JP2020139755A - 脂質プロファイリングシステム、脂質プロファイリング方法、及び脂質プロファイリングプログラム - Google Patents
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Abstract
Description
例えば、特許文献1には、質量スペクトルから脂質を同定する質量分析システムが記載されている。
図1は、脂質の分類を説明する図である。脂質は、アルコールと脂肪酸のエステルである単純脂質(Simple Lipid)、分子中にリン酸や糖を含む複合脂質(Complex Lipid)、単純脂質や複合脂質から加水分解によって誘導される誘導脂質(Derived Lipid)に大別される。
単純脂質は、グリセロール骨格、ステロール骨格又はセラミド骨格を有するものに分類される。グリセロール骨格を有する脂質は、モノアシルグリセロール(MG)、ジアシルグリセロール(DG)、及びトリアシルグリセロール(TG)の脂質クラスに分類される。
複合脂質は、グリセロリン脂質とスフィンゴリン脂質に分類される。グリセロリン脂質は、フォスファチジルコリン(PC)、フォスファチジルグリセロール(PG)、フォスファチジルイノシトール(PI)、フォスファチジルエタノールアミン(PE)、フォスファチジン酸(PA)、フォスファチジルセリン(PS)等の脂質クラスに分類される。
図3は、タンデム質量分析の概要を示す図である。図3(A)は、タンデム質量分析を実現するタンデム質量分析装置の概要を示す図である。質量分析(MS)法は、試料中の化合物を気体状にイオン化し、m/z(質量電荷比)に従って分離し、各イオンのイオン強度を測定する分析法である。タンデム質量分析装置(MS/MS)は、2台の質量分析計が直列に結合され、その間に衝突室を備えた装置である。図3(A)に示すように、イオン化された試料は、第1質量分析部(Q1)で特定のm/z値のイオン(プリカーサーイオン)が選択され、衝突室(Q2)でフラグメント化(フラグメンテーション)される。プリカーサーイオンのフラグメント化により生じたフラグメントイオン(プロダクトイオン)は、第2質量分析部(Q3)でm/z値に応じて分離されて、検出器で検出される。
以下、図面を参照して本実施形態の脂質プロファイリングシステム10について説明する。
図4は、本実施形態の脂質プロファイリングシステム10の機能構成の一例を示す図である。この脂質プロファイリングシステム10は、試料中の同じ脂質クラスに属する脂質間の量比LRや濃度COを算出する。
複数種類の脂質L1〜Lnは、同じ脂質クラスLCに属し、共通のヘッドグループHGを有し、脂肪酸側鎖FCを2個以上有する。脂質L1は、脂肪酸側鎖の種類L1(k1),L1(k2)として、脂肪酸側鎖α及び脂肪酸側鎖xを有している。脂質L2は、脂肪酸側鎖の種類L2(k1),L2(k2)として、脂肪酸側鎖α及び脂肪酸側鎖yを有している。脂質L3は、脂肪酸側鎖の種類L3(k1),L3(k2)として、脂肪酸側鎖z及び脂肪酸側鎖xを有している。脂質Lnは、脂肪酸側鎖の種類Ln(k1),Ln(k2)として、脂肪酸側鎖z及び脂肪酸側鎖yを有している。
脂質プロファイリングシステム10の具体的な機能構成及び動作について説明する。
脂質プロファイリングシステム10は、取得部110と、脂質量比算出部120と、脂質濃度取得部130、脂質濃度算出部140と、出力部150と、記憶部160とを備える。なお、この一例においては、脂質プロファイリングシステム10が記憶部160を内蔵するものとして説明するが、これに限られない。例えば、記憶部160がクラウドサーバなどによって実現されるなど、脂質プロファイリングシステム10と記憶部160とが別々の装置として構成されてもよい。
取得部110は、脂肪酸側鎖FCを2個以上有する脂質L1〜L3の、タンデム質量分析により得られた、前記脂肪酸側鎖の種類L1(k1)〜L3(k2)、及び前記脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度L1(i1)〜L3(i2)を、同じ脂質クラスLCに属する複数種類の脂質L1〜L3について、それぞれ取得する。
取得部110は、取得した脂肪酸側鎖の種類L1(k1)〜L3(k2)、及び脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度L1(i1)〜L3(i2)を脂質量比算出部120に出力する。
脂質量比算出部120は、第1種類の脂質L1が有する第1種類の脂肪酸側鎖αのプロダクトイオン強度L1(iα)と、第2種類の脂質L2が有する第1種類の脂肪酸側鎖αのプロダクトイオン強度L2(iα)と、の比を算出する。
脂質量比算出部120は、前記ステップS20で算出した、脂肪酸側鎖αを有する脂質間(L1,L2)での脂肪酸側鎖αのプロダクトイオン強度の比(L2(iα)/L1(iα))に基づいて、第1種類の脂質L1と第2種類の脂質L2との間の量比LR(α)を算出する。
第1種類の脂質L1は、第1種類の脂肪酸側鎖L1(k1)として脂肪酸側鎖αを有しており、そのプロダクトイオン強度度L1(i1)をL1(iα)とする。脂質L1は、さらに、第2種類の脂肪酸側鎖L1(k2)として脂肪酸側鎖xを有しおり、そのプロダクトイオン強度度L1(i1)をL1(ix)とする。
ステップS40では、脂質量比算出部120は、脂質L1が有する第1種類の脂肪酸側鎖αのプロダクトイオン強度L1(iα)と、第2種類の脂肪酸側鎖xのプロダクトイオン強度L1(ix)と、の比が示す第1の補正係数CF(α,x)を算出する。
補正係数CF(α,x)は、脂質L1における脂肪酸側鎖αのプロダクトイオン強度L1(iα)に対する脂肪酸側鎖xのプロダクトイオン強度L1(ix)の比(L1(ix)/L1(iα))により算出される。
脂質量比算出部120は、ステップS40で算出した補正係数CF(α,x)と、脂肪酸側鎖αを有する脂質L1,脂質L2間の量比LR(L1,L2)と、脂質L1が有する第2種類の脂肪酸側鎖xのプロダクトイオン強度L1(ix)と第3種類の脂質L3が有する脂肪酸側鎖xのプロダクトイオン強度L3(ix)との比(L3(ix)/L1(ix))と、に基づいて、脂質L1と脂質L2と脂質L3との間の量比LR(L1,L2,L3)を算出する。
脂質L2の脂肪酸側鎖L2(k2)と脂質L3の脂肪酸側鎖L3(k1)が同じ種類の脂肪酸側鎖である場合(すなわち、y=z)、脂質L2が有する脂肪酸側鎖α,yのプロダクトイオン強度L2(iα),L2(iy)と、の比が示す補正係数CF(α,y)を算出し、前記補正係数CF(α,y)と、量比LR(L1,L2)と、プロダクトイン強度の比(L3(iz)/L2(iy))(ただし、y=z)と、に基づいて、脂質L1と脂質L2と脂質L3との間の量比LR’(L1,L2,L3)を算出してもよい。次いで、ステップ50で算出した量比LR(L1,L2,L3)と、前記量比LR’(L1,L2,L3)とを比較し、その差が閾値以下であれば、ステップS60に進み、その差が閾値以上であれば、ステップS40に戻って、補正係数CF(α,x)、補正係数CF(α,y)の値を調整してもよい。各補正係数の調整には、最尤法を用いてもよい。
ステップS60では、ステップS50で算出した脂質間量比LR(L1,L2,L3)を出力部150に出力し、処理を終了する。
図6は、本実施形態の脂質プロファイリングシステム10の脂質濃度算出にかかる動作の一例を示す図である。以下、図4及び図6を参照しつつ、脂質プロファイリングシステム10の脂質濃度算出にかかる動作の一例について説明する。
濃度取得部130は、第1種類の脂質L1の濃度CO1を取得する。例えば、タンデム質量分析装置20により分析する試料に、放射線標識された標準試料として既知量の脂質L1を添加し、当該添加量を脂質L1の濃度CO1として用いることができる。
脂質濃度取得部130が取得する脂質L1の濃度CO1は、脂質プロファイリングシステム10に接続された他の装置などから供給される。脂質プロファイリングシステム10に接続された他の装置には、例えば、タンデム質量分析装置20や、脂質プロファイリングシステム10の上位のコンピュータ装置や、脂質プロファイリングシステム10のキーボードやタッチパネルなどの操作デバイスが含まれる(いずれも不図示)。
脂質濃度取得部130は、取得した脂質L1の濃度CO1を脂質濃度算出部140に出力する。
脂質濃度算出部140は、脂質量比算出部120から、前記ステップS30又はステップ50により算出された脂質間の量比を取得する。
脂質濃度算出部140は、濃度取得部130が取得した脂質L1の濃度CO1と、脂質L1と脂質L2との間の量比LRに基づいて、脂質L2の濃度CO2を算出する。あるいは、脂質濃度算出部140は、濃度取得部130が取得した脂質L1の濃度CO1と、脂質L1と脂質L2と脂質L3との間の量比LRとに基づいて、脂質L2の濃度CO2及び脂質L3の濃度CO3を算出する。他の脂質L4〜Lnについても同様に、脂質L1との濃度CO1と、脂質L1との量比から、濃度を算出することができる。
ステップS140では、ステップS130で算出した脂質L2〜Lnの濃度を出力部150に出力し、処理を終了する。
以下、本実施形態の脂質プロファイリングシステムの具体的動作例について説明する。
次に、Quantity Ratio Tableに基づき、仮想的検量線(Virtual Calibration Curve)を作成する。(B)及び右下のグラフは、仮想的検量線の具体例を示す。右下のグラフは、脂肪酸側鎖(18:1)のイオン強度を縦軸として、仮想的検量線を作成した図である。ここで、仮想的検量線は、定量値をソルバーで変化させながら、プロダクトイオン強度の実測値との誤差が最小になるように傾きを設定する(最小二乗法)。仮想的検量線の信頼性は、R2で判定し、R2が所定の範囲内(例えば、R2>0.94)であれば、左のフローチャートで「Calculate Distribution Ratio」に進み、前記仮想的検量線を利用して、(C)のように脂質の量比を算出する。
なお、前記仮想的検量線の傾きは、図5で説明した補正係数CFに対応する。
さらに、前述した機能をコンピュータシステムにすでに記録されているプログラムとの組み合わせで実現できるもの、いわゆる差分ファイル(差分プログラム)であってもよい。
本実施形態の脂質プロファイリングシステム10を用いて、脂質プロファイリングを行った具体例を以下に示す。
蒸留水(LC/MSグレード)及びメタノール(LC/MSグレード)を関東化学株式会社(東京、日本)から購入した。HPLCグレードのクロロホルムをキシダ化学株式会社(大阪、日本)から購入した。全ての主な脂質クラスを含むSPLASHTM LipidomixTM Mass Spec Standard(15:0/[D7]18:1−PA(7ng),15:0/[D7]18:1−PC(160ng),15:0/[D7]18:1−PE(5ng),15:0/[D7]18:1−PG(30ng),15:0/[D7]18:1−PI(10ng)及び15:0/[D7]18:1−PS(5 ng)per1μL Methanol)を含む)を、Avanti Polar Lipid Inc.(Alabaster,AL,USA)から購入した。酢酸アンモニウムをSigma−Aldrich Co.(St.Louis,MO,USA)から購入した。二酸化炭素(99.5%グレード,)を株式会社吉田酸素(福岡、日本)から購入し、SFC移動相として使用した。DG(18:0/20:4)、PE(18:0/20:4)、PG(16:0/18:1)、PS(18:0/18:1)、PI(18:0/20:4)、及び10種のPCを、Avanti Polar Lipids Inc.から購入した。
すべての動物のケア及び試験プロトコールは、九州大学医学部のAnimal Ethics Committeeにより承認され、九州大学医学部Committee for Care and Use of Laboratory Animalsの推奨されるものに従って行った。
雄C57BL6マウス、5週齢を日本チャールス・リバー株式会社(横浜、日本)から購入し、24℃、12h/12h明暗サイクルで維持した。急性病理モデルを、メチオニン−コリン欠乏(MCD)の餌(オリエンタル酵母工業株式会社、東京、日本)をマウスに給餌することにより、生育させた。試験前に、全ての動物を通常の餌で1週間順応させ、水道水と適切な餌(MF diet,オリエンタル酵母工業株式会社)に自由にアクセスできるようにした。6週齢で、マウスを2グループ(n=5)に分け、通常の餌又はMCD dietで2週間維持した。
20mgのマウス肝臓試料を2mLのエッペンドルフチューブにそれぞれ入れた。肝臓及び脳から脂質を抽出するために、1mLの氷冷メタノールを試料に加え、1分間超音波処理して、脂質を抽出した。遠心分離(16,000×g、4℃、1分)した後、500μLの上清を採取し、Bligh−Dyer抽出法により抽出した。混合溶媒(MeOH:CHCl3:H2O=10:5:3(v/v/v))を添加し、1分間ボルテックスした後、遠心分離(16,000×g、4℃、5分)し、不純物を除去した。その後、300μLの下相(クロロホルム相)を他のガラスチューブに採取した。最後に、300μLのメタノールを、チューブに添加し、solutionAを添加して、分析するまで−80℃で保存した。
LabSolutions version 5.80(株式会社島津製作所、京都、日本)により制御される、LCMS8060 QqQMSを装備したNexera UC system(SFC)(株式会社島津製作所、京都、日本)を脂質の分離に用いた。DEA column(100x3.0mm i.d.,ACQUITY UPC2TM Torus diethyl amine, Waters Corp.)を、分離に用いた。SFC条件は、以下の通りとした:移動相A,SCCO2;移動相B,95%メタノール/5%水 with 0.1%(w/v)酢酸アンモニウム;背圧,10MPa;カラム温度,50℃;サンプルトレイ温度,5℃。移動相は、流速1.0mL/分でカラムに送出した。移動相の勾配プログラムは、以下の通りとした:A/B=100/0, followed by a linear gradient to A/B = 30/70 for 15 min and held for 3 min, followed by a linear gradient to A/B = 100/0 for 0.1 min, and terminating at A/B = 100/0 for 1.9 min。2μLのサンプルをオートサンプラーでインジェクトした、QqQMSは、最適化後に行った。MRM条件は図9に示した。
6つの脂質クラス(DG、PC,PE、PS、PG、PI)のそれぞれのプリカーサーイオンの同定とフラグメンテーションパターンの分析は、ポジティブ又はネガティブイオンモードにおけるSFCフローインジェクション分析により行った。各脂質のプリカーサーイオンを、酢酸アンモニウムの添加によるポジティブイオンモード([M+H]+又は[M+NH4]+)及び/又はネガティブイオンモード([M−H]−又は[M+CH3COO]−)で観察した。最も豊富な付加イオンに基づいて、LCMS8060の各脂質クラスのMS衝突エネルギーを最適化した。図9に、6種の脂質のMS衝突エネルギーの最適化結果と、7種の脂肪酸側鎖のMRMトランジション設定を示す。全てのMRMトランジションを生成した後、モノイソトニックイオンの存在比を算出した。モノイソトニックイオンの存在比は、脂肪酸側鎖によって異なるからである。
LabSolutions version 5.80(株式会社島津製作所、京都、日本)をMRMスペクトルデータの解析のために用いた。さらに、データ(lcdフォーマット)を、ProteoWizard version 3を用いて、mzMLフォーマットに変換した。その後、これらのデータを、MRMPROBS version 2.26にインプットした。次いで、MRMスペクトルデータのスムージング(smoothing method,linear weighted moving average;smoothing level,5 scan;minimum peak width,5 scan;minimum peak height,100 amplitude)を、MRMPROBSを用いて行った。
化合物は、基本的に、化合物のMRMトランジションの全てのピークがリテンションタイム(RT)にあるときに、アノテーションした。これらのデータを用いて、各サンプルの化合物の平均値及び標準偏差を、Excel 2013を用いて算出した。
2本の脂肪酸側鎖を有する脂質クラス(DG,PC,PE,PS,PI,PG)の脂質では、それぞれ28種の化合物うち、2本の脂肪酸側鎖が同じ化合物は7種類、2本の脂肪酸側鎖が違う化合物が21種類存在する(28=7+21)。2本の脂肪酸側鎖が違う化合物21種類には、それぞれ2つのMRMトランジションが存在し、この2つのトランジションは脂肪酸側鎖の種類によってイオン強度が異なるが、1化合物として定量値は同じである。また、2つのトランジションのイオン強度比は質量分析装置のフラグメント効率の差によって決定され、濃度によらず一定である。そのため、求めるべき21種類の化合物の定量値(未知数)に対して、42種類のイオン強度で化合物濃度とプロダクトイオン強度は正比例するという前提で連立方程式が組める。図7のフローチャートに従い、連立方程式より、それぞれの脂質クラスについて7種類の脂肪酸側鎖から6点の検量点をもった仮想的検量線を作成した。仮想的検量線の相関係数R2を算出し、0.99以上であれば検量線として信頼に値するとして正式な補正係数として採用し、すべての化合物について検量線を使って量比を算出した。
標準物質として、脂質クラス毎に、同位体ラベルした(18:1)の脂肪酸側鎖を有する化合物(Lipidomix Splash,Avanti Inc.)を混合し、(18:1)の脂肪酸側鎖のイオン強度を基準として、7種類の脂肪酸側鎖での検量線を用いて各脂肪酸側鎖の相対定量(mg/ml)を行った。図10の棒グラフは、(18:1)の脂肪酸側鎖を基準値1として、他の脂肪酸側鎖の補正係数を示している。
脂肪酸側鎖が脂質のsn−1,sn−2のそれぞれの位置にどの程度の割合で結合しているかは不明である。用意できた標品を用いて同様のMRMトランジションで測定した結果を表1に示す。それぞれの標品はsn−1,sn−2に結合している脂肪酸側鎖があらかじめ分かっているため、脂肪酸側鎖の種類と結合様式があらかじめ分かった状態でイオン強度比を求めることができる。標準品と比較すると、測定されたサンプルの通常のリン脂質はsn−1に飽和脂肪酸、sn−2に不飽和脂肪酸が配置されている標準品と値が近い。特に位置異性体の標準品を用意できたPC(18:0/18:1)、PC(16:0/18:1)に関しては明らかである。
脂質プロファイリングの結果を図11及び図12に示す。図11は、正常肝臓とNASH(非アルコール性脂肪肝炎:nonalcoholic steato−hepatitis)マウスの肝臓で脂質プロファイリングを行った結果を示す。NASHでは、ほとんどの脂質クラスにおいて脂質量が上昇している。また、脂肪酸側鎖が1つしか結合していないリゾフォスファチジルコリン(LPC)とリゾフォスファチジルエタノールアミン(LPE)の定量値も参考として掲載した。LPCとLPEでは、脂肪酸側鎖はポジティブイオンモードでMRM測定をしている。注目すべきはPGであり、PG全体として増加しているが、パルミチン酸(16:0)はまったく増加していない(ゆえに構成比率としては減少している)。NASHが肝臓のミトコンドリア不全である事を考えると、ミトコンドリア内にのみ存在するPGの変化はNASHを研究する上では重要かもしれない。またLPCとLPEは6種類の脂肪酸側鎖のみの合計値であるが,他のリン脂質は増加しているにもかかわらず減少している。
各脂質の脂肪酸側鎖のイオン強度比の補正係数の結果(図10)から、DGの定量用トランジションにおける飽和脂肪酸((16:0),(18:0))のニュートラルロスと、高度不飽和脂肪酸((20:4),(22:6))のニュートラルロスを比較すると、5〜10倍以上のイオン強度差となっている。この結果からアラキドン酸、DHAともに他の脂肪酸側鎖と比較すると非常に脱離しやすい化合物と言える。PSの定量用トランジションにおける飽和脂肪酸のイオン強度と高度不飽和脂肪酸のイオン強度とでは、6〜20倍以上のイオン強度差が存在する。また、他のグリセロリン脂質においても、PSと同様に脂肪酸側鎖のイオン強度を測定しているが、PCとPEは比較的類似の傾向を示しており、ともに(18:2)が脱離しやすい。グリセロリン脂質の種類によって同じ脂肪酸側鎖であっても、そのイオン強度比がかなり異なる事が分かった。全体的にはグリセロリン脂質のトランジションは、DGのニュートラルロスと逆の傾向となり、高度不飽和脂肪酸のイオン強度は他の脂肪酸と比較すると特にDHAは低くなっている。また、あらかじめsn−1,sn−2の分かっている標品を測定した結果(表1)から、同じ脂肪酸でもsn−1,sn−2と位置異性体でイオン強度が逆転していることが伺える。この事実から、脂肪酸側鎖を2本有する脂質に関して、質量分析を用いる場合はsn−2に結合している脂肪酸側鎖は非常に脱離しやすい傾向がある。すなわち、高度不飽和脂肪酸は通常の生体内ではsn−2に結合しているため、脂肪酸側鎖の種類以外の部分でもプロダクトイオン強度が高くなったと考えられる。この事実は、通常、生体内に存在している脂質は飽和脂肪酸がsn−1に、不飽和脂肪酸はsn−2に結合している事実と合致する。実際に(18:0)/(18:1)と(16:0)/(18:1)を脂肪酸側鎖として結合しているPCの標準品のイオン強度比と、生体サンプルのイオン強度比とを比較すると、sn−1,sn−2の結合様式が明確に分かる。そのイオン強度比から飽和脂肪酸がsn−1に、不飽和脂肪酸がsn−2に結合していることが証明された。PC(16:0/18:0)に関しては、標準品と生体サンプルのイオン強度比に開きがあることから、生体サンプルのPC(16:0/18:0)は必ずしもsn−1が16:0とはなっておらず、半数程度がsn−1に18:0が結合しているものと思われる。このように、生体サンプルのみでもsn−1,sn−2のどちらに脂肪酸側鎖が結合しているかは不明のまま定量を行うことになるが、位置異性体の標準品が存在する場合はそのイオン強度比をつかってsn−1,sn−2のどちらにどの程度の脂肪酸が結合しているかを求めることも可能である。
Claims (10)
- 脂肪酸側鎖を2個以上有する脂質の、タンデム質量分析により得られた、前記脂肪酸側鎖の種類、及び前記脂肪酸側鎖のイオン強度を、同じ脂質クラスに属する複数種類の脂質についてそれぞれ取得する取得部と、
第1種類の脂質が有する第1種類の脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度と、第2種類の脂質が有する第1種類の脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度と、の比に基づいて、前記第1種類の脂質と前記第2種類の脂質との間の量比を算出する、脂質量比算出部と、
を備える、脂質プロファイリングシステム。 - 前記第1種類の脂質は、前記第1種類の脂肪酸側鎖と第2種類の脂肪酸側鎖とを有し、
前記脂質量比算出部は、
前記第1種類の脂質が有する前記第1種類の脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度と、前記第2種類の脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度と、の比が示す第1の補正係数と、
前記第1種類の脂質と前記第2種類の脂質との間の前記量比と、
前記第1種類の脂質が有する前記第2種類の脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度と、第3種類の脂質が有する前記第2種類の脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度と、の比と、
に基づいて、前記第1種類の脂質と前記第2種類の脂質と前記第3種類の脂質との間の量比を算出する、
請求項1に記載の脂質プロファイリングシステム。 - 前記第2種類の脂質は、前記第1種類の脂肪酸側鎖と第3種類の脂肪酸側鎖とを有し、
前記脂質量比算出部は、更に、
前記第2種類の脂質が有する前記第1種類の脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度と、前記第3種類の脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度と、の比が示す第2の補正係数と、
前記第1種類の脂質と前記第2種類の脂質との間の前記量比と、
前記第2種類の脂質が有する前記第3種類の脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度と、第4種類の脂質が有する前記第3種類の脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度と、の比と、
に基づいて、前記第1種類の脂質と前記第2種類の脂質と前記第4種類の脂質との間の量比を算出する、
請求項2に記載の脂質プロファイリングシステム。 - 前記脂質量比算出部は、更に、
前記第1種類の脂質と前記第2種類の脂質と前記第3種類の脂質との間の前記量比と、
前記第1種類の脂質と前記第2種類の脂質と前記第4種類の脂質との間の前記量比と、
に基づいて、前記第1種類の脂質と前記第2種類の脂質と前記第3種類の脂質と前記第4種類の脂質との量比を算出する、
請求項3に記載の脂質プロファイリングシステム。 - 前記第1種類の脂質の濃度を取得する濃度取得部と、
前記濃度取得部が取得した前記第1種類の脂質の濃度と、前記第1種類の脂質と前記第2種類の脂質との間の量比とに基づいて、前記第2種類の脂質の濃度を算出する脂質濃度算出部と、
を更に備える請求項1に記載の脂質プロファイリングシステム。 - 前記脂質濃度算出部は、
前記濃度取得部が取得した前記第1種類の脂質の濃度と、前記第1種類の脂質と前記第2種類の脂質と前記第3種類の脂質との間の前記量比とに基づいて、前記第2種類の脂質の濃度及び前記第3種類の脂質の濃度を算出する、
請求項5に記載の脂質プロファイリングシステム。 - 前記脂質濃度算出部は、
前記濃度取得部が取得した前記第1種類の脂質の濃度と、前記第1種類の脂質と前記第2種類の脂質と前記第4種類の脂質との間の前記量比とに基づいて、前記第2種類の脂質の濃度及び前記第4種類の脂質の濃度を算出する、
請求項5に記載の脂質プロファイリングシステム。 - 前記脂質クラスが、ジアシルグリセロール、トリアシルグリセロール、フォスファチジルコリン、フォスファチジルエタノールアミン、フォスファチジン酸、フォスファチジルセリン、フォスファチジルイノシトール、及びフォスファチジルグリセロールからなる群より選択される、請求項1〜7のいずれか一項に記載の脂質プロファイリングシステム。
- 脂肪酸側鎖を2個以上有する脂質であって、同じ脂質クラスに属する複数種類の脂質を、タンデム質量分析装置により分析するステップと、
前記タンデム質量分析により得られた、前記脂肪酸側鎖の種類、及び前記脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度を、前記脂質の種類毎に取得するステップと、
第1種類の脂質が有する第1種類の脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度と、第2種類の脂質が有する第1種類の脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度と、の比に基づいて、前記第1種類の脂質と前記第2種類の脂質との間の量比を算出する、ステップと、
を含む、脂質プロファイリング方法。 - コンピュータに、
脂肪酸側鎖を2個以上有する脂質であって、同じ脂質クラスに属する複数種類の脂質について、タンデム質量分析により得られた、前記脂肪酸側鎖の種類、及び前記脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度を、前記脂質の種類毎に取得するステップと、
第1種類の脂質が有する第1種類の脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度と、第2種類の脂質が有する第1種類の脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度と、の比に基づいて、前記第1種類の脂質と前記第2種類の脂質との間の量比を算出する、ステップと、
を実行させるための、脂質プロファイリングプログラム。
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