RU2012153212A - ШТАММЫ spnK - Google Patents
ШТАММЫ spnK Download PDFInfo
- Publication number
- RU2012153212A RU2012153212A RU2012153212/10A RU2012153212A RU2012153212A RU 2012153212 A RU2012153212 A RU 2012153212A RU 2012153212/10 A RU2012153212/10 A RU 2012153212/10A RU 2012153212 A RU2012153212 A RU 2012153212A RU 2012153212 A RU2012153212 A RU 2012153212A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- deletion
- spnk
- reading frame
- gene
- point mutation
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N1/00—Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
- C12N1/20—Bacteria; Culture media therefor
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/10—Transferases (2.)
- C12N9/1003—Transferases (2.) transferring one-carbon groups (2.1)
- C12N9/1007—Methyltransferases (general) (2.1.1.)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N1/00—Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N1/00—Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
- C12N1/02—Separating microorganisms from their culture media
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P19/00—Preparation of compounds containing saccharide radicals
- C12P19/44—Preparation of O-glycosides, e.g. glucosides
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P19/00—Preparation of compounds containing saccharide radicals
- C12P19/44—Preparation of O-glycosides, e.g. glucosides
- C12P19/60—Preparation of O-glycosides, e.g. glucosides having an oxygen of the saccharide radical directly bound to a non-saccharide heterocyclic ring or a condensed ring system containing a non-saccharide heterocyclic ring, e.g. coumermycin, novobiocin
- C12P19/62—Preparation of O-glycosides, e.g. glucosides having an oxygen of the saccharide radical directly bound to a non-saccharide heterocyclic ring or a condensed ring system containing a non-saccharide heterocyclic ring, e.g. coumermycin, novobiocin the hetero ring having eight or more ring members and only oxygen as ring hetero atoms, e.g. erythromycin, spiramycin, nystatin
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Virology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
Abstract
1. Способ преобразования продуцирующего спиносад штамма в штамм, продуцирующий предшественника спинеторама, включающий внесение модификации в ген spnK для устранения активности 3'-O-метилтрансферазы.2. Способ по п.1, где модификация выбрана из группы, состоящей из делеции в рамке считывания, точковой мутации, делеции и инсерции.3. Способ по п.2, где делеция в рамке считывания выбрана из группы, состоящей из делеции в рамке считывания 5'-конца, делеции в рамке считывания 3'-конца и делеции в рамке считывания кодирующей области spnK.4. Способ по п.2, где делеция представляет собой делецию одного или нескольких нуклеотидных оснований, которая нарушает нормальную рамку считывания гена spnK.5. Способ по п.2, где инсерция представляет собой инсерцию одного или нескольких нуклеотидных оснований, которая нарушает нормальную рамку считывания гена spnK.6. Способ по п.2, где точковая мутация приводит к аминокислотной замене в активном центре или участке связывания субстрата гена spnK.7. Способ по п.2, где точковая мутация находится в положении пары оснований, выбранном из группы, состоящей из положения 528, 589, 602, 668, 721, 794, 862, 895, 908, 937 и 1131.8. Способ по п.2, где точковая мутация получена в результате химического мутагенеза.9. Способ по п.1, где ген spnK выключен с использованием антисмысловой технологии.10. Способ по п.1, где модификация происходит в кодирующей области spnK.11. Генетически модифицированная клетка-хозяин, которая продуцирует предшественник спинеторама, где генетически модифицированная клетка-хозяин представляет собой прокариотическую клетку-хозяина, которая в норме не продуцирует значительное количество предшественника спинеторама, включа
Claims (20)
1. Способ преобразования продуцирующего спиносад штамма в штамм, продуцирующий предшественника спинеторама, включающий внесение модификации в ген spnK для устранения активности 3'-O-метилтрансферазы.
2. Способ по п.1, где модификация выбрана из группы, состоящей из делеции в рамке считывания, точковой мутации, делеции и инсерции.
3. Способ по п.2, где делеция в рамке считывания выбрана из группы, состоящей из делеции в рамке считывания 5'-конца, делеции в рамке считывания 3'-конца и делеции в рамке считывания кодирующей области spnK.
4. Способ по п.2, где делеция представляет собой делецию одного или нескольких нуклеотидных оснований, которая нарушает нормальную рамку считывания гена spnK.
5. Способ по п.2, где инсерция представляет собой инсерцию одного или нескольких нуклеотидных оснований, которая нарушает нормальную рамку считывания гена spnK.
6. Способ по п.2, где точковая мутация приводит к аминокислотной замене в активном центре или участке связывания субстрата гена spnK.
7. Способ по п.2, где точковая мутация находится в положении пары оснований, выбранном из группы, состоящей из положения 528, 589, 602, 668, 721, 794, 862, 895, 908, 937 и 1131.
8. Способ по п.2, где точковая мутация получена в результате химического мутагенеза.
9. Способ по п.1, где ген spnK выключен с использованием антисмысловой технологии.
10. Способ по п.1, где модификация происходит в кодирующей области spnK.
11. Генетически модифицированная клетка-хозяин, которая продуцирует предшественник спинеторама, где генетически модифицированная клетка-хозяин представляет собой прокариотическую клетку-хозяина, которая в норме не продуцирует значительное количество предшественника спинеторама, включающую внесенную модификацию в гене spnK для устранения активности 3'-O-метилтрансферазы.
12. Способ преобразования продуцирующего спиносад штамма в штамм, продуцирующий предшественник спинеторама, включающий выключение гена spnK при сохранении продуцирования спинозина J и L.
13. Способ по п.12, где выключение гена spnK выбрано из группы, состоящей из делеции в рамке считывания, точковой мутации, делеции и инсерции.
14. Способ по п.12, где выключение гена spnK вызвано манипулированием с участком связывания рибосом.
15. Способ по п.14, где участок связывания рибосом представляет собой последовательность Шайна-Дальгарно в spnK.
16. Способ по п.12, где выключение гена spnK вызвано манипулированием с промотором гена spnK.
17. Способ по п.16, где промотор котранскрибируется с промотором для spnJ.
18. Способ по п.13, где делеция в рамке считывания выбрана из группы, состоящей из делеции в рамке считывания 5'-конца, делеции в рамке считывания 3'-конца и делеции в рамке считывания кодирующей области spnK.
19. Способ по п.13, где делеция представляет собой делецию одного или нескольких нуклеотидных оснований, которая нарушает нормальную рамку считывания гена spnK.
20. Способ по п.13, где точковая мутация приводит к аминокислотной замене в активном центре или участке связывания субстрата гена spnK.
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US33354010P | 2010-05-11 | 2010-05-11 | |
| US61/333,540 | 2010-05-11 | ||
| PCT/US2011/036028 WO2011143291A1 (en) | 2010-05-11 | 2011-05-11 | Spnk strains |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2012153212A true RU2012153212A (ru) | 2014-06-20 |
| RU2580015C2 RU2580015C2 (ru) | 2016-04-10 |
Family
ID=44626430
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2012153212/10A RU2580015C2 (ru) | 2010-05-11 | 2011-05-11 | Штаммы spnk |
Country Status (13)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US20110281359A1 (ru) |
| EP (1) | EP2569414A1 (ru) |
| JP (1) | JP2013531976A (ru) |
| KR (1) | KR20130080007A (ru) |
| CN (1) | CN103119152B (ru) |
| AU (1) | AU2011250904A1 (ru) |
| BR (1) | BR112012028860A2 (ru) |
| CA (1) | CA2798886A1 (ru) |
| IL (1) | IL222821A0 (ru) |
| MX (1) | MX342130B (ru) |
| RU (1) | RU2580015C2 (ru) |
| TW (1) | TW201201700A (ru) |
| WO (1) | WO2011143291A1 (ru) |
Families Citing this family (4)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN103740631B (zh) * | 2013-12-31 | 2015-09-30 | 天津大学 | 能提高多杀菌素产量的基因工程菌及构建方法及应用 |
| CN107815479B (zh) * | 2016-09-12 | 2021-07-13 | 牡丹江佰佳信生物科技有限公司 | 一种提高多杀霉素产量的发酵方法 |
| CN113355339B (zh) * | 2020-03-05 | 2023-01-24 | 山东大学 | 一种大型基因簇的无痕定点改造方法及其应用 |
| CN113999868A (zh) * | 2021-12-06 | 2022-02-01 | 齐鲁制药（内蒙古）有限公司 | 一种高产多杀菌素j/l的工程菌及其构建方法与应用 |
Family Cites Families (29)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US4302204A (en) | 1979-07-02 | 1981-11-24 | The Board Of Trustees Of Leland Stanford Junior University | Transfer and detection of nucleic acids |
| US4358535A (en) | 1980-12-08 | 1982-11-09 | Board Of Regents Of The University Of Washington | Specific DNA probes in diagnostic microbiology |
| FI63596C (fi) | 1981-10-16 | 1983-07-11 | Orion Yhtymae Oy | Mikrobdiagnostiskt foerfarande som grundar sig pao skiktshybridisering av nukleinsyror och vid foerfarandet anvaenda kombinationer av reagenser |
| US4994373A (en) | 1983-01-27 | 1991-02-19 | Enzo Biochem, Inc. | Method and structures employing chemically-labelled polynucleotide probes |
| US4683195A (en) | 1986-01-30 | 1987-07-28 | Cetus Corporation | Process for amplifying, detecting, and/or-cloning nucleic acid sequences |
| US4683202A (en) | 1985-03-28 | 1987-07-28 | Cetus Corporation | Process for amplifying nucleic acid sequences |
| US4965188A (en) | 1986-08-22 | 1990-10-23 | Cetus Corporation | Process for amplifying, detecting, and/or cloning nucleic acid sequences using a thermostable enzyme |
| US4800159A (en) | 1986-02-07 | 1989-01-24 | Cetus Corporation | Process for amplifying, detecting, and/or cloning nucleic acid sequences |
| US5202231A (en) | 1987-04-01 | 1993-04-13 | Drmanac Radoje T | Method of sequencing of genomes by hybridization of oligonucleotide probes |
| US5030557A (en) | 1987-11-24 | 1991-07-09 | Ml Technology Venture | Means and method for enhancing nucleic acid hybridization |
| PE5591A1 (es) | 1988-12-19 | 1991-02-15 | Lilly Co Eli | Un nuevo grupo de compuestos de macrolida |
| US5362634A (en) | 1989-10-30 | 1994-11-08 | Dowelanco | Process for producing A83543 compounds |
| US5231020A (en) | 1989-03-30 | 1993-07-27 | Dna Plant Technology Corporation | Genetic engineering of novel plant phenotypes |
| US5034323A (en) | 1989-03-30 | 1991-07-23 | Dna Plant Technology Corporation | Genetic engineering of novel plant phenotypes |
| US5219726A (en) | 1989-06-02 | 1993-06-15 | The Salk Institute For Biological Studies | Physical mapping of complex genomes |
| CN1073483A (zh) | 1991-11-08 | 1993-06-23 | 道伊兰科公司 | 一种发酵杀虫剂化合物及其制备方法 |
| JP4258575B2 (ja) | 1993-03-12 | 2009-04-30 | ダウ・アグロサイエンス・エル・エル・シー | 新規ａ８３５４３化合物及びそれらの製造法 |
| US5770365A (en) | 1995-08-25 | 1998-06-23 | Tm Technologies, Inc. | Nucleic acid capture moieties |
| US6001981A (en) | 1996-06-13 | 1999-12-14 | Dow Agrosciences Llc | Synthetic modification of Spinosyn compounds |
| GB9710475D0 (en) | 1997-05-21 | 1997-07-16 | Zeneca Ltd | Gene silencing |
| US6506559B1 (en) | 1997-12-23 | 2003-01-14 | Carnegie Institute Of Washington | Genetic inhibition by double-stranded RNA |
| US6143526A (en) | 1998-03-09 | 2000-11-07 | Baltz; Richard H. | Biosynthetic genes for spinosyn insecticide production |
| CA2325344C (en) | 1998-04-08 | 2017-12-05 | Commonwealth Scientific And Industrial Research Organisation | Methods and means for obtaining modified phenotypes |
| AU2070201A (en) * | 1999-12-07 | 2001-06-18 | Regents Of The University Of California, The | Acyl glucosaminyl inositol amidase family and methods of use |
| AR033022A1 (es) * | 2001-03-30 | 2003-12-03 | Dow Agrosciences Llc | Genes biosinteticos para la produccion de insecticida de butenilespinosina |
| US20030225006A1 (en) | 2002-02-19 | 2003-12-04 | Burns Lesley S | Novel spinosyn-producing polyketide synthases |
| US7195907B2 (en) * | 2002-03-29 | 2007-03-27 | Wyeth | Non-ribosomal peptide synthetases and associated biosynthetic genes |
| WO2008002600A2 (en) * | 2006-06-26 | 2008-01-03 | The Regents Of The University Of California | Biosynthesis of salinosporamide a and analogs and methods thereof |
| CN100562565C (zh) * | 2006-11-14 | 2009-11-25 | 湖南师范大学 | 多杀菌素基因重组的工程菌菌剂 |
-
2011
- 2011-05-11 AU AU2011250904A patent/AU2011250904A1/en not_active Abandoned
- 2011-05-11 CN CN201180034360.8A patent/CN103119152B/zh active Active
- 2011-05-11 MX MX2012013099A patent/MX342130B/es active IP Right Grant
- 2011-05-11 WO PCT/US2011/036028 patent/WO2011143291A1/en active Application Filing
- 2011-05-11 BR BR112012028860-1A patent/BR112012028860A2/pt not_active Application Discontinuation
- 2011-05-11 TW TW100116479A patent/TW201201700A/zh unknown
- 2011-05-11 JP JP2013510270A patent/JP2013531976A/ja active Pending
- 2011-05-11 US US13/105,241 patent/US20110281359A1/en not_active Abandoned
- 2011-05-11 CA CA2798886A patent/CA2798886A1/en not_active Abandoned
- 2011-05-11 EP EP11720277A patent/EP2569414A1/en not_active Withdrawn
- 2011-05-11 KR KR1020127029403A patent/KR20130080007A/ko not_active Application Discontinuation
- 2011-05-11 RU RU2012153212/10A patent/RU2580015C2/ru active
-
2012
- 2012-11-01 IL IL222821A patent/IL222821A0/en unknown
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| RU2580015C2 (ru) | 2016-04-10 |
| MX342130B (es) | 2016-09-14 |
| JP2013531976A (ja) | 2013-08-15 |
| BR112012028860A2 (pt) | 2020-09-01 |
| TW201201700A (en) | 2012-01-16 |
| CN103119152A (zh) | 2013-05-22 |
| CN103119152B (zh) | 2015-05-20 |
| WO2011143291A1 (en) | 2011-11-17 |
| US20110281359A1 (en) | 2011-11-17 |
| IL222821A0 (en) | 2012-12-31 |
| KR20130080007A (ko) | 2013-07-11 |
| AU2011250904A1 (en) | 2012-11-08 |
| MX2012013099A (es) | 2013-01-22 |
| CA2798886A1 (en) | 2011-11-17 |
| EP2569414A1 (en) | 2013-03-20 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| DK1987153T3 (da) | Frembringelse af lavmolekylær hyalurosyre | |
| WO2013027999A3 (ko) | 열 안정성이 향상된 사이코스 에피머화 효소 변이체 및 이를 이용한 사이코스의 연속적 생산 | |
| MX2015016967A (es) | Metodo para producir composiciones organicas de oxihidrogeno y co2 via acetoacetil-coa como producto intermedio. | |
| NZ602958A (en) | High level expression of recombinant toxin proteins | |
| WO2011142865A3 (en) | Yeast microorganisms with reduced by-product accumulation for improved production of fuels, chemicals, and amino acids | |
| MY157111A (en) | Recombinant microorganisms and methods of production thereof | |
| NZ700902A (en) | Lowering saturated fatty acid content of plant seeds | |
| NZ596660A (en) | Dig-5 insecticidal cry toxins | |
| RU2012153212A (ru) | ШТАММЫ spnK | |
| WO2013049121A3 (en) | Recombinant phage and methods | |
| MX345399B (es) | Metodo de cultivo de celulas animales. | |
| NZ587858A (en) | Novel 12 alpha-hydroxysteroid dehydrogenases, production and use thereof | |
| MY167122A (en) | Modulating beta-damascenone in plants | |
| MX349345B (es) | Proceso de produccion de celulasas para hongo filamentoso adaptado a fermentador que tiene un coeficiente reducido de transferencia volumetrica del oxigeno. | |
| NZ594110A (en) | Method of double crossover homologous recombination in clostridia | |
| WO2013041969A3 (en) | Didemnin biosynthetic gene cluster in tistrella mobilis | |
| MY185050A (en) | A pentose sugar fermenting cell | |
| WO2013085361A3 (ko) | 4-하이드록시부티릭산 고생성능을 가지는 변이 미생물 및 이를 이용한 4-하이드록시부티릭산의 제조방법 | |
| WO2013182553A3 (en) | CELL ENGINEERING USING RNAs | |
| WO2011159092A3 (ko) | 신규 토양 미생물과 상기 토양 미생물로부터 분리된 신규한 산화환원효소, 상기 산화환원 효소를 암호화하는 유전자 및 이들을 이용한 비당체의 생산방법 | |
| WO2010036391A3 (en) | A novel rna-based expression system | |
| WO2012070795A3 (ko) | 고구마 유래의 ＩｂＯｒ-Ｉｎｓ 유전자 변이체 및 이의 용도 | |
| NZ599479A (en) | Improved reverse genetics methods for virus rescue | |
| CN103589744B (zh) | 一种敲除prcR基因的***质粒pYTRLRRT及其构建方法 | |
| RU2016141403A (ru) | Микроорганизм для продуцирования диамина и способ получения диамина с его использованием |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| TC4A | Change in inventorship |
Effective date: 20160524 |
|
| PD4A | Correction of name of patent owner |