CN109517818A - 一种唾液、口腔拭子基因组dna保护液 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一种唾液、口腔拭子基因组DNA保护液,其特征在于,其特征在于,按1升的浓度计,包括如下组分:SDS(十二烷基硫酸钠)0.10~0.2%;NaCL 0.90%;Tris(三羟甲基氨基甲烷)5~15mM;EDTA 20~25mM;蛋白酶K 150‑160mg。该唾液、口腔拭子保存液以SDS、Tris‑HCl、EDTA、NaCl和蛋白酶K为主要成分,可用于唾液保存。NaCl可以维持细胞渗透压,SDS表面活性剂在蛋白酶K作用下可以破坏蛋白成分抑制细菌的滋生,容易引起DNA的降解;Tris‑HCl、EDTA可以保护游离DNA。本发明的DNA保存液是一种针对口腔拭子保存的保存液,其可以较好的保存口腔细胞;其更加卫生,不易滋生细菌;且保存时间长比信封长3‑5倍;制备方法简单,具有较好的社会价值。
Description
技术领域
本发明涉及生物技术领域,具体涉及一种唾液、口腔拭子基因组DNA保护液。
背景技术
人体组织及体液中提取得到的核酸DNA样本在法医鉴定、疾病检测与治疗等领域应用广泛。当前科研人员和临床医生主要用抗凝血提取DNA,然而抗凝血保存时间稍长后出现凝集现象对提取过程造成不便。同时,通过采血提取DNA还有如下几点不便:(1)对采血人员要求有专业的培训;(2)耗费人力,需要有人辅助完成;(3)部分人心理对抽血无法接受,甚至出现晕血等状况;(4)通量低,无法大量随时随地采集样本。
近些年来,科研和医药领域逐渐采用唾液、口腔拭子取样的方式获取个体的DNA,因为唾液里有一些口腔上皮细胞和唾液腺来源的白细胞,这些细胞里面有DNA。唾液、口腔拭子样本采集相对于传统血液样本采集来讲,是一种对人体无伤害、无痛苦的获取基因组DNA的方法,不易引起被采集者的不适和畏惧心理,该法不会对被采样者造成任何不适,且易接受,因而能最大限度的扩大基因研究的取样范围,特别适合分子流行病学大规模调查,唾液、口腔拭子基因子DNA样品的采集主要为唾液或者口腔黏膜上皮细胞。唾液、口腔拭子样品中含有大量人体分泌的体液,其中包含粘蛋白、球蛋白、消化酶和白蛋白等物质,多种有机物的存在容易滋生大量的微生物,保存需低温且保存时间短,如何避免微生物的生长同时保证脱落细胞中基因组DNA的完整,成为唾液保存液的关键作用所在。
发明内容
为了克服现有技术存在的上述缺陷,本发明的目的在于提供一种唾液、口腔拭子基因组DNA保护液。
为了实现本发明的目的,所采用的技术方案是:
一种唾液、口腔拭子基因组DNA保护液,按1升的浓度计,包括如下组分:
SDS(十二烷基硫酸钠)0.10~0.2%;
NaCL 0.90%;
Tris(三羟甲基氨基甲烷)5~15mM;
EDTA 20~25mM;
蛋白酶K 150-160mg。
在本发明的一个优选实施例中,所述SDS(十二烷基硫酸钠)浓度为0.10。
在本发明的一个优选实施例中,所述Tris(三羟甲基氨基甲烷)浓度为15mM。
在本发明的一个优选实施例中,所述EDTA浓度为20mM。
在本发明的一个优选实施例中,所述蛋白酶K浓度为150mg。
本发明的有益效果在于:
该唾液、口腔拭子保存液以SDS、Tris-HCl、EDTA、NaCl和蛋白酶K为主要成分,可用于唾液保存。
NaCl可以维持细胞渗透压,SDS表面活性剂在蛋白酶K作用下可以破坏蛋白成分抑制细菌的滋生,容易引起DNA的降解;Tris-HCl、EDTA可以保护游离DNA。
本发明的DNA保存液是一种针对口腔拭子保存的保存液,其可以较好的保存口腔细胞;其更加卫生,不易滋生细菌;且保存时间长比信封长3-5倍;制备方法简单,具有较好的社会价值。
附图说明
图1为数据结果示意图1;
图2为数据结果示意图2。
具体实施方式
以下通过实施例对本发明作进一步的说明,但这些实施例不得用于解释对本发明的限制。
取10克的几丁胺糖混合物,内含80%(W/W)几丁胺糖高分子(分子量Mw=340000,脱乙酰度=84%)以及20%的几丁胺糖寡糖(2-10糖),将上列几丁胺糖加入到1公升的纯水下,在室温下,搅拌至几丁胺糖均匀分散于水中后,慢慢滴入冰醋酸,并同时继续搅拌经过半小时滴加3.6克冰醋酸以后,几丁胺糖完全溶解,再加入1克的柠橡酸,继续搅拌半小时后,停止搅拌,得到均匀的溶液;取出上述几丁胺糖溶液100毫升,加水稀释至1公升,再加0.5克的氯化钠(NaCl)及0.01克的氟化钠(NaF),即得到口腔保护液。
此项产品进一步验证其成膜性,以100毫升的烧杯,盛装50毫升唾液样品,符上述口腔保护液涂布在显微镜盖玻片上,再将此盖玻片浸入唾液中,10分钟以后取出,以100倍显微镜检视盖玻片表面,可以观察到完全覆盖一层几丁胺糖薄膜。
1.配制0.5M EDTA母液:将EDTA.Na2.2H2O与约20g NaOH直接加入到1L容器中,搅拌至完全溶解,微调pH值至8.0NaOH不作为最终成分,起辅助溶解作用,最终生成Na3EDTA,定溶至1L,灭菌,备用。
2.配制2M Tris母液:将Tris称量好,接加入到1L容器中,搅拌至完全溶解,溶解后,用HCl将pH调至pH8.0(25℃),定溶至1L,最后用0.22um膜过滤。
3.配制DNA保护液:按比例将上述母液直接加入到1L容器中,按规定的量称取十二烷基硫酸钠(温水溶解)、氯化钠、蛋白酶K到1L容器中,搅拌至完全溶解,用HCl将pH调至pH7.5(25℃),定溶至1L,最后用0.22um膜过滤。
基因组DNA抽提
一、实验材料预处理
1、转移唾液/口腔拭子样品细胞保护液400μL至2.0mL EP管中;
2、向EP管中加入300μL裂解液和20μL蛋白酶K溶液,涡旋混匀后置于60℃水浴锅中温浴30~40min,每隔5min摇晃混匀一次,裂解完毕低速瞬离将管内液体集中至管底。
注:若需去除RNA,请在上述混合液中加入4μL RNase A溶液。
二、提取基因组DNA
1.核酸结合:向裂解完毕液EP管中加入300μL异丙醇和80μL磁珠悬浮液(提前摇晃均匀),高速涡旋震荡5min。
2.磁性分离将EP管置于磁力架上静置20s至磁珠吸附完全(如EP管内盖有磁珠液残留,可保持EP管在磁力架上,整体上下颠倒2~3次至磁珠被完全吸附),吸弃上清液。
3.清洗:1)向EP管中加入700μL清洗液1,吹散磁珠后涡旋震荡2min,参照步骤4进行磁性分离、吸弃上清液;
4.使用700μL清洗液2,参照步骤5(1)操作2次;
5.使用700μL80%乙醇,参照步骤5(1)操作1次。
6.除醇将除尽上清液后EP管同磁力架一并置于45℃真空干燥箱中,干燥10min。注:亦可置于通风橱通风或电风扇直吹约10min,具体时间以磁珠干透无乙醇味为准。
7.核酸洗脱向EP管中加入100μL洗脱液,吹散磁珠,58℃温浴10min,每隔3min涡旋振荡30s。
8.核酸转移将EP管置于磁力架上至磁珠吸附完全,将洗脱液转移至干净EP管中,提取过程完毕。
9.取4μL洗脱液加入1μL上样缓冲液进行电泳检测。
10.使用Thermo NanoDrop-2000进行核酸浓度的测定。
数据结果参加图1、图2和表1、表2,其中:
1、2:为未加保护液的唾液样本,3、4:为未加保护液的口腔拭子样本,5、6:为加保护液的唾液样本,7、8:为加保护液的口腔拭子样本。
表1
Sample 1、2:为未加保护液的唾液样本,sample3、4:为未加保护液的口腔拭子样本,sample5、6:为加保护液的唾液样本,sample7、8:为加保护液的口腔拭子样本。
结论:采取唾液样本和口腔拭子样本,对照组加入800uL的本保护液,
9、10:为未加保护液的唾液样本室温放置1个月,11、12:为未加保护液的口腔拭子样本室温放置1个月,13、14:为加保护液的唾液样本室温放置1个月,15、16:为加保护液的口腔拭子样本室温放置1个月。
表2
Sample 1、2:为未加保护液的唾液样本室温放置1个月,sample3、4:为未加保护液的口腔拭子样本室温放置1个月,sample5、6:为加保护液的唾液样本室温放置1个月,sample7、8:为加保护液的口腔拭子样本室温放置1个月。
由表1和2可知:
本发明的DNA保存液是一种针对口腔拭子保存的保存液,其可以较好的保存口腔细胞;其更加卫生,不易滋生细菌;且保存时间长比信封长3-5倍;制备方法简单,具有较好的社会价值。
Claims (5)
1.一种唾液、口腔拭子基因组DNA保护液,其特征在于,按1升的浓度计,包括如下组分:
SDS(十二烷基硫酸钠)0.10~0.2%;
NaCL 0.90%;
Tris(三羟甲基氨基甲烷)5~15mM;
EDTA 20~25mM;
蛋白酶K 150-160mg。
2.如权利要求1所述的一种唾液、口腔拭子基因组DNA保护液,其特征在于,所述SDS(十二烷基硫酸钠)浓度为0.10。
3.如权利要求1所述的一种唾液、口腔拭子基因组DNA保护液,其特征在于,所述Tris(三羟甲基氨基甲烷)浓度为15mM。
4.如权利要求1所述的一种唾液、口腔拭子基因组DNA保护液,其特征在于,所述EDTA浓度为20mM。
5.如权利要求1所述的一种唾液、口腔拭子基因组DNA保护液,其特征在于,所述蛋白酶K浓度为150mg。
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