JP7374765B2 - 抗dkk-1抗体を使用して癌を治療するためのバイオマーカーとしてのベータ-カテニンの使用 - Google Patents

抗dkk-1抗体を使用して癌を治療するためのバイオマーカーとしてのベータ-カテニンの使用 Download PDF

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Description

関連出願の相互参照
本出願は、2016年10月26日に提出された米国仮特許出願第62/413,198号明細書の利益を主張する。上記の出願の全教示は、参照によって本明細書に組み込まれる。
癌は、公衆衛生にとって重大な脅威であり続けており、予後が不良で、多くの型に利用可能な治療が限られている。癌、特に食道癌、子宮癌、肝癌、および肝内胆管癌または胆管癌を治療する際に効能を増加させることができる療法の深刻な、未だ対処されていない必要がある。本出願は、そのような療法を提供する。
本発明は、治療を必要とする対象において癌(たとえば食道腺癌)を治療するための方法に関する。
したがって、一態様では、本発明は、その必要がある対象において癌を治療するための方法である。癌は、食道癌、子宮癌、肝癌、または肝内胆管癌とすることができる。その代わりに、癌は、胃癌とすることができる。方法は、対象に、治療有効量の抗Dkk-1抗体またはその抗原結合断片を投与するステップを含み、対象は、ベータ-カテニンタンパク質(配列番号2)の恒常的に活性化している突然変異を有することが決定される。
別の態様では、本発明は、癌に罹患している対象を治療するための方法である。癌は、食道癌、子宮癌、肝癌、または肝内胆管癌とすることができる。その代わりに、癌は、胃癌とすることができる。方法は、対象から新生物細胞のサンプルを得るステップ;サンプルにおけるベータ-カテニンタンパク質の配列を決定するステップ;およびベータ-カテニンタンパク質の配列(配列番号2)が恒常的に活性化している突然変異を含む場合、対象に、治療有効量の抗Dkk-1抗体またはその抗原結合断片を投与するステップを含む。
さらに別の態様では、本発明は、その必要がある対象において癌を治療するための方法である。癌は、食道癌、子宮癌、肝癌、または肝内胆管癌とすることができる。その代わりに、癌は、胃癌とすることができる。方法は、対象に、治療有効量の抗Dkk-1抗体またはその抗原結合断片を投与するステップを含み、対象は、ベータ-カテニンタンパク質(配列番号2)の恒常的に活性化している突然変異を有する。
前述のものは、添付の図面において例証されるように、本発明の例となる実施形態についての以下のより詳細な説明から明らかになるであろう。図面は、必ずしも一定の縮尺ではなく、それよりも、本発明の実施形態を説明することに重点を置いている。
DKN-01療法を受けている患者におけるCTNNB1(ベータ-カテニン)タンパク質突然変異データの分析を示す表を示す図である。 食道癌に罹患しており、かつパクリタキセルおよびDKN-01の併用療法を命じられた患者105-023における病変サイズの変化を示す(サイズのパーセントで)プロットを示す図である。患者105-023は、CTNNB1(ベータカテニン)遺伝子のエクソン2~4の欠失を有することが示された。 研究の最初およびサイクル10での患者105-023の標的病変の断層撮影画像を示す図である。 ヒトCTNNB1遺伝子の配列を示す図である。 ベータ-カテニンタンパク質の突然変異の例を示す表1をまとめて示す図である。
本発明の例となる実施形態の説明が続く。
Dickkopf-1(Dkk-1)は、古典的Wnt/β-カテニンシグナル伝達経路の天然の阻害剤として作用するタンパク質である。Wnt経路は、細胞成長、細胞増殖、幹細胞維持、細胞分化、細胞極性、骨発生、および成人組織恒常性維持などのような多くの生物学的プロセスに影響を及ぼす。
古典的Wnt/β-カテニンシグナル伝達経路において、細胞外Wntリガンドは、その関連する受容体「Frizzled」に結合し、膜貫通リポタンパク質LPR5およびLPR6(低密度リポタンパク質受容体関連タンパク質5および6)共受容体をさらに動員する。Wnt/Frizzled/LPR5/6複合体の形成は、β-カテニンタンパク質、CTNNB1遺伝子の遺伝子産物によって媒介されるものを含めて、いくつかの細胞内シグナル伝達カスケードを引き起こす。特に、Wnt/Frizzled/LPR5/6複合体の形成は、ベータ-カテニンリン酸化の阻害により、ベータ-カテニンの細胞質内レベルの安定化をもたらす。リン酸化ベータ-カテニンは細胞質において分解されるが、非リン酸化ベータ-カテニンは核に移動し、そこで、成長因子の中でも、たとえばサイクリンD1、c-myc、c-jun、シクロオキシゲナーゼ-2、マトリックスメタロプロテアーゼ-7、血管内皮成長因子、およびサバイビンの標的遺伝子発現を増強する。Wnt/Frizzled/LPR5/6複合体からのシグナルがない限り、ベータ-カテニンは、グリコゲンシンターゼキナーゼ3β(GSK3β)およびカゼインキナーゼI(CKI)などのような細胞内キナーゼによってリン酸化される。Wnt/Frizzled/LPR5/6複合体からのシグナルの伝達は、このリン酸化を阻害する。
細胞外Dkk-1は、LPR5/6共受容体に結合し、Wntリガンド結合を妨げる。これは、ベータ-カテニンリン酸化および続くその分解の再開をもたらし、したがって、古典的Wntシグナル伝達経路を阻害する。
ヒトCTNNB1のヌクレオチド配列およびゲノム(染色体)座標についてはURL「https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/1499」を参照。手短に言えば、CTNNB1遺伝子のゲノム(染色体)座標は、chr3:41,240,942-41,281,939である。座標はすべて、build GRCh37/hg19からのものである。CTNNB1のヌクレオチド配列は、配列番号1(大文字によって示すエクソンを含む)において提供される。ベータ-カテニンまたはベータ-カテニンタンパク質と本明細書において呼ばれるヒトCNNTB1遺伝子の遺伝子産物は、配列番号2によって提供される配列を有するタンパク質(UniProt受入番号P35222)である。配列番号2においてアミノ酸残基1~4(エクソン2)、5~81(エクソン3)、および82~165(エクソン4)に対応するエクソン2、3、および4が特に興味深い。エクソン2~4のアミノ酸配列は、それぞれ、配列番号3、4、および5によって提供される。
本明細書において使用されるように、「ベータ-カテニンタンパク質の恒常的に活性化している突然変異」は、野生型タンパク質と比較した場合に、機能的に細胞核にシグナルを伝達することができるベータ-カテニンの細胞レベルの上昇をもたらす、ベータ-カテニンのアミノ酸配列の突然変異を指す。ベータ-カテニンの恒常的に活性化している突然変異の例は、Wnt/Frizzled/LPR5/6複合体の非存在下においてGSK3-ベータキナーゼおよび/またはカゼインキナーゼIによってリン酸化することが結果としてできない突然変異を含む。そのような突然変異の例は、エクソン2~4の欠失、エクソン3のまたはエクソン3内の欠失、ならびに配列番号2のSer33、Ser37、Thr41、およびSer45などのような、Wnt/Frizzled/LPR5/6複合体の非存在下においてリン酸化されるセリン残基およびトレオニン残基の突然変異を含む。
様々な実施形態では、ベータ-カテニンタンパク質の突然変異は、表1に列挙され、図4A~4Dにおいて示される突然変異から選択される。
当業者らが認識するように、本明細書において使用される「食道癌」は、食道および食道胃接合部の癌を指す。当技術分野において一般に使用されるように、食道癌は、食道扁平上皮癌(ESCC)および食道腺癌(EAC)を含む。一般に、ESCCは、扁平上皮細胞において生じる癌を指し、これらの細胞は、器官のおよそ上部2/3の食道を裏打ちしている。EACは、腺細胞において生じる癌を指し、腺細胞は、典型的に食道の下部1/3の扁平上皮細胞の領域に取って代わるものである(たとえばバレット食道において)。そのため、本明細書において使用される食道腺癌は、食道および食道胃接合部の腺癌を指す。
「子宮癌」は、子宮の組織から現われる任意の型の癌である。子宮癌は、いくつかの型の癌を指すことができ、子宮頸癌(子宮の下の方の部分から起こる)は、最も一般的な型である。
肝臓癌および原発性肝臓癌としても知られている「肝癌」は、肝臓において発病する癌である。他のところから肝臓に広がった癌は、肝転移として知られており、肝臓において発病するものよりも一般的である。原発性肝癌は、世界的には、6番目に頻発する癌であり(6%)、癌による死亡の主な原因の2番目にあたる(9%)。
「肝内胆管癌」または胆管癌は、肝臓から小腸の中に胆汁を流す胆管において生じる突然変異した上皮細胞(または上皮分化の特徴を示す細胞)から構成される癌の形態である。肝内胆管癌の割合は、過去数十年間にわたって、世界中で高くなっている。肝内胆管癌は、原発性腫瘍およびあらゆる転移の両方を外科手術によって完全に摘出することができない限り、不治で、急速に致命的となる癌であると考えられる。可能性として治効のある治療は、外科手術以外は存在しないが、ほとんどの人々は、診察時には進行期の疾患を有しており、診断の時には手術不可能となる。
胃癌とも呼ばれる「胃癌」は、胃において発病する癌である。胃の癌の約90%~95%は、腺癌である。胃癌または胃癌という用語が使用される場合、それは、ほとんどいつも腺癌を指す。これらの癌は、胃の最も内側の裏打ちを形成する細胞(粘膜として知られている)から発生する。
用語「有効量」は、示される障害を予防的にまたは治療的に治療するのに有効である、治療剤、たとえば抗体の量を意味する。「有効量」はまた、標的障害を治療するのに治療的にまたは予防的に十分な、治療剤の組み合わせの量を指してもよい。有効量は、患者の年齢、性別、および体重、患者の現在の医学的状態、ならびに治療されている食道癌の性質に依存するであろう。当業者らは、これらのおよび他の因子に依存して適切な投薬量を決定することができるであろう。
今や、ある癌に罹患しており、かつベータ-カテニンタンパク質(配列番号2)内に恒常的に活性化している突然変異を有する癌患者は、そのような突然変異を有していない患者よりも抗Dkk-1抗体療法に反応することが予想されることが発見された。したがって、本発明は、治療を必要とする対象において癌(たとえば食道癌、子宮癌、肝癌、および肝内胆管癌)を治療するための方法であって、有効量の抗Dkk-1抗体またはその抗原結合断片を投与するステップを含み、対象は、ベータ-カテニンタンパク質(配列番号2)の恒常的に活性化している突然変異を有することが決定される方法に関する。
Dkk-1抗体
Dkk-1抗体は、以前に記載された(たとえば、それらの全体が参照によって本明細書に組み込まれる米国特許第8,148,498号明細書および米国特許第7,446,181号明細書を参照)。本明細書において開示されるDkk-1抗体またはその抗原結合断片は、配列番号27に記載されるアミノ酸配列を含むヒトDkk-1に結合するヒト改変抗体またはその断片に関する。本発明のDkk-1抗体は、多くの望ましい特性を持つ治療的に有用なDkk-1アンタゴニストである。たとえば、Dkk-1抗体は、骨芽細胞の活性のマーカーであるアルカリホスファターゼのDkk-1媒介性の阻害を遮断し、様々な型の癌(たとえば非小細胞肺癌)を治療する。
完全長抗体は、天然に存在するように、ジスルフィド結合によって相互に連結された2つの重(H)鎖および2つの軽(L)鎖を含む免疫グロブリン分子である。それぞれの鎖のアミノ末端部分は、そこに含有される相補性決定領域(CDR)を介して抗原認識を主として担う約100~110のアミノ酸の可変領域を含む。それぞれの鎖のカルボキシ末端部分は、エフェクター機能を主として担う定常領域を決定づける。
CDRの間には、フレームワーク領域(「FR」)と名付けられた、より保存された領域が挟まっている。それぞれの軽鎖可変領域(LCVR)および重鎖可変領域(HCVR)は、3つのCDRおよび4つのFRから構成され、アミノ末端からカルボキシ末端まで以下の順:FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、FR4で並んでいる。軽鎖の3つのCDRは、「LCDR1、LCDR2、およびLCDR3」と呼ばれ、重鎖の3つのCDRは、「HCDR1、HCDR2、およびHCDR3」と呼ばれる。CDRは、抗原と特異的な相互作用を形成する残基のほとんどを含有する。LCVR領域およびHCVR領域内のCDRアミノ酸残基の番号付けおよび位置決めは、よく知られているKabat番号付け規則に従う。
軽鎖は、カッパまたはラムダとして分類され、当技術分野において知られているように特定の定常領域によって特徴付けられる。重鎖は、ガンマ、ミュー、アルファ、デルタ、またはイプシロンとして分類され、それぞれIgG、IgM、IgA、IgD、またはIgEとして抗体のアイソタイプを決定づける。IgG抗体は、サブクラス、たとえばIgG1、IgG2、IgG3、IgG4にさらに分けることができる。それぞれの重鎖のタイプは、当技術分野においてよく知られている配列を有する特定の定常領域によって特徴付けられる。
本明細書において使用されるように、用語「モノクローナル抗体」(Mab)は、抗体が産生される方法ではなく、たとえば任意の真核生物、原核生物、またはファージクローンを含む単一のコピーまたはクローンに由来する抗体を指す。本発明のMabは、好ましくは、均一のまたは実質的に均一の集団で存在する。完全Mabは、2つの重鎖および2つの軽鎖を含有する。
他に指定のない限り、用語「Dkk-1抗体」は、完全長抗体およびDkk-1抗体の抗原結合断片の両方を包含する。
そのようなモノクローナル抗体の「抗原結合断片」は、たとえばFab断片、Fab’断片、F(ab’)2断片、および単鎖Fv断片を含む。モノクローナル抗体およびその抗原結合断片は、たとえば組換え技術、ファージディスプレー技術、合成技術、たとえばCDRグラフティング、もしくはそのような技術の組み合わせまたは当技術分野において知られている他の技術によって産生することができる。たとえば、マウスは、ヒトDKK-1またはその断片により免疫化することができ、結果として生じる抗体は、回収し、精製することができ、それらが本明細書において開示される抗体化合物に類似するまたはそれと同じ結合特性および機能的な特性を持つかどうかの決定は、当技術分野において知られている方法によって判断することができる。抗原結合断片もまた、従来の方法によって調製することができる。抗体および抗原結合断片を産生するおよび精製する方法は、当技術分野においてよく知られており、たとえばHarlow and Lane(1988)Antibodies,A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Laboratory Press,Cold Spring Harbor,N.Y.,chapters5-8 and 15,ISBN 0-87969-314-2において見つけることができる。
本明細書において開示されるモノクローナルDkk-1抗体は、非ヒト抗体に由来するCDRを囲む、実質的にヒトまたは完全にヒトであるフレームワーク領域を含むよう改変される。そのようなヒト改変抗体の「抗原結合断片」は、たとえばFab断片、Fab’断片、F(ab’)2断片、および単鎖Fv断片を含む。「フレームワーク領域」または「フレームワーク配列」は、フレームワーク領域1~4のいずれか1つを指す。本明細書において開示される抗体によって包含されるヒト改変抗体およびその抗原結合断片は、任意の1つまたはそれ以上のフレームワーク領域1~4が実質的にまたは完全にヒトである、すなわち、実質的にまたは完全にヒトのフレームワーク領域1~4の個々の考え得る組み合わせのいずれかが存在する分子を含む。たとえば、これは、フレームワーク領域1およびフレームワーク領域2、フレームワーク領域1およびフレームワーク領域3、フレームワーク領域1、2、および3などが実質的にまたは完全にヒトである分子を含む。実質的にヒトのフレームワークは、知られているヒト生殖細胞系列フレームワーク配列と少なくとも約80%の配列同一性を有するものである。好ましくは、実質的にヒトのフレームワークは、知られているヒト生殖細胞系列フレームワーク配列と少なくとも約85%、約90%、約95%、または約99%の配列同一性を有する。
本明細書において開示される抗体に加えて類似する機能的な特性を示すヒト改変抗体は、いくつかの様々な方法を使用して生成することができる。本明細書において開示される特異的な抗体化合物は、さらなる抗体化合物を調製するための鋳型または親抗体化合物として使用することができる。1つのアプローチでは、親抗体化合物CDRは、親抗体化合物フレームワークと高い配列同一性を有するヒトフレームワークの中に移植される。新たなフレームワークの配列同一性は、一般に、親抗体化合物における対応するフレームワークの配列と少なくとも約80%、少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、または少なくとも約99%同一になるであろう。この移植は、親抗体の結合親和性と比較して、結合親和性の低下をもたらすかもしれない。この場合には、フレームワークは、Queen et al.(1991)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 88:2869によって開示される特定の基準に基づいて、ある位置で親フレームワークに復帰突然変異させることができる。マウス抗体をヒト化するのに有用な方法を記載するさらなる参考文献は、米国特許第4,816,397号明細書;米国特許第5,225,539明細書および米国特許第5,693,761号明細書;Levitt(1983)J.Mol.Biol.168:595-620において記載されるコンピュータープログラムABMODおよびENCAD;ならびにWinterおよび共同研究者らの方法(Jones et al.(1986)Nature 321:522-525;Riechmann et al.(1988)Nature 332:323-327;およびVerhoeyen et al.(1988)Science 239:1534-1536)を含む。復帰突然変異を考慮するべき残基を同定する方法は、当技術分野において知られている(たとえば米国特許第8,148,498号明細書を参照)。
本明細書において提供される方法は、軽鎖可変領域(LCVR)および重鎖可変領域(HCVR)を含むDkk-1抗体の使用であって、LCVRは、相補性決定領域(CDR)LCDR1、LCDR2、およびLCDR3を含み、HCVRは、CDR HCDR1、HCDR2、およびHCDR3を含み、LCDR1は、配列番号6のアミノ配列を有し、HCDR1は、配列番号9のアミノ配列を有し、HCDR2は、配列番号10のアミノ配列を有する使用に関する。
一実施形態では、Dkk-1抗体は、配列番号6のアミノ配列を有するLCDR1、配列番号7のアミノ配列を有するLCDR2、配列番号8のアミノ配列を有するLCDR3、配列番号9のアミノ配列を有するHCDR1、配列番号10のアミノ配列を有するHCDR2、および配列番号11のアミノ配列を有するHCDR3を含む。
別の実施形態では、Dkk-1抗体は、配列番号12のアミノ酸配列を有するLCVRおよび配列番号13のアミノ酸配列を有するHCVRを含む。特定の実施形態では、LCVRは、配列番号16のアミノ酸配列を含み、HCVRは、配列番号17のアミノ酸配列を含む。
さらなる実施形態では、Dkk-1抗体は、配列番号22のアミノ酸配列を有する重鎖(HC)および配列番号23のアミノ酸配列を有する軽鎖(LC)を含む。それぞれ配列番号22および配列番号23のHCアミノ酸配列およびLCアミノ酸配列を含むDkk-1抗体またはその抗原結合断片は、本明細書においてDKN-01と呼ばれる。特に、DKN-01は、分子/実験式C639498101698201242および144015ダルトンの分子量(未変化)を有する。
ある実施形態では、本明細書において開示されるDkk-1抗体は、配列番号27において示される配列を含むヒトDkk-1に対して中和活性を有するIgG4抗体またはその断片である。たとえば、古典的Wntシグナル伝達は、骨芽細胞の分化および活性にとって重大である。BMP-4と結合したWnt-3aは、多能性マウスC2C12細胞を、骨芽細胞の活性のマーカーであるアルカリホスファターゼ(「AP」)の測定可能なエンドポイントを有する骨芽細胞に分化するように誘発する。Dkk-1は、古典的Wntシグナル伝達の阻害剤であり、分化およびAPの産生を阻害する。中和Dkk-1抗体は、APのDkk-1媒介性の阻害を予防する。Dkk-1阻害活性を遮断する抗体は、AP活性の損失を予防する(米国特許第8,148,498号明細書を参照)。特定の実施形態では、中和活性を持つDkk-1抗体は、DKN-01であり、これはIgG4抗体である。
本明細書において開示されるDkk-1抗体は、米国特許第8,148,498号明細書において記載されるように、Dkk-1(たとえばヒトDkk-1、配列番号27)に対して高い親和性(Kd)を持つ。たとえば、本発明のDkk-1抗体は、37℃で0.5×10-12Mおよび3.0×10-11Mの間のKdを持つ。
投与のモード
本発明の方法または組成物において使用されるDkk-1抗体および化学療法剤は、非経口、経口、経皮、舌下、頬、直腸、鼻内、気管支内、または肺内投与のために製剤することができる。
非経口投与については、本発明の方法または組成物において使用される化合物は、注射もしくは注入、たとえば静脈内、筋肉内、もしくは皮下注射もしくは注入のためにまたはボーラス投与および/もしくは注入(たとえば連続注入)における投与のために製剤することができる。任意選択で、懸濁化剤、安定化剤、および/または分散剤などのような他の調合剤を含有する油性または水性ビヒクル中の懸濁剤、水剤、またはエマルションを使用することができる。
経口投与については、化合物は、結合剤(たとえばポリビニルピロリドンもしくはヒドロキシプロピルメチルセルロース);増量剤(たとえばラクトース、結晶セルロース、もしくはリン酸カルシウム);潤滑剤(たとえばステアリン酸マグネシウム、滑石、もしくはシリカ);崩壊薬(たとえばデンプングリコール酸ナトリウム);または湿潤剤(たとえばラウリル硫酸ナトリウム)などのような薬学的に許容され得る賦形剤と共に従来の手段によって調製される錠剤またはカプセルの形態とすることができる。所望の場合、錠剤は、適した方法を使用してコーティングすることができる。経口投与のための液体調製物は、水剤、シロップ、または懸濁剤の形態を取ることができる。液体調製物は、懸濁化剤(たとえばソルビトールシロップ、メチルセルロース、または硬化食用脂);乳化剤(たとえばレシチンまたはアラビアゴム);非水性ビヒクル(たとえば扁桃油、油性エステル、またはエチルアルコール);および保存剤(たとえばメチルもしくはプロピルp-ヒドロキシベンゾエートまたはソルビン酸)などのような薬学的に許容され得る添加剤と共に従来の手段によって調製することができる。
頬投与については、本発明の方法または組成物において使用される化合物は、従来のやり方で製剤される錠剤またはロゼンジの形態を取ることができる。
直腸投与については、本発明の方法または組成物において使用される化合物は、坐剤の形態を取ることができる。
舌下投与については、錠剤は、従来の方式で製剤することができる。
鼻内、気管支内、または肺内投与については、従来の製剤を用いることができる。
さらに、本発明の方法または組成物において使用される化合物は、徐放性調製物で製剤することができる。たとえば、化合物は、活性薬剤化合物に持続性の特性および/または制御放出特性を提供するのに適したポリマーまたは疎水性材料と共に製剤することができる。そのため、本発明の方法において使用される化合物は、たとえば注射による微粒子の形態でまたは移植によるオブラートもしくはディスクの形態で投与することができる。制御放出薬剤調製物を製剤する様々な方法は、当技術分野において知られている。
化合物またはその薬学的に許容され得る塩または本明細書において記載される方法を実施するのに有用な本発明の1つまたはそれ以上の化合物(もしくはその薬学的な塩)を含む組成物の投与は、継続的、一時間ごと、毎日4回、毎日3回、毎日2回、毎日1回、一日おきに1回、毎週2回、毎週1回、2週間おきに1回、月に1回、または2か月おきにもしくはそれ以上で1回、またはいくつかの他の断続的な投薬レジメンとすることができる。
化合物または本発明の1つもしくはそれ以上の化合物(もしくはその薬学的な塩)を含む組成物の投与の例は、末梢の投与を含む。末梢の投与の例は、経口、皮下、腹腔内、筋肉内、静脈内、直腸、経皮、または鼻内形態の投与を含む。
本明細書において使用されるように、末梢の投与は、頭蓋内投与を除外する、化合物または本発明の化合物を含む組成物の投与の形態をすべて含む。末梢の投与の例は、経口、非経口(たとえば筋肉内、腹腔内、静脈内もしくは皮下注射、長期にわたる放出、緩効性移植片、デポー、およびその他同種のもの)、経鼻、膣、直腸、舌下、または経皮パッチ適用を含む局所投与ルート、ならびにその他同種のものを含むがこれらに限定されない。
併用療法
本明細書において開示されるDkk-1抗体は、第2の量の化学療法剤(時に、本明細書において「第2の薬剤」と呼ばれる)と組み合わせて食道癌を治療するために使用することができる。そのような併用投与は、Dkk-1抗体および第2の薬剤を含む単一の投薬形態によるものとすることができ、そのような単一の投薬形態は、錠剤、カプセル、スプレー、吸入パウダー、注射用の液剤、またはその他同種のものを含む。併用投与は、単一の投薬形態に加えて、さらなる第2の薬剤(たとえば化学療法剤)を含むことができる。その代わりに、併用投与は、2つの異なる投薬形態の投与によるものとすることができ、一方の投薬形態は、Dkk-1抗体を含有し、他方の投薬形態は、第2の量の化学療法剤を含む。この事例では、投薬形態は、同じであってもよいまたは異なっていてもよい。併用療法を限定することを望むものではないが、以下のものが、用いられてもよい、ある併用療法を例証する。必要とされる第2の量の化学療法剤以上のさらなる化学療法剤を本明細書において記載される方法において用いることができることが理解される。
第2の量の化学療法剤(時に、本明細書において第2の薬剤と呼ばれる)は、Dkk-1抗体の投与の前に、それと同時に、またはその後に投与することができる。したがって、Dkk-1抗体および第2の薬剤は、単一の製剤において一緒に投与することができるまたは別個の製剤において、たとえば同時にまたは連続してまたはその両方で投与することができる。たとえば、Dkk-1抗体および第2の薬剤が、別個の組成物において連続して投与される場合、Dkk-1抗体は、化学療法剤の前にまたはその後に投与することができる。Dkk-1抗体および第2の量の化学療法剤の投与の間の時間は、化学療法剤の性質に依存するであろう。ある実施形態では、Dkk-1抗体は、化学療法剤に先行するまたはすぐにもしくは当業者によって適切であるとみなされる時間の後、化学療法剤の後に続けることができる。
そのうえ、Dkk-1抗体および第2の量の化学療法剤は、類似する投薬スケジュールで投与されても、投与されなくてもよい。たとえば、Dkk-1抗体および化学療法剤は、Dkk-1抗体が化学療法剤よりも高い頻度で投与されるまたは化学療法剤がDkk-1抗体よりも高い頻度で投与されるように、異なる半減期を有してもよいおよび/または異なる時間尺度で作用してもよい。たとえば、Dkk-1抗体および化学療法剤は、ある日、一緒に投与することができ(たとえば単一の投薬でまたは連続して)、設定した日数の後に、化学療法剤(または異なる化学療法薬)のみの投与が続く。治療剤の投与の間の日数は、それぞれの薬剤の安全性および薬力学的効果に従って適切に決定することができる。Dkk-1抗体または化学療法剤は、急性的にまたは慢性的に投与することができる。
本明細書において使用されるように、「有効量」は、標的障害を治療するのに治療的にまたは予防的に十分な治療剤または治療剤の組み合わせの量を指す。有効量は、患者の年齢、性別、および体重、患者の現在の医学的状態、ならびに治療されている食道癌の性質に依存するであろう。当業者らは、これらのおよび他の因子に依存して適切な投薬量を決定することができるであろう。
Dkk-1抗体についての1回の投与当たりの適した用量は、約15mg、約20mg、約30mg、約40mg、約50mg、約100mg、約200mg、約300mg、約400mg、約500mg、約600mg、約625mg、約650mg、約675mg、約700mg、約725mg、約750mg、約775mg、約800mg、約825mg、約850mg、約875mg、約900mg、約925mg、約950mg、約975mg、約1000mg、約1025mg、約1050mg、約1075mg、約1100mg、約1125mg、約1150mg、約1175mg、約1200mg、約1225mg、約1250mg、約1275mg、約1300mg、約1325mg、約1350mg、約1375mg、約1400mg、約1425mg、約1450mg、約1475mg、約1500mg、約1525mg、約1550mg、約1575mg、約1600mg、約1625mg、約1650mg、約1675mg、約1700mg、約1725mg、約1750mg、約1775mg、約1800mg、約1825mg、約1850mg、約1875mg、約1900mg、約1925mg、約1950mg、約1975mg、約2000mg、約2025mg、約2050mg、約2075mg、約2100mg、約2125mg、約2150mg、約2175mg、約2200mg、約2225mg、約2250mg、約2275mg、約2300mg、約2325mg、約2350mg、約2375mg、約2400mg、約2425mg、約2450mg、約2475mg、約2500mg、約2525mg、約2550mg、約2575mg、約2600mg、または約3,000mgまたはそれ以上の用量を含む。それぞれの適した用量は、当業者によって適切であるとみなされる期間にわたって投与することができる。たとえば、それぞれの適した用量は、約30分間かつ約1時間、約2時間、約3時間、約4時間、約5時間、約6時間、約7時間、または約8時間以内の期間にわたって投与することができる。特定の実施形態では、Dkk-1抗体に適した用量は、約30分間かつ約2時間以内の期間にわたって投与される約150mgとすることができる。Dkk-1抗体に適した別の用量は、約30分間かつ約2時間以内の期間にわたって投与される約300mgとすることができる。
第2の量の化学療法剤についての1回の投与当たりの適した用量は、ラベル上に見つけられる推奨される投薬に基づいて決定することができる。第2の量の化学療法剤がパクリタキセルである場合、約8mg/m2、10mg/m2、約15mg/m2、約20mg/m2、約25mg/m2、約30mg/m2、約35mg/m2、約40mg/m2、約45mg/m2、約50mg/m2、約55mg/m2、約60mg/m2、約65mg/m2、約70mg/m2、約75mg/m2、約80mg/m2、約85mg/m2、約90mg/m2、約95mg/m2、約100mg/m2、約105mg/m2、約110mg/m2、約120mg/m2、約130mg/m2、約140mg/m2、約150mg/m2、約160mg/m2、約170mg/m2、約180mg/m2、約190mg/m2、約200mg/m2、約225mg/m2、約250mg/m2、約275mg/m2、約300mg/m2、約600mg/m2、または約800mg/m2の用量またはそれ以上が使用される。たとえば、パクリタキセルの1回の投与当たりの適した用量は、約1時間の期間にわたって約80mg/m2である。
有効量は、第1の量のDkk-1抗体(またはその薬学的に許容され得る塩、水和物、もしくは溶媒和化合物)および第2の量の少なくとも1つの化学療法剤を同時投与することによって、本発明の方法または組成物において実現することができる。一実施形態では、Dkk-1抗体および化学療法剤は、それぞれ、それぞれの有効量(たとえば、それぞれ、単独で投与された場合に治療的に有効となり得る量で)で投与される。別の実施形態では、Dkk-1抗体および化学療法剤は、それぞれ、単独では治療効果をもたらさない量(治療量以下の用量)で投与される。さらに別の実施形態では、Dkk-1抗体は、有効量で投与することができるが、化学療法剤は、治療量以下の用量で投与される。さらに別の実施形態では、Dkk-1抗体は、治療量以下の用量で投与することができるが、化学療法剤は、有効量で投与される。
本明細書において使用されるように、用語「対象」は、哺乳動物、好ましくはヒトを指すが、また、獣医の治療を必要とする動物、たとえばコンパニオンアニマル(たとえばイヌ、ネコ、およびその他同種のもの)、家畜(たとえばウシ、ヒツジ、ブタ、ウマ、およびその他同種のもの)、ならびに実験動物(たとえばラット、マウス、モルモット、およびその他同種のもの)を意味することもできる。
本明細書において使用されるように「治療すること」は、治療されている癌に関する臨床的な徴候の進行を遅延させること、阻害すること、または予防することを部分的にまたは実質的に実現することを含む。たとえば、「治療すること」は、たとえばコンピューター断層撮影(CT)スキャン、磁気共鳴画像法(MRI)、胸部X線検査、およびCT/ポジトロン断層撮影(CT/PET)スキャンを含む、当技術分野において知られている標準的な画像法によって検出され、当技術分野において知られているガイドラインおよび方法に従って評価されるように、腫瘍成長の低下またはさらなる成長の予防を含む。たとえば、治療に対する応答は、Response Evaluation Criteria in Solid Tumors(RECIST)(Revised RECIST Guideline version 1.1;Eisenhauer et al.,Eur.J.Cancer 45(2):228-47,2009を参照)を通して評価することができる。したがって、いくつかの実施形態では、「治療」することは、すべての標的病変の消失としてRECISTガイドラインに従って定義される完全奏効(CR)またはベースライン径和を基準とし、標的病変の径の和の少なくとも30%の減少として定義される部分奏効(PR)を指す。治療に対する腫瘍応答を評価するための他の手段は、腫瘍マーカーの評価およびパフォーマンスステータスの評価を含む(たとえばクレアチニンクリアランスの判断;Cockcroft and Gault,Nephron.16:31-41,1976を参照)。
医薬組成物
本明細書において開示されるDkk-1抗体および化学療法剤は、投与に適した医薬組成物の中に組み込むことができる。そのような組成物は、典型的に、抗体または1つもしくはそれ以上の化学療法剤またはその両方および薬学的に許容され得るキャリヤを含む。本明細書において使用されるように、用語「薬学的に許容され得るキャリヤ」は、医薬の投与と適合性である任意のおよびすべての溶媒、分散媒、コーティング、抗菌剤および抗真菌剤、等張剤および吸収遅延剤、ならびにその他同種のものを含むことが意図される。薬学的に活性な物質のためのそのような媒体および作用物質の使用は、当技術分野においてよく知られている。任意の従来の媒体または作用物質が活性化合物と不適合性である場合を除いて、その組成物における使用が、企図される。
本発明の医薬組成物は、投与のその意図されるルートと適合性となるように製剤される。投与のルートの例は、非経口、たとえば静脈内、皮内、皮下、経口(たとえば吸入)、経皮(局所)、経粘膜、および直腸投与を含む。非経口、皮内、または皮下適用のために使用される水剤または懸濁剤は、以下の構成成分を含むことができる:注射用水、生理食塩水、不揮発性油、ポリエチレングリコール、グリセリン、プロピレングリコール、または他の合成溶剤などのような滅菌希釈剤;ベンジルアルコールまたはメチルパラベンなどのような抗菌剤;アスコルビン酸または亜硫酸水素ナトリウムなどのような酸化防止剤;エチレンジアミン四酢酸などのようなキレート剤;酢酸、クエン酸、またはリン酸などのようなバッファー、および塩化ナトリウムまたはデキストロースなどのような張性の調節のための作用物質。pHは、塩酸または水酸化ナトリウムなどのような、酸または塩基により調節することができる。非経口調製物は、ガラスまたはプラスチックから作製されるアンプル、使い捨ての注射器、または複数用量のバイアル中に密封することができる。
注射用の使用に適した医薬組成物は、滅菌水性水剤(水溶性)または分散剤および滅菌注射用水剤または分散剤の即時調製のための滅菌パウダーを含む。静脈内投与については、適したキャリヤは、生理的食塩水、静菌性の水、Cremophor EL(商標)(BASF、Parsippany、N.J)、またはリン酸緩衝食塩水(PBS)を含む。すべての場合において、組成物は、滅菌されていなければならず、容易な注射針通過が見られる程度まで流動性であるべきである。それは、製造および保存の条件下で安定していなければならず、細菌および真菌などのような微生物の混入作用から保護されなければならない。キャリヤは、たとえば水、エタノール、ポリオール(たとえばグリセロール、プロピレングリコール、および液体ポリエチレングリコール、ならびにその他同種のもの)、ならびにその適した混合物を含有する溶媒または分散媒とすることができる。適切な流動性は、たとえば、レシチンなどのようなコーティングの使用によって、分散剤の場合には、必要とされる粒径の維持によって、および界面活性剤の使用によって、維持することができる。微生物の作用の予防は、様々な抗菌剤および抗真菌剤、たとえばパラベン、クロロブタノール、フェノール、アスコルビン酸、チメロサール、およびその他同種のものによって実現することができる。多くの場合において、組成物において、等張剤、たとえば糖、マンニトールなどのような多価アルコール、ソルビトール、および塩化ナトリウムを含むことは好ましいであろう。注射用の組成物の長期間の吸収は、吸収を遅延させる作用物質、たとえばモノステアリン酸アルミニウムおよびゼラチンを組成物中に含むことによって、もたらすことができる。
滅菌注射用水剤は、必要に応じて、上記に列挙される成分のうちの1つまたはその組み合わせと共に、適切な溶剤中に、必要とされる量で、活性化合物(たとえばDkk-1抗体)を組み込み、その後、ろ過滅菌することによって、調製される。一般に、分散剤は、塩基性分散媒および上記に列挙されるものからの必要とされる他の成分を含有する滅菌ビヒクルの中に、活性化合物を組み込むことによって調製される。滅菌注射用水剤の調製のための滅菌パウダーの場合には、調製の好ましい方法は、活性成分および任意のさらなる所望の成分のパウダーをそのあらかじめ滅菌ろ過された水剤から産出する真空乾燥および凍結乾燥である。
経口組成物は、一般に、不活性希釈剤または食用のキャリヤを含む。それらは、ゼラチンカプセル中に密封することができるまたは錠剤の中に圧縮することができる。経口治療投与の目的のために、活性化合物は、賦形剤と共に組み込み、錠剤、トローチ、またはカプセルの形態で使用することができる。経口組成物はまた、口腔洗浄薬としての使用のために、液体キャリヤを使用して調製することができ、液体キャリヤ中の化合物は、経口的に適用され、すばやくすすがれ、吐かれるまたは飲み込まれる。薬学的に適合性の結合剤および/または補助材料は、組成物の一部として含むことができる。錠剤、丸剤、カプセル、トローチ、およびその他同種のものは、類似する性質の以下の成分または化合物のいずれかを含有することができる:結晶セルロース、トラガカントゴム、もしくはゼラチンなどのようなバインダー;デンプンもしくはラクトースなどのような賦形剤、アルギン酸、Primogel、もしくはコーンスターチなどのような崩壊剤;ステアリン酸マグネシウムもしくはSterotesなどのような潤滑剤;コロイド状二酸化ケイ素などのような滑剤;スクロースもしくはサッカリンなどのような甘味剤;またはペパーミント、サリチル酸メチル、もしくはオレンジ矯味剤などのような調味料。
吸入による投与については、化合物は、適した噴射剤、たとえば二酸化炭素などのようなガスを含有する加圧容器もしくはディスペンサーまたはネブライザーからのエアロゾル噴霧剤の形態で送達される。
全身投与はまた、経粘膜または経皮手段によるものとすることもできる。経粘膜または経皮投与については、透過する障壁に適切な浸透剤が、製剤中に使用される。そのような浸透剤は、当技術分野において一般に知られており、たとえば、経粘膜投与については、洗浄剤、胆汁酸塩、およびフシジン酸誘導体を含む。経粘膜投与は、経鼻噴霧剤または坐剤の使用を通して達成することができる。
経皮投与については、活性化合物は、当技術分野において一般に知られている外用薬、軟膏剤、ゲル、またはクリームの中に製剤される。
化合物はまた、坐剤(たとえば、カカオバターおよび他のグリセリドなどのような従来の坐剤基剤と共に)または直腸送達のための保持浣腸剤の形態で調製することができる。
一実施形態において、活性化合物は、移植片およびマイクロカプセル化された送達系を含む放出制御製剤などのような、身体からの急速な排除から化合物を防御し得るキャリヤと共に調製される。エチレン酢酸ビニル、ポリ酸無水物、ポリグリコール酸、コラーゲン、ポリオルトエステル、およびポリ乳酸などのような、生分解性で生体適合性のポリマーを、使用することができる。そのような製剤の調製のための方法は、当業者らに明らかであろう。材料はまた、Alza Corporation and Nova Pharmaceuticals,Inc.から市販で得ることができる。リポソーム懸濁剤(ウイルス抗原に対するモノクローナル抗体により感染細胞を標的にするリポソームを含む)もまた、薬学的に許容され得るキャリヤとして使用することができる。これらは、たとえば、米国特許第4,522,811号明細書において記載されるように、当業者らに知られている方法に従って調製することができる。
投与の容易性および投薬量の均一性のために投薬単位形態で経口または非経口組成物を製剤することはとりわけ有利である。本明細書において使用される投薬単位形態は、治療されることになっている対象に対する単一の投薬に適した物理的に個別の単位を指し、それぞれの単位は、必要とされる医薬キャリヤと関連して、所望の治療効果をもたらすように計算された所定の量の活性化合物を含有する。本発明の投薬単位形態についての規格は、活性化合物の特有の特徴および実現されるべき特定の治療効果ならびに個人の治療のためにそのような活性化合物を合成することについての当技術分野における固有の制限によって必然的に決められ、それらに直接、依存する。
本発明が、その例となる実施形態への参照により特に示され、記載されたが、添付の請求項によって包含される本発明の範囲から逸脱することなく、形式および詳細における様々な変更がその中でなされてもよいことが当業者らによって理解されるであろう。
実施例1-CTNNB1遺伝子の恒常的に活性化している突然変異の検出
生検サンプルは、ベータ-カテニン遺伝子の配列の決定のために患者から得ることができる。遺伝子配列決定は、当業者の理解し得る範囲内に十分にあり、Boulder、COのArcherDX,Inc.から入手可能なArcher(登録商標)VariantPlex Solid Tumor kitおよびSan Diego CAのIllumina,Inc(Worldwide Headquarters)から入手可能なものなどのような次世代シークエンシングプラットフォームなどのような市販で入手可能な製品を使用して達成することができる。比較は、遺伝子の、たとえばNCBIデータベースの公的に入手可能な遺伝子配列に対して行うことができる。
実施例2-ベータ-カテニンタンパク質の恒常的に活性化している突然変異の検出
ベータ-カテニンのリン酸化ステータスは、ベータ-カテニンのリン酸化形態を認識する抗体によりウエスタンブロット分析によって決定することができる。ベータ-カテニンの安定化および活性化は、細胞タンパク質レベルにおける増加を実証するウエスタンブロットによっておよびベータ-カテニンの核局在を実証する免疫蛍光によって決定することができる。下流ベータ-カテニン標的遺伝子または外因性ベータ-カテニンレポーター遺伝子構築物の発現の測定は、ベータ-カテニンの活性化ステータスを決定するために利用することができる。
実施例3-DKN-01療法を受けている患者におけるCTNNB1突然変異データ
パクリタキセル/DKN-01併用療法の臨床研究
患者は、第1相非ランダム化、用量漸増、非盲検、多施設研究として設計された併用DKN-01/パクリタキセル(登録商標)療法の臨床試験のために選択した。
組織学的に確認された再発性または転移性食道または食道胃接合部腺癌を有する患者を選択した。表1で報告するそれぞれの患者を、28日間の治療サイクルに置いた:1~15日目に300mgのDKN-01抗体;1、8、15、および22日目に80mg/m2のパクリタキセル(登録商標)。
DKN-01は、中断を伴うことなく最低30分間かつ最大2時間以内にわたって静脈内に(IV)投与した。パクリタキセル(登録商標)は、標準的な診療に従ってそれぞれのサイクルの1、8、15、および22日目に1時間IV投与した。パクリタキセルについての標準的なケアであるプレメディケイションは投与前に行った。投与の順序:パクリタキセルについてのプレメディケイション、DKN-01、パクリタキセル。両方の薬剤を送達する場合、1および15日目にDKN-01を最初に、その後、パクリタキセルを投与した。
研究の開始前に収集した生検サンプルは、遺伝子発現分析を受けた。
放射線による腫瘍判断を実行した。最低、胸部、腹部、および骨盤のコンピューター断層撮影法(CT)によるスキャンを、Response Evaluation Criteria in Solid Tumors(RECIST)によって定義されるようにX線画像診断で測定可能な1つまたはそれ以上の転移性腫瘍の証拠資料と共に腫瘍判断のために行った。実行可能な場合は常に、研究の全体にわたって好ましい画像診断様式は、CT/PETスキャンとした。ベースラインのX線腫瘍判断は、サイクル1の1日目の前に28日以内に行い、続く腫瘍判断は、偶数サイクルの後に毎回実行した。
以下の応答についての基準を使用した:
完全奏効(CR):すべての病変の消失。あらゆる病的なリンパ節が、<10mmまでの短軸の低下を有した。腫瘍マーカーの結果を標準化した。
部分奏効(PR):ベースライン径和を基準として、病変の径の和の少なくとも30%の減少。
進行性疾患(PD):研究で最も小さな和(ベースラインの和が最も小さい場合、ベースラインの和を含む)を基準として、病変の径の和の少なくとも20%の増加。20%の相対的な増加に加えて、和は、少なくとも5mmの絶対的な増加を実証した。1つまたはそれ以上の新たな病変の出現もまた、進行と考えられた。
安定した疾患(SD):研究の間の最も小さな径和を基準としてPRとみなすのに十分な収縮もPDとみなすのに十分な増加もない。
結果分析
ベータ-カテニン突然変異の分析を、上記に記載される方法に従って、パクリタキセル(登録商標)およびDKN-01の併用療法にかけた患者に対して実行した。結果を図1に示す。わかるように、エクソン2~4、S45F、およびT41Iの欠失から結果として生じるベータ-カテニン突然変異が、部分奏効または少なくとも安定した疾患を示す患者において見つけられる。
このデータは、ベータ-カテニンの活性化突然変異が、抗Dkk-1抗体投与に対する治療応答についてのバイオマーカー予測因子となることを実証する。
実施例4-患者105-023の事例研究:β-カテニン活性化突然変異は食道癌療法におけるDKN-01感受性についてのバイオマーカーとなる
図1に示されるように、GEJ腺癌悪性疾患に罹患している患者105-023は腫瘍容積の最も高い低下を示した。患者105-023に関係する臨床データをさらに分析した。
患者105-023は、14回の28日間治療サイクルの過程にわたって73%の腫瘍後退を経験した。結果を図2Aおよび図2Bに示す。図2Aは、治療のサイクルの数の関数として患者105-023における腫瘍容積のプロットを示す(サイクルは開始日によって表わされる)。患者105-023は、最初の10サイクルについて28日間のサイクルの間に1および15日目に300mgのDKN-01をならびに80mg/m2のパクリタキセルを毎週受けた。サイクル10の間に、パクリタキセルを中断したが、応答は深さを増し続けた。図2Bは、ベースラインからサイクル10までの患者105-023における原発性病変のサイズの低下を実証するコンピューター断層撮影法による画像である。矢印は原発性病変を表わす。
データからわかるように、患者105-023は、サイクル10においてパクリタキセルを中断し、DKN-01単独療法に対する深まる応答を有し続けた。この患者の腫瘍由来の生検サンプルの遺伝子分析(Foundation Medicine,Inc.、Cambridge、MAから市販で入手可能なFoundationOne(登録商標)Panelを用いることによって実施例1において記載される方法を使用して実行した)は、恒常的な活性化をもたらすβ-カテニンエクソン2~4の欠失の存在を示した。
このデータは、ベータ-カテニンの活性化突然変異が、抗Dkk-1抗体投与に対する治療応答についてのバイオマーカー予測因子となるという発見をさらに支持する。
配列
CTNNB1のゲノムDNA配列-配列番号1
配列番号1は、図3A~3Fにおいて示されるが、染色体座標chr3:41,240,942-41,281,939を有するヒトCTNNB1遺伝子の配列を示す。座標はすべて、build GRCh37/hg19からのものである。5’UTRおよび3’UTRのエクソンは含まれない。大文字はエクソンであり、小文字はイントロンである。エクソン2、3、および4に下線を引き、上部に記す。
ベータ-カテニンタンパク質のアミノ酸配列-配列番号2
下記の配列番号2は、ヒトベータ-カテニン、781アミノ酸タンパク質UniProt Database ID-P35222(http://www.uniprot.org/uniprot/P35222)のアミノ酸配列である。エクソン2、3、および4に下線を引き、上部に記す。
Figure 0007374765000001
ベータ-カテニンタンパク質のエクソン
アミノ酸番号の範囲は、転写物のスプライシングのために配列番号1において印をつけたエクソンに正確には対応しない。たとえば、アミノ酸#5についてのコドンの第1の塩基「G」は、エクソン2にあり、第2および第3の塩基「CT」は、エクソン3にある。
エクソン3の強調した残基(太字で下線を引いた)は、突然変異したまたは欠失した場合にベータ-カテニンを安定化するGSK3BおよびCK1αのリン酸化部位を示す):S33、S37、T41、S45。(de La Coste A,Romagnolo B,Billuart P,Renard CA,Buendia MA,Soubrane O,et al.(1998).Somatic mutations of the beta-catenin gene are frequent in mouse and human hepatocellular carcinomas.Proc Natl Acad Sci U S A 95:8847-8851;およびXu W,&Kimelman D(2007).Mechanistic insights from structural studies of beta-catenin and its binding partners.J Cell Sci 120:3337-3344を参照)。
エクソン1(非コード)
エクソン2-配列番号3(配列番号2のアミノ酸1~4)
MATQ(配列番号3)
エクソン3-配列番号4(配列番号2のアミノ酸5~81)
Figure 0007374765000002
エクソン4-配列番号5(配列番号2のアミノ酸82~165)
Figure 0007374765000003
LCDR1
His Ala Ser Asp Ser Ile Ser Asn Ser Leu His(配列番号6)
LCDR2
Tyr Xaa Arg Gln Ser Xaa Gln(配列番号7)
2位のXaaは、GlyまたはAlaであり、6位のXaaは、IleまたはGluである。
LCDR3
Gln Gln Ser Xaa Ser Trp Pro Leu His(配列番号8)
4位のXaaは、GluまたはAlaである。
HCDR1
Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr Thr Met Ser(配列番号9)
HCDR2
Thr Ile Ser Gly Gly Gly Phe Gly Thr Tyr Tyr Pro Asp Ser Val Lys(配列番号10)
HCDR3
Pro Gly Tyr Xaa Asn Tyr Tyr Phe Asp Ile(配列番号11)
4位のXaaは、HisまたはAsnである。
LCVR
Figure 0007374765000004
51位のXaaは、GlyまたはAlaであり、55位のXaaは、IleまたはGluであり、92位のXaaは、GluまたはAlaである。
HCVR
Figure 0007374765000005
102位のXaaは、HisまたはAsnである。
LCVR
Figure 0007374765000006
HCVR
Figure 0007374765000007
LCVR
Figure 0007374765000008
HCVR
Figure 0007374765000009
LCVR
Figure 0007374765000010
LCVR
Figure 0007374765000011
HC
Figure 0007374765000012
LC
Figure 0007374765000013
HC
Figure 0007374765000014
LC
Figure 0007374765000015
HC
Figure 0007374765000016
LC
Figure 0007374765000017
LC
Figure 0007374765000018
ヒトDkk-1アミノ酸配列
Figure 0007374765000019

本発明の態様として以下のものが挙げられる。
[1]その必要がある対象において癌を治療するための方法であって、
前記対象に、有効量の抗Dkk-1抗体またはその抗原結合断片を投与するステップを含み、
前記対象は、ベータ-カテニンタンパク質(配列番号2)の恒常的に活性化している突然変異を有することが決定され、
前記癌は、食道癌、子宮癌、肝癌、または肝内胆管癌である方法。
[2]癌に罹患している対象を治療するための方法であって、
前記対象から癌細胞のサンプルを得るステップ;
前記サンプルにおけるベータ-カテニンタンパク質の配列を決定するステップ;および
ベータ-カテニンタンパク質の配列(配列番号2)が恒常的に活性化している突然変異を含む場合、前記対象に、有効量の抗Dkk-1抗体またはその抗原結合断片を投与するステップを含み、
前記癌は、食道癌、子宮癌、肝癌、または肝内胆管癌である方法。
[3]その必要がある対象において癌を治療するための方法であって、
前記対象に、有効量の抗Dkk-1抗体またはその抗原結合断片を投与するステップを含み、
前記対象は、ベータ-カテニンタンパク質(配列番号2)の恒常的に活性化している突然変異を有し、
前記癌は、食道癌、子宮癌、肝癌、または肝内胆管癌である方法。
[4]有効量の化学療法剤を投与するステップをさらに含む、[1]~[3]のいずれか一項に記載の方法。
[5]前記化学療法剤は、タキサン、パクリタキセル、ドセタキセル、カバジタキセル、ゲムシタビン、カルボプラチン、シスプラチン、オキサリプラチン、フルオロウラシル、カペシタビン、もしくはテガフールまたはその任意の機能的なアナログである、[4]に記載の方法。
[6]前記抗Dkk-1抗体またはその抗原結合断片は、軽鎖可変領域(LCVR)および重鎖可変領域(HCVR)を含み、前記LCVRは、相補性決定領域(CDR)LCDR1、LCDR2、およびLCDR3を含み、前記HCVRは、CDR HCDR1、HCDR2、およびHCDR3を含み、LCDR1は、配列番号6のアミノ配列を有し、LCDR2は、配列番号7のアミノ配列を有し、LCDR3は、配列番号8のアミノ配列を有し、HCDR1は、配列番号9のアミノ配列を有し、HCDR2は、配列番号10のアミノ配列を有し、HCDR3は、配列番号11のアミノ配列を有する、[1]~[5]のいずれか一項に記載の方法。
[7]前記LCVRは、配列番号12のアミノ酸配列を含み、前記HCVRは、配列番号13のアミノ酸配列を含む、[6]に記載の方法。
[8]前記LCVRおよび前記HCVRは、(i)配列番号14のアミノ酸配列を含むLCVRおよび配列番号15のアミノ酸配列を含むHCVR;(ii)配列番号16のアミノ酸配列を含むLCVRおよび配列番号17のアミノ酸配列を含むHCVR;(iii)配列番号18のアミノ酸配列を含むLCVRおよび配列番号15のアミノ酸配列を含むHCVR;(iv)配列番号19のアミノ酸配列を含むLCVRおよび配列番号15のアミノ酸配列を含むHCVRからなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、[6]または[7]に記載の方法。
[9]前記LCVRは、配列番号16のアミノ酸配列を含み、前記HCVRは、配列番号17のアミノ酸配列を含む、[8]に記載の方法。
[10]前記抗Dkk-1抗体は、a)配列番号24のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号21のアミノ酸配列を含む軽鎖、b)配列番号22のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号23のアミノ酸配列を含む軽鎖、c)配列番号24のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号25のアミノ酸配列を含む軽鎖、ならびにd)配列番号24のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号26のアミノ酸配列を含む軽鎖からなる群から選択される重鎖および軽鎖アミノ酸配列を含む、[9]に記載の方法。
[11]前記抗Dkk-1抗体は、配列番号22のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号23のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む、[10]に記載の方法。
[12]前記対象は、ヒトである、[1]~[11]のいずれか一項に記載の方法。
[13]前記突然変異は、エクソン3(配列番号4)の欠失を含む、[1]~[3]のいずれか一項に記載の方法。
[14]前記突然変異は、エクソン2、3、および4(配列番号3、4、および5)の欠失を含む、[13]に記載の方法。
[15]前記突然変異は、エクソン3(配列番号4)内に欠失を含む、[1]~[3]のいずれか一項に記載の方法。
[16]前記突然変異は、配列番号2のタンパク質のアミノ酸配列内の任意のサブ配列の欠失であり、前記サブ配列は、Ser33、Ser37、Thr41、およびSer45から選択される少なくとも1つの残基を含む、[1]~[3]のいずれか一項に記載の方法。
[17]前記突然変異は、配列番号2のタンパク質のSer33、Ser37、Thr41、およびSer45から選択されるアミノ酸残基のいずれか1つの突然変異である、[1]~[3]のいずれか一項に記載の方法。
[18]前記突然変異は、表1に列挙される配列番号2のタンパク質におけるアミノ酸残基の突然変異のいずれか1つである、[1]~[3]のいずれか一項に記載の方法。
[19]その必要がある対象において癌を治療するための方法であって、
前記対象に、有効量の抗Dkk-1抗体またはその抗原結合断片を投与するステップを含み、前記対象は、ベータ-カテニンタンパク質(配列番号2)の恒常的に活性化している突然変異を有することが決定され、
前記癌は、胃癌である方法。
[20]有効量の化学療法剤を投与するステップをさらに含む、[19]に記載の方法。
[21]前記化学療法剤は、タキサン、パクリタキセル、ドセタキセル、カバジタキセル、ゲムシタビン、カルボプラチン、シスプラチン、オキサリプラチン、フルオロウラシル、カペシタビン、もしくはテガフールまたはその任意の機能的なアナログである、[20]に記載の方法。
[22]前記抗Dkk-1抗体またはその抗原結合断片は、軽鎖可変領域(LCVR)および重鎖可変領域(HCVR)を含み、前記LCVRは、相補性決定領域(CDR)LCDR1、LCDR2、およびLCDR3を含み、前記HCVRは、CDR HCDR1、HCDR2、およびHCDR3を含み、LCDR1は、配列番号6のアミノ配列を有し、LCDR2は、配列番号7のアミノ配列を有し、LCDR3は、配列番号8のアミノ配列を有し、HCDR1は、配列番号9のアミノ配列を有し、HCDR2は、配列番号10のアミノ配列を有し、HCDR3は、配列番号11のアミノ配列を有する、[19]~[21]のいずれか一項に記載の方法。
[23]前記LCVRは、配列番号12のアミノ酸配列を含み、前記HCVRは、配列番号13のアミノ酸配列を含む、[22]に記載の方法。
[24]前記LCVRおよび前記HCVRは、(i)配列番号14のアミノ酸配列を含むLCVRおよび配列番号15のアミノ酸配列を含むHCVR;(ii)配列番号16のアミノ酸配列を含むLCVRおよび配列番号17のアミノ酸配列を含むHCVR;(iii)配列番号18のアミノ酸配列を含むLCVRおよび配列番号15のアミノ酸配列を含むHCVR;(iv)配列番号19のアミノ酸配列を含むLCVRおよび配列番号15のアミノ酸配列を含むHCVRからなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、[22]または[23]に記載の方法。
[25]前記LCVRは、配列番号16のアミノ酸配列を含み、前記HCVRは、配列番号17のアミノ酸配列を含む、[24]に記載の方法。
[26]前記抗Dkk-1抗体は、a)配列番号24のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号21のアミノ酸配列を含む軽鎖、b)配列番号22のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号23のアミノ酸配列を含む軽鎖、c)配列番号24のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号25のアミノ酸配列を含む軽鎖、ならびにd)配列番号24のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号26のアミノ酸配列を含む軽鎖からなる群から選択される重鎖および軽鎖アミノ酸配列を含む、[25]に記載の方法。
[27]前記抗Dkk-1抗体は、配列番号22のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号23のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む、[26]に記載の方法。
[28]前記対象は、ヒトである、[19]~[27]のいずれか一項に記載の方法。
[29]前記突然変異は、エクソン3(配列番号4)の欠失を含む、[19]に記載の方法。
[30]前記突然変異は、エクソン2、3、および4(配列番号3、4、および5)の欠失を含む、[29]に記載の方法。
[31]前記突然変異は、エクソン3(配列番号4)内に欠失を含む、[19]に記載の方法。
[32]前記突然変異は、配列番号2のタンパク質のアミノ酸配列内の任意のサブ配列の欠失であり、前記サブ配列は、Ser33、Ser37、Thr41、およびSer45から選択される少なくとも1つの残基を含む、[19]に記載の方法。
[33]前記突然変異は、配列番号2のタンパク質のSer33、Ser37、Thr41、およびSer45から選択されるアミノ酸残基のいずれか1つの突然変異である、[19]に記載の方法。
[34]前記突然変異は、表1に列挙される配列番号2のタンパク質におけるアミノ酸残基の突然変異のいずれか1つである、[19]に記載の方法。

Claims (10)

  1. 癌に罹患している対象を治療する方法に使用するための医薬であって、前記医薬は、抗Dkk-1抗体またはその抗原結合断片を含み、前記方法は:
    前記対象から癌細胞のサンプルを得るステップ;
    前記対象が前記サンプルにおいてベータ-カテニンタンパク質の恒常的に活性化している突然変異を有することを決定するステップ、ここで前記タンパク質は、配列番号2のアミノ酸配列を含む;および
    ベータ-カテニンタンパク質の恒常的に活性化している突然変異を有すると決定された対象に、有効量の抗Dkk-1抗体またはその抗原結合断片を投与するステップ
    を含み、
    前記癌は、食道癌または子宮癌であり、
    さらに、前記恒常的に活性化している突然変異は、以下
    32G、D32N、D32Y、G34E、G34R、G34V、S37F、I35S、S33C、S33F、S33Y、S37A、S37C、S37P、S45C、S45F、T41A、T41I、S33A、K335T、D32A、D32V、T41A、H36P、S33P、I35S、S45Y、S37Y、S45P、T42_K49del、W383C、K335I、N387IまたはN387Kから選択される配列番号2のアミノ酸残基の突然変異のいずれか1つである、医薬。
  2. 前記方法が、有効量の化学療法剤を投与するステップをさらに含む、請求項1に記載の医薬。
  3. 前記化学療法剤は、タキサン、パクリタキセル、ドセタキセル、カバジタキセル、ゲムシタビン、カルボプラチン、シスプラチン、オキサリプラチン、フルオロウラシル、カペシタビン、もしくはテガフールまたはその任意の機能的なアナログである、請求項2に記載の医薬。
  4. 前記抗Dkk-1抗体またはその抗原結合断片は、軽鎖可変領域(LCVR)および重鎖可変領域(HCVR)を含み、前記LCVRは、相補性決定領域(CDR)LCDR1、LCDR2、およびLCDR3を含み、前記HCVRは、CDR HCDR1、HCDR2、およびHCDR3を含み、LCDR1は、配列番号6のアミノ配列を有し、LCDR2は、配列番号7のアミノ配列を有し、LCDR3は、配列番号8のアミノ配列を有し、HCDR1は、配列番号9のアミノ配列を有し、HCDR2は、配列番号10のアミノ配列を有し、HCDR3は、配列番号11のアミノ配列を有する、請求項1~3のいずれか一項に記載の医薬。
  5. 前記LCVRは、配列番号12のアミノ酸配列を含み、前記HCVRは、配列番号13のアミノ酸配列を含む、請求項4に記載の医薬。
  6. 前記LCVRおよび前記HCVRは、(i)配列番号14のアミノ酸配列を含むLCVRおよび配列番号15のアミノ酸配列を含むHCVR;(ii)配列番号16のアミノ酸配列を含むLCVRおよび配列番号17のアミノ酸配列を含むHCVR;(iii)配列番号18のアミノ酸配列を含むLCVRおよび配列番号15のアミノ酸配列を含むHCVR;(iv)配列番号19のアミノ酸配列を含むLCVRおよび配列番号15のアミノ酸配列を含むHCVRからなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項4または5に記載の医薬。
  7. 前記LCVRは、配列番号16のアミノ酸配列を含み、前記HCVRは、配列番号17のアミノ酸配列を含む、請求項6に記載の医薬。
  8. 前記抗Dkk-1抗体は、a)配列番号24のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号21のアミノ酸配列を含む軽鎖、b)配列番号22のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号23のアミノ酸配列を含む軽鎖、c)配列番号24のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号25のアミノ酸配列を含む軽鎖、ならびにd)配列番号24のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号26のアミノ酸配列を含む軽鎖からなる群から選択される重鎖および軽鎖アミノ酸配列を含む、請求項7に記載の医薬。
  9. 前記抗Dkk-1抗体は、配列番号22のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号23のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む、請求項8に記載の医薬。
  10. 前記対象は、ヒトである、請求項1~9のいずれか一項に記載の医薬。
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