CN108374027A - 一种r-3-氨基丁酸的制备方法 - Google Patents

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Abstract

本发明公开了一种R‑3‑氨基丁酸的制备方法,该方法是以巴豆酸、铵盐为底物,加入含有镁离子的盐,用氨水调节pH,然后加入重组天冬氨酸酶作为生物酶催化剂,在适宜温度和碱性条件下反应,反应后经分离、纯化、结晶,获得R‑3‑氨基丁酸。该方法通过控制反应体系的铵根离子,控制逆反应并减少副产物的生成;利用微滤和纳滤截留菌泥、酶蛋白、硫酸根离子以及色素等杂质,通过连续浓缩结晶,获得高手性纯度以及高杂质纯度的优质产品。

Description

一种R-3-氨基丁酸的制备方法
技术领域
本发明属于生物催化技术领域,具体涉及天冬氨酸酶催化巴豆酸制备R-3-氨基丁酸的方法。
背景技术
R-3-氨基丁酸(R-3-aminobutyric acid),CAS:3775-73-3,主要作为医药中间体R-3-氨基丁醇的前体物。R-3-氨基丁醇(R-3-amino-1-butanol),CAS:61477-40-5,是一种用于治疗艾滋病药物度鲁特韦(Dolutegravir)的关键中间体。度鲁特韦是人类免疫缺陷病毒类型I(HIV-1)整合酶抑制药,其化学合成所需原料较多,R-3-氨基丁酸是其重要原料之一。R-3-氨基丁酸的分子结构式如式(I)所示:
R-3-氨基丁酸经一步还原反应即可得到度鲁特韦关键中间体R-3-氨基丁醇。R-3-氨基丁醇的手性纯度决定了后续合成中间体的纯度,因此,对制备高纯度的度鲁特韦起着举足轻重的作用。目前,国内对于R-3-氨基丁醇的制备主要还是传统的化学方法,包括:化学拆分法、化学诱导法、手性原料合成法和制备色谱法等。但采用以上方法制备R-3-氨基丁醇易对环境造成较大的污染且收率不高,不利于企业的节能减排。
开发具有高效、低成本的路线合成高纯度的R-3-氨基丁酸是降低度鲁特韦原料药成本,推广其应用范围的关键步骤。相对于化学法,生物催化具有反应条件温和、高度选择性、产物纯度高等优点,利用生物酶法催化技术是一种可行的方案,但目前未见关于生物酶法制备R-3-氨基丁酸的相关报道。
发明内容
发明目的:本发明的目的是提供一种适用于工业生产级别的生物酶催化合成R-3-氨基丁酸的方法。
技术方案:一种R-3-氨基丁酸的制备方法,以巴豆酸、铵盐为底物,加入含有镁离子的盐,用氨水调节pH;加入重组天冬氨酸酶作为生物酶催化剂,在适宜温度和碱性条件下进行生物酶催化反应,反应后经分离、纯化、结晶,获得R-3-氨基丁酸。
该生物酶催化反应如式(II)所示:
巴豆酸即丁烯酸,有顺式和反式两种异构体,本发明所述R-3-氨基丁酸为反式丁烯酸。在该反应中,氨水作为调节pH的碱性物质,又提供了部分铵根离子,在铵盐的作用下,使得该反应能得到充足的铵根离子,同时在反应过程中,pH控制在碱性条件,进一步保证底物巴豆酸能够完全转化为产物R-3-氨基丁酸。
其中,所述重组天冬氨酸酶的获得方法是:将来源于芽孢杆菌的天冬氨酸酶编码基因进行克隆,获得重组质粒,加入感受态宿主细胞进行转化获得工程菌株;然后依次经发酵培养、细胞破碎处理获得;所述重组质粒的核苷酸序列含有如SEQ ID NO.1所述基因序列。
其中,所述重组天冬氨酸酶的获得方法是:以芽孢杆菌菌液为模板,按照GenBank上公开的芽孢杆菌天冬氨酸酶基因序列设计一对引物,随后进行PCR扩增,将PCR扩增片段和载体进行双酶切并纯化,随后按适量的比例将目的片段和载体进行连接构成重组质粒,加入感受态细胞进行转化构成重组菌株,将重组菌株涂布在相应抗性的平板中进行培养。
其中,所述宿主细胞包括但不限于大肠杆菌、枯草芽孢杆菌、毕赤酵母的任意一种。大肠杆菌细胞生长繁殖速度快且BL21(DE3)适用于高效表达外源基因,因此优选大肠杆菌作为宿主细胞。所述重组质粒选用包括但不限于pET、pGEX、pMAL的任意一种作为载体,优选pET-28质粒。
其中,所述的氨水作为调节pH的碱性物质,在中和巴豆酸的酸性时,又提供了铵根离子,在反应初期只有底物巴豆酸的反应液中,当氨水的加入量至反应体系的pH为7.5时,铵根离子的加入量与底物巴豆酸的摩尔比为1∶1。当pH继续调至8.5-9.5,使得体系中有少量富余的铵根离子,有助于充分反应。后续再补充少量铵盐,该反应体系中的铵根离子过量,以及在镁离子的共同作用下,使得底物巴豆酸的转化率大于98%。
进一步地,所述生物酶催化反应中,铵盐中的铵根离子与巴豆酸的摩尔比为0.2~0.4∶1,优选为0.3∶1。所述铵盐选用包括但不限于硫酸铵、氯化铵、乙酸铵、甲酸铵的任意一种或多种的组合,优选为硫酸铵。甲酸铵和乙酸铵虽然也能作为稳定的铵根离子来源,但对后续的分离纯化要求较高。
所述重组天冬氨酸酶与底物质量比为0.03~0.05∶1,优选为0.04∶1。进一步地,所述巴豆酸的浓度为100~400g/L,优选230~270g/L。
所述的镁离子浓度为0.01~0.03mol/L,优选为0.02mol/L。镁离子有助于提高酶的活性,提高了反应速率,且促使反应向正方向进行。提供镁离子的试剂可选用包括但不限于硝酸镁、氯化镁、硫酸镁的任意一种或多种的组合,优选用硫酸镁。
本发明在生物酶催化反应前,先通过加入氨水调节pH至8.5~9.5,其目的在于使该反应液处于碱性条件,相对来说氨水的加入量更加充分,进一步保证后续底物巴豆酸能够完全转化为产物R-3-氨基丁酸。加入生物酶催化剂后,维持催化反应在碱性条件下,优选的pH为6.5~10.0,更优选的为8.5~9.5。
所述生物酶催化反应的适宜温度为30℃~50℃,优选反应温度为35℃~45℃。在此温度下,该反应能够顺利进行,且转化率在98%以上。若温度低于30℃或者高于50℃,酶活受到影响,反应后有大量的底物残留,转化率远远低于98%。
生物酶催化反应后的分离步骤采用膜过滤工艺,先选用截留相对分子质量大于3000-5000道尔顿物质的微滤膜进行分离,对微滤膜清液再选用截留相对分子质量大于120~200道尔顿物质的钠滤膜进行分离。微滤可选用陶瓷微滤膜,主要用于截留重组天冬氨酸菌泥及大部分酶蛋白;纳滤膜的材质选用聚酰胺或醋酸纤维素,主要用于截留硫酸根等二价离子以及部分色素等杂质。
微滤和纳滤分离后,将清液浓缩至大量晶体形成,料液直接通过离心甩滤,并用少量纯水淋洗,得到R-3-氨基丁酸产品,同时离心出来的母液经过精密过滤器过滤后,可继续回到浓缩器内进一步浓缩结晶,再通过离心分离,得到成品,该步骤不断循环操作。经此浓缩结晶方式可以提高产品的收率,同时可以得到高品质的产品。
有益效果:本发明所述的制备方法选用巴豆酸作为反应底物实现一次反应获得R-3-氨基丁酸。通过体系中过量的铵根离子和特定的温度与pH,控制逆反应并减少副产物的生成。该方法利用微滤和纳滤截留菌泥、酶蛋白、硫酸根离子以及色素等杂质,通过连续浓缩结晶,获得高手性纯度以及高杂质纯度的优质产品。由于该酶具有高度的选择性,产物纯度高等优点,再结合较优的提取工艺,因此可获得的R-3-氨基丁酸手性纯度不低于99.95%,杂质纯度不低于99%,含量不低于99%,产品收率不低于85%。
附图说明
图1为本发明所构建的重组表达质粒pET-28a(+)-Asp;
图2为大肠杆菌BL21(DE3)/pET-28a(+)-Asp诱导表达后重组天冬氨酸酶的SDS-PAGE电泳图,其中M是蛋白分子量标准品,1号是诱导前的破碎上清液,2号是诱导后的破碎上清液;
图3、图4、图5是实施例2中酶催化反应过程中底物和产物HPLC液相图,其中,图3是反应0h时的液相图,图4是反应4h时的液相图,图5是反应12h时的液相图;
图6为实施例2的R-3-氨基丁酸杂质纯度的液相图谱;
图7为实施例4的R-3-氨基丁酸杂质纯度的液相图谱;
图8为实施例2的R-3-氨基丁酸手性纯度的液相图谱;
图9为实施例4的R-3-氨基丁酸手性纯度的液相图谱。
具体实施方式
下面结合附图和具体实施例对本发明进行进一步说明。
实施例1
1.天冬氨酸酶克隆菌株的构建
将冻存的芽孢杆菌进行复苏培养传代后,以该菌液为DNA模板,按照NCBI上公开的芽孢杆菌天冬氨酸酶基因(如GenBank:AB028242.1)序列设计一对引物:
正向引物(ASP-P-BamH I):5’-CGCGGATCCATGAATACCGATGTTCGT-3’;
反向引物(ASP-R-Xho I):5’-CCGCTCGAGTATTTTCTTCCAGCAATTCCCGG-3’;
然后进行PCR扩增,反应条件为94℃预变性5min,然后30个循环(94℃30s,59℃30s,72℃1.5min),72℃再延伸10min。
PCR完毕后进行凝胶验证和产物回收。随后将目的片段与pET-28a(+)质粒分别进行由BamH I和Xho I组成的双酶切体系进行酶切,反应结束后进行酶切产物的回收,然后将酶切后的目的片段和pET-28a(+)载体按一定比例混合,加入含有DNA连接酶的溶液于16℃进行连接反应。
将连接产物加入大肠杆菌DH5α感受态细胞中进行转化,冰浴30min后迅速转移至水浴锅中42℃热激60s,冰浴2min后于超净台中加入500μL无菌无抗性的LB液体培养基进行孵育。孵育后取适量菌液均匀地涂布在含有卡那霉素抗性的LB固体培养基的平板上培养,挑取单克隆菌落至4mL卡那抗性的LB液体培养基中,37℃,220rpm培养14h,以该菌液为模板进行PCR验证。PCR验证成功后进行重组质粒抽提,提取的质粒分别进行酶切和测序,验证获得重组天冬氨酸酶克隆菌株如图1所示,其含有如SEQ ID NO.1所述基因序列。
2.天冬氨酸酶表达菌株的构建
将提取的重组质粒1μL加入大肠杆菌BL21(DE3)感受态细胞中进行转化,冰浴30min后,45℃水浴热激90s,再冰浴2min后将菌液均匀地涂布在含有卡那霉素抗性的LB固体培养基的平板上,37℃培养18h后挑取单克隆菌落至4mL卡那抗性的LB液体培养基中,37℃,220rpm培养14h。即获得天冬氨酸酶表达菌株BL21(DE3)/pET-28a(+)-Asp。
3.重组菌株进行发酵生产天冬氨酸酶
将BL21(DE3)/pET-28a(+)-Asp表达菌株菌体接入4mL含卡那霉素50mg/L的LB液体培养基中,37℃,220rpm培养16h后,按菌液全部接种至600mL TB液体培养基中,37℃,220rpm培养至OD600至4时加入终浓度为0.3mM的IPTG进行诱导,25℃诱导16h。然后5000rpm离心20min收集含天冬氨酸酶的菌体浆状物,该浆状物即可作为生物催化剂。
细胞破碎:菌体浆状物用0.05M的磷酸缓冲液(pH 7.0)重悬,超声破碎后即得到粗酶液。图2说明重组天冬氨酸酶在大肠杆菌中获得了正确表达。
实施例2 1000L体系生物催化反应
在1000L催化体系中,加入250kg巴豆酸,2.4kg硫酸镁,58kg硫酸铵,再用氨水将pH调至9.0,40℃搅拌,加入上述实施例1获得的天冬氨酸酶菌泥10kg,开始反应。反应12h结束后,经检测溶液中的R-3-氨基丁酸浓度可达294g/L,转化率达到98%以上。
请进一步参考图3至图5所示,图3为加完底物调好pH时液相图谱,图4为反应4h的液相图谱,反应速度很快。图5为反应12h时的液相图谱,从该图可以看出底物已经基本被反应完了,底物残留很低。
反应结束后,反应液经微滤膜处理截留天冬氨酸酶菌泥以及大部分酶蛋白,清液经纳滤膜去除SO4 2-以及大部分色素。微滤选用截留相对分子质量大于3000-5000道尔顿物质的微滤膜进行分离,纳滤截留相对分子质量大于120~200道尔顿物质的钠滤膜进行分离。得到的纳滤清液经浓缩结晶、离心以及干燥得到255kg成品。
经检测该成品R-3-氨基丁酸手性纯度为99.98%,杂质纯度为99.54%,含量为99.7%,产品收率为88%。杂质纯度液相图谱见图6,手性纯度液相图谱见图8。
实施例3 1000L体系生物催化反应
在1000L催化体系中,加入270kg巴豆酸,2.4kg硫酸镁,72.5kg乙酸铵,再用氨水将pH调至9.2,38℃搅拌,加入天冬氨酸酶菌泥11kg,开始反应。反应12h结束后,经检测溶液中的R-3-氨基丁酸浓度可达319g/L,转化率达到98%以上。
反应结束后,反应液经微滤膜处理截留天冬氨酸酶菌泥以及大部分酶蛋白,清液经纳滤膜去除SO4 2-以及大部分色素。微滤选用截留相对分子质量大于3000-5000道尔顿物质的微滤膜进行分离,纳滤截留相对分子质量大于120~200道尔顿物质的钠滤膜进行分离。得到的纳滤清液经浓缩结晶、离心以及干燥得到235kg成品。
经检测该成品R-3-氨基丁酸手性纯度为99.97%,杂质纯度为99.1%,含量为99.2%,产品收率为74%。
由于本实施例中,使用的铵盐是乙酸铵,在后分离过程中,纳滤膜对乙酸根离子的截留没有明显效果,大量的乙酸根离子对浓缩结晶产生影响,降低了产品收率。
实施例4 15000L体系生物催化反应
在15000L催化体系中,加入3900kg巴豆酸,36kg硫酸镁,870kg硫酸铵,用氨水将pH调至8.8,42℃搅拌,加入天冬氨酸酶菌泥170kg,开始反应。反应12h结束后,经检测溶液中的R-3-氨基丁酸浓度可达307g/L,转化率达到98%以上。
反应结束后,反应液经微滤膜处理截留天冬氨酸酶菌泥以及大部分酶蛋白,清液经纳滤膜去除SO4 2-以及大部分色素。微滤选用截留相对分子质量大于3000-5000道尔顿物质的微滤膜进行分离,纳滤截留相对分子质量大于120~200道尔顿物质的钠滤膜进行分离。得到的纳滤清液经浓缩结晶、离心以及干燥得到4154kg成品。
经检测该成品R-3-氨基丁酸手性纯度为99.99%,杂质纯度为99.60%,含量为99.6%,产品收率为90.2%。杂质纯度液相图谱见图7,手性纯度液相图谱见图9。
实施例5 1000L体系生物催化反应
在1000L催化体系中,加入250kg巴豆酸,2.4kg硫酸镁,58kg硫酸铵,再用氨水将pH调至7.0,40℃搅拌,加入天冬氨酸酶菌泥10kg,开始反应。反应24h结束后,经检测溶液中的R-3-氨基丁酸浓度可达207g/L,转化率达到69.1%。
反应结束后,反应液经微滤膜处理截留天冬氨酸酶菌泥以及大部分酶蛋白,清液经纳滤膜去除SO4 2-以及大部分色素。微滤选用截留相对分子质量大于3000-5000道尔顿物质的微滤膜进行分离,纳滤截留相对分子质量大于120~200道尔顿物质的钠滤膜进行分离。得到的纳滤清液经浓缩结晶、离心以及干燥得到155kg成品。
经检测该成品R-3-氨基丁酸手性纯度为99.26%,杂质纯度为98.03%,含量为98.8%,产品收率为74.9%。由于反应时间较长,在反应过程中容易受杂菌的影响,会影响产品的手性纯度。故在此实施例中,产品的手性纯度为99.26%。
实施例6 1000L体系生物催化反应
在1000L催化体系中,加入250kg巴豆酸,2.4kg硫酸镁,再用氨水将pH调至9.0,40℃搅拌,加入天冬氨酸酶菌泥10kg,开始反应。反应24h结束后,经检测溶液中的R-3-氨基丁酸浓度可达241g/L,转化率达到80.5%。
反应结束后,反应液经微滤膜处理截留天冬氨酸酶菌泥以及大部分酶蛋白,清液经纳滤膜去除SO4 2-以及大部分色素。微滤选用截留相对分子质量大于3000-5000道尔顿物质的微滤膜进行分离,纳滤截留相对分子质量大于120~200道尔顿物质的钠滤膜进行分离。得到的纳滤清液经浓缩结晶、离心以及干燥得到172kg成品。
经检测该成品R-3-氨基丁酸手性纯度为99.73%,杂质纯度为98.47%,含量为99.1%,产品收率为71.4%。
实施例7 1000L体系生物催化反应
在1000L催化体系中,加入250kg巴豆酸,58kg硫酸铵,再用氨水将pH调至9.0,40℃搅拌,加入天冬氨酸酶菌泥10kg,开始反应。反应24h结束后,经检测溶液中的R-3-氨基丁酸浓度可达263g/L,转化率达到87.8%以上。
反应结束后,反应液经微滤膜处理截留天冬氨酸酶菌泥以及大部分酶蛋白,清液经纳滤膜去除SO4 2-以及大部分色素。微滤选用截留相对分子质量大于3000-5000道尔顿物质的微滤膜进行分离,纳滤截留相对分子质量大于120~200道尔顿物质的钠滤膜进行分离。得到的纳滤清液经浓缩结晶、离心以及干燥得到195kg成品。
经检测该成品R-3-氨基丁酸手性纯度为99.65%,杂质纯度为99.12%,含量为98.4%,产品收率为74.1%。
实施例8 1000L体系生物催化反应
在1000L催化体系中,加入250kg巴豆酸,2.4kg硫酸镁,58kg硫酸铵,再用氨水将pH调至9.0,25℃搅拌,加入天冬氨酸酶菌泥10kg,开始反应。反应24h结束后,经检测溶液中的R-3-氨基丁酸浓度可达184g/L,转化率达到61.4%以上。
反应结束后,反应液经微滤膜处理截留天冬氨酸酶菌泥以及大部分酶蛋白,清液经纳滤膜去除SO4 2-以及大部分色素。微滤选用截留相对分子质量大于3000-5000道尔顿物质的微滤膜进行分离,纳滤截留相对分子质量大于120~200道尔顿物质的钠滤膜进行分离。得到的纳滤清液经浓缩结晶、离心以及干燥得到123.3kg成品。
经检测该成品R-3-氨基丁酸手性纯度为99.47%,杂质纯度为99.54%,含量为99.7%,产品收率为67%。
实施例9 1000L体系生物催化反应
在1000L催化体系中,加入250kg巴豆酸,2.4kg硫酸镁,47kg氯化铵,再用氨水将pH调至9.0,25℃搅拌,加入天冬氨酸酶菌泥10kg,开始反应。反应24h结束后,经检测溶液中的R-3-氨基丁酸浓度可达187g/L,转化率达到62.6%以上。
反应结束后,反应液经微滤膜处理截留天冬氨酸酶菌泥以及大部分酶蛋白,清液经纳滤膜去除SO4 2-以及大部分色素。微滤选用截留相对分子质量大于3000-5000道尔顿物质的微滤膜进行分离,纳滤截留相对分子质量大于120~200道尔顿物质的钠滤膜进行分离。得到的纳滤清液经浓缩结晶、离心以及干燥得到127.5kg成品。
经检测该成品R-3-氨基丁酸手性纯度为99.51%,杂质纯度为99.43%,含量为99.6%,产品收率为69%。
试验例
从上述实施例2、3、6可以看出,加入除硫酸铵以外的铵盐或者不加铵盐,将对转化率、收率以及产品的品质产生很大的影响,如不加硫酸铵生物酶催化反应的转化率只有80.5%。
从上述实施例2、5、8可以看出不同的pH和温度,将对转化率、收率以及产品的品质产生很大的影响。实施例5中在酶催化反应在pH为7.0的环境下,最终转化率只有69.1%,实施例8中当反应温度只有25℃时转化率只有61.4%。
通过上述实施例2、7可以看出不加硫酸镁,也会对转化率、收率以及产品的品质产生很大的影响。
序列表
<110> 长兴制药股份有限公司
<120> 一种R-3-氨基丁酸的制备方法
<130> 18WS2V0070028
<160> 1
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 1404
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 1
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Claims (16)

1.一种R-3-氨基丁酸的制备方法,其特征在于:以巴豆酸、铵盐为底物,加入含有镁离子的盐,用氨水调节pH;加入重组天冬氨酸酶作为生物酶催化剂,在适宜温度和碱性条件下进行生物酶催化反应,反应后经分离、纯化、结晶,获得R-3-氨基丁酸。
2.根据权利要求1所述的一种R-3-氨基丁酸的制备方法,其特征在于:所述铵盐中的铵根离子与巴豆酸的摩尔比为0.2~0.4∶1。
3.根据权利要求1所述的一种R-3-氨基丁酸的制备方法,其特征在于:所述的镁离子浓度为0.01~0.03mol/L。
4.根据权利要求1或2所述的一种R-3-氨基丁酸的制备方法,其特征在于:所述重组天冬氨酸酶与底物巴豆酸质量比为0.03~0.05∶1。
5.根据权利要求4所述的一种R-3-氨基丁酸的制备方法,其特征在于:所述生物酶催化反应中,所述巴豆酸的浓度为100~400g/L。
6.根据权利要求1所述的一种R-3-氨基丁酸的制备方法,其特征在于:所述铵盐为硫酸铵、氯化铵、乙酸铵、甲酸铵的任意一种或多种的组合。
7.根据权利要求6所述的一种R-3-氨基丁酸的制备方法,其特征在于:所述铵盐为硫酸铵。
8.根据权利要求1所述的一种R-3-氨基丁酸的制备方法,其特征在于:加入氨水后pH调节至8.5-9.5。
9.根据权利要求1所述的一种R-3-氨基丁酸的制备方法,其特征在于:加入生物酶催化剂后,生物酶催化反应的pH为6.5~10.0。
10.根据权利要求9所述的一种R-3-氨基丁酸的制备方法,其特征在于:加入生物酶催化剂后,生物酶催化反应的pH为8.5~9.5。
11.根据权利要求1所述的一种R-3-氨基丁酸的制备方法,其特征在于:所述生物酶催化反应的温度为30℃~50℃。
12.根据权利要求1所述的一种R-3-氨基丁酸的制备方法,其特征在于,所述重组天冬氨酸酶的获得方法是:将来源于芽孢杆菌的天冬氨酸酶编码基因进行克隆,获得重组质粒,加入感受态宿主细胞进行转化获得工程菌株;然后依次经发酵培养、细胞破碎处理获得;所述重组质粒的核苷酸序列含有如SEQ ID NO.1所述基因序列。
13.根据权利要求12所述的一种R-3-氨基丁酸的制备方法,其特征在于:所述宿主细胞为大肠杆菌、枯草芽孢杆菌、毕赤酵母的任意一种。
14.根据权利要求12所述的一种R-3-氨基丁酸的制备方法,其特征在于:所述重组质粒选用pET、pGEX、pMAL的任意一种作为载体。
15.根据权利求1所述的一种R-3-氨基丁酸的制备方法,其特征在于:生物酶催化反应后的分离步骤采用膜过滤工艺,先选用截留相对分子质量大于3000-5000道尔顿物质的微滤膜进行分离,对微滤膜清液再选用截留相对分子质量大于120~200道尔顿物质的钠滤膜进行分离。
16.根据权利要求1所述的一种R-3-氨基丁酸的制备方法,其特征在于:该方法获得的R-3-氨基丁酸手性纯度不低于99.95%,杂质纯度不低于99%,含量不低于99%,产品收率不低于85%。
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