WO2006106597A1 - 複数試料自動処理システム及び複数試料自動処理方法 - Google Patents

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WO2006106597A1
WO2006106597A1 PCT/JP2006/302136 JP2006302136W WO2006106597A1 WO 2006106597 A1 WO2006106597 A1 WO 2006106597A1 JP 2006302136 W JP2006302136 W JP 2006302136W WO 2006106597 A1 WO2006106597 A1 WO 2006106597A1
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WO
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container
sample
processing
unit
containers
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Application number
PCT/JP2006/302136
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Inventor
Naoshi Dohmae
Hiroshi Nakayama
Tokuji Kitsunai
Original Assignee
Riken
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    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N35/00Automatic analysis not limited to methods or materials provided for in any single one of groups G01N1/00 - G01N33/00; Handling materials therefor
    • G01N35/10Devices for transferring samples or any liquids to, in, or from, the analysis apparatus, e.g. suction devices, injection devices
    • G01N35/1065Multiple transfer devices
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
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    • G01N35/00584Control arrangements for automatic analysers
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    • G01N35/10Devices for transferring samples or any liquids to, in, or from, the analysis apparatus, e.g. suction devices, injection devices
    • G01N35/1065Multiple transfer devices
    • G01N35/1072Multiple transfer devices with provision for selective pipetting of individual channels

Definitions

  • the present invention relates to a multiple sample automatic processing system and a multiple sample automatic processing method for processing a sample through a plurality of processing steps.
  • a protein sample (gel) is converted into a peptide mixture and supplied to a mass spectrometer.
  • protein gel band destaining, gel band drying, reductive alkylation reaction, enzyme digestion reaction are performed. Etc. need to be done in order.
  • Non-Patent Document 1 Toshiaki Isobe, Nobuhiro Takahashi / “Proteome Analysis Method Protein Expression, Functional Analysis Advanced Genome and Drug Discovery Research” (Yodosha)
  • the preparation can be performed manually or automatically using a commercially available automatic preparation apparatus.
  • manual preparation processing is usually performed one sample at a time, and progress is made while checking the reaction status of each individual sample. Unreacted samples are allowed to react appropriately each time to prevent the generation of defective samples.
  • sample mix-up may occur due to carelessness of the operator, and depending on the level of skill, the reproducibility of the operation may be low, and processing may be delayed or conditions may not be constant.
  • contamination and contamination of the protein from the worker into the sample.
  • an automatic preparation device preparation is performed without human intervention.
  • the present invention eliminates human error in processing a large number of samples by completely automating the process, reduces contamination, and enables product quantification.
  • Another object of the present invention is to provide a system capable of suppressing the defect rate.
  • the object is achieved by fully automating processing steps, providing a reaction monitoring function in each step, extracting an unreacted sample, and performing a reaction again.
  • a reaction monitoring function for example, when 8 ⁇ 12 sample containers can be placed in the sample container storage area, a maximum of 96 sample containers can be continuously processed.
  • 8 sample containers shall be taken as one unit, transported by each unit, and supplied to each dispensing / suction device and each reaction tank.
  • the sample container is returned to the original position of the sample container plate.
  • sample reaction ⁇ In order to ensure the quantitativeness and certainty of the treatment, the reaction status is monitored by a reaction monitoring sensor as necessary, as well as the dispensing of the processing solution (suction stability (quantitative dispensing) complete suction). Samples that are judged to be defective by monitoring are returned to the specified process location and reacted again.
  • the multiple sample automatic processing system of the present invention performs different processing on the sample container place where a plurality of sample containers are placed, the dummy container place where the dummy containers are placed, and the samples in the containers.
  • a first processing unit and a second processing unit an inspection unit for inspecting a sample in a container, a container transport unit for transporting the container between each container storage place, the processing unit and the inspection unit, and a control unit,
  • the control unit controls each unit to process n containers (n is a positive integer greater than or equal to 2) as one unit in the first processing unit, and after the processing, the inspection unit becomes incompatible.
  • the container transport unit preferably includes a first container holding unit that holds n containers at the same time, and a second container holding unit that holds one container.
  • the first processing unit and the second processing unit include dispensing means for injecting or sucking the processing liquid into a set of n containers. Dispensing means can be shared by the first processing unit and the second processing unit, and the dispensing means may be provided in the container transport unit.
  • n containers (n is a positive integer of 2 or more) are arranged in the first processing unit.
  • the process of forming two container units, and adding a dummy container to the container containing the sample that passed the first inspection, n containers Forming a third container unit such as a container, and processing a sample in the second container unit and a sample in the third container unit in the second processing unit. Including.
  • the present invention it is possible to automate the processing of a sample that has undergone a plurality of processing steps to process a large number of samples quickly and reproducibly, prevent contamination, and result from incomplete processing.
  • the defective rate of the sample can be reduced.
  • FIG. 1 is a schematic diagram showing an overall configuration of a sample processing system according to the present invention.
  • FIG. 2 is an explanatory view showing an example of a transport head.
  • FIG. 3 is an explanatory view showing an example of a transport head provided with a dispensing device.
  • FIG. 4 is an explanatory view showing a state of container conveyance by a rod having a container gripping portion at the tip.
  • FIG. 5 is a flowchart showing an outline of processing in each processing step.
  • FIG. 6 is a conceptual diagram visually showing the flowchart of FIG.
  • FIG. 8 is a flowchart showing a destaining process for protein gel bands.
  • FIG. 9 is a diagram for explaining an example of an inspection method.
  • FIG. 10 is a flowchart showing reductive alkylation treatment of protein gelpand.
  • FIG. 11 is an explanatory diagram showing management of sample container information by percode. Explanation of symbols
  • the sample processing system of this example is intended to perform a chemical reaction and an enzymatic reaction automatically on a protein sample for proteome analysis, convert it into a peptide mixture, and supply it to a mass spectrometer.
  • the protein spot (gel piece) obtained by electrophoresis is placed in a sample container (capacity 700 1) and subjected to a reaction 'treatment such as destaining, reductive alkylation, gel elimination and desalting concentration, etc. It supplies to the total.
  • a reaction 'treatment such as destaining, reductive alkylation, gel elimination and desalting concentration, etc. It supplies to the total.
  • the present invention is not limited to the embodiments described here, and can be applied to a processing method in which a plurality of stages of processing are performed on a plurality of samples.
  • FIG. 1 is a schematic diagram showing the overall configuration of a sample processing system according to the present invention.
  • This sample processing system consists of a sample container storage area 11 for holding a test tube transparent container each containing a sample, and a sample container! / Dummy container that holds a test tube transparent container (dummy container).
  • Place 12 Place container with sample that failed in inspection, which will be described later, temporarily place defective sample place 13, Inspection container place 51, Dispensing station 14 with reagent bottle place 50 containing solid reagent, Bar code reader 15 for reading 2D barcodes for identifying individual samples provided on the bottom of transparent containers, vibrating thermostat 16, It has a vacuum centrifuge 17, a constant temperature bath 18a, an ice bath 18b, a light shielding bath 19, and an inspection station 20 where a CCD camera for inspection is placed. There is also a pipette tip storage place 60 where disposable pipette tips are placed, and a pipette tip disposal place 61 where used pipette tips are discarded.
  • a transport head 23 for transporting a plurality of containers, for example, eight containers as a unit to each part is installed.
  • the transfer head 23 can move in the X direction along the ball screw 22, and the ball screw 22 can move in the Y direction along the rails 21a and 21b.
  • the transport head 23 can transport the container to any place in the XY directions.
  • Dispensing station 14 has eight nozzles connected to reagent containers and destaining liquid containers, and the processing solution is supplied to one unit of containers conveyed by the conveying head 23, that is, eight containers.
  • the solution can be injected or the solution can be aspirated from the container.
  • the processing liquid necessary for processing is selected and supplied from the nozzle to each container.
  • Each part of the apparatus is controlled by the control unit 24.
  • the processing unit for processing the sample in the container is shown in FIG. 1, such as a dispensing device and a thermostatic bath, a dispensing device and a vibrating thermostatic bath that injects and sucks the processing liquid into the container. Consists of multiple facilities.
  • the dispensing device may be provided individually for each processing unit, or may be configured to be shared by a plurality of processing units. In this embodiment, a plurality of processing units share one dispensing device.
  • the dispensing device may be fixedly provided on the device or may be provided on the transport head.
  • FIG. 2 is an explanatory view showing an example of the transport head
  • FIG. 2 (a) is a front schematic view
  • FIG. 2 (b) is a lower schematic view.
  • a rod 31 having a container gripping portion 32 at its tip projects below the transport head 23 .
  • the lower end of the container gripping portion 32 swells in a direction perpendicular to the rod axis, and fits into a concave portion of the container lid described later.
  • a hollow outer cylinder 52 having a diameter larger than that of the container gripping portion 32 is provided outside the rod, and can move up and down independently of the rod.
  • the eight rods 31 constitute one unit to form the first container transport unit 33, and the first container transport unit 33 moves up and down at the same time as indicated by arrows.
  • the transport head 23 is a rod having a container gripping portion and an outer cylinder at the tip.
  • it also has a second container transport section 34 that can transport only one container independently.
  • the eight outer cylinders of the first container transfer section 33 also move up and down at the same time, with eight of them as one unit.
  • the dispensing device for dispensing the processing liquid into the container may be fixedly provided at the dispensing station 14, or may be provided at the conveying head, and the dispensing head may be used at the time of dispensing. You may move to and perform dispensing.
  • FIG. 3 is an explanatory view showing an example of a transport head provided with a dispensing device, in which FIG. 3 (a) is a schematic front view, and FIG. 3 (b) is a schematic bottom view.
  • the conveyance Z dispensing head 23 shown in FIG. 3 has a conveyance head portion and a dispensing head portion force, and these may move up and down at the same time or independently.
  • a mouth 31 having a container gripping portion 32 at its tip protrudes downward from the transport head portion.
  • the tip of the container gripping portion 32 swells in a direction perpendicular to the rod axis, and fits into a concave portion of the container lid described later.
  • a hollow outer cylinder 52 having a diameter larger than that of the container holding portion 32 is provided outside the rod, so that it can move up and down independently of the rod!
  • the eight rods 31 constitute one unit to form the first container transport unit 33, and the first container transport unit 33 moves up and down at the same time as indicated by an arrow.
  • the transport head section also has a second container transport section 34 that can independently transport only one container with a force that is a mouth force including a container gripping section and an outer cylinder at the tip.
  • the dispenser head 55 protrudes below the dispenser head portion to which a pipette tip 57 can be attached.
  • Eight dispensers constitute one unit to form a first dispenser 58, and the first dispenser 58 moves up and down at the same time as indicated by arrows.
  • the dispensing head unit also comprises a dispenser that can be fitted with a pipette tip 57 at the tip, but it also has a second dispensing unit 59 that can dispense and aspirate only one container independently.
  • the dispenser is provided with a hollow tip detaching outer tube 56 that can move up and down independently with respect to the dispenser head 55.
  • FIG. 4 is an explanatory view showing a state of container conveyance and container lid opening / closing by a rod 31 having a container gripping portion 32 at the tip.
  • Fig. 4 (a) shows a state in which the transport head is positioned above a container 41 with a lid placed in a sample container storage place and the rod 31 having a container gripping portion 32 at the tip is lowered from the transport head.
  • Fig. 4 (b) is provided at the tip of the rod 31.
  • the container holding part 32 is inserted into the recessed part of the lid 53 fitted in the opening of the container 41 and fixed.
  • FIG. 4 (c) shows a state in which the lid 53 of the container is opened.
  • the holding pin 54 is moved inward by air pressure, etc., as shown in Fig. 4 (a), and the container 41 can be fixed by pressing the lower part of the container.
  • the lid 53 can be removed from the container 41 by raising the transport head while the lid 53 is fixed to the rod 31 as shown in FIG.
  • FIG. 4 (d) shows a state in which the rod 31 is raised in a state where the container gripping portion 32 is fixed to the concave portion of the lid 53 fitted in the opening of the container 41.
  • the container 41 is pulled up by the rod 31 with the container gripping part 32 fitted in the recess of the lid 53.
  • FIG. 4 (e) shows a state in which the container that has been transported is placed. After transporting to the desired position, ground it. Thereafter, the outer cylinder 52 of the rod is lowered, and the lid 53 can be removed from the transport head 23 by raising the rod 31 while holding the lid 53. At this time, the lid 53 remains fitted in the opening of the container 41.
  • the structure of the transport head shown in FIGS. 2 and 3 or the container transport method shown in FIG. 4 is merely an example, and is shown here as a specific structure and transport method for transporting the container. Other structures and methods may be used.
  • the control unit 24 moves the transport head above the pipette tip disposal site 61, where the tip Lower the detachment outer tube 56, push down the pipette tip attached to the dispenser head 55, remove it, and discard it in the pipette tip disposal site 61.
  • the controller 24 moves the transport head above the pipette tip storage 60 and positions the dispenser head 55 so that it is aligned with the pipette tip placed in alignment with the pipette tip storage 60. To do.
  • the pipette tip is attached to the dispenser head 55 by lowering the dispenser head and inserting the dispenser head 55 into the opening at the upper end of the pipette chip. After that, the dispensing head is raised and the transfer head is moved to the dispensing station to perform the dispensing operation.
  • FIG. 5 is a flowchart showing an outline of processing in each processing step.
  • Samples that have been processed are processed in units of a fixed number of container units (
  • each sample container is individualized (S12), and individually inspected for the required processing power (S13). Samples that pass the inspection are grouped into one unit (S15) and transferred to the next processing step. Samples that failed the inspection are united between the rejected samples (S17) and sent to defect handling (S18). When defective processing is completed, it is personalized again (S12) and is inspected (S13). The number of defective treatments is set in advance, and a container containing a sample that does not pass the inspection even if the predetermined number of defective treatments is performed is registered as a defective product and no further processing is performed. In S15 and S17 units, dummy containers are added to match the number of containers to one unit (8 in this embodiment). In addition, the individualization of S12 is a process that is required to inspect individual specimens individually, and the inspection of S13 should be conducted on individual specimens even when the container is in a united state. If it is possible, step S12 may be omitted.
  • FIG. 6 is a conceptual diagram visually showing the flowchart of FIG. A container containing a sample is processed in units of a predetermined number of container forces. After that, one unit of containers is individualized, and the processing status of each container is inspected. At this time, as shown in the figure, it is assumed that seven containers marked with ⁇ passed the inspection, but one container marked with X failed. In this case, it is divided into a pass container and a fail container, and one dummy container is added to the pass container to make 8 pieces, and 7 dummy containers are added to the fail container to make 8 pieces. To do. In this way, the unit is rejected, and the rejected unit is sent to the defective processing. Containers that finally pass the inspection due to defective processing are united again, and are sent to the next processing step together with the first pass.
  • FIG. 7 is an explanatory diagram showing in more detail the flow of a container containing a sample that has passed the inspection and a container containing the sample that has failed.
  • Samples processed in units are subjected to inspection, and individual samples in the unit are determined to be normal samples or defective samples.
  • the defective sample is removed from the unit, and a dummy container is inserted in the place where the defective sample was found to create a normal sample unit.
  • a defective sample taken out from the unit is similarly unitized by adding a dummy container, and the unit is subjected to defect processing. Once the defect handling is over, it will be inspected again and still inspection Samples that fail are taken out of the unit and transferred to the defective sample storage.
  • a dummy container is added at the place where the defective sample is taken out to make a normal sample unit.
  • the two normal sample units thus obtained are processed in the next processing step.
  • the dummy container is removed from the unit, and samples that have been properly processed are stored in the normal sample storage.
  • FIG. 6 and FIG. 7 show an example in which a defective processing unit is formed by adding a dummy container to a defective sample for each unit that has been inspected. However, if the time required for reaction is allowed, if the total number of samples is 96, all 96 samples (or any intermediate number such as 48) will be inspected, and it will be inconvenient from each unit. Acceptable samples are collected and collected to form a defective sample unit of 8 units (if more than 8 units, the first 8 units are united and the remaining dummy is covered). It is.
  • FIG. 8 is a flowchart showing the destaining process of the protein gel band.
  • the control unit 24 first moves the transport head 23 to above the sample container storage 11 and uses the first container transport unit of the transport head 23 to make eight units corresponding to one unit. Remove the sample container from the sample container storage 11. The transport head 23 holding the sample container for one unit moves above the barcode reader 15 and reads the information of the two-dimensional barcode provided on the lower surface of each container by the barcode reader 15 (S21). Read The information is stored in the memory of the control unit 24. Next, the transport head 23 transports the sample container to the dispensing station 14, lowers the container, and then opens the lid. At the dispensing station, the destaining solution (acetic acid methanol solution) is dispensed into each container constituting one unit (S22).
  • the destaining solution acetic acid methanol solution
  • the transport head closes the lid of the sample container into which the destaining solution has been dispensed and transports it to the vibrating thermostat 16.
  • the lid is opened immediately before dispensing unless otherwise noted, and after dispensing, the lid is closed immediately and other processing is performed.
  • the thermostatic bath 16 is temperature adjusted to 37 ° C ⁇ 1 ° C, and the sample is incubated in the bath and stirred and washed (S23). After cleaning for a predetermined time, one unit of sample container is transferred again to the dispensing station 14 by the transfer head. In the dispensing station 14, a nozzle is inserted into each unit of the sample container, and the destaining solution is removed by suction (S24). The sample container from which the destaining liquid has been removed is transported to the inspection station 20 by the transport head 23.
  • a CCD camera is installed in the inspection station 20 as an imaging device, and as shown in Fig. 9, the transport head 23 moves one unit of the container row in front of the CCD camera while moving it in each container.
  • the sample is inspected (S25). In this inspection process, if the gel piece in the container is sufficiently de-stained, it is determined to be acceptable, and if the color of the gel piece is equal to or greater than a predetermined threshold, it is determined that the de-staining is insufficient. (S26).
  • the transfer head 23 moves to the dispensing station, where one unit of the sample container is lowered.
  • the defective sample is conveyed to the place of the two-dimensional barcode reader 15 using the second container conveyance unit of the conveyance head 23, and the barcode information of the defective sample is read (S28).
  • the read information is stored in the memory of the control unit 24.
  • the container containing the defective sample is transported to the defective sample storage 13 by the transport head 23 for temporary retraction.
  • the transport head 23 uses the second container transport section to take out the dummy container from the dummy container storage 12 and leave it in the dispensing station to empty the container row. Insert it at the location (where the container was removed as a defective sample). Repeat this operation for the number of defective samples, and change the number of containers placed in the dispensing station to 8 units. There are 8 dummy containers, and the unitized containers are sample containers. It is transported to the storage 11 and waits for the next processing (S27).
  • the control unit 24 first moves the transport head 23 to above the defective sample storage area 13, and uses the second container transport section to enter the unacceptable sample that has been evacuated to the defective sample storage area 13. Pick up the container and transport it to the dispensing station 14. This operation is repeated as many times as there are defective samples, and all containers containing defective samples are transferred to the dispensing station 14. Next, by using the second container transfer section of the transfer head 23, a required number of dummy containers are transferred from the dummy container storage area 12 to the dispensing station 14 to form a unit that also has eight container forces (S29). .
  • a nozzle is inserted into all containers including the dummy container, and the destaining solution is dispensed (S22).
  • the unit is lifted from the dispensing station 14 by the first container transport section of the transport head 23 and transported to the vibrating thermostat 16.
  • the unit including the container with the defective sample is stirred and destained by incubation in the thermostatic chamber 16 (S23).
  • the sample container of the unit is transported to the dispensing station 14 by the transport head 23 again.
  • a nozzle is inserted into each unit of the sample container, and the destaining solution is removed by suction (S24).
  • the sample container from which the destaining liquid has been removed is transported to the inspection station 20 by the transport head 23.
  • the transport head 23 moves the unit row of the unit in front of the CCD camera, and the sample in the container is inspected (S25). At this time, since the position of the dummy container is known, the control unit does not inspect the dummy container using the information. When the necessary inspections have been completed, the transfer head 23 moves to the dispensing station, where a unit of sample container is lowered. If there is still a defective sample that has been rejected by the inspection, use the second container transport section of the transport head 23 to transport the defective sample to the location of the 2D barcode reader 15 and check the defective sample bar. Read code information. The read information is stored in the memory of the control unit 24. Thereafter, the container containing the defective sample is transported to the defective sample storage 13 by the transport head 23.
  • the transport head 23 takes out the dummy container from the dummy container storage area 12 using the second container transport unit, and leaves it in the dispensing station to empty the container row.
  • Location Insert into the place where there was a container removed as a defective sample.
  • the number of containers placed on the dispensing station is set to 8 and unitized again (S27). Dummy containers are added to make up a total of eight, and the unitized test-accepted sample containers are transported to the sample container storage 11 and wait for the next processing.
  • the sample that has undergone the destaining step is then subjected to a washing and dehydrating step to remove the acetic acid methanol solution and to facilitate drying.
  • the control unit 24 moves the transport head 23 above the sample container storage 11 and uses the first container transport unit of the transport head 23 to add eight sample containers corresponding to one unit to the sample container storage 11. Remove from 11 and transport to dispensing station 14 and lower container. At the dispensing station, ultrapure water is dispensed into each container that constitutes one unit.
  • the transport head transports the sample container into which the cleaning liquid has been dispensed to the vibrating thermostat 16.
  • the thermostatic chamber 16 is adjusted to 37 ° C ⁇ 1 ° C, and the sample is incubated in the bath and stirred and washed.
  • one unit of the sample container is again transported to the dispensing station 14 by the transport head.
  • a nozzle is inserted into each of the sample containers in one unit, and the cleaning solution is removed by suction. Perform this cleaning process a specified number of times.
  • a dewatered solution (acetonitrile) is dispensed into the cleaned sample container.
  • the transport head transports the sample container into which the dehydrated solution has been dispensed to the vibrating thermostat 16.
  • the thermostatic chamber 16 is temperature-controlled at 37 ° C ⁇ 1 ° C, and the sample is incubated in the bath and dehydrated.
  • one unit of the sample container is again transported to the dispensing station 14 by the transport head.
  • a nozzle is inserted into each unit of sample container, and the dehydrated solution is removed by suction.
  • the sample containers are transported to the sample container storage area 11 for each unit and wait for the next process.
  • one unit of the sample container placed in the sample container storage 11 is transported to the vacuum centrifuge 17 by the transport head 23 and vacuum-centrifuged for 30 minutes.
  • the unit container after the drying process is returned to the sample container storage 11.
  • FIG. 10 is a flowchart showing reductive alkylation treatment of a protein gel band.
  • the cysteine residue in the protein in the gel is reduced and then protected with an alkyl group.
  • the reaction is performed in a nitrogen atmosphere and under light-shielding conditions so that a reductive alkylation reaction using dithiothreitol as the reducing solution and sodoacetic acid as the alkylating agent is possible.
  • a reducing solution is prepared (S41).
  • the control unit 24 drives the transport head 23 to be placed in the sample container storage 11 and transports one unit of the sample container to the dispensing station 14.
  • the reducing solution prepared in advance is dispensed in each transported container (S31).
  • the transport head 23 transports the unit container into which the reducing solution is dispensed to the thermostatic chamber 18a.
  • the container is left in the thermostat 18a (37 ° C, 30 minutes) to react.
  • a reduction reaction is performed for all units (S32).
  • the transport head 23 transports an empty container from the container container 51 for inspection to the dispensing station 14 in preparation for the pH test.
  • the pH indicator in the reagent storage 50 in the station is dispensed (S42).
  • one unit of the sample container is transferred from the thermostat 18a to the dispensing station 14, and a part of the reaction solution is sucked by the dispenser (S33).
  • the aspirated reaction solution is discharged into the test container and mixed with the previously dispensed pH indicator by repeating the aspiration and discharge (S43).
  • the inspection container is transported to the inspection station 20.
  • the pH indicator color change is detected by the CCD camera of the inspection station 20.
  • the CCD camera records an image obtained by mixing a buffer solution with a known pH with a pH indicator for calibration, and the control unit makes a determination by comparing these with the actual measured value of the sample (S44).
  • the normal sample container of the unit is transported to the original location of the thermostat (S35). After reading the barcode on the defective sample container (S45), the remaining liquid is aspirated (S46), and the reducing solution is again dispensed (100 / zl) (S47). After that, it is transported to the original place in the thermostat 18a, left in the thermostat 18a (37 ° C, 60 minutes) and reacted (S35).
  • an alkylation solution is prepared (S48).
  • the transport head 23 transports one unit container in the thermostat 18a to the dispensing station 14.
  • the gel unabsorbed solution is completely aspirated from each container (36), and the alkyl solution is dispensed (100 / zl) (S37).
  • the transport head 23 transports the container to the light shielding tank 19, and leaves it (room temperature, 30 minutes) to react (S38).
  • the transport head 23 transports the container from the light shielding tank 19 to the inspection station 20 and performs a pH test in the same manner as in the reduction step.
  • the sample that has undergone the reduced alkylation reaction step is then subjected to a washing and dehydration step to remove excess reagents and buffers.
  • This process is the same as the washing and dehydrating process described above, except that an ammonium bicarbonate solution is used instead of ultrapure water.
  • Proteolytic enzymes are prepared in advance, and are stored in a container as a lyophilized product in an amount necessary for one analysis in the reagent storage 50 in the dispensing station. Dispense ultrapure water into this container to a specified concentration with a dispenser, and repeat suction and discharge to dissolve. Next, one unit of sample container placed in the sample container storage 11 is transported to the dispensing station 14. Dispense the specified amount of the enzyme solution prepared above into each sample container, and then transfer it to the ice bath 18b. The container is placed in an ice bath and the gel in the container is swollen for a predetermined time. Transport the container with the gel swollen for a predetermined time to the inspection station and inspect the degree of swelling. The dried gel before swelling is white, whereas the gel swollen by absorbing the enzyme solution becomes colorless and transparent. Therefore, the degree of swelling is determined using this decrease in white as an index.
  • One unit of the sample container for which the swelling test is completed is transported to a dispensing station. If there is a poorly swelled sample, the second container transport unit of the transport head 23 is used to transport the defective sample to the place of the two-dimensional barcode reader 15 and read the barcode information of the defective sample. The read information is stored in the memory of the control unit 24. Thereafter, the container containing the defective sample is transported to the ice bath 18b by the transport head 23 for temporary retraction.
  • the transport head 23 uses the second container transport section to take out the dummy container from the dummy container storage 12 and leave it in the dispensing station to empty the container row. Insert it at the location (where the container was removed as a defective sample). This operation is repeated for the number of defective samples, the number of containers placed in the dispensing station is set to 8, and again. Unitize. Dispense the digestion buffer into this unit, transfer it to the ice bath again, and leave it for a predetermined time.
  • the sample container is transported to the dispensing station, and a prescribed amount of the buffer solution for digestion is recaptured.
  • the transport head 23 transports the sample container to which the digestion buffer is added to the thermostatic chamber 18a.
  • the temperature chamber is adjusted to 37 ° C ⁇ 1 ° C, and the sample is allowed to stand in the bath for enzyme digestion.
  • the transport head 23 transports an empty container from the test container storage 51 to the dispensing station 14 in preparation for a pH test. Dispense the pH indicator in the reagent storage 50 in the station into this container.
  • the aspirated reaction solution is discharged into a test container and mixed with a previously dispensed pH indicator by suction and discharge. Transport inspection container to inspection station 20.
  • the pH indicator color change is detected with a CCD camera.
  • the CCD camera records an image obtained by mixing a buffer solution with a known pH with a pH indicator for calibration, and the control unit 24 makes a determination by comparing these with the measured sample value.
  • each process is started from the sample container storage place, and then returned to the sample storage place.
  • each process can be directly connected without using a sample storage place.
  • a reducing solution can be prepared during the drying process, and when the drying process is completed, one unit can be directly transferred from the vacuum centrifuge to the dispensing station to dispense the reducing solution. In this way, more efficient preparation is possible by directly combining the steps without going through the sample storage.
  • each sample container is provided with a barcode, and the sample and information are managed by the barcode.
  • FIG. 11 is an explanatory diagram showing an example of using barcode data.
  • the management of the sample container is based on the two-dimensional barcode and the physical position in the sample storage area.
  • the barcode information is attached to the bottom surface of the container in which the sample is placed.
  • the number of the 8 units is the row number (for example, when preparing 96 samples, the row number is 1 to 12), and the position of the 8 units is the column number. 2D data Suppose that For example, the fifth tube from the third set origin is registered as 3-5 (see Fig. 11 (a)).
  • FIG. 11 (b) shows an example of how bar code information and position information are managed.
  • the transport head transports the sample containers on a bar code reader for each unit (eight) to read the barcode of each container.
  • the control unit 24 reads the barcode, it generates a new data line and records the position information in the initial position field and the current position field as shown in FIG. 11 (b).
  • sample containers are taken out for each unit, processed, and returned to the original position in the sample storage area 11, so that the relationship between the barcode information and the position information is maintained.
  • the bar code is read, and a failure (false) is recorded in the corresponding inspection result column.
  • the container containing the rejected sample is transported to a predetermined location such as a defective sample storage area, and the dummy container is transported to the original position instead.
  • the current position column of the control unit is rewritten to the position where the defective sample is conveyed.
  • the control unit recognizes that there is a dummy container in the corresponding initial position column and performs the subsequent steps.

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Abstract

 工程を完全自動化してコンタミネーションを低減し、生成物の定量化を可能とするともに、不良率を抑制することのできるシステムを提供する。  決められた数の試料容器を1ユニットとし、1ユニット毎に搬送し、各分注・吸引装置、各反応槽に供給を行う。試料の反応・処理の定量性および確実性を確保するため、反応監視センサーを設け、試料容器にはバーコードを添付し試料を確認する。監視により不良と判定された試料は、定められた工程個所まで戻され再度反応・処理を行うようにする。

Description

明 細 書
複数試料自動処理システム及び複数試料自動処理方法
技術分野
[0001] 本発明は、試料を複数の処理工程を経て処理する複数試料自動処理システム及 び複数試料自動処理方法に関する。
背景技術
[0002] 試料の分析等、多くの分野において、試料に対して複数の処理を段階的に行うこと が必要とされている。例えば、プロテオーム解析においては、タンパク質試料 (ゲル) をペプチド混合物に変換して質量分析計に供給するが、その前処理としてタンパク 質ゲルバンドの脱染色、ゲルバンドの乾燥、還元アルキル化反応、酵素消化反応な どを順に行う必要がある。
非特許文献 1 :礒辺俊明、高橋信弘 /編「プロテオーム解析法 タンパク質発現,機能 解析の先端技術とゲノム'創薬研究」(羊土社)
特干文献 2: Shevchenko A, Wiim M, Vorm O, Mann M. Mass spectrometnc seque ncing of proteins silver-stained polyacrylamide gels. Anal Chem. 199b Mar 1;68(5):8 50-8.
発明の開示
発明が解決しょうとする課題
[0003] ペプチド混合物調製に関して説明すると、マニュアルで調製を行うこともできるし、 市販の自動調製装置を用いて自動で調製を行うこともできる。しかし、現状ではいず れの場合でもそれぞれ長所'短所を有している。マニュアルで調製を行う場合は、通 常一試料ずつ処理を行うため個別の試料の反応状況を確認しながら進め、未反応 試料はその都度適正な反応を行わせることで不良試料の発生を防止することができ るが、人が調製を行うため、作業者の不注意による試料の取り違えが起こること、熟練 度によっては操作の再現性が低い場合があり処理が遅延したり条件が一定でなくな つてしまうこと、および作業者由来のタンパク質が試料に入り込むコンタミネーシヨン の問題が存在する。一方、自動調製装置においては人手を介さずに調製を行うため 、多数同時処理が可能な点、人為的なミスを防ぐことが可能な点、コンタミネーシヨン の防止の点では優れているが、反応監視機能を持たないため最終的に不良率の増 大を招くという問題がある。また、多数同時処理を行う自動調製装置では、反応監視 機構を持たせて反応状況をモニターしたとしても、エラー処理を個別に行うことは難 しい。
[0004] 本発明は、このような問題点に鑑み、工程を完全自動化して多数試料処理におけ る人為的ミスを取り除き、コンタミネーシヨンを低減し、生成物の定量化を可能とすると もに、不良率を抑制することのできるシステムを提供することを目的とする。
課題を解決するための手段
[0005] 本発明にお ヽては、処理工程を完全自動化し、各工程に反応監視機能を設け未 反応試料を抽出し再反応を行わせることで前記目的を達成する。本発明では、例え ば試料容器置き場に 8 X 12本の試料容器を置くことが可能なとき、最大で 96本の試 料容器を連続して処理可能とする。このとき、試料容器 8本を 1ユニットとし、 1ユニット 毎に搬送し、各分注 ·吸引装置、各反応槽に供給を行うものとする。また、各反応 '処 理工程終了後、試料容器は試料容器プレートの元の位置に戻されるものとする。試 料の反応 ·処理の定量性および確実性を確保するため、処理液の分注 '吸引の安定 性 (定量分注'完全吸引)はもとより、必要により反応監視センサーで反応状態を監視 する。監視により不良と判定された試料は、定められた工程個所まで戻され再度反応 •処理を行うようにする。
[0006] すなわち、本発明の複数試料自動処理システムは、複数の試料容器が置かれる試 料容器置き場と、ダミー容器が置かれるダミー容器置き場と、容器中の試料に対して 異なる処理を行う第 1の処理部及び第 2の処理部と、容器中の試料を検査する検査 部と、容器を各容器置き場、処理部及び検査部の間に搬送する容器搬送部と、制御 部とを備え、制御部は、各部を制御して、第 1の処理部において n個(nは 2以上の正 の整数)の容器を 1単位として処理を行い、その処理後に検査部による検査で不合 格となった試料があるとき、当該不合格になった試料が入った容器にダミー容器を加 えて n個一組とした容器に対して不良処理を行 ヽ、検査に合格した試料が入った容 器にダミー容器を加えて n個一組とした容器を第 2の処理部で処理する。 [0007] 容器搬送部は、 n個の容器を同時に保持する第 1の容器保持部と、 1個の容器を保 持する第 2の容器保持部を有するのが好ましい。第 1の処理部及び第 2の処理部は、 n個一組の容器に対して処理液を注入又は吸引する分注手段を備える。分注手段 は、第 1の処理部と第 2の処理部が共用することができ、容器搬送部に分注手段を設 けてもよい。
[0008] また、複数の試料を複数の処理工程を経て処理する本発明の複数試料自動処理 方法は、第 1の処理部において、 n個(nは 2以上の正の整数)の容器を一組として容 器内の試料に対して処理を行う工程と、第 1の処理部での処理が終わった試料に対 して第 1の検査を行う工程と、第 1の検査で不合格となった試料があるとき、当該不合 格になった試料が入った容器にダミー容器を加えて n個の容器力もなる第 1の容器ュ ニットを形成する工程と、第 1の容器ユニットに対して不良処理を行う工程と、不良処 理後の試料に対して第 2の検査を行う工程と、第 2の検査で合格した試料が入った容 器にダミー容器を加えて n個の容器力もなる第 2の容器ユニットを形成する工程と、第 1の検査に合格した試料が入った容器にダミー容器を加えて n個の容器カゝらなる第 3 の容器ユニットを形成する工程と、第 2の処理部において、第 2の容器ユニット内の試 料及び第 3の容器ユニット内の試料に対して処理を行う工程とを含む。
発明の効果
[0009] 本発明によると、複数の処理工程を経る試料の処理を自動化して多数試料を迅速 かつ再現的に処理することができ、コンタミネーシヨンを防止できるとともに、不完全な 処理に起因する試料の不良率を低減することができる。
図面の簡単な説明
[0010] [図 1]本発明による試料処理システムの全体構成を示す概略図である。
[図 2]搬送ヘッドの一例を示す説明図である。
[図 3]分注装置を備えた搬送ヘッドの一例を示す説明図である。
[図 4]先端に容器把持部を備えるロッドによる容器搬送の様子を示す説明図である。
[図 5]各処理工程における処理の概略を示すフローチャートである。
[図 6]図 4のフローチャートを視覚的に示した概念図である。
[図 7]検査に合格した試料が入った容器と、不合格の試料が入った容器の流れをより 詳細に示した説明図である。
[図 8]タンパク質ゲルバンドの脱染色処理を示すフローチャートである。
[図 9]検査方法の一例を説明する図である。
[図 10]タンパク質ゲルパンドの還元アルキル化処理を示すフローチヤ一 [図 11]パーコードによる試料容器情報の管理を示す説明図である。 符号の説明
11 試料容器置き場
12 ダミー容器置き場
13 不良試料置き場
14 分注ステーション
15 バーコードリーダー
16 振動恒温槽
17 減圧遠心機
18a 恒温槽
18b 氷浴槽
19 遮光槽
20 検査ステーション
21a, 21b レール
22 ボーノレネジ
23 搬送ヘッド
24 制御部
31 ロッド、
32 容器把持部
33 第 1の容器搬送部
34 第 2の容器搬送部
1 試料容器
50 試薬ビン置き場
51 検査容器置き場 52 ロッド、外筒
53 容器蓋
54 押さえピン
55 分注器ヘッド
56 チップ脱離用外筒
57 ピペットチップ
58 第 1の分注部
59 第 2の分注部
60 ピペットチップ置き場
61 ピペットチップ捨て場
発明を実施するための最良の形態
[0012] 以下、本発明の実施の形態を説明する。ここでは、電気泳動法で分離したタンパク 質のゲルバンドある 、はスポットを処理し、液体クロマトグラフィー質量分析法で分析 するための消化ペプチド混合試料を調製する処理の実施例を用いて本発明を説明 する。本実施例の試料処理システムは、プロテオーム解析のため、タンパク質試料に 対して自動的に化学反応および酵素反応を行い、ペプチド混合物に変換し、質量分 析計に供給することを目的とし、 2次元電気泳動で得られたタンパク質スポット (ゲル 片)を試料容器 (容量 700 1)に入れ、ゲル片の脱染色、還元アルキル化、ゲル内消 化と脱塩濃縮等の反応'処理を経て、質量分析計へ供給するものである。なお、本発 明は、ここに説明する実施例に限定されず、複数の試料に対して複数段の処理を行 う処理方法一般に適用可能である。
[0013] 図 1は、本発明による試料処理システムの全体構成を示す概略図である。この試料 処理システムは、それぞれに試料が入った試験管状の透明容器を保持する試料容 器置き場 11、試料の入って!/ヽな ヽ試験管状の透明容器 (ダミー容器)を保持するダミ 一容器置き場 12、後述する検査で不合格となった試料の入った容器を一時的に置く 不良試料置き場 13、検査用容器置き場 51、固体試薬が入った試薬ビン置き場 50を 備えた分注ステーション 14、透明容器の底部に設けられている個々の試料を識別す るための 2次元バーコードを読み取るためのバーコードリーダー 15、振動恒温槽 16、 減圧遠心機 17、恒温槽 18a、氷浴槽 18b、遮光槽 19、検査用 CCDカメラが置かれ た検査ステーション 20を有する。また、使い捨てのピペットチップを置くピペットチップ 置き場 60、及び使 、終わったピペットチップを廃棄するピペットチップ捨て場 61が設 けられている。
[0014] これらの上方には、複数個の容器、例えば 8個の容器を 1ユニットとして各部に搬送 するための搬送ヘッド 23が設置されている。搬送ヘッド 23はボールネジ 22に沿って X方向に移動可能であり、ボールネジ 22はレール 21a, 21bに沿って Y方向に移動 可能である。結果として、搬送ヘッド 23は XY方向の任意の場所に容器を搬送するこ とができる。分注ステーション 14は、試薬容器や脱染色液容器に接続された 8個のノ ズルを有し、搬送ヘッド 23によって搬送されてきた 1ユニットの容器、すなわち 8個の 容器に対して処理溶液を注入したり、容器カゝら溶液を吸引したりすることができる。ノ ズルに接続される処理液容器を切り替えることによって、ノズルからは処理に必要な 処理液が各容器に選択して供給される。また、装置の各部は、制御部 24により制御 される。
[0015] 容器内の試料に対して処理を行う処理部は、容器に対して処理液を注入'吸引す る分注装置と恒温槽、分注装置と振動恒温槽など、図 1に示した複数の設備によつ て構成される。分注装置は、それぞれの処理部に個別に設けてもよいし、複数の処 理部が共用する形態をとつてもよい。本実施例では、複数の処理部が 1つの分注装 置を共用する。さらに、分注装置は、装置上に固定的に設けてもよいし、搬送ヘッド に設けることちできる。
[0016] 図 2は搬送ヘッドの一例を示す説明図であり、図 2 (a)は正面摸式図、図 2 (b)は下 面模式図である。搬送ヘッド 23は、その下方に、先端に容器把持部 32を備えるロッ ド 31が突出している。容器把持部 32の下端は、ロッド軸と垂直な方向に膨らんでおり 、後述する容器の蓋の凹部にはまるようになつている。ロッドの外側には容器把持部 32より大きな径を持つ中空の外筒 52が備えられており、ロッドとは独立に上下動する ことが出来るようになって 、る。ロッド 31は 8本が 1ユニットとなって第 1の容器搬送部 33を構成し、第 1の容器搬送部 33は矢印で示すように 8本同時に上下動するように なっている。搬送ヘッド 23はまた、同様に先端に容器把持部と外筒を備えるロッドか らなるが、 1個の容器だけを独立して搬送可能な第 2の容器搬送部 34をも有する。第 1の容器搬送部 33の 8本の外筒も、 8本が 1ユニットとなって同時に上下する。
[0017] 容器に処理液を分注する分注装置は、分注ステーション 14に固定的に設けられて いても良いし、搬送ヘッドに設けられていて、分注時、搬送ヘッドが分注ステーション に移動して分注を行ってもよい。図 3は、分注装置を備えた搬送ヘッドの一例を示す 説明図であり、図 3 (a)は正面摸式図、図 3 (b)は下面模式図である。図 3に示す搬送 Z分注ヘッド 23は、搬送ヘッド部と分注ヘッド部力 なり、これらは同時に上下動して も、それぞれ独立に上下動してもよい。
[0018] 搬送ヘッド部は、図 3に示すように、その下方に、先端に容器把持部 32を備える口 ッド 31が突出している。容器把持部 32の先端は、ロッド軸と垂直な方向に膨らんで おり、後述する容器の蓋の凹部にはまるようになつている。ロッドの外側には容器把 持部 32より大きな径を持つ中空の外筒 52が備えられており、ロッドとは独立に上下 動することが出来るようになって!/、る。ロッド 31は 8本が 1ユニットとなって第 1の容器 搬送部 33を構成し、第 1の容器搬送部 33は矢印で示すように 8本同時に上下動す るようになっている。搬送ヘッド部はまた、同様に先端に容器把持部と外筒を備える口 ッド力らなる力 1個の容器だけを独立して搬送可能な第 2の容器搬送部 34をも有す る。
[0019] 分注ヘッド部は、図 3に示すように、その下方に、先端にピペットチップ 57を装着可 能な分注器ヘッド 55が突出している。分注器は 8本が 1ユニットとなって第 1の分注部 58を構成し、第 1の分注部 58は矢印で示すように 8本同時に上下動するようになつ ている。分注ヘッド部はまた、同様に先端にピペットチップ 57を装着可能な分注器か らなるが、 1個の容器だけを独立して分注、吸引可能な第 2の分注部 59をも有する。 分注器には、分注器ヘッド 55に対して独立に上下動可能な中空のチップ脱離用外 筒 56が付属している。
[0020] 図 4は、先端に容器把持部 32を備えるロッド 31による容器搬送および容器蓋開閉 の様子を示す説明図である。図 4 (a)は試料容器置き場などに置かれた蓋付きの容 器 41の上方に搬送ヘッドを位置決めし、先端に容器把持部 32を備えるロッド 31を搬 送ヘッドから降下させている状態を示している。図 4 (b)は、ロッド 31の先端に設けら れた容器把持部 32が、容器 41の開口部に嵌った蓋 53の凹部に挿入され、固定され た状態を示している。
[0021] 図 4 (c)は、容器の蓋 53を開ける様子を示す。押さえピン 54は通常パネや磁力によ り図 4 (a)に示すように開いている力 空気圧などにより内側に移動し容器の下部を押 さえることで容器 41を固定することが出来る。この状態で図 4 (b)のように蓋 53をロッ ド 31に固定したまま搬送ヘッドを上昇させることにより、蓋 53を容器 41から取り去るこ とが出来る。図 4 (d)は、容器把持部 32が容器 41の開口部に嵌った蓋 53の凹部に 固定された状態でロッド 31を上昇させた様子を示している。容器 41は、蓋 53の凹部 に容器把持部 32が嵌ったままロッド 31によって引き上げられる。この状態で搬送へッ ドを移動することにより、容器の搬送が行われる。
[0022] 図 4 (e)は、搬送してきた容器を置く様子を示している。所望の位置に搬送後、接地 する。その後、ロッドの外筒 52が降下し、蓋 53を押さえた状態でロッド 31を上昇させ ることにより、搬送ヘッド 23から蓋 53を外すことが出来る。このとき、蓋 53は容器 41の 開口部に嵌ったまま残る。
[0023] なお、図 2、図 3に示した搬送ヘッドの構造あるいは図 4に示した容器搬送方法は 単なる一例であり、容器を搬送するための具体的構造や搬送方法として、ここに示し た以外の構造や方法を用いても構わな 、。
[0024] 図 3に示した分注装置を備えた搬送ヘッドの場合、処理液の分注あるいは吸引が 終わると、制御部 24は搬送ヘッドをピペットチップ捨て場 61の上方に移動し、そこで チップ脱離用外筒 56を降下させ、分注器ヘッド 55に装着されているピペットチップを 押し下げて外し、ピペットチップ捨て場 61に捨てる。ピペットチップの装着に当たって は、制御部 24は搬送ヘッドをピペットチップ置き場 60の上方に移動し、ピペットチッ プ置き場 60に整列して置かれているピペットチップに分注器ヘッド 55が整列するよう に位置決めする。そして、分注器ヘッド部を降下させて分注器ヘッド 55をピペットチ ップ上端の開口に挿入することにより、分注器ヘッド 55にピペットチップを装着する。 その後、分注ヘッド部を上昇させ、搬送ヘッドを分注ステーションに移動して分注操 作を行う。
[0025] 図 5は、各処理工程における処理の概略を示すフローチャートである。前工程での 処理が終了した試料は、決められた個数の容器カゝらなるユニット単位で処理される (
Sl l)。処理が終わると、各試料の容器は個別化され (S12)、必要な処理が完了して いる力個別に検査される(S13)。検査に合格した試料は、 1ユニットにまとめられ (S1 5)、次の処理工程に移される。検査で不合格であった試料は、不合格試料同士でュ ニットィ匕され (S17)、不良処理にまわされる(S18)。不良処理が終わると、再び個別 化され (S12)、検査にかけられる(S13)。不良処理の回数は予め設定されており、 決められた回数だけ不良処理を行っても検査に合格しない試料の入った容器は不 良品として登録され、以後の処理を行わない。なお、 S15及び S17のユニットィ匕では 、ダミー容器を加えて容器の数を 1ユニットの数 (本実施例では 8個)に合わせる。ま た、 S 12の個別化は個々の試料に対して個別に検査を行うために必要とされる工程 であり、容器をユニットィ匕した状態でも個々の試料に対して S 13の検査を行うことがで きるのであれば、 S 12の工程は省略しても構わない。
[0026] 図 6は、図 5のフローチャートを視覚的に示した概念図である。試料の入った容器は 、所定数の容器力 なるユニット単位で処理される。その後、 1ユニットの容器は個別 化され、個々の容器に対して処理状態の検査が行われる。このとき、図示したように、 〇を付した 7個の容器は検査に合格であつたが、 Xを付した 1個の容器が不合格で あつたとする。この場合、合格した容器と不合格の容器に分け、合格した容器には 1 個のダミー容器を追加して 8個とし、不合格の容器には 7個のダミー容器を追加して 8 個とする。こうしてユニットィ匕され、不合格のユニットは不良処理にまわされる。不良処 理によって最終的に検査に合格した容器は再びユニットィ匕され、先に合格したュ-ッ トと合わせて次の処理工程にまわされる。
[0027] 図 7は、検査に合格した試料が入った容器と、不合格の試料が入った容器の流れ をより詳細に示した説明図である。
[0028] ユニット単位で処理された試料は検査にかけられ、ユニット内の個々の試料が正常 試料か不良試料カゝ判定される。不良試料はユニットから外され、不良試料のあった個 所にはダミー容器が挿入されて正常試料ユニットが作られる。一方、ユニットから取り 出された不良試料には、同様にダミー容器が追加されてユニットィ匕され、そのユニット に対して不良処理が行われる。不良処理が終わると再び検査され、依然として検査 に不合格の試料はユニットから取り出されて不良試料置き場に移される。また、不良 試料が取り出された個所にはダミー容器が追加され、正常試料ユニットとされる。こう して得られた 2つの正常試料ユニットは、次の処理工程で処理される。そして、最終 の処理工程が終了すると、ユニットからダミー容器が除去され、各種の処理が正常に 施された試料は正常試料置き場に保管される。
[0029] なお、図 6及び図 7は、検査の終わったユニット毎に、不良試料にダミー容器を追カロ して不良処理用のユニットを形成する例を示している。しかし、反応等の時間が許す 場合には、仮に全試料数が 96本とすれば 96本全て (あるいは 48本など中間的な任 意の本数)の検査を行って力ゝら各ユニットから不合格の試料を取り出して集め、 8本 単位の不良試料ユニットを形成する(8本を越える場合には最初の 8本をユニットィ匕し て残りにダミーをカ卩える) t 、う処理方法も可能である。
[0030] 次に、具体的な処理の例にっ 、て説明する。本実施例の試料処理システムは、以 下の処理工程を自動運転で行う。
[0031] (1)クマシ一ブルー色素染色したタンパク質ゲルバンドの脱染色工程。
[0032] (2)ゲルバンドの洗浄、脱水工程。
[0033] (3)ゲルバンドの乾燥工程。
[0034] (4)還元アルキル化工程。
[0035] (5)酵素消化反応工程。
[0036] (6) (1)、(4)、(5)の各工程が期待通りに進行している力、検査する工程。
[0037] (7)検査結果を試料識別番号とともに記録する工程。
[0038] (8)検査結果に応じて可変する工程。
[0039] 以下に、各工程の詳細を説明する。図 8は、タンパク質ゲルバンドの脱染色処理を 示すフローチャートである。
[0040] 脱染色工程において、制御部 24は、まず、搬送ヘッド 23を試料容器置き場 11の 上方に移動させ、搬送ヘッド 23の第 1の容器搬送部を用いて 1ユニット分である 8個 の試料容器を試料容器置き場 11から取り出す。 1ユニット分の試料容器を保持した 搬送ヘッド 23は、バーコードリーダー 15の上方に移動し、各容器の下面に設けられ た 2次元バーコードの情報をバーコードリーダー 15によって読み取る(S21)。読み取 つた情報は、制御部 24のメモリに記憶される。次に、搬送ヘッド 23は試料容器を分 注ステーション 14に搬送し、容器を下ろした後に蓋を開ける。分注ステーションでは、 1ユニットを構成する各容器に脱染色液 (酢酸メタノール溶液)を分注する(S22)。搬 送ヘッドは、脱染色液が分注された試料容器は蓋を閉めて、振動恒温槽 16に搬送 する。以下の分注操作でも特に断らない限り直前に蓋を開けて分注し、分注したら直 後に蓋を閉めて他の処理を行う。
[0041] 振動恒温槽 16は 37°C± 1°Cに温度調整されており、試料を槽内でインキュベーシ ヨンして攪拌洗浄する(S23)。所定時間の洗浄が終わると、 1ユニットの試料容器は 再び搬送ヘッドによって分注ステーション 14に搬送される。分注ステーション 14では 、 1ユニットの試料容器それぞれにノズルを挿入して脱染色液を吸引除去する(S24) 。脱染色液が除去された試料容器は、搬送ヘッド 23によって検査ステーション 20に 搬送される。
[0042] 検査ステーション 20には撮像装置として CCDカメラが設置されており、図 9に示す ように、搬送ヘッド 23は 1ユニットの容器列を CCDカメラの前に移動させながら一つ 一つの容器内の試料を検査する(S25)。この検査工程では、容器内のゲル片が十 分に脱染色されて 、れば合格と判定し、ゲル片の色調が所定の閾値以上であれば、 脱染色不十分であるとして不良と判定する(S26)。
[0043] 全ての容器に対して検査が終了すると、搬送ヘッド 23は分注ステーションに移動し 、そこに 1ユニットの試料容器を降ろす。次に、搬送ヘッド 23の第 2の容器搬送部を 用いて不良試料を 2次元バーコードリーダー 15の場所まで搬送し、不良試料のバー コード情報を読み取る(S28)。読み取った情報は制御部 24のメモリに記憶される。そ の後、不良試料の入った容器は、一時退避のため、搬送ヘッド 23によって不良試料 置き場 13に搬送される。
[0044] 次に、搬送ヘッド 23は、その第 2の容器搬送部を用いて、ダミー容器置き場 12から ダミー容器を取り出し、それを分注ステーションに残って 、る容器列の空 、て 、る個 所 (不良試料として抜き取られた容器があった個所)に挿入する。この操作を、不良 試料の数だけ反復し、分注ステーションに置かれている容器の数を 8本にして、再度 ユニット化する。ダミー容器をカ卩えて 8本とされ、ユニットィ匕された容器は、試料容器 置き場 11に搬送され、次の処理のために待機する(S27)。
[0045] 次に、検査で不合格となった試料に対する不良処理について説明する。
[0046] 制御部 24は、始めに搬送ヘッド 23を不良試料置き場 13の上方に移動し、第 2の容 器搬送部を用いて、不良試料置き場 13に退避していた検査不合格試料の入った容 器を取り上げて、それを分注ステーション 14に搬送する。この操作を、不良試料の数 だけ繰り返し、不良試料の入った容器を全て分注ステーション 14に搬送する。次に、 搬送ヘッド 23の第 2の容器搬送部を用いて、ダミー容器置き場 12からダミー容器を 必要な数だけ分注ステーション 14に搬送し、 8個の容器力もなるユニットを構成する( S29)。
[0047] 次に、ダミー容器を含む全ての容器に、ノズルを挿入して脱染色液を分注する(S2 2)。脱染色液の分注が終わったら、そのユニットを搬送ヘッド 23の第 1の容器搬送部 にて分注ステーション 14から引き上げ、振動恒温槽 16に搬送する。不良試料の入つ た容器を含むユニットは、振動恒温槽 16内でインキュベーションして攪拌脱染色され る(S23)。脱染色が終わると、そのユニットの試料容器は再び搬送ヘッド 23によって 分注ステーション 14に搬送される。分注ステーション 14では、 1ユニットの試料容器 それぞれにノズルを挿入して脱染色液を吸引除去する(S24)。脱染色液が除去され た試料容器は、搬送ヘッド 23によって検査ステーション 20に搬送される。
[0048] 検査ステーションにおいて、搬送ヘッド 23は 1ユニットの容器列を CCDカメラの前 に移動させ、容器内の試料が検査される(S25)。このときダミー容器の位置は既知で あるため、制御部は、その情報を用いてダミー容器に対しては検査を行わない。必要 な検査が終了すると、搬送ヘッド 23は分注ステーションに移動し、そこに 1ユニットの 試料容器を降ろす。未だ検査で不合格になった不良試料が存在する場合、搬送へ ッド 23の第 2の容器搬送部を用いてその不良試料を 2次元バーコードリーダー 15の 場所まで搬送し、不良試料のバーコード情報を読み取る。読み取った情報は制御部 24のメモリに記憶される。その後、不良試料の入った容器は、搬送ヘッド 23によって 不良試料置き場 13に搬送される。
[0049] 次に、搬送ヘッド 23は、第 2の容器搬送部を用いて、ダミー容器置き場 12からダミ 一容器を取り出し、それを分注ステーションに残って 、る容器列の空 、て 、る個所( 不良試料として抜き取られた容器があった個所)に挿入する。こうして、分注ステーシ ヨンに置かれている容器の数を 8本にして、再度ユニットィ匕する(S27)。ダミー容器を 加えて 8本とされ、ユニットィ匕された検査合格試料の容器は、試料容器置き場 11に搬 送され、次の処理のために待機する。
[0050] 脱染色工程が終了した試料は、次に、酢酸メタノール溶液を除去し、乾燥しやすく するための洗浄、脱水工程を行う。制御部 24は、まず、搬送ヘッド 23を試料容器置 き場 11の上方に移動させ、搬送ヘッド 23の第 1の容器搬送部を用いて 1ユニット分 である 8個の試料容器を試料容器置き場 11から取り出し、分注ステーション 14に搬 送し、容器を下ろす。分注ステーションでは、 1ユニットを構成する各容器に超純水を 分注する。搬送ヘッドは、洗浄液が分注された試料容器を振動恒温槽 16に搬送する 。振動恒温槽 16は 37°C± 1°Cに温度調整されており、試料を槽内でインキュベーシ ヨンして攪拌洗浄する。所定時間の洗浄が終わると、 1ユニットの試料容器は再び搬 送ヘッドによって分注ステーション 14に搬送される。分注ステーション 14では、 1ュ- ットの試料容器それぞれにノズルを挿入して洗浄液を吸引除去する。この洗浄処理 を規定回数行う。
[0051] 次に、洗浄後の試料容器に、脱水溶液 (ァセトニトリル)を分注する。搬送ヘッドは、 脱水溶液が分注された試料容器を振動恒温槽 16に搬送する。振動恒温槽 16は 37 °C± 1°Cに温度調整されており、試料を槽内でインキュベーションして脱水処理する 。所定時間の処理が終わると、 1ユニットの試料容器は再び搬送ヘッドによって分注 ステーション 14に搬送される。分注ステーション 14では、 1ユニットの試料容器それ ぞれにノズルを挿入して脱水溶液を吸引除去する。脱水処理を規定回数行った後に 、試料容器はユニットごとに試料容器置き場 11に搬送され、次の処理のために待機 する。
[0052] ゲルバンドの乾燥工程では、試料容器置き場 11に置かれている 1ユニットの試料容 器を、搬送ヘッド 23にて減圧遠心機 17に搬送し、 30分間減圧遠心乾燥を行う。乾 燥工程が終わったユニットの容器は、試料容器置き場 11に戻す。
[0053] 図 10は、タンパク質ゲルバンドの還元アルキル化処理を示すフローチャートである [0054] 還元アルキル化工程では、ゲル内のタンパク質内のシスティン残基を還元した後に アルキル基により保護する。還元溶液としてジチオスレィトール、アルキル化剤として ョード酢酸を用いた還元アルキル化反応が可能なように、窒素雰囲気下および遮光 条件で反応を行う。最初に還元溶液を調製する(S41)。次に、制御部 24は、搬送へ ッド 23を駆動し、試料容器置き場 11に置かれて 、る 1ユニットの試料容器を分注ステ ーシヨン 14に搬送する。分注ステーション 14では、搬送された各容器に予め調製し ておいた還元溶液を分注する(S31)。次に、搬送ヘッド 23は、還元溶液が分注され た 1ユニットの容器を恒温槽 18aに搬送する。容器は恒温槽 18aに放置(37°C、 30 分)し、反応させる。同様に全てのユニットについて還元反応を行う(S32)。
[0055] 次に、搬送ヘッド 23は pH検査の準備のため、検査用容器置き場 51から空の容器 を分注ステーション 14に搬送する。この容器に、ステーション内の試薬置き場 50内の pH指示薬を分注しておく(S42)。反応時間が終了したら、恒温槽 18aから 1ユニット の試料容器を分注ステーション 14へと搬送し、分注器で反応液の一部を吸引する( S33)。吸引した反応液を検査用容器内で吐出し予め分注しておいた pH指示薬と 吸引吐出を繰り返すことにより混合する(S43)。
[0056] 検査用容器を検査ステーション 20まで搬送する。 pH指示薬色変化は、検査ステー シヨン 20の CCDカメラにて検出する。 CCDカメラは試料分析の前に予め pH既知の 緩衝液を pH指示薬と混合した画像を校正用に記録しておき、制御部がこれらと試料 実測値を比較することで判定を行う(S44)。
[0057] pH不良試料があった場合、そのユニットの正常試料の容器は、恒温槽の元の場所 に搬送する(S35)。不良試料容器はバーコードを読み取らせた後(S45)、残用液を 吸引し (S46)再度還元溶液を分注(100 /z l)する(S47)。その後、恒温槽 18aの元 の場所に搬送し、恒温槽 18a内に放置(37°C、 60分)し反応させる(S35)。
[0058] 続、て、アルキル化溶液を調製する(S48)。還元反応時間が終了したら搬送へッ ド 23は、恒温槽 18a中の 1ユニットの容器を分注ステーション 14に搬送する。分注ス テーシヨン 14では、各容器カゝらゲル未吸収の溶液を完全に吸引し(36)、アルキルィ匕 溶液を分注(100 /z l)する(S37)。その後、搬送ヘッド 23は、容器を遮光槽 19に搬 送し、放置(室温、 30分)し、反応させる(S38)。 [0059] 次に、搬送ヘッド 23は、容器を遮光槽 19から検査ステーション 20に搬送し、還元 工程と同様に pH検査を行う。 pH不良試料があった場合、 pH不良試料は、バーコ一 ドリーダーにバーコードを読み取らせた後に(S52)、残溶液を吸引し (S53)、還元溶 液を分注(100 1)して(S54)、氷浴槽 18bに搬送し、待機させる(S55)。これらの 試料は、正常試料の作業終了後、 S32から再度還元アルキル化反応を行う。
[0060] 還元アルキルィ匕反応工程が終了した試料は、次に、過剰の試薬や緩衝液を除去 するための洗浄、脱水工程を行う。この工程は超純水の代わりに重炭酸アンモ-ゥム 溶液を用いること以外は上述の洗浄、脱水工程と同じである。
[0061] 洗浄、脱水工程が終了した試料は、再度、上述のとおり乾燥工程を行う。
[0062] 次に、酵素消化反応工程について簡単に説明する。最初に酵素溶液を調製する。
タンパク質分解酵素は、予め用意し、分注ステーション内の試薬置き場 50に、一回 の分析に必要な量ずつ凍結乾燥物として容器に入れておく。この容器に分注器によ り規定の濃度となるように超純水を分注し、吸引、吐出を繰り返し、溶解する。次に、 試料容器置き場 11に置かれて 、る 1ユニットの試料容器を分注ステーション 14に搬 送する。先に調製した酵素溶液を各試料容器に規定量分注した後に、氷浴槽 18bに 搬送する。容器を氷浴槽に静置し、容器内のゲルを所定の時間膨潤させる。所定の 時間膨潤したゲルが入った容器を検査ステーションに搬送し、膨潤の程度を検査す る。膨潤前の乾燥したゲルは白色であるのに対して、酵素溶液を吸収して膨潤した ゲルは無色透明となるので、この白色の減少を指標として膨潤の程度を判定する。
[0063] 膨潤検査が終わった 1ユニットの試料容器は分注ステーションに搬送される。もし、 膨潤不良試料がある場合には、搬送ヘッド 23の第 2の容器搬送部を用いて不良試 料を 2次元バーコードリーダー 15の場所まで搬送し、不良試料のバーコード情報を 読み取る。読み取った情報は制御部 24のメモリに記憶される。その後、不良試料の 入った容器は、一時退避のため、搬送ヘッド 23によって氷浴槽 18bに搬送される。
[0064] 次に、搬送ヘッド 23は、その第 2の容器搬送部を用いて、ダミー容器置き場 12から ダミー容器を取り出し、それを分注ステーションに残って 、る容器列の空 、て 、る個 所 (不良試料として抜き取られた容器があった個所)に挿入する。この操作を、不良 試料の数だけ反復し、分注ステーションに置かれている容器の数を 8本にして、再度 ユニット化する。このユニットに消化用緩衝液を分注し、再度氷浴槽に搬送し、所定 の時間静置する。
[0065] 所定の時間が経過した試料容器を分注ステーションに搬送し、規定量の消化用緩 衝液を再びカ卩える。搬送ヘッド 23は、消化用緩衝液が加えられた試料容器を恒温槽 18aに搬送する。恒温槽は 37°C± 1°Cに温度調整されており、試料を槽内で静置し て酵素消化反応を行う。次に、搬送ヘッド 23は、 pH検査の準備のため、検査用容器 置き場 51から空の容器を分注ステーション 14に搬送する。この容器にステーション 内の試薬置き場 50内の pH指示薬を分注しておく。反応時間が終了したら、恒温槽 1 8aから 1ユニットの試料容器を分注ステーション 14へと搬送し、分注器で反応液の一 部を吸引する。吸引した反応液を検査用容器内で吐出し、予め分注しておいた pH 指示薬と吸引吐出により混合する。検査用容器を検査ステーション 20まで搬送する。 pH指示薬色変化は CCDカメラにて検出する。 CCDカメラは試料分析の前に予め p H既知の緩衝液を pH指示薬と混合した画像を校正用に記録しておき、制御部 24が これらと試料実測値を比較することで判定を行う。
[0066] 上述の説明では、一般的な動作を説明するため、試料容器置き場から開始して各 処理を行った後に、また試料置き場まで戻している。しかし、実際に特定のプロトコ一 ルを実行する場合には、試料置き場を介さないで各工程を直結することも出来る。例 えば、乾燥工程中に還元溶液を調製し、乾燥工程が終わった時点で減圧遠心機か ら直接 1ユニットを分注ステーションに搬送して、還元溶液を分注することも出来る。こ のように試料置き場を介さず直接各工程を結合することでより効率的な調製が可能 である。
[0067] 上記の実施例では、試料容器にはそれぞれバーコードが付され、バーコードによる 試料及び情報の管理が行われている。図 11は、バーコードデータの使用例を示す 説明図である。
[0068] 試料容器の管理は、 2次元バーコードと試料置き場での物理的位置による。バーコ ード情報は、本実施例では、試料を入れる容器の底面に付されている。位置データ は、何番目の 8本ユニットかを行番号 (例えば 96試料を調製する場合には行番号は 1〜12である)とし、 8本ユニットの何番目の位置にあるかを列番号とした 2次元デー タとする。例えば 3セット目の原点から 5番目のチューブは 3— 5と登録される(図 11 (a )参照)。
[0069] 図 11 (b)は、バーコード情報と位置情報がどのように管理されるかの例を示したも のである。自動運転の最初に、搬送ヘッドは 1ユニット(8本)ごとに試料容器をバーコ 一ドリーダー上に搬送して各容器のバーコードを読み取らせる。制御部 24はバーコ ードを読み取るごとに新しいデータ行を生成し、図 11 (b)に示すように初期位置欄と 現在位置欄に位置情報を記録する。自動運転中には試料容器は 1ユニットごとに取 り出されて処理され、試料置き場 11の元の位置に戻されるため、バーコード情報と位 置情報の関係は保持される。
[0070] 検査工程で不良試料と判定された場合には、バーコードを読み取り、該当する検査 結果欄に不合格 (偽)が記録される。不合格となった試料が入っている容器は不良試 料置き場などの所定の場所に搬送され、代わりにダミー容器が元の位置に搬送され る。制御部の現在位置欄は不良試料を搬送した位置に書き換えられる。制御部は、 初期位置欄と現在位置欄が異なる場合には、該当する初期位置欄にはダミー容器 があると認識して以降の工程を行う。

Claims

請求の範囲
[1] 複数の試料を複数の処理工程を経て処理する複数試料自動処理システムにお!/ヽ て、
複数の試料容器が置かれる試料容器置き場と、
ダミー容器が置かれるダミー容器置き場と、
容器中の試料に対して異なる処理を行う第 1の処理部及び第 2の処理部と、 容器中の試料を検査する検査部と、
容器を前記各容器置き場、処理部及び検査部の間に搬送する容器搬送部と、 制御部とを備え、
前記制御部は、前記各部を制御して、前記第 1の処理部において n個(nは 2以上 の正の整数)の容器を 1単位として処理を行い、処理後に前記検査部による検査で 不合格となった試料があるとき、当該不合格になった試料が入った容器にダミー容器 をカロえて n個一組とした容器に対して不良処理を行 ヽ、検査に合格した試料が入つ た容器にダミー容器を加えて n個一組とした容器を前記第 2の処理部で処理すること を特徴とする複数試料自動処理システム。
[2] 請求項 1記載の複数試料自動処理システムにお 、て、前記不良処理では前記 n個 一組の容器を前記第 1の処理部に戻して再処理することを特徴とする複数試料自動 処理システム。
[3] 請求項 1又は 2記載の複数試料自動処理システムにお 、て、前記容器搬送部は、 n個の容器を同時に保持する第 1の容器保持部と、 1個の容器を保持する第 2の容器 保持部を有することを特徴とする複数試料自動処理システム。
[4] 請求項 1〜3のいずれか 1項記載の複数試料自動処理システムにおいて、前記第 1 の処理部及び第 2の処理部は、前記 n個一組の容器に対して処理液を注入又は吸 引する分注手段を備えることを特徴とする複数試料自動処理システム。
[5] 請求項 4記載の複数試料自動処理システムにお 、て、前記分注手段を、前記第 1 の処理部と第 2の処理部が共用することを特徴とする複数試料自動処理システム。
[6] 請求項 5記載の複数試料自動処理システムにおいて、前記容器搬送部に前記分 注手段が設けられて ヽることを特徴とする複数試料自動処理システム。
[7] 請求項 1〜6の 、ずれか 1項記載の複数試料自動処理システムにお 、て、前記検 查部は、撮像装置を備え、個々の容器中の試料を撮像して検査することを特徴とす る複数試料自動処理システム。
[8] 複数の試料を複数の処理工程を経て処理する複数試料自動処理方法にお!ヽて、 第 1の処理部において、 n個(nは 2以上の正の整数)の容器を一組として容器内の 試料に対して処理を行う工程と、
前記第 1の処理部での処理が終わった試料に対して第 1の検査を行う工程と、 前記第 1の検査で不合格となった試料があるとき、当該不合格になった試料が入つ た容器にダミー容器を加えて n個の容器力もなる第 1の容器ユニットを形成する工程 と、
前記第 1の容器ユニットに対して不良処理を行う工程と、
前記不良処理後の試料に対して第 2の検査を行う工程と、
前記第 2の検査で合格した試料が入った容器にダミー容器を加えて n個の容器か らなる第 2の容器ユニットを形成する工程と、
前記第 1の検査に合格した試料が入った容器にダミー容器を加えて n個の容器か らなる第 3の容器ユニットを形成する工程と、
前記第 2の処理部において、前記第 2の容器ユニット内の試料及び第 3の容器ュ- ット内の試料に対して処理を行う工程と
を含むことを特徴とする複数試料自動処理方法。
[9] 請求項 8記載の複数試料自動処理方法において、前記第 1の容器ユニットには、 異なる容器の組を対象とする別々の前記第 1の検査で不合格となった容器が混在し て!、ることを特徴とする複数試料自動処理方法。
[10] 請求項 8又は 9記載の複数試料自動処理方法にお 、て、前記不良処理では、前記 第 1の容器ユニットを前記第 1の処理部に戻して処理を行うことを特徴とする複数試 料自動処理方法。
[11] 請求項 8〜 10のいずれか 1項記載の複数試料自動処理方法において、前記第 1 の処理部では、前記 n個の容器に処理液を注入して反応を行わせ、反応後に処理 液を吸引することを特徴とする複数試料自動処理方法。 請求項 8〜: L 1の 、ずれか 1項記載の複数試料自動処理方法にお!、て、前記検査 は前記容器内の試料を撮像することによって行うことを特徴とする複数試料自動処理 方法。
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