SA515360489B1 - استهداف عناصر bcl11a التنظيمية البعيدة لإعادة حث هِيمُوجلُوبِين جَنِينِيّ - Google Patents
استهداف عناصر bcl11a التنظيمية البعيدة لإعادة حث هِيمُوجلُوبِين جَنِينِيّ Download PDFInfo
- Publication number
- SA515360489B1 SA515360489B1 SA515360489A SA515360489A SA515360489B1 SA 515360489 B1 SA515360489 B1 SA 515360489B1 SA 515360489 A SA515360489 A SA 515360489A SA 515360489 A SA515360489 A SA 515360489A SA 515360489 B1 SA515360489 B1 SA 515360489B1
- Authority
- SA
- Saudi Arabia
- Prior art keywords
- cell
- cells
- dna
- expression
- chromosome
- Prior art date
Links
- 108010044495 Fetal Hemoglobin Proteins 0.000 title claims abstract description 122
- 230000008685 targeting Effects 0.000 title claims description 26
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 title description 34
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims abstract description 253
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract description 224
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims abstract description 79
- 230000001965 increasing effect Effects 0.000 claims abstract description 74
- 102100022976 B-cell lymphoma/leukemia 11A Human genes 0.000 claims abstract description 23
- 101000903703 Homo sapiens B-cell lymphoma/leukemia 11A Proteins 0.000 claims abstract description 23
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims description 540
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 claims description 198
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims description 198
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 claims description 156
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 125
- 108010042407 Endonucleases Proteins 0.000 claims description 114
- 102000004533 Endonucleases Human genes 0.000 claims description 114
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 claims description 110
- 210000003958 hematopoietic stem cell Anatomy 0.000 claims description 107
- 210000000130 stem cell Anatomy 0.000 claims description 105
- 241000282414 Homo sapiens Species 0.000 claims description 103
- 238000012239 gene modification Methods 0.000 claims description 76
- 230000005017 genetic modification Effects 0.000 claims description 74
- 235000013617 genetically modified food Nutrition 0.000 claims description 74
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims description 69
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 claims description 63
- 238000012217 deletion Methods 0.000 claims description 58
- 230000037430 deletion Effects 0.000 claims description 58
- 210000005260 human cell Anatomy 0.000 claims description 52
- 238000009472 formulation Methods 0.000 claims description 45
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 claims description 44
- 210000000481 breast Anatomy 0.000 claims description 43
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 claims description 41
- 108010054147 Hemoglobins Proteins 0.000 claims description 41
- 102000001554 Hemoglobins Human genes 0.000 claims description 40
- 239000002253 acid Substances 0.000 claims description 40
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 claims description 40
- 239000008280 blood Substances 0.000 claims description 40
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 claims description 39
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 38
- 230000004048 modification Effects 0.000 claims description 32
- 238000012986 modification Methods 0.000 claims description 32
- 206010020751 Hypersensitivity Diseases 0.000 claims description 31
- 238000013461 design Methods 0.000 claims description 31
- 230000003394 haemopoietic effect Effects 0.000 claims description 31
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 claims description 28
- 108010053770 Deoxyribonucleases Proteins 0.000 claims description 24
- 102000016911 Deoxyribonucleases Human genes 0.000 claims description 24
- 230000027455 binding Effects 0.000 claims description 24
- 230000000925 erythroid effect Effects 0.000 claims description 23
- 239000013598 vector Substances 0.000 claims description 23
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims description 20
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims description 19
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims description 19
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 claims description 18
- 238000012360 testing method Methods 0.000 claims description 15
- 230000011132 hemopoiesis Effects 0.000 claims description 13
- 210000004698 lymphocyte Anatomy 0.000 claims description 13
- 239000003814 drug Substances 0.000 claims description 12
- 229940079593 drug Drugs 0.000 claims description 10
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 claims description 10
- 210000004263 induced pluripotent stem cell Anatomy 0.000 claims description 10
- 108010008532 Deoxyribonuclease I Proteins 0.000 claims description 9
- 102000007260 Deoxyribonuclease I Human genes 0.000 claims description 9
- 210000002593 Y chromosome Anatomy 0.000 claims description 8
- 238000010459 TALEN Methods 0.000 claims description 6
- 108010043645 Transcription Activator-Like Effector Nucleases Proteins 0.000 claims description 6
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 claims description 5
- 210000004556 brain Anatomy 0.000 claims description 5
- 102100031181 Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase Human genes 0.000 claims description 4
- 108020004445 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase Proteins 0.000 claims description 4
- 230000001681 protective effect Effects 0.000 claims description 4
- 210000002784 stomach Anatomy 0.000 claims description 3
- 102100024222 B-lymphocyte antigen CD19 Human genes 0.000 claims description 2
- 101000980825 Homo sapiens B-lymphocyte antigen CD19 Proteins 0.000 claims description 2
- 238000003756 stirring Methods 0.000 claims description 2
- ABYZSYDGJGVCHS-ZETCQYMHSA-N (2s)-2-acetamido-n-(4-nitrophenyl)propanamide Chemical compound CC(=O)N[C@@H](C)C(=O)NC1=CC=C([N+]([O-])=O)C=C1 ABYZSYDGJGVCHS-ZETCQYMHSA-N 0.000 claims 2
- RZVAJINKPMORJF-UHFFFAOYSA-N Acetaminophen Chemical compound CC(=O)NC1=CC=C(O)C=C1 RZVAJINKPMORJF-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 2
- WKMPTBDYDNUJLF-UHFFFAOYSA-N 2-fluoroadenine Chemical compound NC1=NC(F)=NC2=C1N=CN2 WKMPTBDYDNUJLF-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 241000252073 Anguilliformes Species 0.000 claims 1
- 101800000407 Brain natriuretic peptide 32 Proteins 0.000 claims 1
- 101800002247 Brain natriuretic peptide 45 Proteins 0.000 claims 1
- 235000018453 Curcuma amada Nutrition 0.000 claims 1
- 241001512940 Curcuma amada Species 0.000 claims 1
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 claims 1
- 244000287680 Garcinia dulcis Species 0.000 claims 1
- 241000989913 Gunnera petaloidea Species 0.000 claims 1
- 101000684181 Homo sapiens Selenoprotein P Proteins 0.000 claims 1
- 102100034184 Macrophage scavenger receptor types I and II Human genes 0.000 claims 1
- 101710134306 Macrophage scavenger receptor types I and II Proteins 0.000 claims 1
- 240000000233 Melia azedarach Species 0.000 claims 1
- 101100380295 Mus musculus Asah1 gene Proteins 0.000 claims 1
- 101100011750 Mus musculus Hsp90b1 gene Proteins 0.000 claims 1
- 101100127662 Mus musculus Lama1 gene Proteins 0.000 claims 1
- 241000353355 Oreosoma atlanticum Species 0.000 claims 1
- 101100230499 Oryza sativa subsp. japonica HAK2 gene Proteins 0.000 claims 1
- 101100150299 Penicillium chrysogenum SREP gene Proteins 0.000 claims 1
- 241001674048 Phthiraptera Species 0.000 claims 1
- 239000004236 Ponceau SX Substances 0.000 claims 1
- 244000088401 Pyrus pyrifolia Species 0.000 claims 1
- 235000001630 Pyrus pyrifolia var culta Nutrition 0.000 claims 1
- 101150059681 RNR1 gene Proteins 0.000 claims 1
- 101150033538 Rala gene Proteins 0.000 claims 1
- 235000014548 Rubus moluccanus Nutrition 0.000 claims 1
- 240000005499 Sasa Species 0.000 claims 1
- 102100023843 Selenoprotein P Human genes 0.000 claims 1
- 235000013405 beer Nutrition 0.000 claims 1
- OSOCQWFTTAPWEK-BYPYZUCNSA-N beta-Ala-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)CCN OSOCQWFTTAPWEK-BYPYZUCNSA-N 0.000 claims 1
- 239000003245 coal Substances 0.000 claims 1
- MCWXGJITAZMZEV-UHFFFAOYSA-N dimethoate Chemical compound CNC(=O)CSP(=S)(OC)OC MCWXGJITAZMZEV-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- LNEPOXFFQSENCJ-UHFFFAOYSA-N haloperidol Chemical compound C1CC(O)(C=2C=CC(Cl)=CC=2)CCN1CCCC(=O)C1=CC=C(F)C=C1 LNEPOXFFQSENCJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 150000002500 ions Chemical class 0.000 claims 1
- 230000001926 lymphatic effect Effects 0.000 claims 1
- HYIMSNHJOBLJNT-UHFFFAOYSA-N nifedipine Chemical compound COC(=O)C1=C(C)NC(C)=C(C(=O)OC)C1C1=CC=CC=C1[N+]([O-])=O HYIMSNHJOBLJNT-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 230000032696 parturition Effects 0.000 claims 1
- 229940119265 sepp Drugs 0.000 claims 1
- 239000002689 soil Substances 0.000 claims 1
- 101150117196 tra-1 gene Proteins 0.000 claims 1
- 208000034737 hemoglobinopathy Diseases 0.000 abstract description 71
- 238000011282 treatment Methods 0.000 abstract description 52
- 208000018337 inherited hemoglobinopathy Diseases 0.000 abstract description 21
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 70
- 210000003743 erythrocyte Anatomy 0.000 description 66
- 239000003623 enhancer Substances 0.000 description 55
- 230000004049 epigenetic modification Effects 0.000 description 55
- 108060003196 globin Proteins 0.000 description 55
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 54
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 43
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 43
- 102000018146 globin Human genes 0.000 description 43
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 38
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 38
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 37
- 108700028369 Alleles Proteins 0.000 description 33
- 230000001605 fetal effect Effects 0.000 description 30
- 210000001082 somatic cell Anatomy 0.000 description 30
- 208000035475 disorder Diseases 0.000 description 27
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 26
- 108010077544 Chromatin Proteins 0.000 description 25
- 210000003483 chromatin Anatomy 0.000 description 25
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 25
- 230000008672 reprogramming Effects 0.000 description 25
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 24
- 102000054766 genetic haplotypes Human genes 0.000 description 24
- 230000002950 deficient Effects 0.000 description 23
- 239000002243 precursor Substances 0.000 description 23
- 108091023040 Transcription factor Proteins 0.000 description 22
- 102000040945 Transcription factor Human genes 0.000 description 22
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 22
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 22
- -1 alpha proteins ol Proteins 0.000 description 19
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 18
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 18
- 230000006870 function Effects 0.000 description 18
- 208000007056 sickle cell anemia Diseases 0.000 description 17
- 208000007502 anemia Diseases 0.000 description 16
- 230000004069 differentiation Effects 0.000 description 16
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 16
- 101150066555 lacZ gene Proteins 0.000 description 16
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 16
- 238000011161 development Methods 0.000 description 15
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 15
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 15
- 101710163270 Nuclease Proteins 0.000 description 14
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 14
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 14
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 14
- 108010033040 Histones Proteins 0.000 description 13
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N acetic acid Substances CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 13
- 235000002639 sodium chloride Nutrition 0.000 description 13
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 12
- 238000010362 genome editing Methods 0.000 description 12
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 12
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 12
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 12
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 12
- 230000008569 process Effects 0.000 description 12
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 12
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 12
- 238000002512 chemotherapy Methods 0.000 description 11
- 230000000913 erythropoietic effect Effects 0.000 description 11
- 210000003924 normoblast Anatomy 0.000 description 11
- 239000000047 product Substances 0.000 description 11
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 11
- 241000894007 species Species 0.000 description 11
- 230000009261 transgenic effect Effects 0.000 description 11
- 238000011529 RT qPCR Methods 0.000 description 10
- 208000026935 allergic disease Diseases 0.000 description 10
- 230000001973 epigenetic effect Effects 0.000 description 10
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 10
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 10
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 9
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 9
- 239000000839 emulsion Substances 0.000 description 9
- 230000001771 impaired effect Effects 0.000 description 9
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 9
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 9
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 9
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 9
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 9
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 9
- FERIUCNNQQJTOY-UHFFFAOYSA-N Butyric acid Natural products CCCC(O)=O FERIUCNNQQJTOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 239000004480 active ingredient Substances 0.000 description 8
- 238000002487 chromatin immunoprecipitation Methods 0.000 description 8
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 description 8
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 8
- 238000003205 genotyping method Methods 0.000 description 8
- 230000009610 hypersensitivity Effects 0.000 description 8
- 239000011734 sodium Substances 0.000 description 8
- 125000006850 spacer group Chemical group 0.000 description 8
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M Ilexoside XXIX Chemical compound C[C@@H]1CC[C@@]2(CC[C@@]3(C(=CC[C@H]4[C@]3(CC[C@@H]5[C@@]4(CC[C@@H](C5(C)C)OS(=O)(=O)[O-])C)C)[C@@H]2[C@]1(C)O)C)C(=O)O[C@H]6[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O6)CO)O)O)O.[Na+] DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M 0.000 description 7
- HCHKCACWOHOZIP-UHFFFAOYSA-N Zinc Chemical compound [Zn] HCHKCACWOHOZIP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 108010017070 Zinc Finger Nucleases Proteins 0.000 description 7
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 7
- 230000001364 causal effect Effects 0.000 description 7
- 230000008859 change Effects 0.000 description 7
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 7
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 7
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 7
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 7
- 239000012071 phase Substances 0.000 description 7
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 7
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 7
- 229910052708 sodium Inorganic materials 0.000 description 7
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 7
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 7
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 7
- 210000001325 yolk sac Anatomy 0.000 description 7
- 229910052725 zinc Inorganic materials 0.000 description 7
- 239000011701 zinc Substances 0.000 description 7
- YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N (+)-Biotin Chemical compound N1C(=O)N[C@@H]2[C@H](CCCCC(=O)O)SC[C@@H]21 YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 6
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 6
- 239000000592 Artificial Cell Substances 0.000 description 6
- 102100021519 Hemoglobin subunit beta Human genes 0.000 description 6
- 108091005904 Hemoglobin subunit beta Proteins 0.000 description 6
- 208000002903 Thalassemia Diseases 0.000 description 6
- 230000002159 abnormal effect Effects 0.000 description 6
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 6
- 239000000969 carrier Substances 0.000 description 6
- 230000007547 defect Effects 0.000 description 6
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 6
- 239000003937 drug carrier Substances 0.000 description 6
- 210000002257 embryonic structure Anatomy 0.000 description 6
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 6
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 description 6
- VLKZOEOYAKHREP-UHFFFAOYSA-N n-Hexane Chemical compound CCCCCC VLKZOEOYAKHREP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 6
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 6
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 6
- 238000003762 quantitative reverse transcription PCR Methods 0.000 description 6
- 238000001959 radiotherapy Methods 0.000 description 6
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 6
- 238000002054 transplantation Methods 0.000 description 6
- OPIFSICVWOWJMJ-AEOCFKNESA-N 5-bromo-4-chloro-3-indolyl beta-D-galactoside Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1OC1=CNC2=CC=C(Br)C(Cl)=C12 OPIFSICVWOWJMJ-AEOCFKNESA-N 0.000 description 5
- 241000282693 Cercopithecidae Species 0.000 description 5
- 108010044091 Globulins Proteins 0.000 description 5
- 102000006395 Globulins Human genes 0.000 description 5
- 102100031573 Hematopoietic progenitor cell antigen CD34 Human genes 0.000 description 5
- 102000006947 Histones Human genes 0.000 description 5
- 101000777663 Homo sapiens Hematopoietic progenitor cell antigen CD34 Proteins 0.000 description 5
- 101001012669 Homo sapiens Melanoma inhibitory activity protein 2 Proteins 0.000 description 5
- XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N Iron Chemical compound [Fe] XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 102100029778 Melanoma inhibitory activity protein 2 Human genes 0.000 description 5
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 5
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 5
- 101100247004 Rattus norvegicus Qsox1 gene Proteins 0.000 description 5
- 229960002756 azacitidine Drugs 0.000 description 5
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 5
- 210000001185 bone marrow Anatomy 0.000 description 5
- 239000013078 crystal Substances 0.000 description 5
- 230000011559 double-strand break repair via nonhomologous end joining Effects 0.000 description 5
- 230000010437 erythropoiesis Effects 0.000 description 5
- 238000012423 maintenance Methods 0.000 description 5
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 5
- 230000011987 methylation Effects 0.000 description 5
- 238000007069 methylation reaction Methods 0.000 description 5
- 210000004681 ovum Anatomy 0.000 description 5
- 230000036961 partial effect Effects 0.000 description 5
- 210000005259 peripheral blood Anatomy 0.000 description 5
- 239000011886 peripheral blood Substances 0.000 description 5
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 5
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 5
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- FERIUCNNQQJTOY-UHFFFAOYSA-M Butyrate Chemical compound CCCC([O-])=O FERIUCNNQQJTOY-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 4
- 241000070928 Calligonum comosum Species 0.000 description 4
- 208000031637 Erythroblastic Acute Leukemia Diseases 0.000 description 4
- 208000036566 Erythroleukaemia Diseases 0.000 description 4
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 4
- 206010018910 Haemolysis Diseases 0.000 description 4
- 108091005886 Hemoglobin subunit gamma Proteins 0.000 description 4
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 4
- 108010073062 Transcription Activator-Like Effectors Proteins 0.000 description 4
- 208000021841 acute erythroid leukemia Diseases 0.000 description 4
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 4
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 4
- WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N beta-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N 0.000 description 4
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 4
- 230000007423 decrease Effects 0.000 description 4
- NIJJYAXOARWZEE-UHFFFAOYSA-N di-n-propyl-acetic acid Natural products CCCC(C(O)=O)CCC NIJJYAXOARWZEE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 210000000267 erythroid cell Anatomy 0.000 description 4
- 238000000684 flow cytometry Methods 0.000 description 4
- 210000004602 germ cell Anatomy 0.000 description 4
- 230000008588 hemolysis Effects 0.000 description 4
- 235000014304 histidine Nutrition 0.000 description 4
- 238000011065 in-situ storage Methods 0.000 description 4
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 4
- 150000002484 inorganic compounds Chemical class 0.000 description 4
- 229910010272 inorganic material Inorganic materials 0.000 description 4
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 4
- 230000007774 longterm Effects 0.000 description 4
- 230000009456 molecular mechanism Effects 0.000 description 4
- 210000003205 muscle Anatomy 0.000 description 4
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 4
- 150000002894 organic compounds Chemical class 0.000 description 4
- 210000003819 peripheral blood mononuclear cell Anatomy 0.000 description 4
- RXWNCPJZOCPEPQ-NVWDDTSBSA-N puromycin Chemical compound C1=CC(OC)=CC=C1C[C@H](N)C(=O)N[C@H]1[C@@H](O)[C@H](N2C3=NC=NC(=C3N=C2)N(C)C)O[C@@H]1CO RXWNCPJZOCPEPQ-NVWDDTSBSA-N 0.000 description 4
- 102210007272 rs1427407 Human genes 0.000 description 4
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 4
- 210000003491 skin Anatomy 0.000 description 4
- 230000003393 splenic effect Effects 0.000 description 4
- 230000007704 transition Effects 0.000 description 4
- GETQZCLCWQTVFV-UHFFFAOYSA-N trimethylamine Chemical compound CN(C)C GETQZCLCWQTVFV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- MSRILKIQRXUYCT-UHFFFAOYSA-M valproate semisodium Chemical compound [Na+].CCCC(C(O)=O)CCC.CCCC(C([O-])=O)CCC MSRILKIQRXUYCT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 4
- 229960000604 valproic acid Drugs 0.000 description 4
- NEAQRZUHTPSBBM-UHFFFAOYSA-N 2-hydroxy-3,3-dimethyl-7-nitro-4h-isoquinolin-1-one Chemical compound C1=C([N+]([O-])=O)C=C2C(=O)N(O)C(C)(C)CC2=C1 NEAQRZUHTPSBBM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- NMUSYJAQQFHJEW-KVTDHHQDSA-N 5-azacytidine Chemical compound O=C1N=C(N)N=CN1[C@H]1[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 NMUSYJAQQFHJEW-KVTDHHQDSA-N 0.000 description 3
- QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-O Ammonium Chemical compound [NH4+] QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-O 0.000 description 3
- 108091033409 CRISPR Proteins 0.000 description 3
- 238000010354 CRISPR gene editing Methods 0.000 description 3
- 108090000626 DNA-directed RNA polymerases Proteins 0.000 description 3
- 102000004163 DNA-directed RNA polymerases Human genes 0.000 description 3
- 241000283086 Equidae Species 0.000 description 3
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- WSFSSNUMVMOOMR-UHFFFAOYSA-N Formaldehyde Chemical compound O=C WSFSSNUMVMOOMR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 102100024165 G1/S-specific cyclin-D1 Human genes 0.000 description 3
- 108700028146 Genetic Enhancer Elements Proteins 0.000 description 3
- 102000003964 Histone deacetylase Human genes 0.000 description 3
- 108090000353 Histone deacetylase Proteins 0.000 description 3
- 101000980898 Homo sapiens Cell division cycle-associated protein 4 Proteins 0.000 description 3
- 101000980756 Homo sapiens G1/S-specific cyclin-D1 Proteins 0.000 description 3
- CSNNHWWHGAXBCP-UHFFFAOYSA-L Magnesium sulfate Chemical compound [Mg+2].[O-][S+2]([O-])([O-])[O-] CSNNHWWHGAXBCP-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 3
- 241000699660 Mus musculus Species 0.000 description 3
- 102100038895 Myc proto-oncogene protein Human genes 0.000 description 3
- 101710135898 Myc proto-oncogene protein Proteins 0.000 description 3
- ZLMJMSJWJFRBEC-UHFFFAOYSA-N Potassium Chemical compound [K] ZLMJMSJWJFRBEC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- WCUXLLCKKVVCTQ-UHFFFAOYSA-M Potassium chloride Chemical class [Cl-].[K+] WCUXLLCKKVVCTQ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- 241000700159 Rattus Species 0.000 description 3
- 101710150448 Transcriptional regulator Myc Proteins 0.000 description 3
- 230000005856 abnormality Effects 0.000 description 3
- 230000004075 alteration Effects 0.000 description 3
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 3
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 3
- QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N atomic oxygen Chemical compound [O] QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 230000009286 beneficial effect Effects 0.000 description 3
- 239000011230 binding agent Substances 0.000 description 3
- 229960002685 biotin Drugs 0.000 description 3
- 235000020958 biotin Nutrition 0.000 description 3
- 239000011616 biotin Substances 0.000 description 3
- 210000000601 blood cell Anatomy 0.000 description 3
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 3
- 239000007853 buffer solution Substances 0.000 description 3
- GYKLFBYWXZYSOW-UHFFFAOYSA-N butanoyloxymethyl 2,2-dimethylpropanoate Chemical compound CCCC(=O)OCOC(=O)C(C)(C)C GYKLFBYWXZYSOW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 230000003197 catalytic effect Effects 0.000 description 3
- 230000003833 cell viability Effects 0.000 description 3
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 3
- 230000003750 conditioning effect Effects 0.000 description 3
- 238000004132 cross linking Methods 0.000 description 3
- 238000005520 cutting process Methods 0.000 description 3
- 230000006735 deficit Effects 0.000 description 3
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 3
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 3
- 239000008121 dextrose Substances 0.000 description 3
- 230000005782 double-strand break Effects 0.000 description 3
- 239000012636 effector Substances 0.000 description 3
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 3
- 230000002708 enhancing effect Effects 0.000 description 3
- 210000001654 germ layer Anatomy 0.000 description 3
- 235000011187 glycerol Nutrition 0.000 description 3
- 208000020451 hereditary persistence of fetal hemoglobin Diseases 0.000 description 3
- HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N histidine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 230000013632 homeostatic process Effects 0.000 description 3
- 102000044493 human CDCA4 Human genes 0.000 description 3
- 238000003119 immunoblot Methods 0.000 description 3
- 238000010348 incorporation Methods 0.000 description 3
- 238000001802 infusion Methods 0.000 description 3
- 230000003426 interchromosomal effect Effects 0.000 description 3
- 238000001990 intravenous administration Methods 0.000 description 3
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 3
- 210000001161 mammalian embryo Anatomy 0.000 description 3
- 239000000463 material Substances 0.000 description 3
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 3
- 239000003921 oil Substances 0.000 description 3
- 235000019198 oils Nutrition 0.000 description 3
- 229910052760 oxygen Inorganic materials 0.000 description 3
- 239000001301 oxygen Substances 0.000 description 3
- 239000000546 pharmaceutical excipient Substances 0.000 description 3
- 210000001778 pluripotent stem cell Anatomy 0.000 description 3
- 102000054765 polymorphisms of proteins Human genes 0.000 description 3
- 229910052700 potassium Inorganic materials 0.000 description 3
- 239000011591 potassium Substances 0.000 description 3
- 235000011164 potassium chloride Nutrition 0.000 description 3
- 230000035935 pregnancy Effects 0.000 description 3
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 3
- 230000002265 prevention Effects 0.000 description 3
- 230000008439 repair process Effects 0.000 description 3
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 3
- OHRURASPPZQGQM-GCCNXGTGSA-N romidepsin Chemical compound O1C(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)C(=C/C)/NC(=O)[C@H]2CSSCC\C=C\[C@@H]1CC(=O)N[C@H](C(C)C)C(=O)N2 OHRURASPPZQGQM-GCCNXGTGSA-N 0.000 description 3
- 102210059946 rs7606173 Human genes 0.000 description 3
- 238000007480 sanger sequencing Methods 0.000 description 3
- 150000004666 short chain fatty acids Chemical class 0.000 description 3
- 150000003384 small molecules Chemical class 0.000 description 3
- 210000000952 spleen Anatomy 0.000 description 3
- 229960005322 streptomycin Drugs 0.000 description 3
- 230000009885 systemic effect Effects 0.000 description 3
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 description 3
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 3
- 238000011830 transgenic mouse model Methods 0.000 description 3
- RTKIYFITIVXBLE-QEQCGCAPSA-N trichostatin A Chemical compound ONC(=O)/C=C/C(/C)=C/[C@@H](C)C(=O)C1=CC=C(N(C)C)C=C1 RTKIYFITIVXBLE-QEQCGCAPSA-N 0.000 description 3
- QRPSQQUYPMFERG-LFYBBSHMSA-N (e)-5-[3-(benzenesulfonamido)phenyl]-n-hydroxypent-2-en-4-ynamide Chemical compound ONC(=O)\C=C\C#CC1=CC=CC(NS(=O)(=O)C=2C=CC=CC=2)=C1 QRPSQQUYPMFERG-LFYBBSHMSA-N 0.000 description 2
- XGIKILRODBEJIL-UHFFFAOYSA-N 1-(ethylamino)ethanol Chemical compound CCNC(C)O XGIKILRODBEJIL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101150101112 7 gene Proteins 0.000 description 2
- 108010044267 Abnormal Hemoglobins Proteins 0.000 description 2
- 102000007469 Actins Human genes 0.000 description 2
- 108010085238 Actins Proteins 0.000 description 2
- 102000002260 Alkaline Phosphatase Human genes 0.000 description 2
- 108020004774 Alkaline Phosphatase Proteins 0.000 description 2
- 108091093088 Amplicon Proteins 0.000 description 2
- 206010002383 Angina Pectoris Diseases 0.000 description 2
- 108020000948 Antisense Oligonucleotides Proteins 0.000 description 2
- CIWBSHSKHKDKBQ-JLAZNSOCSA-N Ascorbic acid Chemical compound OC[C@H](O)[C@H]1OC(=O)C(O)=C1O CIWBSHSKHKDKBQ-JLAZNSOCSA-N 0.000 description 2
- 101100257372 Caenorhabditis elegans sox-3 gene Proteins 0.000 description 2
- OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N Calcium Chemical compound [Ca] OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 208000005623 Carcinogenesis Diseases 0.000 description 2
- 206010061764 Chromosomal deletion Diseases 0.000 description 2
- 206010011224 Cough Diseases 0.000 description 2
- UHDGCWIWMRVCDJ-CCXZUQQUSA-N Cytarabine Chemical compound O=C1N=C(N)C=CN1[C@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 UHDGCWIWMRVCDJ-CCXZUQQUSA-N 0.000 description 2
- 230000004568 DNA-binding Effects 0.000 description 2
- 101100447432 Danio rerio gapdh-2 gene Proteins 0.000 description 2
- 206010011878 Deafness Diseases 0.000 description 2
- 241000702421 Dependoparvovirus Species 0.000 description 2
- DLVJMFOLJOOWFS-UHFFFAOYSA-N Depudecin Natural products CC(O)C1OC1C=CC1C(C(O)C=C)O1 DLVJMFOLJOOWFS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101100234002 Drosophila melanogaster Shal gene Proteins 0.000 description 2
- 208000000059 Dyspnea Diseases 0.000 description 2
- 206010013975 Dyspnoeas Diseases 0.000 description 2
- 108091092584 GDNA Proteins 0.000 description 2
- 101150112014 Gapdh gene Proteins 0.000 description 2
- 102100038617 Hemoglobin subunit gamma-2 Human genes 0.000 description 2
- 206010019842 Hepatomegaly Diseases 0.000 description 2
- 101000984042 Homo sapiens Protein lin-28 homolog A Proteins 0.000 description 2
- VSNHCAURESNICA-UHFFFAOYSA-N Hydroxyurea Chemical compound NC(=O)NO VSNHCAURESNICA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101710128836 Large T antigen Proteins 0.000 description 2
- 241000713666 Lentivirus Species 0.000 description 2
- 101000926167 Lumbricus terrestris Extracellular globin-2 Proteins 0.000 description 2
- 206010025323 Lymphomas Diseases 0.000 description 2
- 101100257376 Mus musculus Sox3 gene Proteins 0.000 description 2
- 101100369076 Mus musculus Tdgf1 gene Proteins 0.000 description 2
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 2
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 2
- 208000002193 Pain Diseases 0.000 description 2
- 240000002390 Pandanus odoratissimus Species 0.000 description 2
- 235000005311 Pandanus odoratissimus Nutrition 0.000 description 2
- 241001494479 Pecora Species 0.000 description 2
- 239000004698 Polyethylene Substances 0.000 description 2
- 239000002202 Polyethylene glycol Substances 0.000 description 2
- 102100025460 Protein lin-28 homolog A Human genes 0.000 description 2
- 108091030071 RNAI Proteins 0.000 description 2
- 206010040047 Sepsis Diseases 0.000 description 2
- 244000166071 Shorea robusta Species 0.000 description 2
- 235000015076 Shorea robusta Nutrition 0.000 description 2
- 108020004682 Single-Stranded DNA Proteins 0.000 description 2
- 108020004459 Small interfering RNA Proteins 0.000 description 2
- 206010041660 Splenomegaly Diseases 0.000 description 2
- 108010090804 Streptavidin Proteins 0.000 description 2
- 208000006011 Stroke Diseases 0.000 description 2
- 241000282887 Suidae Species 0.000 description 2
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 description 2
- RTKIYFITIVXBLE-UHFFFAOYSA-N Trichostatin A Natural products ONC(=O)C=CC(C)=CC(C)C(=O)C1=CC=C(N(C)C)C=C1 RTKIYFITIVXBLE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 2
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 description 2
- 239000012190 activator Substances 0.000 description 2
- 230000002411 adverse Effects 0.000 description 2
- 230000000735 allogeneic effect Effects 0.000 description 2
- 150000001412 amines Chemical class 0.000 description 2
- 125000003277 amino group Chemical group 0.000 description 2
- 235000011114 ammonium hydroxide Nutrition 0.000 description 2
- 239000000074 antisense oligonucleotide Substances 0.000 description 2
- 238000012230 antisense oligonucleotides Methods 0.000 description 2
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 2
- 239000008365 aqueous carrier Substances 0.000 description 2
- 239000007864 aqueous solution Substances 0.000 description 2
- 210000004436 artificial bacterial chromosome Anatomy 0.000 description 2
- 238000001574 biopsy Methods 0.000 description 2
- 230000017531 blood circulation Effects 0.000 description 2
- 210000000988 bone and bone Anatomy 0.000 description 2
- 210000002798 bone marrow cell Anatomy 0.000 description 2
- 239000011575 calcium Substances 0.000 description 2
- 229910052791 calcium Inorganic materials 0.000 description 2
- 230000036952 cancer formation Effects 0.000 description 2
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 description 2
- 231100000504 carcinogenesis Toxicity 0.000 description 2
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 2
- 230000024245 cell differentiation Effects 0.000 description 2
- 210000003169 central nervous system Anatomy 0.000 description 2
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 2
- 239000013043 chemical agent Substances 0.000 description 2
- 230000000052 comparative effect Effects 0.000 description 2
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 2
- 230000000875 corresponding effect Effects 0.000 description 2
- 239000002385 cottonseed oil Substances 0.000 description 2
- 235000012343 cottonseed oil Nutrition 0.000 description 2
- 238000005138 cryopreservation Methods 0.000 description 2
- 230000006378 damage Effects 0.000 description 2
- 230000007812 deficiency Effects 0.000 description 2
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 2
- DLVJMFOLJOOWFS-INMLLLKOSA-N depudecin Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H]1O[C@H]1\C=C\[C@H]1[C@H]([C@H](O)C=C)O1 DLVJMFOLJOOWFS-INMLLLKOSA-N 0.000 description 2
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 2
- 239000003085 diluting agent Substances 0.000 description 2
- LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I dipotassium trisodium dihydrogen phosphate hydrogen phosphate dichloride Chemical compound P(=O)(O)(O)[O-].[K+].P(=O)(O)([O-])[O-].[Na+].[Na+].[Cl-].[K+].[Cl-].[Na+] LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I 0.000 description 2
- 210000002308 embryonic cell Anatomy 0.000 description 2
- 239000003995 emulsifying agent Substances 0.000 description 2
- 230000002124 endocrine Effects 0.000 description 2
- 210000004700 fetal blood Anatomy 0.000 description 2
- 210000003754 fetus Anatomy 0.000 description 2
- 230000004992 fission Effects 0.000 description 2
- 230000009368 gene silencing by RNA Effects 0.000 description 2
- 239000003102 growth factor Substances 0.000 description 2
- 210000003780 hair follicle Anatomy 0.000 description 2
- 201000001505 hemoglobinuria Diseases 0.000 description 2
- 108010051779 histone H3 trimethyl Lys4 Proteins 0.000 description 2
- 239000000710 homodimer Substances 0.000 description 2
- 229960001330 hydroxycarbamide Drugs 0.000 description 2
- 238000010191 image analysis Methods 0.000 description 2
- 238000007373 indentation Methods 0.000 description 2
- 239000004615 ingredient Substances 0.000 description 2
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 2
- 230000000977 initiatory effect Effects 0.000 description 2
- 150000007529 inorganic bases Chemical class 0.000 description 2
- 238000009434 installation Methods 0.000 description 2
- 230000002452 interceptive effect Effects 0.000 description 2
- 238000001361 intraarterial administration Methods 0.000 description 2
- 229910052742 iron Inorganic materials 0.000 description 2
- 210000004153 islets of langerhan Anatomy 0.000 description 2
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 2
- JJWLVOIRVHMVIS-UHFFFAOYSA-N isopropylamine Chemical compound CC(C)N JJWLVOIRVHMVIS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-N lactic acid Chemical compound CC(O)C(O)=O JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 208000032839 leukemia Diseases 0.000 description 2
- 239000007791 liquid phase Substances 0.000 description 2
- 210000004072 lung Anatomy 0.000 description 2
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 2
- 229910052751 metal Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000002184 metal Substances 0.000 description 2
- 239000011325 microbead Substances 0.000 description 2
- 150000007522 mineralic acids Chemical class 0.000 description 2
- 239000003607 modifier Substances 0.000 description 2
- 210000000663 muscle cell Anatomy 0.000 description 2
- 210000000066 myeloid cell Anatomy 0.000 description 2
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 2
- 150000007524 organic acids Chemical class 0.000 description 2
- 235000005985 organic acids Nutrition 0.000 description 2
- 150000007530 organic bases Chemical class 0.000 description 2
- 230000002018 overexpression Effects 0.000 description 2
- 230000002093 peripheral effect Effects 0.000 description 2
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 description 2
- 125000001997 phenyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(*)C([H])=C1[H] 0.000 description 2
- 239000002953 phosphate buffered saline Substances 0.000 description 2
- 239000002504 physiological saline solution Substances 0.000 description 2
- 210000002826 placenta Anatomy 0.000 description 2
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 2
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 description 2
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 description 2
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 description 2
- 201000011264 priapism Diseases 0.000 description 2
- MFDFERRIHVXMIY-UHFFFAOYSA-N procaine Chemical compound CCN(CC)CCOC(=O)C1=CC=C(N)C=C1 MFDFERRIHVXMIY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229960004919 procaine Drugs 0.000 description 2
- 229950010131 puromycin Drugs 0.000 description 2
- 238000011002 quantification Methods 0.000 description 2
- 230000005855 radiation Effects 0.000 description 2
- 230000006798 recombination Effects 0.000 description 2
- 230000001850 reproductive effect Effects 0.000 description 2
- 238000011160 research Methods 0.000 description 2
- 230000000717 retained effect Effects 0.000 description 2
- 210000001995 reticulocyte Anatomy 0.000 description 2
- 108010091666 romidepsin Proteins 0.000 description 2
- 229960003452 romidepsin Drugs 0.000 description 2
- 102210024377 rs766432 Human genes 0.000 description 2
- 235000021391 short chain fatty acids Nutrition 0.000 description 2
- 210000002027 skeletal muscle Anatomy 0.000 description 2
- 239000001488 sodium phosphate Substances 0.000 description 2
- 229910000162 sodium phosphate Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 2
- 230000000392 somatic effect Effects 0.000 description 2
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 2
- 230000001629 suppression Effects 0.000 description 2
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 2
- 238000004448 titration Methods 0.000 description 2
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 2
- 230000001052 transient effect Effects 0.000 description 2
- RYFMWSXOAZQYPI-UHFFFAOYSA-K trisodium phosphate Chemical compound [Na+].[Na+].[Na+].[O-]P([O-])([O-])=O RYFMWSXOAZQYPI-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 2
- 210000004291 uterus Anatomy 0.000 description 2
- 235000015112 vegetable and seed oil Nutrition 0.000 description 2
- 239000008158 vegetable oil Substances 0.000 description 2
- 239000013603 viral vector Substances 0.000 description 2
- 229960000237 vorinostat Drugs 0.000 description 2
- WAEXFXRVDQXREF-UHFFFAOYSA-N vorinostat Chemical compound ONC(=O)CCCCCCC(=O)NC1=CC=CC=C1 WAEXFXRVDQXREF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- QBYIENPQHBMVBV-HFEGYEGKSA-N (2R)-2-hydroxy-2-phenylacetic acid Chemical compound O[C@@H](C(O)=O)c1ccccc1.O[C@@H](C(O)=O)c1ccccc1 QBYIENPQHBMVBV-HFEGYEGKSA-N 0.000 description 1
- WCAWZARVUUEHRX-FRKDHNBESA-N (2e,4e,6r)-7-[4-(dimethylamino)phenyl]-n-hydroxy-6-methyl-7-oxohepta-2,4-dienamide Chemical compound ONC(=O)/C=C/C=C/[C@@H](C)C(=O)C1=CC=C(N(C)C)C=C1 WCAWZARVUUEHRX-FRKDHNBESA-N 0.000 description 1
- LAQPKDLYOBZWBT-NYLDSJSYSA-N (2s,4s,5r,6r)-5-acetamido-2-{[(2s,3r,4s,5s,6r)-2-{[(2r,3r,4r,5r)-5-acetamido-1,2-dihydroxy-6-oxo-4-{[(2s,3s,4r,5s,6s)-3,4,5-trihydroxy-6-methyloxan-2-yl]oxy}hexan-3-yl]oxy}-3,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-4-yl]oxy}-4-hydroxy-6-[(1r,2r)-1,2,3-trihydrox Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@H](O)[C@H](C)O[C@H]1O[C@H]([C@@H](NC(C)=O)C=O)[C@@H]([C@H](O)CO)O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@]2(O[C@H]([C@H](NC(C)=O)[C@@H](O)C2)[C@H](O)[C@H](O)CO)C(O)=O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O1 LAQPKDLYOBZWBT-NYLDSJSYSA-N 0.000 description 1
- GNYCTMYOHGBSBI-SVZOTFJBSA-N (3s,6r,9s,12r)-6,9-dimethyl-3-[6-[(2s)-oxiran-2-yl]-6-oxohexyl]-1,4,7,10-tetrazabicyclo[10.3.0]pentadecane-2,5,8,11-tetrone Chemical compound C([C@H]1C(=O)N2CCC[C@@H]2C(=O)N[C@H](C(N[C@H](C)C(=O)N1)=O)C)CCCCC(=O)[C@@H]1CO1 GNYCTMYOHGBSBI-SVZOTFJBSA-N 0.000 description 1
- UEJJHQNACJXSKW-UHFFFAOYSA-N 2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)-1H-isoindole-1,3(2H)-dione Chemical compound O=C1C2=CC=CC=C2C(=O)N1C1CCC(=O)NC1=O UEJJHQNACJXSKW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- JKMHFZQWWAIEOD-UHFFFAOYSA-N 2-[4-(2-hydroxyethyl)piperazin-1-yl]ethanesulfonic acid Chemical compound OCC[NH+]1CCN(CCS([O-])(=O)=O)CC1 JKMHFZQWWAIEOD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GBPSCCPAXYTNMB-UHFFFAOYSA-N 4-(1,3-dioxo-2-benzo[de]isoquinolinyl)-N-hydroxybutanamide Chemical compound C1=CC(C(N(CCCC(=O)NO)C2=O)=O)=C3C2=CC=CC3=C1 GBPSCCPAXYTNMB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- YXHLJMWYDTXDHS-IRFLANFNSA-N 7-aminoactinomycin D Chemical compound C[C@H]1OC(=O)[C@H](C(C)C)N(C)C(=O)CN(C)C(=O)[C@@H]2CCCN2C(=O)[C@@H](C(C)C)NC(=O)[C@H]1NC(=O)C1=C(N)C(=O)C(C)=C2OC(C(C)=C(N)C=C3C(=O)N[C@@H]4C(=O)N[C@@H](C(N5CCC[C@H]5C(=O)N(C)CC(=O)N(C)[C@@H](C(C)C)C(=O)O[C@@H]4C)=O)C(C)C)=C3N=C21 YXHLJMWYDTXDHS-IRFLANFNSA-N 0.000 description 1
- 108700012813 7-aminoactinomycin D Proteins 0.000 description 1
- 101150044182 8 gene Proteins 0.000 description 1
- 229920000936 Agarose Polymers 0.000 description 1
- 241001136792 Alle Species 0.000 description 1
- 241000272517 Anseriformes Species 0.000 description 1
- 241001550224 Apha Species 0.000 description 1
- 108091023037 Aptamer Proteins 0.000 description 1
- DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N Asparagine Natural products OC(=O)C(N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000016605 B-Cell Activating Factor Human genes 0.000 description 1
- 108010028006 B-Cell Activating Factor Proteins 0.000 description 1
- 229940122146 Bcl11A inhibitor Drugs 0.000 description 1
- 241000283690 Bos taurus Species 0.000 description 1
- 210000001266 CD8-positive T-lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 102000000905 Cadherin Human genes 0.000 description 1
- 108050007957 Cadherin Proteins 0.000 description 1
- 241000282421 Canidae Species 0.000 description 1
- 241000282465 Canis Species 0.000 description 1
- 241000282472 Canis lupus familiaris Species 0.000 description 1
- 108010078791 Carrier Proteins Proteins 0.000 description 1
- 241000700198 Cavia Species 0.000 description 1
- 238000001353 Chip-sequencing Methods 0.000 description 1
- 208000015943 Coeliac disease Diseases 0.000 description 1
- 241000699800 Cricetinae Species 0.000 description 1
- 244000124209 Crocus sativus Species 0.000 description 1
- 108090000695 Cytokines Proteins 0.000 description 1
- 102000004127 Cytokines Human genes 0.000 description 1
- ZZZCUOFIHGPKAK-UHFFFAOYSA-N D-erythro-ascorbic acid Natural products OCC1OC(=O)C(O)=C1O ZZZCUOFIHGPKAK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102100024812 DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A Human genes 0.000 description 1
- 108050002829 DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A Proteins 0.000 description 1
- 102100024810 DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B Human genes 0.000 description 1
- 101710123222 DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B Proteins 0.000 description 1
- 102000004214 DNA polymerase A Human genes 0.000 description 1
- 108090000725 DNA polymerase A Proteins 0.000 description 1
- 230000007018 DNA scission Effects 0.000 description 1
- 231100001074 DNA strand break Toxicity 0.000 description 1
- 102100031149 Deoxyribonuclease gamma Human genes 0.000 description 1
- 108010002156 Depsipeptides Proteins 0.000 description 1
- 102100036949 Developmental pluripotency-associated protein 2 Human genes 0.000 description 1
- FEWJPZIEWOKRBE-JCYAYHJZSA-N Dextrotartaric acid Chemical compound OC(=O)[C@H](O)[C@@H](O)C(O)=O FEWJPZIEWOKRBE-JCYAYHJZSA-N 0.000 description 1
- 206010061818 Disease progression Diseases 0.000 description 1
- 206010013457 Dissociation Diseases 0.000 description 1
- 108700003861 Dominant Genes Proteins 0.000 description 1
- 101100015729 Drosophila melanogaster drk gene Proteins 0.000 description 1
- 206010059866 Drug resistance Diseases 0.000 description 1
- 241000283074 Equus asinus Species 0.000 description 1
- 102100031690 Erythroid transcription factor Human genes 0.000 description 1
- 101710100588 Erythroid transcription factor Proteins 0.000 description 1
- 108010066805 F-Box Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000018700 F-Box Proteins Human genes 0.000 description 1
- 241000282326 Felis catus Species 0.000 description 1
- 102000018233 Fibroblast Growth Factor Human genes 0.000 description 1
- 108050007372 Fibroblast Growth Factor Proteins 0.000 description 1
- 102000017707 GABRB3 Human genes 0.000 description 1
- 108010088742 GATA Transcription Factors Proteins 0.000 description 1
- 102000009041 GATA Transcription Factors Human genes 0.000 description 1
- 241000283899 Gazella Species 0.000 description 1
- 230000010558 Gene Alterations Effects 0.000 description 1
- 241000282818 Giraffidae Species 0.000 description 1
- 101710166358 Globin-1 Proteins 0.000 description 1
- 108010068370 Glutens Proteins 0.000 description 1
- 102100035364 Growth/differentiation factor 3 Human genes 0.000 description 1
- 108010051041 HC toxin Proteins 0.000 description 1
- 239000007995 HEPES buffer Substances 0.000 description 1
- 206010018852 Haematoma Diseases 0.000 description 1
- 108010068308 Hemoglobin H Proteins 0.000 description 1
- 102100027685 Hemoglobin subunit alpha Human genes 0.000 description 1
- 108091005902 Hemoglobin subunit alpha Proteins 0.000 description 1
- MAJYPBAJPNUFPV-BQBZGAKWSA-N His-Cys Chemical compound SC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 MAJYPBAJPNUFPV-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- 102000011787 Histone Methyltransferases Human genes 0.000 description 1
- 108010036115 Histone Methyltransferases Proteins 0.000 description 1
- 241001272567 Hominoidea Species 0.000 description 1
- 101000804948 Homo sapiens Developmental pluripotency-associated protein 2 Proteins 0.000 description 1
- 101001073597 Homo sapiens Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3 Proteins 0.000 description 1
- 101001023986 Homo sapiens Growth/differentiation factor 3 Proteins 0.000 description 1
- 101001028019 Homo sapiens Metastasis-associated protein MTA2 Proteins 0.000 description 1
- 101001109685 Homo sapiens Nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 Proteins 0.000 description 1
- 101000835745 Homo sapiens Teratocarcinoma-derived growth factor 1 Proteins 0.000 description 1
- 101000800116 Homo sapiens Thy-1 membrane glycoprotein Proteins 0.000 description 1
- 101000687905 Homo sapiens Transcription factor SOX-2 Proteins 0.000 description 1
- 101000835093 Homo sapiens Transferrin receptor protein 1 Proteins 0.000 description 1
- 101000976622 Homo sapiens Zinc finger protein 42 homolog Proteins 0.000 description 1
- 208000001953 Hypotension Diseases 0.000 description 1
- 206010021143 Hypoxia Diseases 0.000 description 1
- 108010000178 IGF-I-IGFBP-3 complex Proteins 0.000 description 1
- 206010023126 Jaundice Diseases 0.000 description 1
- XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N L-Cysteine Chemical compound SC[C@H](N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N L-asparagine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- 241001103596 Lelia Species 0.000 description 1
- 241000408529 Libra Species 0.000 description 1
- 102100027754 Mast/stem cell growth factor receptor Kit Human genes 0.000 description 1
- 102100037511 Metastasis-associated protein MTA2 Human genes 0.000 description 1
- 108010085220 Multiprotein Complexes Proteins 0.000 description 1
- 102000007474 Multiprotein Complexes Human genes 0.000 description 1
- 101000804949 Mus musculus Developmental pluripotency-associated protein 2 Proteins 0.000 description 1
- 101000881849 Mus musculus Developmental pluripotency-associated protein 4 Proteins 0.000 description 1
- 101100224389 Mus musculus Dppa5a gene Proteins 0.000 description 1
- 101100446513 Mus musculus Fgf4 gene Proteins 0.000 description 1
- 101100404103 Mus musculus Nanog gene Proteins 0.000 description 1
- 101100310645 Mus musculus Sox15 gene Proteins 0.000 description 1
- 101100310650 Mus musculus Sox18 gene Proteins 0.000 description 1
- 101000976618 Mus musculus Zinc finger protein 42 Proteins 0.000 description 1
- 108091057508 Myc family Proteins 0.000 description 1
- BHUZLJOUHMBZQY-YXQOSMAKSA-N N-[4-[(2R,4R,6S)-4-[[(4,5-diphenyl-2-oxazolyl)thio]methyl]-6-[4-(hydroxymethyl)phenyl]-1,3-dioxan-2-yl]phenyl]-N'-hydroxyoctanediamide Chemical compound C1=CC(CO)=CC=C1[C@H]1O[C@@H](C=2C=CC(NC(=O)CCCCCCC(=O)NO)=CC=2)O[C@@H](CSC=2OC(=C(N=2)C=2C=CC=CC=2)C=2C=CC=CC=2)C1 BHUZLJOUHMBZQY-YXQOSMAKSA-N 0.000 description 1
- 206010028813 Nausea Diseases 0.000 description 1
- 206010029350 Neurotoxicity Diseases 0.000 description 1
- 102100022669 Nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 Human genes 0.000 description 1
- 206010029825 Nucleated red cells Diseases 0.000 description 1
- 108091005461 Nucleic proteins Proteins 0.000 description 1
- 238000010222 PCR analysis Methods 0.000 description 1
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 1
- 206010033546 Pallor Diseases 0.000 description 1
- 241000282579 Pan Species 0.000 description 1
- 241000282320 Panthera leo Species 0.000 description 1
- 241000282376 Panthera tigris Species 0.000 description 1
- 108091093037 Peptide nucleic acid Proteins 0.000 description 1
- 241000286209 Phasianidae Species 0.000 description 1
- 241000288906 Primates Species 0.000 description 1
- 102000055027 Protein Methyltransferases Human genes 0.000 description 1
- 108700040121 Protein Methyltransferases Proteins 0.000 description 1
- 101001012040 Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) Immunomodulating metalloprotease Proteins 0.000 description 1
- IWYDHOAUDWTVEP-UHFFFAOYSA-N R-2-phenyl-2-hydroxyacetic acid Natural products OC(=O)C(O)C1=CC=CC=C1 IWYDHOAUDWTVEP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101150010363 REM2 gene Proteins 0.000 description 1
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 description 1
- 102000007503 Retinoblastoma-Binding Protein 7 Human genes 0.000 description 1
- 108010071000 Retinoblastoma-Binding Protein 7 Proteins 0.000 description 1
- 241000283984 Rodentia Species 0.000 description 1
- 239000006146 Roswell Park Memorial Institute medium Substances 0.000 description 1
- 101150086694 SLC22A3 gene Proteins 0.000 description 1
- 101150052594 SLC2A3 gene Proteins 0.000 description 1
- 101150064359 SLC6A1 gene Proteins 0.000 description 1
- 101150099493 STAT3 gene Proteins 0.000 description 1
- 238000012300 Sequence Analysis Methods 0.000 description 1
- 108010016797 Sickle Hemoglobin Proteins 0.000 description 1
- 206010040642 Sickle cell anaemia with crisis Diseases 0.000 description 1
- 101150044140 Slc7a5 gene Proteins 0.000 description 1
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 238000002105 Southern blotting Methods 0.000 description 1
- 238000000692 Student's t-test Methods 0.000 description 1
- FEWJPZIEWOKRBE-UHFFFAOYSA-N Tartaric acid Natural products [H+].[H+].[O-]C(=O)C(O)C(O)C([O-])=O FEWJPZIEWOKRBE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010017842 Telomerase Proteins 0.000 description 1
- 102100026404 Teratocarcinoma-derived growth factor 1 Human genes 0.000 description 1
- 208000031320 Teratogenesis Diseases 0.000 description 1
- 206010043276 Teratoma Diseases 0.000 description 1
- 208000035199 Tetraploidy Diseases 0.000 description 1
- 206010043391 Thalassaemia beta Diseases 0.000 description 1
- 206010043395 Thalassaemia sickle cell Diseases 0.000 description 1
- 102100033523 Thy-1 membrane glycoprotein Human genes 0.000 description 1
- RTAQQCXQSZGOHL-UHFFFAOYSA-N Titanium Chemical compound [Ti] RTAQQCXQSZGOHL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010044221 Toxic encephalopathy Diseases 0.000 description 1
- 102100024270 Transcription factor SOX-2 Human genes 0.000 description 1
- 102100022012 Transcription intermediary factor 1-beta Human genes 0.000 description 1
- 101710177718 Transcription intermediary factor 1-beta Proteins 0.000 description 1
- 102100039362 Transducin-like enhancer protein 1 Human genes 0.000 description 1
- 101710101305 Transducin-like enhancer protein 1 Proteins 0.000 description 1
- 108091032917 Transfer-messenger RNA Proteins 0.000 description 1
- 102000004357 Transferases Human genes 0.000 description 1
- 108090000992 Transferases Proteins 0.000 description 1
- 102100026144 Transferrin receptor protein 1 Human genes 0.000 description 1
- 108700019146 Transgenes Proteins 0.000 description 1
- 206010052779 Transplant rejections Diseases 0.000 description 1
- 229930189037 Trapoxin Natural products 0.000 description 1
- 102000004243 Tubulin Human genes 0.000 description 1
- 108090000704 Tubulin Proteins 0.000 description 1
- 241001199012 Usta Species 0.000 description 1
- 229930003268 Vitamin C Natural products 0.000 description 1
- 208000027418 Wounds and injury Diseases 0.000 description 1
- 108700029631 X-Linked Genes Proteins 0.000 description 1
- 101001029301 Xenopus tropicalis Forkhead box protein D3 Proteins 0.000 description 1
- 102100023550 Zinc finger protein 42 homolog Human genes 0.000 description 1
- 108091007916 Zinc finger transcription factors Proteins 0.000 description 1
- 102000038627 Zinc finger transcription factors Human genes 0.000 description 1
- 238000002679 ablation Methods 0.000 description 1
- 210000002506 abnormal erythrocyte Anatomy 0.000 description 1
- 206010000210 abortion Diseases 0.000 description 1
- 231100000176 abortion Toxicity 0.000 description 1
- 238000009825 accumulation Methods 0.000 description 1
- 108020002494 acetyltransferase Proteins 0.000 description 1
- 102000005421 acetyltransferase Human genes 0.000 description 1
- 230000009471 action Effects 0.000 description 1
- 230000003213 activating effect Effects 0.000 description 1
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 1
- 239000013543 active substance Substances 0.000 description 1
- 206010051895 acute chest syndrome Diseases 0.000 description 1
- 230000006978 adaptation Effects 0.000 description 1
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 description 1
- 210000004504 adult stem cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000013566 allergen Substances 0.000 description 1
- 208000033571 alveolar capillary dysplasia with misalignment of pulmonary veins Diseases 0.000 description 1
- 230000001668 ameliorated effect Effects 0.000 description 1
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 1
- 238000012197 amplification kit Methods 0.000 description 1
- 230000033115 angiogenesis Effects 0.000 description 1
- 238000010171 animal model Methods 0.000 description 1
- 230000003460 anti-nuclear Effects 0.000 description 1
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 description 1
- 239000003146 anticoagulant agent Substances 0.000 description 1
- 229940127219 anticoagulant drug Drugs 0.000 description 1
- 229940053200 antiepileptics fatty acid derivative Drugs 0.000 description 1
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 1
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 1
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 1
- 235000009582 asparagine Nutrition 0.000 description 1
- 229960001230 asparagine Drugs 0.000 description 1
- 238000012098 association analyses Methods 0.000 description 1
- 238000012093 association test Methods 0.000 description 1
- 230000002238 attenuated effect Effects 0.000 description 1
- 230000003416 augmentation Effects 0.000 description 1
- 230000003190 augmentative effect Effects 0.000 description 1
- 210000003719 b-lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 210000003651 basophil Anatomy 0.000 description 1
- 210000004103 basophilic normoblast Anatomy 0.000 description 1
- 239000011324 bead Substances 0.000 description 1
- 229940054066 benzamide antipsychotics Drugs 0.000 description 1
- 150000003936 benzamides Chemical class 0.000 description 1
- 125000005605 benzo group Chemical group 0.000 description 1
- 230000005266 beta plus decay Effects 0.000 description 1
- 208000005980 beta thalassemia Diseases 0.000 description 1
- 239000012867 bioactive agent Substances 0.000 description 1
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 1
- 230000031018 biological processes and functions Effects 0.000 description 1
- 239000012472 biological sample Substances 0.000 description 1
- 230000005540 biological transmission Effects 0.000 description 1
- 230000000903 blocking effect Effects 0.000 description 1
- 239000012267 brine Substances 0.000 description 1
- 239000000337 buffer salt Substances 0.000 description 1
- 150000004652 butanoic acids Chemical class 0.000 description 1
- 235000011116 calcium hydroxide Nutrition 0.000 description 1
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 1
- 239000002775 capsule Substances 0.000 description 1
- 230000000747 cardiac effect Effects 0.000 description 1
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 1
- 230000032823 cell division Effects 0.000 description 1
- 239000002771 cell marker Substances 0.000 description 1
- 210000000170 cell membrane Anatomy 0.000 description 1
- 239000002458 cell surface marker Substances 0.000 description 1
- 230000033077 cellular process Effects 0.000 description 1
- 239000003610 charcoal Substances 0.000 description 1
- 230000001149 cognitive effect Effects 0.000 description 1
- 230000005757 colony formation Effects 0.000 description 1
- 229940000425 combination drug Drugs 0.000 description 1
- 230000002301 combined effect Effects 0.000 description 1
- 238000012790 confirmation Methods 0.000 description 1
- 210000002808 connective tissue Anatomy 0.000 description 1
- 108091036078 conserved sequence Proteins 0.000 description 1
- 239000000470 constituent Substances 0.000 description 1
- 238000012937 correction Methods 0.000 description 1
- 230000002596 correlated effect Effects 0.000 description 1
- 239000006071 cream Substances 0.000 description 1
- 230000009260 cross reactivity Effects 0.000 description 1
- 230000001186 cumulative effect Effects 0.000 description 1
- 238000009109 curative therapy Methods 0.000 description 1
- WZHCOOQXZCIUNC-UHFFFAOYSA-N cyclandelate Chemical compound C1C(C)(C)CC(C)CC1OC(=O)C(O)C1=CC=CC=C1 WZHCOOQXZCIUNC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000004122 cyclic group Chemical group 0.000 description 1
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 description 1
- XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N cysteine Natural products SCC(N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000001945 cysteines Chemical class 0.000 description 1
- 229960000684 cytarabine Drugs 0.000 description 1
- 230000021953 cytokinesis Effects 0.000 description 1
- 230000009089 cytolysis Effects 0.000 description 1
- 231100000433 cytotoxic Toxicity 0.000 description 1
- 230000001472 cytotoxic effect Effects 0.000 description 1
- 230000034994 death Effects 0.000 description 1
- 230000003111 delayed effect Effects 0.000 description 1
- 210000004443 dendritic cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000006392 deoxygenation reaction Methods 0.000 description 1
- 108010031616 deoxyribonuclease gamma Proteins 0.000 description 1
- 210000004207 dermis Anatomy 0.000 description 1
- 230000009025 developmental regulation Effects 0.000 description 1
- 229960003957 dexamethasone Drugs 0.000 description 1
- UREBDLICKHMUKA-CXSFZGCWSA-N dexamethasone Chemical compound C1CC2=CC(=O)C=C[C@]2(C)[C@]2(F)[C@@H]1[C@@H]1C[C@@H](C)[C@@](C(=O)CO)(O)[C@@]1(C)C[C@@H]2O UREBDLICKHMUKA-CXSFZGCWSA-N 0.000 description 1
- JXSJBGJIGXNWCI-UHFFFAOYSA-N diethyl 2-[(dimethoxyphosphorothioyl)thio]succinate Chemical compound CCOC(=O)CC(SP(=S)(OC)OC)C(=O)OCC JXSJBGJIGXNWCI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000009792 diffusion process Methods 0.000 description 1
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 1
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 1
- 239000000539 dimer Substances 0.000 description 1
- 230000003292 diminished effect Effects 0.000 description 1
- 230000005750 disease progression Effects 0.000 description 1
- LWUICDQVEORCSP-UHFFFAOYSA-L disodium butanoate Chemical compound [Na+].[Na+].CCCC([O-])=O.CCCC([O-])=O LWUICDQVEORCSP-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 238000010494 dissociation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000005593 dissociations Effects 0.000 description 1
- 208000018459 dissociative disease Diseases 0.000 description 1
- 208000002173 dizziness Diseases 0.000 description 1
- 239000002552 dosage form Substances 0.000 description 1
- 230000034431 double-strand break repair via homologous recombination Effects 0.000 description 1
- 230000003828 downregulation Effects 0.000 description 1
- 230000002900 effect on cell Effects 0.000 description 1
- 235000013601 eggs Nutrition 0.000 description 1
- 230000013020 embryo development Effects 0.000 description 1
- 230000008011 embryonic death Effects 0.000 description 1
- 210000001671 embryonic stem cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000004945 emulsification Methods 0.000 description 1
- 230000003511 endothelial effect Effects 0.000 description 1
- 230000007515 enzymatic degradation Effects 0.000 description 1
- 210000003979 eosinophil Anatomy 0.000 description 1
- 210000002615 epidermis Anatomy 0.000 description 1
- 230000004076 epigenetic alteration Effects 0.000 description 1
- 230000008995 epigenetic change Effects 0.000 description 1
- 239000003797 essential amino acid Substances 0.000 description 1
- 150000002148 esters Chemical class 0.000 description 1
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 1
- 230000007717 exclusion Effects 0.000 description 1
- 238000013401 experimental design Methods 0.000 description 1
- 230000008175 fetal development Effects 0.000 description 1
- 210000002950 fibroblast Anatomy 0.000 description 1
- 229940126864 fibroblast growth factor Drugs 0.000 description 1
- 239000000945 filler Substances 0.000 description 1
- 239000000834 fixative Substances 0.000 description 1
- 231100000221 frame shift mutation induction Toxicity 0.000 description 1
- 230000037433 frameshift Effects 0.000 description 1
- 230000005714 functional activity Effects 0.000 description 1
- 210000000973 gametocyte Anatomy 0.000 description 1
- BTCSSZJGUNDROE-UHFFFAOYSA-N gamma-aminobutyric acid Chemical compound NCCCC(O)=O BTCSSZJGUNDROE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000002496 gastric effect Effects 0.000 description 1
- 210000001035 gastrointestinal tract Anatomy 0.000 description 1
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 1
- 238000001502 gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 238000002523 gelfiltration Methods 0.000 description 1
- 102000054767 gene variant Human genes 0.000 description 1
- 230000004077 genetic alteration Effects 0.000 description 1
- 231100000118 genetic alteration Toxicity 0.000 description 1
- 230000009395 genetic defect Effects 0.000 description 1
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 description 1
- 230000007614 genetic variation Effects 0.000 description 1
- 230000037442 genomic alteration Effects 0.000 description 1
- 230000004110 gluconeogenesis Effects 0.000 description 1
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 1
- 235000021312 gluten Nutrition 0.000 description 1
- 101150098203 grb2 gene Proteins 0.000 description 1
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 1
- 201000000079 gynecomastia Diseases 0.000 description 1
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 1
- GNYCTMYOHGBSBI-UHFFFAOYSA-N helminthsporium carbonum toxin Natural products N1C(=O)C(C)NC(=O)C(C)NC(=O)C2CCCN2C(=O)C1CCCCCC(=O)C1CO1 GNYCTMYOHGBSBI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000002489 hematologic effect Effects 0.000 description 1
- 210000003677 hemocyte Anatomy 0.000 description 1
- 229940000351 hemocyte Drugs 0.000 description 1
- 230000002440 hepatic effect Effects 0.000 description 1
- 210000003494 hepatocyte Anatomy 0.000 description 1
- 150000002411 histidines Chemical class 0.000 description 1
- 125000000487 histidyl group Chemical group [H]N([H])C(C(=O)O*)C([H])([H])C1=C([H])N([H])C([H])=N1 0.000 description 1
- 238000012766 histopathologic analysis Methods 0.000 description 1
- 230000006801 homologous recombination Effects 0.000 description 1
- 238000002744 homologous recombination Methods 0.000 description 1
- 238000003165 hybrid screening Methods 0.000 description 1
- 150000004679 hydroxides Chemical class 0.000 description 1
- 208000021822 hypotensive Diseases 0.000 description 1
- 230000001077 hypotensive effect Effects 0.000 description 1
- 230000007954 hypoxia Effects 0.000 description 1
- 230000006303 immediate early viral mRNA transcription Effects 0.000 description 1
- 210000002865 immune cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000028993 immune response Effects 0.000 description 1
- 238000003365 immunocytochemistry Methods 0.000 description 1
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 description 1
- 238000003364 immunohistochemistry Methods 0.000 description 1
- 238000001114 immunoprecipitation Methods 0.000 description 1
- 238000012744 immunostaining Methods 0.000 description 1
- 239000007943 implant Substances 0.000 description 1
- 230000001976 improved effect Effects 0.000 description 1
- 230000006872 improvement Effects 0.000 description 1
- 239000000411 inducer Substances 0.000 description 1
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 1
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 1
- 208000014674 injury Diseases 0.000 description 1
- 239000012212 insulator Substances 0.000 description 1
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 1
- 210000000936 intestine Anatomy 0.000 description 1
- 238000007918 intramuscular administration Methods 0.000 description 1
- 238000007913 intrathecal administration Methods 0.000 description 1
- 238000007914 intraventricular administration Methods 0.000 description 1
- 235000014413 iron hydroxide Nutrition 0.000 description 1
- NCNCGGDMXMBVIA-UHFFFAOYSA-L iron(ii) hydroxide Chemical class [OH-].[OH-].[Fe+2] NCNCGGDMXMBVIA-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 239000002085 irritant Substances 0.000 description 1
- 231100000021 irritant Toxicity 0.000 description 1
- 235000015110 jellies Nutrition 0.000 description 1
- 239000008274 jelly Substances 0.000 description 1
- 238000005304 joining Methods 0.000 description 1
- 210000003292 kidney cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000004310 lactic acid Substances 0.000 description 1
- 235000014655 lactic acid Nutrition 0.000 description 1
- 238000012177 large-scale sequencing Methods 0.000 description 1
- 230000002045 lasting effect Effects 0.000 description 1
- 231100000225 lethality Toxicity 0.000 description 1
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 1
- 238000012417 linear regression Methods 0.000 description 1
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 description 1
- 238000009630 liquid culture Methods 0.000 description 1
- 239000012669 liquid formulation Substances 0.000 description 1
- 210000005229 liver cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000005923 long-lasting effect Effects 0.000 description 1
- 230000035168 lymphangiogenesis Effects 0.000 description 1
- 210000002540 macrophage Anatomy 0.000 description 1
- 229910052943 magnesium sulfate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000019341 magnesium sulphate Nutrition 0.000 description 1
- 238000002826 magnetic-activated cell sorting Methods 0.000 description 1
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 1
- 210000005075 mammary gland Anatomy 0.000 description 1
- 210000004216 mammary stem cell Anatomy 0.000 description 1
- 229960002510 mandelic acid Drugs 0.000 description 1
- 238000013507 mapping Methods 0.000 description 1
- 238000004949 mass spectrometry Methods 0.000 description 1
- 230000008774 maternal effect Effects 0.000 description 1
- 230000035800 maturation Effects 0.000 description 1
- 235000019988 mead Nutrition 0.000 description 1
- 210000003593 megakaryocyte Anatomy 0.000 description 1
- 210000004379 membrane Anatomy 0.000 description 1
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 1
- 230000004060 metabolic process Effects 0.000 description 1
- 230000031864 metaphase Effects 0.000 description 1
- 239000003697 methyltransferase inhibitor Substances 0.000 description 1
- 244000005700 microbiome Species 0.000 description 1
- 230000000116 mitigating effect Effects 0.000 description 1
- 210000001616 monocyte Anatomy 0.000 description 1
- 239000000178 monomer Substances 0.000 description 1
- 208000030454 monosomy Diseases 0.000 description 1
- 238000010172 mouse model Methods 0.000 description 1
- 210000002894 multi-fate stem cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000002703 mutagenesis Methods 0.000 description 1
- 231100000350 mutagenesis Toxicity 0.000 description 1
- 208000031225 myocardial ischemia Diseases 0.000 description 1
- 210000000107 myocyte Anatomy 0.000 description 1
- FMURUEPQXKJIPS-UHFFFAOYSA-N n-(1-benzylpiperidin-4-yl)-6,7-dimethoxy-2-(4-methyl-1,4-diazepan-1-yl)quinazolin-4-amine;trihydrochloride Chemical compound Cl.Cl.Cl.C=12C=C(OC)C(OC)=CC2=NC(N2CCN(C)CCC2)=NC=1NC(CC1)CCN1CC1=CC=CC=C1 FMURUEPQXKJIPS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108091008800 n-Myc Proteins 0.000 description 1
- OYKBQNOPCSXWBL-SNAWJCMRSA-N n-hydroxy-3-[(e)-3-(hydroxyamino)-3-oxoprop-1-enyl]benzamide Chemical compound ONC(=O)\C=C\C1=CC=CC(C(=O)NO)=C1 OYKBQNOPCSXWBL-SNAWJCMRSA-N 0.000 description 1
- 230000008693 nausea Effects 0.000 description 1
- 210000005036 nerve Anatomy 0.000 description 1
- 210000003061 neural cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000001537 neural effect Effects 0.000 description 1
- 230000007135 neurotoxicity Effects 0.000 description 1
- 231100000228 neurotoxicity Toxicity 0.000 description 1
- 210000000440 neutrophil Anatomy 0.000 description 1
- 210000004940 nucleus Anatomy 0.000 description 1
- 235000015097 nutrients Nutrition 0.000 description 1
- 210000000287 oocyte Anatomy 0.000 description 1
- 230000004768 organ dysfunction Effects 0.000 description 1
- 230000008520 organization Effects 0.000 description 1
- 150000002902 organometallic compounds Chemical class 0.000 description 1
- 230000003204 osmotic effect Effects 0.000 description 1
- 239000006179 pH buffering agent Substances 0.000 description 1
- 210000000496 pancreas Anatomy 0.000 description 1
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 1
- 230000001575 pathological effect Effects 0.000 description 1
- 230000007310 pathophysiology Effects 0.000 description 1
- 229920001277 pectin Polymers 0.000 description 1
- 230000000149 penetrating effect Effects 0.000 description 1
- 210000004303 peritoneum Anatomy 0.000 description 1
- 230000002688 persistence Effects 0.000 description 1
- 230000002085 persistent effect Effects 0.000 description 1
- 208000004594 persistent fetal circulation syndrome Diseases 0.000 description 1
- 230000003094 perturbing effect Effects 0.000 description 1
- 238000011458 pharmacological treatment Methods 0.000 description 1
- NTGBUUXKGAZMSE-UHFFFAOYSA-N phenyl n-[4-[4-(4-methoxyphenyl)piperazin-1-yl]phenyl]carbamate Chemical compound C1=CC(OC)=CC=C1N1CCN(C=2C=CC(NC(=O)OC=3C=CC=CC=3)=CC=2)CC1 NTGBUUXKGAZMSE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000003884 phenylalkyl group Chemical group 0.000 description 1
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K phosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 description 1
- 235000011007 phosphoric acid Nutrition 0.000 description 1
- 150000003016 phosphoric acids Chemical class 0.000 description 1
- 230000001766 physiological effect Effects 0.000 description 1
- 239000013600 plasmid vector Substances 0.000 description 1
- 238000006116 polymerization reaction Methods 0.000 description 1
- 231100000683 possible toxicity Toxicity 0.000 description 1
- 238000004321 preservation Methods 0.000 description 1
- 239000003755 preservative agent Substances 0.000 description 1
- 210000002996 primitive erythroblast Anatomy 0.000 description 1
- 238000007639 printing Methods 0.000 description 1
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 1
- 230000000750 progressive effect Effects 0.000 description 1
- 230000035755 proliferation Effects 0.000 description 1
- 230000031877 prophase Effects 0.000 description 1
- 230000000069 prophylactic effect Effects 0.000 description 1
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 1
- 239000012264 purified product Substances 0.000 description 1
- 238000012175 pyrosequencing Methods 0.000 description 1
- 238000003908 quality control method Methods 0.000 description 1
- 238000002673 radiosurgery Methods 0.000 description 1
- 235000008001 rakum palm Nutrition 0.000 description 1
- 230000008707 rearrangement Effects 0.000 description 1
- 238000005215 recombination Methods 0.000 description 1
- 230000009711 regulatory function Effects 0.000 description 1
- 230000002787 reinforcement Effects 0.000 description 1
- 210000005132 reproductive cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000002271 resection Methods 0.000 description 1
- 230000004044 response Effects 0.000 description 1
- 230000002207 retinal effect Effects 0.000 description 1
- 238000010839 reverse transcription Methods 0.000 description 1
- 238000003757 reverse transcription PCR Methods 0.000 description 1
- 210000003705 ribosome Anatomy 0.000 description 1
- 210000000468 rubriblast Anatomy 0.000 description 1
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 1
- 230000009919 sequestration Effects 0.000 description 1
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 1
- 208000013220 shortness of breath Diseases 0.000 description 1
- 238000007390 skin biopsy Methods 0.000 description 1
- HPALAKNZSZLMCH-UHFFFAOYSA-M sodium;chloride;hydrate Chemical compound O.[Na+].[Cl-] HPALAKNZSZLMCH-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 210000001988 somatic stem cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000006641 stabilisation Effects 0.000 description 1
- 238000011105 stabilization Methods 0.000 description 1
- 238000007920 subcutaneous administration Methods 0.000 description 1
- 125000001424 substituent group Chemical group 0.000 description 1
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 1
- 230000008093 supporting effect Effects 0.000 description 1
- 230000002459 sustained effect Effects 0.000 description 1
- 208000011580 syndromic disease Diseases 0.000 description 1
- 230000002195 synergetic effect Effects 0.000 description 1
- 208000006379 syphilis Diseases 0.000 description 1
- VAZAPHZUAVEOMC-UHFFFAOYSA-N tacedinaline Chemical compound C1=CC(NC(=O)C)=CC=C1C(=O)NC1=CC=CC=C1N VAZAPHZUAVEOMC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000011975 tartaric acid Substances 0.000 description 1
- 235000002906 tartaric acid Nutrition 0.000 description 1
- 231100000419 toxicity Toxicity 0.000 description 1
- 230000001988 toxicity Effects 0.000 description 1
- 239000003053 toxin Substances 0.000 description 1
- 231100000765 toxin Toxicity 0.000 description 1
- 108700012359 toxins Proteins 0.000 description 1
- 230000002463 transducing effect Effects 0.000 description 1
- 238000010361 transduction Methods 0.000 description 1
- 230000026683 transduction Effects 0.000 description 1
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 1
- 108010060597 trapoxin A Proteins 0.000 description 1
- 238000011277 treatment modality Methods 0.000 description 1
- VLCQZHSMCYCDJL-UHFFFAOYSA-N tribenuron methyl Chemical compound COC(=O)C1=CC=CC=C1S(=O)(=O)NC(=O)N(C)C1=NC(C)=NC(OC)=N1 VLCQZHSMCYCDJL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000004614 tumor growth Effects 0.000 description 1
- 241000701161 unidentified adenovirus Species 0.000 description 1
- 241001430294 unidentified retrovirus Species 0.000 description 1
- 238000012795 verification Methods 0.000 description 1
- 230000035899 viability Effects 0.000 description 1
- 210000001835 viscera Anatomy 0.000 description 1
- 235000019154 vitamin C Nutrition 0.000 description 1
- 239000011718 vitamin C Substances 0.000 description 1
- 230000036266 weeks of gestation Effects 0.000 description 1
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 1
- 238000009736 wetting Methods 0.000 description 1
- 239000000080 wetting agent Substances 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/01—Preparation of mutants without inserting foreign genetic material therein; Screening processes therefor
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K35/00—Medicinal preparations containing materials or reaction products thereof with undetermined constitution
- A61K35/12—Materials from mammals; Compositions comprising non-specified tissues or cells; Compositions comprising non-embryonic stem cells; Genetically modified cells
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
- A61K38/16—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- A61K38/43—Enzymes; Proenzymes; Derivatives thereof
- A61K38/46—Hydrolases (3)
- A61K38/465—Hydrolases (3) acting on ester bonds (3.1), e.g. lipases, ribonucleases
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P7/00—Drugs for disorders of the blood or the extracellular fluid
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P7/00—Drugs for disorders of the blood or the extracellular fluid
- A61P7/06—Antianaemics
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/46—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
- C07K14/47—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
- C07K14/4701—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals not used
- C07K14/4702—Regulators; Modulating activity
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/795—Porphyrin- or corrin-ring-containing peptides
- C07K14/805—Haemoglobins; Myoglobins
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
- C12N15/102—Mutagenizing nucleic acids
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/16—Hydrolases (3) acting on ester bonds (3.1)
- C12N9/22—Ribonucleases RNAses, DNAses
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Public Health (AREA)
- Immunology (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Hematology (AREA)
- Diabetes (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Developmental Biology & Embryology (AREA)
- Virology (AREA)
- Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
Abstract
يتعلق الاختراع الحالي بتقديم طرق وتركيبات لزيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني fetal hemoglobin في خلية بواسطة اضطراب التعبير عن BCL11A على المستوى الجينومي genomic. كما يتم في الطلب الحالي تقديم طرق وتركيبات تتعلق بعلاج حالات اعتلال الهيموجلوبين hemoglobinopathies عن طريق إعادة حث مستويات الهيموجلوبين الجنيني. شكل 1.
Description
"١
SES التنظيمية البعيدة لإعادة حث هِيمُوجلوبين BCLITA استهداف عناصر
Targeting BCL1 1A distal regulatory elements for fetal hemoglobin reinduction الوصف الكامل خلفية الاختراع في الكبار على أربع بروتينات جلوبين Normal hemoglobin يشتمل الهيموجلوبين الطبيعي beta منها بروتينات بيتا oily alpha (a) proteins منها بروتينات ألفا ol, globin proteins لاسيما في mammalian fetal development أثناء التطور الجنيني الثديي . (B) proteins والذي يشتمل على اثنين بروتينات fetal hemoglobin البشر, ينتج الجنين الهيموجلوبين الجنيني © 8 - -جلوبين B من اثتين بروتينات Ya: gamma (y)-globin proteins جاما (لا)-جلوبين فترة ما بعد الولادة, يحدث تحول الجلوبين, المشار إليه بالاسم "التحول oi globin proteins الجنيني”, وعند هذه النقطة, تتبدل المواد المنتجة للكريات الحُمر من تصنيع على نحو سائد لا-جلوبين إلى تصنيع على نحو سائد 8 -جلوبين. يبدأ التحول التطوري من إنتاج الهيموجلوبين الجنيني على عند من حوالي (HOA ((X2P2 ((272)ل) إلى إنتاج الهيموجلوبين في الكبار أو HOF نحو سائد أو ٠ سائداً. ينتج هذا HDA أسبوعاً من الحمل ويستمر لفترة وجيزة بعد الولادة حتى يصبح YE إلى YA وزيادة gamma-—globin genes التحول على نحو أولي من انخفاض انتساخ جينات جاما-جلوبين في المتوسط, يحتوي دم الشخص البالغ الطبيعي beta-globin 98085 انتساخ جينات بيت -جلوبين ٠١ المتبقية تكون متباينة بأكثر من HOF على الرغم من أن مستويات (HOF 7١ على أقل من ضعف في الكبار الأصحاء ويتم التحكم فيها وراثياً. V0 يضم اعتلال الهيموجلوبين عدد من أمراض فقر الدم ذات الأصل الجيني والتي فيها يوجد إنتاج .red blood cells (RBCs) منخفض و / أو إتلاف متزايد (انحلال الدم) لخلايا الدم الحمراء تشتمل هذه أيضاً على العيوب الجنينية التي ينتج عنها إنتاج هيموجلوبينات شاذة مع ضعف القدرة تشتمل بعض الاضطرابات المذكورة على فشل oxygen مصاحب في الحفاظ على تركيز الأكسجين بكميات كافية, في حين تشتمل الأخرى على normal 8. —globin awk إنتاج 8 -جلوبين ٠ slam 8 الفشل في إنتاج 8 -جلوبين طبيعي كلياً. يشار إلى هذه الاضطرابات المرتبطة ببروتين
© عموماً بالاسم 8 -اعتلال الهيموجلوبين. على سبيل المثال, تتتج 8 -الثلاسيميا من عيب جزئي أو IS في التعبير عن جين 8 -جلوبين, مما يؤدي إلى نقص HDA أو عدم تواجده. ينتج فقر الدم المنجلي عن طافرة نقطة في الجين البنيوي 8 -جلوبين, مما يؤدي إلى إنتاج هيموجلوبين sickle ais) hemoglobin (HbS) ) شاذ. يكون HBS عرضة للبلمرة, لاسيما في Jb ظروف © نزع الأكسجين. يكون HDS RBCs أكثر هشاشة من RBCS الطبيعي ويخضع لانحلال pall بسرعة أكبر, ممما يؤدي تدريجياً إلى فقر الدم. chase يركز البحث عن علاج يستهدف تقليل اختلال توازن سلسلة الجلوبين في مرضى يعانون من اعتلال الهيموجلوبين ] على المعالجة الدوائية للهيموجلوبين الجنيني hereditary ¢02y2) (persistence fetal HbF يتم اقتراح الإمكانية العلاجية لهذه الطرق بواسطة ملاحظات خاصة ٠ بالنمط الظاهري المعتدل للأفراد الذين لديهم صفات وراثية مشتركة من فقر الدم البحري م المتجانسة والاستدامة الوراثية للهيموجلوبين الجيني hereditary persistence of fetal hemoglobin (HPFH) بالإضافة إلى المرضى الذين لديهم فقر الدم البحري م المتجانسة والتي لا نتتج هيموجلوبين لدى البالغين» ولكن تتم ملاحظة مطلب منخفض لحالات نقل الدم في وجود تركيزات عالية من الهيموجلوبين الجيني. علاوة على ذلك؛ تمت ملاحظة أن مجموعة معينة من المرضى Vo البالغين الذين لديهم تشوهات في سلسلة B يكون لديهم مستويات (Aol من الطبيعية من الهيموجلوبين الجيني hemoglobin (HF) 16181؛ وتمت ملاحظة أن لديهم مسار سريري لمرض أكثر اعندالاً من المرضى الذين لديهم مستويات طبيعية من ال HEF لدى البالغين. على سبيل المثال؛ يكون لمجموعة من المرضى السعوديين الذين يعانون من فقر الدم المنجلي ويعبرون وراثياً على ما يتراوح من 770-7١ من ال HOF مظاهر سريرية معتدلة فقط للمرض «et al. (Pembrey) .ل Br. (Haematol. 40: 415-429 (1978) ٠ . يعتبر مقبولاً الآن أن يتم تحسين اضطرابات الهيموجلوبين؛ Jie فقر الدم المنجلي وفقر pall البحري off بواسطة إنتاج ال HOF المتزايد. كما تم ذكره أعلاه؛ Sale ما يستمر التحويل من هيموجلوبين جنيني إلى هيموجلوبين لدى البالغين (0272؛ (HDA في خلال ستة أشهر بعد الولادة. مع ذلك؛ في غالبية المرضى الذين يعانون من اعتلال الهيموجلوبين ل تعتبر جينات الجلوبين 7 القبلية سليمة وتعمل بشكل كامل؛ بحيث إذا تمت © إعادة تتشيط هذه الجينات؛ يمكن الحفاظ على تخليق الهيموجلوبين الوظيفي أثناء سن البلوخ؛ وبالتالي
و تحسين خطورة المرض. على نحو غير ملاتم؛ تعتبر الآليات الجزيئية داخل الجسم الحي والتي تعتبر أساس تحويل الجلوبين غير مفهومة بصورة جيدة. يتم الحصول على الدليل الذي يدعم إمكانية sale) تنشيط إنتاج الهيموجلوبين الجيني من التجارب التي تظهر أن الدم المحيطي؛ الذي يحتوي على خلايا مولدة للنسائل؛ عند توفير توليفة مناسبة من عوامل 0 النموء ينتج مستعمرات WAL شبيهة بالكريات الحمراء ودفقات في مزرعة نصف صلبة. يمكن للخلايا الفردية في هذه المستعمرات أن تراكم هيموجلوبين جنيني (HDF) أو هيموجلوبين بالغين adult hemoglobin (HbA) أو توليفة منها. في المزارع من دم البالغين»؛ تراكم الخلايا الحمراء المنواة إما (F-A+) HbA فقط أو توليفة من HbA; HOF (++]). على نحو cage تشتمل المستعمرات المستقلة على الخلايا + (Fog الأمر الذي يدل على أن كلا النوعين عبارة عن نسل من نفس ٠ > الخلايا الجذعية الجائلة. بالتالي؛ أثناء المراحل الأولى للتطور في المزرعة؛ تتفذ الخلايا OLE) عن طريق آليات معروفة الآن؛ سواء أن تعبر وراثياً عن ال HBF أم لا. من الواضح أن نسبة خلايا ال Ft في البالغين غير مبرمجة مسبقاً في الجسم الحي؛ ولكن من الواضح أنها تعتمد على ظروف المزرعة: (Say إجراء تعديل في مسار التعبير الوراثي HBF و15/8ا؛ على سبيل (Jill في المعمل بواسطة تركيزات Alle في المصلء نتيجة لنشاط مركب غير محدد يمكن امتصاصه على فحم منشط. عموماً؛ يكون تحديد الجزيئات التي تلعب دوراً في تحويل الجلويين مهماً في تطوير الاستراتيجيات العلاجية الحديثة التي تتداخل مع هيموجلوبين البالغين وتحث تخليق الهيموجلوبين الجنيني. ستوفر هذه الجزتيات أهداف جديدة لتطوير التداخلات العلاجية للعديد من حالات اعتلال الهيموجلوبين والتي يؤدي Led إعادة تنتشيط تخليق الهيموجلوبين الجنيني إلى تحسين خطورة المرض ومسبباته إلى حدٍ كبير . ٠ الوصف العام للاختراع يتم في الطلب الحالي تقديم طرق وتركييات sa) مستويات 8 -جلوبين fetal 8 -globin cual في خلية بواسطة اضطراب التعبير عن 8061118 على المستوى الجينومي. يتم أيضاً في الطلب الحالي تقديم طرق وتركيبات تتعلق بعلاج اعتلال الهيموجلوبين بواسطة إعادة حث مستويات 8 - جلوبين جنيني. CAR
—o—
تتعلق أحد الجوانب الموصوفة في الطلب الحالي بطريقة لإنتاج خلية أولية تشتمل على تعبير متخفض
عن 0088 801118 أو البروتين, تشتمل الطريقة على تلامس خلية أولية معزولة مع عامل يربط
حمض genomic «sual DNA للخلية على الكرموسوم chromosome " الموقع
TY AY لقف الس افد (طبقاً لتجميعة 19 UCSC Genome Browser hg الجينومية
© البشرية human genome ), وبناءً عليه خفض تعبير MRNA أو البروتين عن BCL11A
يتعلق جانب آخر موصوف في الطلب الحالي بطريقة لإنتاج خلية بشرية مهندسة وراثياً بها تعديل
جيني واحد على الأقل تشتمل على تلامس خلية معزولة مع كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل
Deoxyribo Nucleic acid (DNA) يستهدف حمض نوري endonuclease على إندونيوكلياز
أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير لإندونيوكلياز يستهدف حمض DNA والتي بواسطتها يشطر ٠ إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA حمض DNA الجينومي للخلية في الكرموسوم Y الموقع
10771/62171574 ويتسبب في تعديل جيني genetic modification واحد على
الأقل فيه.
يتم أيضاً تقديم في الطلب الحالي في جانب آخر خلية بشرية مهندسة وراثياً معزولة بها تعديل جيني
واحد على الأقل في الكرموسوم ؟ الموقع 10077/0117-7507131061894. في أحد النماذج, تعديل جيني واحد على الأقل يكون حذف في حمض DNA الجينومي في الموقع المحدد. في أحد النماذج,
isolated معزولة genetic engineered human cell Lil); يكون ل خلية بشرية مهندسة
تعبير منخفض أو أقل ل MRNA أو البروتين عن 801118 مقارنة بخلية مقارنة لا تشتمل على
تعديل جيني واحد في الكرموسوم ؟ الموقع SOYTACTI Y= VY TO AR
يتعلق جانب آخر موصوف في الطلب الحالي باستخدام خلية بشرية مهندسة وراثياً معزولة بها تعديل ٠ جيني واحد على الأقل في الكرموسوم ؟ الموقع 100776517-75697156184 الموصوف في
الطلب الحالي بغرض زيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني5ا678١ fetal hemoglobin .في ثديي
.mammal
يتعلق جانب آخر موصوف في الطلب Mall باستخدام خلية بشرية مهندسة وراثياً معزولة بها تعديل
جيني واحد على الأقل في الكرموسوم ؟ الموقع TH YYACH Y=T0 eV TO AS الموصوف في Yo الطلب الحالي لعلاج اعتلال الهيموجلوبين/ا051000810ا1610009 .في ثديي .
h —_ _ يتعلق جانب AT موصوف في الطلب الحالي باستخدام خلية بشرية مهندسة وراثياً معزولة بها تعديل جيني واحد على الأقل في الكرموسوم ؟ الموقع 007700117-75071106184 الموصوف في الطلب الحالي لتصنيع دواء لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في ثديي والتي بواسطتها تتم زيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني في تديي. © يكون جانب آخر موصوف في الطلب Mall تركيبة تشتمل على خلايا بشرية مهندسة Us معزولة بها تعديل جيني واحد على الأقل في الكرموسوم ؟ الموقع 10077/117-55067156184. في أحد النماذج, تشتمل التركيبة علاوة على ذلك على sabe حاملة carrier مقبولة صيدلانياً. يتعلق جانب آخر موصوف في الطلب الحالي باستخدام تركيبة تشتمل على WDA بشرية مهندسة Lis معزولة بها تعديل جيني واحد على الأقل في الكرموسوم ؟ الموقع VTA 0778217-56 Ye بغرض زيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني في تديي. يتعلق جانب آخر موصوف في الطلب الحالي باستخدام تركيبة تشتمل على WDA بشرية مهندسة Lis معزولة بها تعديل جيني واحد على الأقل في الكرموسوم ؟ الموقع VTA 0778217-56 يتعلق جانب AT موصوف في الطلب الحالي باستخدام تركيبة تشتمل على خلايا بشرية مهندسة Lis ٠ معزولة بها تعديل جيني واحد على الأقل في الكرموسوم ؟ الموقع Y= Te VY TOA لتم لتصنيع دوا ءِِ لعلاج f عتلال الهيموجلوبين في تديي والتي بواسطتها تتم زياد IS مستويات الهيموجلوبين يكون جانب آخر موصوف في الطلب الحالي تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير لإندونيوكلياز يستهدف حمض DNA والتي ٠ بواسطتها يشطر إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA حمض DNA الجينومي للخلية البشرية في الكرموسوم ؟ الموقع 10077/6117-7507156184 ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه. في أحد النماذج, تشتمل التركيبة علاوة على ذلك على مادة حاملة مقبولة صيدلانياً. يتعلق جانب آخر موصوف في الطلب الحالي باستخدام تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير coding sequence لإندونيوكلياز YO يستهدف حمض DNA والتي بواسطتها يشطر إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA حمض DNA CAR
ل
الجينومي للخلية البشرية في الكرموسوم 7 الموقع Y=T0 VV TOA 10077771 ويتسبب في تعديل
جيني واحد على الأقل فيه بغرض زيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني في تديي.
يتعلق جانب آخر موصوف في الطلب الحالي باستخدام تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكلياز
يستهدف حمض DNA أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير لإندونيوكلياز يستهدف حمض DNA
© والتي بواسطتها يشطر إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA حمض DNA الجينومي للخلية البشرية في
الكرموسوم ؟ الموقع 1007776717-76071106184 ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه
لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في تديي.
يتعلق جانب آخر موصوف في الطلب الحالي باستخدام تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكلياز
يستهدف حمض DNA أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير لإندونيوكلياز يستهدف حمض DNA Ve والتي بواسطتها يشطر إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA حمض DNA الجينومي للخلية البشرية في
الكرموسوم ؟ الموقع 1007776717-76071106184 ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه
لتصنيع دواء لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في تثديي والتي بواسطتها تتم زيادة مستويات الهيموجلوبين
الجنيني في تديي.
في أحد النماذج, يتم في الطلب Jal) تقديم استخدام عامل يربط حمض DNA الجينومي للخلية في VO الكرموسوم ؟ الموقع 1007780717-75071566184 (طبقاً لتجميعة | UCSC Genome
Browser hg 9 البشرية الجينومية) لزيادة الهيموجلوبين الجنيني في ثديي أو لعلاج اعتلال
الهيموجلوبين في الثديي أو لخفض التعبير عن التعبير عن MRNA أو 806111/8, حيث ينخفض
تعبير MRNA أو البروتين عن 86111/8.
في أحد النماذج, يتم في الطلب الحالي تقديم استخدام كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على ٠ إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير لإندونيوكلياز يستهدف
حمض DNA لزيادة الهيموجلوبين الجنيني في ثديي أو لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في الثديي أو
لخفض التعبير عن MRNA أو 80111/8, حيث يشطر إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA حمض
DNA الجينومي للخلية في الكرموسوم ¥ الموقع 100777717-75071501845 ويتسبب في تعديل
جيني واحد على الأقل فيه.
CAN
-- في أحد النماذج, يتم في الطلب الحالي تقديم استخدام كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إنزيم يستهدف حمض DNA أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير لإنزيم يستهدف حمض DNA لزيادة الهيموجلوبين al) في ثديي أو لعلاج اعتلال الهيموجلويين في الثديي أو لخفض التعبير عن mRNA أو ,BCL11A حيث ينتج إنزيم يستهدف حمض DNA تعديل لا جيني واحد على الأقل في © حمض DNA الجينومي للخلية في الكرموسوم ,١ وبناءً عليه يؤثتر على التعبير عن MRNA أو 80178 . في أحد النماذج, يكون تعديل لا جيني واحد على الأقل في الموقع =I AS 7 . في نموذج آخر, إحداتث تعديل لا جيني واحد يكون خفض تعبير 0401/8 أو البروتين عن .BCL1IA في أحد النماذج, يؤثر تعديل لا جيني واحد على الأقل في حمض DNA الجينومي للخلية في الكرموسوم ١ على نحو غير مباشر أو مباشرةً على الموقع 70071366184- 10727/8021970٠ للكرموسوم 7. في أحد النماذج, يتم في الطلب الحالي تقديم استخدام أي الخلايا المعزولة الموصوفة في الطلب الحالي لزيادة الهيموجلوبين الجنيني في ثديي أو لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في الثديي. في أحد النماذج, يتم في الطلب الحالي تقديم استخدام تركيبة تشتمل على WA بشرية مهندسة Lys معزولة لزيادة الهيموجلوبين الجنيني في ثديي أو لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في الثديي, حيث يكون ١ بالخلايا تعديل جيني واحد على الأقل في الكرموسوم ؟ الموقع Y= Te VY TOA لتمت ١ (طبقاً لتجميعة 19 UCSC Genome Browser hg البشرية الجينومية) تم إجرائه بواسطة lee تلامس الخلايا بكمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكلياز يستهدف حمض 0118 أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير لإندونيوكلياز يستهدف حمض DNA والتي بواسطتها يشطر إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA حمض DNA الجينومي للخلية في الكرموسوم * الموقع ToYYACTIY=Te VY TYAY - ٠ (طبقاً لتجميعة 19 UCSC Genome Browser hg البشرية الجينومية) ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه. في أحد النماذج, يتم في الطلب الحالي تقديم استخدام تركيبة تشتمل على WA بشرية مهندسة Lys معزولة لزيادة الهيموجلوبين الجنيني في ثديي أو لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في الثديي, حيث يكون بالخلايا تعديل لا جيني واحد على الأقل في الكرموسوم 7. في أحد النماذج, تعديل لا جيني واحد على YO الأقل في الكرموسوم 7 يكون في الموقع ToeYYACIY=T0 eV TVA (طبقاً لتجميعة UCSC Genome Browser hg 9 الجينومية البشرية). في نموذج AT , يتم إجراء تعديل لا جيني واحد ١ه
على الأقل في الكرموسوم 7 بواسطة عملية تلامس الخلايا بكمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إنزيم يستهدف حمض DNA أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير لإنزيم يستهدف حمض DNA والتي بواسطتها ينتج إنزيم يستهدف حمض DNA تعديل لا جيني واحد على الأقل في حمض DNA الجينومي للخلية في الكرموسوم ¥ المؤثر على الموقع 00774717-7507156184 (طبقاً © لتجميعة 19 UCSC Genome Browser hg البشرية الجينومية) ويحدث فيه. في أحد النماذج, يتم في الطلب الحالي تقديم استخدام أي الخلايا المعزولة الموصوف في الطلب الحالي أو أي من التركيبات الموصوفة في الطلب الحالي لتصنيع دواء لزيادة الهيموجلوبين الجنيني في ثديي في dala إليه أو لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في ثديي. يكون جانب آخر موصوف في الطلب الحالي طريقة لزيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني في خلية, ٠ تشتمل الطريقة على خطوات: تلامس خلية معزولة بكمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير لإندونيوكلياز يستهدف حمض (Alls DNA بواسطتها يشطر إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA حمض DNA الجينومي للخلية في الكرموسوم ١ الموقع TeeV TAC Y=T0 eV TOA ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه, والتي بواسطتها يزيد التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني في الخلية المذكورة, أو سليفتها, Vo بالنسبة إلى الخلية قبل التلامس. يكون جانب AT موصوف في الطلب الحالي طريقة لزيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني في ثديي في حاجة إليه, تشتمل الطريقة على خطوات تلامس خلية أولية معزولة مكونة للدم في الثديي المذكور مع كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير لإندونيوكلياز يستهدف حمض DNA والتي بواسطتها يشطر إندونيوكلياز ٠ - يستهدف حمض DNA (mes DNA الجينومي للخلية في الكرموسوم ؟ الموقع “TI TOA 77 ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه, والتي بواسطتها يزيد التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني في الثديي المذكور, بالنسبة إلى التعبير قبل التلامس المذكور. يكون جانب آخر موصوف في الطلب الحالي طريقة لزيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني في ثديي في حاجة إليه, تشتمل الطريقة على غرس خلية بشرية مهندسة وراثياً معزولة بها تعديل جيني واحد YO على الأقل في الكرموسوم ؟ الموقع ET TAC Y= TeV TO AS الثديي.
CAR
I. في أحد النماذج, يقدم هذا الكشف طريقة لزيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني في ثديي في حاجة إليه, تشتمل الطريقة على خطوات توفير مجموعة معزولة من خلايا أولية لتكوين الدم أو خلايا جذعية لتكوين الدم من الثديي في خارج الجسم الحي, وتلامس مجموعة من خلايا أولية أو خلايا جذعية لتكوين الدم مع كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكلياز يستهدف حمض 0118 أو والتي بواسطتها يستهدف DNA يحمل متوالية التشفير من إندونيوكلياز يستهدف حمض joes ناقل © , ٠١ الجينومي للخلية على الكرموسوم ؟ الموقع DNA ويشطر حمض DNA إندونيوكلياز حمض ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه, والذي بواسطته يزيد TY YYA LTS VAS 3 التعبير عن الهيموجلويين الجنيني في الثديي, بالنسبة إلى التعبير قبل التلامس. في أحد النماذج, يقدم هذا الكشف طريقة لزيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني في ثديي في حاجة أولية لتكوين الدم أو خلايا جذعية لتكوين WIA إليه, تشتمل الطريقة على خطوات عزل مجموعة من ٠ الدم من الثديي, وتلامس في خارج الجسم الحي مجموعة من خلايا أولية أو خلايا جذعية لتكوين الدم أو ناقل تعبير DNA مع كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكلياز يستهدف حمض بواسطتها يستهدف إندونيوكلياز (Alls DNA يحمل متوالية التشفير من إندونيوكلياز يستهدف حمض -١184 ,7176 ,60 الموقع ١ الجينومي للخلية على الكرموسوم DNA ويشطر حمض DNA حمض ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه, والتي بواسطتها يزيد التعبير عن 117 ,778 ,10 NO الهيموجلوبين الجنيني في الثديي, بالنسبة إلى التعبير قبل التلامس. في أحد النماذج, يقدم هذا الكشف طريقة لزيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني في ثديي في حاجة إليه, تشتمل الطريقة على خطوات توفير عزل مجموعة من خلايا أولية لتكوين الدم أو خلايا جذعية ,716 680 الجينومي للخلايا على الكرموسوم الموقع DNA لتكوين الدم من الثديي وحذف حمض ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه, والتي بواسطتها يزيد التعبير 1١7 LYYA 840ا-:ة, YS عن الهيموجلوبين الجنيني في الثديي, بالنسبة إلى التعبير قبل التلامس. في أحد النماذج, يقدم هذا الكشف طريقة لزيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني في ثديي في حاجة إليه, تشتمل الطريقة على خطوات عزل مجموعة من خلايا أولية لتكوين الدم أو خلايا جذعية لتكوين الجينومي للخلايا على الكرموسوم ؟ الموقع DNA حذف حمض all الدم من الثديي وخارج الجسم ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه, والتي بواسطتها 117 ,7748 ,1:-184 ITT YO يزيد التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني في الثديي, بالنسبة إلى التعبير قبل التلامس.
CAR
-١١- في أحد النماذج, يقدم هذا الكشف طريقة لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في ثديي تشتمل على خطوات: خارج WA جذعية لتكوين الدم أو 105©5: (ب) تلامس WIA (أ) توفير خلايا أولية لتكوين الدم أو الجسم الحي أو في المعمل مع كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكلياز يستهدف والتي DNA أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير من إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA حمض الجينومي للخلية على DNA ويشطر حمض DNA بواسطتها يستهدف إندونيوكلياز حمض © ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل 117 ,778 Tam AL VY الكرموسوم ؟ الموقع فيه, والتي بواسطتها يزيد التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني في الثديي, بالنسبة إلى التعبير قبل التلامس: و (ج) إعطاء من الخطوة (ب) في الثديي. في أحد النماذج, يقدم هذا الكشف طريقة لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في ثديي تشتمل على خطوات: من الثديي: (ب) تلامس الخلايا خارج pall خلايا أولية لتكوين الدم أو خلايا جذعية لتكوين Jie )( ٠ الجسم الحي أو في المعمل مع كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكلياز يستهدف والتي DNA أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير من إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA حمض الجينومي للخلية على DNA ويشطر حمض DNA بواسطتها يستهدف إندونيوكلياز حمض ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل 117 ,778 Tam AL VY الكرموسوم ؟ الموقع بواسطتها يزيد التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني في الثديي, بالنسبة إلى التعبير قبل lly فيه, VO التلامس: و (ج) إعطاء من الخطوة (ب) في الثديي. في أحد النماذج, يقدم هذا الكشف طريقة لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في ثديي تشتمل على خطوات: (ب) خارج الجسم الحي SIPSCs جذعية لتكوين الدم أو WA (أ) توفير خلايا أولية لتكوين الدم أو
TY خالا Te AT TT الجينومي للخلايا على الكرموسوم ؟ المرقع DNA (mea حذف ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه, والتي بواسطتها يزيد التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني ٠٠ في الثديي, بالنسبة إلى التعبير قبل التلامس: و (ج) إعطاء الخلايا من الخطوة (ب)) في الثديي. في أحد النماذج, يقدم هذا الكشف طريقة لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في ثديي تشتمل على خطوات: جذعية لتكوين الدم من الثديي: (ب) خارج الجسم الحي LDA خلايا أولية لتكوين الدم أو Je (أ) TY خالا Te AT TT الجينومي للخلايا على الكرموسوم ؟ المرقع DNA (mea حذف ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه, والتي بواسطتها يزيد التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني YO في الثديي, بالنسبة إلى التعبير قبل التلامس: و (ج) إعطاء من الخطوة (ب) في الثديي.
CAR
_— \ \ _ في أحد النماذج, يقدم هذا الكشف طريقة لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في ثديي (على سبيل المثال إنسان) تشتمل على إدخال تركيبة الموصوف في الطلب الحالي تشتمل على خلايا معالجة بالهندسة الوراثية معزلة وراثياً بها تعديل جيني واحد على الأقل على الكرموسوم ؟ الموقع IAT NTT ١١" ,74 ٠ والتي بواسطتها يزيد التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني في الثديي. © في أحد النماذج, يقدم هذا الكشف طريقة لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في ثديي Ao) سبيل المثال
إنسان) تشتمل على زيادة التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني في الثديي بواسطة الطريقة الموصوفة في الطلب الحالي. في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوف في الطلب الحالي, الخلية المعزولة أو المجموعة المعزولة من الخلايا تكون الخلية (الخلايا) البشرية.
٠ في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوف في الطلب الحالي, الخلية المعزولة أو المجموعة المعزولة من الخلايا تكون خلية (خلايا) أولية. في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوف في الطلب الحالي, الخلية البشرية خلية أولية لتكوين الدم. في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوف في الطلب الحالي, الخلية البشرية
VO خلية جذعية مستحثة متعددة القدرات. في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوف في الطلب الحالي, الخلية الجذعية المستحثة متعددة القدرات تكون خلية أولية لتكوين الدم. في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوف في الطلب الحالي, الخلية الأولية لتكوين الدم عبارة عن خلية ADL إريترويد.
٠ في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوف في الطلب الحالي, يتم تلامس الخلية الأصلية لتكون الدم أو المعزولة خارج الجسم الحي أو في المعمل أو في الكائن الحي. في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوف في الطلب الحالي, يكون التعديل الجيني الواحد على الأقل حذف.
CAR
— \ _ في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوف في الطلب الحالي, يزيل الحذف كامل المنطقة بين الكرموسوم ؟ الموقع LYYA Tam VAS ,7/15 Te 117 أو يزيل جزء من المنطقة مما يترتب عليه تمزق واحد أو أكثر من مواقع مفرطة الحساسية ل hypersensitive sites - ١ .(DHS) © في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوف في الطلب الحالي, يشتمل الحذف على واحد أو أكثر من من المواقع مفرطة الحساسية ل 1 laa, oot, 0A+ ,17+ (DHS) DNAse للموصوف في الطلب الحالي في قسم الأمثلة . في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوف في الطلب الحالي, يشتمل الحذف على واحد أو أكثر من مرقمات صور بلورية انيكليوتيد واحد مشترك | single nucleotide polymorphism (SNP) | ٠ الموصوفة في الجدول XY في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوف في الطلب الحالي, يشتمل الحذف على واحد أو أكثر من الشظايا المدرجة في الجدول 7. في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوف في الطلب الحالي, يزيل الحذف كامل المنطقة بين الكرموسوم 7 الموقع LT AG ,715 Te 7748, 117 أو يزيل جزء من المنطقة ٠ مما يترتب عليه تمزق واحد أو أكثر من مواقع مفرطة الحساسية ل 1 DNAse (0115). في أحد النماذج, وفقاً لاستخدامه في الطلب الحالي, التعبير "جزء” في سياق الحذف الجينومي يبلغ على الأقل 2/0٠ _من المنطقة المحددة. في نموذج إضافي من أية طريقة علاج, تشتمل الطريقة على علاج chemotherapy ils و أو علاج radiation eles) لإزالة remove أو تخفيض خلايا أولية أو خلايا جذعية5|ا06 stem ٠ داخلية المنشاً لتكوين الدم في الثديي. في أحد النماذج من أية طريقة, الخلايا المتلامسة التي تتسم بتعديل جيني واحد على الأقل يمكن HL Lela 335 وتخزينها حتى يتم احتياج الخلايا للإعطاء في ثديي. في أحد النماذج على أية طريقة موصوفة, الخلايا الأولية أو الخلايا الجذعية لتكوين الدم أو الخلايا المعزولة يمكن توزيعها باستخدام IPSCs الموصوف في الطلب الحالي. CAR
_— ¢ \ _ في أحد النماذج على أية طريقة موصوفة, الخلايا الأولية أو الخلايا الجذعية لتكوين الدم أو iPSCs أو الخلايا المعزولة تكون ذاتية إلى الثديي, الأمر الذي يعني أن الخلايا تكون مشتقة من نفس الثديي. في نموذج آخر على الطريقة الموصوفة, الخلايا الأولية أو الخلايا الجذعية لتكوين الدم أو 105605 أو الخلايا المعزولة تكون غير BE BD إلى الثديي, الأمر الذي يعني أن الخلايا لا تكون مشتقة من نفس الثديي , ولكن تديي آخر من نفس النوع . على سبيل المثال, الثديي يكون إنسان . في أحد النماذج من أية طريقة علاج, تشتمل الطريقة أيضاً على انتقاء تديي في حاجة إلى تعبير متزايد عن الهيموجلوبين الجنيني . في أحد النماذج من أية طريقة علاج, تشتمل الطريقة أيضاً على انتقاء ثديي في حاجة إلى علاج اعتلال الهيموجلوبين. ٠ في أي نموذج من أية طريقة علاج موصوفة, يكون اعتلال الهيموجلوبين 8 -اعتلال الهيموجلوبين B —hemoglobinopathy . في أي نموذج من أية طريقة علاج موصوفة, يكون اعتلال الهيموجلوبين 8 -ثلاسيميا- 8( .thalassemia في أي نموذج من أية طريقة علاج موصوفة, يكون اعتلال الهيموجلويين فقر الدم المنجلي sickle .cell anemia ١٠ شرح مختصر للرسومات الشكل رقم ١أ يعرض توزيع 776+ SNPs المنشور سابقاً ليكون مرتبط بسمات شبيهة بالكريات الحمراء عند 8٠١ X 5 > P بالنسبة إلى المعزز, متعلق بالإكسون0016*© , متعلق بالإنترون intronic 1477 لا, ومتواليات بين الجينات. للمقارنة, يتم عرض التوزيع الجينومي genomic distribution | ٠ لهذه المناطق. الشكل رقم ١ب رسم بياني يخطط التوزيع المتراكم لمسافات من 163706 SNPs مرتبطة بالسمات شبيهة بالكريات الحمراء بالنسبة إلى أقرب محسن شبيه بالكريات الحمراء. تم تمييز المحسنات الشبيهة بالكريات الحمراء بواسطة متواليات أكثر من ؟ كيلو بايت من 1958 لجينات موضحة ب Refseq CAR yoo وعدم وجود ,H3K9ac أو H3K27ac إما ,H3K4mel وجود , DNase | ذات حساسية مفرطة مجموعة من 176 بصورة عشوائية 5٠ ل SD + و13/270163. بدلت مسافة متوسط H3K4me3 وتم ,) GWAS مرتبطة بالسمات شبيهة بالكريات الحمراء (من قاعدة بيانات SNPs أنواع غير العشوائية أيضاً. SNPs للتنتميط الجيني, أو Affy 6.0 من مصفوفة SNPS تخطيط تلاه عمل متواليات متوازي بصورة شاملة منفذ بالمواد المنتجة للكريات ChIP الشكل رقم ؟أ يعرض © (H3K4me3 (H3K27me3 الحُمر المشتقة من 0034+-خلية- مع الأجسام المضادة ل النواة المعزولة من المواد المنتجة للكريات L Poll 5, TALI «GATAL (H3K27ac (H3K4mel بحيث تكون مواضع DNase | الحُمر, مخ الجنين, و8- و1-الخلايا اللمفاوية الخاضعة إلى علاج تلك FIDF المرتبطة ب SNPS الانشطار محددة بواسطة عمل متواليات متوازي بصورة شاملة. تتضمن تلك ذات أعلى SNPs وتحرس 8-٠١ x 0 > © عند F خلية sae أو FIDF المرتبطة بمستوى ٠ متجاورة شبيهة بالكريات DHS معينة. يتم ترميز ثلاث GWAS في F ارتباط ب 05ا أو عدد خلية .86111/8 TSS و+0ه بناءً على المسافة بالكيلو بايت من ,0A+ ,67+ ب DHS الحمراء 8611178 الشكل رقم "ب يعرض 6010-9008 لمواد منتجة للكريات الحُمر بشرية رئيسية عند مظللة. TY من الشكل 00+, 0A+ ,17+ DHS كروماتين مدخلة. 7١ ل Lida إنترون-7, معايرة
LCR HS3 ومواضع مقارن موجب (0-جلوبين (GAPDH, OCT4) الإثراء عند مقارن سالب Vo معروضة للمقارنة. (HS=40 وألفا-جلوبين الشكل رقم "ج يعرض التقاط توافق الكرموسوم منفذ في المواد المنتجة للكريات الحُمر البشرية الرئيسية باستخدام معزز 8011178 كمثبت. تتم معايرة تكرار التفاعل طبقاً لتفاعل BCLIIA عبر موضع . LCR-HBB يعرض متبرعين أصحاء مجهولي الاسم توفرت منهم خلايا جذعية / خلايا أولية مكونة IV الشكل رقم ٠ للدم تم إجراء التتميط الجيني لها عند 181427407 لتمييز أفراد متغايرة الزيجوت. تم تمييز خمسة متبرعين. تم إخضاع الخلايا الجذعية / الخلايا الأولية مكونة للدم إلى مستعمرة تمايز شبيهة بالكريات
TALL الحمراء. تم عزل الكروماتين من الأرومة الحمراء, وتم ترسيبها مناعياً بواسطة 687781 أو المدخلة إلى تفاعل تسلسل بالحرارة لتحديد كمية الوفرة النسبية DNA أو ChIP DNA إخضاع rs 1427407 G ليل Yo
CAR
_ أ \ _ الشكل رقم "ب يعرض بيانات من متبرعين أصحاء مجهولي الاسم توفرت منهم خلايا جذعية / خلايا أولية مكونة للدم تم إجراء التتميط الجيني لها عند ,rsT606173 rsl427407 5 57569946 لتمييز أفراد متغايرة الزيجوت Lill القزدانيٌ rs1427407-rsT606173 وكذلك 157569946 تم تمييز ثلاثة متبرعين. كشف (asl bill أن أليل © 57569946”كان على نفس الكرموسوم كما © أليل G 51427407 وأليل © 157606173 في كلٍ. تم إخضاع الخلايا الجذعية / الخلايا الأولية مكونة للدم إلى مستعمرة تمايز شبيهة بالكريات الحمراء. تم عزل حمض RNA وحمض DNA جينومي, وتم إنتاج CDNA بواسطة الانتساخ العكسي. تم إخضاع حمض DNA المتزاوج وعينات cDNA إلى تفاعل تسلسل بالحرارة لتحديد كمية الوفرة النسبية لأليل 1758144847 6-. الشكل “ج يعرض متوسط HDF للأنماط الفردانية 151427407-57606173 في منتخب إحصائي lS.
CSSCD ٠ متوسط مستوى HbF 74,05 )3.10 50) في YAY فرد rsl427407- 6-6 7606173ي ,11018 )4.50 50) في rs1427407-rs7606173 T-G/G-T Yet متغايرة الزيجوت, و711,71 )4.37 (SD في 60 فرد 7-6 rsl427407-rsT606173 . نتاظر قيم © اختبارات 1 student مفردة النتجة. تكون تكرارات النوع الفرداني في CSSCD هي: TG : TC , صما GC اا 66 ٠١ Vo الأشكال ؛أ-؛ z توضح بيانات من شظية ؛,"١-كيلو بايت من 8011178 إنترون-؟ تضم 01155 +57 +/ه 0045 (تضم +0 £-0Y, ,14 كيلو بايت من (TSS المستتسخ قبل 15068 أدنى معزز وجين مبلغ 862 محاط بعناصر عازل 119 . ولدت الأجنة الفأرية المحورة Lis العابرة بواسطة حقن نووي عند مرحلة الخلية الواحدة. الشكل رقم it يعرض جنين متحور Wis عابر E12.5 مبقع ب X-gal ٠ الشكل رقم ؛ب يعرض معلقات WIA معزولة من الدم المحيطي وكبد جنيني من أجنة محورة Lis ثابتة 12.5 . تم Cytospins adi ب X-gal وتم التبقيع المضاد لها باستخدام Nuclear Red الشكل رقم ؛ ج يعرض بيانات من الأرومات الحمراء لنخاع العظم (19 (+CDT71+/Terl والخلايا اللمفاوية الطحالية (19 000+ ل 8-الخلايا اللمفاوية 5 +CD3 ل1-الخلايا اللمفاوية) التي تم عزلها وفرزها من محورات وراثياً ثابتة من صغار بالغين. تم إخضاع الخلايا إلى تبقيع X-gal أو dye CAR
ل \ — RNA تلاه .RT-qPCR تمت معايرة التعبير الجيني طبقاً ل 5/0011 , وتم إظهاره بالنسبة إلى 1-الخلايا اللمفاوية, التي لا تعبر عن أي من BCL11A ولا 862ا1. الأشكال zo-lo توضح خلايا ابيضاض الدّم الاحْمِرَاريٌ mouse erythroleukemia Lally (MEL) والخلايا اللمفاوية المؤازرة ل B= المنقول إليها العدوى بزوجين من TALENS كل منها © مصمم لتوليد 058 على إما نهاية متشابهة عند الموضع أورثو ٠١ كيلو بايت 801117 محسن إنترون-7 شبيهة بالكريات الحمراء من +10,44-55,4 كيلو بايت. تم عزل النسائل (التي يُطلق عليها (AS50.4-60.4 باستخدام حذف al الأليل لقسم ٠١ كيلو بايت. الشكل رقم fo يعرض 1-0068 منفذ من Bell la مع أزواج بادئة تتعرف على متواليات قبل, تمتد, وبعد ARTS Ve الشكل رقم دب يعرض لطخة مناعية من 850.4-60.4 مع مضاد ل BCL 11 A الشكل رقم ٠ج يعرض جلوبين التعبير الجيني في نسائل AS50.4-60.4 MEL . يتعرف زوج بادئ مشترك على جلوبينات oP بالغين P2 وأم, في حين تتعرف بادئات مستقلة على جلوبينات oP PHI sy الجنينية. الشكل رقم 7 يعرض dalla ثّواة الزيجوت من الفأر المحقونة ببنية مبلغ 1862 . تم عزل أجنة محورة Lily, ١5 عند 512.5. تم تتميط ظاهري للأجنة بواسطة PCR 1862. تم إظهار جزء من أجنة محورة وراتياً fraction of transgenic embryos بالتبقيع ب X-gal لكبد fetal liver aus . الشكل رقم ١ يعرض من واحدة إلى شظيتي متوالية كيلو بايت مستنسخة في بنية محسن TKS لأدنى معزز .GFP تم نقل بنيات مبلغ محسن بواسطة ناقلات تعبير فيروسة عدسية إلى المواد المنتجة للكريات الحُمر البشرية الرئيسية. تم انتقاء الخلايا المصابة بالعدوى بواسطة مقاومة بوروميسين. تم ٠ قياس متوسط شدة التألق الفلوري GFP الشكل رقم A يعرض البيانات التي Blan بتحديد خواص الكروماتين للفأر لخلايا شبيهة بالكريات الحمراء تكشف بصمة محسن متشابهة عند الموضع أورثو عند 18 Bell إنترون-". مسحات الفأر التي تم الحصول عليها من تحديد خواص كروماتين كلي تم نشره من قبل من HU شبيه بالكريات الحمراء , بتعديلات هستون وانشطار DNase-| من و GATAL ومن 0010-5680 TALI .
م \ — المستطيل المنقط يربط بصمة محسن متشابهة عند الموضع أورثو تحدد عنصر 50.4-60.4م مستهدف لحذف يتوسط فيه لاطا 1. الشكل رقم 19 Jag مخطط من استراتيجية هندسة جينوم يتوسط فيها 1/81-1مستخدمة في الطلب الحالي. تمثل 181115 إنزيمات نيوكلياز محددة بالمتوالية. تمت معالجة زوجين من TALENS © بالهندسة الوراثية لتوليد فواصل جديلة مزدوجة, إحداها على 50.4+ Bell la والأخرى عند Set تم عزل النسائل التي قومت اثنين من DSBS بواسطة NFFEJ باستتصال القسم المتداخل ٠١ كيلو بايت. تم فحص النسائل بواسطة PCR بالبادئات ©', "', وحذف 46-٠١ الداخلي والممتد. الشكل رقم 8 يعرض لطخة سوذرن لحمض DNA جينومي مهتضم ب 1110011١ من نسائل -50.4م 4 مما أكد أن هذه النسائل قد توقعت أليل الاستئصال وافتقرت إلى الأليل غير المستأصل. ٠ الشكل رقم ٠١ يعرض عمل متواليات Sanger لنواتج PCR من نسائل 50.4-60.4. يتم توضيح متواليات "V5 (00,64) To (+10,4) يسرى ويمنى للتعرف على TALEN مع مباعدات تدخل. أظهرت بعض الآلائل دليل على الارتباط عند الطرف مباشرةً من كل متوالية مباعدة مهتضمة بينما أظهرت الآلائل الأخرى فقد مئات من النيوكليوتيدات الإضافية. تم عزل أليل واحد فقط لكل من نسيلة ١# MEL وطليعة نسيلة #2 P V0 الشكل ١١ يعرض بيانات النمط الجيني التي تم الحصول عليها في ١78 ,١ فرد من 055600 ل YA صورة مغايرة داخل 861118 +17, +8/ه أو +5 .DHSs تتسق معظم الارتباطات ذات الدلالة بدرجة أعلى مستوى 0]7ا7 بين (1 > SNPs (MAF (ع = (V+ قبل (rs1427407) أو بعد (rs7606173) التحليل الشرطي SNP .00551427407 للكرموسوم ؟, buildingl9 الشكل ١١أ يعرض بيانات النمط الجيني التي تم الحصول lee في ١78 ,١ فرد من 05500 ل YA Yo صورة مغايرة داخل 861118 +17, oA+ أو +5 .DHSs تتسق معظم الارتباطات ذات الدلالة بدرجة أعلى مستوى 0]7ا7 بين (1 > SNPs (MAF (ع = (V+ قبل (rs1427407) أو
بعد (rs7606173) التحليل الشرطي SNP .00551427407 للكرموسوم ؟, buildingl9 الشكل ١١ب يحلل ارتباط 107 عند /806111. يعرض بيانات النمط الجيني التي تم الحصول عليها ١78 ,١ فرد من 65560 ل YA صورة مغايرة داخل 861118 +17, of oA+ +00
.DHSs vo
ه١
q —_ \ _ تكون SNPs الحارسة هي تلك التي لها أعلى ارتباط بمستوى HOF أو عدد خلية GWAS iF القبلي L(V Y-V) يتم توضيح SNPS هذه بالنسبة إلى BCLIIA إنترون-؟ مع بيان ¥ 01155 +17, +/ه 4 +00 . الوصف التفصيلى: © تتعلق الطرق والتركيبات الموصوفة في الطلب الحالي, جزثياً, باكتشاف منطقة تنظيمية بعيدة قبل جين 118 ا80 يمكن أن ينظم التعبير عن بروتين 8011178 . يؤتر بروتين 8011178 في صورة منظم محدد بالمرحلة للتعبير عن الهيموجلوبين الجنيني بواسطة إخماد حث جلوبين-لا. وعلى هذا النتحو, تكون الطرق والتركيبات المقدمة في الطلب الحالي طرق جديدة لتتظيم التعيير عن جلوبين-لا في خلايا شبيهة بالكريات الحمر. بمزيد من التحديد, يمكن اقتران هذه الأنشطة في طرق لعلاج م - ٠ اعتلال الهيموجلوبين بواسطة حث جلوبين-لا عن طريق تثبيط منتج جين BCLIIA في أحد النماذج, يتم في الطلب الحالي تقديم طريقة لإنتاج خلية أولية معزولة تتسم بتعبير منخفض عن BCL1IIA mRNA أو البروتين, تشتمل الطريقة على تلامس خلية أولية معزولة بعامل يربط DNA (mea الجينومي للخلية على الكرموسوم ؟ الموقع IY ,7748 Tem A TT (طبقاً ل 19 UCSC Genome Browser hg مجموعة جينوم بشري), وبناءً عليه خفض التعبير عن BCL1 1A ١ 5 أو بروتين MRNA . في أحد النماذج, يتم في الطلب الحالي تقديم طريقة لإنتاج خلية أولية معزولة تتسم بتعبير منخفض عن mRNA 801118 أو البروتين, تشتمل الطريقة على توفير خلية أولية معزولة وتلامس الخلية الأولية المعزولة مع عامل يربط حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم ؟ الموقع IVT, كص ات رغلا TYY (طبقاً ل 19 UCSC Genome Browser hg مجموعة جينوم بشري), Yo وبناءً عليه خفض التعبير عن BCL1 1A أو بروتين MRNA . في أحد النماذج, يتم في الطلب الحالي تقديم طريقة لإنتاج خلية أولية معزولة تتسم بتعبير منخفض عن mRNA 801118 أو البروتين, تشتمل الطريقة على تلامس خلية أولية معزولة بعامل يرتبط ليحدث تعديل لا جيني في حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم ؟ وبناءً عليه خفض التعبير عن /80111 أو بروتين MRNA . في أحد النماذج, يكون التعديل اللا جيني في حمض CAR
١١
UCSC (طبقاً ل 1١7 ,778 Tem A IT Te الجينومي عند الكرموسوم ؟ الموقع DNA .(human genome بشري asin مجموعة Genome Browser hg 19 في أحد النماذج, يتم في الطلب الحالي تقديم طريقة لإنتاج خلية أولية معزولة تتسم بتعبير منخفض أو البروتين, تشتمل الطريقة على توفير خلية أولية معزولة وتلامس الخلية 801118 mRNA عن الجينومي للخلية على الكرموسوم ؟ DNA الأولية المعزولة مع عامل ينتج تعديل لا جيني في حمض © في أحد النماذج, يكون التعديل . MRNA أو بروتين BCLIIA وبناءً عليه خفض التعبير عن
TAY خالا Tem A YT Te للكرمروسوم ١ الجينومي عند موقع DNA اللاجيني في حمض مجموعة جينوم بشري). UCSC Genome Browser hg 19 (طبقاً ل الكشف الموصوف في الطلب الحالي, في نموذج مفضل, لا يتعلق بعملية لاستتساخ كائنات بشرية, عمليات لتعديل الهوية الجينية للسلالة الجرثومية للكائنات البشرية, واستخدامات الأجنة البشرية ٠ لأغراض صناحية أو تجارية أو عمليات لتعديل الهوية الوراثية للحيوانات التي يحتمل أن تجعلها تعاني دون أي فائدة أساسية طبية للإنسان أو الحيوان, وأيضاً الكائنات الناتجة من مثل هذه العمليات. أحد جوانب الموصوف في الطلب الحالي يتعلق بطريقة لإنتاج خلية بشرية مهندسة وراثياً معزولة تتسم بتعديل جيني واحد على الأقل تشتمل على تلامس الخلية مع كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير من إندونيوكلياز DNA على إندونيوكلياز يستهدف حمض ٠
DNA ويشطر حمض DNA والتي بواسطتها يستهدف إندونيوكلياز حمض DNA يستهدف حمض
UCSC (طبقاً ل 11 ,778 ,10-184 ,7136 Te الجينومي للخلية على الكرموسوم ؟ الموقع مجموعة جينوم بشري) ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه. Genome Browser hg 9 يتعلق جانب آخر تم تقديمه في الطلب الحالي بطريقة لزيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني في خلية أو التعبير عن البروتين في الخلية. في 801118 MRNA معزولة, تشتمل الطريقة على تخفيض Yo أو البروتين بواسطة ويتسبب في 801118 MRNA أحد الجوانب, يتم تحقيق تخفيض التعبير عن , ٠١ الجينومي للخلية على الكرموسوم ؟ الموقع DNA تعديل جيني واحد على الأقل عند حمض مجموعة جينوم UCSC Genome Browser hg 19 (طبقاً ل TYY لماص اتمبغالا, LY أو البروتين بواسطة 801118 MRNA بشري). في جانب آخر, يتم تحقيق تخفيض التعبير عن ١ الجينومي للخلية على الكرموسوم DNA ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل عند حمض YO yy يترتب عليه تعديل لا جيني للوظيفة الجينية عند 117 ,778 ,10-184 VT ,10 الموقع في هذا الجانب, يتم تخفيض نشاط محسن .117 ,774 Tem A YY الكرموسوم ؟ الموقع بواسطة IY LYYA 1-184 VY Te 7 الموجود داخل موقع هذا الكرموسوم 861118 أو التعبير عن 801118 MRNA التخفيض في هذا الجانب, تكون فعالية المحسن في تحسين أقل, على الأقل 770 أقل, 77١0 أقل, على الأقل 7٠١ البروتين في الخلية أقل بنسبة 75 على الأقل أقل, على الأقل .75 أقل, على الأقل 7760 أقل, على الأقل 79760 أقل, على الأقل Zee على الأقل أقل, على الأقل 790 أقل, على الأقل ١-ضعف أقل, على الأقل ١-ضعف أقل, على الأقل ٠ فعض-٠٠٠١ ضعف أقل, على الأقل ٠٠١ ضعف أقل, على الأقل ٠١ أقل, على الأقل فعض-٠ أقل, أو أكثر مقارنة بخلية مقارنة لم تتم معالجتها في أية طريقة تم الكشف عنها في الطلب الحالي. أو التعبير عن البروتين في الخلية أن التعبير عن البروتين 801118 MRNA المقصود بتخفيض ٠ أقل, على الأقل 7780 أقل, 77١8 أقل, على الأقل 7٠١ على الأقل على الأقل Te يكون أقل بنسبة أقل, على الأقل .75 أقل, على الأقل 7760 أقل, على الأقل 79760 أقل, على الأقل 74٠0 على الأقل أقل, على الأقل 790 أقل, على الأقل ١-ضعف أقل, على الأقل ١-ضعف أقل, على الأقل ٠ فعض-٠٠٠١ JY) ضعف أقل, على ٠٠١ ضعف أقل, على الأقل ٠١ أقل, على الأقل ano في الطلب الحالي. lee أقل, أو أكثر مقارنة بخلية مقارنة لم تتم معالجتها في أية طريقة تم الكشف ١٠ يتعلق جانب آخر تم تقديمه في الطلب الحالي بطريقة لزيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني في خلية 8061118 MRNA معزولة, تشتمل الطريقة على توفير خلية بشرية أو خلية أولية معزولة وتخفيض عن البروتين في الخلية. uel) أو يتعلق جانب آخر تم تقديمه في الطلب الحالي بطريقة لزيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني في خلية, تشتمل الطريقة على خطوات: _تلامس خلية بشرية معزولة مع كمية فعالة من تركيبة تشتمل على Yo أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير من إندونيوكلياز DNA الأقل على إندونيوكلياز يستهدف حمض
DNA يشطر حمض DNA بواسطتها يستهدف إندونيوكلياز حمض (Ally DNA يستهدف حمض 0656 (طبقاً ل 11 ,778 ,10-184 VT ,60 جينومي للخلية على الكرموسوم ؟ الموقع مجموعة جينوم بشري) ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه, Genome Browser hg 9 والتي بواسطتها يزيد التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني في الخلية, أو سليفتها, بالنسبة إلى الخلية قبل YO التلامس. CAR
و يتعلق جانب آخر تم تقديمه في الطلب الحالي بطريقة لزيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني في خلية, تشتمل الطريقة على خطوات توفير خلية بشرية أو خلية أولية معزولة, تلامس خلية بشرية أو خلية أولية معزولة مع كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكلياز يستهدف حمض 0108 أو ناقل تعبير Jang متوالية التشفير من إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA والتي بواسطتها يستهدف © إندونيوكلياز حمض DNA ويشطر حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم ؟ الموقع ٠١ , LY لماص اتمبغالا, TYY (طبقاً ل 19 UCSC Genome Browser hg مجموعة جينوم بشري) ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه, والتي بواسطتها يزيد التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني في الخلية, أو سليفتها, بالنسبة إلى الخلية قبل التلامس. جانب آخر موصوف في الطلب الحالي يتعلق بطريقة لزيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني في ثديي ٠ في حاجة إليه, تشتمل الطريقة على تخفيض mRNA 8011/8 أو التعبير عن البروتين في خلية أولية لتكوين الدم في الثتديي. في أحد الجوانب, يتم تحقيق تخفيض التعبير عن MRNA 861118 أو البروتين بواسطة ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل عند حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم ؟ الموقع 66 VTA, T= AG VAT 117 (طبقاً ل UCSC Genome Browser hg 9 مجموعة جينوم بشري). في جانب آخر, يتم تحقيق تخفيض التعبير عن BCLIIA mRNA ١ أو البروتين بواسطة ويتسبب في تعديل لا جيني واحد على الأقل عند حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم ؟. في جانب آخر, يتم تحقيق تخفيض التعبير عن mRNA 861118 أو البروتين بواسطة ويتسبب في تعديل لا جيني واحد على الأقل عند حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم > الموقع TAS YY TT خالا 117 جانب آخر موصوف في الطلب الحالي يتعلق بطريقة لزيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني في ثديي ٠ في حاجة إليه, تشتمل الطريقة على توفير خلية بشرية أو خلية أولية معزولة من ثديي وتخفيض mRNA 801118 أو التعبير عن البروتين في الخلية. في أحد الجوانب, تشتمل الطريقة Lad على انتقاء ثديي في حاجة إلى زيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني فيه. جانب آخر موصوف في الطلب الحالي يتعلق بطريقة لزيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني في ثديي في حاجة إليه, تشتمل الطريقة على خطوات تلامس خلية أولية لتكوين الدم في (til) مع كمية فعالة YO من تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير من إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA والتي بواسطتها يستهدف إندونيوكلياز حمض DNA CAR
Ad — \ — ويشطر حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم ؟ المروقع 0, YA TIAL YT 17 (طبقاً ل 19 UCSC Genome Browser hg مجموعة جينوم بشري) ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه, والتي بواسطتها يزيد التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني في الثديي, بالنسبة إلى التعبير قبل التلامس. © جانب AT موصوف في الطلب الحالي يتعلق بطريقة لزيادة مستويات الهيموجلويين الجنيني في ثديي في حاجة إليه, تشتمل الطريقة على خطوات توفير خلية بشرية معزولة أو خلية أولية أو مجموعة معزولة LDA أولية لتكوين pall من ثديي تلامس the الخلية البشرية أو خلية أولية أو خلية أولية لتكوين pal مع كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير من إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA والتي بواسطتها يستهدف ٠ إندونيوكلياز حمض DNA ويشطر حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم ؟ الموقع ٠١ , LY لماص اتمبغالا, TYY (طبقاً ل 19 UCSC Genome Browser hg مجموعة جينوم بشري) ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه, والتي بواسطتها يزيد التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني في ail) المذكور, بالنسبة إلى التعبير قبل التلامس. يتعلق جانب آخر تم تقديمه في الطلب الحالي بطريقة لزيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني في ثديي Vo في حاجة إليه, تشتمل الطريقة على زرع خلية بشرية مهندسة وراثياً وفقاً للموصوف في الطلب الحالي في التديي. في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوف في الطلب الحالي, تشتمل الطريقة أيضاً على توفير خلية معزولة أو خلية أولية معزولة أو مجموعة معزولة من الخلايا التي يمكن أن تكون خلية أولية أو خلية أولية لتكوين الدم .hematopoietic progenitor cell ٠ في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوف في الطلب الحالي, تكون الخلية المعزولة خلية أولية معزولة .isolated progenitor cell في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوف في الطلب الحالي, تكون الخلية الأولية المعزولة خلية بشرية معزولة .isolated human cell في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوف في الطلب الحالي, الخلية البشرية YO المعزولة تكون خلية أولية لتكوين الدم.
_ \ ¢ —_ في نموذج AT من هذا الجانب وجميع الجوانب (AY) الموصوف في الطلب الحالي, تكون الخلية المكونة للدم عبارة عن خلية لسلالة إريثرويد. تعرف طرق Je خلية أولية لتكوين الدم جيداً في المجال, على سبيل المثال, بواسطة تتقية قياس التدفق الخلوي لخلايا +CD34 أو 00133+ , الخرزات الدقيقة المترافقة مع الأجسام المضادة ضد CD34 أو 133 ,CD مرقمات خلية أولية لتكوين © الدم. تتوفر كذلك الأطقم التجارية, على سبيل المثال, MACS® Technology CD34
STEMCELL™ Technology البشرية, و , 21034 MultiSort Kit البشرية, و ,MicroBead Kit . 501100009801 Kit خلية أولية لتكوين الدم EasySep™ Mouse في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, الخلية البشرية تكون خلية جذعية مستحثة متعددة القدرات .induced pluripotent stem cell (IPSC) ٠ في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوف في الطلب الحالي, يمكن أن يكون تلامس أية خلية موصوف في الطلب الحالي خارج الجسم الحي أو في المعمل أو في الكائن الحي. أية خلية موصوف في الطلب الحالي يشتمل على تلامس بعامل يربط حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم Yo ويحدث تعديل لا جيني في الجينوم للخلية على الكرموسوم , وبناءً عليه خفض Vo التعبير عن 806111 أو بروتين MRNA . في أحد النماذج, يكون التعديل اللا جيني على الكرموسوم 7 الموقع ,خالا TYY LVYALT— YA (طبقاً ل UCSC Genome Browser hg 9 مجموعة جينوم بشري). في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوف في الطلب الحالي, التعديل اللا جيني واحد على الأقل في حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم ١ على نحو غير مباشر أو .١ للكرموسوم 1١7 ,748 STA YT Te مباشرةٌ يؤثر على الموقع Ye ,1 0-1894 YT Te وفقاً لاستخدامه في الطلب الحالي, 'يؤثر على نحو غير مباشر على الموقع
DNA للكرموسوم 7" يشير إلى تأثيرات المسافة الطويلة على تعديل لا جيني في حمض 117 ,774 للكرموسوم ا TYY الجينومي للخلية على الكرموسوم للموقع دا خالا تغناص ا بكار في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوف في الطلب الحالي, تلامس أية Yo خلية موصوف في الطلب الحالي يشتمل على تلامس بعامل يربط حمض DNA الجينومي للخلية CAR
اج \ _ على الكرموسوم ؟ الموقع VAT, 0-184 1, 72748, 117 (طبقاً ل UCSC Genome Browser hg 9 مجموعة جينوم بشري), ويحدث تعديل لا جيني على الكرموسوم ,١ وبناءً عليه في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوف في الطلب الحالي, تلامس أية © خلية موصوف في الطلب الحالي يشتمل على تلامس مع كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إنزيم يستهدف حمض DNA أو BU تعبير يحمل متوالية التشفير لإنزيم يستهدف حمض DNA All بواسطتها the إنزيم يستهدف حمض DNA يحدث تعديل لا جيني على الكرموسوم ,١ وبناءً في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوف في الطلب الحالي, تلامس أية ٠ خلية موصوف في الطلب الحالي يشتمل على تلامس مع كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إنزيم يستهدف حمض DNA أو BU تعبير يحمل متوالية التشفير لإنزيم يستهدف حمض DNA والتي بواسطتها the إنزيم يستهدف حمض DNA يحدث تعديل لا جيني على الكرموسوم ؟ الموقع مال تاللا كخناص اتمبغالا, TYY (طبقاً UCSC Genome Browser hg 19 J مجموعة جينوم بشري) وبناءً عليه خفض التعبير عن BCLIIA أو بروتين MRNA . في أحد الجوانب, يزيد VO التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني في الثديي, بالنسبة إلى التعبير قبل التلامس. في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يتم تلامس الخلية الأصلية لتكون الدم, الخلية البشرية المعزولة, أو خلية معزولة خارج الجسم الحي أو في المعمل في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يكون التعديل Yo الجيني الواحد على الأقل حذف. في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, التعديل اللا جيني واحد على الأقل. في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يشتمل الحذف على واحد أو أكثر من المواقع مفرطة الحساسية ل 1 ,0A+ ,17+ (DHS) DNAse ,+00 وفقاً للموصوف في الطلب الحالي في قسم الأمثلة. في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب YO الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يتكون الحذف في الأساس من واحد أو أكثر من المواقع مفرطة CAR
Cyne وفقاً للموصوف في الطلب الحالي في قسم 0045 ,0A+ ,17+ (DHS) DNAse 1 الحساسية ل
DNAse 1 الأمثلة. في نموذج آخر, يتكون الحذف من واحد أو أكثر من المواقع مفرطة الحساسية ل وفقاً للموصوف في الطلب الحالي في قسم الأمثلة. 00+, 0A+ ,17+ (DHS) في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, التعديل اللا hypersensitive sites جيني يشتمل على أو يؤثر على واحد أو أكثر من المواقع مفرطة الحساسية © وفقاً للموصوف في الطلب الحالي في قسم الأمثلة. وفقاً 0045 ,0A+ ,17+ (DHS) DNAse 1 ل لاستخدامه في الطلب الحالي, العبارة 'يؤثر على واحد أو أكثر من المواقع مفرطة الحساسية ل
DNAse 1 يعني أنه يتم تخفيض الوظيفة الطبيعية لهذه المواقع مفرطة الحساسية ل "DNAse 1 على سبيل المثال, الوصول إلى عوامل الانتساخ أو إنزيمات انحلال , 00+ 5 ,0A+ ,17+ (DHS) هي (DHSs) DNase | بصفة عامة؛ تكون مواضع مفرطة الحساسية ل .001856 | Ji ملالا في هذه . DNase | التي تكون حساسة لانشطار بواسطة إنزيم chromatin مناطق الكروماتين مما يجعل من (DNA المناطق المحددة من الجينوم, فقد الكروماتين بنيته المكثفة؛ كاشفاً حمض
Jie للانحلال بواسطة الإنزيمات؛ DNA الممكن الوصول إليه. الأمر الذي يثير إتاحة حمض تكون مناطق الكروماتين هذه القابلة للوصول إليها مرتبطة وظيفياً بنشاط انتساخي؛ ونظراً . DNase ا لأن هذه الحالة المعاد نمذجتها تكو ضرورية لارتباط البروتينات مثل عوامل الانتساخ. وعلى هذا النحو, يترتب على التعديل اللا جيني المتوقع في الطلب الحالي إمكانية وصول منخفض لإنزيمات أقل, 77١0 أقل, على الأقل 7٠١ تكون يكون أقل بنسبة 75 على الأقل على الأقل DNA انحلال أقل, على الأقل 7460 أقل, على الأقل .75 أقل, على الأقل 7760 أقل, على الأقل 77٠0 على الأقل -١ أقل, على الأقل ١-ضعف أقل, على الأقل Za أقل, على الأقل TA أقل, على الأقل 7٠ ضعف أقل, ٠٠١ ضعف أقل, على الأقل ٠١ ضعف أقل, على الأقل ٠-ضعف أقل, على الأقل Ye على الأقل ١٠٠٠-ضعف أقل, أو أكثر مقارنة بخلية مقارنة لم تتم معالجتها في أية طريقة تم الكشف عنها في الطلب الحالي. في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يشتمل الحذف الموصوفة في الجدول 7. في نموذج آخر من هذا SNP markers على واحد أو أكثر من مرقمات الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يتكون الحذف في الأساس من واحد أو Yo من هذا الجانب وجميع الجوانب HAT الموصوفة في الجدول 7. في نموذج SNP أكثر من مرقمات
CAR yy الموصوفة SNP الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يتكون الحذف من واحد أو أكثر من مرقمات .7 في الجدول في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, التعديل اللا الموصوفة في الجدول 7. وفقاً SNP جيني يشتمل على أو يؤثر على واحد أو أكثر من مرقمات تعني أنه تم " SNP ا لاستخدامه في الطلب الحالي, العبارة 'يؤثر على واحد أو أكثر من من مرقمات على سبيل المثال, الوصول إلى عوامل الانتساخ. , SNPS تخفيض الوظيفة (الوظائف) الطبيعية لهذه إلى تخفيض ارتباط SNPs لهذه methylation على سبيل المثال, يمكن أن تؤدي المعالجة بالميثيل . MRNA عوامل الانتساخ, مما يؤدي إلى التعبير المنخفض عن /80111 أو بروتين في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يشتمل الحذف في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع .١7 على واحدة أو أكثر من الشظايا المدرجة في الجدول ٠ الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يتكون الحذف في الأساس من واحدة أو أكثر من في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة .١7 الشظايا المدرجة في الجدول في نموذج .١7 في الطلب الحالي, يتكون الحذف من واحدة أو أكثر من الشظايا المدرجة في الجدول ,٠١ آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يكون الحذف من
YY Te gma, AY الا Te VAT VT Te ,من ,778 Te الاق إلى Ye من 10, 5,777 » إلى , +1 1/14 Te اأالا, 11 إلى Te من YY YA LT إلى 7 إلى م 7132 111,٠١ آلا ,من ٠ إلى AVY خالا Te من , 6 VYY ,٠
IVA فده إلى نت TY Te oe, AAR TYE Te 1ه إلى 177 ST ",من TVA من SAA LYYY Te إلى ١١ YY) ,10 ceo TLV ,10 إلى 779 VY Te من YY ,٠ا١ ge, Yo VE ٠ ذلا إلى VY ,1٠ ee, EY) VY ٠ الا يألا إلى Th Yo
AYN ١ أو من ,اد١ SAY ,0 ,من نا تام 8 إلى VER Te ا إلى EA
LOOT ام Te إلى 4 في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, التعديل
Lay .7 اللاجيني يشتمل على أو يؤثر على واحدة أو أكثر من الشظايا المدرجة في الجدول "7 الاستخدامه في الطلب الحالي, العبارة 'يؤثر على واحدة أو أكثر من الشظايا المدرجة في الجدول 5 تعني أنه يتم تخفيض الوظيفة (الوظائف) الطبيعية لهذه الشظايا, على سبيل المثال, الوصول إلى
CAR yA عوامل الانتساخ. على سبيل المثال, المعالجة بالميثيل لهذه الشظايا يمكن أن تخفض ارتباط عوامل . MRNA أو بروتين BCL11A الانتساخ, مما يؤدي إلى التعبير المنخفض عن في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يكون التعديل
IIE Te إلى VAT YT Te من ,117 ,78 LT اللا جيني من 184,716,360 إلى
See TYNE Te إلى 7756 VY Te رخالا, 117 , من ١ من 10, 77ل, 347 إلى AY. 8
Cle ,من YAY ,777 160 إلى 9 VY 4,10 من , 84/77 Te ذ, "الات إلى ,171 01١ ,من 1483 TY ET إلى OFT 177 ,٠١ ae, «YY TYAS إلى 12 , إلى 7١١ VY) 10 من , oT Te إلى 1 ,الا١/ Te من YY ,174 LT 5ه إلى , a إلى YO VY Te نمر,كا١ ,2771 ٠ إلى YA« آلا 4,٠١ من ,90A ,/77 ,٠
AYY Te من 875,10 8 إلى , 7/44 Te .لا ,من 60ل 2 إلى Ys
LOOT م Te لام فده إلى JT أو من ,10١ في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يزيل الحذف أو يزيل جزء من المنطقة 117 ,7748 LT AG ,715 Te كامل المنطقة بين الكرموسوم 7 الموقع
La, (DHS) DNAse 1 مما يترتب عليه تمزق واحد أو أكثر من مواقع مفرطة الحساسية ل الاستخدامه في الطلب الحالي, التعبير 'تمزيق” يشير إلى تخفيض في انتساخ 861118 شبيه ٠5
DNAse - بالكريات الحمراء في خلية تشتمل على تمزق واحد أو أكثر من مواقع مفرطة الحساسية ل
Ste على الأقل ve على الأقل ZY على الأقل (على سبيل المثال, على الأقل 7٠ بنسبة 1 على الأقل Za على الأقل ZA على الأقل Tye الأقل eT على الأقل ,75 ٠. على الأقل (أي, لا يوجد انتساخ قابل للكشف لشبيهة بالكريات الحمراء)) 7٠٠0 على الأقل 794 أو حتى 700 مقارنة بخلية لا تتسم بمثل هذا التمزق. في أحد النماذج, يشتمل التمزق على عدم قدرة موضع معدل Yo
GATAL للارتباط بعوامل انتساخه الأصلية (على سبيل المثال, DNAse -1 مفرط الحساسية ل (TALI في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, التعديل اللا جيني الذي يتداخل مع تكوين و / أو المحافظة على البصمة اللاجينية عند منطقة المحسن على
UCSC Genome Browser (طبقاً ل TYY LVYALT— YA الكرموسوم 7 الموقع ,خالا Yo
CAR
hg 9 مجموعة جينوم بشري) وبناءً عليه مما يؤدي إلى التعبير المنخفض عن عن 80111 أو بروتين MRNA , وزيادة التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني في الثديي. في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, التعديل اللا جيني الذي يتداخل مع تكوين و / أو المحافظة على البصمة اللاجينية عند منطقة المحسن على fo الكرموسوم 7 الموقع ,خالا TYY LVYALT— YA (طبقاً ل UCSC Genome Browser hg 19 مجموعة جينوم بشري) تتضمن ولكن ليس على سبيل الحصر تعديلات لاجينية تؤثر على حساسية | DNase , تعديلات لاجينية تؤثر على تعديلات الهستونات, تعديلات لاجينية تؤثر على ارتباط GATAL/TALL , وتعديلات لاجينية تؤثر على تفاعل المعزز على المدى البعيد للمعزز من .BCL11A على سبيل المثال, التعديل اللاجيني الذي يتداخل مع تكوين و / أو المحافظة على البصمة اللاجينية عند منطقة المحسن على الكرموسوم ؟ الموقع Tem VA YT Te 774, 117 يتضمن ولكن ليس على سبيل الحصر واحد على الأقل من حذف داخل الكرموسوم ؟ الموقع 60, 715, -١84 LTS 1, 117 بحيث تتأثر الوظيفة الكلية لهذه المنطقة والتي بواسطتها تقليل أو تخفيض التعبير عن mRNA أو 801118 . على سبيل المثال, يكون الحذف عند مناطق حساسية DNasel ٠ الكرموسوم Yo الموقع Tam VAS VY Te 774, 117, على سبيل المثال, +17, L005 0A يمكن أن يكون الحذف عند +67 أو +88 أو cod أو توليفة منه. على سبيل الأمتلة, عند +17 وج ره +00 +17 +00 أو عند جميع الثلاثة من +17, OM 5 +00 كمثال آخر, التعديل اللاجيني الذي يتداخل مع تكوين و / أو المحافظة على البصمة اللاجينية عند منطقة المحسن على الكرموسوم ؟ الموقع Tm YA YT Te 7748, 117 يتضمن ولكن ليس ٠ على سبيل الحصر تغييرات في تعديلات الهستونات على الكرموسوم ؟ الذي لا يكون في الموقع ,٠١ LYALL TSA, 7 117, أو تغييرات في تعديلات الهستونات على الكرموسوم ؟ عند الموقع د الا, LYALL TAG 117, أو كل من تعديلات الهستونات على الكرموسوم ؟ ليست عند الموقع 10, YT 184-:1, 774, 117 وكذلك عند عند الموقع LT SIAL TT خالا ٠١ بحيث تتأثر الوظيفة الكلية لهذه المنطقة والتي بواسطتها تقليل أو تخفيض التعبير عن MRNA Yo أو .BCL1IA CAR
=« اذ في نموذج آخر, التعديل اللاجيني الذي يتداخل مع تكوين و / أو المحافظة على البصمة اللاجينية عند منطقة المحسن على الكرموسوم ؟ الموقع Tem VA YT Te 774, 117 يتضمن ولكن ليس على سبيل الحصر إدخال واحد على الأقل من متوالية محددة بالمخمد معالجة بالهندسة الوراثية تغير السمات اللاجينية للعناصر غير المشفرة عند الكرموسوم ؟ الموقع YA LTA TT © 117 وبالتالي يترتب على ذلك إخماد التعبير الجيني المستهدف. يتم التركيز من الأول على any التحديد على محسنات فردية للإخماد على نحو لا جيني. بعبارة أخرى؛ يمكن أن يؤدي إدخال متواليات محددة بالمخمد معالجة بالهندسة الوراثية في الكروموسوم 7 إلى تداخل على متوقع مع التعديل جين 80111/8. Vo يمكن استخدام أي طرق معروفة في المجال لإنتاج التعديل اللا جيني المتوقع. على سبيل المثال, وفقاً للموصوف في 2013 ,Mendenhall E.
M. et al., Nat.
Biotechnol. 06 September و2013 2013 .Maeder ML et al., Nat Biotechnol. 09 October في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, إدخال متوالية محددة بالمخمد معالجة بالهندسة الوراثية واحدة على الأقل على أي موقع كرموسوم ؟ يترتب عليه Vo ولكن لا يقتصر على ذلك مناطق منخفضة الحساسية DNasel عند الكرموسوم ” للموقع ٠١ , , كاحء1, 1١7 YYA , على سبيل المثال, +17, 0A+ ,+00 تعديلات هستونات متزايدة على الكرموسوم ؟ للموقع LVYA ,1 184 VAT Te 117: وعوامل انتساخ منخفض ترتبط ب 1 لمنطقة المحسن على الكرموسوم ؟ للموقع TT كاحت POY LYYA وتفاعل منخفض أو مضعف بين الكرموسوم 7 للموقع Tam YA YT, 274, 117 مع معزز BCL11A ٠٠ . في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, تكون التأثيرات الكلية لإدخال متوالية محددة بالمخمد معالجة بالهندسة الوراثية واحدة على الأقل على أي موقع كرموسوم Y تعبير منخفض أو أقل عن mRNA و BCL 1 1A . في بعض النماذج , وفقاً لما هو مستخدم في سياق MRNA والتعبير عن /80111, التفاعل بين YO الكرموسوم ؟ للموقع VYA ,1:-144 WT, 117 أو محسن 8061118 مع معزز CAR
١ لمنطقة المحسن, التعبير 'منخفض” أو GATAL/TALL, وعوامل الانتساخ التي ترتبط , 86118 أقل, على الأقل 770 أقل, على الأقل 7٠١ يشير إلى أقل بنسبة 75 على الأقل على الأقل mead أقل, ye أقل, على الأقل 700 أقل, على الأقل Tee أقل, على الأقل Zee أقل, على الأقل أقل, على الأقل 7960 أقل, على الأقل ١-ضعف أقل, على الأقل 7"-ضعف أقل, TA على الأقل ضعف أقل, على الأقل ٠٠١ ضعف أقل, على الأقل ٠١ على الأقل 5٠-ضعف أقل, على الأقل 5 أقل, أو أكثر مقارنة بالموقف المقارن الذي يكون في عدم وجود التعديل اللاجيني أو فعض-٠ 861118 | إدخال المتواليات المعالجة بالهندسة الوراثية في الطلب الحالي. المقصود بتخفيض أو التعبير عن البروتين في الخلية يعني أن التعبير عن البروتين يكون أقل بنسبة 75 على MRNA أقل, على Zee أقل, على الأقل 770 أقل, على الأقل 77١0 أقل, على الأقل 7٠١ الأقل على الأقل
Za أقل, على الأقل TA الأقل 750 أقل, على الأقل 700 أقل, على الأقل 770 أقل, على الأقل Ys أقل, على الأقل ١-ضعف أقل, على الأقل ١-ضعف أقل, على الأقل -- ضعف أقل, على الأقل ضعف أقل, على الأقل ١٠٠٠-ضعف أقل, أو أكثر مقارنة بخلية ٠٠١ ضعف أقل, على الأقل ٠ مقارنة لا تتسم بالتعديل اللا جيني أو إدخال المتواليات المعالجة بالهندسة الوراثية في الطلب الحالي. في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يحدث إدخال
DNasel متوالية محددة بالمخمد معالجة بالهندسة الوراثية واحدة على الأقل داخل مناطق الحساسية ل ١ 00+ 5 OA ,17+ على سبيل المثال, ,117 VTA Tem VAS VY TT للكرموسوم ؟ الموقع أو +58 أو 1+ YY أو عند الطرف oot أو oA+ يمكن أن يكون الإدخال عند #'الطرف +67 أو و+250, أو بين +00 و+17. OAF بين OAs 7+ أو بين 00+ في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يغير إدخال
DNasel متوالية محددة بالمخمد معالجة بالهندسة الوراقية واحدة على الأقل مناطق الحساسية ل Yo
SY كاحت خالا VT Te للكرموسوم > الموقع في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, تغير التعديلات
SOY كاحت خالا YY Te الموقع ١ للكرموسوم DNasel اللاجينية مناطق الحساسية ل في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, تغير التعديلات 117 خالا LT AG YT Te اللاجينية تعديلات الهستونات على الكرموسوم > للمرقع YO
CAR
_— \ اذ في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يغير إدخال متوالية محددة بالمخمد معالجة بالهندسة الوراثية واحدة على الأقل تعديلات الهستونات على الكرموسوم Y للمرقع LTA VT LT خالا CY في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, تغير التعديلات © اللاجينية GATAL/TALL Lis) _لمنطقة المحسن على الكرموسوم ؟ للموقع -١84 ,7156 Te IY ,»1 LTS بحيث تتأثر الوظيفة الكلية لهذه المنطقة والتي بواسطتها تقليل أو تخفيض التعبير عن mRNA أو 861118 . على سبيل المثال, ارتباط عوامل الانتساخ ب 687781/1/811. في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يحدث إدخال متوالية محددة بالمخمد معالجة بالهندسة الوراثية واحدة على الأقل داخل GATAL/TALL وفقاً Yo للموصوف في الطلب الحالي. يمكن أن يكون الإدخال عند #' الطرف أو الطرف 'Y 67/81 أو 1/1 . يمكن أن يكون الإدخال بين 687/81 TALL; يغير الإدخال ارتباط 6/81781/1/811 لمنطقة المحسن على الكرموسوم ¥ للموقع 1١7 ,72748 LTA TT بحيث تتأثر الوظيفة الكلية لهذه المنطقة والتي بواسطتها تقليل أو تخفيض التعبير عن mRNA أو 80611178 . على سبيل المثال, ارتباط عوامل الانتساخ ب 7/81/1/11م/6. Vo في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يغير التعديل اللاجيني التفاعل بين محسن 861118 ومعزز 801118 . في أحد النماذج, يتم تخفيض التفاعل أو إضعافه بحيث تتأثر الوظيفة الكلية لهذه المنطقة والتي بواسطتها تقليل أو تخفيض التعبير عن mRNA أر BCL11A . في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, تغير التعديلات ٠ اللاجينية التفاعل بين الكرموسوم ؟ للموقع 60, 715, Tem AG 7748, 117 مع معزز 861118 . في أحد النماذج, يتم تخفيض التفاعل أو إضعافه بحيث تتأثر الوظيفة الكلية لهذه المنطقة والتي بواسطتها تقليل أو تخفيض التعبير عن mRNA أو 801118 . أيضاً يتم في الطلب الحالي تقديم في جانب AT خلية بشرية مهندسة Uy معزولة تتسم بتعديل جيني واحد على الأقل على الكرموسوم ؟ للموقع Tem) A TT 7748, 117 (طبقاً ل UCSC Genome Browser hg 19 Yo مجموعة جينوم بشري) تم بواسطة lee تلامس الخلية مع كمية CAR
اخ فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير من إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA والتي بواسطتها يستهدف إندونيوكلياز حمض DNA ويشطر حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم ؟ للموقع CIAL YT Te 1١7 ,74 ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه. في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, الخلية البشرية
المعالجة بالهندسة الوراثية معزولة تتسم بتعديل لا جيني واحد على الأقل عند حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم 7. في جانب من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, الخلية البشرية المعالجة بالهندسة الوراثية معزولة تتسم بتعديل لا جيني واحد على الأقل عند حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم للموقع VY تنص ا بلكلا JUYY
٠ في بعض جوانب من أي لهذه خلايا بشرية مهندسة وراثياً معزولة تتسم بتعديل لا جيني واحد على الأقل, يتم زرع الخلايا في ثديي للاستخدام في زيادة الهيموجلوبين الجنيني في الثديي. في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يتم زرع الخلية البشرية المعالجة بالهندسة الوراثية معزولة تتسم بتعديل جيني واحد على الأقل عند حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم للموقع دا خالا تماص ا بكار TYY في ثديي للاستخدام
Ve في زيادة الهيموجلوبين الجنيني في الثديي. في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يتم تخزين الخلية البشرية المعالجة بالهندسة الوراثية معزولة تتسم بتعديل جيني واحد على الأقل عند حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم للموقع ا خللا, تباصا مب مكار TYY للاستخدام اللاحق بواسطة الحفظ بالتبريد.
٠ في بعض جوانب من أي من تلك يتم تخزين خلايا بشرية مهندسة وراثياً معزولة تتسم بتعديل لا جيني واحد على الأقل, الخلايا للاستخدام اللاحق بواسطة الحفظ بالتبريد. في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي,يتم حفظ الخلية البشرية المعالجة بالهندسة الوراثية معزولة التي تتسم بتعديل جيني واحد على الأقل عند حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم للموقع دا خالا تغناص ا بكار TYY بالتبريد , واذابتها
YO وزرعها في ثديي للاستخدام في زيادة الهيموجلوبين الجنيني في الثديي.
OY AY
دوم
في بعض جوانب من أي من تلك الخلايا البشرية المهندسة وراثياً المعزولة تتسم بتعديل لا جيني واحد
على الأقل, يتم حفظها بالتبريد, وتتم إذابتها ويتم زرعها في ثديي للاستخدام في زيادة الهيموجلوبين
الجنيني في الثديي.
يتعلق جانب آخر مقدم في الطلب الحالي بتركيبة تشتمل على خلايا بشرية مهندسة وراثياً معزولة,
© حيث تتسم الخلايا بتعديل جيني واحد على الأقل على الكرموسوم Y للموقع CYA TT
TYY LVYA (طبقاً ل 19 UCSC Genome Browser hg مجموعة جينوم بشري) تم بواسطة
عملية تلامس الخلايا مع كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكلياز يستهدف حمض
DNA أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير من إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA والتي بواسطتها
يستهدف إندونيوكلياز حمض DNA ويشطر حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم ؟ Ye للموقع TYY LVYALT—YA9 VY, (طبقاً ل 19 UCSC Genome Browser hg
مجموعة جينوم بشري) ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه.
يتعلق جانب آخر مقدم في الطلب الحالي بتركيبة تشتمل على خلايا بشرية مهندسة وراثياً معزولة,
حيث تتسم الخلايا بتعديل لا جيني واحد على الأقل على الكرموسوم ؟. في أحد النماذج, يكون
التعديل اللاجيني واحد على الأقل على الكرموسوم ؟ عند الموقع LYALL TA YT Te 7ل yo (طبقاً ل 19 UCSC Genome Browser hg مجموعة جينوم بشري). في نموذج آخر, يتم تعديل
لا جيني واحد على الأقل على الكرموسوم ¥ بواسطة عملية تلامس الخلايا مع كمية فعالة من تركيبة
تشتمل على الأقل على إنزيم يستهدف حمض DNA أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير لإنزيم
يستهدف حمض DNA والذي بواسطته يحدث الإنزيم الذي يستهدف حمض DNA تعديل لا جيني
واحد على الأقل في حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم ١ مما يؤثر على الموقع ,٠١ ٠ الا كتخمناصات بالا TYY (طبقاً ل 19 UCSC Genome Browser hg مجموعة جينوم
بشري) ويتسبب في ذلك.
في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, تحدث التركيبة
زيادة في الهيموجلوبين الجنيني MRNA أو التعبير عن البروتين في خلية التلامس.
oY AY
اج اذ في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, تكون خلايا أي من التركيبات الموصوفة ذاتية المنشاً, إلى الثديي الذي يكون متلقي للخلايا في إجراء زرع, أي, تكون LS DA مشتقة أو تم حصدها من الثديي قبل أي تعديل موصوف . في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, تكون خلايا أي © من التركيبات الموصوفة غير BE Ld إلى الثديي الذي يكون متلقي للخلايا في إجراء زرع, أي, لا تكون خلايا التركيبة مشتقة أو تم حصدها من الثديي قبل أي تعديل موصوف. في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, تكون خلايا أي من التركيبات الموصوفة بحد أدنى من نوع HLA المطابق مع الثديي الذي يكون متلقي للخلايا في إجراء زرع. ٠ في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, تكون خلايا أي من التركيبات الموصوفة خلايا أولية معزولة قبل أي تعديل موصوف. في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, تكون خلايا أي من التركيبات الموصوفة خلايا أولية معزولة مكونة للدم قبل أي تعديل موصوف. في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, تكون خلايا أي ge 5 التركيبات الموصوفة WDA جذعية معزولة مستحثة متعددة القدرة قبل أي تعديل موصوف. في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يشتمل الحذف على واحد أو أكثر من المواقع مفرطة الحساسية ل 1 ,0A+ ,17+ (DHS) DNAse و+ده وفقاً للموصوف في الطلب الحالي في قسم الأمثلة . في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يتكون الحذف في الأساس من واحد أو أكثر من المواقع مفرطة ٠ الحساسية ل 1 0A+ ,17+ (DHS) DNAse و+هه وفقاً للموصوف في الطلب الحالي في قسم الأمثلة . في نموذج آخر, يتكون الحذف من واحد أو أكثر من المواقع مفرطة الحساسية ل DNAse 0A+ ,17+ (DHS) 1 0045 وفقاً للموصوف في الطلب الحالي في قسم AB) . في أحد النماذج, وفقاً لاستخدامه في الطلب الحالي, التعبير "جزء' في سياق الحذف الجينومي على الأقل 7٠١ إلى حوالي ل من المنطقة المحددة. في نماذج أخرى, يكون الجزء المحذوف على f لأقل YAR , على CAR
Cyr على الأقل Ave على الأقل Ze الأقل edo على الأقل Ze الأقل 770, على الأقل من المنطقة المحددة. 72٠٠١ الأقل 72955, على الأقل 799 أو حتى ea على الأقل TA في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يشتمل الحذف الموصوفة في الجدول 7. في نموذج آخر من هذا الجانب SNP على واحد أو أكثر من مرقمات وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يتكون الحذف في الأساس من واحد أو أكثر من © الموصوفة في الجدول ". في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى SNP مرقمات الموصوفة في SNP الموصوفة في الطلب الحالي, يتكون الحذف من واحد أو أكثر من مرقمات
NX الجدول في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يشتمل الحذف على واحدة أو أكثر من الشظايا المدرجة في الجدول 7. في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع ٠ الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يتكون الحذف في الأساس من واحد أو أكثر من في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة .١ الشظايا المدرجة في الجدول في الطلب الحالي, يتكون الحذف من واحدة أو أكثر من الشظايا المدرجة في الجدول 7. في نموذج ,٠١ آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يكون الحذف من
YY Te من AY !آل Te إلى YAR VT Te لالاكذا إلى نتبخالا, ,من Ye
COTLYYY Te eo TLV 0 اأالا, 1 إلى LT رخالا, ,من ١ إلى 7 إلى FATTY LT من YAY VY Te إلى ق٠ YY E Te إلى 0, “الاب , من
Cle إلى 815 IY Te من AAS TYE Te برخلا ",من نا 177 1 إلى
YY Te إلى 7٠١ YY 16 من , TTL, Te الا 735 إلى LT الا من ,1
NOE VE Te قلا إلى 74 Te الاك من VY Te إلى VAL YY E Te دقر من ٠ أو من ,101 SAYY Te إلى ERA LAY Te لاك من Te أ“ إلى YEA LT من LOOT كم Te اك قف إلى TL في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يزيل الحذف 0656 (طبقاً ل 1١7 ,778 Tem A ITT كامل المنطقة بين الكرموسوم ؟ للموقع مجموعة جينوم بشري) أو يزيل جزء من المنطقة مما يترتب عليه Genome Browser hg 19 Yeo .)0115( DNAse 1 تمزق واحد أو أكثر من مواقع مفرطة الحساسية ل
CAR
_ 7 اذ في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, تشتمل الطريقة أيضاً على انتقاء ثديي في حاجة إلى زيادة الهيموجلوبين الجنيني. في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, تم تشخيص الثديي على أنه مصاب باعتلال الهيموجلوبين. © في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يكون الثديي
الذي في dala إلى زيادة الهيموجلوبين الجنيني قد تم تشخيصه أنه مصاب باعتلال الهيموجلوبين. في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يكون اعتلال الهيموجلوبين 8 -اعتلال الهيموجلوبين —hemoglobinopathy 8 . في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يكون اعتلال
٠ - الهيموجلويين مرض الخلية المنجلية. في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يكون اعتلال الهيموجلويين م8 -ثلاسيميا —thalassemia 8 . في أحد النماذج من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, يتم إعطاء الخلية المتلامسة, الخلية البشرية, خلية أولية لتكوين الدم أو سليفتها إلى الثديي.
VO في أحد النماذج, يقدم هذا الكشف طريقة لزيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني في ثديي في حاجة إليه, تشتمل الطريقة على خطوات توفير مجموعة معزولة من خلايا أولية لتكوين الدم أو خلايا جذعية لتكوين الدم من الثديي في خارج الجسم الحي, وتلامس مجموعة من خلايا أولية أو خلايا جذعية لتكوين pall مع كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير من إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA والتي بواسطتها يستهدف
,٠١ الجينومي للخلية على الكرموسوم ؟ للموقع DNA ويشطر حمض DNA إندونيوكلياز حمض ٠ ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه, والتي بواسطتها يزيد 117 LYYA LTS YAR 7 التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني في الثديي, بالنسبة إلى التعبير قبل التلامس. في نموذج إضافي من هذه الطريقة, يتم حفظ المجموعة التي تم تلامسها من الخلايا الأولية أو الخلايا الجذعية لتكوين الدم إدخالها في الثديي. sale] التي تتسم بتعبير متزايد عن الهيموجلوبين الجنيني بالتبريد ويتم تخزينها أو
CAR
A —_ اذ في نموذج آخر, تتم إذابة المجموعة التي تم حفظها بالتبريد من الخلايا الأولية أو الخلايا الجذعية لتكوين الدم التي تتسم بتعبير متزايد عن الهيموجلوبين الجنيني وبعد ذلك تتم sale) إدخالها في الثديي. في نموذج إضافي من هذه الطريقة, تشتمل الطريقة على علاج كيميائي و / أو علاج إشعاعي لإزالة أو تخفيض خلايا أولية أو خلايا جذعية داخلية المنشاً لتكوين الدم في الثديي. في أي من النماذج © على الطريقة الموصوفة, الخلايا الأولية أو الخلايا الجذعية لتكوين الدم يمكن توزيعها باستخدام الموصوف في الطلب الحالي. في أحد النماذج, يقدم هذا الكشف طريقة لزيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني في ثديي في حاجة إليه, تشتمل الطريقة على خطوات عزل مجموعة من خلايا أولية لتكوين الدم أو خلايا جذعية لتكوين الدم من الثديي, وتلامس في خارج الجسم الحي مجموعة من خلايا أولية أو خلايا جذعية لتكوين الدم ٠ مع كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير من إندونيوكلياز يستهدف حمض (Alls DNA بواسطتها يستهدف إندونيوكلياز حمض DNA ويشطر حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم ؟ للموقع -١84 ,7156 Te 1١7 YYA 7٠4 ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه, والذي بواسطته يزيد التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني في الثديي, بالنسبة إلى التعبير قبل التلامس. في نموذج إضافي من هذه VO الطريقة, يتم حفظ بالتبريد للمجموعة المتلامسة خارج الجسم all من خلايا أولية أو خلايا جذعية لتكوين الدم التي نتسم بتعبير متزايد عن الهيموجلوبين الجنيني ويتم تخزينها أو إعادة إدخالها في الثديي. في نموذج آخر, تتم إذابة المجموعة التي تم حفظها بالتبريد من خلايا أولية أو WA جذعية لتكوين الدم والتي تتسم بتعبير متزايد عن الهيموجلوبين الجنيني وبعد ذلك تتم إعادة إدخالها في التديي. في نموذج إضافي من هذه الطريقة, تشتمل الطريقة على علاج كيميائي و / أو علاج إشعاعي لإزالة ٠ أو تخفيض خلايا أولية أو خلايا جذعية داخلية المنشاً لتكوين الدم في الثديي. في أي من النماذج على الطريقة الموصوفة, يمكن توزيع الخلايا الأولية أو الخلايا الجذعية لتكوين الدم باستخدام IPSCs المشتقة من الثديي. في أي نموذج من الطريقة, تشتمل الطريقة أيضاً على انتقاء ثديي في حاجة إلى تعبير متزايد عن الهيموجلوبين الجنيني. في أحد النماذج, يقدم هذا الكشف طريقة لزيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني في ثديي في حاجة Yo إليه, تشتمل الطريقة على خطوات توفير Jie مجموعة من خلايا أولية لتكوين الدم أو خلايا جذعية لتكوين الدم من الثديي وحذف حمض DNA الجينومي للخلايا على الكرموسوم ؟ للموقع ITT CAR
LVYA TYAS 117 ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه, والتي بواسطتها يزيد التعبير عن الهيموجلويين الجنيني في الثديي المذكور, بالنسبة إلى التعبير قبل التلامس المذكور. في نموذج إضافي من هذه الطريقة, يتم حفظ بالتبريد لمجموعة من خلايا أولية أو خلايا جذعية لتكوين الدم بحمض DNA جينومي تم حذفه وتتسم بتعبير متزايد عن الهيموجلوبين الجنيني ويتم تخزينها أو إعادة © إدخالها في الثديي. في نموذج DAT تتم إذابة مجموعة من WDA أولية أو خلايا جذعية لتكوين pall بحمض DNA جينومي تم حذفه وتتسم بتعبير متزايد عن الهيموجلوبين الجنيني وبعد ذلك تتم sale) إدخالها في الثديي. في نموذج إضافي من هذه الطريقة, تشتمل الطريقة على علاج كيميائي و / أو علاج إشعاعي لإزالة أو تخفيض WIA أولية أو WIA جذعية داخلية المنشأً لتكوين الدم في الثديي. في أي نموذج من الطريقة الموصوفة, يمكن توزيع الخلايا الأولية أو الخلايا الجذعية لتكوين الدم ٠ باستخدام 1050658 الموصوف في الطلب الحالي. في أي من النماذج على الطريقة الموصوفة, تكون الخلايا الأولية أو الخلايا الجذعية لتكوين الدم أو IPSCs مناظرة للثديي, الأمر الذي يعني أن Wall تكون مشتقة من نفس الثديي. في نموذج آخر على الطريقة الموصوفة, لا تكون الخلايا الأولية أو الخلايا الجذعية لتكوين الدم أو IPSCs مناظرة للثديي, الأمر الذي يعني أن الخلايا لا تكون مشتقة من نفس الثديي, ولكن من ثديي آخر من نفس النوع. على سبيل JB الثديي يكون إنسان. في أي ٠ نموذج من الطريقة, تشتمل الطريقة أيضاً على انتقاء ثديي في حاجة إلى تعبير متزايد عن
الهيموجلوبين الجنيني. في أحد النماذج, يقدم هذا الكشف طريقة لزيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني في ثديي في حاجة إليه, تشتمل الطريقة على خطوات عزل مجموعة من خلايا أولية لتكوين الدم أو خلايا جذعية لتكوين الدم من الثديي وخارج الجسم all حذف حمض DNA الجينومي للخلايا على الكرموسوم ؟ للموقع TY خالا قا ة, LYYA 117 ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه, والتي بواسطتها يزيد التعيير عن الهيموجلوبين الجنيني في الثديي المذكور, بالنسبة إلى التعبير قبل التلامس المذكور. في نموذج إضافي من هذه الطريقة, يتم حفظ مجموعة من خلايا أولية أو خلايا جذعية لتكوين الدم بحمض DNA جينومي تم حذفه وتتسم بتعبير متزايد عن الهيموجلويين الجنيني بالتبريد ويتم تخزينها أو إعادة إدخالها في الثديي. في نموذج آخر, تتم إذابة المجموعة التي تم حفظها بالتبريد من خلايا YO أولية أو خلايا جذعية لتكوين pall تتسم بتعبير متزايد عن الهيموجلوبين الجنيني وبعد ذلك تتم sale) إدخالها في الثديي. في نموذج إضافي من هذه الطريقة, تشتمل الطريقة على علاج كيميائي و / أو
CAR
=« _ علاج إشعاعي AY أو تخفيض خلايا أولية أو خلايا جذعية داخلية المنشاً لتكوين الدم في الثديي. في أي من النماذج على الطريقة الموصوفة, يمكن توزيع الخلايا الأولية أو الخلايا الجذعية لتكوين الدم باستخدام IPSCs المشتقة من الثديي. في أي نموذج من الطريقة, تشتمل الطريقة Lad على انتقاء ثديي في حاجة إلى تعبير متزايد عن الهيموجلوبين الجنيني. © في أحد النماذج من أية طريقة تم وصفها, تشتمل الطريقة أيضاً على انتقاء ثديي في حاجة إلى تعبير متزايد عن الهيموجلوبين الجنيني. يكون الثديي التمثيلي الذي في حاجة إلى تعبير متزايد عن الهيموجلوبين الجنيني هو الذي تم تشخيص حالته على أنه مصاب باعتلال الهيموجلوبين. في أحد النماذج, يقدم هذا الكشف طريقة لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في ثديي تشتمل على خطوات: (أ) توفير خلايا أولية لتكوين الدم أو WDA جذعية لتكوين الدم أو 10505: (ب) تلامس الخلايا خارج ٠ - الجسم الحي أو في المعمل مع كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير من إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA والتي بواسطتها يستهدف إندونيوكلياز حمض DNA ويشطر حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم " للموقع TY ,7748 ,1:-1484 TT ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه, والتي بواسطتها يزيد التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني في الثديي المذكور, بالنسبة إلى التعبير قبل التلامس NO المذكور: و (ج) إعطاء من الخطوة (ب) في الثديي. في أحد النماذج من أية طريقة, الخلايا بعد الخطوة (ب) يمكن Leta 333500 حتى تكون مطلوبة للإعطاء في الثديي. في نموذج إضافي من هذه الطريقة, تشتمل الطريقة على علاج كيميائي chemotherapy و / أو علاج إشعاعي AY radiation أو تخفيض خلايا أولية أو خلايا جذعية داخلية المنشاً لتكوين pal) في الثديي. في أي من النماذج على الطريقة الموصوفة, الخلايا الأولية أو ٠ -_ الخلايا الجذعية لتكوين الدم أو 10565 تكون ذاتية إلى الثديي, الأمر الذي يعني أن الخلايا تكون مشتقة من نفس الثديي. في نموذج آخر على الطريقة الموصوفة, الخلايا الأولية أو الخلايا الجذعية لتكوين aall أو 10565 تكون غير ذائية CE إلى الثديي, الأمر الذي يعني أن الخلايا لا تكون مشتقة من نفس التديي , ولكن تديي آخر من نفس النوع . على سبيل المثال, الثديي يكون إنسان . في أحد النماذج من أية طريقة تم وصفها, تشتمل الطريقة أيضاً على انتقاء ثديي في حاجة إلى Yo علاج اعتلال الهيموجلوبين . CAR gy في أحد النماذج, يقدم هذا الكشف طريقة لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في ثديي تشتمل على خطوات: (أ) عزل خلايا أولية لتكوين الدم أو خلايا جذعية لتكوين الدم من الثديي: (ب) تلامس الخلايا خارج الجسم الحي أو في المعمل مع كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكلياز يستهدف والتي DNA أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير من إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA حمض الجينومي للخلية على DNA ويشطر حمض DNA بواسطتها يستهدف إندونيوكلياز حمض © ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل 117 ,778 Tam AL VY الكرموسوم ؟ للموقع فيه, والتي بواسطتها يزيد التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني في الثديي, بالنسبة إلى التعبير قبل التلامس المذكور: و (ج) إعطاء من الخطوة (ب) في الثديي. البُزوْدَة حتى تكون مطلوبة للإعطاء في Lelia في أحد النماذج, الخلايا بعد الخطوة (ب) يمكن على انتقاء ثديي في حاجة إلى علاج Lad التديي. في أي نموذج من الطريقة, تشتمل الطريقة ٠ اعتلال الهيموجلوبين. في أحد النماذج, يقدم هذا الكشف طريقة لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في ثديي تشتمل على خطوات: (ب) خارج الجسم الحي SIPSCs جذعية لتكوين الدم أو WA (أ) توفير خلايا أولية لتكوين الدم أو 17 حال TYAS WATT الجينومي للخلايا على الكرموسوم ؟ للمروقع DNA حذف حمض ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه, والتي بواسطتها يزيد التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني VO في الثديي المذكور, بالنسبة إلى التعبير قبل التلامس المذكور: و (ج) إعطاء الخلايا من الخطوة (ب)) في الثديي. البُزوْدَة حتى تكون مطلوبة للإعطاء في Lelia في أحد النماذج, الخلايا بعد الخطوة (ب) يمكن الثديي. في نموذج إضافي من هذه الطريقة, تشتمل الطريقة على علاج كيميائي و / أو علاج إشعاعي لإزالة أو تخفيض خلايا أولية أو خلايا جذعية داخلية المنشاً لتكوين الدم في الثديي. في أي ٠
IPSCs من النماذج على الطريقة الموصوفة, تكون الخلايا الأولية أو الخلايا الجذعية لتكوين الدم أو مناظرة إلى الثديي, الأمر الذي يعني أن الخلايا تكون مشتقة من نفس الثديي. في نموذج آخر على الطريقة الموصوفة, الخلايا الأولية أو الخلايا الجذعية لتكوين الدم أو 10565 لا تكون مناظرة إلى الثديي, الأمر الذي يعني أن الخلايا لا تكون مشتقة من نفس الثديي, ولكن ثديي آخر من نفس النوع. يكون إنسان. في أي نموذج من الطريقة, تشتمل الطريقة أيضاً على انتقاء oi, JB على سبيل YO ثديي في حاجة إلى علاج اعتلال الهيموجلوبين.
CAR
_ \ —_
في أحد النماذج, يقدم هذا الكشف طريقة لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في ثديي تشتمل على خطوات:
(أ) Je خلايا أولية لتكوين الدم أو LDA جذعية لتكوين الدم من الثديي: (ب) خارج الجسم الحي
حذف حمض DNA الجينومي للخلايا على الكرموسوم للموقع دا خالا تغناص ا بكار TYY
ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه, والتي بواسطتها يزيد التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني
© في الثديي, بالنسبة إلى التعبير قبل التلامس المذكور: و (ج) إعطاء من الخطوة (ب) في الثديي.
في أحد النماذج, الخلايا بعد الخطوة (ب) يمكن HL Leki 335 حتى تكون مطلوبة للإعطاء في
الثديي. في نموذج إضافي من هذه الطريقة, تشتمل الطريقة على علاج كيميائي و / أو علاج
إشعاعي لإزالة أو تخفيض خلايا أولية أو خلايا Leda داخلية Land) لتكوين الدم في الثديي. في
أي نموذج من الطريقة, تشتمل الطريقة أيضاً على انتقاء ثديي في حاجة إلى علاج اعتلال ٠ - الهيموجلوبين.
في أحد النماذج, يقدم هذا الكشف طريقة لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في ثديي (على سبيل المثال
إنسان) تشتمل على إدخال تركيبة الموصوف في الطلب الحالي تشتمل على خلايا معالجة بالهندسة
الوراثية معزلة وراثياً بها تعديل جيني واحد على الأقل على الكرموسوم ؟ للموقع 60, 715, 184-
TY y YYA y Te والتي بواسطتها يزيد التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني في الثديي . في نموذج ١ إضافي من هذه الطريقة, تشتمل الطريقة على علاج كيميائي و / أو علاج إشعاعي لإزالة أو تخفيض
خلايا أولية أو خلايا جذعية داخلية Land) لتكوين الدم .في الثديي. في أي نموذج من الطريقة,
تشتمل الطريقة Lad على انتقاء تديي في حاجة إلى علاج اعتلال الهيموجلوبين.
في أحد النماذج, يقدم هذا الكشف طريقة لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في ثديي (على سبيل المثال
إنسان) تشتمل على زيادة التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني في الثديي بواسطة الطريقة الموصوفة في ٠ -_ الطلب الحالي.
في أي نموذج من أية طريقة علاج موصوفة, يكون اعتلال الهيموجلوبين 8 -اعتلال الهيموجلوبين.
في أي نموذج من أية طريقة علاج موصوفة, يكون اعتلال الهيموجلوبين 8 -ثلاسيميا.
في أي نموذج من أية طريقة علاج موصوفة, يكون اعتلال الهيموجلوبين فقر الدم المنجلي.
CAR
_ Ad —_
في أحد النماذج على أي من الطرق الموصوفة, تكون الخلايا الأولية أو الخلايا الجذعية لتكوين الدم
أو iPSCs ذاتية المنشاً إلى الثديي, الأمر الذي يعني أن الخلايا تكون مشتقة من نفس الثديي. في
نموذج آخر على أي طريقة موصوفة, تكون الخلايا الأولية أو الخلايا الجذعية لتكوين الدم أو
IPSCs تكون غير LE As إلى الثديي, الأمر الذي يعني أن الخلايا لا تكون مشتقة من نفس
5 الثديي , ولكن تديي آخر من نفس النوع . على سبيل المثال ٠, يكون الثديي إنسان .
في أحد النماذج على أي من الطرق الموصوفة, يمكن أن يكون تلامس أية خلية موصوفة في الطلب
الحالي خارج الجسم الحي أو في المعمل أو في الكائن الحي.
في نموذج آخر من أية طريقة موصوفة, يشتمل تلامس أية خلية موصوفة في الطلب الحالي على
تلامس بعامل يربط حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم ؟ ويحدث تعديل لا جيني في
في أحد النماذج, يكون التعديل اللاجيني على الكرموسوم ؟ للموقع YA LTA YT,
17 (طبقاً ل 19 UCSC Genome Browser hg مجموعة جينوم بشري).
في نموذج آخر من أية طريقة موصوفة, يشتمل تلامس أية خلية موصوف في الطلب الحالي على
تلامس بعامل يربط حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم ؟ للموقع CIAL YT Te ا WY LYYA (طبقاً ل 19 UCSC Genome Browser hg مجموعة جينوم بشري), ويحدث تعديل
لا جيني على الكرموسوم ؟, وبناءً عليه خفض التعبير عن /80111 أو 4555( MRNA .
في نموذج آخر من أية طريقة موصوفة, يشتمل تلامس أية خلية موصوف في الطلب الحالي على
تلامس مع كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إنزيم يستهدف حمض DNA أو ناقل تعبير
يحمل متوالية التشفير لإنزيم يستهدف حمض DNA والذي بواسطته ١ لإنزيم الذي يستهدف حمض
. MRNA بروتين
في نموذج آخر من أية طريقة موصوفة, يشتمل تلامس أية خلية موصوف في الطلب الحالي على
تلامس مع كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إنزيم يستهدف حمض DNA أو ناقل تعبير
يحمل متوالية wall لتشفير لإنزيم يستهدف حمض DNA والذي بوا سطته ١ لإنزيم الذي يستهدف حمض DNA Yo يحدث تعديل لا جيني على الكرموسوم ؟ للموقع VYA Tem AL TT 117 (طبقاً ل
CAR
_ _ UCSC Genome Browser hg 9 مجموعة جينوم بشري) وبناءً عليه خفض التعبير عن BCL11A أو بروتين MRNA . في أحد الجوانب, يزيد التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني في الثديي, بالنسبة إلى التعبير قبل التلامس. في نموذج آخر من A طريقة موصوفة, يتم تلامس الخلية الأصلية لتكون الدم, الخلية البشرية المعزولة, أو خلية معزولة خارج الجسم الحي أو في المعمل. في نموذج آخر من أية طريقة موصوفة, يكون التعديل الجيني الواحد على الأقل حذف. في نموذج آخر من هذا الجانب وجميع الجوانب الأخرى الموصوفة في الطلب الحالي, التعديل اللا جيني واحد على الأقل. في أحد النماذج, يتم في الطلب الحالي تقديم استخدام عامل يربط حمض DNA الجينومي للخلية على UCSC Genome Browser (طبقاً ل TYY LVYALT— YA الكرموسوم 7 للموقع ,خالا Ye مجموعة جينوم بشري) لزيادة الهيموجلوبين الجنيني في ثديي أو لعلاج اعتلال الهيموجلوبين hg 9
BCL11A في الثديي أو لخفض التعبير عن 00818 أو 56111/8, حيث يتم تخفيض التعبير عن . mRNA أو بروتين في أحد النماذج, يتم في الطلب الحالي تقديم استخدام كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على V0 إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير من إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA لزيادة الهيموجلوبين الجنيني في ثديي أو لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في الثديي أو لخفض التعبير عن MRNA أو 80111/8, حيث يستهدف إندونيوكلياز حمض DNA ويشقطر حمض NA 9 الجينومي للخلية على الكرموسوم للموقع ١ 0 77 A 0 1 += ١ AQ 0 7 ١ 1 0 1 ٠ 1 ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه. ٠ في أحد النماذج, يتم في الطلب الحالي تقديم استخدام كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إنزيم يستهدف حمض DNA أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير لإنزيم يستهدف حمض DNA لزيادة الهيموجلوبين الجنيني في ثديي أو لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في الثديي أو لخفض التعبير عن mRNA أو 801118, حيث يحدث الإنزيم الذي يستهدف حمض DNA تعديل لا جيني واحد على الأقل في حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم ,١ وبناءً عليه يؤثر على التعبير عن ,٠١ في أحد النماذج, يكون التعديل اللا جيني واحد على الأقل عند الموقع BCLIIA أو mRNA Yo CAR gon نموذج آخر, يكون تأثير التعديل اللاجيني الواحد خفض التعبير BL 117 LVYA ,1:- 144 , 7 . MRNA عن 8061118 أو بروتين في أحد النماذج, يتم في الطلب الحالي تقديم استخدام أي الخلايا المعزولة الموصوف في الطلب الحالي لزيادة الهيموجلوبين الجنيني في تديي أو لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في الثديي.
Lys بشرية مهندسة WA في أحد النماذج, يتم في الطلب الحالي تقديم استخدام تركيبة تشتمل على © معزولة لزيادة الهيموجلوبين الجنيني في ثديي أو لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في الثديي, حيث تتسم
TAY خالا Tem AG YT Te الخلايا بتعديل جيني واحد على الأقل على الكرموسوم للموقع مجموعة جينوم بشري) تم بواسطة عملية تلامس UCSC Genome Browser hg 19 (طبقاً ل أو ناقل DNA الخلايا مع كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكلياز يستهدف حمض والتي بواسطتها يستهدف DNA تعبير يحمل متوالية التشفير من إندونيوكلياز يستهدف حمض ٠ ,60 الجينومي للخلية على الكرموسوم ؟ للموقع DNA ويشطر حمض DNA حمض زايلكوينودنإ مجموعة جينوم UCSC Genome Browser hg 19 (طبقاً ل TYY لماص اتمبغالا, LY بشري) ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه.
Lys بشرية مهندسة WA في أحد النماذج, يتم في الطلب الحالي تقديم استخدام تركيبة تشتمل على معزولة لزيادة الهيموجلوبين الجنيني في ثديي أو لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في الثديي, حيث تتسم VO الخلايا بتعديل لا جيني واحد على الأقل على الكرموسوم ". في أحد النماذج, يكون التعديل اللاجيني (طبقاً ل 117 VTA, TA TT الواحد على الأقل على الكرموسوم 7 عند الموقع مجموعة جينوم بشري). في نموذج آخر, يتم تعديل لاجيني UCSC Genome Browser hg 9 واحد على الأقل على الكرموسوم ¥ بواسطة عملية تلامس الخلايا مع كمية فعالة من تركيبة تشتمل أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير لإنزيم يستهدف DNA على الأقل على إنزيم يستهدف حمض Yo تعديل لا جيني واحد على DNA والتي بواسطتها يحدث الإنزيم الذي يستهدف حمض DNA حمض VT 60 الجينومي للخلية على الكرموسوم ؟ مما يؤثر على الموقع DNA الأقل في حمض مجموعة جينوم بشري) UCSC Genome Browser hg 19 (طبقاً ل TYY صخ اغالا 4 ويتسبب في ذلك.
CAR
h —_ _ في أحد النماذج, يتم في الطلب الحالي تقديم استخدام أي الخلايا المعزولة الموصوف في الطلب الحالي أو أي واحدة من التركيبات الموصوفة في الطلب الحالي لتصنيع دواء لزيادة الهيموجلوبين الجنيني في تديي أو لعلاج اعتلال الهيموجلوبين في الثديي. في أحد النماذج على استخدام تركيبة الموصوف في الطلب الحالي, تحدث التركيبة زيادة في الهيموجلوبين الجنيني MRNA أو التعبير عن البروتين في خلية التلامس. في أحد النماذج على استخدام تركيبة الموصوف في الطلب الحالي, تكون خلايا أي من التركيبات الموصوفة ذاتية Lael) , إلى الثديي الذي يكون متلقي للخلايا في إجراء زرع, أي, تكون خلايا التركيبة مشتقة أو تم حصدها من الثديي قبل أي تعديل موصوف . في أحد النماذج على استخدام تركيبة الموصوف في الطلب الحالي, تكون خلايا أي من التركيبات ٠ الموصوفة غير ذاتية TE إلى الثديي الذي يكون متلقي للخلايا في shal زرع, أي, لا تكون خلايا التركيبة مشتقة أو تم حصدها من الثديي قبل أي تعديل موصوف . في أحد النماذج على استخدام تركيبة الموصوف في الطلب الحالي, خلايا أي من التركيبات الموصوفة بحد أدنى من نوع HLA المطابق مع الثديي الذي يكون متلقي للخلايا في إجراء زرع. في أحد النماذج على استخدام تركيبة الموصوف في الطلب الحالي, تكون خلايا أي من التركيبات ١ 25 الموصوفة خلايا أولية معزولة قبل أي تعديل موصوف . في أحد النماذج على استخدام تركيبة الموصوف في الطلب الحالي, تكون خلايا أي من التركيبات في أحد النماذج على استخدام تركيبة الموصوف في الطلب الحالي, خلايا أي من التركيبات الموصوفة تكون خلايا جذعية معزولة مستحثة متعددة القدرة قبل أي تعديل موصوف. ٠ في أحد النماذج على استخدام التركيبة الموصوف في الطلب الحالي, تكون خلايا أي من التركيبات الموصوفة محفوظة بالتبريد قبل الاستخدام. من المعروفة أن هناك صور متغايرة مرتبطة ب HBF في /80111. تم إجراء ست GWAS من مستوى HOF (أو سمة مرتبطة Lay بدرجة عالية عدد خلية ]) في أفراد من ينحدرون من سلالة CAR
PV
.)١"-7( BCL11A أوروبية, أفريقية وأسيوية, كل منهم يميزصورة مغايرة مرتبطة بالسمة في نطاق
HOF ونتسق مع ,)20 ,٠١ ,9( و5 -ثلاسيميا SCD ترتبط نفس الصور المغايرة بالحدة الإكلينيكية ل كمحدد رئيسي لهذه الاضطرابات. وتم تقدير التباين في 80611178 ليشرح -715 من التباين في بوصفهم الأكثر ارتباطا SNPs وتم تمييز أربع مختلفة (67,07 ,7( HDF السمة في مستوى 5766432 5 (1) 54671393 (A) rsl 18868658 ,)1( rsl427407) بدرجة عالية السمة © إنترون-؟ BCLITA من بعضها البعض في kb ¥ الحارسة داخل SNPS تتجمع :))١-٠١(
HOF الحارسة تشرح ارتباط SNPs (الأشكال "أ و١١ب). يبدو أن الأنماط الفردانية التي تتضمن 861118 عند موضع SNPS تم ربط خمسين .)47 ,١١( فردي SNP بصورة أفضل من أي -٠١ x © > P) بدلالة جينوم واسعة HBF داخل إنترون-؟ ربط بمستوى SNPS وسبعة وعشرين على الرغم من جهود إعادة عمل المتواليات على المقياس الكبير, ولم يتم وصف تشفير الصورة (A ٠ (£7) BCL11A المغايرة ل 50111 عند موضع HOF لتعيين إشارة الارتباط مع CSSCD فيما سبق؛ استخدم المخترعون وأفادوا بارتباط قوي مع 14671393 )£7( في تلك الدراسة؛ تم إدخال 51427407. وتم تمييز أيضاً في الدراسات السابقة باعتبار rsl 1886868 هما 18766432 و SNPs اثنين إضافيين من في مجموعة فرعية من .)51 ,1١ ٠١ ,8( الحارسة الأكثر ارتباطا بالسمة بدرجة عالية SNPs ١ الحارسة متوفرة؛ ولم تكن نتيجة SNPS التي كانت الأنماط الجينية لها عند جميع (VYA الأفراد (ع- الارتباط ذات دلالة عند 54671393 8766432 أو 1886868 ل بعد التكييف على الأنماط 51427407 وبالعكس؛ ظل الارتباط ذي دلالة بدرجة عالية بالنسبة ل ¢r81427407 الجينية عند (الجدول 4). بناءً عليه, م rs 18868681 8766432 54671393 عند التكييف على في نطاق 01155 الشبيهة بالكريات HBF الأكثر ارتباطاً بقوة بمستوى SNP تمثل 1427407 ٠ الحارسة الموصوفة فيما سبق. SNPs الحمراء وتفسر ارتباط السمة بصورة أفضل من أظهر التحليل الشرطي ارتباطات ظلت ذات دلالة بعد التكيف على 181427407 وكان الارتباط في 157599488 ;(1\ =) + x 4,11 = P) DHS +55 المتبقي الأكثر دلالة ل 157606173 في -٠١ * 3,47 = P) أقل دلالة بصورة طفيفة فقط GIS, (£F) سبق Led أوردناه 3, DHS +62 النادرة لصورة مغايرة داخل ثلاث 01155 إشارات DNA ولم يعطي تحليل متوالية .)١ (الجدول )٠١ YO .)# (الجدول HBF إضافية مستقلة مرتبطة بإشارات
CAR eA تبين للمخترعين أن ارتباط عامل الانتساخ المحدد بالأليل transcription factor (TF) متعلق بالتعبير عن /80111. وتم إجراء دراسات كيميائية حيوية محددة بالأليل باستخدام زيجوت متغايرة الآلائل إخباري للتحكم في الفروق تبادلية التأثير بين العينات لضمان وفرة متساوية لكل من الآلائل؛ وتم إثباتها بالتمثيل المتساوي للآلائل في gDNA المتزاوج (الأشكال "ب (zs تبين asa ا © 1427407 مباشرة عند مركز قمة ارتباط GATAL و TALI عند 62+ DHS (الشكل رقم (RY في تجارب ChIP المجراة؛ تم تعريض الكروماتين للموجات الصوتية إلى 50٠0 زوج قاعدة تقريباً من الشظايا. وتم عمل متواليات Sanger من خمس عينات بشرية رئيسية من مادة منتجة شبيهة بالكريات الحمراء لزيجوت متغايرة الآلائتل ل 1427407 rs مستخدمة ل 6010-0068 عند 01155 شبيهة بالكريات الحمراء. كان SNP الآخر لزيجوت متغايرة الآلاثل فقط في نطاق Ove زوج قاعدة من 5 ٠ 1427407 في أي من هذه العينات هو 157599488 (4 ١ 7-زوج قاعدة 'V من (S1427407 والتي كانت متغايرة الزيجوت في اثنتين فقط من العينات الخمس. لم يقع SNP هذا داخل محفزات Lis) 67/1 أو TALL . بل بناءً عليه بدا من غير المحتمل أن SNP آخر داخل 62+ DHS يمكن أن يفسر ارتباط TF الملاحظ المحدد بالأليل. إضافة لذلك, اكتشف المخترعون أن هناك ارتباط بين التعبير عن BCLIIA ومستوى HPF توفر Vo دراسات المخترعين تقدير للتغيير في التعبير عن 8011178 يمكن أن يترتب عليه زيادة ذات دلالة إكلينيكياً في مستوى HDF - من بين مجموعة محدودة من سلالات خلية شبيهة بأرومة لمفاوية بشرية أوردت Lad سبق Ale بينية لأليل A مرتبط ب HDF عالي ل 54671393 بتعبير منخفض عن .)١١( 861118 أخفق تمديد هذه التجارب على مجموعة أكبر من سلالات ذات نمط جيني في التأكيد على هذه الملاحظة. ومن ثم؛ تبين للمخترعين أن التعبير عن 801117 لتأثير النوع الفرداني ٠٠ ل 1s1427407-rs7606173 المرتبط HDF في سياق محدد بشبيه بالكريات الحمراء» ومن الممكن أن يتسق مع نتائج حساسية | DNase اختلف التعبير عن MRNA /806111 في المواد المنتجة الرئيسية الشبيهة بالكريات الحمراء بمقدار ٠١" ضعفاً بين -1 rs1427407-1s7606173 HOF 6 المرتفع والأنماط الفردانية ©-6 المنخفضة في Jal) HBF رقم (FF على نحو مناظر؛ كانت مستويات HBF المتوسطة 796 و 77,1 في متغايرات الزيجوت homozygotes de G-C 4 T-G remains Yo الترتيب (الشكل رقم (ZV من الجدير بالملاحظة؛ تمت ملاحظة النتائج التي تبين التعبير المحدد بالأليل عن /806111 في الخلايا البشرية الرئيسية الشبيهة بالكريات
CAR
الحمراء في الخلايا متغايرة الزيجوت للنمط الفرداني rs1427407-rs7606173 وبالتالي تعكس الآثار المتواضعة على التعبير عن /80111 التأثيرات المشتركة لجميع SNPs الوظيفية في نطاق النمط الفرداني. في حين يكون إرث النمط الفرداني 8611178 الواقي مفيد إكلينيكياً على أساس المجموعة (5, ,٠١ 90), ظل متوسط مستوى HBF في متغايرات الزيجوت 1-6 أدنى من ذلك © المطلوب لمنع الوفاة جراء .SCD ومع ذلك؛ تتوقع حساسية مستوى HBF للتعبير عن (BCL1IA أن تخفيف حدة المرض يمكن أن يتطلب تخفيض متواضع إضافي فقط في التعبير عن 86111/8. درس المخترعون أيضاً التتظيم التطويري لجينات جلوبين و86111/5 . أثناء التطوير البشري؛ تم استبدال جلوبين- 0 مشتق من كيس الصفار في الأشهر الثلاثة الأولى بجلوبين-ا] مشتق من كبد جنين. وبعد الميلاد؛ Ui خروج الكريات الحمر من الكبد إلى نخاع العظم؛ يتم إخماد جلوبين- لا ٠ تدريجياً ويسود جلوبين-لا. ويحدث تحويل مفرد فقط في التعبير عن جين جلوبين في تطور الجنين. وأثناء هذا التحول؛ الذي يحدث عند منتتصف الحمل؛ تعبر الكريات الحمراء الأولية المشتقة من كيس الصفار الدائرة عن الجلوبينات في المرحلة الجنينية Oy و IHD في حين تعبر الكريات الحمراء المحددة بكبد الجنين عن الجلوبينات في مرحلة البلوخ 1لا و 02( طبقاً لهذا التحول التطوري؛ يتم التعبير عن 806111/8 في السلالة المحددة ولكن ليس في السلالة الشبيهة بالكريات الحمراء في ١ المرحلة الأولية والمطلوبة للتغيير في التعبير عن جين الجلوبين (OF V1) في سلالات مبلغ 52.0-64.4+ 80111 محورة وراثياً ثابتة عند ٠١,5 000, تمت ملاحظة التعبير عن lacZ فقط في منشم الكبد الجنيني وليس في الدم الدائر داخل الجنين, المشيمة أو كيس الصفار (الشكل رقم +أ). هذه النتائج, مجتمعة مع نتيجة التعبير عن 1802 في الأرومات الحمراء المحددة بالكبد الجنيني dpc ١7,5 ولكن ليس في الخلايا الحمراء الأولية الدائرة المشتقة من كيس ٠٠ الصفار (الشكل رقم ؛ب), توضح أن متواليات محسن مركب BCLITA تثير التعبير في نمط محدد على نحو تطويري متسق مع تحويل جين الجلوبين داخلي المنشاً. تم توليد سلسلة من طافرات الحذف لتتقيح أدنى العناصر المطلوبة لنشاط محسن شبيه بالكريات الحمراء. كانت المتواليات التي تحتوي على المركز +58 0115 كافية لنشاط محسن شبيه بالكريات الحمراء. كانت تلك المتواليات التي لا تحتوي سوى على عناصر +67 أو oot المحيطة غير قادرة YO على توجيه التعبير عن جين شبيه بالكريات الحمراء (الشكل رقم 1( لاختبار قدرة DHSs على تحسين التعبير الجيني في المواد المنتجة للكريات الحُمر البشرية الرئيسية, استخدمنا توصيل فيروسة CAR
مه عدسية لنظام مبلغ lida GFP لما تم وصفه من قبل (39). على نحو مماثل, التعبير الجيني عن +/ه DHS المحسن في تجربة المبلغ المذكورة (الشكل رقم .)١ قرر المخترعون توليد سلالات خلايا مع حذف محسن 18 Bell لبحث متطلبات المحسن المحسن yell عن 806111/8. تم توليد خلايا تابتة شبيهة بالكريات الحمراء مع تمزيق المحسن. نظراً لأنه لم © يكن هناك سلالات خلايا بشرية مناسبة في مرحلة البلوخ شبيهة بالكريات الحمراء, وكدليل على المبدأ, تحول المخترعون إلى النظام الفأري. تعتمد خلايا ابضاض p30 الاحْمِرَارِيٌ بالفأر (MEL) على 801118 لجلوبين التعبير الجيني للنمط في مرحلة البلوغ (VE) وحدد المخترعون محسن مركب ages بالكريات الحمراء متشابه عند الموضع أورثو عند Bell ١18. من Ll لإنترون-7. وعلى غرار إنترون-؟" محسن 801118 المرقم ب GWAS بشري, اتسمت هذه المتواليات بسلسلة من خلايا ٠ شبيهة بالكريات الحمراء محددة ب DHSS إضافة لذلك, تمت زخرفة هذه المتواليات بواسطة ,H3K27ac 3 H3K4mel وافتقر ,H3K2Tme3 5 H3K4me3 وتم شغلها بكل من 68181 TALI في كروماتين من الفأر شبيه بالكريات الحمراء (الشكل رقم (A تبين أن العناصر التتظيمية المركبة التي تتضمن سلسلة من DHSS المتجاورة تعد هامة للتعبير عن الجين عند مواقع متعددة؛ بما في ذلك من بين أخريات منطقة التحكم في موضع جلوبين-بيتا؛ والمتواليات المحافظة للأنواع المتعددة ١ لجلوبين-ألفاء والمنطقة التتظيمية ل IgH )00-07( ولاحظنا السمات الفريدة المحددة بالنوع للمحسن المركب. على سبيل المثال, حدد المخترعون متواليات الفأر المحافظة لكل واحد من 014158 +17, oot 5 oA+ البشرية الثلاث, وتبين لهم أن الحساسية المفرطة ل DNase ١ للخلايا شبيهة بالكريات الحمراء عند +7 5 +00 aay, ذلك افتقرت المتواليات المحافظة oA إلى الحساسية المفرطة ل DNase | . ٠ | تحقق PCR وتلطيخ Southern من استئصال القسم 64 Kb Te fo المتعلق بالإنترون من 98 في ثلاث نسائل MEL فريدة واثنتين من نسائل الخلية اللمفاوية طليعة 8 الفريدة (الشكل رقم ٠ (4 كانت نقاط الفصل ذات المتوالية طبقاً ل Sanger مميزة لانشطار يتوسط فيه TALEN بإصلاح NHEJ لاحق (الشكل رقم .)٠١ عند حذف القسم المتعلق بالإنترون؛ لاحظنا انخفاض كبير في منتسخ /806111 في نسائل خلية MEL بواسطة 41-0068 باستخدام أزواج بادئ تكشف YO وصلات إكسون «JE وبامتداد أو بعد الحذف (الشكل رقم (To التعريفات CAR
-ه- للملائمة؛ يتم في هذه الوثيقة تجميع تعبيرات محددة مستخدمة في الطلب بالكامل (بما في ذلك المواصفة؛ (AB وعناصر الحماية المرفقة). ما لم يتم ذكر ما يخالف ذلك؛ يكون لجميع التعبيرات التقنية والعلمية المستخدمة في هذه الوثيقة نفس المعنى وفقاً لما يتم إدراكها بوجه عام بواسطة ذوي المهارة العادية في المجال الذي ينتمي إليه الاختراع. © وفقاً لاستخدامه في الطلب الحالي, العبارة "عامل يربط حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم Y للموقع TOY ,7748 TIAL YT Te يشير إلى جزيئات صغيرة؛ أو أحماض نووية؛ بروتينات, ببتيدات؛ أو قليل النيوكليوتيدات التي يمكن of ترتبط بالموقع داخل حمض DNA الجينومي (على سبيل المثال, الكرموسوم ؟ للموقع LYALL TAG TT 117) ويخمد التعبير عن 8061118 أو بروتين mRNA في خلية بنسبة على الأقل 770 مقارنة بحمض MRNA ٠ أو مستوى بروتين 80611178 في خلية غير معالجة بمثل هذا العامل. في أحد النماذج, يتداخل العامل " مع تفاعلات 8011178 مع شركاء ربط 8011178 , " وفقاً لاستخدام تلك العبارة في الطلب الحالي. كما هو مستخدم هناء يشير التعبير sin’ صغير" إلى عامل كيميائي بما في ذلك؛ على سبيل المثال وليس الحصرء ببتيدات؛ أو شبيهات الببتيد؛ أو أحماض أمينية؛ أو نظائر حمض أميني؛ أو عديد Vo النيوكليوتيدات» أو نظائر عديد النيوكليوتيدات؛ أو أبتامرات؛ أو نيوكليوتيدات» أو نظائر نيوكليوتيدات أو مركبات عضوية أو غير عضوية (أي؛ بما في ذلك مركبات عضوية غير متجانسة أو عضوية فلزية) لها وزن جزيئي أقل من حوالي ٠٠٠٠١ جم لكل مول؛ مركبات عضوية أو غير عضوية لها وزن جزيئي أقل من حوالي 5080850 جم لكل مول؛ مركبات عضوية أو غير عضوية لها وزن جزيئي أقل من حوالي ٠٠٠١ جم لكل مول؛ مركبات عضوية أو غير عضوية لها وزن جزيئي أقل من حوالي PRS ٠ جم لكل مول» وأملاح» واسترات وأشكال أخرى مقبولة صيدلانياً لهذه المركبات. يمكن أن يكون "الحمض gyal كما تم وصفه هناء عبارة عن RNA أو (DNA ويمكن أن يكون مفرد أو مزدوج الجديلة؛ ويمكن اختياره. على سبيل (JB من مجموعة تشتمل على: حمض نووي يشفر بروتيد ذو فائدة؛ أوليجو نيوكليوتيدات؛ نظائر حمض نووي؛ على سبيل المثال ببتيد--“حمض نووي PNA (peptide— nucleic acid (PNA) متمم -كاذب pseudo-complementary (PNA (pc-PNA) Yo حمض نووي ثابت locked nucleic acid (LNA) إلخ. تشتمل متواليات الحمض الأميني المذكورة؛ على سبيل المثال وليس (oan) متوالية حمض أميني تشفر CAR
اج بروتينات؛ على سبيل المثال التي تعمل ككوابت للاستنساخ؛ وجزيئات مضادة لاتجاه النسخ؛ وجزيئات مضادة لاتجاه النسخ» والريبوسومات 805855005 ؛ ومتواليات حمض نووي صغيرة antisense molecules مثبطة؛ على سبيل المثال وليس الحصر RNAi siRNA shRNAi (RNAI دقيقة «(MRNAI) أوليجو نيوكليوتيدات oligonucleotides مضادة لاتجاه النسخ إلخ. © المقصود بعبارة 'يتداخل مع تفاعلات BCLITA مع شركاء ربط BCL11A " أن كمية من التفاعل لبروتين 861117 مع شريك رابط BCL11A على الأقل 75 أقل في المجموعات المعالجة بمثبط 861118 , وبعد ذلك المجموعة المقارنة, ومجموعة المقارنة, حيث لا يكون هناك أي مثبط 806178 موجود. من المفضل أن كمية من التفاعل من البروتين 861118 مع شريك رابط 806118 في مجموعة معالجة بمثبط IA 8611 على الأقل 7٠١ أقل, على الأقل 770 أقل, على Ys الأقل 770 أقل, على الأقل 746 أقل, على الأقل 75٠ أقل, على الأقل 700 أقل, على الأقل 1776 أقل, على الأقل ZA أقل, على الأقل Za أقل, على الأقل ١-ضعف أقل, على الأقل ١-ضعف أقل, على الأقل ١-ضعف أقل, على الأقل ٠١ ضعف أقل, على الأقل ٠٠١ ضعف أقل, على الأقل ٠-ضعف أقل, أو أكثر من مجموعة معالجة بمجموعة مقارنة لم تتم فيها إضافة أي مثبط BCL11A . عند أدتى حد, يمكن اختبار تفاعل 8011178 بواسطة تحديد كمية من 8611178 Yo ترتبط بشريك رابط 801117 باستخدام التقنيات القياسية في المجال, بما في ذلك, ولكن ليس على سبيل الحصر, قياس الطيف الكتلي, الترسيب المناعي, أو اختبارات الترشيح بالجل. بصورة بديلة, أو إضافة لذلك, يمكن اختبار فعالية 861118 بواسطة قياس التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني عند MRNA أو مستوى بروتين بعد العلاج باستخدام مثبط 8611178 المرشح. في أحد النماذج, تمثل فعالية 11/8 801 تفاعل 11/8 861 مع شركاء الربط الخاصة به: (GATA-1 ٠ 06-1 مكونات معقد .RBBP7; MTA2 0210-3 « NURD وعلى هذا النحو, يمكن اعتبار أي جسم مضاد أو شظية منه, جزيء صغير, أو عامل كيميائي أو مركب يمكن أن يعوق هذا التفاعل Lie لنشاط 8011178 . وفقاً لاستخدامه في الطلب الحالي, التعبير "خلية معالجة بالهندسة الوراثية" يشير إلى خلية تشتمل على تعديل جيني واحد على الأقل, وفقاً لاستخدام هذا التعبير في الطلب الحالي. CAR
سجن وفقاً لاستخدامه في الطلب الحالي, التعبير 'تعديل جيني" يشير إلى تمزيق على المستوى الجينومي يترتب عليه تخفيض في التعبير عن 806111/8 أو نشاط في خلية. يمكن أن تتضمن التعديلات الجينية التمثيلية عمليات حذف, تطفيرات بإزاحة الإطار , طافرات نقطة, إزالة الإكسون, إزالة واحد أو أكثر من مواقع مفرطة الحساسية ل 1 (DHS) DNAse (على سبيل المثال, LY “, ؛ أو المزيد من © مناطق (DHS إلخ. المقصود من التعبير 'يثبط التعبير عن 'BCLIIA أن كمية من التعبير عن 86111/8 تكون على الأقل 75 أقل في خلية أو مجموعة خلايا معالجة بإندونيوكلياز يستهدف حمض DNA عن خلية قابلة للمقارنة, خلية مقارنة أو مجموعة خلايا, حيث لا يوجد أي إندونيوكلياز يستهدف حمض 8/لا0 . ومن المفضل أن تبلغ النسبة المئوية من التعبير عن 8611178 في مجموعة معالجة على الأقل 2٠0 Ye أقل, على الأقل 77١0 أقل, على الأقل 770 أقل, على الأقل 7460 أقل, على الأقل 75٠ أقل, على الأقل 7650 أقل, على الأقل Tye أقل, على الأقل 780 أقل, على الأقل 790 أقل, على الأقل ١-ضعف أقل, على الأقل ١"-ضعف أقل, على الأقل ٠--ضعف أقل, على الأقل ٠١ ضعف أقل, على الأقل ٠٠١ ضعف أقل, على الأقل ١٠٠٠-ضعف أقل, أو أكثر من مجموعة معالجة مقارنة قابلة للمقارنة لا تتم Led إضافة أي إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA . Vo المقصود من التعبير 'يثبط نشاط /80111 " أن كمية من النشاط الوظيفي ل 861117 على الأقل 2 أقل في خلية أو مجموعة WIA معالجة بالطرق الموصوفة في الطلب الحالي, من الخلية القابلة للمقارنة, الخلية أو المجموعة المقارنة, حيث لا يوجد أي إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA . ومن المفضل أن تكون النسبة المئوية من نشاط 801117 في مجموعة معالجة بمتبط IA 8061-1 على الأقل 7٠١ أقل, على الأقل 77١0 أقل, على الأقل 7760 أقل, على الأقل 740 أقل, على الأقل 756 ٠ أقل, على الأقل 760 أقل, على الأقل 7970 أقل, على الأقل 780 أقل, على الأقل 7960 أقل, على الأقل -١ ضعف أقل, على الأقل ١-ضعف أقل, على الأقل 5- ضعف أقل, على الأقل ٠١ ضعف أقل, على الأقل ٠٠١ ضعف أقل, على الأقل ١٠٠٠-ضعف أقل, أو أكثر من مجموعة معالحة بمقارن قابل للمقارنة لا تتم Led إضافة أي إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA . على أدنى تقدير, يمكن اختبار نشاط 8011178 بواسطة تحديد كمية التعبير عن 118 BCL على مستويات Yo البروتين أو MRNA , باستخدام التقنيات القياسية في المجال. بصورة بديلة, أو إضافة لذلك, يمكن تحديد نشاط ,861117 باستخدام بنية مبلغ, حيث تكون بنية المبلغ حساسة لنشاط 861118 . CAR
دوه
تكون متوالية موقع جلويين-7 قابلة للتعرف عليها بواسطة محفز ارتباط الحمض النووي 01061666
.BCL11A لبنية acid-binding motif
في أحد النماذج, وفقاً لاستخدامه في الطلب الحالي, التعبير DNA يستهدف إندونيوكلياز
endonuclease يشير إلى إنزيم إندونيوكلياز يولد فاصل مزدوج الجديلة عند موضع مطلوب في © الجينوم (على سبيل المثال, الكرموسوم ؟ للموقع 60, (VY ,774 ,1 0-184 NT دون إنتاج
فواصل مزدوجة الجديلة غير مستهدفة غير مرغوب فيها. يمكن أن يكون حمض DNA الذي يستهدف
إندونيوكلياز إنزيم إندونيوكلياز حادث بصورة طبيعية (على سبيل المثال, ميجا نيوكلياز بكتيري
(bacterial meganuclease أو يمكن توليده بصورة اصطناعية (على سبيل المثال, إنزيمات ميجا
نيوكلياز meganuclease معالجة بالهندسة الوراثية, 18105 , أو ,ZFNs من بين أخريات).
٠ في نموذج آخر, وفقاً لاستخدامه في الطلب الحالي, التعبير DNA" يستهدف إندونيوكلياز endonuclease " يشير إلى إنزيم إندونيوكلياز يولد فاصل مفرد الجديلة أو "شق" أو فاصل على إحدى جدائل الجزء الأساسي لسكر فوسفات phosphate sugar حمض DNA عند موضع مطلوب في الجينوم genome (على سبيل المثال, الكرموسوم 7 للموقع ٠ خالا كتناصن ات مب الا (TOY دون إنتاج فواصل بجديلة حمض DNA غير مستهدفة غير مرغوب فيها.
Vo وقفقاً لاستخدامه في الطلب الحالي, التعبير 'ناقل تعبير” يشير إلى جزيء الحمض النووي القادر على نقل حمض نووي HAT يرتبط به. ويكون أحد أنواع الناقل عبارة عن Fuad مما يشير إلى حلقة DNA مجدولة مزدوجة دائرية يمكن ربط قطاعات الحمض النووي الإضافية بها. يكون نوع آخر من الناقل عبارة عن ناقل فيروسي؛ حيث يمكن ربط قطاعات الحمض النووي الإضافية في الجينوم الفيروسي. وتكون نواقل محددة قادرة على التكاثر التلقائي في الخلية العائلة التي يتم إدخاله led (متل
٠٠ النواقل البكتيرية bacterial vectors التي يكون لها أصل تكاثر بكتيري ونواقل ثديية لجسيمات ملحقة بالكروموسومات). يتم دمج النواقل الأخرى (النواقل الثديية من غير الجسيمات الملحقة بالجسيمات) في مجموعة العوامل الوراثية للخلية العائلة عند الإدخال في الخلية العائلة؛ وبذلك يتم تكائره مع مجموعة العوامل الوراثية للخلية العائلة. علاوة على ذلك» تكون نواقل محددة قادرة على توجيه التعبير الوراثي للجينات التي ترتبط بها بصورة فعالة. يتم الإشارة إلى تلك النواقل في هذه الوثيقة
YO بتعبير 'ثواقل التعبير الوراثي الناتجة عن عودة الارتباط الجيني"؛ أو بصورة بسيطة أنواقل التعبير الوراثي". بوجه cole تكون نواقل التعبير الوراثي النافعة في تقنيات DNA الناتجة عن عودة الارتباط
OY AY
هه الجيني في صورة بلازميدات. في المواصفة الحالية؛ يتم استخدام تعبيرات 'بلازميد " وناقل" بصورة متبادلة حيث يكون البلازميد مستخدم بصورة متكررة من الناقل. مع هذاء يتضمن الاختراع صور أخرى من نواقل التعبير الوراثي؛ مثل النواقل الفيروسية J) فيروسات النسخ العكسي المعيبة للتكاثر, والفيروس البطيء lentiviruses ¢ والفيروس الغدي «adenoviruses والفيروسات المرتبطة © بالغدد adeno-associated viruses .)؛ التي تقوم بوظائف مكافئة. في نطاق ناقل التعبير الوراتي» يعني تعبير "مرتبط بصورة فعالة” أن متوالية النيوكليوتيد nucleotide 8008 محل الأهمية ترتبط بالمتواليات المنتظمة بطريقة تسمح بالتعبير الوراثي عن متوالية النيوكليوتيد (على سبيل المثال, في نظام الانتساخ / الترجمة في المعمل أو في الخلية المستهدفة عند إدخال الناقل في الخلية المستهدفةاا6©© ]18096 ). يتضمن تعبير 'متوالية منتظمة regulatory Yo 56006068 ' المعززات؛ والمعززات؛ وعناصر التحكم في التعبير sl الأخرى (على سبيل المثال, إشارات المعالجة ببولي signals Juul 007 ). ويتم وصف المتواليات التتظيمية المذكورة» على سبيل المثال؛ في Goeddel; Gene Expression Technology: Methods in Enzymology 185, Academic Press, San Diego, CA (1990) تتضمن المتواليات التتظيمية تلك التي تتعلق بالتعبير الوراثي التكويني المباشر لمتوالية النيوكليوتيد في العديد من أنواع ١ الخلية العائلة وتلك التي ترتبط بالتعبير الوراثي المباشر لمتوالية النيوكليوتيد فقط في خلايا عائلة محددة (مثل المتواليات التتظيمية المحددة بالنسيج 115506). علاوة على ذلك؛ يمكن توصيل إنزيم إندونيوكلياز الذي يستهدف DNA بواسطة الناقل الذي يشتمل على متوالية نتظيمية لإجراء عملية تخليق مباشرة لإنزيم إندونيوكلياز الذي يستهدف DNA عند فترات زمنية محددة؛ أو على فترة زمنية محددة. ويدرك الماهرون في المجال أن تصميم ناقل التعبير الوراثي يمكن أن يعتمد على تلك العوامل ٠ | كاختيار للخلايا المستهدفة؛ ومستوى التعبير الوراثي المطلوب؛ وما شابه ذلك. وفقاً لاستخدامه في الطلب الحالي التعبير 'يشطر” عموماً يشير إلى توليد فاصل مزدوج الجديلة في جينوم ye DNA موضع مطلوب. وفقاً لاستخدامه في الطلب الحالي, التعبير "كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكلياز يستهدف حمض "DNA يشير إلى كمية من إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA ينتج نشاط Yo إندونيوكلياز كافي لتوليد فاصل مزدوج الجديلة في موقع الجينوم المطلوب. في أحد النماذج, تولد كمية فعالة من إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA فاصل مزدوج الجديلة عند الموقع الجيني المطلوب في
على الأقل 770 من الخلايا في مجموعة متلامسة مع تركيبة (على سبيل المثال, على الأقل JX على الأقل Tee على الأقل Tee على الأقل Te على الأقل 770, على الأقل TA على الأقل ,٠ على الأقل 790 على الأقل 799, أو حتى 7٠٠١ للخلايا في المجموعة التي تشتمل على تعديل جيني منتج بواسطة تركيبة إندونيوكلياز تستهدف حمض (DNA © وققاً لاستخدامه في الطلب الحالي التعبير 'زيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني” في خلية يشير إلى أن الهيموجلوبين الجنيني يكون على الأقل 75 أعلى في المجموعات المعالجة بعامل يمزق BCLIIA mRNA أو التعبير عن البروتين (على سبيل المثال, إندونيوكلياز يستهدف حمض (DNA بواسطة الارتباط بحمض DNA جينومي عند الكرموسوم ١ للموقع 60, SYA LVN LVYA 117 , عنه في مجموعة ALE للمقارنة, مقارنة, حيث لا يوجد عامل. ويفضل أن تكون النسبة ٠ المئوية للتعبير عن الهيموجلوبين الجنيني في مجموعة معالجة بمثل هذا العامل الذي يربط حمض DNA الجينومي عند الكرموسوم ؟ للموقع LT VAS YT LT 7748, 117 على الأقل 12٠ أعلى, على الأقل 77١0 أعلى, على الأقل 770 أعلى, على الأقل 7460 أعلى, على الأقل Tow أعلى, على الأقل 72700 أعلى, على الأقل 770 أعلى, على الأقل 7860 أعلى, على الأقل 1790 أعلى, على الأقل ١-ضعف أعلى, على الأقل ١-ضعف أعلى, على الأقل cameo أعلى, على No الأقل ٠١ ضعف أعلى, على الأقل ٠٠١ ضعف أعلى, على الأقل -٠٠٠١ ضعف أعلى, أو أكثر من المجموعة المعالجة بمقارن من حجم LB للمقارنة وظروف المزرعة. يُستخدم التعبير 'مجموعة معالجة بمقارن” في الطلب الحالي ليصف مجموعة من الخلايا تمت معالجتها باستخدام أوساط مطابقة, حث فيروسي, متواليات الحمض الأميني, درجة الحرارة؛ نسبة تشابك النسيج الخلوي؛ حجم الدورق» الرقم الهيدروجيني؛ إلخ؛ مع استثناء أنه تتم إضافة عامل يربط حمض DNA جينومي عند ٠ الكرموسوم ؟ للموقع TAG VT Te 774, 117. في أحد النماذج, يمكن استخدام أية طريقة معروفة في المجال لقياس زيادة في التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني, على سبيل المثال؛ تحليل لطخة وسترن Western Blot لبروتين جلوبين- y جنيني fetal y —globin protein وتحديد كمية MRNA لبروتين جلوبين- 7 جنيني. التعبير "خلية معزولة isolated cell " وفقاً لاستخدامه في الطلب الحالي يشير إلى خلية تمت إزالتها YO من كائن توجد فيه أصلاً, أو تتحدر من Jie هذه الخلية. اختيارياً تم اسنتبات الخلية cell has been cultured في المعمل, على سبيل المتال, في وجود Wal الأخرى. اختيارياً يتم إدخال الخلية CAR
7ه لاحقاً في كائن ثاني أو تتم إعادة إدخالها في الكائن الذي تم عزل الخلية منه (أو الذي تتحدر منه الخلية). التعبير 'مجموعة معزولة” بالنسبة إلى مجموعة معزولة من WA وفقاً لاستخدامه في الطلب الحالي يشير إلى مجموعة من الخلايا تمت إزالتها وتم فصلها من مجموعة مختلطة أو غير متجانسة heterogeneous © من الخلايا. في بعض النماذج, تكون المجموعة المعزولة هي مجموعة نقية من الخلايا إلى حد بعيد مقارنة بالمجموعة غير المتجانسة التي تم عزل الخلايا منها أو إثراؤها بها. في بعض النماذج, تكون المجموعة المعزولة مجموعة معزولة من خلايا أولية بشرية لتكوين الدم, على سبيل المثال, مجموعة نقية إلى حد بعيد من LDA أولية بشرية لتكوين pall مقارنة بمجموعة غير متجانسة من الخلايا التي تشتمل على خلايا أولية بشرية لتكوين الدم والخلايا التي تم منها اشتقاق Vy الخلايا الأولية البشرية لتكوين الدم. التعبير 'نقي إلى حد بعيد, " بالنسبة إلى مجموعة خلايا معينة, يشير إلى مجموعة من WAN تبلغ على الأقل حوالي Ve ويفضل على الأقل حوالي ZA ويفضل أكثر على الأقل حوالي Jae والأفضل على الأقل حوالي 795 نقي, بالنسبة إلى الخلايا التي تشكل إجمالي مجموعة الخلايا. أي, التعبيرات 'نقي إلى حد بعيد" أو 'متقى بصورة أساسية, ' فيما يتعلق بمجموعة من الخلايا الأولية ١ _لتكوين الدم, يشير إلى مجموعة من الخلايا التي تحتوي على أقل من حوالي TY ويفضل أكثر أقل من حوالي 715, ,71١ 78, 71, والأفضل أقل من حوالي 75, BVA SIVA S/S 21, أو أقل من ,7١ ومن الخلايا التي لا تكون خلايا أولية لتكوين الدم طبقاً لما تم تعريفه بواسطة التعبيرات في الطلب الحالي. وفقاً لاستخدامه في الطلب الحالي, التعبير pe يتضمن خفض أو تخفيف واحد على الأقل من Yo تأثير غير ملائم أو عرض حالة, مرض أو اضطراب. على سبيل المثال, التعبير Tallady Ee يشير إلى إعطاء إلى خاضع كمية فعالة من تركيبة, على سبيل المثال, كمية فعالة من تركيبة تشتمل على مجموعة من خلايا أولية لتكوين الدم بحيث يكون لدى الخاضع تخفيض في عرض واحد على الأقل من المرض أو تحسين في المرض, على سبيل المثال, نتائج مفيدة أو إكلنيكية مطلوبة. لأغراض هذا الكشف, تتضمن النتائج المفيدة أو الإكلينيكية المطلوبة, ولكن ليس على سبيل الحصر, تخفيف © واحد أو أكثر من الأعراض, وتقليل مدى المرض, ثبات المرض (على سبيل المثال, عدم ازدياد الحالة سوءا), تأخير أو إبطاء تطور المرض, تخفيف أو تسكين Alla المرض, وهجوع (سواء جزئي أو كلي), CAN
-مه- سواء قابل للكشف أو غير قابل للكشف. في بعض النماذج, يمكن أن يشير العلاج إلى إطالة البقاء مقارنة بالبقاء المتوقع في حالة عدم تلقي العلاج. بالتالي, يدرك ذو المهارة في المجال أن العلاج يمكن أن يحسن حالة المرض, ولكن يمكن ألا يكون شفاء كامل من المرض. في بعض النماذج, يمكن أن يتضمن العلاج الوقاية. ومع ذلك, في نماذج بديلة, لا يتضمن العلاج الوقاية. © تستخدم العبارة "مقبول صيدلانياً”؛ في الطلب الحالي لتشير إلى تلك المركبات, المواد, والتركيبات, و / أو صور الجرعات التي تكون, في نطاق مجال الحكم الطبي الصائب, ومناسبة للاستخدام في تلامس مع أنسجة الكائنات البشرية والكائنات دون سمية مفرطة؛ وتهيج؛ واستجابة تحساسية؛ أو مشكلة أو تعقيد آخر بما يتتاسب مع نسبة الفائدة/ الخطر المعقولة. La, لاستخدامه في الطلب الحالي, التعبير "'مقبول صيدلانياً”؛ LF للتحمل فسيولوجيا” والصور ٠ النحوية المتتوعة منهاء إلى تركيبات» ومواد ناقلة carriers ؛ ومواد مخففة diluents ومواد (Jeli يتم استخدامها بشكل متبادل وتوضح أن المواد قابلة للإعطاء لكائن ثديي بدون إنتاج تأثيرات فسيولوجية مثل الغثيان nausea ¢ والدوار0122107655© واضطراب المعدة gastric upset وما شابه. لن تؤدي المادة الناقلة المقبولة صيدلانياً إلى تعزيز ارتفاع الاستجابة المناعية تجاه عامل يتم خلطها معه؛ إلا عند الحاجة. يعتبر تحضير تركيبة دوائية تحتوي على مكونات فعالة مذابة أو مشتته Vo فيها معروفة في المجال ولا تحتاج إلى تقييد sly على الصيغة. تشتمل الصيغة الصيدلانئية على مركب الاختراع في توليفة مع واحد أو أكثر من المكونات المقبولة صيدلانياً. يمكن أن تكون المادة الناقلة في صورة صلبة؛ أو نصف صلبة أو مادة مخففة سائلة؛ أو كريم أو كبسولة. نمطياً؛ يتم تحضير هذه التركيبات بحيث تكون ALE للحقن Le) في صورة محاليل سائلة أو معلقات؛ مع ذلك يمكن أيضاً تحضير الصور الصلبة للمحلول أو المعلقات في سائل قبل الاستخدام. يمكن أيضاً أن Yo يكون المستحضر في صورة مستحلب أو موجود في تركيبة دهنية. يمكن خلط المكون الفعال مع سواغات مقبولة صيدلانياً ومتوافقة مع المكون الفعال وبكميات مناسبة للاستخدام في الطرق العلاجية التي تم وصفها هنا. Jian السواغات excipients المناسبة؛ على سبيل المثال؛ في الماء؛ أو محلول ملحي saline ؛ أو ديكستروز dextrose ؛ أو جليسرول glycerol أو إيثانول ethanol أو ما شابه وتوليفات منها. بالإضافة إلى ذلك؛ عند الحاجة؛ يمكن أن تشتمل التركيبة على كميات ثانوية من مواد YO مساعدة مثل عوامل الترطيب wetting أو الاستحلاب emulsifying agents « وعوامل منظمة buffering agents للرقم الهيدروجيني PH وما شابه Ally يمكنها تعزيز فاعلية المكون الفعال. CAR
-4ه8-
يمكن أن تشتمل التركيبة العلاجية الخاصة بالاختراع الحالي على أملاح مقبولة صيدلانياً للمكونات الواردة هنا. تشتمل الأملاح المقبولة صيدلانياً على أملاح إضافة الحمض (التي يتم تشكيلها بواسطة مجموعات الأمين الحرة free amino للبولي ببتيد (polypeptide التي يتم تشكيلها بواسطة أحماض غير عضوية inorganic acids ؛ على سبيل المثال» أحماض الهيدروكلوريك hydrochloric © والفسفوريك phosphoric acids « وتتمتل الأحماض العضوية المذكورة في حمض الأسيتيك acetic » والترتريك tartaric « والمندليك mandelic وما شابه. يمكن أيضاً اشتقاق الملاح المتكونة باستخدام مجموعات الكربوكسيل الحرة free carboxyl من قواعد غير عضوية؛ مثل هيدروكسيدات hydroxides من الصوديوم sodium » أو البوتاسيوم potassium ¢ أو الأمونيوم ammonium » أو الكالسيوم calcium أو الحديديك ferric ؛ وتتمثل القواعد العضوية المذكورة في الأيزو ٠ بروبيلامين isopropylamine » وتراي ميثيلامين trimethylamine ¢ و؟-ايقيل أمينو Jeli ethylamino ethanol ؛ وهيستدين histidine ¢ وبروكاين procaine وما شابه. تعتبر المواد الناقلة المقبولة فسيولوجياً معروفة في المجال. تكون المواد الناقلة التمثيلية ALLY عبارة عن محاليل مائية معقمة والتي لا تحتوي على مواد بالإضافة إلى المكونات الفعالة والماء؛ أو تحتوي على محلول منظم Jie فوسفات الصوديوم sodium phosphate عند ded رقم هيدروجيني فسيولوجية؛ أو Vo محلول ملحي فسيولوجي أو Jie (Lads محلول ملحي منظم بالفوسفات phosphate-buffered saline بالإضافة إلى ذلك؛ يمكن للمواد الناقلة المائية أو تشتمل على أكثر من ملح منظم واحد؛ بالإضافة إلى أملاح مثل كلوريدات الصوديوم والبوتاسيوم sodium and potassium chlorides « وديكستروز dextrose ؛ وبولي إيتيلين جليكول polyethylene glycol ومواد مذابة أخرى. يمكن أيضاً أن تشتمل التركيبات السائلة على أطوار سائلة بإضافة الماء أو استبعاده. Ab ian الأطوار ٠ السائلة liquid phases الإضافية المذكورة في الجليسرين» أو الزيوت النباتية Jie زيت بذر القطنء ومستحلبات الماء والزيت. ستعتمد كمية العامل الفعال المستخدم في الاختراع والذي سيكون فعالاً في علاج اضطراب أو Ala محددة على طبيعة الاضطراب أو الحالة؛ ويمكن تحديده بواسطة تقنيات
سريرية قياسية. وفقاً لاستخدامه في الطلب الحالي, 'وقاية" أو "للوقاية, " عند استخدامها في الإشارة إلى مرض, أو Yo اضطراب أو أعراض منها, يشير إلى تخفيض في احتمالية أن يتكون لدى الفرد مرض أو اضطراب, على سبيل المثال, اعتلال الهيموجلوبين. يتم تقليل احتمالية تكوين مرض أو اضطراب, على سبيل qa يعاني فرد ما من واحد أو أكثر من عوامل الخطر لمرض ما أو اضطراب إما يخفق في Lovie, JE هذا المرض أو الاضطراب في وقت لاحق أو بحدة أقل, من الناحية Jie تكوين الاضطراب أو تكوين الإحصائية, بالنسبة إلى مجموعة تعاني من نفس عوامل الخطر ولا تتلقى علاج وفقاً للموصوف في الطلب الحالي. يتم اعتبار الإخفاق في تقليل تطور أعراض مرض ما, أو تطور أعراض مخفضة على الأقل على مقياس مقبول إكلينيكياً لذلك المرض أو الاضطراب) 7٠١ (على سبيل المثال, بنسبة © أو تم تأخيرها (على سبيل المثال, بأيام, أسابيع, أو شهور أو أعوام) وقاية فعالة. ,50111/ لتخفيض التعبير عن DNA يتعلق بتلامس الخلية مع إندونيوكلياز يستهدف حمض Lod العبارة 'زيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني في خلية” تشير إلى أن الهيموجلويين الجنيني في خلية أو مجموعة من الخلايا يكون على الأقل 75 أعلى في الخلية أو مجموعة من الخلايا المعالجة بحمض من مجموعة قابلة للمقارنة, مقارنة, حيث لا يوجد إنزيم DNA يستهدف إندونيوكلياز حمض ٠ ويفضل أن يكون التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني في خلية . DNA إندونيوكلياز يستهدف حمض أعلى, على 77١ أعلى, على الأقل 7٠١ على الأقل DNA بإندونيوكلياز يستهدف حمض dallas الأقل 730 أعلى, على الأقل 7460 أعلى, على الأقل 756 أعلى, على الأقل 71650 أعلى, على الأقل
JN أعلى, على الأقل 780 أعلى, على الأقل 7960 أعلى, على الأقل ١-ضعف أعلى, على ٠ ٠٠١ ضعف أعلى, على الأقل ٠١ أعلى, على الأقل Geese 7-ضعف أعلى, على الأقل | 5 ضعف أعلى, على الأقل ١٠٠٠-ضعف أعلى, أو أكثر من مجموعة معالحة بمقارن قابل للمقارنة. يُستخدم التعبير 'مجموعة معالجة بمقارن" في الطلب الحالي ليصف مجموعة من الخلايا تمت معالجتها باستخدام أوساط مطابقة, حث فيروسي, متواليات الحمض الأميني, درجة الحرارة؛ نسبة
BCL1IA تشابك النسيج الخلوي؛ حجم الدورق» الرقم الهيدروجيني؛ إلخ؛ مع استثناء إضافة متبط ثديي" واحد أو مجموعة من "الثدييات”؛ ويشتمل على AS ثديي" أن يضم GIS يقصد بمصطلح ٠ سبيل المثال وليس الحصرء؛ على البشر؛ والحيوانات الرئيسة مثل القرود؛ والنسانيس والسعلات الهرة والأسود والنمور؛ وفصيلة Jie والشمبانزي؛ وفصيلة الكلبيات متل الكلاب والذئاب ؛فصيلة القطط الخيول مثل الحصان؛ والحمار والحمار الوحشي؛ والحيوانات التي تؤكل مثل البقر؛ والخنازير والخراف؛ والحافريات مثل الغزال والزرافات؛ والقوارض مثل الفئران؛ والجرذان والهمستر والخنازير الغينية؛ والدببة. في بعض النماذج المفضلة؛ يتمثل الكائن الثديي في البشر. Yo
CAR
في أحد النماذج؛ تم تشخيص أن الكائن البشري يعاني من اعتلال الهيموجلوبين. في نموذج colin وفقاً آخرء يكون اعتلال الهيموجلوبين عبارة عن اعتلال الهيموجلوبين ]. في أحد النماذج المفضلة؛ يكون اعتلال الهيموجلوبين عبارة عن مرض الخلية المنجلية. كما هو مستخدم هناء يمكن أن يكون 'مرض sickle-hemoglobin الخلية المنجلية" عبارة عن فقر الدم المنجلي؛ ومرض الهيموجلوبين المنجلي وثلاسيمية الخلية المنجلية (HDS B+) ©؛ وتلاسيمية الخلية المنجلية بيتا بلس disease )155©( ©
PB مفضل؛ يكون اعتلال الهيموجلوبين عبارة عن ثلاسيمية AT بيتا صفر (105/]0). في نموذج وفقاً لاستخدامه في الطلب الحالي, يشير المصطلح "اعتلال الهيموجلوبين" إلى أي خلل في هيكل أو وظيفة أي هيموجلويين خاص بفرد؛ ويتضمن حالات الخلل في الهيكل الأولي؛ أو الثانوي؛ أو الثلاثي فرات الحذف أو طفرات الاستبدال في مناطق Jie والرباعي للهيموجلوبين الذي يحدث بسبب أي طفرة؛ أو طفرات أو حالات حذف في محفزات أو معززات هذه الجينات التي تتسبب I تثشفير جين الجلوبين I
Lad في تقليل كمية الهيموجلوبين الذي يتم إنتاجه مقارنة بحالة عادية أو قياسية. يشتمل المصطلح على أي انخفاض في كمية أو فاعلية الهيموجلوبين» سواء طبيعي أو غير طبيعي؛ والذي يحدث شابه. Los 107005 المرض؛ أو العلاج الكيميائي؛ والسموم Jie بواسطة عوامل خارجية كما هو مستخدم هناء إلى كمية من تركيبة الخلية Clad في أحد النماذج, يشير المصطلح "كمية تكون آمنة وفعالة لعلاج؛ أو تقليل احتمالية أو تأخير تطور اعتلال الهيموجلوبين. بالتالي يمكن للكمية Vo أن تعالج أو تؤدي إلى تحسين أعراض اعتلال الهيموجلوبين؛ أو إبطاء تقدم مرض اعتلال أو تثبيط عرض اعتلال الهيموجلوبين؛ أو إبطاء أو تثبيط ظهور أعراض clad الهيموجلوبين؛ أو ثانوية لاعتلال الهيموجلوبين أو تثبيط تطور العرض الثانوي لاعتلال الهيموجلوبين. تعتمد الكمية الفعالة لعلاج اعتلال الهيموجلوبين على نوع اعتلال الهيموجلوبين المراد علاجه؛ وخطورة الأعراض؛ ونمط الإعطاء وهكذا. بالتالي؛ ليس cad عمر الخاضع والحالة العامة candle والخاضع الذي تتم ٠ بالضرورة تحديد "كمية فعالة' دقيقة. مع ذلك؛ بالنسبة لأي حالة معينة؛ يمكن تحديد "كمية فعالة" مناسبة بواسطة صاحب المهارة العادية في المجال باستخدام التجارب الروتينية فقط. وفقاً لاستخدامه في الطلب الحالي يتم استخدام المصطلح 'يشتمل" أو 'يشتمل على" بالإشارة إلى تركيبات, طرق, ومكون مناظر منه, والتي تكون أساسية للاختراع, ولا تزال مفتوحة لإدراج عناصر غير محددة؛ سواءً أساسية أو لا. YO
CAR
h \ —_ _ وفقاً لاستخدامه في الطلب الحالي يشير المصطلح Gall) بشكل أساسي من" إلى تلك العناصر المطلوبة لنموذج محدد. يسمح المصطلح بوجود عناصر إضافية لا تؤثر مادياً على السمة الأساسية والمبتكرة أو الوظيفية لذلك النموذج من الاختراع. يشير المصطلح "التي تتكون من" إلى تركيبات, طرق, ومكونات مناظرة منه وفقاً للموصوف في الطلب 0 الحالي, والتي تستثني أي عنصر غير مستشهد به في وصف النموذج. كما هو مستخدم في هذه المواصفة وعناصر الحماية المرفقة؛ تتضمن أدوات النكرة والمعرفة الإشارة إلى الجمع ما لم يتم الإشارة إلى ما يخالف ذلك بوضوح في السياق. بالتالي؛ وعلى سبيل المثال؛ تتضمن الإشارة إلى "الطرق" واحد أو أكثر من الطرق»؛ و/ أو الخطوات من النوع المذكور في هذه الوثيقة و/أو الذي يتضح للماهرين في المجال عند الإطلاع على الكشف وما إلى ذلك. يتم إدراك أن ٠٠ الوصف التفصيلي السابق والأمثلة التالية تكون لغرض التوضيح فقط ولا تكون مقيدة لمجال الاختراع. يمكن إجراء العديد من التغيرات والتعديلات على النماذج التي تم الكشف عنهاء والتي تتضح للماهرين في المجال؛ دون الابتعاد عن مجال الاختراع الحالي. علاوة على ذلك؛ يتم تضمين جميع البراءات؛ وطلبات البراءة؛ والنشرات المحددة بوضوح في هذه الوثيقة بواسطة الإشارة إلى أغراض الوصف والكشف؛ على سبيل المثال؛ المنهجيات المذكورة في النشرات المذكورة والتي يمكن استخدامها ١٠ بالاشتراك مع الاختراع الحالي. ويتم توفير تلك النشرات فقط للكشف عنها قبل تاريخ الإيداع للطلب الحالي. ويجب عدم تقبيد أي شيء في هذا المنطلق باعتباره نص على أن المخترع يكون له الحق في التسجيل بتاريخ سابق للكشف المذكور بموجب الاختراع السابق أو لأي سبب آخر. تعتمد جميع البيانات حتى تاريخ أو تقديم محتويات تلك الوثائق على المعلومات المتوفرة لمقدمي الطلب ولا تشكل أي قبول بتصحيح تواريخ أو محتويات تلك الوتائق. Yo اعتلال الهيموجلوبين يكون الهيموجلوبين الجنيني Fetal hemoglobin (HF) عبارة عن تترامير fy من بولي ببتيدات الجلويين © لدى البالغين واثنين من بولي ببتيدات الجلوبين globin polypeptides .8 الشبيهة ببولي ببتيدات الجلوبين 7. أثناء الحملء تُنشاً جينات الجلوبين98065 globin 7 المزدوجة الجينات السائدة التي تم نسخها من موضع الجلوبين B بعد الولادة؛ يتم استبدال الجلوبين y بشكل تدريجي YO بالجلوبين | للبالغين» وهي عملية يشار إليها ب"التحويل الجنيني” (7). ظلت الآليات الجزيئية التي CAR
ا يعتبر أساسها هذا التحويل غير محدد على نحو كبير وتخضع لأبحاث مكثفة, يبدا التحويل التطويري من إنتاج هيموجلوبين جنيني سائد أو HDF (0272) إلى إنتاج هيموجلوبين لدى البالغين أو HDA (0202) عند حوالي 78 إلى TE أسبوع من الحمل ويستمر لفترة قصيرة بعد الولادة عند النقطة التي يصبح Led ال HDA سائداً. ينتج هذا التحويل بشكل أساسي من الاستتساخ المنخفض لجينات 0 الجلوبين جاما والاستتساخ المتزايد لجينات الجلوبين بيتا. في المتوسط؛ يحتوي دم البالغ الطبيعي على حوالي 77 HOF فقط» على الرغم من أن مستويات وحدة ال HBF البنائية يكون بها اختلاف أكثر من ٠٠ مرة في البالغين الأصحاء .(Semin.
Hematol. 38(4):367-73 (2001) «Atweh) تتضمن حالات اعتلال الهيموجلوبين عدد من حالا الأنيميا من أصل وراثي والتي يكون فيها إنتاج منخفض و/أو هدم متزايد (انحلال الدم) لخلايا الدم الحمراء .red blood cells (RBCs) وتشتمل ٠ أيضاً هذه الاضطرابات على عيوب جينية والتي تؤدي إلى إنتاج هيموجلوبينات غير عادية مع قدرة ضعيفة مصاحبة على الحفاظ على تركيز الأكسجين. تتضمن بعض هذه الاضطرابات الفشل في إنتاج جلوبين ] طبيعي بكميات كافية؛ بينما تتضمن أخرى الفشل في إنتاج جلوبين ] طبيعي بشكل كلي. يتم بصفة عامة الإشارة إلى الاضطرابات المصاحبة لبروتين جلوبين B بحالات اعتلال الهيموجلوبين . على سبيل JB تنتج فقر الدم البحري | من الخلل الجزئي أو الكلي في التعبير الوراثي لجين ١ الجلوبين «ff مما يؤدي إلى HDA ناقص أو غير موجود. ينتج فقر الدم المنجلي من طفرة نيوكليوتيد واحد في جين الجلوبين 3] الهيكلي؛ مما يؤدي إلى إنتاج هيموجلوبين غير طبيعي منجلي (HBS) تكون HBS RBCs أكثر هشاشة من ال RBCs الطبيعية وتخضع لانحلال الدم بسهولة؛ مما يؤدي في النهاية إلى الأنيميا (Semin.
Hematol. 38(4):367-73 (2001) Atweh) علاوة على ذلك» يؤدي وجود البديل الجيني ل BCLITA والصور المنتوعة ل HBSIL-MYB إلى تحسين ٠ الخطورة السريرية في فقر الدم البحري بيتا. وجد أن هذا البديل يكون مصاحب لمستويات ال HOF هنا توضيح أنه يوجد نسبة فرق تبلغ © لصورة ثلاسيمية بيتا أقل خطورة مع بديل HEF عالي .(in press «Blood 2009 «Galanello 5. et al.) يركز البحث عن علاج يستهدف تقليل اختلال توازن سلسلة الجلوبين في مرضى يعانون من اعتلال الههموجلوبين ] على المعالجة الدوائية للهيموجلوبين الجنيني (0272؛ (HOF يتم اقتراح الإمكانية Yo العلاجية لهذه الطرق بواسطة ملاحظات خاصة بالنمط الظاهري المعتدل للأفراد الذين لديهم صفات وراثية مشتركة من فقر الدم البحري B المتجانسة والاستدامة الوراثية للهيموجلوبين الجيني hereditary CAR
— أ — persistence fetal hemoglobin (HPFH) بالإضافة إلى المرضى الذين لديهم فقر pall البحري 3 المتجانسة والتي لا تتتج هيموجلوبين لدى البالغين؛ ولكن تتم ملاحظة مطلب منخفض لحالات نقل الدم في وجود تركيزات عالية من الهيموجلوبين الجيني. علاوة على ذلك؛ تمت ملاحظة أن مجموعة معينة من المرضى البالغين الذين لديهم تشوهات في سلسلة م يكون لديهم مستويات أعلى من 5 الطبيعية من الهيموجلوبين الجيني H bF) ( » وتمت ملاحظة أن لديهم مسار سريري لمرض أكثر Vise! من المرضى الذين لديهم مستويات طبيعية من ال HPF لدى البالغين. على سبيل JED يكون لمجموعة من المرضى السعوديين الذين يعانون من فقر الدم المنجلي ويعبرون وراثياً على ما يتراوح من 770-7١ من ال HBF مظاهر سريرية معتدلة فقط للمرض Br. «et al. (Pembrey) Haematol. 40: 415-429 )1978( .ل). يعتبر مقبولاً الآن أن يتم تحسين اضطرابات ٠ الهيموجلوبين» مثل فقر الدم المنجلي وفقر الدم البحري off بواسطة إنتاج ال 107 المتزايد. Reviewed in Jane and Cunningham Br. J. Haematol. 102: 415-422 (1998)) .(N. Engl. J. Med. 328: 129-131 (1993) Bunn على الرغم من أن الآليات الجزيئية التي تتحكم في التحويل التطويري في الجسم الحي من التعبير الوراثي عن جين جلوبين 7 إلى م تعتبر معروفة حالياً؛ يوجد دليل تراكمي على أن العوامل الخارجية .يمكنها أن تؤثر على التعبير الوراثي عن جين جلوبين 7.كانت مجموعة المركبات الأولى التي تم ١ كانت عبارة عن عقاقير مسممة للخلايا. القدرة على إحداث HBF تتشيط sale) اكتشاف أن بها نشاط -٠ التي تم إظهارها أولاً باستخدام Algal) بواسطة المعالجة HEF عملية تخليق من البداية لل
Proc Natl Acad Sci لا 5 A. (DeSimone) آزاسيتيدين في حيوانات التجارب )1982( 79)14(:4428-31). بشكل لاحق للدراسات التي تأكد على قدرة ال © -آزاسيتيدين azacytidine | ٠ على زيادة ال HDF في المرضى الذين يعانون من فقر الدم Bad) ومرض الخلية المنجلية et Ley, 307: 1469-1475 (1982) «N. Engl. J. Medicine cet al. (Ley) (Blood 62: 370-380 (1983) «al. توضح تجارب إضافية أن حيوانات السعدان التي تم علاجها باستخدام جرعات مسممة للخلايا من أرابينو سيل سيتوزسين (Ch) استجابت للارتفاعات الكبيرة في الخلايا الشبكية Science. 224(4649):617-9 Papayannopoulou et al.) F Yo (1984))؛ وأدى العلاج باستخدام الهيدروكسي hydroxyurealy sy إلى حث الجلوبين 7 في القرود أو حيوانات السعدان et. al.) صأساعاء )1984( 310(14):869-73 Engl J Med. ل١).
—vo- تم التحقق من قدرة مجموعة المركبات الثانية على إحداث نشاط HBF Lisi sale) مع أحماض دهنية قصيرة السلسلة05 86 short chain fatty . أدت الملاحظة الأولية في الخلايا الأصلية لدم الحبل السري الجنيني fetal cord blood progenitor cells إلى اكتشاف أن حمض الأمينو بيوتريك y aminobutyric يمكن أن يعمل كمحدث للهيموجلوبين الجنيني Biochem (Perrine et al.) yell. (Biophys Res Commun. 148)2(:694-700 )1987( © الدراسات اللاحقة أن البوتيرات تحث إنتاج الجلوبين في حيوانات السعدان البالغة Blood. 000518010018165 et al.) ¢Dec )1988( 72)6(:1961-7) كما أنها تحث الجلوبين 7 في الخلايا الأصلية الشبيهة بالكريات الحمراء في الحيوانات البالغة أو المرضى الذين يعانون فقر الدم المنجلي Blood. (Perrine et al.) (1989) 74)1(:454-9). أظهرت أيضاً مشتقات الأحماض الدهنية قصيرة السلسة Jie الفينيل (Br J Haematol. 83(3):555-61 (1994) Dover et al.) بوتيرات1/816ا5الا080م ٠ 1: Blood. 186(8):3227-35 «Liakopoulou et al.) valproic acid وحمض الفالبرويك في الجسم الحي. بمعرفة العدد الكبير لنظائر أو مشتقات الأحماض HBF أنها تحث ال ((1995) الدهنية قصيرة السلسة الخاصة بهذه العائلة؛ فإنه يوجد عدد من المركبات المحتملة الخاصة بهذه العائلة والتي تكون أكثر فاعلية من البوتيرات 50173816 . تم إعتبار أن أحماض الفينيل أسيتيك
Blood Cells Mol Dis. 101461500 et al.) phenylalkyl والفينيل ألكيل Phenylacetic Yo محتملة HBF الدراسات اللاحقة؛ أنها محدثات Ui والتي تم اكتشافها ¢(22(2):150-8. (1996) يظل استخدام البوتيرات أو Jal حيث أنها تتتمي لهذه العائلة من المركبات. مع ذلك؛ في الوقت الخاصة به في فقر الدم المنجلي أو فقر الدم البحري م قيد التجربة ولا يمكن تزكيته في sual العلاج خارجة التجارب السريرية. ٠ تتضمن التجارب السريرية التي تهدف إلى إعادة تنشيط تخليق الهيموجلويين الجنيني في فقر الدم المنجلي وفقر الدم Bad) الإعطاء قصير المدى وطويل المدى لهذه المركبات Jie © -آزاسيتيدين azacytidine « والهيدروكسي hydroxyurealyys ومكون كرات الدم الحمراء البشري الناتج عن عودة الارتباط الجيني ونظائر حمض البيوتيريك؛ بالإضافة إلى توليفات منها. بعد هذه الدراسات؛ تم استخدام الهيدروكسي يوريا لحث ال HDF في البشر وأصبح الأخير العقار الأول والوحيد الموافق علية Yo بواسطة (FDA) Food and Drug Administration لعلاج حالات اعتلال الهيموجلوبين. مع cell يدل التفاوت في العيوب على وجود خطأً في الاستخدام طويل الأجل لهذه العوامل أو العلاجات؛
-؟-
بما في ذلك التأثيرات الجانبية غير المرغوب فيها والتغير يف استجابات المريض. على سبيل (JO على الرغم من أن الهيدروكسي يوريا يحث إنتاج ال HBF وأنه أظهر أنه يقلل أزمة تكون الخلايا المنجلية في الدم سريرياً؛ ويتم الحد منه بشكل ممكن بواسطة السمية النقيية وخطر التسرطن. يمكن أيضاً أن يتواجد التسرطن المحتمل طويل الأجل في العلاجات التي أساسها ©-آزاسيتيدين. لم تثبت 0 العلاجات التي أساسها مكون كرات الدم الحمراء أنها ثابتة ضمن نطاق من مجموعات مرضى. أظهرت أنصاف الأعمار القصيرة لحمض البيوتيريك butyric acid في الجسم all عائق محتمل في ملائمة هذه المركبات للاستخدام في التداخلات العلاجية. علاوة على ذلك؛ تكون الجرعات المرتفعة جداً من حمض البيوتريك لازمة لحث التعبير الوراثي عن جين الجلوبين oy الأمر الذي يتطلب قسطرة للانتشار المتواصل للمركب. علاوة على cells يمكن أن تكون الجرعات المرتفعة من ٠ حمض البيوتريك مصحوبة بسمية عصبية وتلف أكثر من عضو Blood 81: «et al.
Blau) (1993) 529-537). على الرغم من أن حتى أدنى زيادة في مستويات ال HBF تكون مفيدة في مرض الخلية المنجلية؛ تتطلب فقر pal البحري م زيادة أعلى بكثير وهو ما لا يمكن تحقيقه على نحو موثوق به أو آمن بواسطة أي من العوامل المستخدمة حالياً Seminars 0 Olivier)
.(Hematology 33: 24-42 (1996) ٠ يمكن of يوفر تحديد المنظمات الطبيعية لحث وإنتاج ال HPF وسائل لاستتباط تداخلات علاجية lam على العيوب المتعددة للمركبات التي تم وصفها أعلاه. نتج عن الدراسات الحالية المكثخف لارتباط الجينوم رؤى تتعلق بالأساس الجيني لأمراض معقدة متعددة وأثارها (McCarthy et al.) Manolio et. al.
J Clin Invest 118356 (2008) «Nat Rev Genet 9 « 1590 xe. ((2008) ذلك؛ في غالبية الحالات؛ لم يتم الكتشف عن الوصلة بين الارتباط الجيني وفسيولوجيا ٠ الأمراض التي تشكل الأساس. يكون مستوى الهيموجلوبين الجنيني (HEF) متأصل في صورة أثر كمي ويعتبر مهم من الناحية السريرية؛ بمعرفة دوره المذكور أعلاه والمميز جيداً في تحسين خطورة حالات اعتلال الهيموجلوبين الرئيسية رء؛ ومرض الخلية المنجلية sickle cell disease وفقر الدم البحري -thalassemia لم Nathan and 0505 hematology of (Nathan et. al.) (XI 0. «1864 «xiv) pp. 2 v. «infancy and childhood ed. 6th 2003)). قامت دراسات YO مكثفة لاثنين من الجينوم بتحديد ثلاث مواقع رئيسية تشتمل على مجموعة من خمس صور بلورية لنيكليوتيد واحد مشترك single nucleotide polymorphisms (SNPs) والتي تبلغ قيمتها حوالي
٠ من الصور المتتوعة في مستويات ال 167 Proc Natl Acad Sci U 5 «Lettre et al.) Menzel ¢1620 (2008) «Proc Natl Acad Sci U 5 A 105 Uda et al. «A (2008) «Nat Genet 39 cet al. )2007( 1197( علاوة على ذلك؛ يظهر أن العديد من هذه الصور المتتوعة تتوقع الخطورة السريرية لمرض الخلية المنجلية Proc Natl Acad Sci «Lettre et al.) A )2008( © 5 لا) ويمكن لواحد على الأقل من هذه ال SNPs أن تؤثر على الحصيلة السريرية في فقر الدم البحري م «Proc Natl Acad Sci U 5 A 105 Uda et al.) )2008( 1620). يتم وضع ال SNP التي لها أكبر تأثير؛ والتي تفسر أكثر من 7٠١0 من الصور المنتوعة في ال HOF في الانترون الثاني للجين على الكروموسوم ¢F 80111/8. حيث تم التحقق من دور 80111/8؛ عامل استتنساخ إصبع زنك من نوع «C2H2 في تطور الخلايا اللمفية «Nat Immunol 4 «Liu et al.) «Mol Cancer 5 Liu et 81. 525 )2003( ٠ )2006( 18)»؛ ولم يتم تحديد دورها في إنتاج خلايا الدم الحمراء أو تتظيم جين الجلوبين. في بداية عهد DNA الناتج عن عودة الارتباط الجيني؛ قدمت الدراسات الخاصة بهيكل جين الجلوبين أساس جزيئي قوي لفحص تحويل الجلوبين الجنيني. تم تركيز مجهود كبير على تحديد عناصر عند الموضع سيس في موضع الجلويين B ضرورية للتتظيم المناسب للجينات في مجموعة الجلوبين ١ المشابهة BJ تعتمد هذه الدراسات على الطفرات الموجودة في الطبيعة وحالات الحذف التي تؤثر على نحو مفاجئ على مستويات ال HOF لدى البالغين» والتي تم إلحاقها بواسطة توليد ly متحورة ورائياً تشتمل على جزء من المجمرعة Nathan and Oski's hematology «Nathan et. al.) (Xli p. 1864 xiv) pp. 2 v. «of infancy and childhood ed. 6th 2003) و( G. «Exp Hematol 33 «Stamatoyannopoulos )2005( 259( على الرغم من عناصر سيس ٠ الدقيقة المطلوبة لتحويل الجلوبين تظل غير محددة؛ تشير النتائج في الفئران المتحورة وراثياً إلى أن جينات الجلوبين 7 تعتبر ساكنة تلقائياً في مرحلة البالغين؛ وهي نتيجة تعتبر متوافقة جداً مع غياب المنشطات المعينة للمرحلة الجنينية أو وجود جين كبت معين لمرحلة. توفر النتائج الخاصة بالارتباط الجيني جينات مرشحة لفحص تدخلها في التحكم في جينات الجلوبين oy متل 80111/8. خلايا أولية لتكوين الدم Yo في أحد النماذج؛ يتم تلامس الخلية الأصلية لتكون الدم خارج الجسم الحي أو في المعمل. في نموذج محدد؛ تكون الخلية التي يتم تلامسها عبارة عن خلية لسلالة خلوية شبيهة بالكريات الحمراء cell of
م+- -the erythroid lineage في أحد النماذج, تركيبة الخلية تشتمل على الخلايا التي لها تعبير منخفض عن .BCL1IA يشير المصطلح "خلية أصلية لتكون all كما هو مستخدم هناء إلى خلايا سلالة خلوية لخلية جذعية والتي تؤدي إلى ارتفاع جميع أنواع WA الدم Ly في ذلك الخلايا النخاعية myeloid (كريات بيضاء © وحيدة النواة monocytes ؛ الخلايا الملتهمة الكبيرة macrophages ؛ خلايا متعادلة بيضاء neutrophils ؛ خلايا تتلون بالملونات القاعدية WIA « basophils يوزينية eosinophils ¢ كريات دموية حمراء erythrocytes ؛ الكريات الكبيرة غير المنواة megakaryocytes /الصفائح الدموية platelets « خلايا متعلقة بالزوائد العصبية (dendritic cells وسلالات خلوية ليمفاوية lymphoid (NK BT WDA) lineages يشير مصطلح "خلية لسلالة خلوية شبيهة بالكريات الحمراء"” إلى ٠ خلية تتلامس مع خلية تخضع لتكون كرات الدم الحمراء والتي بعد التمايز النهائي تشكل كرية حمراء أو خلية دم حمراء ax .80 blood cell (RBC) تلك الخلايا إلى واحدة من ثلاث سلالات خلوية؛ وخلايا شبيهة بالكريات الحمراء؛ وخلايا ليمفاوية وخلايا نخاعية؛ Law من الخلايا الأصلية لتكون الدم لنخاع العظم. بمجرد التعرض لعوامل نمو محددة ومكونات أخرى لبيئة تكون الدم بحجم الميكرو» يمكن أن تتضج الخلايا الأصلية لتكون pall من خلال مجموعة من الأنواع الخلوية الوسيطة ٠ للتتمايزء والمركبات الوسيطة لسلالة خلوية لخلايا شبيهة بالكريات الحمراء في 4805. بالتالي؛ يشتمل المصطلح ADL خلوية لخلايا شبيهة بالكريات الحمراء» كما هو مستخدم هناء على خلايا أصلية لتكون الدم» وأرومات المُضرجة rubriblasts » وسليفة المُضرجة prorubricytes » والأرومات الحمراء erythroblasts ؛ والخليفة المُضرجة ٠ metarubricytes والخلايا الشبكية reticulocytes والكريات الحمراء erythrocytes . ٠ في بعض نموذج, تشتمل الخلية الأصلية لتكون الدم على واحد على الأقل من توصيف مرقم سطح الخلية لخلايا أولية لتكوين الدم: ,+Thyl/CD90 ,+00059 ,+CD34 -/ 003810 , و C-kit/CDI +17. على نحو مفضل, تشتمل الخلايا الأصلية لتكون الدم على العديد من هذه المرقمات. في بعض النماذج, تشتمل الخلايا الأصلية لتكون الدم لسلالة الخلايا شبيهة الكريات الحُمر على توصيف مرقم سطح الخلية لسلالة الخلايا شبيهة الكريات الحُمر: 1071© و19 160.
ve
تكون الخلايا الجذعية Stem cells ؛ مثل الخلايا الأصلية لتكون الدم hematopoietic progenitor cells ¢ قادرة على التكاثر وتؤدي إلى زيادة الخلايا الأصلية التي يكون لديها القدرة على
توليد عدد كبير من الخلايا الأم والتي بدورها تؤدي إلى زيادة خلايا بنت متمايزة أو قابلة للتمايز. يمكن
حث خلايا البنت نفسها لتكاثر lly نسل الذي Lad بعد يتمايز إلى واحدة أو أكثر من أنواع خلية
© ناضجة mature cell ؛ Law يتم Lad احتجاز واحدة أو أكثر من الخلايا مع إمكانية تطوير الأم. بالتالي» يشير المصطلح "خلية جذعية؛ إلى خلية لها القدرة أو الإمكانية؛ في ظل ظروف محددة؛ على
التمايز إلى نمط ظاهري أكثر تخصصاً أو dia والتي تحتجز القدرة» في ظل ظروف محددة؛ على
التكاثر بدون التمايز إلى حدٍ كبير. في أحد النماذج» يشير التعبير خلية أصلية أو جذعية إلى خلية أم
عامة والتي يتخصص السليل (النسل) الخاص بهاء Sale اتجاهات مختلفة؛ بواسطة «pall على
Vs سبيل المثال بواسطة اكتساب صفات فردية بالكامل؛ مما يؤدي إلى تعدد متقدم للخلايا والأنسجة الجنينية. يعتبر التمايز الخلوي عبارة عن عملية معقدة تحدث بشكل نمطي من خلال العديد من اتقسامات الخلية. يمكن اشتقاق خلية متمايزة من خلية متعددة القدرات والتي يتم اشتقاقها من خلية متعددة القدرات» وهكذا. بينما يمكن اعتبار كل خلية من الخلايا متعددة القدرات المذكورة عبارة عن
خلايا جذعية؛ يمكن أن يتفاوت مدى كل نوع من أنواع الخلايا الذي يؤدي إلى زيادة الخلايا المتمايزة.
٠ يكون لبعض الخلايا المتمايزة أيضاً القدرة على زيادة خلايا لها إمكانية أكبر على التطور. يمكن أن تكون هذه القدرة طبيعية أو يمكن Lia طبيعياً عند العلاج بواسطة عوامل متعددة. في العديد من الحالات البيولوجية؛ تكون الخلايا الجذعية أيضاً 'متعددة القدرات" لأنه يمكنها أن تنتج نسل له أكثر
من نوع خلية مميزء ولكن لا يعتبر ذلك مطلوباً "للجذوعية”. يعتبر التجديد الذاتي جزء تقليدي آخر لتعريف الخلية الجذعية؛ وتعتبر أساسية كما هي مستخدمة في هذه الوتيقة. نظرياً؛ يمكن أن يحدث
٠ . التجديد الذاتي بأي من آليتين أساسيتين. يمكن أن تتقسم الخلايا الجذعية لا Bla مع وجود خلية بنت تحتجز الحالة الجذعية والأخرى تعبر وراثياً عن بعض الوظائف المحددة الأخرى المميزة والنمط الظاهري. على نحو بديل؛ يمكن أن تتقسم بعض الخلايا الجذعية في مجموعة بشكل متماثل إلى
خليتين جذعيتين؛ وبالتالي الحفاظ على بعض WAN الجذعية في المجموعة (JSS بينما تؤدي الخلايا الأخرى الموجودة في المجموعة إلى زيادة النسل المتمايز فقط. بصفة عامة؛ يكون DAL الأصلية"
YO نمط ظاهري خلوي يكون أكثر بدائية (أي؛ أنها خطوة أقدم بامتداد مسار تطوري أو تقدمي أكثر من خلية متمايزة بالكامل). dale يكون للخلايا الأصلية إمكانية تكاتر كبيرة أو عالية جداً. يمكن أن ترتفع
CAR
١ «= الخلايا الأصلية إلى أنواع خلايا متمايزة مميزة متعددة أو إلى نوع خلية واحد متمايز؛ بناءً على المسار التطوري والبيئة التي تتطور وتتمايز فيها الخلايا. في سياق نشأة الخلية؛ تعتبر الصفة 'متمايز” أو "lal مصطلح نسبي. تعتبر "خلية متمايزة "differentiated cell عبارة عن خلية تقدمت في مسار التطور أبعد من الخلية التي تتم مقارنتها © بها. بالتالي؛ يمكن أن تتمايز الخلايا الجذعية إلى خلايا منتجة لغيرها مقيدة بسلاسة خلوية Jia) خلايا أصلية مكونة opal والتي بدورها يكن أن تتمايز إلى أنواع أخرى من الخلايا المنتجة لغيرها أبعد من المسار (متل مادة منتجة لكرية حمرا Arig ¢ ( s ذلك مرحلة dale لخلية متمايزة؛ مثل كرية حمرا و والتي تلعب دوراً ase في نوع معين من الأنسجة ويمكنها أن تحتجز أو لا تحتجز القدرة على التكاثر. الخلايا الجذعية متعدد الإمكانات المحفزة ٠ في بعض النماذج, تكون الخلايا البشرية المهندسة Las الموصوفة في الطلب الحالي المشتقة من الخلايا الجذعية متعدد الإمكانات المعزولة. تتمتل ميزة استخدام 105605 في إمكانية أن تكون الخلايا مشتقة من نفس الخاضع الذي يتم إعطاء الخلايا الأولية له. بمعنى أنه, يمكن الحصول على الخلية الجسمية من خاضع, تمت إعادة برمجته إلى خلية جذعية مستحثة متعددة القدرات, وبعد ذلك تمت sale) تمايزه في خلية أولية لتكوين الدم سيتم إعطائها إلى خاضع (على سبيل المثال, الخلايا ذاتية ١ المنشاً). نظراً oF الخلايا السليفة تكون على نحو أساسي مشتقة من مصدر ذاتي المنشاً, يقل خطر رفض الطعم أو الاستجابات التحساسية مقارنة باستخدام الخلايا من خاضع آخر أو مجموعة من الخاضعين. في بعض النماذج, تكون الخلايا السليفة المكونة للدم مشتقة من مصادر غير ذاتية المنشاً. إضافة لذلك, استخدام iPSCs ينفي الحاجة إلى الخلايا التي تم الحصول عليها من مصدر جنيني. بالتالي, في أحد النماذج, لا تكون الخلايا الجذعية المستخدمة في الطرق التي تم الكشف عنها Yo الخلايا الجذعية الجنينية .embryonic stem cells على الرغم من أن التمايز يكون عموماً غير قابل للعكس في ظل السياقات الفسيولوجية,تم تطوير عدة طرق مؤخراً لإعادة برمجة الخلايا الجسمية إلى الخلايا الجذعية متعدد الإمكانات المحفزة. الطرق التمثيلية تكون معروفة لأولئك المهرة في المجال وتكون موصوفة بإيجاز في الطلب الحالي ما يلي. وفقاً لاستخدامه في الطلب الحالي, يشير المصطلح "إعادة البرمجة' إلى عملية Jad أو تعكس حالة Yo تتمايز خلية متمايزة Jo) سبيل المثال, الخلية الجسمية (somatic cell . بطريقة أخرى, تشير إعادة CAR yy البرمجة إلى عملية توجيه تمايز الخلية إلى الخلف إلى خلية من نوع أولي غير متمايزة أو أكثر. ينبغي ملاحظة أن وضع الكثير من الخلايا الأولية في مستتبت قد يؤدي إلى بعض الفقد في السمات المتمايزة بالكامل. بالتالي, وببساطة لا يجعل استتبات الخلايا المذكورة المتضمنة في مصطلح الخلايا سبيل المثال, الخلايا غير المتمايزة (Ho) المتمايزة من هذه الخلايا خلايا غير متمايزة أو الخلايا متعددة الإمكانات. يتطلب انتقال خلية متمايزة إلى تعدد (undifferentiated cells © الإمكانات مثير إعادة برمجة أبعد من المثير الذي يؤدي إلى فقد جزئي في صفة التمايز في مستتبت. تتمتع خلايا تمت إعادة برمجتها أيضاً بمواصفات القدرة على التمرير الموسع دون فقد إمكانيات النمو, بالنسبة إلى آباء الخلية الأولية, والتي تتمتع عموماً بالقدرة على عدد من الانقسامات المحدودة فقط في culture مسنتبت أو طرفياً قبل إعادة البرمجة. في بعض Lia برمجتها إما متمايزة sale] قد تكون الخلية التي سنتم ٠ النماذج, تضم إعادة البرمجة قلب كامل لحالة تمايز خلية متمايزة (على سبيل المثال, الخلية الجسمية) إلى حالة متعددة الإمكانات أو حالة متعدد الفعاليات. في بعض النماذج, تضم إعادة البرمجة قلب تام أو جزئي لحالة تمايز خلية متمايزة (على سبيل المثال, الخلية الجسمية) إلى خلية غير متمايزة (على يمكن أن ينتج عن إعادة البرمجة ٠. (embryonic-like cell سبيل المثال, خلية شبيهة بالجنين sale) التعبير عن جينات محددة بواسطة الخلايا, والتي يساهم التعبير عنها علاوة على ذلك في VO البرمجة. في نماذج محددة موصوفة في الطلب الحالي, تتسبب إعادة برمجة خلية متمايزة (على سبيل الجسمية) في أن تتخذ الخلية المتمايزة حالة غير متمايزة (على سبيل المثال, تكون خلية Ada), JA برمجتها, " أو "الخلايا الجذعية sale) غير متمايزة). الخلايا الناتجة يشار إليها بالاسم "خلايا تمت "(iPS أو IPSCs متعدد الإمكانات المحفزة (خلايا قد تشتمل إعادة البرمجة على تبديل, على سبيل المثال, قلب, بعض على الأقل من الأنماط الموروثة Yo ais, (methylation (على سبيل المثال, المعالجة بالميثيل nucleic acid لتعديل حمض نووي التغيرات اللاجينية, الطباعة الجينومية, إلخ, التي تحدث أنثناء التمايز chromatin الكروماتين الخلوي. تكون إعادة البرمجة مميزة عن الحفاظ المبسط على الحالة القائمة غير المتمايزة للخلية تكون متعددة الإمكانات فعلياً أو المحافظة على أقل من الحالة المتمايزة القائمة لخلية تكون بالفعل خلية تكون إعادة البرمجة مميزة أيضاً عن (pall متعددة الفعاليات (على سبيل المتال, خلية جذعية مكونة YO تعزيز التجديد الذاتي ل أو تكاثر الخلايا التي تكون بالفعل متعددة الإمكانات أو متعددة الفعاليات, على
CAR
7ل الرغم من أن التركيبات والطرق الموصوفة في الطلب الحالي يمكن استخدامها أيضاً للغرض المذكور, في بعض النماذج. لا تكون المنهج أو الطريقة الخاصة المستخدمة لتوليد الخلايا الجذعية متعددة الإمكانات من الخلايا الجسمية (مشار led] على نطاق واسع بالاسم "إعادة (aad ذات أهمية حرجة للاختراع المطلوب © حمايته. بالتالي, ستكون آية طريقة تعيد برمجة الخلية الجسمية إلى النوع النظير متعدد الإمكانات مناسبة للاستخدام في الطرق الموصوفة في الطلب الحالي. تم وصف مناهج إعادة البرمجة لتوليد الخلايا متعددة الإمكانات باستخدام توليفات محددة من عوامل انتساخ الخلايا الجذعية متعددة الإمكانات المحفزة. حول Yamanaka و Takahashi الخلايا الجسمية في الفتران إلى الخلايا شبيهة الخلية ES مع احتمال التطور الموسع بواسطة التحويل المباشر ٠ ل .(Takahashi and Yamanaka, 2006) c-Myc ,KIf4 ,Sox2 ,Oct4 5 تشبه الخلايا ES لأنها تستعيد مجموعة دوائر الانتساخ المرتبطة بتعدد الإمكانات 5 MUC للسطح اللاجيني. إضافة لذلك, تفي 10505 بجميع التجارب القياسية لتعدد الإمكانات: تحديداً, التمايز في المعمل في أنواع الخلية لثلاث طبقات جرثومية, تكوين teratoma المساهمة في الخلايا الخيمرية ,chimeras نقل السلالة الجرثومية ,(Maherali and Hochedlinger, 2008) germline transmission diss; Vo رباعي الصيغة الصبغية )2009 .(Woltjen et al., أوضحت الدراسات التالية أن خلايا IPS البشرية يمكن الحصول عليها باستخدام طرق تحويل مشابهة Lowry et al., 2008; Park et al., 2008; Takahashi et al., 2007; Yu et al., ( Jules ,(2007b الانتساخ ,SOX2 ,0CT4 trio و ,]NANOG المحدد كالمجموعة القلب لعوامل الانتساخ التي تحكم تعدد الإمكانات )2008 (Jaenisch and Young, يمكن إنتاج الخلايا IPS daly Yo تقديم متواليات الحمض الأميني التي تشفر جينات مرتبطة بخلية جذعية في شخص بالغ, الخلية الجسمية, تاريخياً باستخدام نواقل التعبير الفيروسية. يمكن توليد الخلايا IPS أو تكون مشتقة من الخلايا الجسمية المتمايزة طرفياً, وكذلك من الخلايا الجذعية البالغة, أو الخلايا الجذعية الجسمية. بمعنى أن, يمكن جعل خلية أولية غير متعددة الإمكانات متعددة الإمكانات أو متعددة الفعاليات بواسطة إعادة البرمجة. في الحالات المذكورة, قد لا YO يكون من الضروري تضمين الكثير من عوامل إعادة البرمجة المطلوبة لإعادة برمجة خلية متمايزة
السلا
طرفياً. على نحو إضافي, يمكن تحفيز إعادة البرمجة بواسطة تقديم عوامل إعادة البرمجة غير الفيروسية, على سبيل المثال, بواسطة إدخال البروتينات ذاتها, أو بواسطة إدخال أحماض نووية تشفر عوامل إعادة البرمجة, أو بواسطة إدخال RNAS مرسل والذي بمجرد ترجمته وراثياً ينتج عوامل sale) البرمجة (انظر على سبيل المثال, Warren et al.,, Cell Stem Cell, 2010 Nov o(5;7(5):618-30 © يمكن أن تتحقق إعادة البرمجة بواسطة إدخال توليفة من أحماض نووية تشفر جينات مرتبطة خلية جذعية بما في ذلك, على سبيل Jia) 00-4 (أيضاً معروفة بالاسم Oct=3/4 أو ,Sox 18 ,Sox 15 ,Sox3 ,Sox2 ,Soxl ,(Pouf51 و ااحظلا, , KIfl 12لا 4آلها, -LIN28 , , 161 ,Rem2 ,n-Myc ,Myc-) ,c-Myc ,NR5A2 5 في أحد النماذج, تشتمل sale) البرمجة باستخدام الطرق والتركيبات الموصوفة في الطلب الحالي علاوة على ذلك على إدخال ٠ واحد أو أكثر من 001-3/4, عضو من عائلة ,SOX عضو من عائلة KIf وعضو من عائلة Myc في الخلية الجسمية. في أحد النماذج, تشتمل الطرق والتركيبات الموصوفة في الطلب الحالي علاوة على ذلك على إدخال واحد أو أكثر من كل من 4 c-MYC ,Nanog ,Sox2 ,0ct و 14لا لإعادة البرمجة. وفقاً للملاحظ سابقاً, الطريقة المحددة المستخدمة لإعادة البرمجة لا تكون حرجة بالضرورة للطرق والتركيبات الموصوفة في الطلب الحالي. مع ذلك, حيث يكون من المطلوب استخدام الخلايا ١ المتمايزة من خلايا تمت sale) برمجتها في, على سبيل المثال, علاج البشر, في أحد النماذج لا يتم sale) das البرمجة بواسطة طريقة تبدل الجينوم. بالتالي, في النماذج المذكورة, تتحقق إعادة البرمجة,
على سبيل المثال, دون استخدام بلازميد ناقل تعبير أو بلازميد فيروسي plasmid vectors يمكن تحسين كفاءة إعادة البرمجة (أي, عدد خلايا تمت إعادة برمجتها) المشتقة من مجموعة من الخلايا البادئة بواسطة إضافة العديد من جزيئات صغيرة وفقاً للموضح بواسطة Shi, Y., et al Cell-Stem Cell 2:525-528, Huangfu, D., et al (2008) Nature ٠ )2008( Biotechnology 26(7): 195-7191, and Marson, A., et al (2008) Cell-Stem Cell 3:132-5. بالتالي, يمكن استخدام عامل أو توليفة من العوامل التي تحسن كفاءة أو معدل إنتاج خلية جذعية متعددة الإمكانات محفزة في إنتاج IPSCs خاصة بالمريض أو بالمرض. تشتمل بعض أمثلة العوامل غير الحصرية التي تحسن كفاءة sale] البرمجة على Wit قابل للذوبان, وسط مهيا بت BIX-01294 (G9a Wnt Yo هيستون ميثيل ترانسفيراز 1805781856 الإ 00810 ,(histone 1 (متبط (MEK مثبطات ميثيل ترانسفيراز DNA methyltransferase , متبطات
ل هيستون دي أسيليتاز histone deacetylase (HDAC) حمض فالبوريك —'s , valproic acid أزاسيتيدين azacytidine , دكساميثازون dexamethasone , سوبرويل أنيليد 50061080118 , حمض هيدروكساميك hydroxamic acid (/1ا/5), فيتامين ,C وتراي كوستاتين 110051817 (TSA) , من بين غيرها أخرى. © تشتمل الأمثلة الأخرى غير الحصرية لعوامل تحسين إعادة البرمجة على: حمض سوبرويل أنيليد هيدروكساميك 610 Ae) (SAHA) Suberoylanilide Hydroxamic سبيل المثال, 3, فورينوستات vorinostat ) وأحماض هيدروكساميك hydroxamic acids الأخرى), Depudecin ,BML-210 (على سبيل المثال, Depudecin), HC Toxin, Nullscript (4-(1,3-Dioxo-IH,3H—(-) J a4, (benzo[de]isoquinolin-2-yl)-N-hydroxybutanamide | ٠ بوترات Ae) Phenylbutyrate سبيل المثال, فينيل بوتيرات الصوديوم (sodium phenylbutyrate وحمض فالبوريك (VPA) Valproic Acid والأحماض الدهنية fatty acids الأخرى قصيرة السلسلة ,Scriptaid (short chain سورامين الصوديوم Sodium 207 , تريكوستاتين A (TSA) 10000518110, المركب م Apicidin , APHA بوتيرات الصوديوم Sodium Vo 817/1816 , بيفالويل أوكسي ميثيل بوتيرات ,(Pivanex, AN-9) pivaloyloxymethyl butyrate Trapoxin 8 , 001800700610 , ببتيد ديبسي Depsipeptide (أيضاً معروف بالاسم FR901228 أو (FK228 , بنز أميدات (على سبيل المثال, 1-994 (He) سبيل المثال, ل١- أسيتيل دينالين NVP-LAQ-824, ,MGCDO0103 ,(MS-27-275 (N-acetyl dinaline CBHA (حمض ١٠-كربوكسي سيناميك بيس carboxycinnaminic acid حمض هيدروكساميك —A ,Tubacin ,JNJ16241199 ,(bishydroxamic acid VY. 17 1, بروكساميد ,proxamide أوكسامفلاتين 3-C1-UCHA ,oxamflatin (على سبيل المقال, -3)-6 CHAP31 , (chlorophenylureido)caproic hydroxamic 0 و50 .CHAP تشتمل عوامل تحسين إعادة البرمجة الأخرى, على سبيل المتال, على الصور السالبة السائدة من HDACS (على سبيل المثال, الصور غير النشطة حفزياً), ممقبطات siRNA ل ,HDACs والأجسام المضادة © التي ترتبط تحديداً ب 10/05. تكون المثبطات المذكورة متوفرة, على سبيل المثال, من BIOMOL International, Fukasawa, Merck Biosciences, Novartis, Gloucester oY AY
١7
Pharmaceuticals, Aton Pharma, Titan Pharmaceuticals, Schering AG, .Sigma Aldrich 4 ,Pharmion, MethylGene لتأكيد حث الخلايا الجذعية متعددة الإمكانات للاستخدام في الطرق الموصوفة في الطلب الحالي, يمكن اختبار نسائل معزولة للتعبير عن مرقم خلية جذعية. يعرف التعبير المذكور في خلية مشتقة من كخلايا جذعية متعددة الإمكانات محفزة. يمكن انتقاء مرقمات الخلية الجذعية DAY الخلية الجسمية © ,Ecatl ذلسط, ,Nanog ,CD9 ,SSEA4 ,SSEA3 من المجموعة غير الحصرية بما في ذلك في أحد ٠ Natl 5 ,Utfl ,Rex| ,Slc2a3 ,Zpf296 ,Daxl ,Cripto ,Fgf4 , 5013 ,Eras ,Esgl النماذج, يتم تعريف الخلية التي تعبر عن 0014 أو 8009 بالاسم متعددة الإمكانات. قد تشتمل وطرق مناعية ترصد RT-PCR طرق كشف التعبير عن المرقمات المذكورة, على سبيل المثال, على أو تحليلات تدفق Westen مثل لطخ , encoded polypeptides: sic وجود بولي ببتيدات ٠ رصد مرقمات البروتين. Lad فقط, بل RT-PCR الخلايا. في بعض النماذج, لا يشتمل الرصد على عن طريق 81-068 , في حين يتم تعريف did) يمكن تعريف المرقمات بين الخلايا على النحو مرقمات سطح الخلية سريعاً, على سبيل المثال, بواسطة كيمياء الخلايا المناعية .Immunocytochemistry تأكيد صفات خلية جذعية متعددة الإمكانات للخلايا المعزولة بواسطة الاختبارات التي تقيم قدرة (Kg ١ على التمايز إلى خلايا كل من الطبقات الجرثومية الثلاث. كأحد الأمثلة, يمكن استخدام 5 تكوين الورم المسخي في الفثران العارية من الشعر لتقييم الصفة متعددة الإمكانات لنسائل معزولة. يتم تقديم الخلايا إلى الفئران العارية من الشعر ويتم إجراء تحليل النسيج و / أو كيمياء النسيج المناعي على الورم الناشئ من الخلايا. يشتمل نمو الورم على الخلايا من جميع الطبقات الجرثومية الثلاث, على سبيل المثال, ويشير علاوة على ذلك إلى أن الخلايا تكون الخلايا الجذعية متعددة الإمكانات. Yo الخلايا الجسمية لإعادة البرمجة الخلايا الجسمية, وفقاً لاستخدام المصطلح في الطلب الحالي, غلى أي الخلايا التي تكون جسم الكائن — mammalian body ill الحي, باستثناء خلايا السلالة الجرثومية. كل نوع خلية في جسم والخلايا التي يتم تكوينها منها (الخلايا المشجية , sperm بعيداً عن البويضات والحيوانات المنوية والخلايا الجذعية غير المتمايزة --تكون الخلية الجسمية المتمايزة. على سبيل (gametocytes Yo
SRV
المتال, الأعضاء الداخلية والجلد والعظام والدم والنسج الضام المصنوعة جميعها من الخلايا الجسمية . differentiated somatic cells المتمايزة تشتمل أنواع الخلية الجسمية الإضافية للاستخدام مع التركيبات والطرق الموصوفة في الطلب الحالي خلية العضلات (primary fibroblast على: الخلية الليفية (على سبيل المثال, الخلية الليفية الأولية خلية عصبية «cumulus )؛ خلية ركاميةاا8© myocyte سبيل المثال, خلية عضلية lo) © وخلية جزيرة البنكرياس hepatocyte خلية كبدية « mammary cell ius خلية ¢ neural cell بعض النماذج, تكون الخلية الجسمية سلالة الخلية الأولية أو تكون 4. pancreatic islet cell سليفة سلالة خلية أولية أو ثانوية. في بعض النماذج, الخلية الجسمية يتم الحصول عليها من عينة ؛ خزعة blood sample من الدم due ؛ hair follicle بشرية, على سبيل المتال, بصيلات الشعر «(adipose biopsy أو خزعة دهنية skin biopsy سبيل المثال, خزعة الجلد le) biopsy ~~ ٠ وتكون بالتالي الخلية (oral swab sample وعينة مسحة (على سبيل المثال, عينة مسحة الفم الجسمية البشرية. تشتمل بعض الأمثلة غير الحصرية للخلايا المتمايزة الجسمية, على سبيل المثال لا الحصر, على ء adipose ؛ الشحمية neuronal ؛ العصبية endothelial ؛ البطانية epithelial Adal الخلية immune cells ؛ الخلايا المناعية skeletal muscle عضلات الهيكل العظمي ¢ cardiac القلبية Yo circulating blood ؛ خلايا الدم lung الرئة WA « splenic الطحال « hepatic خلايا الكبد « ؛ خلايا نخاع العظام renal ؛ خلايا الكلى gastrointestinal الجهاز الهضمي LDA ؛ cells في بعض النماذج, قد تكون الخلية الجسمية الخلية pancreatic وخلايا البنكرياس bone marrow , brain الأولية المعزولة من أي نسيج جسمي بما في ذلك, على سبيل المثال وليس الحصر المخ العضلات ¢ fat الدهون » intestine والأمعاء stomach القناة الهضمية, المعدة , liver الكبد Yo endocrine ؛ الغدد الصماء الجهازية spleen الطحال ¢ skin ؛ الجلد uterus الرحم « muscle إلخ. على نحو إضافي, قد تكون الخلية الجسمية من أي أنواع تدبية, مع bone والعظام 7 القرود؛ الخنازير؛ الخيول؛ الأغنام أو الخلية «JEN yall اشتمال الأمثلة غير الحصرية على خلايا البشرية. في بعض النماذج, الخلية الجسمية تكون الخلية الجسمية البشرية. عند استخدام الخلايا المعاد برمجتها المستخدمة لتوليد خلايا أولية لتكوين الدم تستخدم في العلاج YO العلاجي للمرض, يكون من المرغوب فيه, وليس ضروري, استخدام الخلايا الجسمية المعزولة من
—yy— المريض الخاضع للعلاج. على سبيل المثال, يمكن استخدام الخلايا الجسمية المشاركة في الأمراض, والخلايا الجسمية المشاركة في العلاج العلاجي للأمراض وما شابه. في بعض النماذج, يمكن إجراء برمجتها من مجموعة غير متجانسة تشتمل على خلايا تمت إعادة Sale] طريقة لانتقاء خلايا تمت برمجتها وخلايا جسمية مشتقة أو متولدة بواسطة أي الوسائل المعروفة. على سبيل المثال, يمكن تمت إعادة برمجتها LDA استخدام جين مقاوم للعقار أو ما شابه, مثل جين مرقم قابل للانتقاء لعزل © باستخدام المرقم القابل للانتقاء كمؤشر. برمجتها وفقاً لما تم الكشف عنه في الطلب الحالي عن أي sale) يمكن أن تعبر خلايا جسمية تمت alkaline phosphatase عدد من مرقمات الخلية متعددة الإمكانات, بما في ذلك: فوسفاتيز قلوي ٠- stage specific embryonic antigen مولد ضد جنيني محدد المرحلة JABCG2 (AP) ;Tra—2-49/6E ;TRA-1-81 ;1.-TRA-1 ;SSEA-4 ;SSEA-3 ;(SSEA-1) ٠ smooth 2-أكتين العضلة الملساء tubulin 0)-م-تيوبولين ;E—cadherin , ERas/ECATS ,Cripto, (Fof4) ¢ fibroblast growth factor عامل النمو الليفي : (a-SMA) muscle actin ترانسفيراز ليتيسأ-١١ :)210296( 77 206 finger protein بروتين إصبع الزنك ; Dax ;(ECATI) ES 1) منتسخ مرتبط بالخلية j(Natl) ١٠- acetyltransferase ,ECAT10 ام : والم: 4 ;ECATT : امنا 6 ;ECAT3 ;ESG1/DPPAS/ECAT2 ٠ عامل انتساخ الخلية الجنينية غير المتمايزة (ا17لا): ;Sall4 : 1017 ;ECAT15-2 ;ECAT15-1 بما في ذلك 141 : جينات الكرموسوم الصامت telomerase 53م: 53011 : تيلوميراز Rex يحتوي على F-box ;TRIM28 ;Dnmt3b ;Dnmt3a ;silent X chromosome genes ;TDGF1 ;Esrb ;c-Myc ;KIf4 ;Sox2 ;Oct3/4 ;Nanog/ECAT4 ;(FbxI5) ١١ بروتين تعدد الإمكانات المتطروة المرتبط ب ؟ ;CYP25A1 ;GDF3 ;FoxD3 ,Zfp42 ;GABRB3 ٠ 000 8 :) للخلية 11 (ال18 lymphoma نقطة انفصال الورم اللمفي ;(DPPA2) المرقمات العامة الأخرى لتعدد الإمكانات, إلخ. قد تشتمل المرقمات الأخرى على : 0004 المذكورة أيضاً WAY يمكن توصيف .Bmil 5 ,p—catenin ;Grb2 ;Stat3 ;Sox|5 ;Dnmt3L بواسطة التنظيم التنازلي للمرقمات المميزة للخلية الجسمية التي يتم اشتقاق الخلية الجذعية المستحثة
Jee متعددة القدرات YO
DNAS mes التعديل الجينومي واندونيوكلياز يستهدف
VA
وفقاً لاستخدامه في الطلب الحالي, يشير المصطلح "التعديل الجينومي" إلى طريقة علم الوراثة العكسي المستخدمة لنيوكلياز المهندس وراثياً صناعياً لقطع وتكوين انفصالات مزدوجة الجديلة محددة في الموقع (المواقع) المطلوبة في الجينوم, والتي يتم إصلاحها بعد ذلك بواسطة عمليات خلوية ذاتية الإصلاح الموجه بالتتاظر homologous recombination (FR) المتجانس seal), Jie المنشاً non-homologous والتوصيل الطرفي غير المتجانس homology directed repair )104( 2 في فصل مزدوج الجديلة, في حين DNA مباشرةً أطراف NHEJ يوصل .end—joining (NFfEJ) المفقودة عند نقطة الانفصال. DNA توليد متوالية soley المتوالية المتجانسة كقالب HDR يستخدم يتعذر إجراء التعديل الجينومي باستخدام إندونيوكلياز التقييد التقليدي نظراً لتعرف معظم إنزيمات التقييد كهدف لها وترتفع الاحتمالية للغاية بحيث يتم العثور على توليفة DNA على أزواج قاعدية قليلة في زوج القاعدة التي تم التعرف عليها في الكثير من المواقع عبر الجينوم مما ينتج عنه قطعات عديدة Vo (أي, لا تقتصر على الموقع المطلوب). للتغلب على هذا التحدي وتكوين انفصالات مزدوجة الجديلة محددة الموقع, تم اكتشاف العديد من الفئات المميزة من نيوكلياز والمهندسة حيوياً ووراثياً حتى اليوم. ola, Zinc finger nucleases (ZFNs) هذه هي ميجا نيوكلياز, نيوكلياز إصبع الزنك شبيه بمنشط الانتساخ effector nucleases ومستجيب نيوكلياز , 0859/0415 .(TALENSs)transcription-activator yo على نحو شائع في أربع مجموعات: مجموعة Meganucleases يتم تصنيف ميجا نيوكلياز تمتاز هذه .18[١[ ومجموعة His—Cys box مجموعة ,GIY-YIG مجموعة ,LAGLIDADG المجموعات بعناصر بنيوية, تؤثر على النشاط الحفزي ومتوالية الإدراك. على سبيل المثال, يمتاز بالاشضتمال على إما نسخة أو نسختين من عنصر LAGLIDADG أعضاء المجموعة
Chevalier et al. (2001), Nucleic Acids Res. 29( 18): المحافظ (انظر LAGLIDADG ٠ مع نسخة واحدة من صورة عنصر LAGLIDADG تم العثور على ميجانيوكلياز .)3757-4 كدايمرات متجانسة, بينما تم العثور على أعضاء من مع نسختين من LAGLIDADG في صورة مونمرات. على نحو مماثل, يشتمل أعضاء مجموعة 617-716 على LAGLIDADG وحدة بنائية في الطول وتشتمل على أربع أو خمس ٠٠١-7١ والتي نتراوح من GIY-YIG وحدة Van Roey عناصر متواليات محافظة مع أربع وحدات بنائية ثابتة, اثنين منها مطلوبة للنشاط (انظر YO يتميز ميجانيوكلياز .)©] al. (2002), Nature Struct. Biol. 9: 806-811 oY AY
١4 histidines بتسلسلات محافظة للغاية من مركبات هيستيدين His—Cys box Meganucleases فوق منطقة تضم عدة مئات من الوحدات البنائية للحمض الأميني (انظر CYStEINeS وسيستين في حالة (Chevalier et al. (2001), Nucleic Acids Res. 29(18): 3757-4 يتم تعريف الأعضاء بواسطة عناصر تحتوي على زوجين من مركبات هيستيدين NHN مجموعة Chevalier et al. (2001), (انظر asparagine المحافظة المحاطة بالوحدات البنائية أسبراجين © المجموعات الأربع من ميجانيوكلياز تكون (Nucleic Acids Res. 29(18): 3757-3774 مستقلة على نطاق واسع عن بعضها البعض فيما يتعلق بالعخاصر البنيوة المحافظة و, بالتالي, . catalytic activity gall والتشاط DNA خصوصية متوالية إدراك يتم العثور على ميجانيوكلياز على نحو شائع في الأنواع الميكروبية ويشتمل على الخاصية الفريدة مم يجعلها بالتالي شديدة الخصوصية (bp VE<) الاشتماله على متواليات الإدراك الطويلة للغاية ٠ طبيعياً للقطع عند الموقع المطلوب. يمكن استغلالها هذا لصنع انفصالات مزدوجة الجديلة محددة الموقع في التعديل الجينومي. يمكن لذا المهارة في المجال استخدام ميجانيوكلياز هذا الذي يحدث طبيعياً, ومع ذلك يكون عدد من ميجانيوكلياز يحدث طبيعياً المذكور محدود. للتغلب على هذا التحدي, تم استخدام طرق التطفير وفحص الإنتاجية العالية لتكوين صور مغايرة من ميجانيوكلياز تتعرف على المتواليات الفريدة. على سبيل المثال, تم دمج العديد من ميجانيوكلياز لتكوين إنزيمات ٠ هجينة تتعرف على متوالية جديدة. على نحو بديل, يمكن تبديل الأحماض الأمينية المتفاعلة
A لميجانيوكلياز لتصميم ميجانيوكلياز خاص بالمتوالية (انظر على سبيل المثال, البراءة الأمريكية رقم
Certo, يمكن تصميم ميجانيوكلياز باستخدام الطرق الموصوفة في على سبيل المثال, (ATY ,07١ :777 ,70 4 A البراءات الأمريكية أرقام MT et al. Nature Method (2012) 9: 073-975
VEY OA كر ITY كد ع IY AYIA NYE JA GYAY NYA LA GATY زلف JAY والتي تم إدراج محتوياتها كمرجع في , 24,117 A تا زه 18 ار 8 »: أو VEY A Ye الطلب الحالي في مجملها. على نحو بديل, يمكن الحصول على ميجانيوكلياز بخصائص القطع محدد
Precision Biosciences’ Directed الموقع باستخدام التقنيات المتوفرة تجارياً على سبيل المتثال, .Neoclease Editor™ Gemnomeic Editing technology يكون مرتبط DNA من إنزيم قطع غير محدد TALENS 5 2215 تستفيد تقنية تقييد إندونيوكلياز YO zinc fingerselsyll أصابع Jie peptide محددة تتعرف على الببتيدات DNA بمتوالية
“Aa . transcription activator-like effectors (TALEs) ومستجيبات شبيهة منشط الانتساخ وموقع الانشطار له منفصلين DNA نمطياً يتم اختيار الإندونيوكلياز الذي يكون موقع التعرف على عن بعضهم البعض ويتم فصل جزء الانشطار له وبعد ذلك ربطه بببتيد يتعرف على المتوالية, وبناءً عليه نحصل على إندونيوكلياز بخصوصية مرتفعة للغاية للمتوالية المطلوبة. إنزيم التقييد التمثيلي على نحو إضافي بمزية الحاجة إلى الدايمرة ليكون له Fokl بالخواص المذكورة يكون 4ا0. يتمتع © نشاط نيوكلياز وهذا يعني زيادة الخصوصية بدرجة كبيرة مع تعرف كل شريك نيوكلياز على متوالية وراثياً والذي يمكن أن يقوم فقط بوظيفة Fokl فريدة. لتعزيز هذا التأثير, تمت هندسة نيوكلياز DNA وله نشاط حفزي متزايد. يتجنب نيوكلياز يقوم بوظيفة homodimer الدايرمات غير المتجانسة الدايمر غير المتجانس إمكانية نشاط الدايمر المتجانس غير المطلوب وبالتالي زيادة خصوصية فصل مزدوج الجديلة. ٠ تتمتع بخواص متشابهة إلا أن الفرق TALENS و ZFNs على الرغم من أن أجزاء نيوكلياز لكل من على أصابع الزنك ZFNs يعتمد DNA يكمن في ببتيد التعرف على Lys بين نيوكلياز هذا المهندس هذه بأنه DNA في 18155 . تمتاز كل من مجالات ببتيد يتعرف على TALENSs ; Cys2-His2
Cys2-His2 يتم العثور عليها على نحو طبيعي في توليفات في بروتيناتها. تحدث أصابع الزنك في توليفات متتوعة في Lede نمطياً في التكرارات التي تكون متباعدة على مسافة 3 50 ويتم العثور ١ على stall مجموعة منتوعة من البروتينات المتفاعلة مع حمض نووي مثل عوامل الانتساخ. يتم من جهة أخرى في التكرارات مع نسبة تعرف واحد إلى واحد بين الأحماض الأمينية وأزواج TALES في أنماط متكررة, TALES 5 النيوكليوتيد التي تم التعرف عليها. نظراً لحدوث كل من أصابع الزنك يمكن تجربة التوليفات المختلفة لتكوين مجموعة واسعة النطاق من خصوصيات المتوالية. تشتمل طرق تصنيع إصبع زنك إندونيوكلياز المحدد بالموقع, على سبيل المثال, على تجميعة نموذجية (حيث ترتبط ٠ منخفض lial) OPEN أصابع الزنك بمتوالية ثلاثية متصلة في صف لتغطية المتوالية المطلوبة), الصرامة لمجالات الببتيد مقابل النيوكليوتيدات الثلاثية يليها الاختيارات مرتفعة الصرامة لتوليفة الببتيد مقابل الهدف النهائي في النظم البكتيرية), والمسح الهجين الواحد البكتيري لمجموعات إصبع الزنك, للاستخدام مع الطرق والتركيبات الموصوفة في الطلب ZFNs من بين أخرى. يمكن الحصول على .(Richmond, CA)Sangamo Biosciences™ الحالي تجارياً من على سبيل المثال, Yo
CAN
للتعديل الجينومي مع الطرق Cas9/CRISPR من المتوقع في الطلب الحالي استخدام نظام والتركيبات الموصوفة في الطلب الحالي. نظم التكرارات التي تتجمع بشكل منتظم والمتباعدة بينياً تكون مفيدة في التعديل (Cas) ddaiyal-CRISPR)/CRISPR) المتتاوبة القصيرة التكرارات
Jinek, M. et al. Science على سبيل المثال, hil) RNA الجينومي القابل للبرمجة لجمض .)2012( 337 (6096): 816-821 © على نحو بديل, يمكن إجراء التعديل الجينومي باستخدام الهندسة الوراثية لجينوم بناءًٌ على فيروس والذي يكون منصة التعديل الجينومي حول نواقل ,(FAAV) غدي لناتج معاودة الارتباط الجيني في DNA المستخدمة والتي تساعد على إدراج, حذف أو استبدال متواليات حمض AAV تعبير جينومات الخلايا الثديية الحية. يكون جزيء جينوم حمض نووي ديوكسي ريبو أحادي الجديلة موجب الشعور أو سالب الشعور, We, single-stranded deoxyribonucleic acid (ssDNA) ٠ مفردة الجديلة DNA طوله حوالي 4,7 كيلو قاعدة. تشتمل نواقل التعبير الفيروسية لحمض aly والذي الاندماج ذاتي المنشأً sole) هذه على معدلات تحويل مرتفعة وتتمتع بخاصية فريدة تتمثل في تحفيز مزدوج الجديلة في الجينوم. يمكن لذي المهارة في المجال DNA المتجانس في عدم وجود انفصالات
Lindl لاستهداف الموقع الجينومي وإجراء كل من تبديلات الجين ذاتي TAAV تصميم ناقل تعبير بميزة استهداف أليل FAAV حذف. يتمتع التعديل الجينومي ل Jie, dda الكلية و / أو المطلقة في Vo تكون TAA فردي ولا ينتج عنه أي تبديلات جينومية بعيدة عن الهدف. تقنية التعديل الجينومي
Cambridge, ) Horizon™ rAAV Genes IS™ system متوفرة تجارياً, على سبيل المثال, (UK مواد حاملة مقبولة صيدلانياً تشتمل طرق إعطاء الخلايا السليفة المكونة للدم البشرية إلى خاضع وفقاً للموصوف في الطلب الحالي ٠ على استخدام تركيبات علاجية تشتمل على خلايا أولية لتكوين الدم. تحتوي التركيبات العلاجية على مادة حاملة يمكن تحملها فسيولوجياً إضافة إلى تركيبة الخلية واختيارياً عامل فعال حيوياً إضافي واحد على الأقل وفقاً للموصوف في الطلب الحالي, مذاب أو مشنتت فيه كمكون فعال. في نموذج مفضل, لا تكون التركيبة العلاجية مولدة للمناعة بدرجة كبيرة عند الإعطاء إلى ثديي أو مريض إنسان لأغراض علاجية, ما لم يكن ذلك مطلوباً. Yo
CAR
-7م- عموماً, يتم إعطاء الخلايا الأصلية لتكون الدم الموصوفة في الطلب الحالي كمعلق مع مادة حاملة مقبولة صيدلانياً. سيدرك ذا المهارة في المجال أن المادة الحاملة المقبولة صيدلانياً التي سيتم استخدمها في تركيية خلية لن تشتمل على محاليل منظم, مركبات, عوامل الحفظ بالتبريد, مواد حافظة, أو عوامل أخرى بكميات تتداخل على نحو أساسي مع حيوية الخلايا المطلوب توصيلها إلى الخاضع. © قد تشتمل صيغة تشتمل على الخلايا على سبيل المثال, على محاليل منظمة أوزموسية تسمح بالحفاظ على تكامل غشاء الخلية, واختيارياً, للمغذيات بالحفاظ على حيوية الخلية أو تعزيز الطعم عند الإعطاء. الصيغ المذكورة والمعلقات تكون معروفة لأولئك المهرة في المجال و / أو يمكن تهيأتها للاستخدام مع الخلايا الأصلية لتكون الدم وفقاً للموصوف في الطلب الحالي باستخدام التجارب الروتينية. Vs يمكن أن تكون تركيبة خلية أيضاً مستحلب أو يتم تقديمها كتركيبة دهنية ما, بشرط ألا يؤثر إجراء الاستحلاب عكسياً على حيوية الخلية. الخلايا ويمكن خلط أي مكون فعال آخر مع السواغات التي تكون مقبولة صيدلانياً وتتوافق مع المكون الفعال وبكميات مناسبة للاستخدام في الطرق العلاجية الموصوفة في الطلب الحالي. قد تشتمل العوامل الإضافية المتضمنة في تركيبة خلية وفقاً للموصوف في الطلب الحالي على أملاح VO مقبولة صيدلانياً من مكونات فيها. تشتمل أملاح مقبولة صيدلانياً على أملاح إضافة الحمض (المتكونة باستخدام مجموعات الأمينو الحرة free amino للبولي ببتيد 0017060106 ) والتي تتكون باستخدام الأحماض غير العضوية مثل, على سبيل (mea, JU الهيدروكلوريك hydrochloric أو الفوسفوريك | «phosphoric أو تلك الأحماض العضوية متل حمض aceticeldall « الطرطريك tartaric « المندليك mandelic وما Yo شابه. يمكن أن تكون الأملاح التي تتكون مع مجموعات الكربوكسيلي الحرة free carboxyl أيضاً مشتقة من قواعد غير عضوية مثل, على سبيل المتال, الصوديوم sodium البوتاسيوم potassium ؛ الأمونيوم ammonium ء الكالسيوم calcium أو هيدروكسيدات الحديد ferric hydroxides « والقواعد العضوية هذه مثل أيزوبروبيل أمين isOpropylamine » ثلاشي Siva أمين trimethylamine » “-إيقيل أمينو ايشانول ethylamino ethanol « هيستيدين histidine , YO بروكايين procaine وما شابه. تكون مواد حاملة يمكن تحملها فسيولوجياً معروفة جيداً في المجال. تكون المواد الحاملة السائلة النموذجية محاليل مائية معقمة لا تحتوي على مواد إضافة إلى مكونات OY AY
ام فعالة وماء, أو تحتوي على محلول منظم مثل فوسفات الصوديوم sodium phosphate عند قيم رقم هيدروجيني فسيولوجي, محلول ملحي فسيولوجي أو كلاهما, مثتل محلول ملحي منظم بالفوسفات 00016 . لا يزال على نحو إضافي, يمكن أن تشتمل المواد الحاملة المائية على أكثر من محلول منظم ملحي واحد, وكذلك أملاح مثل الصوديوم وكلوريدات البوتاسيوم potassium chlorides « © وسكر العنب» بولي إيثيلين جليكول polyethylene glycol والذوابات الأخرى. يمكن أن تحتوي التركيبات السائلة أيضاً على أطوار سائلة إضافة إلى وباستثناء الماء. أمثلة الأطوار السائلة الإضافية المذكورة الجلسرين والزيوت النباتية Jie زيت بذرة القطن, ومستحلبات تحتوي على الماء. ستعتمد كمية المركب الفعال المستخدم في تركيبات الخلية وفقاً للموصوف في الطلب الحالي والفعالة في علاج اضطراب أو حالة محددة على طبيعة الاضطراب أو الحالة, ويمكن تحديدها بواسطة ٠ التقنيات الإكلينيكية القياسية. الإعطاء والفعالية وفقاً لاستخدامها في الطلب الحالي, يتم استخدام المصطلحات "إعطاء, " "إدخال" و"غرس" بالتبادل في سياق وضع الخلايا, على سبيل JE) خلايا أولية لتكوين الدم, وفقاً للموصوف في الطلب الحالي في خاضع, بواسطة طريقة أو مسار ينتج عنه تحديد موضع Sia على الأقل للخلايا المقدمة في الموقع ١ المطلوب, مثل موضع الإصابة أو الإصلاح, بحيث ينتج التأثيرات المطلوب. يمكن إعطاء الخلايا على سبيل المثال خلايا أولية لتكوين الدم, أو الخلايا السليفة المتمايزة منها بواسطة أي مسار مناسب ينتج عنه التوصيل إلى الموقع المطلوب في خاضع حيث يظل جزء على الأقل من الخلايا المنغرسة أو مكونات الخلايا حياً. مدة حيوية الخلايا بعد الإعطاء إلى خاضع يمكن أن تكون قصيرة قدر بضع ساعات, على سبيل المثال, أربع وعشرين ساعة؛ بضعة (ald أو تدوم لعدة سنوات, أي, طعم طويل ٠ الأمد. على سبيل المثال, في بعض نماذج الجوانب الموصوفة في الطلب الحالي, يتم إعطاء كمية فعالة من خلايا أولية لتكوين الدم عن طريق المسار الجهازي للإعطاء, مثل في الغشاء البريتوني أو في الوريد . عند التقديم وقائياً, يمكن إعطاء خلايا أولية لتكوين الدم الموصوفة في الطلب الحالي إلى خاضع قبل أي عرض لاعتلال usta sal) على سبيل المثال, قبل التحول من 7 -جلوبين جنيني إلى على CAR
CAE
نحو سائد 8 -جلوبين. وعلى هذا النحو, يعمل الإعطاء الوقائي لمجموعة خلية أولية لتكوين الدم على منع اعتلال الهيموجلوبين, وفقاً لما تم الكشف عنه في الطلب الحالي. عند التقديم علاجياً, يتم توفير خلايا أولية لتكوين الدم عند (أو بعد) بداية العرض أو مؤشر اعتلال الهيموجلوبين, على سبيل المتال, عند بداية مرض الخلية المنجلية. في بعض النماذج للجوانب الموصوفة في الطلب الحالي, يتم إعطاء مجموعة الخلية الأصلية لتكون © الدم طبقاً للطرق الموصوفة في الطلب الحالي وتشتمل على خلايا أولية لتكوين الدم خيقية تم الحصول عليها من واحد أو أكثر من المتبرعين. وفقاً لاستخدامه في الطلب الحالي, "خيفي" يشير إلى خلية أولية لتكوين الدم أو عينات حيوية تشتمل على خلايا أولية لتكوين الدم تم الحصول عليها من واحد أو أكثر من المتبرعين المختلفين من نفس الأنواع, حيث لا تتطابق الجينات في واحد أو أكثر من المواضع. على سبيل المثال, يمكن إعطاء مجموعة خلية أولية لتكوين الدم إلى الخاضع وتكون مشتقة ٠ من دم الحبل السري الذي تم الحصول عليه من واحد أو أكثر من المتبرعين الخاضعين غير ذي الصلة, أو من واحد أو أكثر من الأخوة والأخوات غير المتماثلين. في بعض النماذج, يمكن استخدام مجموعات خلية أولية لتكوين الدم تآزرية, مثل تلك التي تم الحصول عليها من الحيوانات المتماثلة وراثياً, أو من توائم متماتلة. في نماذج أخرى من هذا الجانب, تكون الخلايا الأصلية لتكون الدم خلايا يتم الحصول عليها أو عزلها من خاضع وإعطائها pall ذاتية المنشاً: بمعنى أن, الخلايا الأصلية لتكون Vo إلى نفس الخاضع, أي, المتبرع والمتلقي متشابهين. , للاستخدام في الجوانب المتتوعة الموصوفة في الطلب الحالي, كمية فعالة من خلايا أولية لتكوين الدم خلايا أولية لتكوين الدم, ٠١١ x 5 خلايا أولية لتكوين الدم, على الأقل ٠١١ على الأقل على Jas خلايا أولية مكونة للدم, على الأقل ٠١ x 0 خلايا أولية لتكوين الدم, على الأقل ٠١7 على الأقل خلايا Veo خلايا أولية لتكوين الدم, على الأقل Veg xo خلايا أولية لتكوين الدم, على الأقل ٠١4 ٠
Adsl خلايا ٠١5 x خلايا أولية لتكوين الدم, على الأقل ؟ Yeo x Y أولية لتكوين الدم, على الأقل خلايا أولية لتكوين ٠١5 xo خلايا أولية لتكوين الدم, على الأقل ٠١5 x لتكوين الدم, على الأقل ؛ خلايا أولية لتكوين الدم, Yeo xv خلايا أولية لتكوين الدم, على الأقل ٠١5 xT الدم, على الأقل خلايا أولية لتكوين الدم, على Yeo x 9 خلايا أولية لتكوين الدم, على الأقل Yeo x A على الأقل خلايا أولية لتكوين الدم, على الأقل ٠١6 * Y خلايا أولية لتكوين الدم, على الأقل ٠١١ xy الأقل Ye x 5 خلايا أولية لتكوين الدم, على الأقل ٠١6 x خلايا أولية لتكوين الدم, على الأقل ؛ ٠١ 7 ؟ CAR
—Ao—
Vel x 7 خلايا أولية لتكوين الدم, على الأقل ٠١6 xT خلايا أولية لتكوين الدم, على الأقل ٠ خلايا Tx 9 خلايا أولية لتكوين الدم, على الأقل ٠١١ x A خلايا أولية لتكوين الدم, على الأقل أولية لتكوين الدم, أو مضاعفاتها. قد تكون الخلايا الأصلية لتكون الدم مشتقة من واحد أو أكثر من المانحين, أو يمكن الحصول عليها من مصدر ذاتي المنشاً. في بعض النماذج للجوانب الموصوفة في الطلب الحالي, يتم توسيع نطاق الخلايا الأصلية لتكون الدم في مستتبت قبل الإعطاء إلى خاضع في 5 حاجة إليها. في أحد النماذج, المصطلح 'كمية فعالة' وفقاً لاستخدامه في الطلب الحالي يشير إلى كمية مجموعة من خلايا أولية لتكوين الدم بشرية أو الخلايا السليفة لها المطلوبة للتخلص من عرض واحد على الأقل أو أكثر من أعراض اعتلال الهيموجلوبين, وتتعلق بكمية كافية من تركيبة لتوفير التأثير المطلوب, فعالة علاجياً” Le على سبيل المثال, علاج خاضع مصاب باعتلال الهيموجلوبين. يشير المصطلح ٠ تكون كافية pall عليه إلى كمية خلايا أولية لتكوين الدم أو تركيبة تشتمل على خلايا أولية لتكوين SL لتعزيز تأثير محدد عند الإعطاء إلى خاضع نمطي, مثل ذلك المصاب ب أو المعرض لخطر اعتلال الهيموجلوبين. يضم المصطلح كمية فعالة وفقاً لاستخدامه في الطلب الحالي أيضاً كمية كافية لمنع أو تأخير تطور عرض المرض, تبديل مسار عرض المرض (على سبيل المثال وليس الحصر, إبطاء تطور عرض المرض), أو قلب عرض المرض. ينبغي إدراك أنه في أية حالة محدد, يمكن تحديد Ve صحيحة بواسطة ذا المهارة العادية في المجال باستخدام التجارب الروتينية. "dled "كمية كما هو مستخدم هناء يشير المصطلح "إعطاء” إلى وضع تركيبة خلية جذعية لتكوين الدم وفقاً للموصوف في الطلب الحالي في خاضع بواسطة طريقة أو مسلك يترتب عليه تحديد موضع تركيبة على الأقل في الموقع المطلوب. يمكن إعطاء تركيبة الخلية بواسطة أي مسار مناسب Lipa الخلية علاج فعال في الخاضع, أي إعطاء ينتج عنه التوصيل إلى الموقع المطلوب في الخاضع aie ينتج Yo خلايا إلى Ex) حيث يتم توصيل جزء على الأقل من التركيبة التي تم توصيلها, أي على الأقل الموقع المطلوب لفترة من الزمن. تشتمل أوضاع الإعطاء على الحقن؛ التسريب»؛ التقطير» أو الابتلاع. intramuscular أو في العضلات intravenous ويتضمن "الحقن"؛ دون حصر؛ الحقن في الوريد ¢ intraventricular البطين Jala ¢ intrathecal القراب Jala ¢ intra-arterial داخل الشرايين » ؛ عبر intracardiac القلب Jala « intraorbital ؛ داخل الحجاج intracapsular داخل المحفظة Yo « transtracheal عبر الرغامى « intraperitoneal في الغشاء البريتوني ¢ intradermal الأدمة
“At ¢ intraarticular المفصل Jala ¢ subcuticular تحت البشرة ¢ subcutaneous تحت الجلد intraspinal النخاع Jala « subarachnoid ؛ تحت العنكبوتية sub capsular المحفظة الفرعية intrasternal القص والتسريب Jala والحقن ¢ intracerebro spinal الدماغي الشوكي Jada » لتوصيل الخلايا, يكون الإعطاء بواسطة الحقن أو التسريب مفصل injection and infusion عموماً. © في أحد النماذج, يتم إعطاء الخلايا وفقاً للموصوف في الطلب الحالي جهازياً. تشير العبارات"إعطاء "إعطاء محيطي"” وايتم إعطائه محيطياً” وفقاً لاستخدامه في الطلب "les جهازي, " 'يتم إعطائه الحالي إلى إعطاء مجموعة من خلايا أولية لتكوين الدم على نحو غير مباشر في الموقع المستهدف, في النسيج, أو العضو, بحيث يدخل, بدلاً من ذلك, في الجهاز الدوري للخاضع و, بالتالي, يكون عرضة للأيض والعمليات الأخرى. ٠ يمكن تحديد فعالية علاج يشتمل على تركيبة وفقاً للموصوف في الطلب الحالي لعلاج اعتلال الهيموجلوبين بواسطة الطبيب الإكلينيكي الماهر. مع ذلك, يعد العلاج "علاج فعال, " وفقاً لاستخدام المصطلح في الطلب الحالي, إذا تغيرت أي المؤشرات أو جميعها أو أعراض, كمثال واحد, مستويات 0-جلوبين جنيني بطريقة مفيدة, وتحسنت أعراض أو مرقمات المرض المقبولة إكلينيكياً أو تم التخفيف عقب العلاج بالمثبط. يمكن قياس الفعالية أيضاً 7٠١ على سبيل المثال, بواسطة على الأقل Lie YO بواسطة فشل الفرد في التفاقم وفقاً للتقييم بواسطة العلاج في المستشفيات أو الحاجة إلى التدخلات الطبية (على سبيل المثال, توقف تطور المرض أو إبطائه على الأقل). طرق قياس هذه المؤشرات تكون معروفة لأولئك المهرة في المجال و / أو موصوفة في الطلب الحالي. يشتمل العلاج على أي علاج لمرض في فرد أو حيوان (تشتمل بعض الأمثلة غير الحصرية على إنسان, أو ثديي) وتشتمل التخفيف من (Y) تثبيط المرض, على سبيل المثال, إيقاف, أو إبطاء تطور الإنتان: أو )١( على: Yo المرض, على سبيل المثال, مما ينتج عنه تراجع الأعرض: و (7) منع أو خفض احتمال تطور العدوى أو الإنتان. يعمل العلاج وفقاً للاختراع الحالي على تحسين عرض واحد أو أكثر من الأعراض المصاحبة للاضطراب جلوبين-بيتا عن طريق زيادة كمية الهيموجلوبين الجنيني في الفرد. نمطياً تكون الأعراض الأنيمياء ونقص الأكسجين في (JU مصحوبة باعتلال الهيموجلوبين؛ بما في ذلك على سبيل YO الأنسجة؛ وقصور وظائف الأعضاءء» وقيم الراسب الدموي غير الطبيعية؛ وتكون كريات الحمراء غير
— A 7 —
الفعال» وعدد الكريات الشبكية (الكريات الحمراء) غير الطبيعي؛ وحمل حديد غير طبيعي abnormal
iron load » ووجود أرومات جانبية حلقية sideroblasts 9 ؛ وتضخم الطحال
impaired ؛ وتدفق الدم الطرفي الضعيف hepatomegaly وتضخم الكبد « splenomegaly
increased وانحلال الدم المتزايد « dyspnea ؛ وضيق التنفس peripheral blood flow
hemolysis © ؛ واليرقان jaundice ؛ وأزمات الألم المتعلقة بالأنيميا pain crises 306016
متلازمة الصدر الحادة chest syndrome 80016 ؛ والاحتجاز الطحالي splenic
hand-foot ؛ وداء اليد والقدم stroke ؛ والسكتة الدماغية priapism والقساح « sequestration
.angina pectoris والألم 7 متثل الذبحة الصدرية syndrome
في أحد النماذج, يتم تلامس الخلية الأصلية لتكون الدم خارج الجسم الحي أو في المعمل مع حمض DNA Vy يستهدف إندونيوكلياز, ويتم إعطاء الخلية أو سليفتها إلى الثديي (على سبيل المثال, إنسان).
في نموذج إضافي, الخلية الأصلية لتكون الدم عبارة عن خلية لسلالة إريترويد. في أحد النماذج, يتم
إعطاء تركيبة تشتمل على خلية أولية لتكوين الدم تم تلامسها مسبقاً مع إندونيوكلياز يستهدف حمض
DNA ومادة حاملة مقبولة صيدلانياً إلى تديي.
في أحد النماذج, يمكن استخدام أية طريقة معروفة في المجال لقياس الزيادة في التعبير عن Vo الهيموجلوبين الجنيني, على سبيل المثال, تحليل لطخة Westen لبروتين الهيموجلويين الجنيني
وتحديد كمية TMRNA لا-جلوبين جنيني.
في أحد النماذج, يتم تلامس الخلية الأصلية لتكون pall مع إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA في
المعمل, أو خارج الجسم الحي. في أحد النماذج, تكون الخلية من أصل بشري (على سبيل المثال,
خلية ذاتية المنشاً أو غيروية المنشاً). في أحد النماذج, تتسبب التركيبة في زيادة في التعبير عن ٠ الهيموجلوبين الجنيني.
يمكن تعريف الاختراع الحالي في أي من الفقرات المرقمة أبجدياً التالية:
]1[ طريقة لإنتاج خلية أولية تشتمل على تعبير منخفض عن MRNA .118 801 أو البروتين,
تشتمل الطريقة على تلامس خلية أولية معزولة مع عامل يربط حمض DNA الجينومي للخلية على
UCSC Genome (طبقاً لتجميعة 117 ,778 Tom A WITT الكرموسوم 7 الموقع
_ A A —_
Browser hg 19 البشرية الجينومية), وبناءً عليه خفض تعبير MRNA أو البروتين عن 11 BCL
A
[ب] طريقة لإنتاج خلية بشرية مهندسة وراثياً معزولة تشتمل على تعديل جيني واحد على الأقل تشتمل
على تلامس خلية معزولة مع كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكلياز يستهدف © حمض DNA أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير من إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA والتي
بواسطتها يستهدف إندونيوكلياز حمض DNA ويشطر حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم
" الموقع 60, Tem AS YT 748ل7, 117 ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه.
[ج] الطريقة وفقاً للفقرة )| أو [ب], حيث خلية أولية معزولة أو خلية معزولة تكون خلية أولية لتكوين
الدم.
٠ [د] الطريقة وفقاً للفقرة [ج], حيث الخلية الأولية لتكوين pal تكون عبارة عن خلية لسلالة إريثرويد. [a] الطريقة وفقاً للفقرة [آ] أو [ب], حيث خلية أولية معزولة أو خلية معزولة تكون خلية جذعية مستحثة متعددة القدرات.
[و] الطريقة وفقاً للفقرة [ج], حيث يتم تلامس الخلية الأصلية لتكون الدم خارج الكائن الحي أو في المعمل.
Ve ([ز] الطريقة وفقاً GY الفقرات [آ]-[و], حيث تعديل جيني واحد على الأقل يكون حذف.
[ح] الطريقة وفقاً للفقرة [ز], حيث يتخلص الحذف من المنطقة بالكامل بين الكرموسوم ؟ الموقع 60, 7 , 0-184 1, 774, 117 أو يتخلص من جزء من المنطقة مما ينتج عنه مقاطعة واحد أو أكثر من المواقع مفرطة الحساسية ل 1 .(DHS) DNAse
[ط] خلية بشرية مهندسة وراثياً معزولة تشتمل على تعديل جيني واحد على الأقل في الكرموسوم ؟
٠ الموقع YA Tem A TT 117 وفقاً للفقرات [ب]-[ح]. [ي] تركيية تشتمل على WA بشرية مهندسة وراثياً معزولة من الفقرة [ط].
[ك] طريقة لزيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني في خلية, تشتمل الطريقة على خطوات: تلامس خلية معزولة مع كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA أو ناقل CAR
A q —_ _ تعبير يحمل متوالية التشفير لإندونيوكلياز يستهدف حمض DNA والتي بواسطتها يستهدف إندونيوكلياز حمض DNA ويشطر حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم ؟ الموقع Cie LYYA LTS YAR 7 117 ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه, والتي بواسطتها يزيد التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني في الخلية المذكورة, أو سليفتها, بالنسبة إلى الخلية المذكورة قبل oo التلامس المذكور. [ل] الطريقة وفقاً للفقرة [ك], حيث الخلية المعزولة تكون خلية أولية لتكوين الدم. [م] الطريقة وفقاً للفقرة [ك] أو [ل], حيث الخلية الأصلية لتكون الدم تكون خلية لسلالة إريثرويد. أن] الطريقة وفقاً للفقرة [ك], حيث الخلية المعزولة تكون خلية جذعية مستحثة متعددة القدرات. [س] الطريقة وفقاً للفقرة [ل] أو [a] حيث يتم تلامس الخلية الأصلية لتكون الدم خارج الجسم الحي أو Yo في المعمل. [ع] The طريقة وفقاً لأي الفقرات [ك]-[س], حيث يكون التعديل الجيني الواحد على الأقل حذف. [ف] الطريقة وفقاً للفقرة [ع], حيث يتخلص الحذف من المنطقة بالكامل بين الكرموسوم ؟ الموقع ٠١ , 7 , 0-144 1, 774, 117 أو يتخلص من جزء من المنطقة مما ينتج عنه مقاطعة واحد أو أكثر من المواقع مفرطة الحساسية ل 1 .(DHS) DNAse VO [ص] طريقة لزيادة مستويات الهيموجلوبين الجنيني في ثديي في حاجة إليه, تشتمل الطريقة على خطوات تلامس خلية أولية معزولة مكونة للدم في الثديي المذكور مع كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكلياز يستهدف حمض DNA أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير من إندونيوكلياز يستهدف حمض lly DNA بواسطتها يستهدف إندونيوكلياز حمض DNA ويشطر حمض DNA الجينومي للخلية على الكرموسوم ؟ الموقع 10, WT كاحت LYYA 17 ٠ ويتسبب في تعديل جيني واحد على الأقل فيه, والتي بواسطتها يزيد التعبير عن الهيموجلوبين الجنيني في الثديي المذكور, بالنسبة إلى التعبير قبل التلامس. يتم توضيح الاختراع علاوة على ذلك بواسطة الأمثلة التالية التي ينبغي عدم اعتبارها مقيدة. يتم إدراج محتويات جميع المراجع المستشهد بها على مدار هذا التطبيق, وكذلك الأشكال والجدول في الطلب الحالي كمرجع. CAR
q «= — المتال اكتشف المخترعون وقاموا بوصف العناصر التظيمية للجين 80111 والتي تعتبر حاسمة في التعيير عنه في سلالة خلايا الكريات الحمراء. ترتبط البدائل الجينية الشائعة ضمن هذه المتواليات بمستوى الهيموجلوبين الجنيني وشدة اضطراب بيتا - جلوبين. تشتمل هذه المتواليات على عناصر © تنظيمية بعيدة ببصمة كروماتين معزّزة؛ حيث تضم كروماتين يمكن الوصول إليه؛ علامات هيستون نشطة؛ والإشغال بواسطة عوامل نسخ الكريات الحمراء. تتفاعل هذه العناصر مع معزّز 80611178 وتعزز التعبير الجيني في خلايا الكريات الحمراء لكن ليس السلالات الأخرى التي تعبر عن BCL11A مثل الخلايا اللمفية 8. ويمكن استهداف هذه العناصر النتظيمية لأغراض Ladle BCLITA layin واعادة حث الهيموجلوبين الجنيني . يمكن أن يتم هذا بأليات لا تقتصر على التعديل ٠ الجينومي»؛ ربط الأحماض النووية أو البروتينات» والتعديل بالتخلق المتوالي. تضم مزايا هذه الطريقة : قطع عامل تنظيم فسيولوجي لمستوى الهيموجلوبين الجنيني مما يؤدي إلى زيادة إنتاج جاما-جلوبين وخفض إنتاج بيتا - جلويين؛ أدنى أثر على إجمالي خرج الجلويين أو على إنتاج خلايا الدم الحمراء أو وظيفتها؛ الحد من الأثر الذي يقع على الخلايا خارج سلالة الكريات الحمراء ومن ثم تقليل السمية المحتملة. Vo المواد والطرق مزارع الخلايا تم الحصول على خلايا +6034 بشرية من دم طرفي مسال لمانحين أصحاء من Centers of Excellence in Molecular Hematology at Yale University, New Haven, Fred Hutchinson Cancer Research Center, Seattle, Connecticut تم إخضاع الخلايا لإنضاج الكريات الحمراء خارج جسم الكائن الحي باستخدام Washington ٠ بروتوكول مزارع سائلة خالية من المصل ثثائية الطور على النحو المبين فيما سبق (79). تم الحصول
Peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) على خلايا أحادية النواة من الدم الطرفي من مانحين أصحاء من Children’s Hospital 805100. تم إجراء تمايز الكريات الحمراء من PBMCs النحو المبين في السابق (40). تمت زراعة WIA ابيضاض الدم الاحمراري في Yo الفثران Mouse erythroleukemia (MEL) و7957 خلية T على النحو المبين في السابق (V9)
(المشتقة v-Abl تمت زراعة خلايا لمفاوية جرذية سابقة على الخلايا 8 محوّلة بشكل ثابت بواسطة « penicillin—streptomycin زائد 707 بنسيلين -استريبتومايسين RPMI كما هو مبين ))£(( في sodium بيريوقات الصوديوم 7١ أحماض أمينية غير أساسية؛ 72١ (HEPES 77 (FCS 5 ميكرومولار 8 -ميركابتو إيثتانول ٠٠١١و 9ا01800176نيماتولج- انن١ » pyruvate .mercaptoethanol ©
DNase ١و ChIP حساسية .)39( تم إجراء الترسيب المناعي للكروماتين وتحديد المتواليات الموازي بشكل هائل على النحو المبين
H3K4me3 «(£¢4 - «Vv Millipore) 13/270083 : تم استخدام الأجسام المضادة التالية «Abcam) 132786 (ab8895 Abcam) H3K4mel (vie - .¢ Millipore) «(sc-899 (Santa Cruz «Polll) Polymerase ١١ إنزيم بوليميراز RNA ((ab4729 | ٠ تم تحديد كثافة .)50-12984 «Santa Cruz) TALL, ) abl1852:Abcam)GATA1 تم «ChIP-gPCR وتم تحليلها على النحو المبين في السابق (47). بالنسبة ل DNase | انقسام تم ACH من كروماتين مُدخل بطريقة 7 ١ مع CHIP تحديد الإثراء النسبي بمقارنة تكبير مادة و GATAL استخدام المواضع المسجلة في السابق باعتبارها مشغولة وغير مشغولة بواسطة (79) 11ظاكمواد مقارنة موجبة وسالبة على الترتيب ٠ (3C) Chromosome توافق الكروموسومات Jalil على النحو المبين في السابق )¥9( باستثثناء ما هو موضح أدناه. تم اهتضام 3C تم إجراء اختبار formaldehyde الأنوية من مواد منتجة للكريات الحمراء بشرية أولية مرتبطة تشابكياً بالفورمالديهايد كمي في الزمن الفعلي PCR قبل الربط وعكس الروابط التشابكية. وتم إجراء Hind باستخدام تم استخدام شظية محتوية .)0 ١7. (Bio-Rad) iQ SYBR Green Supermix باستخدام ٠ يتعلق بكفاءة التكبير للبادئات المختلفة؛ تم Lad على معزّز 801117 كمنطقة تثبيت. للتصحيح تحضير قالب مقارنة باهتضام وربط خليط مولاري متكافئ من اثنين من الكروموسومات الصناعية 501118 المشتملة على موضع bacterial artificial chromosomes (BACs) البكتيرية CTD-) -جلوبين بشري J وواحد من (RP11-139C22 5 RP11-606L8) البشري الكامل -١١ وكان التفاعل بين الشظايا في 1151/1152 و 1153 من منطقة مقارنة موضع .)3055511 © qv
LCR كعينة مقارنة. تم التعبير عن تكرار التفاعل كتكبير بالنسبة لتفاعل (LCR) جلوبين البشري
BAC المعروف» مقرباً إلى قالب مقارنة موضع /806111 للتخطيط المنفّح 861118 الثلاثة من إنترون ؟ ل DHSS كافة الإحداثيات) من بين hg19) تم اختيار العلامات - Te له (عع كت ل (AT خالا Te كح YY من النوع +17 (2نو: عت ©
YY تم التعرف على (AE VY Te — AY YY EL :chr2) 5ه + (ve RARE AR (CEU) علامة من قاعدة بيانات مشروع الألف جينوم باستخدام مجموعات مرجعية من شمال أوروبا 055110135 بديل إضافي في YA (جدول 51). جد (ASW) والأفارقة الأمريكان (YRI) نيجيريا من DNA في DHS لثلاثة فواصل Sanger قام المخترعون بتحديد المتواليات بكيمياء L(Y (جدول نتسم CSSCD من مجموعة (SCD) و1؟ من مرضى مصابين بمرض الخلايا المنجلية OY Yo على الترتيب. من جهد تحديد (HBF ومنخفضة (أقل من 77) من (ZA بمستويات عالية (أكبر من المتواليات هذاء تم تحديد سبع بدائل متواليات جديدة (جدول 7). ولأن معظم العلامات تتكتل في 676 فواصل جينومية صغيرة؛ لم يكن ممكناً تصميم اختبارات لتحديد الأنماط الجينية لبعضها. من بين تم إجراء اختبارات تحديد النمط الجيني ل (DHSS غير تكراري يتم التعرف عليها في ثلاثة من Jay علامة في 1,717 مشارك من 655©60؛ يمتلون مجموعة 5060 من الأفارقة الأمريكان 46 5 تم تحديد .)7١( لديهم معروفة HOF الخاص بهم ومستويات (DNA) المتاح /1ا0الجينومي تم استبعاد الأفراد وبدائل متواليات . 569080007 IPLEX الأنماط الجينية للعلامات باستخدام منصة نجاح في تحديد النمط الجيني أقل من 90 7. بلغت النسبة الإجمالية لتوافق الأنماط Jaze DNA في جدولي (YA =n ¢QC) SNPs يتم بيان التحكم في جودة مرور .7٠٠0 الجينية من نسخ ثلاثية أ و١١ ب أسفل 00155 الثلاثة. ويعتبر جزء كبير ١١ و" ويتم توضيح ذلك تخطيطياً في شكلي * Yo محددة الأنماط الجينية نادراً في المجموعات المرجعية ومن ثم تكون بشكل غير مثير SNPs من SNPS بقي 178 فرد و١7 من «QC بعد .)١8- 0( CSSCD للدهشة أحادية الشكل في
AEF 04) على النحو المبين في السابق HPF متعددة الأشكال للتحليل. تمت نمذجة مستويات أكبر من )1( باستخدام >ال510(؟؛) من خلال MAF) إجراء الربط وتحليلات التهيئة لبدائل أحادية من ST MAF) الارتداد الخطي تحت نموذج جيني يتميز بالإضافة. كشفت تحليلات البدائل الشائعة Yo
X 1,79 =P ( HbF تمتع بأقوى مستوى ارتباط ب DHS +62 عن أن 51427407 في (7)
CAR
او 0-0 شكلي ١١ أ و ب). أظهرت تحليلات التهيئة أنه بعد التهيئة على 251427407 و57606173 لم تكن أية SNPs أخرى ذات بال (شكل ؟ ب). أدى تعديل المكونات الأساسية (PCs) على Aco فرداً متاح بيانات تحديد النمط الجيني على مستوى الجينوم لديهم لتعويض الاختلاط وغير ذلك من حالات الاندماج إلى نتائج متماثلة. © بالنسبة للبدائل النادرة ومنخفضة التكرار MAF) أقل من 0 7( قام المخترعون تحليلات على أساس المجموعات باستخدام كل من 62+ (DHSS 58+ و55+ الثلاثة كوحدة اختبار. لهذه التحليلات؛ استخدمنا برنامج )45( اختبار ربط أنوية المتواليات (SKAT-0) بالمتغيرات الافتراضية. اختار المخترعون قيمة 0 7 الحدية ل MAF من أجل تعظيم القدرة الإحصائية في ضوء حجم عيننتا المحدود؛ لكن لاحظ أنه تم أيضاً تحليل العلامات التي لها MAF بين 71 و75 في تحليلات البدائل ٠ الأحادية المبينة أعلاه.يتم تبرير هذا التراكب في البدائل باستخدام تحليلات التهيئة بالبدائل الشائعة المرتبطة على حدة بمستويات (HBF وجد أن هناك مجموعتان هامتين (fleas) تحديداً 62+ DHS و55+ (DHS لكن بعد التهيئة على 151427407 و57606173؛ لم تعد النتائج هامة laa بشكل يوحي بضعف LD بين البدائل نادرة/ منخفضة التكرار و5005 الشائعة (جدول ©( لم يجد المخترعون دليلاً على أن بدائل المتواليات النادرة ومنخفضة التكرار في 01155 BCL11A تؤثر على V0 مستويات HBF في من يعانون من (SCD على الرغم من إعادة تحديد المتواليات بواسطة Sanger ل 01155 هذه في AA خاضع للعلاج يعانون من النمط الظاهري الشديد ل HOF نسب تكرار النمط الفردي من 51427407-57606173) في CSSCD هي: 1-6 4.5 1-717 .777,١ 6-6 147,2 6-06 6 متوسط مستوى HOF عبارة عن 74.8 ).٠050( في 7١١ من أفراد 6-6 r81427407-rs7606173 املا ( 5050 ) في Yo£ ٠ من اللواقح المخالفة من rS1427407-rs7606173 T-G/G-T و١211,7 ( 7750) في 60 من أفراد 1-6 rS1427407-rs7606173 (شكل 7 ج). لمقارنات مستويات HOF بين الأنماط الجينية؛ تم تحديد قيم © بواسطة اختبارات ستيودينت تي أحادية التذييل. تحديد النمط الفردي الجزيئي لاثنين من SNPS متغايرة اللاقحة على نفس الكروموسوم؛ هناك طوران محتملان: Blab حم Yo (النموذج )١ و5/8-8-م (النموذج (Y ل SNPs في شظية ١١ كيلو قاعدة من إنترون IY CAR
18 ا80من + oY, - 144 كيلو قاعدة؛ تم تحديد الطور باستتساخ منتجات PCR وتحديد determine phase 57569946 ولتحديد طور الأليلين (SNP التوزيع المشترك ل dav دمج PCR كيلو قاعدة على الكروموسوم ؟)» تم إجراء Vo) ا(االمفصولين بواسطة 7 الدمج منطقتين PCR المستحلب على النحو المبين في السابق (74؛ 75) مع تعديل بسيط. يجلب معنيتين» من أجزاء منفصلة من نفس الكروموسوم؛ معاً في منتج واحد. بإحراء التفاعل في المستحلب © بقطيرات دقيقة مائية محاطة بالزيت؛ يتم اشتقاق تفوق منتجات التكبير من جزيء أحادي القالب. كان غير متجانسي اللواقح بشكل مزدوج بالنسبة ل 57569946 و aed من أفراد معروف esa lIDNA التالي (بالتركيزات النهائية المبين): . إنزيم 100 18١ تالعافتلا مث قالباً في 7
KOD ,لا 14)؛ المحلول المنظّم Novagen, 71086) KOD Hot Start بوليميراز 8لا0 ل MgSO4 (1X) Ve. (١5,_مللي مولار)ء A oY) dNTPs مولار لكل منها)؛ بادئات SFr) 187569946-R لكل منهما)؛ بادئات i&M Y) rS1427407-R 457569946-F مولار)؛ $Y) rs7569946-R-reveomp-rS1427407-F مولار)؛ بادئة التجسير الداخلية نانوجم). تمت إضافة التفاعل المائي |8 100 بالتتقيط مع التقليب إلى طور Yeo) gDNA الزيت ا8أ 200 لتكوين مستحلب. تم تكبير جزئين 0&1 125 من المستحلب تحت الظروف التالية : Vo ثانية؛ Ve درجة Ve ثواني؛ ٠١ درجة Te ثانية؛ Ye درجة دقيقتين؛ £0 دورة من 15 درجة 40 VO متداخل في25 PCR ل Hexane اندماج مستخلص بالهكسان PCR درجة دقيقتين . تم إخضاع منتج محلول ¢(0.5 U) KOD Hot Start ل Polymerase DNA اا كما يلي : إنزيم بوليميراز مللي مولار لكل منها)؛ +,Y) dNTPs مولار)؛ Ak ,5( 109504 (©17)؛ KOD من alii (Logie نانو مولار لكل Yoo) 1S1427407-nested-R ; rs7569946-nested-F البادئتين ثانية؛ ٠١ دورة من 90 درجة YO نانولتر)؛ 40 درجة دقيقتين؛ VO) اندماج مستخلص PCR منتج ٠ المنتج المتداخل با لاستشراد ash درجة دقيقتين. تم Ve ثانية؛ Fe درجة Ve ثواني» ٠١ درجة ٠ _لتكوين نطاق أحادي بالحجم المتوقع. تم agarose في جل أجاروزا©9 electrophoresis es!
Life Technologies, ) Zero Blunt PCR Cloning استنساخ المنتج المنقٌّى بمجموعة أدوات لنواتج التكبير بالاندماج إلى تحديد نسائل ؛ Sanger أدى تحديد المتواليات بطريقة L(K2700-20 ؛ © و8-8. تم حساب احتمال كل طور على أساس افتراض توزيع a-bA-B: متواليات ممكنة YO متعدد الحدود (جدول 1). تم حساب نسبة احتمال التصميمين كمقياس للأهمية الإحصائية لنموذج
اج q _ النمط الفردي بمطابقة البيانات ١ (مقارنة بالنموذج. ؟). توحي النسبة التي تقترب من ما لا نهاية بالنموذج ١ء وتوحي نسبة عبارة عن ١ بالتوازن وتوحي نسبة تقترب من الصفر بالنموذج 7. تحديد المتواليات الحراري تم فحص مانحي خلايا +0034 أصحاء للتعرف على خمسة مانحين متغايري اللواقح بالنسبة ل © 51427407. تم إخضاع خلايا +0034 هذه لتمايز الكريات الحمراء خارج جسم BEY الحي. وتم عزل الكروماتين واجراء ChIP بالأجسام المضادة GATAL و1811 . تم إخضاع كروماتين JA مقارنة sales 67/1 أو TALL المترسبة لتحديد المتواليات الحراري من أجل تحديد التوازن الأليلي ل 14277407 .rS ثم فحص مانحي CD34+ أصحاء للتعرف على ثلاثة مانحين متغايري اللواقح بالنسبة للنمط الفردي من0/1-6-© 57606173--51427407. تم إخضاع خلايا +0034 ٠ هذه لتمايز الكريات الحمراء خارج جسم الكائن الحي. تم (CDNA) Zaidi DNA glad) و هلا 0 ولتحديد المتواليات الحراري من أجل تحديد التوازن الأليلي ل 157569946 كانت ظروف PCR كما يلي : خليط 2X ١11015181180 الرئيسي (Qiagen) 47 ١٠):012واا (تركيز نهائي “ مللي مولار)» DNA القالب (ans 1-0,١( وبادئات أمامية وعكسية معالجة ببيوثين خاصة = Yeo ) SNP نانو مولار لكل منها ( . وكانت ظروف دورات PCR كما يلي : ١5 40/941 ١٠ دقيقة؛ fo دورة من ؛ م ٠ ثانية؛ ٠ م ٠ ثانية؛ "لام ٠ ثانية؛ a VY ° دقائق. تمت معالجة بادئة واحدة من كل زوج من ببيوتين (biotinylated وتم ربط جديلة منتج PCR المحتوية على البادئة المعالجة ببيوتين بخرزات استريبتاقيدين streptavidin beads ودمجها مع بادئة تحديد متواليات معينة. تم تحديد متواليات DNA أحادي الجديلة المحضّر وتم تحليل نمطه الجيني باستخدام (Qiagen Pyrosequencing) PSQ96 HS System وفقاً لتعليمات الجهة ٠ المصتئعة. الفئران المحورة وراثياً تم الحصول على التركيبة المبلغة المعزّزة pWHERE-Dest من دكتور William Pu. معدّلة من (Invitrogen, pwhere)pWHERE على النحو المبين في السابق )£7( حيث تحتوي التركيية على بديل 1119 جرذي يحيط lacZ Jus 6086-1468 مشتق بالحد الأدنى من 15068 الأدنى YO معزّز باستخدام شريط وجهة Gateway عند MCS القبلي. تم تكبير الشظايا المعززة من IDNA OY AY
— أ q — فأري؛ وتمت إعادة دمجه في ناقل (Invitrogen, 12536-017) pDONR221 بواسطة إنزيم BP كلوناز (Invitrogen, 11789020) clonase وتمت إعادة دمجها في ناقل PWHERE-Dest مع إنزيم LR كلوناز )11791020 (Invitrogen, .25 اهتضام البلازميدات باستخدام Pacl لإزالة السلسلة الرئيسية للناقل. تمت تتقية شظايا lacZ المبلّغة المعزّزة بالاستشراد الكهربي خلال الجل ثم تم © تركيزها (Promega, A7280) Wizard DNA Clean-Up System تم توليد الفئران المحورة وراثياً بالحقن بطليعة النواة في بويضات 1/8 مخصبة. تم استخدام حوالي ٠١ نانوجم/ ميكرولتر من محلول DNA لسلسلة من الحقن. تم استخدام aly 60-1 كأفراد متلقية للأجنة المحقونة. تم إخراج أجنة أعمارها بين 14,0 16,05 يوماً منذ تاريخ الحقن من الأمهات البديلة مع إجراء التبقيع الكامل والنسيجي ب X-gal على النحو المبين في السابق (17). تم بشكل مضاد ads عناصر التدويم ٠ الخلوي المبقعة ب X-gal باستخدام .(Vector Laboratories, H-3403) Nuclear Fast Red تم استخدام التذييلات لتحديد النمط الجيني ل PCR تمت إجازة إجراءات الحيوانات بواسطة .Children’s Hospital Instititutional Animal Care and Use Committee اختبار تعزيز المواد المنتجة للكريات الحمراء البشرية تم استتساخ شظايا DNA الجينومية المحتوية على عناصر معزَّزة مفترضة إلى pLVX-Puro J# (Clontech, 632164) ٠ أدنى TK 332s وجين am GFP على النحو المبين (79). تمت إصابة 97 خلية T باستخدام عامل التفاعل (Promega, E2691) FuGene6 وفقاً لبروتوكول الجهة المصنّعة. تم تغيير الأوساط بعد 4 7 ساعة وسط SFEM مزوّد ب 77 بنسيلين-استريبتومايسين penicillin-streptomycin « وبعد ١ ساعة؛ تم تجميع المادة الطافية وتم ترشيحها. تم حث مزارع الكريات الحمراء المشتقة من خلايا +6034 باستخدام القيروس البطيء في يومي التوسع ؛ وه ٠ بالعدوى الدورية على النحو المبين في (FA) Glad) تمت إعادة تعليق الخلايا في أوساط تمايز الكريات الحمراء بعد YE ساعة من العدوى الثانية. بدأ الانتقاء باستخدام بيرومايسين ١ PUrOMYCIN ميكرو جم/ مل بعد 8؛ ساعة من العدوى. تم تحليل الخلايا المستحثة بعد خمسة ald في أوساط التمايز بقياس التدفق الخلوي لمتوسط شدة التألق الفلوري ل GFP قياس التدفق التدفق الخلوي oY AY
_qy_ 7-AAD, BD Pharmingen, ) aminoactinomycin نا -١ تم فتح الخلايا الحية باستبعاد تم عزل معلقات نخاع العظم (للأرومة الحمراء) والطحال (للخلية اللمفية) من صغار ..)5 البالغة. بعد الانحلال منخفض الضغط لخلايا الدم الحمراء الناضجة؛ تم فرز Uy الفئران المحورة «(BD, 550992( biotin-CD71 على أساس التبقيع باستخدام (7-AAD-) الخلايا الحية
CD19-APC (BD, 553673) Ter-119-PE (BD, 554067) APC - streptavidin © و CD19+ «CD71+Ter119+ تم فرز .(BD, 100308) CD3-PE أو (BD, 550992)
RNA +003من المجموعات المستخدمة باستخدامها في التدويم الخلوي وعزل
TALEN الحذف الكروموسومي بفعل لإحداث انقسامات في (TALENS) تم تصميم إنزيمات نيوكلياز المؤثّرة الشبيهة بمنشط النسخ الوراثي الإنترون ؟ من 801118 الفأري في موضعي 64 00 كيلو قاعدة (يطلق عليه الموضع 5( و ٠ : على المتواليات التالية TALENS (الموضع 37( بالنسبة ل 155. تتعرف sacl كيلو 0,4+ أيمن)؛ 5°) CCATGCCTTTCCCCCCCT( ه66 ههه 5011/0866 يسار 61 أيسر). تم 3:( CTGACTAATTGATCAT أيسر)ء 3°)GAGTTAAAATCAGAAATCT !8لا للتعرف على 6. تم RVD باستخدام (£4) Golden Gate تخليق 181115 باستتساخ بنطاق إنزيم (Invitrogen, V790-20)pcDNA3.1 المخلّقة في DNA استتساخ نطاقات ربط Vo ؛ نطاق 8152 في الطرف لا ونطاق 63+ في الطرف © المبين في السابق Fokl nuclease 0.5 89 0012*670 الأربعة مع TALEN تم توصيل 89 2.5 من كل من البلازميدات .(£9) سابقة على 8 بالاستشراد الكهربي وفقاً لبروتوكول الجهة WDA أو MEL Voix إلى ؟ (Lonza)
EA بقياس التدفق الخلوي بعد GFP تم فرز الخلايا الموجبة ل .)10028, VCA-1005) المصنّعة ساعة. تم اسنتبات الخلايا بالحد من التخفيف في أطباق مكونة من 96 عيناً لعزل النسائل الفردية. Yo ل 9011/8 لاكتشاف تكبير منتج قصير من موضع سابق PCR بينت النسائل التي تم فحصها بواسطة على الموضع ”5 وموضع تال على الموضع ”3 حذف القطاع المقحّم. تم إخضاع النسائل أحادية للحصول على نسائل محذوفة ثنائية الأليل. تم TALEN الأليل المحذوفة لدورة ثانية من الحذف بفعل من الشظية المحذوفة. بلغ ual التعرف على النسائل التي بها حذف ثنائي الأليل باكتشاف غياب
DNA اهتضام 235. Southem أليل. تم التحقق من الحذف بتبقيع ٠٠ تكرار الحذف تقريباً واحداً في Yo قبل الموضع gDNA من Ss) 561-50 probe jl ويتم تهجين ¢Bmtl الجينومي باستخدام
CAR
Cap
5°( إلى شظية 3,76 كيلو قاعدة من الأليل غير المعالج وشظية AQ كيلو قاعدة من أليل-50.4م
4 المحذوف.
1-005 والتبقيع المناعي
تم RNA (ie بأعمدة (Qiagen, 74106) RNeasy النسخ العكسي باستخدام مجموعة أدوات iQ SYBR Green باستخدام qPCR (Bio-Rad, 170-8890) cDNA لتخليق iScript ©
(Bio-Rad, 170-8890)Supermix والتبقيع المناعي على النحو المبين L(Y) بالنسبة لجينات
التكتل ١١-جلوبين الفأري يتعرف زوج بادئات مشترك على جلوبينات ١“ البالغة من النوعين VY
و١١ بينما تتعرف بادئات مستقلة على جلوبينات ١١“ من النوعين 13H 5 ey تم استخدام الأجسام
Santa Cruz, ) GAPDH (Abcam, ab19487) 58011178 : المضادة التالية للتبقيع المناعي .)50-25778 ٠
النتائج
أدت دراسات الربط الشاملة للجينوم (GWAS) إلى التأكد من البدائل الجينية المتتوعة المرتبطة
بالسمات؛ والتي كثيراً ما يكون موقعها في DNA التتظيمي. ولقد خضعت النظرية القائلة بأن التباين
التتظيمي يمكن أن يفسر القابلية للوراثة بدرجة كبيرة لتقييم تجريبي ضئيل. هنا يظهر المخترعون أن Ls Vo جينياً شائعاً في BCLITA مرتبط بمستوى الهيموجلوبين الجنيني (HPF) يبين متواليات غير
تشفيرية مزينة بصمة كروماتين 335m للكريات الحمراء. يكشف التخطيط المنفّح في DNA التتظيمي
المفترض عن بديل مشترك قاطع للموتيفة مرتبط بانخفاض ربط عامل النسخ الوراثي؛ تضاؤل التعبير
عن 80111/8,؛ وارتفاع HBF تعمل المتواليات المحيطة في جسم الكائن jas all تطوري نوعي
المرحلة محدد السلالة. وباهندسة الوراثية للجينوم؛ اتضح أن هذا المعزّز مطلوب للتعبير عن BCLITA ٠ الكريات الحمراء إلا أنه لا فائدة له خارج سلالة الكريات الحمراء. توضح هذه النتائج كيفية
يمكن أن تبرز GWAS البدائل الوظيفية ذات الأثر المتواضع في العناصر السببية الأساسية للتعبير
الجيني السليم. Jay معزّز 801118 المعلّم بواسطة Ladle as GWAS محبِّذاً في اضطرابات
| -جلوبين.
asl كان | 0/85ا6 ناجحاً بشكل هائل في التعرف على آلاف مؤلّفة من الأشكال المتعددة Yo النيوكليوتيدية الأحادية (SNPs) الشائعة المرتبطة بسمات وأمراض البشر. ومع ذلك كان التقدم من
CAR
الربط الجيني إلى العملية الحيوية السببية في الغالب صعباً. تضم التحديات العدد الضخم من البدائل المتطابقة التي يمكن ربطها بالسمات الفردية (نظراً Baad اتزان الارتباط (LD) الأثر المتواضع لكثير من عمليات ربط البديل بالسمة؛ وموقع الكثير من البدائل المرتبطة في الجينوم غير التشفيري. ولقد أبرزت الدراسات الحديثة لتخطيط الكروماتين على مستوى الجينوم ثراء بدائل GWAS في DNA ile © التتظيمية؛ بشكل يوحي بأن كثيراً من البدائل السببية يمكن أن يؤثر على تتظيم الجينات. ومع ذلك؛ لم تظهر التجارب إلا بضعة أمثلة تؤكد أهمية البدائل أو العناصر السببية. ail كان GWAS لمستوى HOF مدهشاً بشكل خاص. يبرر التباين الجيني عند ثلاثة مواضع فقط (BCL11A 5 (HBS1L-MYB (HBB) نسبة 5٠ 7 من التباين الموروث في مستوى HDF كذلك يتم ربط نفس البدائل بالشدة السريرية في مرض الخلايا المنجلية باعتلالات ]-جلوبين الرئيسية ٠ والتثلاسيمية 8؛ ربما بشكل غير مثير للدهشة لأن Jane HBF رئيسي لهذه الاضطرابات. أكد العمل من معمل المخترع والآخرين أن 801118 عبارة عن منظّم مباشر لمستويات .HbF 8011178 عبارة عن عامل كبت نسخ وراثي يكمن في المعقدات متعددة البروتينات التي تشغل تكتل Gusta الجيني. وبينما يؤدي نقص /80111 التكويني إلى موت الأجنة وضعف تطور الخلايا اللمفية؛ يؤدي العجز الخاص بالكريات الحمراء في /80111 إلى معادلة الكبت التطوري لجينات جلوبين الأجنة ٠ ويكون كافياً لعلاج السمات المتعلقة بالدم والمرضية في مرض الخلايا المنجلية في النماذج الفأرية. لذا ظهر 801116 كهدف علاجي جديد في اضطرابات ]-جلوبين. ويعتبر فهم تبعات ضعف 801118 ضرورياً. لم يتم وصف بدائل التشفير البشرية من 8011178 على الرغم من جهود إعادة تحديد المتواليات واسعة النطاق. وتكمن بدائل 801118 المرتبطة بمستويات HDF في المناطق غير التشفيرية من 806111/8. لمزيد من فهم كيفية تأثير التباين الجيني الشائع على 86111/8؛ ٠ على مستوى (HBF وشدة اضطراب ]|-جلوبين؛ تم اختبار دور البدائل المرتبطة ب HEF بالتفصيل. البدائل المرتبطة بالسمات بالقرب من ely fre الكريات الحمراء تم إجراء العديد من دراسات GWAS بالإضافة إلى التخطيط المنفّح للمتابعة على سمات الكريات الحمراء La) في ذلك الأنماط الظاهرية مثل عدد وحجم الكريات الحمراء؛ تركيز الهيموجلوبين» ومستوى ((HDF للتعرف على SNPs مرتبطة ب 1776 سمة بأهمية تشمل الجينوم P) أقل من-58 Yo 8). يتم الإثراء ب SNPs في المعزّزات ومناطق التشفير مقارنة ب SNPs عشوائية (شكل .)١ كذلك تكمن غالبية SNPs في مكان آخر في الجينوم. تم وصف سمات الكروماتين العامة للخلايا CAR eam المنتتجة للكريات الحمراء البشرية الأولية؛ وأدى ذلك إلى التعرف على مجموعة كبيرة من معزّزات
DNase الكريات الحمراء البعيدة التي يتم التعرف عليها بتعديلات هيستون المميّزة وفرط الحساسية ل غير SNPs الكريات الحمراء بالمعزّزات مقارنة ب GWAS SNPS لوحظ تكون قوي لمستعمرات مرتبطة بسمات الكريات الحمراء» 581058 الموجودة على مصفوفة تحديد أنماط جينية شائعة» أو المرتبطة بسمات الكريات الحمراء بشكل SNPS المبدّلة عشوائياً. سقطت نسبة 71,5 من SNPs © مباشر في معزّزات الكريات الحمراء؛ بإثراء يبلغ lanza VY, مقارنة بالمعززات المبدّلة عشوائياً P) J من ))4-٠١ * ١ مقارنة بنسبة 71,4 من SNPS غير المرتبطة بسمات الكريات الحمراء؛ والتي Jia إثراء بنسبة 1,4 ضعفاً =P) 017 0,0( ولقد وجد أن الكثير من SNPs في تقارب وثيق مع معززات الكريات الحمراء (شكل ١ ب). كانت المسافة المتوسطة إلى معزّز الكريات الحمراء عبارة عن 47,1 7786 المرتبطة بسمات الكريات الحمراء» مقارنة ب SNPs ل (kb) كيلو قاعدة ١,6 0٠ غير المرتبطة بسمات الكريات الحمراء؛ الخاصة SNPs و87,4؛ كيلو قاعدة على الترتيب ل بمصفوفة تحديد النمط الجيني؛ والمبدّلة عشوائياً.تبين هذه النتائج أن جزءاً كبيراً من البدائل الشائعة المرتبطة بسمات الكريات الحمراء يكمن في أو بالقرب من معززات الكريات الحمراء» وتتفق مع النظرية القائلة بأن البدائل السببية تؤثر غالباً في التنتظيم الجيني المعتمد على السياق. Vo علامة 610/85 HBF على Laas معزّز الكريات الحمراء تم إجراء ستة GWAS على مستوى HOF (أو عدد FADIA متوافقة السمات بدرجة كبيرة)؛ بما في ذلك مجموعات من أصل أوروبي» أفريقي» وآسيوي. تعرف كل منها على البدائل المرتبطة بالسمات في 8061-118. يتم تقييم التباين في 8011178 لتفسير -715 من تباين السمات. تم التعرف على أربعة SNPs مختلفة باعتبارها مرتبطة بأعلى درجة ممكنة بالسمة (51427407؛ ٠ التي يطلق عليها "الخافرة” في SNPs تتكتل ¢rs766432 5 54671393 511886868 ٠ أ). يبدو أن الأنماط الفردية Y كيلو قاعدة من بعضها البعض في الإنترون ¥ من 8061118 (شكل فردي. ولقد تم ربط خمسين SNP مقارنة بأي HBF خافرة تفسر بشكل أفضل ربط SNPs التي تضم
HOF ضمن إنترون ؟ بمستوى SNPS من 50005 في الموضع 801118 وسبعة وعشرين من (AY Xo من JETP) بأهمية تضم الجينوم بالكامل على الأقل YO تمت مقارنة توزيع SNPs المرتبطة ب HPF في 8011178 مع الحساسية ل | «DNase وهي مؤشر على حالة الكروماتين التي توحي بقدرة تتظيمية. في الخلايا المنتجة للكريات الحمراء البشرية؛ لوحظت CAR
“yer بجوار وبشكل متراكب مع البدائل المرتبطة oF في الإنترون DNase | ثلاث قمم من فرط الحساسية ل 62+؛ (DHSs) DNase | والتي يطلق عليها مواضع فرط الحساسية ل (AY (شكل HOF ب يظهر المخ والخلايا اللمفية .BCL1IA 12155 و55+ على أساس المسافة بالكيلو قاعدة من +58 ولا يعبران عن oT /80111؛ والخلايا اللمفية le وهما نسيجان يعبران عن مستويات 8 بندرة (BCL11A في الموضع DNase | بدرجة كبيرة» عن أنماط فريدة من الحساسية ل 801118 ٠ المرتبطة بالسمات (شكل ؟ أ). SNPs المتراكبة مع DNase ١ في الحساسية ل تم تحليل بصمة الكروماتين حول موقع /80111 بشكل أكبر بواسطة الترسيب المناعي للكروماتين من المواد المنتجة للكريات ChIP-seq مع تحديد متواليات مواز بشكل هائل (0510-560). كشف المرتبطة بالسمة في SNPS الحمراء البشرية الأولية عن تعديلات هيستون ببصمة معزّز متراكبة مع العلامتين les H3K27ac و H3KAmel الإنترون ؟ من 80111/8؛ بما في ذلك وجود Vo 6787781 أ). وتشغل عوامل نسخ الكريات الحمراء الرئيسية ١ 63و 13/627003 (شكل أظهرت تجارب 6010-9068 ثلاث قمم متمايزة لربط (TY منطقة المعزز هذه (شكل TALL
DHS في الإنترون ¥ من 861118 حيث يسقط كل منها في كرية حمراء TALL 1 (شكل ؟ ب). السمات المشتركة للعناصر التتظيمية البعيدة في التفاعل طويل المدى مع المعزّزات التي gaa) تتمتل Vo كيلو قاعدة من You تنظم التعبير عنها. تم تقييم التفاعلات بين المعزّز 8011178 والشظايا عبر بما في ذلك المتواليات قبل؛ بعدء وداخل الجينات. لوحظ أكبر تفاعل معزّز في BCL1IA موضع المرتبطة بالسمات (شكل ¥ ج). SNPs منطقة الإنترون ؟ المحتوية على 0115 الكريات الحمراء و تبين هذه النتائج أن لهذه المتواليات قدرة تتظيمية. البدائل التتظيمية ٠ السببية المرتبطة بالسمات يمكن أن تعمل بتعديل عناصر سيس 5005 of كان من المقترض 01155 في SNPs التتظيمية الحاسمة. لذا تم إجراء تحديد الأنماط الجينية على نطاق واسع ل في الدراسة التعاونية DNA من عينات ١767 و55+ في «+58 +62 LDU الكريات الحمراء بمجموعة من الأفارقة الأمريكان المصابين بمرض الخلايا ((CSSCD) لمرض الخلايا المنجلية لديهم. تم التعرف على 17 من بدائل HOF الجينومي لهم ومعروف مستويات DNA المنجلية متاح Yo
CAR yay ¢ YRICCEU الثلاثة من 005110 من المجموعات المرجعية DHSS الموجودة في DNA متواليات CSSCD فرداً من AA ل Sanger في مشروع الألف جينوم؛ وبتحديد المتواليات بطريقة ASW
VA علامة في تصميم اختبار النمط الجيني وكان YT أخفقت (HBF يعانون من نمط ظاهري شديد ل متعددة SNPS فرداً و١7 من VIVA و7). بعد التحكم في الجودة؛ بقي ١ أحاديي الشكل (جدولي أكبر minor allele frequency (MAF) ( الأشكال لاختبار الربط. كشف تحليل البدائل الشائعة © *» 1,13 =P) HOF كان له أقوى ارتباط بمستوى DHS +62 عن أن 51427407 في )7١ من .)١ جدول ؛0-٠ في الموضع HDF للتخطيط المنفّح لإشارة الارتباط مع CSSCD في السابق؛ استخدم المخترعون في الدراسة» كان 51427407 مقدّراً. تم أيضاً ersd671393 80118وسجلوا أقوى ارتباط ب الدراسات المسبقة 3 rS11886868 5 5766432 الإضافية» SNPs التعرف على اثنين من ٠ وفي (FDA (أو عدد HDF الخافرة التي ترتبط بأعلى درجة ممكنة بمستوى SNPs باعتبارهما من الخافرة الأربعة لهم SNPs مجموعة فرعية من الأفراد ( اا 778) كانت الأنماط الجينية عند كل الارتباط ذات بال عند dam معروفة؛ عند التهيئة على الأنماط الجينية عند 51427407 لم تكن بقي الارتباط عالياً بدرجة كبيرة «Sally; أو 1511886868؛ crs766432 «rsd671393 ل 51427407 عند التهيئة على 54671393 5766432 أو 511886868 (جدول 9). لذا Vo في 0115 الكريات الحمراء ويفسر بشكل HBF الأكثر ارتباطاً SNP فإن 151427407 يمثل الخافرة الأخرى المبينة في السابق. SNPs أفضل الارتباط بالسمات مقارنة ب ضمن 01155 الثلاثة HBF وجدت الارتباطات الأخرى بمستوى «rs1427407 عند تهيئتها على كان الارتباط الباقي الأكثر دلالة إحصائية 176061733 في .)١ التي لم يتم فقدها بالكامل (جدول التي تم الابلاغ عنها coA+ DHS كان 57599486 في ؛)٠١-٠١ x 0,3) =P) 58+ 0015 | ٠ في هذا التحليل الشرطي. بعد تهيئة كل )1-٠١ XV, YY) = P) مسبقًاء دلالة إحصائية أقل قليلاً فقط ضبط .)١ دلالة إحصائية (جدول SNPs من 151427407 و 157606173 لم يعد لأي من hs بعدد 8505 فرد المتوفر بيانات النمط principal components (PCs) المكونات الأساسية ذو جينومات واسعة النطاق لهم للأخذ في الاعتبار المزيج الدوائي والمواد المدمجة الأخرى التي أدت rs1427407-rs7606173 يتم توضيح البيانات). تم تحديد النمط الأحادي ل ol) إلى نتائج مشابهة YO
HBF على أنه ذاك المرتبط بشدة بمستوى 1-6
CAR
س١ تم أيضنًا تحليل الصور المتغايرة النادرة ومنخفضة التردد MAF) > 75) للكشف عن ارتباطها بمستوى HbFs باستخدام كل من 00155 الثلاثة +217 (OA+ و +00 كمجموعة اختبار. وجدت اثثنتين من المجموعات أنهما ذات دلالة إحصائية»؛ أي DHS +67 و0115 +55,؛ لكن بعد تهيئة (rs7606173 5 rs1427407 لم تعد النتائج ذات دلالة إحصائية؛ مما يشير إلى LD ضعيف بين © الصور المتغايرة النادرة/ منخفضة التردد 5 SNPs المشتركة (جدول 4 ). بالتالي؛ لا يوجد دليل على وجود الصور المتغايرة المتسلسلة النادرة ومنخفضة التردد ضمن 01155 /80111 التي sisi على مستوى HbFs في المرضى بلا50 ؛ على الرغم من إعادة ترتيب Sanger لعدد AA فرد من CSSCD مصابين بالنوع الظاهري HOF المفرط. يقع 51427407 SNP ضمن ذروة ارتباط 67/81 و1811 كما هو محدد بواسطة -0510 ٠ 580 0010-0065 (الأشكال (Ys IY يمزق T-allele الثانوي G-nucleotide لعنصر متسلسل يشابه بشدة تتابع نتظيمي مركب لنصف 5-50«/6/81/8 aay .[CTG(N9)GATA] هذا التتابع التتظيمي أنه غني للغاية بمعقدات 687781 و1811 في LDA الكريات الحمراء بواسطة تجارب .ChlP-seq تم تحديد عينات الكريات الحمراء الأولية من فرد متباين الزيجوت allele Gl الرئيسي 5 T-allele الثانوي عند 151427407 وتم تعريض هذه العينات ChIP يتبع ذلك إحداث V0 تسلسل حسب التخليق. حدد المخترعون توازن متساوي من مركبات الأليل allele في DNA المُدخل. على الرغم من ذلك تمت ملاحظة الارتباط الأكثر تكرارًا ب allele=G مقارنة ب1-أليل الذي يساوي yy 40:75 في كل من عينات الكروماتين المرسبة مناعيًا GATAL J و1811 (الشكل (Iv تم من قبل الابلاغ عن أن allele-A المرتبط HOF, المرتفع ل54671393/ كان مرتبطَا بالتعبير عن 8061118 في سلالات خلايا الأرومات الليمفية البشرية. لم يتمكن المخترعون من sale) إنتاج Yo ارتباط ذي دلالة إحصائية بين النمط الوراثي 861118 ومستوى التعبير الذي يحلل مجموعة أكبر من سلالات خلايا الأرومات الليمفية (لم يتم توضيح البيانات). تم التكهن بأن النمط الأحادي 1s1427407-rs7606173 المرتبط HOF المرتفع يؤثتر على التعبير عن 8611178 في السياق الخاص بالكريات الحمراء. يقع المرادف الشائع ل 57569946 SNP ضمن exon—4 ل/80111 ويمكن أن يعمل كمرقم للتعبير عن الأليل. تم تحديد أن ثلاث عينات أولية من الكريات الحمراء Yo البشرية كانت مزدوجة تباين الزيجوت للنمط الأحادي rs1427407-rsT606173 و157569946. تم تعريض العينات لعملية تحويل إلى نمط أحادي جزيئي بواسطة الدمج في مستحلب PCR CAR yee رئيسي ل 157569946 في allele-G أوضحت عملية التحويل إلى نمط أحادي أنه كان لكل عينة المنخفض. تم تقييم HBF المرتبط /51427407-+57606173 G-C الطور مع النمط الأحادي الجينومي بواسطة إحداث تسلسل حسب التخليق 187569946 لتحديد توازن CDNA 3 DNA الجينومي؛ تمت ملاحظة انعدام التوازن ذي DNA في allele بينما تمت موازنة مركبات .6 المنخفض HOF, الذي يفضل التعبير المتزايد عن 8166-6 المرتبط cDNA الدلالة الإحصائية في ©
HOF 51427407ب المرتبط T-allele تشير هذه النتائج إلى أن (oF (الشكل r$7569946. المرتفع» الذي يمزق نصف التتابع التتظيمي 5-50«*/6/8778؛ يكون مرتبضًا بالارتباط المخفض والتعبير المخفض عن 8061118 في المواد المنتجة للكريات الحمراء. مستوى TALL; GATALL 457 1s1427407- الأساسي في 60 من الأفراد متجانسو الزيجوت ذوي النمط الأحادي HBF من الأفراد متجانسو الزيجوت 7١“ في 74,٠» مقارنة ب# 211,7١ المرتفع كان 87606173 1-6 ٠ )١-١ X Y,0 = P) المنخفض HBF 1s1427407-rs7606173 1-6 ذوي النمط الأحادي اعتيادي لمستوى SNP (الشكل *ج). في المجمل؛ يشير الدليل التالي إلى أن 151427407 يكون له أعلى ارتباط بالنمط الظاهري لأي صورة متغيرة معروفة»؛ يأخذ في الاعتبار الارتباطات التي :HOF تؤثر على التتابع التتظيمي اللازم لارتباط (Blu الخافرة الموصوفة SNPS تمت ملاحظتها مع وتكون متصلة بارتباط 681/1 و1811 بالإضافة إلى مع التعبير عن «TALL; GATAL ١٠ على الرغم من ذلك؛ تكون الصورة المتغايرة عند هذا الموضع في ضبط الأنماط الأحادية .861118 .86111/8 المشتركة مرتبطة بأقل اضطراب فقط في التعبير عن فعالية المحسن للتعبير عن الخلايا الشبيهة بالكريات الحمر الظاهرة المنظمة المرتبطة بالسمات هذه دورهاء تم اكتشاف SNPs لفهم السياق الذي ضمنه تلعب كيلو TE £207, 4) نوظيفة إيواء العناصر المنظمة لسيس. استتتسخ المخترعون -"١-كيلو قاعدة ٠ وقيموا جهد المعزز في (DHSS التي احتوت على ثلاث من الكريات الحمراء (TSS قاعدة من اختبار مرسل التحول الجيني. في هذا الاختبار يتم وضع متواليات المعزز المفترضة قبل محفز ثانوي مرتبط بمتواليات عازلة. تم إدخال البْنىَ إلى الزيجوت الفأري بحيث (18CZ) وجين مرسل (HSP6S) تتم مراقبة التعبير عن الجين المرسل على مدار التطور. أظهر 8011/8 الفأري داخلي المنشاً تعبير فائض على مدار تكوين الجهاز العصبي المركزي مع ملاحظة تعبير أقل بكثير في الكبد الجنيني. Yo على أنه Gia على العكس من ذلك؛ تمت ملاحظة التعبير عن الجين المرسل في الأجنة المتحولة
CAR
ف -١ مقتصر بشكل كبير على الكبد الجنيني؛ موقع تكوّن الكريات الحمراء المحدد؛ مع ملاحظة تعبير أقل في الجهاز العصبي المركزي (الشكل ؛أ). السمة المميزة لجينات الجلوبين هي التتظيم المتتامي لهم. أثناء النمو البشري؛ بيتا Gusta المشتق من كيس الصفار يتم تعليق في أول ثلاثة أشهر بواسطة Lala جلوبين y —globin المشتق من الكبد © الجنيني liver ا1618. قرب حلول موعد الولادة؛ يتم إغلاق جاما جلوبين Gayot ويصبح بيتا جلوبين globin منشطًا. يوجد فقد تحول مفرد في التعبير عن الجين أثناء نمو الفأر. أثناء هذا التحول؛ الذي يحدث عند منتصف فترة الحمل؛ يعبر تدوير خلايا الكريات الحمراء البدائية المشتقة من كيس الصفار عن جلوبينات المرحلة الجنينية #* و Lan BEE تعبر الأرومات الحمراء المحددة بالكبد الجنيني عن جلوبينات مرحلة البلوغ BL و82. بالتوافق مع هذا التحول المتنامي؛ يتم التعبير عن ٠ 8611180 في سلالة الكريات الحمراء محددة المرحلة وليست بدائية المرحلة. تم اشتقاق السلالات ذات التحول الجيني المستقر من 861118 14,4-207,٠+ الفأرية المرسلة. في هذه الفئران عند تدوير LDA الكريات الحمراء لا يلطخ X-gal بينما تلطخ أرومات الكريات الحمراء بالكبد بشدة بشكل موجب (الشكل ؛ب). عند (E10.5 تمت ملاحظة uel) عن lacZ فقط في بداية الكبد الجنيني وليس في الدورة الدموية للجنين؛ المشيمة؛ أو كيس الصفار (الشكل ١أ). تشير هذه النتائج Vo إلى أن المتواليات المنظمة 8061118 إنترون-؟ المرقمة ب85//ا6 كافية لتحديد التعبير المتتامي المناسب عن الجين. Jala الحجيرة المكونة للدم, يوجد التعبير عن 11/8 BCL في المواد المنتجة للكريات الحُمر والخلايا اللمفاوية-8. تم عزل المواد المنتجة للكريات الحُمر والخلايا اللمفاوية-8 من حيوانات بالغة صغيرة محورة وراثياً وتم تقبيم التعبير عن جين مبلغ 1862 . تم التعبير عن 8011178 داخلي المنشأ عند ٠ - مستويات lef Cae) o,f في الخلايا اللمفاوية-8 الطحالية splenic B-lymphocytes مقارنة بالمواد المنتجة للكريات الحُمر بنخاع العظم. مع ذلك, تم تقييد التعبيير عن 1802 على المواد المنتجة للكريات الحُمر aly تتم ملاحظته في الخلايا اللمفاوية-8 ( الشكل ؛ ج). تشير هذه النتائج إلى تحديد بخلايا شبيهة بالكريات الحمراء لهذه المتواليات التتظيمية. تم توليد سلسلة من طافرات الحذف لتتقيح أدنى العناصر المطلوبة لنشاط محسن شبيه بالكريات © الحمراء. كانت المتواليات التي تحتوي على المركز +58 DHS كافية لنشاط محسن شبيه بالكريات الحمراء. كانت تلك المتواليات التي لا تحتوي سوى على عناصر +67 أو oot المحيطة غير قادرة CAR
Nate على توجيه التعبير عن جين شبيه بالكريات الحمراء (الشكل رقم 7ب). تم اختبار 01155 هذه للتأكد من قدرتها على تحسين التعبير الجيني في المواد المنتجة للكريات الحُمر البشرية الرئيسية. استخدم طبقاً لما تم وصفه من قبل. TK بأدنى معزز GFP المخترعون توصيل فيروسة عدسية لنظام مبلغ ولكن ليس +00 أو +67 هي القادرة على تحسين التعبير oA+ DHSs على نحو مماثل, فقط (VY الجيني في تجربة المبلغ المذكورة (الشكل رقم © متطلبات المحسن للتعبير عن الخلايا شبيهة الكريات الحمر 861118 بعد ذلك اختار المخترعون تحديد متطلبات هذه المتواليات التنتظيمية للتعبير المناسب عن في تحديد خواص الكروماتين الكلي المنشور مسبقاً Bell la وجينات الجلوبين. كشف فحص موقع لخلايا شبيهة بالكريات الحمراء أن هذه المنطقة من إنترون-؟ تتسم ببصمة محسن متشابهة عند lal
H3K27me3 و H3K4me3 وعدم وجود ,H3K2Tac ; H3KAMel الموضع أورثو مع وجود ٠ (الشكل رقم 8). علاوة على ما سبق, تمت ملاحظة شبيهة بالكريات TALL; 67/81 وشغل بواسطة عند هذه المتواليات. عند كل واحدة من الخلايا DNase ١ الحمراء-المحددة بالحساسية المفرطة ل ملاحظة دليل على حفظ cai, 00+ 5 DHSS +62, +58 البشرية الشبيهة بالكريات الحمراء المتوالية التطورية, لاسيما داخل +17 5 +00 لتحديد متطلبات لهذه المتواليات التتظيمية المتشابهة عند الموضع أورثو للتعبير عن 86111/8, تم استخدام سلالة خلية ابيضاض الدم الاحمراري من Vo تعتمد هذه الخلايا على التعبير عن . (mouse erythroleukemia cell line (MEL الفأر لنمط جلوبين التعبير الجيني المناسب في مرحلة البلوغخ. يمكن أن يترتب على إنزيمات 8601118
TALENS نيوكلياز محددة بالمتوالية إنتاج عمليات حذف صغيرة الكروموزومات. تمت معالجة متشابهة عند 10-kb 801118 بالهندسة الوراثية لإدخال فواصل مزدوجة الجديلة لإحاطة متواليات الموضع أورثو إنترون-؟ تحمل بصمة كروماتين محسن خلايا شبيهة بالكريات الحمراء. تم فحص ٠ ثلاث نسائل فريدة خضعت لاستئصال ثنائي الأليل. تم Jie وتم NHEJ النسائل لإصلاح يتوسط فيه من الاستئصال لقسم متعلق بالإنترون داخل النسائل Southem ولطخة PCR التحقق من خلال مميزة لانشطار يتوسط فيه Sanger (الشكل رقم 3( كانت نقاط الفصل ذات المتوالية طبقاً ل .)٠١ لاحق (الشكل رقم NHEJ بإصلاح TALEN متعلق بالإنترون | 10-45 ثنائي Gada ذات MEL "تم تحليل التعبير عن 8611178 .في خلايا 5 الأليل. تمت ملاحظة تخفيض هائل للتعبير عن 8011178 إلى مستويات -77 من مستويات القيمة
CAR
-١ ل
الأولية (الشكل رقم #أ). تمت ملاحظة تخفيضات مماثلة مع أزواج بادئة تكشف وصلات الإكسون قبل, بامتداد, أو بعد الحذف. بتلطيخ Western , لم يكن التعبير عن 8011178 قابل للكشف في النسائل ذات 05-٠١ محسن ملغى (الشكل رقم (wo تعبر MEL LDA نمطياً عن مستويات مرتفعة من جينات الجلويين 01 و52 البالغة ومستويات منخفضة من جينات الجلوبين الجنينية sy .PHI, © في عدم وجود محسن »©-٠١ لبروتين 50111/8, تم تخفيض التعبير عن جينات الجلوبين في البالغين بنسبة -09-7-ضعف, بينما تم تخفيض جينات الجلويين الجنينية بدرجة كبيرة. تمت زيادة نسبة sy الجنينية إلى 1/2 من الكبار بواسطة متوسط Canam VRE في ثلاث نسائل تفتقر إلى
خلايا متشابهة لمحسن عند الموضع أورثو BCLIIA شبيهة بالكريات الحمراء (الشكل رقم #٠ج). لتحديد ما إذا كانت متواليات +؛ ,60,45 Kb المتعلقة بالإنترون مطلوبة بصورة كلية للتعبير عن ٠ 8611180 , تم تقييم فقدها في سياق من غير خلايا شبيهة بالكريات الحمراء. تم استخدام نفس الاستراتيجية لتقديم زوجين من TALENS للحصول على النسائل ذات حذف يتوسط فيه NHEJ AS50.4-60.4 في سلالة خلية طليعة لخلية لمفاوية-8. تم عزل اثنتين من النسائل الفريدة -850.4/ 60.4 وتم التحقق منها بواسطة PCR , التلطيخ بلطخة 5001078177 , وعمل متواليات Sanger (الأشكال 9 و١٠). على النتقيض من LOA شبيهة بالكريات الحمراء, تم الاحتفاظ بالتعبير عن ١ 861118 في نسائل خلية طليعة 8 ملغاة محسن A50.4-60.4KD عند كل من مستويات RNA والبروتين (الشكلان ا ودب). تشير هذه النتائج إلى أن متواليات المحسن للخلية المتشابهة عند الموضع أورثو الشبيهة بالكريات الحمراء لا تكون مطلوبة لتكامل انتساخ من موضع 801118 ولكن
تكون ضرورية فقط للتعبير عن جين خلية شبيهة بالكريات الحمر. تم العثور على بصمة كروماتين محسن عند إنترون-؟ ل 80111/8, يغطي مباشرةً SNPs مرتبطة ب ٠ | 405 . تضم المنطقة العديد من السمات الحيوية الكيميائية للمحسنء بما في ذلك الشغل بواسطة الهستون الذي يميز H3K27ac H3KAmMel في عدم وجود 1314407163 لو (H3K2Tme3 وربط TALI TFs GATAL الشبيهة بالكريات الحمرء ومواضع مفرطة الحساسية ل 011856-١ المحددة بالخلايا الشبيهة بالكريات الحمرء وتفاعل المعزز على المدى البعيد بواسطة “ج. علاوة على ما سبق؛ تمكن المخترعون من تعيين خريطة لهذا الموقع؛ باستخدام 01155 كدليل. لتمييز SNP rs Yo 1424707 باعتباره الأعلى ارتباطاً بالسمة؛ ويسفر تماما ارتباط السمة ب SNPS الحارس الموصوف فيما سبق والمرتبطة بدرجة عالية. بالإضافة إلى ما سبق؛ تبين في الطلب الحالي أن 1427407 rs CAR yA و1811 .في المواد المنتجة GATAL بعوامل الانتساخ GATA يعطل محفز نصف-5- مربع/ عديدة SNPs للكريات الحُمر. مع ذلك, حتى بعد التكيف على 51427407 يظل الارتباط مع أخرى في 01155 متجاورة مما يشير إلى تأثير نمط فرداني. وتبين أن الأنماط الفردانية التي تتسم في العناصر المتجاورة أن كل وظيفة تتظيمية معدلة تتعاون لتعطي SNP بتوليفة من أنماط جينية النمط الظاهري الكلي للتعبير عن 86111/8. باستخدام متبرعين متغايري الزيجوت؛ تبين وجود تأثير © .86111/8 والتعبير عن TF عالي على كل من ارتباط HBF متواضع للنمط الفرداني المرتبط ب تساعد هذه الدراسات في تقييم التغيير في التعبير عن /80111 المطلوب ليترتب عليه زيادة ذات الفرق في التعبير عن pm uss في مرضى ذوي اضطرابات HDF دلالة إكلينيكياً في مستوى
HbF و6-6 57606173 T-G illal-HbF rsl427407- بين الأنماط الفردانية BCL11A ) و6©-6 كان 711,7 و74,1 T-G من متغاير الزيجوت HBF المنخفضة 7,١-ضعف ومستوى ٠ النتائج العكسية ل 500. من 770> HBF تم توقع أن تمنع مستويات (2 V5 oF الشكلان هذا. HBF أضعاف هدف sae المحتمل أن يقترب التخفيض في التعبير عن 8011178 من تحدد هذه الدراسة التباين التتظيمي عند 801117 الذي يؤثر على محسن خلايا شبيهة بالكريات المرتبطة بالسمة مشفرة وتتسم بحجم تأثير صغير نسبيا. ونتيجة SNPS الحمر. ولا يكون الكثير من هذه ذات أهمية إكلينيكية طفيفة. وتوضح هذه الدراسة أن SNPs ا لهذه السمات؛ أحيانا يتم اعتبار حجم تأثير صغير تم توليده بواسطة فرد غير مشفر لصورة مغايرة لا يحول دون حجم تأثير كبير
SNPs للعنصر التتظيمي الضمني. على سبيل المثال؛ على الرغم من التأثير الضعيف نسيياً ل وظيفي على التعبير عن 8011178 المستهدف للجين الضمني؛ تكون العناصر التتظيمية السببية أساسية للتعبي عن جينات 801117 والجلوبين في مواد منتجة للخلايا الشبيهة بالكريات الحمر في مرحلة البلوخ. ولا يمكن الاستغناء عن نفس العنصر التتظيمي للتعبير عن 8011178 في سلالات Yo غير شبيهة بالكريات الحمر. يتمتل الهدف من دراسة الألائل الواقية في فهم الآليات الجزيئية الضمنية في مجهود لانتساخ هذا التأثير الحيوي في الأفراد المعرضين للخطر. وبالتالي؛ تبقى الكثير من الصور المتعددة الشكل البلوري المرتبطة بالسمة في العناصر التنتظيمية الهامة المحددة بالسياق والتي يمكن أن تكمن وظيفتها في توضيح البيولوجيا الضمنية بصورة إضافية للسمة التي تتجاوز مجرد تمييز الجين المنتظم. على سبيل المثال, في حين يترتب على فقد 801117 تحويل ضعيف للهيموجلوبين Yo تكوين ضعيف للأوعية وتكوين للأوعية اللمفاوية ويترتب إهلاك جنيني. في النهاية يمكن أن يميز
CAR
_ \ ٠ q —_ الفهم الأفضل للعناصر التتظيمية المسببة والشبكات التتظيمية المرتبطة سمات ضمنية للأهداف العلاجية الجديدة. يمكن أن يشكل محسن شبيه بالكريات الحمر ل 801118 ذاته هدف محبذ للجينوم العلاجي المحرر في أن الاجتثاث يمكن أن يعوق التعبير عن 8611178 في المواد المنتجة لخلايا ناتج بينما تتم المحافظة على التعبير عن 801118 في HDF شبيهة بالكريات الحمر مع تخفيض سلالات من غير الخلايا الشبيهة بالكريات الحمر. © المراجع 1. .ا Fugger, 6. McVean, J. I. Bell, N. Engl. J. Med. 367, 2370-2371 (2012). 2. J. Emst et al., Nature. 473, 43-49 (2011). 3. D. 5. Paul et al., PLoS Genet. 7, el002139 (2011). Yo 4. M. T. Maurano et al., Science. 337, 1190-1195 (2012). 5. P. van der Harst et al., Nature. 492, 369-375 (2012). 6. ENCODE Project Consortium et al., Nature. 489, 57-74 (2012). 7. S. Menzel et al., Nat. Genet. 39, 1197-1199 (2007). 8. M. Uda et al., Proc. Natl. Acad. Sci. .ل 5. A. 105, 1620-1625 (2008). ٠ 9. 6. Lettre et al., Proc. Natl. Acad. Sci. U. 5. A. 105, 11869-11874 (2008). 10. M. Nuinoon et al., Hum. Genet. 127, 303-314 (2010). 11. N. Solovieffetal., Blood. 115, 1815-1822 (2010). 12. ©. Bhatnagar et al., J. Hum. Genet. 56, 316-323 (2011). ٠ 13. V. G. Sankaran et al., Science. 322, 1839-1842 (2008).
OY AY
Ny 14. J. Xu et al., Genes Dev. 24, 783-798 (2010). 15. J. Xu et al., Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 110, 6518-6523 (2013). 16. V. 6. Sankaran et al., Nature. 460, 1093-1097 (2009). 17. J. Xu et al., Science. 334, 993-996 (2011). 18. F. Esteghamat et al., Blood. 121, 2553-2562 (2013). © 19. ©. Liu et al., Nat. Immunol. 4, 525-532 (2003). 20. Y. Yu et al., J. Exp. Med. 209, 2467-2483 (2012). 21. M. D. Farber, M. Koshy, T. R. Kinney, J. Chronic Dis. 38, 495-505 (1985). 22. E. Soler et al., Genes Dev. 24, 277-289 (2010). ٠ 23. M. T. Kassouf et al., Genome Res. 20, 1064-1083 (2010). 24. D. J. Tumer, M. E. Hurles, Nat. Protoc. 4, 1771-1783 (2009). 25. J. Tyson, J. A. Armour, BMC Genomics. 13, 693-2164-13-693 (2012). 26. M. Leid et al., Gene Expr. Patterns. 4, 733-739 (2004). yo 27. M. S. Kowalczyk et al., Mol. Cell. 45, 447-458 (2012). 28. H. J. Lee, E. Kim, J. 5. Kim, Genome Res. 20, 81-89 (2010). 29. D. E. Bauer, S. C. Kamran, S. H. Orkin, Blood. 120, 2945-2953 (2012). 30. A. John et al., Development. 139, 1831-1841 (2012). ٠
SY AY
-١١١- 31. R. 0. Patwardhan et al., Nat. Biotechnol. 30, 265-270 (2012). 32. A. Melnikov et al., Nat. Biotechnol. 30, 271-277 (2012). 33. K. A. Frazer, S. S. Murray, N. J. Schork, E. J. Topol, Nat. Rev. Genet. 10, 241-251 (2009). 34. A. N. Koehler, Curr. Opin. Chem. Biol. 14, 331-340 (2010). 2 35. F. 0. Umov, E. J. Rebar, M. C. Holmes, H. 5. Zhang, P. D. Gregory,
Nat. Rev. Genet. 11, 636-646 (2010). 36. J. K. Joung, J. D. Sander, Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 14, 49-55 (2013). 37. J. van der Oost, Science. 339, 768-770 (2013). 38. Thanks to A. Woo, A. Cantor, M. Kowalczyk, S. Bums, J. Wright, J. Ye
Snow, J. Trowbridge and members of the Orkin laboratory, particularly C. Peng, P. Das, G. Guo, M.
E. Baena, for Kerenyi,
W. Pu the SF. Alt provided the pre-B cell line, A. He discussions. C. Guo pWHERE lacZ reporter Yo 1. Kutyavin sM. Nguyen technical assistance, D. Bates sconstruct, C. Currie expertise with sequence analysis, R. 39. J. Xu et al., Dev. Cell. 23, 796-811 (2012). 40. E. van den Akker, T. J. Satchwell, S. Pellegrin, G. Daniels, A. M. Toye, Yo
Haematologica. 95, 1594-1598 (2010). 04 AY
-١١- 41. A. .ا Bredemeyer et al., Nature. 442, 466-470 (2006). 42. R. E. Thurman et al., Nature. 489, 75-82 (2012). 43. G. Galameau et al., Nat. Genet. 42, 1049-1051 (2010). 44. 5. Purcell et al., Am. J. Hum. Genet. 81, 559-575 (2007). 45. M. ©. Wu et al., Am. J. Hum. Genet. 89, 82-93 (2011). ٠ 46. A. He, S. W. Kong, Q. Ma, W. T. Pu, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 108, 5632-5637 (2011). 47. M. A. McDevitt, Y. Fujiwara, R. A. Shivdasani, S. H. Orkin, Proc. Natl.
Acad. Sci. U. 5. A. 94, 7976-7981 (1997). 48. T. Cermak et al., Nucleic Acids Res. 39, e82 (2011). ٠ 49. J. C. Miller et al., Nat. Biotechnol. 29, 143-148 (2011). 50. R. Galanello et al., Blood. 114, 3935-3937 (2009). 51. H. T. Bae et al., Blood. 120, 1961-1962 (2012). 52. K. E. McGrath et al., Blood. 117, 4600-4608 (2011). 53. 0. Noordermeer, W. de Laat, IUBMB Life. 60, 824-833 (2008). ٠ 54. D. R. Higgs, D. Vemimmen, B. Wood, Adv. Genet. 61, 143-173 (2008). 55. E. Pinaud et al., Adv. Immunol. 110, 27-70 (2011). ل
١1 - و ١48 /// rs rs شرطى على لأا ارمق علا /خالك .حلا
DH
MAF مرقم 5 rs YY vag +, 00A oA ve dy A oo ال١ +
A AT 3 oY Ty Y¢ oy oive Ty rs ٠ 257 1٠ ا ا لال او ا أ + 7 2549 7 vv هه Ao Yo 1 rs +, Yo) vA ve Ye SYA XY, v4 +, 71 محقلا 1م +
A vy £) YA -١٠ V¢ 1 فاخا 1 rs
XY, Y¥ | ott تكد videa| + .رةه Ye 1 VY Ty
OY AN
-١؟- rs
Yot ال ا م +4) vou 7) vodag + 7 ادا اء-٠ YY 1 Ly A AA TY rs +, 140 oY A) ١ ال الت ره ٠ 71317 +
Y £) aA A 5-٠ yy Ad 4 TY rs +, TAA oY Xo, 1¢ +34 XY, Yo +, YA YY 174 7 yy 1-٠ Yo YAY Y ve to | OAT rs ٠ ا 0 دا +, Yo 0 vY + ¥1 oo ١٠7941 ١ دلا to A q¢ 24 +ده | لأك نظ rs +, 40. بي م Ye EE «Yo oo ١٠ عل ١ aA A yy ve AR 3 +ده | 7ه rs
Xq,11 A XY, AT 1 A Yi.) مواحاا 77١ (٠ a) YA YY | oo+
OY AY
-١ \ اج أو +50 من ,oA+ ,17+ SNPsmBCLIIA DHSs شائع (7) < MAF) تحليل ارتباط ,MAF .DNase | موقع مفرط الحساسية ل ,DHS متاح للتحليل. CSSCD فرد من ١١7 ترددد أليل ثاتوي. أو +ده oA+ 7+ 8601118 DHSs Jala SNPs :¥ الجدول ألليل 0
DH
MAF رئيس ألليل 5 نمط جيني H أحادي الشكل | + 5 م C| 7/7844 " البلوري | 7 ١قلدجكتم 0" + a ’ نعم T C TeViVood | ١ ان wy YYYovosy + 9 م تصميم تجربة معيب C TeVIVIEY | ١ wy YEAYYY YY أحادي الشكل | + 5 6 Al كلأكاخفاضح | ١ البلوري | 7 YAYYYYYo أحادي الشكل ١ * 5
Ty T Cl w.vivvia| ١ البلووري VAAY ف + rs ٠, أ" ٍ ,ب أنعم 6 Al حلأاكاحفاخح | ١ $0 YE90AYY
OV AY
-١١١-
Ye + نعم T G Te YYA LY Y ١ ١3 » ا 7 TY + rs ؟ لحخاصعي فد لم 3 تجربة ب تصميم تجربةه معيب ٠721772 + rs تجربة 3 T Al TovyAvY | Y ب تصميم تجربةه معيب
YAVYA) OA أحادي الشكل ١ i. A G| لمعا Y ل البلوري EYAOY + rs 11 ١ 3 A G| اماف ¥ nl جو ‘0 YAY) Lov) + rs aa 3 T C| لعي ¥ f= ay £9 ع + rs re ; T C| صما | ¥ nl جو 7 تكح + Y rs تحرية 2 T C T+ YYAcoo تصميم تجربةه معيب + ٠-4 9. + Y rs
Aaya 2 6 A T«YYAOT14 تصميم تجربةه معيب + 1١1١1110
SV AY
-١١- ل | أحادي الشكل م 6 ٠١4
SRR ay جوري 0/77 + rs ب تصميم تجربة معيب 1 C ادي فد )ار /الا 0/6 + rs د لأارفاخ ا 6 م + تصميم تجربة معيب ١1178 + rs لقص فدح 6 م ب تصميم تجربة معيب 01711٠٠ + rs ب تصميم تجربة معيب 1 C Te VYAVAY ١64 + rs ال اغا 6 م ب تصميم تجربة معيب 11171458 ل | أحادي الشكل ب C Al TYYAAWY اف البلوري + rs الغ اما 6 م ب تصميم تجربة معيب 1١1779361 + rs وي م م 6 ب تصميم تجربة معيب مسي ا
-١١- + rs م ب تصميم تجربة معيب T+ VYAAYT
YATAYY
0 + Y rs ; 71 G| متا AA fy ,م7 4 "0 re تصميم تجربة معيب C T Te YYYOAY oA مال أحادي الشكل ١ 7 ل 9 0 C G اده قفد لبلوري f YAoYo Nov + Y rs مه أنعم C 71 75
Yo TYY AYA + Y rs نعم oA A G لاني vt Wag + Y rs نمط جيني معيب oA C T اا 17 + rs د انعم C 71 777
A 7 أحادي الشكل ١ 7 Y rs oA T| اا البلوري 6477841 e] | | © ' } 1
OV AY
-١١- + v re تصميم تجربة معيب oA A G امفففح 176 xy + v re ; G| Al 77776١
YY هم ا 7 ل | أحادي الشكل الى Al 6 بص 4م البلوري + v re م 0 نعم 6 77721 "" ١819771 ل | أحادي الشكل ل اق ال evry 78م البلوري ل | أحادي الشكل ل Toc صصح البلوري ١175601
A 1 0 rd نعم 0 +71 7 vy 58 7 LAS أحادي الشكل | TF ل 0 71 ل6م )اي بم البلوري ,' + v re انعم |G A 77447 ¢ ١6م7 ار اد
-١ \ «= + ¥ I's تصميم تجربة معيب oo G T اسك فح
YAAEY Tey + ¥ I's تصميم تجربة معيب oo G A ١646 117/784 أحادي الشكل ١ 7 ل 9 oo C G عفد LY البلوري 1174 + I's تصميم تجربة معيب co C T IXRAL-ERAY 2594469١ + I's تصميم تجربة معيب oo G م ماي لصف كين + I's تصميم تجربة معيب oo A G قد عفد
YAAYo VO + ¥ I's تصميم تجربة معيب oo A C ره اعفد اما 84 أحادي الشكل ١ 7 ل 9 oo A C العف البلوري 17 أحادي الشكل ١ 7 Y rs oo G C ارح فد سبي البلوري YS
CAR
-١؟١- + Y re 1 نعم oo C G TaYYo ام vo YI Y + Y re تصميم تجربة معيب oo T C ٠١04 ٠ ل | أحادي الشكل os Tl G| ٠ 4 البلوري 15118751 أحادي الشكل | TF ل os C 7 .vvevyy البلوري ١١74831 + Y re نمط جيني معيب oo A G ١4 18119971 ٠٠٠١ أو ADSNP Ly أو +00 وتوجد في oA+ 17+ 801118 DHSS ضمن aii SNPS
Lis المنمط SNPS و//ا85. تم تعريف CEU YRI ليانات جينومية للمجموعات المرجعية الإحداثيات الجينومية 9او. .CSSCD ضمن MAF [تسجيل Sanger متوالية shal الجدول 17 المرقمات الإضافية التي تم العثور عليها بواسطة إعادة ألليمل | أليمل CH
MAF نمط جينى | DHS ' أتانوي | POS| R قم ٠ 0 * هه *٠ أ" ٠ 7 ١ ما Y 5 م + 17 نعم T
AS ١ اد oN AY
—\YY-
Af S$ ار تصميم اختبار فاشل A
Af S$
T+V¥YYY 0
Cont م +56 انعم G . VY) oA
Yi بره 7 55 مقف Cea نعم T c د VY) oA
Ao « بره 7 55 مقف تصميم ل" T 0 7 اختبار فاشل A \
Af S$ 7671ل" Co انعم 55+ T G VY) oA 0 ١
S$ اف Ce انعم 00% A 0 : 7 7 ١
Banger الأقصى إلى إعادة إجراء متوالية HOF مع النوع النظير CSSCD فرداً من AA [
AR
١ 73- اث 01155 داخل .BCL11A المرقمات المبتكرة المحددة المدرجة. تم تعريف SNPs المنمطة MAF, Lud ضمن CSSCD المسجل. الإحداثيات الجينومية hgl9 الجدول 4 . التحليلات الشرطية لأربع سنتينيل SNPs rs rs rs rs Ae LAVIYAY[ YYAATATA 71177 ١٠7/١ M| Mar
AF | ker rs ٠ ٠ اام 2 Y, YA ٠ ,. الاب ٠ تيا Y¢ VEY “> ا -١ “> ا -١ 41 -١ >“ -١ Ye ١ 1 1 Ya a 0] 6 1 1 rs ty ty Y, EA *, *, و و ٠, -١ ov Yv 71 7 34 م -١ a] ory ve| af of gry 1 اه NA | حلا rs لا ٠ ٠ الح ٠ ٠ ,. Yo ATA .25 ا -١ م YY \Y +, YA ١١ 951١ AR a Af TA اح . Y Al 3 3
-4؟١- rs ٠ -| ev] | + | fv 0 ٠, -١ ov Yv 73 5 1 لبا o—\. 1 NA NA ١ +o Y¢ 1 3 7 التحليلات الشرطية لأربع سنتينيل SNPs شائعة المرتبطة سابقاً بمستويات HPF (44: 17170 37 210)). تمت تحديد النمط الجيني لجميع الأربعة في YYA فرداً من 05500. تعذر حساب © ل 18766432 عند الشرط على 184671393 (والعكس) لأن هذاين المرقمين مرتبطين بقوة (2 - AEA - 2 .) ٠,157 بين 151427407 و15766432: Ved - ١2 ,+ بين © 51427407 5 1886868 ا5: AS - ١2 ,+ بين 51427407 و54671393: 2 - الخلا بين +,YoA - 2 ;rsl 1886868 5 rs766432 بين 1886868 |5 5 Jsaall.rsd671393 © تحليل الصورة المتغيرة نادرة ومنخفضة التردد rs le ays شرطي rs le rsYEYVeayY YEYYEWY 17 حل SY AY
اج \ \ — ينتج عن تحليل الصورة المتغيرة نادرة ومنخفضة التردد (MAF > 75). تم إجراء التحليل باستخدام خوارزم SKAT-O بناءً على المجموعة باستخدام ,١7+ DHSs 0A ,+00 الفردي كثلاث مجموعات مختلفة. الصف الأدنى "الكل" يعرض نتائج الاختبارات عند طي ثلاث مناطق معاً. الجدول :١ متوالية PCR للتتميط الفردي لدمج المستحلب تحليل PCR النوع الفردي 157569946-51427407 لدمج المستحلب. تم الزيجوت المتغاير ل 187569946 و51427407, وتوليد أمبليكون دمج يضم كل من a3. SNPs استتساخ أمبليكون الدمج, وتم إجراء متوالية Sanger للتسائل الفردية . تم إدراج عدد من النسائل لكل نوع جيني. تم حساب نسبة الاحتمالية ل G-G/A-T مقارنة بالطور 6-1/8-6. الجدول 7: إحداثيات شظايا تجارب المرسل Distance from BCL11A TSS (kb) 9019, 2
الطول (bp) انهاية a مرسل | الاسم بداية نهاية ١١ ARERR 16064 Ta dYYACHY ١ بضصت - ٠ 7 q 1¢,¢| LacZ
YTAD 1 16064 ٠١ YYYAY ١ بضصت -2 7 ٠ a 1¢,¢ 21٠ SAFRAN 57241 Te VYACTH ٠ 4 - 6
Y Y oY,1 اأقف لي ييل Tvvay ITA ARTA BR YTA ARTA) 67+ 1 1
Yee OY oYovo SAIYY بره فى كاكلا أي مب ا
A 1 ١٠ 575١ 77 TeeVYTYA[ TeeYY ad 5354 7 ا ٠٠ ١ أ١تالاغعت | Teethers ١٠١6+ ١ v Y 1 GFP ٠م Yoo 64 ١٠١74 TaeAV EAA] ٠١كم ١٠51+ 3 7 a 1 ١ ٠١١م ١١ ٠١ غات ١ حف ا اكت YoY+ 1 A 7 2 اأقف لي ييل Tvvay ITA ARTA BR YTA ARTA) 67+ 1 1
—\YV-
Yer ovivoe 545471 TecYYYd0 بره اكد مل ا
A Y
Yea) 17 oo(AoY TeeVYTtV TeYY EVA 5354 ١ ٠ ٠١4 74 ٠مم و لا او لي 3 2 6١+
Yer بئات ني مح عات أي 771 رض q Y 7+ أخن ك٠ لس ”نت الى |= - ا 1 مي متق ١ A 1- yay - - ١ الى ١ دم ١ دض الى 5,577 | 57 1 35 oy-— المعزز المفترضة المستتسخة في تجارب ناقل المعزز. إحداثيات الكرموسوم ؟ Was إحداثيات .80111/8 TSS وكذلك بالإشارة إلى hgl9 المردجة في متواليات قليل النيوكليوتيد A الجدول الاسم المتوالية التجربة 1 نحنف لاعام AAAGAGCTGTCCGAAGTCCA 0082118-53 -+ 1 نحنف لاعام GGGCACTTCCTAGTCCCTCT 0082118-35 -4 1 طحنفى لاعام 04 TTTGAGCAGGAGGGAATTTG mBcllla—dell-F © 1 وام 04 طحنف لاعام 61661 00016١6611 mBcellla—-dell-R
AR
—\YA-
TALENGWPCR GCAAGGCAGGTACCAAACAT mBcllla-del2-F
TALENGWPCR TAGAGATTCCAGGCCCCTTT mBcllla—-del2-R
TALENGWPCR AGCAAGGAAAGGTGAAGCAG mBcll1a-3'-F
TALENGWPCR CCCAATGTCTTCCGAACTGT mBcllla-3'-R
TALENGWPCR AGGCTGGTCTTGGGATTTTT mBcllla- © upstreamTALEN-F
TALENGAWPCR GCCTTTAACAAGGGTGTCCA mBcllla- downstreamTALEN-R CATAGACCTGGGTCCTGGAA mBcl11a-5'probe-F مسبار '٠ للطغخة ٠ ويسترن TTGCAGAGTGACTCCTGTGG mBcl11a-5'probe-R مسبار '٠ للطغخة ويسترن lacZ Ju ye استتساخ CCAGCCATACCCAAAACAAA hBCL11A-52.0-F lacZ Ju ye استتساخ CTTTCCCTCTTGCCACTCAG hBCL11A-64.4-R lacZ Ju ye استتساخ GGCAGAGAAGGCACAGTGA hBCL11A-56.8-F ١٠ lacZ Ju ye استتساخ GGCTGTCCTGGCATGTAAGT hBCL11A-57.6-R GFP ااستتساخ مرسل 202 AACAGACCCATGTGCTAGGC hBCL11A-63.4-F GFP Ju je /02ااستتساخ TGTGTGGACTGCCTTTTCTG hBCL11A-61.6-R lacZ Ju je اسنتساخ GGGAAAAGGGAGAGGAAAAA hBCL11A-58.6-F lacZ Ju ye استتساخ CTCAGAAAAATGACAGCACCA hBCL11A-57.6-R 0 ٠ oY AY
-١؟4- lacZ Jui ye استتساخ GGACTCAGTGGCCTCTTTTG hBCL11A-55.7-F lacZ Ju ye استتساخ GAAGATAATGGCAGCCCAGA hBCL11A-54.4-R
GFP Jue استتساخ TGTGTGGCCAACCTGTAAAA hBCL11A-164.2-F
GFPJuy اسنتساخ CTCGCTCTGTTTCCCAGTTC hBCL11A-162.6-R
GFPJuje استتساخ CTCTCCGACGACCTCTTTTG hBCL11A-157.1-F ه GFP Ju # Lil GTAGGGAAGGGGCTACTTGG hBCL11A-155.6-R
GFP اسمتتساخ مرسل AGAGCCAAACTCCGTCTCAA hBCL11A-154.1-F
GFP Ju اسنتساخ AAATACCACAGCCCAACAGC hBCL11A-152.5-R 61 اسنتساخ مرسل GAACAGAGACCACTACTGGCAAT hBCL11A-59.4-F
GFP Jue استتساخ 66666/86666111 68116 0680111-57. 7-4 ٠ استتساخ مرسل61© CTTCCACTGGATGGCACTTT hBCL11A-55.9-F
GFP Jue lus) ACTTCAGCCTCCAGCACTGT hBCL11A-54.2-R
GFP Jue استتساخ CCTCCCAGCAATGTAGGTGT hBCL11A-41.6-F
GFP Jue استتساخ TGGTGTGGTCCACTGTGACT hBCL11A-40.5-R ©] اسمتتساخ مرسل GCAAGCTTAGCCCCTTCTTT hBCL11A-32.6-F ١٠
GFP استتساخ مرسل TGAGGCAGAGTCAGATGTGG hBCL11A-31.6-R
GFP Jui استتساخ CCCCGCTCAGAGTAAGTGAG hBCL11A-n45.8-F
GFP Ju اسنتساخ GGAAACTGCCTATCCCATGA hBCL11A-n47.0-R
GFP Jue استتساخ CAACACCCCGATTTCAGACT hBCL11A-n51.0-F
OVA
يدا GAATGGTCCCGATCTCTTGA hBCL11A-n52.9-R استتساخ مرسل ]© RT-gPCR (Gapdh) TGGTGAAGGTCGGTGTGAAC mGapdh-RT-F RT-gPCR CCATGTAGTTGAGGTCAATGAAGG mGapdh-RT-R (Gapdh) ه RT-gPCR AACCCCAGCACTTAAGCAAA mBcl11a-RT-ele2-F (Bcllla exon-1/2)
RT-gPCR ACAGGTGAGAAGGTCGTGGT mBcl11a-RT-ele2-R (Bcllla exon-1/2)
RT-gPCR GCCCCAAACAGGAACACATA mBcll11a-RT-e2e3-F (Bcl 11a exon-2/3) Yo
RT-gPCR GGGGCATATTCTGCACTCAT mBcl11a-RT-e2e3-R (Bcllla exon-2/3)
RT-gPCR ATGCGAGCTGTGCAACTATG mBcll11a-RT-ed4e4-F (Bcl 11a exon-4/4, xLisoform)
RT-gPCR GTAAACGTCCTTCCCCACCT mBcll11a-RT-e4e4-R ١٠٠ (Bcl 11a exon-4/4, xLisoform)
RT-gPCR CAGCTCAAAAGAGGGCAGAC mBcll11a-RT-e4e5-F (Bcl 11a exon-4/5, Lisoform)
RT-gPCR GAGCTTCCATCCGAAAACTG mBcll11a-RT-e4e5-R Y. (Bcl 11a exon-4/5, Lisoform)
RT-gPCR (eY)TGGCCTGTGGAGTAAGGTCAA mHbby-RT-F 04 AY
—V ry -
RT-qPCR (eY) GAAGCAGAGGACAAGTTCCCA mHbby-RT-R
RT-qPCR (bH1) TGGACAACCTCAAGGAGACC mHbb-bh1-RT-F
RT-qPCR (bH1) ACCTCTGGGGTGAATTCCTT mHbb-bh1-RT-R
RT-qPCR (b1/b2) TTTAACGATGGCCTGAATCACTT mHbb-b1-RT-F
RT-qPCR (b1/b2) CAGCACAATCACGATCATATTGC mHbb-b1-RT-R ©
RT-gqPCR (lacZ) GCCAACATTGAGACACATGG lacZ-RT-F
RT-gPCR (lacZ) TGTCTCTCTGCACCATCCTG lacZ-RT-R
PCR genotyping (lacZ) TTCAATGCTGTCAGGTGCTC lacZ-F
PCR genotyping (lacZ) GCCATGTGTCTCAATGTTGG lacZ-R دمج النمط الفردي 04+ GTCTGCCCTCTTTTGAGCTG rs7569946-F ٠ الفردي ball PCR GACTCCAGACAATCGCCTTT rs7569946-R الرابطة , , AAAGGCGATTGTCTGGAGTCAACCTT rs7569946-R-rc— , haplotyping fusion y.all
PCR CTTAGCACCCACAAAC rs1427407-F النمط «PCR CATGTTACTGCAACTTGCTTTTT rs1427407-R ١٠ الفردي bail) "دمج AGATCCCTCCGTCCAGCTC rs7569946-nested-F الفردي z=sTGAAAGTTCAAGTAGATATCAGAAGG PCR rs1427407-nested-R النمط الفردي - ٠٠
AGCAAACCACACAGACTGAAGA 3C-hBCL11A-150.6-F oY AY
-١»7-
CCAGAGCCATTTACGTCACA 3C-hBCL11A-140.9-F 3C CAGAAGGGAATAAGGTACTCTGGA 3C-hBCL11A-114.1-F 30 GTTTGGGCCTCAAGGTCTTT 3C-hBCL11A-111.5-F 30 GAGGTTGGGAGTAAGCATTCTG 3C-hBCL11A-109.1-F 3C ACGCATCAGAATGCCCATAG 3C-hBCL11A-100.7-F ه٠ 3C TTTTGAAAGAAAACGCTGACA 3C-hBCL11A-92.3-F 30 TTCCAGCTGGTTAAATTTAGGG 3C-hBCL11A-80.2-F 3CAGAAGGGGCCAGAAGAACAG 3C-hBCL11A-T717.2-F 30 CCTTCTTTTTICTTTCTTGGTTGC 3C-hBCL11A-72.5-F 3C CCCTGCGTGCCATTAAAATA 3C-hBCL11A-66.8-F ٠ 3C AAAGGCCTTGGGAAGAAAGA 3C-hBCL11A-61.2-F 3C GCAAGTCAGTTGGGAACACA 3C-hBCL11A-59.1-F 3C GGACTCAGTGGCCTCTTTTG 3C-hBCL11A-57.1-F 3C CTGTCTCTGTCTCCCCCAAG 3C-hBCL11A-52.2-F 3CCCAATGCTCCTGTAACAAAGG 3C-hBCL11A-47-F ١ 3CAATGCAGTAGGCAAAGAAGCA 3C-hBCL11A-43.5-F 3C GAAATTTGGAAGGCCACAGA 3C-hBCL11A-38.6-F 30 GCTTGCAACAATTAAAAGATGG 3C-hBCL11A-29.3-F 3C GGTGACAAGGGAGAACCACT 3C-hBCL11A-27.1-F
OVA
-١؟-
TGATTTCCTTGCAGCCTTTT 3C-hBCL11A-20.9-F 3C CACACCCACAGCAACAAATG 3C-hBCL11A-8.6-F 3C TGCAGAGATCCCCCAAAGTA 3C-hBCL11Apromoter-R 3C CTCAGGGAGCAAGGGAAATA 3C-hBCL11A-n8.3-F 3C CCCTCCCAACAGGGATTTAT 3C-hBCL11A-n12.6-F ه 3C CAAAATTGAACACCTATGGTCTGA 3C-hBCL11A-n19.5-F 3C AGGAAGACTTTGGCCTCCAT 3C-hBCL11A-n29.8-F 3C-hBCL11A-n34.6-F TTCCAAACAATTATACACCAACAAA 3C 3C TTTCATGGGGAATAGCCAAC 3C-hBCL11A-n54-F 3C CCCTACTTGTTATTTGCTTCTGC 3C-hBCL11A-n78.2-F ٠ 30 3C-hBCL11A-n104.4-F AGCTGAAGTTTCAGGGACCA 3C CCACACCTGCCTTCCTTAGA 3C-LCR-HS1-F 3C TGCATATGATGGGGTAGCAG 3C-LCR-HS3-F
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-68.7-F AAGAGAAGGGGGAATTTGGA
ChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-68.7-R TGGTGATAAGGGCAGGAAAC ٠١
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-65.5-F AGGAAGCTGCAGAAAGGTGA
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-65.5-R TGCTTCCCCAGGTTTAGATG
ChlP-gPCR ChIP-hBCL11A-64.7-F CCACTGCTACCCAAAACGAT
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-64.7-R CAAGAGCGAAACTCCACCTC ه١
-١»6- 010-004 ChIP-hBCL11A-63.9-F ACTGTGTGCCAAGTGACCAG
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-63.9-R CAGCTTCCTTCAGGTGCTTC
ChIP-gPCR CATGCTGCCTTTGTCTTCTG ChIP-hBCL11A-63.1-F
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-63.1-R TGTGGAGCTCTGGAATGATG
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-63.0-F GAGCTCCACAATCCAACTCC ©
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-63.0-R CCAGGAAGGAAATGAGAACG
ChlP-gPCR ChIP-hBCL11A-62.5-F ACCCACAAACATTTCCCTTCT
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-62.5-R TTTGCTCTTCTCCAGGGTGT
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-62.4-F TTTAAACAGCCACCCCACAC
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-62.4-R ACCACGTAGTTGGGCTTCAC ٠٠
ChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-62.2-F TTTCAACCATGGTCATCTGC
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-62.2-R CCCTCTGGCATCAAAATGAG
ChlP-gPCR ChIP-hBCL11A-61.8-F GAACCTGGGAGGCAGAAGAT
ChlP-gPCR ChIP-hBCL11A-61.8-R TTTTTGGTGAGACGGAGATTT
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-61.7-F CCGGGCAACAAGAGTAAATC ١
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-61.7-R ATGCCTAGGGTGTTTTGACG
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-61.5-F CTCCGTGTTGAGAGCCAAGT
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-61.5-R TGTGTGGACTGCCTTTTCTG
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-61.3-F CAGAAAAGGCAGTCCACACA
OVA
—\yo-
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-61.3-R CCTCTCCAGATTCCCTCTCA
ChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-61.0-F AGCGAGACCCTGTCTCAAAA
ChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-61.0-R TCCAGCAGGCTTCAAAAAGT
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-60.8-F GGTGGATAACCCCATCTCAG
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-60.8-R GGAAATGAGAATGCCCTITG ©
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-60.5-F CAGTCTAGAAAGCCCCCTCA
ChlP-gPCR ChIP-hBCL11A-60.5-R GTGGGGGTTCAGTGGTTAGA
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-60.3-F TCCATGGTGTGGAGTGTGTT
ChlP-gPCR ChIP-hBCL11A-60.3-R ACCCACATGGCAACCAATAG
ChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-60.0-F CCATTCCCTGGAGAGTTCAA ٠
ChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-60.0-R GGGGTCTCTTCCCATCATTT
ChlP-gPCR ChIP-hBCL11A-59.9-F ATGGGAAGAGACCCCAAAAC
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-59.9-R GGACTCCGAACACCACACTT
ChlP-gPCR ChIP-hBCL11A-59.5-F GGGATCAGAGGTGAACAGGA
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-59.5-R TTTAATCAGCTTCCGCCACT ٠٠
ChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-59.0-F TGGGGAGAGAAGAGTGGAAA
ChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-59.0-R TTGCCAATTGGAGATTAGGG
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-58.7-F TGCTCCGAGCTTGTGAACTA
ChlP-gPCR ChIP-hBCL11A-58.7-R GGGAAAGGGCCTGATAACTT
OVA
-؟١-
ChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-58.3-F GAGAGTGCAGACAGGGGAAG
ChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-58.3-R CCTCTTTCGGAAGGCTCTCT
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-58.0-F TGGACTTTGCACTGGAATCA
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-58.0-R GATGGCTGAAAAGCGATACA
ChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-57.3-F GGGGAGATGATTGAAAGCAA ه ChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-57.3-R AGAACTTTCCCGGTTCTGGT
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-57.0-F GCTCTGGACACACAGCAAAA
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-57.0-R TCAAATCCTTGCCTTGAACC
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-56.6-F CCTCAAATCTCCCTCACTGG
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-56.6-R GGGAAATGGGTCCTGCTTTA ٠
ChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-56.3-F AGGGAGTACACCGCAGACAC
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-56.3-R AAGGAAGGCTGCAAGGAAAT
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-55.9-F GACTTAAACTGCCGCTCCTG
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-55.9-R TGACTGGTAAGAGCCGATTG
ChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-55.3-F GCTGGGGTGAGTCAAAAGTC ١٠
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-55.3-R GGTCACCTTAAGGAGCCACA
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-54.8-F GCACCTGCATTTGTTTTTCA
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-54.8-R GGGTCAGATCACCTCTGCTC
ChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-54.4-F AGGCATCCAAAGGGAAGAAT ه١
١ لا 010-004 ChIP-hBCL11A-54.4-R GAAGATAATGGCAGCCCAGA
ChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-54.0-F TGGGAAAGGTTGCACATTCT
ChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-54.0-R GGGCCTCAGGCTCTTTATCT
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-53.4-F CCACTGCCAGGCTGTTTACT
ChIP-gPCR ChIP-hBCL11A-53.4-R GACCGAAAGGAGGAGAGGAG ©
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-53.1-F CAGTTCCCCCATTATGCACT
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-53.1-R CCCTTCTCTGAAGGCACATC
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-52.7-F TTCAAGCCTTGGTGGATAGG
ChlP-gPCR ChIP-hBCL11A-52.7-R GCCAGGAAATTGGTGGTAGA
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-52.3-F TGCCCACATGAGACATCTTT ٠
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-52.3-R AAATTGGCTGCCATTGAATC
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-51.3-F CCACCAGAAGTCCTGGAAAA
ChlP-gPCR ChIP-hBCL11A-51.3-R TTGGAGGGACCTGATCTCTG
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-50.2-F CCAAGATGGAGAAGCCACAT
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-50.2-R TCTGTCTTGGGTCTCCTGGT ٠
ChlP-gPCR ChIP-hBCL11A-49.8-F GAGAAGCCCTCAGCAAACAC
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-49.8-R GGTTGCATCTTGGCTCCTAA
ChlP-gPCR ChIP-hBCL11A-49.5-F GAAATGCAGGAAAGGAACGA
ChlIP-gPCR ChIP-hBCL11A-49.5-R TCTAGCAGATGGGGTTTTGG
OVA
—\YA-
ChIP-gPCRAGTCTGGGCAACAAAGTGAGA ChIP-hOct4-prom-F
ChIP-qPCR AGAAACTGAGGAGAAGGATG ChIP-hOct4-prom-R
ChIP-gPCRATAGACCATGAGTAGAGGGCAGAC ChIP-hHS3-F
ChIP-gPCR TGATCCTGAAAACATAGGAGTCAA ChIP-hHS3-R
ChIP-gPCR CAGATAACTGGGCCAACCAT ChIP-hHS-40-F ه ChIP-gPCR ATTCACCCCTTTCCCTTGTC ChIP-hHS-40-R
ChIP-gPCR CGTAGCTCAGGCCTCAAGAC ChIP-hGAPDH-F
ChIP- CGAACAGGAGGAGCAGAGAG ChIP-hGAPDH-R qPCR aad) قليل النيوكليوتيد المستخدم في التجارب ٠
OY AY
Claims (1)
- -١84- عناصر الحماية BCLIIA تشتمل على تعبير منتخفض عن progenitor cell طريقة لإنتاج خلية أولية .١ isolated progenitor أو بروتين, تشتمل الطريقة على تلامس خلية أولية معزولة mRNA للخلية على الكرموسوم genomic الجينومي DNA مع عامل يربط حمض cell UCSC (طبقاً لتجميعة TYY LVYYA كتخمنصا, VY Te الموقع ١ chromosome عليه خفض ly (human genome البشرية الجينومية Genome Browser hg 19 © .BCL11A أو بروتين عن MRNA تعبير معزولة genetic engineered human cell طريقة لإنتاج خلية بشرية مهندسة وراثياً LY واحد على الأقل تشتمل على genetic modification تشتمل على تعديل جيني isolated مع كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على 15018180 cell تلامس خلية معزولة Vo أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير من DNA يستهدف حمض endonuclease إندونيوكلياز والتي بواسطتها يستهدف إندونيوكلياز DNA يستهدف حمض endonuclease إندونيوكلياز للخلية على genomic الجينومي DNA ويشطر حمض DNA حمض endonuclease ويتسبب في تعديل 1١7 ,7748 ,1 14 VAT Te ؟ الموقع chromosome الكرموسوم واحد على الأقل فيه. genetic modification جيني 5 isolated progenitor أو ؟, حيث الخلية الأولية المعزولة ١ الطريقة وفقاً لعنصر الحماية LY تكون خلية أولية لتكوين الدم. isolated cell أو الخلية المعزولة cell الطريقة وفقاً لعنصر الحماية 3, حيث الخلية الأولية لتكوين الدم تكون خلية لسلالة إريثرويد LEY . erythroid lineage isolated progenitor أو ؟, حيث الخلية الأولية المعزولة ١ الطريقة وفقاً لعنصر الحماية Lo مستحثة متعددة القدرات. Stem cell تكون خلية جذعية isolated cell أو الخلية المعزولة cell oY AY-.؟١-7. الطريقة وفقاً لعنصر الحماية 7, حيث يتم تلامس الخلية الأصلية لتكون الدم خارج الجسم الحي أو في المعمل. Ly الطريقة وفقاً لعنصر الحماية ١ أو 7, حيث يكون التعديل الجيني genetic modification oo الواحد على الأقل حذف. LA الطريقة وفقاً لعنصر الحماية 7, حيث يتخلص الحذف من المنطقة بالكامل بين الكرموسوم chromosome ؟ الموقع VY 14-:1, 74ل7, 117 أو يتخلص من sda من المنطقة التي ينتج عنها مقاطعة واحد أو أكثر من المواقع مفرطة الحساسية ل .(DNAse 1 (DHS ye4. خلية بشرية مهندسة genetic engineered human cell Lil), معزولة isolated تشتمل على تعديل جيني genetic modification واحد على الأقل على الكرموسوم ١ chromosome الموقع د الا تفاضا خالا 17 يتم الحصول عليها alg الطريقة وفقاً لعناصر الحماية 8-7. Vo Aug) تشتمل على خلايا بشرية مهندسة وراثياً معزولة وفقاً لعنصر الحماية 4..١ طريقة لزيادة مستويات الهيموجلوبين hemoglobin الجنيني في خلية, تشتمل الطريقة على خطوات: تلامس خلية معزولة isolated cell مع كمية فعالة من تركيبة تشتمل على الأقل على ٠ إندونيوكلياز endonuclease يستهدف حمض DNA أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير من إندونيوكلياز endonuclease يستهدف حمض DNA والتي بواسطتها يستهدف إندونيوكلياز endonuclease حمض DNA ويشطر حمض DNA الجينومي genomic للخلية على الكرموسوم chromosome ؟ الموقع ١١7 ,7748 ,1 14 VAT Te ويتسبب في تعديل جيني genetic modification واحد على الأقل فيه, والتي بواسطتها يزيد التعبير عن Yo الهيموجلوبين hemoglobin الجنيني في الخلية المذكورة, أو سليفتها, بالنسبة إلى الخلية المذكورة قبل التلامس المذكور. oY AY-١؟- VY الطريقة وفقاً لعنصر الحماية ,١١ حيث الخلية المعزولة cell 15018180 تكون خلية أولية progenitor cell لتكوين الدم. NY الطريقة وفقاً لعنصر الحماية VY حيث الخلية الأصلية progenitor cell لتكون الدم hematopoietic © تكون خلية لسلالة erythroid lineage ai) .4. الطريقة وفقاً لعنصر الحماية ,١١ حيث الخلية المعزولة isolated cell تكون خلية جذعية stem cell مستحثة متعددة القدرات . No ٠ الطريقة وفقاً لعنصر الحماية VY حيث يتم تلامس الخلية الأصلية progenitor cell لتكون الدم خارج الجسم الحي أو في المعمل. . الطريقة وفقاً لأي من عناصر الحماية ,١5-١١ حيث يكون التعديل الجيني genetic modification الواحد على الأقل حذف. Vo حيث يتخلص الحذف من المنطقة بالكامل بين الكرموسوم ,١١ الطريقة وفقاً لعنصر الحماية YY الموقع 10, 15لا, 1-144 74لا, 117 أو من جزء من المنطقة مما Y chromosome .(DNAse 1 (DHS ينتج عنه مقاطعة واحد أو أكثر من المواقع مفرطة الحساسية ل NA Yo تركيبة تشتمل على خلية أولية بشرية معدلة وراثياً تستخدم في صناعة دواء لزيادة مستويات الهيموجلوبين hemoglobin الجنيني في ثديي في حاجة إليه, حيث يشتمل التعديل الجيني لخلية أولية بشرية على خطوات تلامس خلية أولية معزولة isolated progenitor cell مكونة للدم المذكور مع كمية Aled من تركيبة تشتمل على الأقل على إندونيوكلياز endonuclease يستهدف حمض نووري Deoxyribo Nucleic acid (DNA) أو ناقل تعبير يحمل متوالية التشفير Deoxyribo Nucleic acid يستهدف حمض نووي endonuclease .من إندونيوكلياز Yo Deoxyribo حمض نووي endonuclease والتي بواسطتها يستهدف إندونيوكلياز (DNA) oY AYNucleic acid (DNA) ويشطر الحمض النووي Deoxyribo Nucleic acid (DNA) الجينومي genomic للخلية على الكرموسوم chromosome ؟ المرقع ,٠١ الا Cem A 778, 117 ويتسبب في تعديل جيني genetic modification واحد على الأقل فيه, والتي بواسطتها يزيد التعبير عن الهيموجلوبين hemoglobin الجنيني في الخلية المذكورة, أو سليفتها , © بالنسبة إلى الخلية المذكورة قبل التلامس المذكور.4 . خلية بشرية مهندسة genetic engineered human cell Lil), معزولة isolated وفقاً لعنصر الحماية 9 أو تركيبة وفقاً لعنصر الحماية ٠١ تستخدم في صناعة دواء لزيادة مستويات الهيموجلوبين hemoglobin الجنيني في ثديي في حاجة إليه. oY AY1 ا Fail TSE يح + اج 1: شهة بالكريات الجفراع Agia 5 Hi er 2 A Edn, ORR Na 0 fe 1B ANNE RY ا وام حلا BRR a # قا انب ل ah الا 2 mg رز 3 i NRE 5 وح مجح مجح RES, RNR 1 : taal TLE « معد بعيد و SSN BA ا ال ا DIRT. SS Toa Tae I ER ل ا Wg] BE ol A ا ا ا ا ا ا I ; RE a OS CE Da ad الوك 86 ا ال ا ا ل ا م : ا الا Oh wv حي رتو بن دعو ااا «« 8 CEES esate RSE IR RR A Rio بين الجينات: دي dab SR Ay sR M RE TR SRY Ww ف اخ » ky a. SRR SER vd RSA SRN RR Sanna NRE oy 3 ضاي لاقي لني ا بت لما ايت لح اح ل ا ا PER Shae 3 Shia #* معز تريب ا : SRR : عا بعد ا Mk § A i i, a RRR ا aR SRE HEH NE Ny ar Ss K SERA ER قوق لدج اجو اي 1 ال يا ال لات ا 5 = fet] 3 RRC An or DIRE eels HR OT RS i NEE خم aa 58 عرو NW اح ل ا ا eh eS ا RR # ® FUTR ال 1. Neh SO - نت A بيد الجينات يا الاي بحت :7 . ا 0 0 ات خا وا لا Fu 2 1 Sk ; OY AY vod . oreo AAS : Ca : Ta 8 ro BARAT : Py & ps 2 الاي ا & 8 لسية شيهة بالكريات الصراء مم 1 ا ل ا ليو ا ل ا ا ل SN بالكريات الخبراع سس AS د" 85 لسجة غير 8 ا wie al & RR PARE ظاهري : fe " 3 م وق 5 i Pe ; & ey > Re 1 hi Cai ا ١ a ai ”تي عشرائي ...م SNPS & A : " SF FF ممت ّ ٍ & F og & مر و : F apd ل 7,7 8 ض إٍْ & # Me A 1 & wept & A, ل ل حي ny hi} ’ 1 & K حيتت ل > A 8 & es 1 الل ا 5 8 8 oF ao 0 & & 2 | & 4 A ص te F & ا م : مت i & Fi SR 1 Ca > SRC i oF &F d : اع إ & oF re > & ase oF # Sa oF ا ين ا ا FB ا َ “التي ال ا ا : ral 5 i. " ا Sa الل ا م الا السب Leet fret RRR § 3 8 h! Ea Yan واوا 8 ا TE 0 Ey FES المسافة إلى تحن شبية بالكريات التمراء (ny Tt 3 شكل اب AR_ \ ¢ اج شكل ؟) 11 wn rn nm hn sn cnn rn = XE ot bn ono sm on i em drs Sn قا تارك يل oa NE Eh لاعت ا يل « حا اك #* kn بام عا بد يلات ادك JR يما ما ايت كاتف ملام تال لهالل جالع لأالعا لتقا ع اهما لعا ل SUF باع لل ملأب SRA حد ١ ماب لأا لايل ات لد يأل ب سألا ب ليا م لماي SPI حاب اسان اك امات 75 اهلا عد انتب سه حا سه سهدت انها سه * ب =e} em en ye om ch lw pe RefSeq Ske WERT 1 BCLTIA موصعم | oo ne سنا & pI NN 8 لع لد مق den sas fn ahs JO RRC 8 § Fa يا JETER 8 [REDEEMER SNE SS | I. H3Kdmes i OU HiKdmel © TRE } Poo 1 i £0 § oa هذ d 1 1 sins J TPR CIEE C1 INR CR PPR FTG | TR § er 1 ET م 8 8 88 : H3K2Tas 154 ) 8 اماع ا AS ST NITY TT wo v1: WF م pot Ul Cy. ل" $a Frm aii, RTE EE WR 8 لأا نات اه لساك بم شاد ماقا JURE HE RN ST CRO cata Ml i} & Free SRG: + J SET: SOS TC UR: NU: | J Tay 7 § : ba 8 ا ee ee i | ا spd Sie Shy جو وززق نيه |] i 0 : i 1 ا ا 0 0 للمخ DNase 0 file NE pce JU PU SI WR. SOUL UII CCI DUS SPRUUT SRE SEN ein: maida Rann or, Lode. Amada: an or WE ara لت نت ل تا Ta naam [RE] 1 5- did Gad DNase | 1 : 8 ف ماقي SN SE: SU SU OU SOP SSR Roa T- هفولا لحلية لنفاوية 0 حل لا لحاس عم md rn عله eam mm بحا ملم لو وج عا ام bmn me ae ب اسم بع اسع عي اج Eat جد عت en ليا بق يفا edn الع mn جيه deme با يدر ليام a عي الي بعلم الح ايع .يلما ae خم الاقف ديم يجي ملفا مل cman لم ايحا van HbF ب du SNPs. 3 ] ! + +! 113 : {1 FREI £515 I SN ؛ i i حاون SNPs 01 ١ ١ شكل ؟*ب fh SL a 7 : و تدج 3 4 0 = Ty li t : i 1 i 8 : : £1 i FE WA bes ° i : wy HEA 4 0 ا 1 ; IE SA 04 1 8 0 2 إٍْ; . SHE NE و yo a. : k IE od FE ب H 2 a TE I ed i ; Ng IEEE SE لا ! ; ; لوا 0 0 انم 0 0 i ; A { | bo نوم اليد 3 EOE 3 3 eH ل i 1 i 0 0 1 1 م ا 1 i! i Sp SESE ho - NN - تحط By sf يديرت تعس 3 ; 0 1 8 i 1 i : i HIRE, 3 3 + جيم 0 اسع 0 اسم : I A : 2 بي Pr رم : hy : { Pod TE 4 4 * لال لأسا ا لس ايسا ٍْ 0 لجن Ser دما Yer لهو tes Be + Bam germ tens + 0 Pho bg المسافة من : ES I 3 ~ :f . i FO I 80018 TSS (hd) خلخ 3 HE 1 0١ ؛ : = 0 SE اا ل BCLTIA ببييويور تت : HI fg £0 1 1 | 0 10 ا A : ou BNPs [ LG م ل 1 ! |] 0 ا * الست ب اااي اي ايه & TAPAS LT 3 relly GAPDH 0074 HS3 540 va A 0 a et a San BELTIA 785 (kb) من Bll وتع AREAS FS 143T407 SRE طبر CAACASTRCOCTISTOATATORA Hr - 2 - ِ ا re FY HEF DARCATTICLCTTOTGATATUL 4: 5 HAR Ri 0 الوا 8 : ل أيAER. مشا لل اسل مقي لح الا i . bil Ga TR 2, LL اس = Fog £5 00H yd 7 bs = i # Bg A LF ad : NE bt i 0 نيا ها اذاه دك as Th TT نه 3 i 3 i مدا لما مات ما اا 1 فين A اميت Input GATAY Tala Chip iy شكز (57560048 و ER خبط & 0% عت او & T 1 BOLTIA ههه pa aE An, f i الب Bam اد محا 3 03 3 . 33 ou) ل 0 ly td 1 ws 1 رقا ج٠ Te 1 [is 1 TE ده win Bw 3 + ما 0 ie 3 FEE سي سس سنس سسأ إلى ثلاقاج CONA شكل أب 0 Ea دبك ا ا و ل الل ا ا اس ا ل i 1 va 3 و } 8 3 : NN اج i NY) = i NY iw 1 NU a Nie Rok ¢ wg VAN 1 AN a 0 i ke NN NE SS Ee موق عوقف حوعه فم ردي 7508173--427407اا ا شكل اج SAY-\Vev- or LL E125 FB ا ا ا ا ااا تا اا حا ا ااا ا : Lo onLS . ا الس 4 Lh Coal اا i "للك end tar a : EES. Sk Sa ا ا EE RE 0 a SU eae aan NN ad ا ا « ا a ااه EN Nd رالا > ل yo الح د ان أت ا ON 7 3 EE a oR لي ¥ ا الا CA اا ا ا ا ل i Te ee ا ا ااا ا اا E12 5FL I NaN N 3 ا ا اا 3# i Eo NER DE ae . 1 Pe . oe % on 8 4 *# BN = NTN SR ARE TR NE i. Ta Ne “ LL Lo Ng Be Loo له + CORON = 0%, = SRY LL AN gy BE ب = eA و hat SY 3 ١ 0 fT Lo NE « 1 ا La NN ل Cap 5 » - HER 8 NORE ل ا ا 5 ap we? AE WN Cl ER جا a & يج FS : 1 3 0 ليا اا ١ 1 شكل ب شل 1 ف 8 LacZ EOC 86 ا ا Yes ER Raw Hoe ARE Pea 5 a Si EE 0" NN ae ال bE ta NNN Shas = WERE Sea g a Re } NN San ¥ NN Hi i 3 Nee valuta Ne aw QR es NR Nhe RR ae NN Jay NN. LE" } ال SOR rani Ph RON RIS ال CO71+Ter110+ CD19+ La 8 8 8 Ek ~ ES i ~ ARE : الا SORE ا اموي ا 8 a i) BL i 8 8 0 ا hp Co 2 a | ¥& : 80 2h 7 1 ' 3 5 a 0 8 Se 4 Js © 2 ١ Ae bo Sa. Lh TR Bl al 10 Woe a | . شل X A SE ET 2 Se ) ححا يج > od £ oF SY i i @ * zi شكل OY AY-١؟0م ل تن ٍ ! i ا ا ١ 0ه 08 MEL ونم IE ; 8 Exan-di (KL قط رق & RK rat Adan 0 i NES عاتن 4504-4 0 : 8 ENON IL طحي db Dt HA LE 14 Ld i.YD 4 1 3 3 1 3 CAR RE WN | > ب" 1 Na 8 NY NN 1 a 0 4 a 4 3 0 = PNY NAY NY ~ و = {8 Ry NN 4 aN , 2 N a 2 = HE 3 oy 5 3 AN 3 Ah NR 6 ل ا ee & + TN 2 DH) SN fs al va as a a ال ا ov) Ne APS ا {4 _s NK NY aN BLEHA ENN Fa i: XR PERERA BRA 8 الا م ا Cs \ NY Ne 0 ا mR 1 ل 0 8 Sa & pre ERR I ES ب بلا 1 ات مس اتا NY © ل Ee ل ١ 7 N - 2 ) 1 ل ااا ا ow مسيم #1 #2 GAPDH. ا ا ال ا ١ 0 ات od م اج ده ب ومسي خاف4 ففخ Bas AST نسيتة 4وفق-4 SEE ER تاكاه مشا لاسا ساسا ١ ممما ملأتا اا ااا MEL Pro-B 08 1 Fro-B شكل حاب شكل ما با ب يروك مي | 8 N 4 8“ 0 : SR + 8 1 4 0 ل EX w WHEE ER 4 NN يي 5 بد 8 3 Na 1 الجاع 3 NY a DY 8# بحي )لزه 0 “8&8 2 Cae 0 ا BE ": Na ZAR AN # Soil NON © d 0 BB nN Nl Br 8 8 8 pe ANN NO NN Se 0 SIRNAS TEE OE CLE د © : 0 ١ Iw IE 3 BY 83 سس لإ يب ieee eee ناخ 4-504 Has MEL rd EN شكل دج CAN-١6- EN IR TR RE سس اال ل ا الا RENE ال ااي ا ا ل A NAN aN EE SE Sa 0 an i gla CL as RR ل ا SV NE Loa a oN Cl . ا oo LL ak LE Le 3 0 ل ا ااا ا ا ا SR ا اا لسع اا ا ات ات a 1 ا ل ا ال 0 a Le So NN a RE C0 0 و ا ci 5 os N OA AAR ES Nea SE INE No Bc a ET NN 18 ال ا ب جد ا ل ا oN LF Shi 4 EEE SE NIN NN RE aN A SR SS Na NR REN BIN Ne Ea ON NaN 0 ١ شكل بو ججد بود +ع Yet حت sad avs 5+ set +؟5 +جج جوج kb ل 1 ! 1 1 1 { 1 poe 155 OUI up LEERY I seas W تيع ل يح اس مس NG NN اكد NEN 8 NE Ne Ra 5 8 RE iN . اال ا ال الا اا Lae SB a No ae ea RT Rv الا TNE a لاه Yo دار an 234 اتا 0 ابم اا ا ل م ما i 1ل ا ٠٠٠٠٠..٠٠.: Ae وجوش انه ON اللا ال الات ال ا يي يي مسو ص اس ER 8 ل NR ل . ا ل ا RR RN Te NORE des NE TL SRG Ee 5# ONAN ay ا ا ا ا ٍّ ا ا اي ا ال ا ل ا ل 0 ا ل ا د SAY INN 5 Ri a) oN Na NG RUNS aA a BR aa ل ANY ON AEN NE ا ال RR ا ا ل ا ا اد Na Tl Ca aa a? aa Na aa ديد Na 1 ال اللا ااا جار a2 3 rea I TR [RRP TRUE TRNE 4 SN REA a a X Na a 2 اا RA a 0 STIR ey RG vis WN J. : TE YN aaa Ra wr SON eae ال ا ام اا ا ا ل ] AN ER re اد Lose JN) Boo bo hoo SON Ra 9 Ca 3 AN التي Va 3 a.TENE MINN AME OD haar ااا ENG ال لأ dE L 0 أ EN SENG aR ROC RE TR Ah al Baa LONE TaN NET ل Sa N aay oa Na سن NG La we CAR-١ 2م pn RLF وك £2 6 1 0" ل 0 بال a 1 a 0 - + 0 1 لم 0 8 Ya a Ho ved i Ih 0 \ A 0 ps : \ Ss aR | ok N ال 8 \ 5# aw ١ 1١!!! HOE لا ذه §& 8 د ١ § 8 BEER BE \ 0 0 A* 5. RE : iE. 7 a en ES I. سن Nee 8 نسحي + م + Tr + Xr م ' PRE ES 1 ow bong نطول BOLTIATSS الساتةت ب La oo 8 V شكل SAY— \ o \ — BE i EE EE a 20111 er So. ve L§ SREP امات ينح رع يا يقر ا ل د CA 1 1 Refseq =n Tra HE EL [fe] . 1 1 23 ٍ 1 i fa 1 i i 8 ب ا امس أ ا سس حت ل ل اا han ال I NE اا : اراق 43 ل ro تم مس روأ لالت سان سس نس لأف باتلا اللالمسسسسسست A A تح متا TAR AIA AR FARA AANA اي © 1 تح 41 0 Sal : ‘ — wal ss drag Cr a . ااه ما شاك به اسح سر SRY تت الا SI TN ST PRE SEN [25-0] wl Log! H3KZF ac 8 N 0 ا Ng a aldo RG Ng 3 OR 0 strani EN IR SRA a مص سدع هاا سا1 Sos بمج 0 a. ساسح تسج TU SH SEPP A NC ا ا ال ا ل ey 1-1 58 TAL] ا ص" >> aR Ah i A te Sn AT i rai6 . Sant] < Seufingd phase | 1 1 ملأتا المشس سس اسه سال ل SE تتح احج رقم من الت ا لتحت NS Pree] ! 1 ا DNase! وا 1 FI = FR WANAN STOWEE 1 ل SETI SAAT SARA. nes B اللاي الشعارية DNasel red id ٠ 1 لسلس ا ساس سا PINOT JOY. = اسمس سس سنس مت ممه سس الست DNassl vo ا : وت الى نط Role. INURL GEL In : 70 !ليا 0 8 ERIE +32 PhasiCons' § 1 Halk بال SL ET LHR 1 8 1 نب 01 حب PhasiCons { EY 0 ا 0 ب 2 fad AS si BEE EE LE Beek JUIN SRN A 4 م 5 0 . 807173 TBE (kh) اا لشناقة من af سدس سا حا ١١١ KE] ا ااا لماعي حورن LTT SN TE يط يرة؟ _—— بممبممسالسسسسيسسسس سس ¥ 0 ا ا ا ا ا ا ا ا ل[ لقاع للها 1 13 - العا N A ا : ’ 1 , 1 i 1 os f <8 كن H قُْ د 33 f ion بيج gree t——— ب > aA AMA RATA ATE : الع اسم اس ne . Co NR Re 0 ب ada مخ . Salus te NE Rn اتاد NN SO ا te الا اا TCV TNE. TU ددا ا 3 1 ¥ HAK2 ac sss Need Sw : Soni انف تال EE A EE ne SNR ماح مسمس Tey 1 Irs 8 #81 & 8 ¥ رحج 0 4 0 ام . 8 0" 9 0 اا ا ا المت اس و سا O. WY ا ل : ! شيهة ديات قر DNasged ¥ ' جا َّ ال د ا ا ل اس ا سك ان هل د ا م ل ا حم "su. DNased t ل = تم لاس محص visas vin نجل تاق nA FA ES ARS أل nS ماخلا تج Si wean Esa مجح 0 .جد ا I.الخلا اللمفاوية DNase! : X &. EN ARAN ANRY AREAS تس ا I A ea vee : 3 T اخلارا اللمغاوية DNase red 0 0 aa BE الجا ل مما لد ا AAAI المت ام اح ا تح اتا ال ل NBAAFAAIENY تسن ARRAN SARA يترسح نحتما = oa] i Bo 3 6 Ny F 5 PE 1 الي cst PhastCons § © § 8 1 : : $a 3 : 0 ب IE 1 $3} = 3} 3 CEL SI EET i HNL LUE 8 ا طلا شالع لنت تالت طاللمسلتساةا IEEE : JAN الاي I مط TES (kb) oud Suid اليد حا A شخل CANAEA 3717 ب ا MEL و سويد eH سس ا سس اا اسن REQ4-H04 مدق. 1 اح د م لات & الس و اا لم نيج شك تو لخن Te ١ ب FOTALEN و او الوه 1 1 1 1 نيج : Woo # i! A J ce Eas | JN ب" وا اام »م 01 5 {kid Hak CE EA SE Te يا Pes JALEN عدم أرج ee: ar Cady رقا نيدت عن الاج AS 4 4 م 8 FERC RN RE PRE SE Lg eT 204-004 ا ila Fan Be 504804م me, ا as ae a CEs : و ا لا ا ل واي نت سيار = i as Sh Ey an de 8 Lian Ll a fede LIL aE ا Cit “as or Sa ا داواي الي 3 1 تجرد Re as SET a 5 ا د 3 2 خاو Ren hee iq 1 ا كز شكل وب المع دمل ا« 15 ands IT we 103 0 ايكرت ال بكي اف اي "م ofl ! 1 طلا Iman 4غ i امنيحو ! H { 1 i 1 1 l N : 1 4,0 | ! I SRT ! } EI {i rr { PRE vod Ne ! ا ! yd ولاج 5 1 85 في لاما 1 ! 4 ! الس a WN E NX NN ب" “8 CNN 7 2 No NNER 8 sks a. oN oN NLL I EE 0 ار ا NEN BONY 3 Ey Nola 8 3 2 Br i 1 Nl ar 8 a Ns ب" 0 i 7 Na 2A i EN 1 0 ENN نا J EEE I نا اننا لاا 0 ; 0" د RX EE ; Ou 8 NaN ENE اذ i wf ON an 8 اع ع AN SR ا NN Fr] NE 8 5 8 ا 88 AN 8 NANG 8 ل ا 8 ال ا a Ba NO الل NR pia : Noa 7 ا ا ا HEN EN NE لاا A DN 3 Na ل 8 ا 7 I: 2 اد uE a a BE = Ld ERE oO HE ANN Ba 5 wR NUN NE ا ا 1 3 NRE SAN Se 8 pd 9 Ha ANA Na Co aN a 1 ل ل 2 aN LHe] pi re 8 ANA Na 8 8 Sn NY م : Na NB a LL oe NN =n BE ENS NA نا He IN ON i NaN 0 Ea 5 8 RE A EX NNN Wa NN 8 aN ا ا Ey SS BB BEBE BE = NL EB 2 EE ةق i ANNA AN ا SN الس OER HE AANA Wi fe oN 2 ل ا NR ال a VN 2 دا ال اا a ON 0 iI 321 ه٠ EE EE = BE ا + NRE DB A NN - ل BE مع 5 on BERS nS NRE Bc, NESE AN en NR fe ad NF كد حم كد ند" العا ا نود ee لخر ٠١ اا يُسيئد © نسيقة ؟ حسيقة : ’ Ee i أجلي 8 Bid نسيقة؟ £50 4-804 ne A ABT A604 NEL انا اانا اانا i ال نا ناا لاا 7 ااانا Fea-8 ! + zh شكل OY AYo — \ _ LEFT TALE 7 RIGHT TALEN TLE TALLEY RIGHT THEN GASGGIGARGGTCAACTAAL 5 CRANANTC TORT TIARA ATSRTC RAT TRET CAG 0 لت op BRAT 308 ار ال CTY ANRGCARRRAITRACT RIT أي اسيلا TRA 1 1 ل ااا .... MEL“ #1a 17061 ال أ ان ممع أ مت الام ااا ا اتات اماه لاا ا ا ا مانت اناا لني الات الت اا لاا لات ا ا ا ا ل ّ| و سه MEL gf, | ! كن ا ا 1 7 ا ا ا ا ل ا ا TACECCTOTOALARGTTALR ! #28 لك MEL mm am mt mem pre mre 1010577 AVGATIRATIRGICRS | اا ا كسا 681317 ال #73 سك WEL I أ إ ١ | 1 للستت ساس اا اام ا ا ا ا 1000107 Gas 1114 ب #8 حم MEL Si | | : il ليا ا ل 1 SAY ا ا ا لماه سا ل 1 Er ارا ادي الث الا 5 وم 7 وم Aenea 0300 ااا ا ا ا ا ا ا ا ا اك فق وق 1030 GETTARCLAERLLAG ITTY #1b 0 | hua مه Pod زارفا النففاا الاللاليا بوموموور لجال بس سس ب ا ات ات عو لبخي بف نل FTOACTGOTTACASETTATE ’ Pro-B so 8 ) | a 1 الأ ATGATCEATIRATORG. 032177 .حت ers me nen ese ا mmr memes mes nm am 017 الفا ا شكل ٠١ ار ادo ¢ —_ \ _ ATO ااا اليه لأس وها هوا اتا بالا ا يسوي ب ساي يقبا BREE مه ETO ا ل SIV ميتو له ووو جا له اوه مولأ ا عه موه أ و م لح مو موي فا حم لوم اه دج العم ا تأ و لأا ا بح ةا ا ملي جا ام بلا دن تهت بن ل الت هااا لاا باهرا اللا اا للدت مهلا انا ته حت ادل ابه توا ال اتلد المت هل الك نا دق اه نا لها الجا كا ات sey presse ا ل og ال i لحي + {Xie FRR EN drm ind ERS ETRE لم7 is ro N i : vi oma [ENB 0 5 1 184 حيقي 3 حا ae WP a الا للا fad 2 < 08 - = يام ft fy رحد 18 Tes BRE oF Eg BAF i 1 08 و الب حا a. ب ا الا ل جع TY 0 5 يريا ER FELT AETANY Tra YA ALY I Ea CATE gi TE gr o EE i Cig Co vay AY LICE FE Sn ed Pa YY octet a EYAL Fe Rs WE opr an [| (71 fed : قا ا 8 شنا ١ 1 ن”ن- " CAN— 00 \ _ لد واج جم وروي موجنب بي ري ول يام بيرت ييه YY, Sy TEA NYL TVA مسقو ال 1 1 bo 1 1 1 1 0 ات اي مل تست لدي تست ااي فا PF TITRE لع ف الا ادي ل لد لا ل لد م ل ب 8 8 118 الست اسح الجحد اي ااي RA ا ل د RS CI Pent i aed و امات حل لير Fonseca # ا سس Cae ad BHP HIE SB 1 HHI ee Gs 1 SE iE HE WHT SHE شكل 11 اب ببح CARمدة سريان هذه البراءة عشرون سنة من تاريخ إيداع الطلب وذلك بشرط تسديد المقابل المالي السنوي للبراءة وعدم بطلانها أو سقوطها لمخالفتها لأي من أحكام نظام براءات الاختراع والتصميمات التخطيطية للدارات المتكاملة والأصناف النباتية والنماذج الصناعية أو لائحته التنفيذية صادرة عن مدينة الملك عبدالعزيز للعلوم والتقنية ؛ مكتب البراءات السعودي ص ب TAT الرياض 57؟؟١١ ¢ المملكة العربية السعودية بريد الكتروني: patents @kacst.edu.sa
Applications Claiming Priority (5)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US201261730323P | 2012-11-27 | 2012-11-27 | |
US201261730369P | 2012-11-27 | 2012-11-27 | |
US201361776144P | 2013-03-11 | 2013-03-11 | |
US201361889174P | 2013-10-10 | 2013-10-10 | |
PCT/US2013/072236 WO2014085593A1 (en) | 2012-11-27 | 2013-11-27 | Targeting bcl11a distal regulatory elements for fetal hemoglobin reinduction |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
SA515360489B1 true SA515360489B1 (ar) | 2016-12-25 |
Family
ID=50828461
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
SA515360489A SA515360489B1 (ar) | 2012-11-27 | 2015-05-27 | استهداف عناصر bcl11a التنظيمية البعيدة لإعادة حث هِيمُوجلُوبِين جَنِينِيّ |
Country Status (18)
Country | Link |
---|---|
US (4) | US9822355B2 (ar) |
EP (2) | EP2925864B1 (ar) |
JP (2) | JP6542124B2 (ar) |
KR (1) | KR102240555B1 (ar) |
CN (2) | CN104955943B (ar) |
AU (3) | AU2013352156B2 (ar) |
BR (1) | BR112015011995B1 (ar) |
CA (1) | CA2892860C (ar) |
DK (2) | DK2925864T3 (ar) |
ES (2) | ES2884925T3 (ar) |
HK (1) | HK1215720A1 (ar) |
IL (1) | IL238949B (ar) |
MX (1) | MX361412B (ar) |
PT (2) | PT3502240T (ar) |
SA (1) | SA515360489B1 (ar) |
SG (3) | SG10202110062SA (ar) |
WO (1) | WO2014085593A1 (ar) |
ZA (1) | ZA201504004B (ar) |
Families Citing this family (96)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2013066438A2 (en) | 2011-07-22 | 2013-05-10 | President And Fellows Of Harvard College | Evaluation and improvement of nuclease cleavage specificity |
EP2925864B1 (en) * | 2012-11-27 | 2018-10-31 | The Children's Medical Center Corporation | Targeting bcl11a distal regulatory elements for fetal hemoglobin reinduction |
US20150044192A1 (en) | 2013-08-09 | 2015-02-12 | President And Fellows Of Harvard College | Methods for identifying a target site of a cas9 nuclease |
WO2015033343A1 (en) | 2013-09-03 | 2015-03-12 | Yissum Research Development Company Of The Hebrew University Of Jerusalem Ltd. | Compositions and methods for expressing recombinant polypeptides |
SG11201601570QA (en) * | 2013-09-04 | 2016-04-28 | Csir | Site-specific nuclease single-cell assay targeting gene regulatory elements to silence gene expression |
US9526784B2 (en) | 2013-09-06 | 2016-12-27 | President And Fellows Of Harvard College | Delivery system for functional nucleases |
US9322037B2 (en) | 2013-09-06 | 2016-04-26 | President And Fellows Of Harvard College | Cas9-FokI fusion proteins and uses thereof |
US9228207B2 (en) | 2013-09-06 | 2016-01-05 | President And Fellows Of Harvard College | Switchable gRNAs comprising aptamers |
WO2015059690A1 (en) | 2013-10-24 | 2015-04-30 | Yeda Research And Development Co. Ltd. | Polynucleotides encoding brex system polypeptides and methods of using s ame |
PT3066201T (pt) | 2013-11-07 | 2018-06-04 | Massachusetts Inst Technology | Métodos e composições relacionadas com crispr com arng reguladores |
EP3960856A1 (en) * | 2013-11-13 | 2022-03-02 | Children's Medical Center Corporation | Nuclease-mediated regulation of gene expression |
US11053481B2 (en) | 2013-12-12 | 2021-07-06 | President And Fellows Of Harvard College | Fusions of Cas9 domains and nucleic acid-editing domains |
MX2016013832A (es) | 2014-04-25 | 2017-03-09 | Children´S Medical Center Corp | Composiciones y metodos para tratar hemoglobinopatias. |
WO2016005985A2 (en) | 2014-07-09 | 2016-01-14 | Yissum Research Development Company Of The Hebrew University Of Jerusalem Ltd. | Method for reprogramming cells |
AU2015298571B2 (en) | 2014-07-30 | 2020-09-03 | President And Fellows Of Harvard College | Cas9 proteins including ligand-dependent inteins |
IL234638A0 (en) | 2014-09-14 | 2014-12-02 | Yeda Res & Dev | NMDA receptor antagonists for the treatment of Gaucher disease |
BR112017017812A2 (pt) | 2015-02-23 | 2018-04-10 | Crispr Therapeutics Ag | materiais e métodos para tratamento de hemoglobinopatias |
US20180200387A1 (en) | 2015-02-23 | 2018-07-19 | Crispr Therapeutics Ag | Materials and methods for treatment of human genetic diseases including hemoglobinopathies |
EP4218771A1 (en) | 2015-03-27 | 2023-08-02 | Yeda Research and Development Co. Ltd | Methods of treating motor neuron diseases |
WO2016182917A1 (en) * | 2015-05-08 | 2016-11-17 | Children's Medical Center Corporation | Targeting bcl11a enhancer functional regions for fetal hemoglobin reinduction |
CA2986310A1 (en) | 2015-05-11 | 2016-11-17 | Editas Medicine, Inc. | Optimized crispr/cas9 systems and methods for gene editing in stem cells |
KR20170141217A (ko) | 2015-05-12 | 2017-12-22 | 상가모 테라퓨틱스, 인코포레이티드 | 유전자 발현의 뉴클레아제-매개된 조절 |
JOP20160092B1 (ar) * | 2015-05-13 | 2023-03-28 | Celgene Corp | علاج البيتا ثلاسيميا باستخدام مصطبة لجائنية |
AU2016276702B2 (en) | 2015-06-09 | 2022-07-28 | Editas Medicine, Inc. | CRISPR/CAS-related methods and compositions for improving transplantation |
WO2017009843A2 (en) | 2015-07-16 | 2017-01-19 | Biokine Therapeutics Ltd. | Compositions, articles of manufacture and methods for treating cancer |
JP7109784B2 (ja) | 2015-10-23 | 2022-08-01 | プレジデント アンド フェローズ オブ ハーバード カレッジ | 遺伝子編集のための進化したCas9蛋白質 |
US12043843B2 (en) | 2015-11-04 | 2024-07-23 | Vertex Pharmaceuticals Incorporated | Materials and methods for treatment of hemoglobinopathies |
IL260257B2 (en) * | 2015-12-28 | 2024-05-01 | Novartis Ag | Preparations and methods for the treatment of hemoglobinopathies |
CN108697907A (zh) | 2016-01-06 | 2018-10-23 | 耶达研究及发展有限公司 | 用于治疗恶性疾病、自身免疫疾病和炎性疾病的组合物和方法 |
JP7019580B2 (ja) | 2016-01-21 | 2022-02-15 | ザ ステイト オブ イスラエル ミニストリー オブ アグリカルチャー アンド ルーラル ディベロップメント アグリカルチュラル リサーチ オーガニゼイション (エー.アール.オー.) (ボルカニ センター) | 単為結実植物およびその製造方法 |
WO2017130205A1 (en) | 2016-01-31 | 2017-08-03 | Hadasit Medical Research Services And Development Ltd. | Autosomal-identical pluripotent stem cell populations having non-identical sex chromosomal composition and uses thereof |
BR112018016450A2 (pt) | 2016-02-12 | 2018-12-26 | Bluebird Bio Inc | composições intensificadoras de vcn e métodos de uso das mesmas |
EP3413896B1 (en) | 2016-02-12 | 2021-03-17 | Bluebird Bio, Inc. | Vcn enhancer compositions and methods of using the same |
WO2017138008A2 (en) | 2016-02-14 | 2017-08-17 | Yeda Research And Development Co. Ltd. | Methods of modulating protein exocytosis and uses of same in therapy |
WO2017153982A1 (en) | 2016-03-06 | 2017-09-14 | Yeda Research And Development Co. Ltd. | Method for modulating myelination |
CN117802102A (zh) * | 2016-03-14 | 2024-04-02 | 爱迪塔斯医药公司 | 用于治疗β-血红蛋白病的CRISPR/CAS相关方法和组合物 |
SG10202010261YA (en) * | 2016-04-18 | 2020-11-27 | Crispr Therapeutics Ag | Materials and methods for treatment of hemoglobinopathies |
CN110214183A (zh) | 2016-08-03 | 2019-09-06 | 哈佛大学的校长及成员们 | 腺苷核碱基编辑器及其用途 |
US11661590B2 (en) | 2016-08-09 | 2023-05-30 | President And Fellows Of Harvard College | Programmable CAS9-recombinase fusion proteins and uses thereof |
IL247368A0 (en) | 2016-08-18 | 2016-11-30 | Yeda Res & Dev | Diagnostic and therapeutic uses of exosomes |
WO2018039438A1 (en) | 2016-08-24 | 2018-03-01 | President And Fellows Of Harvard College | Incorporation of unnatural amino acids into proteins using base editing |
SG11201903089RA (en) | 2016-10-14 | 2019-05-30 | Harvard College | Aav delivery of nucleobase editors |
JP2019535298A (ja) | 2016-11-28 | 2019-12-12 | イェダ リサーチ アンド ディベロップメント カンパニー リミテッドYeda Research And Development Co.Ltd. | 単離ポリヌクレオチドおよびポリペプチドおよび関心のある発現産物を発現させるためにそれらを使用する方法 |
US10745677B2 (en) | 2016-12-23 | 2020-08-18 | President And Fellows Of Harvard College | Editing of CCR5 receptor gene to protect against HIV infection |
EP3563159A1 (en) | 2016-12-29 | 2019-11-06 | Ukko Inc. | Methods for identifying and de-epitoping allergenic polypeptides |
TW201839136A (zh) | 2017-02-06 | 2018-11-01 | 瑞士商諾華公司 | 治療血色素異常症之組合物及方法 |
IL250479A0 (en) | 2017-02-06 | 2017-03-30 | Sorek Rotem | Genetically engineered cells expressing a disarm system that confers resistance to phages and methods for their production |
EP3592853A1 (en) | 2017-03-09 | 2020-01-15 | President and Fellows of Harvard College | Suppression of pain by gene editing |
JP2020510439A (ja) | 2017-03-10 | 2020-04-09 | プレジデント アンド フェローズ オブ ハーバード カレッジ | シトシンからグアニンへの塩基編集因子 |
WO2018170184A1 (en) | 2017-03-14 | 2018-09-20 | Editas Medicine, Inc. | Systems and methods for the treatment of hemoglobinopathies |
IL306092A (en) | 2017-03-23 | 2023-11-01 | Harvard College | Nucleic base editors that include nucleic acid programmable DNA binding proteins |
US11261441B2 (en) | 2017-03-29 | 2022-03-01 | Bluebird Bio, Inc. | Vectors and compositions for treating hemoglobinopathies |
IL252151A0 (en) | 2017-05-07 | 2017-07-31 | Fainzilber Michael | Treatment of stress disorders |
WO2018209158A2 (en) * | 2017-05-10 | 2018-11-15 | Editas Medicine, Inc. | Crispr/rna-guided nuclease systems and methods |
WO2018209320A1 (en) | 2017-05-12 | 2018-11-15 | President And Fellows Of Harvard College | Aptazyme-embedded guide rnas for use with crispr-cas9 in genome editing and transcriptional activation |
WO2018218135A1 (en) | 2017-05-25 | 2018-11-29 | The Children's Medical Center Corporation | Bcl11a guide delivery |
US11866726B2 (en) | 2017-07-14 | 2024-01-09 | Editas Medicine, Inc. | Systems and methods for targeted integration and genome editing and detection thereof using integrated priming sites |
IL253642A0 (en) | 2017-07-24 | 2017-09-28 | Seger Rony | Combined treatment for cancer |
EP3658573A1 (en) | 2017-07-28 | 2020-06-03 | President and Fellows of Harvard College | Methods and compositions for evolving base editors using phage-assisted continuous evolution (pace) |
WO2019038771A1 (en) | 2017-08-23 | 2019-02-28 | Technion Research & Development Foundation Limited | COMPOSITIONS AND METHODS FOR ENHANCING ALCOHOL TOLERANCE IN YEAST |
EP3676376A2 (en) | 2017-08-30 | 2020-07-08 | President and Fellows of Harvard College | High efficiency base editors comprising gam |
CN111757937A (zh) | 2017-10-16 | 2020-10-09 | 布罗德研究所股份有限公司 | 腺苷碱基编辑器的用途 |
CN109722414A (zh) * | 2017-10-27 | 2019-05-07 | 博雅辑因(北京)生物科技有限公司 | 一种高效制备成熟红细胞的方法以及用于制备成熟红细胞的培养基 |
IL255664A0 (en) | 2017-11-14 | 2017-12-31 | Shachar Idit | Hematopoietic stem cells with enhanced properties |
WO2019147302A1 (en) * | 2018-01-26 | 2019-08-01 | Bauer Daniel E | Targeting bcl11a distal regulatory elements with a cas9-cas9 fusion for fetal hemoglobin reinduction |
IL257225A (en) | 2018-01-29 | 2018-04-09 | Yeda Res & Dev | Treatment of sarcoma |
MA51787A (fr) | 2018-02-05 | 2020-12-16 | Vertex Pharma | Substances et méthodes de traitement d'hémoglobinopathies |
US11268077B2 (en) | 2018-02-05 | 2022-03-08 | Vertex Pharmaceuticals Incorporated | Materials and methods for treatment of hemoglobinopathies |
AU2019236209A1 (en) | 2018-03-14 | 2020-10-01 | Editas Medicine, Inc. | Systems and methods for the treatment of hemoglobinopathies |
AU2019297677A1 (en) | 2018-07-04 | 2021-02-25 | Ukko Inc. | Methods of de-epitoping wheat proteins and use of same for the treatment of celiac disease |
IL262658A (en) | 2018-10-28 | 2020-04-30 | Memorial Sloan Kettering Cancer Center | Prevention of age related clonal hematopoiesis and diseases associated therewith |
WO2020112979A2 (en) * | 2018-11-30 | 2020-06-04 | Bauer Daniel E | Therapeutic gene editing for elane-associated disease |
CN109486850B (zh) * | 2018-12-04 | 2021-05-25 | 厦门大学 | Uv-b光下调控染色质长距离相互作用的光遗传学工具 |
EP3934417A1 (en) | 2019-03-05 | 2022-01-12 | The State of Israel - Ministry of Agriculture & Rural Development, Agricultural Research Organization (ARO) (Volcani Center) | Genome-edited birds |
WO2020191241A1 (en) | 2019-03-19 | 2020-09-24 | The Broad Institute, Inc. | Methods and compositions for editing nucleotide sequences |
CN111939271A (zh) * | 2019-04-30 | 2020-11-17 | 博雅辑因(北京)生物科技有限公司 | 一种血红蛋白病治疗有效性预测方法 |
CR20210591A (es) * | 2019-04-30 | 2022-03-11 | Edigene Inc | Método para la predicción de eficacia del tratamiento de hemoglobinopatía |
AU2020300101A1 (en) | 2019-07-04 | 2022-02-17 | Ukko Inc. | De-epitoped alpha gliadin and use of same for the management of celiac disease and gluten sensitivity |
IL268111A (en) | 2019-07-16 | 2021-01-31 | Fainzilber Michael | Methods of treating pain |
IL270306A (en) | 2019-10-30 | 2021-05-31 | Yeda Res & Dev | Prevention and treatment of pre-myeloid and myeloid malignancies |
IL271656A (en) | 2019-12-22 | 2021-06-30 | Yeda Res & Dev | System and methods for identifying cells that have undergone genome editing |
WO2021152587A1 (en) | 2020-01-30 | 2021-08-05 | Yeda Research And Development Co. Ltd. | Treating acute liver disease with tlr-mik inhibitors |
CA3177481A1 (en) | 2020-05-08 | 2021-11-11 | David R. Liu | Methods and compositions for simultaneous editing of both strands of a target double-stranded nucleotide sequence |
CN111705044B (zh) * | 2020-05-23 | 2022-12-27 | 南京大学 | 新型可控高活性g四链体dna酶的构建 |
KR20230113283A (ko) | 2020-10-05 | 2023-07-28 | 프로탈릭스 리미티드 | 다이서-유사 넉아웃 식물 세포 |
EP4228637A1 (en) | 2020-10-15 | 2023-08-23 | Yeda Research and Development Co. Ltd | Method of treating myeloid malignancies |
US20230416314A1 (en) | 2020-11-26 | 2023-12-28 | Ukko Inc. | Modified high molecular weight glutenin subunit and uses thereof |
IL279559A (en) | 2020-12-17 | 2022-07-01 | Yeda Res & Dev | Controlling the ubiquitination process of mlkl for disease treatment |
JP2024500804A (ja) | 2020-12-18 | 2024-01-10 | イェダ リサーチ アンド ディベロップメント カンパニー リミテッド | Chd2ハプロ不全の処置における使用のための組成物及びその同定方法 |
AU2022272489A1 (en) | 2021-05-10 | 2023-11-30 | Yissum Research Development Company Of The Hebrew University Of Jerusalem Ltd. | Pharmaceutical compositions for treating neurological conditions |
WO2022240787A1 (en) * | 2021-05-13 | 2022-11-17 | The Children's Medical Center Corporation | Methods for stratifying subjects for fetal hemoglobin reinduction |
CA3230677A1 (en) | 2021-06-13 | 2022-12-22 | Yissum Research Development Company Of The Hebrew University Of Jerusalem Ltd. | Method for reprogramming human cells |
CA3226947A1 (en) | 2021-08-03 | 2023-02-09 | Muhammad YASSIN | Engineered tcr complex and methods of using same |
EP4130028A1 (en) | 2021-08-03 | 2023-02-08 | Rhazes Therapeutics Ltd | Engineered tcr complex and methods of using same |
CA3234612A1 (en) | 2021-10-14 | 2023-04-20 | Weedout Ltd. | Methods of weed control |
WO2023240282A1 (en) | 2022-06-10 | 2023-12-14 | Umoja Biopharma, Inc. | Engineered stem cells and uses thereof |
Family Cites Families (47)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5061620A (en) | 1990-03-30 | 1991-10-29 | Systemix, Inc. | Human hematopoietic stem cell |
US5635387A (en) | 1990-04-23 | 1997-06-03 | Cellpro, Inc. | Methods and device for culturing human hematopoietic cells and their precursors |
US5460964A (en) | 1992-04-03 | 1995-10-24 | Regents Of The University Of Minnesota | Method for culturing hematopoietic cells |
US5409813A (en) | 1993-09-30 | 1995-04-25 | Systemix, Inc. | Method for mammalian cell separation from a mixture of cell populations |
US5677136A (en) | 1994-11-14 | 1997-10-14 | Systemix, Inc. | Methods of obtaining compositions enriched for hematopoietic stem cells, compositions derived therefrom and methods of use thereof |
US5928638A (en) | 1996-06-17 | 1999-07-27 | Systemix, Inc. | Methods for gene transfer |
US5731156A (en) * | 1996-10-21 | 1998-03-24 | Applied Imaging, Inc. | Use of anti-embryonic hemoglobin antibodies to identify fetal cells |
US8101349B2 (en) | 1997-12-23 | 2012-01-24 | Novartis Vaccines And Diagnostics, Inc. | Gene products differentially expressed in cancerous cells and their methods of use II |
FR2777909B1 (fr) | 1998-04-24 | 2002-08-02 | Pasteur Institut | Utilisation de sequences d'adn de structure triplex pour le tranfert de sequences de nucleotides dans des cellules, vecteurs recombinants contenant ces sequences triplex |
CZ302719B6 (cs) | 2000-12-01 | 2011-09-21 | MAX-PLANCK-Gesellschaft zur Förderung der Wissenschaften e.V. | Izolovaná molekula dvouretezcové RNA, zpusob její výroby a její použití |
ATE517992T1 (de) | 2002-11-14 | 2011-08-15 | Dharmacon Inc | Funktionelle und hyperfunktionelle sirna |
WO2004054512A2 (en) | 2002-12-13 | 2004-07-01 | Genetix Pharmaceuticals, Inc. | Therapeutic retroviral vectors for gene therapy |
EP1752536A4 (en) | 2004-05-11 | 2008-04-16 | Alphagen Co Ltd | POLYNUCLEOTIDE CAUSING RNA INTERFERENCE AND METHOD OF REGULATING GENE EXPRESSION WITH THE USE OF THE SAME |
EP2341135A3 (en) | 2005-10-18 | 2011-10-12 | Precision Biosciences | Rationally-designed meganucleases with altered sequence specificity and DNA-binding affinity |
US20080051431A1 (en) | 2006-05-26 | 2008-02-28 | Dominique Verhelle | Methods and compositions using immunomodulatory compounds in combination therapy |
EP2172547B1 (en) | 2007-06-11 | 2016-01-06 | Takara Bio Inc. | Method for expression of specific gene |
GB0713183D0 (en) | 2007-07-06 | 2007-08-15 | King S College London | Method |
CA2737180C (en) | 2008-09-15 | 2019-02-19 | Children's Medical Center Corporation | Modulation of bcl11a for treatment of hemoglobinopathies |
US20110294114A1 (en) | 2009-12-04 | 2011-12-01 | Cincinnati Children's Hospital Medical Center | Optimization of determinants for successful genetic correction of diseases, mediated by hematopoietic stem cells |
WO2011072086A1 (en) | 2009-12-08 | 2011-06-16 | Hemaquest Pharmaceuticals, Inc. | Methods and low dose regimens for treating red blood cell disorders |
JP2011135864A (ja) * | 2009-12-30 | 2011-07-14 | Korea Univ Research & Business Foundation | Oct4及びBmi1、またはその上位調節子を用いて体細胞から胚幹細胞類似細胞への逆分化を誘導する組成物及びこれを用いた胚幹細胞類似細胞の製造方法 |
LT2561078T (lt) | 2010-04-23 | 2019-01-10 | Cold Spring Harbor Laboratory | Naujos struktūriškai sukonstruotos shrnr |
WO2012073047A2 (en) | 2010-12-03 | 2012-06-07 | Genome Research Limited | Compositions and methods |
EP2648763A4 (en) | 2010-12-10 | 2014-05-14 | Alnylam Pharmaceuticals Inc | COMPOSITIONS AND METHODS FOR EXPRESSION INHIBITION OF GENES KLF-1 AND BCL11A |
EP3492108A1 (en) | 2011-06-10 | 2019-06-05 | Bluebird Bio, Inc. | Gene therapy vectors for adrenoleukodystrophy and adrenomyeloneuropathy |
AU2012315699B2 (en) | 2011-09-30 | 2017-08-17 | Bluebird Bio, Inc. | Compounds for improved viral transduction |
KR101833589B1 (ko) | 2012-02-24 | 2018-03-02 | 프레드 헛친슨 켄서 리서치 센터 | 이상혈색소증 치료를 위한 조성물 및 방법 |
AU2013262700A1 (en) | 2012-05-16 | 2015-01-22 | Rana Therapeutics, Inc. | Compositions and methods for modulating hemoglobin gene family expression |
GEP20217251B (en) | 2012-05-25 | 2021-04-26 | Charpentier Emmanuelle De Emanuel | Methods and compositions for rna-directed target dna modification and for rna-directed modulation of transcription |
EP2925864B1 (en) | 2012-11-27 | 2018-10-31 | The Children's Medical Center Corporation | Targeting bcl11a distal regulatory elements for fetal hemoglobin reinduction |
CN105121648B (zh) | 2012-12-12 | 2021-05-07 | 布罗德研究所有限公司 | 用于序列操纵的***、方法和优化的指导组合物的工程化 |
US10106816B2 (en) | 2012-12-14 | 2018-10-23 | Case Western Reserve University | Genomic RNA packaging enhancer element |
CN116083487A (zh) | 2013-05-15 | 2023-05-09 | 桑格摩生物治疗股份有限公司 | 用于治疗遗传病状的方法和组合物 |
WO2015065964A1 (en) | 2013-10-28 | 2015-05-07 | The Broad Institute Inc. | Functional genomics using crispr-cas systems, compositions, methods, screens and applications thereof |
EP3960856A1 (en) | 2013-11-13 | 2022-03-02 | Children's Medical Center Corporation | Nuclease-mediated regulation of gene expression |
CN104955119B (zh) | 2014-03-26 | 2019-11-26 | 南京中兴新软件有限责任公司 | 一种基于流量的网络切换方法、装置和终端 |
EP3134434A4 (en) | 2014-04-25 | 2017-10-25 | Bluebird Bio, Inc. | Kappa/lambda chimeric antigen receptors |
DK3689899T3 (da) | 2014-04-25 | 2021-11-22 | 2Seventy Bio Inc | Kimære mnd-promotor-antigenreceptorer |
MX2016013832A (es) | 2014-04-25 | 2017-03-09 | Children´S Medical Center Corp | Composiciones y metodos para tratar hemoglobinopatias. |
JP7026440B2 (ja) | 2014-05-28 | 2022-02-28 | ザ リージェンツ オブ ザ ユニバーシティ オブ カリフォルニア | ハイブリッドtRNA/プレmiRNA分子および使用方法 |
NZ733025A (en) | 2014-12-12 | 2022-01-28 | 2Seventy Bio Inc | Bcma chimeric antigen receptors |
WO2016182893A1 (en) | 2015-05-08 | 2016-11-17 | Teh Broad Institute Inc. | Functional genomics using crispr-cas systems for saturating mutagenesis of non-coding elements, compositions, methods, libraries and applications thereof |
US11535871B2 (en) | 2015-05-14 | 2022-12-27 | University Of Southern California | Optimized gene editing utilizing a recombinant endonuclease system |
CA2996893A1 (en) | 2015-08-31 | 2017-03-09 | Bluebird Bio, Inc. | Anti-sialyl tn chimeric antigen receptors |
GB201522243D0 (en) | 2015-12-16 | 2016-01-27 | Ucl Business Plc | Treatment |
BR112018016450A2 (pt) | 2016-02-12 | 2018-12-26 | Bluebird Bio Inc | composições intensificadoras de vcn e métodos de uso das mesmas |
WO2018218135A1 (en) | 2017-05-25 | 2018-11-29 | The Children's Medical Center Corporation | Bcl11a guide delivery |
-
2013
- 2013-11-27 EP EP13858006.3A patent/EP2925864B1/en active Active
- 2013-11-27 SG SG10202110062SA patent/SG10202110062SA/en unknown
- 2013-11-27 BR BR112015011995-6A patent/BR112015011995B1/pt active IP Right Grant
- 2013-11-27 DK DK13858006.3T patent/DK2925864T3/en active
- 2013-11-27 PT PT182034363T patent/PT3502240T/pt unknown
- 2013-11-27 ES ES18203436T patent/ES2884925T3/es active Active
- 2013-11-27 US US14/647,547 patent/US9822355B2/en active Active
- 2013-11-27 PT PT13858006T patent/PT2925864T/pt unknown
- 2013-11-27 WO PCT/US2013/072236 patent/WO2014085593A1/en active Application Filing
- 2013-11-27 CN CN201380071452.2A patent/CN104955943B/zh active Active
- 2013-11-27 KR KR1020157016749A patent/KR102240555B1/ko active IP Right Grant
- 2013-11-27 AU AU2013352156A patent/AU2013352156B2/en active Active
- 2013-11-27 CA CA2892860A patent/CA2892860C/en active Active
- 2013-11-27 DK DK18203436.3T patent/DK3502240T3/da active
- 2013-11-27 SG SG10201704008RA patent/SG10201704008RA/en unknown
- 2013-11-27 SG SG11201504038XA patent/SG11201504038XA/en unknown
- 2013-11-27 CN CN201810979764.8A patent/CN109554350B/zh active Active
- 2013-11-27 EP EP18203436.3A patent/EP3502240B1/en active Active
- 2013-11-27 ES ES13858006T patent/ES2708948T3/es active Active
- 2013-11-27 JP JP2015544205A patent/JP6542124B2/ja active Active
- 2013-11-27 MX MX2015006528A patent/MX361412B/es active IP Right Grant
-
2015
- 2015-05-21 IL IL238949A patent/IL238949B/en active IP Right Grant
- 2015-05-27 SA SA515360489A patent/SA515360489B1/ar unknown
- 2015-06-04 ZA ZA2015/04004A patent/ZA201504004B/en unknown
-
2016
- 2016-03-30 HK HK16103646.4A patent/HK1215720A1/zh unknown
-
2017
- 2017-11-17 US US15/816,083 patent/US10472619B2/en active Active
- 2017-12-18 JP JP2017241379A patent/JP6633602B2/ja active Active
-
2018
- 2018-12-11 AU AU2018278850A patent/AU2018278850B2/en active Active
-
2019
- 2019-09-17 US US16/573,389 patent/US11542493B2/en active Active
-
2021
- 2021-08-16 AU AU2021218012A patent/AU2021218012B2/en active Active
-
2022
- 2022-12-02 US US18/074,107 patent/US20230348887A1/en active Pending
Also Published As
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
SA515360489B1 (ar) | استهداف عناصر bcl11a التنظيمية البعيدة لإعادة حث هِيمُوجلُوبِين جَنِينِيّ | |
US20230235285A1 (en) | Targeting bcl11a enhancer functional regions for fetal hemoglobin reinduction | |
US20210047632A1 (en) | Targeting bcl11a distal regulatory elements with a cas9-cas9 fusion for fetal hemoglobin reinduction | |
WO2022240787A1 (en) | Methods for stratifying subjects for fetal hemoglobin reinduction | |
Shannon | The Molecular Biology of Sickle Cell Anaemia |