RU2016138692A - Способ снижения содержания днк в ферментационном бульоне - Google Patents

Способ снижения содержания днк в ферментационном бульоне Download PDF

Info

Publication number
RU2016138692A
RU2016138692A RU2016138692A RU2016138692A RU2016138692A RU 2016138692 A RU2016138692 A RU 2016138692A RU 2016138692 A RU2016138692 A RU 2016138692A RU 2016138692 A RU2016138692 A RU 2016138692A RU 2016138692 A RU2016138692 A RU 2016138692A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
minutes
bacillus
less
fermentation broth
aspergillus
Prior art date
Application number
RU2016138692A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2687153C2 (ru
RU2016138692A3 (ru
Inventor
Седрик ХОБЕЛЬ
Хейди Винтерберг АНДЕРСЕН
Петер Фроде ПИНД
Сецилия Янссон КЕПКА
Original Assignee
Новозимс А/С
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Новозимс А/С filed Critical Новозимс А/С
Publication of RU2016138692A publication Critical patent/RU2016138692A/ru
Publication of RU2016138692A3 publication Critical patent/RU2016138692A3/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2687153C2 publication Critical patent/RU2687153C2/ru

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K1/00General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length
    • C07K1/14Extraction; Separation; Purification
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N1/00Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
    • C12N1/08Reducing the nucleic acid content
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K1/00General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length
    • C07K1/14Extraction; Separation; Purification
    • C07K1/145Extraction; Separation; Purification by extraction or solubilisation
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K1/00General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length
    • C07K1/14Extraction; Separation; Purification
    • C07K1/30Extraction; Separation; Purification by precipitation
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N1/00Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/10Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
    • C12N15/1003Extracting or separating nucleic acids from biological samples, e.g. pure separation or isolation methods; Conditions, buffers or apparatuses therefor
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/10Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
    • C12N15/1003Extracting or separating nucleic acids from biological samples, e.g. pure separation or isolation methods; Conditions, buffers or apparatuses therefor
    • C12N15/1006Extracting or separating nucleic acids from biological samples, e.g. pure separation or isolation methods; Conditions, buffers or apparatuses therefor by means of a solid support carrier, e.g. particles, polymers
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14Hydrolases (3)
    • C12N9/24Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
    • C12N9/2402Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
    • C12N9/2405Glucanases
    • C12N9/2408Glucanases acting on alpha -1,4-glucosidic bonds
    • C12N9/2411Amylases
    • C12N9/2414Alpha-amylase (3.2.1.1.)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14Hydrolases (3)
    • C12N9/24Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
    • C12N9/2402Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
    • C12N9/2405Glucanases
    • C12N9/2408Glucanases acting on alpha -1,4-glucosidic bonds
    • C12N9/2411Amylases
    • C12N9/2414Alpha-amylase (3.2.1.1.)
    • C12N9/2417Alpha-amylase (3.2.1.1.) from microbiological source
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14Hydrolases (3)
    • C12N9/78Hydrolases (3) acting on carbon to nitrogen bonds other than peptide bonds (3.5)
    • C12N9/80Hydrolases (3) acting on carbon to nitrogen bonds other than peptide bonds (3.5) acting on amide bonds in linear amides (3.5.1)
    • C12N9/82Asparaginase (3.5.1.1)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y302/00Hydrolases acting on glycosyl compounds, i.e. glycosylases (3.2)
    • C12Y302/01Glycosidases, i.e. enzymes hydrolysing O- and S-glycosyl compounds (3.2.1)
    • C12Y302/01001Alpha-amylase (3.2.1.1)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y305/00Hydrolases acting on carbon-nitrogen bonds, other than peptide bonds (3.5)
    • C12Y305/01Hydrolases acting on carbon-nitrogen bonds, other than peptide bonds (3.5) in linear amides (3.5.1)
    • C12Y305/01001Asparaginase (3.5.1.1)

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
  • Enzymes And Modification Thereof (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)

Claims (25)

1. Способ удаления ДНК из ферментационного бульона, содержащего нужный белок и микроорганизм, продуцирующий нужный белок, причем указанный способ включает:
нагревание ферментационного бульона до температуры не ниже 70°C.
2. Способ по п. 1, дополнительно включающий стадии:
b) введения в ферментационный бульон полихлорида алюминия, и
c) отделения выпавших хлопьями микроорганизмов от ферментационного бульона.
3. Способ по п. 2, где нужный белок представляет собой пептид, такой как противомикробный пептид, липопептид или браззеин, или полипептид, такой как фермент.
4. Способ по п. 3, где нужный белок представляет собой фермент, выбранный из: гидролаз, лиаз, протеаз, амилаз, глюкоамилаз, пектиназ, пектатлиаз, целлюлаз, ксиланаз, арабиназ, арабинофуранозидаз, маннаназ, каррагинаназ, ксантаназ, эндоглюканаз, хитиназ, аспарагиназ, липаз, фосфолипаз, кутиназ, лизоцимов, фитаз, пероксидаз, лактаз, глюкозоизомераз, изомераз ксилозы, эстераз и фосфодиэстераз.
5. Способ по п. 4, где фермент представляет собой теплоустойчивый фермент.
6. Способ по п. 5, где теплоустойчивый фермент характеризуется теплоустойчивостью, измеренной как время полужизни при 70°C и pH 7,0, равное не менее чем 30 минут, предпочтительно - не менее чем 40 минут, предпочтительно - не менее чем 50 минут, предпочтительно - не менее чем 60 минут, предпочтительно - не менее чем 70 минут, предпочтительно - не менее чем 80 минут, предпочтительно - не менее чем 90 минут, предпочтительно - не менее чем 100 минут.
7. Способ по п. 5 или 6, где теплоустойчивый фермент представляет собой амилазу или аспарагиназу.
8. Способ по любому из предыдущих пунктов, где микроорганизм представляет собой бактерию или гриб.
9. Способ по п. 8, где микроорганизм представляет собой гриб, выбранный из группы, состоящей из клеток-хозяев Trichoderma и Aspergillus, предпочтительно из Trichoderma harzianum, Trichoderma koningii, Trichoderma longibrachiatum, Trichoderma reesei, Trichoderma viridel, Aspergillus awamori, Aspergillus fumigatus, Aspergillus foetidus, Aspergillus japonicus, Aspergillus nidulans, Aspergillus niger или Aspergillus oryzae.
10. Способ по п. 8, где микроорганизм представляет собой бактерию из группы, состоящей из грамположительных бактерий, таких как Bacillus, Clostridium, Enterococcus, Geobacillus, Lactobacillus, Lactococcus, Oceanobacillus, Staphylococcus, Streptococcus или Streptomyces, или грамотрицательных бактерий, таких как Campylobacter, Escherichia, Flavobacterium, Fusobacterium, Helicobacter, Ilyobacter, Neisseria, Pseudomonas, Salmonella, или Ureaplasma, таких как Bacillus alkalophilus, Bacillus amyloliquefaciens, Bacillus brevis, Bacillus circulans, Bacillus clausii, Bacillus coagulans, Bacillus firmus, Bacillus lautus, Bacillus lentus, Bacillus licheniformis, Bacillus megaterium, Bacillus pumilus, Bacillus stearothermophilus, Bacillus subtilis или Bacillus thuringiensis.
11. Способ по любому из предыдущих пунктов, где температуру ферментационного бульона поднимают до не ниже чем 75°C, предпочтительно - не ниже чем 80°C.
12. Способ по любому из пп. 1-11, где температуру ферментационного бульона поднимают до температуры в интервале от 70°C до 110°C.
13. Способ по любому из пп. 1-12, где температуру поддерживают при температуре выше 70°C в течении периода времени не менее 10 мин, предпочтительно - не менее 20 мин, предпочтительно - не менее 30 мин, предпочтительно - не менее 40 мин, предпочтительно - не менее 50 мин, предпочтительно - не менее 60 мин, предпочтительно - не менее 70 мин, предпочтительно - не менее 80 мин.
14. Способ по любому из предыдущих пунктов, где полихлорид алюминия вводят в количестве 0,1-10% (вес/вес) в пересчете на кг ферментационного бульона.
15. Способ согласно любому из предыдущих пунктов, где в дополнение к полихлориду алюминия вводят один или несколько флокулянтов, предпочтительно выбранных из группы, состоящей из солей и полимеров.
16. Способ по п. 15, где полимер представляет собой анионный или катионный полимер.
17. Способ согласно любому из предыдущих пунктов, где стадию разделения с) выполняют, используя центрифугирование или фильтрацию.
18. Способ по п. 2, где рН доводят до рН со значением в интервале от рН 2 до рН 11 после введения полихлорида алюминия.
19. Способ по любому из предыдущих пунктов, где уровень содержания ДНК снижают до уровня содержания ниже 1мкг/мл, предпочтительно - ниже 500 нг/мл, предпочтительно - ниже 200 нг/мл, предпочтительно - ниже 100 нг/мл, предпочтительно - ниже 50 нг/мл, предпочтительно - ниже 20 нг/мл, предпочтительно - ниже 10 нг/мл, предпочтительно - ниже 5 нг/мл, предпочтительно - ниже 2 нг/мл, предпочтительно - ниже 1 нг/мл, предпочтительно - ниже 500 пг/мл.
20. Способ по п. 19, где уровень содержания ДНК снижают до уровня ниже предела обнаружения.
21. Способ по п. 20, где предел обнаружения определяют, используя ПЦР-амплификацию любого сегмента геномной ДНК, присутствующего в единственном числе в гаплоидном геноме, вслед за которой проводят гель-электрофорез и окрашивание бромистым этидием, при этом окрашивание не выявляет каких-либо видимых полос.
22. Способ по любому из предыдущих пунктов, где ферментационный бульон можно разбавлять водой вплоть до 2000% (вес/вес).
RU2016138692A 2014-04-30 2015-04-30 Способ снижения содержания днк в ферментационном бульоне RU2687153C2 (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
EP14166721 2014-04-30
EP14166721.2 2014-04-30
PCT/EP2015/059497 WO2015166037A1 (en) 2014-04-30 2015-04-30 Method for reducing the dna content of a fermentation broth

Publications (3)

Publication Number Publication Date
RU2016138692A true RU2016138692A (ru) 2018-05-30
RU2016138692A3 RU2016138692A3 (ru) 2018-10-11
RU2687153C2 RU2687153C2 (ru) 2019-05-07

Family

ID=50679872

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2016138692A RU2687153C2 (ru) 2014-04-30 2015-04-30 Способ снижения содержания днк в ферментационном бульоне

Country Status (8)

Country Link
US (1) US10259841B2 (ru)
EP (1) EP3137483B1 (ru)
CN (1) CN106255698B (ru)
CA (1) CA2941536C (ru)
DK (1) DK3137483T3 (ru)
MX (1) MX2016012822A (ru)
RU (1) RU2687153C2 (ru)
WO (1) WO2015166037A1 (ru)

Families Citing this family (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN109251872A (zh) * 2018-07-31 2019-01-22 北京林业大学 废弃物堆肥用复合菌剂、其制备方法及废弃物堆肥方法
CN111040966B (zh) * 2019-12-23 2022-06-24 河北科技大学 一种地衣芽孢杆菌KD-1、其生产的β-甘露聚糖酶及其应用
EP3926039A1 (en) 2020-06-17 2021-12-22 AB Enzymes GmbH Use of a nuclease for reducing the viscosity and/or preventing an increase in viscosity of a fermentation broth

Family Cites Families (8)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2002534975A (ja) * 1999-01-25 2002-10-22 ノボザイムス アクティーゼルスカブ 高pHにおいてのタンパク質の回収
WO2004048588A1 (en) 2002-11-26 2004-06-10 Novo Nordisk A/S Process for purifying a fermentation-derived product
ES2287687T3 (es) 2003-01-09 2007-12-16 Genentech, Inc. Purificacion de polipeptidos.
US20050176090A1 (en) * 2003-10-31 2005-08-11 Novozymes A/S Method for flocculation of a fermentation broth comprising a fungus
US7935798B2 (en) 2004-02-27 2011-05-03 Dow Global Technologies Llc Method for the extraction of intracellular proteins from a fermentation broth
EP2089422A1 (en) 2006-11-27 2009-08-19 Natimmune A/S Methods of separating nucleic acids and protein
US20140212885A1 (en) * 2011-09-22 2014-07-31 Danisco Us Inc. Endogenous dnase activity to reduce dna content
US9249432B2 (en) * 2012-07-13 2016-02-02 Alliance For Sustainable Energy, Llc Enzymes for improved biomass conversion

Also Published As

Publication number Publication date
CN106255698B (zh) 2021-08-03
CA2941536A1 (en) 2015-11-05
EP3137483B1 (en) 2019-01-16
RU2687153C2 (ru) 2019-05-07
CA2941536C (en) 2023-01-17
RU2016138692A3 (ru) 2018-10-11
MX2016012822A (es) 2016-12-09
DK3137483T3 (en) 2019-04-23
US20170044209A1 (en) 2017-02-16
EP3137483A1 (en) 2017-03-08
WO2015166037A1 (en) 2015-11-05
CN106255698A (zh) 2016-12-21
US10259841B2 (en) 2019-04-16

Similar Documents

Publication Publication Date Title
AR101956A1 (es) Composiciones que comprenden células recombinantes de bacillus y otro agente de control biológico
RU2016138692A (ru) Способ снижения содержания днк в ферментационном бульоне
MX2019001924A (es) Proceso para preparar una bebida o componente de bebida a partir de bagazo de cerveza.
MX369218B (es) Composición biocatalítica para el tratamiento de sustratos.
Zafar et al. Recombinant expression and characterization of a novel endoglucanase from Bacillus subtilis in Escherichia coli
US20180030087A1 (en) Method for removal of dna
Saha et al. Optimization of amylase production from B. amyloliquefaciens (MTCC 1270) using solid state fermentation
AR101958A1 (es) Composiciones que comprenden células recombinantes de bacillus y un fungicida
FI3607097T3 (fi) BEETA-GALAKTOSIDAASEJA JA LAKTAASEJA ILMAN p-NITROBENTSYYLIESTERASISIVUAKTIIVISUUTTA TUOTTAVIA BACILLUS-ISÄNTÄSOLUJA
JP2019503688A5 (ru)
US20180312893A1 (en) Direct inoculation
BR112018011896A2 (pt) promotor, ácido nucleico, célula hospedeira procariótica, método de fermentação, e, método para aumentar a expressão ou atividade de catalase em uma célula hospedeira procariótica
Kumar et al. Global scenario of industrial enzyme market
Sae-Lee et al. Newly derived GH43 gene from compost metagenome showing dual xylanase and cellulase activities
심현수 et al. Antipathogenic activity of Bacillus amyloliquefaciens isolated from Korean traditional rice wine
CN104371993A (zh) 一种酶活提高的天冬酰胺酶突变体
MX2017009419A (es) Uso de enzimas con una amplia gama de actividades como medicamentos para favorecer la digestion.
HRP20161615T1 (hr) Endoglukanaze s poboljšanim svojstvima
FI3728583T3 (fi) Vastaselektio ehdollisesti välttämättömien geenien inhibition avulla
Khodayari et al. Optimization of xylanase and?-amylase production by alkaline and thermophilic Bacillus isolate KH-13
Khodayari et al. Improvement of enzyme activity of a novel native alkaline and thermophile Bacillus sp. CU-48 producing α-Amylase and CMCase by mutagenesis
US20170099858A1 (en) New arthrobacter gandavensis strains
Hu et al. Isolation, identification and enzyme properties of a strain producing feruloyl esterases
ZHAO et al. Cloning, Recombinant Expression and Enzymatic Properties of α-Amylase Gene from Laceyella sp.
SAVCHITS et al. EXOGENOUS CONTROL OF GROWTH AND DEVELOPMENT OF FLORAL CULTURES BY MICROBIAL PREPARATION «AGROMYC»