ES2235844T3 - Agentes antibacterianos. - Google Patents

Agentes antibacterianos.

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ES2235844T3 ES00914262T ES00914262T ES2235844T3 ES 2235844 T3 ES2235844 T3 ES 2235844T3 ES 00914262 T ES00914262 T ES 00914262T ES 00914262 T ES00914262 T ES 00914262T ES 2235844 T3 ES2235844 T3 ES 2235844T3
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Vernalis Oxford Ltd
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Abstract

El uso de un compuesto de fórmula (I) o una sal, hidrato o solvato farmacéutica o veterinariamente aceptable del mismo en la preparación de una composición para tratamiento de infecciones bacterianas en mamíferos humanos y no humanos **(Fórmula)** en la que R1 representa hidrógeno, metilo, o trifluorometilo; R2 representa un grupo R10-(Xn)-(ALK)- en el que R10 representa hidrógeno, un grupo alquilo C1-C6, alquenilo C2-C6, alquinilo C2-C6, cicloalquilo, arilo, o heterociclilo, cualquiera de los cuales puede estar no sustituido o sustituido con alquilo C1-C6, alcoxi C1-C6, hidroxi, mercapto, alquiltio C1-C6, amino, halo (incluyendo fluoro, cloro, bromo y yodo), trifluorometilo, ciano, nitro, -COOH, , -CONH2, -COORA, -NHCORA, -CONHRA, -NHRA, -NRARB, o -CONRARB en los que RAy RB son independientemente un grupo alquilo C1-C6, y ALK representa un radical alquileno C1-C6, alquenileno C2-C6, alquinileno C2-C6, divalente lineal o ramificado, y se puede interrumpir con uno o más enlaces -NH-, O-o S-no adyacentes, X representa -NH-, -O- o -; y n es 0 ó 1; y R3 y R4, tomados juntos con los átomos de carbono al que están unidos respectivamente, forman (i) un anillo carbocíclico o heterocíclico saturado de 5 a 8 átomos, opcionalmente sustituido con hasta cuatro sustituyentes, independientemente seleccionados entre alquilo C1-C6, bencilo, alcoxi C1-C6, fenoxi, hidroxi, mercapto, alquiltio C1-C6, amino, halo (incluyendo fluoro, cloro, bromo y yodo), trifluorometilo, nitro, -COOH-, -CONH2, -CORA, -COORA, -NHCORA, -CONHRA, -NHRA, -NRARB, o -CONRARB en los que RAy RB son independientemente un grupo alquilo (C1-C6) o (ii) un anillo de fórmula (iii): **(Fórmula)** en la que R8 es hidrógeno o un grupo alquilo C1-C4, cicloalquilo, fenilo o bencilo, y R9 es hidrógeno o un grupo alquilo C1-C4, fenilo o bencilo, o R8 y R9 tomados juntos representan un radical -(CH2)p- divalente en el que p es 3 ó 4.

Description

Agentes antibacterianos.
Esta invención se refiere a una nueva clase de derivados de N-formilhidroxilamina que tienen actividad antibacteriana, y a composiciones farmacéuticas y veterinarias que comprenden tales compuestos.
Antecedentes de la invención
En general, los patógenos bacterianos se clasifican en Gram-positivos y Gram-negativos. Muchos agentes antibacterianos (incluyendo antibióticos) son específicos contra uno u otra clase de patógenos Gram. Por lo tanto los agentes antibacterianos eficaces contra patógenos tanto Gram-positivos como Gram-negativos se consideran en general que tienen actividad de amplio espectro.
Se conocen muchas clases de agentes antibacterianos, incluyendo las penicilinas y cefalosporinas, tetraciclinas, sulfonamidas, monobactamas, fluoroquinolonas y quinolonas, amidoflicósidos, glicopéptidos, macrólidos, polimixinas, lincosamidas, trimetoprim y cloranfenicol. Los mecanismos fundamentales de acción de estas clases antibacterianas varían.
La resistencia bacteriana a muchos antibacterianos conocidos es un problema creciente. De acuerdo a lo anterior existe una continua necesidad en la técnica de agentes antibacterianos alternativos, especialmente los que tienen mecanismos de acción fundamentalmente diferentes de las clases conocidas.
Entre los patógenos Gram-positivos, tales como Estafilococos, Estreptococos, Micobacterias y Enterococos, han evolucionado/surgido cepas resistentes que los hacen particularmente difíciles de erradicar. Los ejemplos de tales cepas son Staphylococcus aureus resistentes a meticilina (MRSA), Estafilococos coagulasa negativos resistentes a meticilina (MRCNS), Staphylococcus pneumoniae resistente a penicilina y Enterococcus faecium de resistencia múltiple.
Las bacterias patogénicas son a menudo resistentes a los tipos de antibiótico aminoglucósido, \beta-lactama (penicilinas y cefalosporinas), y cloranfenicol. Esta resistencia implica la inactivación enzimática del antibiótico por hidrólisis o por formación de derivados inactivos. La familia de antibióticos de \beta-lactama (penicilinas y cefalosporinas) se caracteriza por la presencia de una estructura de anillo de \beta-lactama. La resistencia a esta familia de antibióticos en aislamientos clínicos se debe más comúnmente a la producción de una enzima "penicilinasa" (\beta-lactamasa) mediante la bacteria resistente que hidroliza el anillo de \beta-lactama eliminando de este modo su actividad antibacteriana.
Recientemente ha habido una emergencia de cepas de enterococos resistentes a vancomicina (Woodford N. 1998 Glycopeptide - resistant enterococci: a decade of experience. Journal of Medical Microbiology. 47 (10): 849-62). Los enterococos resistentes a vancomicina son particularmente peligrosos porque son causas frecuentes de infecciones vinculadas a los hospitales y son inherentemente resistentes a la mayoría de los antibióticos. La vancomicina actúa mediante la unión a los residuos D-Ala-D-Ala terminal del precursor peptidioglicano de la pared celular. La resistencia de alto nivel a vancomicina se conoce como VanA y se confiere mediante unos genes localizados en un elemento que altera los residuos terminales en D-Ala-lac reduciendo de ese modo la afinidad por vancomicina.
En vista de la rápida emergencia de las bacterias de resistencia multifármaco, es de la máxima importancia el desarrollo de los agentes antibacterianos con modos novedosos de acción que son eficaces contra el número creciente de bacterias resistentes, particularmente los enterococos resistentes a vancomicina y bacterias resistentes a los antibióticos de \beta-lactama, tales como Staphylococcus aureus resistente a meticilina.
Breve descripción de la invención
Esta invención se basa en el hallazgo de que ciertos derivados de N-formilhidroxilamina tienen actividad antibacteriana, y hace disponible una nueva clase de agentes antibacterianos.
Aunque puede ser de interés establecer el mecanismo de acción de los compuestos a los que la invención se refiere, es su capacidad para inhibir el crecimiento bacteriano, que los hace útiles. Sin embargo, actualmente se cree que su actividad antibacteriana se debe, al menos en parte, a la inhibición intracelular de la enzima polipéptido deformilasa (PDF).
Las polipéptido deformilasas bacterianas (PDF) (EC 3.5.1.31), son una familia conservada de metaloenzimas (Revisión: Meinnel T, Lazennec C, Villoing S, Blanquet S, 1997, Journal of Molecular Biology 267, 749-761) que son esenciales para la viabilidad bacteriana, siendo su función eliminar el grupo formilo del residuo metionina N-terminal de proteínas sintetizadas en los ribosomas en eubacterias. Mazel y col., (EMBO J. 13 (4): 914-923, 1994) han clonado recientemente y caracterizado una PDF de E. coli. Ya que PDF es esencial para el crecimiento de bacterias y no existe ningún equivalente eucariótico a PDF, Mazel y col., (íbidem), Rajagopalan y col., (J. Am. Chem. Soc. 119: 12418-12419, 1997) y Becker y col., (J. Biol. Chem. 273 (19): 11413-11416, 1998) han propuesto cada uno que PDF es una diana antibacteriana excelente.
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Ciertos derivados de N-formil hidroxilamina se han reivindicado previamente en las publicaciones de patentes listadas más adelante, aunque se han realizado y descrito muy pocos ejemplos de tales compuestos:
Documento EP-B-0236872 (Roche)
Documento WO 92/09563 (Glycomed)
Documento WO 92/04735 (Syntex)
Documento WO 95/19965 (Glycomed)
Documento WO 95/22966 (Sanofi Winthrop)
Documento WO 95/33709 (Roche)
Documento WO 96/23791 (Syntex)
Documento WO 96/16027 (Syntex Agouron)
Documento WO 97/03783 (British Biotech)
Documento WO 97/18207 (DuPont Merck)
Documento WO 98/38179 (GlaxoWellcome)
Documento WO 98/47863 (Labs Jaques Logeais)
La utilidad farmacéutica atribuida a los derivados de N-formil hidroxilamina en esas publicaciones es la capacidad de inhibir las metaloproteínasas de matriz (MMP) y en algunos casos la liberación del factor de necrosis tumoral (TNF), y por lo tanto el tratamiento de enfermedades o afecciones mediadas por enzimas, tal como cáncer y artritis reumatoide. Esta técnica previa no describe o implica que los derivados de N-formil hidroxilamina tienen actividad antibacteriana.
Además de éstas, el documento US-A-4.738.803 (Roques y col.) también describe los derivados de N-formil hidroxilamina, sin embargo, estos compuestos se describen como inhibidores de la encefalinasa y se proponen para uso como agentes antidepresivos e hipotensivos. También, el documento WO 97/38705 (Bristol - Myers Squibb) describe ciertos derivados de N-formil hidroxilamina como inhibidores de enzimas que convierten la encefaliana y la angiotensina. Esta técnica anterior no describe o implica que los derivados de N-formil hidroxilamina tengan cualquier actividad antibacteriana.
La solicitud de patente internacional en tramitación con la presente de los inventores nº PCT/GB99/00386 describe que ciertos derivados de N-formil hidroxilamina tienen actividad antibacteriana. Una clase de compuestos descrita por tener tal actividad tiene la fórmula general (IA):
1
en la que los varios sustituyentes "R" son como se especifica en el documento. Los compuestos útiles de acuerdo con la presente invención difieren en estructura de las del documento PCT/GB99/00386 principalmente porque el radical acíclico amidoalquilo mostrado como que se encuentra a la derecha de la línea curva en la fórmula (IA) se reemplaza por un radical cíclico.
Descripción detallada de la invención
Según el primer aspecto de la presente invención se proporciona el uso de un compuesto de fórmula (I) o una sal, hidrato o solvato farmacéuticamente aceptable del mismo
2
en la que:
R_{1} representa hidrógeno, metilo, o trifluorometilo;
R_{2} representa un grupo R_{10}-(Xn)-(ALK)- en el que
R_{10} representa hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, alquenilo C_{2}-C_{6}, alquinilo C_{2}-C_{6}, cicloalquilo, arilo, o heterociclilo, cualquiera de los cuales puede estar no sustituido o sustituido con alquilo C_{1}-C_{6}, alcoxi C_{1}-C_{6}, hidroxi, mercapto, alquiltio C_{1}-C_{6}, amino, halo (incluyendo fluoro, cloro, bromo y yodo), trifluorometilo, ciano, nitro, -COOH, -CONH_{2}, -COOR^{A}, -NHCOR^{A}, -CONHR^{A}, -NHR^{A}, -NR^{A}R^{B}, o -CONR^{A}R^{B} en los que R^{A}y R^{B} son independientemente un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, y ALK representa un radical alquileno C_{1}-C_{6}, alquenileno C_{2}-C_{6}, alquinileno C_{2}-C_{6}, divalente lineal o ramificado, y se puede interrumpir con uno o más enlaces -NH-, -O- o -S- no adyacentes,
X representa -NH-, -O- o -S-, y
n es 0 ó 1; y
R_{3} y R_{4}, tomados juntos con los átomos de carbono al que están unidos respectivamente, forman (i) un anillo carbocíclico o heterocíclico saturado de 5 a 8 átomos, opcionalmente sustituido con hasta cuatro sustituyentes, independientemente seleccionados entre alquilo C_{1}-C_{6}, bencilo, alcoxi C_{1}-C_{6}, fenoxi, hidroxi, mercapto, alquiltio C_{1}-C_{6}, amino, halo (incluyendo fluoro, cloro, bromo y yodo), trifluorometilo, nitro, -COOH-, -CONH_{2}, -COR^{A}, -COOR^{A}, -NHCOR^{A}, -CONHR^{A}, -NHR^{A}, -NR^{A}R^{B}, o -CONR^{A}R^{B} en los que R^{A}y R^{B} son independientemente un grupo alquilo (C_{1}-C_{6}) o (ii) un anillo de fórmula (iii):
3
en la que R_{8} es hidrógeno o un grupo alquilo C_{1}-C_{4}, cicloalquilo, fenilo o bencilo, y R_{9} es hidrógeno o un grupo alquilo C_{1}-C_{4}, fenilo o bencilo, o R_{8} y R_{9} tomados juntos representan un radical -(CH_{2})_{p}- divalente en el que p es 3 ó 4, en la preparación de una composición para el tratamiento de infecciones antibacterianas.
Los compuestos de fórmula (I) como se han definido anteriormente se pueden usar como componente (s) de materiales de limpieza o desinfección antibacteriana.
En la hipótesis de que los compuestos (I) actúan mediante inhibición de PDF intracelular, el efecto antibacteriano más potente se puede lograr usando compuestos que pasan eficazmente a través de la pared celular bacteriana, De este modo, los compuestos que son altamente activos como inhibidores de PDF in vitro y que penetran las células bacterianas se prefieren para uso de acuerdo con la invención. Se espera que la potencia antibacteriana de los compuestos que son potentes inhibidores de la enzima PDF in vitro, pero son escasamente penetrantes celulares, se pueden mejorar mediante su uso en la forma de un profármaco, es decir un análogo modificado estructuralmente que se convierte en la molécula precursora de la molécula (I), por ejemplo mediante acción enzimática, después de que ha pasado a través de la pared celular bacteriana.
Como se usa en esta memoria descriptiva el término "alquilo (C_{1}-C_{6})" significa un resto alquilo de cadena lineal o ramificada que tiene entre 1 y 6 átomos de carbono, que incluye por ejemplo, metilo, etilo, n-propilo, isopropilo, n-butilo, isobutilo, sec-butilo, t-butilo, n-pentilo y n-hexilo.
Como se usa en esta memoria descriptiva el término "radical alquileno (C_{1}-C_{6}) divalente" significa una cadena de hidrocarburo saturada que tiene entre 1 y 6 átomos de carbono y dos valencias insatisfechas.
Como se usa en esta memoria descriptiva el término "alquenilo (C_{2}-C_{6})" significa un resto alquenilo de cadena lineal o ramificada que tiene entre 2 y 6 átomos de carbono que tiene al menos un doble enlace de estereoquímica E o Z donde sea aplicable. El término incluye, por ejemplo, vinilo, alilo, 1- y 2- butenilo y 2-metil-2-propenilo.
Como se usa en esta memoria descriptiva el término "radical alquenileno (C_{2}-C_{6}) divalente" significa una cadena de hidrocarburo saturada que tiene entre 2 y 6 átomos de carbono, al menos un doble enlace, y dos valencias insatisfechas.
Como se usa en esta memoria descriptiva el término "alquinilo C_{2}-C_{6}" se refiere a grupos hidrocarburos de cadena lineal o cadena ramificada que tienen entre dos y seis átomos de carbono y que tienen además un triple enlace. Este término incluiría por ejemplo, etinilo, 1-propinilo, y 1- y 2-butinilo, 2-metil-2-propinilo, 2-pentinilo, 3-pentinilo, 4-pentinilo, 2-hexinilo, 3-hexinilo, 4-hexinilo y 5-hexinilo.
Como se usa en esta memoria descriptiva el término "radical alquinileno (C_{2}-C_{6}) divalente" significa una cadena de hidrocarburo saturada que tiene entre 2 y 6 átomos de carbono, al menos un triple enlace, y dos valencias insatisfechas.
Como se usa en esta memoria descriptiva el término "cicloalquilo" significa un resto alicíclico saturado que tiene entre 3 y 8 átomos de carbono e incluye, por ejemplo, ciclopropilo, ciclobutilo, ciclopentilo, ciclohexilo, cicloheptilo y ciclooctilo.
Como se usa en esta memoria descriptiva el término "cicloalquenilo" significa un resto alicíclico no saturado que tiene entre 3 y 8 átomos de carbono e incluye, por ejemplo, ciclopropenilo, ciclobutenilo, ciclopentenilo, ciclohexenilo, cicloheptenilo y ciclooctenilo. En el caso de anillos cicloalquenilo de entre 5 y 8 átomos de carbono, el anillo puede contener más de un doble enlace.
Como se usa en esta memoria descriptiva el término "arilo" se refiere a un grupo mono-, bi- o tri-cíclico carbocíclico aromático, y a grupos constituidos por dos grupos aromáticos monocíclicos carbocíclicos unidos covalentemente. Los ejemplos ilustrativos de tales grupos son fenilo, bifenilo y naftilo.
Como se usa en esta memoria descriptiva el término "heteroarilo" se refiere a un anillo aromático de 5 ó 6 miembros que contiene uno o más heteroátomos, y opcionalmente condensado a un anillo bencilo o piridilo; y a grupos constituidos por dos anillos aromáticos de 5 ó 6 miembros unidos covalentemente conteniendo cada uno, uno o más heteroátomos; y a grupos constituidos por un grupo monocíclico aromático unido covalentemente a un anillo aromático de 5 ó 6 miembros que contiene uno o más heteroátomos. Los ejemplos ilustrativos de tales grupos son tienilo, furilo, pirrolilo, imidazolilo, benzimidazolilo, tiazolilo, pirazolilo, isoxazolilo, isotiazolilo, triazolilo, tiadiazolilo, oxadiazolilo, piridinilo, piridazinilo, pirimidinilo, piarzinilo, triazinilo, 4-([1,2,3])tiadiazolil-4-il)fenilo y 5-isoxazol-3-iltienilo.
Como se usa en esta memoria descriptiva el término no calificado "carbociclilo" o "carbocíclico" se refiere a un anillo de 5 a 8 miembros cuyos átomos en el anillo son todos carbonos.
Como se usa en esta memoria descriptiva el término no calificado "heterociclilo" o "heterocíclico" incluye "heteroarilo" como se ha definido anteriormente, y en particular significa un anillo heterocíclico aromático o no aromático de 5 a 8 miembros que contiene uno o más heteroátomos seleccionados entre S, N y O, y opcionalmente condensado a un anillo de benceno, incluyendo por ejemplo, grupos pirrolilo, furilo, tienilo, piperidinilo, imidazolilo, oxazolilo, tiazolilo, tiadiazolilo, tiazepinilo, pirazolilo, piridinilo, pirrolidinilo, pirimidinilo, morfolinilo, piperazinilo, indolilo, benzimidazolilo, maleimido, succinimido, ftalimido, y 1,3-dioxo-1,3-dihidroisoindol-2-ilo.
Salvo que se especifique de otra manera en el contexto en que se produce, el término "sustituido" como se aplica a cualquier resto en esta memoria descriptiva significa sustituido con hasta cuatro sustituyentes, cada uno de los cuales independientemente puede ser alquilo (C_{1}-C_{6}), bencilo, alcoxi (C_{1}-C_{6}), fenoxi, hidroxi, mercapto, alquiltio (C_{1}-C_{6}), amino, halo (incluyendo fluoro, cloro, bromo y yodo), trifluorometilo, nitro, -COOH-, -CONH_{2}, -COR^{A}, -COOR^{A}, -NHCOR^{A}, -CONHR^{A}, -NHR^{A}, -NR^{A}R^{B}, o -CONR^{A}R^{B} en los que R^{A} y R^{B} son independientemente un grupo alquilo (C_{1}-C_{6}). En el caso en el que "sustituido" significa bencilo, el anillo fenilo del mismo puede estar sustituido él mismo con cualquiera de los anteriores, excepto bencilo.
Existen al menos dos centros quirales reales o potenciales en los compuestos según la invención debido a la presencia de átomos de carbono asimétricos. La presencia de varios carbonos asimétricos da lugar a un número de diastereoisómeros con estereoquímica R o S en cada centro quiral. La invención incluye todos estos diastereoisómeros y las mezclas de los mismos. Actualmente, la estereoconfiguración preferida del átomo de carbono que lleva el grupo R_{2} es R; y la del átomo de carbono que lleva el grupo R_{1} (cuando es asimétrico) es R.
En los compuestos de fórmula (I) como se ha definido anteriormente:
R_{1} puede ser, por ejemplo, hidrógeno, metilo, o trifluorometilo. Actualmente se prefiere hidrógeno.
R_{2} puede ser, por ejemplo:
alquilo C_{1}-C_{8}, alquilo C_{1}-C_{8}, alquenilo C_{3}-C_{6}, alquinilo C_{3}-C_{6} o cicloalquilo opcionalmente sustituidos;
fenil (alquil C_{1}-C_{6})-, fenil (alquenil C_{3}-C_{6})- o fenil (alquinil C_{3}-C_{6})- opcionalmente sustituido en el anillo fenilo;
cicloalquil (alquil C_{1}-C_{6})-, cicloalquil (alquenil C_{3}-C_{6})- o cicloalquil (alquinil C_{3}-C_{6})- opcionalmente sustituido en el anillo cicloalquilo;
heterociclil (alquil C_{1}-C_{6})-, heterociclil (alquenil C_{3}-C_{6})- o heterociclil (alquinil C_{3}-C_{6})- opcionalmente sustituido en el anillo heterociclilo; o
CH_{3}(CH_{2})_{p}O(CH_{2})_{q}- o CH_{3}(CH_{2})S(CH_{2})_{q}-, en los que p es 0, 1, 2 ó 3 y q es 1, 2 ó 3.
De este modo, R_{2} puede ser, por ejemplo,
alquilo C_{1}-C_{6}, alquenilo C_{3}-C_{6} o alquinilo C_{3}-C_{6};
fenil (alquil C_{1}-C_{6})-, fenil (alquenil C_{3}-C_{6})- o fenil (alquinil C_{3}-C_{6})- opcionalmente sustituido en el anillo fenilo;
cicloalquil (alquil C_{1}-C_{6})-, cicloalquil (alquenil C_{3}-C_{6})- o cicloalquil (alquinil C_{3}-C_{6})- opcionalmente sustituido en el anillo fenilo;
heterociclil (alquil C_{1}-C_{6})-, heterociclil (alquenil C_{3}-C_{6})- o heterociclil (alquinil C_{3}-C_{6})- opcionalmente sustituido en el anillo heterociclilo; o
4-fenilfenil (alquil C_{1}-C_{6})-, 4-fenilfenil (alquenil C_{3}-C_{6})-, 4-fenilfenil (alquinil C_{3}-C_{6})-, 4-heteroarilfenil (alquil C_{1}-C_{6})-, 4-heteroarilfenil (alquenil C_{3}-C_{6})-, 4-heteroarilfenil (alquinil C_{3}-C_{6})-, opcionalmente sustituidos en el fenilo terminal o anillo heteroarilo.
Los ejemplos específicos de grupos R_{2} incluyen metilo, etilo, n- e iso-propilo, n- e iso-butilo, n-pentilo, iso-pentilo, 3-metilbut-ilo, n-hexilo, n-heptilo, n-acetilo, n-octilo, metilsulfaniletilo, etilsulfanilmetilo, 2-metoxietilo, 2-etoxietilo, 2-etoximetilo, 3-hidroxipropilo, alilo, 3-fenilprop-2-en-1-ilo, prop-2-in-1-ilo, 3-fenilprop-2-in-1-ilo, 3-(2-clorofenil)prop-2-in-ilo, but-2-in-ilo, ciclopentilo, ciclohexilo, ciclopentilmetilo, ciclopentiletilo, ciclopentilpropilo, ciclohexilmetilo, ciclohexiletilo, ciclohexilpropilo, furan-2-ilmetilo, furan-3-metilo, tetrahidrofuran-2-ilmetilo, tetrahidrofuran-2-ilmetilo, piperidinilmetilo, fenilpropilo, 4-ciclofenilpropilo, 4-metilfenilpropilo, 4-metoxifenilpropilo, bencilo, 4-clorobencilo, 4-metilbencilo, o 4-metoxibencilo.
Los grupos preferidos actualmente en R_{2} son n-propilo, n-butilo, n-pentilo, bencilo y ciclopentilmetilo.
El anillo formado por R_{3} y R_{4}, tomado junto con los átomos de carbono a los que están unidos respectivamente, puede estar sustituido (como se ha definido anteriormente). En una realización particular el átomo del anillo en la posición n de un anillo de n miembros (n siendo 5, 6, 7 u 8 y numerando desde la posición 1, con el átomo de carbono oxo - sustituido estando en la posición 2) puede ser un átomo de carbono sustituido con uno o dos grupos metilo, y el átomo del anillo en al posición n - 1 puede ser un átomo de azufre. Los ejemplos de tales anillos, formados por R_{3} y R_{4}, tomados juntos con los átomos de carbono a los que se unen respectivamente, son aquellos de la estructura siguiente (III):
4
en la que R_{8} puede ser hidrógeno o un grupo alquilo C_{1}-C_{4} (por ejemplo metilo, etilo o n-propilo), cicloalquilo (por ejemplo ciclopentilo), fenilo o bencilo, y R_{9} puede ser hidrógeno o un grupo alquilo C_{1}-C_{4} (por ejemplo isobutilo), fenilo o bencilo, o R_{8} y R_{9} tomados juntos representan un divalente -
Los ejemplos específicos de radicales que tienen la estructura general (II) incluyen
4,7,7-trimetil-5-oxo-[1,4]tiazepan-6-ilo
3-bencil-4,7,7-trimetil-5-oxo-[1,4]tiazepan-6-ilo
3,3-dimetil-5-oxo-hexahidropirrolo[2,1,-c][1,4]tiazepin-4-ilo
7,7-dimetil-5-oxo-octahidro-8-tia-4a-aza-benzociclohepten-6-ilo
7,7-dimetil-5-oxo-octahidro-8-tia-4a-aza-benzocicloocten-6-ilo
4-etil-7,7-dimetil-5-oxo-[1,4]tiazepan-6-ilo
7,7-dimetil-5-oxo-4-propil[1,4]tiazepan-6-ilo
7,7-dimetil-5-oxo-4-fenil[1,4]tiazepan-6-ilo
7,7-dimetil-5-oxo-4-fenil[1,4]tiazepan-6-ilo
1-metil-2-oxo-azepan-3-ilo
1-bencil-2-oxo-piperidin-3-ilo
1-metil-2-oxo-pirrolidin-3-ilo
4-metil-3,5-oxo-[1,4]oxazepan-6-ilo
4-metil-3,5-oxo-[1,4]tiazepan-6-ilo
1-metil-2,7-dioxoazepan-3-ilo
1-metil-2,6-dioxopiperidin-3-ilo
1-metil-2-oxo-1,2,3,4-tetrahidroquinolin-3-ilo
2-metil-3-oxo-2,3,4,5-tetrahidro-1H-benzo[c]azepin-4-ilo
1-metil-2-oxo-2,3,4,5-tetrahidro-1H-benzo[c]azepin-3-ilo
9-metil-8-oxo-6,7,8,9-tetrahidro-5-oxa-9-aza-benzociclohepten-7-ilo
1-metil-7-oxo-[1,4]diazepan-6-ilo
1-(4-metoxibencenosulfonil)-4-metil-5-oxo-[1,4]diazepan-6-ilo
1-benzoil-4-metil-5-oxo[1,4]diazepan-6-ilo
1,4-dimetil-5-oxo-[1,4]diazepan-6-ilo
3-bencil-5-oxo-[1,4]tiazepan-6-ilo
3-bencil-4-metil-1,1,5-trioxo-[1,4]tiazepan-6-ilo
2-bencil-7-oxo-[1,4]oxatiazepan-6-ilo y
4-oxotiazepan-3-ilo.
Los ejemplos específicos de los compuestos de la invención incluyen los nombrados y caracterizados específicamente en los ejemplos en esta memoria descriptiva.
Los compuestos de la invención se pueden preparar mediante un procedimiento que comprende acoplamiento de un ácido de fórmula (IV) con una amina de fórmula (V)
5
en la que R_{1}, R_{2}, R_{3} y R_{4} son como se han definido en relación a la fórmula (I). El grupo N-hidroxi del compuesto (IV) se protege preferiblemente durante la reacción de acoplamiento, y el grupo hidroxi regenerado posteriormente.
Los compuestos de fórmula (V) se pueden preparar mediante la formación de ciclos de los compuestos de fórmula (VA)
6
en la que uno de R_{13} y R_{14} contiene un grupo reactivo capaz de reaccionar con un sitio asociado reactivo sobre los otros R_{13} y R_{14} para formar un enlace covalente entre R_{13} y R_{14}, por lo tanto formando el anillo deseado, representado en la fórmula (I) por R_{3} y R_{4} tomados juntos con los átomos de carbono a los que están unidos respectivamente. Durante esta reacción de formación de ciclos, el grupo amino de (VA) usualmente estarán protegidos, y el grupo amino liberado posteriormente. Tales formaciones de ciclos intramoleculares, por ejemplo reacciones de condensación intramolecular, se conocen en la técnica química de síntesis. Como alternativa, los compuestos de fórmula (V) se pueden preparar mediante la reacción de un compuesto de fórmula (VB).
7
con un engarce bifuncional representado esquemáticamente como X_{1}-L-X_{2}, en la que X_{1} es un grupo reactivo capaz de hacer reaccionar con un sitio asociado reactivo en R_{23}, X_{2} es un grupo reactivo capaz de hacer reaccionar con un sitio asociado reactivo en R_{24}, y R_{23}, R_{24} y L se eligen de manera tal que después de la reacción de X_{1} y X_{2} con sus sitio asociados reactivos respectivos, L forma un puente unido covalentemente entre R_{23} y R_{24} y completa el anillo deseado, representado en la fórmula (I) por R_{3} y R_{4} tomados juntos con los átomos de carbono a los que están unidos respectivamente. De nuevo, durante esta reacción de formación de ciclos, el grupo amino de (VA) usualmente estará protegido, y el grupo amino liberado posteriormente.
De nuevo tal formación de ciclo intramolecular mediante la formación de anillo en la técnica de la química sintética. El ejemplo 1 es una ilustración de tal reacción. Tales reacciones se llevan a cabo preferiblemente a alta dilución para maximizar la formación de puente intramolecular mejor que intermolecular.
Los compuestos de la invención pueden ser accesibles mediante la formación de ciclos de un compuesto de fórmula (VI)
8
en la que R_{1} y R_{2} son como se han definido en relación a la fórmula (I), y R_{13} y R_{14} son como se han definido en relación a la fórmula (VA). Preferiblemente el grupo N-formil hidroxilamina en (VI) se protege durante la reacción de la formación de ciclos y el grupo protector eliminado posteriormente, o se puede unir a un soporte de fase sólida (por ejemplo una resina), y posteriormente liberado.
Como alternativa, los compuestos de la invención pueden ser accesibles mediante una reacción de un compuesto de fórmula (VIA)
9
con un engarce bifuncional representado esquemáticamente como X_{1}-L-X_{2}, en la que R_{1} y R_{2} son como se han definido en realización a la fórmula (I), y X_{1} y X_{2} y L son como se han definido en relación a la fórmula (VB). Preferiblemente el grupo N-formil hidroxilamina en (V) se protege durante la reacción de formación de puentes y el grupo protector eliminado posteriormente, o se puede unir a un soporte de fase sólida (por ejemplo una resina), y liberado posteriormente.
Las composiciones antibacterianas a la que se refiere la invención se pueden preparar para administración mediante cualquier vía consistente con las propiedades farmacocinéticas del (de los) ingrediente (s) activo (s).
Las composiciones administrables por vía oral pueden estar en forma de comprimidos, cápsulas, polvos, gránulos, grageas, preparaciones líquidas o en gel, tales como soluciones o suspensiones orales, tópicas, o parenterales estériles. Los comprimidos y cápsulas para administración oral pueden estar en forma de presentación de dosis unitaria, y pueden contener excipientes convencionales tales como agentes aglutinantes, por ejemplo, jarabe, goma arábiga, gelatina, sorbitol, tragacanto, o polivinilpirrolidona; cargas por ejemplo, lactosa, azúcar, almidón de maíz, fosfato cálcico, sorbitol o glicina; lubricante para la formación de comprimidos, por ejemplo estearato de magnesio, talco, polietilenglicol o sílice; agentes disgregantes por ejemplo almidón de patata, o agentes humectantes aceptables tales como lauril sulfato sódico. Los comprimidos se pueden recubrir según los procedimientos bien conocidos en la práctica farmacéutica normal. Las preparaciones líquidas orales pueden estar en la forma de, por ejemplo, suspensiones acuosas u oleosas, soluciones, emulsiones, jarabes o elixires, o se pueden presentar en forma de un producto seco para reconstitución con agua u otro vehículo adecuado antes de uso. Tales preparaciones líquidas pueden contener aditivos convencionales tales como agentes de suspensión, por ejemplo sorbitol, jarabe, metilcelulosa, jarabe de glucosa, grasas comestibles hidrogenadas de gelatina; agentes emulsionantes, por ejemplo lecitina, monoleato de sorbitán, o goma arábiga; portadores no acuosos (que pueden incluir aceites comestibles), por ejemplo aceite de almendra, aceite de coco fraccionado, ésteres oleosos tales como glicerina, propilenglicol, o alcohol etílico; conservantes, por ejemplo p-hidroxibenzoato de metilo o propilo o ácido sórbico, y si se desea agentes aromatizantes o colorantes convencionales.
Para aplicación tópica a la piel, el (los) ingrediente (s) se pueden realizar en un crema, loción o ungüento. Las formulaciones en crema o ungüento que se pueden usar para el fármaco son formulaciones convencionales bien conocidas en la técnica, por ejemplo como se describe en los libros de texto convencionales de compuestos farmacéuticos tales como la farmacopea británica.
El (los) ingrediente (s) activo (s) también se puede administrar por vía parenteral en un medio estéril. Dependiendo del portador y concentración usada, el fármaco se puede suspender o disolver en el portador. De manera ventajosa, se pueden disolver en el portador adyuvantes tales como un anestésico local, conservante y agentes de tamponación. La infusión intravenosa es otra vía de administración para los compuestos usados según la invención.
Las dosificaciones seguras y eficaces para diferentes clases de pacientes y para estados patológicos diferentes se determinarán mediante ensayo clínico como se requiere en la técnica. Se entenderá que el nivel de dosis específico para cualquier paciente particular dependerá de una diversidad de factores que incluyen la actividad del compuesto específico empleado, la edad, peso corporal, salud general, sexo, dieta, tiempo de administración, vía de administración, velocidad de excreción, combinación de fármacos y la gravedad de la enfermedad particular que se somete a terapia.
El hallazgo de los compuestos con actividad inhibidora de PDF pueden inhibir o prevenir el crecimiento bacteriano, abre un nuevo planteamiento para identificar nuevos agentes antibacterianos mediante la selección de los compuestos de ensayo para evaluar la actividad como inhibidores de PDF in vitro, seguido de la confirmación de su capacidad antibacteriana usando estudios de inhibición de crecimiento bacteriano. Este hallazgo también hace accesible (i) el uso de compuestos con actividad inhibidora de PDF como agentes antibacterianos, y (ii) un procedimiento para el tratamiento de infección o contaminación bacteriana aplicando o administrando un compuesto que inhibe la actividad de PDH bacteriano.
El siguiente ejemplo ilustra una realización de la invención.
Las siguientes abreviaturas se han usado a lo largo de este documento:
DMF N,N-dimetilformamida
EDC Clorhidrato de N-etil-N'-(3-diemtilaminopropil)carbodiimida
TFA Ácido trifluoroacético
HOAt 1-Hidroxi-7-aza-benzotriazol
HOBt 1-Hidroxibenzotriazol
HPLC Cromatografía líquida de alto rendimiento
EMBR Espectrometría de masas de baja resolución
TLC Cromatografía de capa fina
Los espectros de ^{1}H y ^{13}C RMN se registraron usando un espectrómetro Bruker AC 250E a 250,1 y 62,9 MHz, respectivamente. Los espectros de masas se obtuvieron usando un espectrómetro Pewrkin Elmer Sciex API 165 usando modos iónicos tanto positivos como negativos.
Los materiales de partida ácido 2R-(terc-butoxiaminometil)hexanoico y éster pentafluorofenílico del ácido 2R-[(terc-butoxiformilamino]metilhexanoico se prepararon como se describe más adelante (véase también el esquema 1). Los materiales de partida ácido 2R-[(benciloxiamino)metil]hexanoico y éster pentafluorofenílico del ácido 2R-[(benciloxiformilamino)metil]hexanoico se prepararon de manera similar.
Etapa 1
Ácido 2-butilacrílico
Se disolvió ácido butilmalónico (25 g, 156 mmoles) en etanol y se añadió una solución de formaldehído al 37% (15,45 ml, 156 mmoles) seguido de piperidina (47 ml, 624 mmoles). La mezcla se agitó durante toda una noche a 80ºC en un condensador de reflujo. Se retiraron los disolventes a presión reducida y el residuo se diluyó con ácido clorhídrico 1 M y se extrajo con diclorometano (3 x 30 ml). Los extractos orgánicos combinados se lavaron con salmuera, se secaron sobre sulfato de magnesio anhidro, se filtraron y se evaporaron para producir el producto deseado en forma de un aceite amarillo (25 g, con disolvente residual). ^{1}H-RMN: \delta (CDCl_{3}), 10,04 (1H, s a), 6,22 (1H, s), 5,57 (1H, d, J = 1,3 Hz), 2,30 (2H, t, J = 6,9 Hz), 1,38 (4H, m), y 0,91 (3H, t, J = 7,2 Hz).
Etapa 2
4S-bencil-3-(2-butilacriloil)-5,5-diemtiloxazolidin-2-ona
Se disolvió ácido 2-butilacrílico (21,5 g, 168 mmoles) en THF seco (30 ml, 218 mmoles) y enfriado hasta -78ºC en una atmósfera de argón. Se añadieron trietilamina (30 ml, 218 mmoles) y cloruro de pivaloilo (21 ml, 168 mmoles) a tal velocidad que la temperatura permaneciera por debajo de -60ºC. La mezcla se agitó a -78ºC durante 30 minutos, se calentó hasta temperatura ambiente durante 2 horas y finalmente se volvió a enfriar hasta -78ºC.
En un matraz separado, se disolvió 4S-bencil-5,5-diemtiloxazolidin-2-ona en THF seco (500 ml) y se enfrió hasta -78ºC en una atmósfera de argón. Se añadió lentamente n-butillitio (solución 2,4 M en hexanos, 83 ml, 200 mmoles) y la mezcla se agitó durante 30 minutos a temperatura ambiente. El anión resultante se transfirió mediante una cánula al interior del recipiente de reacción original. La mezcla se dejó que se calentara hasta temperatura ambiente y se agitó durante toda una noche a temperatura ambiente. La reacción se inactivó con carbonato ácido de potasio 1 M (200 ml) y los disolventes se retiraron a presión reducida. El residuo se repartió entre acetato de etilo y agua. La fase orgánica se lavó con salmuera, se secó sobre sulfato de magnesio anhidro, se filtró y se concentró a presión reducida para proporcionar un aceite naranja. El análisis de TLC reveló la presencia de un auxiliar quiral además del producto requerido. Una porción del material (30 g) se disolvió en diclorometano y se lavó abundantemente a través de una almohadilla de sílice para proporcionar el compuesto del título en forma de un aceite amarillo (25,3 g). ^{1}H-RMN; \delta (CDCl_{3}), 7,31-7,19 (5H, m), 5,41 (2H, s), 4,51 (1H, dd, J = 9,7, 4,2 Hz), 3,2 (1H, d, J = 14,2 Hz), 2,82 (1H, dd, J = 14,2, 9,7 Hz), 2,40-2,34 (2H, m), 1,48-1,32 (4H, m), 1,43 (3H, s), 1,28 (3H, s), y 0,91 (3H, t, J = 7,1 Hz). Se recuperó algún auxiliar quiral lavando abundantemente la almohadilla de sílice con
metanol.
Etapa 3
4S-terc-butil-3-(2-butilacriloil)-5,5-diemtiloxazolidin-2-ona-2R-(terc- butoxiaminometil)hexanamida
Se disolvió 4S-bencil-3-(2-butilacriloil)-5,5-diemtiloxazolidin-2-ona (5 g, 15,2 mmoles) en etanol (20 ml). Después se añadió clorhidrato de O-terc-butilhidroxilamina (2,4 ml, 19,10 mmoles) y trietilamina (2,75 ml, 19,90 mmoles) y la mezcla de reacción se agitó a 30ºC durante 24 horas. Se retiró el disolvente a presión reducida y el residuo se disolvió en acetato de etilo y se lavó sucesivamente con ácido clorhídrico 1 M, carbonato ácido de sodio y salmuera, se secó sobre sulfato de magnesio y se filtró. Los disolventes se retiraron a presión reducida para proporcionar el compuesto del título (5,62 g, 13,89 mmoles, 87%) en forma de un aceite incoloro. ^{1}H-RMN: \delta (CDCl_{3}), 7,29 (5H, m), 5,07 (1H, s), 4,51 (1H, dd, J = 3,2, 10,0 Hz), 4,01 (1H, m), 3,25 (1H, dd, J = 2,9, 14,4 Hz), 3,03 (2H, m), 2,84 (1H, dd, J = 2,9, 14,4 Hz), 1,69 (1H, m), 1,49 (2H, m), 1,34 (6H, s), 1,25 (3H, m), 1,13 (9H, s) y 0,87 (3H, t, J = 6,9 Hz). EMBR: ion +ve 405 [M + H].
Etapa 4
Ácido 2R-(ter-butoxiaminometil)hexanoico
Se disolvió 4S-terc-butil-3-(2-butilacriloil)-5,5-diemtiloxazolidin-2-ona-2R-terc-butoxiaminometil)hexanamida
(5,62 g, 13,89 mmoles) en THF (40 ml) y agua (10 ml) y se enfrió hasta 0ºC y se trató con hidróxido de litio (0,64 g, 15,28 mmoles). La solución se agitó durante 30 minutos a 0ºC, después durante toda una noche a temperatura ambiente. La reacción se acidificó hasta pH 4 con ácido cítrico 1 M y se retiraron los disolventes. El residuo se repartió entre diclorometano y carbonato sódico 1 M. La fase acuosa básica se acidificó hasta pH 4 con ácido cítrico 1 M y s extrajo tres veces con acetato de etilo. Las fases orgánicas combinadas se secaron sobre sulfato de magnesio anhidro, se filtraron y se concentraron para proporcionar el compuesto del título en forma de un aceite incoloro (2,0 g, 66%). ^{1}H-RMN: \delta (CDCl_{3}), 7,31 (2H, s a), 3,14 (1H, dd, J = 9,1, 12,7 Hz), 2,99 (1H, dd, J = 4,2, 12,7 Hz), 2,63 (1H, m), 1,65 (1H, m), 1,54 (1H, m), 1,29 (4H, m), 1,17 (9H, s) y 0,90 (3H, t, J = 7,2 Hz).
\newpage
Etapa 5
Ácido 2R[(terc-butoxifromilamino)metil]hexanoico
A una solución de ácido 2R-(ter-butoxiaminometil)hexanoico (4 g, 18,5 mmoles) en diclorometano (40 ml) a 0ºC se añadió anhídrido acético fórmico (4,1 ml, 46,25 mmoles) y trietilamina (2,4 ml, 18,5 mmoles). Después de 2 horas la solución se lavó con agua, carbonato ácido de sodio saturado y salmuera, se secó sobre sulfato sódico anhidro y se filtró. El filtrado se evaporó para proporcionar el compuesto del título en forma de un aceite, que se empleó en la etapa 6 sin purificación adicional. EMBR: ion +ve 245 (M + H).
Etapa 6
Éster pentafluorofenílico del ácido 2R-[(terc-butoxiformilamino)metil]hexanoico
Se disolvió ácido 2R-[(terc-butoxifromilamino)metil]hexanoico (1,73 g, 7,06 mmoles) en diclorometano (60 ml) y se enfrió hasta 0ºC. Se añadieron pentafluorofenol (1,43 g, 7,77 mmolers) y EDC (1,5 g, 7,77 mmoles) y la solución resultante se agitó a 0ºC durante 0,5 horas y a temperatura ambiente durante 4 horas. Después la solución se lavó con carbonato sódico 1 M y salmuera, se secó sobre sulfato de magnesio y se filtró. Los disolventes se retiraron a presión reducida para proporcionar el compuesto del título en forma de un aceite incoloro (2,6 g, 6,33 mmoles, 90%. EMBR: ion +ve 412 (M + H).
Ejemplo 1 (4,4,7-trimetil-5-oxo-[1,4]tiazepan-6R-il)amida del ácido 2R[(formilhidroxiamino)metil]hexanoico
10
El compuesto del título se preparó mediante el procedimiento descrito más adelante (véase también el esquema 2):
Etapa A
Ácido 2R-terc-butoxicarbonilamino-3-meracpto-3-metilbutírico
L-Penicilamina (15 g, 0,1 moles) se suspendió en metanol (250 ml) y se enfrió hasta 0ºC. Después se añadieron secuencialmente trietilamina (14 ml, 0,1 moles) y dicarbonato de di-terc-butilo (24 g, 0,11 moles) en metanol (25 ml). Se dejó que la mezcla de reacción se agitara a temperatura ambiente durante toda una noche, después de lo cual los disolventes de retiraron a presión reducida. El residuo se disolvió en acetato de etilo (100 ml) y se lavaron con ácido clorhídrico (100 ml), agua (50 ml) y salmuera (50 ml), se secaron sobre sulfato de magnesio anhidro, se filtraron y se evaporaron para proporcionar el compuesto del título en forma de un sólido blanco, (28,1 g, incluyendo disolvente residual). ^{1}H-RMN: \delta (CDCl_{3}), 9,13 (1H, s a), 5,52 (1H, d, J = 9,9 Hz), 4,34 (1H, d, J = 9,3 Hz), 2,01 (1H, s), 1,53 (3H, m), 1,46 (9H, s) y 1,42 (3H, s).
Etapa B
Éster terc-butílico del ácido {1R-[(2-hidroxietil)metilcarbamoil]-2-mercapto-2-metilpropil}carbámico
Se disolvió ácido 2R-terc-butoxicarbonilamino-3-mercapto-3-metilbutírico (5 g, 20 mmoles) en DMF (30 ml) y la solución se enfrió hasta 0ºC. Se añadieron EDC (4,6 g, 24 mmoles) y HOBt (3,25 g, 24 mmoles) y la mezcla se agitó durante 15 minutos. Se añadió N-(2-hidroxietil)-N-metilamina (1,16 ml, 20 mmoles) y la reacción se dejó que se calentara hasta temperatura ambiente y se agitó durante toda una noche. Se retiró el disolvente a presión reducida y el residuo se disolvió en diclorometano, se lavó sucesivamente con ácido clorhídrico 1 M, carbonato ácido de sodio saturado y salmuera, se secó sobre sulfato de magnesio y se filtró. Los disolventes se retiraron a presión reducida y el residuo se purificó mediante cromatografía en columna ultra-rápida (gel de sílice, metanol al 5% en diclorometano) para proporcionar el compuesto del título en forma de un aceite incoloro (3,58 g, 58%). ^{1}H-RMN: \delta (CDCl_{3}), 5,67 (1H, d, J = 9,5 Hz), 5,5 (1H, d, J = 8,7 Hz), 4,68 (2H, dd, J = 9,7, 13,8 Hz), 3,79 (2H, m), 3,27 (3H, s), 2,77 (1H, s a), 1,81 (1H, s), 1,44 (9H, s), 1,45 (3H, s) y 1,43 (3H, s).
Etapa C
Éster terc-butílico del ácido (4,7,7-trimetil-5-oxo-[1,4]tiazepan-6-il)carbámico
Una solución del éster terc-butílico del ácido {1R-[(2-hidroxietil)metilcarbamoil]-2-mercapto-2-metilpropil}car-
bámico (3 g, 9,8 moles) en THF (100 ml) se trató con trifenilfosfina (3,28 g, 12,5 mmoles) y diisopropilazodicarboxilato (2,45 ml, 12,5 mmoles) y la solución resultante se agitó a temperatura ambiente durante 6 horas. Se retiró el disolvente a presión reducida y el residuo se purificó mediante cromatografía en columna ultra-rápida (Biotage, acetato de etilo al 40%) para proporcionar el compuesto del título en forma de un aceite incoloro (1,0 g, 35%). ^{1}H-RMN: \delta (CDCl_{3}), 5,83 (1H, d, J = 7,8 Hz), 4,89 (1H, d, J = 9,4 Hz), 4,00 (1H, dd, J = 3,6, 9,6 Hz), 3,56 (1H, dd, J = 5,4, 9,8 Hz), 3,04 (3H, m), 2,69 (1H, ddd, J = 3,5, 5,5, 11,0 Hz), 1,44 (9H, s), 1,36 (3H, s) y 1,19 (3H, s). EMBR: ion +ve 289 [M + H].
Etapa D
6S-Amino-4,7,7-trimetil-[1,4]tiazepan-5-ona
Una solución del éster terc-butílico del ácido (4,7,7-trimetil-5-oxo-[1,4]tiazepan-6-il)carbámico (1 g, 3,47 mmoles) en diclorometano (10 ml) y THF se dejó en reposo a 0ºC durante toda una noche. Se retiraron los disolventes a presión reducida y el residuo se disolvió en metanol (30 ml) y agua (3 ml) y se trató con resina Dowex-400 hasta pH 8. La resina se retiró mediante filtración y se lavó bien con metanol. El filtrado y los lavados se evaporaron para proporcionar el compuesto del título en forma de un aceite amarillo (0,65 g, cuantitativo). ^{1}H-RMN: \delta (CD_{3}OD), 3,94 (1H, s), 3,89 (1H, t, J = 6,8 Hz), 3,62 (1H, dt, J = 5,3, 15,5 Hz), 3,00 (3H, s), 2,82 (2H, t, J = 5,3 Hz), 1,38 (3H, s) y 1,16 (3H, s). EMBR: ion +ve 189 [M + H].
Etapa E
(4,7,7-trimetil-5-oxo-[1,4]tiazepan-6-R-il)amida del ácido 2R-[(terc-butoxiamino)metil]hexanoico
Se disolvió ácido 2R-terc-butoxiaminometil)hexanoico (0,4 g, 1,85 mmoles) en DMF (30 ml) y al solución se enfrió hasta 0ºC. Se añadieron EDC (0,42 g, 2,18 mmoles) y HOAt (25 mg, 0,185 mmoles) y la mezcla se agitó durante 15 minutos. Se añadió 6S-amino-4,7,7-trimetil-[1,4]tiazepan-5-ona (0,5 g, 1,85 mmoles) y se dejó que la reacción se calentara hasta temperatura ambiente y se agitó durante toda una noche. Se retiró el disolvente a presión reducida y el residuo se disolvió en diclorometano, se lavó sucesivamente con ácido clorhídrico 1 M, carbonato ácido de sodio saturado y salmuera, se secó sobre sulfato de magnesio y se filtró. Se retiraron los disolventes a presión reducida y el residuo se purificó mediante cromatografía en columna ultra-rápida (Biotage, acetato de etilo al 50%) para proporcionar el compuesto del título en forma de un aceite incoloro (160 mg, 22%). ^{1}H-RMN: \delta (CDCl_{3}), 6,99 (1H, d, J = 8,2 Hz), 5,25 (1H, d, J = 8,3 Hz), 5,00 (1H, s), 4,06 (1H, ddd, J = 4,9, 10,5, 16,5 Hz), 3,53 (1H, dt, J = 4,6, 16,8 Hz), 3,07 (1H, dd, J = 7,1, 12,5 Hz), 3,04 (3H, s), 2,94 (1H, dd, J = 4,6, 8,5 Hz), 2,84 (1H, dd, J = 4,5, 9,5 Hz), 2,73 (1H, dt, J = 3,9, 14,0 Hz), 1,55 (1H, m), 1,37 (3H, s), 1,28 (5H, m), 1,22 (3H, s), 1,16 (9H, s) y 0,87 (3H, t, J = 7,7 Hz). EMBR: ion +ve 387 [M + H].
Etapa F
(4,7,7-trimetil-5-oxo-[1,4]tiazepan-6-R-il)amida del ácido 2R-[(terc-butoxiformilamino)metil]hexanoico
Una solución de la (4,7,7-trimetil-5-oxo-[1,4]tiazepan-6-R-il)amida del ácido 2R-[(terc-butoxiamino)metil]hexanoico (160 mg, 0,41 mmoles) en diclorometano (5 ml) se trató con anhídrido acético fórmico (0,2 ml) y se agitó durante 5 horas. Los disolventes se retiraron a presión reducida para proporcionar el compuesto del título en forma de un aceite incoloro (180 mg, 97%). ^{1}H-RMN: \delta (CDCl_{3} rotámeros) 8,3 (1H, s), 7,17 (0,33 H, d, J = 7,4 Hz), 6,92 (0,66H, d, J = 7,8 Hz), 5,31 (0,33H, d, J = 9,4 Hz), 5,19 (0,66H, d, J = 8,3 Hz), 4,03 (1H, m), 3,90 (1H, m), 3,52 (1H, dt, J= 5,7, 16,6 Hz), 3,03 (3H, s), 2,78 (3H, m), 1,56 (1H, m), 1,41 (2H, m), 1,35 (3H, s), 1,27 (9H, s), 1,23 (3H, m), 1,20 (3H, s) y 0,86 (3H, t, J = 7,6 Hz). EMBR: ion +ve 416 [M + H].
Etapa G
(4,7,7-trimetil-5-oxo-[1,4]tiazepan-6-R-il)amida del ácido 2R-[(formilhidroxiamino)metil]hexanoico
(4,7,7-Trimetil-5-oxo-[1,4]tiazepan-6-R-il)amida del ácido 2R-[(terc-butoxiformilamino)metil]hexanoico (180 mg, 0,4 mmoles) se disolvió en THF (10 ml) y se agitó a temperatura ambiente durante 6 horas. El disolvente se retiró a presión reducida, destilando azeotrópicamente varias veces con tolueno. El compuesto del título se purificó usando HPLC preparativa (metanol : agua, procedimiento de gradiente) en forma de un sólido blanco (80 mg, 0,22 mmoles, 54%). ^{1}H-RMN: \delta (CDCl_{3} (rotámeros)) 8,39 (0,5H, s), 7,84 (0,5H, s), 7,19 (0,5 H, d, J = 8,3 Hz), 6,99 (0,5H, d, J = 8,3 Hz), 5,28 (0,5H, d, J = 8,2 Hz), 5,23 (0,5H, d, J = 8,2 Hz), 4,05 (1,5 H, m), 3,86 (0,5 H, dd, J = 9,9, 14,1 Hz), 3,52 (2H, m), 3,06 (1,5H, s), 3,04 (1,5H, s), 2,85 (1,5 H, s), 2,85 (1,5 H, m), 2,74 (1,5H, m), 1,61 (1H, m), 1,43 (1H, m), 1,32 (1H, s), 1,30 (4H, m), 1,26 (2H, s), 1,17 (2H, s) y 0,88 (3H, t, J = 6,7 Hz). ^{13}C-RMN: \delta (CDCl_{3} (rotámeros)) 171,1, 59,4, 53,1, 52,8, 51,5, 48,4, 46,6, 45,2, 44,0, 36,7, 36,5, 30,3, 29,6, 27,5, 27,2, 24,0, 23,0 y 14,2. EMBR: ion +ve 360 [M + H], 382 [M + Na], ion -ve 358 [M - H].
Esquema 1
11
Reactivos y condiciones: 1. piperidina, HCHO, EtOH, 80ºC, o/n; 2. tBuCOCl, Et_{3}N después 3-litio-4-bencil-5,5-dimetiloxazolidin-2-ona; 3. H_{2}NOtBu. HCl, Et_{3}N, EtOH, 30ºC, o/n; 4. LiOH, THF acuoso, 0ºC después HCl 1 M. 5. HCOOAc, Et_{3}N, CH_{2}Cl_{2}; 6. pentafluorofenol, EDC, CH_{2}Cl_{2};
Esquema 2
12
Reactivos y condiciones: A dicarbonato de di-terc-butilo, Et_{3}N MeOH; B. N-metil-2-aminoetanol, HOBT, EDC, DMF; C PPh_{3}, diisopropilazo dicarboxilato, TH; D TFA, CH_{2}Cl_{2}; E ácido 2R-(terc-butiloximainometil)hexanoico, EDC, HOAt, DMF; F HCOAc, CH_{2}Cl_{2}; G TFA.
Ejemplo 2 (5,5-Dimetil-7-oxo-[1,4]oxotiepan-6-il)amida del ácido 2-[(formilhidroxiamino)metil]ehxanoico
13
Etapa A
Ácido 2S-terc-butoxicarbonilamino-3-(2-hidroxietilsulfanil)-3- metilbutírico
Se disolvió ácido 2S-terc-butoxicarbonilamino-3-mercapto-3-metilbutírico (1 g, 4 mmoles) en una mezcla 1:1 de etanol y solución de hidróxido sódico 1 M (20 ml). Después se añadió 2-bromoetanol (0,34 ml, 4,8 mmoles) y la solución resultante se agitó a 40ºC durante toda una noche. Se retiró el etanol a vacío y el residuo se diluyó con agua (10 ml), se acidificó hasta pH 1 con ácido clorhídrico 1 M y se extrajo con diclorometano (3 x 10 ml). La fase orgánica se combinó, se lavó con salmuera (10 ml), se secó sobre sulfato sódico anhidro, se filtró y se evaporó para proporcionar el compuesto del título en forma de una goma blanca (1,1 g, 3,75 mmoles, 94%). ^{1}H-RMN: \delta (CDCl_{3}), 5,57 (1H, d, J = 9,1 Hz), 5,38 (1H, s a), 4,40 (1H, d, J = 9,2 Hz), 3,76 (2H, m), 2,83 (2H, t, J = 5,8 Hz), 1,45 (9H, s), 1,42 (3H, s) y 1,35 (3H, s). EMBR: ion +ve 294 [M + H], 316 [M + Na], ion -ve 292 M - H]).
Etapa B
Éster terc-butílico del ácido (5,5-dimetil-7-oxo[1,4]oxatiepan-6S-il)carbámico
Una solución del ácido 2S-terc-butoxicarbonilamino-3-(2-hidroxietilsulfanil)-3-metilbutírico (1,1 g, 3,75 mmoles) y cloroformiato de etilo (0,4 ml, 4,12 mmoles) en diclorometano se enfrió hasta 0ºC y se trató gota a gota con trietilamina (0,57 ml, 4,12 mmoles) y dimetilaminopiridina (46 mg, 0,375 mmoles). La solución resultante se agitó a 0ºC durante 0,5 horas después se diluyó con diclorometano (15 ml), se lavó sucesivamente con ácido clorhídrico 1 M, carbonato ácido de sodio saturado y salmuera, se secó sobre sulfato de magnesio y se filtró. Los disolventes se retiraron a vacío para proporcionar el compuesto del título (0,86 g, 3,12 mmoles, 83%) en forma de un aceite incoloro. ^{1}H-RMN: \delta (CDCl_{3}), 5,59 (1H, d, J = 8,1 Hz), 5,03 (1H, d, J = 8,6 Hz), 4,65 (2H, m), 3,05 (1H, ddd, J = 3,7, 8,4, 15,7 Hz), 2,79 (1H, ddd, J = 2,3, 4,8, 15,8 Hz), 1,45 (9H, s), 1,39 (3H, s) y 1,27 (3H, s). EMBR: ion +ve 276 [M + H], 298 [M + Na].
Etapa C
6S-amino-5,5-diemtil-[1,4]oxatieopan-7-ona
Una solución del éster terc-butílico del ácido (5,5-dimetil-7-oxo[1,4]oxatiepan-6-il)carbámico (0,86 g, 3,12 mmoles) en ácido trifluoroacético acuoso al 5% (20 ml) se dejó en reposo a 0ºC durante 16 horas. Los disolventes de retiraron a vacío, de destilaron azeotrópicamente con tolueno, después el residuo se disolvió en metanol acuoso al 10% (30 ml) y se ajustó hasta pH 8 con resina Dowex 1 x 8 400. Esto se filtró y se concentró a presión reducida para proporcionar el compuesto del título en forma de una goma incolora (0,72 g, 4 mmoles, 100%). ^{1}H-RMN: \delta (CDCl_{3}), 4,71 (1H, ddd, J = 2,7, 5,5, 12,9 Hz), 4,54 (1H, ddd, J = 2,0, 8,9, 14,9 Hz), 4,33 (1H, m), 3,02 (1H, ddd, J = 2,8, 8,9, 15,9 Hz), 2,81 (1H, ddd, J = 1,9, 5,7, 11,68 Hz), 2,33 (2H, s a), 1,46 (3H, s) y 1,34 (3H, s).
Etapa D
(5,5-dimetil-7-oxo-[1,4+oxatiepan-6-il)amida del ácido 2-[(formilhidroxiamino)metil]hexanoico
Una solución de 6S-amino-5,5-diemtil-[1,4]oxatieopan-7-ona (320 mg, 1,83 mmoles) y éster pentafluorofenílico del ácido 2R[(terc-butoxiformilamino)metil]hexanoico (0,5 g, 1,22 mmoles) en DMF (5 ml) se agitó a temperatura ambiente durante 5 días. Se retiró la DMF a vacío y el residuo se disolvió en diclorometano (30 ml), se lavó sucesivamente con ácido clorhídrico 1 M, carbonato ácido de sodio saturado y salmuera, se secó sobre sulfato de magnesio y se filtró. Los disolventes se retiraron a presión reducida y el residuo se disolvió en ácido trifluoroacético (10 ml) y se agitó a temperatura ambiente durante 6 horas. Se retiró el disolvente a vacío, se destiló azeotrópicamente con tolueno, y el compuesto del título se purificó usando HPLC preparativa (metanol: agua, procedimiento de gradiente) (80 mg, 0,22 mmoles, 54%) en forma de un sólido blanco ^{1}H-RMN: \delta (CDCl_{3} (rotámeros)) 8,36 (0,33H, s), 7,85 (0,66H, s), 7,18 (0,66 H, d, J = 7,3 Hz), 7,10 (0,33H, d, J = 7,9 Hz), 5,41 (1H, d, J = 8,5 Hz), 4,69 (2H, m), 3,75 (2H, m), 3,42 (1H, dd, J = 4,0, 14,2 Hz), 3,09 (1 H, m), 2,94 (1H, m), 2,80 (2H, m), 1,65 (1H, m), 1,35 (3H, s), 1,32 (5H, m), 1,30 (3H, s), y 0,89 (3H, t, J = 6,5 Hz). ^{13}C-RMN: \delta (CDCl_{3} (rotámeros)) 173,8, 172,8, 71,6, 71,3, 61,2, 60,9, 52,3, 49,1, 46,0, 44,7, 43,4, 43,2, 30,4, 30,2, 29,8, 28,8, 27,5, 26,5, 23,0 y 14,3. EMBR: ion +ve 347 (M + H), 369 [M + Na], ion -ve 345 [M - H].
Los compuestos de los ejemplos 3 a 5 se prepararon mediante síntesis paralela en solución a partir del éster pentafluorofenílico del ácido 2R-terc-butiloxiaminometil)hexanoico y [1,4]oxatiepan aminas derivadas de penicilamina. Las aminas requeridas se prepararon como se ha indicado en el esquema 3 y como se describe en detalle más adelante.
Etapa A
Éster terc-butílico del ácido (2,2-dimetil-4-oxotietan-3-il)carbámico
Ácido 2S-terc-butoxicarbonilamino-3-mercapto-3-metilbutírico (8 g, 32,10 mmoles) se disolvió en diclorometano (300 ml) y se enfrió hasta 0ºC. Después se añadieron pentafluorofenol (6,5 g, 35,31 mmoles) y EDC (7,4 g, 38,52 mmoles) y la solución resultante se dejó que se calentara hasta temperatura ambiente y se agitó durante 2 horas, se lavó sucesivamente con ácido clorhídrico 1 M, carbonato sódico 1 M y salmuera, se secó sobre sulfato de magnesio y se filtró. Los disolventes se retiraron a vacío para proporcionar el compuesto del título en forma de un sólido blanco (7,45 g, 100%). ^{1}H-RMN: \delta (CDCl_{3}); 5,41 (1H, d, J = 8,4 Hz), 5,30 (1H, s a), 1,83 (3H, s), 1,64 (3 H, s) y 1,45 (9H, s).
Etapas B-D
Éster terc-butílico del ácido (2,2-dimetil-4-oxotietan-3-il)carbámico (0,62 g, 2,7 mmoles) y la 2-hidroxiamina requerida (2-hidroximetilpiperidina para el ejemplo 3, N-etiletanolamina para el ejemplo 4 o N-propiletanolamina para el ejemplo 5; 2,7 mmoles) se disolvieron en DMF (5 ml) y se agitó a temperatura ambiente durante toda una noche después se concentraron a vacío. El residuo se disolvió en tetrahidrofurano (20 ml) y se añadió tri-n-butilfosfina (1 ml, 4,05 mmoles) y la solución de enfrió hasta 0ºC. Después se añadió 1,1-(azodicarbonil)dipiperidina (1 g, 4,05 mmoles) y la solución se agitó a 0ºC durante 5 minutos y a temperatura ambiente durante 4 horas, después se diluyó con hexano (5 ml), se filtró a través de un cartucho que contenía un lecho de sílice y se concentró a vacío. El residuo se disolvió en TFA acuoso al 5% (20 ml) y se dejó en reposo a 0ºC durante toda una noche después se concentró a vacío, destilando azeotrópicamente con tolueno. El residuo se disolvió en diclorometano (20 ml) y se extrajo en agua (3 x 10 ml). La solución acuosa se ajustó hasta pH 8 con carbonato sódico 1 M y se extrajo con diclorometano, se secó sobre sulfato de magnesio y se filtró. Los disolventes se retiraron a vacío para proporcionar las aminas requeridas. Una solución de la amina (1,1 equivalente) y éster pentafluorofenólico del ácido 2R-[(terc-butiloxifaminometil)hexanoico (1 equivalente) en diclorometano (5 ml) se agitó a temperatura ambiente durante toda una noche.
Después la solución se trató con resina de carbonato (3 mmoles/g, 3 equivalentes) durante 1 hora, se filtró y se trató con resina de ácido sulfónico (1 mmoles/g, 3 equivalentes) durante una hora adicional. La suspensión se filtró y se concentró hasta sequedad a vacío. El residuo se disolvió en ácido trifluoroacético (10 ml) a temperatura ambiente durante 6 horas después se concentró a vacío. Los compuestos finales se purificaron usando HPLC preparativa (metanol: agua, procedimiento de gradiente).
Esquema 3
14
Reactivos y condiciones: A Pfp, EDC, DCM; B 2-hidroxiamina, DMF; C P(^{n}Bu)_{3}, ADDP, THF; D TFA después NaHCO_{3}
Ejemplo 3 (7,7-Dimetil-5-oxo-octahidro-8-tia-4a-azabenzocilohepten-6-il)amida del ácido 2-[(formilhidroxiamino)metil]hexanoico
15
Aceite amarillo, 4,6 mg. EMBR ion +ve: 400 (M + H).
Ejemplo 4 (4-Etil-7,7-dimetil-5-oxo-[1,4]tizapan-6-il)amida del ácido 2-[(formilhidroxiamino)metil]hexanoico
16
Aceite incoloro, 24 mg. EMBR ion +ve: 374 (M + H).
Ejemplo 5 (4-Propil-7,7-dimetil-5-oxo-[1,4]tiazapan-6-il)amida del ácido 2-[(formilhidroxiamino)metil]hexanoico
17
Aceite amarillo, 40 mg. EMBR ion +ve: 388 (M + H), ion -ve: 386 (M - H).
Ejemplo 6 (1-Bencil-2-oxo-piepridin-3S-il)amida del ácido 2R-[(formilhidroxiamino)metil]hexanoico
18
Etapa A
Ácido 5-bencilamino-2S-benciloxicarbonilaminopentanoico
Se añadió benzaldehído (0,42 ml, 4,25 mmoles) a una suspensión agitada de ácido 5-amino-2S-benciloxicarbonilaminopentanoico (1,0 g, 3,75 mmoles), trietilamina (0,62 ml, 4,5 mmoles) y sulfato de magnesio (0,96 g, 8,1 mmoles) en metanol (10 ml) y continuó la agitación a temperatura ambiente durante toda una noche. Después la mezcla de reacción se filtró y se concentró a vacío. El residuo se disolvió en metanol, se enfrió en un baño de hielo y se añadió por partes cianoborohidruro de sodio (0,28 g, 7,5 mmoles). Después de 2 horas se añadió acetona (30 ml) para inactivar la reacción y la mezcla de reacción se concentró a vacío para dejar el compuesto del título en forma de un sólido marrón (1,6 g) que se empleó en la siguiente sin posterior purificación.
Etapa B
Éster bencílico del ácido (1-bencil-2-oxopiperidin-3S-il)carbámico
Se diluyó ácido 5-bencilamino-2S-benciloxicarbonilaminopentanoico en DMF (16 ml) y se enfrió en un baño de hielo. Se añadieron HOBt (51 mg, 0,37 mmoles) y EDC (0,75 g, 3,9 mmoles) a la solución agitada y se continuó la agitación durante 60 horas. La mezcla de reacción se concentró a vacío y el residuo se disolvió en acetato de etilo. El extracto orgánico se lavó con ácido clorhídrico 1 M (15 ml), carbonato sódico 1 M (15 ml), salmuera (15 ml), se secó sobre sulfato de magnesio y se concentró a presión reducida. La cromatografía en columna de sílice (diclorometano: metanol 98:2 a 80:2) proporcionó el compuesto del título puro (0,3 g, 25%). ^{1}H-RMN: \delta (CDCl_{3}) 7,30 (10H, m), 5,85 (1H, s), 5,12 (2H, s), 4,64 (2H, m), 4,15 (1H, m), 3,24 (2H, m), 1,88-1,52 (4H, m). EMBR: ion +ve 339 [M + H].
Etapa C
3C: 3S-Amino-1-bencilpiperidin-2-ona
Se añadió paladio cobre carbón (10%) a una solución agitada de éster bencílico del ácido (1-bencil-2-oxopiperidin-3S-il)carbámico (0,29 g, 0,86 mmoles) en etanol (40 ml) en atmósfera de argón . Se burbujeó H_{2} a través de la suspensión durante 2 horas. La mezcla se purgó con argón antes de que se retirara el catalizador mediante filtración. Se retiró el disolvente a vacío para producir el compuesto del título en forma de un aceite incoloro (0,17 g, 98%). ^{1}H-RMN: \delta (CDCl_{3}) 7,26 (5H, m), 4,49 (2H, m), 3,52 (1H, m), 3,23 (2H, m), 2,26-1,73 (4H, m). EMBR: ion +ve 205 [M + H].
Etapa D
(1-bencilpiperidin-2-oxopiperidin-3S-il)amida del ácido 2R-[(benciloxiaminoformil)metil]hexanoico
A una solución de 2R-[(benciloxiformilamino]metil]hexil pentafluorofeniléster (155 mg, 0,81 mmoles) en diclorometano (4 ml) se añadió 3S-amino-1-bencilpiperidin-2-ona (240 mg, 0,54 mmoles) y la mezcla de reacción se agitó a 30ºC durante 48 horas. La purificación se efectuó retirando el exceso de amina y pentafluorofenol usando resinas depuradoras. Se retiró el pentafluorofenol usando un exceso de tres veces (0,46 g, 1,62 mmoles) de resina de A-26 carbonato (carga de 3,5 mmoles). La resina se añadió a la mezcla de reacción y se agitó durante 3 horas, tiempo después del cual se retiró mediante filtración. Se retiró el exceso de amina usando un exceso de cinco veces (2,7 g, 2,76 mmoles) de resina de metilisocianato poliestireno (carga de 1,2 mmoles). La resina se añadió a la mezcla de reacción y se agitó durante 3 horas, tiempo después del cual se retiró mediante filtración y se retiró el disolvente a vacío. La columna en cromatografía en columna de sílice (diclorometano:metanol 99:1 a 97:3) proporcionó el compuesto del título (140 mg, 57%). ^{1}H-RMN: \delta (CDCl_{3}, (rotámeros) 8,15 (0,5H, s), 7,87 (0,5H, s), 7,36 (10H, m), 6,61 (1H, s a), 4,98-4,47 (4H, m), 4,28 (1H, m), 3,78 (1H, s), 3,22 (2H, m), 2,53 (2H, m), 1,82-1,29 (10H, m), 0,88 (3H, s). EMBR: ion +ve 466 [M + H].
Etapa E
3C: (1-bencilpiperidin-2-oxopiperidin-3S-il)amida del ácido 2R-[(formilhidroxiamino)metil]hexanoico
La (1-bencilpiperidin-2-oxopiperidin-3-Sil)amida del ácido 2R-[(benciloxiaminoformil)metil]hexanoico (140 mg, 0,30 mmoles) se disolvió en etanol (10 ml) y se colocó en una atmósfera de argón. Se añadió paladio sobre carbón (14 mg, 10% de peso) y la mezcla se agitó vigorosamente a medida que se burbujeaba gas hidrógeno a través del sistema durante 3 horas. El matraz se purgó con argón antes de retirar el catalizador por filtración. El filtrado se concentró a presión reducida para proporcionar el compuesto del título en forma de un aceite incoloro (110 mg, 98%). %). ^{1}H-RMN: \delta (CDCl_{3}, (rotámeros) 8,42 (0,5H, s), 7,80 (0,5H, s), 7,32 (5H, m), 4,73-4,47 (2H, m), 4,24 (0,5H, m), 3,93 (1H, c), 3,61-3,34 (1H, s), 3,24 (2H, m), 2,78-2,43 (2H, m), 2,23-1,24 (10H, m), 0,89 (3H, t, J = 6,3 Hz). ^{13}C-RMN: \delta (CDCl_{3}, rotámeros) 174,3, 169,9, 136,1, 128,7, 127,8, 127,5, 51,9, 50,9, 50,8, 47,1, 45,7, 29,3, 26,9, 22,5, 21,5, 20,7 y 13,8. EMBR: ion +ve 376 [M + H].
Ejemplo 7 (2-Oxoazepan-3S-il)amida del ácido 2R-[(formilhidroxiamino)metil)hexanoico]
19
El compuesto de título se preparó de una manera análoga a la del ejemplo 6, a partir de 3-S-aminohexahidro-2-azepinona comercialmente disponible.
Aceite incoloro. ^{1}H-RMN: \delta (CDCl_{3}, rotámeros) 8,85 (0,5H, s), 7,79 (0,5H, s), 4,51 (1H, m), 3,71 (1H, m), 3,46-3,19 (3H, m), 2,86 (1H, t, J = 8,5 Hz), 1,98-1,66 (6H, m), 1,32-1,17 (6H, m) y 0,89 (3H, t, J = 6,6 Hz). ^{13}C-RMN: \delta (CDCl_{3}, rotámeros) 177,2, 172,3, 157,9, 53,7, 52,7, 45,6, 42,7, 31,4, 30,1, 29,4, 29,0, 28,5, 23,2 y 14,3. EMBR: ion +ve 300 [M + H].
Ejemplo 8 de referencia
(2,9-Dioxo-1,8-diaza-ciclotetradec-3S-il)amida del ácido 2R-[(formilhidroxiamino)metil)hexanoico]
20
El compuesto del título se preparó mediante el procedimiento indicado en el esquema 4 y se describe en detalle a continuación.
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Esquema 4
21
Reactivos y condiciones: A: THF/CH_{2}Cl_{2}, TsOH; B éster 4-nitrofenílico del ácido 6-terc-cutoxicarbonilamino-
hexanoico, imidazol, Et_{3}N, CH_{2}Cl_{2}; C: Et_{2}NH, CH_{2}Cl_{2}; D pentafluorofenol, EDCl, CH_{2}Cl_{2}, E: CF_{3}COOH, CH_{2}Cl_{2}; F: piridina, 80 C; G: Pg/C, H_{2}, AcOH/AcOEt (2:1); H 2R[(terc-benciloxiformilamino)metil]hexil pentafluorofenil éster, DMF, 12 h; E: Pd/C, H_{2}, MeOH/CHCl_{3}.
Etapa A
Éster 9-H-fluoren-9-ilmetílico del ácido (6-amino-2-benciloxilcarbonilaminohexanoil)carbámico, sal de ácido p-tolueosulfónico
Éster terc-butílico del ácido [5-benciloxicarbonilamino-6-(9H-fluoren-9-ilmetoxicarbonilamino)-6-oxohexil]carbámico (0,6 g, 1 mmoles) se disolvió en diclorometano (10 ml) y se añadió gota a gota THF (1 ml). La mezcla de reacción se agitó durante 30 minutos adicionales y se concentró a vacío. El residuo se trituró con éter dietílico y se sembró. Después de 2 horas a 4ºC, se recogió el sólido blanco mediante filtración. (0,49 g, 78%) ^{1}H-RMN: \delta (CDCl_{3}) 7,77-7,27 (17H, m), 6,15 (1H, s a), 5,67 (1H, d, J = 7,8 Hz), 5,06 (2H, m), 4,52-4,11 (5H, m), 2,75 (2H, s a) 2,26 (3H, s) y 1,25-1,14 (6H, m). ^{13}C-RMN: \delta (CDCl_{3}) 172,1, 156,0, 143,4, 143,2, 141,2, 140,8, 136,2, 128,0, 124,8, 119,8, 66,8, 66,6, 53,8, 46,7, 39,3, 31,3, 26,9, 21,8 y 21,2.
Etapa B
Éster 9-H-fluoren-9-ilmetílico del ácido [2-benciloxicarbonilamino-6-(6-terc-butoxicarbonilaminohexanoilamino)hexanoil)carbámico
A una solución del éster 9H-fluoren-9-ilmetílico del ácido (6-amino-2-benciloxilcarbonilaminohexanoil)carbámico, sal de ácido tósico (0,252 g, 0,4 mmoles) y éster 4-nitrofenílico de ácido (6-terc-butoxicarbonilaminohexanoico (0,14 g, 0,4 mmoles) en diclorometano (3 ml) se añadió imidazol (0,03 g, 0,44 mmoles). Después de agitar durante 1 hora a temperatura ambiente, se observó un color amarillo, después se añadió trietilamina (55 \mul, 0,4 mmoles). La mezcla de reacción se agitó durante 12 horas. La mezcla se diluyó y se lavó con ácido clorhídrico 1 M (10 ml), carbonato sódico 0,5 M (10 ml), salmuera (10 ml), se secó sobre sulfato de magnesio anhidro y se concentró a presión reducida. La cromatografía en columna ultra-rápida (diclorometano-metanol, 9:1) proporcionó una espuma de color claro (0,203 g, 76%). ^{1}H-RMN: \delta (CDCl_{3}) 7,77-7,26 (13H, m), 5,77 (1H, s a), 5,60 (1H, d, J = 8,0 Hz), 5,10 (2H, s), 4,65 (1H, s a), 4,49 (2H, m), 4,35 (1H, s a), 4,19 (1H, m), 3,18 (2H, m), 3,15 (2H, m), 2,10 (2H, t, t, J = 7,5 Hz), y 1,68-1,18 (21H, m).
Etapa C
Ácido [2-benciloxicarbonilamino-6-(6-terc-butiloxicarbonilaminohexanoilamino)hexanoico
El éster 9-H-fluoren-9-ilmetílico del ácido [2-benciloxicarbonilamino-6-(6-terc-butoxicarbonilaminohexanoila-
mino)hexanoil]carbámico se disolvió en diclorometano que contenía 5% de dietilamina (2 ml) y se agitó durante 6 horas a temperatura ambiente. La mezcla de reacción se concentró se concentró a vacío. La columna cromatografía en columna (diclorometano-metanol ácido acético 18:1:1) proporcionó el producto bruto (0,13 g, 87%). ^{1}H-RMN: \delta (CDCl_{3}) 9,00-8,75 (1H, s a), 7,26 (5H, s), 6,31 (1H, s a), 5,80 (1H, d, J = 7,8 Hz), 5,12 (2H, s), 4,85 (1H, s a), 4,35 (1H, m), 3,11 (2H, m), 3,05 (2H, m), 2,17 (2H, t, t, J = 7,4 Hz), y 1,95-1,20 (21H, m).
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Etapa D
Éster pentafluorofenílico del ácido [2-benciloxicarbonilamino-6-(6-terc- butiloxicarbonilaminohexanoilamino)hexanoico
Una solución del ácido [2-benciloxicarbonilamino-6-(6-terc-butiloxicarbonilaminohexanoilamino)hexanoico
(0,13 g, 0,26 mmoles) y pentafluorofenol (0,1 g, 0,54 mmoles) en diclorometano (5 ml) se agitó y se enfrió en un baño de hielo durante la adición de EDC (55 mg, 0,29 mmoles). La agitación se continuó a temperatura ambiente durante 3 horas. La mezcla se lavó dos veces con ácido clorhídrico 1 M (10 ml), carbonato sódico 0,5 M (10 ml), salmuera (10 ml), se secó sobre sulfato de magnesio anhidro y se concentró a presión reducida. La goma resultante se trituró con hexano para proporcionar un sólido amorfo (0,13 g, 75%). ^{1}H-RMN: \delta (CDCl_{3}) 7,32 (5H, s), 6,00 (2H, t a y d a), 5,12 (2H, s), 4,63 (2H, m), 3,23 (2H, m), 3,03 (2H, m), 2,12 (2H, t, J = 7,5 Hz) y 1,65-1,21 (21H, m).
Etapa E
Sal del ácido trifluoroacético de éster pentafluorofenílico del ácido 6-(6-aminohexanoilamino)hexanoico
Éster pentafluorofenílico del ácido [2-benciloxicarbonilamino-6-(6-terc-butoxicarbonilamino)hexanoico (130 mg, 0,2 mmoles) se disolvió en diclorometano (3 ml) y se añadió gota a gota THF (0,5 ml). La mezcla de reacción se agitó durante 2 horas a temperatura ambiente y se concentró a vacío para dejar el compuesto del título que se empleó en la siguiente etapa sin purificación adicional.
Etapa F
Sal del ácido trifluoroacético del éster bencílico del ácido 6-(6- aminohexanoilamino)-2-benciloxicarbonilaminohexanoico se disolvió en piridina y se calentó hasta 80ºC (64 mg, 86%).
Etapa G
3S-amino-1,8-diazaciclotetradecano-2,9-diona
Se añadió paladio sobre carbón (10%, 50 mg) a una suspensión saturada del éster bencílico del ácido (2,9-dioxo-1,8-diazaciclotetradec-3-S-il)carbámico (500 mg, 1,33 mmoles) en ácido acético-acetato de etilo 2:1 (6 ml) en argón. Se burbujeó H_{2} a través de la suspensión durante 2 horas y se dejó en una atmósfera de hidrógeno. El matraz se purgó con argón antes de que el, catalizador se retirara mediante filtración. El filtrado se concentró a presión reducida para proporcionar el compuesto del título en forma de un aceite amarillo (254 mg, 98%). ^{1}H-RMN: \delta (CD_{3}OD) 3,69-3,40 (3H, m), 3,04 (2H, m a), 2,25-2,16 (2H, m a), 1,94-1,12 (12H, m a). EMBR: ion +ve 242 [M + H].
Etapa H
(2,9-dioxo-1,8-diaza-ciclotetradec-3S-il)amida del ácido 2R-[(benciloxiaminoformil)metil]hexanoico
A una solución del 2R-[(benciloxiformilamino)metil]hexilpentafluorofenil éster (2,33 mg, 0,52 mmoles) en DMF (10 ml) se añadió 3S-amino-1,8-diaza-ciclotetradecano-2,9-diona (254 mg, 1,05 mmoles) y la mezcla de reacción se agitó a temperatura ambiente durante 12 horas. La mezcla de reacción se concentró a vacío y el residuo se disolvió en metanol-diclorometano 1:1 (10 ml). La purificación se efectuó retirando el exceso de amina y pentafluorofenol usando resinas depuradoras. El pentafluorofenol se retiró usando un exceso de tres veces (0,44 g, 1,56 mmoles) de resina A-26 carbonato (carga de 3,5 mmoles). La resina se añadió a la mezcla de reacción y se agitó durante 3 horas, tiempo después del cual se retiró mediante filtración. El exceso de amina se retiró usando un exceso de cinco veces (2,6 g, 2,60 mmoles) de resina de metilisocianato poliestireno (carga de 1,2 mmoles). La resina se añadió a la mezcla de reacción y se agitó durante 3 horas, tiempo después del cual se retiró mediante filtración y el disolvente se retiró a vacío. El sólido amarillo resultante se trituró con MeOH para proporcionar mediante filtración el compuesto del título en forma de un sólido incoloro (100 mg, 38%). %). ^{1}H-RMN: \delta (CDCl_{3}, rotámeros) 8,14 (0,5H, s), 7,87 (0,5H, s), 7,40 (5H, m), 4,91 (2H, m), 4,28 (1H, m), 3,77-3,37 (3H, m), 2,95 (2H, m), 2,70 (1H, m), 2,19 (2H, m), 1,69-1,27 (18H, m), 0,88 (3H, t, J = 6,9 Hz). EMBR: ion +ve 503 [M + H].
Etapa I
(2,9-dioxo-1,8-diaza-ciclotetradec-3S-il)amida del ácido 2R-[(formilhidroxiamino)metil)hexanoico
Se disolvió (2,9-dioxo-1,8-diaza-ciclotetradec-3S-il)amida del ácido 2R-[(benciloxiaminoformil)metil]hexanoico (100 mg, 0,20 mmoles) en metanol-cloroformo 1:1 (10 ml) y se situó en una atmósfera de argón. Se añadió paladio sobre carbón (10 mg, 10% de peso) y la mezcla se agitó vigorosamente a medida que se burbujeaba gas hidrógeno a través del sistema durante 2 horas. El matraz se purgó con argón antes de retirar el catalizador por filtración. El filtrado se concentró a presión reducida para proporcionar el compuesto del título en forma de un sólido incoloro (80 mg, 97%). %). ^{1}H-RMN: \delta (CD_{3}OD, rotámeros), 8,25 (0,4H, s), 8,15 (1H, m), 7,97 (1H, m), 7,82 (0,6H, s), 4,27 (1H, m), 3,77-3,37 (4H, m), 2,99-2,85 (3H, m), 2,18 (2H, m), 1,66-1,31 (18 H), 0,89 (3H, t, J = 6,8 Hz). ^{13}C-RMN: \delta (CDCl_{3}, rotámeros) 53,3, 53,9, 47,8, 40,2, 39,8, 36,9, 33,5, 31,2, 30,7, 30,2, 26,9, 26,8, 24,1, 23,7 y 14,6. EMBR: ion +ve 376 [M + Na], 413 [M + H].
Ejemplo 9 de referencia
(2-oxo-azaciclotridec-3R,S-il)amida del ácido 2R-[(formilhidroxiamino)metil)hexanoico
22
El compuesto del título se preparó de una manera análoga a las etapas H e I del esquema 6 a partir de 3-amino-azabiciclotridecan-2-ona (patente; Ajinomoto Co. Inc.; DE 1955038; Chem. Abstr.; EN; 73; 34829). Sólido incoloro.
^{1}H-RMN: \delta (CDCl_{3}, rotámeros, mezcla de diastereoisómeros), 8,39 (0,3H, s), 8,38 (0,2H, s), 7,81 (0,3H, s), 7,79 (0,2H, s), 6,80-5,98 (2H, m a), 4,47 (1H, m), 3,76 (2H, m), 3,50 (1H, m), 2,96-2,65 (2H, m), 1,71-1,04 (24H, m), 0,88 (3H, t, J = 6,1 Hz). ^{13}C-RMN: \delta (CDCl_{3}, rotámeros) 175,5, 174,0, 53,6, 51,8, 44,8, 39,4, 31,9, 31,6, 29,4, 29,3, 28,9, 26,7, 26,3, 24,7, 24,5, 23,8, 22,6 y 22,2. EMBR: ion +ve 384 [M + H].
Ejemplo 10 [4-metil-5-oxo-1-(4-trifluorometilbencenosulfonil)-[1,4]diazxepan-6S- il]amida del ácido 2R-[(formilhidroxiamino)metil)hexanoico
23
El compuesto se preparó según el procedimiento descrito más adelante (véase también el esquema 5):
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Etapa 5
24
Reactivos y condiciones: A: SOCl_{2}, MeOH, 4 h; B 2-[N-(ter-butoxicarbonilamino)]acetaldehído, NaBH_{3}CN,
MeOH/AcOH (99/1), 12 h; C: HCl/Et_{2}O, 12 h; D: LiOH, MeOH/H_{2}O (3/1), 3 h; E: EDC, HOAt, DMF, 12 h; F: cloruro de trifluorometilbenceno sulfonilo, Et_{3}N, DCM, 5 h; G: HBr (45%), AcOH, 3 h; H: 2R-[(benciloxiformilamino)metil]hexil pentafluorofenil éster, DMF, 12 h; I: Pd/C,H_{2}, EtOH, 12 h.
Etapa A
Clorhidrato del éter metílico del ácido 3-amino-2S-benciloxicarbonilaminopropiónico
A una solución enfriada (0ºC) de ácido 3-amino-2S-benciloxicarbonilaminopropiónico (1 g, 4,2 mmoles) en metanol (15 ml) se añadió gota agota cloruro de tionilo (0,36 ml, 5,04 mmoles). La mezcla de reacción se agitó durante 4 horas a temperatura ambiente y se concentró a vacío para proporcionar en cristal blanco (1,2 g, 99%). ^{1}H-RMN: \delta ((CD_{3})_{2}SO): 8,25 (3H, s a), 7,92 (1H, d, J = 8,3 Hz), 7,37 (5H, s), 5,07 (2H, s), 4,48-4,39 (1H, m), 3,68 (3H, s) y 3,24-3,06 (2H, s a). EMBR: ion +ve 253 [M + H].
Etapa B
Clorhidrato del éter metílico del ácido 2S-benciloxicarbonilamino-3-[2- (terc-butoxicarbonilmetilamino)etilamino]propiónico
2-[N-(terc-butoxicarbonil)-N-metilamino)]acetaldehído (S. Kato, H. Harada y T. Morie, J. Chem. Soc., Perkin Trans. 1, 1997, 3219) se añadió a una solución del clorhidrato del éster metílico del ácido 3-amino-2S-benciloxicarbonilaminopropiónico en metanol/ácido acético (99/1, 12 ml). Durante un período de 45 minutos, se añadió por partes ciianoborohidruro de sodio y la mezcla de reacción se agitó durante toda una noche a temperatura ambiente. Esto último se diluyó con acetato de etilo (150 ml) y se añadió una solución de bicarbonato sódico a 0ºC. La fase orgánica se lavó con agua (40 ml), salmuera (40 ml), se secó sobre sulfato de magnesio anhidro y se concentró a vacío. La mezcla de la reacción bruta se purificó mediante una cromatografía ultra-rápida (acetato de etilo) para proporcionar un aceite transparente (0,44 g, 63%). %). ^{1}H - RMN: \delta (CDCl_{3}): 7,35 (5H, s), 5,88-5,71 (1H, s a), 5,11 (2H, s), 4,41 (1H, m), 3,75 (3H, s), 3,26 (2H, m), 3,06-2,92 (2H, m), 2,83 (3H, s), 2,75 (2H, m). EMBR: ion +ve 410 [M + H].
Etapa C
Diclorhidrato del éster metílico del ácido 2S-benciloxicarbonilamino-3-(2-metilaminoetilamino)propiónico
Clorhidrato del éter metílico del ácido 2S-benciloxicarbonilamino-3-[2-(terc-butoxicarbonilmetilamino)etilamino]propiónico (200 mg, 0,49 mmoles) se disolvió en éter dietílico (3 ml) en una atmósfera de argón. A la mezcla de reacción enfriada en un baño de hielo, se añadió cloruro de hidrógeno 1 M en éter dietílico 1 M (1,5 ml, 1,5 mmoles). La mezcla de reacción se agitó durante toda una noche a temperatura ambiente y se concentró a vacío para proporcionar el compuesto del título puro (168 mg, 99%). ^{1}H-RMN: \delta (CDCl_{3}): 7,37 (5H, m), 5,14 (2H, s), 4,88 (1H, m), 3,77 (3H, s), 3,61-3,41 (6H, m), 2,77 (3H, s). EMBR: ion +ve 310 [M + H].
Etapa D
Diclorhidrato del ácido 2S-benciloxicarbonilamino-3-(2-metilaminoetilamino)propiónico
Diclorhidrato del éster metílico del ácido 2S-benciloxicarbonilamino-3-(2-metilaminoetilamino)propiónico (168 mg, 0,48 mmoles) se disolvió en metanol/agua (3/1, 4 ml) e hidróxido de litio (101 g, 2,4 mmoles) se añadió a la mezcla de reacción a 5ºC. La mezcla de reacción se agitó a temperatura ambiente durante 4 horas, y después de concentró a vacío. El residuo se disolvió en agua (8 ml), se acidificó hasta pH = 1 mediante HCl 1 M y el disolvente se retiró a vacío para proporcionar el compuesto del título puro (0,15 g, 85%). ^{1}H-RMN: \delta (CD_{3}OD): 7,38 (5H, m), 5,14 (2H, s), 4,58 (1H, m), 3,65-3,45 (6H, m) y 2,77 (3H, s). EMBR: ion +ve 296 [M + H].
Etapa E
Éster bencílico del ácido (1-metil-7-oxo-[1,4]diazepan-6-il)carbámico
Diclorhidrato del ácido 2S-benciloxicarbonilamino-3-(2-metilaminoetilamino)propiónico (0,15 g, 0,4 mmoles) se diluyó en DMF (12 ml) y se enfrió en una baño de hielo. Se añadieron HOAt (8 mg, 0,06 mmoles) y EDC (102 mg, 0,53 mmoles) a la solución agitada y la agitación se continuó durante 14 horas. La mezcla de reacción se concentró a vacío. La purificación mediante cromatografía ultra-rápida (diclorometano-metanol: 95/5) proporcionó el compuesto del título puro (60 mg, 54%). ^{1}H-RMN: \delta (CDCl_{3}): 7,35 (5H, m), 6,25 (1H, m), 5,11 (2H, s), 4,48 (1H, m), 3,76-3,66 (2H, m), 3,27-3,05 (5H, m), 2,97-2,66 (2H, m), 1,9 (2H, s a). EMBR: ion +ve 278 [M + H].
Etapa F
Éster bencílico del ácido [4-metil-5-oxo-1-(4-trifluorometilbencenosulfonil)-[1,4]diazepan-6-S- il]carbámico
Éster bencílico del ácido (1-metil-7-oxo-[1,4]diazepan-6S-il)carbámico (0,12 g, 0,43 mmoles) se diluyó en diclorometano seco (5 ml) y se enfrió en un baño de hielo. Se añadió trietilamina (60 \mul, 0,43 mmoles) y se añadió cloruro de 4-trifluorometilbencenoaulfonilo (105 mg, 0,43 mmoles) a la solución agitada y la agitación se continuó durante 5 horas. la mezcla de reacción se lavó con agua (5 ml), se secó sobre sulfato de magnesio anhidro y se concentró a presión reducida para proporcionar un sólido blanco (200 mg, 95%) ^{1}H-RMN: \delta (CDCl_{3}): 8,02 (2H, d, J = 8,0 Hz), 7,80 (2H, d, J = 8,0 Hz), 7,37 (5H, s), 6,22 (1H, m), 5,17 (2H, m), 4,53 (1H, m), 4,25 (1H, m), 4,03 (1H, m), 3,63 (1H, m), 3,32 (1H, m), 3,01 (3H, s), 2,82-2,60 (2H, m).
Etapa G
Bromhidrato de 6S-amino-4-metil-1-(4-trifluorometilbencenosulfonil)-[1,4]diazepan-5-ona
A una solución enfriada (0º) del éster bencílico del ácido [4-metil-5-oxo-1-(4-trifluorometilbencenosulfonil)-[1,4]diazepan-6-S- il]carbámico (160 mg, 0,33 mmoles) en ácido acético (2 ml), se añadió bromuro de hidrógeno (45% en ácido acético, 2 ml). La mezcla de reacción se agitó durante 3 horas a temperatura ambiente y se añadieron 5 l de éter dietílico para producir una cristalización. El cristal blanco se retiró por filtración (0,14 g, 99%). ^{1}H-RMN: \delta (CD_{3}OD) 8,01 (4H, m), 4,48 (1H, m), 4,08-3,78 (3H, m), 3,57 (1H, m), 3,10-2,92 (5H, m). EMBR: ion +ve 352 [M + H].
Etapa H
[4-metil-5-oxo-1-(4-trifluorometilbencenosulfonil)-[1,4]diazepan- 6S-il]amida del ácido 2R-[(benziloxiformi- lamino)metil]hexanoico
A una solución de 2R-[(benciloxiformilamino)metil]hexil pentafluorofenil éster (107 mg, 0,24 mmoles) en DMF (6 ml) se añadieron bromhidrato de 6S-amino-4-metil-1-(4-trifluorometilbencenosulfonil)-[1,4]diazepan-5-ona (125 mg, 0,29 mmoles) y trietilamina (66 \mul, 0,48 mmoles). La mezcla de reacción se agitó a temperatura ambiente durante 14 horas. El disolvente se retiró a presión reducida y el residuo se disolvió en diclorometano. El bromhidrato de trietilamina se retiró por filtración, y la fase orgánica se concentró a vacío. El residuo se recogió en metanol (10 ml). El exceso de pentafluorofenol y amina se retiraron usando resinas depuradoras, resina A-26 carbonato (carga de 3,5 mmoles, 0,2 g, 0,72 mmoles) y resina de metilisocianato poliestireno (carga de 1,2 mmoles, 1,0 g, 1,2 mmoles) respectivamente. Una purificación a través de cromatografía ultra-rápida (diclorometano-metanol 99:1) proporcionó el compuesto del título puro (100 mg, 68%). ^{1}H-RMN: \delta (CDCl_{3}, rotámeros) 8,07 (3H, m), 7,81 (2H, m), 7,38 (5H, s a), 7,01 (1H, s a), 5,01-4,68 (2H, m), 4,18 (1H, m), 3,89-3,48 (4H, m), 3,28 (1H, m), 3,01-2,88 (5H, m), 2,64-2,17 (2H, m), 1,74-1,25 (6H, m), 0,85 (3H, t, J = 6,8 Hz). EMBR: ion +ve 635 [M + Na].
Etapa I
[4-metil-5-oxo-1-(4-trifluorometilbencenosulfonil)-[1,4]diazepan-6S-il]amida del ácido 2R-[(formilhidroxiamino)metil]hexanoico
[4-Metil-5-oxo-1-(4-trifluorometilbencenosulfonil)-[1,4]diazepan-6S-il]amida del ácido 2R-[(benciloxiformila-
mino)metil]hexanoico (100 mg, 0,16 mmoles) se disolvió en etanol (10 ml) y se colocó en una atmósfera de argón. Se añadió paladio sobre carbón (10 mg, 10% de peso) y la mezcla de reacción se agitó vigorosamente mientras se burbujeaba gas hidrógeno durante 45 minutos. Después la mezcla de reacción se agitó durante 12 horas en una atmósfera de hidrógeno. El matraz se purgó con argón antes de retirar el catalizador mediante filtración. El filtrado se concentró a presión reducida para proporcionar el compuesto del título en forma de un aceite incoloro (75 mg, 88%). ^{1}H-RMN: \delta (CDCl_{3}, rotámeros), 8,39 (0,25H, s), 8,04 (2H, d, J = 8,2 Hz), 7,91 (0,75H, s), 7,82 (2H, d, J = 8,1 Hz), 4,73 (1H, m), 3,87 (2H, m), 3,51 (1H, m), 3,32 (1H, m), 3,02 (3H, m), 2,87 (1H, m), 2,75 (1H, m), 1,84-1,23 (6H, m), 0,87 (3H, t, J = 6,8 Hz). ^{13}C-RMN: \delta (CDCl_{3}, rotámeros) 172,9, 170,7, 141,0, 128,5, 128,3, 127,0, 126,9, 52,9, 52,5, 50,2, 48,9, 47,3, 45,2, 36,9, 29,8, 29,7, 23,0 y 14,2. EMBR: ion +ve 545 [M + H].

Claims (6)

1. El uso de un compuesto de fórmula (I) o una sal, hidrato o solvato farmacéutica o veterinariamente aceptable del mismo en la preparación de una composición para tratamiento de infecciones bacterianas en mamíferos humanos y no humanos
25
en la que
R_{1} representa hidrógeno, metilo, o trifluorometilo;
R_{2} representa un grupo R_{10}-(Xn)-(ALK)- en el que
R_{10} representa hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, alquenilo C_{2}-C_{6}, alquinilo C_{2}-C_{6}, cicloalquilo, arilo, o heterociclilo, cualquiera de los cuales puede estar no sustituido o sustituido con alquilo C_{1}-C_{6}, alcoxi C_{1}-C_{6}, hidroxi, mercapto, alquiltio C_{1}-C_{6}, amino, halo (incluyendo fluoro, cloro, bromo y yodo), trifluorometilo, ciano, nitro, -COOH, -CONH_{2}, -COOR^{A}, -NHCOR^{A}, -CONHR^{A}, -NHR^{A}, -NR^{A}R^{B}, o -CONR^{A}R^{B} en los que R^{A}y R^{B} son independientemente un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, y
ALK representa un radical alquileno C_{1}-C_{6}, alquenileno C_{2}-C_{6}, alquinileno C_{2}-C_{6}, divalente lineal o ramificado, y se puede interrumpir con uno o más enlaces -NH-, -O- o -S- no adyacentes,
X representa -NH-, -O- o -S-, y
n es 0 ó 1; y
R_{3} y R_{4}, tomados juntos con los átomos de carbono al que están unidos respectivamente, forman (i) un anillo carbocíclico o heterocíclico saturado de 5 a 8 átomos, opcionalmente sustituido con hasta cuatro sustituyentes, independientemente seleccionados entre alquilo C_{1}-C_{6}, bencilo, alcoxi C_{1}-C_{6}, fenoxi, hidroxi, mercapto, alquiltio C_{1}-C_{6}, amino, halo (incluyendo fluoro, cloro, bromo y yodo), trifluorometilo, nitro, -COOH-, -CONH_{2}, -COR^{A}, -COOR^{A}, -NHCOR^{A}, -CONHR^{A}, -NHR^{A}, -NR^{A}R^{B}, o -CONR^{A}R^{B} en los que R^{A}y R^{B} son independientemente un grupo alquilo (C_{1}-C_{6}) o (ii) un anillo de fórmula (iii):
26
en la que R_{8} es hidrógeno o un grupo alquilo C_{1}-C_{4}, cicloalquilo, fenilo o bencilo, y R_{9} es hidrógeno o un grupo alquilo C_{1}-C_{4}, fenilo o bencilo, o R_{8} y R_{9} tomados juntos representan un radical -(CH_{2})_{p}- divalente en el que p es 3 ó 4.
2. El uso según la reivindicación 1 en la que R_{1} es hidrógeno.
3. El uso según la reivindicación 1 ó la reivindicación 2 en el que R_{2} es
alquilo C_{1}-C_{6}, alquenilo C_{3} - C_{6} o alquinilo C_{3}-C_{6};
fenil (alquil C_{1}-C_{6})-, fenil (alquenil C_{3}-C_{6})- o fenil (alquinil C_{3}-C_{6})- opcionalmente sustituido en el anillo fenilo;
cicloalquil (alquil C_{1}-C_{6})-, cicloalquil (alquenil C_{3}-C_{6})- o cicloalquil (alquinil C_{3}-C_{6})- opcionalmente sustituido en el anillo fenilo;
heterociclil (alquil C_{1}-C_{6})-, heterociclil (alquenil C_{3}-C_{6})- o heterociclil (alquinil C_{3}-C_{6})- opcionalmente sustituido en el anillo heterociclilo; o
4-fenilfenil (alquil C_{1}-C_{6})-, 4-fenilfenil (alquenil C_{3}-C_{6})-, 4-fenilfenil (alquinil C_{3}-C_{6})-, 4-heteroarilfenil (alquil C_{1}-C_{6})-, 4-heteroarilfenil (alquenil C_{3}-C_{6})-, 4-heteroarilfenil (alquinil C_{3}-C_{6})-, opcionalmente sustituidos en el anillo fenilo ó heteroarilo terminal.
4. El uso según la reivindicación 1 o reivindicación 2 en el que R_{2} es metilo, etilo, n- e iso-propilo, n- e iso-butilo, n-pentilo, iso-pentilo, 3-metilbut-ilo, n-hexilo, n-heptilo, n-acetilo, n-octilo, metilsulfaniletilo, etilsulfanilmetilo, 2-metoxietilo, 2-etoxietilo, 2-etoximetilo, 3-hidrxipropilo, alilo, 3-fenilprop-2-en-1-ilo, prop-2-in-1-ilo, 3-fenilprop-2-in-1-ilo, 3-(2-clorofenil)prop-2-in-ilo, but-2-in-ilo, ciclopentilo, ciclohexilo, ciclopentilmetilo, ciclopentiletilo, ciclopentilpropilo, ciclohexilmetilo, ciclohexiletilo, ciclohexilpropilo, furan-2-ilmetilo, furan-3-metilo, tetrahidrofuran-2-ilmetilo, tetrahidrofuran-2-ilmetilo, piperidinilmetilo, fenilpropilo, 4-clorofenilpropilo, 4-metilfenilpropilo, 4-metoxifenilpropilo, bencilo, 4-clorobencilo, 4-metilbencilo, o 4-metoxibencilo.
5. El uso según la reivindicación 1 o reivindicación 2 en el que R_{2} es n-propilo, n-butilo, n-pentilo, bencilo o ciclopentilmetilo.
6. El uso o procedimiento según la reivindicación 1 en el que el anillo formado por R_{3} y R_{4}, es de la fórmula (II) en la que R_{8} es hidrógeno, metilo, etilo, n-propilo, ciclopentilo, fenilo o bencilo, y R_{9} es hidrógeno, isobutilo, fenilo o bencilo.
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