CN1169954C - 编码具有抑制癌细胞生长功能的人蛋白的多核苷酸 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一类新的具有抑癌功能的人蛋白,编码此多肽的多核苷酸和经重组技术产生该多肽的方法。本发明还公开了此多肽用于治疗多种疾病如癌症等的方法。本发明还公开了抗此多肽的拮抗剂及其治疗作用。本发明还公开了编码这类新的具有抑癌功能的人蛋白的多核苷酸的用途。
Description
本发明属于生物技术领域,具体地说,本发明涉及新的编码具有抑癌功能的人蛋白的多核苷酸,以及此多核苷酸编码的多肽。本发明还涉及此多核苷酸和多肽的用途和制备。
人基因组学研究目前是国际上的热点,除人染色体DNA大规模测序,表达序列测序(EST)的方法外,还缺少从功能开始的筛选具有功能基因的高通量的方法。
癌症是危害人类健康的主要疾病之一。为了有效地治疗和预防肿瘤,目前人们已越来越关注肿瘤的基因治疗。因此,本领域迫切需要开发研究具有抑癌功能的人蛋白及其激动剂/抑制剂。
本发明的目的是提供一类新的具有抑癌功能的人蛋白多肽以及其片段、类似物和衍生物。
本发明的另一目的是提供编码这些多肽的多核苷酸。
本发明的另一目的是提供生产这些多肽的方法以及该多肽和编码序列的用途。
在本发明的第一方面,提供新颖的分离出的具有抑癌功能的蛋白多肽,它包含具有选自下组的氨基酸序列的多肽:SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:8、SEQ IDNO:11、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:26;或其保守性变异多肽、或其活性片段、或其活性衍生物。
较佳地,该多肽是具有选自下组的氨基酸序列的多肽;SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:20、SEQ IDNO:23、SEQ ID NO:26。
在本发明的第二方面,提供了一种分离的多核苷酸,它包含一核苷酸序列,该核苷酸序列与选自下组的一种核苷酸序列有至少85%相同性:(a)编码上述的具有抑癌功能的蛋白多肽的多核苷酸;(b)与多核苷酸(a)互补的多核苷酸。较佳地,该多核苷酸编码的多肽具有选自下组的氨基酸序列:SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:8、SEQ IDNO:11、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:26。更佳地,该多核苷酸的序列选自下组:SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:9、SEQID NO:12、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:18、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:27的编码区序列或全长序列。
在本发明的第三方面,提供了含有上述多核苷酸的载体,以及被该载体转化或转导的宿主细胞或者被上述多核苷酸直接转化或转导的宿主细胞。
在本发明的第四方面,提供了制备具有具有抑癌功能的蛋白活性的多肽的制备方法,该方法包含:(a)在适合表达具有抑癌功能的蛋白的条件下,培养上述被转化或转导的宿主细胞;(b)从培养物中分离出具有具有抑癌功能的蛋白活性的多肽。
在本发明的第五方面,提供了与上述的具有抑癌功能的蛋白多肽特异性结合的抗体。还提供了可用于检测的核酸分子,它含有上述的多核苷酸中连续的10-800个核苷酸。
在本发明的第六方面,提供了一种药物组合物,它含有安全有效量的本发明的具有抑癌功能的蛋白多肽以及药学上可接受的载体。这些药物组合物可治疗癌症以及细胞异常增殖等病症。
本发明的其它方面由于本文的技术的公开,对本领域的技术人员而言是显而易见的。
本发明采用大规模cDNA克隆转染癌细胞,在获得具有抑癌作用的基础上,经测序证明为新的基因,进一步得到全长cDNA克隆。DNA转染试验证明,本发明的具有抑癌功能的蛋白对癌细胞(肝癌细胞)具有抑制克隆形成的作用,其抑制率在50%或50%以上。
如本文所用,“分离的”是指物质从其原始环境中分离出来(如果是天然的物质,原始环境即是天然环境)。如活体细胞内的天然状态下的多聚核苷酸和多肽是没有分离纯化的,但同样的多聚核苷酸或多肽如从天然状态中同存在的其他物质中分开,则为分离纯化的。
如本文所用,“分离的具有抑癌功能的蛋白或多肽”是指具有抑癌功能的蛋白多肽基本上不含天然与其相关的其它蛋白、脂类、糖类或其它物质。本领域的技术人员能用标准的蛋白质纯化技术纯化具有抑癌功能的蛋白。基本上纯的多肽在非还原聚丙烯酰胺凝胶上能产生单一的主带。具有抑癌功能的蛋白多肽的纯度能用氨基酸序列分析。
本发明的多肽可以是重组多肽、天然多肽、合成多肽,优选重组多肽。本发明的多肽可以是天然纯化的产物,或是化学合成的产物,或使用重组技术从原核或真核宿主(例如,细菌、酵母、高等植物、昆虫和哺乳动物细胞)中产生。根据重组生产方案所用的宿主,本发明的多肽可以是糖基化的,或可以是非糖基化的。本发明的多肽还可包括或不包括起始的甲硫氨酸残基。
本发明还包括具有抑癌功能的人蛋白的片段、衍生物和类似物。如本文所用,术语“片段”、“衍生物”和“类似物”是指基本上保持本发明的天然具有抑癌功能的人蛋白相同的生物学功能或活性的多肽。本发明的多肽片段、衍生物或类似物可以是(i)有一个或多个保守或非保守性氨基酸残基(优选保守性氨基酸残基)被取代的多肽,而这样的取代的氨基酸残基可以是也可以不是由遗传密码编码的,或(ii)在一个或多个氨基酸残基中具有取代基团的多肽,或(iii)成熟多肽与另一个化合物(比如延长多肽半衰期的化合物,例如聚乙二醇)融合所形成的多肽,或(iv)附加的氨基酸序列融合到此多肽序列而形成的多肽(如前导序列或分泌序列或用来纯化此多肽的序列或蛋白原序列)。根据本文的教导,这些片段、衍生物和类似物属于本领域熟练技术人员公知的范围。
本发明的多核苷酸可以是DNA形式或RNA形式。DNA形式包括cDNA、基因组DNA或人工合成的DNA。DNA可以是单链的或是双链的。DNA可以是编码链或非编码链。以PP6蛋白(在本申请中,蛋白质的命名采用其克隆编号)(在本申请中,蛋白质的命名采用其克隆编号)为例,编码成熟多肽的编码区序列可以与SEQ ID NO:3所示的编码区序列相同或者是简并的变异体。如本文所用,“简并的变异体”在本发明中是指编码具有SEQ ID NO:2的蛋白质,但与SEQ ID NO:3所示的编码区序列有差别的核酸序列。以PP208蛋白(在本申请中,蛋白质的命名采用其克隆编号)(在本申请中,蛋白质的命名采用其克隆编号)为例,编码成熟多肽的编码区序列可以与SEQ ID NO:6所示的编码区序列相同或者是简并的变异体。如本文所用,“简并的变异体”在本发明中是指编码具有SEQ ID NO:5的蛋白质,但与SEQ ID NO:6所示的编码区序列有差别的核酸序列。对于其他具有抑癌功能的蛋白,可依此类推。对于其他具有抑癌功能的蛋白,可依此类推。
编码成熟多肽的多核苷酸包括:只编码成熟多肽的编码序列;成熟多肽的编码序列和各种附加编码序列;成熟多肽的编码序列(和任选的附加编码序列)以及非编码序列。
术语“编码多肽的多核苷酸”可以是包括编码此多肽的多核苷酸,也可以是还包括附加编码和/或非编码序列的多核苷酸。
本发明还涉及上述多核苷酸的变异体,其编码与本发明有相同的氨基酸序列的多肽或多肽的片段、类似物和衍生物。此多核苷酸的变异体可以是天然发生的等位变异体或非天然发生的变异体。这些核苷酸变异体包括取代变异体、缺失变异体和***变异体。如本领域所知的,等位变异体是一个多核苷酸的替换形式,它可能是一个或多个核苷酸的取代、缺失或***,但不会从实质上改变其编码的多肽的功能。
本发明还涉及与上述的序列杂交且两个序列之间具有至少50%,较佳地至少70%,更佳地至少80%相同性的多核苷酸。本发明特别涉及在严格条件下与本发明所述多核苷酸可杂交的多核苷酸。在本发明中,“严格条件”是指:(1)在较低离子强度和较高温度下的杂交和洗脱,如0.2×SSC,0.1%SDS,60℃;或(2)杂交时加有变性剂,如50%(v/v)甲酰胺,0.1%小牛血清/0.1%Ficoll,42℃等;或(3)仅在两条序列之间的相同性至少在95%以上,更好是97%以上时才发生杂交。并且,可杂交的多核苷酸编码的多肽与SEQ IDNO:2所示的成熟多肽有相同的生物学功能和活性。
本发明还涉及与上述的序列杂交的核酸片段。如本文所用,“核酸片段”的长度至少含15个核苷酸,较好是至少30个核苷酸,更好是至少50个核苷酸,最好是至少100个核苷酸以上。核酸片段可用于核酸的扩增技术(如PCR)以确定和/或分离编码具有抑癌功能的蛋白的多聚核苷酸。
本发明中的多肽和多核苷酸优选以分离的形式提供,更佳地被纯化至均质。
本发明的DNA序列能用几种方法获得。例如,用本领域熟知的杂交技术分离DNA。这些技术包括但不局限于:1)用探针与基因组或cDNA文库杂交以检出同源性核苷酸序列,和2)表达文库的抗体筛选以检出具有共同结构特征的克隆的DNA片段。
编码具有抑癌功能的蛋白的特异DNA片段序列产生也能用下列方法获得:1)从基因组DNA分离双链DNA序列;2)化学合成DNA序列以获得所需多肽的双链DNA。
上述提到的方法中,分离基因组DNA最不常用。当需要的多肽产物的整个氨基酸序列已知时,DNA序列的直接化学合成是经常选用的方法。如果所需的氨基酸的整个序列不清楚时,DNA序列的直接化学合成是不可能的,选用的方法是cDNA序列的分离。分离感兴趣的cDNA的标准方法是从高表达该基因的供体细胞分离mRNA并进行逆转录,形成质粒或噬菌体cDNA文库。提取mRNA的方法已有多种成熟的技术,试剂盒也可从商业途径获得(Qiagene)。而构建cDNA文库也是通常的方法(Sambrook,et al.,Molecular Cloning,A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Laboratory.New York,1989)。还可得到商业供应的cDNA文库,如Clontech公司的不同cDNA文库。当结合使用聚合酶反应技术时,即使极少的表达产物也能克隆。
可用常规方法从这些cDNA文库中筛选本发明的基因。这些方法包括(但不限于):(1)DNA-DNA或DNA-RNA杂交;(2)标志基因的功能出现或丧失;(3)测定具有抑癌功能的蛋白的转录本的水平;(4)通过免疫学技术或测定生物学活性,来检测基因表达的蛋白产物。上述方法可单用,也可多种方法联合应用。
在第(1)种方法中,杂交所用的探针是与本发明的多核苷酸的任何一部分同源,其长度至少15个核苷酸,较好是至少30个核苷酸,更好是至少50个核苷酸,最好是至少100个核苷酸。此外,探针的长度通常在2kb之内,较佳地为1kb之内。此处所用的探针通常是在本发明的基因DNA序列信息的基础上化学合成的DNA序列。本发明的基因本身或者片段当然可以用作探针。DNA探针的标记可用放射性同位素,荧光素或酶(如碱性磷酸酶)等。
在第(4)种方法中,检测具有抑癌功能的蛋白基因表达的蛋白产物可用免疫学技术如Western印迹法,放射免疫沉淀法,酶联免疫吸附法(ELISA)等。
应用PCR技术扩增DNA/RNA的方法(Saiki,et al.Science 1985;230:1350-1354)被优选用于获得本发明的基因。特别是很难从文库中得到全长的cDNA时,可优选使用RACE法(RACE-cDNA末端快速扩增法),用于PCR的引物可根据本文所公开的本发明的序列信息适当地选择,并可用常规方法合成。可用常规方法如通过凝胶电泳分离和纯化扩增的DNA/RNA片段。
如上所述得到的本发明的基因,或者各种DNA片段等的核苷酸序列的测定可用常规方法如双脱氧链终止法(Sanger et al.PNAS,1977,74:5463-5467)。这类核苷酸序列测定也可用商业测序试剂盒等。为了获得全长的cDNA序列,测序需反复进行。有时需要测定多个克隆的cDNA序列,才能拼接成全长的cDNA序列。
本发明也涉及包含本发明的多核苷酸的载体,以及用本发明的载体或具有抑癌功能的蛋白编码序列经基因工程产生的宿主细胞,以及经重组技术产生本发明所述多肽的方法。
通过常规的重组DNA技术,可利用本发明的多聚核苷酸序列可用来表达或生产重组的具有抑癌功能的蛋白多肽(Science,1984;224:1431)。一般来说有以下步骤:
(1).用本发明的编码具有抑癌功能的人蛋白的多核苷酸(或变异体),或用含有该多核苷酸的重组表达载体转化或转导合适的宿主细胞;
(2).在合适的培养基中培养的宿主细胞;
(3).从培养基或细胞中分离、纯化蛋白质。
本发明中,具有抑癌功能的人蛋白多核苷酸序列可***到重组表达载体中。术语“重组表达载体”指本领域熟知的细菌质粒、噬菌体、酵母质粒、植物细胞病毒、哺乳动物细胞病毒如腺病毒、逆转录病毒或其他载体。在本发明中适用的载体包括但不限于:在细菌中表达的基于T7的表达载体(Rosenberg,et al.Gene,1987,56:125);在哺乳动物细胞中表达的pMSXND表达载体(Lee and Nathans,J Bio Chem.263:3521,1988)和在昆虫细胞中表达的来源于杆状病毒的载体。总之,只要能在宿主体内复制和稳定,任何质粒和载体都可以用。表达载体的一个重要特征是通常含有复制起点、启动子、标记基因和翻译控制元件。
本领域的技术人员熟知的方法能用于构建含具有抑癌功能的人蛋白编码DNA序列和合适的转录/翻译控制信号的表达载体。这些方法包括体外重组DNA技术、DNA合成技术、体内重组技术等(Sambroook,et al.Molecular Cloning,a Laboratory Manual,coldSpring Harbor Laboratory.New York,1989)。所述的DNA序列可有效连接到表达载体中的适当启动子上,以指导mRNA合成。这些启动子的代表性例子有:大肠杆菌的lac或trp启动子;λ噬菌体PL启动子;真核启动子包括CMV立即早期启动子、HSV胸苷激酶启动子、早期和晚期SV40启动子、反转录病毒的LTRs和其他一些已知的可控制基因在原核或真核细胞或其病毒中表达的启动子。表达载体还包括翻译起始用的核糖体结合位点和转录终止子。
此外,表达载体优选地包含一个或多个选择性标记基因,以提供用于选择转化的宿主细胞的表型性状,如真核细胞培养用的二氢叶酸还原酶、新霉素抗性以及绿色荧光蛋白(GFP),或用于大肠杆菌的四环素或氨苄青霉素抗性。
包含上述的适当DNA序列以及适当启动子或者控制序列的载体,可以用于转化适当的宿主细胞,以使其能够表达蛋白质。
宿主细胞可以是原核细胞,如细菌细胞;或是低等真核细胞,如酵母细胞;或是高等真核细胞,如哺乳动物细胞。代表性例子有:大肠杆菌,链霉菌属;鼠伤寒沙门氏菌的细菌细胞;真菌细胞如酵母;植物细胞;果蝇S2或Sf9的昆虫细胞;CHO、COS或Bowes黑素瘤细胞的动物细胞等。
本发明的多核苷酸在高等真核细胞中表达时,如果在载体中***增强子序列时将会使转录得到增强。增强子是DNA的顺式作用因子,通常大约有10到300个碱基对,作用于启动子以增强基因的转录。可举的例子包括在复制起始点晚期一侧的100到270个碱基对的SV40增强子、在复制起始点晚期一侧的多瘤增强子以及腺病毒增强子等。
本领域一般技术人员都清楚如何选择适当的载体、启动子、增强子和宿主细胞。
用重组DNA转化宿主细胞可用本领域技术人员熟知的常规技术进行。当宿主为原核生物如大肠杆菌时,能吸收DNA的感受态细胞可在指数生长期后收获,用CaCl2法处理,所用的步骤在本领域众所周知。可供选择的是用MgCl2。如果需要,转化也可用电穿孔的方法进行。当宿主是真核生物,可选用如下的DNA转染方法:磷酸钙共沉淀法,常规机械方法如显微注射、电穿孔、脂质体包装等。
获得的转化子可以用常规方法培养,表达本发明的基因所编码的多肽。根据所用的宿主细胞,培养中所用的培养基可选自各种常规培养基。在适于宿主细胞生长的条件下进行培养。当宿主细胞生长到适当的细胞密度后,用合适的方法(如温度转换或化学诱导)诱导选择的启动子,将细胞再培养一段时间。
在上面的方法中的重组多肽可包被于细胞内、细胞外或在细胞膜上表达或分泌到细胞外。如果需要,可利用其物理的、化学的和其它特性通过各种分离方法分离和纯化重组的蛋白。这些方法是本领域技术人员所熟知的。这些方法的例子包括但并不限于:常规的复性处理、用蛋白沉淀剂处理(盐析方法)、离心、渗透破菌、超处理、超离心、分子筛层析(凝胶过滤)、吸附层析、离子交换层析、高效液相层析(HPLC)和其它各种液相层析技术及这些方法的结合。
重组的具有抑癌功能的人蛋白或多肽有多方面的用途。这些用途包括(但不限于):直接做为药物治疗具有抑癌功能的蛋白功能低下或丧失所致的疾病,和用于筛选促进或对抗具有抑癌功能的蛋白功能的抗体、多肽或其它配体。例如,抗体可用于激活或抑制具有抑癌功能的人蛋白的功能。用表达的重组具有抑癌功能的人蛋白筛选多肽库可用于寻找有治疗价值的能抑制或刺激具有抑癌功能的人蛋白功能的多肽分子。
本发明也提供了筛选药物以鉴定提高(激动剂)或阻遏(拮抗剂)具有抑癌功能的人蛋白的药剂的方法。激动剂提高具有抑癌功能的人蛋白刺激细胞增殖等生物功能,而拮抗剂阻止和治疗与细胞过度增殖有关的紊乱如各种癌症。例如,能在药物的存在下,将哺乳动物细胞或表达具有抑癌功能的人蛋白的膜制剂与标记的具有抑癌功能的人蛋白一起培养。然后测定药物提高或阻遏此相互作用的能力。
具有抑癌功能的人蛋白的拮抗剂包括筛选出的抗体、化合物、受体缺失物和类似物等。具有抑癌功能的人蛋白的拮抗剂可以与具有抑癌功能的人蛋白结合并消除其功能,或是抑制具有抑癌功能的人蛋白的产生,或是与多肽的活性位点结合使多肽不能发挥生物学功能。具有抑癌功能的人蛋白的拮抗剂可用于治疗用途。
在筛选作为拮抗剂的化合物时,可以将具有抑癌功能的蛋白加入生物分析测定中,通过测定化合物影响具有抑癌功能的蛋白和其受体之间的相互作用来确定化合物是否是拮抗剂。用上述筛选化合物的同样方法,可以筛选出起拮抗剂作用的受体缺失物和类似物。
本发明的多肽可直接用于疾病治疗,例如,各种恶性肿瘤、和细胞异常增殖等。
本发明的多肽,及其片段、衍生物、类似物或它们的细胞可以用来作为抗原以生产抗体。这些抗体可以是多克隆或单克隆抗体。多克隆抗体可以通过将此多肽直接注射动物的方法得到。制备单克隆抗体的技术包括杂交瘤技术,三瘤技术,人B-细胞杂交瘤技术,EBV-杂交瘤技术等。
可以将本发明的多肽和拮抗剂与合适的药物载体组合后使用。这些载体可以是水、葡萄糖、乙醇、盐类、缓冲液、甘油以及它们的组合。组合物包含安全有效量的多肽或拮抗剂以及不影响药物效果的载体和赋形剂。这些组合物可以作为药物用于疾病治疗。
本发明还提供含有一种或多种容器的药盒或试剂盒,容器中装有一种或多种本发明的药用组合物成分。与这些容器一起,可以有由制造、使用或销售药品或生物制品的政府管理机构所给出的指示性提示,该提示反映出生产、使用或销售的政府管理机构许可其在人体上施用。此外,本发明的多肽可以与其它的治疗化合物结合使用。
药物组合物可以以方便的方式给药,如通过局部、静脉内、腹膜内、肌内、皮下、鼻内或皮内的给药途径。具有抑癌功能的蛋白以有效地治疗和/或预防具体的适应症的量来给药。施用于患者的具有抑癌功能的蛋白的量和剂量范围将取决于许多因素,如给药方式、待治疗者的健康条件和诊断医生的判断。
具有抑癌功能的人蛋白的多聚核苷酸也可用于多种治疗目的。基因治疗技术可用于治疗由于具有抑癌功能的蛋白的无表达或异常/无活性的具有抑癌功能的蛋白的表达所致的细胞增殖、发育或代谢异常。重组的基因治疗载体(如病毒载体)可设计成表达变异的具有抑癌功能的蛋白,以抑制内源性的具有抑癌功能的蛋白活性。例如,一种变异的具有抑癌功能的蛋白可以是缩短的、缺失了信号传导功能域的具有抑癌功能的蛋白,虽可与下游的底物结合,但缺乏信号传导活性。因此重组的基因治疗载体可用于治疗具有抑癌功能的蛋白表达或活性异常所致的疾病。来源于病毒的表达载体如逆转录病毒、腺病毒、腺病毒相关病毒、单纯疱疹病毒、细小病毒等可用于将具有抑癌功能的蛋白基因转移至细胞内。构建携带具有抑癌功能的蛋白基因的重组病毒载体的方法可见于已有文献(Sambrook,et al.)。另外重组具有抑癌功能的人蛋白基因可包装到脂质体中转移至细胞内。
抑制具有抑癌功能的人蛋白mRNA的寡聚核苷酸(包括反义RNA和DNA)以及核酶也在本发明的范围之内。核酶是一种能特异性分解特定RNA的酶样RNA分子,其作用机制是核酶分子与互补的靶RNA特异性杂交后进行核酸内切作用。反义的RNA和DNA及核酶可用已有的任何RNA或DNA合成技术获得,如固相磷酸酰胺化学合成法合成寡核苷酸的技术已广泛应用。反义RNA分子可通过编码该RNA的DNA序列在体外或体内转录获得。这种DNA序列已整合到载体的RNA聚合酶启动子的下游。为了增加核酸分子的稳定性,可用多种方法对其进行修饰,如增加两侧的序列长度,核糖核苷之间的连接应用磷酸硫酯键或肽键而非磷酸二酯键。
多聚核苷酸导入组织或细胞内的方法包括:将多聚核苷酸直接注入到体内组织中;或在体外通过载体(如病毒、噬菌体或质粒等)先将多聚核苷酸导入细胞中,再将细胞移植到体内等。
本发明的多肽还可用作肽谱分析,例如,多肽可用物理的、化学或酶进行特异性切割,并进行一维或二维或三维的凝胶电泳分析。
本发明还提供了针对具有抑癌功能的人蛋白抗原决定簇的抗体。这些抗体包括(但不限于);多克隆抗体、单克隆抗体、嵌合抗体、单链抗体、Fab片段和Fab表达文库产生的片段。
抗具有抑癌功能的人蛋白的抗体可用于免疫组织化学技术中,检测活检标本中的具有抑癌功能的人蛋白。
与具有抑癌功能的人蛋白结合的单克隆抗体也可用放射性同位素标记,注入体内可跟踪其位置和分布。这种放射性标记的抗体可作为一种非创伤性诊断方法用于肿瘤细胞的定位和判断是否有转移。
本发明中的抗体可用于治疗或预防与具有抑癌功能的人蛋白相关的疾病。给予适当剂量的抗体可以刺激或阻断具有抑癌功能的人蛋白的产生或活性。
抗体也可用于设计针对体内某一特殊部位的免疫毒素。如具有抑癌功能的人蛋白高亲和性的单克隆抗体可与细菌或植物毒素(如白喉毒素,蓖麻蛋白,红豆碱等)共价结合。一种通常的方法是用巯基交联剂如SPDP,攻击抗体的氨基,通过二硫键的交换,将毒素结合于抗体上,这种杂交抗体可用于杀灭具有抑癌功能的人蛋白阳性的细胞。
多克隆抗体的生产可用具有抑癌功能的人蛋白或多肽免疫动物,如家兔,小鼠,大鼠等。多种佐剂可用于增强免疫反应,包括但不限于弗氏佐剂等。
具有抑癌功能的人蛋白单克隆抗体可用杂交瘤技术生产(Kohler and Milstein.Nature,1975,256:495-497)。将人恒定区和非人源的可变区结合的嵌合抗体可用已有的技术生产(Morrison et al,PNAS,1985,81:6851)。而已有的生产单链抗体的技术(U.S.PatNo.4946778)也可用于生产抗具有抑癌功能的人蛋白的单链抗体。
能与具有抑癌功能的人蛋白结合的多肽分子可通过筛选由各种可能组合的氨基酸结合于固相物组成的随机多肽库而获得。筛选时,必须对具有抑癌功能的人蛋白分子进行标记。
本发明还涉及定量和定位检测具有抑癌功能的人蛋白水平的诊断试验方法。这些试验是本领域所熟知的,且包括FISH测定和放射免疫测定。试验中所检测的具有抑癌功能的人蛋白水平,可以用作解释具有抑癌功能的人蛋白在各种疾病中的重要性和用于诊断具有抑癌功能的蛋白起作用的疾病。
具有抑癌功能的蛋白的多聚核苷酸可用于具有抑癌功能的蛋白相关疾病的诊断和治疗。在诊断方面,具有抑癌功能的蛋白的多聚核苷酸可用于检测具有抑癌功能的蛋白的表达与否或在疾病状态下具有抑癌功能的蛋白的异常表达。如具有抑癌功能的蛋白DNA序列可用于对活检标本的杂交以判断具有抑癌功能的蛋白的表达异常。杂交技术包括Southern印迹法,Northern印迹法、原位杂交等。这些技术方法都是公开的成熟技术,相关的试剂盒都可从商业途径得到。本发明的多核苷酸的一部分或全部可作为探针固定在微阵列(Microarray)或DNA芯片(又称为“基因芯片”)上,用于分析组织中基因的差异表达分析和基因诊断。用具有抑癌功能的蛋白特异的引物进行RNA-聚合酶链反应(RT-PCR)体外扩增也可检测具有抑癌功能的蛋白的转录产物。
检测具有抑癌功能的蛋白基因的突变也可用于诊断具有抑癌功能的蛋白相关的疾病。具有抑癌功能的蛋白突变的形式包括与正常野生型具有抑癌功能的蛋白DNA序列相比的点突变、易位、缺失、重组和其它任何异常等。可用已有的技术如Southern印迹法、DNA序列分析、PCR和原位杂交检测突变。另外,突变有可能影响蛋白的表达,因此用Northern印迹法、Western印迹法可间接判断基因有无突变。
本发明的序列对染色体鉴定也是有价值的。该序列会特异性地针对某条人染色体具***置且并可以与其杂交。目前,需要鉴定染色体上的各基因的具***点。现在,只有很少的基于实际序列数据(重复多态性)的染色体标记物可用于标记染色***置。根据本发明,为了将这些序列与疾病相关基因相关联,其重要的第一步就是将这些DNA序列定位于染色体上。
简而言之,根据cDNA制备PCR引物(优选15-35bp),可以将序列定位于染色体上。然后,将这些引物用于PCR筛选含各条人染色体的体细胞杂合细胞。只有那些含有相应于引物的人基因的杂合细胞会产生扩增的片段。
体细胞杂合细胞的PCR定位法,是将DNA定位到具体染色体的快捷方法。使用本发明的的寡核苷酸引物,通过类似方法,可利用一组来自特定染色体的片段或大量基因组克隆而实现亚定位。可用于染色体定位的其它类似策略包括原位杂交、用标记的流式分选的染色体预筛选和杂交预选,从而构建染色体特异的cDNA库。
将cDNA克隆与中期染色体进行荧光原位杂交(FISH),可以在一个步骤中精确地进行染色体定位。此技术的综述,参见Verma等,Human Chromosomes:a Manual of BasicTechniques,Pergamon Press,New York(1988)。
一旦序列被定位到准确的染色***置,此序列在染色体上的物理位置就可以与基因图数据相关联。这些数据可见于例如,V.Mckusick,Mendelian Inheritance in Man(可通过与Johns Hopkins University Welch Medical Library联机获得)。然后可通过连锁分析,确定基因与业已定位到染色体区域上的疾病之间的关系。
接着,需要测定患病和未患病个体间的cDNA或基因组序列差异。如果在一些或所有的患病个体中观察到某突变,而该突变在任何正常个体中未观察到,则该突变可能是疾病的病因。比较患病和未患病个体,通常涉及首先寻找染色体中结构的变化,如从染色体水平可见的或用基于cDNA序列的PCR可检测的缺失或易位。根据目前的物理作图和基因定位技术的分辨能力,被精确定位至与疾病有关的染色体区域的cDNA,可以是50至500个潜在致病基因间之一种(假定1兆碱基作图分辨能力和每20kb对应于一个基因)。
本发明的具有抑癌功能的蛋白核苷酸全长序列或其片段通常可以用PCR扩增法、重组法或人工合成的方法获得。对于PCR扩增法,可根据本发明所公开的有关核苷酸序列,尤其是开放阅读框序列来设计引物,并用市售的cDNA库或按本领域技术人员已知的常规方法所制备的cDNA库作为模板,扩增而得有关序列。当序列较长时,常常需要进行两次或多次PCR扩增,然后再将各次扩增出的片段按正确次序拼接在一起。
一旦获得了有关的序列,就可以用重组法来大批量地获得有关序列。这通常是将其克隆入载体,再转入细胞,然后通过常规方法从增殖后的宿主细胞中分离得到有关序列。
此外,还可用人工合成的方法来合成有关序列,尤其是片段长度较短时。通常,通过先合成多个小片段,然后再进行连接可获得序列很长的片段。
目前,已经可以完全通过化学合成来编码本发明蛋白(或其片段,或其衍生物)的DNA序列。然后可将该DNA序列引入本领域中的各种DNA分子(如载体)和细胞中。此外,还可通过化学合成将突变引入本发明蛋白序列中。
此外,由于本发明的具有抑癌功能的蛋白具有源自人的天然氨基酸序列,因此,与来源于其他物种的同族蛋白相比,预计在施用于人时将具有更高的活性和/或更低的副作用(例如在人体内的免疫原性更低或没有)。
下面结合具体实施例,进一步阐述本发明。应理解,这些实施例仅用于说明本发明而不用于限制本发明的范围。下列实施例中未注明具体条件的实验方法,通常按照常规条件如Sambrook等人,分子克隆:实验室手册(New York:Cold Spring Harbor LaboratoryPress,1989)中所述的条件,或按照制造厂商所建议的条件。
实施例1:cDNA基因的获得及对癌细胞克隆形成的抑制作用
PP6,PP208,PP451,PP624,PP722,PP902,PP1628,PP1650,PP2672是通过用常规方法构建人胎盘cDNA文库获得的。取3、6、10月龄的胎盘组织,用Trizol试剂(GIBCO BRL公司)按厂方说明书提取总RNA,用mRNA提纯试剂盒(pharmacia公司)提取mRNA。用pCMV-script TMXR cDNA文库构建试剂盒(Stratagene公司)构建上述mRNA的cDNA文库。其中反转录酶改用MMLV-RT-SuperscriptII(GIBCO BRL),反转录反应在42℃进行。转化XL 10-Gold感受细胞,获得了1×106cfu/μg cDNA滴度的cDNA文库。第一轮随机挑取cDNA克隆,其后以高丰度cDNA克隆和已证明有抑癌细胞生长功能的cDNA克隆为探针,杂交筛选cDNA文库,挑取弱阳性及阴性克隆。用Qiagen 96孔板质粒抽提试剂盒,按厂家说明书进行质粒DNA的提取。质粒DNA和空载体同时转染肝癌细胞系7721。100ng DNA酒精沉淀干燥后,加6μl H2O溶解,待转染。每份DNA样品中加0.74μl脂质体及9.3μl无血清培液,混匀后,室温放置10分钟。每管中加150μl无血清培液,均分加入3孔生长于96孔板的7721细胞中,37℃放置2小时,每孔再加50μl无血清培液,37℃24小时。每孔换100μl全培液,37℃24小时,换含G418的全培液100μl,37℃24~48小时,边观察,边换G418浓度不等的培液。约2~3次后,直到镜检细胞有克隆形成,计数。发现上述克隆有抑制细胞克隆形成作用,结果如下表所示。
cDNA克隆转染细胞(7721)克隆形成情况
cDNA克隆名称 CDNA克隆数(三个重复) 空载体克隆数(三个重复)
PP6 1 0 1 50 26 31
PP208 37 40 45 27 31 26
PP451 26 39 29 25 23 30
PP624 3 1 1 21 30 42
PP722 18 19 22 21 18 19
PP902 28 26 24 57 54 40
PP1628 26 20 30 22 25 13
PP1650 18 22 24 22 25 13
PP2672 0 0 1 12 23 28
对cDNA克隆采用双脱氧终止法,在ABI377 DNA自动测序仪上测定其一端近500bp的核苷酸序列。分析后,确定为新基因克隆,进行另一端测序,仍未获得全长cDNA序列,设计引物,再次进行测序,直到获得全长序列。
实施例2:从胎盘cDNA中PCR获得基因克隆:
取3、6、10月龄的人胎盘组织,用Trizol试剂(GIBCO BRL公司)按厂方说明书提取总RNA,用mRNA提纯试剂盒(pharmacia公司)提取mRNA。用MMLV-RT-Superscript II(GIBCO BRL)反转录酶在42℃进行反转录反应,获得胎盘cDNA。利用各个基因的转异引物(如下表所示),按90℃3′1个循环。94℃30″60℃30″72℃1′35个循环,72℃10′1个循环进行PCR扩增,获得含有完整开放阅读框序列的各蛋白基因的扩增产物。扩增产物经测序验证,与实施例1测得的序列相符,随后用常规技术将扩增产物转入宿主细胞,以获得重组蛋白。
基因特异引物序列
克隆名称 特异引物1(5′→3′) 特异引物2(5′→3′)
PP6 CTTCCCCTCCTGGTGCAGCCATT CCAAAGCAAACCCAACCCTCGTG
PP208 GAACCTCAATGCCAGCACCGTCC GTACCCCAAGTTGCCCAGGAGGC
PP451 TCTTTGTCATCAGCCTGGCTCGC CTGGGCAACATGTCTGCAAGGGT
PP624 GCAAAAGGAGAATGTGCCCCCAG TGACAAAGGGCAGTGGCTCGCTA
PP722 GCTCCCCATCCCACTGACTGCTT TGGCTGAGTGTATCTGGGTGGGC
PP902 TCCGCCCCTCTCCTAAAGCCTGA CACCTGCAGCCGACGGACTAGTTG
PP1628 CGGCACTTGGGGTTTCTGGGAAT AGGCAAGATGGCAGGGGATCACA
PP1650 TCTGTGACAGGGTCCAACAGGGC CCGGGGAAAAGCCCTACTGGTGT
PP2672 AGCCGTTGCCCTGTTCTTGGTGA CACACCAGCAATCAGTGTGGCGA
实施例3:cDNA克隆序列分析
1.PP6
A:核苷酸序列:(SEQ ID NO:1)长度:2104bp
1 GTGAAACAGG GTGAGTCTGG ACATTCTGCA GTCAGCCACT GTTCTTGGCT
51 TCCAACCAAA AGCAAAACTA AGGCAAGGCA GAGCACAGAG GGTGCTCAGG
101 CAGAAGCTGC TTCCCCTCCT GGTGCAGCCA TTAGCTGCTG TAGTATCTGT
151 GACCTGTCAG AACCTGCTTC CTTCATTTTG GGAATATTTG ACCAACCTCA
201 GAGCAATTGC TGTTACGAGC TAAGGAGGTC AAAGAGCAAT GTCCAGTCTT
251 CCCATTCTGT CCAAGTCAGA TTTATCGACC ATGTTTCGGA AAAAGGTGAG
301 CCTCAGGGAT AGTTTGTCAA TGGCTGAGCT AATCACAAAG GTGCCTGGGC
351 AGGAATACTG GCACCAGCCA AATTTGCATT ACTTGTTCTG AGCAATTGAG
401 CTTTGTTTGA AGAATGGGAG GGGATAAAGA AGATAACTGA TCATTTTCTC
451 AGGTGACTGA CCTGGTGATT AGGAGCAGCC TTCTTGGATG CAGTTAGGCA
501 AAGTCTGAAT GTCTTCCCTT CTCCCCCCAC CGCTCTCTCC TGCCACCCCA
551 GGAGCAACAT ATAAAAATGT GTAGCTCCAG GCATGAAAGT AGCTTCTGTC
601 TACACAATGC AGGTCAAAGA GAAGGAACTG ACCAGGTGTC CAGGCACCAA
651 AATACCAGGC TGGTCTAGCC CCAACTCTCC TTCTCACATG CCCACGTTCA
701 CGCAACTAAC TCACAGGGTT TTGGGGAAGA CTAAGACGGA GTGAATGTAA
751 AACCCACTCC CTTCTGCCCA CGTTCACATG GTCCATGCTG AGGGAATTCA
801 GAAAAGGAGA CAGACCCGGG GGGGTGCGTC AGTCAAGGCA AGTTTCTCGA
851 AGGAAGGAAG CAGAACTCAG GAGGACATGG ACTGGAACAG TCAGGGCAAT
901 TTCAGGCTGT GACAAAGCTG GAACGGACGA CTGTAGGAGG AGCAGGAGTC
951 ACTGACATTC TAGGCCAGGC CAGGGCTAAG CCAGAGAACC TATTAATAGT
1001 AATCCACAAA TAGATATGGG GCACCTCCTA GGAACTCTCC TTGTTCCAAG
1051 CGTCGTACCT CGTGTGATCC TTAGCGGCTC TCTGAAGCAG ACAGAAGAGG
1101 GCCAGCCATC TTTCTTCCAC CTTTGAGGCT TGGGAAGGGT GAGACTTGCT
1151 GGTGACTTAC AACTCCATCA AAGGGGCATG GTGAAATAAG GGCCTGGGCT
1201 CCTGACTTCT GGGCTAGGGC TCTTCCAAAG GCAGAGTCTG GAGAGGCCTG
1251 GCTGTGGCCA GACCATGGGG CAAGTGGCTA GAGGGGCGAG TAGACAGCAG
1301 AGGCAGCTGT GGCCCCCGGG ATTAGCACTG GGGGACCGGA TGGGGGAGGG
1351 AGGCCTCACT TTGTTCTATC TGAGCAGCTT CCTCGGCAGT CATGGGACTG
1401 ATTGAGACCA CGCGAGGGCT CCTCCCGGGG GCAGGAGGGA CTCAGAGGCT
1451 GCCCCGTTGT CTGGGGGTGG CCCTGGCGAA GGAGCTCATC TTCACGGGCC
1501 GACGACTGAG TGGAACTGAG GCCCACGTAC TGGGGCTGGT GAATCACGCT
1551 GTGGCCCAGA ACGAGGAGGG GGACGCCGCC TACCAGCGGG CACGAGCACT
1601 GGCCCAGGAG ATCCTGCCCC AGGCCCCCAT TGCCGTGCGG CTGGGCAAAG
1651 TAGCCATTGA CCGAGGAACG GAGGTGGACA TTGCATCTGG GATGGCCATT
1701 GAAGGGATGT GCTATGCCCA GAATATTCCA ACCCGGGACC GGCTAGAGGG
1751 CATGGCAGCC TTCAGGGAGA AGCGGACTCC CAAATTTGTT GGCAAATGAC
1801 CCCCATTTTA ACCTTCAGCA TGGGAGATGC ATGCCCTGAA GAGCAGGATC
1851 CAGAAGGAAG ATTTGTGGCC AGATTGCCTT CATCATTTCA CCTCTCCAGA
1901 CTTCCATTTC TTCACAAGGA TGATGATGGA AATAAAATGA CTGGCGTGAT
1951 GCCTGGAACC AAGGTGCTGA TCCTACCACC TACTGCTACC TTCCTTAGCT
2001 TCACCCTGGC TAGAAATAAT CACGAGGGTT GGGTTTGCTT TGGAAAATGC
2051 CTGTCTCTCT ACTTGAATGA TAAAGAATTA AATTAGAAAA AAAAAAAAAA
2101 AAAA
B:氨基酸序列:(SEQ ID NO:2) 长度:135个氨基酸
1 MGLIETTRGL LPGAGGTQRL PRCLGVALAK ELIFTGRRLS GTEAHVLGLV
51 NHAVAQNEEG DAAYQRARAL AQEILPQAPI AVRLGKVAID RGTEVDIASG
101 MAIEGMCYAQ NIPTRDRLEG MAAFREKRTP KFVGK
C:核苷酸及氨基酸组合序列(SEQ ID NO:3)
克隆号和蛋白质名称:PP6
起始编码子: 1392 ATG 终止编码子:1799 TGA
蛋白质分子量:14435.95
1 GT GAA ACA GGG TGA GTC TGG ACA TTC TGC AGT CAG CCA CTG TTC TTG 47
48 GCT TCC AAC CAA AAG CAA AAC TAA GGC AAG GCA GAG CAC AGA GGG TGC 95
96 TCA GGC AGA AGC TGC TTC CCC TCC TGG TGC AGC CAT TAG CTG CTG TAG 143
144 TAT CTG TGA CCT GTC AGA ACC TGC TTC CTT CAT TTT GGG AAT ATT TGA 191
192 CCA ACC TCA GAG CAA TTG CTG TTA CGA GCT AAG GAG GTC AAA GAG CAA 239
240 TGT CCA GTC TTC CCA TTC TGT CCA AGT CAG ATT TAT CGA CCA TGT TTC 287
288 GGA AAA AGG TGA GCC TCA GGG ATA GTT TGT CAA TGG CTG AGC TAA TCA 335
336 CAA AGG TGC CTG GGC AGG AAT ACT GGC ACC AGC CAA ATT TGC ATT ACT 383
384 TGT TCT GAG CAA TTG AGC TTT GTT TGA AGA ATG GGA GGG GAT AAA GAA 431
432 GAT AAC TGA TCA TTT TCT CAG GTG ACT GAC CTG GTG ATT AGG AGC AGC 479
480 CTT CTT GGA TGC AGT TAG GCA AAG TCT GAA TGT CTT CCC TTC TCC CCC 527
528 CAC CGC TCT CTC CTG CCA CCC CAG GAG CAA CAT ATA AAA ATG TGT AGC 575
576 TCC AGG CAT GAA AGT AGC TTC TGT CTA CAC AAT GCA GGT CAA AGA GAA 623
624 GGA ACT GAC CAG GTG TCC AGG CAC CAA AAT ACC AGG CTG GTC TAG CCC 671
672 CAA CTC TCC TTC TCA CAT GCC CAC GTT CAC GCA ACT AAC TCA CAG GGT 719
720 TTT GGG GAA GAC TAA GAC GGA GTG AAT GTA AAA CCC ACT CCC TTC TGC 767
768 CCA CGT TCA CAT GGT CCA TGC TGA GGG AAT TCA GAA AAG GAG ACA GAC 815
816 CCG GGG GGG TGC GTC AGT CAA GGC AAG TTT CTC GAA GGA AGG AAG CAG 863
864 AAC TCA GGA GGA CAT GGA CTG GAA CAG TCA GGG CAA TTT CAG GCT GTG 911
912 ACA AAG CTG GAA CGG ACG ACT GTA GCA GGA GCA GGA GTC ACT GAC ATT 959
960 CTA GGC CAG GCC AGG GCT AAG CCA GAG AAC CTA TTA ATA GTA ATC CAC 1007
1008 AAA TAG ATA TGG GGC ACC TCC TAG GAA CTC TCC TTG TTC CAA GCG TCG 1055
1056 TAC CTC GTG TGA TCC TTA GCG GCT CTC TGA AGC AGA CAG AAG AGG GCC 1103
1104 AGC CAT CTT TCT TCC ACC TTT GAG GCT TGG GAA GGG TGA GAC TTG CTG 1151
1152 GTG ACT TAC AAC TCC ATC AAA GGG GCA TGG TGA AAT AAG GGC CTG GGC 1199
1200 TCC TGA CTT CTG GGC TAG GGC TCT TCC AAA GGC AGA GTC TGG AGA GGC 1247
1248 CTG GCT GTG GCC AGA CCA TGG GGC AAG TGG CTA GAG GGG CGA GTA GAC 1295
1296 AGC AGA GGC AGC TGT GGC CCC CGG GAT TAG CAC TGG GGG ACC GGA TGG 1343
1344 GGG AGG GAG GCC TCA CTT TGT TCT ATC TGA GCA GCT TCC TCG GCA GTC 1391
1392 ATG GGA CTG ATT GAG ACC ACG CGA GGG CTC CTC CCG GGG GCA GGA GGG 1439
1 Met Gly Leu Ile Glu Thr Thr Arg Gly Leu Leu Pro Gly Ala Gly Gly 16
1440 ACT CAG AGG CTG CCC CGT TGT CTG CGG GTG GCC CTG GCG AAG GAG CTC 1487
17 Thr Gln Arg Leu Pro Arg Cys Leu Gly Val Ala Leu Ala Lys Glu Leu 32
1488 ATC TTC ACG GGC CGA CGA CTG AGT GGA ACT GAG GCC CAC GTA CTG GGG 1535
33 Ile Phe Thr Gly Arg Arg Leu Ser Gly Thr Glu Ala His Val Leu Gly 48
1536 CTG GTG AAT CAC GCT GTG GCC CAG AAC GAG GAG GGG GAC GCC GCC TAC 1583
49 Leu Val Asn His Ala Val Ala Gln Asn Glu Glu Gly Asp Ala Ala Tyr 64
1584 CAG CGG GCA CGA GCA CTG GCC CAG GAG ATC CTG CCC CAG GCC CCC ATT 1631
65 Gln Arg Ala Arg Ala Leu Ala Gln Glu Ile Leu Pro Gln Ala Pro Ile 80
1632 GCC GTG CGG CTG GGC AAA GTA GCC ATT GAC CGA GGA ACG GAG GTG GAC 1679
81 Ala Val Arg Leu Gly Lys Val Ala Ile Asp Arg Gly Thr Glu Val Asp 96
1680 ATT GCA TCT GGG ATG GCC ATT GAA GGG ATG TGC TAT GCC CAG AAT ATT 1727
97 Ile Ala Ser Gly Met Ala Ile Glu Gly Met Cys Tyr Ala Gln Asn Ile 112
1728 CCA ACC CGG GAC CGG CTA GAG GGC ATG GCA GCC TTC AGG GAG AAG CGG 1775
113 Pro Thr Arg Asp Arg Leu Glu Gly Met Ala Ala Phe Arg Glu Lys Arg 128
1776 ACT CCC AAA TTT GTT GGC AAA TGA CCC CCA TTT TAA CCT TCA GCA TGG 1823
129 Thr Pro Lys Phe Val Gly Lys *** 136
1824 GAG ATG CAT GCC CTG AAG AGC AGG ATC CAG AAG GAA GAT TTG TGG CCA 1871
1872 GAT TGC CTT CAT CAT TTC ACC TCT CCA GAC TTC CAT TTC TTC ACA AGG 1919
1920 ATG ATG ATG GAA ATA AAA TGA CTG GCG TGA TGC CTG GAA CCA AGG TGC 1967
1968 TGA TCC TAC CAC CTA CTG CTA CCT TCC TTA GCT TCA CCC TGG CTA GAA 2015
2016 ATA ATC ACG AGG GTT GGG TTT GCT TTG GAA AAT GCC TGT CTC TCT ACT 2063
2064 TGA ATG ATA AAG AAT TAA ATT AGA AAA AAA AAA AAA AAA AA 2104
D:Blastp结果
Query=PP6蛋白(135个氨基酸)
>SP_IN:O45106 O45106 caenorhabditis elegans.f56b3.5蛋白(片段).5/1999
长度=281
分值=131bits(326),预期值=3e-30
相同性=66/128(51%),相似性=93/128(72%),缺口=5/128(3%)
Query:1 MGLIETTRGLLPGAGGTQRLPRCLGVALAKELIFTGRRLSGTEAHVLGLVNHAVAQNEEG 60
MGL+ET L+PGAGG+QRL R +GVA AKELI+T L+G +A LG+VNH V N
Sbjct:158 MGLVETKWALIPGAGGSQRLYRIVGVAKAKELIYTAEVLNGADAAKLGVVNHVVEANP-- 215
Query:61 DAAYQRARALAQEILPQAPIAVRLGKVAIDRGTEVDIASGMAIEGMCYAQNIPTRDRLEG 120
+++ +A++I+P+ PIAV+L K+AI+ G++ DI S +++E CYAQ + ++DRLEG
Sbjct:216 ---IEKSLEIARKIIPRGPIAVKLAKLAINLGSQTDITSALSVEQQCYAQIVHSKDRLEG 272
Query:121 MAAFREKR 128
MAAF EKR
Sbjct:273 MAAFAEKR 280
2.PP208
A:核苷酸序列:(SEQ ID NO:4)长度:1587bp
1 TGGCTCAACA ATGCCTTCCA GGATGTGGAG TCAGAGAACG TCAACGTGGT
51 GAAGCGGCTG TTCAAGATCC AGAACCTCAA TGCCAGCACC GTCCGCACGG
101 TGATGGTGGC CGACTGCAGC CGCTTCGACA GCCCTGACCT GCTGCTGGAA
151 GCCGGTGACC CGGCCACGTC CCCCTGCCGC ATCTTTGACC TGGGCAGCGA
201 CAACGAGGAG GTGGTGGCTG GCCCGGCCCC CGCCCACGCC AAGGAGGGCT
251 TGCGGCACTT TCTGGACCGC GTGCTGGAGG GGCGGGCGCA GCACAGCTGT
301 CGGAGCGCAT GCTAGAGACC AAGGTGCCGA GCTGCTGGCC CAGGGCACAC
351 CAAGCCACCC GAGCGCAGTG CCACAGGCGC CAAGAGCAAG TACCTCATCT
401 TCACCACTGG CTGCCTCACC TACTCCCCAC ACCAGATCGG CATCAAGCAG
451 ATCCTGCCAC ACCAGATGAC CACGGCAGGG CCCCGTGCTG GGTGAGGGCC
501 GGGGCTCCGA TGCCTTCTTC GACGCGCTGG ACCACGTCAT AGACATACAC
551 GGACACATCA TCGGCATGGG CCTGTCGCCC GACAACAGGT ACCTGTACGT
601 GAACAGCCGC GCCTGGCCCA ACGGTGCGGT GGTGGCCGAC CCCATGCAGC
651 CGCCACCAAT CGCGGAGGAG ATTGACCTGC TGGTGTTCGA CCTCAAGACC
701 ATGCGGGAGG TGAGGCGGGC TCTGCGTGCG CACCGCGCCT ACACGCCCAA
751 CGACGAGTGC TTCTTCATCT TCCTGGACGT CAGCAGGGAC TTCGTGGCCA
801 GCGGGGCGGA GGACCGGCAC GGCTACATCT GGGACCGCCA CTACAACATC
851 TGTCTGGCCA GGCTGCGGCA CGAGGATGTG GTCAACTCAG TGGTCTTCAG
901 TCCCCAGGAG CAGGAGCTGC TGCTCACGGC CAGCGACGAC GCCACCATCA
951 AAGCCTGGCG CTCCCCACGC ACCATGCGCG TCCTCCAGGC ACCTCGCCCA
1001 CGGCCTCGCA CCTTCTTCTC CTGGCTTGCC AGCCAGAGGC GCTGAGGTGT
1051 GCTGGGTGCA CTGGACCACC GGGACCCCTT GAGGACATCG CCAGGCTCTG
1101 TGGCTTTTTC CCGAGCGGGA GAGGTGGAGA TGCTTATAGC AGTTACGCCT
1151 TAGGAAGGGG ACAACCAGGC CCCGCCACAC GCTCACACAC AAACCTGCTC
1201 ACGCAGCTGT GATGCTTGGC ACGGGGTGGC CAGTGCAGAT GGAGCCCAAG
1251 GCCCCCTCGG CCTCCTGGGC AACTTGGGGT ACACAGGATA CTGGGGGTGC
1301 CGCTCCTCAC TCAACCCCAG GCTAGGGGTA CACCTGACCC AGCTGGCCTC
1351 GGCCCGGGGC ACCTTCGGCT GGTCCTGTGG GGCCCTGGAC GGTGGCCCAG
1401 TGGTGGCAGG GGCTGCTCCT GGCTGTGGTT GTGCGCCCGG GGCTTGGGAG
1451 CGGCCGGTCA CGCTGCTGTG GGCCCGAGTG TGTTGCATGT CCACGCACCA
1501 CCCGTTCAGG GCCCTGAATA AACAGTTGGC AACAGCCCAA AAAAAAAAAA
1551 AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAA
B:氨基酸序列:PP208 (SEQ ID NO:5)长度:159个氨基酸
1 MGLSPDNRYL YVNSRAWPNG AVVADPMQPP PIAEEIDLLV FDLKTMREVR
51 RALRAHRAYT PNDECFFIFL DVSRDFVASG AEDRHGYIWD RHYNICLARL
101 RHEDVVNSVV FSPQEQELLL TASDDATIKA WRSPRTMRVL QAPRPRPRTF
151 FSWLASQRR
C:核苷酸及氨基酸组合序列(SEQ ID NO:6)
克隆号和蛋白质名称:PP208
起始编码子: 566 ATG 终止编码子:1045 TGA
蛋白质分子量:18544.09
1 T GGC TCA ACA ATG CCT TCC AGG ATG TGG AGT CAG AGA ACG TCA ACG 46
47 TGG TGA AGC GGC TGT TCA AGA TCC AGA ACC TCA ATG CCA GCA CCG TCC 94
95 GCA CGG TGA TGG TGG CCG ACT GCA GCC GCT TCG ACA GCC CTG ACC TGC 142
143 TGC TGG AAG CCG GTG ACC CGG CCA CGT CCC CCT GCC GCA TCT TTG ACC 190
191 TGG GCA GCG ACA ACG AGG AGG TGG TGG CTG GCC CGG CCC CCG CCC ACG 238
239 CCA AGG AGG GCT TGC GGC ACT TTC TGG ACC GCG TGC TGG AGG GGC GGG 286
287 CGC AGC ACA GCT GTC GGA GCG CAT GCT AGA GAC CAA GGT GCC GAG CTG 334
335 CTG GCC CAG GGC ACA CCA AGC CAC CCG AGC GCA GTG CCA CAG GCG CCA 382
383 AGA GCA AGT ACC TCA TCT TCA CCA CTG GCT GCC TCA CCT ACT CCC CAC 430
431 ACC AGA TCG GCA TCA AGC AGA TCC TGC CAC ACC AGA TGA CCA CGG CAG 478
479 GGC CCC GTG CTG GGT GAG GGC CGG GGC TCC GAT GCC TTC TTC GAC GCG 526
527 CTG GAC CAC GTC ATA GAC ATA CAC GGA CAC ATC ATC GGC ATG GGC CTG 574
1 Met Gly Leu 3
575 TCG CCC GAC AAC AGG TAC CTG TAC GTG AAC AGC CGC GCC TGG CCC AAC 622
4 Ser Pro Asp Asn Arg Tyr Leu Tyr Val Asn Ser Arg Ala Trp Pro Asn 19
623 GGT GCG GTG GTG GCC GAC CCC ATG CAG CCG CCA CCA ATC GCG GAG GAG 670
20 Gly Ala Val Val Ala Asp Pro Met Gln Pro Pro Pro Ile Ala Glu Glu 35
671 ATT GAC CTG CTG GTG TTC GAC CTC AAG ACC ATG CGG GAG GTG AGG CGG 718
36 Ile Asp Leu Leu Val Phe Asp Leu Lys Thr Met Arg Glu Val Arg Arg 51
719 GCT CTG CGT GCG CAC CGC GCC TAC ACG CCC AAC GAC GAG TGC TTC TTC 766
52 Ala Leu Arg Ala His Arg Ala Tyr Thr Pro Asn Asp Glu Cys Phe Phe 67
767 ATC TTC CTG GAC GTC AGC AGG GAC TTC GTG GCC AGC GGG GCG GAG GAC 814
68 Ile Phe Leu Asp Val Ser Arg Asp Phe Val Ala Ser Gly Ala Glu Asp 83
815 CGG CAC GGC TAC ATC TGG GAC CGC CAC TAC AAC ATC TGT CTG GCC AGG 862
84 Arg His Gly Tyr Ile Trp Asp Arg His Tyr Asn Ile Cys Leu Ala Arg 99
863 CTG CGG CAC GAG GAT GTG GTC AAC TCA GTG GTC TTC AGT CCC CAG GAG 910
100 Leu Arg His Glu Asp Val Val Asn Ser Val Val Phe Ser Pro Gln Glu 115
911 CAG GAG CTG CTG CTC ACG GCC AGC CAC GAC GCC ACC ATC AAA GCC TGG 958
116 Gln Glu Leu Leu Leu Thr Ala Ser Asp Asp Ala Thr Ile Lys Ala Trp 131
959 CGC TCC CCA CGC ACC ATG CGC GTC CTC CAG GCA CCT CGC CCA CGG CCT 1006
132 Arg Ser Pro Arg Thr Met Arg Val Leu Gln Ala Pro Arg Pro Arg Pro 147
1007 CGC ACC TTC TTC TCC TGG CTT GCC AGC CAG AGG CGC TGA GGT GTG CTG 1054
148 Arg Thr Phe Phe Set Trp Leu Ala Ser Gln Arg Arg *** 160
1055 GGT GCA CTG GAC CAC CGG GAC CCC TTG AGG ACA TCG CCA GGC TCT GTG 1102
1103 GCT TTT TCC CGA GCG GGA GAG GTG GAG ATG CTT ATA GCA GTT ACG CCT 1150
1151 TAG GAA GGG GAC AAC CAG GCC CCG CCA CAC GCT CAC ACA CAA ACC TGC 1198
1199 TCA CGC AGC TGT GAT GCT TGG CAC GGG GTG GCC AGT GCA GAT GGA GCC 1246
1247 CAA GGC CCC CTC GGC CTC CTG GGC AAC TTG GGG TAC ACA GGA TAC TGG 1294
1295 GGG TGC CGC TCC TCA CTC AAC CCC AGG CTA GGG GTA CAC CTG ACC CAG 1342
1343 CTG GCC TCG GCC CGG GGC ACC TTC GGC TGG TCC TGT GGG GCC CTG GAC 1390
1391 GGT GGC CCA GTG GTG GCA GGG GCT GCT CCT GGC TGT GGT TGT GCG CCC 1438
1439 GGG GCT TGG GAG CGG CCG GTC ACG CTG CTG TGG GCC CGA GTG TGT TGC 1486
1487 ATG TCC ACG CAC CAC CCG TTC AGG GCC CTG AAT AAA CAG TTG GCA ACA 1534
1535 GCC CAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA 1582
1583 AAA AA 1587
D:Blastp结果
Query=PP208蛋白[基因=PP208] (159个氨基酸)
>SP_IN:O96698 O96698 drosophila melanogaster(果蝇).
lissencephaly-1(lis1 homolog).8/1999
长度=411
分值=46.5bits(108),预计值=1e-04
相同性=28/70(40%),相似性=41/70(58%),缺口=4/70(5%)
Query:76 FVASGAEDRHGYIWDRHYNICLARLR-HEDVVNSVVFSPQEQELLLTASDDATIKAW--R 132
F+ASG+ D+ IWD +CL L H++ V + F P + L++ASDD TI+ W R
Sbjct:311 FLASGSRDKTIRIWDVSVGLCLLTLSGHDNWVRGLAFHP-GGKYLVSASDDKTIRVWDLR 369
Query:133 SPRTMRVLQA 142
+ R M+ L A
Sbjct:370 NKRCMKTLYA 379
>SW:TUP1_CANAL P56093 candida albicans(yeast).transcriptional
repressor tup1.7/1998
长度=514
分值=43.8bits(101),预计值=9e-04
相同性=37/125(29%),相似性=60/125(47%),缺口=14/125(11%)
Query:10 LYVNSRAW-PNGAVVADPMQPPPIAEEIDLLVFDLKTMREVRRALRAHRAYTPNDECFFI 68
LY+ S + P+G ++A AE+ + ++DL T R ++ LR H + + +
Sbjct:258 LYIRSVCFSPDGKLLATG------AEDKLIRIWDLSTKRIIK-ILRGHE-----QDIYSL 305
Query:69 FLDVSRDFVASGAEDRHGYIWDRHYNICLARLRHEDVVNSVVFSPQEQELLLTASDDATI 128
D + SG+ DR IWD + C L ED V +V SP + +L+ S D T+
Sbjct:306 DFFPDGDRLVSGSGDRSVRIWDLRTSQCSLTLSIEDGVTTVAVSP-DGKLIAAGSLDRTV 364
Query:129 KAWRS 133
+ W S
Sbjct:365 RVWDS 369
>SW:YA3A_SCHPO Q09715 schizosaccharomyces pombe (fission yeast).
hypothetical 67.3 kd trp-asp repeats containing protein
c18b11.10 in chromosome i.7/1998
长度=614
分值=43.4bits(100),预计值=0.001
相同性=36/136(26%),相似性=62/136(45%),缺口=15/136(11%)
Query:4 SPD-NRYLYVNSRAW-PNGAVVADPMQPPPIAEEIDLLVFDLKTMREVRRALRAHRAYTP 61
SPD +R LYV + A+ P+G + E+ + ++DL T + VR H
Sbjct:354 SPDPSRDLYVRTIAFSPDGKYLVTG------TEDRQIKLWDLSTQK-VRYVFSGHE---- 402
Query:62 NDECFFIFLDVSRDFVASGAEDRHGYIWDRHYNICLARLRHEDVVNSVVFSPQEQELLLT 121
+ + + + F+ SG+ DR +WD C+ +L E+ V ++ SP +Q +
Sbjct:403 -QDIYSLDFSHNGRFIVSGSGDRTARLWDVETGQCILKLEIENGVTAIAISPNDQ-FIAV 460
Query:122 ASDDATIKAWRSPRTM 137
S D I+ W T+
Sbjct:461 GSLDQIIRVWSVSGTL 476
分值=37.1bits(84),预计值=0.086
相同性=28/89(31%),相似性=42/89(46%),缺口=13/89(14%)
Query:58 AYTPNDECFFIFLDVSRDFVASGAEDRHGYIWDRHYNICLARLRHEDVVNSVVFSPQEQE 117
A +PND+ F+A G+ D+ +W + H++ V S+ FSP +
Sbjct:450 AISPNDQ-----------FIAVGSLDQIIRVWSVSGTLVERLEGHKESVYSIAFSP-DSS 497
Query:118 LLLTASDDATIKAWRSPRTMRV-LQAPRP 145
+LL+ S D TIK W T V L A +P
Sbjct:498 ILLSGSLDKTIKVWELQATRSVGLSAIKP 526
>SP_IN:O96995 O96995 drosophila melanogaster(fruit fly).notchless
protein.5/1999
长度=480
分值=43.0bits(99),预计值=0.002
相同性=26/92(28%),相似性=50/92(54%),缺口=12/92(13%)
Query:43 LKTMREVRRALRAHRAYTPNDECFFIFLDVSRDFVASGAEDRHGYIWDRHYNICLARLR- 101
L T AL+ ++A P++ + + S ++D Y+W + N C+ R+
Sbjct:316 LSTEELQESALKRYQAVCPDEV----------ESLVSCSDDNTLYLWRNNQNKCVERMTG 365
Query:102 HEDVVNSVVFSPQEQELLLTASDDATIKAWRS 133
H++VVN V +SP + +L ++AS D +++ WR+
Sbjct:366 HQNVVNDVKYSP-DVKLIASASFDKSVRLWRA 396
分值=30.9bits(68),预计值=6.5
相同性=25/97(25%),相似性=44/97(44%),缺口=3/97(3%)
Query:38 LLVFDLKTMREVRRALRAHRAYTPNDECFFIFLDVSRDFVASGAEDRHGYIWDRHYNICL 97
++++D +T ++ R L H+ + D +AS + D IWD CL
Sbjct:177 IIIWDPETGQQKGRPLSGHKKHINCLAWEPYHRDPECRKLASASGDGDCRIWDVKLGQCL 236
Query:98 ARLR-HEDVVNSVVFSPQEQELLLTASDDATIKAWRS 133
+ H + V +V + L+ T+S D T+K WR+
Sbjct:237 MNIAGHTNAVTAVRWGGAG--LIYTSSKDRTVKMWRA 271
3.PP451
A:核苷酸序列:(SEQ ID NO:7)长度:1456bp
1 GTCAACTTCA TCCACCTGAT CTTAGAAGCA CTAGTGGACG GCCCCCGCAT
51 GCAGGCCTCA GCTCATGTGA CTCGGCCCTC TAAGAGGCCC AGCAAGATAG
101 GGTTTGACGA GGTCTTTGTC ATCAGCCTGG CTCGCAGGCC TGACCGTCGG
151 GAACGCATGC TCGCCTCGCT CTGGGAGATG GAGATCTCTG GGAGGGTGGT
201 GGACGCTGTG GATGGCTGGA TGCTCAACAG CAGTGCCATC AGGAACCTCG
251 GCGTAGACCT GCTCCCGGGC TACCAGGACC CTTACTCGGG CCGCACTCTG
301 ACCAAGGGCG AGGTGGGCTG CTTCCTCAGC CATTACTCCA TCTGGGAAGA
351 GGTGGTTGCC AGGGGCCTGG CCCGGGTCCT GGTGTTTGAG GATGACGTGC
401 GCTTTGAGAG CAACTTCAGG GGGCGGCTGG AACGGCTGAT GGAGGATGTG
451 GAAGCAGAGA AACTGTCTTG GGACCTGATC TACCTCGGAC GGAAGCAGGT
501 GAACCCCTGA GAAGGAGACG GCCGTGGAGG GGCTGCCGGG CCTGGTGGTG
551 GCTGGGTACT CCTACTGGAC GCTGGCCTAT GCCCTGCGTC TGGCGGGTGC
601 CCGCAAGCTG CTGGCCTCAC AGCCTCTGCG CCGCATGCTG CCCGTGGACG
651 AGTTCCTGCC CATCATGTTC GACCAGCACC CCAACGAGCA GTACAAGGCA
701 CACTTCTGGC CACGGGACCT GGTGGCCTTC TCCGCCCAGC CCCTGCTCGC
751 TGCCCCTACC CACTATGCCG GGGACGCCGA GTGGCTCAGT GACACGGAGA
801 CATCCTCTCC ATGGGATGAT GACAGCGGCC GCCTCATCAG CTGGAGCGGC
851 TCCCAAAAGA CCCTGCGCAG CCCCCGCCTG GACCTGACTG GCAGCAGCGG
901 GCACAGCCTC CAACCCCAGC CCCGAGATGA GCTCTAGGTC CAGGTGATGA
951 CTGCAAAGCA GTGTCCAGGA GCAGGCCACT ACTGCCCAGA GAGCAGAGGA
1001 GGAGGTTGTT GCCAGGGACT GCAGATCCTG TCAGACCTGG CCACCACCTT
1051 GGGCATGGCC ACTCTGCCCT CTGGACCTGT CTTTCATCGG GAGAAACCAC
1101 TCAGAGATGG ATCCCATTCC CTAAAGGTCT CACAGCAAAG GAGCAGGACT
1151 CCCAGGCCCC TGTACCCTGC CTGGCCTGAT TCAGGGCCTT GTGGCCCCCA
1201 GCTTCTTGTT TCAAGCTGGG CAGACCCCAG GATCCCTTCC CTCCCTAAGG
1251 ACTCAGCTGA GGGGCCCCTC TTGCCCCCTT CTTACCTCCA CCTCAGCACC
1301 CTCCCCCAGC TTGATGTTTG GGTCTCCCCA GCACCCTCCT CCTTGGCCGG
1351 TGCAAAGTAC AGGGAGGTAA AGCAGGACCC TTGCAGACAT GTTGCCCAGC
1401 ACACAGTAGG CCCTCAATAA AAGCCATTTG CACTTTAAAA AAAAAAAAAA
1451 AAAAAA
B:氨基酸序列:(SEQ ID NO:8)长度:157个氨基酸
1 MTAKQCPGAG HYCPESRGGG CCQGLQILSD LATTLGMATL PSGPVFHREK
51 PLRDGSHSLK VSQQRSRTPR PLYPAWPDSG PCGPQLLVSS WADPRIPSLP
101 KDSAEGPLLP PSYLHLSTLP QLDVWVSPAP SSLAGAKYRE VKQDPCRHVA
151 QHTVGPQ
C:核苷酸及氨基酸组合序列(SEQ ID NO:9)
克隆号和蛋白质名称:PP451
起始编码子: 947 ATG 终止编码子:1420 TAA
蛋白质分子量:16819.29
1 G TCA ACT TCA TCC ACC TGA TCT TAG AAG CAC TAG TGG ACG GCC CCC 46
47 GCA TGC AGG CCT CAG CTC ATG TGA CTC GGC CCT CTA AGA GGC CCA GCA 94
95 AGA TAG GGT TTG ACG AGG TCT TTG TCA TCA GCC TGG CTC GCA GGC CTG 142
143 ACC GTC GGG AAC GCA TGC TCG CCT CGC TCT GGG AGA TGG AGA TCT CTG 190
191 GGA GGG TGG TGG ACG CTG TGG ATG GCT GGA TGC TCA ACA GCA GTG CCA 238
239 TCA GGA ACC TCG GCG TAG ACC TGC TCC CGG GCT ACC AGG ACC CTT ACT 286
287 CGG GCC GCA CTC TGA CCA AGG GCG AGG TGG GCT GCT TCC TCA GCC ATT 334
335 ACT CCA TCT GGG AAG AGG TGG TTG CCA GGG GCC TGG CCC GGG TCC TGG 382
383 TGT TTG AGG ATG ACG TGC GCT TTG AGA GCA ACT TCA GGG GGC GGC TGG 430
431 AAC GGC TGA TGG AGG ATG TGG AAG CAG AGA AAC TGT CTT GGG ACC TGA 478
479 TCT ACC TCG GAC GGA AGC AGG TGA ACC CCT GAG AAG GAG ACG GCC GTG 526
527 GAG GGG CTG CCG GGC CTG GTG GTG GCT GGG TAC TCC TAC TGG ACG CTG 574
575 GCC TAT GCC CTG CGT CTG GCG GGT GCC CGC AAG CTG CTG GCC TCA CAG 622
623 CCT CTG CGC CGC ATG CTG CCC GTG GAC GAG TTC CTG CCC ATC ATG TTC 670
671 GAC CAG CAC CCC AAC GAG CAG TAC AAG GCA CAC TTC TGG CCA CGG GAC 718
719 CTG GTG GCC TTC TCC GCC CAG CCC CTG CTC GCT GCC CCT ACC CAC TAT 766
767 GCC GGG GAC GCC GAG TGG CTC AGT GAC ACG GAG ACA TCC TCT CCA TGG 814
815 GAT GAT GAC AGC GGC CGC CTC ATC AGC TGG AGC GGC TCC CAA AAG ACC 862
863 CTG CGC AGC CCC CGC CTG GAC CTG ACT GGC AGC AGC GGG CAC AGC CTC 910
911 CAA CCC CAG CCC CGA GAT GAG CTC TAG GTC CAG GTG ATG ACT GCA AAG 958
1 Met Thr Ala Lys 4
959 CAG TGT CCA GGA GCA GGC CAC TAC TGC CCA GAG AGC AGA GGA GGA GGT 1006
5 Gln Cys Pro Gly Ala Gly His Tyr Cys Pro Glu Ser Arg Gly Gly Gly 20
1007 TGT TGC CAG GGA CTG CAG ATC CTG TCA GAC CTG GCC ACC ACC TTG GGC 1054
21 Cys Cys Gln Gly Leu Gln Ile Leu Ser Asp Leu Ala Thr Thr Leu Gly 36
1055 ATG GCC ACT CTG CCC TCT GGA CCT GTC TTT CAT CGG GAG AAA CCA CTC 1102
37 Met Ala Thr Leu Pro Ser Gly Pro Val Phe His Arg Glu Lys Pro Leu 52
1103 AGA GAT GGA TCC CAT TCC CTA AAG GTC TCA CAG CAA AGG AGC AGG ACT 1150
53 Arg Asp Gly Ser His Ser Leu Lys Val Ser Gln Gln Arg Ser Arg Thr 68
1151 CCC AGG CCC CTG TAC CCT GCC TGG CCT GAT TCA GGG CCT TGT GGC CCC 1198
69 Pro Arg Pro Leu Tyr Pro Ala Trp Pro Asp Ser Gly Pro Cys Gly Pro 84
1199 CAG CTT CTT GTT TCA AGC TGG GCA GAC CCC AGG ATC CCT TCC CTC CCT 1246
85 Gln Leu Leu Val Ser Ser Trp Ala Asp Pro Arg Ile Pro Ser Leu Pro 100
1247 AAG GAC TCA GCT GAG GGG CCC CTC TTG CCC CCT TCT TAC CTC CAC CTC 1294
101 Lys Asp Ser Ala Glu Gly Pro Leu Leu Pro Pro Ser Tyr Leu His Leu 116
1295 AGC ACC CTC CCC CAG CTT GAT GTT TGG GTC TCC CCA GCA CCC TCC TCC 1342
117 Ser Thr Leu Pro Gln Leu Asp Val Trp Val Ser Pro Ala Pro Ser Ser 132
1343 TTG GCC GGT GCA AAG TAC AGG GAG GTA AAG CAG GAC CCT TGC AGA CAT 1390
133 Leu Ala Gly Ala Lys Tyr Arg Glu Val Lys Gln Asp Pro Cys Arg His 148
1391 GTT GCC CAG CAC ACA GTA GGC CCT CAA TAA AAG CCA TTT GCA CTT TAA 1438
149 Val Ala Gln His Thr Val Gly Pro Gln *** 158
1439 AAA AAA AAA AAA AAA AAA 1456
4.PP624
A:核苷酸序列:(SEQ ID NO:10)长度:1754bp
1 AGATGACCTG GAAATAGGCC CAGGTCAGTT GTCATCTTCT ACATTTGACT
51 CGGAGAAAAA TGAGAGTAGA CGAAATCTGG AACTTCCACG CCTCTCAGAA
101 ACCTCTATAA AGGATCGAAT GGCCAAGTAC CAGGCAGCTG TGTCCAAACA
151 AAGCAGCTCA ACCAACTATA CAAATGAGCT GAAAGCCAGT GGTGGCGAAA
201 TCAAAATTCA TAAAATGGAG CAAAAGGAGA ATGTGCCCCC AGGTCCTGAG
251 GTCTGCATCA CCCATCAGGA AGGGGAAAAG ATTTCTGCAA ATGAGAATAG
301 CCTGGCAGTC CGTTCCACCC CTGCCGAAGA TGACTCCCGT GACTCCCAGG
351 TTAAGAGTGA GGTTCAACAG CCTGTCCATC CCAAGCCACT AAGTCCAGAT
401 CTCCAGAGCC TCCAGTCTTT CTGAAAGTTC TCCTCCCAAA GCAATGAAGA
451 AGTTTCAGGC ACCTGCAAGA GAGACCTGCG TGGAATGTCA GAAGACAGTC
501 TATRCAATGG AGCGTCTCTT GGCCAACCAG CAGGTGTTTC ACATCAGCTG
551 CTTRCGTTGC TRCTATTGCA KCAACAAACT CAGTCTAGGA ACATATGCAT
601 CTTTACATGG AAGAATCTAT TGTAAGCCTC ACTTCAATCA ACTCTTTAAA
651 TCTAAGGGCA ACTATGATGA AGGCTTTGGG CACAGACCAC ACAAGGATCT
701 ATGGGCAAGC AAAAATGAAA ACGAAGAGAT TTTGGAGAGA CCAGCCCAGC
751 TTGCAAATGC AAGGGAGACC CCTCACAGCC CAGGGGTAGA AGATGCCCCT
801 ATTGCTAAGG TGGGTGTCCT GGCTGCAAGT ATGGAAGCCA AGGCCTCCTC
851 TCAGCAGGAG AAGGAAGACA AGCCAGCTGA AACCAAGAAG CTGAGGATCG
901 CCTGGCCACC CCCCACTGAA CTTGGAAGTT CAGGAAGTGC CTTGGAGGAA
951 GGGATCAAAA TGTCAAAGCC CAAATGGCCT CCTGAAGACG AAATCAGCAA
1001 GCCCGAAGTT CCTGAGGATG TCGATCTAGA TCTGAAGAAG CTAAGACGAT
1051 CTTCTTCACT GAAGGAAAGA AGCCGCCCAT TCACTGTAGC AGCTTCATTT
1101 CAAAGCACCT CTGTCAAGAG CCCAAAAACT GTGTCCCCAC CTATCAGGAA
1151 AGGCTGGAGC ATGTCAGAGC AGAGTGAAGA GTCTGTGGGT GGAAGAGTTG
1201 CAGAAAGGAA ACAAGTGGAA AATGCCAAGG CTTCTAAGAA GAATGGGAAT
1251 GTGGGAAAAA CAACCTGGCA AAACAAAGAA TCTAAAGGAG AGCAGGGAAG
1301 AGAAGTAAGG AAGGTCATAG TTTGGAGATG GAGAATGAGA ATCTTGTAGA
1351 AAATGGTGCA GACTCCGATG AAGATGATAA CAGCTTCCTC AAACAACAAT
1401 CTCCACAAGA ACCCAAGTCT CTGAATTGGT CGAGTTTTGT AGACAACACC
1451 TTTGCTGAAG AATTCACTAC TCAGAATCAG AAATCCCAGG ATGTGGAACT
1501 CTGGGAGGGA GAAGTGGTCA AAGAGCTCTC TGTGGAAGAA CAGATAAAGA
1551 GAAATCGGTA TTATGATGAG GATGAGGATG AAGAGTGACA AATTGCAATG
1601 ATGCTGGGCC TTAAATTCAT GTTAGTGTTA GCGAGCCACT GCCCTTTGTC
1651 AAAATGTGAT GCACATAAGC AGGTATCCCA GCATGAAATG TAATTTACTT
1701 GGAAGTAACT TTGGAAAAGA ATTCCTTCTT AAAATCAAAA AAAAAAAAAA
1751 AAAA
B:氨基酸序列:(SEQ ID NO:11)长度:301个氨基酸
1 MKKFQAPARE TCVECQKTVY XMERLLANQQ VFHISCLRCX YCXNKLSLGT
51 YASLHGRIYC KPHFNQLFKS KGNYDEGFGH RPHKDLWASK NENEEILERP
101 AQLANARETP HSPGVEDAPI AKVGVLAASM EAKASSQQEK EDKPAETKKL
151 RIAWPPPTEL GSSGSALEEG IKMSKPKWPP EDEISKPEVP EDVDLDLKKL
201 RRSSSLKERS RPFTVAASFQ STSVKSPKTV SPPIRKGWSM SEQSEESVGG
251 RVAERKQVEN AKASKKNGNV GKTTWQNKES KGEQGREVRK VIVWRWRMRI
301 L
C:核苷酸及氨基酸组合序列(SEQ ID NO:12)
克隆号和蛋白质名称:PP624
起始编码子: 444 ATG 终止编码子:1349 TAG
蛋白质分子量:33999.27
1 AG ATG ACC TGG AAA TAG GCC CAG GTC AGT TGT CAT CTT CTA CAT TTG 47
48 ACT CGG AGA AAA ATG AGA GTA GAC GAA ATC TGG AAC TTC CAC GCC TCT 95
96 CAG AAA CCT CTA TAA AGG ATC GAA TGG CCA AGT ACC AGG CAG CTG TGT 143
144 CCA AAC AAA GCA GCT CAA CCA ACT ATA CAA ATG AGC TGA AAG CCA GTG 191
192 GTG GCG AAA TCA AAA TTC ATA AAA TGG AGC AAA AGG AGA ATG TGC CCC 239
240 CAG GTC CTG AGG TCT GCA TCA CCC ATC AGG AAG GGG AAA AGA TTT CTG 287
288 CAA ATG AGA ATA GCC TGG CAG TCC GTT CCA CCC CTG CCG AAG ATG ACT 335
336 CCC GTG ACT CCC AGG TTA AGA GTG AGG TTC AAC AGC CTG TCC ATC CCA 383
384 AGC CAC TAA GTC CAG ATC TCC AGA GCC TCC AGT CTT TCT GAA AGT TCT 431
432 CCT CCC AAA GCA ATG AAG AAG TTT CAG GCA CCT GCA AGA GAG ACC TGC 479
1 Met Lys Lys Phe Gln Ala Pro Ala Arg Glu Thr Cys 12
480 GTG GAA TGT CAG AAG ACA GTC TAT RCA ATG GAG CGT CTC TTG GCC AAC 527
13 Val Glu Cys Gln Lys Thr Val Tyr Xxx Met Glu Arg Leu Leu Ala Asn 28
528 CAG CAG GTG TTT CAC ATC AGC TGC TTR CGT TGC TRC TAT TGC AKC AAC 575
29 Gln Gln Val Phe His Ile Ser Cys Leu Arg Cys Xxx Tyr Cys Xxx Asn 44
576 AAA CTC AGT CTA GGA ACA TAT GCA TCT TTA CAT GGA AGA ATC TAT TGT 623
45 Lys Leu Ser Leu Gly Thr Tyr Ala Ser Leu His Gly Arg Ile Tyr Cys 60
624 AAG CCT CAC TTC AAT CAA CTC TTT AAA TCT AAG GGC AAC TAT GAT GAA 671
61 Lys Pro His Phe Asn Gln Leu Phe Lys Ser Lys Gly Asn Tyr Asp Glu 76
672 GGC TTT GGG CAC AGA CCA CAC AAG GAT CTA TGG GCA AGC AAA AAT GAA 719
77 Gly Phe Gly His Arg Pro His Lys Asp Leu Trp Ala Ser Lys Asn Glu 92
720 AAC GAA GAG ATT TTG GAG AGA CCA GCC CAG CTT GCA AAT GCA AGG GAG 767
93 Asn Glu Glu Ile Leu Glu Arg Pro Ala Gln Leu Ala Asn Ala Arg Glu 108
768 ACC CCT CAC AGC CCA GGG GTA GAA GAT GCC CCT ATT GCT AAG GTG GGT 815
109 Thr Pro His Ser Pro Gly Val Glu Asp Ala Pro Ile Ala Lys Val Gly 124
816 GTC CTG GCT GCA AGT ATG GAA GCC AAG GCC TCC TCT CAG CAG GAG AAG 863
125 Val Leu Ala Ala Ser Met Glu Ala Lys Ala Ser Ser Gln Gln Glu Lys 140
864 GAA GAC AAG CCA GCT GAA ACC AAG AAG CTG AGG ATC GCC TGG CCA CCC 911
141 Glu Asp Lys Pro Ala Glu Thr Lys Lys Leu Arg Ile Ala Trp Pro Pro 156
912 CCC ACT GAA CTT GGA AGT TCA GGA AGT GCC TTG GAG GAA GGG ATC AAA 959
157 Pro Thr Glu Leu Gly Ser Ser Gly Ser Ala Leu Glu Glu Gly Ile Lys 172
960 ATG TCA AAG CCC AAA TGG CCT CCT GAA GAC GAA ATC AGC AAG CCC GAA 1007
173 Met Ser Lys Pro Lys Trp Pro Pro Glu Asp Glu Ile Ser Lys Pro Glu 188
1008 GTT CCT GAG GAT GTC GAT CTA GAT CTG AAG AAG CTA AGA CGA TCT TCT 1055
189 Val Pro Glu Asp Val Asp Leu Asp Leu Lys Lys Leu Arg Arg Ser Ser 204
1056 TCA CTG AAG GAA AGA AGC CGC CCA TTC ACT GTA GCA GCT TCA TTT CAA 1103
205 Ser Leu Lys Glu Arg Ser Arg Pro Phe Thr Val Ala Ala Ser Phe Gln 220
1104 AGC ACC TCT GTC AAG AGC CCA AAA ACT GTG TCC CCA CCT ATC AGG AAA 1151
221 Ser Thr Ser Val Lys Ser Pro Lys Thr Val Ser Pro Pro Ile Arg Lys 236
1152 GGC TGG AGC ATG TCA GAG CAG AGT GAA GAG TCT GTG GGT GGA AGA GTT 1199
237 Gly Trp Ser Met Ser Glu Gln Ser Glu Glu Ser Val Gly Gly Arg Val 252
1200 GCA GAA AGG AAA CAA GTG GAA AAT GCC AAG GCT TCT AAG AAG AAT GGG 1247
253 Ala Glu Arg Lys Gln Val Glu Asn Ala Lys Ala Ser Lys Lys Asn Gly 268
1248 AAT GTG GGA AAA ACA ACC TGG CAA AAC AAA GAA TCT AAA GGA GAG CAG 1295
269 Asn Val Gly Lys Thr Thr Trp Gln Asn Lys Glu Ser Lys Gly Glu Gln 284
1296 GGA AGA GAA GTA AGG AAG GTC ATA GTT TGG AGA TGG AGA ATG AGA ATC 1343
285 Gly Arg Glu Val Arg Lys Val Ile Val Trp Arg Trp Arg Met Arg Ile 300
1344 TTG TAG AAA ATG GTG CAG ACT CCG ATG AAG ATG ATA ACA GCT TCC TCA 1391
301 Leu *** 302
1392 AAC AAC AAT CTC CAC AAG AAC CCA AGT CTC TGA ATT GGT CGA GTT TTG 1439
1440 TAG ACA ACA CCT TTG CTG AAG AAT TCA CTA CTC AGA ATC AGA AAT CCC 1487
1488 AGG ATG TGG AAC TCT GGG AGG GAG AAG TGG TCA AAG AGC TCT CTG TGG 1535
1536 AAG AAC AGA TAA AGA GAA ATC GGT ATT ATG ATG AGG ATG AGG ATG AAG 1583
1584 AGT GAC AAA TTG CAA TGA TGC TGG GCC TTA AAT TCA TGT TAG TGT TAG 1631
1632 CGA GCC ACT GCC CTT TGT CAA AAT GTG ATG CAC ATA AGC AGG TAT CCC 1679
1680 AGC ATG AAA TGT AAT TTA CTT GGA AGT AAC TTT GGA AAA GAA TTC CTT 1727
1728 CTT AAA ATC AAA AAA AAA AAA AAA AAA 1754
5.PP722
A:核苷酸序列:(SEQ ID NO:13)长度:1690bp
1 GTCTGACCCA GGCCTGCCTC CCTTCCCTAG GCCTGGCTCC TTCTGTTGAC
51 ATGGGAGATT TTAGCTCATC TTGGGGGCCT CCTTAAACAC CCCCATTTCT
101 TGCGGAAGAT GCTCCCCATC CCACTGACTG CTTGACCTTT ACCTCCAACC
151 CTTCTGTTCA TCGGGAGGGC TCCACCAATT GAGTCTCTCC CACCATGCAT
201 GCAGGTCACT GTGTGTGTGC ATGTGTGCCT GTGTGAGTGT TGACTGACTG
251 TGTGTGTGTG GAGGGGTGAC TGTCCGTGGA GGGGTGACTG TGTCCGTGGT
301 GTGTATTATG CTGTCATATC AGAGTCAAGT GAACTGTGGT GTATGTGCCA
351 CGGGATTTGA GTGGTTGCCG TGGGCAACAC TGTCAGGGTT TGGCGTGTGT
401 GTCATGTGGC TGTGTGTGAC CTCTGCCTGA AAAAGCAGGT ATTTTCTCAG
451 ACCCCAGAGC AGTATTAATG ATGCAGAGGT TGGAGGAGAG AGGTGGAGAC
501 TGTGGCTCAG ACCCAGGTGT GCGGGCATAG CTGGAGCTGG AATCTGCCTC
551 CGGTGTGAGG GAACCTGTCT CCTACCACTT CGGAGCCATG GGGGCAAGTG
601 TGAAGCAGCC AGTCCCTGGG TCAGCCAGAG GCTTGAACTG TTACAGAAGC
651 CCTCTGCCCT CTGGTGGCCT CTGGGCCTGC TGCATGTACA TATTTTCTGT
701 AAATATACAT GCGCCGGGAG CTTCTTGCAG GAATACTGCT CCGAATCACT
751 TTTAATTTTT TTCTTTTTTT TTTCTTGCCC TTTCCATTAG TTGTATTTTT
801 TATTTATTTT TATTTTTATT TTTTTTTAGA GATGGAGTCT CACTATGTTG
851 CTCAGGCTGG CCTTGAACTC CTGGGCTCAA GCAATCCTCC TGCCTCAGCC
901 TCCCTAGTAG CTGGGACTTT AAGTGTACAC CACTGTGCCT GCTTTGAATC
951 CTTTACGAAG AGAAAAAAAA AATTAAAGAA AGCCTTTAGA TTTATCCAAT
1001 GTTTACTACT GGGATTGCTT AAAGTGAGGC CCCTCCAACA CCAGGGGGTT
1051 AATTCCTGTG ATTGTGAAAG GGGCTACTTC CAAGGCATCT TCATGCAGGC
1101 AGCCCCTTGG GAGGGCACCT GAGAGCTGGT AGAGTCTGAA ATTAGGGATG
1151 TGAGCCTCGT GGTTACTGAG TAAGGTAAAA TTGCATCCAC CATTGTTTGT
1201 GATACCTTAG GGAATTGCTT GGACCTGGTG ACAAGGGCTC CTGTTCAATA
1251 GTGGTGTTGG GGAGAGAGAG AGCAGTGATT ATAGACCGAG AGAGTAGGAG
1301 TTGAGGTGAG GTGAAGGAGG TGCTGGGGGT GAGAATGTCG CCTTTCCCCC
1351 TGGGTTTTGG ATCACTAATT CAAGGCTCTT CTGGATGTTT CTCTGGGTTG
1401 GGGCTGGAGT TCAATGAGGT TTATTTTTAG CTGGCCCACC CAGATACACT
1451 CAGCCAGAAT ACCTAGATTT AGTACCCAAA CTCTTCTTAG TCTGAAATCT
1501 GCTGGATTTC TGGCCTAAGG GAGAGGCTCC CATCCTTCGT TCCCCAGCCA
1551 GCCTAGGACT TCGAATGTGG AGCCTGAAGA TCTAAGATCC TAACATGTAC
1601 ATTTTATGTA AATATGTGCA TATTTGTACA TAAAATGATA TTCTGTTTTT
1651 AAATAAACAG ACAAAACTTG AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA
B:氨基酸序列:PP722(SEQ ID NO:14)长度:137个氨基酸
1 MRRELLAGIL LRITFNFFLF FFLPFPLVVF FIYFYFYFFL EMESHYVAQA
51 GLELLGSSNP PASASLVAGT LSVHHCACFE SFTKRKKKLK KAFRFIQCLL
101 LGLLKVRPLQ HQGVNSCDCE RGYFQGIFMQ AAPWEGT
C:核苷酸及氨基酸组合序列(SEQ ID NO:14)
克隆号和蛋白质名称:PP722
起始编码子: 709 ATG 终止编码子:1122 TGA
蛋白质分子量:15824.94
1 GTC TGA CCC AGG CCT GCC TCC CTT CCC TAG GCC TGG CTC CTT CTG TTG 48
49 ACA TGG GAG ATT TTA GCT CAT CTT GGG GGC CTC CTT AAA CAC CCC CAT 96
97 TTC TTG CGG AAG ATG CTC CCC ATC CCA CTG ACT GCT TGA CCT TTA CCT 144
145 CCA ACC CTT CTG TTC ATC GGG AGG GCT CCA CCA ATT GAG TCT CTC CCA 192
193 CCA TGC ATG CAG GTC ACT GTG TGT GTG CAT GTG TGC CTG TGT GAG TGT 240
241 TGA CTG ACT GTG TGT GTG TGG AGG GGT GAC TGT CCG TGG AGG GGT GAC 288
289 TGT GTC CGT GGT GTG TAT TAT GCT GTC ATA TCA GAG TCA AGT GAA CTG 336
337 TGG TGT ATG TGC CAC GGG ATT TGA GTG GTT GCC GTG GGC AAC ACT GTC 384
385 AGG GTT TGG CGT GTG TGT CAT GTG GCT GTG TGT GAC CTC TGC CTG AAA 432
433 AAG CAG GTA TTT TCT CAG ACC CCA GAG CAG TAT TAA TGA TGC AGA GGT 480
481 TGG AGG AGA GAG GTG GAG ACT GTG GCT CAG ACC CAG GTG TGC GGG CAT 528
529 AGC TGG AGC TGG AAT CTG CCT CCG GTG TGA GGG AAC CTG TCT CCT ACC 576
577 ACT TCG GAG CCA TGG GGG CAA GTG TGA AGC AGC CAG TCC CTG GGT CAG 624
625 CCA GAG GCT TGA ACT GTT ACA GAA GCC CTC TGC CCT CTG GTG GCC TCT 672
673 GGG CCT GCT GCA TGT ACA TAT TTT CTG TAA ATA TAC ATG CGC CGG GAG 720
1 Met Arg Arg Glu 4
721 CTT CTT GCA GGA ATA CTG CTC CGA ATC ACT TTT AAT TTT TTT CTT TTT 768
5 Leu Leu Ala Gly Ile Leu Leu Arg Ile Thr Phe Asn Phe Phe Leu Phe 20
769 TTT TTC TTG CCC TTT CCA TTA GTT GTA TTT TTT ATT TAT TTT TAT TTT 816
21 Phe Phe Leu Pro Phe Pro Leu Val Val Phe Phe Ile Tyr Phe Tyr Phe 36
817 TAT TTT TTT TTA GAG ATG GAG TCT CAC TAT GTT GCT CAG GCT GGC CTT 864
37 Tyr Phe Phe Leu Glu Met Glu Ser His Tyr Val Ala Gln Ala Gly Leu 52
865 GAA CTC CTG GGC TCA AGC AAT CCT CCT GCC TCA GCC TCC CTA GTA GCT 912
53 Glu Leu Leu Gly Ser Ser Asn Pro Pro Ala Ser Ala Ser Leu Val Ala 68
913 GGG ACT TTA AGT GTA CAC CAC TGT GCC TGC TTT GAA TCC TTT ACG AAG 960
69 Gly Thr Leu Ser Val His His Cys Ala Cys Phe Glu Ser Phe Thr Lys 84
961 AGA AAA AAA AAA TTA AAG AAA GCC TTT AGA TTT ATC CAA TGT TTA CTA 1008
85 Arg Lys Lys Lys Leu Lys Lys Ala Phe Arg Phe Ile Gln Cys Leu Leu 100
1009 CTG GGA TTG CTT AAA GTG AGG CCC CTC CAA CAC CAG GGG GTT AAT TCC 1056
101 Leu Gly Leu Leu Lys Val Arg Pro Leu Gln His Gln Gly Val Asn Ser 116
1057 TGT GAT TGT GAA AGG GGC TAC TTC CAA GGC ATC TTC ATG CAG GCA GCC 1104
117 Cys Asp Cys Glu Arg Gly Tyr Phe Gln Gly Ile Phe Met Gln Ala Ala 132
1105 CCT TGG GAG GGC ACC TGA GAG CTG GTA GAG TCT GAA ATT AGG GAT GTG 1152
133 Pro Trp Glu Gly Thr *** 138
1153 AGC CTC GTG GTT ACT GAG TAA GGT AAA ATT GCA TCC ACC ATT GTT TGT 1200
1201 GAT ACC TTA GGG AAT TGC TTG GAC CTG GTG ACA AGG GCT CCT GTT CAA 1248
1249 TAG TGG TGT TGG GGA GAG AGA GAG CAG TGA TTA TAG ACC GAG AGA GTA 1296
1297 GGA GTT GAG GTG AGG TGA AGG AGG TGC TGG GGG TGA GAA TGT CGC CTT 1344
1345 TCC CCC TGG GTT TTG GAT CAC TAA TTC AAG GCT CTT CTG GAT GTT TCT 1392
1393 CTG GGT TGG GGC TGG AGT TCA ATG AGG TTT ATT TTT AGC TGG CCC ACC 1440
1441 CAG ATA CAC TCA GCC AGA ATA CCT AGA TTT AGT ACC CAA ACT CTT CTT 1488
1489 AGT CTG AAA TCT GCT GGA TTT CTG GCC TAA GGG AGA GGC TCC CAT CCT 1536
1537 TCG TTC CCC AGC CAG CCT AGG ACT TCG AAT GTG GAG CCT GAA GAT CTA 1584
1585 AGA TCC TAA CAT GTA CAT TTT ATG TAA ATA TGT GCA TAT TTG TAC ATA 1632
1633 AAA TGA TAT TCT GTT TTT AAA TAA ACA GAC AAA ACT TGA AAA AAA AAA 1680
1681 AAA AAA AAA A 1690
6.PP902
A:核苷酸序列:(SEQ ID NO:16)长度:2136bp
1 TGTCGCTGCC GGAGAGTCTC TGCTTCCCCC TTCCTACGCG CTCCGCGGCG
51 GTAGCTCGGG CTCTCCGGAG GAGGGGGCGA CAGAGAAAAA GAGAGGCTGA
101 CTTAATAAAG TTTCCTGAAA CAACAACTAC CACCGAAAAG GCCCAAGGTG
151 GGGGGAGACC CCCATTTTCC TCCGCCCCTC TCCTAAAGCC TGAGGGACCG
201 TTGCAGGTGG AGCGGCGCTG GTGGGACCCG GGTTGCGGCG GCAGCCGTTG
251 CCCCGGCGAG GGAAGCCTCA GGTCCTGCCC GCTCCGGTTC CGGCTCCTTC
301 GGTGGTGGCG GCGGCAGCTG CTGCCGGGCG GTTCCTCCTG TCAACTGCCT
351 CCGCCCGCGC GCCTCCCGCC TAGCCACACA GCGCGGAGGA CGCCGTGAGC
401 CGCCGCCGCA GTCGTCTCGG CCCGCGGAGG GACGTGGTGA GCTGTGGCGC
451 TTCCGCGTCA GCGCCGGCGG GGACTCTTTG GGAGCGCGTC GGGCCCGAGT
501 CCGGGTTCCC CCGCGTGGTC AGCGGAGGCT GCGCCAGGTG GGGCCCGCAG
551 CCGCCTCCCA CGCCAGGCTG TCCCCGCGGC CGCCCGGCCT GCCTTCCTTC
601 CTTCCGCCCG CCCGCCGGCC CGCCCTAAGA GTTGACCACG CCGCAATGAA
651 GAGCTTCTTA CAGTGAAAGC AAAGTAGGTC GAGTCCACTG AAAATGCCTT
701 TAAGGGACAA ATACTGTCAG ACTGACCACC ATCATCACGG ATGCTGTGAA
751 CCAGTTTATA TCCTGGAACC TGGAGATCCT CCTTTGTTAC AGCAACCACT
801 ACAGACATCC AAATCTGGTA TTCAACAAAT AATTGAGTGC TTTCGATCAG
851 GAACTAAACA ACTTAAGCAT ATTTTATTAA AAGATGTGGA CACTATTTTT
901 GAATGTAAGT TATGCCGCAG TCTCTTCAGA GGATTACCAA ATTTAATTAC
951 CCATAAAAAA TTCTACTGCC CACCAAGTCT CCAGATGGAT GACAACCTTC
1001 CTGATGTAAA TGATAAACAA AGCGAAGCCA TAAATGATCT CCTAGAAGCC
1051 ATATATCCAA GTGTGGACAA ACGAGAATAT ATTATTAAGC TAGAACCCAT
1101 AGAAACTAAT CAAAATGCAG TATTTCAATA TATTTCGAGG ACTGATAATC
1151 CTATTGAAGT CACAGAGTCA AGCAGTACTC CTGAACAAAC CGAAGTTCAG
1201 ATACAGGAAA CTAGCACTGA ACAGTCAAAA ACAGTACCGG TTACAGATAC
1251 AGAGGTGGAA ACTGTAGAGC CCCCTCCTGT TGAGATTGTT ACAGATGAAG
1301 TTGCACCTAC ATCTGATGAA CAACCTCAGG AGTCGCAGGC TGACTTGGAA
1351 ACTTCTGACA ATTCTGATTT TGGTCACCAG TTGATATGTT GTCTTTGTAG
1401 AAAAGAATTC AATTCTAGAC GAGGTGTTCG CCGTCACATT CGAAAAGTAC
1451 ACAAGAAAAA GATGGAAGAA CTAAAAAAGT ACATTGAAAC ACGAAAGAAT
1501 CCAAACCAAT CCTCTAAAGG ACGCAGTAAG AATGTTCTAG TTCCATTAAG
1551 TAGGAGTTGT CCAGTATGTT GTAAATCATT TGCTACAAAA GCGAATGTAA
1601 GGAGGCATTT TGATGAAGTT CATAGAGGAC TAAGGAGGGA TTCAATTACT
1651 CCTGATATAG CAACAAAGCC TGGGCAACCT TTGTTCCTGG ATTCATATTT
1701 CTCCTAAAAA ATCTTTTAAG ACTCGAAAAC AAAAGTCTTC TTCAAAGGCT
1751 GAATACAATT TAACTGCATG CAAATGCCTC CTTTGCAAGA GGAAATATAG
1801 TTCACAAATA ATGCTTAAAA GACATATGCA AATTGTCCAC AAGATAACTC
1851 TTTCTGGAAC AAACTCTAAA AGAGAAAAAG GCCCTAATAA TACTGCCAAC
1901 AGTTCAGAAA TAAAAGTTAA AGTTGAACCA GCAGATTCTG TAGAATCTTC
1951 ACCCCCTTCC ATTACCCATT CTCCACAGAA TGAATTAAAG GGAACAAATC
2001 ATTCAAATGA AAAAAAGAAC ACACCGGCAG CACAGAAAAA TAAAGTTAAA
2051 CAAGACTCTG AAAGCCCTAA ATCAACTAGT CCGTCGGCTG CAGGTGGCCA
2101 GCAAAAATAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAA
B:氨基酸序列:(SEQ ID NO:17)长度:337个氨基酸
1 MPLRDKYCQT DHHHHGCCEP VYILEPGDPP LLQQPLQTSK SGIQQIIECF
51 RSGTKQLKHI LLKDVDTIFE CKLCRSLFRG LPNLITHKKF YCPPSLQMDD
101 NLPDVNDKQS QAINDLLEAI YPSVDKREYI IKLEPIETNQ NAVFQYISRT
151 DNPIEVTESS STPEQTEVQI QETSTEQSKT VPVTDTEVET VEPPPVEIVT
201 DEVAPTSDEQ PQESQADLET SDNSDFGHQL ICCLCRKEFN SRRGVRRHIR
251 KVHKKKMEEL KKYIETRKNP NQSSKGRSKN VLVPLSRSCP VCCKSFATKA
301 NVRRHFDEVH RGLRRDSITP DIATKPGQPL FLDSYFS
C:核苷酸及氨基酸组合序列(SEQ ID NO:18)
克隆号和蛋白质名称:PP902
起始编码子: 694 ATG 终止编码子:1707 TAA
蛋白质分子量:38572.81
1 TGT CGC TGC CGG AGA GTC TCT GCT TCC CCC TTC CTA CGC GCT CCG CGG 48
49 CGG TAG CTC GGG CTC TCC GGA GGA GGG GGC GAC AGA GAA AAA GAG AGG 96
97 CTG ACT TAA TAA AGT TTC CTG AAA CAA CAA CTA CCA CCG AAA AGG CCC 144
145 AAG GTG GGG GGA GAC CCC CAT TTT CCT CCG CCC CTC TCC TAA AGC CTG 192
193 AGG GAC CGT TGC AGG TGG AGC GGC GCT GGT GGG ACC CGG GTT GCG GCG 240
241 GCA GCC GTT GCC CCG GCG AGG GAA GCC TCA GGT CCT GCC CGC TCC GGT 288
289 TCC GGC TCC TTC GGT GGT GGC GGC GGC AGC TGC TGC CGG GCG GTT CCT 336
337 CCT GTC AAC TGC CTC CGC CCG CGC GCC TCC CGC CTA GCC ACA CAG CGC 384
385 GGA GGA CGC CGT GAG CCG CCG CCG CAG TCG TCT CGG CCC GCG GAG GGA 432
433 CGT GGT GAG CTG TGG CGC TTC CGC GTC AGC GCC GGC GGG GAC TCT TTG 480
481 GGA GCG CGT CGG GCC CGA GTC CGG GTT CCC CCG CGT GGT CAG CGG AGG 528
529 CTG CGC CAG GTG GGG CCC GCA GCC GCC TCC CAC GCC AGG CTG TCC CCG 576
577 CGG CCG CCC GGC CTG CCT TCC TTC CTT CCG CCC GCC CGC CGG CCC GCC 624
625 CTA AGA GTT GAC CAC GCC GCA ATG AAG AGC TTC TTA CAG TGA AAG CAA 672
673 AGT AGG TCG AGT CCA CTG AAA ATG CCT TTA AGG GAC AAA TAC TGT CAG 720
1 Met Pro Leu Arg Asp Lys Tyr Cys Gln 9
721 ACT GAC CAC CAT CAT CAC GGA TGC TGT GAA CCA GTT TAT ATC CTG GAA 768
10 Thr Asp His His His His Gly Cys Cys Glu Pro Val Tyr Ile Leu Glu 25
769 CCT GGA GAT CCT CCT TTG TTA CAG CAA CCA CTA CAG ACA TCC AAA TCT 816
26 Pro Gly Asp Pro Pro Leu Leu Gln Gln Pro Leu Gln Thr Ser Lys Ser 41
817 GGT ATT CAA CAA ATA ATT GAG TGC TTT CGA TCA GGA ACT AAA CAA CTT 864
42 Gly Ile Gln Gln Ile Ile Glu Cys Phe Arg Ser Gly Thr Lys Gln Leu 57
865 AAG CAT ATT TTA TTA AAA GAT GTG GAC ACT ATT TTT GAA TGT AAG TTA 912
58 Lys His Ile Leu Leu Lys Asp Val Asp Thr Ile Phe Glu Cys Lys Leu 73
913 TGC CGC AGT CTC TTC AGA GGA TTA CCA AAT TTA ATT ACC CAT AAA AAA 960
74 Cys Arg Ser Leu Phe Arg Gly Leu Pro Asn Leu Ile Thr His Lys Lys 89
961 TTC TAC TGC CCA CCA AGT CTC CAG ATG GAT GAC AAC CTT CCT GAT GTA 1008
90 Phe Tyr Cys Pro Pro Ser Leu Gln Met Asp Asp Asn Leu Pro Asp Val 105
1009 AAT GAT AAA CAA AGC CAA GCC ATA AAT GAT CTC CTA GAA GCC ATA TAT 1056
106 Asn Asp Lys Gln Ser Gln Ala Ile Asn Asp Leu Leu Glu Ala Ile Tyr 121
1057 CCA AGT GTG GAC AAA CGA GAA TAT ATT ATT AAG CTA GAA CCC ATA GAA 1104
122 Pro Ser Val Asp Lys Arg Glu Tyr Ile Ile Lys Leu Glu Pro Ile Glu 137
1105 ACT AAT CAA AAT GCA GTA TTT CAA TAT ATT TCG AGG ACT GAT AAT CCT 1152
138 Thr Asn Gln Asn Ala Val Phe Gln Tyr Ile Ser Arg Thr Asp Asn Pro 153
1152 ATT GAA GTC ACA GAG TCA AGC AGT ACT CCT GAA CAA ACC GAA GTT CAG 1200
154 Ile Glu Val Thr Glu Ser Ser Ser Thr Pro Glu Gln Thr Glu Val Gln 169
1201 ATA CAG GAA ACT AGC ACT GAA CAG TCA AAA ACA GTA CCG GTT ACA GAT 1248
170 Ile Gln Glu Thr Ser Thr Glu Gln Ser Lys Thr Val Pro Val Thr Asp 185
1249 ACA GAG GTG GAA ACT GTA GAG CCC CCT CCT GTT GAG ATT GTT ACA GAT 1296
186 Thr Glu Val Glu Thr Val Glu Pro Pro Pro Val Glu Ile Val Thr Asp 201
1297 GAA GTT GCA CCT ACA TCT GAT GAA CAA CCT CAG GAG TCG CAG GCT GAC 1244
202 Glu Val Ala Pro Thr Ser Asp Glu Gln Pro Gln Glu Ser Gln Ala Asp 217
1345 TTG GAA ACT TCT GAC AAT TCT GAT TTT GGT CAC CAG TTG ATA TGT TGT 1392
218 Leu Glu Thr Ser Asp Asn Ser Asp Phe Gly His Gln Leu Ile Cys Cys 233
1393 CTT TGT AGA AAA GAA TTC AAT TCT AGA CGA GGT GTT CGC CGT CAC ATT 1440
234 Leu Cys Arg Lys Glu Phe Asn Ser Arg Arg Gly Val Arg Arg His Ile 249
1441 CGA AAA GTA CAC AAG AAA AAG ATG GAA GAA CTA AAA AAG TAC ATT GAA 1488
250 Arg Lys Val His Lys Lys Lys Met Glu Glu Leu Lys Lys Tyr Ile Glu 265
1489 ACA CGA AAG AAT CCA AAC CAA TCC TCT AAA GGA CGC AGT AAG AAT GTT 1536
266 Thr Arg Lys Asn Pro Asn Gln Ser Ser Lys Gly Arg Ser Lys Asn Val 281
1537 CTA GTT CCA TTA AGT AGG AGT TGT CCA GTA TGT TGT AAA TCA TTT GCT 1584
282 Leu Val Pro Leu Ser Arg Ser Cys Pro Val Cys Cys Lys Ser Phe Ala 297
1585 ACA AAA GCG AAT GTA AGG AGG CAT TTT GAT GAA GTT CAT AGA GGA CTA 1632
298 Thr Lys Ala Asn Val Arg Arg His Phe Asp Glu Val His Arg Gly Leu 313
1633 AGG AGG GAT TCA ATT ACT CCT GAT ATA GCA ACA AAG CCT CGG CAA CCT 1680
314 Arg Arg Asp Ser Ile Thr Pro Asp Ile Ala Thr Lys Pro Gly Gln Pro 329
1681 TTG TTC CTG GAT TCA TAT TTC TCC TAA AAA ATC TTT TAA GAC TCG AAA 1728
330 Leu Phe Leu Asp Ser Tyr Phe Ser *** 338
1729 ACA AAA GTC TTC TTC AAA GGC TGA ATA CAA TTT AAC TGC ATG CAA ATG 1776
1777 CCT CCT TTG CAA GAG GAA ATA TAG TTC ACA AAT AAT GCT TAA AAG ACA 1824
1825 TAT GCA AAT TGT CCA CAA GAT AAC TCT TTC TGG AAC AAA CTC TAA AAG 1872
1873 AGA AAA AGG CCC TAA TAA TAC TGC CAA CAG TTC AGA AAT AAA AGT TAA 1920
1921 AGT TGA ACC AGC AGA TTC TGT AGA ATC TTC ACC CCC TTC CAT TAC CCA 1968
1969 TTC TCC ACA GAA TGA ATT AAA GGG AAC AAA TCA TTC AAA TGA AAA AAA 2016
2017 GAA CAC ACC GGC AGC ACA GAA AAA TAA AGT TAA ACA AGA CTC TGA AAG 2064
2065 CCC TAA ATC AAC TAG TCC GTC GGC TGC AGG TGG CCA GCA AAA ATA AAA 2112
2113 AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA 2136
7.PP1628
A:核苷酸序列:(SEQ ID NO:19)长度:1913bp
1 GCTGGGAGCA CACACGCTGG GACCTATGTG TTTGTGTGGT CGTTCCAAAC
51 TGCCCCAGGG CTTTGGGGGC GGCACTTGGG GTTTCTGGGA ATGACATCAT
101 CTCTGTTCCC CATCCCCAGT AGTTTACATT CCTGACTTCT GAATACAGCA
151 CAGCTGAGCC CCCTGCAGCT CCGATCTCCA GCTATTCCTA GGCAAAGAGC
201 CTCATGGCTA AGGCAGCCTC AAAGCCAGCC CCTCCTCCCA CCTATTCTGA
251 GTAGCTGCAG AGGCCTTGGG TCCAGGCTCT AGGTTCATCC CTCAGTTGGG
301 GGGAACGTAG GACCCAGCTG GAGCCTCTTG AGGGAGATGA GAGGCCTCTT
351 TGTGAGGAGG ACATTAGCTG TGTGGCCTCT CTCTCTTTGG CCCTGTTTCC
401 TTTTTTGCAA AACAAGGACA TTTTCTGCAG CCCCTTCCTC TCAGTGAGCT
451 ATGATTGGAG GGCTTAGGTC TGGAGGATTC AAGAGTGGGA AGAGGAATTT
501 AAGGGGGTCC CCTAGTCTAG TCTCTGCCCC TGGATAGTGT CCAGCCTTTA
551 TATTTCTGAA GAGGTGGATC CCAGAGTGGC TCTGATGTCC ACATTAGAAA
601 AGCTTACTTG TAATGATCAT GTCAGCCTTC AGAAGAGAAT CCCCACCAAC
651 TTCTGTGCCT CCTCAGATGG GGATTTATCT GGATCTCTGT GGTTCCTTCT
701 CAGCCGAAAC AGGTCCAGTA TCCCAGTCAT TTCTTCAAAT GCTGATAGGG
751 GTATGTTGGA ATCCGAAGCC ACTTCCCCGC CTTCAAGCCC CAGATGGGCT
801 GCTCTCCTGT AACTTTCTAG GAGAAGAGAC ATTTTCTTCT TTCCCTTTCC
851 TGGTCCATCC CTGCACCCTG GTCCTCTCCC AGCCTCTCCC CCACATTGTC
901 CCTGACTCTA GGGGCACATC CAGTCTCCAT CGTGCTGCAG CAGCTGGACT
951 GAGGGCAGAG CCTGTAGGTG CAGAGGCCCT GGCTCCCGAG GTCCAGCCAC
1001 TCTCCCTGGG GCCTCTGGGG TGAGAGCAGC TTCCGATAGG ACCTGCCCAG
1051 ATTTCTGCAT GTGCACTTTT GTTTACTGAA AGAGAGAAAG GGGGGGGTCA
1101 CAGCAACATG CCCTGGCCTT TCTGCCCTGT TCCCCAACCC CACTGAGGCC
1151 TGCTGCACAG GTCAATGCCT TCGTTATCGT TATTGTACTG TCACTTTGTT
1201 CTTGAGGTAG TAGTCAAGGA TCAGGAGGGG CAGATGTCTT CTCTGGGCTG
1251 CGTGGGGCCG GAGCAGAGGT GAGCAGCAAT GCACTGGTTC GGGAGCCCCC
1301 ATCAGCCTCC TTGTGCAAAC TGGGCCCCCA TGCCACAGTC TGGCTTTCCC
1351 TCCATCTGCC CCAGGACAAG AGCAAGAAGG ACATCAGTTG CCCAGTCATG
1401 TGATCCCCTG CCATCTTGCC TTAGGAACAG CCTTCCCCCA CCAGCAGCCA
1451 TGGCTGGCTG GGGCGTTAGC CAAGCCACCT ACTGCCAGGA ATTGGAGCCT
1501 CAGTTCCCTC CTGTGTCAAG TAGCTAACTG CAGCAGCTGG ACTGAGGGCA
1551 GAGTCTGTGG GTGCAGAGAC CCTGCATGTA GGTCACAGGT TGAGGCCCAG
1601 CCACTCTCCC TGGGGCCTGG TGGGTAGGCA AGTAGCTCTG GGGCCACCTC
1651 AAGTGACCAA ATGCTATTAA TTTCCATCCT TTAGCAGGCT GGGCCCTAGG
1701 CAGGAAGCTG GCTTCTGGGA GAGGAGTGAG AACGTGCAGG GCCTGCCTAG
1751 CTTGCGTGCT TGAGGAAGGT GGCATTCCGT GCTTGCCTCC TTGAGGAGGG
1801 TGGCATTCTG TGTCTTCTGC TTATGAAGCG CCTTTCTTAA AGTTTGGCAA
1851 TAAATCCATT TTTATGGAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA
1901 AAAAAAAAAA AAA
B:氨基酸序列:(SEQ ID NO:20)长度:136个氨基酸
1 MIMSAFRRES PPTSVPPQMG IYLDLCGSFS AETGPVSQSF LQMLIGVCWN
51 PKPLPRLQAP DGLLSCNFLG EETFSSFPFL VHPCTLVLSQ PLPHIVPDSR
101 GTSSLHRAAA AGLRAEPVGA EALAPEVQPL SLGPLG
C:核苷酸及氨基酸组合序列(SEQ ID NO:21)
克隆号和蛋白质名称:PP1628
起始编码子: 613 ATG 终止编码子:1023 TGA
蛋白质分子量:14421.90
1 GCT GGG ACC ACA CAC GCT GGG ACC TAT GTG TTT GTG TGG TCG TTC CAA 48
49 ACT GCC CCA GGG CTT TGG GGG CGG CAC TTG GGG TTT CTG GGA ATG ACA 96
97 TCA TCT CTG TTC CCC ATC CCC AGT AGT TTA CAT TCC TGA CTT CTG AAT 144
145 ACA GCA CAG CTG AGC CCC CTG CAG CTC CCA TCT CCA GCT ATT CCT AGG 192
193 CAA AGA GCC TCA TGG CTA AGG CAG CCT CAA AGC CAG CCC CTC CTC CCA 240
241 CCT ATT CTG AGT AGC TGC AGA GGC CTT GGG TCC AGG CTC TAG GTT CAT 288
289 CCC TCA GTT GGG GGG AAC GTA GGA CCC AGC TGG AGC CTC TTG AGG GAG 336
337 ATG AGA GGC CTC TTT GTG AGG AGG ACA TTA GCT GTG TGG CCT CTC TCT 384
385 CTT TGG CCC TGT TTC CTT TTT TGC AAA ACA AGG ACA TTT TCT GCA GCC 432
433 CCT TCC TCT CAG TGA GCT ATG ATT GGA GGG CTT AGG TCT GGA GGA TTC 480
481 AAG AGT GGG AAG AGG AAT TTA AGG GGG TCC CCT AGT CTA GTC TCT GCC 528
529 CCT GGA TAG TGT CCA GCC TTT ATA TTT CTG AAG AGG TGG ATC CCA GAG 576
577 TGG CTC TGA TGT CCA CAT TAG AAA AGC TTA CTT GTA ATG ATC ATG TCA 624
1 Met Ile Met Ser 4
625 GCC TTC AGA AGA GAA TCC CCA CCA ACT TCT GTG CCT CCT CAG ATG GGG 672
5 Ala Phe Arg Arg Glu Ser Pro Pro Thr Ser Val Pro Pro Gln Met Gly 20
673 ATT TAT CTG GAT CTC TGT GGT TCC TTC TCA GCC GAA ACA GGT CCA GTA 720
21 Ile Tyr Leu Asp Leu Cys Gly Ser Phe Ser Ala Glu Thr Gly Pro Val 36
721 TCC CAG TCA TTT CTT CAA ATG CTG ATA GGG GTA TGT TGG AAT CCG AAG 768
37 Ser Gln Ser Phe Leu Gln Met Leu Ile Gly Val Cys Trp Asn Pro Lys 52
769 CCA CTT CCC CGC CTT CAA GCC CCA GAT GGG CTG CTC TCC TGT AAC TTT 816
53 Pro Leu Pro Arg Leu Gln Ala Pro Asp Gly Leu Leu Ser Cys Asn Phe 68
817 CTA GGA GAA GAG ACA TTT TCT TCT TTC CCT TTC CTG GTC CAT CCC TGC 864
69 Leu Gly Glu Glu Thr Phe Ser Ser Phe Pro Phe Leu Val His Pro Cys 84
865 ACC CTG GTC CTC TCC CAG CCT CTC CCC CAC ATT GTC CCT GAC TCT AGG 912
85 Thr Leu Val Leu Ser Gln Pro Leu Pro His Ile Val Pro Asp Ser Arg 100
913 GGC ACA TCC AGT CTC CAT CGT GCT GCA GCA GCT GGA CTG AGG GCA GAG 960
101 Gly Thr Ser Ser Leu His Arg Ala Ala Ala Ala Gly Leu Arg Ala Glu 116
961 CCT GTA GGT GCA GAG GCC CTG GCT CCC GAG GTC CAG CCA CTC TCC CTG 1008
117 Pro Val Gly Ala Glu Ala Leu Ala Pro Glu Val Gln Pro Leu Ser Leu 132
1009 GGG CCT CTG GGG TGA GAG CAG CTT CCG ATA GGA CCT GCC CAG ATT TCT 1056
133 Gly Pro Leu Gly *** 137
1057 GCA TGT GCA CTT TTG TTT ACT GAA AGA GAG AAA GGG GGG GGT CAC AGC 1104
1105 AAC ATG CCC TGG CCT TTC TGC CCT GTT CCC CAA CCC CAC TGA GGC CTG 1152
1153 CTG CAC AGG TCA ATG CCT TCG TTA TCG TTA TTG TAC TGT CAC TTT GTT 1200
1201 CTT GAG GTA GTA GTC AAG GAT CAG GAG GGG CAG ATG TCT TCT CTG GGC 1248
1249 TGC GTG GGG CCG GAG CAG AGG TGA GCA GCA ATG CAC TGG TTC GGG AGC 1296
1297 CCC CAT CAG CCT CCT TGT GCA AAC TGG GCC CCC ATG CCA CAG TCT GGC 1344
1345 TTT CCC TCC ATC TGC CCC AGG ACA AGA GCA AGA AGG ACA TCA GTT GCC 1392
1393 CAG TCA TGT GAT CCC CTG CCA TCT TGC CTT AGG AAC AGC CTT CCC CCA 1440
1441 CCA GCA GCC ATG GCT GGC TGG GGC GTT AGC CAA GCC ACC TAC TGC CAG 1488
1489 GAA TTG GAG CCT CAG TTC CCT CCT GTG TCA AGT AGC TAA CTG CAG CAG 1536
1537 CTG GAC TGA GGG CAG AGT CTG TGG GTG CAG AGA CCC TGC ATG TAG GTC 1584
1585 ACA GGT TGA GGC CCA GCC ACT CTC CCT GGG GCC TGG TGG GTA GGC AAG 1632
1633 TAG CTC TGG GGC CAC CTC AAG TGA CCA AAT GCT ATT AAT TTC CAT CCT 1680
1681 TTA GCA GGC TGG GCC CTA GGC AGG AAG CTG GCT TCT GGG AGA GGA GTG 1728
1729 AGA ACG TGC AGG GCC TGC CTA GCT TGC GTG CTT GAG GAA GGT GGC ATT 1776
1777 CCG TGC TTG CCT CCT TGA GGA GGG TGG CAT TCT GTG TCT TCT GCT TAT 1824
1825 GAA GCG CCT TTC TTA AAG TTT GGC AAT AAA TCC ATT TTT ATG GAA AAA 1872
1873 AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AA 1913
D:Blastp结果
Query=PP1628[基因=PP1628] (136个氨基酸)
>SP_IN:Q24146 Q24146 drosophila melanogaster(fruit fly).hlh106.
11/1998
长度=1113
分值=30.5bits(67),预计值=6.6
相同性=34/129(26%),相似性=52/129(39%),缺口=12/129(9%)
Query:7 RRESPPTSV-PPQMGIYLDLCGSFSAETGPVSQSF--LQMLIGVCWNPKP----LPRLQA 59
+R P T+V PP +G + S S T PV + + ++ V P P LP+
Sbjct:145 QRMPPNTAVYPPSLGSSF-VYQSMSPPTSPVESANQNVNVMQPVAATPAPASAPLPQQSY 203
Query:60 PDGLLSCNFLGEETFSSFPFLVHPCTLVLSQPLPHIVPDSRGTSSLHRAAAAGLRAEPVG 119
P ++ N T +L+ T+ P P + P T S A+ +R P+
Sbjct:204 PQPFITYNSKAGMTSDEAMYLLLQPTVASPTPSPPVAPPPTSTGS----RASKVRVAPLA 259
Query:120 AEALAPEVQ 128
A EVQ
Sbjct:260 PSPAAMEVQ 268
8.PP1650
A:核苷酸序列:(SEQ ID NO:22)长度:1494bp
1 TCTTTGTTCT GTCCCCGGTG TGTGGGTCTG TGACAGGGTC CAACAGGGCC
51 TGGTCCGTGT CCGGTCCCCC AAATCTGTCG TCCCTGCCCC CAGGCATTGG
101 CATCAACAAA AGTCAGAATT CCCGGGAACT TGAACAGAGG CTGCTAAATT
151 CCCAGTAATT GCTCCTTTGG CCTTCTAGGG ACTGACTTCA AAGAAGGAAG
201 GAAAGAATCA GGCAGTGCTT CCTCATTCTC TTTTAAAACC CGCTTCCCGC
251 TGAGTCTGCA CCCAGGAGAC CAGAGAGCAC CTTGCCCTTC CATGGAAACT
301 CAGGCTGATC TCGTATCTCA GGAACCTCAG GCCCTGCTTG ACAGTGCTCT
351 TCCTTCAAAA GTTCCTGCCT TTTCCGACAA GGACAGCCTG GGGGATGAGA
401 TGTTGGCGGC TGCGCTCCTA AAGGCCAAGT CCCAGGAGCT GGTAACCTTT
451 GAGGATGTAG CTGTGTACTT CATCCGGAAG GAGTGGAAGC GTTTGGAACC
501 TGCTCAGAGG GACCTCTATA GAGATGTGAT GCTGGAGAAT TACGGGAATG
551 TGTTCTCACT GGACTGGATA CACGTCTGTT TAACTACGCA AAAGGTAATG
601 CTGGCATGGC TTACTGGGAC CCTAAGTGTG GCGAAGGGAC TCTGCTCCAG
651 TGAACTGGCG AGTGTGGAAC CTCCTGACAC CTTCTGAGGA CCTCCTGCCT
701 GCCATGTTGC TGTGGAGCTC GCACTCCTCA GGCATCCCCT GATGTTGAGT
751 GATACAAACT CTATCACCGG AATCGATGCT GCTGCAATGA CAAGACTTCT
801 TTCTGGTTTT CAGATTCTAA AGTTTAAAAC AACGACAACA ACAGGAGCGC
851 TTGAAAGTTA CGGTGCTTCT CCCTCTCCAG TGTGGACTCG CTGATGTTTG
901 GAAAGATTGG ACTTGCTACA GAAGGTCTTT CCACAGTGAT GACACCAGTA
951 GGGCTTTTCC CCGGTGTGGA TTCTGTGGTG TTTATTGAAG TTGGAGCTGT
1001 GGTTGAAGGC TTTCCCACAC TCCTTACACT TATATGGCTT CTCTCCGGTG
1051 TGGAGTCTCT GGTGGGAGCT GAGGCCCGCA TGCTGACTGA AGCTCTTCCC
1101 ACATTCGTTA CACTGATAAG GCTTCTCCCC AGTGTGGATC CGATAGTGAC
1151 GAATGAGGCT GCCTTTCCCG CTGAAAGCCT TGCCACAATC TTTGCACTGA
1201 TATGGCGCCT CTTCTGTGTG CATTCTCTGA TGTTTAAGAA GGTCTGAGCT
1251 CTGCCCAAAA GCTTTTCCAC ACTTACAGTC ATAGGGCCGG TCCACCAAGT
1301 GTGTTCTGTA GTGGAGGGTG AGGTTTGAGC TGTGGCTGAA AGCTTTCCCA
1351 CACTTGGTGC ACACGTAAGG TTTCTCCCCA GTGTGTGTTC TCCTGTGTTT
1401 GGTGAGATTT GAGCTATTAC TAAAGGCTTT GCCACATTCA GCCCAAAAAA
1451 AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAASS AAAAAAAAAA AAAA
B:氨基酸序列:(SEQ ID NO:23)长度:131个氨基酸
1 METQADLVSQ EPQALLDSAL PSKVPAFSDK DSLGDEMLAA ALLKAKSQEL
51 VTFEDVAVYF IRKEWKRLEP AQRDLYRDVM LENYGNVFSL DWIHVCLTTQ
101 KVMLAWLTGT LSVAKGLCSS ELASVEPPDT F
C:核苷酸及氨基酸组合序列(SEQ ID NO:24)
克隆号和蛋白质名称:PP1650
起始编码子: 292 ATG 终止编码子:687 TGA
蛋白质分子量:14625.94
1 TCT TTG TTC TGT CCC CGG TGT GTG GGT CTG TGA CAG GGT CCA ACA GGG 48
49 CCT GGT CCG TGT CCG GTC CCC CAA ATC TGT CGT CCC TGC CCC CAG GCA 96
97 TTG GCA TCA ACA AAA GTC AGA ATT CCC GGG AAC TTG AAC AGA GGC TGC 144
145 TAA ATT CCC AGT AAT TGC TCC TTT GGC CTT CTA GGG ACT GAC TTC AAA 192
193 GAA GGA AGG AAA GAA TCA GGC AGT GCT TCC TCA TTC TCT TTT AAA ACC 240
241 CGC TTC CCG CTG AGT CTG CAC CCA GGA GAC CAG AGA GCA CCT TGC CCT 288
289 TCC ATG GAA ACT CAG GCT GAT CTC GTA TCT CAG GAA CCT CAG GCC CTG 336
1 Met Glu Thr Gln Ala Asp Leu Val Ser Gln Glu Pro Gln Ala Leu 15
337 CTT GAC AGT GCT CTT CCT TCA AAA GTT CCT GCC TTT TCC GAC AAG GAC 384
16 Leu Asp Ser Ala Leu Pro Ser Lys Val Pro Ala Phe Ser Asp Lys Asp 31
385 AGC CTG GGG GAT GAG ATG TTG GCG GCT GCG CTC CTA AAG GCC AAG TCC 432
32 Ser Leu Gly Asp Glu Met Leu Ala Ala Ala Leu Leu Lys Ala Lys Ser 47
433 CAG GAG CTG GTA ACC TTT GAG GAT GTA GCT GTG TAC TTC ATC CGG AAG 480
48 Gln Glu Leu Val Thr Phe Glu Asp Val Ala Val Tyr Phe Ile Arg Lys 63
481 GAG TGG AAG CGT TTG GAA CCT GCT CAG AGG GAC CTC TAT AGA GAT GTG 528
64 Glu Trp Lys Arg Leu Glu Pro Ala Gln Arg Asp Leu Tyr Arg Asp Val 79
529 ATG CTG GAG AAT TAC GGG AAT GTG TTC TCA CTG GAC TGG ATA CAC GTC 576
80 Met Leu Glu Asn Tyr Gly Asn Val Phe Ser Leu Asp Trp Ile His Val 95
577 TGT TTA ACT ACG CAA AAG GTA ATG CTG GCA TGG CTT ACT GGG ACC CTA 624
96 Cys Leu Thr Thr Gln Lys Val Met Leu Ala Trp Leu Thr Gly Thr Leu 111
625 AGT GTG GCG AAG GGA CTC TGC TCC AGT GAA CTG GCG AGT GTG GAA CCT 672
112 Ser Val Ala Lys Gly Leu Cys Ser Ser Glu Leu Ala Ser Val Glu Pro 127
673 CCT GAC ACC TTC TGA GGA CCT CCT GCC TGC CAT GTT GCT GTG GAG CTC 720
128 Pro Asp Thr Phe *** 132
721 GCA CTC CTC AGG CAT CCC CTG ATG TTG AGT GAT ACA AAC TCT ATC ACC 768
769 GGA ATC GAT GCT GCT GCA ATG ACA AGA CTT CTT TCT GGT TTT CAG ATT 816
817 CTA AAG TTT AAA ACA ACG ACA ACA ACA GGA GCG CTT GAA AGT TAC GGT 864
865 GCT TCT CCC TCT CCA GTG TGG ACT CGC TGA TGT TTG GAA AGA TTG GAC 912
913 TTG CTA CAG AAG GTC TTT CCA CAG TGA TGA CAC CAG TAG GGC TTT TCC 960
961 CCG GTG TGG ATT CTG TGG TGT TTA TTG AAG TTG GAG CTG TGG TTG AAG 1008
1009 GCT TTC CCA CAC TCC TTA CAC TTA TAT GGC TTC TCT CCG GTG TGG AGT 1056
1057 CTC TGG TGG GAG CTG AGG CCC GCA TGC TGA CTG AAG CTC TTC CCA CAT 1104
1105 TCG TTA CAC TGA TAA GGC TTC TCC CCA GTG TGG ATC CGA TAG TGA CGA 1152
1153 ATG AGG CTG CCT TTC CCG CTG AAA GCC TTG CCA CAA TCT TTG CAC TGA 1200
1201 TAT GGC GCC TCT TCT GTG TGC ATT CTC TGA TGT TTA AGA AGG TCT GAG 1248
1249 CTC TGC CCA AAA GCT TTT CCA CAC TTA CAG TCA TAG GGC CGG TCC ACC 1296
1297 AAG TGT GTT CTG TAG TGG AGG GTG AGG TTT GAG CTG TGG CTG AAA GCT 1344
1345 TTC CCA CAC TTG GTG CAC ACG TAA GGT TTC TCC CCA GTG TGT GTT CTC 1392
1393 CTG TGT TTG GTG AGA TTT GAG CTA TTA CTA AAG GCT TTG CCA CAT TCA 1440
1441 GCC CAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA 1488
1489 AAA AAA 1494
D:Blastp结果
Query=PP1650[基因=PP1650] (131个氨基酸)
>SP_HUM:O14709 O14709 homo sapiens(human).zinc finger protein.
5/1999
长度=1029
分值=76.5bits(185),预计值=8e-14
相同性=45/90(50%),相似性=60/90(66%),缺口=6/90(6%)
Query:6 DLVS---QEPQALLDSALPSKVPAFSDKDSLGDEMLAAALLKAKSQELVTFEDVAVYFIR 62
DLV+ Q+PQ DS P + A S +++ ++++A LL A+ QELV FE+V+V F
Sbjct:172 DLVAFNLQDPQH--DSPAP-EASALSQEENPRNQLMALMLLTAQPQELVMFEEVSVCFTS 228
Query:63 KEWKRLEPAQRDLYRDVMLENYGNVFSLDW 92
+EW L P QR LY DVMLENYGNV SL+W
Sbjct:229 EEWACLGPIQRALYWDVMLENYGNVTSLEW 258
9.PP2672
A:核苷酸序列:(SEQ ID NO:25)长度:2455bp
1 GGCGTCTGGA CACCCTTCAT CTTTTAGCCG TTGCCCTGTT CTTGGTGAAC
51 TGCTTGTTAG GACCAAAAGT GGCCCACCCC TTTCTCTGGG ACAGTGCAGA
101 GCACCGGGGC CAGAGGCTCA AAGCACCTCC AAGCTGAGAT CAGAGACTTT
151 GGATATCGTT GATCCAGAGG CTTCCAAACT TTTCCTGGTG ATTGAATTCT
201 TACCATGAAA TCCAGTGAGG AGCTCCAATG CCTCAAGCAG ATGGAAGAGG
251 AACTGCTCTT CTTGAAGGCA GGGCAGGGCT CTCAGAGGGC AAGACTCACC
301 CCACCCCTGC CACGGGCTCT CCAGGGTAAC TTTGGAGCCC CAGCACTCTG
351 TGGAATATGG TTCGCAGAAC ACTTGCATCC TGCTGTTGGG ATGCCCCCAA
401 ACTATAATAG CAGCATGCTC AGTCTTTCAC CAGAAAGAAC CATCTTATCT
451 GGAGGATGGT CAGGAAAACA AACTCAACAG CCAGTGCCTC CCCTCAGAAC
501 TCTGCTCCTG AGGTCTCCTT TCAGTCTGCA TAAGTCCTCC CAACCTGGGA
551 GCCCCAAAGC TTCTCAGCGG ATCCATCCCC TCTTCCATTC TATCCCAAGG
601 TCTCAGCTGC ATTCTGTTCT GCTTGGTCTT CCTCTCCTCT TCATACAGAC
651 TAGACCTTCA CCCCCTGCCC AGTATGGCGC GCAAATGCCA TTGAGATACA
701 TTTGTTTTGG TCCCAATATC TTTTGGGGCT CCAAAAAGCC CCAGAAAGAG
751 TAATGCCTTC AGCCATGGCC CATGTGATGA CTTTTCCCAG AGACAGCCCC
801 ATGGGTCAGT GATCGCCGGT GGGAGGTCTC CCCAGCCTCC CTTCAAGCCT
851 TCAAGTCTGT GTAGAGGCGC CTTCTCTTCT CTGGGCATTC CCCGCTTTGT
901 TGCAGAGAAA TTATTTTCTA CTCAGCGGCT TTCAGGTAGA GAGAGAAAGT
951 GCATGCGGTA TGAAGGATGT GAAGATGGAG GGCTTGACGT CGTGGGTCAT
1001 GTTTTGTGGT TAATTCCCCC ACATAACAAA ACAGTGAGCA AATGTTTATA
1051 AACAGGAACT CAGTGTTTCA GTGATGAAAG CCTCTGGCCT CGCCACACTG
1101 ATTGCTGGTG TGCGCGCACA CACACACTCA CACACCCTGT TTTTCTTACA
1151 CACACACAGC TTCATGGAGC AGAGAGCTGG AAAGGGTGTC CAGAATGGTG
1201 GATCAGGCTT ATTATTATTA CTTTTTTTAT CTCCACCAAA CTCTCTCCTT
1251 AAGCCCCAGC AGCCAACCCC CCCCCCCCCA CCAGACAGCA TGTCGAAGGA
1301 GTAAGCTGCA GGTCAGCCTA TATTTTAGGC AGAAAATTAG GCAACCTTGG
1351 GAGAGACCGG TTTCCAGCAG ACACGCACGG ACGCGATGGT GAGGTTGGGC
1401 TGAGACGGTC CTTCCTGGAT GCAGTCACCC TCCCCATCCC GAGTTTTACT
1451 CCCTGGGGGG ATTGTGGTGG GTGCCTGGCC TCCTCTCCCA CCAGCGCACT
1501 GCCCCAAGCT TGCCTAGGTA GTATCAGCAC TGGGGTGAGG GATGCAATGC
1551 GGGTTTATAG TTGGCTGTGG GGACTTCTGA TTTCTCCACC CCATAGATGA
1601 TAAACGACCG CGGGGCTTCC TCTCCCAGGT CTTTCCTCAC TCTCCTTCGT
1651 CTTTCCCTCT TTCTCCATGG GAAAGGTAGA ATGAGACTTG CCACCAGGGA
1701 CATCCAGGCA CATTCCTCTT CCCAATCAGC CTCTACCCAT TCTCTTTCTG
1751 TCTCGTGTGT ATCAGTGGCA TTTTCTTGTG TAGCTTCCCA GATTTGCAAA
1801 CCCGCTCCAC ATCCTGGACG CAGACCCCCT TCGCTGGCTC TATGAAGGCT
1851 TCACGTTCCT GGGGCATTCG AGACTTGACT TTCCAGAGCA ACTTTGGATC
1901 CACCCTGTTA CCCTTTTTTT TGTTTTGTTT TGTTTTGAGA GGGAGTCTCG
1951 CTGTGTTGTC CAGGCTGGAG TGCAGTGGTG TGATCTCGGC TTACTGCAAC
2001 CTCCGCCTAC TGGGTTCAAG TGATTCTCTT GCCTCAATCT CCCCAGTACC
2051 TGGGATTACA GGTAGACACC ATCACGCCTG GCTAATTTTT GTATTTTTAG
2101 TAAAGACAGG GTTTCATCAT GTTGGCCTGG CTGGTCTCAA ACTCCTGACC
2151 TCAGCCGATC CGCCCGCCTC AGCCTCCCAA AGTTCTGGGA TTACAAGTGT
2201 GAACCACCGT GCCCAACCTC CCCTCGTTTT TGACCTTTGT CCCCAAATGT
2251 CTTTCATCCA GTTACTAGGA CTTGTAGCCT TTTTGCAAAT AGGTATCTGT
2301 AAGCATAGAA GAATAGGGTG ATTTGTGAAG TGACCCTTAG TGGCATCTGT
2351 GGTGGTCCTA CTAATCAGAT TTGCAGAAGA AACATGGAAA CAAGGAAACT
2401 CCTCTCTTAT ATTAAAATAA ATAAGGTTTT TAATTTCAAA AAAAAAAAAA
2451 AAAAA
B:氨基酸序列:(SEQ ID NO:26)长度:182个氨基酸
1 MKSSEELQCL KQMEEELLFL KAGQGSQRAR LTPPLPRALQ GNFGAPALCG
51 IWFAEHLHPA VGMPPNYNSS MLSLSPERTI LSGGWSGKQT QQPVPPLRTL
101 LLRSPFSLHK SSQPGSPKAS QRIHPLFHSI PRSQLHSVLL GLPLLFIQTR
151 PSPPAQYGAQ MPLRYICFGP NIFWGSKKPQ KE
C:核苷酸及氨基酸组合序列(SEQ ID NO:27)
克隆号和蛋白名称:PP2672
起始编码子:205 ATG 终止编码子:753 TAA
蛋白分子量:20179.43
1 GGC GTC TGG ACA CCC TTC ATC TTT TAG CCG TTG CCC TGT TCT TGG TGA 48
49 ACT GCT TGT TAG GAC CAA AAG TGG CCC ACC CCT TTC TCT GGG ACA GTG 96
97 CAG AGC ACC GGG GCC AGA GGC TCA AAG CAC CTC CAA GCT GAG ATC AGA 144
145 GAC TTT GGA TAT CGT TGA TCC AGA GGC TTC CAA ACT TTT CCT GGT GAT 192
193 TGA ATT CTT ACC ATG AAA TCC AGT GAG GAG CTC CAA TGC CTC AAG CAG 240
1 Met Lys Ser Ser Glu Glu Leu Gln Cys Leu Lys Gln 12
241 ATG GAA GAG GAA CTG CTC TTC TTG AAG GCA GGG CAG GGC TCT CAG AGG 288
13 Met Glu Glu Glu Leu Leu Phe Leu Lys Ala Gly Gln Gly Ser Gln Arg 28
289 GCA AGA CTC ACC CCA CCC CTG CCA CGG GCT CTC CAG GGT AAC TTT GGA 336
29 Ala Arg Leu Thr Pro Pro Leu Pro Arg Ala Leu Gln Gly Asn Phe Gly 44
337 GCC CCA GCA CTC TGT GGA ATA TGG TTC GCA GAA CAC TTG CAT CCT GCT 384
45 Ala Pro Ala Leu Cys Gly Ile Trp Phe Ala Glu His Leu His Pro Ala 60
385 GTT GGG ATG CCC CCA AAC TAT AAT AGC AGC ATG CTC AGT CTT TCA CCA 432
61 Val Gly Met Pro Pro Asn Tyr Asn Ser Ser Met Leu Ser Leu Ser Pro 76
433 GAA AGA ACC ATC TTA TCT GGA GGA TGG TCA GGA AAA CAA ACT CAA CAG 480
77 Glu Arg Thr Ile Leu Ser Gly Gly Trp Ser Gly Lys Gln Thr Gln Gln 92
481 CCA GTG CCT CCC CTC AGA ACT CTG CTC CTG AGG TCT CCT TTC AGT CTG 528
93 Pro Val Pro Pro Leu Arg Thr Leu Leu Leu Arg Ser Pro Phe Ser Leu 108
529 CAT AAG TCC TCC CAA CCT GGG AGC CCC AAA GCT TCT CAG CGG ATC CAT 576
109 His Lys Ser Ser Gln Pro Gly Ser Pro Lys Ala Ser Gln Arg Ile His 124
577 CCC CTC TTC CAT TCT ATC CCA AGG TCT CAG CTG CAT TCT GTT CTG CTT 624
125 Pro Leu Phe His Ser Ile Pro Arg Ser Gln Leu His Ser Val Leu Leu 140
625 GGT CTT CCT CTC CTC TTC ATA CAG ACT AGA CCT TCA CCC CCT GCC CAG 672
141 Gly Leu Pro Leu Leu Phe Ile Gln Thr Arg Pro Ser Pro Pro Ala Gln 156
673 TAT GGC GCG CAA ATG CCA TTG AGA TAC ATT TGT TTT GGT CCC AAT ATC 720
157 Tyr Gly Ala Gln Met Pro Leu Arg Tyr Ile Cys Phe Gly Pro Asn Ile 172
721 TTT TGG GGC TCC AAA AAG CCC CAG AAA GAG TAA TGC CTT CAG CCA TGG 768
173 Phe Trp Gly Ser Lys Lys Pro Gln Lys Glu*** 183
769 CCC ATG TGA TGA CTT TTC CCA GAG ACA GCC CCA TGG GTC AGT GAT CGC 816
817 CGG TGG GAG GTC TCC CCA GCC TCC CTT CAA GCC TTC AAG TCT GTG TAG 864
865 AGG CGC CTT CTC TTC TCT GGG CAT TCC CCG CTT TGT TGC AGA GAA ATT 912
913 ATT TTC TAC TCA GCG GCT TTC AGG TAG AGA GAG AAA GTG CAT GCG GTA 960
961 TGA AGG ATG TGA AGA TGG AGG GCT TGA CGT CGT GGG TCA TGT TTT GTG 1008
1009 GTT AAT TCC CCC ACA TAA CAA AAC AGT GAG CAA ATG TTT ATA AAC AGG 1056
1057 AAC TCA GTG TTT CAG TGA TGA AAG CCT CTG GCC TCG CCA CAC TGA TTG 1104
1105 CTG GTG TGC GCG CAC ACA CAC ACT CAC ACA CCC TGT TTT TCT TAC ACA 1152
1153 CAC ACA GCT TCA TGG AGC AGA GAG CTG GAA AGG GTG TCC AGA ATG GTG 1200
1201 GAT CAG GCT TAT TAT TAT TAC TTT TTT TAT CTC CAC CAA ACT CTC TCC 1248
1249 TTA AGC CCC AGC AGC CAA CCC CCC CCC CCC CAC CAG ACA GCA TGT CGA 1296
1297 AGG AGT AAG CTG CAG GTC AGC CTA TAT TTT AGG CAG AAA ATT AGG CAA 1344
1345 CCT TGG GAG AGA CCG GTT TCC AGC AGA CAC GCA CGG ACG CGA TGG TGA 1392
1393 GGT TGG GCT GAG ACG GTC CTT CCT GGA TGC AGT CAC CCT CCC CAT CCC 1440
1441 GAG TTT TAC TCC CTG GGG GGA TTG TGG TGG GTG CCT GGC CTC CTC TCC 1488
1489 CAC CAG CGC ACT GCC CCA AGC TTG CCT AGG TAG TAT CAG CAC TGG GGT 1536
1537 GAG GGA TGC AAT GCG GGT TTA TAG TTG GCT GTG GGG ACT TCT GAT TTC 1584
1585 TCC ACC CCA TAG ATG ATA AAC GAC CGC GGG GCT TCC TCT CCC AGG TCT 1632
1633 TTC CTC ACT CTC CTT CGT CTT TCC CTC TTT CTC CAT GGG AAA GGT AGA 1680
1681 ATG AGA CTT GCC ACC AGG GAC ATC CAG GCA CAT TCC TCT TCC CAA TCA 1728
1729 GCC TCT ACC CAT TCT CTT TCT GTC TCG TGT GTA TCA GTG GCA TTT TCT 1776
1777 TGT GTA GCT TCC CAG ATT TGC AAA CCC GCT CCA CAT CCT GGA CGC AGA 1824
1825 CCC CCT TCG CTG GCT CTA TGA AGG CTT CAC GTT CCT GGG GCA TTC GAG 1872
1873 ACT TGA CTT TCC AGA GCA ACT TTG GAT CCA CCC TGT TAC CCT TTT TTT 1920
1921 TGT TTT GTT TTG TTT TGA GAG GGA GTC TCG CTG TGT TGT CCA GGC TGG 1968
1969 AGT GCA GTG GTG TGA TCT CGG CTT ACT GCA ACC TCC GCC TAC TGG GTT 2016
2017 CAA GTG ATT CTC TTG CCT CAA TCT CCC CAG TAC CTG GGA TTA CAG GTA 2064
2065 GAC ACC ATC ACG CCT GGC TAA TTT TTG TAT TTT TAG TAA AGA CAG GGT 2112
2113 TTC ATC ATG TTG GCC TGG CTG GTC TCA AAC TCC TGA CCT CAG CCG ATC 2160
2161 CGC CCG CCT CAG CCT CCC AAA GTT CTG GGA TTA CAA GTG TGA ACC ACC 2208
2209 GTG CCC AAC CTC CCC TCG TTT TTG ACC TTT GTC CCC AAA TGT CTT TCA 2256
2257 TCC AGT TAC TAG GAC TTG TAG CCT TTT TGC AAA TAG GTA TCT GTA AGC 2304
2305 ATA GAA GAA AAG GGT GAT TTG TGA AGT GAC CCT TAG TGG CAT CTG TGG 2352
2353 TGG TCC TAC TAA TCA GAT TTG CAG AAG AAA CAT GGA AAC AAG GAA ACT 2400
2401 CCT CTC TTA TAT TAA AAT AAA TAA GGT TTT TAA TTT CAA AAA AAA AAA 2448
2449 AAA AAA A 2455
D:Blastp结果
Query=PP2672[基因=PP2672]
(182个氨基酸)
>SP_RO:O70132 O70132 rattus norvegicus(rat).ets domain
transcription factor pet-1.5/1999
长度=340
分值=37.1bits(84),预计值=0.10
相同性=25/78(32%),相似性=37/78(47%),缺口=8/78(10%)
Query:84 GWSGKQTQQPVPPLRTLLLRSPFSLHKSSQPGSPKASQRIHPLFHSIPRSQLHSVLLGLP 143
GW+G Q Q P+PP TL RS + + P ++ HP PR+ + + L
Sbjct:35 GWAGMQLQDPLPPHHTLAARS-----RQALPDPAASTLPCHP---QSPRAGIGTPSAKLT 86
Query:144 LLFIQTRPSPPAQYGAQM 161
+++ PSP AQ A M
Sbjct:87 CPPVRSPPSPTAQSPAAM 104
Claims (5)
1.一种分离的多核苷酸,其特征在于,它包含一核苷酸序列,该核苷酸序列选自下组:
(a)编码具有抑癌功能的人蛋白的多核苷酸,所述蛋白具有选自下组的氨基酸序列:
SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:26;
(b)与多核苷酸(a)互补的多核苷酸。
2.如权利要求1所述的多核苷酸,其特征在于,该多核苷酸编码的多肽具有选自下组的氨基酸序列:SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:26。
3.如权利要求1所述的多核苷酸,其特征在于,该多核苷酸的序列选自下组:
SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:18、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:27的编码区序列或全长序列。
4.一种载体,其特征在于,它含有权利要求1所述的多核苷酸。
5.一种遗传工程化的宿主细胞,其特征在于,它是选自下组的一种宿主细胞:
(a)用权利要求4所述的载体转化或转导的宿主细胞;
(b)用权利要求1所述的多核苷酸转化或转导的宿主细胞。
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2000
- 2000-03-09 CN CNB001119486A patent/CN1169954C/zh not_active Expired - Fee Related
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