JP4741948B2 - プロテインキナーゼインヒビターおよびそれらの使用 - Google Patents
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Description
本発明は、医化学分野に属し、そしてプロテインキナーゼインヒビターであるピリミジン化合物、このような化合物を含有する組成物、および使用方法に関する。この化合物は、癌、神経学的障害、自己免疫障害、およびプロテインキナーゼインヒビターによって緩和される他の疾患の処置に有用である。
新しい治療剤の探索は、近年、標的疾患に関連する酵素および他の生物分子の構造のよりよい理解によって、非常に助けられている。多くの研究の対象となってきた酵素の1つの重要な分類は、プロテインキナーゼである。
本発明の化合物、およびその組成物は、プロテインキナーゼのインヒビターとして有用であることが見出された。特定の実施形態において、これらの化合物は、ERK2、AKT3、GSK3、p70s6k、PDK1、Aurora−2、ROCK、SRC、SYK、ZAP70、JNK3、JAK3、TEC、LCK、FLT3、および/またはCDK2のインヒビターである。これらの化合物は、一般式IおよびV:
本発明は、以下の式I:
環Bは、0〜3個の窒素を有する6員のアリール環であり;
Z1およびZ2は、NまたはCHから各々独立して選択され;
TおよびQは、飽和または不飽和のC1〜6アルキリデン鎖から各々独立して選択され;
ここで:
鎖の2つまでのメチレン単位は、必要に応じて、そして独立して−C(O)−、−C(O)C(O)−、−C(O)NR−、−C(O)NRNR−、−CO2−、−OC(O)−、−NRCO2−、−O−、−NRC(O)NR−、−OC(O)NR−、−NRNR−、−NRC(O)−、−S−、−SO−、−SO2−、−NR−、−SO2NR−、または−NRSO2−によって置換され;
各Rは、水素または必要に応じて置換されたC1〜6脂肪族基から独立して選択されるか、あるいは:
同窒素上の2つのRは、窒素と一緒になって、窒素、酸素もしくは硫黄から独立して選択される1〜3個のヘテロ原子を有する5〜8員のヘテロシクリル環またはヘテロアリール環を形成し;
Uは、−NR−、−NRC(O)−、−NRC(O)NR−、−NRCO2−、−O−、−C(O)NR−、−C(O)−、−CO2−、−OC(O)−、−NRSO2−、−SO2NR−、−NRSO2NR−、または−SO2−から選択され;
mおよびnは、0または1から各々独立して選択され;
pは、0、1、2、3、または4から選択され;
R1は、RまたはArから選択され;
各Arは、6〜10員のアリール環、窒素、酸素、もしくは硫黄から独立して選択される1〜4個のへテロ原子を有する5〜10員のヘテロアリール環、または窒素、酸素、もしくは硫黄から独立して選択される1〜4個のへテロ原子を有する3〜10員のヘテロシクリル環から選択される必要に応じて置換された環であり;
R2は、−(CH2)yCH(R5)2または−(CH2)yCH(R4)CH(R5)2から選択され;
yは、0〜6であり;
R3は、R、Ar、−(CH2)yCH(R5)2、またはCNから選択され;
R4は、R、(CH2)wOR、(CH2)WN(R)2、または(CH2)WSRから選択され;
wは、0〜4であり;
各R5は、必要に応じて置換されたC1〜6脂肪族、Ar、OR、CO2R、(CH2)yN(R)2、N(Ar)(R)、SR、NRC(O)R、NRC(O)N(R)2、C(O)N(R)2、SO2R、NRSO2R、C(O)R、CN、またはSO2N(R)2からなる群より独立して選択され;そして
各R6は、R、F、Cl、N(R)2、OR、SR、NRC(O)R、NRC(O)N(R)2、C(O)N(R)2、SO2R、NRSO2R、C(O)R、CN、SO2N(R)2、N(R)O、ON(R)、またはN(R)N(R)から独立して選択される。
環Bは、0〜3個の窒素を有する6員のアリール環であり;
Z1およびZ2は、NまたはCHから各々独立して選択され;
Tは、飽和または不飽和のC1〜6アルキリデン鎖であり
ここで:
鎖の2つまでのメチレン単位は、必要に応じて、そして独立して−C(O)−、−C(O)C(O)−、−C(O)NR−、−C(O)NRNR−、−CO2−、−OC(O)−、−NRCO2−、−O−、−NRC(O)NR−、−OC(O)NR−、−NRNR−、−NRC(O)−、−S−、−SO−、−SO2−、−NR−、−SO2NR−、または−NRSO2−によって置換され;
各Rは、水素または必要に応じて置換されたC1〜6脂肪族基から独立して選択されるか、あるいは:
同窒素上の2つのRは、窒素と一緒になって、窒素、酸素もしくは硫黄から独立して選択される1〜3個のヘテロ原子を有する5〜8員のヘテロシクリル環またはヘテロアリール環を形成し;
Q’は、飽和または不飽和のC1〜6アルキリデン鎖であり、ここで:
鎖の1または2個のメチレン単位は、必要に応じて、そして独立して−C(O)NR’−、−NR’CO2−、−OC(O)NR’−、−NR’C(O)−、−NR’−、−SO2NR’−、もしくは−NR’SO2によって置換され;
各R’は、C1〜6脂肪族基から独立して選択され、ここでこの脂肪族基は、1個のAr基で置換され、そして必要に応じて−OR、−SR、−NO2、−CN、−N(R)2、−NRC(O)R、−NRC(O)N(R)2、−NRCO2R、−NRNRC(O)R、−NRNRC(O)N(R)2、−NRNRCO2R、−C(O)C(O)R、−C(O)CH2C(O)R、−CO2R、もしくは−C(O)Rから独立して選択される1〜2個のさらなる基で置換され;
Uは、−NR−、−NRC(O)−、−NRC(O)NR−、−NRCO2−、−O−、−C(O)NR−、−C(O)−、−CO2−、−OC(O)−、−NRSO2−、−SO2NR−、−NRSO2NR−、または−SO2−から選択され;
mおよびnは、0または1から各々独立して選択され;
pは、0、1、2、3、または4から選択され;
R1は、RまたはArから選択され;
各Arは、6〜10員のアリール環、窒素、酸素、もしくは硫黄から独立して選択される1〜4個のへテロ原子を有する5〜10員のヘテロアリール環、または窒素、酸素、もしくは硫黄から独立して選択される1〜4個のへテロ原子を有する3〜10員のヘテロシクリル環から選択される必要に応じて置換された環であり;
yは、0〜6であり;
RXは、−(CH2)yR5であり;
R3は、R、Ar、−(CH2)yCH(R5)2、またはCNであり;
wは、0〜4であり;
各R5は、必要に応じて置換されたC1〜6脂肪族、Ar、OR、CO2R、(CH2)yN(R)2、N(Ar)(R)、SR、NRC(O)R、NRC(O)N(R)2、C(O)N(R)2、SO2R、NRSO2R、C(O)R、CN、またはSO2N(R)2から独立して選択され;そして
各R6は、R、F、Cl、N(R)2、OR、SR、NRC(O)R、NRC(O)N(R)2、C(O)N(R)2、SO2R、NRSO2R、C(O)R、CN、SO2N(R)2、N(R)O、ON(R)、またはN(R)N(R)から独立して選択される。
Z1およびZ2は、NまたはCHからそれぞれ独立に選択され;
Tは、飽和C1−6アルキリデン鎖であるか、または不飽和C1−6アルキリデン鎖であり、ここで:
この鎖の二つまでのメチレン単位は、必要に応じて、−C(O)−、−C(O)C(O)−、−C(O)NR−、−C(O)NRNR−、−CO2−、−OC(O)−、−NRCO2−、−O−、−NRC(O)NR−、−OC(O)NR−、−NRNR−、−NRC(O)−、−S−、−SO−、−SO2−、−NR−、−SO2NR−、もしくは−NRSO2−で、独立に置換され;
Uは、−NR−、−NRC(O)−、−NRC(O)NR−、−NRCO2−、−O−、−C(O)NR−、−C(O)−、−CO2−、−OC(O)−、−NRSO2−、−SO2NR−、−NRSO2NR−、もしくは−SO2−から選択され;
mおよびnは、0もしくは1からそれぞれ独立に選択され;
pは、0、1、2、3、もしくは4から選択され;
R1は、RもしくはArから選択され;
各Rは、水素もしくは必要に応じて置換されたC1−6脂肪族基から、独立に選択され、または;
同一窒素上の二つのRは、窒素と一緒になって、窒素、酸素、もしくは硫黄から独立に選択された1〜3のヘテロ原子を有する5〜8員のヘテロシクリル環または5〜8員のヘテロアリール環を形成し;
各Arは、6〜10員環のアリール環、窒素、酸素、もしくは硫黄から独立に選択された、1〜4のヘテロ原子を有する5〜10員へテロアリール環または、窒素、酸素、または硫黄から独立に選択された、1〜4のヘテロ原子を有する3〜10員ヘテロシクリル環から選択された、必要に応じて置換された環であり;
yは、0〜6であり;
R3は、R、Ar、−(CH2)yCH(R5)2、またはCNから選択され;
各R5は、必要に応じて置換されたC1−6脂肪族の、Ar、OR、CO2R、(CH2)yN(R)2、N(R)2、SR、NRC(O)R、NRC(O)N(R)2、C(O)N(R)2、SO2R、NRSO2R、C(O)R、CN、またはSO2N(R)2から独立に選択され;そして
各R6は、R、F、Cl、N(R)2、OR、SR、NRC(O)R、NRC(O)N(R)2、C(O)N(R)2、SO2R、NRSO2R、C(O)R、CN、SO2N(R)2、N(R)O、ON(R)またはN(R)N(R)から独立に選択される。
Z1およびZ2は、NまたはCHからそれぞれ独立に選択され;
TおよびQは、飽和C1−6アルキリデン鎖、または不飽和C1−6アルキリデン鎖から独立に選択され、ここで:
この鎖の二つまでのメチレン単位は、必要に応じて、−C(O)−、−C(O)C(O)−、−C(O)NR−、−C(O)NRNR−、−CO2−、−OC(O)−、−NRCO2−、−O−、−NRC(O)NR−、−OC(O)NR−、−NRNR−、−NRC(O)−、−S−、−SO−、−SO2−、−NR−、−SO2NR−、もしくは−NRSO2−で、独立に置換され;
Uは、−NR−、−NRC(O)−、−NRC(O)NR−、−NRCO2−、−O−、−C(O)NR−、−C(O)−、−CO2−、−OC(O)−、−NRSO2−、−SO2NR−、−NRSO2NR−、もしくは−SO2−から選択され;
mおよびnは、0もしくは1からそれぞれ独立に選択され;
pは、0、1、2、3、もしくは4から選択され;
R1は、RもしくはArから選択され;
各Rは、水素もしくは必要に応じて置換されたC1−6脂肪族基から、独立に選択され、または;
同一窒素上の二つのRは、窒素と一緒になって、窒素、酸素、もしくは硫黄から独立に選択された1〜3のヘテロ原子を有する5〜8員のヘテロシクリル環または5〜8員のヘテロアリール環を形成し;
各Arは、6〜10員アリール環、窒素、酸素、または硫黄から独立に選択された1〜4のヘテロ原子を有する5〜10員へテロアリール環もしくは、窒素、酸素、または硫黄から独立に選択された、1〜4のヘテロ原子を有する3〜10ヘテロシクリル環から選択された、必要に応じて置換された環であり;
R4は、R、(CH2)WOR、(CH2)WN(R)2または(CH2)WSRから選択され、ここで、wは、0〜4であり;
yは、0〜6であり;
R3は、R、Ar、−(CH2)yCH(R5)2、またはCNから選択され;
各R5は、必要に応じて置換されたC1−6脂肪族の、Ar、OR、CO2R、(CH2)yN(R)2、N(R)2、SR、NRC(O)R、NRC(O)N(R)2、C(O)N(R)2、SO2R、NRSO2R、C(O)R、CN、またはSO2N(R)2から独立に選択され;そして
各R6は、R、F、Cl、N(R)2、OR、SR、NRC(O)R、NRC(O)N(R)2、C(O)N(R)2、SO2R、NRSO2R、C(O)R、CN、SO2N(R)2、N(R)O、ON(R)またはN(R)N(R)から独立に選択される。
Z1およびZ2は、NまたはCHからそれぞれ独立に選択され;
Qは、NRC(O)、C(O)NR、NRSO2、またはSO2NRから選択され;
Tは、飽和C1−6アルキリデン鎖、または不飽和C1−6アルキリデン鎖であり、ここで:
この鎖の二つまでのメチレン単位は、必要に応じて、−C(O)−、−C(O)C(O)−、−C(O)NR−、−C(O)NRNR−、−CO2−、−OC(O)−、−NRCO2−、−O−、−NRC(O)NR−、−OC(O)NR−、−NRNR−、−NRC(O)−、−S−、−SO−、−SO2−、−NR−、−SO2NR−、もしくは−NRSO2−で、独立に置換され;
Uは、−NR−、−NRC(O)−、−NRC(O)NR−、−NRCO2−、−O−、−C(O)NR−、−C(O)−、−CO2−、−OC(O)−、−NRSO2−、−SO2NR−、−NRSO2NR−、もしくは−SO2−から選択され;
mおよびnは、0もしくは1からそれぞれ独立に選択され;
pは、0、1、2、3、もしくは4から選択され;
R1は、RもしくはArから選択され;
各Rは、水素もしくは必要に応じて置換されたC1−6脂肪族基から、独立に選択されるか、または;
同一窒素上の二つのRは、窒素と一緒になって、窒素、酸素、もしくは硫黄から独立に選択された1〜3のヘテロ原子を有する5〜8員のヘテロシクリル環または5〜8員のヘテロアリール環を形成し;
各Arは、6〜10員アリール環、窒素、酸素、または硫黄から独立に選択された1〜4のヘテロ原子を有する5〜10員のへテロアリール環もしくは、窒素、酸素、または硫黄から独立に選択された、1〜4のヘテロ原子を有する3〜10ヘテロシクリル環から選択された必要に応じて置換された環であり;
yは、0〜6であり;
R3は、R、Ar、−(CH2)yCH(R5)2、またはCNから選択され;
各R5は、必要に応じて置換されたC1−6脂肪族の、Ar、OR、CO2R、(CH2)yN(R)2、N(R)2、SR、NRC(O)R、NRC(O)N(R)2、C(O)N(R)2、SO2R、NRSO2R、C(O)R、CN、またはSO2N(R)2から独立に選択され;そして
各R6は、R、F、Cl、N(R)2、OR、SR、NRC(O)R、NRC(O)N(R)2、C(O)N(R)2、SO2R、NRSO2R、C(O)R、CN、SO2N(R)2、N(R)O、ON(R)またはN(R)N(R)から独立に選択される。
Z1、Z2、U、T、m、n、p、Q’、R1、RX、R3、およびR6は、前述のようなものである。
Tは、飽和C1−6アルキリデン鎖、または不飽和C1−6アルキリデン鎖であり、ここで:
この鎖の二つまでのメチレン単位は、必要に応じて、−C(O)−、−C(O)C(O)−、−C(O)NR−、−C(O)NRNR−、−CO2−、−OC(O)−、−NRCO2−、−O−、−NRC(O)NR−、−OC(O)NR−、−NRNR−、−NRC(O)−、−S−、−SO−、−SO2−、−NR−、−SO2NR−、もしくは−NRSO2−で、独立に置換され;
各Rは、水素もしくは必要に応じて置換されたC1−6脂肪族基から、独立に選択されるか、または;
同一窒素上の二つのRは、窒素と一緒になって、窒素、酸素、もしくは硫黄から独立に選択された1〜3のヘテロ原子を有する5〜8員のヘテロシクリル環または5〜8員のヘテロアリール環を形成し;
各R’は、C1−6脂肪族基から、独立に選択され、ここでこの脂肪族基は、一つのAr基を用いて置換され、そしてハロゲン、−OR、−SR、−NO2、−CN、−N(R)2、−NRC(O)R、−NRC(O)N(R)2、−NRCO2R、−NRNRC(O)R、−NRNRC(O)N(R)2、−NRNRCO2R、−C(O)C(O)R、−C(O)CH2C(O)R、−CO2R、または−C(O)Rから独立して選択される1〜2の付加的な基を用いて必要に応じて置換され;
Uは、−NR−、−NRC(O)−、−NRC(O)NR−、−NRCO2−、−O−、−C(O)NR−、−C(O)−、−CO2−、−OC(O)−、−NRSO2−、−SO2NR−、−NRSO2NR−、もしくは−SO2−から選択され;
mおよびnは、0もしくは1からそれぞれ独立に選択され;
pは、0、1、2、3、もしくは4から選択され;
R1は、RもしくはArから選択され;
各Arは、6〜10員のアリール環、窒素、酸素、または硫黄から独立に選択された1〜4のヘテロ原子を有する5〜10員のへテロアリール環もしくは、窒素、酸素、または硫黄から独立に選択された、1〜4のヘテロ原子を有する3〜10員ヘテロシクリル環から選択された必要に応じて置換された環であり;
yは、0〜6であり;
RXは、−(CH2)yR5であり;
R3は、R、Ar、−(CH2)yCH(R5)2、またはCNから選択され;
wは、0〜4であり;
各R5は、必要に応じて置換されたC1−6脂肪族の、Ar、OR、CO2R、(CH2)yN(R)2、N(R)2、SR、NRC(O)R、NRC(O)N(R)2、C(O)N(R)2、SO2R、NRSO2R、C(O)R、CN、またはSO2N(R)2から独立に選択され;そして
各R6は、R、F、Cl、N(R)2、OR、SR、NRC(O)R、NRC(O)N(R)2、C(O)N(R)2、SO2R、NRSO2R、C(O)R、CN、SO2N(R)2、N(R)O、ON(R)またはN(R)N(R)から独立に選択される。
適切なコーティングおよびコーティングされる移植可能なデバイスの一般的な調製は、米国特許第6,099,562号;同第5,886号,026;および同第5,304,121号に記載されている。このコーティングは、代表的には、生物適合性ポリマー物質(例えば、ヒドロゲルポリマー、ポリメチルジシロキサン、ポリカプロラクトン、ポリエチレングリコール、ポリ乳酸、エチレンビニルアセテートおよびそれらの混合物である。このコーティングは、その組成物において徐放特徴を与えるために、フルオロシリコーン、ポリサッカライド、ポリエチレングリコール、リン脂質またはそれらの組み合わせの適切なトップコーティングによって、必要に応じてさらに覆われ得る。本発明の化合物を用いてコーティングされる医療デバイスは、本発明の別の実施形態である。
(実施例1)
3−(3−ジメチルアミノ−アクリロイル)−ベンゾニトリル):3−アセチル−ベンゾニトリル(36.2g、249mmol)のジメチルホルムアミド ジメチルアセタール(200ml、過剰)の混合物を、一晩加熱還流した。この溶媒を減圧下でエバポレートしてオレンジ色固体を得た。この固体をジクロロメタンに溶解して、20%酢酸エチル/ジクロロメタンで溶出するシリカゲルのプラグで濾過した。この濾液を減圧下で濃縮して、オレンジ固体として42.0g(84%)の表題化合物を得た。
(3−(2−フェニルアミノ−ピリジン−4−イル)−ベンゾニトリル):3−(3−ジメチルアミノ−アクリロイル)−ベンゾニトリル(30.4g、152mmol)のアセトニトリル(250ml)溶液に、フェニルグアニジン(21.0g、155mmol)のアセトニトリル(250ml)溶液をおよびこの混合物を2時間加熱還流した。この溶液を冷まして、得られる固体を濾過してアセトニトリルで洗浄して、表題化合物を得た。
(3−(2−フェニルアミノ−ピリジン−4−イル)−安息香酸):3−(2−フェニルアミノ−ピリジン−4−イル)−ベンゾニトリル(10g、36.7mmol)の酢酸(20ml)の懸濁液に、濃塩酸(30ml)を加えて、この懸濁液を一晩100℃で加熱した。出発物質が完全に溶解して、次いで固体が沈殿した。この反応混合物を濾過して、沈殿物をエーテルおよびメタノールで洗浄して、9g(84%)の表題化合物を得た。
本発明の一連の化合物を、以下の方法で3−(2−フェニルアミノ−ピリジン−4−イル)−安息香酸から調製した:3−(2−フェニルアミノ−ピリジン−4−イル)−安息香酸(100mg、343μmol)のDMF溶液に、EDC(105mg、548μmol)、HOBT(90mg、666μmol)およびエチルジイソプロピルアミン(177μl、1.02mmol)を加えた。この反応混合物を、室温にて1時間攪拌した。アミン(3当量)を加えて、反応物を、室温にて一晩攪拌した。反応混合物を、酢酸エチルで希釈して、その後、水、ブラインで洗浄して、乾燥させた(MgSO4)。この有機層を濃縮して、黄色油状物として粗生成物を得た。この粗生成物を、分取HPLC(カラム:Kiomasil、150×21mm、C8、10mm 勾配:15分間かけて、20%CH3CN−−>90%CH3CN)により精製して、所望のアミド生成物を得た。
(N−(4−アセチル−フェニル)−2−モルホリン−4−イル−2−フェニル−アセトアミド):α−ブロモ−2−フェニル酢酸(1g)のCH2Cl2溶液(15mL)に、オキサリルクロライド(2MのCH2Cl25mL)を加えた。得られる溶液に、1 DMF(10μL)を加えた。2時間後、この溶液を濃縮して、トルエン(2×10mL)から共沸させて、次いで、CH2Cl2(15mL)に再溶解した。攪拌させた溶液を、4−アミノアセトフェノン(1.0g)で処理した。30分後、得られる懸濁液を、連続して、ジイソプロピルエチルアミン(3mL)およびモルホリン(2mL)で処理した。得られる暗溶液を8時間室温にて攪拌して、次いで、回転エバボレーターを介して濃縮した。粗生成物を、シリカゲルクロマトグラフィー(1:1 CH2Cl2:酢酸エチル)により精製して、黄色油状物として200mgの表題化合物を得た。
1HNMR(CDCl3、500MHz)δ9.32(1H、s)、7.95(2H、d)、7.70(2H、d)、7.40(5H、m)、4.0(1H、s)、3.8(4H、m)、2.60(3H、s)、2.55(4H、m)、ppm.FIA MASS:339.2(M+H)。
(N−{4−[2−(3−アミノ−フェニルアミノ)−ピリミジン−4−イル]−フェニル}−2−モルホリン−4−イル−2−フェニル−アセトアミド(I’’−1)):化合物I’’−1を、実施例4に記載される方法と実質的に同様な方法によってN−(4−アセチル−フェニル)−2−モルホリン−4−イル−2−フェニル−アセトアミド調製した。
1HNMR(CDCl3、500MHz)δ9.2(1H、s)、8.35(1H、h)、8.0(2H、d)、8.65(2H、d)、7.3(5H、m)、7.15(1H、m)、7.0(1H、m)、6.9(1H、d)、6.32(1H、m)、3.95(1H、s)、3.70(4H、m)、2.50(4H、m)ppm.M+l 481.3。
4−[5−クロロ−2−(1−(S)−ヒドロキシメチルエチルアミノ)−ピリミジン−4−イル]−N−[1−(3−(S)−クロロフェニル)−2−ヒドロキシエチル]−ベンズアミド(I”−40):5−クロロウラシル(25g、0.17mol)を、乾燥したフラスコ(250mL)中に入れ、そしてオキシ三塩化亜リン酸(100mL)を室温にて添加した。この溶液に、N,N−ジメチルアニリン(1mL)を添加した。得られた溶液を、110℃にて3日間または反応混合物が均質になるまで加熱した。溶媒を減圧下でエバポレートし、そして残渣を酢酸エチル中に可溶化し、次いで水、ブラインで2回洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥し、次いで粗製生成物を、シリカでのクロマトグラフィー(酢酸エチル、ヘキサン中3%)によって精製して、25gの2,4,5−トリクロロピリミジンを白色液体として得た。構造を、1H NMRによって確認した。
N−[1−(3−(S)−クロロフェニル)−2−ヒドロキシエチル]−4−[2−(1−(S)−ヒドロキシメチル−プロピルアミノ)−ピリミジン−4−イル]−ベンズアミド(I”−36):DMF(6mL)中の4−(2−アミノ−ピリミジン−4−イル)−安息香酸(1.0当量、661mg、3.1mmol)およびHOBt(1.1当量、467mg、3.4mmol)の溶液に、DIEA(2.2当量、1.18mL、6.8mmol)およびEDC(1.2当量、708mg、3.7mmol)を添加した。溶液を10分間攪拌し、次いで(S)−(+)−3−クロロフェニルグリシノール塩酸塩(1.1当量、703mg、3.4mmol)を添加した。24時間の攪拌後、溶液を酢酸エチル中に希釈し、そして有機層を重炭酸ナトリウム、ブラインで洗浄し、そしてMgSO4で乾燥した。粗製物質を、シリカでのクロマトグラフィー(MeOH、CH2Cl2中5%)によって精製して、9.4mgの4−(2−アミノピリミジン−4−イル)−N−[1−(3−(S)−クロロフェニル)−2−ヒドロキシエチル]−ベンズアミドを得た。1H NMR 500 MHz(DMSO−d6):8.4(d,1H)、8.0−8.2(dd,4H)、7.5(s,1H)、7.2−7.4(m,4H)、5.15(m,1H)、3.7(m,2H)。LCMS:ES+=369、ES−=367.2。
N−[1−(3−クロロフェニル)−2−(S)−ヒドロキシエチル]−4−(2−シクロプロピルアミノ−5−メチルピリジン−4−イル)−ベンズアミド(I”−46):2−フルオロ−4−ヨード−5−メチル−ピリジン(0.90g、3.8mmol)、4−カルボキシメチル−フェニルボロン酸(0.72g、4.0mmol)、リン酸カリウム(2.5g、11.8mmol)、およびジクロロ[1,1’−ビス(ジフェニルホスフィノ)フェロセン]パラジウム(II)ジクロロメタン付加物(0.30g、0.37mmol)をスクリューキャップチューブ中で合わせ、そして1.4−ジオキサン(20mL)を添加した。アルゴンを反応混合物を通して発泡させ、次いでこれを密封して、95℃まで一晩加熱した。反応混合物を水で希釈し、そして酢酸エチルで抽出した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥し、そして濃縮して赤色固体を得て、これを、シリカでのクロマトグラフィー(EtOAc、ヘキサン中0〜40%)によって精製して、4−(2−フルオロ−5−メチル−ピリジン−4−イル)−安息香酸メチルエステルを0.62g、2.5mmol、66%の収率で得た。1H NMR 500MHz(CDCl3):8.05(m,3H)、7.33(d,2H)、6.74(s,1H)、3.90(s,3H)、2.15(s,3H)。
N−[1−(3−クロロ−フェニル)−2−ヒドロキシ−エチル]−4−[5−フルオロ−2−(1−ヒドロキシメチル−プロピルアミノ)−ピリミジン−4−イル]−ベンズアミド(I”37):2,4−ジクロロ−5−フルオロピリミジン(0.50g、3.0mmol)および4−カルボキシフェニルボロン酸(0.5g、3.0mmol)をスクリューキャップ試験管中のジメトキシエタン(20mL)中に溶解し、そして6mLの2M Na2CO3を添加し、続いて80mg(0.069mmol)のテトラキス(トリフェニルホスフィン)パラジウムを添加した。アルゴンを、反応混合物を通して5分間発泡させ、次いで反応混合物を85℃まで一晩攪拌した。反応混合物を水に注ぎ、そして酢酸エチルで抽出した。有機層をブラインで洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥し、そして濃縮して固体とし、この固体をシリカでのクロマトグラフィー(MeOH 5%/CH2Cl2)によって精製して、0.22g(0.87mmol、29%の収率)の4−(2−クロロ−5−フルオロピリミジン−4−イル)−安息香酸を白色固体として得た。1H NMR 500 MHz(MeOH−d4):8.85(m,1H)、8.20(m,4H)。
4−[5−クロロ−2−(1−(S)−ヒドロキシメチルプロピルアミノ)−ピリミジン−4−イル]−N−[1−(3−(S)−クロロフェニル)−2−ヒドロキシエチル]−ベンズアミド(I”−38):2,4,5−トリクロロピリミジン(0.40g、2.2mmol)および4−カルボキシメチルフェニルボロン酸(0.4g、2.2mmol)をスクリューキャップ試験管中のジメトキシエタン(20mL)中に溶解し、そしてNa2CO3(3.3mL、2M)を添加し、続いてテトラキス(トリフェニルホスフィン)パラジウム(40mg、0.036mmol)を添加した。アルゴンを反応混合物を通して5分間発泡し、次いで反応混合物を密封し、そして90℃まで一晩加熱した。反応混合物を水中に注ぎ、そして酢酸エチルで抽出した。有機層をブラインで洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥し、そして濃縮してオイルとし、このオイルをシリカでのクロマトグラフィー(EtOAc、0〜15%/ヘキサン)によって精製して、0.31g(1.1mmol、50%の収率)の4−(2,5−ジクロロピリミジン−4−イル)−安息香酸メチルエステルを白色固体として得た。1H NMR 500 MHz(CDCl3):8.78(s,1H)、8.27(d,2H)、8.04(d,2H)、4.02(s,3H)。
4−(5−クロロ−2−シクロプロピルアミノ−ピリミジン−4−イル)−N−[1−(3−(S)−クロロ−フェニル)−2−ヒドロキシ−エチル]−ベンズアミド(I”−39):4−(2,5−ジクロロピリミジン−4−イル)−安息香酸メチルエステル(85mg、0.30mmol)を、0.2mLシクロプロピルアミンを含むエタノール中に溶解し、そして反応混合物を80℃まで一晩加熱した。反応混合物を水で希釈し、そして酢酸エチルで抽出した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥し、そして濃縮して、4−(5−クロロ−2−シクロプロピルアミノピリミジン−4−イル)安息香酸メチルエステルを、固体として、90mg、0.30mmol、100%の収率で得た。LCMS:ES+=304.1。
4−(5−クロロ−2−イソプロピルアミノ−ピリジン−4−イル)−N−[1−(3−クロロ−フェニル)−2−ヒドロキシ−エチル]−ベンズアミド(I”−44):5−クロロ−2−フルオロ−4−ヨードピリジン(257mg、1mmol)、4−カルボキシメチルフェニルボロン酸(0.2g、1.1mmol)を、スクリューキャップ試験管中のジメトキシエタン中に溶解し、そして1.5mLの2M Na2CO3を添加し、続いてテトラキス(トリフェニルホスフィン)パラジウム(50mg、0.044mmol)を添加した。アルゴンを反応混合物を通して5分間発泡し、チューブを密封し、次いで反応混合物を85℃まで一晩加熱した。反応混合物を水中に注ぎ、そして酢酸エチルで抽出した。有機層をブラインで洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥し、そして濃縮してオイルを得て、このオイルをシリカでのクロマトグラフィー(EtOAc、ヘキサン中0〜15%)によって精製して、90mg(0.34mmol、34%の収率)の4−(5−クロロ−2−フルオロピリジン−4−イル)−安息香酸メチルエステルを得た。1H NMR 500 MHz(CDCl3):8.24(s,1EI)、8.10(d,2H)、7.48(d,2H)、6.89(d,1H)、3.91(s,3H)。LCMS:ES+=257.9。
N−[1−(3−(S)−クロロフェニル)−2−ヒドロキシ−エチル]−4−(5−フルオロ−2−イソプロピルアミノ−ピリミジン−4−イル)−ベンズアミド(I”−41):5mLのエチレングリコールジメチルエーテル中の2,4−ジクロロ−5−フルオロピリミジン(0.478g、2.86mmol)および4−カルボキシフェニルボロン酸メチルエステル(0.516g、2.86mmol)の溶液に、アルゴン下でPd(PPh3)4を添加し、続いて2N Na2CO3を添加し、そして得られた混合物にアルゴンを2分間パージした。得られた混合物を密封し、そして85℃にて一晩加熱した。18時間後、反応物を20mLの酢酸エチルで希釈し、そしてH2Oで洗浄した。有機層を濃縮し、そしてクロマトグラフィー(シリカ、ヘキサン中10%酢酸エチル)によって精製して、4−(2−クロロ−5−フルオロピリミジン−4−イル)−安息香酸メチルエステル(0.35g、46%)を白色固体として得た。LCMS:ES+=267。
N−[1−(3−(S)−クロロフェニル)−2−ヒドロキシエチル]−4−[5−フルオロ−2−(2−(S)−ヒドロキシ−1−メチル−エチルアミノ)−ピリミジン−4−イル]−3−メチル−ベンズアミド(I”−58):0.5mLのDMSO中の4−(2−クロロ−5−フルオロピリミジン−4−イル)−N−[1−(3−(S)−クロロフェニル)−2−ヒドロキシ−エチル]−3−メチル−ベンズアミド(0.015g、0.036mmol)の溶液に、(S)−(+)−2−アミノ−1−プロパノール(0.05mL、074mmol)を添加し、そして得られた混合物を110℃にて2時間加熱した。反応物を10mLの酢酸エチルで希釈し、そして5mLのH2Oで洗浄した。有機層を濃縮し、そしてクロマトグラフィー(シリカ、ヘキサン中40%の酢酸エチル)によって精製して、表題化合物(0.010g、63%)を白色固体として得た。1H NMR(CDCl3、500MHz):8.15(s,1H)、7.70(s,1H)、7.65(d,1H)、730−7.35(m,3H)、7.20−7.25(m,2H)、5.32(d,1H)、5.09−5.12(m,1H)、4.00−4.08(m,1H)、3.80−3.90(m,2H)、3.65−3.71(m,1H)、3.52−3.55(m,1H)、2.30(s,3H)、1.21(d,3H)。LC/MS:ES+=459。
4−[5−クロロ−2−(2−ヒドロキシ−1−メチルエチルアミノ)−ピリミジン−4−イル]−N−[1−(3−(S)−クロロフェニル)−2−ヒドロキシ−エチル]−3−メチルベンズアミド(I”−45):1H NMR(CDCl3、500MHz):8.25(s,1H)、7.70(s,1H)、7.65(d,1H)、7.30(s,1H)、7.20−7.25(m,3H)、6.92(m,1H)、5.35−5.40(m,1H)、5.10−5.15(m,1H)、4.02−4.10(m,1H)、3.90−3.92(m,2H)、3.65−3.70(m,1H)、3.55−3.60(m,1H)、2.20(s,3H)、1.25(d,3H)。LCMS:ES+=475。
DCM(10mL)中の4−[5−クロロ−2−(1−(S)−ヒドロキシメチルプロピルアミノ)−ピリミジン−4−イル]−N−[1−(3−(S)クロロフェニル)−2−ヒドロキシエチル]−ベンゼンスルホンアミド(I”−47):DCM(10mL)中の3−(S)−クロロフェニルグリシノールHCl塩(416mg、2mmol)の懸濁物に、TEA(0.8mL、5.7mmol)および塩化ピプシル(pipsyl chloride)(605mg、2mmol)を添加した。得られた反応物を、室温にて2時間攪拌した。反応混合物をDCM(30mL)で希釈し、そしてH2Oおよびブライン溶液で洗浄した。有機層をNa2SO4で乾燥し、そして減圧下で濃縮した。粗製N−[1−(3−(S)−クロロフェニル)−2−ヒドロキシ−エチル]−4−ヨードベンゼンスルホンアミドを直接用いた。
N−[1−(3−クロロフェニル)−2−(S)−ヒドロキシエチル]−4−(2−プロピルアミノ−5−メチル−4−フェニル)−ベンズアミド(I”−62):水(50mL)中の鉄(1.5g、27.6mmol)および塩化アンモニウム(2.46g、46mmol)の懸濁物に、メタノール(25mL)中の3−ブロモ−4−メチル−1−ニトロベンゼン(1.0g、4.6,mmol)の溶液をゆっくりと添加した。得られた混合物を、2時間を還流した。形成された固体を、反応混合物が依然として熱いままで、セライトを通して濾過し、次いで、透明な濾液の溶媒を除去した。粗製残渣を水中に再溶解し、酢酸エチルで抽出し、そして無水硫酸ナトリウムで乾燥した。粗製オイルをシリカゲルで吸着し、そしてシリカゲルでのフラッシュクロマトグラフィー(95:5〜50:50のヘキサン/EtOAc)によって精製した。生成物3−ブロモ−4−メチルアニリンを淡赤色オイル(462mg)として得た。HPLC Rt3.425分。
4−(5−クロロ−2−エトキシアミノピリミジン−4−イル)−N−[1−(3−(S)−クロロフェニル)−2−ヒドロキシエチル]−ベンズアミド(I”−72):2mLのDMSO中の4−(2−クロロ−5−フルオロピリミジン−4−イル)−N−[1−(3−(S)−クロロフェニル)−2−ヒドロキシ−エチル]−3−メチル−ベンズアミド(50mg、0.12mmol)の溶液に、O−エチルヒドロキシルアミン・HCl(2当量、23mg、0.24mmol)を添加し、そして得られた混合物を110℃にて5時間攪拌した。粗製生成物を分取HPLCによって精製して、6.7mgの表題化合物を得た。1H NMR 500MHz(MeOH−d4):8.4(s,1H)、7.9−8.0(dd,4H)、7.25−7.4(m,4H)、5.2(m,1H)、4.0(m,2H)、3.85(m,2H)、1.3(t,3H)。LCMS:ES+=447.0,ES−=445.1。
本発明の化合物を、上記の実施例1〜19に記載される方法、スキームI〜VIIIに示される方法と実質的に類似の方法によって、そして当業者に公知の方法によって調製した。これらの化合物についての特徴付けデータを、以下の表4にまとめ、そしてLC/MS、HPLCおよび1H NMRのデータを含む。他に指定しない限り、1H NMRデータを、CDCl3中で500MHzにおいて得て、そして全ての報告された化学シフトはppmである。
カラム:YMC ODS AQ、3×100mm、C18、5mm;
勾配:10% CH3CN−−>90% CH3CN、8分間にわたる。
(JNK3阻害アッセイ)
化合物を、分光光度滴定共役−酵素アッセイによってJNK3の阻害についてアッセイした。このアッセイでは、固定した濃度の活性化JNK3(10nM)を、10mM MgCl2、2.5mMホスホエノールピルビン酸、200μM NADH、150μg/mLピルビン酸キナーゼ、50μg/mL乳酸デヒドロゲナーゼ、および200μM EGFレセプターペプチドを含む0.1M HEPES緩衝液(pH 7.5)を含む緩衝液中で、DMSO中に溶解した種々の濃度の潜在的インヒビターとともに30℃にて10分間インキュベートした。EGFレセプターペプチドは、JNK3触媒キナーゼ反応中でホスホリルアクセプターである。反応を、10μM ATPの添加によって開始した。そしてアッセイプレートを分光光度計のアッセイプレート区画中に挿入し、これを30℃にて維持した。340nmでの吸光度の減少を、時間の関数としてモニタリングした。インヒビター濃度の関数としての速度のデータを、競合阻害反応速度モデルに適合させて、Kiを決定した。
(CDK−2阻害アッセイ)
化合物を、標準共役酵素アッセイ(Foxら(1998)Protein Sci 7,2249)を用いて、CDK−2を阻害する能力について以下の様式でスクリーニングした。
(JAK阻害アッセイ)
JAKの化合物阻害を、以下の様式で、G.R.Brownら,Bioorg.Med.Chem.Lett.2000,第10巻,575−579頁によって記載された方法によってアッセイした。4℃においてポリ(Glu、Ala、Tyr)6:3:1を用いて予めコーティングして、リン酸緩衝化生理食塩水0.05%およびTween(PBST)で洗浄したMaxisorbプレート中に、2μM ATP、5mM MgCl2、およびDMSO中の化合物溶液を添加した。JAK酵素を用いて反応を開始し、そしてプレートを30℃にて60分間インキュベートした。次いで、このプレートをPBSTで洗浄し、100μL HRP結合体化4G10抗体を添加し、そしてこのプレートを30℃にて90分間インキュベートした。このプレートをPBSTで再度洗浄し、100μL TMB溶液を添加し、そしてこのプレートを30℃にてさらに30分間インキュベートした。硫酸(100μLの1M)を添加して反応を停止させ、そしてこのプレートを450nmにおいて読み取って、IC50値を決定するための分析のための光学密度を得た。本発明の化合物は、JAK3を阻害することが示された。
(ERK2阻害アッセイ)
化合物を、分光光度滴定共役−酵素アッセイ(Foxら,Protein Sci.1998,7,2249)によってERK2の阻害についてアッセイした。このアッセイでは、固定した濃度の活性化ERK2(10nM)を、DMSO(2.5%)中の種々の濃度の本発明の化合物とともに、10mM MgCl2、2.5mMホスホエノールピルビン酸、200μM NADH、150μg/mlピルビン酸キナーゼ、50μg/ml乳酸デヒドロゲナーゼ、および200μMエルクチド(erktide)ペプチドを含む0.1M HEPES緩衝液(pH 7.5)中で30℃にて10分間インキュベートした。65μM ATPの添加によって反応を開始した。340nMにおける吸光度の減少速度をモニタリングした。Ki値を速度データから、インヒビター濃度の関数として決定した。
(ERK2阻害:細胞増殖アッセイ)
化合物を、細胞増殖アッセイによってERK2の阻害についてアッセイし得る。このアッセイでは、完全培地を、10%ウシ胎児血清およびペニシリン/ストレプトマイシン溶液をRPMI 1640培地(JRH Biosciences)に添加することにより調製する。結腸癌細胞(HT−29細胞株)を96ウェルプレートの84個のウェルの各々に、10,000細胞/ウェル/150μLの播種密度で添加する。細胞を、37℃にて2時間インキュベートすることにより、このプレートに付着させる。試験化合物の溶液を、系列希釈によって完全培地中で調製して、以下の濃度を得る:20μM、6.7μM、2.2μM、0.74μM、0.25μM、および0.08μM。試験化合物溶液(50μL)を、72個の細胞含有ウェルの各々に添加する。残りの12個の細胞含有ウェルに、完全培地(200μL)のみを添加して、コントロール群を形成して、最大増殖を測定する。残りの12個の空のウェルに、完全培地を添加して、ビヒクルコントロール群を形成して、バックグラウンドを測定する。プレートを、37℃にて3日間インキュベートする。3H−チミジン(1mCi/mL、New England Nuclear,Boston,MA)のストック溶液を、RPMI培地中に20μCi/mLに希釈し、次いで20μLのこの溶液を各ウェルに添加する。このプレートを、37℃にて8時間さらにインキュベートし、次いで収集し、そして液体シンチレーションカウンターを用いて3H−チミジン取り込みについて分析する。
(ERK1阻害アッセイ)
化合物を、分光光度滴定共役−酵素アッセイ(Foxら(1998)Protein Sci 7,2249)によってERK1の阻害についてアッセイする。このアッセイでは、固定した濃度の活性化ERK1(20nM)を、10mM MgCl2、2.5mMホスホエノールピルビン酸、200μM NADH、30μg/mLピルビン酸キナーゼ、10μg/mL乳酸デヒドロゲナーゼ、および150μMエルクチド(erktide)ペプチドを含む0.1M HEPES緩衝液(pH7.6)中で、DMSO(2.0%)中の種々の濃度の化合物とともに、30℃にて10分間インキュベートする。140μM ATP(20μL)の添加によってこの反応を開始する。340nMでの吸光度の減少速度をモニタリングする。このKiを、速度データから、インヒビター濃度の関数として評価する。
(AKT−3阻害アッセイ)
化合物を、標準的な共役酵素アッセイ(Foxら,Protein Sci.1998 7,2249)を用いて、AKTを阻害するそれらの能力についてスクリーニングした。アッセイを、100mM HEPES 7.5、10mM MgCl2、25mM NaCl、1mM DTTおよび3% DMSOの混合物中で実施した。このアッセイにおける最終基質濃度は、170μM ATP(Sigma Chemicals)および200μMペプチド(American Peptide,Sunnyvale,CA)であった。アッセイを、30℃および45nM AKTにおいて実施した。共役酵素系の成分の最終濃度は、2.5mMホスホエノールピルビン酸、300μM NADH、30μg/mlピルビン酸キナーゼおよび10μg/ml乳酸デヒドロゲナーゼであった。
(Aurora−2阻害アッセイ)
化合物を、標準的共役酵素アッセイ(Foxら,Protein Sci.1998,7,2249)を用いて、Aurora−2を阻害するそれらの能力について、以下の様式でスクリーニングする。
(c−KIT阻害アッセイ)
化合物を、放射性フィルター結合アッセイを用いて、c−KIT活性を阻害するそれらの能力についてスクリーニングする。このアッセイは、基質ポリ(Glu、Tyr)4:1(pE4Y)への33P取り込みをモニタリングする。反応を、100mM HEPES(pH7.5)、10mM MgCl2、25mM NaCl、1mM DTT、0.01% BSAおよび2.5% DMSOを含む溶液中で実施する。このアッセイにおける最終基質濃度は、700μM ATPおよび0.5mg/mL pE4Y(両方とも、Sigma Chemicals,St Louis,MOから)である。化合物の最終濃度は、一般に、0.01μMと5μMとの間である。代表的に、12点滴定を、試験化合物の10mM DMSOストックから系列希釈物を調製することにより実施する。反応を、室温にて実施する。
(FLT−3阻害アッセイ)
化合物を、放射測定フィルター結合アッセイを使用して、FLT−3活性を阻害するそれらの能力についてスクリーニングした。このアッセイは、基質のポリ(Glu、Tyr)4:1(pE4Y)への33P取り込みをモニターする。反応を、100mM HEPES(pH7.5)、10mM MgCl2、25mM NaCl、1mM DTT、0.01% BSAおよび2.5% DMSOを含有する溶液中で行った。アッセイにおける最終基質濃度は、90μM ATPおよび0.5mg/ml pE4Y(いずれも、Sigma Chemicals,St Louis,MO製)であった。本発明の化合物の最終濃度は、一般的には、0.01μM〜5μMとの間である。代表的には、試験化合物の10mM DMSOストックから段階希釈液を調製することによって、12点滴定を行った。反応を室温で行った。
(GSK−3阻害アッセイ)
本発明の化合物を、標準的な連結酵素系(coupled enzyme system)(Foxら、Protein Sci.1998、7、2249)を使用して、GSK−3β(AA 1−420)活性を阻害するそれらの能力についてスクリーニングした。反応を、100mM HEPES(pH7.5)、10mM MgCl2、25mM NaCl、300μM NADH、1mM DTTおよび1.5% DMSOを含有する溶液中で行った。アッセイにおける最終基質濃度は、20μM ATP(Sigma Chemicals,St Louis,MO)および300μMペプチド(American Peptide,Sunnyvale,CA)であった。反応を、30℃の温度および20nM GSK−3βにて行った。連結酵素系の成分の最終濃度は、2.5mMホスホエノールピルベート、300μM NADH、30μg/mlピルビン酸キナーゼおよび10μg/ml乳酸デヒドロゲナーゼであった。
(MK2阻害アッセイ)
化合物を、標準的な連結酵素系(Foxら、Protein Sci.1998、7、2249)を使用して、MK2活性を阻害するそれらの能力についてスクリーニングする。反応を、100mM HEPES(pH7.5)、10mM MgCl2、25mM NaCl、300μM NADH、1mM DTTおよび1.5% DMSOを含有する溶液中で行う。アッセイの最終基質濃度は、30μM ATP(Sigma Chemicals,St Louis,MO)および300μMペプチド(American Peptide,Sunnyvale,CA)である。反応を、30℃の温度および30nM MK2にて行う。連結酵素系の成分の最終濃度は、2.5mMホスホエノールピルベート、300μM NADH、30μg/mlピルビン酸キナーゼおよび10μg/ml乳酸デヒドロゲナーゼである。
(PDK−1阻害アッセイ)
化合物を、放射活性リン酸取り込みアッセイ(PittおよびLee、J.Biomol.Screen.1996、1、47)を使用して、PDK−1を阻害するそれらの能力についてスクリーニングする。アッセイを、100mM HEPES(pH7.5)、10mM MgCl2、25mM NaCl、2mM DTTの混合物中で行う。アッセイにおける最終基質濃度は、40μM ATP(Sigma Chemicals)および65μMペプチド(PDKtide,Upstate,Lake Placid,NY)である。アッセイを、約27.5nCi/μlの[γ−32P]ATP(Amersham Pharmacia Biotech,Amersham,UK)の存在下で、30℃の温度および25nM PDK−1にて行う。アッセイストック緩衝溶液を、ATPおよび本発明の試験化合物を除いて上記に列挙したすべての試薬を含んで調製する。15μlのストック溶液を、96ウェルプレート中に配置し、次いで、本発明の試験化合物を含む0.5mM DMSOストック(1μl)(最終化合物濃度25μM、最終DMSO濃度5%)を添加する。このプレートを30℃で10分間プレインキュベートし、そして4μl ATP(最終濃度40μM)の添加によって反応を開始させる。
(PIM−1阻害アッセイ)
化合物を、標準的な連結酵素系(Foxら、Protein Sci.1998、7、2249)を使用して、PIM−1を阻害するそれらの能力についてスクリーニングする。反応を、100mM HEPES(pH7.5)、10mM MgCl2、25mM NaCl、1mM DTT、20μg/ml BSAおよび1.5% DMSO中で行う。アッセイにおける最終基質濃度は、120μM ATP(Sigma chemicals)および200μMペプチド(American Peptide,Sunnyvale,CA)である。アッセイを、30℃の温度および50nM PIM−1にて行う。連結酵素系の成分の最終濃度は、2.5mMホスホエノールピルベート、350μM NADH、30μg/mlピルビン酸キナーゼ、および10μg/ml乳酸デヒドロゲナーゼである。
(PKA阻害アッセイ)
化合物を、標準的な連結酵素系(Foxら、Protein Sci、1998、7、2249)を使用して、PKAを阻害するそれらの能力についてスクリーニングした。アッセイを、100mM HEPES(pH7.5)、10mM MgCl2、25mM NaCl、1mM DTTおよび3% DMSOの混合物中で行った。アッセイにおける最終基質濃度は、50μM ATP(Sigma Chemicals)および80μMペプチド(Kemptide,American Peptide,Sunnyvale,CA)であった。アッセイを、30℃の温度および18nM PKAにて行った。連結酵素系の成分の最終濃度は、2.5mMホスホエノールピルベート、300μM NADH、30μg/mlピルビン酸キナーゼおよび10μg/ml乳酸デヒドロゲナーゼであった。
(p70S6K阻害アッセイ)
化合物を、Upstate Biotechnologyでの放射活性リン酸取り込みアッセイ(PittおよびLee、J.Biomol.Screen.1996、1、47)を使用して、p70S6Kを阻害するそれらの能力についてスクリーニングした。アッセイを、8mM MOPS(pH7.0)、10mM酢酸マグネシウム、0.2mM EDTAの混合物中で行った。アッセイにおける最終基質濃度は、15μM ATP(Sigma Chemicals)および100μMペプチド(Upstate Ltd.,Dundee,UK)であった。アッセイを、30℃の温度およびp70S6K(5−10mU、Upstate Ltd.,Dundee,UK)および[γ−33P]ATP(比活性約500cpm/pmol、Amersham Pharmacia Biotech,Amersham,UK)にて行った。アッセイストック緩衝溶液を、ATPおよび本発明の試験化合物を除いて上記で列挙したすべての試薬を含んで調製した。15μlのストック溶液を、96ウェルプレート中に配置し、次いで、本発明の試験化合物を含む40μMのDMSOストック(1μl)または8μMのDMSOストック(1μl)(それぞれ、最終化合物濃度2μMまたは0.4μM、最終DMSO濃度5%)を二連で添加した。このプレートを30℃で約10分間プレインキュベートし、そして4μl ATP(最終濃度15μM)の添加によって反応を開始させた。
(ROCK阻害アッセイ)
本発明の化合物を、標準的な連結酵素アッセイ(Foxら、Protein Sci.1998、7、2249)を使用して、ROCKを阻害するそれらの能力についてスクリーニングした。反応を、100mM HEPES(pH7.5)、10mM MgCl2、25mM NaCl、1mM DTTおよび1.5% DMSO中で行った。アッセイにおける最終基質濃度は、13μM ATP(Sigma chemicals)および200μMペプチド(American Peptide,Sunnyvale,CA)であった。アッセイを、30℃の温度および200nM ROCKにて行った。連結酵素系の成分の最終濃度は、2.5mMホスホエノールピルベート、400μM NADH、30μg/mlピルビン酸キナーゼおよび10μg/ml乳酸デヒドロゲナーゼであった。
(SRC阻害アッセイ)
本発明の化合物を、放射能ベースのアッセイまたは分光光度アッセイのいずれかを使用して、ヒトSrcキナーゼのインヒビターとして評価した。
本発明の化合物を、バキュロウイルス細胞から発現されかつ精製される完全長組換えヒトSrcキナーゼ(Upstate Biotechnology製、カタログ番号14−117)のインヒビターとしてアッセイした。Srcキナーゼ活性を、ATPからチロシンのランダムポリGlu−Tyrポリマー基質の組成物(Glu:Tyr=4:1)(Sigma、カタログ番号P−0275)への、33Pの取り込みによってモニターした。アッセイ成分の最終濃度は:0.05M HEPES(pH7.6)、10mM MgCl2、2mM DTT、0.25mg/ml BSA、10nM ATP(1回の反応当たり1〜2μCi 33P−ATP)、5mg/mlポリGlu−Tyr、および1〜2単位の組換えヒトSrcキナーゼであった。代表的なアッセイにおいて、ATPを除くすべての反応成分を予め混合し、そしてアッセイプレートウェルにアリコートした。本発明の化合物を、DMSOに溶解させ、そしてウェルに添加して2.5%の最終DMSO濃度を得た。このアッセイプレートを、33P−ATPとの反応を開始する前に、30℃で10分間インキュベートした。反応の20分後、20mM Na3PO4を含む10%トリクロロ酢酸(TCA)(150μl)で、反応をクエンチした。次いで、クエンチしたサンプルを、フィルタープレート真空マニホールド上に取り付けた96ウェルフィルタープレート(Whatman、UNI−Filter GF/F Glass Fiber Filter、カタログ番号7700−3310)に転写した。フィルタープレートを、20mM Na3PO4を含む10%TCAで4回洗浄し、次いで、メタノールで4回洗浄した。次いで、200μlのシンチレーション流体を、各々のウェルに加えた。このプレートを封着し、そしてTopCountシンチレーションカウンター上で、フィルターに関連する放射能を定量する。取り込まれた放射能を、本発明の化合物濃度の関数としてプロットした。このデータを、競合阻害動力学モデルにフィッティングして、本発明の化合物についてのKi値を得た。
ポリGlu−Tyr基質のヒト組換えSrcキナーゼ触媒リン酸化によって、ATPから生成されたADPを、連結酵素系(Foxら、Protein Sci.、1998、7、2249)を使用して定量した。このアッセイにおいて、キナーゼ反応で生成されたADP分子ごとに、1分子のNADHがNADに酸化された。NADHの消失は、340nmで都合良く起こった。
(SYK阻害アッセイ)
化合物を、標準的な連結酵素アッセイ(Foxら、Protein Sci.1998、7、2249)を使用して、SYKを阻害するそれらの能力についてスクリーニングした。反応を、100mM HEPES(pH7.5)、10mM MgCl2、25mM NaCl、1mM DTTおよび1.5% DMSO中で行った。アッセイにおける最終基質濃度は、200μM ATP(Sigma chemical Co.)および4μMポリGly−Tyrペプチド(Sigma Chemical Co.)であった。アッセイを、30℃の温度および200nM SYKにて行った。連結酵素系の成分の最終濃度は、2.5mMホスホエノールピルベート、300μM NADH、30μg/mlピルビン酸キナーゼおよび10μg/ml乳酸デヒドロゲナーゼであった。
化合物を、標準的な結合酵素アッセイ(Foxら、Protein Sci.1998,7,2249)を使用して、ZAP−70を阻害する能力についてスクリーニングした。アッセイを、100mM HEPES(pH 7.5)、10mM MgCl2、25mM NaCl、2mM DTTおよび3% DMSOの混合物中で行った。アッセイにおける最終基質濃度は、100μM ATP(Sigma Chemicals)および20μM ペプチド(ポリ−4EY,Sigma Chemicals)であった。アッセイを、30℃、60nMのZAP−70にて行った。結合酵素系の成分の最終濃度は、2.5mM ホスホエノールピルビン酸、300μM NADH、30μg/ml ピルビン酸キナーゼおよび10μg/ml 乳酸デヒドロゲナーゼであった。
化合物を、放射活性ベースのアッセイまたは分光学的アッセイのいずれかを使用して、ヒトLckキナーゼのインヒビターとして評価した。
化合物を、バキュロウイルス細胞で発現され、バキュロウイルスから精製した全長ウシ胸腺Lckキナーゼ(Upstate Biotechnology製,カタログ番号14−106)のインヒビターとしてアッセイした。Lckキナーゼ活性をモニタリングした後、ATPからの33Pを組成物のランダムなポリGlu−Tyrポリマー基質(Glu:Tyr=4:1(Sigma,カタログ番号P−0275))のチロシンへと組み込んだ。以下は、アッセイ成分の最終濃度である:0.025M HEPES,pH 7.6、10mM MgCl2、2mM DTT、0.25mg/ml BSA、10μM ATP(1反応あたり1〜2μCi 33P−ATP)、5mg/ml ポリGlu−Tyrおよび1〜2単位の組み換えヒトSrcキナーゼ。代表的なアッセイにおいて、ATPを除く全ての反応成分を予め混合し、アッセイプレートウェル内にアリコートに分けた。DMSOに溶解したインヒビターをウェルに添加し、2.5%の最終DMSO濃度にした。アッセイプレートを、30℃にて10分間インキュベートし、その後、33P−ATPを用いて反応を開始した。反応の20分後、反応を20mM Na3PO4を含有する10%トリクロロ酢酸(TCA)150μlでクエンチした。次いで、クエンチしたサンプルを、フィルタープレート真空マニホールドに据え付けられた96ウェルフィルタープレート(Whatman,UNI−Filter GF/F Glass Fiber Filter,カタログ番号7700−3310)に移した。フィルタープレートを、20mM Na3PO4を含有する10% TCAで4回、次いで、メタノールで4回洗浄した。次いで、200μlのシンチレーション流体を各ウェルに添加した。プレートに封をし、フィルターに結合させた放射活性の量をTopCountシンチレーションカウンターで定量した。組み込まれた放射活性を、インヒビター濃度の関数としてプロットした。データを、競合阻害動力学モデルにフィットさせ、化合物についてのKiを得た。
ポリGlu−Tyr基質のヒト組換えLckキナーゼ触媒リン酸化によりATPから生成されるADPを、結合酵素アッセイ(Foxら(1998)Protein Sci 7,2249)を使用して定量した。このアッセイにおいて、キナーゼ反応において生成されるADPの分子毎につき1分子のNADHをNADに酸化する。NADHの消失を、340nmにおいて簡便に追跡され得る。
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