KR20080027775A - 피롤(２,３-ｂ)피리딘 유도체 단백질 키나제 억제제 - Google Patents

피롤(２,３-ｂ)피리딘 유도체 단백질 키나제 억제제 Download PDF

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Abstract

<화학식 I>
Figure 112007090494669-PCT00173
수용체 단백질 티로신 키나제 c-kit 및 c-fms에 대해 활성인 화합물을 본원에서 제공한다. c-kit 매개 질환 또는 상태 및 c-fms 매개 질환 또는 상태의 치료에 유용한 조성물 및 그의 사용을 위한 방법이 또한 본원에 제공된다.
수용체 단백질 티로신 키나제, c-kit, c-fms, 질환 치료, 조성물, 방법

Description

피롤(２,３-Ｂ)피리딘 유도체 단백질 키나제 억제제 {PYRROLE(2,3-B)PYRIDINE DERIVATIVES PROTEIN KINASE INHIBITORS}
본 발명은 c-kit 및 c-fms에 대한 리간드, 및 그의 사용 방법에 관한 것이다. 제공된 정보는 전적으로 독자의 이해를 돕기 위한 것이다. 제공된 정보나 인용된 참고문헌은 본 발명에 대한 선행 기술로 인정되지 않는다. 각각의 인용된 참고문헌은 임의의 목적으로 그 전문이 본원에 포함된다.
c-kit 및 c-fms는 둘다 세포 성장 및 증식을 제어하는 핵심적인 신호 전달 케스케이드를 조절하는 타입 III 막횡단 수용체 단백질 티로신 키나제 (RPTK)이다. 두 수용체는 5개의 세포외 면역글로불린 (IG) 도메인, 단일 막횡단 도메인, 및 키나제 삽입 세그먼트에 의해 분리된 스플리트 (split) 세포질 키나제 도메인을 포함하는 유사한 구조 특징을 갖는다.
c- KIT
줄기 세포 인자 (SCF) 수용체 c-kit는 멜라닌세포 및 비만, 생식 및 조혈 세포의 발생에서 중요한 역할을 한다. 줄기 세포 인자 (SCF)는 S1 로커스 (locus)에 의해 코딩되는 단백질이고, 그를 확인하기 위해 사용된 생물학적 특성에 기초하여 "kit 리간드" (KL) 및 비만 세포 성장 인자 (MGF)로도 불렸다 (문헌 (Tsujimura, Pathol Int 1996, 46:933-938; Loveland, et al., J. Endocrinol 1997, 153:337-344; Vliagoftis, et al., Clin Immunol 1997, 100:435-440; Broudy, Blood 1997, 90:1345-1364; Pignon, Hermatol Cell Ther 1997, 39:114-116; 및 Lyman, et al., Blood 1998, 91:1101-1134)에 개관됨). 본원에서 약어 SCF는 c-kit에 대한 생리학적 리간드를 의미한다.
SCF는 엑손 6을 코딩하는 mRNA의 선택적 스플라이싱 (alternative splicing)에 따라 분자량 220 또는 248 달톤의 막횡단 단백질로서 합성된다. 보다 큰 단백질은 단백분해적 절단되어 비공유적으로 이량체화하는 가용형 글리코실화 단백질을 형성할 수 있다. SCF의 가용형 및 막-결합 형태는 모두 c-kit에 결합하여 활성화시킬 수 있다. 예를 들어, 피부에서, SCF는 섬유모세포, 각질세포, 및 내피 세포에 의해 주로 발현되고, 이는 c-kit를 발현하는 멜라닌세포 및 비만 세포의 활성을 조절한다. 뼈에서, 골수 간질 세포는 SCF를 발현하고 c-kit 발현 줄기 세포의 조혈을 조절한다. 위장관에서, 장 상피 세포는 SCF를 발현하고, 카잘 (Cajal) 및 상피내 림프구의 사이질 세포에 영향을 미친다. 고환에서, 세르톨리 (Sertoli) 세포 및 과립층 세포는 SCF를 발현하고, 이는 생식 세포 상에서 c-kit와의 상호작용에 의해 정자형성을 조절한다.
c- Fms
c-fms는 고양이 육종 바이러스의 수잔 맥도너 (Susan McDonough) 균주로부터 최초로 단리된 유전자의 패밀리의 구성원이다. 세포성 원-발암유전자 FMS (c-fms, cellular feline McDonough 육종)는 대식세포 콜로니 자극 인자 (M-CSF)에 대한 수용체를 코딩한다. c-fms는 단핵구-대식세포 연결의 성장 및 분화를 위해 중대하고, M-CSF가 c-fms의 세포외 도메인에 결합 시에, 수용체는 이량체화하고 세포질 티로신 잔기를 트랜스-자가인산화시킨다.
로빈슨 (Robinson)과 동료들 (Blood. 1969, 33:396-9)에 의해 처음 설명된M-CSF는 대식세포의 생산, 분화, 및 기능을 제어하는 사이토킨이다. M-CSF는 기원 세포의 성숙 단핵구로의 분화를 자극하고, 단핵구의 생존을 연장시킨다. 또한, M-CSF는 단핵구 및 대식세포에서 세포독성, 과산화물 생산, 포식작용, 화학주성, 및 추가의 인자의 2차 사이토킨 생산을 향상시킨다. 상기 추가의 인자의 예는 과립구 콜로니 자극 인자 (G-CSF), 인터루킨-6 (IL-6), 및 인터루킨-8 (IL-8)을 포함한다. M-CSF는 조혈을 자극하고, 파골세포 기원 세포의 분화 및 증식을 촉진하고, 지질 대사에 대해 현저한 효과를 갖는다. 또한, M-CSF는 임신에 있어서 중요하다. 생리학적으로, 다량의 M-CSF가 태반에서 생산되고, M-CSF는 영양막 분화에서 필수 역할을 하는 것으로 믿어진다 (Motoyoshi, Int J Hematol. 1998, 67:109-22). 초기 임신에서 M-CSF의 상승된 혈청 수준은 임신의 유지에 책임을 지는 면역학 기전에 참여할 수 있다 (Flanagan ＆ Lader, Curr Opin Hematol. 1998, 5:181-5).
2개의 혈소판-유래 성장 인자 수용체 (platelet-derived growth factor receptors), 알파 (alpha) (즉, pdgfra) 및 베타 (beta) (pdgfrb) (PDGF)가 c-fms 및 c-kit에 관련된다. pdgfra를 코딩하는 유전자는 c-kit를 코딩하는 발암유전자와 염색체 4의 동일한 구역에서 염색체 4q11-q12에 위치한다. pdgfra 및 c-fms를 코딩하는 유전자는 상기 2개의 유전자가 염색체 5 상에서 직렬로 연결되므로 유전자 복제에 의해 공통의 조상 유전자로부터 진화한 것으로 보인다. 이들은 pdgfra를 코딩하는 유전자의 마지막 3-프라임 (prime) 엑손으로부터 단지 500 bp에 위치하는 c-fms 유전자의 5-프라임 엑손과 헤드-투-테일 (head-to-tail)로 배향된다. 대부분의 위장관 기질 종양 (GIST)은 c-kit에서 활성화 돌연변이를 갖고, GIST를 갖는 환자의 대부분은 c-kit를 억제하는 글리벡 (Gleevec)에 잘 반응한다. 하인리히 (Heinrich) 등 (Science 2003, 299:708-10)은 c-kit 돌연변이가 결핍된 GIST의 약 35％가 pdgfra를 코딩하는 유전자에서 유전자내 활성화 돌연변이를 갖고, c-kit 또는 pdgfra를 발현하는 종양은 하류 시그널링 중간체의 활성화 및 종양 진행과 연관된 세포유전 변화에 관하여 구별될 수 없음을 보였다. 따라서, c-kit 및 pdgfra 돌연변이는 GIST에서 선택적이고 상호 배타적인 발암 기전인 것으로 보인다.
유사하게, M-CSF (주요 대식세포 성장 인자)의 생산이 염증 동안 조직에서 증가된다는 관찰은 예를 들어, 염증성 질병과 같은 질병에서 c-fms에 대한 역할을 지적한다. 보다 특히, 상승된 수준의 M-CSF가 질병 상태에서 발견되기 때문에, c-fms의 활성의 조절은 증가된 수준의 M-CSF와 연관된 질병을 개선할 수 있다.
따라서, c-kit 및/또는 c-fms의 강력하고 특이적인 억제제 및 조절제 및 그를 설계하기 위한 방법이 당업계에 필요하다.
<발명의 개요>
본 발명은 c-kit, c-fms, 또는 c-kit 및 c-fms 모두에 활성인 화합물에 관한 것이다. 본 발명의 한 측면에 따르면, 유효량의 c-kit 단독 또는 c-fms 단독의 조 절제에 의한 치료를 받을 수 있는 질병의 치료에서, 상기 화합물이 c-kit 및 c-fms 모두의 이중 억제제인 경우 치료 효능은 향상될 수 있는 것으로 밝혀졌다. 특히, 본 발명은 하기 설명된 바와 같은 화학식 I의 화합물, 그의 모든 염, 전구약물, 호변이성질체 및 이성질체를 사용하는 방법을 제공한다. 따라서, 본 발명은 c-kit, c-fms, 또는 c-kit 및 c-fms 모두의 조절을 포함하는 치료상 및/또는 예방상 사용될 수 있는 화합물을 사용하는 방법을 제공한다.
화학식 I의 화합물은 다음 구조를 갖는다:
Figure 112007090494669-PCT00001
여기서, X1은 N 또는 CR2이고, X2는 N 또는 CR6이고, Y1은 N 또는 CR4이고, Y2는 N 또는 CR5이되, X2, Y1 및 Y2 중 1개 이하가 N이고;
L1은 임의로 치환된 저급 알킬렌, -S-, -O-, -C(O)-, -C(S)-, -S(O)-, -S(O)2-, 및 -NR7-로 이루어지는 군 중에서 선택되고;
L2는 결합, 임의로 치환된 저급 알킬렌, -(alk)a-S-(alk)b-, -(alk)a-O- (alk)b-, -(alk)a-OC(O)-(alk)b-, -(alk)a-C(O)O-(alk)b-, -(alk)a-OC(S)-(alk)b-, -(alk)a-C(S)O-(alk)b-, -(alk)a-C(O)-(alk)b-, -(alk)a-C(S)-(alk)b-, -(alk)a-C(O)NR9-(alk)b-, -(alk)a-OC(O)NR9-(alk)b-, -(alk)a-OC(S)NR9-(alk)b-, -(alk)a-C(S)NR9-(alk)b-, -(alk)a-S(O)-(alk)b-, -(alk)a-S(O)2-(alk)b-, -(alk)a-S(O)2NR9-(alk)b-, -(alk)a-NR9-(alk)b-, -(alk)a-NR9C(O)-(alk)b-, -(alk)a-NR9C(S)-(alk)b-, -(alk)a-NR9C(O)NR9-(alk)b-, -(alk)a-NR9C(S)NR9-(alk)b-, -(alk)a-NR9C(O)O-(alk)b-, -(alk)a-NR9C(S)O-(alk)b-, -(alk)a-NR9S(O)2-(alk)b-, 및 -(alk)a-NR9S(O)2NR9-(alk)b-로 이루어지는 군 중에서 선택되고, 여기서 alk는 임의로 치환된 C1 -3 알킬렌이고, a 및 b는 독립적으로 0 또는 1이고;
R1은 임의로 치환된 저급 알킬, 임의로 치환된 시클로알킬, 임의로 치환된 헤테로시클로알킬, 임의로 치환된 아릴, 및 임의로 치환된 헤테로아릴로 이루어지는 군 중에서 선택되고;
R2, R4, R5 및 R6은 수소, 할로겐, 임의로 치환된 저급 알킬, 임의로 치환된 저급 알케닐, 임의로 치환된 저급 알키닐, 임의로 치환된 시클로알킬, 임의로 치환된 헤테로시클로알킬, 임의로 치환된 아릴, 임의로 치환된 헤테로아릴, -OH, -NH2, -NO2, -CN, -C(O)OH, -C(S)OH, -C(O)NH2, -C(S)NH2, -S(O)2NH2, -NHC(O)NH2, -NHC(S)NH2, -NHS(O)2NH2, -NR10R11, -NHR3, -OR3, -SR3, -C(O)R3, -C(S)R3, -S(O)R3, -S(O)2R3, -C(O)OR3, -C(S)OR3, -C(O)NHR3, -C(O)NR3R3, -C(S)NHR3, -C(S)NR3R3, -S(O)2NHR3, -S(O)2NR3R3, -NHC(O)R3, -NR3C(O)R3, -NHC(S)R3, -NR3C(S)R3, -NHS(O)2R3, -NR3S(O)2R3, -NHC(O)OR3, -NR3C(O)OH, -NR3C(O)OR3, -NHC(S)OR3, -NR3C(S)OH, -NR3C(S)OR3, -NHC(O)NHR3, -NHC(O)NR3R3, -NR3C(O)NH2, -NR3C(O)NHR3, -NR3C(O)NR3R3, -NHC(S)NHR3, -NHC(S)NR3R3, -NR3C(S)NH2, -NR3C(S)NHR3, -NR3C(S)NR3R3, -NHS(O)2NHR3, -NHS(O)2NR3R3, -NR3S(O)2NH2, -NR3S(O)2NHR3, 및 -NR3S(O)2NR3R3으로 이루어지는 군 중에서 독립적으로 선택되고;
Ar1은 하기 구조를 갖는 5 또는 6원의 임의로 치환된 헤테로아릴렌이고,
Figure 112007090494669-PCT00002
여기서,
Figure 112007090494669-PCT00003
는 L1의 부착 지점을 나타내고,
Figure 112007090494669-PCT00004
는 L2의 부착 지점을 나타 내고, 여기서 표시된 N은 =N- 또는 -N=이고;
n은 0 또는 1이고;
F 및 J는 둘다 C이거나, F 및 J 중 하나는 C이고 F 및 J 중 다른 하나는 N이고;
P 및 Q는 CR, N, NR, O 또는 S 중에서 독립적으로 선택되고;
T는 CR 또는 N 중에서 선택되고;
여기서, n이 1일 때, F 및 J는 C이고, P, T 및 Q는 CR이거나, P, T 및 Q 중 임의의 하나는 N이고 P, T 및 Q 중 다른 2개는 CR이고,
n이 0이고 F 및 J가 둘다 C일 때, P 및 Q 중 하나는 CR, N 또는 NR이고 P 및 Q 중 다른 하나는 C, N, NR, O 또는 S이되, P 및 Q가 둘다 CR인 것은 아니고,
n이 0이고, F 및 J 중 하나는 N이고 F 및 J 중 다른 하나는 C일 때, P 및 Q 중 하나는 N이고 P 및 Q 중 다른 하나는 CR이거나, P 및 Q는 둘다 CR이고,
R은 수소, 또는 안정한 화합물을 제공하는 임의로 치환된 헤테로아릴렌에 대해 본원에서 정의된 바와 같은 선택적인 치환체이고;
R3은 각각 임의로 치환된 저급 알킬, 임의로 치환된 저급 알케닐 (그러나, 단, 그의 알켄 탄소는 임의의 -OR3, -SR3, -C(O)R3, -C(S)R3, -S(O)R3, -S(O)2R3, -C(O)OR3, -C(S)OR3, -C(O)NHR3, -C(O)NR3R3, -C(S)NHR3, -C(S)NR3R3, -S(O)2NHR3, -S(O)2NR3R3, -NHR3, -NHC(O)R3, -NR3C(O)R3, -NHC(S)R3, -NR3C(S)R3, -NHS(O)2R3, -NR3S(O)2R3, -NHC(O)OR3, -NR3C(O)OH, -NR3C(O)OR3, -NHC(S)OR3, -NR3C(S)OH, -NR3C(S)OR3, -NHC(O)NHR3, -NHC(O)NR3R3, -NR3C(O)NH2, -NR3C(O)NHR3, -NR3C(O)NR3R3, -NHC(S)NHR3, -NHC(S)NR3R3, -NR3C(S)NH2, -NR3C(S)NHR3, -NR3C(S)NR3R3, -NHS(O)2NHR3, -NHS(O)2NR3R3, -NR3S(O)2NH2, -NR3S(O)2NHR3, 또는 -NR3S(O)2NR3R3의 임의의 -C(O)-, -C(S)-, -S(O)-, -S(O)2-, -O-, -S-, 또는 -N-에 결합되지 않는다), 임의로 치환된 저급 알키닐 (그러나, 단, 그의 알킨 탄소는 임의의 -OR3, -SR3, -C(O)R3, -C(S)R3, -S(O)R3, -S(O)2R3, -C(O)OR3, -C(S)OR3, -C(O)NHR3, -C(O)NR3R3, -C(S)NHR3, -C(S)NR3R3, -S(O)2NHR3, -S(O)2NR3R3, -NHR3, -NHC(O)R3, -NR3C(O)R3, -NHC(S)R3, -NR3C(S)R3, -NHS(O)2R3, -NR3S(O)2R3, -NHC(O)OR3, -NR3C(O)OH, -NR3C(O)OR3, -NHC(S)OR3, -NR3C(S)OH, -NR3C(S)OR3, -NHC(O)NHR3, -NHC(O)NR3R3, -NR3C(O)NH2, -NR3C(O)NHR3, -NR3C(O)NR3R3, -NHC(S)NHR3, -NHC(S)NR3R3, -NR3C(S)NH2, -NR3C(S)NHR3, -NR3C(S)NR3R3, -NHS(O)2NHR3, -NHS(O)2NR3R3, -NR3S(O)2NH2, -NR3S(O)2NHR3, 또는 -NR3S(O)2NR3R3의 임의의 -C(O)-, -C(S)-, -S(O)-, -S(O)2-, -O-, -S-, 또는 -N-에 결합되지 않는다), 임의로 치환된 시클로알킬, 임의로 치환된 헤테로시클로알킬, 임의로 치환된 아릴, 및 임의로 치환된 헤테로아릴로 이루어지는 군 중에서 독립적으로 선택되고;
R7은 수소, 임의로 치환된 저급 알킬, 임의로 치환된 시클로알킬, 임의로 치환된 헤테로시클로알킬, 임의로 치환된 아릴, 임의로 치환된 헤테로아릴, -C(O)R8, 및 -S(O)2R8로 이루어지는 군 중에서 선택되고;
R8은 임의로 치환된 저급 알킬, 임의로 치환된 시클로알킬, 임의로 치환된 헤테로시클로알킬, 임의로 치환된 아릴 및 임의로 치환된 헤테로아릴로 이루어지는 군 중에서 선택되고;
R9는 각각 수소, 저급 알킬, 및 플루오로, -OH, -NH2, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 플루오로 치환된 저급 알킬티오, 모노-알킬아미노, 플루오로 치환된 모노-알킬아미노, 디-알킬아미노, 플루오로 치환된 디-알킬아미노, 및 -NR12R13으로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 치환된 저급 알킬로 이루어지는 군 중에서 독립적으로 선택되지만, 단, R9가 치환된 저급 알킬일 때, -NR9-의 -N-에 결합된 알킬 탄소 상의 임의의 치환체는 플루오로이고;
R10 및 R11은 각각 임의로 치환된 저급 알킬, 임의로 치환된 저급 알케닐 (그러나, 단, 그의 알켄 탄소는 -NR10R11의 질소에 결합되지 않는다), 임의로 치환된 저급 알키닐 (그러나, 단, 그의 알킨 탄소는 -NR10R11의 질소에 결합되지 않는다), 임의로 치환된 시클로알킬, 임의로 치환된 헤테로시클로알킬, 임의로 치환된 아릴, 및 임의로 치환된 헤테로아릴로 이루어지는 군 중에서 독립적으로 선택되거나; 또는
R10 및 R11은 그들이 부착된 질소와 함께 임의로 치환된 5-7원의 모노시클릭 헤테로시클로알킬 또는 임의로 치환된 5 또는 7원의 모노시클릭 질소 함유 헤테로아릴을 형성하고;
R12 및 R13은 그들이 부착된 질소와 결합하여 5-7원의 헤테로시클로알킬, 또는 플루오로, -OH, -NH2, 저급 알킬, 플루오로 치환된 저급 알킬, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 및 플루오로 치환된 저급 알킬티오로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 치환된 5-7원의 헤테로시클로알킬을 형성하지만;
화합물이
Figure 112007090494669-PCT00005
의 구조를 갖고 L1a가 -CH2-, -CH(OH)-, 또는 -C(O)-이면, R1a는 페닐, 4-트리플루오로메틸-페닐, 4-메톡시-페닐, 4-클로로-페닐, 4-플루오로-페닐, 4-메틸-페닐, 3-플루오로-페닐 또는 티오펜-2-일이 아니고, 화합물은 하기 구조를 갖지 않는다:
Figure 112007090494669-PCT00006
화학식 I과 관련하여, X1, X2, Y1 및 Y2를 CH로서 갖고 H로 교체된 L1-Ar1-L2-R1을 갖는 상기 도시된 코어 구조는 "아자인돌 코어"로서 불린다. 상기 아자인돌 코어에 있어서, 고리 원자 또는 고리 위치에 대한 참조는 다음 구조에 나타낸 바와 같다:
Figure 112007090494669-PCT00007
화학식 I의 화합물의 한 실시태양에서, 화합물은 다음 구조 중에서 선택된 구조를 갖는다:
Figure 112007090494669-PCT00008
여기서, L1, Ar1, L2, R1, R2, R4, R5 및 R6은 화학식 I에 대해서 정의된 바와 같다.
화학식 I의 화합물의 한 실시태양에서, X1 및 X2는 N 또는 CH이다. 다른 실시태양에서, X1, X2 및 Y1은 N 또는 CH이고, 추가의 실시태양에서, Y2는 CR5이고 R5는 수소 이외의 것이다. 다른 실시태양에서, X1, X2 및 Y2는 N 또는 CH이고, 추가의 실시태양에서, Y1은 CR4이고 R4는 수소 이외의 것이다. 다른 실시태양에서, X1, X2 및 Y1은 CH이고, 추가의 실시태양에서, Y2는 CR5이고 R5는 수소 이외의 것이다. 다 른 실시태양에서, X1, X2 및 Y2는 CH이고, 추가의 실시태양에서 Y1은 CR4이고 R4는 수소 이외의 것이다.
화학식 I의 화합물의 한 실시태양에서, X1, X2, Y1 및 Y2는 각각 독립적으로 CR2, CR6, CR4 및 CR5이고, R4 또는 R5 중 하나는 수소 이외의 것이고, 바람직하게는 여기서 R2 및 R6은 수소이다. 한 실시태양에서, X1, X2, Y1 및 Y2는 각각 독립적으로 CR2, CR6, CR4 및 CR5이고, R2, R5 및 R6은 수소이고 R4는 수소 이외의 것이다. 한 실시태양에서, X1, X2, Y1 및 Y2는 각각 독립적으로 CR2, CR6, CR4 및 CR5이고, R2, R4 및 R6은 수소이고 R5는 수소 이외의 것이다.
화학식 I의 화합물의 한 실시태양에서, X1 및 X2는 N 또는 CH이고, 바람직하게는 여기서 X1 및 X2는 둘다 CH이다.
화학식 I의 화합물의 한 실시태양에서, L1은 -S-, -O- 저급 알킬렌, -C(O)-, -C(S)-, -S(O)-, -S(O)2-, 및 -NR7-로 이루어지는 군 중에서 선택되고, 저급 알킬렌은 플루오로로 임의로 치환되고, 여기서 L2가 임의로 치환된 저급 알킬렌이거나 임의로 치환된 C1 -3 알킬렌을 포함할 때, 알킬렌은 플루오로 또는 저급 알킬로 임의로 치환된다. 한 실시태양에서, L1은 -S-, -O-, -CH2-, -CF2-, -C(O)-, -C(S)-, -S(O)-, -S(O)-, 및 -NH-로 이루어지는 군 중에서 선택된다.
화학식 I의 화합물의 한 실시태양에서, L2는 결합, 임의로 치환된 저급 알킬렌, -O-(alk)b-, -OC(O)-(alk)b-, -C(O)O-(alk)b-, -OC(S)-(alk)b-, -C(S)O-(alk)b-, -C(O)-(alk)b-, -C(S)-(alk)b-, -C(O)NR9-(alk)b-, -OC(O)NR9-(alk)b-, -OC(S)NR9-(alk)b-, -C(S)NR9-(alk)b-, -S(O)-(alk)b-, -S(O)2-(alk)b-, S(O)2NR9-(alk)b-, -NR9-(alk)b-, -NR9C(O)-(alk)b-, -NR9C(O)O-(alk)b-, -NR9C(S)-(alk)b-, -NR9C(S)O-(alk)b-, -NR9C(O)NR9-(alk)b-, -NR9C(S)NR9-(alk)b-, -NR9S(O)2-(alk)b-, 및 -NR9S(O)2NR9-(alk)b-로 이루어지는 군 중에서 선택된다.
화학식 I의 임의의 상기 실시태양에 추가로, L1이 치환된 저급 알킬렌일 때 또는 L2가 치환된 저급 알킬렌이거나 치환된 C1 -3 알킬렌을 포함할 때, 알킬렌은 하나 이상, 바람직하게는 1, 2 또는 3개의 플루오로, -OH, -NH2, 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 모노-알킬아미노, 디-알킬아미노, 및 -NR12R13으로 이루어지는 군 중에서 선택되는 치환체로 치환되고, 여기서 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 모노-알킬아미 노 또는 디-알킬아미노의 알킬 사슬(들)은 하나 이상, 바람직하게는 1, 2 또는 3개의 플루오로, -OH, -NH2, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 플루오로 치환된 저급 알킬티오, 모노-알킬아미노, 디-알킬아미노, 또는 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택되는 치환체로 임의로 치환된다.
화학식 I의 화합물의 한 실시태양에서, 변수 P, J, Q, T, F, 및 n은 하기 구조들로 이루어진 군 중에서 선택되는 Ar1의 구조를 제공하도록 선택되고,
Figure 112007090494669-PCT00009
Figure 112007090494669-PCT00010
여기서, 각각의 R은 독립적으로 수소, 또는 임의로 치환된 헤테로아릴에 대해 본원에서 정의된 바와 같은 선택적인 치환체이다.
화학식 I의 화합물, 및 본원에서 상세히 설명되는 모든 하위 실시태양은 본원에 개시된 것과 같은 Kit 및/또는 Fms 단백질 키나제 매개 질환 또는 상태에 걸려 있거나 그러한 위험이 있는 대상을 치료하기 위해 사용될 수 있다.
한 실시태양에서, 화학식 I의 화합물, 그의 모든 염, 전구약물, 호변이성질 체 및 이성질체는 하기 하위-일반 구조, 화학식 Ia에 따른 구조를 갖는다,
Figure 112007090494669-PCT00011
여기서, L1, Ar1, R1, R2, R4, R5 및 R6은 화학식 I에 대해서 정의된 바와 같고;
L3은 결합, 임의로 치환된 저급 알킬렌, -O-(alk)b-, -S-(alk)b-, -NR14-(alk)b-, -C(O)-(alk)b-, -C(S)-(alk)b-, -S(O)-(alk)b-, -S(O)2-(alk)b-, -NR14C(O)-(alk)b-, -C(O)NR14-(alk)b-, -S(O)2NR14-(alk)b-, -NR14S(O)2-(alk)b-, -NR14C(O)NR14-(alk)b-, -NR14C(S)NR14-(alk)b-, 및 -NR14S(O)2NR14-(alk)b-로 이루어지는 군 중에서 선택되고;
alk는 임의로 치환된 저급 알킬렌이고;
b는 0 또는 1이고;
R14는 수소 또는 저급 알킬이다.
화학식 Ia의 화합물의 다른 실시태양에서, R2, R5 및 R6은 수소이고, 추가로 R4는 수소 이외의 것이다. 다른 실시태양에서, R2, R4 및 R6은 수소이고, 추가로 R5 수소 이외의 것이다.
화학식 Ia의 화합물, 및 본원에서 상세히 설명되는 모든 하위 실시태양은 본원에 개시된 것과 같은 Kit 및/또는 Fms 단백질 키나제 매개 질환 또는 상태에 걸려 있거나 그러한 위험이 있는 대상을 치료하기 위해 사용될 수 있다.
특정 실시태양에서, 화학식 I의 화합물, 그의 모든 염, 전구약물, 호변이성질체 및 이성질체는 하기 하위-일반 구조, 화학식 Ib에 따른 구조를 갖는다,
Figure 112007090494669-PCT00012
여기서, V 및 W는 N 및 CH로 이루어지는 군 중에서 독립적으로 선택되고;
U 및 Z는 N 및 CR18로 이루어지는 군 중에서 독립적으로 선택되지만, 단, W, U 및 Z 중 1개 이하가 N이고;
A는 -CR19R20-, -C(O)-, -C(S)-, -S-, -S(O)-, -S(O)2-, -NR21-, 및 -O-로 이루어지는 군 중에서 선택되고;
n은 0 또는 1이고;
F 및 J는 둘다 C이거나, F 및 J 중 하나는 C이고 F 및 J 중 다른 하나는 N이고;
E 및 K는 C, N, O 또는 S로부터 선택되고;
G는 C 또는 N으로부터 선택되고;
여기서, n이 1일 때, F 및 J는 C이고, E, G 및 K는 C이거나, E, G 및 K 중 임의의 하나는 N이고 E, G 및 K 중 다른 2개는 C이되, E, G 또는 K가 N인 경우, R15, R17 및 R16은 각각 부재하고,
n이 O이고 F 및 J가 둘다 C일 때, E 및 K 중 하나는 C 또는 N이고 E 및 K 중 다른 하나는 C, N, O 또는 S이되, E 및 K가 둘다 C인 것은 아니고, E 및 K가 둘다 N일 때, R15 및 R16 중 하나는 부재하되, E 및 K 중 하나가 N이고 다른 하나가 O 또는 S일 때, R15 및 R16은 부재하고,
n이 O이고, F 및 J 중 하나가 N이고 F 및 J 중 다른 하나가 C일 때, E 및 K 중 하나는 N이고 E 및 K 중 다른 하나는 C이거나, E 및 K는 둘다 C이되, E가 N일 때 R15가 부재하고, K가 N일 때 R16이 부재하고;
R1은 임의로 치환된 저급 알킬, 임의로 치환된 시클로알킬, 임의로 치환된 헤테로시클로알킬, 임의로 치환된 아릴 및 임의로 치환된 헤테로아릴로 이루어지는 군 중에서 선택되고;
R15는 E가 C일 때 수소, 임의로 치환된 저급 알킬, -OR22, -SR22 및 할로겐으로 이루어지는 군 중에서 선택되고, E가 O 또는 S일 때 또는 n=1이고 E가 N일 때 부재하고, n=0이고 E가 N일 때 부재하거나 수소 및 임의로 치환된 저급 알킬로 이루어지는 군 중에서 선택되고;
R16은 K가 C일 때 수소, 임의로 치환된 저급 알킬, -OR22, -SR22 및 할로겐으로 이루어지는 군 중에서 선택되고, K가 O 또는 S일 때 또는 n=1이고 K가 N일 때 부재하고, n=0이고 K가 N일 때 부재하거나 수소 및 임의로 치환된 저급 알킬로 이루어지는 군 중에서 선택되고;
R17은 G가 C일 때 수소, 임의로 치환된 저급 알킬, -OR22, -SR22 및 할로겐으로 이루어지는 군 중에서 선택되거나, G가 N일 때 부재하고;
R18은 수소, 할로겐, 임의로 치환된 저급 알킬, 임의로 치환된 아릴, 임의로 치환된 헤테로아릴, -OH, -NH2, -NO2, -CN, -NHC(O)NH2, -NHC(S)NH2, -NHS(O)2NH2, -NR24R25, -NHR23, -OR23, -SR23, -NHC(O)R23, -NR23C(O)R23, -NHC(S)R23, -NR23C(S)R23, -NHS(O)2R23, -NR23S(O)2R23, -NHC(O)NHR23, -NR23C(O)NH2, -NR23C(O)NHR23, -NHC(O)NR23R23, -NR23C(O)NR23R23, -NHC(S)NHR23, -NR23C(S)NH2, -NR23C(S)NHR23, -NHC(S)NR23R23, -NR23C(S)NR23R23, -NHS(O)2NHR23, -NR23S(O)2NH2, -NR23S(O)2NHR23, -NHS(O)2NR23R23, 및 -NR23S(O)2NR23R23으로 이루어지는 군 중에서 선택되고;
M은 결합, -(CR19R20)u-, -(CR19R20)t-C(O)-(CR19R20)s-, -(CR19R20)t-C(S)-(CR19R20)s-, -(CR19R20)t-C(O)O-(CR19R20)s-, -(CR19R20)t-C(S)O-(CR19R20)s-, -(CR19R20)t-C(O)NR26-(CR19R20)s-, -(CR19R20)t-C(S)NR26-(CR19R20)s-, -(CR19R20)t-S(O)-(CR19R20)s-, -(CR19R20)t-S(O)2-(CR19R20)s-, -(CR19R20)t-S(O)2NR26-(CR19R20)s-, -(CR19R20)t-O-(CR19R20)s-, -(CR19R20)t-OC(O)-(CR19R20)s-, -(CR19R20)t-OC(S)-(CR19R20)s-, -(CR19R20)t-OC(O)NR26-(CR19R20)s-, -(CR19R20)t-OC(S)NR26-(CR19R20)s-, -(CR19R20)t-S-(CR19R20)s-, -(CR19R20)t-NR26-(CR19R20)s-, -(CR19R20)t-NR26C(O)-(CR19R20)s-, -(CR19R20)t-NR26C(S)-(CR19R20)s-, -(CR19R20)t-NR26C(O)O-(CR19R20)s-, -(CR19R20)t-NR26C(S)O-(CR19R20)s-, -(CR19R20)t-NR26C(O)NR26-(CR19R20)s-, -(CR19R20)t-NR26C(S)NR26-(CR19R20)s-, -(CR19R20)t-NR26S(O)2-(CR19R20)s-, 및 -(CR19R20)t-NR26S(O)2NR26-(CR19R20)s-으로 이루어지는 군 중에서 선택되고;
R19 및 R20은 각각 수소, 플루오로, -OH, -NH2, 저급 알킬, 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 모노-알킬아미노, 디-알킬아미노, 및 -NR27R28로 이루어지는 군 중에서 독립적으로 선택되고, 여기서 저급 알킬, 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 모노-알킬아미노, 또는 디-알킬아미노의 알킬 사슬(들)은 플루오로, -OH, -NH2, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 플루오로 치환된 저급 알킬티오, 모노-알킬아미노, 디-알킬아미노, 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 임의로 치환되거나; 또는
동일하거나 상이한 탄소 상의 임의의 2개의 R19및 R20은 결합하여 3-7원의 모노시클릭 시클로알킬 또는 5-7원의 모노시클릭 헤테로시클로알킬을 형성하고, 임의의 다른 R19및 R20은 수소, 플루오로, -OH, -NH2, 저급 알킬, 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 모노-알킬아미노, 디-알킬아미노, 및 -NR27R28로 이루어지는 군 중에서 독립적으로 선택되고, 여기서 저급 알킬, 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 모노-알킬아미노, 또는 디-알킬아미노의 알킬 사슬(들)은 플루오로, -OH, -NH2, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 플루오로 치환된 저급 알킬티오, 모노-알킬아미노, 디-알킬아미노, 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 임의로 치환되고, 여기서 모노시클릭 시클로알킬 또는 모 노시클릭 헤테로시클로알킬은 할로겐, -OH, -NH2, 저급 알킬, 플루오로 치환된 저급 알킬, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 플루오로 치환된 저급 알킬티오, 모노-알킬아미노, 디-알킬아미노, 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 임의로 치환되고;
R21 및 R22는 각각 독립적으로 수소 또는 임의로 치환된 저급 알킬이고;
R23은 각각 임의로 치환된 저급 알킬, 임의로 치환된 저급 알케닐 (그러나, 단, 그의 알켄 탄소는 임의의 -NHR23, -OR23, -SR23, -NHC(O)R23, -NR23C(O)R23, -NHC(S)R23, -NR23C(S)R23, -NHS(O)2R23, -NR23S(O)2R23, -NHC(O)NHR23, -NR23C(O)NH2, -NR23C(O)NHR23, -NHC(O)NR23R23, -NR23C(O)NR23R23, -NHC(S)NHR23, -NR23C(S)NH2, -NR23C(S)NHR23, -NHC(S)NR23R23, -NR23C(S)NR23R23, -NHS(O)2NHR23, -NR23S(O)2NH2, -NR23S(O)2NHR23, -NHS(O)2NR23R23, 또는 -NR23S(O)2NR23R23의 임의의 -C(O)-, -C(S)-, -S(O)-, -S(O)2-, -O-, -S-, 또는 -N-에 결합되지 않는다), 임의로 치환된 저급 알키닐 (그러나, 단, 그의 알킨 탄소는 임의의 -NHR23, -OR23, -SR23, -NHC(O)R23, -NR23C(O)R23, -NHC(S)R23, -NR23C(S)R23, -NHS(O)2R23, -NR23S(O)2R23, -NHC(O)NHR23, -NR23C(O)NH2, -NR23C(O)NHR23, -NHC(O)NR23R23, -NR23C(O)NR23R23, -NHC(S)NHR23, -NR23C(S)NH2, -NR23C(S)NHR23, -NHC(S)NR23R23, -NR23C(S)NR23R23, -NHS(O)2NHR23, -NR23S(O)2NH2, -NR23S(O)2NHR23, -NHS(O)2NR23R23, 또는 -NR23S(O)2NR23R23의 임의의 -C(O)-, -C(S)-, -S(O)-, -S(O)2-, -O-, -S-, 또는 -N-에 결합되지 않는다), 임의로 치환된 시클로알킬, 임의로 치환된 헤테로시클로알킬, 임의로 치환된 아릴, 및 임의로 치환된 헤테로아릴로 이루어지는 군 중에서 독립적으로 선택되고;
R24 및 R25는 각각 임의로 치환된 저급 알킬, 임의로 치환된 저급 알케닐 (그러나, 단, 그의 알켄 탄소는 -NR24R25의 질소에 결합되지 않는다), 임의로 치환된 저급 알키닐 (그러나, 단, 그의 알킨 탄소는 -NR24R25의 질소에 결합되지 않는다), 임의로 치환된 시클로알킬, 임의로 치환된 헤테로시클로알킬, 임의로 치환된 아릴, 및 임의로 치환된 헤테로아릴로 이루어지는 군 중에서 독립적으로 선택되거나; 또는
R24 및 R25는 그들이 부착된 질소와 함께 임의로 치환된 5-7원의 모노시클릭 헤테로시클로알킬 또는 임의로 치환된 5 또는 7원의 모노시클릭 질소 함유 헤테로아릴을 형성하고;
R26은 각각 수소, 저급 알킬, 및 플루오로, -OH, -NH2, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 플루오로 치환된 저급 알킬티오, 모노-알킬아미노, 플루오로 치환된 모노-알킬아미노, 디-알킬아미노, 플루오로 치환된 디-알킬아미노, 및 -NR27R28로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 치환된 저급 알킬로 이루어지는 군 중에서 독립적으로 선택되지만, 단, R26이 치환된 저급 알킬일 때, -NR26-의 -N-에 결합된 저급 알킬 탄소 상의 임의의 치환체는 플루오로이고;
R27 및 R28은 그들이 부착된 질소와 결합하여 5-7원의 헤테로시클로알킬, 또는 플루오로, -OH, -NH2, 저급 알킬, 플루오로 치환된 저급 알킬, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 및 플루오로 치환된 저급 알킬티오로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 치환된 5-7원의 헤테로시클로알킬을 형성하고;
u는 1-6이고;
t는 0-3이고;
s는 0-3이고;
단, V, W, U 및 Z가 CH이고, n=1이고, E, F, G, J 및 K는 C이고, R15, R16 및 R17은 H이고, A는 -CH2-, -CH(OH)-, 또는 -C(O)-이고, M은 -NHCH2-일 때, R1은 페닐, 4-트리플루오로메틸-페닐, 4-메톡시-페닐, 4-클로로-페닐, 4-플루오로-페닐, 4-메틸-페닐, 3-플루오로-페닐 또는 티오펜-2-일이 아니고,
V, W, U 및 Z가 CH이고, n=1이고, E, F, G, J 및 K는 C이고, R15, R16 및 R17은 H이고, A는 -CH2-일 때, M-R1은 -NHCH2CH(CH3)2이 아니고,
V, W 및 U가 CH이고, n=1이고, E, F, G, J 및 K는 C이고, R15, R16 및 R17은 H이고, A는 -CH2-이고, M-R1은 -OCH3이고, Z는 CR18일 때, R18은 티오펜-3-일이 아니고,
V, W 및 U는 CH이고, n=0이고, F, J 및 K는 C이고, E는 N이고, R15는 CH3이고, R16은 H이고, A는 -C(O)-이고, M-R1이 -CH(CH3)3이고, Z는 CR18일 때, R18은 3-((E)-2-카르복시-비닐)페닐이 아니다.
화학식 Ib의 화합물의 한 실시태양에서, E, J, K, G, F, n, R15, R16 및 R17 은 하기 구조로 이루어지는 구조를 제공하도록 선택된다,
Figure 112007090494669-PCT00013
여기서, R15, R16 및 R17은 화학식 Ib의 화합물에 대해 정의된 바와 같고,
Figure 112007090494669-PCT00014
는 A의 부착 지점을 나타내고,
Figure 112007090494669-PCT00015
는 M의 부착 지점을 나타낸다.
화학식 Ib의 화합물의 한 실시태양에서, M은 -O-(CR19R20)s-, -S-(CR19R20)s-, -OC(O)-(CR19R20)s-, -OC(S)-(CR19R20)s-, -OC(O)NR26-(CR19R20)s-, -OC(S)NR26-(CR19R20)s-, -C(O)NR26-(CR19R20)s-, -C(S)NR26-(CR19R20)s-, -S(O)2NR26-(CR19R20)s-, -NR26-(CR19R20)s-, -NR26C(O)-(CR19R20)s-, -NR26C(S)-(CR19R20)s-, -NR26C(O)O-(CR19R20)s-, -NR26C(S)O-(CR19R20)s-, -NR26C(O)NR26-(CR19R20)s-, -NR26C(S)NR26-(CR19R20)s-, -NR26S(O)2-(CR19R20)s-5 및 -NR26S(O)2NR26-(CR19R20)s-로 이루어지는 군 중에서 선택된다.
화학식 Ib의 화합물의 한 실시태양에서, R26은 각각 수소, 저급 알킬, 또는 플루오로, -OH, -NH2, 알콕시, 저급 알킬티오, 모노-알킬아미노, 디-알킬아미노 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택되는 1, 2 또는 3개의 치환체로 치환된 저급 알킬로 이루어지는 군 중에서 독립적으로 선택되되, -NR26의 질소에 결합된 탄소 상의 임의의 치환체는 플루오로이다.
화학식 Ib의 화합물의 한 실시태양에서, R1은 임의로 치환된 아릴 및 임의로 치환된 헤테로아릴로 이루어지는 군 중에서 선택된다.
화학식 Ib의 화합물의 한 실시태양에서, Z는 N 또는 CH이고, n은 1이고, E-R15는 N 또는 CH이고, K-R16은 N 또는 CH이고, G-R17은 N 또는 CH이되, E-R15, K-R16 및 G-R17 중 1개 이하가 N이다. 한 실시태양에서, Z는 N 또는 CH이고, n은 1이고, E-R15, K-R16 및 G-R17은 CH이다.
화학식 Ib의 화합물의 한 실시태양에서, V, W 및 Z는 CH이고, U는 CR18이고, n은 1이고, E-R15는 N 또는 CH이고, K-R16은 N 또는 CH이고, G-R17은 N 또는 CH이되, E-R15, K-R16 및 G-R17 중 1개 이하가 N이다. 다른 실시태양에서, V, W 및 Z는 CH이고, U는 CR18이고, n은 1이고, E-R15, K-R16 및 G-R17은 CH이다.
화학식 Ib의 화합물의 한 실시태양에서, Z는 N 또는 CH이고, n은 1이고, E-R15, K-R16 및 G-R17은 CH이고, A는 -CH2-이고, M은 -NHCH2-이고, 추가로 R1은 임의로 치환된 페닐이다. 다른 실시태양에서, V, Z, U 및 W는 CH이고, n은 1이고, E-R15는 N 또는 CH이고, K-R16은 N 또는 CH이고, G-R17은 N 또는 CH이되, E-R15, K-R16 및 G-R17 중 1개 이하가 N이다.
화학식 Ib의 화합물의 한 실시태양에서, Z는 N 또는 CH이고, n은 1이고, E-R15는 N 또는 CH이고, K-R16은 N 또는 CH이고, G-R17은 N 또는 CH이되, E-R15, K-R16 및 G-R17 중 1개 이하가 N이고, R1은 할로겐, -OH, -NH2, -NO2, -CN, 임의로 치환된 저급 알킬 및 -OR29로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 임의로 치환된 페닐이고, 여기서 R29는 임의로 치환된 저급 알킬, 임의로 치환된 시클로알킬, 임의로 치환된 헤테로시클로알킬, 임의로 치환된 아릴 및 임의로 치환된 헤테로아릴로 이루어지는 군 중에서 선택된다.
화학식 Ib의 화합물의 한 실시태양에서, V, Z, U 및 W는 CH이고, n은 1이고, E-R15, K-R16 및 G-R17은 CH이고, A는 -CH2-이고, M은 -NHCH2이고, R1은 임의로 치환된 페닐이고, 추가로 R1은 할로겐, -OH, -NH2, -NO2, -CN, 임의로 치환된 저급 알킬 및 -OR29로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 임의로 치환된 페닐이고, 여기서 R29는 임의로 치환된 저급 알킬, 임의로 치환된 시클로알킬, 임의로 치환된 헤테로시클로알킬, 임의로 치환된 아릴 및 임의로 치환된 헤테로아릴로 이루어지는 군 중에서 선택된다.
화학식 Ib의 화합물의 한 실시태양에서, V, W 및 Z는 CH이고, U는 CR18이고, n은 1이고, E-R15, K-R16 및 G-R17은 CH이고, A는 -CH2-이고, M은 -NHCH2이고, R1은 임의로 치환된 페닐이고, 추가로 R1은 할로겐, -OH, -NH2, -NO2, -CN, 임의로 치환된 저급 알킬 및 -OR29로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 임의로 치환되고, 여기서 R29는 임의로 치환된 저급 알킬, 임의로 치환된 시클로알킬, 임의로 치환된 헤테로시클로알킬, 임의로 치환된 아릴 및 임의로 치환된 헤테로아릴로 이루어지는 군 중에서 선택된다.
화학식 Ib의 화합물의 한 실시태양에서, n은 1이고, E, K 및 G는 C일 때, R15, R16 및 R17 중 적어도 하나는 수소 이외의 것이다. 다른 실시태양에서, n은 1이고, E, K 및 G 중 하나는 N이고, E, K 및 G 중 다른 2개는 C이고, R15, R16 및 R17 중 적어도 하나는 수소 이외의 것이다. 다른 실시태양에서, n은 1이고, E, K 및 G는 C이고, R15, R16 및 R17 중 적어도 하나는 수소 이외의 것이다.
화학식 Ib의 화합물의 한 실시태양에서, n은 1이고, V 및 W는 CH이고, U 및 Z는 독립적으로 CR18이고, E, K 및 G 중 하나는 N이고, E, K 및 G 중 다른 2개는 C이고, R15, R16 및 R17 중 적어도 하나는 수소 이외의 것이다. 다른 실시태양에서, n은 1이고, V 및 W는 CH이고, U 및 Z는 독립적으로 CR18이고, E, K 및 G는 C이고, R15, R16 및 R17 중 적어도 하나는 수소 이외의 것이다.
화학식 Ib의 화합물의 한 실시태양에서, n은 1이고, E, K 및 G 중 하나는 N이고, E, K 및 G 중 다른 2개는 C이고, R15, R16 및 R17 중 적어도 하나는 수소 이외의 것이고, A는 -CH2-이고, M은 -NHCH2-이고, 추가로 R1은 임의로 치환된 페닐이다. 다른 실시태양에서, n은 1이고, E, K 및 G는 C이고, R15, R16 및 R17 중 적어도 하나는 수소 이외의 것이고, A는 -CH2-이고, M은 -NHCH2-이고, 추가로 R1은 임의로 치환된 페닐이다.
화학식 Ib의 화합물의 한 실시태양에서, n은 1이고, V, Z, U 및 W은 CH이고, E, K 및 G 중 하나는 N이고 E, K 및 G 중 다른 2개는 C이고, R15, R16 및 R17 중 적어도 하나는 수소 이외의 것이다. 다른 실시태양에서, V, Z, U 및 W는 CH이고, E, K 및 G는 C이고, R15, R16 및 R17 중 적어도 하나는 수소 이외의 것이다.
화학식 Ib의 화합물의 한 실시태양에서, Z는 CR18이고, 여기서 R18은 수소 이외의 것이고, n은 1이고, E-R15는 N 또는 CH이고, K-R16은 N 또는 CH이고, G-R17은 N 또는 CH이다. 다른 실시태양에서, Z는 CR18이고, 여기서 R18은 수소 이외의 것이고, n은 1이고, E-R15, K-R16 및 G-R17은 CH이다. 다른 실시태양에서, Z는 CR18이고, 여기서 R18은 수소 이외의 것이고, U는 CR18이고, V 및 W는 CH이고, n은 1이고, E-R15, K-R16 및 G-R17은 CH이고, 추가로 여기서 U는 CH이다.
화학식 Ib의 화합물의 한 실시태양에서, Z는 CR18이고, 여기서 R18은 수소 이외의 것이고, n은 1이고, E-R15, K-R16 및 G-R17은 CH이고, A는 -CH2-이고, M은 -NHCH2-이고, 추가로 여기서 R1은 임의로 치환된 페닐이다. 추가의 실시태양에서, Z는 CR18이고, 여기서 R18은 수소 이외의 것이고, U는 CR18이고, V 및 W는 CH이고, n은 1이고, E-R15, K-R16 및 G-R17은 CH이고, A는 -CH2-이고, M은 -NHCH2-이고, 추가로 여기서 R1은 임의로 치환된 페닐이다. 추가의 실시태양에서, Z는 CR18이고, 여기서 R18은 수소 이외의 것이고, V, U 및 W는 CH이고, n은 1이고, E-R15, K-R16 및 G-R17은 CH이고, A는 -CH2-이고, M은 -NHCH2-이고, 추가로 여기서 R1은 임의로 치환된 페닐이다.
화학식 Ib의 화합물의 한 실시태양에서, U는 CR18이고, 여기서 R18은 수소 이외의 것이고, n은 1이고, E-R15는 N 또는 CH이고, K-R16은 N 또는 CH이고, G-R17은 N 또는 CH이다. 다른 실시태양에서, U는 CR18이고, 여기서 R18은 수소 이외의 것이고, n은 1이고, E-R15, K-R16 및 G-R17은 CH이다. 다른 실시태양에서, U는 CR18이고, 여기서 R18은 수소 이외의 것이고, Z는 CR18이고, V 및 W는 CH이고, n은 1이고, E-R15, K-R16 및 G-R17은 CH이고, 추가로 여기서 Z는 CH이다.
화학식 Ib의 화합물의 한 실시태양에서, U는 CR18이고, 여기서 R18은 수소 이 외의 것이고, n은 1이고, E-R15, K-R16 및 G-R17은 CH이고, A는 -CH2-이고, M은 -NHCH2-이고, 추가로 여기서 R1은 임의로 치환된 페닐이다. 추가의 실시태양에서, U는 CR18이고, 여기서 R18은 수소 이외의 것이고, Z는 CR18이고, V 및 W는 CH이고, n은 1이고, E-R15, K-R16 및 G-R17은 CH이고, A는 -CH2-이고, M은 -NHCH2-이고, 추가로 여기서 R1은 임의로 치환된 페닐이다. 추가의 실시태양에서, U는 CR18이고, 여기서 R18은 수소 이외의 것이고, V, Z 및 W는 CH이고, n은 1이고, E-R15, K-R16 및 G-R17은 CH이고, A는 -CH2-이고, M은 -NHCH2-이고, 추가로 여기서 R1은 임의로 치환된 페닐이다.
화학식 Ib의 화합물의 한 실시태양에서, 임의의 상기 실시태양에 추가로, R15, R16 및 R17은 할로겐, -OH, 저급 알킬, 플루오로 치환된 저급 알킬, 저급 알콕시, 및 플루오로 치환된 저급 알콕시로 이루어지는 군 중에서 독립적으로 선택된다. 임의의 상기 실시태양에 추가로, R1은 할로겐, -OH, -NH2, -NO2, -CN, 임의로 치환된 저급 알킬 및 -OR29로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 임의로 치환된 페닐이고, 여기서 R29는 임의로 치환된 저급 알킬, 임의로 치환된 시 클로알킬, 임의로 치환된 헤테로시클로알킬, 임의로 치환된 아릴 및 임의로 치환된 헤테로아릴로 이루어지는 군 중에서 선택된다.
화학식 Ib의 화합물의 한 실시태양에서, 임의의 상기 실시태양에 추가로, R18은 할로겐, -OH, 임의로 치환된 저급 알킬 및 -OR29로 이루어지는 군 중에서 선택되고, 여기서 R29는 임의로 치환된 저급 알킬, 임의로 치환된 시클로알킬, 임의로 치환된 헤테로시클로알킬, 임의로 치환된 아릴 및 임의로 치환된 헤테로아릴로 이루어지는 군 중에서 선택된다. 임의의 상기 실시태양에 추가로, R1은 할로겐, -OH, -NH2, -NO2, -CN, 임의로 치환된 저급 알킬 및 -OR29로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 임의로 치환된 페닐이고, 여기서 R29는 임의로 치환된 저급 알킬, 임의로 치환된 시클로알킬, 임의로 치환된 헤테로시클로알킬, 임의로 치환된 아릴 및 임의로 치환된 헤테로아릴로 이루어지는 군 중에서 선택된다.
화학식 Ib의 화합물의 다른 실시태양에서, M은 결합이고, R1은 티오페닐 이외의 것이다.
화학식 Ib의 화합물의 다른 실시태양에서, Z는 N 또는 CR18이고, 여기서 R18은 수소가 아니다. 상기 실시태양에 추가로, 화학식 Ib의 설명에서 허용되는 바와 같이, E는 NR15 또는 CR15이고, K는 NR16 또는 CR16이고, G는 CR17이거나, 이들의 조합 이고, 여기서 R15, R16 및 R17 중 적어도 하나는 수소가 아니다.
화학식 Ib의 화합물, 및 본원에서 상세히 설명되는 모든 하위 실시태양은 본원에 개시된 것과 같은 Kit 및/또는 Fms 단백질 키나제 매개 질환 또는 상태에 걸려 있거나 그러한 위험이 있는 대상을 치료하기 위해 사용될 수 있다.
한 실시태양에서, 화학식 I의 화합물, 그의 모든 염, 전구약물, 호변이성질체 및 이성질체는 하기 하위-일반 구조, 화학식 Ig에 따른 구조를 갖는다,
Figure 112007090494669-PCT00016
여기서, Z1은 N 및 CR34로 이루어지는 군 중에서 선택되고;
U1은 N 및 CR35로 이루어지는 군 중에서 선택되고;
A1은 -CH2- 및 -C(O)-로 이루어지는 군 중에서 선택되고;
M3은 결합, -NR39-, -S-, -O-, -NR39CH2-, -NR39CH(R40)-, -SCH2-, -OCH2-, -C(O)NR39-, -S(O)2NR39-, -CH2NR39-, -CH(R40)NR39-, -NR39C(O)-, 및 -NR39S(O)2-로 이루어지는 군 중에서 선택되고;
n은 0 또는 1이고;
v는 0, 1, 2 또는 3이고;
F1 및 J1은 둘다 C이거나, F1 및 J1 중 하나는 C이고 F1 및 J1 중 다른 하나는 N이고;
E1 및 K1은 C, N, O 또는 S로부터 선택되고;
G1은 C 또는 N으로부터 선택되고;
여기서, n이 1일 때, F1 및 J1은 C이고, E1, G1 및 K1은 C이거나, E1, G1 및 K1 중 임의의 하나는 N이고 E1, G1 및 K1 중 다른 2개는 C이되, E1, G1 또는 K1이 N일 때, R36, R37 및 R38은 각각 부재하고,
n은 0이고, F1 및 J1은 둘다 C일 때, E1 및 K1 중 하나는 C 또는 N이고 E1 및 K1 중 다른 하나는 C, N, O 또는 S이되, E1 및 K1가 둘다 C인 것은 아니고, E1 및 K1이 둘다 N일 때, R36 및 R37 중 하나는 부재하되, E1 및 K1 중 하나는 N이고 다른 하나는 O 또는 S일 때, R36 및 R37은 부재하고,
n은 0이고, F1 및 J1 중 하나는 N이고 F1 및 J1 중 다른 하나는 C일 때, E1 및 K1 중 하나는 N이고 E1 및 K1 중 다른 하나는 C이거나, E1 및 K1은 둘다 C이되, E1이 N일 때 R36은 부재하고, K1이 N일 때 R37은 부재하고;
Cy는 시클로알킬, 헤테로시클로알킬, 아릴 및 헤테로아릴로 이루어지는 군 중에서 선택되고;
R34 및 R35는 수소, -OR41, -SR41, -NHR41, -NR41R41, -NR39C(O)R41, -NR39S(O)2R41, 할로겐, 저급 알킬, 시클로알킬, 헤테로시클로알킬, 아릴 및 헤테로아릴로 이루어지는 군 중에서 독립적으로 선택되고, 여기서 저급 알킬은 플루오로, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 플루오로 치환된 저급 알킬티오, 모노-알킬아미노, 디-알킬아미노, 시클로알킬, 헤테로시클로알킬, 아릴, 및 헤테로아릴로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 임의로 치환되고, 여기서 R34 또는 R35로서 또는 저급 알킬의 치환체로서 시클로알킬, 헤테로시클로알킬, 아릴, 및 헤테로아릴은 -OH, -NH2, -CN, -NO2, -S(O)2NH2, -C(O)NH2, -OR42, -SR42, -NHR42, -NR42R42, -NR39C(O)R42, -NR39S(O)2R42, -S(O)2R42, 할로겐, 저급 알킬, 플루오로 치환된 저급 알킬, 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 임의로 치환되고;
R45는 각각 -OR41, -SR41, -NHR41, -NR41R41, -NR39C(O)R41, -NR39S(O)2R41, 할로겐, 저급 알킬, 시클로알킬, 헤테로시클로알킬, 아릴 및 헤테로아릴로 이루어지는 군 중에서 독립적으로 선택되고, 여기서 저급 알킬은 플루오로, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 플루오로 치환된 저급 알킬티오, 모노-알킬아미노, 디-알킬아미노, 시클로알킬, 헤테로시클로알킬, 아릴, 및 헤테로아릴로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 임의로 치환되고, 여기서 R45로서 또는 저급 알킬의 치환체로서 시클로알킬, 헤테로시클로알킬, 아릴, 및 헤테로아릴은 -OH, -NH2, -CN, -NO2, -S(O)2NH2, -C(O)NH2, -OR42, -SR42, -NHR42, -NR42R42, -NR39C(O)R42, -NR39S(O)2R42, -S(O)2R42, 할로겐, 저급 알킬, 플루오로 치환된 저급 알킬, 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 임의로 치환되고;
R36은 E1이 C일 때 수소, 할로겐, 저급 알킬, 플루오로 치환된 저급 알킬, 저급 알콕시, 및 플루오로 치환된 저급 알콕시로 이루어지는 군 중에서 선택되고, E1이 O 또는 S일 때 또는 n=1이고 E1이 N일 때 부재하고, n=0이고 E1이 N일 때 부재하거나 수소, 저급 알킬, 및 플루오로 치환된 저급 알킬로 이루어지는 군 중에서 선택되고;
R37은 K1이 C일 때 수소, 할로겐, 저급 알킬, 플루오로 치환된 저급 알킬, 저급 알콕시, 및 플루오로 치환된 저급 알콕시로 이루어지는 군 중에서 선택되고, K1 이 O 또는 S일 때 또는 n=1이고 K1이 N일 때 부재하고, n=0이고 K1이 N일 때 부재하거나 수소, 저급 알킬, 및 플루오로 치환된 저급 알킬로 이루어지는 군 중에서 선택되고;
R38은 G1이 C일 때 수소, 할로겐, 저급 알킬, 플루오로 치환된 저급 알킬, 저급 알콕시, 및 플루오로 치환된 저급 알콕시로 이루어지는 군 중에서 선택되거나, G1이 N일 때 부재하고;
R39는 각각 수소 및 저급 알킬로 이루어지는 군 중에서 독립적으로 선택되고;
R40은 저급 알킬, 및 플루오로 치환된 저급 알킬로 이루어지는 군 중에서 선택되고;
R41은 저급 알킬, 시클로알킬, 헤테로시클로알킬, 아릴 및 헤테로아릴로 이루어지는 군 중에서 선택되고, 여기서 저급 알킬은 플루오로, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 플루오로 치환된 저급 알킬티오, 모노-알킬아미노, 디-알킬아미노, 시클로알킬, 헤테로시클로알킬, 아릴, 및 헤테로아릴로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 임의로 치환되고, 여기서 R41로서 또는 저급 알킬의 치환체로서 시클로알킬, 헤테로시클로알킬, 아릴, 및 헤테 로아릴은 -OH, -NH2, -CN, -NO2, -S(O)2NH2, -C(O)NH2, -OR42, -SR42, -NHR42, -NR42R42, -NR39C(O)R42, -NR39S(O)2R42, -S(O)2R42, 할로겐, 저급 알킬, 플루오로 치환된 저급 알킬, 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 임의로 치환되고;
R42는 각각 저급 알킬, 헤테로시클로알킬 및 헤테로아릴로 이루어지는 군 중에서 독립적으로 선택되고, 여기서 저급 알킬은 플루오로, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 플루오로 치환된 저급 알킬티오, 모노-알킬아미노, 디-알킬아미노, 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 임의로 치환된다.
화학식 Ig의 화합물의 한 실시태양에서, n은 1이고, G1 및 K1은 C이고, E는 N 또는 C이고, 바람직하게는 여기서 E는 C이다.
화학식 Ig의 화합물의 한 실시태양에서, M3은 -NR39-, -O-, -NR39CH2-, -NR39CH(R40)-, -SCH2-, -OCH2-, -CH2NR39-, -NR39C(O)-, 및 -NR39S(O)2-로 이루어지는 군 중에서 선택되고, 바람직하게는 여기서 M3은 -NR39CH2-, -NR39CH(R40)-, -SCH2-, -OCH2-, 또는 -CH2NR39-이다.
화학식 Ig의 화합물의 한 실시태양에서, n은 1이고, G1 및 K1은 C이고, E는 N 또는 C이고, 바람직하게는 여기서 E는 C이고, M3은 -NR39-, -O-, -NR39CH2-, -NR39CH(R40)-, -SCH2-, -OCH2-, -CH2NR39-, -NR39C(O)-, 및 -NR39S(O)2-로 이루어지는 군 중에서 선택되고, 바람직하게는 여기서 M3은 -NR39CH2-, -NR39CH(R40)-, -SCH2-, -OCH2-, 또는 -CH2NR39-이다.
화학식 Ig의 화합물의 한 실시태양에서, 각각의 R45는 -OH, -NH2, -CN, -NO2, 할로겐, 저급 알킬, 플루오로 치환된 저급 알킬, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 티오알킬, 플루오로 치환된 저급 티오알킬, 모노-알킬아미노, 디-알킬아미노 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택되고, 바람직하게는 여기서 v는 0, 1 또는 2이고, 또한 0 또는 1이다.
화학식 Ig의 화합물의 한 실시태양에서, n은 1이고, G1 및 K1은 C이고, E는 N 또는 C이고, 바람직하게는 여기서 E는 C이고, M3은 -NR39-, -O-, -NR39CH2-, -NR39CH(R40)-, -SCH2-, -OCH2-, -CH2NR39-, -NR39C(O)-, 및 -NR39S(O)2-로 이루어지는 군 중에서 선택되고, 바람직하게는 여기서 M3은 -NR39CH2-, -NR39CH(R40)-, -SCH2-, -OCH2-, 또는 -CH2NR39-이고, 각각의 R45는 -OH, -NH2, -CN, -NO2, 할로겐, 저급 알킬, 플루오로 치환된 저급 알킬, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 티오알킬, 플루오로 치환된 저급 티오알킬, 모노-알킬아미노, 디-알킬아미노 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택되고, 바람직하게는 여기서 v는 0, 1, 또는 2이고, 또한 0 또는 1이다.
화학식 Ig의 화합물의 한 실시태양에서, Z1은 CR34이고, U1은 CR35이고, R34 및 R35는 둘다 수소이다. 한 실시태양에서, Z1은 CR34이고, U1은 CR35이고, R34 및 R35는 수소, -OR41, 할로겐, 저급 알킬, 시클로알킬, 헤테로시클로알킬, 아릴 및 헤테로아릴로 이루어지는 군 중에서 독립적으로 선택되고, 여기서 시클로알킬, 헤테로시클로알킬, 아릴 및 헤테로아릴은 -OH, -NH2, -CN, -NO2, -S(O)2NH2, -C(O)NH2, -OR42, -SR42, -NHR42, -NR42R42, -NR39C(O)R42, -NR39S(O)2R42, -S(O)2R42, 할로겐, 저급 알킬, 플루오로 치환된 저급 알킬, 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 임의로 치환되고, 여기서 저급 알킬은 플루오로, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 플루오로 치환된 저급 알킬티오, 모노-알킬아미노, 디-알킬아미노, 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 임의로 치환된다. 추가의 실시태양에서, R34 및 R35 중 하나는 수소이고, R34 및 R35 중 다른 하나는 수소, 할로겐, 저급 알킬, 저급 알콕시, 아릴 및 헤테로아릴로 이루어지는 군 중에서 선택되고, 여기서 아릴 및 헤테로아릴은 -OH, -NH2, -CN, -NO2, -S(O)2NH2, -C(O)NH2, -OR42, -SR42, -NHR42, -NR42R42, -NR39C(O)R42, -NR39S(O)2R42, -S(O)2R42, 할로겐, 저급 알킬, 플루오로 치환된 저급 알킬, 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 임의로 치환되고, 여기서 저급 알킬 및 저급 알콕시는 플루오로, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 플루오로 치환된 저급 알킬티오, 모노-알킬아미노, 디-알킬아미노, 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 임의로 치환되고, 추가로 여기서 R34 및 R35 중 다른 하나는 할로겐, 저급 알킬, 및 저급 알콕시로 이루어지는 군 중에서 선택되고, 여기서 저급 알킬 및 저급 알콕시는 플루오로, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 플루오로 치환된 저급 알킬티오, 모노-알킬아미노, 디-알킬아미노, 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 임의로 치환된다.
화학식 Ig의 화합물의 한 실시태양에서, 각각의 R45는 -OH, -NH2, -CN, -NO2, 할로겐, 저급 알킬, 플루오로 치환된 저급 알킬, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 티오알킬, 플루오로 치환된 저급 티오알킬, 모노-알킬아미노, 디- 알킬아미노 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 독립적으로 선택되고, 바람직하게는 여기서 v는 0, 1, 또는 2이고, 또한 0 또는 1이고, Z1은 CR34이고, U1은 CR35이고, R34 및 R35는 수소, -OR41, 할로겐, 저급 알킬, 시클로알킬, 헤테로시클로알킬, 아릴 및 헤테로아릴로 이루어지는 군 중에서 독립적으로 선택되고, 여기서 시클로알킬, 헤테로시클로알킬, 아릴 및 헤테로아릴은 -OH, -NH2, -CN, -NO2, -S(O)2NH2, -C(O)NH2, -OR42, -SR42, -NHR42, -NR42R42, -NR39C(O)R42, -NR39S(O)2R42, -S(O)2R42, 할로겐, 저급 알킬, 플루오로 치환된 저급 알킬, 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 임의로 치환되고, 여기서 저급 알킬은 플루오로, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 플루오로 치환된 저급 알킬티오, 모노-알킬아미노, 디-알킬아미노, 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 임의로 치환된다. 추가의 실시태양에서, R34 및 R35는 둘다 수소이다.
화학식 Ig의 화합물의 한 실시태양에서, 각각의 R45는 -OH, -NH2, -CN, -NO2, 할로겐, 저급 알킬, 플루오로 치환된 저급 알킬, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 티오알킬, 플루오로 치환된 저급 티오알킬, 모노-알킬아미노, 디-알킬아미노 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택되고, 바람직하게는 여기서 v는 0, 1, 또는 2이고, 또한 0 또는 1이고, Z1은 CR34이고, U1은 CR35이고, R34 및 R35 중 하나는 수소이고, R34 및 R35 중 다른 하나는 수소, 할로겐, 저급 알킬, 저급 알콕시, 아릴 및 헤테로아릴로 이루어지는 군 중에서 선택되고, 여기서 아릴 및 헤테로아릴은 -OH, -NH2, -CN, -NO2, -S(O)2NH2, -C(O)NH2, -OR42, -SR42, -NHR42, -NR42R42, -NR39C(O)R42, -NR39S(O)2R42, -S(O)2R42, 할로겐, 저급 알킬, 플루오로 치환된 저급 알킬, 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 임의로 치환되고, 여기서 저급 알킬 및 저급 알콕시는 플루오로, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 플루오로 치환된 저급 알킬티오, 모노-알킬아미노, 디-알킬아미노, 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 임의로 치환되고, 추가로 여기서 R34 및 R35 중 다른 하나는 할로겐, 저급 알킬, 및 저급 알콕시로 이루어지는 군 중에서 선택되고, 여기서 저급 알킬 및 저급 알콕시는 플루오로, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 플루오로 치환된 저급 알킬티오, 모노-알킬아미노, 디-알킬아미노, 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 임의로 치환된다.
화학식 Ig의 화합물의 한 실시태양에서, n은 1이고, G1 및 K1은 C이고, E는 N 또는 C이고, 바람직하게는 여기서 E는 C이고, M3은 -NR39-, -O-, -NR39CH2-, -NR39CH(R40)-, -SCH2-, -OCH2-, -CH2NR39-, -NR39C(O)-, 및 -NR39S(O)2-로 이루어지는 군 중에서 선택되고, 바람직하게는 여기서 M3은 -NR39CH2-, -NR39CH(R40)-, -SCH2-, -OCH2-, 또는 -CH2NR39-이고, 각각의 R45는 -OH, -NH2, -CN, -NO2, 할로겐, 저급 알킬, 플루오로 치환된 저급 알킬, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 티오알킬, 플루오로 치환된 저급 티오알킬, 모노-알킬아미노, 디-알킬아미노 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택되고, 바람직하게는 여기서 v는 O, 1, 또는 2이고, 또한 0 또는 1이고, Z1은 CR34이고, U1은 CR35이고, R34 및 R35는 둘다 수소이다.
화학식 Ig의 화합물의 한 실시태양에서, n은 1이고, G1 및 K1은 C이고, E는 N 또는 C이고, 바람직하게는 여기서 E는 C이고, M3은 -NR39-, -O-, -NR39CH2-, -NR39CH(R40)-, -SCH2-, -OCH2-, -CH2NR39-, -NR39C(O)-, 및 -NR39S(O)2-로 이루어지는 군 중에서 선택되고, 바람직하게는 여기서 M3은 -NR39CH2-, -NR39CH(R40)-, -SCH2-, -OCH2-, 또는 -CH2NR39-이고, 각각의 R45는 -OH, -NH2, -CN, -NO2, 할로겐, 저급 알 킬, 플루오로 치환된 저급 알킬, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 티오알킬, 플루오로 치환된 저급 티오알킬, 모노-알킬아미노, 디-알킬아미노 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택되고, 바람직하게는 여기서 v는 0, 1, 또는 2이고, 또한 0 또는 1이고, Z1은 CR34이고, U1은 CR35이고, R34 및 R35는 수소, -OR41, 할로겐, 저급 알킬, 시클로알킬, 헤테로시클로알킬, 아릴 및 헤테로아릴로 이루어지는 군 중에서 독립적으로 선택되고, 여기서 시클로알킬, 헤테로시클로알킬, 아릴 및 헤테로아릴은 -OH, -NH2, -CN, -NO2, -S(O)2NH2, -C(O)NH2, -OR42, -SR42, -NHR42, -NR42R42, -NR39C(O)R42, -NR39S(O)2R42, -S(O)2R42, 할로겐, 저급 알킬, 플루오로 치환된 저급 알킬, 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 임의로 치환되고, 여기서 저급 알킬은 플루오로, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 플루오로 치환된 저급 알킬티오, 모노-알킬아미노, 디-알킬아미노, 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 임의로 치환된다. 추가의 실시태양에서, R34 및 R35 중 하나는 수소이고, R34 및 R35 중 다른 하나는 할로겐, 저급 알킬, 저급 알콕시, 아릴 및 헤테로아릴로 이루어지는 군 중에서 선택되고, 여기서 아릴 및 헤테로아릴은 -OH, -NH2, -CN, -NO2, -S(O)2NH2, -C(O)NH2, -OR42, -SR42, -NHR42, -NR42R42, -NR39C(O)R42, -NR39S(O)2R42, -S(O)2R42, 할로겐, 저급 알킬, 플루오로 치환된 저급 알킬, 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 임의로 치환되고, 여기서 저급 알킬 및 저급 알콕시는 플루오로, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 플루오로 치환된 저급 알킬티오, 모노-알킬아미노, 디-알킬아미노, 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 임의로 치환되고, 추가로 여기서 R34 및 R35 중 다른 하나는 할로겐, 저급 알킬, 및 저급 알콕시로 이루어지는 군 중에서 선택되고, 여기서 저급 알킬 및 저급 알콕시는 플루오로, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 플루오로 치환된 저급 알킬티오, 모노-알킬아미노, 디-알킬아미노, 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 임의로 치환되고, 추가로 여기서 R34는 수소이다.
화학식 Ig의 화합물, 및 본원에서 상세히 설명되는 모든 하위 실시태양은 본원에 개시된 것과 같은 Kit 및/또는 Fms 단백질 키나제 매개 질환 또는 상태에 걸려 있거나 그러한 위험이 있는 대상을 치료하기 위해 사용될 수 있다.
상기 화합물의 특정 실시태양에서, N (N이 헤테로아릴 고리 원자인 경우 제외), O, 또는 S가 또한 N (N이 헤테로아릴 고리 원자인 경우 제외), O, 또는 S에 결합된 탄소에 결합되거나; 또는 N (N이 헤테로아릴 고리 원자인 경우 제외), O, C(S), C(O), 또는 S(O)n (n은 0-2임)이 알케닐기의 알켄 탄소에 결합되거나 알키닐 기의 알킨 탄소에 결합되는 화합물은 제외되고; 따라서, 특정 실시태양에서, 다음과 같은 연결기를 포함하는 화합물은 본 발명으로부터 제외된다: -NR-CH2-NR-, -O-CH2-NR-, -S-CH2-NR-, -NR-CH2-O-, -O-CH2-O-, -S-CH2-O- -NR-CH2-S-, -O-CH2-S-, -S-CH2-S-, -NR-CH=CH-, -CH=CH-NR-, -NR-C≡C-, -C≡C-NR-, -O-CH=CH-, -CH=CH-O-, -O-C≡C-, -C≡C-O-, -S(O)0-2-CH=CH-, -CH=CH-S(O)0-2-, -S(O)0-2-C≡C-, -C≡C-S(O)0-2-, -C(O)-CH=CH-, -CH=CH-C(O)-, -C≡C-C(O)-, 또는 -C(O)-C≡C-, -C(S)-CH=CH-, -CH=CH-C(S)-, -C≡C-C(S)-, 또는 -C(S)-C≡C-.
또다른 측면에서, 본 발명은 동물 대상 (예를 들어, 포유동물, 예를 들어 인간, 다른 영장류, 스포츠용 동물, 상업적으로 중요한 동물, 예를 들어 소, 사육 동물, 예를 들어 말, 또는 애완동물, 예를 들어 개 및 고양이)에서 c-kit 매개 질환 또는 상태, 예를 들어, 비정상적인 c-kit 활성 (예를 들어, 키나제 활성)을 특징으로 하는 질병 또는 상태를 치료하기 위한 방법을 제공한다. 본 발명의 방법은 c-kit 매개 질환 또는 상태에 걸려 있거나 그러한 위험이 있는 대상에게 유효량의 화학식 I, 화학식 Ia, 화학식 Ib, 또는 화학식 Ig의 화합물 및 그의 모든 하위 실시태양을 투여하는 것을 포함한다. 한 실시태양에서, c-kit 매개 질병은 악성종양, 예를 들어 비만 세포 종양, 소세포 (small cell) 폐암, 고환암, 위장관 기질 종양 (GIST), 교아세포종, 성상세포종, 신경아세포종, 여성 생식관의 암종, 신경외배엽 기원의 육종, 결장직장 암종, 상피내 암종 (carcinoma in situ), 신경섬유종증과 연관된 쉬반 (Schwann) 세포 신생물, 급성 골수구성 백혈병, 급성 림프성 백혈병, 만성 골수성 백혈병, 비만세포증, 흑색종, 및 개 비만 세포 종양, 및 염증성 질병, 예를 들어 천식, 류마티스성 관절염, 알러지성 비염, 다발 경화증, 염증성 대장 증후군, 이식 거부, 및 과다호산구증가증으로 이루어지는 군 중에서 선택된다.
관련 측면에서, 화학식 I, 화학식 Ia, 화학식 Ib, 또는 화학식 Ig의 화합물 및 그의 모든 하위 실시태양은 악성종양, 예를 들어 비만 세포 종양, 소세포 폐암, 고환암, 위장관 기질 종양 (GIST), 교아세포종, 성상세포종, 신경아세포종, 여성 생식관의 암종, 신경외배엽 기원의 육종, 결장직장 암종, 상피내 암종, 신경섬유종증과 연관된 쉬반 세포 신생물, 급성 골수구성 백혈병, 급성 림프성 백혈병, 만성 골수성 백혈병, 비만세포증, 흑색종, 및 개 비만 세포 종양, 및 염증성 질병, 예를 들어 천식, 류마티스성 관절염, 알러지성 비염, 다발 경화증, 염증성 대장 증후군, 이식 거부, 및 과다호산구증가증으로 이루어지는 군 중에서 선택되는 c-kit 매개 질환 또는 상태의 치료용 의약의 제조에서 사용될 수 있다.
추가의 측면에서, 본 발명은 동물 대상 (예를 들어, 포유동물, 예를 들어 인간, 다른 영장류, 스포츠용 동물, 상업적으로 중요한 동물, 예를 들어 소, 사육 동물, 예를 들어 말, 또는 애완동물, 예를 들어 개 및 고양이)에서 c-fms 매개 질환 또는 상태, 예를 들어, 비정상적인 c-fms 활성 (예를 들어, 키나제 활성)을 특징으로 하는 질병 또는 상태를 치료하기 위한 방법을 제공한다. 본 발명의 방법은 c-fms 매개 질환 또는 상태에 걸려 있거나 그러한 위험이 있는 대상에게 유효량의 화학식 I, 화학식 Ia, 화학식 Ib, 또는 화학식 Ig의 화합물 및 그의 모든 하위 실시 태양을 투여하는 것을 포함한다. 한 실시태양에서, c-fms 매개 질병은 면역 질환, 예를 들어 류마티스성 관절염, 전신 홍반 루푸스 (SLE), 베게너 (Wegener) 육아종증 및 이식 거부, 염증성 질병, 예를 들어 만성 폐쇄성 폐질환 (COPD), 폐기종 및 죽상경화증, 대사 질환, 예를 들어 인슐린 내성, 과혈당증 및 지질분해, 뼈 구조 또는 무기질침착의 질환, 예를 들어 골다공증, 골절 위험 증가, 고칼슘혈증 및 뼈 전이, 신장 질병, 예를 들어 신장염 (예를 들어, 사구체신염, 간질 신장염, 루푸스 신장염), 세뇨관 괴사, 당뇨병-관련 신장 합병증, 및 비대 및 암, 예를 들어 다발 골수종, 급성 골수성 백혈병, 만성 골수성 백혈병 (CML), 유방암 및 난소암으로 이루어지는 군 중에서 선택된다.
관련 측면에서, 화학식 I, 화학식 Ia, 화학식 Ib, 또는 화학식 Ig의 화합물 및 그의 모든 하위 실시태양은 면역 질환, 예를 들어 류마티스성 관절염, 전신 홍반 루푸스 (SLE), 베게너 육아종증 및 이식 거부, 염증성 질병, 예를 들어 만성 폐쇄성 폐질환 (COPD), 폐기종 및 죽상경화증, 대사 질환, 예를 들어 인슐린 내성, 과혈당증 및 지질분해, 뼈 구조 또는 무기질침착의 질환, 예를 들어 골다공증, 골절 위험 증가, 고칼슘혈증 및 뼈 전이, 신장 질병, 예를 들어 신장염 (예를 들어, 사구체신염, 간질 신장염, 루푸스 신장염), 세뇨관 괴사, 당뇨병-관련 신장 합병증, 및 비대 및 암, 예를 들어 다발 골수종, 급성 골수성 백혈병, 만성 골수성 백혈병 (CML), 유방암 및 난소암으로 이루어지는 군 중에서 선택되는 c-fms 매개 질환 또는 상태의 치료용 의약의 제조에서 사용될 수 있다.
추가의 측면에서, 본 발명은 동물 대상 (예를 들어, 포유동물, 예를 들어 인 간, 다른 영장류, 스포츠용 동물, 상업적으로 중요한 동물, 예를 들어 소, 사육 동물, 예를 들어 말, 또는 애완동물, 예를 들어 개 및 고양이)에서 c-fms 매개 및/또는 c-kit 매개 질환 또는 상태, 예를 들어, 비정상적인 c-fms 활성 및/또는 c-kit 활성 (예를 들어, 키나제 활성)을 특징으로 하는 질병 또는 상태를 치료하기 위한 방법을 제공한다. 본 발명의 방법은 c-fms 매개 및/또는 c-kit 매개 질환 또는 상태에 걸려 있거나 그러한 위험이 있는 대상에게 유효량의 화학식 I, 화학식 Ia, 화학식 Ib, 또는 화학식 Ig의 화합물 및 그의 모든 하위 실시태양을 투여하는 것을 포함한다. 한 실시태양에서, c-fms 및/또는 c-kit 매개 질병은 비만 세포 종양, 소세포 폐암, 고환암, 위장관 기질 종양, 교아세포종, 성상세포종, 신경아세포종, 여성 생식관의 암종, 신경외배엽 기원의 육종, 결장직장 암종, 상피내 암종, 신경섬유종증과 연관된 쉬반 세포 신생물, 급성 골수성 백혈병, 급성 림프성 백혈병, 만성 골수성 백혈병, 다발 골수종, 비만세포증, 흑색종, 유방암, 난소암, 개 비만 세포 종양, 비대증, 천식, 류마티스성 관절염, 알러지성 비염, 다발 경화증, 염증성 대장 증후군, 이식 거부, 전신 홍반 루푸스, 베게너 육아종증, 만성 폐쇄성 폐질환, 폐기종, 죽상경화증, 인슐린 내성, 과혈당증, 지질분해, 과다호산구증가증, 골다공증, 골절 위험 증가, 고칼슘혈증, 뼈 전이, 사구체신염, 간질 신장염, 루푸스 신장염, 세뇨관 괴사, 및 당뇨병-관련 신장 합병증으로 이루어지는 군 중에서 선택된다.
관련 측면에서, 화학식 I, 화학식 Ia, 화학식 Ib, 또는 화학식 Ig의 화합물 및 그의 모든 하위 실시태양은 비만 세포 종양, 소세포 폐암, 고환암, 위장관 기질 종양, 교아세포종, 성상세포종, 신경아세포종, 여성 생식관의 암종, 신경외배엽 기원의 육종, 결장직장 암종, 상피내 암종, 신경섬유종증과 연관된 쉬반 세포 신생물, 급성 골수성 백혈병, 급성 림프성 백혈병, 만성 골수성 백혈병, 다발 골수종, 비만세포증, 흑색종, 유방암, 난소암, 개 비만 세포 종양, 비대증, 천식, 류마티스성 관절염, 알러지성 비염, 다발 경화증, 염증성 대장 증후군, 이식 거부, 전신 홍반 루푸스, 베게너 육아종증, 만성 폐쇄성 폐질환, 폐기종, 죽상경화증, 인슐린 내성, 과혈당증, 지질분해, 과다호산구증가증, 골다공증, 골절 위험 증가, 고칼슘혈증, 뼈 전이, 사구체신염, 간질 신장염, 루푸스 신장염, 세뇨관 괴사, 및 당뇨병-관련 신장 합병증으로 이루어지는 군 중에서 선택되는 c-fms 매개 및/또는 c-kit 매개 질환 또는 상태의 치료용 의약의 제조에서 사용될 수 있다.
또다른 측면에서, 본 발명은 본원에 기재된 바와 같은 화학식 I, 화학식 Ia, 화학식 Ib, 또는 화학식 Ig의 화합물 및 그의 모든 하위 실시태양 (예를 들어, c-kit, c-fms 또는 c-kit 및 c-fms 모두에 대해 유익한 수준의 활성 및/또는 선택성을 갖는 화합물)을 사용하는 방법을 제공한다. 특정 실시태양에서, 화합물은 코어 비시클릭 고리 구조 (아자인돌 코어)의 3-위치에서, 제2 아릴 또는 헤테로아릴기에 결합된 1 내지 3 원자의 링커 (linker)에 결합된 제1 아릴 또는 헤테로아릴기에 결합된 제1 링커를 포함하는 치환체기로 치환된다. 상기 설명된 3-위치 치환체기를 포함하는 특정 실시태양에서, 제1 링커는 메틸렌, 에틸렌, -C(O)-, -C(S)-, -O-, -S- 또는 -S(O)2-이고; 제1 아릴 또는 헤테로아릴기는 피리디닐, 피리미디닐, 피라 지닐, 피리다지닐, 피롤릴, 이미다졸릴, 트리아졸릴, 티아졸릴 또는 옥사졸릴이고; 제2 링커는 메틸 아미노 (NHCH2), 에틸 아미노 (NHCH2CH2), 아미드 (NHC(O)) 또는 술폰아미드 (NHSO2)이고; 제2 아릴 또는 헤테로아릴기는 페닐, 피리디닐, 피리미디닐, 피라지닐, 피리다지닐, 피롤릴, 이미다졸릴, 트리아졸릴, 티아졸릴, 푸라닐 또는 옥사졸릴이고; 제2 아릴 또는 헤테로아릴기는 저급 알킬기 (예를 들어, 메틸기, 에틸기, 프로필기, 또는 부틸기), 알콕시기 (예를 들어, 메톡시기, 에톡시기, 프로폭시기, 또는 부톡시기), 할로 치환된 저급 알킬 (예를 들어, -CH2F, -CHF2, 또는 -CF3), 또는 할로 (예를 들어, F 또는 Cl)로 임의로 치환된다. 특정 실시태양에서, 제2 아릴 또는 헤테로아릴기는 6원 고리이고; 6원 고리는 파라 위치에서 치환되거나; 6원 고리는 메타 위치에서 치환되거나; 6원 고리는 오르쏘 위치에서 치환되거나; 6원 고리는 메타 및 파라 위치에서 치환된다. 특정 실시태양에서, 제2 아릴 또는 헤테로아릴기는 5원 고리이고; 5원 고리는 제2 링커에 결합된 원자에 인접한 위치에서 치환되거나; 5원 고리는 제2 링커에 결합된 원자에 인접하지 않은 위치에서 치환된다. 특정 실시태양에서, 3-위치 치환체기는 아자인돌 코어 상의 유일한 비-수소 치환체이다.
특정 실시태양에서, 화합물은 일반적으로 인정되는 키나제 활성 분석으로 측정할 때 IC50이 100 nM 미만, 50 nM 미만, 20 nM 미만, 10 nM 미만, 또는 5 nM 미만이다. 특정 실시태양에서, 화합물의 선택성은 화합물이 Ret, PDGF, 또는 Ret 및 PDGF 모두에 대해서보다 c-kit에 대해 적어도 2배, 5배, 10배, 또는 100배 더 활성인 정도이다. 특정 실시태양에서, 화합물의 선택성은 화합물이 c-fms에 대해서보다 c-kit에 대해 적어도 2배, 5배, 10배, 또는 100배 더 활성인 정도이다. 특정 실시태양에서, 화합물의 선택성은 화합물이 c-kit에 대해서보다 c-fms에 대해 적어도 2배, 5배, 10배, 또는 100배 더 활성인 정도이다. 특정 실시태양에서, 화합물은 본 문단에 명시한 바와 같은 활성 (예를 들어, IC50) 및/또는 선택성의 각각의 페어링 (pairing)을 조합으로 갖는다.
특정 실시태양에서, 화합물은 c-kit, c-fms, 또는 c-kit 및 c-fms 키나제 활성 모두에 대한 일반적으로 인정되는 키나제 활성 분석으로 측정할 때 IC50이 100 nM 미만, 50 nM 미만, 20 nM 미만, 10 nM 미만, 또는 5 nM 미만이다. 특정 실시태양에서, 화합물의 선택성은 화합물이 Ret, PDGF, 또는 Ret 및 PDGF 둘다에 대해서보다 c-kit, c-fms, 또는 c-kit 및 c-fms 둘다에 대해서 적어도 2배, 5배, 10배, 또는 100배 더 활성인 정도이다.
본 발명의 추가의 측면은 치료 유효량의 화학식 I의 화합물 (화학식 Ia, Ib, Ig 및 그의 모든 하위 실시태양 포함) 및 적어도 하나의 제약상 허용되는 담체, 부형제, 및/또는 희석제를 포함하는 조성물에 관한 것이다. 조성물은 다수의 상이한 약물학적 활성 화합물을 포함할 수 있고, 이는 다수의 화학식 I의 화합물 (화학식 Ia, Ib, Ig 및 그의 모든 하위 실시태양 포함)을 포함할 수 있다.
관련 측면에서, 본 발명은 본원에 기재된 바와 같은 조성물을 포함하는 키트 를 제공한다. 특정 실시태양에서, 조성물은 예를 들어, 바이알, 보틀 (bottle), 플라스크 내에 포장되고, 이는 예를 들어, 상자, 엔벨롭 (envelope), 또는 백 (bag) 내에 추가로 포장될 수 있고; 조성물은 포유동물, 예를 들어, 인간에 대한 투여에 대해 미국 식품의약국 (U.S. Food and Drug Administration) 또는 유사한 규제 기관에 의해 승인되었고; 조성물은 c-kit 및/또는 c-fms 매개 질환 또는 상태에 대한 포유동물, 예를 들어, 인간에 대한 투여에 대해 승인되었고; 본 발명의 키트는 사용 및/또는 조성물이 c-kit 및/또는 c-fms 매개 질환 또는 상태에 대한 포유동물, 예를 들어, 인간에 대한 투여에 대해 적합하거나 승인된 다른 적응증에 대한 서면 지시서를 포함하고; 조성물은 단위 용량 또는 단일 용량 형태, 예를 들어, 단일 용량 알약 (pill), 캡슐 등으로 포장된다.
본 발명은 또한 c-kit 및 c-fms에 대해 활성인 임의의 다수의 화학식 I, 화학식 Ia, 화학식 Ib, 또는 화학식 Ig의 시험 화합물 및 그의 모든 하위 실시태양이 c-kit 및 c-fms에 대해 활성인 참조 화합물에 비해 하나 이상의 목적하는 약물학적 특성에서 개선을 제공하는지 결정하고, 목적하는 약물학적 특성에서 개선이 있는 화합물이 존재하는 경우 선택하여, 개선된 조절제를 제공함으로써 c-kit 및 c-fms에 대해 활성인 추가의 화합물, 예를 들어 개선된 조절제를 확인 또는 개발하기 위한 방법을 제공한다.
조절제 개발의 특정 측면에서, 목적하는 약물학적 특성은 2 hr 초과 또는 4 hr 초과 또는 8 hr 초과의 혈청 반감기, 수성 용해도, 10％ 초과의 경구 생체이용률, 또는 20％ 초과의 경구 생체이용률이다.
또한, 조절제 개발의 특정 측면에서, 방법은 수차례 반복될 수 있고, 즉, 유도체의 제조 및/또는 추가의 관련 화합물의 선택 및 관련 화합물의 상기 추가의 유도체의 평가의 다수 라운드, 예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10회 이상의 추가의 라운드가 수행될 수 있다.
또다른 측면에서, 본 발명은 c-kit 또는 c-fms를 c-kit 및/또는 c-fms에 대해 활성인 유효량의 화학식 I의 화합물 (화학식 Ia, Ib, Ig 및 그의 모든 하위 실시태양 포함) (예를 들어, 본원에 설명된 방법을 이용하여 개발된 화합물)과 접촉시킴으로써, c-kit 또는 c-fms 활성을 조절하기 위한 방법을 또한 제공한다. 화합물은 바람직하게는 c-kit 또는 c-fms 활성을 적어도 10％, 보다 바람직하게는 적어도 20％, 30％, 40％, 50％, 60％, 70％, 80％, 90％ 또는 90％ 초과로 조절하기 위해 충분한 수준으로 제공된다. 많은 실시태양에서, 화합물은 약 1 μM, 100 μM, 또는 1 mM의 농도, 또는 1-100 nM, 100-500 nM, 500-1000 nM, 1-100 μM, 100-500 μM, 또는 500-1000 μM의 범위일 것이다. 특정 실시태양에서, 접촉은 시험관 내에서 (in vitro) 수행된다.
추가의 측면 및 실시태양은 하기 상세한 설명 및 청구의 범위로부터 명백해질 것이다.
본원에서 사용되는 바와 같이, 하기 정의가 적용된다:
"할로" 및 "할로겐"은 모든 할로겐, 즉, 클로로 (Cl), 플루오로 (F), 브로모 (Br), 또는 요오도 (I)를 의미한다.
"히드록실" 및 "히드록시"는 기 -OH를 의미한다.
"티올"은 기 -SH를 의미한다.
"저급 알킬"은 단독으로 또는 조합으로 직쇄 알킬 또는 분지쇄 알킬을 포함하는, 1 내지 6 탄소 원자 (구체적으로 정의하지 않으면)를 함유하는 알칸-유래된 라디칼을 의미한다. 직쇄 또는 분지쇄 알킬기는 안정한 화합물을 생성하도록 임의의 이용가능한 위치에서 부착된다. 많은 실시태양에서, 저급 알킬은 1-6, 1-4, 또는 1-2개의 탄소 원자를 함유하는 직쇄 또는 분지쇄 알킬기, 예를 들어 메틸, 에틸, 프로필, 이소프로필, 부틸, t-부틸 등이다. "임의로 치환된 저급 알킬"은 달리 나타내지 않으면, 안정한 화합물을 생성하도록 임의의 이용가능한 원자에 부착된 하나 이상, 바람직하게는 1, 2, 3, 4 또는 5, 또한 1, 2 또는 3개의 치환체로 독립적으로 치환된 저급 알킬을 나타내고, 여기서 치환체는 -F, -OH, -NH2, -NO2, -CN, -C(O)OH, -C(S)OH, -C(O)NH2, -C(S)NH2, -S(O)2NH2, -NHC(O)NH2, -NHC(S)NH2, -NHS(O)2NH2, -C(NH)NH2, -ORa, -SRa, -OC(O)Ra, -OC(S)Ra, -C(O)Ra, -C(S)Ra, -C(O)ORa, -C(S)ORa, -S(O)Ra, -S(O)2Ra, -C(O)NHRa, -C(S)NHRa, -C(O)NRaRa, -C(S)NRaRa, -S(O)2NHRa, -S(O)2NRaRa, -C(NH)NHRa, -C(NH)NRbRc, -NHC(O)Ra, -NHC(S)Ra, -NRaC(O)Ra, -NRaC(S)Ra, -NHS(O)2Ra, -NRaS(O)2Ra, -NHC(O)NHRa, -NHC(S)NHRa, -NRaC(O)NH2, -NRaC(S)NH2, -NRaC(O)NHRa, -NRaC(S)NHRa, -NHC(O)NRaRa, -NHC(S)NRaRa, -NRaC(O)NRaRa, -NRaC(S)NRaRa, -NHS(O)2NHRa, -NRaS(O)2NH2, -NRaS(O)2NHRa, -NHS(O)2NRaRa, -NRaS(O)2NRaRa, -NHRa, -NRaRa, -Re, -Rf 및 -Rg로 이루어지는 군 중에서 선택된다. 추가로, 가능한 치환은 안정한 화합물을 생성하도록 임의의 이용가능한 원자에 부착된 예를 들어, 화학식 I의 화합물 (화학식 Ia, Ib, Ig 및 그의 모든 하위 실시태양 포함)의 설명에서 본원에 나타낸 바와 같은 상기 치환의 하위세트를 포함한다. 예를 들어, "플루오로 치환된 저급 알킬"은 하나 이상의 플루오로 원자로 치환된 저급 알킬기, 예를 들어 퍼플루오로알킬을 나타내고, 여기서 바람직하게는 저급 알킬은 1, 2, 3, 4 또는 5개의 플루오로 원자, 또한 1, 2 또는 3개의 플루오로 원자로 치환된다. 치환체는 안정한 화합물을 생성하도록 임의의 이용가능한 원자에서 부착되는 것이 이해되지만, 임의로 치환된 알킬이 -OR, -NHR, -C(O)NHR 등과 같은 잔기의 R기인 경우에, 알킬 R기의 치환은 잔기의 임의의 -O-, -S-, 또는 -N- (-N-이 헤테로아릴 고리 원자인 경우 제외)에 결합된 알킬 탄소의 치환이 치환체의 임의의 -O-, -S-, 또는 -N- (-N-이 헤테로아릴 고리 원자인 경우 제외)이 잔기의 임의의 -O-, -S-, 또는 -N-에 결합된 알킬 탄소에 결합되도록 할 치환체를 제외하는 것이다.
"저급 알킬렌"은 직쇄 또는 분지쇄의 1-6 탄소 원자를 함유하는 2가의 알칸-유래된 라디칼을 의미하고, 그로부터 2개의 수소 원자는 동일한 탄소 원자 또는 상이한 탄소 원자로부터 취해진다. 저급 알킬렌의 예는 메틸렌 -CH2-, 에틸렌 - CH2CH2-, 프로필렌 -CH2CH2CH2-, 이소프로필렌 -CH(CH3)CH- 등을 포함하지만 이로 제한되지 않는다. "임의로 치환된 저급 알킬렌"은 달리 나타내지 않으면, 안정한 화합물을 생성하도록 임의의 이용가능한 원자에서 부착된 하나 이상, 바람직하게는 1, 2, 3, 4 또는 5개, 또한 1, 2 또는 3개의 치환체로 독립적으로 치환된 저급 알킬렌을 나타내고, 여기서 치환체는 -F, -OH, -NH2, -NO2, -CN, -C(O)OH, -C(S)OH, -C(O)NH2, -C(S)NH2, -S(O)2NH2, -NHC(O)NH2, -NHC(S)NH2, -NHS(O)2NH2, -C(NH)NH2, -ORa, -SRa, -OC(O)Ra, -OC(S)Ra, -C(O)Ra, -C(S)Ra, -C(O)ORa, -C(S)ORa, -S(O)Ra, -S(O)2Ra, -C(O)NHRa, -C(S)NHRa, -C(O)NRaRa, -C(S)NRaRa, -S(O)2NHRa, -S(O)2NRaRa, -C(NH)NHRa, -C(NH)NRbRc, -NHC(O)Ra, -NHC(S)Ra, -NRaC(O)Ra, -NRaC(S)Ra, -NHS(O)2Ra, -NRaS(O)2Ra, -NHC(O)NHRa, -NHC(S)NHRa, -NRaC(O)NHRa, -NRaC(O)NH2, -NRaC(S)NH2, -NRaC(S)NHRa, -NHC(O)NRaRa, -NHC(S)NRaRa, -NRaC(O)NRaRa, -NRaC(S)NRaRa, -NHS(O)2NHRa, -NRaS(O)2NH2, -NRaS(O)2NHRa, -NHS(O)2NRaRa, -NRaS(O)2NRaRa, -NHRa, -NRaRa, -Re, -Rf, 및 -Rg로 이루어지는 군 중에서 선택되거나, 임의의 하나의 탄소 상의 2개의 치환체 또는 알킬렌 사슬 내의 각각의 임의의 2개의 탄소 상의 치환체는 연결하여 3-7원의 모노시클릭 시클로알킬 또는 5-7원의 모노시클릭 헤테로시클로알킬을 형성할 수 있고, 여기서 모노시클릭 시클로알킬 또는 모노시클릭 헤테로시클로알킬은 할로겐, -OH, -NH2, 저급 알킬, 플루오로 치환된 저급 알킬, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 플루오로 치환된 저급 알킬티오, 모노-알킬아미노, 디-알킬아미노, 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 임의로 치환된다.
"저급 알케닐"은 단독으로 또는 조합으로 2-6 탄소 원자 (구체적으로 정의하지 않으면) 및 적어도 하나, 바람직하게는 1-3개, 보다 바람직하게는 1-2개, 가장 바람직하게는 하나의 탄소 대 탄소 이중 결합을 함유하는 직쇄 또는 분지쇄의 탄화수소를 의미한다. 탄소 대 탄소 이중 결합은 직쇄 또는 분지쇄 부분 내에 함유될 수 있다. 저급 알케닐기의 예는 에테닐, 프로페닐, 이소프로페닐, 부테닐 등을 포함한다. "치환된 저급 알케닐"은 달리 나타내지 않으면, 안정한 화합물을 생성하도록 임의의 이용가능한 원자에서 부착된 하나 이상, 바람직하게는 1, 2, 3, 4 또는 5개, 또한 1, 2 또는 3개의 치환체로 독립적으로 치환된 저급 알케닐을 나타내고, 여기서 치환체는 -F, -OH, -NH2, -NO2, -CN, -C(O)OH, -C(S)OH, -C(O)NH2, -C(S)NH2, -S(O)2NH2, -NHC(O)NH2, -NHC(S)NH2, -NHS(O)2NH2, -C(NH)NH2, -ORa, -SRa, -OC(O)Ra, -OC(S)Ra, -C(O)Ra, -C(S)Ra, -C(O)ORa, -C(S)ORa, -S(O)Ra, -S(O)2Ra, -C(O)NHRa, -C(S)NHRa, -C(O)NRaRa, -C(S)NRaRa, -S(O)2NHRa, -S(O)2NRaRa, -C(NH)NHRa, -C(NH)NRbRc, -NHC(O)Ra, -NHC(S)Ra, -NRaC(O)Ra, -NRaC(S)Ra, -NHS(O)2Ra, -NRaS(O)2Ra, -NHC(O)NHRa, -NHC(S)NHRa, -NRaC(O)NH2, -NRaC(S)NH2, -NRaC(O)NHRa, -NRaC(S)NHRa, -NHC(O)NRaRa, -NHC(S)NRaRa, -NRaC(O)NRaRa, -NRaC(S)NRaRa, -NHS(O)2NHRa, -NRaS(O)2NH2, -NRaS(O)2NHRa, -NHS(O)2NRaRa, -NRaS(O)2NRaRa, -NHRa, -NRaRa, -Rd, -Rf, 및 -Rg로 이루어지는 군 중에서 선택된다. 추가로, 가능한 치환은 안정한 화합물을 생성하도록 임의의 이용가능한 원자에서 부착된, 예를 들어, 화학식 I의 화합물 (화학식 Ia, Ib, Ig 및 그의 모든 하위 실시태양 포함)의 설명에서 본원에 나타낸 바와 같은 상기 치환의 하위세트를 포함한다. 예를 들어, "플루오로 치환된 저급 알케닐"은 하나 이상의 플루오로 원자로 치환된 저급 알케닐기를 나타내고, 여기서 바람직하게는 저급 알케닐은 1, 2, 3, 4 또는 5개의 플루오로 원자, 또한 1, 2 또는 3개의 플루오로 원자로 치환된다. 치환은 안정한 화합물을 생성하도록 임의의 이용가능한 원자에서 부착되는 것이 이해되지만, 알케닐기의 치환은 -F, -C(O)-, -C(S)-, -C(NH)-, -S(O)-, -S(O)2-, -O-, -S-, 또는 -N- (-N-이 헤테로아릴 고리 원자인 경우 제외)이 그의 알켄 탄소에 결합되지 않도록 하는 것이다. 추가로, 알케닐이 다른 잔기의 치환체 또는 -OR, -NHR, -C(O)R 등과 같은 잔기의 R기인 경우에, 잔기의 치환은 그의 임의의 -C(O)-, -C(S)-, -S(O)-, -S(O)2-, -O-, -S-, 또는 -N- (-N-이 헤테로아릴 고리 원자인 경우 제외)이 알케닐 치환체의 알켄 탄소 또는 R기에 결합되지 않도록 하는 것이다. 추가로, 알케닐이 다른 잔기의 치환체 또는 -OR, -NHR, -C(O)NHR 등과 같은 잔기의 R기인 경우에, 알케닐 R기의 치환은 잔기의 임의의 -O-, -S-, 또는 -N- (-N-이 헤테로아릴 고리 원자인 경우 제외)에 결합된 알케닐 탄소의 치환이 치환체의 임의의 -O-, -S-, 또는 -N- (-N-이 헤테로아릴 고리 원자인 경우 제외)이 잔기의 임의의 -O-, -S-, 또는 -N-에 결합된 알케닐 탄소에 결합되도록 할 치환체를 제외하는 것이다. "알케닐 탄소"는 포화되든 탄소 대 탄소 이중 결합의 일부이든 알케닐기 내의 임의의 탄소를 의미한다. "알켄 탄소"는 탄소 대 탄소 이중 결합의 일부인 알케닐기 내의 탄소를 의미한다.
"저급 알키닐"은 단독으로 또는 조합으로 적어도 하나, 바람직하게는 하나의 탄소 대 탄소 삼중 결합을 함유하는, 2-6 탄소 원자 (구체적으로 정의하지 않으면)를 함유하는 직쇄 또는 분지쇄의 탄화수소를 의미한다. 알키닐기의 예는 에티닐, 프로피닐, 부티닐 등을 포함한다. "치환된 저급 알키닐"은 달리 나타내지 않으면, 안정한 화합물을 생성하도록 임의의 이용가능한 원자에서 부착된 하나 이상, 바람직하게는 1, 2, 3, 4 또는 5개, 또한 1, 2 또는 3개의 치환체로 독립적으로 치환된 저급 알키닐을 나타내고, 여기서 치환체는 -F, -OH, -NH2, -NO2, -CN, -C(O)OH, -C(S)OH, -C(O)NH2, -C(S)NH2, -S(O)2NH2, -NHC(O)NH2, -NHC(S)NH2, -NHS(O)2NH2, -C(NH)NH2, -ORa, -SRa, -OC(O)Ra, -OC(S)Ra, -C(O)Ra, -C(S)Ra, -C(O)ORa, -C(S)ORa, -S(O)Ra, -S(O)2Ra, -C(O)NHRa, -C(S)NHRa, -C(O)NRaRa, -C(S)NRaRa, -S(O)2NHRa, -S(O)2NRaRa, -C(NH)NHRa, -C(NH)NRbRc, -NHC(O)Ra, -NHC(S)Ra, -NRaC(O)Ra, -NRaC(S)Ra, -NHS(O)2Ra, -NRaS(O)2Ra, -NHC(O)NHRa, -NHC(S)NHRa, -NRaC(O)NH2, -NRaC(S)NH2, -NRaC(O)NHRa, -NRaC(S)NHRa, -NHC(O)NRaRa, -NHC(S)NRaRa, -NRaC(O)NRaRa, -NRaC(S)NRaRa, -NHS(O)2NHRa, -NRaS(O)2NH2, -NRaS(O)2NHRa, -NHS(O)2NRaRa, -NRaS(O)2NRaRa, -NHRa, -NRaRa, -Rd, -Re, 및 -Rg로 이루어지는 군 중에서 선택된다. 추가로, 가능한 치환은 안정한 화합물을 생성하도록 임의의 이용가능한 원자에서 부착된, 예를 들어, 화학식 I의 화합물 (화학식 Ia, Ib, Ig 및 그의 모든 하위 실시태양 포함)의 설명에서 본원에 나타낸 바와 같은 상기 치환의 하위세트를 포함한다. 예를 들어, "플루오로 치환된 저급 알키닐"은 하나 이상의 플루오로 원자로 치환된 저급 알키닐기를 나타내고, 여기서 바람직하게는 저급 알키닐은 1, 2, 3, 4 또는 5개의 플루오로 원자, 또한 1, 2 또는 3개의 플루오로 원자로 치환된다. 치환은 안정한 화합물을 생성하도록 임의의 이용가능한 원자에서 부착되는 것이 이해되지만, 알키닐기의 치환은 -F, -C(O)-, -C(S)-, -C(NH)-, -S(O)-, -S(O)2-, -O-, -S-, 또는 -N- (-N-이 헤테로아릴 고리 원자인 경우 제외)이 그의 알킨 탄소에 결합되지 않도록 하는 것이다. 추가로, 알키닐이 다른 잔기의 치환체 또는 -OR, -NHR, -C(O)R 등과 같은 잔기의 R기인 경우에, 잔기의 치환은 그의 임의의 -C(O)-, -C(S)-,-S(O)-, -S(O)2-, -O-, -S-, 또는 -N- (-N-이 헤테로아릴 고리 원자인 경우 제외)이 알키닐 치환체의 알킨 탄소 또는 R기에 결합되지 않도록 하는 것이다. 추가로, 알키닐이 다른 잔기의 치환체 또는 -OR, -NHR, -C(O)NHR 등과 같은 잔기의 R기인 경우에, 알키닐 R기의 치환은 잔기의 임의의 -O-, -S-, 또는 -N- (-N-이 헤테로아릴 고리 원자인 경우 제외)에 결합된 알키닐 탄소의 치환이 치환체의 임의의 -O-, -S-, 또는 -N- (-N-이 헤테로아릴 고리 원자인 경우 제외)이 잔기의 임의의 -O-, -S-, 또는 -N-에 결합된 알키닐 탄소에 결합되도록 할 치환체를 제외하는 것이다. "알키닐 탄소"는 포화되든 탄소 대 탄소 삼중 결합의 일부이든 알키닐기 내의 임의의 탄소를 의미한다. "알킨 탄소"는 탄소 대 탄소 삼중 결합의 일부인 알키닐기 내의 탄소를 의미한다.
"시클로알킬"은 고리 당 3-10개, 또한 3-8개, 보다 바람직하게는 3-6개의 고리 구성원의 포화 또는 불포화된 비-방향족 모노시클릭, 비시클릭 또는 트리시클릭 탄소 고리계, 예를 들어 시클로프로필, 시클로펜틸, 시클로헥실, 아다만틸 등을 의미한다. "시클로알킬렌"은 2가의 시클로알킬이다. "치환된 시클로알킬"은 달리 나타내지 않으면, 안정한 화합물을 생성하도록 임의의 이용가능한 원자에서 부착된 하나 이상, 바람직하게는 1, 2, 3, 4 또는 5개, 또한 1, 2 또는 3개의 치환체로 독립적으로 치환된 시클로알킬이고, 여기서 치환체는 할로겐, -OH, -NH2, -NO2, -CN, -C(O)OH, -C(S)OH, -C(O)NH2, -C(S)NH2, -S(O)2NH2, -NHC(O)NH2, -NHC(S)NH2, -NHS(O)2NH2, -C(NH)NH2, -ORa, -SRa, -OC(O)Ra, -OC(S)Ra, -C(O)Ra, -C(S)Ra, -C(O)ORa, -C(S)ORa, -S(O)Ra, -S(O)2Ra, -C(O)NHRa, -C(S)NHRa, -C(O)NRaRa, -C(S)NRaRa, -S(O)2NHRa, -S(O)2NRaRa, -C(NH)NHRa, -C(NH)NRbRc, -NHC(O)Ra, -NHC(S)Ra, -NRaC(O)Ra, -NRaC(S)Ra, -NHS(O)2Ra, -NRaS(O)2Ra, -NHC(O)NHRa, -NHC(S)NHRa, -NRaC(O)NH2, -NRaC(S)NH2, -NRaC(O)NHRa, -NRaC(S)NHRa, -NHC(O)NRaRa, -NHC(S)NRaRa, -NRaC(O)NRaRa, -NRaC(S)NRaRa, -NHS(O)2NHRa, -NRaS(O)2NH2, -NRaS(O)2NHRa, -NHS(O)2NRaRa, -NRaS(O)2NRaRa, -NHRa, -NRaRa, -Rd, -Re, -Rf, 및 -Rg로 이루어지는 군 중에서 선택된다. "치환된 시클로알킬렌"은 2가의 치환된 시클로알킬이다.
"헤테로시클로알킬"은 5 내지 10 원자를 갖는 포화 또는 불포화의 비-방향족 시클로알킬기를 의미하고, 여기서 고리 내의 1 내지 3개의 탄소 원자는 O, S 또는 N의 헤테로원자로 교체되고, 5-6 고리 구성원의 벤조 또는 헤테로아릴과 선택적으로 융합된다. 헤테로시클로알킬은 또한 산화된 S 또는 N, 예를 들어 3차 고리 질소의 술피닐, 술포닐 및 N-옥시드를 포함하도록 의도된다. 헤테로시클로알킬은 또한 고리 탄소 중 하나가 옥소 치환된, 즉, 고리 탄소가 카르보닐기인 화합물, 예를 들어 락톤 및 락탐을 포함하도록 의도된다. 헤테로시클로알킬 고리의 부착 지점은 안정한 고리가 유지되도록 탄소 또는 질소 원자이다. 헤테로시클로알킬기의 예는 모르폴리노, 테트라히드로푸라닐, 디히드로피리디닐, 피페리디닐, 피롤리디닐, 피롤리도닐, 피페라지닐, 디히드로벤조푸릴, 및 디히드로인돌릴을 포함하고 이로 제한되지 않는다. "헤테로시클로알킬렌"은 2가의 헤테로시클로알킬이다. "치환된 헤테로시클로알킬"은 달리 나타내지 않으면, 안정한 화합물을 생성하도록 임의의 이용가능한 원자에서 부착된 하나 이상, 바람직하게는 1, 2, 3, 4 또는 5개, 또한 1, 2 또는 3개의 치환체로 독립적으로 치환된 헤테로시클로알킬이고, 여기서 치환체는 할로겐, -OH, -NH2, -NO2, -CN, -C(O)OH, -C(S)OH, -C(O)NH2, -C(S)NH2, -S(O)2NH2, -NHC(O)NH2, -NHC(S)NH2, -NHS(O)2NH2, -C(NH)NH2, -ORa, -SRa, -OC(O)Ra, -OC(S)Ra, -C(O)Ra, -C(S)Ra, -C(O)ORa, -C(S)ORa, -S(O)Ra, -S(O)2Ra, -C(O)NHRa, -C(S)NHRa, -C(O)NRaRa, -C(S)NRaRa, -S(O)2NHRa, -S(O)2NRaRa, -C(NH)NHRa, -C(NH)NRbRc, -NHC(O)Ra, -NHC(S)Ra, -NRaC(O)Ra, -NRaC(S)Ra, -NHS(O)2Ra, -NRaS(O)2Ra, -NHC(O)NHRa, -NHC(S)NHRa, -NRaC(O)NH2, -NRaC(S)NH2, -NRaC(O)NHRa, -NRaC(S)NHRa, -NHC(O)NRaRa, -NHC(S)NRaRa, -NRaC(O)NRaRa, -NRaC(S)NRaRa, -NHS(O)2NHRa, -NRaS(O)2NH2, -NRaS(O)2NHRa, -NHS(O)2NRaRa, -NRaS(O)2NRaRa, -NHRa, -NRaRa, -Rd, -Re, -Rf, 및 -Rg로 이루어지는 군 중에서 선택된다. "치환된 헤테로시클로알킬렌"은 2가의 치환된 헤테로시클로알킬이다.
"아릴"은 단독으로 또는 조합으로 방향족 탄화수소를 함유하는 모노시클릭 또는 비시클릭 고리계, 예를 들어 페닐 또는 나프틸를 의미하고, 이는 바람직하게는 5-7개, 보다 바람직하게는 5-6개의 고리 구성원의 시클로알킬과 선택적으로 융합될 수 있다. "아릴렌"은 2가의 아릴이다. "치환된 아릴"은 달리 나타내지 않으면, 안정한 화합물을 생성하도록 임의의 이용가능한 원자에서 부착되는 하나 이상, 바람직하게는 1, 2, 3, 4 또는 5개, 또한 1, 2 또는 3개의 치환체로 독립적으로 치환된 아릴이고, 여기서 치환체는 할로겐, -OH, -NH2, -NO2, -CN, -C(O)OH, -C(S)OH, -C(O)NH2, -C(S)NH2, -S(O)2NH2, -NHC(O)NH2, -NHC(S)NH2, -NHS(O)2NH2, -C(NH)NH2, -ORa, -SRa, -OC(O)Ra, -OC(S)Ra, -C(O)Ra, -C(S)Ra, -C(O)ORa, -C(S)ORa, -S(O)Ra, -S(O)2Ra, -C(O)NHRa, -C(S)NHRa, -C(O)NRaRa, -C(S)NRaRa, -S(O)2NHRa, -S(O)2NRaRa, -C(NH)NHRa, -C(NH)NRbRc, -NHC(O)Ra, -NHC(S)Ra, -NRaC(O)Ra, -NRaC(S)Ra, -NHS(O)2Ra, -NRaS(O)2Ra, -NHC(O)NHRa, -NHC(S)NHRa, -NRaC(O)NH2, -NRaC(S)NH2, -NRaC(O)NHRa, -NRaC(S)NHRa, -NHC(O)NRaRa, -NHC(S)NRaRa, -NRaC(O)NRaRa, -NRaC(S)NRaRa, -NHS(O)2NHRa, -NRaS(O)2NH2, -NRaS(O)2NHRa, -NHS(O)2NRaRa, -NRaS(O)2NRaRa, -NHRa, -NRaRa, -Rd, -Re, -Rf, 및 -Rg로 이루어지는 군 중에서 선택된다. "치환된 아릴렌"은 2가의 치환된 아릴이다.
"헤테로아릴"은 단독으로 또는 조합으로 하나 이상, 바람직하게는 1-4개, 보다 바람직하게는 1-3개, 훨씬 더 바람직하게는 1-2개의, O, S, 및 N으로 이루어지는 군 중에서 독립적으로 선택된 헤테로원자를 함유하는, 5 또는 6개의 고리 원자를 함유하는 모노시클릭 방향족 고리 구조 또는 8 내지 10개의 원자를 갖는 비시클릭 방향족기를 의미한다. 헤테로아릴은 또한 산화된 S 또는 N, 예를 들어 3차 고리 질소의 술피닐, 술포닐 및 N-옥시드를 포함하도록 의도된다. 탄소 또는 질소 원자가 헤테로아릴 고리 구조의 부착 지점이어서, 안정한 화합물이 생성된다. 헤테로아릴기의 예는 피리디닐, 피리다지닐, 피라지닐, 퀴나옥살릴, 인돌리지닐, 벤조[b]티에닐, 퀴나졸리닐, 푸리닐, 인돌릴, 퀴놀리닐, 피리미디닐, 피롤릴, 옥사졸릴, 티아졸릴, 티에닐, 이속사졸릴, 옥사티아디아졸릴, 이소티아졸릴, 테트라졸릴, 이미다졸릴, 트리아지닐, 푸라닐, 벤조푸릴, 및 인돌릴을 포함하고 이로 제한되지 않는다. "질소 함유 헤테로아릴"은 임의의 헤테로원자가 N인 헤테로아릴을 의미한다. "헤테로아릴렌"은 2가의 헤테로아릴이다. "치환된 헤테로아릴"은 달리 나타내지 않으면, 안정한 화합물을 생성하도록 임의의 이용가능한 원자에서 부착된 하나 이상, 바람직하게는 1, 2, 3, 4 또는 5개, 또한 1, 2 또는 3개의 치환체로 독립적으로 치환된 헤테로아릴이고, 여기서 치환체는 할로겐, -OH, -NH2, -NO2, -CN, -C(O)OH, -C(S)OH, -C(O)NH2, -C(S)NH2, -S(O)2NH2, -NHC(O)NH2, -NHC(S)NH2, -NHS(O)2NH2, -C(NH)NH2, -ORa, -SRa, -OC(O)Ra, -OC(S)Ra, -C(O)Ra, -C(S)Ra, -C(O)OR3, -C(S)ORa, -S(O)Ra, -S(O)2Ra, -C(O)NHRa, -C(S)NHRa, -C(O)NRaRa, -C(S)NRaRa, -S(O)2NHRa, -S(O)2NRaRa, -C(NH)NHRa, -C(NH)NRbRc, -NHC(O)Ra, -NHC(S)Ra, -NRaC(O)Ra, -NRaC(S)Ra, -NHS(O)2Ra, -NRaS(O)2Ra, -NHC(O)NHRa, -NHC(S)NHRa, -NRaC(O)NH2, -NRaC(S)NH2, -NRaC(O)NHRa, -NRaC(S)NHRa, -NHC(O)NRaRa, -NHC(S)NRaRa, -NRaC(O)NRaRa, -NRaC(S)NRaRa, -NHS(O)2NHRa, -NRaS(O)2NH2, -NRaS(O)2NHRa, -NHS(O)2NRaRa, -NRaS(O)2NRaRa, -NHRa, -NRaRa, -Rd, -Re, -Rf, 및 -Rg로 이루어지는 군 중에서 선택된다. "치환된 헤테로아릴렌"은 2가의 치환된 헤테로아릴이다.
알킬, 알킬렌, 알케닐, 알키닐, 시클로알킬, 헤테로시클로알킬, 아릴 및 헤테로아릴에 대한 선택적인 치환체의 설명에서 사용되는 변수 Ra, Rb, Rc, -Rd, -Re, -Rf, 및 -Rg는 다음과 같이 정의된다:
각각의 Ra, Rb, 및 Rc는 -Rd, -Re, -Rf, 및 -Rg로 이루어지는 군 중에서 독립적으로 선택되거나, Rb 및 Rc는 그들이 부착된 질소와 결합하여 5-7원의 헤테로시클로알킬 또는 5 또는 7원의 질소 함유 헤테로아릴을 형성하고, 여기서 5-7원의 헤테로시클로알킬 또는 5 또는 7원의 질소 함유 헤테로아릴은 할로겐, -NO2, -CN, -OH, -NH2, -ORu, -SRu, -NHRu, -NRuRu, -Rx, 및 -Ry로 이루어지는 군 중에서 선택된 하나 이상, 바람직하게는 1, 2, 3, 4 또는 5개, 또한 1, 2 또는 3개의 치환체로 임의로 치환되고;
각각의 -Rd는 독립적으로 저급 알킬이고, 여기서 저급 알킬은 플루오로, -OH, -NH2, -NO2, -CN, -C(O)OH, -C(S)OH, -C(O)NH2, -C(S)NH2, -S(O)2NH2, -NHC(O)NH2, -NHC(S)NH2, -NHS(O)2NH2, -C(NH)NH2, -ORk, -SRk, -OC(O)Rk, -OC(S)Rk, -C(O)Rk, -C(S)Rk, -C(O)ORk, -C(S)ORk, -S(O)Rk, -S(O)2Rk, -C(O)NHRk, -C(S)NHRk, -C(O)NRkRk, -C(S)NRkRk, -S(O)2NHRk, -S(O)2NRkRk, -C(NH)NHRk, -C(NH)NRmRn, -NHC(O)Rk, -NHC(S)Rk, -NRkC(O)Rk, -NRkC(S)Rk, -NHS(O)2Rk, -NRkS(O)2Rk, -NHC(O)NHRk, -NHC(S)NHRk, -NRkC(O)NH2, -NRkC(S)NH2, -NRkC(O)NHRk, -NRkC(S)NHRk, -NHC(O)NRkRk, -NHC(S)NRkRk, -NRkC(O)NRkRk, -NRkC(S)NRkRk, -NHS(O)2NHRk, -NRkS(O)2NH2, -NRkS(O)2NHRk, -NHS(O)2NRkRk, -NRkS(O)2NRkRk, -NHRk, -NRkRk, -Ri, 및 -Rj로 이루어지는 군 중에서 선택된 하나 이상, 바람직하게는 1, 2, 3, 4 또는 5개, 또한 1, 2 또는 3개의 치환체로 임의로 치환되고;
각각의 -Re는 독립적으로 저급 알케닐이고, 여기서 저급 알케닐은 플루오로, -OH, -NH2, -NO2, -CN, -C(O)OH, -C(S)OH, -C(O)NH2, -C(S)NH2, -S(O)2NH2, -NHC(O)NH2, -NHC(S)NH2, -NHS(O)2NH2, -C(NH)NH2, -ORk, -SRk, -OC(O)Rk, -OC(S)Rk, -C(O)Rk, -C(S)Rk, -C(O)ORk, -C(S)ORk, -S(O)Rk, -S(O)2Rk, -C(O)NHRk, -C(S)NHRk, -C(O)NRkRk, -C(S)NRkRk, -S(O)2NHRk, -S(O)2NRkRk, -C(NH)NHRk, -C(NH)NRmRn, -NHC(O)Rk, -NHC(S)Rk, -NRkC(O)Rk, -NRkC(S)Rk, -NHS(O)2Rk, -NRkS(O)2Rk, -NHC(O)NHRk, -NHC(S)NHRk, -NRkC(O)NH2, -NRkC(S)NH2, -NRkC(O)NHRk, -NRkC(S)NHRk, -NHC(O)NRkRk, -NHC(S)NRkRk, -NRkC(O)NRkRk, -NRkC(S)NRkRk, -NHS(O)2NHRk, -NRkS(O)2NH2, -NRkS(O)2NHRk, -NHS(O)2NRkRk, -NRkS(O)2NRkRk, -NHRk, -NRkRk, -Rh, 및 -Rj로 이루어지는 군 중에서 선택된 하나 이상, 바람직하게는 1, 2, 3, 4 또는 5개, 또한 1, 2 또는 3개의 치환체로 임의로 치환되고;
각각의 -Rf는 독립적으로 저급 알키닐이고, 여기서 저급 알키닐은 플루오로, -OH, -NH2, -NO2, -CN, -C(O)OH, -C(S)OH, -C(O)NH2, -C(S)NH2, -S(O)2NH2, -NHC(O)NH2, -NHC(S)NH2, -NHS(O)2NH2, -C(NH)NH2, -ORk, -SRk, -OC(O)Rk, -OC(S)Rk, -C(O)Rk, -C(S)Rk, -C(O)ORk, -C(S)ORk, -S(O)Rk, -S(O)2Rk, -C(O)NHRk, -C(S)NHRk, -C(O)NRkRk, -C(S)NRkRk, -S(O)2NHRk, -S(O)2NRkRk, -C(NH)NHRk, -C(NH)NRmRn, -NHC(O)Rk, -NHC(S)Rk, -NRkC(O)Rk, -NRkC(S)Rk, -NHS(O)2Rk, -NRkS(O)2Rk, -NHC(O)NHRk, -NHC(S)NHRk, -NRkC(O)NH2, -NRkC(S)NH2, -NRkC(O)NHRk, -NRkC(S)NHRk, -NHC(O)NRkRk, -NHC(S)NRkRk, -NRkC(O)NRkRk, -NRkC(S)NRkRk, -NHS(O)2NHRk, -NRkS(O)2NH2, -NRkS(O)2NHRk, -NHS(O)2NRkRk, -NRkS(O)2NRkRk, -NHRk, -NRkRk, -Rh, 및 -Rj로 이루어지는 군 중에서 선택된 하나 이상, 바람직하게는 1, 2, 3, 4 또는 5개, 또한 1, 2 또는 3개의 치환체로 임의로 치환되고;
각각의 -Rg는 시클로알킬, 헤테로시클로알킬, 아릴, 및 헤테로아릴로 이루어지는 군 중에서 독립적으로 선택되고, 여기서 시클로알킬, 헤테로시클로알킬, 아릴, 및 헤테로아릴은 할로겐, -OH, -NH2, -NO2, -CN, -C(O)OH, -C(S)OH, -C(O)NH2, -C(S)NH2, -S(O)2NH2, -NHC(O)NH2, -NHC(S)NH2, -NHS(O)2NH2, -C(NH)NH2, -ORk, -SRk, -OC(O)Rk, -OC(S)Rk, -C(O)Rk, -C(S)Rk, -C(O)ORk, -C(S)ORk, -S(O)Rk, -S(O)2Rk, -C(O)NHRk, -C(S)NHRk, -C(O)NRkRk, -C(S)NRkRk, -S(O)2NHRk, -S(O)2NRkRk, -C(NH)NHRk, -C(NH)NRmRn, -NHC(O)Rk, -NHC(S)Rk, -NRkC(O)Rk, -NRkC(S)Rk, -NHS(O)2Rk, -NRkS(O)2Rk, -NHC(O)NHRk, -NHC(S)NHRk, -NRkC(O)NH2, -NRkC(S)NH2, -NRkC(O)NHRk, -NRkC(S)NHRk, -NHC(O)NRkRk, -NHC(S)NRkRk, -NRkC(O)NRkRk, -NRkC(S)NRkRk, -NHS(O)2NHRk, -NRkS(O)2NH2, -NRkS(O)2NHRk, -NHS(O)2NRkRk, -NRkS(O)2NRkRk, -NHRk, -NRkRk, -Rh, -Ri, 및 -Rj로 이루어지는 군 중에서 선택된 하나 이상, 바람직하게는 1, 2, 3, 4 또는 5개, 또한 1, 2 또는 3개의 치환체로 임의로 치환되고;
여기서 Rk, Rm, 및 Rn은 각각 -Rh, -Ri, 및 -Rj로 이루어지는 군 중에서 독립적으로 선택되거나, Rm 및 Rn은 그들이 부착된 질소와 결합하여 5-7원의 헤테로시클로알킬 또는 5 또는 7원의 질소 함유 헤테로아릴을 형성하고, 여기서 5-7원의 헤테로시클로알킬 또는 5 또는 7원의 질소 함유 헤테로아릴은 할로겐, -NO2, -CN, -OH, -NH2, ORu, -SRu, -NHRu, -NRuRu, -Rx, 및 -Ry로 이루어지는 군 중에서 선택된 하나 이상, 바람직하게는 1, 2, 3, 4 또는 5개, 또한 1, 2 또는 3개의 치환체로 임의로 치환되고;
여기서 각각의 -Rh는 독립적으로 플루오로, -OH, -NH2, -NO2, -CN, -C(O)OH, -C(S)OH, -C(O)NH2, -C(S)NH2, -S(O)2NH2, -NHC(O)NH2, -NHC(S)NH2, -NHS(O)2NH2, -C(NH)NH2, -ORr, -SRr, -OC(O)Rr, -OC(S)Rr, -C(O)Rr, -C(S)Rr, -C(O)ORr, -C(S)ORr, -S(O)Rr, -S(O)2Rr, -C(O)NHRr, -C(S)NHRr, -C(O)NRrRr, -C(S)NRrRr, -S(O)2NHRr, -S(O)2NRrRr, -C(NH)NHRr, -C(NH)NRsRt, -NHC(O)Rr, -NHC(S)Rr, -NRrC(O)Rr, -NRrC(S)Rr, -NHS(O)2Rr, -NRrS(O)2Rr, -NHC(O)NHRr, -NHC(S)NHRr, -NRrC(O)NH2, -NRrC(S)NH2, -NRrC(O)NHRr, -NRrC(S)NHRr, -NHC(O)NRrRr, -NHC(S)NRrRr, -NRrC(O)NRrRr, -NRrC(S)NRrRr, -NHS(O)2NHRr, -NRrS(O)2NH2, -NRrS(O)2NHRr, -NHS(O)2NRrRr, -NRrS(O)2NRrRr, -NHRr, -NRrRr, -Ri, 및 -Rj로 이루어지는 군 중에서 선택된 하나 이상, 바람직하게는 1, 2, 3, 4 또는 5개, 또한 1, 2 또는 3개의 치환체로 임의로 치환된 저급 알킬이고;
여기서 각각의 -Ri는 저급 알케닐 및 저급 알키닐로 이루어지는 군 중에서 독립적으로 선택되고, 여기서 저급 알케닐 또는 저급 알키닐은 플루오로, -OH, -NH2, -NO2, -CN, -C(O)OH, -C(S)OH, -C(O)NH2, -C(S)NH2, -S(O)2NH2, -NHC(O)NH2, -NHC(S)NH2, -NHS(O)2NH2, -C(NH)NH2, -ORr, -SRr, -OC(O)Rr, -OC(S)Rr, -C(O)Rr, -C(S)Rr, -C(O)ORr, -C(S)ORr, -S(O)Rr, -S(O)2Rr, -C(O)NHRr, -C(S)NHRr, -C(O)NRrRr, -C(S)NRrRr, -S(O)2NHRr, -S(O)2NRrRr, -C(NH)NHRr, -C(NH)NRsRt, -NHC(O)Rr, -NHC(S)Rr, -NRrC(O)Rr, -NRrC(S)Rr, -NHS(O)2Rr, -NRrS(O)2Rr, -NHC(O)NHRr, -NHC(S)NHRr, -NRrC(O)NH2, -NRrC(S)NH2, -NRrC(O)NHRr, -NRrC(S)NHRr, -NHC(O)NRrRr, -NHC(S)NRrRr, -NRrC(O)NRrRr, -NRrC(S)NRrRr, -NHS(O)2NHRr, -NRrS(O)2NH2, -NRrS(O)2NHRr, -NHS(O)2NRrRr, -NRrS(O)2NRrRr, -NHRr, -NRrRr, 및 -Rj로 이루어지는 군 중에서 선택된 하나 이상, 바람직하게는 1, 2, 3, 4 또는 5개, 또한 1, 2 또는 3개의 치환체로 임의로 치환되고;
여기서 각각의 -Rj는 시클로알킬, 헤테로시클로알킬, 아릴, 및 헤테로아릴로 이루어지는 군 중에서 독립적으로 선택되고, 여기서 시클로알킬, 헤테로시클로알킬, 아릴, 및 헤테로아릴은 할로겐, -OH, -NH2, -NO2, -CN, -C(O)OH, -C(S)OH, -C(O)NH2, -C(S)NH2, -S(O)2NH2, -NHC(O)NH2, -NHC(S)NH2, -NHS(O)2NH2, -C(NH)NH2, -ORr, -SRr, -OC(O)Rr, -OC(S)Rr, -C(O)Rr, -C(S)Rr, -C(O)ORr, -C(S)ORr, -S(O)Rr, -S(O)2Rr, -C(O)NHRr, -C(S)NHRr, -C(O)NRrRr, -C(S)NRrRr, -S(O)2NHRr, -S(O)2NRrRr, -C(NH)NHRr, -C(NH)NRsRt, -NHC(O)Rr, -NHC(S)Rr, -NRrC(O)Rr, -NRrC(S)Rr, -NHS(O)2Rr, -NRrS(O)2Rr, -NHC(O)NHRr, -NHC(S)NHRr, -NRrC(O)NH2, -NRrC(S)NH2, -NRrC(O)NHRr, -NRrC(S)NHRr, -NHC(O)NRrRr, -NHC(S)NRrRr, -NRrC(O)NRrRr, -NRrC(S)NRrRr, -NHS(O)2NHRr, -NRrS(O)2NH2, -NRrS(O)2NHRr, -NHS(O)2NRrRr, -NRrS(O)2NRrRr, -NHRr, -NRrRr, 시클로알킬아미노, 및 -Rx로 이루어지는 군 중에서 선택된 하나 이상, 바람직하게는 1, 2, 3, 4 또는 5개, 또한 1, 2 또는 3개의 치환체로 임의로 치환되고;
여기서 각각의 Rr, Rs, 및 Rt는 각각 저급 알킬, C3 -6 알케닐, C3 -6 알키닐, 시클로알킬, 헤테로시클로알킬, 아릴 및 헤테로아릴로 이루어지는 군 중에서 독립적으로 선택되고, 여기서 저급 알킬은 -Ry, 플루오로, -OH, -NH2, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 플루오로 치환된 저급 알킬티오, 모노-알킬아미노, 디-알킬아미노, 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택된 하나 이상, 바람직하게는 1, 2, 3, 4 또는 5개, 또한 1, 2 또는 3개의 치환체로 임의로 치환되고, 단, -ORr, -SRr, -C(O)ORr, -C(S)ORr, -C(O)NHRr, -C(S)NHRr, -C(O)NRrRr, -C(S)NRrRr, -S(O)2NHRr, -S(O)2NRrRr, -C(NH)NHRr, -NRrC(O)Rr, -NRrC(S)Rr, -NRrS(O)2Rr, -NHC(O)NHRr, -NHC(S)NHRr, -NRrC(O)NH2, -NRrC(S)NH2, -NRrC(O)NHRr, -NRrC(S)NHRr, -NHC(O)NRrRr, -NHC(S)NRrRr, -NRrC(O)NRrRr, -NRrC(S)NRrRr, -NHS(O)2NHRr, -NRrS(O)2NH2, -NRrS(O)2NHRr, -NHS(O)2NRrRr, -NRrS(O)2NRrRr, -NHRr, 또는 -NRrRr의 임의의 -O-, -S-, 또는 -N-에 결합된 저급 알킬 탄소의 임의의 치환체는 플루오로 및 -Ry로 이루어지는 군 중에서 선택되고, 여기서 C3 -6 알케닐 또는 C3 -6 알키닐은 -Ry, 플루오로, 저급 알킬, 플루오로 치환된 저급 알킬, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 플루오로 치환된 저급 알킬티오, 모노-알킬아미노, 디-알킬아미노, 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택된 하나 이상, 바람직하게는 1, 2, 3, 4 또는 5개, 또한 1, 2 또는 3개의 치환체로 임의로 치환되고, 단, -ORr, -SRr, -C(O)ORr, -C(S)ORr, -C(O)NHRr, -C(S)NHRr, -C(O)NRrRr, -C(S)NRrRr, -S(O)2NHRr, -S(O)2NRrRr, -C(NH)NHRr, -NRrC(O)Rr, -NRrC(S)Rr, -NRrS(O)2Rr, -NHC(O)NHRr, -NHC(S)NHRr, -NRrC(O)NH2, -NRrC(S)NH2, -NRrC(O)NHRr, -NRrC(S)NHRr, -NHC(O)NRrRr, -NHC(S)NRrRr, -NRrC(O)NRrRr, -NRrC(S)NRrRr, -NHS(O)2NHRr, -NRrS(O)2NH2, -NRrS(O)2NHRr, -NHS(O)2NRrRr, -NRrS(O)2NRrRr, -NHRr, 또는 -NRrRr의 임의의 -O-, -S-, 또는 -N-에 결합된 C3 -6 알케닐 또는 C3 -6 알키닐 탄소의 임의의 치환체는 플루오로, 저급 알킬, 플루오로 치환된 저급 알킬, 또는 -Ry로 이루어지는 군 중에서 선택되고, 여기서 시클로알킬, 헤테로시클로알킬, 아릴, 및 헤테로아릴은 할로겐, -OH, -NH2, -NO2, -CN, 저급 알킬, 플루오로 치환된 저급 알킬, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 플루오로 치환된 저급 알킬티오, 모노-알킬 아미노, 디-알킬 아미노, 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택된 하나 이상, 바람직하게는 1, 2, 3, 4 또는 5개, 또한 1, 2 또는 3개의 치환체로 임의로 치환되거나, Rs 및 Rt는 그들이 부착된 질소와 결합하여 5-7원의 헤테로시클로알킬 또는 5 또는 7원의 질소 함유 헤테로아릴을 형성하고, 여기서 5-7원의 헤테로시클로알킬 또는 5 또는 7원의 질소 함유 헤테로아릴은 할로겐, -NO2, -CN, -OH, -NH2, ORu, -SRu, -NHRu, -NRuRu, -Rx, 및 -Ry로 이루어지는 군 중에서 선택된 하나 이상, 바람직하게는 1, 2, 3, 4 또는 5개, 또한 1, 2 또는 3개의 치환체로 임의로 치환되고;
여기서 각각의 Ru는 저급 알킬, C3 -6 알케닐, C3 -6 알키닐, 시클로알킬, 헤테로시클로알킬, 아릴, 및 헤테로아릴로 이루어지는 군 중에서 독립적으로 선택되고, 여기서 저급 알킬은 -Ry, 플루오로, -OH, -NH2, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 플루오로 치환된 저급 알킬티오, 모노-알킬아미노, 디-알킬아미노, 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택된 하나 이상, 바람직하게는 1, 2, 3, 4 또는 5개, 또한 1, 2 또는 3개의 치환체로 임의로 치환되고, 단, -ORu의 -O-, -SRu의 -S-, 또는 -NHRu의 -N-에 결합된 저급 알킬 탄소의 임의의 치환체는 플루오로 또는 -Ry이고, 여기서 C3 -6 알케닐 또는 C3 -6 알키닐은 -Ry, 플루오로, -OH, -NH2, 저급 알킬, 플루오로 치환된 저급 알킬, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 플루오로 치환된 저급 알킬티오, 모노-알킬아미노, 디-알킬아미노, 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택된 하나 이상, 바람직하게는 1, 2, 3, 4 또는 5개, 또한 1, 2 또는 3개의 치환체로 임의로 치환되고, 단, -ORu의 -O-, -SRu의 -S-, 또는 -NHRu의 -N-에 결합된 C3-6 알케닐 또는 C3 -6 알키닐 탄소의 임의의 치환체는 플루오로, 저급 알킬, 플루오로 치환된 저급 알킬, 또는 -Ry이고, 여기서 시클로알킬, 헤테로시클로알킬, 아릴, 및 헤테로아릴은 할로겐, -OH, -NH2, -NO2, -CN, 저급 알킬, 플루오로 치환된 저급 알킬, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 플루오로 치환된 저급 알킬티오, 모노-알킬 아미노, 디-알킬 아미노, 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택된 하나 이상, 바람직하게는 1, 2, 3, 4 또는 5개, 또한 1, 2 또는 3개의 치환체로 임의로 치환되고;
여기서 각각의 -Rx는 저급 알킬, 저급 알케닐 및 저급 알키닐로 이루어지는 군 중에서 선택되고, 여기서 저급 알킬은 -Ry, 플루오로, -OH, -NH2, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 플루오로 치환된 저급 알킬티오, 모노-알킬 아미노, 디-알킬 아미노, 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택된 하나 이상, 바람직하게는 1, 2, 3, 4 또는 5개, 또한 1, 2 또는 3개의 치환체로 임의로 치환되고, 여기서 저급 알케닐 또는 저급 알키닐은 -Ry, 플루오로, -OH, -NH2, 저급 알킬, 플루오로 치환된 저급 알킬, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 플루오로 치환된 저급 알킬티오, 모노-알킬 아미노, 디-알킬 아미노, 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택된 하나 이상, 바람직하게는 1, 2, 3, 4 또는 5개, 또한 1, 2 또는 3개의 치환체로 임의로 치환되고;
여기서 각각의 -Ry는 시클로알킬, 헤테로시클로알킬, 아릴, 및 헤테로아릴로 이루어지는 군 중에서 선택되고, 여기서 시클로알킬, 헤테로시클로알킬, 아릴, 및 헤테로아릴은 할로겐, -OH, -NH2, -NO2, -CN, 저급 알킬, 플루오로 치환된 저급 알킬, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 플루오로 치환된 저급 알킬티오, 모노-알킬 아미노, 디-알킬 아미노, 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택된 하나 이상, 바람직하게는 1, 2, 3, 4 또는 5개, 또한 1, 2 또는 3개의 치환체로 임의로 치환된다.
"저급 알콕시"는 기 -ORz를 나타내고, 여기서 Rz는 저급 알킬이다. "치환된 저급 알콕시"는 Rz가 안정한 화합물을 생성하도록 임의의 이용가능한 원자에서 부착된, 예를 들어, 치환된 시클로알킬, 시클로헤테로알킬, 아릴 및 헤테로아릴의 설명을 포함하여 화학식 I의 화합물 (화학식 Ia, Ib, Ig 및 그의 모든 하위 실시태양 포함)의 설명에서 본원에 나타낸 바와 같이 하나 이상의 치환체로 치환된 저급 알킬인 저급 알콕시를 나타낸다. 바람직하게는, 저급 알콕시의 치환은 1, 2, 3, 4, 또는 5개의 치환체, 또한 1, 2 또는 3개의 치환체로 이루어진다. 예를 들어, "플루오로 치환된 저급 알콕시"는 저급 알킬이 하나 이상의 플루오로 원자로 치환되는 저급 알콕시를 나타내고, 여기서 바람직하게는 저급 알콕시는 1, 2, 3, 4 또는 5개의 플루오로 원자, 또한 1, 2 또는 3개의 플루오로 원자로 치환된다. 알콕시 상의 치환체는 안정한 화합물을 생성하도록 임의의 이용가능한 원자에서 부착되는 것이 이해되지만, 알콕시의 치환은 -O-, -S-, 또는 -N- (N이 헤테로아릴 고리 원자인 경우 제외)이 알콕시 -O-에 결합된 알킬 탄소에 결합되지 않도록 하는 것이다. 추가로, 알콕시가 다른 잔기의 치환체로서 설명되는 경우에, 알콕시 산소는 다른 잔기의 -O-, -S-, 또는 -N- (N이 헤테로아릴 고리 원자인 경우 제외)에 결합된 탄소 원자, 또는 다른 잔기의 알켄 또는 알킨 탄소에 결합되지 않는다.
"저급 알킬티오"는 기 -SRaa를 나타내고, 여기서 Raa는 저급 알킬이다. "치환된 저급 알킬티오"는 Raa가 안정한 화합물을 생성하도록 임의의 이용가능한 원자에서 부착된, 예를 들어, 치환된 시클로알킬, 시클로헤테로알킬, 아릴 및 헤테로아릴의 설명을 포함하여 화학식 I의 화합물 (화학식 Ia, Ib, Ig 및 그의 모든 하위 실시태양 포함)의 설명에서 본원에 나타낸 바와 같이 하나 이상의 치환체로 치환된 저급 알킬인 저급 알킬티오를 나타낸다. 바람직하게는, 저급 알킬티오의 치환은 1, 2, 3, 4, 또는 5개의 치환체, 또한 1, 2 또는 3개의 치환체로 이루어진다. 예를 들어, "플루오로 치환된 저급 알킬티오"는 저급 알킬이 하나 이상의 플루오로 원자로 치환되는 저급 알킬티오를 나타내고, 여기서 바람직하게는 저급 알킬티오는 1, 2, 3, 4 또는 5개의 플루오로 원자, 또한 1, 2 또는 3개의 플루오로 원자로 치환된다. 알킬티오 상의 치환체는 안정한 화합물을 생성하도록 임의의 이용가능한 원자에서 부착되는 것이 이해되지만, 알킬티오의 치환은 -O-, -S-, 또는 -N- (N이 헤테로아릴 고리 원자인 경우 제외)이 알킬티오 -S-에 결합된 알킬 탄소에 결합되지 않도록 하는 것이다. 추가로, 알킬티오가 다른 잔기의 치환체로서 설명되는 경우에, 알킬티오 황은 다른 잔기의 -O-, -S-, 또는 -N- (N이 헤테로아릴 고리 원자인 경우 제외)에 결합된 탄소 원자, 또는 다른 잔기의 알켄 또는 알킨 탄소에 결합되지 않는다.
"아미노" 또는 "아민"은 기 -NH2를 나타낸다. "모노-알킬아미노"는 기 -NHRbb를 나타내고, 여기서 Rbb는 저급 알킬이다. "디-알킬아미노"는 기 -NRbbRcc를 나타내고, 여기서 Rbb 및 Rcc는 독립적으로 저급 알킬이다. "시클로알킬아미노"는 기 -NRddRee를 나타내고, 여기서 Rdd 및 Ree는 질소와 결합하여 5-7원의 헤테로시클로알킬을 형성하고, 여기서 헤테로시클로알킬은 고리 내에 추가의 헤테로원자, 예를 들어 -O-, -N-, 또는 -S-를 함유할 수 있고, 또한 저급 알킬로 추가로 치환될 수 있다. 5-7원의 헤테로시클로알킬의 예는 피페리딘, 피페라진, 4-메틸피페라진, 모르폴린, 및 티오모르폴린을 포함하고 이로 제한되지 않는다. 모노-알킬아미노, 디-알킬아미노, 또는 시클로알킬아미노가 안정한 화합물을 생성하도록 임의의 이용가능한 원자에서 부착되는 다른 잔기 상의 치환체일 때, 치환체로서 모노-알킬아미노, 디-알킬아미노, 또는 시클로알킬아미노의 질소는 다른 잔기의 -O-, -S-, 또는 -N-에 결합되는 탄소 원자에 결합되지 않음이 이해된다.
본원에서 사용되는 용어 c-kit 매개 질환 또는 상태는 c-kit의 생물학적 기능이 질병 또는 상태의 발병 및/또는 과정에 영향을 미치고/미치거나 c-kit의 조절이 발병, 과정, 및/또는 증상을 변경시키는 질병 또는 상태를 의미한다. 예를 들어, c-kit 유전자에서의 돌연변이, 예를 들어 문헌 [Herbst et al, J. Biol. Chem., 1992, 267: 13210-13216]에 보고된 W42, Wv, 및 W41 돌연변이는 각각 심한, 중간정도, 및 약한 표현형 특징을 부여한다. 상기 돌연변이는 수용체의 고유 티로신 키나제 활성을 상이한 정도로 약화시키고, c-kit 활성의 조절의 영향에 대한 모델이다. c-kit 매개 질환 또는 상태는 c-kit 억제가 치료 이익을 제공하는 질병 또는 상태를 포함하고, 예를 들어, 여기서 본원에 기재된 화합물을 포함한 c-kit 억제제를 사용하는 치료는 질병 또는 상태에 걸려 있거나 그러한 위험이 있는 대상에게 치료 이익을 제공한다.
본원에서 사용되는 용어 c-fms 매개 질환 또는 상태는 c-fms의 생물학적 기능이 질병 또는 상태의 발병 및/또는 과정에 영향을 미치고/미치거나 c-fms의 조절이 발병, 과정, 및/또는 증상을 변경시키는 질병 또는 상태를 의미한다. 예를 들어, c-fms가 결핍되는 문헌 [Dai et al, Blood, 2002, 99: 111-120]의 Csflr-/Csflr- 돌연변이체 마우스는 c-fms 활성이 파괴된 질병 또는 상태에 대한 동물 모델이다. c-fms 매개 질환 또는 상태는 c-fms 억제가 치료 이익을 제공하는 질병 또는 상태를 포함하고, 예를 들어, 여기서 본원에 기재된 화합물을 포함한 c-fms 억제제를 사용하는 치료는 질병 또는 상태에 걸려 있거나 그러한 위험이 있는 대상에게 치료 이익을 제공한다.
본원에서 사용되는 용어 "조성물"은 적어도 하나의 제약상 활성 화합물 및 적어도 하나의 제약상 허용되는 담체 또는 부형제를 함유하는, 치료 목적을 위해 의도된 동물 대상에 투여하기에 적합한 제형을 의미한다.
용어 "제약상 허용되는"은 표시된 물질이 합리적으로 신중한 의사가 치료될 질병 또는 상태 및 개별 투여 경로를 고려하여 환자에게 물질의 투여를 회피시킬 특성을 갖지 않는 것을 나타낸다. 예를 들어, 상기 물질은 예를 들어 주사를 위해 본질적으로 무균인 것이 일반적으로 요구된다.
본 발명의 문맥에서, 용어 "치료상 유효한" 및 "유효량"은 물질 또는 물질의 양이 질병 또는 의학 상태의 하나 이상의 증상을 예방하거나 경감하거나 개선하기 위해, 및/또는 치료되는 대상의 생존을 연장시키기 위해 효과적인 것을 나타낸다.
인간 c-kit 폴리펩티드 내의 특정 아미노산 잔기에 대한 참조는 GenBank NP_000213 (서열 1)에서 Kit 서열에 대응하는 넘버링으로 정의된다. c-kit의 전부 또는 일부를 코딩하는 뉴클레오티드 서열 내의 특정 뉴클레오티드 위치에 대한 참조는 GenBank NM_000222 (서열 2)에 제공된 서열에 대응하는 넘버링으로 정의된다. 인간 c-fms 폴리펩티드 내의 특정 아미노산 잔기에 대한 참조는 GenBank NP 005202 (서열 3) 내의 FMS 전구체 서열에 대응하는 넘버링으로 정의된다. c-fms의 전부 또는 일부를 코딩하는 뉴클레오티드 서열 내의 특정 뉴클레오티드 위치에 대한 참조는 GenBank NM 005211 (서열 4)에 제공된 서열에 대응하는 넘버링으로 정의된다.
용어 "kit", "c-kit", 및 "c-Kit"는 동일한 길이 세그먼트에 걸친 최대 정렬에 대해, 전장 c-kit (예를 들어, 인간 c-kit, 예를 들어, 서열 NP_000213, 서열 1)의 ATP 결합 부위를 포함하는 아미노산 잔기에 대해 90％를 초과하는 아미노산 서열 동일성을 갖는 부분을 포함하는; 또는 자연 c-kit의 적어도 200개 접속 아미노산에 대해 90％를 초과하는 아미노산 서열 동일성을 갖는 부분을 포함하고 키나제 활성을 보유하는 효소적 활성 키나제를 의미한다. 바람직하게는, 서열 동일성은 적어도 95, 97, 98, 99, 또는 심지어 100％이다. 바람직하게는, 명시된 수준의 서열 동일성은 서열 적어도 100-500, 적어도 200-400, 또는 적어도 300개의 접속 아미노산 잔기 길이에 걸친 것이다. 반대로 표시되지 않으면, 용어는 야생형 c-kit, 대립유전자 변이체, 및 돌연변이된 형태 (예를 들어, 활성화 돌연변이를 갖는)에 대한 참조를 포함한다.
용어 "fms", "c-fms", "FMS", 및 "c-Fms"는 동일한 길이 세그먼트에 걸친 최대 정렬에 대해, 전장 c-fms (예를 들어, 인간 c-fms, 예를 들어, GenBank 서열 NP 005202의 잔기 20-972, 서열 3)의 ATP 결합 부위를 포함하는 아미노산 잔기에 대해 90％를 초과하는 아미노산 서열 동일성을 갖는 부분을 포함하는; 또는 자연 c-fms의 적어도 200개 접속 아미노산에 대해 90％를 초과하는 아미노산 서열 동일성을 갖는 부분을 포함하고 키나제 활성을 보유하는 효소적 활성 키나제를 의미한다. 바람직하게는, 서열 동일성은 적어도 95, 97, 98, 99, 또는 100％이다. 바람직하게는, 명시된 수준의 서열 동일성은 적어도 100-150, 적어도 200-400, 또는 적어도 300개의 접속 아미노산 잔기 길이의 서열에 걸친 것이다. 반대로 표시되지 않으면, 용어는 야생형 c-fms, 대립유전자 변이체, 및 돌연변이된 형태 (예를 들어, 활성화 돌연변이를 갖는)를 포함한다. 용어 "pFMS"는 인산화된 c-fms를 의미한다. 용어 "c-fms 활성"은 특히 키나제 활성을 포함하는 c-fms의 생물학적 활성을 의미한다. 약어 "M-CSF"는 c-fms RPTK에 대한 리간드를 의미하고, 약어 "SCF"는 c-Kit RPTK에 대한 리간드를 의미한다.
용어 "c-kit 키나제 도메인"은 c-kit 내의 키나제 촉매 구역을 포함하는 감소된 길이 c-kit (즉, 전장 c-kit보다 적어도 100개 아미노산이 더 짧은)를 의미한다. 용어 "c-fms 키나제 도메인"은 c-fms의 키나제 촉매 구역을 포함하는 감소된 길이의 c-fms (즉, 전장 c-fms보다 적어도 100개 아미노산이 더 짧은)를 의미한다. 본 발명에서 사용하기 위해 매우 바람직하게는, 키나제 도메인은 키나제 활성을, 바람직하게는 적어도 60, 70, 80, 90, 또는 100％의 자연 c-fms 키나제 활성을 보유한다. 용어 "키나제" 또는 유사한 의미의 용어는 c-kit 또는 c-fms에 관한 것이다.
본원에서 사용되는 용어 "리간드" 및 "조절제"는 표적 생체분자의 활성을 변화시키는 (즉, 증가 또는 감소시키는) 화합물, 예를 들어, 키나제(들)과 같은 효소를 의미하도록 동등하게 사용된다. 일반적으로, 리간드 또는 조절제는 소분자일 것이고, 여기서 "소분자"는 분자량이 1500 달톤 이하, 또는 바람직하게는 1000 달톤 이하, 800 달톤 이하, 또는 600 달톤 이하인 화합물을 의미한다.
표적과 잠재적인 결합 화합물 사이의 상호작용과 관련하여 용어 "결합하는"은 잠재적인 결합 화합물이 일반적인 단백질과의 연합 (즉, 비-특이적 결합)에 비해 통계상 유의한 정도로 표적과 연합하는 것을 나타낸다. 따라서, 용어 "결합 화합물"은 표적 분자와 통계상 유의한 연합을 갖는 화합물을 의미한다. 바람직하게는, 결합 화합물은 특이화 표적과 1 mM 이하의 해리 상수 (KD)로 상호작용한다. 결합 화합물은 본원에 기재된 바와 같이 "낮은 친화도", "매우 낮은 친화도", "극히 낮은 친화도", "중등도 친화도", "중등도로 높은 친화도", 또는 "높은 친화도"로 결합할 수 있다.
표적에 결합하는 화합물의 문맥에서, 용어 "보다 큰 친화도"는 화합물이 참조 화합물보다 또는 참조 조건에서 동일한 화합물보다 더 단단히, 즉, 더 낮은 해리 상수로 결합하는 것을 나타낸다. 특정 실시태양에서, 보다 큰 친화도는 적어도 2, 3, 4, 5, 8, 10, 50, 100, 200, 400, 500, 1000, 또는 10,000배 더 큰 친화도이다.
또한 생체분자 표적에 결합하는 화합물의 문맥에서, 용어 "보다 큰 특이성"은 화합물이 관련 결합 조건 하에 존재할 수 있는 다른 생체분자(들)에보다 더 큰 정도로 특이화 표적에 결합하는 것을 나타내고, 여기서 상기 다른 생체분자에 대한 결합은 특이화 표적에 대한 결합과는 상이한 생물학적 활성을 생성시킨다. 대개, 특이성은 한정된 세트의 다른 생체분자, 예를 들어, c-kit 또는 c-fms의 경우에, 다른 티로신 키나제 또는 심지어 다른 종류의 효소에 참고한 것이다. 특정 실시태양에서, 보다 큰 특이성은 적어도 2, 3, 4, 5, 8, 10, 50, 100, 200, 400, 500, 또는 1000배 더 큰 특이성이다.
결합 화합물 또는 리간드와 관련하여 본원에서 사용되는 용어 "c-kit 키나제에 특이적인", "c-kit에 특이적인", 및 유사한 의미의 용어는 특정 화합물이 특정 샘플 내에 존재할 수 있는 다른 키나제보다 통계상 더 큰 정도로 c-kit에 결합하는 것을 의미한다. 또한, 결합 이외의 생물학적 활성이 표시되는 경우, 용어 "c-kit에 특이적인"은 특정 화합물이 다른 티로신 키나제보다 c-kit에 결합하는 것과 연관된 더 큰 생물학적 효과, 예를 들어, 키나제 활성 억제를 갖는 것을 나타낸다. 바람직하게는, 특이성은 또한 특정 샘플 내에 존재할 수 있는 다른 생체분자 (티로신 키나제에 한정되지 않음)에 관한 것이다. 용어 "c-fms 키나제에 특이적인", "c-fms에 특이적인", 및 유사한 의미의 용어는 특정 화합물이 특정 샘플 내에 존재할 수 있는 다른 키나제보다 통계상 더 큰 정도로 c-fms에 결합하는 것을 의미한다. 또한, 결합 이외의 생물학적 활성이 표시되는 경우, 용어 "c-fms에 특이적인"은 특정 화합물이 다른 티로신 키나제보다 c-fms에 결합하는 것과 연관된 더 큰 생물학적 효과, 예를 들어, 키나제 활성 억제를 갖는 것을 나타낸다. 바람직하게는, 특이성은 또한 특정 샘플 내에 존재할 수 있는 다른 생체분자 (티로신 키나제에 한정되지 않음)에 관한 것이다.
시험 화합물, 결합 화합물, 및 조절제 (리간드)와 연관하여 본원에서 사용되는 용어 "합성하는" 및 유사한 용어는 하나 이상의 전구체 물질로부터의 화학적 합성을 의미한다.
"분석하는"은 실험 조건의 생성 및 실험 조건의 특정 결과에 관한 데이타의 수집을 의미한다. 예를 들어, 효소는 검출가능한 기질 상에 작용하는 능력에 기초하여 분석될 수 있다. 화합물 또는 리간드는 특정 표적 분자(들)에 결합하는 능력에 기초하여 분석될 수 있다.
본원에서 사용되는 용어 "조절하는" 또는 "조절하다"는 생물학적 활성, 특히 특정 생체분자, 예를 들어 c-kit 또는 c-fms와 연관된 생물학적 활성을 변경시키는 효과를 의미한다. 예를 들어, 특정 생체분자의 효능제 또는 길항제는 그 생체분자, 예를 들어, 효소의 활성을 조절한다.
용어 "c-kit 활성"은 특히 키나제 활성을 포함하는 c-kit의 생물학적 활성을 의미한다. 용어 "c-fms 활성"은 특히 키나제 활성을 포함하는 c-fms의 생물학적 활성을 의미한다.
조절제이거나 조절제일 수 있는 화합물의 사용, 시험 또는 스크리닝의 문맥에서, 용어 "접촉하는"은 화합물(들)이 특정 분자, 복합체, 세포, 조직, 유기체, 또는 다른 특이화 물질에, 화합물과 다른 특이화 물질 사이의 잠재적인 결합 상호작용 및/또는 화학 반응이 일어날 수 있도록 충분하게 근접하게 되는 것을 의미한다.
아미노산 또는 핵산 서열과 연관하여 본원에서 사용되는 용어 "단리하다"는 서열이 정상적으로는 그와 연합될 아미노산 및/또는 핵산 서열의 적어도 일부로부터 분리되는 것을 나타낸다.
아미노산 또는 핵산 서열과 연관하여 용어 "정제된"은 특정 분자가 예를 들어, 세포 배양물 내에 이전 조성물보다 조성물에서 유의하게 더 큰 비율의 생체분자를 구성하는 것을 나타낸다. 보다 큰 비율은 2배, 5배, 10배 이상 더 클 수 있다.
I. 일반
한 측면에서, 본 발명은 c-kit, c-fms, 또는 c-kit 및 c-fms 둘다의 억제제인 화학식 I, 화학식 Ia, 화학식 Ib, 또는 화학식 Ig의 화합물 및 그의 모든 하위 실시태양, 및 c-kit, c-fms, 또는 c-kit 및 c-fms 둘다에 의해 매개되는 질병을 치료하는데 있어서 화합물의 사용에 관한 것이다.
본원에서 실시예에 설명된 방법에 따라 제조된 화학식 I, 화학식 Ia, 화학식 Ib 또는 화학식 Ig의 예시적인 화합물은 다음과 같다:
벤질-[5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-아민 (P-0001),
(6-벤질아미노-피리딘-3-일)-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메타논 (P-0002),
[5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-(4-트리플루오로메틸-벤질)-아민 (P-0003),
(4-메톡시-벤질)-[5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-아민 (P-0004),
(4-클로로-벤질)-[5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-아민 (P-0005),
(4-플루오로-벤질)-[5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-아민 (P-0006),
(4-메틸-벤질)-[5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-아민 (P-0007),
[5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-티오펜-2-일메틸-아민 (P-0008),
(4-클로로-벤질)-[5-(4-클로로-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-아민 (P-0009),
(4-클로로-벤질)-[5-(4-메톡시-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-아민 (P-0010),
[5-(4-메톡시-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-(4-트리플루오로메틸-벤질)-아민 (P-0011),
[6-메톡시-5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-(4-트리플루오로메틸-벤질)-아민 (P-0012),
[6-메틸-5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-(4-트리플루오로메틸-벤질)-아민 (P-0013),
(4-클로로-벤질)-[6-메틸-5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-아민 (P-0014),
[6-(4-플루오로-벤질아미노)-피리딘-3-일]-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메타논 (P-0015),
[6-(3-플루오로-벤질아미노)-피리딘-3-일]-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메타논 (P-0016),
(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-[6-(4-트리플루오로메틸-벤질아미노)-피리딘-3-일]-메타논 (P-0017),
(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-{6-[(티오펜-2-일메틸)-아미노]-피리딘-3-일}-메타논 (P-0018),
3-(6-이소프로필-피리딘-3-일메틸)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 (P-0019),
3-(6-t-부톡시-피리딘-3-일메틸)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 (P-0020),
디메틸-[5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-아민 (P-0021),
3-(6-메톡시-피리딘-3-일메틸)-4-티오펜-3-일-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 (P-0022),
(6-페닐아미노-피리딘-3-일)-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메타논 (P-0023),
(6-이소프로필아미노-피리딘-3-일)-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메타논 (P-0024),
(6-이소부틸아미노-피리딘-3-일)-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메타논 (P-0025),
[6-(3-벤질옥시-페닐아미노)-피리딘-3-일]-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메타논 (P-0026),
[6-(3-히드록시-페닐아미노)-피리딘-3-일]-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메타논 (P-0027),
이소부틸-[5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-아민 (P-0028),
(6-이소부틸아미노-피리딘-3-일)-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메탄올 (P-0029),
[6-(시클로프로필메틸-아미노)-피리딘-3-일]-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메타논 (P-0030),
[6-(시클로헥실메틸-아미노)-피리딘-3-일]-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메타논 (P-0031),
시클로프로필메틸-[5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-아민 (P-0032),
시클로헥실메틸-[5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-아민 (P-0033),
[6-(시클로프로필메틸-아미노)-피리딘-3-일]-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메탄올 (P-0034),
[6-(시클로헥실메틸-아미노)-피리딘-3-일]-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메탄올 (P-0035),
(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-[6-(4-트리플루오로메틸-벤질아미노)-피리딘-3-일]-메탄올 (P-0036),
[6-(4-클로로-벤질아미노)-피리딘-3-일]-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메탄올 (P-0037),
[5-(5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-(4-클로로-벤질)-아민 (P-0038),
(4-클로로-벤질)-{5-[메톡시-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메틸]-피리딘-2-일}-아민 (P-0039),
(4-클로로-3-트리플루오로메틸-벤질)-{5-[메톡시-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메틸]-피리딘-2-일}-아민 (P-0040),
(4-클로로-벤질)-{5-[메톡시-(5-피리딘-3-일-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메틸]-피리딘-2-일}-아민 (P-0041),
(4-클로로-벤질)-(5-{[5-(3-메탄술포닐-페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일]-메톡시-메틸}-피리딘-2-일)-아민 (P-0042),
{5-[메톡시-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메틸]-피리딘-2-일}-(4-트리플루오로메틸-벤질)-아민 (P-0043),
[6-(4-클로로-벤질아미노)-2-메틸-피리딘-3-일]-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메탄올 (P-0046),
[2-클로로-6-(4-클로로-벤질아미노)-피리딘-3-일]-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메타논 (P-0048),
[2,6-비스-(4-클로로-벤질아미노)-피리딘-3-일]-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메타논 (P-0049),
[2-클로로-6-(4-클로로-벤질아미노)-피리딘-3-일]-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메탄올 (P-0050),
6-(4-클로로-벤질아미노)-3-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-올 (P-0051),
3-(2-에틸술파닐-4,6-디메틸-피리미딘-5-일메틸)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 (P-0052),
[5-(5-메톡시-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-(4-트리플루오로메틸-벤질)-아민 (P-0053),
[5-(5-클로로-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-(4-트리플루오로메틸-벤질)-아민 (P-0054),
3-[6-(3-클로로-벤질옥시)-피리딘-3-일메틸]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 (P-0055),
3-[6-(4-클로로-벤질옥시)-피리딘-3-일메틸]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 (P-0056),
3-[6-(3-트리플루오로메틸-벤질옥시)-피리딘-3-일메틸]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 (P-0057),
(4-클로로-벤질)-[5-(5-메톡시-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-아민 (P-0058),
(4-클로로-벤질)-[5-(5-클로로-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-아민 (P-0059),
{5-[5-(2-디에틸아미노-에톡시)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸]-피리딘-2-일}-(4-트리플루오로메틸-벤질)-아민 (P-0060),
3-[6-(4-트리플루오로메틸-벤질아미노)-피리딘-3-일메틸]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-올 (P-0061),
3-[6-(4-클로로-벤질아미노)-피리딘-3-일메틸]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-올 (P-0062),
(4-클로로-벤질)-{5-[5-(2-모르폴린-4-일-에톡시)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸]-피리딘-2-일}-아민 (P-0063),
{5-[5-(2-피롤리딘-1-일-에톡시)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸]-피리딘-2-일}-(4-트리플루오로메틸-벤질)-아민 (P-0064),
{5-[5-(2-모르폴린-4-일-에톡시)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸]-피리딘-2-일}-(4-트리플루오로메틸-벤질)-아민 (P-0065),
{5-[5-(3-디에틸아미노-프로폭시)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸]-피리딘-2-일}-(4-트리플루오로메틸-벤질)-아민 (P-0066),
N-[5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-피리딘-2-일]-4-트리플루오로메틸-벤즈아미드 (P-0067),
N-[5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-피리딘-2-일]-4-트리플루오로메틸-벤젠술폰아미드 (P-0068),
(4-클로로-벤질)-{5-[5-(3-디에틸아미노-프로폭시)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸]-피리딘-2-일}-아민 (P-0069),
[6-(4-클로로-벤질아미노)-2-트리플루오로메틸-피리딘-3-일]-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메타논 (P-0070),
N-[5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-4-트리플루오로메틸-벤젠술폰아미드 (P-0071),
N-[5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-4-트리플루오로메틸-벤즈아미드 (P-0072),
4-플루오로-N-[5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-벤즈아미드 (P-0073),
4-클로로-N-[5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-벤즈아미드 (P-0074),
[(S)-1-(4-클로로-페닐)-에틸]-[5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-아민 (P-0075),
5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-카르복실산 (4-클로로-페닐)-아미드 (P-0076),
[2-(4-클로로-벤질아미노)-티아졸-5-일]-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메타논 (P-0077),
(4-클로로-페닐)-[5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일메틸]-아민 (P-0078),
3-[(5-클로로-3-메틸-1-페닐-1H-피라졸-4-일)-메톡시-메틸]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 (P-0079),
3-(5-클로로-3-메틸-1-페닐-1H-피라졸-4-일메틸)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 (P-0080),
(4-클로로-벤질)-[6-메톡시-5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-아민 (P-0081),
(4-클로로-벤질)-[6-플루오로-5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-아민 (P-0082), 및
(4-클로로-벤질)-[4-클로로-5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-티아졸-2-일]-아민 (P-0083),
3,5-디메틸-4-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피라졸-1-카르복실산 벤질아미드 (P-0084),
3,5-디메틸-4-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피라졸-1-카르복실산 페닐아미드 (P-0085),
[3,5-디메틸-4-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피라졸-1-일]-페닐-메타논 (P-0086),
1-[3,5-디메틸-4-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피라졸-1-일]-3-페닐-프로판-1-온 (P-0087),
3-(3,5-디메틸-1-페닐메탄술포닐-1H-피라졸-4-일메틸)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 (P-0088),
3-[1-(부탄-1-술포닐)-3,5-디메틸-1H-피라졸-4-일메틸]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 (P-0089), 및
3,5-디메틸-4-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피라졸-1-카르복실산 부틸아미드 (P-0090).
c- Kit 와 연관된 예시적인 질병.
본원에 기재된 화합물은 c-kit와 관련된 질환, 예를 들어, 특히 세포 증식 질환, 섬유성 질환 및 대사 질환을 포함하는 조절되지 않은 키나제 신호 전달에 관련된 질환을 치료하기 위해 유용하다. 아래에 및 그 전문이 본원에 참고로 포함된 립슨 (Lipson) 등의 미국 특허 출원 공개 20040002534 (2003년 6월 23일 출원된 미국 특허 출원 10/600,868)에 보다 상세히 설명된 바와 같이, 본 발명에 의해 치료될 수 있는 세포 증식 질환은 암, 및 비만 세포 증식 질환을 포함한다.
c-kit의 존재는 또한 하기 설명된 바와 같은 많은 상이한 종류의 암과 연관되었다. 또한, c-kit에서의 이상과 질병 사이의 연관은 암에 제한되지 않는다. 따라서, c-kit는 악성종양, 예를 들어 비만 세포 종양, 소세포 폐암, 고환암, 위장관 기질 종양 (GIST), 교아세포종, 성상세포종, 신경아세포종, 여성 생식관의 암종, 신경외배엽 기원의 육종, 결장직장 암종, 상피내 암종, 신경섬유종증과 연관된 쉬반 세포 신생물, 급성 골수구성 백혈병, 급성 림프성 백혈병, 만성 골수성 백혈병, 비만세포증, 흑색종, 및 개 비만 세포 종양, 및 염증성 질병, 예를 들어 천식, 류마티스성 관절염, 알러지성 비염, 다발 경화증, 염증성 대장 증후군, 이식 거부, 및 과다호산구증가증과 연관되었다.
c- kit 와 연관된 예시적인 악성 질병
c-kit의 이상 발현 및/또는 활성화는 다양한 암에 관련되었다. 신생물성 병리학에 대한 c-kit의 기여에 대한 증거는 그의 백혈병 및 비만 세포 종양, 소세포 폐암, 고환암, 및 위장관 및 중추신경계의 일부 암과의 관련을 포함한다. 또한, c-kit는 여성 생식관의 발암 (Inoue, et al., 1994, Cancer Res. 54(11):3049-3053), 신경외배엽 기원의 육종 (Ricotti, et al., 1998, Blood 91:2397-2405), 및 신경섬유종증과 연관된 쉬반 세포 신생물 (Ryan, et al., 1994, J. Neuro. Res. 37:415-432)에서 역할을 하는데 관련되었다. 비만 세포는 종양 미세환경을 변형시키고 종양 성장을 향상시키는데 관여되는 것으로 밝혀졌다 (Yang et al., 2003, J Clin Invest. 112:1851-1861; Viskochil, 2003, J Clin Invest. 112:1791-1793). 따라서, c-kit는 신경섬유종증 뿐만 아니라 악성 종양을 치료하는데 있어서 유용한 표적이다.
소세포 폐 암종: c-kit 키나제 수용체는 소세포 폐 암종 (SCLC) 세포의 많은 경우에 비정상적으로 발현되는 것으로 밝혀졌다 (Hibi, et al., 1991, Oncogene 6:2291-2296). 따라서, 한 예로서, c-kit 키나제의 억제는 예를 들어, SCLC의 환자의 장기 생존을 개선시키기 위해 SCLC의 치료에서 유익할 수 있다.
백혈병: c-kit에 결합하는 SCF는 조혈 줄기 세포 및 기원 세포를 세포자멸로부터 보호하여 (Lee, et al., 1997, J. Immunol. 159:3211-3219), 콜로니 형성 및 조혈에 기여한다. c-kit의 발현은 종종 급성 골수구성 백혈병 (AML), 및 급성 림프성 백혈병 (ALL)의 일부 경우에 관찰된다 (문헌 [Sperling, et al., 1997, Haemat 82:617-621; Escribano, et al., 1998, Leuk. Lymph. 30:459-466] 참조). c-kit는 대다수의 AML 세포에서 발현되지만, 그의 발현은 질병 진행의 예후인 것으로 보이지 않는다 (Sperling, et al, 1997, Haemat 82:617-621). 그러나, SCF는 AML 세포를 화학치료제에 의해 유발된 세포자멸로부터 보호하였다 (Hassan, et al., 1996, Acta. Hem. 95:257-262). 본 발명에 의한 c-kit의 억제는 상기 약제의 효능을 향상시킬 것이고, AML 세포의 세포자멸을 유도할 수 있다.
골수형성이상 증후군 (Sawada, et al., 1996, Blood 88:319-327) 또는 만성 골수성 백혈병 (CML) (Sawai, et al., 1996, Exp. Hem. 2:116-122)의 환자로부터의 세포의 클론 성장은 다른 사이토킨과 조합한 SCF에 의해 유의하게 향상된 것으로 밝혀졌다. CML은 골수의 필라델피아 (Philadelphia) 염색체 양성 세포의 팽창을 특징으로 하고 (Verfaillie, et al., Leuk. 1998, 12:136-138), 이는 주로 세포자멸사의 억제에 기인하는 것으로 보인다 (Jones, Curr. Opin. One. 1997, 9:3-7). 필라델피아 염색체의 산물, p210BCR - ABL은 세포자멸의 억제를 매개하는 것으로 보고되었다 (Bedi, et al., Blood 1995, 86:1148-1158). p210BCR - ABL 및 c-kit는 둘다 세포자멸을 억제하고 p62dok는 기질로서 제안되었으므로 (Carpino, et al., Cell 1997, 88:197-204), 상기 키나제에 의해 매개된 클론 팽창은 공통적인 신호전달 경로를 통해 일어날 수 있다. 그러나, c-kit는 또한 p210BCR - ABL과 직접 상호작용하는 것으로 보고되었고 (Hallek, et al., Brit. J Haem. 1996, 94:5-16), 이는 c-kit가 CML 병리학에 보다 원인이 되는 역할을 하는 것으로 제안한다. 따라서, c-kit의 억제는 상기 질환의 치료에 유용할 것이다.
위장관암: 정상 결장직장 점막은 c-kit를 발현하지 않는다 (Bellone, et al., 1997, J. Cell Physiol. 172:1-11). 그러나, c-kit는 결장직장 암종에서 종종 발현되고 (Bellone, et al., 1997, J. Cell Physiol. 172:1-11), SCF 및 c-kit의 자가분비 루프가 몇몇 결장 암종 세포주에서 관찰되었다 (Toyota, et al., 1993, Turn Biol 14:295-302; Lahm, et al., 1995, Cell Growth ＆ Differ 6:1111-1118; Bellone, et al., 1997, J. Cell Physiol. 172:1-11). 또한, 중화 항체의 사용에 의한 자가분비 루프의 파괴 (Lahm, et al., 1995, Cell Growth ＆ Differ. 6:1111-1118) 및 c-kit 및/또는 SCF의 하향조절은 세포 증식을 유의하게 억제한다 (Lahm, et al., 1995, Cell Growth ＆ Differ 6:1111-1118; Bellone, et al., 1997, J. Cell Physiol. 172:1-11).
SCF/c-kit 자가분비 루프는 위 암종 세포주에서 관찰되었고 (Turner, et al., 1992, Blood 80:374-381; Hassan, et al., 1998, Digest. Dis. Science 43:8-14), 구성적 c-kit 활성화는 또한 위장관 기질 종양 (GIST)에 중요한 것으로 보인다. GIST는 소화계의 가장 일반적인 간엽 종양이다. 90％를 초과하는 GIST가 c-kit를 발현하고, 이는 카잘의 사이질 세포 (ICC)로부터 상기 종양 세포의 추정 기원과 일치한다 (Hirota, et al., 1998, Science 279:577-580). ICC는 위장관의 수축을 조절하는 것으로 생각되고, 그들의 ICC에서 c-kit가 결여된 환자는 만성 특발성 장 가폐색의 근육병 형태를 나타냈다 (Isozaki, et al., 1997, Amer. J. of Gast. 9 332-334). 몇몇 상이한 환자로부터의 GIST에서 발현된 c-kit는 c-kit의 구성적 활성화를 일으키는 세포내 막근접 도메인에서 돌연변이를 갖는 것으로 관찰되었다 (Hirota, et al., 1998, Science 279:577-580). 따라서, c-kit 키나제의 억제는 상기 암의 치료를 위한 유효한 수단일 것이다.
고환암: 남성 생식 세포 종양은 조직학적으로 생식 세포 특징을 보유하는 정상피종 (seminoma), 및 배아 분화의 특징을 나타낼 수 있는 비정상피종으로 분류된다. 정상피종 및 비정상피종은 모두 상피내 암종 (CIS)으로 지정된 전이전 (preinvasive) 단계로부터 개시되는 것으로 생각된다 (Murty, et al., 1998, Sem. Oncol. 25:133-144). c-kit 및 SCF는 모두 배발생 동안 정상 생식선 발생에 필수적인 것으로 보고되었다 (Loveland, et al., 1997, J. Endocrinol 153:337-344). 수용체 또는 리간드의 손실은 생식 세포가 결여된 동물을 생성시킨다. 출생후 고환에서, c-kit는 라이디히 (Leydig) 세포 및 정조세포에서 발현되는 것으로 밝혀진 반면, SCF는 세르톨리 세포에서 발현되었다 (Loveland, et al., 1997, J. Endocrinol 153:337-344). 고환 종양은 인간 유두종 바이러스 16 (HPV16) E6 및 E7 발암유전자를 발현하는 형질전환 마우스에서 높은 빈도로 라이디히 세포로부터 발생한다 (Kondoh, et al., 1991, J. Virol. 65:3335-3339; Kondoh, et al., 1994, J. Urol. 152:2151-2154). 상기 종양은 c-kit 및 SCF를 모두 발현하고, 자가분비 루프는 기능성 p53의 세포성 손실과 연관된 종양발생 (Kondoh, et al., 1995, Oncogene 10:341-347) 및 E6 및 E7과 연관에 의한 망막모세포종 유전자 산물 (Dyson, et al., 1989, Science 243:934-937; Werness, et al., 1990, Science 248:76-79; Scheffher, et al., 1990, Cell 63:1129-1136)에 기여할 수 있다. SCF (Kondoh, et al., 1995, Oncogene 10:341-347) 또는 c-kit (Li, et al., 1996, Canc. Res. 56:4343-4346)의 결함 시그널링 돌연변이체는 HPV16 E6 및 E7을 발현하는 마우스에서 고환 종양의 형성을 억제하였다. c-kit 키나제 활성화는 상기 동물에서 종양발생에 중추적이고, 따라서 본 발명에 의한 c-kit 키나제 경로의 조절은 상기 질환을 예방 또는 치료할 것이다.
생식 세포 종양에서 c-kit의 발현은 수용체는 대다수의 상피내 암종 및 정상피종에 의해 발현되지만, c-kit는 소수의 비정상피종에서만 발현되는 것을 보여준다 (Strohmeyer, et al., 1991, Canc. Res. 51:1811-1816; Rajpert-de Meyts, et al., 1994, Int. J. Androl. 17:85-92; Izquierdo, et al., 1995, J. Pathol. 177:253-258; Strohmeyer, et al., 1995, J. Urol. 153:511-515; Bokenmeyer, et al., 1996, J. Cancer Res. Clin. Oncol. 122:301-306; Sandlow, et al., 1996, J. Androl. 17:403-408). 따라서, c-kit 키나제의 억제는 상기 질환의 치료 수단을 제공한다.
CNS 암: SCF 및 c-kit는 발생하는 설치류의 CNS 전체에서 발현되고, 발현 패턴은 신경외배엽 세포의 성장, 이동 및 분화에서의 역할을 나타낸다. 성체 뇌에서 수용체 및 리간드 모두의 발현이 또한 보고되었다 (Hamel, et al., 1997, J. Neuro-Onc. 35:327-333). c-kit의 발현은 또한 정상 인간 뇌 조직에서 관찰되었다 (Tada, et al. 1994, J. Neuro 80:1063-1073). 대다수의 두개내 종양을 규정하는 교아세포종 및 성상세포종은 성상세포의 신생물성 변환으로부터 발생한다 (Levin, et al., 1997, Principles ＆ Practice of Oncology:2022-2082). c-kit의 발현은 교아세포종 세포주 및 조직에서 관찰되었다 (Berdel, et al., 1992, Canc. Res. 52:3498-3502; Tada, et al. 1994, J. Neuro 80:1063-1073; Stanulla, et al., 1995, Act Neuropath 89:158-165).
문헌 [Cohen, et al., 1994, Blood 84:3465-3472]에서는 검사된 14개의 모든 신경아세포종 세포주가 c-kit/SCF 자가분비 루프를 포함하였고, 수용체 및 리간드 모두의 발현이 검사된 종양 샘플의 45％에서 관찰되었음을 보고하였다. 2개의 세포주에서, 항-c-kit 항체는 세포 증식을 억제하였고, 이는 SCF/c-kit 자가분비 루프가 성장에 기여함을 제안한다 (Cohen, et al., 1994, Blood 84:3465-3472). 따라서, c-kit 키나제 억제제는 상기 암을 치료하기 위해 사용될 수 있다.
c- kit 를 포함하는 예시적인 비만 세포 질병
c-kit의 과도한 활성화는 또한 비만 세포의 과잉으로 인한 질병과 연관된다. 비만세포증은 과도한 비만 세포 증식을 특징으로 하는 불균질한 집단의 질환을 설명하기 위해 사용되는 용어이다 (Metcalfe, 1991, J. Invest. Derm 93:2S-4S; Golkar, et al., 1997, Lancet 349:1379-1385). 침습 비만세포증의 환자로부터의 비만 세포에서 상승된 c-kit 발현이 보고되었다 (Nagata, et al., 1998, Leukemia 12:175-181).
추가로, 비만 세포 및 호산구는 알러지, 염증 및 천식에 관여되는 핵심적인 세포를 나타낸다 (Thomas, et al., 1996, Gen. Pharmacol 27:593-597; Metcalfe, et al., 1997, Physiol Rev 77:1033-1079; Naclerio, et al., 1997, JAMA 278:1842-1848; Costa, et al., 1997, JAMA 278:1815-1822). SCF 및 따라서 c-kit는 비만 세포 및 호산구 모두의 활성화를 직접적으로 및 간접적으로 조절하여, 다중 기전을 통해 알러지 및 천식에 관여된 일차 세포에 영향을 미친다. 비만 세포 및 호산구 기능의 상기 상호 조절, 및 SCF가 상기 조절에서 할 수 있는 역할 때문에, c-kit의 억제는 알러지-연관 만성 비염, 염증 및 천식을 치료하기 위해 사용될 수 있다.
비만세포증: c-kit의 SCF (또한 비만 세포 성장 인자로서 공지됨) 자극은 비만 세포의 성장 및 발생에 필수적인 것으로 보고되었다 (Hamel, et al., 1997, J. Neuro-Onc. 35:327-333; Kitamura, et al., 1995, Int. Arch. Aller. Immunol. 107:54-56). 그의 시그널링 활성을 약화시키는 c-kit의 돌연변이를 갖는 마우스는 그들의 피부에서 유의하게 더 적은 비만 세포를 나타냈다 (Tsujimura, 1996, Pathol Int 46:933-938). c-kit의 과도한 활성화는 비만 세포의 과잉으로 인한 질병과 연관될 수 있다.
비만세포증은 대다수의 환자에서 피부에 제한되지만, 15-20％의 환자에서 다른 장기를 포함할 수 있다 (Valent, 1996, Wein/Klin Wochenschr 108:385-397; Golkar, et al., 1997, Lancet 349:1379-1385). 심지어 전신 비만세포증의 환자들 사이에서도, 질병은 비교적 양성 예후를 갖는 것에서부터 침습 비만세포증 및 비만 세포 백혈병까지의 범위일 수 있다 (Valent, 1996, Wein/Klin Wochenschr 108:385-397; Golkar, et al., 1997, Lancet 349:1379-1385). c-kit는 개 비만 세포 종양으로부터의 악성 비만 세포 상에서 (London, et al., 1996, J. Compar. Pathol. 115:399-414), 및 침습 전신 비만세포증 환자로부터의 비만 세포 상에서 관찰되었다 (Baghestanian, et al., 1996, Leuk.: 116-122; Castells, et al., 1996, J. Aller. Clin. Immunol. 98:831-840).
SCF는 간질 세포 상에서 막-결합된 단백질로서 발현되는 것으로 나타났고, 그의 발현은 섬유원성 성장 인자, 예를 들어 PDGF에 의해 유도될 수 있다. 이는 또한 정상 피부에서 각질세포 상에서 막-결합된 단백질로서 발현되는 것으로 나타났다. 그러나, 비만세포증 환자의 피부에서, 증가된 양의 가용형 SCF가 관찰되었다 (Longley, et al., 1993, New Engl. J. Med. 328:1302-1307).
비만 세포 치마제 (chymase)는 막-연합된 SCF를 가용형 및 생물학적 활성 형태로 절단시키는 것으로 보고되었다. 상기 비만 세포-매개 과정은 비만 세포 증식 및 기능을 향상시키는 피드백 (feedback) 루프를 생성시킬 수 있고 (Longley, et al., 1997, Proc. Natl. Acad. Sci. 94:9017-9021), 비만세포증의 병인에 중요할 수 있다. 각질세포로부터 단백분해적으로 방출될 수 없는 SCF 형태를 과다발현하는 형질전환 마우스는 비만세포증을 발병하지 않았지만, 각질세포에서 정상 SCF를 발현하는 유사한 동물은 인간 피부 비만세포증과 유사한 표현형을 나타냈다 (Kunisada, et al., 1998, J. Exp. Med. 187:1565-1573). 다량의 가용형 SCF의 형성은 일부 환자에서 비만세포증과 연관된 병리학에 기여할 수 있고, 본 발명은 SCF와 c-kit 키나제 사이의 상호작용을 조절함으로써 상기 질환을 치료 또는 예방할 수 있다. 구성적 키나제 활성을 생성시키는 c-kit의 몇몇 상이한 돌연변이가 인간 및 설치류 비만 세포 종양 세포주에서 발견되었다 (Furitsu, et al., 1993, J. Clin. Invest. 92:1736-1744; Tsujimura, et al., 1994, Blood 9:2619-2626; Tsujimura, et al., 1995, Int. Arch. Aller. Immunol 106:377-385; Tsujimura, 1996, Pathol hit 46:933-938). 또한, c-kit 유전자의 활성화 돌연변이가 비만세포증 및 관련 혈액 질환의 환자로부터 단리된 말초 단핵 세포 (Nagata, et al., 1998, Mastocytosis Leuk 12:175-181), 및 색소성 두드러기 및 침습 비만세포증 환자로부터의 비만 세포 (Longley, et al., 1996, Nat. Gen. 12:312-314)에서 관찰되었다. 따라서, c-kit 키나제의 억제는 상기 질환의 치료에서 뛰어난 치료 역할을 갖는 것으로 판명될 것이다.
일부 환자에서, c-kit의 활성화 돌연변이는 질병의 발병기전에 기여할 수 있고, c-kit 키나제를 사용하는 SCF 상호작용의 조절에 의해 상기 환자가 치료될 수 있거나 그들의 질병이 예방될 수 있다. c-kit의 SCF 활성화는 피부 비만 세포 항상성을 유지하기 위해 중요할 수 있는 비만 세포 세포자멸을 예방하는 것으로 나타났다 (Iemura, et al., 1994, Amer. J. Pathol 144:321-328; Yee, et al., 1994, J. Exp. Med. 179:1777-1787; Mekori, et al., 1994, J. Immunol 153:2194-2203; Mekori, et al., 1995, Int. Arch. Allergy Immunol. 107:137-138). 비만 세포 세포자멸의 억제는 비만세포증과 연관된 비만 세포 축적을 일으킬 수 있다. 따라서, 수용체의 과다발현, 가용형 SCF의 과도한 형성, 또는 그의 키나제를 구성적으로 활성화시키는 c-kit 유전자의 돌연변이으로 인한 c-kit 활성화의 관찰은 c-kit의 키나제 활성의 억제가 비만 세포의 수를 감소시키고 비만세포증 환자에게 이익을 제공할 것이라는 이론적인 근거를 제공한다.
활성화 c-kit 돌연변이를 갖는 세포에 있어서, 특히 조절 구역에서의 돌연변이에 대해서 (Ma et al., 2002, Blood 99:1741-1744), c-kit의 억제제가 세포를 억제하거나 심지어 사멸시키는 것이 발견되었다 (Ma et al., 2000, J Invest Dermatol. 114:392-394). 상기 문헌 [Ma et al., 2002]에서는 또한 촉매 구역에서 돌연변이에 대해, 억제제 STI571 (글리벡) 및 SU9529가 세포를 억제하지 않았고, 추가의 종류의 c-kit 억제제가 유용함을 보였다. 따라서, c-kit 억제제는 야생형 c-kit 및 돌연변이, 예를 들어, 조절 구역 및/또는 촉매 구역에서 활성화 돌연변이를 갖는 c-kit 모두에 대해 사용될 수 있다.
천식 ＆ 알러지: 비만 세포 및 호산구는 기생충 감염, 알러지, 염증, 및 천식에서 핵심적인 세포를 나타낸다 (Thomas, et al., 1996, Gen. Pharmacol 27:593-597; Metcalfe, et al., 1997, Physiol Rev 77:1033-1079; Holgate, 1997, CIBA Found. Symp.; Naclerio, et al, 1997, JAMA 278:1842-1848; Costa, et al., 1997, JAMA 778:1815-1822). SCF는 비만 세포 발생, 생존 및 성장에 필수적인 것으로 나타났다 (Kitamura, et al., 1995, Int. Arch. Aller. Immunol. 107:54-56; Metcalfe, et al., 1997, Physiol Rev 77:1033-1079). 또한, SCF는 호산구-특이적 조절제인 IL-5와 협동하여 호산구 기원세포의 발생을 증가시킨다 (Metcalf, et al., 1998, Proc. Natl. Acad. Sci., USA 95:6408-6412). SCF는 또한 호산구의 생존을 촉진시키는 (Kay, et al., 1997, Int. Arch. Aller. Immunol. 113:196-199) 인자들을 분비하도록 비만 세포를 유도하는 것으로 보고되었고 (Okayama, et al., 1997, Int. Arch. Aller. Immunol. 114:75-77; Okayama, et al., 1998, Eur. J. Immunol. 28:708-715), 이는 만성 호산구-매개 염증에 기여할 수 있다 (Okayama, et al., 1997, Int. Arch. Aller. Immunol. 114:75-77; Okayama, et al., 1998, Eur. J. Immunol. 28:708-715). 이러한 점에서, SCF는 비만 세포 및 호산구 모두의 활성화를 직접적으로 및 간접적으로 조절한다.
SCF는 비만 세포로부터 매개체 방출을 유도할 뿐만 아니라, 상기 세포를 IgE-유도된 탈과립에 대해 준비시키고 (Columbo, et al., 1992, J. Immunol 149:599-602) 호산구-유래 과립 주요 기초 단백질에 대한 그들의 반응성을 감작시킨다 (Furuta, et al., 1998, Blood 92:1055-1061). 활성화된 비만 세포에 의해 방출된 인자들 중에 IL-5, GM-CSF 및 TNF-α가 있고, 이는 호산구 단백질 분비에 영향을 미친다 (Okayama, et al., 1997, Int. Arch. Aller. Immunol. 114:75-77; Okayama, et al., 1998, Eur. J. Immunol. 28:708-715). 비만 세포로부터 히스타민 방출을 유도하는 것 외에 (Luckacs, et al., 1996, J. Immunol. 156:3945-3951; Hogaboam, et al., 1998, J. Immunol. 160:6166-6171), SCF는 호산구 화학주성 인자 에오탁신의 비만 세포 생산 (Hogaboam, et al., 1998, J. Immunol. 160:6166-6171), 및 호산구 침윤 (Luckacs, et al., 1996, J. Immunol. 156:3945-3951)을 촉진한다.
SCF는 또한 비만 세포 (Dastych, et al., 1994, J. Immunol. 152:213-219; Kinashi, et al., 1994, Blood 83:1033-1038) 및 호산구 (Yuan, et al., 1997, J. Exp. Med. 186:313-323) 모두의 부착에 직접적으로 영향을 미치고, 이는 다시 조직 침윤을 조절한다. 따라서, SCF는 다중 기전을 통해 알러지 및 천식에 관여된 일차 세포에 영향을 미칠 수 있다. 현재, 코르티코스테로이드가 알러지와 연관된 만성 비염 및 염증에 대한 가장 효과적인 치료제이다 (Naclerio, et al., 1997, JAMA 278:1842-1848; Meltzer, 1997, Aller. 52:33-40). 상기 약제는 순환 및 침윤하는 비만 세포 및 호산구의 감소, 및 사이토킨 생산의 억제와 연관된 호산구의 생존 감소를 포함한 다수의 기전을 통해 작용한다 (Meltzer, 1997, Aller. 52:33-40). 스테로이드는 또한 섬유모세포 및 정주 결합 조직 세포에 의한 SCF의 발현을 억제하는 것으로 보고되었고, 이는 비만 세포 생존을 감소시킨다 (Finotto, et al., 1997, J. Clin. Invest. 99:1721-1728). 비만 세포 및 호산구 기능의 상호 조절, 및 SCF가 상기 조절에서 할 수 있는 역할 때문에, c-kit 키나제의 억제는 알러지-연관 만성 비염, 염증 및 천식을 치료하는 수단을 제공할 것이다.
염증성 관절염 (예를 들어, 류마티스성 관절염): 비만 세포의 관절염 과정과의 연관성으로 인해 (Lee et al., 2002, Science 297:1689-1692), c-kit는 염증성 관절염, 예를 들어 류마티스성 관절염의 예방, 지연, 및/또는 치료를 위한 유용한 표적을 제공한다.
다발 경화증: 비만 세포는 다발 경화증 (MS), 실험적 알러지성 뇌척수염 (EAE)의 마우스 모델에서 증명되는 바와 같이, 자가면역 질병에서 광범한 역할을 하는 것으로 나타났다. 비만 세포는 질병의 완전한 증상을 위해 요구되는 것으로 나타났다 (Secor et al., 2000, J Exp Med 191:813-821). 따라서, c-kit는 또한 다발 경화증의 예방, 지연, 및/또는 치료를 위한 유용한 표적을 제공한다.
c- fms 와 연관된 예시적인 질병
c-fms의 존재는 많은 상이한 종류의 질병과 연관되었다. 따라서, c-fms는 면역 질환, 예를 들어 류마티스성 관절염, 전신 홍반 루푸스 (SLE), 베게너 육아종증 및 이식 거부, 염증성 질병, 예를 들어 만성 폐쇄성 폐질환 (COPD), 폐기종 및 죽상경화증, 대사 질환, 예를 들어 인슐린 내성, 과혈당증 및 지질분해, 뼈 구조 또는 무기질침착의 질환, 예를 들어, 골다공증, 골절 위험 증가, 고칼슘혈증 및 뼈 전이, 신장 질병, 예를 들어 신장염 (예를 들어, 사구체신염, 간질 신장염, 루푸스 신장염), 세뇨관 괴사, 당뇨병-관련 신장 합병증, 및 비대 및 암, 예를 들어 다발 골수종, 급성 골수성 백혈병, 만성 골수성 백혈병 (CML), 유방암 및 난소암과 연관되었다.
c-fms의 이상 발현 및/또는 활성화는 급성 골수성 백혈병, AML과 관련되었다 (Ridge et al, Proc. Nat. Acad. Sci., 1990, 87:1377-1380). 코돈 301에서 돌연변이는 리간드 독립성 및 수용체의 구성적 티로신 키나제 활성에 의해 신생물성 변환을 일으키는 것으로 생각된다. 코돈 969에서 티로신 잔기는 네가티브 조절 활성에 관여되는 것으로 나타나고, 이는 아미노산 치환에 의해 파괴된다. 따라서, c-fms 돌연변이는 만성 골수단구 백혈병 및 AML 타입 M4 (23％)에서 가장 우세하고 (20％), 이들 둘다는 단핵구 분화를 특징으로 한다.
AML과 관련된 상태는 만성 골수성 백혈병 (CML)이다. CML의 골수 모구성 발증 (BC) 동안, 비-랜덤한 추가의 염색체 이상이 80％를 초과하는 환자에서 발생한다. 그러나, 상기 세포유전적 변화는 CML-BC의 임상 증후에 수개월 내지 수년 앞서는 것으로 보고되었고, 이는 다른 생물학적 사건이 CML의 급성 변환의 다단계 과정에 참여할 수 있음을 제안한다. 성장 인자의 자가분비 생산이 몇몇 혈액 악성종양, 및 특히 AML에서 일어나는 것으로 나타났다. 스페치아 (Specchia) 등 [Br J Haematol. 1992 Mar; 80(3):310-6]은 IL-1 베타 유전자가 거의 모든 경우의 CML에서 골수 모구성 발증에서 발현되고, 높은 비율의 사례가 M-CSF 유전자의 구성적 발현을 나타냈음을 입증하였다. 스페치아 등의 연구에서 많은 동일한 환자가 c-fms의 동시에 일어나는 동시-발현을 나타냈다. 백혈병 세포를 포르볼 미리스테이트 아세테이트 (PMA)에 노출시킨 후, M-CSF 단백질의 방출이 연구된 5명의 환자 중 3명에서 기록되었지만; 유의한 인터루킨-3 (IL-3), 과립구-대식세포 콜로니 자극 인자 (GM-CSF) 또는 과립구 콜로니 자극 인자 (G-CSF)는 상기 환자에서 검출되지 않았다. 이는 상이한 패턴의 성장 인자 분비가 AML 및 CML에 존재하고, 뚜렷한 분자상 사건이 백혈병 증식의 제어에 관여되는 것 같음을 증명한다.
M-CSF (주요 대식세포 성장 인자)의 생산이 염증 동안 조직에서 증가된다는 관찰 (Le Meur et al, J. Leukocyte Biology. 2002;72:530-537)은 특정 질병에서 c-fms에 대한 역할을 제공한다. 예를 들어, COPD는 완전히 가역적이 아닌 기류 제한을 특징으로 한다. 기류 제한은 보통 진행성이고 유해 입자 또는 기체에 대한 폐의 비정상적인 염증 반응과 연관된다. COPD의 만성 염증은 기도, 실질, 및 폐 혈관구조를 통해 관찰된다. 염증 세포 집단은 일부 환자에서 호산구와 함께 호중구, 대식세포, 및 T 림프구로 이루어진다. 대식세포는 TNF-α, IL-8 및 LTB4와 같은 매개체를 방출함으로써 COPD 염증에서 조정 역할을 하는 것으로 가정되고, 이는 폐 구조를 손상시키고/시키거나 호중구성 염증을 유지할 수 있다.
또한, M-CSF/Fms 시그널링은 파골세포 형성 및 파골세포 전구체의 생존에 중대하다. 예를 들어, 폐경에서 에스트로겐 손실은 M-CSF를 증가시켜, 파골세포 수 및 뼈 흡수를 증가시키고 이는 골절 위험 증가 및 골다공증을 일으킨다. 따라서, 상기 시그널의 차단이 뼈 흡수의 억제를 위한 표적이다 (Teitelbaum, Science. 2000;289:1504; Rohan, Science. 2000;289:1508.)
죽상경화증 (혈관벽의 염증성 질병)은 유의한 이환율 및 사망률과 연관된다. 죽상경화증의 치료 및 예방에서 c-fms 억제에 대한 효과는 몇몇 관찰에 좌우된다 (Libby, Nature. 2002;420:868-874). 먼저, 동맥 내막에 정주하는 단핵구는 스캐빈저 (scavenger) 수용체의 발현을 증가시키고 변형된 지단백질을 내재화시킨다. 생성되는 지질이 많은 대식세포는 죽상경화 병변의 특징인 포말 세포로 발전한다. 죽종에서 대식세포는 병변 진행에 관여되는 사이토킨 및 성장 인자를 분비한다. 추가로, 대식세포는 내막 내에서 복제한다. c-fms를 통해, M-CSF는 단핵구에서 지질이 많은 대식세포로의 전이를 활성화시키고, 스캐빈저 수용체 A의 발현을 증대시킨다. 실제로, 죽상경화판은 죽상경화 진행에 중대한 M-CSF를 과다발현한다. M-CSF가 결핍된 마우스는 정상 M-CSF를 갖는 마우스보다 덜 심한 죽상경화증을 경험하는 것으로 밝혀졌다 (Rajavashisth, et. al., J. Clin. Invest. 1998;101-:2702-2710; Qiao, et. al., Am. J. Path. 1997;150:1687-1699). 따라서, c-fms의 억제제는 M-CSF 시그널링을 파괴하여, 단핵구에서 대식세포 포말 세포로의 진행, 대식세포 생존 및 복제, 및 병변 진행에 참여하는 사이토킨 시그널링을 손상시킨다.
베게너 육아종증 (또한 혈관염으로서 공지됨)은 괴사가 있는 혈관의 육아종 염증을 특징으로 한다. 상기 염증은 결과의 손상이 있는 장기로 혈액 유동을 제한한다. 질병은 임의의 장기 시스템을 포함할 수 있지만, 베게너 육아종증은 주로 기도 (즉, 부비동, 코, 기관, 및 폐) 및 신장에 침범한다. 내피는 많은 염증성 상태, 예를 들어 베게너 육아종증에서 몇몇 혈관 질환의 면역병리학에서 중심 역할을 하고, 여기서 정맥내 면역글로불린 (IV Ig)의 사용이 유익한 것으로 나타났다 (예를 들어, 문헌 [Basta et al, J Clin Invest 1994, 94:1729-1735] 참조). IV Ig가 내피 세포 증식을 용량- 및 시간-의존 방식으로 억제하고, TNF-α 또는 IL-1β에 의해 유도된 부착 분자 mRNA (ICAM-I 및 VCAM-I), 케모카인 mRNA (MCP-I, M-CSF, 및 GM-CSF), 및 전염증 사이토킨 mRNA (TNF-α, IL-1β, 및 IL-6)의 발현을 하향조절하는 것이 보고되었다 (Xu et al, Am. J. Path. 1998;153:1257-1266). 상기 결과는 혈관 및 염증성 질환에서 IV Ig의 치료 효과를 적어도 부분적으로 설명할 수 있다. 추가로, 상기 결과는 c-fms와의 상호작용의 수준에서 M-CSF 활성의 억제가 유효한 치료 전략임을 제안한다.
폐기종에서 M-CSF 및 c-fms의 역할은 매트릭스 금속단백질의 제어를 통해 엘라스틴 대사의 조절을 포함하는 것으로 보인다. M-CSF는 생체 내에서 폐포 대식세포 (AMs)의 축적 및 기능의 조절에서 역할을 한다 (Shibata et al, Blood 2001, 98:pp.2845-2852). 골화성 (Op/Op) 마우스는 검출가능한 M-CSF를 갖지 않고, 대식세포 수에서 가변적인 조직-특이적 감소를 보인다. 따라서, AMs는 M-CSF의 부재로 인해 Op/Op 마우스에서 수가 감소하고 변경된 기능을 가질 것으로 가정되었다. 쉬바타 (Shibata) 등은 폐 절편에서 확인된 폐 대식세포가 연령이 일치하는 동배 대조군에서의 발견치에 비해 20일령 Op/Op 마우스에서는 수가 감소하였지만 4개월 초과의 Op/Op 마우스에서는 감소하지 않은 것을 밝혔다. 기관지폐포 세척 (BAL)에서 회수된 AMs의 수는 또한 대조군에 비해 어린 Op/Op 마우스에서는 감소하지만 성체 Op/Op 마우스에서는 감소하지 않았다. 중요하게는, Op/Op 마우스의 AMs는 자발적으로 대조군의 AMs보다 더 높은 수준의 매트릭스 메탈로프로테이나제 (MMP)를 방출한다. MMP의 증가된 방출과 일관되게, Op/Op 마우스는 비정상적인 엘라스틴 침적을 갖고, 폐 염증의 분자 또는 세포성 증거 없이 자발적으로 폐기종을 발병한다. 따라서, M-CSF에 의한 대식세포에서 메탈로엘라스타제 활성의 조절은 폐 또는 혈관에서 엘라스틴 섬유의 파괴를 제어할 수 있다.
전이 암 세포는 종양 세포에 의한 M-CSF를 포함한 파골성 인자의 생산 때문에 골절, 통증, 변형, 및 고칼슘혈증과 연관된 뼈 파괴를 일으킨다 (Clohisy et al, Clin. Orthop. 2000, 373:104-14). c-fms 생성물에 대한 M-CSF의 결합은 파골세포의 형성 및 골용해 활성을 자극한다 (Kodama et al, J. Exp,. Med. 1991, 173: 269-72; Feng et al, Endocrinology 2002, 143: 4868-74). 따라서, c-fms의 수준에서 파골세포 활성의 억제는 뼈 전이의 개선을 위한 설득력있는 표적을 제공한다.
대식세포 축적은 많은 형태의 사구체신염에서 현저한 특징이다. 신장 내에서 대식세포의 국소 증식이 인간 및 실험적 사구체신염에서 설명되었고, 염증 반응을 증대시키는데 중요한 역할을 한다. 이스벨 (Isbel) 등 (Nephrol Dial Transplant 2001, 16:1638-1647)은 국소 대식세포 증식과 M-CSF의 신장 발현 사이의 관계를 검토하였다. 사구체 및 세뇨관사이질 M-CSF 발현은 인간 사구체신염에서 상향 조절되고, 증식 형태의 질병에서 가장 현저한 것으로 밝혀졌다. 이는 국소 대식세포 증식와 상호관련되므로, 증가된 신장 M-CSF 생산이 인간 사구체신염에서 국소 대식세포 증식을 조절하는데 중요한 역할을 하는 것을 제안한다. 신장 염증의 모델에서 (UUO-편측 요관 폐쇄), 항-c-fms 항체 치료는 대식세포 축적을 감소시켰다 (Le Meur et al., J Leukocyte Biology, 2002, 72: 530-537). 따라서, c-fms의 억제는 사구체신염에서 치료 시술을 위한 표적을 제공한다.
인슐린 내성 및 비만은 II형 당뇨병의 특질이고, 인슐린 내성과 복부 내장 지방 축적 사이에 강한 상호관련이 존재한다 (Bjorntrop, Diabetes Metab. Res. Rev., 1999, 15: 427-441). 현재의 증거는 지방 조직에 축적하는 대식세포가 TNF-a 및 지방세포 변화 (비대증, 지질분해, 감소된 인슐린 감수성)를 일으키는 다른 인자를 방출하고, 또한 주위 조직에서 인슐린 내성을 촉진하는 것을 나타낸다. 따라서, 2형 당뇨병에서 대식세포 축적은 질병 진행에 중요하다. 따라서, c-fms의 억제는 인슐린 내성 및 과혈당증의 발병을 예방하는데 있어서 잠재성을 갖는다.
데워 (Dewar) 등은 최근에 키나제 억제제 이마티닙이 또한 치료 농도에서 대식세포 콜로니 자극 인자 수용체, c-fms를 특이적으로 표적하는 것을 증명하였다. 상기 발견이 현재 이마티닙 치료를 받는 환자에서 잠재적인 부작용에 관련하여 중요한 의미를 갖지만, 상기 결과는 이마티닙이 또한 c-fms가 관련되는 질병의 치료에 유용할 수 있음을 제안한다. 이는 유방암과 난소암 및 염증성 상태, 예를 들어 류마티스성 관절염을 포함한다. 데워 등은 또한 이마티닙이 과도한 파골세포 활성으로 인해 뼈 파괴가 일어나는 질병, 예를 들어 혈액암, 다발 골수종에서 사용될 수 있음을 서술한다 (Dewar et al., Cell Cycle 2005, 4(7):851-3).
급성 거부 동안 대식세포 증식을 추진시키는데 있어서 M-CSF의 중요성을 결정하기 위해, 호세 (Jose) 등은 급성 신장 동종이식 거부의 마우스 모델에서 M-CSF 수용체인 c-fms를 차단하였다. 이들은 세뇨관사이질 거부의 중증도가 감소된 세뇨관염 및 세뇨관 세포 증식에 의해 나타난 바와 같이 치료군에서 감소되었음을 관찰하였다. 급성 동종이식 거부 동안 대식세포 증식은 M-CSF와 그의 수용체 c-fms와의 상호작용에 의존적이다. 이들은 상기 경로가 거부하는 신장 동종이식편 내에 대식세포의 축적에서 유의하고 특이적인 역할을 하는 것을 나타낸다 (Jose et al., Am J Transplant 2003, 3(3):294-300).
또한, c-fms 및 c-kit 기능 모두의 조절제는 상기 나타낸 것과 같은 질병에 대해 사용될 수 있고, 여기서 일부 경우에서, c-fms 및 c-kit 모두에 대한 조절제의 이중 활성은 상기 질병을 치료하는데 명백한 잇점을 제공한다. 단일 화합물에 의해 제공된 상보적 활성은 하나의 또는 다른 활성을 표적하는 화합물, 또는 상기 활성을 표적하는 별개의 화합물에 비해 추가의 이익을 제공할 것이다. 예를 들어, 비만 세포에 의한 대식세포 화학주성물질의 방출, 또는 대식세포에 의한 비만 세포 화학주성물질의 방출을 약화시킴으로써, 상기 소염 효과는 고유 세포성 기능의 동시 억제를 갖고 상승할 것이다. 동시투여에서의 제한은 이중 억제제에서 부재한다. 또한, 이중 활성은 치료를 위한 유효 용량을 훨씬 더 적게 할 수 있다.
II . c- kit 및 c- fms 관련 폴리펩티드의 생산
본원에 기재된 천연 및 돌연변이된 키나제 폴리펩티드는 당업계에 잘 알려진 기술을 이용하여 전체 또는 일부로 화학적으로 합성될 수 있다 (예를 들어, 문헌 [Creighton (1983) Biopolymers 22(1):49-58] 참조).
별법으로, 천연 또는 돌연변이된 키나제 폴리펩티드 코딩 서열 및 적절한 전사/번역 제어 시그널을 포함하는 발현 벡터를 구성하기 위해 당업자에게 잘 공지된 방법을 사용할 수 있다. 상기 방법은 시험관 내 재조합 DNA 기술, 합성 기술 및 생체내 재조합/유전자 재조합을 포함한다. 예를 들어, 문헌 ([Maniatis, T (1989). Molecular cloning: A laboratory Manual. Cold Spring Harbor Laboratory, New York. Cold Spring Harbor Laboratory Press]; 및 [Ausubel, F.M. et al. (1994) Current Protocols in Molecular Biology. John Wiley ＆ Sons, Secaucus, N.J.])에 기재된 기술을 참조한다.
다양한 숙주-발현 벡터 시스템이 키나제 코딩 서열을 발현시키기 위해 사용될 수 있다. 이들은 미생물, 예를 들어 키나제 도메인 코딩 서열을 포함하는 재조합 박테리오파지 DNA, 플라스미드 DNA 또는 코스미드 DNA 발현 벡터로 형질전환된 세균; 키나제 도메인 코딩 서열을 포함하는 재조합 효모 발현 벡터로 형질전환된 효모; 키나제 도메인 코딩 서열을 포함하는 재조합 바이러스 발현 벡터 (예를 들어, 바큘로바이러스)로 감염된 곤충 세포계; 재조합 바이러스 발현 벡터 (예를 들어, 꽃양배추 모자이크 바이러스, CaMV; 담배 모자이크 바이러스, TMV)로 감염되거나, 키나제 도메인 코딩 서열을 포함하는 재조합 플라스미드 발현 벡터 (예를 들어, Ti 플라스미드)로 형질전환된 식물 세포계; 또는 동물 세포계를 포함하고 이로 제한되지 않는다. 상기 시스템의 발현 성분은 그들의 강도 및 특이성에 따라 변한다.
사용되는 숙주/벡터 시스템에 따라, 구성적 및 유도가능 프로모터를 포함하는 임의의 많은 적합한 전사 및 번역 성분이 발현 벡터에서 사용될 수 있다. 예를 들어, 세균계에서 클로닝할 때, 유도가능 프로모터, 예를 들어 박테리오파지 λ, plac, ptrp, ptac (ptrp-lac 하이브리드 프로모터) 등의 pL이 사용될 수 있고; 곤충 세포계에서 클로닝할 때, 프로모터, 예를 들어 바큘로바이러스 폴리헤드린 프로모터가 사용될 수 있고; 식물 세포계에서 클로닝할 때, 식물 세포의 게놈으로부터 유래된 프로모터 (예를 들어, 열 충격 프로모터; RUBISCO의 작은 하위단위에 대한 프로모터; 클로로필 a/b 결합 단백질에 대한 프로모터) 또는 식물 바이러스로부터 유래된 프로모터 (예를 들어, CaMV의 35S RNA 프로모터; TMV의 코트 단백질 프로모터)가 사용될 수 있고; 포유동물 세포계에서 클로닝할 때, 포유동물 세포의 게놈으로부터 유래된 프로모터 (예를 들어, 메탈로티오네인 프로모터) 또는 포유동물 바이러스로부터 유래된 프로모터 (예를 들어, 아데노바이러스 후기 프로모터; 우두 바이러스 7.5K 프로모터)가 사용될 수 있고; 다중 카피의 키나제 도메인 DNA를 포함하는 세포주를 생성할 때, SV4O-, BPV- 및 EBV-기반 벡터가 적절한 선택가능 마커와 함께 사용될 수 있다.
DNA 조작의 방법, 벡터, 사용된 다양한 종류의 세포, 벡터를 세포 내로 포함시키는 방법, 발현 기술, 단백질 정제 및 단리 방법을 설명하는 예시적인 방법, 및 단백질 농축 방법은 PCT 특허 출원 공개 WO 96/18738에 상세히 개시되어 있다. 상기 문헌은 도면을 포함하여 그 전문이 본원에 참고로 포함된다. 당업자는 상기 설명이 본 발명에 적용가능하고 그를 위해 쉽게 적응될 수 있음을 이해할 것이다.
III . 결합 분석
본 발명의 방법은 표적 분자에 대한 화합물의 결합을 검출할 수 있는 분석을 포함할 수 있다. 분석 시그널이 표적 분자에 대한 결합을 나타내는, 즉, 배경으로부터 구분되는 상기 결합은 바람직하게는 신뢰 수준이 적어도 90％인, 보다 바람직하게는 적어도 95, 97, 98, 99％ 이상의 신뢰 수준으로 통계상 유의한 수준이다. 바람직하게는, 대조군이 표적 결합을 비-특이적 결합으로부터 구분하기 위해 사용된다. 결합을 표시하는 매우 다양한 분석이 상이한 표적 종류에 대해 공지되어 있고, 본 발명에 사용될 수 있다.
결합 화합물은 표적 분자의 활성에 대한 그들의 효과를 특징으로 할 수 있다. 따라서, "낮은 활성" 화합물은 억제 농도 (IC50) 또는 유효 농도 (EC50)이 표준 조건 하에 1 μM을 초과한다. "매우 낮은 활성"은 표준 조건 하에 100 μM을 초과하는 IC50 또는 EC50을 의미한다. "극히 낮은 활성"은 표준 조건 하에 1 mM을 초과하는 IC50 또는 EC50을 의미한다. "중등도 활성"은 표준 조건 하에 200 nM 내지 1 μM의 IC50 또는 EC50을 의미한다. "중등도로 높은 활성"은 1 nM 내지 200 nM의 IC50 또는 EC50을 의미한다. "높은 활성"은 표준 조건 하에 1 nM 미만의 IC50 또는 EC50을 의미한다. IC50 또는 EC50은 화합물이 존재하지 않을 때 관찰된 활성의 범위에 비해 측정되는 표적 분자 (예를 들어, 효소 또는 다른 단백질) 활성의 50％의 활성이 손실되거나 얻어지는 화합물의 농도로서 정의된다. 활성은 당업자에게 공지된 방법을 이용하여, 예를 들어, 효소 반응의 발생에 의해 생산된 임의의 측정가능한 생성물 또는 시그널, 또는 측정되는 단백질에 의한 다른 활성을 을 측정함으로써 측정할 수 있다.
결합 분석과 관련하여 "배경 시그널"은 시험 화합물, 분자 스캐폴드, 또는 표적 분자에 결합하는 리간드의 부재 하에 특정 분석을 위한 표준 조건 하에 기록된 시그널을 의미한다. 당업자는 배경 시그널을 결정하기 위한 허용되는 방법이 존재하고 널리 이용가능함을 알 것이다.
"표준 편차"는 분산의 제곱근을 의미한다. 분산은 분포가 확산된 정도의 척도이다. 이는 그의 평균으로부터 각각의 수의 평균 제곱 편차로서 계산된다. 예를 들어, 수 1, 2, 및 3에 대해, 평균은 2이고, 분산은 다음과 같다:
Figure 112007090494669-PCT00017
표면 플라즈몬 공명
결합 파라미터는 예를 들어, 고정된 결합 성분으로 코팅된 BIAcore(등록상표) 칩 (비아코어 (Biacore, 일본))을 사용하는 표면 플라즈몬 공명을 이용하여 측정할 수 있다. 표면 플라즈몬 공명은 표적 분자에 대해 지정된 sFv 또는 다른 리간드 사이의 반응의 현미경적 결합 및 해리 상수를 특성화하기 위해 사용된다. 상기 방법은 본원에 참고로 포함된 다음 문헌에 일반적으로 설명되어 있다 (Vely F. et al., (2000) BIAcore® analysis to test phosphopeptide-SH2 domain interactions, Methods in Molecular Biology. 121:313-21; Liparoto et al., (1999) Biosensor analysis of the interleukin-2 receptor complex, Journal of Molecular Recognition. 12:316-21; Lipschultz et al., (2000) Experimental design for analysis of complex kinetics using surface plasmon resonance, Methods. 20(3):310-8; Malmqvist, (1999) BIACORE: an affinity biosensor system for characterization of biomolecular interactions, Biochemical Society Transactions 27:335-40; Alfthan, (1998) Surface plasmon resonance biosensors as a tool in antibody engineering, Biosensors ＆ Bioelectronics. 13:653-63; Fivash et al., (1998) BIAcore for macromolecular interaction, Current Opinion in Biotechnology. 9:97-101; Price et al.; (1998) Summary report on the ISOBM TD-4 Workshop: analysis of 56 monoclonal antibodies against the MUC1 mucin. Tumour Biology 19 Suppl 1:1-20; Malmqvist et al, (1997) Biomolecular interaction analysis: affinity biosensor technologies for functional analysis of proteins, Current Opinion in Chemical Biology. 1:378-83; O'Shannessy et al., (1996) Interpretation of deviations from pseudo-first-order kinetic behavior in the characterization of ligand binding by biosensor technology, Analytical Biochemistry. 236:275-83; Malmborg et al., (1995) BIAcore as a tool in antibody engineering, Journal of Immunological Methods. 183:7-13; Van Regenmortel, (1994) Use of biosensors to characterize recombinant proteins, Developments in Biological Standardization. 83:143-51; 및 O'Shannessy, (1994) Determination of kinetic rate and equilibrium binding constants for macromolecular interactions: a critique of the surface plasmon resonance literature, Current Opinions in Biotechnology. 5:65-71).
BIAcore(등록상표)는 금/유리 센서 칩 경계면의 표면 상에 놓인 덱스트란 매트릭스 (덱스트란 바이오센서 매트릭스)에 결합된 단백질 농도에서 변경을 검출하기 위해 표면 플라즈몬 공명 (SPR)의 광학 특성을 이용한다. 요약하면, 단백질은 공지된 농도에서 덱스트란 매트릭스에 공유 결합되고, 단백질에 대한 리간드가 덱스트란 매트릭스를 통해 주입된다. 센서 칩 표면의 반대 측면 상으로 보내진 근적외광이 반사되고, 또한 금 필름 내에 소산파를 유도하고, 이는 다시 공명 각으로 공지된 특정 각에서 반사광에서 강도 딥 (dip)을 일으킨다. 센서 칩 표면의 굴절률이 변경되면 (예를 들어, 결합된 단백질에의 리간드 결합에 의해), 공명 각에서 변위가 일어난다. 상기 각 변위는 측정될 수 있고, 공명 단위 (RUs)로서 표현되고, 여기서 1000 RU는 1 ng/mm2의 표면 단백질 농도의 변화와 동등하다. 상기 변화는 임의의 생물학적 반응의 결합 및 해리를 도시하는 센소그램 (sensorgram)의 y-축을 따른 시간에 관하여 표시된다.
고효율 스크리닝 ( HTS ) 분석
HTS는 일반적으로 목적하는 활성에 대해 많은 수의 화합물을 탐색하기 위해 자동화 분석을 이용한다. 일반적으로 HTS 분석은 특정 효소 또는 분자에 대해 작용하는 화학물질에 대해 스크리닝함으로써 새로운 약물을 발견하기 위해 사용된다. 예를 들어, 화학물질이 효소를 불활성화시키면, 질병을 유발하는 세포 내의과정을 예방하는데 효과적인 것으로 증명될 수 있다. 고효율 방법으로 연구자들은 로봇식 취급 시스템 및 결과의 자동화 분석을 이용하여 수천의 상이한 화학물질을 각각의 표적 분자에 대하여 매우 신속하게 분석할 수 있다.
본원에서 사용되는 "고효율 스크리닝" 또는 "HTS"는 로봇식 스크리닝 분석을 이용하는 많은 수의 화합물 (라이브러리); 일반적으로 수십 내지 수천의 화합물의 신속한 시험관내 스크리닝을 의미한다. 초고효율 스크리닝 (uHTS)은 일반적으로 1일 100,000 시험을 초과하도록 가속화된 고효율 스크리닝을 의미한다.
고효율 스크리닝을 달성하기 위해, 샘플을 다중용기 (multicontainer) 캐리어 또는 플랫폼 상에 수용하는 것이 유리하다. 다중용기 캐리어는 다수의 후보 화합물의 반응을 동시에 측정하는 것을 용이하게 한다. 다중-웰 마이크로플레이트가 캐리어로서 사용될 수 있다. 상기 다중-웰 마이크로플레이트, 및 수많은 분석에서 그를 사용하기 위한 방법은 당업계에 공지되어 있고 상업적으로 입수가능하다.
스크리닝 분석은 분석의 성분의 적절한 조작의 검정 및 확인을 위한 대조군을 포함할 수 있다. 모든 반응물을 포함하지만 화학물질 라이브러리의 구성원을 포함하지 않는 블랭크 웰이 보통 포함된다. 다른 예로서, 그의 조절제를 찾고자 하는 효소의 공지의 억제제 (또는 활성화제)가 분석의 하나의 샘플과 함께 인큐베이팅될 수 있고, 효소 활성에서 결과의 감소 (또는 증가)가 비교기 또는 대조군으로서 사용될 수 있다. 조절제는 또한 공지된 효소 조절제의 존재에 의해 달리 유발된 효소 활성화 또는 억제를 억제하는 조절제를 찾기 위해 효소 활성화제 또는 억제제와 조합될 수 있음이 이해될 것이다.
스크리닝 분석 동안 효소 및 결합 반응의 측정
예를 들어, 다중용기 캐리어 내에서 효소 및 결합 반응의 진행을 측정하기 위한 기술은 당업계에 공지되고 아래의 것을 포함하고 이로 제한되지 않는다.
분광광도 및 분광형광 분석은 당업계에 잘 알려져 있다. 상기 분석의 예는 문헌 [Gordon, A. J. and Ford, R. A., (1972) The Chemist's Companion: A Handbook Of Practical Data, Techniques, And References, John Wiley and Sons, N.Y., Page 437]에 기재된 바와 같이 과산화물의 검출을 위한 색도 분석의 사용을 포함한다.
형광 분광법은 반응 생성물의 생성을 모니터링하기 위해 사용될 수 있다. 형광 방법은 일반적으로 흡수 방법보다 더 민감하다. 형광 프로브의 사용은 당업자에게 잘 알려져 있다 (문헌 [Bashford et al., (1987) Spectrophotometry and Spectrofluorometry: A Practical Approach, pp.91-114, IRL Press Ltd.]; 및 [Bell, (1981) Spectroscopy In Biochemistry. Vol. I, pp.155-194, CRC Press] 참조).
분광형광 방법에서, 효소는 표적 효소에 의해 처리될 때 그들의 고유 형광이 변화하는 기질에 노출된다. 대개, 기질은 비형광이고, 하나 이상의 반응을 통해 형광단으로 전환된다. 비제한적인 예로서, Amplex(등록상표) Red 시약 (몰레큘라 프로브스 (Molecular Probes, 미국 오레곤주 유진))을 사용하여 SMase 활성도를 검출할 수 있다. Amplex(등록상표) Red를 사용하여 스핑고미엘리나제 활성을 측정하기 위해, 다음 반응이 일어난다. 첫째로, SMase는 스핑고미엘린을 가수분해시켜 세라미드 및 포스포릴콜린을 얻는다. 둘째로, 알칼린 포스파타제는 포스포릴콜린을 가수분해시켜 콜린을 얻는다. 셋째로, 콜린은 콜린 옥시다제에 의해 베타인으로 산화된다. 마지막으로, H2O2는 양고추냉이 페록시다제의 존재하에 Amplex(등록상표) Red와 반응하여 형광 생성물 레소루핀 (Resorufin)을 생성하고, 그로부터 시그널이 분광형광계를 사용하여 검출된다.
형광 편광 (FP)은 결합된 리간드에 의한 편광된 형광 방출을 허용하는, 보다 큰 분자, 예를 들어 수용체 단백질에 결합시 일어나는 형광단의 분자 회전 속도의 감소에 기초한다. FP는 평면 편광된 광을 사용하여 여기시킨 후 형광단 방출의 수직 및 수평 성분을 측정함으로써 경험적으로 결정된다. 형광단의 분자 회전이 감소할 때 편광된 방출은 증가한다. 형광단은 형광단의 분자 회선을 느리게하는 보다 큰 분자 (즉, 수용체)에 결합할 때 보다 큰 편광된 시그널을 생성한다. 편광된 시그널의 크기는 형광 리간드 결합의 정도에 정량적으로 관련된다. 따라서, "결합된" 시그널의 편광은 고친화도 결합의 유지에 좌우된다.
FP는 균질한 기술이고, 반응은 매우 신속하여, 평형에 도달하기까지 수초 내지 수분이 소요된다. 시약은 안정하고, 큰 배치가 제조될 수 있어서, 재현성이 높아진다. 상기 특성 때문에, FP는 고도로 자동화가능한 것으로 입증되었고, 종종 단일의 예비혼합된 트레이서 (tracer)-수용체 시약을 사용하는 단일 인큐베이션으로 수행된다 (문헌 [Owickiet al., (1997), Application of Fluorescence Polarization Assays in High-Throughput Screening, Genetic Engineering News, 17:27] 참조).
FP는 그의 판독이 방출 강도에 독립적이고 (Checovich, W. J., et al., (1995) Nature 375:254-256; Dandliker, W. B., et al., (1981) Methods in Enzymology 74:3-28), 따라서 형광 방출을 켄칭시키는 착색된 화합물의 존재에 영향을 받지 않으므로 특히 바람직하다. FP 및 FRET (하기 참조)는 스핑고지질 수용체와 그들의 리간드 사이의 상호작용을 차단하는 화합물을 확인하기 위해 매우 적합하다 (예를 들어, 문헌 [Parker et al., (2000) Development of high throughput screening assays using fluorescence polarization: nuclear receptor-ligand-binding and kinase/phosphatase assays, J Biomol Screen 5:77-88] 참조).
FP 분석에서 사용될 수 있는 스핑고지질로부터 유래된 형광단은 상업적으로 입수가능하다. 예를 들어, 몰레큘라 프로브스에서는 현재 스핑고미엘린 및 하나의 세라미드 형광단을 시판한다. 이들은 각각 N-(4,4-디플루오로-5,7-디메틸-4-보라-3a,4a-디아자-s-인다센-3-펜타노일)스핑고실 포스포콜린 (BODIPY(등록상표) FL C5-스핑고미엘린); N-(4,4-디플루오로-5,7-디메틸-4-보라-3a,4a-디아자-s-인다센-3-도데카노일)스핑고실 포스포콜린 (BODIPY(등록상표) FL C12-스핑고미엘린); 및 N-(4,4-디플루오로-5,7-디메틸-4-보라-3a,4a-디아자-s-인다센-3-펜타노일)스핑고신 (BODIPY(등록상표) FL C5-세라미드)이다. 미국 특허 4,150,949 (Immunoassay for gentamicin)에서는 플루오레세인티오카르바닐 겐타미신을 포함하는 플루오레세인-표지된 겐타미신을 개시한다. 추가의 형광단은 당업자에게 잘 알려진 방법을 이용하여 제조할 수 있다.
예시적인 정상-및-편광 형광 판독기는 POLARION(등록상표) 형광 편광 시스템 (테칸 아게 (Tecan AG, 스위스 홈브레크티콘))을 포함한다. 다른 분석을 위한 일반적인 다중웰 플레이트 판독기, 예를 들어 VERSAMAX(등록상표) 판독기 및 SPECTRAMAX(등록상표) 다중웰 플레이트 분광광도계 (둘다 몰레큘라 디바이시즈 (Molecular Devices))가 이용가능하다.
형광 공명 에너지 전이 (FRET)가 상호작용을 검출하기 위한 또다른 유용한 분석이고 설명되어 있다 (예를 들어, 문헌 [Heim et al., (1996) Curr. Biol. 6:178-182]; [Mitra et al., (1996) Gene 173:13-17]; 및 [Selvin et al., (1995) Meth. Enzymol. 246:300-345] 참조). FRET는 공지된 여기 및 방출 파장을 갖는 밀접하게 근접하는 2개의 형광 물질 사이의 에너지의 전이를 검출한다. 한 예로서, 단백질은 녹색 형광 단백질 (GFP)과의 융합 단백질로서 발현될 수 있다. 2개의 형광 단백질이 근접할 때, 예를 들어 단백질이 표적 분자와 특이적으로 상호작용할 때, 공명 에너지는 하나의 여기된 분자로부터 다른 분자로 전이될 수 있다. 그 결과, 샘플의 방출 스펙트럼은 변위하고, 이는 형광측정기, 예를 들어 fMAX 다중웰 형광측정기 (몰레큘라 디바이시즈 (미국 캘리포니아주 서니베일))에 의해 측정할 수 있다.
섬광 근접 분석 (SPA)이 표적 분자와의 상호작용을 측정하기 위해 특히 유용한 분석이다. SPA는 제약업계에서 널리 사용되고, 설명되어 있다 (Hanselman et al., (1997) J. Lipid Res. 38:2365-2373; Kahl et al., (1996) Anal. Biochem. 243:282-283; Undenfriend et al., (1987) Anal. Biochem. 161:494-500, 또한 미국 특허 4,626,513 및 4,568,649, 및 유럽 특허 0,154,734 참조). 하나의 상업적으로 입수가능한 시스템은 FLASHPLATE(등록상표) 섬광제 (scintillant)-코팅 플레이트 (엔이엔 라이프 사이언스 프로덕츠 (NEN Life Science Products, 미국 매사추세츠주 보스턴))를 사용한다.
표적 분자는 다양한 잘 공지된 수단에 의해 섬광체 플레이트에 결합될 수 있다. 융합 단백질, 예를 들어 GST, His6 또는 Flag 융합 단백질에 결합하도록 유도화된 섬광제 플레이트가 이용가능하다. 표적 분자가 단백질 복합체 또는 멀티머 (multimer)인 경우, 하나의 단백질 또는 하위단위가 먼저 플레이트에 부착된 후, 복합체의 다른 성분이 이후에 결합 조건 하에 첨가되어, 결합된 복합체를 생성시킬 수 있다.
대표적인 SPA 분석에서, 발현 풀 내에서 유전자 생성물은 방사성 표지되고 웰에 첨가되고, 웰 내의 고정된 표적 분자 및 섬광제 코팅인 고정상과 상호작용하도록 허용될 것이다. 분석물은 즉시 측정되거나 평형에 도달하도록 허용될 수 있다. 두 방식에서, 방사성 표지가 섬광제 코팅에 충분히 근접하게 될 때, TOPCOUNT NXT(등록상표) 마이크로플레이트 섬광 계수기 (팩카드 바이오사이언스 컴퍼니 (Packard BioScience Co., 미국 커넥티컷주 메리덴)와 같은 장치에 의해 검출가능한 시그널을 생성한다. 방사성 표지된 발현 생성물이 표적 분자에 결합하면, 방사성 표지는 검출가능한 시그널을 생산하기에 충분히 오래 섬광제에 근접하게 남아있다.
반대로, 표적 분자에 결합되지 않거나 잠깐동안만 결합하는 표지된 단백질은 배경을 초과하는 시그널을 생성하기에 충분히 오래 섬광제에 가까이 남아있지 않을 것이다. 랜덤 브라운 (Brownian) 운동에 의해 유발된 섬광제 가까이에서 소비된 임의의 시간은 또한 유의한 양의 시그널을 생성하지 않을 것이다. 마찬가지로, 발현 단계 동안 사용된 잔류하는 포함되지 않은 방사성 표지가 존재할 수 있지만, 이는 표적 분자와 상호작용하기 보다 용액 내에 존재할 것이기 때문에 유의한 시그널을 생성하지 않을 것이다. 따라서, 상기 비-결합 상호작용은 수학적으로 제거될 수 있는 특정 수준의 배경 시그널을 유발할 것이다. 너무 많은 시그널이 얻어지면, 목적하는 특이성이 얻어질 때까지 염 또는 다른 변형제를 분석 플레이트에 직접 첨가할 수 있다 (Nichols et al, (1998) Anal. Biochem. 257:112-119).
IV . 키나제 활성 분석
키나제 활성에 대한 많은 상이한 분석이 활성 조절제에 대해 분석하고/하거나 특정 키나제 또는 군 또는 키나제들에 대한 조절제의 특이성을 결정하기 위해 사용될 수 있다. 하기 실시예에 언급된 분석에 추가로, 당업계의 통상의 기술자는 사용될 수 있고 특정 용도에 대해 분석을 변형할 수 있는 다른 분석을 알 것이다. 예를 들어, 키나제에 관한 수많은 논문에 사용될 수 있는 분석이 기재되어 있다.
추가의 대안적인 분석은 결합 결정을 이용할 수 있다. 예를 들어, 상기 종류의 분석은 형광 공명 에너지 전이 (FRET) 포맷으로, 또는 스트렙타비딘 또는 포스포-특이적 항체에 부착되는 공여체 (donor) 및 수여체 (acceptor) 시약을 변화시킴으로써 AlphaScreen (증폭된 발광 근접 균질 분석) 포맷을 사용하여 포맷팅될 수 있다.
V. 유기 합성 기술
잠재적인 조절제를 제작하는 과제를 만족시키기 위해 매우 다양한 유기 합성 기술이 당업계에 존재한다. 상기 많은 유기 합성 방법은 당업자가 이용하는 표준 문헌에 상세히 설명되어 있다. 상기 문헌의 한 예는 문헌 [March, 1994, Advanced Organic Chemistry; Reactions, Mechanisms and Structure, New York, McGraw Hill]이다. 따라서, 키나제 기능의 잠재적인 조절제를 합성하기 위해 유용한 기술은 유기 화학 합성의 당업자가 쉽게 이용가능하다.
본원에 기재된 합성예에 관하여, 용매는 당업자에게 공지된 극성 및 비-극성 용매, 예를 들어 극성 비양성자성 및 극성 양성자성 용매를 포함한다. 극성 용매는 비제한적으로 양성자성 용매, 예를 들어 메탄올, 에탄올, 이소프로필 알콜, t-부탄올, n-부탄올, 아세트산, 포름산 또는 물, 또는 비양성자성 용매, 예를 들어 테트라히드로푸란 (THF), 아세토니트릴, 디옥산, 메틸렌 클로라이드, 디메틸술폭시드 (DMSO), 아세톤, N,N-디메틸포름아미드 (DMF), N,N-디메틸아세트아미드 (DMA), 에틸 아세테이트, 1,2-디메톡시에탄, 1,2-디클로로에탄, 클로로포름, 1,2-디클로로에탄, 또는 피리딘을 포함한다. 극성 용매는 물과 임의의 상기 용매의 혼합물, 또는 임의의 2개 이상의 상기 용매의 혼합물을 포함한다. 비극성 용매는 비제한적으로 톨루엔, 벤젠, 클로로벤젠, 크실렌 및 헥산을 포함한다.
본원에 기재된 합성예에 관하여, 환원제는 비제한적으로 환원제, 예를 들어 수소와 전이 금속 촉매, 예를 들어 팔라듐, 백금, 로듐 등을 사용하는 촉매 환원제 (예를 들어, Pt/아세트산/H2); 트리플루오로아세트산과 트리에틸실란의 혼합물, 보란 테트라히드로푸란 착체, 디보란, 보란 디메틸술파이드 착체, 및 수소화붕소나트륨과 삼불화붕소의 조합물; 금속, 예를 들어 환원철, 아연 분말, 마그네슘 등; 금속 수소 착체 화합물, 예를 들어 알칼리 금속 보로히드라이드 (예를 들어, 수소화붕소칼륨, 수소화붕소나트륨, 수소화붕소리튬, 수소화붕소아연, 나트륨 트리아세톡시보로히드라이드 등), 수소화리튬알루미늄 등; 금속 수소화물, 예를 들어 수소화나트륨 등; 유기 주석 화합물 (트리페닐틴 수소화물 등); 및 금속 염, 예를 들어 니켈 화합물, 아연 화합물, 주석 화합물 (예를 들어, 염화주석(II)), 및 요오드화사마륨/피발린산/헥사메틸인산 트리아미드를 포함한다.
본원에 기재된 합성예에 관하여, 산화제는 비제한적으로 산화제, 예를 들어 데스-마르틴 (Dess-Martin) 시약, TEMPO (2,2,6,6-테트라메틸피페리딘-N-옥시드), DDQ (2,3-디클로로-5,6-디시아노-1,4-벤조퀴논), PDC (피리디늄 디크로메이트), PCC (피리디늄 클로로크로메이트), 피리딘.SC3, 삼산화크롬, p-니트로퍼벤조인산, 마그네슘 모노퍼옥시프탈레이트, 과요오드산나트륨, 과요오드산칼륨, 과산화수소, 우레아 퍼옥시드, 알칼리 금속 브롬산염, 쿠멘 히드록시퍼옥시드, t-부틸 퍼옥시드, 과산, 예를 들어 과포름산, 과아세트산, 퍼트리플루오로아세트산, 페르벤조인산, m-클로로페르벤조인산, o-카르복시페르벤조인산 등; 메타과요오드산나트륨, 중크롬산; 중크롬산염, 예를 들어 중크롬산나트륨, 중크롬산칼륨; 과망간산; 과망간산염, 예를 들어 과망간산칼륨, 과망간산나트륨; 및 납염, 예를 들어 납 테트라아세테이트를 포함한다.
VI . 대체 화합물 형태 또는 유도체
(a) 이성질체, 전구약물, 및 활성 대사체
본원에서 고려되는 화합물은 일반식 및 구체적인 화합물 모두를 참고로 하여 설명된다. 또한, 본 발명 화합물은 많은 상이한 형태 또는 유도체로 존재할 수 있고, 이들은 모두 본 발명의 범위 내에 있다. 이들은 예를 들어, 호변이성질체, 입체이성질체, 라세미 혼합물, 위치이성질체, 염, 전구약물 (예를 들어, 카르복실산 에스테르), 용매화 형태, 상이한 결정 형태 또는 다형체, 및 활성 대사체를 포함한다.
(b) 호변이성질체, 입체이성질체, 위치이성질체, 및 용매화 형태
특정 화합물은 호변이성을 나타낼 수 있음이 이해된다. 상기 경우에, 본원에 제공된 화학식은 가능한 호변이성질체 형태 중 하나만을 명백히 도시한다. 따라서, 본원에 제공된 화학식은 도시된 화합물의 임의의 호변이성질체 형태를 나타내도록 의도되고, 화학식 그림에 도시된 구체적인 호변이성질체 형태에만 제한되지 않음을 이해해야 한다.
마찬가지로, 본 발명에 따른 화합물의 일부는 입체이성질체로서 존재할 수 있고, 즉, 이들은 동일한 서열의 공유 결합된 원자를 갖고 원자의 공간 배향이 상이하다. 예를 들어, 화합물은 광학 입체이성질체일 수 있고, 이는 하나 이상의 키랄 중심을 갖고, 따라서, 2개 이상의 입체이성질체 형태 (예를 들어, 에난티오머 또는 부분입체이성질체)로 존재할 수 있다. 따라서, 상기 화합물은 단일 입체이성질체 (즉, 본질적으로 다른 입체이성질체가 없는), 라세미체, 및/또는 에난티오머 및/또는 부분입체이성질체의 혼합물로서 제공될 수 있다. 다른 예로서, 입체이성질체는 기하 이성질체, 예를 들어 이중 결합의 인접한 탄소 상에 치환체의 시스- 또는 트랜스-배향을 포함한다. 상기 모든 단일 입체이성질체, 라세미체 및 그의 혼합물은 본 발명의 범위 내에 있는 것으로 의도된다. 반대로 명시하지 않으면, 상기 모든 입체이성질체 형태는 본원에 제공된 화학식 내에 포함된다.
특정 실시태양에서, 본 발명의 키랄 화합물은 적어도 80％의 단일 이성질체 (60％ 에난티오머 순도 (excess) ("e.e.") 또는 부분입체이성질체 순도 ("d.e."), 또는 적어도 85％ (70％ e.e. 또는 d.e.), 90％ (80％ e.e. 또는 d.e.), 95％ (90％ e.e. 또는 d.e.), 97.5％ (95％ e.e. 또는 d.e.), 또는 99％ (98％ e.e. 또는 d.e.)를 함유하는 형태이다. 당업자가 일반적으로 이해하는 바와 같이, 하나의 키랄 중심을 갖는 광학상 순수한 화합물은 본질적으로 2개의 가능한 에난티오머 중 하나로 이루어지는 것이고 (즉, 에난티오머상 순수하고), 하나 초과의 키랄 중심을 갖는 광학상 순수한 화합물은 부분입체이성질체상 순수하고 에난티오머상 순수하다. 특정 실시태양에서, 화합물은 광학상 순수한 형태로 존재한다.
합성이 이중 결합, 특히 탄소-탄소 이중 결합에서 단일기의 첨가를 포함하는 화합물에 대해, 첨가는 이중 결합-연결된 원자 중 하나에서 일어날 수 있다. 상기 화합물에 대해, 본 발명는 그러한 두 위치이성질체를 모두 포함한다.
추가로, 화학식은 확인된 구조체의 용매화 형태와 비용매화 형태를 포함하도록 의도된다. 예를 들어, 표시된 구조체는 수화 및 비-수화 형태를 둘다 포함한다. 용매화물의 다른 예는 이소프로판올, 에탄올, 메탄올, DMSO, 에틸 아세테이트, 아세트산, 또는 에탄올아민과 조합된 구조체를 포함한다.
(c) 전구약물 및 대사체
본 발명의 화학식 및 본원에 기재된 화합물에 추가로, 본 발명은 또한 전구약물 (일반적으로 제약상 허용되는 전구약물), 활성 대사 유도체 (활성 대사체), 및 그들의 제약상 허용되는 염을 포함한다.
전구약물은 생리학적 조건 하에 대사될 때 또는 가용매분해에 의해 전환될 때 목적하는 활성 화합물을 제공하는 화합물 또는 그의 제약상 허용되는 염이다. 일반적으로, 전구약물은 비활성이거나, 또는 활성 화합물보다 활성이 적지만, 유익한 취급, 투여, 또는 대사 특성을 제공할 수 있다. 예를 들어, 일부 전구약물은 활성 화합물의 에스테르이고; 대사분해 동안, 에스테르기가 절단되어 활성 약물을 제공한다. 또한, 일부 전구약물은 효소적으로 활성화되어 활성 화합물, 또는 추가의 화학 반응시 활성 화합물을 제공하는 화합물을 제공한다.
문헌 [The Practice of Medicinal Chemistry, Ch. 31-32 (Ed. Wermuth, Academic Press, San Diego, CA, 2001)]에 기재된 바와 같이, 전구약물은 개념상 2개의 비배타적 카테고리; 생체전구체 (bioprecursor) 전구약물 및 캐리어 전구약물로 나누어질 수 있다. 일반적으로, 생체전구체 전구약물은 하나 이상의 보호기를 포함하고 대사 또는 가용매분해에 의해 활성 형태로 전환되는, 비활성이거나 대응하는 활성 약물 화합물에 비해 낮은 활성을 갖는 화합물이다. 활성 약물 형태 및 임의의 방출된 대사 산물은 모두 허용되는 낮은 독성을 가져야 한다. 대체고, 활성 약물 화합물의 형성은 다음 종류 중 하나인 대사 과정 또는 반응을 포함한다:
산화 반응: 산화 반응은 알콜, 카르보닐 및 산 관능기의 산화, 지방족 탄소의 히드록실화, 지환족 탄소 원자의 히드록실화, 방향족 탄소 원자의 산화, 탄소-탄소 이중 결합의 산화, 질소-함유 관능기의 산화, 규소, 인, 비소 및 황의 산화, 산화적 N-탈알킬화, 산화적 O- 및 S-탈알킬화, 산화적 탈아민화, 및 다른 산화 반응과 같은 반응으로 예시되고 이로 제한되지 않는다.
환원 반응: 환원 반응은 카르보닐기의 환원, 히드록실기 및 탄소-탄소 이중 결합의 환원, 질소-함유 관능기의 환원, 및 다른 환원 반응과 같은 반응으로 예시되고 이로 제한되지 않는다..
산화 상태의 변화가 없는 반응: 산화 상태의 변화가 없는 반응은 에스테르 및 에테르의 가수분해, 탄소-질소 단일 결합의 가수분해 절단, 비-방향족 헤테로사이클의 가수분해 절단, 다중 결합에서 수화 및 탈수, 탈수 반응으로 인한 새로운 원자 연결기, 가수분해적 탈할로겐화, 수소 할라이드 분자의 제거, 및 다른 상기 반응과 같은 반응으로 예시되고 이로 제한되지 않는다.
캐리어 전구약물은 예를 들어, 섭취 및/또는 작용 부위(들)에 국소화 전달을 개선시키는 수송 잔기를 포함하는 약물 화합물이다. 바람직하게는, 상기 캐리어 전구약물에 대해, 약물 잔기와 수송 잔기 사이의 연결은 공유 결합이고, 전구약물은 비활성이거나 약물 화합물보다 활성이 적고, 전구약물 및 임의의 방출 수송 잔기는 허용가능하게 무독성이다. 수송 잔기가 섭취를 향상시키도록 의도되는 전구약물에 있어서, 대개 수송 잔기의 방출은 신속해야 한다. 다른 경우에, 느린 방출을 제공하는 잔기, 예를 들어, 특정 중합체 또는 다른 잔기, 예를 들어 시클로덱스트린를 사용하는 것이 바람직하다 (예를 들어, 본원에 참고로 포함된 쳉 (Cheng) 등의 미국 특허 출원 공개 2004/0077595, 출원 번호 10/656,838 참조). 상기 캐리어 전구약물은 종종 경구 투여된 약물에 대해 유익하다. 캐리어 전구약물은 예를 들어, 하나 이상의 다음 특성을 개선하기 위해 사용될 수 있다: 증가된 친지성, 약물학상 효과의 증가된 지속시간, 증가된 부위-특이성, 감소된 독성 및 이상 반응, 및/또는 약물 제형화에서 개선 (예를 들어, 안정성, 수 용해도, 바람직하지 않은 감각수용성 또는 물리화학 특성의 억제). 예를 들어, 친지성은 친지성 카르복실산을 사용하여 히드록실기를, 또는 알콜, 예를 들어, 지방족 알콜을 사용하여 카르복실산기를 에스테르화함으로써 증가될 수 있다 (Wermuth, The Practice of Medicinal Chemistry, Ch. 31-32, Ed. Wermuth, Academic Press, San Diego, CA, 2001).
전구약물은 전구약물 형태로부터 활성 형태로 단일 단계로 진행할 수 있거나, 자체가 활성을 갖거나 비활성일 수 있는 하나 이상의 중간체 형태를 가질 수 있다.
대사체, 예를 들어, 활성 대사체는 상기 설명된 바와 같은 전구약물, 예를 들어, 생체전구체 전구약물과 겹친다. 따라서, 상기 대사체는 약물학적 활성 화합물, 또는 대상 또는 환자의 체내에서 대사 과정으로부터의 유도체인 약물학적 활성 화합물로 추가로 대사되는 화합물이다. 이들 중에, 활성 대사체는 상기 약물학적 활성 유도체 화합물이다. 전구약물에 있어서, 전구약물 화합물은 일반적으로 비활성이거나 대사 산물보다 활성이 더 적다. 활성 대사체에 있어서, 모화합물은 활성 화합물일 수 있거나 비활성 전구약물일 수 있다.
전구약물 및 활성 대사체는 당업계에 공지된 일상적 기술을 이용하여 확인할 수 있다 (예를 들어, 문헌 [Bertolini et al., 1997, J. Med. Chem., 40:2011-2016; Shan et al., 1997, J Pharm Sci 86(7):756-757; Bagshawe, 1995, Drug Dev. Res., 34:220-230; Wermuth, The Practice of Medicinal Chemistry, Ch. 31-32, Academic Press, San Diego, CA, 2001] 참조).
(d) 제약상 허용되는 염
화합물은 제약상 허용되는 염으로서 제형화되거나 그 형태로 존재할 수 있다. 제약상 허용되는 염은 그들의 투여되는 양 및 농도에서 무독성 염이다. 상기 염의 제제는 그의 생리학적 효과를 발휘하는 것을 방해하지 않으면서 화합물의 물리적 특징을 변경시킴으로써 약물학상 사용을 용이하게 한다. 물리적 특징에서 유용한 변경은 경점막 투여를 용이하게 하기 위해 융점을 낮추고, 보다 고농도의 약물을 투여하는 것을 용이하게 하기 위해 용해도를 증가시키는 것을 포함한다.
제약상 허용되는 염은 산 부가염, 예를 들어 술페이트, 클로라이드, 히드로클로라이드, 푸마레이트, 말레에이트, 포스페이트, 술파메이트, 아세테이트, 시트레이트, 락테이트, 타르트레이트, 메탄술포네이트, 에탄술포네이트, 벤젠술포네이트, p-톨루엔술포네이트, 시클로헥실술파메이트 및 퀴네이트를 포함하는 염을 포함한다. 제약상 허용되는 염은 염산, 말레산, 황산, 인산, 술팜산, 아세트산, 시트르산, 락트산, 타르타르산, 말론산, 메탄술폰산, 에탄술폰산, 벤젠술폰산, p-톨루엔술폰산, 시클로헥실술팜산, 푸마르산, 및 퀸산과 같은 산으로부터 얻을 수 있다.
제약상 허용되는 염은 또한 염기 부가염, 예를 들어 산성 관능기, 예를 들어 카르복실산 또는 페놀이 존재할 때 벤자틴, 클로로프로카인, 콜린, 디에탄올아민, 에틸렌디아민, 메글루민, 프로카인, 알루미늄, 칼슘, 리튬, 마그네슘, 칼륨, 나트륨, 암모늄, 알킬아민, 및 아연을 포함하는 염을 포함한다 (예를 들어, 문헌 [Remington's Pharmaceutical Sciences, 19th ed., Mack Publishing Co., Easton, PA, Vol. 2, p.1457, 1995] 참조). 상기 염은 적절한 대응하는 염기를 사용하여 제조할 수 있다.
제약상 허용되는 염은 표준 기술에 의해 제조할 수 있다. 예를 들어, 화합물의 유리 염기 형태를 적절한 산을 함유하는 적합한 용매, 예를 들어 수성 또는 수성-알콜 용액에 용해시킨 후 용액을 증발시켜 단리할 수 있다. 다른 예에서, 염은 유리 염기 및 산을 유기 용매 내에서 반응시켜 제조할 수 있다.
따라서, 예를 들어, 특정 화합물이 염기이면, 목적하는 제약상 허용되는 염은 당업계에 이용가능한 임의의 적합한 방법에 의해, 예를 들어, 무기산, 예를 들어 염산, 브롬화수소산, 황산, 질산, 인산 등을 사용하여, 또는 유기산, 예를 들어 아세트산, 말레산, 숙신산, 만델산, 푸마르산, 말론산, 피루브산, 옥살산, 글리콜산, 살리실산, 피라노시딜산, 예를 들어 글루쿠론산 또는 갈락투론산, 알파-히드록시산, 예를 들어 시트르산 또는 타르타르산, 아미노산, 예를 들어 아스파르트산 또는 글루탐산, 방향족 산, 예를 들어 벤조인산 또는 신남산, 술폰산, 예를 들어 p-톨루엔술폰산 또는 에탄술폰산 등을 사용하여 유리 염기를 처리하여 제조할 수 있다.
유사하게, 특정 화합물이 산이면, 목적하는 제약상 허용되는 염은 임의의 적합한 방법에 의해, 예를 들어, 무기 또는 유기 염기, 예를 들어 아민 (1차, 2차 또는 3차), 알칼리 금속 수산화물 또는 알칼리성 토금속 수산화물 등을 사용하여 유리 산을 처리하여 제조할 수 있다. 적합한 염의 예시적인 예는 아미노산, 예를 들어 글리신 및 아르기닌, 암모니아, 1차, 2차, 및 3차 아민, 및 시클릭 아민, 예를 들어 피페리딘, 모르폴린 및 피페라진으로부터 유래된 유기 염, 및 나트륨, 칼슘, 칼륨, 마그네슘, 망간, 철, 구리, 아연, 알루미늄 및 리튬으로부터 유래된 무기 염을 포함한다.
상이한 화합물의 제약상 허용되는 염은 착체로서 제공될 수 있다. 착체의 예는 8-클로로테오필린 착체 (예를 들어, 디멘히드리네이트:디펜히드라민 8-클로로테오필린 (1:1) 착체; 드라마민 (Dramamine)에 유사한) 및 각종 시클로덱스트린 포합 착체를 포함한다.
반대로 명시하지 않으면, 본원의 화합물의 명시는 상기 화합물의 제약상 허용되는 염을 포함한다.
(e) 다형태
고체인 약제의 경우에, 당업자는 화합물 및 염은 상이한 결정 또는 다형태로 존재할 수 있고, 그 모두는 본 발명의 범위 및 명시된 화학식 내에 포함되는 것으로 의도됨을 이해한다.
VII . 투여
방법 및 화합물은 대개 인간 환자에 대한 치료법에서 사용될 것이다. 그러나, 이들은 다른 척추동물, 예를 들어, 포유동물, 예를 들어 다른 영장류, 상업상 중요한 동물, 예를 들어, 스포츠용 동물, 사육 동물, 예를 들어, 소, 말, 돼지, 및 양, 및 애완동물, 예를 들어 개 및 고양이에서 유사하거나 동일한 질병을 치료하기 위해 또한 사용될 수 있다.
적합한 투여형은 부분적으로 사용 또는 투여 경로, 예를 들어, 경구, 경피, 경점막, 흡입, 또는 주사 (비경구)에 좌우된다. 상기 투여형은 화합물이 표적 세포에 도달하도록 해야 한다. 다른 인자는 당업계에 잘 알려져 있고, 독성, 및 화합물 또는 조성물이 그의 효과를 발휘하는 것을 저해하는 투여형과 같은 고려사항을 포함한다. 기술 및 제형은 일반적으로 문헌 [Remington: The Science and Practice of Pharmacy, 21st edition, Lippincott, Williams and Wilkins, Philadelphia, PA, 2005 (본원에 참고로 포함됨)]에서 찾을 수 있다.
본 발명의 화합물 (즉, 화학식 Ia, Ib, Ig 및 본원에 개시된 모든 하위 실시태양을 포함하는 화학식 I)은 제약상 허용되는 염으로서 제형화할 수 있다.
조성물을 제조하기 위해 담체 또는 부형제가 사용될 수 있다. 담체 또는 부형제는 화합물의 투여를 용이하게 하도록 선택될 수 있다. 담체의 예는 탄산칼슘, 인산칼슘, 각종 당, 예를 들어 락토스, 글루코스, 또는 수크로스, 또는 전분의 종류, 셀룰로스 유도체, 젤라틴, 식물유, 폴리에틸렌 글리콜 및 생리학상 적합성 용매를 포함한다. 생리학상 적합성 용매의 예는 주사용수 (WFI), 염수 용액, 및 덱스트로스의 멸균 용액을 포함한다.
화합물은 정맥내, 복강내, 피하, 근육내, 경구, 경점막, 직장, 경피, 또는 흡입을 포함하는 상이한 경로로 투여될 수 있다. 일부 실시태양에서, 경구 투여가 바람직하다. 예를 들어, 경구 투여에 있어서, 화합물은 통상적인 경구 투여형, 예를 들어 캡슐, 정제, 및 액체 제제, 예를 들어 시럽, 엘릭시르, 및 농축 점적액 (drop)으로서 제형화될 수 있다.
경구 사용을 위한 제약 제제는 예를 들어, 활성 화합물을 고체 부형제와 합하고, 생성되는 혼합물을 선택적으로 연마하고, 원하는 경우 과립의 혼합물을 적합한 보조제를 첨가한 후 가공하여 정제 또는 당의정 코어를 얻음으로써 얻을 수 있다. 적합한 부형제는 특히, 충전제, 예를 들어 당, 예를 들어 락토스, 수크로스, 만니톨, 또는 소르비톨; 셀룰로스 제제, 예를 들어, 옥수수 전분, 밀 전분, 쌀 전분, 감자 전분, 젤라틴, 트라가칸트 검, 메틸 셀룰로스, 히드록시프로필메틸-셀룰로스, 나트륨 카르복시메틸셀룰로스 (CMC), 및/또는 폴리비닐피롤리돈 (PVP: 포비돈)이다. 원하는 경우, 붕해제, 예를 들어 가교결합된 폴리비닐피롤리돈, 한천, 또는 알긴산 또는 그의 염, 예를 들어 알긴산나트륨이 첨가될 수 있다.
당의정 코어에는 적합한 코팅이 제공된다. 상기 목적을 위해, 농축 당 용액이 사용될 수 있고, 이는 임의로 예를 들어, 아라비아고무, 활석, 폴리비닐피롤리돈, 카르보폴 겔, 폴리에틸렌 글리콜 (PEG), 및/또는 이산화티탄, 래커 (lacquer) 용액, 및 적합한 유기 용매 또는 용매 혼합물을 포함할 수 있다. 식별을 위해 또는 상이한 조합의 활성 화합물 용량을 특성화하기 위해 염료 또는 안료가 정제 또는 당의정 코팅에 첨가될 수 있다.
경구로 사용될 수 있는 제약 제제는 젤라틴 ("겔캡스 (gelcaps)")으로 제조된 푸시핏 (push-fit) 캡슐, 및 젤라틴 및 가소화제, 예를 들어 글리세롤 또는 소르비톨로 제조된 연질 밀봉 캡슐을 포함한다. 푸시핏 캡슐은 활성 성분을 충전제, 예를 들어 락토스, 결합제, 예를 들어 전분, 및/또는 활택제, 예를 들어 활석 또는 스테아르산마그네슘 및 임의로 안정화제와의 혼합물로 포함할 수 있다. 연질 캡슐에서, 활성 화합물은 적합한 액체, 예를 들어 지방 오일, 액체 파라핀, 또는 액체 폴리에틸렌 글리콜 (PEG)에 용해되거나 현탁될 수 있다. 또한, 안정화제가 첨가될 수 있다.
별법으로, 주사 (비경구 투여), 예를 들어, 근육내, 정맥내, 복강내, 및/또는 피하 주사가 사용될 수 있다. 주사에 있어서, 본 발명의 화합물은 멸균 액체 용액, 바람직하게는 생리학상 적합성 버퍼 또는 용액, 예를 들어 염수 용액, 행크 (Hank) 용액, 또는 링거 (Ringer) 용액 중에 제형화된다. 또한, 화합물은 고체 형태로 제형화되고, 사용 직전에 재용해되거나 현탁될 수 있다. 동결건조 형태가 또한 제조될 수 있다.
투여는 또한 경점막, 국소, 경피, 또는 흡입 수단에 의할 수 있다. 경점막, 국소 또는 경피 투여에 있어서, 투과될 장벽에 적절한 침투제가 제형 내에 사용된다. 상기 침투제는 당업계에 일반적으로 공지되어 있고, 예를 들어, 경점막 투여를 위해 담즙산염 및 푸시딘산 유도체를 포함한다. 또한, 투과를 용이하게 하기 위해 세제가 사용될 수 있다. 경점막 투여는 예를 들어 코 스프레이 또는 좌제 (직장 또는 질)를 통할 수 있다.
본 발명의 국소 조성물은 당업계에 공지된 적절한 담체를 선택하여 바람직하게는 오일, 크림, 로션, 연고 등으로서 제형화된다. 적합한 담체는 식물유 또는 광물유, 백색 바셀린 (petrolatum) (백색 소프트 파라핀), 분지쇄 지방 또는 오일, 동물 지방 및 고분자량 알콜 (C12 초과)을 포함한다. 바람직한 담체는 활성 성분이 가용성인 것이다. 또한, 유화제, 안정화제, 습윤제 및 항산화제뿐만 아니라 원하는 경우 색상 또는 향기 부여제가 포함될 수 있다. 국소 투여용 크림은 바람직하게는 광물유, 자가-유화 밀랍 및 물의 혼합물로부터 제형화되고, 상기 혼합물 내에 소량 용매 (예를 들어, 오일) 중에 용해된 활성 성분이 혼합된다. 추가로, 경피 수단에 의한 투여는 활성 성분 및 임의로 당업계에 공지된 하나 이상의 담체 또는 희석제로 함침된 경피 패치 또는 드레싱, 예를 들어 밴드 (bandage)를 포함할 수 있다. 경피 전달 시스템 형태로 투여되는 경우, 용량 투여는 물론 용량 계획 전체 동안 간헐적이기보다 연속적일 것이다.
흡입에 있어서, 본 발명의 화합물은 건조 분말 또는 적합한 용액, 현탁액, 또는 에어로졸로서 제형화될 수 있다. 분말 및 용액은 당업계에 공지된 적합한 첨가제를 사용하여 제형화될 수 있다. 예를 들어, 분말은 적합한 분말 베이스, 예를 들어 라카토스 또는 전분을 포함할 수 있고, 용액은 프로필렌 글리콜, 멸균수, 에탄올, 염화나트륨 및 다른 첨가제, 예를 들어 산, 알칼리 및 버퍼 염을 포함할 수 있다. 상기 용액 또는 현탁액은 스프레이, 펌프, 분무기 (atomizer), 또는 연무기 (nebulizer) 등을 통해 흡입함으로써 투여될 수 있다. 본 발명의 화합물은 또한 다른 흡입 치료제, 예를 들어, 코르티코스테로이드, 예를 들어 플루티카손 프로피오네이트, 베클로메타손 디프로피오네이트, 트리암시놀론 아세토니드, 부데소니드, 및 모메타손 푸로에이스; 베타 효능제, 예를 들어 알부테롤, 살메테롤, 및 포르모테롤; 항콜린제, 예를 들어 이프라트로프리움 브로마이드 또는 티오트로피움; 혈관확장제, 예를 들어 트레프로스티날 및 이로프로스트; 효소, 예를 들어 DNAase; 치료 단백질; 면역글로불린 항체; 올리고뉴클레오티드, 예를 들어 단일 또는 이중 가닥 DNA 또는 RNA, siRNA; 항생제, 예를 들어 토브라마이신; 무스카린 수용체 길항제; 류코트리엔 길항제; 사이토킨 길항제; 프로테아제 억제제; 크로몰린 나트륨; 네도크릴 나트륨; 및 나트륨 크로모글리케이트와 조합으로 사용될 수 있다.
본 발명의 화합물은 또한 동일한 질병을 치료하기 위한 다른 치료제와 조합으로 사용될 수 있다. 상기 조합 사용은 상이한 시간에 화합물 및 하나 이상의 다른 치료제의 투여, 또는 화합물 및 하나 이상의 다른 치료제의 동시-투여를 포함한다. 특정 실시태양에서, 용량은 당업자에게 잘 공지된 방법에 의해 조합으로 사용된 본 발명의 하나 이상의 화합물 또는 다른 치료제에 대해 수정될 수 있고, 예를 들어, 단독으로 사용된 화합물 또는 치료제에 비해 투약되는 양이 감소된다.
조합 사용은 다른 요법, 약물, 의학적 시술 등과 함께 사용을 포함하는 것이 이해되고, 여기서 다른 요법 또는 시술은 본 발명의 화합물과는 상이한 시간에 (예를 들어, 단시간 내에, 예를 들어 수시간 (예를 들어, 1, 2, 3, 4-24 시간) 내에, 또는 더 긴 시간 (예를 들어, 1-2일, 2-4일, 4-7일, 1-4주) 내에), 또는 본 발명의 화합물과 동일한 시간에 투여될 수 있다. 조합 사용은 또한 1회 또는 드물게 투여되는 요법 또는 의학적 시술, 예를 들어 수술과 함께 사용을 포함하고, 여기서 본 발명의 화합물은 다른 요법 또는 시술 전후에 단시간 또는 보다 긴 시간 내에 투여된다. 특정 실시태양에서, 본 발명은 상이한 투여 경로로 또는 동일한 투여 경로로 전달된 본 발명의 화합물 및 하나 이상의 다른 약물 요법의 전달을 제공한다. 임의의 투여 경로를 위한 조합 사용은 2개의 화합물이 투여될 때 그들의 치료 활성을 유지하는 방식으로 화학적으로 연결되는 제형을 포함하는, 임의의 제형 내에 함께 동일한 투여 경로로 전달된 본 발명의 화합물 및 하나 이상의 다른 약물 요법의 전달을 포함한다. 한 측면에서, 다른 약물 요법이 본 발명의 하나 이상의 화합물과 동시-투여될 수 있다. 동시-투여에 의한 조합 사용은 공동-제형 또는 화학적으로 연결된 화합물의 제형의 투여, 또는 동일하거나 상이한 경로로 투여되는, 서로 단시간 내에 (예를 들어, 1시간, 2시간, 3시간, 24시간 이내에) 별개의 제형 내의 2개 이상의 화합물의 투여를 포함한다. 별개의 제형의 동시-투여는 하나의 장치, 예를 들어, 동일한 흡입 장치, 동일한 시린지 등을 통한 전달에 의한 동시-투여, 또는 서로 단시간 내에 별개의 장치로부터의 투여를 포함한다. 동일한 경로로 전달된 본 발명의 화합물 및 하나 이상의 추가의 약물 요법의 동시-투여는 하나의 제형 내에 합해진 별개의 화합물, 또는 화학적으로 연결되지만 여전히 그들의 생물학적 활성을 유지하도록 변형된 화합물을 포함하는, 하나의 장치에 의해 투여될 수 있도록 물질들의 제제를 함께 포함한다. 상기 화학적으로 연결된 화합물은 생체 내에서 실질적으로 유지되는 연결기를 가질 수 있거나, 연결기는 생체 내에서 파괴될 수 있어서, 2개의 활성 성분을 분리시킨다.
유효량으로서 투여될 다양한 화합물의 양은 화합물 IC50, 화합물의 생물학적 반감기, 대상의 연령, 체격 및 체중, 및 대상과 관련된 질병과 같은 인자를 고려하여 표준 과정에 의해 결정될 수 있다. 상기 및 다른 인자의 중요성은 당업자에게 잘 공지되어 있다. 일반적으로, 용량은 약 0.01 내지 50 mg/kg (치료될 대상), 바람직하게는 0.1 내지 20 mg/kg일 것이다. 다중 용량이 사용될 수 있다.
VIII . c- kit 및 c- fms 의 조작
인간을 포함하는 다양한 포유동물로부터의 c-kit 및 c-fms의 전장 코딩 서열 및 아미노산 서열은 공지되어 있으므로, 클로닝, 재조합 c-kit 및 c-fms의 제작, 재조합 단백질의 생산 및 정제, c-kit 또는 c-fms의 다른 유기체 내로의 도입, 및 c-kit 및 c-fms의 다른 분자 생물학적 조작은 쉽게 수행된다.
핵산의 조작을 위한 기술, 예를 들어, 서브클로닝, 라벨링 프로브 (예를 들어, 클레나우 (Klenow) 폴리머라제를 사용하는 랜덤-프라이머 라벨링, 닉 (nick) 번역, 증폭), 서열결정, 혼성화 등은 학술 및 특허 문헌에 잘 개시되어 있다 (예를 들어, 문헌 [Sambrook, ed., Molecular Cloning: a Laboratory Manual (2nd ed.), Vols. 1-3, Cold Spring Harbor Laboratory, (1989); Current Protocols in Molecular Biology, Ausubel, ed. John Wiley ＆ Sons, Inc., New York (1997); Laboratory Techniques in Biochemistry and Molecular Biology: Hybridization With Nucleic Acid Probes, Part I. Theory and Nucleic Acid Preparation, Tijssen, ed. Elsevier, N.Y. (1993)] 참조).
핵산 서열은 추가로 사용하기 위해 필요한 경우 증폭 방법, 예를 들어 PCR, 등온 방법, 회전 환 방법 등을 사용하여 증폭될 수 있고, 이는 당업자에게 잘 공지되어 있다 (예를 들어, 문헌 [Saiki, "Amplification of Genomic DNA" in PCR Protocols, Innis et al., Eds., Academic Press, San Diego, CA 1990, pp 13-20; Wharam et al., Nucleic Acids Res. 2001 Jun 1;29(11):E54-E54; Hafner et al., Biotechniques 2001 Apr;30(4):852-6, 858, 860 passim; Zhong et al., Biotechniques 2001 Apr;30(4):852-6, 858, 860 passim] 참조).
핵산, 벡터, 캡시드, 폴리펩티드 등은 당업자에게 잘 공지된 임의의 많은 일반적인 수단에 의해 분석되고 정량될 수 있다. 이들은 예를 들어, 분석적 생화학적 방법, 예를 들어 NMR, 분광광도법, 방사선촬영, 전기영동, 모세관 전기영동, 고성능 액체 크로마토그래피 (HPLC), 박층 크로마토그래피 (TLC), 및 고도확산 크로마토그래피, 다양한 면역학적 방법, 예를 들어, 유체 또는 겔 침강소 반응, 면역확산, 면역-전기영동, 방사선면역분석 (RIA), 효소 면역흡착 분석 (ELISA), 면역-형광 분석, 서던 (Southern) 분석, 노던 (Northern) 분석, 도트-블롯 (dot-blot) 분석, 겔 전기영동 (예를 들어, SDS-PAGE), 핵산 또는 표적 또는 시그널 증폭 방법, 방사선표지, 섬광 계수, 및 친화도 크로마토그래피를 포함한다.
본 발명의 방법을 실시하기 위해 사용된 핵산을 얻고 조작하는 것은 게놈 샘플로부터 클로닝하고, 원하는 경우, 삽입체를 단리된 또는 증폭된 형태로, 예를 들어, 게놈 클론 또는 cDNA 클론을 스크리닝하고 재-클로닝함으로써 수행할 수 있다. 본 발명의 방법에서 사용된 핵산의 원료는 예를 들어, 포유동물 인공 염색체 (MAC) (예를 들어, 미국 특허 5,721,118; 6,025,155 참조); 인간 인공 염색체 (예를 들어, 문헌 [Rosenfeld (1997) Nat. Genet. 15:333-335] 참조); 효모 인공 염색체 (YAC); 세균 인공 염색체 (BAC); P1 인공 염색체 (예를 들어, 문헌 [Woon (1998) Genomics 50:306-316] 참조); P1-유래 벡터 (PAC) (예를 들어, 문헌 [Kern (1997) Biotechniques 23:120-124] 참조); 코스미드, 재조합 바이러스, 파지 또는 플라스미드에 포함된 게놈 또는 cDNA 라이브러리를 포함한다.
본 발명의 핵산은 프로모터에 작동적으로 연결될 수 있다. 프로모터는 핵산의 전사를 지시하는 핵산 제어 서열의 하나의 모티프 또는 어레이일 수 있다. 프로모터는 전사의 개시 부위 부근의 필수적인 핵산 서열, 예를 들어, 폴리머라제 II 타입 프로모터의 경우에, TATA 엘리먼트 (element)를 포함할 수 있다. 프로모터는 또한 임의로 전사의 개시 부위로부터 수천 염기쌍정도에 위치할 수 있는 말단 인핸서 (enhancer) 또는 리프레서 (repressor) 엘리먼트를 포함한다. "구성적" 프로모터는 대부분의 환경 및 발생 조건 하에 활성인 프로모터이다. "유도가능" 프로모터는 환경 또는 발생적 조절 하에 있는 프로모터이다. "조직 특이적" 프로모터는 유기체의 특정 조직 종류 내에서 활성이지만, 동일한 유기체의 다른 조직 종류 내에서 활성이 아니다. 용어 "작동적으로 연결된"은 핵산 발현 제어 서열 (예를 들어 프로모터, 또는 전사 인자 결합 부위의 어레이)과 제2 핵산 서열 사이의 기능적 연결을 의미하고, 여기서 발현 제어 서열은 제2 서열에 대응하는 핵산의 전사를 지시한다.
본 발명의 핵산은 또한 발현 벡터 및 클로닝 비히클, 예를 들어, 본 발명의 폴리펩티드를 코딩하는 서열 내에 제공될 수 있다. 본 발명의 발현 벡터 및 클로닝 비히클은 바이러스 입자, 바큘로바이러스, 파지, 플라스미드, 파지미드, 코스미드, 포스미드, 세균 인공 염색체, 바이러스 DNA (예를 들어, 우두, 아데노바이러스, 수두 바이러스, 가광견병 및 SV40의 유도체), P1-기반 인공 염색체, 효모 플라스미드, 효모 인공 염색체, 및 관심있는 특이적 숙주 (예를 들어, 바실루스 (bacillus), 아스페르길루스 (Aspergillus) 및 효모)에 특이적인 임의의 다른 벡터를 포함할 수 있다. 본 발명의 벡터는 염색체, 비-염색체 및 합성 DNA 서열을 포함할 수 있다. 매우 많은 적합한 벡터가 당업자에게 공지되어 있고, 상업적으로 입수가능하다.
본 발명의 핵산은 원하는 경우 일상적 분자 생물학적 방법을 이용하여 임의의 다양한 벡터 내로 클로닝될 수 있고; 시험관 내 증폭된 핵산을 클로닝하기 위한 방법은 예를 들어, 미국 특허 5,426,039에 개시되어 있다. 증폭된 서열의 클로닝을 용이하게 하기 위해, 제한 효소 부위는 PCR 프라이머 쌍 "내로 제작될" 수 있다. 벡터는 게놈 내로 또는 세포의 세포질 또는 핵 내로 도입되고, 학술 및 특허 문헌에 잘 설명되어 있는 다양한 통상적인 기술에 의해 발현될 수 있다 (예를 들어, 문헌 [Roberts (1987) Nature 328:731; Schneider (1995) Protein Expr. Purif. 6435:10; Sambrook, Tijssen or Ausubel] 참조). 벡터는 천연 원료로부터 단리하거나, ATCC 또는 GenBank 라이브러리와 같은 공급원으로부터 입수하거나, 합성 또는 재조합 방법에 의해 제조할 수 있다. 예를 들어, 본 발명의 핵산은 세포 내에 안정하게 또는 일시적으로 발현되는 발현 카세트, 벡터 또는 바이러스 (예를 들어, 에피솜 (episomal) 발현 시스템) 내에 발현될 수 있다. 선택 마커는 형질전환된 세포 및 서열에 선택가능 표현형을 부여하기 위해 발현 카세트 및 벡터 내로 포함될 수 있다. 예를 들어, 선택 마커는 숙주 게놈 내로의 통합이 요구되지 않도록 에피솜 유지 및 복제를 코딩할 수 있다.
한 측면에서, 본 발명의 핵산은 본 발명의 펩티드 또는 폴리펩티드의 인 시츄 (in situ) 발현을 위해 생체내 투여될 수 있다. 핵산은 "네이키드 (naked) DNA"로서 (예를 들어, 미국 특허 5,580,859 참조) 또는 발현 벡터, 예를 들어, 재조합 바이러스 형태로 투여될 수 있다. 핵산은 하기 설명된 바와 같은 임의의 경로, 예를 들어 종양주변에 또는 종양내 투여될 수 있다. 생체내 투여된 벡터는 바람직하게는 바큘로바이러스과, 파르보바이러스과, 피코르노바이러스과, 헤르페스바이러스과, 폭스바이러스과, 아데노바이러스과, 또는 피코르나바이러스과로부터 선택된 재조합 변형된 외피보유 또는 외피비보유 DNA 및 RNA 바이러스를 포함하는 바이러스 게놈으로부터 유래될 수 있다. 각각의 모 벡터 특성의 유리한 장점을 활용하는 키메릭 벡터가 또한 사용될 수 있다 (예를 들어, 문헌 [Feng (1997) Nature Biotechnology 15:866-870] 참조). 상기 바이러스 게놈은 재조합 DNA 기술에 의해 본 발명의 핵산을 포함하도록 변형될 수 있고; 복제 결함이거나 조건적으로 복제하거나 복제 유능하도록 추가로 공학처리될 수 있다. 별도의 측면에서, 벡터는 아데노바이러스 (예를 들어, 인간 아데노바이러스 게놈으로부터 유래된 복제 불능 벡터, 예를 들어, 미국 특허 6,096,718; 6,110,458; 6,113,913; 5,631,236 참조); 아데노-관련 바이러스 및 레트로바이러스 게놈으로부터 유래된다. 레트로바이러스 벡터는 쥐 백혈병 바이러스 (MuLV), 긴팔원숭이 백혈병 바이러스 (GaLV), 원숭이 면역 결핍 바이러스 (SIV), 인간 면역 결핍 바이러스 (HIV), 및 이들의 조합에 기반한 것을 포함할 수 있다 (예를 들어, 미국 특허 6,117,681; 6,107,478; 5,658,775; 5,449,614; 문헌 [Buchscher (1992) J. Virol. 66:2731-2739; Johann (1992) J. Virol. 66:1635-1640] 참조). 예를 들어, 핵산 및 펩티드의 시험관 내 생산에서, 및 생체내 및 생체외 유전자 요법 시술에서 세포를 표적 핵산으로 형질도입시키기 위해 아데노-관련 바이러스 (AAV)-기반 벡터가 사용될 수 있다 (예를 들어, 미국 특허 6,110,456; 5,474,935; 문헌 [Okada (1996) Gene Ther. 3:957-964] 참조).
본 발명은 또한 융합 단백질, 및 그를 코딩하는 핵산에 관한 것이다. 본 발명의 폴리펩티드는 목적하는 특징, 예를 들어 증가된 안정성 또는 단순화된 정제를 부여하는 이종 펩티드 또는 폴리펩티드, 예를 들어 N-말단 확인 펩티드에 융합될 수 있다. 본 발명의 펩티드 및 폴리펩티드는 또한 예를 들어, 보다 면역원성인 펩티드를 생산하기 위해, 재조합 합성된 펩티드를 보다 쉽게 단리하기 위해, 항체 및 항체-발현 B 세포를 확인하고 단리하기 위해 등의 목적으로 그에 연결된 하나 이상의 추가의 도메인을 갖는 융합 단백질로서 합성되고 발현될 수 있다. 검출 및 정제 촉진 도메인은 예를 들어, 금속 킬레이팅 펩티드, 예를 들어 고정된 금속 상의 정제를 허용하는 폴리히스티딘 트랙트 (tract) 및 히스티딘-트립토판 모듈, 고정된 면역글로불린 상의 정제를 허용하는 단백질 A 도메인, 및 FLAGS 연장/친화도 정제 시스템 (이뮤넥스 코퍼레이션 (Immunex Corp, 미국 워싱턴주 시애틀)에서 사용되는 도메인을 포함한다. 정제 도메인과 모티프-포함 펩티드 또는 폴리펩티드 사이에 팩터 Xa 또는 엔테로키나제 (인비트로겐 (Invitrogen, 미국 캘리포니아주 샌 디에고))와 같은 절단가능 링커 서열을 포함시키면 정제를 촉진한다. 예를 들어, 발현 벡터는 티오레독신 및 엔테로키나제 절단 부위 앞의 6개의 히스티딘 잔기에 연결된 에피토프-코딩 핵산 서열을 포함할 수 있다 (예를 들어, 문헌 [Williams (1995) Biochemistry 34:1787-1797; Dobeli (1998) Protein Expr. Purif. 12:404-414] 참조). 히스티딘 잔기는 검출 및 정제를 촉진하는 한편, 엔테로키나제 절단 부위는 나머지 융합 단백질로부터 에피토프를 정제하기 위한 수단을 제공한다. 한 측면에서, 본 발명의 폴리펩티드를 코딩하는 핵산은 번역된 폴리펩티드 또는 그의 단편의 분비를 지시할 수 있는 리더 (leader) 서열을 사용하여 적절한 위상으로 조립된다. 융합 단백질을 코딩하는 벡터에 관한 기술 및 융합 단백질의 적용은 학술 및 특허 문헌에 잘 개시되어 있다 (예를 들어, 문헌 [Kroll (1993) DNA Cell. Biol. 12:441-53] 참조).
본 발명의 핵산 및 폴리펩티드는 예를 들어, 스크리닝 및 진단 방법에서 사용하기 위해 고체 지지체에 결합될 수 있다. 고체 지지체는 예를 들어, 막 (예를 들어, 니트로셀룰로스 또는 나일론), 미세적정 디쉬 (예를 들어, PVC, 폴리프로필렌, 또는 폴리스티렌), 시험관 (유리 또는 플라스틱), 딥스틱 (dip stick) (예를 들어, 유리, PVC, 폴리프로필렌, 폴리스티렌, 라텍스 등), 미세원침관, 또는 유리, 실리카, 플라스틱, 금속 또는 중합체 비드 또는 다른 기재, 예를 들어 종이를 포함할 수 있다. 하나의 고체 지지체는 펩티드 상으로 공학처리된 히스티딘 태그에 특이성을 갖고 결합하는 금속 (예를 들어, 코발트 또는 니켈)-함유 컬럼을 사용한다.
고체 지지체에의 분자의 부착은 직접적 (즉, 분자가 고체 지지체에 접촉한다) 또는 간접적 ("링커"가 지지체에 결합되고, 관심있는 분자가 상기 링커에 결합한다)일 수 있다. 분자는 폴리히스티딘 융합체의 결합을 위해 공유적으로 (예를 들어, 시스테인 잔기의 단일 반응성 티올기를 사용하여 (예를 들어, 문헌 [Colliuod (1993) Bioconjugate Chem. 4:528-536] 참조) 또는 비-공유적이지만 특이적으로 (예를 들어, 고정된 항체를 통해 (예를 들어, 문헌 [Schuhmann (1991) Adv. Mater. 3:388-391; Lu (1995) Anal. Chem. 67:83-87] 참조); 비오틴/스트렙타비딘 시스템 (예를 들어, 문헌 [Iwane (1997) Biophys. Biochem. Res. Comm. 230:76-80] 참조); 금속 킬레이팅, 예를 들어, 랑뮤어-블로젯 (Langmuir-Blodgett) 필름 (예를 들어, 문헌 [Ng (1995) Langmuir 11:4048-55] 참조); 금속-킬레이팅 자가-조립 단층 (예를 들어, 문헌 [Sigal (1996) Anal. Chem. 68:490-497] 참조) 고정될 수 있다.
간접 결합은 상업적으로 입수가능한 다양한 링커를 사용하여 달성할 수 있다. 반응성 단부는 아미노 반응 단부, 예를 들어 N-히드록시숙신이미드 (NHS) 활성 에스테르, 이미도에스테르, 알데히드, 에폭시드, 술포닐 할라이드, 이소시아네이트, 이소티오시아네이트, 및 니트로아릴 할라이드; 및 티올 반응 단부, 예를 들어 피리딜 디술파이드, 말레이미드, 티오프탈이미드, 및 활성 할로겐을 포함하지만 이로 제한되지 않는 임의의 다양한 관능기일 수 있다. 비균질 이중관능성 가교결합 시약은 2개의 상이한 반응성 단부, 예를 들어, 아미노-반응성 단부 및 티올-반응성 단부를 갖는 반면, 균질 이중관능성 시약은 2개의 유사한 반응성 단부, 예를 들어, 술프히드릴-함유 화합물의 가교결합을 허용하는 비스말레이미도헥산 (BMH)을 갖는다. 스페이서는 다양한 길이이고 지방족 또는 방향족일 수 있다. 상업적으로 입수가능한 균질 이중관능성 가교결합 시약의 예는 이미도에스테르, 예를 들어 디메틸 아디프이미데이트 디히드로클로라이드 (DMA); 디메틸 피멜이미데이트 디히드로클로라이드 (DMP); 및 디메틸 수베르이미데이트 디히드로클로라이드 (DMS)를 포함하고 이로 제한되지 않는다. 비균질 이중관능성 시약은 상업적으로 입수가능한 활성 할로겐-NHS 활성 에스테르 커플링제, 예를 들어 N-숙신이미딜 브로모아세테이트 및 N-숙신이미딜(4-요오도아세틸)아미노벤조에이트 (SIAB) 및 술포숙신이미딜 유도체, 예를 들어 술포숙신이미딜(4-요오도아세틸)아미노벤조에이트 (술포-SIAB) (피어스 케미칼스 (Pierce Chemicals, 미국 일리노이주 록필드))를 포함한다. 커플링제의 다른 군은 비균질 이중관능성 및 티올 절단가능제, 예를 들어 N-숙신이미딜 3-(2-피리딜디티오)프로피오네이트 (SPDP) (피어스)이다.
본 발명의 폴리펩티드 및 펩티드를 고체 지지체에 결합시키기 위해 항체가 또한 사용될 수 있다. 이는 펩티드-특이적 항체를 컬럼에 결합시켜 직접 이루어질 수 있거나, 예를 들어, 공지의 에피토프 (예를 들어, 태그 (예를 들어, FLAG, myc) 또는 적절한 면역글로불린 불변 도메인 서열 ("면역어드헤신 (immunoadhesin)", 예를 들어, 문헌 [Capon (1989) Nature 377:525-531 (1989)] 참조)에 연결된 모티프-함유 펩티드를 포함하는 융합 단백질 키메라를 생성시킴으로써 이루어질 수 있다.
본 발명의 핵산 또는 폴리펩티드는 어레이에 고정되거나 적용될 수 있다. 어레이는 본 발명의 핵산 또는 폴리펩티드에 결합하거나 그 활성을 조절하는 능력에 대해 조성물 (예를 들어, 소분자, 항체, 핵산 등)의 라이브러리를 스크리닝하거나 모니터링하기 위해 사용될 수 있다. 예를 들어, 본 발명의 한 측면에서, 모니터링된 파라미터는 본 발명의 핵산을 포함하는 유전자의 전사체 발현이다. 세포의 하나 이상 또는 모든 전사체는 세포의 전사체, 또는 세포의 전사체를 표시하는 또는 상보성인 핵산을 포함하는 샘플의 혼성화에 의해, 어레이 또는 "바이오칩" 상에서 고정된 핵산에의 혼성화에 의해 측정될 수 있다. 마이크로칩 상의 핵산의 "어레이"를 사용함으로써, 일부 또는 모든 세포의 전사체가 동시에 정량될 수 있다. 별법으로, 게놈 핵산을 포함하는 어레이가 또한 본 발명의 방법에 의해 제조된 새로 공학처리된 균주의 유전자형을 결정하기 위해 사용될 수 있다. "폴리펩티드 어레이"가 또한 다수의 단백질을 동시에 정량하기 위해 사용될 수 있다.
본원에서 사용되는 용어 "어레이" 또는 "마이크로어레이" 또는 "바이오칩" 또는 "칩"은 다수의 표적 엘리먼트이고, 상기 각각의 표적 엘리먼트는 기질 표면의 규정된 영역 상으로 고정된 규정된 양의 하나 이상의 폴리펩티드 (항체 포함) 또는 핵산을 포함한다. 본 발명의 방법을 실시하는데 있어서, 임의의 공지된 어레이 및/또는 어레이를 제조하고 사용하는 방법 또는 그의 변법이 전체로 또는 부분적으로 포함될 수 있다 (예를 들어, 미국 특허 6,277,628; 6,277,489; 6,261,776; 6,258,606; 6,054,270; 6,048,695; 6,045,996; 6,022,963; 6,013,440; 5,965,452; 5,959,098; 5,856,174; 5,830,645; 5,770,456; 5,632,957; 5,556,752; 5,143,854; 5,807,522; 5,800,992; 5,744,305; 5,700,637; 5,556,752; 5,434,049; 또한 예를 들어 WO 99/51773; WO 99/09217; WO 97/46313; WO 96/17958 참조; 또한 예를 들어 문헌 [Johnston (1998) Curr. Biol. 8:R171-R174; Schummer (1997) Biotechniques 23:1087-1092; Kern (1997) Biotechniques 23:120-124; Solinas-Toldo (1997) Genes, Chromosomes ＆ Cancer 20:399-407; Bowtell (1999) Nature Genetics Supp. 21:25-32 참조, 또한 미국 특허 출원 공개 20010018642; 20010019827; 20010016322; 20010014449; 20010014448; 20010012537; 20010008765 참조).
숙주 세포 및 형질전환된 세포
본 발명은 또한 본 발명의 핵산 서열, 예를 들어, 본 발명의 폴리펩티드를 코딩하는 서열, 또는 본 발명의 벡터를 포함하는 형질전환된 세포를 제공한다. 숙주 세포는 당업자에게 친숙한 임의의 숙주 세포, 예를 들어 원핵 세포, 진핵 세포, 예를 들어 세균 세포, 진균 세포, 효모 세포, 포유동물 세포, 곤충 세포, 또는 식물 세포일 수 있다. 예시적인 세균 세포는 이. 콜라이 (E. coli), 스트렙토마이세스 (Streptomyces), 바실루스 섭틸리스 (Bacillus subtilis), 살모넬라 티피무륨 (Salmonella typhimurium) 및 슈도모나스 (Pseudomonas), 스트렙토마이세스, 및 스태필로코커스 (Staphylococcus) 속 내의 다양한 종을 포함한다. 예시적인 곤충 세포는 드로소필라 (Drosophila) S2 및 스포돕테라 (Spodoptera) Sf9를 포함한다. 예시적인 동물 세포는 CHO, COS 또는 보웨스 (Bowes) 흑색종 또는 임의의 마우스 또는 인간 세포주를 포함한다. 적절한 숙주의 선택은 당업자의 능력 내에 있다.
벡터는 형질전환, 형질감염, 형질도입, 바이러스 감염, 유전자 건 (gun), 또는 Ti-매개 유전자 전이를 포함하는 임의의 다양한 기술을 이용하여 숙주 세포 내로 도입될 수 있다. 특정 방법은 인산칼슘 형질감염, DEAE-덱스트란 매개 형질감염, 리포펙션 (lipofection), 또는 전기천공을 포함한다.
공학처리된 숙주 세포는 프로모터를 활성화하거나 형질전환체를 선택하거나 본 발명의 유전자를 증폭시키기 위해 적절하게 변형된 통상적인 영양 배지 내에 배양될 수 있다. 적합한 숙주 균주의 형질전환 및 적절한 세포 밀도로의 숙주 균주의 성장 후, 선택된 프로모터는 적절한 수단 (예를 들어, 온도 변위 또는 화학적 유도)에 의해 유도될 수 있고, 세포는 목적하는 폴리펩티드 또는 그의 단편을 생산하도록 허용하기 위해 추가의 기간 동안 배양될 수 있다.
세포는 원심분리에 의해 수확되고, 물리적 또는 화학적 수단에 의해 파괴될 수 있고, 생성되는 조질 추출물은 추가의 정제를 위해 보유된다. 단백질의 발현을 위해 사용된 미생물 세포는 동결-해동 사이클링, 초음파분해, 기계적 파괴, 또는 세포 용해제의 사용을 포함하는 임의의 간편한 방법에 의해 파괴될 수 있다. 상기 방법은 당업자에게 잘 공지되어 있다. 발현된 폴리펩티드 또는 단편은 재조합 세포 배양물로부터 황산암모늄 또는 에탄올 침강, 산 추출, 음이온 또는 양이온 교환 크로마토그래피, 포스포셀룰로스 크로마토그래피, 소수성 상호작용 크로마토그래피, 친화도 크로마토그래피, 수산화인회석 크로마토그래피 및 렉틴 크로마토그래피를 포함하는 방법에 의해 회수되고 정제될 수 있다. 폴리펩티드의 형상을 완성하는데 있어서 필요한 경우 단백질 재접기 단계가 사용될 수 있다. 원하는 경우, 고성능 액체 크로마토그래피 (HPLC)가 최종 정제 단계에 사용될 수 있다.
재조합 단백질을 발현하기 위해 다양한 포유동물 세포 배양계가 또한 사용될 수 있다. 포유동물 발현계의 예는 원숭이 신장 섬유모세포의 COS-7주 및 적합성 벡터로부터 단백질을 발현할 수 있는 다른 세포주, 예를 들어 C127, 3T3, CHO, HeLa 및 BHK 세포주를 포함한다.
숙주 세포 내의 구성체는 재조합 서열에 의해 코딩된 유전자 산물을 생산하기 위해 통상적인 방식으로 사용될 수 있다. 재조합 생산 절차에 사용된 숙주에 따라, 벡터를 포함하는 숙주 세포에 의해 생산된 폴리펩티드는 글리코실화될 수 있거나 비-글리코실화될 수 있다. 본 발명의 폴리펩티드는 초기 메티오닌 아미노산 잔기를 포함할 수 있거나 포함하지 않을 수 있다.
본 발명의 폴리펩티드를 생산하기 위해 무세포 번역 시스템이 또한 사용될 수 있다. 무세포 번역 시스템은 폴리펩티드 또는 그의 단편을 코딩하는 핵산에 작동적으로 연결된 프로모터를 포함하는 DNA 구성체로부터의 전사된 mRNA를 사용할 수 있다. 일부 측면에서, DNA 구성체는 시험관 내 전사 반응을 수행하기 전에 선형화될 수 있다. 이어서, 목적하는 폴리펩티드 또는 그의 단편을 생산하기 위해 전사된 mRNA를 적절한 무세포 번역 추출물, 예를 들어 토끼 망상적혈구 추출물과 함께 인큐베이팅한다.
발현 벡터는 형질전환된 숙주 세포의 선택을 위한 표현형 속성, 예를 들어 진핵 세포 배양에 대해 디히드로폴레이트 리덕타제 또는 네오마이신 내성, 또는 예를 들어 이. 콜라이에서 테트라사이클린 또는 암피실린 내성을 제공하도록 하나 이상의 선택가능 마커 유전자를 포함할 수 있다.
포유동물 세포 내의 일시적 발현을 위해, 관심있는 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA가 포유동물 발현 벡터, 예를 들어, pcDNA1 (인비트로겐 코퍼레이션으로부터 상업적으로 입수가능함 (카탈로그 번호 V490-20)) 내로 포함될 수 있다. 이는 진핵계에서 cDNA 발현 및 원핵세포에서 cDNA 분석을 위해 설계된 다관능성 4.2 kb 플라스미드 벡터이다. 벡터 상에 CMV 프로모터 및 인핸서, 스플라이스 세그먼트 및 폴리아데닐화 시그널, SV40 및 폴리오마 바이러스 복제 기원, 및 서열결정 및 돌연변이유발을 위한 단일 가닥 DNA를 구조하기 위해 M13 기원, 센스 및 안티-센스 RNA 전사체의 생산을 위한 Sp6 및 T7 RNA 프로모터, 및 Col E1-유사 고복제 플라스미드 기원이 포함된다. 폴리링커가 CMV 프로모터 (및 T7 프로모터의 3')의 하류에 적절하게 위치한다.
cDNA 삽입체는 pcDNAI 폴리링커 내에 적절한 제한 부위에 포함된 상기 파지미드로부터 먼저 방출될 수 있다. pcDNAI에서 적절한 삽입체 배향을 확인하기 위해 접합부를 가로질러 서열결정을 수행할 수 있다. 이어서, 생성되는 플라스미드를 일시적 발현을 위해 선택된 포유동물 세포 숙주, 예를 들어, COS-1 연결의 원숭이-유래 섬유모세포 유사 세포 (아메리칸 타입 컬쳐 컬렉션 (American Type Culture Collection, 미국 메릴랜드주 록빌))로부터 ATCC CRL 1650로서 입수가능함) 내로 도입시킬 수 있다.
단백질-코딩 DNA의 일시적 발현을 위해, 예를 들어, COS-1 세포를 문헌 [Sambrook et al, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 1989, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor N.Y, pp. 16.30-16.37]에 기재된 절차에 따라 DEAE-매개 DNA 형질감염에 의해 약 8 ㎍ DNA/106 COS 세포로 형질감염시키고 클로로퀸으로 처리할 수 있다. 예시적인 방법은 다음과 같다. 간단히 설명하면, COS-1 세포를 5 x 106 세포/디쉬의 밀도로 플레이팅한 후, 24시간 동안 FBS-보충 DMEM/F12 배지 내에서 성장시킨다. 이어서, 배지를 제거하고, 세포를 PBS 내에, 이어서 배지 내에 세척한다. 이어서, DMEM/F12 배지 중에 DEAE 덱스트란 (0.4 mg/ml), 100 μM 클로로퀸, 10％ NuSerum, DNA (0.4 mg/ml)을 함유하는 형질감염 용액을 세포 상에 10 ml 부피로 적용한다. 3시간 동안 37℃에서 인큐베이팅한 후, 세포를 방금 설명한 바와 같이 PBS 및 배지 내에서 세척한 후, 1분 동안 DMEM/F12 배지 중 10％ DMSO로 충격을 준다. 세포를 2-3일 동안 10％ FBS-보충 배지에서 성장시키고, 인큐베이션의 끝에 디쉬를 얼음 상에 놓고, 빙냉 PBS로 세척한 후 스크래핑 (scraping)에 의해 제거한다. 이어서, 세포를 1000 rpm에서 10분 동안 원심분리하여 수확하고, 세포 펠렛을 단백질 발현에서 후속 사용을 위해 액체 질소 내에서 동결시켰다. 저장 중의 세포 내에서 수용체-코딩 cDNA의 발현을 확인하기 위해 동결된 세포의 해동 분취액의 노던 블롯 분석이 사용될 수 있다.
유사한 방식으로, 안정하게 형질감염된 세포주는 또한 예를 들어, 숙주로서 2가지 상이한 세포 종류: CHO K1 및 CHO Pro5를 사용하여 제조할 수 있다. 상기 세포주를 제작하기 위해, 관련 단백질을 코딩하는 cDNA를 안정한 발현을 가능하게 하는 포유동물 발현 벡터 pRC/CMV (인비트로겐) 내에 포함시킬 수 있다. 상기 부위에서의 삽입은 cDNA를 시토메갈로바이러스 프로모터의 발현 제어 하에 및 폴리아데닐화 부위의 상류 및 소 성장 호르몬 유전자의 종료자, 및 선택가능 마커로서 네오마이신 내성 유전자 (SV40 조기 프로모터에 의해 구동된)를 포함하는 벡터 배경 내로 놓는다.
상기 설명된 바와 같이 제작된 플라스미드를 도입하기 위한 예시적인 프로토콜은 다음과 같다. 숙주 CHO 세포를 먼저 5x105의 밀도로 10％ FBS-보충 MEM 배지에 접종한다. 24시간 동안 성장시킨 후, 신선한 배지를 플레이트에 첨가하고, 3시간 후 세포를 인산칼슘-DNA 동시-침전 절차를 이용하여 형질감염시킨다 (Sambrook et al, 상기 문헌). 간단히 설명하면, 3 ㎍의 DNA를 실온에서 10분 동안 완충된 칼슘 용액과 혼합하고 인큐베이팅한다. 동일 부피의 완충 인산염 용액을 첨가하고, 현탁액을 실온에서 15분 동안 인큐베이팅한다. 이어서, 인큐베이팅된 현탁액을 세포에 4시간 동안 적용하고, 제거하고, 세포에 15％ 글리세롤을 함유하는 배지로 충격을 주었다. 3분 후, 세포를 배지로 세척하고 24시간 동안 정상 성장 조건에서 인큐베이팅한다. 네오마이신에 내성인 세포를 G418 (1 mg/ml)를 함유하는 10％ FBS-보충 알파-MEM 배지 내에서 선택한다. G418-내성 세포의 개별 콜로니를 약 2-3주 후 단리하고, 클론을 선택한 후 분석 목적을 위해 증식시킨다.
본 발명을 예시하는 많은 실시예를 아래에 설명한다. 대부분의 경우에, 대체 기술을 사용할 수도 있다. 실시예는 본 발명을 예시하고자 한 것으로서, 본 발명의 범위를 제한하거나 한정하는 것이 아니다. 반대로 구체적으로 설명되지 않으면, 실시예 섹션에서 화합물 번호 앞에 "P-" (예를 들어, "P-0001")가 존재하지 않는 경우에, 화합물 명명 및/또는 목록은 본원의 다른 섹션에서 사용된 명명 및/또는 목록에 관련되지 않는다. 유사하게, 실시예에 사용된 구조체 및 치환체의 명명 및 목록은 달리 분명하게 표시되지 않으면 본원의 상기 섹션에서 사용된 구조체 및 치환체의 명명 및 목록과 무관하다.
실시예 1: X 1 , X 2 , Y 1 및 Y 2 가 CH 이고 L 1 이 - CH 2 -인 화학식 I의 화합물의 합성:
X1, X2, Y1 및 Y2가 CH이고 L1이 -CH2- 또는 -CO-인 화학식 I의 화합물은 다음 반응식 1 내지 3에 따라 7-아자인돌로부터 합성할 수 있고, 여기서 R24는 Ar1에 대응하고, 이는 R24가 화학식 I에 대해 설명된 바와 같이 Ar1-L2-R1인 화합물을 제공하기 위해 추가로 치환될 수 있다.
반응식 - 1
Figure 112007090494669-PCT00018
단계 1 - 화합물 2의 합성.
화합물 2는 상업적으로 입수가능한 7-아자인돌로부터 문헌 (Robinson, J. Am. Chem. Soc, 1955, 77, p. 457)의 절차에 따라 합성된다.
단계 2 - 화학식 II 의 화합물의 합성
화학식 II의 화합물은 테트라히드로푸란 또는 에테르와 같은 비양성자성 용매 중에서 염기 (예를 들어, BuLi, NaH)를 사용한 탈양성자화 및 음이온과 실릴 클로라이드 (예를 들어, TIPS) 또는 안히드라이드 (예를 들어, Boc 안히드라이드)의 반응에 의해 합성된다. 화합물은 표준 과정 (빙냉 염수를 사용한 켄칭, 마무리 처 리, 및 플래시 실리카 겔 크로마토그래피에 의한 정제)에 따라 단리된다.
단계 3 및 4 - 화학식 1의 화합물의 합성
R24가 화학식 I에 규정된 Ar1인 화학식 I의 화합물은 실온에서 톨루엔 중에서 화학식 II의 화합물과 이소프로필 클로로포르메이트 (또는 에틸 클로로포르메이트)의 반응을 통해 3-클로로메틸 중간체를 생성시켜 합성된다. 상기 중간체를 -78℃로 냉각시키고, 그리냐드 (Grignard) 시약 (또는 유기리튬 시약)과 시안화구리 및 LiCl의 용액 사이의 반응으로부터 생성된 유기구리 시약과 즉시 반응시킨다. 혼합물을 -78℃에서 1시간 동안 교반하고, 실온으로 가온시킨다. 반응물을 4:1의 염화암모늄:수산화암모늄 용액으로 켄칭시킨다. 반응물을 통상적인 방법으로 켄칭시키고, 플래시 실리카 겔 크로마토그래피에 의해 정제하여 질소-보호된 화합물을 수득한다. 최종 화합물은 실온에서 표준 조건 (TFA 또는 NH4F)을 사용하여 보호기 (Boc, TIPS)의 탈보호를 통해 확인할 수 있다.
반응식 - 2
Figure 112007090494669-PCT00019
단계 1 - 화합물 3의 합성
화합물 3은 물 중에서 상업적으로 입수가능한 7-아자인돌인 화합물 1을 헥사메틸테트라민 및 아세트산과 2시간 동안 환류로 가열하면서 반응시켜 합성된다. 냉각시킨 후, 요구되는 화합물을 침전시키고 여과에 의해 수거한다.
단계 2 - 화학식 III 의 화합물의 합성
P가 보호기인 화학식 III의 화합물은 화합물 3을 보호기를 도입하기 위한 적절한 시약 (예를 들어, t-부틸옥시카르보닐 디안히드라이드) 및 염기 (예를 들어, 수소화나트륨)와 적절한 용매 (예를 들어, 테트라히드로푸란) 중에서 일반적으로 실온에서 12-18시간 동안 반응시켜 합성한다. 화합물은 통상적인 수단 (예를 들어, 추출)에 의해 단리할 수 있다.
단계 3 - 화학식 IV 의 화합물의 합성
R24가 Ar1인 화학식 IV의 화합물은 적절한 용매 (예를 들어, 1,2-디메톡시에탄) 중의 화학식 III의 화합물을 적절한 용매 (예를 들어, 테트라히드로푸란) 중의 화학식 R24MgCl 또는 R24MgBr (예를 들어, 피리디닐 브롬화마그네슘)의 그리냐드 시약 또는 동등한 친핵체와 일반적으로 -10℃로 냉각된 불활성 분위기 하에서 반응시켜 합성한다. 반응물은 일반적으로 실온으로 가온하고, 12-18시간 동안 교반한다. 요구되는 화합물을 역상 고압 액체 크로마토그래피에 의해 정제한다.
단계 4 및 5 - 화학식 I의 화합물의 중간체의 합성
화학식 I의 화합물의 중간체는 화학식 IV의 화합물을 극성 용매 (예를 들어, 에탄올) 중에서 환원제 (예를 들어, 수소화붕소나트륨)와 일반적으로 1-4시간 동안 80℃로 가열하면서 반응시켜 합성한다. 반응물은 메탄올을 첨가하여 켄칭시키고, 역상 고성능 액체 크로마토그래피에 의해 농축 및 정제한다. R24가 Ar1인 화학식 I의 화합물은 상기 중간체를 보호기 P 제거에 적절한 시약 (예를 들어 염산)과 비극성 용매 (예를 들어, 디옥산) 중에서 반응시켜 합성한다. 최종 화합물은 표준 과정 (예를 들어, 역상 예비 고압 액체 크로마토그래피)에 의해 단리한다.
반응식 - 3
Figure 112007090494669-PCT00020
단계 1 - 화학식 I' 의 화합물의 합성
R24가 Ar1인 화학식 I'의 화합물은 화합물 1을 비-반응성 용매 (예를 들어, 디클로로메탄) 중에서 불활성 분위기 (예를 들어, 아르곤) 하에 실온에서 또는 18-24시간 동안 환류로 가열하면서 활성화제 (예를 들어, 메틸 브롬화마그네슘 및 이염화아연 또는 무수 염화알루미늄) 및 헤테로아릴 산 클로라이드 (예를 들어, 니코틴산 클로라이드)와 반응시켜 합성한다. 화합물은 표준 과정 (예를 들어, 추출 및 실리카겔 크로마토그래피)에 의해 단리한다.
실시예 2: 중간체 3-(6- 클로로 -피리딘-3- 일메틸 )-1- 트리이소프로필실라닐 -1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 (6) 및 (3-(6- 브로모 -피리딘-3- 일메틸 )-1- 트리이소프로필실라닐 -1H-피롤로[2,3-b]피리딘) (6a)의 합성
X1, X2, Y1 및 Y2가 CH이고, n은 1이고, P, Q 및 T가 CH이고, L1이 -CH2-인 화학식 I의 화합물에 대한 중간체인 화합물 6은 다음 반응식 4에 따라 7-아자인돌로부터 4개의 단계로 합성될 수 있다.
반응식 - 4
Figure 112007090494669-PCT00021
단계 1 - 디메틸-(1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3- 일메틸 )-아민 (2)의 합성
3구 둥근바닥 플라스크에 이소프로필 알콜 (320.0 mL), 이어서 1H-피롤로[2,3-b]피리딘 1 (7.10 g, 60.1 mmol), 디메틸아민 히드로클로라이드 (5.4 g, 0.066 mol), 및 포름알데히드 (2.0 g, 0.066 mol)을 첨가하였다. 반응 혼합물을 실온에서 12시간 동안 교반한 후, 30분 동안 환류시켰다. 현탁액을 진공 하에 증발 건조시켰다. 잔사에 물 (60.0 mL, 3.33 mol) 및 진한 염산 (6.0 mL, 0.20 mol)을 첨가하였다. 수층을 에테르로 추출하고, 수성층을 탄산칼륨으로 중화시켰다. 수성층을 디클로로메탄으로 추출하고, 황산나트륨으로 건조시키고, 농축하여 화합물을 수득한 후, 이를 추가로 에테르로 세척하고 건조시켜 화합물 2 (7.1 g, 수율 = 67.4％)를 백색 고체로서 수득하였다.
단계 2 - 디메틸-(1- 트리이소프로필실라닐 -1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3- 일메틸 )-아민 (4)의 합성
환저 플라스크에 7-아자그라민 2 (5.38 g, 30.7 mmol), N,N-디메틸포름아미드 (25.0 mL), 및 수소화나트륨 (1.35 g, 33.8 mol)을 합하였다. 반응물 내에 트리이소프로필실릴 클로라이드 (6.8 mL, 0.032 mol)를 첨가하였다. 반응물을 20℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 물에 붓고, 에틸 아세테이트로 추출하였다. 유기층을 염수로 세척하고, 황산나트륨으로 건조시켜 농축하고, 바이오타지 (biotage)로 정제하여 화합물 4 (6.0 g, 수율 = 58.8％)를 무색 오일로서 수득하였다.
단계 3 - 3- 클로로메틸 -1- 트리이소프로필실라닐 -1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 (5)의 합성
환저 플라스크에 화합물 4 (500.0 mg, 1.51 mmol) 및 톨루엔 (5.0 mL, 0.047 mol)을 질소 분위기 하에서 첨가하였다. 반응 혼합물에 톨루엔 (1.6 mL) 중의 1.0 M 이소프로필 클로로포르메이트를 실온에서 서서히 첨가하였다. 반응 혼합물을 추가로 2시간 동안 교반하여 요구되는 화합물 5를 수득하고, 정제하지 않은 채로 다음 단계에 사용하였다.
단계 4 - 3-(6- 클로로 -피리딘-3- 일메틸 )-1- 트리이소프로필실라닐 -1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 (6)의 합성
환저 플라스크에 5-요오도-2-클로로-피리딘 (315.0 mg, 1.32 mmol) 및 테트라히드로푸란 (12.0 mL, 0.15 mol)을 -40℃에서 질소 분위기 하에서 첨가하였다. 반응물에 테트라히드로푸란 중의 2.0 M의 이소프로필마그네슘 클로라이드 (0.72 mL, 1.44 mmol)를 첨가하였다. 반응 혼합물을 40분 동안 -40℃에서 교반하였다. TLC (헥산/에틸 아세테이트 2:1)는 출발 물질이 존재하지 않음을 보여주었다. 반응 혼합물에 테트라히드로푸란 중의 0.6 M의 CuCN.2LiCl (2.4 mL, 1.44 mmol)을 첨가하였다. 반응 혼합물을 5분 동안 실온으로 가온하고, 트리메틸 포스파이트 (0.29 mL, 2.4 mmol)를 첨가하였다. 10분 후, 상기 용액을 화합물 5 (315.0 mg) 및 톨루엔 (8.0 mL)을 포함하는 환저 플라스크에 첨가하였다. 반응물을 20℃에서 40시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 물에 붓고, 화합물을 에틸 아세테이트로 추출하였다. 유기층을 염수로 세척하고, 황산나트륨으로 건조시켜 농축하고, 바이오타지 (디클로로메탄/메탄올 1:10)로 정제하여 화합물 6 (230 mg, 수율 = 59.0％)을 백색 고체로서 수득하였다. 화합물 6a (3-(6-브로모-피리딘-3-일메틸)-1-트리이소프로필실라닐-1H-피롤로[2,3-b]피리딘) (MS (ESI) [M+H+]+ = 288.1, 290.1)는 화합물 6의 합성과 동일한 반응 조건 및 마무리 처리 과정을 사용하여 단계 4에서 5-요오도-2-클로로-피리딘을 5-요오도-2-브로모-피리딘으로 치환하여 제조하였다.
실시예 3: 중간체 (6- 클로로 -피리딘-3-일)-(1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3-일)- 메타논 (7)의 합성
X1, X2, Y1 및 Y2는 CH이고, n은 1이고, P, Q 및 T는 CH이고, L1은 -CO-인 화학식 I의 화합물의 중간체인 화합물 7은 다음 반응식 5에 따라 7-아자인돌로부터 1단계로 합성할 수 있다.
반응식 - 5
Figure 112007090494669-PCT00022
환저 플라스크에 삼염화알루미늄 (16.0 g, 0.12 mol) 및 디클로로메탄 (100.0 mL)을 질소 분위기 하에서 첨가하였다. 반응 혼합물에 디클로로메탄 (20.0 mL) 중의 1H-피롤로[2,3-b]피리딘 1 (3.2 g, 0.027 mol)을 첨가하였다. 반응물을 실온에서 70.0분 동안 교반하고, 디클로로메탄 (10.0 mL) 중의 6-클로로피리딘-3-카르보닐 클로라이드 8 (5.4 g, 0.031 mol)을 첨가하였다. 반응 혼합물을 실온에서 3시간 동안 교반하였다. 메탄올 (10 mL)을 반응 혼합물에 첨가하고, 용매를 진공 하에 증발시켰다. 잔사를 물에 붓고, 침전 화합물을 여과에 의해 제거하였다. 수성층을 에틸 아세테이트로 추출하고, 유기층을 건조 및 농축시키고 여과에 의해 단리된 고체와 합하여 화합물 7 (6.2 g, 수율 = 88.6％)을 백색 고체로서 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 258.
실시예 4: 벤질-[5-(1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3- 일메틸 )-피리딘-2-일]-아민 (P-0001)의 합성
벤질-[5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-아민 (P-0001)은 반응식 6에 따라 3-(6-클로로-피리딘-3-일메틸)-1-트리이소프로필실라닐-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 (6)으로부터 2 단계로 제조하였다.
반응식 6
Figure 112007090494669-PCT00023
단계 1 - 벤질-[5-(1- 트리이소프로필실라닐 -1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3- 일메틸 )-피리딘-2-일]-아민 (10)의 합성:
환저 플라스크에 3-(6-클로로-피리딘-3-일메틸)-1-트리이소프로필실라닐-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 6 (160.0 mg, 0.40 mmol, 실시예 2에 기재된 바와 같이 제조), 벤질아민 (32, 0.1 mL, 0.90 mmol), 팔라듐 아세테이트 (17.0 mg, 0.076 mmol), 톨루엔 (10.0 mL), 칼륨 t-부톡시드 (80.0 mg, 0.71 mmol) 및 2-(디-t-부틸포스피노)비페닐 (31.4 mg, 0.11 mmol)을 질소 분위기 하에 첨가하였다. 반응물을 3시간 동안 환류 하에 교반하였다. TLC 및 MS는 출발 물질이 존재하지 않음을 나타내었다. 반응 혼합물을 물에 붓고, 에틸 아세테이트로 추출하였다. 유기층을 염수로 세척하고, 황산나트륨으로 건조시키고, 농축하고, 바이오타지 (디클로로메탄/메탄올 1:20)로 정제하여 화합물 10 (110 mg, 수율 = 58.5％)을 백색 고체로서 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 471.
단계 2 - 벤질-[5-(1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3- 일메틸 )-피리딘-2-일]-아민 (P-0001)의 합성:
환저 플라스크에 벤질-[5-(1-트리이소프로필실라닐-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-아민 10 (400.0 mg, 0.85 mmol), 테트라히드로푸란 (20.0 mL) 및 테트라-n-부틸암모늄 플루오라이드 (240 mg, 0.93 mmol)을 첨가하였다. 반응 혼합물을 20℃에서 30분 동안 교반하였다. TLC는 출발 물질이 존재하지 않음을 보여주었다. 반응 혼합물을 물에 붓고, 에틸 아세테이트로 추출하였다. 유기층을 염수로 세척하고, 황산나트륨으로 건조시키고, 농축하고, 바이오타지 (디클로로메탄/메탄올 1:10)로 정제하여 화합물 P-0001 (220 mg, 수율 = 82.4％)을 백색 고체로서 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 315.
단계 1에서 벤질 아민을 적합한 아민으로 치환하고 단계 1에서 3-(6-클로로-피리딘-3-일메틸)-1-트리이소프로필실라닐-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 6 또는 3-(6-브로모-피리딘-3-일메틸)-1-트리이소프로필실라닐-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 6a를 사용하여 추가의 화합물을 반응식 6의 프로토콜에 따라 제조하였다. 하기 화합물을 상기 과정에 따라 제조하였다:
디메틸-[5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-아민 (P-0021),
(4-메톡시-벤질)-[5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-아민 (P-0004),
(4-클로로-벤질)-[5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-아민 (P-0005),
(4-플루오로-벤질)-[5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-아민 (P-0006),
(4-메틸-벤질)-[5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-아민 (P-0007), 및
[5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-티오펜-2-일메틸-아민 (P-0008).
하기 표는 벤질 아민 대신에 단계 1에 사용된 아민을 컬럼 2에 나타내고, 3-(6-클로로-피리딘-3-일메틸)-1-트리이소프로필실라닐-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 또는 3-(6-브로모-피리딘-3-일메틸)-1-트리이소프로필실라닐-1H-피롤로[2,3-b]피리딘이 단계 1에 사용되었는지를 컬럼 3에 (각각 Cl 또는 Br), 화합물 구조를 컬럼 4에, 실험적 질량 분광 결과를 컬럼 5에, 화합물 번호를 컬럼 1에 나타내었다.
Figure 112007090494669-PCT00024
실시예 5: (6- 벤질아미노 -피리딘-3-일)-(1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3-일)- 메타논 (P-0002)의 합성
(6-벤질아미노-피리딘-3-일)-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메타논 (P-0002)을 반응식 7에 따라 (6-클로로-피리딘-3-일)-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메타논 (7)로부터 하나의 단계로 제조하였다.
반응식 - 7
Figure 112007090494669-PCT00025
압력관에 (6-클로로-피리딘-3-일)-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메타논 7 (270.0 mg, 1.05 mmol, 실시예 3에 기재된 바와 같이 제조), 및 벤질아민 (32, 0.7 mL, 0.006 mol) 및 테트라히드로푸란 (25.0 mL)을 질소 분위기 하에 첨가하였다. 반응 혼합물을 185℃로 60시간 동안 가열하였다. 반응 혼합물을 농축하여 대부분의 용매를 제거하고, 잔사를 물에 붓고, 에틸 아세테이트로 추출하였다. 유기층을 황산나트륨으로 건조시키고, 농축하고, 바이오타지 (디클로로메탄/메탄올 1:20)로 정제하여 화합물 P-0002 (30 mg, 수율 = 8.7％)를 백색 고체로서 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 329.
벤질아민을 적합한 아민으로 대체하여 반응식 7의 프로토콜에 따라 추가의 화합물을 제조하였다. 하기 화합물을 상기 과정에 따라 제조하였다:
[6-(4-플루오로-벤질아미노)-피리딘-3-일]-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메타논 (P-0015),
[6-(3-플루오로-벤질아미노)-피리딘-3-일]-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메타논 (P-0016),
(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-[6-(4-트리플루오로메틸-벤질아미노)-피리딘-3-일]-메타논 (P-0017),
(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-{6-[(티오펜-2-일메틸)-아미노]-피리딘-3-일}-메타논 (P-0018),
(6-페닐아미노-피리딘-3-일)-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메타논 (P-0023),
(6-이소프로필아미노-피리딘-3-일)-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메타논 (P-0024),
(6-이소부틸아미노-피리딘-3-일)-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메타논 (P-0025),
[6-(3-벤질옥시-페닐아미노)-피리딘-3-일]-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메타논 (P-0026),
[6-(시클로프로필메틸-아미노)-피리딘-3-일]-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메타논 (P-0030),
[6-(시클로헥실메틸-아미노)-피리딘-3-일]-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메타논 (P-0031),
하기 표는 컬럼 3의 구조식으로 제시된 상기 화합물을 제공하기 위해 벤질아민 대신에 치환된 아민을 컬럼 2에 나타낸다. 컬럼 1은 화합물 번호를, 컬럼 4는 실험적 질량 분광 결과를 제시한다.
Figure 112007090494669-PCT00026
실시예 6: 이소부틸-[5-(1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3- 일메틸 )-피리딘-2-일]-아민 P-0028의 합성
화합물 P-0028은 반응식 8에 제시된 바와 같이 (6-이소부틸아미노-피리딘-3-일)-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메타논 P-0025로부터 1 단계로 합성하였다.
반응식 8
Figure 112007090494669-PCT00027
단계 1 - 이소부틸-[5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-아민 (P-0028)의 합성.
1,2-에탄디올 (5.0 mL) 중의 (6-이소부틸아미노-피리딘-3-일)-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메타논 (P-0025, 60.0 mg, 0.20 mmol, 실시예 5에 기재된 바와 같이 제조)에 히드라진 (1.0 mL, 0.032 mol) 및 수산화칼륨 (200.0 mg, 3.56 mmol)에 첨가하였다. 반응 혼합물을 180℃로 철야 가열하였다. 반응 혼합물을 물에 붓고, 에틸 아세테이트로 추출하였다. 유기층을 염수로 세척하고, 황산나트륨으로 건조시키고, 농축하고, 디클로로메탄 중에서 10％ 메탄올로 추출하는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하여 화합물 (P-0028, 10 mg, 16.7％)을 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+= 281.
시클로프로필메틸-[5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-아민 (P-0032)
Figure 112007090494669-PCT00028
은 (6-이소부틸아미노-피리딘-3-일)-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메타논 P-0025를 [6-(시클로프로필메틸-아미노)-피리딘-3-일]-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메타논 P-0030 (실시예 5에 기재된 바와 같이 제조)으로 치환하여 반응식 8의 프로토콜에 따라 제조하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 279.
시클로헥실메틸-[5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-아민 (P-0033)
Figure 112007090494669-PCT00029
은 (6-이소부틸아미노-피리딘-3-일)-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메타논 P-0025를 [6-(시클로헥실메틸-아미노)-피리딘-3-일]-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메타논 P-0031 (실시예 5에 기재된 바와 같이 제조)로 치환하여 반응식 8의 프로토콜에 따라 제조하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 321.
실시예 7: 3-(6-이소프로필-피리딘-3- 일메틸 )-1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 P-0019
3-(6-이소프로필-피리딘-3-일메틸)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 P-0019은 반응식 9에 제시된 바와 같이 3-(6-클로로-피리딘-3-일메틸)-1-트리이소프로필실라닐-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 6으로부터 2 단계로 합성하였다.
반응식 9
Figure 112007090494669-PCT00030
단계 1 - 3-(6-이소프로필-피리딘-3- 일메틸 )-1- 트리이소프로필실라닐 -1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 (39)의 합성
테트라히드로푸란 (4.0 mL) 중의 3-(6-클로로-피리딘-3-일메틸)-1-트리이소프로필실라닐-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 (6, 54.0 mg, 0.000135 mol, 실시예 2에 기재된 바와 같이 제조)에 [1,1'-비스(디페닐포스피노)페로센]-디클로로팔라듐(II) (23.0 mg) 및 이소프로필마그네슘 클로라이드 (0.15 mL, 테트라히드로푸란 중의 2.0 M)를 첨가하였다. 반응물을 20℃에서 질소 분위기 하에 3시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 물에 붓고 에틸 아세테이트로 추출하였다. 유기층을 염수로 세척하고, 황산나트륨으로 건조시키고, 농축하고, 디클로로메탄 중의 10％ 메탄올로 용출하는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피로 정제하여 화합물 39 (38 mg, 70.4％)를 수득하였다.
단계 2 - 3-(6-이소프로필-피리딘-3- 일메틸 )-1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 (P-0019)의 합성
테트라히드로푸란 (3.0 mL) 중의 3-(6-이소프로필-피리딘-3-일메틸)-1-트리이소프로필실라닐-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 (39, 35.0 mg, 0.086 mmol)에 테트라-n-부틸암모늄 플루오라이드 (29 mg, 0.11 mmol)를 첨가하였다. 반응물을 20℃에서 30분 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 물에 붓고 에틸 아세테이트로 추출하였다. 유기층을 염수로 세척하고, 황산나트륨으로 건조시키고, 농축하고, 디클로로메탄 중의 10％ 메탄올로 용출하는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피로 정제하여 화합물 (P-0019, 18.0 mg, 81.9％)을 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 252.
실시예 8: [5-(1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3- 일메틸 )-피리딘-2-일]-(4- 트리플루오로메틸 -벤질)-아민 (P-0003)의 합성
[5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-(4-트리플루오로메틸-벤질)-아민 (P-0003)은 반응식 10에 따라 (6-클로로-피리딘-3-일)-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메타논 (7)으로부터 3 단계로 제조하였다.
반응식 10
Figure 112007090494669-PCT00031
단계 1 - (1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3-일)-[6-(4- 트리플루오로메틸 - 벤질아미노 )-피리딘-3-일]- 메타논 (P-0017)의 합성
압력 플라스크에 (6-클로로-피리딘-3-일)-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메타논 7 (3.5 g, 0.014 mol, 실시예 3에 기재된 바와 같이 제조), 4-(트리플루오로메틸)벤질아민 (30, 9.0 g, 0.051 mol), 테트라히드로푸란 (30.0 mL, 0.37 mol), 팔라듐 아세테이트 (200.0 mg, 0.890 mmol) 및 2-(디-t-부틸포스피노)비페닐 (200.0 mg, 0.67 mmol)을 첨가하였다. 반응 혼합물을 180℃에서 철야 교반하고, 물에 붓고 에틸 아세테이트로 추출하였다. 유기층을 염수로 세척하고, 황산나트륨으로 건조시키고 농축하였다. 잔사에 아세트산 (15.0 mL) 및 H2O (5.0 mL)를 첨가하였다. 반응 혼합물을 100℃에서 5시간 동안 교반하고, 농축하여 아세트산을 제거하였다. 이어서, 잔사를 수성 Na2HCO3로 처리하고, 에틸 아세테이트로 추출하였다. 유기층을 세척하고, 건조시키고, 농축하고 정제하여 화합물 P-0017 (1.0 g, 수율 = 18.5％)을 담황색 고체로서 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 397.
단계 2 - (1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3-일)-[6-(4- 트리플루오로메틸 - 벤질아미노 )-피리딘-3-일]-메탄올 (14)의 합성
환저 플라스크에 N,N-디메틸포름아미드 (5.0 mL) 및 에탄올 (20.0 mL)에 용해된 (1H-피롤로[2,3-b]피리딘~3-일)-[6-(4-트리플루오로메틸-벤질아미노)-피리딘-3-일]-메타논 P-0017 (210.0 mg, 0.53 mmol) 및 나트륨 테트라히드로보레이트 (80.0 mg, 2.11 mmol)를 첨가하였다. 반응물을 실온에서 철야 교반하고, 물에 붓고 에틸 아세테이트로 추출하였다. 유기층을 염수로 세척하고, 황산나트륨으로 건조시키고, 농축하고, 바이오타지 (디클로로메탄/메탄올 1:20)로 정제하여 화합물 14 (63 mg, 수율 = 30％)를 백색 고체로서 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+= 399.
단계 3 - [5-(1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3- 일메틸 )-피리딘-2-일]-(4- 트리플루오로메 틸 -벤질)-아민 (P-0003)의 합성
환저 플라스크에 (1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-[6-(4-트리플루오로메틸-벤질아미노)-피리딘-3-일]-메탄올 14 (200.0 mg, 0.50 mmol), 트리플루오로아세트산 (5.0 mL, 0.065 mol) 및 트리에틸실란 (3.0 mL, 0.019 mol)을 첨가하였다. 반응물을 실온에서 30분 동안 교반하고, 수성 중탄산나트륨에 붓고, 에틸 아세테이트로 추출하였다. 유기층을 염수로 세척하고, 황산나트륨으로 건조시키고, 농축하고, 정제하여 순수한 화합물 P-0003 (120.0 mg, 수율 = 62.8％)을 백색 고체로서 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+= 383.
실시예 9. n은 1이고, P, Q 및 T는 CH 이고, X 1 , X 2 및 Y 2 는 CH 이고, Y 1 은 CR 4 이고, L 1 은 - CH 2 -이고, L 2 는 - NHCH 2 -이고, R 1 은 4 치환된 페닐인 화학식 I의 화합물 (화학식 Ic )의 합성.
R4가 화학식 I에 대해 정의된 바와 같고 Z가 임의로 치환된 아릴에 대해 정의된 치환체인 화학식 Ic의 화합물은 하기 반응식 11에 제시된 바와 같이 2-아미노-5-브로모피리딘으로부터 5 단계로 합성될 수 있다.
반응식 11
Figure 112007090494669-PCT00032
단계 1 - 화학식 V의 화합물의 제조
비-반응성 용매 (예를 들어, 테트라히드로푸란) 중의 적절하게 치환된 벤즈알데히드 (예를 들어, p-트리플루오로메틸 벤즈알데히드)의 용액에 적절한 2-아미노-5-브로모-피리딘 15, 이어서 환원 수행에 적절한 시약 (예를 들어, 디부틸틴 디클로라이드 및 페닐실란)을 첨가한다. 일반적으로, 반응물을 철야 가열한다 (예를 들어, 50℃). 용매를 50℃로 철야 가열한 후에 감압 하에 제거한다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출)에 의해 단리하여 화학식 V의 화합물을 수득한다.
단계 -2- 화학식 VI 의 화합물의 제조
화학식 V의 화합물을 비-반응성 용매 (예를 들어, 테트라히드로푸란)에 용해시키고, 일반적으로 불활성 분위기 하에 -78℃에서 냉각시킨다. 상기 혼합물에 유기 리튬 시약 (예를 들어, 메틸 리튬)을 첨가한다. 반응 혼합물은 일반적으로 -78℃에서 수시간 동안 교반한다. 상기 혼합물에 유기 리튬 시약 (예를 들어, t-부틸 리튬)을 첨가하고, 혼합물을 수시간 동안 교반한다. 반응 혼합물을 -78℃에서 유지시키고, 적절한 포르밀화 시약 (예를 들어, 1-피페리딘 카르복스알데히드)을 첨가한다. 일반적으로, 반응물을 -78℃에서 추가로 수시간 동안 교반하고, 서서히 실온으로 가온한다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출)에 의해 단리하여 화학식 VI의 화합물을 수득한다.
단계 3 - 화학식 VII 의 화합물의 제조
화학식 VI의 화합물을 비-반응성 용매 (예를 들어, 테트라히드로푸란)에 용해시키고, 불활성 분위기 하에서 교반한다. 상기 용액에 염기 (예를 들어, 트리에틸아민) 및 일반적으로 촉매 (예를 들어, 4-디메틸아미노피리딘)를 첨가한다. 일반적으로, 혼합물을 수분 동안 교반한 후, 보호기 (예를 들어, 디-t-부틸디카르보네이트) 도입에 적절한 시약을 첨가한다. 일반적으로, 반응물을 철야 교반한다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출)에 의해 단리하여 화학식 VII의 화합물을 수득한다.
단계 4 - 화학식 VIII 및 IX 의 화합물의 제조
4-치환된 1H-피롤로[2,3-b]피리딘 XXX을 적절한 극성 양성자성 용매 (예를 들어, 메탄올) 중의 염기 (예를 들어, 수산화칼륨)의 교반 용액에 첨가한다. 화학식 VII의 화합물을 첨가하고, 혼합물을 일반적으로 실온에서 수일 동안 교반한다. 용매를 증발시키고, 1 M HCl을 잔사에 첨가한다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출, 실리카 겔 크로마토그래피)에 의해 단리하여 화학식 VIII 및 IX의 화합물을 수득한다.
단계 5 - 화학식 Ic 의 화합물의 제조
일반적으로, 화학식 VIII 및 IX의 화합물을 합하여 적절한 극성 비양성자성 용매 (예를 들어, 아세토니트릴)에 용해시킨다. 환원 수행에 적절한 시약 (예를 들어, 트리에틸실란 및 트리플루오로아세트산)을 첨가한다. 일반적으로, 반응물을 실온에서 수일 동안 교반한다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출, 실리카 겔 크로마토그래피)에 의해 단리하여 화학식 Ic의 화합물을 수득한다.
실시예 10. [5-(4- 메톡시 -1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3- 일메틸 )-피리딘-2-일]-(4- 트리플루오로메틸 -벤질)-아민 (P-0011)의 합성
Figure 112007090494669-PCT00033
[5-(4-메톡시-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-(4-트리플루오로메틸-벤질)-아민 P-0011은 반응식 12에 나타낸 바와 같이 합성하였다:
반응식 12
Figure 112007090494669-PCT00034
단계 1: (5- 브로모 -피리딘-2-일)-(4- 트리플루오로메틸 -벤질)-아민 (17)의 제조
교반기 및 환류 응축기가 설치된 환저 플라스크 내의 트리플루오로아세트산 (400 mL), 트리에틸실란 (825 mL) 및 아세토니트릴 (7500 mL)의 용액에 2-아미노-5-브로모피리딘 (15, 1.73 mol, 300 g) 및 p-트리플루오로메틸벤즈알데히드 (16, 1.723 mol, 300 g)를 첨가하였다. 반응물을 환류로 철야 (24시간) 가열하였다. 용매를 제거하고, 잔사를 수성 K2CO3에 붓고, 에틸 아세테이트로 추출하였다. 유기층을 염수로 세척하고, 황산나트륨으로 건조시키고, 농축하였다. 조질 화합물을 디에틸 에테르/헥산으로 결정화시켜 420 g의 화합물 17 (73.6％)을 회백색 고체로서 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+= 331.1 및 333.1 (1:1 비율).
단계 2: 6-(4- 트리플루오로메틸 - 벤질아미노 )-피리딘-3- 카르브알데히드 (18)의 제조
5 L 둥근바닥 플라스크에 화합물 17 (0.6 mol, 198.6 g,) 및 테트라히드로푸란 (2.5 L)을 아르곤 분위기 하에서 -78℃에서 첨가하였다. 반응 혼합물에 펜탄 (800 mL) 중의 1.7 M t-부틸리튬을 60분에 걸쳐 첨가하였다. t-부틸리튬을 첨가한 지 2시간 후에, N,N-디메틸포름아미드 (100 mL)를 첨가하였다. 반응 혼합물을 -78℃에서 2시간 동안 교반한 후, 실온에서 추가로 1시간 동안 정치시켰다. 반응 혼합물을 포화 염화암모늄 용액에 붓고, 에틸 아세테이트로 추출하였다. 유기층을 염수로 세척하고, 황산나트륨으로 건조시키고, 농축하고, 헥산/이소프로필 에테르 (1:1)로 연마하여 알데히드 화합물 18을 수득하였다.
단계 3: (5- 포르밀 -피리딘-2-일)-(4- 트리플루오로메틸 -벤질)- 카르밤산 t-부틸 에스 테르 (19)의 제조
2 L 둥근바닥 플라스크에 디-t-부틸디카르보네이트 (90 g), 알데히드 18 (75 g), 디이소프로필 에틸 아민 (60 g), 4-디메틸아미노피리딘 (2.0 g) 및 디클로로메탄 (1000.0 mL)을 첨가하였다. 반응물을 실온에서 철야 (18시간) 교반하고, 용매를 증발시켜 화합물 19 (94 g)를 수득하였다.
단계 4 및 5: [5-(4- 메톡시 -1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3- 일메틸 )-피리딘-2-일]-(4-트리플루오로메틸-벤질)-아민 (P-0011)의 제조
단계 4: 메탄올 (20 mL, 0.5 mol)의 용액에 수산화나트륨 (0.62 g, 0.016 mol), 이어서 4-메톡시-7-아자인돌 (20, 600 mg, 4 mmol, 실시예 12에 기재된 바와 같이 제조)을 첨가하였다. 혼합물이 균질해지면, 화합물 19 (1.7 g, 4.46 mmol)를 첨가하고, 혼합물을 실온에서 48시간 동안 교반하였다. 용매를 증발시키고, 묽은 HCl을 잔사에 첨가하였다. 잔사를 에틸 아세테이트로 추출하고, 10％ 중탄산나트륨, 이어서 염수로 세척하였다. 유기층을 MgSO4로 건조시키고, 여과한 후 증발시켜 조질 화합물 21과 22의 혼합물을 수득하고, 다음 단계에 사용하였다.
단계 5: 단계 4로부터의 21과 22의 혼합물 (2.36 g, 4.46 mmol)을 디클로로메탄 (60 mL, 0.9 mol)에 용해시키고, 여기에 트리에틸실란 (3.6 mL, 0.022 mol) 및 트리플루오로아세트산 (2.1 mL, 0.027 mol)을 첨가하였다. 생성되는 혼합물을 48시간 동안 실온에서 교반하였다. 용매를 증발시키고, 혼합물을 디클로로메탄:메탄올 (3:1)로 추출하였다. 유기층을 포화 비카르보네이트, 이어서 염수로 세척하 였다. 유기층을 MgSO4로 건조시키고, 여과한 후 증발시켜 조질 화합물을 잔사로 수득하였다. 잔사를 플래시 실리카 겔 크로마토그래피로 정제하여 1.15 g의 고체 P-0011을 60％ 수율로 얻었다. MS (ESI) [M+H+]+= 413.24.
[5-(4-메톡시-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-(4-클로로-벤질)-아민 P-0010
Figure 112007090494669-PCT00035
을 단계 1에서 4-트리플루오로-벤질아민을 4-클로로-벤질아민으로 치환하여 반응식 12의 프로토콜에 따라 제조하였다. MS (ESI) [M+H+]+= 379.2 및 381.2 (3:1 비율).
[5-(4-클로로-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-(4-클로로-벤질)-아민 P-0009
Figure 112007090494669-PCT00036
를 단계 1에서 4-트리플루오로-벤질아민을 4-클로로-벤질아민으로, 단계 4에서 4-메톡시-7-아자인돌을 4-클로로-7-아자인돌 (24, 실시예 11에 기재된 바와 같이 제조)로 치환하여 반응식 12의 프로토콜에 따라 제조하였다. MS (ESI) [M+H+]+= 381.1 및 383.0.
실시예 11: 4- 클로로 -7- 아자인돌 (24)의 합성
4-클로로-7-아자인돌 24는 반응식 13의 프로토콜에 따라 7-아자인돌로부터 2 단계로 합성하였다.
반응식 13
Figure 112007090494669-PCT00037
단계 1 - 1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 7- 옥시드 (23)의 합성
1H-피롤로[2,3-b]피리딘 7-옥시드 23은 문헌 [Schneller, S. W.; Luo, Jiann-Kuan. J. Org. Chem. 1980, 45:4045-4048]에 기재된 바와 같이 상업적으로 입수가능한 7-아자인돌 1을 비-반응성 용매 (예를 들어, 디메톡시에탄) 중에서 산화제 (예를 들어, m-CPBA)와 반응시켜 합성하였다. 5℃에서 일반적으로 1-3 h 동안 정치시에 형성되는 생성되는 고체의 여과에 의해 화합물을 단리하였다.
단계 2 - 4- 클로로 -7- 아자인돌 (24)의 합성
4-클로로-7-아자인돌 24는 1H-피롤로[2,3-b]피리딘 7-옥시드 23을 문헌 [Schneller, S. W.; Luo, Jiann-Kuan. J. Org. Chem. 1980, 45:4045-4048]에 기재된 바와 같이 순수한 염소화제 (예를 들어, POCl3)와 반응시켜 합성하였다. 3-5h 동안 승온 (100-150℃)에서 가열한 후에 생성되는 용액을 고체가 침전될 때까지 염기 (예를 들어, NH4OH)로 중화시켰다. 고체를 여과에 의해 단리하였다.
실시예 12: 4- 메톡시 -7- 아자인돌 (20)의 합성
4-메톡시-7-아자인돌 20은 반응식 14의 프로토콜에 따라 4-클로로-7-아자인돌로부터 1단계로 합성하였다.
반응식 14
Figure 112007090494669-PCT00038
4-메톡시-7-아자인돌 20은 문헌 [Girgis, N. etal., J. Heterocyclic. Chem. 1989, 26:317-325]에 기재된 바와 같이 4-클로로-7-아자인돌 24 (실시예 9에 기재된 바와 같이 제조)를 수산화나트륨과 메탄올 중에서 반응시켜 제조하였다.
실시예 13: n은 1이고, P는 CR 30 이고, Q, T, X 1 , X 2 , Y 1 및 Y 2 는 CH 이고, L 1 은 - CH 2 -이고, L 2 는 - NHCH 2 -이고, R 1 은 치환된 페닐인 화학식 I의 화합물 (화학식 Id )의 합성.
R30이 임의로 치환된 헤테로아릴렌에 대해 정의된 (하기 반응식 13에서 추가로 정의된) 치환체이고 R31이 임의로 치환된 아릴에 대해 정의된 치환체인 화학식 Id의 화합물은 하기 반응식 15에 제시된 바와 같이 적절하게 치환된 2-할로피리딘으로부터 6 단계로 합성할 수 있다.
반응식 15
Figure 112007090494669-PCT00039
단계 1 - 화학식 XI 의 화합물의 제조
적절하게 치환된 2-할로피리딘 X (예를 들어, 2-클로로-6-메톡시피리딘) (여기서, Y는 할로겐, 바람직하게는 염소 또는 브롬이고, R30은 일반적으로 -78℃ 아세톤/무수 빙조에 냉각된 비-반응성 용매 (예를 들어, 테트라히드로푸란) 중에서 5-위치에 대해 다음 리티에이션 (lithiation)을 지시하기 적절한 기 (예를 들어, R30 = 메톡시)임)에 유기리튬 시약 (예를 들어, t-부틸리튬)의 용액을 첨가한다. 반응물을 일정 시간, 일반적으로 1시간 동안 정치시킨다. 적절한 포르밀화제 (예를 들어, 디메틸포름아미드)를 첨가하고, 반응물을 일정 시간 동안 냉각시키면서 교반한 후, 일정 시간, 일반적으로 30분 동안 실온으로 가온시킨다. 반응물을 다시 무수 빙조에 위치시키고, 6 N HCl (1.5 mL), 이어서 물로 켄칭시킨 후, 실온으로 가온시킨다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출)에 의해 단리하여 화학식 XI의 화합물을 수득한다.
단계 2 - 화학식 XII 의 화합물의 제조
1H-피롤로[2,3-b]피리딘 1 및 화학식 XI의 화합물에 적절한 극성 용매 (예를 들어, 메탄올), 이어서 적절한 염기 (예를 들어, 수산화칼륨)를 첨가한다. 반응물은 일반적으로 실온에서 철야 교반한다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출, 세척 및 여과)에 의해 화학식 XII의 화합물을 수득한다.
단계 3 - 화학식 XIII 의 화합물의 제조
적절한 극성 용매 (예를 들어, 아세토니트릴) 중의 화학식 XII의 화합물에 환원제 (예를 들어, 트리플루오로아세트산 및 트리에틸실란)을 첨가한다. 일반적으로, 반응물을 실온에서 철야 교반한다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)에 의해 화학식 XIII의 화합물을 수득한다.
단계 4 - 화학식 XIV 의 화합물의 제조
적절한 극성 용매 (예를 들어, 디메틸포름아미드) 중의 화학식 XIII의 화합물의 용액에 염기 (예를 들어, 수소화나트륨)를 첨가한다. 일반적으로, 반응물을 실온에서 30분 동안 교반한 후, 보호기 ("P") 도입에 적절한 시약을 첨가한다 (예를 들어, 트리이소프로필실릴 클로라이드). 반응물을 일반적으로 실온에서 수시간 동안 교반한다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)에 의해 단리하여 화학식 XIV의 화합물을 수득한다.
단계 5 - 화학식 XVI 의 화합물의 제조
화학식 XIV의 화합물, 적절하게 치환된 벤질아민 XV (예를 들어, 4-(트리플 루오로메틸)벤질아민), 염기 (예를 들어, 나트륨 t-부톡시드), 촉매 (예를 들어, 트리스(디벤질리덴아세톤)디팔라듐(0)), 및 리간드 (예를 들어, 2,2'-비스(디페닐포스피노)-1,1'-비나프틸)에 불활성 분위기 하에 비-반응성 용매 (예를 들어, 톨루엔)를 첨가한다. 일반적으로, 반응물을 수시간 동안 가열한다 (예를 들어, 80℃). 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)에 의해 단리하여 화학식 XVI의 화합물을 수득한다.
단계 6 - 화학식 Id 의 화합물의 제조
화학식 XVI의 화합물에 적절한 극성 용매 (예를 들어, 테트라히드로푸란), 이어서 보호기 제거에 적절한 시약 (예를 들어, 테트라-n-부틸암모늄 플루오라이드)을 첨가한다. 일반적으로, 반응물을 실온에서 수시간 동안 교반한다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)에 의해 단리하여 화학식 Id의 화합물을 수득한다.
실시예 14: n은 1이고, P는 CR 32 이고, Q, T, X 1 , X 2 , Y 1 및 Y 2 는 CH 이고, L 1 은 - CH 2 -이고, L 2 는 - NHCH 2 -이고, R 1 은 치환된 페닐인 화학식 I의 화합물 (화학식 Ie )의 합성.
R32가 임의로 치환된 헤테로아릴렌에 대해 정의된 치환체이고 R33이 임의로 치환된 아릴에 대해 정의된 치환체인 화학식 Id의 화합물은 반응식 16에 제시된 바와 같이 적절하게 치환된 2-아미노-5-브로모피리딘으로부터 5 단계로 합성할 수 있 다.
반응식 16
Figure 112007090494669-PCT00040
단계 1 - 화학식 XIX 의 화합물의 제조
비-반응성 용매 (예를 들어, 테트라히드로푸란) 중의 적절하게 치환된 벤즈알데히드 XVIII (예를 들어, p-트리플루오로메틸 벤즈알데히드)의 용액에 적절한 2-아미노-5-브로모-피리딘 XVII (예를 들어, 2-아미노-5-브로모-6-메틸피리딘), 이어서 환원 수행에 적절한 시약 (예를 들어, 디부틸틴 디클로라이드 및 페닐실란)을 첨가할 수 있다. 일반적으로 반응물을 철야 가열한다 (예를 들어, 50℃). 통상적인 수단 (예를 들어, 추출)에 의해 단리하여 화학식 XIX의 화합물을 수득한다.
단계 2 - 화학식 XX 의 화합물의 제조
화학식 XIX의 화합물을 비-반응성 용매 (예를 들어, 테트라히드로푸란)에 용해시키고, 일반적으로 불활성 분위기 하에 -78℃로 냉각시킨다. 상기 혼합물에 유기리튬 시약 (예를 들어, 메틸리튬)을 첨가한다. 반응 혼합물을 일반적으로 -78℃ 에서 수시간 동안 교반한다. 상기 혼합물에 유기리튬 시약 (예를 들어, t-부틸리튬)을 첨가하고, 혼합물을 수시간 동안 교반한다. 반응 혼합물을 -78℃에서 유지시키고, 적절한 포르밀화 시약 (예를 들어, 1-피페리딘 카르복스알데히드)을 첨가한다. 일반적으로, 반응물을 -78℃에서 추가로 수시간 동안 교반하고, 서서히 실온으로 가온시킨다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출)에 의해 단리하여 화학식 XX의 화합물을 수득한다.
단계 3 - 화학식 XXI 의 화합물의 제조
화학식 XX의 화합물을 비-반응성 용매 (예를 들어, 테트라히드로푸란) 중에 용해시키고, 불활성 분위기 하에 교반한다. 상기 용액에 염기 (예를 들어, 트리에틸아민) 및 일반적으로 촉매 (예를 들어, 4-디메틸아미노피리딘)을 첨가한다. 일반적으로, 혼합물을 수분 동안 교반한 후, 보호기 도입에 적절한 시약 (예를 들어, 디-t-부틸디카르보네이트)를 첨가한다. 일반적으로, 반응물을 철야 교반한다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출)에 의해 단리하여 화학식 XXI의 화합물을 수득한다.
단계 4 - 화학식 XXII 및 XXIII 의 화합물의 제조
1H-피롤로[2,3-b]피리딘 1을 적절한 극성 용매 (예를 들어, 메탄올) 중의 염기 (예를 들어, 수산화칼륨)의 교반된 용액에 첨가한다. 화학식 XXI의 화합물을 첨가하고, 혼합물을 일반적으로 실온에서 수일 동안 교반한다. 용매를 증발시키고, 1 M HCl을 잔사에 첨가한다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출, 실리카 겔 크로마토그래피)에 의해 단리하여 화학식 XXII 및 XXIII의 화합물을 수득한다.
단계 5 - 반응식 14의 화학식 XIV 의 화합물의 제조
일반적으로, 화학식 XII 및 XIII의 화합물을 합하여 적절한 극성 비양성자성 용매 (예를 들어, 아세토니트릴)에 용해시킨다. 환원 수행에 적절한 시약 (예를 들어, 트리에틸실란 및 트리플루오로 아세트산)을 첨가한다. 일반적으로, 반응물을 실온에서 수일 동안 교반한다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출, 실리카 겔 크로마토그래피)에 의해 단리하여 화학식 Ie의 화합물을 수득한다.
실시예 15: [6- 메톡시 -5-(1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3- 일메틸 )-피리딘-2-일]-(4- 트리플루오로메틸 -벤질)-아민 (P-0012)의 합성
[6-메톡시-5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-(4-트리플루오로메틸-벤질)-아민 P-0012를 반응식 17에 제시된 바와 같이 상업적으로 입수가능한 2-클로로-6-메톡시피리딘 및 7-아자인돌로부터 5 단계로 합성하였다.
반응식 17
Figure 112007090494669-PCT00041
단계 1 - 6- 클로로 -2- 메톡시피리딘 - 카르브알데히드 (26)의 제조
-78℃ 아세톤/무수 빙조에 냉각시킨 테트라히드로푸란 (10 mL) 중의 2-클로로-6-메톡시피리딘 (25, 0.511 g, 3.56 mmol)에 t-부틸리튬 (펜탄 중의 1.7 M, 5.0 mL, 7.66 mmol)을 첨가하였다. 반응물을 1시간 동안 교반하였다. 디메틸포름아미드 (0.673 mL, 17.4 mmol)를 첨가하고, 추가로 30분 동안 -78℃에서 계속 반응시킨 후, 무수 빙조 밖에서 30분 동안 교반하였다. 반응물을 다시 무수 빙조에 넣고, 6 N HCl (1.5 mL), 이어서 물로 켄칭하고, 실온으로 가온시켰다. 반응물을 디에틸 에테르 및 수성 (1M) 중탄산나트륨으로 추출하였다. 유기층을 분리하여 무수 황산마그네슘으로 건조시키고 여과한 후, 휘발물질을 회전 증발에 의해 제거하고, 생성되는 황색 고체를 진공 건조시켜 561 mg의 화합물 26 (3.27 mmol, 92％ 수율)을 수득하였다. MS(ESI) [M+H+]+ = 172.0.
단계 2 - (6- 클로로 -2- 메톡시피리딘 -3-일)(1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3-일)메탄올 (27)의 제조
1H-피롤로[2,3-b]피리딘 (1, 0.455 g, 3.85 mmol) 및 6-클로로-2-메톡시피리딘-3-카르브알데히드 (26, 0.661 g, 3.85 mmol)에 메탄올 (10 mL), 이어서 수산화칼륨 (0.310 g, 5.52 mmol)을 첨가하였다. 반응물을 실온에서 철야 교반하였다. 반응물을 디에틸 에테르/에틸 아세테이트 및 물로 추출하였다. 유기층을 분리하여 무수 황산마그네슘으로 건조시키고, 여과한 후, 휘발물질을 회전 증발에 의해 제거하여 고체를 수득하고, 이를 디클로로메탄으로 처리하여 냉동기에서 철야 보관하였다. 백색 고체를 진공 여과에 의해 수거하고 진공 건조시켜 613 mg의 화합물 27 (2.12 mmol, 55％)을 수득하였다. MS(ESI) [M+H+]+ = 290.1.
단계 3 - 3-(6- 클로로 -2- 메톡시피리딘 -3- 일메틸 )-1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 (28)의 제조
아세토니트릴 (10 mL) 중의 (6-클로로-2-메톡시피리딘-3-일)(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)메탄올 (27, 0.613 g, 2.12 mmol)에 트리플루오로아세트산 (0.82 mL, 10.0 mmol), 이어서 트리에틸실란 (1.69 mL, 10.6 mmol)을 첨가하였다. 반응물을 실온에서 2일 동안 교반한 후, 60℃에서 4시간 동안 교반하였다. 반응물을 디에틸 에테르 및 수성 중탄산나트륨으로 추출하였다. 유기층을 무수 황산마그네슘으로 건조시키고 여과하였다. 목적하는 물질을 여액으로부터 디클로로메탄 중의 1％ 메탄올로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 단리하여 516 mg의 백색 고체 화합물 28 (1.88 mmol, 89％)을 수득하였다. MS(ESI) [M+H+]+ = 274.1.
단계 4 - 3-(6- 클로로 -2- 메톡시피리딘 -3- 일메틸 )-1-( 트리이소프로필실릴 )-1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 (29)의 제조
디메틸포름아미드 (10 mL) 중의 3-(6-클로로-2-메톡시피리딘-3-일메틸)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 (28, 0.516 g, 1.88 mmol)의 투명한 용액에 수소화나트륨 (60％ 분산액, 0.113 g, 2.82 mmol)을 첨가하였다. 실온에서 30분 동안 교반한 후, 트리이소프로필실릴 클로라이드 (600 ㎕, 2.83 mmol)를 첨가하였다. 반응물을 실온에서 2시간 동안 교반한 후, 수성 (1M) 중탄산나트륨에 붓고, 에틸 아세테이트로 추출하였다. 유기층을 분리하여 건조시키고 (황산마그네슘), 여과한 후, 휘발물질을 회전 증발에 의해 제거하여 조질 고체를 수득하였다. 화합물을 헥산 중의 2％ 에틸 아세테이트로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하였다. 이를 통해 732 mg의 요구되는 화합물을 백색의 결정질 고체 (29, 1.70 mmol, 90％)로서 수득하였다. MS(ESI) [M+H+]+ = 430.2.
단계 5 - [6-메톡시-5-(1-트리이소프로필실라닐-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-(4- 트리플루오로메틸 -벤질)-아민 (31)의 제조
3-(6-클로로-2-메톡시피리딘-3-일메틸)-1-(트리이소프로필실릴)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 (29, 0.104 g, 0.242 mmol), 4-(트리플루오로메틸)벤질아민 (30, 0.047 g, 0.266 mmol), 나트륨 t-부톡시드 (0.0325 g, 0.338 mmol), 트리스(디벤질리덴아세톤)-디팔라듐(0) (0.00062 g, 0.0006 mmol), 및 2,2'-비스(디페닐포스피노)-1,1'-비나프틸 (0.0011 g, 0.0018 mmol)을 톨루엔 (2 mL)에 질소 하에 첨가하였다. 반응 바이알을 80℃에서 3시간 동안 오일조에 배치하였다. 반응물을 물에 붓고 에틸 아세테이트로 추출하였다. 유기층을 건조시키고 (황산마그네슘), 여과한 후, 휘발물질을 회전 증발에 의해 제거하였다. 잔사를 헥산 중의 2％ 에틸 아세테이트로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하였다. 이에 의해 34 mg의 요구되는 화합물 31 (0.060 mmol, 25％)을 수득하였다. MS(ESI) [M+H+]+ = 569.3.
단계 6 - [6- 메톡시 -5-(1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3- 일메틸 )-피리딘-2-일]-(4- 트리플 루오로메틸 -벤질)-아민 (P-0012)의 제조
[6-메톡시-5-(1-트리이소프로필실라닐-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-(4-트리플루오로메틸-벤질)-아민 (31, 0.0340 g, 0.0598 mmol)에 테트라히드로푸란 (5 mL), 이어서 테트라-n-부틸암모늄 플루오라이드 (테트라히드로푸란 중의 1M 용액, 66 ㎕, 0.0658 mmol)를 첨가하였다. 반응물을 실온에서 2시간 동안 교반한 후, 1:1의 물:포화 중탄산나트륨에 붓고, 에틸 아세테이트로 추출하였다. 유기층을 분리하고, 황산마그네슘으로 건조시키고, 여과한 후, 휘발물질을 회전 증발에 의해 제거하였다. 생성되는 잔류물을 디클로로메탄, 이어서 디클로로메탄 중의 1％ 메탄올, 마지막으로 디클로로메탄 중의 3％ 메탄올로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하였다. 이에 의해 20 mg의 요구되는 화합물을 백색 고체 (P-0012, 0.048 mmol, 81％)로서 수득하였다. MS(ESI) [M+H+]+ = 413.2.
실시예 16: [6- 메틸 -5-(1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3- 일메틸 )-피리딘-2-일]-(4- 트리플루오로메틸 -벤질)-아민 (P-0013)의 합성
[6-메틸-5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-(4-트리플루오로메틸-벤질)-아민 (P-0013)을 반응식 18에 제시된 바와 같이 상업적으로 입수가능한 2-아미노-5-브로모-6-메틸피리딘 및 7-아자인돌로부터 5단계로 합성하였다.
반응식 18
Figure 112007090494669-PCT00042
단계 1 - (5- 브로모 -6- 메틸 -피리딘-2-일)-(4- 트리플루오로메틸 -벤질)-아민 (34)의 제조
테트라히드로푸란 (9 mL) 중의 p-트리플루오로메틸벤즈알데히드 (16, 1.00 g, 5.74 mmol)의 용액에 2-아미노-5-브로모-6-메틸피리딘 (33, 1.08 g, 5.77 mmol), 이어서 디부틸틴 디클로라이드 (40 mg, 0.13 mmol)를 첨가하였다. 혼합물을 5분 동안 25℃에서 교반하고, 페닐실란 (0.69 g, 6.4 mmol)을 첨가하였다. 반응물을 50℃에서 철야 가열한 후, 용매를 감압 하에 제거하였다. 에틸 아세테이트를 생성되는 고체에 첨가하고, 포화 탄산나트륨으로 세척하여 황산마그네슘으로 건조시키고 여과하였다. 감압 하에 농축하여 담황색 고체 (34, 1.7 g, 4.93 mmol)를 수득하였다. MS(ESI) [M + H+]+ = 345.1.
단계 2 - 2- 메틸 -6-(4- 트리플루오로메틸 - 벤질아미노 )-피리딘-3- 카르브알데히드 (35)의 제조
(5-브로모-6-메틸-피리딘-2-일)-(4-트리플루오로메틸-벤질)-아민 (34, 1.7 g, 4.93 mmol)을 테트라히드로푸란 (40 mL)에 용해시키고, 질소 분위기 하에 -78℃에서 냉각시켰다. 상기 혼합물에 메틸리튬 (디에틸 에테르 중의 1.6 M, 5.91 mmol)을 20분에 걸쳐 적가하였다. 메틸리튬의 첨가가 완료된 후, 반응 혼합물을 -78℃에서 2시간 동안 교반하였다. 상기 혼합물에 t-부틸리튬 (펜탄 중의 1.7 M, 10.85 mmol)을 첨가하고, 혼합물을 4시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 -78℃에서 유지시키고, 1-피페리딘카르복스알데히드 (0.60 mL, 5.42 mmol)를 적가하였다. 반응물을 -78℃에서 추가로 2시간 동안 교반하고, 무수 얼음/아세톤 냉각조를 서서히 증발시켜 25℃로 가온시켰다. 반응물을 빙냉 포화 염화나트륨으로 켄칭시키고, 생성되는 혼합물을 에틸 아세테이트로 추출하였다. 유기층을 황산마그네슘으로 건조시키고 여과하였다. 감압 하에 농축시켜 오렌지색 오일 (35, 1.4 g, 4.93 mmol)을 수득하였다. MS(ESI) [M + H+]+ = 295.1.
단계 3 - (5- 포르밀 -6- 메틸 -피리딘-2-일)-(4- 트리플루오로메틸 -벤질)- 카르밤산 t-부틸 에스테르 (36)의 제조
2-메틸-6-(4-트리플루오로메틸-벤질아미노)-피리딘-3-카르브알데히드 (35, 1.4 g, 4.9 mmol)를 테트라히드로푸란 (22 mL)에 용해시키고, 질소 분위기 하에서 교반하였다. 상기 용액에 4-디메틸아미노피리딘 (150 mg, 1.23 mmol) 및 트리에틸아민 (0.66 mL, 4.9 mmol)을 첨가하였다. 혼합물을 5분 동안 교반한 후, 고체 디- t-부틸디카르보네이트 (1.0 g, 4.9 mmol)를 직접 반응 혼합물에 첨가하였다. 혼합물을 25℃에서 철야 교반하고, 에틸 아세테이트로 희석하여 중탄산나트륨, 이어서 포화 염화나트륨으로 세척하였다. 생성되는 유기층을 황산마그네슘으로 건조시키고, 여과한 후 증발시켜 베이지색 고체 (36, 1.8 g, 4.6 mmol)를 수득하였다. MS(ESI) [M + H+]+ = 395.2.
단계 4 - {5-[히드록시-(1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3-일)- 메틸 ]-6- 메틸 -피리딘-2-일}-(4- 트리플루오로메틸 -벤질)- 카르밤산 t-부틸 에스테르 (37) 및 {5-[ 메톡시 -(1H-피 롤로[2,3-b]피 리딘-3-일)- 메틸 ]-6- 메틸 -피리딘-2-일}-(4- 트리플루오로메틸 -벤질)- 카르밤산 t-부틸 에스테르 (38)의 제조
1H-피롤로[2,3-b]피리딘 (1, 540 mg, 4.57 mmol)을 메탄올 (33 mL) 중의 수산화칼륨 (868 mg, 10.08 mmol)의 교반 용액에 첨가하였다. 혼합물이 균질해지면, (5-포르밀-6-메틸-피리딘-2-일)-(4-트리플루오로메틸-벤질)-카르밤산 t-부틸 에스테르 (36, 1.8 g, 4.6 mmol)를 첨가하고, 혼합물을 25℃에서 72시간 동안 교반하였다. 용매를 증발시키고, 1 M HCl을 잔사에 첨가하였다. 유기 물질을 에틸 아세테이트로 추출하고, 10％ 중탄산나트륨, 이어서 포화 염화나트륨으로 세척하였다. 유기층을 황산마그네슘으로 건조시켰다. 감압 하에 농축하여 조질 물질을 수득하고, 이를 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피 (디클로로메탄 중의 0-5％ 메탄올)로 정제하여 목적하는 화합물을 담황색 고체 (혼합물로서의 37 및 38, 294 mg; 13％ 수율)로서 수득하였다. MS(ESI) [M + H+]+ = 511.2 (37에 대해) 및 MS(ESI) [M + H+]+ = 525.2 (38에 대해).
단계 5 - [6- 메틸 -5-(1H- 피롤로[2,3-b]비피리딘 -3- 일메틸 )-피리딘-2-일]-(4- 트리플루오로메틸 -벤질)-아민 (P-0013)의 제조
{5-[히드록시-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메틸]-6-메틸-피리딘-2-일}-(4-트리플루오로메틸-벤질)-카르밤산 t-부틸 에스테르 (37) 및 {5-[메톡시-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메틸]-6-메틸-피리딘-2-일}-(4-트리플루오로메틸-벤질)-카르밤산 t-부틸 에스테르 (38) (194 mg, 0.378 mmol)의 합한 물질을 아세토니트릴 (3 mL)에 용해시키고, 트리에틸실란 (0.30 mL, 1.9 mmol) 및 트리플루오로아세트산 (0.17 mL, 2.3 mmol)을 첨가하였다. 25℃에서 철야 교반한 후, TLC 분석은 반응이 약 50％ 완료되었음을 나타내었다. 반응 혼합물에 트리에틸실란 (0.30 mL, 1.9 mmol), 및 트리플루오로아세트산 (0.17 mL, 2.3 mmol)을 첨가하였다. 혼합물을 추가로 48시간 동안 25℃에서 교반하고, 용매, 과량의 트리에틸실란 및 트리플루오로아세트산을 증발에 의해 제거하였다. 에틸 아세테이트를 첨가하고, 포화 중탄산나트륨으로 세척하였다. 유기층을 황산마그네슘으로 건조시키고, 여과한 후 감압 하에 농축하여 갈색 오일을 수득하였다. 80 mg의 조질 물질의 정제는 예비 크로마토그래피 (헥산 중의 50％ 에틸 아세테이트)로 수행하여 화합물을 회백색 고체 (P-0013, 10 mg, 0.025 mmol)로서 수득하였다. MS(ESI) [M + H+]+ = 397.2.
(4-클로로-벤질)-[6-메틸-5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-아민 P-0014
Figure 112007090494669-PCT00043
는 단계 1에서 4-트리플루오로메틸 벤즈알데히드를 4-클로로벤즈알데히드 (40)로 치환하여 반응식 18의 프로토콜에 따라 제조하였다. MS(ESI) [M + H+]+ = 363.1.
실시예 17: [5-(5- 브로모 -1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3- 일메틸 )-피리딘-2-일]-(4- 클로로 -벤질)-아민 (P-0038)의 합성
[5-(5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-(4-클로로-벤질)-아민 P-0038을 반응식 19에 제시된 바와 같이 상업적으로 입수가능한 2-아미노-5-브로모피리딘 15로부터 5 단계로 합성하였다.
반응식 19
Figure 112007090494669-PCT00044
단계 1 - (5- 브로모 -피리딘-2-일)-(4- 클로로 -벤질)-아민 (41)의 합성
톨루엔 (90.0 mL) 중의 2-아미노-5-브로모피리딘 (15, 6.1O g, 0.0352 mol)에 4-클로로벤즈알데히드 (40, 5.00 g, 0.0356 mol), 트리플루오로아세트산 (8.0 mL, 0.10 mol) 및 트리에틸실란 (16.5 mL, 0.103 mol)을 첨가하였다. 반응물을 48시간 동안 환류로 가열하였다. 반응물을 농축하고, 수성 탄산칼륨에 붓고, 에틸 아세테이트로 추출하였다. 유기층을 염수로 세척하고, 황산나트륨으로 건조시키고 농축하였다. 조질 잔사를 에틸 아세테이트로 결정화시켜 화합물 (41, 6.8 g, 65.4％)을 수득하였다.
단계 2 - 6-(4- 클로로 - 벤질아미노 )-피리딘-3- 카르브알데히드 (42)의 합성
-78℃에서 질소 분위기 하에 테트라히드로푸란 (400.0 mL) 중의 (5-브로모-피리딘-2-일)-(4-클로로-벤질)-아민 (41, 10.00 g, 0.03360 mol)에 n-부틸리튬 (17.5 mL, 시클로헥산 중의 2.00 M)을 첨가하였다. 90분 후, t-부틸리튬 (42.00 mL, 헥산 중의 1.70 M)을 반응물에 첨가하였다. 80분 후, N,N-디메틸포름아미드 (6.9 mL, 0.089 mol)를 반응물에 첨가하였다. 반응 혼합물을 -78℃에서 2시간 동안 교반한 후, 1시간 동안 실온으로 가온시켰다. 반응 혼합물을 물에 붓고, 에틸 아세테이트로 추출하였다. 유기층을 염수로 세척하고, 황산나트륨으로 건조시키고 농축하여 조질 화합물을 수득하고, 이를 t-부톡실 메틸 에테르로부터 결정화시켜 화합물 (42, 7.66 g, 92.2％)을 수득하였다.
단계 3 - (4- 클로로 -벤질)-(5- 포르밀 -피리딘-2-일)- 카르밤산 t-부틸 에스테르 (43)의 합성
디클로로메탄 (20.0 mL) 중의 6-(4-클로로-벤질아미노)-피리딘-3-카르브알데히드 (42, 2.00 g, 8.11 mmol)에 트리에틸아민 (1.70 mL, 12.2 mmol), 디-t-부틸디카르보네이트 (2.00 g, 9.16 mmol) 및 4-디메틸아미노피리딘 (52.3 mg, 0.43 mmol) 을 첨가하였다. 반응물을 실온에서 48시간 동안 교반하였다. 반응물을 농축하고 헥산 중의 20％ 에틸 아세테이트로 용출하는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하여 화합물 (43, 2.50 g, 89.3％)을 수득하였다.
단계 4 - {5-[(5- 브로모 -1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3-일)-히드록시- 메틸 ]-피리딘-2-일}-(4- 클로로 -벤질)- 카르밤산 t-부틸 에스테르 (45)의 합성
메탄올 (30.0 mL, 0.741 mol) 중의 5-브로모-7-아자인돌 (44, 198.0 mg, 1.01 mmol)에 (4-클로로-벤질)-(5-포르밀-피리딘-2-일)-카르밤산 t-부틸 에스테르 (43, 355.0 mg, 1.02 mmol) 및 수산화칼륨 (80.0 mg, 1.42 mmol)을 첨가하였다. 반응물을 실온에서 48시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 물에 붓고, 에틸 아세테이트로 추출하였다. 유기층을 염수로 세척하고, 황산나트륨으로 건조시키고, 농축하고, 디클로로메탄 중의 8％ 메탄올로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하여 화합물 (45, 200.0 mg, 36.8％)을 수득하였다.
단계 5 - [5-(5- 브로모 -1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3- 일메틸 )-피리딘-2-일]-(4- 클로로 -벤질)-아민 (P-0038)의 합성
아세토니트릴 (30.0 mL) 중의 {5-[(5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-히드록시-메틸]-피리딘-2-일}-(4-클로로-벤질)-카르밤산 t-부틸 에스테르 (45, 180.0 mg, 0.33 mmol)에 트리플루오로아세트산 (2.0 mL, 0.026 mol) 및 트리에틸실란 (4.0 mL, 0.025 mol)을 첨가하였다. 반응물을 4시간 동안 환류로 가열하였다. 반응 혼합물을 물에 붓고, 에틸 아세테이트로 추출하였다. 유기층을 염수로 세척하고, 황산나트륨으로 건조시키고, 농축하고, 디클로로메탄 중의 10％ 메탄올로 용 출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하여 화합물 (P-0038, 120 mg, 85.2％)을 수득하였다. MS(ESI)[M+H+]+ = 427.2, 429.2.
실시예 18: 1- 트리이소프로필실라닐 -1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3- 카르브알데히드 47의 합성.
화합물 47을 반응식 20에 기재된 바와 같이 7-아자인돌 1로부터 2단계로 합성하였다.
반응식 20
Figure 112007090494669-PCT00045
단계 1 - 1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3- 카르브알데히드 (46)의 제조:
물 (110 mL) 중의 1H-피롤로[2,3-b]피리딘 (1, 16.0 g, 135 mmol)에 헥사메틸렌테트라민 (26.0 g, 185 mmol), 및 아세트산 (55.0 mL, 967 mmol)을 첨가하였다. 반응물을 12시간 동안 환류시켰다. 물 (329 mL)을 첨가하고, 반응물을 실온으로 냉각시켰다. 반응물을 여과하고 물로 세척하여 화합물 (46, 15.0 g, 76％)을 수득하였다. MS(ESI)[M+H+]+ = 147.
단계 2 - 1- 트리이소프로필실라닐 -1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3- 카르브알데히드 (47)의 제조:
테트라히드로푸란 (30.0 mL) 중의 1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르브알데히드 (46, 4.05 g, 27.71 mmol)에 수소화나트륨 (광물유 중의 60％, 1.5 g, 38 mmol) 및 트리이소프로필실릴 클로라이드 (8.0 mL, 38 mmol)를 질소 분위기 하에 첨가하였다. 반응물을 2시간 동안 실온에서 교반하였다. 반응물을 물에 붓고, 에틸 아세테이트로 추출하였다. 유기층을 염수로 세척하고, 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하였다. 여액을 농축하고, 헥산 중의 10％ 에틸 아세테이트로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하여 화합물 (47, 3.0 g, 36％)을 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 303.
1-(t-부틸-디메틸-실라닐)-3-요오도-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 66
Figure 112007090494669-PCT00046
은 1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르브알데히드 46을 3-요오도-1H-피롤로[2,3-b]피리딘으로, 트리이소프로필실릴 클로라이드를 t-부틸-디메틸-실릴 클로라이드로 치환하여 반응식 20 단계 2의 프로토콜에 따라 제조하였다.
1-벤젠술포닐-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르브알데히드 55
Figure 112007090494669-PCT00047
는 단계 2에서 트리이소프로필실릴 클로라이드를 벤젠술포닐 클로라이드로 치환하여 반응식 20의 프로토콜에 따라 제조하였다.
실시예 19: N-[5-(1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3- 일메틸 )-피리딘-2-일]-4- 트리플루오로메틸 - 벤젠술폰아미드 (P-0071)의 합성
N-[5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-4-트리플루오로메틸-벤젠술폰아미드 P-0071을 반응식 21에 제시된 바와 같이 2-아미노-5-브로모피리딘 15로부터 3 단계로 합성하였다.
반응식 21
Figure 112007090494669-PCT00048
단계 1 - N-(5- 브로모 -피리딘-2-일)-4- 트리플루오로메틸 - 벤젠술폰아미드 (49)의 합성:
아세토니트릴 (20.0 mL) 중의 2-아미노-5-브로모피리딘 (15, 1.50 g, 8.67 mmol)에 피리딘 (6.0 mL, 0.074 mol), 4-디메틸아미노피리딘 (0.10 g, 0.82 mmol) 및 4-트리플루오로메틸-벤젠술포닐 클로라이드 (48, 2.14 g, 8.75 mmol)를 첨가하였다. 반응 혼합물을 실온에서 철야 교반하였다. 반응물을 농축하고, 물에 붓고, 1N HCl을 사용하여 pH 2로 산성화시키고, 에틸 아세테이트로 추출하였다. 유기층을 염수로 세척하고, 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 농축하였다. 잔사를 에틸 아세테이트로 세척하여 백색 고체를 요구되는 화합물 (49, 2.80 g, 84.8％)로서 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 381.0, 383.0.
단계 2 - N-5-[히드록시-(1- 트리이소프로필실라닐 -1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3-일)-메틸]-피리딘-2-일-4- 트리플루오로메틸 - 벤젠술폰아미드 (50)의 합성:
테트라히드로푸란 (50.0 mL) 중의 N-(5-브로모-피리딘-2-일)-4-트리플루오로메틸-벤젠술폰아미드 (49, 0.96 g, 2.5 mmol)에 질소 분위기 하에서 -78℃에서 t-부틸리튬 (4.62 mL, 헥산 중의 1.70 M)을 서서히 첨가하였다. 15분 후, 테트라히드로푸란 (15.0 mL) 중의 1-트리이소프로필실라닐-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르브알데히드 (47, 0.30 g, 0.99 mmol, 실시예 18에 기재된 바와 같이 제조)를 반응물에 첨가하였다. 30분 후, 반응물을 10분 동안 실온으로 가온하였다. 반응물을 물에 붓고, 1N HCl을 사용하여 약 pH 2로 산성화시키고, 에틸 아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하였다. 여액을 농축하고, 헥산 중의 20％ 에틸 아세테이트로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하여 백색 고체 화합물 (5O, 0.55 g, 90.1％)을 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 605.3.
단계 3 - N-[5-(1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3- 일메틸 )-피리딘-2-일]-4- 트리플루오로메틸 - 벤젠술폰아미드 (P-0071)의 합성:
아세토니트릴 (15.0 mL) 중의 N-5-[히드록시-(1-트리이소프로필실라닐-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메틸]-피리딘-2-일-4-트리플루오로메틸-벤젠술폰아미드 (50, 0.27 g, 0.45 mmol)에 트리플루오로아세트산 (1.0 mL, 0.013 mol) 및 트리에틸실란 (2.0 mL, 0.012 mol)을 첨가하였다. 반응물을 1시간 동안 85℃로 가열하였 다. 반응물을 농축하고, 물에 붓고, 에틸 아세테이트로 추출하였다. 유기층을 헥산 중의 50％ 에틸 아세테이트로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피로 정제하여 백색 고체 화합물 (P-0071, 28.5 mg, 14.7％)을 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 433.2.
4-클로로-N-[5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-벤즈아미드 P-0074
Figure 112007090494669-PCT00049
는 단계 1에서 4-트리플루오로메틸-벤젠술포닐 클로라이드 48을 4-클로로-벤조일 클로라이드로 치환하여 반응식 21의 프로토콜에 따라 제조하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 363.2.
실시예 20: N-[5-(1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3- 일메틸 )-피리딘-2-일]-4- 트리플루오로메틸 - 벤즈아미드 (P-0072)의 합성
N-[5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-4-트리플루오로메틸-벤즈아미드 P-0072를 반응식 22에 제시된 바와 같이 (3-(6-브로모-피리딘-3-일메틸)-1-트리이소프로필실라닐-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 6a로부터 1단계로 합성하였다.
반응식 22
Figure 112007090494669-PCT00050
단계 1 - N-[5-(1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3- 일메틸 )-피리딘-2-일]-4- 트리플루오로메틸 - 벤즈아미드 (P-0072)의 합성:
1,4-디옥산 (4.0 mL) 중의 3-(6-브로모-피리딘-3-일메틸)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 (6a, 50.0 mg, 0.000174 mol, 실시예 2에 기재된 바와 같이 제조)에 4-트리플루오로메틸-벤즈아미드 (51, 70.0 mg, 0.37 mmol), 크산트포스 (Xanthphos) (15.0 mg, 0.026 mmol), 탄산세슘 (130.0 mg, 0.40 mmol) 및 트리스(디벤질리덴아세톤)-디팔라듐(O) (25.0 mg, 0.024 mmol)을 질소 분위기 하에 첨가하였다. 반응물을 CEM Discover 마이크로파 장비에서 10분 동안 120℃로 가열하였다. 반응물을 물에 붓고, 에틸 아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하였다. 여액을 농축하고, 헥산 중의 50％ 에틸 아세테이트로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하여 백색 고체 (P-0072, 4.7 mg, 6.8％)를 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 397.2.
4-플루오로-N-[5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-벤즈아미드 P-0073
Figure 112007090494669-PCT00051
은 4-트리플루오로메틸-벤즈아미드를 4-플루오로메틸-벤즈아미드로 치환하여 반응식 22의 프로토콜에 따라 제조하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 347.2.
실시예 21: (4- 클로로 - 페닐 )-[5-(1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3- 일메틸 )-피리딘-2- 일메틸 ]-아민 (P-0078)의 합성
(4-클로로-페닐)-[5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일메틸]-아민 P-0078을 반응식 23에 제시된 바와 같이 5-브로모-피리딘-2-카르브알데히드 52로부터 3 단계로 합성하였다.
반응식 23
Figure 112007090494669-PCT00052
단계 1 - (5- 브로모 -피리딘-2- 일메틸 )-(4- 클로로 - 페닐 )-아민 (54)의 합성:
아세토니트릴 (50.0 mL) 중의 5-브로모-피리딘-2-카르브알데히드 (52, 1.00 g, 5.38 mmol)에 p-클로로아닐린 (53, 0.686 g, 5.38 mmol), 트리에틸실란 (6.00 mL, 0.0376 mol) 및 트리플루오로아세트산 (3.00 mL, 0.0389 mol)을 첨가하였다. 반응물을 3시간 동안 환류로 가열하였다. 반응물을 농축하고, 물에 붓고, 에틸 아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하였다. 여액을 농축하고, 헥산 중의 20％ 에틸 아세테이트로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하여 백색 고체 (54, 0.75 g, 47.0％)를 수득하였다.
단계 2- (1- 벤젠술포닐 -1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3-일)-6-[(4- 클로로 - 페닐아미노 )-메틸]-피리딘-3-일-메탄올 (56)의 합성:
질소 분위기 하에서 -78℃에서 테트라히드로푸란 (15.0 mL) 중의 (5-브로모-피리딘-2-일메틸)-(4-클로로-페닐)-아민 (54, 0.380 g, 1.28 mmol)에 n-부틸리튬 (0.850 mL, 헥산 중의 1.60 M)을 첨가하였다. 10분 후, 테트라히드로푸란 (5.0 mL) 중의 1,2-비스-(클로로-디메틸-실라닐)-에탄 (0.135 g, 0.627 mmol)을 반응물에 첨가하였다. 반응물을 40분 동안 실온으로 가온시켰다. 반응물을 -78℃로 냉각시킨 후, 헥산 (1.58 mL) 중의 1.70 M t-부틸리튬을 첨가하였다. 30분 후, 테트라히드로푸란 (10.0 mL) 중의 1-벤젠술포닐-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르브알데히드 (55, 0.380 g, 1.33 mmol, 실시예 18에 기재된 바와 같이 제조)를 반응물에 첨가하였다. 20분 후, 반응물을 실온으로 가온시켰다. 반응물을 물에 붓고, 에틸 아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하였다. 여액을 농축하고, 헥산 중의 50％ 에틸 아세테이트로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하여 화합물 (56, 0.30 g, 46.0％)을 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 505.3.
단계 3 - (4- 클로로 - 페닐 )-5-[ 메톡시 -(1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3-일)- 메틸 ]-피리딘-2- 일메틸 -아민 (57):
메탄올 (20.0 mL) 중의 (1-벤젠술포닐-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-6-[(4-클로로-페닐아미노)-메틸]-피리딘-3-일-메탄올 (56, 120.0 mg, 0.24 mmol)에 수산화칼륨 (0.400 g, 7.13 mmol) 및 물 (5.0 mL, 0.28 mol)을 첨가하였다. 반응물을 10시간 동안 50℃로 가열하였다. 반응물을 물에 붓고, 에틸 아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하였다. 여액을 농축하고, 헥산 중의 20％ 에틸 아세테이트로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하여 화합물 (57, 30 mg, 33.0％)을 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 379.4.
단계 4 - (4- 클로로 - 페닐 )-[5-(1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3- 일메틸 )-피리딘-2- 일메틸 ]-아민 (P-0078)의 합성:
아세토니트릴 (10.0 mL) 중의 (4-클로로-페닐)-5-[메톡시-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메틸]-피리딘-2-일메틸-아민 (57, 20.8 mg, 0.055 mmol)에 트리플루오로아세트산 (0.50 mL, 6.5 mmol) 및 트리에틸실란 (1.00 mL, 6.26 mmol)을 첨가하였다. 반응물을 3시간 동안 환류로 가열한 후, 물에 붓고, 에틸 아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하였다. 여액을 농축하고, 디클로로메탄 중의 10％ 메탄올로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그 래피에 의해 정제하여 화합물 (P-0078, 6.1 mg, 32.0％)을 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 349.4.
실시예 22: (4- 클로로 -벤질)-[6- 플루오로 -5-(1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3- 일메틸 )-피리딘-2-일]-아민 (P-0082)의 합성
(4-클로로-벤질)-[6-플루오로-5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-아민 P-0082를 반응식 24에 제시된 바와 같이 2,6-디플루오로피리딘 58로부터 8 단계로 합성하였다.
반응식 24
Figure 112007090494669-PCT00053
단계 1 - 2,6- 디플루오로 -니코틴산 (59)의 합성:
질소 분위기 하에서 -78℃에서 테트라히드로푸란 (150.0 mL) 중의 2,6-디플루오로피리딘 (58, 7.10 g, 0.0617 mol)에 n-부틸리튬 (26.0 mL, 헥산 중의 2.50 M)을 서서히 첨가하였다. 30분 후, 드라이 아이스 (3.0 g)를 반응물에 첨가하였다. 1시간 후, 반응물을 실온으로 가온시킨 후, 물에 붓고, 에틸 아세테이트로 추출하였다. 수성층을 1 N HCl을 사용하여 pH = 4-5로 산성화시키고, 에틸 아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과한 후 농축하여 조질 화합물을 담황색 고체 (59, 5.6 g, 57.0％)로서 수득하였다.
단계 2 - 2,6- 디플루오로 -니코틴산 메틸 에스테르 (60)의 합성:
메탄올 (60.0 mL) 중의 2,6-디플루오로-니코틴산 (59, 5.60 g, 0.0352 mol)에 진한 황산 (1.0 mL, 0.019 mol)을 첨가하였다. 반응물을 환류로 철야 가열한 후, 물에 붓고, 1M 탄산칼륨을 사용하여 약 pH 9로 염기성화시키고, 에틸 아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 농축하여 황색 오일 (60, 3.5 g, 57.0％)을 수득하였다.
단계 3 - 6-(4- 클로로 - 벤질아미노 )-2- 플루오로 -니코틴산 메틸 에스테르 (62)의 합성:
질소 분위기 하에서 -40℃에서 N,N-디메틸포름아미드 (20.0 mL) 중의 2,6-디플루오로-니코틴산 메틸 에스테르 (60, 2.00 g, 0.0116 mol)에 p-클로로벤질아민 (61, 2.60 mL, 0.0214 mol)을 첨가하였다. 반응물을 -40℃ 내지 -20℃에서 2시간 동안 교반한 후, 물에 붓고, 에틸 아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하였다. 여액을 농축하고, 헥산 중의 25％ 에틸 아세테이트로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하여 화합물 (62, 2.0 g, 58.7％)을 수득하였다.
단계 4 - [6-(4- 클로로 - 벤질아미노 )-2- 플루오로 -피리딘-3-일]-메탄올 (63)의 합성:
테트라히드로푸란 (100.0 mL) 중의 6-(4-클로로-벤질아미노)-2-플루오로-니코틴산 메틸 에스테르 (62, 2.00 g, 6.79 mmol)에 리튬 테트라히드로알루미네이트 (13.6 mL, 테트라히드로푸란 중의 1.00 M)를 질소 분위기 하에서 첨가하였다. 반응물을 실온에서 철야 교반하였다. 반응물에 과량의 NaSO4·10H2O를 첨가한 후, 1시간 동안 교반하였다. 여과, 농도 및 헥산 중의 30％ 에틸 아세테이트로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의한 정제를 통해 화합물 63 (1.0 g, 55.0％)을 수득하였다.
단계 5 - 6-(4- 클로로 - 벤질아미노 )-2- 플루오로 -피리딘-3- 카르브알데히드 (64)의 합성:
테트라히드로푸란 (50.0 mL) 중의 [6-(4-클로로-벤질아미노)-2-플루오로-피리딘-3-일]-메탄올 (63, 1.0 g, 3.7 mmol)에 데스-마르틴 페리오디난 (1.75 g, 4.12 mmol)을 첨가하였다. 반응물을 실온에서 10분 동안 교반한 후, 물에 붓고, 에틸 아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하였다. 여액을 농축하고, 헥산 중의 20％ 에틸 아세테이트로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하여 백색 고체 (64, 0.67 g, 68.0％)를 수득하였다.
단계 6 - (4- 클로로 -벤질)-(6- 플루오로 -5- 포르밀 -피리딘-2-일)- 카르밤산 t-부틸 에스테르 (65)의 합성:
디클로로메탄 (16.2 mL) 중의 6-(4-클로로-벤질아미노)-2-플루오로-피리딘-3-카르브알데히드 (64, 670.0 mg, 2.53 mmol)에 디-t-부틸디카르보네이트 (1.23 g, 5.65 mmol) 및 4-디메틸아미노피리딘 (16.2 mg, 0.133 mmol)을 첨가하였다. 반응물을 실온에서 철야 교반하였다. 반응물을 농축하고, 헥산 중의 30％ 에틸 아세테이트로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하여 백색 고체 (65, 0.63 g, 68.0％)를 수득하였다.
단계 7 - (5-[1-(t-부틸-디메틸- 실라닐 )-1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3-일]-히드록시-메틸-6- 플루오로 -피리딘-2-일)-(4- 클로로 -벤질)- 카르밤산 t-부틸 에스테르 (67)의 합성:
질소 분위기 하에서 -20℃에서 1-(t-부틸-디메틸-실라닐)-3-요오도-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 (66, 0.53 g, 0.0015 mol) 및 테트라히드로푸란 (15.0 mL)에 이소프로필마그네슘 클로라이드 (0.78 mL, 테트라히드로푸란 중의 2.0 M)를 첨가하였다. 반응물을 0℃로 가온시킨 후 (약 80분), -20℃로 냉각시키고, 테트라히드로푸란 (6.0 mL) 중의 (4-클로로-벤질)-(6-플루오로-5-포르밀-피리딘-2-일)-카르밤산 t-부틸 에스테르 (65, 0.200 g, 0.55 mmol)를 첨가하였다. 반응물을 1시간 내에 실온으로 가온시킨 후, 물에 붓고, 에틸 아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하였다. 여액을 농축하고, 헥산 중의 20％ 에틸 아세테이트로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하여 황색 고체 (67, 0.20 g, 61.1％)를 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 597.4.
단계 8 - (4- 클로로 -벤질)-[6- 플루오로 -5-(1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3- 일메틸 )-피리딘-2-일]-아민 (P-0082)의 합성:
아세토니트릴 (10.0 mL) 중의 (5-[1-(t-부틸-디메틸-실라닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일]-히드록시-메틸-6-플루오로-피리딘-2-일)-(4-클로로-벤질)-카르밤산 t-부틸 에스테르 (67, 0.10 g, 0.17 mmol)에 트리에틸실란 (1.00 mL, 6.26 mmol) 및 트리플루오로아세트산 (0.50 mL, 6.5 mmol)을 첨가하였다. 반응물을 2시간 동안 환류로 가열한 후, 수성 탄산칼륨에 붓고, 에틸 아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하였다. 여액을 농축하고, 헥산 중의 30％ 에틸 아세테이트로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하여 백색 고체 (P-0082, 43.2 mg, 70.0％)를 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 367.4.
실시예 23: (4- 클로로 -벤질)-[6- 메톡시 -5-(1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3- 일메틸 )-피리딘-2-일]-아민 (P-0081)의 합성.
(4-클로로-벤질)-[6-메톡시-5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-아민 P-0081을 반응식 25에 제시된 바와 같이 (4-클로로-벤질)-(6-플루오로-5-포르밀-피리딘-2-일)-카르밤산 t-부틸 에스테르 65로부터 2 단계로 합성하였다.
반응식 25
Figure 112007090494669-PCT00054
단계 1 - (4- 클로로 -벤질)-5-[히드록시-(1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3-일)- 메틸 ]-6-메톡시-피리딘-2-일- 카르밤산 t-부틸 에스테르 (68)의 합성:
메탄올 (30.0 mL) 중의 1H-피롤로[2,3-b]피리딘 (1, 90.0 mg, 0.76 mmol)에 (4-클로로-벤질)-(6-플루오로-5-포르밀-피리딘-2-일)-카르밤산 t-부틸 에스테르 (65, 300.0 mg, 0.82 mmol) 및 수산화칼륨 (720.0 mg, 12.83 mmol)을 질소 분위기 하에서 첨가하였다. 반응물을 실온에서 2시간 동안 교반한 후, 물에 붓고, 에틸 아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하였다. 여액을 농축하고, 헥산 중의 20％ 에틸 아세테이트로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하여 화합물 (68, 60 mg, 15.9％)를 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 495.3.
단계 2 - (4- 클로로 -벤질)-[6- 메톡시 -5-(1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3- 일메틸 )-피리딘-2-일]-아민 (P-0081)의 합성.
아세토니트릴 (10.0 mL) 중의 (4-클로로-벤질)-5-[히드록시-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메틸]-6-메톡시-피리딘-2-일-카르밤산 t-부틸 에스테르 (68, 40.0 mg, 0.081 mmol)에 트리플루오로아세트산 (0.30 mL, 0.0039 mol) 및 트리에틸실란 (0.60 mL, 0.0038 mol)을 첨가하였다. 반응물을 3시간 동안 환류로 가열하였다. 반응물을 농축시켜 용매를 제거한 후, 헥산 중의 40％ 에틸 아세테이트로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피로 정제하여 화합물 (P-0081, 10 mg, 32.7％)을 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 379.4.
실시예 24: 5-(1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3- 일메틸 )-피리딘-2- 카르복실산 (4- 클로로 -페닐)-아미드 (P-0076)의 합성
5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-카르복실산 (4-클로로-페닐)-아미드 P-0076을 반응식 26에 제시된 바와 같이 5-브로모-피리딘-2-카르보닐 클로라이드 69로부터 3 단계로 합성하였다.
반응식 26
Figure 112007090494669-PCT00055
단계 1 - 5- 브로모 -피리딘- 카르복실산 (4- 클로로 - 페닐 )-아미드 (70)의 합성:
아세토니트릴 (29.0 mL) 중의 5-브로모-피리딘-2-카르보닐 클로라이드 (69, 0.76 g, 3.4 mmol)에 p-클로로아닐린 (53, 0.702 g, 5.50 mmol), 4-디메틸아미노-피리딘 (0.12 g, 0.96 mmol) 및 피리딘 (2.9 mL, 0.036 mol)을 첨가하였다. 반응 물을 68℃에서 철야 교반한 후, 물에 붓고, 1 N HCl을 사용하여 약 pH 1로 산성화시키고, 에틸 아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하였다. 여액을 농축하고, 디클로로메탄으로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하여 백색 고체 (70, 0.75 g, 70.0％)를 수득하였다.
단계 2 - 5-[히드록시-(1- 트리이소프로필실라닐 -1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3-일)- 메틸 ]-피리딘-2- 카르복실산 (4- 클로로 - 페닐 )-아미드 (71)의 합성:
질소 분위기 하에서 -78℃에서 테트라히드로푸란 (20.0 mL) 중의 5-브로모-피리딘-2-카르복실산 (4-클로로-페닐)-아미드 (70, 0.50 g, 1.60 mmol)에 t-부틸리튬 (3.02 mL, 헥산 중의 1.70 M)을 첨가하였다. 20분 후, 테트라히드로푸란 (10.0 mL) 중의 1-트리이소프로필실라닐-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르브알데히드 (47, 0.39 g, 1.3 mmol, 실시예 18에 기재된 바와 같이 제조)를 반응물에 첨가하였다. 반응물을 -78℃에서 1시간 동안 교반한 후, 10분 동안 실온으로 가온시켰다. 반응물을 물에 붓고, 에틸 아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하였다. 여액을 농축하고, 헥산 중의 20％ 에틸 아세테이트로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하여 화합물을 무색 오일 (71, 100 mg, 14％)로서 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 535.3.
단계 3 - 5-(1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3- 일메틸 )-피리딘-2- 카르복실산 (4- 클로로 -페닐)-아미드 (P-0076)의 합성.
아세토니트릴 (10.0 mL) 중의 5-[히드록시-(1-트리이소프로필실라닐-1H-피롤 로[2,3-b]피리딘-3-일)-메틸]-피리딘-2-카르복실산 (4-클로로-페닐)-아미드 (71, 100.0 mg, 0.19 mmol)에 트리플루오로아세트산 (0.20 mL, 2.6 mmol) 및 트리에틸실란 (0.40 mL, 2.5 mmol)을 첨가하였다. 반응물을 80℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응물을 농축하고, 헥산 중의 20％ 에틸 아세테이트로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하여 황색 고체 화합물 (P-0076, 5.5 mg, 8.1％)를 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 361.1.
실시예 25: [6-(3-히드록시- 페닐아미노 )-피리딘-3-일]-(1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3-일)- 메타논 (P-0027)의 합성
[6-(3-히드록시-페닐아미노)-피리딘-3-일]-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메타논 P-0027을 반응식 27에 제시된 바와 같이 [6-(3-벤질옥시-페닐아미노)-피리딘-3-일]-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메타논 P-0026으로부터 1 단계로 합성하였다.
반응식 27
Figure 112007090494669-PCT00056
메탄올 (5.0 mL) 중의 [6-(3-벤질옥시-페닐아미노)-피리딘-3-일]-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메타논 (P-0026, 12.0 mg, 0.0285 mmol)에 탄소 (10.0 mg) 상의 20％ 수산화팔라듐을 수소 분위기 하에 첨가하였다. 반응물을 실온에서 5시간 동안 교반하였다. 여과 및 농축에 의해 화합물 (P-0027, 3.5 mg, 37％)을 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+= 331.
실시예 26: 3-[6-(3- 트리플루오로메틸 - 벤질옥시 )-피리딘-3- 일메틸 ]-1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 P-0057의 합성
3-[6-(3-트리플루오로메틸-벤질옥시)-피리딘-3-일메틸]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 P-0057을 반응식 28에 제시된 바와 같이 상업적으로 입수가능한 7-아자인돌로부터 4 단계로 합성하였다.
반응식 28
Figure 112007090494669-PCT00057
단계 1 - (6- 클로로 -피리딘-3-일)-(1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3-일)- 메타논 (7)의 제조:
디클로로메탄 중의 7-아자인돌 1에 6-클로로니코티노일 클로라이드 8, 이어서 염화알루미늄을 질소 분위기 하에서 -10℃에서 첨가하였다. 반응물을 교반하여 실온으로 철야 가온시켰다. 반응물을 3 N 염산으로 켄칭시키고, 진한 염산을 모든 고체가 용해될 때까지 첨가하였다. 혼합물을 디클로로메탄으로 추출하고, 유기 부분을 합하여 황산마그네슘으로 건조시키고, 여과하여 여액을 농축하였다. 생성되 는 고체 물질을 클로로포름/헥산으로부터 재결정화시켜 (6-클로로-피리딘-3-일)-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메타논 7을 수득하고, 추가의 정제 없이 다음 단계에 사용하였다.
단계 2 - (1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3-일)-[6-(3- 트리플루오로메틸 - 벤질옥시 )-피리딘-3-일]- 메타논 (73)의 제조:
DMSO 중의 (6-클로로-[피리딘-3-일)-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메타논 7에 (3-트리플루오로메틸-페닐)-메탄올 72를 첨가하였다. 수소화나트륨을 첨가하고, 반응물을 60℃로 2시간 동안 가열하였다. 반응물을 물로 켄칭하고, 에틸 아세테이트로 추출하였다. 유기 부분을 황산마그네슘으로 건조시키고 농축하여 (1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-[6-(3-트리플루오로메틸-벤질옥시)-피리딘-3-일]-메타논 73을 수득하고, 추가의 정제 없이 다음 단계에 사용하였다.
단계 3 - (1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3-일)-[6-(3- 트리플루오로메틸 - 벤질옥시 )-피리딘-3-일]-메탄올 (74)의 제조:
에탄올 중의 (1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-[6-(3-트리플루오로메틸-벤질옥시)-피리딘-3-일]-메타논 73에 수소화붕소나트륨을 첨가하였다. 1시간 후, 반응물을 물로 켄칭하고, 에틸 아세테이트로 추출하였다. 유기 부분을 황산마그네슘으로 건조시키고 농축하여 (1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-[6-(3-트리플루오로메틸-벤질옥시)-피리딘-3-일]-메탄올 74를 수득하고, 추가의 정제 없이 다음 단계에 사용하였다.
단계 4 - 3-[6-(3- 트리플루오로메틸 - 벤질옥시 )-피리딘-3- 일메틸 ]-1H- 피롤로[2,3-b] 피리딘 P-0057의 제조
(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-[6-(3-트리플루오로메틸-벤질옥시)-피리딘-3-일]-메탄올 74를 9:1의 트리플루오로아세트산:트리에틸실란에 용해시켰다. 반응물을 실온에서 15시간 동안 교반하였다. 반응물을 물로 희석하고, 에틸 아세테이트로 추출하여 농축하였다. 조질 물질을 역상 HPLC에 의해 정제하여 3-[6-(3-트리플루오로메틸-벤질옥시)-피리딘-3-일메틸]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 P-0057을 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+= 384.3.
(3-트리플루오로메틸-페닐)-메탄올을 적절한 벤질 알콜로 치환하여 반응식 28의 단계 2-4를 사용하여 추가의 화합물을 제조할 수 있다. 하기 화합물을 상기 과정에 따라 제조하였다:
3-[6-(4-클로로-벤질옥시)-피리딘-3-일메틸]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 (P-0056)
3-[6-(3-클로로-벤질옥시)-피리딘-3-일메틸]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 (P-0055)
상기 과정의 단계 2에 사용된 벤질 알콜을 하기 표의 컬럼 2에 나타내고, 화합물 구조는 컬럼 3에 나타내었다. 컬럼 1은 화합물 번호를 제시하고, 컬럼 4는 측정된 질량 분광 결과를 나타낸다.
Figure 112007090494669-PCT00058
실시예 27: [2- 클로로 -6-(4- 클로로 - 벤질아미노 )-피리딘-3-일]-(1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3-일)- 메타논 P-0048의 합성
[2-클로로-6-(4-클로로-벤질아미노)-피리딘-3-일]-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메타논 P-0048을 반응식 29에 제시된 바와 같이 상업적으로 입수가능한 2,6-디클로로피리딘-3-카르복실산 75로부터 3 단계로 합성하였다.
반응식 29
Figure 112007090494669-PCT00059
단계 1 - 2,6- 디클로로피리딘 -3-카르보닐 클로라이드 (76)의 제조:
디클로로메탄 (75 mL) 중의 2,6-디클로로[피리딘-3-카르복실산 (75, 1.00 g, 0.00521 mol)에 2 M 옥살릴 클로라이드 (2.61 mL, 0.727 g, 0.00573 mol)를 첨가하였다. 용액은 격렬한 기체 발생을 보이기 시작하였고, 이것은 약 2시간 동안 느리 지만 계속 발생하였다. 반응을 실온에서 추가로 3시간 동안 계속 진행되도록 하였다. 반응물을 농축하여 화합물을 정치시에 결정화되는 갈색 오일 (76, 1.09 g, 99％)로서 수득하였다.
단계 2 - (2,6- 디클로로피리딘 -3-일)(1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3-일) 메타논 (77)의 제조:
질소 분위기 하에서 삼염화알루미늄 (4.18 g, 0.0314 mol) 및 디클로로메탄 (97.5 mL, 1.52 mol)에 디클로로메탄 (5.0 mL) 중의 1H-피롤로[2,3-b]피리딘 (1, 828.5 mg, 0.0070 mol)에 첨가하였다. 반응물을 실온에서 60분 동안 교반한 후, 디클로로메탄 (6.0 mL) 중의 2,6-디클로로피리딘-3-카르보닐 클로라이드 (76, 1.09 g, 0.00523 mol)를 첨가하였다. 반응물을 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 형성된 침전물 및 니트로메탄을 거의 모든 고체가 용해될 때까지 ~1 mL씩 첨가하였다 (8 mL). 추가로 60분 동안 실온에서 정치시킨 후, 반응물을 서서히 물에 붓고, 에틸 아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수 황산마그네슘으로 건조시키고, 여과하였다. 여액을 농축하여 1.54 g의 고체를 수득하였고, 이를 철야 정치시키자 어두운 자주색으로 변하였다. 고체를 디클로로메탄으로 처리하고, 불용성 물질을 진공 여과에 의해 수거하여 화합물 (77, 863 mg, 57％)을 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+= 292.2.
단계 3 - [2- 클로로 -6-(4- 클로로 - 벤질아미노 )-피리딘-3-일]-(1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3-일)- 메타논 (P-0048)의 제조:
(2,6-디클로로피리딘-3-일)(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)메타논 (77, 0.0570 g, 0.195 mmol)에 2-프로판올 (1.5 mL), 이어서 p-클로로벤질아민 (61, 49.8 ㎕, 0.410 mmol)을 첨가하였다. 반응물을 300와트로, 100℃에서 10분 동안, 120℃에서 10분 동안, 마지막으로 150℃에서 10분 동안 마이크로파 처리하였다. 추가의 p-클로로벤질아민 (50 ㎕, 0.410 mmol)을 첨가하고, 반응을 150℃에서 20분 동안 계속 진행시켰다. 반응물을 에틸 아세테이트 및 1 M 중탄산나트륨으로 추출하였다. 유기층을 무수 황산마그네슘으로 건조시키고, 여과하였다. 여액을 농축하고, 디클로로메탄, 이어서 1％ 메탄올로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하여 화합물 (P-0048, 47 mg, 61％)를 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 397.3.
2,6-디클로로피리딘-3-카르복실산을 적절한 카르복실산으로 치환하여 반응식 29에 따라 추가의 화합물을 제조할 수 있다. (6-(4-클로로벤질아미노)-2-(트리플루오로메틸)피리딘-3-일)(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)메타논 P-0070
Figure 112007090494669-PCT00060
은 카르복실산으로서 6-클로로-2-트리플루오로메틸-니코틴산 (문헌 [Cottet, F. and Schlosser, M. Eur. J. Org. Chem. 2004, 3793-3798]에 따라 상업적으로 입수가능한 2-클로로-6-(트리플루오로메틸)피리딘으로부터 2단계로 제조함)을 사용하여 상기 프로토콜에 따라 제조하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 431.2.
실시예 28: 3-((1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3-일) 메틸 )-6-(4- 클로로벤질아미노 )피리딘-2-올 P-0051의 합성
3-((1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)메틸)-6-(4-클로로벤질아미노)피리딘-2-올 P-0051을 반응식 30에 제시된 바와 같이 [2-클로로-6-(4-클로로-벤질아미노)-피리딘-3-일]-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메타논 P-0048로부터 2 단계로 합성하였다.
반응식 30
Figure 112007090494669-PCT00061
단계 1 - (6-(4- 클로로벤질아미노 )-2- 클로로피리딘 -3-일)(1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3-일)메탄올 (P-0050)의 제조:
[2-클로로-6-(4-클로로-벤질아미노)-피리딘-3-일]-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메타논 (P-0048, 0.045 g, 0.00011 mol, 실시예 27에 기재된 바와 같이 제조)에 메탄올 (10 mL) 및 수소화붕소나트륨 (0.00428 g, 0.000113 mol)을 첨가하였다. 반응물을 50℃에서 철야 교반하였다. 휘발물질을 반응물로부터 제거하고, 생성되는 물질을 에틸 아세테이트 및 1M 수성 중탄산나트륨으로 추출하였다. 유기층을 황산마그네슘으로 건조시키고 여과하였다. 여액을 농축하고, 디클로로메탄, 이 어서 디클로로메탄 중의 1％ 메탄올로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하여 화합물 (P-0050, 31 mg, 68％)를 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 399.2.
단계 2 - 3-((1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3-일) 메틸 )-6-(4- 클로로벤질아미노 )피리딘-2-올 (P-0051)의 제조:
아세토니트릴 (1 mL)에 용해시킨 (6-(4-클로로벤질아미노)-2-클로로피리딘-3-일)(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)메탄올 (P-0050, 0.028 g, 0.000070 mol)에 트리에틸실란 (42.6 ㎕, 0.000266 mol) 및 트리플루오로아세트산 (28.4 ㎕, 0.000368 mol)을 첨가하였다. 반응물을 85℃에서 철야 가열하였다. 반응물을 에틸 아세테이트 및 포화 중탄산나트륨으로 추출하였다. 유기층을 분리하고, 황산마그네슘으로 건조시키고 여과하였다. 여액을 농축하고, 디클로로메탄, 디클로로메탄 중의 3％, 5％ 및 마지막으로 10％ 메탄올로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하여 화합물을 백색 고체 (P-0051, 20 mg, 78％)로서 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 365.3.
실시예 29: 5 치환된 7- 아자인돌 중간체의 합성
5-(2-모르폴린-4-일-에톡시)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 79를 반응식 31에 제시된 바와 같이 상업적으로 입수가능한 5-브로모-아자인돌로부터 1 단계로 합성하였다.
반응식 31
Figure 112007090494669-PCT00062
단계 1 - 5-(2-모르폴린-4-일- 에톡시 )-1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 (79):
N,N-디메틸포름아미드 (30 mL) 중의 4-모르폴린에탄올 (30 mL, 0.2 mol)에 서서히 수소화나트륨 (7 g, 광물유 중의 60％ 분산액, 0.2 mol)을 첨가하였다. 용액이 투명해진 후, N,N-디메틸포름아미드 (5 mL) 및 브롬화구리(I) (1.4 g, 0.0098 mol) 중의 5-브로모-7-아자인돌 (44, 1.0 g, 0.0051 mol)의 용액을 첨가하였다. 반응 혼합물을 120℃에서 질소 하에 2시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 농축하고, 잔사를 에틸 아세테이트 및 물에 용해시켰다. 유기층을 수거하고, 염화암모늄 및 수산화암모늄 (4:1)의 용액, 염수로 세척하고, 황산마그네슘으로 건조시켰다. 용매 제거 후, 잔사를 헥산 중의 에틸 아세테이트로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하여 화합물을 회백색 고체 (79, 0.62 g, 50％)로서 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 248.25.
4-모르폴린에탄올을 2-디에틸아미노-에탄올, 3-디에틸아미노-프로판-1-올, 2-피페리딘-1-일-에탄올, 또는 2-피롤리딘-1-일-에탄올로 치환하여 각각 디에틸-[2-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일옥시)-에틸]-아민, 디에틸-[3-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일옥시)-프로필]-아민, 5-(2-피페리딘-1-일-에톡시)-1H-피롤로[2,3-b]피 리딘, 및 5-(2-피롤리딘-1-일-에톡시)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘을 제공하여 추가의 5-치환된 7-아자인돌을 반응식 31의 프로토콜에 따라 제조하였다,
실시예 30: {5-[5-(2-모르폴린-4-일- 에톡시 )-1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3- 일메틸 ]-피리딘-2-일}-(4- 트리플루오로메틸 -벤질)-아민 P-0065의 합성:
{5-[5-(2-모르폴린-4-일-에톡시)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸]-피리딘-2-일}-(4-트리플루오로메틸-벤질)-아민 P-0065를 반응식 32에 제시된 바와 같이 (5-브로모-피리딘-2-일)-(4-트리플루오로메틸벤질)-아민 17로부터 4 단계로 합성하였다.
반응식 32
Figure 112007090494669-PCT00063
단계 1 - 6-(4- 트리플루오로메틸 - 벤질아미노 )-피리딘-3- 카르브알데히드 (18)의 제조:
테트라히드로푸란 (150 mL) 중의 (5-브로모-피리딘-2-일)-(4-트리플루오로메틸-벤질)-아민 (17, 3.55 g, 0.0107 mol, 상업적으로 입수가능하거나, 또는 실시예 10에 기재된 바와 같이 제조)의 용액에 t-부틸리튬 (13.2 mL, 펜탄 중의 1.70 M, 0.0224 mol)을 질소 분위기 하에서 -78℃에서 10분에 걸쳐 서서히 첨가하였다. 반응 혼합물을 -78℃에서 90분 동안 교반하였다. N,N-디메틸포름아미드 (2.2 mL, 0.028 mol)를 서서히 반응 혼합물에 첨가하였다. 반응 혼합물을 -78℃에서 2시간 동안 교반한 후, 실온으로 가온시켰다. 실온에서 2시간 동안 교반한 후, 반응 혼합물을 빙수에 붓고, 에틸 아세테이트로 추출하였다. 유기상을 포화 중탄산나트륨, 염수로 세척하고, 황산마그네슘으로 건조시켰다. 용매 제거 후, 잔사를 헥산 중의 에틸 아세테이트로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하여 화합물을 담황색 고체 (18, 1.67 g, 56％)로서 수득하였다.
단계 2 - (5- 포르밀 -피리딘-2-일)-(4- 트리플루오로메틸 -벤질)- 카르밤산 t-부틸 에스테르 (19)의 제조:
디클로로메탄 (100 mL) 중의 6-(4-트리플루오로메틸-벤질아미노)-피리딘-3-카르브알데히드 (18, 3.7 g, 0.013 mol) 및 디-t-부틸디카르보네이트 (3.4 g, 0.016 mol)이 용액에 N,N-디이소프로필에틸아민 (4.6 mL, 0.026 mol) 및 4-디에틸아미노피리딘 (0.2 g, 0.002 mol)을 첨가하였다. 반응 혼합물을 실온에서 철야 교반하였다. 반응 혼합물을 농축시킨 후, 에틸 아세테이트에 용해시켰다. 용액을 염산 (10％), 포화 중탄산나트륨, 염수로 세척하고, 황산마그네슘으로 건조시켰다. 용매 제거 후, 잔사를 헥산 중의 에틸 아세테이트로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하여 화합물을 백색 고체 (19, 4.38 g, 87％)로서 수득하였다.
단계 4 - (5-{히드록시-[5-(2-모르폴린-4-일- 에톡시 )-1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3- 일]- 메틸 }-피리딘-2-일)-(4- 트리플루오로메틸 -벤질)- 카르밤산 t-부틸 에스테 르 (80)의 제조:
메탄올 (25 mL) 중의 (5-포르밀-피리딘-2-일)-(4-트리플루오로메틸-벤질)-카르밤산 t-부틸 에스테르 (19, 315 mg, 0.828 mmol), 5-(2-모르폴린-4-일-에톡시)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 (79, 205 mg, 0.829 mmol, 실시예 29에 기재된 바와 같이 제조), 및 수산화칼륨 (70 mg, 1 mmol)의 혼합물을 실온에서 철야 교반하였다. 반응 혼합물을 빙수에 붓고, 에틸 아세테이트로 추출하고, 염수로 세척하고, 황산나트륨으로 건조시켰다. 용매 제거 후, 잔사를 디클로로메탄 중의 메탄올로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하여 화합물을 황색 고체 (80, 0.2 g, 40％)로서 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 628.42.
단계 5 - {5-[5-(2-모르폴린-4-일- 에톡시 )-1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3- 일메틸 ]-피리딘-2-일}-(4- 트리플루오로메틸 -벤질)-아민 (P-0065)의 제조:
아세토니트릴 (30 mL) 중의 (5-{히드록시-[5-(2-모르폴린-4-일-에톡시)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일]-메틸}-피리딘-2-일)-(4-트리플루오로메틸-벤질)-카르밤산 t-부틸 에스테르 (80, 0.2 g, 0.3 mmol), 트리에틸실란 (4 mL, 0.02 mol), 및 트리플루오로아세트산 (2 mL, 0.02 mol)의 혼합물을 2시간 동안 환류시켰다. 용매 제거 후, 잔사를 에틸 아세테이트에 용해시키고, 포화 중탄산나트륨, 염수로 세척하고, 황산마그네슘으로 건조시켰다. 용매 제거 후, 잔사를 디클로로메탄 중의 메탄올로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하여 화합물을 담황 색 고체 (P-0065, 17 mg, 10％)로서 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 512.42.
(5-포르밀-피리딘-2-일)-(4-트리플루오로메틸-벤질)-카르밤산 t-부틸 에스테르 19를 사용하거나 또는 이를 (5-포르밀-피리딘-2-일)-(4-클로로-벤질)-카르밤산 t-부틸 에스테르 (43, 실시예 17에 기재된 바와 같이 제조)로 치환하고 5-(2-모르폴린-4-일-에톡시)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 79를 실시예 29에서 제조한 적절한 아자인돌 또는 5- 메톡시-7-아자인돌 (실시예 31에 기재된 바와 같이 제조) 또는 상업적으로 입수가능한 5-클로로-7-아자인돌로 치환하여 반응식 32의 단계 3 및 4를 사용하여 추가의 화합물을 제조할 수 있다. 하기 화합물을 상기 과정에 따라 제조하였다:
[5-(5-메톡시-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-(4-트리플루오로메틸-벤질)-아민 (P-0053),
[5-(5-클로로-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-(4-트리플루오로메틸-벤질)-아민 (P-0054),
(4-클로로-벤질)-[5-(5-메톡시-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-아민 (P-0058),
(4-클로로-벤질)-[5-(5-클로로-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-아민 (P-0059),
{5-[5-(2-디에틸아미노-에톡시)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸]-피리딘-2-일}-(4-트리플루오로메틸-벤질)-아민 (P-0060),
(4-클로로-벤질)-{5-[5-(2-모르폴린-4-일-에톡시)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸]-피리딘-2-일}-아민 (P-0063),
{5-[5-(2-피롤리딘-1-일-에톡시)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸]-[피리딘-2-일}-(4-트리플루오로메틸-벤질)-아민 (P-0064),
{5-[5-(3-디에틸아미노-프로폭시)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸]-피리딘-2-일}-(4-트리플루오로메틸-벤질)-아민 (P-0066),
(4-클로로-벤질)-{5-[5-(3-디에틸아미노-프로폭시)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸]-피리딘-2-일}-아민 (P-0069).
상기 과정의 단계 4에 사용된 알데히드 및 아자인돌을 하기 표의 컬럼 2 및 3에 나타내고, 화합물 구조는 컬럼 4에 나타내었다. 컬럼 1은 화합물 참조 번호를 나타내고, 컬럼 5는 실험적 질량 분광 결과를 나타낸다.
Figure 112007090494669-PCT00064
Figure 112007090494669-PCT00065
실시예 31: 3-[6-(4- 트리플루오로메틸 - 벤질아미노 )-피리딘-3- 일메틸 ]-1H- 피롤 로[ 2,3-b]피리딘 -5-올 P-0061의 합성:
3-[6-(4-트리플루오로메틸-벤질아미노)-피리딘-3-일메틸]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-올 P-0061을 반응식 33에 기재된 바와 같이 5-브로모-7-아자인돌 44로부터 6 단계로 합성하였다.
반응식 33
Figure 112007090494669-PCT00066
단계 1 - 5- 메톡시 -1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 (81)의 제조:
N,N-디메틸포름아미드 (20 mL) 중의 5-브로모-7-아자인돌 (1 g, 0.005 mol) 및 메탄올 (20 mL)의 혼합물에 나트륨 메톡시드 (13 g, 0.24 mol) 및 브롬화구리(I) (0.7 g, 0.0048 mol)를 실온에서 첨가하였다. 반응 혼합물을 120℃에서 질소 하에서 3시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 농축하고, 잔사를 에틸 아세테이트 및 물에 용해시켰다. 유기층을 수거하고, 염화암모늄 및 수산화암모늄 (4:1)의 용액, 염수로 세척하고, 황산마그네슘으로 건조시켰다. 용매 제거 후, 잔사를 헥산 중의 에틸 아세테이트로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하여 화합물을 백색 고체 (81, 0.4 g, 50％)로서 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 149.09.
단계 2 - 1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -5-올 (82)의 제조:
테트라히드로푸란 (20 mL) 중의 5-메톡시-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 (81, 0.5 g, 3 mmol)의 용액에 붕소 트리브로마이드 (1.5 g, 6.0 mmol)를 0℃에서 첨가하였다. 반응 혼합물 실온으로 가온시킨 후, 실온에서 3시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 메탄올에 의해 켄칭시켰다. 메탄올 첨가 및 용매 제거를 반복한 후, 농축된 반응 혼합물을 에틸 아세테이트 및 물에 용해시켰다. 유기층을 수거하고, 염수로 세척하고, 황산마그네슘으로 건조시켰다. 용매 제거 후, 잔사를 헥산 중의 에틸 아세테이트로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하여 화합물을 회백색 고체 (82, 0.18 g, 40％)로서 수득하였다.
단계 3 - 5- 트리이소프로필실라닐옥시 -1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 (83)의 제조:
N,N-디메틸포름아미드 (5 mL) 중의 1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-올 (0.5 g, 0.004 mol) 및 1H-이미다졸 (0.98 g, 0.014 mol)의 용액에 트리이소프로필실릴 클로라이드 (1 mL, 0.005 mol)를 첨가하였다. 반응 혼합물을 실온에서 철야 교반하였다. 디클로로메탄 (10 mL)을 첨가하고, 용액을 염수로 세척하고, 황산나트륨으로 건조시켰다. 용매 제거 후, 잔사를 헥산 중의 에틸 아세테이트로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하여 화합물을 점성 액체 (83, 0.4 g, 40％)로서 수득하였다.
단계 4 - {5-[히드록시-(5- 트리이소프로필실라닐옥시 -1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3-일)- 메틸 ]-피리딘-2-일}-(4- 트리플루오로메틸 -벤질)- 카르밤산 t-부틸 에스테 르 (84)의 제조:
메탄올 (10 mL) 중의 (5-포르밀-피리딘-2-일)-(4-트리플루오로메틸-벤질)-카르밤산 t-부틸 에스테르 (19, 41 mg, 0.11 mmol, 실시예 30에 기재된 바와 같이 제조), 5-트리이소프로필실라닐옥시-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 (83, 34 mg, 0.12 mmol) 및 수산화칼륨 (9.8 mg, 0.17 mmol)의 혼합물을 실온에서 철야 교반하였다. 반응 혼합물을 물에 붓고, 에틸 아세테이트로 추출하고, 염수로 세척하고, 황산나트륨으로 건조시켰다. 용매 제거 후, 잔사를 헥산 중의 에틸 아세테이트로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하여 화합물을 점성 액체 (84, 0.05 g, 70％)로서 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 671.38.
단계 5 - (4- 트리플루오로메틸 -벤질)-[5-(5- 트리이소프로필실라닐옥시 -1H-피롤로 [ 2,3-b]피리딘 -3- 일메틸 )-피리딘-2-일]-아민 (85)의 제조:
아세토니트릴 (10 mL) 중의 {5-[히드록시-(5-트리이소프로필실라닐옥시-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메틸]-피리딘-2-일}-(4-트리플루오로메틸-벤질)-카르밤산 t-부틸 에스테르 (84, 0.05 g, 0.07 mmol), 트리플루오로아세트산 (0.5 mL, 0.006 mol), 및 트리에틸실란 (1 mL, 0.006 mol)의 혼합물을 2시간 동안 환류시켰다. 반응 혼합물을 빙수에 붓고, 에틸 아세테이트로 추출하고, 포화 중탄산나트륨, 염수로 세척하고, 황산나트륨으로 건조시켰다. 용매 제거 후, 잔사를 헥산 중의 에틸 아세테이트로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하여 화합물을 점성 액체 (85, 0.04 g, 97％)로서 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 555.38.
단계 6 - 3-[6-(4- 트리플루오로메틸 - 벤질아미노 )-피리딘-3- 일메틸 ]-1H- 피롤 로[ 2,3-b]피리딘 -5-올 (P-0061)의 제조:
테트라히드로푸란 (10 mL) 중의 (4-트리플루오로메틸-벤질)-[5-(5-트리이소프로필실라닐옥시-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-아민 (85, 0.13 g, 0.23 mmol)에 테트라부틸암모늄 플루오라이드 (3 mL, 테트라히드로푸란 중의 1.0 M, 3 mmol)를 첨가하였다. 반응 혼합물을 실온에서 철야 교반한 후, 65℃에서 48시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 농축하고, 헥산 중의 에틸 아세테이트로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하여 화합물을 점성 액체 (P-0061, 0.062 g, 66％)로서 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 399.19.
3-[6-(4-클로로-벤질아미노)-피리딘-3-일메틸]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-올 P-0062
Figure 112007090494669-PCT00067
는 (5-포르밀-피리딘-2-일)-(4-트리플루오로메틸-벤질)-카르밤산 t-부틸 에스테르 19를 (5-포르밀-피리딘-2-일)-(4-클로로-벤질)-카르밤산 t-부틸 에스테르 (43, 실시예 17에 기재된 바와 같이 제조)로 치환하여 반응식 33의 프로토콜에 따라 제조하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 365.2.
실시예 32: N-[5-(1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3-카르보닐)피리딘-2-일]-4- 트리플루오 로메틸- 벤즈아미드 P-0067의 합성
N-[5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-피리딘-2-일]-4-트리플루오로메틸-벤즈아미드 P-0067을 반응식 34에 기재된 바와 같이 7-아자인돌 1로부터 2 단계로 합성하였다.
반응식 34
Figure 112007090494669-PCT00068
단계 1 - (6- 브로모 -피리딘-3-일)-(1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3-일)- 메타논 (87)의 제조:
디클로로메탄 (50 mL) 중의 1H-피롤로[2,3-b]피리딘 (1, 1.2 g, 0.010 mol)의 용액에 6-브로모-니코티노일 클로라이드 (86, 2.6 g, 0.012 mol)를 -10℃에서 첨가하였다. 용액이 투명해진 후에, 삼염화알루미늄 (10.2 g, 0.0765 mol)을 격렬하게 교반하면서 한번에 첨가하였다. 반응 혼합물을 -10℃에서 30분 동안 교반한 후, 실온으로 가온시키고, 실온에서 철야 교반하였다. 반응물을 빙수로 켄칭시키고, 중탄산나트륨으로 중화시켰다. 용액을 디클로로메탄으로 추출하고, 염수로 세척하고, 황산나트륨으로 건조시켰다. 용매 제거 후, 잔사를 디클로로메탄 중의 메탄올로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하여 화합물을 백색 고체 (87, 0.35 g, 11％)로서 수득하였다.
단계 2 - N-[5-(1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3-카르보닐)-피리딘-2-일]-4- 트리플루오로메틸 - 벤즈아미드 (P-0067)의 제조:
밀봉 튜브 내의 톨루엔 (2 mL) 중의 (6-브로모-피리딘-3-일)-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메타논 (87, 160 mg, 0.53 mmol), 4-트리플루오로메틸 벤즈아미드 (51, 130 mg, 0.69 mmol), 크산트포스 (9 mg, 0.02 mmol), 탄산세슘 (245 mg, 0.752 mmol), 및 트리스(디벤질리덴아세톤)디팔라듐(0) (5 mg, 0.005 mmol)의 혼합물을 110℃에서 1시간 동안 교반하였다. 반응물을 물로 켄칭하고, 디클로로메탄으로 추출하였다. 유기층을 수거하고, 염수로 세척하고, 황산나트륨으로 건조시켰다. 용매 제거 후, 잔사를 헥산 중의 에틸 아세테이트로 용출시키는 실리카 겔 칼 럼 크로마토그래피로 정제하여 화합물을 회백색 고체 (P-0067, 0.42 mg, 19％)로서 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 411.17.
N-[5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-피리딘-2-일]-4-트리플루오로메틸-벤젠술폰아미드 P-0068
Figure 112007090494669-PCT00069
을 단계 2에서 4-트리플루오로메틸 벤즈아미드 51을 4-트리플루오로메틸-벤젠술폰아미드로 치환하여 반응식 34의 프로토콜에 따라 제조하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 445.1.
실시예 33: [(S)-1-(4- 클로로 - 페닐 )-에틸]-[5-(1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3-일메틸)-피리딘-2-일]-아민 P-0075의 합성
[(S)-1-(4-클로로-페닐)-에틸]-[5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-아민 P-0075를 반응식 35에 제시된 바와 같이 7-아자인돌 1로부터 3 단계로 합성하였다.
반응식 35
Figure 112007090494669-PCT00070
단계 1 - (6- 브로모 -피리딘-3-일)-(1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3-일)-메탄올 (89)의 제조:
메탄올 (25 mL) 중의 1H-피롤로[2,3-b]피리딘 (1, 1.2 g, 0.010 mol), 6-브로모-피리딘-3-카르브알데히드 (88, 1.8 g, 0.0097 mol), 및 수산화칼륨 (1.8 g, 0.032 mol)의 혼합물을 실온에서 철야 교반하였다. 반응 혼합물을 빙수에 붓고, 에틸 아세테이트로 추출하고, 염수로 세척하고, 황산나트륨으로 건조시켰다. 용매 제거 후, 잔사를 디클로로메탄 중의 메탄올로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하여 화합물을 백색 고체 (89, 1.4 g, 45％)로서 수득하거나, 또는 단계 2에서 89와 90의 혼합물로서 사용할 수 있다.
단계 2 - 3-(6- 브로모 -피리딘-3- 일메틸 )-1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 (91)의 제조:
아세토니트릴 (25 mL) 중의 (6-브로모-피리딘-3-일)-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메탄올 (89, 1 g, 0.003 mol) 및 3-[(6-브로모-피리딘-3-일)-메톡시-메틸]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 (90, 2 g, 0.006 mol), 트리에틸실란 (1 mL, 0.006 mol), 및 트리플루오로아세트산 (0.5 mL, 0.006 mol)의 혼합물을 2시간 동안 환류시켰다. 반응 혼합물을 농축시키고, 잔사를 에틸 아세테이트 및 물에 용해시켰다. 유기층을 수거하고, 포화 중탄산나트륨, 염수로 세척하고, 황산나트륨으로 건조시켰다. 용매 제거 후, 잔사를 헥산 중의 에틸 아세테이트로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피로 정제하여 화합물을 회백색 고체 (91, 0.75 g, 60％)로서 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 288.06, 290.00.
단계 3 - [(S)-1-(4-클로로-페닐)-에틸]-[5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피리딘-2-일]-아민 P-0075의 제조:
N-메틸피롤리딘 (3 mL) 중의 3-(6-브로모-피리딘-3-일메틸)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 (91, 100 mg, 0.0003 mol) 및 (S)-1-(4-클로로-페닐)-에틸아민 (92, 0.5 g, 0.003 mol)의 혼합물을 150℃에서 마이크로파로 100분 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 진공 하에 농축하고, 잔사를 헥산 중의 에틸 아세테이트로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피로 정제하여 화합물을 백색 고체 (P-0075, 0.03 g, 20％)로서 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 363.18.
실시예 34: (4- 클로로 -벤질)-[4- 클로로 -5-(1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3- 일메틸 )-티아졸-2-일]-아민 P-0083의 합성
(4-클로로-벤질)-[4-클로로-5-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-티아졸-2-일]-아민 P-0083을 반응식 36에 제시된 바와 같이 2,4-디클로로-티아졸-5-카르브알데히드 93으로부터 4 단계로 합성하였다
반응식 36
Figure 112007090494669-PCT00071
단계 1 - 4- 클로로 -2-(4- 클로로 - 벤질아미노 )-티아졸-5- 카르브알데히드 (94)의 제조:
테트라히드로푸란 (2O mL) 중의 p-클로로벤질아민 (61, 283 mg, 2.00 mmol) 및 N,N-디이소프로필에틸아민 (0.697 mL)의 용액에 테트라히드로푸란 (1O mL) 중의 2,4-디클로로-티아졸-5-카르브알데히드 (93, 364 mg, 2.00 mmol)를 실온에서 서서히 첨가하였다. 반응물을 실온에서 철야 교반하였다. 반응 혼합물을 빙수에 붓고, 에틸 아세테이트로 추출하고, 염수로 세척하고, 황산나트륨으로 건조시켰다. 용매 제거 후, 잔사를 헥산 중의 에틸 아세테이트로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하여 화합물을 황색 고체 (94, 0.3 g, 50％)로서 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 286.97.
단계 2 - (4- 클로로 -벤질)-(4- 클로로 -5- 포르밀 -티아졸-2-일)- 카르밤산 t-부틸 에스테르 (95)의 제조:
디클로로메탄 (20 mL) 중의 4-클로로-2-(4-클로로-벤질아미노)-티아졸-5-카 르브알데히드 (94, 0.32 g, 0.0011 mol)의 용액에 N,N-디이소프로필에틸아민 (0.4 mL, 0.002 mol), 4-디메틸아미노피리딘 (27 mg, 0.22 mmol), 및 디클로로메탄 (5 mL) 중의 디-t-부틸디카르보네이트 (290 mg, 0.0013 mol)의 용액을 실온에서 첨가하였다. 반응 혼합물을 실온에서 철야 교반한 후, 빙수에 붓고, 디클로로메탄으로 추출하고, 염수로 세척하고, 황산나트륨으로 건조시켰다. 용매 제거 후, 잔사를 헥산 중의 에틸 아세테이트로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하여 화합물을 담갈색 고체 (95, 0.32 g, 74％)로서 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 387.26.
단계 3 - (4- 클로로 -벤질)-{4- 클로로 -5-[히드록시-(1- 트리이소프로필실라닐 -1H-피롤로[ 2,3-b]피리딘 -3-일)- 메틸 ]-티아졸-2-일}- 카르밤산 t-부틸 에스테르 (97)의 제조:
-20℃에서 질소 하에 테트라히드로푸란 (5 ml) 중의 3-요오도-1-트리이소프로필실라닐-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 (96, 99 mg, 0.25 mmol)의 용액에 테트라히드로푸란 (0.2 ml, 0.31 mmol) 중의 2.0 M 이소프로필마그네슘 클로라이드 용액을 첨가하였다. 반응 혼합물을 1.5시간 동안 교반한 후, 5℃로 가온시켰다. 반응 혼합물을 -20℃로 냉각시킨 후, 테트라히드로푸란 (5 mL) 중의 (4-클로로-벤질)-(4-클로로-5-포르밀-티아졸-2-일)-카르밤산 t-부틸 에스테르 (95, 80 mg, 0.2 mmol)의 용액을 서서히 첨가하였다. 반응 혼합물을 2.5시간 동안 교반한 후, 5℃로 가온시켰다. 반응 혼합물을 빙수에 붓고, 에틸 아세테이트로 추출하고, 염수로 세척하 고, 황산마그네슘으로 건조시켰다. 용매 제거 후, 잔사를 헥산 중의 에틸 아세테이트로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하여 화합물을 회백색 고체 (97, 76 mg, 50％)로서 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 661.32, 663.32.
단계 4 - (4- 클로로 -벤질)-[4- 클로로 -5-(1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3- 일메틸 )-티아졸-2-일]-아민 (P-0083)의 제조:
아세토니트릴 (5 mL) 중의 (4-클로로-벤질)-{4-클로로-5-[히드록시-(1-트리이소프로필실라닐-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메틸]-티아졸-2-일}-카르밤산 t-부틸 에스테르 (97, 16 mg, 0.11 mmol), 트리에틸실란 (0.5 mL, 3 mmol), 및 트리플루오로아세트산 (0.25 mL, 3.2 mmol)의 혼합물을 3시간 동안 환류시켰다. 반응 혼합물을 빙수에 붓고, 에틸 아세테이트로 추출하고, 중탄산나트륨, 염수로 세척하고, 황산나트륨으로 건조시켰다. 용매 제거 후, 잔사를 헥산 중의 에틸 아세테이트로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하여 화합물을 황색 고체 (P-0083, 5.6 mg, 14％)로서 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 389.35, 390.36.
실시예 35: [2-(4- 클로로 - 벤질아미노 )-티아졸-5-일]-(1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3-일)- 메타논 P-0077의 합성:
[2-(4-클로로-벤질아미노)-티아졸-5-일]-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메타논 P-0077을 반응식 37에 제시된 바와 같이 2-브로모-티아졸-5-카르복실산 98 및 1H-피롤로[2,3-b]피리딘 1로부터 2 단계로 합성하였다.
반응식 37
Figure 112007090494669-PCT00072
단계 1 - (2- 브로모 -티아졸-5-일)-(1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3-일)- 메타논 (99)의 제조:
옥살릴 클로라이드 (3 mL) 중의 2-브로모-티아졸-5-카르복실산 (98, 0.5 g, 0.002 mol)의 현탁액을 투명한 용액으로 변할 때까지 실온에서 교반하였다. 용매를 제거하고, 잔사를 진공 건조시켰다. 담황색 고체를 얻고, 디클로로메탄 (10 mL)에 용해시키고, -10℃에서 디클로로메탄 (30 mL) 중의 1H-피롤로[2,3-b]피리딘 (1, 0.34 g, 0.0029 mol)의 용액에 서서히 첨가하였다. 이어서, 혼합물에 삼염화알루미늄 (2.6 g, 0.019 mol)을 격렬하게 교반하면서 한번에 첨가하였다. 반응물을 -10℃에서 30분 동안 유지시킨 후, 실온으로 가온시켰다. 반응 혼합물을 주변 온도에서 철야 교반하였다. 반응물을 빙수로 켄칭시키고, 염산 (10％)을 사용하여 pH 4로 산성화시켰다. 이어서, 용액을 디클로로메탄으로 추출하였다. 유기층을 수거하고, 염수로 세척하고, 황산마그네슘으로 건조시켰다. 용매 제거 후, 잔사를 헥산 중의 에틸 아세테이트로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하여 화합물을 백색 고체 (99, 12 mg, 2％)로서 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 369.09.
단계 2 - [2-(4- 클로로 - 벤질아미노 )-티아졸-5-일]-(1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3-일)- 메타논 (P-0077)의 제조:
밀봉된 반응 용기 내의 테트라히드로푸란 (10 mL) 중의 (2-브로모-티아졸-5-일)-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-메타논 (99, 5 mg, 0.02 mmol), p-클로로벤질아민 (61, 10 mg, 0.08 mmol), 및 N,N-디이소프로필에틸아민 (10 ㎕, 0.08 mmol)의 혼합물을 실온에서 철야 교반하였다. 반응 혼합물을 빙수에 붓고, 에틸 아세테이트로 추출하고, 염수로 세척하고, 황산마그네슘으로 건조시켰다. 용매 제거 후, 잔사를 헥산 중의 에틸 아세테이트로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하여 화합물을 담황색 고체 (P-0077, 2 mg, 30％)로서 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 305.90, 307.88.
실시예 36: 3-((5- 클로로 -3- 메틸 -1- 페닐 -1H- 피라졸 -4-일) 메틸 )-1H- 피롤로[2,3-b] 피리딘 P-0080의 합성
3-((5-클로로-3-메틸-1-페닐-1H-피라졸-4-일)메틸)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 P-0080을 반응식 38에 제시된 바와 같이 5-클로로-3-메틸-1-페닐-1H-피라졸-4-카르브알데히드 100 및 7-아자인돌 1로부터 2 단계로 합성하였다.
반응식 38
Figure 112007090494669-PCT00073
단계 1 - 3-((5- 클로로 -3- 메틸 -1- 페닐 -1H- 피라졸 -4-일)( 메톡시 ) 메틸 )-1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 (P-0079)의 제조:
1H-피롤로[2,3-b]피리딘 (1, 0.100 g, 0.846 mmol) 및 5-클로로-3-메틸-1-페닐-1H-피라졸-4-카르브알데히드 (100, 0.205 g, 0.931 mmol)에 2 mL의 메탄올을 첨가하여 용액을 수득하였다. 수산화칼륨 (0.0475 g, 0.846 mmol)을 첨가하고, 반응물을 실온에서 48시간 동안 교반하였다. 반응물을 에틸 아세테이트 및 물로 추출하였다. 유기층을 무수 황산마그네슘으로 건조시키고, 여과하였다. 여액을 농축하고, 디클로로메탄 중의 0-5％ 메탄올의 구배로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하여 화합물 (P-0079, 32 mg, 11％)로서 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 353.2.
단계 2 - 3-((5- 클로로 -3- 메틸 -1- 페닐 -1H- 피라졸 -4-일) 메틸 )-1H- 피롤로[2,3-b]피 리딘 (P-0080)의 제조:
3-((5-클로로-3-메틸-1-페닐-1H-피라졸-4-일)(메톡시)메틸)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 (P-0079, 0.030 g, 0.085 mmol)에 아세토니트릴 (10 mL, 0.2 mol)을 첨가하였다. 트리플루오로아세트산 (500 ㎕, 0.006 mol) 및 트리에틸실란 (500 ㎕, 0.003 mol)을 첨가하고, 반응물을 실온에서 16시간 동안 교반하였다. 반응물을 에틸 아세테이트 및 물로 추출하였다. 유기층을 무수 황산마그네슘으로 건조시키고, 여과하였다. 여액을 농축하고, 디클로로메탄, 이어서 디클로로메탄 중의 5％ 메탄올로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하여 화합물을 노르스 름한 포움 (P-0080, 29 mg, 98％)로서 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 353.2.
실시예 37: cKit 키나제 도메인 및 c- Kit 서열의 제작
c-Kit cDNA 서열은 NCBI로부터 예를 들어, GenBank 수탁 번호 NM_000222로서 입수가능하다. 상기 서열을 사용하여, c-kit DNA 서열을 상업적으로 입수가능한 라이브러리 (예를 들어, cDNA 라이브러리)로부터 클로닝할 수 있거나, 통상적인 클로닝 방법에 의해 합성할 수 있다.
통상적인 클로닝 방법을 사용하여, 3개의 c-kit 폴리펩티드를 코딩하는 구성체를 제조하고, c-kit 키나제 도메인 폴리펩티드를 발현하기 위해 사용하였다. 하나의 상기 활성 c-kit 키나제 도메인 서열은 잔기 Q694-T753의 결손을 갖는 잔기 P551-S948를 포함하였다.
실시예 38: c- Kit 키나제 도메인의 발현 및 정제
정제된 c-kit 키나제 도메인은 통상적인 발현 및 정제 방법을 사용하여 얻을 수 있다. 예시적인 방법은 예를 들어, 그 전문이 본원에 참고로 포함된 립슨 등의 미국 특허 출원 공개 20040002534 (2003년 6월 23일 출원된 미국 특허 출원 10/600,868)에 기재되어 있다.
실시예 39: 결합 분석
결합 분석은 당업계에 공지된 다양한 방식을 포함한 다양한 방식으로 수행할 수 있다. 예를 들어, 상기 나타낸 바와 같이, 결합 분석은 형광 공명 에너지 전이 (FRET) 포맷을 사용하여, 또는 AlphaScreen을 사용하여 수행할 수 있다.
별법으로, ATP-결합 부위에 대한 리간드의 결합을 측정할 수 있는 임의의 방법을 사용할 수 있다. 예를 들어, 형광 리간드가 사용될 수 있다. c-kit에 결합될 때, 방출된 형광은 편광된다. 억제제 결합에 의해 일단 치환되면, 편광이 감소한다.
경쟁적 결합 분석에 의한 화합물에 대한 IC50의 결정. (KI는 억제제 결합에 대한 해리 상수이고; KD는 기질 결합에 대한 해리 상수임에 주목.) 상기 시스템에서, IC50, 억제제 결합 상수 및 기질 결합 상수는 하기 수식에 따라 상호관계될 수 있다:
방사성 표지된 기질을 사용할 때,
Figure 112007090494669-PCT00074
IC50 ~ 소량의 표지된 기질이 존재할 때 KI.
실시예 40: c- fms 키나제 활성 또는 c- kit 키나제 활성의 세포-기반 분석.
M-CSF 의존 RAW264.7 세포를 12웰 플레이트 상에 2.5x1O5 세포/웰로 접종하고, 세포를 37℃, 5％ CO2에서 철야로 부착시켰다. 이어서, 세포를 무혈청 배지 내에서 37℃, 5％ CO2에서 철야로 굶겼다. 세포를 무혈청 배지 (1％ DMSO 최종 농도) 내에서 화합물로 1시간 동안 처리한 후; 20 ng/ml M-CSF로 5분 동안 자극하였다. 자극 후, 세포를 얼음 상에서 용해시키고, 용해물을 13,000 rpm에서 1분 동안 원심 분리하였다. 샘플 내의 단백질의 양을 정량하고, 샘플 버퍼를 첨가하고, 샘플을 95℃에서 10분 동안 비등시켰다. 이어서, 샘플을 13,000 rpm에서 1분 동안 원심분리하였다. 샘플 (15-20 ㎍/레인)을 로딩하고, 4-12％ 트리스-글리신 겔 상에 75V에서 진행시킨 후, PVDF 막 상으로 전달시켰다. 막을 사용된 1차 항체에 따라 1시간 동안 PBS/1％ Tween-20 (PBST) 중 5％ BSA; 또는 5％ 우유를 사용하여 차단하였다. 이어서, 블롯을 부드럽게 진탕하면서 1차 항체와 함께 4도에서 철야로 인큐베이팅하였다. 포획 항체와 함께 인큐베이팅한 후, 막을 3x10분 동안 PBST로 세척한 다음; 부드럽게 진탕하면서 검출 항체 염소 항-토끼-HRP와 함께 1시간 동안 인큐베이팅하였다. 막을 다시 3x10분 동안 PBST로 세척하였다. 이어서, ECL Plus 기질을 블롯에 첨가하고, 영상을 화학발광 카메라로 포획하고, 밴드를 pFMS 및 FMS 수준에 대해 정량하였다.
Fms 억제제는 또한 M-NFS-60 마우스 골수성 백혈병 세포주 (ATCC 카탈로그 #CRL-1838)를 사용하여 평가할 수 있다. 상기 세포주 증식은 fms 티로신 키나제 수용체에 결합하여 활성화시키는 M-CSF에 의해 자극된다. fms 키나제 활성의 억제제는 M-CSF로 자극된 키나제 활성을 감소시키거나 제거하여, 세포 증식을 감소시킨다. 상기 억제는 IC50 값을 평가하기 위해 화합물 농도의 함수로서 측정된다. M-NFS-60 세포를 5 x 104 세포/웰로 96웰 세포 배양 플레이트에 10％ FBS (하이클론 (HyClone) 카탈로그 #SH30071.03)으로 보충한 RPMI 1640 (셀그로 메디아테크 (CellGro Mediatech) 카탈로그 #10-040-CV)의 50 ㎕의 세포 배양 배지 중에 접종하 였다. 화합물을 DMSO 내에 1 mM의 농도로 용해시키고, 총 8개 지점에 대해 1:3으로 계열 희석하고, 세포에 100 ㎕ 세포 배양 배지 (최종 농도 0.2％ DMSO) 중 10, 3.3, 1.1, 0.37, 0.12, 0.041, 0.014 및 0.0046 μM의 최종 농도로 첨가하였다. 세포를 또한 양성 대조군으로서 스타우로스포린으로 처리하였다. 20 ㎕의 372 ng/ml M-CSF (알앤디 시스템즈 (R＆D Systems) 카탈로그 #216-MC)를 62 ng/ml의 최종 농도로 첨가하여 세포를 자극하였다. 세포를 37℃, 5％ CO2에서 3일 동안 인큐베이팅하였다. 셀타이터-글로 (CellTiter-Glo) 버퍼 (프로메가 (Promega) 세포 생활력 분석 카탈로그 #G7573) 및 기질을 실온으로 평형화시키고, 효소/기질 재조합 반딧불이 루시퍼라제 (Recombinant Firefly Luciferase)/딱정벌레 루시페린 (Beetle Luciferin)을 재구성하였다. 세포 플레이트를 실온으로 30분 동안 평형화시킨 후, 동등한 부피의 셀타이터-글로 시약을 첨가하여 용해시켰다. 플레이트를 2분 동안 플레이트 진탕기 상에서 혼합하여 세포를 용해시킨 후, 10분 동안 실온에서 인큐베이팅하였다. 플레이트를 0.1s/웰을 판독하도록 변형된 발광 프로토콜을 이용하여 빅터 월락 (Victor Wallac) II 상에서 판독하였다. 발광 판독치는 ATP 함량을 평가하고, 이는 세포 수와 직접 상호관련되어, 화합물 농도의 함수로서 판독치는 IC50 값을 결정하기 위해 사용될 수 있다.
c-Kit 억제제는 M-07e 세포주 (DSMZ 카탈로그 #ACC 104)를 사용하여 평가하였다. M-07e 증식은 c-Kit 티로신 키나제 수용체에 결합하여 활성화시키는 SCF (줄기 세포 인자)에 의해 자극된다. c-Kit 키나제의 억제제는 SCF 매개 키나제 활 성화를 감소시키거나 제거하여, SCF 자극된 세포의 세포 증식을 감소시킨다. 상기 억제는 IC50 값을 평가하기 위해 세포 성장에 대한 화합물 농도의 효과에 의해 측정된다. M-07e 세포를 5 x 104 세포/웰로 96웰 세포 배양 플레이트에 10％ FBS (하이클론 카탈로그 #SH30071.03)로 보충한 이스코베 (Iscove) 배지 1X (MOD, 셀그로 메디아테크 카탈로그 #15-016-CV)의 50 ㎕의 세포 배양 배지 내에 접종하였다. 화합물을 DMSO 내에 1 mM의 농도로 용해시키고, 총 8개 지점에 대해 1:3으로 계열 희석하고, 세포에 100 ㎕ 세포 배양 배지 (최종 농도 0.2％ DMSO) 중 1, 0.33, 0.11, 0.037, 0.012, 0.0041, 0.0014 및 0.00046 μM의 최종 농도로 첨가하였다. 세포를 또한 양성 대조군으로서 스타우로스포린으로 처리하였다. 세포 배양 배지 내에 20 ㎕의 600 ng/ml SCF (바이오소스 인터내셔날 (Biosource International) SCF 키트 리간드 카탈로그 #PHC2115)를 100 ng/ml의 최종 농도로 첨가하여 세포를 자극하였다. 세포를 37℃, 5％ CO2에서 3일 동안 인큐베이팅하였다. 셀타이터-글로 버퍼 (프로메가 세포 생활력 분석 카탈로그 #G7573) 및 기질을 실온으로 평형화시키고, 효소/기질 재조합 반딧불이 루시퍼라제/딱정벌레 루시페린을 재구성하였다. 세포 플레이트를 실온으로 30분 동안 평형화시킨 후, 동등한 부피의 셀타이터-글로 시약을 첨가하여 용해시켰다. 플레이트를 2분 동안 플레이트 진탕기 상에서 혼합하여 세포를 용해시킨 후, 10분 동안 실온에서 인큐베이팅하였다. 플레이트를 0.1s/웰을 판독하도록 변형된 발광 프로토콜을 이용하여 빅터 월락 II 상에서 판독하였다. 발광 판독치는 ATP 함량을 평가하고, 이는 세포 수와 직접 상호관련되어, 화합물 농도의 함수로서 판독치는 IC50 값을 결정하기 위해 사용될 수 있다.
상기 세포 기반 분석을 또한 인산화를 평가하기 위해 사용하였다. 성장 억제 분석에 대해 상기 설명한 화합물을 사용하여 샘플을 제조하고, M-07e 세포만을 2 x 105 세포/웰로 96 웰 필터 플레이트에 접종하였다. 세포를 1시간 동안 37℃에서 상기 설명된 화합물과 함께 인큐베이팅한 후, SCF를 50 ng/ml의 최종 농도로 첨가하여 자극하고 10분 동안 37℃에서 인큐베이팅하였다. 배양 배지를 원심분리에 의해 제거하고, 30 ㎕ 용해 버퍼 (25 mM 트리스 HCl pH 7.5, 150 mM NaCl, 5 mM EDTA, 1％ Triton X100, 5 mM NaF, 1 mM Na바나데이트, 10 mM 베타-글리세로포스페이트, EDTA 없음 (뵈링거-로슈 (Boehringer-Roche) 카탈로그 #1873580)를 첨가하여 세포를 용해시키고 30분 동안 얼음 상에 놓았다. 용해물의 15 ㎕ 분취액을 취하고, 분취액을 분석 플레이트에서 85 ㎕ 희석 버퍼로 희석하고, 2시간 동안 실온에서 인큐베이팅하고, 플레이트를 세척 버퍼로 4회 세척함으로써 바이오소스 면역분석 키트: Human c-Kit [pY823] (카탈로그 #KHO0401)에 따라 분석하였다. 검출 항체 (100 ㎕)를 플레이트에 첨가하고, 샘플을 1시간 동안 실온에서 인큐베이팅한 후, 세척 버퍼로 4회 세척하였다. HRP 항-토끼 항체 (100 ㎕)를 첨가하고, 샘플을 30분 동안 실온에서 인큐베이팅한 후, 세척 버퍼로 4회 세척하였다. 안정화된 크로모겐 (100 ㎕)을 첨가하고, 샘플을 15-25분 동안 실온에서 인큐베이팅한 후, 세척 버퍼로 4회 세척하였다. 중지 용액 (100 ㎕)을 첨가하고, 샘플을 월락 빅터 판독기 상에서 450 run에서 판독하였다. 흡광도를 화합물 농도에 대해 플로팅하고, IC50 농도를 결정하였다.
실시예 41: c- kit 및 c- fms 활성 분석
c-kit 및 다른 키나제의 키나제 활성의 잠재적인 조절제의 효과는 당업계에 공지된 다양한 상이한 분석, 예를 들어, 생화학적 분석, 세포-기반 분석, 및 생체내 시험 (예를 들어, 모델 시스템 시험)으로 측정할 수 있다. 상기 시험관 내 및/또는 생체내 분석 및 시험은 본 발명에서 사용될 수 있다. 예시적인 키나제 분석으로서, c-kit 또는 Fms의 키나제 활성은 AlphaScreening (팩카드 바이오사이언스)에서 측정된다.
예시적인 c- kit 생화학적 분석
c-kit (또는 그의 키나제 도메인)은 AlphaScreen에서 활성 키나제이다. IC50 값은 c-Kit 키나제 활성의 억제에 관하여 결정되고, 여기서 펩티드 기질의 인산화의 억제가 화합물 농도의 함수로서 측정된다. 시험될 화합물을 DMSO 내에 20 mM의 농도로 용해시켰다. 이들을 30 ㎕로 120 ㎕의 DMSO (4 mM)에 희석하고, 1 ㎕을 분석 플레이트에 첨가하였다. 이어서, 이들을 총 8 지점으로 1:3 (50 ㎕ 내지 100 ㎕ DMSO) 계열 희석하였다. 각각의 키나제 반응액이 1x 키나제 버퍼 (50 mM HEPES, pH 7.2, 5 mM MgCl2, 5 mM MnCl2, 0.01％ NP-40, 0.2％ BSA), 5％ DMSO 및 10 μM ATP 중에 20 ㎕이도록 플레이트를 준비하였다. 기질은 100 nM 비오틴-(E4Y)3 (오픈 소스 바이오테크, 인크. (Open Source Biotech, Inc.))이었다. C-kit 키나제는 샘플 당 0.1 ng이었다. 키나제 반응액을 1시간 동안 실온에서 인큐 베이팅한 후, 중지 버퍼 (1x 키나제 버퍼 중 5O mM EDTA) 중 5 ㎕의 공여체 비드 (스트렙타비딘 코팅된 비드 (퍼킨 엘머 라이프 사이언스 (Perkin Elmer Life Science)) 최종 농도 1 ㎍/ml)을 첨가하고, 샘플을 혼합하고 20분 동안 실온에서 인큐베이팅한 후, 중지 버퍼 중 5 ㎕의 수여체 비드 (PY20 코팅된 비드 (퍼킨 엘머 라이프 사이언스) 최종 농도 1 ㎍/ml)를 첨가하였다. 샘플을 60분 동안 실온에서 인큐베이팅하고, 웰당 시그널을 AlphaQuest 판독기 상에서 판독하였다. 인산화된 기질은 시그널이 키나제 활성과 상호관련되도록 PY20 항체의 결합 및 공여체 및 수여체 비드의 회합을 일으킨다. 시그널 대 화합물 농도를 사용하여 IC50을 결정하였다.
화합물을 또한 유사한 분석을 이용하여 10배 더 높은 ATP 농도를 사용하여 시험하였다. 상기 샘플에 대해, 시험될 화합물을 DMSO에 20 mM의 농도로 용해시켰다. 이들을 30 ㎕을 120 ㎕의 DMSO (4 mM)에 희석하고, 1 ㎕을 분석 플레이트에 첨가하였다. 이어서, 이들을 총 8 지점으로 1:3 (50 ㎕ 내지 100 ㎕ DMSO) 계열 희석하였다. 각각의 키나제 반응액이 1x 키나제 버퍼 (8 mM MOPS pH 7.0, 1 mM MgCl2, 2 mM MnCl2, 0.01％ Tween-20, 1 mM DTT, 및 0.001％ BSA), 5％ DMSO 및 100 μM ATP 중 20 ㎕이도록 플레이트를 준비하였다. 기질은 30 nM 비오틴- (E4Y)10 (업스테이트 바이오테크 (Upstate Biotech), Cat# 12-440)이었다. C-kit 키나제는 샘플당 1 ng이었다. 키나제 반응액을 1시간 동안 실온에서 인큐베이팅한 후, 중지 버퍼 (8 mM MOPS pH 7.0, 100 mM EDTA, 0.3％ BSA) 중 5 ㎕의 공여체 비드 (스트렙 타비딘 코팅 비드 (퍼킨 엘머 라이프 사이언스) 최종 농도 10 ㎍/ml)를 첨가하고, 샘플을 혼합하고 20분 동안 실온에서 인큐베이팅한 후, 중지 버퍼 중 5 ㎕의 수여체 비드 (PY20 코팅된 비드 (퍼킨 엘머 라이프 사이언스) 최종 농도 10 ㎍/ml)를 첨가하였다. 샘플을 60분 동안 실온에서 인큐베이팅하고, 웰당 시그널을 AlphaQuest 판독기 상에서 판독하였다. 인산화된 기질은 시그널이 키나제 활성과 상호관련되도록 PY20 항체의 결합 및 공여체 및 수여체 비드의 회합을 일으킨다. 시그널 대 화합물 농도를 사용하여 IC50을 결정하였다.
상기 분석에서 사용된 c-kit 효소는 셀 시그널링 테크놀로지 (Cell Signaling Technology (Cat. #7754))로부터 입수하거나, 다음과 같이 준비하였다: kit를 코딩하는 플라스미드 (DNA 및 코딩된 단백질 서열을 아래 나타낸다)를 일반적인 폴리머라제 사슬 반응 (PCR) 방법을 이용하여 공학처리하였다. 다양한 인간 조직으로부터 클로닝된 상보적 DNA를 인비트로겐으로부터 구입하였고, 이들을 PCR 반응에서 기질로서 사용하였다. PCR 생성물을 개시하기 위해 및 또한 플라스미드와의 라이게이션을 위한 적절한 제한 효소 절단 부위를 제공하기 위해 특별 주문 합성 올리고뉴클레오티드 프라이머를 설계하였다. 효소를 코딩하는 전체 서열은 전체 코딩 서열을 덮는 주문 합성 올리고뉴클레오티드 (인비트로겐, 하기 참조)를 사용하여 유전자 합성 절차를 통해 제조하였다.
키나제-코딩 삽입체와의 라이게이션을 위해 사용된 플라스미드는 이. 콜라이를 사용하는 발현을 위한 pET (노바겐 (Novagen))의 유도체이었다. Kit 키나제는 금속 친화도 크로마토그래피를 사용하는 정제를 위해 히스티딘 태그를 포함하도록 공학처리하였다. 키나제-코딩 플라스미드는 숙주 세포 내에서 그의 발현 동안 키나제 단백질을 변형시키는 제2 단백질을 동시발현하도록 비시스트론 (bicistronic) mRNA으로서 공학처리하였다. 단백질 티로신 포스파타제 1B (PTP)가 포스포-티로신의 탈인산화를 위해 동시발현되었다.
단백질 발현을 위해, Kit 유전자를 함유하는 플라스미드를 이. 콜라이 균주 BL21(DE3)RIL 내로 형질전환시키고, 형질전환체를 적절한 항생제를 함유하는 LB 한천 플레이트 상에서 성장을 위해 선택하였다. 단일 콜로니를 37℃에서 200 ml TB (Terrific broth) 배지 내에서 철야 성장시켰다. 2.8 L 플라스크 내의 16x1 L의 신선한 TB 배지에 10 ml의 철야 배양물을 접종하고 37℃에서 일정하게 진탕하면서 성장시켰다. 일단 배양물이 600 nm에서 1.0의 흡광도에 도달하면, IPTG를 첨가하고 배양물을 12-30℃의 온도에서 추가로 12 내지 18시간 성장시켰다. 세포를 원심분리에 의해 수확하고, 용해를 위해 준비할 때까지 펠렛을 -80℃에서 동결시켰다.
단백질 정제를 위해; 동결된 이. 콜라이 세포 펠렛을 용해 버퍼 중에 재현탁시키고, 표준 기계적 방법을 이용하여 용해시켰다. 단백질을 고정된 금속 친화도 정제 IMAC를 사용하여 폴리-히스티딘 태그를 통해 정제하였다. Kit 키나제는 IMAC, 크기 배제 크로마토그래피 및 이온 교환 크로마토그래피를 사용하는 3 단계 정제 과정을 이용하여 정제하였다. 폴리-히스티딘 태그는 트롬빈 (칼비오켐 (Calbiochem))을 사용하여 제거하였다.
화합물을 8 mM MOPS pH 7.0, 0.2 mM EDTA, 10 mM MnCl2, 0.1 mg/ml 폴리(Glu, Tyr) 4:1, 10 mM Mg아세테이트 및 γ-33P-ATP (약 500 cpm/pmol) 중 c-Kit (h) (5-10 mU)의 25 ㎕의 최종 반응 부피 내에 적절한 농도의 화합물을 사용하여 상기 설명된 것과 유사한 분석을 이용하여 분석하였다. 40분 동안 실온에서 인큐베이팅하고, 5 ㎕의 3％ 인산을 첨가하여 중지시켰다. 10 ㎕의 각각의 샘플을 필터매트 A 상에 스폿팅하고 (spot), 75 mM 인산으로 3x, 메탄올로 1회 세척하고, 건조시키고 섬광 계수기 (업스테이트 유에스에이 (Upstate USA, 미국 버지니아주 샬롯테스빌)에서 수행됨) 상에서 측정하였다.
화합물 P-0001, P-0002, P-0003, P-0004, P-0005, P-0006, P-0007, P-0008, P-0009, P-0010, P-0011, P-0012, P-0013, P-0014, P-0015, P-0016, P-0017, P-0018, P-0020, P-0022, P-0024, P-0025, P-0026, P-0027, P-0028, P-0030, P-0031, P-0032, P-0033, P-0038, P-0053, P-0054, P-0055, P-0056, P-0057, P-0058, P-0059, P-0060, P-0061, P-0062, P-0063, P-0064, P-0065, P-0066, P-0069, P-0071, P-0072, P-0073, P-0074, P-0075, P-0078, 및 P-0082는 실시예 40 및 41에서 상기 설명된 c-kit 분석의 적어도 하나에서 IC50이 1 μM 미만이었다.
Kit
Figure 112007090494669-PCT00075
Figure 112007090494669-PCT00076
Figure 112007090494669-PCT00077
Figure 112007090494669-PCT00078
Figure 112007090494669-PCT00079
추가의 생화학적 및 세포-기반 분석
일반적으로, 임의의 단백질 키나제 분석이 c-kit에서 사용하기 위해 채용될 수 있다. 예를 들어, 립슨 등의 미국 특허 출원 공개 20040002534 (그 전문이 본원에 참고로 포함됨)에 기재된 바와 같은 분석 (예를 들어, 생화학적 및 세포-기반 분석)이 본 발명에서 사용될 수 있다.
생체내 모델 시스템 시험
생체내 시험을 위해, 적합한 동물 모델계가 사용을 위해 선택될 수 있다. 예를 들어, 다발 경화증에 대해, 설치류 실험 알러지성 뇌척수염 (EAE)이 일반적으로 사용된다. 상기 시스템은 잘 공지되어 있고, 예를 들어, 그 전문이 본원에 참고로 포함된 문헌 ([Steinman, 1996, Cell 85:299-302] 및 [Secor et al., 2000, J Exp. Med 5:813-821])에 기재되어 있다.
유사하게, 다른 모델 시스템이 선택되고 본 발명에서 사용될 수 있다.
예시적인 Fms 생화학적 분석
Fms 키나제 활성의 억제에 관하여 IC50 값이 결정되었고, 여기서 펩티드 기질의 인산화의 억제가 화합물 농도의 함수로서 측정된다. DMSO (1 ㎕)에 용해시킨 시험될 화합물을 백색 384-웰 플레이트 (코스타 (Costar) #3705)에 첨가하였다. Fms 키나제 (업스테이트 바이오테크, #14-551), 비오틴-(E4Y)10 기질 (업스테이트 바이오테크, Cat# 12-440), 및 ATP (시그마 (Sigma), Cat#A-3377)의 작업 원액을 8 mM MOPS pH 7.4, 2 mM MgCl2, 8 mM MnCl2, 2 mM DTT, 및 0.01％ Tween-20 중에 제조하였다. 모든 성분을 384-웰 플레이트에 20 ㎕의 부피 내에 0.5 ng/웰 Fms, 30 nM 비오틴-(E4Y)10 (업스테이트 바이오테크놀로지) 및 10 μM ATP의 최종 농도로 첨가하였다. 각각의 샘플은 5％ DMSO로 존재하였다. 이어서, 플레이트를 60분 동안 실온에서 인큐베이팅하였다. 사용 직전에, AlphaScreen PY20 검출 키트 (퍼킨 엘 머, Cat#676601M)로부터의 공여체 및 수여체 비드의 작업 원액을 8 mM MOPS, pH 7.4, 100 mM EDTA, 0.3％ BSA 중에 제조하였다. 반응을 중지시키기 위해, 플레이트를 암소에서 덮지 않고 5 ㎕의 공여체 비드 용액 (스트렙타비딘 비드)을 각각의 웰에 첨가하였다. 플레이트를 실온에서 20분 동안 인큐베이팅하였다. 이어서, 5 ㎕의 수여체 비드 용액 (PY20 코팅된 비드)을 각각의 웰에 첨가하였다. 각각의 비드의 최종 농도는 20 ㎍/mL이었다. 플레이트를 실온에서 60분 동안 인큐베이팅하였다. 형광 시그널을 Fusion Alpha 판독기 또는 AlphaQuest 판독기 상에서 기록하였다. 인산화된 기질은 시그널이 키나제 활성과 상호관련되도록 PY20 항체의 결합 및 공여체 및 수여체 비드의 회합을 일으킨다. 시그널 대 화합물 농도를 사용하여 IC50을 결정하였다.
화합물을 또한 10배 더 높은 ATP 농도에서 유사한 분석을 이용하여 시험하였다. DMSO (1 ㎕)에 용해시킨 시험될 화합물을 백색 384-웰 플레이트 (코스타 #3705)에 첨가하였다. Fms 키나제 (업스테이트 바이오테크, #14-551), 비오틴-(E4Y)10 기질 (업스테이트 바이오테크, Cat# 12-440), 및 ATP (시그마, Cat#A-3377)의 작업 원액을 8 mM MOPS pH 7.0, 2 mM MgCl2, 8 mM MnCl2, 2 mM DTT, 50 mM NaCl5, 0.01％ BSA, 및 0.01％ Tween-20 중에 제조하였다. 모든 성분을 384-웰 플레이트에 20 ㎕의 부피 내에 0.5 ng/웰 Fms, 30 nM 비오틴-(E4Y)10 (업스테이트 바이오테크놀로지) 및 100 μM ATP의 최종 농도로 첨가하였다. 각각의 샘플은 5％ DMSO로 존재하였다. 이어서, 플레이트를 20분 동안 3O℃에서 인큐베이팅하였다. 사용 직전에, AlphaScreen PY20 검출 키트 (퍼킨 엘머, Cat#676601M)로부터의 공여체 및 수여체 비드의 작업 원액을 8 mM MOPS, pH 7.0, 100 mM EDTA, 0.01％ BSA 중에 제조하였다. 반응을 중지시키기 위해, 플레이트를 암소에서 덮지 않고, 5 ㎕의 공여체 비드 용액 (스트렙타비딘 비드)을 각각의 웰에 첨가하였다. 플레이트를 실온에서 20분 동안 인큐베이팅하였다. 이어서, 5 ㎕의 수여체 비드 용액 (PY20 코팅된 비드)을 각각의 웰에 첨가하였다. 각각의 비드의 최종 농도는 10 ㎍/mL이었다. 플레이트를 실온에서 60분 동안 인큐베이팅하였다. 형광 시그널을 Fusion Alpha 판독기 또는 AlphaQuest 판독기 상에서 기록하였다. 인산화된 기질은 시그널이 키나제 활성과 상호관련되도록 PY20 항체의 결합 및 공여체 및 수여체 비드의 회합을 일으킨다. 시그널 대 화합물 농도를 사용하여 IC50을 결정하였다.
화합물을 8 mM MOPS pH 7.0, 0.2 mM EDTA, 250 mM KKKSPGEYVNIEFG (서열: ), 10 mM Mg아세테이트 및 γ-33P-ATP (약 500 cpm/pmol) 중 Fms (h) (5-10 mU)의 25 ㎕의 최종 반응 부피 내에 적절한 농도의 화합물을 사용하여 상기 설명된 것과 유사한 분석을 이용하여 분석하였다. 샘플을 40분 동안 실온에서 인큐베이팅하고, 5 ㎕의 3％ 인산을 첨가하여 중지시켰다. 10 ㎕의 각각의 샘플을 P30 필터매트 상에 스폿팅하고, 75 mM 인산으로 3x, 메탄올로 1회 세척하고, 건조시키고 섬광 계수기 (업스테이트 유에스에이) 상에서 측정하였다.
화합물 P-0001, P-0002, P-0003, P-0004, P-0005, P-0006, P-0007, P-0008, P-0009, P-0010, P-0011, P-0013, P-0014, P-0015, P-0016, P-0028, P-0032, P-0033, P-0038, P-0053, P-0054, P-0055, P-0056, P-0057, P-0058, P-0059, P-0060, P-0061, P-0062, P-0063, P-0064, P-0065, P-0066, P-0069, P-0072, P-0073, P-0074, P-0075, P-0076, P-0078, P-0081, 및 P-0082는 실시예 40 및 41에서 상기 설명된 Fms 분석의 적어도 하나에서 IC50이 1 μM 미만이었다.
실시예 42: c- Kit , c- Fms 및 다른 키나제의 부위-지정 돌연변이유발
c-kit 및 다른 키나제 (및 관심있는 다른 서열)의 돌연변이유발은 특히 문헌 [Molecular Biology: Current Innovations and Future Trends. Eds. A.M. Griffin and H.G.Griffm. (1995) ISBN 1-898486-01-8, Horizon Scientific Press, PO Box 1, Wymondham, Norfolk, U.K.]에 기재된 바와 같이 다음 절차에 따라 수행할 수 있다.
시험관 내 부위-지정 돌연변이유발은 단백질 구조-기능 관계, 유전자 발현 및 벡터 변형을 연구하기 위한 매우 귀중한 기술이다. 몇몇 방법이 문헌에 나타나 있지만, 상기 많은 방법은 템플레이트로서 단일-가닥 DNA를 필요로 한다. 그 이유는 역사적으로 재어닐링을 방지하기 위해 상보성 스트랜드를 분리시키기 위한 필요이다. 부위-지정 돌연변이유발에서 PCR의 사용은 상보적인 스트랜드를 분리하고 PCR 프라이머의 능률적인 중합화를 허용하기 위해 변성 단계를 사용함으로써스트랜드 분리를 달성한다. 따라서, PCR 부위-지정 방법은 부위-특이적 돌연변이가 실질적으로 임의의 이중-가닥 플라스미드 내에 포함되도록 허용하고; M13-기반 벡터 또 는 단일 가닥 구조에 대한 필요를 제거한다.
PCR-기반 부위-지정 돌연변이유발을 수행할 때 임의의 (목적하지 않는) 제2-부위 돌연변이의 클론 팽창을 방지하기 위해 PCR 동안 사이클 수를 감소시키는 것이 종종 바람직하다. 생성물 수율을 감소시킬 제한된 사이클링은 출발 템플레이트 농도를 증가시킴으로써 상쇄된다. 반응을 성공하는 모 분자의 수를 감소시키기 위해 선택이 사용된다. 또한, 단일 PCR 프라이머 세트를 사용하기 위해, 긴 PCR 방법을 최적화하는 것이 바람직하다. 또한, 일부 열안정성 폴리머라제의 익스텐다제 (extendase) 활성 때문에, 하나 또는 두 PCR 프라이머 내에 포함된 돌연변이를 함유하는 PCR-생성된 생성물의 단부-대-단부 라이게이션에 앞서 단부-연마 (polishing) 단계를 절차 내로 포함시키는 것이 종종 필요하다.
다음 프로토콜은 부위-지정 돌연변이유발을 위한 손쉬운 방법을 제공하고, 하기 단계를 포함함으로써 상기 목적하는 특징을 달성한다: (i) 템플레이트 농도를 통상적인 PCR 조건보다 약 1000배 증가시키고; (ii) 사이클 수를 25-30에서 5-10으로 감소시키고; (iii) 모 DNA에 대항하여 선택하기 위해 제한 엔도뉴클레아제 DpnI (인식 표적 서열: 5-Gm6ATC-3, 여기서 A 잔기는 메틸화됨)을 첨가하고 (이. 콜라이의 거의 모든 일반 균주로부터 단리된 DNA는 서열 5-GATC-3에서 Dam-메틸화되는 것에 주목한다); (iv) 10 kb로 PCR에 대한 증가된 신뢰성을 위해 PCR 믹스 (mix)에서 Taq Extender를 사용하고; (v) PCR 생성물의 단부를 연마하기 위해 Pfu DNA 폴리머라제를 사용하고, (vi) T4 DNA 리가제의 존재 하에 능률적인 분자내 라이게이션.
플라스미드 템플레이트 DNA (약 0.5 pmole)를 25 ㎕의 1x 돌연변이유발 버 퍼: (20 mM 트리스 HCl, pH 7.5; 8 mM MgCl2; 40 ug/ml BSA) 내에 12-20 pmole의 각각의 프라이머 (그 중 하나는 5-프라임 포스페이트를 포함해야 한다), 250 uM 각각의 dNTP, 2.5 U Taq DNA 폴리머라제, 2.5 U의 Taq Extender (스트라타젠 (Stratagene))를 함유하는 PCR 칵테일에 첨가한다.
PCR 사이클링 파라미터는 94℃에서 4분, 50℃에서 2분 및 72℃에서 2분의 1 사이클에 이어 94℃에서 1분, 54℃에서 2분 및 72℃에서 1분의 5-10 사이클이다 (단계 1).
모 템플레이트 DNA, 및 새로 합성된 DNA를 포함하는 선형의 돌연변이유발-프라이머는 DpnI (10 U) 및 Pfu DNA 폴리머라제 (2.5 U)로 처리된다. 이는 생체내 메틸화된 모 템플레이트 및 하이브리드 DNA의 DpnI 소화, 및 Pfu DNA 폴리머라제에 의한 선형 PCR 생성물 상에서 Taq DNA 폴리머라제-연장된 염기(들)의 제거를 일으킨다.
반응물을 37℃에서 30분 동안 인큐베이팅한 후, 추가의 30분 동안 72℃로 옮긴다 (단계 2).
돌연변이유발 버퍼 (1x, 115 ㎕, 0.5 mM ATP 함유)를 DpnI-소화된, Pfu DNA 폴리머라제-연마된 PCR 생성물에 첨가한다.
용액을 혼합하고, 10 ㎕을 새로운 미세원침관에 취하고 T4 DNA 리가제 (2-4 U)를 첨가한다.
라이게이션을 60분 초과 동안 37℃에서 인큐베이팅한다 (단계 3).
처리된 용액을 유능 이. 콜라이 내로 형질전환시킨다 (단계 4).
상기 설명된 PCR-기반 부위-지정 돌연변이유발 외에, 다른 방법이 이용가능하다. 그 예는 문헌 [Kunkel (1985) Proc. Natl. Acad. Sci. 82:488-492; Eckstein et al. (1985) Nucl. Acids Res. 13:8764-8785]에 기재된 것을 포함하고; 프로메가의 GeneEditor(TM) 부위-지정 돌연변이유발 시스템을 이용한다.
하기 실시예와 상기 실시예 1-36에서, 사용되거나 제안된 용매 및 시약은 그로 제한되지 않고, 당업자에게 공지된 용매 및 시약으로 적절하게 대체될 수 있음을 이해해야 한다. 반응 생성물은 당업계에 공지된 수단, 예를 들어 적합한 용매를 사용한 추출, 적합한 용매로부터의 침전, 적합한 용매계를 사용한 크로마토그래피, 예를 들어 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피, HPLC, 예비 TLC 등에 의해 단리할 수 있다.
하기 화학식 I 또는 화학식 Ib에 적용될 수 있는 합성 경로를 하기 반응식 및 실시예에서 설명한다.
<화학식 I>
Figure 112007090494669-PCT00080
상기 식에서, X1, X2, Y1, Y2, L1, Ar1, L2 및 R1은 상기 화학식 I에서 정의된 바와 같다.
<화학식 Ib>
Figure 112007090494669-PCT00081
상기 식에서, U, V, W, Z, R1, R15, R16, R17, A, M, E, G, J, K, F 및 n은 상기 화학식 Ib에서 정의된 바와 같다. 아래에서 설명되는 방법은 화학식 Ib와 관련하여 제시되지만, 당업자는 이 방법을 사용하여 화학식 I 또는 화학식 Ib의 화합물을 제조할 수 있음을 분명히 알 것이다. 하기 반응식 및 실시예와 관련하여, 반대로 명백하게 명시하지 않으면, 화학식 및 화합물 목록은 상기 명세서의 목록과 무관하게 각각의 반응식 또는 실시예에 대해 규정되지만, 화학식 I 및 Ib에 대한 일반적인 언급은 상기 명세서에 기재된 화학식을 나타낸다.
화학식 Ib의 화합물은 반응식 39에 제시된 바와 같이 화학식 III 및 화학식 X의 화합물로부터 제조할 수 있다.
반응식 39:
Figure 112007090494669-PCT00082
R41 이 수소 또는 보호기 P (예를 들어, 페닐술폰, t-부틸옥시카르보닐, 트리이소프로필실릴)이고 R40이 수소 또는 커플링에 적절한 관능기 (예를 들어, Br, SH, OH, CHO 등)인 화학식 III의 화합물을, 당업자에게 공지된 표준 커플링 조건을 사용하여 연결 A를 형성하기 위해 R42가 R40을 기초로 하여 적절하게 선택된 관능기인 화학식 X의 화합물과 반응시켜 화학식 Ib의 화합물을 수득한다.
화학식 Ib의 화합물은 R43이 M-R1 도입에 적절한 관능기인 화학식 III 및 화학식 Xa의 화합물로부터 반응식 40에 제시된 바와 같이 제조할 수 있다.
반응식 40:
Figure 112007090494669-PCT00083
R41이 수소 또는 보호기 P (예를 들어, 페닐술폰, t-부틸옥시카르보닐, 트리이소프로필실릴)이고 R40이 수소 또는 커플링에 적절한 관능기 (예를 들어, Br, SH, OH, CHO 등)인 화학식 III의 화합물을, 당업자에게 공지된 표준 커플링 조건을 사 용하여 연결 A를 형성하기 위해 R42가 R40을 기초로 하여 적절하게 선택된 관능기이고 R43이 M-R1 도입에 적절한 관능기인 화학식 Xa의 화합물과 반응시켜 화학식 II의 화합물을 수득한다. 화학식 II의 화합물은 화학식 Ib의 화합물을 제공하기 위해 당업자에게 공지된 조건을 사용하여 M-R1을 도입하기 위해 추가로 관능화된다.
반응식 40의 단계 1 및 2는 화학식 X의 화합물을 단계 2의 방법에 의해 화학식 Xa의 화합물로부터 제조한 후, 생성되는 화학식 X의 화합물을 단계 1의 방법에 따라 화학식 III의 화합물과 커플링시키도록 변경될 수 있다.
반응식 39 또는 40의 화학식 X 또는 Xa의 많은 화합물은 상업적으로 입수가능하거나 또는 질소 함유 헤테로사이클의 치환을 포함하는 요구되는 특정 고리계 및 치환 패턴에 따라 문헌에 공지된 많은 상이한 경로, 및 방향족 헤테로사이클의 드 노보 (de novo) 합성으로 제조할 수 있다.
R40이 H 또는 화학식 X 또는 Xa의 화합물에 커플링하기 적절한 관능기 (예를 들어 알데히드, 카르복실산, 아민)인 반응식 39 또는 40의 화학식 III의 화합물의 합성을 반응식 41에 제시한다.
반응식 41:
Figure 112007090494669-PCT00084
U 또는 Z가 C-Br, C-Cl, C-NO2 또는 C-NH2인 화학식 IIIa의 화합물은 일반적으로 당업자에게 공지된 방법을 사용하여 상업적으로 입수가능한 적절한 단일 헤테로시클릭 고리 또는 융합된 두개의 고리 헤테로시클릭 화합물로부터 제조할 수 있다. 화학식 IIIa의 화합물은 당업자에게 공지된 방법을 사용하여 U 또는 Z가 C-Br, C-Cl, C-NO2 또는 C-NH2이고 R41이 H 또는 보호기 P인 적절하게 치환된 화학식 III의 화합물을 제공하도록 추가로 변경된다.
R40이 H인 화학식 IIIb의 화합물로부터 반응식 39 또는 40의 화학식 III의 화합물의 합성을 반응식 42에 제시한다.
반응식 42:
Figure 112007090494669-PCT00085
R41이 수소 또는 보호기 P이고 R40이 반응식 39 또는 40의 화학식 X 또는 Xa의 화합물의 커플링에 적절하거나 (예를 들어 알데히드, 카르복실산, 아민) 또는 상기 치환체 변형에 적절한 (예를 들어, 에스테르, 니트로) 화학식 III의 화합물도 당업자에게 공지된 합성 방법 [예를 들어, Merour and Joseph, Curr. Org. Chem. 2001, 5:471-506]을 사용하여 화학식 IIIb의 화합물 (여기서, R40은 H임)로부터 제조할 수 있다.
상기 반응식 이외에, 하기 실시예에 제시된 반응을 상이한 순서로 조합하여 화학식 Ib의 화합물을 수득할 수 있다. 일부 특정한 경우에는 요구되는 화합물을 수득하기 위해 2 이상의 반응 단계가 필요할 수 있기 때문에, 단일 단계로서 반응식 39-42 및 하기 반응식 및 실시예에 제시된 변형은 일반적인 전체적인 변형을 제시하는 것으로서 간주되어야 한다.
화학식 Ib, 화학식 II 및 화학식 III의 화합물의 제조시에, 반응식 43, 단계 1에 예시된 바와 같이 7-아자인돌 또는 그의 유사체에서 N-H의 수소를 보호기로 치환하는 것이 종종 유리할 수 있다. 이어서, 단계 2에 따라 N-H를 노출시키는 것이 적절할 때 보호기를 제거할 수 있다
반응식 43:
Figure 112007090494669-PCT00086
단계 1 - R 41 이 보호기 P인 화학식 IIIc 의 제조
R41이 보호기 P인 화학식 IIIc의 화합물은 R41이 수소인 화학식 IIIa의 화합물을 비-반응성 용매 (예를 들어, 디메틸포름아미드, 테트라히드로푸란) 중에 용해시키고 염기 (예를 들어, 수성 수산화나트륨, 수소화나트륨) 및 가능하게는 촉매 (예를 들어, 테트라부틸암모늄 수소 술페이트)를 첨가하여 제조할 수 있다. 이어서, 보호기 도입에 적절한 시약 (예를 들어, 페닐술포닐 클로라이드, 트리이소프로 필실릴 클로라이드, Boc 안히드라이드)을 첨가하고, 반응물을 1 내지 수시간 동안 교반한다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출, 실리카 겔 크로마토그래피)에 의해 단리 및 정제하여 R43이 보호기인 화학식 IIIc의 화합물을 수득한다.
단계 2 - R 41 이 수소인 화학식 IIIa 의 제조
R41이 수소인 화학식 IIIa의 화합물은 R41이 보호기 P인 화학식 IIIc의 화합물을 적합한 용매 (예를 들어, 에탄올, 테트라히드로푸란, 디클로로메탄)에 용해시키고 보호기 제거에 적절한 시약 (예를 들어, 수산화칼륨, 테트라부틸암모늄 플루오라이드, 트리플루오로아세트산)을 첨가하여 제조할 수 있다. 반응물을 30분 내지 수시간 동안 가열하면서 교반한다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출, 실리카 겔 크로마토그래피)에 의해 단리 및 정제하여 R43이 수소인 화학식 IIIa의 화합물을 수득한다.
상기 화학식 II의 화합물은 R43이 M-R1로서 또는 M-R1을 제공하기 위한 추가의 치환에 적절한 치환체로서 규정되고 R41이 수소 또는 보호기 P인 화학식 Ib의 화합물과 유사하다.
<화학식 II>
Figure 112007090494669-PCT00087
U, V, W, Z, J, E, F, G, K는 C이고 n은 1인 화학식 II의 화합물은 하기 화학식 IIa의 화합물을 형성한다.
<화학식 IIa>
Figure 112007090494669-PCT00088
화학식 IIa의 화합물의 합성에 대해 제시된 실시예는 화학식 Ib 및 화학식 II의 다른 정의를 충족시키는 많은 화합물에도 적용할 수 있다. 예를 들어, 7-아자인돌, 화합물 1은 U, V, W 및 Z가 C-H 이외의 다른 것인 화합물에 의해 상기 합성에서 대체될 수 있다.
실시예 43: A가 CH 2 또는 C(O)인 화학식 IIa 의 화합물의 합성
A가 CH2 또는 C(O)인 화학식 IIa의 화합물은 반응식 100에 따라 화학식 Xb (R42가 C(O)H이고, J, E, F, G 및 K는 C이고 n은 1인 화학식 Xa)의 화합물 및 화합 물 1로부터 2 단계로 합성할 수 있다.
반응식 100
Figure 112007090494669-PCT00089
단계 1 - R 44 가 수소 또는 메틸인 화학식 XI 의 제조
7-아자인돌 1 및 화학식 Xb의 화합물에 적절한 용매 (예를 들어, 극성 용매, 예를 들어 메탄올, 테트라히드로푸란 및 아세토니트릴, 또는 비극성 용매, 예를 들어 톨루엔), 이어서 적절한 수산화물 또는 알콕시드 염기 (예를 들어, 수산화칼륨, 나트륨 메톡시드)를 첨가한다. 반응물을 일반적으로 실온에서 철야 교반한다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 메탄올이 용매로서 사용될 때 R44가 수소인 화학식 XI의 화합물 또는 R44가 메틸인 화학식 XI의 화합물을 수득하거나, 또는 메탄올이 용매로서 사용될 때 R44가 수소 또는 메틸인 화학식 XI의 화합물의 혼합물을 수득한다. 생성되는 혼합물을 크로마토그래 피에 의해 분리하거나 또는 단계 2에서 혼합물로서 사용할 수 있다.
단계 2a - A가 CH 2 인 화학식 IIa 의 제조
적절한 극성 용매 (예를 들어, 아세토니트릴) 중의 R44가 수소 또는 메틸인 화학식 XI의 화합물에 환원제 (예를 들어, 트리플루오로아세트산 및 트리에틸실란)를 첨가한다. 일반적으로, 반응물을 실온에서 철야 교반한다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 A가 CH2이고 R41이 H인 화학식 IIa의 화합물을 수득한다.
단계 2b - A가 C(O)인 화학식 IIa 의 제조
A가 C(O)인 화학식 IIa의 화합물은 R44가 수소인 화학식 XI의 화합물을 비-반응성 용매 (예를 들어, 테트라히드로푸란) 중의 적절한 산화제 (예를 들어, 데스-마르틴 시약, TEMPO)로 산화시켜 제조한다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 A가 C(O)이고 R41이 H인 화학식 IIa의 화합물을 수득한다.
반응식 100의 반응물은 일반적으로 화학식 Xa의 화합물에 적용될 수 있고, 7-아자인돌 1을 4, 5, 또는 6 위치, 바람직하게는 4 또는 5 위치에서 치환된 7-아자인돌로 대체하여 X1이 CH이고 X2, Y1 및 Y2가 각각 CR6, CR4 및 CR5인 화학식 I의 화합물, 또는 V 및 W가 CH이고 U 및 Z가 독립적으로 CR18인 화학식 Ib의 화합물을 수득할 수 있다. 화학식 Xa의 화합물은 상업적으로 입수할 수 있거나, 또는 본원의 실시예의 프로토콜에 따라 합성할 수 있다. 따라서, A가 CH2인 화학식 IIa의 화합물 (또는 유사한 화학식 I, 화학식 Ib)은 적절한 용매 (예를 들어, 메탄올, 테트라히드로푸란, 아세토니트릴, 톨루엔) 중의 4, 5 또는 6 위치에서 적합한 헤테로아릴 알데히드로 임의로 치환된 7-아자인돌 화합물 (R42가 C(O)H인 화학식 Xa)을 수산화물 또는 알콕시드 염기 (예를 들어, 수산화칼륨, 나트륨 메톡시드)와 반응시켜 제조한다. 생성되는 화합물은 환원 조건 하에서 극성 용매 (예를 들어, 아세토니트릴) 중에서 반응시켜 요구되는 화합물을 수득한다. A가 C(O)인 화학식 IIa의 화합물 (또는 유사한 화학식 I, 화학식 Ib)은 적절한 용매 (예를 들어, 메탄올, 테트라히드로푸란, 아세토니트릴, 톨루엔) 중의 4, 5 또는 6 위치에서 적합한 헤테로아릴 알데히드로 임의로 치환된 7-아자인돌 화합물 (R42가 C(O)H인 화학식 Xa)을 수산화물 또는 알콕시드 염기 (예를 들어, 수산화칼륨, 나트륨 메톡시드)와 반응시켜 제조한다. 생성되는 화합물로부터, 알콜 중간체 (예를 들어, R44가 OH인 화학식 XI)를 단리하고, 산화 조건 하에서 비-반응성 용매 (예를 들어, 테트라히드로푸란) 중에서 반응시켜 요구되는 화합물을 수득한다.
실시예 44: A가 CH 2 또는 C(O)인 화학식 IIa 의 화합물의 합성
또한, A가 CH2 또는 C(O)인 화학식 IIa의 화합물을 화학식 Xc의 화합물 (J, E, F, G 및 K가 C이고, n은 1이고, R42는 유기금속 치환체 T인 화학식 Xa) 및 화합물 IIId (U, V, W 및 Z는 CH이고, R40은 C(O)H이고, R41은 P인 화학식 III)로부터 반응식 101에 따라 4단계로 합성할 수 있다.
반응식 101
Figure 112007090494669-PCT00090
단계 1 - 화학식 IIId 의 제조
7-아자인돌 1을 수시간 동안 환류로 가열하면서 물 중의 헥사메틸테트라민 및 아세트산으로 처리하여 3-위치에 알데히드를 도입한다. 상기 중간체를 농축 및 추출에 의해 단리한다. 보호기 P는 반응식 43에 제시된 바와 같이 중간체의 N-1 위치에 첨가되어 화학식 IIId의 화합물을 생성시킨다.
단계 2 - R 42 가 T인 화학식 Xc 의 제조
R42가 유기금속 치환체 T (예를 들어, 리튬, MgBr)인 화학식 Xc의 화합물은 R42가 브롬인 화학식 Xc의 화합물을 유기리튬 시약 (예를 들어, 부틸리튬) 또는 마그네슘으로 처리하거나, 또는 비-반응성 용매 (예를 들어, 테트라히드로푸란) 중에서 일반적으로 저하된 온도 (예를 들어, -78℃)에서 R42가 수소일 때 유기리튬 시약 (예를 들어, 부틸리튬)을 사용한 오르토리티에이션 (ortholithiation)을 통해 수득하여 단리하지 않은 상태로 단계 3에 사용한다.
단계 3 - 화학식 XIa 의 제조
R42가 T인 화학식 Xc의 화합물을 비-반응성 용매 (예를 들어, 테트라히드로푸란) 중의 화학식 IIIc의 화합물에 저하된 온도 (예를 들어, -78℃)에서 첨가하고, 수시간 동안 교반한다. 실온으로 가온시킨 후, 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 화학식 XIa의 화합물을 수득한다.
단계 4a - A가 CH 2 인 화학식 IIa 의 제조
적절한 극성 용매 (예를 들어, 아세토니트릴) 중의 화학식 XIa의 화합물에 환원제 (예를 들어, 트리플루오로아세트산 및 트리에틸실란)를 첨가한다. 일반적으로, 반응물을 실온에서 철야 교반한다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)에 의한 단리, 이어서 반응식 43, 단계 2에 따른 N-P의 탈보호에 의해 A가 CH2이고 R41이 H인 화학식 IIa의 화합물을 수득한다.
단계 4b - A가 C(O)인 화학식 IIa 의 제조
A가 C(O)인 화학식 IIa의 화합물은 실시예 43, 단계 2b의 프로토콜에 따라 화학식 XIa의 화합물로부터 제조한 후, 반응식 43, 단계 2에 따른 탈보호에 의해 R41이 H인 화합물을 수득한다.
실시예 45: A가 C(O) 또는 CH 2 인 화학식 IIa 의 화합물의 합성
A가 C(O) 또는 CH2인 화학식 IIa의 화합물은 반응식 102에 따라 각각 1단계 및 2 단계에서 화학식 Xd의 화합물 (J, E, F, G 및 K는 C이고, n은 1이고, R42은 C(O)Cl인 화학식 Xa) 및 화합물 1로부터 합성할 수 있다.
반응식 102
Figure 112007090494669-PCT00091
단계 1 - A가 C=O인 화학식 IIa의 제조
A가 카르보닐인 화학식 IIa의 화합물은 실온에서 수시간 동안 교반하면서 비-반응성 용매 (예를 들어, 디클로로메탄) 중에서 루이스 산 (예를 들어, 삼염화알루미늄)의 존재 하에 화합물 1을 화학식 Xd의 산 클로라이드와 반응시켜 제조한다. 반응물을 메탄올로 켄칭시킬 수 있고, 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 A가 C=O이고 R41이 H인 화학식 IIa의 화합물을 수득한다.
단계 2 - A가 CH 2 인 화학식 IIa 의 제조
A가 CH2인 화학식 IIa의 화합물은 비-반응성 용매 (예를 들어, 테트라히드로푸란) 중에서 A가 C(O)인 화합물 IIa를 환원제 (예를 들어, 리튬 알루미늄 수소화물)와 수시간 동안 반응시켜 제조할 수 있다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 A가 CH2이고 R41이 H인 화학식 IIa의 화합물을 수득한다.
실시예 46: A가 CH 2 인 화학식 IIa 의 화합물의 합성
A가 CH2인 화학식 IIa의 화합물은 반응식 103에 따라 2 단계로 화합물 1로부터 합성할 수 있다.
반응식 103
Figure 112007090494669-PCT00092
단계 1 - 화학식 IIIe 의 제조
화학식 IIIe의 화합물 (U, V, W 및 Z는 CH이고, R41은 P이고, R40은 CH2N(CH3)2인 화학식 III)은 문헌 절차 (Robinson, J. Am. Chem. Soc, 1955, 77, p. 457)에 따라 화합물 1로부터 합성된 후, 반응식 43, 단계 1에 따라 N-H의 탈보호에 의해 합성된다.
단계 2 - A가 CH 2 인 화학식 IIa 의 제조
A가 CH2인 화학식 IIa의 화합물은 실온에서 톨루엔 중에서 화학식 IIIe의 화합물과 이소프로필 클로로 포르메이트 (또는 에틸 클로로포르메이트)의 반응을 통해 3-클로로메틸 중간체를 제조하여 합성한다. -78℃로 냉각시킨 상기 중간체를 R42가 금속인 화학식 Xc의 유기구리 시약 (실시예 44, 단계 2에 기재된 바와 같이 제조) 및 시안화구리 및 염화리튬의 용액과 반응시킨다. 반응물을 -78℃에서 1시간 동안 교반한 후, 실온으로 가온시키고, 4:1의 염화암모늄:수산화암모늄으로 켄칭시킬 수 있다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 A가 CH2이고 R41이 P인 화학식 IIa의 화합물을 수득하고, 상기 P는 반응식 43 단계 2에 따라 제거하여 R41이 H인 화합물을 수득할 수 있다.
실시예 47: A가 O인 화학식 IIa 의 화합물의 합성
A가 O인 화학식 IIa의 화합물은 반응식 104에 따라 2 단계로 화합물 1로부터 합성할 수 있다.
반응식 104
Figure 112007090494669-PCT00093
단계 1 - 화합물 400의 제조
3-브로모-7-아자인돌 400은 7-아자인돌 1을 클로로포름에 용해시키고 0℃에서 사염화탄소 중의 Br2를 서서히 첨가하여 제조할 수 있다. 1-2시간 동안 교반한 후, 반응물을 수성 염산으로 켄칭시킬 수 있다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 화합물 400을 수득한다.
단계 2 - A가 O인 화학식 IIa 의 제조
A가 O인 화학식 IIa의 화합물은 비-반응성 용매 (예를 들어, 디메틸포름아미드) 중에서 염기 (예를 들어 수소화나트륨) 및 구리 촉매 (예를 들어, 브롬화구리)의 존재 하에 수시간 동안 가열 (예를 들어, 120℃)하면서 반응식 43, 단계 1에 따라 N-H에서 보호된 3-브로모-7-아자인돌 400을 화학식 Xe의 화합물 (J, E, F, G 및 K가 C이고, n은 1이고, R42는 OH인 화학식 Xa)과 반응시켜 제조한다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)에 의한 단리, 이어서 반응식 43, 단계 2에 따른 보호기의 제거에 의해 A가 O이고 R41이 H인 화학식 IIa의 화합물을 수득한다.
실시예 48: 중간체 1-(3-히드록시- 피롤로[2,3-b]피리딘 -1-일)- 에타논 (503)의 합성
1-(3-히드록시-피롤로[2,3-b]피리딘-1-일)-에타논 503은 반응식 105에 제시된 바와 같이 2-아미노-니코틴산 500으로부터 3 단계로 합성할 수 있다. 화합물은 U, V, W 및 Z는 CH이고, R40이 OH이고, R41이 P (예를 들어, 아세틸)인 화학식 III의 예시적인 화합물이다.
반응식 105
Figure 112007090494669-PCT00094
단계 1 - 2-( 카르복시메틸 -아미노)-니코틴산 (501)의 제조
2-(카르복시메틸-아미노)-니코틴산 501은 상업적으로 입수가능한 2-아미노-니코틴산 500을 2-클로로아세트산과 염기 (예를 들어, 탄산나트륨)의 존재 하에 일반적으로 실온에서 1-4시간 동안 반응시킨 후, 정제 및 통상적인 수단 (예를 들어, 산 염기 추출 및 재결정화)에 의한 단리에 의해 제조한다.
단계 2 - 아세트산 1-아세틸-1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3-일 에스테르 (502)의 제조
아세트산 1-아세틸-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일 에스테르 502는 2-(카르복시메틸-아미노)-니코틴산 501을 아세트산 무수물 환류시에 나트륨 아세테이트와 수시간 동안 반응시킨 후, 정제 및 통상적인 수단 (예를 들어, 재결정화)에 의한 단리에 의해 제조한다 (Su ＆ Tsou; J. Am. Chem. Soc.,82, 1960, 1187).
단계 3 - 1-(3-히드록시- 피롤로[2,3-b]피리딘 -1-일)- 에타논 (503)의 제조
1-(3-히드록시-피롤로[2,3-b]피리딘-1-일)-에타논 503은 메탄올 중에서 실온에서 일반적으로 30분 내지 1시간 동안 나트륨과의 반응에 의해 3-위치에서 아세테이트의 선택적인 제거, 이어서 정제 및 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 재결정화)에 의한 단리에 의해 아세트산 1-아세틸-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일 에스테르 502로부터 제조한다.
실시예 49: A가 O인 화학식 IIa 의 화합물의 합성
A가 O인 화학식 IIa의 화합물은 화학식 IIIf의 화합물 (U, V, W 및 Z는 CH이고, R41이 P이고 R40이 OH인 화학식 III) 및 화학식 Xf의 화합물 (J, E, F, G 및 K가 C이고, n은 1이고, R42가 이탈기 L인 화학식 Xa)로부터 반응식 106에 따라 1 단계로 합성할 수 있다.
반응식 106
Figure 112007090494669-PCT00095
단계 1 - A가 O인 화학식 IIa 의 제조
A가 O인 화학식 IIa는 L이 이탈기 (예를 들어, 할로겐 또는 트리플레이트)인 화학식 Xf의 화합물을 염기 (예를 들어, 수소화나트륨)의 존재 하에 비-반응성 용매 (예를 들어, 디메틸포름아미드)에 용해시켜 제조한다. 화학식 IIIf의 화합물은 구리 촉매 (예를 들어, 브롬화구리)의 존재 하에 수시간 동안 가열하면서 첨가한다. 반응식 43, 단계 2에 따른 보호기의 제거, 이어서 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)에 의한 단리를 통해 A가 O이고 R41이 H인 화학식 IIa의 화합물을 수득한다.
실시예 50: A가 NH 또는 N- R 45 인 화학식 IIa 의 화합물의 합성
A가 NH 또는 NR45인 화학식 IIa의 화합물 (R45는 화학식 Ib의 화합물에 대한 A의 정의 또는 화학식 I의 화합물에 대한 L1의 정의와 일치함)은 반응식 107에 따라 2 단계로 3-브로모-7-아자인돌 400 및 화학식 Xg의 화합물 (J, E, F, G 및 K는 C이고, n은 1이고, R42는 NH2인 화학식 Xa)로부터 합성할 수 있다.
반응식 107
Figure 112007090494669-PCT00096
단계 1 - A가 NH 인 화학식 IIa의 제조
A가 NH인 화학식 IIa의 화합물은 3-브로모-7-아자인돌 400을 화학식 Xg의 순수 화합물과 수시간 동안 가열하면서 (예를 들어, 150℃) 반응시켜 제조한다. 별법으로, 400은 팔라듐 촉매화된 부흐발트-하르트비히 (Buchwald-Hartwig) 조건 ( 즉, 수시간 동안 가열하면서 (예를 들어, 80℃) 비-반응성 용매 (예를 들어, 톨루엔) 중의 팔라듐 촉매 (예를 들어, 트리스(디벤질리덴아세톤)디팔라듐(0)), 리간드 (예를 들어, 트리-t-부틸포스핀), 및 염기 (예를 들어, 나트륨 t-부톡시드))을 사용하여 화학식 Xg의 화합물과 반응시킬 수 있다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 A가 NH이고 R41이 P인 화학식 IIa의 화합물을 수득한다. 반응식 43, 단계 2에 따른 보호기의 제거를 통해 A가 NH이고 R41이 H인 화학식 IIa의 화합물을 수득한다.
단계 2 - A가 N- R 45 인 화학식 IIa 의 제조
A가 N-R45인 화학식 IIa의 화합물은 R41이 P이고 A가 NH인 화학식 IIa의 화합물을 비-반응성 용매 (예를 들어, 디메틸포름아미드) 중에서 염기 (예를 들어, 탄산칼륨, 디이소프로필에틸아민)의 존재 하에 이탈기 (예를 들어, 메틸 요오다이드, 아세틸 클로라이드)가 존재하는 적절한 시약과 수시간 동안 실온에서 반응시켜 제조한다. 반응식 43, 단계 2에 따른 보호기의 제거 및 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)에 의한 단리를 통해 A가 N-R45이고 R41이 H인 화학식 IIa의 화합물을 수득한다.
실시예 51: R 40 이 NH 2 인 화학식 IIIh 의 중간체의 합성
화학식 IIIh의 화합물 (U, V, W 및 Z가 CH이고, R41은 H이고 R40이 NH2인 화학 식 III)은 반응식 108에 따라 3 단계로 7-아자인돌 1로부터 합성할 수 있다.
반응식 108
Figure 112007090494669-PCT00097
단계 1 - 3-니트로-7- 아자인돌 (504)의 제조
3-니트로-7-아자인돌 504는 냉각시키면서 (예를 들어, 0℃) 7-아자인돌 1을 발연 (fuming) 질산에 첨가하여 제조한다. 1 내지 수시간 동안 교반한 후, 물을 조심스럽게 첨가하고, 혼합물을 포화 중탄산나트륨으로 중화시킨다. 고체를 여과에 의해 수거하고 건조시켜 3-니트로-7-아자인돌 504를 수득한다.
단계 2 - 화학식 IIIg 의 제조
화학식 IIIg의 화합물 (U, V, W 및 Z는 CH이고, R41은 H이고, R40은 NH2인 화학식 III)은 반응식 43, 단계 1에 따라 3-니트로-7-아자인돌 504로부터 제조한다.
단계 3 - 화학식 IIIh 의 제조
화학식 IIIh의 화합물은 니트로기의 환원 (예를 들어, 수소 기체 및 메탄올 중의 탄소 상의 팔라듐)에 의해 화학식 IIIg의 화합물로부터 제조된다. 혼합물을 여과하고 농축하여 화학식 IIIh의 화합물을 수득한다.
실시예 52: A가 NH 또는 NR 45 인 화학식 IIa 의 화합물의 합성
A가 NH 또는 NR45인 화학식 IIa의 화합물 (R45는 화학식 Ib의 화합물에 대한 A의 정의 또는 화학식 I의 화합물에 대한 L1의 정의와 일치함)은 반응식 109에 제시된 바와 같이 2 단계로 화학식 IIIh의 화합물 및 화학식 Xh의 화합물 (J, E, F, G 및 K는 C이고, n은 1이고, R42는 Br인 화학식 Xa)로부터 합성할 수 있다.
반응식 109
Figure 112007090494669-PCT00098
단계 1 - A가 NH 인 화학식 IIa 의 제조
A가 NH인 화학식 IIa의 화합물은 화학식 Xh의 화합물을 화학식 IIIh의 화합물 (실시예 51에 기재된 바와 같이 제조)과 수시간 동안 가열하면서 (예를 들어, 100℃) 반응시켜 제조한다. 별법으로, 화학식 IIIh의 화합물은 팔라듐 촉매화된 부흐발트-하르트비히 조건 (즉, 비-반응성 용매 (예를 들어, 톨루엔) 중에서 수시간 동안 가열하면서 (예를 들어, 80℃) 팔라듐 촉매 (예를 들어, 트리스(디벤질리덴아세톤)디팔라듐(0)), 리간드 (예를 들어, 트리-t-부틸포스핀), 및 염기 (예를 들어, 나트륨 t-부톡시드))을 사용하여 화학식 Xh의 화합물과 반응시킨다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 A가 NH이고 R41이 P인 화학식 IIa의 화합물을 수득한다. 반응식 43, 단계 2에 따라 보호기를 제거하여 A가 NH이고 R41이 H인 화학식 IIa의 화합물을 수득한다.
단계 2 - A가 N- R 45 인 화학식 IIa 의 제조
A가 N-R45인 화학식 IIa의 화합물은 실시예 50, 단계 2에 기재된 바와 같이 제조한다.
실시예 53: A가 S인 화학식 IIa 의 화합물의 합성
A가 S인 화학식 IIa의 화합물은 반응식 110에 제시된 바와 같이 1 단계로 7-아자인돌 1 및 화학식 Xi의 화합물 (J, E, F, G 및 K는 C이고, n은 1이고, R42는 아릴 디술파이드인 화학식 Xa)로부터 합성할 수 있다.
반응식 110
Figure 112007090494669-PCT00099
단계 1 - A가 S인 화학식 IIa 의 제조
A가 S인 화학식 IIa의 화합물은 7-아자인돌 1을 적절한 용매 (예를 들어, 디메틸포름아미드)에 염기 (예를 들어, 수소화나트륨)와 함께 용해시킨 후, 화학식 Xi의 대칭적인 아릴 디술파이드를 첨가하여 제조한다. 실온에서 수시간 동안 교반한 후, 반응물을 물로 켄칭시키고, 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)에 의해 단리하여 A가 S이고 R41이 H인 화학식 IIa의 화합물을 수득한다.
실시예 54: A가 S인 화학식 IIa 의 화합물의 합성
A가 S인 화학식 IIa의 화합물은 반응식 111에 제시된 바와 같이 1 단계로 3-브로모-7-아자인돌 400 및 화학식 Xj의 화합물 (J, E, F, G 및 K는 C이고, n은 1이고, R42는 SH인 화학식 Xa)로부터 합성할 수 있다.
반응식 111
Figure 112007090494669-PCT00100
단계 1 - A가 S인 화학식 IIa 의 제조
A가 S인 화학식 IIa의 화합물은 3-브로모-7-아자인돌 400을 염기 (예를 들어, 수소화나트륨)의 존재 하에 적절한 용매 (예를 들어, 디메틸포름아미드) 중에서 수시간 동안 가열하면서 (예를 들어, 100℃) 화학식 Xj의 화합물과 반응시켜 제조한다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 A가 S이고 R41이 H인 화학식 IIa의 화합물을 수득한다.
실시예 55: A가 S(O) 2 인 화학식 IIa 의 화합물의 합성
A가 S(O)2인 화학식 IIa의 화합물은 반응식 112에 제시된 바와 같이 1 단계 로 A가 S이고 R41이 H인 화학식 IIa의 화합물로부터 합성할 수 있다.
반응식 112
Figure 112007090494669-PCT00101
단계 1 - A가 S(O) 2 인 화학식 IIa 의 제조
A가 S(O)2인 화학식 IIa의 화합물은 A가 S인 화학식 IIa의 화합물 (실시예 53 또는 54에 기재된 바와 같이 제조)을 적절한 비양성자성 용매 (예를 들어, 디클로로메탄) 중에서 산화제 (예를 들어, 메타-클로로-퍼옥시벤조인산, 과산화수소)와 반응시켜 제조한다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 A가 S(O)2이고 R41이 H인 화학식 IIa의 화합물을 수득한다.
실시예 56: A가 S(O) 2 인 화학식 IIa 의 화합물의 합성
A가 S(O)2인 화학식 IIa의 화합물은 반응식 113에 제시된 바와 같이 1 단계로 7-아자인돌 1 및 화학식 Xk의 화합물 (J, E, F, G 및 K는 C이고, n은 1이고, R42는 S(O)2Cl인 화학식 Xa)로부터 합성할 수 있다.
반응식 113
Figure 112007090494669-PCT00102
단계 1 - A가 S(O) 2 인 화학식 IIa 의 제조
A가 S(O)2인 화학식 IIa의 화합물은 7-아자인돌 1을 트리플루오로아세트산에 용해된 화학식 Xk의 술포닐 클로라이드와 촉매 (예를 들어, 삼염화인듐) 및 트리플루오로술폰산의 존재 하에 수시간 동안 가열하면서 (예를 들어, 70℃) 반응시켜 제조한다. 수산화나트륨을 사용하여 중화시키고 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 A가 S(O)2이고 R41이 H인 화학식 IIa의 화합물을 수득한다 (Garzya et al., Tetrahedron Lett. 2004, 45:1499-1501).
실시예 57: A가 CF 2 인 화학식 IIa 의 화합물의 합성
A가 CF2인 화학식 IIa의 화합물은 반응식 114에 제시된 바와 같이 1 단계로 A가 C(O)이고 R41이 P인 화학식 IIa의 화합물로부터 합성할 수 있다.
반응식 114
Figure 112007090494669-PCT00103
단계 1 - A가 CF 2 인 화학식 IIa 의 제조
A가 CF2인 화학식 IIa의 화합물은 A가 C(O)이고 R41은 P인 화학식 IIa의 화합물 (실시예 44에 기재된 바와 같이 제조)을 수시간 동안 가열하면서 불소화제 (예를 들어, (디에틸아미노)황 트리플루오라이드)와 반응시켜 제조한다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 A가 CF2이고 R41이 H인 화학식 IIa의 화합물을 수득한다.
실시예 58: A가 C(S)인 화학식 IIa 의 화합물의 합성
A가 C(S)인 화학식 IIa의 화합물은 반응식 115에 제시된 바와 같이 1 단계로 A가 C(O)이고 R41이 H인 화학식 IIa의 화합물로부터 합성할 수 있다.
반응식 115
Figure 112007090494669-PCT00104
단계 1 - A가 C(S)인 화학식 IIa 의 제조
A가 C(S)인 화학식 IIa의 화합물은 A가 C(O)이고 R41이 H인 화학식 IIa의 화합물 (실시예 43, 44 또는 45에 기재된 바와 같이 제조)을 적절한 용매 (예를 들어, 테트라히드로푸란) 중에서 수시간 동안 가열하면서 로손 (Lawesson) 시약, (1,3,2,4-디티아디포스페탄-2,3-디술파이드)와 반응시켜 제조한다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 A가 C(S)이고 R41이 H인 화학식 IIa의 화합물을 수득한다.
실시예 59: A가 S(O)인 화학식 IIa 의 화합물의 합성
A가 S(O)인 화학식 IIa의 화합물은 반응식 116에 제시된 바와 같이 1 단계로 A가 S이고 R41이 H인 화학식 IIa의 화합물로부터 합성할 수 있다.
반응식 116
Figure 112007090494669-PCT00105
단계 1 - A가 S(O)인 화학식 IIa 의 제조
A가 S(O)인 화학식 IIa의 화합물은 A가 S이고 R41이 H인 화학식 IIa의 화합물 (실시예 53 또는 54에 기재된 바와 같이 제조)을 적절한 비양성자성 용매 (예를 들어, 디클로로메탄) 중에서 1 당량의 산화제 (예를 들어, 메타-클로로-퍼옥시벤조인산, 과산화수소, 옥손)과 반응시켜 제조한다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 A가 S(O)이고 R41이 H인 화학식 IIa의 화합물을 수득한다.
화학식 III의 화합물은 7-아자인돌 또는 실시예에 제시된 유사체를 화학식 III의 화합물로 대체하여 실시예 43-59에 기재된 화학식 Ib 또는 IIa의 화합물의 제조에 사용될 수 있다. R40은 화학식 X의 화합물의 커플링에 적절한, 실시예에 사용된 3-위치에서의 치환체 (예를 들어, 수소, C(O)H, CH2N(CH3)2, C(O)Cl, 브로모, 아미노, 히드록시, 티오)이고 R41은 수소 또는 보호기 P이다.
<화학식 III>
Figure 112007090494669-PCT00106
화학식 IIIi, 즉 V 및 W는 CH이고, U 및 Z 중 적어도 하나는 CR46이고, 바람직하게는 U 및 Z 중 하나는 CR46이고 U 및 Z 중 다른 하나는 CH이고, 여기서 R46은 상기 화학식 Ib에서 R18에 대해 정의된 바와 같되 수소가 아닌 화학식 III의 화합물은 화학식 III의 화합물에 대해 기재된 바와 같이 화학식 Ib 및 IIa의 화합물의 합성에 사용될 수 있다.
<화학식 IIIi>
Figure 112007090494669-PCT00107
화학식 IIIi의 화합물의 합성에 대해 제시된 실시예는 화학식 III의 다른 정의를 충족시키는 많은 화합물에도 적용가능하거나 또는 화학식 IIIi의 화합물은 화학식 III의 화합물, 또는 화학식 I의 화합물의 합성하기 위해 사용될 수 있는 관련 화합물을 제공하기 위해 특히 3-위치에서 추가로 치환될 수 있다.
추가로, 화학식 III 및 IIIa의 화합물의 제조에 사용되는 기술은 다른 화학 식 Ib의 화합물을 수득하기 위해 R5가 브로모, 클로로, 또는 아미노인 화학식 Ib의 화합물에도 적용될 수 있다.
실시예 60: 화학식 IVa 의 중간체의 합성
화학식 IVa의 화합물은 반응식 117에 제시된 바와 같이 3 단계로 3-메틸-5-니트로-피리딘-2-일아민 505로부터 합성할 수 있다.
반응식 117
Figure 112007090494669-PCT00108
단계 1 - 5-니트로-1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 (506)의 제조
5-니트로-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 506은 3-메틸-5-니트로-피리딘-2-일아민 505를 t-부틸옥시카르보닐 안히드라이드와 적절한 용매 (예를 들어, 에틸 아세테이트 및 헥산) 중에서 반응시켜 제조한다. 농축 및 추출을 통해 Boc-보호된 중간체를 수득한 후, 이를 냉각시키면서 (예를 들어, 0℃) 2 당량의 부틸리튬과 적절한 극성 용매 (예를 들어, 테트라히드로푸란) 중에서 반응시키고, 디메틸포름아미드를 첨가하여 30분 내지 1시간 동안 교반한 후, 5.5 M HCl을 첨가한다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 506을 수득한다 (Hands et. al., Synthesis 1996, 877-882.)
단계 2 - 화학식 XLII 의 제조
화학식 XIII의 화합물은 반응식 43, 단계 1에 제시된 바와 같이 5-니트로- 1H-피롤로[2,3-b]피리딘 506을 반응시켜 제조한다.
단계 3 - 화학식 IVa 의 제조
화학식 IVa의 화합물은 니트로기의 환원 (예를 들어, 수소 기체 및 메탄올 중의 탄소 상의 팔라듐)에 의해 화학식 XIII의 화합물로부터 제조한다. 혼합물을 여과하고 농축시켜 화학식 IVa의 화합물을 수득한다.
실시예 61: 화학식 IVb 의 중간체의 합성
화학식 IVb의 화합물은 반응식 118에 제시된 바와 같이 4 단계로 7-아자인돌 1로부터 합성할 수 있다.
반응식 118
Figure 112007090494669-PCT00109
단계 1 - 1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 7- 옥시드 (507)의 제조
1H-피롤로[2,3-b]피리딘 7-옥시드 507은 7-아자인돌 1을 산화제 (예를 들어, m-클로로-퍼옥시벤조인산)와 적절한 용매 (예를 들어, 디클로로메탄) 중에서 반응시켜 제조한다. 실온에서 30분 내지 1시간 동안 교반한 후, 화합물 507을 여과에 의해 수거한다.
단계 2 - 4-니트로-1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 7- 옥시드 (508)의 제조
4-니트로-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 7-옥시드 508은 1H-피롤로[2,3-b]피리딘 7-옥시드 507을 질산에 용해시킨 후, 황산을 첨가하여 제조한다. 1시간 동안 가열 (예를 들어, 70℃)한 후, 물에 부어서 화합물 508을 수득하고, 여과에 의해 단리한다 (Schneller et. al., J. Org. Chem. 1980, 45:4045).
단계 3 - 화학식 XIV 의 화합물의 제조
화학식 XIV의 화합물은 적절한 용매 (예를 들어, 에틸 아세테이트) 중에서 삼염화인을 첨가하고 수분 동안 가열하여 (예를 들어, 80℃) 4-니트로-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 7-옥시드 508로부터 제조한다. 염기 (예를 들어, 탄산칼륨)를 사용하여 중화시키고 추출하여 중간체를 수득한 후, 반응식 43, 단계 1에 따라 N-1 수소에서 보호하여 화학식 XIV의 화합물을 수득할 수 있다.
단계 4 - 화학식 IVb 의 제조
화학식 IVb의 화합물은 니트로기의 환원 (예를 들어, 수소 기체 및 메탄올 중의 탄소 상의 팔라듐)에 의해 화학식 XIV의 화합물로부터 제조한다. 혼합물을 여과하고 농축시켜 화학식 IVb의 화합물을 수득한다.
실시예 62: R 46 이 NHR 47 이고 R 40 이 H인 화학식 IIIi 의 화합물의 합성
R46이 NHR47이고 R40이 H인 화학식 IIIi의 화합물은 반응식 119에 제시된 바와 같이 1 단계로 화학식 IVa 또는 IVb의 화합물로부터 합성할 수 있다.
반응식 119
Figure 112007090494669-PCT00110
단계 1 - R 46 이 NHR 47 이고 R 40 이 H인 화학식 IIIi 의 화합물의 제조
R46이 NHR47이고 R40이 H인 화학식 IIIi의 화합물 (R47은 임의로 치환된 저급 알킬, 임의로 치환된 저급 알케닐, 임의로 치환된 저급 알키닐, 임의로 치환된 시클로알킬, 임의로 치환된 헤테로시클로알킬, 임의로 치환된 아릴 또는 임의로 치환된 헤테로아릴임)은 염기 (예를 들어, 탄산칼륨)의 존재 하에 적절한 용매 (예를 들어, 디메틸포름아미드) 중에서 수시간 동안 실온에서 R47-X (여기서, X는 이탈기 (예를 들어, 알킬화제, 예를 들어 메틸요오다이드)임)와 반응시켜 중간체 화학식 IVa (실시예 60) 또는 IVb (실시예 61)로부터 제조한다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 R46이 NHR47이고 R40이 H이고 R41이 P인 화학식 IIIi의 화합물을 수득한다.
실시예 63: R 46 이 NHCH 2 R 48 이고 R 40 이 H인 화학식 IIIi 의 화합물의 합성
R46이 NHCH2R48이고 R40이 H인 화학식 IIIi의 화합물은 반응식 120에 제시된 바와 같이 1 단계로 화학식 IVa 또는 IVb의 화합물로부터 합성할 수 있다.
반응식 120
Figure 112007090494669-PCT00111
단계 1 - R 46 이 NHCH 2 R 48 이고 R 40 이 H인 화학식 IIIc 의 화합물의 제조
R46이 NHCH2R48이고 R40이 H인 화학식 IIIi의 화합물 (R48은 임의로 치환된 저급 알킬임)은 비-반응성 용매 (예를 들어, 디클로로에탄) 중에 촉매량의 산 (예를 들어, 아세트산) 및 환원제 (예를 들어, 나트륨 트리아세톡시보로히드라이드)의 존재 하에 화학식 R48-C(O)H의 알데히드를 사용한 환원성 아민화에 의해 중간체 화학식 IVa (실시예 60) 또는 IVb (실시예 61)로부터 제조한다. 수시간 동안 교반한 후에, 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)에 의해 단리하여 R46이 NHCH2R48이고, R40이 H이고, R41이 P인 화학식 IIIi의 화합물을 수득한다.
실시예 64: R 46 이 NHC (O)R 49 이고 R 40 이 H인 화학식 IIIi 의 화합물의 합성
R46이 NHC(O)R49이고 R40이 H인 화학식 IIIi의 화합물은 반응식 121에 제시된 바와 같이 1 단계로 화학식 IVa 또는 IVb의 화합물로부터 합성할 수 있다.
반응식 121
Figure 112007090494669-PCT00112
단계 1 - R 46 이 NHC (O)R 49 이고 R 40 이 H인 화학식 IIIi의 화합물의 제조
R46이 NHC(O)R49이고 R40이 H인 화학식 IIIi의 화합물 (R49는 임의로 치환된 저급 알킬, 임의로 치환된 저급 알케닐, 임의로 치환된 저급 알키닐, 임의로 치환된 시클로알킬, 임의로 치환된 헤테로시클로알킬, 임의로 치환된 아릴 또는 임의로 치환된 헤테로아릴임)은 비-반응성 용매 (예를 들어, 디클로로메탄) 중에서 염기 (예를 들어, N,N-디이소프로필에틸아민 (DIEA))의 존재 하에 화학식 R49-C(O)X (여기서, X는 이탈기, 예를 들어 클로로 (예를 들어, 벤조일 클로라이드)임)의 활성화된 카르복실산과의 반응에 의해 중간체 화학식 IVa (실시예 60) 또는 IVb (실시예 61)로부터 제조된다. 수시간 동안 교반한 후에, 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 R46이 NHC(O)R49이고 R40이 H이고 R41이 P인 화학식 IIIi의 화합물을 수득한다.
실시예 65: R 46 이 NHC (O)NHR 50 이고 R 40 이 H인 화학식 IIIi 의 화합물의 합성
R46이 NHC(O)NHR50이고 R40이 H인 화학식 IIIi의 화합물은 반응식 122에 제시된 바와 같이 1 단계로 화학식 IVa 또는 IVb의 화합물로부터 합성할 수 있다.
반응식 122
Figure 112007090494669-PCT00113
단계 1 - R 46 이 NHC (O)NHR 50 이고 R 40 이 H인 화학식 IIIi 의 화합물의 제조
R46이 NHC(O)NHR50이고 R40이 H인 화학식 IIIi의 화합물 (R50은 임의로 치환된 저급 알킬, 임의로 치환된 저급 알케닐, 임의로 치환된 저급 알키닐, 임의로 치환된 시클로알킬, 임의로 치환된 헤테로시클로알킬, 임의로 치환된 아릴 또는 임의로 치환된 헤테로아릴임)은 비-반응성 용매 (예를 들어, 디클로로메탄) 중에서 염기 (예를 들어, DIEA)의 존재 하에 화학식 R50-NCO의 이소시아네이트 (예를 들어, 프로필이소시아네이트)와의 반응에 의해 중간체 화학식 IVa (실시예 60) 또는 IVb (실시예 61)로부터 제조한다. 수시간 동안 교반한 후에, 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 R46이 NHC(O)NHR50이고, R40이 H이 고 R41이 P인 화학식 IIIi의 화합물을 수득한다.
실시예 66: R 46 이 NHC (S)NHR 51 이고 R 40 이 H인 화학식 IIIi 의 화합물의 합성
R46이 NHC(S)NHR51이고 R40이 H인 화학식 IIIi의 화합물은 반응식 123에 제시된 바와 같이 1 단계로 화학식 IVa 또는 IVb의 화합물로부터 합성할 수 있다.
반응식 123
Figure 112007090494669-PCT00114
단계 1 - R 46 이 NHC (S)NHR 51 이고 R 40 이 H인 화학식 IIIi의 화합물의 제조
R46이 NHC(S)NHR51이고 R40이 H인 IIIi의 화합물 (R51은 임의로 치환된 저급 알킬, 임의로 치환된 저급 알케닐, 임의로 치환된 저급 알키닐, 임의로 치환된 시클로알킬, 임의로 치환된 헤테로시클로알킬, 임의로 치환된 아릴 또는 임의로 치환된 헤테로아릴임)은 비-반응성 용매 (예를 들어, 디클로로메탄) 중에서 염기 (예를 들어, DIEA)의 존재 하에 화학식 R51-NCS의 이소티오시아네이트 (예를 들어, 프로필이소티오시아네이트)와의 반응에 의해 중간체 화학식 IVa (실시예 60) 또는 IVb (실시예 61)로부터 제조한다. 수시간 동안 교반한 후에, 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 R46이 NHC(S)NHR51이고 R40이 H이고, R41이 P인 화학식 IIIi의 화합물을 수득한다.
실시예 67: R 46 이 NHS (O) 2 R 52 이고 R 40 이 H인 화학식 IIIi 의 화합물의 합성
R46이 NHS(O)2R52이고 R40이 H인 화학식 IIIi의 화합물은 반응식 124에 제시된 바와 같이 1 단계로 화학식 IVa 또는 IVb의 화합물로부터 합성할 수 있다.
반응식 124
Figure 112007090494669-PCT00115
단계 1 - R 46 이 NHS (O) 2 R 52 이고 R 40 이 H인 화학식 IIIi 의 화합물의 제조
R46이 NHS(O)2R52이고 R40이 H인 화학식 IIIi의 화합물 (R52는 임의로 치환된 저급 알킬, 임의로 치환된 저급 알케닐, 임의로 치환된 저급 알키닐, 임의로 치환된 시클로알킬, 임의로 치환된 헤테로시클로알킬, 임의로 치환된 아릴 또는 임의로 치환된 헤테로아릴임)은 비-반응성 용매 (예를 들어, 디클로로메탄) 중에서 염기 ( 예를 들어, DIEA, 피리딘)의 존재 하에 화학식 R52-S(O)2C1의 술포닐 클로라이드 (예를 들어, 프로필술포닐 클로라이드)와의 반응에 의해 중간체 화학식 IVa (실시예 60) 또는 IVb (실시예 61)로부터 제조한다. 수시간 동안 교반한 후에, 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 R46이 NHS(O)2R52이고 R40이 H이고 R41이 P인 화학식 IIIi의 화합물을 수득한다.
실시예 68: 화학식 Va 의 중간체의 합성
화학식 Va의 화합물은 반응식 125에 제시된 바와 같이 2 단계로 7-아자인돌 1로부터 합성할 수 있다.
반응식 125
Figure 112007090494669-PCT00116
단계 1 - 5- 브로모 -7- 아자인돌 (44)의 제조
5-브로모-7-아자인돌 44는 문헌 [Mazeas et. al., Heterocycles 1999, 50:1065-1080]에 기재된 바와 같이 7-아자인돌로부터 제조한다.
단계 2 - 화학식 Va 의 중간체의 제조
화학식 Va의 중간체는 반응식 43, 단계 1에 제시된 바와 같이 5-브로모-7-아자인돌 44를 보호시켜 제조한다.
실시예 69: 화학식 Vb 의 중간체의 합성
화학식 Vb의 화합물은 반응식 126에 제시된 바와 같이 2 단계로 1H-피롤로[2,3-b]피리딘 7-옥시드 507로부터 합성할 수 있다.
반응식 126
Figure 112007090494669-PCT00117
단계 1 - 4- 브로모 -7- 아자인돌 (509)의 제조
4-브로모-7-아자인돌 509는 문헌 [Thibault et. al., Org. Lett. 2003, 5:5023-5025]에 기재된 바와 같이 1H-피롤로[2,3-b]피리딘 7-옥시드 507 (실시예 61에 기재된 바와 같이 제조)로부터 제조한다.
단계 2 - 화학식 Vb 의 중간체의 제조
화학식 Vb의 중간체는 반응식 43, 단계 1에 제시된 바와 같이 4-브로모-7-아자인돌 509를 보호시켜 제조한다.
실시예 70: R 46 이 할로겐이고 R 40 이 H인 화학식 IIIi 의 화합물의 합성
R46이 할로겐이고 R40이 H인 화학식 IIIi의 화합물은 반응식 127에 제시된 바와 같이 1 단계로 화학식 Va 또는 Vb의 화합물로부터 합성할 수 있다.
반응식 127
Figure 112007090494669-PCT00118
단계 1 - R 46 이 F 또는 Cl 이고 R 40 이 H인 화학식 IIIi 의 화합물의 제조
R46이 할로겐 R53 (바람직하게는 플루오로 또는 클로로)이고 R40이 수소인 화학식 IIIi의 화합물은 화학식 Va (실시예 68) 또는 Vb (실시예 69)의 대응하는 브로모 중간체를 냉각시키면서 (예를 들어, -78℃) 적절한 용매 (예를 들어, 테트라히드로푸란)에 용해시키고 유기리튬 시약과 반응시켜 브로모의 리튬-할로겐 교환 (예를 들어, t-부틸리튬)을 수행한 후, 문헌 [Thibault et. al., Org. Lett. 2003, 5:5023-5025]에 기재된 바와 유사하게 불소원 (예를 들어, N-플루오로벤젠술피미드) 또는 염소원 (예를 들어, 헥사클로로에탄)을 첨가하여 제조한다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 R46이 F 또는 Cl이고 R40이 H이고 R41이 P인 화학식 IIIi의 화합물을 수득한다.
실시예 71: R 46 이 NHR 47 이고 R 40 이 H인 화학식 IIIi 의 화합물의 합성
R46이 NHR47이고 R40이 H인 화학식 IIIi의 화합물은 반응식 128에 제시된 바와 같이 1 단계로 화학식 Va 또는 Vb의 화합물로부터 합성할 수 있다.
반응식 128
Figure 112007090494669-PCT00119
단계 1 - R 46 이 NHR 47 이고 R 40 이 H인 화학식 IIIi 의 화합물의 제조
R46이 NHR47이고 R40이 H인 화학식 IIIi의 화합물 (R47은 실시예 62에서 정의된 바와 같음)은 팔라듐 촉매화된 부흐발트-하르트비히 조건 (즉, 수시간 동안 가열하면서 (예를 들어, 100℃) 비-반응성 용매 (예를 들어, 1,4-디옥산) 중의 팔라듐 촉매 (예를 들어, 팔라듐(II) 아세테이트), 리간드 (예를 들어, 디시클로헥실(o-비페닐)포스핀), 및 염기 (예를 들어, 나트륨 t-부톡시드))을 사용하여 중간체 화학식 Va (실시예 68) 또는 Vb (실시예 69)를 화학식 R47-NH2의 아민과 반응시켜 제조한다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 R46이 NHR47이고 R40은 H이고 R41이 P인 화학식 IIIi의 화합물을 수득한다.
실시예 72: R 46 이 OR 54 이고 R 40 이 H인 화학식 IIIi 의 화합물의 합성
R46이 OR54이고 R40이 H인 화학식 IIIi의 화합물은 반응식 129에 제시된 바와 같이 1 단계로 화학식 Va 또는 Vb의 화합물로부터 합성할 수 있다.
반응식 129
Figure 112007090494669-PCT00120
단계 1 - R 46 이 OR 54 이고 R 40 이 H인 화학식 IIIi 의 화합물의 제조
R46이 OR54이고 R40이 H인 화학식 IIIi의 화합물 (R54는 임의로 치환된 저급 알킬, 임의로 치환된 저급 알케닐, 임의로 치환된 저급 알키닐, 임의로 치환된 시클로알킬, 임의로 치환된 헤테로시클로알킬, 임의로 치환된 아릴 또는 임의로 치환된 헤테로아릴임)은 중간체 화학식 Va (실시예 68) 또는 Vb (실시예 69)를 비-반응성 용매 (예를 들어, 디메틸포름아미드) 중에서 염기 (예를 들어 수소화나트륨) 및 구리 촉매 (예를 들어, 브롬화구리)의 존재 하에 수시간 동안 가열하면서 (예를 들어, 120℃) 화학식 R54-OH의 알콜과 반응시켜 제조한다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 R46이 OR54이고 R40은 H이고 R41이 P인 화학식 IIIi의 화합물을 수득한다.
실시예 73: R 46 이 임의로 치환된 저급 알킬이고 R 40 이 H인 화학식 IIIi 의 화합물의 합성
R46이 임의로 치환된 저급 알킬이고 R40이 H인 화학식 IIIi의 화합물은 반응식 130에 제시된 바와 같이 1 단계로 화학식 Va 또는 Vb의 화합물로부터 합성할 수 있다.
반응식 130
Figure 112007090494669-PCT00121
단계 1 - R 46 이 임의로 치환된 저급 알킬이고 R 40 이 H인 화학식 IIIi 의 화합물의 제조
R46이 임의로 치환된 저급 알킬 R55이고 R40이 H인 화학식 IIIi의 화합물은 중간체 화학식 Va (실시예 68) 또는 Vb (실시예 69)를 적절한 용매 (예를 들어, 톨루엔)에 용해시킨 후, 팔라듐 촉매 (예를 들어, [1,1'-비스(디페닐포스피노)페로센] 디클로로팔라듐(II), 디클로로메탄과의 착체 (1:1))를 첨가하여 제조한다. 수분 후, 화학식 R55-MgBr의 그리냐드 시약을 첨가하고, 반응물을 1 내지 수시간 동안 가열한다 (예를 들어, 90℃). 셀라이트를 통한 여과 후에, 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 R46이 임의로 치환된 저급 알킬이고, R40은 H이고 R41은 P인 화학식 IIIc의 화합물을 수득한다.
실시예 74: R 46 이 임의로 치환된 아릴 또는 임의로 치환된 헤테로아릴이고 R 40 이 H인 화학식 IIIi 의 화합물의 합성
R46이 임의로 치환된 아릴 또는 임의로 치환된 헤테로아릴이고 R40이 H인 화학식 IIIi의 화합물은 반응식 131에 제시된 바와 같이 1 단계로 화학식 Va 또는 Vb의 화합물로부터 합성할 수 있다.
반응식 131
Figure 112007090494669-PCT00122
단계 1 - R 46 이 임의로 치환된 아릴 또는 임의로 치환된 헤테로아릴이고 R 40 이 H인 화학식 IIIi 의 화합물의 제조
R46이 임의로 치환된 아릴 또는 임의로 치환된 헤테로아릴 R56이고 R40이 H인 화학식 IIIi의 화합물은 스즈끼 (Suzuki) 커플링 조건 (Muyaura and Suzuki, Chem. Rev. 1995, 95:2457) 하에, 예를 들어 적절한 용매 (예를 들어, 테트라히드로푸란, 아세토니트릴) 중에서 팔라듐 촉매 (예를 들어, 테트라키스(트리페닐포스핀)팔라듐(0)) 및 염기 (예를 들어, 수성 탄산칼륨)의 존재 하에 열로 1 내지 수시간 동안 가열 (예를 들어, 80℃)하거나 또는 마이크로파 기구로 가열하면서 (예를 들어, 120℃, 10분 동안) 중간체 화학식 Va (실시예 68) 또는 Vb (실시예 69)를 화학식 R56-B(OH)2의 붕소산 또는 화학식 R56-B(OR)2의 붕소산 에스테르와 반응시켜 제조한다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 R46이 임의로 치환된 아릴 또는 임의로 치환된 헤테로아릴이고 R40이 H이고 R41이 P인 화학식 IIIi의 화합물을 수득한다.
V, W, U 및 Z는 CH이고, J, E, F, G 및 K는 C이고, n은 1이고, R15, R16, 및 R17은 수소인 화학식 Ib의 화합물은 화학식 VI의 화합물을 형성한다.
<화학식 VI>
Figure 112007090494669-PCT00123
화학식 VI의 화합물의 합성에 대해 제시된 실시예는 화학식 I 또는 화학식 Ib의 다른 정의를 충족시키는 많은 화합물에도 적용될 수 있다.
실시예 75: M이 NR 57 또는 O이고 R 1 이 임의로 치환된 아릴 또는 임의로 치환된 헤 테로아릴인 화학식 VI 의 화합물의 합성
화학식 VIa의 화합물 (M이 NR57 또는 O이고 (R57은 화학식 Ib의 화합물에 대한 M의 정의 또는 화학식 I의 화합물에 대한 L2의 정의와 일치함), R1은 임의로 치 환된 아릴 또는 임의로 치환된 헤테로아릴인 화학식 VI)은 반응식 132에 제시된 바와 같이 2 단계로 화학식 IIb의 화합물로부터 합성할 수 있다.
반응식 132
Figure 112007090494669-PCT00124
단계 1 - 화학식 IIc 의 화합물의 제조
화학식 IIc의 화합물 (R15, R16 및 R17이 H이고, R41이 P이고, R43이 M1R58이고, 여기서 M1은 O 또는 NR57이고 R58은 임의로 치환된 아릴 또는 임의로 치환된 헤테로아릴인 화학식 IIa)은 적절한 용매 (예를 들어, 디메틸포름아미드) 중에서 염기 (예를 들어, 수소화나트륨)의 존재 하에 수시간 동안 가열하면서 (예를 들어, 80℃) 화학식 IIb의 화합물 (R15, R16 및 R17이 H이고, R41이 P이고, R43이 M1H이고, 여기서 M1은 O 또는 NR57인 화학식 IIa)을 화학식 R58-X의 화합물 (여기서, X는 적절한 이탈기, 예를 들어 할로겐 또는 트리플레이트임)과 반응시켜 제조한다. 별법으로, 반응은 금속 (예를 들어, M1이 NR57일 때 팔라듐 아세테이트 및 트리-t-부틸포스핀, M1이 O일 때 브롬화구리)에 의해 촉매화될 수 있다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 화학식 IIc의 화합물을 수득한다.
단계 2 - M이 NR 57 또는 O이고 R 1 이 임의로 치환된 아릴 또는 임의로 치환된 헤테로아릴인 화학식 VI 의 화합물의 제조
화학식 VIa의 화합물 (M이 NR57 또는 O (M1)이고, R1이 임의로 치환된 아릴 또는 임의로 치환된 헤테로아릴 (R58)인 화학식 VI)은 반응식 43, 단계 2에 따라 N-1 보호기를 제거하여 화학식 IIc의 화합물로부터 제조한다.
실시예 76: M이 NR 57 또는 O이고 R 1 이 임의로 치환된 아릴 또는 임의로 치환된 헤테로아릴인 화학식 VI 의 화합물의 합성
화학식 VI의 화합물 (M이 NR57 또는 O (R57은 화학식 Ib의 화합물에 대한 M의 정의 또는 화학식 I의 화합물에 대한 L2의 정의와 일치함)이고 R1이 임의로 치환된 아릴 또는 임의로 치환된 헤테로아릴인 화학식 VI)은 반응식 133에 제시된 바와 같이 2 단계로 화학식 IId의 화합물로부터 합성할 수 있다.
반응식 133
Figure 112007090494669-PCT00125
단계 1 - 화학식 IIc 의 화합물의 제조
화학식 IIc의 화합물 (R15, R16 및 R17이 H이고, R41이 P이고, R43이 M1R58이고, 여기서 M1은 O 또는 NR57이고 R58은 임의로 치환된 아릴 또는 임의로 치환된 헤테로아릴인 화학식 IIa)은 화학식 IId의 화합물 (R15, R16 및 R17은 H이고, R41은 P이고, R43은 할로겐, R59, 예를 들어 클로로인 화학식 IIa)를 적절한 용매 (예를 들어, 디메틸포름아미드) 중에서 염기 (예를 들어, 수소화나트륨)의 존재 하에 수시간 동안 가열하면서 (예를 들어, 80℃) 화학식 R58-OH 또는 화학식 R58-NR57의 화합물과 반응시켜 제조한다. 별법으로, 반응물은 금속 (예를 들어, M1이 NR57일 때 팔라듐 아세테이트 및 트리-t-부틸포스핀, M1이 O일 때 브롬화구리)에 의해 촉매화될 수 있다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 화학식 IIc의 화합물을 수득한다.
단계 2 - M이 NR 57 또는 O이고 R 1 이 임의로 치환된 아릴 또는 임의로 치환된 헤테로아릴인 화학식 VI 의 화합물의 제조
화학식 VIa의 화합물 (M이 NR57 또는 O (M1)이고, R1이 임의로 치환된 아릴 또는 임의로 치환된 헤테로아릴 (R58)인 화학식 VI)은 반응식 43, 단계 2에 따라 N-1 보호기를 제거하여 화학식 IIc의 화합물로부터 제조한다.
실시예 77: M이 -O- alk - 또는 - NR 57 - alk -인 화학식 VI 의 화합물의 합성
화학식 VIb의 화합물 (M이 -O-alk- 또는 -NR57-alk- (R57은 화학식 Ib의 화합 물에 대한 M의 정의 또는 화학식 I의 화합물에 대한 L2의 정의와 일치함)인 화학식 VI)은 반응식 134에 제시된 바와 같이 2 단계로 화학식 IIb의 화합물로부터 합성할 수 있다.
반응식 134
Figure 112007090494669-PCT00126
단계 1 - 화학식 IIe 의 화합물의 제조
화학식 IIe의 화합물 (R15, R16 및 R17이 H이고, R41이 P이고, R43이 M1(CH2)1-3R1이고, 여기서 M1은 O 또는 NR57인 화학식 IIa)은 화학식 IIb의 화합물 (R15, R16 및 R17이 H이고, R41이 P이고, R43이 M1H이고, 여기서 M1은 O 또는 NR57인 화학식 IIa)을 적절한 용매 (예를 들어, 디메틸포름아미드, 아세토니트릴) 중에서 염기 (예를 들어, 수소화나트륨, 탄산칼륨)의 존재 하에 1 내지 수시간 동안 가열하면서 (예를 들어, 80℃) 화학식 R1-(CH2)1-3-X의 화합물 (여기서, X는 이탈기 (예를 들어, 할로겐, 메실레이트)임)과 반응시켜 제조한다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 화학식 IIe의 화합물을 수득한다.
단계 2 - M은 M 1 ( CH 2 ) 1-3 이고 M 1 은 O 또는 NR 57 인 화학식 VI 의 화합물의 제조
화학식 VIb의 화합물 (M이 O(CH2)1-3 또는 NR57(CH2)1-3인 화학식 VI)은 반응식 43, 단계 2에 따라 N-1 보호기를 제거하여 화학식 IIe의 화합물로부터 제조한다.
실시예 78: M이 -O- alk - 또는 - NR 57 - alk -인 화학식 VI 의 화합물의 합성
화학식 VIb의 화합물 (M이 -O-alk- 또는 -NR57-alk-인 화학식 VI (여기서 R57은 화학식 Ib의 화합물에 대한 M의 정의 또는 화학식 I의 화합물에 대한 L2의 정의와 일치함))은 반응식 135에 제시된 바와 같이 2 단계로 화학식 IId의 화합물로부터 합성할 수 있다.
반응식 135
Figure 112007090494669-PCT00127
단계 1 - 화학식 IIe 의 화합물의 제조
화학식 IIe의 화합물 (R15, R16 및 R17은 H이고, R41은 P이고, R43은 M1(CH2)1-3R1이고, 여기서 M1은 O 또는 NR57인 화학식 IIa)은 화학식 IId의 화합물 (R15, R16 및 R17은 H이고, R41은 P이고, R43은 할로겐, R59, 예를 들어 클로로인 화학식 IIa)을 1 내지 수시간 동안 가열하면서 (예를 들어, 80℃) 적절한 용매 (예를 들어, 디메틸포름아미드, 아세토니트릴) 중에서 염기 (예를 들어, 수소화나트륨, 탄산칼륨)의 존재 하에 화학식 R1-(CH2)1-3-OH 또는 R1-(CH2)1-3-NR57의 화합물과 반응시켜 제조한다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 화학식 IIe의 화합물을 수득한다.
단계 2 - M이 M 1 ( CH 2 ) 1-3 이고 M 1 이 O 또는 NR 57 인 화학식 VI 의 화합물의 제조
화학식 VIb의 화합물 (M이 O(CH2)1-3 또는 NR57(CH2)1-3인 화학식 VI)은 반응식 43, 단계 2에 따라 N-1 보호기를 제거하여 화학식 IIe의 화합물로부터 제조한다.
실시예 79: M이 NH - alk -인 화학식 VI 의 화합물의 합성
화학식 VIc의 화합물 (M이 NH-alk-인 화학식 VI)은 반응식 136에 제시된 바와 같이 2 단계로 화학식 IIf의 화합물로부터 합성할 수 있다.
반응식 136
Figure 112007090494669-PCT00128
단계 1 - 화학식 IIg 의 화합물의 제조
화학식 IIg의 화합물 (R15, R16 및 R17이 H이고, R41이 P이고, R43이 NH(CH2)1-3R1인 화학식 IIa)은 비-반응성 용매 (예를 들어, 디클로로에탄) 중에서 촉매량의 산 (예를 들어, 아세트산) 및 환원제 (예를 들어, 나트륨 트리아세톡시보로히드라이드)의 존재 하에 화학식 R1-(CH2)0-2-CHO의 알데히드를 사용한 환원성 아민화에 의해 화학식 IIf의 화합물 (R15, R16 및 R17이 H이고, R41이 P이고, R43이 NH2인 화학식 IIa)로부터 제조한다. 수시간 동안 교반한 후에, 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 화학식 IIg의 화합물을 수득한다.
단계 2 - M이 NH ( CH 2 ) 1-3 인 화학식 VI 의 화합물의 제조
화학식 VIc의 화합물 (M이 NH(CH2)1-3인 화학식 VI)은 반응식 43, 단계 2에 따라 N-1 보호기를 제거하여 화학식 IIg의 화합물로부터 제조한다.
실시예 80: M이 NR 57 C (O) 또는 OC (O)인 화학식 VI 의 화합물의 합성
화학식 VId의 화합물 (M이 NR57C(O) 또는 OC(O)인 화학식 VI (R57은 화학식 Ib의 화합물에 대한 M의 정의 또는 화학식 I의 화합물에 대한 L2의 정의와 일치함))은 반응식 137에 제시된 바와 같이 2 단계로 화학식 IIb의 화합물로부터 합성할 수 있다.
반응식 137
Figure 112007090494669-PCT00129
단계 1 - 화학식 IIh 의 화합물의 제조
화학식 IIh의 화합물 (R15, R16 및 R17이 H이고, R41이 P이고, R43이 M1C(O)R1이고, 여기서 M1은 O 또는 NR57인 화학식 IIa)은 화학식 IIb의 화합물 (R15, R16 및 R17이 H이고, R41이 P이고, R43이 M1H이고, 여기서 M1은 O 또는 NR57인 화학식 IIa)을 비-반응성 용매 (예를 들어, 디클로로메탄) 중에서 염기 (예를 들어, DIEA)의 존재 하에 화학식 R1-COX (여기서, X는 이탈기, 예를 들어 클로로 (예를 들어, 벤조일 클로라이드)임)의 활성화된 카르복실산과 반응시켜 제조한다. 수시간 동안 교반한 후에, 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 화학식 IIh의 화합물을 수득한다.
단계 2 - M이 OC (O) 또는 NR 57 C (O)인 화학식 VI 의 화합물의 제조
화학식 VId의 화합물 (M이 OC(O) 또는 NR57C(O)인 화학식 VI)은 반응식 43, 단계 2에 따라 N-1 보호기를 제거하여 화학식 IIh의 화합물로부터 제조한다.
실시예 81: M이 NR 57 S (O) 2 인 화학식 VI 의 화합물의 합성
화학식 VIe의 화합물 (M이 NR57S(O)2인 화학식 VI (여기서 R57은 화학식 Ib의 화합물에 대한 M의 정의 또는 화학식 I의 화합물에 대한 L2의 정의와 일치함))은 반응식 138에 제시된 바와 같이 2 단계로 화학식 IIh의 화합물로부터 합성할 수 있다.
반응식 138
Figure 112007090494669-PCT00130
단계 1 - 화학식 IIi 의 화합물의 제조
화학식 IIi의 화합물 (R15, R16 및 R17이 H이고, R41이 P이고, R43이 NR57S(O)2R1인 화학식 IIa)은 화학식 IIh의 화합물 (R15, R16 및 R17은 H이고, R41은 P이고, R43이 NR57H인 화학식 IIa)을 비-반응성 용매 (예를 들어, 디클로로메탄) 중에서 염기 (예를 들어, DIEA, 피리딘)의 존재 하에 화학식 R1-SO2Cl의 술포닐 클로라이드 (예를 들어, 페닐술포닐 클로라이드)와 반응시켜 제조한다. 수시간 동안 교반한 후에, 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 화학식 IIi의 화합물을 수득한다.
단계 2 - M이 NR 57 S (O) 2 인 화학식 VI 의 화합물의 제조
화학식 VIe의 화합물 (M이 NR57S(O)2인 화학식 VI)은 반응식 43, 단계 2에 따라 N-1 보호기를 제거하여 화학식 IIi의 화합물로부터 제조한다
실시예 82: M이 NR 57 C (O) NH (CH 2 ) 1-3 또는 NR 57 C (S) NH ( CH 2 ) 1-3 인 화학식 VI 의 화합물의 합성
화학식 VIf의 화합물 (M이 NR57C(O)NH(CH2)1-3 또는 NR57C(S)NH(CH2)1-3인 화학식 VI (여기서, R57은 화학식 Ib의 화합물에 대한 M의 정의 또는 화학식 I의 화합물에 대한 L2의 정의와 일치함))은 반응식 139에 제시된 바와 같이 2 단계로 화학식 IIh의 화합물로부터 합성할 수 있다.
반응식 139
Figure 112007090494669-PCT00131
단계 1 - 화학식 IIj 의 화합물의 제조
화학식 IIj의 화합물 (R15, R16 및 R17은 H이고, R41은 P이고, R43은 NR57C(L)NH(CH2)1-3R1이고, 여기서 L은 O 또는 S인 화학식 IIa)은 화학식 IIh의 화합물 (R15, R16 및 R17은 H이고, R41은 P이고, R43은 NR57H인 화학식 IIa)을 비-반응성 용매 (예를 들어, 디클로로메탄) 중에서 염기 (예를 들어, DIEA)의 존재 하에 화학식 R1-(CH2)1-3NCL의 화합물 (여기서, L은 이소시아네이트 (예를 들어, 페닐 이소시아네이트)를 형성하는 O이거나 또는 L은 티오이소시아네이트 (예를 들어, 페닐 이소티오시아네이트)를 형성하는 S임)과 반응시켜 제조한다. 수시간 동안 교반한 후에, 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 화학식 IIj의 화합물을 수득한다.
단계 2 - B가 NR 이고 D가 C(=L) NH (CH 2 ) q 인 화학식 VI 의 화합물의 제조
화학식 VIf의 화합물 (M이 NR57C(O)NH(CH2)1-3 또는 NR57C(S)NH(CH2)1-3인 화학식 VI)은 반응식 43, 단계 2에 따라 N-1 보호기를 제거하여 화학식 IIj의 화합물로부터 제조한다.
실시예 83: M이 NR 57 S (O) 2 NH ( CH 2 ) 1-3 인 화학식 VI 의 화합물의 합성
화학식 VIg의 화합물 (M이 NR57S(O)2NH(CH2)1-3인 화학식 VI) (여기서, R57은 화학식 Ib의 화합물에 대한 M의 정의 또는 화학식 I의 화합물에 대한 L2의 정의와 일치함)은 반응식 140에 제시된 바와 같이 3 단계로 화학식 IIh의 화합물로부터 합성할 수 있다.
반응식 140
Figure 112007090494669-PCT00132
단계 1 - 화학식 IIk 의 화합물의 제조
화학식 IIk의 화합물 (R15, R16 및 R17은 H이고, R41은 P이고, R43은 NR57S(O)2Cl인 화학식 IIa)은 화학식 IIh의 화합물 (R15, R16 및 R17은 H이고, R41은 P이고, R43은 NR57H인 화학식 IIa)을 비반응성 용매 (예를 들어, 디클로로메탄) 중에서 가능하게는 가열하면서 (예를 들어 60℃) 술푸릴 클로라이드과 반응시켜 제조한다. 수시간 동안 교반한 후에, 반응물을 농축하여 화학식 IIk의 화합물을 수득할 수 있고, 이는 추가의 정제 없이 사용된다.
단계 2 - 화학식 IIm 의 화합물의 제조
화학식 IIm의 화합물 (R15, R16 및 R17은 H이고, R41은 P이고, R43은 NR57S(O)2NH(CH2)1-3R1인 화학식 IIa)은 비반응성 용매 (예를 들어, 디클로로메탄) 중에서 염기 (예를 들어, DIEA)의 존재 하에 화학식 NH2(CH2)1-3R1의 아민과의 반응에 의해 화학식 IIk의 화합물로부터 제조되다. 수시간 동안 교반한 후에, 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 화학식 IIm의 화합물을 수득한다.
단계 3 - M이 NR 57 S (O) 2 NH ( CH 2 ) 1-3 인 화학식 VI 의 화합물의 제조
화학식 VIg의 화합물 (M이 NR57S(O)2NH(CH2)1-3인 화학식 VI)은 반응식 43, 단계 2에 따라 N-1 보호기를 제거하여 화학식 IIm의 화합물로부터 제조한다.
실시예 84: M이 S(O) 2 (CH 2 ) 0-3 또는 S( CH 2 ) 0-3 인 화학식 VI 의 화합물의 합성
화학식 VIh의 화합물 (M이 S(O)2(CH2)0-3 또는 S(CH2)0-3인 화학식 VI)은 반응식 141에 제시된 바와 같이 2 단계로 화학식 IId의 화합물로부터 합성할 수 있다.
반응식 141
Figure 112007090494669-PCT00133
단계 1 - 화학식 IIn의 화합물의 제조
화학식 IIn의 화합물 (R15, R16 및 R17은 H이고, R41은 P이고, R43은 S(CH2)0-3R1인 화학식 IIa)은 화학식 IId의 화합물 (R15, R16 및 R17은 H이고, R41은 P이고, R43은 할로겐, R59, 예를 들어 클로로인 화학식 IIa)을 1 내지 수시간 동안 가열하면서 (예를 들어, 80℃) 적절한 용매 (예를 들어, 디메틸포름아미드, 아세토니트릴) 중에서 염기 (예를 들어, 수소화나트륨, 탄산칼륨)의 존재 하에 화학식 R1-(CH2)0-3-SH의 화합물과 반응시켜 제조한다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 화학식 IIn의 화합물을 수득한다. 이 화합물을 다음 단계에서 사용할 수 있거나 또는 N-1 보호기 P를 반응식 43, 단계 2에 따라 제거하여 M이 S(CH2)0-3인 화학식 VI의 화합물을 수득할 수 있다.
단계 2 - M이 S0 2 ( CH 2 ) 0-3 인 화학식 VI 의 화합물의 제조
화학식 VIh의 화합물 (M이 S(O)2(CH2)0-3인 화학식 VI)은 화학식 IIn의 화합물 을 적절한 비양성자성 용매 (예를 들어, 디클로로메탄) 산화제 (예를 들어, 메타-클로로-퍼옥시벤조인산, 과산화수소)와 반응시켜 제조한다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)에 의해 단리한 후, 반응식 43, 단계 2에 따라 N-1 보호기를 제거하여 화학식 VIh의 화합물을 수득한다.
실시예 85: M이 C(O)( CH 2 ) 0-3 인 화학식 VI 의 화합물의 합성
화학식 VIi의 화합물 (M이 C(O)(CH2)0-3인 화학식 VI)은 반응식 142에 제시된 바와 같이 3 단계로 화학식 IId의 화합물로부터 합성할 수 있다.
반응식 142
Figure 112007090494669-PCT00134
단계 1 - 화학식 IIo 의 화합물의 제조
화학식 IIo의 화합물 (R15, R16 및 R17은 H이고, R41은 P이고, R43은 C(OH)(CH2)0-3R1인 화학식 IIa)은 화학식 IId의 화합물 (R15, R16 및 R17은 H이고, R41 은 P이고, R43은 할로겐, R59, 예를 들어 클로로인 화학식 IIa)을 적절한 용매 (예를 들어, 테트라히드로푸란) 중에서 저하된 온도 (예를 들어, -78℃)에서 유기리튬 시약 (예를 들어, 부틸리튬)과 반응시켜 리튬-할로겐 교환을 실시한 후, 화학식 R1-(CH2)0-3-C(O)H의 알데히드를 첨가하여 제조한다. 수시간 동안 교반하고 실온으로 가온시킨 후에, 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 화학식 IIo의 화합물을 수득한다.
단계 2 - 화학식 IIp 의 화합물의 제조
화학식 IIp의 화합물 (R15, R16 및 R17은 H이고, R41은 P이고, R43은 C(O)(CH2)0-3R1인 화학식 IIa)은 화학식 IIo의 화합물을 적절한 용매 (예를 들어, 테트라히드로푸란) 중에서 산화제 (예를 들어, 데스-마르틴 페리오디난)와 반응시켜 제조한다. 1 내지 수시간 동안 교반한 후, 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 화학식 IIp의 화합물을 수득한다.
단계 3 - B가 C=O이고 D가 ( CH 2 ) W 인 화학식 VI 의 화합물의 제조
화학식 VIi의 화합물 (M이 C(O)(CH2)0-3인 화학식 VI)은 반응식 43, 단계 2에 따라 N-1 보호기를 제거하여 화학식 IIp의 화합물로부터 제조한다.
실시예 86: 화학식 IIr 의 화합물의 합성
화학식 IIr의 화합물 (R15, R16 및 R17은 H이고, R41은 P이고, R43은 S(O)2Cl인 화학식 IIa)은 반응식 143에 제시된 바와 같이 2 단계로 화학식 IIf의 화합물로부터 합성할 수 있다.
반응식 143
Figure 112007090494669-PCT00135
단계 I - 화학식 IIq 의 화합물의 제조
화학식 IIq의 화합물 (R15, R16 및 R17은 H이고, R41은 P이고, R43이 N2 +인 화학식 IIa)은 화학식 IIf의 화합물 (R15, R16 및 R17은 H이고, R41은 P이고, R43은 NH2인 화학식 IIa)을 수성 염산 및 수성 아질산나트륨과 반응시켜 제조한다. 물 및 염을 첨가하여 화합물을 침전시키고, 이를 여과하여 화학식 IIq의 디아조늄의 클로라이드염을 수득한다.
단계 2 - 화학식 IIr 의 화합물의 제조
화학식 IIr의 화합물 (R15, R16 및 R17은 H이고, R41은 P이고, R43은 S(O)2Cl인 화학식 IIa)은 화학식 IIq의 화합물 (R15, R16 및 R17은 H이고, R41은 P이고, R43은 N2 + 인 화학식 IIa)을 냉각하면서 (예를 들어, 10℃) 이산화황으로 포화시킨 아세트산 중에서 염화제일구리의 혼합물과 반응시켜 제조한다. 30분 내지 1시간 동안 교반한 후, 혼합물을 물에 붓고, 건조된 유기 부분의 추출 및 농축에 의해 화합물을 단리하여 화학식 IIr의 화합물을 수득한다 (Organic Syntheses, Coll. Vol. 7, p.508; Vol. 60, p.121).
실시예 87: 화학식 IIt 의 화합물
화학식 IIt의 화합물 (R15, R16 및 R17은 H이고, R41은 P이고, R43은 COOH인 화학식 IIa)은 반응식 144에 제시된 바와 같이 1 단계로 화학식 IIs의 화합물로부터 합성할 수 있다.
반응식 144
Figure 112007090494669-PCT00136
단계 1 - 화학식 IIt 의 화합물의 제조
화학식 IIt의 화합물 (R15, R16 및 R17은 H이고, R41은 P이고, R43은 COOH인 화학식 IIa)은 적절한 용매 (예를 들어, 테트라히드로푸란) 중에 용해시킨 화학식 IIs의 화합물 (R15, R16 및 R17은 H이고, R41은 P이고, R43은 MgBr인 화학식 IIa)을 드라이 아이스와 반응시켜 제조한다. 물의 첨가 및 화합물의 산-염기 추출에 의해 화학식 IIt의 화합물을 수득한다.
실시예 88: M이 C(O) NR 57 (CH 2 ) 0-3 또는 S(O) 2 NR 57 ( CH 2 ) 0-3 인 화학식 VI 의 화합물의 합성
화학식 VIj의 화합물 (M이 C(O)NR57(CH2)0-3 또는 S(O)2NR57(CH2)0-3인 화학식 VI) (여기서, R57은 화학식 Ib의 화합물에 대한 M의 정의 또는 화학식 I의 화합물에 대한 L2의 정의와 일치함)은 반응식 145에 제시된 바와 같이 3 단계로 화학식 IIu의 화합물로부터 합성할 수 있다.
반응식 145
Figure 112007090494669-PCT00137
단계 1 - 화학식 IIv 의 화합물의 제조
화학식 IIv의 화합물 (R15, R16 및 R17은 H이고, R41은 P이고, R43은 M2Cl이고, 여기서 M2는 C(O) 또는 S(O)2인 화학식 IIa)은 화학식 IIu의 화합물 (R15, R16 및 R17 은 H이고, R41은 P이고, R43은 M2OH이고, 여기서 M2는 C(O) 또는 S(O)2인 화학식 IIa)을 가능하게는 용매 (예를 들어, 톨루엔) 중에서 수시간 동안 가열하면서 (예를 들어, 80℃) 적절한 시약과 반응시켜 산 클로라이드 또는 술포닐 클로라이드 (예를 들어, 티오닐 클로라이드)를 형성시켜 제조한다. 반응 혼합물을 농축하여 화학식 IIv의 화합물을 수득하고, 이를 추가의 정제 없이 사용한다.
단계 2 - 화학식 IIw 의 화합물의 제조
화학식 IIw의 화합물 (R15, R16 및 R17은 H이고, R41은 P이고, R43은 M2NR57(CH2)0-3R1이고, 여기서 M2는 C(O) 또는 S(O)2인 화학식 IIa)은 화학식 IIv의 화합물을 적절한 비양성자성 용매 (예를 들어, 디메틸포름아미드, 디클로로메탄) 중에서 염기 (예를 들어, DIEA)의 존재 하에 화학식 NR57H(CH2)0-3R1의 아민과 반응시켜 제조한다. 1 내지 수시간 동안 교반한 후, 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 화학식 IIw의 화합물을 수득한다.
단계 3 - M이 C(O) NR 57 (CH 2 ) 0-3 또는 S(O) 2 NR 57 ( CH 2 ) O-3 인 화학식 VI 의 화합물의 제조
화학식 VIj의 화합물 (M이 C(O)NR57(CH2)0-3 또는 S(O)2NR57(CH2)0-3인 화학식 VI)은 반응식 43, 단계 2에 따라 N-1 보호기를 제거하여 화학식 IIw의 화합물로부터 제조한다.
R43이 M-R1 (예를 들어, 클로로, NH2, NHR57, OH, MgBr, C(O)OH, S(O)2OH; 실시예 78-88에 기재된 바와 같이)을 제시하기 위해 추가의 치환에 적절한 치환체이고 R42가 A 또는 L1 형성을 위해 7-아자인돌 고리 또는 그의 유사체에 대한 커플링에 적절한 관능기인 화학식 X 또는 Xa의 화합물은 실시예 43-59에 기재된 바와 같이 화학식 I 또는 Ib의 화합물 또는 화학식 II의 화합물의 합성에 유용하다.
<화학식 X>
Figure 112007090494669-PCT00138
<화학식 Xa>
Figure 112007090494669-PCT00139
화학식 X 또는 Xa의 많은 화합물은 상업적으로 입수가능하고, 예를 들어 R43이 클로로 또는 아미노이고 R42가 카르복실산 또는 알데히드인 많은 5원 및 6원 질소-함유 헤테로사이클이 상업적으로 입수가능하거나 공지의 방법을 사용하여 제조할 수 있다.
E, F, G, K, L은 C이고 n은 1인 화학식 Xa의 화합물은 화학식 X10의 화합물을 형성한다. 화학식 X10의 화합물의 합성 및 화학식 I, Ib 및 II의 화합물의 합성에 있어서의 그들의 용도는 화학식 X의 정의에 부합하는 다른 화합물에도 적용될 수 있다.
<화학식 X10>
Figure 112007090494669-PCT00140
R42가 수소 또는 할로겐 (R60)이고, R15, R16 및 R17이 화학식 Xa에 대해 정의된 것이거나 또는 화학식 X10의 화합물을 제시하기 위한 추가의 변형에 적절한 치환체인 화학식 Xa의 화합물은 화학식 X20의 화합물을 형성하고, 이는 화학식 Xa의 화합물의 합성에 유용하다.
<화학식 X20>
Figure 112007090494669-PCT00141
화학식 X10 또는 X20의 화합물의 용도는 화학식 X 또는 Xa의 화합물을 사용하 는 유사한 반응에도 유용할 수 있는 반응의 대표적인 예로서 하기 실시예에서 예시된다.
실시예 89: R 42 가 C(O)H인 화학식 X 10 의 화합물의 합성
화학식 X10a의 화합물 (R42가 C(O)H인 화학식 X10)은 반응식 146에 제시된 바와 같이 1 단계로 화학식 X2Oa의 화합물로부터 합성할 수 있다.
반응식 146
Figure 112007090494669-PCT00142
단계 1 - 화학식 X 20 b 의 화합물의 제조
화학식 X10a의 화합물 (R42가 C(O)H인 화학식 X10)은 화학식 X20a의 화합물 (R60이 Br인 화학식 X20)을 적절한 용매 (예를 들어, 테트라히드로푸란) 중에서 저하된 온도 (예를 들어, -78℃)에서 유기리튬 시약 (예를 들어, 부틸리튬)과 반응시켜 리튬-할로겐 교환을 수행한 후, 포르밀화 시약 (예를 들어, 디메틸포름아미드)을 첨가하여 제조한다. 수시간 동안 교반하고 실온으로 가온시킨 후, 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 화학식 X10a의 화합 물을 수득한다. 상기 반응에 바람직한 X20a의 화합물은 임의로 치환된 저급 알킬, 트리플루오로메틸, CH2CF3, OR, 또는 SR (여기서, R은 임의로 치환된 저급 알킬임)인 R15를 갖는다.
실시예 90: R 42 가 C(O)OH인 화학식 X 10 의 화합물의 합성
화학식 X10b의 화합물 (R42가 C(O)OH인 화학식 X10)은 반응식 147에 제시된 바와 같이 1 단계로 화학식 X2Oa의 화합물로부터 합성할 수 있다.
반응식 147
Figure 112007090494669-PCT00143
단계 1 - 화학식 X 10 b 의 화합물의 제조
화학식 X10b의 화합물 (R42가 C(O)OH인 화학식 X10)은 화학식 X2Oa의 화합물 (R60이 Br인 화학식 X2O)을 가능하게는 가열하면서 (예를 들어, 80℃) 촉매 (예를 들어, 요오드)가 존재하는 적절한 용매 (예를 들어, 테트라히드로푸란) 중의 고체 마그네슘과 반응시켜 대응하는 그리냐드 시약을 수득하여 제조한다. 드라이 아이스 를 반응물에 첨가하여 그리냐드를 켄칭시키고 R42에 카르복실산을 형성시킨다. 증발 및 산-염기 추출에 의해 단리하여 화학식 X10b의 화합물을 수득한다.
실시예 91: R 15 가 임의로 치환된 저급 알킬이고 R 42 가 C(O)H인 화학식 X 10 의 화합물의 합성
화학식 X10c의 화합물 (R42가 C(O)H이고 R15가 임의로 치환된 저급 알킬인 화학식 X10)은 반응식 148에 제시된 바와 같이 2 단계로 화학식 X20b의 화합물로부터 합성할 수 있다.
반응식 148
Figure 112007090494669-PCT00144
단계 1 - 화학식 X 20 c 의 화합물의 제조
화학식 X20c의 화합물 (R60은 H이고 R15는 임의로 치환된 저급 알킬 R61인 화학식 X20)은 화학식 X20b의 화합물 (R60은 H이고 R15가 Br인 화학식 X20)을 적절한 용매 (예를 들어, 톨루엔)에 용해시킨 후, 팔라듐 촉매 (예를 들어, [1,1'-비스(디페닐포스피노)-페로센] 디클로로팔라듐(II), 디클로로메탄과의 착체 (1:1))를 첨가하여 제조한다. 수분 후에, 화학식 R61-MgBr (여기서, R61은 임의로 치환된 저급 알킬임)의 그리냐드 시약을 첨가하고, 반응물을 1 내지 수시간 동안 가열한다 (예를 들어, 90℃). 셀라이트를 통한 여과 후에, 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 화학식 X20c의 화합물을 수득한다.
단계 2 - 화학식 X 10 c 의 화합물의 제조
화학식 X10c의 화합물 (R42가 C(O)H이고 R15가 임의로 치환된 저급 알킬인 화학식 X10)은 화학식 X20c의 화합물을 적절한 용매 (예를 들어, 테트라히드로푸란) 중에서 저하된 온도 (예를 들어, -78℃)에서 유기리튬 시약 (예를 들어, 리튬 디이소프로필아민)과 반응시켜 R42 위치에서 리티에이션을 수행한 후, 포르밀화 시약 (예를 들어, 디메틸포름아미드)을 첨가하여 제조한다. 수시간 동안 교반하고 실온으로 가온시킨 후, 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 화학식 X10c의 화합물을 수득한다.
실시예 92: R 15 가 OR 62 또는 SR 62 이고 R 42 가 C(O)H인 화학식 X 10 의 화합물의 합성
화학식 X10d의 화합물 (R42가 C(O)H이고 R15가 OR62 또는 SR62인 화학식 X10 (여기서, R62는 임의로 치환된 저급 알킬임))은 반응식 149에 제시된 바와 같이 2 단계 로 화학식 X2Od의 화합물로부터 합성할 수 있다.
반응식 149
Figure 112007090494669-PCT00145
단계 1 - 화학식 X 2O e 의 화합물의 제조
화학식 X2Oe의 화합물 (R60은 H이고 R15는 LR62이고, 여기서 L은 O 또는 S이고 R62는 임의로 치환된 저급 알킬인 화학식 X20)은 적절한 용매 (예를 들어, 디메틸포름아미드, 테트라히드로푸란) 중에서 염기 (예를 들어, 수소화나트륨)의 존재 하에 가열하면서 (예를 들어, 80℃) 화학식 X2Od의 화합물 (R60은 H이고 R15는 Cl인 화학식 X20)을 화학식 R62-OH 또는 R62-SH의 화합물과 반응시켜 제조한다. 수시간 동안 교반한 후에, 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 화학식 X2Oe의 화합물을 수득한다.
단계 2 - 화학식 X 10 d 의 화합물의 제조
화학식 X10d의 화합물 (R42가 C(O)H이고 R15가 LR62이고, 여기서 L은 O 또는 S 이고 R62는 임의로 치환된 저급 알킬인 화학식 X10)은 화학식 X2Oe의 화합물을 적절한 용매 (예를 들어, 테트라히드로푸란) 중에서 저하된 온도 (예를 들어, -78℃)에서 유기리튬 시약 (예를 들어, 리튬 디이소프로필아민)과 반응시켜 R42 위치에서 오르토리티에이션을 수행한 후, 포르밀화 시약 (예를 들어, 디메틸포름아미드)을 첨가하여 제조한다. 수시간 동안 교반하고 실온으로 가온시킨 후, 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 화학식 X10d의 화합물을 수득한다.
실시예 93: R 15 가 할로겐이고 R 42 가 C(O)H인 화학식 X 1O 의 화합물의 합성
화학식 X10e의 화합물 (R42가 C(O)H이고 R15가 할로겐인 화학식 X10)은 반응식 150에 제시된 바와 같이 2 단계로 화학식 X20f의 화합물로부터 합성할 수 있다.
반응식 150
Figure 112007090494669-PCT00146
단계 1 - 화학식 X 2O g 의 화합물의 제조
화학식 X20g의 화합물 (R60이 H이고 R15가 클로로 또는 브로모 (할로겐 R63)인 화학식 X20)은 빙초산 중의 화학식 X20f의 화합물 (R60이 H이고 R15가 NH2인 화학식 X20)을 산 (예를 들어, 염산, 황산) 중의 아질산나트륨과 반응시켜 디아조늄 중간체를 수득하여 제조한다. R63이 클로로 또는 브로모인 화합물을 형성하기 위해, 디아조늄염을 30분 내지 1시간 동안 가열하면서 (예를 들어, 80℃) 염산 중의 염화제일구리 또는 브롬화제일구리에 각각 첨가한다. 반응물을 물에 첨가한 후, 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)에 의해 단리하여, R63이 클로로 또는 브로모인 화학식 X20g의 화합물을 수득한다.
화학식 X2Og의 화합물 (R60이 H이고 R15가 플루오로 (할로겐 R63)인 화학식 X20)은 적절한 비양성자성 용매 (예를 들어, 테트라히드로푸란 또는 디클로로메탄) 중의 화학식 X20f의 화합물을 삼불화붕소 에테레이트와 반응시켜 제조한다. 후속적으로, 반응물을 냉각시키면서 (예를 들어, -15℃) t-부틸 니트라이트를 첨가하여 디아조늄 테트라플루오로보레이트 중간체를 침전물로서 수득하고, 이를 여과에 의해 수거할 수 있다. R63이 플루오로인 화합물을 형성하기 위해서, 디아조늄염을 버너로 마른 상태로 가열하여 삼불화붕소 증발을 개시시키고, 이는 이어서 자발적으로 계속 진행된다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리한 후에, R63이 플루오로인 화학식 X2Og의 화합물을 수득한다 (Doyle and Bryker, J. Org. Chem. 1979, 44:1572; Schiemann and Winkelmueller, Org. Syn. Coll. Vol. 2:299).
단계 2 - 화학식 X 10 e 의 화합물의 제조
화학식 X10e의 화합물 (R42가 C(O)H이고 R15가 할로겐 R63인 화학식 X10)은 화학식 X2Og의 화합물을 적절한 용매 (예를 들어, 테트라히드로푸란) 중에서 저하된 온도 (예를 들어, -78℃)에서 유기리튬 시약 (예를 들어, 리튬 디이소프로필아민)과 반응시켜 R42 위치에서 오르토리티에이션을 수행한 후, 포르밀화 시약 (예를 들어, 디메틸포름아미드)을 첨가하여 제조한다. 수시간 동안 교반하고 실온으로 가온시킨 후, 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 화학식 X10e의 화합물을 수득한다.
실시예 94: R 16 이 임의로 치환된 저급 알킬이고 R 42 가 C(O)H인 화학식 X 10 의 화합물의 합성
화학식 X10f의 화합물 (R42가 C(O)H이고 R16이 임의로 치환된 저급 알킬인 화학식 X10)은 반응식 151에 제시된 바와 같이 2 단계로 화학식 X20h의 화합물로부터 합성할 수 있다.
반응식 151
Figure 112007090494669-PCT00147
단계 1 - 화학식 X 20 i 의 화합물의 제조
화학식 X20i의 화합물 (R60은 H이고 R16은 임의로 치환된 저급 알킬 R64인 화학식 X20)은 화학식 X20h의 화합물 (R60은 H이고 R16이 Br인 화학식 X20)을 적절한 용매 (예를 들어, 톨루엔) 중에 용해시킨 후, 팔라듐 촉매 (예를 들어, [1,1'-비스(디페닐포스피노)-페로센] 디클로로팔라듐(II)의 디클로로메탄과의 착체 (1:1))를 첨가하여 제조한다. 수분 후에, 화학식 R64-MgBr (R64는 임의로 치환된 저급 알킬임)의 그리냐드 시약을 첨가하고, 반응물을 1 내지 수시간 동안 가열한다 (예를 들어, 90℃). 셀라이트를 통한 여과 후에, 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 화학식 X20i의 화합물을 수득한다.
단계 2 - 화학식 X 10 f 의 화합물의 제조
화학식 X10f의 화합물 (R42는 C(O)H이고 R16은 임의로 치환된 저급 알킬 R64인 화학식 X10)은 화학식 X2Oi의 화합물을 적절한 용매 (예를 들어, 테트라히드로푸란) 중에서 저하된 온도 (예를 들어, -78℃)에서 유기리튬 시약 (예를 들어, 리튬 디이 소프로필아민)과 반응시켜 R42 위치에서 리티에이션을 수행한 후, 포르밀화 시약 (예를 들어, 디메틸포름아미드)을 첨가하여 제조한다. 수시간 동안 교반하고 실온으로 가온시킨 후, 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 화학식 X10f의 화합물을 수득한다.
실시예 95: R 16 이 할로겐이고 R 42 가 C(O)H인 화학식 X 10 의 화합물의 합성
화학식 X10g의 화합물 (R42가 C(O)H이고 R16이 할로겐인 화학식 X10)은 반응식 152에 제시된 바와 같이 2 단계로 화학식 X20j의 화합물로부터 합성할 수 있다.
반응식 152
Figure 112007090494669-PCT00148
단계 1 - 화학식 X 20 k 의 화합물의 제조
화학식 X2Ok의 화합물 (R60은 H이고 R16은 클로로 또는 브로모 (할로겐 R65)인 화학식 X20)은 빙초산 중의 화학식 X20j의 화합물 (R60은 H이고 R16은 NH2인 화학식 X20)을 산 (예를 들어, 염산, 황산) 중의 아질산나트륨과 반응시켜 디아조늄 중간체 를 수득하여 제조한다. R65가 클로로 또는 브로모인 화합물을 형성시키기 위해, 디아조늄염을 30분 내지 1시간 동안 가열하면서 (예를 들어, 80℃) 염산 중의 염화제일구리 또는 브롬화제일구리에 각각 첨가한다. 반응물을 물에 첨가한 후, 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)에 의해 단리하여, R65가 브로모 또는 클로로인 화학식 X20k의 화합물을 수득한다.
화학식 X2Ok의 화합물 (R60은 H이고 R16은 플루오로 (할로겐 R65)인 화학식 X20)은 적절한 비양성자성 용매 (예를 들어, 테트라히드로푸란 또는 디클로로메탄) 중의 화학식 X20j의 화합물을 삼불화붕소 에테레이트와 반응시켜 제조한다. 후속적으로, 반응물을 냉각하면서 (예를 들어, -15℃) t-부틸 니트라이트를 첨가하여 디아조늄 테트라플루오로보레이트 중간체를 침전물로서 수득할 수 있고, 이는 여과에 의해 수거할 수 있다. R65가 플루오로인 화합물을 형성시키기 위해, 디아조늄염을 버너로 마른 상태로 가열하여 삼불화붕소 증발을 개시시키고, 이는 이어서 자발적으로 계속 진행된다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)에 의해 단리하여, R15가 H이고 R65가 플루오로인 화학식 X20k의 화합물을 수득한다 (Doyle and Bryker, J. Org. Chem. 1979, 44:157; Schiemann and Winkelmueller, Org. Syn. Coll. Vol. 2:299.)
단계 2 - 화학식 X 10 g 의 화합물의 제조
화학식 X10g의 화합물 (R42가 C(O)H이고 R16이 할로겐 R65인 화학식 X10)은 화학식 X2Ok의 화합물을 적절한 용매 (예를 들어, 테트라히드로푸란) 중에서 저하된 온도 (예를 들어, -78℃)에서 유기리튬 시약 (예를 들어, 리튬 디이소프로필아민)과 반응시켜 R42 위치에서 리티에이션을 수행한 후, 포르밀화 시약 (예를 들어, 디메틸포름아미드)을 첨가하여 제조한다. 수시간 동안 교반하고 실온으로 가온시킨 후, 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 화학식 X10g의 화합물을 수득한다.
실시예 96: R 16 이 OR 66 이고 R 42 가 C(O)H인 화학식 X 10 의 화합물의 합성
화학식 X10h의 화합물 (R42가 C(O)H이고 R16이 OR66이고, 여기서 R66은 임의로 치환된 저급 알킬인 화학식 X10)은 반응식 153에 제시된 바와 같이 2 단계로 화학식 X20h의 화합물로부터 합성할 수 있다.
반응식 153
Figure 112007090494669-PCT00149
단계 1 - 화학식 X 20 m 의 화합물의 제조
화학식 X2Om의 화합물 (R60은 H이고 R16은 OR66이고, 여기서 R66은 임의로 치환된 저급 알킬인 화학식 X20)은 화학식 X20h의 화합물 (R60은 H이고 R16이 Br인 화학식 X20)을 수시간 동안 가열하면서 (예를 들어, 120℃) 비반응성 용매 (예를 들어, 디메틸포름아미드) 중에서 염기 (예를 들어 수소화나트륨) 및 구리 촉매 (예를 들어, 브롬화구리)의 존재 하에 화학식 R66-OH의 화합물 (R66은 임의로 치환된 저급 알킬임)과 반응시켜 제조한다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 화학식 X20m의 화합물을 수득한다.
단계 2 - 화학식 X 10 h 의 화합물의 제조
화학식 X10h의 화합물 (R42가 C(O)H이고 R16이 OR66이고, 여기서 R66은 임의로 치환된 저급 알킬인 화학식 X10)은 화학식 X2Om의 화합물을 적절한 용매 (예를 들어, 테트라히드로푸란) 중에서 저하된 온도 (예를 들어, -78℃)에서 유기리튬 시약 (예를 들어, 리튬 디이소프로필아민)과 반응시켜 R42 위치에서 오르토리티에이션을 수행한 후, 포르밀화 시약 (예를 들어, 디메틸포름아미드)을 첨가하여 제조한다. 수시간 동안 교반하고 실온으로 가온시킨 후, 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실 리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 화학식 X10h의 화합물을 수득한다.
실시예 97: R 17 이 할로겐이고 R 42 가 C(O)H인 화학식 X 10 의 화합물의 합성
화학식 X10i의 화합물 (R42가 C(O)H이고 R17이 할로겐인 화학식 X10)은 반응식 154에 제시된 바와 같이 2 단계로 화학식 X2On의 화합물로부터 합성할 수 있다.
반응식 154
Figure 112007090494669-PCT00150
단계 1 - 화학식 X20 o 의 화합물의 제조
화학식 X20o의 화합물 (R60은 H이고 R17은 클로로 또는 브로모 (할로겐 R67)인 화학식 X20)은 빙초산 중의 화학식 X2On의 화합물 (R60은 H이고 R17은 NH2인 화학식 X20)을 산 (예를 들어, 염산, 황산) 중의 아질산나트륨과 반응시켜 디아조늄 중간체를 수득하여 제조한다. R67이 클로로 또는 브로모인 화합물을 형성시키기 위해, 디아조늄염을 30분 내지 1시간 동안 가열하면서 (예를 들어, 80℃) 염산 중의 염화제일구리 또는 브롬화제일구리에 각각 첨가한다. 반응물을 물에 첨가한 후, 통상적 인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)에 의해 단리하여 R67이 브로모 또는 클로로인 화학식 X20o의 화합물을 수득한다.
화학식 X20o의 화합물 (R60은 H이고 R17은 플루오로 (할로겐 R67)인 화학식 X20)은 적절한 비양성자성 용매 (예를 들어, 테트라히드로푸란 또는 디클로로메탄) 중의 화학식 X20n의 화합물을 삼불화붕소 에테레이트와 반응시켜 제조한다. 후속적으로, 반응물을 냉각하면서 (예를 들어, -15℃) t-부틸 니트라이트를 첨가하여 디아조늄 테트라플루오로보레이트 중간체를 침전물로서 수득할 수 있고, 이는 여과에 의해 수거할 수 있다. R67이 플루오로인 화합물을 형성시키기 위해, 디아조늄염을 버너로 마른 상태로 가열하여 삼불화붕소 증발을 개시시키고, 이는 이어서 자발적으로 계속 진행된다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)에 의해 단리한 후에, R67이 플루오로인 화학식 X20o의 화합물을 수득한다 (Doyle and Bryker, J. Org. Chem. 1979, 44:1572. Schiemann and Winkelmueller, Org. Syn. Coll. Vol. 2:299).
단계 2 - 화학식 X 10 i 의 화합물의 제조
화학식 X10i의 화합물 (R42가 C(O)H이고 R17이 할로겐 R67인 화학식 X10)은 화학식 X20O의 화합물을 적절한 용매 (예를 들어, 테트라히드로푸란) 중에서 저하된 온도 (예를 들어, -78℃)에서 유기리튬 시약 (예를 들어, 리튬 디이소프로필아민)과 반응시켜 R42 위치에서 오르토리티에이션을 수행한 후, 포르밀화 시약 (예를 들어, 디메틸포름아미드)을 첨가하여 제조한다. 수시간 동안 교반하고 실온으로 가온시킨 후, 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 화학식 X10i의 화합물을 수득한다.
실시예 98: R 17 이 OR 68 이고 R 42 가 C(O)H인 화학식 X 10 의 화합물
화학식 X10j의 화합물 (R42가 C(O)H이고 R17이 OR68이고, 여기서 R68은 임의로 치환된 저급 알킬인 화학식 X10)은 반응식 155에 제시된 바와 같이 2 단계로 화학식 X20p의 화합물로부터 합성할 수 있다.
반응식 155
Figure 112007090494669-PCT00151
단계 1 - 화학식 X 20 q 의 화합물의 제조
화학식 X2Oq의 화합물 (R60은 H이고 R17은 OR68이고, 여기서 R68은 임의로 치환된 저급 알킬인 화학식 X20)은 화학식 X2Op의 화합물 (R60은 H이고 R17이 Br인 화학식 X20)을 비반응성 용매 (예를 들어, 디메틸포름아미드) 중에서 염기 (예를 들어 수소화나트륨) 및 구리 촉매 (예를 들어, 브롬화구리)의 존재 하에 수시간 동안 가열하면서 (예를 들어, 120℃) 화학식 R68-OH의 화합물 (R68은 임의로 치환된 저급 알킬)과 반응시켜 제조한다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 화학식 X20q의 화합물을 수득한다.
단계 2 - 화학식 X 10 j 의 화합물의 제조
화학식 X10j의 화합물 (R42가 C(O)H이고 R17이 OR68이고, 여기서 R68은 임의로 치환된 저급 알킬인 화학식 X10)은 화학식 X2Oq의 화합물을 적절한 용매 (예를 들어, 테트라히드로푸란) 중에서 저하된 온도 (예를 들어, -78℃)에서 유기리튬 시약 (예를 들어, 리튬 디이소프로필아민)과 반응시켜 R42 위치에서 리티에이션을 수행한 후, 포르밀화 시약 (예를 들어, 디메틸포름아미드)을 첨가하여 제조한다. 수시간 동안 교반하고 실온으로 가온시킨 후, 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 화학식 X1Oj의 화합물을 수득한다.
실시예 99: n은 1이고; G는 N이고; K, J, F 및 E는 C이고; R 15 및 R 16 은 임의로 치환된 저급 알킬이고 ; M은 NH -D-이고 R 42 는 C(O)H인 화학식 X의 화합물의 합성
n=1이고 G는 N인 화학식 X의 화합물은 문헌에 공지된 많은 경로를 통해 제조 할 수 있고 실시예 89-98에서와 같이 화학식 Xa의 화합물에 대해 기재된 바와 유사한 반응에 사용될 수 있는 피리미딘 유도체이다. M은 NH-D이고, 여기서 D는 M의 정의와 일치한다. 상기 한 화합물의 합성을 다음과 같은 반응식 156에 제시한다.
반응식 156
Figure 112007090494669-PCT00152
단계 1 - 화학식 X 30 의 화합물의 제조
화학식 X30의 화합물 (n=1이고, G는 N이고, K, J, F 및 E는 C이고, R15 및 R16은 임의로 치환된 저급 알킬 (각각 R69 및 R70)이고, R43이 S-Me이고 R42가 H인 화학식 Xa)은 티오우레아 510을 비반응성 용매 (예를 들어, 에탄올) 중에서 염기 (예를 들어, 수산화나트륨)의 존재 하에 수시간 동안 화학식 XVII의 화합물 (R69 및 R70은 독립적으로 임의로 치환된 저급 알킬임)과 반응시켜 제조한다. 후속적으로, 메틸 요오다이드를 수시간 동안 가열하면서 (예를 들어, 60℃) 첨가한 후, 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)에 의해 단리하여 화학식 X30의 화합물을 수득한다.
단계 2 - 화학식 X 40 의 화합물의 제조
화학식 X40의 화합물 (n=1이고, G는 N이고, K, J, F 및 E는 C이고, R15 및 R16은 임의로 치환된 저급 알킬 (각각 R69 및 R70)이고, M이 NH-D- (D는 화학식 Ib의 M의 정의 또는 화학식 I의 L2의 정의와 일치함)이고 R42가 H인 화학식 X)은 화학식 X30의 화합물을 비반응성 용매 (예를 들어, 디메틸포름아미드) 중에서 염기 (예를 들어, 수소화나트륨)의 존재 하에 수시간 동안 화학식 NH2-D-R1의 화합물 (예를 들어, 벤질 아민 또는 다른 적합한 친핵체)과 반응시켜 제조한다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 화학식 X40의 화합물을 수득한다.
단계 3 - 화학식 X 50 의 화합물의 제조
화학식 X50의 화합물 (n=1이고, G는 N이고, K, J, F 및 E는 C이고, R15 및 R16은 임의로 치환된 저급 알킬 (각각 R69 및 R70)이고, M이 NH-D-(D는 화학식 Ib의 M의 정의 또는 화학식 I의 L2의 정의와 일치함)이고 R42가 H인 화학식 X)은 화학식 X40의 화합물을 적절한 용매 (예를 들어, 테트라히드로푸란) 중에서 저하된 온도 (예를 들어, -78℃)에서 유기리튬 시약 (예를 들어, 리튬 디이소프로필아민)과 반응시켜 R42 위치에서 리티에이션을 수행한 후, 포르밀화 시약 (예를 들어, 디메틸포름아미드)을 첨가하여 제조한다. 수시간 동안 교반하고 실온으로 가온시킨 후에, 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 화학식 X50의 화합물을 수득하고, 이는 화학식 II의 화합물의 합성에 사용될 수 있고, 이는 다시 화학식 Ib의 화합물의 합성에 사용될 수 있다.
실시예 100: n=0; K는 S이고; J, E, 및 F는 C이고; R 43 이 NHP 이고; R 15 가 임의로 치환된 저급 알킬 또는 임의로 치환된 저급 알콕시이고 R 42 가 COOH 인 화학식 Xa 의 화합물의 합성
n=0인 화학식 X의 화합물은 문헌에 공지된 많은 경로를 통해 제조할 수 있고 실시예 89-98에서와 같이 화학식 Xa의 화합물에 대해 기재된 바와 유사한 반응에 사용될 수 있는 5원 헤테로사이클이다. 상기 한 화합물의 합성을 다음과 같은 반응식 157에 제시한다.
반응식 157
Figure 112007090494669-PCT00153
단계 1 - 화학식 X 60 의 화합물의 제조
화학식 X60 (n=0, K는 S이고, J, E, 및 F는 C이고, R43이 NH2이고, R15가 R71이고 (R71은s 임의로 치환된 저급 알킬 또는 O-R72이고, 여기서 R72는 임의로 치환된 저급 알킬임), R42가 CO2R이고, 여기서 R은 저급 알킬인 화학식 Xa)의 화합물은 티오우레아 510을 비반응성 용매 (예를 들어, 디메틸포름아미드, 에탄올) 중에서 수시간 동안 가열하면서 (예를 들어, 60℃) R71이 임의로 치환된 저급 알킬 또는 O-R72 (R72는 임의로 치환된 저급 알킬임)이고 R이 저급 알킬인 화학식 XVI의 화합물과 반응시켜 제조한다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 화학식 X60의 화합물을 수득한다.
단계 2 - 화학식 X 70 의 화합물의 제조
화학식 X70의 화합물 (n=0, K는 S이고, J, E, 및 F는 C이고, R43은 NHP이고, 여기서 P는 보호기 [예를 들어, 트리이소프로필실릴, t-부틸옥시카르보닐]이고, R15는 R71이고 R42는 CO2R이고, 여기서 R은 저급 알킬인 화학식 Xa)은 화학식 X60의 화합물을 비반응성 용매 (예를 들어, 디메틸포름아미드) 중에서 염기 (예를 들어, 수소화나트륨, 디이소프로필에틸아민)의 존재 하에 보호기 도입에 적절한 시약 (예를 들어, 트리이소프로필실릴 클로라이드, Boc 안히드라이드)과 수시간 동안 반응시켜 제조한다. 통상적인 수단 (예를 들어, 추출 및 실리카 겔 크로마토그래피)으로 단리하여 화학식 X70의 화합물을 수득한다.
단계 3 - 화학식 X 80 의 화합물의 제조
화학식 X80의 화합물 (n=0, K는 S이고, J, E 및 F는 C이고, R43은 NHP이고, R15는 R71이고, R42는 CO2H인 화학식 Xa)은 화학식 X70의 화합물을 적절한 용매 (예를 들어, 테트라히드로푸란 및 물) 중에서 염기 (예를 들어, 수산화리튬)와 수시간 동안 반응시켜 제조한다. 통상적인 수단 (예를 들어, 산-염기 추출)으로 단리하여 X80의 화합물을 수득하고, 이는 R43이 NHP인 화학식 II의 화합물의 합성에 사용될 수 있고, 이는 다시 화학식 Ib의 화합물을 제조하기 위해 사용될 수 있다.
실시예 101 3,5-디메틸-4-(1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3- 일메틸 )- 피라졸 -1- 카르복실산 벤질아미드 P-0084의 합성
3,5-디메틸-4-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피라졸-1-카르복실산 벤질아미드 P-0084를 반응식 158에 제시된 바와 같이 6 단계로 디메틸-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-아민 2로부터 합성하였다.
반응식 158
Figure 112007090494669-PCT00154
단계 1: 3- 디메틸아미노메틸 - 피롤로[2,3-b]피리딘 -1- 카르복실산 t-부틸 에스테르 (511)의 제조
테트라히드로푸란 (200.0 mL) 중의 디메틸-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-아민 (2, 2.50 g, 14.3 mmol, 실시예 2, 반응식 4, 단계 1에 기재된 바와 같이 제조)에 수소화나트륨 (0.685 g, 광물유 중의 60％, 17.1 mmol)을 첨가하였다. 10분 후에, 디-t-부틸디카르보네이트 (3.74 g, 17.1 mmol)를 반응물에 첨가하였다. 반응물을 실온에서 철야 교반하였다. 반응물을 물에 붓고, 에틸 아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하였다. 여액을 농축하고, 헥산 중의 30％ 에틸 아세테이트로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하여 백색 고체 (511, 3.80 g, 96.7％)를 수득하였다.
단계 2: 3- 클로로메틸 - 피롤로[2,3-b]피리딘 -1- 카르복실산 t-부틸 에스테르 (512)의 제조
톨루엔 (50.00 mL) 중의 3-디메틸아미노메틸-피롤로[2,3-b]피리딘-1-카르복실산 t-부틸 에스테르 (511, 2.60 g, 9.44 mmol)에 이소프로필 클로로포르메이트 (11.3 mL, 톨루엔 중의 1.0 M)를 질소 분위기 하에서 첨가하였다. 반응물을 실온에서 3시간 동안 교반하였다. 반응물을 물에 붓고, 에틸 아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하였다. 여액을 농축하고, 헥산 중의 20％ 에틸 아세테이트로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하여 백색 고체 (512, 2.0 g, 79.4％)를 수득하였다.
단계 3 - 3-(2-아세틸-3-옥소-부틸)- 피롤로[2,3-b]피리딘 -1- 카르복실산 t-부틸 에스테르 (513)의 제조:
디메틸 술폭시드 (29.0 mL) 중의 아세틸아세톤 (0.563 g, 5.62 mmol)에 수소화나트륨 (0.225 g, 광물유 중의 60％, 5.62 mmol)을 첨가하였다. 20분 후에, 3-클로로메틸-피롤로[2,3-b]피리딘-1-카르복실산 t-부틸 에스테르 (512, 1.00 g, 3.75 mmol)를 반응물에 첨가하였다. 반응물을 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 반응물을 물에 붓고, 에틸 아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하였다. 여액을 농축하고, 헥산 중의 40％ 에틸 아세테이트로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하여 무색 오일 (513, 0.59 g, 48.0％)을 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 331.4.
단계 4 - 3-(3,5-디메틸-1H- 피라졸 -4- 일메틸 )- 피롤로[2,3-b]피리딘 -1- 카르복실산 t-부틸 에스테르 (514)의 제조
질소 분위기 하에서 -20℃로 냉각시킨 메탄올 (15.0 mL) 중의 3-(2-아세틸-3-옥소-부틸)-피롤로[2,3-b]피리딘-1-카르복실산 t-부틸 에스테르 (513, 1.20 g, 3.63 mmol)에 디클로로메탄 (6.0 mL) 중의 히드라진 (0.128 g, 4.00 mmol)을 첨가하였다. 반응물을 2시간 동안 교반하였다. 반응물을 농축하여 용매를 제거하고, 잔사를 물에 붓고, 에틸 아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하였다. 여액을 농축하고, 헥산 중의 60％ 에틸 아세테이트로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하여 백색 고체 (514, 1.0 g, 84.4％)를 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+= 327.4.
단계 5 - 3-(1- 벤질카르바모일 -3,5-디메틸-1H- 피라졸 -4- 일메틸 )- 피롤 로[ 2,3-b]피 리딘-1- 카르복실산 t-부틸 에스테르 (515)의 제조
디클로로메탄 (6.0 mL) 중의 3-(3,5-디메틸-1H-피라졸-4-일메틸)-피롤로[2,3-b]피리딘-1-카르복실산 t-부틸 에스테르 (514, 60.0 mg, 0.18 mmol)에 1,8-디아자비시클로[5.4.0]운데크-7-엔 (0.033 mL, 0.220 mmol) 및 벤질 이소시아네이트 (29.4 mg, 0.220 mmol)를 질소 분위기 하에서 첨가하였다. 반응물을 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 반응물을 농축하고, 헥산 중의 30％ 에틸 아세테이트로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하여 조질 화합물 (515, 약 50 mg)을 수득하고, 다음 단계에 직접 사용하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 460.5.
단계 6 - 3,5-디메틸-4-(1H- 피롤로[2,3-b]피리딘 -3- 일메틸 )-피라졸-1-카르복실산 벤질아미드 (P-0084)
디클로로메탄 (6.0 mL) 중의 3-(1-벤질카르바모일-3,5-디메틸-1H-피라졸-4-일메틸)-피롤로[2,3-b]피리딘-1-카르복실산 t-부틸 에스테르 (515, 50.0 mg, 0.11 mmol)에 트리플루오로아세트산 (0.20 mL, 2.6 mmol)을 질소 분위기 하에서 첨가하였다. 반응물을 실온에서 20분 동안 교반하였다. 반응물을 수성 탄산칼륨에 붓고, 에틸 아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하였다. 여액을 농축하고, 헥산 중의 30％ 에틸 아세테이트로 용출시키는 실리카 겔 칼럼 크로마토그래피에 의해 정제하여 백색 고체 (P-0084, 11.0 mg, 28.1％)를 수득하였다. MS (ESI) [M+H+]+ = 360.5.
단계 5에서 벤질 이소시아네이트를 적절한 친전자체로 치환하여 반응식 158의 프로토콜에 따라 추가의 화합물을 제조하였다. 하기 화합물을 상기 과정에 따라 제조하였다:
3,5-디메틸-4-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피라졸-1-카르복실산 페닐아미드 (P-0085),
[3,5-디메틸-4-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피라졸-1-일]-페닐-메타논 (P-0086),
1-[3,5-디메틸-4-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피라졸-1-일]-3-페닐-프로판-1-온 (P-0087),
3-(3,5-디메틸-1-페닐메탄술포닐-1H-피라졸-4-일메틸)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 (P-0088),
3-[1-(부탄-1-술포닐)-3,5-디메틸-1H-피라졸-4-일메틸]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 (P-0089),
3,5-디메틸-4-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피라졸-1-카르복실산 부틸아미드 (P-0090), 및
3,5-디메틸-4-(1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일메틸)-피라졸-1-카르복실산 페네틸-아미드 (P-0091).
단계 5에서 벤질 이소시아네이트 대신에 사용된 친전자체는 하기 표의 컬럼 2에 나타내었고, 화합물 구조는 컬럼 3에 제시하였다. 컬럼 1은 화합물 번호를, 컬럼 4는 실험적 질량 분광 결과를 보여준다.
Figure 112007090494669-PCT00155
명세서에서 모든 특허 및 다른 인용된 참고문헌은 본 발명이 속하는 기술 분야의 당업자의 수준을 나타내고, 마치 각각의 문헌이 개별적으로 그 전체가 참고로 포함된 것과 동일한 정도로 임의의 표 및 도면을 포함하여 그 전부가 본원에 참고로 포함된다.
당업자는 언급한 목적 및 잇점, 및 본 발명에 고유한 목적 및 잇점을 달성하 기 위해 본 발명을 잘 변용할 수 있음을 쉽게 이해할 것이다. 바람직한 실시태양을 대표적으로 나타내는 것으로 본원에 기재된 방법, 변형, 및 조성물은 예시적인 것으로서, 본 발명의 범위를 제한하고자 하는 것이 아니다. 본 발명의 취지에 포함되는, 본 발명에 대한 변경 및 다른 용도는 당업자가 쉽게 실시할 수 있을 것이고, 이는 청구의 범위에 의해 규정되는 것이다.
본 발명의 범위 및 취지를 벗어나지 않으면서 본 발명에 대한 상이한 치환 및 변형이 가능함을 당업자는 쉽게 이해할 것이다. 예를 들어, 추가의 화학식 I의 화합물을 제공하기 위해 변형을 도입하고/하거나 다양한 투여 방법을 사용할 수 있다. 따라서, 상기 추가의 실시태양은 본 발명의 범위 및 하기 청구의 범위에 포함된다.
본원에 예시적으로 기재된 본 발명은 본원에서 구체적으로 개시되지 않은 임의의 성분(들), 제한(들)의 부재 시에도 적합하게 실시될 수 있다. 사용된 용어 및 표현은 설명의 용어로 사용되는 것이지 제한의 용어로 사용되는 것은 아니며, 상기 용어 및 표현의 사용이 도시되거나 기술된 특징 또는 그 일부의 임의의 동등물을 배제하려는 의도는 아니고, 청구된 발명의 범위 내에서 다양한 변형이 가능하다는 것이 인식된다. 따라서, 본 발명이 바람직한 실시태양 및 임의의 특징에 의해 구체적으로 개시되었지만, 본원에 개시된 사상의 변형 및 변화를 당업자가 수행할 수 있다는 점, 및 상기 변형 및 변화가 첨부된 청구의 범위에 의해 정의된 본 발명의 범위 내에 포함되는 것으로 간주된다는 점이 이해되어야 한다.
또한, 본 발명의 특징 또는 측면이 마쿠쉬 (Markush) 군 또는 다른 대체의 분류에 의해 기술되는 경우, 당업자는 본 발명이 또한 마쿠쉬 군 또는 다른 군의 임의의 개별적인 구성원에 의해 또는 구성원들의 하부군에 의해 설명된다는 점을 인식할 것이다.
또한, 반대로 지시하지 않으면, 다양한 수치가 실시태양에 제공되는 경우, 부가적인 실시태양이 임의의 두 상이한 값을 범위의 종점으로 취하여 기술된다. 상기 범위는 또한 기술된 본 발명의 범위 내이다.
따라서, 추가의 실시태양은 본 발명의 범위 및 하기 청구의 범위 내에 포함된다.
Figure 112007090494669-PCT00156
Figure 112007090494669-PCT00157
Figure 112007090494669-PCT00158
Figure 112007090494669-PCT00159
Figure 112007090494669-PCT00160
Figure 112007090494669-PCT00161
Figure 112007090494669-PCT00162
SEQUENCE LISTING <110> PLEXXIKON <120> COMPOUNDS MODULATING C-KIT AND C-FMS ACTIVITY AND USES THEREFOR <130> 039363/2193 <140> PCT/US2006/018726 <141> 2006-05-16 <150> 60/682,063 <151> 2005-05-17 <150> 60/682,051 <151> 2005-05-17 <150> 60/682,042 <151> 2005-05-17 <150> 60/692,750 <151> 2005-06-22 <150> 60/692,960 <151> 2005-06-22 <160> 66 <170> PatentIn Ver. 3.3 <210> 1 <211> 976 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 1 Met Arg Gly Ala Arg Gly Ala Trp Asp Phe Leu Cys Val Leu Leu Leu 1 5 10 15 Leu Leu Arg Val Gln Thr Gly Ser Ser Gln Pro Ser Val Ser Pro Gly 20 25 30 Glu Pro Ser Pro Pro Ser Ile His Pro Gly Lys Ser Asp Leu Ile Val 35 40 45 Arg Val Gly Asp Glu Ile Arg Leu Leu Cys Thr Asp Pro Gly Phe Val 50 55 60 Lys Trp Thr Phe Glu Ile Leu Asp Glu Thr Asn Glu Asn Lys Gln Asn 65 70 75 80 Glu Trp Ile Thr Glu Lys Ala Glu Ala Thr Asn Thr Gly Lys Tyr Thr 85 90 95 Cys Thr Asn Lys His Gly Leu Ser Asn Ser Ile Tyr Val Phe Val Arg 100 105 110 Asp Pro Ala Lys Leu Phe Leu Val Asp Arg Ser Leu Tyr Gly Lys 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aagcccatga gtccttgaaa atatttttta tatatacagt 4980 aactttatgt gtaaatacat aagcggcgta agtttaaagg atgttggtgt tccacgtgtt 5040 ttattcctgt atgttgtcca attgttgaca gttctgaaga attc 5084 <210> 3 <211> 972 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 3 Met Gly Pro Gly Val Leu Leu Leu Leu Leu Val Ala Thr Ala Trp His 1 5 10 15 Gly Gln Gly Ile Pro Val Ile Glu Pro Ser Val Pro Glu Leu Val Val 20 25 30 Lys Pro Gly Ala Thr Val Thr Leu Arg Cys Val Gly Asn Gly Ser Val 35 40 45 Glu Trp Asp Gly Pro Pro Ser Pro His Trp Thr Leu Tyr Ser Asp Gly 50 55 60 Ser Ser Ser Ile Leu Ser Thr Asn Asn Ala Thr Phe Gln Asn Thr Gly 65 70 75 80 Thr Tyr Arg Cys Thr Glu Pro Gly Asp Pro Leu Gly Gly Ser Ala Ala 85 90 95 Ile His Leu Tyr Val Lys Asp Pro Ala Arg Pro Trp Asn Val Leu Ala 100 105 110 Gln Glu Val Val Val Phe Glu Asp Gln Asp Ala Leu Leu Pro Cys Leu 115 120 125 Leu Thr Asp Pro Val Leu Glu Ala Gly Val Ser Leu Val Arg Val Arg 130 135 140 Gly Arg Pro Leu Met Arg His Thr Asn Tyr Ser Phe Ser Pro Trp His 145 150 155 160 Gly Phe Thr Ile His Arg Ala Lys Phe Ile Gln Ser Gln Asp Tyr Gln 165 170 175 Cys Ser Ala Leu Met Gly Gly Arg Lys Val Met Ser Ile Ser Ile Arg 180 185 190 Leu Lys Val Gln Lys Val Ile Pro Gly Pro Pro Ala Leu Thr Leu Val 195 200 205 Pro Ala Glu Leu Val Arg Ile Arg Gly Glu Ala Ala Gln Ile Val Cys 210 215 220 Ser Ala Ser Ser Val Asp Val Asn Phe Asp Val Phe Leu Gln His Asn 225 230 235 240 Asn Thr Lys Leu Ala Ile Pro Gln Gln Ser Asp Phe His Asn Asn Arg 245 250 255 Tyr Gln Lys Val Leu Thr Leu Asn Leu Asp Gln Val Asp Phe Gln His 260 265 270 Ala Gly Asn Tyr Ser Cys Val Ala Ser Asn Val Gln Gly Lys His Ser 275 280 285 Thr Ser Met Phe Phe Arg Val Val Glu Ser Ala Tyr Leu Asn Leu Ser 290 295 300 Ser Glu Gln Asn Leu Ile Gln Glu Val Thr Val Gly Glu Gly Leu Asn 305 310 315 320 Leu Lys Val Met Val Glu Ala Tyr Pro Gly Leu Gln Gly Phe Asn Trp 325 330 335 Thr Tyr Leu Gly Pro Phe Ser Asp His Gln Pro Glu Pro Lys Leu Ala 340 345 350 Asn Ala Thr Thr Lys Asp Thr Tyr Arg His Thr Phe Thr Leu Ser Leu 355 360 365 Pro Arg Leu Lys Pro Ser 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Ala Lys Ile Gly Asp Phe Gly Leu Ala 785 790 795 800 Arg Asp Ile Met Asn Asp Ser Asn Tyr Ile Val Lys Gly Asn Ala Arg 805 810 815 Leu Pro Val Lys Trp Met Ala Pro Glu Ser Ile Phe Asp Cys Val Tyr 820 825 830 Thr Val Gln Ser Asp Val Trp Ser Tyr Gly Ile Leu Leu Trp Glu Ile 835 840 845 Phe Ser Leu Gly Leu Asn Pro Tyr Pro Gly Ile Leu Val Asn Ser Lys 850 855 860 Phe Tyr Lys Leu Val Lys Asp Gly Tyr Gln Met Ala Gln Pro Ala Phe 865 870 875 880 Ala Pro Lys Asn Ile Tyr Ser Ile Met Gln Ala Cys Trp Ala Leu Glu 885 890 895 Pro Thr His Arg Pro Thr Phe Gln Gln Ile Cys Ser Phe Leu Gln Glu 900 905 910 Gln Ala Gln Glu Asp Arg Arg Glu Arg Asp Tyr Thr Asn Leu Pro Ser 915 920 925 Ser Ser Arg Ser Gly Gly Ser Gly Ser Ser Ser Ser Glu Leu Glu Glu 930 935 940 Glu Ser Ser Ser Glu His Leu Thr Cys Cys Glu Gln Gly Asp Ile Ala 945 950 955 960 Gln Pro Leu Leu Gln Pro Asn Asn Tyr Gln Phe Cys 965 970 <210> 4 <211> 3985 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 4 gaagggcaga cagagtgtcc aaaagcgtga gagcacgaag tgaggagaag gtggagaaga 60 gagaagagga agaggaagag gaagagagga agcggaggga actgcggcca ggctaaaagg 120 ggaagaagag gatcagccca aggaggagga agaggaaaac aagacaaaca gccagtgcag 180 aggagaggaa cgtgtgtcca gtgtcccgat ccctgcggag ctagtagctg agagctctgt 240 gccctgggca ccttgcagcc ctgcacctgc ctgccacttc cccaccgagg ccatgggccc 300 aggagttctg ctgctcctgc tggtggccac agcttggcat ggtcagggaa tcccagtgat 360 agagcccagt gtccctgagc tggtcgtgaa gccaggagca acggtgacct tgcgatgtgt 420 gggcaatggc agcgtggaat gggatggccc cccatcacct cactggaccc tgtactctga 480 tggctccagc agcatcctca gcaccaacaa cgctaccttc caaaacacgg ggacctatcg 540 ctgcactgag cctggagacc ccctgggagg cagcgccgcc atccacctct atgtcaaaga 600 ccctgcccgg ccctggaacg tgctagcaca ggaggtggtc gtgttcgagg accaggacgc 660 actactgccc tgtctgctca cagacccggt gctggaagca ggcgtctcgc tggtgcgtgt 720 gcgtggccgg cccctcatgc gccacaccaa ctactccttc tcgccctggc atggcttcac 780 catccacagg gccaagttca ttcagagcca ggactatcaa tgcagtgccc tgatgggtgg 840 caggaaggtg atgtccatca gcatccggct gaaagtgcag aaagtcatcc cagggccccc 900 agccttgaca ctggtgcctg cagagctggt gcggattcga ggggaggctg cccagatcgt 960 gtgctcagcc agcagcgttg atgttaactt tgatgtcttc ctccaacaca acaacaccaa 1020 gctcgcaatc cctcaacaat ctgactttca taataaccgt taccaaaaag tcctgaccct 1080 caacctcgat caagtagatt tccaacatgc cggcaactac tcctgcgtgg ccagcaacgt 1140 gcagggcaag cactccacct ccatgttctt ccgggtggta gagagtgcct acttgaactt 1200 gagctctgag cagaacctca tccaggaggt gaccgtgggg gaggggctca acctcaaagt 1260 catggtggag gcctacccag gcctgcaagg ttttaactgg acctacctgg gacccttttc 1320 tgaccaccag cctgagccca agcttgctaa tgctaccacc aaggacacat acaggcacac 1380 cttcaccctc tctctgcccc gcctgaagcc ctctgaggct ggccgctact ccttcctggc 1440 cagaaaccca ggaggctgga gagctctgac gtttgagctc acccttcgat accccccaga 1500 ggtaagcgtc atatggacat tcatcaacgg ctctggcacc cttttgtgtg ctgcctctgg 1560 gtacccccag cccaacgtga catggctgca gtgcagtggc cacactgata ggtgtgatga 1620 ggcccaagtg ctgcaggtct gggatgaccc ataccctgag gtcctgagcc aggagccctt 1680 ccacaaggtg acggtgcaga gcctgctgac tgttgagacc ttagagcaca accaaaccta 1740 cgagtgcagg gcccacaaca gcgtggggag tggctcctgg gccttcatac ccatctctgc 1800 aggagcccac acgcatcccc cggatgagtt cctcttcaca ccagtggtgg tcgcctgcat 1860 gtccatcatg gccttgctgc tgctgctgct cctgctgcta ttgtacaagt ataagcagaa 1920 gcccaagtac caggtccgct ggaagatcat cgagagctat gagggcaaca gttatacttt 1980 catcgacccc acgcagctgc cttacaacga gaagtgggag ttcccccgga acaacctgca 2040 gtttggtaag accctcggag ctggagcctt tgggaaggtg gtggaggcca cggcctttgg 2100 tctgggcaag gaggatgctg tcctgaaggt ggctgtgaag atgctgaagt ccacggccca 2160 tgctgatgag aaggaggccc tcatgtccga gctgaagatc atgagccacc tgggccagca 2220 cgagaacatc gtcaaccttc tgggagcctg tacccatgga ggccctgtac tggtcatcac 2280 ggagtactgt tgctatggcg acctgctcaa ctttctgcga aggaaggctg aggccatgct 2340 gggacccagc ctgagccccg gccaggaccc cgagggaggc gtcgactata agaacatcca 2400 cctcgagaag aaatatgtcc gcagggacag tggcttctcc agccagggtg tggacaccta 2460 tgtggagatg aggcctgtct ccacttcttc aaatgactcc ttctctgagc aagacctgga 2520 caaggaggat ggacggcccc tggagctccg ggacctgctt cacttctcca gccaagtagc 2580 ccagggcatg 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Sequence: Synthetic Primer <400> 12 gccgcgtcag atttgatcag accgtacgcg gtcgcttcaa c 41 <210> 13 <211> 43 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 13 ctgatcaaat ctgacgcggc gatgaccgtt gcggttaaaa tgc 43 <210> 14 <211> 43 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 14 gtcaggtgcg cagacggttt cagcatttta accgcaacgg tca 43 <210> 15 <211> 43 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 15 aaaccgtctg cgcacctgac cgaacgtgaa gcgctgatgt ctg 43 <210> 16 <211> 44 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 16 ccaggtaaga cagaactttc agttcagaca tcagcgcttc acgt 44 <210> 17 <211> 44 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 17 ctgaaagttc tgtcttacct gggtaaccac atgaacatcg ttaa 44 <210> 18 <211> 41 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 18 ggtgcacgca cccagcaggt taacgatgtt catgtggtta c 41 <210> 19 <211> 43 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 19 ctgctgggtg cgtgcaccat cggtggtccg accctggtta tca 43 <210> 20 <211> 43 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 20 gtcaccgtag cagcagtatt cggtgataac cagggtcgga cca 43 <210> 21 <211> 43 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 21 gaatactgct gctacggtga cctgctgaac ttcctgcgtc gta 43 <210> 22 <211> 43 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 22 agagcagatg aaagagtcac gtttacgacg caggaagttc agc 43 <210> 23 <211> 43 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 23 cgtgactctt tcatctgctc taaacaggaa gaccacgcgg aag 43 <210> 24 <211> 43 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 24 cagcaggttt ttgtacagcg ccgcttccgc gtggtcttcc tgt 43 <210> 25 <211> 44 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 25 gcgctgtaca aaaacctgct gcactctaaa gaatcttctt gctc 44 <210> 26 <211> 45 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 26 ccatgtattc gttggtagag tcagagcaag aagattcttt agagt 45 <210> 27 <211> 44 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 27 gactctacca acgaatacat ggacatgaaa ccgggtgttt ctta 44 <210> 28 <211> 43 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 28 tccgctttgg tcggaacaac gtaagaaaca cccggtttca tgt 43 <210> 29 <211> 43 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 29 gttgttccga ccaaagcgga caaacgtcgt tctgttcgta tcg 43 <210> 30 <211> 46 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 30 taacgtcacg ttcgatgtaa gaaccgatac gaacagaacg acgttt 46 <210> 31 <211> 43 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 31 tcttacatcg aacgtgacgt taccccggcg atcatggaag acg 43 <210> 32 <211> 40 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 32 ccaggtccag cgccagttcg tcgtcttcca tgatcgccgg 40 <210> 33 <211> 43 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 33 gaactggcgc tggacctgga agacctgctg tctttctctt acc 43 <210> 34 <211> 44 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 34 gaacgccata cctttcgcaa cctggtaaga gaaagacagc aggt 44 <210> 35 <211> 44 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 35 gttgcgaaag gtatggcgtt cctggcgtct aaaaactgca tcca 44 <210> 36 <211> 39 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 36 cgcgccgcca ggtcacggtg gatgcagttt ttagacgcc 39 <210> 37 <211> 41 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 37 cgtgacctgg cggcgcgtaa catcctgctg acccacggtc g 41 <210> 38 <211> 43 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 38 accgaagtcg cagattttgg tgatacgacc gtgggtcagc agg 43 <210> 39 <211> 43 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 39 accaaaatct gcgacttcgg tctggcgcgt gacatcaaaa acg 43 <210> 40 <211> 46 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 40 gttaccttta acaacgtagt tagagtcgtt tttgatgtca cgcgcc 46 <210> 41 <211> 44 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 41 tctaactacg ttgttaaagg taacgcgcgt ctgccggtta aatg 44 <210> 42 <211> 42 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 42 gaagatagat tccggcgcca tccatttaac cggcagacgc gc 42 <210> 43 <211> 44 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 43 atggcgccgg aatctatctt caactgcgtt tacaccttcg aatc 44 <210> 44 <211> 43 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 44 gataccgtaa gaccaaacgt cagattcgaa ggtgtaaacg cag 43 <210> 45 <211> 43 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 45 gacgtttggt cttacggtat cttcctgtgg gaactgttct ctc 43 <210> 46 <211> 41 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 46 cctgtgggaa ctgttctctc tgggttcttc tccgtacccg g 41 <210> 47 <211> 45 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 47 ggttcttctc cgtacccggg tatgccggtt gactctaaat tctat 45 <210> 48 <211> 45 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 48 cggaaacctt ctttgatcat tttgtagaat ttagagtcaa ccggc 45 <210> 49 <211> 43 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 49 aaaatgatca aagaaggttt ccgtatgctg tctccggaac acg 43 <210> 50 <211> 42 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 50 atgtcgtaca tttccgccgg cgcgtgttcc ggagacagca ta 42 <210> 51 <211> 42 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 51 ccggcggaaa tgtacgacat catgaaaacc tgctgggacg cg 42 <210> 52 <211> 42 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 52 aaggtcggac gtttcagcgg gtccgcgtcc cagcaggttt tc 42 <210> 53 <211> 43 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 53 ccgctgaaac gtccgacctt caaacagatc gttcagctga tcg 43 <210> 54 <211> 46 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 54 ttggtagatt cagagatctg tttttcgatc agctgaacga tctgtt 46 <210> 55 <211> 44 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 55 aaacagatct ctgaatctac caaccacatc tactctaacc tggc 44 <210> 56 <211> 42 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 56 tgacggttcg gagagcagtt cgccaggtta gagtagatgt gg 42 <210> 57 <211> 43 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 57 aactgctctc cgaaccgtca gaaaccggtt gttgaccact ctg 43 <210> 58 <211> 45 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 58 gtagaaccaa cagagttgat acgaacagag tggtcaacaa ccggt 45 <210> 59 <211> 42 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 59 cgtatcaact ctgttggttc taccgcgtct tcttctcagc cg 42 <210> 60 <211> 40 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 60 aacgtcgtcg tgaaccagca gcggctgaga agaagacgcg 40 <210> 61 <211> 32 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 61 gttgtttcat atgtacgaag ttcagtggaa ag 32 <210> 62 <211> 36 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 62 gttgtttgtc gactaaacgt cgtcgtgaac cagcag 36 <210> 63 <211> 34 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Primer <400> 63 gttcttgtcg actatttctg acggttcgga gagc 34 <210> 64 <211> 1325 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <221> CDS <222> (88)..(1302) <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic DNA Construct <400> 64 taatacgact cactataggg gaattgtgag cggataacaa ttcccctcta gaaataattt 60 tgtttaactt taagaaggag atatacc atg ggt cac cac cat cac cat cat atg 114 Met Gly His His His His His His Met 1 5 tac gaa gtt cag tgg aaa gtt gtt gaa gaa atc aac ggt aac aac tac 162 Tyr Glu Val Gln Trp Lys Val Val Glu Glu Ile Asn Gly Asn Asn Tyr 10 15 20 25 gtt tac atc gac ccg acc cag ctg ccg tac gac cac aaa tgg gag ttc 210 Val Tyr Ile Asp Pro Thr Gln Leu Pro Tyr Asp His Lys Trp Glu Phe 30 35 40 ccg cgt aac cgt ctg tct ttc ggt aaa acc ctg ggt gcg ggt gcg ttc 258 Pro Arg Asn Arg Leu Ser Phe Gly Lys Thr Leu Gly Ala Gly Ala Phe 45 50 55 ggt aaa gtt gtt gaa gcg acc gcg tac ggt ctg atc aaa tct gac gcg 306 Gly Lys Val Val Glu Ala Thr Ala Tyr Gly Leu Ile Lys Ser Asp Ala 60 65 70 gcg atg acc gtt gcg gtt aaa atg ctg aaa ccg tct gcg cac ctg acc 354 Ala Met Thr Val Ala Val Lys Met Leu Lys Pro Ser Ala His Leu Thr 75 80 85 gaa cgt gaa gcg ctg atg tct gaa ctg aaa gtt ctg tct tac ctg ggt 402 Glu Arg Glu Ala Leu Met Ser Glu Leu Lys Val Leu Ser Tyr Leu Gly 90 95 100 105 aac cac atg aac atc gtt aac ctg ctg ggt gcg tgc acc atc ggt ggt 450 Asn His Met Asn Ile Val Asn Leu Leu Gly Ala Cys Thr Ile Gly Gly 110 115 120 ccg acc ctg gtt atc acc gaa tac tgc tgc tac ggt gac ctg ctg aac 498 Pro Thr Leu Val Ile Thr Glu Tyr Cys Cys Tyr Gly Asp Leu Leu Asn 125 130 135 ttc ctg cgt cgt aaa cgt gac tct ttc atc tgc tct aaa cag gaa gac 546 Phe Leu Arg Arg Lys Arg Asp Ser Phe Ile Cys Ser Lys Gln Glu Asp 140 145 150 cac gcg gaa gcg gcg ctg tac aaa aac ctg ctg cac tct aaa gaa tct 594 His Ala Glu Ala Ala Leu Tyr Lys Asn Leu Leu His Ser Lys Glu Ser 155 160 165 tct tgc tct gac tct acc aac gaa tac atg gac atg aaa ccg ggt gtt 642 Ser Cys Ser Asp Ser Thr Asn Glu Tyr Met Asp Met Lys Pro Gly Val 170 175 180 185 tct tac gtt gtt ccg acc aaa gcg gac aaa cgt cgt tct gtt cgt atc 690 Ser Tyr Val Val Pro Thr Lys Ala Asp Lys Arg Arg Ser Val Arg Ile 190 195 200 ggt tct tac atc gaa cgt gac gtt acc ccg gcg atc atg gaa gac gac 738 Gly Ser Tyr Ile Glu Arg Asp Val Thr Pro Ala Ile Met Glu Asp Asp 205 210 215 gaa ctg gcg ctg gac ctg gaa gac ctg ctg tct ttc tct tac cag gtt 786 Glu Leu Ala Leu Asp Leu Glu Asp Leu Leu Ser Phe Ser Tyr Gln Val 220 225 230 gcg aaa ggt atg gcg ttc ctg gcg tct aaa aac tgc atc cac cgt gac 834 Ala Lys Gly Met Ala Phe Leu Ala Ser Lys Asn Cys Ile His Arg Asp 235 240 245 ctg gcg gcg cgt aac atc ctg ctg acc cac ggt cgt atc acc aaa atc 882 Leu Ala Ala Arg Asn Ile Leu Leu Thr His Gly Arg Ile Thr Lys Ile 250 255 260 265 tgc gac ttc ggt ctg gcg cgt gac atc aaa aac gac tct aac tac gtt 930 Cys Asp Phe Gly Leu Ala Arg Asp Ile Lys Asn Asp Ser Asn Tyr Val 270 275 280 gtt aaa ggt aac gcg cgt ctg ccg gtt aaa tgg atg gcg ccg gaa tct 978 Val Lys Gly Asn Ala Arg Leu Pro Val Lys Trp Met Ala Pro Glu Ser 285 290 295 atc ttc aac tgc gtt tac acc ttc gaa tct gac gtt tgg tct tac ggt 1026 Ile Phe Asn Cys Val Tyr Thr Phe Glu Ser Asp Val Trp Ser Tyr Gly 300 305 310 atc ttc ctg tgg gaa ctg ttc tct ctg ggt tct tct ccg tac ccg ggt 1074 Ile Phe Leu Trp Glu Leu Phe Ser Leu Gly Ser Ser Pro Tyr Pro Gly 315 320 325 atg ccg gtt gac tct aaa ttc tac aaa atg atc aaa gaa ggt ttc cgt 1122 Met Pro Val Asp Ser Lys Phe Tyr Lys Met Ile Lys Glu Gly Phe Arg 330 335 340 345 atg ctg tct ccg gaa cac gcg ccg gcg gaa atg tac gac atc atg aaa 1170 Met Leu Ser Pro Glu His Ala Pro Ala Glu Met Tyr Asp Ile Met Lys 350 355 360 acc tgc tgg gac gcg gac ccg ctg aaa cgt ccg acc ttc aaa cag atc 1218 Thr Cys Trp Asp Ala Asp Pro Leu Lys Arg Pro Thr Phe Lys Gln Ile 365 370 375 gtt cag ctg atc gaa aaa cag atc tct gaa tct acc aac cac atc tac 1266 Val Gln Leu Ile Glu Lys Gln Ile Ser Glu Ser Thr Asn His Ile Tyr 380 385 390 tct aac ctg gcg aac tgc tct ccg aac cgt cag aaa tagtcgactg 1312 Ser Asn Leu Ala Asn Cys Ser Pro Asn Arg Gln Lys 395 400 405 aaaaaggaag agt 1325 <210> 65 <211> 405 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Protein Construct <400> 65 Met Gly His His His His His His Met Tyr Glu Val Gln Trp Lys Val 1 5 10 15 Val Glu Glu Ile Asn Gly Asn Asn Tyr Val Tyr Ile Asp Pro Thr Gln 20 25 30 Leu Pro Tyr Asp His Lys Trp Glu Phe Pro Arg Asn Arg Leu Ser Phe 35 40 45 Gly Lys Thr Leu Gly Ala Gly Ala Phe Gly Lys Val Val Glu Ala Thr 50 55 60 Ala Tyr Gly Leu Ile Lys Ser Asp Ala Ala Met Thr Val Ala Val Lys 65 70 75 80 Met Leu Lys Pro Ser Ala His Leu Thr Glu Arg Glu Ala Leu Met Ser 85 90 95 Glu Leu Lys Val Leu Ser Tyr Leu Gly Asn His Met Asn Ile Val Asn 100 105 110 Leu Leu Gly Ala Cys Thr Ile Gly Gly Pro Thr Leu Val Ile Thr Glu 115 120 125 Tyr Cys Cys Tyr Gly Asp Leu Leu Asn Phe Leu Arg Arg Lys Arg Asp 130 135 140 Ser Phe Ile Cys Ser Lys Gln Glu Asp His Ala Glu Ala Ala Leu Tyr 145 150 155 160 Lys Asn Leu Leu His Ser Lys Glu Ser Ser Cys Ser Asp Ser Thr Asn 165 170 175 Glu Tyr Met Asp Met Lys Pro Gly Val Ser Tyr Val Val Pro Thr Lys 180 185 190 Ala Asp Lys Arg Arg Ser Val Arg Ile Gly Ser Tyr Ile Glu Arg Asp 195 200 205 Val Thr Pro Ala Ile Met Glu Asp Asp Glu Leu Ala Leu Asp Leu Glu 210 215 220 Asp Leu Leu Ser Phe Ser Tyr Gln Val Ala Lys Gly Met Ala Phe Leu 225 230 235 240 Ala Ser Lys Asn Cys Ile His Arg Asp Leu Ala Ala Arg Asn Ile Leu 245 250 255 Leu Thr His Gly Arg Ile Thr Lys Ile Cys Asp Phe Gly Leu Ala Arg 260 265 270 Asp Ile Lys Asn Asp Ser Asn Tyr Val Val Lys Gly Asn Ala Arg Leu 275 280 285 Pro Val Lys Trp Met Ala Pro Glu Ser Ile Phe Asn Cys Val Tyr Thr 290 295 300 Phe Glu Ser Asp Val Trp Ser Tyr Gly Ile Phe Leu Trp Glu Leu Phe 305 310 315 320 Ser Leu Gly Ser Ser Pro Tyr Pro Gly Met Pro Val Asp Ser Lys Phe 325 330 335 Tyr Lys Met Ile Lys Glu Gly Phe Arg Met Leu Ser Pro Glu His Ala 340 345 350 Pro Ala Glu Met Tyr Asp Ile Met Lys Thr Cys Trp Asp Ala Asp Pro 355 360 365 Leu Lys Arg Pro Thr Phe Lys Gln Ile Val Gln Leu Ile Glu Lys Gln 370 375 380 Ile Ser Glu Ser Thr Asn His Ile Tyr Ser Asn Leu Ala Asn Cys Ser 385 390 395 400 Pro Asn Arg Gln Lys 405 <210> 66 <211> 14 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Peptide <400> 66 Lys Lys Lys Ser Pro Gly Glu Tyr Val Asn Ile Glu Phe Gly 1 5 10

Claims (42)

  1. 하기 화학식의 화합물, 그의 모든 염, 전구약물, 호변이성질체 및 이성질체:
    Figure 112007090494669-PCT00163
    상기 식에서,
    X1은 N 또는 CR2이고, X2는 N 또는 CR6이고, Y1은 N 또는 CR4이고, Y2는 N 또는 CR5이지만, X2, Y1 및 Y2 중 1개 이하가 N이고,
    L1은 임의로 치환된 저급 알킬렌, -S-, -O-, -C(O)-, -C(S)-, -S(O)-, -S(O)2- 및 -NR7-로 이루어지는 군 중에서 선택되고,
    L2는 결합, 임의로 치환된 저급 알킬렌, -(alk)a-S-(alk)b-, -(alk)a-O-(alk)b-, -(alk)a-OC(O)-(alk)b-, -(alk)a-C(O)O-(alk)b-, -(alk)a-OC(S)-(alk)b-, -(alk)a-C(S)O-(alk)b-, -(alk)a-C(O)-(alk)b-, -(alk)a-C(S)-(alk)b-, -(alk)a-C(O)NR9-(alk)b-, -(alk)a-OC(O)NR9-(alk)b-, -(alk)a-OC(S)NR9-(alk)b-, -(alk)a- C(S)NR9-(alk)b-, -(alk)a-S(O)-(alk)b-, -(alk)a-S(O)2-(alk)b-, -(alk)a-S(O)2NR9-(alk)b-, -(alk)a-NR9-(alk)b-, -(alk)a-NR9C(O)-(alk)b-, -(alk)a-NR9C(S)-(alk)b-, -(alk)a-NR9C(O)NR9-(alk)b-, -(alk)a-NR9C(S)NR9-(alk)b-, -(alk)a-NR9C(O)O-(alk)b-, -(alk)a-NR9C(S)O-(alk)b-, -(alk)a-NR9S(O)2-(alk)b- 및 -(alk)a-NR9S(O)2NR9-(alk)b-로 이루어지는 군 중에서 선택되고, 여기서 alk는 임의로 치환된 C1 -3 알킬렌이고, a 및 b는 독립적으로 0 또는 1이고,
    R1은 임의로 치환된 저급 알킬, 임의로 치환된 시클로알킬, 임의로 치환된 헤테로시클로알킬, 임의로 치환된 아릴 및 임의로 치환된 헤테로아릴로 이루어지는 군 중에서 선택되고,
    R2, R4, R5 및 R6은 수소, 할로겐, 임의로 치환된 저급 알킬, 임의로 치환된 저급 알케닐, 임의로 치환된 저급 알키닐, 임의로 치환된 시클로알킬, 임의로 치환된 헤테로시클로알킬, 임의로 치환된 아릴, 임의로 치환된 헤테로아릴, -OH, -NH2, -NO2, -CN, -C(O)OH, -C(S)OH, -C(O)NH2, -C(S)NH2, -S(O)2NH2, -NHC(O)NH2, -NHC(S)NH2, -NHS(O)2NH2, -NR10R11, -NHR3, -OR3, -SR3, -C(O)R3, -C(S)R3, -S(O)R3, -S(O)2R3, -C(O)OR3, -C(S)OR3, -C(O)NHR3, -C(O)NR3R3, -C(S)NHR3, -C(S)NR3R3, -S(O)2NHR3, -S(O)2NR3R3, -NHC(O)R3, -NR3C(O)R3, -NHC(S)R3, -NR3C(S)R3, -NHS(O)2R3, -NR3S(O)2R3, -NHC(O)OR3, -NR3C(O)OH, -NR3C(O)OR3, -NHC(S)OR3, -NR3C(S)OH, -NR3C(S)OR3, -NHC(O)NHR3, -NHC(O)NR3R3, -NR3C(O)NH2, -NR3C(O)NHR3, -NR3C(O)NR3R3, -NHC(S)NHR3, -NHC(S)NR3R3, -NR3C(S)NH2, -NR3C(S)NHR3, -NR3C(S)NR3R3, -NHS(O)2NHR3, -NHS(O)2NR3R3, -NR3S(O)2NH2, -NR3S(O)2NHR3 및 -NR3S(O)2NR3R3으로 이루어지는 군 중에서 독립적으로 선택되고,
    Ar1은
    Figure 112007090494669-PCT00164
    (이때,
    Figure 112007090494669-PCT00165
    는 L1의 부착 지점을 나타내고,
    Figure 112007090494669-PCT00166
    는 L2의 부착 지점을 나타내고, 여기서 표시된 N은 =N- 또는 -N=임)의 구조를 갖는 5 또는 6원의 임의로 치환된 헤테로아릴렌이고,
    n은 0 또는 1이고,
    F 및 J는 둘다 C이거나, F 및 J 중 하나는 C이고 F 및 J 중 다른 하나는 N이고,
    P 및 Q는 CR, N, NR, O 또는 S 중에서 독립적으로 선택되고,
    T는 CR 또는 N 중에서 선택되고,
    여기서, n이 1인 경우에는 F 및 J는 C이고 P, T 및 Q는 CR이거나, P, T 및 Q 중 임의의 하나는 N이고 P, T 및 Q 중 다른 2개는 CR이고,
    n이 0이고 F 및 J가 둘다 C인 경우에는 P 및 Q 중 하나는 CR, N 또는 NR이고 P 및 Q 중 다른 하나는 C, N, NR, O 또는 S이지만, P 및 Q가 둘다 CR인 것은 아니고,
    n이 0이고 F 및 J 중 하나는 N이고 F 및 J 중 다른 하나는 C인 경우에는 P 및 Q 중 하나는 N이고 P 및 Q 중 다른 하나는 CR이거나, P 및 Q가 둘다 CR이고,
    R은 수소, 또는 치환된 헤테로아릴렌의 치환체이고,
    R3은 각각 임의로 치환된 저급 알킬, 임의로 치환된 저급 알케닐 (단, 이때의 알켄 탄소는 임의의 -OR3, -SR3, -C(O)R3, -C(S)R3, -S(O)R3, -S(O)2R3, -C(O)OR3, -C(S)OR3, -C(O)NHR3, -C(O)NR3R3, -C(S)NHR3, -C(S)NR3R3, -S(O)2NHR3, -S(O)2NR3R3, -NHR3, -NHC(O)R3, -NR3C(O)R3, -NHC(S)R3, -NR3C(S)R3, -NHS(O)2R3, -NR3S(O)2R3, -NHC(O)OR3, -NR3C(O)OH, -NR3C(O)OR3, -NHC(S)OR3, -NR3C(S)OH, -NR3C(S)OR3, -NHC(O)NHR3, -NHC(O)NR3R3, -NR3C(O)NH2, -NR3C(O)NHR3, -NR3C(O)NR3R3, -NHC(S)NHR3, -NHC(S)NR3R3, -NR3C(S)NH2, -NR3C(S)NHR3, -NR3C(S)NR3R3, -NHS(O)2NHR3, -NHS(O)2NR3R3, -NR3S(O)2NH2, -NR3S(O)2NHR3 또는 -NR3S(O)2NR3R3의 임의의 -C(O)-, -C(S)-, -S(O)-, -S(O)2-, -O-, -S- 또는 -N-에 결합되지 않음), 임의로 치환된 저급 알키닐 (단, 이때의 알킨 탄소는 임의의 -OR3, -SR3, -C(O)R3, -C(S)R3, -S(O)R3, -S(O)2R3, -C(O)OR3, -C(S)OR3, -C(O)NHR3, -C(O)NR3R3, -C(S)NHR3, -C(S)NR3R3, -S(O)2NHR3, -S(O)2NR3R3, -NHR3, -NHC(O)R3, -NR3C(O)R3, -NHC(S)R3, -NR3C(S)R3, -NHS(O)2R3, -NR3S(O)2R3, -NHC(O)OR3, -NR3C(O)OH, -NR3C(O)OR3, -NHC(S)OR3, -NR3C(S)OH, -NR3C(S)OR3, -NHC(O)NHR3, -NHC(O)NR3R3, -NR3C(O)NH2, -NR3C(O)NHR3, -NR3C(O)NR3R3, -NHC(S)NHR3, -NHC(S)NR3R3, -NR3C(S)NH2, -NR3C(S)NHR3, -NR3C(S)NR3R3, -NHS(O)2NHR3, -NHS(O)2NR3R3, -NR3S(O)2NH2, -NR3S(O)2NHR3 또는 -NR3S(O)2NR3R3의 임의의 -C(O)-, -C(S)-, -S(O)-, -S(O)2-, -O-, -S- 또는 -N-에 결합되지 않음), 임의로 치환된 시클로알킬, 임의로 치환된 헤테로시클로알킬, 임의로 치환된 아릴 및 임의로 치환된 헤테로아릴로 이루어지는 군 중에서 독립적으로 선택되고,
    R7은 수소, 임의로 치환된 저급 알킬, 임의로 치환된 시클로알킬, 임의로 치환된 헤테로시클로알킬, 임의로 치환된 아릴, 임의로 치환된 헤테로아릴, -C(O)R8 및 -S(O)2R8로 이루어지는 군 중에서 선택되고,
    R8은 임의로 치환된 저급 알킬, 임의로 치환된 시클로알킬, 임의로 치환된 헤테로시클로알킬, 임의로 치환된 아릴 및 임의로 치환된 헤테로아릴로 이루어지는 군 중에서 선택되고,
    R9는 각각 수소, 저급 알킬, 및 플루오로, -OH, -NH2, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 플루오로 치환된 저급 알킬티오, 모노-알킬아미노, 플루오로 치환된 모노-알킬아미노, 디-알킬아미노, 플루오로 치환된 디-알킬아미노 및 -NR12R13으로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 치환된 저급 알킬로 이루어지는 군 중에서 독립적으로 선택되지만, 단, R9가 치환된 저급 알킬인 경우에는 -NR9-의 -N-에 결합된 알킬 탄소 상의 임의의 치환체는 플루오로이고,
    R10 및 R11은 각각 임의로 치환된 저급 알킬, 임의로 치환된 저급 알케닐 ( 단, 이때의 알켄 탄소는 -NR10R11의 질소에 결합되지 않음), 임의로 치환된 저급 알키닐 (단, 이때의 알킨 탄소는 -NR10R11의 질소에 결합되지 않음), 임의로 치환된 시클로알킬, 임의로 치환된 헤테로시클로알킬, 임의로 치환된 아릴 및 임의로 치환된 헤테로아릴로 이루어지는 군 중에서 독립적으로 선택되거나, 또는
    R10 및 R11은 그들이 부착된 질소와 함께 임의로 치환된 5 내지 7원의 모노시클릭 헤테로시클로알킬 또는 임의로 치환된 5 또는 7원의 모노시클릭 질소 함유 헤테로아릴을 형성하고,
    R12 및 R13은 그들이 부착된 질소와 결합하여 5 내지 7원의 헤테로시클로알킬, 또는 플루오로, -OH, -NH2, 저급 알킬, 플루오로 치환된 저급 알킬, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 및 플루오로 치환된 저급 알킬티오로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 치환된 5 내지 7원의 헤테로시클로알킬을 형성하지만,
    단, 화합물이
    Figure 112007090494669-PCT00167
    의 구조를 갖고, L1a가 -CH2-, -CH(OH)- 또는 -C(O)-인 경우에는, R1a는 페닐, 4-트리플루오로메틸-페닐, 4-메톡시-페닐, 4-클로로-페닐, 4-플루오로-페닐, 4-메틸-페닐, 3-플루오로-페닐 또는 티오 펜-2-일이 아니며, 화합물은
    Figure 112007090494669-PCT00168
    ,
    Figure 112007090494669-PCT00169
    또는
    Figure 112007090494669-PCT00170
    의 구조를 갖지 않는다.
  2. 제1항에 있어서, X1 및 X2가 CH인 화합물.
  3. 제2항에 있어서, Y1이 N 또는 CH이고, Y2가 CR5인 화합물.
  4. 제3항에 있어서, Y1이 CH이고, R5가 수소 이외의 것인 화합물.
  5. 제4항에 있어서, L1이 -CH2- 또는 C(O)-인 화합물.
  6. 제3항에 있어서, Y1이 CH이고, R5가 수소인 화합물.
  7. 제6항에 있어서, L1이 -CH2- 또는 C(O)-인 화합물.
  8. 제2항에 있어서, Y2가 N 또는 CH이고, Y1이 CR4인 화합물.
  9. 제8항에 있어서, Y2가 CH이고, R4가 수소 이외의 것인 화합물.
  10. 제9항에 있어서, L1이 -CH2- 또는 C(O)-인 화합물.
  11. 제8항에 있어서, Y2가 CH이고, R4가 수소인 화합물.
  12. 제11항에 있어서, L1이 -CH2- 또는 -C(O)-인 화합물.
  13. 제1항에 있어서, 하기 화학식의 화합물, 그의 모든 염, 전구약물, 호변이성질체 및 이성질체:
    Figure 112007090494669-PCT00171
    상기 식에서,
    V 및 W는 N 및 CH로 이루어지는 군 중에서 독립적으로 선택되고,
    U 및 Z는 N 및 CR18로 이루어지는 군 중에서 독립적으로 선택되지만, W, U 및 Z 중 1개 이하가 N이고,
    A는 -CR19R20-, -C(O)-, -C(S)-, -S-, -S(O)-, -S(O)2-, -NR21- 및 -O-로 이루어지는 군 중에서 선택되고,
    n은 0 또는 1이고,
    F 및 J는 둘다 C이거나, F 및 J 중 하나는 C이고 F 및 J 중 다른 하나는 N이고,
    E 및 K는 C, N, O 또는 S로부터 선택되고,
    G는 C 또는 N으로부터 선택되고,
    여기서, n이 1인 경우에는 F 및 J는 C이고 E, G 및 K는 C이거나, E, G 및 K 중 임의의 하나는 N이고 E, G 및 K 중 다른 2개는 C이지만, E, G 또는 K가 N인 경우에는 각각 R15, R17 및 R16이 부재하고,
    n이 O이고 F 및 J가 둘다 C인 경우에는 E 및 K 중 하나는 C 또는 N이고 E 및 K 중 다른 하나는 C, N, O 또는 S이지만, E 및 K가 둘다 C인 것은 아니고, E 및 K가 둘다 N인 경우에는 R15 및 R16 중 하나가 부재하지만, E 및 K 중 하나가 N이고 다른 하나가 O 또는 S인 경우에는 R15 및 R16이 부재하고,
    n이 O이고, F 및 J 중 하나는 N이고 F 및 J 중 다른 하나는 C인 경우에는 E 및 K 중 하나는 N이고 E 및 K 중 다른 하나는 C이거나, E 및 K가 둘다 C이지만, E가 N인 경우에는 R15가 부재하고, K가 N인 경우에는 R16이 부재하고,
    R1은 임의로 치환된 저급 알킬, 임의로 치환된 시클로알킬, 임의로 치환된 헤테로시클로알킬, 임의로 치환된 아릴 및 임의로 치환된 헤테로아릴로 이루어지는 군 중에서 선택되고,
    R15는 E가 C인 경우에는 수소, 임의로 치환된 저급 알킬, -OR22, -SR22 및 할로겐으로 이루어지는 군 중에서 선택되고, E가 O 또는 S인 경우 또는 n=1이고 E가 N인 경우에는 부재하고, n=0이고 E가 N인 경우에는 부재하거나 수소 및 임의로 치환된 저급 알킬로 이루어지는 군 중에서 선택되고,
    R16은 K가 C인 경우에는 수소, 임의로 치환된 저급 알킬, -OR22, -SR22 및 할로겐으로 이루어지는 군 중에서 선택되고, K가 O 또는 S인 경우 또는 n=1이고 K가 N인 경우에는 부재하고, n=0이고 K가 N인 경우에는 부재하거나 수소 및 임의로 치 환된 저급 알킬로 이루어지는 군 중에서 선택되고,
    R17은 G가 C인 경우에는 수소, 임의로 치환된 저급 알킬, -OR22, -SR22 및 할로겐으로 이루어지는 군 중에서 선택되거나, G가 N인 경우에는 부재하고,
    R18은 수소, 할로겐, 임의로 치환된 저급 알킬, 임의로 치환된 아릴, 임의로 치환된 헤테로아릴, -OH, -NH2, -NO2, -CN, -NHC(O)NH2, -NHC(S)NH2, -NHS(O)2NH2, -NR24R25, -NHR23, -OR23, -SR23, -NHC(O)R23, -NR23C(O)R23, -NHC(S)R23, -NR23C(S)R23, -NHS(O)2R23, -NR23S(O)2R23, -NHC(O)NHR23, -NR23C(O)NH2, -NR23C(O)NHR23, -NHC(O)NR23R23, -NR23C(O)NR23R23, -NHC(S)NHR23, -NR23C(S)NH2, -NR23C(S)NHR23, -NHC(S)NR23R23, -NR23C(S)NR23R23, -NHS(O)2NHR23, -NR23S(O)2NH2, -NR23S(O)2NHR23, -NHS(O)2NR23R23 및 -NR23S(O)2NR23R23으로 이루어지는 군 중에서 선택되고,
    M은 결합, -(CR19R20)u-, -(CR19R20)t-C(O)-(CR19R20)s-, -(CR19R20)t-C(S)-(CR19R20)s-, -(CR19R20)t-C(O)O-(CR19R20)s-, -(CR19R20)t-C(S)O-(CR19R20)s-, -(CR19R20)t-C(O)NR26-(CR19R20)s-, -(CR19R20)t-C(S)NR26-(CR19R20)s-, -(CR19R20)t-S(O)-(CR19R20)s-, -(CR19R20)t-S(O)2-(CR19R20)s-, -(CR19R20)t-S(O)2NR26-(CR19R20)s-, -(CR19R20)t-O-(CR19R20)s-, -(CR19R20)t-OC(O)-(CR19R20)s-, -(CR19R20)t-OC(S)-(CR19R20)s-, -(CR19R20)t-OC(O)NR26-(CR19R20)s-, -(CR19R20)t-OC(S)NR26-(CR19R20)s-, -(CR19R20)t-S-(CR19R20)s-, -(CR19R20)t-NR26-(CR19R20)s-, -(CR19R20)t-NR26C(O)-(CR19R20)s-, -(CR19R20)t-NR26C(S)-(CR19R20)s-, -(CR19R20)t-NR26C(O)O-(CR19R20)s-, -(CR19R20)t-NR26C(S)O-(CR19R20)s-, -(CR19R20)t-NR26C(O)NR26-(CR19R20)s-, -(CR19R20)t-NR26C(S)NR26-(CR19R20)s-, -(CR19R20)t-NR26S(O)2-(CR19R20)s- 및 -(CR19R20)t-NR26S(O)2NR26-(CR19R20)s-으로 이루어지는 군 중에서 선택되고,
    여기서, R19 및 R20은 각각 수소, 플루오로, -OH, -NH2, 저급 알킬, 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 모노-알킬아미노, 디-알킬아미노 및 -NR27R28로 이루어지는 군 중에서 독립적으로 선택되고, 여기서 저급 알킬, 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 모노-알킬아미노 또는 디-알킬아미노의 알킬 사슬(들)은 플루오로, -OH, -NH2, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 플루오로 치환된 저급 알킬티오, 모노-알킬아미노, 디-알킬아미노 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에 서 선택되는 하나 이상의 치환체로 임의로 치환되거나, 또는
    동일하거나 상이한 탄소 상의 임의의 2개의 R19및 R20은 결합하여 3 내지 7원의 모노시클릭 시클로알킬 또는 5 내지 7원의 모노시클릭 헤테로시클로알킬을 형성하고, 임의의 다른 R19및 R20은 수소, 플루오로, -OH, -NH2, 저급 알킬, 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 모노-알킬아미노, 디-알킬아미노 및 -NR27R28로 이루어지는 군 중에서 독립적으로 선택되고, 여기서 저급 알킬, 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 모노-알킬아미노 또는 디-알킬아미노의 알킬 사슬(들)은 플루오로, -OH, -NH2, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 플루오로 치환된 저급 알킬티오, 모노-알킬아미노, 디-알킬아미노 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 임의로 치환되고, 여기서 모노시클릭 시클로알킬 또는 모노시클릭 헤테로시클로알킬은 할로겐, -OH, -NH2, 저급 알킬, 플루오로 치환된 저급 알킬, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 플루오로 치환된 저급 알킬티오, 모노-알킬아미노, 디-알킬아미노 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 임의로 치환되고,
    R21 및 R22는 각각 독립적으로 수소 또는 임의로 치환된 저급 알킬이고,
    R23은 각각 임의로 치환된 저급 알킬, 임의로 치환된 저급 알케닐 (단, 이때의 알켄 탄소는 임의의 -NHR23, -OR23, -SR23, -NHC(O)R23, -NR23C(O)R23, -NHC(S)R23, -NR23C(S)R23, -NHS(O)2R23, -NR23S(O)2R23, -NHC(O)NHR23, -NR23C(O)NH2, -NR23C(O)NHR23, -NHC(O)NR23R23, -NR23C(O)NR23R23, -NHC(S)NHR23, -NR23C(S)NH2, -NR23C(S)NHR23, -NHC(S)NR23R23, -NR23C(S)NR23R23, -NHS(O)2NHR23, -NR23S(O)2NH2, -NR23S(O)2NHR23, -NHS(O)2NR23R23 또는 -NR23S(O)2NR23R23의 임의의 -C(O)-, -C(S)-, -S(O)2-, -O-, -S- 또는 -N-에 결합되지 않음), 임의로 치환된 저급 알키닐 (단, 이때의 알킨 탄소는 임의의 -NHR23, -OR23, -SR23, -NHC(O)R23, -NR23C(O)R23, -NHC(S)R23, -NR23C(S)R23, -NHS(O)2R23, -NR23S(O)2R23, -NHC(O)NHR23, -NR23C(O)NH2, -NR23C(O)NHR23, -NHC(O)NR23R23, -NR23C(O)NR23R23, -NHC(S)NHR23, -NR23C(S)NH2, -NR23C(S)NHR23, -NHC(S)NR23R23, -NR23C(S)NR23R23, -NHS(O)2NHR23, -NR23S(O)2NH2, -NR23S(O)2NHR23, -NHS(O)2NR23R23 또는 -NR23S(O)2NR23R23의 임의의 -C(O)-, -C(S)-, -S(O)-, -S(O)2-, -O-, -S- 또는 -N-에 결합되지 않음), 임의로 치환된 시클로알킬, 임의로 치환된 헤테로시클로알킬, 임의로 치환된 아릴 및 임의로 치환된 헤테로아릴로 이루어지는 군 중에서 독립적으로 선택되고,
    R24 및 R25는 각각 임의로 치환된 저급 알킬, 임의로 치환된 저급 알케닐 ( 단, 이때의 알켄 탄소는 -NR24R25의 질소에 결합되지 않음), 임의로 치환된 저급 알키닐 (단, 이때의 알킨 탄소는 -NR24R25의 질소에 결합되지 않음), 임의로 치환된 시클로알킬, 임의로 치환된 헤테로시클로알킬, 임의로 치환된 아릴 및 임의로 치환된 헤테로아릴로 이루어지는 군 중에서 독립적으로 선택되거나, 또는
    R24 및 R25는 그들이 부착된 질소와 함께 임의로 치환된 5 내지 7원의 모노시클릭 헤테로시클로알킬 또는 임의로 치환된 5 또는 7원의 모노시클릭 질소 함유 헤테로아릴을 형성하고,
    R26은 각각 수소, 저급 알킬, 및 플루오로, -OH, -NH2, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 플루오로 치환된 저급 알킬티오, 모노-알킬아미노, 플루오로 치환된 모노-알킬아미노, 디-알킬아미노, 플루오로 치환된 디-알킬아미노 및 -NR27R28로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 치환된 저급 알킬로 이루어지는 군 중에서 독립적으로 선택되지만, R26이 치환된 저급 알킬인 경우에는 -NR26-의 -N-에 결합된 저급 알킬 탄소 상의 임의의 치환체는 플루오로이고,
    R27 및 R28은 그들이 부착된 질소와 결합하여 5 내지 7원의 헤테로시클로알킬, 또는 플루오로, -OH, -NH2, 저급 알킬, 플루오로 치환된 저급 알킬, 저급 알콕 시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 및 플루오로 치환된 저급 알킬티오로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 치환된 5 내지 7원의 헤테로시클로알킬을 형성하고,
    u는 1 내지 6이고,
    t는 0 내지 3이고,
    s는 0 내지 3이고,
    단, V, W, U 및 Z가 CH이고 n=1이고 E, F, G, J 및 K가 C이고 R15, R16 및 R17이 H이고 A가 -CH2-, -CH(OH)- 또는 -C(O)-이고 M이 -NHCH2-인 경우, R1은 페닐, 4-트리플루오로메틸-페닐, 4-메톡시-페닐, 4-클로로-페닐, 4-플루오로-페닐, 4-메틸-페닐, 3-플루오로-페닐 또는 티오펜-2-일이 아니고,
    V, W, U 및 Z가 CH이고 n=1이고 E, F, G, J 및 K가 C이고 R15, R16 및 R17이 H이고 A가 -CH2-인 경우, M-R1은 -NHCH2CH(CH3)2이 아니고,
    V, W 및 U가 CH이고 n=1이고 E, F, G, J 및 K가 C이고 R15, R16 및 R17이 H이고 A가 -CH2-이고 M-R1이 -OCH3이고 Z가 CR18인 경우, R18은 티오펜-3-일이 아니고,
    V, W 및 U가 CH이고 n=0이고 F, J 및 K가 C이고 E가 N이고 R15가 CH3이고 R16 이 H이고 A가 -C(O)-이고 M-R1이 -CH(CH3)3이고 Z가 CR18인 경우, R18은 3-((E)-2-카르복시-비닐)페닐이 아니다.
  14. 제13항에 있어서, V 및 W가 CH인 화합물.
  15. 제14항에 있어서, U 및 Z가 독립적으로 CR18인 화합물.
  16. 제15항에 있어서, n이 1인 화합물.
  17. 제16항에 있어서, G 및 K가 C인 화합물.
  18. 제17항에 있어서, E가 N인 화합물.
  19. 제17항에 있어서, E가 C인 화합물.
  20. 제1항에 있어서, 하기 구조의 화합물, 그의 모든 염, 전구약물, 호변이성질체 및 이성질체:
    Figure 112007090494669-PCT00172
    상기 식에서,
    Z1은 N 및 CR34로 이루어지는 군 중에서 선택되고,
    U1은 N 및 CR35로 이루어지는 군 중에서 선택되고,
    A1은 -CH2- 및 -C(O)-로 이루어지는 군 중에서 선택되고,
    M3은 결합, -NR39-, -S-, -O-, -NR39CH2-, -NR39CH(R40)-, -SCH2-, -OCH2-, -C(O)NR39-, -S(O)2NR39-, -CH2NR39-, -CH(R40)NR39-, -NR39C(O)- 및 -NR39S(O)2-로 이루어지는 군 중에서 선택되고,
    n은 0 또는 1이고,
    v는 0, 1, 2 또는 3이고,
    F1 및 J1은 둘다 C이거나, F1 및 J1 중 하나는 C이고 F1 및 J1 중 다른 하나는 N이고,
    E1 및 K1은 C, N, O 또는 S로부터 선택되고,
    G1은 C 또는 N으로부터 선택되고,
    여기서, n이 1인 경우에는 F1 및 J1은 C이고 E1, G1 및 K1은 C이거나, E1, G1 및 K1 중 임의의 하나는 N이고 E1, G1 및 K1 중 다른 2개는 C이지만, E1, G1 또는 K1이 N인 경우에는 각각 R36, R37 및 R38이 부재하고,
    n이 0이고 F1 및 J1이 둘다 C인 경우에는 E1 및 K1 중 하나는 C 또는 N이고 E1 및 K1 중 다른 하나는 C, N, O 또는 S이지만, E1 및 K1이 둘다 C인 것은 아니고, E1 및 K1이 둘다 N인 경우에는 R36 및 R37 중 하나가 부재하지만, E1 및 K1 중 하나가 N이고 다른 하나가 O 또는 S인 경우에는 R36 및 R37이 부재하고,
    n이 0이고 F1 및 J1 중 하나는 N이고 F1 및 J1 중 다른 하나는 C인 경우에는 E1 및 K1 중 하나는 N이고 E1 및 K1 중 다른 하나는 C이거나, E1 및 K1이 둘다 C이지만, E1이 N인 경우에는 R36이 부재하고, K1이 N인 경우에는 R37이 부재하고,
    Cy는 시클로알킬, 헤테로시클로알킬, 아릴 및 헤테로아릴로 이루어지는 군 중에서 선택되고,
    R34 및 R35는 수소, -OR41, -SR41, -NHR41, -NR41R41, -NR39C(O)R41, -NR39S(O)2R41, 할로겐, 저급 알킬, 시클로알킬, 헤테로시클로알킬, 아릴 및 헤테로아릴로 이루어지는 군 중에서 독립적으로 선택되고, 여기서 저급 알킬은 플루오로, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 플루오로 치환된 저급 알킬티오, 모노-알킬아미노, 디-알킬아미노, 시클로알킬, 헤테로시클로알킬, 아릴 및 헤테로아릴로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 임의로 치환되고, 여기서 R34 또는 R35로서 또는 저급 알킬의 치환체로서의 시클로알킬, 헤테로시클로알킬, 아릴 및 헤테로아릴은 -OH, -NH2, -CN, -NO2, -S(O)2NH2, -C(O)NH2, -OR42, -SR42, -NHR42, -NR42R42, -NR39C(O)R42, -NR39S(O)2R42, -S(O)2R42, 할로겐, 저급 알킬, 플루오로 치환된 저급 알킬 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 임의로 치환되고,
    R45는 각각 -OR41, -SR41, -NHR41, -NR41R41, -NR39C(O)R41, -NR39S(O)2R41, 할로겐, 저급 알킬, 시클로알킬, 헤테로시클로알킬, 아릴 및 헤테로아릴로 이루어지는 군 중에서 독립적으로 선택되고, 여기서 저급 알킬은 플루오로, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 플루오로 치환된 저급 알킬티오, 모노-알킬아미노, 디-알킬아미노, 시클로알킬, 헤테로시클로알킬, 아릴 및 헤테로아릴로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 임의로 치환되고, 여기서 R45로서 또는 저급 알킬의 치환체로서의 시클로알킬, 헤테로시클로알킬, 아릴 및 헤테로아릴은 -OH, -NH2, -CN, -NO2, -S(O)2NH2, -C(O)NH2, -OR42, -SR42, -NHR42, -NR42R42, -NR39C(O)R42, -NR39S(O)2R42, -S(O)2R42, 할로겐, 저급 알킬, 플루오로 치환된 저급 알킬 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 임의로 치환되고,
    R36은 E1이 C인 경우에는 수소, 할로겐, 저급 알킬, 플루오로 치환된 저급 알킬, 저급 알콕시, 및 플루오로 치환된 저급 알콕시로 이루어지는 군 중에서 선택되고, E1이 O 또는 S인 경우 또는 n=1이고 E1이 N인 경우에는 부재하며, n=0이고 E1이 N인 경우에는 부재하거나 수소, 저급 알킬, 및 플루오로 치환된 저급 알킬로 이루어지는 군 중에서 선택되고,
    R37은 K1이 C인 경우에는 수소, 할로겐, 저급 알킬, 플루오로 치환된 저급 알킬, 저급 알콕시, 및 플루오로 치환된 저급 알콕시로 이루어지는 군 중에서 선택되고, K1이 O 또는 S인 경우 또는 n=1이고 K1이 N인 경우에는 부재하고, n=0이고 K1이 N인 경우에는 부재하거나 수소, 저급 알킬, 및 플루오로 치환된 저급 알킬로 이루어지는 군 중에서 선택되고,
    R38은 G1이 C인 경우에는 수소, 할로겐, 저급 알킬, 플루오로 치환된 저급 알킬, 저급 알콕시, 및 플루오로 치환된 저급 알콕시로 이루어지는 군 중에서 선택되거나, G1이 N인 경우에는 부재하며,
    R39는 각각 수소 및 저급 알킬로 이루어지는 군 중에서 독립적으로 선택되고,
    R40은 저급 알킬, 및 플루오로 치환된 저급 알킬로 이루어지는 군 중에서 선택되고,
    R41은 저급 알킬, 시클로알킬, 헤테로시클로알킬, 아릴 및 헤테로아릴로 이루어지는 군 중에서 선택되고, 여기서 저급 알킬은 플루오로, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 플루오로 치환된 저급 알킬티오, 모노-알킬아미노, 디-알킬아미노, 시클로알킬, 헤테로시클로알킬, 아릴 및 헤테로아릴로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 임의로 치환되고, 여기서 R41로서 또는 저급 알킬의 치환체로서의 시클로알킬, 헤테로시클로알킬, 아릴 및 헤테로아릴은 -OH, -NH2, -CN, -NO2, -S(O)2NH2, -C(O)NH2, -OR42, -SR42, -NHR42, -NR42R42, -NR39C(O)R42, -NR39S(O)2R42, -S(O)2R42, 할로겐, 저급 알킬, 플루오로 치환된 저급 알킬 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 임의로 치환되고,
    R42는 각각 저급 알킬, 헤테로시클로알킬 및 헤테로아릴로 이루어지는 군 중에서 독립적으로 선택되고, 여기서 저급 알킬은 플루오로, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 플루오로 치환된 저급 알킬티오, 모노-알킬아 미노, 디-알킬아미노 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 임의로 치환된다.
  21. 제20항에 있어서, 각각의 R45는 -OH, -NH2, -CN, -NO2, 할로겐, 저급 알킬, 플루오로 치환된 저급 알킬, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 티오알킬, 플루오로 치환된 저급 티오알킬, 모노-알킬아미노, 디-알킬아미노 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택되고,
    Z1은 CR34이고, U1은 CR35이고,
    R34 및 R35는 수소, -OR41, 할로겐, 저급 알킬, 시클로알킬, 헤테로시클로알킬, 아릴 및 헤테로아릴로 이루어지는 군 중에서 독립적으로 선택되고,
    여기서 시클로알킬, 헤테로시클로알킬, 아릴 및 헤테로아릴은 -OH, -NH2, -CN, -NO2, -S(O)2NH2, -C(O)NH2, -OR42, -SR42, -NHR42, -NR42R42, -NR39C(O)R42, -NR39S(O)2R42, -S(O)2R42, 할로겐, 저급 알킬, 플루오로 치환된 저급 알킬 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 임의로 치환되고,
    여기서 저급 알킬은 플루오로, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 플루오로 치환된 저급 알킬티오, 모노-알킬아미노, 디-알킬아미노 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 임의로 치환되는 것인 화합물.
  22. 제21항에 있어서, v가 0, 1 또는 2인 화합물.
  23. 제22항에 있어서, n이 1이고, G1 및 K1이 C인 화합물.
  24. 제23항에 있어서, E1이 N인 화합물.
  25. 제23항에 있어서, E1이 C인 화합물.
  26. 제25항에 있어서, M3이 -NR39-, -O-, -NR39CH2-, -NR39CH(R40)-, -SCH2-, -OCH2-, -CH2NR39-, -NR39C(O)- 및 -NR39S(O)2-로 이루어지는 군 중에서 선택되는 것인 화합물.
  27. 제26항에 있어서, M3이 -NR39CH2-, -NR39CH(R40)-, -SCH2-, -OCH2- 및 -CH2NR39- 로 이루어지는 군 중에서 선택되는 것인 화합물.
  28. 제27항에 있어서, R34 및 R35가 둘다 수소인 화합물.
  29. 제27항에 있어서, R34 및 R35 중 하나는 수소이고,
    R34 및 R35 중 다른 하나는 할로겐, 저급 알킬, 저급 알콕시, 아릴 및 헤테로아릴로 이루어지는 군 중에서 선택되고,
    여기서 아릴 및 헤테로아릴은 -OH, -NH2, -CN, -NO2, -S(O)2NH2, -C(O)NH2, -OR42, -SR42, -NHR42, -NR42R42, -NR39C(O)R42, -NR39S(O)2R42, -S(O)2R42, 할로겐, 저급 알킬, 플루오로 치환된 저급 알킬 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 임의로 치환되고,
    여기서 저급 알킬 및 저급 알콕시는 플루오로, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 플루오로 치환된 저급 알킬티오, 모노-알킬아미노, 디-알킬아미노 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 임의로 치환되는 것인 화합물.
  30. 제29항에 있어서, R34가 수소인 화합물.
  31. 제29항에 있어서, R34 및 R35 중 하나는 수소이고,
    R34 및 R35 중 다른 하나는 할로겐, 저급 알킬 및 저급 알콕시로 이루어지는 군 중에서 선택되고,
    여기서 저급 알킬 및 저급 알콕시는 플루오로, 저급 알콕시, 플루오로 치환된 저급 알콕시, 저급 알킬티오, 플루오로 치환된 저급 알킬티오, 모노-알킬아미노, 디-알킬아미노 및 시클로알킬아미노로 이루어지는 군 중에서 선택되는 하나 이상의 치환체로 임의로 치환되는 것인 화합물.
  32. 제31항에 있어서, R34가 수소인 화합물.
  33. 제약상 허용되는 담체, 및 제1항의 화합물을 포함하는 조성물.
  34. 제약상 허용되는 담체, 및 제13항의 화합물을 포함하는 조성물.
  35. 제약상 허용되는 담체, 및 제20항의 화합물을 포함하는 조성물.
  36. c-kit 또는 c-fms 매개 질환 또는 상태에 걸려 있거나 그러한 위험이 있는 대상에게 유효량의 제1항의 화합물을 투여하는 것을 포함하는, c-kit 또는 c-fms 매개 질환 또는 상태에 걸려 있거나 그러한 위험이 있는 대상의 치료 방법.
  37. c-kit 또는 c-fms 매개 질환 또는 상태에 걸려 있거나 그러한 위험이 있는 대상에게 유효량의 제13항의 화합물을 투여하는 것을 포함하는, c-kit 또는 c-fms 매개 질환 또는 상태에 걸려 있거나 그러한 위험이 있는 대상의 치료 방법.
  38. c-kit 또는 c-fms 매개 질환 또는 상태에 걸려 있거나 그러한 위험이 있는 대상에게 유효량의 제20항의 화합물을 투여하는 것을 포함하는, c-kit 또는 c-fms 매개 질환 또는 상태에 걸려 있거나 그러한 위험이 있는 대상의 치료 방법.
  39. 제36항 내지 제38항 중 어느 한 항에 있어서, 화합물이 인간 투여에 대해 승인된 것인 방법.
  40. 제39항에 있어서, 질환 또는 상태가 비만 세포 종양, 소세포(small cell) 폐암, 고환암, 위장관 기질 종양, 교아세포종, 성상세포종, 신경아세포종, 여성 생식관의 암종, 신경외배엽 기원의 육종, 결장직장 암종, 상피내 암종(carcinoma in situ), 신경섬유종증과 연관된 쉬반(Schwann) 세포 신생물, 급성 골수성 백혈병, 급성 림프성 백혈병, 만성 골수성 백혈병, 다발 골수종, 비만세포증, 흑색종, 유방암, 난소암, 개 비만 세포 종양, 비대증, 천식, 류마티스성 관절염, 알러지성 비염, 다발 경화증, 염증성 대장 증후군, 이식 거부, 전신 홍반 루푸스, 베게너 (Wegener) 육아종증, 만성 폐쇄성 폐질환, 폐기종, 죽상경화증, 인슐린 내성, 과혈당증, 지질분해, 과다호산구증가증, 골다공증, 골절 위험 증가, 고칼슘혈증, 뼈 전이, 사구체신염, 간질 신장염, 루푸스 신장염, 세뇨관 괴사 및 당뇨병-관련 신장 합병증으로 이루어지는 군 중에서 선택되는 것인 방법.
  41. 제33항 내지 제35항 중 어느 한 항에 따른 조성물을 포함하는 키트.
  42. 제41항에 있어서, 조성물이 비만 세포 종양, 소세포 폐암, 고환암, 위장관 기질 종양, 교아세포종, 성상세포종, 신경아세포종, 여성 생식관의 암종, 신경외배엽 기원의 육종, 결장직장 암종, 상피내 암종, 신경섬유종증과 연관된 쉬반 세포 신생물, 급성 골수성 백혈병, 급성 림프성 백혈병, 만성 골수성 백혈병, 다발 골수종, 비만세포증, 흑색종, 유방암, 난소암, 개 비만 세포 종양, 비대증, 천식, 류마티스성 관절염, 알러지성 비염, 다발 경화증, 염증성 대장 증후군, 이식 거부, 전신 홍반 루푸스, 베게너 육아종증, 만성 폐쇄성 폐질환, 폐기종, 죽상경화증, 인슐린 내성, 과혈당증, 지질분해, 과다호산구증가증, 골다공증, 골절 위험 증가, 고칼슘혈증, 뼈 전이, 사구체신염, 간질 신장염, 루푸스 신장염, 세뇨관 괴사 및 당뇨병-관련 신장 합병증으로 이루어지는 군 중에서 선택되는 의학적 증상에 대해 승인된 것인 키트.
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