JP2009535060A5

JP2009535060A5 -

Info

Publication number: JP2009535060A5
Application number: JP2009509709A
Authority: JP
Filing date: 2007-05-02
Publication date: 2010-06-24

Claims

活性プロテアーゼを検出するためのインジケーターであって、
ペプチドと結合したナノクレセントを含み、前記ペプチドが前記プロテアーゼの認識部位を含むインジケーター。
前記ペプチドと結合したラマン標識をさらに含む、請求項1に記載のインジケーター。
前記ラマン標識がフルオロフォア、発色団、量子ドット、蛍光ミクロスフェア、およびビオチンからなる群から選択される、請求項2に記載のインジケーター。
前記ラマン標識が前記ペプチドと直接結合しているか、または、リンカーによって前記ペプチドと結合している、請求項2に記載のインジケーター。
前記ナノクレセントがコアを有さない殻を含む、請求項1から4のいずれかに記載のインジケーター。
前記ナノクレセントがコアおよび殻を含む、請求項1から4のいずれかに記載のインジケーター。
前記コアが一定のラマンスペクトルをもたらす物質を含む、請求項6に記載のインジケーター。
前記コアがプラスチック、シリカまたは他のIII族、IV族、またはV族の物質、デキストラン、および磁性物質からなる群から選択される物質を含む、請求項7に記載のインジケーター。
前記ナノクレセントがGa、Au、Ag、Cu、Al、Ta、Ti、Ru、Ir、Pt、Pd、Os、Mn、Hf、Zr、V、Nb、La、Y、Gd、Sr、Ba、Cs、Cr、Co、Ni、Zn、Ga、In、Cd、Rh、Re、W、Moからなる群から選択される金属、およびその酸化物、合金、混合物、および/または窒化物を含む、請求項6に記載のインジケーター。
前記ナノクレセントが約20〜約800nmの範囲の外半径を有し、および/または、約10nm〜約500nmの内半径を有する、請求項6に記載のインジケーター。
前記ペプチドがセリンプロテアーゼ、メタロプロテアーゼ、システインプロテアーゼ、アスパラギン酸プロテアーゼ、およびグルタミン酸プロテアーゼからなる群から選択されるプロテアーゼの認識部位を含む、請求項6に記載のインジケーター。
前記ペプチドが2アミノ酸〜30アミノ酸の長さの範囲である、請求項6に記載のインジケーター。
前記ペプチドが前記ナノクレセントと直接結合しているか、または、リンカーによって前記ナノクレセントと結合している、請求項6に記載のインジケーター。
2つ以上の異なるペプチドが前記ナノクレセントと結合している、請求項2に記載のインジケーター。
サンプル中の少なくとも1つのプロテアーゼの存在、量、または活性を検出または定量化する方法であって、
請求項1から14のいずれかに記載のインジケーターと前記サンプルを接触させる段階と、
検出した表面ラマン散乱スペクトルのスペクトル特性の差異をモニターする段階であって、前記差異がサンプル中に存在するプロテアーゼの存在、量、または活性の指標である段階と
を含む方法。
前記サンプルが全血、血漿、血清、滑液、脳脊髄液、気管支洗浄液、腹水、***、骨髄穿刺液、胸水、尿、および腫瘍細胞または組織からなる群から選択される物質を含む、請求項15に記載の方法。
前記ペプチドが癌の存在または進行のマーカーであるプロテアーゼの認識部位を含む、請求項15または16のいずれか一項に記載の方法。
2つ以上の活性プロテアーゼの存在または活性を検出するためのライブラリーであって、
ペプチドと結合したナノクレセントを含む複数のプロテアーゼインジケーターであって、前記ペプチドが前記プロテアーゼの認識部位を含み；異なるナノクレセントが異なるプロテアーゼを検出するように、異なるナノクレセントが異なるペプチドと結合しているプロテアーゼインジケーター
を含むライブラリー。
異なるプロテアーゼに特異的なプロテアーゼインジケーターが基材上の異なる位置に局在するように空間的に処理された、請求項18に記載のライブラリー。
異なるプロテアーゼに特異的なプロテアーゼインジケーターが異なるシグナルを生成するように光学的に処理された、請求項18に記載のライブラリー。
前記インジケーターが基材と結合している、請求項18または19のいずれか一項に記載のライブラリー。
ヌクレアーゼを検出するためのインジケーターであって、
一本鎖または二本鎖オリゴヌクレオチドと結合したナノクレセントであって、前記オリゴヌクレオチドが前記ヌクレアーゼの認識部位を含むナノクレセント
を含むインジケーター。
前記インジケーターが前記オリゴヌクレオチドと結合したラマン標識をさらに含む、請求項1に記載のインジケーター。
検体の存在または量を検出する方法であって、
前記検体を含むサンプルとインジケーターを接触させる段階であって、前記インジケーターが、基質との結合に関して前記検体と競合するラマン標識部分の存在下で前記検体と特異的または優先的に結合する基質と結合したナノクレセントを含む段階と、
前記インジケーターのラマンスペクトルを検出する段階であって、前記基質からの前記ラマン標識部分の解離によって生じるラマンスペクトルの変化が前記サンプル中の前記検体の存在または量の尺度をもたらす段階と
を含む方法。
前記基質がペプチドまたは核酸である、請求項24に記載の方法。