CN110982700A - 一种抗幽门螺旋杆菌活性的聚酮化合物及其制备方法和应用 - Google Patents

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Abstract

本发明公开了一株木贼镰刀菌(Fusarium equiseti)菌株Shsl21,它的保藏编号为CGMCC No.18550。本发明还提供了用菌株Shsl21制备的化合物,该化合物具有较好的抗幽门螺旋杆菌(H.pylori BHKS159)活性,适宜于抗幽门螺旋杆菌先导化合物研究或制备抗幽门螺旋杆菌药物。

Description

一种抗幽门螺旋杆菌活性的聚酮化合物及其制备方法和应用
技术领域
本发明属于抗幽门螺旋杆菌活性的聚酮化合物技术领域。
背景技术
幽门螺旋杆菌(Helicobacter pylori)是一种能长期定植于胃粘膜的微需氧、螺旋状的革兰氏阴性细菌,其感染率已达到全球人口的50%以上,中国也是一个感染率较高的国家,据统计感染率为40-90%。幽门螺旋杆菌是慢性胃炎,链球菌疾病,胃癌和粘膜相关淋巴组织淋巴瘤的发病机制中重要致病因子。世界卫生组织/国际癌症研究机构已将幽门螺旋杆菌列为人类Ⅰ类致癌原。因此研发高效、低毒的幽门螺旋杆菌药物迫在眉睫。
发明内容
本发明的第一目的是提供一种抗幽门螺旋杆菌活性的化合物,其结构式如式Ⅰ所示:
Figure BDA0002252168000000011
本发明的第二目的是提供一株木贼镰刀菌(Fusarium equiseti)菌株Shsl21,其已于2019年9月19日保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心(简称为CGMCC,地址为:北京市朝阳区北辰西路1号院3号),保藏中心登记入册编号为CGMCCNo.18550。
本发明的第三目的是提供一种化合物的制备方法,包括如下步骤:
活化菌株Shsl21;
固体发酵菌株Shsl21;
用乙酸乙酯浸提固体发酵物得粗提物;
用减压硅胶柱层析得到洗脱液;
用反向硅胶色谱分离得反向洗脱液;
用凝胶色谱分离得凝胶洗脱液;
用反相HPLC分离得HPLC洗脱液。
本发明提供的菌株和化合物,具有较好的抗幽门螺旋杆菌(H.pylori BHKS159)活性,适宜于抗幽门螺旋杆菌先导化合物研究或制备抗幽门螺旋杆菌药物。
附图说明
图1为化合物的1H核磁共振图谱。
图2为化合物的13C核磁共振图谱。
具体实施方式
以下的实施例便于更好地理解本发明,但并不限定本发明。下述实施例中的实验方法,如无特殊说明,均为常规方法。下述实施例中所用的试验材料,如无特殊说明,均为自常规生化试剂商店购买得到的。以下实施例中的定量试验,均设置3次重复实验,结果取平均值。
实施例1
菌株Shsl21的分离和鉴定
一、菌株Shsl21的采集与分离
2015年从广西防城港市北仑河口桐花树的花上分离到一株菌,命名为菌株Shsl21。
菌株Shsl21为一种红树林内生真菌。
二、菌株Shsl21的鉴定
1、分子鉴定
菌株Shsl21的18S ribosomal RNA部分序列见序列表的序列1,如GENBANKACCESSION NO.MN443741的序列相似性最高,相似性为99%。
根据以上鉴定结果,菌株Shsl21属于木贼镰刀菌(Fusarium equiseti)。
三、菌株Shsl21的保藏
菌株Shsl21,属于木贼镰刀菌(Fusarium equiseti),已于2019年9月19日保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心(简称CGMCC,地址为:北京市朝阳区北辰西路1号院3号),保藏号为CGMCC No.18550。
实施例2
化合物的制备
PDA培养基:将马铃薯200g、葡萄糖20g、琼脂15g和水1000mL混匀,121℃高压蒸汽灭菌30min。
种子培养基:将葡萄糖4.0g、麦芽汁10.0g、酵母提取物4.0g和水1000mL混匀,将pH调节到6.5,每个250mL三角瓶中加入50mL并121℃灭菌30min。
大米培养基:将80g大米和120mL水加入500mL三角瓶中,浸泡过夜,121℃高压蒸汽灭菌30min。
1菌株Shsl21的固体发酵
1.1菌株Shsl21的活化
将菌株Shsl21在PDA平板上培养5d,待菌落长满平板后,将5个1cm2大小的菌块连同培养基接种到含有50mL种子培养基的250mL三角瓶中,在摇床上培养(25℃、200rpm)7d后作为种子培养液。
1.2菌株Shsl21的固体发酵
将5mL种子培养液接种于装有大米培养基的三角瓶中,25℃无菌培养30d。
2化合物的提取
2.1在步骤1.2得到的三角瓶(含固体发酵物)中加入1.0L乙酸乙酯,室温浸提24h,收集第一次上清液。
2.2在步骤2.1的三角瓶中再次加入1.0L乙酸乙酯,室温浸提24h,收集第二次上清液。
2.3在步骤2.2的三角瓶中再次加入1.0L乙酸乙酯,室温浸提24h,收集第三次上清液。
2.4在步骤2.3的三角瓶中再次加入1.0L乙酸乙酯,室温浸提24h,收集第四次上清液。
2.5将步骤2.1的第一次上清液、步骤2.2的第二次上清液、步骤2.3的第三次上清液和步骤2.4的第四次上清液合并,减压蒸馏至干燥,得到14.0g粗提物。
3、化合物的分离纯化
3.1减压硅胶柱层析得到洗脱液
将步骤2.5得到的粗提物进行减压硅胶柱层析。
柱子型号为:8×30cm;
填充物为:薄层层析硅胶H和柱层层析硅胶(精制型);
洗脱过程为:
(1)依次用1000mL洗脱液A(由6体积份石油醚和4体积份乙酸乙酯组成)进行洗脱;
(2)1000mL洗脱液B(由5体积份石油醚和5体积份乙酸乙酯组成)进行洗脱;
(3)1000mL洗脱液C(由4体积份石油醚和6体积份乙酸乙酯组成)进行洗脱;
(4)1000mL洗脱液D(由3体积份石油醚和7体积份乙酸乙酯组成)进行洗脱;
(5)1000mL洗脱液E(由2体积份石油醚和8体积份乙酸乙酯组成)进行洗脱;
流速为50mL/min,收集洗脱液A-E的过柱后洗脱液。
3.2将层析洗脱液进行反向硅胶色谱分离得反向洗脱液
所述反向硅胶色谱分离的参数具体如下:
柱子型号为:3×60cm;
填充物为:C18;
流动相为500mL洗脱液(由6体积份甲醇和4体积份水组成),流速为0.5mL/min;
收集过柱后反向洗脱液。
3.3将反向洗脱液进行凝胶色谱分离得凝胶洗脱液
所述凝胶色谱分离的参数具体如下:
柱子型号为:3×60cm;
填充物为:Sephadex LH-20;
流动相为百分含量为100%甲醇有机溶剂,流速为0.5mL/min;
收集保留体积为80-100mL的过柱后得凝胶洗脱液。
3.4将凝胶洗脱液进行反相HPLC分离得HPLC洗脱液
所述反相HPLC分离的参数具体如下:
柱子型号为:Kramosil C18柱(10μm;10×250mm);
洗脱过程为:用体积百分含量为57-59%的甲醇水溶液洗脱30min,流速为2mL/min。
收集保留时间为20.6-21.0min(峰值的保留时间tR为20.8min)的过柱后洗脱液。
3.5将步骤3.4收集的HPLC洗脱液减压蒸馏至干燥,得到5.5mg产物。
4化合物的确认
将步骤3.5的产物进行有机质谱和核磁共振谱分析。
产物的表征数据如下:
黄色针状;
分子式:C14H20O6;分子量:284;
1H核磁共振图谱见图1,13C核磁共振图谱见图2;
依据以上表征数据上述化合物的理化数据和图谱,步骤3.5的产物为式(I)所示的化合物。
Figure BDA0002252168000000051
实施例3
式(I)所示化合物对抗幽门螺旋杆菌(H.pylori BHKS159)的抑制作用
采用微量稀释法检测式(I)所示化合物对抗幽门螺旋杆菌(H.pylori BHKS159)的最低抑菌浓度(MIC,100μL体系)。
将甲硝唑(Aladdin公司)作为化合物的阳性对照,进行平行实验。
本实施例所用细菌为:抗幽门螺旋杆菌(H.pylori BHKS159)。
实验具体步骤如下:
1.制备MIC板
第1孔先加脑心浸出液培养基(BHI)(具体成分包括:蛋白胨、脱水小牛脑浸粉、脱水牛心浸粉、氯化钠、葡萄糖、磷酸氢二钠,pH=7.4)173.6μL,再加6.4μL待测化合物,倍比稀释至第7孔;第8孔不加,保留90μL培养基,作为加菌不加待测化合物对照。
2.制备菌液
取固体平板上对数期生长的抗幽门螺旋杆菌(H.pylori BHKS159),用BHI培养基制作成菌悬液,调整浓度OD600为0.3(1×108CFU/mL),稀释10倍,为1×107CFU/mL,备用。
3.接种菌液
取10μL加至第1-8孔(每孔菌液浓度约为1.0×106CFU/mL)。培养72h判断结果。第1孔至第7孔化合物浓度分别为64、32、16、8、4、2、1μg/mL。
4.结果判断
以在小孔内完全抑制细菌生长的最低式(I)所示化合物浓度为MIC。
当阳性对照孔第8孔(即不含抗生素)内细菌明显生长试验才有意义。
当在微量稀释法出现单一的跳孔时,应记录抑制细菌生长的最高式(I)所示化合物浓度。如出现多处跳孔,则不应报告结果,需重复试验。
式(I)所示化合物对抗幽门螺旋杆菌(H.pylori BHKS159)的抑菌作用需重复3次试验。
式(I)所示化合物对抗幽门螺旋杆菌(H.pylori BHKS159)的MIC值为8μg/mL。
甲硝唑对抗幽门螺旋杆菌(H.pylori BHKS159)的MIC值为大于16μg/mL。
序列表
<110> 中国科学院微生物研究所
<120> 一种抗幽门螺旋杆菌活性的聚酮化合物及其制备方法和应用
<160> 1
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 481
<212> DNA
<213> 镰刀菌(Fusarium equiseti)
<400> 1
acggcgtggc cgcgacgatc accagtaacg aggtgtatga ttactacgct atggaagctc 60
gacgtgaccg ccaatcgatt tggggaacgc gggttaccgc gagtcccaac accaagctga 120
gcttgagggt tgaaatgacg ctcgaacagg catgcccgcc agaatactgg cgggcgcaat 180
gtgcgttcaa agattcgatg attcactgaa ttctgcaatt cacattactt atcgcatttt 240
gctgcgttct tcatcgatgc cagaaccaag agatccgttg ttgaaagttt tgatttattt 300
gtttgtttta ctcagaagtt ccactaaaaa cagagtttag gggtcctcgg gcgggccgtc 360
ccgttttacg gggcgcgggc tgatccgccg aggcaacgta taggtatgtt cacaggggtt 420
tgggagttgt aaactcggta atgatccctc cgctggttca ccaacggaga ccttgttacg 480
a 481

Claims (5)

1.一株木贼镰刀菌(Fusarium equiseti)菌株Shsl21 CGMCC No.18550。
2.一种抗幽门螺旋杆菌活性的化合物,其结构式如下式所示:
Figure FDA0002252167990000011
3.权利要求2所述化合物的制备方法,其特征在于,包括以下步骤:
活化菌株Shsl21;
固体发酵菌株Shsl21;
用乙酸乙酯浸提固体发酵物得粗提物;
用减压硅胶柱层析得到洗脱液;
用反向硅胶色谱分离得反向洗脱液;
用凝胶色谱分离得凝胶洗脱液;
用反相HPLC分离得HPLC洗脱液。
4.权利要求2所述的化合物在抑制抗幽门螺旋杆菌活性中的应用。
5.根据权利要求4所述的应用,其特征在于,所述化合物抑制细菌生长的最高浓度为8μg/mL。
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