CN108290058B - 使用il23途径生物标志物预测il23拮抗剂的临床应答 - Google Patents

使用il23途径生物标志物预测il23拮抗剂的临床应答 Download PDF

Info

Publication number
CN108290058B
CN108290058B CN201680066986.XA CN201680066986A CN108290058B CN 108290058 B CN108290058 B CN 108290058B CN 201680066986 A CN201680066986 A CN 201680066986A CN 108290058 B CN108290058 B CN 108290058B
Authority
CN
China
Prior art keywords
lcn2
patient
level
antibody
aspects
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Active
Application number
CN201680066986.XA
Other languages
English (en)
Other versions
CN108290058A (zh
Inventor
R.W.乔甘塔斯三世
C.摩尔豪斯
B.希格斯
K.拉纳德
K.斯特雷彻尔
W.里斯
M.梁
R.法焦尼
J.李
I.维因什泰因
Y-W.李
J.陈
R.A.小加塞尔
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Amgen Inc
MedImmune LLC
Original Assignee
Amgen Inc
MedImmune LLC
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Amgen Inc, MedImmune LLC filed Critical Amgen Inc
Priority to CN202310427386.3A priority Critical patent/CN116672446A/zh
Publication of CN108290058A publication Critical patent/CN108290058A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN108290058B publication Critical patent/CN108290058B/zh
Active legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Images

Classifications

    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/395—Antibodies; Immunoglobulins; Immune serum, e.g. antilymphocytic serum
    • A61K39/39533—Antibodies; Immunoglobulins; Immune serum, e.g. antilymphocytic serum against materials from animals
    • A61K39/3955—Antibodies; Immunoglobulins; Immune serum, e.g. antilymphocytic serum against materials from animals against proteinaceous materials, e.g. enzymes, hormones, lymphokines
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/68—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
    • G01N33/6863—Cytokines, i.e. immune system proteins modifying a biological response such as cell growth proliferation or differentiation, e.g. TNF, CNF, GM-CSF, lymphotoxin, MIF or their receptors
    • G01N33/6869—Interleukin
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P1/00—Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P1/00—Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system
    • A61P1/04—Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system for ulcers, gastritis or reflux esophagitis, e.g. antacids, inhibitors of acid secretion, mucosal protectants
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P1/00—Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system
    • A61P1/16—Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system for liver or gallbladder disorders, e.g. hepatoprotective agents, cholagogues, litholytics
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P11/00—Drugs for disorders of the respiratory system
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P11/00—Drugs for disorders of the respiratory system
    • A61P11/06—Antiasthmatics
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P17/00—Drugs for dermatological disorders
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P17/00—Drugs for dermatological disorders
    • A61P17/06—Antipsoriatics
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P19/00—Drugs for skeletal disorders
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P19/00—Drugs for skeletal disorders
    • A61P19/02—Drugs for skeletal disorders for joint disorders, e.g. arthritis, arthrosis
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P25/00—Drugs for disorders of the nervous system
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P25/00—Drugs for disorders of the nervous system
    • A61P25/02—Drugs for disorders of the nervous system for peripheral neuropathies
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P25/00—Drugs for disorders of the nervous system
    • A61P25/28—Drugs for disorders of the nervous system for treating neurodegenerative disorders of the central nervous system, e.g. nootropic agents, cognition enhancers, drugs for treating Alzheimer's disease or other forms of dementia
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P29/00—Non-central analgesic, antipyretic or antiinflammatory agents, e.g. antirheumatic agents; Non-steroidal antiinflammatory drugs [NSAID]
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/04—Antibacterial agents
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/10—Antimycotics
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/12—Antivirals
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/12—Antivirals
    • A61P31/20—Antivirals for DNA viruses
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00—Antineoplastic agents
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00—Antineoplastic agents
    • A61P35/02—Antineoplastic agents specific for leukemia
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P37/00—Drugs for immunological or allergic disorders
    • A61P37/02—Immunomodulators
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P37/00—Drugs for immunological or allergic disorders
    • A61P37/08—Antiallergic agents
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P5/00—Drugs for disorders of the endocrine system
    • A61P5/14—Drugs for disorders of the endocrine system of the thyroid hormones, e.g. T3, T4
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P9/00—Drugs for disorders of the cardiovascular system
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/24—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against cytokines, lymphokines or interferons
    • C07K16/244—Interleukins [IL]
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K2039/505—Medicinal preparations containing antigens or antibodies comprising antibodies
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
    • G01N2333/435—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans
    • G01N2333/52—Assays involving cytokines
    • G01N2333/54—Interleukins [IL]
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
    • G01N2800/06—Gastro-intestinal diseases
    • G01N2800/065—Bowel diseases, e.g. Crohn, ulcerative colitis, IBS
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
    • G01N2800/52—Predicting or monitoring the response to treatment, e.g. for selection of therapy based on assay results in personalised medicine; Prognosis
    • Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02A—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
    • Y02A50/00—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE in human health protection, e.g. against extreme weather
    • Y02A50/30—Against vector-borne diseases, e.g. mosquito-borne, fly-borne, tick-borne or waterborne diseases whose impact is exacerbated by climate change

Abstract

本公开内容涉及使用例如IL22、LCN2及其组合的IL23途径的组分作为生物标志物来分层和/或鉴定对用IL23拮抗剂(包括例如抗IL23抗体或其抗原结合片段)治疗作出应答的患有IL23介导的疾病(例如，克罗恩氏病)的患者群体。可以使用高于或低于预定阈值的IL23途径生物标志物水平，例如(i)确定患有IL23介导的疾病或病症如克罗恩氏病的患者是否符合或不符合用治疗剂(例如，抗IL23抗体)进行治疗的条件，(ii)确定是否应该开始，暂停或改进用某种药剂的治疗，(iii)诊断所述IL23介导的疾病是否可用特定的治疗剂治疗或不能用其治疗，或(iv)预测用特定治疗剂治疗所述IL23介导的疾病的结果。

Description

使用IL23途径生物标志物预测IL23拮抗剂的临床应答
电子递交的序列表的引用
与本申请一起提交的ASCII文本文件(名称：49653_Seqlisting.txt；大小：70,851bytes；且创建日期：2016年9月8日)中的电子提交序列表的内容以引用的方式整体并入本文。
发明领域
本公开内容涉及使用例如白细胞介素-22、脂质运载蛋白-2及其组合的IL23途径生物标志物来分层和/或鉴定患有IL23介导的疾病或病症的患者群体，所述IL23介导的疾病或病症适合用IL23拮抗剂(包括例如抗IL23抗体或其片段)治疗。
技术背景
白细胞介素(IL)-23是包括但不限于克罗恩氏病(Crohn’s disease，CD)、溃疡性结肠炎(UC)、牛皮癣、牛皮癣性关节炎、类风湿性关节炎和强直性脊柱炎的各种炎性病症的发病机理中涉及的促炎细胞因子。IL23诱导T细胞表达许多炎性基因，包括IL17A、IL17A受体、TNF-α和GM-CSF。IL23的主要已知作用是驱动T辅助子Th17细胞以及巨噬细胞、自然杀伤(NK)细胞、树突细胞和先天淋巴细胞的分化，导致IL17、IL22、TNFα、GMCSF和IFN-γ的上调以及IL10的下调。
白细胞介素(IL)-23是由2个亚基：p40和p19组成的异二聚细胞因子。p40亚基作为共同亚基由IL12和IL23共享，并被IL12/23的抑制剂靶向，例如优特克单抗/
Figure BDA0001662404150000011
(Janssen Biotech，Inc，Horsham，PA)和布拉吉单抗/ABT-874(Abbott Laboratories，Abbott Park，IL)。
对患者的研究已经证明IL23在克罗恩氏病(CD)和溃疡性结肠炎(UC)的细胞和靶组织中上调，而IL12并未上调(Schmidt等，Inflamm Bowel Dis.11(1)：16-23(2005)。已经报道来自多发性硬化症患者(MS；Vaknin等，J of Immunol.176：776874(2006))、牛皮癣患者(Lee等，J Exp Med 199：125-30(2004))的树突细胞以及来自MS患者的活性损害(Li等，Brain.130(2)：490-501(2007))中的类似观察结果。IL23在包括类风湿性关节炎(RA)、强直性脊柱炎(AS)、慢性阻塞性肺病(COPD)和视神经脊髓炎的其他疾病中也升高。CD和牛皮癣(PsO)患者的全基因组关联研究显示在独特的IL23受体组分(IL23R)中的多态性与疾病之间存在显著关联(Cargill等，Am J of Human Gen.80：273-90(2007)；Duerr等，Science314：1461-63(2006))。另外，已经显示出IL23R的等位基因变体与UC的频率的显著相关(Cargill等，Am.J.Hum.Gen.80：273-90(2007))、RA(Farago等，Ann.Rheum.Dis.67：248-50(2008))、AS(Burton等，Nature Gen.39：1329-37(2007))、以及MS(Illes等，NeuroLetters.431：36-38(2008))。因此，IL23及其受体对于药物研发都是非常有吸引力的目标。
在炎性肠病(IBD)(Ahem等，Immun Rev.226：147-59(2008))、PsO炎性关节炎(Yago等，Arthritis Res and Ther.9：R96(2007))以及MS(Cua等，Nature 421：744-48(2003)的临床前模型中，抗IL12/23p40抗体的有益作用已经通过单独阻断IL23同时免去IL12而得到重演。在临床中，已经显示抗IL12/23p40抗体(例如，优特克单抗和布拉吉单抗)诱导在以下疾病的临床应答：CD(2期研究；Toedter等，Am J Gastroenterol.104(11)：2768-73(2009)；Sandborn等，Gastroenter0l.135：1130-41(2008)；Mannon等，N Eng J of Med.351(20)：2069-79(2004))和PsO(2期和3期研究；Gordon等，J.Invest.Dermatol.132：304-314(2012)；Kimball等，Br J Dermatol.167(增刊1)：64(摘要，第94页)(2012)；Langley等，JAm Acad Dermatol.66：AB195(摘要，4779)(2012)；Gottlieb等，Br.J.Dermatol.165：652-660(2011)；Reich等，N Engl J Med.365：1586-1596(2011)；Strober等，Br JDermatol.165：661-668(2011)；Leonardi等，Lancet.371(9625)：1665-74(2008)；Papp等，Lancet.371(9625)：1675-84(2008))。在患有PsO的受试者中用抗IL23抗体MEDI2070(NCT01094093)和CNTO 1959的1期临床研究(Sofen等，Drugs Dermatol.10(8)：885-92(2011))已经证明与靶向IL12和IL23的抗体相当的临床功效，表明抗IL12/23p40抗体的治疗效果可能归因于单独中和IL23。
尽管靶向IL23途径的不同要素的几种药剂目前被批准或正在研发中，但是IL23介导的疾病的发病率、并发症和内在异质性仍然需要新的疗法和/或改善的方法来鉴定适合用IL23拮抗剂治疗的特定患者群体。参见，例如Gaffe等，Nature Revs.Immunol.14：585-600(2014)。
发明简述
本公开内容提供一种治疗患者的白细胞介素-23(IL23)介导的疾病的方法，其包括，如果确定或鉴定患者在一种或多种从患者取得的样品中具有与预定的IL22和/或LCN2阈值水平相比或者与在一种或多种对照样品中的IL22和/或LCN2水平相比(i)更高或增加的白细胞介素-22(IL22)水平和/或(ii)更高或增加的脂质运载蛋白2(LCN2)水平，则对所述患者施用IL23拮抗剂。
还提供治疗患有IL23介导的疾病的患者的方法，其包括，如果确定或鉴定患者在一种或多种从患者取得的样品中具有与预定的IL22和/或LCN2阈值水平相比或者与在一种或多种对照样品中的IL22和/或LCN2水平相比(i)更低或减小的白细胞介素-22(IL22)水平和/或(ii)更低或减小的脂质运载蛋白2(LCN2)水平，则暂停或不起始对患者施用IL23拮抗剂。
还提供一种治疗患者的白细胞介素-23(IL23)介导的疾病的方法，其中患者对于用抗TNF剂治疗失败，无应答或不耐受，所述方法包括，如果确定或鉴定患者在一种或多种从患者取得的样品中具有与预定的IL22和/或LCN2阈值水平相比或者与在一种或多种对照样品中的IL22和/或LCN2水平相比(i)更高或增加的白细胞介素-22(IL22)水平和/或(ii)更高或增加的脂质运载蛋白2(LCN2)水平，则对患者施用IL23拮抗剂。
本公开内容还提供了一种确定是否用IL23拮抗剂治疗患有IL23介导的疾病的患者的方法，其包括，如果确定或鉴定患者在一种或多种从患者取得的样品中具有与预定的IL22和/或LCN2阈值水平相比或者与在一种或多种对照样品中的IL22和/或LCN2水平相比(i)更高或增加的白细胞介素-22(IL22)水平和/或(ii)更高或增加的脂质运载蛋白2(LCN2)水平，则确定治疗所述患者。
此外，本公开内容提供一种选择被诊断为患有IL23介导的疾病的患者作为用IL23拮抗剂治疗的候选者的方法，其包括，如果确定或鉴定患者在一种或多种从患者取得的样品中具有与预定的IL22和/或LCN2阈值水平相比或者与在一种或多种对照样品中的IL22和/或LCN2水平相比(i)更高或增加的白细胞介素-22(IL22)水平和/或(ii)更高或增加的脂质运载蛋白2(LCN2)水平，则选择所述患者用于治疗。
在一些方面，本文公开的方法还包括测量在从患者获得的一种或多种样品中的IL22和/或LCN2水平，或指导临床实验室或保健提供者测量样品中的IL22和/或LCN2水平和/或递交从患者获得一种或多种样品到临床实验室或保健提供者以测量样品中的IL22和/或LCN2水平。
在一些方面，本文公开的方法还包括确定在从患者获得的一种或多种样品中的IL22和/或LCN2水平。
在一些方面，本文公开的方法还包括如果确定或鉴定患者在一种或多种样品中具有与预定的IL22和/或LCN2阈值水平相比或者与在一种或多种对照样品中的IL22和/或LCN2水平相比(i)更高或增加的IL22水平和/或(ii)更高或增加的LCN2水平，则建议保健提供者对患者施用IL23拮抗剂，或者如果确定或鉴定患者在一种或多种样品中具有与预定的IL22和/或LCN2阈值水平相比或者与在一种或多种对照样品中的IL22和/或LCN2水平相比(i)更低或减小的IL22水平和/或(ii)更低或减小的LCN2水平，则建议保健提供者暂停或拒绝对患者施用IL23拮抗剂。
本公开内容还提供一种测量IL23拮抗剂在诊断患有IL23介导的疾病的患者中的功效或药效动力学的方法，其包括：(a)测量从患者取得的第一样品中的IL22和/或LCN2的水平；(b)施用IL23拮抗剂；(c)测量从患者取得的第二样品中的IL22和/或LCN2的水平，其中，与第一样品中患者的IL22和/或LCN2水平相比，第二样品中的IL22和/或LCN2的水平降低指示患者对治疗作出应答。在一些方面，在施用IL23拮抗剂之后，在第1、2、4、8、12或28周或在居间的时间取得第二样品。
在一些方面，IL23拮抗剂是抗IL23抗体或其抗原结合片段。在一些方面，抗IL23抗体或其抗原结合片段结合IL23的p19亚基(SEQ ID NO：13)、IL23的p40亚基(SEQ ID NO：14)或两者。在一些方面，抗IL23抗体或其抗原结合片段包含优特克单抗(ustekinumab)、布拉吉单抗(briakinumab)、吉塞克单抗(guselkumab)、BI-655066、蒂尔他昔单抗(tildrakinumab)、LY-3074828或其抗原结合片段。在一些方面，抗IL23抗体或其抗原结合片段包含MEDI2070的可变区(VH)(SEQ ID NO：5)和/或轻链可变区(VL)(SEQ ID NO：6)。在一些方面，抗IL23抗体或其抗原结合片段包含MEDI2070的互补决定区(SEQ ID NO：31-36)中的至少一个。在一些方面，抗体以固定剂量施用。在一些方面，所述固定剂量在10毫克/剂与1000毫克/剂之间。在一些方面，固定剂量为约210毫克/剂或约700毫克/剂。
在一些方面，在施用IL23拮抗剂或抗IL23抗体或抗原结合片段之前、期间、之后或作为替代，已经用一种或多种用于治疗IL23介导的疾病或病症的额外疗法治疗患者。在一些方面，从患者取得的一种或多种样品和/或一种或多种对照样品是选自由以下组成的组的一种或多种样品：全血、血清、血浆、唾液、痰、支气管肺泡灌洗液、脑脊液、胸膜液、心包液、腹水、滑液、上皮细胞、尿液、粪便、皮肤、组织活检或其组合。在一些方面，一种或多种对照样品是(i)从正常健康个体获得的一种或多种样品；(ii)从患有非IL23介导的疾病的患者获得的一种或多种样品；或(iii)其组合。在一些方面，患者的IL22和/或LCN2水平在实施例3中描述的免疫测定中测量。
在一些方面，上面公开的方法还包括确定选自由以下各物组成的组的一种或多种IL23途径生物标志物的水平：IL17F、IL17A/F、IL23R、IL12B、IL6、IL21、TNF、CCR6、CCL22、IL1R1、IFN-γ、S100A12、DEFB-2、DEFB-4、IL1、SERPINB3、PI3/弹力素、LL37、RORγ、RORγT、IL26、S100A7、DEFB103B和GM-CSF。
在一些方面，IL22和/或LCN2的预定阈值水平选自由以下水平组成的组：(a)约为IL22和/或LCN2的均值水平；(b)约为IL22和/或LCN2的中值水平；以及(c)约为如图6或表4或5中在实施例4中描述的IL22和/或LCN2的第1、第2、第3、第4、第5、第6、第7、第8或第9十分位数基线水平；如使用免疫测定在来自多个(i)正常健康患者、(ii)患有非IL23介导的疾病的患者或(iii)患有IL23介导的疾病的患者的血清中所测量。
在一些方面，IL23介导的疾病或病症是肺部疾病、炎性肠病、慢性炎性皮肤病、炎性疾病、自身免疫性疾病、神经退化性疾病或癌症。在一些方面，IL23介导的疾病或病症选自由以下疾病或病症组成的组：哮喘、IPF、COPD、克罗恩氏病、溃疡性结肠炎(UC)、乳糜泻、特应性皮炎、过敏性接触性皮炎、湿疹、牛皮癣、斑秃、掌跖脓疱病、牛皮癣关节炎、强直性脊椎炎、关节炎、类风湿性关节炎(RA)、风湿性病症、ANCA血管炎、贝赫特氏病、自身免疫性甲状腺炎、1型糖尿病、多发性硬化症(MS)、修格兰氏综合征(SS)、全身性红斑狼疮(SLE)、阿尔茨海默病、胃癌、结直肠癌、食道癌、白血病、乙型肝炎病毒(HBV)相关的肝细胞癌、乳腺癌、肺癌和鼻咽癌。在一些方面，炎性肠病是克罗恩氏病、UC或乳糜泻。
在一些方面，确定患者在从患者取得的一种或多种样品中具有≥5mg/L的高CRP水平，和/或≥250μg/g的高FCP水平，≥200μg/g的高FCP水平，≥150μg/g的高FCP水平，≥100μg/g的高FCP水平或至少约100μg/g至至少约250μg/g的高FCP水平。在一些方面，如使用免疫测定所测量，(a)预定的IL22阈值水平为至少约7.9pg/mL至至少约31.4pg/mL，并且/或者如使用免疫测定所测量，(b)预定的LCN2阈值水平为至少约143ng/mL至至少约261ng/mL。在一些方面，如使用免疫测定所测量，(a)预定的IL22阈值水平为至少约15.6pg/mL，并且/或者如使用免疫测定所测量，(b)预定的LCN2阈值水平为至少约215ng/mL。在一些方面，确定患者在从患者取得的一种或多种样品中具有(a)CRP水平≥5mg/L和/或FCP水平≥250μg/g，FCP水平≥200μg/g，FCP水平≥150μg/g，FCP水平≥100μg/g或FCP水平为至少约100μg/g至至少约250μg/g；(b)(i)如使用免疫测定所测量，预定的IL22阈值水平为至少约7.9pg/mL至至少约31.4pg/mL；和/或(ii)如使用免疫测定所测量，预定的LCN2阈值水平为至少约143ng/mL至至少约261ng/mL；和/或(c)(i)如使用免疫测定所测量，预定的IL22阈值水平为约15.6pg/mL；和/或(ii)如使用免疫测定所测量，预定的LCN2阈值水平为约215ng/mL。
在一些方面，在首次施用抗IL23抗体或其抗原结合片段之后IL23拮抗剂或抗IL23抗体或其抗原结合片段的施用引起克罗恩氏病活动性指数(CDAI)应答评分降低至少100分和/或在首次施用抗IL23抗体或其抗原结合片段之后总CDAI评分降低至低于150分。在一些方面，在首次施用IL23拮抗剂或抗IL23抗体或其抗原结合片段之后至少100分的CDAI应答评分降低或总CDAI评分降低至低于150分在1、2、4、8、12、16或24周内或以后发生。
Figure IDA0001662404230000011
Figure IDA0001662404230000021
Figure IDA0001662404230000031
Figure IDA0001662404230000041
Figure IDA0001662404230000051
Figure IDA0001662404230000061
Figure IDA0001662404230000071
Figure IDA0001662404230000081
Figure IDA0001662404230000091
Figure IDA0001662404230000101
Figure IDA0001662404230000111
Figure IDA0001662404230000121
Figure IDA0001662404230000131
Figure IDA0001662404230000141
Figure IDA0001662404230000151
Figure IDA0001662404230000161
Figure IDA0001662404230000171
Figure IDA0001662404230000181
Figure IDA0001662404230000191
Figure IDA0001662404230000201
Figure IDA0001662404230000211
Figure IDA0001662404230000221
Figure IDA0001662404230000231
Figure IDA0001662404230000241
Figure IDA0001662404230000251
Figure IDA0001662404230000261
Figure IDA0001662404230000271
Figure IDA0001662404230000281
Figure IDA0001662404230000291
Figure IDA0001662404230000301
Figure IDA0001662404230000311
Figure IDA0001662404230000321
Figure IDA0001662404230000331
Figure IDA0001662404230000341
Figure IDA0001662404230000351
Figure IDA0001662404230000361
Figure IDA0001662404230000371
Figure IDA0001662404230000381
Figure IDA0001662404230000391
Figure IDA0001662404230000401
Figure IDA0001662404230000411
Figure IDA0001662404230000421
Figure IDA0001662404230000431
Figure IDA0001662404230000441
Figure IDA0001662404230000451
Figure IDA0001662404230000461
Figure IDA0001662404230000471
附图简述
图1显示直到第24周的患者处置。图表汇总了2a期研究中登记和随机患者的数量和处置(clinicaltrials.gov identifier：NCT01714726)评价患有中度或重度CD的患者中的MEDI2070。mITT，调整意向治疗群体；PP，按照协议；OL，非盲。
图2A显示如由CDAI临床效果、CDAI缓解和CR100所指示的在调整意向治疗群体中第8周的临床功效。MEDI2070组与安慰剂组相比，在第8周CDAI临床效果(定义为CDAI评分小于150或CDAI评分从基线降低至少100分)率显著更高(分别地，49.2％对比26.7％；P＝0.01)。CDAI缓解(定义为CDAI评分低于150)率对于MEDI2070为27.1％，且对于安慰剂为15.0％(P＝0.10)。CR100率(定义为至少100分的CDAI评分降低)在MEDI2070组和安慰剂组中分别为45.8％和25.0％(P＝0.02)。
图2B显示如由复合端点所指示的在调整意向治疗群体中第8周的临床功效。与基线相比，比例显著增加的接受MEDI2070的患者实现CDAI效果的复合端点和相对于基线而言FCP或CRP降低50％(P＜0.001)，以及CDAI缓解和相对于基线而言FCP或CRP降低50％(P＝0.02)。CDAI，克罗恩氏病活动性指数；CI，置信区间；CRP，C-反应蛋白；FCP，粪便钙卫蛋白；p，p-值。
图3A显示如由克罗恩氏病活动性指数效果率(从基线到第24周)所指示在非盲群体中使用无应答者推定在至第24周的各个时间点的功效。非盲期的样品量：安慰剂/MEDI2070组(n＝52)；MEDI2070组(n＝52)。
图3B显示如由克罗恩氏病活动性指数缓解率(从基线到第24周)所指示在非盲群体中使用无应答者推定在至第24周的各个时间点的功效。非盲期的样品量：安慰剂/MEDI2070组(n＝52)；MEDI2070组(n＝52)。
图4显示依据基线IL22水平随时间推移而具有CDAI-100应答的患者的百分比。IL22 LO，基线IL22＜15.6pg/mL；IL22 HI，基线IL22≥15.6pg/mL。CI，置信区间。研究群体中的中值IL22浓度：15.6pg/mL。116名患者具有可评价的基线IL22值。在第8周，与安慰剂相比，基线血清IL22水平≥15.6pg/mL的患者具有统计学显著增加的CDAI-100应答。
图5显示依据基线LCN2水平随时间推移而具有CDAI-100应答的患者的百分比。LCN2 LO，基线LCN2＜215ng/mL；LCN2 HI，基线LCN2≥215ng/mL。CI，置信区间。研究群体中的中值LCN2浓度：215ng/mL。在第8周，与安慰剂相比，基线血清LCN2水平≥215ng/mL的患者具有统计学显著增加的CDAI-100应答。
图6A-C显示与安慰剂相比在用MEDI2070治疗的受试者之间的差异临床应答率，如下测量：如由在随基线IL22或LCN2水平而变的第8周在用MEDI2070和安慰剂治疗的受试者之间实现CDAI评分＜150或CDAI评分降低＞100(图6A)、实现100分的CDAI评分改善(图6B)、或实现CDAI评分＜150或CDAI评分降低＞100(图6C)，+还实现与基线FCP或CRP相比FCP或CRP降低＞50％的受试者的百分比(％)之间的差异。临床应答率报道为在对于MEDI2070治疗的受试者观察到的临床应答率与对于安慰剂治疗的受试者观察到的临床应答率之间的Δ或差异(“应答率差”)。对于整个研究群体中的IL22或LCN2的基线值组，每个分布被分成10个水平或十分位数，使得11个分析物截止点中的每一个(在图6A-C中，记作“分位数“)将研究群体逐步分割成占总研究群体10％以下的组。例如，在第4十分位数(显示为0.4分位数)下，总研究群体中的40％具有小于特定分析物水平的基线IL-22或LCN2血清水平，而总研究群体中的60％具有大于或等于特定分析物水平的基线IL-22或LCN2血清水平。如图6A-C所示，与安慰剂相比，用MEDI2070治疗的具有越来越高的基线IL22或LCN2水平的CD患者实现更高的临床应答率(如使用三种不同的临床应答测量所测量)，表明MEDI2070在第8周在具有高基线IL22或LCN2血清水平的患者中诱导更好的临床应答。与IL22或LCN2低的受试者(包括例如具有在第1或第2十分位数(0.1或0.2分位数)处的IL22或LCN2水平的受试者)相比，具有高IL22或LCN2水平的受试者(包括例如具有在第5、第6或第7十分位数(0.5、0.6或0.7分位数)处的IL22或LCN2水平的受试者)具有自安慰剂起更大的临床应答率差异(不管使用三种不同的临床应答测量中的哪一种)。这些结果强调了在鉴定对用MEDI2070治疗作出应答的患者方面高或升高的IL22和/或LCN2血清水平的预测价值。对应于图6A-C中描述的每个十分位数的基线IL22或LCN2血清水平的汇总提供在实施例4(参见表4(IL22)或表5(LCN2))中。
图7显示MEDI2070和安慰剂组中血清IL22水平从基线降低的百分比。误差条代表中值绝对偏差(MAD)。与用安慰剂治疗相比，用MEDI2070治疗与第8周血清IL-22水平显著更大程度地下降相关。“N”对应于第0周时受试者的数量。
图8比较对于如所示用施用的各种分子治疗4至10周的患者的差异临床应答率(定义为在治疗与安慰剂之间实现CDAI-100应答的受试者的百分比(％)产值(“对比安慰剂的CDAI应答Δ”))(y轴)和差异临床缓解率(定义为在治疗与安慰剂之间实现低于150分的总CDAI评分的受试者的百分比(％)差异(“相对于安慰剂的CDAI缓解Δ”))(x轴)。具有基线CRP≥5mg/L(n＝85)；基线IL-22≥11.3pg/mL(n＝81)；基线IL-22≥15.6pg/mL(n＝58)；或基线IL-22≥11.3pg/mL+CRP≥5mg/L(n＝62)(如使用实施例3中描述的IL22免疫测定测量)的用MEDI2070治疗8周的患者具有增加的CDAI-100应答率和/或CDAI缓解率。具有基线CRP≥5mg/L；基线IL-22≥11.3pg/mL；基线IL-22≥15.6pg/mL；或基线IL-22≥11.3pg/mL+CRP≥5mg/L(如使用实施例3中描述的IL22免疫测定所测量)的用MEDI2070治疗8周的患者的CDAI-100应答率和CDAI缓解率大于目前批准或正在研发的用于治疗CD患者的其他分子报道的CDAI-100应答率和/或CDAI缓解率，这些分子包括：优特克单抗(用6mg/kg剂量治疗6周或8周之后，如Sandborn等，N Engl J Med.2012年10月18日；367(16)：1519-28的图1中所报道)；Vedolizumab(用治疗6周或10周之后，如Sands等，Gastroenterology.2014年9月；147(3)：618-627的图3中所报道)；或Adalimumab(对于对英夫利昔单抗治疗二次失败的患者治疗4周之后，如Sandborn等，Ann Intern Med.2007；146：829-838中所报道在治疗对英利昔单抗二次失败的患者4周之后的应答率)。对于2a期研究中用MEDI2070治疗的所有患者(与生物标志物状态无关(mITT(n＝119))的总临床应答和临床缓解率与目前批准或正在研发的其他分子的应答率类似。mITT，调整意向治疗群体。表6汇总了图8中绘制的每个MEDI2070治疗的亚组的CDAI-100应答率差和CDAI缓解率差。
具体的实施方式
本公开内容涉及一种或多种IL23途径蛋白质(包括但不限于白细胞介素-22(IL22)和/或脂质运载蛋白-2(LCN2))作为生物标志物预测患有白细胞介素23(IL23)介导的疾病并用IL23拮抗剂治疗的患者的临床结果的用途，所述IL23拮抗剂靶向例如IL12和IL23的p40亚基(例如由优特克单抗靶向)或IL23的p19亚基(例如由蒂尔他昔单抗、古塞库单抗(guselkumab)、MEDI2070、BI-655066和LY-3074828靶向)。
根据本文公开的方法可以用作生物标志物的IL23途径中的一种或多种基因或蛋白质包括例如白细胞介素-22(IL22)、脂质运载蛋白-2(LCN2)、趋化因子(CC基序)配体20(CCL20，MIP-3α)、IL23R、IL12B、IL6、IL21、TNF、CCR6、CCL22、IL1R1、IFNγ、S100钙结合蛋白A12(S100A12)、防御素B2(DEFB-2、DEFB-4)、白细胞介素-1β(IL1β、丝氨酸(或半胱氨酸)蛋白酶抑制剂成员3(SERPINB3)、肽酶抑制剂3(PI3)/弹力素、人类抗菌肽(LL37)、视黄素相关孤儿受体-γ(RORγ和RORγT)、白细胞介素-26(IL26)、牛皮癣素(S100A7)、防御素β103B(DEFB103B)或GM-CSF。参见Haider等，J.Immunol.180：1913-1920(2008)；Nakae等，J.Leukocyte Biol.81：1258-1268(2007)；Guttman-Yassky等，J hmmunol.181(10)：7420-7427(2008)；E1-Behi Nature Immunol.12：568-75(2011)，Wilson等，Nature Immunology8：950-7(2007)；其全部通过引用整体并入本文。
本公开内容提供了例如治疗、预防和/或减轻IL23介导的疾病以基于确定一种、两种、三种或更多种包括例如IL22和/或LCN2的IL23途径生物标志物的表达水平预测临床结果，选择患者进行治疗或者对患有由IL23介导的特定疾病或病症的患者群体进行分层的方法。因此，在一个方面，本公开内容提供包括确定在从患有IL23介导的疾病的受试者获得的样品中一种或多种IL23途径生物标志物的表达水平(例如，IL22水平、LCN2水平或其组合)以确定适当的治疗过程的方法。
CD是病因未知的慢性透壁炎性疾病，其最常影响回肠远端和结肠，并且可以在胃肠(GI)道的任何部位发生。CD患者患有不受控制的炎症，这导致肠粘膜的直接或间接损坏。当前的主要假设是，在遗传易感个体中，这种炎症可能由由于肠道屏障功能受损引起持续炎性刺激或由炎性应答失调产生(Sandborn等，Gastroenterol.135：1130-41(2008)；Rutgeerts等，Aliment Pharmacol Ther.17(12)：1435-50(2003)。CD在15至35岁之间最常见，尽管任何年龄的患者都可以受到影响。
常用的医学疗法包括氨基水杨酸盐(包括柳氮磺胺吡啶和美沙拉嗪)、全身皮质类固醇、免疫抑制剂(例如，硫唑嘌呤和甲氨蝶呤)；抗菌剂；和生物制剂，例如阿达木单抗/
Figure BDA0001662404150000121
(Abbott laboratories，IL)(SEQ ID NO：21，22)、英利昔单抗/
Figure BDA0001662404150000122
(Janssen Biotech，Inc)、赛妥珠单抗/
Figure BDA0001662404150000123
(UCB，Inc，Smyrna，GA)(SEQ ID NO：23，24)、维多珠单抗/
Figure BDA0001662404150000131
(Takeda Pharmaceuticals America，Inc.，Deerfield，IL)和那他株单抗/TYSABRITM(Biogen Idec Inc，Cambridge，MA)。作为高度异质性疾病，很难预测患者是否会对某种疗法产生有利的应答。
可以使用本文公开的IL23途径生物标志物(例如，单独或与例如升高或高水平的包括CRP和/或FCP的临床生物标志物组合的IL22和/或LCN2的表达范围和/或阈值水平)以分层和/或鉴定适合用IL23拮抗剂(包括例如抗IL23抗体或其抗原结合片段)治疗的患有IL23介导的疾病如CD的受试者群体。在每一层内，可以使用本文公开的IL23途径生物标志物例如用于诊断患者，例如用IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体)治疗患者；选择或不选择用于例如用IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体)治疗的患者；选择例如用IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体)的一定治疗；暂时或永久地暂停或修改治疗；确定患者的预后；或监测治疗的效果，其中这些方法包括例如确定单独或与其他生物标志物相组合的IL22和/或LCN2的表达范围和/或阈值水平。
在一些方面，IL23拮抗剂是可以特异性结合IL23的p19亚基(SEQ ID NO：13)、IL23的p40亚基(SEQ ID NO：14)或两者的抗IL23抗体。在一些方面，IL23拮抗剂是可以与MEDI2070或本领域已知的另一抗IL23抗体竞争性结合IL23的p19亚基(SEQ ID NO：13)、IL23的p40亚基(SEQ ID NO：14)或两者的抗IL23抗体或其他分子(例如，小分子、适体、支架分子等)。
在一些方面，抗IL23抗体或其抗原结合片段包含MEDI2070的重链(HC)(SEQ IDNO：15)和/或轻链(SEQ ID NO：16)或其抗原结合片段、变体或衍生物。在一些方面，抗IL23抗体或其抗原结合片段包含MEDI2070的可变区(VH)(SEQ ID NO：5)和/或轻链可变区(VL)(SEQ ID NO：6)。在一些方面，抗IL23抗体或其抗原结合片段包含MEDI2070的互补决定区(SEQ ID NO：31-36)中的至少一个。在一些方面，抗IL23抗体或其抗原结合片段包含VH区和/或VL区或其抗原结合片段、变体或衍生物，VH区包含SEQ ID NO：43的序列，VL区包含SEQID NO：44的序列。在一些方面，抗IL23抗体或其抗原结合片段包含SEQ ID NO：45-47(SEQID NO：43的VH的CDR)和/或SEQ ID NO：48-50(SEQ ID NO：44的VL的CDR)的互补决定区中的至少一个。
在其他方面，IL23拮抗剂是选自优特克单抗或布拉吉单抗(靶向IL23的p40亚基)、吉塞克单抗、蒂尔他昔单抗、BI-655066或LY-3074828(靶向IL23的p19亚基)的抗IL23抗体、其抗原结合片段或其组合。在其他方面，IL23拮抗剂是与优特克单抗或布拉吉单抗(靶向IL23的p40亚基)、吉塞克单抗、蒂尔他昔单抗、BI-655066或LY-3074828(靶向IL23的p19亚基)、其抗原结合片段或其组合竞争结合IL23的分子。
本文公开的方法不仅仅适用于IL23结合抗体。本文公开的方法可以应用于IL23的p19亚基的任何抑制剂，包括例如抗体及其抗原结合片段、适体、支架分子、小分子、可溶性IL23受体等。
为了更容易理解本公开内容，首先定义某些术语。附加的定义在整个详细描述中阐述。
I.定义
本文提供的标题不是对本公开内容的各个方面或方面的限制，这些方面可以通过参考整个说明书来获得。因此，即将在下文定义的术语通过参考说明书全文而得到更充分地定义。
在本说明书和随附的权利要求书中，除非上下文另外明确规定，否则单数形式“一个/种(a/an)”和“所述/该(the)”包括多个指示物。术语“一”(或“一个/种”)以及术语“一个/种或多个/种”和“至少一个/种”可以在本文中互换使用。
此外，在本文中使用时将“和/或”视为对两个指定特征或组分中的每一个具有或不具有另一者的具体公开内容。因此，如本文中诸如“A和/或B”的词组中所使用的术语“和/或”意图包括“A和B”、“A或B”、“A”(单独)和“B”(单独)。同样，如诸如“A、B和/或C”的词组中所使用的术语“和/或”旨在涵盖以下方面中的每一个：A、B和C；A、B或C；A或C；A或B；B或C；A和C；A和B；B和C；A(单独)；B(单独)；以及C(单独)。
无论在本文中将方面用语言“包含”来描述的情况如何，也提供以“由...组成”和/或“基本上由...组成”的术语描述的另外相似方面。
结合整个说明书和权利要求中的数值使用的术语“约”表示本领域技术人员熟悉且可接受的准确性区间。一般来说，这种准确性区间为±15％。
除非另外定义，否则本文所使用的所有技术和科学术语均具有与本揭露内容所属技术的本领域技术人员通常所理解相同的含义。例如，Concise Dictionary ofBiomedicine and Molecular Biology，Juo，Pei-Show，第2版，2002，CRC出版社；TheDictionary of Cell and Molecular Biology，第3版，1999，Academic出版社；以及theOxford Dictionary Of Biochemistry And Molecular Biology，Revised，2000，牛津大学出版社，为本领域技术人员提供本公开中所使用的许多术语的一般解释。
单位、前缀和符号均以其国际单位制(Système International de Unites，(SI))可接受的形式表示。
数字范围包括限定范围的数字。在列举值的范围的情况下，应该理解的是，在所述范围的所列举的上限和下限之间的每个中间整数值及其每一部分也与这些值之间的每个子范围一起具体地公开。任何范围的上限和下限都可以独立地包括在所述范围中包括或者从所述范围内排除，并且其中包括任一极限、无一极限或两个极限的每个范围也涵盖在本发明内。在明确列举值的情况下，应该理解的是，与所列举的值大致相同的量或量的值也在本发明的范围内。在公开了组合的情况下，所述组合的要素的每个子组合也具体地公开并且在本发明的范围内。相反，在单独公开不同要素或要素组的情况下，还公开了其组合。在本发明的任何要素被公开为具有多个替代方案的情况下，在此还公开了其中每个替代方案单独地或与其他替代方案组合排除在外的本发明的实施例；本发明的多于一个要素可以具有这样的排除，并且在此公开具有这种排除的要素的全部组合。
氨基酸在本文中通过其通常已知的三字母符号或通过IUPAC-IUB生物化学命名委员会所推荐的单字母符号来提及。除非另外指明，否则氨基酸序列是以氨基至羧基定向自左至右书写。
核苷酸由其通常接受的单字母代码提及。除非另外指明，否则核酸是以5′至3′定向自左至右书写。核苷酸在本文中通过其由IUPAC-IUB生物化学命名委员会推荐的通常已知的单字母符号来提及。因此，A代表腺嘌呤，C代表胞嘧啶，G代表鸟嘌呤，T代表胸腺嘧啶，U代表尿嘧啶。
术语“多核苷酸”、“低聚核苷酸”、“核酸”和“核酸分子”以及“基因”在本文中可互换使用以指代任何长度的核苷酸的聚合物，以及核糖核苷酸、脱氧核糖核苷酸、其类似物或其混合物。
短语“DNA序列”是指连续的核酸序列。序列可以是单链或双链，DNA或RNA，但双链DNA序列是优选的。所述序列可以是长度为6至20个核苷酸的寡核苷酸，其长度为数千或数十万碱基对的全长基因组序列。
术语“多肽”、“肽”以及“蛋白质”在本文可互换使用，以指具有任何长度的氨基酸的聚合物。聚合物可以是直链或支链的，其可以包含修饰的氨基酸，并且可以间杂有非氨基酸。所述术语还涵盖经天然或通过干涉修饰的氨基酸聚合物；例如二硫键形成、糖基化、脂化、乙酰化、磷酸化或任何其他操纵或修饰，诸如与标记组分缀合。定义中还包括例如含有一种或多种氨基酸类似物(包括，例如非天然氨基酸，诸如高半胱氨酸、鸟氨酸、对乙酰基苯丙氨酸、D-氨基酸和肌酸)以及本领域已知的其他修饰的多肽。
“分离的”多肽、抗体、多核苷酸、载体、细胞或组合物是以在自然界中未发现的形式的多肽、抗体、多核苷酸或组合物。分离的多肽、多核苷酸或组合物包括已经被纯化到不再以它们在自然界被发现的形式的程度的那些。在一些方面，分离的多肽、多核苷酸或组合物基本上是纯的。
术语“氨基酸取代”是指用另一氨基酸残基置换亲本序列中存在的氨基酸残基。氨基酸可以在亲本序列中例如经由化学肽合成或通过本领域已知的重组方法被取代。因此，提及“位置X处的取代”或“位置X处的取代”是指位置X处存在的氨基酸用替代氨基酸残基取代。在一些方面，取代模式可以根据图式AXY描述，其中A是对应于位置X处天然存在的氨基酸的单字母代码，并且Y是取代氨基酸残基。在其他方面，取代模式可以根据图式XY来描述，其中Y是对应于取代位置X处天然存在的氨基酸的氨基酸残基的单字母代码。
“保守氨基酸取代”为氨基酸残基用具有类似侧链的氨基酸残基置换的取代。具有类似侧链的氨基酸残基的家族已经在本领域中进行了定义，包括碱性侧链(例如，赖氨酸、精氨酸、组氨酸)、酸性侧链(例如，天冬氨酸、谷氨酸)、不带电荷的极性侧链(例如，甘氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸、半胱氨酸)、非极性侧链(例如，丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸、甲硫氨酸、色氨酸)、β分支侧链(例如，苏氨酸、缬氨酸、异亮氨酸)以及芳族侧链(例如，酪氨酸、苯丙氨酸、色氨酸、组氨酸)。因此，如果多肽中的氨基酸用来自同一侧链家族的另一氨基酸置换，则将取代视为保守的。在另一方面，一串氨基酸可以用在侧链家族成员的顺序和/或组成上不同的结构类似的串保守置换。
非保守取代包括如下取代：其中(i)具有正电性侧链(例如Arg、His或Lys)的残基被电负性残基(例如，Glu或Asp)取代，(ii)亲水性残基(例如，Ser或Thr)被疏水性残基(例如，Ala、Leu、Ile、Phe或Val)取代，(iii)半胱氨酸或脯氨酸被任何其他残基取代，或(iv)具有大体积疏水性或芳族侧链的残基(例如Val、His、Ile或Trp)被具有较小侧链的残基(例如，Ala、Ser)或不具有侧链的残基(例如，Gly)取代。
其他取代可以由普通技术人员容易地鉴定。例如，对于氨基酸丙氨酸，取代可以自D-丙氨酸、甘氨酸、β-丙氨酸、L-半胱氨酸和D-半胱氨酸中的任何一种取得。对于赖氨酸，置换可以是D-赖氨酸、精氨酸、D-精氨酸、高精氨酸、甲硫氨酸、D-甲硫氨酸、鸟氨酸或D-鸟氨酸中的任何一种。通常，可以预期诱导分离的多肽的性质变化的功能重要区中的置换是如下置换：其中(i)极性残基如丝氨酸或苏氨酸被疏水性残基如亮氨酸、异亮氨酸、苯丙氨酸或丙氨酸取代；(ii)半胱氨酸残基被任何其他残基取代；(iii)具有正电性侧链的残基如赖氨酸、精氨酸或组氨酸被具有电负性侧链的残基如谷氨酸或天冬氨酸取代；或(iv)具有大体积侧链的残基如苯丙氨酸被取代不具有这种侧链的残基如甘氨酸取代。前述非保守取代之一可以改变蛋白质的功能性质的可能性也与取代相对于蛋白质的功能重要区的位置相关：一些非保守取代可以相应地对于生物性质几乎没有影响。
术语“氨基酸***”是指在亲本序列中存在的两个氨基酸残基之间引入新的氨基酸残基。氨基酸可以例如经由化学肽合成或通过本领域已知的重组方法***亲本序列中。因此，如本文所用，其中X和Y对应于氨基酸位置的短语“位置X和Y之间的***”是指在X位置和Y位置之间***氨基酸，并且还指在编码位置X和Y处的氨基酸的密码子之间***编码氨基酸的密码子的核酸序列。
两个多肽或多核苷酸序列之间的术语“百分比序列同一性”是指在比较窗上由序列共享的相同匹配位置的数目，考虑为了最佳比对两个序列而必须引入的添加或缺失(即，间隙)。匹配位置为靶序列和参考序列二者中存在相同核苷酸或氨基酸的任何位置。靶序列中存在的间隙不做计数，因为间隙不为核苷酸或氨基酸。同样，参考序列中存在的间隙不做计数，因为对靶序列核苷酸或氨基酸计数，而不对来自参考序列的核苷酸或氨基酸计数。
序列同一性百分比通过以下方式计算：确定两个序列中出现相同的氨基酸残基或核酸碱基的位置数以得到匹配位置数，用匹配位置数除以比较窗中的位置总数，且将结果乘以100以得到序列同一性百分比。序列的比较和两个序列之间序列同一性百分比的确定可以使用供在线使用和供下载的易于获得的软件完成。合适的软件程序可自各种来源获得，并且可用于比对蛋白质和核苷酸序列两者。确定百分比序列同一性的一种合适程序为b12seq，其为可自美国政府国家生物技术信息中心BLAST网址(blast.ncbi.nlm.nih.gov)得到的BLAST程序套件的部分。B12seq使用BLASTN或BLASTP算法执行两个序列之间的比较。BLASTN用于比较核酸序列，而BLASTP用于比较氨基酸序列。其他合适程序为例如Needle、Stretcher、Water或Matcher，其为生物信息程序的EMBOSS套件的部分，并且也可自欧洲生物信息研究所(EBI)在www.ebi.ac.uk/Tools/psa上得到。
与多核苷酸或多肽参考序列比对的单个多核苷酸或多肽靶序列内的不同区域可各自具有其自己的百分比序列同一性。应注意，将百分比序列同一性值舍入至最接近的十分位。例如，将80.11、80.12、80.13和80.14向下舍去至80.1，而将80.15、80.16、80.17、80.18和80.19向上舍入至80.2。还应注意，长度值将始终是整数。
在某些方面，第一氨基酸序列与第二氨基酸序列的百分比同一性“X”计算为100x(Y/Z)，其中Y是在第一序列和第二序列的比对中评分为相同匹配的氨基酸残基的数目(如通过目视检查或特定序列比对程序所比对)，并且Z是第二序列中的残基的总数目。如果第一序列的长度比第二序列长，则第一序列与第二序列的百分比同一性将高于第二序列与第一序列的百分比同一性。
本领域的技术人员将理解，产生用于计算百分比序列同一性的序列比对不限于唯一地由原始序列数据驱动的二进制序列-序列比较。序列比对可以来源于多重序列比对。产生多序列比对的一种合适程序是ClustalW2，其可自www.clustal.org得到。另一合适程序是可自www.drive5.com/muscle/得到的MUSCLE。ClustalW2和MUSCLE可替代地例如自EBI得到。
还应理解，序列比对可以通过整合序列数据与异类来源的数据产生，所述异类来源的数据诸如为结构数据(例如，结晶蛋白结构)、功能数据(例如，突变的定位)或谱系学数据。整合异类数据以产生多重序列比对的合适程序为T-Coffee，其可自www.tcoffee.org得到且可替代地自例如EBI得到。还应理解，用于计算百分比序列同一性的最终比对可以自动地或人工地加以验证。
如本文所用，术语“抗体”是指能够结合至抗原如IL23的抗体的至少最小部分，在由B细胞产生的典型抗体的背景中，其包含至少重链可变结构域(VH)和轻链可变结构域(VL)。脊椎动物***中的基本抗体结构相对较好理解。参见，例如，Harlow等，Antibodies：ALaboratory Manual，(Cold Spring Harbor Laboratory Press，第2版，1988)。
抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物包括但不限于多克隆抗体，单克隆抗体，人类抗体，人源化抗体或嵌合抗体，单链抗体，表位结合片段，例如Fab、Fab′和F(ab′)2、Fd、Fv、单链Fv(scFv)、单链抗体、二硫键连接的Fv(sdFv)、包含VL或VH结构域的片段、由Fab表达文库产生的片段。ScFv分子在本领域中是已知的并且描述于例如美国专利5,892,019中。本公开内容涵盖的免疫球蛋白或抗体分子可以是任何类型(例如，IgG、IgE、IgM、IgD、IgA和IgY)、类别(例如，IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1和IgA2)或亚类的免疫球蛋白分子。
因此，鉴于术语“抗体”的这种定义提及抗体，例如抗IL23抗体MEDI2070的抗体是指MEDI2070抗体以及其抗原结合片段、变体和衍生物。在一些方面，抗体是可以特异性结合IL23的p19亚基(SEQ ID NO：13)、IL23的p40亚基(SEQ ID NO：14)或两者的抗IL23抗体。
在一些方面，抗IL23抗体或其抗原结合片段包含MEDI2070的重链(HC)(SEQ ID NO二15)和/或轻链(SEQ ID NO：16)或其抗原结合片段、变体或衍生物，由其组成或基本上由其组成。在一些方面，抗IL23抗体或其抗原结合片段包含MEDI2070的重链可变区(VH)(SEQID NO：5)和/或轻链可变区(VL)(SEQ ID NO：6)，由其组成或基本上由其组成。在一些方面，抗IL23抗体或其抗原结合片段包含MEDI2070的互补决定区(SEQ ID NO：31-36)中的至少一个，例如，其包含MEDI2070的一个、两个、三个、四个、五个或六个互补决定区。
在一些方面，抗IL23抗体或其抗原结合片段包含VH区和/或VL区或其抗原结合片段、变体或衍生物，所述VH区包含SEQ ID NO：43的序列，由SEQ ID NO：43的序列组成或基本上由SEQ ID NO二43的序列组成，所述VL区包含SEQ ID NO：44的序列，由SEQ ID NO：44的序列组成或基本上由SEQ ID NO：44的序列组成。在一些方面，抗IL23抗体或其抗原结合片段包含SEQ ID NO：45-47(SEQ ID NO：43的VH的CDR)和/或SEQ ID NO：48-50(SEQ ID NO：44的VL的CDR)的互补决定区中的至少一个。参见美国专利8,722,033，其通过引用整体并入本文。
在其他方面，IL23拮抗剂是选自优特克单抗或布拉吉单抗(靶向IL23的p40亚基)、吉塞克单抗、蒂尔他昔单抗、BI-655066或LY-3074828(靶向IL23的p19亚基)的抗IL23抗体、其抗原结合片段或其组合。在其他方面，IL23拮抗剂是与优特克单抗或布拉吉单抗(靶向IL23的p40亚基)、吉塞克单抗、蒂尔他昔单抗、BI-655066或LY-3074828(靶向IL23的p19亚基)、其抗原结合片段或其组合竞争结合IL23的分子。
在一些方面，抗体是天然存在的抗体，例如从哺乳动物分离和/或纯化的抗体，或由哺乳动物细胞产生的杂交瘤生成的抗体。在一些方面，抗体是基因工程化抗体，例如人源化抗体、嵌合抗体、CDR移植抗体、人化抗体、双特异性抗体、三特异性抗体等。基因工程技术还提供了制造在非人类来源中的完全人类抗体的能力。在一些方面，抗体使用噬菌体展示产生。
在一些方面，抗体是以聚合、低聚或多聚形式。在抗体包含两个或更多个不同的抗原结合区片段的某些方面，抗体被认为是双特异性、三特异性或多特异性的，或二价、三价或多价的，这取决于由抗体识别和结合的不同表位的数目。
在一些方面，结合剂是前述段落的任何抗体的抗原结合片段。抗原结合片段(在本文中也称为“抗原结合部分”)可以是本文所述的任何抗体的抗原结合片段。抗原结合片段可以是具有至少一个抗原结合位点的抗体的任何部分，包括但不限于Fab、Fab′、F(ab′)2、Fd、Fv、dsFv、二硫键连接的Fv(sdFv)、单链Fv(scFV)、包含轻链或重链可变结构域的片段、单链抗体、双链抗体、三链抗体、双-scFv、由Fab表达文库表达的片段、结构域抗体、VhH结构域、V-NAR结构域、VH结构域、VL结构域等。
典型的抗体包含通过二硫键相互连接的至少两条重链(H)和两条轻链(L)。每条重链由重链可变区(本文中缩写为VH、VH区或VH结构域)和重链恒定区组成。重链恒定区由三个或四个恒定结构域CH1、CH2、CH3和CH4组成。每条轻链由轻链可变区(本文中缩写为VL、VL区或VL结构域)和轻链恒定区组成。轻链恒定区由一个结构域CL组成。
VH区和VL区可以进一步细分为高变区，称为互补决定区(CDR)，其间散布着较保守的区域，称为框架区(FW)。每个VH和VL由按照以下顺序从氨基末端到羧基末端排列的三个CDR和四个FW组成：FW1、CDR1、FW2、CDR2、FW3、CDR3、FW4。框架区可以根据它们各自的VH区和VL区来命名。因此，例如，VH-FW1将是指VH的第一框架区。重链和轻链的可变区含有与抗原相互作用的结合结构域。抗体的恒定区可以介导免疫球蛋白与宿主组织或因子的结合，所述宿主组织或因子包括各种免疫***细胞(例如，效应细胞)或经典补体***的第一组分(C1q)。
“特异性结合”通常意指抗体(例如，抗IL23抗体)或其片段、变体或衍生物经由其抗原结合结构域与表位结合，并且所述结合需要在抗原结合结构域和表位之间的一定补充。根据所述定义，当与抗体将与随机不相关的表位结合相比，其更易于经由其抗原结合结构域与表位结合时，抗体被称为与表位“特异性结合”。
如本文所用的术语“表位”是指能够与本文公开的抗体(例如，抗IL23抗体)或其片段、变体或衍生物结合的抗原蛋白决定簇。在一些方面，术语表位是指IL23的p19亚基的蛋白决定簇(例如，氨基酸序列)。在一些方面，术语表位是指IL23的p40亚基的蛋白决定簇(例如，氨基酸序列)。表位通常由分子的化学活性表面基团(诸如氨基酸或糖侧链)组成，并且通常具有特定三维结构特征，以及特定电荷特征。识别表位的抗体或结合分子的部分被称为互补位。蛋白抗原的表位基于其结构和与互补位的相互作用而被分成两类：构象表位和线性表位。构象表位由抗原的氨基酸序列的不连续部分组成。这些表位基于抗原的3-D表面特征和形状或三级结构而与互补位相互作用。相反，线性表位基于其一级结构而与互补位相互作用。线性表位由来自抗原的氨基酸的连续序列形成。
术语“抗体结合位点”是指抗原中的区域(例如，IL23的p19亚基的氨基酸序列，或IL23的p40亚基的氨基酸序列)，所述区域包含互补抗体特异性结合的连续或不连续的位点(即，表位)。因此，抗体结合位点可以在抗原中含有额外区域，这些区域超出表位并且可以决定诸如结合亲和力和/或稳定性的性质，或者影响诸如抗原酶活性或二聚化性质。因此，即使两种抗体结合抗原内的相同表位，如果抗体分子与表位之外的氨基酸建立不同的分子间接触，则将此类抗体视为结合不同的抗体结合位点。
如果抗体或其片段、变体或衍生物优先结合给定表位的程度使得其在一定程度上阻断参考抗体或抗原结合片段与表位的结合，则将抗体或其片段、变体或衍生物说成是竞争性地抑制参考抗体或抗原结合片段与给定表位的结合。可以通过本领域已知的任何方法如竞争ELISA测定来确定竞争性抑制。结合分子可以说成是竞争性抑制参考抗体或抗原结合片段与给定表位以至少90％、至少80％、至少70％、至少60％或至少50％结合。
本文公开的抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物可以根据抗原的一个或多个表位或一个或多个部分来描述或指定，所述抗原例如为它们识别或特异性结合的靶多糖。例如，与抗IL23抗体(例如，MEDI2070)的抗原结合结构域特异性相互作用的Il23的部分是“表位”。
本文中与“IL23介导的疾病”可互换使用的术语“IL23介导的疾病或病症”以及其语法变体是指本领域已知的任何病理学，在患有所述病症的受试者中其由(单独或与其他介体相关)异常IL23水平或IL23途径的异常激活所引起，由此加剧，与此相关或由此延长。非限制性实例包括IL23介导的炎性肠病(例如，克罗恩氏病)以及肺部疾病、慢性炎性皮肤病、炎性疾病、自身免疫性疾病、神经退行性疾病或癌症。在一些方面，IL23介导的炎性肠病是CD、溃疡性结肠炎(UC)、贝赫特氏病或乳糜泻。在一些方面，IL23介导的肺部疾病是哮喘(例如，过敏性哮喘、特应性哮喘、皮质类固醇初始哮喘、慢性哮喘、皮质类固醇抗性哮喘、皮质类固醇难治性哮喘、吸烟引起的哮喘或皮质类固醇失控的哮喘)、特发性肺纤维化(IPF)或慢性阻塞性肺病(COPD)。在一些方面，IL23介导的慢性炎性皮肤病是特应性皮炎、变应性接触性皮炎、湿疹、牛皮癣、斑秃或掌跖脓疱病。在一些方面，IL23介导的炎性病症是牛皮癣关节炎、僵直性脊椎炎、关节炎、类风湿性关节炎(RA)、风湿性病症、ANCA血管炎、贝赫特氏病或自身免疫性甲状腺炎。在一些方面，IL23介导的自身免疫性疾病是多发性硬化症(MS)、修格兰氏综合征(SS)、全身性红斑狼疮(SLE)、自身免疫性脑脊髓炎、胶原诱导的关节炎或1型糖尿病。在一些方面，IL23介导的神经退行性疾病是阿尔茨海默氏病。在一些方面，IL23介导的癌症是黑素瘤、结直肠癌、胃癌、骨髓瘤、***癌、结肠炎相关癌症、卵巢癌、口腔癌、食管癌、白血病乙型肝炎病毒(HBV)相关肝细胞癌、乳腺癌、肺癌和鼻咽癌。在一些方面，IL23介导的疾病或病症是微生物感染，包括例如分枝杆菌病或利什曼病。在一些方面，IL23介导的疾病或病症是真菌或病毒感染(参见，例如Khader等，Mucosal Immunol 2(5)：403-411(2009))。
如本文所用，本文使用的术语“治疗(treat)”、“治疗(treating)”、“治疗(treatment)”或“治疗(treatment of)”是指如下方法，这些方法旨在(1)降低IL23介导的疾病或病症的可能性，例如延迟或预防IL23介导的疾病或病症的发作，(2)减少IL23介导的疾病或病症的发生，例如减缓或停止与IL23介导的疾病或病症相关的症状或身体恶化的进展或加重，(3)降低IL23介导的疾病或病症的症状的严重性或改善，优选达到受试者不再遭受由其引起的不适和/或改变的功能的程度(例如，当与未治疗的患者相比时，CD恶化或疾病严重性的相对降低)，和/或(4)治愈IL23介导的疾病或病症。
除非另外指明，否则术语“治疗(treat)”、“治疗(treating)”、“治疗(treatment)”或“治疗(treatment of)”(或语法等同术语)是指预防性治疗方案和治疗性治疗方案两者。因此，可以在疾病发作之前施用治疗，以起到预防性或预防作用。其也可以在起始IL23介导的疾病或病症之后施用，以起到治疗作用。在一些方面，IL23介导的疾病或病症的治疗可以包括手术。
如本文所用的术语“受试者”或“患者”是指需要对其进行IL23介导的疾病或病症的诊断、预后或疗法的任何受试者，特别是哺乳动物受试者。如本文所用，术语“受试者”或“患者”包括任何人类或非人类动物。术语“非人类动物”包括所有脊椎动物，例如哺乳动物和非哺乳动物，诸如非人类灵长类动物、绵羊、犬、猫、马、牛、熊、鸡、两栖动物、爬行动物等。如本文所用，诸如“患有IL23介导的疾病的受试者”的短语包括受试者，诸如哺乳动物受试者，包括将受益于对IL23介导的疾病施用疗法、成像或其他诊断过程和/或预防治疗的人类。
在一些方面，受试者是原生受试者。“原生受试者”是未施用疗法如治疗剂的受试者。在一些方面，原生受试者在被诊断为患有IL23介导的疾病之前尚未用治疗剂治疗过。在一些方面，受试者在被诊断为患有IL23介导的疾病之前接受了疗法和/或一种或多种剂量的治疗剂(例如，能够调节IL23介导的疾病的治疗剂)。
在一些方面，术语“患有IL23介导的疾病或病症的患者”，例如患有特异性IL23介导的病症如克罗恩氏病的患者(即，“克罗恩氏病患者”或“CD患者”)是指到呈现指示IL23介导的疾病或病症(例如，CD)的一种或多种症状或针对特定的IL23介导的疾病或病症(例如，CD)筛选的受试者。替代或另外地，术语“患有IL23介导的疾病的患者”还涵盖怀疑患有IL23介导的疾病或病症(例如，CD)或可能具有一种或多种风险因子(例如，年龄、性别、家族史等)的受试者。所述术语还涵盖尚未接受过IL23介导的疾病或病症测试的受试者以及已经接受初步诊断的受试者。
如本文所用的术语“疗法”包括用于治愈、缓解或预防IL23介导的疾病或病症的任何手段，包括例如治疗剂、器械、支持措施和手术或康复程序。就此而言，术语疗法涵盖可以用于预防、控制、治疗和/或改善IL23介导的疾病或病症的任何协议、方法和/或治疗或诊断。
如本文所用的术语“治疗剂”是指向患有IL23介导的疾病或病症的受试者施用以产生期望的通常有益的效果的任何治疗活性物质。术语治疗剂包括例如通常称为小分子药物和生物制剂的经典低分子量治疗剂，包括但不限于抗体或其活性片段、肽、蛋白质药物、蛋白质缀合物药物等。治疗剂也可以前药，当施用到受试者时，其代谢成所需的治疗活性物质。在一些方面，治疗剂是预防剂。此外，治疗剂可以在药学上配制。
如本文所用，术语“有效量”或“药学有效量”或“治疗有效量”是指制剂中一定量的一种或多种化合物在施用到受试者时足以实现所需的治疗和/或预防效果，例如根据临床上对于待治疗的疾病或病症可接受的标准减轻症状，改善病症或减缓疾病状况的发作的量。施用到受试者的组合物的量将取决于IL23介导的疾病或病症的类型和严重性以及个体的特性如一般健康、年龄、性别、体重和对药物的耐受性。这也将取决于疾病的程度、严重性和类型。本领域技术人员将能够依据所述和其他因素确定适当剂量。组合物还可以与一种或多种额外治疗化合物和/或治疗组合施用。
术语“生物样品”在本文中以其最广泛的含义使用。本文公开的方法可以使用任何样品进行，所述样品可以含有所公开的IL23途径生物标志物如IL22、LCN2或其组合。生物样品通常自受试者获得。样品可以是可以用来测定本公开内容的生物标志物的任何生物组织或流体。通常，样品将是“临床样品”，即来源于患者的样品。
关于本文公开的方法，从受试者获得的样品的非限制性实例包括例如全血、血清、血浆、唾液、痰、支气管肺泡灌洗液、脑脊髓液、胸膜液、心包液、腹水、滑液、上皮细胞、尿液、粪便、皮肤、组织、箍缩或细针活检样品以及具有已知的诊断、治疗和/或结果历史的档案样品。生物样品还可以包括组织切片，诸如为了组织学目的而取得的冷冻切片，或其组合。样品可以通过本领域已知的任何手段获得。
术语“生物样品”还涵盖通过加工生物样品衍生的任何材料。衍生材料包括但不限于从样品中提取的蛋白质、从样品中提取的核酸或从样品中PCR扩增的核酸序列。生物样品的加工可以包括以下加工中的一种或多种：过滤、蒸馏、提取、浓缩、干扰组分的失活、试剂的添加等。例如，血液样品可以分成血清或含有特定类型细胞的部分
在一些方面，样品可以是来自个体的样品的组合，例如组织和流体样品的组合。样品可以根据需要通过在适当的缓冲溶液中稀释或浓缩进行预处理。可以使用许多标准缓冲水溶液和/或蛋白酶抑制剂中的任一种，其在生理pH下采用各种缓冲剂如磷酸盐、TRIS等中的任一种。
为了诊断和/或确定某种IL23介导的疾病或病症的生物标志物的表达水平而获得的样品可以根据本领域中使用的具体方法而变化。因此，样品可以是例如生物样品(全血、血清、血浆、唾液、痰、支气管肺泡灌洗液、粪便、上皮细胞、组织活检样品、肠组织活检样品、尿液、皮肤、息肉、脑脊髓液、胸膜液、心包液、腹水、滑液等)、身体检查数据(例如，发烧、疼痛和/或腹部压痛的存在)、家族史、来自实验室测试(例如，血液蛋白质水平、血液沉降率、身体矿物质水平、红细胞计数、白细胞计数、粪便样品中血液和/或感染性微生物的存在)、成像研究和内窥镜检查(例如，钡X射线和其他X射线、CT扫描、结肠镜检查、乙状结肠镜、胶囊内镜)等的结果。
如本文所用，术语“对照”在用于表征受试者时，是指健康的受试者或已经被诊断患有除IL23介导的疾病或病症以外的特定疾病的患者。术语“对照样品”是指从健康受试者或从被诊断患有除IL23介导的疾病或病症以外的疾病的患者获得的一种或多于一种生物样品。
来自患者的样品可以在施用疗法以治疗IL23介导的疾病或病症之前或之后获得。在一些情况下，可以在开始疗法后或停止疗法后从患者获得连续样品。例如，样品可以例如由保健提供者(例如，医生)或保健福利提供者请求，由其或不同保健提供者(例如，护士、医院)或临床实验室获得和/或加工，并且在加工之后，结果可以被转发给原始保健提供者或又一保健提供者、保健福利提供者或患者。
类似地，本文公开的IL23途径生物标志物如IL22、LCN2或其组合的表达水平的量化；生物标志物基因或蛋白质表达水平之间的比较和/或比率；缺乏或存在生物标志物的评价；相对于某个阈值确定生物标志物水平；治疗决定；或其组合可以由一个或多个保健提供者、保健福利提供者和/或临床实验室执行。
如本文所用，术语“保健提供者”是指直接与活受试者如人类患者相互作用和向其施用的个体或机构。医疗服务提供者的非限制性实例包括医生、护士、技术人员、治疗学家、药剂师、顾问、可选的医学从业者、医疗机构、医生办公室、医院、急诊室、诊所、紧急护理中心、可选的医学诊所/机构以及任何其他提供以下服务的实体：通常和/或专门的治疗、评价、维持、疗法、药物治疗和/或涉及所有或任何部分的患者的健康状态的建议，包括但不限于通常医疗、专门医疗、手术和/或任何其他类型的治疗、评价、维持、疗法、药物治疗和/或建议。
如本文所用，术语“临床实验室”是指用于检查或加工来源于活受试者(例如，人类)的材料的设施。出于提供信息(例如，出于诊断、预防或治疗活受试者(例如，人类)的任何疾病或损伤或评价活受试者(例如，人类)的健康)的目的，加工的非限制性实例包括生物检验、生化检验、血清检验、化学检验、免疫血液检验、血液检验、生物物理检验、细胞检验、病理检验、遗传检验或其他检验源自人体的材料。这些检验还可以包括收集或以另外的方式获得样品、制备、确定、测量或以另外的方式描述活受试者(例如，人类)的身体中或从活受试者(例如，人类)的身体获得的样品中的各种物质的存在或不存在的程序。
临床实验室可以例如收集或获得样品；加工样品；递交样品；接收样品；转移样品；分析或测量样品；定量样品；提供在分析/测量/定量样品之后获得的结果；接收在分析/测量/定量样品之后获得的结果；比较/评分在分析/测量/定量一种或多种样品之后获得的结果；提供来自一种或多种样品的比较/得分；获得来自一种或多种样品的比较/得分；或其他相关活动。
如本文所用，术语“保健福利提供者”涵盖提供、呈现、赋予、全部或部分地支付或以其他方式与给出患者访问一项或多项保健福利、福利计划、健康保险和/或保健费用账户计划相关的个人团体、组织或组。
在一些方面中，保健提供者可以施用或指示另一保健提供者施用疗法以治疗IL23介导的疾病或病症。保健提供者可以实施或指示另一保健提供者或患者执行以下行为：获得样品；加工样品；递交样品；接收样品；转移样品；分析或测量样品；定量样品；提供在分析/测量/定量样品之后获得的结果；接收在分析/测量/定量样品之后获得的结果；比较/评分在分析/测量/定量一种或多种样品之后获得的结果；提供来自一种或多种样品的比较/得分；获得来自一种或多种样品的比较/得分；施用疗法(例如，治疗IL23介导的疾病或病症的治疗剂)；开始施用疗法；终止施用疗法；继续施用疗法；暂时中断施用疗法；增加施用的治疗剂的量；减少施用的治疗剂的量；继续施用一定量的治疗剂；增加施用治疗剂的频率；减少施用治疗剂的频率；维持治疗剂的相同给药频率；通过至少另一疗法或治疗剂替代一种疗法或治疗剂；将一种疗法或治疗剂与至少另一疗法或额外的治疗剂组合。
在一些方面中，医疗服务福利提供者可以授权或拒绝例如收集样品；加工样品；递交样品；接收样品；转移样品；分析或测量样品；定量样品；提供分析/测量/定量样品之后所获得的结果；转移分析/测量/定量样品之后所获得的结果；比较/记分分析/测量/定量一个或多个样品之后所获得的结果；转移来自一个或多个样品的比较/得分；施用疗法或治疗剂；开始施用疗法或治疗剂；终止施用疗法或治疗剂；继续施用疗法或治疗剂；暂时中断施用疗法或治疗剂；增加施用的治疗剂的量；减少施用的治疗剂的量；继续施用一定量的治疗剂；增加施用治疗剂的频率；减少施用治疗剂的频率；维持治疗剂的相同给药频率；通过至少另一种疗法或治疗剂替代一种疗法或治疗剂；或将一种疗法或治疗剂与至少另一种疗法或额外的治疗剂组合。
此外，保健福利提供者可以例如授权或拒绝疗法的处方，授权或拒绝疗法的覆盖，授权或拒绝偿还疗法费用，确定或拒绝疗法的资格等。
II.IL23途径组分作为临床应答生物标志物
新CD4+ T细胞亚组Th17的最近发现已经转变了我们对数目越来越多的慢性免疫介导的疾病的致病基础的理解。特别是在与微生物环境相互作用的组织如肠道和呼吸道和皮肤中，身体中大多数Th17细胞驻留其中，对自身(或扩展的自身，通常定居于这些组织的多种微生物群)下调免疫性可能导致慢性炎性疾病。各种炎性病症对于沿着IL23途径的药理学发展具有潜在的靶。这些包括例如影响Th17细胞分化的IL23。
一些IL23介导的疾病和病症如CD或牛皮癣是显示广泛的症状、严重性和因此药物应答性的异质性疾病。IL23介导的疾病和病症的临床管理中的一个问题是难以鉴定对于及时且适当的治疗经历症状的早期临床急性发作的特定患者亚组，或者鉴定可能或可能不受益于某种疗法如用IL23拮抗剂治疗的特定患者亚组。
据报道，若干基因和蛋白质在患有IL23介导的疾病和病症的患者的血清中过表达。例如，已经在CD患者或炎性肠综合征的小鼠模型中报道了升高水平的IL22和LCN2。Dige等，Journal of Crohn’s and Colitis 7：248-255(2013)提出，产生IL22的CD45RO+CD4+ T细胞的水平可以用作使用抗TNFα抗体治疗CD的临床应答的预测因子。然而，Dige提供的实验数据指示，IL22的高基线血浆水平并未预测CD患者中抗TNFα治疗的一般应答，结论是尽管IL22的显著性未知，但CD患者中的IL22表达支持CD的已知异质性。类似地，Schemmel等人，Inflamm.Bowel Dis.14：204-212(2008)公开了与健康对照相比，CD患者血清中IL22升高，并且IL22血清表达与疾病活动性相关；然而，Schemmel对于潜在使用单独或与其他生物标志物组合的IL22以分层或鉴定对特定治疗作出高度应答的CD患者群体保持沉默。此外，美国公开2011/0212104公开了包括IL22和LCN2的许多分子的水平在CD患者中升高并且提出IL22和LCN2作为IBD(包括CD和UC)的潜在生物标志物。重要的是，上面引用的参考文献都没有公开可以用于分层或鉴定患有IL23介导的疾病的患者群体和/或选择患有IL23介导的疾病的患者亚群用于用特异性IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体)治疗的包括IL22和/或LCN2的那些IL23途径生物标志物的阈值、水平或范围。因此，本领域仍然需要鉴定和治疗对抗IL23疗法作出应答的患有IL23介导的疾病的特定患者组的方法。
新的治疗选择，例如特异性靶向IL23的抗体如MEDI2070，具有解决患有IL23介导的疾病的患者的未满足的医疗需求的可能性。因此，鉴定例如可能对MEDI2070(例如，诊断性生物标志物或其组合)具有良好临床应答的患者组和/或本领域已知的其他抗IL23治疗剂的手段可以极大地增加它们的效用。
通常，本文公开的方法基于在患有IL23介导的疾病或病症(例如，CD)的患者中特异性IL23途径生物标志物(包括例如IL22和/或LCN2)的水平变化的检测，以及这些变化与对用IL23拮抗剂(包括例如靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体或其抗原结合片段)的疗法的增加的临床应答之间的相关性。换句话说，IL23途径生物标志物(包括例如IL22和/或LCN2)的特定水平与疗法的临床功效相关并且可用以预测患有IL23介导的疾病或病症如CD的特定患者群体中的临床结果。
如本文所用的术语“IL23途径生物标志物”涵盖IL23途径中的蛋白质，包括白细胞介素-22(IL22)、脂质运载蛋白-2(LCN2)、趋化因子(CC基序)配体20(CCL20、MIP-3α)、白细胞介素-17F(IL17F)、IL17A/IL17F(IL17A/F)、S100钙结合蛋白A12(S100A12)、白细胞介素23受体(IL23R)、白细胞介素12B(IL12B)、白细胞介素23A(IL23A)、防御素B2(DEFB-2、DEFB-4)、IL1β、丝氨酸(或半胱氨酸)蛋白酶抑制剂成员3(SERPINB3)、肿瘤坏死因子α(TNF-α)、CCL6、α3整联蛋白、白细胞介素-21(IL21)、CCR6、CCL22、ILlR1、IFNγ、PI3/弹力素、LL37、RORγ、RORγT、IL26、S100A7、DEFB103B、GM-CSF或其组合。参见，例如Haider等，J.Immunol.180：1913-1920(2008)；Nakae等，J.Leukocyte Biol.81：1258-1268(2007)；Guttman-Yassky等，J Immunol.181(10)：7420-7427(2008)；Wilson等，Nature Immunology8：950-7(2007)；其全部通过引用整体并入本文。在一些方面，本文公开的方法使用的IL23途径生物标志物组包括IL22和/或LCN2。
在一些方面，IL23途径生物标志物IL22和/或LCN2可以被本领域已知的其他炎症途径中存在的一种或多种分子和/或本领域已知的与IL23介导的疾病或病症连接的其他生物标志物取代或者与其相组合，这些其他生物标志物包括但不限于例如C-反应蛋白(CRP)、钙卫蛋白(S100A8/S100A9复合物)、DMBT1、MIF、PAP/REG3α、REG3γ、触珠蛋白、白细胞介素-6(IL6)、乳铁蛋白、GP-39(YKL-40)、GPX-2、GPX-3、嗜中性粒细胞弹性蛋白酶等。
术语“生物标志物”是指作为生物过程、生物事件和/或病理学病症的独特指标的因子，例如对用IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体或其抗原结合片段)治疗的临床应答的预测因子。如本文所用，术语生物标志物涵盖临床标志物和生物标志物两者。因此，在本发明的上下文中，术语“生物标志物”涵盖例如“生物学生物标志物”，其包含例如IL23途径生物标志物如IL22和/或LCN2、与IL23介导的疾病或病症连接的其他生物标志物(例如，CRP和/或钙卫蛋白)及其组合。本文公开的生物学标志物还包括编码那些蛋白质(DNA和/或RNA)以及代谢产物的基因。
术语“生物标志物”还涵盖可以预测对生物疗法的应答的“临床生物标志物”(也称为“临床状态标志物”)，例如性别、年龄、伴随药物、吸烟状况、体重指数(BMI)等。参见例如美国公开US20150065530、US20140141990、US20130005596、US20090233304、US20140199709、US20130303398、US20110212104，其通过引用整体并入本文。
本文公开的生物标志物(例如，IL23途径组分，诸如IL22和/或LCN2)还包括与其相应的野生型序列(例如，在IL22和LCN2的情况下，分别与SEQ ID No：2和4)具有80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％或99％的序列同一性的蛋白质和与其相应的野生型序列(例如，在IL22和LCN2的情况下，分别与SEQ ID No：1和3)具有80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％或99％的序列统一性的核酸。
本文公开的IL23途径生物标志物如IL22和/或LCN2还包括其片段、变体和衍生物。如本文所用，如与相应野生型多肽的氨基酸序列相比，“变体”生物标志物含有至少一个氨基酸序列改变。氨基酸序列改变可以是例如一种或多种氨基酸的取代、缺失或***，优选保守取代。变体生物标志物可以具有氨基酸取代、缺失或***的任何组合。在一个方面，生物标志物变体多肽可以具有整数个氨基酸改变，使得其氨基酸序列与相应野生型多肽的氨基酸序列共有至少60％、70％、80％、85％、90％、95％、97％、98％、99％、99.5％或100％同一性。
下面提供本申请中讨论的一些IL23途径生物标志物的描述。
a.白细胞介素22(IL22)
如本文所用的术语“IL22”是指白细胞介素22蛋白(NCBI参考序列NP_065386.1；SEQ ID NO：2)，其由IL22基因(NCBI参考序列NM_020525.4；SEQ ID NO：1)编码。另参见Uniprot Acc.No.Q9GZX6，其通过引用整体并入本文。IL22是已知自Thl7细胞表达的促炎性细胞因子。Wilson等，Nature Immunol.8：950(2007)。IL22的血清水平增加也与IBD相关。参见，例如Schmechel等，Inflamm.Bowel Dis.14：204(2008)；和Brand等，Am.J.Physiol.Gastrointest.Liver Physiol 290：G827-G838(2006)。已经显示IL22诱导肝细胞中的触珠蛋白表达(Dumoutier等，Proc.Nat’l.Acad.Sci USA 97：10144(2000))，以上调REG3α、REG3γ、S100A8、S100A9和触珠蛋白在结肠上皮细胞中的表达(Zheng等，NatureMedicine 14：282(2008))，并上调S100A8和S100A9在角质细胞中的表达(Boniface等，J.Immunol.174：3695(2005))。
IL22具有33个氨基酸的信号序列，即对应于成熟IL22的SEQ ID NO：2的残基34-179。Xie等，J.Biol.Chem.275：31335(2000)。
术语IL22还包括其片段、变体(例如，S158G和本领域已知的其他变体)及衍生物(例如，IL22蛋白的糖基化或去糖基化形式，或所述蛋白质的其他化学修饰形式)。在一些方面，术语IL22是指IL22基因，其包括基因组DNA、cDNA、mRNA及其片段。在一些方面，术语IL22还指在严格条件下能够与IL22基因特异性杂交的低聚核苷酸。
b.脂质运载蛋白-2(LCN2)
如本文所用的术语“LCN2”是指脂质运载蛋白-2蛋白(NCBI参考序列NP_005555.2；SEQ ID NO：4)，其由LCN2基因(NCBI参考序列NM_005564.3；SEQ ID NO：3)编码。另参见Uniprot Acc.No.P80188，其通过引用整体并入本文。LCN2，还被认为是24p3和嗜中性粒细胞明胶酶相关的脂质运载蛋白(NGAL)(Kjeldsen等，J.Biol.Chem.268：10425-10432(1993))，是最初在小鼠肾细胞和人类嗜中性粒细胞颗粒中鉴定的25kDa分泌糖蛋白。它属于脂质运载蛋白超家族，所述脂质运载蛋白超家族包括超过20种小分泌蛋白，诸如RBP4、脂肪酸结合蛋白(FABP)、主要尿蛋白(MUP)、载脂蛋白D(apoD)和***素D合成酶(PODS)。参见Akerstrom等，Biochim Biophys Acta.1482：1-8(2000)。这种蛋白质家族的共同特征是它们结合和运输小亲脂性物质如游离脂肪酸、类视色素、花生四烯酸和各种类固醇的能力(Flower，Biochem J.318：1-14(1996)。LCN2在克罗恩氏病结肠中的结肠上皮细胞和白细胞中表达。
LCN2具有20个氨基酸的信号序列，即对应于成熟LCN2的SEQ ID NO：4的残基21-198。参见Bundgaard等，Biochem.Biophys.Res.Comm.202：1468(1994)；国际申请公开WO2006/091035；以及美国专利申请公开20050261191，其通过引用整体并入本文。
术语LCN2还包括其片段、同种型(例如，同种型2，其中在残基193和198之间的序列DQCIDG(SEQ ID NO：37)被序列GNGQSG(SEQ ID NO：38)置换)、变体(例如，G9R、L13S、K82N、I155V、S178Y和本领域已知的其他变体)及衍生物(例如，LCN2蛋白的糖基化或去糖基化形式，或所述蛋白质的其他化学修饰形式)。在一些方面，术语LCN2是指LCN2基因，其包括基因组DNA、cDNA、mRNA及其片段。在一些方面，术语LCN2还指在严格条件下能够与LCN2基因特异性杂交的低聚核苷酸。
c.C-反应蛋白(CRP)
出于诊断、预测或监测目的，可以将本文公开的IL23途径生物标志物如IL22和/或LCN2与其他IL23途径生物标志物、治疗干预点下游的生物标志物(例如，IL23)或对某种IL23介导的疾病或病症具有特异性的生物标志物相组合。例如，对于炎性肠病(IBD)(包括例如CD或UC)，这样的特异性生物标志物包括下面描述的C-反应蛋白(CRP)和/或钙卫蛋白。
如本文所用的术语“CRP”是指C-反应蛋白(NCBI参考序列NP_000558.2；SEQ IDNO：8)，其由CRP基因(NCBI参考序列NM_000567.2；SEQ ID NO：7)编码。另参见UniprotAcc.No.P02741，其通过引用整体并入本文。CRP(还被认为是PTX1)早已被视为急性期反应物，其在组织损伤或炎症后浓度急剧升高。CRP水平升高与冠状动脉疾病相关。CRP长期以来一直被用作炎性肠病，特别是克罗恩氏病的标志物。参见，例如Vermerie等，(2004)Inflamm.Bowel Dis.10：661和Keshet等，(2009)Am.J.Med.ScL337：248。为了用作人类中的生物标志物，可以使用定制设计的ELISA测定或者例如使用可商购的ELISA试剂盒如得自R&D Systems(Minneapolis，Minnesota，USA)的
Figure BDA0001662404150000381
人类CRP免疫测定试剂盒和得自AssayPro(St.Charles，Missouri，USA)的
Figure BDA0001662404150000382
人类乳铁蛋白ELISA试剂盒测定。
CRP具有18个氨基酸的信号序列，即对应于成熟CRP的SEQ ID NO：8的残基19-224。
术语CRP还包括其片段、变体(例如，K1G、T1G、L170V、在位置16处开始的序列YSIFSYATKRQDNEIL(SEQ ID NO：39)被序列TVFSRMPPRDKTMRFF(SEQ ID NO：40)取代、从位置80至位置98的序列缺失以及本领域已知的其他变体)及衍生物(例如，在***残基1-19信号肽后产生的CRP的吡咯烷N-末端羧酸修饰形式，和所述蛋白质的其他化学修饰形式)。在CRP的同种型2中，缺失从位置67至位置199的序列。在一些方面，术语CRP是指CRP基因，其包括基因组DNA、cDNA、mRNA及其片段。在一些方面，术语CRP还指在严格条件下能够与CRP基因特异性杂交的低聚核苷酸。
d.钙卫蛋白(S100A8/S100A9)
钙卫蛋白是在炎性条件下由嗜中性粒细胞、单核细胞和上皮细胞产生的哺乳动物蛋白S100A8和S100A9的复合体，Foell等，J.Leukocyte Biol.81：28(2007)。钙卫蛋白可以通过螯合营养物Mn2+和Zn2+抑制金黄色葡萄球菌在脓肿中的生长。Corbin等，Science 319：962(2008)。钙卫蛋白长期以来一直与肠道炎症相关，并且被提议作为IBD的标志物。参见，例如Lugering等，Digestion 56：406(1995)；von Roon等，Am.J.Gastroenterol.102：803(2007)；Leach等，Scand.J.Gastroenterol.42：1321(2007)；Langhorst等，Am.J.Gastroenterol.103：162(2008)。它在粪便中的测量已经显示可用于检测活性IBD并预测疾病的复发。Angriman等，Clinica Chimica Acta 381：63(2007)。2006年，美国食品和药品管理局(FDA)批准
Figure BDA0001662404150000383
粪便钙卫蛋白免疫测定(Genova Diagnostics，Inc.，Asheville，NC，USA)用于诊断IBD。参见美国专利US4833074；US5455160；和US6225072。所述测试涉及具有比色读数的ELISA测定。其他人类钙卫蛋白检测试剂盒也可以商购得到。参见例如美国专利6,225,072。检测到粪便钙卫蛋白的水平大于100μg/g粪便诊断为IBD。vonRoon等，Am.J.Gastroenterol.102：803(2007)。根据具有
Figure BDA0001662404150000391
测试的文献，基于IBD患者中的中值粪便钙卫蛋白水平超过1700μg/g(例如，200-20.000μg/g)以及正常健康受试者中的中值粪便钙卫蛋白水平为25μg/g，将超过50μg/g的粪便钙卫蛋白水平视为“阳性”结果。
S100A8(S100钙结合蛋白A8)(NCBI参考序列NP_002955.2；SEQ ID NO：10)，还被认为是钙粒蛋白A、囊性纤维化抗原、骨髓相关蛋白8、粒细胞L1蛋白、钙卫蛋白L1L亚基、CFAG、白细胞L1复合物轻链、迁移抑制因子相关蛋白8、MRP-8、S100钙结合蛋白A8和尿结石蛋白带A，由S100A8基因(NCBI参考序列NM_002964.3；SEQ ID NO：9)编码。另参见UniprotAcc.No.P05109，其通过引用整体并入本文。
S100A9(S100钙结合蛋白A9)(NCBI参考序列NP_002956.1；SEQ ID NO：12)，还被认为是钙粒蛋白B、囊性纤维化抗原B、骨髓相关蛋白14、钙卫蛋白L1H亚基、白细胞L1复合物重链、迁移抑制因子相关蛋白14和MRP-14，由S100A9基因(NCBI参考序列NM_002965.3；SEQ IDNO：11)编码。
S100A8和S100A9都没有经典的信号序列。Rammes等，J.Bio.Chem.272：9496(1997)。另参见Uniprot Acc.No.P06702，其通过引用整体并入本文。术语钙卫蛋白还包括S100A8和S100A9蛋白的片段、变体。例如，可以除去S100A8的起始甲硫氨酸以产生包含氨基酸残基2至93的N末端加工的S100A8蛋白。而且，S100A8蛋白中位置42处的半胱氨酸氨基酸可以被S-亚硝基化以产生S-亚硝基半胱氨酸。在S100A8蛋白的变体中，来自氨基位置80至93的序列VAAHKKSHEESHKE(SEQ ID NO：41)被WQPTKKAMKKATKSS(SEQ ID NO：42)置换。钙卫蛋白的S100A9亚基的已知变体包括C3A、E36Q、M63A、E78Q、M81A、M83A、S6H、K25F、H28L和H20R。可以除去S100A9的起始甲硫氨酸以产生包含氨基酸残基2至114的N末端加工的S100A9蛋白。在除去N末端Met之后，可以阻断N末端Thr。S100A9中位置3处的半胱氨酸氨基酸可以被瞬时S-亚硝基化以产生S-亚硝基半胱氨酸。Cys-3的S-亚硝基化在通过包括iNOS-S100A8/S100A9复合物的跨亚硝基酶机制在‘Cys-247’处的GAPDH的LDL(ox)诱导的S-亚硝基化中涉及到。S100A9中位置105处的组氨酸也可以修饰成前-甲基组氨酸。此外，S100A9的位置113处的苏氨酸可被MAPK14磷酸化以产生磷酸苏氨酸。
在一些方面，术语钙卫蛋白是指编码S100A8和/或S100A9的基因，这些基因编码基因组DNA、cDNA、mRNA或其片段。在一些方面，术语钙卫蛋白还指在严格条件下能够与编码S100A8或S100A9的基因特异性杂交的低聚核苷酸。
在本公开内容的一些方面，本文公开的方法可以通过使用包含IL22和/或LCN2和任选的额外生物标志物如CRP和/或钙卫蛋白的一组生物标志物以及其任何组合或亚组应用于IL23介导的疾病如炎性肠病(IBD)(包括例如CD或UC)。贯穿本申请的任何部分，“IL22和/或LCN2”的叙述涵盖列表的各个组分以及其组合。因此，“IL22和/或LCN2”涵盖单独的IL22；单独的LCN2；以及一起的IL22和LCN2。
III.IL23途径生物标志物的检测和定量
本发明的IL23途径生物标志物如IL22和/或LCN2(它们表达的蛋白质水平或它们各自的核酸水平，诸如mRNA水平)可以通过本领域技术人员熟知的许多方法中的任一种检测和定量。这些方法包括分析生物化学方法，诸如电泳、毛细管电泳、高效液相色谱法(HPLC)、薄层色谱法(TLC)、超扩散色谱法、质谱法等；或各种免疫方法，诸如流体或凝胶沉淀反应、免疫扩散(单或双)、免疫组织化学、亲和层析、免疫电泳、放射免疫测定(RIA)、酶联免疫吸附测定(ELISA)、免疫荧光测定、西方印迹等。
在一些方面，用于检测和/或定量本文公开的IL23途径生物标志物的方法包括测量由样品中的基因或基因片段编码的RNA如mRNA的水平、浓度或量。RNA如mRNA的水平可以通过本领域已知的任何技术测量，这些技术包括但不限于北方印迹或定量PCR(qPCR)，包括诸如逆转录qPCR、实时qPCR和端点qPCR的方法。或者，可以进行“基于标签”的技术，诸如基因表达的系列分析(SAGE)和RNA-Seq，以提供不同mRNA的细胞浓度的相对量度。
在一些方面，用于检测和/或定量本文公开的IL23途径生物标志物的方法包括测量由样品中的基因或基因片段编码的蛋白质产物的水平、浓度或量。确定蛋白质产物的表达水平的合适方法是本领域已知的，并且包括免疫测定(例如，西方印迹、酶联免疫吸附测定(ELISA)、放射免疫测定(RIA)或夹心免疫测定或免疫组织化学测定)。对于免疫测定的一般综述，参见Methods in Cell Biology，第37卷：Antibodies in Cell Biology，Asai编，Academic Press，Inc.New York(1993)；Basic and Clinical Immunology，第7版，Stites和Terr编，(1991)。另参见例如美国专利申请公开2007/0212723 A1，Shang等，CirculationResearch 101：1146-1154(2007)；和国际专利申请公开WO/2012/094651和WO/2010/129964。
在一些方面，IL23途径生物标志物如IL22和/或LCN2可以在电泳多肽分离(例如，1-或2-维电泳)中检测和/或定量。使用电泳技术检测多肽的手段是本领域技术人员熟知的(一般参见R.Scopes(1982)Polypeptide Purification，Springer-Verlag，N.Y.；Deutscher，(1990)Methods in Enzymology，第182卷：Guide to PolypeptidePurification，Academic Press，Inc.，N.Y.)。在一些方面，使用西方印迹(免疫印迹)分析来检测和定量样品中IL22和/或LCN2的存在。该技术通常包括通过基于分子量的凝胶电泳分离样品多肽，将分离的多肽转移至合适的固体载体(诸如，硝酸纤维素滤纸、尼龙滤纸或衍生尼龙滤纸)，并将样品用特异性结合分析物的抗体孵育。可以直接标记特异性结合分析物的抗体，或者可以随后使用特异性结合一次抗体的结构域的标记抗体(例如，标记的绵羊抗小鼠抗体)检测特异性结合分析物的抗体。
在一些方面，IL23途径生物标志物如IL22和/或LCN2可以使用免疫测定在生物学样品中检测和/或定量。对于免疫测定的一般综述，另参见Methods in Cell Biology，第37卷：Antibodies in Cell Biology，Asai编，Academic Press，Inc.New York(1993)；Basicand Clinical Immunology，第7版，Stites和Terr编，(1991)。在一些方面，免疫测定可以使用分别识别人类IL22或人类LCN2的一种或多种抗IL22和/或抗LCN2抗体或其抗原结合片段。
在一些方面，免疫测定包括夹心免疫测定，例如酶联免疫吸附测定(ELISA)或夹心电化学发光(ECL)测定，其中第一抗IL22或抗LCN2“捕获”抗体或其抗原结合片段附接到固体载体，允许来自样品或标准品的抗原与捕获抗体结合，然后加入第二抗IL22或抗LCN2“检测”抗体或其抗原结合片段并通过酶反应、ECL反应、放射性或本领域已知的任何其他检测方法检测。
在一些方面，免疫测定包括以下步骤：首先，允许捕获抗体或其片段结合固体载体，例如本领域普通技术人员已知的多孔板或其他测定装置。允许捕获抗体附接一段时间，例如过夜，然后除去未结合的抗体。然后可以洗涤板以除去任何未结合的捕获抗体。然后可以用阻断溶液处理板，以允许非特异性蛋白质结合固体载体的任何未结合区域。典型的阻断溶液包括不相关的蛋白质，例如脱脂奶粉或血清白蛋白。然后可以再次洗涤板以除去任何未结合的阻断溶液。接着，将怀疑含有IL22和/或LCN2的样品加到板中。通常将样品连续稀释并一式两份或一式三份地铺板。还包括包含标准量的IL22和/或LCN2或其合适的片段的对照物以及各种阴性对照物。允许抗原与捕获抗体结合一段时间，例如室温下1小时。孵育之后，然后可以洗涤板以除去任何未结合的抗原。接着，添加检测抗体。检测抗体通常是与捕获抗体相比结合不同IL22或LCN2表位的抗IL22或抗LCN2抗体。检测抗体可以是标记的或未标记的。在检测抗体未标记的情况下，如本领域普通技术人员所熟知的，将需要添加标记的二次抗体的添加步骤。
检测抗体可以用酶如辣根过氧化物酶或碱性磷酸酶直接标记，或者可以用将允许酶结合的标签标记。例如，检测抗体可以与生物素缀合，并且所述酶通过允许酶缀合的链霉亲和素与生物素标签结合而在后续步骤中附着。或者，检测抗体可以缀合至化学发光、荧光或ECL标签。后者的一个实例是钌螯合物。孵育之后，然后可以洗涤板以除去任何未结合的检测抗体。检测抗体的检测可以通过基于使用的检测抗体的类型而变化的方法来完成。
如果检测抗体用生物素做标签，则添加酶缀合的链霉亲和素，洗去未结合的链霉亲和素，并且添加底物，所述底物提供可以例如在分光光度计上读取的比色反应。如果检测抗体与钌螯合物缀合，则使板经受电流，并测量光发射。
用于检测本文公开的IL23途径生物标志物如IL22和/或LCN2的免疫测定可以是竞争性的或非竞争性的。非竞争性免疫测定是直接测量捕获的分析物的量的测定。在竞争性测定中，样品中分析物的量通过测量由样品中存在的分析物从捕获剂置换(或竞争离开)的添加(外源)的标记分析物的量来间接测量。在一种竞争性测定中，将已知量的(在这种情况下)标记的IL22和/或LCN2添加到样品中，然后使样品与捕获剂接触。与抗体结合的标记的IL22或LCN2的量与样品中存在的IL22或LCN2的浓度成反比。
在一些方面，所述方法直接测量患者样品中的IL22和/或LCN2水平，其中绝对水平通过使用例如纯化的全长或IL22或LCN2片段在标准曲线上绘制免疫测定结果来计算。然后可以基于包含在板上的各种标准物和对照物来定量来自检测抗体的检测信号。通过将结果绘制在标准曲线上，可以计算测试样品中IL22和/或LCN2的绝对水平，例如，以pg或ng IL22和/或LCN2/mL或者pg或ng IL22和/或LCN2/mg总蛋白质计。
根据本领域技术人员熟知的标准方法可以对本文公开的IL23途径生物标志物如IL22和/或LCN2的检测测定进行评分(作为分析物的阳性或阴性或量)。特定的评分方法将取决于测定格式和标记的选择。例如，西方印迹测定可以通过可视化由酶标记产生的有色产物来评分。在校正分子量下的清晰可见的有色带或斑点被评为阳性结果，而没有清晰可见的斑点或带则评为阴性。带或斑点的强度可以提供分析物浓度的定量量度。
在一些方面，本文公开的IL23途径生物标志物的测量的表达水平表示基于表达水平的多于一个测量结果的平均表达水平或均值表达水平。在一些方面，测量的表达水平是相同样品的表达水平的多次测量的平均值或均值。在一些方面，测量的表达水平是含有从相同受试者获得的相同组分的不同样品的表达水平的多次测量的平均值或均值。在一些方面，测量的表达水平经分位数归一化，如在使用本领域普通技术人员熟知的技术的RNA Seq技术中所进行。
如在“IL22水平”和/或“LCN2水平”中，如应用于本文公开的IL23途径生物标志物的术语“水平”是指如下测量结果，其使用用于检测生物样品中生物标志物的存在或表达(蛋白质表达或基因表达)的任何分析方法得到，并且指示生物样品中的生物标志物的、对于或对应于生物样品中的生物标志物的存在、不存在、绝对量或浓度、相对量或浓度、滴度、表达水平、测量水平的比率等。
“值”或“水平”的确切性质取决于用以检测IL23途径生物标志物如IL22和/或LCN2的特定分析方法(例如，免疫测定、质谱法、体内分子成像、基因表达谱分析、基于适体的测定等)的具体设计和组分。参见，例如U.S.2010/00221752。
如本文关于IL23途径生物标志物(例如，IL22和/或LCN2)所使用，术语“升高的水平”、“增加的水平”、“更高的水平”或“高水平”是指高于对照样品中测量的生物标志物的表达水平或范围(“正常水平”)或本文公开的特定阈值(包括例如如使用包括实施例3中描述的IL22免疫测定的IL22免疫测定所测量的IL22血清蛋白质的约15.6pg/mL；和/或如使用包括实施例3中描述的LCN2免疫测定的LCN2免疫测定所测量的LCN2血清蛋白质的约215ng/mL)的生物样品(例如，血清)中的水平。
如本文关于IL23途径生物标志物(例如，IL22和/或LCN2)所使用，术语“减低的水平”、“降低的水平”、“减小的水平”或“低水平”是指低于对照样品中测量的生物标志物的表达水平或范围(“正常水平”)或本文公开的特定阈值(包括例如如使用包括实施例3中描述的IL22免疫测定的IL22免疫测定所测量的IL22血清蛋白质的约15.6pg/mL；和/或如使用包括实施例3中描述的LCN2免疫测定的LCN2免疫测定所测量的LCN2血清蛋白质的约215ng/mL)的生物样品(例如，血清)中的水平。
本文公开的IL23途径生物标志物(例如，IL22和/或LCN2)的正常水平或范围可以根据标准实践定义。因此，可以将特定生物样品中测量的水平与类似正常样品中测定的水平或水平范围进行比较。在这种情况下，正常样品或对照样品可以是例如从没有IL23介导的疾病或病症的可检测症状的个体获得的样品。据称IL22和/或LCN2的水平升高，其中IL22和/或LCN2的相应水平在测试样品中以比正常样品、对照样品中或本文公开的特定阈值水平(包括例如如使用包括实施例3中描述的IL22免疫测定的IL22免疫测定所测量的IL22血清蛋白质的约15.6pg/mL；和/或如使用包括实施例3中描述的LCN2免疫测定的LCN2免疫测定所测量的LCN2血清蛋白质的约215ng/mL)高的水平或范围存在。
在一些方面，如果本文公开的IL23途径生物标志物(例如，IL22和/或LCN2)的水平比正常样品或对照样品或者本文公开的特定阈值水平高至少约5％、至少约10％、至少约15％、至少约20％、至少约25％、至少约30％、至少约35％、至少约40％、至少约45％、至少约50％、至少约55％、至少约60％、至少约65％、至少约70％、至少约75％、至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％、或至少约100％，则将本文公开的IL23途径生物标志物的水平视为升高或高。
在一些方面，如果本文公开的IL23途径生物标志物(例如，IL22和/或LCN2)的水平比正常样品或对照样品或者本文公开的特定阈值水平低至少约5％、至少约10％、至少约15％、至少约20％、至少约25％、至少约30％、至少约35％、至少约40％、至少约45％、至少约50％、至少约55％、至少约60％、至少约65％、至少约70％、至少约75％、至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％、或至少约100％，则将本文公开的IL23途径生物标志物的水平视为降低或低。
如本文所用，术语“阈值水平”(或者本文中可选地，“阈值”或“预定的阈值水平”)是指例如IL23途径生物标志物如IL22和/或LCN2的物质的水平，其可以具有用于比较目的的意义。在一些方面，阈值水平可以是蛋白质或核酸的表达水平，其表示为从健康(无疾病)受试者的对照群体取得的样品中蛋白质或核酸的表达水平的水平平均值。在一些方面，阈值水平可以是在不同时间如在本测定之前的相同受试者中的水平，诸如在受试者发展疾病之前或在起始治疗之前确定的水平。通常，样品通过公因子归一化。例如，体液样品通过体积体液归一化，并且含有细胞的样品通过蛋白质含量或细胞计数归一化。另一方面，阈值水平还可以指在对于用例如IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体或其抗原结合片段)治疗没有作出应答的受试者的相应对照样品或对照组中相同生物标志物的表达水平。
在一些方面，将IL23途径生物标志物如IL22和/或LCN2的表达水平与阈值水平(或本文中可选地，“预定的阈值水平”)进行比较。因此，如本文所用，术语“阈值水平”或“预定的阈值水平”是比较蛋白质或核酸的测量的表达水平的截止值或阈值。
基于与已知对照样品的比较，可以确定IL23途径生物标志物如IL22和/或LCN2的“阈值水平”，并且落在那些相应的IL22和/或LCN2阈值水平之上或之下的测试样品指示从其获得样品的患者可能受益于用IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体或其抗原结合片段)的治疗。
在一些方面，可以预先确定IL23途径生物标志物(例如，IL22和/或LCN2)的阈值水平(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)并且使其与样品类型(例如，血清、肺组织、皮肤)、疾病类型(例如，哮喘、IPF、COPD、克罗恩氏病、UC或特应性皮炎)以及在某些情况下，所使用的测定匹配。
如实施例中所述，使用实施例3中描述的IL22免疫测定由来自中度至重度克罗恩氏病患者群体的血清样品定量的IL22蛋白质水平指示具有大于或等于15.6pg/mL(对于研究中的患者群体而言，中值IL22水平)的较高或升高的IL22水平的患者增加了对抗IL23抗体的临床应答，而具有小于15.6pg/mL的较低或降低的IL22水平的患者具有类似于安慰剂组的降低的临床应答。参见实施例2至4；图4、图6和图8。因此，在本文公开的方法的一些方面，预定的IL22阈值水平为如使用实施例3中描述的IL22免疫测定所测量的在血清中约15.6pg/mL IL22蛋白表达。在一些其他方面，预定的IL22阈值水平为如从使用实施例3中描述的IL22免疫测定所测量的在自具有IL23介导的疾病的多个患者测量的血清中的大约中值IL22值。在一些方面，“低水平的IL22”(IL22 LO)定义为如使用实施例3中描述的IL22免疫测定所测量的低于血清中约15.6pg/mL IL22蛋白表达的中值的值。在一些方面，“高水平的IL22”(IL22 HI)定义为如使用实施例3中描述的IL22免疫测定所测量的等于或高于血清中约15.6pg/mL IL22蛋白表达的中值的值。
在一些方面，预定的IL22阈值水平为如使用实施例3中描述的IL22免疫测定所测量的在血清中约15.6pg/mL+/-10pg/mL IL22蛋白表达。因此，IL22阈值水平可以是约5pg/mL、6pg/mL、7pg/mL、8pg/mL、9pg/mL、10pg/mL、11pg/mL、12pg/mL、13pg/mL、14pg/mL、15pg/mL、16pg/mL、17pg/mL、18pg/mL、19pg/mL、20pg/mL、21pg/mL、22pg/mL、23pg/mL、24pg/mL、25pg/mL或26pg/mL。在一些方面，“低水平的IL22”(IL22 LO)定义为低于这些阈值水平之一的值，而“高水平的IL22”(IL22 HI)定义为等于或高于相同阈值水平的值(即，如果阈值水平是20pg/mL，则低水平的IL22将低于20pg/mL，而高水平的IL22将是20pg/mL或更高)。
在一些方面，预定的IL22阈值对应于如表4中报道的第2、第3、第4、第5、第6、第7或第8十分位IL22基线水平。在一些方面，预定的IL22阈值水平为如使用实施例3中描述的IL22免疫测定所测量的在血清中约7.9pg/mL、约11.3pg/mL、约12.7pg/mL、约15.6pg/mL、约19.6pg/mL、约23.1pg/mL、约31.4pg/mL或约46.8pg/mL IL22蛋白表达。在一些方面，“低水平的IL22”(IL22 LO)定义为低于这些阈值水平之一的值，而“高水平的IL22”(IL22 HI)定义为等于或高于相同阈值水平的值。
在一些方面，如使用实施例3中描述的IL22免疫测定所测量的预定IL22阈值水平对应于7.9pg/mL与31.4pg/mL之间，例如约8pg/mL、9pg/mL、10pg/mL、11pg/mL、12pg/mL、13pg/mL、14pg/mL、15pg/mL、16pg/mL、17pg/mL、18pg/mL、19pg/mL、20pg/mL、21pg/mL、22pg/mL、23pg/mL、24pg/mL、25pg/mL、26pg/mL、27pg/mL、28pg/mL、29pg/mL、30pg/mL或31pg/mL的在血清中的IL22的浓度。
如实施例中所述，使用实施例3中描述的LCN2免疫测定由来自中度至重度克罗恩氏病患者群体的血清样品定量的LCN2蛋白质水平指示具有大于或等于215ng/mL(对于研究中的患者群体而言，中值LCN2水平)的较高或升高的LCN2水平的患者增加了对抗IL23抗体的临床应答，而具有小于215ng/mL的较低或降低的LCN2水平的患者具有降低的临床应答。参见实施例2至4；图5和图6。因此，在本文公开的方法的一些方面，预定的LCN2阈值水平为如使用实施例3中描述的LCN2免疫测定所测量的在血清中约215ng/mL LCN2蛋白表达。在一些其他方面，预定的LCN2阈值水平为如从使用实施例3中描述的LCN2免疫测定所测量的在自具有IL23介导的疾病的多个患者测量的血清中的大约中值LCN2值。在一些方面，“低水平的LCN2”(LCN2 LO)定义为如使用实施例3中描述的LCN2免疫测定所测量的低于血清中约215ng/mL LCN2蛋白表达的中值的值。在一些方面，“高水平的LCN2”(LCN2 HI)定义为如使用实施例3中描述的LCN2免疫测定所测量的等于或高于血清中约215ng LCN2/mL LCN2蛋白表达的中值的值。
在一些方面，预定的LCN2阈值水平为如使用实施例3中描述的LCN2免疫测定所测量的在血清中约215ng/mL+/-70ng/mL LCN2蛋白表达。因此，LCN2阈值水平可以是约145ng/mL、150ng/mL、155ng/mL、160ng/mL、165ng/mL、170ng/mL、175ng/mL、180ng/mL、185ng/mL、190ng/mL、195ng/mL、200ng/mL、205ng/mL、210ng/mL、215ng/mL、220ng/mL、225ng/mL、230ng/mL、235ng/mL、240ng/mL、245ng/mL、250ng/mL、255ng/mL、260ng/mL、265ng/mL、270ng/mL、275ng/mL、280ng/mL或285ng/mL。在一些方面，“低水平的LCN2”(LCN2 LO)定义为低于这些阈值水平之一的值，而“高水平的LCN2”(LCN2 HI)定义为等于或高于相同阈值水平的值(即，如果阈值水平是250ng/mL，则低水平的LCN2将低于250ng/mL，而高水平的LCN2将是250ng/mL或更高)。
在一些方面，预定的LCN2阈值对应于如表5中报道的第1、第2、第3、第4、第5、第6或第7十分位LCN2基线水平。在一些方面，预定的LCN2阈值水平为如使用实施例3中描述的免疫测定所测量的在血清中约142.8ng/mL、约163.6ng/mL、约184.3ng/mL、约201.3ng/mL、约214.6ng/mL、约233.4ng/mL、约261.1ng/mL、约294.8ng/mL或约326.6ng/mL LCN2蛋白表达。在一些方面，“低水平的LCN2”(LCN2 LO)定义为低于这些阈值水平之一的值，而“高水平的LCN2”(LCN2 HI)定义为等于或高于相同阈值水平的值。
在一些方面，如使用实施例3中描述的LCN2免疫测定所测量的预定LCN2阈值水平对应于143ng/mL与261ng/mL之间，例如约145ng/mL、150ng/mL、155ng/mL、160ng/mL、165ng/mL、170ng/mL、175ng/mL、180ng/mL、185ng/mL、190ng/mL、195ng/mL、200ng/mL、205ng/mL、210ng/mL、215ng/mL、220ng/mL、225ng/mL、230ng/mL、235ng/mL、240ng/mL、245ng/mL、250ng/mL、255ng/mL或260ng/mL的在血清中的LCN2的浓度。
在一些方面，阈值水平是如用于检测样品中IL23途径生物标志物(例如，IL22和/或LCN2)的存在或不存在的商业免疫测定的制造商手册所报道的从自健康志愿者获得的样品测量的平均或均值表达水平。例如，用于定量从R&D Systems(人类IL22
Figure BDA0001662404150000501
ELISA试剂盒(目录号D2200)；或人类脂质运载蛋白-2/NGAL
Figure BDA0001662404150000502
ELISA试剂盒(目录号DLCN20/SLCN20/PDLCN20))获得的IL22或LCN2的固相夹心ELISA试剂盒。人类IL22
Figure BDA0001662404150000503
ELISA试剂盒和人类脂质运载蛋白-2/NGAL
Figure BDA0001662404150000511
ELISA试剂盒的R&D Systems制造商手册通过引用整体并入本文。因此，如人类IL22
Figure BDA0001662404150000512
测定制造商手册中指示，使用IL22
Figure BDA0001662404150000513
免疫测定对来自明显健康的志愿者的血清(n＝53)、EDTA血浆(n＝51)、肝素血浆(n＝53)和尿液(n＝42)中的IL22水平进行评价，并且IL22均值分别地对于血清为35.7pg/mL，对于EDTA血浆为29.3pg/mL，对于肝素血浆为31.7pg/mL，且对于尿液为35.2pg/mL。因此，在本文公开的方法的一些方面中，如根据制造商的指导说明通过人类IL22
Figure BDA0001662404150000517
ELISA试剂盒(目录号D2200；R&D Systems)对于他们各自的样品所测量，预定的IL22阈值水平对于血清为约35.7pg/mL，对于EDTA血浆为约29.3pg/mL，对于肝素血浆为约31.7pg/mL，和/或对于尿液为约35.2pg/mL。类似地，如人类LCN2
Figure BDA0001662404150000514
测定制造商手册中指示，使用LCN2
Figure BDA0001662404150000515
免疫测定对来自明显健康的志愿者的血清(n＝35)、肝素血浆(n＝35)、唾液(n＝9)和尿液(n＝19)中的可检测的LCN2水平进行评价，并且LCN2均值分别地对于血清为119ng/mL，对于肝素血浆为94ng/mL，对于唾液为320ng/mL，且对于尿液为9.94ng/mL。因此，在本文公开的方法的一些方面中，如根据制造商的指导说明通过人类脂质运载蛋白-2/NGAL
Figure BDA0001662404150000516
ELISA试剂盒(目录号DLCN20/SLCN20/PDLCN20；R&D Systems)对于他们各自的样品所测量，预定的LCN2阈值水平对于血清为约119ng/mL，对于肝素血浆为约94ng/mL，对于唾液为约320ng/mL，且对于尿液为约9.94ng/mL。
在一些方面，样品中测量的IL23途径生物标志物(例如，IL22和/或LCN2)的表达水平高于或低于阈值水平或阈值。在样品中测量的IL23途径生物标志物(例如，IL22和/或LCN2)的表达水平高于或低于阈值水平或阈值的这些方面，表达水平可以指示自其取得样品的患者可能受益于或可能并未受益于用IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体或其抗原结合片段)的治疗。测量的表达水平高于或低于阈值水平或阈值的程度可以达到任何程度。在示例性方面，测量的表达水平比阈值水平高或低至少或约10％(例如比阈值水平高或低至少或约15％、比阈值水平高或低至少或约20％、比阈值水平高或低至少或约25％、比阈值水平高或低至少或约30％、比阈值水平高或低至少或约35％、比阈值水平高或低至少或约40％、比阈值水平高或低至少或约45％、比阈值水平高或低至少或约50％、比阈值水平高或低至少或约55％、比阈值水平高或低至少或约60％、比阈值水平高或低至少或约65％、比阈值水平高或低至少或约70％、比阈值水平高或低至少或约75％、比阈值水平高或低至少或约80％、比阈值水平高或低至少或约85％、比阈值水平高或低至少或约90％、比阈值水平高或低至少或约95％)。在示例性方面，测量的表达水平比阈值水平高或低至少2倍、比阈值水平高或低至少3倍、比阈值水平高或低至少4倍、比阈值水平高或低至少5倍、比阈值水平高或低至少6倍、比阈值水平高或低至少7倍、比阈值水平高或低至少8倍、比阈值水平高或低至少9倍或者比阈值水平高或低至少10倍。
如上所讨论，IL23途径生物标志物(例如，IL22和/或LCN2)的水平可以使用本领域已知的方法来确定。本领域技术人员将会理解，除了上面公开的
Figure BDA0001662404150000521
测定外，有许多本领域可用的方法将允许本领域技术人员确定如本部分通篇描述的阈值水平，这些方法包括实施例，特别是实施例3中描述的方法和免疫测定。
在一些方面，IL23途径生物标志物(例如，IL22和/或LCN2)的预定阈值水平相对于受试者群体(例如，多个正常的健康患者、患有非IL23介导的疾病的患者和/或患有IL23介导的疾病的患者)中的某个百分位数值定义。在一些方面中，IL22的预定阈值水平对应于第10、第15、第20、第25、第30、第35、第40、第45、第50、第50、第55、第60、第65、第70、第75、第80、第85或第90百分位数。在一些方面中，LCN2的预定阈值水平对应于第10、第15、第20、第25、第30、第35、第40、第45、第50、第50、第55、第60、第65、第70、第75、第80、第85或第90百分位数。
IL23途径生物标志物如IL22和/或LCN2的阈值水平(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)可以基于测定的性质，例如使用的捕获抗体和检测抗体，标准品的来源、纯度和组成等变化。
在一个方面，代替使用任意的阈值水平来确定患者是否可以受益于用IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体，诸如MEDI2070，或其抗原结合片段)的治疗，可以对患者的IL22和/或LCN2水平与一种或多种对照IL22和/或LCN2水平进行比较。根据这个方面，对测试样品(例如，来自患有IL23介导的疾病或病症的患者的样品)与一种或多种对照样品(例如，自正常健康个体取得的样品，自相同患者取得的较早样品，自患有患者疾病如哮喘、COPD、IPF、克罗恩氏病、UC或特应性皮炎的非IL23介导的亚组的患者取得的样品，预定标准量的分离的IL22或LCN2或其组合)进行比较。
结果可以表示为与对照样品的比率，以确定与对照IL22和/或LCN2水平相比患者的IL22和/或LCN2水平(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)的百分比增加或百分比减小。对照样品可以是与患者样品匹配的配对，例如，以下的一种或多种：如果患者样品为全血，则为全血中的一种或多种；如果患者样品为血清，则为血清；如果患者样品为血浆，则为血浆；如果患者样品为唾液，则为唾液；如果患者样品为尿液，则为尿液；如果患者样品为痰，则为痰；如果患者样品为肺泡灌洗液，则为肺泡灌洗液；如果患者样品为肺组织，则为肺组织；或者如果患者样品为皮肤，则为皮肤。一旦确定，则可以将IL22和/或LCN2表达水平记录在患者病历中。
在一个特定方面，高IL22水平(如使用实施例3中公开的IL22免疫测定所测量，血清中至少约15.6pg/mL)和/或高LCN2水平(如使用实施例3中公开的LCN2免疫测定所测量，至少约215ng/mL)预测在患有IL23介导的疾病(包括例如CD)的患者中对IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体，诸如MEDI2070，或其抗原结合片段)的阳性临床应答。在一个方面，如使用实施例3中公开的IL22免疫测定所测量，高IL22水平为约7.9pg/mL至约31.4pg/mL之间的值。在一个方面，如使用实施例3中公开的LCN2免疫测定所测量，高LCN2水平为约143pg/mL至约261pg/mL之间的值。
在一个特定方面，上面的IL22水平：如使用实施例3中描述的IL22免疫测定所测量的在血清中约7.9pg/mL、约11.3pg/mL、约12.7pg/mL、约15.6pg/mL、约19.6pg/mL、约23.1pg/mL、约31.4pg/mL或约49.8pg/mL IL22蛋白表达；和/或上面的LCN2水平：如根据实施例3中公开的LCN2免疫测定所测量的约142.8ng/mL、约163.6ng/mL、约184.3ng/mL、约201.3ng/mL、约214.6ng/mL、约233.4ng/mL、约261.1ng/mL、约294.8ng/mL或约326.6ng/mLLCN2表达预测在患有IL23介导的疾病(包括例如CD)的患者中对IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体，诸如MEDI2070，或其抗原结合片段)的阳性临床应答。
在一个方面，在首次施用IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体，诸如MEDI2070，或其抗原结合片段)之后IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体，诸如MEDI2070，或其抗原结合片段)的施用引起克罗恩氏病活动性指数(CDAI)应答评分降低至少100分或总CDAI评分降低至低于150分。
在其他方面，在施用一种或多种剂量的IL23抗体或其抗原结合片段之后IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体，诸如MEDI2070，或其抗原结合片段)的施用引起克罗恩氏病活动性指数(CDAI)应答评分降低至少10、15、20、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、105、110、115、120、125、130、135、140、145或150分。
IV.IL23拮抗剂
可以使用本文公开的IL23途径生物标志物(例如，IL22和/或LCN2)例如以确定是否作出关于是否选择用IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体，诸如MEDI2070，或其抗原结合片段)治疗患有IL23介导的疾病或病症的患者，进行所述治疗，监测所述治疗，或者开始、改进或停止所述治疗。
如本文所用，术语“IL23拮抗剂”是指如下的任何药剂，其可以在体外或体内影响IL23的表达、活性或半衰期，或者在患有IL23介导的疾病或病症如CD的受试者中由IL23引起或由IL23加重的症状、病理学或后遗症。IL23拮抗剂可以是如本文所定义的任何治疗剂，其可以直接或间接地抑制，减轻或中和IL23活性，抑制或降低IL23表达，降低IL23半衰期，或者可以防止由IL23引起症状恶化。在某些方面，IL23拮抗剂是抗IL23单克隆抗体。
本文预期的特定IL23拮抗剂特异性结合并抑制IL23，但不抑制IL12。如果本公开内容的IL23拮抗剂或结合剂(例如，和诸如MEDI2070的抗体)优先结合靶位点达到在某种程度阻断参考分子与靶位点的结合，则其竞争性抑制参考分子(例如，不同IL23拮抗剂或结合剂)与给定靶位点的结合。可以通过本领域已知的任何方法如竞争ELISA测定来确定竞争性抑制。可以说本公开内容的IL23拮抗剂或结合剂(例如，诸如MEDI2070的抗体)竞争性抑制参考分子与给定表位的结合至少约90％、至少约85％、至少约80％、至少约75％、至少约70％、至少约65％、至少约60％、至少约55％或至少50％。
在一些方面，IL23拮抗剂是靶向例如IL23的p19亚基、IL23的p40亚基或两者的抗IL23抗体。预期的示例性IL23拮抗剂是靶向IL23的p19亚基的抗IL23抗体MEDI2070。MEDI2070是完全人化中国仓鼠卵巢(CHO)细胞来源的免疫球蛋白G2(IgG2)单克隆抗体(MAb)，其以高亲和力与人类IL23特异性结合并防止IL23与IL23受体相互作用。所述分子是异四聚体，由IgG2亚类的2个重链和λ亚类的2个轻链组成，它们通过二硫键共价连接。参见国际公开WO 2011/056600，通过引入并入本文。
MEDI2070包含SEQ ID NO：15的重链和/或SEQ ID NO：16的轻链。MEDI2070包含重链可变区(SEQ ID NO：5)，所述重链可变区包含具有分别对应于SEQ ID NO：31、32和33的序列的VH-CDR1、VH-CDR2和VH-CDR3。MEDI2070包含轻链可变区(SEQ ID NO：6)，所述轻链可变区包含具有分别对应于SEQ ID NO：34、35和36的序列的VL-CDR1、VL-CDR2和VL-CDR3。
如本文所用，术语“MEDI2070”不仅指完整的MEDI2070免疫球蛋白，还指MEDI2070抗原结合片段、其变体或衍生物，与MEDI2070结合相同IL23表位的抗体或其片段，或竞争性抑制MEDI2070与IL23的结合的抗体或其片段。预期在氨基酸序列中，特别是在可变区中或在其CDR中与MEDI2070相同或类似的抗体(或其片段)(但还预期恒定区中的变异)。例如，在一个方面，MEDI2070是指与本文公开的MEDI2070多肽(MEDI2070的重链、MEDI2070的轻)具有约70％、约75％、约80％、约85％、约90％、约92％、约95％、约98％、约99％或100％同一性的氨基酸序列的多肽。在一些方面，MEDI2070是分离的IL23特异性抗原结合蛋白，其包含MEDI2070的至少一个、两个、三个、四个或六个互补决定区。
预期的另一种示例性IL23拮抗剂是靶向IL23的p19亚基的抗IL23抗体，其包含SEQID NO：43的VH和/或SEQ ID NO：44的VL。在一些方面，IL23拮抗剂包含重链可变区和/或轻链可变区，所述重链可变区包含自SEQ ID NO：43起的VH-CDR1、VH-CDR2和VH-CDR3(即，SEQID NO：45-47)，所述轻链可变区包含自SEQ ID NO：44起的VL-CDR1、VL-CDR2和VL-CDR3(即，SEQ ID NO：48-50)。在一些方面，IL23拮抗剂与包含SEQ ID NO：43的VH和SEQ ID NO：44的VL的抗体结合相同的IL23表位。在一些方面，IL23拮抗剂竞争性抑制包含SEQ ID NO：43的VH和SEQ ID NO：44的VL的抗体与IL23的结合。预期包含在氨基酸序列中，特别是在可变区中或在其CDR中，与SEQ ID NO：43的VH和/或SEQ ID NO：44的VL相同或类似的VH和/或VL结构域的抗体(或其片段)(然而，还预期恒定区中的变异)。例如，在一个方面，IL23拮抗剂是具有与SEQ ID NO：43的VH和/或SEQ ID NO：44的VL具有约70％、约75％、约80％、约85％、约90％、约92％、约95％、约98％、约99％或100％同一性的氨基酸序列的多肽。在一些方面，IL23拮抗剂分离的IL23特异性抗原结合蛋白，其包含SEQ ID NO：43的VH和/或SEQ ID NO：44的VL的至少一个、两个、三个、四个或六个互补决定区。
术语“IL23拮抗剂”还涵盖例如在US7491391、US7807414、US7872102、US7807160、US8362212、US7935344、US7790862、US2012282269、US20090123479、US20120128689、US2012264917、WO199905280、WO20070244846、WO2007027714、WO2007076524、WO2007147019、WO2008103473、WO2008103432、WO2009043933、WO2009082624、WO 12009760中描述的靶向IL23的抗体，其全部通过引用整体并入本文。在一些方面，“IL23拮抗剂”涵盖包含引用的参考文献中公开的抗体的CDR序列中的一个、两个、三个、四个、五个或六个的抗体及其抗原片段(包括例如构建体，诸如scFv)。在一些方面，“IL23拮抗剂”涵盖与引用的参考文献中公开的抗体竞争结合IL23的抗体及其抗原片段(包括例如构建体，诸如scFv)。
在一些具体的方面，术语“IL23拮抗剂”是指优特克单抗(CNTO-1275，
Figure BDA0001662404150000571
)(SEQ ID NO：17、18)、巴列津单抗(ABT-874)(SEQ ID NO：25、26)、吉塞克单抗(CNTO-1959)、蒂尔他昔单抗(MK-3222；SCH-900222)(SEQ ID NO：27、28)、BI-655066(参见Krueger等，J.Allergy Clin Immunol.136：116-124(2015))、LY-3074828(参见Gaffen等，Nature Reviews Immunology 14：585-600，(2014))或其包含其各自CDR序列中的一个、两个、三个、四个、五个和/或六个的抗原结合片段。
本公开内容的IL-23拮抗剂还可以与其他细胞因子的一种或多种拮抗剂(例如，抗体)组合使用，所述其他细胞因子包括但不限于IL17A、IL17F、TNF-α、IL-1β、IL-6和TGF-β。参见例如Veldhoen，Immunity 24：179-189(2006)；Dong，Nat.Rev.Immunol.6(4)：329-333(2006)。
在各个方面，本文公开的IL-23拮抗剂包含抗体的抗原结合片段，诸如本文提及的任何IL-23拮抗剂抗体的片段。这样的片段包括但不限于Fab、Fab′、Fab′-SH、Fv、scFv、F(ab′)2、纳米抗体和双抗体。
术语“IL23拮抗剂”还涵盖拮抗剂，诸如适体(参见，例如美国专利申请公开2007066550)、肽(例如，如Quiniou等，Am J Physiol Regul Integr Comp Physiol.2014年11月15日；307(10)：R1216-30中所公开)、抗IL-23受体的口服稳定的肽或小分子抑制剂(例如，Synta Pharmaceuticals的STA-5326)。
V.基于IL23途径生物标志物水平诊断、治疗和监测IL23介导的疾病的方法
在患有IL23介导的疾病(例如，CD)的受试者中差异表达的IL23途径生物标志物可以用于预测在用某种疗法如IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体，诸如MEDI2070，或其抗原结合片段)治疗受试者时的临床结果。
在一些方面，IL23拮抗剂是可以特异性结合IL23的p19亚基(SEQ ID NO：13)、IL23的p40亚基(SEQ ID NO：14)或两者的抗IL23抗体或其抗原结合部分，例如靶向IL23的p19亚基的抗IL23抗体MEDI2070。
在一些方面，抗IL23抗体或其抗原结合片段包含MEDI2070的重链(HC)(SEQ IDNO：15)和/或轻链(SEQ ID NO：16)或其抗原结合片段、变体或衍生物。在一些方面，抗IL23抗体或其抗原结合片段包含MEDI2070的重链可变区(VH)(SEQ ID NO：5)和/或轻链可变区(VL)(SEQ ID NO：6)，由其组成或基本上由其组成。在一些方面，抗IL23抗体或其抗原结合片段包含MEDI2070的互补决定区(SEQ ID NO：31-36)中的至少一个。在一些方面，抗IL23抗体或其抗原结合片段包含VH区和/或VL区或其抗原结合片段、变体或衍生物，VH区包含SEQID NO：43的序列，VL区包含SEQ ID NO：44的序列。在一些方面，抗IL23抗体或其抗原结合片段包含SEQ ID NO：45-47(SEQ ID NO：43的VH的CDR)和/或SEQ ID NO：48-50(SEQ ID NO：44的VL的CDR)的互补决定区中的至少一个。
在其他方面，IL23拮抗剂是选自优特克单抗或布拉吉单抗(靶向IL23的p40亚基)、吉塞克单抗、蒂尔他昔单抗、BI-655066或LY-3074828(靶向IL23的p19亚基)的抗IL23抗体、其抗原结合片段或其组合。在其他方面，IL23拮抗剂是与选自优特克单抗或布拉吉单抗(靶向IL23的p40亚基)、吉塞克单抗、蒂尔他昔单抗、BI-655066或LY-3074828(靶向IL23的p19亚基)的抗体、其抗原结合片段或其组合竞争结合IL23的分子(例如，抗体)
例如，可以应用该发现来设计确定治疗的新方法(例如，通过选择患者作为某种疗法的候选者)，治疗IL-23介导的疾病的方法，监测治疗剂(例如，抗IL23抗体)治疗IL23介导的疾病和病症的功效的方法，或调节制剂、给药方案或施用路径的方法。
本文公开的方法包括至少部分地基于受试者的一种或多种IL23途径生物标志物的表达水平嘱咐、起始和/或改变例如对于诸如CD的IL23介导的疾病的预防和/或治疗。在一个特定方面，这类IL23途径生物标志物是IL22和/或LCN2。
本公开内容提供一种确定是否用治疗方案治疗患有IL23介导的疾病或病症的患者的方法，所述治疗方案包括施用IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体，诸如MEDI2070，或其抗原结合片段)，其中所述方法包括：(a)测量或指导临床实验室测量在从患者取得的样品中的至少一种IL23途径生物标志物的水平，和(b)治疗或指导保健提供者用治疗方案治疗患者，或暂停所述治疗，不起始所述治疗，拒绝所述治疗，或指导保健提供者暂停，不起始或拒绝所述治疗，所述治疗方案包括，如果确定患者在样品中具有与预定阈值水平相比较或者与一种或多种对照样品中的水平相比较更高或更低水平的所述至少一种IL23途径生物标志物，则施用IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体，诸如MEDI2070，或其抗原结合片段)。
在一个方面，本公开内容提供一种确定是否用治疗方案治疗患有IL23介导的疾病或病症的患者的方法，所述治疗方案包括施用IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体，诸如MEDI2070，或其抗原结合片段)，其中所述方法包括：(a)测量或指导临床实验室测量在从患者取得的样品中的IL22和/或LCN2的水平，和(b)治疗或指导保健提供者用治疗方案治疗患者，所述治疗方案包括，如果确定患者在样品中具有与预定的IL22和/或LCN2阈值水平相比较或者与一种或多种对照样品中的IL22和/或LCN2水平相比较(i)更高或增加水平的IL22，和/或(ii)更高或增加水平的LCN2，则施用特异性结合IL23的抗体或其抗原结合片段。
在一个方面，本公开内容提供一种确定是否用治疗方案治疗患有IL23介导的疾病或病症的患者的方法，所述治疗方案包括施用IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体，诸如MEDI2070，或其抗原结合片段)，其中所述方法包括：(a)测量或指导临床实验室测量在从患者取得的样品中的IL22和/或LCN2水平，和(b)暂停用治疗方案治疗患者，不起始所述治疗，拒绝所述治疗，或指导保健提供者暂停，不起始或拒绝所述治疗，所述治疗方案包括，如果确定患者在样品中具有与预定的IL22和/或LCN2阈值水平相比较或者与一种或多种对照样品中的IL22和/或LCN2水平相比较(i)更低或减小水平的IL22，和/或(ii)更低或减小水平的LCN2，则施用特异性结合IL23的抗体或其抗原结合片段。
还提供了一种选择诊断患有IL23介导的疾病或病症的患者作为用IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体，诸如MEDI2070，或其抗原结合片段)治疗的候选者的方法，所述方法包括(a)测量或指导临床实验室测量在从患者取得的样品中的IL22和/或LCN2水平，和(b)如果确定患者在样品中具有与预定的IL22和/或LCN2阈值水平相比较或者与一种或多种对照样品中的IL22和/或LCN2水平相比较(i)更高或增加水平的IL22，和/或(ii)更高或增加水平的LCN2，则用L23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体，诸如MEDI2070，或其抗原结合片段)治疗患者或指导保健提供者治疗患者。
还提供了一种选择诊断患有IL23介导的疾病或病症的患者作为用IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体，诸如MEDI2070，或其抗原结合片段)治疗的候选者的方法，所述方法包括(a)测量或指导临床实验室测量在从患者取得的样品中的L22和/或LCN2水平，和(b)如果确定患者在样品中具有与预定的IL22和/或LCN2阈值水平相比较或者与一种或多种对照样品中的IL22和/或LCN2水平相比较(i)更低或减小水平的IL22，和/或(ii)更低或减小水平的LCN2，则暂停用L23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体，诸如MEDI2070，或其抗原结合片段)治疗患者，不起始所述治疗，拒绝所述治疗或指导保健提供者暂停，不起始或拒绝所述治疗。
在一些方面，所公开的方法可能需要排序和/或执行一种或多种额外的测定。例如，如果确定IL22和/或LCN2水平(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)在正常范围内(即，未升高)时，则可以重复IL22和/或LCN2测定以排除假阴性结果，和/或可以执行一种或多种额外IL22和/或LCN2测定以监测受试者的状态。相反，如果确定IL22和/或LCN2水平(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)升高，则可能需要重复IL22和/或LCN2测定以排除假阳性结果。
在一些方面，如使用IL22免疫测定(包括例如实施例3中描述的IL22免疫测定)在血清中所测量，预定的IL22阈值水平为至少约15.6pg/mL；和/或如使用LCN2免疫测定(包括例如实施例3中描述的LCN2免疫测定)在血清中所测量，预定的LCN2阈值水平为至少约215ng/mL。
在一些方面，在患有IL23介导的疾病的患者中高于或低于预定阈值水平的IL23途径生物标志物水平(例如，IL22和/或LCN2水平)的存在可以与对这种疾病具有特异性的一种或多种生物标志物组合使用。例如，对于患有炎性肠病(IBD)(包括例如CD或UC)的患者，IL23途径生物标志物水平(例如，IL22和/或LCN2水平)的测量可以与诸如C-反应蛋白(CRP)和/或钙卫蛋白的生物标志物的水平的测量相组合。因此，在一个方面，在本文公开的任何方法中可以组合IL22和/或LCN2的水平与CRP和/或钙卫蛋白水平相组合以(i)确定患有IL23介导的疾病(例如，IBD、CD或UC)的患者符合或不符合用IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基如MEDI2070的抗IL23抗体或其抗原结合片段)特定治疗的条件或将对所述特定治疗作出应答，(ii)确定是否应该开始，暂停或改进特定治疗(例如，用IL23拮抗剂，诸如MEDI2070)，(iii)诊断疾病(例如，IBD、CD或UC)可用特定治疗剂治疗或不能用其治疗，或(iv)如果CRP和/钙卫蛋白水平很高，则预言或预测用特定治疗剂等治疗疾病(例如，IBD、CD或UC)的结果。在一些方面，如果如使用包括例如Dade Behring hs-CRP免疫比浊测定的适合测量患者中的CRP水平的测定根据制造商的指导说明所测量的C-反应蛋白的均值水平≥5mg/L，则C-反应蛋白的均值水平是较高或升高的(并且因此指示患有活动性疾病)。在一些方面，如果如使用包括例如Phadia ELiATM钙卫蛋白测定的适合测量患者中的粪便钙卫蛋白水平的测定根据制造商的指导说明所测量的粪便钙卫蛋白的均值水平≥250μg/g，则粪便钙卫蛋白的均值水平是较高或升高的(并且因此指示患有活动性疾病)。在一些方面，如果如使用包括例如Dade Behring hs-CRP免疫比浊测定的适合测量患者中的CRP水平的测定根据制造商的指导说明所测量的C-反应蛋白的均值水平为至少约2mg/L、3mg/L、4mg/L、5mg/L、6mg/L、7mg/L、8mg/L、9mg/L或10mg/L，则C-反应蛋白的均值水平是较高或升高的。在一些方面，如果如使用包括例如Phadia ELIATM钙卫蛋白测定的适合测量患者中的粪便钙卫蛋白水平的测定根据制造商的指导说明所测量的粪便钙卫蛋白的均值水平为至少150μg/g、160μg/g、170μg/g、180μg/g、190μg/g、200μg/g、210 μg/g、220μg/g、230μg/g、240μg/g、250μg/g、260μg/g、270μg/g、280μg/g、290μg/g、300μg/g、310μg/g、320μg/g、330μg/g、340μg/g或350μg/g，则粪便钙卫蛋白的均值水平是较高或升高的。在一些方面，如果如使用包括例如Phadia ELIATM钙卫蛋白测定的适合测量患者中的粪便钙卫蛋白水平的测定根据制造商的指导说明所测量的粪便钙卫蛋白的水平≥250μg/g，≥200μg/g，≥150μg/g，≥100μg/g，或者至少约100μg/g到至少约250μg/g，则粪便钙卫蛋白的水平是较高或升高的。本领域技术人员将理解，可以在本文公开的方法中应用定量C-反应蛋白或钙卫蛋白的不同方法。参见，例如美国专利US8541180；美国专利申请公开US20140227725或US20140227725；和PCTPubl.WO2012175616、WO2010062663、WO2012175602、WO2013132338或WO2013132347，其以引用方式整体并入本文中。
本领域技术人员将理解，可以根据包括但不限于治疗、诊断和监测方法的本文公开的方法使用IL22和/或LCN2水平(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)作为阳性选择因子，即，如果在从患者取得的样品中的IL22和/或LCN2水平(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)高于预定的IL22和/或LCN2阈值水平或者相对于在一种或多种对照样品中的IL22和/或LCN2水平而言升高，则将采用特定行为(例如，用IL23拮抗剂治疗患有IL23介导的疾病的患者)。
本领域技术人员还将理解，可以根据包括但不限于治疗、诊断和监测方法的本文公开的方法使用IL22和/或LCN2水平(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)作为阴性选择因子，即，如果在从患者取得的样品中的IL22和/或LCN2水平(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)低于预定的IL22和/或LCN2阈值水平或者相对于在一种或多种对照样品中的IL22和/或LCN2水平而言降低，则不采用特定行为(例如，用IL23拮抗剂治疗患有IL23介导的疾病的患者)。
在一个方面，本公开内容包括方法、测定和试剂盒以便于由保健提供者、保健福利提供者或临床实验室确定患者是否将受益于用IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体，诸如MEDI2070，或其抗原结合片段)治疗。
本文提供的方法测定和试剂盒也有利于由保健提供者、保健福利提供者或临床实验室确定患者是否将受益于用本文公开的或本领域普通技术人员已知的任何其他IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体，诸如MEDl2070，或其抗原结合片段)治疗。
在一个方面，本文公开的方法包括至少部分地基于患者的IL22和/或LCN2水平进行诊断，所述诊断可以是鉴别诊断。在一些方面，本文公开的方法包括至少部分地基于IL22和/或LCN2水平向受试者通知IL22和/或LCN2测定结果和/或诊断结果。可以口头、书面和/或以电子方式通知患者。
该诊断也可以记录在患者病历中。例如，在各个方面，将可用特异性IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体，诸如MEDI2070，或其抗原结合片段)治疗的IL23介导的疾病(例如，CD)的诊断记录在病历中。术语“病历”或“患者病历”是指对患者的检查和/或治疗的描述，其通常包括以下一项或多项：患者的病史和诉说、医师的身体发现、诊断测试和程序的结果以及患者药物和治疗程序。病历通常由一位或多位医师和/或医师助理记录，并且是需要医疗护理的各种疾病或损伤、和/或接种、和/或过敏、和/或治疗、和/或预后、和/或关于父母、兄弟姐妹和/或职业的频繁健康信息的书面、转录或以其他方式记录的记录和/或历史。所述记录可以由医师在诊断病症时查看。
医疗记录可以是纸质形式和/或可以保存在计算机可读介质中。医疗记录可以由实验室、医师办公室、医院、保健维护组织、保险公司和/或个人医疗记录网站维护。在一些方面，至少部分地基于IL22和/或LCN2水平的诊断被记录在诸如卡片、佩戴制品和/或射频识别(RFID)标签的医疗警报制品上或内。如本文所用，术语“穿戴制品”是指可以穿戴在受试者身体上的任何制品，所述制品包括但不限于标签、手镯、项链、臂带或头带。
如本文所用，术语“诊断”是指检测疾病或确定疾病的阶段或程度。通常，疾病的诊断基于对预测疾病的一种或多种因子和/或症状的评价。也就是说，可以基于指示预测疾病或病症的存在或不存在的因子的存在、不存在或量进行诊断。认为指示特定疾病的诊断的每种因子或症状不需要排他地与特定疾病有关，例如，可以存在可以从诊断因子或症状中推断出的鉴别诊断。同样地，可以存在指示特定疾病的因子或症状存在于没有特定疾病的个体中的情况。术语“诊断”还涵盖确定药物疗法的治疗效果，或预测对药物疗法的应答模式。诊断方法可以独立地使用，或者与医学领域中已知用于特定疾病的其他诊断和/或分期方法组合使用。
如本文所用，术语“鉴别诊断”是指基于对临床数据的分析确定具有类似症状的两种或更多种疾病中的哪种疾病可能导致受试者的一种或多种症状。所述术语还用以指根据患者样品中测量的IL22和/或LCN2水平是高于预定阈值水平还是相对于一种或多种对照样品中的水平升高来确定患者是否对用IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体，诸如MEDI2070，或其抗原结合片段)治疗敏感。
如本文所用的术语“预后”是指预测临床病况或疾病的可能过程和结果。预后通常通过评价指示疾病的有利或不利过程或结果的疾病的因子或症状来进行。如本文所用的短语“确定预后”是指本领域技术人员可以预测患者的病况的过程或结果的过程。术语“预后”并不是指能够以100％的准确度预测病况的过程或结果。相反，本领域技术人员将理解术语“预后”是指某一过程或结果将发生的可能性增加；也就是说，与未表现出病况的那些个体相比，在表现出给定病况的患者中更容易出现所述过程或结果。如本文所用的术语“有利预后”和“积极预后”或者“不利预后”和“消极预后”是用于预测病况或疾病的可能过程和/或可能结果的相对术语。有利或积极的预后预测比不利或消极的预后好的结果。从一般意义上讲，“有利预后”是比可能与特定病况相关的许多其他可能的预后相对更好的结果，而不利预后预测比可能与特定病况相关的许多其他可能的预后相对更差的结果。有利或积极预后的典型实例包括好于平均缓解率、较低转移倾向、久于预期寿命预期、良性过程与癌性过程分化等。
本公开内容包括基于例如IL22和/或LCN2的IL23途径生物标志物的表达的变化来治疗受试者中的IL23介导的疾病的方法。本公开内容提供一种治疗患有IL23介导的疾病或病症的患者的方法，其包括：如果确定患者在一种或多种从患者取得的样品中具有与预定的IL22和/或LCN2阈值水平相比或者与在一种或多种对照样品中的IL22和/或LCN2水平相比(i)更高或增加的IL22水平，和/或(ii)更高或增加的LCN2水平，则对患者施用IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体如MEDI2070或其抗原结合部分)。在一些方面，样品从患者获得并被递交用于测量样品中的IL22和/或LCN2水平。
本公开内容还提供一种治疗患有IL23介导的疾病或病症的患者的方法，其包括：(a)递交从患者取得的样品以测量样品中的IL22和/或LCN2水平，和(b)如果确定患者在所取得的样品中具有与预定的IL22和/或LCN2阈值水平相比或者与在一种或多种对照样品中的IL22和/或LCN2水平相比(i)更高或增加的IL22水平，和/或(ii)更高或增加的LCN2水平，则对患者施用特异性结合IL23(例如，IL23的p19亚基，诸如MEDI2070)的抗体或其抗原结合部分。
还提供了治疗患有IL23介导的疾病或病症的患者的方法，其包括：(a)递交从患者取得的样品以测量样品中的IL22和/或LCN2水平，和(b)如果确定患者在样品中具有与预定的IL22和/或LCN2阈值水平相比或者与在一种或多种对照样品中的IL22和/或LCN2水平相比(i)更低或减小的IL22水平，和/或(ii)更低或减小的LCN2水平，则暂停或不起始对患者施用特异性结合IL23(例如，IL23的p19亚基，诸如MEDI2070)的抗体或其抗原结合部分。
本公开内容还提供一种治疗患有IL23介导的疾病或病症的患者的方法，其包括：(a)测量从患者获得的样品中的IL22和/或LCN2水平；(b)确定样品中的IL22和/或LCN2水平；以及(c)如果确定患者在样品中具有与预定的IL22和/或LCN2阈值水平相比或者与在一种或多种对照样品中的IL22和/或LCN2水平相比(i)更高或增加的IL22水平，和/或(ii)更高或增加的LCN2水平，则建议保健提供者对患者施用特异性结合IL23(例如，IL23的p19亚基，诸如MEDI2070)的抗体或其抗原结合部分；或如果确定患者在样品中具有与预定的IL22和/或LCN2阈值水平相比或者与在一种或多种对照样品中的IL22和/或LCN2水平相比(i)更低或减小的IL22水平，和/或(ii)更低或减小的LCN2水平，则建议保健提供者暂停或拒绝对患者施用特异性结合IL23的抗体或其抗原结合部分。
还提供了一种治疗患有IL23介导的疾病或病症的患者的方法，其包括：(a)递交从患者取得的样品以测量在从患者获得的样品中的IL22和/或LCN2水平，和(b)如果确定患者在样品中具有与预定的IL22和/或LCN2阈值水平相比或者与在一种或多种对照样品中的IL22和/或LCN2水平相比(i)更高或增加的IL22水平，和/或(ii)更高或增加的LCN2水平，则对患者施用特异性结合IL23(例如，IL23的p19亚基，诸如MEDI2070)的抗体或其抗原结合部分；或如果确定患者在样品中具有与预定的IL22和/或LCN2阈值水平相比或者与在一种或多种对照样品中的IL22和/或LCN2水平相比(i)更低或减小的IL22水平，和/或(ii)更低或减小的LCN2水平，则暂停，不起始或拒绝对患者施用特异性结合IL23(例如，IL23的p19亚基，诸如MEDI2070)的抗体或其抗原结合部分。
在一些方面，所述方法包括对受试者施用有效量的IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体，诸如MEDI2070，或其抗原结合片段)。在一些方面，IL23介导的疾病是肺部疾病、炎性肠病、慢性炎性皮肤病、炎性疾病、自身免疫性疾病、神经退化性疾病、感染或癌症。在一些方面，IL23介导的疾病或病症选自由以下疾病或病症组成的组：哮喘、IPF、COPD、克罗恩氏病、溃疡性结肠炎(UC)、乳糜泻、特应性皮炎、过敏性接触性皮炎、湿疹、牛皮癣、斑秃、掌跖脓疱病、牛皮癣关节炎、强直性脊椎炎、关节炎、类风湿性关节炎(RA)、风湿性病症、ANCA血管炎、贝赫特氏病、自身免疫性甲状腺炎、1型糖尿病、多发性硬化症(MS)、修格兰氏综合征(SS)、全身性红斑狼疮(SLE)、阿尔茨海默病、分枝杆菌病、利什曼病、真菌感染、病毒感染、胃癌、结直肠癌、食道癌、白血病、乙型肝炎病毒(HBV)相关的肝细胞癌、乳腺癌、肺癌和鼻咽癌。在一些方面，患者的IL22和/或LCN2水平在采用一种或多种识别人类IL22或人类LCN2或其抗原结合片段、变体或衍生物的抗IL22和/或抗LCN2抗体或其抗原结合片段的如本文所述的免疫测定中测量。在一些方面，样品从患者获得并被递交例如到临床实验室用于测量样品中的IL22和/或LCN2水平。
在上述治疗方法的一些方面，患者的IL22和/或LCN2水平(例如，DNA或RNA水平)在采用一种或多种能够特异性测量IL22和/或LCN2基因的表达水平的低聚核苷酸探针的测定中测量。
在一些方面，IL22和/或LCN2检测测定(例如，免疫测定)由治疗患者的保健专业人员对从患者获得的样品执行(例如，使用如本文所述的免疫测定，包括例如实施例3中描述的免疫测定，配制为“定点护理”诊断试剂盒)。在一些方面，样品从患者获得并被递交例如到临床实验室用于根据保健专业人员的指导说明测量样品中的IL22和/或LCN2水平(例如，使用如本文所述的免疫测定，包括例如实施例3中描述的免疫测定)。在一些方面，执行测定的临床实验室将基于患者的IL22和/或LCN2水平是否高于预定的IL22和/或LCN2阈值或相对于一种或多种对照样品而言升高而建议保健提供关于患者是否可以受益于用IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体，诸如MEDI2070，或其抗原结合片段)的治疗。
本公开内容还提供测量在诊断患有IL23介导的疾病或病症的患者中与IL23(例如，与IL23的p19亚基，诸如MEDI2070)特异性结合的抗体或其抗原结合片段的功效或药效动力学的方法，其包括：(a)对从患者取得的第一样品中的IL22和/或LCN2的水平进行第一测量；(b)施用特异性结合IL23(例如，IL23的p19亚基，诸如MEDI2070)的抗体或其抗原结合片段；和(c)对从患者取得的第二样品中的IL22和/或LCN2的水平进行第二测量，其中，如使用实施例3中描述的免疫测定自患者血清所测量，第二测量中的IL22和/或LCN2水平与第一测量中的患者IL22和/或LCN2水平相比降低指示患者对用特异性结合IL23(例如，IL23的p19亚基，诸如MEDI2070)的IL23抗体或其抗原结合片段治疗作出应答。
在一些方面中，在施用特异性结合IL23(例如，IL23的p19亚基，诸如MEDI2070)的IL23抗体或其抗原结合片段之后，进行第二测量1周、2周、4周、8周、12周或28周或在介入时间进行。
在一些方面，本公开内容包括一种在一段时间内治疗患有IL23介导的疾病的患者的方法，其包括：测量在从患者取得的第一样品中的第一IL22和/或LCN2水平(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)，或递交从患者取得的第一样品用于测量样品中的第一IL22和/或LCN2水平，其中患者的IL22和/或LCN2水平例如在包括例如实施例3中描述的免疫测定的免疫测定中采用识别人类IL22和/或LCN2的一种或多种抗IL22和/或抗LCN2抗体或其抗原结合片段测量，以及如果第一样品中患者的IL22和/或LCN2水平高于预定的IL22和/或LCN2阈值水平或者相对于一种或多种对照样品中的IL22和/或LCN2水平而言升高，则对患者施用IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体，诸如MEDI2070，或其抗原结合片段)。如上所提，测试可以由保健提供者或临床实验室执行。
根据这些方面，所述方法还可以包括：测量从患者取得的第二样品中的第二IL22和/或LCN2水平(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)，或递交从患者取得的第二样品以测量样品中的第二IL22和/或LCN2水平，其中患者的IL22和/或LCN2水平再次例如在包括例如实施例3中描述的免疫测定的免疫测定中采用识别人类IL22和/或人类LCN2的一种或多种抗IL22和/或抗LCN2抗体或其抗原结合片段测量；比较患者中的第一IL22和/或LCN2水平和第二IL22和/或LCN2水平，以及改变剂量，例如增加或维持施用到患者的IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体，诸如MEDI2070，或其抗原结合片段)的量和频率。在一些方面，如果例如第二样品中患者的IL22和/或LCN2水平高于第一样品中的IL22和/或LCN2水平，则可以中断IL23拮抗剂疗法。
在一些方面，如果第二样品中患者的IL22和/或LCN2水平低于第一样品中的IL22和/或LCN2水平或与第一样品中的IL22和/或LCN2水平大致相同，则可以维持或降低施用到患者的IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体，诸如MEDI2070，或其抗原结合片段)的量或频率。
在某些方面，在本文公开的所有治疗方法中，施用“负荷”剂量的IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体，诸如MEDI2070，或其抗原结合片段)以在患者中达到所需的治疗水平。如果负荷剂量不显著影响患者的IL22和/或LCN2水平(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)或者患者的IL22和/或LCN2水平上升，则可以作出中断治疗的决定，例如使用非IL23拮抗剂疗法。
如果负荷剂量导致患者中的IL22和/或LCN2水平降低，则可以做出将剂量大小或频率降低至“维持”剂量的决定。值得注意的是，这里提供的方法是保健提供者施用治疗的指南，而最终的治疗决定将基于保健提供者的合理判断。
在一些方面，可以将如本文提供的免疫测定的结果递交给保健福利提供者以确定患者的保险是否将覆盖用IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体，诸如MEDI2070，或其抗原结合片段)的治疗。
在一些方面，本公开内容包括一种治疗患有IL23介导的疾病的患者的方法，其包括：例如在临床实验室中测量在从患有IL23介导的疾病的患者获得的第一样品如由保健提供者提供的样品中的IL22和/或LCN2水平(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)，其中第一样品中患者的IL22和/或LCN2水平例如在包括例如实施例3中描述的免疫测定的免疫测定中采用识别人类IL22和/或人类LCN2的一种或多种抗IL22和/或抗LCN2抗体或其抗原结合片段测量，确定第一样品中患者的IL22和/或LCN2水平是否高于预定的IL22和/或LCN2水平，或者相对于一种或多种对照样品中的IL22和/或LCN2水平而言升高；以及如果患者的IL22和/或LCN2水平高于预定的IL22和/或LCN2阈值水平或相对于一种或多种对照样品中的IL22和/或LCN2水平而言升高，则建议保健提供者对患者施用IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体，诸如MEDI2070，或其抗原结合片段)。
在一些方面，这些方法还可以包括：测量从患者获得的第二样品如由保健提供者提供的样品中的IL22和/或LCN2水平(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)，其中患者的IL22和/或LCN2水平再次例如在包括例如实施例3中描述的免疫测定的免疫测定中采用识别人类IL22和/或人类LCN2的一种或多种抗IL22和/或抗LCN2抗体或其抗原结合片段测量；确定第二样品中患者的IL22和/或LCN2水平是否高于、大致相同于或低于第一样品中测量的IL22和/或LCN2水平；并且如果指示出来，则建议保健提供者调整IL23拮抗剂疗法(例如，包括施用靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体如MEDI2070或其抗原结合片段的疗法)，例如以增加或维持施用到患者的IL23拮抗剂的量或频率，或者如果第二样品中患者的IL22和/或LCN2水平高于第一样品中的IL22和/或LCN2水平，则中断IL23拮抗剂疗法，或者如果第二样品中患者的IL22和/或LCN2水平低于第一样品中的IL22和/或LCN2水平或与第一样品中的IL22和/或LCN2水平大致相同，则维持或降低施用到患者的IL23拮抗剂的量或频率。
在一些方面，从患者获得样品并将其递交至例如临床实验室，以例如使用免疫测定测量样品中的IL22和/或LCN2水平(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)。在一些方面，执行测定的临床实验室将基于患者的IL22和/或LCN2水平(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)是否高于预定的IL22和/或LCN2阈值或相对于一种或多种对照样品而言升高而建议保健提供关于患者是否可以受益于用IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体，诸如MEDI2070，或其抗原结合片段)的治疗。
在一些方面，本文预期的治疗方法(例如，对于IL23介导的疾病，诸如克罗恩氏病)包括对受试者以足够的量和/或以足够的间隔施用靶向IL23(例如，IL23的p19亚基，诸如MEDI2070)的抗体或其抗原结合片段以达到和/或维持使用例如如本文所述的测定得到的每体积血清中一定量的IL23特异性抗体。
例如，可以给予靶向IL23(例如，IL23的p19亚基，诸如MEDI2070)的抗体或其抗原结合片段以在血清中达到至少25ng/ml、30ng/ml、35ng/ml、40ng/ml、45ng/ml、50ng/ml、55ng/ml、60ng/ml、65ng/ml、70ng/ml、75ng/ml、80ng/ml、85ng/ml、90ng/ml、95ng/ml、100ng/ml、150ng/ml、200ng/ml、250ng/ml、300ng/ml、350ng/ml、400ng/ml、450ng/ml、500ng/ml、550ng/ml、600ng/ml、650ng/ml、700ng/ml、750ng/ml、800ng/ml、850ng/ml、900ng/ml、950ng/ml、或1000ng/ml。
在另一实施方案中，可以给予靶向IL23(例如，IL23的p19亚基，诸如MEDI2070)的抗体或其抗原结合片段以在血清中达到约12.5ng/ml至约1000ng/ml的IL23特异性抗体的浓度。本领域技术人员将理解，此处给出的量适用于全长抗体或免疫球蛋白分子；如果使用其抗原结合片段，则其绝对量将不同于以此方式给出的量，所述绝对量可以基于片段的分子量计算。
在一些方面，本文预期的治疗方法(例如，对于IL23介导的疾病，诸如克罗恩氏病)包括对受试者以如下的量和如下间隔施用IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体如MEDI2070或其抗原结合片段)：每0.5至1.5个月，15mg至54mg；每1.5至4.5个月，55mg至149mg；每4至8个月，150mg至299mg；或每4至12个月，300mg至1100mg。在一些方面，所述量和间隔是：每0.5至1.0个月，15mg至21mg；每1.5至3.0个月，55mg至70mg；每4至6个月，150mg至260mg；或每4至8个月，300mg至700mg。在一些方面，所述量和间隔是：每个月，21mg；每3个月，70mg；每6个月，210mg；或每6个月，700mg。在一些方面，所述量和间隔是：每3个月，210mg，或每3个月，700mg。在一些方面，所述量和间隔是：每1个月，210mg，或每1个月，700mg。
在所述方法的一些方面，静脉内(IV)施用IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体，诸如MEDI2070，或其抗原结合片段)。在所述方法的一些方面，皮下(SC)施用IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体，诸如MEDI2070，或其抗原结合片段)。
在所述方法的一些方面，以一种或多种固定剂量施用IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体，诸如MEDI2070，或其抗原结合片段)。在一些方面，剂量每周、每2周、每3周、每4周、每5周、每6周、每7周、每8周、每9周、每10周或每12周施用。在一些方面，剂量包含约1mg、2mg、3mg、4mg、5mg、10mg、15mg、20mg、25mg、30mg、35mg、40mg、45mg、50mg、60mg、70mg、80mg、90mg、100mg、110mg、120mg、130mg、140mg、150mg、160mg、170mg、180mg、190mg、200mg、210mg、220mg、230mg、240mg、250mg、260mg、270mg、280mg、290mg、300mg、310mg、320mg、330mg、340mg、350mg、360mg、370mg、380mg、390mg、400mg、410mg、420mg、430mg、440mg、450mg、460mg、470mg、480mg、490mg、500mg、510mg、520mg、530mg、540mg、550mg、560mg、570mg、580mg、590mg、600mg、610mg、620mg、630mg、640mg、650mg、660mg、670mg、680mg、690mg、700mg、710mg、720mg、730mg、740mg、750mg、760mg、770mg、780mg、790mg、800mg、810mg、820mg、830mg、840mg、850mg、860mg、870mg、880mg、890mg、900mg、910mg、920mg、930mg、940mg、950mg、960mg、970mg、980mg、990mg或1000mg。在一些方面，剂量高于1000mg。
在一些方面，SC施用的剂量为约210mg的IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体，诸如MEDI2070，或其抗原结合片段)。
在一些方面，IV施用的剂量为约700mg的IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体，诸如MEDI2070，或其抗原结合片段)。
在一些方面中，施用2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49或50次剂量。
在一个具体方面，抗IL23抗体(例如MEDI2070)以210mg Q4W的固定剂量施用，施用26次剂量。在其他具体方面，抗IL23抗体(例如，MEDI2070)以700mg IV Q4W的固定剂量施用12周。在一些方面，IV施用然后是以210mg SC Q4W的固定剂量施用抗IL23抗体(例如，MEDI2070)，施用100周。
治疗剂例如和IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体，诸如MEDI2070，或其抗原结合片段)的制剂、剂量方案和施用路径可以根据本文公开的方法进行调整以提供用于最佳治疗应答的有效量。关于IL23拮抗剂的施用，拮抗剂可以通过本领域已知的任何合适的手段、组合物和路径施用。关于剂量方案，可以施用单次大剂量，可以随着时间而施用若干分次剂量，或者剂量可以如由治疗情况的紧急程度所指示按比例降低或增加。
IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体，诸如MEDI2070，或其抗原结合片段)可以通过包括但不限于肠胃外、局部或通过吸入的任何合适的技术施用。如果注射，则药物组合物可以例如经由关节内、静脉内、肌内、病灶内、腹膜内或皮肤路径(包括皮内、透皮或真皮下或皮下)、通过大剂量注射或连续输注施用。在一些方面，药物组合物通过静脉内路径施用。在一些方面，药物组合物通过皮下路径施用。在另外方面，组合物通过口服、口腔、直肠、气管内、胃或颅内路径施用。预期例如对于涉及胃肠道的病况通过灌肠或栓剂例如在疾病或损伤部位局部施用。还预期透皮递送和从植入物持续释放。通过吸入递送包括例如鼻腔或口腔吸入、使用雾化器、以气溶胶形式吸入拮抗剂等。其他替代品包括滴眼液；口服制剂，包括药丸、糖浆、锭剂或口香糖；和局部制剂，诸如乳液、凝胶剂、喷雾剂和软膏；预充式注射器和自动注射器。
有利地，IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体，诸如MEDI2070，或其抗原结合片段)可以以包含一种或多种额外组分如生理上可接受的载剂、赋形剂或稀释剂的组合物的形式施用。任选地，所述组合物额外包含一种或多种用于组合疗法的生理活性剂。
药物组合物可以包含IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体，诸如MEDI2070，或其抗原结合片段)以及一种或多种选自由以下物质组成的组的物质：缓冲剂，抗氧化剂，诸如抗坏血酸，低分子量多肽(诸如少于10个氨基酸的多肽)，蛋白质，氨基酸，碳水化合物，诸如葡萄糖、蔗糖或糊精，螯合剂，诸如EDTA，谷胱甘肽，稳定剂和赋形剂。中性缓冲盐水或与同种血清白蛋白混合的盐水是适当稀释剂的实例。根据适当的工业标准，还可以添加防腐剂，诸如苯甲醇。可以使用适当的赋形剂溶液(例如蔗糖)作为稀释剂将组合物配制成冻干物。
在一些方面，IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体，诸如MEDI2070，或其抗原结合片段)可以以约5mg/ml、10mg/ml、15mg/ml、20mg/ml、25mg/ml、30mg/ml、35mg/ml、40mg/ml、45mg/ml、50mg/ml、55mg/ml、60mg/ml、65mg/ml、70mg/ml、75mg/ml、80mg/ml、85mg/ml、90mg/ml、95mg/ml、100mg/ml、105mg/ml、110mg/ml、115mg/ml、120mg/ml、125mg/ml、130mg/ml、135mg/ml、140mg/ml、145mg/ml、150mg/ml、155mg/ml、160mg/ml、165mg/ml、170mg/ml、175mg/ml、180mg/ml、185mg/ml、190mg/ml、195mg/ml或200mg/ml的浓度提供。
可用于本发明的示例性制剂是包含在4.5-5.2的适当pH下的谷氨酸、柠檬酸或乙酸缓冲剂；在诸如1％至20％(w/v)的适当浓度下的诸如蔗糖、甘氨酸、脯氨酸、甘油和/或山梨糖醇的赋形剂；以及在0.001％至0.1％(w/v)的适当浓度下的诸如非离子表面活性剂如聚山梨醇酯(聚山梨醇酯20或80)或泊洛沙姆(泊洛沙1888)的表面活性剂。这种制剂公开在美国专利6171586和WIPO公开的申请号WO20100027766和WO2011088120中。在一些方面，制剂包含乙酸钠、蔗糖和聚山梨醇酯20。在一些方面，制剂包含70mg/mL抗IL23抗体(例如，MEDI2070)、10mM乙酸钠、9％(w/v)蔗糖和0.004％(w/v)聚山梨醇酯20，在pH 5.2下。合适的组分在采用的剂量和浓度下对接受者是无毒的。可以在药物制剂中采用的组分的另外实例呈现在包括第21版(2005)的任何Remington’s Pharmaceutical Sciences，MackPublishing Company，Easton，PA。
VI.组合治疗
本发明方法的特定方面涉及与额外治疗剂组合的抗IL23抗体(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体，诸如MEDI2070，或其抗原结合片段)和一种或多种如在题为“IL23拮抗剂”的本说明书的部分中描述的额外IL23拮抗剂的用途。
在一些方面，IL23拮抗剂是可以特异性结合IL23的p19亚基(SEQ ID NO：13)、IL23的p40亚基(SEQ ID NO：14)或两者的抗IL23抗体。
在一些方面，抗IL23抗体或其抗原结合片段包含MEDI2070的重链(HC)(SEQ IDNO：15)和/或轻链(SEQ ID NO：16)或其抗原结合片段、变体或衍生物。在一些方面，抗IL23抗体或其抗原结合片段包含MEDI2070的重链可变区(VH)(SEQ ID NO：5)和/或轻链可变区(VL)(SEQ ID NO：6)。在一些方面，抗IL23抗体或其抗原结合片段包含MEDI2070的互补决定区(SEQ ID NO：31-36)中的至少一个。在一些方面，抗IL23抗体或其抗原结合片段包含VH区和/或VL区或其抗原结合片段、变体或衍生物，VH区包含SEQ ID NO：43的序列，VL区包含SEQID NO：44的序列。在一些方面，抗IL23抗体或其抗原结合片段包含SEQ ID NO：45-47(SEQID NO：43的VH的CDR)和/或SEQ ID NO：48-50(SEQ ID NO：44的VL的CDR)的互补决定区中的至少一个。
在其他方面，IL23拮抗剂是选自优特克单抗或布拉吉单抗(靶向IL23的p40亚基)、吉塞克单抗、蒂尔他昔单抗、BI-655066或LY-3074828(靶向IL23的p19亚基)的抗IL23抗体、其抗原结合片段或其组合。在其他方面，IL23拮抗剂是与优特克单抗或布拉吉单抗(靶向IL23的p40亚基)、吉塞克单抗、蒂尔他昔单抗、BI-655066或LY-3074828(靶向IL23的p19亚基)、其抗原结合片段或其组合竞争结合IL23的分子(例如，抗体)。
实例包括使用抗IL23抗体与一种或多种具有抗炎性质的其他治疗性部分(例如，非甾族抗炎剂、类固醇和/或免疫调节剂)的组合或抗IL23抗体与一种或多种其他治疗(例如，手术、超声波或有效减轻炎症的治疗)的组合。可以与抗IL23抗体组合的有用药剂包括用于治疗例如克罗恩氏病或溃疡性结肠炎的那些药剂，诸如氨基水杨酸盐(例如，美沙拉嗪(mesalamine)或代谢成美沙拉嗪的物质，包括例如
Figure BDA0001662404150000781
Figure BDA0001662404150000782
和
Figure BDA0001662404150000783
)；皮质类固醇/糖皮质激素(包括***龙甲磺酸苯甲酸酯、替可的松匹伐酯(tixocortol pivalate)、丙酸氟替卡松(fluticasonepropionate)、二丙酸倍氯米松(beclomethasone dipropionate)和布***(budesonide))；抗生素，诸如甲硝唑(metronidazole)或环丙沙星(ciprofloxacin)(或可用于治疗例如患有瘘管的患者的其他抗生素)；和免疫抑制剂，诸如硫唑嘌呤(azathioprine)(例如，
Figure BDA0001662404150000784
知
Figure BDA0001662404150000785
)、6-巯基嘌呤(例如，
Figure BDA0001662404150000791
)、甲氨蝶呤(methotrexate)(例如，
Figure BDA0001662404150000792
Figure BDA0001662404150000793
)、他克莫司(tacrolimus)(例如，
Figure BDA0001662404150000794
)和环孢霉素(cyclosporine)(例如，
Figure BDA0001662404150000795
和
Figure BDA0001662404150000796
)。这样的药剂可以以本领域已知并且在处方信息中描述的剂量和间隔口服或通过其他路径例如经由栓剂或灌肠剂施用。
另外，IL23抗体或抗体衍生物或前述组合可以与一种或多种分子或其他治疗联合使用，其中其他分子和/或治疗不直接结合或影响IL23，但是哪种组合对治疗或预防正在治疗的病况有效。例如，抗IL23抗体可以与益生菌疗法或包括肠道菌群移植的用于恢复或维持正常肠道菌群的其他疗法组合使用。在一个实施方案中，这些分子和/或治疗中的一种或多种治疗或预防在疗法过程中由其他分子或治疗中的一种或多种引起的病况，例如恶心、乏力、脱发、恶病质、失眠等。这样的药剂或疗法可以以本领域已知并且在处方信息中描述的路径以及剂量和间隔施用。
在一些方面，IL23抗体或抗体衍生物或前述组合可以与一种或多种元素饮食治疗联合使用。参见，例如Voitk等，Arch Surg 107：329(1973)；Yamamoto等，Int J ColorectalDis 28：335-340(2013)。
其他支持疗法包括在用IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体，诸如MEDI2070，或其抗原结合片段)的可能组合治疗中；诸如(但不限于)止痛剂和抗胆碱能剂和止泻剂的支持疗法。在治疗方案开始时，可使用这样的组合支持疗法来减轻患者症状并改善他们的生活质量。支持疗法包括口服施用铁、叶酸和维生素B12。止泻剂包括但不限于地芬诺酯(diphenoxylate)、可待因(codeine)、洛哌丁胺(loperamide)和抗胆碱能剂(或其药理学等同物)，其可以对患有轻度疾病的患者施用以减少肠运动频率并重新调节直肠紧迫性。考来烯胺(Cholestyramine)可以用于患者中以预防已经经历有限的回结肠切除术的患者中的胆汁盐诱导的结肠分泌。抗胆碱能剂包括但不限于溴化吡啶鎓、盐酸双环胺、颠茄酊(tincture of belladonna)等，并且可用于减轻腹部痉挛、疼痛和直肠紧迫性。支持或疗法可以以本领域已知并且在处方信息中描述的路径以及剂量和间隔施用。
在使用分子和/或其他治疗的组合的每种情况下，可以以任何顺序以任何时间长度施用单个分子和/或治疗，其例如同时、连续或交替地有效。在一个实施方案中，治疗方法包括在开始第二疗程之前用一种分子或其他治疗完成第一疗程。第一疗程结束和第二疗程开始之间的时间长度可以是允许总疗程有效的任何时间长度，例如数秒、数分钟、数小时、数天、数周、数月或甚至数年。
VII.用于检测IL23途径生物标志物的试剂盒和测定
本公开内容还提供用于例如通过免疫测定方法检测IL23途径生物标志物如IL22、LCN2或其组合(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)的试剂盒。这样的试剂盒可以包括容器，每个容器具有在所述方法中利用的各种试剂(例如，浓缩形式)中的一种或多种，这些试剂包括例如一种或多种抗IL22和/或抗LCN2抗体。可以提供已经附接到固体载体的一种或多种抗IL22抗体和/或抗LCN2抗体，例如捕获抗体。可以提供已经缀合至可检测标记如生物素或钌螯合物的一种或多种抗体：抗IL22抗体和/或抗LCN2抗体，例如检测抗体。
试剂盒还可以提供用于将可检测标记与抗体(以及标记本身)、缓冲剂和/或试剂和支持本文提供的测定的实践的仪器偶联的试剂。在某些方面，可以提供结合检测抗体的标记的二次抗体。根据本公开内容提供的试剂盒还可以包括合适的容器、板和实施本文提供的测定所必需的任何其他试剂或材料。
在一些方面，试剂盒包含能够在高度严格条件下与IL22或LCN2基因序列的子序列杂交的一种或多种核酸探针(例如，包含天然存在的和/或化学修饰的核苷酸单元的低聚核苷酸)。在一些方面，在高度严格条件下能够与IL22或LCN2基因序列的子序列杂交的一种或多种核酸探针(例如，包含天然存在的和/或化学修饰的核苷酸单元的低聚核苷酸)附接到微阵列芯片。
根据本公开内容提供的试剂盒还可以包括描述所述过程的小册子或指导说明。对于IL22或LCN2检测免疫测定，且特别是夹心免疫测定，例如ELISA测定或ECL测定，夹心免疫测定包括附接到固体载体的第一抗IL22或抗LCN2“捕获”抗体或其抗原结合片段以及第二抗IL22或抗LCN2“检测”抗体或其抗原结合片段。免疫测定可以通过本文提供的方法或本领域普通技术人员熟知并理解的方法执行。在一个方面，免疫测定包括将捕获抗体或其片段附接至固体载体；施加测试样品或对照样品，允许样品中的IL22或LCN2(如果存在的话)结合至捕获抗体或其片段；应用检测抗体或其片段，所述检测抗体或其片段可以结合已经结合至捕获抗体或其片段的IL22或LCN2；以及测量结合IL22或LCN2的检测抗体或其片段的量。在某些方面，测定还可以包括洗涤步骤、阻断步骤和孵育步骤。
测试试剂盒可以包括用于进行一种或多种IL22或LCN2检测测定如免疫测定或核酸检测测定的指导说明。试剂盒中所包括的指导说明可以固定到包装材料上或可以作为包装***物包括在内。虽然指导说明通常是书写或印刷的材料，但它们不限于此类。涵盖能够存储这类说明书并且将其传达至终端用户的任何媒介。这些媒介包括但不限于，电子存储介质(如，磁盘、磁带、磁片盒、芯片)、光储介质(如，CD ROM)等等。本文所用，术语“指导说明”可以包括提供指导说明的网站(internet site)的地址。
VIII.伴随诊断***
本文公开的方法可以作为伴随诊断提供，例如可经由网络服务器得到，以向临床医生或患者通知潜在的治疗选择。本文公开的方法可以包括收集或以其他方式获得生物样品并执行分析方法以检测和测量单独或与其他生物标志物(例如，IL23途径的其他组分、IL23途径下游的生物标志物或本领域已知的炎症途径的组分)组合的本文公开的IL23途径生物标志物的水平(例如，IL22、LCN2和/或其组合的蛋白质表达水平或基因表达水平)。以上在说明书中讨论了可以与IL22、LCN2及其组合相组合的示例性生物标志物。
IL22、LCN2及其组合的水平(例如，蛋白质表达水平或基因表达水平)或源自测量的水平的归一化评分可以单独使用(例如，用于治疗、诊断、预后或监测目的)，或与源自其他生物标志物(例如，用于衍生基因签名的小组基因)的水平或归一化评分组合使用。这些评分还可以与其他评分相组合以产生诊断评分，这些其他评分例如对应于临床生物标记，诸如(i)性别、(ii)年龄、(iii)体重指数、(iv)吸烟状况、(v)伴随药物、(vi)健康评估质量(HAQ)、或两种或更多种的组合。在该方法中，诊断评分可以是从所有标志物计算的总和确定的单个数字，将其与指示疾病的存在或不存在的预设阈值进行比较。或者，诊断评分可以是各自代表生物标志物值的一系列条，并且可以将应答的模式与用于确定疾病的存在或不存在的预设模式进行比较。
由于所涉及的计算的复杂性，本文所述的方法的至少一些方面包括使用IL22、LCN2及其组合作为生物标志物的方法可以通过使用计算机来实施。在一些方面，计算机***包括经由总线电耦合的硬件元件，包括处理器、输入装置、输出装置、存储装置、计算机可读存储介质读取器、通信***、处理加速度(例如，DSP或专用处理器)和存储器。计算机可读存储介质读取器可以进一步耦合到计算机可读存储介质，所述组合综合地代表用于临时和/或更永久地包含计算机可读信息的远程、本地、固定和/或可移动存储装置以及存储介质、存储器等，其可以包括存储装置、存储器和/或任何其他的这种可访问的***资源。
可以利用单个构造来实施可以根据当前期望的协议、协议变体、扩展等进一步构造的一个或多个服务器。然而，对于本领域技术人员将显而易见的是，实施方案可以根据更具体的应用要求充分利用。还可以利用定制的硬件和/或特定的元件可以在硬件、软件或两者中实施。另外，尽管可以采用到诸如网络输入/输出装置(未示出)的其他计算装置的连接，但是应当理解，还可以利用到其他计算装置的有线、无线、调制解调器和/或一种或多种其他连接。
在一个方面，所述***还包括用于向一种或多种处理器提供输入数据的一种或多种装置。所述***还包括用于存储排序的数据元素的数据集的存储器。在另一方面，用于提供输入数据的装置包括用于检测数据元素的特征的检测器，例如荧光板阅读器、质谱仪或基因芯片阅读器。
所述***可以额外包括数据库管理***。用户请求或查询可以用数据库管理***理解的适当语言格式化，所述***处理查询以从训练集数据库中提取相关信息。所述***可以连接到网络，所述网络与网络服务器和一个或多个客户端连接。如本领域所知，网络可以是局域网(LAN)或广域网(WAN)。优选地，服务器包括运行计算机程序产品(例如，软件)以访问用于处理用户请求的数据库数据所必需的硬件。所述***可以与输入装置通信以向***提供关于数据元素的数据(例如，表达值)。在一个方面，输入装置可以包括基因表达谱***，其包括例如质谱仪、基因芯片或阵列阅读器等。
可以实施本文描述的一些方面以包括计算机程序产品。计算机程序产品可以包括具有介质中体现的用于使应用程序在具有数据库的计算机上执行的计算机可读程序代码的计算机可读介质。如本文所用，“计算机程序产品”是指以包含在任何性质(例如，书写、电子、磁性、光学或其他性质)的物理介质上且可以与计算机或其他自动数据处理***一起使用的以自然或程序设计语言语句形式的一组有组织的指令。这样的编程语言语句在由计算机或数据处理***执行时，使得计算机或数据处理***根据语句的特定内容而工作。
计算机程序产品包括但不限于：源代码和目标代码中的程序和/或嵌入计算机可读介质中的测试或数据库。另外，使计算机***或数据处理设备装置能够以预先选择的方式工作的计算机程序产品可以以多种形式提供，这些形式包括但不限于原始源代码、汇编代码、目标代码、机器语言、前述加密或压缩版本以及任何和所有的等同物。
在一个方面，提供计算机程序产品以实施本文公开的治疗、诊断、预后或监测方法，例如如果从患者取得的样品中的IL23途径生物标志物的水平高于或低于预定的阈值水平，例如，如果IL22和/或LCN2水平高于相应的预定阈值水平，则确定是否对有此需要的患者施用IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体，诸如MEDI2070，或其抗原结合片段)。
在一些方面，IL23拮抗剂是可以特异性结合IL23的p19亚基(SEQ ID NO：13)、IL23的p40亚基(SEQ ID NO：14)或两者的抗IL23抗体。
在一些方面，抗IL23抗体或其抗原结合片段包含MEDI2070的重链(HC)(SEQ IDNO：15)和/或轻链(SEQ ID NO：16)或其抗原结合片段、变体或衍生物。在一些方面，抗IL23抗体或其抗原结合片段包含MEDI2070的重链可变区(VH)(SEQ ID NO：5)和/或轻链可变区(VL)(SEQ ID NO：6)。在一些方面，抗IL23抗体或其抗原结合片段包含MEDI2070的互补决定区(SEQ ID NO：31-36)中的至少一个。在一些方面，抗IL23抗体或其抗原结合片段包含VH区和/或VL区或其抗原结合片段、变体或衍生物，VH区包含SEQ ID NO：43的序列，VL区包含SEQID NO：44的序列。在一些方面，抗IL23抗体或其抗原结合片段包含SEQ ID NO：45-47(SEQID NO：43的VH的CDR)和/或SEQ ID NO：48-50(SEQ ID NO：44的VL的CDR)的互补决定区中的至少一个。
在其他方面，IL23拮抗剂是选自优特克单抗或布拉吉单抗(靶向IL23的p40亚基)、吉塞克单抗、蒂尔他昔单抗、BI-655066或LY-3074828(靶向IL23的p19亚基)的抗IL23抗体、其抗原结合片段或其组合。在其他方面，IL23拮抗剂是与优特克单抗或布拉吉单抗(靶向IL23的p40亚基)、吉塞克单抗、蒂尔他昔单抗、BI-655066或LY-3074828(靶向IL23的p19亚基)、其抗原结合片段或其组合竞争结合IL23的分子(例如，抗体)。
所述计算机程序产品包括体现可由计算装置或***的处理器执行的程序代码的计算机可读介质，所述程序代码包括：(a)检索归因于来自受试者的生物样品的数据的代码，其中所述数据包括单独的IL23途径生物标志物(例如，IL22和/或LCN2)水平值(存在/不存在、量或以其他方式从这些水平值导出的数据)或与对应于生物样品中的其他生物标志物(例如，生物标志物或临床标志物)的值相组合的IL23途径生物标志物水平值。这些值还可以与对应于临床生物标志物的值相组合，这些临床生物标志物例如指示疾病或病症的严重程度或患有此类疾病或病症的患者的倾向性；和(b)执行分类方法的代码，所述分类方法指示例如是否对有此需要的患者施用IL23拮抗剂(例如，靶向例如IL23的p19亚基的抗IL23抗体，诸如MEDI2070，或其抗原结合片段)。
尽管已经对于方法或设备描述了各个方面，但应该理解的是，各方面可以通过例如驻留在计算机上或可由计算机访问的代码的与计算机耦合的代码来实施。例如，可以利用软件和数据库来实施上面讨论的许多方法。因此，除了通过硬件完成的这些方面之外，还应该注意的是，这些方面可以通过使用由具有体现在其中的计算机可读程序代码的计算机可用介质组成的制造制品来实现，这促使实现本说明书中公开的功能。因此，期望这些方面也被视为以其程序代码方式中受到本专利的保护。
另外，一些方面可以是存储在包括而不限于RAM、ROM、磁介质、光学介质或磁光介质的实际上任何种类的计算机可读存储器中的代码。更一般地讲，一些方面可以在软件中、在硬件中或在包括但不限于在通用处理器上运行的软件、微代码、PLA或ASIC的其任何组合中实施。
还可以设想，一些方面可以作为体现在载波中的计算机信号以及通过传输介质传播的信号(例如，电和光)来实现。因此，上面讨论的各种类型的信息可以在诸如数据结构的结构中格式化，并且通过传输介质作为电信号传输或存储在计算机可读介质上。
IX.实施方案
E1.一种治疗患者的白细胞介素-23(IL23)介导的疾病的方法，其包括，如果确定或鉴定患者在一种或多种从所述患者取得的样品中具有与预定的IL22和/或LCN2阈值水平相比或者与在一种或多种对照样品中的IL22和/或LCN2水平相比(i)更高或增加的白细胞介素-22(IL22)水平和/或(ii)更高或增加的脂质运载蛋白2(LCN2)水平，则对所述患者施用IL23拮抗剂。
E2.一种治疗患有IL23介导的疾病的患者的方法，其包括，如果确定或鉴定患者在一种或多种从所述患者取得的样品中具有与预定的IL22和/或LCN2阈值水平相比或者与在一种或多种对照样品中的IL22和/或LCN2水平相比(i)更低或减小的白细胞介素-22(IL22)水平和/或(ii)更低或减小的脂质运载蛋白2(LCN2)水平，则暂停或不起始对所述患者施用IL23拮抗剂。
E3.一种治疗患者的白细胞介素-23(IL23)介导的疾病的方法，其中所述患者对于用抗TNF剂治疗失败，无应答或不耐受，所述方法包括，如果确定或鉴定患者在一种或多种从所述患者取得的样品中具有与预定的IL22和/或LCN2阈值水平相比或者与在一种或多种对照样品中的IL22和/或LCN2水平相比(i)更高或增加的白细胞介素-22(IL22)水平和/或(ii)更高或增加的脂质运载蛋白2(LCN2)水平，则对所述患者施用IL23拮抗剂。
E4.一种确定是否用IL23拮抗剂治疗患有IL23介导的疾病的患者的方法，其包括，如果确定或鉴定患者在一种或多种从所述患者取得的样品中具有与预定的IL22和/或LCN2阈值水平相比或者与在一种或多种对照样品中的IL22和/或LCN2水平相比(i)更高或增加的白细胞介素-22(IL22)水平和/或(ii)更高或增加的脂质运载蛋白2(LCN2)水平，则确定治疗所述患者。
E5.一种选择被诊断为患有IL23介导的疾病的患者作为用IL23拮抗剂治疗的候选者的方法，其包括，如果确定或鉴定患者在一种或多种从所述患者取得的样品中具有与预定的IL22和/或LCN2阈值水平相比或者与在一种或多种对照样品中的IL22和/或LCN2水平相比(i)更高或增加的白细胞介素-22(IL22)水平和/或(ii)更高或增加的脂质运载蛋白2(LCN2)水平，则选择所述患者用于治疗。
E6.根据实施方案E1至E5中任一项所述的方法，其还包括测量在从所述患者获得的一种或多种样品中的IL22和/或LCN2水平，或指导临床实验室或保健提供者测量所述样品中的IL22和/或LCN2水平和/或递交从所述患者获得一种或多种样品到临床实验室或保健提供者以测量所述样品中的IL22和/或LCN2水平。
E7.根据实施方案E1至E6中任一项所述的方法，其还包括确定在从所述患者获得的一种或多种样品中的所述IL22和/或LCN2水平。
E8.根据实施方案E1至E7中任一项所述的方法，其还包括如果确定或鉴定患者在一种或多种样品中具有与预定的IL22和/或LCN2阈值水平相比或者与在一种或多种对照样品中的IL22和/或LCN2水平相比(i)更高或增加的IL22水平和/或(ii)更高或增加的LCN2水平，则建议保健提供者对所述患者施用IL23拮抗剂，或者如果确定或鉴定患者在一种或多种样品中具有与预定的IL22和/或LCN2阈值水平相比或者与在一种或多种对照样品中的IL22和/或LCN2水平相比(i)更低或减小的IL22水平和/或(ii)更低或减小的LCN2水平，则建议保健提供者暂停或拒绝对所述患者施用IL23拮抗剂。
E9.一种测量IL23拮抗剂在诊断患有IL23介导的疾病的患者中的功效或药效动力学的方法，其包括二(a)测量从所述患者取得的第一样品中的IL22和/或LCN2的水平；(b)施用IL23拮抗剂；(c)测量从所述患者取得的第二样品中的IL22和/或LCN2的水平，其中，与所述第一样品中患者的IL22和/或LCN2水平相比，所述第二样品中的IL22和/或LCN2的水平降低指示所述患者对治疗作出应答。
E10.根据实施方案E9所述的方法，其中在施用所述IL23拮抗剂之后，在第1、2、4、8、12或28周或在居间的时间取得所述第二样品。
E11.根据实施方案E1至E10中任一项所述的方法，其中所述IL23拮抗剂是抗IL23抗体或其抗原结合片段。
E12.根据实施方案E11所述的方法，其中所述抗IL23抗体或其抗原结合片段结合IL23的p19亚基(SEQ ID NO：13)、IL23的p40亚基(SEQ ID NO：14)或两者。
E13.根据实施方案E11或E12中任一项所述的方法，其中所述抗IL23抗体或其抗原结合片段包含优特克单抗、布拉吉单抗、吉塞克单抗、BI-655066、蒂尔他昔单抗、LY-3074828或其抗原结合片段。
E14.根据实施方案11所述的方法，其中所述抗IL23抗体或其抗原结合片段包含(i)包含SEQ ID NO：5或由SEQ ID NO：5组成的可变区(VH)和/或包含SEQ ID NO：6或由SEQID NO：6组成的轻链可变区(VL)，或(ii)包含SEQ ID NO：43或由SEQ ID NO：43组成的可变区(VH)和/或包含SEQ ID NO：44或由SEQ ID NO：44组成的轻链可变区(VL)。
E15.根据实施方案11所述的方法，其中所述抗IL23抗体或其抗原结合片段包含选自SEQ ID NO：31-36或SEQ ID NO：45-50的至少一个、两个、三个、四个、五个或六个互补决定区。
E16.根据实施方案E14或E15中任一项所述的方法，其中所述抗体以固定剂量施用。
E17.根据实施方案E16所述的方法，其中所述固定剂量在10毫克/剂与1000毫克/剂之间。
E18.根据实施方案E16所述的方法，其中所述固定剂量为约210毫克/剂或约700毫克/剂。
E19.根据实施方案E1至E18中任一项所述的方法，其中在施用IL23拮抗剂或抗IL23抗体或抗原结合片段之前、期间、之后或作为替代已经用一种或多种用于治疗所述IL23介导的疾病或病症的额外疗法治疗所述患者。
E20.根据实施方案E1至E19中任一项所述的方法，其中从所述患者取得的所述一种或多种样品和/或所述一种或多种对照样品是选自由以下组成的组的一种或多种：全血、血清、血浆、唾液、痰、支气管肺泡灌洗液、脑脊液、胸膜液、心包液、腹水、滑液、上皮细胞、尿液、粪便、皮肤、组织活检或其组合。
E21.根据实施方案E1至E20中任一项所述的方法，其中所述一种或多种对照样品是(i)从正常健康个体获得的一种或多种样品；(ii)从患有非IL23介导的疾病的患者获得的一种或多种样品；或(iii)其组合。
E22.根据实施方案E1至E21中任一项所述的方法，其中所述患者的IL22和/或LCN2水平在包括实施例3中描述的免疫测定的免疫测定中测量。
E23.根据实施方案E1至E22中任一项所述的方法，其还包括确定选自由以下各物组成的组的一种或多种IL23途径生物标志物的水平：IL17F、IL17A/F、IL23R、IL12B、IL6、IL21、TNF、CCR6、CCL22、IL1R1、IFNλ、S100A12、DEFB-2、DEFB-4、IL1、SERPINB3、PI3/弹力素、LL37、RORγ、RORγT、IL26、S100A7、DEFB103B和GM-CSF。
E24.根据实施方案E1至E23中任一项任一项所述的方法，其中所述IL22和/或LCN2的预定阈值水平选自由以下组成的组：(a)约为IL22和/或LCN2的均值水平；(b)约为IL22和/或LCN2的中值水平；以及(c)约为如表4或5中描述的IL22和/或LCN2的第1、第2、第3、第4、第5、第6、第7、第8或第9十分位数基线水平；且如使用免疫测定在来自多个(i)正常健康患者、(ii)患有非IL23介导的疾病的患者和/或(iii)患有IL23介导的疾病的患者的血清中所测量。
E25.根据实施方案E1至E24中任一项所述的方法，其中所述IL23介导的疾病或病症是肺部疾病、炎性肠病、慢性炎性皮肤病、炎性疾病、自身免疫性疾病、神经退化性疾病、感染或癌症。
E26.根据实施方案E1至E25中任一项的方法，其中所述IL23介导的疾病或病症选自：哮喘、IPF、COPD、克罗恩氏病、溃疡性结肠炎(UC)、乳糜泻、特应性皮炎、过敏性接触性皮炎、湿疹、牛皮癣、斑秃、掌跖脓疱病、牛皮癣关节炎、强直性脊椎炎、关节炎、类风湿性关节炎(RA)、风湿性病症、ANCA血管炎、贝赫特氏病、自身免疫性甲状腺炎、1型糖尿病、多发性硬化症(MS)、修格兰氏综合征(SS)、全身性红斑狼疮(SLE)、阿尔茨海默病、分枝杆菌病、利什曼病、胃癌、结直肠癌、食道癌、白血病、乙型肝炎病毒(HBV)相关的肝细胞癌、乳腺癌、肺癌和鼻咽癌。
E27.根据实施方案E25所述的方法，其中所述炎性肠病是克罗恩氏病、UC或乳糜泻。
E28.根据实施方案E27所述的方法，其中确定所述患者在从所述患者取得的一种或多种样品中CRP水平≥5mg/L，和/或FCP水平≥250μg/g，FCP水平≥200μg/g，FCP水平≥150μg/g，FCP水平≥100μg/g或FCP水平为至少约100μg/g至至少约250μg/g。
E29.根据实施方案E1至E28中任一项所述的方法，其中(a)如使用免疫测定所测量，所述预定的IL22阈值水平为至少约7.9pg/mL至至少约31.4pg/mL，并且/或者(b)如使用免疫测定所测量，所述预定的LCN2阈值水平为至少约143ng/mL至至少约261ng/mL。
E30.根据实施方案E29所述的方法，其中(a)如使用免疫测定所测量，所述预定的IL22阈值水平为至少约15.6pg/mL，并且/或者(b)如使用免疫测定所测量，所述预定的LCN2阈值水平为至少约215ng/mL。
E31.根据实施方案E1至E28中任一项所述的方法，其中(a)如使用IL22免疫测定所测量，血清中所述预定的IL22阈值水平为约7.9pg/mL、约11.3pg/mL、约12.7pg/mL、约15.6pg/mL、约19.6pg/mL、约23.1pg/mL、约31.4pg/mL、或约46.8pg/mL；和/或(b)如使用LCN2免疫测定所测量，血清中所述预定的LCN2阈值水平为约142.8ng/mL、约163.6ng/mL、约184.3ng/mL、约201.3ng/mL、约214.6ng/mL、约233.4ng/mL、约261.1ng/mL、约294.8ng/mL、或约326.6ng/mL。
E32.根据实施方案E27至E31中任一项所述的方法，其中，在首次施用所述抗IL23抗体或其抗原结合片段之后，所述IL23拮抗剂或抗IL23抗体或其抗原结合片段的施用引起克罗恩氏病活动性指数(CDAI)应答评分降低至少100分或总CDAI评分降低至低于150分。
E33.根据实施方案E32所述的方法，其中，在首次施用所述IL23拮抗剂或抗IL23抗体或其抗原结合片段之后，至少100分的所述CDAI应答评分降低或所述总CDAI评分降低至低于150分在1、2、4、8、12、16或24周内或以后发生。
E34.一种治疗患者的白细胞介素-23(IL23)-介导的疾病的方法，其包括，如果确定或鉴定患者在一种或多种从所述患者取得的样品中具有与预定的IL23途径活动性阈值水平相比或与一种或多种对照样品中的IL23途径活动性水平相比活动性增加或更高的IL23途径，则对所述患者施用IL23拮抗剂(包括例如抗IL23抗体)。
E35.根据实施方案E34所述的方法，其还包括确定选自由以下各物组成的组的一种或多种IL23途径生物标志物的水平：IL22、LCN2、CCL20、IL17F、IL17A/F、IL23R、IL12B、IL6、IL21、TNF、CCR6、CCL22、ILlRl、IFNγ、S100A12、DEFB-2、DEFB-4、IL1、SERPINB3、PI3/弹力素、LL37、RORγ、RORγT、IL26、S100A7、DEFB103B和GM-CSF；其中在一种或多种从所述患者取得的样品中与预定的IL23途径生物标志物阈值水平相比或与一种或多种对照样品中的IL23途径生物标志物水平相比增加或更高的一种或多种IL23途径生物标志物水平指示具有增加或更高的活动性的IL23途径。
缩写列表
Figure BDA0001662404150000921
Figure BDA0001662404150000931
序列
Figure BDA0001662404150000932
Figure BDA0001662404150000941
Figure BDA0001662404150000951
Figure BDA0001662404150000961
Figure BDA0001662404150000971
Figure BDA0001662404150000981
Figure BDA0001662404150000991
Figure BDA0001662404150001001
Figure BDA0001662404150001011
Figure BDA0001662404150001021
Figure BDA0001662404150001031
Figure BDA0001662404150001041
***
本文中提及的所有专利和公开均以引用的方式整体明确地并入本文中。
可以通过参考以下非限制性实施例来进一步限定本公开内容的方面，所述非限制性实施例详细描述了本公开内容的某些抗体的制备以及使用本公开内容的抗体的方法。对于本领域技术人员将显而易见的是：可以在不背离本公开内容的范围的情况下实践对材料与方法两者的许多修改。
应当理解，旨在使用详述部分而非发明内容以及摘要部分来对权利要求进行解释。发明内容部分和摘要部分可以阐述发明人所预期的本发明的一个或多个但不是全部示例性方面，并且因此，不旨在以任何方式限制本发明和所附权利要求。
本发明已经在上文中借助于说明特定功能的实施和其关系的功能性结构单元加以描述。为便于描述，本文中已经任意地界定这些功能性结构单元的边界。只要适当地执行特定功能和其关系，就可界定替代边界。
***
实施例
通过参考以下详细描述本发明的示例性方面的实施例，将更全面地理解本发明。
实施例1
2a期临床研究协议
进行2a期研究以评价在抗TNFα疗法失败或不耐受的患有中度至重度CD的受试者中在初始12周治疗期期间在第0周(第1天)和第4周(第29天)施用的多重IV剂量的MEDI2070(700mg)或安慰剂的功效和安全性。以下临床试验协议在人类患者中进行。临床试验的结果提供在实施例2中。
I.临床研究概述
2a期研究评价在抗TNFα疗法失败或不耐受的患有中度至重度CD的受试者中在初始12周治疗期期间在第0周(第1天)和第4周(第29天)施用的多重IV剂量的MEDI2070(700mg)或安慰剂的功效和安全性。包括为期100周的非盲治疗期，以允许评价MEDI2070(以210mg SC Q4W施用)的长期安全性，并提供关于PK和功效数据的信息。
该研究的主要目的是评价MEDI2070与安慰剂相比在患有中度至重度CD的受试者中在第8周诱导临床效果(定义为CDAI从基线降低至少100分)或缓解(定义为CDAI＜150))的功效。
该研究的次要目的是评价：在第8周MEDI2070相对于安慰剂实现CDAI缓解的功效；在第8周MEDI2070相对于安慰剂实现CDAI从基线降低至少100分的效果；在第8周MEDI2070相对于安慰剂实现CDAI从基线降低至少70分的效果；在第12周MEDI2070相对于安慰剂实现CDAI缓解或CDAI从基线降低至少100分的效果；在第8周MEDI2070相对于安慰剂实现CDAI从基线变化的效果；MEDI2070的安全性和耐受性；以及MEDI2070的PK和免疫原性(IM)。
该研究的探索性目的包括评价：MEDI2070对其他临床效果的量度的影响，所述临床效果的量度包括但不限于CDAI应答、其他时间点下CDAI从基线的变化和持续CDAI应答；治疗对血液和大便中炎性标志物的影响；血液或粪便生物标志物相对于受试者对MEDI2070的应答的预测价值；以及MEDI2070对患者报告的结果(PRO)的影响。
II.研究设计综述
这是两部分的2a期研究，其包括12周双盲安慰剂对照的治疗期，然后是100周的非盲治疗期，以评价如由研究者确定的抗TNFα疗法失败或不耐受的患有中度至重度活动CD的受试者中MEDI2070的短期功效以及短期和长期安全性。基于先前已经失败的抗TNFα剂的数量对受试者进行分层(1对＞1)。全世界各中心的受试者以1∶1的比率随机分配，以在12周双盲安慰剂对照的治疗期在第0周(第1天)和第4周(第29天)开始接受固定IV剂量的MEDI2070(700mg)或安慰剂。在完成双盲安慰剂对照的治疗期(第12周)后，受试者选择进入100周的非盲治疗期，其中他们接受非盲MEDI2070(210mg SC)Q4W(第12周至第112周)，如图1所述。
MEDI2070或安慰剂在第0周(第1天)和第4周(第29天)经由输注泵经至少60分钟的时间静脉输注。完成12周双盲安慰剂对照的治疗期并进入100周非盲治疗期的受试者接受MEDI2070，其以固定剂量的210mg SC注射Q4W进行26次剂量(至第112周)。所述研究的主要分析是在研究的最后一个受试者完成12周双盲安慰剂对照的治疗期或者在完成12周双盲安慰剂对照的治疗组之前从研究中退出之后进行。
本研究中MEDI2070的剂量在12周双盲安慰剂对照的治疗期(第0周和第4周)为700mg IV Q4W且在100周非盲治疗期(第12周至第112周)为210mg SC Q4W。
MEDI2070的药代动力学/PD模型预测，在整个研究期间，对于700mg IV和210mg SC给药方案，血浆IL23的均值抑制大于99％。另外，预计在这些给药方案中MEDI2070的(效价校正的)血清浓度高于显示在CD中有效的抗IL12/23p40抗体优特克单抗的血清浓度(Sandborn等，Gastroenterol.135：1130-41(2008))。预计静脉内施用700mg快速实现稳态目标抑制。
先前的临床数据(Sandborn等，Gastroenterol.135：1130-41(2008))指出，在静脉内施用优特克单抗之后应答参数从安慰剂的变化在优特克单抗施用开始之后在6至8周之间最大化；因此，建议的12周安慰剂对照双盲期足以表征MEDI2070在这一患者群体中的效果。法规指导方针推荐评估在4至8周(或给药2个周期后)诱导效果的一次端点，因此在第8周评估一次端点是适当的。此外，评估第12周以观察MEDI2070的潜在延长的效果时程。
所有受试者都在12周双盲安慰剂对照的治疗期期间通过IV输注最少60分钟接受研究产品(700mg MEDI2070或安慰剂)。MEDI2070(700mg)或安慰剂使用输注泵经至少60分钟递送体积为100mL的5.0％w/v右旋糖。在每次IV输注之前和之后，IV通路用5％w/v右旋糖冲洗。
在100周非盲治疗期期间，通过皮下(SC)注射施用MEDI2070。每一SC剂量由经验丰富且合格的工作人员施用到受试者的前腹壁。每次SC注射的体积不超过1.0mL(即，对于210mg SC剂量，注射3×1.0mL)。当MEDI2070剂量体积超过1.0mL时，将剂量在3个注射器中等分，并且在受试者的前腹壁上的交替(左或右)部位以多次SC注射施用，其中每次注射之间不超过约30秒的时间并且距离间隔至少2cm。
III.疾病评价和方法
CDAI：CDAI是已经研发的几种多项目仪器中最早且最广泛使用的，并且经过验证用于临床研究以测量CD中的疾病活动性(Best等，Gastroenterology 70：439-44(1976)；Sands等，N Engl J Med.350(9)：876-85(2004)。CDAI使用前一周监测的症状评分测量活动性疾病的严重程度，并且包括患者报告的症状、医生评估的体征和实验室标志物。CDAI评分通过对1周内由日记记录的主观项目(液体或非常软的粪便的次数、腹痛和一般健康状况)和客观项目(相关症状、服用止泻剂如洛哌丁胺(loperamide)/***、腹部肿块、血细胞比容、每日早晨体温和体重)的加权分数加和来计算。CDAI评分在0至600范围内，分数越高指示疾病活动性越大。评分＜150、150至219以及220至450的受试者分别代表缓解、轻度疾病和中度至重度疾病；而评分＞450分的受试者具有非常严重的疾病(Buxton等，ValueHealth.10：214-20(2007))。CDAI在现场计算，以确定研究的合格性。对于统计分析，还计算了所有访视的CDAI。
患者报告的结果：所述研究使用IBDQ评估患者报告的结果(PRO)。IBDQ由受试者使用在安排在第0周、第4周、第8周和第12周的研究访视时的纸质问卷完成，并且在任何其他评估之前施用。
炎症性肠病问卷(IBDQ)：IBDQ是经过验证的疾病特异性PRO仪器，其用于测量IBD患者的健康相关的生活质量(Guyatt等，Gastroenterology.96：804-10(1989))。IBDQ涵盖以下量纲：肠道症状(10项)、全身症状(5项)、情绪功能(12项)和社会功能(5项)。用7分李克特量表(7-point Likert scale)对项目进行评分，产生在32至224范围内的总分(分数越高指示生活质量越好)。IBDQ经常用于药物批准申请中以评估在IBD中的治疗功效。IBDQ被设计成自行管理的，并在5分钟内完成。
IV.端点
研究的一次端点是第8周的CDAI应答，由CDAI评分＜150或CDAI从基线降低至少100分定义。基线定义为在首次施用研究产品之前的最新无缺失观察结果。
缺失数据由无应答者推定方法来推定；即缺失一次端点的信息的任何受试者都被假设为无应答者。此外，从初级分析的角度来看，在类固醇使用方面具有临床上有意义的增加的受试者被假设为无应答者。
对于一次端点，在治疗组之间的比较基于mITT群体，并且使用逻辑回归模型执行，其中治疗和分层因子作为协变量。该研究的分层因子由受试者已经接受的先前抗TNFα剂的数量定义(1对＞1)。使用双侧测试在α＝10％下测试治疗效果的意义。
执行以下敏感性分析：(1)敏感性分析通过调整基线CDAI评分和/或其他基线协变量通过扩展上面对于mITT群体中受试者计划的模型执行。(2)对观察到的应答实施混合效果纵向逻辑回归模型。该逻辑随机效果模型包括随机截距来解释受试者之间的变化。固定的分类效果包括分层因子、治疗、访视和访视治疗互动以及基线评分的连续固定协变量。(3)敏感性分析通过调整基线CDAI评分和/或其他基线协变量通过扩展上面对于PP群体中受试者计划的模型执行。
二次端点包括：
1)正如CDAI评分小于150所定义，在第8周CDAI缓解；
2)在第8周CDAI从基线降低至少100分；
3)在第8周CDAI从基线降低至少70分；
4)在第12周CDAI应答(由CDAI＜150定义的缓解或从基线起CDAI从基线降低至少100分)。二次端点1、2、3和4以与一次端点类似的方式分析。此外，敏感性分析对于具有增加的类固醇(定义为5毫克/天***龙或相当量，或者3毫克/天布***)的受试者在第8周访视至第12周时或之前发扬最后应答来执行。
5)在第8周CDAI从基线的变化。通过使用调整先前抗TNFα使用的逆概率加权广义估计方程方法来分析二次端点5。并且，在使用调整先前抗TNFα使用的LOCF方法直至双盲安慰剂对照的治疗期结束对缺失数据进行推定之后，使用ANCOVA模型执行敏感性分析。
6)为了评价MEDI2070的安全性和耐受性，安全性和耐受性端点包括包括SAE的AE、实验室值和生命体征的显著变化。12周双盲安慰剂对照的治疗期的所有安全性相关的端点均基于使用实际接受的治疗的安全群体报告。施用至少一剂MEDI2070的随机分配至安慰剂的受试者包括在活动组；并且不施用任何活性剂量的随机分配到MEDI2070组的受试者包括在安慰剂组。管理控制活动医学字典(MedDRA)用于编码所有AE。治疗突发AE定义为在施用第一剂量的研究产品时或在施用第一剂量的研究产品之后直至且包括最后一次剂量后36周发生的任何AE。
7)为了评价多剂量MEDI2070的PK和免疫原性(IM)，通过访视提供血清MEDI2070浓度数据的描述性统计。产生MEDI2070的个体和均值血清浓度-时间曲线。对于PK数据分析，时间零点被定义为输注的开始。还评估了在血清中对抗MEDI2070的抗药物抗体(ADA)的存在。
实施例2
2a期临床研究结果
I.研究设计和患者
实施例1中描述的2a期研究(clinicaltrials.gov标识符：NCT01714726)包括12周双盲安慰剂对照的治疗期，然后是100周非盲治疗期，以评价先前抗TNF-α疗法失败的患有活动中度至重度克罗恩氏病的受试者中MEDI2070的短期功效以及短期和长期安全性。所述研究在全球60个中心进行，包括诊断为患有回肠、回肠结肠或结肠克罗恩氏病至少6个月的18岁至65岁的成人。
患者必须患有中度至重度活动性克罗恩氏病(定义为克罗恩氏病活动性指数[CDAI]评分为220至450)，并且具有活动性炎症的迹象(在筛选之前在12周内，基线C-反应蛋白[CRP]≥5mg/L，粪便钙卫蛋白[FCP]≥250μg/g或内镜下炎症迹象[至少3处非吻合性溃疡的摄影记录，每处直径大于0.5cm，或10处口疮性溃疡包括至少10cm的连续肠]。患者必须已经接受以批准用于克罗恩氏病的剂量的至少一种抗TNF-α疗法，其具有一次无应答(活动性疾病的体征和症状，尽管有至少一种诱导方案，包括间隔至少两周的至少两剂量的抗TNF-α疗法)，或二次无应答(在初始临床益处后维持抗TNF-α疗法期间持续活动性疾病的症状复发)，或耐受不良(包括但不限于输注相关的反应、脱髓鞘、充血性心力衰竭或感染)。排除标准包括具有异源骨髓移植或基于细胞的移植；短肠综合征；3个月研究内阻塞性狭窄；12周研究内的肠道手术；回肠造口术或结肠造口术；临床上显著的伴随疾病；或先前用靶向IL12或IL23的生物剂治疗。
需要冲洗去其他先前的疗法，包括研究前8周的英夫利昔单抗；10周的阿达木单抗或塞妥珠单抗；12周的那他珠单抗；4周的环孢霉素、吗替麦考酚酯、西罗莫司、沙利度胺或他克莫司；2周静脉内或肌内施用皮质类固醇；或2周局部施用美沙拉嗪或直肠皮质类固醇。如果剂量在随机化之前稳定至少2周并且保持稳定至第8周，则容许同时使用5-氨基水杨酸盐和糖皮质激素。类似地，如果剂量从随机化之前8周保持稳定，直至第8周，则容许同时使用免疫调节剂，例如硫唑嘌呤。允许使用用于克罗恩氏病的口服抗生素、益生菌和止泻药。
所有患者均提供书面知情同意书。所述研究根据赫尔辛基宣言(Declaration ofHelsinki)和良好临床实践指南进行，并且每个地点的当地机构审查委员会批准所述协议。
II.治疗
对于双盲期，使用交互式语音或基于网络的应答***以使治疗组随机化，为每位患者分配独特的随机化代码。基于先前失败的抗TNF-α剂的数量对随机化进行分层(1对＞1)。使用具有基于置换块算法的隐蔽分配的盲法随机化，患者在每个分层内以1∶1随机化以在第0周(第1天)和第4周(第29天)静脉内接受MEDI2070700mg或安慰剂60分钟。在进行一次分析时，患者、研究者和赞助者对于治疗盲化，直到最后一位患者到达第12周。在非盲期(第12周至第112周)期间，所有患者都每4周接受一次皮下注射MEDI2070210mg(在100周内共26次剂量)。
III.研究评估
一次结果量度是实现临床效果的患者的比例，定义为在第8周时CDAI评分从基线降低至少100分或CDAI评分小于150。二次量度包括实现以下的患者的比例：第8周CDAI缓解(定义为CDAI评分＜150)，第8周CDAI评分从基线降低至少100分(CR100)，第8周CDAI评分从基线降低至少70分(CR70)，第12周临床效果，第12周CDAI缓解，以及MEDI2070的安全性和耐受性，包括不良事件、严重不良事件以及实验室值和生命体征的显著变化。在基线、第8周、第24周和研究结束时评价血清MEDI2070浓度和ADA的存在。
探索性结果量度包括血液和粪便中的炎症标志物(CRP和FCP)、其他生物标志物的应答以及其对临床效果的预测价值、第8周和第24周之间的持续临床效果、以及在第8周和第24周评估的持续CDAI缓解。生物标志物评估包括与安慰剂相比在用MEDI2070治疗之后在第8周和第12周IL22血清水平自基线的变化(表示为在克罗恩氏病患者中的高水平以及疾病活动性的标志物[Schmechel等，Inflamm Bowel Dis，14：204-212(2008)])；与安慰剂相比在用MEDI2070治疗之后在第8周和第12周IL22水平自基线的变化与临床效果和CDAI缓解的关联；以及与安慰剂相比在用MEDI2070治疗之后在第8周和第12周评估作为临床效果的预测因子的在基线下的较高IL22血清水平以及CDAI缓解。
IV.统计分析
假设安慰剂组的CDAI临床效果率为20％，每个治疗组需要约54名患者以提供87％的功率来使用两侧检验在α＝0.1的显著水平下检测在MEDI2070 700mg和安慰剂之间在第8周的CDAI临床效果率的25％差异。假设每次治疗组调整后退出率为约10％，则使约60名患者随机化。
调整意向治疗群体包括在双盲期期间接受至少一次研究治疗剂量的所有随机化患者。安全群体包括在双盲期期间接受任何研究治疗的患者。按照协议的群体包括接受所有治疗剂量且没有主要协议偏差的患者。非盲群体包括在非盲期间接受至少1次剂量的MEDI2070的所有患者。
对于具有二元结果的一次量度和二次量度，在治疗组之间的比较基于调整意向治疗群体使用逻辑回归模型[Ge等，Drug Inf J，45：481-493(2011)]进行，其中治疗和分层因子(先前的抗TNF-α剂的数值1对＞1)作为协变量。使用双侧测试在α＝10％下测试治疗效果的显著性。通过扩展计划的逻辑回归模型以调整基线CDAI评分和/或其他基线协变量来进行敏感性分析。二分法端点的缺失数据使用无应答者推定来推定。在第8周之前推定为无应答者的患者被认为是所有后续访视的无应答者。此外，在类固醇使用方面具有临床上有意义的增加的患者被假定为无应答者。类固醇剂量方面临床上有意义的增加定义为对于至少3天***或等同物增加至少5毫克/天，或者对于至少3天布***增加至少3毫克/天。使用调整先前抗TNFα剂使用的逆概率加权广义估计方程方法来分析连续量度的缺失数据。
汇总药代动力学数据。在非盲期对患者执行探索性分析。将来自这些患者的双盲和非盲期至第24周的功效数据组合并在双盲期由治疗组报告。对于非盲群体，使用对于先前抗TNF-α使用和基线进行调整的混合效果重复的测量模型来分析CRP和FCP自基线的变化。执行第24周时MEDI2070 210 mg和第12周时MEDI2070 700mg或安慰剂之间的比较。
V.患者结果
总共使121名患者随机化；其中119名接受双盲治疗(图1)。在双盲期，MEDI2070组和安慰剂组分别在59名患者中有52名(86.7％)和在60名患者中有52名(85.2％)完成第12周治疗。基线患者特征通常在治疗组之间平衡(表1)，除了在MEDI2070组中CDAI水平和CRP水平在数值上更高。这里报告了来自第8周、第12周和第24周的结果；所述研究正在进行长期随访。
表1.基线特征和人口统计学(调整意向治疗群体)。
Figure BDA0001662404150001141
Figure BDA0001662404150001151
*三名患者具有缺失的粪便钙卫蛋白评估。
VI.功效
(i)第8周
对于一次结果量度，MEDI2070组与安慰剂组相比，第8周的临床效果率显著更高(分别地，49.2％对比26.7％；P＝0.01；估分：0.225[90％置信区间(CI)：0.083至0.368]；图2A)。在MEDI2070的情况下，CDAI缓解率为27.1％，且在安慰剂的情况下，CDAI缓解率为15.0％(P＝0.10；估分：0.122[90％CI：0.000至0.243])。在MEDI2070组和安慰剂组中CR70率分别为52.5％和46.7％(P＝0.52)，且在MEDI2070组和安慰剂组CR100率分别为45.8％和25.0％(P＝0.02)。
显著较大比例的接受MEDI2070的患者实现CDAI效果和FCP或CRP相对于基线降低50％(P＜0.001)以及CDAI缓解和FCP或CRP相对于基线降低50％(P＝0.02；图2B)的复合端点。MEDI2070治疗也引起与安慰剂相比FCP显著更大程度地降低(最小二乘均值变化-153.5对比-49.7；最小二乘均值差-105.6[90％CI：-184.0至-27.2]；P＝0.027)和CRP水平显著降低(最小二乘均值变化：-12.6对比安慰剂情况下的5.1；最小二乘均值差-17.6[90％CI：-28.3至-6.9]；P＝0.007)。
(ii)第12周
在第12周，MEDI2070的临床效果率更高(37.3％对比28.3％；P＝0.29)，CDAI缓解率也是如此(20.3％对比13.3％；P＝0.31)；然而，差异没有统计学意义。在用MEDI2070的情况下在第12周CR100的比率为37.3％，并且在用安慰剂的情况下，在第12周CR100的比率为28.3％(P＝0.288)。在第12周时，在用MEDI2070的情况下，维持FCP和CRP的显著降低(FCP：最小二乘均值变化-179.6对比-55.1；最小二乘均值差-124.6[90％CI：-221.2至-27.9]；P＝0.034；CRP：最小二乘均值变化：-13.4对比在安慰剂情况下的-2.6；最小二乘均值差-10.8[90％CI：-17.6至-4.1]；P＝0.008)。
(iii)第24周
MEDI2070组在24周时维持临床效果和CDAI缓解率。在第24周，实现临床效果和CDAI缓解的接受安慰剂，然后接受非盲MEDI2070的患者(安慰剂/MEDI2070组)的比例与接受MEDI2070 700mg，然后接受非盲MEDI2070的患者(MEDI2070/MEDI2070)类似(图3A和图3B)。在24周的时间内，MEDI2070/MEDI2070组继续达到CDAI效果加FCP或CRP相对于基线降低50％以及CDAI缓解加FCP或CRP相对于基线降低50％的复合端点(表2)。安慰剂/MEDI2070组中在第24周达到两个复合端点的患者的比例与MEDI2070/MEDI2070组中的相应比例类似。在MEDI2070/MEDI2070组中，FCP和CRP水平从基线的变化在第12周和第24周之间维持；在安慰剂/MEDI2070组中，在第12周和第24周之间观察到FCP和CRP水平的减小。
表2.复合端点(第8周至第24周)、持续效果和缓解(非盲群体)以及粪便钙卫蛋白和C-反应蛋白从基线的变化(混合效果模型；非盲群体)。
Figure BDA0001662404150001171
Figure BDA0001662404150001181
*持续效应定义为在第8周和第24周均达到效果标准。百分比使用非盲群体中的患者数量计算。
Figure BDA0001662404150001182
持续缓解定义为在第8周和第24周均达到缓解标准。百分比使用非盲群体中的患者数量计算。
Figure BDA0001662404150001183
均值和P值自具有治疗组的固定项目、访视、访视互动治疗、先前抗肿瘤坏死因子-α使用的分层因子和基线粪便钙卫蛋白或C-反应蛋白，以及作为随机效果的治疗内患者的混合效果模型获得，其中假设非结构协方差结构。
VII.MEDI2070暴露-应答关系
在静脉注射700-mg剂量的MEDI2070时，没有确立暴露和功效之间的明确关系(数据未示出)。在第4周时的血清MEDI2070浓度处于谷且第8周和第12周时的血清MEDI2070浓度在10倍范围内变化，并且在第8周与CDAI应答无关或无应答(数据未示出)。这些发现与在剂量-应答曲线平台处的剂量一致。
VIII.生物标志物
与在安慰剂/MEDI2070组中相对比，MEDI2070组患者的血清IL22水平降低更多(图7)。基线血清IL22水平大于或等于15.6pg/mL的中值与MEDI2070组中临床效果的可能性增加相关。基线IL22水平低于15.6pg/mL的MEDI2070组患者具有与安慰剂组类似的CR100应答率(图4)。临床应答并不随安慰剂组中的IL22强烈变化。
IX.安全性
(i)第12周
在双盲期结束时，具有治疗突发不良事件的患者的比例在MEDI2070组和安慰剂组之间类似(分别为67.8％和68.3％)，具有3级或更高级别的不良事件的患者的比例(分别为10.2％和11.7％)和具有严重不良事件的患者的比例(分别为8.5％和8.3％)正是如此。在13.6％的接受MEDI2070的患者和21.7％的接受安慰剂的患者中观察到治疗相关的不良事件，在任一组中至少5％的患者中观察到的结果显示在表3中。MEDI2070组中有5名患者且安慰剂组有5名患者出现严重不良事件；在MEDI2070组中，此类事件包括克罗恩氏病(2名患者中3例事件)、结肠镜检查相关的结肠穿孔(n＝1)、发热(n＝1)和蜂窝织炎(n＝1)，且在安慰剂组中，此类事件包括贫血(n＝1)、克罗恩氏病(2名患者中2例事件)、腹泻(n＝1)、胃肠道出血(n＝1)和腹部脓肿(n＝1)。
表3.治疗组中至少5％的患者有治疗突发不良事件(直至第12周；安全群体)
Figure BDA0001662404150001191
MEDI2070组中4名患者发生4例且安慰剂中7名患者发生11例严重或严重程度至少3级或需要口服或肠胃外抗菌疗法的感染。归因于治疗突发不良事件的治疗中断在8.5％的MEDI2070患者(包括胃肠道病症[6.8％]和感染[1.7％])和10.0％的安慰剂患者(包括胃肠道病症[6.7％]、感染[1.7％])和眼科病症[1.7％])发生。
(ii)第24周
在第24周，在MEDI2070组中67.3％的患者和安慰剂/MEDI2070组中65.4％的患者中观察到治疗突发不良事件，其中分别在25.0％和21.2％的患者中观察到治疗相关不良事件。在MEDI2070组中13.5％的患者以及在安慰剂/MEDI2070组中3.8％的患者出现严重程度至少3级的治疗突发不良事件；分别在15.4％和7.7％的患者中观察到严重不良事件。归因于治疗突发不良事件的治疗中断在9.6％的MEDI2070患者(包括克罗恩氏病加剧[3.8％]、肛瘘[1.9％]、贫血和淋巴细胞减少[1.9％]以及***脓肿[1.9％])和3.8％的安慰剂/MEDI2070患者(包括盆腔脓肿[1.9％]和肾结石[1.9％])中发生。严重、严重程度至少3级或需要口服或肠胃外抗菌疗法的感染事件的次数在MEDI2070组和安慰剂/MEDI2070组(13例事件)中相同。
X.免疫原性
在119名患者中的两名中检测到抗药物抗体。一名接受MEDI2070的患者在基线时具有抗药物抗体，但在后续评估中没有。另一名在双盲期接受安慰剂的患者在第24周时具有抗药物抗体。
XI.讨论
在对先前抗TNF-α治疗失败的患有中度至重度克罗恩氏病的患者中，与安慰剂相比，在第8周，MEDI2070产生显著更高的临床效果率，CDAI降低100分和CDAI缓解的复合(分别地，49.2％对比26.7％，P＝0.01)，这符合一次研究端点。临床功效与用MEDI2070观察到的生物效果一致。相对于安慰剂而言，MEDI2070组中的患者的FCP和CRP从基线更大程度地减小。MEDI2070对FCP和CRP的有益效果是显著的，因为该患者群体先前曾用抗TNF-α疗法严重治疗；超过65％的患者接受了两种或两种以上的抗TNF-α剂。
在第12周，在MEDI2070组中临床效果率更高，CDAI缓解率也更高；然而，这些差异并不显著。在第12周维持用MEDI2070实现的FCP和CRP显著降低。在第24周，在MEDI2070组中在第12周和第24周之间维持临床效果、CDAI缓解以及FCP和CRP水平从基线的变化。在安慰剂/MEDI2070组的患者之中，第24周实现临床效果和CDAI缓解的比例与在两期都接受MEDI2070的患者类似，并且在第12周和第24周之间观察到FCP和CRP水平的显著减小。在MEDI2070静脉内剂量为700-mg时，没有确立在暴露和功效之间的确定关系。这一发现与在剂量-应答曲线的平台处的剂量一致。未来的研究将探索更广泛的剂量范围。
与安慰剂类似，在第12周，MEDI2070对治疗突发不良事件、3级或更高级别不良事件、严重不良事件的比率，以及由于治疗突发不良事件而引起的中断方面耐受性良好。在第12周，MEDI2070组中严重或重度感染率低于10％。在第24周，治疗突发不良事件的总比率在MEDI2070组和安慰剂/MEDI2070组之间类似；MEDI2070组与安慰剂/MEDI2070组相对比，3级或更高级别不良事件和严重不良事件的比率在数值上更大(分别为13.5％对比3.8％，和15.4％对比7.7％)，归因于治疗紧急不良事件的中断的比率也是如此(分别为9.6％和3.8％)。在第24周在两个治疗组中严重或重度感染的比率相同(13例事件)。一名患者在基线处具有抗药物抗体；据推测，这是一个假阳性结果，且在随访评估中未检测到。
虽然具体的纳入标准、一次端点和评估时机有所不同，但我们研究的结果表明MEDI2070实现的短期CDAI缓解率(8周时，27.1％)通常与在对先前抗TNF-α治疗失败的患有克罗恩氏病的患者中评价的其他生物疗法相媲美。这些包括优特克单抗(8周时，26％[7/27])(Sandborn等，Gastroenterology 135：1130-41(2008))、维多珠单抗(6周时，10.5％[n＝105])(Sandborn等，N Engl J Med 369：711-21(2013))和阿达木单抗(4周时，21％[34/159对英夫利昔单抗二次无应答])(Sandborn等，Ann Intern Med 146：829-38(2007))。MEDI2070的安全性概况也与克罗恩病患者可用的其他生物制剂相媲美。评估双重IL23/IL12抑制剂优特克单抗和布拉吉单抗的研究的最近元分析发现，在治疗12至20周的牛皮癣患者中主要不良心血管事件的风险增加[Tzellos等，J Eur Acad Dermatol Venereol，27：1586-1587(2013)]。在我们的研究中，直至24周访视也没有患者发生主要不良心血管事件。MEDI2070对IL23具有特异性，并且不抑制IL12；这种特异性的临床意义尚不清楚。然而，这项研究的后续行动(104周)正在进行中，以确定长期功效和安全性。
我们评价了基线处和MEDI2070治疗后的血清IL22水平。在克罗恩氏病中以高水平表达的IL22是支持粘膜屏障完整性的效应细胞因子并且是IL23轴活动性的指标[Schmechel等，Inflamm Bowel Dis，14：204-212(2008)]。与安慰剂组相比较，MEDI2070组的血清IL22水平降低。另外，在MEDI2070组中大于或等于15.6pg/mL的基线血清IL22水平与临床效果的可能性增加相关，而基线IL22水平小于15.6pg/mL的MEDI2070治疗的患者具有与安慰剂组中类似的CR100应答。图4。相反，在Dige等的研究中，在用阿达木单抗有效治疗的克罗恩氏病患者中IL22水平没有降低[Dige等，J Crohns Colitis，7：248-255(2013)]。该研究首次针对于纳入新型生物标志物，以进一步理解发病机制并改善克罗恩氏病的治疗。
总之，MEDI2070治疗表现出始终如一的稳固功效，对先前抗TNF-α疗法失败的克罗恩氏病患者具有可接受的安全性。
实施例3
用于检测和定量IL23途径生物标志物IL22和LCN2的免疫测定
可以根据本实施例(实施例3)中公开的示例性方法检测和定量IL22和/或LCN2。例如，应用这些方法以获得实施例4中呈现的实验数据(参见下文)。这些方法也用于测试用于实施例1和2中呈现的2a期研究的样品。
3.1 IL22 ELISA免疫测定
IL22水平使用基于定量ELISA的免疫测定来测量。将对人类IL-22具有特异性的小鼠单克隆抗体预先涂布到微板(R&D Systems，目录号D2200)上。首先将100微升的测定稀释液添加到微板的孔中，然后添加100μL的标准品、对照物和样品。将板在室温下孵育2小时±15分钟以允许IL22与板上的捕获抗体结合。然后用1X洗涤缓冲液(1X PBS pH7.4/0.05％Tween-20)洗涤板5次以除去未结合的物质，并进一步在室温下用200μL的检测抗体(抗IL22抗体-HRP缀合物(R&D Systems，目录号D2200)孵育2小时±15分钟。之后，再次洗涤板并在室温下在黑暗中将其用150μL TMB生色的HRP底物(Neogen，目录号331176))孵育20分钟±3分钟。通过添加100μL终止液(1M HCL)终止酶反应。
在终止反应后的30分钟内，在SpectraMaxPlus 384微板分光光度计(MolecularDevices)上读取板以测量450nm下的光密度。产生的颜色的强度与结合的IL22的量成正比。样品和对照物中的IL22浓度从重组大肠杆菌衍生的IL22的标准曲线插值，这在每个板上运行。二次模型用于曲线拟合。所述测定是可重复的且精确的。确立可定量的范围是在100％血清中10pg/mL至800pg/mL的IL-22。
3.2 LCN2 ELISA免疫测定
在2℃至8℃下将标准Meso Scale Discovery板(MSD，目录号L15XA)用1μg/mL的大鼠抗人类脂质运载蛋白-2抗体(R&D Systems，目录号MAB17571)以50μL/孔涂布。将板用200μL ELISA洗涤缓冲液(0.05％Tween-20/PBS)洗涤三次并在平板振荡器上在轻轻振荡下用150μL/孔的I-阻断缓冲液(IBB)(0.5％Tween-20/0.2％I-阻断缓冲液/PBS)阻断至少60分钟。在IBB中制备的参比标准品、质量控制品和阴性对照物以及在IBB中以1∶50稀释到最小稀释度的血清测试样品以30μL/孔添加到板中。
将测试板在板振荡器上在轻轻振荡下在室温下孵育2小时。通过洗涤板除去未结合的分析物。为了检测结合的分析物，以30μL/孔添加0.5μg/mL的生物素缀合的山羊抗人脂质运载蛋白-2抗体(R&D Systems，目录号BAF1757)，并将板在板振荡器上在轻轻振荡下再孵育60分钟。通过洗涤板除去未结合的检测抗体。链霉亲和素SULFO-TAGTM检测染料(MSD，目录号R32AD-1)以0.5μg/孔添加到板中，并将板再孵育30分钟以将其覆盖，从而防止光暴露。洗涤板并以150μL/孔添加1X读取缓冲液(MSD，目录号R92TC-2)，并在20分钟内在MSD扇形成像仪上读取板。
使用MSD扇形成像仪收集每个板的ECL(电化学发光)值。使用5参数逻辑曲线拟合模型，用Softmax Pro GxP v6.4软件(Molecular Devices，Sunnyvale，CA)绘制参考标准的ECL值。未知样品的浓度从相同测定板上的标准曲线插值。然后将Softmax导出的数据导入Microsoft Excel软件以生成数据报告和图表。在调整至100％血清的情况下，测定的动态范围确立为0.70ng/ml至1000.00ng/mL。
实施例4
鉴定IL23途径生物标志物(IL22和/或LCN2)为用抗IL23抗体治疗IL23介导的疾病的预测性生物标志物
IL23主要由活化的树突细胞和巨噬细胞表达(参见Gaffen等(2014)Nature RevsImmunol 14：585-600；Oppmann等，(2000)Immunity 13：715-251)并且直接作用于包括Th17、Th22、γδT细胞和先天淋巴细胞(ILC)的各种造血细胞类型以诱导包括IL22、IL21、IL17A、IL17F、IL17A/F、TNFα和GM-CSF的细胞因子(参见，例如Gaffen等(2014)Nature RevsImmunol 14：585-600；Zheng等(2007)Nature 445：648-51；El-Behi等(2011)Naturehmmunol 12：568-575)。这些效应子和调节性细胞因子反过来可以作用于表达适当的同源受体的多种其他细胞类型。IL23诱导的IL22例如可以刺激表达IL22受体的上皮细胞和角质形成细胞以分泌抗微生物蛋白如LCN2(Sonnenberg等(2010)Adv Immunol 107：1-29；Stallhofer等，(2015)Inflamm Bowel Dis 2015年8月7日；Behnsen等，(2014)Immunity40：262-73)。
在实施例1和2中描述的2a期研究中，在MEDI2070组中具有分别大于或等于15.6pg/mL或215ng/mL的升高的基线血清IL22或LCN2水平的CD患者(如使用实施例3中描述的免疫测定所测量)具有增加的临床效果可能性，而具有分别小于15.6pg/mL或215ng/mL的基线IL22水平的MEDI2070治疗的患者具有与安慰剂组类似的CR100应答。图4和图5。特别地讲，与安慰剂相比，在用MEDI2070治疗时，在第8周观察到基线血清IL22水平≥15.6pg/mL的患者或基线血清LCN2水平≥215ng/mL的患者具有统计学显著增加的CDAI-100应答。图4和图5。
为了进一步理解在基线血清IL22和/或LCN2水平与对MEDI2070治疗的应答之间的关系，将整个研究群体中IL22或LCN2的基线值的组分成10种水平或十分位数，使得11个分析物截止值中的每一个都将研究群体逐渐分成几组，每组占总研究群体的10％以下。图6A-C中提供了MEDI2070和安慰剂暴露的受试者之间随每个十分位数截止值处的基线IL22和LCN2血清水平而变的差异临床应答率，并且个别的IL22和LCN2血清十分位数值汇总在下表4(IL22)和表5(LCN2)中。例如，如表4中所报道，在第4十分位数处，总研究群体中的40％的基线IL-22水平＜12.7pg/mL，并且总研究群体中的60％的基线IL-22水平≥12.7pg/mL。在暴露于MEDI2070并且基线IL-22水平≥12.7pg/mL(即，高于第4十分位数)的受试者中，第8周的CDAI应答率(如通过实现CDAI评分＜150或CDAI评分降低＞100的受试者的百分比(％)所测量)为58.3％。在第8周时发现21名暴露于MEDI2070且基线IL22水平高于研究群体的第4十分位数(12.7pg/ml)的受试者是CDAI应答者。称为“分位数”的R中的功能用以确定十分位数值。表4和表5中还指出，MEDI2070和安慰剂暴露组中的CDAI应答者和无应答者的数目以及在基线IL22或LCN2值大于或等于每个十分位数截止值的受试者中在研究的第8周时的CDAI应答率，且图6A提供了每个十分位数截止值的治疗应答率和安慰剂应答率之间的差异。还执行了临床应答的两种额外测量：在第8周时用MEDI2070治疗的受试者与用安慰剂治疗的受试者在实现CDAI评分的100分改善方面的百分比(％)之间的差异(图6B)；以及在第8周时用MEDI2070治疗的受试者与用安慰剂治疗的受试者在实现实现CDAI应答(CDAI评分＜150或CDAI评分降低＞100)+还实现与基线FCP或CRP相比较FCP或CRP降低＞50％方面的百分比(％)之间的差异(图6C)，它们随表4或表5中所述的基线IL22和LCN2水平/十分位数而变。
如图6A-C所示并在下表4中报道，在第8周与安慰剂相比，用MEDI2070治疗的具有越来越高的基线IL22水平的CD患者实现更高的CDAI应答率(如使用图6A-C中所示的三种不同的临床应答测量中的任一种所测量)，表明MEDI2070在具有高基线IL22血清水平的患者中诱导更好的临床应答。值得注意的是，与IL22低的受试者(包括例如具有在第1或第2十分位数(0.1或0.2分位数)处的IL22水平的受试者)相比较，具有高水平IL22的受试者(包括例如具有在第5、第6或第7十分位数(0.5、0.6或0.7分位数)处的IL22水平的受试者)具有自安慰剂起更大的临床应答率差(不管使用三种不同临床应答测量中的哪一种)。参见图6A-C。与用MEDI2070治疗的所有来者相比较，这些IL22高的受试者还具有增加的CDAI应答率(参见，例如图8)。
重要的是，在2a期研究中用MEDI2070治疗的IL22高的受试者中观察到的CDAI应答率和CDAI缓解率是迄今为止报道的用于CD的生物制剂疗法的最高临床应答率。例如，如图8所示，在用MEDI2070治疗8周的具有升高的基线血清IL22的患者中实现的CDAI-100应答率差(定义为在治疗与安慰剂之间实现CDAI-100应答的受试者的百分比(％)的差异)和/或CDAI缓解率差(定义为在治疗和安慰剂之间实现总CDAI评分降低至低于150份的受试者的百分比(％)的差异)与用包括以下各物的目前批准或正在研发用以治疗CD的许多其他化合物治疗的患者的公布的CDAI-100应答和/或CDAI缓解率相比较高度增加：优特克单抗(如Sandborn等，N Engl J Med.2012年10月18日；367(16)：1519-28的图1中所报道的在用6mg/kg剂量治疗6周或8周之后的应答率)；维多珠单抗(如Sands等，Gastroenterology.2014年9月；147(3)：618-627的图3中所报道的在治疗6周或10周之后的应答率)；或阿达木单抗(根据Sandborn等，Ann Intern Med.2007；146：829-838中所报道在治疗对英利昔单抗二次失败的患者4周之后的应答率)。例如，在基线CRP≥5mg/L；基线IL-22≥11.3pg/mL；基线IL-22≥15.6pg/mL；或基线IL-22≥11.3pg/mL+CRP≥5mg/L(如使用实施例3中描述的IL22免疫测定所测量)的用MEDI2070治疗8周的患者中实现的CDAI-100应答率差(“CDAI应答Δ相比安慰剂”)和CDAI缓解率差(“CDAI缓解Δ相比安慰剂”)大于图8中对于优特克单抗、维多珠单抗和阿达木单抗报道的所报道的CDAI-100应答率差和/或CDAI缓解率差。对于2a期研究中用MEDI2070治疗的所有患者(与生物标志物状态无关)的总临床应答和缓解率与目前批准或正在研发的其他分子的应答率类似。表6汇总了图8中绘制的每个MEDI2070治疗的亚组的CDAI-100应答率差和CDAI缓解率差。这些结果进一步强调了高或升高的IL22血清水平(单独或与本文公开的其他生物标志物组合)在鉴定对用IL23拮抗剂(包括例如，抗IL23抗体或其片段，诸如MEDI2070)治疗作出应答的患有IL23介导的疾病或病症的患者中的惊人且出乎意料的预测价值。
类似地，如图6A-C所示且如表5中所报道，在第8周与安慰剂相比，用MEDI2070治疗的具有越来越高的基线LCN2水平的CD患者实现更高的临床应答率(如使用图6A-C所示的三种不同的临床应答测量中的任一种所测量)，支持MEDI2070在具有高基线LCN2血清水平的患者中诱导更好的临床应答。值得注意的是，与LCN2低的受试者(包括例如具有在第1或第2十分位数(0.1或0.2分位数)处的LCN2水平的受试者)相比，LCN2高的受试者(包括例如具有在第5、第6或第7十分位数(0.5、0.6或0.7分位数)处的LCN2水平的受试者)具有自安慰剂起更大的临床应答率差异(不管使用三种不同的临床应答测量中的哪一种)。这些结果进一步证明了高或升高的LCN2血清水平在鉴定对用IL23拮抗剂(包括例如，抗IL23抗体或其片段，诸如MEDI2070)治疗作出应答的患有IL23介导的疾病或病症的患者中的惊人且出乎意料的预测价值。
在增加的临床应答率与增加的基线生物标志物水平之间的关系并不总是如患者在第8、第9、第10等分位数处那么明显。在这些IL22或LCN2水平情况下，太少(如果有的话)的用MEDI2070或安慰剂治疗的患者可用于分析。参见，例如图6A-C；表4和表5。然而，如果样品量较大，则预计鉴定为具有在第8、第9或第10等分位数处的IL22或LCN2水平的患者的临床应答率增加。
总之，这些结果支持高IL22血清水平和/或高LCN2血清水平(包括例如在研究中鉴定的中值基线IL22和/或LCN2血清水平和/或在7.9pg/mL和31.4pg/mL之间的血清IL22水平和/或在142.8ng/mL和261.1ng/mL之间的血清LCN2水平)可以用于鉴定适合用IL23拮抗剂(包括例如，抗IL23抗体或其片段，诸如MEDI2070)治疗的患有IL23介导的疾病或病症的患者。
表4.受试者计数和在第8周依据十分位数基线IL22水平的CDAI应答率。
Figure BDA0001662404150001291
表5.受试者计数和在第8周依据十分位数基线LCN2水平的CDAI应答率。
Figure BDA0001662404150001292
表6.对于各种亚组，CDAI-100应答率差(定义为在治疗与安慰剂之间实现CDAI-100应答的受试者的百分比(％)差异)和CDAI缓解率差(定义为在治疗与安慰剂之间实现总CDAI评分低于150分的受试者的百分比(％)差异)。
Figure BDA0001662404150001301
如先前所提，IL23诱导的IL22诱导细胞分泌LCN2。因此，观察到两种独立的IL23途径成员的基线血清水平(即，升高的IL22或LCN2)均预测对MEDI2070的患者临床应答(例如，在第8周的CDAI-100应答率)强烈表明其他IL23途径生物标志物也可以预测响应MEDI2070治疗的临床效果的可能性增加。因此，就IL22和/或LCN2或任何其他IL23途径分析物(包括例如CCL20、IL17F、IL17A/F、IL23R、IL12B、IL6、IL21、TNF、CCR6、CCL22、IL1R1、IFN-γ、S100A12、DEFB-2、DEFB-4、IL1、SERPINB3、P13/弹力素、LL37、RORγ、RORγT、IL26、S100A7、DEFB103B或GM-CSF)的血清基线水平反映IL23轴活动性增加的程度而言，确定具有增加的IL23途径活动性(如通过测量一种或多种IL23途径生物标志物确定)的患者可能更易于受益于用IL23拮抗剂(包括，例如抗IL23抗体或其抗原结合片段，诸如MEDI2070)的治疗。
***
虽然已经根据具体方面描述了本发明，但是应该理解，本领域技术人员将想到变化和修改。因此，只有如权利要求中出现的这些限制才应该对本发明起作用。
本发明的广度和范围不应受任何上述示例性方面限制，而应仅根据以下权利要求和其等效物定义。
具体方面的前文描述将充分地披露本发明的一般特性，以使得其他人通过应用本领域中的知识，在无不当实验且不偏离本发明的一般概念的情况下，可以容易地针对各种应用对所述具体方面进行修改和/或调适。因此，基于本文呈现的教示和指导说明，这些改变和修改意图在所公开方面的等效物的含义和范围内。应了解，本文的措辞或术语是出于描述而非限制的目的，以使得本说明书的术语或措辞应由本领域技术人员根据教示和指导进行解释。
本申请要求2015年9月17日提交的美国临时申请62/220，062的权益，该申请以引用的方式整体并入本文。

Claims (15)

1.IL23拮抗剂在制备用于治疗患者的克罗恩氏病的药物中的用途，所述患者被确定在一种或多种从所述患者取得的样品中具有与预定的IL22和/或LCN2阈值水平相比或者与在一种或多种对照样品中的IL22和/或LCN2水平相比(i) 更高或增加的IL22水平和/或(ii)更高或增加的LCN2水平；其中所述患者的IL22和/或LCN2水平在免疫测定中测量；其中从所述患者取得的所述一种或多种样品和/或所述一种或多种对照样品是选自由以下组成的组的一种或多种：全血、血清和血浆或其组合；以及其中所述IL23拮抗剂是包含SEQ ID NO:31-36所述的互补决定区的抗IL23抗体或其抗原结合片段。
2.IL23拮抗剂在制备用于治疗患者的克罗恩氏病的药物中的用途，所述患者对于用抗TNF剂治疗失败，无应答或不耐受，并且被确定在一种或多种从所述患者取得的样品中具有与预定的IL22和/或LCN2阈值水平相比或者与在一种或多种对照样品中的IL22和/或LCN2水平相比(i) 更高或增加的IL22水平和/或(ii) 更高或增加的LCN2水平；其中所述患者的IL22和/或LCN2水平在免疫测定中测量；其中从所述患者取得的所述一种或多种样品和/或所述一种或多种对照样品是选自由以下组成的组的一种或多种：全血、血清和血浆或其组合；以及其中所述IL23拮抗剂是包含SEQ ID NO: 31-36所述的互补决定区的抗IL23抗体或其抗原结合片段。
3.用于确定IL22或LCN2的水平的试剂在制备用于确定是否用IL23拮抗剂治疗患有克罗恩氏病的患者的试剂盒或药物中的用途，其中所述确定包括如果确定患者在一种或多种从所述患者取得的样品中具有与预定的IL22和/或LCN2阈值水平相比或者与在一种或多种对照样品中的IL22和/或LCN2水平相比(i) 更高或增加的IL22水平和/或(ii) 更高或增加的LCN2水平，则确定治疗所述患者；其中所述患者的IL22和/或LCN2水平在免疫测定中测量；其中从所述患者取得的所述一种或多种样品和/或所述一种或多种对照样品是选自由以下组成的组的一种或多种：全血、血清和血浆或其组合；以及其中所述IL23拮抗剂是包含SEQ ID NO: 31-36所述的互补决定区的抗IL23抗体或其抗原结合片段。
4.用于确定IL22或LCN2的水平的试剂在制备用于选择被诊断为患有克罗恩氏病的患者作为用IL23拮抗剂治疗的候选者的试剂盒或药物中的用途，其中所述选择包括如果确定患者在一种或多种从所述患者取得的样品中具有与预定的IL22和/或LCN2阈值水平相比或者与在一种或多种对照样品中的IL22和/或LCN2水平相比(i) 更高或增加的IL22水平和/或(ii) 更高或增加的LCN2水平，则选择所述患者用于治疗；其中所述患者的IL22和/或LCN2水平在免疫测定中测量；其中从所述患者取得的所述一种或多种样品和/或所述一种或多种对照样品是选自由以下组成的组的一种或多种：全血、血清和血浆或其组合；以及其中所述IL23拮抗剂是包含SEQ ID NO: 31-36所述的互补决定区的抗IL23抗体或其抗原结合片段。
5.根据权利要求1至4中任一项所述的用途，其还包括测量在从所述患者获得的所述样品中的一种或多种中的IL22和/或LCN2水平，或指导临床实验室或保健提供者测量所述样品中的所述IL22和/或LCN2水平和/或递交从所述患者获得的所述一种或多种样品到临床实验室或保健提供者以测量所述样品中的所述IL22和/或LCN2水平。
6.根据权利要求1至4中任一项所述的用途，其还包括确定在从所述患者获得的所述一种或多种样品中的所述IL22和/或LCN2水平。
7.根据权利要求1至4中任一项所述的用途，其还包括如果确定患者在一种或多种样品中具有与预定的IL22和/或LCN2阈值水平相比或者与在一种或多种对照样品中的IL22和/或LCN2水平相比(i) 更高或增加的IL22水平和/或(ii) 更高或增加的LCN2水平，则建议保健提供者对所述患者施用IL23拮抗剂，或者如果确定患者在一种或多种样品中具有与预定的IL22和/或LCN2阈值水平相比或者与在一种或多种对照样品中的IL22和/或LCN2水平相比(i) 更低或减小的IL22水平和/或(ii) 更低或减小的LCN2水平，则建议保健提供者暂停或拒绝对所述患者施用IL23拮抗剂。
8.根据权利要求1至4中任一项所述的用途，其中所述抗IL23抗体或其抗原结合片段包含(i) 包含SEQ ID NO: 5或由SEQ ID NO:5组成的可变区(VH)和/或包含SEQ ID NO: 6或由SEQ ID NO:6组成的轻链可变区(VL)。
9.根据权利要求1至4中任一项所述的用途，其中所述IL22和/或LCN2的预定阈值水平选自由以下组成的组：
(a) 为IL22和/或LCN2的均值水平；
(b) 为IL22和/或LCN2的中值水平；以及
(c) 为以下表格中描述的IL22和/或LCN2的第1、第2、第3、第4、第5、第6、第7、第8或第9十分位数基线水平；
所述水平使用免疫测定在来自多个正常健康患者、患有非IL23介导的疾病的患者和/或患有IL23介导的疾病的患者的血清中所测量；
。
10.根据权利要求1至4中任一项所述的用途，其中确定所述患者在从所述患者取得的一种或多种样品中CRP水平≥5 mg/L，和/或FCP水平≥250 μg/g，FCP水平≥200 μg/g，FCP水平≥150 μg/g，FCP水平≥100 μg/g或FCP水平为100 μg/g至250 μg/g。
11.根据权利要求1至4中任一项所述的用途，其中
(a) 所述预定的IL22阈值水平为7.9 pg/mL至31.4 pg/mL；和/或
(b) 所述预定的LCN2阈值水平为143 ng/mL至261 ng/mL。
12.根据权利要求11所述的用途，其中
(a) 所述预定的IL22阈值水平为15.6 pg/mL；和/或
(b) 如所述预定的LCN2阈值水平为215 ng/mL。
13.根据权利要求1至4中任一项所述的用途，其中确定或测量IL22的水平。
14.根据权利要求1至4中任一项所述的用途，其中确定或测量LCN2的水平。
15.根据权利要求1至4中任一项所述的用途，其中确定或测量IL22和LCN2的水平。
CN201680066986.XA 2015-09-17 2016-09-16 使用il23途径生物标志物预测il23拮抗剂的临床应答 Active CN108290058B (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN202310427386.3A CN116672446A (zh) 2015-09-17 2016-09-16 使用il23途径生物标志物预测il23拮抗剂的临床应答

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201562220062P 2015-09-17 2015-09-17
US62/220062 2015-09-17
PCT/US2016/052060 WO2017049035A1 (en) 2015-09-17 2016-09-16 Prediction of clinical response to il23-antagonists using il23 pathway biomarkers

Related Child Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN202310427386.3A Division CN116672446A (zh) 2015-09-17 2016-09-16 使用il23途径生物标志物预测il23拮抗剂的临床应答

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN108290058A CN108290058A (zh) 2018-07-17
CN108290058B true CN108290058B (zh) 2023-05-16

Family

ID=58289919

Family Applications (2)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN202310427386.3A Pending CN116672446A (zh) 2015-09-17 2016-09-16 使用il23途径生物标志物预测il23拮抗剂的临床应答
CN201680066986.XA Active CN108290058B (zh) 2015-09-17 2016-09-16 使用il23途径生物标志物预测il23拮抗剂的临床应答

Family Applications Before (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN202310427386.3A Pending CN116672446A (zh) 2015-09-17 2016-09-16 使用il23途径生物标志物预测il23拮抗剂的临床应答

Country Status (13)

Country Link
US (1) US11016099B2 (zh)
EP (1) EP3349854A4 (zh)
JP (3) JP6909208B2 (zh)
KR (1) KR20180063127A (zh)
CN (2) CN116672446A (zh)
AU (1) AU2016323579A1 (zh)
BR (1) BR112018005175A2 (zh)
CA (1) CA2998349A1 (zh)
HK (1) HK1258292A1 (zh)
IL (1) IL257969A (zh)
MX (1) MX2018003376A (zh)
RU (1) RU2018113694A (zh)
WO (1) WO2017049035A1 (zh)

Families Citing this family (24)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
AU2015323979A1 (en) 2014-09-29 2017-05-18 Immusant, Inc. Use of HLA genetic status to assess or select treatment of celiac disease
EP3349854A4 (en) 2015-09-17 2019-04-03 Amgen Inc. PREDICTING THE CLINICAL RESPONSE TO IL23 ANTAGONISTS WITH IL23 PATIENT BIOMARKERS
TW201922780A (zh) * 2017-09-25 2019-06-16 美商健生生物科技公司 以抗ｉｌ１２／ｉｌ２３抗體治療狼瘡之安全且有效之方法
WO2019113037A1 (en) * 2017-12-04 2019-06-13 Immusant, Inc. Measurement of ccl20 after gluten exposure
BR112020011360A2 (pt) * 2017-12-07 2021-01-26 Amgen Inc. método de tratamento de púrpura trombocitopênica idiopática (itp) com romiplostim
KR20200129125A (ko) * 2018-03-05 2020-11-17 얀센 바이오테크 인코포레이티드 항-il23 특이적 항체로 크론병을 치료하는 방법
US11578124B2 (en) 2018-05-18 2023-02-14 Janssen Biotech, Inc. Safe and effective method of treating lupus with anti-IL12/IL23 antibody
KR20210064315A (ko) * 2018-09-24 2021-06-02 얀센 바이오테크 인코포레이티드 항-il12/il23 항체로 궤양성 결장염을 치료하는 안전하고 효과적인 방법
US20220364171A1 (en) * 2018-11-23 2022-11-17 Katholieke Universiteit Leuven Predicting a treatment response in inflammatory bowel disease
CN109337974B (zh) * 2018-12-14 2022-01-25 北京蛋白质组研究中心 一种检测银屑病的诊断标志物的试剂及其应用
EP3897722A4 (en) * 2018-12-18 2022-09-14 Janssen Biotech, Inc. SAFE AND EFFECTIVE METHOD OF TREATING LUPUS WITH AN ANTI-IL12/IL23 ANTIBODY
MA55383A (fr) * 2019-03-18 2022-01-26 Janssen Biotech Inc Méthode de traitement du psoriasis chez des sujets pédiatriques avec un anticorps anti-il12/il23
JP2022527278A (ja) * 2019-03-26 2022-06-01 アストラゼネカ・コラボレイション・ベンチャーズ・リミテッド・ライアビリティ・カンパニー Ｉｌ２３アンタゴニスト療法に適した患者集団
WO2020215019A1 (en) * 2019-04-17 2020-10-22 Millennium Pharmaceuticals, Inc. Alpha4beta7 inhibitor and il-23 inhibitor combination therapy
JP2022534020A (ja) 2019-05-23 2022-07-27 ヤンセン バイオテツク，インコーポレーテツド Ｉｌ－２３及びｔｎｆアルファに対する抗体の併用療法による炎症性腸疾患の治療方法
CN114641493A (zh) * 2019-08-21 2022-06-17 阿斯特捷利康合作创业有限责任公司 使用布雷库单抗治疗克罗恩病
WO2021074897A2 (en) * 2019-10-18 2021-04-22 Janssen Biotech, Inc. Safe and effective method of treating ulcerative colitis with anti-il12/il23 antibody
WO2021106453A1 (ja) * 2019-11-29 2021-06-03 東洋紡株式会社 組換えｃ反応性タンパク質
JP2023509373A (ja) * 2019-12-20 2023-03-08 ノヴァロック バイオセラピューティクス， リミテッド 抗インターロイキン－２３ ｐ１９抗体およびそれの使用方法
AU2021218265A1 (en) * 2020-02-14 2022-10-06 Janssen Biotech, Inc. Safe and effective method of treating ulcerative colitis with anti-IL-12/IL23 antibody
CN111424086A (zh) * 2020-03-19 2020-07-17 上海交通大学 用于胃癌诊断及预后评估的生物标记物及应用和检测试剂盒
EP4232062A1 (en) * 2020-10-23 2023-08-30 HAN, Hq Bifunctional antagonists of activin and tumor necrosis factor-alpha and uses thereof
CA3199737A1 (en) * 2020-11-30 2022-06-02 Tobin Dickerson Microneedle devices and methods, and skin condition assays
US20220373539A1 (en) * 2021-05-24 2022-11-24 Amgen Inc. Prediction of clinical response to il23-antagonists using il23 pathway biomarkers

Family Cites Families (69)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
GB8318754D0 (en) 1983-07-11 1983-08-10 Fagerhol M K F Human proteins anti-sera test kits
US5455160A (en) 1993-05-27 1995-10-03 Fagerhol; Magne K. Diagnostic test and kit for disease or disorders in the digestive system
PT937259E (pt) 1996-11-01 2005-01-31 Magne K Fagerhol Processo para a extraccao de proteinas
US6171586B1 (en) 1997-06-13 2001-01-09 Genentech, Inc. Antibody formulation
CO4810232A1 (es) 1997-07-25 1999-06-30 Schering Corp Citoquinas de mamiferos y sus secuencias codificadoras
US7226591B2 (en) 2000-05-22 2007-06-05 Genentech, Inc. Interleukin-22 polypeptides, nucleic acids encoding the same and methods for the treatment of pancreatic disorders
DK1311679T3 (da) 2000-08-24 2009-02-23 Genentech Inc Fremgangsmåde til inhibering af IL-22-induceret PAP1
RU2006135119A (ru) 2004-03-05 2008-04-10 Аркемикс Корп. (Us) Аптамеры к семейству цитокинов il-12 человека и их применение в качестве лекарственных средств для аутоиммунных заболеваний
EP2661963B1 (en) 2004-05-06 2015-09-16 The Trustees of Columbia University in the City of New York Method for diagnosing acute renal failure or chronic renal failure
KR100681763B1 (ko) 2005-02-28 2007-02-15 재단법인 목암생명공학연구소 인간 리포칼린 2를 유효성분으로 포함하는 암 전이 억제용약학적 조성물, 이를 이용한 암 전이 억제 방법
WO2007005955A2 (en) 2005-06-30 2007-01-11 Centocor, Inc. Anti-il-23 antibodies, compositions, methods and uses
JP5022367B2 (ja) 2005-08-25 2012-09-12 イーライ リリー アンド カンパニー 抗ｉｌ−２３抗体
EP3190125A1 (en) 2005-08-31 2017-07-12 Merck Sharp & Dohme Corp. Engineered anti-il-23 antibodies
US20080199460A1 (en) * 2005-09-01 2008-08-21 Schering Corporation Use of IL-23 and IL-17 antagonists to treat autoimmune ocular inflammatory disease
CN102887954B (zh) 2005-12-29 2015-02-04 詹森生物科技公司 人抗il-23抗体、组合物、方法和用途
US20070203216A1 (en) 2006-02-14 2007-08-30 Bjarke Ebert Method of treating inflammatory diseases
WO2007098065A2 (en) 2006-02-17 2007-08-30 The United States Of America As Represented By The Department Of Veterans Affairs Human sodium channel isoforms
WO2007147019A2 (en) 2006-06-13 2007-12-21 Zymogenetics, Inc. Il-17 and il-23 antagonists and methods of using the same
MX2008015446A (es) 2006-06-19 2008-12-12 Wyeth Corp Metodos de modulacion il-22 e il-17.
GB0613470D0 (en) 2006-07-06 2006-08-16 Ares Trading Sa Protein
WO2008028044A2 (en) * 2006-08-30 2008-03-06 Centocor, Inc. Markers and methods for assessing and treating ulcerative colitis and related disorders using 66 gene panel
JP2010518858A (ja) 2007-02-23 2010-06-03 シェーリング コーポレイション 操作された抗−ｉｌ−２３ｐ１９抗体
EP2426144B1 (en) 2007-02-23 2018-10-31 Merck Sharp & Dohme Corp. Engineered anti-il-23p19 antibodies
AR068723A1 (es) 2007-10-05 2009-12-02 Glaxo Group Ltd Proteina que se une a antigenos que se une a il-23 humana y sus usos
US20090123946A1 (en) 2007-10-19 2009-05-14 Abbott Laboratories Immunoassays and kits for the detection of ngal
JP2011501673A (ja) 2007-10-19 2011-01-13 アボット・ラボラトリーズ グリコシル化された哺乳動物ｎｇａｌ及びその使用
US20090269777A1 (en) 2007-10-19 2009-10-29 Abbott Laboratories Immunoassays and kits for the detection of ngal
EP2215481B2 (en) 2007-11-15 2017-01-18 Bioporto Diagnostics A/S Diagnostic use of individual molecular forms of a biomarker
WO2009082624A2 (en) 2007-12-10 2009-07-02 Zymogenetics, Inc. Antagonists of il-17a, il-17f, and il-23 and methods of using the same
JP2011514162A (ja) 2008-03-14 2011-05-06 エグザジェン ダイアグノスティクス インコーポレイテッド 炎症性腸疾患および過敏性腸症候群のバイオマーカー
US20100227775A1 (en) 2008-04-16 2010-09-09 Abbott Laboratories Immunoassays and kits for the detection of ngal
MX2011002159A (es) 2008-08-27 2011-03-29 Schering Corp Formulaciones liofilizadas de anticuerpos anti-interleucina-23p19 construidos por ingenieria.
GB2464183A (en) 2008-09-19 2010-04-14 Singulex Inc Sandwich assay
WO2010042903A1 (en) 2008-10-09 2010-04-15 Alfagene Bioscience, Inc Use and identification of biomarkers for gastrointestinal diseases
US20100105150A1 (en) 2008-10-24 2010-04-29 Abbott Laboratories Isolated human autoantibodies to neutrophil gelatinase-associated lipocalin (ngal) and methods and kits for the detection of human autoantibodies to ngal
CA2741566A1 (en) * 2008-11-03 2010-06-03 Schering Corporation Inflammatory bowel disease biomarkers and related methods of treatment
US20120128689A1 (en) 2009-04-01 2012-05-24 Glaxo Group Limited Anti-il-23 immunoglobulins
WO2010129964A1 (en) 2009-05-08 2010-11-11 The Board Of Trustees Of The University Of Illinois Drug targets for prevention of arrhythmia in heart disease
US20120264917A1 (en) 2009-05-27 2012-10-18 Ablynx N.V. Biparatopic protein constructs directed against il-23
AU2010266028B2 (en) 2009-06-25 2015-04-30 Société des Produits Nestlé S.A. Methods for diagnosing irritable bowel syndrome
US10704096B2 (en) 2009-07-07 2020-07-07 University Of Southern California Biomarkers for the early detection of autoimmune diseases
JO3244B1 (ar) 2009-10-26 2018-03-08 Amgen Inc بروتينات ربط مستضادات il – 23 البشرية
EP2504457A4 (en) 2009-11-25 2013-08-14 Nestec Sa NOVEL GENOMIC BIOMARKERS USED IN THE DIAGNOSIS OF IRRITABLE COLON SYNDROME
ES2652637T3 (es) 2010-01-15 2018-02-05 Kirin-Amgen, Inc. Formulación de anticuerpos y regímenes terapéuticos
CN103108886B (zh) 2010-07-20 2016-08-24 赛法隆澳大利亚控股有限公司 抗il-23杂二聚体特异性抗体
US8541180B1 (en) 2010-10-11 2013-09-24 Genova Diagnostics, Inc. Compositions and methods for assessing gastrointestinal health
LT2635601T (lt) * 2010-11-04 2016-10-10 Boehringer Ingelheim International Gmbh Antikūnai prieš il-23
BR112013017445A2 (pt) 2011-01-06 2016-08-23 Univ Illinois métodos de determinar a necessidade de um indivíduo para um desfibrilador cardíaco implantado (icd) e para uma terrapia antiarrítmica, de determinar o risco de um indivíduo para uma morte cardiáca súbita, para arritmias e para insuficiência cardíaca, de reduzir risco de morte cardíaca súbita em um indivíduo, kit, sistema, meio de armazenamento legível por computador, e, método implementado por um processador em um computador
US10208349B2 (en) 2011-01-07 2019-02-19 Ucb Biopharma Sprl Lipocalin 2 as a biomarker for IL-17 inhibitor therapy efficacy
GB201100282D0 (en) 2011-01-07 2011-02-23 Ucb Pharma Sa Biological methods
CA2827894A1 (en) 2011-02-22 2012-08-30 Caris Life Sciences Luxembourg Holdings, S.A.R.L. Circulating biomarkers
IL278227B (en) 2011-04-29 2022-07-01 Cancer Prevention & Cure Ltd Data classification systems for identifying biomarkers and diagnosing diseases
WO2012158831A1 (en) 2011-05-16 2012-11-22 Prometheus Laboratories Inc. Performance of a biomarker panel for irritable bowel syndrome
NO20110895A1 (no) 2011-06-21 2012-12-24 Magne Fagerhol Kompetitive S100A9 immunoanalyser
NO336551B1 (no) 2011-06-21 2015-09-28 Magne Fagerhol Forbedret ELISA for kalprotektin i fekalprøve eller gastrointestinaltraktsprøve
EP2742154A4 (en) 2011-08-08 2015-08-12 Caris Life Sciences Switzerland Holdings Gmbh BIOMARKER COMPOSITIONS AND METHODS
EA201491460A1 (ru) 2012-02-03 2015-01-30 Тева Фармасьютикал Индастриз Лтд. ПРИМЕНЕНИЕ ЛАХИНИМОДА В ЛЕЧЕНИИ ПАЦИЕНТОВ С БОЛЕЗНЬЮ КРОНА, У КОТОРЫХ НЕ ЭФФЕКТИВНА ТЕРАПИЯ ПЕРВОЙ ЛИНИИ АНТИ-TNFα
WO2013132338A2 (en) 2012-03-06 2013-09-12 Calpro As Competitive immunoassay for calprotectin
WO2013132347A2 (en) 2012-03-06 2013-09-12 Calpro As Improved elisa immunoassay for calprotectin
US9732387B2 (en) 2012-04-03 2017-08-15 The Regents Of The University Of Michigan Biomarker associated with irritable bowel syndrome and Crohn's disease
WO2014055824A1 (en) 2012-10-05 2014-04-10 Genentech, Inc. Methods for diagnosing and treating inflammatory bowel disease
JP6695280B2 (ja) 2014-05-15 2020-05-20 メソ スケール テクノロジーズ エルエルシー 改善されたアッセイ方法
WO2015191783A2 (en) 2014-06-10 2015-12-17 Abbvie Inc. Biomarkers for inflammatory disease and methods of using same
WO2016014775A1 (en) * 2014-07-24 2016-01-28 Boehringer Ingelheim International Gmbh Biomarkers useful in the treatment of il-23a related diseases
EP3349854A4 (en) 2015-09-17 2019-04-03 Amgen Inc. PREDICTING THE CLINICAL RESPONSE TO IL23 ANTAGONISTS WITH IL23 PATIENT BIOMARKERS
GB201521357D0 (en) 2015-12-03 2016-01-20 Univ Liverpool Methods for predicting response to anti-TNF therapy
US11220541B2 (en) 2015-12-22 2022-01-11 Amgen Inc. CCL20 as a predictor of clinical response to IL23-antagonists
WO2018089693A2 (en) 2016-11-09 2018-05-17 Protagonist Therapeutics, Inc. Methods for determining and monitoring gastrointestinal inflammation
WO2018119626A1 (zh) 2016-12-27 2018-07-05 菲鹏生物股份有限公司 中性粒细胞明胶酶相关脂质运载蛋白检测试剂盒

Also Published As

Publication number Publication date
KR20180063127A (ko) 2018-06-11
RU2018113694A (ru) 2019-10-17
JP6909208B2 (ja) 2021-07-28
BR112018005175A2 (pt) 2018-10-16
JP2018535394A (ja) 2018-11-29
IL257969A (en) 2018-05-31
WO2017049035A1 (en) 2017-03-23
AU2016323579A1 (en) 2018-04-05
RU2018113694A3 (zh) 2020-01-31
EP3349854A1 (en) 2018-07-25
CN116672446A (zh) 2023-09-01
HK1258292A1 (zh) 2019-11-08
MX2018003376A (es) 2018-08-15
US20180252728A1 (en) 2018-09-06
JP2023002583A (ja) 2023-01-10
CA2998349A1 (en) 2017-03-23
JP2021170017A (ja) 2021-10-28
JP7153775B2 (ja) 2022-10-14
CN108290058A (zh) 2018-07-17
EP3349854A4 (en) 2019-04-03
US11016099B2 (en) 2021-05-25

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN108290058B (zh) 使用il23途径生物标志物预测il23拮抗剂的临床应答
US20220144935A1 (en) Ccl20 as a predictor of clinical response to il23-antagonists
JP2012507723A (ja) 炎症性腸疾患生物マーカーおよび関連治療方法
TW201307845A (zh) 預測方法及利用ｉｌ－１７拮抗劑治療關節炎的方法
WO2015034926A1 (en) Treatment methods for rheumatoid arthritis
US20230303707A1 (en) Anti-pad4 autoantibodies as clinical response biomarkers for the treatment of rheumatoid arthritis
EP3371225A2 (en) Dipeptidyl peptidase-4 and periostin as predictors of clinical response to eosinophil-targeted therapeutic agents in eosinophilic diseases
US20220373539A1 (en) Prediction of clinical response to il23-antagonists using il23 pathway biomarkers
US20190352425A1 (en) Assay to detect human dpp-4

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
GR01 Patent grant
GR01 Patent grant