JP7337850B2 - 抗体ライブラリー及びこれを用いた抗体スクリーニング方法 - Google Patents
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Description
VH3-15(配列番号1)/Vκ1-39(配列番号16)、VH3-15(配列番号1)/Vκ3-20(配列番号21)、VH3-15(配列番号1)/Vκ3-20-2(配列番号26)、VH3-15(配列番号1)/Vλ1-51(配列番号31)、VH3-23(配列番号6)/Vκ1-39(配列番号16)、VH3-23(配列番号6)/Vκ3-20(配列番号21)、VH3-23(配列番号6)/Vκ3-20-2(配列番号26)、VH3-23(配列番号6)/Vλ1-51(配列番号31)、VH1-69(配列番号11)/Vκ1-39(配列番号16)、VH1-69(配列番号11)/Vκ3-20(配列番号21)、VH1-69(配列番号11)/Vκ3-20-2(配列番号26)及びVH1-69(配列番号11)/Vλ1-51(配列番号31)からなる群から選ばれる重鎖及び軽鎖可変領域対に含まれているフレームワーク領域と、
各重鎖可変領域別に異なるCDRH1、CDRH2及びCDRH3の組合せ及び各軽鎖可変領域別に異なるCDRL1、CDRL2及びCDRL3の組合せを含むことを特徴とする。
前記VH3-15(配列番号1)の配列を有する重鎖可変領域内のフレームワーク領域は、FR1(配列番号2)、FR2(配列番号3)、FR3(配列番号4)及びFR4(配列番号5)を含み、
VH3-23(配列番号6)の配列を有する重鎖可変領域内のフレームワーク領域は、FR1(配列番号7)、FR2(配列番号8)、FR3(配列番号9)及びFR4(配列番号10)を含み、
VH1-69(配列番号11)の配列を有する重鎖可変領域内のフレームワーク領域は、FR1(配列番号12)、FR2(配列番号13)、FR3(配列番号14)及びFR4(配列番号15)を含み、
Vκ1-39(配列番号16)の配列を有する軽鎖可変領域内のフレームワーク領域は、FR1(配列番号17)、FR2(配列番号18)、FR3(配列番号19)及びFR4(配列番号20)を含み、
Vκ3-20(配列番号21)の配列を有する軽鎖可変領域内のフレームワーク領域は、FR1(配列番号22)、FR2(配列番号23)、FR3(配列番号24)及びFR4(配列番号25)を含み、
Vκ3-20-2(配列番号26)の配列を有する軽鎖可変領域内のフレームワーク領域は、FR1(配列番号27)、FR2(配列番号28)、FR3(配列番号29)及びFR4(配列番号30)を含み、及び
Vλ1-51(配列番号31)の配列を有する軽鎖可変領域内のフレームワーク領域は、FR1(配列番号32)、FR2(配列番号33)、FR3(配列番号34)及びFR4(配列番号35)を含むことができる。
前記VH3-15(配列番号1)の配列を有する重鎖可変領域における重鎖相補性決定領域1(CDRH1)内の位置別アミノ酸比率は、表3の範囲を含み、
前記VH3-15(配列番号1)の配列を有する重鎖可変領域における重鎖相補性決定領域2(CDRH2)内の位置別アミノ酸比率は、表4の範囲を含み、
前記VH3-23(配列番号6)の配列を有する重鎖可変領域における重鎖相補性決定領域1(CDRH1)内の位置別アミノ酸比率は、表3の範囲を含み、
前記VH3-23(配列番号6)の配列を有する重鎖可変領域における重鎖相補性決定領域2(CDRH2)内の位置別アミノ酸比率は、表4の範囲を含み、
前記VH1-69(配列番号11)の配列を有する重鎖可変領域における重鎖相補性決定領域1(CDRH1)内の位置別アミノ酸比率は、表5の範囲を含み、
前記VH1-69(配列番号11)の配列を有する重鎖可変領域における重鎖相補性決定領域2(CDRH2)内の位置別アミノ酸比率は、表6の範囲を含み、
前記VH3-15(配列番号1)、VH3-23(配列番号6)又はVH1-69(配列番号11)の配列を有する重鎖可変領域における重鎖相補性決定領域3(CDRH3)が9個のアミノ酸である場合、前記CDRH3内の位置別アミノ酸比率は、表7の範囲を含み、
前記VH3-15(配列番号1)、VH3-23(配列番号6)又はVH1-69(配列番号11)の配列を有する重鎖可変領域における重鎖相補性決定領域3(CDRH3)が10個のアミノ酸である場合、前記CDRH3内の位置別アミノ酸比率は、表8の範囲を含み、
前記VH3-15(配列番号1)、VH3-23(配列番号6)又はVH1-69(配列番号11)の配列を有する重鎖可変領域における重鎖相補性決定領域3(CDRH3)が11個のアミノ酸である場合、前記CDRH3内の位置別アミノ酸比率は、表9の範囲を含み、
前記VH3-15(配列番号1)、VH3-23(配列番号6)又はVH1-69(配列番号11)の配列を有する重鎖可変領域における重鎖相補性決定領域3(CDRH3)が12個のアミノ酸である場合、前記CDRH3内の位置別アミノ酸比率は、表10の範囲を含み、
前記VH3-15(配列番号1)、VH3-23(配列番号6)又はVH1-69(配列番号11)の配列を有する重鎖可変領域における重鎖相補性決定領域3(CDRH3)が13個のアミノ酸である場合、前記CDRH3内の位置別アミノ酸比率は、表11の範囲を含み、
前記VH3-15(配列番号1)、VH3-23(配列番号6)又はVH1-69(配列番号11)の配列を有する重鎖可変領域における重鎖相補性決定領域3(CDRH3)が14個のアミノ酸である場合、前記CDRH3内の位置別アミノ酸比率は、表12の範囲を含み、
前記Vκ1-39(配列番号16)の配列を有する軽鎖可変領域における軽鎖相補性決定領域1(CDRL1)内の位置別アミノ酸比率は、表13の範囲を含み、
前記Vκ1-39(配列番号16)の配列を有する軽鎖可変領域における軽鎖相補性決定領域2(CDRL2)内の位置別アミノ酸比率は、表14の範囲を含み、
前記Vκ1-39(配列番号16)の配列を有する軽鎖可変領域における軽鎖相補性決定領域3(CDRL3)内の位置別アミノ酸比率は、表15の範囲を含み、
前記Vκ3-20(配列番号21)の配列を有する軽鎖可変領域における軽鎖相補性決定領域1(CDRL1)内の位置別アミノ酸比率は、表16の範囲を含み、
前記Vκ3-20(配列番号21)の配列を有する軽鎖可変領域における軽鎖相補性決定領域2(CDRL2)内の位置別アミノ酸比率は、表17の範囲を含み、
前記Vκ3-20(配列番号21)の配列を有する軽鎖可変領域における軽鎖相補性決定領域3(CDRL3)内の位置別アミノ酸比率は、表18の範囲を含み、
前記Vκ3-20-2(配列番号26)の配列を有する軽鎖可変領域における軽鎖相補性決定領域1(CDRL1)内の位置別アミノ酸比率は、表19の範囲を含み、
前記Vκ3-20-2(配列番号26)の配列を有する軽鎖可変領域における軽鎖相補性決定領域2(CDRL2)内の位置別アミノ酸比率は、表17の範囲を含み、
前記Vκ3-20-2(配列番号26)の配列を有する軽鎖可変領域における軽鎖相補性決定領域3(CDRL3)内の位置別アミノ酸比率は、表18の範囲を含み、
前記Vλ1-51(配列番号31)の配列を有する軽鎖可変領域における軽鎖相補性決定領域1(CDRL1)内の位置別アミノ酸比率は、表20の範囲を含み、
前記Vλ1-51(配列番号31)の配列を有する軽鎖可変領域における軽鎖相補性決定領域2(CDRL2)内の位置別アミノ酸比率は、表21の範囲を含み、及び
前記Vλ1-51(配列番号31)の配列を有する軽鎖可変領域における軽鎖相補性決定領域3(CDRL3)内の位置別アミノ酸比率は、表22の範囲を含むことを特徴とし得る。
次のi)~iv)から選択された一つ以上の特性を有することを特徴とし得る。
i)10%以下のリダンダンシー(redundancy)(反復配列の比率)
ii)CDR構成(composition)のp値(p-value)>0.05
iii)70℃以上の熱安定性
iv)107以上の多様性(library size)。
VH3-23(配列番号6)の配列を有する重鎖可変領域内のフレームワーク領域は、FR1(配列番号7)、FR2(配列番号8)、FR3(配列番号9)及びFR4(配列番号10)を含み、
VH1-69(配列番号11)の配列を有する重鎖可変領域内のフレームワーク領域は、FR1(配列番号12)、FR2(配列番号13)、FR3(配列番号14)及びFR4(配列番号15)を含み、
Vκ1-39(配列番号16)の配列を有する軽鎖可変領域内のフレームワーク領域は、FR1(配列番号17)、FR2(配列番号18)、FR3(配列番号19)及びFR4(配列番号20)を含み、
Vκ3-20(配列番号21)の配列を有する軽鎖可変領域内のフレームワーク領域は、FR1(配列番号22)、FR2(配列番号23)、FR3(配列番号24)及びFR4(配列番号25)を含み、
Vκ3-20-2(配列番号26)の配列を有する軽鎖可変領域内のフレームワーク領域は、FR1(配列番号27)、FR2(配列番号28)、FR3(配列番号29)及びFR4(配列番号30)を含み、及び
Vλ1-51(配列番号31)の配列を有する軽鎖可変領域内のフレームワーク領域は、FR1(配列番号32)、FR2(配列番号33)、FR3(配列番号34)及びFR4(配列番号35)を含むことを特徴とし得る。
前記VH3-15(配列番号1)の配列を有する重鎖可変領域における重鎖相補性決定領域2(CDRH2)内の位置別アミノ酸比率は、表4の範囲を含み、
前記VH3-23(配列番号6)の配列を有する重鎖可変領域における重鎖相補性決定領域1(CDRH1)内の位置別アミノ酸比率は、表3の範囲を含み、
前記VH3-23(配列番号6)の配列を有する重鎖可変領域における重鎖相補性決定領域2(CDRH2)内の位置別アミノ酸比率は、表4の範囲を含み、
前記VH1-69(配列番号11)の配列を有する重鎖可変領域における重鎖相補性決定領域1(CDRH1)内の位置別アミノ酸比率は、表5の範囲を含み、
前記VH1-69(配列番号11)の配列を有する重鎖可変領域における重鎖相補性決定領域2(CDRH2)内の位置別アミノ酸比率は、表6の範囲を含み、
前記VH3-15(配列番号1)、VH3-23(配列番号6)又はVH1-69(配列番号11)の配列を有する重鎖可変領域における重鎖相補性決定領域3(CDRH3)が9個のアミノ酸である場合、前記CDRH3内の位置別アミノ酸比率は、表7の範囲を含み、
前記VH3-15(配列番号1)、VH3-23(配列番号6)又はVH1-69(配列番号11)の配列を有する重鎖可変領域における重鎖相補性決定領域3(CDRH3)が10個のアミノ酸である場合、前記CDRH3内の位置別アミノ酸比率は、表8の範囲を含み、
前記VH3-15(配列番号1)、VH3-23(配列番号6)又はVH1-69(配列番号11)の配列を有する重鎖可変領域における重鎖相補性決定領域3(CDRH3)が11個のアミノ酸である場合、前記CDRH3内の位置別アミノ酸比率は、表9の範囲を含み、
前記VH3-15(配列番号1)、VH3-23(配列番号6)又はVH1-69(配列番号11)の配列を有する重鎖可変領域における重鎖相補性決定領域3(CDRH3)が12個のアミノ酸である場合、前記CDRH3内の位置別アミノ酸比率は、表10の範囲を含み、
前記VH3-15(配列番号1)、VH3-23(配列番号6)又はVH1-69(配列番号11)の配列を有する重鎖可変領域における重鎖相補性決定領域3(CDRH3)が13個のアミノ酸である場合、前記CDRH3内の位置別アミノ酸比率は、表11の範囲を含み、
前記VH3-15(配列番号1)、VH3-23(配列番号6)又はVH1-69(配列番号11)の配列を有する重鎖可変領域における重鎖相補性決定領域3(CDRH3)が14個のアミノ酸である場合、前記CDRH3内の位置別アミノ酸比率は、表12の範囲を含み、
前記Vκ1-39(配列番号16)の配列を有する軽鎖可変領域における軽鎖相補性決定領域1(CDRL1)内の位置別アミノ酸比率は、表13の範囲を含み、
前記Vκ1-39(配列番号16)の配列を有する軽鎖可変領域における軽鎖相補性決定領域2(CDRL2)内の位置別アミノ酸比率は、表14の範囲を含み、
前記Vκ1-39(配列番号16)の配列を有する軽鎖可変領域における軽鎖相補性決定領域3(CDRL3)内の位置別アミノ酸比率は、表15の範囲を含み、
前記Vκ3-20(配列番号21)の配列を有する軽鎖可変領域における軽鎖相補性決定領域1(CDRL1)内の位置別アミノ酸比率は、表16の範囲を含み、
前記Vκ3-20(配列番号21)の配列を有する軽鎖可変領域における軽鎖相補性決定領域2(CDRL2)内の位置別アミノ酸比率は、表17の範囲を含み、
前記Vκ3-20(配列番号21)の配列を有する軽鎖可変領域における軽鎖相補性決定領域3(CDRL3)内の位置別アミノ酸比率は、表18の範囲を含み、
前記Vκ3-20-2(配列番号26)の配列を有する軽鎖可変領域における軽鎖相補性決定領域1(CDRL1)内の位置別アミノ酸比率は、表19の範囲を含み、
前記Vκ3-20-2(配列番号26)の配列を有する軽鎖可変領域における軽鎖相補性決定領域2(CDRL2)内の位置別アミノ酸比率は、表17の範囲を含み、
前記Vκ3-20-2(配列番号26)の配列を有する軽鎖可変領域における軽鎖相補性決定領域3(CDRL3)内の位置別アミノ酸比率は、表18の範囲を含み、
前記Vλ1-51(配列番号31)の配列を有する軽鎖可変領域における軽鎖相補性決定領域1(CDRL1)内の位置別アミノ酸比率は、表20の範囲を含み、
前記Vλ1-51(配列番号31)の配列を有する軽鎖可変領域における軽鎖相補性決定領域2(CDRL2)内の位置別アミノ酸比率は、表21の範囲を含み、及び
前記Vλ1-51(配列番号31)の配列を有する軽鎖可変領域における軽鎖相補性決定領域3(CDRL3)内の位置別アミノ酸比率は、表22の範囲を含むことを特徴とし得るが、これに限定されるものではない。
前記VH3-15(配列番号1)の配列を有する重鎖可変領域における重鎖相補性決定領域2(CDRH2)内の位置別アミノ酸比率は、表24の範囲を含み、
前記VH3-23(配列番号6)の配列を有する重鎖可変領域における重鎖相補性決定領域1(CDRH1)内の位置別アミノ酸比率は、表23の範囲を含み、
前記VH3-23(配列番号6)の配列を有する重鎖可変領域における重鎖相補性決定領域2(CDRH2)内の位置別アミノ酸比率は、表24の範囲を含み、
前記VH1-69(配列番号11)の配列を有する重鎖可変領域における重鎖相補性決定領域1(CDRH1)内の位置別アミノ酸比率は、表25の範囲を含み、
前記VH1-69(配列番号11)の配列を有する重鎖可変領域における重鎖相補性決定領域2(CDRH2)内の位置別アミノ酸比率は、表26の範囲を含み、
前記VH3-15(配列番号1)、VH3-23(配列番号6)又はVH1-69(配列番号11)の配列を有する重鎖可変領域における重鎖相補性決定領域3(CDRH3)が9個のアミノ酸である場合、前記CDRH3内の位置別アミノ酸比率は、表27の範囲を含み、
前記VH3-15(配列番号1)、VH3-23(配列番号6)又はVH1-69(配列番号11)の配列を有する重鎖可変領域における重鎖相補性決定領域3(CDRH3)が10個のアミノ酸である場合、前記CDRH3内の位置別アミノ酸比率は、表28の範囲を含み、
前記VH3-15(配列番号1)、VH3-23(配列番号6)又はVH1-69(配列番号11)の配列を有する重鎖可変領域における重鎖相補性決定領域3(CDRH3)が11個のアミノ酸である場合、前記CDRH3内の位置別アミノ酸比率は、表29の範囲を含み、
前記VH3-15(配列番号1)、VH3-23(配列番号6)又はVH1-69(配列番号11)の配列を有する重鎖可変領域における重鎖相補性決定領域3(CDRH3)が12個のアミノ酸である場合、前記CDRH3内の位置別アミノ酸比率は、表30の範囲を含み、
前記VH3-15(配列番号1)、VH3-23(配列番号6)又はVH1-69(配列番号11)の配列を有する重鎖可変領域における重鎖相補性決定領域3(CDRH3)が13個のアミノ酸である場合、前記CDRH3内の位置別アミノ酸比率は、表31の範囲を含み、
前記VH3-15(配列番号1)、VH3-23(配列番号6)又はVH1-69(配列番号11)の配列を有する重鎖可変領域における重鎖相補性決定領域3(CDRH3)が14個のアミノ酸である場合、前記CDRH3内の位置別アミノ酸比率は、表32の範囲を含み、
前記Vκ1-39(配列番号16)の配列を有する軽鎖可変領域における軽鎖相補性決定領域1(CDRL1)内の位置別アミノ酸比率は、表33の範囲を含み、
前記Vκ1-39(配列番号16)の配列を有する軽鎖可変領域における軽鎖相補性決定領域2(CDRL2)内の位置別アミノ酸比率は、表34の範囲を含み、
前記Vκ1-39(配列番号16)の配列を有する軽鎖可変領域における軽鎖相補性決定領域3(CDRL3)内の位置別アミノ酸比率は、表35の範囲を含み、
前記Vκ3-20(配列番号21)の配列を有する軽鎖可変領域における軽鎖相補性決定領域1(CDRL1)内の位置別アミノ酸比率は、表36の範囲を含み、
前記Vκ3-20(配列番号21)の配列を有する軽鎖可変領域における軽鎖相補性決定領域2(CDRL2)内の位置別アミノ酸比率は、表37の範囲を含み、
前記Vκ3-20(配列番号21)の配列を有する軽鎖可変領域における軽鎖相補性決定領域3(CDRL3)内の位置別アミノ酸比率は、表38の範囲を含み、
前記Vκ3-20-2(配列番号26)の配列を有する軽鎖可変領域における軽鎖相補性決定領域1(CDRL1)内の位置別アミノ酸比率は、表39の範囲を含み、
前記Vκ3-20-2(配列番号26)の配列を有する軽鎖可変領域における軽鎖相補性決定領域2(CDRL2)内の位置別アミノ酸比率は、表37の範囲を含み、
前記Vκ3-20-2(配列番号26)の配列を有する軽鎖可変領域における軽鎖相補性決定領域3(CDRL3)内の位置別アミノ酸比率は、表38の範囲を含み、
前記Vλ1-51(配列番号31)の配列を有する軽鎖可変領域における軽鎖相補性決定領域1(CDRL1)内の位置別アミノ酸比率は、表40の範囲を含み、
前記Vλ1-51(配列番号31)の配列を有する軽鎖可変領域における軽鎖相補性決定領域2(CDRL2)内の位置別アミノ酸比率は、表41の範囲を含み、及び
前記Vλ1-51(配列番号31)の配列を有する軽鎖可変領域における軽鎖相補性決定領域3(CDRL3)内の位置別アミノ酸比率は、表42の範囲を含むことを特徴とし得るが、これに限定されるものではない。
以下、実施例を挙げて本発明をより詳細に説明する。これらの実施例は単に本発明を例示するためのものであり、本発明の範囲がこれらの実施例によって制限されるものと解釈されないことは、当業界における通常の知識を有する者にとって明らかであろう。
4-1)軽鎖可変領域ライブラリー構築
5-1)ライブラリーサイズ確認
Claims (11)
- 抗体又はその断片の集合であって、
前記抗体又はその断片は、重鎖可変領域及び軽鎖可変領域対(pair)を含み、
前記重鎖可変領域は、VH3-15(配列番号1)の重鎖可変領域に含まれているフレームワーク領域(framework region)と、
各重鎖可変領域別に異なる、重鎖相補性決定領域1(CDRH1)、重鎖相補性決定領域2(CDRH2)及び重鎖相補性決定領域3(CDRH3)の組合せとを含み、
前記軽鎖可変領域は、Vλ1-51(配列番号31)の軽鎖可変領域に含まれているフレームワーク領域と、
各軽鎖可変領域別に異なる、軽鎖相補性決定領域1(CDRL1)、軽鎖相補性決定領域2(CDRL2)及び軽鎖相補性決定領域3(CDRL3)の組合せとを含み、
前記VH3-15(配列番号1)の重鎖可変領域のフレームワーク領域は、FR1(配列番号2)、FR2(配列番号3)、FR3(配列番号4)及びFR4(配列番号5)を含み、そして
Vλ1-51(配列番号31)の軽鎖可変領域のフレームワーク領域は、FR1(配列番号32)、FR2(配列番号33)、FR3(配列番号34)及びFR4(配列番号35)を含む
ことを特徴とする、抗体又はその断片の集合。 - 前記抗体又はその断片の集合が、
VH3-23(配列番号6)又はVH1-69(配列番号11)の重鎖可変領域に含まれているフレームワーク領域と;
各重鎖可変領域別に異なるCDRH1、CDRH2及びCDRH3の組合せと;
Vκ1-39(配列番号16)、Vκ3-20(配列番号21)、又はVκ3-20-2(配列番号26)の軽鎖可変領域に含まれているフレームワーク領域と;
各軽鎖可変領域別に異なるCDRL1、CDRL2及びCDRL3の組合せと
を含む抗体又はその断片をさらに含み、
前記VH3-23(配列番号6)の重鎖可変領域のフレームワーク領域は、FR1(配列番号7)、FR2(配列番号8)、FR3(配列番号9)及びFR4(配列番号10)を含み、
前記VH1-69(配列番号11)の配列を有する重鎖可変領域のフレームワーク領域は、FR1(配列番号12)、FR2(配列番号13)、FR3(配列番号14)及びFR4(配列番号15)を含み、
Vκ1-39(配列番号16)の軽鎖可変領域のフレームワーク領域は、FR1(配列番号17)、FR2(配列番号18)、FR3(配列番号19)及びFR4(配列番号20)を含み、
Vκ3-20(配列番号21)の配列を有する軽鎖可変領域のフレームワーク領域は、FR1(配列番号22)、FR2(配列番号23)、FR3(配列番号24)及びFR4(配列番号25)を含み、そして
Vκ3-20-2(配列番号26)の配列を有する軽鎖可変領域のフレームワーク領域は、FR1(配列番号27)、FR2(配列番号28)、FR3(配列番号29)及びFR4(配列番号30)を含むことを特徴とする、請求項1に記載の抗体又はその断片の集合。 - VH3-15(配列番号1)/Vκ1-39(配列番号16)、VH3-15(配列番号1)/Vλ1-51(配列番号31)、VH3-23(配列番号6)/Vκ1-39(配列番号16)、及びVH3-23(配列番号6)/Vλ1-51(配列番号31)からなる群から選ばれる重鎖及び軽鎖可変領域対に含まれているフレームワーク領域と、
各重鎖可変領域別に異なるCDRH1、CDRH2及びCDRH3の組合せ及び各軽鎖可変領域別に異なるCDRL1、CDRL2及びCDRL3の組合せとを含むことを特徴とする、請求項2に記載の抗体又はその断片の集合。 - 前記VH3-15(配列番号1)の重鎖可変領域における重鎖相補性決定領域1(CDRH1)内の位置別アミノ酸比率は、表3の分布比率を有し、
前記VH3-15(配列番号1)の重鎖可変領域における重鎖相補性決定領域2(CDRH2)内の位置別アミノ酸比率は、表4の分布比率を有し、
前記VH3-23(配列番号6)の重鎖可変領域における重鎖相補性決定領域1(CDRH1)内の位置別アミノ酸比率は、表3の分布比率を有し、
前記VH3-23(配列番号6)の重鎖可変領域における重鎖相補性決定領域2(CDRH2)内の位置別アミノ酸比率は、表4の分布比率を有し、
前記VH1-69(配列番号11)の重鎖可変領域における重鎖相補性決定領域1(CDRH1)内の位置別アミノ酸比率は、表5の分布比率を有し、
前記VH1-69(配列番号11)の重鎖可変領域における重鎖相補性決定領域2(CDRH2)内の位置別アミノ酸比率は、表6の分布比率を有し、
前記VH3-15(配列番号1)、VH3-23(配列番号6)又はVH1-69(配列番号11)の重鎖可変領域における重鎖相補性決定領域3(CDRH3)が9個のアミノ酸である場合、前記CDRH3内の位置別アミノ酸比率は、表7の分布比率を有し、
前記VH3-15(配列番号1)、VH3-23(配列番号6)又はVH1-69(配列番号11)の重鎖可変領域における重鎖相補性決定領域3(CDRH3)が10個のアミノ酸である場合、前記CDRH3内の位置別アミノ酸比率は、表8の分布比率を有し、
前記VH3-15(配列番号1)、VH3-23(配列番号6)又はVH1-69(配列番号11)の重鎖可変領域における重鎖相補性決定領域3(CDRH3)が11個のアミノ酸である場合、前記CDRH3内の位置別アミノ酸比率は、表9の分布比率を有し、
前記VH3-15(配列番号1)、VH3-23(配列番号6)又はVH1-69(配列番号11)の重鎖可変領域における重鎖相補性決定領域3(CDRH3)が12個のアミノ酸である場合、前記CDRH3内の位置別アミノ酸比率は、表10の分布比率を有し、
前記VH3-15(配列番号1)、VH3-23(配列番号6)又はVH1-69(配列番号11)の重鎖可変領域における重鎖相補性決定領域3(CDRH3)が13個のアミノ酸である場合、前記CDRH3内の位置別アミノ酸比率は、表11の分布比率を有し、
前記VH3-15(配列番号1)、VH3-23(配列番号6)又はVH1-69(配列番号11)の重鎖可変領域における重鎖相補性決定領域3(CDRH3)が14個のアミノ酸である場合、前記CDRH3内の位置別アミノ酸比率は、表12の分布比率を有し、
前記Vκ1-39(配列番号16)の軽鎖可変領域における軽鎖相補性決定領域1(CDRL1)内の位置別アミノ酸比率は、表13の分布比率を有し、
前記Vκ1-39(配列番号16)の軽鎖可変領域における軽鎖相補性決定領域2(CDRL2)内の位置別アミノ酸比率は、表14の分布比率を有し、
前記Vκ1-39(配列番号16)の軽鎖可変領域における軽鎖相補性決定領域3(CDRL3)内の位置別アミノ酸比率は、表15の分布比率を有し、
前記Vκ3-20(配列番号21)の軽鎖可変領域における軽鎖相補性決定領域1(CDRL1)内の位置別アミノ酸比率は、表16の分布比率を有し、
前記Vκ3-20(配列番号21)の軽鎖可変領域における軽鎖相補性決定領域2(CDRL2)内の位置別アミノ酸比率は、表17の分布比率を有し、
前記Vκ3-20(配列番号21)の軽鎖可変領域における軽鎖相補性決定領域3(CDRL3)内の位置別アミノ酸比率は、表18の分布比率を有し、
前記Vκ3-20-2(配列番号26)の軽鎖可変領域における軽鎖相補性決定領域1(CDRL1)内の位置別アミノ酸比率は、表19の分布比率を有し、
前記Vκ3-20-2(配列番号26)の軽鎖可変領域における軽鎖相補性決定領域2(CDRL2)内の位置別アミノ酸比率は、表17の分布比率を有し、
前記Vκ3-20-2(配列番号26)の軽鎖可変領域における軽鎖相補性決定領域3(CDRL3)内の位置別アミノ酸比率は、表18の分布比率を有し、
前記Vλ1-51(配列番号31)の軽鎖可変領域における軽鎖相補性決定領域1(CDRL1)内の位置別アミノ酸比率は、表20の分布比率を有し、
前記Vλ1-51(配列番号31)の軽鎖可変領域における軽鎖相補性決定領域2(CDRL2)内の位置別アミノ酸比率は、表21の分布比率を有し、及び
前記Vλ1-51(配列番号31)の軽鎖可変領域における軽鎖相補性決定領域3(CDRL3)内の位置別アミノ酸比率は、表22の分布比率を有することを特徴とする、請求項3に記載の抗体又はその断片の集合。 - 前記断片は、Fab、Fab’、F(ab’)2、scFv、(scFv)2、scFv-Fc、及びFvからなる群から選ばれる一つ以上の形態であることを特徴とする、請求項1~4のいずれか一項に記載の抗体又はその断片の集合。
- 次のi)又はii)から選択された一つ以上の特性を有することを特徴とする、請求項1~5のいずれかに記載の抗体又はその断片の集合:
i)10%以下のリダンダンシー(反復配列の比率)
ii)107以上の多様性(library size)。 - 前記抗体又はその断片の集合は、前記抗体又はその断片の集合をコードする核酸が導入されたファージ又は宿主細胞の表面で発現することを特徴とする、請求項1~6のいずれか一項に記載の抗体又はその断片の集合。
- 前記宿主細胞は、大腸菌又は酵母であることを特徴とする、請求項7に記載の抗体又はその断片の集合。
- 請求項1~8のいずれか一項に記載の抗体又はその断片の集合をコードする核酸。
- (a)抗原を、請求項1~8のいずれか一項に記載の抗体又はその断片の集合と接触させる段階;及び(b)前記抗原に結合する一つ以上の抗体又は抗体断片を選択する段階を含む、抗原に対して特異的な抗体又はその断片を同定する方法。
- 前記抗体又はその断片の集合は、前記抗体又はその断片の集合をコードする核酸が導入されたファージ又は宿主細胞の表面で発現することを特徴とする、請求項10に記載の抗原に対して特異的な抗体又はその断片を同定する方法。
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