KR102446839B1 - B-Raf 억제제와 제2 억제제를 포함하는 조합 요법 - Google Patents

B-Raf 억제제와 제2 억제제를 포함하는 조합 요법 Download PDF

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Abstract

환자로부터 종양 표본을 수득하고, BRAF, CRAF, CCND1, CDK4, HER2, IGF-1R, cMET, FGFR1, FGFR2, FGFR3 EGFR, MAP2K1, MAP2K2, NRAS, KRAS HRAS, PTEN, PIK3CA 및 P16을 포함하는 유전자 패널에서의 유전적 변형에 대해 이를 시험하고, 그리고 B-Raf 억제제 및 B-Raf 억제제에 대한 내성을 극복하는 제2 억제제(이때 제2 억제제는 종양 표본에서 발견되는 유전적 변형에 기초하여 선택된다)를 포함하는 약물 조합 요법을 투여함으로써, 증식성 질환의 치료를 위한 B-Raf 억제제에 대한 내성을 반전시키는 방법.

Description

B-Raf 억제제와 제2 억제제를 포함하는 조합 요법{COMBINATION THERAPY COMPRISING A B-RAF INHIBITOR AND A SECOND INHIBITOR}
본 발명은 B-Raf에서의 돌연변이를 특징으로 하는 증식성 질환을 앓는 환자를 치료하기 위한 제2 억제제와 조합된 B-Raf 억제제의 용도에 관한 것으로, 이때 상기 제2 억제제는 종양 표본에서 확인되는 유전적 변형에 기초하여 선택된다.
흑색종의 발전과 관련된 분자량 변화의 이해에 있어서 중요한 진전이 있어왔다. RAF/MEK/ERK 경로의 세린-트레오닌 단백질 키나아제인 B-RAF의 발암 돌연변이는 특히 흑색종에서 일반적이며, 흑색종의 40 내지 60%가 B-RAF 유전자의 활성화 돌연변이를 갖는다. 아미노산 600(V600E 돌연변이)에서 발린에 대한 글루탐산의 치환은 보고된 B-Raf에서의 돌연변이의 95% 이상을 나타낸다. 이 돌연변이는 구조적으로 암 세포 증식과 생존 신호를 보내는 RAF/MEK/ERK 경로에서 B-Raf 및 다운스트림 신호 전달을 활성화한다. 흑색종 이외에도, 이러한 B-Raf에서의 돌연변이는 다른 증식성 질환 예를 들면 대장암, 갑상선암, 특히 유두 갑상선암, 성상 세포종, 췌장암 및 신경 섬유종에서 발생하는 것으로 알려져 있다. 상기 질환을 B-Raf 억제제로 처리할 때 극적인 결과가 발생하는 것으로 알려져 있지만, 전형적으로 B-Raf 억제제 치료에 대한 내성이 발달하며 종종 매우 짧은 시간 내에 발생한다.
B-Raf 억제제 치료에 대한 내성에는 여러 경로가 있다. 주요 메커니즘은 B-Raf 억제제의 존재 하에서 RAF/MEK/ERK 신호전달 경로를 재활성화시키는 것이다. 이러한 재활성화는 유전자 증폭 및 과발현 및/또는 리간드 생성을 통한 수용체 티로신 키나아제(RTK)의 증가된 활성, NRAS 및 MEK1 유전자의 돌연변이 수득, COT 및 RAF-1(CRAF) 등 키나아제의 과발현을 통한 BRAF의 우회, 돌연변이 BRAF 대립 유전자의 스플라이스 변종의 발현, 및 예컨대 유전자 증폭으로 인한 돌연변이 BRAF 대립 유전자의 발현 증가를 통해 발생할 수 있다. PDGFR-β 및 IGF-IR 등 RTK의 활성화 또는 PTEN 유전자의 손실을 통한 MAPK 경로로부터 구별되는 PIK3Cα 신호화 시스템과 같은 생존 경로의 활성화가 또한 내성 역할을 할 수 있다. 다른 메커니즘은, c-Met 및 RTK의 FGFR 패밀리를 통해, 여러 흑색종의 B-Raf 억제제에 대한 내성을 촉진할 수 있는 잠재적인 메커니즘이다.
B-Raf 억제제 치료에 대한 재발 후 조기에 합리적인 병용 요법을 개시하기 위해, 상기 기재된 내용은 실시간으로 내성 메커니즘을 확인하는 것의 중요성을 기술하고 있다. 예비-치료 대비 재발시 환자의 종양에 존재하는 유전적 변형의 비교를 통한 메커니즘-기반 접근법을 사용하여, 가능한 내성 메커니즘을 확인할 수 있어야 한다. 이는 더 나은 우회 내성을 회피하기 위해 개별 환자에 적절한 약물 조합 요법을 선택하는 데 도움이 된다. 본 발명은 B-Raf 억제제에 대한 내성의 발달 후 매우 불량한 예후를 갖는 BRAF-돌연변이 진전된 또는 전이성 흑색종 환자의 치료 선택권을 확장하고 향상시키기 위한 메커니즘-기반 조합 치료 요법에 관한 것이다.
간단한 설명
본 발명은 B-Raf 억제제에 의한 B-Raf에서의 돌연변이를 특징으로 하는 증식성 질환을 앓는 환자의 치료에 관한 것으로, 이때 B-Raf 억제제에 대한 내성은
(a) 환자로부터 취한 종양 표본에서 유전적 변형을 결정하고,
(b) 환자에게 B-Raf 억제제, 및 종양 표본에서 발견된 유전적 변형에 기초하여 선택된 제2 억제제로 이루어진 약물 조합 요법을 투여하는 것에 의해 감소한다.
도 1은 실시예 4에 기재된 바와 같이 생체 내 HT-29 세포주 모델의 성장에 미치는 단일 제제로서의 화학식 (I)의 화합물 및 화합물 F, 및 이들의 조합물의 효과를 나타낸다.
도 2는 실시예 4에 기재된 바와 같이 생체 내 RKO 세포주 모델의 성장에 미치는 단일 제제로서의 화학식 (I)의 화합물 및 화합물 F, 및 이들의 조합물의 효과를 나타낸다.
도 3은 BRAF의 BRAFV600E-인코딩 대립 유전자를 갖는 2가지 흑색종 유래 세포주에서 FGFR 억제제 화합물 H와 RAF 억제제(화학식 I의 화합물) 조합이 증식에 미치는 영향을 나타낸다. 실시예 5에서 논의한 바와 같이 xCELLigence 임피던스-기반 세포 분석기를 사용하여 측정시 (상단 A) COLO 741 및 (하단 B) SK-MEL-5 세포주의 실시간 성장을 나타낸다. FGF2 및 화합물 H를 각각 100 ng/ml 및 1 uM의 농도로 상기 배지에 보충하였다. 화학식 (I)의 화합물은 (A)에서 500 nM 및 (B)에서 100 nM로 사용하였다.
도 4는 시험관 내 2가지 BRAF V600E 돌연변이 흑색종 유래 세포주에서 화학식 (I)의 화합물을 FGFR 억제제 화합물 H 및 FGFR 리간드 FGF2를 조합한 것의 신호화 효과를 나타낸다. (A) COLO 74 및 (B) SK-MEL-5 세포로부터 단리한 후 화학식 (I)의 화합물(100 nM), FGF2(100 ng/ml) 및 화합물 H(1 uM)로 처리된 인산화된 및 총 AKT, ERK1/2 및 MEK1/2 단백질의 웨스턴 분석을 나타낸다. 세포들을 실시예 5에서 설명한 바와 같이 제제 단독으로 또는 조합하여 2시간 및 24시간 동안 처리하였다.
본 발명은 B-Raf에서의 돌연변이, 특히 B-Raf에서의 V600 돌연변이를 특징으로 하는 증식성 질환을 앓는 환자를 치료하는 방법에 관한 것으로, 이는
(a) 환자에서 종양 표본을 얻고, BRAF, CRAF, CCND1, CDK4, HER2, IGF-1R, cMET, FGFR1, FGFR2, FGFR3 EGFR, MAP2K1, MAP2K2, NRAS, KRAS HRAS, PTEN, PIK3CA 및 P16을 포함하는 유전자의 패널에서 유전적 변형에 대해 시험하는 단계, 및
(b) B-Raf 억제제, 및 종양 표본에서 발견된 유전적 변형에 기초하여 선택되는 제2 억제제를 포함하는 약물 조합 요법을 투여하는 단계를 포함한다.
한 구현예에서, 증식성 질환은 암이다. 용어 "암"은 모든 고형 종양 및 혈액 악성종양을 비롯한 광범위한 종양을 의미하는 것으로 본원에 사용된다. 이러한 종양의 예는 뇌, 폐(특히, 소세포 폐암 및 비소세포 폐암), 편평 세포, 방광, 위, 췌장, 유방, 두경부, 신, 신장, 요관, 난소, 전립선, 결장직장, 식도, 고환, 부인과(예를 들어, 자궁 육종, 난관, 자궁내막, 자궁경부, 질 또는 외음부의 암종), 갑상선, 췌장, 골, 피부, 흑색종, 자궁, 난소, 직장, 항문, 결장, 고환, 호지킨병, 식도, 소장, 내분비계(예를 들어, 갑상선, 부갑상선 또는 부신), 연부 조직 육종, 요도, 음경, 백혈병, 림프종, 중추 신경계의 신생물, 육종, 골수종, 담도, 간, 신경섬유종증, 급성 골수 백혈병(AML), 골수이형성 증후군(MDS) 및 카포시 육종의 양성 또는 악성 종양을 포함하나 이에 제한되지 않는다.
본 발명의 추가 구현예에서, 증식성 질환은 흑색종, 폐암(비소세포 폐암(NSCLC) 포함), 대장암(CRC), 유방암, 신장암, 예컨대 신세포 암종(RCC), 간암, 자궁내막암, 급성 골수 백혈병(AML), 골수이형성 증후군(MDS), 갑상선암, 특히 유두상 갑상선암, 췌장암, 신경섬유종증 또는 간세포성 암종이다.
본 발명의 추가 구현예에서, 증식성 질환은 고형 종양이다. 용어 "고형 종양"은 특히 흑색종, 유방암, 난소암, 대장암, 및 일반적으로 위장관암, 자궁경부암, 폐암(소세포 폐암 및 비소세포 폐암 포함), 두경부암, 방광암, 전립선암 또는 카포시 육종을 의미한다.
더욱 특히, 본 발명은, B-Raf의 V600 변이 예를 들면 V600E 돌연변이를 특징으로 하는 증식성 질환을 앓는 환자를 치료하는 방법에 관한 것이다. 종종 이러한 돌연변를 특징으로 하는 증식성 질환은 흑색종, 대장암, 갑상선암, 특히 유두상 갑상선암, 성상 세포종, 췌장암 및 신경섬유종증을 포함한다. 본 발명은 특히 증식성 질환이 B-Raf에서의 V600 돌연변이 예를 들면 V600E, V600K 또는 V600G 돌연변이인 것을 특징으로 하는 흑색종인 상기 방법에 관한 것이다.
B-Raf 억제제 및 이의 증식성 질환을 치료하기 위한 용도는 당업계에 공지되어 있다. 베무라페닙(Vemurafenib)(PLX4032)은 그 종양이 BRAF V600E를 발현하는 흑색종 환자의 치료를 위해 FDA 승인을 받은 BRAF 억제제이다. 소라페닙(Sorafenib), 다브라페닙(dabrafenib) 및 CEP-32496은 추가로 알려진 B-Raf 억제제이다. 그 전문을 본원에 참고로 인용한 US 7,482,367에 개시된 벤즈이미다졸릴 에테르는, 본원의 조합, 특히 RAF265에 유용한 B-Raf 억제제이다. WO2011/025927에 개시되어 있고 그 전문이 본원에 참고로 인용된 피라졸 피리미딘은 본원의 조합에 유용한 B-Raf 억제제의 또 다른 부류이다.
B-Raf 억제제와 조합되기에 적합한 제2 억제제는 종양 표본에서 발견되는 유전적 변형을 기초로 환자의 치료를 위해 표 1에 따라 선택된다. 유전적 변형은 유전자의 증폭, 유전자 돌연변이 또는 유전자의 활성 손실로 발생할 수 있다.
Figure 112021060126967-pat00001
표 1에서 확인된 유전자에 관한 정보, 그 서열 및 관련 단백질은 당업자에게 공지되어 있으며, 공개적으로 사용가능한 데이터베이스 예를 들면 미국 국립생물공학정보센터, 미국 20894 메릴랜드주 베데스다 락빌 파이크 8600 미국 국립 의학 도서관에서 제공되는 유전자(URL: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene) 또는 생물청 및 미국 과학 에너지부 생물 및 환경 연구소, 인간 게놈 프로젝트 정보(URL: http://genomics.energy.gov/)에서 확인할 수 있다.
약물 조합 요법은 임상적 병용 치료 장애의 관찰가능한 징후 및 증상의 기준선에 대해 관찰가능한 개선을 제공하기에 충분한 양으로 각각의 병용 치료 약물의 투여를 포함한다. 약물은 환자에서 (바람직하게는 상승작용적) 상호작용(병용 치료 효과)을 나타내도록 하는 바람직한 시간 간격으로 개별적으로(순서대로 시차를 두는 방식, 특히 순서-특이적 방식으로) 제공될 수 있으며, 특히 이때 환자의 B-Raf 억제제 치료에 대한 내성이 극복되거나 감소한다.
용어 치료제 조합의 "약학적 유효량"또는 "임상적 유효량" 또는 "치료적 유효량"은 병용 치료되는 장애의 임상적으로 관찰가능한 징후 및 증상의 기준선에 대해 관찰가능한 개선을 제공하기에 충분한 양이다.
본원에 사용된 일반적 용어는 달리 명확하게 언급되지 않는 한 하기 의미로 정의된다.
용어 "포함하는(comprising)" 및 "포함하는(including)"은 달리 나타내지 않는 한 개방적이고 비-제한적 의미로 본원에 사용된다.
본 발명을 기재하는 문맥(특히, 하기 특허청구범위의 문맥)에서의 단수 용어("a" 및 "an" 및 "the") 및 유사한 언급은 본원에 달리 나타내거나 문맥에 의해 명백하게 모순되지 않는 한 단수형 및 복수형 둘 다를 포함하는 것으로 해석되어야 한다. 복수형이 화합물, 염 등에 사용된 경우에, 이는 단일 화합물, 염 등을 또한 의미하는 것으로 여겨진다.
본원에 사용된 용어 "조합물", "치료적 조합물", "조합 치료" 또는 "약학적 조합물"은 하나의 단위 투여 형태의 고정 조합물 또는 B-Raf 억제제 및 제2 억제제가 조합 파트너가 협동적 예를 들어 상승작용적 효과를 나타내도록 허용되는 시간 간격 내에서 독립적으로 동시에 또는 개별적으로 투여될 수 있는 조합 투여용 부분들 또는 지침들의 키트를 정의한다.
용어 "약학 조성물"은 포유동물에 영향을 미치는 특정 질환 또는 상태를 예방하거나 또는 치료하기 위해 대상체 예를 들어 포유동물 또는 인간에게 투여될 하나 이상의 치료제를 함유하는 혼합물 또는 용액을 지칭하는 것으로 본원에 정의된다.
용어 "약제학적으로 허용가능한"은 타당한 의학적 판단 범위 내에서 과도한 독성, 자극 알레르기 반응 및 합리적 이익/위험 비에 상응하는 다른 문제되는 합병증 없이 대상체 예를 들어 포유동물 또는 인간의 조직과의 접촉에 적합한 화합물, 물질, 조성물 및/또는 투여 형태를 지칭하는 것으로 본원에 정의된다.
본원에 사용된 "약제학적으로 허용가능한 염"은 달리 나타내지 않는 한 본 발명의 화합물에 존재할 수 있는 산성 및 염기성 기의 염을 포함한다. 본질상 염기성인 본 발명의 화합물은 다양한 무기 및 유기 산과 함께 매우 다양한 염을 형성할 수 있다. 이러한 본 발명의 염기성 화합물의 약제학적으로 허용가능한 산 부가염을 제조하는 데 사용될 수 있는 산은 비-독성 산 부가염, 즉 약제학적으로 허용가능한 음이온을 함유하는 염, 예컨대 아세테이트, 벤조에이트, 브로마이드, 클로라이드, 시트레이트, 푸마레이트, 히드로브로마이드, 히드로클로라이드, 아이오다이드, 락테이트, 말레에이트, 만델레이트, 니트레이트, 옥살레이트, 살리실레이트, 숙시네이트 및 타르트레이트 염을 형성하는 것이다. 달리 명시되지 않는 한, 본 발명의 방법에 사용되는 치료제는 유리 형태 또는 약학적 염으로서 투여된다.
용어 "조합 제제"는 특히 상기 정의된 조합 파트너 (a) 및 (b)가 독립적으로 투여되거나, 또는 조합 파트너 (a) 및 (b)의 구별되는 양을 갖는 상이한 고정 조합물을 사용하여, 즉 동시에 또는 상이한 시점에 투여될 수 있다는 점에서 "부분들의 키트"를 지칭하는 것으로 본원에 정의된다. 이어서, 부분들의 키트의 부분들은 예를 들어 동시에 또는 시차를 두고, 즉 상이한 시점에 부분들의 키트의 임의의 부분에 대해 동일하거나 상이한 시간 간격으로 투여될 수 있다. 조합 제제로 투여되는 조합 파트너 (b)에 대한 조합 파트너 (a)의 총량의 비는 예를 들어 치료될 환자 하위-집단의 요구 또는 단일 환자의 요구에 대처하기 위해 달라질 수 있다.
본원에 사용된 용어 "공-투여", "조합 치료" 또는 "조합 투여"는 단일 환자에게 선택된 치료제를 투여하는 것을 포괄하는 것으로 정의되며, 작용제가 반드시 동일한 투여 경로에 의해 또는 동시에 투여될 필요가 없는 치료 요법을 포함하도록 의도된다.
본원에 사용된 용어 "치료하는" 또는 "치료"는 대상체에서 하나 이상의 증상을 경감 또는 감소시키거나 완화하거나, 또는 질환의 진행 지연을 일으키는 치료를 포함한다. 예를 들어, 치료는 장애의 하나 또는 여러 증상의 경감 또는 장애, 예컨대 암의 완전 박멸일 수 있다. 본 발명의 의미 내에서, 용어 "치료하다"는 또한 발병(즉, 질환의 임상 징후 전의 기간)을 저지, 지연시키고/거나 질환의 발생 또는 악화의 위험을 감소시키는 것을 의미한다. 용어 "보호하다"는 대상체에서의 질환의 발생 또는 지속 또는 악화를 예방하거나 지연시키거나 치료하는 것, 또는 적절한 경우에 이들 모두를 의미하는 것으로 본원에 사용된다.
본원에 사용된 용어 "대상체" 또는 "환자"는 특히 예를 들어 증식성 질환을 앓고 있거나 앓을 위험이 있거나 또는 잠재적으로 앓을 가능성이 있는 인간을 지칭한다. 그러나, 포유동물 예를 들어 개, 소, 말, 돼지, 양, 염소, 고양이, 마우스, 토끼, 래트 및 형질전환된 비-인간 동물의 치료를 배제하는 것은 아니다.
용어 "약" 또는 "대략"은 소정의 값 또는 범위의 10% 이내, 더 바람직하게 5% 이내의 의미를 갖는다.
따라서, 본 발명은 B-Raf에서의 돌연변이, 특히 B-Raf에서의 V600 돌연변이를 특징으로 하는 증식성 질환, 매우 특히 B-Raf에서의 V600 돌연변이를 특징으로 하는 흑색종을 앓고 있는 환자를 치료하는 방법에 관한 것으로, 이는 하기 단계를 포함한다:
(a) 환자로부터 종양 표본을 수득하고 BRAF, CRAF, CCND1, CDK4, HER2, IGF-1R, cMET, FGFR1, FGFR2, FGFR3 EGFR, MAP2K1, MAP2K2, NRAS, KRAS HRAS, PTEN, PIK3CA 및 P16을 포함하는 군으로부터 선택된 유전자의 유전적 변형에 대해 시험하는 단계;
(b) B-Raf 억제제, 및 표 1에 따른 종양 표본에서 발견되는 유전적 변형에 기초하여 선택된 제2 억제제를 포함하는 약물 조합 요법을 투여하는 단계, 특히 이때
(i) 제2 억제제는 종양 표본이 BRAF, CRAF, MAP2K1, MAPK2, NRAS, KRAS HRAS 또는 EGFR에서 유전적 변형을 갖는 경우에 Mek 1/2 억제제이거나,
(ii) 제2 억제제는 종양 표본이 CCND1, CDK4 또는 P16에서 유전적 변형을 갖는 경우에 CDK 4 억제제이거나,
(iii) 제2 억제제는 종양 표본이 HER2, IGF-1R, PTEN 또는 PIK3CA에서 유전적 변형을 갖는 경우에 PI3 키나아제 억제제이거나,
(iv) 제2 억제제는 종양 표본이 cMet에서 유전적 변형을 갖는 경우에 c-Met 수용체 티로신 키나아제 억제제이거나, 또는
(v) 제2 억제제는 종양 표본이 FGFR1, FGFR2 또는 FGFR3에서 유전적 변형을 갖는 경우에 FGFR 키나아제 억제제이다.
따라서, 본 발명은 상기 B-Raf에서의 돌연변이, 특히 B-Raf에서의 V600 돌연변이를 특징으로 하는 증식성 질환, 매우 특히 B-Raf에서의 V600 돌연변이를 특징으로 하는 흑색종을 앓는 환자를 치료하는 방법에 관한 것으로, 이는 하기 단계를 포함한다:
(a) 환자로부터 종양 표본을 수득하고 BRAF, CRAF, MAP2K1, MAPK2, NRAS, KRAS HRAS 또는 EGFR을 포함하는 군으로부터 선택되는 유전자의 유전적 변형을 검출하는 단계;
(b) B-Raf 억제제 및 Mek 1/2 억제제인 제2 억제제를 포함하는 약물 조합 요법을 환자에게 투여하는 단계.
또한, 본 발명은 B-Raf에서의 돌연변이, 특히 B-Raf에서의 V600 돌연변이를 특징으로 하는 증식성 질환, 매우 특히 B-Raf에서의 V600 돌연변이를 특징으로 하는 흑색종으로 고통받는 환자를 치료하는 방법에 관한 것으로, 이는 하기 단계를 포함한다:
(b) 환자로부터 종양 표본을 수득하고 CCND1, CDK4 또는 P16을 포함하는 군으로부터 선택되는 유전자의 유전적 변형을 검출하는 단계;
(d) B-Raf 억제제 및 CDK 4 억제제인 제2 억제제를 포함하는 약물 조합 요법을 환자에게 투여하는 단계.
또한, 본 발명은 B-Raf에서의 돌연변이, 특히 B-Raf에서의 V600 돌연변이를 특징으로 하는 증식성 질환, 매우 특히 B-Raf에서의 V600 돌연변이를 특징으로 하는 흑색종을 앓는 환자를 치료하는 방법에 관한 것으로, 이는 하기 단계를 포함한다:
(a) 질환 진행 후 환자로부터 종양 표본을 수득하고 HER2, IGF-1R, PTEN 또는 PIK3CA를 포함하는 군으로부터 선택되는 유전자의 유전적 변형을 검출하는 단계;
(b) B-Raf 억제제 및 PI3 키나아제 억제제인 제2 억제제를 포함하는 약물 조합 요법을 환자에게 투여하는 단계.
또한, 본 발명은 B-Raf에서의 돌연변이, 특히 B-Raf에서의 V600 돌연변이를 특징으로 하는 증식성 질환, 매우 특히 B-Raf에서의 V600 돌연변이를 특징으로 하는 흑색종을 앓는 환자를 치료하는 방법에 관한 것으로, 이는 하기 단계를 포함한다:
(a) 종양 표본을 수득하고 cMET를 포함하는 군으로부터 선택되는 유전자의 유전적 변형을 검출하는 단계;
(b) B-Raf 억제제 및 c-Met 수용체 티로신 키나아제 억제제인 제2 억제제를 포함하는 약물 조합 요법을 환자에게 투여하는 단계.
또한, 본 발명은 B-Raf에서의 돌연변이, 특히 B-Raf에서의 V600 돌연변이를 특징으로 하는 증식성 질환, 매우 특히 B-Raf에서의 V600 돌연변이를 특징으로 하는 흑색종을 앓는 환자를 치료하는 방법에 관한 것으로, 이는 하기 단계를 포함한다:
(a) 환자로부터 종양 표본을 수득하고 FGFR1, FGFR2 또는 FGFR3를 포함하는 군으로부터 선택되는 유전자의 유전적 변형을 검출하는 단계;
(b) B-Raf 억제제 및 FGFR 키나아제 억제제인 제2 억제제를 포함하는 약물 조합 요법을 환자에게 투여하는 단계.
본 발명의 중요한 구현예에서, 앞서서 B-Raf 억제제 단독 요법으로 환자를 치료하였다. 특히, 질환이 진행된 후 표 1에 따른 약물 조합 치료를 결정하기 전까지 B-Raf 억제제 단독 요법으로 환자를 치료한다.
바람직한 구현예에서, 질환이 진행되거나 또는 약물 조합 요법을 개시하기까지 B-Raf를 연속적으로 단일 요법으로 투여하고, 약물 조합 요법으로 치료하는 동안에는 지속적으로 투여한다.
다른 구현예에서, B-Raf 억제제는 간헐적인 투여 스케줄로 투여되는데, 이는 B-Raf 억제제를 일정 시간 동안 투여한 후 일정 시간 동안 B-Raf 억제제에 의한 치료를 보류하는 것을 의미한다. 예를 들어, Raf를 3주 또는 4주 동안은 매일 투여한 후 1주 또는 2주 동안은 치료없이 보내는 주기이 반복된다.
질환 진행은 적절한 임상 기준 예를 들어 RECIST 기준에 의해 평가한다. RECIST(고형 종양에서의 반응 평가 기준)는 암 환자가 치료하는 동안 개선되거나("응답"), 같은 상태로 머물거나("안정") 또는 악화되는("진행") 경우를 정의하는 일련의 공개된 규칙이다. 원래 기준은 유럽 암연구치료기관(European Organization for Research and Treatment of Cancer(EORTC)), 미국 국립암연구소(National Cancer Institute(NCI)) 및 캐나다 국립암연구소(Cancer Institute of Canada) 임상시험 그룹을 포함한 국제 공동 연구에 의해 2000년 2월에 공개되었다. 2009년 1월에 발간된 RECIST 1.1은 원래 기준의 업데이트 버전이다. 문헌[Eur. J. Cancer, 45, (2009) 228-247] 참조.
질환 진행 메커니즘은 예를 들어 예비-치료 대비 재발시 환자의 종양에 존재하는 유전적 변형을 비교하여 결정한다. 유전적 변형은 유전자의 증폭, 유전자의 돌연변이 또는 유전자의 활성 손실로 발생할 수 있다. 유전적 변형은 당해 분야에 공지된 방법, 전형적으로 공지의 시퀀싱 방법에 의해 결정된다. 바람직한 구현예에서, 예비-치료 대비 재발 시에 취한 종양 표본에서 B-Raf, C-Raf, CCND1, CDK4, HER2, IGF-1R, cMET, FGFRl, FGFR2, FGFR3 EGFR, MAP2K1, MAP2K2, NRAS, KRAS HRAS, PTEN, PIK3CA 및 P16로 이루어진 군으로부터 선택된 유전자를 비교한다.
따라서, 본 발명은 또한, B-Raf 억제제 치료 후 질환 진행의 메커니즘을 결정하기 위해, B-Raf에서의 돌연변이, 특히 B-Raf에서의 V600 돌연변이를 특징으로 하는 증식성 질환, 매우 특히 B-Raf에서의 V600 돌연변이를 특징으로 하는 흑색종을 앓는 환자로부터 얻은 종양 표본을 B-Raf, C-Raf, CCND1, CDK4, HER2, IGF-1R, cMET, FGFR1, FGFR2, FGFR3 EGFR, MAP2K1, MAP2K2, NRAS, KRAS HRAS, PTEN, PIK3CA 및 P16를 포함하는 유전자 패널에서의 유전적 변형을 시험하는 것에 관한 것이다.
본 발명은 또한 B-Raf 억제제와 조합될 제2 억제제를 선택하기 위한 진단 방법에 관한 것으로, 이때 종양 표본을 B-Raf, C-Raf, CCND1, CDK4, HER2, IGF-1R, cMET, FGFR1, FGFR2, FGFR3 EGFR, MAP2K1, MAP2K2, NRAS, KRAS HRAS, PTEN, PIK3CA 및 P16으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자의 유전적 변형에 대해 시험한다. 제2 억제제는 표 1에 따라 선택된다. 바람직하게는, 제2 억제제는 B-Raf 억제제 치료에 대한 내성을 극복하도록 선택된다.
본 발명은 또한 B-Raf, C-Raf, CCND1, CDK4, HER2, IGF-1R, cMET, FGFR1, FGFR2, FGFR3 EGFR, MAP2K1, MAP2K2, NRAS, KRAS HRAS, PTEN, PIK3CA 및 P16으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자, 또는 상기 유전자의 전부 또는 일부를 포함하는 유전자의 유전적 변형을 검출하는 데 유용한 유전자 칩에 관한 것이다. 유전자 칩은 B-Raf 억제제 처리에 대한 내성 메커니즘을 결정하고 이러한 내성을 극복하는 약물 조합 요법에 사용될 제2 억제제를 선택하는 데 유용하다.
본 발명의 특정 구현예는 B-Raf에서의 돌연변이, 특히 B-Raf에서의 V600 돌연변이를 특징으로 하는 증식성 질환, 매우 특히 B-Raf에서의 V600 돌연변이를 특징으로 하는 흑색종을 앓는 환자를 치료하는 방법으로서, 이는 하기 단계를 포함한다:
(a) 환자가 질환 진행을 나타낼 때까지 B-Raf의 치료 유효량을 환자에게 투여하는 단계;
(b) 질환 진행 후 환자로부터 종양 표본을 수득하고 BRAF, CRAF, CCND1, CDK4, HER2, IGF-1R, cMET, FGFR1, FGFR2, FGFR3 EGFR, MAP2K1, MAP2K2, NRAS, KRAS HRAS, PTEN, PIK3CA 및 P16으로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자의 유전적 변형을 시험하는 단계; 및
(c) B-Raf 억제제 및 종양 표본에서 발견되는 유전적 변형에 기초하여 선택되는 제2 억제제를 포함하는 약물 조합 요법을 투여하는 단계, 이때
(i) 제2 억제제는 유전적 변형이 BRAF, CRAF, MAP2K1, MAPK2, NRAS, KRAS HRAS 또는 EGFR에 존재하는 경우에 Mek 1/2 억제제이거나,
(ii) 제2 억제제는 유전적 변형이 CCND1, CDK4 또는 P16에 존재하는 경우에 CDK 4 억제제이거나,
(iii) 제2 억제제는 유전적 변형이 HER2, IGF-1R, PTEN 또는 PIK3CA에 존재하는 경우에 PI3 키나아제 억제제이거나,
(iv) 제2 억제제는 유전적 변형이 cMet에 존재하는 경우에 c-Met 수용체 티로신 키나아제 억제제이거나, 또는
(v) 제2 억제제는 유전적 변형이 FGFR1, FGFR2 또는 FGFR3에 존재하는 경우에 FGFR 키나아제 억제제이다.
본 발명에 유용한 바람직한 B-Raf 억제제는 하기 화학식 (I)의 화합물이다:
Figure 112021060126967-pat00002
.
화학식 (I)의 화합물 및 이의 B-Raf 억제제로서의 유용성은 WO2011/025927에 개시되어 있다.
따라서, 본 발명은 더욱 특히 B-Raf에서의 돌연변이, 특히 B-Raf에서의 V600 돌연변이를 특징으로 하는 증식성 질환, 매우 특히 B-Raf에서의 V600 돌연변이를 특징으로 하는 흑색종을 앓는 환자를 치료하는 방법에 관한 것으로, 이는 하기 단계를 포함한다:
(a) 환자로부터 종양 표본을 수득하고 BRAF, CRAF, CCND1, CDK4, HER2, IGF-1R, cMET, FGFR1, FGFR2, FGFR3 EGFR, MAP2K1, MAP2K2, NRAS, KRAS HRAS, PTEN, PIK3CA 및 P16으로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자의 유전적 변형을 시험하는 단계; 및
(b) 하기 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 또는 이의 약제학적으로 허용가능한 염, 및 표 1에 따라 종양 표본에서 발견되는 유전적 변형에 기초하여 선택되는 제2 억제제를 포함하는 약물 조합 요법을 투여하는 단계:
Figure 112021060126967-pat00003
,
특히 이때
(i) 제2 억제제는 종양 표본이 BRAF, CRAF, MAP2K1, MAPK2, NRAS, KRAS HRAS 또는 EGFR에서 유전적 변형을 갖는 경우에 Mek 1/2 억제제이거나,
(ii) 제2 억제제는 종양 표본이 CCND1, CDK4 또는 P16에서 유전적 변형을 갖는 경우에 CDK 4 억제제이거나,
(iii) 제2 억제제는 종양 표본이 HER2, IGF-1R, PTEN 또는 PIK3CA에서 유전적 변형을 갖는 경우에 PI3 키나아제 억제제이거나,
(iv) 제2 억제제는 종양 표본이 cMET에서 유전적 변형을 갖는 경우에 c-Met 수용체 티로신 키나아제 억제제이거나, 또는
(v) 제2 억제제는 종양 표본이 FGFR1, FGFR2 또는 FGFR3에서 유전적 변형을 갖는 경우에 FGFR 키나아제 억제제이다.
본 발명의 더욱 특정 구현예는 약물 조합 요법 이전에 화학식 (I)의 B-Raf 억제제에 의해 단독 요법을 제공하는 것을 포함한다. 따라서, 본 발명은 또한 B-Raf에서의 돌연변이, 특히 B-Raf에서의 V600 돌연변이를 특징으로 하는 증식성 질환, 매우 특히 B-Raf에서의 V600 돌연변이를 특징으로 하는 흑색종을 앓는 환자를 치료하는 방법에 관한 것으로, 이는 하기 단계를 포함한다:
(a) 환자가 질환 진행을 나타낼 때까지 하기 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 또는 이의 약제학적으로 허용가능한 염의 치료적 유효량을 환자에게 투여하는 단계:
Figure 112021060126967-pat00004
,
(b) 질환 진행 후 환자로부터 종양 표본을 수득하고 B-Raf, C-Raf, CCND1, CDK4, HER2, IGF-1R, cMET, FGFR1, FGFR2, FGFR3 EGFR, MAP2K1, MAP2K2, NRAS, KRAS HRAS, PTEN, PIK3CA 및 P16으로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자의 유전적 변형을 시험하는 단계; 및
(c) 상기 B-Raf 억제제 및 표 1에 따라 종양 표본에서 발견되는 유전적 변형에 기초하여 선택되는 제2 억제제를 포함하는 약물 조합 요법을 투여하는 단계, 특히 이때,
(i) 제2 억제제는 질환 진행의 메커니즘이 BRAF, CRAF, MAP2K1, MAPK2, NRAS, KRAS HRAS 또는 EGFR에서의 유전적 변형을 특징으로 하는 경우 또는 유전적 변형이 단계 (b)에서 전혀 발견되지 않는 경우에 Mek 1/2 억제제이거나,
(ii) 제2 억제제는 질환 진행의 메커니즘이 CCND1, CDK4 또는 P16에서의 유전적 변형을 특징으로 하는 경우에 CDK 4 억제제이거나,
(iii) 제2 억제제는 질환 진행의 메커니즘이 HER2, IGF-1R, PTEN 또는 PIK3CA에서의 유전적 변형을 특징으로 하는 경우에 PI3 키나아제 억제제이거나,
(iv) 제2 억제제는 질환 진행의 메커니즘이 cMET에서의 유전적 변형을 특징으로 하는 경우에 c-Met 수용체 티로신 키나아제 억제제이거나, 또는
(v) 제2 억제제는 질환 진행의 메커니즘이 FGFR1, FGFR2 또는 FGFR3에서의 유전적 변형을 특징으로 하는 경우에 FGFR 키나아제 억제제이다.
화학식 (I)의 화합물은 단계 (a) 및 (c)에서 연속적으로 또는 간헐적 투여 스케줄에 따라 투여될 수 있다. 이는 바람직하게는 연속적으로 투여된다.
상술한 각각의 방법에서, 바람직한 구현예는 특히 증식성 질환이 B-Raf에서의 V600 돌연변이, 예를 들어 V600E 돌연변이인 것을 특징으로 하는 것을 포함한다. 종종 이러한 돌연변이를 특징으로 하는 증식성 질환은 흑색종, 대장암, 갑상선암, 특히 유두 갑상선암, 성상세포종, 췌장암 및 신경섬유종증을 포함한다. 바람직하게는, 증식성 질환은 B-Raf에서의 V600 돌연변이 예를 들어 V600E, V600K 또는 V600G 돌연변이를 특징으로 하는 흑색종 또는 대장암이다. 본 발명은 특히 증식성 질환이 B-Raf에서의 V600 돌연변이, 예를 들어 V600E, V600K 또는 V600G 돌연변이를 특징으로 하는 상기 방법에 관한 것이다.
본 방법에 사용하기에 적합한 Mek 1/2 억제제는 당해 분야에 공지되어 있다. 본 발명에 유용한 Mek 1/2 억제제는 PD325901, PD-181461, ARRY142886 / AZD6244, ARRY-509, XL518, JTP-74057, AS-701255, AS-701173, AZD8330, ARRY162, ARRY300, RDEA436, E6201, RO4987655/R-7167, GSK1120212 또는 AS703026을 포함한다.
중요한 구현예에서, Mek 1/2 억제제는 본원에 그 전체가 참고로 인용된 WO03/077914에 기재된 화합물, 특히 하기 화학식 (II) 또는 (III)의 화합물 또는 이의 약제학적으로 허용가능한 염(이하, 각각 화합물 A 및 B라 함), 및 증식성 질환 치료용 Mek 1/2 억제제로서의 N3-알킬화 벤즈이미다졸 및 다른 유사한 헤테로환형 유도체를 포함하는 본원에 그 전체가 참고로 인용된 WO05/051906, WO05/023251, WO03/077855, US20050049419 및 US7235537에 기재된 화합물을 포함한다:
Figure 112021060126967-pat00005
.
CDK 4 억제제는 당해 분야에 공지되어 있으며 플라보리피돌, P1446A-05, LEE0ll, AT7519, BMS265246, LY2835219 및 PD-0332991을 포함한다. 본 발명의 특정 구현예에서, CDK 4 억제제는 그 전체가 본원에 참고로 인용된 WO2007/140222 또는 WO20210/020675에 개시된 화합물이다. 특정 구현예에서, CDK 4 억제제는 하기 화학식 (IV)의 화합물 또는 이의 약제학적으로 허용가능한 염(이하, 화합물 C라 함)이다:
Figure 112021060126967-pat00006
.
PI3 키나아제 억제제는 당해 분야에 공지되어 있으며 페리포신, CAL-101, PX-866, BEZ235, SF1126, INK1117, GDC-0941, BKM120, XL147, XL765, Palomid529, GSK1059615, Zstk474, PTW33597, IC87114, TG100-115, CAL283, PI-103, BYL719, GNE-477, CUDC-907 및 AEZS-136을 포함한다.
본원에 그 전체가 참고로 인용된 WO2006/122806는 PI3 키나아제 억제제 활성을 갖는 이미다조퀴놀린 유도체를 기재한다. 본 발명의 매우 바람직한 화합물은 2-메틸-2-[4-(3-메틸-2-옥소-8-퀴놀린-3-일-2,3-디하이드로-이미다조[4,5-c]퀴놀린-1-일)- 페닐]-프로피오니트릴 및 이의 모노토실레이트 염(화합물 D)이다. 2-메틸-2-[4-(3-메틸-2-옥소-8-퀴놀린-3-일-2,3-디하이드로-이미다조[4,5-c]퀴놀린-1-일)-페닐]-프로피오니트릴은 예를 들어 실시예 7 및 152-3으로 WO2006/122806에 기재되어 있다. 본 발명의 또 다른 매우 바람직한 화합물은 8-(6-메톡시-피리딘-3-일)-3-메틸-1-(4-피페라진-1-일-3-트리플루오로메틸-페닐)-1,3-디하이드로-이미다조[4,5-c]퀴놀린-2-온(화합물 E)이다. 8-(6-메톡시-피리딘-3-일)-3-메틸-1-(4-피페라진-1-일-3-트리플루오로메틸-페닐)-1,3-디하이드로-이미다조[4,5-c]퀴놀린-2-온의 합성은 예를 들어 실시예 86으로 WO2006/122806에 기재되어 있다. WO07/084786은 PI3 키나아제 억제제 활성을 갖는 피리미딘 유도체에 대해 기재하고 있다. 본 발명의 매우 바람직한 화합물은 5-(2,6-디-모르폴린-4-일-피리미딘-4-일)-4-트리플루오로메틸-피리딘-2-일아민(화합물 F)이다. 5-(2,6-디-모르폴린-4-일-피리미딘-4-일)-4-트리플루오로메틸-피리딘-2-일아민의 합성은 실시예 10으로 WO07/084786에 기재되어 있다. PI3-키나아제 억제제 활성을 갖는 또 다른 바람직한 화합물은 (S)-피롤리딘-1,2-디카르복실산 2-아미드 1-({4-메틸-5-[2-(2,2,2-트리플루오로-1,1-디메틸-에틸)-피리딘-4-일]-티아졸-2-일}- 아미드)(화합물 X)이다.
c-Met 수용체 티로신 키나아제 억제제는 당업계에 공지되어 있으며 크리조티닙, PHA-665752, SU11274, PF-04217903, 포레티닙, SGX523, JNJ-38877605, GSK1363089, AMG208 및 NCB28060을 포함한다. 특정 구현예에서, c-Met 수용체 티로신 키나아제 억제제는 화학식 IV의 화합물 또는 이의 약제학적으로 허용가능한 염(이하, 화합물 G라 함)이다:
Figure 112021060126967-pat00007
.
본 발명의 방법에 따라 사용되는 FGFR 키나아제 억제제는 바람직하게는AZD4547 및 BGJ398을 포함하는 선택적 및 ATP 경쟁적 팬 FGFR 키나아제 억제제이다. 특정 구현예에서, FGFR 키나아제 억제제는 WO2006/000420에 개시된 아릴-피리미딜-우레아 유도체, 특히 하기 화학식 (V)의 화합물 또는 이의 약제학적으로 허용가능한 염(이하, 화합물 H라 함)이다:
Figure 112021060126967-pat00008
.
특히 바람직하게는 Mek 1/2 억제제가 화합물 A 또는 화합물 B, 특히 화합물 B이고, CDK 4 억제제가 화합물 C이고, PI3 키나아제 억제제가 화합물 D, 화합물 E, 화합물 F 또는 화합물 X, 특히 화합물 F이고, c-Met 수용체 티로신 키나아제 억제제가 화합물 G이고, FGFR 키나아제 억제제가 화합물 H, 또는 이들 화합물의 약제학적으로 허용가능한 염인 본 발명의 방법의 구현예이다.
화학식 (I)의 B-Raf 억제제는 하루에 150 내지 600, 바람직하게는 하루에 400 내지 600, 특히 450 또는 600 mg/일의 투여량으로 투여된다. 약물 조합 요법의 제2 억제제로서 화합물 B는 15 내지 60 mg BID, 바람직하게는 45 mg BID의 투여량으로 투여되고, 화합물 C는 100 내지 900 mg/일, 바람직하게는 200 내지 900 mg/일, 예를 들어 200, 400, 700 또는 900 mg/일의 투여량으로 투여되고, 화합물 F는 30 내지 100 mg/일, 바람직하게는 60 내지 100 mg/일 또는 60 내지 80 mg/일의 투여량으로 투여되고, 화합물 G는 50 내지 300 mg BID, 바람직하게는 100 내지 300 mg BID, 예를 들어 100, 150, 200, 250 또는 300 mg BID의 투여량으로 투여되고, 화합물 H는 25 내지 125 mg/일, 예를 들어 75, 100 또는 125 mg/일의 투여량으로 투여된다.
상기 방법의 중요한 구현예에서, 종양 표본에서 발견된 BRAF의 유전적 변형은 V600 돌연변이와 다른 것이다.
본 발명은 또한 B-Raf 억제제, 바람직하게는 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 및 별도로, 동시에 또는 순차적으로 투여하기 위한 PI3 키나아제 억제제, c-Met 수용체 티로신 키나아제 억제제 및 FGFR 키나아제 억제제로 이루어진 군으로부터 선택된 제2 억제제를 포함하는 치료적 조합물에 관한 것이다. 보다 구체적으로, 치료적 조합물은 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 및 화합물 D, 화합물 E, 화합물 F 및 화합물 X 또는 이들의 약제학적으로 허용가능한 염으로 이루어진 군으로부터 선택된 PI3 키나아제 억제제인 제2 억제제를 포함하거나; 치료적 조합물은 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 및 화합물 G 또는 이의 약제학적으로 허용가능한 염으로부터 선택된 c-Met 억제제인 제2 억제제를 포함하거나; 치료적 조합은 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 및 화합물 H 또는 이의 약제학적으로 허용가능한 염으로부터 선택된 FGFR 키나아제 억제제인, 별도로, 동시에 또는 순차적으로 투여하기 위한, 제2 억제제를 포함한다. 이하, 이러한 치료적 조합물을 "본 발명의 조합물"이라 한다.
본 발명은 또한 B-Raf에서의 돌연변이를 특징으로 하는 증식성 질환 예를 들어 B-Raf에서의 V600 돌연변이를 특징으로 하는 흑색종을 앓는 환자를 치료하는 방법에 관한 것으로, 이는 B-Raf 억제제, 바람직하게는 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 및 PI3 키나아제 억제제, c-Met 수용체 티로신 키나아제 억제제 및 FGFR 키나아제 억제제로 이루어진 군으로부터 선택된 제2 억제제를 포함하는 조합물의 치료적 유효량을 환자에게 투여하는 것을 포함한다. 더 구체적으로, 본 발명은 B-Raf에서의 돌연변이 예를 들어 V600 돌연변이를 특징으로 하는 증식성 질환 예를 들어 B-Raf에서의 V600 돌연변이를 특징으로 하는 흑색종을 앓는 환자를 치료하는 방법에 관한 것으로, 이는 본 발명의 조합물의 치료적 유효량을 환자에게 투여하는 것을 포함한다. 바람직하게는, 이들 억제제는 조합될 때 유익한 효과를 제공하는 치료적 유효 투여량으로 투여된다. 이러한 투여는 별도로, 동시에 또는 순차적일 수 있다.
본 발명은 또한 증식성 질환, 특히 B-Raf에서의 돌연변이, 특히 B-Raf에서의 V600 돌연변이를 특징으로 하는 증식성 질환, 예를 들어 B-Raf에서의 V600 돌연변이를 특징으로 하는 흑색종의 치료 또는 예방을 위한 약학 조성물 또는 약제의 제조에 사용하기 위한 본 발명의 조합물에 관한 것이다.
본 발명은 또한 증식성 질환의 진행 지연 또는 치료에 사용하기 위한 치료제로서 본 발명의 조합물을 동시에, 별도로 또는 순차적 투여를 위한 지침과 함께 포함하는 시판용 패키지를 제공한다.
본 발명의 조합물의 투여는, 본 발명의 조합물에 사용된 약학적 치료제 중 단지 하나의 단일 요법만을 적용한 것에 비해, 예를 들어 증상의 완화, 진행 지연 또는 억제에 대해 유리한 효과 예를 들어 상승적 치료 효과를 초래할 뿐만 아니라, 더 놀라운 유리한 효과 예를 들어 적은 부작용, 지속적 응답, 삶의 질 향상 또는 이환율 감소를 초래할 수 있다.
하기 실시예는 본 발명을 예시하기 위한 것으로 본 발명을 한정하는 것은 아니다.
실시예 1
본 실험의 첫 번째 파트 동안, 환자는 450 mg/일의 II 상 권장 투여량으로 단일 제제로서 화학식 (I)의 B-Raf 억제제로 치료한다. 화학식 (I)의 B-Raf 억제제는 캡슐화된 고체 분산물로서 제형화되어 경구 투여한다.
본 실험의 두 번째 파트에서, 환자는 제2 표적제와 조합된 화학식 (I)의 B-Raf 억제제(즉, 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 + 화합물 B, 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 + 화합물 F, 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 + 화합물 H, 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 + 화합물 G, 또는 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 + 화합물 C)로 치료할 것이다. 각 조합의 분기에서의 투여량 상승은 이전에 별도의 조합 시험으로 결정되지 않는 한 각 조합물의 MTD/RP2D를 설정하기 위해 베이지안(Bayesian) 로지스틱 회귀 모델(BLRM)에 의해 안내될 것이다. BLRM을 이용한 오픈-라벨 투여량 상승 실험은 암 환자의 MTD 및/또는 RP2D를 추정하는 잘 확립된 방법이다. 적합한 BLRM은 실험 대상 장래 환자의 DLT의 위험을 제어하기 위해 과다 복용 제어(EWOC) 원칙에 의해 확대하여 안내될 것이다. 환자 내 투여량 상승은 DLT를 경험하지 않은 환자에 대한 첫 번째 주기 후 허용될 것이다.
환자 내 투여량 상승은 개별 환자의 내성을 반영한 수정된 EWOC 기준으로 BLRM에 의해 결정할 것이다. 작은 데이터 세트에 대한 베이지안 응답 적합성 모델의 사용은 EMEA에 의해 용인되었고 이의 개발과 적절한 사용은 FDA의 임계경로계획(Critical Path Initiative)의 한 측면이다.
조합 약물의 선택에 대한 이론적 근거
전-임상 및 임상 연구의 데이터는, 화학식 (I)의 B-Raf 억제제와 화합물 B의 조합에 의한 RAF/MEK/ERK 신호 전달 경로의 동시, 이중, 수직 경로 억제에 의해, 증가된 임상적 효능으로 이어질 수 있고 가능하게는 BRAF V600-의존적 진전된 흑색종 환자에서 단일 제제에 대한 초기 저항을 극복할 수 있음을 시사한다. 또한, MAPK 신호 전달을 재활성화하거나 또는 PI3K/AKT 신호 전달 경로와 같은 다른 경로를 활성화하는 다른 메카니즘이 BRAF 억제제에 대한 1차 및/또는 후천적 저항 역할을 한다. 따라서, 각각 PI3K, c-Met, FGFR 및 CDK4/6 키나아제를 표적하는 선택된 제제 화합물 F, 화합물 H, 화합물 G 및 화합물 C와 조합된 화학식 (I)의 B-Raf 억제제의 항-종양 활성을 또한 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 + 화합물 B와 더불어 평가할 수 있다. 개별 환자에게 제공된 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 조합물의 선택은 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 진행에 대한 환자의 종양 표본에서 확인되는 유전적 변형에 기초할 것이다(표 1 참조).
실험 설계에 대한 설명
이는 BRAF 돌연변이가 국소적으로 진행되었거나 전이된 흑색종을 가진 약 100명의 환자가 등록된 다기관 오픈-라벨 II상 실험으로서 2개의 치료 파트로 구성된다.
첫 번째 파트인 파트 I에서는, 선택적 BRAF 억제제에 대해 경험이 없는 환자를 (RECIST v1.1에 다라 정의된 바와 같이) 질환 진행까지 450 mg/일의 RP2D로 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 단일 제제로 치료한다. 질환 진행시에는 종양을 조직 검사하고 선택된 유전자 패널에 대해 분석한다(표 1).
파트 I의 실험에서 재발 환자는, 적절한 화학식 (I)의 B-Raf 억제제의 바람직한 조합물을 확인하고 개시할 때까지 내성 조직 검사의 분자 분석에 예상되는 반출 시간 동안 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 단일 제제를 계속해서 받게 된다.
재발된 종양 조직 검사로부터 확인된 유전적 변형에 기초하여, 환자의 코호트는 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 및 제2 표적 제제의 맞춤 조합 치료를 위해 실험의 제2 파트인 파트 II에 진입한다. 5가지 조합의 실험 치료에 상응하는 5가지 분기가 있게 된다: 즉, 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 + 화합물 B, 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 + 화합물 F, 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 + 화합물 H, 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 + 화합물 G, 및 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 + 화합물 C. 제2 제제의 선택은 하기 표 1의 기준에 따라 정의된다. 등록된 환자의 절반 이상은 화학식 (I)의 B-Raf 억제제의 진행 후 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 및 화합물 B의 조합 치료를 받을 것으로 예상된다.
화학식 (I)의 B-Raf 억제제로 치료된 BRAF V600 돌연변이 흑색종 환자에서 이전 실험에서 재발한 BRAF 억제제 치료에 대해 경험이 있는 환자는 파트 II에서 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 단일 제제 진행 후에 등록될 수 있다. 이들 환자의 경우, 이전 실험에서 치료 방문 끝에 수집한 새로운 종양 조직 검사의 분석 결과는 파트 II에서의 조합 치료 배정에 사용될 것이다.
화학식 (I)의 B-Raf 억제제 단일 제제 실험(예컨대, IIT)에서의 재발 환자는, 진행 후 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 치료를 중단하고, 파트 II 실험에서 바람직한 조합 치료에 배정될 때까지, 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 단일 제제의 수취를 중단할 것이다.
이러한 환자의 진행성 질환은 이전의 연구에서 확인된 것으로 간주되며, 본 실험의 진행 중 CT 및 실험 치료 시작 전 시간 간격이 28일을 초과하지 않은 경우, 파트 II 실험에 대한 기준선 종양 평가로 사용될 것이다.
모든 환자는, 정의된 이중 조합물 MTD/RP2D, 또는 이중 조합물 MTD/RP2D가 이전에 결정되지 않은 경우, 베이지안 로지스틱 회귀 모델에서 허용된 개시 투여량의 제2 제제와 조합된 화학식 (I)의 B-Raf 억제제(또는 환자에게 용인된 최고 마지막 투여량)에 대한 450 mg/일의 RP2D의 합리적인 조합을 시작할 것이다. 합리적인 조합 치료 부분은 MTD/RP2D 조합이 확립될 때까지 제2 제제의 상승 투여량 가능성에 따라 계속된다. BLRM에 의해 유도되는 제2 제제의 환자 내 투여량 증가는 하나 이상의 주기 동안 소정 투여량의 조합물에 대해 내성을 가진 환자에 대해 사전-정의된 조건 하에서 허용될 것이다.
조합 치료는 질환 진행 시까지 21일 주기로 투여될 것이며, 이때 조합 치료 중의 종양 평가를 재계산된 기준선과 비교한다(즉, 종양 평가 결과는 파트 I 또는 이전 실험에서 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 단일 제제 치료에 대한 PD 평가를 유도한다).
분자 예비-검사(pre-screening)
실험의 검사 단계로 들어가기 위해, 환자는 새로운 종양 조직 검사(바람직함)에서 국소적으로 얻거나 또는 입수가능한 가장 최근의 보관 종양 표본인 BRAF V600 돌연변이에 대한 문서를 작성해야 한다. 그러나, 실험 등록을 고려하는 시점에서 분자 상태를 알 수 없는 환자, 지역 실험실에서 BRAF 돌연변이에 대해 일상적으로 검사되지 않은 종양을 가진 환자 및 새로운 종양 수집이 필요한 환자는 돌연변이 상태의 현지 평가를 위해 새로운 종양 표본 수집에 대한 분자 예비-검사 사전 동의서에 서명해야 한다. BRAF V600 돌연변이 상태가 일단 알려지거나 결정되면, 환자는 주 실험 사전 동의서 양식에 서명하고 검사를 시작할 수 있다.
검사
BRAF V600 돌연변이 상태가 일단 알려지거나 결정되면, 환자는 주 실험 사전 동의서에 서명하고 검사를 시작할 수 있다. 모든 검사는 실험 치료 투여 전에 실시되어야 한다.
치료 기간
2가지 치료 파트, 즉 파트 I 및 파트 II가 있을 것이다.
파트 I = 단일 제제 치료 단계로서, 조합 치료 개시 때까지 1일 1 주기로 시작된다.
파트 II = 조합 치료 단계로서, 재발시의 종양 조직 검사 수집에서 유전적 변형이 알려지면 개시된다.
실험 치료는 21일 주기로 투여되고 (이중 조합 치료시) 질환 진행, 수용할 수 없는 독성, 사전 동의서의 철회 또는 사망시까지 계속된다.
환자 집단
실험은 확인된 BRAF V600 돌연변이의 국소 진행성 또는 전이성 흑색종을 가진 성인 환자에서 실시된다.
실험(파트 I)의 제1 파트에 등록된 환자는 선택적 BRAF 억제제에 대해 경험이 없어야 한다.
화학식 (I)의 B-Raf 억제제 단일 제제에 의해 이전에 치료를 받은 환자는 재발시에 종양 조직 검사가 수집된 경우 파트 II에 직접 등록할 수 있다.
이 실험에 등록한 환자는 병행되는 연구 임상시험용 약물 또는 장치 실험에 참여하는 것이 허용되지 않는다. 추가로, 실험을 완료한 환자는 두 번째 치료 과정에 재등록하면 안 된다.
검사원 또는 대행자는 다음의 포함 기준을 모두 충족시키고 배제 기준 중 어느 것에도 해당하지 않는 환자만이 실험 치료에 제공되어야 함을 확인해야 한다.
포함 기준
화학식 (I)의 B-Raf 억제제에 대해 경험이 없는 환자(파트 I에 적격).
실험에 포함 기준에 적격인 환자는 하기 기준을 모두 충족시켜야 한다:
투여 시작 연령: 18세 이상.
사전 동의서를 이해하고 자발적 서명이 가능하며, 실험 방문 스케줄 및 다른 프로토콜 요건에 맞을 것. 서면 사전 동의는 검사 절차 전에 받아야 한다.
조직학적으로 확인된 절제 불가능한 단계 III 또는 전이성 흑색종 진단(미국 AJCC에 따른 단계 IIIC 내지 IV).
BRAF V600 돌연변이의 서면 기록.
의학적으로 달리 지시되지 않는 한, 기준선에서의 새로운 종양 조직 검사 및 재발 시점에서의 필수 조직 검사에 대한 환자 동의.
RECIST vl.l.에 의해 결정시 측정가능한 질환의 증거.
주: 이전 방사선 요법 또는 다른 국소 요법(예를 들어, 경피 절제)의 영역에서의 병변은 병변 진행이 요법 이후에 기록되지 않는 한 측정가능한 것으로 여겨서는 안 된다.
기대 수명 ≥ 3개월.
세계 보건기구(WHO) 성능 상태 < 2.
모든 가임 여성에서 실험 치료의 첫 번째 투여 전 72시간 내의 혈청 임신 시험에 대해 음성이어야 한다.
화학식 (I)의 B-Raf 억제제 단일 제제 치료 후 재발시 필수적인 새로운 조직 검사가 가능해야 한다.
기록된 진행성 질환을 가진 화학식 (I)의 B-Raf 억제제의 다른 단일 제제 실험의 환자는 치료를 위한 조합 분기 배정을 결정하는 내성 프로파일 결과에 따라 파트 II로 진입할 수 있다.
환자의 진행성 질환은 종양 평가와 함께 이전 연구에서 확인해야 한다. 질환 진행의 종양 평가 기록과 첫 번째 조합 치료 투여 사이의 시간 간격이 4주(28일)를 초과하면, 새로운 종양 평가가 수행되어야 한다. 이전 연구의 치료 방문의 끝에 수행된 광범위한 게놈 분석을 통해 특징 분석된 조직 검사는 조합 치료의 배정을 위해 필요하다.
배제 기준
본 실험에 적합한 환자는 하기 기준 중 어느 것도 충족해서는 안 된다:
파트 I 등록(화학식 (I)의 B-Raf 억제제 단일 제제 치료):
RAF-억제제에 의한 이전의 치료
증후성 또는 치료되지 않은 연수막 질환
증후성 뇌 전이. 코르티코스테로이드 요법의 부재 하에 무증상인 이러한 상태에 대해 이전에 치료받거나 또는 치료받지 않은 환자는 등록이 허용된다. 뇌 전이는 영상 검증에서 적어도 3개월 동안 안정해야 한다(예를 들어, 진행성 뇌 전이의 어떠한 최근의 증거도 뇌 MRI 또는 CT 검사시 나타나지 않아야 한다). 환자는 효소 유래 항간질 약물을 제공받는 것이 허용되지 않는다.
기지의 급성 또는 만성 췌장염
다음 중 어느 것을 포함하는 임상적으로 유의한 심장 질환:
CHF를 필요로 하는 치료(NYHA 등급 ≥ 2), MUGA 스캔 또는 ECHO에 의해 결정시 LVEF < 45%, 또는 제어되지 않는 고혈압(WHO-ISH 지침 참조)
임상적으로 유의한 심실 부정맥 또는 심방 세동의 병력 또는 존재
임상적으로 유의한 휴식기 서맥
연구 약물 시작 3개월 이전의 불안정한 협심증
연구 약물 시작 3개월 이전의 급성 심근경색(AMI)
ECG 검사에 대해 QTcF > 480 msec
기준선에서 임의의 하기 실험실 값을 갖는 환자:
절대 호중구 수(ANC)<1,500/mm3[1.5×109/L]
혈소판 < 100,000개/mm3[100×109/L]
헤모글로빈 < 9.0 g/dL
혈청 크레아티닌 > 1.5 × ULN
혈청 총 빌리루빈 > 1.5 × ULN
AST/SGOT 및 ALT/SGPT > 2.5 × ULN, 또는 간 전이가 존재하는 경우에 > 5 × ULN
경구 중재 약물의 흡수를 상당히 변경시킬 수 있는 위장(GI) 기능 장애 또는 GI 질환(예를 들어, 궤양성 질환, 제어되지 않는 오심, 구토, 설사, 흡수장애 증후군, 소장 절제).
이전의 또는 동반되는 악성종양. 예외: 적절하게 치료된 기저 세포 또는 편형 세포 피부암; 치유적으로 치료되고 실험 가입 이전 적어도 3년 동안 재발의 증거가 없는 자궁 경부의 상피내 암종; 또는 치유적으로 치료되고 연구 가입 이전 적어도 3년 동안 재발의 증거가 없는 다른 고형 종양.
일과성 허혈 발작, 뇌혈관 사고, 심부정맥 혈전증 또는 폐색전증을 포함하여, 마지막 6개월 내의 혈전색전성 또는 뇌혈관 사건의 병력.
실험 약물 시작 전 4주(니트로소우레아, 미토마이신-C의 경우에 6주) 내에 방사선 요법(30% 초과의 골수 예비량 포함), 화학요법, 생물학적 요법(예를 들어, 항체)을 받았거나, 또는 지속적 또는 간헐적 소분자 요법 또는 임상시험용 제제의 5 반감기(또는 반감기가 알려져 있지 않은 경우에 4주 이내) 내에 상기 제제를 사용하여 치료받았거나, 또는 이러한 요법의 부작용(탈모증 제외)으로부터 회복되지 않은 환자.
실험 약물의 시작 전 마지막 2주 내에 임의의 대수술을 받았거나 또는 이전 수술에서 완전히 회복되지 않은 환자.
기지의 인간 면역 결핍 바이러스(HIV) 감염.
실험 참여 또는 실험 약물 투여와 연관된 위험을 증가시킬 수 있거나 또는 실험 결과의 해석을 방해할 수 있고, 실험자의 판단으로 환자가 실험에 부적절한 것으로 간주될 다른 중증, 급성 또는 만성 의학적 또는 정신과적 상태 또는 실험실 이상.
임신 또는 간호(수유) 여성(여기서, 임신은 수정 후 및 임신 종결까지의 여성의 상태로 규정되며, 양성 hCG 실험실 시험(> 5 mIU/mL)에 의해 확인됨). 생리학상 임신할 수 있는 모든 여성으로 규정된 가임 여성은 이들이 실험 전반에 걸쳐 및 실험 약물 중단 후 10일 동안 매우 효과적인 피임 방법을 이용하고 있지 않는 한 본 실험에 참여가 허용되지 않는다.
폐경후 여성이 이 실험에 참여할 수 있다. 적절한 임상 프로파일(예를 들어, 적절한 연령, 혈관운동 증상의 병력)을 갖는 12개월의 자연적(자발적) 무월경 또는 혈청 여포-자극 호르몬(FSH) 수준 > 40 mIU/mL을 갖는 6개월의 자발적 무월경을 갖거나 또는 적어도 검사 6주 전에 수술적 양측 난소절제술(자궁절제술이 동반되거나 동반되지 않음)을 받았거나 또는 난관 결찰을 갖는 경우에 여성은 폐경후 및 불임으로 간주된다. 난소절제술 단독의 경우에, 여성의 생식 상태가 추적 호르몬 수준 평가에 의해 확인된 경우에만 여성은 불임으로 간주된다.
성적 활동이 활발한 남성은 약물 복용 동안 및 치료 중지 후 3개월 동안 성관계시에 콘돔을 사용하여야 하며, 이 기간에는 아이를 갖지 않아야 한다. 콘돔은 또한 정액을 통한 약물의 전달을 방지하게 위해 정관 수술한 남성에서도 사용이 요구된다.
실험 치료
본 연구에 사용되는 임상시험용 약물은 화학식 (I)의 B-Raf 억제제, 화합물 B, 화합물 F, 화합물 H, 화합물 G 및 화합물 C이다.
실험 치료는 다음과 같다:
파트 I: 단일 제제 화학식 (I)의 B-Raf 억제제
파트 II: 이중 조합
화학식 (I)의 B-Raf 억제제(QD) 및 화합물 B(BID)
화학식 (I)의 B-Raf 억제제(QD) 및 화합물 F(QD)
화학식 (I)의 B-Raf 억제제(QD) 및 화합물 H(QD)
화학식 (I)의 B-Raf 억제제(QD) 및 화합물 G(BID)
화학식 (I)의 B-Raf 억제제(QD) 및 화합물 C(QD)
투여 요법
표 2 투여량 및 치료 스케줄
Figure 112021060126967-pat00009
화학식 (I)의 B-Raf 억제제 + 제2 제제 투여에 대한 지침
화학식 (I)의 B-Raf 억제제, 화합물 F, 화합물 H 및 화합물 C는 균일-고정 투여량으로서, 및 체중 또는 체표면적에 의하지 않고, 일일 스케줄(QD)로 경구로 투여될 것이다.
QD　투여:　환자는 오전에 큰 물잔(약 250 ml)으로 매일 화학식 (I)의 B-Raf 억제제(및, 화합물 F, 화합물 H 또는 화합물 C) 캡슐을 복용하도록 지시받게 된다. 모든 투여량 투여시 환자는 실험 약물 투여 전과 후 2시간 동안 단식해야 한다. 환자가 오전에 복용하는 것을 잊은 경우에, 그/그녀는 복용을 놓친 후에 6시간 내에 복용해야 한다. 6시간이 넘게 경과한 경우에는, 그 날의 복용은 보류되어야 하며, 환자는 다음 예정된 복용으로 치료를 계속하여야 한다. 어떠한 이유로 아침이 소비되지 않았다면, 환자는 물 한 잔과 예정된 오전 복용을 지속해야 한다. 이것이 전체 PK 표본화 당일에 일어난 경우, 이를 기록해야 한다.
화합물 B 및 화합물 G는 균일-고정 투여량으로, 체중 또는 체표면적에 의하지 않고, 일일 2회 스케줄(BID)로 경구 투여될 것이다.
BID 투여:　화합물 B 또는 화합물 G의 투여는 12±2시간 간격으로 이루어져야 한다. 환자는 가벼운 아침과 저녁으로 큰 물 한 잔(약 250 ml)과 함께 매일 복용하도록 지시받게 된다. 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 및 화합물 G 조합의 경우, 모든 투여량 투여시, 환자는 실험 약물 투여 전후 약 2시간 동안 단식해야 한다. 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 및 화합물 B 조합의 경우, 모든 아침 투여량 투여 일에, 환자는 실험 약물 투여 전 2시간 내에 아무것도 먹어서는 안 되고 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 및 화합물 B 투여 후 2시간 동안 음식을 자제해야 한다. 모든 저녁 투여량 투여시에 환자는 화합물 B 투여 전후 1시간 동안 단식해야 한다. 모든 약물(화학식 (I)의 B-Raf 억제제 + 화합물 B 또는 화합물 G)은 아침에 함께 복용해야 하고 BID 투여 약물(화합물 B 또는 화합물 G)만은 저녁에 복용해야 함을 유념해야 한다.
PK 표본화가 수행되는 경우에 일일 투여 지침:
투여전 PK 표본은 투여량 투여 직전에 수집되어야 한다.
각 방문시에, 담당자는 각 실험 약물의 적절한 투여량이 투여되는 것을 확인할 것이며, 후속 투여를 위한 실험 약물(들)의 정확한 양을 환자에게 제공할 것이다. 환자는 각 방문시에 미사용 실험 약물을 부서에 반환하도록 지시받을 것이다.
환자는 캡슐/정제를 삼켜야 하며 이를 씹거나 부수지 말아야 함을 지시받아야 한다.
놓친 임의의 투여는 건너뛰어야 하고, 다음 예정된 투여 동안 또는 다음날에 어느 것이 적용되던지 대체되거나 또는 보충하지 않아야 한다.
환자는 실험 의약과의 잠재적 CYP3A4 상호작용 때문에 자몽, 석류, 스타 과일, 세빌 오렌지 또는 각각의 주스를 함유하는 제품의 소비를 전체 실험 동안 및 바람직하게는 실험 의약의 첫 번째 투여 전 7일 동안 피해야 한다. 오렌지 주스는 허용된다.
치료 과정 동안 구토 및/또는 설사가 발생한다면, 환자의 재투여는 다음 예정된 투여 전에 허용되지 않는다. 투여 후 4시간 내의 임의의 구토 및/또는 설사(또는 증가된 배변 횟수)의 발생 및 빈도는 eCRF의 AE 섹션에서 언급되어야 한다. 또한, 전체 PK 표본화 당일에, 그날의 투여 후 처음 4시간 이내의 임의의 구토 에피소드의 개시 시간은 해당 투여량 투여 기록 PK eCRF에서 언급되어야 한다.
실험자 또는 담당자는 환자가 프로토콜에 따라 실험 약물을 복용하도록 지시하여야 한다(준수 촉구). 실험 동안 환자에게 처방 및 조제된 모든 투여량 및 모든 투여량 변화 및 모든 놓친 투여량은 투여량 투여 기록 eCRF 상에 기록되어야 한다. 약물 계량 관리는 정기적으로 수행되어야 한다. 환자는 각 주기의 종점에 미사용 실험 약물을 부서에 반환하도록 지시받을 것이다. 담당자는 각 실험 약물의 적절한 투여량이 각 방문시에 투여되는지 확인할 것이며, 후속 투여를 위한 약물의 정확한 양을 환자에게 제공할 것이다.
화학식 (I)의 B-Raf 억제제와 화합물 F만의 조합에 대해
공복시 혈당 모니터링을 수행할 때의 일일 투여에 대한 지침: 공복시 혈당 모니터링 날에, 환자는 채혈 전 적어도 8시간 동안 밤새 금식해야한다. 가벼운 아침/간식을 공복시 혈당을 유도한 후에 소비할 수 있다. 화학식 (I)의 B-Raf 억제제(및 적용가능한 경우 화합물 F)는 아침 식사 후 2 시간 뒤에 투여될 수 있다. 환자는 화학식 (I)의 B-Raf 억제제(및 적용가능한 경우 화합물 F) 투여 후 2 시간 동안 금식을 계속해야 한다.
치료 지속기간
환자는 수용할 수 없는 독성을 경험할 때까지 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 단일 제제에 의한 치료를 계속할 수 있고/있거나 실험자의 재량으로 또는 동의 철회 시에 치료는 중단된다. 질환 진행에서, 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 단일 제제 치료 후, 환자는 재발 조직 검사에서 확인된 유전적 변형에 의한 조합 치료에 배정될 것이다. 환자는 수용할 수 없는 독성, 질환의 진행을 경험할 때까지 조합 치료를 계속할 수 있고/있거나 치료는 실험자의 재량에 따라 또는 동의 철회 시에 중단된다.
투여량 증가 지침
시작 투여량의 이론적 근거
화학식 (I)의 B-Raf 억제제 단일 제제
이 실험의 첫 번째 파트에 등록된 환자에 대한 화학식 (I)의 B-Raf 억제제에 대한 투여량은 단일 제제 RP2D에 상응하는 450 mg QD로 설정된다. 시작 투여량의 선택은 암환자에서 수행된 첫 임상 시험용 투여량을 선택하기 위한 ICH S9 지침을 따르며 표 6-2에 나타나 있다.
화합물 B와 조합된 화학식 (I)의 B-Raf 억제제:
화학식 (I)의 B-Raf 억제제 + 화합물 B에 대한 시작 투여량은 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 600 mg QD 및 화합물 B 45 mg BID, 또는 안전한 것으로 입증된 최고 투여량의 조합으로 설정된다.
제2 제제(화합물 F, 화합물 H, 화합물 G 또는 화합물 C)와 조합된 화학식 (I)의 B-Raf 억제제:
이 실험의 두 번째 파트에서, 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 및 제2 제제에 대한 초기 투여량은 각각 450 mg QD(RP2D)이거나, 또는 최고 마지막 투여량은 화학식 (I)의 B-Raf 억제제의 허용된 값이고, 제2 제제의 최고 투여량은 BLRM에 의해 허용된 값일 것이다(표 3 참조).
화학식 (I)의 B-Raf 억제제의 RP2D는 450 ㎎ QD로 고지되었다.
정량적 DDI 평가는 동시에 투여되는 경우 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 또는 화합물 F 노출에 대해 큰 영향을 미치지 않을 것으로 예상했다. SimCYP 시뮬레이션을 이용한 정량적 분석은 이 평가를 확인했다. 따라서, 이러한 조합 쌍에 대한 시작 투여량은 화학식 (I)의 B-Raf 억제제에 대해서는 현재 설정된 RP2D 및 화합물 F에 대해서는 75% MTD: 45 mg QD 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 및 75 mg 화합물 F로 선택된다.
Simcyp 시뮬레이션을 이용한 정량적 DDI 평가는 화합물 H와 공동 투여되는 경우 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 노출에 최소한의 변화를 예상한다. 450 mg의 화학식 (I)의 B-Raf 억제제에서, 화합물 H의 노출(Cmax 및 AUC)은 20 내지 40% 감소할 것으로 예상된다. 따라서, 이 조합 쌍에 대한 시작 투여량은 화학식 (I)의 B-Raf 억제제에 대해서는 현재 설정된 RP2D 및 화합물 H에 대해서는 60% MTD: 450 mg QD 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 및 75 mg 화합물 H로 선택된다.
Simcyp 시뮬레이션을 이용한 정량적 DDI 평가는 450 mg QD 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 및 150 mg BID 화합물 G가 공동으로 투여되는 경우에 각각 화학식 (I)의 B-Raf 억제제의 AUC 및 Cmax에서 76% 및 43% 증가가 예상될 뿐만 아니라, 화합물 G의 AUC 및 Cmax에서 54% 및 36% 감소를 예상한다. 임상에서, 화학식 (I)의 B-Raf 억제제는 최대 700 mg QD 투여량으로 시험하고 관찰된 부작용은 가역적이고 관리가능하며, 따라서 2개 분자 간의 잠재적 DDI는, 현재 설정된 RP2D보다 더 높은 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 농도를 초래할 수 있지만, 부작용이 모니터링 가능하고 관리가능하고 가역적이기 때문에 위험하지 않다. 이러한 조합 쌍에 대한 시작 투여량은 화학식 (I)의 B-Raf 억제제에 대해서는 현재 설정된 RP2D이고 화합물 G에 대해서는 50% MTD: 450 mg QD 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 및 150 mg 화합물 G로 선택된다.
Simcyp 시뮬레이션을 이용한 정량적 DDI 평가는 450 mg QD 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 및 300 mg 화합물 C가 공동으로 투여되는 경우에 각각 화학식 (I)의 B-Raf 억제제의 AUC 및 Cmax에서 43% 및 20% 증가뿐만 아니라 화합물 C의 AUC 및 Cmax에서 43% 및 37% 감소를 예상한다. 임상에서, 화학식 (I)의 B-Raf 억제제는 최대 700 mg QD 투여량으로 시험하고 관찰된 부작용은 가역적이고 관리가능하며, 따라서 2개 분자 간의 잠재적 DDI는, 현재 설정된 RP2D보다 더 높은 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 농도를 초래할 수 있지만, 부작용이 모니터링 가능하고 관리가능하고 가역적이기 때문에 위험하지 않다. 이러한 조합 쌍에 대한 시작 투여량은 최대 내성 투여량(MTD)이 화합물 C: 450 mg QD 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 및 200 mg 화합물 C에 대해 달성되지 않았기 때문에 화학식 (I)의 B-Raf 억제제에 대해서는 현재 설정된 RP2D이고 900 mg QD 투여량 수준으로 현재 시험한 투여량의 약 23%이도록 선택된다.
본 실험에서는 모든 조합 파트너뿐만 아니라 이의 활성 대사(적용가능한 경우)의 약동학이 정상 상태에서 가능한 한 빨리 평가되고 잠재적인 약물-약물 상호 작용의 평가를 위해 각각의 단독 요법 실험에서 얻은 것과 비교될 것이다.
첫 번째 환자에게 조합물 중 하나를 투여하기 전에, 이 조합에 대한 베이지안 모델은 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 및 제2 제제에 대해 제안된 시작 투여량이 여전히 적절한지(즉, EWOC 기준에 부합하는지) 확인하기 위해 현재 진행 중인 단일 제제 실험으로부터의 가장 최근의 데이터로 업데이트될 것이다. 제안된 시작 투여량이 기준에 맞지 않는다면, EWOC 기준을 만족시키는 더 낮은 투여량의 조합이 사용될 것이다.
잠정 투여량 수준
하기 표 3은 이 실험 동안 평가될 수 있는 조합물에 대한 실험 치료의 시작 투여량 및 잠정 투여량 수준을 기재한다. 현재 명시되지 않은 추가의 투여량 수준이 등록될 수 있고 추가의 환자들은 이러한 변화가 최적의 안전성 및 내약성, 약동학 및 약력학적 데이터를 제공하기 위해 필요하다고 판단되는 경우에 이미 시험된 투여량 수준으로 등록될 수 있다.
표 3 잠정 투여량 수준
Figure 112021060126967-pat00010
* 추가 및/또는 중간 투여량 수준은 실험 과정 동안 안전성, PK 또는 PD를 더 잘 이해하기 위해 MTD 이하의 임의의 투여량 수준으로 첨가될 수 있다.
** 투여량 수준 -1 및 -2는 또한 시작 투여량으로부터 투여량 감소가 필요한 환자에 대해 사용된다. 투여량 수준 -2 아래의 투여량 감소는 이 실험에서는 허용되지 않는다.
투여량 증가 결정의 구현
제2 제제의 투여량을 증가시키기 위한 결정은 주기의 첫 번째 21일 동안 이중 조합의 개별 환자의 내성을 평가한 후에 이루어질 것이다.
투여량 증가 결정을 구현하기 위해, (부작용 및 DLT가 아닌 실험실 이상을 포함하는) 입수가능한 독성 정보, BLRM 권장 사항 및 입수가능한 PK 및 PD 정보는 모두 투여량 결정시 평가된다. 다음으로 높은 투여량 수준의 약물 투여는 실험자가 이전 투여량 수준의 결과를 평가하고 더 높은 투여량 수준으로 진행하는 것이 허용되는 것을 나타내는 확인서를 받을 때까지 진행하지 않을 수 있다. 더 높은 투여량 수준으로 증가하는 것이 결정되었지만 이전 투여량 수준으로 치료한 하나 이상의 추가 환자가 제1 치료 주기 동안 DLT를 경험하는 경우, BRLM은 임의의 추가 환자가 상기 높은 투여량 수준으로 등록하기 전에 이러한 새로운 정보로 업데이트될 것이다.
투여량 증가 과정은 단계적으로 구현될 것이고 3명의 환자의 코호트에 의해 진행할 것이다. 제2 제제인 화합물 F, 화합물 H, 화합물 G 또는 화합물 C만이 BLRM에 따라 증가될 것이다.
환자 내 투여량 증가는 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 단일 제제에 의한 파트 I 치료의 어느 시점에서든 허용되지 않는다.
제2 제제에 대한 환자 내 투여량 증가는 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 및 화합물 B(45 mg BID)의 조합의 공시된 RP2D로 치료되는 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 + 화합물 B 분기 환자를 제외하고는 조합 치료에 의한 제2 파트 동안 허용된다.
환자를 고 투여량의 화합물 F, 화합물 H, 화합물 G 또는 화합물 C로 치료하기 위해, 그 또는 그녀는 치료의 적어도 1 주기 동안 저 투여량을 견뎌야 한다(예를 들어, 그 또는 그녀는 실험 약물을 배제할 수 없는 CTCAE 등급≥2의 독성을 초기에 배정된 저 투여량 쌍으로 경험하지 않았어야 한다). 또한, 환자를 치료할 때 사용하는 더 고 투여량 쌍이 환자 내 상승에 사용되는 변형된 EWOC 기준을 충족시켜야 한다 (섹션에 기준 추가).
다음 코호트에서 새로 등록된 환자는 마지막 투여량 증가 회의에서 결정된 투여량으로 치료를 시작할 것이다. 이어서, 베이지안 로지스틱 회귀 모델(BLRM) 및 환자 내 투여량 경계가 다음 코호트에 대해 업데이트될 것이다.
치료 중단 및 치료 정지
환자가 다음 예정된 투여량의 의도된 날로부터 화학식 (I)의 B-Raf 억제제, 화합물 B, 화합물 F, 화합물 H, 화합물 C 또는 화합물 G의 21일 연속일 초과의 투여량 지연을 요구하는 경우, 환자는 실험 치료를 정지시켜야 한다. 예외적인 상황에서, 환자가 실험 치료로부터 명백히 혜택을 받고(즉, 안정 병변, 부분 반응, 완전 반응) 검사자의 의견에서 안전성에 대한 우려가 존재하지 않는 경우에, 환자는 안정성에 기초하여 조정된 투여량 수준으로 실험 치료에 남아있을 수 있다.
분자 예비-검사
분자 예비-검사 사전 동의서
분자 예비-검사 사전 동의서는 임의의 실험-관련된 분자 예비-검사 절차 이전에 서명해야 한다(BRAF의 돌연변이 상태가 이미 실험의 외부에서 평가된 경우에는 적용되지 않는다). 이는 파트 1 환자에게만 적용된다.
새로운 또는 보관 조직 검사상의 BRAF 돌연변이 상태
실험의 검사 단계로 들어가기 위해, 환자는 새로운 종양 조직 검사(바람직함)에서 국소적으로 얻거나 또는 입수가능한 가장 최근의 보관 종양 표본인 BRAF V600 돌연변이에 대한 문서를 작성해야 한다. 임의의 실험-관련된 분자 예비-검사 절차 이전에 예비-검사 사전 동의서에 서명해야 한다(돌연변이 상태가 이미 실험의 외부에서 평가된 경우에는 적용되지 않는다).
BRAF V600 코돈(예컨대, V600E/K/D/R)의 돌연변이가 일단 지정된 지역 실험실에서 확인되고 부서에서 문서화되면, 환자는 검사 절차를 시작할 수 있다.
치료 기간
치료 기간은 두 파트로 나누어진다:
파트 I: BRAF 억제제 무경험 환자는 주기 1의 1일째를 시작으로 21일 주기(달력으로 3주)로 화학식 (I)의 B-Raf 억제제로 지속적으로 투여될 것이다. 주기 사이에는 휴식기가 예정되어 있지 않을 것이다. 환자는 어느 것이든 먼저 질환 진행한 후 또는 수용할 수 없는 독성 발생 후 조합 치료의 시작 때까지 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 단일 제제를 받게 될 것이다.
파트 II: 적어도 하나의 21일 주기로 화학식 (I)의 B-Raf 억제제를 받은 진행된 환자는 파트 II로 들어가 재발 종양 조직 검사에서 확인된 유전적 변형에 기초하여 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 + 제2 제제의 치료 조합을 받게 될 것이다.
고정된 치료기간은 없다; 환자는 조합 치료까지 그리고 첫 번째 질환 진행 동안 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 단일 제제로 치료를 계속할 수 있고, 임의의 추가 치료를 배제하는 수용할 수 없는 독성이 발생하고/하거나 검사자의 재량에 따라 또는 환자의 거절(동의 철회)에 의해 정지된다. 첫 번째 질환 진행 시에, 조직 검사 분석 결과가 일단 알려지면, 환자는 두 번째 질환 진행까지 화학식 (I)의 B-Raf 억제제 + 제2 제제에 의한 조합 치료를 개시할 수 있고, 임의의 추가 치료를 배제하는 수용할 수 없는 독성이 발생하고/하거나 검사자의 재량에 따라 또는 환자의 거절(동의 철회)에 의해 정지된다.
환자가 실험에 남아 있는 경우, 환자는 21일을 초과하는 투여량 중단이 필요하지만, 환자는 객관적인 임상적 효과의 증거를 경험했기 때문에, 검사자의 의견에 따라 실험에 남아 있는 것이 환자에게는 최선의 이익이다.
베이지안 로지스틱 회귀 모델
EWOC 원리에 의해 유도된 적합성 BLRM은 그 각각의 MTD/RP2D에 대해 화학식 (I)의 B-Raf 억제제와 조합된 실험 약물 각각(화합물 F, 화합물 H, 화합물 G 또는 화합물 C)의 투여량 상을 유도할 것이다. 각각의 조합에 대해, 조합 치료를 위한 5-파라미터 BLRM은 화학식 (I)의 B-Raf 억제제와 조합하여 제공된 화합물 F, 화합물 H, 화합물 G 또는 화합물 C의 투여량-독성 관계를 모델링하기 위해 투여량 상승을 통해 축적된 주기 1 투여량-제한 독성 데이터(즉, DLT의 존재 또는 부재)에 대해 도시될 것이다.
BLRM의 정의, (표적 제제에 대해 현재 입수가능한 정보에 기초한) 모델 파라미터에 대한 종래 분포 및 관련된 DLT 비율의 사전 분포가 부록 1에 제공된다.
권장 투여량
조합 파트너에 대한 투여량 권장량은 파트 II에 진입하는 환자마다 다를 수 있는 화학식 (I)의 B-Raf 억제제의 투여량에 의존한다. 이러한 권장량은 평균값, 중간값, 표준편차, 95%-신뢰도 구간 및 확률을 비롯해 DLT 비율의 사후 개요에 기초하며, 각 투여량 조합에 대한 진정한 DLT 비율은 하기 카테고리 중 하나에 놓인다:
[0%, 16%] 투여량-미만
[16%, 35%] 표적 독성
[35%, 100%] 과도한 독성
EWOC의 원리에 따라, 환자의 각 코호트 후, 권장 투여량 조합은 25% 미만의 확률의 과도한 독성인 과다 기준을 충족시키는 투여량 중에서 대상 구간 [16%, 35%]에서 DLT의 가장 높은 사후 확률을 갖는 것이다. 또한, 2가지 실험 약물에 걸쳐 최대 코호트 간 조합 투여량 상승은 100%로 제한되며, 여기서 100%는 각각 화학식 (I)의 B-Raf 억제제(이 투여량은 450 mg을 초과함) 및 제2 표적 제제(이는 가능한 경우 s.a. MTD/RP2D 이상으로 상승할 수 없음)에 대해 각각의 실험 약물에 대한 상대적 상승률의 합, 즉 0% 및 100%를 지칭한다.
조합 파트너의 환자 내 투여량 상승은 50%로 제한되며, 개별 환자의 내성을 반영한 다음과 같은 변형된 EWOC 기준에 따른 BLRM에 의해 결정될 것이다: 환자는 40% 미만의 과도한 독성인 경우의 투여량까지 내부 상승될 수 있다. 또한, CTCAE 등급 2의 치료-관련 독성이 투여량 수준에서 2명 이상의 환자에서 관찰되거나 어떤 환자가 등급 3 이상의 독성을 경험하게 되는 경우, 조합 파트너의 투여량 증가는 임의의 후속 투여량 증가에 대해 25% 이하일 것이다.
가능한 독성 정보(DLT가 아닌 AE를 포함), PK, PD 및 효능 정보뿐만 아니라 베이지안 모델로부터의 권장량의 임상적 합성을 사용하여 투여량-증가 회의에서 다음 코호트에 대한 투여량 조합을 결정할 것이다. 검사원 및 시험 인력이 의사 결정에 참여할 것이다.
임의의 조합에 대한 모델은 코호트 중 첫 번째 2명의 평가가능한 환자가 3번째 환자 등록 전에 DLT를 경험하게 되는 경우 코호트에 임의의 추가 환자를 등록하기 전에 재평가될 것이다. 각 조합에 대한 최종 권장된 MTD/RP2D는 BLRM 권장량의 고려사항 및 시험한 모든 상이한 투여량 조합에서 후속 주기에서 내성 데이터로 고려되는 전체적인 안전성 평가에 기초할 것이다.
실시예 2
물질 및 방법
화합물 원액을 DMSO 중에 최종 농도 10 mM로 제조한다. 작업 원액을 적절한 세포 배양 배지 중에 3배 증분으로 계대 희석하여 2.7 μM 내지 1.2 nM 범위의 최종 검정 농도를 달성한다.
세포주, 세포 배양, 세포 생존율 측정
A-375 및 WM-266-4 세포를 아메리칸 타입 컬쳐 콜렉션(American Type Culture Collection: ATCC)으로부터 구입하였다. A-375 세포는 DMEM 배지(ATCC) 중에 배양하고, WM-266-4 세포는 EMEM 배지(ATCC) 중에 배양하였으며, 이들 둘 다 10% 태아 소 혈청(깁코(Gibco))으로 보충하고, 37℃/5% CO2에서 배양하였다. 흔히 발생하는 내성 대립유전자 지표를 발현하도록 조작된 세포주를 노바티스-에머리빌(Novartis-Emeryville)로부터 입수하였다. 이들 내성 모델은 돌연변이체 MEK1P124L, 말단절단된 p61-BRAFV600E 또는 돌연변이체 NRASQ61K를 발현하는 A-375 세포, 및 돌연변이체 MEK1C121S, 말단절단된 p61-BRAFV600E 또는 돌연변이체 NRASQ61K를 발현하는 WM-266-4 세포를 포함한다. 이들 세포를 선택 마커 G418를 함유한 적절한 모 배지 중에 및 5 uM LFE158(MEK 돌연변이체) 또는 LIH720(말단절단된 p61-BRAFV600E)의 존재 하에 배양하였다.
플레이트 구성, 세포 분배 및 화합물 첨가
검사를 위해, 세포를 8-채널 표준 카세트가 장착된 멀티드롭 콤비(MultiDrop Combi)(써모-피셔(Thermo-Fisher))를 사용하여 웰당 500(A-375) 또는 750(WM-266-4) 세포 밀도로 384-웰 플레이트(써모 사이언티픽(Thermo Scientific), cat# 4332) 내 배지 80 ul 중에 접종하였다. 전 웰에 걸친 세포의 균등 분배를 촉진하기 위해, 세포를 1000 RPM에서 간단히 원심분리하고, 실온에서 30분 동안 배양하였다. 모든 플레이트를 37℃, 5% CO2에서 24시간 동안 배양한 후에 화합물을 첨가하였다. 화합물 원액을 적절한 배양 배지 중에 새롭게 준비하고, 200 nl 핀 도구를 갖춘 PAA 로봇을 사용하여 첨가하였다. 최소 3개의 반복 웰에서, 72시간 후의 단일 작용제 및 조합물 효과를 제조업체의 프로토콜에 따라 셀 타이터 글로(Cell Titer Glo)(프로메가(Promega))를 통한 세포 ATP 수준의 정량화에 의해 그리고 현미경검사 영상화에 의해 둘 다 평가하였다. 영상화를 위해, 세포를 플레이트에 고정시키고, 제어된 분배 속도를 갖는 웰메이트(WellMate) 분배기를 통해 PBS 중 10% PFA, 0.3% TX-100의 용액과 함께 투과시켰다. 세포 핵을 훽스트(Hoechst) 33342(H3570, 인비트로젠(Invitrogen))로 염색하고, 모든 필요한 세척 단계를 바이오텍(BioTek) 세척기로 수행하였다.
자동화 영상 분석
인셀 애널라이저(InCell Analyzer) 2000(지이 헬스케어(GE Healthcare), 28-9534-63)로부터의 영상은 TIFF 포맷으로 있고, 2048x2048 픽셀의 크기를 가졌으며, 이는 384-웰 플레이트의 전 웰을 캡쳐한 것이다. 자동화 영상 분석 파이프라인은 오픈-소스, 통계 프로그래밍 언어 R에서의 주문-제작 스크립트 및 바이오컨덕터 패키지 이비이미지(BioConductor package EBImage)의 함수를 사용하여 설정하였다. 목적은 세포 생존율에 대한 근사치로서 웰 당 생존 핵(세포)의 수를 정량화하는 것이다. 파이프라인은 하기 7 단계로 구성되었다: (I.) 강도 피크의 수를 감소시키기 위한 이미지의 평활화, (II.) 포그라운드(foreground)(신호)를 백그라운드(background)(잡음)으로부터 분리하기 위한 임계 함수의 적용, (III.) 핵에 대한 시드로서 작용하는, 포그라운드에서의 국부 최대치의 확인, (IV.) 아주 근접한 국부 최대치의 필터링, (V.) 남아있는 국부 최대치로부터 핵의 확대, (VI.) 및 확대된 핵으로부터 목적하는 특징(핵의 수, 크기 특징 및 강도 특징)의 추출. 마지막 단계 (VII.)로서, 파편(예를 들어 단편화 핵)을 계수로부터 제외하기 위해, DMSO- 및 스타우로스포린-처리 웰에서 확인된 목적물을 사용하여 각각 생존 및 단편화 핵에 대한 특징 분포를 수득하였다. 이들을 사용하여 생존 및 단편화 핵을 구별하는 컷-오프를 설정하였다. 단편화 핵의 수를 확인된 목적물의 총 수에서 빼고, 결과는 그 웰에 대한 최종 계수로서 보고하였다.
데이터 정규화
데이터는 각 처리(화합물) 조건에 대한 삼중 측정, DMSO-처리된 웰의 42회 반복 측정, 스타우로스포린-처리된 웰의 이중 측정을 포함하였다. 데이터를 DMSO 측정의 중간값에 대해 정규화시키고, 삼중 중간값을 계산함으로써 요약하였다. 데이터를 챌리스(Chalice) 내로 입력하여 화합물 상승작용을 계산하였다.
표 4 -ATP-기반 CTG 분석법을 사용하여 결정된 단일 제제 IC50 값 및 조합 상승작용 점수 표
Figure 112021060126967-pat00011
표 5 - 현미경 분석법을 사용하여 결정된 단일 제제 IC50 값 및 조합 상승작용 점수 표
Figure 112021060126967-pat00012
실시예 3
7개의 BRAF-돌연변이 CRC-유래된 세포주에서의 RAF의 억제제(화학식 (I)의 화합물) 및 PIK3Cα(화합물 X) 키나아제에 대한 단일 제제 및 조합 효과. 모든 세포주는 BRAFV600E 단백질을 발현한다. PI3Ka 유전자에 알려지거나 추정 활성화 돌연변이를 갖는 세포는 (*)로 표시하고 PTEN 손실 세포는 (#)로 표시했다. 세포 증식은 72시간 셀 타이터 글로™ 분석에서 측정하고 모든 제공된 결과는 적어도 삼중 측정한 결과이다. 화학식 (I)의 화합물 및 화합물 X에 대한 단일 제제 IC50 값을 나타냈다. 상승작용 점수(SS) 측정뿐만 아니라 50% 효과 수준의 조합 지수(CI50)가 표 6에 각 조합에 대해 제공된다. SS 값이 2.0 이상이고 CI 값이 0.5 이하일 때 상호 상승작용이 있는 것으로 간주하였다. SS 값이 2.0 이상이지만 CI 값이 0.5 초과이거나 또는 SS 값이 2.0 미만이지만 CI 값이 0.5 이하일 때 상호 첨가적/상승작용적이라 한다. 첨가적이라는 용어는 SS 값이 2.0 미만이고 CI 값이 0.5 초과일 때 상호작용이 첨가적이라 한다. 상승작용은 "효과 설명" 칼럼에 제공되어 있다.
표 6
BRAFV600E 돌연변이 CRC 세포주에서 화학식 (I)의 화합물과 화합물 X의 조합물
Figure 112021060126967-pat00013
실시예 4
본 실시예는 생체 내 HT-29 및 RKO 세포주의 성장 모델에서 단일 제제로서의 화학식 (I)의 화합물 및 화합물 F와 조합물의 효과를 실험한다. 억제제에 대한 농도 및 투여 스케줄은 50 mg/kg q.d.(화학식 (I)의 화합물) 및 32.7 ㎎/㎏ q.d.(화합물 F)이었다. 모든 화합물은 이들이 단일 제제로서 존재하는 것처럼 조합하여 투여했다. 투여는 HT-29 모델에서 28일째 중지하고 RKO 모델에서 21일 후에 중지하였다. 결과를 각각 도 1 및 2에 보고하였다.
실시예 5
모든 세포주는 ATTC(SK-MEL-5, SK-MEL-24, UACC-62, COLO 741, COLO-800, WM-266-4, Colo205, LS411N, SW 1417), ECACC(MDST8), DSMZ(CL-34) 및 NCI(LOX IMVI)에서 구입하였다. 세포는 공급업체의 권장 사항에 따라 10%(또는 CL-34 세포에 대해 20%) FBS(GIBCO, 카탈로그 번호 10099-141)으로 보충된 RPMI1640(ATCC, 카탈로그 번호 30-2001) 또는 DMEM(ATCC, 카탈로그 번호 30-2002)에서 배향하였다. 세포주는 37oC, 5% C02 배양기에서 배양하고 T-75 플라스크에서 확장시켰다. 모든 경우에, 세포들을 동결 원액으로부터 해동하고, 1:3 희석액을 사용하여 1개 이상의 통로를 통해 확장시키고, 계수하고, 바이셀(ViCell) 카운터(베크만-코울터)를 사용하여 생존력을 평가한 후, 96-웰 또는 6-웰 플레이트에 플레이팅하였다. 세포주를 분할하고 확장하기 위해, 세포들을 0.25% 트립신-EDTA(GIBCO, 카탈로그 번호 25200)를 사용하여 플라스크에서 탈락시켰다. 모든 세포주는 이덱스 라딜(Idexx Radil)(미국 미주리주 콜롬비아)에서 수행된 PCR 검출 방법에 의해 결정하고 SNP 패널 검출에 의해 정확히 식별된 바와 같이 미코플라즈마 오염이 없는 것으로 결정되었다.
화학식 (I)의 화합물 및 화합물 H를 l0 mM 농도로 100% DMSO(셀그로(Cellgro), 카탈로그 번호 25-290-CQC)에 용해시키고, 사용할 때까지 -20oC에서 저장했다. 화합물을 2 ㎖ 들이 96-웰 플레이트(그라이너 바이오-온(Greiner bio-one) 카탈로그 번호 780271)에 배열하고, 일곱 번 3배로 계대 희석시켜 22 nM 내지 16200 nM 농도 범위를 수득했다. 재조합 인간 FGF 염기성은 R&D 시스템(카탈로그 번호 233-FB)에서 구입하고, 멸균 PBS에서 50 ㎍/㎖로 재구성했다. 이는 모든 실험에서 고정 농도 100 ng/㎖로 사용하였다.
셀타이터-글로(CellTiter-Glo™) 분석의 경우, 세포를 80 μL의 최종 부피의 배지 및 웰 당 3000개의 세포 밀도로 조직 배양 처리된 96-웰 플레이트(코스타(Costar), 카탈로그 번호 3904)에 분배하였다. 플레이팅 12 내지 24시간 후, 각각의 화합물 희석 시리즈 20 μL를 세포 함유 플레이트로 옮기고, 3배 희석시켜 2700 nM 내지 3.7 nM의 화합물 농도 범위 및 최종 DMSO 농도 0.16%를 생성하였다. 각 웰의 총 부피는 120μL였다. 플레이트를 72시간 동안 배양하고, 세포 증식에 대한 화합물의 효과를 셀타이터-글로 발광 세포 생존 분석(CTG, 프로메가(Promega)) 및 빅터(Victor™) X4 플레이트 리더(퍼킨 엘머)를 사용하여 측정했다. 실시간 성장 분석을 위해 세포를 xCELLigence E-플레이트(로슈 카탈로그 번호05232368001)에 총 90μL의 배지에서 웰 당 4000개 세포 농도로 접종하고, 플레이팅 24시간 후, 화합물이 있거나 없는 11 μL의 배지를 웰에 첨가하였다. 2 내지 4개 복제 웰을 LGX818 + FGF2 처리된 COLO 741 셀(N =1)을 제외하고는 모든 세포주 및 치료 군에 대해 플레이팅하였다. 여기서 화합물의 최종 농도 및 성장 인자를 나타내는 경우, 화합물 H에 대해서는 1 uM이고, FGF2에 대해서는 100 ng/ml이고, 화학식 (I)의 화합물에 대해서는 100 nM(SK-MEL-5) 또는 500 nM(COLO 741)이었다. 세포들을 xCELLigence 실시간 임피던스 기반 세포 분석기를 사용하여 7일 동안 매 2시간 간격으로 모니터링하였다. 임피던스는 E-플레이트 상의 전극을 사용하여 측정하였고, 이때 세포의 표면적 비율이 증가함에 따라 더 큰 임피던스를 생성하였다. 전극 임피던스는 셀 인덱스 값으로 표시하고, 세포 생존율 및 개수에 대한 프록시로서 사용하였다. 모든 경우에 셀 인덱스 값은 화합물을 첨가 후 즉시 정규화하였다.
웨스턴 분석을 위하여, 세포들은 완전 배양 배지 2.0 ㎖ 중에 웰 당 5 × 105 세포의 밀도로 6-웰(코스타, 카탈로그 번호 3506) 플레이트에서 플레이팅하였다. 12 내지 24시간 플레이팅한 후, 세포를 다양한 화합물로 처리하고 모든 실험에서 화학식 (I)의 화합물, 화합물 H 및 FGF2를 각각 100 nM, 1.O uM 및 100 ng/ml의 최종 농도에서 사용하였다. 세포를 포스파타아제(포스스탑(PhosStop), 로슈 카탈로그 번호 04906845001) 및 단백질 분해효소 억제제(로슈, 카탈로그 번호 11697498001)로 보충된 새로 제조된 세포 용해 버퍼(셀 신호화 테크놀로지 카탈로그 번호 9803)에 화합물을 첨가한 후 2시간 및 24시간째에 수확하였다. 세포 용해물로부터의 단백질을 NuPAGE 4 내지 12% 비스-티스 미디 겔(노벡스(NOVEX), 카탈로그 번호 WG1402BX10)를 통해 전기영동에 의해 분리하고, 니트로셀룰로오스 멤브레인으로 옮기고, 이어서 이를 p-AKT(S473, 카탈로그 번호 4058), 총 AKT(카탈로그 번호 2920), p-ERK1/2(T202/Y204, 카탈로그 번호 9101), 총 ERK1/2(카탈로그 번호 9107), p-MEKl/2(S217/221, 카탈로그 번호 9121) 및 β-액틴(앰비온, 카탈로그 번호 AM4302)를 인식하는 셀 신호화 테크놀로지(미국 메사추세츠주 댄버스(Danvers))로부터의 항체와 함께 배양하였다. 웨스턴 블롯은 IRDye 680RD 염소 항-토끼 IgG(Li-Cor, 카탈로그 번호 926-68071) 및 IRDye 800 CW 염소 항-마우스 IgG(Li-Cor, 카탈로그 번호 926-32210)으로 배양하고 오디세이 적외선 이미저 시스템(Li-Cor, 미국 네브라스카주 링컨)으로 스캔하여 시각화하였다.
FGFR이 화학식 (I)의 화합물로 처리된 BRAFV600E 돌연변이 흑색종 세포주의 서브세트를 구제할 수 있는지 여부를 결정하기 위해, 이의 항-증식 효과를 FGFR-활성화 리간드 FGF2의 존재 또는 부재 하에서 11개의 T1799 돌연변이 BRAF 세포주에서 검사하였다. FGF2가 없는 경우, IC50 값은 6개 흑색종 및 5개 CRC-유래 세포주에서 각각 3.0 내지 470 nm 및 4.0 내지 185 nM였다(표 7). 세포주 6개에 대해 측정된 IC50 값은 FGF2의 존재에 의해 영향을 받지 않았지만, 화학식 (I)의 화합물에 대한 나머지 5개 세포주 응답은 크게 감소하였거나(예컨대, CL-34) 또는 완전히 없어졌다(예컨대, ls 411N). 따라서 FGF2의 존재 하에 화학식 (I)의 B-Raf 억제제의 항-증식성 효과로부터 BRAFV600E 흑색종-유래 세포주 세트를 구제할 수 있다. 또한, 마찬가지의 효과가 또한 CRC 종양으로부터 유래된 BRAFV600E 돌연변이 세포주에서 관찰된다.
표 7
Figure 112021060126967-pat00014
BRAF T1799 돌연변이 흑색종 및 CRC 세포주의 패널에서 100 ng/㎖ FGF2의 존재 또는 부재의 화학식 (I)의 화합물에 대한 단일 제제 IC50 값. 돌연변이(mut) 및 야생형(wt) 상태는 게시된 데이터에서 결정되었다. 모든 BRAF 돌연변이는 각각 V600K 및 V600D을 갖는 MDST8(mut*) 및 WM-266-4(mut**)의 경우를 제외하고 V600E 대체 결과를 낳는다. PTEN mut 지정은 PTEN 유전자에 대한 돌연변이, 유전자 카피 수 및 mRNA 발현 정보에 기초하여 요약해서 나타낸다.
FGF2에 의해 BRAFV600E 흑색종 세포주 구제가 FGFR 신호화에 의존하는지 여부를 확인하기 위해, 본 발명자들은 선택적 FGFR 억제제 화합물 H가 FGF2-매개 구제를 억제하는지 여부를 조사했다. FGF2(COLO 741 및 SK-MEL-5, 표 8-1)로 다양한 정도로 구제된 두 세포주를 화합물 H의 존재 또는 부재 하에 화학식 (I)의 화합물 및 FGF2를 함유하는 배지에서 배양하고 성장을 실시간으로 측정하였다.
이전 IC50 데이터와 일치되게, 화학식 (I)의 화합물은 두 세포주의 성장을 억제했고, 이러한 성장 억제는 FGF2의 첨가에 의해 없어졌다(도 3). 단일 제제로서, 화합물 H는 어느 세포주에도 영향을 미치지 않았고(SK-MEL-5에 대해 미도시된 패널 A), FGF2의 부재 하에 화학식 (I)의 화합물과 조합될 때 그 단일 제제 활성에 기여하지 않았다. FGF2의 존재 하에 화학식 (I)의 화합물과 조합할 때, 화합물 H는 FGF2의 부재 하에 관찰된 수준으로 항-증식성 효과를 회복했다. 이러한 결과는 FGF2 매개된 구제가 선택적 FGFR 억제제 화합물 H의 첨가로 억제될 수 있음을 나타낸다.
회복된 MAPK 또는 활성화된 PIK3C 신호화가 FGF2-매개된 구제에 기초하는 지를 조사하기 위해, MAPK 및 PIK3C 신호화에 대한 FGF2의 효과를 인산화 MEK1/2(MAP2K1/2), ERK1/2(MAPK1/2) 및 AKT1/2/3의 웨스턴-블롯 분석을 통해 검사했다. 도 4에 도시된 바와 같이, 화학식 (I)의 화합물과 함께 COLO 741 및 SK-MEL-5 세포의 배양은 인산화 MEK 및 ERK의 수준 감소로 판단시 화합물 첨가 후 2시간 및 24시간에서 MAPK 신호화의 현저한 억제를 초래했다. AKT의 인산화 수준은 2시간에서 영향을 받지 않았지만, COLO 741 세포에서 24시간에서 완만한 감소를 보였다. 대조적으로, FGF2 또는 화합물 H는 단일 제제로 첨가될 때 2시간 또는 24시간에서 신호화 영향을 받지 않았다. FGF2 및 화학식 (I)의 화합물을 조합한 경우, 화학식 (I)의 화합물 하나에 대한 신호화에는 약간의 변화가 처리 후 2시간에서 관찰되었지만(p-ERK의 약간의 증가가 SK-MEL-5 세포에서 관찰되었다), 인산화 MEK 및 ERK의 수준은 대부분(완전히는 아니지만) 24시간째에 회복되었다. 마지막으로, 화학식 (l)의 화합물/FGF2 조합물에 대한 첨가 화합물 H는 MAPK 및 PIK3C 신호화에서의 FGF2-유도 변화를 완전히 말소시켰다. 이러한 데이터는 MAPK 신호화의 재-활성화로 인한 FGF2 결과에 의해 B-Raf 억제제의 항-증식성 효과가 억제됨을 강하게 시사하고 있으며, 화합물 H가 이러한 FGF2 유도된 신호화 변화를 완전히 억제할 수 있음을 의미한다.
실시예 6
목적: 5 mg/kg 화학식 (I)의 화합물의 존재 하에 성장된 그리고 이에 대해 내성인 HMEX1906 1차 흑색종 모델(HMEX1906-R5)에서 화학식 (I)의 화합물과 CDK 4 억제제 화합물 C의 조합의 효능을 평가하기 위한 것이다.
약물 제형: 화합물 C는 0.5% MC/0.5% 트윈(Tween) 80으로 제형화하고, 화학식 (I)의 화합물은 20% PEG300/3% ETPGS로 제형화하였다.
종양을 현탁액 같은 세포주 내로 자르고/잘게 썰었다(종양 균질화). 7 mL의 마트리겔(matrigel) 및 1.5 mL의 HBSS를 가했다. 마트리겔이 두꺼워질 때까지 현탁액을 팜(palm)에서 가온하고, 암컷 누드 마우스의 18G 바늘 피하로(s.c.) 오른쪽 측면으로 이식했다.
마우스를 266 ㎣의 평균 종양 부피 및 25 g의 평균 체중으로 이식한 후 18일째 하기 그룹으로 배정하였다.
그룹: 10마리 마우스/그룹, 경로 PO, 투여량 부피 0.2 mL
그룹 1: 비히클, 0 mg/kg bid xl4
그룹 2: 화합물 C, 250 ㎎/㎏ qd x21
그룹 3: 화학식 (I)의 화합물, 5 ㎎/㎏ bid x21
그룹 4: 화합물 C 250 ㎎/kg qd x21 + 화학식 (I)의 화합물 5 ㎎/㎏ bid x21
결과:
Figure 112021060126967-pat00015
*3마리의 마우스는 큰 종양으로 인해 안락사시켰다.

Claims (3)

  1. 하기 화학식 (I)의 화합물을 포함하는, 환자에서 B-Raf에서의 V600 돌연변이를 특징으로 하는 흑색종을 치료하기 위한 조성물로서, 상기 조성물이 화합물 B인 Mek 1/2 억제제와 조합하여 투여되는, 조성물:
    [화학식 (I)]
    Figure 112022024231011-pat00022

    [화합물 B]
    Figure 112022024231011-pat00023
    .
  2. 화합물 B인 Mek 1/2 억제제를 포함하는, 환자에서 B-Raf에서의 V600 돌연변이를 특징으로 하는 흑색종을 치료하기 위한 조성물로서, 상기 조성물이 하기 화학식 (I)의 화합물과 조합하여 투여되는, 조성물:
    [화학식 (I)]
    Figure 112022024231011-pat00024

    [화합물 B]
    Figure 112022024231011-pat00025
    .
  3. 삭제
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Families Citing this family (17)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
SG10201906270VA (en) 2013-03-21 2019-08-27 Novartis Ag Combination therapy comprising a b-raf inhibitor and a second inhibitor
WO2015191996A1 (en) * 2014-06-13 2015-12-17 Genentech, Inc. Methods of treating and preventing cancer drug resistance
CN105753869B (zh) * 2015-04-01 2018-09-25 苏州晶云药物科技有限公司 一种cdk抑制剂和mek抑制剂的共晶及其制备方法
BR112017021283A2 (pt) * 2015-04-16 2018-06-26 Novartis Ag comprimido de ribociclib
CA2986739C (en) * 2015-05-22 2023-03-14 Plexxikon Inc. Plx-8394 or plx-7904 for use in the treatment of braf-v600-related diseases
CN105732642B (zh) * 2015-11-18 2018-09-25 苏州晶云药物科技有限公司 一种cdk抑制剂和mek抑制剂的共晶及其制备方法
CN109562103A (zh) * 2016-02-19 2019-04-02 国家医疗保健研究所 用于治疗pik3ca相关过度生长综合征群的方法
SG11201810793XA (en) 2016-06-03 2018-12-28 Giordano Caponigro Pharmaceutical combinations
CN107058565A (zh) * 2016-08-31 2017-08-18 郭军 肢端型黑色素瘤的诊断和治疗
US10973829B2 (en) * 2016-09-19 2021-04-13 Novartis Ag Therapeutic uses of a C-RAF inhibitor
US20200087732A1 (en) 2016-12-20 2020-03-19 Eth Zurich Identification of drugs targeting non-genetic drug tolerance programs in cancer
AU2018269982A1 (en) * 2017-05-16 2020-01-02 Biomed Valley Discoveries, Inc. Compositions and methods for treating cancer with atypical BRAF mutations
WO2018218633A1 (en) * 2017-06-02 2018-12-06 Beijing Percans Oncology Co. Ltd. Combination therapies for treating cancers
WO2019195959A1 (en) 2018-04-08 2019-10-17 Cothera Biosciences, Inc. Combination therapy for cancers with braf mutation
WO2023212071A1 (en) * 2022-04-26 2023-11-02 Beigene Switzerland Gmbh Combination and the use thereof
WO2023230554A1 (en) 2022-05-25 2023-11-30 Pfizer Inc. Combination of a braf inhibitor, an egfr inhibitor, and a pd-1 antagonist for the treatment of braf v600e-mutant, msi-h/dmmr colorectal cancer
WO2023240178A1 (en) * 2022-06-08 2023-12-14 Mapkure, Llc Methods of treating cancer with a b-raf inhibitor

Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2012068468A1 (en) 2010-11-19 2012-05-24 Glaxosmithkline Llc Method of treatment with braf inhibitor

Family Cites Families (26)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
UA76837C2 (uk) 2002-03-13 2006-09-15 Еррей Байофарма Інк. N3 алкіловані похідні бензімідазолу як інгібітори мек
US7235537B2 (en) 2002-03-13 2007-06-26 Array Biopharma, Inc. N3 alkylated benzimidazole derivatives as MEK inhibitors
SG148857A1 (en) * 2002-03-13 2009-01-29 Array Biopharma Inc N3 alkylated benzimidazole derivatives as mek inhibitors
US7144907B2 (en) 2003-09-03 2006-12-05 Array Biopharma Inc. Heterocyclic inhibitors of MEK and methods of use thereof
AU2004293019B2 (en) 2003-11-19 2010-10-28 Array Biopharma Inc. Bicyclic inhibitors of MEK and methods of use thereof
GB0512324D0 (en) 2005-06-16 2005-07-27 Novartis Ag Organic compounds
US20060134068A1 (en) * 2004-11-09 2006-06-22 Mount Sinai School Of Medicine Of New York University Treatment of cancer by simultaneous inhibiton of BRAF and restoration or mimicry of p16INK4A activity
GB0510390D0 (en) 2005-05-20 2005-06-29 Novartis Ag Organic compounds
TW200804345A (en) 2005-08-30 2008-01-16 Novartis Ag Substituted benzimidazoles and methods of preparation
JO2660B1 (en) * 2006-01-20 2012-06-17 نوفارتيس ايه جي Pi-3 inhibitors and methods of use
TWI398252B (zh) 2006-05-26 2013-06-11 Novartis Ag 吡咯并嘧啶化合物及其用途
CN109970735A (zh) * 2006-11-20 2019-07-05 诺华公司 化合物的盐和晶型
MX2010012718A (es) * 2008-05-21 2011-04-04 Incyte Corp Sales de 2-fluoro-n-metil-4-[7-(quinolin-6-il-metil)-imidazo[1,2-b ][1,2,4] triazin-2-il]benzamida y procesos relacionados con la preparacion de las mismas.
WO2010020675A1 (en) 2008-08-22 2010-02-25 Novartis Ag Pyrrolopyrimidine compounds as cdk inhibitors
UA104147C2 (uk) * 2008-09-10 2014-01-10 Новартис Аг Похідна піролідиндикарбонової кислоти та її застосування у лікуванні проліферативних захворювань
JO3002B1 (ar) * 2009-08-28 2016-09-05 Irm Llc مركبات و تركيبات كمثبطات كيناز بروتين
KR20120097496A (ko) 2009-10-12 2012-09-04 글락소스미스클라인 엘엘씨 조합물
TWI480276B (zh) * 2010-08-27 2015-04-11 Irm Llc 作為蛋白質激酶抑制劑之化合物及組合物
US20130004481A1 (en) 2011-01-12 2013-01-03 Boehringer Ingelheim International Gmbh Anticancer therapy
WO2012145503A1 (en) * 2011-04-21 2012-10-26 Novartis Ag Pharmaceutical combinations
WO2012178038A1 (en) * 2011-06-24 2012-12-27 The Broad Institute, Inc. Methods of treating cancer
EP2570127A1 (en) * 2011-09-16 2013-03-20 Sanofi Compositions and methods for treating cancer using PI3KB beta inhibitor and MAPK pathway inhibitor, including MEK and RAF inhibitors
MX2014002990A (es) * 2011-09-19 2014-05-21 Genentech Inc Tratamientos combinados que comprenden antagonistas de c-met y antagonistas de b-raf.
AR091876A1 (es) * 2012-07-26 2015-03-04 Novartis Ag Combinaciones farmaceuticas para el tratamiento de enfermedades proliferativas
PT2882440T (pt) 2012-08-07 2019-04-23 Array Biopharma Inc Combinações farmacêuticas compreendendo um inibidor de braf, um inibidor de egfr e opcionalmente um inibidor de pi3k-alfa
SG10201906270VA (en) 2013-03-21 2019-08-27 Novartis Ag Combination therapy comprising a b-raf inhibitor and a second inhibitor

Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2012068468A1 (en) 2010-11-19 2012-05-24 Glaxosmithkline Llc Method of treatment with braf inhibitor

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
P&T Vol. 38 No. 2, (2013. 02).

Also Published As

Publication number Publication date
WO2014147573A2 (en) 2014-09-25
AU2014233805B2 (en) 2018-10-18
PH12015502040A1 (en) 2016-01-18
AR095699A1 (es) 2015-11-04
JP2019055978A (ja) 2019-04-11
NZ712184A (en) 2020-01-31
KR20210110794A (ko) 2021-09-09
HK1214135A1 (zh) 2016-07-22
JP6742391B2 (ja) 2020-08-19
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IL272921B (en) 2022-10-01
BR112015023483A8 (pt) 2019-12-03
CL2015002807A1 (es) 2016-05-13
EA201591842A1 (ru) 2016-01-29
IL241188B (en) 2021-02-28
UA118846C2 (uk) 2019-03-25
CA2907704A1 (en) 2014-09-25
BR112015023483B1 (pt) 2022-07-19
IL241188A0 (en) 2015-11-30
MA44934A1 (fr) 2020-01-31
KR20150132205A (ko) 2015-11-25
CL2018001371A1 (es) 2018-09-07
CN112641787A (zh) 2021-04-13
JP2016522160A (ja) 2016-07-28
PL2976106T3 (pl) 2021-10-25
PH12015502040B1 (en) 2016-01-18
ZA201800424B (en) 2022-10-26
TN2015000389A1 (en) 2017-01-03
PE20151785A1 (es) 2015-12-20
SI2976106T1 (sl) 2021-08-31
MX2015013466A (es) 2016-06-21
GT201500249A (es) 2017-09-01
IL272921B2 (en) 2023-02-01
US20160296520A1 (en) 2016-10-13
US20180221370A1 (en) 2018-08-09
ES2870716T3 (es) 2021-10-27
US10548894B2 (en) 2020-02-04
MA44934B1 (fr) 2021-11-30
SG10201906270VA (en) 2019-08-27
IL272921A (en) 2020-04-30
US20200246338A1 (en) 2020-08-06
CA2907704C (en) 2023-01-10
JOP20140128B1 (ar) 2021-08-17
KR102258698B1 (ko) 2021-06-01
WO2014147573A3 (en) 2014-12-11
CN105209073A (zh) 2015-12-30
MY181085A (en) 2020-12-17
EP2976106A2 (en) 2016-01-27
TW201440770A (zh) 2014-11-01
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TWI603734B (zh) 2017-11-01
US9913844B2 (en) 2018-03-13
SG11201507730UA (en) 2015-10-29
EP2976106B1 (en) 2021-04-14
BR112015023483B8 (pt) 2023-01-31
NZ751830A (en) 2020-09-25
AU2014233805A1 (en) 2015-10-01
BR112015023483A2 (pt) 2017-07-18
DK2976106T3 (da) 2021-06-14
CY1124776T1 (el) 2022-11-25

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