminoácidos opcionais podem estar ausentes, e que os aminoácidos ausentes dos resíduos opcionais são contíguos do terminal de peptídeo relevante, como exemplificado acima.
[0114] Em uma modalidade, X1 compreende um peptídeo com identidade para o comprimento total do peptídeo ((PKKKIQ)LHAEHALYDAL(MILNI) (SEQ ID NO: 4); X3 compreende um peptídeo com identidade para o comprimento total do peptídeo (LE)DYAFNFELILEE(IARLFESG) (SEQ ID NO: 5); e X4 compreende um peptídeo com identidade para o comprimento total do peptídeo em relação ao comprimento total do peptídeo (EDEQEEMANAI)ITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 6), respectivamente, de pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100%.
[0115] Em várias modalidades, X1 é um peptídeo compreendendo uma sequência de aminoácidos com identidade para o comprimento total do peptídeo ((PKKKIQ)LHAEHALYDAL(MILNI) (SEQ ID NO: 4) ou (PKKKI)QLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 4), X3 é um peptídeo compreendendo uma sequência de aminoácidos com a identidade para o comprimento total do peptídeo (LE)DYAFNFELILEE(IARLFESG) (SEQ ID NO: 5) ou LEDYAFNFELILEEIARLFES(G) (SEQ ID NO: 5); e X4 é um peptídeo que compreende uma sequência de aminoácidos com identidade para o comprimento total do peptídeo em relação ao comprimento total do peptídeo (EDEQEEMANAI)ITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 6) ou (E)DEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 6), respectivamente, de pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100%.
[0116] Em modalidades específicas;
[0117] (i) X1 é um peptídeo que compreende uma sequência de aminoácidos com identidade para o comprimento total do peptídeo (PKKKIQ)LHAEHALYDAL(MILNI) (SEQ ID NO: 4) ou (PKKKI)QLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 4) de pelo menos 70%, X3 é um peptídeo compreendendo uma sequência de aminoácidos com a identidade para o comprimento total do peptídeo (LE)DYAFNFELILEE(IARLFESG) (SEQ ID NO: 5) ou LEDYAFNFELILEEIARLFES(G) (SEQ ID NO: 5) de pelo menos 70%; e X4 é um peptídeo compreendendo uma sequência de aminoácidos com identidade para o comprimento total do peptídeo em relação ao comprimento total do peptídeo (EDEQEEMANAI)ITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 6) ou (E)DEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 6) de pelo menos 70%;
[0118] (ii) X1 é um peptídeo que compreende uma sequência de aminoácidos com identidade para o comprimento total do peptídeo (PKKKIQ)LHAEHALYDAL(MILNI) (SEQ ID NO: 4) ou (PKKKI)QLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 4) de pelo menos 70%, X3 é um peptídeo compreendendo uma sequência de aminoácidos com a identidade para o comprimento total do peptídeo (LE)DYAFNFELILEE(IARLFESG) (SEQ ID NO: 5) ou LEDYAFNFELILEEIARLFES(G) (SEQ ID NO: 5) de pelo menos 70%; e X4 é um peptídeo compreendendo uma sequência de aminoácidos com identidade para o comprimento total do peptídeo em relação ao comprimento total do peptídeo (EDEQEEMANAI)ITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 6) ou
(E)DEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 6) de pelo menos 70%;
[0119] (iii) X1 é um peptídeo que compreende uma sequência de aminoácidos com identidade para o comprimento total do peptídeo (PKKKIQ)LHAEHALYDAL(MILNI) (SEQ ID NO: 4) ou (PKKKI)QLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 4) de pelo menos 85%, X3 é um peptídeo compreendendo uma sequência de aminoácidos com a identidade para o comprimento total do peptídeo (LE)DYAFNFELILEE(IARLFESG) (SEQ ID NO: 5) ou LEDYAFNFELILEEIARLFES(G) (SEQ ID NO: 5) de pelo menos 85%; e X4 é um peptídeo compreendendo uma sequência de aminoácidos com identidade para o comprimento total do peptídeo em relação ao comprimento total do peptídeo (EDEQEEMANAI)ITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 6) ou (E)DEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 6) de pelo menos 85%;
[0120] (iv) X1 é um peptídeo que compreende uma sequência de aminoácidos com 100% de identidade para o comprimento total do peptídeo (PKKKIQ)LHAEHALYDAL(MILNI) (SEQ ID NO: 4) ou (PKKKI)QLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 4), X3 é um peptídeo compreendendo uma sequência de aminoácidos com a identidade de 100% para o comprimento total do peptídeo (LE)DYAFNFELILEE(IARLFESG) (SEQ ID NO: 5) ou LEDYAFNFELILEEIARLFES(G) (SEQ ID NO: 5); e X4 é um peptídeo compreendendo uma sequência de aminoácidos com 100% de identidade para o comprimento total do peptídeo em relação ao comprimento total do peptídeo (EDEQEEMANAI)ITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 6) ou (E)DEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 6);
[0121] (v) X1 é um peptídeo compreendendo uma sequência de aminoácidos com identidade para o comprimento total do peptídeo (PKKKIQ)LHAEHALYDAL(MILNI) (SEQ ID NO: 4) de pelo menos 85%, X3 é um peptídeo compreendendo um aminoácido sequência com identidade para o comprimento total do peptídeo (LE)DYAFNFELILEE(IARLFESG) (SEQ ID NO: 5) de pelo menos 85%; e X4 é um peptídeo compreendendo uma sequência de aminoácidos com identidade para o comprimento total do peptídeo em relação ao comprimento total do peptídeo (EDEQEEMANAI)ITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 6) de pelo menos 85%; ou
[0122] (vi) X1 é um peptídeo compreendendo uma sequência de aminoácidos com 100% de identidade para o comprimento total do peptídeo (PKKKIQ)LHAEHALYDAL(MILNI) (SEQ ID NO: 4), X3 é um peptídeo compreendendo uma sequência de aminoácidos com 100% de identidade para o comprimento total do peptídeo (LE)DYAFNFELILEE(IARLFESG) (SEQ ID NO: 5); e X4 é um peptídeo compreendendo uma sequência de aminoácidos com 100% de identidade para o comprimento total do peptídeo em relação ao comprimento total do peptídeo (EDEQEEMANAI)ITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 6).
[0123] Nessas modalidades, diferentes versões de SEQ ID NO: 4, 5 e 6 são mostradas que têm a mesma sequência de aminoácidos primária, mas diferem na posição dos resíduos opcionais, conforme indicado pelos parênteses.
[0124] Em outras modalidades:
[0125] X1 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos de pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica ao comprimento total do peptídeo QLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 320);
[0126] X3 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos de pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica ao comprimento total do peptídeo LEDYAFNFELILEEIARLFES (SEQ ID NO: 321); e/ou
[0127] X4 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos de pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica ao comprimento total do peptídeo DEQEEMANAIITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 322).
[0128] Em outra modalidade, onde os resíduos opcionais de SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5 e SEQ ID NO: 6 estão presentes,
[0129] (a) X1 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos de pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica ao comprimento total do peptídeo PKKKIQLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 4);
[0130] (c) X3 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos de pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica ao comprimento total do peptídeo LEDYAFNFELILEEIARLFESG (SEQ ID NO: 5); e
[0131] (d) X4 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos de pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica ao comprimento total do peptídeo EDEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 6).
[0132] Em outra modalidade, onde os resíduos opcionais da SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5 e SEQ ID NO: 6 estão presentes,
[0133] (a) X1 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos de pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica ao comprimento total do peptídeo QLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 320);
[0134] (c) X3 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos de pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica ao comprimento total do peptídeo LEDYAFNFELILEEIARLFES (SEQ ID NO: 321); e
[0135] X4 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos de pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica ao comprimento total do peptídeo ou DEQEEMANAIITILQSWIF(S) (SEQ ID NO:
322).
[0136] Em várias modalidades em que os resíduos opcionais de SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5 e SEQ ID NO: 6 estão presentes, X1 é um peptídeo que compreende uma sequência de aminoácidos com identidade para o comprimento total do peptídeo PKKKIQLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 4), X3 é um peptídeo compreendendo uma sequência de aminoácidos com identidade para o comprimento total do peptídeo LEDYAFNFELILEEIARLFESG (SEQ ID NO: 5) ou LEDYAFNFELILEEIARLFES (SEQ ID NO: 321); e X4 é um peptídeo que compreende uma sequência de aminoácidos com identidade para o comprimento total do peptídeo com o comprimento total do peptídeo EDEQEEMANAIITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 6) ou DEQEEMANAIITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 322), respectivamente, de pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100%.
[0137] Em modalidades específicas;
[0138] (i) X1 é um peptídeo que compreende uma sequência de aminoácidos com identidade para o comprimento total do peptídeo PKKKIQLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 4) ou QLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 320) de pelo menos 65%; X3 é um peptídeo compreendendo uma sequência de aminoácidos com identidade para o comprimento total do peptídeo LEDYAFNFELILEEIARLFESG (SEQ ID NO: 5) ou LEDYAFNFELILEEIARLFES (SEQ ID NO: 321) de pelo menos 65%; e X4 é um peptídeo que compreende uma sequência de aminoácidos com identidade para o comprimento total do peptídeo EDEQEEMANAIITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 6) ou DEQEEMANAIITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 322), de pelo menos 65%;
[0139] (ii) X1 é um peptídeo que compreende uma sequência de aminoácidos com identidade para o comprimento total do peptídeo PKKKIQLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 4) ou QLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 320) de pelo menos 75%; X3 é um peptídeo compreendendo uma sequência de aminoácidos com identidade para o comprimento total do peptídeo LEDYAFNFELILEEIARLFESG (SEQ ID NO: 5) ou LEDYAFNFELILEEIARLFES
(SEQ ID NO: 321) de pelo menos 75%; e X4 é um peptídeo que compreende uma sequência de aminoácidos com identidade para o comprimento total do peptídeo EDEQEEMANAIITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 6) ou DEQEEMANAIITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 322), de pelo menos 75%;
[0140] (iii) X1 é um peptídeo que compreende uma sequência de aminoácidos com identidade para o comprimento total do peptídeo PKKKIQLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 4) ou QLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 320) de pelo menos 80%; X3 é um peptídeo compreendendo uma sequência de aminoácidos com identidade para o comprimento total do peptídeo LEDYAFNFELILEEIARLFESG (SEQ ID NO: 5) ou LEDYAFNFELILEEIARLFES (SEQ ID NO: 321) de pelo menos 80%; e X4 é um peptídeo que compreende uma sequência de aminoácidos com identidade para o comprimento total do peptídeo EDEQEEMANAIITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 6) ou DEQEEMANAIITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 322), de pelo menos 80%;
[0141] (iv) X1 é um peptídeo que compreende uma sequência de aminoácidos com identidade para o comprimento total do peptídeo PKKKIQLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 4) ou QLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 320) de pelo menos 90%; X3 é um peptídeo compreendendo uma sequência de aminoácidos com identidade para o comprimento total do peptídeo LEDYAFNFELILEEIARLFESG (SEQ ID NO: 5) ou LEDYAFNFELILEEIARLFES (SEQ ID NO: 321) de pelo menos 90%; e X4 é um peptídeo que compreende uma sequência de aminoácidos com identidade para o comprimento total do peptídeo EDEQEEMANAIITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 6) ou DEQEEMANAIITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 322), de pelo menos 90%;
[0142] (v) X1 é um peptídeo que compreende uma sequência de aminoácidos com identidade para o comprimento total do peptídeo PKKKIQLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 4) ou QLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 320) de 100%; X3 é um peptídeo que compreende uma sequência de aminoácidos com identidade para o comprimento total do peptídeo LEDYAFNFELILEEIARLFESG (SEQ ID NO: 5) ou LEDYAFNFELILEEIARLFES
(SEQ ID NO: 321) de 100%; e X4 é um peptídeo que compreende uma sequência de aminoácidos com identidade para o comprimento total do peptídeo EDEQEEMANAIITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 6) ou DEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 322), de 100%.
[0143] (vi) X1 é um peptídeo que compreende uma sequência de aminoácidos com identidade para o comprimento total do peptídeo PKKKIQLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 4) de pelo menos 80%; X3 é um peptídeo que compreende uma sequência de aminoácidos com identidade para o comprimento total do peptídeo LEDYAFNFELILEEIARLFESG (SEQ ID NO: 5) de pelo menos 80%; e X4 é um peptídeo que compreende uma sequência de aminoácidos com identidade para o comprimento total do peptídeo EDEQEEMANAIITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 6) de pelo menos 80%;
[0144] (vii) X1 é um peptídeo que compreende uma sequência de aminoácidos com identidade para o comprimento total do peptídeo PKKKIQLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 4) de pelo menos 90%; X3 é um peptídeo que compreende uma sequência de aminoácidos com identidade para o comprimento total do peptídeo LEDYAFNFELILEEIARLFESG (SEQ ID NO: 5) de pelo menos 90%; e X4 é um peptídeo que compreende uma sequência de aminoácidos com identidade para o comprimento total do peptídeo EDEQEEMANAIITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 6), de pelo menos 90%;
[0145] (viii) X1 é um peptídeo que compreende uma sequência de aminoácidos com identidade para o comprimento total do peptídeo PKKKIQLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 4) de 100%; X3 é um peptídeo que compreende uma sequência de aminoácidos com identidade para o comprimento total do peptídeo LEDYAFNFELILEEIARLFESG (SEQ ID NO: 5) de 100%; e X4 é um peptídeo que compreende uma sequência de aminoácidos com identidade para o comprimento total do peptídeo EDEQEEMANAIITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 6) de 100%;
[0146] (ix) X1 é um peptídeo que compreende uma sequência de aminoácidos com identidade para o comprimento total do peptídeo
QLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 320) de pelo menos 80%; X3 é um peptídeo que compreende uma sequência de aminoácidos com identidade para o comprimento total do peptídeo LEDYAFNFELILEEIARLFES (SEQ ID NO: 321) de pelo menos 80%; e X4 é um peptídeo que compreende uma sequência de aminoácidos com identidade para o comprimento total do peptídeo DEQEEMANAIITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 322), de pelo menos 80%;
[0147] (x) X1 é um peptídeo que compreende uma sequência de aminoácidos com identidade para o comprimento total do peptídeo QLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 320) de pelo menos 90%; X3 é um peptídeo que compreende uma sequência de aminoácidos com identidade para o comprimento total do peptídeo LEDYAFNFELILEEIARLFES (SEQ ID NO: 321) de pelo menos 90%; e X4 é um peptídeo que compreende uma sequência de aminoácidos com identidade para o comprimento total do peptídeo DEQEEMANAIITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 322), de pelo menos 90%; ou
[0148] (xi) X1 é um peptídeo que compreende uma sequência de aminoácidos com identidade para o comprimento total do peptídeo QLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 320) de 100%; X3 é um peptídeo que compreende uma sequência de aminoácidos com identidade para o comprimento total do peptídeo LEDYAFNFELILEEIARLFES (SEQ ID NO: 321) de 100%; e X4 é um peptídeo que compreende uma sequência de aminoácidos com identidade para o comprimento total do peptídeo DEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 322), de 100%.
[0149] Em uma modalidade, os agentes miméticos de IL-2/15 agonistas de receptor condicionalmente ativos são agonistas de receptor condicionalmente ativos e
[0150] (i) X1 inclui 1, 2, 3, 4 ou todos os 5 dos seguintes: L no resíduo 7, H no resíduo 8, H no resíduo 11, Y no resíduo 14; M no resíduo 18, em que a numeração é relativa à SEQ ID NO: 4 com base na presença de resíduos opcionais; e/ou
[0151] (ii) X3 inclui 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 ou todos os 8 dos seguintes: D no resíduo 3, Y no resíduo 4, F no resíduo 6, N no resíduo 7, L no resíduo 10, I no resíduo 11, E no resíduo 13 ou E no resíduo 14, em que a numeração é relativa à SEQ ID NO: 5 com base na presença de resíduos opcionais. Em uma outra modalidade, (iii) X4 inclui I no resíduo 19, em que a numeração é relativa à SEQ ID NO: 6 com base na presença de resíduos opcionais.
[0152] Nas SEQ ID NOs: 4, 5 e 6, vários resíduos de aminoácidos estão marcados em negrito. Em (PKKKIQ)LHAEHALYDAL(MILNI) (SEQ ID NO: 4): os resíduos de aminoácidos E10, L13, Y14, D15 e L17 (numerados com base na presença de resíduos opcionais) são marcados em negrito; em (LE)DYAFNFELILEE(IARLFESG) (SEQ ID NO: 5): resíduos de aminoácidos L1, Y4, N7, L10, I11 e I15 (numerados com base na presença de resíduos opcionais) são marcados em negrito; e em (EDEQEEMANAI)ITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 6) os resíduos de aminoácidos I12, Q16 e W18 (numerados com base na presença de resíduos opcionais) estão marcados em negrito.
[0153] Em uma modalidade:
[0154] (a) substituições de aminoácidos (AA) em X1 em relação à sequência AA de SEQ ID NO: 4 ocorrem em não mais de 3 resíduos AA marcados em fonte em negrito, ou ocorrem em não mais de 2 resíduos AA marcados em fonte em negrito, ou ocorrem em não mais de 1 resíduo AA marcado em negrito, ou não ocorrem em resíduos AA marcados em negrito;
[0155] (b) substituições de AA em X3 em relação à sequência AA de SEQ ID NO: 5 ocorrem em não mais de 3 resíduos AA marcados em fonte em negrito, ou ocorrem em não mais de 2 resíduos AA marcados em fonte em negrito, ou ocorrem em não mais de 1 AA resíduo marcado em fonte em negrito, ou não ocorrem em resíduos AA marcados em fonte em negrito; e/ou
[0156] (c) substituições de AA em X4 em relação à sequência AA de SEQ ID NO: 6 ocorrem em não mais do que 2 resíduos AA marcados em fonte em negrito, ou ocorrem em não mais do que 1 resíduo AA marcado em negrito, ou não ocorrem nos resíduos AA marcados em negrito.
[0157] Em outra modalidade, as substituições de AA em X2 em relação à sequência AA de SEQ ID NO: 7 não ocorrem nos resíduos AA marcados em negrito.
[0158] Em outra modalidade de agentes miméticos de IL-2 agonistas de receptor condicionalmente ativos, as substituições de aminoácidos em relação aos domínios de peptídeo de referência (isto é: SEQ ID NO: 4, 5 ou 6) não ocorrem em resíduos AA marcados em fonte em negrito. Conforme mostrado abaixo, as SEQ ID NOs: 4, 5 e 6 incluem, cada uma, resíduos em negrito que estão envolvidos na ligação ao receptor:
[0159] (PKKKIQ)LHAEHALYDAL(MILNI) (SEQ ID NO: 4): os resíduos de aminoácidos E10, L13, Y14, D15 e L17 (numerados com base na presença de resíduos opcionais) são invariantes nessa modalidade;
[0160] (LE)DYAFNFELILEE(IARLFESG) (SEQ ID NO: 5) resíduos de aminoácidos L1, Y4, N7, L10, I11 e I15 (numerados com base na presença de resíduos opcionais) são invariantes nessa modalidade; e
[0161] (EDEQEEMANAI)ITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 6) resíduos de aminoácidos I12, Q16 e W18 (numerados com base na presença de resíduos opcionais) são invariantes nessa modalidade.
[0162] Em uma outra modalidade, o resíduo de aminoácido W13 é invariante quando X2 compreende um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos de pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica ao comprimento total do peptídeo KDEAEKAKRMKEWMKRIK(T) (SEQ ID NO: 7), em que os resíduos entre parênteses são opcionais. Em uma modalidade, o resíduo opcional está presente; em outra modalidade, o resíduo opcional está ausente.
[0163] Em outra modalidade de agentes miméticos de
IL-2 agonistas de receptor condicionalmente ativos, substituições de aminoácidos em relação aos domínios de peptídeo de referência (isto é: SEQ ID NO: 4, 5 ou 6) não ocorrem em mais de 3, 2 ou 1 resíduos AA marcado em fonte em negrito.
[0164] Em outra modalidade, os agonistas do receptor condicionalmente ativos são agentes miméticos de IL-4/IL-13 de agonistas do receptor condicionalmente ativos, e
[0165] X1 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos de pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica ao longo do seu comprimento em relação ao peptídeo PKKKIQIMAEEALKDALSILNI (SEQ ID NO: 8);
[0166] X3 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos de pelo menos 37% 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica ao longo de seu comprimento, o peptídeo LERFAKRFERNLWGIARLFESG (SEQ ID NO: 9); e
[0167] X4 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos de pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica ao longo de seu comprimento ao peptídeo EDEQEEMANAIITILQSWFFS (SEQ ID NO: 10).
[0168] em que
[0169] (i) X1 inclui I no resíduo 7, T ou M no resíduo 8, E no resíduo 11, K no resíduo 14 e S no resíduo 18; e
[0170] (ii) X3 inclui R no resíduo 3, F no resíduo 4, K no resíduo 6, R no resíduo 7, R no resíduo 10, N no resíduo 11, W no resíduo 13 e G no resíduo 14.
[0171] Em outra modalidade, (iii) X4 inclui F no resíduo 19.
[0172] Em várias modalidades, X1 é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos tendo identidade para o comprimento total de PKKKIQIMAEEALKDALSILNI (SEQ ID NO: 8), X3 é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos tendo identidade para o comprimento total de LERFAKRFERNLWGIARLFESG (SEQ ID NO: 9), e X4 é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos tendo identidade para o comprimento total de EDEQEEMANAIITILQSWFFS (SEQ ID NO: 10) que são cada um pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100%. Em modalidades específicas,
[0173] (i) X1 é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos 65% idêntica ao longo do seu comprimento e relação ao peptídeo PKKKIQIMAEEALKDALSILNI (SEQ ID NO: 8); X3 é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos 65% idêntica ao longo de seu comprimento em relação ao peptídeo LERFAKRFERNLWGIARLFESG (SEQ ID NO: 9); e X4 é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos 65% idêntica ao longo do seu comprimento em relação ao peptídeo EDEQEEMANAIITILQSWFFS (SEQ ID NO: 10);
[0174] (ii) X1 é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos 75% idêntica ao longo do seu comprimento em relação ao peptídeo PKKKIQIMAEEALKDALSILNI (SEQ ID NO: 8); X3 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos pelo menos 75% idêntica ao longo de seu comprimento em relação ao peptídeo LERFAKRFERNLWGIARLFESG (SEQ ID NO: 9); e X4 é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos 75% idêntica ao longo do seu comprimento em relação ao peptídeo EDEQEEMANAIITILQSWFFS (SEQ ID NO: 10);
[0175] (iii) X1 é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos 80% idêntica ao longo do seu comprimento em relação ao peptídeo PKKKIQIMAEEALKDALSILNI (SEQ ID NO: 8); X3 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos pelo menos 80% idêntica ao longo de seu comprimento em relação ao peptídeo LERFAKRFERNLWGIARLFESG (SEQ ID NO: 9); e X4 é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos 80% idêntica ao longo do seu comprimento em relação ao peptídeo EDEQEEMANAIITILQSWFFS (SEQ ID NO: 10); ou
[0176] (iv) X1 é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos 90% idêntica ao longo do seu comprimento em relação ao peptídeo PKKKIQIMAEEALKDALSILNI (SEQ ID NO: 8); X3 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos pelo menos 90% idêntica ao longo de seu comprimento em relação ao peptídeo LERFAKRFERNLWGIARLFESG (SEQ ID NO: 9); e X4 é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos 90% idêntica ao longo do seu comprimento em relação ao peptídeo EDEQEEMANAIITILQSWFFS (SEQ ID NO: 10);
[0177] em cada caso, em que
[0178] (A) X1 inclui I no resíduo 7, T ou M no resíduo 8, E no resíduo 11, K no resíduo 14 e S no resíduo 18; e (B) X3 inclui R no resíduo 3, F no resíduo 4, K no resíduo 6, R no resíduo 7, R no resíduo 10, N no resíduo 11, W no resíduo 13 e G no resíduo 14.
[0179] Em outra modalidade de agentes miméticos de IL-4/IL-13 de agonistas de receptor condicionalmente ativos, substituições de aminoácidos em relação aos domínios de peptídeo de referência (isto é: SEQ ID NO: 8, 9 ou 10) não ocorrem em resíduos AA marcados em fonte em negrito. Conforme mostrado abaixo, as SEQ ID NOs: 8, 9 e 10 incluem, cada uma, resíduos em fonte em negrito:
[0180] PKKKIQIMAEEALKDALSILNI (SEQ ID NO: 8): resíduos de aminoácidos E10, E11, A12, L13, K14, D15, A16 e L17 são invariantes nessa modalidade
[0181] LERFAKRFERNLWGIARLFESG (SEQ ID
NO: 9): resíduos de aminoácidos F4, A5, K6, R7, F8, E9, R10 e N11 são invariantes nessa modalidade
[0182] EDEQEEMANAIITILQSWFFS (SEQ ID NO: 10): resíduos de aminoácidos I11, I12, T13, I14, L15, Q16, S17, W18, F19 e F20 são invariantes nessa modalidade
[0183] Em uma outra modalidade, o resíduo de aminoácido W13 é invariante quando X2 é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos de pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica ao comprimento total do peptídeo KDEAEKAKRMKEWMKRIK(T) (SEQ ID NO: 7).
[0184] Em outra modalidade, as substituições de aminoácidos em relação aos domínios de peptídeo de referência são substituições de aminoácidos conservativas. Tal como aqui utilizado, substituição conservativa de aminoácidos significa que um determinado aminoácido pode ser substituído por um resíduo com características físico- químicas semelhantes, por exemplo, substituindo um resíduo alifático por outro (tal como Ile, Val, Leu ou Ala um pelo outro), ou substituição de um resíduo polar por outro (tal como entre Lys e Arg; Glu e Asp; ou Gln e Asn). Outras substituições conservativas, por exemplo, substituições de regiões inteiras com características de hidrofobicidade semelhantes, são conhecidas. Os polipeptídeos que compreendem substituições conservativas de aminoácidos podem ser testados em qualquer um dos ensaios aqui descritos para confirmar que uma atividade desejada, por exemplo, atividade de ligação ao antígeno e especificidade de um polipeptídeo nativo ou de referência é retida. Os aminoácidos podem ser agrupados de acordo com as semelhanças nas propriedades das suas cadeias laterais (em AL Lehninger, em Biochemistry, segunda edição, páginas 73 a 75, Worth Publishers, Nova York (1975)): (1) não polar: Ala (A), Val (V), Leu (L), Ile (I), Pro (P), Phe (F), Trp (W), Met (M); (2) polar sem carga: Gly (G), Ser (S), Thr (T), Cys (C), Tyr (Y), Asn (N), Gln (Q); (3) ácidos: Asp (D), Glu (E); (4) básico: Lys (K), Arg (R), His (H). Alternativamente, os resíduos de ocorrência natural podem ser divididos em grupos com base nas propriedades comuns da cadeia lateral: (1) hidrofóbico: Norleucina, Met, Ala, Val, Leu, Ile; (2) hidrofílico neutro: Cys, Ser, Thr, Asn, Gln; (3) ácidos: Asp, Glu; (4) básico: His, Lys, Arg; (5) resíduos que influenciam a orientação da cadeia: Gly, Pro; (6) aromático: Trp, Tyr, Phe. As substituições não conservadoras implicarão na troca de um membro de uma dessas classes por outra classe. Substituições conservativas particulares incluem, por exemplo; Ala em Gly ou em Ser; Arg em Lys; Asn em Gln ou em H é; Asp em Glu; Cys em Ser; Gln em Asn; Glu em Asp; Gly em Ala ou Pro; His em Asn ou em Gln; Ile em Leu ou em Val; Leu em Ile ou em Val; Lys em Arg, em Gln ou em Glu; Met em Leu, em Tyr ou em Ile; Phe em Met, em Leu ou em Tyr; Ser em Thr; Thr em Ser; Trp em Tyr; Tyr em Trp; e/ou Phe em Val, em Ile ou em Leu.
[0185] Em uma modalidade, os resíduos de aminoácidos em X1 em relação à SEQ ID NO: 4 são selecionados a partir do grupo que consiste em:
[0186] Posição 01: A F I L M P Q R S W
[0187] Posição 02: A D E G V K
[0188] Posição 03: D E F W K
[0189] Posição 04: D E K N P R W
[0190] Posição 05: D E H I K L M S
[0191] Posição 06: A D E G L P S W Q
[0192] Posição 07: D E L Q Y I
[0193] Posição 08: A F H W Y M T
[0194] Posição 09: C F P A
[0195] Posição 10: C D E F K P
[0196] Posição 11: D F H E
[0197] Posição 12: A D E P S T V
[0198] Posição 13: H I L M P R V W
[0199] Posição 14: F R W Y K
[0200] Posição 15: D E N Y
[0201] Posição 16: A C L M S
[0202] Posição 17: F I L M P R
[0203] Posição 18: G M Q Y S
[0204] Posição 19: I L M P Q V
[0205] Posição 20: A K L M Q R S
[0206] Posição 21: G K N P R S W
[0207] Posição 22: D E I K M N W Y
[0208] Em uma modalidade, os agonistas do receptor condicionalmente ativos são agentes miméticos de IL-4 condicionalmente ativos e a posição 7 é I, a posição 8 é M ou T, a posição 11 é E, a posição 14 é K e a posição 18 é S.
[0209] Em outra modalidade, os agonistas do receptor condicionalmente ativos são agentes miméticos de IL-2 condicionalmente ativos e 1, 2, 3, 4 ou 5 dos seguintes não são verdadeiros: a posição 7 é I, a posição 8 é M ou T, a posição 11 é E, a posição 14 é K e a posição 18 é S.
[0210] Em outra modalidade, os resíduos de aminoácidos em X3 em relação à SEQ ID NO: 5 são selecionados a partir do grupo que consiste em:
[0211] Posição 01: A L
[0212] Posição 02: D E G K M T
[0213] Posição 03: D E N Y R
[0214] Posição 04: C D G T Y F
[0215] Posição 05: A F H S V W Y
[0216] Posição 06: A F I M T V Y K
[0217] Posição 07: D K N S T R
[0218] Posição 08: A C G L M S V F
[0219] Posição 09: C H K L R S T V E
[0220] Posição 10: F I L M Y R
[0221] Posição 11: I L N T Y
[0222] Posição 12: F K L M S V
[0223] Posição 13: A D F G I N P Q S T E W
[0224] Posição 14: A E F G H S V
[0225] Posição 15: C I L M V W
[0226] Posição 16: A D G S T V
[0227] Posição 17: H K L N R
[0228] Posição 18: C D G I L Q R T W
[0229] Posição 19: D F M N W
[0230] Posição 20: A C E F G M S Y
[0231] Posição 21: D E G H L M R S T V W
[0232] Posição 22: A D G K N S Y
[0233] Em outra modalidade, os agonistas do receptor condicionalmente ativos são agentes miméticos de IL-4/IL-13 condicionalmente ativos e a posição 3 é R, a posição 4 é F, a posição 6 é K, a posição 7 é R, a posição 10 é R, a posição 11 é N, a posição 13 é W e a posição 14 é G.
[0234] Em outra modalidade, os agonistas do receptor condicionalmente ativos são agentes miméticos de IL-2 condicionalmente ativos e 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 ou todos os 8 dos seguintes não são verdadeiros: a posição 3 é R, a posição 4 é F, a posição 6 é K, a posição 7 é R, a posição 10 é R, a posição 11 é N, a posição 13 é W e a posição 14 é G.
[0235] Em qualquer uma de tais modalidades, os agonistas de receptor condicionalmente ativos permitem ainda uma cisteína na posição 17 em relação à SEQ ID NO: 5, além dos resíduos de aminoácidos de H, K, L, N e R, ou na posição 20 em relação à SEQ ID NO: 5 além dos resíduos de aminoácidos de A, C, E, F, G, M, S e Y. Consequentemente, nesta modalidade, resíduos de aminoácidos em X3 em relação à SEQ ID NO: 5 podem ser selecionados a partir do grupo que consiste em:
[0236] Posição 01: A L
[0237] Posição 02: D E G K M T
[0238] Posição 03: D E N Y R
[0239] Posição 04: C D G T Y F
[0240] Posição 05: A F H S V W Y
[0241] Posição 06: A F I M T V Y K
[0242] Posição 07: D K N S T R
[0243] Posição 08: A C G L M S V F
[0244] Posição 09: C H K L R S T V E
[0245] Posição 10: F I L M Y R
[0246] Posição 11: I L N T Y
[0247] Posição 12: F K L M S V
[0248] Posição 13: A D F G I N P Q S T E W
[0249] Posição 14: A E F G H S V
[0250] Posição 15: C I L M V W
[0251] Posição 16: A D G S T V
[0252] Posição 17: H K L N R C
[0253] Posição 18: C D G I L Q R T W
[0254] Posição 19: D F M N W
[0255] Posição 20: A C E F G M S Y C
[0256] Posição 21: D E G H L M R S T V W
[0257] Posição 22: A D G K N S Y
[0258] Em outra modalidade, os resíduos de aminoácidos em X4 em relação à SEQ ID NO: 6 são selecionados a partir do grupo que consiste em:
[0259] Posição 01: D E G K V
[0260] Posição 02: D I M S
[0261] Posição 03: E G H K
[0262] Posição 04: E G I K Q R S
[0263] Posição 05: A D E G H S V
[0264] Posição 06: C D E G I M Q R T V
[0265] Posição 07: C E L M P R T
[0266] Posição 08: A F L M W
[0267] Posição 09: A G L N Q R T
[0268] Posição 10: A C D E F H I W
[0269] Posição 11: I M N S V W
[0270] Posição 12: I K L S V
[0271] Posição 13: C L M R S T
[0272] Posição 14: I L P T Y
[0273] Posição 15: F G I L M N V
[0274] Posição 16: H K Q R
[0275] Posição 17: C F K S W Y
[0276] Posição 18: K Q T W
[0277] Posição 19: C G N I
[0278] Posição 20: C F G L Y
[0279] Posição 21: A F G H S Y
[0280] Em outra modalidade, os agonistas do receptor condicionalmente ativos são agentes miméticos de IL-4/IL-13 condicionalmente ativos e a posição 19 é I. Em outra modalidade, os agonistas do receptor condicionalmente ativos são agentes miméticos de IL-2 condicionalmente ativos e a posição 19 não é I.
[0281] Em qualquer uma dessas modalidades, os agonistas de receptor condicionalmente ativos permitem ainda uma cisteína na posição 3 em relação à SEQ ID NO: 6, além dos resíduos de aminoácidos de E, G, H e K. Consequentemente, nessa modalidade, os resíduos de aminoácidos em X4 em relação à SEQ ID NO: 6 podem ser selecionados a partir do grupo que consiste em:
[0282] Posição 01: D E G K V
[0283] Posição 02: D I M S
[0284] Posição 03: E G H K C
[0285] Posição 04: E G I K Q R S
[0286] Posição 05: A D E G H S V
[0287] Posição 06: C D E G I M Q R T V
[0288] Posição 07: C E L M P R T
[0289] Posição 08: A F L M W
[0290] Posição 09: A G L N Q R T
[0291] Posição 10: A C D E F H I W
[0292] Posição 11: I M N S V W
[0293] Posição 12: I K L S V
[0294] Posição 13: C L M R S T
[0295] Posição 14: I L P T Y
[0296] Posição 15: F G I L M N V
[0297] Posição 16: H K Q R
[0298] Posição 17: C F K S W Y
[0299] Posição 18: K Q T W
[0300] Posição 19: C G N I
[0301] Posição 20: C F G L Y
[0302] Posição 21: A F G H S Y
[0303] Conforme observado neste documento, o domínio X2 é um domínio estrutural e, portanto, qualquer sequência de aminoácidos que conecta (isto é: no mesmo polipeptídeo ou mediante interação não covalente do primeiro e segundo polipeptídeos) os outros domínios relevantes e permite que eles dobrem pode ser usada. O comprimento necessário dependerá das especificações do primeiro polipeptídeo e do segundo polipeptídeo sendo usado e pode ser de 8 aminoácidos ou mais. Em uma modalidade exemplificativa e não limitativa, X2 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos de pelo menos 20%, 27%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% ou 100% idêntica ao longo de seu comprimento para KDEAEKAKRMKEWMKRIK(T) (SEQ ID NO: 7) ou KDEAEKAKRMKEWMKRIKT (SEQ ID NO: 7). Em uma modalidade, as alterações de aminoácidos em relação à sequência de aminoácidos de SEQ ID NO: 7 são substituições de aminoácidos conservativas. Em outra modalidade, o resíduo de aminoácido W13 é invariante. Em uma outra modalidade, os resíduos de aminoácidos em X2 em relação à SEQ ID NO: 7 são selecionados a partir do grupo que consiste em:
[0304] Posição 01: A H L M R S V K
[0305] Posição 02: A D E Q R S T V W Y
[0306] Posição 03: C E G K L N Q R W
[0307] Posição 04: A F G N S T V Y
[0308] Posição 05: A E G I M R V
[0309] Posição 06: C E K L N R V
[0310] Posição 07: A C E I L S T V W
[0311] Posição 08: H K L M S T W Y
[0312] Posição 09: A I L M Q S R
[0313] Posição 10: A I M S W Y
[0314] Posição 11: C I K L S V
[0315] Posição 12: C E K L P Q R T
[0316] Posição 13: A D H N W
[0317] Posição 14: A C G I L S T V M
[0318] Posição 15: A E G I K L M R V
[0319] Posição 16: G H L R S T V
[0320] Posição 17: A I L V
[0321] Posição 18: A C D E G H I K M S
[0322] Posição 19: D E G L N V T
[0323] Em outra modalidade, os polipeptídeos são agentes miméticos de IL-4/IL-13 e a posição 11 é I. Em outra modalidade, os polipeptídeos são agentes miméticos de IL-2 e a posição 11 não é I.
[0324] Em qualquer uma dessas modalidades, o polipeptídeo permite ainda uma cisteína nas posições 5 ou 16 em relação à SEQ ID NO: 7.
[0325] Alternativamente, em qualquer uma dessas modalidades, o polipeptídeo permite ainda uma cisteína nas posições 1, 2, 5, 9 ou 16 em relação à SEQ ID NO: 7´.
[0326] Consequentemente, os resíduos de aminoácidos em X2 em relação à SEQ ID NO: 7 podem ser selecionados a partir do grupo que consiste em:
[0327] Posição 01: A H L M R S V K C
[0328] Posição 02: A D E Q R S T V W Y C
[0329] Posição 03: C E G K L N Q R W
[0330] Posição 04: A F G N S T V Y
[0331] Posição 05: A E G I M R V C
[0332] Posição 06: C E K L N R V
[0333] Posição 07: A C E I L S T V W
[0334] Posição 08: H K L M S T W Y
[0335] Posição 09: A I L M Q S R C
[0336] Posição 10: A I M S W Y
[0337] Posição 11: C I K L S V
[0338] Posição 12: C E K L P Q R T
[0339] Posição 13: A D H N W
[0340] Posição 14: A C G I L S T V M
[0341] Posição 15: A E G I K L M R V
[0342] Posição 16: G H L R S T V C
[0343] Posição 17: A I L V
[0344] Posição 18: A C D E G H I K M S
[0345] Posição 19: D E G L N V T
[0346] Em várias modalidades específicas:
[0347] (i) X2 é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos 70% idêntica ao longo do seu comprimento em relação a KDEAEKAKRMKEWMKRIK(T) (SEQ ID NO: 7);
[0348] (ii) X2 é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos 80% idêntica ao longo do seu comprimento em relação a KDEAEKAKRMKEWMKRIK(T) (SEQ ID NO: 7);
[0349] (iii) X2 é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos 90% idêntica ao longo do seu comprimento em relação a KDEAEKAKRMKEWMKRIK(T) (SEQ ID NO: 7);
[0350] (iv) X2 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos tendo identidade para o comprimento total do peptídeo KDEAEKAKRMKEWMKRIK(T) (SEQ ID NO: 7) de pelo menos 65%; X1 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos tendo identidade para o comprimento total do peptídeo PKKKIQLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 4) ou QLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 320) de pelo menos 65%; X3 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos tendo identidade para o comprimento total do peptídeo LEDYAFNFELILEEIARLFESG (SEQ ID NO: 5) ou LEDYAFNFELILEEIARLFES (SEQ ID NO: 321) de pelo menos 65%; e X4 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos tendo identidade para o comprimento total do peptídeo EDEQEEMANAIITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 6) ou DEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 322) de pelo menos 65%;
[0351] (v) X2 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos tendo identidade para o comprimento total do peptídeo KDEAEKAKRMKEWMKRIK(T) (SEQ ID NO: 7) de pelo menos 75%; X1 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos tendo identidade para o comprimento total do peptídeo PKKKIQLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 4) ou QLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 320) de pelo menos 75%; X3 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos tendo identidade para o comprimento total do peptídeo LEDYAFNFELILEEIARLFESG (SEQ ID NO: 5) ou LEDYAFNFELILEEIARLFES (SEQ ID NO: 321) de pelo menos 75%; e X4 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos tendo identidade para o comprimento total do peptídeo EDEQEEMNAIITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 6) ou DEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 322) de pelo menos 75%;
[0352] (vi) X2 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos tendo identidade para o comprimento total do peptídeo KDEAEKAKRMKEWMKRIK(T) (SEQ ID NO: 7) de pelo menos 80%; X1 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos tendo identidade para o comprimento total do peptídeo PKKKIQLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 4) ou QLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 320) de pelo menos 80%; X3 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos tendo identidade para o comprimento total do peptídeo LEDYAFNFELILEEIARLFESG (SEQ ID NO: 5) ou LEDYAFNFELILEEIARLFES (SEQ ID NO: 321) de pelo menos 80%; e X4 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos tendo identidade para o comprimento total do peptídeo EDEQEEMANAIITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 6) ou DEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 322) de pelo menos 80%;
[0353] (vii) X2 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos tendo identidade para o comprimento total do peptídeo KDEAEKAKRMKEWMKRIK(T) (SEQ ID NO: 7) de pelo menos 90%; X1 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos tendo identidade para o comprimento total do peptídeo PKKKIQLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 4) ou QLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 320) de pelo menos 90%; X3 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos tendo identidade para o comprimento total do peptídeo LEDYAFNFELILEEIARLFESG (SEQ ID NO: 5) ou LEDYAFNFELILEEIARLFES (SEQ ID NO: 321) de pelo menos 90%; e X4 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos tendo identidade para o comprimento total do peptídeo EDEQEEMANAIITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 6) ou DEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 322) de pelo menos 90%; ou
[0354] (viii) X2 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos tendo 100% de identidade para o comprimento total do peptídeo KDEAEKAKRMKEWMKRIK(T) (SEQ ID NO: 7); X1 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos tendo 100% de identidade para o comprimento total do peptídeo PKKKIQLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 4)
ou QLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 320); X3 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos tendo 100% de identidade para o comprimento total do peptídeo LEDYAFNFELILEEIARLFESG (SEQ ID NO: 5) ou LEDYAFNFELILEEIARLFES (SEQ ID NO: 321); e X4 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos tendo 100% de identidade para o comprimento total do peptídeo EDEQEEMANAIITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 6) ou DEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 322).
[0355] Em modalidades exemplificativas de (i) a (viii) acima, os resíduos de aminoácidos opcionais listados na SEQ ID NO: 7 estão presentes. Em modalidades exemplificativas de (i) a (viii) acima, os peptídeos para X1, X3 e X4 são mostrados nas SEQ ID NOs: 4, 5 e 6. Em modalidades exemplificativas de (i) a (viii) acima, os peptídeos para X1, X3 e X4 são mostrados nas SEQ ID NOs: 320, 321 e 322.
[0356] Em várias modalidades:
[0357] (i) o primeiro componente polipeptídico inclui um de X1, X2, X3 e X4, e o segundo componente polipeptídico inclui os três de X1, X2, X3 e X4 que não estão presentes no primeiro componente polipeptídico; ou
[0358] (ii) o primeiro componente polipeptídico inclui dois de X1, X2, X3 e X4, e o segundo componente polipeptídico inclui os dois de X1, X2, X3 e X4 que não estão presentes no primeiro componente polipeptídico.
[0359] Em outras modalidades;
[0360] (a) o primeiro polipeptídeo compreende X1 e exclui X2, X3 e X4; e o segundo polipeptídeo é uma proteína de fusão compreendendo X3-Z1-X2-Z2-X4 e excluindo X1;
[0361] (b) o primeiro polipeptídeo compreende X4 e exclui X1, X2 e X3; e o segundo polipeptídeo é uma proteína de fusão compreendendo X1-Z1-X3-Z2-X2 e excluindo X4; ou
[0362] (c) o primeiro polipeptídeo é uma proteína de fusão compreendendo X1-Z1-X3 e excluindo X2 e X4; e o segundo polipeptídeo é uma proteína de fusão compreendendo X2-Z1-X4 e excluindo X1 e X3;
[0363] em que cada um de Z1 e Z2 independentemente é um ligante de aminoácido opcional. Z1 e/ou Z2 podem compreender qualquer número de resíduos de aminoácidos para separar domínios dentro do primeiro e/ou segundo polipeptídeo conforme considerado apropriado para um uso pretendido. Os ligantes 1 e/ou Z2 podem ser de qualquer comprimento e composição de aminoácidos adequados. Em uma modalidade, Z1 e Z2 estão ambos ausentes; em outra modalidade, 1 e 2 estão ambos presentes; em uma outra modalidade, um de Z1 e Z2 está presente e o outro está ausente.
[0364] Em outras modalidades, X1, X2, X3 e X4, respectivamente, compreendem um peptídeo pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntico, respectivamente, ao comprimento total dos domínios X1, X2, X3 e X4 mostrados abaixo (SEQ ID NOs: 4-7), onde os resíduos entre parênteses podem estar presentes ou ausentes:
[0365] X1: PKKKIQLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 4)
[0366] X2: (K)DEAEKAKRMKEWMKRIKT (SEQ ID NO: 7)
[0367] X3: (LE)DYAFNFELILEEIARLF(ESG) (SEQ ID NO: 5)
[0368] X4: (E)DEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 6)
[0369] Em outras modalidades, X1, X2, X3 e X4 são peptídeos compreendendo sequências de aminoácidos pelo menos 80% idênticas, respectivamente, ao comprimento total dos domínios X1, X2, X3 e X4 mostrados abaixo (SEQ ID NOs: 4-7), onde os resíduos entre parênteses podem estar presentes ou ausentes:
[0370] X1: PKKKIQLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID
NO: 4)
[0371] X2: (K)DEAEKAKRMKEWMKRIKT (SEQ ID NO: 7)
[0372] X3: (LE)DYAFNFELILEEIARLF(ESG) (SEQ ID NO: 5)
[0373] X4: (E)DEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 6)
[0374] Em outras modalidades, X1, X2, X3 e X4 são peptídeos compreendendo sequências de aminoácidos pelo menos 90% idênticas, respectivamente, ao comprimento total dos domínios X1, X2, X3 e X4 mostrados abaixo (SEQ ID NOs: 4-7), onde os resíduos entre parênteses podem estar presentes ou ausentes:
[0375] X1: PKKKIQLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 4)
[0376] X2: (K)DEAEKAKRMKEWMKRIKT (SEQ ID NO: 7)
[0377] X3: (LE)DYAFNFELILEEIARLF(ESG) (SEQ ID NO: 5)
[0378] X4: (E)DEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 6).
[0379] Em outras modalidades, X1, X2, X3 e X4, respectivamente, são 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idênticos, respectivamente, ao comprimento total dos domínios X1, X2, X3 e X4 mostrados abaixo, onde os resíduos entre parênteses podem estar presentes ou ausentes:
[0380] X1: QLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 320)
[0381] X2: (K)DEAEKAKRMKEWMKRIKT (SEQ ID NO: 7)
[0382] X3: LEDYAFNFELILEEIARLFES (SEQ ID NO: 321)
[0383] X4: DEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 322).
[0384] Em outras modalidades, X1, X2, X3 e X4, respectivamente, são peptídeos compreendendo sequências de aminoácidos pelo menos 80% idênticas, respectivamente, ao comprimento total dos domínios X1, X2, X3 e X4 mostrados abaixo, onde os resíduos entre parênteses podem estar presentes ou ausentes:
[0385] X1: QLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 320)
[0386] X2: (K)DEAEKAKRMKEWMKRIKT (SEQ ID NO: 7)
[0387] X3: LEDYAFNFELILEEIARLFES (SEQ ID NO: 321)
[0388] X4: DEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 322).
[0389] Em outras modalidades, X1, X2, X3 e X4, respectivamente, são peptídeos compreendendo sequências de aminoácidos pelo menos 90% idênticas, respectivamente, ao comprimento total dos domínios X1, X2, X3 e X4 mostrados abaixo, onde os resíduos entre parênteses podem estar presentes ou ausentes:
[0390] X1: QLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 320)
[0391] X2: (K)DEAEKAKRMKEWMKRIKT (SEQ ID NO: 7)
[0392] X3: LEDYAFNFELILEEIARLFES (SEQ ID NO: 321)
[0393] X4: DEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 322).
[0394] Em uma modalidade, um ou mais ou todos os aminoácidos opcionais estão presentes; em outra modalidade, um ou mais ou todos os aminoácidos opcionais estão ausentes. Em outras modalidades:
[0395] (i) X1 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos tendo identidade para comprimento total da sequência de aminoácidos da SEQ ID NO: 4 ou SEQ ID NO: 320 de pelo menos 55%; X2 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos tendo identidade para comprimento total da sequência de aminoácidos da SEQ ID NO: 7 de pelo menos 55%, X3 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos tendo identidade para comprimento total da sequência de aminoácidos da SEQ ID NO: 5 ou SEQ ID NO: 321 de pelo menos 55%; e X4 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos tendo identidade para comprimento total da sequência de aminoácidos da SEQ ID NO: 6 ou SEQ ID NO: 322 de pelo menos 55%;
[0396] (ii) X1 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos tendo identidade para o comprimento total da sequência de aminoácidos da SEQ ID NO: 4 ou SEQ ID NO: 320 de pelo menos 75%; X2 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos tendo identidade para o comprimento total da sequência de aminoácidos da SEQ ID NO: 7 de pelo menos 75%, X3 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos tendo identidade para o comprimento total da sequência de aminoácidos da SEQ ID NO: 5 ou SEQ ID NO: 321 de pelo menos 75%; e X4 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos tendo identidade para o comprimento total da sequência de aminoácidos da SEQ ID NO: 6 ou SEQ ID NO: 322 de pelo menos 75%;
[0397] (iii) X1 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos tendo identidade para o comprimento total da sequência de aminoácidos da SEQ ID NO: 4 ou SEQ ID NO: 320 de pelo menos 80%; X2 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos tendo identidade para o comprimento total da sequência de aminoácidos da SEQ ID NO: 7 de pelo menos 80%, X3 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos tendo identidade para o comprimento total da sequência de aminoácidos de SEQ ID NO: 5 ou SEQ ID NO: 321 de pelo menos 80%; e X4 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos tendo identidade para o comprimento total da sequência de aminoácidos da SEQ ID NO: 6 ou SEQ ID NO: 322 de pelo menos 80%;
[0398] (iv) X1 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos tendo identidade para o comprimento total da sequência de aminoácidos da SEQ ID NO: 4 ou SEQ ID NO: 320 de pelo menos 90%; X2 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos tendo identidade para o comprimento total da sequência de aminoácidos da SEQ ID NO: 7 de pelo menos 90%, X3 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos tendo identidade para o comprimento total da sequência de aminoácidos da SEQ ID NO: 5 ou SEQ ID NO: 321 de pelo menos 90%; e X4 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos tendo identidade para o comprimento total da sequência de aminoácidos da SEQ ID NO: 6 ou SEQ ID NO: 322 de pelo menos 90%; ou
[0399] (vi) X1 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos tendo 100% de identidade em relação ao comprimento total da sequência de aminoácidos da SEQ ID NO: 4 ou SEQ ID NO: 320; X2 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos tendo 100% de identidade e relação ao comprimento total da sequência de aminoácidos da SEQ ID NO: 7; X3 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos tendo 100% de identidade em relação ao comprimento total da sequência de aminoácidos da SEQ ID NO: 5 ou SEQ ID NO: 321; e X4 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos tendo 100% de identidade em relação ao comprimento total da sequência de aminoácidos da SEQ ID NO: 6 ou SEQ ID NO: 322.
[0400] Em modalidades exemplificativas de (i) a (vi) acima, os peptídeos para X1, X3 e X4 são mostrados em SEQ ID NOs: 4, 5 e 6. Em modalidades exemplificativas de (i) a (vi) acima, os peptídeos para X1, X3 e X4 são mostrados em SEQ ID NOs: 320, 321 e 322.
[0401] Em outra modalidade, o primeiro polipeptídeo e o segundo polipeptídeo são pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%,
50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idênticos a um par de primeiro e segundo polipeptídeos mostrados abaixo (resíduos sublinhados ou res duos X s o opcionais e cada res duo do dom nio opcional, quando presente, pode compreender qualquer aminoácido):
[0402] (i)
[0403] Primeiro polipeptídeo X1 (Neo2A) PKKKIQLHAEHALYDALMILNIVKTNS (SEQ ID NO: 256) e
[0404] Segundo polipeptídeo: X3-X2 -X4 (Neo2B)
TNSPPAEEKLEDYAFNFELILEEIARLFESGDQKDEAEKAKRMKEWMKRIKTTA SEDEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 257)
[0405] (ii)
[0406] Primeiro polipeptídeo X1-X3-X2
PKKKIQLHAEHALYDALMILNIVKTNSPPAEEKLEDYAFNFELILEEIARLFESGD QKDEAEKAKRMKEWMKRIKTTAS (SEQ ID NO: 258) e
[0407] Segundo polipeptídeo X4 TTASEDEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 259);
[0408] (iii)
[0409] Primeiro polipeptídeo X1-X3
PKKKIQLHAEHALYDALMILNIVKTNSPPAEEKLEDYAFNFELILEEIARLFESGD (SEQ ID NO: 260) e
[0410] Segundo polipeptídeo X2-X4 DQKDEAEKAKRMKEWMKRIKTTASEDEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 261)
[0411] (iv)
[0412] Primeiro polipeptídeo X1 (Neo4A) PKKKIQIMAEEALKDALSILNIVKTNS (SEQ ID NO: 262)
[0413] Segundo polipeptídeo X3-X2 -X4 (Neo4B)
TNSPPAEEQLERFAKRFERNLWGIARLFESGDQKDEAEKAKRMIEWMKRIKTT ASEDEQEEMANAIITILQSWFFS (SEQ ID NO: 263)
[0414] (v)
[0415] Primeiro polipeptídeo X1 (Neo2A) PKKKIQLHAEHALYDALMILNIXXXXX (SEQ ID NO: 311) e
[0416] Segundo polipeptídeo: X3-X2 -X4 (Neo2B)
XXXXXXXXXLEDYAFNFELILEEIARLFESGXXKDEAEKAKRMKEWMKRIKTXX XEDEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 264)
[0417] (vi)
[0418] Primeiro polipeptídeo X1-X3-X2
PKKKIQLHAEHALYDALMILNIXXXXXXXXXXXLEDYAFNFELILEEIARLFESGX XKDEAEKAKRMKEWMKRIKTTAS (SEQ ID NO: 265) e
[0419] Segundo polipeptídeo X4 XXXXXDEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 266);
[0420] (vii)
[0421] Primeiro polipeptídeo X1-X3
PKKKIQLHAEHALYDALMILNIXXXXXXXXXXXLEDYAFNFELILEEIARLFESXX GD (SEQ ID NO: 267) e
[0422] Segundo polipeptídeo X2-X4 DQKDEAEKAKRMKEWMKRIKTXXXEDEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 268)
[0423] (viii)
[0424] Primeiro polipeptídeo X1 (Neo4A) PKKKIQIMAEEALKDALSILNIXXXXX (SEQ ID NO: 269)
[0425] Segundo polipeptídeo X3-X2 -X4 (Neo4B)
XXXXXXXXQLERFAKRFERNLWGIARLFESGXXKDEAEKAKRMIEWMKRIKTX XXEDEQEEMANAIITILQSWFFS(SEQ ID NO: 270)
[0426] (ix)
[0427] Primeiro polipeptídeo >Neo4_H1-H3
[0428] PKKKIQIMAEEALKDALSILNIVKTNSPPAEEQ LERFAKRFERNLWGIARLFESGD (SEQ ID NO: 312)
[0429] Segundo polipeptídeo >Neo4_H2-H4
[0430] DQKDEAEKAKRMIEWMKRIKTTASEDEQEE
MANAIITILQSWFFS (SEQ ID NO: 313)
[0431] (x)
[0432] Primeiro polipeptídeo >Neo4_H1-H3
[0433] PKKKIQIMAEEALKDALSILNIXXXXXXXXXXQ LERFAKRFERNLWGIARLFESXX (SEQ ID NO: 314)
[0434] Segundo polipeptídeo >Neo4_H2-H4
[0435] XXKDEAEKAKRMIEWMKRIKXXXXEDEQEE MANAIITILQSWFFS (SEQ ID NO: 315)
[0436] (xi)
[0437] Primeiro polipeptídeo Neo4_H1-H3 -H2
[0438] PKKKIQIMAEEALKDALSILNIVKTNSPPAEEQ LERFAKRFERNLWGIARLFESGDQKDEAEKAKRMIEWMKRIKTTA (SEQ ID NO: 316)
[0439] Segundo polipeptídeo Neo4_H4
[0440] TTASEDEQEEMANAIITILQSWFFS (SEQ ID NO: 317)
[0441] (xii)
[0442] Primeiro polipeptídeo Neo4_H1-H3 -H2
[0443] PKKKIQIMAEEALKDALSILNIXXXXXXXXXXX LERFAKRFERNLWGIARLFESXXXKDEAEKAKRMIEWMKRIKXXX (SEQ ID NO: 318)
[0444] Segundo polipeptídeo Neo4_H4
[0445] XXXXXDEQEEMANAIITILQSWFFS (SEQ ID NO: 319)
[0446] (xiii)
[0447] Primeiro polipeptídeo (X1)
[0448] PKKKIQLHAEHALYDALMILNIVGGSS (SEQ ID NO: 323), ou SKEAIQLHAEHALYDALMILNIVKTNS (SEQ ID NO: 324), ou
[0449] PIQLHAEHALYDALMILNIV (SEQ ID NO: 325)
[0450] Segundo polipeptídeo (X3-X2 -X4)
[0451] PKLEDYAFNFELILEEIARLFESGDQKDEAEK AKRMKEWMKRIKTTASEDEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 326); ou
[0452] GGSSGGLEDYAFNFELILEEIARLFESGGSS GGKDEAEKAKRMKEWMKRITGGSSGGDEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 327); ou
[0453] GGSSGGLEDYAFNFELILEEIARLFESGGSS GGGGEAEKAKRMKEWMKRIGGSSGGDEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 328).
[0454] Em modalidades exemplificativas, o primeiro polipeptídeo e o segundo polipeptídeo são peptídeos compreendendo uma sequência de aminoácidos pelo menos 80% idêntica a um par de primeiro e segundo polipeptídeos mostrados nas modalidades (i) - (viii) acima (resíduos sublinhados ou res duos X s o opcionais e cada res duo do dom nio opcional, quando presente, pode compreender qualquer aminoácido).
[0455] Em modalidades exemplificativas, o primeiro polipeptídeo e o segundo polipeptídeo são peptídeos compreendendo uma sequência de aminoácidos pelo menos 90% idêntica a um par de primeiro e segundo polipeptídeos mostrados nas modalidades (i) - (viii) acima (resíduos sublinhados ou res duos X s o opcionais e cada res duo do dom nio opcional, quando presente, pode compreender qualquer aminoácido).
[0456] Em modalidades exemplificativas, o primeiro polipeptídeo e o segundo polipeptídeo são peptídeos compreendendo uma sequência de aminoácidos 100% idêntica a um par de primeiro e segundo polipeptídeos mostrados nas modalidades (i) - (viii) acima (resíduos sublinhados ou res duos X s o opcional e cada res duo do dom nio opcional, quando presente, pode compreender qualquer aminoácido).
[0457] Em várias outras modalidades, X1, X2, X3 e X4, respectivamente, compreendem um peptídeo pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntico a, respectivamente, domínios X1, X2, X3 e X4 (conforme definido na Tabela 1 (embora listados como domínios H1, H2, H3 e H4) presentes na sequência de aminoácidos das SEQ ID NOs: 11-94, 190-216, 247 e SEQ ID NOs: 275-300.
[0458] A Tabela 1 fornece duas SEQ ID NOs para muitas das variantes: uma primeira SEQ ID NO: que lista as posições do ligante como opcionais e variáveis (mostradas em sublinhado na tabela), e uma segunda SEQ ID NO: que inclui as posições do ligante como requeridas. A Tabela 1 mostra a disposição de domínios para o polipeptídeo das SEQ ID NOs: 11-94, 190-216, 247 e SEQ ID NOs: 275-300 (ver a segunda coluna), enquanto a sequência mostra ligantes de aminoácidos sublinhados separando domínios. Ver, por exemplo, SEQ ID NO: 11, tendo a disposição de domínio H1->H4->H2 - >H3 (correspondendo a uma disposição X1-X4-X2-X3):
[0459] STKKWQLQAEHALLDWQMALNKSPEPNEN
LNRAITAAQSWISTGKIDLDKAEDIRRNSDQARREAEKRGIDVRDLISNAQVILL EAR (SEQ ID NO: 11)
[0460] Como será evidente para os versados na técnica com base nessa disposição, na SEQ ID NO: 11, o domínio X1 é STKKWQLQAEHALLDWQMALNK (SEQ ID NO: 271), o domínio X4 é ENLNRAITAAQSWIS (SEQ ID NO: 272), o domínio X2 é LDKAEDIRRNSDQARREAEK (SEQ ID NO: 273) e o domínio X3 é RDLISNAQVILLEAR (SEQ ID NO: 274). Da mesma forma, a sequência de aminoácidos de cada domínio X1, X2, X3 e X4 SEQ ID NOs: 11-94, 190-216, 247 e SEQ ID NOs: 275-300 será clara para aqueles versados na técnica com base nos ensinamentos aqui. Como será entendido por aqueles versados na técnica, os aminoácidos X1, X2, X3 e/ou X4 podem incluir (1, 2, 3, 4, 5 ou mais) aminoácidos adicionais no N-terminal N e/ou no C-terminal em relação aos domínios X1, X2, X3 e X4 mostrados em SEQ ID NOs: 11-94, 190-216, 247 e SEQ ID NOs: 275-300. TABELA 1
Nome Disposição de Sequência domínio G1_neo2_33 H1->H4->H2 ->H3 STKKWQLQAEHALLDWQMALNKSPEPNE
DQARREAEKRGIDVRDLISNAQVILLEAR (SEQ ID NO: 11)
DQARREAEKRGIDVRDLISNAQVILLEAR (SEQ ID NO: 103) G1_neo2_34 H1->H4->H2 ->H3 STKKWQLQAEHALLDWQMALNKSPEPNE
DQARREAEKRGIDVRDLISNAQVILLEAR (SEQ ID NO: 12)
DQARREAEKRGIDVRDLISNAQVILLEAR (SEQ ID NO: 104) G1_neo2_35 H1->H4->H2 ->H3 STKKWQLQAEHALLDWQMALNKSPEPNE
DQARREAEKRGIDVRDLISNAQVILLEAC (SEQ ID NO: 13)
DQARREAEKRGIDVRDLISNAQVILLEAC (SEQ ID NO: 105) G1_neo2_36 H1->H4->H2 ->H3 STKKLQLQAEHFLLDVQMILNESPEPNEE
KVRDEALKRGIDVRDLVSNAKVIALELK (SEQ ID NO: 14)
KVRDEALKRGIDVRDLVSNAKVIALELK (SEQ ID NO: 106)
G1_neo2_37 H1->H4->H2 ->H3 STKKLQLQAEHFLLDVQMILNESPEPNEE
KVRDEALKRGIDVRDLVSNAKVIALELK (SEQ ID NO: 15)
KVRDEALKRGIDVRDLVSNAKVIALELK (SEQ ID NO: 107) G1_neo2_38 H1->H4->H2 ->H3 STKKLQLQAEHFLLDVQMILNESPEPNEE
KVRDEALKRGIDVRDLVSNAKVIALELK (SEQ ID NO: 16)
KVRDEALKRGIDVRDLVSNAKVIALELK (SEQ ID NO: 108) G1_neo2_39 H1->H4->H2 ->H3 STKKLQLQAEHFLLDVQMILNESPEPNEE
KVRDEALKRGIDVRDLVSNACVIALELK (SEQ ID NO: 17)
KVRDEALKRGIDVRDLVSNACVIALELK (SEQ ID NO: 109) G1_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 STKKLQLQAEHALLDAQMMLNRSPEPNE
EELRQEAEKRGIDVRDLASNLKVILLELA (SEQ ID NO: 18)
EELRQEAEKRGIDVRDLASNLKVILLELA (SEQ ID NO: 110) G1_neo2_41 H1->H4->H2 ->H3 STKKLQLQAEHALLDAQMMLNRSPEPNE
EELRQEAEKRGIDVRDLASNLKVILLELA (SEQ ID NO: 19)
EELRQEAEKRGIDVRDLASNLKVILLELA (SEQ ID NO: 111)
G1_neo2_42 H1->H4->H2 ->H3 STKKIQLQLEHALLDVQMALNRSPEPNES
EKIRKEMEKRGIDVRDLISNIIVILLELS (SEQ ID NO: 20)
EKIRKEMEKRGIDVRDLISNIIVILLELS (SEQ ID NO: 112) G1_neo2_43 H1->H4->H2 ->H3 STKKIQLQLEHALLDVQMALNRSPEPNES
EKIRKEMEKRGIDVRDLISNIIVILLELS (SEQ ID NO: 21)
EKIRKEMEKRGIDVRDLISNIIVILLELS (SEQ ID NO: 113) G1_neo2_44 H1->H4->H2 ->H3 STKKIQLQLEHALLDVQMALNRSPEPNES
EKIRKEMEKRGIDVRDLISNICVILLELS (SEQ ID NO: 22)
EKIRKEMEKRGIDVRDLISNICVILLELS (SEQ ID NO: 114) G1_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 STKKTQLLAEHALLDAFMMLNVVPEPNEK _1A LNRIITTMQSWIYTGKIDADGAKELAKEVE
ELEQEYEKRGIDVEDDASNLKVILLELA (SEQ ID NO: 23)
ELEQEYEKRGIDVEDDASNLKVILLELA (SEQ ID NO: 115) G1_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 STKKTQLLAEHALLDAHMMLNMLPEPNEK _1B LNRIITTMQSWIHTGKIDGDGAQELAKEVE
ELEQEYEKRGIDVEDEASNLKVILLELA (SEQ ID NO: 24)
ELEQEYEKRGIDVEDEASNLKVILLELA (SEQ ID NO: 116)
G1_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 STKKTQLLAEHALLDAFMMLNMVPEPNEK _1C LNRIITTMQSWIFTGKIDGDGAKELAKEVE
ELEQEFEKRGIDVEDEASNLKVILLELA (SEQ ID NO: 25)
ELEQEFEKRGIDVEDEASNLKVILLELA (SEQ ID NO: 117) G1_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 STKKTQLLAEHALLDALMMLNMVPEPNEK _1D LNRIITTMQSWIFTGKIDGDGAQELAKEVE
ELEQELEKRGIDVEDYASNLKVILLELA (SEQ ID NO: 26)
ELEQELEKRGIDVEDYASNLKVILLELA (SEQ ID NO: 118) G1_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 STKKTQLLAEHALLDAHMMLNVVPEPNEK _1E LNRIITTMQSWIYTGKIDRDGAQELAKEVE
ELEQELEKRGIDVDDDASNLKVILLELA (SEQ ID NO: 27)
ELEQELEKRGIDVDDDASNLKVILLELA (SEQ ID NO: 119) G1_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 STKKTQLLAEHALLDALMMLNLLPEPNEKL _1F NRIITTMQSWIFTGKIDGDGAQELAKEVEE
LEQEHEKRGIDVEDYASNLKVILLELA (SEQ ID NO: 28)
LEQEHEKRGIDVEDYASNLKVILLELA (SEQ ID NO: 120) G1_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 STKKTQLLAEHALLDAYMMLNMVPEPNEK _1G LNRIITTMQSWILTGKIDSDGAQELAKEVE
ELEQELEKRGIDVDDDASNLKVILLELA (SEQ ID NO: 29)
ELEQELEKRGIDVDDDASNLKVILLELA (SEQ ID NO: 121) G1_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 STKKTHLLAEHALLDAYMMLNVMPEPNEK
_1H LNRIITTMQSWIFTGKIDGDGAKELAKEVE
ELEQEFEKRGIDVDDDASNLKVILLELA (SEQ ID NO: 30)
ELEQEFEKRGIDVDDDASNLKVILLELA (SEQ ID NO: 122) G1_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 STKKTQLLAEHALLDAYMMLNLVPEPNEK _1I LNRIITTMQSWIFTGKIDADGAQELAIEVEE
LEQEYEKRGIDVDDYASNLKVILLELA (SEQ ID NO: 31)
LEQEYEKRGIDVDDYASNLKVILLELA (SEQ ID NO: 123) G1_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 STKKTQLMAEHALLDAFMMLNVLPEPNEK _1J LNRIITTMQSWIFTGKIDGDDAQELAKEVE
ELEQELEKRGIDVDDDASNLKVILLELA (SEQ ID NO: 32)
ELEQELEKRGIDVDDDASNLKVILLELA (SEQ ID NO: 124) G1_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 STKKTQLLIEHALLDALDMSRNLPEPNEKL _1F_H1 SRIITTMQSWIFTGKIDGDGAQQLAKEVEE
LEQEHEKRGEDVEDEASNLKVILLELA (SEQ ID NO: 33)
LEQEHEKRGEDVEDEASNLKVILLELA (SEQ ID NO: 125) G1_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 STKKTQLLLEHALLDALHMRRNLPEPNEK _1F_H2 LSRIITTMQSWIFTGKIDGDGAQELAKEVE
ELEQEHEKRGRDVEDDASNLKVILLELA (SEQ ID NO: 34)
ELEQEHEKRGRDVEDDASNLKVILLELA (SEQ ID NO: 126) G1_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 STKKTQLLIEHALLDALNMRKKLPEPNEKL _1F_H3 SRIITDMQSWIFTGKIDGDGAQQLAKEVEE
LEQEHEKRGGDVEDYASNLKVILLELA (SEQ ID NO: 35)
LEQEHEKRGGDVEDYASNLKVILLELA (SEQ ID NO: 127) G1_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 STKKTQLLLEHALLDALHMSRELPEPNEKL _1F_H4 NRIITDMQSWIFTGKIDGDGAQDLAKEVEE
LEQEHEKRGGDVEDYASNLKVILLELA (SEQ ID NO: 36)
LEQEHEKRGGDVEDYASNLKVILLELA (SEQ ID NO: 128) G1_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 STKKTQLLIEHALLDALHMSRKLPEPNEKL _1F_H5 SRIITTMQSWIFTGKIDGDGAQHLAKEVEE
LEQEHEKRGGEVEDEASNLKVILLELA (SEQ ID NO: 37)
LEQEHEKRGGEVEDEASNLKVILLELA (SEQ ID NO: 129) G1_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 STKKTQLLIEHALLDALHMKRKLPEPNEKL _1F_H6 NRIITNMQSWIFTEKIDGDGAQDLAKEVEE
LEQEHEKRGQDVEDYASNLKVILLELA (SEQ ID NO: 38)
LEQEHEKRGQDVEDYASNLKVILLELA (SEQ ID NO: 130) G1_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 STEKTQLAAEHALRDALMLKHLLNEPNEK _1F_M1 LARIITTMQSWQFTGKIDGDGAQELAKEV
EELQQEHEVRGIDVEDYASNLKVILLHLA (SEQ ID NO: 39)
EELQQEHEVRGIDVEDYASNLKVILLHLA (SEQ ID NO: 131) G1_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 STKNTQLAAEDALLDALMLRNLLNEPNEK _1F_M2 LARIITTMQSWQFTEKIDGDGAQELAKEVE
(SEQ ID NO: 40)
ELQQEHEERGIDVEDYASNLKVILLQLA (SEQ ID NO: 132) G1_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 STEKTQHAAEDALRDALMLRNLLNEPNEK _1F_M3 LARIITTMQSWQFTEKIDGDGAQELAKEVE
ELQQEHEVRGIDVEDYASNLKVILLQLA (SEQ ID NO: 41)
ELQQEHEVRGIDVEDYASNLKVILLQLA (SEQ ID NO: 133) G2_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 TQKKQQLLAEHALLDALMILNMLKTSSEAV _1F_seq02 NRMITIAQSWIFTGTSNPEEAKEMIKMAEQ
AEEEARREGVDTEDYVSNLKVILKEIA (SEQ ID NO: 42)
AEEEARREGVDTEDYVSNLKVILKEIA (SEQ ID NO: 134) G2_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 TTKKYQLLVEHALLDALMMLNLSSESNEK _1F_seq03 MNRIITTMQSWIFTGTFDPDQAEELAKLVE
ELREEFRKRGIDTEDYASNLKVILKELS (SEQ ID NO: 43)
ELREEFRKRGIDTEDYASNLKVILKELS (SEQ ID NO: 135) G2_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 TTKKIQLLVEHALLDALMILNLSSESNEKLN _1F_seq04 RIITTLQSWIFRGEIDPDRARELAKLLEEIR EEMRKRGIDTEDYVSNMIVIIRELA (SEQ ID NO: 44)
RIITTLQSWIFRGEIDPDRARELAKLLEEIR EEMRKRGIDTEDYVSNMIVIIRELA (SEQ ID NO: 136) G2_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 TKKKIQLLAEHVLLDLLMMLNLSSESNEKM _1F_seq05 NRLITIVQSWIFTGTIDPDQAEEMAKWVEE
(SEQ ID NO: 45)
LREEFRKRGIDTEDYASNVKVILKELS (SEQ ID NO: 137) G2_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 TKKKYQLLIEHLLLDALMVLNMSSESNEKL _1F_seq06 NRIITILQSWIFTGTWDPDLAEEMEKLMQE
IEEELRRRGIDTEDYMSNMRVIIKELS (SEQ ID NO: 46)
IEEELRRRGIDTEDYMSNMRVIIKELS (SEQ ID NO: 138) G2_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 TKKKLQLLVEHLLLDMLMILNMSSESNEKL _1F_seq07 NRLITELQSWIFRGEIDPDKAEEMWKIMEE IEKELRERGIDTEDYMSNAKVIIKELS (SEQ ID NO: 47)
NRLITELQSWIFRGEIDPDKAEEMWKIMEE IEKELRERGIDTEDYMSNAKVIIKELS (SEQ ID NO: 139) G2_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 TSKKQQLLAEHALLDALMILNISSESSEAV _1F_seq08 NRAITWLQSWIFKGTVNPDQAEEMRKLAE
QIREEMRKRGIDTEDYVSNLEVIAKELS (SEQ ID NO: 48)
QIREEMRKRGIDTEDYVSNLEVIAKELS (SEQ ID NO: 140) G2_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 TKKKYQLLIEHLLLDLLMVLNMSSESNEKI _1F_seq09 NRLITWLQSWIFTGTYDPDLAEEMYKILEE
LREEMRERGIDTEDYMSNMRVIVKELS (SEQ ID NO: 49)
LREEMRERGIDTEDYMSNMRVIVKELS (SEQ ID NO: 141) G2_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 TKKKWQLLIEHLLLDLLMILNLSSESNEKLN _1F_seq10 RLITWLQSWIFTGTYDPDLAEEMKKMMDE IEDELRERGIDTEDYMSNAKVIIKELS (SEQ ID NO: 50)
RLITWLQSWIFTGTYDPDLAEEMKKMMDE IEDELRERGIDTEDYMSNAKVIIKELS (SEQ ID NO: 142) G2_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 TKKKIQLLVEHALLDALMILNLSSESNEKLN _1F_seq11 RIITTMQSWIFTGTIDPDQAEELSKLVEEIR EEMRKRGIDTEDYVSNLKVILDELS (SEQ ID NO: 51)
RIITTMQSWIFTGTIDPDQAEELSKLVEEIR EEMRKRGIDTEDYVSNLKVILDELS (SEQ ID NO: 143) G2_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 TEKKLQLLVEHALLDALMILNLWSESNEKL _1F_seq12 NRIITTMQSWIFTGRIDPDKAEELAKLVEEL REEARERGIDTEDYVSNLKVILKELS (SEQ ID NO: 52)
NRIITTMQSWIFTGRIDPDKAEELAKLVEEL REEARERGIDTEDYVSNLKVILKELS (SEQ ID NO: 144) G2_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 TKKKYQLLMEHLLLDLLMVLNMSSESNEK _1F_seq13 LNRLITIIQSWIFTGTWDPDKAEEMAKMLK
EIEDELRERGIDTEDYMSNMIVIMKELS (SEQ ID NO: 53)
EIEDELRERGIDTEDYMSNMIVIMKELS (SEQ ID NO: 145) G2_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 TTKKIQLLVEHALLDALMLLNLSSESNEKM _1F_seq14 NRIITTMQSWIFEGRIDPDQAQELAKLVEE
LREEFRKRGIDTEDYVSNLKVILEELS (SEQ ID NO: 54)
LREEFRKRGIDTEDYVSNLKVILEELS (SEQ ID NO: 146) G2_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 TKKKIQLLVEHALLDALMMLNLSSESNEKL _1F_seq15 NRIITTMQSWIFTGTIDPDQAEELAKLVREL REEFRKRGIDTEDYASNLEVILRELS (SEQ ID NO: 55)
NRIITTMQSWIFTGTIDPDQAEELAKLVREL REEFRKRGIDTEDYASNLEVILRELS (SEQ ID NO: 147) G2_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 TKKKIQLLVEHALLDALMILNLSSKSNEKLN _1F_seq16 RIITTMQSWIFNGTIDPDRARELAKLVEEIR DEMEKNGIDTEDYVSNLKVILEELA (SEQ ID NO: 56)
RIITTMQSWIFNGTIDPDRARELAKLVEEIR DEMEKNGIDTEDYVSNLKVILEELA (SEQ ID NO: 148) G2_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 TKKKYQLLIEHVLLDLLMLLNLSSESNEKM _1F_seq17 NRLITILQSWIFTGTYDPDKAEEMAKLLKE LREEFRERGIDTEDYISNAIVILKELS (SEQ ID NO: 57)
NRLITILQSWIFTGTYDPDKAEEMAKLLKE LREEFRERGIDTEDYISNAIVILKELS (SEQ ID NO: 149) G2_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 TKKKIQLLVEHALLDALMMLNLSSESNEKL _1F_seq18 NRIITTMQSWIFTGTIDPDRAEELAKLVEEL REEFRKRGIDTEDYASNLKVILKELS (SEQ ID NO: 58)
NRIITTMQSWIFTGTIDPDRAEELAKLVEEL REEFRKRGIDTEDYASNLKVILKELS (SEQ ID NO: 150) G2_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 TKKKIQLLVEHALLDALMMLNLSSESNEKL _1F_seq19 NRIITTMQSWIFNGTIDPDQARELAKLVEE
LREEFRKRGIDTEDYASNLKVILEELA (SEQ ID NO: 59)
LREEFRKRGIDTEDYASNLKVILEELA (SEQ ID NO: 151) G2_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 TKKKLQLLVEHALLDALMLLNLSSESNEKL _1F_seq20 NRIITTMQSWIFTGTVDPDQAEELAKLVEE IREELRKRGIDTEDYVSNLKVILKELS (SEQ ID NO: 60)
IREELRKRGIDTEDYVSNLKVILKELS (SEQ ID NO: 152) G2_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 TTKKYQLLVEHALLDALMILNLSSESNEKL _1F_seq21 NRIITTMQSWIFTGTFDPDQAEELAKLVRE
IREEMRKRGIDTEDYVSNLEVILRELS (SEQ ID NO: 61)
IREEMRKRGIDTEDYVSNLEVILRELS (SEQ ID NO: 153) G2_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 TKKKIQLLVEHALLDALMILNLSSESNEKLN _1F_seq22 RIITTMQSWIFTGTIDPDRAEELAKLVREIR EEMRKRGIDTEDYVSNLEVILRELS (SEQ ID NO: 62)
RIITTMQSWIFTGTIDPDRAEELAKLVREIR EEMRKRGIDTEDYVSNLEVILRELS (SEQ ID NO: 154) G2_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 TKKKYQLLIEHLLLDLLMILNLSSESNEKLN _1F_seq23 RLITWLQSWIFRGEWDPDKAEEWAKILKEI REELRERGIDTEDYMSNAIVIMKELS (SEQ ID NO: 63)
RLITWLQSWIFRGEWDPDKAEEWAKILKEI REELRERGIDTEDYMSNAIVIMKELS (SEQ ID NO: 155) G2_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 TDKKLQLLVEHLLLDLLMMLNLSSKSNEK _1F_seq24 MNRLITIAQSWIFTGKVDPDLAREMIKLLE
ETEDENRKNGIDTEDYVSNARVIAKELE (SEQ ID NO: 64)
ETEDENRKNGIDTEDYVSNARVIAKELE (SEQ ID NO: 156) G2_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 TKKKIQLLVEHALLDALMLLNLSSESNEKM _1F_seq25 NRIITTMQSWIFTGTIDPDQAEELAKLVEEL KEEFKKRGIDTEDYVSNLKVILKELS (SEQ ID NO: 65)
ID NO: 157) G2_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 TKKKYQLLIEHALLDALMILNLWSESNEKL _1F_seq26 NRIITTMQSWIFTGTYDPDKAEELEKLAKEI EDEARERGIDTEDYMSNLRVILKELS (SEQ ID NO: 66)
NRIITTMQSWIFTGTYDPDKAEELEKLAKEI EDEARERGIDTEDYMSNLRVILKELS (SEQ ID NO: 158) G2_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 TKKKAQLLAEHALLDALMLLNLSSESNERL _1F_seq27 NRIITWLQSIIFTGTYDPDMVKEAVKLADEI
EDEMRKRGIDTEDYVSNLRVILQELA (SEQ ID NO: 67)
EDEMRKRGIDTEDYVSNLRVILQELA (SEQ ID NO: 159) G2_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 TQKKNQLLAEHLLLDALMVLNQSSESSEV _1F_seq28 ANRIITWAQSWIFEGRVDPNKAEEAKKLA
KKLEEEMRKRGIDMEDYISNMKVIAEEMS (SEQ ID NO: 68)
KKLEEEMRKRGIDMEDYISNMKVIAEEMS (SEQ ID NO: 160) G2_neo2_40 H3->H2 ->H4->H1 EDYYSNLKVILEELAREMERNGLSDKAEE _1F_seq29 WRQWKKIVERIRQIRSNNSDLNEAKELLN
RLITYIQSQIFEISERIRETDQEKKEESWKK WQLLLEHALLDVLMLLND (SEQ ID NO: 69)
RLITYIQSQIFEISERIRETDQEKKEESWKK WQLLLEHALLDVLMLLND (SEQ ID NO: 161) G2_neo2_40 H1->H3->H2 ->H4 PEKKRQLLLEHILLDALMLLNLXXXXXXNT _1F_seq30 ESKFEDYISNAEVIAEELAKLMESXXLSDE
AEKFKKIKQWLREVWRIWXXXXWSTLED KARELLNRIITTIQSQIFY (SEQ ID NO: 70)
KARELLNRIITTIQSQIFY (SEQ ID NO: 162) G2_neo2_40 H1->H3->H2 ->H4 PEKKRQLLLEHILLDLLMILNMXXXXXXNT _1F_seq31 ESEMEDYWSNVRVILRELARLMEEXXXKE
LSELMERMRKIVEKIRQIVTXXXXLDTARE WLNRLITWIQSLIFR (SEQ ID NO: 71)
SELMERMRKIVEKIRQIVTNNSSLDTARE WLNRLITWIQSLIFR (SEQ ID NO: 163) G2_neo2_40 H1->H3->H2 ->H4 PEKKRQLLAEHALLDALMLLNIIETNSKNT _1F_seq32 ESKMEDYVSNLEVILTEFKKLAEKLNFSEE
AERAERMKRWARKAYQMMTLDLSLDKAK EMLNRIITILQSIIFN (SEQ ID NO: 72)
AERAERMKRWARKAYQMMTLDLSLDKAK EMLNRIITILQSIIFN (SEQ ID NO: 164) G2_neo2_40 H1->H3->H2 ->H4 PEKKRQLLAEHLLLDVLMMLNGNASLKDY _1F_seq33 ASNAQVIADEFRELARELGLTDEAKKAEKII
EALERAREWLLNNKDKEKAKEALNRAITIA QSWIFN (SEQ ID NO: 73)
EALERAREWLLNNKDKEKAKEALNRAITIA QSWIFN (SEQ ID NO: 165) G2_neo2_40 H1->H3->H2 ->H4 PEKKRQLLLEHLLLDLLMILNMLRTNPKNIE _1F_seq34 SDWEDYMSNIEVIIEELRKIMESLGRSEKA
KEWKRMKQWVRRILEIVKNNSDLEEAKE WLNRLITIVQSEIFE (SEQ ID NO: 74)
KEWKRMKQWVRRILEIVKNNSDLEEAKE WLNRLITIVQSEIFE (SEQ ID NO: 166) G2_neo2_40 H1->H3->H2 ->H4 WEKKRQLLLEHLLLDLLMILNMWRTNPQN _1F_seq35 TESLMEDYMSNAKVIVEELARMMRSQGL
EDKAREWEEMKKRIEEIRQIIQNNSSKERA KEELNRLITYVQSEIFR (SEQ ID NO: 75)
EDKAREWEEMKKRIEEIRQIIQNNSSKERA KEELNRLITYVQSEIFR (SEQ ID NO: 167)
G2_neo2_40 H1->H3->H2 ->H4 PKKKIQLLAEHALLDALMILNIVKTNSQNAE _1F_seq36 EKLEDYASNVEVILEEIARLMESGDQKDEA
EKAKRMKEWMKRIKTTASEDEQEEMANR IITLLQSWIFS (SEQ ID NO: 76)
EKAKRMKEWMKRIKTTASEDEQEEMANR IITLLQSWIFS (SEQ ID NO: 168) G2_neo2_40 H1->H3->H2 ->H4 PEKKRQLLAEHALLDALMILNXXXXXXQN _1F_seq37 AEEKLEDYMSNVEVIMEEFARMMRXXXX
SEEAENAERIKKWVRKASSXXXSEEQRE MMNRAITLMQSWIFE (SEQ ID NO: 77)
EEAENAERIKKWVRKASSTASSEEQREM MNRAITLMQSWIFE (SEQ ID NO: 169) G2_neo2_40 H1->H3->H2 ->H4 PEKKRQLLAEHLLLDALMVLNMXXXXXXN _1F_seq38 TEEKLEDYISNMKVIIKEMIELMRSLXXXEE
AEKWKEALKAVEKIXXXXDSETARELANRI ITLAQSAIFY (SEQ ID NO: 78)
AEKWKEALKAVEKIGSRMDSETARELANR IITLAQSAIFY (SEQ ID NO: 170) G2_neo2_40 H1->H3->H2 ->H4 PEKKRQLLAEHALLDALMFLNLXXXXXXQ _1F_seq39 AEEKIEDYASNLRVIAEELARLFENLXXXD
EAQKAKDIKELAERARSXXSSEKRKEAMN RAITILQSMIFR (SEQ ID NO: 79)
EAQKAKDIKELAERARSRVSSEKRKEAMN RAITILQSMIFR (SEQ ID NO: 171) G2_neo2_40 H1->H3->H2 ->H4 PEKKRQLLAEHALLDALMILNIIRTNSDNTE _1F_seq40 SKLEDYISNLKVILEEIARLMESLGLSDEAE
KAKEAMRLADKAGSTASEEEKKEAMNRVI TWAQSWIFN (SEQ ID NO: 80)
KAKEAMRLADKAGSTASEEEKKEAMNRVI TWAQSWIFN (SEQ ID NO: 172) G2_neo2_40 H1->H3->H2 ->H4 PEKKRQLLAEHALLDALMMLNILRTNPDN
_1F_seq41 AEEKLEDYWSNLIVILREIAKLMESLGLTDE
AEKAKEAARWAEEARTTASKDQRRELAN RIITLLQSWIFS (SEQ ID NO: 81)
AEKAKEAARWAEEARTTASKDQRRELAN RIITLLQSWIFS (SEQ ID NO: 173) G2_neo2_40 H1->H3->H2 ->H4 PEKKRQLLAEHLLLDALMILNIIETNEQNAE _1F_seq42 SKLEDYISNAKVILDEFREMARDLGLLDEA
KKAEKMKRWLEKMRSNASSDERREWAN RMITTAQSWIFN (SEQ ID NO: 82)
KKAEKMKRWLEKMRSNASSDERREWAN RMITTAQSWIFN (SEQ ID NO: 174) G2_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 TNKKAQLHAEFALHDALMLLNLSSESNER _1F_seq27_ LNRIITWLQSIIFYGTYDPDMVKEAVKDAD S3 EIEDEMRKRGIDTEDYVSNLRLILQELA (SEQ ID NO: 83)
EIEDEMRKRGIDTEDYVSNLRLILQELA (SEQ ID NO: 245) G2_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 TNKEAQLHAEFALYDALMLLNLSSESNER _1F_seq27_ LNRIITWLQSIIFYETYDPDMVKEAVKLADE S18 IEDEMRKRKIDTEDYVVNLRLILQELA (SEQ ID NO: 84)
IEDEMRKRKIDTEDYVVNLRLILQELA (SEQ ID NO: 175) G2_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 TKKDAELLAEFALYDALMLLNLSSESNERL _1F_seq27_ NEIITWLQSIIFYGTYDPDMVKEAVKLADEI S22 EDEMRKRGIDTEDYVSNLRLILQELA (SEQ ID NO: 85)
NEIITWLQSIIFYGTYDPDMVKEAVKLADEI EDEMRKRGIDTEDYVSNLRLILQELA (SEQ ID NO: 176) G2_neo2_40 H1->H4->H2 ->H3 TNKKAQLHAEFALYDALMLLNLSSESNER
_1F_seq27_ LNDIITWLQSIIFTGTYDPDMVKEAVKLADE S24 IEDEMRKRKIDTEDYVVNLRYILQELA (SEQ ID NO: 86)
IEDEMRKRKIDTEDYVVNLRYILQELA (SEQ ID NO: 177) G2_neo2_40 H3->H2 ->H4->H1 EDYYSNLKLILEELAREMERNGLSDKAEE _1F_seq29_ WRQWKKIVERIRQIRSNNSDLNEAKELLN S6 RLITYIQSQIFEVLHGVGETDQEKKEESWK KWDLLLEHALLDVLMLLND (SEQ ID NO: 87)
RLITYIQSQIFEVLHGVGETDQEKKEESWK KWDLLLEHALLDVLMLLND (SEQ ID NO: 178) G2_neo2_40 H3->H2 ->H4->H1 EDYYSNLKVILEELAREMERNGLSDKAEE _1F_seq29_ WRQWKKIVERIRQIRSNNSDLNEAKELLN S7 ELITYIQSQIFEVIEREGETDQEKKEESWK KWELHLEHALLDVLMLLND (SEQ ID NO: 88)
ELITYIQSQIFEVIEREGETDQEKKEESWK KWELHLEHALLDVLMLLND (SEQ ID NO: 179) G2_neo2_40 H3->H2 ->H4->H1 EDYYSNLKLILEELAREMERNGLSDKAEE _1F_seq29_ WRQWKKIVERIRQIRSNNSDLNEAKELLN S8 RLITYIQSQIFEVLEGVGETDQEKKEESWK KWELHLEHALLDVLMLLND (SEQ ID NO: 89)
RLITYIQSQIFEVLEGVGETDQEKKEESWK KWELHLEHALLDVLMLLND (SEQ ID NO: 180) Neoleucina- H1->H3->H2 ->H4 PKKKIQLHAEHALYDALMILNIVKTNSPPAE 2/15 EKLEDYAFNFELILEEIARLFESGDQKDEA (ou seja, EKAKRMKEWMKRIKTTASEDEQEEMANAI G2_neo2_40 ITILQSWIFS (SEQ ID NO: 90, versão 1) _1F_seq36_ PKKKIQLHAEHALYDALMILNIVKTNSPPAE
S11) EKLEDYAFNFELILEEIARLFESGDQKDEA
EKAKRMKEWMKRIKTTASEDEQEEMANAI ITILQSWIFS (SEQ ID NO: 90, versão 2)
EKAKRMKEWMKRIKTTASEDEQEEMANAI ITILQSWIFS (SEQ ID NO: 181) G2_neo2_40 H1->H3->H2 ->H4 PKKKIQLLAEHALFDLLMILNIVKTNSQNAE _1F_seq36_ EKLEDYAYNAGVILEEIARLFESGDQKDEA S12 EKAKRMKEWMKRIKDTASEDEQEEMANE IITILQSWNFS (SEQ ID NO: 91)
EKAKRMKEWMKRIKDTASEDEQEEMANE IITILQSWNFS (SEQ ID NO: 182) Neoleucina- H1->H3->H2 ->H4 PKKKIQLYAEHALYDALMILNIVKTNSPPAE 2/15-H8Y- EELEDYAFNFELILEEIARLFESGDQKDEA K33E EKAKRMKEWMKRIKTTASEDEQEEMANAI ITILQSWIFS (SEQ ID NO: 94)
EKAKRMKEWMKRIKTTASEDEQEEMANAI ITILQSWIFS (SEQ ID NO: 246) Neoleucina- H1->H3->H2 ->H4 PKKKIQLHAEHALYDALMILNIVKTNSPPAE 2/15 EKLEDYAFNFELILEEIARLFESGDQKDEA (K32 é EKAKRMKEWMKRIKTTASEDEQEEMANAI considerado ITILQSWIFS (SEQ ID NO: 247) como sendo um resíduo do ligante opcional nessa sequência retratada) IL4_G2_neo PKKKIQITAEEALKDALSILNIVKTNSPPAEEQLERFAKRFERNL 2_40_1F_se WGIARLFESGDQKDEAEKAKRMKEWMKRIKTTASEDEQEEM q36_S11 ANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 92)
WGIARLFESGDQKDEAEKAKRMKEWMKRIKTTASEDEQEEM ANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 183)
Neoleucina- PKKKIQIMAEEALKDALSILNIVKTNSPPAEEQLERFAKRFERNL 4 WGIARLFESGDQKDEAEKAKRMIEWMKRIKTTASEDEQEEMA (ou seja, NAIITILQSWFFS (SEQ ID NO: 93) IL4_G2_neo PKKKIQIMAEEALKDALSILNIVKTNSPPAEEQLERFAKRFERNL 2_40_1F_se WGIARLFESGDQKDEAEKAKRMIEWMKRIKTTASEDEQEEMA q36_S11_MI NAIITILQSWFFS (SEQ ID NO: 184) F) Neoleucina- PKKKIQLHAEHALYDALMILNIXXXXXXXXXXXLEDYAFNFELIL 2/15_R50C EEIACLFESGXXKDEAEKAKRMKEWMKRIKTXXXEDEQEEMA NAIITILQSWIFS* (SEQ ID NO: 275) Neoleucina- PKKKIQLHAEHALYDALMILNIXXXXXXXXXXXLEDYAFNFELIL 2/15_E53C EEIARLFCSGXXKDEAEKAKRMKEWMKRIKTXXXEDEQEEMA NAIITILQSWIFS* (SEQ ID NO: 276) Neoleucina- PKKKIQLHAEHALYDALMILNIXXXXXXXXXXXLEDYAFNFELIL 2/15_D56C EEIARLFESGCQKDEAEKAKRMKEWMKRIKTXXXEDEQEEMA NAIITILQSWIFS* (SEQ ID NO: 277) Neoleucina- PKKKIQLHAEHALYDALMILNIXXXXXXXXXXXLEDYAFNFELIL 2/15_K58C EEIARLFESGXXCDEAEKAKRMKEWMKRIKTXXXEDEQEEMA NAIITILQSWIFS* (SEQ ID NO: 278) Neoleucina- PKKKIQLHAEHALYDALMILNIXXXXXXXXXXXLEDYAFNFELIL 2/15_D59C EEIARLFESGXXKCEAEKAKRMKEWMKRIKTXXXEDEQEEMA NAIITILQSWIFS* (SEQ ID NO: 279) Neoleucina- PKKKIQLHAEHALYDALMILNIXXXXXXXXXXXLEDYAFNFELIL 2/15_E62C EEIARLFESGXXKDEACKAKRMKEWMKRIKTXXXEDEQEEMA NAIITILQSWIFS* (SEQ ID NO: 280) Neoleucina- PKKKIQLHAEHALYDALMILNIXXXXXXXXXXXLEDYAFNFELIL 2/15_R66C EEIARLFESGXXKDEAEKAKCMKEWMKRIKTXXXEDEQEEMA NAIITILQSWIFS* (SEQ ID NO: 281) Neoleucina- PKKKIQLHAEHALYDALMILNIXXXXXXXXXXXLEDYAFNFELIL 2/15_E69C EEIARLFESGXXKDEAEKAKRMKCWMKRIKTXXXEDEQEEMA NAIITILQSWIFS* (SEQ ID NO: 282) Neoleucina- PKKKIQLHAEHALYDALMILNIXXXXXXXXXXXLEDYAFNFELIL 2/15_R73C EEIARLFESGXXKDEAEKAKRMKEWMKCIKTXXXEDEQEEMA NAIITILQSWIFS* (SEQ ID NO: 283) Neoleucina- PKKKIQLHAEHALYDALMILNIXXXXXXXXXXXLEDYAFNFELIL 2/15_T77C EEIARLFESGXXKDEAEKAKRMKEWMKRIKTCASEDEQEEMA NAIITILQSWIFS* (SEQ ID NO: 284) Neoleucina- PKKKIQLHAEHALYDALMILNIXXXXXXXXXXXLEDYAFNFELIL 2/15_E82C EEIARLFESGXXKDEAEKAKRMKEWMKRIKTXXXEDCQEEMA
NAIITILQSWIFS* (SEQ ID NO: 285) Neoleucina- PKKKIQLHAEHALYDALMILNIXXXXXXXXXXXLEDYAFNFELIL 2/15_E85C EEIARLFESGXXKDEAEKAKRMKEWMKRIKTXXXEDEQECMA NAIITILQSWIFS* (SEQ ID NO: 286) Neoleucina- PKKKIQLHAEHALYDALMILNIXXXXXXXXXXXLEDYAFNFELIL 2/15_R50C_ EEIACLFESGXXKDEAEKAKRMKEWMKCIKTXXXEDEQEEMA R73C NAIITILQSWIFS* (SEQ ID NO: 287) Neoleucina- PKKKIQLHAEHALYDALMILNIXXXXXXXXXXXLEDYAFNFELIL 2/15_E53C_ EEIARLFCSGXXKDEAEKAKRMKEWMKCIKTXXXEDEQEEMA R73C NAIITILQSWIFS* (SEQ ID NO: 288) Neoleucina- PKKKIQLHAEHALYDALMILNIXXXXXXXXXXXLEDYAFNFELIL 2/15_D56C_ EEIARLFESGCQKDEAEKAKRMKEWMKCIKTXXXEDEQEEMA R73C NAIITILQSWIFS* (SEQ ID NO: 289) Neoleucina- PKKKIQLHAEHALYDALMILNIXXXXXXXXXXXLEDYAFNFELIL 2/15_K58C_ EEIARLFESGXXCDEAEKAKRMKEWMKCIKTXXXEDEQEEMA R73C NAIITILQSWIFS* (SEQ ID NO: 290) Neoleucina- PKKKIQLHAEHALYDALMILNIXXXXXXXXXXXLEDYAFNFELIL 2/15_D59C_ EEIARLFESGXXKCEAEKAKRMKEWMKCIKTXXXEDEQEEMA R73C NAIITILQSWIFS* (SEQ ID NO: 291) Neoleucina- PKKKIQLHAEHALYDALMILNIXXXXXXXXXXXLEDYAFNFELIL 2/15_R66C_ EEIARLFESGXXKDEAEKAKCMKEWMKCIKTXXXEDEQEEMA R73C NAIITILQSWIFS* (SEQ ID NO: 292) Neoleucina- PKKKIQLHAEHALYDALMILNIXXXXXXXXXXXLEDYAFNFELIL 2/15_R50C_ EEIACLFESGXXKDEAEKAKRMKEWMKRIKTXXXEDCQEEMA E82C NAIITILQSWIFS* (SEQ ID NO: 293) Neoleucina- PKKKIQLHAEHALYDALMILNIXXXXXXXXXXXLEDYAFNFELIL 2/15_E53C_ EEIARLFCSGXXKDEAEKAKRMKEWMKRIKTXXXEDCQEEMA E82C NAIITILQSWIFS* (SEQ ID NO: 294) Neoleucina- PKKKIQLHAEHALYDALMILNIXXXXXXXXXXXLEDYAFNFELIL 2/15_D56C_ EEIARLFESGCQKDEAEKAKRMKEWMKRIKTXXXEDCQEEMA E82C NAIITILQSWIFS* (SEQ ID NO: 295) Neoleucina- PKKKIQLHAEHALYDALMILNIXXXXXXXXXXXLEDYAFNFELIL 2/15_K58C_ EEIARLFESGXXCDEAEKAKRMKEWMKRIKTXXXEDCQEEMA E82C NAIITILQSWIFS* (SEQ ID NO: 296) Neoleucina- PKKKIQLHAEHALYDALMILNIXXXXXXXXXXXLEDYAFNFELIL 2/15_D59C_ EEIARLFESGXXKCEAEKAKRMKEWMKRIKTXXXEDCQEEMA E82C NAIITILQSWIFS* (SEQ ID NO: 297) Neoleucina- PKKKIQLHAEHALYDALMILNIXXXXXXXXXXXLEDYAFNFELIL
2/15_E62C_ EEIARLFESGXXKDEACKAKRMKEWMKRIKTXXXEDCQEEMA E82C NAIITILQSWIFS* (SEQ ID NO: 298) Neoleucina- PKKKIQLHAEHALYDALMILNIXXXXXXXXXXXLEDYAFNFELIL 2/15_R66C_ EEIARLFESGXXKDEAEKAKCMKEWMKRIKTXXXEDCQEEMA E82C NAIITILQSWIFS* (SEQ ID NO: 299) Neoleucina- PKKKIQLHAEHALYDALMILNIXXXXXXXXXXXLEDYAFNFELIL 2/15_E69C_ EEIARLFESGXXKDEAEKAKRMKCWMKRIKTXXXEDCQEEMA E82C NAIITILQSWIFS* (SEQ ID NO: 300)
[0461] Em uma modalidade específica, X1, X2, X3 e X4, respectivamente, são 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idênticos, respectivamente, aos domínios X1, X2, X3 e X4 (conforme definido na Tabela 1 (embora listados como domínios H1, H2, H3 e H4) presentes na sequência de aminoácidos da SEQ ID NO: 90 versão 1 ou 2, que têm a mesma sequência de aminoácidos primária, mas que diferem ligeiramente em resíduos de ligante opcionais/variáveis. Em várias modalidades, essa modalidade pode incluir variantes dos domínios X1, X2, X3 e/ou X4 presentes na SEQ ID NO: 90 versão 1 ou 2 que incorporam as mutações em relação à sequência de aminoácidos primária SEQ ID NO: 90 mostrada em SEQ ID NOs: 275-300.
[0462] Em uma modalidade de qualquer modalidade ou combinação de modalidades aqui divulgadas, X1, X2, X3 e X4 são domínios alfa-helicoidais. Em outra modalidade, o comprimento de aminoácido de cada um de X1, X2, X3 e X4 é, independentemente, pelo menos cerca de 8, 10, 12, 14, 16, 19 ou mais aminoácidos de comprimento. Em outras modalidades, o comprimento de aminoácido de cada um de X1, X2, X3 e X4 é, independentemente, não mais do que 1.000, 500, 400, 300, 200, 100 ou 50 aminoácidos de comprimento. Em várias outras modalidades, o comprimento de aminoácido de cada um de X1, X2, X3 e X4 é independentemente entre cerca de 8 a 1.000, 8 a 500, 8 a 400, 8 a 300, 8 a 200, 8 a 100, 8 a 50, 10 a 1.000, 10 a 500, 10 a 400, 10 a 300, 10 a 200, 10 a 100, 10 a 50, 12 a 1.000, 12 a 500, 12 a 400, 12 a 300, 12 a 200, 12 a 100, 12 a 50, 14 a 1.000, 14 a 500, 14 a 400, 14 a 300, 14 a 200, 14 a 100, 14 a 50, 16 a 1.000, 16 a 500, 16 a 400, 16 a 300, 16 a 200, 16 a 100, 16 a 50, 19 a 1.000, 19 a 500, 19 a 400, 19 a 300, 19 a 200, 19 a 100 ou cerca de 19 a 50 aminoácidos de comprimento.
[0463] Em uma modalidade, o primeiro componente polipeptídico e/ou o segundo componente polipeptídico incluem pelo menos uma ligação dissulfeto.
[0464] Em outra modalidade, o primeiro componente polipeptídico e o segundo componente polipeptídico estão associados de forma não covalente. Como observado aqui, o primeiro componente polipeptídico e o segundo componente polipeptídico não são agonistas de receptor ativos individualmente, e em que o primeiro componente polipeptídico e o segundo polipeptídeo interagem para formar um agonista ativo do heterodímero c do receptor de IL-2 (IL-2R c), heterodímero c do receptor de IL-4 (IL-4R c), IL-13 alfa ou heterodímero IL-4Ralfa/IL13Ralfa. Assim, nessa modalidade, o primeiro polipeptídeo e o segundo polipeptídeo podem interagir para formar um agonista ativo. Essa interação pode ser qualquer interação adequada, como uma interação não covalente. A interação pode compreender a ligação não covalente direta do primeiro e do segundo polipeptídeos, ou uma interação indireta. Em uma modalidade, o primeiro componente polipeptídico e o segundo componente polipeptídico estão indiretamente ligados um ao outro através de um receptor, tal como um heterodímero c do receptor de IL-2 (IL-2R c), um heterodímero c do receptor de IL-4 (IL-4R c), IL-13 alfa ou um heterodímero IL-4Ralfa/IL13Ralfa.
[0465] Os métodos de determinação da ligação a receptores são conhecidos na técnica e descritos aqui, por exemplo, ensaios de ligação de interferometria de biocamada. Em algumas modalidades, quando o primeiro componente polipeptídico e o segundo polipeptídeo interagem em seu receptor pretendido, eles colocalizam para se ligar a esse receptor com uma afinidade de ligação de 1.000 nm ou menos, 200 nm ou menos, 100 nm ou menos, 50 nM ou menos ou 25 nM ou menos. Por exemplo, um mimético de IL-2 dividida da presente invenção irá colocalizar para se ligar ao heterodímero c do receptor de IL-2 (IL-2R c) com uma afinidade de ligação de 1.000 nm ou menos, 200 nm ou menos, 100 nm ou menos, 50 nM ou menos ou 25 nM ou menos. Da mesma forma, como um exemplo, um mimético de IL-4 dividida da presente invenção irá colocalizar para se ligar ao heterodímero c do receptor de IL-4 (IL-4R c) com uma afinidade de ligação de 1.000 nm ou menos, 200 nm ou menos, 100 nm ou menos, 50 nM ou menos ou 25 nM ou menos. Em alguns aspectos, o agonismo do receptor ao qual os agentes miméticos divididos colocalizam e se ligam é medido por fosforilação de STAT5.
[0466] Em outro aspecto, a divulgação fornece polipeptídeos compreendendo 1, 2 ou 3, mas não todos os 4 domínios X1, X2, X3 e X4, em que:
[0467] (a) X1, quando presente, é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos de pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica ao comprimento total do peptídeo (PKKKIQ)LHAEHALYDAL(MILNI); (SEQ ID NO: 4);
[0468] (b) X2, quando presente, é qualquer domínio de peptídeo helicoidal;
[0469] (c) X3, quando presente, é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos de pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica ao comprimento total do peptídeo (LE)DYAFNFELILEE(IARLFESG) (SEQ ID NO: 5); e
[0470] (d) X4, quando presente, é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica ao comprimento total do peptídeo (EDEQEEMANAI)ITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 6); e
[0471] resíduos de aminoácidos entre parênteses podem estar presentes ou ausentes.
[0472] Os polipeptídeos deste aspecto podem ser usados, por exemplo, para gerar os agonistas do receptor condicionalmente ativos de qualquer modalidade ou combinação de modalidades aqui divulgadas (isto é: os polipeptídeos deste aspecto são o primeiro polipeptídeo ou o segundo polipeptídeo dos agonistas do receptor condicionalmente ativos da divulgação). Assim, como ficará claro para os versados na técnica, todas as modalidades e combinações de modalidades do primeiro e segundo polipeptídeos divulgados acima, todas as modalidades e combinações de modalidades dos domínios X1, X2, X3 e X4 descritos acima são igualmente aplicáveis aos polipeptídeos deste aspecto da divulgação. Em uma modalidade,
[0473] (a) substituições de aminoácidos (AA) em X1 em relação à sequência AA de SEQ ID NO: 4 ocorrem em não mais de 3 resíduos AA marcados em fonte em negrito, ou ocorrem em não mais de 2 resíduos AA marcados em fonte em negrito, ou ocorrem em não mais de 1 resíduo AA marcado em negrito, ou não ocorrem em resíduos AA marcados em negrito;
[0474] (b) substituições de AA em X3 em relação à sequência AA de SEQ ID NO: 5 ocorrem em não mais de 3 resíduos AA marcados em fonte em negrito, ou ocorrem em não mais de 2 resíduos AA marcados em fonte em negrito, ou ocorrem em não mais de 1 AA resíduo marcado em fonte em negrito, ou não ocorrem em resíduos AA marcados em fonte em negrito; e/ou
[0475] (c) substituições de AA em X4 em relação à sequência AA de SEQ ID NO: 6 ocorrem em não mais do que 2 resíduos AA marcados em fonte em negrito, ou ocorrem em não mais do que 1 resíduo AA marcado em negrito, ou não ocorrem nos resíduos AA marcados em negrito.
[0476] Em outra modalidade, as substituições de AA em X2 em relação à sequência AA de SEQ ID NO: 7 não ocorrem nos resíduos AA marcados em negrito.
[0477] Em várias modalidades, o polipeptídeo pode ser selecionado a partir do grupo que consiste em:
[0478] (i) um polipeptídeo compreendendo X1 e excluindo X2, X3 e X4;
[0479] (ii) um polipeptídeo compreendendo X2 e excluindo X1, X3 e X4;
[0480] (iii) um polipeptídeo compreendendo X3 e excluindo X1, X2 e X4;
[0481] (iv) um polipeptídeo compreendendo X4 e excluindo X1, X2 e X3;
[0482] (v) um polipeptídeo compreendendo X1 e X2, e excluindo X3 e X4;
[0483] (vi) um polipeptídeo compreendendo X1 e X3, e excluindo X2 e X4;
[0484] (vii) um polipeptídeo compreendendo X1 e X4, e excluindo X2 e X3;
[0485] (viii) um polipeptídeo compreendendo X2 e X3, e excluindo X1 e X4;
[0486] (ix) um polipeptídeo compreendendo X2 e X4, e excluindo X1 e X3;
[0487] (x) um polipeptídeo compreendendo X3 e X4, e excluindo X1 e X2;
[0488] (xi) um polipeptídeo compreendendo X1, X2 e X3 e excluindo X4;
[0489] (xii) um polipeptídeo compreendendo X1, X2 e X4 e excluindo X3;
[0490] (xiii) um polipeptídeo compreendendo X1, X3 e X4 e excluindo X2; e
[0491] (xiv) um polipeptídeo compreendendo X2, X3 e X4 e excluindo X1.
[0492] Em uma modalidade, o polipeptídeo compreende a sequência de aminoácidos pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica a um primeiro polipeptídeo ou um segundo polipeptídeo listado abaixo (resíduos sublinhados são opcionais e cada resíduo opcional, quando presente, pode compreender qualquer aminoácido):
[0493] (i)
[0494] Primeiro polipeptídeo X1 (Neo2A) PKKKIQLHAEHALYDALMILNIVKTNS (SEQ ID NO: 256) e
[0495] Segundo polipeptídeo: X3-X2 -X4 (Neo2B)
TNSPPAEEKLEDYAFNFELILEEIARLFESGDQKDEAEKAKRMKEWMKRIKTTA SEDEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 257)
[0496] (ii)
[0497] Primeiro polipeptídeo X1-X3-X2
PKKKIQLHAEHALYDALMILNIVKTNSPPAEEKLEDYAFNFELILEEIARLFESGD QKDEAEKAKRMKEWMKRIKTTAS (SEQ ID NO: 258) e
[0498] Segundo polipeptídeo X4 TTASEDEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 259);
[0499] (iii)
[0500] Primeiro polipeptídeo X1-X3
PKKKIQLHAEHALYDALMILNIVKTNSPPAEEKLEDYAFNFELILEEIARLFESGD (SEQ ID NO: 260) e
[0501] Segundo polipeptídeo X2-X4 DQKDEAEKAKRMKEWMKRIKTTASEDEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 261)
[0502] (iv)
[0503] Primeiro polipeptídeo X1 (Neo4A) PKKKIQIMAEEALKDALSILNIVKTNS (SEQ ID NO: 262)
[0504] Segundo polipeptídeo X3-X2 -X4 (Neo4B)
ASEDEQEEMANAIITILQSWFFS (SEQ ID NO: 263)
[0505] (v)
[0506] Primeiro polipeptídeo X1 (Neo2A) PKKKIQLHAEHALYDALMILNIXXXXX (SEQ ID NO: 311) e
[0507] Segundo polipeptídeo: X3-X2 -X4 (Neo2B)
XXXXXXXXXLEDYAFNFELILEEIARLFESGXXKDEAEKAKRMKEWMKRIKTXX XEDEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 264)
[0508] (vi)
[0509] Primeiro polipeptídeo X1-X3-X2
PKKKIQLHAEHALYDALMILNIXXXXXXXXXXXLEDYAFNFELILEEIARLFESGX XKDEAEKAKRMKEWMKRIKTTAS (SEQ ID NO: 265) e
[0510] Segundo polipeptídeo X4 XXXXXDEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 266);
[0511] (vii)
[0512] Primeiro polipeptídeo X1-X3
PKKKIQLHAEHALYDALMILNIXXXXXXXXXXXLEDYAFNFELILEEIARLFESXX GD (SEQ ID NO: 267) e
[0513] Segundo polipeptídeo X2-X4 DQKDEAEKAKRMKEWMKRIKTXXXEDEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 268)
[0514] (viii)
[0515] Primeiro polipeptídeo X1 (Neo4A) PKKKIQIMAEEALKDALSILNIXXXXX (SEQ ID NO: 269)
[0516] Segundo polipeptídeo X3-X2 -X4 (Neo4B)
XXXXXXXXQLERFAKRFERNLWGIARLFESGXXKDEAEKAKRMIEWMKRIKTX XXEDEQEEMANAIITILQSWFFS(SEQ ID NO: 270)
[0517] (ix)
[0518] Primeiro polipeptídeo >Neo4_H1-H3
[0519] PKKKIQIMAEEALKDALSILNIVKTNSPPAEEQ LERFAKRFERNLWGIARLFESGD (SEQ ID NO: 312)
[0520] Segundo polipeptídeo >Neo4_H2-H4
[0521] DQKDEAEKAKRMIEWMKRIKTTASEDEQEE MANAIITILQSWFFS (SEQ ID NO: 313)
[0522] (x)
[0523] Primeiro polipeptídeo >Neo4_H1-H3
[0524] PKKKIQIMAEEALKDALSILNIXXXXXXXXXXQ LERFAKRFERNLWGIARLFESXX (SEQ ID NO: 314)
[0525] Segundo polipeptídeo >Neo4_H2-H4
[0526] XXKDEAEKAKRMIEWMKRIKXXXXEDEQEE MANAIITILQSWFFS (SEQ ID NO: 315)
[0527] (xi)
[0528] Primeiro polipeptídeo Neo4_H1-H3 -H2
[0529] PKKKIQIMAEEALKDALSILNIVKTNSPPAEEQ LERFAKRFERNLWGIARLFESGDQKDEAEKAKRMIEWMKRIKTTA (SEQ ID NO: 316)
[0530] Segundo polipeptídeo Neo4_H4
[0531] TTASEDEQEEMANAIITILQSWFFS (SEQ ID NO: 317)
[0532] (xii)
[0533] Primeiro polipeptídeo Neo4_H1-H3 -H2
[0534] PKKKIQIMAEEALKDALSILNIXXXXXXXXXXX LERFAKRFERNLWGIARLFESXXXKDEAEKAKRMIEWMKRIKXXX (SEQ ID NO: 318)
[0535] Segundo polipeptídeo Neo4_H4
[0536] XXXXXDEQEEMANAIITILQSWFFS (SEQ ID NO: 319);
[0537] (xiii)
[0538] Primeiro polipeptídeo (X1)
[0539] PKKKIQLHAEHALYDALMILNIVGGSS (SEQ ID NO: 323), ou SKEAIQLHAEHALYDALMILNIVKTNS (SEQ ID NO: 324), ou
[0540] PIQLHAEHALYDALMILNIV (SEQ ID NO: 325)
[0541] Segundo polipeptídeo (X3-X2 - X4)PKLEDYAFNFELILEEIARLFESGDQKDEAEKAKRMKEWMKRIKTTASEDE QEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 326); ou
[0542] GGSSGGLEDYAFNFELILEEIARLFESGGSS GGKDEAEKAKRMKEWMKRITGGSSGGDEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 327); ou
[0543] GGSSGGLEDYAFNFELILEEIARLFESGGSS GGGGEAEKAKRMKEWMKRIGGSSGGDEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 328).
[0544] Em modalidades exemplificativas, o polipeptídeo compreende uma sequência de aminoácidos pelo menos 80% idêntica a um primeiro ou segundo polipeptídeos mostrados nas modalidades (i) - ( iii) acima (res duos sublinhados ou res duos X s o opcionais e cada res duo do domínio opcional, quando presente, pode compreender qualquer aminoácido).
[0545] Em modalidades exemplificativas, o polipeptídeo compreende uma sequência de aminoácidos pelo menos 90% idêntica a um primeiro ou segundo polipeptídeos mostrados nas modalidades (i) - ( iii) acima (res duos sublinhados ou res duos X s o opcionais e cada res duo do domínio opcional, quando presente, pode compreender qualquer aminoácido).
[0546] Em modalidades exemplificativas, o polipeptídeo compreende uma sequência de aminoácidos pelo menos 100% idêntica a um primeiro ou segundo polipeptídeos mostrados nas modalidades (i) - ( iii) acima (res duos sublinhados ou res duos X s o opcionais e cada res duo do domínio opcional, quando presente, pode compreender qualquer aminoácido).
[0547] Em outra modalidade, X1, X2, X3 e X4, quando presentes, compreendem a sequência de aminoácidos pelo menos 25%, 27%,
30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica, respectivamente, a domínios X1, X2, X3 e X4 (conforme definido na Tabela 1) presentes dentro da sequência de aminoácidos selecionada a partir do grupo que consiste em SEQ ID NOs: 11-94, 190-216, 247 e SEQ ID NOs: 275-300. Em uma modalidade específica, X1, X2, X3 e X4, quando presentes, compreendem a sequência de aminoácidos pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica, respectivamente, a domínios X1, X2, X3 e X4 (conforme definido na Tabela 1 (embora listados como domínios H1, H2, H3 e H4) presentes na sequência de aminoácidos de SEQ ID NO: 90 versões 1 ou 2, que têm a mesma sequência de aminoácidos primária, mas que diferem ligeiramente em resíduos de ligante opcionais/variáveis. Em várias modalidades, essa modalidade pode incluir variantes dos domínios X1, X2, X3 e/ou X4 presentes na SEQ ID NO: 90 versão 1 ou 2 que incorporam as mutações em relação à sequência de aminoácidos primária SEQ ID NO: 90 mostrada nas SEQ ID NOs: 275-300.
[0548] Os primeiros polipeptídeos, segundos polipeptídeos e polipeptídeos aqui descritos podem ser sintetizados quimicamente ou expressos de forma recombinante (quando o polipeptídeo é geneticamente codificado). Os polipeptídeos podem ser ligados a outros compostos, tais como compostos de estabilização para promover um aumento da meia-vida in vivo, incluindo, mas sem limitação à albumina, PEGuilação (ligação de uma ou mais cadeias de polietilenoglicol), HESilação, PASilação, glicosilação ou pode ser produzido como uma fusão Fc ou em variantes desimunizadas. Essa ligação pode ser covalente ou não covalente. Por exemplo, a adi o de por es contendo polietilenoglicol ( PEG ) pode compreender a liga o de um grupo PEG ligado ao grupo maleimida ( PEG-MAL ) a um res duo de cisteína do polipeptídeo. Exemplos adequados de PEG-MAL são metóxi PEG-MAL de 5 kD; metóxi PEG-MAL de 20 kD; metóxi (PEG)2-MAL de 40 kD; metóxi PEG(MAL)2 de 5 kD; metóxi PEG(MAL)2 de 20 kD; metóxi PEG(MAL)2 de 40 kD; ou qualquer combinação dos mesmos. Ver também Patente nº U.S.
8.148.109. Em outras modalidades, o PEG pode compreender PEGs de cadeia ramificada e/ou múltiplas cadeias de PEG.
[0549] Em uma modalidade, o composto de estabilização, incluindo, mas sem limitação a uma porção contendo PEG, está ligado a um resíduo de cisteína no polipeptídeo. Em outra modalidade, o resíduo de cisteína está presente no domínio X2. Em algumas modalidades, o resíduo de cisteína está presente, por exemplo, em qualquer uma de uma série de posições no domínio X2. Em algumas dessas modalidades, o domínio X2 tem pelo menos 19 aminoácidos de comprimento e o resíduo de cisteína está nas posições 1, 2, 5, 9 ou 16 em relação a esses 19 aminoácidos. Em uma outra modalidade, o composto de estabilização, incluindo, mas sem limitação a uma porção contendo PEG, está ligado ao resíduo de cisteína por meio de um grupo maleimida.
[0550] Em uma outra modalidade, os primeiros polipeptídeos, segundos polipeptídeos e polipeptídeos podem compreender ainda um domínio de direcionamento. Nessa modalidade, o agonista do receptor condicional pode ser direcionado a um alvo de interesse. O domínio de direcionamento pode ser covalentemente ou não covalentemente ligado ao primeiro polipeptídeo, segundo polipeptídeo e/ou polipeptídeo. Em modalidades em que o domínio de direcionamento é ligado não covalentemente, qualquer meio adequado para tal ligação não covalente pode ser usado, incluindo, mas sem limitação a ligantes de estreptavidina-biotina.
[0551] Em outra modalidade, o domínio de direcionamento, quando presente, é uma fusão de tradução com o polipeptídeo. Nessa modalidade, o polipeptídeo e o domínio de direcionamento podem confinar diretamente um ao outro na fusão de tradução ou podem ser ligados por um ligante polipeptídico adequado para uma finalidade pretendida. Exemplos de tais ligantes incluem, mas sem limitação aos divulgados nos documentos WO2016178905, WO2018153865 (em particular, na página 13) e WO
2018170179 (em particular, nos parágrafos [0316] a [0317]). Em outras modalidades, ligantes adequados incluem, mas sem limitação a ligantes de peptídeo, como GGGGG (SEQ ID NO: 95), GSGGG (SEQ ID NO: 96), GGGGGG (SEQ ID NO: 97), GGSGGG (SEQ ID NO: 98), GGSGGSGGGSGGSGSG (SEQ ID NO: 99), GSGGSGGGSGGSGSG (SEQ ID NO: 100), GGSGGSGGGSGGSGGGGSGGSGGGSGGGGS (SEQ ID NO: 101) e [GGGGX]n (SEQ ID NO: 102), em que X é Q, E ou S e n é 2-5.
[0552] Os domínios de direcionamento são domínios polipeptídicos ou pequenas moléculas que se ligam a um alvo de interesse. Em uma modalidade não limitativa, o domínio de direcionamento se liga a uma proteína da superfície celular; nessa modalidade, a célula pode ser qualquer tipo de célula de interesse que inclui uma proteína de superfície que pode ser ligada por um domínio de direcionamento adequado. Em uma modalidade, as proteínas da superfície celular estão presentes na superfície das células selecionadas do grupo que consiste em células tumorais, células de componentes vasculares tumorais, células do microambiente tumoral (por exemplo, fibroblastos, células imunológicas infiltrantes ou elementos do estroma), outras células cancerosas e células (incluindo, mas sem limitação a células T CD8+, células T regulatórias, células dendríticas, células NK ou macrófagos). Quando a proteína de superfície celular está sobre a superfície de uma célula tumoral, célula de componente vascular ou célula de microambiente tumoral (por exemplo, fibroblastos, células imunes infiltrantes ou elementos do estroma), qualquer marcador de superfície celular de célula tumoral, célula de componente vascular ou célula de microambiente tumoral pode ser alvejado incluindo, mas sem limitação a EGFR, EGFRvIII, Her2, HER3, EpCAM, MSLN, MUC16, PSMA, TROP2, ROR1, RON, PD-L1, CD47, CTLA-4, CD5, CD19, CD20, CD25, CD37, CD30, CD33, CD40, CD45, CAMPATH-1, BCMA, CS-1, PD-L1, B7-H3, B7-DC, HLD-DR, antígeno carcinoembriônico (CEA), TAG-72, EpCAM, MUC1, proteína de ligação ao folato, A33, G250, antígeno de membrana específica da próstata (PSMA), ferritina, GD2, GD3, GM2, Le y, CA-125, CA19-9, fator de crescimento espidérmico,
p185HER2, receptor de IL-2, EGFRvIII (de2-7 EGFR), proteína de ativação de fibroblastos, tenascina, uma metaloproteinase, endosialina, fator de crescimento endotelial vascular, avB3, WT1, LMP2, HPV E6, HPV E7, Her-2/neu, MAGE A3, não mutante p53, NY-ESO-1, MelanA/MART1, mutante Ras, gp100, mutante p53, PR1, bcr-abl, tironsinase, survivina, PSA, hTERT, uma proteína de ponto de interrupção de translocação de sarcoma, EphA2, PAP, ML-IAP, AFP, ERG, NA17, PAX3, ALK, receptor de andrógeno, ciclina B 1, ácido polisiálico, MYCN, RhoC, TRP-2, fucosila GM1, mesotelina (MSLN), PSCA, MAGE Al, sLe (animal), CYP1B1, PLAV1, GM3, BORIS, Tn, GloboH, ETV6-AML, NY-BR-1, RGS5, SART3, STn, anidrase carbônica IX, PAX5, proteína 17 do esperma OY-TESL, LCK, HMWMAA, AKAP-4, SSX2, XAGE 1, Legumaína, Tie 3, VEGFR2, MAD- CT-1, PDGFR-B, MAD-CT-2, ROR2, TRAIL1, MUC16, MAGE A4, MAGE C2, GAGE, EGFR, CMET, HER3, MUC15, CA6, NAPI2B, TROP2, CLDN6, CLDN16, CLDN18.2, CLorf186, RON, LY6E, FRA, DLL3, PTK7, STRA6, TMPRSS3, TMPRSS4, TMEM238, UPK1B, VTCN1, LIV1, ROR1, antígeno 1 relacionado a Fos, BMPR1B (receptor de proteína morfogenética óssea tipo IB, número de acesso no Genbank NM- 001203); E16 (LAT1, SLC7A5, número de acesso no Genbank NM-003486); STEAP1 (seis antígenos epiteliais transmembranares da próstata, número de acesso no Genbank NM-012449); 0772P (CA125, MUC16, número de acesso no Genbank AF361486); MPF (MPF, MSLN, SMR, fator de potencialização de megacariócitos, mesotelina, número de acesso no Genbank NM-005823); Napi3b (NAPI-3B, NPTIIb, SLC34A2, família de transportadores de soluto 34 (fosfato de sódio), membro 2, transportador de fosfato 3b dependente de sódio tipo II, número de acesso no Genbank NM-006424); Sema 5b (FLJ10372, KIAA1445, Mm. 42015, SEMA5B, SEMAG, Semaforina 5b Hlog, domínio sema, sete repetições de trombospondina (tipo 1 e semelhante ao tipo 1), domínio transmembranar (TM) e domínio citoplasmático curto, (semaforina) 5B, número de acesso no Genbank AB040878); PSCA hlg (2700050C12Rik, C530008O16Rik, RIKEN cDNA 2700050C12, gene 2700050C12 RIKEN cDNA, número de acesso no Genbank AY358628); ETBR (receptor de endotelina tipo
B, número de acesso no Genbank AY275463); MSG783 (RNF124, proteína hipotética FLJ20315, número de acesso no Genbank NM 017763); STEAP2 (HGNC.sub.--8639, IPCA-1, PCANAP1, STAMP1, STEAP2, STMP, gene associado ao câncer de próstata 1, proteína associada ao câncer de próstata 1, seis antígenos epiteliais transmembranares da próstata 2, seis proteínas transmembranares da próstata, número de acesso no Genbank AF455138); TrpM4 (BR22450, FLJ20041, TRPM4, TRPM4B, canal catiônico de potencial receptor transiente, subfamília M, membro 4, número de acesso no Genbank NM 017636); CRIPTO (CR, CR1, CRGF, CRIPTO, TDGF1, fator de crescimento derivado de teratocarcinoma, número de acesso no Genbank NP003203 ou NM003212); CD21 (CR2 (receptor 2 do complemento) ou C3DR (receptor do vírus C3d/Epstein Barr) ou Hs. 73792, número de acesso ao Genbank M26004); CD79b (IGb (beta associado a imunoglobulina), B29, número de acesso ao Genbank NM 000626); FcRH2 (IFGP4, IRTA4, SPAP1A (domínio SH2 contendo proteína âncora de fosfatase 1a), SPAP1B, SPAP1C, número de acesso ao Genbank NM030764); HER2 (número de acesso ao Genbank M11730); NCA (número de acesso ao Genbank M18728); MDP (número de acesso ao Gnebank BC017023); IL20R.alfa. (Número de acesso ao Genbank AF184971); Brevican (número de acesso ao Genbank AF229053); Ephb2R (número de acesso ao Genbank NM004442); ASLG659 (número de acesso ao Genbank AX092328); PSCA (número de acesso ao Genbank AJ297436); GEDA (número de acesso ao Genbank AY260763); BAFF-R (número de acesso ao Genbank NP443177.1); CD22 (número de acesso ao Genbank NP-001762.1); CD79a (CD79A, CD79.alfa., alfa associado a imunoglobulina, uma proteína específica de células B que interage covalentemente com Ig beta (CD79B) e forma um complexo na superfície com moléculas de Ig M, transduz um sinal envolvido na diferenciação de células B, número de acesso ao Genbank NP001774.1); CXCR5 (receptor de linfoma de Burkitt 1, um receptor acoplado à proteína G que é ativado pela quimiocina CXCL13, funções na migração de linfócitos e defesa humoral, desempenha um papel na infecção por HIV-2 e talvez no desenvolvimento de
AIDS, linfoma, mieloma e leucemia, número de acesso ao Genbank NP001707.1); HLA-DOB (subunidade beta da molécula MHC de classe II (antígeno Ia) que se liga a peptídeos e os apresenta a linfócitos T CD4+, número de acesso ao Genbank NP002111.1); P2X5 (canal 5 de íon bloqueado por ligante do receptor purinérgico P2X, um canal de íon bloqueado por ATP extracelular, pode estar envolvido na transmissão sináptica e neurogênese, a deficiência pode contribuir para a fisiopatologia da instabilidade idiopática do detrusor, número de acesso ao Genbank NP002552.2); CD72 (antígeno de diferenciação de células B CD72, Lyb-2, número de acesso ao Genbank NP001773.1); LY64 (antígeno linfocitário 64 (RP105), proteína de membrana tipo I da família de repetição rica em leucina (LRR), regula a ativação de células B e apoptose, a perda de função está associada ao aumento da atividade da doença em pacientes com lúpus eritematoso sistêmico, número de acesso ao Genbank NP005573.1); FCRH1 (proteína 1 semelhante a receptor Fc, um receptor putativo para o domínio Fc de imunoglobulina que contém domínios semelhantes a Ig tipo C2 e ITAM, pode ter um papel na diferenciação de linfócitos B, número de acesso ao Genbank NP443170.1); ou IRTA2 (translocação do receptor da superfamília de imunoglobulina associada 2, um imunorreceptor putativo com possíveis papéis no desenvolvimento de células B e linfomagenesia; ocorre desregulação do gene por translocação em algumas doenças malignas de células B, número de acesso ao Genbank NP112571.1).
[0553] Em outra modalidade, o domínio de direcionamento se liga a marcadores de superfície de células imunológicas. Nessa modalidade, o alvo pode ser proteínas de superfície celular em qualquer célula imunológica adequada, incluindo, mas sem limitação a células T CD8+, células T regulatórias, células dendríticas, células NK ou macrófagos. O domínio de direcionamento pode ter como alvo qualquer marcador de superfície de célula imunológica adequado (seja uma célula imunológica endógena ou projetada, incluindo, mas sem limitação a células CAR-T projetadas), incluindo, mas sem limitação a CD3, CD4, CD8, CD19, CD20, CD21, CD25, CD37, CD30, CD33,
CD40, CD68, CD123, CD254, PD-1, B7-H3 e CTLA-4. Em outra modalidade, o domínio de direcionamento se liga a PD-1, PDL-1, CTLA-4, TROP2, B7-H3, CD33, CD22, anidrase carbônica IX, CD123, Nectina-4, antígeno de fator de tecido, CD154, B7-H3, B7-H4, FAP (proteína de ativação de fibroblastos) ou MUC16, e/ou onde o domínio de direcionamento se liga a PD-1, PDL-1, CTLA-4, TROP2, B7-H3, CD33, CD22, anidrase carbônica IX, CD123, Nectina- 4, antígeno de fator de tecido, CD154, B7-H3, B7-H4, FAP (proteína de ativação de fibroblastos) ou MUC16.
[0554] Em todas essas modalidades, os domínios de direcionamento podem ser quaisquer polipeptídeos adequados que se ligam a alvos de interesse e podem ser incorporados ao polipeptídeo da divulgação. Em modalidades não limitativas, o domínio de direcionamento pode incluir, mas sem limitação a um scFv, um F(ab), um F(ab') 2, um receptor de células B (BCR), um DARPin, um aficorpo, um monocorpo, um nanocorpo, diacorpo, um anticorpo (incluindo um anticorpo monoespecífico ou biespecífico); um oligopeptídeo de direcionamento de célula incluindo, mas sem limitação a peptídeos de ligação de integrina RGD, ligantes projetados de novo, aptâmeros, um peptídeo de biciclo, conotoxinas, moléculas pequenas, como ácido fólico e um vírus que se liga à superfície da célula.
[0555] Os primeiros polipeptídeos, segundos polipeptídeos e polipeptídeos da divulgação podem incluir resíduos adicionais no N-terminal, C-terminal ou ambos que não estão presentes nos primeiros polipeptídeos, segundos polipeptídeos e polipeptídeos da divulgação; estes resíduos adicionais não estão incluídos na determinação da identidade percentual dos polipeptídeos ou domínios peptídicos da divulgação em relação ao polipeptídeo de referência. Esses resíduos podem ser quaisquer resíduos adequados para um uso pretendido, incluindo, mas sem limitação a marcas de detecção (ou seja: proteínas fluorescentes, marcas de epítopos de anticorpos, etc.), adaptadores, ligantes adequados para fins de purificação (marcas de His, etc.) domínios peptídicos que adicionam funcionalidade aos polipeptídeos, etc.
Os resíduos adequados para a ligação de tais grupos podem incluir resíduos de cisteína, lisina ou p-acetilfenilalanina ou podem ser marcadores, tais como marcadores de aminoácidos adequados para reação com transglutaminases conforme divulgado nas Patentes nº U.S. 9.676.871 e 9.777.070.
[0556] Em um outro aspecto, a presente invenção fornece ácidos nucleicos, incluindo ácidos nucleicos isolados, que codificam os primeiros polipeptídeos, segundos polipeptídeos e polipeptídeos da presente divulgação que podem ser codificados geneticamente. A sequência de ácido nucleico isolada pode compreender RNA ou DNA. Tais sequências de ácido nucleico recombinante podem compreender sequências adicionais úteis para promover a expressão e/ou purificação da proteína codificada, incluindo, porém sem limitação, sequências poliA, sequências Kozak modificadas e sequências que codificam tags de epítopo, sinais de exportação e sinais secretores, sinais de localização nuclear e sinais de localização da membrana plasmática. Será evidente para os versados na técnica, com base nos ensinamentos deste documento, quais sequências de ácido nucleico irão codificar os polipeptídeos da invenção.
[0557] Em outro aspecto, a presente divulgação fornece vetores de expressão compreendendo o ácido nucleico de qualquer aspecto da invenção operacionalmente ligado a uma sequência de controle adequada. Vetor de e press o inclui etores que ligam operati amente uma região ou gene de codificação de ácido nucleico a quaisquer sequências de controle capa es de efetuar a e press o do produto do gene. Sequ ncias de controle operacionalmente ligadas s sequências de ácidos nucleicos da invenção são sequências de ácidos nucleicos capazes de efetuar a expressão das moléculas de ácidos nucleicos. As sequências de controle não precisam ser contíguas às sequências de ácidos nucleicos, desde que funcionem para direcionar sua expressão. Assim, por exemplo, sequências não traduzidas ainda transcritas e intervenientes podem estar presentes entre uma sequência promotora e as sequências de ácido nucleico e a sequência promotora ainda pode ser considerada ligada operacionalmente sequ ncia codificante. Outras sequências de controle incluem, porém sem limitação, sinais de poliadenilação, sinais de terminação e locais de ligação ao ribossomo. Tais vetores de expressão incluem, mas sem limitação a vetores de expressão baseados em plasmídeo e viral. A sequência de controle usada para conduzir a expressão das sequências de ácido nucleico divulgadas em um sistema de mamífero pode ser constitutiva (conduzida por qualquer um de uma variedade de promotores, incluindo, mas sem limitação a, CMV, SV40, RSV, actina, EF) ou induzível (conduzida por qualquer um de uma série de promotores indutíveis incluindo, mas sem limitação a, tetraciclina, ecdisona, responsivo a esteroides). O vetor de expressão pode ser replicável nos organismos hospedeiros como um epissoma ou por integração no DNA cromossômico do hospedeiro. Em várias modalidades, o vetor de expressão pode compreender um plasmídeo, vetor baseado em vírus (incluindo, mas sem limitação a um vetor retroviral ou vírus oncolítico), ou qualquer outro vetor de expressão adequado. Em algumas modalidades, o vetor de expressão pode ser administrado nos métodos da divulgação para expressar os polipeptídeos in vivo para benefício terapêutico. Em modalidades não limitativas, os vetores de expressão podem ser usados para transfectar ou transduzir alvos terapêuticos celulares (incluindo, mas sem limitação a células CAR-T ou células tumorais) para efetuar os métodos terapêuticos aqui divulgados.
[0558] Em um aspecto adicional, a presente divulgação fornece células hospedeiras que compreendem os vetores de expressão e/ou ácidos nucleicos aqui divulgados, em que as células hospedeiras podem ser procarióticas ou eucarióticas. As células podem ser transitoriamente ou estavelmente modificadas para incorporar o vetor de expressão da invenção, usando técnicas incluindo, mas sem limitação a transformações bacterianas, coprecipitação de fosfato de cálcio, eletroporação ou mediada por lipossoma, mediada por DEAE dextrano, mediada por policatiônica, ou transfecção mediada por vírus. (Ver, por exemplo, Molecular Cloning: A Laboratory Manual (Sambrook, et al., 1989, Cold Spring Harbor Laboratory Press); Culture of Animal
Cells: A Manual of Basic Technique, 2a Ed. (R.I. Freshney. 1987. Liss, Inc. Nova York, NY)). Um método de produção de um polipeptídeo de acordo com a invenção é uma parte adicional da invenção. O método compreende as etapas de (a) cultivar um hospedeiro de acordo com este aspecto da invenção em condições que conduzam à expressão do polipeptídeo, e (b) opcionalmente, recuperar o polipeptídeo expresso. O polipeptídeo expresso pode ser recuperado do extrato livre de células, mas preferencialmente eles são recuperados do meio de cultura.
[0559] Em outro aspecto, a presente divulgação fornece composições farmacêuticas, compreendendo um ou mais agonistas de receptor condicionalmente ativos, polipeptídeos, ácidos nucleicos, vetores de expressão e/ou células hospedeiras de qualquer aspecto ou modalidade da divulgação e um transportador farmaceuticamente aceitável. As composições farmacêuticas da divulgação podem ser usadas, por exemplo, nos métodos da divulgação descritos abaixo. A composição farmacêutica pode compreender além da composição e transportador (a) um lioprotetor; (b) um tensoativo; (c) um agente de volume; (d) um agente de ajuste de tonicidade; (e) um estabilizador; (f) um conservante e/ou (g) um tampão.
[0560] Em algumas modalidades, o tampão na composição farmacêutica é um tampão Tris, um tampão histidina, um tampão fosfato, um tampão citrato ou um tampão acetato. A composição farmacêutica também pode incluir um lioprotetor, por exemplo, sacarose, sorbitol ou trealose. Em certas modalidades, a composição farmacêutica inclui um conservante, por exemplo, cloreto de benzalcônio, benzetônio, clorexidina, fenol, m-cresol, álcool benzílico, metilparabeno, propilparabeno, clorobutanol, o-cresol, p-cresol, clorocresol, nitrato fenilmercúrico, timerosal, ácido benzoico e várias misturas dos mesmos. Em outras modalidades, a composição farmacêutica inclui um agente de volume, como glicina. Em ainda outras modalidades, a composição farmacêutica inclui um tensoativo, por exemplo, polissorbato-20, polissorbato- 40, polissorbato-60, polissorbato-65, polissorbato-80, polissorbato-85,
poloxâmero-188, monolaurato de sorbitano, monopalmitato de sorbitano, monostearato de sorbitano, sorbitano monooleato, trilaurato de sorbitano, tristearato de sorbitano, trioleasto de sorbitano ou uma combinação dos mesmos. A composição farmacêutica também pode incluir um agente de ajuste de tonicidade, por exemplo, um composto que torna a formulação substancialmente isotônica ou iso-osmótica com sangue humano. Agentes de ajuste de tonicidade exemplificativos incluem sacarose, sorbitol, glicina, metionina, manitol, dextrose, inositol, cloreto de sódio, arginina e cloridrato de arginina. Em outras modalidades, a composição farmacêutica inclui adicionalmente um estabilizador, por exemplo, uma molécula que, quando combinada com uma composição à base de proteína, impede ou reduz substancialmente a instabilidade química e/ou física da proteína na forma liofilizada ou líquida. Estabilizadores exemplares incluem sacarose, sorbitol, glicina, inositol, cloreto de sódio, metionina, arginina e cloridrato de arginina.
[0561] Os agonistas de receptor condicionalmente ativos, polipeptídeos, ácidos nucleicos, vetores de expressão e/ou células hospedeiras podem ser o único agente ativo na composição farmacêutica, ou a composição pode compreender ainda um ou mais outros agentes ativos adequados para um uso pretendido.
[0562] Em um aspecto adicional, a presente divulgação fornece métodos para o tratamento do câncer, compreendendo a administração a um sujeito em necessidade de uma quantidade terapeuticamente eficaz do agonista de receptor condicionalmente ativo, polipeptídeo, ácidos nucleicos, vetores de expressão e/ou células hospedeiras de qualquer modalidade ou combinação de modalidades aqui divulgadas sob condições em que o primeiro componente polipeptídico e o segundo componente polipeptídico interagem nas células do tumor para tratar o câncer. Em modalidades para administrar os agonistas de receptor condicionalmente ativos, o primeiro e o segundo polipeptídeo podem ser administrados juntos ou podem ser administrados em formulações farmacêuticas separadas.
[0563] Tal como aqui utili ado, tratar ou tratamento significa realizar um ou mais dos seguintes: (a) reduzir o tamanho ou volume de tumores e/ou metástases no sujeito; (b) limitar qualquer aumento no tamanho ou volume de tumores e/ou metástases no sujeito; (c) aumentar a sobrevivência; (d) reduzir a gravidade dos sintomas associados ao câncer; (e) limitar ou prevenir o desenvolvimento de sintomas associados ao câncer; e (f) inibir o agravamento dos sintomas associados ao câncer.
[0564] Os métodos podem ser usados para tratar qualquer câncer adequado, incluindo, mas sem limitação a câncer de cólon, melanoma, câncer de células renais, câncer de células escamosas de cabeça e pescoço, câncer gástrico, carcinoma urotelial, linfoma de Hodgkin, câncer de pulmão de células não pequenas, câncer de células pequenas de pulmão, carcinoma hepatocelular, câncer de pâncreas, câncer colorretal de carcinoma de células de Merkel, leucemia mieloide aguda, leucemia linfoblástica aguda, leucemia linfocítica crônica, linfoma não Hodgkin, mieloma múltiplo, câncer de ovário, câncer cervical e quaisquer tipos de tumor selecionados por um teste diagnóstico, como instabilidade de microssatélites, carga de mutação tumoral, nível de expressão de PD-L1 ou o ensaio de imunoscore (conforme desenvolvido pela Society for Immunotherapy of Cancer).
[0565] O sujeito pode ser qualquer sujeito que tenha câncer. Em uma modalidade, o sujeito é um mamífero, incluindo, porém sem limitação, humanos, cachorros, gatos, cavalos, gado, etc.
[0566] Em uma modalidade, o primeiro domínio de direcionamento se liga a um marcador de célula e o segundo domínio de direcionamento se liga a um segundo marcador de célula distinto, e em que a coexpressão desses dois marcadores nas mesmas células ou nas células próximas ocorre mais comumente no tumor do que em outros tecidos, e em que o primeiro polipeptídeo e o segundo polipeptídeo interagem apenas após a ligação do primeiro domínio de direcionamento ao primeiro marcador de célula e ligação do segundo domínio de direcionamento ao segundo marcador de célula.
Essa modalidade, por exemplo, emprega dois domínios de direcionamento que se ligam a marcadores separados que não são enriquecidos em células tumorais, mas para os quais a coexpressão é enriquecida no tumor.
[0567] Em outra modalidade, o primeiro componente polipeptídico compreende um primeiro domínio de direcionamento e o segundo componente polipeptídico compreende um segundo domínio de direcionamento, em que o primeiro domínio de direcionamento se liga a um primeiro marcador de célula tumoral e o segundo domínio de direcionamento se liga a um segundo marcador de célula tumoral que pode ser o mesmo ou diferente do primeiro marcador de células tumorais, e em que o primeiro polipeptídeo e o segundo polipeptídeo interagem apenas após a ligação do primeiro domínio de direcionamento ao primeiro marcador de células tumorais e ligação do segundo domínio de direcionamento ao segundo marcador de células tumorais.
[0568] Em outra modalidade, o primeiro componente polipeptídico compreende um primeiro domínio de direcionamento e o segundo componente polipeptídico compreende um segundo domínio de direcionamento, em que o primeiro domínio de direcionamento se liga a um marcador de célula tumoral e o segundo domínio de direcionamento se liga a um marcador de célula imune (incluindo, mas sem limitação a células T CD8+, células T regulatórias, células dendríticas ou macrófagos), e em que o primeiro polipeptídeo e o segundo polipeptídeo interagem apenas após a ligação do primeiro domínio de direcionamento ao marcador de célula tumoral e ligação do segundo domínio de direcionamento ao marcador de célula imune.
[0569] Em uma modalidade, o primeiro domínio de direcionamento se liga a um marcador de célula e o segundo domínio de direcionamento se liga a um segundo e distinto marcador de célula, e em que a coexpressão desses dois marcadores ocorre mais comumente em células tumorais do que em alguns outros tipos de células, e em que o primeiro polipeptídeo e o segundo polipeptídeo interagem apenas após a ligação do primeiro domínio de direcionamento ao primeiro marcador de célula e ligação do segundo domínio de direcionamento ao segundo marcador de célula na mesma célula. Essa modalidade, por exemplo, emprega dois domínios de direcionamento que se ligam a marcadores separados que não são enriquecidos em células tumorais, mas para os quais a coexpressão é enriquecida no tumor.
[0570] Em outra modalidade, o primeiro componente polipeptídico compreende um primeiro domínio de direcionamento e o segundo componente polipeptídico compreende um segundo domínio de direcionamento, em que o primeiro domínio de direcionamento se liga a um primeiro marcador de célula imune (incluindo, mas sem limitação a células T CD8+, T reguladoras células, células dendríticas ou macrófagos) e o segundo domínio de direcionamento se liga a um segundo marcador de célula imune (incluindo, mas sem limitação a células T CD8+, células T regulatórias, células dendríticas ou macrófagos) que podem ser iguais ou diferentes do que o primeiro marcador de célula imune, e em que o primeiro polipeptídeo e o segundo polipeptídeo interagem apenas após a ligação do primeiro domínio de direcionamento ao primeiro marcador de célula imune e a ligação do segundo domínio de direcionamento ao segundo marcador de célula imune.
[0571] Em um aspecto adicional, a presente divulgação fornece métodos para modular uma resposta imune em um sujeito pela administração a um sujeito de um agonista de receptor condicionalmente ativo, polipeptídeo, ácido nucleico, vetor de expressão, célula hospedeira ou a composição farmacêutica da presente divulgação. Em uma modalidade, o método compreende a administração a um sujeito de um agonista de receptor condicionalmente ativo sob condições em que o primeiro componente polipeptídico e o segundo componente polipeptídico interagem nas células imunes para modular uma resposta imune.
[0572] Tal como aqui utili ado, uma resposta imunol gica sendo modulada refere-se a uma resposta por uma célula do sistema imunológico, tal como uma célula B, célula T (CD4 ou CD8), célula T reguladora, célula apresentadora de antígeno, célula dendrítica, monócito,
macrófago, célula NKT, célula NK, basófilo, eosinófilo ou neutrófilo, a um estímulo. Em algumas modalidades, a resposta é específica para um antígeno particular (uma resposta espec fica do ant geno ) e se refere a uma resposta de uma célula T CD4, célula T CD8 ou célula B por meio de seu receptor específico do antígeno. Em algumas modalidades, uma resposta imunológica é uma resposta de células T, como uma resposta CD4+ ou uma resposta CD8+. Essas respostas por essas células podem incluir, por exemplo, citotoxicidade, proliferação, produção de citocinas ou quimiocinas, tráfego ou fagocitose e podem ser dependentes da natureza da célula imunológica que sofre a resposta. Em algumas modalidades das composições e métodos aqui descritos, uma resposta imunológica sendo modulada é mediada por células T.
[0573] Em alguns aspectos, a resposta imunológica é uma resposta imunológica anticâncer. Em alguns de tais aspectos, um mimético de IL-2 condicionalmente ativo aqui descrito é administrado a um sujeito com câncer para modular uma resposta imune anticâncer no sujeito.
[0574] Em alguns aspectos, a resposta imunológica é uma resposta imunológica reparadora de tecidos. Em alguns de tais aspectos, um mimético de IL-4 condicionalmente ativo descrito aqui é administrado a um sujeito em necessidade para modular uma resposta imune reparativa de tecido no sujeito.
[0575] Em alguns aspectos, a resposta imunológica é uma resposta imunológica de cicatrização de feridas. Em alguns de tais aspectos, um mimético de IL-4 condicionalmente ativo descrito aqui é administrado a um sujeito em necessidade para modular uma resposta imune de cicatrização de feridas no sujeito.
[0576] Em alguns aspectos, métodos são fornecidos para modular uma resposta imunológica a um segundo agente terapêutico em um sujeito. Em alguns de tais aspectos, o método compreende a administração de um polipeptídeo da presente divulgação em combinação com uma quantidade eficaz do segundo agente terapêutico ao sujeito. O segundo agente terapêutico pode ser, por exemplo, um agente quimioterapêutico ou um agente imunoterapêutico específico para o antígeno. Em alguns aspectos, o agente imunoterapêutico específico do antígeno compreende células T receptoras de antígeno quiméricas (células CAR-T). Em alguns aspectos, o polipeptídeo da presente divulgação aumenta a resposta imunológica do sujeito ao agente terapêutico. A resposta imunológica pode ser aumentada, por exemplo, melhorando a resposta das células T (incluindo a resposta das células CAR-T), aumentando a resposta imunológica inata das células T, diminuindo a inflamação, inibindo a atividade das células T reguladoras ou suas combinações.
[0577] Em alguns aspectos, um mimético de citocina condicionalmente ativo da presente invenção, por exemplo, um mimético de IL- 4 condicionalmente ativo como aqui descrito, será impregnado ou de outra forma associado a um biomaterial e o biomaterial será introduzido a um sujeito. Em alguns aspectos, o biomaterial será um componente de um dispositivo médico implantável e o dispositivo será, por exemplo, revestido com o biomaterial. Esses dispositivos médicos incluem, por exemplo, enxertos vasculares e arteriais. Os biomateriais associados a IL-4 e/ou IL-4 condicionalmente ativas podem ser usados, por exemplo, para promover a cicatrização de feridas e/ou a reparação e regeneração de tecidos.
[0578] Em outro aspecto, a divulgação fornece métodos para agonizar o receptor de IL-2 ou o receptor de IL-4, compreendendo a administração a um sujeito do agonista de receptor condicionalmente ativo de qualquer modalidade ou combinação de modalidades aqui divulgadas, sob condições em que o primeiro componente polipeptídico e o segundo componente polipeptídico interagem com o receptor.
[0579] Tal como aqui utili ado, uma quantidade terapeuticamente efica se refere a uma quantidade do agonista de receptor condicionalmente ativo, polipeptídeo, ácidos nucleicos, vetores de expressão e/ou células hospedeiras que é eficaz para tratar e/ou limitar a doença a ser tratada (por exemplo, câncer). O agonista do receptor condicionalmente ativo,
polipeptídeos, ácidos nucleicos, vetores de expressão e/ou células hospedeiras são tipicamente formulados como uma composição farmacêutica, tal como as divulgadas acima, e podem ser administrados por qualquer via adequada, incluindo, mas sem limitação a, por via oral, por inalação por spray, ocularmente, intravenosamente, subcutaneamente, intraperitonealmente e intravesicularmente em formulações de unidades de dosagem convencionais contendo carreadores, adjuvantes e veículos farmaceuticamente aceitáveis. Em uma modalidade particular, os polipeptídeos, ácidos nucleicos, vetores de expressão e/ou células hospedeiras são administrados por via mucosa, incluindo, mas sem limitação a administração intraocular, inalada ou intranasal. Em outra modalidade particular, os polipeptídeos, ácidos nucleicos, vetores de expressão e/ou células hospedeiras são administrados por via oral. Essas modalidades particulares podem ser administradas por meio de gotículas, nebulizadores, sprays ou outras formulações adequadas.
[0580] Qualquer intervalo de dosagem adequado pode ser usado conforme determinado pelo pessoal médico assistente. Os regimes de dosagem podem ser ajustados para fornecer a resposta desejada ideal (por exemplo, uma resposta terapêutica ou profilática). Uma gama de dosagem adequada para os agonistas ou polipeptídeos do receptor condicionalmente ativos pode, por exemplo, ser 0,1 ug/kg a 100 mg/kg de peso corporal; alternativamente, pode ser de 0,5 µg/kg a 50 mg/kg; 1 ug/kg a 25 mg/kg ou 5 ug/kg a 10 mg/kg de peso corporal. Em algumas modalidades, a dose recomendada pode ser inferior a 0,1 mcg/kg, especialmente se administrada localmente. Em outras modalidades, a dose recomendada pode ser baseada no peso/m2 (ou seja, área de superfície corporal) e/ou pode ser administrada em uma dose fixa (por exemplo, 0,5 a 100 mg). Os agonistas de receptor condicionalmente ativos, polipeptídeos, ácidos nucleicos, vetores de expressão e/ou células hospedeiras podem ser entregues em um único bolus ou podem ser administrados mais de uma vez (por exemplo, 2, 3, 4, 5 ou mais vezes), conforme determinado por um médico assistente.
[0581] Os agonistas de receptor condicionalmente ativos, polipeptídeos, ácidos nucleicos, vetores de expressão e/ou células hospedeiras podem ser administrados como o único agente profilático ou terapêutico, ou podem ser administrados em conjunto com (ou seja: combinado ou separadamente) um ou mais outros agentes profiláticos ou terapêuticos, incluindo, mas sem limitação a ressecção tumoral, quimioterapia, radioterapia, imunoterapia, etc.
[0582] Numerosas modificações e variações da presente divulgação são possíveis à luz dos ensinamentos acima.
EXEMPLOS EXEMPLO 1.
[0583] Uma abordagem computacional para projetar agentes miméticos de citocinas de novo é descrita que recapitula os locais funcionais das citocinas naturais, mas de outra forma não estão relacionados na topologia ou sequência de aminoácidos. Essa estratégia foi usada para projetar agentes miméticos não divididos de novo de IL-2 e interleucina-15 (IL-15) que se ligam ao heterodímero c do receptor de IL-2 (IL-2R c), mas não têm sítio de ligação para IL-2R ou IL-15R . Os projetos são hiperestáveis, ligam-se à IL-2R c humana e de camundongo com maior afinidade do que as citocinas naturais e induzem sinalização celular a jusante independente de IL-2R e IL-15R . As estruturas de cristal de um mimético otimizado experimentalmente, neoleucina-2/15, estão muito próximas do modelo de design e fornecem a primeira informação estrutural sobre o complexo de IL-2R c murina. Neoleucina-2/15 tem atividade terapêutica altamente eficaz em comparação com IL-2 em modelos murinos de melanoma e câncer de cólon, com toxicidade reduzida e sem sinais de imunogenicidade.
[0584] Muitas citocinas interagem com várias subunidades de receptor diferentes e, como a maioria das proteínas que ocorrem naturalmente, contêm características estruturais não ideais que comprometem a estabilidade, mas são importantes para a função. Um protocolo computacional foi desenvolvido no qual os elementos estruturais que interagem com a (s) subunidade (s) receptor (es) desejada (s) são fixados no espaço, e uma cadeia principal de proteína globular idealizada é construída para suportar esses elementos. A montagem do fragmento combinatório foi usada para suportar epítopos lineares curtos com construção paramétrica de hélices desincorporadas acopladas com fechamento de laço baseado em conhecimento (Figura 1a-b). A abordagem foi testada tentando projetar de novo proteínas idealizadas estáveis com superfícies de interação que imitam aquelas de IL-2 humana (hIL-2) e IL-15 humana (hIL-15) para o IL-2R c humano (hIL-2R c), mas totalmente sem a superfície de interação do receptor alfa de IL-2 (IL-2R ).
[0585] Projeto computacional de agentes miméticos de IL-2/IL-15 de não separação que se ligam e ativam IL-2RβƔc: hIL-2 nativo compreende quatro hélices conectadas por laços longos irregulares. A hélice N-terminal (H1) interage com as subunidades beta e gama do receptor IL-2, a terceira hélice (H3) interage com a subunidade beta e a hélice C-terminal (H4) com a subunidade gama; a superfície de interação da subunidade alfa é formada pela segunda hélice irregular (H2) e duas voltas longas, uma conectando H1 a H2 e a outra conectando H3 e H4. Foi projetada uma proteína idealizada que recapitula a interface formada por H1, H3 e H4 com beta e gama e que substitui H2 por uma hélice regular que oferece melhor empacotamento. As hélices H1, H3 e H4 (ver Figura 1a) foram usadas como um modelo para o local de ligação, enquanto a hélice H2 foi reconstruída (H2') usando um banco de dados de fragmentos agrupados altamente representados (ver Métodos). Os pares de hélices foram conectados com laços extraídos do mesmo banco de dados (ver Figura 1b), os grampos de cabelo helicoidais resultantes combinados em estruturas principais totalmente conectados (ver Figura 1c) e cálculos de projeto de sequência de estrutura principal flexível combinatória Rosetta TM foram realizados na presença de hIL-2R c (ver Métodos). Os quatro principais projetos computacionais e oito variações grampeadas de dissulfeto único (ver Tabela 2) foram selecionados para caracterização experimental por exibição de levedura (ver Métodos). Oito projetos foram encontrados para ligar receptor de IL-2 quimérico beta-gama marcado com fluorescência em baixas concentrações nanomolares.
A melhor concepção não dissulfureto (G1_neo2_40) foi sujeita à mutagênese de saturação local seguido de seleção e combinação de substituições que aumentam a afinidade para a IL-2R c murina (mIL-2R c, ver a Figura 5). Projetos otimizados (foram expressos de forma recombinante em E. coli e verificou-se que eliciam a sinalização de pSTAT5 in vitro em células murinas responsivas à IL-2 em baixas concentrações nanomolares ou mesmo picomolares (Tabela 3, ver Silva et al., Nature 565, página 186, 10 de janeiro de 2019), mas tinha estabilidade térmica relativamente baixa (Tm ~<45 °C, ver Figuras 9 e 10). Para melhorar a estabilidade, o protocolo de projeto computacional foi repetido a partir da estrutura principal do projeto de primeira rodada de maior afinidade (G1_neo2_40_1F, topologia: H1->H4->H2 ->H3), acoplando o processo de construção de laço com variação paramétrica no comprimento da hélice (+/- 8 aminoácidos, consulte a Figura 1a painel inferior). Essa segunda abordagem melhorou a qualidade dos modelos, permitindo a exploração de substancialmente mais combinações de laços conectando cada par de hélices.
Os quatorze melhores projetos da segunda geração, junto com vinte e sete reprojetos de sequência Rosetta TM de G1_neo2_40_1F (ver Tabela 4), foram caracterizados experimentalmente e todos, exceto um, se ligaram ao receptor de IL-2 em baixas concentrações nanomolares.
Os três projetos de maior afinidade e estabilidade (um reprojeto de sequência e dois novos agentes miméticos) foram submetidos à mutagênese de saturação local para ligação de mIL-2R c (Figuras 6 a 8), seguido por seleção e combinação de substituições de aumento de afinidade para IL-2R c humana e de camundongo.
Os projetos amadurecidos (ver Tabela 5) mostraram ligação aprimorada, mantendo hiperestabilidade (ver Silva et al., Nature 565, página 186, 10 de janeiro de 2019)). O projeto superior, neoleucina-2/15 (também referido aqui como Neo- 2/15), é uma proteína de 100 resíduos com uma nova topologia e sequência bastante diferente da IL-2 humana ou murina (29% de identidade de sequência para hIL-2 em 89 resíduos e 16% de identidade de sequência para mIL-2 em 76 resíduos alinhados, em alinhamento estrutural com base em topologia agnóstica).
[0586] Caracterização funcional da neoleucina- 2/15: Neoleucina-2/15 se liga com alta afinidade à IL-2R c humana e de camundongo, mas não interage com IL-2R ( er Silva et al., Nature 565, páginas 186, janeiro 10, 2019). As afinidades de Neoleucina-2/15 para os receptores de IL-2 humana e de camundongo (receptores de IL-2R e IL-2R c) são significativamente mais elevadas do que as das citocinas de IL-2 correspondentes nativas. Em contraste com a IL-2 nativa, a Neoleucina-2/15 induz a sinalização independente de IL-2R em células responsivas à IL-2 humana e murina e em células T primárias murinas (ver Silva et al., Nature 565, página 186, 10 de janeiro de 2019). Neoleucina-2/15 ativa células IL-2R mais potentemente do que a IL-2 humana ou murina nativa de acordo com sua maior afinidade de ligação. Em células primárias, a neoleucina-2/15 é mais ativa em células IL-2R - e menos ativa em IL-2R + em comparação com Super-2, presumivelmente devido à sua completa falta de ligação à IL-2R . Neoleucina- 2/15 é hiperestável (ver Figura 12) e não perde afinidade de ligação para hIL- 2R c após incubação a 80 °C por 2 horas, enquanto hIL-2 e Super-2 são completamente inativadas após 10 minutos (meio-tempo de inativação = ~4,2 min e ~2,6 min, respectivamente, Figura 2). Da mesma forma, em culturas de células primárias ex vivo, a neoleucina-2/15 impulsionou a sobrevivência das células T efetivamente após serem fervidas por 60 minutos a 95 °C, enquanto essas condições inativaram IL-2 e Super-2 (ver Silva et al., Nature 565, página 186, 10 de janeiro de 2019). Estudos de desnaturação térmica foram realizados em muitos outros agentes miméticos projetados, demonstrando sua estabilidade térmica também (consulte a Figura 11). Essa estabilidade sem precedentes para uma molécula semelhante à citocina, além de eliminar a necessidade de armazenamento em cadeia a frio, sugere uma robustez para mutações (ver Figura 8 e 13), fusões genéticas e modificação química excedendo em muito a da IL-2 nativa (ver Figura 3).
[0587] Aplicações terapêuticas de neoleucina- 2/15: O uso clínico de IL-2 tem sido limitado principalmente pela toxicidade. Embora as interações responsáveis pela toxicidade de IL-2 em humanos não sejam completamente compreendidas, em modelos murinos a toxicidade é independente de células T e melhorada em animais deficientes na cadeia de IL-2R (CD25+). Assim, muitos esforços têm sido direcionados para a reengenharia de IL-2 para enfraquecer as interações com IL-2R , mas as mutações no local de ligação de CD25 podem ser altamente desestabilizadoras. A baixa estabilidade inerente de IL-2 e sua dependência fortemente desenvolvida em CD25 têm sido barreiras para a tradução de compostos de IL-2 reprojetados. Outros esforços se concentraram na IL-15, uma vez que ela provoca sinalização semelhante à IL-2 por dimerização do IL-2R c, mas não tem afinidade para o CD25. No entanto, IL-15 é dependente da apresentação trans pelo receptor de IL-15 (CD215), que é exibido principalmente em células apresentadoras de antígeno e células assassinas naturais. A baixa estabilidade da IL-15 nativa e sua dependência da apresentação trans também têm sido barreiras substanciais para os esforços de reengenharia.
[0588] Estudos de escalonamento de dose em camundongos ingênuos mostram que mIL-2 expande preferencialmente células T regulatórias, consistente com a ligação preferencial a células CD25+, enquanto a neoleucina-2/15 impulsiona principalmente a expansão de células T CD8+ e não induz ou induz minimamente a expansão de células T regulatórias apenas na dose mais alta testada. Da mesma forma, em um modelo murino de inflamação das vias aéreas, que normalmente induz uma pequena porcentagem de células T CD8+ residentes no tecido, a neoleucina-2/15 produz um aumento nas células T Thy1.2- CD44+ CD8+ sem aumentar o antígeno CD4+ Foxp3+ Tregs específicos nos órgãos linfoides (dados não mostrados; ver Silva et al., Nature 565, página 186, 10 de janeiro de 2019).
[0589] A eficácia terapêutica da neoleucina-2/15 foi testada no melanoma B16F10 fracamente imunogênico e nos modelos de camundongos com câncer de cólon CT26 mais imunogênicos.
O tratamento de agente único com neoleucina-2/15 levou a atrasos dependentes da dose no crescimento do tumor em ambos os modelos de câncer.
No câncer de cólon CT26, o tratamento com agente único mostrou eficácia melhorada em relação à observada para mIL-2 recombinante (ver Silva et al., Nature 565, página 186, 10 de janeiro de 2019). No melanoma B16F10, o cotratamento com o anticorpo antimelanoma TA99 (anti-TRP1) levou a atrasos significativos no crescimento do tumor, enquanto o tratamento com TA99 sozinho teve pouco efeito (ver Silva et al., Nature 565, página 186, 10 de janeiro de 2019). Em experimentos de sobrevivência de longo prazo (8 semanas), a neoleucina-2/15 em combinação com TA99 mostrou toxicidade substancialmente reduzida e um efeito terapêutico geral superior em comparação com mIL-2 (ver Silva et al., Nature 565, página 186, 10 de janeiro de 2019). Os camundongos tratados com a combinação mIL- 2 e TA99 perderam peso de forma constante e sua saúde geral declinou a ponto de exigir a eutanásia, enquanto um pequeno declínio foi observado com a combinação de neoleucina-2/15 e TA99 (ver Silva et al., Nature 565, página 186, 10 de janeiro de 2019). Consistente com um benefício terapêutico, o tratamento com neoleucina-2/15 levou a um aumento significativo nas razões CD8: T reg intratumorais (ver Silva et al., Nature 565, página 186, 10 de janeiro de 2019), que foi previamente correlacionado com respostas imunes antitumorais eficazes 58 . Os aumentos das razões CD8: Treg pela neoleucina-2/15 são dependentes da dose e do antígeno (ver Silva et al., Nature 565, página 186, 10 de janeiro de 2019); efeitos terapêuticos ideais foram obtidos em doses mais altas e em combinação com outras imunoterapias (ver Silva et al., Nature 565, página 186, 10 de janeiro de 2019). Em conjunto, esses dados mostram que a neoleucina- 2/15 exibe o benefício homeostático previsto derivado da sua atividade imunopotenciadora semelhante à IL-2, mas sem os efeitos adversos associados à ligação preferencial de CD25 +. A eficácia terapêutica da neoleucina-2/15 foi testada em um modelo CAR-T.
Camundongos NSG inoculados com 0,5 × 10 6 células tumorais RAJI não foram tratados, foram tratados com 0,8 × 10 6 células CAR-T anti-CD19 (infundidos 7 dias após a inoculação das células tumorais) ou foram tratados de forma semelhante com células CAR-T anti-CD19 mais 20 µg/dia de IL-2 humana ou neoleucina-2/15 nos dias 8-14 após a inoculação do tumor. Como esperado, a Neoleucina-2/15 mostrou aumentar significativamente o efeito antitumoral da terapia com células CAR-T, retardando o crescimento do tumor e estendendo a sobrevivência do camundongo ((ver Silva et al., Nature 565, página 186, 10 de janeiro de 2019)).
[0590] O projeto de novo de agentes miméticos de proteínas tem o potencial de transformar o campo da terapêutica baseada em proteínas, permitindo o desenvolvimento de moléculas biossuperiores com propriedades terapêuticas aprimoradas e efeitos colaterais reduzidos, ao contrário de IL-2 recombinante e variantes projetadas de hIL-2, neoleucina-2/15 pode ser expressa de forma solúvel em E. coli (ver Figura 17), retém a atividade em alta temperatura, não interage com IL-2R e é robusta a mudanças de sequência substanciais que permitem a engenharia de novas funções (Figura 7).
[0591] Modularidade robusta de neoleucina-2/15. Agrafamento de dissulfeto e reengenharia em um mimético de IL-4: Neoleucina-2/15 é altamente modular, permitindo ajustar facilmente suas propriedades, como aumentar sua estabilidade ou modificar sua preferência de ligação. Essa modularidade e robustez foram aproveitadas pela introdução, por projeto computacional, de grampos de dissulfeto único que aumentam a estabilidade e preservam a função de neoleucina-2/15. Em um exemplo, uma ponte dissulfeto foi introduzida pesquisando pares de posições com arranjos geométricos favoráveis seguido por minimização de estrutura principal flexível. O projeto final introduziu um único dissulfeto entre os resíduos 38 e 75, que estabiliza as hélices H3 e H2. Essa estratégia aumentou a estabilidade da neoleucina-2/15 (Tm > 95 °C), mantendo sua sequência e função praticamente inalterada (ver Silva et al., Nature 565, página 186, 10 de janeiro de 2019). As propriedades de modularidade da neoleucina-2/15 foram usadas para modificar sua preferência de ligação. Todas as citocinas da família da interleucina-2 interagem com o c e compartilham uma arquitetura comum. Portanto, foi hipotetizado que a neoleucina-2/15 poderia ser transformada em outra citocina mimética da família IL-2 alterando apenas os aminoácidos na metade do sítio de ligação que interage com IL-2R (hélices H1 e H3). Como prova de um conceito, a interleucina-4 humana (hIL-4) foi escolhida como alvo, uma vez que compartilha extensa homologia estrutural com a IL-2 e tem aplicações potenciais na medicina regenerativa. Neo-2/15 foi modificada para se ligar ao receptor de IL-4 humana (compreendendo IL-4R e c) e não ao receptor de IL-2 humana (compreendendo IL-2R e c) alinhando o modelo de Neo-2/15 na estrutura de IL-4 humana ligada ao seu receptor de IL-4, e mutando 14 resíduos em Neo-2/15 para combinar os aminoácidos de IL-4 nas posições estruturais que medeiam as interações entre IL-4 e IL4r (Figura 3). A ligação foi ainda otimizada pela evolução direcionada usando mutagênese aleatória e triagem de variantes de alta afinidade de ligação, que introduziram duas substituições de aminoácidos adicionais e modificou um dos quatorze resíduos originais enxertados da proteína IL-4, criando assim uma nova proteína Neoleucina-4 com um total de dezesseis mutações de Neoleucina-2/15. O projeto otimizado resultante, neoleucina-4 (ver Tabela 6), foi expresso de forma recombinante e purificado a partir de E. coli e testado para ligação. Neoleucina-4 liga-se com alta afinidade ao receptor de IL-4R , liga-se cooperativamente ao IL-4R c (ver Figura 3), e não se liga com nenhuma afinidade ao receptor de IL-2 (dados não mostrados). Neoleucina-4 retém as propriedades termoestáveis superiores de neoleucina- 2/15 (ver Figura 14b, c), e se liga ao receptor de IL-13 como esperado, dada a reatividade cruzada natural de IL-4 para o receptor de IL-13 (dados não mostrados).
[0592] Projeto computacional de agentes miméticos de citocina de novo: O projeto de agentes miméticos de citocina de novo começou definindo a estrutura de hIL-2 no complexo quaternário com o receptor de IL-2R c como molde para o projeto.
Após a inspeção, os resíduos que compõem o sítio de ligação foram definidos como hotspots usando metadados de RosettaTM (PDBInfoLabels). A estrutura foi alimentada no novo protocolo de projeto mimético que é programado em PyRosetta TM, e que pode detectar automaticamente os elementos da estrutura central secundária que compõem o modelo de destino e produzem as estruturas principais miméticas de novo resultantes com informações compatíveis de RosettaScripts TM completas para o projeto.
Resumidamente, o algoritmo de construção mimético funciona da seguinte maneira.
Para a primeira geração de projetos, cada um dos elementos centrais foi idealizado por reconstrução usando laços de um banco de dados agrupado de fragmentos altamente ideais (fragmentos de 4 aminoácidos). Após a idealização, o protocolo de construção mimética visa reconectar os elementos idealizados aos pares em todas as combinações possíveis.
Para fazer isso, ele usa a montagem de fragmentos combinatórios de fragmentos agnósticos de sequência do banco de dados, seguido por minimização de estrutura restrita cartesiana para soluções potenciais (ou seja, onde as extremidades N e C do fragmento construído estão perto o suficiente para ligar as duas estruturas secundárias). Após a minimização, as soluções são verificadas para conter fragmentos altamente ideais (ou seja, cada fragmento sobreposto que compõe os dois elementos conectados também está contido no banco de dados) e nenhum conflito de estrutura com o receptor-alvo (contexto). As soluções de estrutura de passagem foram então traçadas usando o mesmo banco de dados de fragmentos para determinar os aminoácidos mais prováveis em cada posição (essa informação foi codificada em metadados no projeto). Em seguida, soluções para pares de estruturas secundárias conectadas foram combinadas combinatoriamente para produzir estruturas principais totalmente conectadas usando componentes conectados da teoria dos gráficos.
Como o número de soluções cresce exponencialmente com cada par de elementos, em cada etapa de combinação de fragmentos classificamos os projetos para favorecer aqueles com interconexões mais curtas entre pares de elementos centrais, e mantivemos apenas as soluções principais para prosseguir para a próxima etapa.
Soluções totalmente conectadas foram então perfiladas por camada (interface, núcleo, superfície não núcleo, superfície), a fim de restringir as identidades dos possíveis aminoácidos para serem compatíveis com as camadas.
Finalmente, todas as informações sobre pontos ativos, aminoácidos de fragmentos integrados compatíveis e camadas foram combinadas (o ponto ativo tem precedência sobre a probabilidade de aminoácidos e a probabilidade de aminoácidos tem precedência sobre a camada). Essas estruturas principais totalmente perfiladas foram então passadas para RosettaScriptsTM para projeto e filtragem da estrutura principal flexível.
Para a segunda geração de projetos, duas abordagens foram seguidas.
Na primeira abordagem, reprojetos de sequência do melhor projeto otimizado de primeira geração foram executados (G1_neo2_40_1F,). Na segunda abordagem, novos agentes miméticos foram desenvolvidos usando G1_neo2_40_1F como o modelo-alvo.
O protocolo de projeto mimético nessa segunda geração era semelhante ao descrito para a primeira geração, mas com duas diferenças principais.
Em primeiro lugar, os fragmentos do núcleo não foram mais construídos a partir de fragmentos, mas sim pela constatação de equações paramétricas de ângulos phi e psi repetitivos (ômega fixados em 180º) que resultam em estruturas secundárias repetitivas que recapitulam cada uma das hélices-al o o mais pr imo poss el, um passo nos ângulos phi e psi foi permitido a cada X-aminoácidos para permitir às hélices a possibilidade de ter curvatura (parâmetros finais: H1:, H2:, H3, H4), o uso dessas equações paramétricas permitiu alterar o tamanho de cada um dos elementos do núcleo na estrutura-alvo à vontade (aumentar ou diminuir o tamanho), que foi acoplado (máx/min 8.a.a.) com o processo de construção do circuito e reduções no tamanho do núcleo elementos não tinham permissão para remover pontos de acesso do local de ligação.
A segunda diferença nos projetos de segunda geração, é que em vez de reconectar os elementos centrais da estrutura secundária, usamos um tamanho de fragmento de 7 aminoácidos, e nenhuma montagem combinatória de mais de um fragmento foi permitida (ou seja, um único fragmento deve ser capaz de fechar um par de estruturas secundárias). O resto do algoritmo de projeto era essencialmente semelhante ao seguido no algoritmo de geração. As funções de energia da RosetaTM utilizadas foram talaris2013 e talaris2014 , para a primeira e segunda gera o de projetos, respectivamente.
[0593] Os bancos de dados de fragmentos altamente ideais usados para o projeto das estruturas principais para os agentes miméticos de novo foram construídos com o novo aplicativo da Rosetta TM kcenters_clustering_of_fragments usando um e tenso banco de dados de estruturas de proteínas não redundantes publicamente disponíveis do banco de dados de proteínas RCSB, que era composto de 16767 PDBs para o banco de dados 4-mer usado para os projetos de primeira geração e 7062 PDBs para o banco de dados 7-mer usado para os projetos de segunda geração.
[0594] Exibição de levedura: A levedura foi transformada com genes que codificam as proteínas a serem exibidas juntamente com o vetor pETcon3 linearizado. O vetor foi linearizado por superdigestão de 100 vezes por NdeI e XhoI (New England Biolabs) e então purificado por extração em gel (Qiagen). Os genes incluíram 50 bases de sobreposição com o etor em ambas as e tremidades 5 e 3 , de modo que a recombinação homóloga colocaria os genes no quadro entre o gene AGA2 e o marcador myc no vetor. A levedura foi cultivada em meio C-Trp-Ura antes da indução em meio SGCAA como descrito anteriormente. 12 a 18 horas após a indução, as células foram lavadas em tampão de exibição resfriado (50 mM NaPO4, pH 8, 20 mM NaCl, BSA a 0,5%) e incubadas com concentrações variáveis de receptor biotinilado (IL-2R humana ou murina, IL-2R , IL-2R ou IL-4R humana) enquanto agitada a 4 °C. Após aproximadamente 30 minutos, as células foram lavadas novamente em tampão resfriado e, em seguida, incubadas em gelo por 5 minutos com anticorpo anti-c-Myc conjugado com FITC (1 ul por 3x106 células) e estreptavidina-ficoeritrina (1 ul por 100 ul de volume de levedura). A levedura foi então lavada e contada por citometria de fluxo (Accuri
C6) ou classificada por FACS (Sony SH800). Para experiências em que a incubação inicial do receptor foi conduzida com uma combinação de IL-2R biotinilado e IL-4R não biotinilado, o receptor não biotinilado foi fornecido em excesso molar.
[0595] Mutagênese e maturação de afinidade: Para mutagênese baseada em PCR propensa a erros, o projeto a ser mutado foi clonado no vetor pETcon3 e amplificado usando o kit de mutagênese II MutaGeneTM (Invitrogen), de acordo com as instruções do fabricante para produzir uma frequência de mutação de aproximadamente 1% por nucleotídeo. 1 ug deste gene mutado foi eletroporado em levedura EBY100 em conjunto com 1 ug de vetor linearizado pETcon3, com uma eficiência de transformação da ordem de 108. As leveduras foram induzidas e classificadas várias vezes em sucessão com concentrações de receptor progressivamente decrescentes até a convergência da população. As leveduras cresceram novamente em meio C-Trp- Ura entre cada tipo.
[0596] Bibliotecas de mutagênese de saturação de sítio (SSM) foram construídas a partir de DNA sintético de Genscript. Para cada aminoácido em cada modelo de projeto, iniciadores diretos e iniciadores reversos foram projetados, de modo que a amplificação por PCR resultasse em um produto de PCR 5 com um c don NNK degenerado e um produto de PCR 3 , respecti amente. A amplifica o dos produtos esquerdo e direito por iniciadores COF e COR gerou uma série de produtos de molde, cada uma consistindo em um códon NNK degenerado em uma posição de resíduo diferente. Para cada projeto, esses produtos foram agrupados para gerar a biblioteca SSM. Bibliotecas SSM foram transformadas por eletroporação em células condicionadas de Saccharomyces cerevisiae cepa EBY100, juntamente com o vetor pETCON3 linearizado, usando o protocolo previamente descrito por Benatuil et al.
[0597] Bibliotecas combinatórias foram construídas a partir de DNA sintético de Genscript contendo nucleotídeos ambíguos e similarmente transformadas em vetor pETCON3 linearizado.
[0598] Expressão de proteínas: Os genes que codificam as sequências de proteínas projetadas foram sintetizados e clonados em vetores de expressão de plasmídeo pET-28b(+) E. coli (GenScript, etiqueta 6xHis N-terminal e local de clivagem de trombina). Os plasmídeos foram então transformados em células E. coli Lemo21 quimicamente competentes (NEB). A expressão da proteína foi realizada usando caldo Terrific Broth TM e sais M, as culturas foram cultivadas a 37 °C até OD600 atingir aproximadamente 0,8, então a expressão foi induzida com 1 mM de isopropil -D-tiogalactopiranosídeo (IPTG), e a temperatura foi reduzida para 18 °C. Após a expressão por aproximadamente 18 horas, as células foram colhidas e lisadas com um microfluidizador Microfluidics M110P a 124 MPa (18.000 psi), então a fração solúvel foi clarificada por centrifugação a 24.000 g por 20 minutos. A fração solúvel foi purificada por cromatografia de afinidade de metal imobilizado (Qiagen) seguida por cromatografia de exclusão por tamanho de FPLC (SuperdexTM 75 10/300 GL, GE Healthcare). A neoleucina-2/15 purificada foi caracterizada por verificação de Espectro de Massa (MS) do peso molecular das espécies em solução (Thermo Scientific), Exclusão de Tamanho - MultiAngle Laser Light Scattering (SEC-MALLS) a fim de verificar o estado monomérico e molecular peso (Agilent, Wyatt), SDS-PAGE e níveis de endotoxina (Charles River).
[0599] Componentes do complexo de IL-2 humana e de camundongo incluindo hIL-2 (a.a. 1-133), hIL-2Ra (a.a. 1-217), hIL-2Rb (a.a. 1-214) hIL-2Rg (a.a. 1-232), mIL-2 (a.a. 1-149), ectodomínio mIL-2Ra (a.a. 1- 213), ectodomínio mIL-2Rb (a.a. 1-215), e ectodomínio mgc (a.a. 1-233) foram secretados e purificados usando um sistema de expressão de baculovírus, conforme descrito anteriormente 17,49. Todas as proteínas foram purificadas para >98% de homogeneidade com uma coluna de dimensionamento Superdex TM 200 (GE Healthcare) equilibrada em HBS. A pureza foi verificada por análise SDS-PAGE. Para a expressão de IL-2 humana biotinilada e subunidades de receptor de IL-2 de camundongo, proteínas contendo um peptídeo aceitador de biotina C-terminal (BAP)-LNDIFEAQKIEWHE (SEQ ID NO: 303) foram expressas e purificadas conforme descrito por meio de cromatografia de afinidade Ni-NTA e depois biotiniladas com a enzima BirA ligase solúvel em Bicina 0,5 mM pH 8,3, ATP 100 mM, acetato de magnésio 100 mM e biotina 500 mM (Sigma). O excesso de biotina foi removido por cromatografia de exclusão de tamanho em uma coluna Superdex 200 equilibrada em HBS.
[0600] Dicroísmo circular (CD): medições de CD ultravioleta distante foram realizadas com um espectrômetro AVIV modelo 420 em tampão PBS (pH 7,4) em uma cubeta de comprimento de caminho de 1 mm com concentração de proteína de ~0,20 mg/ml (salvo indicação em contrário no texto). A temperatura derrete de 25 a 95 °C e o sinal de absorção monitorado é de 222 nm (etapas de 2 °C/min, 30 s de equilíbrio por etapa). Varreduras de comprimento de onda (195 a 260 nm) foram coletadas a 25 °C e 95 °C, e novamente a 25 °C após redobramento rápido (~5 min).
[0601] Estudos de fosforilação STAT5: estudos in vitro: Aproximadamente 2x105 YT-1, IL-2Ra+ YT-1 ou células CTLL-2 são colocadas em cada poço de uma placa de 96 poços e ressuspensas em meio completo RPMI contendo diluições em série de hIL-2, mIL-2, Super-2 ou agentes miméticos de IL-2 projetados. As células são estimuladas por 15 min a 37 °C e imediatamente fixadas pela adição de formaldeído a 1,5% e incubação por 10 min em temperatura ambiente. A permeabilização das células é obtida por ressuspensão em metanol 100% gelado por 30 min a 4 °C. As células fixadas e permeabilizadas são lavadas duas vezes com tampão FACS (solução salina tamponada com fosfato [PBS] pH 7,2 contendo 0,1% de albumina de soro bovino) e incubadas com Alexa Fluor® 647 conjugado com anti-STAT5 pY694 (BD Biosciences) diluído em tampão FACS por 2 horas à temperatura ambiente. As células são então lavadas duas vezes em tampão FACS e MFI foi determinado em um citômetro de fluxo CytoFLEX TM (Beckman-Coulter). As curvas de dose-resposta são ajustadas a um modelo logístico e metade da concentração efetiva máxima (valores de EC 50) são calculadas usando o software de análise de dados GraphPad Prism após subtração da intensidade média de fluorescência (MFI) de células não estimuladas e normalização para a intensidade máxima do sinal. As experiências são realizadas em triplicado e realizadas três vezes com resultados semelhantes. Estudos ex vivo: Os baços e os gânglios linfáticos são colhidos a partir de camundongos C57BL/6J ou B6;129S4-Il2ratm1Dw do tipo selvagem (CD25KO) e feitos em uma suspensão de célula única em tampão de classificação (2% de soro fetal de bezerro em solução salina tamponada com fosfato de pH 7,2). As células T CD4+ são enriquecidas por meio de seleção negativa pela coloração da suspensão de células com anticorpos anti-B220, CD8, NK1.1, CD11b, CD11c, Ter119 e CD19 conjugados com biotina a 1:100 por 30 min em gelo. Após uma lavagem com tampão de classificação, o antibiotina MicroBeadsTM (Miltenyi Biotec) é adicionado à suspensão de células a 20 l por 107 células no total e incubado em gelo por 20 minutos. As células são lavadas, ressuspensas e a seleção negativa é então realizada usando ímãs EasySepTM (STEMCELL Technologies). Aproximadamente 1 x 105 células enriquecidas são adicionadas a cada poço de uma placa de 96 poços em meio RPMI completo com FCS a 5% com 10 diluições em série de mIL-2, Super-2, ou Neoleucina-2/15. As células são estimuladas por 20 minutos a 37 °C em 5% de CO2, fixadas com 4% de PFA e incubadas por 30 minutos a 4 °C. Após a fixação, as células são colhidas e lavadas duas vezes com tampão de classificação e novamente fixadas em 500 l de metanol 90% gelado em dH2O por 30 minutos em gelo para permeabilização. As células são lavadas duas vezes com tampão Perm/Wash (BD Biosciences) e coradas com anti-CD4-PerCP em tampão Perm/Wash (1:300), anti-CD44-Alexa Fluor 700 (1:200), anti-CD25-PE-C 7 (1:200) e 5 l por amostra de anti-pSTAT5-PE pY694 por 45 min em temperatura ambiente no escuro. As células são lavadas com Perm/Wash e ressuspensas em tampão de classificação para análise em um citômetro de fluxo BD LSR II (BD Biosciences).
[0602] Tabela 2: Sequências de aminoácidos para os doze melhores projetos de primeira rodada.
Dez dos projetos foram (G1_neo2_35-44) foram experimentalmente caracterizados por exibição de levedura e todos, exceto dois (G1_neo2_35 e G1_neo2_44) foram encontrados para se ligar a ILR c quimérico marcado com fluorescência em baixas concentrações nanomolares por meio de triagem de citometria de fluxo de ligantes de proteína de primeira rodada projetados.
Os projetos indicados foram expressos em levedura e incubados com 2 nM de hIL-2R c ou 0 nM de IL-2R c (dados não mostrados).
Projeto Sequência
STGKIDLDKAEDIRRNSDQARREAEKRGIDVRDLISNAQVILL G1_neo2_33 EAR (SEQ ID NO: 103)
STGKCDLDKAEDIRRNSDQARREAEKRGIDVRDLISNAQVIL G1_neo2_34 LEAR (SEQ ID NO: 104)
STGKIDCDKAEDIRRNSDQARREAEKRGIDVRDLISNAQVILL G1_neo2_35 EAC (SEQ ID NO: 105)
TGKIDLDRAEELARNLEKVRDEALKRGIDVRDLVSNAKVIALE G1_neo2_36 LK (SEQ ID NO: 106)
TGKIDLDRAEECARNLEKVRDEALKRGIDVRDLVSNAKVIAL G1_neo2_37 ELK (SEQ ID NO: 107)
GKCDLDRAEELARNLEKVRDEALKRGIDVRDLVSNAKVIALE G1_neo2_38 LK (SEQ ID NO: 108)
TGKIDLDRAEELCRNLEKVRDEALKRGIDVRDLVSNACVIALE G1_neo2_39 LK (SEQ ID NO: 109)
TGKIDLDGAKELAKEVEELRQEAEKRGIDVRDLASNLKVILLE G1_neo2_40 LA (SEQ ID NO: 110)
TGKCDLDGAKELAKEVEELRQEAEKRGIDVRDLASNLKVILL G1_neo2_41 ELA (SEQ ID NO: 111)
TGKIDLDNAQEMAKEAEKIRKEMEKRGIDVRDLISNIIVILLEL G1_neo2_42 S (SEQ ID NO: 112)
TGKCDLDNAQEMAKEAEKIRKEMEKRGIDVRDLISNIIVILLEL G1_neo2_43 S (SEQ ID NO: 113)
TGKIDLDNAQEMCKEAEKIRKEMEKRGIDVRDLISNICVILLEL G1_neo2_44 S (SEQ ID NO: 114)
[0603] Tabela 3. Sequências de aminoácidos para os projetos de primeira rodada otimizados experimentalmente.
Projeto Sequência
STKKTQLLAEHALLDAFMMLNVVPEPNEKLNRIITTMQSWIY G1_neo2_40_ TGKIDADGAKELAKEVEELEQEYEKRGIDVEDDASNLKVILLE 1A LA (SEQ ID NO: 115)
STKKTQLLAEHALLDAHMMLNMLPEPNEKLNRIITTMQSWIH G1_neo2_40_ TGKIDGDGAQELAKEVEELEQEYEKRGIDVEDEASNLKVILL 1B ELA (SEQ ID NO: 116)
STKKTQLLAEHALLDAFMMLNMVPEPNEKLNRIITTMQSWIF G1_neo2_40_ TGKIDGDGAKELAKEVEELEQEFEKRGIDVEDEASNLKVILLE 1C LA (SEQ ID NO: 117)
STKKTQLLAEHALLDALMMLNMVPEPNEKLNRIITTMQSWIF G1_neo2_40_ TGKIDGDGAQELAKEVEELEQELEKRGIDVEDYASNLKVILLE 1D LA (SEQ ID NO: 118)
STKKTQLLAEHALLDAHMMLNVVPEPNEKLNRIITTMQSWIY G1_neo2_40_ TGKIDRDGAQELAKEVEELEQELEKRGIDVDDDASNLKVILL 1E ELA (SEQ ID NO: 119)
STKKTQLLAEHALLDALMMLNLLPEPNEKLNRIITTMQSWIFT G1_neo2_40_ GKIDGDGAQELAKEVEELEQEHEKRGIDVEDYASNLKVILLE 1F LA (SEQ ID NO: 120)
STKKTQLLAEHALLDAYMMLNMVPEPNEKLNRIITTMQSWIL G1_neo2_40_ TGKIDSDGAQELAKEVEELEQELEKRGIDVDDDASNLKVILLE 1G LA (SEQ ID NO: 121)
STKKTHLLAEHALLDAYMMLNVMPEPNEKLNRIITTMQSWIF G1_neo2_40_ TGKIDGDGAKELAKEVEELEQEFEKRGIDVDDDASNLKVILL 1H ELA (SEQ ID NO: 122)
STKKTQLLAEHALLDAYMMLNLVPEPNEKLNRIITTMQSWIFT G1_neo2_40_ GKIDADGAQELAIEVEELEQEYEKRGIDVDDYASNLKVILLEL 1I A (SEQ ID NO: 123)
STKKTQLMAEHALLDAFMMLNVLPEPNEKLNRIITTMQSWIF G1_neo2_40_ TGKIDGDDAQELAKEVEELEQELEKRGIDVDDDASNLKVILL 1J ELA (SEQ ID NO: 124)
STKKTQLLIEHALLDALDMSRNLPEPNEKLSRIITTMQSWIFT G1_neo2_40_ GKIDGDGAQQLAKEVEELEQEHEKRGEDVEDEASNLKVILL 1F_H1 ELA (SEQ ID NO: 125)
STKKTQLLLEHALLDALHMRRNLPEPNEKLSRIITTMQSWIFT G1_neo2_40_ GKIDGDGAQELAKEVEELEQEHEKRGRDVEDDASNLKVILL 1F_H2 ELA (SEQ ID NO: 126)
STKKTQLLIEHALLDALNMRKKLPEPNEKLSRIITDMQSWIFT G1_neo2_40_ GKIDGDGAQQLAKEVEELEQEHEKRGGDVEDYASNLKVILL 1F_H3 ELA (SEQ ID NO: 127)
STKKTQLLLEHALLDALHMSRELPEPNEKLNRIITDMQSWIFT G1_neo2_40_ GKIDGDGAQDLAKEVEELEQEHEKRGGDVEDYASNLKVILL 1F_H4 ELA (SEQ ID NO: 128)
STKKTQLLIEHALLDALHMSRKLPEPNEKLSRIITTMQSWIFT G1_neo2_40_ GKIDGDGAQHLAKEVEELEQEHEKRGGEVEDEASNLKVILL 1F_H5 ELA (SEQ ID NO: 129)
STKKTQLLIEHALLDALHMKRKLPEPNEKLNRIITNMQSWIFT G1_neo2_40_ EKIDGDGAQDLAKEVEELEQEHEKRGQDVEDYASNLKVILLE 1F_H6 LA (SEQ ID NO: 130)
STEKTQLAAEHALRDALMLKHLLNEPNEKLARIITTMQSWQF G1_neo2_40_ TGKIDGDGAQELAKEVEELQQEHEVRGIDVEDYASNLKVILL 1F_M1 HLA (SEQ ID NO: 131)
STKNTQLAAEDALLDALMLRNLLNEPNEKLARIITTMQSWQF G1_neo2_40_ TEKIDGDGAQELAKEVEELQQEHEERGIDVEDYASNLKVILL 1F_M2 QLA (SEQ ID NO: 132)
STEKTQHAAEDALRDALMLRNLLNEPNEKLARIITTMQSWQF G1_neo2_40_ TEKIDGDGAQELAKEVEELQQEHEVRGIDVEDYASNLKVILL 1F_M3 QLA (SEQ ID NO: 133)
[0604] Tabela 4: Sequências de aminoácidos para projetos de segunda rodada. G2_neo2_40_1F_seq02 a G2_neo2_40_1F_seq28 correspondem aos 27 reprojetos de sequência RosettaTM de G1_neo2_40_1F; G2_neo2_40_1F_seq29 a G2_neo2_40_1F_seq42 representam os 14 novos projetos miméticos de novo.
Projeto Sequência
TQKKQQLLAEHALLDALMILNMLKTSSEAVNRMITIAQSWIFTG G2_neo2_40 TSNPEEAKEMIKMAEQAEEEARREGVDTEDYVSNLKVILKEIA _1F_seq02 (SEQ ID NO: 134) G2_neo2_40 TTKKYQLLVEHALLDALMMLNLSSESNEKMNRIITTMQSWIFT _1F_seq03 GTFDPDQAEELAKLVEELREEFRKRGIDTEDYASNLKVILKELS
(SEQ ID NO: 135)
TTKKIQLLVEHALLDALMILNLSSESNEKLNRIITTLQSWIFRGEI G2_neo2_40 DPDRARELAKLLEEIREEMRKRGIDTEDYVSNMIVIIRELA _1F_seq04 (SEQ ID NO: 136)
TKKKIQLLAEHVLLDLLMMLNLSSESNEKMNRLITIVQSWIFTG G2_neo2_40 TIDPDQAEEMAKWVEELREEFRKRGIDTEDYASNVKVILKELS _1F_seq05 (SEQ ID NO: 137)
TKKKYQLLIEHLLLDALMVLNMSSESNEKLNRIITILQSWIFTGT G2_neo2_40 WDPDLAEEMEKLMQEIEEELRRRGIDTEDYMSNMRVIIKELS _1F_seq06 (SEQ ID NO: 138)
TKKKLQLLVEHLLLDMLMILNMSSESNEKLNRLITELQSWIFRG G2_neo2_40 EIDPDKAEEMWKIMEEIEKELRERGIDTEDYMSNAKVIIKELS _1F_seq07 (SEQ ID NO: 139)
TSKKQQLLAEHALLDALMILNISSESSEAVNRAITWLQSWIFKG G2_neo2_40 TVNPDQAEEMRKLAEQIREEMRKRGIDTEDYVSNLEVIAKELS _1F_seq08 (SEQ ID NO: 140)
TKKKYQLLIEHLLLDLLMVLNMSSESNEKINRLITWLQSWIFTG G2_neo2_40 TYDPDLAEEMYKILEELREEMRERGIDTEDYMSNMRVIVKELS _1F_seq09 (SEQ ID NO: 141)
TKKKWQLLIEHLLLDLLMILNLSSESNEKLNRLITWLQSWIFTGT G2_neo2_40 YDPDLAEEMKKMMDEIEDELRERGIDTEDYMSNAKVIIKELS _1F_seq10 (SEQ ID NO: 142)
TKKKIQLLVEHALLDALMILNLSSESNEKLNRIITTMQSWIFTGTI G2_neo2_40 DPDQAEELSKLVEEIREEMRKRGIDTEDYVSNLKVILDELS _1F_seq11 (SEQ ID NO: 143)
TEKKLQLLVEHALLDALMILNLWSESNEKLNRIITTMQSWIFTG G2_neo2_40 RIDPDKAEELAKLVEELREEARERGIDTEDYVSNLKVILKELS _1F_seq12 (SEQ ID NO: 144)
TKKKYQLLMEHLLLDLLMVLNMSSESNEKLNRLITIIQSWIFTGT G2_neo2_40 WDPDKAEEMAKMLKEIEDELRERGIDTEDYMSNMIVIMKELS _1F_seq13 (SEQ ID NO: 145)
TTKKIQLLVEHALLDALMLLNLSSESNEKMNRIITTMQSWIFEG G2_neo2_40 RIDPDQAQELAKLVEELREEFRKRGIDTEDYVSNLKVILEELS _1F_seq14 (SEQ ID NO: 146)
TKKKIQLLVEHALLDALMMLNLSSESNEKLNRIITTMQSWIFTG G2_neo2_40 TIDPDQAEELAKLVRELREEFRKRGIDTEDYASNLEVILRELS _1F_seq15 (SEQ ID NO: 147)
TKKKIQLLVEHALLDALMILNLSSKSNEKLNRIITTMQSWIFNGTI G2_neo2_40 DPDRARELAKLVEEIRDEMEKNGIDTEDYVSNLKVILEELA _1F_seq16 (SEQ ID NO: 148)
TKKKYQLLIEHVLLDLLMLLNLSSESNEKMNRLITILQSWIFTGT G2_neo2_40 YDPDKAEEMAKLLKELREEFRERGIDTEDYISNAIVILKELS _1F_seq17 (SEQ ID NO: 149)
TKKKIQLLVEHALLDALMMLNLSSESNEKLNRIITTMQSWIFTG G2_neo2_40 TIDPDRAEELAKLVEELREEFRKRGIDTEDYASNLKVILKELS _1F_seq18 (SEQ ID NO: 150)
TKKKIQLLVEHALLDALMMLNLSSESNEKLNRIITTMQSWIFNG G2_neo2_40 TIDPDQARELAKLVEELREEFRKRGIDTEDYASNLKVILEELA _1F_seq19 (SEQ ID NO: 151)
TKKKLQLLVEHALLDALMLLNLSSESNEKLNRIITTMQSWIFTG G2_neo2_40 TVDPDQAEELAKLVEEIREELRKRGIDTEDYVSNLKVILKELS _1F_seq20 (SEQ ID NO: 152)
TTKKYQLLVEHALLDALMILNLSSESNEKLNRIITTMQSWIFTGT G2_neo2_40 FDPDQAEELAKLVREIREEMRKRGIDTEDYVSNLEVILRELS _1F_seq21 (SEQ ID NO: 153)
TKKKIQLLVEHALLDALMILNLSSESNEKLNRIITTMQSWIFTGTI G2_neo2_40 DPDRAEELAKLVREIREEMRKRGIDTEDYVSNLEVILRELS _1F_seq22 (SEQ ID NO: 154)
TKKKYQLLIEHLLLDLLMILNLSSESNEKLNRLITWLQSWIFRGE G2_neo2_40 WDPDKAEEWAKILKEIREELRERGIDTEDYMSNAIVIMKELS _1F_seq23 (SEQ ID NO: 155)
TDKKLQLLVEHLLLDLLMMLNLSSKSNEKMNRLITIAQSWIFTG G2_neo2_40 KVDPDLAREMIKLLEETEDENRKNGIDTEDYVSNARVIAKELE _1F_seq24 (SEQ ID NO: 156)
TKKKIQLLVEHALLDALMLLNLSSESNEKMNRIITTMQSWIFTG G2_neo2_40 TIDPDQAEELAKLVEELKEEFKKRGIDTEDYVSNLKVILKELS _1F_seq25 (SEQ ID NO: 157)
TKKKYQLLIEHALLDALMILNLWSESNEKLNRIITTMQSWIFTGT G2_neo2_40 YDPDKAEELEKLAKEIEDEARERGIDTEDYMSNLRVILKELS _1F_seq26 (SEQ ID NO: 158)
TKKKAQLLAEHALLDALMLLNLSSESNERLNRIITWLQSIIFTGT G2_neo2_40 YDPDMVKEAVKLADEIEDEMRKRGIDTEDYVSNLRVILQELA _1F_seq27 (SEQ ID NO: 159) G2_neo2_40 TQKKNQLLAEHLLLDALMVLNQSSESSEVANRIITWAQSWIFE _1F_seq28 GRVDPNKAEEAKKLAKKLEEEMRKRGIDMEDYISNMKVIAEE
MS (SEQ ID NO: 160)
EDYYSNLKVILEELAREMERNGLSDKAEEWRQWKKIVERIRQI G2_neo2_40 RSNNSDLNEAKELLNRLITYIQSQIFEISERIRETDQEKKEESW _1F_seq29 KKWQLLLEHALLDVLMLLND (SEQ ID NO: 161)
PEKKRQLLLEHILLDALMLLNLLETNPQNTESKFEDYISNAEVIA G2_neo2_40 EELAKLMESLGLSDEAEKFKKIKQWLREVWRIWSSTNWSTLE _1F_seq30 DKARELLNRIITTIQSQIFY (SEQ ID NO: 162)
PEKKRQLLLEHILLDLLMILNMIETNRENTESEMEDYWSNVRVI G2_neo2_40 LRELARLMEELNYKELSELMERMRKIVEKIRQIVTNNSSLDTAR _1F_seq31 EWLNRLITWIQSLIFR (SEQ ID NO: 163)
PEKKRQLLAEHALLDALMLLNIIETNSKNTESKMEDYVSNLEVI G2_neo2_40 LTEFKKLAEKLNFSEEAERAERMKRWARKAYQMMTLDLSLDK _1F_seq32 AKEMLNRIITILQSIIFN (SEQ ID NO: 164)
PEKKRQLLAEHLLLDVLMMLNGNASLKDYASNAQVIADEFREL G2_neo2_40 ARELGLTDEAKKAEKIIEALERAREWLLNNKDKEKAKEALNRAI _1F_seq33 TIAQSWIFN (SEQ ID NO: 165)
PEKKRQLLLEHLLLDLLMILNMLRTNPKNIESDWEDYMSNIEVII G2_neo2_40 EELRKIMESLGRSEKAKEWKRMKQWVRRILEIVKNNSDLEEA _1F_seq34 KEWLNRLITIVQSEIFE (SEQ ID NO: 166)
WEKKRQLLLEHLLLDLLMILNMWRTNPQNTESLMEDYMSNAK G2_neo2_40 VIVEELARMMRSQGLEDKAREWEEMKKRIEEIRQIIQNNSSKE _1F_seq35 RAKEELNRLITYVQSEIFR (SEQ ID NO: 167)
PKKKIQLLAEHALLDALMILNIVKTNSQNAEEKLEDYASNVEVIL G2_neo2_40 EEIARLMESGDQKDEAEKAKRMKEWMKRIKTTASEDEQEEM _1F_seq36 ANRIITLLQSWIFS (SEQ ID NO: 168)
PEKKRQLLAEHALLDALMILNILQTNPQNAEEKLEDYMSNVEVI G2_neo2_40 MEEFARMMRNGDRSEEAENAERIKKWVRKASSTASSEEQRE _1F_seq37 MMNRAITLMQSWIFE (SEQ ID NO: 169)
PEKKRQLLAEHLLLDALMVLNMLTTNSKNTEEKLEDYISNMKVI G2_neo2_40 IKEMIELMRSLGRLEEAEKWKEALKAVEKIGSRMDSETARELA _1F_seq38 NRIITLAQSAIFY (SEQ ID NO: 170)
PEKKRQLLAEHALLDALMFLNLVETNPDQAEEKIEDYASNLRVI G2_neo2_40 AEELARLFENLGRLDEAQKAKDIKELAERARSRVSSEKRKEAM _1F_seq39 NRAITILQSMIFR (SEQ ID NO: 171)
PEKKRQLLAEHALLDALMILNIIRTNSDNTESKLEDYISNLKVILE G2_neo2_40 EIARLMESLGLSDEAEKAKEAMRLADKAGSTASEEEKKEAMN _1F_seq40 RVITWAQSWIFN (SEQ ID NO: 172)
PEKKRQLLAEHALLDALMMLNILRTNPDNAEEKLEDYWSNLIVI G2_neo2_40 LREIAKLMESLGLTDEAEKAKEAARWAEEARTTASKDQRREL _1F_seq41 ANRIITLLQSWIFS (SEQ ID NO: 173)
PEKKRQLLAEHLLLDALMILNIIETNEQNAESKLEDYISNAKVILD G2_neo2_40 EFREMARDLGLLDEAKKAEKMKRWLEKMRSNASSDERREWA _1F_seq42 NRMITTAQSWIFN (SEQ ID NO: 174)
[0605] Tabela 5. Sequências de aminoácidos para os designs de segunda rodada otimizados experimentalmente.
Projeto Sequência G2_neo2_40_ TNKEAQLHAEFALYDALMLLNLSSESNERLNRIITWLQSIIFYE 1F_seq27_S1 TYDPDMVKEAVKLADEIEDEMRKRKIDTEDYVVNLRLILQELA 8 (SEQ ID NO: 175) G2_neo2_40_ TKKDAELLAEFALYDALMLLNLSSESNERLNEIITWLQSIIFYG 1F_seq27_S2 TYDPDMVKEAVKLADEIEDEMRKRGIDTEDYVSNLRLILQELA 2 (SEQ ID NO: 176) G2_neo2_40_ TNKKAQLHAEFALYDALMLLNLSSESNERLNDIITWLQSIIFTG 1F_seq27_S2 TYDPDMVKEAVKLADEIEDEMRKRKIDTEDYVVNLRYILQELA 4 (SEQ ID NO: 177)
EDYYSNLKLILEELAREMERNGLSDKAEEWRQWKKIVERIRQ G2_neo2_40_ IRSNNSDLNEAKELLNRLITYIQSQIFEVLHGVGETDQEKKEE 1F_seq29_S6 SWKKWDLLLEHALLDVLMLLND (SEQ ID NO: 178)
EDYYSNLKVILEELAREMERNGLSDKAEEWRQWKKIVERIRQ G2_neo2_40_ IRSNNSDLNEAKELLNELITYIQSQIFEVIEREGETDQEKKEES 1F_seq29_S7 WKKWELHLEHALLDVLMLLND (SEQ ID NO: 179)
EDYYSNLKLILEELAREMERNGLSDKAEEWRQWKKIVERIRQ G2_neo2_40_ IRSNNSDLNEAKELLNRLITYIQSQIFEVLEGVGETDQEKKEE 1F_seq29_S8 SWKKWELHLEHALLDVLMLLND (SEQ ID NO: 180) Neolucina- 2/15 (ou seja, G2_neo2_40_ PKKKIQLHAEHALYDALMILNIVKTNSPPAEEKLEDYAFNFELI 1F_seq36_S1 LEEIARLFESGDQKDEAEKAKRMKEWMKRIKTTASEDEQEE 1) MANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 181) G2_neo2_40_ PKKKIQLLAEHALFDLLMILNIVKTNSQNAEEKLEDYAYNAGVI 1F_seq36_S1 LEEIARLFESGDQKDEAEKAKRMKEWMKRIKDTASEDEQEE 2 MANEIITILQSWNFS (SEQ ID NO: 182)
[0606] Neoleucina-2/15-H8Y-K33E: H1->H3->H2 - >H4
[0607] PKKKIQLYAEHALYDALMILNIVKTNSPPAEE
ELEDYAFNFELILEEIARLFESGDQKDEAEKAKRMKEWMKRIKTTASEDEQEE MANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 94)
[0608] A ligação de Neoleucina-2/15-H8Y-K33E ao receptor de IL2 foi medida por interferometria de biocamada e verificou-se que tinha maior afinidade de ligação do que Neoleucina-2 para IL2-Rbeta, tanto quando testado contra IL2Rbeta sozinho e quando testado contra o complexo IL2Rbeta-gama. Essa afinidade aumentada foi atribuída principalmente a uma taxa de desativação melhorada de IL2-Rbeta.
[0609] Tabela 6. Sequências de aminoácidos para os projetos miméticos da interleucina-4 com base na reengenharia de neolucina- 2/15.
Projeto Sequência
PKKKIQITAEEALKDALSILNIVKTNSPPAEEQLERFAKRF IL4_G2_neo2_40 ERNLWGIARLFESGDQKDEAEKAKRMKEWMKRIKTTAS _1F_seq36_S11 EDEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 183) Neoleucina-4 (ou seja, PKKKIQIMAEEALKDALSILNIVKTNSPPAEEQLERFAKRF IL4_G2_neo2_40 ERNLWGIARLFESGDQKDEAEKAKRMIEWMKRIKTTASE _1F_seq36_S11_ DEQEEMANAIITILQSWFFS (SEQ ID NO: 184) MIF) EXEMPLO 2: MÍMICOS DE CITOCINAS DIVIDIDAS PARA
[0610] As proteínas de novo são projetadas seguindo as regras de uma estrutura de proteína ideal, fornecendo-lhes propriedades bioquímicas incomuns, como termoestabilidade extrema e robustez mutacional. Portanto, proteínas projetadas de novo são candidatas ideais para uso no desenvolvimento de proteínas terapêuticas condicionalmente ativas. Aqui, relatamos o desenvolvimento de agentes miméticos de citocinas divididas para imunoterapia altamente direcionada com base na proteína mimética de IL-2 recentemente desenvolvida, Neoleucina-2/15. Esse sistema permite a entrega de proteínas terapêuticas condicionalmente ativas que reconstituem sua atividade por colocalização na superfície das células-alvo. Identificamos potenciais locais de divisão e demonstramos reconstituição bem-sucedida da atividade de Neoleucina-2/15 pela ligação aos receptores de IL-2, sinalização celular e ativação dependente de colocalização na superfície das células tumorais-alvo. Também demonstramos essa aplicação para outro mimetizador de citocina projetado de novo, Neoleucina-4.
[0611] A fim de identificar potenciais locais de divisão de Neoleucina-2/15 (Neo2), avaliamos a estrutura da proteína para encontrar posições de divisão que minimizariam os efeitos prejudiciais sobre a função da proteína. Como resultado, definimos três posições de divisão exemplificativas: (i) entre os elementos helicoidais H1 (Neo2A1) e H3 -H2-H4 (Neo2B1), (ii) entre os elementos helicoidais H1-H3 (Neo2A2) e H2-H4 (Neo2B2), (iii) entre os elementos helicoidais H1-H3 -H2 (Neo2A3) e H4 (Neo2B3) (Figura 15). Os fragmentos de Neo2 dividida foram caracterizados analisando a sua capacidade de ligação ao receptor de IL-2 humana (Figura 15) e sinalizando em células CTTL-2 responsivas à IL-2 (Figura 16). Os fragmentos individuais divididos mostraram ter ligação desprezível a IL-2R e capacidade de sinali ação na maioria dos casos, mas atividade potente na combinação equimolar dos fragmentos separados divididos.
[0612] O desenvolvimento da Neo2 dividida permite a reconstituição dependente da colocalização da proteína e, portanto, a ativação condicional da Neo2 dividida. A fim de permitir a colocalização dos fragmentos Neo2A e Neo2B, em primeiro lugar realizamos fusões genéticas para os domínios de direcionamento (Figura 17). Neo2A1, Neo2A2 e Neo2A3 foram fundidos ao C-terminal de uma proteína de repetição de anquirina direcionada a Her2 (DARPin) por um ligante flexível de 15 resíduos (GSGGSGGGSGGSGSG; SEQ ID NO: 100). Neo2B1, Neo2B2 e Neo2B3 foram fundidos ao N-terminal de uma proteína de repetição de anquirina projetada direcionada a EGFR (DARPin) por um ligante flexível de 15 resíduos (GSGGSGGGSGGSGSG; SEQ ID NO: 100). Em seguida, avaliamos sua capacidade de reconstituir a ligação para IL- 2R após combinação dos fragmentos de divisão, demonstrando que as fusões não interferiram em sua capacidade de reconstituição de Neo-2 dividida (Figura 17).
[0613] Para avaliar a ativação dependente de colocalização e seletividade de direcionamento do sistema de Neo2 dividida, realizamos um ensaio in vitro com Neo-2/15 dividida direcionado para EGFR e Her2 (Figura 18a) na superfície de linhas celulares K562 manipuladas. Usamos quatro linhas celulares projetadas: (i) sem receptores de superfície, (ii) Her2+/eGFP+, (iii) EGFR+/iRFP+, (iv) Her2+/eGFP+ EGFR+/iRFP+ (Figura 18b). As quatro linhas de células foram misturadas em proporções equivalentes e incubadas com os fragmentos de Neo2 dividida direcionados por 15 minutos. Posteriormente, as células foram lavadas e incubadas com uma mistura de receptor IL-2 biotinilada e um conjugado fluorescente estreptavidina-ficoeritrina (SAPE). Finalmente, as células foram analisadas por classificação de células ativadas por fluorescência (FACS). A reconstituição bem-sucedida da atividade de Neo-2 resultou em marcação fluorescente com PE na superfície das células alvo (Figura 18c). Observamos forte ligação do receptor de IL-2 na superfície de Her2+ e Her2+/EGFR+ quando Neo2 completo foi direcionado com um único domínio de direcionamento anti-Her2 (aHer2-Neo2). Ligação semelhante foi observada quando os fragmentos de divisão de Neo2A1 e Neo2B1 foram ambos direcionados para Her2 (aHer2-Neo2A1 + aHer2-Neo2B1), demonstrando que ambos os fragmentos poderiam ser entregues ao mesmo marcador de superfície celular, se desejado. Além disso, observamos reconstituição altamente seletiva na superfície de Her2+/EGFR+ duplo positivo quando cada fragmento dividido foi direcionado para Her2 ou EGFR (aHer2-Neo2A1 + Neo2B1-aEGFR, aHer2- Neo2A2 + Neo2B2-aEGFR, aHer2-Neo2A3 + Neo2B3-aEGFR). Estudos adicionais demonstraram que para cada combinação de fragmentos de Neo2 dividida, a presença simultânea de ambos os fragmentos foi necessária para permitir o recrutamento do receptor de IL-2 na superfície das células K562 (Figura 19). Esses resultados demonstram a alta seletividade dos agentes miméticos da citoquina dividida para reconstituir a atividade desejada especificamente na superfície das células-alvo.
[0614] As aplicações da tecnologia de simulação de citocina dividida não se limitam apenas a antígenos associados a tumor. Para determinadas aplicações, direcionar subconjuntos específicos de células imunes a serem estimulados seletivamente seria benéfico para direcionar a resposta imune para tratar doenças. Por exemplo, este pedido seria útil para aumentar especificamente a expansão de células T citotóxicas CD8+, células Natural Killer ou células T CAR projetadas para potencializar sua resposta antitumoral, mas também, direcionar as células T regulatórias para suprimir um forte sistema imunológico resposta (Figura 20a). Além disso, em alguns cenários, abordagens de direcionamento mistas podem ser implantadas, ou seja, direcionar um fragmento dividido para as células tumorais ou microambiente tumoral, enquanto o outro fragmento é entregue às células imunes (Figura 20b).
[0615] Finalmente, para demonstrar a transferibilidade da metodologia descrita aqui para outras interleucinas projetadas de novo, criamos um novo mimético de IL-4 condicionalmente ativo (Figura 21). Para conseguir isso, introduzimos com sucesso mutações específicas na Neo-2 dividida que modificam a interface de ligação ao receptor de hIL-2Beta, para ligar o receptor de hIL-4alfa.
SEQUÊNCIAS EXEMPLIFICATIVAS DE VARIANTES DE NEOLEUCINA-2/15 DIVIDIDA USADAS NO EXEMPLO 2
[0616] H1 (Neo2A1) PKKKIQLHAEHALYDALMILNIVKTNS (SEQ ID NO: 256)
[0617] H3-H2'-H4 Neo2B1)
TNSPPAEEKLEDYAFNFELILEEIARLFESGDQKDEAEKAKRMKEWMKRIKTTA SEDEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 257)
[0618] H1-H3-H2 Neo2A3
[0619] PKKKIQLHAEHALYDALMILNIVKTNSPPAEE KLEDYAFNFELILEEIARLFESGDQKDEAEKAKRMKEWMKRIKTTAS (SEQ ID NO: 258)
[0620] H4 (Neo2B3) TTASEDEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 259)
[0621] H1-H3 (Neo2A2)
PKKKIQLHAEHALYDALMILNIVKTNSPPAEEKLEDYAFNFELILEEIARLFESGD (SEQ ID NO: 260)
[0622] H2 -H4 (Neo2B2) DQKDEAEKAKRMKEWMKRIKTTASEDEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 261) SEQUÊNCIAS EXEMPLIFICATIVAS DE NEOLEUCINA-4 DIVIDIDA USADAS NO EXEMPLO 2
[0623] H1 Neo4A1) PKKKIQIMAEEALKDALSILNIVKTNS (SEQ ID NO: 262)
[0624] H3-H2 -H4 (também conhecido como Neo4B1)
TNSPPAEEQLERFAKRFERNLWGIARLFESGDQKDEAEKAKRMIEWMKRIKTT ASEDEQEEMANAIITILQSWFFS (SEQ ID NO: 263)
CONSTRUTOS EXEMPLIFICATIVOS USADOS NO EXEMPLO 2
[0625] X2-Z1-X3-Z2-X4-E01_EGFR_DARPin
[0626] (MGSHHHHHHGSGSENLYFQGSGGG)TNSP
[0627] (SEQ ID NO: 304)
[0628] G3_Her2_DARPin_X1
[0629] (MGSHHHHHHGSGSENLYFQGSGSG)DLGK
GADVNAVDAIGFTPLHLAAFIGHLEIAEVLLKHGADVNAQDKFGKTAFDISIGNG NEDLAEILQKLN(GSGGSGGGSGGSGSG)PKKKIQLHAEHALYDALMILNIVKT NS (SEQ ID NO: 305)
[0630] G3_Her2_DARPin_X2-Z1-X3-Z3-X4
[0631] (MGSHHHHHHGSGSENLYFQGSGSG)DLGK
RLFESGDQKDEAEKAKRMKEWMKRIKTTASEDEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 306)
[0632] X2-Z1-X3-Z2-X4-E01_EGFR_DARPin
[0633] (MGSHHHHHHGSGSENLYFQGSGGG)TNSP
[0634] (SEQ ID NO: 307)
[0635] X2-Z2-X4-E01_EGFR_DARPin
[0636] (MGSHHHHHHGSGSENLYFQGSGGG)DQK DEAEKAKRMKEWMKRIKTTASEDEQEEMANAIITILQSWIFS(GSGGSGGGSG GSGSGGSGGG)DLGKKLLEAARAGQDDEVRILMANGADVNADDTWGWTPLH
ASDYIGDTPLHLAAHNGHLEIVEVLLKHGADVNAQDKFGKTAFDISIDNGNEDL AEILQKLN (SEQ ID NO: 308)
[0637] X4-E01_EGFR_DARPin
[0638] (MGSHHHHHHGSGSENLYFQGSGGG)TTAS EDEQEEMANAIITILQSWIFS(GSGGSGGGSGGSGSGGSGGG)DLGKKLLEAA
AYDYIGWTPLHLAADGHLEIVEVLLKNGADVNASDYIGDTPLHLAAHNGHLEIV EVLLKHGADVNAQDKFGKTAFDISIDNGNEDLAEILQKLN (SEQ ID NO: 309)
[0639] G3_Her2_DARPin_X1-Z1-X3
[0640] (MGSHHHHHHGSGSENLYFQGSGSG)
LLKNGADVNAVDAIGFTPLHLAAFIGHLEIAEVLLKHGADVNAQDKFGKTAFDIS IGNGNEDLAEILQKLN(GSGGSGGGSGGSGSG)PKKKIQLHAEHALYDALMILN IVKTNSPPAEEKLEDYAFNFELILEEIARLFESG SEQ ID NO: 310)
[0641] G3_Her2_DARPin_X1-Z1-X3-Z2-X2
[0642] (MGSHHHHHHGSGSENLYFQGSGSG)DLGK
NSPPAEEKLEDYAFNFELILEEIARLFESGDQKDEAEKAKRMKEWMKRIKTTA (SEQ ID NO: 311).
Claims (140)
1. Agonista de receptor condicionalmente ativo de ocorrência não natural caracterizado pelo fato de que compreende um primeiro componente polipeptídico e um segundo componente polipeptídico, em que o primeiro componente polipeptídico e o segundo componente polipeptídico não estão presentes em uma proteína de fusão, em que no total o primeiro componente polipeptídico e o segundo polipeptídeo componente compreendem domínios X1, X2, X3 e X4, em que: (a) X1 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos de pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica ao comprimento total do peptídeo (PKKKIQ)LHAEHALYDAL(MILNI) (SEQ ID NO: 4); (b) X2 é qualquer domínio de peptídeo helicoidal; (c) X3 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos de pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica ao comprimento total do peptídeo (LE)DYAFNFELILEE(IARLFESG) (SEQ ID NO: 5); e (d) X4 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos de pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica ao comprimento total do peptídeo (EDEQEEMANAI)ITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 6). em que: (i) os resíduos de aminoácidos entre parênteses podem estar presentes ou ausentes; (ii) o primeiro componente polipeptídico compreende pelo menos um de X1, X2, X3 e X4, mas não compreende cada um de X1, X2, X3 e X4; e (iii) o segundo componente polipeptídico compreende cada um de X1, X2, X3 e X4 que não está presente no primeiro componente polipeptídico;
em que o primeiro componente polipeptídico e o segundo componente polipeptídico não são agonistas do receptor ativo individualmente, e em que o primeiro componente polipeptídico e o segundo polipeptídeo interagem para formar um agonista ativo do heterodímero c do receptor de IL- 2 (IL-2R c), heterodímero c do receptor de IL-4 (IL-4R c), IL-13 alfa ou heterodímero IL-4Ralfa/IL13Ralfa.
2. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com a reivindicação 1, caracterizado pelo fato de que: (a) X1 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos pelo menos 70% idêntica ao comprimento total do peptídeo (PKKKIQ)LHAEHALYDAL(MILNI) (SEQ ID NO: 4) ou (PKKKI)QLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO:4); (b) X2 é qualquer domínio de peptídeo helicoidal; (c) X3 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos pelo menos 70% idêntica ao comprimento total do peptídeo (LE)DYAFNFELILEE(IARLFESG) (SEQ ID NO: 5) ou LEDYAFNFELILEEIARLFES(G) (SEQ ID NO: 5); e (d) X4 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos pelo menos 70% idêntica ao comprimento total do peptídeo (EDEQEEMANAI)ITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 6) ou (E)DEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 6).
3. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com a reivindicação 1, caracterizado pelo fato de que: (a) X1 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos pelo menos 85% idêntica ao comprimento total do peptídeo (PKKKIQ)LHAEHALYDAL(MILNI) LHAEHALYDAL(MILNI) (SEQ ID NO: 4) ou (PKKKI)QLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO:4); (b) X2 é qualquer domínio de peptídeo helicoidal; (c) X3 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos pelo menos 85% idêntica ao comprimento total do peptídeo
(LE)DYAFNFELILEE(IARLFESG) (SEQ ID NO: 5) ou LEDYAFNFELILEEIARLFES(G) (SEQ ID NO: 5); e (d) X4 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos pelo menos 85% idêntica ao comprimento total do peptídeo (EDEQEEMANAI)ITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 6) ou (E)DEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 6).
4. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com a reivindicação 1, caracterizado pelo fato de que: (a) X1 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos idêntica ao comprimento total do peptídeo (PKKKIQ)LHAEHALYDAL(MILNI) LHAEHALYDAL(MILNI) (SEQ ID NO: 4) ou (PKKKI)QLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 4); (b) X2 é qualquer domínio de peptídeo helicoidal; (c) X3 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos idêntica ao comprimento total do peptídeo (LE)DYAFNFELILEE(IARLFESG) (SEQ ID NO: 5) ou LEDYAFNFELILEEIARLFES(G) (SEQ ID NO: 5); e (d) X4 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos idêntica ao comprimento total do peptídeo (EDEQEEMANAI)ITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 6) ou (E)DEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 6).
5. Agonista do receptor condicionalmente ativo, de acordo com a reivindicação 1, caracterizado pelo fato de que: (a) X1 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica ao comprimento total do peptídeo PKKKIQLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 4); (b) X3 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica ao comprimento total do peptídeo LEDYAFNFELILEEIARLFESG (SEQ ID NO: 5); e (c) X4 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica ao comprimento total do peptídeo EDEQEEMANAIITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 6).
6. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com a reivindicação 1, caracterizado pelo fato de que: (a) X1 é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos 65% idêntica ao comprimento total do peptídeo PKKKIQLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 4) ou QLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 320); (b) X3 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos pelo menos 65% idêntica ao comprimento total do peptídeo LEDYAFNFELILEEIARLFESG (SEQ ID NO: 5) ou LEDYAFNFELILEEIARLFES (SEQ ID NO: 321); e (c) X4 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos pelo menos 65% idêntica ao comprimento total do peptídeo EDEQEEMANAIITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 6) ou DEQEEMANAIITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 322).
7. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com a reivindicação 1, caracterizado pelo fato de que: (a) X1 é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos 75% idêntica ao comprimento total do peptídeo PKKKIQLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 4) ou QLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 320); (b) X3 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos pelo menos 75% idêntica ao comprimento total do peptídeo LEDYAFNFELILEEIARLFESG (SEQ ID NO: 5) ou LEDYAFNFELILEEIARLFES (SEQ ID NO: 321); e (c) X4 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos pelo menos 75% idêntica ao comprimento total do peptídeo EDEQEEMANAIITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 6) ou DEQEEMANAIITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 322).
8. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com a reivindicação 1, caracterizado pelo fato de que: (a) X1 é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos 80% idêntica ao comprimento total do peptídeo PKKKIQLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 4) ou QLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 320); (b) X3 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos pelo menos 80% idêntica ao comprimento total do peptídeo LEDYAFNFELILEEIARLFESG (SEQ ID NO: 5) ou LEDYAFNFELILEEIARLFES (SEQ ID NO: 321); e (c) X4 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos pelo menos 80% idêntica ao comprimento total do peptídeo EDEQEEMANAIITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 6) ou DEQEEMANAIITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 322).
9. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com a reivindicação 1, caracterizado pelo fato de que: (a) X1 é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos 90% idêntica ao comprimento total do peptídeo PKKKIQLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 4) ou QLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 320); (b) X3 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos pelo menos 90% idêntica ao comprimento total do peptídeo LEDYAFNFELILEEIARLFESG (SEQ ID NO: 5) ou LEDYAFNFELILEEIARLFES (SEQ ID NO: 321); e (c) X4 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos pelo menos 90% idêntica ao comprimento total do peptídeo EDEQEEMANAIITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 6) ou DEQEEMANAIITILQSWIF(S)
(SEQ ID NO: 322).
10. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 9, caracterizado pelo fato de que X2 tem pelo menos 8 aminoácidos de comprimento;
11. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 10, caracterizado pelo fato de que: X2 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica ao comprimento total do peptídeo KDEAEKAKRMKEWMKRIK(T) (SEQ ID NO: 7), em que resíduos de aminoácidos entre parênteses podem estar presentes ou ausentes.
12. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 11, caracterizado pelo fato de que: (i) X1 inclui 1, 2, 3, 4 ou todos os 5 dos seguintes: L no resíduo 7, H no resíduo 8, H no resíduo 11, Y no resíduo 14; M no resíduo 18, em que a numeração é relativa à SEQ ID NO: 4 com base na presença de resíduos opcionais; e/ou (ii) X3 inclui 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 ou todos os 8 dos seguintes: D no resíduo 3, Y no resíduo 4, F no resíduo 6, N no resíduo 7, L no resíduo 10, I no resíduo 11, E no resíduo 13 ou E no resíduo 14, em que a numeração é relativa à SEQ ID NO: 5 com base na presença de resíduos opcionais.
13. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 12, caracterizado pelo fato de que: (iii) X4 inclui I no resíduo 19 em que a numeração é relativa à SEQ ID NO: 6 com base na presença de resíduos opcionais.
14. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 11, caracterizado pelo fato de que: X1 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntico ao longo do seu comprimento ao peptídeo PKKKIQIMAEEALKDALSILNI (SEQ ID NO: 8); X3 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos de pelo menos 37% 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98 % ou 100% idêntica ao longo do seu comprimento ao peptídeo LERFAKRFERNLWGIARLFESG (SEQ ID NO: 9); e X4 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica ao longo de seu comprimento ao peptídeo EDEQEEMANAIITILQSWFFS (SEQ ID NO: 10). em que (i) X1 inclui I no resíduo 7, T ou M no resíduo 8, E no resíduo 11, K no resíduo 14 e S no resíduo 18; e (ii) X3 inclui R no resíduo 3, F no resíduo 4, K no resíduo 6, R no resíduo 7, R no resíduo 10, N no resíduo 11, W no resíduo 13 e G no resíduo 14.
15. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 11, caracterizado pelo fato de que: X1 é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos 65% idêntica ao longo do seu comprimento ao peptídeo PKKKIQIMAEEALKDALSILNI (SEQ ID NO: 8); X3 é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos 65% idêntica ao longo do seu comprimento ao peptídeo LERFAKRFERNLWGIARLFESG (SEQ ID NO: 9); e X4 é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos 65% idêntica ao longo do seu comprimento ao peptídeo EDEQEEMANAIITILQSWFFS (SEQ ID NO: 10). em que (i) X1 inclui I no resíduo 7, T ou M no resíduo 8, E no resíduo 11, K no resíduo 14 e S no resíduo 18; e (ii) X3 inclui R no resíduo 3, F no resíduo 4, K no resíduo 6,
R no resíduo 7, R no resíduo 10, N no resíduo 11, W no resíduo 13 e G no resíduo 14.
16. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 11, caracterizado pelo fato de que: X1 é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos 75% idêntica ao longo do seu comprimento ao peptídeo PKKKIQIMAEEALKDALSILNI (SEQ ID NO: 8); X3 é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos 75% idêntica ao longo do seu comprimento ao peptídeo LERFAKRFERNLWGIARLFESG (SEQ ID NO: 9); e X4 é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos 75% idêntica ao longo do seu comprimento ao peptídeo EDEQEEMANAIITILQSWFFS (SEQ ID NO: 10). em que (i) X1 inclui I no resíduo 7, T ou M no resíduo 8, E no resíduo 11, K no resíduo 14 e S no resíduo 18; e (ii) X3 inclui R no resíduo 3, F no resíduo 4, K no resíduo 6, R no resíduo 7, R no resíduo 10, N no resíduo 11, W no resíduo 13 e G no resíduo 14.
17. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 11, caracterizado pelo fato de que: X1 é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos 80% idêntica ao longo do seu comprimento ao peptídeo PKKKIQIMAEEALKDALSILNI (SEQ ID NO: 8); X3 é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos 80% idêntica ao longo do seu comprimento ao peptídeo LERFAKRFERNLWGIARLFESG (SEQ ID NO: 9); e X4 é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos 80% idêntica ao longo do seu comprimento ao peptídeo EDEQEEMANAIITILQSWFFS (SEQ ID NO: 10)
em que (i) X1 inclui I no resíduo 7, T ou M no resíduo 8, E no resíduo 11, K no resíduo 14 e S no resíduo 18; e (ii) X3 inclui R no resíduo 3, F no resíduo 4, K no resíduo 6, R no resíduo 7, R no resíduo 10, N no resíduo 11, W no resíduo 13 e G no resíduo 14.
18. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 11, caracterizado pelo fato de que: X1 é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos 90% idêntica ao longo do seu comprimento ao peptídeo PKKKIQIMAEEALKDALSILNI (SEQ ID NO: 8); X3 é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos 90% idêntica ao longo do seu comprimento ao peptídeo LERFAKRFERNLWGIARLFESG (SEQ ID NO: 9); e X4 é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos 90% idêntica ao longo do seu comprimento ao peptídeo EDEQEEMANAIITILQSWFFS (SEQ ID NO: 10) em que (i) X1 inclui I no resíduo 7, T ou M no resíduo 8, E no resíduo 11, K no resíduo 14 e S no resíduo 18; e (ii) X3 inclui R no resíduo 3, F no resíduo 4, K no resíduo 6, R no resíduo 7, R no resíduo 10, N no resíduo 11, W no resíduo 13 e G no resíduo 14.
19. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 14 a 18, caracterizado pelo fato de que (iii) X4 inclui F no resíduo 19.
20. Agonista do receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 19, caracterizado pelo fato de que as substituições de aminoácidos (AA) em relação aos domínios de peptídeo de referência ocorrem em não mais do que 3 resíduos AA marcados em negrito, ou ocorrem em não mais do que 2 resíduos AA marcados em fonte em negrito, ou ocorrem em no máximo 1 resíduo AA marcado em fonte em negrito, ou não ocorrem em resíduos AA marcados em fonte em negrito.
21. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 20, caracterizado pelo fato de que as substituições de aminoácidos em relação aos domínios de peptídeo de referência são substituições de aminoácidos conservativas.
22. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 21, caracterizado pelo fato de que os resíduos de aminoácidos relativos à SEQ ID NO: 4 são selecionados a partir do grupo que consiste em: Posição 01: A F I L M P Q R S W Posição 02: A D E G V K Posição 03: D E F W K Posição 04: D E K N P R W Posição 05: D E H I K L M S Posição 06: A D E G L P S W Q Posição 07: D E L Q Y I Posição 08: A F H W Y M T Posição 09: C F P A Posição 10: C D E F K P Posição 11: D F H E Posição 12: A D E P S T V Posição 13: H I L M P R V W Posição 14: F R W Y K Posição 15: D E N Y Posição 16: A C L M S Posição 17: F I L M P R Posição 18: G M Q Y S Posição 19: I L M P Q V
Posição 20: A K L M Q R S Posição 21: G K N P R S W Posição 22: D E I K M N W Y
23. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com a reivindicação 22, caracterizado pelo fato de que a posição 7 é I, a posição 8 é M ou T, a posição 11 é E, a posição 14 é K e a posição 18 é S.
24. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com a reivindicação 22, caracterizado pelo fato de que 1, 2, 3, 4 ou 5 dos seguintes não são verdadeiros: a posição 7 é I, a posição 8 é M ou T, a posição 11 é E, a posição 14 é K e a posição 18 é S.
25. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 24, caracterizado pelo fato de que os resíduos de aminoácidos relativos à SEQ ID NO: 5 são selecionados a partir do grupo que consiste em: Posição 01: A L Posição 02: D E G K M T Posição 03: D E N Y R Posição 04: C D G T Y F Posição 05: A F H S V W Y Posição 06: A F I M T V Y K Posição 07: D K N S T R Posição 08: A C G L M S V F Posição 09: C H K L R S T V E Posição 10: F I L M Y R Posição 11: I L N T Y Posição 12: F K L M S V Posição 13: A D F G I N P Q S T E W Posição 14: A E F G H S V Posição 15: C I L M V W Posição 16: A D G S T V
Posição 17: H K L N R Posição 18: C D G I L Q R T W Posição 19: D F M N W Posição 20: A C E F G M S Y Posição 21: D E G H L M R S T V W Posição 22: A D G K N S Y
26. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 25, caracterizado pelo fato de que compreende uma substituição de cisteína na posição 17 ou 20 em relação à SEQ ID NO: 5.
27. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com a reivindicação 25 ou 26, caracterizado pelo fato de que a posição 3 é R, a posição 4 é F, a posição 6 é K, a posição 7 é R, a posição 10 é R, a posição 11 é N, a posição 13 é W e a posição 14 é G.
28. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com a reivindicação 25 ou 26, caracterizado pelo fato de que 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 ou todos os 8 dos seguintes não são verdadeiros: a posição 3 é R, a posição 4 é F, a posição 6 é K, a posição 7 é R, a posição 10 é R, a posição 11 é N, a posição 13 é W e a posição 14 é G.
29. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 28, caracterizado pelo fato de que os resíduos de aminoácidos relativos à SEQ ID NO: 6 são selecionados a partir do grupo que consiste em: Posição 01: D E G K V Posição 02: D I M S Posição 03: E G H K Posição 04: E G I K Q R S Posição 05: A D E G H S V Posição 06: C D E G I M Q R T V Posição 07: C E L M P R T
Posição 08: A F L M W Posição 09: A G L N Q R T Posição 10: A C D E F H I W Posição 11: I M N S V W Posição 12: I K L S V Posição 13: C L M R S T Posição 14: I L P T Y Posição 15: F G I L M N V Posição 16: H K Q R Posição 17: C F K S W Y Posição 18: K Q T W Posição 19: C G N I Posição 20: C F G L Y Posição 21: A F G H S Y
30. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 29, caracterizado pelo fato de que compreende uma substituição de cisteína na posição 3 em relação à SEQ NO:
6.
31. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com a reivindicação 30 ou 31, caracterizado pelo fato de que a posição 19 é I.
32. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com a reivindicação 30 ou 31, caracterizado pelo fato de que a posição 19 não é I.
33. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 32, caracterizado pelo fato de que X2 é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica ao longo de seu comprimento a KDEAEKAKRMKEWMKRIKT (SEQ ID NO: 7).
34. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com a reivindicação 11 ou 33, caracterizado pelo fato de que os resíduos de aminoácidos relativos à SEQ ID NO: 7 são selecionados a partir do grupo que consiste em: Posição 01: A H L M R S V K Posição 02: A D E Q R S T V W Y Posição 03: C E G K L N Q R W Posição 04: A F G N S T V Y Posição 05: A E G I M R V Posição 06: C E K L N R V Posição 07: A C E I L S T V W Posição 08: H K L M S T W Y Posição 09: A I L M Q S R Posição 10: A I M S W Y Posição 11: C I K L S V Posição 12: C E K L P Q R T Posição 13: A D H N W Posição 14: A C G I L S T V M Posição 15: A E G I K L M R V Posição 16: G H L R S T V Posição 17: A I L V Posição 18: A C D E G H I K M S Posição 19: D E G L N V T
35. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com a reivindicação 11, 33 ou 34, caracterizado pelo fato de que compreende uma substituição de cisteína na posição 1, 2, 5, 9, 12 ou 16 em relação à SEQ NO: 7.
36. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com a reivindicação 34 ou 35, caracterizado pelo fato de que a posição 11 é I.
37. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com a reivindicação 34 ou 35, caracterizado pelo fato de que a posição 11 não é I.
38. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 37, caracterizado pelo fato de que: (i) o primeiro componente polipeptídico inclui um de X1, X2, X3 e X4, e o segundo componente polipeptídico inclui os três de X1, X2, X3 e X4 que não estão presentes no primeiro componente polipeptídico; ou (ii) o primeiro componente polipeptídico inclui dois de X1, X2, X3 e X4, e o segundo componente polipeptídico inclui os dois de X1, X2, X3 e X4 que não estão presentes no primeiro componente polipeptídico.
39. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 37, caracterizado pelo fato de que (i) o primeiro polipeptídeo compreende X1 e o segundo polipeptídeo compreende X2, X3 e X4; (ii) o primeiro polipeptídeo compreende X2 e o segundo polipeptídeo compreende X1, X3 e X4; (iii) o primeiro polipeptídeo compreende X3 e o segundo polipeptídeo compreende X1, X2 e X4; (iv) o primeiro polipeptídeo compreende X4 e o segundo polipeptídeo compreende X1, X2 e X3; (v) o primeiro polipeptídeo compreende X1 e X2, e o segundo polipeptídeo compreende X3 e X4; (vi) o primeiro polipeptídeo compreende X1 e X3, e o segundo polipeptídeo compreende X2 e X4; (vii) o primeiro polipeptídeo compreende X1 e X4, e o segundo polipeptídeo compreende X2 e X3; (viii) o primeiro polipeptídeo compreende X2 e X3, e o segundo polipeptídeo compreende X1 e X4; (ix) o primeiro polipeptídeo compreende X2 e X4, e o segundo polipeptídeo compreende X1 e X3; (x) o primeiro polipeptídeo compreende X3 e X4, e o segundo polipeptídeo compreende X1 e X2; (xi) o primeiro polipeptídeo compreende X1, X2 e X3 e o segundo polipeptídeo compreende X4; (xii) o primeiro polipeptídeo compreende X1, X2 e X4 e o segundo polipeptídeo compreende X3; (xiii) o primeiro polipeptídeo compreende X1, X3 e X4 e o segundo polipeptídeo compreende X2; ou (xiv) o primeiro polipeptídeo compreende X2, X3 e X4 e o segundo polipeptídeo compreende X1.
40. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 39, caracterizado pelo fato de que: (a) o primeiro polipeptídeo compreende X1 e exclui X2, X3 e X4; e o segundo polipeptídeo é uma proteína de fusão compreendendo X3-Z1- X2-Z2-X4 e excluindo X1; (b) o primeiro polipeptídeo compreende X4 e exclui X1, X2 e X3; e o segundo polipeptídeo é uma proteína de fusão compreendendo X1-Z1- X3-Z2-X2 e excluindo X4; ou (c) o primeiro polipeptídeo é uma proteína de fusão compreendendo X1-Z1-X3 e excluindo X2 e X4; e o segundo polipeptídeo é uma proteína de fusão compreendendo X2-Z1-X4 e excluindo X1 e X3; em que cada um de Z1 e Z2 independentemente é um ligante de aminoácido opcional.
41. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 40, caracterizado pelo fato de que X1, X2, X3 e X4, respectivamente, compreendem a sequência de aminoácidos com pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica, respectivamente, ao comprimento total dos domínios X1, X2, X3 e X4 mostrados abaixo, onde os resíduos entre parênteses podem estar presentes ou ausentes: X1: PKKKIQLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO:4)
X2: (K)DEAEKAKRMKEWMKRIKT (SEQ ID NO:7) X3: (LE)DYAFNFELILEEIARLF(ESG) (SEQ ID NO:5) X4: (E)DEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO:6)
42. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 41, caracterizado pelo fato de que o primeiro polipeptídeo e o segundo polipeptídeo compreendem a sequência de aminoácidos com pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50 %, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica a um par de primeiro e segundo polipeptídeos mostrados abaixo (resíduos sublinhados ou res duos X s o opcionais e cada res duo do dom nio opcional, quando presente, pode compreender qualquer aminoácido): (i) Primeiro polipeptídeo X1 (Neo2A) PKKKIQLHAEHALYDALMILNIVKTNS (SEQ ID NO: 256) e Segundo polipeptídeo: X3-X2 -X4 (Neo2B)
TNSPPAEEKLEDYAFNFELILEEIARLFESGDQKDEAEKAKRMKEWMKRIKTTA SEDEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 257) (ii) Primeiro polipeptídeo X1-X3-X2
PKKKIQLHAEHALYDALMILNIVKTNSPPAEEKLEDYAFNFELILEEIARLFESGD QKDEAEKAKRMKEWMKRIKTTAS (SEQ ID NO: 258) e Segundo polipeptídeo X4 TTASEDEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 259); (iii) Primeiro polipeptídeo X1-X3
PKKKIQLHAEHALYDALMILNIVKTNSPPAEEKLEDYAFNFELILEEIARLFESGD (SEQ ID NO: 260) e Segundo polipeptídeo X2-X4 DQKDEAEKAKRMKEWMKRIKTTASEDEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 261)
(iv) Primeiro polipeptídeo X1 (Neo4A) PKKKIQIMAEEALKDALSILNIVKTNS (SEQ ID NO: 262) Segundo polipeptídeo X3-X2 -X4 (Neo4B)
TNSPPAEEQLERFAKRFERNLWGIARLFESGDQKDEAEKAKRMIEWMKRIKTT ASEDEQEEMANAIITILQSWFFS (SEQ ID NO: 263) (v) Primeiro polipeptídeo X1 PKKKIQLHAEHALYDALMILNIXXXXX (SEQ ID NO: 311) e Segundo polipeptídeo: X3-X2 -X4
XXXXXXXXXLEDYAFNFELILEEIARLFESGXXKDEAEKAKRMKEWMKRIKTXX XEDEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 264) (vi) Primeiro polipeptídeo X1-X3-X2
PKKKIQLHAEHALYDALMILNIXXXXXXXXXXXLEDYAFNFELILEEIARLFESGX XKDEAEKAKRMKEWMKRIKTTAS (SEQ ID NO: 265) e Segundo polipeptídeo X4 XXXXXDEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 266); (vii) Primeiro polipeptídeo X1-X3
PKKKIQLHAEHALYDALMILNIXXXXXXXXXXXLEDYAFNFELILEEIARLFESXX GD (SEQ ID NO: 267) e Segundo polipeptídeo X2-X4 DQKDEAEKAKRMKEWMKRIKTXXXEDEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 268) (viii) Primeiro polipeptídeo X1 PKKKIQIMAEEALKDALSILNIXXXXX (SEQ ID NO: 269) Segundo polipeptídeo X3-X2 -X4
XXXXXXXXQLERFAKRFERNLWGIARLFESGXX
KDEAEKAKRMIEWMKRIKTXXXEDEQEEMANAIITILQSWFFS(SEQ ID NO: 270) (ix) Primeiro polipeptídeo >Neo4_X1-X3
PKKKIQIMAEEALKDALSILNIVKTNSPPAEEQLERFAKRF ERNLWGIARLFESGD (SEQ ID NO: 312) Segundo polipeptídeo >Neo4_X2-X4
DQKDEAEKAKRMIEWMKRIKTTASEDEQEEMANAIITILQ SWFFS (SEQ ID NO: 313) (x) Primeiro polipeptídeo >Neo4_X1-X3
PKKKIQIMAEEALKDALSILNIXXXXXXXXXXQLERFAKRF ERNLWGIARLFESXX (SEQ ID NO: 314) Segundo polipeptídeo >Neo4_X2-X4
XXKDEAEKAKRMIEWMKRIKXXXXEDEQEEMANAIITILQ SWFFS (SEQ ID NO: 315) (xi) Primeiro polipeptídeo Neo4_X1-X3'-X2
PKKKIQIMAEEALKDALSILNIVKTNSPPAEEQLERFAKRF ERNLWGIARLFESGDQKDEAEKAKRMIEWMKRIKTTA (SEQ ID NO: 316) Segundo polipeptídeo Neo4X4 TTASEDEQEEMANAIITILQSWFFS (SEQ ID NO: 317) (xii) Primeiro polipeptídeo Neo4_X1-X3'-X2
PKKKIQIMAEEALKDALSILNIXXXXXXXXXXXLERFAKRF ERNLWGIARLFESXXXKDEAEKAKRMIEWMKRIKXXX (SEQ ID NO: 318) Segundo polipeptídeo Neo4_X4 XXXXXDEQEEMANAIITILQSWFFS (SEQ ID NO: 319); ou (xiii) Primeiro polipeptídeo (X1)
PKKKIQLHAEHALYDALMILNIVGGSS (SEQ ID NO: 323), ou SKEAIQLHAEHALYDALMILNIVKTNS (SEQ ID NO: 324), ou PIQLHAEHALYDALMILNIV (SEQ ID NO: 325) Segundo polipeptídeo (X3-X2 -X4)
PKLEDYAFNFELILEEIARLFESGDQKDEAEKAKRMKEW MKRIKTTASEDEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 326); ou
GGSSGGLEDYAFNFELILEEIARLFESGGSSGGKDEAEK AKRMKEWMKRITGGSSGGDEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 327); ou
GGSSGGLEDYAFNFELILEEIARLFESGGSSGGGGEAEK AKRMKEWMKRIGGSSGGDEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 328).
43. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 41, caracterizado pelo fato de que X1, X2, X3 e X4, respectivamente, compreendem a sequência de aminoácidos que é pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40% 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica, respectivamente, aos domínios X1, X2, X3 e X4 (conforme definido na Tabela 1) presentes na sequência de aminoácidos de SEQ ID NO: 11-94, 190-216, 247 e SEQ ID NOs: 275-300.
44. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 43, caracterizado pelo fato de que o primeiro componente polipeptídico e/ou o segundo componente polipeptídico incluem pelo menos uma ligação dissulfeto.
45. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 44, caracterizado pelo fato de que o primeiro componente polipeptídico e o segundo componente polipeptídico estão associados de forma não covalente.
46. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 44, caracterizado pelo fato de que o primeiro componente polipeptídico e o segundo componente polipeptídico estão indiretamente ligados um ao outro através de um receptor.
47. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 46, caracterizado pelo fato de que o primeiro componente polipeptídico compreende ainda um primeiro domínio de direcionamento ou o segundo componente polipeptídico compreende ainda um segundo domínio de direcionamento.
48. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 46, caracterizado pelo fato de que o primeiro componente polipeptídico compreende ainda um primeiro domínio de direcionamento e o segundo componente polipeptídico compreende ainda um segundo domínio de direcionamento.
49. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com a reivindicação 47 ou 48, caracterizado pelo fato de que o primeiro domínio de direcionamento, quando presente, é uma fusão de tradução com o primeiro polipeptídeo, e em que o segundo domínio de direcionamento, quando presente, é uma fusão de tradução com o segundo polipeptídeo.
50. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 47 a 49, caracterizado pelo fato de que o primeiro domínio de direcionamento e o segundo domínio de direcionamento estão ambos presentes, e em que o primeiro domínio de direcionamento e o segundo domínio de direcionamento são iguais.
51. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 47 a 49, caracterizado pelo fato de que o primeiro domínio de direcionamento e o segundo domínio de direcionamento estão ambos presentes, e em que o primeiro domínio de direcionamento e o segundo domínio de direcionamento são diferentes.
52. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 47 a 51, caracterizado pelo fato de que o primeiro domínio de direcionamento e/ou o segundo domínio de direcionamento se ligam a proteínas de superfície celular.
53. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com a reivindicação 52, caracterizado pelo fato de que as proteínas da superfície celular estão presentes na superfície das células selecionadas do grupo que consiste em células tumorais, componentes vasculares, microambiente tumoral (por exemplo, fibroblastos, células imunes infiltrantes ou elementos estromais), outras células de câncer e células imunes (incluindo, mas sem limitação a células T CD8+, células T reguladoras, células dendríticas, células NK ou macrófagos), tais marcadores de superfície de células imunes incluindo, mas sem limitação a CD3, CD4, CD8, CD19, CD20, CD21, CD25, CD37, CD30, CD33, CD40, CD68, CD123, CD254, PD-1, B7-H3 e CTLA-4.
54. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com a reivindicação 52 ou 53, caracterizado pelo fato de que o primeiro domínio de direcionamento e o segundo domínio de direcionamento se ligam a uma célula tumoral, célula de componente vascular tumoral ou marcador de superfície celular do microambiente tumoral.
55. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com a reivindicação 54, caracterizado pelo fato de que a célula tumoral, célula de componente vascular ou marcador de superfície celular do microambiente tumoral é selecionado a partir do grupo que inclui, mas não se limita a EGFR, EGFRvIII, Her2, HER3, EpCAM, MSLN, MUC16, PSMA, TROP2, ROR1, RON, PD-L1, CD47, CTLA-4,CD5, CD19, CD20, CD25, CD37, CD30, CD33, CD40, CD45, CAMPATH-1, BCMA, CS-1, PD-L1, B7-H3, B7-DC, HLD-DR, antígeno carcinoembriônico (CEA), TAG-72, EpCAM, MUC1, proteína de ligação ao folato, A33, G250, antígeno de membrana específico da próstata (PSMA), ferritina, GD2, GD3, GM2, Ley, CA-125, CA19-9, fator de crescimento epidérmico, p185HER2, receptor de IL-2, EGFRvIII (de2-7 EGFR), proteína de ativação de fibroblastos, tenascina, uma metaloproteinase, endosialina, fator de crescimento endotelial vascular, avB3, WT1, LMP2, HPV E6, HPV E7, Her-2/neu, MAGE A3, não mutante p53, NY-ESO-1, MelanA/MART1, mutante Ras, gp100, mutante p53, PR1, bcr-abl, tironsinase, survivina, PSA, hTERT, uma proteína de ponto de interrupção de translocação de Sarcoma, EphA2, PAP, ML-IAP, AFP, ERG,
NA17, PAX3, ALK, receptor de andrógeno, ciclina B 1, ácido polissiálico, MYCN, RhoC, TRP-2, fucosila GM1, mesotelina (MSLN), PSCA, MAGE Al, sLe (animal), CYP1B1, PLAV1, GM3, BORIS, Tn, GloboH, ETV6-AML, NY-BR-1, RGS5, SART3, STn, anidrase carbônica IX, PAX5, proteína 17 do esperma OY-TESL, LCK, HMWMAA, AKAP-4, SSX2, XAGE 1, Legumaína, Tie 3, VEGFR2, MAD- CT-1, PDGFR-B, MAD-CT-2, ROR2, TRAIL1, MUC16, MAGE A4, MAGE C2, GAGE, EGFR, CMET, HER3, MUC15, CA6, NAPI2B, TROP2, CLDN6, CLDN16, CLDN18.2, CLorf186, RON, LY6E, FRA, DLL3, PTK7, STRA6, TMPRSS3, TMPRSS4, TMEM238, UPK1B, VTCN1, LIV1, ROR1, antígeno relacionado a Fos 1, BMPR1B (receptor de proteína morfogenética óssea tipo IB, número de acesso ao Genbank NM. 001203); E16 (LAT1, SLC7A5, número de acesso no Genbank NM-003486); STEAP1 (seis antígenos epiteliais transmembranares da próstata, número de acesso no Genbank NM-012449); 0772P (CA125, MUC16, número de acesso no Genbank AF361486); MPF (MPF, MSLN, SMR, fator de potencialização de megacariócitos, mesotelina, número de acesso no Genbank NM-005823); Napi3b (NAPI-3B, NPTIIb, SLC34A2, família de transportadores de soluto 34 (fosfato de sódio), membro 2, transportador de fosfato 3b dependente de sódio tipo II, número de acesso no Genbank NM-006424); Sema 5b (FLJ10372, KIAA1445, Mm. 42015, SEMA5B, SEMAG, Semaforina 5b Hlog, domínio sema, sete repetições de trombospondina (tipo 1 e semelhante ao tipo 1), domínio transmembranar (TM) e domínio citoplasmático curto, (semaforina) 5B, número de acesso no Genbank AB040878); PSCA hlg (2700050C12Rik, C530008O16Rik, RIKEN cDNA 2700050C12, gene 2700050C12 RIKEN cDNA, número de acesso no Genbank AY358628); ETBR (receptor de endotelina tipo B, número de acesso no Genbank AY275463); MSG783 (RNF124, proteína hipotética FLJ20315, número de acesso no Genbank NM 017763); STEAP2 (HGNC.sub.--8639, IPCA-1, PCANAP1, STAMP1, STEAP2, STMP, gene associado ao câncer de próstata 1, proteína associada ao câncer de próstata 1, seis antígenos epiteliais transmembranares da próstata 2, seis proteínas transmembranares da próstata, número de acesso no Genbank AF455138);
TrpM4 (BR22450, FLJ20041, TRPM4, TRPM4B, canal catiônico de potencial receptor transiente, subfamília M, membro 4, número de acesso no Genbank NM 017636); CRIPTO (CR, CR1, CRGF, CRIPTO, TDGF1, fator de crescimento derivado de teratocarcinoma, número de acesso no Genbank NP003203 ou NM003212); CD21 (CR2 (receptor 2 do complemento) ou C3DR (receptor do vírus C3d/Epstein Barr) ou Hs. 73792, número de acesso ao Genbank M26004); CD79b (IGb (beta associado a imunoglobulina), B29, número de acesso ao Genbank NM 000626); FcRH2 (IFGP4, IRTA4, SPAP1A (domínio SH2 contendo proteína âncora de fosfatase 1a), SPAP1B, SPAP1C, número de acesso ao Genbank NM030764); HER2 (número de acesso ao Genbank M11730); NCA (número de acesso ao Genbank M18728); MDP (número de acesso ao Gnebank BC017023); IL20R.alfa. (Número de acesso ao Genbank AF184971); Brevican (número de acesso ao Genbank AF229053); Ephb2R (número de acesso ao Genbank NM004442); ASLG659 (número de acesso ao Genbank AX092328); PSCA (número de acesso ao Genbank AJ297436); GEDA (número de acesso ao Genbank AY260763); BAFF-R (número de acesso ao Genbank NP443177.1); CD22 (número de acesso ao Genbank NP-001762.1); CD79a (CD79A, CD79.alfa., alfa associado a imunoglobulina, uma proteína específica de células B que interage covalentemente com Ig beta (CD79B) e forma um complexo na superfície com moléculas de Ig M, transduz um sinal envolvido na diferenciação de células B, número de acesso ao Genbank NP001774.1); CXCR5 (receptor de linfoma de Burkitt 1, um receptor acoplado à proteína G que é ativado pela quimiocina CXCL13, funções na migração de linfócitos e defesa humoral, desempenha um papel na infecção por HIV-2 e talvez no desenvolvimento de AIDS, linfoma, mieloma e leucemia, número de acesso ao Genbank NP001707.1); HLA-DOB (subunidade beta da molécula MHC de classe II (antígeno Ia) que se liga a peptídeos e os apresenta a linfócitos T CD4+, número de acesso ao Genbank NP002111.1); P2X5 (canal 5 de íon bloqueado por ligante do receptor purinérgico P2X, um canal de íon bloqueado por ATP extracelular, pode estar envolvido na transmissão sináptica e neurogênese, a deficiência pode contribuir para a fisiopatologia da instabilidade idiopática do detrusor, número de acesso ao Genbank NP002552.2); CD72 (antígeno de diferenciação de células B CD72, Lyb-2, número de acesso ao Genbank NP001773.1); LY64 (antígeno linfocitário 64 (RP105), proteína de membrana tipo I da família de repetição rica em leucina (LRR), regula a ativação de células B e apoptose, a perda de função está associada ao aumento da atividade da doença em pacientes com lúpus eritematoso sistêmico, número de acesso ao Genbank NP005573.1); FCRH1 (proteína 1 semelhante a receptor Fc, um receptor putativo para o domínio Fc de imunoglobulina que contém domínios semelhantes a Ig tipo C2 e ITAM, pode ter um papel na diferenciação de linfócitos B, número de acesso ao Genbank NP443170.1); ou IRTA2 (translocação do receptor da superfamília de imunoglobulina associada 2, um imunorreceptor putativo com possíveis papéis no desenvolvimento de células B e linfomagenesia; ocorre desregulação do gene por translocação em algumas doenças malignas de células B, número de acesso ao Genbank NP112571.1).
56. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 47 a 55, caracterizado pelo fato de que o primeiro domínio de direcionamento e/ou o segundo domínio de direcionamento se ligam a um marcador de superfície de célula imune (incluindo, mas sem limitação a células T CD8+, células T regulatórias, células dendríticas, células NK ou macrófagos), em que o marcador de superfície da célula imune pode incluir, mas sem limitação a CD3, CD4, CD8, CD19, CD20, CD21, CD25, CD37, CD30, CD33, CD40, CD68, CD123, CD254, PD-1, B7-H3 e CTLA-4, e/ou em que o domínio de direcionamento se liga a PD-1, PDL-1, CTLA-4, TROP2, B7- H3, CD33, CD22, anidrase carbônica IX, CD123, Nectina-4, antígeno de fator de tecido, CD154, B7-H3, B7-H4, FAP (proteína de ativação de fibroblastos) ou MUC16.
57. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com a reivindicação 52 ou 53, caracterizado pelo fato de que o primeiro domínio de direcionamento e o segundo domínio de direcionamento se ligam a marcadores de superfície de células T (incluindo, mas sem limitação a células T CD8+, células T regulatórias, células dendríticas ou macrófagos).
58. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com a reivindicação 52 ou 53, caracterizado pelo fato de que o primeiro domínio de direcionamento ou o segundo domínio de direcionamento se liga a um marcador de superfície de célula tumoral, célula de componente vascular ou célula de microambiente tumoral (por exemplo, fibroblastos, células imunes infiltrantes ou elementos do estroma), e em que o outro domínio de direcionamento se liga a um marcador de superfície de célula imune (incluindo, mas sem limitação a células T CD8+, células T regulatórias, células dendríticas ou macrófagos), em que o marcador de superfície de célula imune pode incluir, mas não está limitado a CD3, CD4, CD8, CD19, CD20, CD21, CD25, CD37, CD30, CD33, CD40, CD68, CD123, CD254, PD-1, B7-H3 e CTLA-4.
59. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 47 a 58, caracterizado pelo fato de que o primeiro domínio de direcionamento e/ou o segundo domínio de direcionamento podem incluir, mas sem limita o a um scF , um F(ab), um F(ab ) 2, um receptor de células B (BCR), um DARPin, um aficorpo, um monocorpo, um nanocorpo, diacorpo, um anticorpo (incluindo um anticorpo monoespecífico ou biespecífico); um oligopeptídeo de direcionamento de célula incluindo, mas sem limitação a peptídeos de ligação de integrina RGD, ligantes projetados de novo, aptâmeros, conotoxinas de um peptídeo biciclo, moléculas pequenas, como ácido fólico, e um vírus que se liga à superfície da célula.
60. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 47 a 58, caracterizado pelo fato de que o primeiro domínio de direcionamento e/ou o segundo domínio de direcionamento podem incluir, mas sem limita o a um scF , um F(ab), um F(ab ) 2, um receptor de células B (BCR), um DARPin, um aficorpo, um monocorpo, um nanocorpo, diacorpo e um anticorpo (incluindo um anticorpo monoespecífico ou biespecífico).
61. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 60, caracterizado pelo fato de que X2 é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos 70% idêntica ao longo de seu comprimento a KDEAEKAKRMKEWMKRIK(T) (SEQ ID NO: 7), em que os resíduos em parênteses são opcionais.
62. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 60, caracterizado pelo fato de que X2 é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos 80% idêntica ao longo de seu comprimento a KDEAEKAKRMKEWMKRIK(T) (SEQ ID NO: 7), em que os resíduos entre parênteses são opcionais.
63. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 60, caracterizado pelo fato de que X2 é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos 90% idêntica ao longo de seu comprimento a KDEAEKAKRMKEWMKRIK(T) (SEQ ID NO: 7), em que os resíduos entre parênteses são opcionais.
64. Polipeptídeo caracterizado pelo fato de que compreende 1, 2 ou 3, mas não todos os 4 domínios X1, X2, X3 e X4, em que: (a) X1, quando presente, é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos de pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica ao comprimento total do peptídeo (PKKKIQ)LHAEHALYDAL(MILNI); (SEQ ID NO: 4); (b) X2, quando presente, é qualquer domínio de peptídeo helicoidal; (c) X3, quando presente, é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos de pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica ao comprimento total do peptídeo (LE)DYAFNFELILEE(IARLFESG) (SEQ ID NO: 5); e (d) X4, quando presente, é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos de pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica ao comprimento total do peptídeo (EDEQEEMANAI)ITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 6); resíduos de aminoácidos entre parênteses podem estar presentes ou ausentes.
65. Polipeptídeo, de acordo com a reivindicação 64, caracterizado pelo fato de que: (a) X1, quando presente, é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos 70% idêntica ao comprimento total do peptídeo (PKKKIQ)LHAEHALYDAL(MILNI); (SEQ ID NO: 4) ou (PKKKI)QLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 4); (b) X2, quando presente, é qualquer domínio de peptídeo helicoidal; (c) X3, quando presente, é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos 70% idêntica ao comprimento total do peptídeo (LE)DYAFNFELILEE(IARLFESG) (SEQ ID NO: 5) ou LEDYAFNFELILEEIARLFES(G) (SEQ ID NO: 5); e (d) X4, quando presente, é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos 70% idêntica ao comprimento total do peptídeo (EDEQEEMANAI)ITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 6) ou (E)DEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 6).
66. Polipeptídeo, de acordo com a reivindicação 64, caracterizado pelo fato de que: (a) X1, quando presente, é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos 85% idêntica ao comprimento total do peptídeo (PKKKIQ)LHAEHALYDAL(MILNI); (SEQ ID NO: 4) ou (PKKKI)QLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 4); (b) X2, quando presente, é qualquer domínio de peptídeo helicoidal;
(c) X3, quando presente, é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos 85% idêntica ao comprimento total do peptídeo (LE)DYAFNFELILEE(IARLFESG) (SEQ ID NO: 5) ou LEDYAFNFELILEEIARLFES(G) (SEQ ID NO: 5); e (d) X4, quando presente, é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos 85% idêntica ao comprimento total do peptídeo (EDEQEEMANAI)ITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 6) ou (E)DEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 6).
67. Polipeptídeo, de acordo com a reivindicação 64, caracterizado pelo fato de que: (a) X1, quando presente, é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos idêntica ao comprimento total do peptídeo (PKKKIQ)LHAEHALYDAL(MILNI); (SEQ ID NO: 4) ou (PKKKI)QLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 4); (b) X2, quando presente, é qualquer domínio de peptídeo helicoidal; (c) X3, quando presente, é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos idêntica ao comprimento total do peptídeo (LE)DYAFNFELILEE(IARLFESG) (SEQ ID NO: 5) ou LEDYAFNFELILEEIARLFES(G) (SEQ ID NO: 5); e (d) X4, quando presente, é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos idêntica ao comprimento total do peptídeo (EDEQEEMANAI)ITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 6) ou (E)DEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 6).
68. Polipeptídeo, de acordo com a reivindicação 64, caracterizado pelo fato de que (a) X1, quando presente, é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica ao comprimento total do peptídeo PKKKIQLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 4);
(c) X3, quando presente, é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica ao comprimento total do peptídeo LEDYAFNFELILEEIARLFESG (SEQ ID NO: 5); e (d) X4, quando presente, é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica ao comprimento total do peptídeo EDEQEEMANAIITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 6).
69. Polipeptídeo, de acordo com a reivindicação 64, caracterizado pelo fato de que (a) X1, quando presente, é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos 65% idêntica ao comprimento total do peptídeo PKKKIQLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 4) ou QLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 320); (c) X3, quando presente, é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos 65% idêntica ao comprimento total do peptídeo LEDYAFNFELILEEIARLFESG (SEQ ID NO: 5) ou LEDYAFNFELILEEIARLFES (SEQ ID NO: 321); e (d) X4 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos pelo menos 65% idêntica ao comprimento total do peptídeo EDEQEEMANAIITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 6) ou DEQEEMANAIITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 322).
70. Polipeptídeo, de acordo com a reivindicação 68, caracterizado pelo fato de que (a) X1, quando presente, é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos 75% idêntica ao comprimento total do peptídeo PKKKIQLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 4) ou QLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 320); (c) X3, quando presente, é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos 75% idêntica ao comprimento total do peptídeo LEDYAFNFELILEEIARLFESG (SEQ ID NO: 5) ou LEDYAFNFELILEEIARLFES (SEQ ID NO: 321); e (d) X4, quando presente, é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos pelo menos 75% idêntica ao comprimento total do peptídeo EDEQEEMANAIITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 6) ou DEQEEMANAIITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 322).
71. Polipeptídeo, de acordo com a reivindicação 68, caracterizado pelo fato de que (a) X1, quando presente, é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos 80% idêntica ao comprimento total do peptídeo PKKKIQLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 4) ou QLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 320); (c) X3, quando presente, é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos 80% idêntica ao comprimento total do peptídeo LEDYAFNFELILEEIARLFESG (SEQ ID NO: 5) ou LEDYAFNFELILEEIARLFES (SEQ ID NO: 321); e (d) X4, quando presente, é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos pelo menos 80% idêntica ao comprimento total do peptídeo EDEQEEMANAIITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 6) ou DEQEEMANAIITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 322).
72. Polipeptídeo, de acordo com a reivindicação 68, caracterizado pelo fato de que (a) X1, quando presente, é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos 90% idêntica ao comprimento total do peptídeo PKKKIQLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 4) ou QLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO: 320); (c) X3, quando presente, é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos 90% idêntica ao comprimento total do peptídeo LEDYAFNFELILEEIARLFESG (SEQ ID NO: 5) ou
LEDYAFNFELILEEIARLFES (SEQ ID NO: 321); e (d) X4, quando presente, é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos pelo menos 90% idêntica ao comprimento total do peptídeo EDEQEEMANAIITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 6) ou DEQEEMANAIITILQSWIF(S) (SEQ ID NO: 322).
73. Polipeptídeo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 64 a 72, caracterizado pelo fato de que X2, quando presente, compreende a sequência de aminoácidos pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica ao comprimento total do peptídeo KDEAEKAKRMKEWMKRIKT (SEQ ID NO: 7), em que os resíduos entre parênteses são opcionais.
74. Polipeptídeo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 64 a 72, caracterizado pelo fato de que X2, quando presente, compreende a sequência de aminoácidos pelo menos 75% idêntica ao comprimento total do peptídeo KDEAEKAKRMKEWMKRIK(T) (SEQ ID NO: 7), em que os resíduos entre parênteses são opcionais.
75. Polipeptídeo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 64 a 72, caracterizado pelo fato de que X2, quando presente, compreende a sequência de aminoácidos pelo menos 85% idêntica ao comprimento total do peptídeo KDEAEKAKRMKEWMKRIK(T) (SEQ ID NO: 7), em que os resíduos entre parênteses são opcionais.
76. Polipeptídeo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 64 a 72, caracterizado pelo fato de que X2, quando presente, compreende a sequência de aminoácidos pelo menos 90% idêntica ao comprimento total do peptídeo KDEAEKAKRMKEWMKRIK(T) (SEQ ID NO: 7), em que os resíduos entre parênteses são opcionais.
77. Polipeptídeo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 64 a 72, caracterizado pelo fato de que X2, quando presente, compreende a sequência de aminoácidos pelo menos 80% idêntica ao comprimento total do peptídeo KDEAEKAKRMKEWMKRIKT (SEQ ID NO: 7), em que os resíduos entre parênteses são opcionais.
78. Polipeptídeo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 64 a 72, caracterizado pelo fato de que X2, quando presente, compreende a sequência de aminoácidos pelo menos 90% idêntica ao comprimento total do peptídeo KDEAEKAKRMKEWMKRIKT (SEQ ID NO: 7), em que os resíduos entre parênteses são opcionais.
79. Polipeptídeo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 64 a 78, caracterizado pelo fato de que é selecionado a partir do grupo que consiste em: (i) um polipeptídeo compreendendo X1 e excluindo X2, X3 e X4; (ii) um polipeptídeo compreendendo X2 e excluindo X1, X3 e X4; (iii) um polipeptídeo compreendendo X3 e excluindo X1, X2 e X4; (iv) um polipeptídeo compreendendo X4 e excluindo X1, X2 e X3; (v) um polipeptídeo compreendendo X1 e X2, e excluindo X3 e X4; (vi) um polipeptídeo compreendendo X1 e X3, e excluindo X2 e X4; (vii) um polipeptídeo compreendendo X1 e X4, e excluindo X2 e X3; (viii) um polipeptídeo compreendendo X2 e X3, e excluindo X1 e X4; (ix) um polipeptídeo compreendendo X2 e X4, e excluindo X1 e X3; (x) um polipeptídeo compreendendo X3 e X4, e excluindo X1 e X2; (xi) um polipeptídeo compreendendo X1, X2 e X3 e excluindo X4; (xii) um polipeptídeo compreendendo X1, X2 e X4 e excluindo X3; (xiii) um polipeptídeo compreendendo X1, X3 e X4 e excluindo X2; e (xiv) um polipeptídeo compreendendo X2, X3 e X4 e excluindo X1.
80. Polipeptídeo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 64 a 79, sendo que o polipeptídeo é caracterizado pelo fato de que compreende X1, em que X1 inclui 1, 2, 3, 4 ou todos os 5 dos seguintes: L no resíduo 7, H no resíduo 8, H no resíduo 11, Y no resíduo 14; M no resíduo 18, em que a numeração é relativa à SEQ ID NO: 4 com base na presença de resíduos opcionais.
81. Polipeptídeo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 64 a 80, sendo que o polipeptídeo é caracterizado pelo fato de que compreende X3, em que X3 inclui 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 ou todos os 8 dos seguintes: D no resíduo 3, Y no resíduo 4, F no resíduo 6, N no resíduo 7, L no resíduo 10, I no resíduo 11, E no resíduo 13 ou E no resíduo 14, em que a numeração é relativa à SEQ ID NO: 5 com base nos resíduos opcionais presentes.
82. Polipeptídeo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 64 a 81, sendo que o polipeptídeo é caracterizado pelo fato de que compreende X4, em que X4 inclui I no resíduo 19, em que a numeração é relativa à SEQ ID NO: 6 com base nos resíduos opcionais presentes.
83. Polipeptídeo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 64 a 79, caracterizado pelo fato de que X1 está presente, em que X1 é um peptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica ao longo de seu comprimento ao peptídeo PKKKIQIMAEEALKDALSILNI (SEQ ID NO: 8), e em que X1 inclui I no resíduo
7, T ou M no resíduo 8, E no resíduo 11, K no resíduo 14 e S no resíduo 18.
84. Polipeptídeo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 64 a 79 ou 83, caracterizado pelo fato de que X3 está presente, em que X3 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos pelo menos 37% 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica ao longo de seu comprimento ao peptídeo LERFAKRFERNLWGIARLFESG (SEQ ID NO: 9), e em que X3 inclui R no resíduo 3, F no resíduo 4, K no resíduo 6, R no resíduo 7, R no resíduo 10, N no resíduo 11, W no resíduo 13 e G no resíduo 14.
85. Polipeptídeo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 64 a 79, 84 ou 84, caracterizado pelo fato de que X4 está presente, em que X4 é um peptídeo que compreende a sequência de aminoácidos pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica ao longo de seu comprimento ao peptídeo EDEQEEMANAIITILQSWFFS (SEQ ID NO: 10).
86. Polipeptídeo, de acordo com a reivindicação 85, caracterizado pelo fato de que X4 inclui F no resíduo 19.
87. Polipeptídeo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 64 a 86, caracterizado pelo fato de que as substituições de aminoácidos (AA) em relação aos domínios de peptídeo de referência ocorrem em não mais do que 3 resíduos AA marcados em negrito, ou ocorrem em não mais do que 2 resíduos AA marcados em negrito, ou ocorrem em no máximo 1 resíduo AA marcado em negrito, ou não ocorrem em resíduos AA marcados em negrito.
88. Polipeptídeo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 64 a 87, caracterizado pelo fato de que as substituições de aminoácidos em relação aos domínios de peptídeo de referência são substituições de aminoácidos conservativas.
89. Polipeptídeo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 64 a 88, caracterizado pelo fato de que X1 está presente, e em que os resíduos de aminoácidos relativos à SEQ ID NO: 4 são selecionados a partir do grupo que consiste em: Posição 01: A F I L M P Q R S W Posição 02: A D E G V K Posição 03: D E F W K Posição 04: D E K N P R W Posição 05: D E H I K L M S Posição 06: A D E G L P S W Q Posição 07: D E L Q Y I Posição 08: A F H W Y M T Posição 09: C F P A Posição 10: C D E F K P Posição 11: D F H E Posição 12: A D E P S T V Posição 13: H I L M P R V W Posição 14: F R W Y K Posição 15: D E N Y Posição 16: A C L M S Posição 17: F I L M P R Posição 18: G M Q Y S Posição 19: I L M P Q V Posição 20: A K L M Q R S Posição 21: G K N P R S W Posição 22: D E I K M N W Y
90. Polipeptídeo, de acordo com a reivindicação 89, caracterizado pelo fato de que a posição 7 é I, a posição 8 é M ou T, a posição 11 é E, a posição 14 é K e a posição 18 é S.
91. Polipeptídeo, de acordo com a reivindicação 89, caracterizado pelo fato de que 1, 2, 3, 4 ou 5 dos seguintes não são verdadeiros:
a posição 7 é I, a posição 8 é M ou T, a posição 11 é E, a posição 14 é K e a posição 18 é S.
92. Polipeptídeo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 64 a 91, caracterizado pelo fato de que X3 está presente e em que os resíduos de aminoácidos relativos à SEQ ID NO: 5 são selecionados a partir do grupo que consiste em: Posição 01: A L Posição 02: D E G K M T Posição 03: D E N Y R Posição 04: C D G T Y F Posição 05: A F H S V W Y Posição 06: A F I M T V Y K Posição 07: D K N S T R Posição 08: A C G L M S V F Posição 09: C H K L R S T V E Posição 10: F I L M Y R Posição 11: I L N T Y Posição 12: F K L M S V Posição 13: A D F G I N P Q S T E W Posição 14: A E F G H S V Posição 15: C I L M V W Posição 16: A D G S T V Posição 17: H K L N R Posição 18: C D G I L Q R T W Posição 19: D F M N W Posição 20: A C E F G M S Y Posição 21: D E G H L M R S T V W Posição 22: A D G K N S Y
93. Polipeptídeo, de acordo com a reivindicação 92, caracterizado pelo fato de que compreende uma substituição de cisteína na posição 17 ou 20 em relação à SEQ ID NO: 5.
94. Polipeptídeo, de acordo com a reivindicação 92 ou 93, caracterizado pelo fato de que a posição 3 é R, a posição 4 é F, a posição 6 é K, a posição 7 é R, a posição 10 é R, a posição 11 é N, a posição 13 é W e a posição 14 é G.
95. Polipeptídeo, de acordo com a reivindicação 92 ou 93, caracterizado pelo fato de que 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 ou todos os 8 dos seguintes não são verdadeiros: a posição 3 é R, a posição 4 é F, a posição 6 é K, posição 7 é R, a posição 10 é R, a posição 11 é N, a posição 13 é W e a posição 14 é G.
96. Polipeptídeo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 64 a 95, caracterizado pelo fato de que X4 está presente e em que os resíduos de aminoácidos relativos à SEQ ID NO: 6 são selecionados a partir do grupo que consiste em: Posição 01: D E G K V Posição 02: D I M S Posição 03: E G H K Posição 04: E G I K Q R S Posição 05: A D E G H S V Posição 06: C D E G I M Q R T V Posição 07: C E L M P R T Posição 08: A F L M W Posição 09: A G L N Q R T Posição 10: A C D E F H I W Posição 11: I M N S V W Posição 12: I K L S V Posição 13: C L M R S T Posição 14: I L P T Y Posição 15: F G I L M N V Posição 16: H K Q R Posição 17: C F K S W Y
Posição 18: K Q T W Posição 19: C G N I Posição 20: C F G L Y Posição 21: A F G H S Y
97. Polipeptídeo, de acordo com a reivindicação 96, caracterizado pelo fato de que compreende uma substituição de cisteína na posição 3 em relação à SEQ NO: 6.
98. Polipeptídeo, de acordo com a reivindicação 95 ou 96, caracterizado pelo fato de que a posição 19 é I.
99. Polipeptídeo, de acordo com a reivindicação 95 ou 96, caracterizado pelo fato de que a posição 19 não é I.
100. Polipeptídeo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 64 a 99, caracterizado pelo fato de que X4 está presente e em que os resíduos de aminoácidos relativos à SEQ ID NO: 7 são selecionados a partir do grupo que consiste em: Posição 01: A H L M R S V K Posição 02: A D E Q R S T V W Y Posição 03: C E G K L N Q R W Posição 04: A F G N S T V Y Posição 05: A E G I M R V Posição 06: C E K L N R V Posição 07: A C E I L S T V W Posição 08: H K L M S T W Y Posição 09: A I L M Q S R Posição 10: A I M S W Y Posição 11: C I K L S V Posição 12: C E K L P Q R T Posição 13: A D H N W Posição 14: A C G I L S T V M Posição 15: A E G I K L M R V
Posição 16: G H L R S T V Posição 17: A I L V Posição 18: A C D E G H I K M S Posição 19: D E G L N V T
101. Polipeptídeo, de acordo com a reivindicação 100, caracterizado pelo fato de que compreende uma substituição de cisteína na posição 1, 2, 5, 9, 12 ou 16 em relação à SEQ NO: 7.
102. Polipeptídeo, de acordo com a reivindicação 101 ou 101, caracterizado pelo fato de que a posição 11 é I.
103. Polipeptídeo, de acordo com a reivindicação 100 ou 101, caracterizado pelo fato de que a posição 11 não é I.
104. Polipeptídeo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 64 a 103, sendo que o polipeptídeo é caracterizado pelo fato de que compreende a sequência de aminoácidos que é pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica a um primeiro polipeptídeo ou um segundo polipeptídeo listado abaixo (resíduos sublinhados são opcionais e cada resíduo opcional, quando presente, pode compreender qualquer aminoácido): (i) Primeiro polipeptídeo X1 (Neo2A) PKKKIQLHAEHALYDALMILNIVKTNS (SEQ ID NO: 256) e Segundo polipeptídeo: X3-X2 -X4 (Neo2B)
TNSPPAEEKLEDYAFNFELILEEIARLFESGDQKDEAEKAKRMKEWMKRIKTTA SEDEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 257) (ii) Primeiro polipeptídeo X1-X3-X2
PKKKIQLHAEHALYDALMILNIVKTNSPPAEEKLEDYAFNFELILEEIARLFESGD QKDEAEKAKRMKEWMKRIKTTAS (SEQ ID NO: 258) e Segundo polipeptídeo X4 TTASEDEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 259);
(iii) Primeiro polipeptídeo X1-X3
PKKKIQLHAEHALYDALMILNIVKTNSPPAEEKLEDYAFNFELILEEIARLFESGD (SEQ ID NO: 260) e Segundo polipeptídeo X2-X4 DQKDEAEKAKRMKEWMKRIKTTASEDEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 261) (iv) Primeiro polipeptídeo X1 (Neo4A) PKKKIQIMAEEALKDALSILNIVKTNS (SEQ ID NO: 262) Segundo polipeptídeo X3-X2 -X4 (Neo4B)
TNSPPAEEQLERFAKRFERNLWGIARLFESGDQKDEAEKAKRMIEWMKRIKTT ASEDEQEEMANAIITILQSWFFS (SEQ ID NO: 263) (v) Primeiro polipeptídeo X1 (Neo2A) PKKKIQLHAEHALYDALMILNIXXXXX (SEQ ID NO: 311) e Segundo polipeptídeo: X3-X2 -X4 (Neo2B)
XXXXXXXXXLEDYAFNFELILEEIARLFESGXXKDEAEKAKRMKEWMKRIKTXX XEDEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 264) (vi) Primeiro polipeptídeo X1-X3-X2
PKKKIQLHAEHALYDALMILNIXXXXXXXXXXXLEDYAFNFELILEEIARLFESGX XKDEAEKAKRMKEWMKRIKTTAS (SEQ ID NO: 265) e Segundo polipeptídeo X4 XXXXXDEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 266); (vii) Primeiro polipeptídeo X1-X3
PKKKIQLHAEHALYDALMILNIXXXXXXXXXXXLEDYAFNFELILEEIARLFESXX GD (SEQ ID NO: 267) e Segundo polipeptídeo X2-X4
DQKDEAEKAKRMKEWMKRIKTXXXEDEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO: 268) (viii) Primeiro polipeptídeo X1 (Neo4A) PKKKIQIMAEEALKDALSILNIXXXXX (SEQ ID NO: 269) Segundo polipeptídeo X3-X2 -X4 (Neo4B)
XXXXXXXXQLERFAKRFERNLWGIARLFESGXXKDEAEKAKRMIEWMKRIKTX XXEDEQEEMANAIITILQSWFFS(SEQ ID NO: 270) (ix) Primeiro polipeptídeo >Neo4_X1-X3
PKKKIQIMAEEALKDALSILNIVKTNSPPAEEQLERFAKRF ERNLWGIARLFESGD (SEQ ID NO: 312) Segundo polipeptídeo >Neo4_X2-X4
DQKDEAEKAKRMIEWMKRIKTTASEDEQEEMANAIITILQ SWFFS (SEQ ID NO: 313) (x) Primeiro polipeptídeo >Neo4_X1-X3
PKKKIQIMAEEALKDALSILNIXXXXXXXXXXQLERFAKRF ERNLWGIARLFESXX (SEQ ID NO: 314) Segundo polipeptídeo >Neo4_X2-X4
XXKDEAEKAKRMIEWMKRIKXXXXEDEQEEMANAIITILQ SWFFS (SEQ ID NO: 315) (xi) Primeiro polipeptídeo Neo4_X1-X3'-X2
PKKKIQIMAEEALKDALSILNIVKTNSPPAEEQLERFAKRF ERNLWGIARLFESGDQKDEAEKAKRMIEWMKRIKTTA (SEQ ID NO: 316) Segundo polipeptídeo Neo4_X4 TTASEDEQEEMANAIITILQSWFFS (SEQ ID NO: 317) (xii) Primeiro polipeptídeo Neo4_X1-X3'-X2
PKKKIQIMAEEALKDALSILNIXXXXXXXXXXXLERFAKRF ERNLWGIARLFESXXXKDEAEKAKRMIEWMKRIKXXX (SEQ ID NO: 318) Segundo polipeptídeo Neo4_X4 XXXXXDEQEEMANAIITILQSWFFS (SEQ ID NO:319); (xiii) Primeiro polipeptídeo (X1) PKKKIQLHAEHALYDALMILNIVGGSS (SEQ ID NO:323) ou SKEAIQLHAEHALYDALMILNIVKTNS (SEQ ID NO:324), ou PIQLHAEHALYDALMILNIV (SEQ ID NO:325) Segundo polipeptídeo (X3-X2'-X4)
PKLEDYAFNFELILEEIARLFESGDQKDEAEKAKRMKEW MKRIKTTASEDEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO:326); ou
GGSSGGLEDYAFNFELILEEIARLFESGGSSGGKDEAEK AKRMKEWMKRITGGSSGGDEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO:327); ou
GGSSGGLEDYAFNFELILEEIARLFESGGSSGGGGEAEK AKRMKEWMKRIGGSSGGDEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO:328).
105. Polipeptídeo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 64 a 103, caracterizado pelo fato de que X1, X2, X3 e X4, quando presentes, compreendem a sequência de aminoácidos que é pelo menos 25%, 27%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica, respectivamente, aos domínios X1, X2, X3 e X4 (conforme definido na Tabela 1) presentes na sequência de aminoácidos de SEQ ID NO: 11 a 94, 190 a 216, 247 e SEQ ID NOS: 275 a 300.
106. Polipeptídeo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 64 a 105, sendo que o polipeptídeo é caracterizado pelo fato de que inclui pelo menos uma ligação dissulfeto.
107. Polipeptídeo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 64 a 106, sendo que o polipeptídeo é caracterizado pelo fato de que compreende ainda um domínio de direcionamento.
108. Polipeptídeo, de acordo com a reivindicação 107,
caracterizado pelo fato de que o domínio de direcionamento é uma fusão de tradução com o polipeptídeo.
109. Polipeptídeo, de acordo com a reivindicação 108, caracterizado pelo fato de que o domínio de direcionamento se liga a uma proteína da superfície celular.
110. Polipeptídeo, de acordo com a reivindicação 109, caracterizado pelo fato de que a proteína da superfície celular está presente na superfície das células selecionadas do grupo que consiste em células tumorais, componentes vasculares, microambiente tumoral (por exemplo, fibroblastos, células imunes infiltrantes ou elementos estromais), outras células cancerosas e células (incluindo, mas sem limitação, as células T CD8+, células T reguladoras, células dendríticas, células NK ou macrófagos), tais marcadores de superfície de células imunes incluindo, mas sem limitação, CD3, CD4, CD8, CD19, CD20, CD21, CD25, CD37, CD30, CD33, CD40, CD68, CD123, CD254, PD-1, B7-H3 e CTLA-4.
111. Polipeptídeo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 107 a 110, caracterizado pelo fato de que o domínio de direcionamento se liga a um marcador de superfície de célula tumoral, célula de componente vascular ou célula do microambiente tumoral (por exemplo, fibroblastos, células imunes infiltrantes ou elementos do estroma).
112. Polipeptídeo, de acordo com a reivindicação 111, caracterizado pelo fato de que o marcador de superfície de célula tumoral, célula de componente vascular ou célula de microambiente tumoral (por exemplo, fibroblastos, células imunes infiltrantes ou elementos do estroma) é selecionado a partir do grupo que inclui, mas sem limitação a, EGFR, EGFRvIII, Her2, HER3, EpCAM, MSLN, MUC16, PSMA, TROP2, ROR1, RON, PD-L1, CD47, CTLA-4,CD5, CD19, CD20, CD25, CD37, CD30, CD33, CD40, CD45, CAMPATH-1, BCMA, CS-1, PD-L1, B7-H3, B7-DC, HLD-DR, antígeno carcinoembriônico (CEA), TAG-72, EpCAM, MUC1, proteína de ligação ao folato, A33, G250, antígeno de membrana específica da próstata (PSMA), ferritina,
GD2, GD3, GM2, Le y, CA-125, CA19-9, fator de crescimento espidérmico, p185HER2, receptor de IL-2, EGFRvIII (de2-7 EGFR), proteína de ativação de fibroblastos, tenascina, uma metaloproteinase, endosialina, fator de crescimento endotelial vascular, avB3, WT1, LMP2, HPV E6, HPV E7, Her-2/neu, MAGE A3, não mutante p53, NY-ESO-1, MelanA/MART1, mutante Ras, gp100, mutante p53, PR1, bcr-abl, tironsinase, survivina, PSA, hTERT, uma proteína de ponto de interrupção de translocação de sarcoma, EphA2, PAP, ML-IAP, AFP, ERG, NA17, PAX3, ALK, receptor de andrógeno, ciclina B 1, ácido polisiálico, MYCN, RhoC, TRP-2, fucosila GM1, mesotelina (MSLN), PSCA, MAGE Al, sLe (animal), CYP1B1, PLAV1, GM3, BORIS, Tn, GloboH, ETV6-AML, NY-BR-1, RGS5, SART3, STn, anidrase carbônica IX, PAX5, proteína 17 do esperma OY-TESL, LCK, HMWMAA, AKAP-4, SSX2, XAGE 1, Legumaína, Tie 3, VEGFR2, MAD-CT-1, PDGFR-B, MAD-CT-2, ROR2, TRAIL1, MUC16, MAGE A4, MAGE C2, GAGE, EGFR, CMET, HER3, MUC15, CA6, NAPI2B, TROP2, CLDN6, CLDN16, CLDN18.2, CLorf186, RON, LY6E, FRA, DLL3, PTK7, STRA6, TMPRSS3, TMPRSS4, TMEM238, UPK1B, VTCN1, LIV1, ROR1, antígeno 1 relacionado a Fos, BMPR1B (receptor de proteína morfogenética óssea tipo IB, número de acesso no Genbank NM- 001203); E16 (LAT1, SLC7A5, número de acesso no Genbank NM-003486); STEAP1 (seis antígenos epiteliais transmembranares da próstata, número de acesso no Genbank NM-012449); 0772P (CA125, MUC16, número de acesso no Genbank AF361486); MPF (MPF, MSLN, SMR, fator de potencialização de megacariócitos, mesotelina, número de acesso no Genbank NM-005823); Napi3b (NAPI-3B, NPTIIb, SLC34A2, família de transportadores de soluto 34 (fosfato de sódio), membro 2, transportador de fosfato 3b dependente de sódio tipo II, número de acesso no Genbank NM- 006424); Sema 5b (FLJ10372, KIAA1445, Mm. 42015, SEMA5B, SEMAG, Semaforina 5b Hlog, domínio sema, sete repetições de trombospondina (tipo 1 e semelhante ao tipo 1), domínio transmembranar (TM) e domínio citoplasmático curto, (semaforina) 5B, número de acesso no Genbank AB040878); PSCA hlg (2700050C12Rik, C530008O16Rik, RIKEN cDNA 2700050C12, gene
2700050C12 RIKEN cDNA, número de acesso no Genbank AY358628); ETBR (receptor de endotelina tipo B, número de acesso no Genbank AY275463); MSG783 (RNF124, proteína hipotética FLJ20315, número de acesso no Genbank NM 017763); STEAP2 (HGNC.sub.--8639, IPCA-1, PCANAP1, STAMP1, STEAP2, STMP, gene associado ao câncer de próstata 1, proteína associada ao câncer de próstata 1, seis antígenos epiteliais transmembranares da próstata 2, seis proteínas transmembranares da próstata, número de acesso no Genbank AF455138); TrpM4 (BR22450, FLJ20041, TRPM4, TRPM4B, canal catiônico de potencial receptor transiente, subfamília M, membro 4, número de acesso no Genbank NM 017636); CRIPTO (CR, CR1, CRGF, CRIPTO, TDGF1, fator de crescimento derivado de teratocarcinoma, número de acesso no Genbank NP003203 ou NM003212); CD21 (CR2 (receptor 2 do complemento) ou C3DR (receptor do vírus C3d/Epstein Barr) ou Hs. 73792, número de acesso ao Genbank M26004); CD79b (IGb (beta associado a imunoglobulina), B29, número de acesso ao Genbank NM 000626); FcRH2 (IFGP4, IRTA4, SPAP1A (domínio SH2 contendo proteína âncora de fosfatase 1a), SPAP1B, SPAP1C, número de acesso ao Genbank NM030764); HER2 (número de acesso ao Genbank M11730); NCA (número de acesso ao Genbank M18728); MDP (número de acesso ao Gnebank BC017023); IL20R.alfa. (Número de acesso ao Genbank AF184971); Brevican (número de acesso ao Genbank AF229053); Ephb2R (número de acesso ao Genbank NM004442); ASLG659 (número de acesso ao Genbank AX092328); PSCA (número de acesso ao Genbank AJ297436); GEDA (número de acesso ao Genbank AY260763); BAFF-R (número de acesso ao Genbank NP443177.1); CD22 (número de acesso ao Genbank NP-001762.1); CD79a (CD79A, CD79.alfa., alfa associado a imunoglobulina, uma proteína específica de células B que interage covalentemente com Ig beta (CD79B) e forma um complexo na superfície com moléculas de Ig M, transduz um sinal envolvido na diferenciação de células B, número de acesso ao Genbank NP001774.1); CXCR5 (receptor de linfoma de Burkitt 1, um receptor acoplado à proteína G que é ativado pela quimiocina
CXCL13, funções na migração de linfócitos e defesa humoral, desempenha um papel na infecção por HIV-2 e talvez no desenvolvimento de AIDS, linfoma, mieloma e leucemia, número de acesso ao Genbank NP001707.1); HLA-DOB (subunidade beta da molécula MHC de classe II (antígeno Ia) que se liga a peptídeos e os apresenta a linfócitos T CD4+, número de acesso ao Genbank NP002111.1); P2X5 (canal 5 de íon bloqueado por ligante do receptor purinérgico P2X, um canal de íon bloqueado por ATP extracelular, pode estar envolvido na transmissão sináptica e neurogênese, a deficiência pode contribuir para a fisiopatologia da instabilidade idiopática do detrusor, número de acesso ao Genbank NP002552.2); CD72 (antígeno de diferenciação de células B CD72, Lyb-2, número de acesso ao Genbank NP001773.1); LY64 (antígeno linfocitário 64 (RP105), proteína de membrana tipo I da família de repetição rica em leucina (LRR), regula a ativação de células B e apoptose, a perda de função está associada ao aumento da atividade da doença em pacientes com lúpus eritematoso sistêmico, número de acesso ao Genbank NP005573.1); FCRH1 (proteína 1 semelhante a receptor Fc, um receptor putativo para o domínio Fc de imunoglobulina que contém domínios semelhantes a Ig tipo C2 e ITAM, pode ter um papel na diferenciação de linfócitos B, número de acesso ao Genbank NP443170.1); ou IRTA2 (translocação do receptor da superfamília de imunoglobulina associada 2, um imunorreceptor putativo com possíveis papéis no desenvolvimento de células B e linfomagenesia; ocorre desregulação do gene por translocação em algumas doenças malignas de células B, número de acesso ao Genbank NP112571.1).
113. Polipeptídeo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 107 a 100, caracterizado pelo fato de que o domínio de direcionamento se liga a um marcador de superfície de célula imune (incluindo, mas sem limitação a células T CD8+, células T regulatórias, células dendríticas ou macrófagos), em que o marcador de superfície de célula imune pode incluir, mas sem limitação a CD3, CD4, CD8, CD19, CD20, CD21, CD25, CD37, CD30, CD33, CD40, CD68, CD123, CD254, PD-1, B7-H3 e CTLA-4.
114. Polipeptídeo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 107 a 113, caracterizado pelo fato de que o domínio de direcionamento pode incluir, mas sem limita o a um scF , um F(ab), um F(ab ) 2, um receptor de células B (BCR), um DARPin, um aficorpo, um monocorpo, um nanocorpo, um diacorpo, um anticorpo (incluindo um anticorpo monoespecífico ou biespecífico); um oligopeptídeo de direcionamento de célula incluindo, mas sem limitação a peptídeos de ligação de integrina RGD, ligantes projetados de novo, aptâmeros, conotoxinas de um peptídeo de bicicleta, moléculas pequenas, como ácido fólico, e um vírus que se liga à superfície da célula.
115. Ácido nucleico caracterizado pelo fato de que codifica o polipeptídeo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 64 a 114, ou o primeiro componente polipeptídico ou o segundo componente polipeptídico, conforme definido em qualquer uma das reivindicações 1 a 63.
116. Vetor de expressão caracterizado pelo fato de que compreende o ácido nucleico, de acordo com a reivindicação 115, operacionalmente ligado a um promotor.
117. Célula hospedeira caracterizada pelo fato de que compreende o ácido nucleico, de acordo com a reivindicação 115 e/ou o vetor de expressão, de acordo com a reivindicação 116.
118. Composição farmacêutica caracterizada pelo fato de que compreende o agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 63, o polipeptídeo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 64 a 114, o ácido nucleico, de acordo com a reivindicação 115, o vetor de expressão, de acordo com a reivindicação 116, ou a célula hospedeira, de acordo com a reivindicação 117, e um carreador farmaceuticamente aceitável.
119. Método para tratar câncer caracterizado pelo fato de que compreende a administração a um sujeito em necessidade do agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 63, sob condições em que o primeiro componente polipeptídico e o segundo componente polipeptídico interagem nas células do tumor para tratar o câncer.
120. Método, de acordo com a reivindicação 119, caracterizado pelo fato de que o primeiro componente polipeptídico compreende um primeiro domínio de direcionamento e o segundo componente de polipeptídeo compreende um segundo domínio de direcionamento, em que o primeiro domínio de direcionamento se liga a um primeiro marcador de célula tumoral e o segundo domínio de direcionamento se liga a uma segunda célula tumoral marcador que pode ser o mesmo ou diferente do primeiro marcador de células tumorais, e em que o primeiro polipeptídeo e o segundo polipeptídeo interagem apenas após a ligação do primeiro domínio de direcionamento ao primeiro marcador de células tumorais e ligação do segundo domínio de direcionamento ao segundo tumor marcador de célula.
121. Método, de acordo com a reivindicação 120, caracterizado pelo fato de que o primeiro componente de polipeptídeo compreende um primeiro domínio de direcionamento e o segundo componente de polipeptídeo compreende um segundo domínio de direcionamento, em que o primeiro domínio de direcionamento se liga a um marcador de célula tumoral e o segundo domínio de direcionamento se liga a um marcador de célula imune (incluindo, mas sem limitação a células T CD8+, células T reguladoras, células dendríticas ou macrófagos), e em que o primeiro polipeptídeo e o segundo polipeptídeo interagem apenas após a ligação do primeiro domínio de direcionamento ao marcador de célula tumoral e ligação do segundo direcionamento domínio para o marcador de célula imune.
122. Método, de acordo com a reivindicação 120, caracterizado pelo fato de que o primeiro componente polipeptídico compreende um primeiro domínio de direcionamento e o segundo componente polipeptídico compreende um segundo domínio de direcionamento, em que o primeiro domínio de direcionamento se liga a um primeiro marcador de célula imune (incluindo, mas sem limitação a células T CD8+, T células reguladoras, células dendríticas ou macrófagos) e o segundo domínio de direcionamento se liga a um segundo marcador de células imunes (incluindo, mas sem limitação a células T CD8+, células T reguladoras, células dendríticas ou macrófagos) que podem ser iguais ou diferentes do que o primeiro marcador de célula imune, e em que o primeiro polipeptídeo e o segundo polipeptídeo interagem apenas após a ligação do primeiro domínio de direcionamento ao primeiro marcador de célula imune e a ligação do segundo domínio de direcionamento ao segundo marcador de célula imune.
123. Método, de acordo com qualquer uma das reivindicações 119 a 122, caracterizado pelo fato de que o câncer é selecionado a partir do grupo que consiste em câncer de cólon, melanoma, câncer de células renais, câncer de células escamosas de cabeça e pescoço, câncer gástrico, carcinoma urotelial, linfoma de Hodgkin, câncer de pulmão de células não pequenas, câncer de células pequenas pulmonares, carcinoma hepatocelular, câncer pancreático, carcinoma de células Merkel, câncer colorretal, leucemia mieloide aguda, leucemia linfoblástica aguda, leucemia linfocítica crônica, linfoma não Hodgkin, mieloma múltiplo, câncer de ovário, câncer cervical e quaisquer tipos de tumor selecionados por um teste de diagnóstico, como instabilidade de microssatélites, carga mutacional do tumor, nível de expressão de PD-L1 ou o ensaio de imunoscore (conforme desenvolvido pela Society for Immunotherapy of Cancer).
124. Agonista do receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 63, o polipeptídeo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 64 a 114, o ácido nucleico, de acordo com a reivindicação 115, o vetor de expressão, de acordo com a reivindicação 116, ou a célula hospedeira, de acordo com a reivindicação 117, ou a composição farmacêutica, de acordo com a reivindicação 118, caracterizado pelo fato que é para uso como um medicamento para tratar câncer e/ou para modular uma resposta imune em um sujeito.
125. Método para modular uma resposta imune em um sujeito caracterizado pelo fato de que compreende administrar ao sujeito o agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 63, o polipeptídeo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 64 a 114, o ácido nucleico, de acordo com a reivindicação 115, o vetor de expressão, de acordo com a reivindicação 116, ou célula hospedeira, de acordo com a reivindicação 117, ou composição farmacêutica, de acordo com a reivindicação 118.
126. Método, de acordo com a reivindicação 125, caracterizado pelo fato de que a resposta imune é uma resposta imune anticâncer, uma resposta imune reparativa de tecido ou uma resposta imune de cicatrização de feridas.
127. Método, de acordo com a reivindicação 125 ou 126, caracterizado pelo fato de que o agonista de receptor condicionalmente ativo, ácido nucleico, vetor de expressão, célula hospedeira ou composição farmacêutica é administrado como um componente de um biomaterial.
128. Método para agonizar o receptor de IL-2 ou o receptor de IL-4 caracterizado pelo fato de que compreende administrar a um sujeito o agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 63, sob condições em que o primeiro componente polipeptídico e o segundo componente polipeptídico interagem no receptor.
129. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 63, caracterizado pelo fato de que o primeiro componente polipeptídico e o segundo polipeptídeo interagem para formar um agonista ativo de heterodímero c de receptor de IL-2 (IL- 2R c).
130. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 63, caracterizado pelo fato de que o primeiro componente polipeptídico e o segundo polipeptídeo interagem para formar um agonista ativo de heterodímero c de receptor IL-4 (IL-4R c), IL-13 alfa, ou heterodímero IL-4Ralfa/IL13Ralfa.
131. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 63, caracterizado pelo fato de que os resíduos de aminoácidos entre parênteses estão presentes.
132. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 63, caracterizado pelo fato de que os resíduos de aminoácidos entre parênteses estão ausentes.
133. Polipeptídeo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 64 a 114, caracterizado pelo fato de que os resíduos de aminoácidos entre parênteses estão presentes.
134. Polipeptídeo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 64 a 114, caracterizado pelo fato de que os resíduos de aminoácidos entre parênteses estão ausentes.
135. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 63, caracterizado pelo fato de que X1, X3 e X4, respectivamente, compreendem a sequência de aminoácidos que é pelo menos 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98%, ou 100% idêntica, respectivamente, ao comprimento total dos domínios X1, X2, X3 e X4 mostrados abaixo, onde os resíduos entre parênteses podem estar presentes ou ausentes: X1: PKKKIQLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO:4) X3: (LE)DYAFNFELILEEIARLF(ESG) (SEQ ID NO:5) X4: (E)DEQEEMANAIITILQSWIFS (SEQ ID NO:6).
136. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 63, caracterizado pelo fato de que X1, X3 e X4, respectivamente, compreendem a sequência de aminoácidos que é pelo menos 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98%, ou 100% idêntica, respectivamente, ao comprimento total dos domínios X1, X2, X3 e X4 mostrados abaixo, onde os resíduos entre parênteses podem estar presentes ou ausentes: X1: QLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO:320) X3: LEDYAFNFELILEEIARLFES (SEQ ID NO:321) X4: DEQEEMANAIITILQSWIF(S) (SEQ ID NO:322).
137. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 63, 135 e 136, caracterizado pelo fato de que X2 compreende a sequência de aminoácidos que é pelo menos 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica ao comprimento total da sequência de aminoácidos DEAEKAKRMKEWMKRIK(T) (SEQ ID NO:7), em que os resíduos entre parênteses são opcionais.
138. Agonista de receptor condicionalmente ativo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 63, caracterizado pelo fato de que X1, X2, X3 e X4, respectivamente, compreendem a sequência de aminoácidos que é pelo menos 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica, respectivamente, aos domínios X1, X2, X3 e X4 presentes na sequência de aminoácidos da SEQ ID NO: 90 versão 1 ou versão 2, conforme definido na Tabela 1.
138. Polipeptídeo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 64 a 114, 133 ou 134, caracterizado pelo fato de que X1, X3 e X4, respectivamente, quando presentes, compreendem a sequência de aminoácidos que é pelo menos 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica, respectivamente, ao comprimento total dos domínios X1, X2, X3 e X4 mostrados abaixo, onde os resíduos entre parênteses podem estar presentes ou ausentes: X1: QLHAEHALYDALMILNI (SEQ ID NO:320) X3: LEDYAFNFELILEEIARLFES (SEQ ID NO:321) X4: DEQEEMANAIITILQSWIF(S) (SEQ ID NO:322).
139. Polipeptídeo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 64 a 114, 133, 134 ou 138, caracterizado pelo fato de que X2, quando presente, compreende a sequência de aminoácidos que é pelo menos 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idêntica ao comprimento total da sequência de aminoácidos KDEAEKAKRMKEWMKRIK(T) (SEQ ID NO:7), em que os resíduos entre parênteses são opcionais.
140. Polipeptídeo, de acordo com qualquer uma das reivindicações 64 a 114, 133, 134, caracterizado pelo fato de que X1, X2, X3 e
X4, quando presentes, são pelo menos 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% ou 100% idênticas, respectivamente, aos domínios X1, X2, X3 e X4 (conforme definido na Tabela 1) presentes na sequência de aminoácidos de SEQ ID NO: 90 versão 1 ou versão 2, conforme definido na Tabela 1.
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US201862770152P | 2018-11-20 | 2018-11-20 | |
US62/770,152 | 2018-11-20 | ||
PCT/US2019/062198 WO2020106708A1 (en) | 2018-11-20 | 2019-11-19 | Split interleukin mimetics and their use |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
BR112021008985A2 true BR112021008985A2 (pt) | 2021-10-26 |
Family
ID=69500815
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
BR112021008985-3A BR112021008985A2 (pt) | 2018-11-20 | 2019-11-19 | Agentes miméticos de interleucina divididos e seus usos |
Country Status (13)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US20220017588A1 (pt) |
EP (1) | EP3883956A1 (pt) |
JP (1) | JP2022511390A (pt) |
KR (1) | KR20210094531A (pt) |
CN (1) | CN112912388A (pt) |
AU (1) | AU2019384523A1 (pt) |
BR (1) | BR112021008985A2 (pt) |
CA (1) | CA3119472A1 (pt) |
EA (1) | EA202190593A1 (pt) |
IL (1) | IL283217A (pt) |
MX (1) | MX2021005593A (pt) |
SG (1) | SG11202103045SA (pt) |
WO (1) | WO2020106708A1 (pt) |
Families Citing this family (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
AU2019295637B2 (en) * | 2018-06-25 | 2022-12-22 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | De novo design of potent and selective interleukin mimetics |
EP3818083A2 (en) | 2018-07-03 | 2021-05-12 | Elstar Therapeutics, Inc. | Anti-tcr antibody molecules and uses thereof |
CA3210492A1 (en) * | 2021-02-05 | 2022-08-11 | Dharmacon, Inc. | Fusion proteins for crispr-based transcriptional repression |
WO2023044318A2 (en) * | 2021-09-15 | 2023-03-23 | Neoleukin Therapeutics, Inc. | Interleukin-2 receptor βeta (il-2rβ) binding polypeptides |
US20230295348A1 (en) * | 2022-01-24 | 2023-09-21 | Novimmune Sa | Composition and methods for the selective activation of cytokine signaling pathways |
Family Cites Families (11)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
GB0019638D0 (en) * | 2000-08-09 | 2000-09-27 | European Molecular Biology Lab Embl | Peptide mimetics |
US20030013851A1 (en) * | 2001-06-07 | 2003-01-16 | Robert Powers | Solution structure of IL-13 and uses thereof |
CN1930300A (zh) * | 2004-03-05 | 2007-03-14 | 希龙公司 | 预测患者治疗药物耐受性的体外试验*** |
CA2813411C (en) | 2010-11-05 | 2016-08-02 | Rinat Neuroscience Corporation | Engineered polypeptide conjugates and methods for making thereof using transglutaminase |
US10150802B2 (en) * | 2014-04-24 | 2018-12-11 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Superagonists, partial agonists and antagonists of interleukin-2 |
AU2015253422B2 (en) | 2014-04-30 | 2020-09-03 | Abbvie Stemcentrx Llc | Anti-PTK7 antibody-drug conjugates |
ES2807260T3 (es) * | 2014-08-11 | 2021-02-22 | Delinia Inc | Variantes de IL-2 modificadas que activan selectivamente las células T reguladoras para el tratamiento de enfermedades autoinmunes |
AR105616A1 (es) | 2015-05-07 | 2017-10-25 | Lilly Co Eli | Proteínas de fusión |
EP3585806A1 (en) | 2017-02-24 | 2020-01-01 | Philogen S.p.A. | Immunoconjugates with optimized linkers and orientation |
WO2018170179A1 (en) | 2017-03-15 | 2018-09-20 | Silverback Therapeutics, Inc. | Benzazepine compounds, conjugates, and uses thereof |
AU2019295637B2 (en) * | 2018-06-25 | 2022-12-22 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | De novo design of potent and selective interleukin mimetics |
-
2019
- 2019-11-19 EA EA202190593A patent/EA202190593A1/ru unknown
- 2019-11-19 BR BR112021008985-3A patent/BR112021008985A2/pt unknown
- 2019-11-19 JP JP2021517768A patent/JP2022511390A/ja active Pending
- 2019-11-19 WO PCT/US2019/062198 patent/WO2020106708A1/en unknown
- 2019-11-19 CN CN201980070569.6A patent/CN112912388A/zh active Pending
- 2019-11-19 EP EP19848950.2A patent/EP3883956A1/en active Pending
- 2019-11-19 CA CA3119472A patent/CA3119472A1/en active Pending
- 2019-11-19 US US17/294,807 patent/US20220017588A1/en active Pending
- 2019-11-19 KR KR1020217014525A patent/KR20210094531A/ko unknown
- 2019-11-19 SG SG11202103045SA patent/SG11202103045SA/en unknown
- 2019-11-19 AU AU2019384523A patent/AU2019384523A1/en active Pending
- 2019-11-19 MX MX2021005593A patent/MX2021005593A/es unknown
-
2021
- 2021-05-16 IL IL283217A patent/IL283217A/en unknown
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
MX2021005593A (es) | 2021-08-11 |
SG11202103045SA (en) | 2021-04-29 |
EA202190593A1 (ru) | 2021-11-18 |
IL283217A (en) | 2021-06-30 |
US20220017588A1 (en) | 2022-01-20 |
KR20210094531A (ko) | 2021-07-29 |
WO2020106708A1 (en) | 2020-05-28 |
CA3119472A1 (en) | 2020-05-28 |
EP3883956A1 (en) | 2021-09-29 |
JP2022511390A (ja) | 2022-01-31 |
AU2019384523A1 (en) | 2021-04-22 |
CN112912388A (zh) | 2021-06-04 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
US11117944B2 (en) | De novo design of potent and selective interleukin mimetics | |
BR112021008985A2 (pt) | Agentes miméticos de interleucina divididos e seus usos | |
RU2711979C2 (ru) | Белковый комплекс интерлейкина 15 и его применение | |
ES2961498T3 (es) | Método y composiciones para el funcionamiento mejorado del efecto antitumoral de las células T | |
JP2021531013A (ja) | Il2アゴニスト | |
BR112019017001A2 (pt) | composição, proteína de fusão, ácido nucleico, célula hospedeira, e, métodos para produção de um domínio de aglutinação de albumina, para preparação de uma variante de il-15, para produção de uma proteína de fusão e para inibição ou redução de um tumor em um indivíduo em necessidade do mesmo. | |
ES2930681T3 (es) | Linfocitos T transfectados y receptores de linfocito T para el uso en la inmunoterapia contra el cáncer | |
MX2008013575A (es) | Citoquinas dirigidas a anticuerpos para terapia. | |
US8133873B2 (en) | Recombinant chemokine-antigen vaccine | |
US20090221682A1 (en) | DNA Vaccine for Cancer Therapy | |
Xu et al. | Interleukins in the treatment of melanoma | |
KR20240004453A (ko) | 변형된 과립구 집락-자극 인자(g-csf) 및 이에 결합하는 키메라 사이토카인 수용체 | |
US20170252435A1 (en) | Combination | |
Pandya | SELECTION/CONSTRUCTION AND CHARACTERIZATION OF NOVEL PEPTIDE AND RECOMBINANT PROTEIN AGENTS TARGETING INTERLEUKIN 13 RECEPTOR ALPHA 2 IN GLIOBLASTOMA MULTIFORME | |
TW202241937A (zh) | 用於追踪基因工程細胞的肽標記 | |
WO2024077251A2 (en) | Interleukin-21 mimetics | |
CN114245802A (zh) | 修饰的il-2蛋白、peg偶联物及其用途 |